TW202140037A - 組合療法 - Google Patents

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Abstract

本發明揭示組合療法，其包含TIM-3抑制劑。該等組合可用於治療癌性病況及病症，包括血液癌。

Description

組合療法
骨髓發育不良症候群(MDS)對應於與骨髓功能減弱、造血無效、骨髓母細胞升高及持續性周邊血液血球減少相關的血液惡性病之異質群體。貧血為MDS之最常見症狀之一，因此大部分MDS患者經歷至少一次紅血球輸注。MDS亦可進展為急性骨髓性白血病(AML)(Heaney及Golde (1999)N. Engl, J. Med. 340(21):1649-60)。儘管進展為AML會引起MDS患者之死亡，但在無白血病轉化之存在下，MDS相關死亡亦可能由血球減少及骨髓衰竭導致。MDS之預後通常使用國際預後評分系統修訂版(IPSS-R)確定，該系統考慮骨髓母細胞之百分比、血球減少之數目及骨髓細胞遺傳學。將MDS未經治療之患者分類為五個IPSS-R預後危險類別：極低、低、中等、高及極高(Greenberg等人 (2012)Blood 108(11):2623)。
慢性骨髓單核球性白血病(CMML)為與骨髓發育不良症候群及骨髓增生性贅瘤具有重疊特徵的純系造血幹細胞病症，其具有固有白血病轉化危險(Patnaik等人 (2018)Am J Hematol 93(6)824-840)。CMML之特徵在於存在持續(＞3個月)周邊血液單核球增多以及骨髓發育不良特徵。基於存在之周邊母細胞及骨髓母細胞之百分比將CMML患者分類為三個不同亞群。CMML-0對應於例如約＜2%之周邊母細胞及約＜5%之骨髓母細胞，CMML-1對應於例如2-4%之周邊母細胞及約5-9%之骨髓母細胞，且CMML-2對應於例如＞5%之周邊母細胞及10-19%之骨髓母細胞。
中危、高危或極高危MDS以及慢性骨髓單核球性白血病2 (CMML-2)患者之預後不良且預期壽命短暫。當前標準照護為使用低甲基化劑、化學療法及/或造血幹細胞移植(HSCT)。HSCT為唯一治癒選項。然而，僅少數MDS或CMML患者為HSCT及強化化學療法之候選者(Steensma (2018)Blood Cancer J 8(5): 47；Platzbecker (2019)Blood 133(10): 1096-1107；Itzykson等人 (2018)HemaSphere 2(6):150)。僅少數僅用阿紮胞苷(azacitidine)治療之患者報導完全緩解，且此藥物之臨床益處常常較為短暫。當治療失敗時，另外治療選項有限。儘管單一藥劑低甲基化劑可供用於治療較高危MDS及CMML-2患者，但仍需要替代性治療策略。
本文至少部分揭示組合，其包含T細胞免疫球蛋白域及黏蛋白域3 (TIM-3)之抑制劑。在一些實施例中，該組合包含以高親和力及特異性結合於TIM-3的抗體分子(例如人類化抗體分子)。在一些實施例中，該組合進一步包含低甲基化劑。亦提供與本文中所描述之該等組合相關的醫藥組合物及劑量調配物。本文中所描述之該等組合可用於治療或預防病症，諸如癌性病症(例如血液癌)。因此，本文揭示使用該等組合治療各種病症的方法，包括劑量方案。
因此，在一個態樣中，本發明之特徵在於一種治療個體之血液癌，例如骨髓發育不良症候群(MDS)的方法，其包含向該個體投與TIM-3抑制劑及低甲基化劑之組合。
在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含抗TIM-3抗體分子。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含抗TIM-3抗體分子。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含MBG453、TSR-022、LY3321367、Sym023、BGB-A425、INCAGN-2390、MBS-986258、RO-7121661、BC-3402、SHR-1702或LY-3415244。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含MBG453。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約800 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約300 mg至約500 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約400 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係在28天週期之第8天投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每兩週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係在28天週期之第8天及第22天投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約30分鐘之時段靜脈內投與。
在一些實施例中，該低甲基化劑包含阿紮胞苷、地西他濱(decitabine)、CC-486或ASTX727。在一些實施例中，該低甲基化劑包含阿紮胞苷。在一些實施例中，該低甲基化劑係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。在一些實施例中，該低甲基化劑係以約75 mg/m2 之劑量投與。在一些實施例中，該低甲基化劑係一天投與一次。在一些實施例中，該低甲基化劑係投與連續5至7天。在一些實施例中，該低甲基化劑係如下投與：(a)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。在一些實施例中，該低甲基化劑係皮下或靜脈內投與。
在一些實施例中，該組合進一步包含CD47抑制劑、CD70抑制劑、NEDD8抑制劑、CDK9抑制劑、FLT3抑制劑、KIT抑制劑或p53活化劑或其任何組合，例如CD47抑制劑、CD70抑制劑、NEDD8抑制劑、CDK9抑制劑、FLT3抑制劑、KIT抑制劑或p53活化劑，全部如本文中所描述。
在一些實施例中，該骨髓發育不良症候群(MDS)為中危MDS、高危MDS或極高危MDS。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種治療個體之慢性骨髓單核球性白血病(CMML)的方法，其包含向該個體投與TIM-3抑制劑及低甲基化劑之組合。
在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含抗TIM-3抗體分子。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含MBG453、TSR-022、LY3321367、Sym023、BGB-A425、INCAGN-2390、MBS-986258、RO-7121661、BC-3402、SHR-1702或LY-3415244。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑包含MBG453。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約800 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約300 mg至約500 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係以約400 mg之劑量投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係在28天週期之第8天投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每兩週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係在28天週期之第8天及第22天投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約30分鐘之時段靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。在一些實施例中，該TIM-3抑制劑係歷經約30分鐘之時段靜脈內投與。
在一些實施例中，該低甲基化劑包含阿紮胞苷、地西他濱、CC-486或ASTX727。在一些實施例中，該低甲基化劑包含阿紮胞苷。在一些實施例中，該低甲基化劑係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。在一些實施例中，該低甲基化劑係以約75 mg/m2 之劑量投與。在一些實施例中，該低甲基化劑係一天投與一次。在一些實施例中，該低甲基化劑係投與連續5至7天。在一些實施例中，該低甲基化劑係如下投與：(a)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。在一些實施例中，該低甲基化劑(例如阿紮胞苷)係皮下或靜脈內投與。
在一些實施例中，該組合進一步包含CD47抑制劑、CD70抑制劑、NEDD8抑制劑、CDK9抑制劑、FLT3抑制劑、KIT抑制劑或p53活化劑或其任何組合，例如CD47抑制劑、CD70抑制劑、NEDD8抑制劑、CDK9抑制劑、FLT3抑制劑、KIT抑制劑或p53活化劑，全部如本文中所描述。
在一些實施例中，該慢性骨髓單核球性白血病(CMML)為CMML-1或CMML-2。在一些實施例中，該CMML為CMML-2。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)。在一些實施例中，MGB453係以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量每四週投與一次，且阿紮胞苷係以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量如下投與：(a)例如在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)例如在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在28天週期之第8天及第9天投與連續兩天。在一些實施例中，MDS為中危MDS、高危MDS或極高危MDS。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。在一些實施例中，MGB453係以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量每四週投與一次，且阿紮胞苷係以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量如下投與：(a)例如在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)例如在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在28天週期之第8天及第9天投與連續兩天。在一些實施例中，MDS為中危MDS、高危MDS或極高危MDS。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之慢性骨髓單核球性白血病(CMML)。在一些實施例中，MGB453係以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量每四週投與一次，且阿紮胞苷係以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量如下投與：(a)例如在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)例如在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在28天週期之第8天及第9天投與連續兩天。在一些實施例中，該CMML為CMML-2。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種治療個體之慢性骨髓單核球性白血病(CMML)的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。在一些實施例中，MGB453係以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量每四週投與一次，且阿紮胞苷係以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量如下投與：(a)例如在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)例如在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在28天週期之第8天及第9天投與連續兩天。在一些實施例中，該CMML為CMML-2。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種降低血液癌細胞之活性(例如生長、存活率或活力或全部)的方法。該方法包括使該細胞與本文中所描述之組合接觸。該方法可例如作為治療方案之一部分對個體進行。該血液癌細胞可為例如來自本文中所描述之血液癌的細胞，該血液癌諸如骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)及慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。
在本文所揭示之方法之某些實施例中，該方法進一步包括測定該個體中之腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)中之TIM-3表現量。在其他實施例中，測定自該個體獲得之樣本(例如液體生物檢體)中之TIM-3表現量(例如使用免疫組織化學)。在某些實施例中，回應於該個體中可偵測水準或升高水準之TIM-3，投與該組合。偵測步驟亦可用於例如監測本文所描述之治療劑之有效性。舉例而言，該偵測步驟可用於監測該組合之有效性。
在另一態樣中，本發明之特徵在於一種組合物(例如一或多種組合物或劑型)，其包括如本文中所描述之TIM-3抑制劑及低甲基化劑。本文中亦描述調配物(例如劑量調配物)及套組(例如治療套組)，其包括TIM-3抑制劑及低甲基化劑。在某些實施例中，該組合物或調配物用於治療血液癌，例如骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)及慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。
本文所描述之方法、組合物、劑量調配物及套組之另外特徵或實施例包括以下中之一或多者。
TIM-3抑制劑  在一些實施例中，本文所描述之該組合包含TIM-3抑制劑，例如抗TIM-3抗體。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自包含表 7 中所示或由表 7 中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈及輕鏈可變區(例如，來自表 7 中揭示之ABTIM3-hum11或ABTIM3-hum03之重鏈及輕鏈可變區序列)的互補決定區(CDR)(或集合地所有CDR)。在一些實施例中，CDR係根據Kabat定義(例如，如表 7 中所闡述)。在一些實施例中，CDR係根據Chothia定義(例如，如表 7 中所闡述)。在一個實施例中，相對於表 7 中所示或由表 7 中所示核苷酸序列編碼的胺基酸序列，一或多個CDR (或集合地所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化，例如胺基酸取代(例如保守胺基酸取代)或缺失。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含重鏈可變區(VH)及輕鏈可變區(VL)，該VH包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 802之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列；該VL包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列，該等序列各自揭示於表 7 中。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含重鏈可變區(VH)及輕鏈可變區(VL)，該VH包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 820之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列；該VL包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列，該等序列各自揭示於表 7 中。
在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 806之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 806具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 816之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 816具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 822之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 822具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 826之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 826具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 806之胺基酸序列的VH及含有SEQ ID NO: 816之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 822之胺基酸序列的VH及含有SEQ ID NO: 826之胺基酸序列的VL。
在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 807具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 817具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 823具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 827具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列編碼的VL。
在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 808之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 808具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 818之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 818具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 824之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 824具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO:828之胺基酸序列或與SEQ ID NO:828具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 808之胺基酸序列的重鏈及含有SEQ ID NO: 818之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 824之胺基酸序列的重鏈及含有SEQ ID NO: 828之胺基酸序列的輕鏈。
在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 809具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 819具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 825具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 829具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列編碼的輕鏈。
在一些實施例中，該抗TIM-3抗體為MBG453，其揭示於WO2015/117002中。MBG453有時在本文中亦稱作薩巴托利單抗(sabatolimab)。
其他例示性 TIM-3 抑制劑 在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為TSR-022 (AnaptysBio/Tesaro)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含TSR-022之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含例如如表 8 所揭示的APE5137或APE5121之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。APE5137、APE5121及其他抗TIM-3抗體揭示於以全文引用之方式併入的WO 2016/161270中。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為抗體純系F38-2E2。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含F38-2E2之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為LY3321367 (Eli Lilly)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含LY3321367之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為Sym023 (Symphogen)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含Sym023之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為BGB-A425 (Beigene)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含BGB-A425之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為INCAGN-2390 (Agenus/Incyte)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含INCAGN-2390之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為MBS-986258 (BMS/Five Prime)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含MBS-986258之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為RO-7121661 (Roche)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含RO-7121661之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為LY-3415244 (Eli Lilly)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含LY-3415244之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
其他已知抗TIM-3抗體包括例如WO 2016/111947、WO 2016/071448、WO 2016/144803、US 8,552,156、US 8,841,418及US 9,163,087中描述之彼等抗體，該等文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體為與本文中所描述之抗TIM-3抗體中之一者競爭結合TIM-3及/或結合於TIM-3上之相同抗原決定基的抗體。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為BC-3402 (Wuxi Zhikanghongyi Biotechnology)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含BC-3402之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為SHR-1702 (Medicine Co Ltd.)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含SHR-1702之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。SHR-1702揭示於例如WO 2020/038355中。
低甲基化劑  在一些實施例中，本文中所描述之該組合包含低甲基化劑。在一些實施例中，該低甲基化劑係與TIM-3抑制劑(例如抗TIM-3抗體分子)組合使用。在一些實施例中，該低甲基化劑係與TIM-3抑制劑(例如抗TIM-3抗體分子)組合使用以治療血液癌。在一些實施例中，該血液癌為骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)及慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。在一些實施例中，該低甲基化劑為阿紮胞苷、地西他濱、CC-486或ASTX727。在一些實施例中，該低甲基化劑為阿紮胞苷。在某些實施例中，該低甲基化劑(例如阿紮胞苷)係與抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)組合使用以治療MDS。在某些實施例中，該低甲基化劑(例如阿紮胞苷)係與抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)組合使用以治療CMML，例如CMML-2。在某些實施例中，至少五個(例如5、6、7、8、9、10或更多個)劑量之低甲基化劑(例如阿紮胞苷)係在給藥週期中於投與第一劑量之抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)之前投與。在某些實施例中，該抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)及該低甲基化劑(例如阿紮胞苷)係在同一天(例如28天週期之第8天)投與。在某些實施例中，該低甲基化劑係在抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)之前投與，例如在投與該抗TIM-3抗體分子(例如MBG453)之前至少30分鐘投與。
治療用途  不希望受理論所束縛，咸信在一些實施例中，本文中所描述之組合可抑制、降低或中和TIM-3或DNA甲基轉移酶之一或多種活性，從而引起例如免疫檢查點抑制、低甲基化或細胞毒性中之一或多者。因此，本文中所描述之組合可用於治療或預防病症(例如癌症)，其中需要增強個體之免疫反應。
因此，在另一態樣中，提供一種調節個體之免疫反應之方法。該方法包含例如根據本文所描述之劑量方案向個體投與治療有效量之本文所描述之組合，使得個體之免疫反應得以調節。在一個實施例中，該組合增強、刺激或提高個體之免疫反應。該個體可為哺乳動物，例如靈長類動物、較佳高等靈長類動物，例如人類(例如患有或處於患本文所描述之病症之風險下的患者)。在一個實施例中，個體需要增強免疫反應。在一個實施例中，個體患有或處於患本文所描述之病症(例如如本文所描述之癌症)之風險中。在某些實施例中，個體患有或處於患免疫功能不全之風險中。舉例而言，個體正經歷或已經歷化學治療性治療及/或放射療法。替代地或組合地，個體患有或處於患因感染所致之免疫功能不全之風險中。在某些實施例中，個體不適於化學療法，例如強化誘導化學療法。
在一個態樣中，提供一種治療個體之癌症(例如減少、抑制或延遲其進展中之一或多者)的方法。該方法包含例如根據本文所描述之劑量方案向個體投與治療有效量之本文所揭示之組合，從而治療個體之癌症。
在某些實施例中，用組合治療之癌症包括但不限於血液癌(例如白血病、淋巴瘤或骨髓瘤)、實體腫瘤及轉移性病灶。在一個實施例中，癌症為血液癌。血液癌之實例包括例如白血病(例如急性骨髓性白血病(AML)或慢性淋巴球性白血病(CLL)、淋巴瘤(例如小淋巴球性淋巴瘤(SLL))及骨髓瘤(例如多發性骨髓瘤(MM))。癌症可處於早期、中期、晚期或為轉移癌。
在某些實施例中，用該組合治療之該血液癌包括但不限於骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)或慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。在某些實施例中，用該組合治療之該癌症為CMML-2。
在某些實施例中，癌症為MSI-高癌症。在一些實施例中，癌症為轉移癌。在其他實施例中，癌症為晚期癌症。在其他實施例中，癌症為復發性或難治性癌症。
在其他實施例中，個體具有或經鑑別具有腫瘤浸潤淋巴球(TIL)中之TIM-3表現。在一個實施例中，癌症微環境具有升高之TIM-3表現量。在一個實施例中，癌症微環境具有升高之PD-L1表現量。替代地或組合地，癌症微環境可具有提高之IFNγ及/或CD8表現。
在一些實施例中，個體患有或經鑑別患有腫瘤，該腫瘤具有以下中之一或多者：高PD-L1水準或表現，或腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)+ (例如TIL數目增加)，或其兩者。在某些實施例中，個體患有或經鑑別患有具有高PD-L1水準或表現及TIL+的腫瘤。在一些實施例中，本文所描述之方法進一步包括基於患有具有以下中之一或多者之腫瘤來鑑別個體：高PD-L1水準或表現，或TIL+，或其兩者。在某些實施例中，本文所描述之方法進一步包括基於患有具有高PD-L1水準或表現及TIL+之腫瘤來鑑別個體。在一些實施例中，TIL+之腫瘤對於CD8及IFNγ呈陽性。在一些實施例中，個體具有或經鑑別具有高百分比的對於PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者呈陽性之細胞。在某些實施例中，個體具有或經鑑別具有高百分比的對於所有PD-L1、CD8及IFNγ均呈陽性之細胞。
在一些實施例中，本文所描述之方法進一步包括基於具有高百分比的對於PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者呈陽性之細胞來鑑別個體。在某些實施例中，本文所描述之方法進一步包括基於具有高百分比的對於所有PD-L1、CD8及IFNγ均呈陽性之細胞來鑑別個體。在一些實施例中，個體具有或經鑑別具有PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者，且患有或經鑑別患有血液癌，例如白血病(例如AML或CLL)、淋巴瘤(例如SLL)及/或骨髓瘤(例如MM)中之一或多者。在某些實施例中，本文所描述之方法進一步描述基於具有PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者以及白血病(例如AML或CLL)、淋巴瘤(例如SLL)及/或骨髓瘤(例如MM)中之一或多者來鑑別個體。
本文所揭示之方法、組合物及調配物適用於治療與前述癌症相關之轉移性病變。
再者，本發明提供一種增強個體對抗原之免疫反應的方法，其包含根據本文所描述之劑量方案向個體投與：(i)抗原；及(ii)如本文所描述之組合，以便增強個體對抗原之免疫反應。抗原可為例如腫瘤抗原、病毒抗原、細菌抗原或來自病原體之抗原。
如本文所描述之組合可全身性地(例如，經口、非經腸、皮下、靜脈內、經直腸、肌肉內、腹膜內、鼻內、經皮，或藉由吸入或腔內安設)、體表或藉由施用於黏膜(諸如鼻、喉及支氣管)向個體投與。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子係以本文所描述之均一劑量靜脈內投與。
免疫調節劑 本文中所描述之組合(例如包含治療有效量之本文所描述之抗TIM-3抗體分子的組合)可進一步與一或多種免疫調節劑組合使用。
在某些實施例中，免疫調節劑為免疫檢查點分子之抑制劑。在一個實施例中，免疫調節劑為PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGF β之抑制劑。在一個實施例中，免疫檢查點分子之抑制劑抑制PD-1、PD-L1、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、CTLA-4或其任何組合。
抑制性分子之抑制可以DNA、RNA或蛋白質水準進行。在實施例中，可使用抑制核酸(例如dsRNA、siRNA或shRNA)抑制抑制性分子之表現。在其他實施例中，抑制性信號之抑制劑為多肽，例如可溶配體(例如PD-1-Ig或CTLA-4 Ig)，或結合於抑制性分子之抗體分子；例如結合於PD-1、PD-L1、PD-L2、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、CTLA-4、LAG-3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGFβ或其組合的抗體分子。
在某些實施例中，組合包含呈雙特異性或多特異性抗體分子形式之抗TIM-3抗體分子。在一個實施例中，雙特異性抗體分子具有針對TIM-3之第一結合特異性，及第二結合特異性，例如針對PD-1、PD-L1、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、LAG-3或PD-L2之第二結合特異性。在一個實施例中，雙特異性抗體分子結合於(i) PD-1或PD-L1及(ii)TIM-3。在另一實施例中，雙特異性抗體分子結合於TIM-3及LAG-3。在另一實施例中，雙特異性抗體分子結合於TIM-3及CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)。在另一實施例中，雙特異性抗體分子結合於TIM-3及CEACAM-1。在再一實施例中，雙特異性抗體分子結合於TIM-3及CEACAM-3。在又一實施例中，雙特異性抗體分子結合於TIM-3及CEACAM-5。
在其他實施例中，組合進一步包含雙特異性或多特異性抗體分子。在另一實施例中，雙特異性抗體分子結合於PD-1或PD-L1。在又一實施例中，雙特異性抗體分子結合於PD-1及PD-L2。在另一實施例中，雙特異性抗體分子結合於CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)及LAG-3。
前述分子之任何組合可產生多特異性抗體分子，例如三特異性抗體，其包括針對TIM-3之第一結合特異性及針對以下中之一或多者之第二及第三結合特異性：PD-1、PD-L1、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、LAG-3或PD-L2。
在某些實施例中，免疫調節劑為PD-1 (例如人類PD-1)之抑制劑。在另一實施例中，免疫調節劑為PD-L1 (例如人類PD-L1)之抑制劑。在一個實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑為針對PD-1或PD-L1之抗體分子(例如如本文所描述之抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)。
PD-1或PD-L1抑制劑與抗TIM-3抗體分子之組合可進一步包括一或多種另外免疫調節劑，例如與LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)或CTLA-4之抑制劑組合。在一個實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-1或PD-L1抗體分子)係與抗TIM-3抗體分子及LAG-3抑制劑(例如抗LAG-3抗體分子)組合投與。在另一實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-1或PD-L1抗體分子)係與抗TIM-3抗體分子及CEACAM抑制劑(例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5抑制劑)(例如抗CEACAM抗體分子)組合投與。在另一實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-1或PD-L1抗體分子)係與抗TIM-3抗體分子及CEACAM-1抑制劑(例如抗CEACAM-1抗體分子)組合投與。在另一實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-1或PD-L1抗體分子)係與抗TIM-3抗體分子及CEACAM-5抑制劑(例如抗CEACAM-5抗體分子)組合投與。在其他實施例中，PD-1或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-1或PD-L1抗體分子)係與抗TIM-3抗體分子、LAG-3抑制劑(例如抗LAG-3抗體分子)及TIM-3抑制劑(例如抗TIM-3抗體分子)組合投與。免疫調節劑與抗TIM-3抗體分子及PD-1抑制劑(例如PD-L2、CTLA-4、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGF β中之一或多者)之其他組合亦屬於本發明。此項技術中已知或本文所揭示之任何抗體分子皆可用於檢查點分子之抑制劑之前述組合中。
在其他實施例中，免疫調節劑為CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)(例如人類CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5))之抑制劑。在一個實施例中，免疫調節劑為CEACAM-1 (例如人類CEACAM-1)之抑制劑。在另一實施例中，免疫調節劑為CEACAM-3 (例如人類CEACAM-3)之抑制劑。在另一實施例中，免疫調節劑為CEACAM-5 (例如人類CEACAM-5)之抑制劑。在一個實施例中，CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)之抑制劑為針對CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)之抗體分子。CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)抑制劑及抗TIM-3抗體分子之組合可進一步包括一或多種另外免疫調節劑，例如與LAG-3、PD-1、PD-L1或CTLA-4之抑制劑組合。
在其他實施例中，免疫調節劑為LAG-3 (例如人類LAG-3)之抑制劑。在一個實施例中，LAG-3之抑制劑為針對LAG-3之抗體分子。LAG-3抑制劑及抗TIM-3抗體分子之組合可進一步包括一或多種另外免疫調節劑，例如與CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、PD-1、PD-L1或CTLA-4之抑制劑組合。
在某些實施例中，本文中所揭示之組合(例如與選自抗原呈遞組合之治療劑組合)中使用之免疫調節劑為共刺激分子之活化劑或促效劑。在一個實施例中，共刺激分子之促效劑係選自以下之促效劑(例如促效抗體或其抗原結合片段，或可溶融合物)：OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體。
在其他實施例中，免疫調節劑為GITR促效劑。在一個實施例中，GITR促效劑為針對GITR之抗體分子。抗GITR抗體分子及抗TIM-3抗體分子可呈單獨抗體組合物形式或呈雙特異性抗體分子形式。GITR促效劑與抗TIM-3抗體分子之組合可進一步包括一或多種另外免疫調節劑，例如與PD-1、PD-L1、CTLA-4、CEACAM  (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)或LAG-3之抑制劑組合。在一些實施例中，抗GITR抗體分子為雙特異性抗體，其結合於GITR及PD-1、PD-L1、CTLA-4、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)或LAG-3。在其他實施例中，GITR促效劑可與共刺激分子之一或多種另外活化劑組合投與，該等活化劑例如為OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體之促效劑。
在其他實施例中，免疫調節劑為OX40促效劑。在一個實施例中，OX40促效劑為針對OX40之抗體分子。OX40抗體分子及抗TIM-3抗體分子可呈單獨抗體組合物形式，或呈雙特異性抗體分子形式。OX40促效劑與抗TIM-3抗體分子之組合可進一步包括一或多種另外免疫調節劑，例如與PD-1、PD-L1、CTLA-4、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)或LAG-3之抑制劑組合。在一些實施例中，抗OX40抗體分子為雙特異性抗體，其結合於OX40及PD-1、PD-L1、CTLA-4、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)或LAG-3。在其他實施例中，OX40促效劑可與其他共刺激分子(例如GITR、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體之促效劑)組合投與。
應注意，本文中僅提供檢查點分子之抑制劑或共刺激分子之促效劑的例示性組合。此等藥劑之另外組合屬於本發明之範疇內。
生物標記物 在某些實施例中，本文所揭示之方法中之任一者進一步包括評估或監測本文所描述之療法(例如組合療法)在個體，例如患有癌症(例如本文所描述之癌症)之個體中的有效性。該方法包括獲取對於療法具有效性之值，其中該值指示療法之有效性。
在實施例中，對於療法具有效性之值包含以下中之一者、兩者、三者、四者、五者、六者、七者、八者、九者或更多者(例如全部)之量度： (i)     腫瘤浸潤性淋巴球(TIL)表型之參數； (ii)    骨髓細胞群體之參數； (iii)   表面表現標記物之參數； (iv)   免疫反應之生物標記物之參數； (v)    系統性細胞介素調節之參數； (vi)   循環游離DNA (cfDNA)之參數； (vii)  系統性免疫調節之參數； (viii) 微生物群落之參數； (ix)   循環免疫細胞之活化之標記物的參數； (x)    循環細胞介素之參數；或 (xi)   微小殘存疾病(MRD)之參數。
在一些實施例中，TIL表型之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如腫瘤樣本)中之TIL計數之蘇木精及伊紅(H&E)染色、CD8、FOXP3、CD4或CD3中的一者、兩者、三者、四者或更多者(例如全部)之水準或活性。
在一些實施例中，骨髓細胞群體之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如腫瘤樣本)中之CD68或CD163中的一或兩者之水準或活性。
在一些實施例中，表面表現標記物之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如腫瘤樣本)中之TIM-3、PD-1、PD-L1或LAG-3中的一者、兩者、三者或更多者(例如全部)之水準或活性。在某些實施例中，TIM-3、PD-1、PD-L1或LAG-3之水準係藉由免疫組織化學(IHC)測定。在某些實施例中，測定TIM-3之水準。
在一些實施例中，免疫反應之生物標記物之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如腫瘤樣本)中之一或多種基於核酸之標記物的水準或序列。
在一些實施例中，系統性細胞介素調節之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如血液樣本，例如血漿樣本)中之IL-18、IFN-γ、ITAC (CXCL11)、IL-6、IL-10、IL-4、IL-17、IL-15或TGF-β中的一者、兩者、三者、四者、五者、六者、七者、八者或更多者(例如全部)之水準或活性。
在一些實施例中，cfDNA之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如血液樣本，例如血漿樣本)中之一或多種循環腫瘤DNA (cfDNA)分子之序列或水準。
在一些實施例中，系統性免疫調節之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如血液樣本，例如PBMC樣本)中之活化免疫細胞(例如CD3表現細胞、CD8表現細胞或兩者)之表型表徵。
在一些實施例中，微生物群落之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如大便樣本)中之微生物群落中的一或多種基因之序列或表現量。
在一些實施例中，循環免疫細胞之活化之標記物的參數包含樣本(例如血液樣本，例如血漿樣本)中之循環CD8+、HLA-DR+Ki67+、T細胞、IFN-γ、IL-18或CXCL11 (IFN-γ誘導之CCK)表現細胞中的一者、兩者、三者、四者、五者或更多者(例如全部)之水準或活性。
在一些實施例中，循環細胞介素之參數包含個體中，例如來自個體之樣本(例如血液樣本，例如血漿樣本)中之IL-6之水準或活性。
在一些實施例中，該微小殘存疾病之參數包含該個體中，例如來自該個體之樣本(例如骨髓樣本或血液樣本，例如血漿樣本)中之可溶性生物標記物，例如可溶性TIM-3及/或MDS相關基因，例如DNMT3、ASXL1、TET2、RUNX1、TP53或其任何組合之量測。在一些實施例中，該微小殘存疾病(MRD)參數係使用細胞(例如多參數流動式細胞測量術(MFC))及/或分子(例如下一代定序(NGS))方法來量測(參見Jongen-Lavrencic M、Grob T、Hanekamp D等人  (2018)Molecular Minimal Residual Disease in Acute Myeloid Leukemia . N Engl J Med; 378(13): 1189-99)。
在本文所揭示之任一方法之一些實施例中，該療法包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子與免疫檢查點分子之第二抑制劑，例如PD-1之抑制劑(例如抗PD-1抗體分子)或PD-L1之抑制劑(例如抗PD-L1抗體分子)之組合。
在本文所揭示之任一方法之一些實施例中，(i)至(xi)自中之一或多者之量測係自獲自個體之樣本獲得。在一些實施例中，樣本係選自腫瘤樣本、血液樣本(例如血漿樣本或PBMC樣本)或大便樣本。
在本文所揭示之任一方法之一些實施例中，在接受療法之前、期間或之後評估個體。
在本文所揭示之任一方法之一些實施例中，(i)-(xi)中之一或多者之量測評估基因表現、流動式細胞測量術或蛋白質表現中之一或多者的概況。
在本文所揭示之任一方法之一些實施例中，個體或樣本中水準或活性提高之循環CD8+、HLA-DR+Ki67+、T細胞、IFN-γ、IL-18或CXCL11 (IFN-γ誘導之CCK)表現細胞之一者、兩者、三者、四者、五者或更多者(例如全部)之存在及/或水準或活性降低之IL-6之存在為療法之有效性之積極預測因子。
替代地或與本文所揭示之方法組合，回應於該值，進行以下中之一者、兩者、三者、四者或更多者(例如全部)： (i)     向個體投與療法； (ii)    投與改變劑量之療法； (iii)   改變療法之時程(schedule或time course)； (iv)   向個體投與另外藥劑(例如本文所描述之治療劑)與療法之組合；或 (v)    向個體投與替代性療法。
另外實施例 在某些實施例中，本文所揭示之方法中之任一者進一步包括鑑別個體或樣本(例如包含癌細胞及/或免疫細胞，諸如TIL之個體之樣本)中TIM-3之存在，從而提供TIM-3之值。該方法可進一步包括比較TIM-3值與參考值，例如對照值。若TIM-3值大於參考值，例如對照值，則向個體投與治療有效量之本文所描述之組合且視情況與第二治療劑(例如低甲基化劑，例如阿紮胞苷)或本文所描述之程序或模式組合投與，從而治療癌症，該組合包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子。
在其他實施例中，本文所揭示之方法中之任一者進一步包括鑑別個體或樣本(例如包含癌細胞及/或免疫細胞，諸如TIL之個體之樣本)中PD-L1之存在，從而提供PD-L1之值。方法可進一步包括比較PD-L1值與參考值，例如對照值。若PD-L1值大於參考值，例如對照值，則向個體投與治療有效量之本文所描述之抗TIM-3抗體分子，且視情況與本文所描述之第二治療劑、程序或模式組合投與，從而治療癌症。
在其他實施例中，本文所揭示之方法中之任一者進一步包括鑑別個體或樣本(例如包含癌細胞及視情況存在之免疫細胞，諸如TIL之個體之樣本)中PD-L1、CD8或IFN-γ中之一者、兩者或全部之存在，從而提供PD-L1、CD8及IFN-γ中之一者、兩者或全部的值。方法可進一步包括比較PD-L1、CD8及/或IFN-γ值與參考值，例如對照值。若PD-L1、CD8及/或IFN-γ值大於參考值，例如對照值，則向個體投與治療有效量之本文所描述之抗TIM-3抗體分子，且視情況與本文所描述之第二治療劑、程序或模式組合投與，從而治療癌症。
該個體可患有本文中所描述之癌症，諸如血液癌或實體腫瘤，例如白血病(例如急性骨髓性白血病(AML)，例如復發性或難治性AML或新生AML)、淋巴瘤、骨髓瘤、卵巢癌、肺癌(例如小細胞肺癌(SCLC)或非小細胞肺癌(NSCLC))、間皮瘤、皮膚癌(例如梅克爾細胞癌(Merkel cell carcinoma；MCC)或黑素瘤)、腎癌(例如腎細胞癌)、膀胱癌、軟組織肉瘤(例如血管外皮瘤(HPC))、骨癌(例如骨肉瘤)、大腸直腸癌、胰臟癌、鼻咽癌、乳癌、十二指腸癌、子宮內膜癌、腺癌(未知腺癌)、肝癌(例如肝細胞癌)、膽管癌、肉瘤。該個體可患有骨髓發育不良症候群(MDS)，例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS。該個體可患有慢性骨髓單核球性白血病(CMML)，例如CMML-1或CMML-2。
在某些實施例中，本文所揭示之組合使得個體中之最小殘存疾病(MRD)之水準低於1%、0.5%、0.2%、0.1%、0.05%、0.02%或0.01%。在其他實施例中，本文所揭示之組合使得個體中之MRD水準相較於參考MRD水準低至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、50、100、200、500或1000倍，該參考MRD水準例如為接受該組合之前該個體中之MRD水準。在其他實施例中，在接受該組合之後，本文所描述之個體具有或經鑑別具有低於1%、0.5%、0.2%、0.1%、0.05%、0.02%或0.01%之MRD水準。在其他實施例中，本文所揭示之個體具有或經鑑別具有相較於參考MRD水準低至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、50或100、200、500或1000倍之MRD水準，該參考MRD水準例如為接受該組合之前的該MRD水準。在其他實施例中，本文所揭示之方法中之任一者進一步包含測定來自個體之樣本中之MRD水準。在其他實施例中，本文所揭示之組合進一步包含測定個體之緩解持續時間。
本文所提及之所有公開案、專利申請案、專利及其他參考文獻均以全文引用之方式併入本文中。
本發明之其他特徵、目標及優勢將自實施方式及圖式以及自申請專利範圍顯而易知。
相關申請案之交叉引用  本申請案主張2020年1月17日申請之美國臨時申請案第62/962,653號、2020年8月4日申請之美國臨時申請案第63/061,001號及2020年12月15日申請之美國臨時申請案第63/125,691號的權益。前述申請案之內容以全文引用之方式併入本文中。
序列表  本申請案含有序列表，該序列表已以ASCII格式以電子方式提交且其以全文引用之方式併入本文中。2021年1月11日創建之該ASCII複本命名為C2160-7026WO_SL.txt且大小為59,558個位元組。
T細胞免疫球蛋白及黏蛋白域分子3(TIM-3；亦稱為A型肝炎病毒細胞受體2)為T細胞之負調節劑。TIM-3最初經描述為表現於分泌干擾素-γ (IFN-γ)之活化T輔助細胞(Th) 1 CD4+及細胞毒性CD8+ T細胞上之抑制性蛋白(Monney等人Nature . 2002; 415(6871):536-541；Sánchez Fueyo等人Nat Immunol. 2003; 4(11):1093-101)。TIM-3在FoxP3+ Treg上增濃，且組成性表現於DC、單核球/巨噬細胞及NK細胞上(Anderson等人Science. 2007; 318(5853):1141-1143；Ndhlovu等人Blood . 2012; 119(16): 3734-3743)。患有骨髓發育不良症候群(MDS)之患者過度表現TIM-3，其藉由細胞毒性T細胞抑制免疫識別(Kikushige等人Cell Stem Cell. 2010; 7(6): 708-717)，且MDS母細胞上之TIM-3表現量隨著MDS進展至晚期而增加。已觀測到，TIM-3及MDS母細胞之增殖藉由使用抗TIM-3抗體阻斷TIM-3而得以抑制(Asayama等人Oncotarget 2017; 8(51):88904-17)。已報導TIM-3阻斷之另外臨床前及臨床抗癌活性(Kikushige等人Cell Stem Cell . 2010; 7(6): 708-717；Sakuishi等人J Exp Med. 2010; 207(10): 2187-2194；Ngiow等人Cancer Res. 2011; 71(21): 6567-6571；Sakuishi等人Trends Immunol. 2011; 32(8): 345-349；Jing等人J Immunother Cancer . 2015; 3(1):2；Asayama等人Oncotarget . 2017; 8(51): 88904-88917)。實際上，巨噬細胞及抗原交叉呈遞樹突狀細胞上TIM-3之阻斷增強活化及發炎性細胞介素/趨化介素產生(Zhang 2011；Zhang等人 (2012)J. Leukoc Biol 91(2):189-96；Chiba等人 (2012)Nat Immunol . 13(9):832-42；de Mingo Pulido等人 (2018)Cancer Cell 33(1):60-74)，最終引起增強之效應T細胞反應。
本文中所描述之組合包括TIM-3抑制劑且可用以治療癌症，例如血液癌。組合低甲基化劑與另外藥劑可改良其臨床功效且克服耐藥性。臨床前資料表明，低甲基化劑增強檢查點表現且可藉由使用檢查點抑制劑及低甲基化劑產生協同反應。低甲基化劑誘導MDS患者中檢查點分子(例如TIM-3、PD-1、PD-L1、PD-L2及CTLA4)之表現增加，潛在地下調免疫介導之抗白血病作用(Yang等人, (2014)Leukemia , 28(6):1280-8；Ørskov等人 (2015)Oncotarget , 6(11): 9612-9626)。另外，已顯示TIM-3啟動子之去甲基化對於TIM-3在T細胞上之穩定表現十分重要，表明藉由低甲基化劑(例如阿紮胞苷或地西他濱)調節TIM-3之表現可具有重要免疫調節意義(Chou等人 (2016)Genes Immun 17(3): 179-86)。不希望受理論所束縛，咸信在一些實施例中，本文中所描述之組合(例如包含本文中所描述之抗TIM-3抗體分子之組合)可用於減少免疫抑制腫瘤微環境。
不希望受理論所束縛，咸信在一些實施例中，包含TIM-3抑制劑及低甲基化劑之組合可安全地投與，且TIM-3抑制劑可改良低甲基化劑之功效及/或改良反應之持久性。
因此，本文至少部分揭示可用以治療或預防病症(諸如癌腫病症)的組合療法。在某些實施例中，組合包含TIM-3抑制劑及低甲基化劑。在一些實施例中，TIM-3抑制劑包含以高親和力及特異性結合於TIM-3的抗體分子(例如人類化抗體分子)。本文中所描述之組合可根據本文中所描述之劑量方案使用。亦提供與本文中所描述之該等組合相關的醫藥組合物及劑量調配物。
定義  另外術語在下文及通篇申請案中進行定義。
如本文所用，冠詞「一(a/an)」係指該冠詞之一個或多於一個(例如至少一個)語法對象。
術語「或」在本文中用於意謂術語「及/或」且可與術語「及/或」互換使用，除非上下文另有明確說明。
「約」及「大約」一般應意謂鑒於量測之性質或精確度，所量測之量之可接受誤差程度。例示性誤差程度在既定值或值範圍之20個百分比(%)以內，通常在10%以內，且更通常在5%以內。
「組合」或「與…組合」不意欲暗示療法或治療劑必須同時投與及/或經調配以一起遞送，但此等遞送方法屬於本文中所描述之範疇內。組合中之治療劑可與一或多種其他另外療法或治療劑同時投與，在其之前投與或在其之後投與。治療劑或治療方案可以任何次序投與。一般而言，各藥劑將以針對彼藥劑所確定的劑量及/或時程來投與。應進一步瞭解，此組合中所用之另外治療劑可在單一組合物中一起投與或在不同組合物中分開投與。一般而言，預期組合中所用之另外治療劑的用量不超過其個別使用時的量。在一些實施例中，組合中之用量將低於個別使用量。
在實施例中，另外治療劑以治療性或低於治療性劑量之量投與。在某些實施例中，當第二治療劑與第一治療劑(例如抗TIM-3抗體分子)組合投與時，實現抑制(例如生長抑制)所需之第二治療劑之濃度低於第二治療劑個別投與時之濃度。在某些實施例中，當第一治療劑與第二治療劑組合投與時，實現抑制(例如生長抑制)所需之第一治療劑之濃度低於第一治療劑個別投與時之濃度。在某些實施例中，在組合療法中，實現抑制(例如生長抑制)所需之第二治療劑之濃度低於作為單一療法之第二治療劑之治療性劑量，例如低10-20%、20-30%、30-40%、40-50%、50-60%、60-70%、70-80%或80-90%。在某些實施例中，在組合療法中，實現抑制(例如生長抑制)所需之第一治療劑之濃度低於作為單一療法之第一治療劑之治療性劑量，例如低10-20%、20-30%、30-40%、40-50%、50-60%、60-70%、70-80%或80-90%。
術語「抑制」、「抑制劑」或「拮抗劑」包括某一參數(例如既定分子，例如免疫檢查點抑制劑之活性)之降低。舉例而言，此術語包括將活性(例如TIM-3活性)抑制至少5%、10%、20%、30%、40%或更多。因此，抑制不必為100%。
術語「活化」、「活化劑」或「促效劑」包括某一參數(例如既定分子，例如共刺激分子之活性)之提高。舉例而言，此術語包括活性(例如共刺激活性)提高至少5%、10%、25%、50%、75%或更多。
術語「抗癌效應」係指可藉由各種手段體現之生物效應，包括但不限於例如腫瘤體積之減小、癌細胞數目之減少、癌轉移數目之減少、預期壽命之增加、癌細胞增殖之減少、癌細胞存活率之降低或與癌性病況相關的各種生理症狀之改善。「抗癌效應」亦可藉由肽、聚核苷酸、細胞及抗體首先預防癌症出現之能力體現。
術語「抗腫瘤效應」係指可藉由多種手段體現之生物效應，包括但不限於例如腫瘤體積之減小、腫瘤細胞數目之減少、腫瘤細胞增殖之減少或腫瘤細胞存活率之降低。
術語「癌症」係指以異常細胞之生長快速且不受控制為特徵的疾病。癌細胞可局部擴散或經由血流及淋巴系統擴散至身體的其他部位。各種癌症之實例描述於本文中且包括但不限於實體腫瘤，例如肺癌、乳癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、皮膚癌、胰臟癌、大腸直腸癌、腎癌、肝癌及腦癌，以及血液科惡性病，例如淋巴瘤及白血病，及其類似者。術語「腫瘤」與「癌症」在本文中可互換使用，例如兩個術語涵蓋實體及液體，例如彌漫性或循環腫瘤。如本文所用，術語「癌症」或「腫瘤」包括惡化前以及惡性癌症及腫瘤。
術語「抗原呈遞細胞」或「APC」係指在其表面上呈現與主要組織相容複合體(MHC's)複合之外來抗原的免疫系統細胞，諸如輔助細胞(例如B細胞、樹突狀細胞及其類似物)。T細胞可使用其T細胞受體(TCR)識別此等複合體。APC處理抗原且將其呈遞給T細胞。
術語「共刺激分子」係指T細胞上之同源結合搭配物，其與共刺激配體特異性結合，進而藉由T細胞介導共刺激反應，諸如但不限於增殖。共刺激分子為除抗原受體或其配體以外的細胞表面分子，其為有效免疫反應所需。共刺激分子包括但不限於MHC I類分子、TNF受體蛋白、免疫球蛋白樣蛋白、細胞介素受體、整合素、信號傳導淋巴球性活化分子(SLAM蛋白)、活化NK細胞受體、BTLA、鐸配體受體、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、4-1BB (CD137)、B7-H3、CDS、ICAM-1、ICOS (CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM (LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80 (KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8α、CD8β、IL2Rβ、IL2R γ、IL7R α、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1 (CD226)、SLAMF4 (CD244、2B4)、CD84、CD96 (Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9 (CD229)、CD160 (BY55)、PSGL1、CD100 (SEMA4D)、CD69、SLAMF6 (NTB-A、Ly108)、SLAM (SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME (SLAMF8)、SELPLG (CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD19a及特異性結合CD83之配體。
當在本文中使用術語「免疫效應細胞」或「效應細胞」時，其係指參與免疫反應，例如促進免疫效應反應之細胞。免疫效應細胞之實例包括T細胞，例如α/β T細胞及γ/δ T細胞、B細胞、自然殺手(NK)細胞、自然殺手T (NKT)細胞、肥大細胞及骨髓衍生吞噬細胞。
當在本文中使用術語「免疫效應子」或「效應子」、「功能」或「反應」時，其係指例如免疫效應細胞之增強或促進目標細胞之免疫侵襲的功能或反應。例如，免疫效應功能或反應係指T或NK細胞促進目標細胞之殺傷或生長或增殖之抑制的特性。在T細胞之情況下，主要刺激及共刺激為免疫效應功能或反應之實例。
術語「效應功能」係指細胞之特別功能。T細胞之效應功能例如可為溶胞活性或輔助活性，包括分泌細胞介素。
如本文所用，術語「治療(treat/treatment/treating)」係指由投與一或多種療法促使減輕或改善病症(例如增生性病症)之進展、嚴重度及/或持續時間，或改善病症之一或多個症狀(較佳一或多個可辨別症狀)。在特定實施例中，術語「治療」係指改善增生性病症之患者未必可辨別之至少一種可量測物理參數，諸如腫瘤生長。在其他實施例中，術語「治療」係指以物理方式藉由例如穩定可辨別症狀、以生理學方式藉由例如穩定物理參數或此兩者來抑制增生性病症之進展。在其他實施例中，術語「治療」係指減小或穩定腫瘤大小或癌細胞計數。
本發明之組合物、調配物及方法涵蓋具有指定序列或與該序列實質上一致或相似之序列，例如與指定序列具有至少85%、90%、95%一致性或更高一致性之序列的多肽及核酸。在胺基酸序列之上下文中，術語「實質上一致」在本文中用於指代第一胺基酸含有足夠或最小數目之如下胺基酸殘基：i)與第二胺基酸序列中之所比對胺基酸殘基一致或ii)為第二胺基酸序列中之所比對胺基酸殘基之保守取代，使得第一及第二胺基酸序列可具有共同結構域及/或共同功能活性。舉例而言，含有與參考序列，例如本文所提供之序列具有至少約85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的共同結構域的胺基酸序列。
在核苷酸序列之上下文中，本文所用之術語「實質上一致」係指第一核酸序列含有足夠或最小數目之核苷酸與第二核酸序列中之比對核苷酸一致，使得第一及第二核苷酸序列編碼具有共同功能活性之多肽或編碼共同結構多肽域或共同功能多肽活性。舉例而言，與參考序列，例如本文所提供之序列具有至少約85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性的核苷酸序列。
術語「功能變異體」係指具有與天然存在之序列實質上一致之胺基酸序列，或由實質上一致之核苷酸序列編碼，且可具有天然存在之序列之一或多種活性的多肽。
如下進行序列之間的同源性或序列一致性之計算(該等術語在本文中可互換使用)。
為了測定兩個胺基酸序列或兩個核酸序列之一致性百分比，出於最佳比較目的而比對序列(例如可將間隙引入第一及第二胺基酸或核酸序列中之一或兩者中以用於最佳比對且出於比較目的，可忽略非同源序列)。在較佳實施例中，出於比較目的而比對之參考序列之長度為參考序列之長度的至少30%、較佳至少40%、更佳至少50%、60%且更佳至少70%、80%、90%、100%。隨後比較對應胺基酸位置或核苷酸位置處之胺基酸殘基或核苷酸。當第一序列中之位置由與第二序列中對應位置相同之胺基酸殘基或核苷酸佔據時，則分子在此位置上一致(如本文中所用，胺基酸或核酸「一致性」等效於胺基酸或核酸「同源性」)。
在考慮到為了兩個序列之最佳比對需要引入的間隙之數目及各間隙之長度的情況下，兩個序列之間的一致性百分比與由該等序列共用之一致位置之數目有關。
可使用數學演算法實現序列比較及兩個序列之間的一致性百分比之測定。在較佳實施例中，兩個胺基酸序列之間的一致性百分比係使用Needleman及Wunsch ((1970)J. Mol. Biol. 48:444-453)演算法(其已併入GCG套裝軟體(可在gcg.com獲得)中之GAP程式中)，使用Blossum 62矩陣或PAM250矩陣以及間隙權數16、14、12、10、8、6或4及長度權數1、2、3、4、5或6來測定。在另一較佳實施例中，兩個核苷酸序列之間的一致性百分比係使用GCG套裝軟體(可在gcg.com獲得)中之GAP程式，使用NWSgapdna.CMP矩陣以及間隙權數40、50、60、70或80及長度權數1、2、3、4、5或6來測定。一種尤佳參數集(及應使用者，除非另有說明)為Blossum 62計分矩陣，其使用間隙罰分12、間隙擴展罰分4及讀框轉移間隙罰分5。
可使用E. Meyers及W. Miller ((1989)CABIOS , 4:11-17)之演算法(其已併入ALIGN程式(2.0版)中)，使用PAM120權數殘基表、間隙長度罰分12及間隙罰分4來測定兩個胺基酸或核苷酸序列之間的一致性百分比。
本文所描述之核酸及蛋白質序列可用作「查詢序列」以對照公用資料庫進行搜尋，例如以鑑別其他家族成員或相關序列。此類搜尋可使用Altschul等人(1990)J. Mol. Biol . 215:403-10之NBLAST及XBLAST程式(2.0版)進行。BLAST核苷酸搜尋可用NBLAST程式(評分=100，字長=12)進行，以獲得與本發明之核酸分子同源的核苷酸序列。BLAST蛋白質搜尋可用XBLAST程式(評分=50，字長=3)進行，以獲得與本發明之蛋白分子同源的胺基酸序列。為了使間隙式比對達成比較目的，可如Altschul等人, (1997)Nucleic Acids Res . 25:3389-3402中所描述使用間隙式BLAST。當利用BLAST及間隙式BLAST程式時，可使用各別程式(例如XBLAST及NBLAST)之預設參數。參見ncbi.nlm.nih.gov。
如本文所用，術語「在低嚴格度、中嚴格度、高嚴格度或極高嚴格度條件下雜交」描述雜交及洗滌條件。用於進行雜交反應之指南可見於Current Protocols in Molecular Biology , John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6中，其以引用之方式併入。該參考文獻中描述水性及非水性方法且可使用任一者。本文所提及的特定雜交條件如下：1)低嚴格度雜交條件為在約45℃使用6×氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)，隨後至少在50℃ (對於低嚴格度條件而言，洗滌溫度可升高至55℃)用0.2× SSC、0.1% SDS洗滌兩次；2)中嚴格度雜交條件為在約45℃使用6× SSC，隨後在60℃用0.2× SSC、0.1% SDS洗滌一或多次；3)高嚴格度雜交條件為在約45℃使用6× SSC，隨後在65℃用0.2× SSC、0.1% SDS洗滌一或多次；及較佳地，4)極高嚴格度雜交條件為在65℃使用0.5 M磷酸鈉、7% SDS，隨後在65℃、使用0.2× SSC、1% SDS洗滌一或多次。極高嚴格度條件(4)為較佳條件及應使用的條件，除非另有說明。
應理解，本發明之分子可具有另外保守性或非必需胺基酸取代，該等取代對於其功能不具有實質作用。
術語「胺基酸」意欲涵蓋所有分子，無論天然或合成的，其包括胺基官能基及酸官能基兩者且能夠包括於天然存在之胺基酸之聚合物中。例示性胺基酸包括天然存在之胺基酸；其類似物、衍生物及同類物；具有變異側鏈之胺基酸類似物；及前述中之任一者之所有立體異構體。如本文所用，術語「胺基酸」包括D-光學異構體或L-光學異構體及肽模擬物。
「保守性胺基酸取代」為其中胺基酸殘基經具有類似側鏈之胺基酸殘基置換的取代。此項技術中已定義具有類似側鏈之胺基酸殘基的家族。此等家族包括具有鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電極性側鏈(例如甘胺酸、天冬醯胺、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β分支鏈側鏈(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳族側鏈(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)之胺基酸。
術語「多肽」、「肽」及「蛋白質」(若為單鏈)在本文中可互換使用以指代任何長度之胺基酸之聚合物。聚合物可為直鏈或分支鏈，其可包含經修飾之胺基酸，且其可間雜有非胺基酸。該等術語亦涵蓋已經修飾之胺基酸聚合物；舉例而言，二硫鍵形成、糖基化、脂質化、乙醯化、磷酸化或任何其他操縱，諸如與標記組分結合。多肽可自天然來源中分離，可藉由重組技術、自真核或原核宿主產生，或可為合成程序之產物。
術語「核酸」、「核酸序列」、「核苷酸序列」或「聚核苷酸序列」及「聚核苷酸」可互換使用。其係指任何長度之核苷酸(去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)之聚合物形式，或其類似物。聚核苷酸可為單股或雙股的，且若為單股，則可為編碼股或非編碼(反義)股。聚核苷酸可包含經修飾之核苷酸，諸如甲基化核苷酸及核苷酸類似物。核苷酸之序列可間雜有非核苷酸組分。可在聚合之後諸如藉由與標記組分結合而進一步修飾聚核苷酸。核酸可為重組聚核苷酸，或基因組、cDNA、半合成或合成來源之聚核苷酸，其不存在於自然界中或以非天然排列連接至另一聚核苷酸。
如本文所用，術語「經分離」係指自原始或原生環境(例如，若其為天然存在的，則為天然環境)移除物質。舉例而言，存在於活動物中之天然存在之聚核苷酸或多肽未經分離，但藉由人工干預而與天然系統中之一些或所有共存物質分離的相同聚核苷酸或多肽經分離。此類聚核苷酸可為載體之一部分且/或此類聚核苷酸或多肽可為組合物之一部分，且仍經分離以使得此載體或組合物不為自然界中發現其之環境之一部分。
在下文中更詳細地描述本發明之各種態樣。貫穿說明書闡述另外定義。
TIM-3抑制劑  在某些實施例中，本文所描述之組合包括TIM-3抑制劑，例如抗TIM-3抗體分子。在一些實施例中，抗TIM-3抗體分子結合於哺乳動物TIM-3，例如人類TIM-3。舉例而言，抗體分子特異性結合於TIM-3上之抗原決定基，例如線形或構形抗原決定基。
如本文所用，術語「抗體分子」係指包含至少一個免疫球蛋白可變域序列之蛋白質，例如免疫球蛋白鏈或其片段。術語「抗體分子」包括例如單株抗體(包括具有免疫球蛋白Fc區之全長抗體)。在一實施例中，抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈。在一實施例中，抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈之抗原結合片段或功能片段。在一實施例中，抗體分子為多特異性抗體分子，例如其包含複數個免疫球蛋白可變域序列，其中該複數個序列中之第一免疫球蛋白可變域序列對第一抗原決定基具有結合特異性且該複數個序列中之第二免疫球蛋白可變域序列對第二抗原決定基具有結合特異性。在一實施例中，多特異性抗體分子為雙特異性抗體分子。
在一實施例中，抗體分子為單特異性抗體分子且結合單一抗原決定基。舉例而言，單特異性抗體分子可具有複數個免疫球蛋白可變域序列，其中之每一者結合同一抗原決定基。
在一實施例中，抗體分子為多特異性抗體分子，例如其包含複數個免疫球蛋白可變域序列，其中該複數個序列中之第一免疫球蛋白可變域序列對第一抗原決定基具有結合特異性且該複數個序列中之第二免疫球蛋白可變域序列對第二抗原決定基具有結合特異性。在一實施例中，第一及第二抗原決定基位於同一抗原上，例如同一蛋白質(或多聚體蛋白之亞單元)上。在一實施例中，第一及第二抗原決定基重疊。在一實施例中，第一及第二抗原決定基不重疊。在一實施例中，第一及第二抗原決定基位於不同抗原上，例如不同蛋白質(或多聚體蛋白之不同亞單元)上。在一實施例中，多特異性抗體分子包含第三、第四或第五免疫球蛋白可變域。在一實施例中，多特異性抗體分子為雙特異性抗體分子、三特異性抗體分子或四特異性抗體分子。
在一實施例中，多特異性抗體分子為雙特異性抗體分子。雙特異性抗體對不超過兩個抗原具有特異性。雙特異性抗體分子之特徵為第一免疫球蛋白可變域序列對第一抗原決定基具有結合特異性及第二免疫球蛋白可變域序列對第二抗原決定基具有結合特異性。在一實施例中，第一及第二抗原決定基位於同一抗原上，例如同一蛋白質(或多聚體蛋白之亞單元)上。在一實施例中，第一及第二抗原決定基重疊。在一實施例中，第一及第二抗原決定基不重疊。在一實施例中，第一及第二抗原決定基位於不同抗原上，例如不同蛋白質(或多聚體蛋白之不同亞單元)上。在一實施例中，雙特異性抗體分子包含對第一抗原決定基具有結合特異性的重鏈可變域序列及輕鏈可變域序列以及對第二抗原決定基具有結合特異性的重鏈可變域序列及輕鏈可變域序列。在一實施例中，雙特異性抗體分子包含對第一抗原決定基具有結合特異性的半抗體及對第二抗原決定基具有結合特異性的半抗體。在一實施例中，雙特異性抗體分子包含對第一抗原決定基具有結合特異性之半抗體或其片段及對第二抗原決定基具有結合特異性之半抗體或其片段。在一實施例中，雙特異性抗體分子包含對第一抗原決定基具有結合特異性之scFv或其片段及對第二抗原決定基具有結合特異性之scFv或其片段。在一實施例中，第一抗原決定基位於TIM-3上，且第二抗原決定基位於PD-1、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1及/或CsEACAM-5)、PD-L1或PD-L2上。
用於產生多特異性(例如雙特異性或三特異性)或異二聚體抗體分子之方案為此項技術中已知；包括但不限於例如：如例如US 5,731,168中所描述之「臼包杵」方法；如例如WO 09/089004、WO 06/106905及WO 2010/129304中所描述之靜電導向Fc配對；如例如WO 07/110205中所描述之股交換工程改造域(SEED)異二聚體形成；如例如WO 08/119353、WO 2011/131746及WO 2013/060867中所描述之Fab臂交換；如例如US 4,433,059中所描述的雙抗體結合物，例如藉由抗體交聯以使用具有胺反應性基團及硫氫基反應性基團之異雙官能試劑產生雙特異性結構；如例如US 4,444,878中所描述的藉由經由兩個重鏈之間的二硫鍵之還原氧化週期自不同抗體重組半抗體(重-輕鏈對或Fab)產生的雙特異性抗體決定子；如例如US 5,273,743中所描述的三官能抗體，例如經由硫氫基反應性基團交聯的三個Fab'片段；如例如US 5,534,254中所描述的生物合成結合蛋白，例如經由C端尾、較佳經由二硫鍵或胺反應性化學交聯而交聯的scFv對；如例如US 5,582,996中所描述的雙官能抗體，例如經由置換恆定域之白胺酸拉鏈(例如c-fos及c-jun)二聚合的具有不同結合特異性的Fab片段；如例如US 5,591,828中所描述的雙特異性及寡特異性單價受體及寡價受體，例如經由一個抗體之CH1區與通常具有相關輕鏈之另一抗體之VH區之間的多肽間隔子連接的兩個抗體(兩個Fab片段)之VH-CH1區；如例如US 5,635,602中所描述的雙特異性DNA抗體結合物，例如經由雙股DNA片段交聯之抗體或Fab片段；如例如US 5,637,481中所描述的雙特異性融合蛋白，例如含有在其與完整恆定區之間具有親水性螺旋肽連接子的兩個scFv之表現構築體；如例如US 5,837,242中所描述的多價及多特異性結合蛋白，例如具有含Ig重鏈可變區之結合區之第一域及含Ig輕鏈可變區之結合區之第二域的多肽之二聚體，一般稱為雙功能抗體(亦揭示產生雙特異性、三特異性或四特異性分子之更高級結構)；如例如US 5,837,821中所描述的具有連接之VL及VH鏈的微型抗體構築體，該等VL及VH鏈進一步由肽間隔子連接至抗體鉸鏈區及CH3區，從而可二聚合而形成雙特異性/多價分子；在任一定向上由短肽連接子(例如5或10個胺基酸)連接或根本不由連接子連接的VH及VL域，其可形成二聚體以形成雙特異性雙功能抗體；如例如US 5,844,094中所描述的三聚體及四聚體；如例如US 5,864,019中所描述的VH域鏈帶(或家族成員中之VL域)，其藉由C端處進一步與VL域相關之可交聯基團的肽鍵聯連接以形成一系列FV(或scFv)；及如例如US 5,869,620中所描述的具有經由肽連接子連接之VH及VL域的單鏈結合多肽，其經由非共價或化學交聯組合成多價結構，以使用scFv或雙功能抗體類型式形成例如同二價、異二價、三價及四價結構。另外例示性多特異性及雙特異性分子及其製備方法見於例如US 5,910,573、US 5,932,448、US 5,959,083、US 5,989,830、US 6,005,079、US 6,239,259、US 6,294,353、US 6,333,396、US 6,476,198、US 6,511,663、US 6,670,453、US 6,743,896、US 6,809,185、US 6,833,441、US 7,129,330、US7,183,076、US7,521,056、US7,527,787、US7,534,866、US7,612,181、US 2002/004587A1、US 2002/076406A1、US 2002/103345A1、US 2003/207346A1、US 2003/211078A1、US 2004/219643A1、US 2004/220388A1、US 2004/242847A1、US 2005/003403A1、US 2005/004352A1、US 2005/069552A1、US 2005/079170A1、US 2005/100543A1、US 2005/136049A1、US 2005/136051A1、US 2005/163782A1、US 2005/266425A1、US 2006/083747A1、US 2006/120960A1、US 2006/204493A1、US 2006/263367A1、US 2007/004909A1、US 2007/087381A1、US 2007/128150A1、US 2007/141049A1、US 2007/154901A1、US 2007/274985A1、US 2008/050370A1、US 2008/069820A1、US 2008/152645A1、US 2008/171855A1、US 2008/241884A1、US 2008/254512A1、US 2008/260738A1、US 2009/130106A1、US 2009/148905A1、US 2009/155275A1、US 2009/162359A1、US 2009/162360A1、US 2009/175851A1、US 2009/175867A1、US 2009/232811A1、US 2009/234105A1、US 2009/263392A1、US 2009/274649A1、EP 346087A2、WO 00/06605A2、WO 02/072635A2、WO 04/081051A1、WO 06/020258A2、WO 2007/044887A2、WO 2007/095338A2、WO 2007/137760A2、WO 2008/119353A1、WO 2009/021754A2、WO 2009/068630A1、WO 91/03493A1、WO 93/23537A1、WO 94/09131A1、WO 94/12625A2、WO 95/09917A1、WO 96/37621A2、WO 99/64460A1。上述申請案之內容以全文引用之方式併入本文中。
在其他實施例中，抗TIM-3抗體分子(例如單特異性、雙特異性或多特異性抗體分子)共價連接(例如融合)至另一搭配物(例如蛋白質，例如一個、兩個或更多個細胞介素)，例如呈融合分子(例如融合蛋白)形式。在其他實施例中，融合分子包含一或多個蛋白質，例如一個、兩個或更多個細胞介素。在一個實施例中，細胞介素為選自IL-1、IL-2、IL-12、IL-15或IL-21中之一者、兩者、三者或更多者之介白素(IL)。在一個實施例中，雙特異性抗體分子具有針對第一目標(例如針對PD-1)之第一結合特異性、針對第二目標(例如LAG-3或TIM-3)之第二結合特異性，且視情況連接至介白素(例如IL-12)域，例如全長IL-12或其部分。
「融合蛋白」及「融合多肽」係指具有至少兩個共價連接在一起之部分的多肽，其中各部分為具有不同特性之多肽。該特性可為生物特性，諸如活體外或活體內活性。該特性亦可為簡單化學或物理特性，諸如與目標分子之結合、反應催化等。兩個部分可藉由單一肽鍵直接連接或經由肽連接子連接，但彼此在閱讀框架中。
在一實施例中，抗體分子包含雙功能抗體及單鏈分子，以及抗體之抗原結合片段(例如Fab、F(ab')2 及Fv)。舉例而言，抗體分子可包括重(H)鏈可變域序列(本文中縮寫為VH)及輕(L)鏈可變域序列(本文中縮寫為VL)。在一實施例中，抗體分子包含或其組成為重鏈及輕鏈(在本文中稱作半抗體)。在另一實例中，抗體分子包括兩個重(H)鏈可變域序列及兩個輕(L)鏈可變域序列，從而形成兩個抗原結合位點，諸如Fab、Fab'、F(ab')2 、Fc、Fd、Fd'、Fv、單鏈抗體(例如scFv)、單可變域抗體、雙功能抗體(Dab)(二價及雙特異性)及嵌合(例如人類化)抗體，其可藉由修飾完全抗體或使用重組DNA技術重新合成之抗體產生。此等功能抗體片段保持與其各別抗原或受體選擇性結合之能力。抗體及抗體片段可來自任何抗體類別(包括但不限於IgG、IgA、IgM、IgD及IgE)，及來自任何抗體子類(例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4)。抗體分子之製劑可為單株或多株的。抗體分子亦可為人類、人類化、CDR移植或活體外產生之抗體。抗體可具有選自例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4之重鏈恆定區。抗體亦可具有選自例如κ或λ之輕鏈。在本文中，術語「免疫球蛋白」(Ig)可與術語「抗體」互換使用。
抗體分子之抗原結合片段之實例包括：(i) Fab片段，由VL、VH、CL及CH1域組成之單價片段；(ii) F(ab')2片段，包含兩個藉由二硫橋鍵在鉸鏈區連接之Fab片段之二價片段；(iii)由VH及CH1域組成之Fd片段；(iv)由抗體之單臂之VL及VH域組成之Fv片段，(v)雙功能抗體(dAb)片段，其由VH域組成；(vi)駱駝或駱駝化可變域；(vii)單鏈Fv (scFv)，參見例如Bird等人 (1988)Science 242:423-426；及Huston等人 (1988)Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883)；(viii)單域抗體。此等抗體片段係使用熟習此項技術者已知之習知技術獲得，且以與完整抗體相同之方式來篩選供使用的片段。
術語「抗體」包括完整分子以及其功能片段。抗體之恆定區可改變(例如突變)以修飾抗體之特性(例如，以增加或減少以下中之一或多者：Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基之數目、效應細胞功能或補體功能)。
抗體分子亦可為單域抗體。單域抗體可包括互補決定區為單域多肽之一部分的抗體。實例包括但不限於重鏈抗體、天然缺乏輕鏈之抗體、來源於習知4鏈抗體之單域抗體、經工程改造之抗體及除來源於抗體之骨架以外的單域骨架。單域抗體可為此項技術中之任一者，或任何未來的單域抗體。單域抗體可來源於任何物種，包括但不限於小鼠、人類、駱駝、駱馬、魚、鯊魚、山羊、兔及牛。根據本發明之另一態樣，單域抗體為天然存在之單域抗體，稱為缺乏輕鏈之重鏈抗體。此類單域抗體揭示於例如WO 94/04678中。為了清楚起見，此來源於天然缺乏輕鏈之重鏈抗體的可變域在本文中稱為VHH或奈米抗體，以與四鏈免疫球蛋白之習知VH區分。此VHH分子可來源於駱駝科物種(例如駱駝、駱馬、單峰駝、羊駝及原駝)中產生之抗體。除駱駝科以外的其他物種可產生天然缺乏輕鏈之重鏈抗體；此類VHH亦屬於本發明之範疇內。
VH區及VL區可再分為高變區，稱為「互補決定區」(CDR)，其間穿插有更保守之區域，稱為「構架區」(FR或FW)。
構架區及CDR之範圍已由多種方法(參見Kabat, E. A.等人(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第五版, U.S. Department of Health and Human Services, NIH刊物第91-3242號；Chothia, C.等人(1987)J. Mol. Biol . 196:901-917；及牛津分子AbM抗體模型化軟體(Oxford Molecular's AbM antibody modeling software)使用之AbM定義精確定義。大體參見例如Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains 。在Antibody Engineering Lab Manual (編者：Duebel, S.及Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg)中。
如本文所用之術語「互補決定區」及「CDR」係指在抗體可變區內之胺基酸序列，其賦予抗原特異性及結合親和力。一般而言，各重鏈可變區中存在三個CDR (HCDR1、HCDR2及HCDR3)，且各輕鏈可變區中存在三個CDR (LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
既定CDR之精確胺基酸序列邊界可使用多種熟知方案中的任一者測定，該等方案包括由Kabat等人(1991), 「Sequences of Proteins of Immunological Interest」, 第5版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (「Kabat」編號方案)；Al-Lazikani等人, (1997)JMB 273,927-948 (「Chothia」編號方案)所描述之方案。如本文所用，根據「Chothia」編號方案定義之CDR有時亦稱作「高變環」。
舉例而言，根據Kabat，重鏈可變域(VH)中之CDR胺基酸殘基編號為31-35 (HCDR1)、50-65 (HCDR2)及95-102 (HCDR3)；且輕鏈可變域(VL)中之CDR胺基酸殘基編號為24-34 (LCDR1)、50-56 (LCDR2)及89-97 (LCDR3)。根據Chothia，VH中之CDR胺基酸編號為26-32 (HCDR1)、52-56 (HCDR2)及95-102 (HCDR3)；且VL中之胺基酸殘基編號為26-32 (LCDR1)、50-52 (LCDR2)及91-96 (LCDR3)。藉由組合Kabat及Chothia兩者之CDR定義，CDR由人類VH中之胺基酸殘基26-35 (HCDR1)、50-65 (HCDR2)及95-102 (HCDR3)以及人類VL中之胺基酸殘基24-34 (LCDR1)、50-56 (LCDR2)及89-97 (LCDR3)組成。
一般而言，除非特別指示，否則抗TIM-3抗體分子可包括一或多個Kabat CDR及/或Chothia高變環之任何組合，例如表 7 中所描述。在一個實施例中，以下定義用於表7中所描述之抗TIM-3抗體分子：根據Kabat及Chothia兩者之組合CDR定義之HCDR1，及根據Kabat之CDR定義之HCCDR 2-3及LCCDR 1-3。根據所有定義，各VH及VL通常包括三個CDR及四個FR，其自胺基端至羧基端按以下次序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。
如本文所用，「免疫球蛋白可變域序列」係指可形成免疫球蛋白可變域之結構的胺基酸序列。舉例而言，序列可包括天然存在之可變域之胺基酸序列的全部或部分。舉例而言，序列可或可不包括一個、兩個或更多個N端或C端胺基酸，或可包括與蛋白質結構形成相容的其他變化。
術語「抗原結合位點」係指抗體分子之一部分，其包含形成結合於TIM-3多肽或其抗原決定基之界面的決定子。就蛋白質(或蛋白質模擬物)而言，抗原結合位點通常包括形成結合於TIM-3多肽之界面的(至少四個胺基酸或胺基酸模擬物之)一或多個環。通常，抗體分子之抗原結合位點包括至少一個或兩個CDR及/或高變環，或更通常至少三個、四個、五個或六個CDR及/或高變環。
術語「競爭」或「交叉競爭」在本文中可互換使用以指代抗體分子干擾抗TIM-3抗體分子(例如本文所提供之抗TIM-3抗體分子)結合於目標(例如人類TIM-3)的能力。干擾結合可為直接或間接的(例如經由抗體分子或目標之異位調節)。可使用競爭結合分析(例如FACS分析、ELISA或BIACORE分析)測定抗體分子能夠干擾另一抗體分子結合於目標的程度且因此測定其是否可稱為競爭。在一些實施例中，競爭結合分析為定量競爭分析。在一些實施例中，在競爭結合分析(例如本文所描述之競爭分析)中，當第一抗體分子與目標之結合減少10%或更多，例如20%或更多、30%或更多、40%或更多、50%或更多、55%或更多、60%或更多、65%或更多、70%或更多、75%或更多、80%或更多、85%或更多、90%或更多、95%或更多、98%或更多、99%或更多時，稱第一抗TIM-3抗體分子與第二抗TIM-3抗體分子競爭結合於目標。
如本文所用之術語「單株抗體」或「單株抗體組合物」係指單一分子組成之抗體分子之製劑。單株抗體組合物顯示針對特定抗原決定基之單一結合特異性及親和力。單株抗體可藉由融合瘤技術或藉由不使用融合瘤技術之方法(例如重組方法)製得。
「有效的人類」蛋白質為不引起中和抗體反應(例如人類抗鼠類抗體(HAMA)反應)之蛋白質。HAMA可在許多情形下存在問題，例如在重複投與抗體分子時，例如在治療慢性或復發性疾病病況時。由於抗體自血清之清除率增加(參見例如Saleh等人, Cancer Immunol. Immunother. 32:180-190 (1990))及潛在過敏反應(參見例如LoBuglio等人,Hybridoma , 5:5117-5123 (1986))，因此HAMA反應可使得重複投與抗體可能無效。
抗體分子可為多株或單株抗體。在其他實施例中，抗體可以重組方式產生，例如藉由噬菌體呈現或藉由組合方法產生。
用於產生抗體之噬菌體呈現及組合方法為此項技術中已知的(如以下中所描述：例如Ladner等人 美國專利第5,223,409號；Kang等人 國際公開案第WO 92/18619號；Dower等人 國際公開案第WO 91/17271號；Winter等人 國際公開案WO 92/20791；Markland等人 國際公開案第WO 92/15679號；Breitling等人 國際公開案WO 93/01288；McCafferty等人 國際公開案第WO 92/01047號；Garrard等人 國際公開案第WO 92/09690號；Ladner等人 國際公開案第WO 90/02 809號；Fuchs等人 (1991)Bio/Technology 9 :1370-1 372；Hay等人 (1992)Hum Antibody Hybridomas 3:81-85；Huse等人 (1989)Science 246:1275-1281；Griffths等人 (1993)EMBO J 12:725-734；Hawkins等人 (1992)J Mol Biol 226:889-896；Clackson等人 (1991)Nature 352:624-628；Gram等人 (1992)PNAS 89:3576-3580；Garrad等人 (1991)Bio/Technology 9:1373-1377；Hoogenboom等人 (1991)Nuc Acid Res 19:4133-4137；及Barbas等人 (1991)PNAS 88:7978-7982，全部該等文獻之內容以引用之方式併入本文中)。
在一個實施例中，抗體為完全人類抗體(例如已經基因工程改造以產生來自人類免疫球蛋白序列之抗體之小鼠中產生的抗體)，或非人類抗體，例如嚙齒動物(例如小鼠或大鼠)、山羊、靈長類動物(例如猴)、駱駝抗體。較佳地，非人類抗體為嚙齒動物(小鼠或大鼠抗體)。產生嚙齒動物抗體之方法為此項技術中已知。
人類單株抗體可使用攜有人類免疫球蛋白基因而非小鼠系統之轉殖基因小鼠產生。將來自經所關注之抗原免疫接種之此等基因轉殖小鼠之脾細胞用於產生融合瘤，該等融合瘤分泌對於來自人類蛋白之抗原決定基具有特異性親和力之人類mAb (參見例如Wood等人 國際申請案WO 91/00906、Kucherlapati等人 PCT公開案WO 91/10741；Lonberg等人 國際申請案WO 92/03918；Kay等人 國際申請案92/03917；Lonberg, N.等人 1994Nature 368:856-859；Green, L.L.等人 1994Nature Genet . 7:13-21；Morrison, S.L.等人 1994Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855；Bruggeman等人 1993Year Immunol 7:33-40；Tuaillon等人 1993PNAS 90:3720-3724；Bruggeman等人 1991Eur J Immunol 21:1323-1326)。
抗體可為其中可變區或其部分(例如CDR)在非人類生物體(例如大鼠或小鼠)中產生之抗體。嵌合、CDR移植及人類化抗體均屬於本發明。非人類生物體(例如大鼠或小鼠)中產生且接著經修飾(例如在可變構架或恆定區中)以降低在人體中之抗原性的抗體屬於本發明。
嵌合抗體可藉由此項技術中已知之重組型DNA技術產生(參見Robinson等人, 國際專利公開案PCT/US86/02269；Akira等人, 歐洲專利申請案184,187；Taniguchi, M., 歐洲專利申請案171,496；Morrison等人, 歐洲專利申請案173,494；Neuberger等人, 國際申請案WO 86/01533；Cabilly等人 美國專利第4,816,567號；Cabilly等人 歐洲專利申請案125,023；Better等人 (1988Science 240:1041-1043)；Liu等人 (1987)PNAS 84:3439-3443；Liu等人, 1987,J. Immunol. 139:3521-3526；Sun等人 (1987)PNAS 84:214-218；Nishimura等人, 1987,Canc. Res . 47:999-1005；Wood等人 (1985)Nature 314:446-449；及Shaw等人, 1988,J. Natl Cancer Inst . 80:1553-1559)。
人類化或CDR移植抗體中將有至少一個或兩個，但通常全部三個受體CDR (重鏈及/或輕鏈免疫球蛋白鏈之CDR)經供體CDR置換。抗體可經非人類CDR之至少一部分置換或僅一些CDR可經非人類CDR置換。僅需要置換人類化抗體結合於PD-1所需之數目的CDR。較佳地，供體應為嚙齒動物抗體，例如大鼠或小鼠抗體，且受體應為人類構架或人類共同構架。通常，提供CDR之免疫球蛋白稱為「供體」，且提供構架之免疫球蛋白稱為「受體」。在一個實施例中，供體免疫球蛋白為非人類(例如嚙齒動物)。受體構架為天然存在之(例如人類)構架或共同構架，或與其具有約85%或更高、較佳90%、95%、99%或更高一致性的序列。
如本文所用，術語「共同序列」係指由相關序列家族中最頻繁出現之胺基酸(或核苷酸)形成的序列(參見例如Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987)。在蛋白質家族中，共同序列中之各位置由該家族中最頻繁出現於該位置處之胺基酸佔據。若兩個胺基酸同樣頻繁地出現，則共同序列中可包括任一個。「共同構架」係指共同免疫球蛋白序列中之構架區。
抗體可藉由此項技術中已知之方法人類化(參見例如Morrison, S. L., 1985,Science 229:1202-1207，Oi等人, 1986,BioTechniques 4:214，及Queen等人 US 5,585,089、US 5,693,761及US 5,693,762，所有該等文獻之內容以引用之方式併入本文中)。
人類化或CDR移植抗體可藉由CDR移植或CDR取代來產生，其中免疫球蛋白鏈中之一個、兩個或所有CDR可經置換。參見例如美國專利5,225,539；Jones等人 1986Nature 321:552-525；Verhoeyan等人 1988Science 239:1534；Beidler等人 1988J. Immunol. 141:4053-4060；Winter US 5,225,539，所有該等文獻之內容以引用之方式明確併入本文中。Winter描述一種CDR移植方法，其可用於製備本發明之人類化抗體(1987年3月26日申請之英國專利申請案GB 2188638A；Winter US 5,225,539)，其內容以引用之方式明確併入本文中。
特定胺基酸已經取代、缺失或添加之人類化抗體亦在本發明之範疇內。自供體選擇胺基酸之準則描述於US 5,585,089中，例如US 5,585,089之第12欄至第16欄，該文獻之內容以引用之方式併入本文中。用於使抗體人類化的其他技術描述於1992年12月23日公開的Padlan等人 EP 519596 A1中。
抗體分子可為單鏈抗體。單鏈抗體(scFv)可經工程改造(參見例如Colcher, D.等人 (1999)Ann N Y Acad Sci 880:263-80；及Reiter, Y. (1996)Clin Cancer Res 2:245-52)。單鏈抗體可經二聚合或多聚合以產生對相同目標蛋白之不同抗原決定基具有特異性的多價抗體。
在其他實施例中，抗體分子具有重鏈恆定區，該重鏈恆定區選自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD及IgE之重鏈恆定區；特定言之，選自例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之(例如人類)重鏈恆定區。在另一實施例中，抗體分子具有輕鏈恆定區，該輕鏈恆定區選自例如κ或λ之(例如人類)輕鏈恆定區。恆定區可經改變，例如經突變以修改抗體之特性(例如以增加或減少以下中之一或多者：Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基之數目、效應細胞功能及/或補體功能)。在一個實施例中，抗體分子具有效應功能且可固定補體。在其他實施例中，該抗體不募集效應細胞或固定補體。在另一實施例中，抗體具有降低的結合Fc受體之能力或不具有該能力。舉例而言，其為不支持Fc受體結合之同型或亞型、片段或其他突變體，例如其具有誘變或缺失之Fc受體結合區。
用於改變抗體恆定區之方法為此項技術中已知的。功能改變(例如對效應配體，諸如細胞上之FcR或補體之C1組分之親和性改變)的抗體可藉由抗體恆定部分中的至少一個胺基酸殘基經不同殘基置換來產生(參見例如EP 388,151 A1、美國專利第5,624,821號及美國專利第5,648,260號，所有該等文獻之內容以引用之方式併入本文中)。可描述若應用於鼠類或其他物種免疫球蛋白則會降低或消除此等功能的類似改變類型。
抗體分子可經衍化或連接至另一功能分子(例如另一肽或蛋白質)。如本文所用，「衍化」抗體分子為已經修飾之抗體分子。衍化方法包括但不限於添加螢光部分、放射性核苷酸、毒素、酶或親和性配體，諸如生物素。因此，本發明之抗體分子意欲包括本文所描述之抗體之衍化及以其他方式修飾之形式，包括免疫黏附分子。舉例而言，抗體分子可在功能上連接(藉由化學偶合、基因融合、非共價結合或以其他方式)至一或多種其他分子實體，諸如另一抗體(例如雙特異性抗體或雙功能抗體)、可偵測劑、細胞毒性劑、醫藥劑及/或可介導抗體或抗體部分與另一分子(諸如抗生蛋白鏈菌素核心區或聚組胺酸標籤)結合的蛋白質或肽。
一種類型之衍化抗體分子係由兩種或更多種抗體(相同類型或不同類型之抗體，例如用以產生雙特異性抗體)交聯而產生。適合之交聯劑包括具有兩個不同反應性基團由適當間隔基分隔開之異雙官能交聯劑(例如間順丁烯二醯亞胺苯甲醯基-N-羥基丁二醯亞胺酯)或同雙官能交聯劑(例如辛二酸二丁二醯亞胺酯)。此類連接子可自Pierce Chemical Company, Rockford, Ill獲得。
可用於本發明之抗體分子衍化(或標記)之適用可偵測劑包括螢光化合物、各種酶、輔基、發光物質、生物發光物質、螢光發射金屬原子(例如銪(Eu)及其他鑭系元素)及放射性物質(描述於下文中)。例示性螢光可偵測劑包括螢光素(fluorescein)、螢光異硫氰酸鹽、若丹明(rhodamine)、5-二甲胺-1-萘磺醯氯、藻紅素(phycoerythrin)及其類似物。抗體亦可用可偵測酶衍化，諸如鹼性磷酸酶、辣根過氧化酶、β-半乳糖苷酶、乙醯膽鹼酯酶、葡萄糖氧化酶及其類似物。當抗體用可偵測酶衍化時，其係藉由添加該酶用以產生可偵測反應產物之另外試劑來偵測。舉例而言，當存在可偵測劑辣根過氧化酶時，添加過氧化氫及二胺基聯苯胺產生可偵測的有色反應產物。抗體分子亦可用輔基(例如抗生蛋白鏈菌素/生物素及抗生物素蛋白/生物素)衍化。舉例而言，抗體可用生物素衍化且經由間接量測抗生物素蛋白或抗生蛋白鏈菌素結合來進行偵測。適合螢光物質之實例包括繖酮(umbelliferone)、螢光素、螢光異硫氰酸鹽、若丹明、二氯三𠯤基胺螢光素、丹磺醯氯或藻紅素；發光物質之實例包括流明諾(luminol)；且生物發光物質之實例包括螢光素酶、螢光素及水母素(aequorin)。
可使用經標記之抗體分子，例如在多種情形下在診斷上及/或在實驗上，包括(i)藉由標準技術(諸如親和層析或免疫沈澱)分離預定抗原；(ii)偵測預定抗原(例如在細胞溶解物或細胞上清液中)以評估蛋白質之豐度及表現型；(iii)監測組織中之蛋白質含量作為臨床測試程序之一部分，例如以確定所給治療方案之功效。
抗體分子可結合於另一分子實體，通常為標記或治療(例如細胞毒性或細胞生長抑制)劑或部分。放射性同位素可用於診斷或治療應用中。
本發明提供放射性標記之抗體分子及標記抗體分子之方法。在一個實施例中，揭示一種標記抗體分子之方法。該方法包括使抗體分子與螯合劑接觸，從而產生經結合抗體。
如上文所論述，抗體分子可與治療劑結合。已提及治療活性放射性同位素。其他治療劑之實例包括紫杉醇(taxol)、細胞鬆弛素B(cytochalasin B)、短桿菌素D (gramicidin D)、溴化乙錠(ethidium bromide)、吐根素(emetine)、絲裂黴素(mitomycin)、依託泊苷(etoposide)、替尼泊苷(tenoposide)、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、秋水仙鹼(colchicin)、小紅莓(doxorubicin)、道諾黴素(daunorubicin)、二羥基炭疽菌素二酮(dihydroxy anthracin dione)、米托蒽醌(mitoxantrone)、光神黴素(mithramycin)、放線菌素D (actinomycin D)、1-去氫睪固酮(1-dihydrotestosterone)、糖皮質激素、普魯卡因(procaine)、四卡因(tetracaine)、利多卡因(lidocaine)、普萘洛爾(propranolol)、嘌呤黴素(puromycin)、類美登素(maytansinoids)(例如美登醇(maytansinol))(參見例如美國專利第5,208,020號)、CC-1065 (參見例如美國專利第5,475,092號、第5,585,499號、第5,846,545號)及其類似物或同源物。治療劑包括但不限於抗代謝物(例如甲胺喋呤(methotrexate)、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)、達卡巴嗪(decarbazine))、烷基化劑(例如甲氮芥(mechlorethamine)、噻替派苯丁酸氮芥(thioepa chlorambucil)、CC-1065、美法侖(melphalan)、卡莫司汀(carmustine) (BSNU)及洛莫司汀(lomustine) (CCNU)、環硫磷醯胺(cyclothosphamide)、硫酸布他卡因(busulfan)、二溴甘露醇(dibromomannitol)、鏈佐黴素(streptozotocin)、絲裂黴素C (mitomycin C)及順-二氯二胺鉑(II) (DDP)順鉑)、蒽環黴素(anthracyclinies) (例如道諾黴素(daunorubicin) (先前為柔紅黴素(daunomycin))及小紅莓)、抗生素(例如放線菌素D (先前為放射菌素)、博萊黴素(bleomycin)、光神黴素及安麯黴素(anthramycin) (AMC))，及抗有絲分裂劑(例如長春新鹼、長春鹼、紫杉醇及類美登素)。
在一個態樣中，本發明提供一者提供特異性結合於本文所揭示之目標(例如TIM-3)之目標結合分子的方法。舉例而言，目標結合分子為抗體分子。該方法包括：提供包含非人類蛋白之至少一部分的目標蛋白，該部分與人類目標蛋白之對應部分同源(至少70%、75%、80%、85%、87%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%一致)，但至少一個胺基酸(例如至少一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個或九個胺基酸)不同；獲得特異性結合於抗原之抗體分子；及評估結合劑在調節目標蛋白之活性中的功效。該方法可進一步包括向人類個體投與結合劑(例如抗體分子)或衍生物(例如人類化抗體分子)。
本發明提供一種編碼上述抗體分子之經分離核酸分子、其載體及宿主細胞。核酸分子包括但不限於RNA、基因組DNA及cDNA。
例示性 TIM-3 抑制劑 在某些實施例中，本文所描述之組合包含抗TIM-3抗體分子。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子揭示於2015年8月6日公開之名稱為「Antibody Molecules to TIM-3 and Uses Thereof」之US 2015/0218274中，該文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自包含表 7 中所示或由表 7 中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈及輕鏈可變區(例如，來自表 7 中揭示之ABTIM3-hum11或ABTIM3-hum03之重鏈及輕鏈可變區序列)的互補決定區(CDR)(或集合地所有CDR)。在一些實施例中，CDR係根據Kabat定義(例如，如表 7 中所闡述)。在一些實施例中，CDR係根據Chothia定義(例如，如表 7 中所闡述)。在一個實施例中，相對於表 7 中所示或由表 7 中所示核苷酸序列編碼的胺基酸序列，一或多個CDR (或集合地所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化，例如胺基酸取代(例如保守胺基酸取代)或缺失。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含重鏈可變區(VH)及輕鏈可變區(VL)，該VH包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 802之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列；該VL包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列，該等序列各自揭示於表 7 中。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含重鏈可變區(VH)及輕鏈可變區(VL)，該VH包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 820之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列；該VL包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列，該等序列各自揭示於表 7 中。
在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 806之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 806具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 816之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 816具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 822之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 822具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 826之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 826具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 806之胺基酸序列的VH及含有SEQ ID NO: 816之胺基酸序列的VL。在一個實施例中，該抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 822之胺基酸序列的VH及含有SEQ ID NO: 826之胺基酸序列的VL。
在一個實施例中，該抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 807具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 817具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 823具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 827具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列編碼的VL。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 808之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 808具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 818之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 818具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 824之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 824具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 828之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 828具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 808之胺基酸序列的重鏈及含有SEQ ID NO: 818之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 824之胺基酸序列的重鏈及含有SEQ ID NO: 828之胺基酸序列的輕鏈。
在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 809具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 819具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 825具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 829具有至少85%、90%、95%或99%或更高一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中，抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列編碼的輕鏈。
本文所描述之抗體分子可藉由US 2015/0218274中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。表 7 . 例示性抗TIM-3抗體分子之胺基酸及核苷酸序列
ABTIM3-hum11   
SEQ ID NO: 801 (Kabat) HCDR1 SYNMH
SEQ ID NO: 802 (Kabat) HCDR2 DIYPGNGDTSYNQKFKG
SEQ ID NO: 803 (Kabat) HCDR3 VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 804 (Chothia) HCDR1 GYTFTSY
SEQ ID NO: 805 (Chothia) HCDR2 YPGNGD
SEQ ID NO: 803 (Chothia) HCDR3 VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 806 VH QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWMGDIYPGNGDTSYNQKFKGRVTITADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 807 DNA VH CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCTCTAGCGTGAAAGTTTCTTGTAAAGCTAGTGGCTACACCTTCACTAGCTATAATATGCACTGGGTTCGCCAGGCCCCAGGGCAAGGCCTCGAGTGGATGGGCGATATCTACCCCGGGAACGGCGACACTAGTTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGTCACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTAGC
SEQ ID NO: 808 重鏈 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWMGDIYPGNGDTSYNQKFKGRVTITADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 809 DNA重鏈 CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCTCTAGCGTGAAAGTTTCTTGTAAAGCTAGTGGCTACACCTTCACTAGCTATAATATGCACTGGGTTCGCCAGGCCCCAGGGCAAGGCCTCGAGTGGATGGGCGATATCTACCCCGGGAACGGCGACACTAGTTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGTCACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTAGCGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
SEQ ID NO: 810 (Kabat) LCDR1 RASESVEYYGTSLMQ
SEQ ID NO: 811 (Kabat) LCDR2 AASNVES
SEQ ID NO: 812 (Kabat) LCDR3 QQSRKDPST
SEQ ID NO: 813 (Chothia) LCDR1 SESVEYYGTSL
SEQ ID NO: 814 (Chothia) LCDR2 AAS
SEQ ID NO: 815 (Chothia) LCDR3 SRKDPS
SEQ ID NO: 816 VL AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGKAPKLLIYAASNVESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQSRKDPSTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO: 817 DNA VL GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGGAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATCTCTAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGCTACCTACTTCTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 818 輕鏈 AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGKAPKLLIYAASNVESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQSRKDPSTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 819 DNA輕鏈 GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGGAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATCTCTAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGCTACCTACTTCTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
ABTIM3-hum03   
SEQ ID NO: 801 (Kabat) HCDR1 SYNMH
SEQ ID NO: 820 (Kabat) HCDR2 DIYPGQGDTSYNQKFKG
SEQ ID NO: 803 (Kabat) HCDR3 VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 804 (Chothia) HCDR1 GYTFTSY
SEQ ID NO: 821 (Chothia) HCDR2 YPGQGD
SEQ ID NO: 803 (Chothia) HCDR3 VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 822 VH QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWIGDIYPGQGDTSYNQKFKGRATMTADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 823 DNA VH CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTAGTGTGAAAGTTAGCTGTAAAGCTAGTGGCTATACTTTCACTTCTTATAATATGCACTGGGTCCGCCAGGCCCCAGGTCAAGGCCTCGAGTGGATCGGCGATATCTACCCCGGTCAAGGCGACACTTCCTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGCTACTATGACCGCCGATAAGTCTACTTCTACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCAATGGACTACTGGGGTCAAGGCACCCTGGTCACCGTGTCTAGC
SEQ ID NO: 824 重鏈 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWIGDIYPGQGDTSYNQKFKGRATMTADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 825 DNA重鏈 CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTAGTGTGAAAGTTAGCTGTAAAGCTAGTGGCTATACTTTCACTTCTTATAATATGCACTGGGTCCGCCAGGCCCCAGGTCAAGGCCTCGAGTGGATCGGCGATATCTACCCCGGTCAAGGCGACACTTCCTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGCTACTATGACCGCCGATAAGTCTACTTCTACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCAATGGACTACTGGGGTCAAGGCACCCTGGTCACCGTGTCTAGCGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
SEQ ID NO: 810 (Kabat) LCDR1 RASESVEYYGTSLMQ
SEQ ID NO: 811 (Kabat) LCDR2 AASNVES
SEQ ID NO: 812 (Kabat) LCDR3 QQSRKDPST
SEQ ID NO: 813 (Chothia) LCDR1 SESVEYYGTSL
SEQ ID NO: 814 (Chothia) LCDR2 AAS
SEQ ID NO: 815 (Chothia) LCDR3 SRKDPS
SEQ ID NO: 826 VL DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGQPPKLLIYAASNVESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSRKDPSTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO: 827 DNA VL GATATCGTCCTGACTCAGTCACCCGATAGCCTGGCCGTCAGCCTGGGCGAGCGGGCTACTATTAACTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGTCAACCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCGATAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATTAGTAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCGTCTACTACTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 828 輕鏈 DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGQPPKLLIYAASNVESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSRKDPSTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 829 DNA輕鏈 GATATCGTCCTGACTCAGTCACCCGATAGCCTGGCCGTCAGCCTGGGCGAGCGGGCTACTATTAACTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGTCAACCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCGATAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATTAGTAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCGTCTACTACTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包括至少一個或兩個重鏈可變域(視情況包括恆定區)、至少一個或兩個輕鏈可變域(視情況包括恆定區)或其兩者，其包含ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23之胺基酸序列；或如US 2015/0218274之表1至表4中所描述之胺基酸序列；或由表1至表4中之核苷酸序列編碼之胺基酸序列；或與任一前述序列實質上一致(例如具有至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致性)之序列。抗TIM-3抗體分子視情況包含來自重鏈、輕鏈或其兩者之前導序列，如US 2015/0218274中所示；或與其實質上一致之序列。
在又一實施例中，抗TIM-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個來自本文所描述之抗體之重鏈可變區及/或輕鏈可變區的互補決定區(CDR)，例如選自以下中之任一者之抗體：ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23；或如US 2015/0218274之表1至表4中所描述；或由表1至表4中之核苷酸序列編碼；或與任一前述序列實質上一致(例如具有至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致性)之序列。
在又一實施例中，抗TIM-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個來自包含US 2015/0218274之表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈可變區的CDR (或集合地所有CDR)。在一個實施例中，相對於表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列，一或多個CDR (或集合地所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化，例如胺基酸取代或缺失。
在又一實施例中，抗TIM-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個來自包含US 2015/0218274之表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的輕鏈可變區的CDR(或集合地所有CDR)。在一個實施例中，相對於表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列，一或多個CDR (或集合地所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化，例如胺基酸取代或缺失。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子包括輕鏈CDR中之取代，例如輕鏈之CDR1、CDR2及/或CDR3中之一或多個取代。
在另一實施例中，抗TIM-3抗體分子包括至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自包含US 2015/0218274之表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈及輕鏈可變區的CDR (或集合地所有CDR)。在一個實施例中，相對於表1至表4中所示或由表1至表4中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列，一或多個CDR (或集合地所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化，例如胺基酸取代或缺失。
在另一實施例中，抗TIM-3抗體分子為MBG453。不希望受理論束縛，通常認為MBG453為可阻斷TIM-3與磷脂醯絲胺酸(PtdSer)之結合的高親和力、配體阻斷、人類化抗TIM-3 IgG4抗體。
其他例示性 TIM-3 抑制劑 在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為TSR-022 (AnaptysBio/Tesaro)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含TSR-022之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含例如如表 8 所揭示的APE5137或APE5121之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。APE5137、APE5121及其他抗TIM-3抗體揭示於以全文引用之方式併入的WO 2016/161270中。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為抗體純系F38-2E2。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含F38-2E2之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為LY3321367 (Eli Lilly)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含LY3321367之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為Sym023 (Symphogen)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含Sym023之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為BGB-A425 (Beigene)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含BGB-A425之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為INCAGN-2390 (Agenus/Incyte)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含INCAGN-2390之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為MBS-986258 (BMS/Five Prime)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含MBS-986258之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為RO-7121661 (Roche)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含RO-7121661之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為LY-3415244 (Eli Lilly)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含LY-3415244之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為BC-3402 (Wuxi Zhikanghongyi Biotechnology)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含BC-3402之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子為SHR-1702 (Medicine Co Ltd.)。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子包含SHR-1702之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈可變區序列及/或輕鏈可變區序列或重鏈序列及/或輕鏈序列。SHR-1702揭示於例如WO 2020/038355中。
其他已知抗TIM-3抗體包括例如WO 2016/111947、WO 2016/071448、WO 2016/144803、US 8,552,156、US 8,841,418及US 9,163,087中描述之彼等抗體，該等文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗TIM-3抗體為與本文所描述之抗TIM-3抗體中之一者競爭結合TIM-3及/或結合於TIM-3上之相同抗原決定基的抗體。表 8 . 其他例示性抗TIM-3抗體分子之胺基酸序列
APE5137   
SEQ ID NO: 830 VH EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAAASGFTFSSYDMSWVRQAPGKGLDWVSTISGGGTYTYYQDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCASMDYWGQGTTVTVSSA
SEQ ID NO: 831 VL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSIRRYLNWYHQKPGKAPKLLIYGASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQSHSAPLTFGGGTKVEIKR
APE5121      
SEQ ID NO: 832 VH EVQVLESGGGLVQPGGSLRLYCVASGFTFSGSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKKYYVGPADYWGQGTLVTVSSG
SEQ ID NO: 833 VL DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSVLYSSNNKNYLAWYQHKPGQPPKLLIYWASTRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYSSPLTFGGGTKIEVK
調配物 本文所描述之抗TIM-3抗體分子可經調配成適合於如本文所描述向個體投與(例如靜脈內投與)的調配物(例如劑量調配物或劑型)。本文所描述之調配物可為液體調配物、凍乾調配物或復原調配物。
在某些實施例中，調配物為液體調配物。在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含抗TIM-3抗體分子(例如本文所描述之抗TIM-3抗體分子)及緩衝劑。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以如下濃度存在之抗TIM-3抗體分子：25 mg/mL至250 mg/mL，例如50 mg/mL至200 mg/mL、60 mg/mL至180 mg/mL、70 mg/mL至150 mg/mL、80 mg/mL至120 mg/mL、90 mg/mL至110 mg/mL、50 mg/mL至150 mg/mL、50 mg/mL至100 mg/mL、150 mg/mL至200 mg/mL或100 mg/mL至200 mg/mL，例如50 mg/mL、60 mg/mL、70 mg/mL、80 mg/mL、90 mg/mL、100 mg/mL、110 mg/mL、120 mg/mL、130 mg/mL、140 mg/mL或150 mg/mL。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子係以80 mg/mL至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含緩衝劑，該緩衝劑包含組胺酸(例如組胺酸緩衝液)。在某些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以如下濃度存在：1 mM至100 mM，例如2 mM至50 mM、5 mM至40 mM、10 mM至30 mM、15至25 mM、5 mM至40 mM、5 mM至30 mM、5 mM至20 mM、5 mM至10 mM、40 mM至50 mM、30 mM至50 mM、20 mM至50 mM、10 mM至50 mM或5 mM至50 mM，例如2 mM、5 mM、10 mM、15 mM、20 mM、25 mM、30 mM、35 mM、40 mM、45 mM或50 mM。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以15 mM至25 mM (例如20 mM)之濃度存在。在其他實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)或調配物之pH為4至7，例如5至6，例如5、5.5或6。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)或調配物之pH為5至6，例如5.5。在某些實施例中，緩衝劑包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)。在某些實施例中，緩衝劑包含組胺酸及組胺酸-HCL。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；及包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)進一步包含碳水化合物。在某些實施例中，碳水化合物為蔗糖。在一些實施例中，碳水化合物(例如蔗糖)係以如下濃度存在：50 mM至500 mM，例如100 mM至400 mM、150 mM至300 mM、180 mM至250 mM、200 mM至240 mM、210 mM至230 mM、100 mM至300 mM、100 mM至250 mM、100 mM至200 mM、100 mM至150 mM、300 mM至400 mM、200 mM至400 mM或100 mM至400 mM，例如100 mM、150 mM、180 mM、200 mM、220 mM、250 mM、300 mM、350 mM或400 mM。在一些實施例中，調配物包含以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液的緩衝劑；及以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度、5至6 (例如5.5)之pH存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)進一步包含界面活性劑。在某些實施例中，界面活性劑為聚山梨醇酯20。在一些實施例中，界面活性劑或聚山梨醇酯20係以如下濃度存在：0.005 %至0.1% (w/w)，例如0.01%至0.08%、0.02%至0.06%、0.03%至0.05%、0.01%至0.06%、0.01%至0.05%、0.01%至0.03%、0.06%至0.08%、0.04%至0.08%或0.02%至0.08% (w/w)，例如0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%、0.07%、0.08%、0.09%或0.1% (w/w)。在一些實施例中，調配物包含以0.03%至0.05% (例如0.04%)(w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液的緩衝劑；以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.03%至0.05% (例如0.04%)(w/w)之濃度、5至6 (例如5.5)之pH存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以100 mg/mL之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為20 mM之組胺酸緩衝液(例如組胺酸/組胺酸-HCL)的緩衝劑；以220 mM之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.04% (w/w)之濃度、5至6 (例如5.5)之pH存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
本文所描述之調配物可儲存於容器中。用於本文所描述之調配物中之任一者的容器可包括例如小瓶及視情況存在之塞子、蓋子或兩者。在某些實施例中，小瓶為玻璃小瓶，例如6R白色玻璃小瓶。在其他實施例中，塞子為橡膠塞，例如灰色橡膠塞。在其他實施例中，蓋子為易拉蓋，例如鋁易拉蓋。在一些實施例中，容器包含6R白色玻璃小瓶、灰色橡膠塞及鋁易拉蓋。在一些實施例中，容器(例如小瓶)係單次用容器。在某些實施例中，容器(例如小瓶)中存在25 mg/mL至250 mg/mL，例如50 mg/mL至200 mg/mL、60 mg/mL至180 mg/mL、70 mg/mL至150 mg/mL、80 mg/mL至120 mg/mL、90 mg/mL至110 mg/mL、50 mg/mL至150 mg/mL、50 mg/mL至100 mg/mL、150 mg/mL至200 mg/mL或100 mg/mL至200 mg/mL，例如50 mg/mL、60 mg/mL、70 mg/mL、80 mg/mL、90 mg/mL、100 mg/mL、110 mg/mL、120 mg/mL、130 mg/mL、140 mg/mL或150 mg/mL之抗TIM-3抗體分子。
在另一態樣中，本發明之特徵在於治療套組，其包括本文所描述之抗TIM-3抗體分子、組合物或調配物，以及例如根據本文所描述之劑量方案的使用說明書。
低甲基化劑  在某些實施例中，本文所描述之組合包括低甲基化劑。低甲基化劑亦稱為HMA或去甲基劑，其抑制DNA甲基化。在某些實施例中，低甲基化劑阻斷DNA甲基轉移酶之活性。在某些實施例中，低甲基化劑包含阿紮胞苷、地西他濱、CC-486 (Bristol Meyers Squibb)或ASTX727 (Astex)。
在一些實施例中，本文中所描述之用以治療MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)或CMML (例如CMML-1或CMML-2)的組合包含：本文中所描述之TIM-3抑制劑(例如MBG453)，其例如在各28天週期之第8天例如歷經30分鐘以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量靜脈內投與；及本文中所描述之低甲基化劑(例如阿紮胞苷)，其例如在28天週期之第1天、第2天、第3天、第4天、第5天、第6天及第7天以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量例如靜脈內或皮下投與連續七天。在其他實施例中，本文中所描述用以治療MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)或CMML (例如CMML-1或CMML-2)之物包含：本文中所描述之TIM-3抑制劑(例如MBG453)，其在各28天週期之第8天例如歷經30分鐘以600 mg至1000 mg (例如800 mg)之劑量靜脈內投與；及本文中所描述之低甲基化劑(例如阿紮胞苷)，其例如在28天週期之第1天、第2天、第3天、第4天及第5天以及第8天及第9天以50 mg/m2 至100 mg/m2 (例如75 mg/m2 )之劑量靜脈內或皮下投與。在一些實施例中，TIM-3抑制劑(例如MBG453)及低甲基化劑係在同一天投與。在一些實施例中，TIM-3抑制劑(例如MBG453)係在完成低甲基化劑(例如阿紮胞苷)之投與後投與。在一些實施例中，TIM-3抑制劑係在完成低甲基化劑(例如阿紮胞苷)之投與後約30分鐘至約四個小時(例如約一小時)投與。
例示性低甲基化劑 在一些實施例中，該低甲基化劑包含阿紮胞苷。阿紮胞苷亦稱為5-AC、5-氮雜胞嘧啶核苷、氮雜胞嘧啶核苷、拉達卡黴素(ladakamycin)、5-AZC、AZA-CR、U-18496、4-胺基-1-β-D-呋喃核糖基-1,3,5-三𠯤-2(1H)-酮、4-胺基-1-[(2R,3R ,4S ,5R )-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊-2-基]-1,3,5-三𠯤-2-酮或VIDAZA®。阿紮胞苷具有以下結構式：
Figure 02_image001
，或其醫藥學上可接受之鹽。
阿紮胞苷為胞嘧啶核苷之具有抗贅生活性之嘧啶核苷類似物。阿紮胞苷併入DNA中，其在DNA中可逆地抑制DNA甲基轉移酶，從而阻斷DNA甲基化。藉由阿紮胞苷使DNA低甲基化可活化由於高甲基化而沈默之腫瘤抑制基因，從而產生抗腫瘤效應。阿紮胞苷亦可併入RNA中，從而破壞正常RNA功能且削弱tRNA胞苷-5-甲基轉移酶活性。
在一些實施例中，阿紮胞苷係以如下劑量投與：約25 mg/m2 至約150 mg/m2 ，例如約50 mg/m2 至約100 mg/m2 、約70 mg/m2 至約80 mg/m2 、約50 mg/m2 至約75 mg/m2 、約75 mg/m2 至約125 mg/m2 、約50 mg/m2 、約75 mg/m2 、約100 mg/m2 、約125 mg/m2 或約150 mg/m2 。在一些實施例中，阿紮胞苷係一天投與一次。在一些實施例中，阿紮胞苷係靜脈內投與。在其他實施例中，阿紮胞苷係皮下投與。在一些實施例中，阿紮胞苷係在例如28天週期中以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 (例如約75 mg/m2 )之劑量投與例如約連續5至7天。舉例而言，阿紮胞苷可在28天週期之第1天至第7天以約75 mg/m2 之劑量投與連續七天。作為另一實例，阿紮胞苷可如下投與：在28天週期之第1天至第5天以約75 mg/m2 之劑量投與連續五天，接著中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
其他例示性低甲基化劑 在一些實施例中，低甲基化劑包含地西他濱、CC-486或ASTX727。 地西他濱亦稱為5-氮雜-dCyd、去氧氮雜胞嘧啶核苷(deoxyazacytidine)、德左胞苷(dezocitidine)、5AZA、DAC、2'-去氧-5-氮雜胞嘧啶核苷、4-胺基-1-(2-去氧-β-D-赤-呋喃戊醣基)-1,3,5-三𠯤-2(1H)-酮、5-氮雜-2'-去氧胞苷、5-氮雜-2-去氧胞嘧啶核苷、5-氮雜去氧胞嘧啶核苷或DACOGEN®。地西他濱具有以下結構式：
Figure 02_image003
，或其醫藥學上可接受之鹽。
地西他濱為具有潛在抗贅生活性之胞嘧啶核苷抗代謝物類似物。地西他濱併入DNA中且抑制DNA甲基轉移酶，促成DNA低甲基化及DNA複製S相內停滯。
在一些實施例中，地西他濱係以如下劑量投與：約5 mg/m2 至約50 mg/m2 ，例如約10 mg/m2 至約40 mg/m2 、約20 mg/m2 至約30 mg/m2 、約5 mg/m2 至約40 mg/m2 、約5 mg/m2 至約30 mg/m2 、約5 mg/m2 至約20 mg/m2 、約5 mg/m2 至約10 mg/m2 、約10 mg/m2 至約50 mg/m2 、約20 mg/m2 至約50 mg/m2 、約30 mg/m2 至約50 mg/m2 、約40 mg/m2 至約50 mg/m2 、約10 mg/m2 至約20 mg/m2 、約15 mg/m2 至約25 mg/m2 、約5 mg/m2 、約10 mg/m2 、約15 mg/m2 、約20 mg/m2 、約25 mg/m2 、約30 mg/m2 、約35 mg/m2 、約40 mg/m2 、約45 mg/m2 或約50 mg/m2 。在一些實施例中，地西他濱係靜脈內投與。在某些實施例中，地西他濱係根據三天方案投與，例如藉由持續3天每8小時重複之歷經約3小時的連續靜脈內輸注以約10 mg/m2 至約20 mg/m2 (例如15 mg/m2 )之劑量投與(例如每6週重複週期，例如持續最少4個週期)。在其他實施例中，地西他濱係根據五天方案投與，例如藉由持續5天每天歷經約1小時的連續靜脈內輸注以約10 mg/m2 至約20 mg/m2 (例如15 mg/m2 )之劑量投與(例如每4週重複週期，例如持續最少4個週期)。
在一些實施例中，低甲基化劑包含口服阿紮胞苷(例如CC-486)。在一些實施例中，低甲基化劑包含CC-486。CC-486為阿紮胞苷(胞嘧啶核苷之嘧啶核苷類似物)之口服生物可用調配物，具有抗贅生活性。經口投與後，阿紮胞苷由細胞吸收且代謝成三磷酸5-氮雜去氧胞苷。將三磷酸5-氮雜去氧胞苷併入DNA中能可逆地抑制DNA甲基轉移酶且阻斷DNA甲基化。藉由阿紮胞苷使DNA低甲基化可再活化先前由於高甲基化而沈默之腫瘤抑制基因，從而產生抗腫瘤效應。將三磷酸5-阿紮胞苷併入RNA中可破壞正常RNA功能且削弱tRNA (胞嘧啶-5)-甲基轉移酶活性，從而抑制RNA及蛋白質合成。CC-486描述於例如Laille等人 J Clin Pharmacol. 2014; 54(6):630-639；Mesia等人European Journal of Cancer 2019 123:138-154中。胞嘧啶核苷類似物之口服調配物亦描述於例如PCT公開案第WO 2009/139888號及美國專利第US 8,846,628號中。在一些實施例中，CC-486係經口投與。在一些實施例中，CC-486係每天投與一次。在一些實施例中，CC-486係以約200 mg至約500 mg (例如300 mg)之劑量投與。在一些實施例中，CC-486係在例如21天或28天週期中之連續5至15天(例如第1天至第14天)投與。在一些實施例中，CC-486係一天投與一次。
在一些實施例中，低甲基化劑包含CDA抑制劑(例如色達瑞丁(cedazuridine)/地西他濱組合劑(例如ASTX727))。在一些實施例中，低甲基化劑包含ASTX727。ASTX727為具有抗贅生活性的包含胞嘧啶核苷脫胺酶(CDA)抑制劑色達瑞丁(亦稱為E7727)及胞嘧啶核苷抗代謝物地西他濱的經口可用組合劑。經口投與ASTX727後，CDA抑制劑E7727結合且抑制CDA，其為主要見於胃腸道(GI)及肝臟中的催化胞嘧啶核苷及胞嘧啶核苷類似物之脫胺作用的酶。此可防止地西他濱分解，從而增加其生物可用性及功效，同時由於投與較低劑量之地西他濱而降低GI毒性。地西他濱經由將其三磷酸酯形式併入DNA中來發揮其抗贅生活性，該併入抑制DNA甲基轉移酶且促成DNA低甲基化。此可干擾DNA複製且減少腫瘤細胞生長。ASTX727揭示於例如Montalaban-Bravo等人Current Opinions in Hematology 2018 25(2):146-153中。在一些實施例中，ASTX727包含例如約50-150 mg (例如約100 mg)色達瑞丁及例如約300-400mg (例如345 mg)地西他濱。在一些實施例中，ASTX727係經口投與。在一些實施例中，ASTX727係在例如28天週期中之連續5至15天(例如第1至第5天)投與。在一些實施例中，ASTX727係一天投與一次。
阿糖胞苷  在一些實施例中，本文所描述之組合包括阿糖胞苷。阿糖胞苷亦稱為胞嘧啶阿拉伯糖苷或4-胺基-1-[(2R,3S,4S,5R)-3,4-二羥基-5-(羥甲基)氧雜環戊-2-基]嘧啶-2-酮。阿糖胞苷具有以下結構式：
Figure 02_image005
，或其醫藥學上可接受之鹽。
阿糖胞苷為具有經修飾糖部分(阿拉伯糖代替核糖)的胞嘧啶核苷抗代謝物類似物。阿糖胞苷經轉化成三磷酸酯形式，期與胞嘧啶核苷競爭併入至DNA中。歸因於阿拉伯糖，DNA分子之旋轉為空間位阻的，且DNA複製停止。阿糖胞苷亦干擾DNA聚合酶。
在一些實施例中，阿糖胞苷係以約5 mg/m2 至約75 mg/m2 (例如30 mg/m2 )投與。在一些實施例中，阿糖胞苷係投與約100 mg/m2 至約400 mg/m2 ，例如100 mg/m2 。在一些實施例中，阿糖胞苷係藉由靜脈內輸注或注射皮下或鞘內投與。在一些實施例中，阿糖胞苷係藉由連續IV輸注以100 mg/m2 /天之劑量投與或以100 mg/m2 之劑量每12小時靜脈內投與。在一些實施例中，阿糖胞苷係投與持續7天(例如第1天至第7天)。在一些實施例中，阿糖胞苷係以在每平方米體表面積5至75 mg/m2 之範圍內的劑量鞘內投與。在一些實施例中，阿糖胞苷係每4天一次至一天一次鞘內投與持續4天。在一些實施例中，阿糖胞苷係每4天以30 mg/m2 之劑量投與。
其他組合  本文中所描述之組合可進一步包含一或多種其他治療劑、程序或模式。
在一個實施例中，本文所描述之方法包括以有效治療或預防本文所描述之病症的量向個體投與包含本文所描述之TIM-3抑制劑及本文所描述之低甲基化劑之組合與治療劑、程序或模式的組合。在某些實施例中，根據本文所描述之劑量方案投與或使用組合。在其他實施例中，組合係作為本文所描述之組合物或調配物投與或使用。
TIM-3抑制劑、低甲基化劑及治療劑、程序或模式可同時或以任何次序依序投與或使用。可使用TIM-3抑制劑、低甲基化劑及治療劑、程序或模式之任何組合及順序(例如如本文所描述)。TIM-3抑制劑、低甲基化劑及/或治療劑、程序或模式可在活動性病症之時段期間或在緩解或活動性較低疾病之時段期間投與或使用。TIM-3抑制劑或低甲基化劑可在用治療劑、程序或模式進行治療之前、同時或之後投與。
在某些實施例中，本文所描述之組合可與以下中之一或多者一起投與：其他抗體分子、化學療法、其他抗癌療法(例如靶向抗癌療法、基因療法、病毒療法、RNA療法、骨髓移植、奈米療法或溶瘤藥物)、細胞毒性劑、基於免疫之療法(例如基於細胞介素或細胞之免疫療法)、手術程序(例如乳房腫瘤切除術或乳房切除術)或放射程序，或前述中之任一者之組合。另外療法可呈佐劑或新輔助療法形式。在一些實施例中，另外療法為酶抑制劑(例如小分子酶抑制劑)或轉移抑制劑。可組合投與的例示性細胞毒性劑包括抗微管劑、拓樸異構酶抑制劑、抗代謝物、有絲分裂抑制劑、烷基化劑、蒽環黴素(anthracycline)、長春花生物鹼(vinca alkaloid)、插入劑、能夠干擾信號轉導路徑之藥劑、促進細胞凋亡之藥劑、蛋白酶體抑制劑及放射(例如局部或全身照射(例如γ照射)。在其他實施例中，另外療法為手術或放射，或其組合。在其他實施例中，另外療法為靶向PI3K/AKT/mTOR路徑中之一或多者的療法、HSP90抑制劑或微管蛋白抑制劑。
替代地或與前述組合進行組合，本文中所描述之組合可與CD47、CD70、NEDD8、CDK9、MDM2、FLT3或KIT之抑制劑及/或p53之活化劑中之一或多者一起投與或使用。在一些實施例中，TIM-3抑制劑係與CD47、CD70、NEDD8、CDK9、MDM2、FLT3或KIT之抑制劑及/或p53之活化劑一起投與。在一些實施例中，TIM-3抑制劑係進一步與CD47、CD70、NEDD8、CDK9、MDM2、FLT3或KIT之抑制劑及/或p53之活化劑組合而與低甲基化劑(例如本文中所描述之低甲基化劑)一起投與。
在一些實施例中，TIM-3抑制劑係進一步與CD47、CD70、NEDD8、CDK9、MDM2、FLT3或KIT之抑制劑及/或p53之活化劑組合而與低甲基化劑(例如本文所描述之低甲基化劑)一起投與以治療MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。
在一些實施例中，TIM-3抑制劑係進一步與CD47、CD70、NEDD8、CDK9、MDM2、FLT3或KIT之抑制劑及/或p53之活化劑組合而與低甲基化劑(例如本文所描述之低甲基化劑)一起投與以治療CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
替代地或與前述組合進行組合，本文中所描述之組合可與以下中之一或多者一起投與或使用：免疫調節劑(例如共刺激分子之活化劑或抑制性分子(例如免疫檢查點分子)之抑制劑)；疫苗，例如治療性癌症疫苗；或細胞免疫療法之其他形式。
在某些實施例中，本文中所描述之組合係與共刺激分子或抑制性分子(例如共抑制配體或受體)之調節劑一起投與或使用。
在一個實施例中，本文中所描述之化合物及組合係與共刺激分子之調節劑(例如促效劑)一起投與或使用。在一個實施例中，共刺激分子之促效劑係選自以下之促效劑(例如促效抗體或其抗原結合片段，或可溶融合體)：OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體。
在另一實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與GITR促效劑(例如抗GITR抗體分子)組合投與或使用。
在一個實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與選自以下之抑制性(或免疫檢查點)分子之抑制劑組合投與或使用：PD-L1、PD-L2、CTLA-4、TIM-3、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGF β。在一個實施例中，抑制劑為可溶配體(例如CTLA-4-Ig)或結合於PD-1、LAG-3、PD-L1、PD-L2或CTLA-4之抗體或抗體片段。
在另一實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與PD-1抑制劑(例如抗PD-1抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，本文中所描述之抗TIM-3抗體分子係與LAG-3抑制劑(例如抗LAG-3抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，本文中所描述之抗TIM-3抗體分子係與PD-L1抑制劑(例如抗PD-L1抗體分子)組合投與或使用。
在另一實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與PD-1抑制劑(例如抗PD-1抗體分子)及LAG-3抑制劑(例如抗LAG-3抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，本文中所描述之抗TIM-3抗體分子係與PD-1抑制劑(例如抗PD-1抗體分子)及PD-L1抑制劑(例如抗PD-L1抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，本文中所描述之抗TIM-3抗體分子係與LAG-3抑制劑(例如抗LAG-3抗體分子)及PD-L1抑制劑(例如抗PD-L1抗體分子)組合投與或使用。
在另一實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與CEACAM抑制劑(例如CEACAM-1、CEACAM-3及/或CEACAM-5抑制劑，例如抗CEACAM抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，抗TIM-3抗體分子係與CEACAM-1抑制劑(例如抗CEACAM-1抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，抗TIM-3抗體分子係與CEACAM-3抑制劑(例如抗CEACAM-3抗體分子)組合投與或使用。在另一實施例中，抗PD-1抗體分子係與CEACAM-5抑制劑(例如抗CEACAM-5抗體分子)組合投與或使用。
本文中所揭示之抗體分子之組合可分開地(例如呈單獨抗體分子)形式投與或例如呈雙特異性或三特異性抗體分子形式連接。在一個實施例中，投與包括抗TIM-3抗體分子及抗PD-1、抗CEACAM (例如抗CEACAM-1、抗CEACAM-3及/或抗CEACAM-5)、抗PD-L1或抗LAG-3抗體分子之雙特異性抗體。在某些實施例中，本文中揭示之抗體之組合用於治療癌症，例如如本文中所描述之癌症(例如實體腫瘤或惡性血液病)。
CD47抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與CD47抑制劑組合投與。在一些實施例中，CD47抑制劑為瑪格瑞單抗(magrolimab)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 CD47 抑制劑 在一些實施例中，CD47抑制劑為抗CD47抗體分子。在一些實施例中，抗CD47抗體包含瑪格瑞單抗。瑪格瑞單抗亦稱為ONO-7913、5F9或Hu5F9-G4。瑪格瑞單抗選擇性地結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與其配體信號調節蛋白α (SIRPα)(表現於吞噬細胞上之蛋白質)之相互作用。此通常防止CD47/SIRPα介導之信號傳導，經由誘導鈣網蛋白(calreticulin)(其特異性地表現於腫瘤細胞之表面上)介導之促吞噬細胞信號傳導而允許巨噬細胞之活化，且促成特異性腫瘤細胞吞噬作用。另外，阻斷CD47信號傳導通常活化抗腫瘤T淋巴球免疫反應及T介導性細胞殺傷。瑪格瑞單抗揭示於例如Sallaman等人Blood 2019 134(Supplement_1):569中。
在一些實施例中，瑪格瑞單抗係靜脈內投與。在一些實施例中，瑪格瑞單抗係在第1週期(例如28天週期)之第1天、第4天、第8天、第11天、第15天及第22天，第2週期(例如28天週期)之第1天、第8天、第15天及第22天，以及第3週期(例如28天週期)之第1天及第15天，以及後續之週期投與。在一些實施例中，瑪格瑞單抗係在例如28天週期之每一週投與至少每週兩次。在一些實施例中，瑪格瑞單抗係以劑量累增方案投與。在一些實施例中，瑪格瑞單抗係以1-30 mg/kg，例如每週1-30 mg/kg投與。
其他 CD47 抑制劑 在一些實施例中，CD47抑制劑為選自以下之抑制劑：B6H12.2、CC-90002、C47B157、C47B161、C47B222、SRF231、ALX148、W6/32、4N1K、4N1、TTI-621、TTI-622、PKHB1、SEN177、MiR-708及MiR-155。在一些實施例中，CD47抑制劑為雙特異性抗體。
在一些實施例中，CD47抑制劑為B6H12.2。B6H12.2揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。B6H12.2為結合於表現於腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與其配體信號調節蛋白α (SIRPα)之相互作用的人類化抗CD74-IgG4抗體。
在一些實施例中，CD47抑制劑為CC-90002。CC-90002揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。CC-90002為靶向人類細胞表面抗原CD47之單株抗體，具有潛在吞噬作用誘導活性及抗贅生活性。投與後，抗CD47單株抗體CC-90002選擇性地結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與信號調節蛋白α (SIRPα)(表現於吞噬細胞上之蛋白質)之相互作用。此防止CD47/SIRPα介導之信號傳導且消除吞噬作用之CD47/SIRPα介導之抑制。此誘導由鈣網蛋白(CRT)(其特異性表現於腫瘤細胞之表面上)與表現於巨噬細胞上之低密度脂蛋白(LDL)受體相關蛋白(LRP)的結合介導之促吞噬細胞信號傳導。此促成巨噬細胞活化及腫瘤細胞之特異性吞噬作用。另外，阻斷CD47信號傳導可活化抗腫瘤T淋巴球免疫反應及表現CD47之腫瘤細胞之T細胞介導性殺傷兩者。在一些實施例中，CC-90002係靜脈內投與。在一些實施例中，CC-90002係在28天週期中靜脈內投與。
在一些實施例中，CD47抑制劑為C47B157、C47B161或C47B222。C47B157、C47B161及C47B222揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/ 10.1186/s13045-020-00930-1中。C47B157、C47B161及C47B222為結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與其配體信號調節蛋白α (SIRPα)之相互作用的人類化抗CD74-IgG1抗體。
在一些實施例中，CD47抑制劑為SRF231。SRF231揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。SRF231為靶向人類細胞表面抗原CD47之單株抗體，具有潛在吞噬作用誘導活性及抗贅生活性。投與後，抗CD47單株抗體SRF231選擇性地結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與信號調節蛋白α (SIRPα)(表現於吞噬細胞上之蛋白質)之相互作用。此防止CD47/SIRPα介導之信號傳導且消除吞噬作用之CD47/SIRPα介導之抑制。此誘導由鈣網蛋白(CRT)(其特異性表現於腫瘤細胞之表面上)與表現於巨噬細胞上之低密度脂蛋白(LDL)受體相關蛋白(LRP)的結合介導之促吞噬細胞信號傳導。此促成巨噬細胞活化及腫瘤細胞之特異性吞噬作用。另外，阻斷CD47信號傳導可活化抗腫瘤T淋巴球免疫反應及表現CD47之腫瘤細胞之T細胞介導性殺傷兩者。
在一些實施例中，CD47抑制劑為ALX148。ALX148揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。ALX148為CD47拮抗劑。其為拮抗人類細胞表面抗原CD47的信號調節蛋白α (SIRPα)之變異體，具有潛在吞噬作用誘導活性、免疫刺激活性及抗贅生活性。投與後，ALX148結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且防止CD47與其配體SIRPα (表現於吞噬細胞上之蛋白質)之相互作用。此防止CD47/SIRPα介導之信號傳導且消除吞噬作用之CD47/SIRPα介導之抑制。此誘導由促吞噬細胞信號傳導蛋白鈣網蛋白(CRT)(其特異性表現於腫瘤細胞之表面上)與表現於巨噬細胞上之低密度脂蛋白(LDL)受體相關蛋白(LRP)的結合介導之促吞噬細胞信號傳導。此促成巨噬細胞活化及腫瘤細胞之特異性吞噬作用。另外，阻斷CD47信號傳導可活化抗腫瘤細胞毒性T淋巴球(CTL)免疫反應及表現CD47之腫瘤細胞之T細胞介導性殺傷兩者。在一些實施例中，ALX148係靜脈內投與。在一些實施例中，ALX148係一週投與至少一次。在一些實施例中，ALX148係一週投與至少兩次。
在一些實施例中，CD47抑制劑為W6/32。W6/32揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。W6/32為靶向CD47-MHC-1之抗CD47抗體。
在一些實施例中，CD47抑制劑為4N1K或4N1。4N1K及4N1揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。4N1K及4N1為CD47-SIRPα肽促效劑。
在一些實施例中，CD47抑制劑為TTI-621。TTI-621揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。TTI-621亦稱為SIRPα-IgG1 Fc。TTI-621為由連接至人類免疫球蛋白G1 (IgG1)之Fc域的人類信號調節蛋白α (SIRPα)之N端CD47結合域構成的可溶重組抗體樣融合蛋白，具有潛在免疫檢查點抑制活性及抗贅生活性。投與後，SIRPα-Fc融合蛋白TTI-621選擇性地靶向及結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與內源性SIRPα (表現在巨噬細胞上之細胞表面蛋白)之相互作用。此防止CD47/SIRPα介導之信號傳導且消除巨噬細胞活化及癌細胞之吞噬作用的CD47/SIRPα介導之抑制。此誘導由鈣網蛋白(CRT)(其特異性表現於腫瘤細胞之表面上)與表現於巨噬細胞上之低密度脂蛋白(LDL)受體相關蛋白-1 (LRP-1)的結合介導之促吞噬細胞信號傳導，且促成巨噬細胞活化及腫瘤細胞之特異性吞噬作用。在一些實施例中，TTI-621係瘤內投與。
在一些實施例中，CD47抑制劑為TTI-622。TTI-622揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。TTI-622亦稱為SIRPα-IgG1 Fc。TTI-622為由連接至來源於人類免疫球蛋白G亞型4 (IgG4)之Fc域的人類信號調節蛋白α (SIRPα；CD172a)之N端CD47結合域構成的可溶重組抗體樣融合蛋白，具有潛在免疫檢查點抑制活性、吞噬作用誘導活性及抗贅生活性。投與後，SIRPα-IgG4-Fc融合蛋白TTI-622選擇性地靶向及結合於表現在腫瘤細胞上之CD47且阻斷CD47與內源性SIRPα (表現在巨噬細胞上之細胞表面蛋白)的相互作用。此防止CD47/SIRPα介導之信號傳導且消除巨噬細胞活化之CD47/SIRPα介導之抑制。此誘導由鈣網蛋白(CRT)(其特異性表現於腫瘤細胞之表面上)與表現於巨噬細胞上之低密度脂蛋白(LDL)受體相關蛋白-1 (LRP-1)的結合引起之促吞噬細胞信號傳導，且促成巨噬細胞活化及腫瘤細胞之特異性吞噬作用。
在一些實施例中，CD47抑制劑為PKHB1。PKHB1揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。PKHB1為結合CD47且阻斷其與SIRPα之相互作用的CD47肽促效劑。
在一些實施例中，CD47抑制劑為SEN177。SEN177揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。SEN177為靶向CD47中之QPCTL的抗體。
在一些實施例中，CD47抑制劑為MiR-708。MiR-708揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。MiR-708為靶向CD47且阻斷其與SIRPα之相互作用的miRNA。
在一些實施例中，CD47抑制劑為MiR-155。MiR-155揭示於例如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1中。MiR-155為靶向CD47且阻斷其與SIRPα之相互作用的miRNA。
在一些實施例中，CD47抑制劑為抗CD74、抗PD-L1雙特異性抗體或抗CD47、抗CD20雙特異性抗體，如Eladl等人Journal of Hematology & Oncology 2020 13(96) https://doi.org/10.1186/s13045-020-00930-1所揭示。
在一些實施例中，CD74抑制劑為LicMAB，如例如Ponce等人Oncotarget 2017 8(7):11284-11301所揭示。
CD70抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與CD70抑制劑組合投與。在一些實施例中，CD70抑制劑為庫薩土珠單抗(cusatuzumab)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 CD70 抑制劑 在一些實施例中，CD70抑制劑為抗CD70抗體分子。在一些實施例中，抗CD70抗體包含庫薩土珠單抗。庫薩土珠單抗亦稱為ARGX-110或JNJ-74494550。庫薩土珠單抗選擇性地結合於CD70且中和其活性，其亦可誘導針對表現CD70之腫瘤細胞的抗體依賴性細胞毒性(ADCC)反應。庫薩土珠單抗揭示於例如Riether等人Nature Medicine 2020 26:1459-1467。
在一些實施例中，庫薩土珠單抗係靜脈內投與。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係皮下投與。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係以1-20 mg/kg，例如1 mg/kg、3 mg/kg、10 mg/kg或20 mg/kg投與。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係每兩週投與一次。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係每兩週以10 mg/kg投與一次。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係每兩週以20 mg/kg投與一次。在一些實施例中，庫薩土珠單抗係在例如28天週期之第3天及第17天投與。
p53活化劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與p53活化劑組合投與。在一些實施例中，p53活化劑為APR-246。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 p53 活化劑 在一些實施例中，p53活化劑為APR-246。APR-246為PRIMA-1之甲基化衍生物及結構類似物(p53再活化及大規模細胞凋亡之誘導)。APR-246亦稱為Eprenetapopt、PRIMA-1MET。APR-246經由硫醇基之烷基化共價調節細胞瘤p53之突變形式之核心域。此等調節恢復突變p53之野生型構形及功能，其恢復內源性p53活性，使得腫瘤細胞之細胞週期停滯及細胞凋亡。APR-246揭示於例如Zhang等人Cell Death and Disease 2018 9(439)中。
在一些實施例中，APR-246在例如28天週期之第1天至第4天投與，例如持續12個週期。在一些實施例中，APR-246係每天以4-5 g (例如4.5 g)投與。
NEDD8抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與NEDD8抑制劑組合投與。在一些實施例中，NEDD8抑制劑為NEDD8活化酶(NAE)之抑制劑。在一些實施例中，NEDD8抑制劑為派伏司他(pevonedistat)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 NEDD8 抑制劑 在一些實施例中，NEDD8抑制劑為小分子抑制劑。在一些實施例中，NEDD8抑制劑為派伏司他。派伏司他亦稱為TAK-924、NAE抑制劑MLN4924、Nedd8活化酶抑制劑MLN4924、MLN4924或胺基苯磺酸((1S,2S,4R)-4-(4-((1S)-2,3-二氫-1H-茚-1-基胺基)-7H-吡咯并(2,3-d)嘧啶-7-基)-2-羥基環戊基)甲酯。派伏司他結合且抑制NAE，此可促成腫瘤細胞增殖及存活之抑制。NAE活化Nedd8 (神經元前驅細胞表現之發育性下調蛋白8)，其為一種修飾與泛素蛋白酶體路徑(UPP)平行但不同的路徑中之細胞目標的類泛素(UBL)蛋白。派伏司他揭示於例如Swords等人Blood (2018) 131(13)1415-1424中。
在一些實施例中，派伏司他係靜脈內投與。在一些實施例中，派伏司他以10-50 mg/m2 ，例如10 mg/m2 、20 mg/m2 、25 mg/m2 、30 mg/m2 或50 mg/m2 投與。在一些實施例中，派伏司他係在例如28天週期之第1天、第3天及第5天投與，持續例如至多16個週期。在一些實施例中，派伏司他係使用固定劑量投與。在一些實施例中，派伏司他係以漸增給藥時程投與。在一些實施例中，派伏司他係在例如各28天週期之第1天以25 mg/m2 及在第8天以50 mg/m2 投與。
CDK9抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與週期蛋白依賴性激酶抑制劑組合投與。在一些實施例中，本文中所描述之組合係進一步與CDK9抑制劑組合投與。在一些實施例中，CDK9抑制劑係選自奧爾沃昔布(alvocidib)或奧爾沃昔布前藥TP-1287。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 CDK9 抑制劑 在一些實施例中，CDK9抑制劑為奧爾沃昔布。奧爾沃昔布亦稱為夫拉平度(flavopiridol)、FLAVO、HMR 1275、L-868275或(-)-2-(2-氯苯基)-5,7-二羥基-8-[(3R,4S)-3-羥基-1-甲基-4-哌啶基]-4H-1-苯并吡喃-4-酮鹽酸鹽。奧爾沃昔布為合成N-甲基哌啶基氯苯基黃酮化合物。作為週期蛋白依賴性激酶之抑制劑，奧爾沃昔布藉由防止週期蛋白依賴性激酶(CDK)之磷酸化及下調週期蛋白D1及D3表現來誘導細胞週期停滯，從而促成G1細胞週期停滯及細胞凋亡。此藥劑亦為三磷酸腺苷活性之競爭性抑制劑。奧爾沃昔布揭示於例如Gupta等人Cancer Sensistizing Agents for Chemotherapy 2019: 第125-149頁。
在一些實施例中，奧爾沃昔布係靜脈內投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係在例如28天週期之第1天、第2天及/或第3天投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係使用固定劑量投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係以漸增給藥時程投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係投與4週，接著為2週休息期，持續例如長達最多6個週期(例如28天週期)。在一些實施例中，奧爾沃昔布係以30-50 mg/m2 ，例如30 mg/m2 或50 mg/m2 投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係以30 mg/m2 呈30分鐘靜脈內(IV)輸注形式，接著以30 mg/m2 呈4小時連續輸注形式投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係歷經30分鐘以30 mg/m2 投與，接著歷經4小時以50 mg/m2 投與。在一些實施例中，奧爾沃昔布係以30 mg/m2 呈30分鐘靜脈內(IV)輸注形式、接著以30 mg/m2 呈4小時連續輸注形式投與第一劑量，且歷經30分鐘以30 mg/m2 、接著歷經4小時以50 mg/m2 投與一或多個後續劑量。
其他 CDK9 抑制劑 在一些實施例中，CDK9抑制劑為TP-1287。TP-1287亦稱為磷酸奧爾沃昔布TP-1287或磷酸奧爾沃昔布。TP-1287為具有潛在抗贅生活性的奧爾沃昔布之經口生物可用、高度可溶磷酸酯前藥，其為一種週期蛋白依賴性激酶-9 (CDK9)之強力抑制劑。投與磷酸酯前藥TP-1287後，前藥在腫瘤位點處酶裂解且釋放活性部分奧爾沃昔布。奧爾沃昔布靶向且結合於CDK9，從而減少諸如抗細胞凋亡蛋白MCL-1之CDK9目標基因之表現，且誘導過度表現CDK9之癌細胞中的G1細胞週期停滯及細胞凋亡。TP-1287係揭示於例如Kim等人Cancer Research (2017) Abstract 5133; 會議記錄：AACR年度會議2017 (Proceedings: AACR Annual Meeting 2017)。在一些實施例中，TP-1287係經口投與。
MDM2抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與MDM2抑制劑組合投與。在一些實施例中，MDM2抑制劑係選自伊達努素(idasanutlin)、KRT-232、米拉德坦(milademetan)或APG-115。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 MDM2 抑制劑 在一些實施例中，MDM2抑制劑為小分子抑制劑。在一些實施例中，MDM2抑制劑為伊達努素。伊達努素亦稱為RG7388或RO 5503781。伊達努素為MDM2 (小鼠雙微體2；Mdm2 p53結合蛋白同源物)之經口可用小分子拮抗劑，具有潛在抗贅生活性。伊達努素結合於MDM2，從而阻斷MDM2蛋白與腫瘤抑制蛋白p53之轉錄活化域之間的相互作用。藉由防止MDM2-p53相互作用，p53不會酶降解，且p53之轉錄活性恢復，由此可引起腫瘤細胞細胞凋亡之p53介導性誘導。伊達努素揭示於例如Mascarenhas等人 Blood (2019) 134(6):525-533中。在一些實施例中，伊達努素係經口投與。在一些實施例中，伊達努素係在例如28天週期之第1天至第5天投與。在一些實施例中，伊達努素係以400-500 mg (例如300 mg)投與。在一些實施例中，伊達努素係每天投與一次或兩次。在一些實施例中，伊達努素係以300 mg在第1週期(例如28天週期)中每天投與兩次或在第2週期及/或第3週期(例如28天週期)中每天投與一次，每個治療週期(例如28天週期)持續例如5天。
在一些實施例中，MDM2抑制劑為KRT-232。KRT-232亦稱為(3R,5R,6S)-5-(3-氯苯基)-6-(4-氯苯基)-3-甲基-1-((1S)-2-甲基-1-(((1-甲基乙基)磺醯基)甲基)丙基)-2-側氧基-3-哌啶乙酸或AMG-232。KRT-232為MDM2 (鼠類雙微體2)之經口可用抑制劑，具有潛在抗贅生活性。經口投與後，MDM2抑制劑KRT-232結合於MDM2蛋白且防止其結合於腫瘤抑制蛋白p53之轉錄活化域。藉由防止此MDM2-p53相互作用，p53之轉錄活性恢復。KRT-232揭示於例如Garcia-Delgado等人Blood (2019) 134(Supplement_1): 2945中。在一些實施例中，KRT-232係經口投與。在一些實施例中，KRT-232係每天投與一次。在一些實施例中，KRT-232係在週期(例如28天週期)之第1天至第7天投與。在一些實施例中，KRT-232係在例如28天週期之第4天至第10天及第18天至第24天投與，持續例如至多4個週期。
在一些實施例中，MDM2抑制劑為米拉德坦。米拉德坦亦稱為HDM2抑制劑DS-3032b或DS-3032b。米拉德坦為經口可用MDM2 (鼠類雙微體2)拮抗劑，具有潛在抗贅生活性。經口投與後，甲苯磺酸米拉德坦結合於MDM2蛋白且防止其結合於腫瘤抑制蛋白p53之轉錄活化域。藉由防止MDM2-p53相互作用，抑制p53之蛋白酶體介導性酶降解，且p53之轉錄活性恢復。此促成p53信號傳導之恢復且引起腫瘤細胞細胞凋亡之p53介導性誘導。米拉德坦揭示於例如DiNardo等人Blood (2019) 134(Supplement_1):3932中。在一些實施例中，米拉德坦係經口投與。在一些實施例中，米拉德坦係以5-200 mg (例如5 mg、20 mg、30 mg、80 mg、100 mg、90 mg及/或200 mg)投與。在一些實施例中，米拉德坦係以單顆膠囊或多顆膠囊投與。在一些實施例中，米拉德坦係以固定劑量投與。在一些實施例中，米拉德坦係以劑量累增方案投與。在一些實施例中，米拉德坦係進一步與喹紮替尼(quizartinib)(FLT3之抑制劑)組合投與。在一些實施例中，米拉德坦係以5-200 mg (例如5 mg、20 mg、80 mg或200 mg)投與，且喹紮替尼係以20-30 mg (例如20 mg或30 mg)投與。
在一些實施例中，MDM2抑制劑為APG-115。APG-115為人類同源微體2 (HDM2；小鼠雙微體2同源物；MDM2)之經口可用抑制劑，具有潛在抗贅生活性。經口投與後，p53-MDM2蛋白-蛋白相互作用抑制劑APG-115結合於MDM2，從而防止HDM2蛋白與腫瘤抑制蛋白p53之轉錄活化域結合。藉由防止此MDM2-p53相互作用，抑制p53之蛋白酶體介導性酶降解，且p53之轉錄活性恢復。此可促成p53信號傳導之恢復且引起腫瘤細胞細胞凋亡之p53介導性誘導。APG-115揭示於例如Fang等人Journal for ImmunoTherapy of Cancer (2019) 7(327)中。在一些實施例中，APG-115係經口投與。在一些實施例中，APG-115係以100-250 mg (例如100 mg、150 mg、200 mg及/或250 mg)投與。在一些實施例中，APG-115係在例如28天週期之第1天至第5天投與。在一些實施例中，APG-115係在例如28天週期之第1天至第7天投與。在一些實施例中，APG-115係以均一劑量投與。在一些實施例中，APG-115係以劑量累增時程投與。在一些實施例中，APG-115係在28天週期之第1天至第5天以100毫克/天投與。在一些實施例中，APG-115係在28天週期之第1天至第5天以150毫克/天投與。在一些實施例中，APG-115係在28天週期之第1天至第5天以200毫克/天投與。在一些實施例中，APG-115係在28天週期之第1天至第5天以250毫克/天投與。
FLT3抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與FTL3抑制劑組合投與。在一些實施例中，FLT3抑制劑係選自吉列替尼(gilteritinib)、喹紮替尼(quizartinib)或克諾拉尼(crenolanib)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 FLT3 抑制劑 在一些實施例中，FLT3抑制劑為吉列替尼。吉列替尼亦稱為ASP2215。吉列替尼為受體酪胺酸激酶(RTK) FMS相關酪胺酸激酶3 (FLT3、STK1或FLK2)、AXL (UFO或JTK11)及退行性淋巴瘤激酶(ALK或CD246)之經口生物可用抑制劑，具有潛在抗贅生活性。吉列替尼結合且抑制FLT3、AXL及ALK之野生型形式及突變形式。此可促成FLT3、AXL及ALK介導性信號轉導路徑之抑制及過度表現此等RTK之癌細胞類型中腫瘤細胞增殖之減少。吉列替尼揭示於例如Perl等人N Engl J Med (2019) 381:1728-1740中。在一些實施例中，吉列替尼係經口投與。
在一些實施例中，FLT3抑制劑為喹紮替尼。喹紮替尼亦稱為AC220或1-(5-第三丁基-1,2-㗁唑-3-基)-3-[4-[6-(2-𠰌啉-4-基乙氧基)咪唑并[2,1-b][1,3]苯并噻唑-2-基]苯基]脲。喹紮替尼揭示於例如Cortes等人The Lancet (2019) 20(7):984-997中。在一些實施例中，喹紮替尼係經口投與。在一些實施例中，喹紮替尼係以20-60 mg (例如20 mg、30 mg、40 mg及/或60 mg)投與。在一些實施例中，喹紮替尼係一天投與一次。在一些實施例中，喹紮替尼係以均一劑量投與。在一些實施例中，喹紮替尼係以20毫克/天投與。在一些實施例中，喹紮替尼係每天以30 mg投與一次。在一些實施例中，喹紮替尼係每天以40 mg投與一次。在一些實施例中，喹紮替尼係以劑量累增方案投與。在一些實施例中，喹紮替尼係在例如28天週期之第1天至第14天以30毫克/天投與，且在例如28天週期之第15天至第28天以60毫克/天投與。在一些實施例中，喹紮替尼係在例如28天週期之第1天至第14天以20毫克/天投與，且在例如28天週期之第15天至第28天以30毫克/天投與。
在一些實施例中，FLT3抑制劑為克諾拉尼。克諾拉尼為具有潛在抗贅生活性之經口生物可用小分子，其靶向血小板衍生生長因子受體(PDGFR)。克諾拉尼結合且抑制PDGFR，此可促成PDGFR相關信號轉導路徑之抑制且因此抑制腫瘤血管生成及腫瘤細胞增殖。克諾拉尼亦稱為CP-868596。克諾拉尼揭示於例如Zimmerman等人Blood (2013) 122(22):3607-3615中。在一些實施例中，克諾拉尼係經口投與。在一些實施例中，克諾拉尼係每天投與。在一些實施例中，克諾拉尼係以100-200 mg(例如100 mg或200 mg)投與。在一些實施例中，克諾拉尼係一天投與一次、一天投與兩次或一天投與三次。在一些實施例中，克諾拉尼係以200毫克/天分三個相等劑量例如每8個小時進行投與。
KIT抑制劑  在某些實施例中，視情況與本文中所描述之低甲基化劑組合的本文中所描述之抗TIM-3抗體進一步與KIT抑制劑組合投與。在一些實施例中，KIT抑制劑係選自瑞普替尼(ripretinib)或阿瓦替尼(avapritinib)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 KIT 抑制劑 在一些實施例中，KIT抑制劑為瑞普替尼。瑞普替尼為腫瘤相關抗原(TAA)肥大細胞/幹細胞因子受體(SCFR)KIT及血小板衍生生長因子受體α (PDGFR-α；PDGFRa)之野生型形式及突變型式的經口生物可用切換袋(switch pocket)控制抑制劑，具有潛在抗贅生活性。經口投與後，瑞普替尼特異性地在其切換袋結合位點靶向且結合KIT及PDGFRa之野生型形式及突變形式，從而防止此等激酶自非活性構形切換至活性構形且使其野生型形式及突變形式不活化。此消除KIT/PDGFRa介導之腫瘤細胞信號傳導且防止KIT/PDGFRa驅動之癌症的擴散。DCC-2618亦抑制若干其他激酶，包括2型血管內皮生長因子受體(VEGFR2；KDR)、血管生成素-1受體(TIE2；TEK)、PDGFR-β及巨噬細胞群落刺激因子1受體(FMS；CSF1R)，從而進一步抑制腫瘤細胞生長。瑞普替尼亦稱為DCC2618、QINLOCK™ (Deciphera)或1-N'-[2,5-二氟-4-[2-(1-甲基吡唑-4-基)吡啶-4-基]氧基苯基]-1-N'-苯基環丙烷-1,1-二甲醯胺。在一些實施例中，瑞普替尼係經口投與。在一些實施例中，瑞普替尼係以100-200 mg (例如150 mg)投與。在一些實施例中，瑞普替尼係以三片50 mg錠劑投與。在一些實施例中，瑞普替尼係每天以150 mg投與一次。在一些實施例中，瑞普替尼係每天以三片50 mg錠劑一起投與一次。
在一些實施例中，KIT抑制劑為阿瓦替尼。阿瓦替尼亦稱為BLU-285或AYVAKIT™ (Blueprint Medicines)。阿瓦替尼為血小板衍生生長因子受體α (PDGFRα；PDGFRa)及肥大細胞/幹細胞因子受體c-Kit (SCFR)之特定突變形式之經口生物可用抑制劑，具有潛在抗贅生活性。經口投與後，阿瓦替尼特異性結合且抑制PDGFRa及c-Kit之特定突變形式，包括PDGFRa D842V突變體及各種KIT外顯子17突變體。此促成PDGFRa及c-Kit介導之信號轉導路徑之抑制以及表現此等PDGFRa及c-Kit突變體之腫瘤細胞之增殖的抑制。在一些實施例中，阿瓦替尼係經口投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係每天投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係以100-300 mg (例如100 mg、200 mg、300 mg)投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係一天投與一次。在一些實施例中，阿瓦替尼係一天一次以300 mg投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係一天一次以200 mg投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係一天一次以100 mg投與。在一些實施例中，阿瓦替尼係在例如28天週期中連續地投與。
PD-1抑制劑  在某些實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係進一步與PD-1抑制劑組合投與。在一些實施例中，PD-1抑制劑係選自斯巴達珠單抗(spartalizumab) (PDR001，Novartis)、納武單抗(Nivolumab)(Bristol-Myers Squibb)、帕博利珠單抗(Pembrolizumab)(Merck & Co)、皮立珠單抗(Pidilizumab)(CureTech)、MEDI0680 (Medimmune)、REGN2810 (Regeneron)、TSR-042 (Tesaro)、PF-06801591 (Pfizer)、BGB-A317 (Beigene)、BGB-108 (Beigene)、INCSHR1210 (Incyte)或AMP-224 (Amplimmune)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 PD-1 抑制劑 在一個實施例中，PD-1抑制劑為抗PD-1抗體分子。在一個實施例中，PD-1抑制劑為如2015年7月30日公開之名稱為「Antibody Molecules to PD-1 and Uses Thereof」之US 2015/0210769中所描述之抗PD-1抗體分子，該文獻以全文引用之方式併入。本文所描述之抗體分子可藉由US 2015/0210769中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。
其他例示性 PD-1 抑制劑 在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為納武單抗(Bristol-Myers Squibb)，亦稱為MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558或OPDIVO®。納武單抗(純系5C4)及其他抗PD-1抗體揭示於US 8,008,449及WO 2006/121168中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含納武單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為帕博利珠單抗(Merck & Co)，亦稱為拉立珠單抗(Lambrolizumab)、MK-3475、MK03475、SCH-900475或KEYTRUDA®。帕博利珠單抗及其他抗PD-1抗體揭示於Hamid, O.等人(2013)New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44、US 8,354,509及WO 2009/114335中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含帕博利珠單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為皮立珠單抗(CureTech)，亦稱為CT-011。皮立珠單抗及其他抗PD-1抗體揭示於Rosenblatt, J.等人(2011)J Immunotherapy 34(5): 409-18、US 7,695,715、US 7,332,582及US 8,686,119中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含皮立珠單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為MEDI0680 (Medimmune)，亦稱為AMP-514。MEDI0680及其他抗PD-1抗體揭示於US 9,205,148及WO 2012/145493中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含MEDI0680之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為REGN2810 (Regeneron)。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含REGN2810之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為PF-06801591 (Pfizer)。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含PF-06801591之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為BGB-A317或BGB-108 (Beigene)。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含BGB-A317或BGB-108之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為INCSHR1210 (Incyte)，亦稱為INCSHR01210或SHR-1210。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含INCSHR1210之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-1抗體分子為TSR-042 (Tesaro)，亦稱為ANB011。在一個實施例中，抗PD-1抗體分子包含TSR-042之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
其他已知抗PD-1抗體包括例如以下中所描述之彼等抗體：WO 2015/112800、WO 2016/092419、WO 2015/085847、WO 2014/179664、WO 2014/194302、WO 2014/209804、WO 2015/200119、US 8,735,553、US 7,488,802、US 8,927,697、US 8,993,731及US 9,102,727，該等文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗PD-1抗體為與本文所描述之抗PD-1抗體中之一者競爭結合PD-1及/或結合於PD-1上之相同抗原決定基的抗體。
在一個實施例中，PD-1抑制劑為抑制PD-1信號傳導路徑之肽，例如如US 8,907,053中所描述，該文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，PD-1抑制劑為與恆定區(例如免疫球蛋白序列之Fc區)融合之免疫黏附素(例如包含PD-L1或PD-L2的細胞外或PD-1結合部分的免疫黏附素)。在一個實施例中，PD-1抑制劑為AMP-224 (例如揭示於WO 2010/027827及WO 2011/066342中之B7-DCIg (Amplimmune)，該等文獻以全文引用之方式併入)。
PD-L1抑制劑  在某些實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係進一步與PD-L1抑制劑組合投與。在一些實施例中，PD-L1抑制劑係選自FAZ053 (Novartis)、阿特珠單抗(Atezolizumab)(Genentech/Roche)、阿維魯單抗(Avelumab)(Merck Serono及Pfizer)、德瓦魯單抗(Durvalumab) (MedImmune/AstraZeneca)或BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 PD-L1 抑制劑 在一個實施例中，PD-L1抑制劑為抗PD-L1抗體分子。在一個實施例中，PD-L1抑制劑為如2016年4月21日公開之名稱為「Antibody Molecules to PD-L1 and Uses Thereof」之US 2016/0108123中所揭示之抗PD-L1抗體分子，該文獻以全文引用之方式併入。本文所描述之抗體分子可藉由US 2016/0108123中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。
其他例示性 PD-L1 抑制劑 在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子為阿特珠單抗(Genentech/Roche)，亦稱為MPDL3280A、RG7446、RO5541267、YW243.55.S70或TECENTRIQ™。阿特珠單抗及其他抗PD-L1抗體揭示於US 8,217,149中，該文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子包含阿特珠單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子為阿維魯單抗(Merck Serono及Pfizer)，亦稱為MSB0010718C。阿維魯單抗及其他抗PD-L1抗體揭示於WO 2013/079174中，該文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子包含阿維魯單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子為德瓦魯單抗(MedImmune/AstraZeneca)，亦稱為MEDI4736。德瓦魯單抗及其他抗PD-L1抗體揭示於US 8,779,108中，該文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子包含德瓦魯單抗之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子為BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb)，亦稱為MDX-1105或12A4。BMS-936559及其他抗PD-L1抗體揭示於US 7,943,743及WO 2015/081158中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗PD-L1抗體分子包含BMS-936559之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
其他已知抗PD-L1抗體包括例如以下中所描述之彼等抗體：WO 2015/181342、WO 2014/100079、WO 2016/000619、WO 2014/022758、WO 2014/055897、WO 2015/061668、WO 2013/079174、WO 2012/145493、WO 2015/112805、WO 2015/109124、WO 2015/195163、US 8,168,179、US 8,552,154、US 8,460,927及US 9,175,082，該等文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗PD-L1抗體為與本文所描述之抗PD-L1抗體中之一者競爭結合PD-L1及/或結合於PD-L1上之相同抗原決定基的抗體。
LAG-3抑制劑  在某些實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係進一步與LAG-3抑制劑組合投與。在一些實施例中，LAG-3抑制劑係選自LAG525 (Novartis)、BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb)或TSR-033 (Tesaro)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 LAG-3 抑制劑 在一個實施例中，LAG-3抑制劑為抗LAG-3抗體分子。在一個實施例中，LAG-3抑制劑為如2015年9月17日公開之名稱為「Antibody Molecules to LAG-3 and Uses Thereof」之US 2015/0259420中所揭示之抗LAG-3抗體分子，該文獻以全文引用之方式併入本文中。本文所描述之抗體分子可藉由US 2015/0259420中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。
其他例示性 LAG-3 抑制劑 在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子為BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb)，亦稱為BMS986016。BMS-986016及其他抗LAG-3抗體揭示於WO 2015/116539及US 9,505,839中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子包含BMS-986016之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子為TSR-033 (Tesaro)。在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子包含TSR-033之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子為IMP731或GSK2831781 (GSK及Prima BioMed)。IMP731及其他抗LAG-3抗體揭示於WO 2008/132601及US 9,244,059中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子包含IMP731之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子包含GSK2831781之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子為IMP761 (Prima BioMed)。在一個實施例中，抗LAG-3抗體分子包含IMP761之一或多個CDR序列(或集合地所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。
其他已知抗LAG-3抗體包括例如以下中所描述之彼等抗體：WO 2008/132601、WO 2010/019570、WO 2014/140180、WO 2015/116539、WO 2015/200119、WO 2016/028672、US 9,244,059、US 9,505,839，該等文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗LAG-3抗體為與本文所描述之抗LAG-3抗體中之一者競爭結合LAG-3及/或結合於LAG-3上之相同抗原決定基的抗體。
在一個實施例中，抗LAG-3抑制劑為可溶LAG-3蛋白，例如IMP321 (Prima BioMed)，例如如WO 2009/044273中所揭示，該文獻以全文引用之方式併入。
GITR促效劑  在某些實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係與GITR促效劑組合投與。在一些實施例中，GITR促效劑為GWN323 (NVS)、BMS-986156、MK-4166或MK-1248 (Merck)、TRX518 (Leap Therapeutics)、INCAGN1876 (Incyte/Agenus)、AMG 228 (Amgen)或INBRX-110 (Inhibrx)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 GITR 促效劑 在一個實施例中，GITR促效劑為抗GITR抗體分子。在一個實施例中，GITR促效劑為如2016年4月14日公開之名稱為「Compositions and Methods of Use for Augmented Immune Response and Cancer Therapy」之WO 2016/057846中所描述的抗GITR抗體分子，該文獻以全文引用之方式併入。本文所描述之抗體分子可藉由WO 2016/057846中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。
其他例示性 GITR 促效劑 在一個實施例中，抗GITR抗體分子為BMS-986156 (Bristol-Myers Squibb)，亦稱為BMS 986156或BMS986156。BMS-986156及其他抗GITR抗體揭示於例如US 9,228,016及WO 2016/196792中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗GITR抗體分子包含BMS-986156之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗GITR抗體分子為MK-4166或MK-1248 (Merck)。MK-4166、MK-1248及其他抗GITR抗體揭示於例如US 8,709,424、WO 2011/028683、WO 2015/026684，及Mahne等人Cancer Res. 2017; 77(5):1108-1118中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗GITR抗體分子包含MK-4166或MK-1248之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗GITR抗體分子為TRX518 (Leap Therapeutics)。TRX518及其他抗GITR抗體揭示於例如US 7,812,135、US 8,388,967、US 9,028,823、WO 2006/105021及Ponte J等人(2010)Clinical Immunology ; 135:S96中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗GITR抗體分子包含TRX518之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗GITR抗體分子為INCAGN1876 (Incyte/Agenus)。INCAGN1876及其他抗GITR抗體揭示於例如US 2015/ 0368349及WO 2015/184099中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗GITR抗體分子包含INCAGN1876之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗GITR抗體分子為AMG 228 (Amgen)。AMG 228及其他抗GITR抗體揭示於例如US 9,464,139及WO 2015/ 031667中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，抗GITR抗體分子包含AMG 228之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，抗GITR抗體分子為INBRX-110 (Inhibrx)。INBRX-110及其他抗GITR抗體揭示於例如US 2017/0022284及WO 2017/015623中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，GITR促效劑包含INBRX-110之一或多個CDR序列(或全體所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列，或重鏈或輕鏈序列。
在一個實施例中，GITR促效劑(例如融合蛋白)為MEDI 1873 (MedImmune)，亦稱為MEDI1873。MEDI 1873及其他GITR促效劑揭示於例如US 2017/0073386、WO 2017/025610，及Ross 等人Cancer Res 2016; 76(14增刊): Abstract nr 561中，該等文獻以全文引用之方式併入。在一個實施例中，GITR促效劑包含MEDI 1873之糖皮質激素誘導TNF受體配體(GITRL)之IgG Fc域、功能性多聚合域及受體結合域中之一或多者。
其他已知GITR促效劑(例如抗GITR抗體)包括例如WO 2016/054638中所描述之彼等促效劑，該文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，抗GITR抗體為與本文所描述之抗GITR抗體中之一者競爭結合GITR及/或結合於GITR上之相同抗原決定基的抗體。
在一個實施例中，GITR促效劑為活化GITR信號傳導路徑之肽。在一個實施例中，GITR促效劑為與恆定區(例如免疫球蛋白序列之Fc區)融合之免疫黏附素結合片段(例如包含GITRL之細胞外或GITR結合部分的免疫黏附素結合片段)。
IL15/IL-15Ra複合物  在某些實施例中，本文中所描述之化合物及/或組合係進一步與IL-15/IL-15Ra複合物組合投與。在一些實施例中，IL-15/IL-15Ra複合物係選自NIZ985 (Novartis)、ATL-803 (Altor)或CYP0150 (Cytune)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括MDS (例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，此等組合用於治療本文中所揭示之癌症適應症，包括本文中所揭示之血液科適應症，包括CMML (例如CMML-1或CMML-2)。
例示性 IL-15/IL-15Ra 複合物 在一個實施例中，IL-15/IL-15Ra複合物包含與人類IL-15Ra之可溶形式複合的人類IL-15。該複合物可包含與IL-15Ra之可溶形式共價或非共價結合的IL-15。在一特定實施例中，人類IL-15與IL-15Ra之可溶形式非共價結合。在一特定實施例中，該組合物中之人類IL-15包含如以全文引用之方式併入本文中的WO 2014/066527中所描述之胺基酸序列，且人類IL-15Ra之可溶形式包含如以全文引用之方式併入的WO 2014/066527中所描述的胺基酸序列。本文所描述之分子可藉由WO 2007/084342中所描述之載體、宿主細胞及方法製得，該文獻以全文引用之方式併入。
其他例示性 IL-15/IL-15Ra 複合物 在一個實施例中，IL-15/IL-15Ra複合物為ALT-803，一種IL-15/IL-15Ra Fc融合蛋白(IL-15N72D:IL-15RaSu/Fc可溶複合物)。ALT-803揭示於WO 2008/143794中，該文獻以全文引用之方式併入。
在一個實施例中，IL-15/IL-15Ra複合物包含與IL-15Ra之sushi域融合的IL-15 (CYP0150，Cytune)。IL-15Ra之sushi域係指開始於IL-15Ra之信號肽之後的第一半胱胺酸殘基且結束於該信號肽之後的第四半胱胺酸殘基的域。IL-15與IL-15Ra之sushi域融合的複合物揭示於WO 2007/04606及WO 2012/175222中，該等文獻以全文引用之方式併入。
醫藥組合物、調配物及套組  在另一態樣中，本發明提供組合物，例如醫藥學上可接受之組合物，其包括與醫藥學上可接受之載劑調配在一起的本文所描述之組合。如本文所用，「醫藥學上可接受之載劑」包括生理學上相容的任何及所有溶劑、分散介質、等張劑及吸收延遲劑及其類似物。載劑可適合於靜脈內、肌肉內、皮下、非經腸、經直腸、經脊髓或表皮投與(例如藉由注射或輸注)。
本文所描述之組合物可呈多種形式。此等形式包括例如液體、半固體及固體劑型，諸如液體溶液(例如可注射及可輸注溶液)、分散液或懸浮液、脂質體及栓劑。較佳形式視所欲投與模式及治療應用而定。典型較佳組合物係呈可注射或可輸注溶液形式。較佳投與模式為非經腸(例如靜脈內、皮下、腹膜內、肌肉內)。在一較佳實施例中，抗體係藉由靜脈內輸注或注射投與。在另一較佳實施例中，抗體係藉由肌肉內或皮下注射投與。
如本文所用之片語「非經腸投與(parenteral administration/administered parenterally)」意謂除經腸及體表投與以外的投與模式，通常為注射，且包括但不限於靜脈內、肌肉內、動脈內、鞘內、囊內、眶內、心內、皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛膜下、脊柱內、硬膜外及胸骨內注射及輸注。
治療組合物在製造及儲存條件下通常應無菌且穩定。組合物可調配為溶液、微乳液、分散液、脂質體或適合於高抗體濃度之其他有序結構。可藉由視需要將所需量之活性化合物(例如抗體或抗體部分)與以上所列舉成分之一者或組合一起併入適當溶劑中，隨後過濾滅菌來製備無菌可注射溶液。一般而言，藉由將活性化合物併入含有鹼性分散介質及來自以上所列舉成分的所需其他成分的無菌媒劑中來製備分散液。在用於製備無菌可注射溶液之無菌粉末的情況下，較佳製備方法為真空乾燥及冷凍乾燥，其自其先前無菌過濾溶液產生活性成分加上任何另外所需成分的粉劑。可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣、在分散液之情況下藉由維持所需粒度及藉由使用界面活性劑來維持溶液之適當流動性。可注射組合物之延長吸收可藉由在組合物中包括延遲吸收劑(例如單硬脂酸鹽及明膠)來達成。
本文所描述之組合或組合物可調配於適合於如本文所描述向個體投與(例如靜脈內投與)的調配物(例如劑量調配物或劑型)。本文所描述之調配物可為液體調配物、凍乾調配物或復原調配物。
在某些實施例中，調配物為液體調配物。在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含TIM-3抑制劑(例如本文所描述之抗TIM-3抗體分子)及緩衝劑。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以如下濃度存在之抗TIM-3抗體分子：25 mg/mL至250 mg/mL，例如50 mg/mL至200 mg/mL、60 mg/mL至180 mg/mL、70 mg/mL至150 mg/mL、80 mg/mL至120 mg/mL、90 mg/mL至110 mg/mL、50 mg/mL至150 mg/mL、50 mg/mL至100 mg/mL、150 mg/mL至200 mg/mL或100 mg/mL至200 mg/mL，例如50 mg/mL、60 mg/mL、70 mg/mL、80 mg/mL、90 mg/mL、100 mg/mL、110 mg/mL、120 mg/mL、130 mg/mL、140 mg/mL或150 mg/mL。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子係以80 mg/mL至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含緩衝劑，該緩衝劑包含組胺酸(例如組胺酸緩衝液)。在某些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以如下濃度存在：1 mM至100 mM，例如2 mM至50 mM、5 mM至40 mM、10 mM至30 mM、15至25 mM、5 mM至40 mM、5 mM至30 mM、5 mM至20 mM、5 mM至10 mM、40 mM至50 mM、30 mM至50 mM、20 mM至50 mM、10 mM至50 mM或5 mM至50 mM，例如2 mM、5 mM、10 mM、15 mM、20 mM、25 mM、30 mM、35 mM、40 mM、45 mM或50 mM。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以15 mM至25 mM (例如20 mM)之濃度存在。在其他實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)之pH為4至7，例如5至6，例如5、5.5或6。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)之pH為5至6，例如5.5。在某些實施例中，緩衝劑包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)。在某些實施例中，緩衝劑包含組胺酸及組胺酸-HCl。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；及包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)進一步包含碳水化合物。在某些實施例中，碳水化合物為蔗糖。在一些實施例中，碳水化合物(例如蔗糖)係以如下濃度存在：50 mM至500 mM，例如100 mM至400 mM、150 mM至300 mM、180 mM至250 mM、200 mM至240 mM、210 mM至230 mM、100 mM至300 mM、100 mM至250 mM、100 mM至200 mM、100 mM至150 mM、300 mM至400 mM、200 mM至400 mM或100 mM至400 mM，例如100 mM、150 mM、180 mM、200 mM、220 mM、250 mM、300 mM、350 mM或400 mM。在一些實施例中，調配物包含以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL(例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑；及以200 mM至250 mM(例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)進一步包含界面活性劑。在某些實施例中，界面活性劑為聚山梨醇酯20。在一些實施例中，界面活性劑或聚山梨醇酯20係以如下濃度存在：0.005 %至0.1% (w/w)，例如0.01%至0.08%、0.02%至0.06%、0.03%至0.05%、0.01%至0.06%、0.01%至0.05%、0.01%至0.03%、0.06%至0.08%、0.04%至0.08%或0.02%至0.08% (w/w)，例如0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%、0.07%、0.08%、0.09%或0.1% (w/w)。在一些實施例中，調配物包含以0.03%至0.05% (例如0.04%)(w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑；以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.03%至0.05% (例如0.04%)(w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，調配物(例如液體調配物)包含以100 mg/mL之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為20 mM之組胺酸緩衝液(例如組胺酸/組胺酸-HCL)且pH為5.5的緩衝劑；以220 mM之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.04% (w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，該液體調配物係藉由稀釋包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子的調配物來製備。舉例而言，可用包含一或多種賦形劑(例如濃縮賦形劑)之溶液稀釋藥物物質調配物。在一些實施例中，溶液包含組胺酸、蔗糖或聚山梨醇酯20中之一者、兩者或全部。在某些實施例中，溶液包含與藥物物質調配物相同之賦形劑。例示性賦形劑包括但不限於胺基酸(例如組胺酸)、碳水化合物(例如蔗糖)或界面活性劑(例如聚山梨醇酯20)。在某些實施例中，液體調配物不為復原凍乾調配物。在其他實施例中，液體調配物為復原凍乾調配物。在一些實施例中，調配物以液體形式儲存。在其他實施例中，調配物係以液體形式製備，且隨後例如藉由凍乾或噴霧乾燥而乾燥，之後儲存。
在某些實施例中，每容器(例如小瓶)填充0.5 mL至10 mL (例如0.5 mL至8 mL、1 mL至6 mL或2 mL至5 mL，例如1 mL、1.2 mL、1.5 mL、2 mL、3 mL、4 mL、4.5 mL或5 mL)液體調配物。在其他實施例中，液體調配物填充至容器(例如小瓶)中，以使得每容器(例如小瓶)可抽取至少1 mL(例如至少1.2 mL、至少1.5 mL、至少2 mL、至少3 mL、至少4 mL或至少5 mL)之可抽出體積的液體調配物。在某些實施例中，液體調配物係在臨床地點在不稀釋之情況下自容器(例如小瓶)抽出。在某些實施例中，液體調配物係在臨床地點自藥物物質調配物稀釋及/或自容器(例如小瓶)抽出。在某些實施例中，調配物(例如液體調配物)係在開始向患者輸注之前例如1小時內(例如45分鐘、30分鐘或15分鐘內)注射至輸注袋。
本文所描述之調配物可儲存於容器中。用於本文所描述之調配物中之任一者的容器可包括例如小瓶及視情況存在之塞子、蓋子或兩者。在某些實施例中，小瓶為玻璃小瓶，例如6R白色玻璃小瓶。在其他實施例中，塞子為橡膠塞，例如灰色橡膠塞。在其他實施例中，蓋子為易拉蓋，例如鋁易拉蓋。在一些實施例中，容器包含6R白色玻璃小瓶、灰色橡膠塞及鋁易拉蓋。在一些實施例中，容器(例如小瓶)係單次用容器。在某些實施例中，容器(例如小瓶)中存在25 mg/mL至250 mg/mL，例如50 mg/mL至200 mg/mL、60 mg/mL至180 mg/mL、70 mg/mL至150 mg/mL、80 mg/mL至120 mg/mL、90 mg/mL至110 mg/mL、50 mg/mL至150 mg/mL、50 mg/mL至100 mg/mL、150 mg/mL至200 mg/mL或100 mg/mL至200 mg/mL，例如50 mg/mL、60 mg/mL、70 mg/mL、80 mg/mL、90 mg/mL、100 mg/mL、110 mg/mL、120 mg/mL、130 mg/mL、140 mg/mL或150 mg/mL之抗TIM-3抗體分子。
在一些實施例中，調配物為凍乾調配物。在某些實施例中，凍乾調配物係自包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子的液體調配物凍乾或乾燥。舉例而言，每容器(例如小瓶)可填充1至5 mL(例如1至2 mL)之液體調配物，且予以凍乾。
在一些實施例中，調配物為復原調配物。在某些實施例中，復原調配物係自包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子的凍乾調配物復原。舉例而言，復原調配物可藉由將凍乾調配物溶解於稀釋劑中以便蛋白質分散於復原調配物中而製備。在一些實施例中，凍乾調配物係用1 mL至5 mL (例如1 mL至2 mL，例如1.2 mL)注射用水或緩衝液復原。在某些實施例中，凍乾調配物係用1 mL至2 mL注射用水例如在臨床地點復原。
在一些實施例中，復原調配物包含抗TIM-3抗體分子(例如本文所描述之抗TIM-3抗體分子)及緩衝劑。
在一些實施例中，復原調配物包含以如下濃度存在之抗TIM-3抗體分子：25 mg/mL至250 mg/mL，例如50 mg/mL至200 mg/mL、60 mg/mL至180 mg/mL、70 mg/mL至150 mg/mL、80 mg/mL至120 mg/mL、90 mg/mL至110 mg/mL、50 mg/mL至150 mg/mL、50 mg/mL至100 mg/mL、150 mg/mL至200 mg/mL或100 mg/mL至200 mg/mL，例如50 mg/mL、60 mg/mL、70 mg/mL、80 mg/mL、90 mg/mL、100 mg/mL、110 mg/mL、120 mg/mL、130 mg/mL、140 mg/mL或150 mg/mL。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子係以80 mg/mL至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在。
在一些實施例中，復原調配物包含緩衝劑，該緩衝劑包含組胺酸(例如組胺酸緩衝液)。在某些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以如下濃度存在：1 mM至100 mM，例如2 mM至50 mM、5 mM至40 mM、10 mM至30 mM、15至25 mM、5 mM至40 mM、5 mM至30 mM、5 mM至20 mM、5 mM至10 mM、40 mM至50 mM、30 mM至50 mM、20 mM至50 mM、10 mM至50 mM或5 mM至50 mM，例如2 mM、5 mM、10 mM、15 mM、20 mM、25 mM、30 mM、35 mM、40 mM、45 mM或50 mM。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)係以15 mM至25 mM (例如20 mM)之濃度存在。在其他實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)之pH為4至7，例如5至6，例如5、5.5或6。在一些實施例中，緩衝劑(例如組胺酸緩衝液)之pH為5至6，例如5.5。在某些實施例中，緩衝劑包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)。在某些實施例中，緩衝劑包含組胺酸及組胺酸-HCl。
在一些實施例中，復原調配物包含以80至120 mg/mL (例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；及包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑。
在一些實施例中，復原調配物進一步包含碳水化合物。在某些實施例中，碳水化合物為蔗糖。在一些實施例中，碳水化合物(例如蔗糖)係以如下濃度存在：50 mM至500 mM，例如100 mM至400 mM、150 mM至300 mM、180 mM至250 mM、200 mM至240 mM、210 mM至230 mM、100 mM至300 mM、100 mM至250 mM、100 mM至200 mM、100 mM至150 mM、300 mM至400 mM、200 mM至400 mM或100 mM至400 mM，例如100 mM、150 mM、180 mM、200 mM、220 mM、250 mM、300 mM、350 mM或400 mM。在一些實施例中，調配物包含以200 mM至250 mM (例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，復原調配物包含以80至120 mg/mL(例如100 mg/mL)之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑；及以200 mM至250 mM(例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖。
在一些實施例中，復原調配物進一步包含界面活性劑。在某些實施例中，界面活性劑為聚山梨醇酯20。在一些實施例中，界面活性劑或聚山梨醇酯20係以如下濃度存在：0.005 %至0.1% (w/w)，例如0.01%至0.08%、0.02%至0.06%、0.03%至0.05%、0.01%至0.06%、0.01%至0.05%、0.01%至0.03%、0.06%至0.08%、0.04%至0.08%或0.02%至0.08% (w/w)，例如0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%、0.07%、0.08%、0.09%或0.1% (w/w)。在一些實施例中，調配物包含以0.03%至0.05% (例如0.04%)(w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，復原調配物包含以80至120 mg/mL(例如100 mg/mL)之濃度存在之抗TIM-3抗體分子；包含濃度為15 mM至25 mM (例如20 mM)之組胺酸緩衝液且pH為5至6 (例如5.5)的緩衝劑；以200 mM至250 mM(例如220 mM)之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.03%至0.05% (例如0.04%) (w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，復原調配物包含以100 mg/mL之濃度存在的抗TIM-3抗體分子；包含濃度為20 mM之組胺酸緩衝液(例如組胺酸/組胺酸-HCL)且pH為5.5的緩衝劑；以220 mM之濃度存在的碳水化合物或蔗糖；及以0.04% (w/w)之濃度存在的界面活性劑或聚山梨醇酯20。
在一些實施例中，調配物經復原，以使得至少1 mL (例如至少1.2 mL、1.5 mL、2 mL、2.5 mL或3 mL)之可抽出體積的復原調配物可自含有復原調配物之容器(例如小瓶)抽取。在某些實施例中，調配物係在臨床地點自容器(例如小瓶)復原及/或抽出。在某些實施例中，調配物(例如復原調配物)在開始向患者輸注之前例如1小時內(例如45分鐘、30分鐘或15分鐘內)注射至輸注袋。
可用於本文所描述之調配物中的其他例示性緩衝劑包括但不限於精胺酸緩衝液、檸檬酸鹽緩衝液或磷酸鹽緩衝液。可用於本文所描述之調配物中的其他例示性碳水化合物包括但不限於海藻糖、甘露糖醇、山梨糖醇或其組合。本文所描述之調配物亦可含有張力劑，例如氯化鈉；及/或穩定劑，例如胺基酸(例如甘胺酸、精胺酸、甲硫胺酸或其組合)。
可藉由此項技術中已知之各種方法投與抗體分子，但對於許多治療應用，較佳投與途徑/模式為靜脈內注射或輸注。舉例而言，抗體分子可藉由靜脈內輸注以大於20 mg/min (例如20-40 mg/min)且通常大於或等於40 mg/min之速率投與以達至約35至440 mg/m2 、通常約70至310 mg/m2 且更通常約110至130 mg/m2 之劑量。在實施例中，抗體分子可藉由靜脈內輸注以小於10 mg/min、較佳小於或等於5 mg/min之速率投與以達至約1至100 mg/m2 、較佳約5至50 mg/m2 、約7至25 mg/m2 且更佳約10 mg/m2 之劑量。如熟習此項技術者應瞭解，投與途徑及/或模式將視所需結果而變化。在某些實施例中，活性化合物可用將保護化合物以免快速釋放之載劑製備，諸如控制釋放調配物，包括植入物、經皮貼片及微囊封遞送系統。可使用生物可降解、生物相容聚合物，諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此類調配物之許多方法已獲得專利或通常為熟習此項技術者已知的。參見例如Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems , J.R. Robinson編, Marcel Dekker, Inc., New York, 1978。
在某些實施例中，抗體分子可經口投與，例如與惰性稀釋劑或可吸收可食用載劑一起經口投與。化合物(在需要時與其他成分)亦可封閉於硬殼或軟殼明膠膠囊中，壓縮成錠劑，或直接併入個體之膳食中。對於經口治療性投與，可將化合物與賦形劑合併且以可攝取之錠劑、經頰錠劑、糖衣錠、膠囊、酏劑、懸浮液、糖漿、糯米紙囊劑及其類似者之形式使用。為藉由除非經腸投與以外之形式投與本發明之化合物，可能有必要用防止其失活之物質包覆化合物或將化合物與防止其失活之物質共投與。亦可用此項技術中已知之醫療裝置投與治療組合物。
調節劑量方案以得到最佳所需反應(例如治療反應)。舉例而言，可投與單一推注劑，可隨時間投與若干分次劑量，或可如治療情形之緊急程度所指示而按比例減少或增加劑量。就投與簡便性及劑量均一性而言，將非經腸組合物調配成單位劑型尤其有利。如本文所用之單位劑型係指適合作為單位劑量用於待治療之個體的實體離散單位；各單位含有與所需醫藥載劑結合，經計算以產生所要治療作用的預定量之活性化合物。本發明之單位劑型之規格係藉由下列情況指定且直接取決於下列情況：(a)活性化合物之獨特特徵及欲實現之特定治療作用，及(b)混配此類用於治療個體敏感性之活性化合物之技術中的固有限制。
抗體分子之治療或預防有效量的例示性非限制性範圍為50 mg至1500 mg，通常100 mg至1000 mg。在某些實施例中，抗TIM-3抗體分子係藉由以約300 mg至約500 mg (例如約400 mg)或約700 mg至約900 mg (例如約800 mg)之劑量(例如均一劑量)注射(例如皮下或靜脈內)來投與。給藥時程(例如均一給藥時程)可在例如一週一次至每2、3、4、5或6週一次之間變化。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子係以約300 mg至500 mg (例如約400 mg)之劑量每兩週投與一次或每四週投與一次。在一個實施例中，抗TIM-3抗體分子係以約700 mg至約900 mg(例如約800 mg)之劑量每兩週投與一次或每四週投與一次。雖然不希望受理論束縛，但在一些實施例中，均一或固定劑量可對患者有益，例如節約藥物供應且減小藥劑學誤差。
抗體分子可藉由靜脈內輸注以大於20 mg/min (例如20-40 mg/min)且通常大於或等於40 mg/min之速率投與以達至約35至440 mg/m2 、通常約70至310 mg/m2 且更通常約110至130 mg/m2 之劑量。在實施例中，約110至130 mg/m2 之輸注速率達成約3 mg/kg之水準。在其他實施例中，抗體分子可藉由靜脈內輸注以小於10 mg/min (例如小於或等於5 mg/min)之速率投與以達至約1至100 mg/m2 (例如約5至50 mg/m2 、約7至25 mg/m2 或約10 mg/m2 )之劑量。在一些實施例中，抗體歷經約30 min之時段輸注。應注意，劑量值可隨待緩解之病況之類型及嚴重度而變化。應進一步理解，對於任何特定個體而言，特定劑量方案應根據個體需要及投與組合物或監督組合物投與之人員的專業判斷而隨時間調整，且本文所闡述之劑量範圍僅具例示性且不意欲限制所主張之組合物的範疇或實務。
在一些實施例中，抗TIM-3抗體係與本文中所描述之低甲基化劑組合投與。低甲基化劑之治療或預防有效量的例示性非限制性範圍為50 mg/m2 至約100 mg/m2 ，通常60 mg/m2 至80 mg/m2 。在某些實施例中，低甲基化劑係藉由注射(例如皮下或靜脈內)以如下劑量投與：約50 mg/m2 至約60 mg/m2 (約75 mg/m2 )、約60 mg/m2 至約70 mg/m2 (約75 mg/m2 )、約70 mg/m2 至約80 mg/m2 (約85 mg/m2 )、約80 mg/m2 至約90 mg/m2 (約95 mg/m2 )或約90 mg/m2 至約100 mg/m2 (約95 mg/m2 )。在一些實施例中，給藥時程(例如均一給藥時程)可在28天週期期間變化，例如第1天至第7天一天一次或第1天至第5天、第8天及第9天一天一次。
在一個實施例中，阿紮胞苷係在第1天至第7天(或在第1天至第5天以及第8天及第9天)以75 mg/m2 靜脈內或皮下投與，且MBG453係在各28天週期之第8天(Q4W)以800 mg靜脈內投與。
本發明之醫藥組合物可包括「治療有效量」或「預防有效量」之本發明之抗體或抗體部分。「治療有效量」係指以所需劑量及時間段有效達成所需治療結果之量。經修飾抗體或抗體片段之治療有效量可根據以下因素改變，諸如疾病病況、個體之年齡、性別及體重，及抗體或抗體部分在個體中引發所需反應的能力。治療有效量亦為經修飾之抗體或抗體片段之治療有益效應超過任何毒性或有害效應的量。相對於未經治療之個體，「治療有效劑量」較佳將可量測參數(例如腫瘤生長速率)抑制至少約20%、更佳至少約40%、甚至更佳至少約60%且再更佳至少約80%。化合物抑制可量測參數(例如癌症)之能力可在預測人類腫瘤中之功效的動物模型系統中評估。或者，組合物之此特性可藉由利用熟習此項技術者已知之分析檢查化合物之抑制能力(諸如活體外抑制)來評估。
「預防有效量」係指在所需劑量及時間段有效實現所需預防結果之量。通常，由於預防劑量係在疾病之前或在疾病早期階段時用於個體，因此預防有效量將小於治療有效量。
包含本文所描述之組合、組合物或調配物的套組亦在本發明之範疇內。套組可包括一或多個其他元件，包括：使用說明書(例如根據本文所描述之劑量方案)；其他試劑，例如標記、治療劑或適用於使抗體與標記或治療劑螯合或以其他方式偶合之試劑，或放射防護組合物；製備用於投與之抗體之裝置或其他材料；醫藥學上可接受之載劑；及用於向個體投與之裝置或其他材料。
組合之用途  本文中所描述之組合可用於調節個體之免疫反應。在一些實施例中，增強、刺激或上調免疫反應。在某些實施例中，抑制、降低或下調免疫反應。舉例而言，組合可例如活體外或離體投與至培養物中之細胞或例如活體內投與至個體以治療、預防及/或診斷各種病症，諸如癌症及免疫病症。在一些實施例中，組合產生協同效應。在其他實施例中，組合產生累加效應。
如本文所用，術語「個體」意欲包括人類及非人類動物。在一些實施例中，個體為人類個體，例如患有特徵為TIM-3功能異常之病症或病況的人類患者。一般而言，個體之至少一些TIM-3蛋白(包括與抗體分子結合之TIM-3抗原決定基)(例如足夠高水準之蛋白質及抗原決定基)支持抗體結合於TIM-3。術語「非人類動物」包括哺乳動物及非哺乳動物，諸如非人類靈長類動物。在一些實施例中，個體為人類。在一些實施例中，個體為需要增強免疫反應之人類患者。本文中所描述之組合適合於治療患有可藉由調節(例如加強或抑制)免疫反應加以治療之病症的人類患者。在某些實施例中，患者患有或處於患本文所描述之病症(例如本文所描述之癌症)之風險下。
在一些實施例中，組合用於治療骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)、慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)、白血病(例如(例如急性骨髓性白血病(AML)，例如復發性或難治性AML或新生AML；或慢性淋巴球性白血病(CLL))、淋巴瘤(例如T細胞淋巴瘤、B細胞淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma)或小淋巴球性淋巴瘤(SLL))、骨髓瘤(例如多發性骨髓瘤)、肺癌(例如非小細胞肺癌(NSCLC)(例如具有鱗狀及/或非鱗狀組織結構之NSCLC或NSCLC腺癌)或小細胞肺癌(SCLC))、皮膚癌(例如梅克爾細胞癌或黑素瘤(例如晚期黑素瘤))、卵巢癌、間皮瘤、膀胱癌、軟組織肉瘤(例如血管外皮瘤(HPC))、骨癌(骨肉瘤)、腎癌(例如腎臟癌(例如腎細胞癌))、肝癌(例如肝細胞癌)、膽管癌、肉瘤、骨髓發育不良症候群(MDS)、前列腺癌、乳癌(例如不表現雌激素受體、黃體酮受體或Her2/neu中之一者、兩者或全部的乳癌，例如三陰性乳癌)、大腸直腸癌、鼻咽癌、十二指腸癌、子宮內膜癌、胰臟癌、頭頸癌(例如頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC))、肛門癌、胃食道癌(gastro-esophageal cancer)、甲狀腺癌(例如退行性甲狀腺癌)、子宮頸癌或神經內分泌腫瘤(NET)(例如非典型性肺類癌瘤)。
在一些實施例中，癌症為血液癌，例如骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)、慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)、白血病、淋巴瘤或骨髓瘤。舉例而言，本文中所描述之組合可用於治療癌症惡性病及相關病症，包括但不限於例如骨髓發育不良症候群(MDS)，例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS；慢性骨髓單核球性白血病(CMML)，例如CMML-1或CMML-2；急性白血病，例如B細胞急性淋巴球性白血病(BALL)、T細胞急性淋巴球性白血病(TALL)、急性骨髓性白血病(AML)、急性淋巴球性白血病(ALL)；慢性白血病，例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴球性白血病(CLL)；其他血液癌或血液科病況，例如B細胞前淋巴球性白血病、母細胞性漿細胞樣樹突細胞贅瘤(blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm)、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、彌漫性大B細胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma)、濾泡性淋巴瘤(Follicular lymphoma)、毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴增生病況、MALT淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、緣帶淋巴瘤(Marginal zone lymphoma)、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞淋巴瘤、漿細胞樣樹突細胞贅瘤、華氏巨球蛋白血症(Waldenström macroglobulinemia)、骨髓纖維化、類澱粉蛋白輕鏈澱粉樣變性、慢性嗜中性球白血病、原發性血小板過多症、慢性嗜酸性球白血病、慢性骨髓單核球性白血病、里氏症候群(Richter Syndrome)、混合表型急性白血病、急性雙表型白血病及為結合骨髓血細胞之無效產生(或發育不良)之多種血液學病況的「前白血病」及其類似疾病。
在一些實施例中，組合用於治療骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)。在一些實施例中，個體分類為患有中危MDS、高危MDS或極高危MDS之個體。在一些實施例中，將在國際預後評分系統(IPSS-R)上大於3分但小於或等於4.5分之評分分類為中危MDS。在一些實施例中，將在國際預後評分系統(IPSS-R)上大於4.5分但小於或等於6分之評分分類為高危MDS。在一些實施例中，將在國際預後評分系統(IPSS-R)上大於6分之評分分類為極高危MDS。
在一些實施例中，組合用於治療慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。在一些實施例中，個體分類為患有CMML-1或CMML-2之個體。在一些實施例中，將周邊血液中具有約2%至約4%母細胞及/或骨髓中具有約5%至約9%母細胞之個體分類為患有CMML-1之個體。在一些實施例中，將周邊血液中具有約5%至約19%母細胞及/或骨髓中具有約10%至約19%母細胞之個體分類為患有CMML-2之個體。
在一些實施例中，個體不適合於確定對患有本文中所描述之癌症之患者有益的標準治療方案。在一些實施例中，個體不適於化學療法或造血幹細胞移植(HSCT)。
在某些實施例中，個體經鑑別在腫瘤浸潤性淋巴球中具有TIM-3表現。在其他實施例中，個體在腫瘤浸潤性淋巴球中不具有可偵測TIM-3表現量。
在一些實施例中，本文中所揭示之組合使得個體(例如緩解期患者)之緩解持續時間及/或白血病清除率得以改善。舉例而言，在治療之後，個體可具有低於約1%、通常低於0.1%的微小殘存疾病(MRD)水準。用於測定微小殘存疾病的方法(例如包括用於急性骨髓性白血病之下一代定序(NGS)及/或多參數流動式細胞測量術)描述於例如Schuurhuis等人Blood. 2018; 131(12): 1275-1291；Ravandi等人,Blood Adv. 2018; 2(11): 1356-1366；DiNardo等人 Blood. 2019; 133(1):7-17中。患者之MRD可在基線(亦即治療前)、在治療期間、治療結束及/或直至疾病進展時進行量測。
治療癌症之方法  在一個態樣中，本發明係關於使用本文所描述之組合、或包含本文所描述之組合之組合物或調配物活體內治療個體，使得抑制或減少癌性腫瘤之生長。
在某些實施例中，組合包含TIM-3抑制劑及低甲基化劑。在一些實施例中，TIM-3抑制劑及/或低甲基化劑係根據本文所揭示之劑量方案投與或使用。在某些實施例中，組合係以有效治療癌症或其症狀之量投與。
本文所描述之組合、組合物或調配物可單獨用於抑制癌性腫瘤之生長。或者，本文所描述之組合、組合物或調配物可與以下中之一或多者組合使用：癌症之標準治療照護、另一抗體或其抗原結合片段、免疫調節劑(例如共刺激分子之活化劑或抑制性分子之抑制劑)；疫苗，例如治療性癌症疫苗；或其他形式之細胞免疫療法，如本文所描述。
因此，在一個實施例中，本發明提供一種抑制個體之腫瘤細胞之生長的方法，其包含例如根據本文所描述之劑量方案向個體投與治療有效量之本文所描述之組合。在一實施例中，組合係呈本文所描述之組合物或調配物形式投與。
在一個實施例中，組合適合於活體內治療癌症。為實現免疫性之抗原特異性增強，組合可與所關注之抗原一起投與。在投與本文所描述之組合時，該組合可以任一次序或同時投與。
在另一態樣中，提供一種治療個體之方法，例如減少或改善個體之過度增生性病況或病症(例如癌症)，例如實體腫瘤、血液癌、軟組織腫瘤或轉移性病變。該方法包括根據本文所揭示之劑量方案向個體投與本文所描述之組合或包含本文所描述之組合的組合物或調配物。
如本文所用，術語「癌症」意欲包括所有類型的癌性生長或致癌過程、轉移性組織或惡性轉型細胞、組織或器官(無論組織病理型或侵襲階段)。癌性病症之實例包括但不限於血液癌、實體腫瘤、軟組織腫瘤及轉移性病變。
在某些實施例中，癌症為血液癌。血液癌之實例包括但不限於骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)、慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)、急性骨髓性白血病、慢性淋巴球性白血病、小淋巴球性淋巴瘤、多發性骨髓瘤、急性淋巴球性白血病、非霍奇金氏淋巴瘤、霍奇金氏淋巴瘤、套細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、華氏巨球蛋白血症、B細胞淋巴瘤及彌漫性大B細胞淋巴瘤、前驅體B淋巴母細胞白血病/淋巴瘤、B細胞慢性淋巴球性白血病/小淋巴球性淋巴瘤、B細胞前淋巴球性白血病、淋巴漿細胞淋巴瘤、脾緣帶B細胞淋巴瘤(具有或不具有絨毛狀淋巴球)、毛細胞白血病、漿細胞骨髓瘤/漿細胞瘤、MALT型結外緣帶B細胞淋巴瘤、結緣帶B細胞淋巴瘤(具有或不具有單核細胞樣B細胞)、伯基特氏淋巴瘤、前驅體T淋巴母細胞淋巴瘤/白血病、T細胞前淋巴球性白血病、T細胞顆粒性淋巴球性白血病、侵襲性NK細胞白血病、成人T細胞淋巴瘤/白血病(HTLV 1-陽性)、鼻型結外NK/T細胞淋巴瘤、腸病型T細胞淋巴瘤、肝脾γ-δ T細胞淋巴瘤、皮下脂膜炎樣T細胞淋巴瘤、蕈樣肉芽腫(mycosis fungoides)/塞紮里症候群(Sézary syndrome)、退行性大細胞淋巴瘤(T細胞/裸細胞，原發性皮膚型)、退行性大細胞淋巴瘤(T-細胞/裸細胞，原發性全身型)、無其他特徵之外周T細胞淋巴瘤、血管免疫母細胞T細胞淋巴瘤、真性紅血球增多症(PV)、骨髓發育不良症候群(MDS)、低惡性度非霍奇金氏淋巴瘤(iNHL)及侵襲性非霍奇金氏淋巴瘤(aNHL)。
在一些實施例中，血液癌為骨髓發育不良症候群(MDS)(例如中危MDS、高危MDS或極高危MDS)、慢性骨髓單核球性白血病(CMML)(例如CMML-1或CMML-2)。
實體腫瘤之實例包括但不限於各種器官系統之惡性病，例如肉瘤及癌瘤(包括腺癌及鱗狀細胞癌)，諸如影響肝、肺、乳房、淋巴、胃腸道(例如結腸)、肛門、生殖器及泌尿生殖道(例如腎臟、尿道上皮、膀胱)、前列腺、CNS (例如腦、神經或膠細胞)、頭頸部、皮膚、胰臟及咽喉。腺癌包括惡性病，大部分結腸癌、直腸癌、腎癌(例如腎細胞癌(例如透明細胞或非透明細胞腎細胞癌)、肝癌、肺癌(例如非小細胞肺癌(例如鱗狀或非鱗狀非小細胞肺癌))、小腸癌及食道癌。鱗狀細胞癌包括例如肺、食道、皮膚、頭頸區、口腔、肛門及子宮頸中之惡性病。在一個實施例中，癌症為黑素瘤，例如晚期黑素瘤。癌症可處於早期、中期、晚期或為轉移癌。亦可使用本文中所描述之組合治療或預防前述癌症之轉移性病變。
在某些實施例中，癌症為實體腫瘤。在一些實施例中，癌症為卵巢癌。在其他實施例中，癌症為肺癌，例如小細胞肺癌(SCLC)或非小細胞肺癌(NSCLC)。在其他實施例中，癌症為間皮瘤。在其他實施例中，癌症為皮膚癌，例如梅克爾細胞癌或黑素瘤。在其他實施例中，癌症為腎癌，例如腎細胞癌(RCC)。在其他實施例中，癌症為膀胱癌。在其他實施例中，癌症為軟組織肉瘤，例如血管外皮瘤(HPC)。在其他實施例中，癌症為骨癌，例如骨肉瘤。在其他實施例中，癌症為大腸直腸癌。在其他實施例中，癌症為胰臟癌。在其他實施例中，癌症為鼻咽癌。在其他實施例中，癌症為乳癌。在其他實施例中，癌症為十二指腸癌。在其他實施例中，癌症為子宮內膜癌。在其他實施例中，癌症為腺癌，例如未知腺癌。在其他實施例中，癌症為肝癌，例如肝細胞癌。在其他實施例中，癌症為膽管癌。在其他實施例中，癌症為肉瘤。在某些實施例中，癌症為骨髓發育不良症候群(MDS)(例如高危MDS)。
在另一實施例中，癌症為癌瘤(例如晚期或轉移性癌瘤)、黑素瘤或肺癌，例如非小細胞肺癌。在一個實施例中，癌症為肺癌，例如非小細胞肺癌或小細胞肺癌。在一些實施例中，非小細胞肺癌為I期(例如Ia或Ib期)、II期(例如IIa或IIb期)、III期(例如IIIa或IIIb期)或IV期非小細胞肺癌。在一個實施例中，癌症為黑素瘤，例如晚期黑素瘤。在一個實施例中，癌症為對其他療法無反應的晚期或不可切除性黑素瘤。在其他實施例中，癌症為具有BRAF突變(例如BRAF V600突變)的黑素瘤。在另一實施例中，癌症為肝癌，例如晚期肝癌，伴有或不伴有病毒感染，例如慢性病毒性肝炎。在另一實施例中，癌症為前列腺癌，例如晚期前列腺癌。在又一實施例中，癌症為骨髓瘤，例如多發性骨髓瘤。在又一實施例中，癌症為腎癌，例如腎細胞癌(RCC)(例如轉移性RCC、非透明細胞腎細胞癌(nccRCC)或透明細胞腎細胞癌(CCRCC))。
在一些實施例中，癌症為MSI-高癌症。在一些實施例中，癌症為轉移癌。在其他實施例中，癌症為晚期癌症。在其他實施例中，癌症為復發性或難治性癌症。
生長可使用如本文所揭示之組合、組合物或調配物抑制的例示性癌症包括通常對免疫療法有反應之癌症。另外，可使用本文中所描述之組合治療難治性或復發性惡性病。
可治療之其他癌症之實例包括但不限於基底細胞癌；膽道癌；膀胱癌；骨癌；腦癌及CNS癌；原發性CNS淋巴瘤；中樞神經系統(CNS)贅瘤；乳癌；子宮頸癌；絨毛膜癌；結腸直腸癌；結締組織癌；消化系統癌；子宮內膜癌；食道癌；眼癌；頭頸癌；胃癌；上皮內贅瘤；腎癌；喉癌；白血病(包括急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病、急性淋巴母細胞白血病、慢性淋巴球性白血病、慢性或急性白血病)；肝癌；肺癌(例如小細胞及非小細胞)；淋巴瘤，包括霍奇金氏及非霍奇金氏淋巴瘤；淋巴球性淋巴瘤；黑素瘤，例如皮膚或眼內惡性黑素瘤；骨髓瘤；神經母細胞瘤；口腔癌(例如唇、舌、口及咽)；卵巢癌；胰臟癌；前列腺癌；視網膜母細胞瘤；橫紋肌肉瘤；直腸癌；呼吸系統癌；肉瘤；皮膚癌；胃癌；睪丸癌；甲狀腺癌；子宮癌；泌尿系統癌、肝癌、肛門區癌、輸卵管癌、陰道癌、外陰癌、小腸癌、內分泌系統癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、兒童實體腫瘤、脊軸腫瘤、腦幹神經膠質瘤、垂體腺瘤、卡波西氏肉瘤、表皮樣癌、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境誘發之癌症(包括石棉誘發之癌症)以及其他癌瘤及肉瘤，及該等癌症之組合。
如本文所用，術語「個體」意欲包括人類及非人類動物。在一些實施例中，個體為人類個體，例如患有特徵為TIM-3功能異常之病症或病況的人類患者。一般而言，個體之至少一些TIM-3蛋白(包括與抗體分子結合之TIM-3抗原決定基)(例如足夠高水準之蛋白質及抗原決定基)支持抗體結合於TIM-3。術語「非人類動物」包括哺乳動物及非哺乳動物，諸如非人類靈長類動物。在一些實施例中，個體為人類。在一些實施例中，個體為需要增強免疫反應之人類患者。本文所描述之方法及組合物適合於治療患有可藉由調節(例如加強或抑制)免疫反應加以治療之病症的人類患者。
本文所揭示之方法及組合物適用於治療與前述癌症有關的轉移性病變。
在一些實施例中，該方法進一步包含確定腫瘤樣本是否對PD-L1、CD8及IFN-γ中之一或多者呈陽性，且若腫瘤樣本對該等標記物中之一或多個(例如兩個或全部三個)呈陽性，則如本文所描述視情況與一或多種其他免疫調節劑或抗癌劑組合向患者投與治療有效量之抗TIM-3抗體分子。
在一些實施例中，本文所描述之組合用於治療表現TIM-3之癌症。表現TIM-3之癌症包括但不限於子宮頸癌(Cao等人,PLoS One . 2013;8(1): e53834)、肺癌(Zhuang等人,Am J Clin Pathol . 2012;137(6):978-985)(例如非小細胞肺癌)、急性骨髓性白血病(Kikushige等人,Cell Stem Cell. 2010年12月3日;7(6):708-17)、彌漫性大B細胞淋巴瘤、黑素瘤(Fourcade等人,JEM, 2010; 207 (10): 2175)、腎癌(例如腎細胞癌(RCC)，例如腎透明細胞癌、腎乳突狀細胞癌或轉移性腎細胞癌)、鱗狀細胞癌、食道鱗狀細胞癌、鼻咽癌、大腸直腸癌、乳癌(例如不表現雌激素受體、黃體酮受體或Her2/neu中之一者、兩者或全部之乳癌，例如三陰性乳癌)、間皮瘤、肝細胞癌及卵巢癌。表現TIM-3之癌症可為轉移癌。
在其他實施例中，本文所描述之組合用於治療以巨噬細胞活性或巨噬細胞標記物之高度表現為特徵的癌症。在一實施例中，組合用於治療以如下巨噬細胞標記物中之一或多者之高度表現為特徵的癌症：LILRB4 (巨噬細胞抑制性受體)、CD14、CD16、CD68、MSR1、SIGLEC1、TREM2、CD163、ITGAX、ITGAM、CD11b或CD11c。此類癌症之實例包括但不限於彌漫性大B細胞淋巴瘤、多形性神經膠母細胞瘤、腎透明細胞癌、胰臟腺癌、肉瘤、肝細胞癌、肺腺癌、腎乳頭狀細胞癌、皮膚黑素瘤、較低級別腦神經膠質瘤、肺鱗狀細胞癌、卵巢漿液性囊腺癌(ovarian serious cystadenocarcinoma)、頭頸部鱗狀細胞癌、侵襲性乳癌、急性骨髓性白血病、子宮頸鱗狀細胞癌、子宮頸內腺癌、子宮癌、大腸直腸癌、子宮體子宮內膜癌、甲狀腺癌、膀胱尿道上皮癌、腎上腺皮質癌、腎難染及前列腺腺癌。
本文所描述之組合療法可包括與以下共調配及/或共投與之組合物：一或多種治療劑，例如一或多種抗癌劑、細胞毒性或細胞生長抑制劑、激素治療、疫苗及/或其他免疫療法。在其他實施例中，抗體分子與其他治療性治療模式(包括手術、放射、冷凍手術及/或熱療法)組合投與。此類組合療法可有利地利用較低之治療劑投與劑量，從而避免與各種單一療法相關之可能毒性或併發症。
本文所描述之組合、組合物及調配物可進一步與其他藥劑或治療模式(例如選自WO 2017/019897之表6中所列之藥劑中之一或多者的第二治療劑)組合使用，該文獻之內容以全文引用之方式併入。在一個實施例中，本文所描述之方法包括以有效治療或預防病症(例如如本文所描述之病症，例如癌症)之量向個體投與如WO2017/019897中所描述之抗TIM-3抗體分子(視情況與PD-1、PD-L1、LAG-3、CEACAM (例如CEACAM-1及/或CEACAM-5)或CTLA-4之一或多種抑制劑組合)，進一步包括投與選自WO2017/019897之表6中所列之藥劑中之一或多者的第二治療劑。當組合投與時，TIM-3抑制劑、低甲基化劑、一或多種另外藥劑或全部藥劑可以比例如作為單一療法個別地使用的各藥劑之量或劑量高、低或相同的量或劑量投與。在某些實施例中，TIM-3抑制劑、低甲基化劑、一或多種另外藥劑或所有藥劑之投與量或劑量比例如作為單一療法個別地使用的各藥劑之量或劑量低(例如至少20%、至少30%、至少40%或至少50%)。在其他實施例中，產生所需效應(例如治療癌症)之TIM-3抑制劑、低甲基化劑、一或多種另外藥劑或所有藥劑之量或劑量較低(例如低至少20%、至少30%、至少40%或至少50%)。
在其他實施例中，另外治療劑係選自WO 2017/019897之表6中所列的藥劑中之一或多者。在一些實施例中，另外治療劑係選自以下中之一或多者：1)蛋白激酶C (PKC)抑制劑；2)熱休克蛋白90 (HSP90)抑制劑；3)磷酸肌醇3-激酶(PI3K)及/或雷帕黴素靶蛋白(mTOR)之抑制劑；4)細胞色素P450之抑制劑(例如CYP17抑制劑或17α-羥化酶/C17-20裂解酶抑制劑)；5)鐵螯合劑；6)芳香酶抑制劑；7)p53抑制劑，例如p53/Mdm2相互作用之抑制劑；8)細胞凋亡誘導劑；9)血管生成抑制劑；10)醛固酮合成酶抑制劑；11)平滑(smoothened；SMO)受體抑制劑；12)促乳素受體(PRLR)抑制劑；13) Wnt信號傳導抑制劑；14) CDK4/6抑制劑；15)纖維母細胞生長因子受體2 (FGFR2)/纖維母細胞生長因子受體4 (FGFR4)抑制劑；16)巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)之抑制劑；17) c-KIT、組織胺釋放、Flt3 (例如FLK2/STK1)或PKC中之一或多者之抑制劑；18) VEGFR-2 (例如FLK-1/KDR)、PDGFRβ、c-KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑；19)生長抑素促效劑及/或生長激素釋放抑制劑；20)退行性淋巴瘤激酶(ALK)抑制劑；21)似胰島素生長因子1受體(IGF-1R)抑制劑；22)P-醣蛋白1抑制劑；23)血管內皮生長因子受體(VEGFR)抑制劑；24) BCR-ABL激酶抑制劑；25)FGFR抑制劑；26)CYP11B2抑制劑；27) HDM2抑制劑，例如HDM2-p53相互作用之抑制劑；28)酪胺酸激酶抑制劑；29) c-MET抑制劑；30) JAK抑制劑；31) DAC抑制劑；32) 11β-羥化酶抑制劑；33) IAP抑制劑；34) PIM激酶抑制劑；35)魚鱗癬(Porcupine)抑制劑；36) BRAF抑制劑，例如BRAF V600E或野生型BRAF抑制劑；37) HER3抑制劑；38) MEK抑制劑；或39)脂質激酶抑制劑，例如，如WO 2017/019897之表6中所描述。
包含本文所描述之抗TIM-3抗體分子的組合療法之另外實施例描述於WO2017/019897中，該文獻以全文引用之方式併入。
核酸 在一些實施例中，本文所描述之組合包含抗TIM-3抗體。本文所描述之抗TIM-3抗體分子可由本文所描述之核酸編碼。核酸可用於產生本文所描述之抗TIM-3抗體分子。
在某些實施例中，核酸包含編碼如本文所描述的抗TIM-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區以及CDR的核苷酸序列。舉例而言，本發明之特徵在於分別編碼選自本文所揭示之抗體分子中之一或多者(例如US 2015/0218274之表1至表4之抗體)的抗TIM-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區的第一及第二核酸。核酸可包含編碼本文表格中的胺基酸序列中之任一者的核苷酸序列，或與其實質上一致之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性或與表1至表4中所提供之序列相差不超過3、6、15、30或45個核苷酸的序列)。舉例而言，本文揭示分別編碼選自以下中之一或多者之抗TIM-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區的第一及第二核酸，例如如表1至4表中所概述之ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23中之任一者或與其實質上一致之序列。
在某些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至表4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。在一些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至表4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。在一些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至表4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。
在某些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至4中所闡述之核苷酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或能夠在本文所描述之嚴格條件下雜交的序列)。在一些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至4中所闡述之核苷酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或能夠在本文所描述之嚴格條件下雜交的序列)。在某些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR的核苷酸序列，該等CDR具有如表1至表4中所闡述之核苷酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或能夠在本文所描述之嚴格條件下雜交的序列)。本文所揭示之核酸包括去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其類似物。聚核苷酸可為單股或雙股的，且若為單股，則可為編碼股或非編碼(反義)股。聚核苷酸可包含經修飾之核苷酸，諸如甲基化核苷酸及核苷酸類似物。核苷酸之序列可間雜有非核苷酸組分。可在聚合之後諸如藉由與標記組分結合而進一步修飾聚核苷酸。核酸可為重組聚核苷酸，或基因組、cDNA、半合成或合成來源之聚核苷酸，其不存在於自然界中或以非天然排列連接至另一聚核苷酸。
在某些實施例中，編碼抗TIM-3抗體分子的核苷酸序列經密碼子最佳化。
在一些實施例中，揭示核酸，其包含編碼如本文所描述之抗TIM-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區以及CDR的核苷酸序列。舉例而言，本發明提供根據表1至4的分別編碼抗TIM-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區的第一及第二核酸，或與其實質上一致的序列。舉例而言，核酸可包含根據表1至表4的編碼抗TIM-3抗體分子之核苷酸序列，或與彼核苷酸序列實質上一致之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性或與前述核苷酸序列相差不超過3、6、15、30或45個核苷酸之序列)。
在某些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR或高變環的核苷酸序列，該等CDR或高變環具有如表1至4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)的序列)。
在某些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR或高變環的核苷酸序列，該等CDR或高變環具有如表1至4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)的序列)。
在一些實施例中，核酸可包含編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR或高變環的核苷酸序列，該等CDR或高變環具有如表1至表4中所闡述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如與其具有至少約85%、90%、95%、99%或更高一致性及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)的序列)。
在一些實施例中，抗TIM-3抗體分子為經分離的或重組的。 在一些態樣中，本申請案之特徵在於含有本文所描述之核酸的宿主細胞及載體。核酸可存在於單一載體或單獨載體中，該單一載體或單獨載體存在於同一宿主細胞或單獨宿主細胞中，如下文中更詳細描述。
載體及宿主細胞  在一些實施例中，本文所描述之組合包含抗TIM-3抗體分子。本文所描述之抗TIM-3抗體分子可使用含有本文所描述之核酸的宿主細胞及載體產生。核酸可存在於單一載體或單獨載體中，該單一載體或單獨載體存在於同一宿主細胞或單獨宿主細胞中。
在一個實施例中，載體包含編碼本文所描述之抗體分子之核苷酸。在一個實施例中，載體包含本文所描述之核苷酸序列。載體包括但不限於病毒、質體、黏質體、λ噬菌體或酵母人工染色體(YAC)。
可採用多種載體系統。舉例而言，一種載體利用來源於動物病毒(諸如牛乳頭狀瘤病毒、多瘤病毒、腺病毒、痘瘡病毒、桿狀病毒、反轉錄病毒(勞斯肉瘤病毒(Rous Sarcoma Virus)、MMTV或MOMLV)或SV40病毒)之DNA元件。另一種載體利用來源於RNA病毒(諸如塞姆利基森林病毒(Semliki Forest virus)、東部馬腦炎病毒(Eastern Equine Encephalitis virus)及黃病毒(Flavivirus))之RNA元件。
另外，可藉由引入一或多個允許選擇經轉染宿主細胞之標記物來選擇將DNA穩定整合至其染色體中之細胞。標記物可例如提供原始營養型(至營養缺陷型宿主)、殺生物劑抗性(例如抗生素)或對於重金屬(諸如銅)之抗性或其類似者。可選標記物基因可直接連接至待表現之DNA序列，或藉由共轉化來引入同一細胞。mRNA之最佳合成亦可能需要另外元件。此等元件可包括剪接信號以及轉錄啟動子、強化子及終止信號。
含有構築體之表現載體或DNA序列一經製備以用於表現，即可將表現載體轉染或引入適當宿主細胞中。為此，可採用多種技術，諸如原生質體融合、磷酸鈣沈澱、電穿孔、反轉錄病毒轉導、病毒轉染、基因槍、基於脂質之轉染或其他習知技術。在原生質體融合之情況下，細胞生長於培養基中且根據適當活性進行篩選。培養所得經轉染細胞及回收產生之抗體分子之方法及條件為熟習此項技術者已知的，且可基於本發明描述，視所採用之特定表現載體及哺乳動物宿主細胞而改變或最佳化。
在某些實施例中，宿主細胞包含編碼本文所描述之抗TIM-3抗體分子之核酸。在其他實施例中，宿主細胞經基因工程改造以包含編碼抗TIM-3抗體分子之核酸。
在一個實施例中，宿主細胞藉由使用表現卡匣而經基因工程改造。片語「表現卡匣」係指能夠影響與核苷酸序列相容之宿主中之基因之表現的核苷酸序列。此類卡匣可包括啟動子、具有或不具有內含子之開放閱讀框架，及終止信號。亦可使用實行表現所需或有助於實行表現的另外因子，諸如誘導型啟動子。在某些實施例中，宿主細胞包含本文所描述之載體。
細胞可為但不限於真核細胞、細菌細胞、昆蟲細胞或人類細胞。適合之真核細胞包括但不限於Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞及MDCKII細胞。適合的昆蟲細胞包括但不限於Sf9細胞。
在一些實施例中，宿主細胞為真核細胞，例如哺乳動物細胞、昆蟲細胞、酵母細胞或原核細胞，例如大腸桿菌。舉例而言，哺乳動物細胞可為經培養之細胞或細胞株。例示性哺乳動物細胞包括淋巴細胞株(例如NSO)、中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞及來自轉殖基因動物之細胞，例如乳房上皮細胞。
實例  實例1 此實例揭示添加至阿紮胞苷以治療根據IPSS-R患有中危、高危或極高危MDS或患有CMML-2之個體的MBG453或安慰劑之隨機雙盲安慰劑對照多中心III階段研究設計。 個體將以1:1比率隨機分組以在28天治療週期中在使用或不使用MBG453 800 mg IV Q4W之情況下靜脈內或皮下接受阿紮胞苷75 mg/m2。隨機分組將分為4組：中危MDS、高危MDS、極高危MDS及CMML-2。在研究期間之任何時候，將不准許處理組之間的交叉。
研究治療由以下週期組成：在各週期之第8天投與MBG453或安慰劑800 mg IV Q4W與在各週期之第1天至第7天(或在第1天至第5天以及第8天及第9天)向個體投與阿紮胞苷組合，直至治療中斷。週期之計劃持續時間為28天。
在研究時程中之任何時候符合造血幹細胞移植(HSCT)或強化化學療法條件之個體可中斷研究治療。
研究中所提出之MBG453劑量基於自兩次I階段研究累積之資料為800 mg Q4W：實體腫瘤患者中之[CMBG453X2101]具有寬MBG453劑量範圍(每2週(Q2W)或每4週(Q4W)80至1200 mg之單一藥劑MBG453，以及另外與PDR001組合測試的較低20 mg Q2W MBG453劑量。由於[CMBG453X2101]中所得之資料，研究[CPDR001X2105]開始評估240 mg Q2W之MBG453及另外與地西他濱組合測試之400 mg Q2W及800 mg Q4W。
MBG453之藥物動力學(PK)在實體腫瘤患者中之研究[CMBG453X2101]與AML及高危MDS患者中之[CPDR001X2105]之間類似。在較低劑量下(在針對Q2W給藥之80 mg及以下之劑量下或在針對Q4W給藥之240 mg及以下之劑量下)，PK為非線性的，且在較低濃度下消除較快。在針對Q2W給藥之240 mg及以上之劑量下及在針對Q4W給藥之800 mg及以上之劑量下，PK呈現為線性，具有大致成比例之劑量-暴露(AUC及Cmax)關係。在重複投與之情況下觀測到MBG453積聚，且對於Q2W方案，第3週期期間之AUCtau範圍介於比第1週期期間高1.01至2.78倍之間。800 mg Q4W之劑量具有處於穩定狀態的與400 mg Q2W類似之AUCtau。在研究[CPDR001X2105]中，在與地西他濱組合於240 mg Q2W、400 mg Q2W及800 mg Q4W下測試之3個劑量水準中發現臨床效益，其中高危MDS個體具有CR或骨髓CR且新診斷AML個體具有CR或CRi。
在反應個體中，存在長達19個月(截至截止日期2019年3月25日)之持久反應。未觀測到劑量反應關係。在初步暴露反應分析中，使用AUCtau或Ctrough之穩定狀態暴露量度及臨床益處(CR/mCR/CRi)之功效量度或母細胞減少百分比，在暴露與反應之間亦未發現明顯關係。
在研究[CMBG453X2101]中，截至2019年7月25日，患有實體腫瘤之總共133名個體已用MBG453單一藥劑療法進行治療。不存在發生率＞10%的歸因於研究治療之不良事件。歸因於研究治療的最頻繁報導之不良事件包括疲乏(9%)，食慾下降及噁心次之(各4.5%)。第一週期期間不存在DLT。無個體由於治療相關AE而中斷研究治療。
在研究[CPDR001X2105]中，截至2019年7月26日，患有血液惡性病之總共123名個體已用MBG453作為單一藥劑(n=26)或與地西他濱(n=81)或阿紮胞苷(n=16)組合進行治療。在用MBG453單一藥劑治療之26名個體中，不存在發生率＞10%的歸因於研究治療之不良事件。歸因於研究治療之最頻繁報導之不良事件為兩名個體之皮疹(8%)。所有其他歸因於研究治療之不良事件為單次發生。第一週期期間不存在DLT。無個體由於治療相關AE而中斷研究治療。在用MBG453與地西他濱之組合治療的81名個體中，歸因於研究治療之最頻繁不良事件(所有等級，＞10%)包括血小板減少症、貧血、嗜中性球減少症、噁心及疲乏。一名個體在前2個週期期間經歷DLT，其由顯示為3級ALT增加之肝炎組成。一名個體由於可能的噬血細胞性淋巴組織細胞增生症之治療相關AE而中斷研究治療。在用MBG453與阿紮胞苷之組合治療的16名個體中，歸因於研究治療之最頻繁不良事件(所有等級，＞10%)包括噁心、嘔吐、貧血、便秘、嗜中性球計數減少、血小板計數減少。前2個週期期間不存在DLT。無個體由於治療相關AE而中斷研究治療。未在上文所提及之任一研究中觀測到研究治療相關之死亡。
初步分析顯示在不同治療組中，不良事件之劑量、發生率及嚴重度之間無關係。未觀測到潛在免疫相關不良事件之Cmax與發生率之間的關係，從而對在所測試劑量之中具有最高Cmax的800 mg Q4W方案提供另外支持。
預測目標接合：藉由作出關於骨髓之MBG453生物分佈及TIM-3結合的假設，將MBG453濃度之群體藥物動力學模型擬合至兩個研究之所有個體以預測骨髓中之TIM-3佔有率。使用試驗性模擬，此模型預測800 mg Q4W劑量將以穩定狀態Ctrough在至少95%個體中得到至少95%受體佔有率。此高度目標接合亦受在240 mg Q2W及以上之劑量以及800 mg Q4W及以上之劑量下觀測到的所積聚可溶TIM-3之平穩段支持。
總而言之，鑒於在[CMBG453X2101]及[CPDR001X2105]中之所有劑量及時程中所見的極佳安全性及耐受性、在研究[CPDR001X2105]中所測試之所有3個劑量下所見的活性、自可溶性TIM-3資料及受體佔用模型預測的TIM-3飽和以及關於MBG453之清晰劑量-反應或暴露-反應關係之缺乏，選擇800 mg Q4W作為此研究之劑量方案。
實例2 此實例描述薩巴托利單抗(亦稱為MBG453)與低甲基化劑(HMA)之組合在患有急性骨髓性白血病(AML)及高危骨髓發育不良症候群(HR-MDS)之患者中的功效及安全性。
研究設計及方法 ：此為患有AML或HR-MDS之患者(pt)之薩巴托利單抗+HMA (地西他濱[Dec]或阿紮胞苷[Aza])之Ib階段開放標記多中心劑量累增研究(NCT03066648；CPDR001X2105)。患者為患有新診斷(ND)之或復發性/難治性(R/R；≥1先前療法) AML或IPSS-R高危或極高危MDS之成年人；患有慢性骨髓單核球性白血病(CMML)之患者亦符合條件。患者未經HMA治療且不符合強化化學療法之條件。檢驗的IV薩巴托利單抗之累增劑量群組為：每28天週期240或400 mg Q2W (D8，D22)或800 mg Q4W (D8)與Dec (20 mg/m2 ；IV D1-5)或Aza (75 mg/m2 ；IV/SC D1 -7)之組合。主要目標包括安全性/耐受性；次要目標包括初步功效及藥物動力學。
結果 ：截至資料截止(2020年6月25日)，48名ND AML患者、39名HR-MDS患者及12名CMML患者接受薩巴托利單抗+HMA。先前報導來自29名R/R AML患者之資料。為了更廣泛理解薩巴托利單抗+HMA之作用，此處報導組合及分開之Dec及Aza組的結果(表 13 )。薩巴托利單抗暴露之中值(範圍)持續時間為針對ND AML 4.5 (0.3至28.3)個月且針對HR-MDS 4.1 (0.7至33.6)個月，其中分別有17名及11名患者堅持。
對於薩巴托利單抗+HMA，分別患有ND AML及HR-MDS之患者的最常見(在疾病群體中＞10%) ≥3級之治療引發不良事件(TEAE)為血小板減少症(45.8%，51.2%)、嗜中性球減少症(50%，46.1%)、發熱性嗜中性球減少症(29.2%，41%)、貧血(27.1%，28.2%)及肺炎(10.4%，5.1%)。歸因於AE之中斷在ND AML患者之中不頻繁(6.3% [3/48]；疲乏、發熱性嗜中性球減少症及可能之HLH各1名)；HR-MDS患者之中未發生該中斷。薩巴托利單抗240 mg Q2W+Dec發生一個劑量限制性毒性(3級ALT升高)；任一組合均未達到最大耐受劑量。
為全面評定可能的免疫介導之AE (imAE)，在所有疾病群組中評估事件。5名患者報導七個3級治療相關可能imAE (ALT提高[2名患者]，以及關節炎、可能之HLH、輸注相關反應、甲狀腺功能低下及皮疹[各1名患者])。未發生4級治療相關可能imAE；然而，存在一例HR-MDS患者小腸結腸炎病例，其死於中性白細胞減少結腸炎之敗血性休克。未報導其他治療相關死亡。
在34名可評估ND AML患者之中，總反應率(ORR)為41.2%：8 CR，3 CRi，3 PR。中值(範圍)反應時間(TTR)為2.1 (1.8至13.1)個月，且估計之6個月反應持續(DOR)率為85.1% (95% CI：68-100%)。估計之12個月無進展存活(PF)率為44% (95% CI：28-69.3%)。35名可評估HR-MDS患者之中，ORR為62.9%：8 CR，8 mCR，(5名具有血液學改善[HI])，6 SD+HI。中值(範圍) TTR為2.0 (1.7至9.6)個月，且CR/mCR/PR的估計之6個月DOR率為90% (95% CI：73.2-100%)。在患有高危MDS (ORR 50% [11/22])及極高危MDS (ORR 84.6% [11/13])之患者中皆達到令人鼓舞之反應率。HR-MDS患者中，8名(5名高危，3名極高危)進行移植。估計之12個月PFS率為58.1% (95% CI：39.9-84.6%)。
12名CMML患者之中，薩巴托利單抗+HMA之安全性概況與AML/HR-MDS之安全性概況大體上一致(最常見≥3級TEAE：血小板減少症，n=7；嗜中性球減少症，n=7；貧血，n=6)。11名可評估患者之中的ORR為63.6%：2 CR，3 mCR，1 PR，1 SD+HI。
結論 ：薩巴托利單抗+HMA在AML及HR-MDS患者中具有良好耐受性，且持續顯示有前景之抗白血病活性及新出現之持久性。此等結果支持TIM-3作為潛在治療目標且提供在AML或高危MDS患者中進一步研究薩巴托利單抗+HMA之基礎。表 13 ： 在向患有新診斷 (ND) 之 AML 、 高危 (HR) MDS 或 CMML 之 患者投與薩巴托利單抗 +HMA 後之結果的概述
   ND AML HR-MDS CMMLa
參數 + Dec n=22 + Aza n=26 + Dec n=19 + Aza n=20 + Dec n=5 + Aza n=7
薩巴托利單抗暴露持續時間，中值(範圍)月數 6.8 (0.7-28.3) 3.5 (0.3-15.2) 8.0 (0.7-33.6) 2.8 (0.8-14.3) 8.4 (5.6-12.6) 5.0 (1.6-15.8)
功效可評估患者，n 17 17 18 17 5 6
ORRb , n (%) 8 (47.1) 6 (35.3) 11 (61.1) 11 (64.7) 3 (60) 4 (66.7)
CR 6 (35.3 2 (11.8) 6 (33.3) 2 (11.8) 0 2 (33.3)
CRi 1 (5.9) 2 (11.8) NA NA NA NA
mCR NA NA 3 (16.7) 5 (29.4) 1 (20) 2 (33.3)
mCR+HI NA NA 3 (16.7) 2 (11.8) 0 1 (16.7)
PR 1 (5.9) 2 (11.8) 0 0 1 (20) 0
SD+HI NA NA 2 (11.1) 4 (23.5) 1 (20) 0
a CMML患者之反應評定使用IWG準則(Cheson 2006)。b MDS患者之ORR定義為CR + mCR + PR + SD與HI；ND AML患者之ORR定義為CR + CRi + PR。 CR，完全緩解；CRi，伴隨不完全血球計數恢復之CR；mCR，骨髓CR；PR，部分緩解。
實例3-MBG453部分阻斷TIM-3與半乳糖凝集素9之間的相互作用 半乳糖凝集素-9為TIM-3之配體。Asayama等人(Oncotarget 8(51): 88904-88971 (2017)證實TIM-3-半乳糖凝集素9路徑與MDS之發病機制及疾病進展相關。此實例說明MBG453部分阻斷TIM-3與半乳糖凝集素9之間的相互作用之能力。
將TIM-3融合蛋白(R&D Systems)以2 µg/ml於PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水)中塗佈於標準MesoScale96孔培養盤(Meso Scale Discovery)上，且在室溫下培育六小時。用PBST (含有0.05% Tween-20之PBS緩衝液)洗滌培養盤三次，且在4℃用含有5% Probumin (Millipore)之PBS阻斷過夜。培育後，用PBST洗滌培養盤三次，且將稀釋於分析稀釋劑(2% Probumin、0.1% Tween-20、0.1% Triton X-100 (Sigma)及10% StabilGuard (SurModics))中的未標記之抗體(F38-2E2 (BioLegend)；MBG453；MBG453 F(ab')2；MBG453 F(ab)；或對照重組人類半乳糖凝集素-9蛋白)以連續稀釋形式添加至培養盤，且在室溫下於定軌振盪器上培育一小時。隨後用PBST洗滌培養盤三次，且在室溫下於定軌振盪器上將於分析稀釋劑中稀釋至100 nM的按照製造商說明書經MSD SULFOTag (Meso Scale Discovery)標記之半乳糖凝集素-9添加至培養盤中，保持一小時。用PBST再次洗滌培養盤三次，且將Read Buffer T (1×)添加至培養盤中。在MA600成像儀上讀取培養盤，且評定競爭以作為抗體阻斷Gal9-SULFOTag信號與TIM-3受體之能力的量度。如圖 1 中所示，MBG453 IgG4、MBG453 F(ab')2、MBG453 F(ab)及2E2部分阻斷TIM-3與半乳糖凝集素-9之間的相互作用，而對照半乳糖凝集素-9蛋白則不。
實例4-MBG453經由接合FcγR1介導抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP) 藉由在37℃、5% CO2下用20 ng/ml佛波醇-12-豆蔻酸酯13-乙酸酯(PMA)刺激兩天至三天來將THP-1效應細胞(人類單核球性AML細胞株)分化成吞噬細胞。在燒瓶中於FACS緩衝液(含2mM EDTA之PBS)中洗滌經PMA刺激之THP-1細胞，且隨後藉由用Accutase (Innovative Cell Technologies)處理來分離。按照製造商說明書用5.5 µM CellTrace CFSE (ThermoFisherScientific)標記過度表現TIM-3之目標Raji細胞。在96孔培養盤中將THP-1細胞及過度表現TIM-3之CFSE+ Raji細胞與MBG453、MabThera抗CD20 (Roche)陽性對照或陰性對照抗體(具有不由Raji TIM-3+細胞表現之目標的hIgG4抗體)之稀釋液以1:5之效應子:目標(E:T)比共培養(於分析開始時在室溫於100×g下旋轉1分鐘)。在37℃、5% CO2下將共培養物培育30-45分鐘。隨後用4%甲醛固定(自16%儲備液稀釋，ThermoFisherScientific)使吞噬作用停止，且用APC結合抗CD11c抗體(BD Bioscience)對細胞染色。藉由基於流動式細胞測量術之分析在BD FACS Canto II上量測ADCP。以對於CFSE (表示經吞噬Raji細胞目標)及來自THP-1 (效應子)群體之CD11c呈雙陽性的THP-1細胞之百分比來評估吞噬作用。如圖 2 中所示，MBG453 (正方形)以劑量依賴性方式增強TIM-3+ Raji細胞之THP-1細胞吞噬作用，其隨後相對於抗CD20陽性對照(空心圓)達到平穩。以三角形展示陰性對照IgG4抗體。
在與經工程改造效應子Jurkat細胞之共培養分析中將表現TIM-3之Raji細胞用作目標細胞，該等Jurkat細胞在NFAT (活化T細胞之核因子)反應元件(NFAT-RE；Promega)控制下經穩定轉染以過度表現FcγRIa(CD64)及螢光素酶報導基因。在96孔培養盤中將目標TIM-3+ Raji細胞與Jurkat-FcγRIa報導細胞以6:1之E:T比及MBG453或抗CD20 MabThera參考對照(Roche)之梯度濃度(500 ng/ml至6 pg/ml)共培育。隨後在分析開始時將培養盤在室溫於300×g下離心5分鐘，且在37℃、5% CO2 濕潤培育箱中培育6小時。在細胞溶解及添加受質溶液(Bio-GLO)之後藉由螢光素酶活性定量藉由與FcγRIa結合而誘導的NFAT依賴性報導基因表現之活化。如圖 3 中所示，MBG453顯示FcγRIa報導細胞株之中等劑量-反應接合，如藉由螢光素酶活性所量測。在單獨分析中，MBG453並未接合FcγRIIa (CD32a)。
實例5-MBG453增強經地西他濱預處理之AML細胞之免疫介導性殺傷 將THP-1細胞接種於完全RPMI-1640 (Gibco)培養基(補充有2 mM麩醯胺酸、100 U/ml青黴素-鏈黴素、10 mM HEPES、1 mM NaPyr及10%胎牛血清(FBS))中。在37℃、5% CO2 下添加地西他濱(250或500 nM；每天補充至培養基，持續五天)或DMSO對照以進行5天之培育。在接種THP-1細胞後兩天，藉由將檸檬酸鈉CPT管在1,800×g下離心20分鐘來將健康人類供體周邊血液單核細胞(PBMC；Medcor)與全血分離。完成旋轉時，將試管倒置10次以混合血漿層及PBMC層。以2×體積之PBS/MACS緩衝液(Miltenyi)洗滌細胞，且在250×g下離心5分鐘。抽取上清液，且在移液後添加1 mL PBS/MACS緩衝液以洗滌細胞集結粒。添加19 mL PBS/MACS緩衝液，接著重複離心。抽取上清液，且將細胞集結粒再懸浮於1 mL完全培養基中，接著移液至單一細胞懸浮液，且用完全RPMI使體積達至10 mL。在37℃、5% CO2 下將100 ng/mL抗CD3 (eBioscience)添加至培養基中以進行48小時之刺激。在用地西他濱或DMSO培養5天之後，收集THP-1細胞且根據製造商說明書用CellTracker™ Deep Red Dye(ThermoFisher)標記。
將經標記之THP-1細胞(經地西他濱預處理或經DMSO對照處理)與受激PBMC以1:1、1:2及1:3之效應子:目標(E:T)比(針對各供體最佳化，其中目標細胞數目恆定於10,000個細胞/孔(Costar 96孔平底培養盤))共培養。用1 µg/mL之hIgG4同型對照或MBG453處理各孔。將培養盤置於Incucyte S3中，且每4小時捕捉影像相位及紅色螢光通道，持續5天。完成分析時，使用Incucyte影像分析軟體以第一成像時間點標準化目標細胞數目(紅色事件)。
如圖 4 中所示，THP-1細胞與抗CD3活化之PBMC的共培養引起THP-1細胞之殺傷，其在分析之最後時間點在相對於hIgG4同型對照之MBG453存在下增強(底部小提琴圖中之條柱，各點代表單個健康PBMC供體)。此殺傷藉由用地西他濱預處理THP-1細胞而進一步增強(頂部小提琴圖中之條柱，各點代表單個健康PBMC供體)。總之，此等資料表明MBG453阻斷TIM-3，增強THP-1 AML細胞之免疫介導性殺傷，其中用地西他濱預處理進一步增強此活性。
實例 6- 免疫缺陷宿主中患者來源之異種移植物之 MBG453 及地西他濱介導性殺傷的研究 在兩個AML患者來源之異種移植(PDX)模型HAMLX21432及HAMLX5343中評估在存在及不存在地西他濱之情況下MBG453的活性。在每次投藥之前新近將地西他濱(TCI America)調配於5%於水中之右旋糖(D5W)中，且每天投與，持續5天。以10 mL/kg腹膜內(i.p.)投與，最終劑量體積為1 mg/kg。在PBS中將MBG453調配至最終濃度為1 mg/mL。每週以10 mL/kg之體積腹膜內投與，最終劑量為10 mg/kg，其中在地西他濱之最終劑量之後24小時在給藥第6天開始處理。MBG453及地西他濱之組合具良好耐受性，如藉由兩個模型之體重變化監測及健康狀況視覺檢查兩者所量測。
對於一項研究，向小鼠靜脈內(i.v.)注射2×106 個細胞，該等細胞係自含有IDH1R132H突變之AML PDX #21432模型的活體內繼代5分離。動物一達到平均39%之白血病負擔，則將其隨機分為處理組。在隨機分組當天開始處理，且持續21天。動物處於研究中直至分別達到個別評估指標為止，該等評估指標由大於90%人類CD45+細胞之循環白血病負擔、＞20%之體重減輕、後肢麻痹徵象或不良身體狀況定義。用單獨的地西他濱處理植入HAML21432之小鼠證實在大約植入後第49天或處理開始後第14天達到峰值的中等抗腫瘤活性。此時，經地西他濱處理之組的平均值為51%及47%之hCD45+細胞，分別使用單一藥劑及與MBG453之組合(圖 5 )。同時，未經處理及經MBG453處理之組隊白血病負擔分別為81%及77%。然而，在植入後第56天，經地西他濱處理之組在循環中之白血病負擔增加至66%及61%之hCD45+細胞。在此模型中，當地西他濱與MBG453組合時，未觀測到組合活性(圖 5 )。未經處理及經MBG453單一藥劑處理之組皆在第56天結束時達到90%白血病負擔之去除。
對於另一研究，向小鼠靜脈內注射2×106 個細胞，該等細胞係自含有突變KRASG12D、WT1及PTPN11之AML PDX #5343模型的活體內繼代4分離。動物一達到平均20%之白血病負擔，則將其隨機分為處理組。在隨機分組當天開始處理，且持續3週。動物處於研究中直至分別達到個別評估指標為止，該等評估指標由大於90%人類CD45+細胞之循環白血病負擔、＞20%之體重減輕、後肢麻痹徵象或不良身體狀況定義。用單獨的地西他濱處理之植入HAML5343之小鼠顯示在大約植入後第53天或處理開始後第21天達到峰值之顯著抗腫瘤活性。此時，經地西他濱處理之組的平均值為1%及1.3%之hCD45+細胞，分別使用單一藥劑及與MBG453之組合(圖 6 )。同時，未經處理之組的白血病負擔為91%。經MBG453處理之組在第53天僅剩餘一隻動物。在此模型中，當地西他濱與MBG453組合時，未觀測到組合活性(圖 6 )。在此模型中，腫瘤負擔之顯著降低在地西他濱單一藥劑組及地西他濱/MBG453組合組中相當。
用於AML PDX植入之Nod scid γ (NSG；NOD.Cg-prkdc＜scid＞Il2rg＜tm1wj1＞/SzJ，Jackson)模型缺乏免疫細胞，諸如表現TIM-3之T細胞、NK細胞及骨髓細胞，表明MBG453可能需要某些免疫細胞功能以增強地西他濱在小鼠模型中之活性。
實例 7-MBG453 增強經工程改造以過度表現 TIM-3 之 Thp-1 AML 細胞之殺傷 THP-1細胞在細胞表面上表現TIM-3 mRNA，但幾乎不表現TIM-3蛋白。用由慢病毒載體編碼之Flag標籤工程改造THP-1細胞以穩定地過度表現TIM-3，而親本THP-1細胞不在表面上表現TIM-3蛋白。根據製造商說明書，用2 µM CFSE (Thermo Fisher Scientific)標記經TIM-3 Flag標記之THP-1細胞，且用2 µM CTV (Thermo Fisher Scientific)標記THP-1親本細胞。在96孔圓底培養盤中進行共培養分析。以1:1比率混合THP-1細胞，總共每孔100,000個THP-1細胞(50,000個表現TIM-3之THP-1且50,000個THP-1親本細胞)且在不同量之抗CD3/抗CD28 T細胞活化珠粒(ThermoFisherScientific)及25 µg/ml MBG453 (完全抗體)、MBG453 F(ab)或hIgG4同型對照存在下用100,000個T細胞共培養三天，該等T細胞係使用人類pan T細胞分離套組(Miltenyi Biotec)自健康人類供體PBMC (Bioreclamation)純化。隨後偵測細胞且藉由流動式細胞測量術計數。計算表現TIM-3之THP-1細胞與親本THP-1細胞之間的比率(曲線圖之y軸中之「倍數」)，且將其以無抗CD3/抗CD28珠粒刺激之條件標準化。曲線圖之x軸標示呈每細胞珠粒數目形式之刺激量。資料表示兩個獨立實驗中之一者。如圖 7 中所見，MBG453 (三角形)而非MBG453 F(ab) (空心正方形)相對於親本對照THP-1細胞增強過度表現TIM-3之THP-1細胞的T細胞介導性殺傷，表明MBG453之Fc部分對於THP-1 AML細胞之MBG453增強T細胞介導性殺傷可能十分重要。
本申請案之實施例  以下為本申請案中揭示之實施例。實施例包括但不限於： 1.     一種組合，其包含TIM-3抑制劑及低甲基化劑，該組合用於治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)或慢性骨髓單核球性白血病(CMML)。 2.     一種治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)或慢性骨髓單核球性白血病(CMML)之方法，其包含向該個體投與TIM-3抑制劑及低甲基化劑之組合。 3.     如如實施例1所使用之組合或如實施例2之方法，其中該TIM-3抑制劑包含抗TIM-3抗體分子。 4.     如實施例1或3所使用之組合或如實施例2或3之方法，其中該TIM-3抑制劑包含MBG453或TSR-022。 5.     如實施例1或3所使用之組合或如實施例2或3之方法，其中該TIM-3抑制劑包含MBG453。 6.     如實施例1或3至5中任一項所使用之組合或如實施例2至5中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。 7.     如實施例1或3至6中任一項所使用之組合或如實施例2至6中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係以約800 mg之劑量投與。 8.     如實施例1或3至7中任一項所使用之組合或如實施例2至7中任一項之方法，其中該TIM-3係在28天週期之第8天投與。 9.     如實施例1或3至8中任一項所使用之組合或如實施例2至8中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。 10.    如實施例1或3至9中任一項所使用之組合或如實施例2至9中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係靜脈內投與。 11.    如實施例1或3至10中任一項所使用之組合或如實施例2至10中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係歷經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。 12.    如實施例1或3至11中任一項所使用之組合或如實施例2至11中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係歷經約30分鐘之時段靜脈內投與。 13.    如實施例1或3至12所使用之組合或如實施例2至12之方法，其中該低甲基化劑包含阿紮胞苷或地西他濱。 14.    如實施例1或3至13所使用之組合或如實施例2至13之方法，其中該低甲基化劑包含阿紮胞苷。 15.    如實施例1或3至14中任一項所使用之組合或如實施例2至14中任一項之方法，其中該低甲基化劑係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。 16.    如實施例1或3至15中任一項所使用之組合或如實施例2至15中任一項之方法，其中該低甲基化劑係以約75 mg/m2 之劑量投與。 17.    如實施例1或3至16中任一項所使用之組合或如實施例2至16中任一項之方法，其中該低甲基化劑係一天投與一次。 18.    如實施例1或3至17中任一項所使用之組合或如實施例2至17中任一項之方法，其中該低甲基化劑係投與連續5至7天。 19.    如實施例1或3至18中任一項所使用之組合或如實施例2至18中任一項之方法，其中該低甲基化劑係如下投與：(a)在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。 20.    如實施例1或3至19中任一項所使用之組合或如實施例2至19中任一項之方法，其中該低甲基化劑係皮下或靜脈內投與。 21.    如實施例1或3至20中任一項之組合或如實施例2至20中任一項之方法，其中該骨髓發育不良症候群(MDS)為中危MDS、高危MDS或極高危MDS。 22.    如實施例1或3至20中任一項所使用之組合或如實施例2至20中任一項之方法，其中該慢性骨髓單核球性白血病(CMML)為CMML-1或CMML-2。 23.    一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之CMML-2。 24.    一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS。 25.    一種治療個體之CMML-2的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。 26.    一種治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。 27.    如實施例23或24所使用之組合或如實施例25或26之方法，其中MBG453係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。 28.    如實施例23至24或27所使用之組合或如實施例25至27之方法，其中MBG453係以約800 mg之劑量投與。 29.    如實施例23至24或27至28中任一項所使用之組合或如實施例25至28中任一項之方法，其中MBG453係每四週投與一次。 30.    如實施例23至24或27至29中任一項所使用之組合或如實施例25至29中任一項之方法，其中MBG453係在28天週期之第8天投與。 31.    如實施例23至24或27至30中任一項所使用之組合或如實施例25至30中任一項之方法，其中MBG453係每四週投與一次。 32.    如實施例23至24或27至31中任一項所使用之組合或如實施例25至31中任一項之方法，其中MBG453係靜脈內投與。 33.    如實施例23至24或27至32中任一項所使用之組合或如實施例25至32中任一項之方法，其中MBG453係歷經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。 34.    如實施例23至24或27至33中任一項所使用之組合或如實施例25至33中任一項之方法，其中MBG453係歷經約30分鐘之時段靜脈內投與。 35.    如實施例23至24或27至34中任一項所使用之組合或如實施例25至34中任一項之方法，其中阿紮胞苷係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。 36.    如實施例23至24或27至35中任一項所使用之組合或如實施例25至35中任一項之方法，其中阿紮胞苷係以約75 mg/m2 之劑量投與。 37.    如實施例23至24或27至36中任一項所使用之組合或如實施例25至36中任一項之方法，其中阿紮胞苷係一天投與一次。 38.    如實施例23至24或27至37中任一項所使用之組合或如實施例25至37中任一項之方法，其中阿紮胞苷係投與連續5至7天。 39.    如實施例23至24或27至38中任一項所使用之組合或如實施例25至38中任一項之方法，其中阿紮胞苷係如下投與：(a)在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。 40.    如實施例23至24或27至39中任一項所使用之組合或如實施例25至39中任一項之方法，其中阿紮胞苷係皮下或靜脈內投與。 41.    一種治療個體之CMML-2的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；且 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。 42.    一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之CMML-2，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；且 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。 43.    一種治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；且 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。 44.    一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；且 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
以引用之方式併入 本文提及之所有公開案、專利及寄存編號以全文引用之方式併入本文中，如同各個別公開案或專利特別且個別地指定為以引用之方式併入一般。
等效物 雖然已論述本發明之特定實施例，但以上說明書具說明性而非限制性。熟習此項技術者在審閱本說明書及下文申請專利範圍後，將顯而易知本發明之諸多變化形式。本發明之完整範疇以及其等效物之完整範疇，及說明書以及此類變化形式應參照申請專利範圍確定。
圖 1 為描繪MBG453對TIM-3與半乳糖凝集素-9之間的相互作用之影響的曲線圖。評定競爭以作為抗體阻斷針對TIM-3受體之Gal9-SULFOTag信號的能力之量度，其展示於Y軸。抗體之濃度展示於X軸。圖 2 為展示MBG453介導中等的抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)的曲線圖。在MBG453、利妥昔單抗(Rituximab)及對照hIgG4單株抗體(mAB)之各種測試濃度下定量吞噬作用之百分比。圖 3 為展現如藉由螢光素酶活性所量測的FcγR1a之MBG453接合的曲線圖。在所測試抗體之各種濃度下，藉由螢光素酶活性定量由MBG453或抗CD20 MabThera參考對照組與FcγRIa之結合誘導的NFAT依賴性報導基因表現之活化。圖 4 展示MBG453增強經地西他濱預處理之AML細胞的免疫介導性殺傷。圖 5 為描繪AML患者來源之異種移植(PDX)模型HAMLX21432中，MBG453在存在及不存在地西他濱之情況下的抗白血病活性的曲線圖。將MBG453呈單一藥劑型式每週一次(在給藥之第6天起)以10 mg/kg腹膜內投與，或與地西他濱組合每日一次以1 mg/kg腹膜內投與總共5個劑量(自開始給藥起)。初始組大小：4個動物。在植入後第27天開始的21天給藥期期間，每週記錄體重(AML PDX 模型#21432  2×106 個細胞/動物)。在第56天記錄所有最終資料。藉由FACS分析以人類CD45+細胞於周邊血液中之百分比形式來量測白血病負擔。圖 6 為描繪AML患者來源之異種移植(PDX)模型HAMLX5343中，MBG453在存在及不存在地西他濱之情況下的抗白血病活性的曲線圖。在植入後第32天開始處理(2百萬個細胞/動物)。將MBG453呈單一藥劑形式每週一次(在給藥之第6天起)以10 mg/kg腹膜內投與，或與地西他濱組合每日一次以1 mg/kg腹膜內投與總共5個劑量(自開始給藥起)。初始組大小：4個動物。在21天給藥期期間每週記錄體重。在第56天記錄所有最終資料。藉由FACS分析以CD45+細胞於周邊血液中之百分比形式來量測白血病負擔。圖 7 為描繪經工程改造而過度表現TIM-3之THP-1 AML細胞相對於親本對照THP-1細胞的MBG453增強之殺傷的曲線圖。計算表現TIM-3之THP-1細胞與親本THP-1細胞之間的比率(曲線圖之y軸中之「倍數」)，且將其以無抗CD3/抗CD28珠粒刺激之條件標準化。曲線圖之x軸標示呈每細胞珠粒數目形式之刺激量。資料表示兩個獨立實驗中之一者。
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Claims (44)

  1. 一種組合，其包含TIM-3抑制劑及低甲基化劑，該組合用於治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)或慢性骨髓單核球性白血病(CMML)。
  2. 一種治療個體之骨髓發育不良症候群(MDS)或慢性骨髓單核球性白血病(CMML)之方法，其包含向該個體投與TIM-3抑制劑及低甲基化劑之組合。
  3. 如請求項1所使用之組合或如請求項2之方法，其中該TIM-3抑制劑包含抗TIM-3抗體分子。
  4. 如請求項1或3所使用之組合或如請求項2或3之方法，其中該TIM-3抑制劑包含MBG453或TSR-022。
  5. 如請求項1或3所使用之組合或如請求項2或3之方法，其中該TIM-3抑制劑包含MBG453。
  6. 如請求項1或3至5中任一項所使用之組合或如請求項2至5中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。
  7. 如請求項1或3至6中任一項所使用之組合或如請求項2至6中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係以約800 mg之劑量投與。
  8. 如請求項1或3至7中任一項所使用之組合或如請求項2至7中任一項之方法，其中該TIM-3係在28天週期之第8天投與。
  9. 如請求項1或3至8中任一項所使用之組合或如請求項2至8中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係每四週投與一次。
  10. 如請求項1或3至9中任一項所使用之組合或如請求項2至9中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係靜脈內投與。
  11. 如請求項1或3至10中任一項所使用之組合或如請求項2至10中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。
  12. 如請求項1或3至11中任一項所使用之組合或如請求項2至11中任一項之方法，其中該TIM-3抑制劑係經約30分鐘之時段靜脈內投與。
  13. 如請求項1或3至12所使用之組合或如請求項2至12之方法，其中該低甲基化劑包含阿紮胞苷(azacitidine)或地西他濱(decitabine)。
  14. 如請求項1或3至13所使用之組合或如請求項2至13之方法，其中該低甲基化劑包含阿紮胞苷。
  15. 如請求項1或3至14中任一項所使用之組合或如請求項2至14中任一項之方法，其中該低甲基化劑係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。
  16. 如請求項1或3至15中任一項所使用之組合或如請求項2至15中任一項之方法，其中該低甲基化劑係以約75 mg/m2 之劑量投與。
  17. 如請求項1或3至16中任一項所使用之組合或如請求項2至16中任一項之方法，其中該低甲基化劑係一天投與一次。
  18. 如請求項1或3至17中任一項所使用之組合或如請求項2至17中任一項之方法，其中該低甲基化劑係投與連續5至7天。
  19. 如請求項1或3至18中任一項所使用之組合或如請求項2至18中任一項之方法，其中該低甲基化劑係如下投與：(a)在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
  20. 如請求項1或3至19中任一項所使用之組合或如請求項2至19中任一項之方法，其中該低甲基化劑係皮下或靜脈內投與。
  21. 如請求項1或3至20中任一項之組合或如請求項2至20中任一項之方法，其中該骨髓發育不良症候群(MDS)為中危MDS、高危MDS或極高危MDS。
  22. 如請求項1或3至20中任一項所使用之組合或如請求項2至20中任一項之方法，其中該慢性骨髓單核球性白血病(CMML)為CMML-1或CMML-2。
  23. 一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之CMML-2。
  24. 一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS。
  25. 一種治療個體之CMML-2的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。
  26. 一種治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合。
  27. 如請求項23或24所使用之組合或如請求項25或26之方法，其中MBG453係以約700 mg至約900 mg之劑量投與。
  28. 如請求項23至24或27所使用之組合或如請求項25至27之方法，其中MBG453係以約800 mg之劑量投與。
  29. 如請求項23至24或27至28中任一項所使用之組合或如請求項25至28中任一項之方法，其中MBG453係每四週投與一次。
  30. 如請求項23至24或27至29中任一項所使用之組合或如請求項25至29中任一項之方法，其中MBG453係在28天週期之第8天投與。
  31. 如請求項23至24或27至30中任一項所使用之組合或如請求項25至30中任一項之方法，其中MBG453係每四週投與一次。
  32. 如請求項23至24或27至31中任一項所使用之組合或如請求項25至31中任一項之方法，其中MBG453係靜脈內投與。
  33. 如請求項23至24或27至32中任一項所使用之組合或如請求項25至32中任一項之方法，其中MBG453係經約15分鐘至約45分鐘之時段靜脈內投與。
  34. 如請求項23至24或27至33中任一項所使用之組合或如請求項25至33中任一項之方法，其中MBG453係經約30分鐘之時段靜脈內投與。
  35. 如請求項23至24或27至34中任一項所使用之組合或如請求項25至34中任一項之方法，其中阿紮胞苷係以約50 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量投與。
  36. 如請求項23至24或27至35中任一項所使用之組合或如請求項25至35中任一項之方法，其中阿紮胞苷係以約75 mg/m2 之劑量投與。
  37. 如請求項23至24或27至36中任一項所使用之組合或如請求項25至36中任一項之方法，其中阿紮胞苷係一天投與一次。
  38. 如請求項23至24或27至37中任一項所使用之組合或如請求項25至37中任一項之方法，其中阿紮胞苷係投與連續5至7天。
  39. 如請求項23至24或27至38中任一項所使用之組合或如請求項25至38中任一項之方法，其中阿紮胞苷係如下投與：(a)在28天週期之第1天至第7天投與連續七天，或(b)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
  40. 如請求項23至24或27至39中任一項所使用之組合或如請求項25至39中任一項之方法，其中阿紮胞苷係皮下或靜脈內投與。
  41. 一種治療個體之CMML-2的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；及 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
  42. 一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之CMML-2，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；及 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
  43. 一種治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS的方法，其包含向該個體投與MBG453及阿紮胞苷之組合，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；及 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
  44. 一種組合，其包含MBG453及阿紮胞苷，該組合用於治療個體之中危MDS、高危MDS或極高危MDS，其中： a) MBG453係在28天給藥週期之第8天以約800 mg之劑量每四週投與一次；及 b)阿紮胞苷係以一天約75 mg/m2 之劑量如下投與：(i)在28天給藥週期之第1天至第7天投與連續七天，或(ii)在28天週期之第1天至第5天投與連續五天，之後中斷兩天，隨後在第8天至第9天投與連續兩天。
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