WO2010084879A1 - フラボノイド3位グルクロン酸転移酵素、及びそれをコードするポリヌクレオチド - Google Patents
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Definitions
- Non-Patent Document 10 It has been reported that quercetin 3-position glucose glycoside and quercetin 3-position glucuronic acid glycoside are accumulated in grape leaves as flavonol glycosides, which are a kind of flavonoids. . In recent years, accumulation of various flavonol glycosides has also been reported in grape fruits and wine (Non-patent Document 11). Quercetin 3-position glucuronic acid glycoside is called michelinin and is known as one of the pharmacological species of St. John's wort used as an antidepressant. It is absorbed from the intestinal tract by oral administration and reaches the central nervous system. However, quercetin 3-position rhamnose glycoside has no activity (see Non-Patent Document 12).
- the polynucleotide (e) above is the same “AGG” in which the bases corresponding to the 418th to 420th bases (AGG) in the base sequence represented by SEQ ID NO: 3 are the same, or Even if it is not the same base, it is preferable that it contains a polynucleotide that is one of “CGU”, “CGC”, “CGA”, “CGG”, and “AGA”.
- the 418th to 420th bases (AGG) are bases (codons) encoding the 140th amino acid residue (arginine) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4. This preferred embodiment is the same for the polynucleotide (i).
- the present invention also provides a protein encoded by the above-described polynucleotide of the present invention.
- a protein of an embodiment of the present invention is a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4.
- Another embodiment of the present invention is a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4.
- Group A leucine, isoleucine, norleucine, valine, norvaline, alanine, 2-aminobutanoic acid, methionine, o-methylserine, t-butylglycine, t-butylalanine, cyclohexylalanine;
- Group B aspartic acid, glutamic acid, isoaspartic acid , Isoglutamic acid, 2-aminoadipic acid, 2-aminosuberic acid;
- group C asparagine, glutamine;
- group D lysine, arginine, ornithine, 2,4-diaminobutanoic acid, 2,3-diaminopropionic acid;
- group E Proline, 3-hydroxyproline, 4-hydroxyproline;
- Group F serine, threonine, homoserine;
- Group G phenylalanine, tyrosine.
- the protein of the present invention can also be produced by chemical synthesis methods such as the Fmoc method (fluorenylmethyloxycarbonyl method) and the tBoc method (t-butyloxycarbonyl method). It can also be chemically synthesized using peptide synthesizers such as Advanced Chemtech, Perkin Elmer, Pharmacia, Protein Technology Instrument, Syntheselve Vega, Perceptive, Shimadzu, etc. .
- the protein of the present invention is a flavonoid 3-position glucuronyltransferase.
- the glucuronic acid conjugate thus obtained is useful as a functional food material, a reagent for investigating its function in vivo, or an antioxidant (Gao, Z., Huang, K., Yang, X., and Xu, H., Biochimica et Biophysica Acta, vol. 1472, p. 643-650, 1999).
- VvGT5 grape leaf-derived cDNA was prepared by the following method, and amplification by PCR was performed using it as a template.
- Total RNA was extracted from 0.1 g of grape leaves (Vitis vinifera, variety: Cabernet Sauvignon) using FruitMate for RNA purification and Fast Pure RNA kit (TaKaRa Bio) according to the manufacturer's recommended method, and SuperScript First-Strand CDNA was synthesized from 1 ⁇ g of total RNA using Synthesis System for RT-PCR (Invitrogen) according to the conditions recommended by the manufacturer.
- Synthesis System for RT-PCR Invitrogen
- the procedure for cDNA cloning and expression vector construction is shown below using the VvGT5 gene as an example.
- the optimum pH of the enzyme was determined. As shown in FIG. 5, various buffers from pH 3 to pH 10.5 were prepared, 100 ⁇ M quercetin as a sugar acceptor, 1 mM UDP-glucuronic acid as a sugar donor, 50 mM buffer, 14 mM 2-mercaptoethanol, and the above purified VvGT5 enzyme 50 ng was reacted at 30 ° C. for 5 minutes. The reaction was started by adding quercetin and stopped by adding a 40% acetonitrile solution containing an equal amount of 0.1% TFA.
- VvGT5 Gene expression analysis In order to identify the functional region of VvGT5, a method similar to that described in “Noguchi, A. et al., Plant J., vol. 54, p. 415-427, 2008” was used.
- the gene expression pattern of each grape organ was analyzed by SYBR-Green quantitative RT-PCR using 7500 Real Time PCR System (Applied Biosystems).
- Applied Biosystems For grapes, total RNA was extracted from the organs (leaves, petiole, seeds, fruits, and peels) of the Pinot Noir and Cabernet Sauvignon varieties in the same manner as in Example 1.
- RT Real Time PCR System
- the supernatant obtained by centrifuging the sonication solution (3000 rpm, 10 minutes, 4 ° C.) was filtered (Mirex LH, pore size 0.45 ⁇ m, manufactured by Millipore) and subjected to HPLC analysis.
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Abstract
Description
ワイン原料であるブドウ科ブドウ(Vitis vinifera)は世界的に主要な農作物であり、赤ワインは心臓病リスクの軽減や抗肥満効果などの有用な機能性が知られているが、近年、抗肥満効果や延命効果の主要な機能性分としてスチルベンの一種であるレスベラトロールや、フレンチパラドクスの要因となる主要な成分としてプロシアニジンが同定されたことから機能性食品として注目されている(非特許文献3~9参照)。
ところで、近年、イタリア及びフランスの合同コンソーシアムによって、ブドウ(ピノノワール(Pinot Noir)品種)のゲノム配列が解読され、240個もの配糖体化酵素(UGT)遺伝子が同定された(非特許文献21、22参照)。
しかしながら、遺伝子配列情報から糖転移酵素遺伝子であることが推定されても、そこから基質である糖の種類や受容体となる物質を類推することは容易ではなく、しかも、上述したように候補遺伝子の数も240個と非常に多いため、これらUGT遺伝子の中から、これまで他の生物においても報告のないフラボノイド3位グルクロン酸転移酵素(Flavonoid 3-O-glucuronic acid transferase; F3GAT)を同定することは極めて困難であった。
(1) 以下の(a)~(f)のいずれかに記載のポリヌクレオチド:
(a)配列番号3で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(c)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は (f)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。
上記(1)のポリヌクレオチドは、例えば、以下の(g)~(j)のいずれかのポリヌクレオチドが挙げられる。
(g)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は (j)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。
(c’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において第140番目のアミノ酸を除く1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列中の第140番目のアミノ酸に対応するアミノ酸がアルギニンであるアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e’)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号3で表わされる塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;(f’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(g’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において第140番目のアミノ酸を除く10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列中の第140番目のアミノ酸に対応するアミノ酸がアルギニンであるアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i’)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号3で表わされる塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は(j’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。
上記(1)のポリヌクレオチドは、例えば、配列番号3で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は、配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するものが挙げられる。
上記(1)のポリヌクレオチドは、例えば、DNAであるものが挙げられる。
(3) 上記(1)のポリヌクレオチドを含有するベクター。
(4) 上記(1)のポリヌクレオチドが導入された形質転換体。
(5) 上記(3)のベクターが導入された形質転換体。
(6) 上記(4)又は(5)の形質転換体を用いる上記(2)のタンパク質の製造方法。
(7) 上記(2)のタンパク質を触媒として、UDP-グルクロン酸と糖受容体基質からグルクロン酸抱合体を生成する、グルクロン酸抱合体の製造方法。
上記(7)の方法は、例えば、糖受容体基質がフラボノイドである方法が挙げられる。
本発明によれば、in vitroで、もしくは宿主細胞に本発明の遺伝子を導入することにより、フラボノイドの3位にグルクロン酸を転移することが可能となり、ミケリアニンをはじめとする有用フラボノイドグルクロナイドを上記のような天然資源に依存せずに容易に生産させ得る、糖転移酵素(配糖体化酵素)を提供することができる。また、本発明によれば、当該酵素をコードするポリヌクレオチド、当該ポリヌクレオチドを含有するベクター、及び当該ベクターを用いて得られる形質転換体、並びに当該酵素を用いたグルクロン酸抱合体の製造方法等を提供することもできる。
1.本発明のポリヌクレオチド
まず、本発明は、(a)配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド(具体的には、DNA、以下、これらを単に「DNA」とも称する);及び(b)配列番号4で表わされるアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを提供する。本発明で対象とするDNAは、上記のグルクロン酸転移酵素をコードするDNAに限定されるものではなく、このタンパク質と機能的に同等なタンパク質をコードする他のDNAを含む。
UDP-グルクロン酸転移酵素活性は、例えば、UDP-グルクロン酸と糖受容体基質であるフラボノイド(例えば、フラボン、フラボノール等)とを評価対象となる酵素の存在下で反応させ、得られる反応物をHPLC等で分析することによって測定することができる(より具体的には、後述の実施例の記載を参照。)。
本明細書中、「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、例えば、配列番号3の塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は配列番号4で表わされるアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドの、全部又は一部をプローブとして、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法又はサザンハイブリダイゼーション法などを用いることにより得られるポリヌクレオチドをいう。ハイブリダイゼーションの方法としては、例えば、“Sambrook & Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual Vol. 3, Cold Spring Harbor, Laboratory Press 2001”、“Ausubel, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons 1987-1997”などに記載されている方法を利用することができる。
なお、ハイブリダイゼーションに市販のキットを用いる場合は、例えばAlkphos Direct Labelling Reagents(アマシャムファルマシア社製)を用いることができる。この場合は、キットに添付のプロトコルにしたがい、標識したプローブとのインキュベーションを一晩行った後、メンブレンを55℃の条件下で0.1% (w/v) SDSを含む1次洗浄バッファーで洗浄後、ハイブリダイズしたDNAを検出することができる。
上記した本発明のポリヌクレオチドは、公知の遺伝子工学的手法又は公知の合成手法によって取得することが可能である。
2.本発明のタンパク質 本発明は、さらに別の実施形態において、上記本発明のポリヌクレオチドにコードされるタンパク質も提供する。本発明のある態様のタンパク質は、配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質である。本発明の別の態様のタンパク質は、配列番号4で表わされるアミノ酸配列を有するタンパク質である。
以下に、相互に置換可能なアミノ酸残基の例を示す。同一群に含まれるアミノ酸残基は相互に置換可能である。A群:ロイシン、イソロイシン、ノルロイシン、バリン、ノルバリン、アラニン、2-アミノブタン酸、メチオニン、o-メチルセリン、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、シクロヘキシルアラニン;B群:アスパラギン酸、グルタミン酸、イソアスパラギン酸、イソグルタミン酸、2-アミノアジピン酸、2-アミノスベリン酸;C群:アスパラギン、グルタミン;D群:リジン、アルギニン、オルニチン、2,4-ジアミノブタン酸、2,3-ジアミノプロピオン酸;E群:プロリン、3-ヒドロキシプロリン、4-ヒドロキシプロリン;F群:セリン、スレオニン、ホモセリン;G群:フェニルアラニン、チロシン。
また、本発明のタンパク質は、Fmoc法(フルオレニルメチルオキシカルボニル法)、tBoc法(t-ブチルオキシカルボニル法)等の化学合成法によっても製造することができる。また、アドバンスドケムテック社製、パーキンエルマー社製、ファルマシア社製、プロテインテクノロジーインストゥルメント社製、シンセセルーベガ社製、パーセプティブ社製、島津製作所等のペプチド合成機を利用して化学合成することもできる。
ここで、本発明のタンパク質は、フラボノイド3位グルクロン酸転移酵素である。「グルクロン酸転移酵素」とは、糖供与体から糖受容体基質にグルクロン酸残基を転移し、グルクロン酸抱合体を生じる反応を触媒する。本発明において、糖受容体基質はフラボノイドであり、糖供与体は、UDP-グルクロン酸である。本発明のある態様のタンパク質は、UDP-グルクロン酸から、糖受容体基質であるフラボノイド(例えば、フラボノール、フラボン)の3位の水酸基にグルクロン酸残基を転移し、グルクロン酸抱合体とUDPとを生じる反応を触媒する。
3.ベクター及びこれを導入した形質転換体
本発明はまた、別の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを提供する。本発明の発現ベクターは、本発明のポリヌクレオチド(例えば、前記(a)~(j)のいずれかのポリヌクレオチド)を含有する。好ましくは、本発明の発現ベクターは、前記(g)~(j)のいずれかのポリヌクレオチドを含有する。さらに好ましくは、本発明の発現ベクターは、配列番号3の塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は、配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを含有する。
ベクターの具体的な種類は特に限定されず、宿主細胞中で発現可能なベクターが適宜選択され得る。すなわち、宿主細胞の種類に応じて、確実に本発明のポリヌクレオチドを発現させるために適宜プロモーター配列を選択し、これと本発明のポリヌクレオチドを各種プラスミド等に組み込んだベクターを発現ベクターとして用いればよい。
発現ベクターは、少なくとも1つの選択マーカーを含むことが好ましい。このようなマーカーとしては、栄養要求性マーカー(ura5、niaD)、薬剤耐性マーカー(ハイグロマイシン、ゼオシン、ジェネチシン)、銅耐性遺伝子(CUP1)(Marin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 81, p. 337, 1984)、セルレニン耐性遺伝子(fas2miri, PDR4)(それぞれ、猪腰淳嗣ら, 生化学, vol. 64, p. 660, 1992;Hussain et al., Gene, vol. 101, p. 149, 1991)などが利用可能である。
形質転換体の作製方法(生産方法)は特に限定されないが、例えば、上述した組換えベクターを宿主に導入して形質転換する方法が挙げられる。ここで用いられる宿主細胞は、特に限定されるものではなく、従来公知の各種細胞を好適に用いることができる。具体的には、例えば、大腸菌(Escherichia coli)等の細菌、酵母(出芽酵母Saccharomyces cerevisiae、分裂酵母Schizosaccharomyces pombe)、線虫(Caenorhabditis elegans)、アフリカツメガエル(Xenopus laevis)の卵母細胞等を挙げることができる。上記の宿主細胞のための適切な培養培地及び条件は当分野で周知である。また、形質転換の対象となる生物も特に限定されるものではなく、上記宿主細胞で例示した各種微生物、植物又は動物が挙げられる。
宿主細胞の形質転換方法としては一般に用いられる公知の方法が利用できる。例えば、エレクトロポレーション法(Mackenxie D. A. et al., Appl. Environ. Microbiol., vol. 66, p. 4655-4661, 2000)、パーティクルデリバリー法(特開2005-287403「脂質生産菌の育種方法」に記載の方法)、スフェロプラスト法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 75, p. 1929, 1978)、酢酸リチウム法(J. Bacteriology, vol. 153, p. 163, 1983)、Methods in yeast genetics, 2000 Edition : A Cold Spring Harbor Laboratory Course Manualなどに記載の方法)で実施可能であるが、これらに限定されない。
組換え発現ベクターを用いる場合、植物体の形質転換に用いられる組換え発現ベクターは、当該植物内で本発明に係るポリヌクレオチドを発現させることが可能なベクターであれば特に限定されない。このようなベクターとしては、例えば、植物細胞内でポリヌクレオチドを構成的に発現させるプロモーター(例えば、カリフラワーモザイクウイルスの35Sプロモーター)を有するベクター又は外的な刺激によって誘導性に活性化されるプロモーターを有するベクターが挙げられる。
本発明において形質転換の対象となる植物は、植物体全体、植物器官(例えば葉、花弁、茎、根、種子など)、植物組織(例えば表皮、師部、柔組織、木部、維管束、柵状組織、海綿状組織など)又は植物培養細胞、あるいは種々の形態の植物細胞(例えば、懸濁培養細胞)、プロトプラスト、葉の切片、カルスなどのいずれをも意味する。形質転換に用いられる植物としては、特に限定されず、単子葉植物綱又は双子葉植物綱に属する植物のいずれでもよい。
遺伝子が導入された細胞又は植物組織は、まずハイグロマイシン耐性などの薬剤耐性で選択され、次いで定法によって植物体に再生される。形質転換細胞から植物体の再生は、植物細胞の種類に応じて当業者に公知の方法で行うことが可能である。
植物培養細胞を宿主として用いる場合は、形質転換は、組換えベクターを遺伝子銃、エレクトロポレーション法などで培養細胞に導入する。形質転換の結果得られるカルスやシュート、毛状根などは、そのまま細胞培養、組織培養又は器官培養に用いることが可能であり、また従来知られている植物組織培養法を用い、適当な濃度の植物ホルモン(オーキシン、サイトカイニン、ジベレリン、アブシジン酸、エチレン、ブラシノライドなど)の投与などによって植物体に再生させることができる。
本発明に係るポリヌクレオチドがゲノム内に組み込まれた形質転換植物体が一旦取得されれば、当該植物体の有性生殖又は無性生殖によって子孫を得ることができる。また、当該植物体又はその子孫、あるいはこれらのクローンから、例えば、種子、果実、切穂、塊茎、塊根、株、カルス、プロトプラストなどを得て、それらを基に当該植物体を量産することができる。従って、本発明には、本発明に係るポリヌクレオチドが発現可能に導入された植物体、若しくは当該植物体と同一の性質を有する当該植物体の子孫、又はこれら由来の組織も含まれる。
本発明のある態様によれば、形質転換植物体は機能性食品材料用植物体である。
4.本発明のタンパク質の製造方法
本発明はまた、別の実施形態において、上記の形質転換体を用いる本発明のタンパク質の製造方法を提供する。
具体的には、上記形質転換体の培養物から、本発明のタンパク質を分離・精製することによって、本発明のタンパク質を得ることができる。ここで、培養物とは、培養液、培養菌体若しくは培養細胞、又は培養菌体若しくは培養細胞の破砕物のいずれをも意味する。本発明のタンパク質の分離・精製は、通常の方法に従って行うことができる。
このようにして得られた抽出液若しくは培養上清中に含まれる本発明のタンパク質の精製は、通常の分離・精製方法に従って行うことができる。分離・精製方法としては、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、ゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、透析法及び限外ろ過法等を、単独で又は適宜組み合わせて用いることができる。
さらに、本発明は、本発明のタンパク質を用いてグルクロン酸抱合体を製造する方法を提供する。本発明のタンパク質は、糖受容体基質としてのフラボノイドに、糖供与体としてのUDP-グルクロン酸からグルクロン酸を転移する(詳しくは、フラボノイドの3位の水酸基に転移する)反応を触媒するので、本発明のタンパク質を用いることにより、糖受容体基質及び糖供与体を原料として、グルクロン酸抱合体を製造することができる。糖受容体基質としては、フラボノイドの中でも、フラボン及びフラボノールが好ましく、より好ましくはフラボノール、特に好ましくはケルセチン、ケンフェロール及びミリセチンである。
このようにして得られるグルクロン酸抱合体は、機能性食品の材料、その生体内での機能を調べるための試薬、又は抗酸化剤などとして有用である(Gao, Z., Huang, K., Yang, X., and Xu, H., Biochimica et Biophysica Acta, vol. 1472, p. 643-650, 1999)。
以下に、実施例を挙げて本発明をより具体的に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
本実施例において用いる分子生物学的手法は、他で詳述しない限り、Molecular Cloning(Sambrookra,Cold Spring Harbour Laboratory Press,2001)に記載の方法に従った。
ブドウ由来フラボノイド3位グルコース転移酵素遺伝子であるVvGT1(Offen, W. et al., EMBO J., vol. 25, p. 1396-1405, 2006)の完全長配列を基に、Istituto Agrario San Michele all'Adige(IASMA)が提供するブドウゲノムデータベース(http://genomics.research.iasma.it/iasma/)に対してBlastホモロジー検索を行った。その結果、相同性の高い7種の候補UGT遺伝子を見出した(図1)。これらはMEGA4プログラム(Tamura, K. et al., Mol. Biol. Evol., vol. 24, p. 1596-1599, 2007)を利用したNJ系統樹解析によってフラボノイド3位UGTのクラスターであるCluster Iに属することを確認した(図1)。さらに、候補遺伝子配列を染色体物理地図と照らし合わせることで、染色体上のシンテニーを明らかにした(図2)。VvGT3、VvGT5及びVvGT6は、11番染色体上に同じ転写向きに座位しており、それらの間にはフラボノールスルフォトランスフェラーゼ様遺伝子が共通して見出された(Varin, L. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 89, p. 1286-1290, 1992)。VvGT5及びVvGT6は、特に相同性が高く、遺伝子重複によって生じたパラログであると考えられた。また、6番染色体には同じ転写向きに座位したVvGT2及びVvGT4が見出された。その下流に同じ転写向きにVvGT2及びVvGT4のセットのコピーが見出され、それぞれ順に、VvGT2-like及びVvGT4-likeと命名した。一方、既知のVvGT1は16番染色体に座位した。
VvGT5遺伝子を例に、cDNAクローニング及び発現ベクター構築手順を下記に示す。逆転写によって得られたcDNAを鋳型に、ゲノム配列情報(GenBankアクセッション番号:CAN74919)を基にデザインした下記のVvGT5遺伝子特異的プライマー(配列番号1及び2)を用いて、PCRによるVvGT5の単離を試みた。
具体的には、PCR反応液(50μl)は、ブドウ葉由来cDNA 1μl、1×ExTaq buffer(TaKaRaBio)、0.2mM dNTPs、プライマー(配列番号1及び2)各0.4pmol/μl、ExTaq polymerase 2.5unitからなる。PCR反応は、94℃で3分間反応させた後、94℃で1分間、50℃で1分間、72℃で2分間の反応を1サイクルとして、計35サイクルの増幅反応を行った。
5’- CAC CCA TAT GAC TAC CAC CGC CAG CTC CAT -3’(配列番号1)
BglII-VvGT5-RV:
5’- AGA TCT CTA CTT ATT GGT GTC CAA AGG TA -3’(配列番号2)
ATGACTACCACCGCCAGCTCCATGGACAGGCATGTTGCAGTATTAGGGTTCCCCACCCATACAGCTACCCTCTTAAAACTCCTGCGCAGACTAGCATCTGCCGCACCCACCACCATCTTCTCCTTCTTCAACACTCCCAAGGCCAACAGCTCCATCTCCTCTGCTCAAAGTCCCCACGGTATTCACAATCTAAGAGTTTATGATGTAGCAGACGGCGTGCCAGAGGACCTTGTGCTTTCAGCAAACCCCCTGGCACGCATCGAGATGTTCTTGAAGGCGACGCCTGGGAACTTTCGTGATGCTTTGGAAGTGGCTGAGAAGGACATTGGAAGGAAGATAAGTTGCCTGGTGAGTGATGTCTTTTTGTGGTTCACTGCTGATATGGCTGAGGAAATGGGGGTTCCGTGGGTGGCAATTAGGACTGCTGCGCTTTACTCACTCTCCGTCCACATTTATACTGATGCTATCCGGGAAGCAGTGGGAGTTGCGGGGCAGGTGCAAGACCAAACCCTTGATTTCATCCCAGGATTCTCAGCAATAAAGGTTGAAGACCTACCTGAAGGAATGGTTTTCGGGGACACAGAATCTCCCTTCGCATGCATGTTGCATAAAATGGGGCTCATGCTGCCACGAGCAACCATTGTTGCCACAAATTCCTTTGAAGAACTAGAGCCGACCATTGTCACAAATGATCTCAAGTCCAAGCTCCAAAAAGTTCTTACTGTTGGTCCTTTTGACCTATCTTCACCACCACCGCTGATATTGGACGCCAGTGGCTGCCTGCCATGGTTGGACAATAAAAAAGAAGCGTCAGTGGCATATGTTAGTTTTGGAAGCATAGCAACACCACCACCCAACGAGATTGTAGCATTGGCAGAAGCCCTAGAAGCAACTGGGATACCGTTTCTTTGGTCTCTTAGGGAGCATGCAATGAACAATTTACCAAAAGGATTTCTAGAGAGGACGACCGCTCATGGAAAAGTAGTTTCGTGGGCACCCCAGCCTCAGGTCTTAGCACATGCCTCAGTTGCAGTGTTTATTACTCATAGCGGTTGGAACTCGGTGACTGAGAGTATAGTTGGTGGTGTGCCCATGATCTGCAGGCCATTCTTTGGAGATCAACGTCTTAACAGGCGGATGGTACAGGATGTATGGGGGATTGGTATAGGAGTTGAGGGAGGGATCCTCACAAAAAGGGGAGTAATGAGTGCTTTGGGACTAATTTTGTCCCATGAAGGGAAGAAAATGAGAGAGAAAATTGGGGTCCTAAAAGAGCTTGCTAGAAGGGCTGTTGAACCAAACGGGAGCTCAACTCAAAATTTAGGTCATTTGTTGGAGGTAATCACAACATCTAAGTTACCTTTGGACACCAATAAGTAG(配列番号3)
MTTTASSMDRHVAVLGFPTHTATLLKLLRRLASAAPTTIFSFFNTPKANSSISSAQSPHGIHNLRVYDVADGVPEDLVLSANPLARIEMFLKATPGNFRDALEVAEKDIGRKISCLVSDVFLWFTADMAEEMGVPWVAIRTAALYSLSVHIYTDAIREAVGVAGQVQDQTLDFIPGFSAIKVEDLPEGMVFGDTESPFACMLHKMGLMLPRATIVATNSFEELEPTIVTNDLKSKLQKVLTVGPFDLSSPPPLILDASGCLPWLDNKKEASVAYVSFGSIATPPPNEIVALAEALEATGIPFLWSLREHAMNNLPKGFLERTTAHGKVVSWAPQPQVLAHASVAVFITHSGWNSVTESIVGGVPMICRPFFGDQRLNRRMVQDVWGIGIGVEGGILTKRGVMSALGLILSHEGKKMREKIGVLKELARRAVEPNGSSTQNLGHLLEVITTSKLPLDTNK(配列番号4)
本酵素の生化学的な機能を明らかにするために、本酵素を大腸菌において発現させた。
上記で得られたプラスミドを用い定法に従って大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。得られた形質転換体を、50μg/mlのアンピシリンを含むLB培地(10 g/l typtone pepton,5 g/l yeast extract,1 g/l NaCl)4 mlに、て,37℃で一晩振盪培養した。静止期に達した培養液4 mlを同組成の培地80 mlに接種し、37℃で振盪培養した。菌体濁度(OD600)がおよそ0.5に達した時点で終濃度0.5 mMのIPTGを添加し、18℃で20時間振盪培養した。
以下のすべての操作は4℃で行った。培養した形質転換体を遠心分離(5,000×g,10分)にて集菌し、Buffer S[20 mM HEPESバッファー(pH 7.5),20 mM イミダゾール,14 mM β-メルカプトエタノール]1 ml/g cellを添加して、懸濁した。続いて、超音波破砕(15秒間×8回)を行い、遠心分離(15,000×g,15分間)した。得られた上清を粗酵素液として回収した。この中からHisタグを有するVvGT5発現タンパク質を精製するため、粗酵素液をBuffer Sにて平衡化したHis SpinTrap(GE Healthcare)に負荷し、遠心(70×g,30秒間)した。Bufferで洗浄後、100及び500 mM イミダゾールを含むBuffer S 各5mlにてカラムに結合したタンパク質を段階的に溶出した。各溶出画分をMicrocon YM-30(Amicon)を用いて、20 mM HEPESバッファー(pH 7.5)及び14 mM β-メルカプトエタノールにバッファー置換した(透析倍率1000倍)。
標準的な酵素反応条件は、以下の通りである。反応液(1 mM 糖供与体,200μM 糖受容体基質,20 mM HEPESバッファー(pH 7.5),精製酵素約2μg)50μlを調製し、酵素溶液を添加することで反応を開始させ、30℃で一晩反応させた。20%リン酸を 5μl添加することにより反応を停止させ、逆相HPLCで分析した。
逆相HPLCシステムは、以下の機器で構成される。Pump AとしてMODEL305(Gilson社)、Pump BとしてMODEL302(Gilson社)、Sample InjectorとしてMODEL231(Gilson社)、Dilutorとして401(Gilson社)、DYNAMIC MIXERとして811B(Gilson社)、Pressure Module(RAININ)、DEGASSERとしてDGU-12A(島津製作所)、検出器としてSPD-M20A DIODE ARRAY DETECTOR(島津製作所)を用いた。
ケルセチンを糖受容体、UDP-グルクロン酸を糖供与体とした酵素反応液のHPLC分析の結果、ケルセチン3-グルクロナイドと保持時間が一致する保持時間約11.8分に新たな生成物が確認された(図4)。これによってVvGT5遺伝子がフラボノイドの3位にグルクロン酸を転移する活性を有するF3GATをコードすることが示された。
次に、本酵素の至適温度を求めた。糖受容体として100μMケルセチン、糖供与体として1mM UDP-グルクロン酸、50mM Glycine-NaOH(pH9.5)バッファー、14mM 2-メルカプトエタノール及び上記精製VvGT5酵素50ngを、10、20、30、35、40、45、50及び60℃で、それぞれ15分間反応させた。ケルセチンを加えることで反応を開始し、等量の0.1%TFAを含む40%アセトニトリル溶液を加えることで反応を停止した。反応停止溶液を遠心分離(15000 rpm, 2分間, 4℃)することによって得られた上清100μlをHPLC分析に供し、各温度条件における生成物量を比較した。その結果、最適反応温度は45℃であった(図7)。
アントシアニン類については上記HPLCシステムを用い、下記の条件で分析を行った。また、アントシアン分析用HPLC条件は、以下の通りである。カラムはAsahipak ODP-50 4E(4.6×250 mm、昭和電工)を室温で用い、移動相A(0.5% TFA/H2O)と移動相B(0.5% TFA/50% CH3CN)を用いた。溶離条件はB30%による3分間の平衡化の後、15分間の直線濃度勾配(B30%→B65%)、さらに1分間の直線濃度勾配(B65%→B100%)の後、さらに5分間B100%で保持した。その後再びB30%に戻し10分間平衡化した。流速は0.7 ml/分で行った。検出は、520 nmで行った。本条件で標準品のペラルゴニジン、シアニジン及びデルフィニジンは、それぞれ順に、保持時間約25.7分、23.9分及び20.8分に溶出される。
次に、本酵素の糖供与体特異性について検討した。各糖受容体として100μMケルセチン、1mM各糖供与体(UDP-グルクロン酸、UDP-グルコース又はUDP-ガラクトース;いずれもSIGMAより購入)、50mM Glycine-NaOH(pH9.5)バッファー、14mM 2-メルカプトエタノール及び上記精製VvGT5酵素 50ngを、30℃で15分間反応させた。糖受容体を加えることで反応を開始し、等量の0.1% TFAを含む40%アセトニトリル溶液を加えることで反応を停止した。反応停止溶液を遠心分離(15000 rpm, 2分, 4℃)することによって得られた上清100μlをHPLC分析に供し、各糖供与体における生成物量を比較した。その結果、UDP-グルクロン酸を基質にした場合にのみ生成物が得られ、UDP-グルクロン酸に対する基質特異性(Km)は17.7±2.9であった。このことからVvGT5はUDP-グルクロン酸に対して特異的であり、UDP-グルクロン酸依存的フラボノール3位グルクロン酸転移酵素(F3GAT)であることが明らかとなった。
<ブドウからのフラボノイドの抽出と精製>
ブドウ葉(カベルネソーヴィニョン品種)164gを液体窒素中で粉砕し、1.5Lの60% CH3CN及び0.05% HCOOHに一晩浸漬し、セライトろ過した。ろ液を体積が1/3程度になるまで減圧濃縮し、濃縮液を600mlのCHP-20Pに負荷し、600mlの水で洗浄後、20, 30, 40% CH3CN/H2O 各300ml x 2でステップワイズ溶出を行った。20%-2画分からポリフェノール類の溶出が認められた。20%-2から40%-1までの各画分について濃縮及び凍結乾燥を行い、HPLCで分析した。収量は20%-2(568.6mg)、30%-1(345.8mg)、30%-2(787.0mg)、40%-1(181.2mg)であった。
フラボノール配糖体が高純度で含まれていた30%-1画分及び30%-2画分を、下記の2段階の分取HPLC条件で精製した。
<分取HPLC条件1>
カラム:Develosil ODS-HG-15/30, φ50mm x 500mm
移動相:A-0.05%TFA, B-0.05% TFA/90% CH3CN
流速:32 ml/分
グラジエント:B10iso(15分間), B15→B40%(100分間),B40%iso(30分間)
検出:A350nm
次に、この画分について下記の分取HPLC条件2で再分離を行った。
<分取HPLC条件2>
カラム:YMC-Pack Polymer C18, φ20mm x 300mm
移動相:A-0.05%TFA, B-0.05% TFA/90% CH3CN
流速:6 ml/分
グラジエント:B30iso(20分間), B30→B50%(60分間),B50%iso(10分間)
検出:A350nm
<質量分析(MS)及びNMRによる各ピークの確認等>
MSは、Q-TOF Premier(Micromass社製、UK)でイオン源にZスプレーイオンソースをつけたESIを用い、ネガティブ、Vモードで測定した。Collision energy:45 eV、Ionspray voltage:3KV、ロックスプレーによる質量補正を行い、レファレンスにはロイシンエンケファリン(m/z 554.2777 [M-H]-)を用いた。その結果、ピークBは、m/z 477.0664 [M-H] -の分子イオンを与え、分子式C21H17O13(err.:-1.0 ppm)であった。また、同条件で測定したピークAは、m/z 463.0878 [M-H] -の分子イオンを与え、分子式C21H19O11(err.:0.2 ppm)であり、上述したように標品のケルセチン3-グルコシドと一致したことから、ケルセチン3-グルコシドと確認された。
上記MS及びNMRの結果、ピークBはケルセチンのグルクロナイドであり、1H{13C}-HMBCにおいてグルクロナイドの1位のプロトンからのケルセチンの3位(δ132.95)の炭素へのピークが認められたため、グルクロン酸は3位に結合していることが明らかになり、この化合物はケルセチン3-O-グルクロナイドであることが確認された(図9;図9中の太線はHMBCを示す。)。よって、この化合物をケルセチン3-O-グルクロナイドの標品として用いた。
VvGT5の機能領域を同定するために、“Noguchi, A. et al., Plant J., vol. 54, p. 415-427, 2008”に記載の方法と同様の方法で、VvGT5遺伝子のブドウ器官別の遺伝子発現パターンを7500 Real Time PCR System(Applied Biosystems)を用いたSYBR-Green定量RT-PCRによって解析した。
ブドウは、ピノノアール品種及びカベルネソーヴィニョン品種の各器官(葉、葉柄、種子、果実、果皮)から、実施例1と同様の方法でトータルRNAを抽出し、そのうち0.5μgをRandom Hexamerプライマーで逆転写(RT)反応することによって各器官のcDNAを得、これをPCRの鋳型とした。
5’-GCT CCA TCT CCT CTG CTC AAA -3’(配列番号5)
qVvGT5-Rv2:
5’- GAA AGC ACA AGG TCC TCT -3’(配列番号6)
VvGT1-Fw:
5’- CCC ACC GCC GGT TAT ACC -3’(配列番号7)
VvGT1-Rv:
5’- CGA CCG AGG TGG GTT TTC T -3’(配列番号8)
VvGT6-Fw:
5’- GGT TCC CTG GTT GGC AAT TT -3’(配列番号9)
VvGT5-Rv:
5’- GCA CCC GCC CCA CAA CCT T -3’(配列番号10)
VvUBQ2-Fw:
5’- TCC AGG ACA AGG AAG GGA TTC -3’(配列番号11)
VvUBQ2-Rv:
5’- GCC ATC CTC AAG CTG CTT TC -3’(配列番号12)
実施例3のVvGT5の遺伝子発現パターンから、果皮においてもフラボノール3-グルクロナイドが蓄積している可能性が示されたため、果皮フラボノイドの分析を行った。
ブドウ3品種(ピノノアール、カベルネソーヴィニョン及びシラー)の果皮と、比較対照としてピノノアール及びカベルネソーヴィニョンの葉を用い、各サンプルの生重量0.8gを凍結乾燥した。乾燥体をスパチュラで破砕し、8mlの0.1%蟻酸を含む50%アセトニトリル溶液を加え、室温で30分間超音波処理を行うことで、フラボノイド類を抽出した。超音波処理液を遠心分離(3000 rpm, 10分間, 4℃)して得られた上清をフィルター濾過(マイレクスLH、ポアサイズ0.45μm、ミリポア(株)製)し、HPLC分析に供した。
LC-MS分析条件は、YMC-pak Polymer-C18(3.0mm×150mm、YMC)を用い、移動相は、A液として0.1%蟻酸を含む水を、B液として0.1%蟻酸を含む100%アセトニトリルを用いた。20分間の直線濃度勾配(B液10%→70%(15分間)を用いて溶出し、その後、B液70%で5分間のアイソクラティック溶出を行った。(流速:0.2ml/分、カラムオーブン:40℃)。
検出は、フォトダイオードアレイ検出器(SPD-M10A、島津製作所)で230~500nmのデータを収集し、A350nmのクロマトグラムを測定した。また、PDA検出器の後にQ-TOF Premier(Micromass社製、UK)検出器を接続し、以下の条件で生成物の分子量の測定を行った。MSの測定条件は、ネガティブ、Vモードで行った(イオン化:ESI、Lock spray reference: ロイシンエンケファリン、Capillary: 2.6kV、Cone: 35V, collision energy: 5eV)。
この条件下で、Q3GlcはR.T.12.32分に溶出し、463.09[M-H]-の分子イオンを与え-3GlcAはR.T.12.41分に溶出し、477.07[M-H]-の分子イオンを与えた。マスクロマトグラムにより、葉及び果皮のQ3GAのピークを確認することができた。
赤ワイン(ボージョレ2007年、ガメイ品種)、赤ワイン(ブルゴーニュ2006年、ピノノアール品種)及びレーズン(干しブドウ、中国産白ブドウ)について検討した。
ワインについては、10mlに水を等量加えた溶液をSEP-PAK 1ccカートリッジ(Waters社)に吸着させ、10mlの水で洗浄後、1mlの90%アセトニトリルによって溶出し、10倍濃縮サンプルを得た。
レーズンについては、10gを液体窒素で凍結し乳鉢で粉砕し、20mlの50%アセトニトリルで抽出した。抽出液15mlに85mlの水を加え、SEP-PAK 20ccカートリッジ(Waters社)に吸着させ、100mlの水で洗浄後、2mlの90%アセトニトリルによって溶出しLC-MSサンプル液を得た。
LC-MSの条件は、YMC-Pack Polymer C18カラム(YMC、2.0mm×150mm、6μm)を用い、移動相は、A液として0.1%ギ酸を含む水を、B液として0.1%ギ酸を含む90%アセトニトリルを用いた。15分間の直線濃度勾配(A液80%:B液20%→A液40%:B液60%)を用いて溶出し、その後、A液40%:B液60で、5分間のアイソクラティック溶出を行った。(流速:0.2ml/分間)。
この条件下で、標品であるQ3Glc及びQ3GAは8.5分付近に溶出された。上記3食品サンプルについて8.5分付近を探索したところ、いずれのサンプルにおいてもネガティブモードでQ3GAと一致するm/z 477.04 [M-H]-の分子イオンを検出した。また同時に、ネガティブモードでQ3Glcと一致するm/z 463.06 [M-H]-の分子イオンを検出した。
このようにVvGT5の遺伝子発現パターンから示されたように、ブドウ果皮及びそれが含まれる食品(ワイン及びレーズン)においてケルセチン3-グルクロナイドが存在することが確認された。従って、VvGT5は主にブドウの葉と果皮で発現し、フラボノールの3位をグルクロン酸化していることが示された。
実施例2で示したように、VvGT5はUDP-グルクロン酸を特異的に利用することが明らかとなったが、この糖供与体選択性を決定するアミノ酸残基を明らかにするために、Clustal-Wによるアミノ酸配列のマルチプルアライメントを行った(図13)。その結果、VvGT5と相同性が高いブドウのアントシアニン3位グルコース転移酵素であるVvGT1やシロイヌナズナ及びペチュニアのフラボノイド3位グルコース転移酵素であるAt3GlcT(UGT78D2; GenBankアクセッション番号:AAM91139)及びPh3GlcT(GenBankアクセッション番号:BAA89008)において高く保存されているN末端から140アミノ酸付近に存在するトリプトファン(W)が、VvGT5においてはアルギニン(R)に置換されていた。これらのアミノ酸残基のC末端側に隣接するスレオニン(T)は、VvGT1の結晶構造解析から糖供与体であるUDP-グルコースと相互作用することが知られているため(Offen, W. et al., EMBO J., vol. 25, p. 1396-1405, 2006)、VvGT5に特異的に見出されたアルギニン残基(配列番号4のアミノ酸配列の第140番目のアミノ酸残基)はその糖供与体であるUDP-グルクロン酸と何らかの相互作用をすることが示された。
PCR条件は、96℃で30秒間の熱編成後、96℃で30秒間→ 58℃で1分間→ 68℃で7分間を1サイクルとする反応を、16サイクル行った。PCR溶液に制限酵素Dpn Iを添加し、37℃で1時間処理した後、反応液10μl分を大腸菌(Mach株)に形質転換した。得られたプラスミドを回収し、シークエンシングにより目的の変異導入を確認した。
5’- GGGTGGCAATTTGGACTGCTG -3’(配列番号13)
VvGT5 R140W QuikRv:
5’-CAGCAGTCCAAATTGC ACCC -3’(配列番号14)
このことから、VvGT5の140番目のアルギニン残基は、UDP-グルクロン酸の認識に必須の役割を果たしていることが示された。このことから、アルギニン残基の特徴的な側鎖であるグアニジニウム基と、グルクロン酸の特徴的な官能基であるカルボン酸との電気的な相互作用がUDP-グルクロン酸を認識するために重要であることが推測され、おそらくUDP-グルクロン酸を特異的な糖供与体とするUGT酵素にはVvGT5のR140のようなアルギニン残基が備わっていると考えられた。
配列番号2:合成DNA
配列番号5:合成DNA
配列番号6:合成DNA
配列番号7:合成DNA
配列番号8:合成DNA
配列番号9:合成DNA
配列番号10:合成DNA
配列番号11:合成DNA
配列番号12:合成DNA
配列番号13:合成DNA
配列番号14:合成DNA
Claims (14)
- 以下の(a)~(f)のいずれかに記載のポリヌクレオチド:
(a)配列番号3で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(c)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は(f)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。 - 以下の(g)~(j)のいずれかである請求項1に記載のポリヌクレオチド:
(g)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は(j)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。 - 前記(c)~(j)に記載のポリヌクレオチドが、それぞれ、以下の(c’)~(j’)に記載のポリヌクレオチドである、請求項1又は2記載のポリヌクレオチド:
(c’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において第140番目のアミノ酸を除く1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列中の第140番目のアミノ酸に対応するアミノ酸がアルギニンであるアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e’)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号3で表わされる塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;(f’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(g’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列において第140番目のアミノ酸を除く10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列であって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列中の第140番目のアミノ酸に対応するアミノ酸がアルギニンであるアミノ酸配列を有し、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i’)配列番号3で表わされる塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号3で表わされる塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;又は(j’)配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドあって当該配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列中の第418~420番目の塩基に対応する塩基がアルギニンをコードする塩基であるポリヌクレオチドであり、かつUDP-グルクロン酸転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。 - UDP-グルクロン酸転移酵素活性が、フラボノイド3位グルクロン酸転移酵素活性である、請求項1~3のいずれか1項に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号3で表わされる塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号4で表わされるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- DNAである、請求項1~6のいずれか1項に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドにコードされるタンパク質。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドを含有するベクター。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドが導入された形質転換体。
- 請求項9に記載のベクターが導入された形質転換体。
- 請求項10又は11に記載の形質転換体を用いる、請求項8に記載のタンパク質の製造方法。
- 請求項8に記載のタンパク質を触媒として、UDP-グルクロン酸と糖受容体基質からグルクロン酸抱合体を生成する、グルクロン酸抱合体の製造方法。
- 糖受容体基質がフラボノイドである、請求項13に記載の方法。
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