CN115516301A - 色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序 - Google Patents
色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序 Download PDFInfo
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Abstract
本发明的色谱质量分析装置具备:测量部(1),包含色谱部(1A)与可进行MS/MS分析的质量分析部(1B),对包含由色谱部分离的化合物的试样,在质量分析部反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析,收集具有时间、m/z及信号强度这三维的色谱质量分析数据;成分检测部(42),基于针对目标试样的规定的m/z范围内的色谱质量分析数据分别求出MS/MS谱,推定前体离子峰,以各MS/MS谱中的关于m/z方向的规定的基准及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准来取舍选择峰,检测与化合物及其部分结构对应的成分;锁定部(43、44),对检测出的成分进行使用了先验信息的筛选来锁定解析对象的成分;组成推定部(45),推定该成分的组成或化学式。
Description
技术领域
本发明涉及用于对通过色谱质量分析收集到的数据进行处理的色谱质量分析数据处理方法、使用该方法的色谱质量分析装置以及使用计算机来实现该方法的色谱质量分析数据处理用程序。本发明例如适合于检测试样中包含的大量化合物来鉴定或确认目标化合物、或者调查是否含有大量目标化合物的筛选等用途。
背景技术
在液相色谱质量分析装置(LC-MS)、气相色谱质量分析装置(GC-MS)中,能够利用色谱部随时间分离试样中包含的各种化合物,并利用质量分析部依次检测该分离出的各化合物。另外,在本说明书中,将LC-MS、GC-MS等组合了色谱部与质量分析部的装置称为色谱质量分析装置。此外,在以下的说明中,特别以LC-MS为例进行说明,但在GC-MS中情况也相同。
在一般的LC-MS中,通过在质量分析部中反复进行遍及规定的质荷比(严格来说是斜体字记载的m/z,但在本说明书中使用惯用的“质荷比”这一用语)范围的扫描测量,能够收集具有保留时间、质荷比、信号强度值这三个维度的数据。为了使用计算机基于上述数据来鉴定未知的化合物或调查是否含有特定的化合物和含量,以往利用各种数据处理用的软件。
例如在非专利文献1中公开了命名为“Profiling Solution”的软件。在该软件中,通过对由色谱质量分析装置得到的处理前的数据(以下,根据惯用有时称为“原始数据”)进行处理,能够检测质谱上以及色谱图上的峰,生成主成分分析等多变量解析用的峰列表。
但是,一般而言,在使用了这样的现有软件的峰检测处理中,根据化合物的种类、噪声、背景等的状况等,存在常常产生假阳性、假阴性的结果这样的问题。
本申请人在先前申请的日本特愿2019-154820号中提出了用于解决这样的问题的新的方法,并且正在销售搭载有实施基于该提出方法的处理的软件(参照非专利文献2)的装置。
在该新的方法中,在对包含碳、氧、氢等元素的有机化合物进行质量分析的情况下,利用在质谱中比较良好地观测到示出同位素簇的多个峰这一点,使用每个化合物的同位素簇中包含的多个峰的信号强度比的预测式,从在实测的质谱上观测到的大量峰中识别同位素簇所包含的峰,并且在其中推定单一同位素离子峰。此外,还具有基于被推定为单一同位素离子峰的质荷比中的时间方向的信号强度的变化来识别有意义的峰与噪声的功能等。通过组合这样的各种功能,能够从在质谱上观测到的大量峰中检测出源自化合物的有意义的峰,并根据该峰来确定化合物。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:国际公开第2019/012589号
专利文献2:美国专利第8809770号说明书
专利文献3:日本特开2013-231715号公报
非专利文献
非专利文献1:“Profiling Solution ver.1.1轮廓曲线(Profiling)解析用软件”、[在线]、[2020年4月27日检索]、株式会社岛津制作所、网址<URL:https://www.an.shimadzu.co.jp/lcms/profilingsol-v11.htm>
非专利文献2:“LabSolutions InsightTM GC/MS&LC/MS用多被检体定量辅助软件LabSolutions Insight”、[在线]、[2020年4月27日检索]、株式会社岛津制作所、网址<URL:https://www.an.shimadzu.co.jp/data-net/labsolutions/insight/index.htm>
非专利文献3:“组成推定软件(Formula Predictor,选项)”、[在线]、[2020年4月27日检索]、株式会社岛津制作所、网址<URL:https://www.an.shimadzu.co.jp/lcms/it-tof5.htm>
非专利文献4:Ivana Blazenovic等4人,“用于代谢组学中LC-MS/MS数据的化合物鉴定的软件工具和方法(Software Tools and Approaches for CompoundIdentification of LC-MS/MS Data in Metabolomics)”、《Metabolites》、2018年、Vol.8、No.2、第31页
发明内容
发明要解决的技术问题
近年来,在食品中的残留农药检查、环境水中的污染物质检查等需要进行多被检体多成分的定性与定量分析的领域中,将串联型质量分析装置作为检测器的LC-MS的利用急速发展。特别是使用飞行时间型质量分离器作为后级的质量分离器的四极-飞行时间型质量分析装置(Q-TOF型质量分析装置)与一般的三重四极型质量分析装置相比,能够进行高质量精度及质量分辨率的测量,因此在复杂的试样中的化合物的鉴定、定量中发挥威力。
在这样的LC-MS中,作为质量分析部中的MS/MS分析的方法,采用被称为数据依赖型解析(DDA:Data Dependent Analysis或Data Dependent Acquisition)与数据非依赖型解析(DIA:Data Independent Analysis或Data Independent Acquisition)的方法(参照专利文献1、2等)。
DDA是如下方法:首先通过通常的质量分析(以下称为“MS分析”)获取质谱(以下,将通过MS分析得到的质谱称为“MS谱”),将具有基于在该MS谱中观测到的峰的信号强度等而选择的特定的质荷比的离子作为前体离子,接着上述MS分析进行MS/MS分析,获取可观测到多种产物离子的MS/MS谱。在DDA中,在MS谱中不存在满足适当条件的峰的情况下,不执行MS/MS分析。
另一方面,DIA是如下方法:将作为测量对象的质荷比范围分割为多个而分别设定质量窗,将具有各质量窗中包含的质荷比的离子一并作为前体离子,对由这些前体离子生成的产物离子全面地进行扫描测量,对每个质量窗得到MS/MS谱。
与实施以具有特定的质荷比的离子为前体离子的MS/MS分析的DDA不同,在DIA中,进行以质量窗中包含的多个离子为前体离子的MS/MS分析,并且对于不同的质荷比范围的质量窗,在实质上可视为同时的时间内分别实施MS/MS分析,因此MS/MS谱的全面性高。因此,DIA是适合于大范围而全面地对试样中包含的大量化合物进行定性及定量的方法。
在DIA中,一个质量窗的质荷比宽度为10~100Da左右的范围,在MS/MS谱中混合观测到源自多个化合物的各种产物离子、源自一个化合物的同位素簇中包含的大量离子的产物离子等。因此,通过DIA得到的MS/MS谱中的信息量远大于MS谱的信息量。在上述在先申请的提出方法中,主要设想MS谱数据作为其数据处理的对象,因此,即使想要将该方法用于MS/MS谱数据的处理,也未必能够有效地利用所得到的信息,有时无法改善化合物的推定精度等解析精度。
此外,通过DIA得到的MS/MS谱中出现大量源自一个化合物的产物离子峰,而且血液等试样中除了目标化合物以外还含有大量夹杂物,因此MS/MS谱中也出现大量源自夹杂物的产物离子峰。因此,当对通过DIA得到的MS/MS谱进行峰检测时,将数目庞大的峰列举为与化合物候选对应的峰。虽然在该化合物候选中也包含解析者完全不关心的化合物的候选,但在以往的方法中无法有效地排除这样的不需要的候选,因此存在解析者的作业负担大,并且计算机中的处理时间也颇为浪费地长这样的问题。
进而,以往在想要求出利用上述那样的方法鉴定出的化合物的组成、分子式、离子式等的情况下,需要利用“Formula Predictor”(参照非专利文献3等)等其他软件。因此,还存在对所鉴定的化合物进行详细解析时的解析者的作业负担大、解析效率差这样的问题。
本发明是为了解决这样的技术问题而完成的,其主要目的在于提供一种色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序,能够适当地利用由DIA得到的MS/MS谱的信息来提高化合物的鉴定精度、定量精度或者化合物的组成、结构的推定的精度,并且能够减轻这样的解析时的解析者的作业负担而实现效率化。
用于解决上述技术问题的方案
为了解决上述技术问题而完成的本发明的色谱质量分析数据处理方法的一方案,是对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理方法,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,该色谱质量分析数据处理方法具有:
成分检测步骤,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定步骤,针对在所述成分检测步骤中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定步骤,利用与在所述锁定步骤中锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
此外,为了解决上述技术问题而完成的本发明的色谱质量分析装置的一方案具备:
测量部,包含色谱部与能够进行MS/MS分析的质量分析部,对于包含由所述色谱部分离出的化合物的试样,通过由所述质量分析部反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析,从而收集具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据;
成分检测部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定部,针对在所述成分检测部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定部,利用与由所述锁定部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
此外,为了解决上述技术问题而完成的本发明的色谱质量分析数据处理用程序的一方案,是用于使用计算机对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理用程序,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,使计算机作为如下功能部工作:
成分检测功能部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定功能部,针对在所述成分检测功能部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定功能部,利用与由所述锁定功能部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
在此,色谱仪可以是液相色谱仪或气相色谱仪中的任一种。
此外,数据非依赖型解析(DIA)是上述的被称为Data Independent Analysis或Data Independent Acquisition的MS/MS分析的方法。在数据非依赖型解析中,通过将具有规定的质荷比宽度的质量窗中包含的离子全部作为前体离子并通过碰撞诱导解离等使其解离来进行MS/MS分析,但通过适当调整该碰撞诱导解离中的碰撞能量等解离条件,能够使一部分前体离子不解离而供于后级的质量分析。即,在该情况下,在MS/MS谱中同时观察到源自某种化合物的分子离子(例如,质子化分子)与源自相同化合物的产物离子。另一方面,在使全部前体离子解离的情况下,在MS/MS谱中仅观测到产物离子。在该情况下,在与MS/MS分析实质上相同的时机也进行MS分析,将仅观测到前体离子的MS谱与MS/MS谱一并获取即可。
发明效果
在本发明的色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序的上述方案中,先验信息是指,例如能够设为要解析的化合物的化学式和质量的列表、或者与之相反不需要解析的化合物的化学式和质量的列表等。
例如血液等源自生物体的试样包含非常多的化合物。因此,若在上述成分检测步骤中对通过针对这样的试样进行色谱质量分析而得到的数据执行成分检测,则检测出大量与多个化合物候选对应的峰。与此相对,根据本发明的色谱质量分析数据处理方法、色谱质量分析装置以及色谱质量分析数据处理用程序的上述方案,利用先验信息将如上述那样检测出的大量化合物的候选锁定为解析者所关注的候选、应关注的候选或者相反地未设想包含于试样的候选等,在此基础上,能够不进行麻烦的作业而计算出该化合物的组成式、分子式、离子式等。由此,能够有效地利用通过基于DIA的MS/MS分析得到的信息,减轻解析者的作业负担,并且能够高效地鉴定试样中包含的化合物且高精度地求出其组成等。
附图说明
图1是作为本发明的一实施方式的LC-MS分析系统的概略构成图。
图2是说明本实施方式的LC-MS分析系统中的DIA模式下的分析的示意图。
图3是说明本实施方式的LC-MS分析系统中的DIA模式下的分析的示意图。
图4是本实施方式的LC-MS分析系统中的用于化合物鉴定的数据处理的概略流程图。
图5是本实施方式的LC-MS分析系统中的成分检测处理的说明图。
图6是示出本实施方式的LC-MS分析系统中的成分检测结束时间点的显示画面的一例的图。
图7是示出本实施方式的LC-MS分析系统中的筛选结束时间点的显示画面的一例的图。
图8是示出本实施方式的LC-MS分析系统中的组成推定结束时间点的显示画面的一例的图。
图9是示出本实施方式的LC-MS分析系统中的化合物鉴定结束时间点的显示画面的一例的图。
具体实施方式
以下,参照附图对作为本发明的色谱质量分析装置的一实施方式的LC-MS分析系统进行说明。
[LC-MS分析系统的构成]
图1是本实施方式的LC-MS分析系统的概略构成图。
如图1所示,该LC-MS分析系统包括:测量部1,包含液相色谱部1A以及质量分析部1B;控制与处理部4;输入部5;显示部6。
液相色谱部1A包括:流动相容器10,储存流动相;送液泵11,抽吸流动相并以大致恒定流量进行输送;注射器12,向流动相中注入试样液;以及色谱柱13,随时间分离试样液中所含的各种化合物。
质量分析部1B是四极-飞行时间型(Q-TOF型)质量分析装置,包括大致大气压气氛的离子化室201与内部被划分为四个室的真空腔室20。在真空腔室20内设置有第1中间真空室202、第2中间真空室203、第1高真空室204、第2高真空室205,以真空度按该顺序依次变高的方式利用真空泵对各室进行真空排气。即,在该质量分析部1B中采用多级差动排气系统的构成。
离子化室201中配置有从色谱柱13的出口供给洗脱液的电喷雾离子化(ESI:Electrospray ionization)探针21,离子化室201与第1中间真空室202通过细径的脱溶剂管22连通。第1中间真空室202与第2中间真空室203通过形成于截取锥(Skimmer)24的顶部的孔连通,在第1中间真空室202内与第2中间真空室203内分别配置有离子导向器23、25。在第1高真空室204内设置有四极滤质器26与在内部配置有离子导向器28的碰撞池27。此外,跨越第1高真空室204与第2高真空室205配置的多个电极构成离子导向器29。进而,在第2高真空室205内设置有包含正交加速部30以及具有反射器的离子飞行部31的正交加速方式的飞行时间型质量分离器与离子检测器32。
控制与处理部4包括分析控制部40、数据存储部41、成分检测部42、筛选信息存储部43、筛选部44、组成推定部45、化合物决定部46及显示处理部47作为功能块。
通常,控制与处理部4的实体是个人计算机、工作站等,能够设为通过在该计算机中执行安装于这样的计算机的专用的一个或多个软件(计算机程序)来实现上述各功能块的构成。这样的计算机程序能够存储在CD-ROM、DVD-ROM、存储卡、USB存储器(加密狗)等计算机可读取的非暂态记录介质中而提供给用户。或者,也能够以经由因特网等通信线路的数据传输的形式提供给用户。或者,也能够在用户购买系统的时间点预先预安装在作为系统的一部分的计算机中。
[LC-MS分析系统的分析动作]
分析控制部40通过控制测量部1,执行对于所准备的试样的LC/MS分析。接着,对在该分析控制部40的控制下执行的典型的测量动作概略地进行说明。在该LC-MS分析系统中,能够选择性地进行不伴随离子解离的通常的质量分析(MS分析)与通过碰撞诱导解离(CID:Collision-Induced Dissociation)使离子解离的MS/MS(=MS2)分析。
在液相色谱部1A中,送液泵11从流动相容器10抽吸流动相并以大致恒定流量输送至色谱柱13。注射器12根据来自分析控制部40的指示将试样注入到流动相中。试样随着流动相被导入至色谱柱13,在通过色谱柱13的期间,试样中包含的化合物随时间被分离。来自色谱柱13的出口的洗脱液被导入至ESI探针21,ESI探针21将洗脱液作为带电液滴向离子化室201内喷雾。在带电液滴被微细化、该液滴中的溶剂气化的过程中,该液滴中的化合物成为气体离子。
将生成的离子经由脱溶剂管22向第1中间真空室202内输送,依次经由离子导向器23、截取锥24、离子导向器25,被导入至第1高真空室204内的四极滤质器26。在MS分析的情况下,离子基本上直接通过四极滤质器26及碰撞池27,并被输送至正交加速部30。另一方面,在MS/MS分析的情况下,对构成四极滤质器26的多个杆电极分别施加规定的电压,选择具有与该电压相应的特定的质荷比的离子种类、或包含在与该电压相应的特定的质荷比范围内的离子种类作为前体离子并通过四极滤质器26。在碰撞池27内导入有Ar气体等碰撞气体,前体离子与碰撞气体接触而通过CID被解离,生成各种产物离子。所生成的产物离子经由离子导向器29被输送至正交加速部30。
该离子的解离方式根据前体离子入射至碰撞池27时该离子所具有的动能(碰撞能量)而不同。因此,即使前体离子相同,也能够通过适当调整碰撞能量,使生成的产物离子的种类变化。此外,也能够不使全部前体离子解离,而是使一部分前体离子不解离而残留。另外,众所周知,碰撞能量一般由施加于四极滤质器26的直流偏置电压与施加于配置在碰撞池27的离子入口的透镜电极的直流电压的电压差决定。
在正交加速部30中,离子在与其入射方向(X轴方向)大致正交的方向(Z轴方向)上大致一齐被加速。加速后的离子以与其质荷比相应的速度飞行,在离子飞行部31中如图1中双点划线所示那样折返飞行,到达离子检测器32。从正交加速部30大致同时出发的各种离子按照质荷比从小到大的顺序到达离子检测器32而被检测,离子检测器32将与离子数相应的检测信号(离子强度信号)向控制与处理部4输出。
在控制与处理部4中,数据存储部41将检测信号数字化,进而将以从正交加速部30射出离子的时间点为基点的飞行时间换算成质荷比,由此获取质谱数据(原始数据)并保存。在正交加速部30中,以规定的周期反复向离子飞行部31射出离子。由此,数据存储部41能够以规定的周期反复获取遍及规定的质荷比范围的质谱数据。
在LC/MS分析中,多数情况下难以对一个试样进行多次测量。因此,需要通过1次测量(1次试样的注入)尽可能多地收集关于该试样中包含的大量化合物的信息。与此对应,在本实施方式的LC-MS分析系统中,能够进行包括上述的DDA以及DIA的多个解析模式下的测量。
[DIA模式的动作说明]
图2以及图3是DIA模式下的分析的说明图。图2是不实施MS分析的情况的例子,图3是周期性地实施MS分析的情况的例子。
在DIA中,将作为测量对象的质荷比范围的整体分割为多个而分别设定质量窗,将具有各质量窗中包含的质荷比的离子一并选择为前体离子而执行MS/MS分析。
在图2以及图3的例子中,将质荷比范围M1~M6分割为五个,实施以具有这5个质量窗中分别包含的质荷比的离子为目标的MS/MS分析。由于在每个该质量窗中得到一个MS/MS谱,因此在图3以及图4的例子中,可在1个循环中得到5个MS/MS谱,在该5个MS/MS谱中,出现源自在该时间点导入到质量分析部1B的全部化合物的产物离子。即,可得到关于全部化合物的全面的产物离子信息。此外,如上所述,若调整CID时的碰撞能量,例如将碰撞能量调整为相对低的值,则能够避免前体离子完全解离,因此在MS/MS谱中也观测到前体离子本身的峰。因此,例如在1个循环中使碰撞能量变化为包含相对高的值与相对低的值的多个值,对于各质荷比范围M1~M6分别获取使碰撞能量变化而得的多个MS/MS谱,若将该多个MS/MS谱相加或平均化而生成一个MS/MS谱,则能够得到在其保留时间内作为测量对象的化合物的全部的产物离子的信息、或产物离子与前体离子这两者的信息。
通过如上述那样调整碰撞能量,能够得到实质上观测到前体离子本身的峰的MS/MS谱。在该情况下,如图2所示,不需要执行MS分析,因此能够相应地缩短1个循环的时间。另一方面,在图3所示的DIA中,在1个循环中实施1次遍及规定的质荷比范围的MS分析,因此除了MS/MS谱之外还能够获取MS谱。因此,不需要在MS/MS分析时获取前体离子的信息,例如可以在MS/MS分析时通过CID使全部前体离子解离。因此,MS/MS谱中的产物离子的信号强度变高,能够提高灵敏度。
另外,图2以及图3是为了说明而简化的图,一般而言,质量窗的数量更多,一个质量窗的质荷比宽度为10~100Da左右的范围,例如为20Da等。
在DIA中,能够将通过MS分析得到的MS谱数据以及通过MS/MS分析得到的MS/MS谱数据针对每次分析而分别存储在不同的数据文件中。此外,在相同的保留时间(tn,tn+1,…)获取的MS谱数据与多个MS/MS谱数据、或者多个MS/MS谱数据可以存储在相同的数据文件中。
在对一个试样执行了上述那样的利用DIA的LC/MS分析的情况下,在数据存储部41中保存有数据文件,该数据文件存储有与该LC/MS分析对应的MS谱数据以及/或者MS/MS谱数据。接着,对在保存有这样的数据的状态下,在本实施方式的LC-MS分析系统中执行的特征性的数据处理进行说明。
[化合物鉴定的数据处理]
图4是示出本实施方式的LC-MS分析系统中的化合物的鉴定处理的概略流程的流程图。在根据图4对整体的处理的流程进行了说明之后,对各步骤的处理进行详细叙述。另外,在此,设为对目标试样收集图2所示那样的通过无MS分析的DIA模式得到的数据。
成分检测部42从数据存储部41读出通过分析收集到的原始数据,对构成一个MS/MS谱的每个数据进行质心变换处理,由此得到作为柱状图显示的MS/MS谱(步骤S1、S2)。例如在图2的例子中,针对1个循环生成5个MS/MS谱。
接着,成分检测部42根据所得到的全部MS/MS谱,检测被推定为与试样中包含的化合物以及该化合物的部分结构对应的有意义的成分(步骤S3)。此处所说的“成分”是指,基本上对应于在质荷比轴、时间轴以及信号强度轴的3维图表中观测到的峰,但源自一个化合物或源自一个化合物的一个部分结构的质荷比不同的峰、即构成同位素簇的多个峰被汇总而被视为一个成分。此外,成分检测部42针对每个MS/MS谱推定前体离子峰(步骤S4)。例如,能够将存在于与该MS/MS谱对应的质量窗的质荷比范围的峰中信号强度最大的峰推定为前体离子峰。
然后,显示处理部47生成将检测出的各成分按照每个化合物候选进行整理而得到的成分列表,并将其显示在显示部6的画面上。图6是示出步骤S3、S4的结束时间点的显示画面的一例的图。在图6中,“RT”是保留时间,“m/z”是质荷比,“Response(响应)”是信号强度。详细情况后述。
筛选部44通过将上述成分列表与预先保存在筛选信息存储部43中的目标列表进行对照,对记载在该成分列表中的成分信息进行取舍选择。然后,根据使用了目标列表的筛选结果,根据成分列表生成肯定列表(positive list)或否定列表(negative list)中的任一个作为解析对象的化合物候选的列表(步骤S5)。即,肯定列表是与目标列表中列举的化合物对应的成分的列表,否定列表是与目标列表中未列举的化合物对应的成分的列表。根据用户的事前的指定来决定生成肯定列表或否定列表中的哪一个。通常,通过该步骤S5的处理,解析对象的化合物候选变得相当少。
显示处理部47在显示部6的画面上显示筛选后的肯定列表或否定列表来代替此前显示的成分列表。图7是示出步骤S5的结束时间点的显示画面的一例的图。在图7中,“Target Name(目标名称)”是目标列表中的化合物或其部分结构的名称,“Target m/z(目标m/z)”是该化合物的分子离子或其部分结构的离子的质荷比,“Target Formula(目标式)”是该化合物或其部分结构的组成式。
组成推定部45根据用户事前对肯定列表或否定列表的指定,针对所指定的列表中列举出的成分信息,按照规定的组成推定的算法,推定与该成分对应的化合物或部分结构的组成,求出其化学式(包含组成式、离子式)(步骤S6)。
显示处理部47在显示部6的画面上显示组成推定后的成分列表来代替此前显示的列表。图8是示出步骤S6的结束时间点的显示画面的一例的图。在图8中,“PredictedFormula(推定式)”是推定出的化合物或其部分结构的组成式,“Score(得分)”是示出该组成推定的确定性的得分值。
进而,化合物决定部46对基于在所指定的肯定列表或否定列表中列举出的成分信息的前体离子进行in silico碎片映射。即,进行利用了理论上的计算的虚拟的碎片化,尝试进行由此得到的各碎片离子的归属。由此,对与该前体离子对应的化合物的鉴定作出决定(步骤S7)。
显示处理部47在显示部6的画面上显示基于in silico碎片映射进行化合物决定后的成分列表来代替此前显示的列表。图9是示出步骤S7的结束时间点的显示画面的一例的图,在(B)中示出紧接着(A)所示的列表的右方的部分。
通过以上的一系列的处理,例如能够确认在试样中包含的大量化合物中是否存在用户想要解析的化合物,并且能够得到其详细信息。
另外,为了进行步骤S6的处理,步骤S5的处理并不是必须的,但步骤S5的处理对于高效地进行步骤S6的处理是较为重要的。此外,同样地,为了进行步骤S7的处理,步骤S5、S6的处理并不是必须的,但步骤S5、S6的处理对于高效地进行步骤S7的处理是较为重要的。
此外,在步骤S3以后的任意时间点,都能够在显示部6的画面上描绘出在色谱图、MS/MS谱上示出步骤S3中的成分检测结果的图表。此外,对于MS/MS谱,能够一并记载后述的反卷积谱,或者只要是在步骤S6以后则能够一并记载理论MS/MS谱。
接着,对上述各步骤中的处理的详细情况进行说明。
[步骤S3、S4:成分检测处理]
作为一例,能够按照以下的步骤检测与化合物或其部分结构对应的成分。
成分检测部42首先从柱状图显示的MS/MS谱中分别以规定的基准提取峰(质心峰)。然后,对于提取出的质心峰,进行如下处理:利用质荷比轴方向以及时间轴方向各自中的峰、波形的特征等,删除被推定为不需要的或不是源自化合物的峰,并且将被推定为源自相同化合物的峰分组。例如如图5所示的例子那样,即使在保留时间不同的情况下,也能够将质荷比落入一个质荷比宽度ΔM的峰视为相同的组、即视为源自相同化合物的离子峰。
接着,对于分组后的峰,基于信号强度、时间轴方向的连续性等基准,删除不需要的峰。例如,在汇总在一个组的多个峰中信号强度最大的峰的信号强度为规定的阈值以下的情况下,删除包含该峰的组整体。此外,出于在液相色谱仪中的分离的性质,一个化合物在时间轴方向上遍及一定程度的时间而被检测出,因此也删除在时间轴方向上仅连续规定个数以下而不存在峰的组。
然后,在全部的MS/MS谱中,对每个分组后的峰生成提取离子色谱图。即,将即使质荷比不同但落入相同组的峰视为相同质荷比而生成提取离子色谱图。因此,针对每个组生成提取离子色谱图。使用该提取离子色谱图中出现的峰的SN比、峰波形形状,删除被推定为不需要的组,并且进一步进行组的汇总、分割。例如,在提取离子色谱图上出现明显不同的多个峰的情况下,对其每个峰进行分组即可。
通过以上那样的处理,能够检测被推定为与化合物或化合物的部分结构相关联的成分。另外,在成分检测时,能够适当利用在上述的日本特愿2019-154820号中公开的峰检测技术。
如上所述,使用全部的MS/MS谱检测到的成分以如图6所示那样的成分列表显示。各成分分别对应于3维图表上的峰,因此可得到该峰的峰顶的保留时间、质荷比、信号强度值。这是图6中的“RT”、“m/z”以及“Response(响应)”。此外,在图6中,对于#1~#14的成分的任一个,在m/z123.00566观测到的峰均被推定为前体离子峰,因此这些成分的“PrecursorIon(前体离子)”的m/z为123.00566。另外,在MS/MS谱中未观测到被推定为前体离子峰的峰的情况下,成分列表的“Precursor Ion(前体离子)”一栏为空栏。
[步骤S5:筛选处理]
例如在预先决定了解析对象的化合物的情况下,将该化合物的质荷比、化学式等的列表以规定的格式存储在文件中,作为目标列表提前保存在筛选信息存储部43中。在步骤S5中,读出该目标列表的文件,对在步骤S3、S4中求出的成分检测结果进行筛选,锁定化合物候选即可。
具体而言,在将解析对象的化合物的质荷比设为目标列表的情况下,确定以该质荷比值为中心的规定的容许宽度的质荷比范围,搜索并保留作为上述成分检测结果的质荷比值属于该质荷比范围的化合物,由此能够实施化合物候选的筛选。此外,在解析对象的化合物的质荷比值及其容许宽度这两者被列表化的情况下,确定基于所指定的质荷比值及容许宽度的质荷比范围,搜索并保留作为上述峰检测结果的质荷比值属于该质荷比范围的化合物,由此能够实施化合物候选的筛选。
此外,在将解析对象的化合物的化学式设为目标列表的情况下,能够将该列表中的化学式根据此时的数据获取时的离子极性转换为考虑了金属等的加合物而得的离子式,根据该离子式计算质荷比,在此基础上与指定化合物的质荷比时同样地进行筛选。此外,在除了质荷比、化学式之外也将各化合物的保留时间由目标列表规定的情况下,能够以该保留时间为中心确定规定宽度的保留时间范围,并通过筛选将保留时间偏离该保留时间范围那样的化合物候选排除。
当然,作为目标列表,也可以不准备用户想要解析的化合物,而是相反地准备不需要解析的化合物的列表。此外,例如也可以设为,能够将在上述的化合物鉴定的解析的中途确认到的化合物、或在与MS/MS分析同时(例如有MS分析的DIA模式的情况下)实施的MS分析或在MS/MS分析之前执行的MS分析中鉴定而得的化合物的信息逐次追加到目标列表中,或者相反地从目标列表中排除。
此外,可以设为能够将多个目标列表组合而用于筛选。例如,可以设为能够通过筛选来选择在多个目标列表中共同列举的化合物,或者通过筛选来选择在某个目标列表中列举的化合物中去除在其他目标列表中列举的化合物而得的化合物。
[步骤S6:组成推定的处理]
在基于成分检测结果的化合物的组成推定中,能够使用与非专利文献3所记载的软件“Formula Prediction”相同的算法。
在利用“Formula Prediction”从MS谱求出化学式时,通常对于在MS谱中观测到的作为目标的分子离子峰的质荷比值,通过搜索考虑了加合物的元素的组合来进行离子式的匹配,导出多个候选。然后,根据该多个离子式分别计算伴随同位素簇的理论质谱,根据该理论质谱与实际的质谱的图案的一致度计算得分。选择对能够匹配的多个离子式分别求出的得分中给出最高得分的离子式,求出化合物的组成、化学式。
与此相对,在对如上述那样根据MS/MS谱得到的成分检测结果应用“FormulaPrediction”来推定组成的情况下,实施如下的处理即可。
在步骤S3、S4中得到的成分检测结果包含被判定为产物离子的成分和被判定为前体离子的成分这两者。因此,组成推定部45在对各成分进行组成推定时,判定作为该组成推定的对象的成分是否为前体离子。并且,在判定为组成推定对象的成分是前体离子的情况下选择MS谱解析模式,在判定为不是前体离子的情况下选择MS/MS谱解析模式。
在MS谱解析模式中,与基于上述通常的MS谱的解析同样地,对于作为解析对象的前体离子峰的质荷比值,匹配根据考虑了加合物的元素的组合而得的离子式。然后,计算根据该离子式计算的伴随同位素簇的理论质谱,根据该理论质谱与实际的MS谱的图案的一致度求出分数,选择给出最大分数的离子式,求出化合物的组成、化学式。另外,在成分检测结果中具有与被判定为前体离子的成分相同的质荷比的其他成分同样能够推定为前体离子,因此能够通过“Formula Prediction”的MS谱解析模式求出组成。另外,在基于同位素分布的组成推定中,也能够使用专利文献3所公开的方法。
另一方面,在MS/MS谱解析模式中,使用预先决定的多个元素的质量,搜索与作为解析对象的成分的质荷比值的差异最小的元素的组合。所使用的元素的种类根据作为解析对象的试样的种类等来决定即可,在一般的有机化合物中,作为元素至少使用碳、氢、氧及氮,进而能够添加硫、磷、氯、溴等元素,进而还能够添加钠、钾等各种金属。
如上所述,通过在判定解析对象的成分是前体离子还是产物离子的基础上切换组成推定的方法,对于前体离子、产物离子的任一个均能够更准确地推定组成。
[步骤S7:最终的化合物的鉴定]
作为通过虚拟碎片化使产物离子归属的方法,能够利用各种已知的技术(例如非专利文献4中记载的In silico碎片化(In silico fragmentation)的方法等)。在基于在步骤S3、S4中得到的成分检测结果进行产物离子的归属的情况下,能够将该成分检测结果直接用作检索化学结构数据库时的检索关键字。即,在进行了上述那样的组成推定的情况下,作为推定的结果得到了化学式,因此将该化学式作为检索关键字进行对已知的化学结构数据库的检索即可。另一方面,在未进行上述的组成推定而未得到化学式的情况下,将对成分的质荷比应用了规定的容许宽度而得的质荷比范围作为检索关键字,进行对化学结构数据库的检索即可。
[其他功能]
如上所述,在DIA模式下得到的MS/MS谱中,通常混合观测到源自多个前体离子的产物离子峰。在上述的数据处理中,能够在步骤S3中的峰检测结果中使各产物离子归属于前体离子。因此,利用该归属结果,能够生成仅汇总了源自特定前体离子的产物离子峰的反卷积谱。此外,由于这样得到的反卷积谱是纯粹的、即针对唯一的前体离子的MS/MS谱,因此也能够通过将该MS/MS谱直接提供给库检索来鉴定化合物。
此外,在本实施方式的LC-MS分析系统中,也可以设为在画面上显示图6~图9所示的成分列表时,若在该列表上选择指示任意一个成分,则在画面上适当显示与该指示的成分关联的实测的MS谱或MS/MS谱、提取离子色谱图、平均MS/MS谱(例如在提取离子色谱图上观测到该成分的整个保留时间的平均MS/MS谱)、理论MS/MS谱还有反卷积谱等。
另外,上述实施方式是本发明的一例,在本发明的主旨的范围内适当进行修正、变更、追加也显然包含于本申请权利要求的保护范围内。
例如,上述实施方式是LC-MS分析系统,但显然也能够将本发明应用于将色谱仪设为气相色谱仪的GC-MS分析系统。
此外,在上述实施方式的系统中,质量分析部1B使用了四极-飞行时间型质量分析装置,但也能够使用三重四极型质量分析装置、离子阱飞行时间型质量分析装置等其他方式的串联型质量分析装置。但是,通常由于在根据质荷比值推定组成时需要较高的质量精度,因此期望使用飞行时间型质量分析装置、傅里叶变换离子回旋共振型质量分析装置等高质量精度的装置。
此外,在上述说明中,例示了数个能够在数据处理时利用的现有的软件,它们当然也仅为一例。
[各种方案]
对于本领域技术人员而言,上述的例示性的实施方式为以下方案的具体例是显而易见的。
(第1项)本发明的色谱质量分析数据处理方法的一方案是对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理方法,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,该色谱质量分析数据处理方法具有:
成分检测步骤,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定步骤,针对在所述成分检测步骤中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定步骤,利用与在所述锁定步骤中锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
(第5项)此外,本发明的色谱质量分析装置的一方案具备:
测量部,包含色谱部与能够进行MS/MS分析的质量分析部,对于包含由所述色谱部分离出的化合物的试样,通过由所述质量分析部反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析,从而收集具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据;
成分检测部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定部,针对在所述成分检测部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定部,利用与由所述锁定部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
(第9项)此外,本发明的色谱质量分析数据处理用程序的一方案,是用于使用计算机对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理用程序,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,使计算机作为如下功能部工作:
成分检测功能部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定功能部,针对在所述成分检测功能部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选而锁定解析对象的成分;
组成推定功能部,利用与由所述锁定功能部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
根据第1项记载的方法、第5项记载的装置以及第9项记载的程序,即使在试样所含的化合物非常多的情况下,也能够利用先验信息,将检测出的大量化合物的候选锁定为解析者关注的候选、应关注的候选、或者相反地未设想包含于试样的候选等,在此基础上,无需进行麻烦的作业就能够计算该化合物的组成式、分子式、离子式等。由此,能够有效地利用通过基于DIA的MS/MS分析得到的信息,减轻解析者的作业负担,并且高效地鉴定试样中包含的化合物且高精度地求出其组成等。
(第2项、第6项、第10项)在第1项所述的方法、第5项所述的装置以及第9项所述的程序中,能够设为,所述先验信息是关于化合物及其部分结构的质荷比或化学式的列表,在所述锁定步骤中,以在该列表中列举或未列举为条件来进行锁定。
根据第2项记载的方法、第6项记载的装置以及第10项记载的程序,例如能够仅针对用户(解析者)所关注的、或者需要解析的化合物确认是否包含于试样,或者掌握其组成或化学式。
(第3项、第7项、第11项)在第1项记载的方法、第5项记载的装置以及第9项记载的程序中,能够设为,在所述组成推定步骤、所述组成推定部或所述组成推定功能部中,判定组成推定对象的成分是前体离子或产物离子中的哪一种,根据其判定结果以不同的流程推定组成或化学式。
(第4项、第8项、第12项)进而,在第3项记载的方法、第7项记载的装置以及第11项记载的程序中,能够设为,在组成推定对象的成分为产物离子的情况下,通过搜索与该成分的质荷比值的差异最小的元素的种类及数量的组合来推定组成或化学式,在组成推定对象的成分为前体离子的情况下,基于根据该成分的质荷比值推定的化学式来计算包含同位素簇的理论上的谱,利用该谱与实测的谱的一致程度来推定组成或化学式。
根据第3项以及第4项记载的方法、第7项以及第8项记载的装置、还有第9项以及第10项记载的程序,根据在通过DIA获取的MS/MS谱中观测到的前体离子与产物离子中的任一种,均能够以高精度推定化合物或其部分结构的组成。通过DIA得到的MS/MS谱具有很高的全面性。因此,能够全面地、即不遗漏地检测或解析试样中包含的化合物。
附图标记说明
1 测量部
1A 液相色谱部
10 流动相容器
11 送液泵
12 注射器
13 色谱柱
1B 质量分析部
20 真空腔室
201 离子化室
202 第1中间真空室
203 第2中间真空室
204 第1高真空室
205 第2高真空室
21 ESI探针
22 脱溶剂管
23 离子导向器
24 截取锥
25、28、29 离子导向器
26 四极滤质器
27 碰撞池
30 正交加速部
31 离子飞行部
32 离子检测器
4 控制与处理部
40 分析控制部
41 数据存储部
42 成分检测部
43 筛选信息存储部
44 筛选部
45 组成推定部
46 化合物决定部
47 显示处理部
5 输入部
6 显示部。
Claims (12)
1.一种色谱质量分析数据处理方法,是对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理方法,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,所述色谱质量分析数据处理方法的特征在于,具有:
成分检测步骤,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定步骤,针对在所述成分检测步骤中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选来锁定解析对象的成分;
组成推定步骤,利用与在所述锁定步骤中锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
2.如权利要求1所述的色谱质量分析数据处理方法,其特征在于,所述先验信息是关于化合物及其部分结构的质荷比或化学式的列表,在所述锁定步骤中,以在该列表中列举或未列举为条件来进行锁定。
3.如权利要求1所述的色谱质量分析数据处理方法,其特征在于,在所述组成推定步骤中,判定组成推定对象的成分是前体离子或产物离子中的哪一种,根据其判定结果以不同的流程推定组成或化学式。
4.如权利要求3所述的色谱质量分析数据处理方法,其特征在于,在所述组成推定步骤中,在组成推定对象的成分为产物离子的情况下,通过搜索与该成分的质荷比值的差异最小的元素的种类及数量的组合来推定组成或化学式,在组成推定对象的成分为前体离子的情况下,基于根据该成分的质荷比值推定的化学式来计算包含同位素簇的理论上的谱,利用该谱与实测的谱的一致程度来推定组成或化学式。
5.一种色谱质量分析装置,其特征在于,具备:
测量部,包含色谱部与能够进行MS/MS分析的质量分析部,对于包含由所述色谱部分离出的化合物的试样,通过由所述质量分析部反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析,从而收集具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据;
成分检测部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定部,针对在所述成分检测部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选来锁定解析对象的成分;
组成推定部,利用与由所述锁定部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
6.如权利要求5所述的色谱质量分析装置,其特征在于,所述先验信息是关于化合物及其部分结构的质荷比或化学式的列表,所述锁定部以在该列表中列举或未列举为条件来进行锁定。
7.如权利要求5所述的色谱质量分析装置,其特征在于,所述组成推定部判定组成推定对象的成分是前体离子或产物离子中的哪一种,根据其判定结果以不同的流程推定组成或化学式。
8.如权利要求7所述的色谱质量分析装置,其特征在于,在组成推定对象的成分为产物离子的情况下,所述组成推定部通过搜索与该成分的质荷比值的差异最小的元素的种类及数量的组合来推定组成或化学式,在组成推定对象的成分为前体离子的情况下,所述组成推定部基于根据该成分的质荷比值推定的化学式来计算包含同位素簇的理论上的谱,利用该谱与实测的谱的一致程度来推定组成或化学式。
9.一种色谱质量分析数据处理用程序,是用于使用计算机对具有时间、质荷比及信号强度这三个维度的色谱质量分析数据进行处理的色谱质量分析数据处理用程序,所述色谱质量分析数据是通过对包含由色谱仪分离出的化合物的试样反复进行基于数据非依赖型解析的MS/MS分析而收集到的,其特征在于,使计算机作为如下功能部工作:
成分检测功能部,基于针对目标试样的遍及规定的质荷比范围的色谱质量分析数据,分别求出柱状图显示的MS/MS谱,在各MS/MS谱中推定前体离子峰,并且以各MS/MS谱中的关于质荷比方向的规定的基准、以及针对在MS/MS谱上被视为相同或同组的峰的关于时间方向的规定的基准,对峰进行取舍选择,由此检测与化合物及其部分结构对应的成分;
锁定功能部,针对在所述成分检测功能部中检测出的成分,进行使用了先验信息的筛选来锁定解析对象的成分;
组成推定功能部,利用与由所述锁定功能部锁定后的成分对应的质荷比信息,推定该成分的组成或化学式。
10.如权利要求9所述的色谱质量分析数据处理用程序,其特征在于,所述先验信息是关于化合物及其部分结构的质荷比或化学式的列表,所述锁定功能部以在该列表中列举或未列举为条件来进行锁定。
11.如权利要求9所述的色谱质量分析数据处理用程序,其特征在于,所述组成推定功能部判定组成推定对象的成分是前体离子或产物离子中的哪一种,根据其判定结果以不同的流程推定组成或化学式。
12.如权利要求11所述的色谱质量分析数据处理用程序,其特征在于,所述组成推定功能部在组成推定对象的成分为产物离子的情况下,通过搜索与该成分的质荷比值的差异最小的元素的种类及数量的组合来推定组成或化学式,在组成推定对象的成分为前体离子的情况下,基于根据该成分的质荷比值推定的化学式来计算包含同位素簇的理论上的谱,利用该谱与实测的谱的一致程度来推定组成或化学式。
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