五、發明説明（9 ) 年月 η7. oa 修-4 88-07-09 修正 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 由下列諸實驗例，可將本發明作進一步之閜明。 實驗例1 :源自桿菌種290-3之7-環糊精糖基轉移醮（DSM 5850)之導致突變 由另外任一氨基酸殘基，尤其，由一色胺酸殘1或絲 胺酸殘基置換源自桿菌種290-3 (布朗希威格市德^ 收集中心寄存.編號DSM 5850,又於民國84年2 新竹市食品工業發展研究所，寄存號碼為CCRC 910^?)之 7 -環糊精糖基轉移酶內位置211之氨基酸殘基賂胺酸之工 作，業K精於此技藝者熟知之方法及方式予以達成，其中 ,係以另一鐮基三聯體（該_(基三_體編錄任一氨基酸殘 基，但K一色胺酸殘基為佳）置換7-環糊精耱基轉移酶結 構基因之醮基三聯體（該鑣基三聯體編錄賂胺酸211)。 為導致突變，首先將源自稈菌種290-3之環糊精糖 基轉移醮基因殖入商售大腸稈菌載體pUC 19 (伯林格爾公司 .曼海慕市）。付諸實施時，係用限制核酸內切® San3AI (伯林格爾公司，曼海篡市）將源自稈菌種290-3之染色體 脫氧核糖核酸（DNA)[第四届國際環糊精學術研討會論文集 (1988)第87至92頁]分雛出來，並予以部分裂解（如奧蘇伯 爾所述，分子生物現行記錄，第1卷；格林出販公司及威 利-科際，紐約）。某些片段，其大小介於二至五仟鹹基者 ，均分離出來，並與PUC19-DNA〔曾經用眼制梭酸內切醮 BamHI (伯林格爾公司，曼海慕市）及T4 DNA連接睡予K線 性化〕一起保溫在161C,歷時12小時。該連接混合物係用 以轉化大腸桿菌K12细胞，該等细胞曾以習知方法〔曼尼 阿提斯，分子無性繁殖，一實驗室手冊；冷泉港實驗室（ -11 - 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210 X 297公釐） ^^1- .^n 11 nn l t m I ml In 1 y 0¾ 言 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央橾準局貝工消費合作社印製 A7 _B7_五、發明説明（1 ) 本發明相開於①製造環期精所用之琛糊精糖基轉 移酶（CGTases)EC(酶分類）2.4.1.19，②其製備方法及③ 其用途。 通常，環糊精係由澱粉或類澱粉酶解物製得。澱粉係 藉環糊精糖基轉移酶之酶促作用，將醱粉轉化成環糊精。 無論反應中採用何種環糊精糖基轉移酶，為了熱力學上之 理由，若反應進行至達到熱力學平衡（琛糊精産率最高）， 澱粉則主要轉化成環湖精。但在初始階段，源粉轉化 反應開始時，在初级産物混合物之組成中，轉化作用所使 用之酶不同。因初始階段由酶形成之主要産物為《-、 或7-環糊精，所以將該等酶區分為α-、 /3-或7 -環糊精 糖基轉移酶。 迄今，適於工業量産環糊精且經採用之酶，業由細菌 中單獨偵撿出來。截至目前為止，α-環糊精糖基轉移酶 業於軟化桿菌中單獨鑑定出來〔細菌學報（1986) 166，第 11 1 8至1 1 2 2頁〕，瞜脂熱桿菌（G Β 2 1 6 9 9 0 2 )及克雷白氏催 産捍菌〔基因學報（1 9 8 6 ) 4 7 ,第2 6 9至2 7 7頁〕。iS -環糊 精耱基轉移酶亦在若干桿菌中偵檢出來，例如：在環形桿 菌中〔應用微生物生物技術（19 9 0 ) 3 4,第2 2 9至2 3 0頁〕， 巨大捍菌（US-A 3 , 8 1 2,011) , 〇hbensis桿菌（JP 7 4 1 2 4 2 8 5 ) ，撤球菌種（EP 0017242)及噻鹼桿菌，但該等桿菌尚未依 照分類學予以精確地分類，例如：桿菌種38-2〔普通撖生 物學報（ 1 988 ) 1 34,第97至105頁〕，17-1〔第四屆國際環 糊精學術研討會論文集（1 9 8 8 ),第8 7至9 2頁〕，1 011〔應 本纸伕尺度適用t國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公；t ) 經濟部中央橾準局貝工消費合作社印装 A7 B7___五、發明説明（2 ) 用撖生物生物技術（1 9 8 7 ) 2 6 ,第1 4 9至1 5 3頁〕及1 - 1〔第 四屆國際環糊精學術研討會論文集（1988),第71至76頁]。 具有初始高度 7-環糊精形成活性之酶，曾於若干文獻中 述及，例如：枯草桿菌313〔農業生物化學（1986) 50，第 2161至2162頁〕，桿菌種A1-6〔發酵生物工程學報（199〇) 70(3),第150至154頁〕及桿菌種290 -3〔第四屆國際環撕 精學術研討會論文集（1988),第87至92頁〕。 源自琛形桿菌之環糊精糖基轉移酶，其三維結構 業已籍X-射線結構分析予以閨明[分子生物學報（1991)217 .第737至7 5 0頁〕。由此結構，可推知何種氛基酸殘基可 能直接參與酶解物結合部位及該環糊精糖基轉移酶活性中 心之構造，但無法推知何種氨基酸殘基決定該環糊精糖基 轉移酶之産物特異性〔生物化學雜誌（ 1 9 92 ) 3 1，第87 40至 8746頁〕。 因工業置産環糊精所用之環糊精糖基轉移酶，常將澱 粉轉化成若干環糊精組成之混合物，所以，分離純環糊精 U,点，或7)之方法，業經發展出下列幾種： -利用層析法，依照分子量之差異，將諸界定之環糊精 自産物混合物中分離出來（US-A 4808232内曾述及）。 -藉酶促作用將澱粉轉化成環糊繪時，添加僅與某—種 界定之環糊精反應之複合體形成劑，因而形成一不溶 性複合醱，該複合體可自反應混合物中實際分離出來 。之後，將該夜合體加以離析，得以分離出單質環糊 精（EP 0 2 9 1 0 6 7中曾述及）。 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂 本纸張尺度適用t國國家標準（CNS ) A4规格（210X297公釐） 經濟部中央標準局貝工消費合作社印袈 A7 B7_五、發明説明（3 ) -於反應混合物中，添加一有機溶劑，例如：乙醇，若 使用7-環糊精糖基轉移酶，則産物組成物可移向7- 環糊精[發酵生物工程學報（1990)70(3),第150至154 頁〕。 在每種方法中，對待製純淨環糊精之初始産物形成具 有極高度噻好之環糊精糖基轉移酶，均加以最佳蓮用。 迄今習知之ct -及/8 -環糊精糖基轉移酶之特異性適於 工業量産相對應之環糊精。相反地，無一種習知7-環湖 精糖基轉移酶具有可量産7 -環糊精之産物特異性。 所以，為製備7-環糊精，日本專利JP 03053892中曾 建議：添加7 -環糊精專用複合體形成劑：糖基甘草甜素、 麥芽糖及一環糊精糖基轉移酶，可藉酶促作用將ct -及/ 或々-環糊精轉化成7-環猢精。 本發明之目標係利用現有環湖精糖基轉移酶（該等環 糊精糖基轉移酶可將澱粉或類澱粉酶解物轉化成環糊精）， 大規模製造7-環糊精。 本發明之另一目標係利用現有方法以製備該等環糊精 糖基轉移酶。 本發明之再一個目標係藉助於該等環糊精糖基轉移酶 ，利用現有方法製造7-環糊精。 本發明之目標偽由若干環糊精糖基轉移酶達成，在氨 基酸位置180及氨基酸位置240間之區域内，該等糖基轉移 酶之蛋白質序列含有氨基酸序列Asn Leu Xxx Asp，其中， 蛋白質序列之位置1係環糊精糖基轉移酶信號肽之開端， -5 - (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂 本纸張尺度逍用中國困家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐〉 經濟部中央揉準局貝工消费合作社印裝 A7 B7五、發明説明（4 ) 且XxxR表酪胺酸以外之一種天然氨基酸。 合意的是：在本發明環猢精糖基轉移酶之蛋白質序列 中，介於氨基酸位置180及氨基酸位置2 40間之區域内，含 有氣基酸序列Asn Leu_Trp(色胺酸）Asp或Asn Leu Ser (絲 胺酸）Asp,其中，蛋白質序列之位置1傺環糊精耱基轉移 酶信號肽之開端。 特別合金的是：在本發明環湖精糖基轉移酶之蛋白質 序列中，介於氨基酸位置180及氨基酸位置2 40間之區域内 ,含有序列圖式 Asn Leu Trp Asp,其中，蛋白質序列之 位置1係環糊精糖基轉移酶信號肽之開端。 轉化澱粉或類澱粉酶解物時，以本發明之環糊精糖基 轉移酶製造之環糊精，在其産物分配中，7 -環糊精及7-環糊精及/9-環糊精之和所佔比例，較以各原有起始酶所 製該等産物所佔比例為大。 關於此點，應予了解者，起始酶偽指製備本發明之環 糊精糖基轉移酶所用之環糊精糖基轉移酶。所以，出乎意 料地，本發明之環糊精糖基轉移酶所具對7-環糊精之特 異性，較製造本發明環糊精糖基轉移酶所用起始酶者為高。 本發明環糊精糖基轉移酶之實例是：以另一天然氨基 酸置換各案例中畫有底線之Tyr (酪胺酸），由表1所列環 糊精糖基轉移酶製得之環糊精糖基轉移酶。較合意的是： 該等環糊精糖基轉移酶之Ty「係由Trp或Ser置換。更合意 的是：該等環糊精糖基轉移酶之Tyr偽由Trp置換。 表1 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度逍用中國®家梯準（CNS ) A4洗格（2IOX297公釐） A7 B7 五、發明説明（5 ) 經濟部中央橾率局負工消費合作杜印裝 環棚精糖基 源自菌株 位置 氛基酸序列 轉移酶類型 β 環形捍菌 225 Tyr Lys Asn Leu Try Asp Leu Ala Asp β 捍菌種1-1 213 Tyr Arg Asn Leu Tyr _ 一 Asp Leu Ala Asp β ohbensis 挥菌 213 Tyr Arg Asn Leu Asp Leu Ala Asp β 枯草捍菌 218 Tyr Lys Asn Leu IXL Asp Leu Ala Asp 0 t 捍菌種290-1 207 Tyr Arg Asn Leu Tyr Asp Leu Ala : Ser 以 若 干環 糊精 糖 基 轉 移 m 為 例 t 表 1 内 所 列 舉 者， 乃 顯 示 β -及7 - 環糊 精 糖 基 轉 移 酶 内 常 存 在 之 氨 基 酸 序列 匾 域 及 該 序 列區 域内 與 修 改 産 物 特 異 性 有 關 之 Ty Γ c ，在表1内 > 毎 掴 案 例中 重現 之 氨 基 酸 序 列 9 其 第 一 偁 氨 基 酸 之编 號 指 定 為 位置 ,其 中 9 相 m 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 序 列 内信 號 肽 之 第 一 値氨 基酸 乃 數 作 位 置 1 0 所 有 β -及， 1 - 環 糊精 糖 基 轉 移 酶 内之 aki 〇te 封懕 序 列 區 域 9 可 用 一 般 習 知 之 標 準 方法 找 出 〇 利 用 類似 習知 之 標 準 方 法 (例 如 本 Φ 請 案 内 舉例 說 明 者 ), 依照本發明， 使該等瓖糊精糖基轉移酶内之Tyr ‘産 生 突 變 9 由任 何/9 -或1 f - 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 可 製 得 本發 明 之 酶 0 有 — 種方 法可 以 逹 成 本 發 明 之 另 一 百 標 9 在 該 方法 中 > 编 錄 一 >3 -或 7 - 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 之 基 因 f 其 脱 氣核 糖 核 酸 序 列 ,可 用習 知 之 誘 變 方 法 > 位 於 所 用 β •或7 _環 糊 精 糖 基 轉 移酶 序列 圖 式 A S Π L e u T y r A S Ρ 内 0 介 於 氨基 酸 位置180及240 間之Tyr 9 用 另 一 天 然 氨 基 酸 在 突 變 之環 糊 精糖基轉移酶中予以置換。 (請先聞讀背面之注意事項再填寫本頁)
,1T 本紙張又度適用中國國家揉準（CNS ) Α4規格（210X297公釐） A7 B7 經濟部中央橾準局負工消费合作社印製 五、 發明説明 (6 ) 1 1 I 所 有 β ••及 7 - 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 均 適 於 製 備 本 發 明 之 1 1 I 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 0 编 錄 一 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 之 基 因 係 以 I I 習 知 方 法 分 離 出 來 ， 且 本 發 明 之 突 變 9 % 藉 厂 在 體 内 J 或 請 先 1 厂 在 體 外 J 致 突 變 之 方 法 導 入 基 因 0 聞 讀 1 背 • I 應 了 解 的 是 9 所 謂 厂 在 體 内 J 致 突 變 之 方 法 » 持 別 傑 之 1 注 | 指 若 干 方 法 9 其 中 t 某 些 徹 生 物 利 用 染 色 體 及 / 或 附 加 ( 意 事 1 游 離 ) 基 因 9 以 儲 藏 编 錄 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 之 基 因 > 利 用 項 再 1 填 1 —· 誘 變 劑 » 例 如 紫 外 光 % 亞 硝 基 胍 或 磺 酸 乙 甲 酯 > 可 導 寫 本 i 致 該 等 微 生 物 産 生 非 持 異 性 突 變 0 該 方 法 曽 由 米 勒 在 其 分 頁 1 1 子 遣 傳 實 驗 (172)中述及 ,冷泉港實驗室 ;冷泉港， 紐約。 I 隨 後 9 若 干 公 開 之 方 法 例 如 藉 桑 格 等 人 在 國 家 科 1 1 學 院 論 文 集 74 (1 9 7 7 ) 第 5 463 至 546 7 頁 所 述 及 之 鍵 终 止 法 以 1 訂 1 實 施 序 列 分 析 之 方 法 9 % 用 以 鑑 定 突 變 體 9 在 該 等 突 變 體 中 9 至 少 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 基 因 之 密 碼 子 (該 密 碼 子 编 錄 1 1 一 酪 胺 酸 > 該 酪 胺 酸 係 源 白 璟 形 桿 菌 之 環 糊 精 糖 基 轉 移 酶 1 I 中 Ty Γ 2 2 9之同条物） 1 係 由 — 密 碼 子 (該 密 碼 子 编 錄 另 一 1 1 天 然 氨 基 酸 殘 基 » 以 絲 胺 酸 或 色 胺 酸 殘 基 較 為 合 意 > 尤 以 皆 I 色 胺 酸 殘 基 更 為 合 )所置換。 1 I 就 本 發 明 之 範 圍 而 m $ 與 源 白 環 形 捍 菌 之 環 糊 精 耱 基 1 1 轉 移 酶 中 Ty Γ 229 屬 同 糸 物 之 密 碼 子 i 乃 指 其 他 環 糊 精 糖 1 I 基 轉 移 酶 基 因 之 Ty Γ - 编 錄 密 碼 子 » 該 等 密 碼 子 编 錄 表 1 内 1 1 氨 基 酸 序 列 圖 式 中 畫 有 底 線 之 Ty Γ 0 1 I 就 本 發 明 之 範 圍 而 論 DM 9 可 了 解 的 是 : 厂 在 體 外 J 致 突 1 變 之 方 法 係 指 若 干 方 法 9 其 中 8 » 以 習 知 之 方 法 及 方 式 * 將 1 1 1 1 1 1 本纸張尺度逍用中國國家揉率（CNS ) A4洗格（210X297公釐） 經濟部令央揉率局員工消费合作社印製 A7 B7五、發明説明（7 ) 一分離之環糊精糖基轉移酶基因，或一環糊精糖基轉移酶 基因之片段，加以修飾，因而産生一基因，該基因编錄一 環糊精糖基轉移酶，在該轉移酶中，至少一氨基酸殘基（ 該殘基像源自環形捍菌之環猢精糖基轉移酶中Tyr 229之 同条物）由另一氨基酸殘基（以色胺酸殘基或絲胺酸殘基較 為合意，尤以色胺酸殘基更為合意）所置換。 有關「在髏外」致突變之方法，自最新技術公開之實 例是：利用「切補修復」技術之持異性致突變方法〔生物 技術學報（ 1 99 2 ) 1 3 ( 3 ),第3 42至346頁〕或非待異性致突 變方法〔技術學報（1989)1(1)，第11至15頁〕。另外若干 方法亦經公開，在該等方法中，突變傜藉助於一合成寡核 苔酸，以引導之方式傳入靶基因。此項工作之進行，可使 用所讀之「單股方法」〔奧蘇伯爾等人（1987),分子生物 學現行紀錄，格林出販公司]或使用「雙股方法」（Prom eg a 1992-1993摘要，150)或使用其他方法，例如：遺傳年報 ( 1 985 ) 1 9 ,第 423至 46 2 頁所述。 本發明之環糊精糖基轉移酶具有極高之7 -環糊精形 成活性，其主要用途像用以將7-環糊精自澱粉中分離出 來。藉現行製備方法，本發明之環糊精糖基轉移酶可作此 項用途。製造7-環糊精之現行方法，其中可使用本發明 環糊精糖基轉移酶以取代該等方法指定之環猢精糖基轉移 酶者，曾於下列文獻中述及： - 發酵及生物工程學報（1990)70(3),第190至192頁： 在有乙醇存在之情況下，利用源自捍菌種AL-6之/9-及r- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂 本纸法尺度遥用中國國家橾準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 經濟部中央棣準局負工消费合作社印裂 A7 B7___五、發明説明（8 ) 環糊精形成環糊精糖基轉移酶，以裂備7-環糊精，如此， 可大幅提昇7 -環糊精之産量。 -JP 87 25,976:利用源自桿菌種313之7 -環糊精糖基 轉移酶，以製備7-環糊精。 -EP 291,067:利用源自軟化捍菌之環湖精糖基轉移酶 ,以製得7-環糊精。藉添加一複合體形成劑，例如：環 十六-8-烯-1-麵1,可獲致對7-環棚精之産物特異性。 -DE 40 09 822:利用源自捍菌290-3之7 -環糊精糖基 轉移酶，以製備7-環糊精。 與α-環瑚精相較及與/3-環糊精相較，7-環糊精具 有若干待別優點，使其在一条列應用場合，成為唯一可能 之環糊精或最適宜之環瑚精。 與α-環糊精（由六餹葡萄糖單元組成）相較，7-環糊 精（由八個蕕萄耱單元組成）具有較大之疏水性腔洞，所以 亦可與外來分子複合，但α-環糊精由於疏水性腔洞較小， 卻無法與該等外來分子複合。 與/9-環糊精（室溫下，水中溶解度：約18.5公克/公 升）相較，環糊精之水中溶解度極高（室溫下：約232.0 公克/公升），所以，涉及自水溶液中行複合作用之反應， 7-環糊精較/3-環糊精更為適宜。7-環糊精之另一優點 是：7-環糊精之毒性較/9-環湖精及經修飾之 /3-環糊精 衍生物者為低。以動物作實驗之結果顯示：在口服藥及靜 脈注射藥方面，7-環猢精衍生物及；8-環湖精衍生物均較 7 -環糊精為毒。 -10 - (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 、1Τ 本紙張尺度逍用中國國家標準（CNS ) Α4規格（210X297公釐） 五、發明説明（9 ) 年月 η7. oa 修-4 88-07-09 修正 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 由下列諸實驗例，可將本發明作進一步之閜明。 實驗例1 :源自桿菌種290-3之7-環糊精糖基轉移醮（DSM 5850)之導致突變 由另外任一氨基酸殘基，尤其，由一色胺酸殘1或絲 胺酸殘基置換源自桿菌種290-3 (布朗希威格市德^ 收集中心寄存.編號DSM 5850,又於民國84年2 新竹市食品工業發展研究所，寄存號碼為CCRC 910^?)之 7 -環糊精糖基轉移酶內位置211之氨基酸殘基賂胺酸之工 作，業K精於此技藝者熟知之方法及方式予以達成，其中 ,係以另一鐮基三聯體（該_(基三_體編錄任一氨基酸殘 基，但K一色胺酸殘基為佳）置換7-環糊精耱基轉移酶結 構基因之醮基三聯體（該鑣基三聯體編錄賂胺酸211)。 為導致突變，首先將源自稈菌種290-3之環糊精糖 基轉移醮基因殖入商售大腸稈菌載體pUC 19 (伯林格爾公司 .曼海慕市）。付諸實施時，係用限制核酸內切® San3AI (伯林格爾公司，曼海篡市）將源自稈菌種290-3之染色體 脫氧核糖核酸（DNA)[第四届國際環糊精學術研討會論文集 (1988)第87至92頁]分雛出來，並予以部分裂解（如奧蘇伯 爾所述，分子生物現行記錄，第1卷；格林出販公司及威 利-科際，紐約）。某些片段，其大小介於二至五仟鹹基者 ，均分離出來，並與PUC19-DNA〔曾經用眼制梭酸內切醮 BamHI (伯林格爾公司，曼海慕市）及T4 DNA連接睡予K線 性化〕一起保溫在161C,歷時12小時。該連接混合物係用 以轉化大腸桿菌K12细胞，該等细胞曾以習知方法〔曼尼 阿提斯，分子無性繁殖，一實驗室手冊；冷泉港實驗室（ -11 - 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210 X 297公釐） ^^1- .^n 11 nn l t m I ml In 1 y 0¾ 言 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 B7 經濟部中央梂準局属工消費合作社印裂 五、 發明説明 (] 〇) 1 I 1 98 2 ) 紐約〕 使其具有吸收DN A 之反應 潛 能 〇 重 組 體 質 Μ 粒 1 1 1 (該等質粒撝有 :源自捍菌種290 -3之 7 - 環 糊 精 糖 基 轉 移 1 | 酶 所 需 之 基 因 )係從該等大腸捍菌細胞丨 ,該 等 細 胞 於 經 過 轉 請 先 1 化 後 » 在 含 有 澱 粉之指 示 板 上形 成澱粉 降 解 之 a U Γ e c 1 € S ) 閲 讀 1 背 中 分 離 出 來 [ 曼 尼阿提 斯 » 分子 無性繁 殖 t 一 實 驗 室 手 冊 面 之 1 I 冷 泉 港 實 驗 室 (1982) t 紐 約， 第86至 92 頁 ] 0 /王 意 事 1 1 該 基 因 之 致 突變工 作 ， 係利 用艾黙 斯 海 慕 公 司 (布 朗 項 再 1 填 I 希 威 格 市 )發售之「寡糖苷酸引導體外致突變条统， 第2 .1 寫 本 Λ 販 J 實 施 者 » 其 中，且 以 艾 克斯 坦所發 展 之 方 法 ( 核 酸 殘 頁 1 1 基 (1986) 1 4 , 第9679至9698頁及核酸殘基（1988 ) 1 6 第 1 I 791 至 802 頁 3 為 基礎。 該 項 致突 變工作 係 兀 全 依 照 艾 黙 斯 1 1 海 慕 公 司 發 行 之 該致突 變 % 統所 附之記 錄 而 實 施 〇 該 方 法 1 訂 1 I 摘 要 如 下 0 詳 情 請參閲 該 致 突變 条统之 記 錄 〇 利 用 商 售 酶 ,例如 限 制核 酸内切 酶 及 T4 DN A 連 接 酶 1 1 (伯林格爾公司， 曼海慕市） ,将 源自捍 菌 種 2 9 0 - 3之ϊ f — 環 1 I 糊 精 糖 基 轉 移 酶 所需之 部 分 基因 (該基因業经殖入P UC19 9 1 1 且 含 有 可 编 錄 在 該酶位 置 2 1 1之 氨基酸 殘 基 酪 胺 酸 之 鹼 基 | '三 聯 體 )殖入商售載體M13 (新英格蘭實驗室）。 該 片 段 之 一 1 I 個 實 例 係 一 〇. 6仟鹼基之P s t 1/ E coR I 片 段 0 該 片 段 % 殖 入 1 1 Ml 3載體且由限制核酸P Ϊ切酶P s t I 及 E c 〇 R I 予 以 裂 解 0 1 I 依 照 艾 黙 斯 海慕公 司 提 供之 實驗記 錄 及 上 述 之 致 突 變 1 1 糸 統 • 業 經 〇〇 単 股 、重組 體 Ml 3 DNA(模板 DNA) 從 該 等 大 腸 桿 1 菌 宿 主 細 胞 (該等細胞曾吸收該重組體M13 載髏） 中 分 離 出 1 I 來 0 1 1 1 V - 12 - 1 1 1 本紙張尺度遑用中國國家揉率（CNS ) A4規格（210X297公釐） 五、發明説明（1 1 ) A7 B7 之等者 列該品 序。出 期需— 預所 具變 均突 中致 例際 案實 個供 每以 於 * 且成 定合 界經例 學業， 化，市 經酸上 ί甘已 核業 如 市 堡 斯 伯 易 /IV 司 公 分 致部 該某 ，之 以列 所序 ，酸 擇ί甘 選核 以板 加模 經該 業與 先係 事序 列次 序之 之基 酸鹾 ί甘内 核酸 寡苷 將種 ，菌 基捍 鹾自 値源 15錄 各编 游並 下， 、圍 上包 以以 均加 ，體 中聯 例.三 案基 一 鹼 毎含 在所 分内 突核致變 板 〇 致寡。突分模29 寡酸變 變苷突 致 核部 寡該 之 3 - 7但 移 轉 基 糖 精 糊 環 基 殘 酸 胺 酪 之 變 突 致 ί甘成 核生 干之 若精 有糊 核， 寡酸 ί甘 該中 其 酸等 鹼 之 酸 胺 酪 錄 21编 置替 位代 在以 酶 互體 反聯 ΙΜ三 丨基 補 含 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 在置 酸位 ί甘於 核位 成 達
1 IX 環 ， -基 7殘 致酸 導基 即氨 ,1 後另 變係 突者 而並非一酪胺酸殘基。 所用兩種致突變寡核苷酸之序列，如表2内所示： 表2 5'_ ΑΤτ TAT CGA AAT CTT TGG GAT TTA GCT AGT CTA -3/ 5^- ATT TAT CGA AAT CTT NNN GAT TTA GCT AGT CTA -37 經濟部中央揉準局員工消费合作社印製 - 之 化體聯寡中 7 代 退聯三此其 干則 謂三基 ，， 若 1 所之鹾中物 生21即酸能例生 産基(^胺可案衍 可殘 丨酪種値酶 ，酸 酸錄641 移 酸胺 ί甘编用每轉 ί甘酪 核用可在基 核， 寡可，，糖 寡中 變不體以精 變其 突除聯所糊 突， 致，三。環 致物 之時之換· 之生 部} 1 置 ？ 部衍 下酸 CSI 以干 上酶 内苷酸予若 内移。2 核胺種造 2 轉基表寡酪一製 表基殘用 J錄何於 用糖酸使合编任適 採精胺當混，之酸 糊色 Γ 外中 J-H· 環以 或之體核 本纸》尺度逍用t國國家標準（CNS ) Α4規格（210Χ297公釐） 經濟部中央椟準局負工消費合作杜印裝 A7 B7五、發明説明（12) ，位於位置211之氨基酸殘基酪胺酸，僳由任一其他天然 氨基酸所置換。 採用T4多核苷酸澍酶及腺核苷三磷酸（艾黙斯海慕公 司出品）使致突變寡核苷酸在5’端磷酸化。經磷酸化之致 突變寡核苷酸偽與模板DNA之同条區相結合。為達成此目 的，將5徹公克單股楔板DNA與約4徹徹莫耳磷酸化之致突 變寡核苷酸，在70t：溫度下保溫3分鐘，之後，在371D溫 度下保溫30分鐘。隨後，一 DNA股（該股除待突變之位置外 ，傜與模板DNA互補）得以合成，其中，致突變寡核苷酸與 用作合成起點之模板DNA及用作致突變DHA股全程合成模板 之模板DNA相結合。於添加DNA聚合酶克林諾片段（艾黙斯 海慕公司出品），一 Τ4 DNA連接酶及一核苷酸混合物，該 混合物含有核dGTP及dTTP及硫核苷酸 dCTPcfS (艾黙斯海慕公司出品）（以代替dCTP)之後，合成反應本身 在1 6 t：之溫度下進行，歴時超過1 5小時。 單股模板DNA之其餘分子，則由該合成樣品中除去。 為此，於樣品中加入食鹽（NaCl),再以硝化缕維濾材（艾 黙斯海慕公司出品）（該濾材待別與單股DNA相結合）過濾之 。添加乙醇可使存留在濾液内之雙股混體DNA得以濃縮並 除去鹽分。隨後，在混有Neil (艾黙斯海慕公司出品，係 一限制核酸内切酶，該酶可識別核苔酸序列CC(G/C)GG, 但僅裂解天然DNA股而不裂解含有核¥酸類似物dCTPa S者） 之適當保溫缓衝液内，使該混體DNA在371C溫度下保溫90 分鐘。此項處理可導致唯獨未突變股（模板DNA)之斷裂。 -14 - (請先閏讀背面之注意事項再填寫本頁)
本紙張尺度逍用t國國家標率（CNS > A4洗格（210X297公釐） 經濟部中央糅準局身工消费合作社印製 A7 B7五、發明説明（1 3 ) 在37亡溫度下，用核酸外切酶111(艾黙斯海慕公司出 品，傜一酶，該酶從自由端降解DNA)處理30分鐘，可將模 板DNA除去。瀵核酸外切酶III之熱失活作用（7〇t溫度下， 歴時15分鐘）之後，使餘留下來之單股且經致突變之DNA股 ，連同DNA聚合酶1(艾黙斯海慕公司出品）、Τ4 DNA連接酶 及核苷酸d A Τ Ρ、 d Τ Τ Ρ、d C Τ Ρ及d G Τ Ρ ,在1 6 1C溫度下保溫 3 小時。如此，致突變之單股DNA則轉化為一雙股者。在進 一步乙醇沉澱之純化工作中，經突變之DHA可轉化成具有 反應潛能之大腸桿菌K1 2細胞。 將源自轉化作用所得五個純糸之重組DNA内相關區域 之序列加以分析，得以驗證致突變程序之成功。該序列分 析僳用以測定：使用一退化致突變寡核苷酸（表2下部）時 所獲得之突變。原先被殖入M13以求突變之DNA片段，僳用 適當之限制酶，從確實發生突變之載體中切除。若所用Η 段傜0.6仟驗基，切除工作偽藉PstI及EcoRI完成。 隨後，相對應但未曾突變之Pstl/EcoRI片段，偽用 T4 DNA連接酶，從源自桿菌種290-3之7-環糊精糖基轉移 酶所需之表現質粒（以PUC19為主）中切除，並代之以經已 突變之片段。 實驗例2 :源自捍菌體1-1之/3-環糊精糖基轉移酶之導致 突變 ~ 與實驗例1内所述相似之方法，源自桿菌種1-1之/S-環糊精糖基轉移酶基因之密碼子（該密碼子编錄對應環糊 精糖基轉移酶位置217之酪胺酸殘基）係由一编錄色胺酸殘 -15 - (請先閱水背面之注意事項再填寫本頁) 訂 本紙張尺度逍用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 經濟部中央榣準局貝工消费合作社印装 A7 _B7_五、發明説明（14 ) 基之三聯體所置換。該致突變所用之寡核苷酸，如表3所 不〇 表3 5^- ATT TAC AGA AAC TTA TGG GAT CTG GCA GAC TAT -37 實驗例3 :源自環形桿菌之環糊精糖基轉移酶之導致 突變 與實驗例1内相似，源自環形桿菌之/3-環糊精糖基 轉移酶基因之密碼子，其编錄相對應環糊精糖基轉移酶位 置22 9之酪胺酸殘基者，係由编錄一色胺酸殘基（表4上部） 或一絲胺酸殘基之三聯體所置換。用於導致該等突變之寡 核苷酸如表4所示。 表4 5f- ATC TAC AAA AAC CTG TGG GAC CTG GCC GAC TTC -3, 5f- ATC TAC AAA AAC CTG TCT GAC CTG GCC GAC TTC -3f 實驗例4 :於大腸捍菌中製造本發明之桿菌種290-37 -環 糊精糖基轉移酶及其衍生物 為了依照實驗例1以製造捍菌種290-37 -環糊精糖基 轉移酶及其衍生物，曾將如實驗例1中所述以PUC19為主 之表現質粒轉化成分泌性大腸桿菌菌株。大腸桿菌WCM105~ 曾用作分泌性大腸择菌菌株。該菌株俗依照EP 3 38 41 0中 所述，由大腸桿菌DS 410製得。 所以，為製造桿菌種290-37 -環期精糖基轉移酶或其 衍生物，將含有適當環糊精糖基轉移酶表現質粒之大腸捍 菌WCM105細胞，置於一振動水浴（轉速為25 0轉/分鐘）之 -16 - (請先聞讀背面之注意事項再填寫本頁) >体紙張尺度逋用.中國困家橾準（CNS ) A4规格（210X297公釐） 經濟部中央標準局只工消费合作社印製 58i3oG A7 B7五、發明説明（15) 保加利亞乳酸菌培養基内〔曼尼阿提斯，分子無性繁殖， -實驗室手册；冷泉港實驗室（1982),纽約〕，該培養基 中含有10公克/公升乳糖及0.1公克/公升安比西林。再 以5000 X g(重力加速度）之離心力作用下，將細胞分離出 來。培養種菌上清液中，不含細胞，僅含 7-環猢精耱基 轉移酶及其衍生物。 實驗例5 :於大腸捍菌中製造本發明之捍菌種1-1召-環糊 精糖基轉移酶及其衍生物 製造程序與實驗例4者相似，但使用實驗例2内所述 之表現質粒。 實驗例6 :於大腸捍菌中製造本發明之環形桿菌/?-環糊 精糖基轉移酶及其衍生物 製造程序與實驗例4者相似，但使用實驗例3内所述 之表現質粒。 實驗例7 :澱粉轉化成環猢精 環糊精糖基轉移酶之活性，係用歐洲生物化學學報（ 1990)191,第177至185頁所述之方法測定。 在每個案例中，於一缓衝液〔該缓衝液係由20毫莫耳 三羥甲基氨基甲烷缓衝劑/ HC1,酸鹾值7.2,及5毫莫耳 氯化鈣<CaCl2>所組成〕内，在45t：溫度下，使每公克澱粉1〇値單 元之環糊精糖基轉移酶與一可溶澱粉之5¾溶液（黙克公司 出品，達慕斯搭德市），共同保溫，歴經一段設定之時間。 到達設定時間之後，添加1.5份體積比之甲醇以終止反應。 在溫度下保溫1小時，可使未曽反應之殘留澱粉發生沉 -17 - (請先閲讀背面之注意事項再填寫本貢) 本紙乐尺度逍用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 經濟部中央搮準局貞工消费合作社印裝 S833W A7 B7五、發明説明（16) 澱，並以離心力作用[10分鐘，12,000 X g(重力加速度）〕 將其分離出來。所得産物則用高壓液體色譜法之Nukleosil 10 - NH2 柱（瑪歇瑞及納格爾公司出品，杜倫市），以界定之環糊 精或直缠麥芽寡糖（西格馬公司出品，慕尼黑市）為標準而 測定之。 實驗例8 :利用依照實驗例4所製未突變桿菌種290-37 - 環糊精糖基轉移酶及其衍生物實施澱粉轉化 反應依照實驗例7内所述進行。直鐽麥芽寡糖（G1至 G7)之量像累積者。所得結果如下： 表5 : (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 反應時間 澱粉轉化成環糊精及G1至G7之百分率U) (分鐘） 未突變之環糊精糖基轉移酶 突變之環糊精糖基轉移酶 /3-環糊精 7-環湖精G1-G7 ;3-環糊精 7 -環糊精G1-G7 5 7.0 8.6 0. 0 0. 0 7.8 0.0 10 11.0 13.0 0. 0 0. 0 12. 8 0.0 15 12.6 14.4 0. 0 0. 0 16. 2 0.0 30 21.4 18.2 1. 2 2. 0 22. 8 2.2 驗 例9 :利 用 依 照實 驗 例 6 所 製 未 突 變 環 形 捍 菌 β -環 糊 精 糖 基轉 移 酶 及 其 衍 生 物 實 施 澱 粉 轉 化， 在 該 衍 生 物中 9 位 於 位 置 229 之 酪 胺 酸 殘 基偽由 一 色 胺 酸殘 基 所 取 代 反應 係依 照 實 驗例 7 内 所 述 進 行 〇 所 得 結 果 如 下： -18 - 本紙張尺度逍用中國國家橾準（CNS ) A4洗格（210X 297公釐）
SSiSoG A7 B7
反應時間 澱粉轉化成環糊精之百分率U) (分鐘） 未突變之環糊精糖基轉移酶 突變之環糊精糖基轉移酶 α-環糊精/3-環猢精 7-環糊精 or-環糊精/5-環糊精7-環糊精 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 0.0 4 6 6.410.6 13.5 16.4 18.2 20.0 22.2 23.0 24.6 26.2 1.22. 0.00.0 1.02.0 6.0 8 4.48.0 14.6 17.2 16.4 16.0 16.4 19.822.020.8 實驗例10:利用依照實驗例6所製未突變環形捍菌/3-環 糊精糖基轉移酶及其衍生物實施澱粉轉化，在 該衍生物中，位於位置229之酪胺酸殘基，偽 在有 7-環糊精複合體形成劑存在之情況下， 由一色胺酸殘基所置換 轉化作用傣依照實驗例7内所述進行，但具有下列修 (請先聞讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局負工消費合作社印製 訂 可溶性澱粉代之以馬鈐薯澱粉 毎10公克鎩粉添加1.25公克環十六烯酮 所得結果如下： -19 - 本紙張尺度逍用中國國家揉準（CNS ) A4規格（210乂29：7公釐） A7 B7 五、發明説明（18) 表7 : (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 反應時間 澱粉轉化成環糊精之百分率（¾) (分鐘） 未突變之環糊精糖基轉移酶 突變之環湖精糖基轉移酶 α-環糊精 β -環糊精 環糊精 α -環糊精 /3-環糊精 環糊精 1 2.3 18.0 5.4 1.4 10.5 13.7 2 3.2 20. 0 7.2 2.2 13.8 22.2 3 4.4 21. 8 9.5 3.4 15.8 23.7 4 未測得 未測得 未測得 3.5 11.2 25.5 5 5.4 20. g 12.8 3.5 11.5 29.0 6 5.8 21. 1 14.6 未測得 未测得 未測得 7 6.4 20. 6 17.0 4.7 11.0 32.0 驗 例 11 :利 用 依 照 實 驗 例6所 製 未 突變 環 形捍 菌 冷-環 糊 精 糖 基 轉 移 酶及其 衍 生 物實 施 澱粉 轉 化 ,在 該 衍 生 物 中 9 位於位 置 22 9之 酪 胺酸 殘 基 ,像 由 — 絲 胺 酸 殘 基所置 換 反 應像依 照 實 驗 例 7 内所述 進 行 ,下 列 結果 像 經 由20 分鐘保溫所得： 表8 : 經濟部中央標準局貝工消费合作社印製 反應時間 澱粉轉化成琛糊精之百分率00 (分鐘） 未突變之環糊精糖基轉移酶 突變之環瑚精糖基轉移酶 OC-環湖精/3-環糊精 7-環糊精 琛糊精β -環猢精 7 -環糊精 20 4.3 20.1 6.6 1 13 13 -20 - 本纸張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（2!0X297公釐）