TW202003569A - 多價抗體 - Google Patents

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Abstract

本發明係有關於一種多價抗體，其包含有：一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分藉由一個連接子而被連接至該至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及其中該連接子包含有一個鉸鏈序列或一個衍生自一鉸鏈序列的序列。本發明亦有關於一種多價抗體，其包含有：一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及至少一個附加的結合領域，其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區並且藉由連接該主體抗體部分的一個可變區與該CH1區的該連接子而被連接至該主體抗體部分，以及其中該多價抗體結合至少3個不相同的表位。

Description

多價抗體
本發明係有關於具有3個或更多個結合領域(binding domains)的多價抗體(multivalent antibodies)以及一種用於製造該等多價抗體的方法。本發明進一步係有關於該等多價抗體的組份胜肽(constituent polypeptides)以及有關於可被用來連接該多價抗體的一個或多個結合領域之連接子(linkers)。本發明另外係有關於編碼(encode)該等多價抗體、連接子的核酸(nucleic acids)以及有關於包含有該等核酸的載體(vectors)，還有有關於生成該等多價抗體的宿主細胞(host cells)。本發明亦有關於多價抗體，它們能夠馬上同時地結合3種抗原(antigens)或標的物(targets)，包含存在於癌細胞(cancer cells)上的標的抗原(target antigens)或者銜接(engage)免疫效應細胞(immune effector cells)的腫瘤細胞抗原(tumor cell antigens)與標的物。又，本發明係有關於一種包含有該多價抗體的藥學組成物(pharmaceutical composition)以及有關於該多價抗體來供應用於人類或動物透過療法(therapy)的治療(treatment)。又，本發明係有關於一種使用該抗體來治療人類或動物的方法。
多價抗體，諸如能夠結合兩種抗原或兩種表位(epitopes)的雙特異性抗體(bispecific antibodies)，係為本技藝中已知曉的。這樣的多價結合蛋白質(multivalent binding proteins)可以使用各種不同的技術而被產生，包含細胞融合(cell fusion)、化學接合(chemical conjugation)或重組DNA技術(recombinant DNA techniques)。
抗體典型地係為由4個蛋白質[包含兩個相同的重鏈(heavy chains)和兩個相同的輕鏈(light chains)]所構成的多聚體(multimers)，其中該重鏈係由一個可變領域(variable domain)(VH)和3個恆定區(constant regions)(CH1、CH2、CH3)所構成，以及其中該輕鏈係由一個可變輕鏈領域(variable light chain domain)(VL)和一個恆定區(CL)所構成。典型地，該輕鏈和該重鏈經由許多非共價相互作用(noncovalent interactions)的影響還有亦經由雙硫鍵(disulphide bonds)而配成對。該二重鏈在連接CH1至CH2的鉸鏈區(hinge region)之處，和/或經由位在兩個CH3領域之間的介面(interface)中的胺基酸相互作用(amino acid interactions)，而配成對。VH與VL的配對形成一個抗原結合領域(antigen binding domain)，而且可變性(variability)典型地被發現係在VH和VL領域的3個表面迴圈形成區(superficial-loop forming regions)中，該等表面迴圈形成區是互補決定區(complementarity determining regions)或CDRs。
某些多價抗體型式(multivalent antibody formats)係為本技藝中已知曉的，諸如具有在諸如雙特異性抗體中的可結合兩個不相同的抗原或兩個位在相同抗原之內的不相同表位的兩個不相同的結合領域的抗體。這樣的一種型式可允許校準結合(calibrated binding)的使用，該校準結合允許多價抗體要被選擇性地標靶(selectively targeted)至表現(express)兩種抗原或表位的細胞或標的物(諸如一腫瘤細胞)而不標靶表現一種抗原的健康細胞(healthy cells)，或者去標靶以較低的表現位準(expression levels)來表現一種抗原的該等健康細胞。同樣地，在一個多價抗體上具有兩個不相同的結合領域，諸如一個雙特異性抗體，可以允許不相同的抗原之結合，而使得該多價抗體可以被用來標靶位在一個單細胞(single cell)或兩個相互作用的細胞上的一種抑制分子(inhibitory molecule)與一種刺激分子(stimulatory molecule)這兩者，俾以導致該多價抗體之增強的效力(enhanced potency)。一個多價抗體亦可被用來重定向(redirect)細胞，例如免疫調節細胞(immunomodulatory cells)，該等細胞可被重定向至一腫瘤。
兩個以上的結合領域在一個單一抗體(single antibody)內之併入(incorporation)可以允許標的物以及功效(efficacy)的有利組合之一更寬廣的排列。舉例來說，一個具有3個或更多個結合領域的多價抗體可以標靶相同的抗原和表位，允許在一較低的抗體對標的物的比值下對於一給定的標的物(a given target)之特異性(specificity)和/或一標的物的飽和度(saturation)。一個多價抗體可以含有兩個或更多個相同的抗原結合領域以容許對一標的細胞的高親留力結合(high avidity binding)。這可被用來特異性地標靶抗原，諸如被過度表現(over-expressed)在腫瘤細胞上的神經節苷脂(gangliosides)。這些腫瘤相關抗原(tumor associated antigens)存在於正常細胞之上，但以更高的密度(density)存在於腫瘤細胞之上。一個含有幾個較低親和力結合區(lower affinity binding regions)的多價抗體可允許對腫瘤細胞之特異性標靶而不與健康細胞反應，或者以一較低比例這樣做而且同時活化(activating)或封阻(blocking)另外的受體(receptors)。最終，3個或更多個結合區在這樣的應用中是有用的。
雖然某些多價抗體已被描述於本技藝中，為了針對一系列的抗原之結合領域可被容易地製造並且被有效率地、安定地轉換成一個能夠結合各種各樣的抗原和表位之多價抗體，在本技藝中需要有允許多價抗體的有效生產(efficient production)之新的型式以及新的連接子。工程化(engineering)一個含有多於兩個結合領域的抗體在傳統上是耗時的、低效的和昂貴的。確實，要有效率地生成高品質、低免疫原性(immunogenic)的多價抗體(它們可被產生以標靶各式各樣的抗原)，存在有許多阻礙(impediments)。
舉例來說，含有3個或4個結合領域的現有多價型式仰賴合成的連接子(synthetic linkers)，諸如Gly4Ser (G4S)重複序列(repeats)，該等合成的連接子含有序列領域(sequence domains)，該等序列領域首先傾向於限制對該分子中的所有結合領域之接近(access)，其次就可發展性(developability)也可能是有問題的。
現有的多價抗體型式亦仰賴不相同的重鏈和輕鏈，它們係藉由雙硫鍵和胺基酸相互作用而被相聯(associated)，或就單鏈可變片段(single-chain fragment variables，scFvs)來說可藉由短連接子而被連接。然而在被使用於一種具有3種或更多種結合特異性(binding specificities)之多特異性型式(multispecific format)中的多個可變領域之每一者內使用有差別的可變鏈(重鏈和/或輕鏈)之需求需要這些分子的大量工程化，俾以防止重鏈和輕鏈的錯配(mispairing)。這總是會影響這些分子的複雜性(complexity)、安定性(stability)、免疫原性(immunogenicity)和生產水準(production levels)。
多價抗體型式可以仰賴對每個結合領域使用相同的輕鏈，其中被配對以該輕鏈之一個或多個同源可變區(cognate variable regions)被迫經由化學修飾(chemical modifications)來配對，而非同源鏈(cognate chain)因應抗原的暴露(antigenic exposure)而被形成並與一共同輕鏈(common light chain)配對，以及發生在B細胞發育(B-cell development)期間當中的共同演化(co-evolution)之過程(processes)。
多價抗體型式亦可以仰賴來自結合一種抗原之一現有單特異性抗體(monospecific antibody)的輕鏈，該輕鏈接而被使用於一個資料庫(library)中，俾以便辨識能夠配對該輕鏈同時亦結合一相異的表位或抗原的重鏈。
這樣的假-共同輕鏈(pseudo-common light chains)不被偏好供應用於本發明中。對於本發明較佳的共同輕鏈是那些能夠與各種不同的同源鏈配對而且可以得自於(obtained from)、衍生自(derived from)或者根據(based on)與一重排的同源鏈(rearranged cognate chain)配對之共同鏈(common chains)，該重排的同源鏈係由已經歷體細胞重組(somatic recombination)[而且較佳為因應抗原的暴露之體細胞超突變(somatic hypermutation)]的DNA所編碼。
一個假輕鏈方法(pseudo light chain approach)限制了可用的同源鏈之範圍。迫使不是在一針對抗原的暴露之反應中被一起形成的重鏈和輕鏈之配對導致了特異性和親和力之喪失而限制了實用性。再者，通常很少見到任何一種給定的抗體會允許VH和VL的混排(shuffling)並且守恆(conserve)親和力和特異性。
迫使輕鏈與一重鏈[其中這兩者並未在免疫反應(immune response)中共同演化卻維持著去結合一抗原的能力(capacity)]配對並不是微不足道的，而且可能限制了這個方法的靈活性(flexibility)。
同樣地，再利用(reusing)一種抗體之一輕鏈來辨識能夠結合該輕鏈且亦結合一感興趣的相異抗體之重鏈，這限制了可用的重鏈之範圍，而且被尋求要予以結合的抗原或表位越多，就變得越來越不可能去辨識合適的額外重鏈。亦即，吾人可使用一種與一重鏈配對的輕鏈來形成一個會結合一給定抗原的Fab，俾以辨識一與該輕鏈配對並且能夠結合一種第二抗原的後繼重鏈(subsequent heavy chain)。但是，第三次使用那個輕鏈來辨識能夠配對該輕鏈同時結合一種第三抗原或表位的第三重鏈變得越來越罕見，而且要被尋找的被辨識為能夠與該輕鏈配對同時亦結合相異的表位或抗原之重鏈越多，就會更加地罕見。
被描述於此的本發明之一較佳具體例使用一種共同鏈，該共同鏈回應一抗原而與多種多樣的重鏈配對，並且不需要一種來自一單特異性抗體的現有輕鏈之再利用或者一輕鏈與一同源鏈經由化學修飾之強迫配對(forced pairing)。
多價抗體的成功建構仰賴介於不相同領域之間的蛋白質連接子之正確選擇，因為兩個領域的直接融合(direct fusion)可導致受危害的生物活性(compromised biological activity)。該(等)連接子的生物物理特徵(biophysical characteristics)，諸如電荷(charge)、剛性(rigidity)或可撓曲性(flexibility)還有介於該等結合領域之間的距離以及介於結合區之間的空間構形(spatial conformation)，可衝擊(impact)表位可近性(epitope access)以及該多價抗體去結合它的標的物之能力(ability)。因此，需要一種多價型式，它在一模組化方式(modular fashion)下可以使用具有不相同特徵的各式各樣連接子以允許多價抗體的建構，該等多價抗體允許同時結合至不相同的表位組合，該等表位可能坐落在不相同分子和/或不相同細胞上。
於是，在本技藝中需要有一組含有不相同的剛性、可撓曲性、長度特徵的連接子之設計，該等連接子可根據標的物的組合而以一模組化方式被使用，同時維持著安定性、低免疫原性以及可發展性的容易度。
於是，需要有用於具有3個或更多個結合領域的多價抗體之新穎而且有用的型式以及用於該等抗體之生成的連接子，它們廣泛地適用於一廣泛範圍之包含有兩個以上的結合領域之抗體的快速且穩健的產生。
發明概要 本發明係根據用於一包含有3個或更多個結合領域的多價抗體(其可為一多特異性抗體)之新穎模組化型式。在這些型式中，至少一個結合領域被連接至一個主體抗體部分(base antibody portion)，該主體抗體部分包含有兩個結合領域。該附加的結合領域(additional binding domain)可包含有一個可變區、Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的(modified) Fab領域或此等任一者之一功能性片段(functional fragment)。該主體抗體部分，舉例來說，可以是一個全長的抗體(full length antibody)或其片段，但就每一種情況而言皆包含有兩個結合領域。
該一個或多個附加的結合領域經由一(多)個連接子而被連接至該主體抗體部分，這提供了一個或多個除了那些為該主體抗體部分所具者以外的結合部分(binding moieties)。
一個連接子被用來將該一個或多個附加的結合領域連接至該主體抗體部分。該連接子包含有一個胜肽區(peptide region)，例如一個或多個鉸鏈區和/或一個或多個衍生自一鉸鏈區的區域。該連接子和一個它要被連接的恆定區(例如CH1)之組合在決定該多價抗體的性質上可能是至關重要的，並且允許該抗體之正確的功能性(correct functionality)和/或該一個或多個附加的結合領域對該主體抗體的定向(orientation)。因此，如果一個連接子序列係根據一給定的亞型(subtype)之一鉸鏈，可能較佳的是：與該連接子序列連接的該附加的結合領域之恆定區是屬於相同的亞型。
該一個或多個附加的結合領域可包含有一個可變區、Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域。
Fab領域特別地構成有益之附加的結合領域，因為它們包含有蛋白質領域具有對於多價分子的製造是有用的可預測行為(predictable behavior)，該等多價分子是安定的而且可被容易地製造。
為促進本發明的多價抗體之有效生產以及可發展性，該多價抗體可包含有一個共同可變區(common variable region)，該共同可變區可為一個免疫球蛋白(immunoglobulin)重鏈可變區(VH)或一輕鏈可變區(VL)，但典型地是一個共同輕鏈(cLC)可變區。
該共同可變區典型地被配對以一同源可變區，該同源可變區係由一個已經歷體細胞重組而且較佳為親和力成熟作用(affinity maturation)的核酸所編碼或者係根據或衍生自一個重排的可變區(rearranged variable region)，該重排的可變區係由一個已經歷體細胞重組而且較佳為親和力成熟作用的過程之核酸所編碼和/或係根據或衍生自已知的抗體產生技術(antibody generation techniques)，諸如噬菌體顯示(phage display)、動物[包含帶有人類化免疫系統(humanized immune systems)的基因轉殖動物(transgenic animals)]的免疫(immunization)以及本技藝中已詳知的其他技術。
一個在本發明的多價抗體之各個結合領域中基本上是相同的共同可變區之使用促進了該等抗體之發展和製造。
供應用於本發明之一多價抗體中的共同可變區之選擇因此應該是可與許多不相同的同源重鏈或輕鏈被廣泛地使用的一種。
一個相同的或實質相同的(substantially identical)共同可變區，例如一個cLC可變區，允許完整的或實質完整的Fab領域使用於全部3個或更多個結合領域，而不需要如Crossmab技術中所使用的大量工程化或者用以防止重鏈或輕鏈的錯配之連接子(諸如被使用於scFv領域中的那些)。又，由於基本上生殖系編碼的(essentially germline encoded)且為非免疫原性的共同可變區係為已知的(參見WO 2009/157771)，將之使用於該3個或更多個Fab結合領域的每一者之中可以提供降低的免疫原性。
被描述於此之用於生成多價抗體的該型式之一額外益處允許基因轉殖動物[較佳為基因轉殖的囓齒動物(transgenic rodents)]的使用，該等基因轉殖動物在牠們的基因體(genomes)內具有一個能夠與各式各樣的同源可變區配對之共同可變區(例如，與各式各樣的重鏈可變區配對的共同輕鏈可變區)(參見WO 2009/157771)，其允許編碼從暴露於不相同的抗原而被形成之該等同源可變區的DNA被引入(introduced)至一個帶有編碼該共同可變區的DNA之宿主細胞內，該等DNA可以各自被表現以供多價抗體的產生。
舉例來說，一個在牠的生殖系內包含有編碼一共同可變區的DNA以及編碼一可重排以形成一同源可變區並且能夠經歷一體細胞重組之未重排的免疫球蛋白基因座(unrearranged immunoglobulin locus)的DNA之基因轉殖的小鼠(transgenic mouse)可被暴露於一種或多種抗原，而使得根據對該3種或更多種抗原的暴露而被生成之重排的可變區可接而被用來產生本發明之一多價抗體。編碼該共同可變區以及該3個或更多個重排的可變區之核酸序列可被轉形(transformed)至一個宿主細胞之內，俾以表現本發明之一多價抗體。
因此，被描述於此之用於生成多價抗體的該型式使用了3個或更多個結合領域，該等結合領域全都包含有一個共同可變區，較佳為一個共同輕鏈可變區。
本發明的型式包含有一個或多個除了那些為該主體抗體部分所具有者之外的結合領域。這樣的一個附加的結合領域可以是經由一個連接子被連接至該主體抗體部分的一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域(較佳地包含有一個CH1領域以及一個可變領域)。在一個經修飾的Fab領域中，該CH1領域未被配對以一個CL。一個合適的CH1領域可以是一種被工程化以移除一個或多個疏水性區(hydrophobic regions)之物或者可為一種衍生自一駱駝科動物(camelid animal)或一鯊魚(shark)之物。任擇地，一個附加的結合領域可包含有一個CL領域以及一個可變領域，其經由一個連接子被連接至該主體抗體部分。該CL可為一個Cκ (Ckappa)或一個Cλ (Clambda)領域。
典型地，該(等)附加的結合領域係在該主體抗體部分的結合領域之一共同可變部分(common variable portion)或一重排的可變區或這兩者的N-端區(N-terminal region)之處被連接至該主體抗體部分的一個或兩個結合領域。
任擇地，一個附加的結合領域可以經由一個將該主體抗體部分的結合領域之一共同鏈與一重排的可變區這兩者連接至該附加的結合領域之一CH1和CL區的連接子而被連接至該主體抗體部分。在一個附加的結合領域缺少一個恆定區的情況下，被揭示於此的新穎連接子可以將該主體抗體部分的結合領域之一共同鏈與一重排的可變區這兩者連接至該附加的結合領域之共同鏈和/或重排的可變區。
任擇地，一個附加的結合領域可以是一個VH和VL區，亦即一個Fv領域，它藉由一個單一連接子胜肽而被連接至該主體抗體部分。典型地，這種型式之附加的結合領域係在該主體抗體部分的結合領域之共同可變部分或者重排的可變區之N-端區處被附接至該主體抗體部分的一個或兩個結合領域。
這種型式，當以此處所揭示的連接子[包含不相同的長度、結構與剛度(degrees of rigidity)]來予以使用之時，是出奇地可撓曲的。因此，本發明提供了一庫(a repertoire of)的具有不相同性質之連接子來供應用於所揭示的多價抗體型式，該等連接子使得要將3個或更多個結合領域組合成一個多價抗體是發展容易的。
作為此處所揭示的連接子，本發明因此提供一種模組化方法(modular approach)，其中合適的連接子之選擇連同一個對應組(corresponding set)的結合領域(諸如Fab領域)之選擇容許那些結合領域為了各式各樣的功效而在一個多價抗體中一起發揮作用。
本發明的一個多價抗體可被使用於療法中，特別是作為一種所謂的“銜接元(engager)”抗體，藉此，該抗體能夠形成一個介於一免疫效應細胞和一腫瘤細胞之間的連接。
根據本發明，因此被提供的是一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分藉由一個連接子而被連接至該至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及 其中該連接子包含有一個鉸鏈序列(hinge sequence)或一個衍生自一鉸鏈序列的序列。
本發明亦有關於一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區並且藉由連接該主體抗體部分的一個可變區與該CH1區的該連接子而被連接至該主體抗體部分，以及 其中該多價抗體結合至少3個不相同的表位。
較佳地，該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者可以全部都具有一個共同可變區。該一個或多個附加的結合領域之變化(Variety)
一個較佳具體例是一種多價抗體，其中一個或多個結合領域是一個Fv領域包含有一個重鏈可變區(VH)以及一個輕鏈可變區(VL)。
一個進一步的較佳具體例是一種多價抗體，其中一個或多個結合領域是一個Fab領域包含有一個重鏈可變區(VH)以及一個輕鏈可變區(VL)，該Fab領域的該重鏈可變區包含有一個CH1區(VH-CH1)，以及該Fab領域的該輕鏈可變區包含有一個CL區(VL-CL)。該Fab領域可含有一個VL-CL，其為一個Vκ-Cκ、Vλ-Cλ、Vλ-Cκ或Vκ-Cλ。
另一個具體例是一種多價抗體，其中該一個或多個附加的結合領域是一種由一個VH-CH1和VL所構成之經修飾的Fab領域。任擇地，一個具體例是一種多價抗體，其中該一個或多個附加的結合領域是一種由一個VL-CL和一個VH所構成之經修飾的Fab領域。在此種經修飾的Fab領域中，一個恆定區CH1或CL係呈未被配對以它的同源區(cognate region)而存在，和/或一個可變區VH或VL係呈未被配對以它的同源區而存在。共同鏈
一個較佳具體例是一種多價抗體，其中該一個或多個附加的結合領域包含有一個Fab領域包含有一個共同重排的可變區被配對至一個重排的可變區，該重排的可變區已經歷在暴露給一種抗原之後的體細胞重排(somatic rearrangement)或者係為得自於、衍生自或根據一個序列(係為體細胞重排之結果)的核酸所編碼。任擇地，該重排的可變區可為一個得自於、衍生自或根據一個合成庫(synthetic repertoire)之物，該合成庫係使用本技藝中已知的分子生物學技術(molecular biology techniques)[包含合成的噬菌體顯示庫(synthetic phage display libraries)之使用]而將多樣性(diversity)引入至一庫而成。較佳地，該Fab領域包含有一個共同輕鏈可變區被配對至一個對應重排的重鏈可變區(counterpart rearranged heavy chain variable region)。較佳地，該共同輕鏈可變區被連接至一個CL區而該重排的重鏈可變區被連接至一個CH1區。較佳地，該共同輕鏈係經由該CL和CH1區的連接而被配對至該重鏈可變區。任擇地，其中該共同鏈是一個重鏈，該重排的可變區是一個輕鏈，而該等鏈可分別地包含有一個CH1和CL領域而且可經由該CL和CH1區的連接而被配對。
一個較佳具體例是一種多價抗體，其中該3個或更多個結合領域各自包含有相同的共同鏈，但是其中該3個或更多個結合領域包含有不相同之重排的可變同源鏈(rearranged variable cognate chains)，更佳地，該相同的共同鏈是一個共同輕鏈。
一個較佳具體例是一種多價抗體，其中該3個或更多個結合領域包含有重排的可變區係由得自於、衍生自或根據一包含有一共同輕鏈以及未重排的重鏈可變區之基因轉殖動物的核酸序列之核酸所編碼，該基因轉殖動物已被暴露給一抗原並且已生成包含有一被配對至一共同輕鏈之重排的重鏈可變區之抗體。任擇地，在一多價抗體之一具體例中，該3個或更多個結合領域包含有重排的可變區係由得自於、衍生自或根據一包含有一共同重鏈(common heavy chain)以及未重排的輕鏈可變區之基因轉殖動物的核酸序列之核酸所編碼，該基因轉殖動物已被暴露給一抗原並且已生成包含有一被配對至一共同重鏈之重排的輕鏈可變區之抗體。連接子組成(Linker Composition)
一個較佳具體例是該多價抗體，其中該連接子是一個天然存在的序列(naturally occurring sequence)，或者是根據一個天然存在的序列。更特別地，該連接子是一個鉸鏈序列或者包含有一個序列係根據一鉸鏈序列。更特別地該連接子可包含有一個鉸鏈區係根據一IgG1鉸鏈區、一IgG2鉸鏈區、一IgG3鉸鏈區或一IgG4鉸鏈區。
任擇地，該連接子包含有一個胜肽區包含有下列之一者或多者： ESKYGPP (序列辨識編號:1) EPKSCDKTHT (序列辨識編號:2) GGGGSGGGGS (序列辨識編號:3) ERKSSVESPPSP (序列辨識編號:4) ERKCSVESPPSP (序列辨識編號:5) ELKTPLGDTTHT (序列辨識編號:6) ESKYGPPSPSSP (序列辨識編號:7) ERKSSVEAPPVAG (序列辨識編號:8) ERKCSVEAPPVAG (序列辨識編號:9) ESKYGPPAPEFLGG (序列辨識編號:10) EPKSCDKTHTSPPSP (序列辨識編號:11) EPKSCDGGGGSGGGGS (序列辨識編號:12) GGGGSGGGGSAPPVAG (序列辨識編號:13) EPKSCDKTHTAPELLGG (序列辨識編號:14) ERKSSVESPPSPAPPVAG (序列辨識編號:15) ERKCSVESPPSPAPPVAG (序列辨識編號:16) ELKTPLGDTTHTAPEFLGG (序列辨識編號:17) ESKYGPPSPSSPAPEFLGG (序列辨識編號:18) EPKSCDKTHTSPPSPAPELLGG (序列辨識編號:19) ERKSSVEEAAAKEAAAKAPPVAG (序列辨識編號:20) ERKCSVEEAAAKEAAAKAPPVAG (序列辨識編號:21) ESKYGPPEAAAKEAAAKAPEFLGG (序列辨識編號:22) EPKSCDKTHTEAAAKEAAAKAPELLGG (序列辨識編號:23) ELKTPLGDTTHTEAAAKEAAAKAPEFLGG (序列辨識編號:24) 或者一個對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約85%序列相同性的序列。
較佳地，本發明之一多價抗體包含有一個連接子，它藉由包含有一個由序列辨識編號:1至24之中的任何一者所構成的胺基酸序列或一包含有一個對序列辨識編號:1至24之中的任何一者具有至少大約85%序列相同性的胺基酸序列之多胜肽而將該主體抗體部分連接至一個或多個結合領域。
表1例示說明這樣的連接子如何可以被連接至一個CH1區。
本發明之一較佳的多價抗體包含有一個連接子係為剛性的。更佳地，該多價抗體包含有一個連接子包含有一個螺旋形成序列(helix-forming sequence)。
本發明之一較佳的多價抗體包含有一個連接子包含有一個胜肽序列包含有一個(EAAK)2 要素(motif)。
本發明之一較佳的多價抗體包含有一個連接子係為可撓曲的。
本發明之一較佳的多價抗體包含有一個連接子包含有3個或更多個胺基酸殘基(amino acid residues)係對應於(correspond to)該多價抗體的一個跟該連接子連接的恆定區之一亞型的一個鉸鏈區。
本發明之一較佳的多價抗體包含有一個連接子，其包含有一個序列辨識編號:1至24的序列，該序列對應於該多價抗體的一個跟該連接子連接的恆定區之一亞型的一個鉸鏈區。連接子定位/ 定向(Linker Location/Orientation)
一個較佳具體例是一種多價抗體，其中該主體抗體部分藉由一個連接子而被連接至一個或多個附加的結合領域，其中該連接子將該主體抗體部分的一個可變區之一N-端末端(N-terminal end)連接至該一個或多個附加的結合領域的C-端末端(C-terminal end)。較佳地，該主體抗體部分包含有一個Fab領域以及該一個或多個附加的結合領域包含有一個Fab領域包含有一個CH1領域和CL領域，而該連接子將該主體抗體部分的Fab領域之一可變區的一個N-端末端連接至該一個或多個附加的結合領域之Fab領域的CH1領域和CL領域之中一者或兩者的C-端末端。
本發明之一較佳具體例是一種多價抗體，其包含有一個共同鏈位在該主體抗體部分的每一個結合領域以及該一個或多個附加的結合領域的每一者，以及一個連接子將該主體抗體部分之一重排的可變區的一個N-端末端連接至該一個或多個附加的結合領域之一重排的可變區的一個C-端末端。更佳地，該一個或多個附加的結合領域包含有一個Fab領域包含有一個CH1領域和CL領域，而該連接子將該主體抗體部分的Fab領域之一可變區的一個N-端末端連接至該一個或多個附加的結合領域的Fab領域之CH1領域或CL領域。包含有附加的結合領域之區的配對
抗體組裝(antibody assembly)係經由輕鏈和重鏈的相聯(association)而發生，亦即VH與VL以及CH1與CL的相聯(配對)，這是根據位在介於VH與VL以及CH1與CL之間的介面中的相互作用的殘基(interacting residues)。典型地，配對被進一步地安定化，藉此，一輕鏈藉由一個雙硫鍵而被共價地連接(covalently connected)至重鏈，該雙硫鍵係介於該輕鏈的一個位在該CL中的半胱胺酸殘基(cysteine residue)以及該重鏈的一個位在該CH1或鉸鏈(視亞型而定)之處的半胱胺酸殘基之間。
因此，在本發明之一多價抗體中，附加的一個或多個結合領域經由一(多)個連接子而被連接至該主體抗體部分，其中該一個或多個結合領域包含有一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域，而包含有該結合領域(典型地是一重鏈區和輕鏈區)之對應免疫球蛋白鏈呈一安定的相聯(stable association)而被配對在一起。
對於本發明之含有一個附加的結合領域(其中該結合領域是一個Fv或Fab領域)之多價抗體而言，一個半胱胺酸殘基可以存在於或者被工程化至該等重鏈和輕鏈領域之內，而使得一個雙硫鍵形成俾以安定介於該附加的結合領域之重鏈和輕鏈之間的配對。在本發明的多價抗體包含一個包含有一個IgG1次型(subclass)之附加的結合領域的情況下，一為IgG1之重鏈的上方鉸鏈(upper hinge)(EPKSC)可被使用，該上方鉸鏈被連接至並且位於一個人工連接子(artificial linker)[諸如(G4S)n]的上游(upstream)[N-端側(N-terminal side)]，俾以提供一個半胱胺酸來與該附加的結合領域之輕鏈共價地配對。就被使用於該附加的結合領域中的其他次型而言，熟習本領域技藝者將會認知在所使用的連接子之內工程化一個半胱胺酸殘基的能力，俾以安定化該附加的結合領域之輕鏈和重鏈領域的配對以及在所使用的該輕鏈和重鏈之間形成一個雙硫鍵(disulfide bridge)。
野生型(wild-type) IgG1鉸鏈區具有下列序列：EPKSC DKTHTCPPCPAPELLGG (序列辨識編號:65)。被劃底線的C殘基是位在IgG1重鏈中的Cys220，它與輕鏈的Cys214配成對。在本發明之一多價抗體包含有一個連接子係根據這樣一種鉸鏈的情況下，較佳地任何一個除了Cys220之外的Cys殘基被替代(substituted)以一個不能形成一個雙硫鍵的胺基酸殘基，例如Ser。
野生型IgG2鉸鏈區具有下列序列：ERKC CV ECPPCPAPPVAG (序列辨識編號:69)。被劃底線的C殘基是位在IgG2-B重鏈中的Cys219，它與輕鏈的Cys214配成對。在IgG2-A中，位在重鏈中的Cys127與Cys214配成對。在本發明之一多價抗體包含有一個連接子係根據這樣一種鉸鏈的情況下，較佳地任何一個除了Cys215之外的Cys殘基被以一個不能形成一個雙硫鍵的胺基酸殘基(例如Ser)替代。
野生型IgG3鉸鏈區區具有下列序列：ELKTPL GDTTHTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPAPEFLGG (序列辨識編號:73)。在IgG3中，位在重鏈中的Cys131與輕鏈的Cys214配成對。
IgG4鉸鏈區具有下列序列：ESKYGPPCP SCPAPEFLGG (序列辨識編號:77)。在IgG4中，位在重鏈中的Cys131與輕鏈的Cys214配成對。在本發明之一多價抗體包含有一個連接子係根據這樣一種鉸鏈的情況下，較佳地位在該鉸鏈的CPSPC區內的該等Cys殘基之一者或兩者被替代以一個不能形成一個雙硫鍵的胺基酸殘基，例如Ser。
如此處所述的，要根據一個能夠同時結合3個不相同的表位之IgG結構來產生多價建構物(multivalent constructs)[包含三價建構物(trivalent constructs)]，連接子係根據來自不同次型的IgG鉸鏈而被使用，俾以將一個主體抗體部分之一結合領域連接至一個包含有一重鏈恆定區之附加的結合領域。為確保介於該輕鏈中的一個半胱胺酸與該附加的結合領域之重鏈中的一個半胱胺酸之間的共價鍵(covalent bond)之安定化(stabilization)，本發明將一個包含有一鉸鏈區或是根據一個具有一特定亞型的鉸鏈區之連接子匹配以來自於該相同亞型之附加的結合領域的CH1。
在該多價抗體包含有一個係由成對的區域(pair regions)(例如，VH-CH1配對以VL-CL，或VH配對以VL)所構成之附加的結合領域之情況下，安定化介於該等區域之間的介面在本發明中可以各種不同的方法來予以完成。在該一個或多個附加的結合領域是一個由一可變重鏈區與一可變輕鏈區所構成的Fab領域之情況下，一個CH1可被連接至該可變重鏈區。該CH1可使用一共價鍵(典型地是一雙硫鍵)而被配對至一個被連接至該可變輕鏈區的CL。此外，一個Fab領域的重鏈和輕鏈係經由非共價相互作用而被配對。任擇地，將該一個或多個附加的結合領域連接至該主體抗體部分的連接子亦可被用來將該附加的結合領域之可變重鏈區配對至該可變輕鏈區，藉由以任一鏈來形成一個胜肽鍵(peptide bond)以及以對應之鏈(counterpart chain)來形成一個共價鍵聯(covalent linkage)。這可以藉由設計一個半胱胺酸位在該連接子的N-端(N-terminus)之處或附近以及一個半胱胺酸位在該一個或多個附加的結合領域之可變重鏈區和/或可變輕鏈區的C-端(C-termini)而被完成，因而在該連接子以及該一個或多個附加的結合領域之可變重鏈區和/或可變輕鏈區之間形成一個共價鍵。其他的用以配對包含有該一個或多個附加的結合領域之領域(諸如一個Fab領域)的方式係為具有本領域中的通常技藝之人士所知曉的，並且將予以進一步詳細說明如下。
一個較佳具體例是一種多價抗體，其包含有一個主體抗體部分以及一個或多個附加的結合領域。在該一個或多個附加的結合領域是一個包含有一重鏈可變區(VH)和輕鏈可變區(VL)的Fv領域之情況下，本發明的一個連接子將該主體抗體部分連接至該Fv領域，同時將該Fv的重鏈可變區和輕鏈可變區配對。
任擇地，該結合領域是一個Fab領域包含有：一個可變重鏈區包含有一個CH1區，以及一個可變輕鏈區包含有一個CL區。本發明的一個連接子在該CH1區或該CL區或這兩者之處將該主體抗體部分連接至該Fab領域，同時將該Fab領域的CH1區和CL區配對。該主體抗體部分的配對
不相同的技術在本技藝中被知曉係要用來將一個主體抗體部分的重鏈恆定區(例如，CH2和CH3)配對以及造成異二聚體化(heterodimerization)。舉例來說，用以造成抗體重鏈之異二聚體化的DEKK突變之使用[WO 2013/157954以及De Nardiset al .,J. Biol. Chem. (2017), 292(35): 14706-14717，在此被併入本案以作為參考]進一步允許有效率的異二聚體形成、安定的Fc區以及製造的容易度。這個方法使該分子的Fc區保留功能性而且能夠銜接免疫受體(immune receptors)[諸如Fc受體、補體(complement)和FcRn]。於是，本發明的某些多價抗體具體例使用了該DEKK修飾或者熟習本領域技藝者所知曉的其他Fc修飾，俾以優先地異二聚體化該主體抗體部分的重鏈。
再者，就多價抗體的某些具體例而言，可能企求的是不要參與(engage)免疫系統的效應子功能(effector function)[例如，去限制抗體依賴型細胞毒性(antibody- dependent cellular cytotoxicity)、抗體媒介的吞噬作用(antibody-mediated phagocytosis)和/或細胞依賴型細胞毒性(cellular-dependent cytotoxicity)]，諸如使用一個多價抗體去銜接、刺激和/或共-刺激(co-stimulate) T細胞，在這種情況下，可以對該Fc區採用另外的修飾以消除(eliminate)或減輕(mitigate)效應子功能。於是，本發明的某些多價抗體具體例含有對該主體抗體部分的重鏈恆定區之修飾，該等修飾消除或減輕了效應子功能。
本發明之一額外的較佳具體例是一種多價抗體，其包含有一個主體抗體部分係由兩個缺乏CH2或CH3區的重鏈所構成，其中該等重鏈在該鉸鏈區之處被接合在一起。
本發明亦提供一種用於一多價抗體之製備的方法，該方法包括提供一種包含有一個或多個核酸之細胞，該一個或多個核酸編碼能夠組裝成本發明之一多價抗體的多胜肽。該細胞可以被培養(cultivated)在用以提供該主體抗體部分、該至少一個附加的結合領域以及該至少一個連接子之表現以及讓它們組裝成本發明之一多價抗體的條件下。
本發明亦提供編碼本發明之一多價抗體的組份蛋白質之核酸以及它們所生成的多價抗體。
本發明亦提供一種包含有本發明之一核酸序列的載體。
本發明亦提供表現該等核酸並且生成該多價抗體的宿主細胞。
本發明亦提供用以產生該多價抗體的方法，包含經由使用在牠的生殖系內包含有一共同鏈的基因轉殖動物，該基因轉殖動物生成在一同源鏈處具有多樣性的共同鏈抗體(commom chain antibodies)，其中該多價抗體包含有一個或多個結合領域，其具有由一得自於、衍生自或根據已被暴露給一抗原的該基因轉殖動物所表現之共同鏈抗體之一個或多個同源鏈的核酸所編碼的一重排可變區。
本發明亦提供一種非人類基因轉殖動物，牠包含有一個共同人類輕鏈可變區能夠與各式各樣的人類重鏈可變區配對，其中編碼該共同輕鏈可變區和人類重鏈可變區的核酸係存在於該非人類基因轉殖動物的內源性可變區基因座(endogenous variable region loci)(分別為輕鏈和重鏈或者反之亦然)之處和/或被安定地整合(stably integrated)至該基因轉殖動物之生殖系中的別處[例如，Rosa基因座(Rosa locus)]，其中令該基因轉殖動物與一抗原接觸產生一系列之重排的人類重鏈可變區與該共同輕鏈可變區配對，其中一個編碼該等重排的人類重鏈可變區之核酸被轉形至一個能夠生成本發明之一多價抗體的宿主細胞之內，而該多價抗體包含有一個或多個結合領域，其包含有由一得自於、衍生自或根據已被暴露給一抗原的該基因轉殖動物所生成之一個或多個重排的人類重鏈可變區之核酸所編碼的該重排的人類重鏈可變區。
本發明亦提供一種藥學組成物，其包含有本發明的一種抗體以及一藥學上可接受的載體(pharmaceutically acceptable carrier)和/或稀釋劑(diluent)。
本發明亦提供本發明的一種抗體來供應用於人類或動物身體透過療法的治療。
本發明亦提供一種用於一罹患一醫療適應症(medical indication)的人類或動物之治療的方法，該方法包括對該人類或動物投藥(administering)一治療有效量(therapeutically effective amount)的本發明的一種抗體。
詳細說明 一個“抗體”是屬於蛋白質的免疫球蛋白類之蛋白質性分子(proteinaceous molecule)，其含有結合一位在一抗原上的表位之一個或多個領域，其中該等領域係衍生自或者共享(share)一個抗體的可變區之序列同源性(sequence homology)。
抗體結合(antibody binding)具有不相同的特質(qualities)，包括特異性和親和力。特異性決定那個抗原或它的表位被該結合領域特異性地結合。親和力是對於一個特定抗原或表位之結合強度的量度(measure)。在此可方便地注意到：一個抗體的“特異性”意指它對於一個特定抗原的選擇性(selectivity)，而“親和力”意指介於該抗體的抗原結合位(antigen binding site)以及它結合的表位之間的相互作用之強度。
因此，如此處所用的“結合特異性(binding specificity)”意指一個單獨的抗體結合位去跟一個抗原決定位(antigenic determinant)反應之能力。典型地，本發明的抗體之結合位係坐落在該等Fab領域之內，並且係從一個重鏈和/或輕鏈之高度變異區(hypervariable region)被建構。
“親和力”是介於一個單一抗原結合位和它的抗原之間的相互作用之強度。本發明的一個抗體對於一個抗原之一個單一抗原結合位可以用解離常數(dissociation constant，KD)來表示。典型地，用於治療應用(therapeutic applications)的抗體可以具有高達1x1010 M或甚至更高的親和力。
一個“抗原”是一個能夠在一宿主生物體(host organism)內誘發(inducing)一免疫反應(俾以生成一抗體)和/或被一抗體標靶的分子。處在分子級(molecular level)下，一個抗原的特徵係在於它被一個抗體的抗原結合位所結合之能力。又，由抗原所構成的混合物(mixtures)可被視為是一個“抗原”，亦即熟習本領域技藝的人士將會理解：有時候腫瘤細胞之一溶胞產物(lysate)或病毒粒子(viral particles)可被表示為“抗原”，而這樣的腫瘤細胞溶胞產物或病毒粒子製品(preparation)存在有許多抗原決定位。一個抗原胞含有至少一個但通常是更多的表位。
一個“表位”或“抗原決定位”是一個位在一抗原上的位址，一個免疫球蛋白或抗體特異性地結合至該位址。表位可以從相連胺基酸(contiguous amino acids)或藉由一個蛋白質之三級摺疊(tertiary folding)而被並置(juxtaposed)的非相連胺基酸[分別為所謂的線形(linear)或構形(conformational)表位]而被形成。形成自相連直鏈胺基酸(contiguous, linear amino acids)的表位在暴露於變性溶劑(denaturing solvents)之下典型地被保留(retained)，而藉由三級摺疊形成的表位在使用變性溶劑的處理之下典型地會喪失構形。一個表位典型地可以在一個獨特的空間構形中包含3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15個胺基酸。
術語“重鏈”或“免疫球蛋白重鏈”包含來自任何一種生物體的一個免疫球蛋白重鏈恆定區序列，而且除非另有規定，包含一個重鏈可變領域。除非另有規定，術語重鏈可變領域包含3個重鏈CDRs以及4個FR區。重鏈的片段包含CDRs、CDRs與FRs以及此等之組合。一個典型的重鏈在該可變領域(從N-端至C-端)之後具有一個CH1領域、一個鉸鏈、一個CH2領域以及一個CH3領域。一個重鏈之一功能性片段包含一個能夠特異性地辨識一個抗原並且包含有至少一個CDR的片段。
術語“輕鏈”包含來自任何一種生物體的一個免疫球蛋白輕鏈可變領域或VL (或其功能性片段)，以及一個免疫球蛋白恆定領域(constant domain)或CL (或其功能性片段)序列。除非另有規定，術語輕鏈可包含一個選自於人類κ、λ以及此等之一組合的輕鏈。除非另有規定，輕鏈可變(VL)領域典型地包含3個輕鏈CDRs以及4個架構(framework，FR)區。一般而言，一個全長的輕鏈從N-端至C-端包含了一個VL領域(包含FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3- CDR3-FR4)以及一個輕鏈恆定領域。可隨本發明被使用的輕鏈包含那些，例如，不會選擇性地結合一個選擇性地被該等重鏈所結合的表位之物。
供應用於本發明的一個多價抗體之合適的輕鏈包含一個共同輕鏈，諸如那些可藉由篩選現有的抗體庫(existing antibody libraries)[濕式庫(wet libraries)或電腦模擬(in silico )]中最常被使用的輕鏈而被鑑定出之物，其中該等輕鏈大體上不會干擾(interfere)該等重鏈的表位-結合領域(epitope-binding domains)之親和力和/或選擇性，但也適合於與一系列的重鏈配對。舉例來說，一個合適的輕鏈包含一個來自一基因轉殖動物(諸如一基因轉殖的囓齒動物)之物，該基因轉殖動物包含有被整合(integrated)至它的基因體之內的共同輕鏈，而且牠可被用來在暴露於一抗原之時產生大量的(large panels of)在重鏈之處具有多樣性的共同輕鏈抗體(common light chain antibodies)。
根據本發明，術語“共同輕鏈”係意指可以是相同的或者具有某些胺基酸序列差異但本發明的抗體之結合特異性不被影響(亦即該等差異不會實質地影響功能性結合區的形成)的輕鏈。
例如，有可能在如此處所用的共同鏈之定義的範圍內來製備或發現非為相同的但仍為功能上等效的(functionally equivalent)可變鏈，例如藉由引入以及測試守恆的胺基酸變化(conservative amino acid changes)、位在當被配對以一同源鏈之時不會或僅部分地有助於結合特異性之區域內的胺基酸之變化，諸如此類。這樣的變異體(variants)因此能夠結合不相同的同源鏈而且形成功能性抗原結合領域。如此處所用的術語“共同輕鏈”因此意指可以是相同的或者具有某些胺基酸序列差異但在與一重鏈配對之後保留了所形成的抗體之結合特異性的輕鏈。某些共同輕鏈和這樣的功能上等效的變異體之一組合被涵蓋在術語“共同輕鏈”之內。
一個“Fv領域”意指一個包含有一個重鏈可變區(VH)和一個輕鏈可變區(VL)的結合領域。
一個“Fab領域”意指一個包含有一個可變區的結合領域，典型地是一個包含有一配對的重鏈可變區和輕鏈可變區的結合領域。一個Fab領域可包含有恆定區領域，包含一個CH1與VH領域被以一個恆定輕鏈領域(CL)與VL領域配對。這樣的配對可以發生，例如，經由一個位在CH1和CL領域之處的雙硫鍵來作為共價鍵聯。
一個“經修飾的Fab領域”意指一個包含有一個CH1和一個VH領域的結合領域，其中該VH與一個VL領域配對且沒有CL領域存在。任擇地，一個經修飾的Fab領域是一個包含有一個CL和一個VL領域的結合領域，其中該VL與一個VH領域配對且沒有CH1領域存在。為了使該CH1或CL區可呈一非配對形式(non-paired form)而存在，可能有需要來移除或降低具疏水性(hydrophobicity)的區域之長度。來自於自然地表現單鏈抗體之動物物種[例如來自於一駱駝科動物，諸如一駱馬(llama)或一駱駝(camel)，或來自於一鯊魚]的CH1區可被使用。一個經修飾的Fab領域之其他示範例包含一個恆定區CH1或CL，其未與它的同源區配對，和/或存在一個可變區VH或VL，其未與它的同源區配對。
如此處所用的術語“免疫效應子細胞”或“效應子細胞”意指一種位在哺乳動物免疫系統(mammalian immune system)中的天然細胞庫(natural repertoire of cells)之內的細胞，該細胞可被活化以影響一標的細胞的存活率(viability)。免疫效應子細胞包含淋巴譜系(lymphoid lineage)的細胞，諸如自然殺手(natural killer，NK)細胞、T細胞[包含細胞毒性T細胞(cytotoxic T cells)]或B細胞，但還有骨髓譜系(myeloid lineage)的細胞可以被視為免疫效應子細胞，諸如單核細胞(monocytes)或巨噬細胞(macrophages)、樹突細胞(dendritic cells)以及嗜中性顆粒細胞(neutrophilic granulocytes)。因此，該效應子細胞較佳地係為一個NK細胞、一個T細胞、一個B細胞、一個單核細胞、一個巨噬細胞、一個樹突細胞或一個嗜中性顆粒細胞。
當在此提及核酸或胺基酸序列時，“百分比(%)相同性[Percent (%) identity]”被定義為：在排比(aligning)序列以供最佳比較(optimal comparison)目的之後，一候選序列(candidate sequence)中的殘基與一選定序列(selected sequence)中的殘基係為相同的百分比。為了最佳化(optimize)該兩個序列之間的排比，可以在被比較的該兩個序列之任何一者內引入空位(gaps)。這樣的排比可於正被進行比較的序列之全長上來予以進行。任擇地，該排比可於一較短的長度上來予以進行，例如在大約20個、大約50個、大約100個或更多個核酸/鹼基或胺基酸。序列相同性是在所報告的排比區域(aligned region)上，介於兩個序列之間的相同匹配(identical matches)之百分比。
介於兩個序列之間的序列比較以及序列相同性百分比的測定可以使用一個數學演算法(mathematical algorithm)來予以完成。熟習本領域技藝的人士將會瞭解下列事實：數種不相同的電腦程式(computer programs)可以應用於排比兩個序列並且測定介於兩個序列之間的相同性(Kruskal, J. B. (1983) An overview of sequence comparison. In D. Sankoff and J. B. Kruskal, (ed.), Time warps, String edits and Macromolecules: The theory and Practice of Sequence Comparison,pp . 1-44, Addison Wesley)。介於兩個胺基酸序列或核酸序列之間的序列相同性百分比可以使用供兩個序列的排比之尼德曼-翁施演算法(Needleman and Wunsch algorithm)來予以測定(Needleman, S. B. and Wunsch, C. D. (1970)J. Mol. Biol. 48, 443-453)。該尼德曼-翁施演算法已在電腦程式NEEDLE中被執行。為了本發明之目的，來自EMBOSS套裝軟體(EMBOSS package)的NEEDLE程式(NEEDLE program)被用來決定胺基酸和核酸序列之間的相同性百分比(版本2.8.0或更高階版本，EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite (2000) Rice, P. Longden J. and Bleasby, A.Trends in Genetics 16, (6)pp . 276-277, http://emboss.bioinformatics.nl/)。對於蛋白質序列，EBLOSUM62被使用於替代矩陣(substitution matrix)。對於DNA序列，DNAFULL被使用。所使用的參數(parameters)是一為10的空位開放罰分(gap-open penalty)以及一為0.5的空位延伸罰分(gap extension penalty)。
在藉由如上所述之程式NEEDLE的排比之後，介於一個查詢序列(query sequence)和一個本發明的序列之間的序列相同性百分比係如下述來予以計算(calculated)：在排比中顯示出一個相同的胺基酸或相同的核苷酸(nucleotide)係位在兩條序列中的對應位置之數目(number of corresponding positions)除以減去(subtraction)排比中的空位總數(total number of gaps in the alignment)後的排比總長度(total length of the alignment)。
在此，術語“連接(connected)”係指經由位在一級胺基酸序列(primary amino acid sequence)處的胜肽鍵而被彼此連接的領域。舉例來說，一個包含有VH-CH1-CH2-CH3的主體抗體部分之一重鏈可被連接至一個附加的結合領域VH-CH1之一重鏈(或者一個附加的結合領域至一個附加的結合領域)，其係經由一個連接子(在CH1處將該附加的結合領域之該重鏈連接至該主體抗體部分的VH區)，它們一起組成一個多胜肽鏈。同樣地，一個CH1領域可被連接至一個可變重鏈區，而一個CL領域可被連接至一個可變輕鏈區。
“配對”意指介於構成本發明之一個多價抗體的多胜肽之間的相互作用，而使得它們可以多聚體化(multimerize)。舉例來說，一個附加的結合領域可以包含有一個重鏈區(VH-CH1)被配對至一個輕鏈區(VL-CL)，其中該CH1和CL配對以形成該結合領域。如此處所述的，抗體領域的配對(例如，重鏈和輕鏈)係由於非共價相互作用且亦經由雙硫鍵而發生，而且可以經由此處所揭示的技術以及本技藝中已知的方法來予以工程化。
在本案發明說明書以及檢附的申請專利範圍之全文中，詞語“包含有(comprise)”、“包含(include)”和“具有(having)”以及諸如“包括(comprises)”、“包含有(comprising)”、“包含(includes)”和“包含(including)”的變化(variations)將被包含性地解釋(interpreted inclusively)。亦即，這些詞語被意欲用以表達(convey)：在上下文允許的情況下，未被具體敘述其他的要素(elements)或整數(integers)之可能包含(possible inclusion)。
如此處所用的冠詞“一個(a)”和“一個(an)”係指該冠詞的語法對象(grammatical object)有一個或多於一個(亦即一個或至少一個)。舉例來說，“一個要素”可以表示一個要素或多於一個要素。
本發明提供一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分藉由一個連接子而被連接至該至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及 其中該連接子包含有一個鉸鏈序列或一個衍生自一鉸鏈序列的序列。
本發明亦提供一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區並且藉由連接該主體抗體部分的一個可變區與該CH1區的該連接子而被連接至該主體抗體部分，以及 其中該多價抗體結合至少3個不相同的表位。
在這樣的一種多價抗體中，該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者可以全部都具有一個共同可變區。
本發明亦提供一種多價抗體，它典型地能夠經由至少3個結合領域而結合至它的標的物(們)，亦即該抗體是一個多價抗體。該多價抗體選擇性地可為一種多特異性抗體。也就是說，本發明之一抗體也許能夠結合兩個或更多個不相同的表位或是兩個或更多個不相同的抗原，例如兩個、3個、4個或更多個不相同的表位或抗原。不相同型式的多價抗體
應予以注意的是：本發明的其他特徵和方面從詳細說明，結合以檢附的圖式，是明顯可見的，該等圖式藉由示範例來例示說明根據本發明的具體例之特徵。該等圖式是例示性的而且它們不被意欲也不會限制本發明的範圍，該範圍係由申請專利範圍以及詳細的揭露內容之全部內容來予以界定，該揭露內容描述了被闡述於此的發明並使之能實現。本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個附加的結合領域，較佳為一個Fab領域包含有一個VH-CH1區被配對至一個VL-CL區。該多價抗體包含有3個VH區以及3個VL區。該VH或者VL可為一個共同可變區(VHc或VLc)被配對至該同源鏈的一個重排的可變區。舉例來說，該3個VL區可為一個共同鏈(VLc)，而每一個VH區(VH1-VH3)可包含有一個重排的可變區，其中該VH1、VH2和VH3區可結合相同的表位或高達3個不相同的表位。其中，該多價抗體包含有一個共同輕鏈(VLc)以及3個重鏈可變區(VH1-VH3)，由一個被配對以一個VLc-CL的VH3-CH1所構成之該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體，該連接子位在該主體抗體部分的一個VH1或VH2區以及該附加的Fab領域之CH1之間。參見，例如，圖1a。
任擇地，該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體，該連接子位在該主體抗體的共同輕鏈區(VLc)以及該附加的Fab領域之CL區之間。參見，例如，圖1b。在本發明的另一個方面中，該3個VH區可為一個共同鏈(VHc)，而每一個VL區可包含有一個重排的可變區，其中該3個VL區可結合相同的表位或不相同的表位(VL1-VL3)。在該多價抗體包含有一個共同重鏈(VHc)以及3個輕鏈可變區(VL1-VL3)之情況中，該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體，該連接子位在該主體抗體部分的一個VL1或VL2區以及該附加的Fab領域之CL區之間。參見，例如，圖1c。任擇地，該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體，該連接子位在該主體抗體的共同重鏈區(VHc)以及該附加的Fab領域之CH1區之間。參見，例如，圖1d。
任擇地，該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體，該連接子位在該主體抗體的重鏈與輕鏈可變區以及該附加的Fab領域之CH1和CL區之間，不管該共同鏈是否為重鏈或輕鏈。參見，例如，圖1e。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個以上之附加的結合領域，例如兩個Fab領域。該多價抗體的VH或VL區可為一個共同可變區(例如，VHc或VLc)連同包含有一個重排的可變區之同源鏈來結合相同或不相同的抗原或表位(例如，VHc和VL1-VL4；或者VH1-VH4和VLc)。該附加的Fab領域可經由一個連接子而被連接至該主體抗體部分，該連接子位在該主體抗體部分的共同鏈(VHc或VLc)以及該附加的Fab領域之共同可變區的個別恆定區之間，或者位在該主體抗體之重排的可變領域(VH1與VH2；或VL1與VL2)以及該附加的Fab領域之重排的可變領域之個別恆定區之間。舉例來說，圖1f描繪本發明的一個多價抗體包含有一個主體抗體以及兩個附加的Fab領域，其中該抗體包含有一個共同輕鏈(VLc)以及4個重鏈可變區(VH1-VH4)，其中一個連接子在該主體抗體之重排的重鏈可變領域(VH2與VH3)以及該等附加的Fab領域之CH1區之處將該主體抗體連接至該等附加的Fab領域。任擇地，圖1g描繪本發明的一個多價抗體，其中該主體抗體被連接至兩個附加的Fab領域，在一個第一重排的可變領域(VH2)至該第一附加的Fab領域之CH1區之處，以及在該主體抗體的一個共同輕鏈可變區(VLc)至該第二附加的Fab領域之CL區之處。任擇地，圖1h描繪本發明的一個多價抗體，其中該主體抗體經由一個連接子而被連接至兩個附加的Fab領域，該連接子將該主體抗體的兩個共同輕鏈區(VLc)連接至該兩個附加的Fab領域之CL區。任擇地，圖1j描繪本發明的一個多價抗體，其中該主體抗體經由一個連接子而被連接至該第一附加的Fab領域，該連接子分別地將該主體抗體之重排的重鏈可變區(VH3)和共同輕鏈區(VLc)連接至該第一附加的Fab領域的CH1和CL之處，而該第二附加的Fab領域係在它的CH1之處經由一個連接子而被連接至該主體抗體之該第二重排的重鏈可變區(VH2)。任擇地，(圖1i)該第二附加的Fab領域經由一個連接子而在它的CL之處被連接至該主體抗體之共同輕鏈可變區(VLc)。任擇地，(圖1k)該第二附加的Fab領域經由一個連接子而在它的CH1和CL之處被分別地連接至該主體抗體部分之第二個重排的重鏈可變區(VH2)以及共同輕鏈(VLc)。被描述於此以及被描繪於圖1f-1k之處的型式亦適用於其中該共同鏈是一個重鏈(VHc)而該多價抗體包含有4個重排的輕鏈可變區(VL1-VL4)包含有高達4個不相同的結合特異性之情況。
再者，兩個或更多個附加的結合領域可經由連接子而只被連接至一個主體抗體部分的一個結合領域，而使得一個第一附加的Fab領域經由一個連接子而被連接至一個第二附加的Fab領域，後者接而被連接至該主體抗體部分。也就是說，一個第一連接子係位在該主體抗體部分和該等附加的Fab領域當中一個之間，而一個第二連接子係位在該兩個附加的Fab領域之間。該兩個連接子可為相同或不相同。
在本發明的另一個方面中，構成該多價抗體之個別的蛋白質可以將重鏈和輕鏈混合在同一個蛋白質中。舉例來說，一個多價抗體可以由一個第一蛋白質所構成，該第一蛋白質包含有附加的Fab領域被連接至該主體抗體從N-端至C-端依序為VLc-CL-VH2-CH1-CH2-CH3，而使得一個連接子在VH2-CL之處將該附加的Fab領域之VLc-CL區連接至該主體抗體部分。一個第二蛋白質包含有VH1-CH1，其與該第一蛋白質的VLc-CL配對。一第三蛋白質包含有從N-端至C-端依序為VH3-CH1-CH2-CH3，而使得該第三和該第一蛋白質在它們的CH1區的下方處配對。而一個第四蛋白質包含有從N-端至C-端依序為VLc-CL，其與該第一蛋白質的VH2-CH1以及該第三蛋白質的VH3-CH1配對。參見，例如，圖1l。
雖然被描述於此以及被描繪於圖1l中的型式例示說明了一個共同輕鏈和至少3個重排的重鏈可變區(VH1-VH3)(包含有高達3個不相同的結合特異性)的使用，應予以瞭解的是：這個型式適用在該共同鏈是一個重鏈(VHc)而該多價抗體包含有3個或更多個重排的輕鏈可變區(VL1-VL3)(包含有高達3個不相同的結合特異性)之情況下。
本發明的另一個方面是一種包含有4個蛋白質的多價抗體，其中該共同鏈是一個共同輕鏈。該多價抗體係由4個蛋白質所構成從N-端至C-端依序包含有：一為VH1-CH1-VLc-CL的第一蛋白質，其中一個連接子將CH1連接至VLc；一為VLc-CL的第二蛋白質，該VLc-CL與該VH1-CH1配對以形成一個附加的Fab領域；一包含有VH2-CH1-CH2-CH3的第三蛋白質，其中該第三蛋白質的CH1與該第二蛋白質的CL配對；以及一包含有VH3-CH1-CH2-CH3的第四蛋白質，其中該第三和該第四蛋白質在CH1區的下方處配對，而該第二蛋白質(VLc-CL)在該第四蛋白質的CH1區之處跟該第四蛋白質配成對。參見，例如，圖1m。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個附加的Fab領域，其中該多價抗體的VH或VL區可為一個共同可變區，以及其中該附加的Fab領域可經由一個位在該主體抗體的VH (圖1n)或VL (圖1o)之處的連接子而被連接至該主體抗體部分，其中該連接子同時連接該主體抗體至該Fab領域並且將該Fab領域的同源鏈配對。在這樣的情況下，該Fab領域可選擇性地缺少一個CH1-CL領域，並且使用該連接子來配對該Fab領域的可變領域。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個包含有一配對的VH和VL之附加的結合領域。包含有一VH和VL之該附加的結合領域可經由一個被形成於該VH和VL之間的半胱胺酸橋而被配成對，而使得它可以不需要一個CH1或CL區的存在。參見，例如，圖1p。注意，一個半胱胺酸橋被描繪於1p中，雖然具有本領域中的通常技藝之人士瞭解額外的半胱胺酸橋典型地存在於CH1/CL介面之處(未被顯示於圖式中)。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個附加的經修飾的Fab領域。該經修飾的Fab領域可包含有一個經修飾的CH1，而使得它不需要與一個CL配對。舉例來說，該CH1可為一個駱駝科CH1或根據一個駱駝科CH1，或可經由本技藝中已知的技術來予以修飾俾以缺少疏水性殘基(hydrophobic residues)。各個VH或VL可為一個共同或重排的可變區。該附加的經修飾的Fab領域可經由一個位在該主體抗體部分的VH2以及該經修飾的Fab領域的CH1之間處的連接子而被連接至該主體抗體部分。該經修飾的Fab領域之VH和VL可經由一個半胱胺酸橋，或任擇地非共價相互作用，而被配成對。參見，例如，圖1q。任擇地，該附加的經修飾的Fab領域可經由一個位在該主體抗體部分的VL以及該經修飾的Fab領域的CH1之間處的連接子而被連接至該主體抗體部分。該經修飾的Fab領域之VH和VL可經由一個半胱胺酸橋而被配成對。參見，例如，圖1r。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個附加的經修飾的Fab領域，其中該經修飾的Fab領域可包含有一個經修飾的CL，而使得它不需要與一個CH1配對。舉例來說，該CL可被工程化以移除疏水性區。該經修飾的Fab領域之各個VH或VL可為一個共同或重排的可變區。該附加的經修飾的Fab領域可經由一個位在該主體抗體部分的VL以及該經修飾的Fab領域的CL之間處的連接子而被連接至該主體抗體部分。該經修飾的Fab領域之VH和VL可經由一個半胱胺酸橋而被配成對。參見，例如，圖1s。
本發明的一個多價抗體可包含有一個主體抗體部分以及一個附加的經修飾的Fab領域，其中該經修飾的Fab領域可包含有一個經修飾的CL，而使得它不需要與一個CH1配對。舉例來說，該CL可被工程化以移除疏水性區。該經修飾的Fab領域之各個VH或VL可為一個共同或重排的可變區。該附加的經修飾的Fab領域可經由一個位在該主體抗體部分的VH2以及該經修飾的Fab領域的CL之間處的連接子而被連接至該主體抗體部分。該經修飾的Fab領域之VH和VL可經由一個半胱胺酸橋而被配成對。參見，例如，圖1t。本發明的主體抗體部分
應予以注意的是，雖然圖1a-1u將該多價抗體的主體抗體部分描繪為包含配對的重鏈恆定區(包含有CH2和CH3區)，這些區域僅是為了例示說明之目的而被顯示，而且本發明不受限於這些具體例。在此被描述的是適合供應用於所揭示的抗體之不相同型式的主體抗體部分和附加的結合領域。
本發明的多價抗體之主體抗體部分可為一個全長的免疫球蛋白，例如一個全長的IgG、IgA、IgE、IgD或IgM部分，但較佳為IgG，而且更佳為IgG1。
在本發明的任何一個抗體中，該等附加的結合領域之中的至少一者，較佳為一個Fab領域，可包含有一個CH1領域具有一免疫球蛋白次型係不相同於那個為該抗體的主體抗體部分之CH1領域所具者，和/或可具有一個具一不相同類型之輕鏈。舉例來說，在該抗體的主體部分是一個全長的IgG1的情況下，該等附加的結合領域之中的至少一者可以包含一個屬於IgG2a、IgG2b、IgG3或IgG4次型的CH1領域，和/或在該抗體的主體部分包含一個κ輕鏈(kappa light chain)的情況下，該等附加的結合領域之中的至少一者可含一個λ輕鏈(lambda light chain)。
經由那些具有本領域之技藝者所知曉的技術，諸如將DEKK修飾工程化至該主體抗體的CH3區之內，該主體抗體的重鏈可被設計成優先地配對。參見WO 2013/157954以及De Nardiset al .,J. Biol. Chem. (2017) 292(35) 14706-14717 (在此被併入本案以作為參考)，此等證明在CH3區之內進行工程化以供驅動該等重鏈的異二聚體化。可被使用於本發明之用於驅動異二聚體化的替代方法(alternative approaches)包含孔中鈕型式(knob-in-hole format)(WO 1998/050431)以及電荷工程(charge engineering)的使用(Gunasekaran,JBC 2010, vol 285,pp . 19637-19646)。
該Fc區調解(mediates)一個抗體的效應子功能，諸如補體依賴型細胞毒性(complement-dependent cytotoxicity，CDC)、抗體依賴型細胞毒性(antibody- dependent cellular cytotoxicity，ADCC)以及抗體依賴型細胞吞噬作用(antibody-dependent cell phagocytosis，ADCP)。端視該多價抗體而定，可能被企求的是要降低或提高該效應子功能。如在本發明的某些具體例中，當一免疫反應是要被活化、增強或刺激之時，降低的效應子功能可以被企求。具有降低的效應子功能之抗體可被用來標靶免疫細胞的細胞表面分子(cell-surface molecules)，以及其他等等。當一抗體正在標靶有害的細胞(harmful cells)時，增高的效應子功能可以被企求，而因此補強(boosting)免疫效應子細胞的能力或補體級聯反應(complement cascade)俾以消除或溶解(lyse)該等標的物。
該重鏈Fc區的效應子功能可以經由那些具有本領域之技藝者所知曉的修飾而被減輕或消除。同樣地，該重鏈Fc區的效應子功能可以經由那些具有本領域之技藝者所知曉的修飾而被增強。舉例來說，ADCC可經由CH2領域的基因改造(genetic modification)而被增強。參見，例如，Strohl,Curr. Opin. Biotechnol . 2009 (6) 685-91。
本發明的一個多價抗體在一個具體例中可以是去岩藻糖化的(afucosylated)。當相較於在一正常的CHO細胞內所生成的相同抗體，本發明的一個多價抗體較佳地在該Fc區內包含有一降低數量之岩藻糖化(fucosylation)的N-連接的醣類結構(N-linked carbohydrate structure)。
本發明的多價抗體之一個方面亦包含一個缺少一個CH2或CH3區的主體抗體，其中該主體抗體部分的該等重鏈可藉由一個位在CH1區的下方處的半胱胺酸共價橋(cysteine covalent bridge)而被連接。
本發明的方面(包含針對本發明的主體抗體部分之變化)被例示說明於圖1u之處。
在此被描述的是一庫(repertoire)的連接子，它們可被用來將本發明的抗體之主體部分與一個或多個結合領域連接。一個或多個結合領域，諸如一個可變區、一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域，可被連接至本發明的一個抗體之主體抗體部分。
本發明的抗體包含有一個主體抗體部分以及經由一(多)個連接子而被附接至該主體抗體部分的一個或多個結合領域。
包含有一個全長的IgG主體抗體部分之多價抗體被偏好，因為這樣的結構典型地具有有益的性質(beneficial properties)，諸如一有利的半衰期(a favorable half-life)、可預測的生物物理行為(predictable biophysical behavior)以及較低的免疫原性。本發明的抗體典型地適合於供治療用途(therapeutic use)而因此係由供應用於人類治療(human therapeutics)的人類序列所構成。任擇地，使用那些具有本領域之通常技藝者所詳知的技術，該等抗體具有屬於該治療正在被施用的物種(species)之序列或具有根據落在那個給定物種之中的共通序列(consensus sequences)之序列。
在本發明的一個多價抗體之主體抗體部分係為一個全長的IgG之情況下，該全長的IgG可包含有提供所企求的特徵之突變。該等突變典型地不是該等區域之任何一者的實質部分(substantial portions)之缺失(deletions)。但是，當中的一個或數個胺基酸殘基被插入(inserted)、刪除(deleted)或取代(substituted)而基本上不改變所形成的IgG部分之結合特徵的全長的IgG部分被包羅(embraced)在術語“全長的IgG”之內。例如，該等IgG部分可以具有一個或多個具有介於1個和10個胺基酸殘基之間的插入、刪除或取代，較佳地係位在非-CDR區中，其中該等被插入、刪除或取代的胺基酸對於IgG的結合特異性而言不是必需的。
IgG1根據它在人體內的長循環半衰期(long circulatory half-life)而可能被偏愛。又，為了要減輕在人體內的免疫原性，被偏好的是：根據本發明的一個抗體之主體抗體部分是一個人類抗體。
本發明的抗體之主體部分可以是一個全長的免疫球蛋白，它被界定為包含有一個基本上完整的抗體(essentially complete antibody)。這樣一個基本上完整的抗體可不必然地具有一個完整的抗體(intact antibody)之所有功能。
如此處所述的一個抗體之一全長的主體部分包含有兩個重鏈和兩個輕鏈。各個鏈含有恆定區(C)和可變區(V)，它們就重鏈而言可被分解成CH1、CH2、CH3、VH 以及就輕鏈而言可被分解成CL 、VL 。該抗體可經由該等恆定領域(典型地經由該Fc部分)而與免疫系統的分子和細胞相互作用。
本發明的一個抗體(包含雙特異性或多特異性抗體)之恆定區較佳地是一個人類恆定區。該恆定區對於一個天然存在的人類抗體之恆定區可以含有一個或多個(較佳為不多於10個，較佳為不多於5個)胺基酸差異。此處所生成的抗體之各種不同的可變領域係衍生自一個人類抗體可變領域庫(human antibody variable domain library)。照此，這些可變領域是人類的。獨特的CDR區可以衍生自人類、可以是合成的或衍生自另一種生物體。本發明的一個抗體或雙特異性抗體較佳地係為一個人類的或人類化抗體。合適的重鏈恆定區被非限制性地例證(exemplified)於表21中。
本發明的一個抗體典型地具有一個完整的Fc區維持著多特異性抗體的半衰期與安定性。該Fc亦可允許與免疫效應子分子(諸如Fc受體、補體和FcRn)之相互作用。如具有本領域的技藝之人士所瞭解的，技術可以用於設計一個Fc區以防止或減輕與Fc受體的相互作用或者增強與Fc受體的相互作用。
該主體抗體部分和一個或多個附加的結合領域(例如Fab領域)經由一個或多個連接子而被連接。該至少一個附加的Fab領域可具有一給定的同型(isotype)或次型，例如IgG1、2a、2d、3或4：至少一個附加的Fab可具有一個次型係不相同於那個為該全長的IgG部分之Fab領域所具者或可攜帶一個具有不相同類型的輕鏈(κ或λ)。供應用於多價抗體型式的連接
本發明的一個抗體包含有一個或多個連接子將該一個或多個附加的結合領域連接至該主體抗體部分。該連接子連同該連接子所連接的結合領域至少部分地決定了該多價抗體的功能性。
在本發明的一個抗體中，一個連接子的胜肽區可包含有一個鉸鏈序列或包含有一個根據一鉸鏈序列的序列。因此，一個合適的胜肽區之胺基酸序列可包含有一個天然存在的序列或包含有一個根據一天然存在的序列之序列。這樣的序列之使用可幫助本發明的多價抗體之可發展性以及幫助確保低免疫原性。
一個鉸鏈區是一個位在IgG和IgA免疫球蛋白類型的重鏈之中間部分(central part)中的可撓曲胺基酸拉伸物(flexible amino acid stretch)(亦即那個將Fab連接至Fc的部分)，它藉由雙硫鍵來將這兩個重鏈配成對。它富含半胱胺酸和脯胺酸(proline)胺基酸並且對於任何其他的免疫球蛋白區帶有極少的相似性(resemblance)。
於是，用以將該一個或多個附加的結合領域連接至供應用於本發明之一多價抗體的主體抗體部分之一合適的連接子可以衍生自一個IgG或IgA鉸鏈序列。該連接子區可以根據一個IgG1鉸鏈區、一個IgG2鉸鏈區、一個IgG3鉸鏈區或一個IgG4鉸鏈區。
典型地，所使用的鉸鏈區之類型係與跟該連接子所連接之該附加的Fab領域之恆定區(例如CH1)的類型相匹配。也就是說，如果一個連接子係根據來自一個IgG1鉸鏈區的一(多)個序列，跟該連接子所連接之該附加的Fab領域之CH1係為一個來自一個IgG1的CH1。
一個抗體之一連接子可以根據一個上方(upper)、中間(middle)或下方(lower)鉸鏈區，或為這樣一個區域的一個次群(subset)。
該IgG1鉸鏈區具有下面序列：EPKSC DKTHT CPPCPAPELLGG (序列辨識編號:42)。
該上方鉸鏈區被界定為：EPKSCDKTHT (序列辨識編號:43)。
該中間鉸鏈區被界定為：CPPCP (序列辨識編號:44)。
該下方鉸鏈區被界定為：APELLGG (序列辨識編號:45)。
因此，在本發明的一個抗體中，該連接子可包含有這些序列之中的一者或多者，和/或一個根據這些序列之中的一者或多者之序列。
該IgG2鉸鏈區具有下面序列：ERKC CVECPP CPAPPVAG (序列辨識編號:46)。
該上方鉸鏈區被界定為：ERKCCVE (序列辨識編號:47)。
該中間鉸鏈區被界定為：CPPCP (序列辨識編號:48)。
該下方鉸鏈區被界定為：APPVAG (序列辨識編號:49)。
因此，在本發明的一個抗體中，該連接子可包含有這些序列之中的一者或多者，和/或一個根據這些序列之中的一者或多者之序列。
該IgG3鉸鏈區具有下面序列：ELKTPLGDT THTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPAPEFLGG (序列辨識編號:50)。
該上方鉸鏈區被界定為：ELKTPLGDTTHT (序列辨識編號:51)。
該中間鉸鏈區被界定為：CPRCPEPKSCDT PPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCP (序列辨識編號:52)。
該下方鉸鏈區被界定為：APEFLGG (序列辨識編號:53)。
該IgG4鉸鏈區具有下面序列：ESKYGPPCPS CPAPEFLGG (序列辨識編號:54)。
該上方鉸鏈區被界定為：ESKYGPP (序列辨識編號:55)。
該中間鉸鏈區被界定為：CPSCP (序列辨識編號:56)。
該下方鉸鏈區被界定為：APEFLGG (序列辨識編號:57)。
帶有共通序列CXXC的該中間區在一個野生型IgG的背景下連接兩個IgG重鏈而且係為剛性的。這些雙硫鍵對於現今應用而言是不被需要的，而因此在一個連接子包含有一個中間鉸鏈序列的情況下，較佳地，位在該CXXC共通序列之中的一個或兩個Cys殘基被取代，例如使用一個Ser殘基。因此，在一個較佳具體例中，CxxC可以是SxxS。
一個適合供應用於本發明的一個多價抗體之連接子可以是一個根據一個中間鉸鏈序列之物，例如一個包含有一個中間鉸鏈序列但是不包含有一個下方和/或一個上方鉸鏈序列之序列。一個適合供應用於本發明的一個多價抗體之連接子可以是一個根據一個上方鉸鏈序列之物，例如一個包含有一個上方鉸鏈序列但是不包含有一個下方和/或一個中間鉸鏈序列之序列。一個適合供應用於本發明的一個多價抗體之連接子可以是一個不包含有一個中間鉸鏈序列之物，例如一個包含有上方和下方鉸鏈序列之一組合的序列。
於是，本發明提供一種連接子，其包含有一個具有序列辨識編號3至5、7至11或13至24之中一者的胺基酸序列。
因此，在本發明的一個抗體中，該連接子可包含有這些序列之中的一者或多者，和/或一個根據這些序列之中的一者或多者之序列。一個胜肽區可以基本上由一個中間區序列所構成或根據該序列，或者基本上由一個上方和一個下方區序列所構成或根據該等序列。
一個適合供應用於本發明的一個抗體之連接子可以參照一個包含有如此處所闡述的任何一個連接子序列之胺基酸序列的序列[其中有0至5個胺基酸插入、刪除、取代或加入(additions)(或此等之一組合)被進行]來予以界定。在某些具體例中，該連接子包含有一個胺基酸序列，它相對於一個如此處所闡述的連接子序列包含有從0至4個(較佳為從0至3個，較佳為從0至2個，較佳為從0至1個，較佳為0個)胺基酸插入、刪除、取代或加入(或此等之一組合)。
一個合適的連接子可以是從大約7個至大約29個胺基酸的長度，例如從大約10個至大約20個胺基酸的長度。但是，一個合適的連接子可為一短型連接子，例如從大約7個至大約10個胺基酸的長度，或可為一長型連接子，例如從大約20個至大約29個胺基酸的長度。
該連接子可包含有一個Ig鉸鏈區或者包含有一個序列係根據一個被連接至一個與該連接子係屬相同次型的CH1區之Ig鉸鏈區，而且可以包含有半胱胺酸來供該共同輕鏈的共價鍵聯。
一個適合供應用於本發明的一個抗體之連接子可以根據一個IgG1鉸鏈區、一個IgG2鉸鏈區、一個IgG3鉸鏈區或一個IgG4鉸鏈區。
如果一個(G4 S)n 序列要被使用，較佳地它係組合以一個來自於一個非為IgG的同型或一個非為IgG1的次型之鉸鏈序列而被使用並且包含一個CH1區。
在本發明的一個抗體中，該連接子可以是剛性的或可撓曲的，可包含有一個帶電荷的序列(charged sequence)，可為筆直的(straight)或彎曲的(bent)。
一個為了本發明之目的之剛性序列是具有一為大約1.015或更低的卡帕斯與舒茲可撓曲性預測度(Karplus and Schulz flexibility Prediction)之序列。一個部分可撓曲的序列是一個具有一為從大約1.015至大約1.04的卡帕斯與舒茲可撓曲性預測度之物。一個為了本發明之目的之可撓曲的序列是一個具有一為至少大約1.015的卡帕斯與舒茲可撓曲性預測度之序列(Karplus PA, Schulz GE. Prediction of Chain Flexibility in Proteins - A tool for the Selection of Peptide Antigens. Naturwissenschaften 1985; 72:212-3; http://tools.immuneepitope.org/bcell/)。可撓曲性預測度係透過7個殘基之連續窗口(consecutive windows)沿著序列[1殘基步進式(1 residue step)]來計算以產生每個窗口之預測的“可撓曲性”指數(predicted “flexibility” index per window)。該連接子序列的整體可撓曲性(overall flexibility)被給定為是整個序列的平均值(average)。
位在一個IgG鉸鏈區中的Cys殘基之移除或取代，包含經由以一個絲胺酸(serine，Ser)來替換該Cys殘基，可以使一個根據那個鉸鏈的連接子成為更加可撓曲的。任擇地，一個連接子可基於一個螺旋形成序列的存在而為一個剛性連接子。於是，一個中間鉸鏈區，例如守恆的CPPCP要素(conserved CPPCP motif)，可被一個螺旋形成序列[例如(EAAAK)2 ]來替換，這會導致一個短剛性螺旋位在該連接子中。因此，在本發明的一個抗體中，該連接子可包含有一個螺旋形成序列，例如包含有該胺基酸序列(EAAAK)2 。這樣一個序列的使用可幫助增加剛性。
本發明的一個連接子較佳地可以包含有一個如序列辨識編號:3至5、7至11或13至24之中的任一者所闡述的胺基酸序列，或一個對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約90%序列相同性(較佳為對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約95%序列相同性、更佳為對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約97%序列相同性、更佳為對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約98%序列相同性、更佳為對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約99%序列相同性)的胺基酸序列。
舉例來說，一個適合供應用於本發明的一個多價抗體之連接子可以參照一個包含有序列辨識編號:1至24之中的任何一者之胺基酸序列的序列[其中有0至5個胺基酸插入、刪除、取代或加入(或此等之一組合)被進行]來予以界定。在某些具體例中，該連接子包含有一個胺基酸序列，它相對於一個被闡述於序列辨識編號:3至5、7至11或13至24之中的序列具有從0至4個(較佳為從0至3個，較佳為從0至2個，較佳為從0至1個，以及較佳為0個)胺基酸插入、刪除、取代或加入(或此等之一組合)。
一個適合供應用於本發明的一個多價抗體之連接子可以參照一個包含有序列辨識編號:1至24之中的任何一者之胺基酸序列的序列或一個對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約85%序列相同性(諸如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約90%序列相同性、例如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約95%序列相同性、諸如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約98%序列相同性、例如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約99%序列相同性)的胺基酸序列來予以界定。
表1例示說明一個連接子序列如何可被連接至CH1和VH2區。表 1 ：劃底線的序列 (underlined sequence) 是該連接子序列；側翼序列 (flanking sequences) 係為 該附加的 Fab 之 CH1 區的 CH1 區以及一個隨後的重鏈 VH 區之 VH2 區
Figure 108111354-A0304-0001
注意，端視所使用的特定可變區而定，跟隨在該連接子(上面被劃底線者)之後的VH2序列可以變化。在其他具體例中，跟隨在該連接子之後的序列可以是一個輕鏈可變區，包含一個共同輕鏈。使用連接子來配對該附加的結合領域之區域
在此被使用的連接子可以連接該主體抗體部分至該至少一個附加的結合領域。此外，在該至少一個附加的結合領域是一個Fab領域或者係由一個重鏈可變區和一個輕鏈可變區之配對所構成的情況下，該連接子可經由共價鍵聯(典型地經由一個雙硫鍵)來配對該重鏈和輕鏈。該雙硫鍵可以在該連接子之中的一個半胱胺酸殘基和該(等)附加的結合領域的一個可變區之間形成。由該連接子所造成的該配對可適用於一個包含有一個Fab領域之附加的結合領域，該Fab領域包含有一個共同輕鏈和一個對應重排的重鏈可變區，或包含有一個共同重鏈和一個對應重排的輕鏈可變區。多價性 (multivalency) 以及多特異性 (multispecificity)
在本發明的一個多價蛋白質之主體抗體的兩個結合領域結合不相同的抗原之情況下，該第一個和第二個抗原可以是坐落在一個細胞上或坐落在不相同的細胞類型上之兩個不相同的分子或部分。包含有兩個藉由招募(recruiting)以及活化內源性免疫細胞來調解細胞毒性之結合領域的抗體是一種新興類型的抗體治療劑(antibody therapeutics)。這可藉由將對於標的細胞(亦即腫瘤細胞)和效應子細胞(亦即T細胞、NK細胞以及巨噬細胞)之抗原結合特異性組合在一個分子中而被達成(參見，例如，WO 2014/051433)。本發明的一個抗體包含有至少3個結合領域。該主體抗體部分典型地將包含有兩個不相同的結合領域(雖然該兩個結合領域可以具有相同的序列或結合相同的表位)。一個包含有3個或更多個結合領域之多價抗體可以標靶一個、兩個、3個或更多個腫瘤相關抗原，這允許對有害的細胞(deleterious cells)而非健康細胞之一特異性標靶(specific targeting)。舉例來說，該多價抗體的一個或兩個結合領域可以結合一個位在一異常的(aberrant)(腫瘤)細胞上的抗原，而該多價抗體之一個第二或第三結合領域可以結合一個位在一可造成表現一個或多個腫瘤相關抗原之腫瘤細胞的直接殺除(directed killing)之免疫效應子細胞上的抗原。任擇地，該多價抗體的兩個結合領域可以特異性地結合至位在被表現於腫瘤細胞上之一相同抗原或不相同抗原上的兩個不相同表位，而這些臂之親和力被減弱(attenuated)俾以減輕結合至僅表現一種抗原的細胞或者只有該多價抗體的一個結合領域被銜接之處。或者本發明的多價抗體之3個結合領域可以結合至3個不相同抗原或相同的抗原，但位在免疫效應子細胞的不相同表位之處。
同樣地，一個包含有3個或更多個結合領域的多價抗體可以結合一個功能性標的物，諸如一個配位基(ligand)或酵素(enzyme)，觸發(triggering)該標的物之一生物反應(biological response)或封阻該標的物之功能，導致抑制性或促效性細胞活性(inhibitory or agonistic cellular activity)。本發明的一個多價抗體之至少一個結合領域經由一個連接子而被連接至該主體抗體部分的一個結合領域。在該主體抗體部分的該結合領域是一個Fab領域的情況下可以採用例如VH-CH1-連接子-VH-CH1的型式，其中該連接子連接該主體抗體部分的重鏈至該至少一個附加的結合領域(較佳為一個Fab領域)。
任擇地，這可以採用，例如，VL-CL-連接子-VL-CL的型式，其中該連接子連接該主體抗體部分的輕鏈至該至少一個附加的結合領域(較佳為一個Fab領域)。
一個附加的結合領域，諸如一個Fab領域，可被連接至該主體抗體部分的該等結合領域之每一者，各自經由一個獨立的連接子。連接該等附加的結合領域至該主體抗體部分或附加的結合領域的該兩個或更多個連接子可以是相同的或不相同的。再者，該等連接子可以允許該結合領域之同源鏈的配對。
如果本發明的一個抗體包含有多於一個連接子，那些連接子可以是相同的或不相同的或者此等之一組合。後者情況之一示範例是在一個多特異性抗體包含有3個連接子的情況下，它們之中的兩個是相同的而第3個則為不相同的(有別於另外兩個)。
再者，經由一個連接子而被連接至一個主體抗體部分之一結合領域的一個結合領域它本身可以被附接至一個經由此處所述的一個連接子而被連接的結合領域，其中該主體抗體部分可呈一模組化方式而被延伸(extended)，藉由透過一個連接子連接至一個附加的結合領域以及經由一個連接子將那個結合領域連接至一個第二附加的結合領域，以此類推。
以此方式，本發明的一個抗體也許能夠結合3個或更多個表位。因此，本發明的一個多特異抗體也許能夠特異性地結合3個或更多個表位。
本發明的一個抗體也許能夠結合兩個、3個或更多個抗原。本發明的一個多特異抗體也許因此能夠特異性地結合兩個、3個或更多個抗原。
本發明的一個抗體可包含有兩個或更多個結合領域，諸如兩個或更多個Fab領域，它們能夠結合至位在一個抗原上的不相同表位。
於是，本發明的一個抗體包含有至少3個結合領域，諸如兩個或更多個係為不相同的Fab領域。
本發明的另一個方面包含有一個多價抗體，其包含有至少3個Fab領域而因此能夠結合至3個典型地彼此互不相同的表位。
本發明的一個抗體可以是多價的。本發明的一個抗體亦可以是多特異性的。多價的表示該抗體具有至少3個結合領域而因此具有至少3個抗原結合位。多特異性表示該抗體能夠結合至少兩個不相同的表位，例如兩個不相同的抗原或者兩個位在相同抗原上的表位。三特異性表示該抗體能夠結合3個不相同的表位。四特異性表示該抗體能夠結合4個不相同的表位，以此類推。
本發明的一個抗體可結合坐落在相同分子上的標的表位(target epitopes)。相較於一種當中僅有一個表位被標靶的情況，這可允許該標的分子的(生物)功能之更有效率的抵消(counteraction)。舉例來說，本發明的一個抗體可同時地結合至存在於一個抗原細胞上的2個或3個或更多個表位，例如生長因子受體(growth factor receptors)或對於腫瘤細胞要增殖(proliferate)至為關鍵的可溶性分子(soluble molecules)，而因此有效地封阻導致失控的增殖(uncontrolled proliferation)之數個獨立的訊息傳遞路徑(signaling pathways)。
由本發明的至少兩個抗體所構成之任何一種組合可同時結合至存在於一個標的分子(諸如一個生長因子受體或可溶性分子)上的2個、3個、4個或更多個表位。
該標的部分(target moiety)可以是一個可溶性分子或者可以是一個膜結合的部分(membrane-bound moiety)或者可以是一個在結合之時內在化(internalizes)之存在於一細胞表面上的部分。
該標的表位可以坐落在不相同的部分上，例如位在兩個(亦即兩個或更多個標的表位係位在一個第一部分上，而一個或多個標的表位係位在一個第二部分上)或3個不相同的部分(亦即在3個部分的每一者之上有至少一個標的表位)。在這個情況下，該等不相同的標的部分之每一者可以是一個可溶性部分或一個膜結合的部分或一個在結合之時內在化之存在於一細胞表面上的部分。在一個具體例中，該等不相同的標的部分是可溶性部分。任擇地，至少一個標的部分是一個可溶性部分，而有至少一個標的部分是一個膜結合的部分。在另一個替代方案中，所有的標的部分是膜結合的部分。在一個具體例中，該等不相同的標的部分被表現在相同的細胞上，而在其他具體例中，該等不相同的標的部分被表現在不相同的細胞上。
作為一個非限制性示範例，本發明的任何一個抗體或者由本發明的一個抗體和一個附加抗體(additional antibody)所構成的任何一個組合也許適合於同時封阻多個膜結合的受體、中和(neutralizing)多個可溶性分子(諸如用於腫瘤細胞的細胞激素或生長因子)或者中和不相同的病毒血清型(viral serotypes)或病毒株(viral strains)。
在本發明的一個抗體中，至少一個標的表位可以坐落在一個腫瘤細胞上。任擇地，或另外地，至少一個標的表位可以坐落在一個效應子細胞之表面上。這適合於，例如，用於腫瘤細胞殺除的T細胞或NK細胞的招募。舉例來說，本發明的一個抗體也許能夠藉由特異性地結合至一個坐落在免疫效應子細胞上之標的分子來招募免疫效應子細胞，較佳為人類免疫效應子細胞。在一個進一步的具體例中，該免疫效應子細胞在本發明的抗體結合至該標的分子之時被活化。效應子機制中的招募可能涵蓋，例如，藉由投藥一種根據本發明之一方法而被生成的Ig樣分子(Ig-like molecule)來重定向免疫調變的細胞毒性(immune modulated cytotoxicity)，該Ig樣分子能夠結合至一個細胞毒性觸發分子(cytotoxic trigger molecule)[諸如T細胞受體(T cell receptor)或一個Fc γ受體(Fc gamma receptor)]，而因此活化下游免疫效應子途徑(downstream immune effector pathways)或免疫效應子細胞。免疫細胞 銜接元(Immune cell engagers)
一個多價多聚體，諸如本發明的一個抗體，可以是一個免疫效應子細胞銜接元抗體(immune effector cell engager antibody)。也就是說，本發明的一個多價抗體可以是一個如下之物：包含有至少一個結合領域特異性地結合至一個抗原或一個免疫效應子細胞(諸如一個T細胞)，而且也包含有至少一個結合領域特異性地結合至一個位在一異常的細胞(諸如一個癌或腫瘤細胞)上之抗原。
本發明的一個多價多聚體，諸如一個三特異性抗體，可以是一個具有3個結合領域之物，該3個結合領域將3個細胞(包含一個腫瘤細胞以及兩個免疫效應子細胞)一起聚集在一個銜接元複合物(engager complex)中。
本發明的一個多價多聚體，諸如一個三特異性抗體，可進一步是一個具有3個結合領域之物，該3個結合領域標靶兩個細胞以及一個可溶性分子。
對於被闡述於此的具體例，該Fc可以是一個野生型Fc，可以根據具有本領域技藝之人士所知曉的方式而就ADCC以及Cq1的結合來予以增強，或者可以根據具有本領域技藝之人士所知曉的方式而就這樣的活性來予以廢除(abrogated)。
這樣的免疫細胞銜接多價抗體(immune cell engaging multivalent antibodies)之組份(components)可以呈各式各樣的構形而相對於彼此來予以配置(arranged)。示範性構形被描繪於圖1a至1u中。在特定的具體例中，本發明係針對一種免疫細胞銜接多價抗體，其中一個第三結合領域在該被Fab重鏈的C-端之處被連接至該主體抗體之一個第一或第二結合領域的N-端。
在一個具體例中，一個免疫細胞銜接多價抗體包含有3個結合領域，亦即一個主體抗體部分以及一個附加的結合領域，而使得該多價抗體係為三特異性。
該主體抗體部分的該等結合領域之中的一個可以結合至一個位在一個免疫效應子細胞上的抗原。任擇地，該附加的結合領域可以結合至一個免疫效應子細胞的一個抗原。也就是說，用於一個位在一個免疫效應子細胞上的抗原之結合領域可以是位在位置1、2或3之處，其中這些位置對應於圖1a中所示的VH1、VH2和VH3。任擇地，在一個共同重鏈被使用的情況下，用於一個位在一個免疫效應子細胞上的抗原之該結合領域可以是位在位置1、2或3之處，其中這些位置對應於VL1、VL2和VL3，例如，如圖1c中所示者。
在本發明的一個免疫效應子細胞銜接元抗體中，該等結合領域之中的至少一者可以特異性地結合至一個位在一異常的細胞上之抗原。典型地，至少兩個結合領域結合至一個位在一異常的細胞上之抗原，典型地至少兩個結合領域結合至位在一異常的細胞上之兩個不相同的抗原或者一個抗原上的兩個不相同表位。在本發明的一個免疫效應子細胞銜接元抗體中，兩個或更多個結合領域可以結合相同的標的物(包含抗原和表位)，而另一個結合領域銜接一個免疫效應子細胞。
在本發明的一個較佳具體例中，本發明的一個多價抗體特異性地結合至於一個位在一個免疫效應子細胞上的抗原，而且也特異性地結合至位在一異常的細胞(諸如一腫瘤細胞)上之兩個不相同的抗原。
在本發明的一個具體例中，該T細胞銜接多價抗體能夠同時結合至一個標的細胞抗原(特別是一個腫瘤細胞抗原)以及一個人類T細胞之一表面抗原(surface antigen)。在一個具體例中，該T細胞銜接多價抗體能夠同時結合至一個標的細胞抗原(特別是一個腫瘤細胞抗原)以及一個CD3。在一個具體例中，該T細胞銜接多價抗體能夠藉由同時結合至一個標的細胞抗原和CD3來交聯(crosslinking)一個T細胞和一個標的細胞。在另一個具體例中，該同時的結合導致該標的細胞(特別是一個腫瘤細胞)的溶解。在一個具體例中，該同時的結合導致T細胞的活化。在其他具體例中，該同時的結合導致一個T淋巴細胞(T lymphocyte)(特別是一個細胞毒性T淋巴細胞)的一個選自於下列群組中的細胞反應(cellular response)：增殖、分化(differentiation)、細胞激素分泌(cytokine secretion)、細胞毒性效應子分子釋放(cytotoxic effector molecule release)、細胞毒性活性(cytotoxic activity)以及活化標記(activation markers)的表現。在一個具體例中，將T細胞銜接多胜肽(T cell engaging polypeptide)結合至CD3而沒有同時結合至該標的細胞抗原不會導致T細胞活化，在那樣的情況下，例如，剩餘的結合領域不結合一個腫瘤細胞抗原。
在一個具體例中，該T細胞銜接多價抗體能夠重定向一個T細胞的細胞毒性活性至一個標的細胞。在一個具體例中，該重定向不依賴於該標的細胞之MHC-媒介的胜肽抗原呈現(MHC-mediated peptide antigen presentation)和/或T細胞的特異性。在一個具體例中，該T細胞是一個細胞毒性T細胞。在另一個具體例中，該T細胞是一個CD4+ 或一個CD8+ T細胞。在另一個具體例中，該T細胞是一個CD8+ T細胞。
本發明的T細胞銜接多價抗體包含有至少一個能夠結合至一個人類T細胞之一表面抗原的抗原結合領域。在一個具體例中，該結合領域結合CD3 (在此亦被稱之為一個“CD3抗原結合領域”)。
術語“CD3 [分化簇團3 (cluster of differentiation 3)]”意指一種蛋白質複合物(protein complex)，它係由一個CD3γ鏈(SwissProt P09693)、一個CD3δ鏈(SwissProt P04234)、一個CD3ε鏈(SwissProt P07766)以及一個CD3ζ鏈同質二聚體(CD3 zeta chain homodimer)(SwissProt P20963)所構成。CD3ε係以各種不同的別名(aliases)而聞名，之中有一些係為：“CD3e分子，ε (Epsilon)(CD3-TCR複合物)”；“CD3e抗原，ε多胜肽(TiT3複合物)”；T細胞表面抗原T3/Leu-4 ε鏈；T3E；T細胞抗原受體複合物，T3的ε次單位(epsilon subunit)；CD3e抗原；CD3-ε 3；IMD18；TCRE。關於CD3E基因的識別號碼(Ids)是HGNC: 1674；Entrez Gene: 916；Ensembl: ENSG00000198851；OMIM: 186830；以及UniProtKB: P07766。這些鏈與該T細胞受體(TCR)和該ζ-鏈(ζ-chain)聯合(associate)以形成一個TCR複合物，該TCR複合物在有絲分裂訊息傳遞(mitogenic signaling)之時可在T淋巴細胞內產生一個活化訊息(activation signal)。CD3被表現在T細胞和NK T細胞上。在CD3於此處被提到的情況下，所指的是人類CD3，除非另有特別說明。
在一個特別的具體例中，該T細胞銜接多胜肽包含有不多於一個結合領域能夠特異性地結合至CD3。在一個具體例中，該T細胞銜接多胜肽提供對CD3的單價結合(monovalent binding)。在一個具體例中，該T細胞銜接多胜肽包含有一由結合CD3的結合領域所構成的超級簇團之一成員。一個“超級簇團”在此被使用以意指具有被容許(tolerated)的胺基酸變化之可變區，例如，相對於重鏈可變區(包含本發明的一個VH或VL和/或它裡面的CDR)，而不會失去對特定抗原的結合特異性。更特別地，一個“超級簇團”是一群的選殖株(clones)，它們共享相同的VH V基因使用並且具有在HCDR3中至少70%的序列相同性以及相同的HCDR3長度。一個超級簇團中的選殖株被預期可能以不相同的親和力和/或位在表位上的不相同位置來結合相同的抗原。
CD3結合領域可涉及親和力、表位和其他特徵。可結合CD3的一個細胞外部分(extracellular part)之特異性可變領域是包含有以下之可變領域：MF8057、MF8058、MF8078和這個超級簇團的可變區、MF8397和這個超級簇團的可變區、MF8508和這個超級簇團的可變區、MF9249以及MF9267和這個超級簇團的可變區之VH的胺基酸序列。
CD3抗原結合領域包含有至少一個選自於由MF8057、MF8058、MF8078和這個超級簇團的可變區、MF8397和這個超級簇團的可變區、MF8508和這個超級簇團的可變區、MF9249以及MF9267和這個超級簇團的可變區之VH (序列辨識編號:97、序列辨識編號:106、序列辨識編號:115、序列辨識編號:124、序列辨識編號:133、序列辨識編號:142、序列辨識編號:98、序列辨識編號:107、序列辨識編號:116、序列辨識編號:125、序列辨識編號:134、序列辨識編號:143、序列辨識編號:152、序列辨識編號:99、序列辨識編號:108、序列辨識編號:117、序列辨識編號:126、序列辨識編號:135、序列辨識編號:144和/或序列辨識編號:153)所構成之群組中的重鏈互補決定區(CDR)，以及至少一個選自於由序列辨識編號:254、序列辨識編號:255、序列辨識編號:256所構成之群組中的輕鏈CDR。
在一個具體例中，該CD3抗原結合領域包括具有序列辨識編號:97、序列辨識編號:106、序列辨識編號:115、序列辨識編號:124、序列辨識編號:133或序列辨識編號:142之重鏈CDR1，具有序列辨識編號:98、序列辨識編號:107、序列辨識編號:116、序列辨識編號:125、序列辨識編號:134、序列辨識編號:143或序列辨識編號:152之重鏈CDR2，具有序列辨識編號:99、序列辨識編號:108、序列辨識編號:117、序列辨識編號:126、序列辨識編號:135、序列辨識編號:144或序列辨識編號:153之重鏈CDR3，具有序列辨識編號:254之輕鏈CDR1，具有序列辨識編號:255之輕鏈CDR2，以及具有序列辨識編號:256之輕鏈CDR3。
在一個具體例中，該CD3抗原結合領域包含有一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於由序列辨識編號:100、序列辨識編號:109、序列辨識編號:118、序列辨識編號:127、序列辨識編號:135、序列辨識編號:145和序列辨識編號:154所構成之群組中的胺基酸序列之重鏈可變區序列，以及一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於由序列辨識編號:37和序列辨識編號:40所構成之群組中的胺基酸序列之輕鏈可變區序列。
在一個具體例中，該CD3抗原結合領域包括具有序列辨識編號:100、序列辨識編號:109、序列辨識編號:118、序列辨識編號:127、序列辨識編號:135、序列辨識編號:145或序列辨識編號:154之重鏈可變區，以及包含有具有序列辨識編號:37或序列辨識編號:40之胺基酸序列的輕鏈可變區。
位在該多價抗體中的結合領域之位置可以被界定。當該主體抗體的結合或可變領域被稱為結合領域1和2之時，該附加的一個或多個結合領域可被稱為結合領域3、4等等。一個結合領域亦被稱之為BD。BD3可以被連接至BD1或BD2。當BD3被連接至BD1和BD2之中的一者之時，BD4 (當存在之時)被連接至BD1和BD2之中的另一者。
本發明的T細胞銜接多價抗體包含有至少兩個能夠結合至一個標的細胞抗原之抗原結合領域(在此亦被稱之為一個“標的細胞抗原結合領域”或“第二”或“第三”抗原結合領域)。在某些具體例中，該T細胞銜接多價抗體包含有兩個能夠結合至一個標的細胞抗原之抗原結合領域。在一個具體例中，這些抗原結合領域的每一者特異性地結合至相同的抗原決定位。在另一個具體例中，該等標的細胞抗原結合領域是相同的。在一個具體例中，該T細胞銜接元多胜肽包含有不多於兩個能夠結合至一個標的細胞抗原之標的細胞抗原結合領域。
在一個具體例中，該多價抗體包含有一個BD1係為一個CD3結合領域，一個BD2係為一個結合一個第一標的細胞抗原(被進一步稱為TA1)的結合領域，以及一個BD3係為一個結合一個第二標的細胞抗原(被進一步稱為TA2)的結合領域。在這個具體例中，BD3可以被連接至BD1或BD2。在一個具體例中，該結合TA2的BD3被連接至該結合CD3的BD1。在另一個具體例中，該結合TA2的BD3被連接至該結合TA1的BD2。
在一個具體例中，該多價抗體包含有一個結合TA1的BD1、一個結合TA2的BD2以及一個結合CD3的BD3。在這個具體例中，BD3可被連接至BD1或BD2。在一個具體例中，該結合CD3的BD3被連接至該結合TA1的BD1。在另一個具體例中，該結合CD3的BD3被連接至該結合TA2的BD2。
在一個具體例中，本發明提供一種多價抗體，其中該主體抗體包含有結合領域1和2 (BD1和BD2)，以及其中該附加的結合領域3 (BD3)被連接至該結合領域1 (BD1)，以及其中一個選擇性附加的結合領域4 (BD4)被連接至該結合領域2 (BD2)。在一個具體例中，結合領域1是一個CD3結合領域，而結合領域2和3結合至不相同的標的細胞抗原。在另一個具體例中，結合領域2是一個CD3結合領域，而結合領域1和3結合至不相同的標的細胞抗原。在一個進一步的具體例中，結合領域3是一個CD3結合領域，而結合領域1和2結合至不相同的標的細胞抗原。
在一個較佳具體例中，該多價抗體包含有一個結合另外一種不相同的標的細胞抗原之結合領域4。
本發明進一步提供一種如此處所述的多價抗體，其中該主體抗體包含有結合領域1和2，以及其中該附加的結合領域3被連接至該結合領域1，以及其中一個選擇性附加的結合領域4被連接至該結合領域2。在一個具體例中，結合領域1是一個CD3結合領域，而結合領域2和3結合至不相同的標的細胞抗原。在另一個具體例中，結合領域2是一個CD3結合領域，而結合領域1和3結合至不相同的標的細胞抗原。在一個進一步的具體例中，結合領域3是一個CD3結合領域，而結合領域1和2結合至不相同的標的細胞抗原。
當包含有一個結合領域4之時，該領域較佳地結合另外一種不相同的標的細胞抗原。
在一個具體例中，一個第一標的細胞抗原結合領域結合PD-L1、EGFR、CD137、CLEC12A、纖維蛋白原或甲狀腺球蛋白。在一個具體例中，一個第一和一個第二標的細胞抗原結合領域結合選自於PD-L1、EGFR、CD137、CLEC12A、纖維蛋白原和甲狀腺球蛋白之中的抗原。該第一和該第二標的細胞結合領域較佳地結合不相同的抗原。
一個CD3結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF8057或MF8058或MF8078或MF8397或MF8508或MF9249或MF9267的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。該CD3結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其帶有MF8057或MF8058或MF8078或MF8397或MF8508或MF9249或MF9267的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
一個標的細胞抗原結合領域可以是一個PD-L1結合領域。如果存在的話，該PD-L1結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF5377或MF5444或MF5380的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。該PD-L1結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其帶有MF5377或MF5444或MF5380的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
一個標的細胞抗原結合領域可以是一個EGFR結合領域。如果存在的話，該EGFR結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF8233或MF9891或MF9886或MF9873或MF9988的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。該EGFR結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其帶有MF8233或MF9891或MF9886或MF9873或MF9988的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
一個標的細胞抗原結合領域可以是一個CLEC12A結合領域。如果存在的話，該CLEC12A結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF4327的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。該CLEC12A結合領域較佳地包含有一個重鏈可變區，其帶有MF4327的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
在一個具體例中，該多價抗體包含有一個CD3結合領域、一個EGFR結合領域以及一個PD-L1結合領域。
帶有被指示的重鏈可變區之結合領域包含有一個輕鏈可變區。該輕鏈可變區較佳地包含有一個CDR1、CDR2和CDR3區，其包含有胺基酸序列CDR1 – QSISSY、CDR2 – AAS、CDR3 – QQSYSTP，亦即IGKV1-39 (根據IMGT)的CDRs。胺基酸變化、插入、刪除、取代、加入或此等之一組合較佳地不是位在該輕鏈可變區的CDR3區內，較佳地不是位在該輕鏈可變區的CDR1或CDR2區內。在一個較佳具體例中，該輕鏈可變區相對於該被指示的序列不包含有一個刪除、加入或插入。在這個具體例中，該輕鏈可變區相對於該被指示的序列可具有0至5個胺基酸取代。一個胺基酸取代較佳地是一個守恆的胺基酸取代。本發明的一個抗體之一輕鏈的CDR1、CDR2和CDR3較佳地分別包含有胺基酸序列CDR1 – QSISSY、CDR2 – AAS、CDR3 – QQSYSTP，亦即IGKV1-39 (根據IMGT)的CDRs，如本文中其他地方所述。帶有被指示的重鏈可變區之結合領域的輕鏈較佳地全部都包含有相同的輕鏈。較佳為一個如本文中其他地方所界定的共同輕鏈。
胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之組合較佳地不是位在該重鏈可變區的CDR3區內，較佳地不是位在該重鏈可變區的CDR1和/或CDR2區內。在一個較佳具體例中，該重鏈可變區相對於該被指示的序列不包含有一個刪除、加入或插入。在一個具體例中，該重鏈可變區相對於該被指示的序列可具有0-10個(較佳為0-5個)胺基酸取代。在一個較佳具體例中，該重鏈可變區相對於該被指示的序列包含有0-9個、0-8個、0-7個、0-6個、0-5個、0-4個(較佳為0-3個、較佳為0-2個、較佳為0-1個、較佳為0個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合位在非為該等CDRs之處。如果被排比的序列在不多於10個(較佳為不多於5個)位置處有差異，一個插入、加入、刪除或取代之一組合是一個如所請求(as claimed)的組合。位在被排比的序列之中一者內的一個空位計數為(counts for)是跟在另一個序列中被跳過(skipped)的一樣多的胺基酸。一個胺基酸取代，如果有的話，較佳地是一個守恆的胺基酸取代。
在一個具體例中，該標的細胞抗原結合領域是一個Fab分子。在一個具體例中，該標的細胞抗原結合領域是一個Fab分子，它結合至一個特異性抗原決定位而且能夠引導該T細胞銜接多價抗體至一個標的位址(target site)，例如至一個帶有該抗原決定位的特定類型(specific type)的腫瘤細胞。
在某些具體例中，該標的細胞抗原結合領域特異性地結合計畫性細胞死亡1蛋白質(Programmed Cell Death 1 protein，PD-L1)，較佳為人類PD-L1 (序列辨識編號:257)。
PD-L1是一種第一型跨膜蛋白質(type 1 transmembrane protein)，它在特定事件(particular events)[諸如妊娠(pregnancy)、組織同種異體移植(tissue allografts)，自體免疫疾病(autoimmune disease)以及其他諸如肝炎(hepatitis)的疾病狀態(disease states)]期間當中扮演一個壓制(suppressing)一免疫反應的角色。PD-L1對PD-1或B7.1 (CD80)的結合傳送(transmits)一個降低PD-1表現T細胞(PD-1 expressing T cells)之增殖的抑制訊息(inhibitory signal)。PD-1被認為係能夠經由細胞凋亡(apoptosis)來控制外來抗原特異性T細胞(foreign antigen specific T cells)的蓄積(accumulation)。PD-L1被各式各樣的癌細胞所表現，而它的表現被認為是至少部分地負責一種對抗該癌細胞的免疫反應之一減弱(dampening)。PD-L1是B7蛋白家族(B7-family of proteins)的一個成員，並以各式各樣的其他名稱而聞名，諸如CD274分子；CD274抗原；B7同源物1 (B7 Homolog 1)；PDCD1配位基1 (PDCD1 Ligand 1)；PDCD1LG1；PDCD1L1；B7H1；PDL1；計畫性細胞死亡1配位基1 (Programmed Cell Death 1 Ligand 1)；計畫性死亡配位基1 (Programmed Death Ligand 1)；B7-H1；以及B7-H。關於CD274的外部識別號碼(external Ids)是HGNC: 17635；Entrez Gene: 29126；Ensembl: ENSG00000120217；OMIM: 605402；UniProtKB: Q9NZQ7。
該PD-L1結合領域可以在親和力、表位和其他特徵上有個範圍。可結合PD-L1的一個細胞外部分之特異性可變領域是包含有MF5377、MF5444或MF5380之VH的胺基酸序列之可變領域。
該PD-L1抗原結合領域包含有至少一個選自於由序列辨識編號:160、序列辨識編號:169、序列辨識編號:178、序列辨識編號:161、序列辨識編號:170、序列辨識編號:179、序列辨識編號:162、序列辨識編號:171和序列辨識編號:180的VH所構成之群組中的重鏈CDR，以及至少一個選自於由序列辨識編號:254、序列辨識編號:255和序列辨識編號:256所構成之群組中的輕鏈CDR。
在一個具體例中，該PD-L1抗原結合領域包含有具有序列辨識編號:160、序列辨識編號:169或序列辨識編號:178的重鏈CDR1，具有序列辨識編號:161、序列辨識編號:170或序列辨識編號:179的重鏈CDR2，具有序列辨識編號:162、序列辨識編號:171或序列辨識編號:180的重鏈CDR3，具有序列辨識編號:254的輕鏈CDR1，具有序列辨識編號:255的輕鏈CDR2，以及具有序列辨識編號:256的輕鏈CDR3。
在一個具體例中，該PD-L1抗原結合領域包含有一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於由序列辨識編號:163、序列辨識編號:172和序列辨識編號:181所構成之群組中的胺基酸序列之重鏈可變區序列，以及一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於由序列辨識編號:37和序列辨識編號:40所構成之群組中的胺基酸序列之輕鏈可變區序列。
在一個具體例中，該PD-L1抗原結合領域包含有具有序列辨識編號:163、序列辨識編號:172或序列辨識編號:181之重鏈可變區，以及包含有具有序列辨識編號:37或序列辨識編號:40之胺基酸序列的輕鏈可變區。
在某些具體例中，該PD-L1抗原結合領域包含有含有就下列而被揭示的胺基酸序列之PD-L1抗體的重鏈和輕鏈可變區：MPDL3280A、RG7446，參見US 2010/0203056 A1；MEDI-4736，參見WO 2011/066389；MSB-0010718C，參見 WO 2013/079174；STI-1014，參見WO 2013/181634；CX-072，參見WO 2016/149201；KN035，參見Zhanget al ., Cell Discov. 7:3 (March 2017)；LY3300054，參見，例如WO 2017/034916；以及CK-301，參見Goreliket al ., AACR:Abstract 4606 (Apr 2016)；以及12A4或MDX-1105，參見，例如WO 2013/173223。
在某些具體例中，該PD-L1抗原結合領域與下列PD-L1抗體的重鏈和輕鏈可變區結合相同的表位：MPDL3280A、RG7446，參見US 2010/0203056 A1；MEDI-4736，參見WO 2011/066389；MSB-0010718C，參見 WO 2013/079174；STI-1014，參見WO 2013/181634；CX-072，參見WO 2016/149201；KN035，參見Zhanget al ., Cell Discov. 7:3 (March 2017)；LY3300054，參見，例如WO 2017/034916；以及CK-301，參見Goreliket al ., AACR:Abstract 4606 (Apr 2016)；以及12A4或MDX-1105，參見，例如WO 2013/173223。
在某些具體例中，該PD-L1抗原結合領域與下列PD-L1抗體的重鏈和輕鏈可變區競爭(competes)對於PD-L1的結合：MPDL3280A、RG7446，參見US 2010/0203056 A1；MEDI-4736，參見WO 2011/066389；MSB-0010718C，參見 WO 2013/079174；STI-1014，參見WO 2013/181634；CX-072，參見WO 2016/149201；KN035，參見Zhanget al ., Cell Discov. 7:3 (March 2017)；LY3300054，參見，例如WO 2017/034916；以及CK-301，參見Goreliket al ., AACR:Abstract 4606 (Apr 2016)；以及12A4或MDX-1105，參見，例如WO 2013/173223。
在某些具體例中，該標的細胞抗原結合領域特異性地結合人類表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor，EGFR)(序列辨識編號:258)。“ErbB1”或“EGFR”是一個具有4個受體酪胺酸激酶(receptor tyrosine kinases，RTKs)(被命名為Her-或cErbB-1、-2、-3和-4)的家族之一成員。該EGFR具有一個細胞外領域(extracellular domain，ECD)係由4個次領域(sub-domains)所構成，之中的兩個涉及到配位基結合(ligand binding)，以及之中的一個涉及到同質二聚體化(homo-dimerisation)和異二聚體化。被使用於此節中的參考編號(reference numbers)是指在標題為“被引述於說明書中的參考文獻(References cited in the specification)”的列表之中的參考文獻的編號。EGFR整合(integrates)來自各式各樣的配位基之細胞外訊息(extracellular signals)以產生互異的細胞內反應(diverse intracellular responses)。由EGFR所活化的主要訊息傳導路徑(major signal transduction pathway)係由Ras-促分裂原活化蛋白激酶(Ras-mitogen- activated protein kinase，MAPK)有絲分裂訊息傳遞級聯反應(mitogenic signalling cascade)所構成。這個路徑的活化是藉由招募Grb2至酪胺酸磷酸化的EGFR (tyrosine phosphorylated EGFR)而被起動(initiated)。這導致Ras經由Grb2-結合的Ras-鳥嘌呤核苷酸交換因子(Grb2-bound Ras-guanine nucleotide exchange factor)無七之子(Son of Sevenless，SOS)的活化。此外，PI3-激酶-Akt訊息傳導路徑(PI3-kinase-Akt signal transduction pathway)亦為EGFR所活化，雖然這個活化在有Her3的共同表現(co-expression)之情況下是更加強烈的。EGFR牽涉到數種人類上皮惡性腫瘤(human epithelial malignancies)，特別是乳癌、膀胱癌、非小細胞肺癌、肺癌、結腸癌、卵巢癌、頭頸癌和腦癌。活化基因中的突變已被發現，還有該受體和它的配位基之過度表現(over-expression)引起自體分泌活化圈(autocrine activation loops)。這個RTK因此已被廣泛使用作為癌症治療(cancer therapy)的標的物。標靶該RTK的小型分子抑制劑(small-molecule inhibitors)以及針對細胞外配位基-結合領域的單株抗體(monoclonal antibodies，mAbs)這兩者已經被發展並且迄今已顯示了幾個臨床成功，儘管大多數是對於一選定群組的病患。一個有關於該人類EGFR蛋白質以及編碼它的基因之資料庫登錄編號(database accession number)是(GenBank NM_005228.3)。該登錄編號被給予主要是要提供一個進一步的方法來辨識作為一個標的物之EGFR蛋白質，被一個抗體結合的EGFR蛋白質之實際序列(actual sequence)可能有變化，例如，因為該編碼基因之內的一個突變(諸如發生在某些癌症中的那些)，諸如此類。除非另有說明，當在此處提到EGFR之時，所指的是人類EGFR。結合EGFR的抗原結合位結合EGFR以及它的各式各樣的變異體，諸如被表現在某些EGFR陽性腫瘤(EGFR positive tumors)上的那些。
該EGFR結合領域可以在親和力、表位和其他特徵上有個範圍。可結合EGFR的一個細胞外部分之特異性可變領域是包含有MF8233、MF9891、MF9886、MF9873、MF9988之VH的胺基酸序列之可變領域。
該EGFR抗原結合領域包含有至少一個選自於由序列辨識編號:187、序列辨識編號:196、序列辨識編號:205、序列辨識編號:214、序列辨識編號:223、序列辨識編號:188、序列辨識編號:197、序列辨識編號:206、序列辨識編號:215、序列辨識編號:224、序列辨識編號:189、序列辨識編號:198、序列辨識編號:207、序列辨識編號:216和序列辨識編號:225所構成之群組中的重鏈CDR，以及至少一個選自於由序列辨識編號:254、序列辨識編號:255、序列辨識編號:256所構成之群組中的輕鏈CDR。
在一個具體例中，該EGFR抗原結合領域包含有具有序列辨識編號:187、序列辨識編號:196、序列辨識編號:205、序列辨識編號:214或序列辨識編號:223的重鏈CDR1，具有序列辨識編號:188、序列辨識編號:197、序列辨識編號:206、序列辨識編號:215或序列辨識編號:224的重鏈CDR2，具有序列辨識編號:189、序列辨識編號:198、序列辨識編號:207、序列辨識編號:216或序列辨識編號:225的重鏈CDR3，具有序列辨識編號:254的輕鏈CDR1，具有序列辨識編號:255的輕鏈CDR2，以及具有序列辨識編號:256的輕鏈CDR3。
在一個具體例中，該EGFR抗原結合領域包含有一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於由序列辨識編號:190、序列辨識編號:199、序列辨識編號:208、序列辨識編號:217以及序列辨識編號:226所構成之群組中的胺基酸序列之重鏈可變區序列，以及一個係至少大約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同於一個選自於序列辨識編號:37和序列辨識編號:40所構成之群組中的胺基酸序列之輕鏈可變區序列。
在一個具體例中，該EGFR抗原結合領域包含有具有序列辨識編號:190、序列辨識編號:199、序列辨識編號:208、序列辨識編號:217或序列辨識編號:226之重鏈可變區，以及包含有具有序列辨識編號:37或序列辨識編號:40之胺基酸序列的輕鏈可變區。
在某些具體例中，該EGFR抗原結合領域包含有EGFR抗體西妥昔單抗(cetuximab)[C225，爾必得舒® (Erbitux® )，Lilly]或帕尼單抗(panitumumab)[維克替比(Vectibix)，Amgen]的重鏈和輕鏈可變區。
在某些具體例中，該EGFR抗原結合領域與該EGFR抗體西妥昔單抗(cetuximab)[C225，爾必得舒® (Erbitux® )，Lilly]或帕尼單抗(panitumumab)[維克替比(Vectibix)，Amgen]的重鏈和輕鏈可變區結合相同的表位。
在某些具體例中，該EGFR抗原結合領域與該EGFR抗體西妥昔單抗(cetuximab)[C225，爾必得舒® (Erbitux® )，Lilly]或帕尼單抗(panitumumab)[維克替比(Vectibix)，Amgen]的重鏈和輕鏈可變區競爭對於EGFR的結合。共同 可變區
本發明的多價抗體較佳地在該3個或更多個結合領域的每一者之處使用一個共同鏈。如所述，本發明的多價抗體之主體抗體部分較佳地具有一個結合一個抗原之第一重鏈可變區/輕鏈可變區(VH/VL)組合，以及一個結合一第二個抗原之第二VH/VL組合。被連接至該主體抗體部分的每一個附加的結合領域也可以包含有一個附加的VH/VL組合(結合位在一個抗原上之一個進一步的表位)。
本發明的一個主體抗體部分較佳地包含有兩個重鏈(一者或兩者包含有一個或多個附加的CH1和VH領域)以及一個與各個CH1和VH領域配對的輕鏈。較佳地該兩個重鏈具有相容的異二聚體化領域(compatible heterodimerization domains)，而且較佳地該輕鏈是一個共同輕鏈。任擇地，本發明的多價抗體之主體抗體部分包含有兩個輕鏈(一者或兩者包含有一個或多個附加的CL和VL領域)以及一個與各個CL和VL領域配對的重鏈可變區，而該重鏈可變區包含有一個共同重鏈可變區。
在本發明的具體例包含一個包含有一個共同輕鏈的多價抗體的情況下，其中該輕鏈係在一個包含了編碼兩個或更多個重鏈可變區之DNA的宿主細胞之內被表現，該輕鏈能夠和各個可用的重鏈(或CH1-VH1區)配對，而因此形成至少3個功能性抗原結合領域。
一個功能性抗原結合領域能夠特異性地結合至一個位在一個抗原上之表位。較佳地，一個被使用於本發明的一個多價抗體中的共同輕鏈能夠與利用一個依據本發明的方法而被生成的所有重鏈(或CH1-VH1區)來配對，而因此形成功能性抗原結合領域，而使得不匹配的重鏈和輕鏈之錯配被避免或者在一要比該多價抗體明顯更低的比例下被生成。
本發明的一個較佳方面是：本發明的一個多價抗體具有一個共同輕鏈(可變區)，它可與一系列的重鏈可變區組合以形成一個具有功能性抗原結合領域之抗體(WO 2004/009618、WO 2009/157771)。
一個供應用於本發明的多價抗體之共同輕鏈(可變區)較佳地是一個人類輕鏈(可變區)。一個共同輕鏈(可變區)較佳地具有一個生殖系序列。一個較佳的生殖系序列是一個輕鏈可變區，它經常在人類庫(human repertoire)中被使用並且具有良好的熱力學安定性(thermodynamic stability)、產率(yield)和可溶性(solubility)。一個較佳的生殖系輕鏈是O12。一個共同輕鏈較佳地是重排的生殖系人類κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01 (圖11A；序列辨識編號:35)。該共同輕鏈可變區較佳地是該重排的生殖系人類κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01 (圖11A；序列辨識編號:35)的可變區。一個共同輕鏈較佳地包含有一個如圖11B或8D (分別為序列辨識編號:37或40)中所描繪的輕鏈可變區，帶有0-5個胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。該共同輕鏈較佳地進一步包含有一個輕鏈恆定區，較佳為一個κ輕鏈恆定區。一個編碼該共同輕鏈的核酸可以就被用來表現該共同輕鏈蛋白質的細胞系統而被密碼子最佳化(codon optimized)。該編碼核酸可以偏離(deviate from)一個生殖系核酸序列。
供應用於本發明的多價抗體之共同輕鏈(可變區)可以是一個λ輕鏈，而這因此亦被提供在本發明的上下文中，但是一個κ輕鏈被偏好。本發明的共同輕鏈可以包含有一個或一個λ輕鏈之一恆定區。它較佳地是一個κ輕鏈之一恆定區，較佳地其中該共同輕鏈是一個生殖系輕鏈，較佳為一個包含有IgVκ1-39基因節段(gene segment)之重排的生殖系人類κ輕鏈，例如重排的生殖系人類κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01 (圖11)。術語重排的生殖系人類κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01、IGKV1-39/IGκJ1、huVκ1-39輕鏈或簡而言之huVκ1-39，或簡單地1-39在整個申請案中被互換地使用。那些熟習本領域之技藝者將會認知：“共同”也意指具有不是相同的胺基酸序列之輕鏈的功能等效物(functional equivalents)。有許多該輕鏈的變異體存在，其中不會實質地影響功能性結合區的形成之突變(刪除、取代、加入)是存在的。
IgVκ1-39是免疫球蛋白可變κ1-39基因(Immunoglobulin Variable Kappa 1-39 Gene)的縮寫。該基因亦被稱為免疫球蛋白κ可變1-39、IGKV139、IGKV1-39、O12a或O12。關於該基因的外部識別號碼是HGNC: 5740；Entrez Gene: 28930；Ensembl: ENSG00000242371。關於IgVκ1-39之一較佳的胺基酸序列被給予在圖11中。這列示了V-區的序列。該V-區可以被組合以5個J-區(J-regions)之中的一者。圖11描述兩個關於IgVκ1-39與一個J-區組合的較佳序列。被連接的序列被表示為IGKV1-39/jk1和IGKV1-39/jk5；替代名稱(alternative names)是IgVκ1-39*01/IGJκ1*01或IgVκ1-39*01/IGJκ5*01 [根據位在imgt.org的IMGT資料庫全球網站(IMGT database worldwide web)之命名(nomenclature)]。
一個共同輕鏈可變區較佳地被連接至一個κ輕鏈恆定區。在一個較佳具體例中，被使用於本發明之多價抗體中的輕鏈可變區包含有κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01或IgVκ1-39*01/IGJκ5*01。在一個較佳具體例中，位在該多價抗體中的共同輕鏈是IgVκ1-39*01/IGJκ1*01。
一個生成一共同輕鏈的細胞可以生成，例如，重排的生殖系人類κ輕鏈IgVκ1-39*01/IGJκ1*01以及一個包含有所提到的輕鏈之可變區被融合(fused)至一個λ恆定區的輕鏈。在此處一個生殖系序列被提到的情況下，被偏好的是：該可變區是一個生殖系序列。
一個供應用於本發明之一多價抗體中的較佳共同輕鏈是一個包含有被闡述於序列辨識編號:29中的序列之物。
供應用於本發明之多價抗體中的共同鏈也可以是一個重鏈，而這因此亦被提供於本發明的上下文中。共同重鏈在本技術領域中已經被用來製造雙特異性抗體，而在此可被用於製造一種包含有3個或更多個結合領域的多價抗體，該等結合領域之中的兩個或更多個包含有一個本技術領域中已知的共同重鏈。舉例來說，使用抗體庫，其中該重鏈可變領域對於所有的庫內成員是相同的，而因此多樣性是根據該輕鏈可變領域。這樣的抗體庫被描述於，例如，PCT/US2010/035619以及PCT/US2010/057780，它們之中的每一者以其整體在此被併入本案以作為參考。用以產生具有共同重鏈之結合領域的這些以及其他技術可以由熟習此藝者來產生並且可以在本發明中被使用，俾以生成具有此處所揭示之新穎型式的多價抗體。一個 多價抗體 的生成
本發明的一個多價抗體可以藉由個別的細胞(individual cells)利用一個或多個基因建構物(genetic constructs)之共轉染(co-transfection)而被產生，該一個或多個基因建構物一起編碼3個或更多個蛋白質，這些蛋白質形成一個包含有該多價抗體(諸如上面所描述的那些，包含圖1a-u之內者)的多聚體。舉例來說，一個宿主細胞可以被共轉染以編碼3個或更多個重鏈可變區和一個共同輕鏈可變區的核酸，俾以生成一個多價抗體。任擇地，本發明的一個多價抗體可以藉由個別的細胞利用一個或多個基因建構物之共轉染而被產生，該一個或多個基因建構物一起編碼3個或更多個輕鏈可變區以及一個共同重鏈。
幾個有利於係為異二聚體(heterodimers)的抗體之生成的方法已被發表。在本發明中，被偏好的是：細胞有利於異二聚體的生成勝過個別的同質二聚體的生成。這典型地係藉由修飾該等重鏈的恆定區來予以達成，而使得它們有利於異二聚體化(亦即一種重鏈組合以一個第二重鏈之二聚體化)勝過同質二聚體化(homodimerization)。在一個較佳具體例中，本發明的抗體包含有兩個不相同的免疫球蛋白重鏈帶有相容的異二聚體化領域。
該等相容的異二聚體化領域較佳地係為相容的免疫球蛋白重鏈CH3異二聚體化領域。當野生型CH3領域被使用之時，兩個不相同的重鏈(A和B)以及一個共同輕鏈之共同表現將會導致3個不相同的抗體物種類，AA、AB和BB。AA和BB是用於該兩個同質二聚體抗體的稱號，而AB是用於該異二聚體抗體的稱號。為了提高所欲的異二聚體產物(AB)之百分比，CH3工程化可以被採用，或者換句話說，可以使用如下面所界定的帶有相容的異二聚體化領域之重鏈。本技術領域描述了各種不同的方式，其中這樣的重鏈之異二聚體化可以被達成。
如此處所用的術語“相容的異二聚體化領域”意指蛋白質領域，它們被工程化而使得被工程化的領域A’會與被工程化的領域B’優先地形成異二聚體，反之亦然，而A’-A’和B’-B’之間的同質二聚體化被減少(diminished)。
在US13/866,747 (現已獲准領證為US 9,248,181)、US14/081,848 (現已獲准領證為US 9,358,286)、WO 2013/157953以及 WO 2013/157954中，使用相容的異二聚化領域來生成多價抗體的方法和手段(means)被揭示。這些方法和手段也可以在本發明中被有利地採用。特別地，本發明的一個抗體較佳地包含有突變俾以生成基本上只有雙特異性全長的IgG 分子。較佳的突變係為位在該第一CH3領域中的胺基酸取代L351K和T366K [EU編號(EU numbering)]或者位在與之對應的位置(“KK-變異體”的重鏈)之處的胺基酸取代，以及位在第二領域中的胺基酸取代L351D和L368E或者位在與之對應的位置(“DE-變異體”的重鏈)之處的胺基酸取代，反之亦然。先前在我們的美國9,248,181和9,358,286專利以及WO 2013/157954 PCT申請案中證明了DE-變異體和KK-變異體優先地配對以形成異二聚體(所謂的“DEKK”雙特異性分子)。DE-變異體重鏈之同質二聚體化(DE-DE同質二聚體)或KK-變異體重鏈之同質二聚體化(KK-KK同質二聚體)由於位在相同重鏈之間的CH3-CH3介面中的帶電荷殘基之間的排斥(repulsion)而幾乎不會發生。
在本發明的一個能夠表現會多聚體化以形成一個多價抗體之蛋白質的較佳宿主細胞中，該宿主細胞係以一個編碼3個蛋白質的核酸來予以轉形。依序地從N-端至C-端，被編碼的蛋白質包含一個第一蛋白質，其包含有VH1-CH1-VH2-CH1-CH2-CH3，其中一個連接子連接位在該第一蛋白質上的VH2和CH1；一個第二被編碼的蛋白質，其包含有VLc-CL；一個第三被編碼的蛋白質，其包含有VH3-CH1-CH2-CH3，其中該第一和第三被編碼的蛋白質之CH1與該第二被編碼的蛋白質之CL配對，而該第一和第三蛋白質之被編碼的CH3區編碼位在該第一CH3蛋白質中的胺基酸L351K和T366K (EU編號)或者位在與之對應的位置之處的胺基酸以及位在該第三蛋白質中的胺基酸L351D和L368E或者位在與之對應的位置之處的胺基酸，反之亦然。任擇地，該第一和第三蛋白質包含有造成這些蛋白質之每一者的CH3領域之有效配對的其他相容的異二聚體化領域。
編碼該3個蛋白質的該等核酸可以是位在一個或多個載體上，俾以產生本發明的一個多價抗體。同樣地，對於上面所述的多價抗體之每一者(包含圖1a-1u之內者)，編碼多於3個蛋白質的宿主細胞可以被產生。
編碼該3個蛋白質的該等核酸可進一步被安定地整合至宿主細胞的基因體之內，較佳地係在已知為高度表現而且不存在有或者是減少的基因緘默化之染色體區域處。
根據本發明，因此被提供的是一種用於一個多價抗體之製備的方法，該方法包括： 提供一種包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為一個根據本發明的多價抗體；以及 在用以提供該等多肽胜之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞。
根據總表現的免疫球蛋白，本發明的一個宿主細胞也許能夠在一為至少大約50%、至少大約60%、至少大約70%、至少大約80%、至少大約90%、至少大約95%、至少大約98%的本發明之多價抗體的純度下來生成該多價抗體。
本發明的一個宿主細胞也許能夠生成該多價抗體，其中至少大約50%、至少大約60%、至少大約70%、至少大約80%、至少大約90%、至少大約95%、至少大約98%之被生成的該多價抗體包含有一個可變重排區(variable rearranged region)被配對以一個用於所有的結合位址之同源共同鏈(cognate common chain)。
本發明的一個宿主細胞也許能夠生成該多價抗體，其中至少大約50%、至少大約60%、至少大約70%、至少大約80%、至少大約90%、至少大約95%、至少大約98%之被表現的共同鏈被配對至該多價抗體而因此沒有游離的、未相聯的蛋白質(free, unassociated protein)。
用於抗體生成之合適的係包係為一種融合瘤細胞(hybridoma cell)、一種中國倉鼠卵巢(Chinese hamster ovary，CHO)細胞、一種NS0細胞或一種PER-C6細胞。在一個特別的較佳具體例中，該細胞是一種CHO細胞。用於此處所揭示的一種抗體之生成的細胞在此亦被稱之為宿主細胞。
各種不同的機構和公司已開發展出用於抗體[例如用於臨床應用(clinical use)]之大規模生產(large scale production)的細胞株(cell lines)。這樣的細胞株之非限制性示範例是CHO細胞、NS0細胞或PER.C6細胞。這些細胞中的至少某一些也被使用於其他目的，諸如蛋白質的生成。為了蛋白質和抗體的工業規模生產(industrial scale production)而被發展出的細胞株在此進一步被稱為工業細胞株(industrial cell lines)。在一個較佳具體例中，本發明提供一種生成本發明之一抗體的工業細胞株。
本發明在一個具體例中提供一種細胞(宿主細胞)包含有一根據本發明的抗體和/或一根據本發明的核酸。該細胞較佳的是一動物細胞，更佳為一哺乳動物細胞，更佳為一靈長類動物細胞(primate cell)，最佳為一人類細胞。為了本發明之目的，一個合適的細胞、合適的宿主細胞係為任何一種能夠包含有而且較佳地生成一種根據本發明的抗體和/或一種根據本發明的核酸之細胞。
本發明進一步提供一種細胞包含有一根據本發明的抗體。較佳地該細胞[典型地是一活體外(in vitro )、分離的(isolated)或重組型(recombinant)細胞]生成該抗體。在一個較佳具體例中，該細胞是一種融合瘤細胞、一種中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、一種NS0細胞或一種PER.C6細胞。在一個特別的較佳具體例中，該細胞是一種CHO細胞。進一步被提供的是一種細胞培養物(cell culture)包含有一種根據本發明的細胞。各種不同的機構和公司已開發展出用於抗體(例如用於臨床應用)之大規模生產的細胞株。這樣的細胞株之非限制性示範例是CHO細胞、NS0細胞或PER.C6細胞。這些細胞也被使用於其他目的，諸如蛋白質的生成。為了蛋白質和抗體的工業規模生產而被發展出的細胞株在此進一步被稱為工業細胞株。因此在一個較佳具體例中，本發明提供一種為了抗體之大規模生產而被發展出的細胞株用於生成本發明之一抗體的使用。本發明進一步提供一種用於生成一多價抗體的細胞，該細胞包含有一個或多個核酸分子單獨地或者一起編碼一個如所請求的多價抗體。
本發明亦提供一種用於藉由相同細胞來生成兩個或更多個抗體的方法，其中該等抗體之中的至少一者是一個如此處所請求的多價抗體。這個具體例現在藉由先前所述的DE/KK異二聚體化系統來予以例證。但是，本發明不受限於一個用於實現(enabling)重鏈之異二聚化的特定方法。如先前所述的，該DE-變異體和KK-變異體優先地配對以形成異二聚體(所謂的“DEKK”雙/多價分子)。DE-變異體重鏈之同質二聚體化(DE-DE同質二聚體)或KK-變異體重鏈之同質二聚體化(KK-KK同質二聚體)由於位在相同重鏈之間的CH3-CH3介面中的帶電荷殘基之間的排斥而幾乎不會發生。引入具有DE-或KK-變異體重鏈的另外一個重鏈允許另外一個DEKK雙/多價分子的生成。一個新引入的DE-重鏈(DE2)可與現有的KK重鏈相聯。該細胞因此生成兩個雙/多價抗體，一個DE1KK以及一個DE2KK雙價抗體。如果一個新的KK重鏈(KK2)而非該新的DE重鏈被引入，具有DEKK1和DEKK2組合的雙價抗體(bivalent antibodies)被生成。不相同的抗體可被該細胞所生成的位準典型地藉由調整DE1/2和KK1/2鏈相對於彼此的相對表現(relative expression)而被最佳地調整。輕鏈典型地被充分地生成俾以降低單一重鏈的位準，而一個鏈被生成的位準典型地係足以允許與互補鏈(complementary chains)之有效配對。在DE1/2;KK的示範例中，該DE1和DE2重鏈較佳地被生成至一個位準，其一起匹配該KK重鏈的位準。個別抗體的位準可以藉由調整該DE1和DE2相對於彼此而被生成的位準來予以調整。就該KK1/2 DE變異體而言，情況當然是類似的，但現在是針對相對於彼此的KK1和KK2鏈。端視與該等重鏈的每一者相聯的結合領域和可變領域之數目而定，這個方法允許各式各樣的不相同雙/多價抗體之生成。幾個非限制性示範例現在在此予以說明。在這個示範例中，重鏈DE1具有一個重鏈可變區，其與共同於所有的結合領域之輕鏈形成一個結合抗原V的結合領域或可變領域；重鏈DE2具有兩個重鏈可變區，其與該共同輕鏈一起形成兩個結合抗原W和X的結合領域或可變領域。重鏈KK具有一個重鏈可變區與該共同輕鏈一起形成一個結合抗原Y的結合領域或可變領域。在一個細胞內生成這些重鏈和輕鏈將會生成一個抗體DE1KK和一個抗體DE2KK，其中抗體DE1KK是一個結合抗原V和Y的雙價抗體。抗體DE2KK是一個結合抗原W、X和Y的多價抗體。如果在上面的示範例中，DE1也具有兩個重鏈可變區與該共同輕鏈一起形成兩個結合領域或可變領域，兩個本發明的多價抗體被生成。該KK重鏈也可被提供以一個附加的重鏈可變區，而因此加入具有相同或不相同抗原結合特異性之其他另外的結合領域。兩個或更多個不相同的異二聚體化領域(諸如上面所述的DE/KK)與孔中鈕領域(knob in hole domains)之組合可以進一步在寡株抗體生成(oligoclonic antibody production)中加入多樣性。舉例來說加入兩個重鏈，一個具有鈕(knob)而另一個具有互補孔(complementary hole)，允許一個包含有一個鈕重鏈和一個孔重鏈之獨立雙/多價抗體的生成。取決於與各重鏈相關聯的重鏈可變區之數目以及取決於它們是相同的或不相同的，一個進一步的單特異性抗體或者一個進一步的雙或多價抗體被生成。
根據本發明，被提供的是一種組成物包含有兩個或更多個抗體，它們之中的至少一者可以是一個本發明的多價抗體。本發明的這樣一種組成物可以包含有兩個或更多個本發明的多價抗體。這樣一種組成物可以包含有3個、4個、5個或更多個抗體，它們之中的至少一者可以是一個本發明的多價抗體。在這樣一種組成物中，存在於該組成物中的該等抗體之中的一個或多個可以具有一個共同的重鏈。
本發明的一個宿主細胞可以表現或者能夠表現兩個或更多個抗體，它們之中的至少一者可以是一個本發明的多價抗體。本發明的一個宿主細胞可以表現或者能夠表現兩個或更多個本發明的多價抗體。這樣的宿主細胞可以表現或者能夠表現3個、4個、5個或更多個抗體，它們之中的至少一者可以是一個本發明的多價抗體。這樣的宿主細胞可以表現或者能夠表現3個、4個、5個或更多個抗體，它們全部都可以是一個本發明的多價抗體。
根據本發明，因此被提供的是一種用於製備一包含有兩個或更多個抗體的組成物之方法，該方法包括： 提供一種包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為兩個或更多個抗體，之中的至少一者是一個根據本發明的多價抗體；以及 在用以提供該等多肽胜之表現以及它們的組裝成為兩個或更多個抗體(之中的至少一者是一個根據本發明的多價抗體)之條件下來培養該宿主細胞。
本發明亦提供一種藉由相同細胞來生成兩個或更多個抗體的方法，其中該等抗體之中的至少一者是一個如此處所描述的多價抗體。
本發明提供一種用於生成一包含有兩個或更多個抗體的組成物之方法，該等抗體之中的至少一者是一個如所請求的多價抗體，該方法包括提供一種具有下列的細胞： – 核酸，它編碼一個第一重鏈帶有一重鏈可變區與一個共同輕鏈一起形成一個結合領域或可變領域結合一個第一抗原； – 核酸，它編碼一個第二重鏈帶有一重鏈可變區與該共同輕鏈一起形成一個可變領域結合一個第二抗原以及一重鏈可變區與該共同輕鏈一起形成一個可變領域結合一個第三抗原； – 核酸，它編碼一個第三重鏈帶有一重鏈可變區與該共同輕鏈一起形成一個可變領域結合一個第四抗原；以及 – 核酸，它編碼一個多胜肽包含有該共同輕鏈； 其中該等核酸之中的兩個或更多個可以是或者不是實體連接的(physically linked)，以及其中該等核酸之中的每一者進一步包含有一個表現控制序列(expression control sequence)以允許被編碼的重鏈和輕鏈在該細胞中的表現，以及其中該方法進一步包括培養該細胞以允許該等重鏈和輕鏈的表現，以及選擇性地，收集該兩個或更多個抗體。在一個具體例中，該第一和第二重鏈具有一個相容的異二聚體化領域，較佳為一個DE/KK異二聚體化領域。在一個較佳具體例中，該第三重鏈包含有該相容的異二聚體化領域的部分之中一者，由此而產生兩種抗體。在一個具體例中，該方法進一步包括提供一由帶有該等核酸的細胞所構成之收集以及從該收集中選擇出一個具有個別的重鏈和輕鏈之一所欲的表現比例(desired ratio of expression)之細胞。在一個較佳具體例中，該兩個或更多個抗體係為兩個或更多個多特異性抗體。在一個較佳具體例中，該等細胞生成基本上等莫耳數量(essentially equimolar amounts)的該兩個或更多個抗體。在某些較佳具體例中，該等細胞生成該兩個或更多個抗體之中的一者要多於另外一者。非人類 動物
多價結合蛋白質的合成和表現一直是有問題的，部分係由於與鑑定一可與兩個或更多個不相同重鏈相聯與表現之合適的輕鏈有關聯的議題，以及部分係由於分離議題。再者，本技術領域一直缺少一系列允許各式各樣的抗體效價(antibody valence)、具有安定性的可撓曲性(flexibility with stability)以及低免疫原性的連接子。
此處所描述的方法和組成物允許製造合適的多價結合蛋白質，該等多價結合蛋白質具有得自於、衍生自或根據合適的方法之結合領域。合適的方法可包含噬菌體顯示法(phage display methods)(包含在噬菌體顯示系統中被產生的生殖系序列之修飾)以及本季術領域中已知的其他活體外方法(in vitro methods)。一個特別有用的方法是讓一個基因改造的(genetically modified)非人類動物透過體細胞重組以及親和力成熟作用的自然過程(natural processes)來製造一個可與一共同輕鏈相聯以及表現之合適的重鏈可變領域。
在一個具體例中，被使用於本發明的一個多價抗體中的可變領域係得自於、衍生自或根據一個非人類基因轉殖動物之重鏈和輕鏈可變區，該非人類基因轉殖動物(例如一個共同輕鏈哺乳動物，諸如一囓齒動物)在牠的生殖系內包含有一個未重排的重鏈可變基因座(unrearranged heavy chain variable locus)並且表現一個單一重排的人類輕鏈可變領域。這樣一個非人類基因轉殖動物當暴露至一個抗原將會表現多種多樣的與一個共同輕鏈配對的重鏈可變區，該等重鏈可變區接而可被用來發展編碼得自於、衍生自或根據來自該基因轉殖動物之重鏈可變區的重鏈可變區的核酸序列，該等核酸序列能夠被有效地轉形至用於生成多價抗體的宿主細胞之內。
特別地，來自一個被免疫的(immunized)共同輕鏈動物[牠被基因工程化(genetically engineered)以表現衍生自不超過1個或不超過兩個人類VL基因節段的人類輕鏈可變領域]之合適的B細胞之人類可變區序列可以被使用作為用於本發明的多價抗體之有潛力的VH 領域(potential VH domains)的一來源。該B細胞來自於被免疫以一個或多個感興趣的抗原之該動物，在各種不同的具體例中，該一個或多個感興趣的抗原是該多價抗體將會結合的抗原。該等動物的細胞、組織或血清(serum)、脾臟或淋巴物質(splenic or lymph materials)被篩選俾以獲得展現出相對於該感興趣的抗原之所欲特徵(例如高親和力、低親和力、封阻能力、活化、內在化或其他特徵)的重鏈可變領域(或者表現它們的B細胞)。因為實際上因應一個抗原的刺激(antigenic stimulation)而在該基因轉殖動物體內被產生的所有重鏈可變領域係連同一個衍生自不超過1個或不超過兩個VL 基因節段的人類免疫球蛋白輕鏈之表現而被製造，該等重鏈可變區能夠表現並且與被表現於該基因轉殖動物體內的共同輕鏈領域相聯。
在一個方面，一個如此處所述的表位結合蛋白質(epitope-binding protein)被提供，其中人類VL 和VH 序列係為根據得自於已被免疫以一個包含有一感興趣的表位之抗原的一個此處所述的基因轉殖的小鼠和/或一個被揭示於WO 2009/157771 (在此被併入本案以作為參考)中的基因轉殖動物之B-細胞的核酸之核酸所編碼。核酸序列 、多 胜肽 、載體和 細胞
本發明進一步提供：編碼可被使用於本發明的一個多價抗體之組裝中的多胜肽或連接子之核酸序列；包含有該等核酸序列的載體；一個能夠生成本發明的一個多價抗體之細胞；以及一種使用這樣的一個細胞來製備這樣的一個多價抗體之方法。
根據本發明的多價抗體典型地係藉由表現編碼一起組裝以形成發明的一個抗體之多胜肽的核酸序列之細胞而被生成。
於是，本發明提供一個連接子，其包含有一個如序列辨識編號:1至3或5至24之中的任一者所闡述的胺基酸序列，或一個對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約85%序列相同性(諸如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約90%序列相同性，例如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約95%序列相同性，諸如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約98%序列相同性，例如對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約99%序列相同性)的多胜肽。
本發明進一步提供一種多胜肽包含有一個VH1-CH1-以鉸鏈為基礎的連接子(hinge-based linker)-VH2- CH1。
在某些具體例中，VH1和VH2結合相同的表位。在某些具體例中，該VH1和VH2結合相同的抗原但是不相同的表位。以及在某些具體例中，該VH1和VH2結合獨立的表位和抗原。
亦為本發明所提供的是一個編碼這樣一個連接子或多胜肽的核酸序列以及一個包含有這樣一個核酸序列的載體。
被使用以製造所描述的多胜肽之核酸序列可以被置放在任何一個合適的表現載體中，以及在適當的情況下，被置放在位於一個單一宿主細胞內的兩個或更多個載體中。
一般而言，編碼可變領域的核酸序列係與合適的連接子和/或恆定區被轉殖，而且該等序列係與一個啟動子(promoter)呈可操作連接(operable linkage)而被置放在一個用於表現之合適的細胞株內的一個合適的表現建構物(expression construct)中。
於是，本發明亦提供一種用於一個抗體之製備的方法，該方法包括： 提供一種包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為本發明的一個多價抗體；以及 在用以提供該等多肽胜之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞。一個 多價抗體 的表現
抗體在重組型宿主細胞(recombinant host cells)中的表現已經被描述於本技術領域中。編碼本發明的一個抗體之輕鏈和重鏈的核酸分子可以有如染色體外複本(extrachromosomal copies)而存在，和/或被安定地整合至宿主細胞的染色體之內。後者被偏好，在那樣的情況下，一個被知曉為缺乏基因緘默化的基因座可以被標靶。
為了得到編碼會組裝為本發明的一個抗體之多胜肽的核酸分子之表現，被那些熟習本領域之技藝者所詳知的是：能夠驅動這樣的表現之序列可以被功能性地連接至編碼該等多胜肽的核酸序列。被功能性地連接意在描述：編碼該等多胜肽或它們的前驅物(precursors)之核酸序列被連接至能夠驅動表現的序列，而使得這些序列可以驅動該等多胜肽或它們的前驅物之表現。有用的表現載體在本技術領域中是可以得到的，例如Invitrogen的pcDNA載體系列(pcDNA vector series)。在編碼感興趣的多胜肽之序列參考操縱(governing)被編碼的多胜肽之轉錄(transcription)和轉譯的序列而被適當地插入之情況下，所形成的表現匣(expression cassette)可以用來生成感興趣的多胜肽，這被稱之為表現。驅動表現的序列可以包含啟動子、增強子(enhancers)諸如此類以及此等之組合。這些應該能夠在宿主細胞中產生作用，而因此驅動被功能性地連接至它們的核酸序列之表現。該啟動子可為組成型(constitutive)或調控型(regulated)，而且可以得自於各種不同的來源，包括病毒、原核生物的(prokaryotic)或真核生物的(eukaryotic)來源，或者是人工設計的(artificially designed)。
本發明的核酸序列之表現可以來自於天然啟動子(natural promoter)或它的一個衍生物(derivative)，或來自於一個完全異源的啟動子(entirely heterologous promoter)。一些眾所周知而且常被使用於真核生物的細胞中之表現的啟動子包括衍生自病毒的啟動子，諸如腺病毒(adenovirus)(例如E1A啟動子)、衍生自巨細胞病毒(cytomegalovirus，CMV)的啟動子[諸如CMV立即早期(immediate early，IE)]啟動子、衍生自猴病毒40 (Simian Virus 40，SV40)的啟動子，諸如此類。合適的啟動子也可以衍生自真核生物的細胞，諸如金屬硫蛋白(metallothionein，MT)啟動子、延長因子1α (elongation factor 1a，EF-1a)啟動子、肌動蛋白(actin)啟動子、一個免疫球蛋白啟動子、熱休克啟動子(heat shock promoter)，諸如此類。能夠驅動本發明的一個核酸序列在一個宿主細胞中的表現之任何一種啟動子或增強子/啟動子在本發明中是合適的。在一個具體例中，能夠驅動表現的該序列包含有來自於一個CMV啟動子的一個區域，較佳為包含有CMV立即早期基因增強子/啟動子的核苷酸-735至+95之區域。熟習本領域技藝的人士將會理解：被使用於本發明中的表現序列可被合適地組合以可以安定化或增強表現的要素，諸如絕緣子(insulators)、基質結合區(matrix attachment regions)、STAR要素(STAR elements)，諸如此類。這可以增進表現的安定性和/或位準。
任何適合於表現一個重組型核酸序列的細胞可被用來產生本發明的一個抗體。較佳地，該細胞被調適用於懸浮生長(suspension growth)。
本發明的一個多價抗體可以在宿主細胞中被表現，典型地係藉由培養本發明的一個合適的細胞，以及從該培養物(culture)來收穫(harvesting)該抗體。較佳地，該細胞被培養在一個不含血清的培養基(serum free medium)中。本發明的一個多價抗體可以藉由通常為熟習本領域技藝之人士所知曉的方法而從該細胞或者從細胞培養基來予以回收(recovered)。
進一步被提供的是一種可得自於一種用於生成一個根據本發明的抗體之方法的抗體。該抗體較佳地係純化(purified)自培養物的培養基。
在回收(recovery)後，一個抗體可藉由使用本技術領域中已知的方法而從培養物被純化出。這樣的方法可包含沉澱法(precipitation)、離心法(centrifugation)、過濾法(filtration)、粒徑篩析層析法(size-exclusion chromatography)、親和力層析法(affinity chromatography)、陽離子和/或陰離子交換層析法(cation- and/or anion-exchange chromatography)、疏水性交互作用層析法(hydrophobic interaction chromatography)，諸如此類。親和力層析法，包含根據該連接子序列來作為分離本發明的多價抗體之一手段，可以被使用。藥學 組成物 以及使用方法 ( methods of use )
亦為本發明所提供的是一種藥學組成物，其包含有本發明的一個抗體以及一藥學上可接受的載體和/或稀釋劑。
於是，本發明提供一種如此處所述的多特異性抗體來供應用於人類或動物透過療法的治療。
進一步為本發明所提供的是一種用於一個罹患(suffering from)一種醫療病況(medical condition)的人類或動物之治療的方法，該方法包括對該人類或動物投藥一治療有效量的一種如此處所述的抗體。
要被投藥給一個病患之根據本發明的抗體之數量典型地係位在治療範圍(therapeutic window)中，這意指一足夠的數量被使用以供獲得一治療成效(therapeutic effect)，而該數量不超過一個導致一不可接受程度的副作用(unacceptable extent of side-effects)之閥值(threshold value)。為了獲得一所欲的治療成效而需要的抗體之數量越低，該治療範圍典型地將會越大。在低劑量(low dosage)下發揮(exerting)充分治療成效的一個根據本發明的抗體因此被偏好。
在此對一個被提供作為先前技術的專利文獻或其他物件之引述不應被視為承認該文獻或物件是已知的或者它含有的資料在本案申請專利範圍之任何一項的優先權日(priority date)之時係為通常一般知識(common general knowledge)的部分。
此處所提到的每一份參考文獻之揭露內容在此以其整體被併入本案以作為參考。
為了明確性以及一個簡潔的發明說明之目的，特徵在此被描述以作為相同的或獨立的具體例之部分，然而，將會被理解的是：本發明的範圍可以包含具有全部的或者一些的所述特徵之組合的具體例。
下面的示範例例示說明本發明。為便於參考，針對示範例8至15，當描述三特異性分子之時，下面的型式被使用：MFAxMFB:MFC或者抗原Ax抗原B:抗原C，而使得MFA或抗原A接續以x構成該“短臂”，同時該x表示二聚體化，接續以MFB或抗原B描述該長臂的內部位置，接續以一個“:”指明一個連接子接續以MFC或抗原C描述位在該長臂的遠端領域之處的MFC或抗原C。示範例 示範例 1 ：用於產生一個能夠表現一個多特異性抗體之載體的可變領域和連接子之轉殖
24個連接子建構物根據它們如表2中所詳述的尺寸在庫中(in pools)被轉殖(cloned)至MV1626載體(參見圖3)之內，該MV1626載體在該CH3區內含有該等KK殘基(L351K、T366K)以供IgG重鏈異二聚體的產生(WO 2013/157954和WO 2013/157953)。該等建構物係使用限制酶(restriction enzyme)SfiI 和XhoI 而被轉殖至載體MV1626之內。所有的建構物依序地含有MF1337的VH基因、一個CH1領域、該連接子序列(它的轉譯被列示於表2中)以及MF1122的VH基因。作為一個是範例，建構物MF1337xIgG4 UHxMF1122的DNA序列被提供於下面的表3中。該建構物被示意地描繪於圖2a中。該等建構物係根據被表明在該等建構物的名稱中的IgG同型之CH1和連接子序列這兩者。全部24個CH1區組合以該等連接子序列之一轉譯被提供於圖5中。全部3個VH基因和共同輕鏈基因之一轉譯被提供於表4中。 表2：如所使用的24個不相同的連接子/建構物之序列以及命名；注意，在CH1中也存在有差異(圖5)。連接子序列被表明如下。個別的CH1序列連同連接子被表明於圖5中。“連接子名稱”意指被表明的連接子序列連同該CH1領域。
Figure 108111354-A0304-0002
 表3：建構物MF1337xIgG4 UHxMF1122的DNA序列
Figure AA1
 表4：全部3個VH基因和共同輕鏈基因的轉譯
Figure AA2
該等插入物和該載體係在50℃下使用SfiI 限制酶予以消化(digested)歷時2小時，繼而在37℃下使用XhoI 酶歷時2小時。經消化的DNA被裝填(loaded)至一個0.8%瓊脂糖凝膠(agarose gel)上，並且在100伏特(volts)下予以運行(run)歷時2小時。經消化的載體和插入物隨後使用Qiagen QlAquick凝膠萃取套組(Qiagen QlAquick Gel Extraction kit)而從該凝膠被分離出，然後呈1/5比例(w/w，載體/插入物)在16℃下使用T4 DNA連接酶(T4 DNA ligase)進行連接(ligation)過夜。50 μL的DH5α-T1R勝任大腸桿菌(competentE. coli )在5 μL的連接混合物(ligation mix)之存在下被轉形，繼而為一個熱休克程序(heat shock procedure)(在冰上30分鐘，然後在42℃下2分鐘，然後在冰上2分鐘)。被轉形的細菌被平板接種(plated)在補充有安比西林(Ampicillin)的LB瓊脂培養基(LB agar)上，並於37℃下予以培育(incubated)過夜。單一菌落(single colonies)被挑取(picked)並被混合以100 μL的無菌去離子水(sterile deionised water)而且被使用於使用引子DO_2130和DO_1056的菌落PCR (colony PCR)以確認該插入物的存在，繼而使用引子DO_2130以BigDye® Terminator V1.1 Cycle Sequencing Kit (Thermofisher)來做序列PCR (sequence PCR)以供選殖株確認(clone confirmation)。
經確認的選殖株之單一菌落被用來接種(inoculate) 4 mL的LB-Amp。在37℃下的過夜培養物(overnight cultures)係根據製造商手冊(manufacturer manual)使用QIAGEN Plasmid Mini Kit而在24 wells format mini-prep中被製得。在從管柱(column)洗提(elution)之後，被純化的DNA藉由加入0.7倍容積(volumes)的室溫異丙醇(room-temperature isopropanol)而被沉澱出。DNA沉澱丸(DNA pellet)以1 mL的70%乙醇(ethanol)予以清洗並在無菌狀況(sterile conditions)下予以風乾(air dried)以及在儲存於-20℃下之前將之再散浮(resuspended)於無菌的Tris-EDTA緩衝液(Tris-EDTA buffer)中。最終的建構物係使用BigDye® Terminator V1.1 Cycle Sequencing Kit來予以雙脫氧定序(dideoxy sequenced)，對於插入物使用引子DO_1488、DO_1056和DO_2130，還有對於CH2/CH3區使用引子DO_0182和DO_0091。
所有的引子序列被闡述於表5中。
定序(sequencing)顯示所有的建構物已被成功地製備。 表5：引子序列
Figure 108111354-A0304-0005
 示範例 2 ：轉染以及 IgG 純化(purification)
在示範例1中被產生的表現載體被組合以表現多特異性抗體的主體抗體部分之第二重鏈之載體MG1025C377 (圖4)，其在該CH3區帶有L351D-L368E突變(WO 2013/157954和WO 2013/157953)以及抗體 MF1025的甲狀腺球蛋白Fab基因(參見WO 2013/157953的示範例2)。兩個重鏈連同一個共同輕鏈的表現導致如圖2b中所示的三特異性抗體之生成。
FreeStyle 293-F細胞(Thermofisher)被使用於在一種24孔培養盤形式(24 wells plate format)中表現所設計的抗體。在轉染之前兩天，FreeStyle 293-F細胞原液(stock)以一為1:1的比例被分離(split)於293-F培養基中，並且在一為155 rpm的迴轉式振盪速度(orbital shaking speed)之下、於37℃和8% CO2 之下被培育過夜。細胞在轉染之前一天被稀釋至一為5x105 個細胞/mL的密度。4 mL的懸浮細胞(suspension cells)被播種(seeded)至一個24深孔培養盤(24 deep wells plate)之內，以一個透氣封件(breathable seal)予以覆蓋(covered)並在一為285 rpm的迴轉式振盪速度之下、於37℃和8% CO2 之下予以培育過夜。在轉染當天，4.8 mL的293-F培養基被混合以240 μg的線性聚乙烯亞胺[polyethylenimine (PEI) linear](MW 25,000)。對於每一種要被生成的IgG，200 μL的293F培養基-PEI混合物被加入8 µL的如表6中所詳述的DNA (對於異二聚體，4 µL的編碼各個重鏈之DNA)。在被溫和地加入至該等細胞之前，該混合物在室溫下被培育歷時20分鐘。在轉染之後一天，被稀釋於500 µL的293F培養基中的青黴素-鏈黴素(Penicillin- Streptomycin，Pen-Strep)被加入至每個孔內。該等培養盤在一為285 rpm的迴轉式振盪速度之下、於37℃和8% CO2 之下予以培育直到轉染之後7天要收穫(harvest)之時。培養盤在500 g之下予以離心5分鐘，含有IgGs的上澄液(supernatants)使用10-12 μm熔噴聚丙烯過濾板(melt blown polypropylene filter plates)予以過濾並在純化之前予以儲存在-20℃之下。
各種不同的對照組抗體亦被表現，亦即： 使用Fab MF1337的雙價抗-破傷風類毒素抗體(使用載體MG1337C057) 使用Fab MF1025的雙價抗-甲狀腺球蛋白抗體(使用載體MG1025C059) 使用Fab MF1122v的雙價抗-纖維蛋白原抗體(使用載體MG1122C057) MG1337C057表示一個建構物表現來自載體MV1057的MF1337之VH區。MG1025C059表示一個建構物表現來自載體MV1059的MF1025之VH區。MG1122C057表示一個建構物表現來自載體MV1057的MF1122之VH區。MV1057 (圖6)和MV1059是表現單特異性-雙價人類IgG1分子的載體。MV1057和MV1059基本上是相同的載體導致相同的IgG1分子之表現。
雙特異性抗-甲狀腺球蛋白x抗-破傷風類毒素抗體組合Fab MF1337和Fab MF1025 (使用MG1025C377 x MG1337C260) 雙特異性抗-甲狀腺球蛋白x抗-纖維蛋白原抗體組合Fab MF1122和Fab MF1025 (使用MG1025C377 x MG1122C260) MG1025C377 (圖4)表現抗體MF1025 [在一個人類IgG1重鏈之背景下含有L351D、L368E (DE)突變]之重鏈可變領域。MG1337C260 (圖7)表現抗體MF1337 [在一個人類IgG1重鏈之背景下含有L351K、T366K (KK)突變]之重鏈可變領域。MG1122C260表現抗體MF1122 [在一個人類IgG1重鏈之背景下含有L351K、T366K (KK)突變]之重鏈可變領域。表 6 ： 用於 IgG 生成的轉染方案 (transfection scheme)
Figure 108111354-A0304-0006
在收穫之後，抗體係如下述在24孔形式(24 well format)中來予以純化：上澄液被混合以50 µL的1 M Trizma (pH 8)以及100 µL的蛋白質A Sepharose CL-4B珠粒(protein A Sepharose CL-4B beads)(50% v/v, G.E Healthcare Life Sciences)並且在600 rpm的迴轉振盪下、於25℃之下予以培育歷時2小時。珠粒被真空過濾(vacuum filtered)並且以3 mL的PBS (pH 7.4)予以清洗2次。抗體的洗提(elution)係藉由加入200 µL的檸檬酸鹽緩衝液(citrate buffer)(0.1 M, pH 3)繼而為利用300 µL的1 M Trizma (pH 8)的中和反應(neutralization)來予以執行。被純化的IgG分餾物(fractions)被立即更換緩衝液為PBS (pH 7.4)。IgG樣品被轉移至一個30 kDa 96孔過濾板(96 well filter plate)[聚醚碸膜(polyethersulfone membrane)]之內，並且在1500 g、4℃之下予以離心直到每個孔被留下一為10 µL的容積。200 µL的PBS被加入至每個孔之內，樣品在500 rpm之下被混合3分鐘，然後IgGs被收集以供在4℃下的儲存。IgG濃度(concentration)係藉由Octet和蛋白質A生物感測劑(Protein A biosensors)(Pall ForteBio)來予以測定。7個從192 µg/mL開始以至3 µg/mL的2倍稀釋物(2 folds dilutions)的人類IgG被使用作為標準品(standard)。IgG樣品的濃度係以兩次重複(in duplicate)來予以測定。
對於全部30個被生成的IgGs (而因此包含了對照組)，還原的和非還原的SDS-PAGE (Reduced and Non-Reduced SDS-PAGE)被執行。結果被呈現於圖8中。在非還原條件(NR conditions)下，觀察到三特異性多價抗體之預期的產物大小(expected product sizes)係為~200 kDa，而對照組單株IgGs和Biclonics® 係為~150 kDa。就還原條件(R conditions)，觀察到三特異性多價抗體之產物大小係為~25 kDa (LC)、~50 kDa (HC/1VH)以及~75 kDa (HC/2VH)。具有~25 kDa (LC)以及~50 kDa (HC)的對照組單株IgGs帶大小(band sizes)係如所預期的。該等結果亦顯示該等三特異性建構物位在~150 kDa之帶。這些是從DE重鏈的相聯而形成的同質二聚體，這可能是含有DE之較短重鏈要比含有KK的較長重鏈有更高的表現位準之結果。示範例 3 ：在 ELISA 中被測量的 Fab 領域在 VH1 、 VH2 和 VH3 位置中的結合活性
在每個建構物中的3個Fab領域之結合活性係藉由使用破傷風類毒素、纖維蛋白原和甲狀腺球蛋白抗原以及作為一負對照組(negative control)的huEGFR-Fc抗原之ELISA來予以檢查[關於塗覆條件(coating conditions)、供應商(supplier)和產品目錄編號(catalogue numbers)，參見表7]。
每個多特異性IgG樣品首先以PBS予以稀釋至10 µg/mL，並且針對纖維蛋白原、破傷風類毒素和甲狀腺球蛋白以滴定法來予以分析(analysed in titration)；在4個從10至0.08 µg/mL的5倍稀釋物中。全部30個樣品在10 µg/mL之下針對huEGFR-Fc來予以分析。配於PBS之內的適當數量之抗原被製備。在4℃下，每個ELISA盤孔(ELISA plate well)被加入50 µL之經稀釋的抗原溶液並且被塗覆過夜(coated o/n)。該等盤以清洗緩衝液(wash buffer)(PBS/Tween)予以清洗兩次。在室溫下以300 µL/孔的封阻緩衝液(block buffer)(PBS/2% BSA)來封阻該等孔歷時1小時。在培育期間當中，適當的IgG稀釋物在封阻緩衝液中被製造出。該等盤藉由在水槽上方倒置(inverting above sink)然後於棉紙上拍打(slapping on tissue)而被清空(emptied)。50 µL之IgG樣品以及對照組被加入至經封阻的盤之孔內，以封件予以覆蓋並且在室溫下予以培育60分鐘。該等盤以清洗緩衝液(PBS/0.05% Tween)予以清洗3次。每個孔被加入50 µL的以封阻緩衝液配成1/2000之經稀釋的偵測抗體(detection antibody)[HRP-綴合的(HRP-conjugated)小鼠抗-人類IgG；Becton Dickinson, cat. no. 555788)。該盤以封件予以覆蓋並且在室溫下予以培育60分鐘。該盤以清洗緩衝液予以清洗3次。TMB基質溶液(TMB substrate solution)(BD, OptEIA™ cat. no. 51-2606KC)係藉由以1:1的比例將試劑A和B混合而被製成，以及對每個孔加入50 µL並且顯色(developed)歷時(最高)10分鐘。50 µL的1 M H2 SO4 被加入至每個孔俾以終止染色反應(staining reaction)。
該等盤係在A450之下使用一個BioTek Elx808 ELISA盤讀取儀(BioTek Elx808 ELISA plate reader)來予以讀取。結合曲線(binding curves)係使用GraphPad Prism 7來予以繪圖(plotted)，且針對每個建構物之每個抗原ELISA所計算(calculated)的曲線下面積(Area Under Curve，AUC)係列示於表8中。就對於甲狀腺球蛋白(VH1，位在該DE-臂，參見圖1)以及破傷風類毒素[VH3，位在該KK-臂的頂端(tip)，參見圖1]的結合，一個在AUC上係為12%以及8%的小變化被看到。對於纖維蛋白原-臂(這是VH2，圖1)，一個較大的變化被看到。這表示：位在VH2位置中的Fab領域之可及性(accessibility)或親和力端視將位在VH2位置中的Fab領域連接至位在VH3位置中的Fab領域之連接子而定。所有的連接子提供有功能的VH2s。表 7. 被使用於 ELISA 的抗原之名單
Figure 108111354-A0304-0007
 表 8 ：從表 6 中所列示的 24 個三特異性多價抗體之 ELISA 結合分析 (binding assays) 而得到的曲線下面積數值。該等抗體在 ELISA 中被滴定以供結合至 3 種不相同的抗原。所形成的 AUC 數值係根據對於纖維蛋白原的結合活性 ( 由位在 VH2 位置中的 Fab 所產生 ) 來予以分選 (sorted) 。這確認：位在 VH2 位置中的 Fab 存在有一個範圍的結合活性。對位在 VH2 位置中的 Fab 具有最高活性的 15 個建構物被優先處理 (prioritized) 來供進一步的實驗 (experimentation) ，具有最低活性的 6 個建構物以斜體字來表示。 ND 表示未做。
Figure 108111354-A0304-0008
 示範例 4 ： 結合活性 的安定性
位在該等三價抗體建構物中的3個Fab領域之結合活性的安定性係跟隨在4種加速壓力狀況(accelerated stress conditions)之後來予以分析。該等樣品以PBS予以稀釋至10 µg/mL並且被培育在4℃下歷時1個月。該等樣品以D10F培養基予以稀釋至10 µg/mL並且被培育在40℃下歷時7天。該等樣品也以D10F培養基予以稀釋至10 µg/mL並且被培育在50℃下歷時2天。該等樣品也用PBS予以稀釋並進行5次凍融循環(freeze-thaw cycles)(5XFT)。
在這些加速壓力狀況之後，對於被該3個Fab領域所辨識的抗原之結合活性係如前面所述的在ELISA中來予以分析。曲線下面積被計算並且列表(tabulated)。
在所測試的不相同建構物中，在40℃下被施加的壓力僅顯著地影響位在VH2位置中的Fab之結合，對纖維蛋白原的結合至不相同的程度。在所測試的不相同建構物中，在4℃下、在50℃下以及5xFT的壓力影響全部3個Fab領域至不相同的程度。
該等結合活性係針對各個抗原以及壓力狀況而被排序(ranked)，並且針對各個Fab位置來鑑定出在各個壓力狀況之下的16個最佳建構物。根據該3個Fab在加速壓力狀況之下的結合活性之守恆(conservation)，一個建構物係居於該16個最佳建構物之中的次數被加起來(added up)並且被用來排序所有的建構物。
該等結果被闡述於圖9中，這表示：在加速壓力狀況之下，該等不相同建構物存在有一個範圍的安定性。位在21個被生成的三價抗體建構物中的該3個Fab領域之結合活性的安定性係跟隨在4種加速壓力狀況之後被分析。ELISA數據(AUC)被列表。該等結合活性被排序，並且針對各個Fab位置來鑑定出在各個壓力狀況之下的16個最佳建構物。根據該3個Fab在加速壓力狀況之下的結合活性之守恆，一個建構物係居於該16個最佳建構物之中的次數被加起來並且被用來排序所有的建構物。
所有的抗體是安定的而且有些要比其他者更為安定。示範例5 ：大規模轉染以及IgG 純化
18個如下的建構物被選擇用於一個大規模生產以供進一步的分析：IgG1 MH、IgG1 H、IgG1 R、IgG1 G4S、IgG1 UH、IgG3 R、IgG3 UH、**IgG2A R、IgG2A MH、IgG3 ULH、IgG2B R、IgG4 MH、IgG4 UL、IgG2A H、IgG2B H、*IgG1 UL、*IgG4 H、*IgG4 R。作為一個對照組，下面的產品被包含：雙特異性抗-甲狀腺球蛋白x抗-破傷風類毒素(使用被描述於示範例2中的MG1025C377xMG1337C260)以及雙特異性抗-甲狀腺球蛋白x抗-纖維蛋白原(使用之前所描述的MG1025C377xMG1122C260)。
這些建構物的DNA係如之前所描述的來予以製備。多特異性IgGs係如之前所描述的藉由被列示於表6中的建構物之共轉染而被轉染。那些被選擇的建構物係在更大的規模下被生成。在轉染之前兩天，FreeStyle HEK293-F細胞原液以一為1:1的比例被分離於293-F培養基中，每個500 mL培養瓶(culture flask)中含有100 mL最終體積，並且在一為155 rpm的迴轉式振盪速度之下被培育於37℃和8% CO2 之下。在轉染之前一天，細胞被計數，而一具有一為5.0x105 個細胞/mL的密度之細胞懸浮液(cell suspension)係藉由以293-F培養基來稀釋細胞而被製備出。細胞接而在每個T500燒瓶(T500 flask)含有100 mL細胞懸浮液之下被播種並且在一為155 rpm的迴轉式振盪速度之下被培育於37℃和8% CO2 之下。隔天該等細胞被轉染。一個含有293-F培養基、PEI和DNA的混合物被製備，藉由混合7.5 mL的293-F培養基、187.5 µL的PEI原液(處在1 µg/µL之下)以及150 µL的DNA (處在0.5 µg/µL之下)。這個混合物在室溫下被培育歷時20分鐘並接而被加入至細胞，然後細胞在一為155 rpm的迴轉式振盪速度之下被培育於37℃和8% CO2 之下歷時7天。
含有抗體蛋白質的上澄液在1000 g之下予以離心歷時10分鐘俾以移除細胞。使用一個0.45 µm過濾器(filter)來過濾該上澄液。使用一個ÄKTAexplorer 100 system (GE Health Care)以及蛋白質A親和力層析法繼之以脫鹽(desalting)而從該上澄液純化出IgG。一個HiTrap MabSelect SuRe 5 mL管柱以及HiTrap 5 mL脫鹽管柱(Desalting column)(GE Health Care)係根據製造商的指示說明來予以使用。IgG濃度係藉由OD280 吸收光譜(OD280 absorption)來予以測定。對於所有的建構物，這生成了0.8-4.9 mg IgG配於PBS之內。如之前在示範例2中所述的，所產生的蛋白質在(還原的或非還原的) SDS-PAGE上予以分析。該等數據確認了如在示範例2中所發現到的數據而在此未予以提供。
HP-SEC被執行俾以建立介於構成該等多特異性抗體之主體抗體部分的兩個重鏈之間的表現比值。由於位在該等三價建構物中的兩個重鏈之尺寸差異，半體(halfbodies)和同質二聚體可以在高效能粒徑篩析層析法(High Performance Size Exclusion Chromatography，HP-SEC)中被鑑定出並且定量。HP-SEC係使用一個裝配有一個TSK保護管柱(TSK guard column) SWXL (Tosoh Bioscience cat# 08543)以及一個TSK-凝膠管柱(TSK-gel column) G3000SWXL (Tosoh Bioscience cat# 08541)的Dionex HPLC系統來予以執行。對於每個分析，配於PBS中的20 µg蛋白質樣品被注射至在4℃下於一為1 mL/min的流動速度(flow speed)下使用200 mM磷酸鈉(sodium phosphate)、50 mM NaCl作為運行緩衝液(running buffer)予以運行的管柱。層析圖(chromatograms)係使用Chromeleon 6.80軟體(Chromeleon 6.80 software)根據UV280結果而就滯留時間(retention times)和相對波峰面積(relative peak areas)來予以分析。介於三價IgG/DEDE同質二聚體的數量之間的比值被計算並且被呈現於下面的表9中。具有一個高於平均值的三價/DEDE比值之建構物係呈斜體字被展現。表 9 ： HP-SEC 被執行俾以建立介於構成該等多特異性抗體之主體抗體部分的兩個重鏈之間的表現比值。介於三價 IgG/DEDE 同質二聚體的數量之間的比值被計算並且被列表。
Figure 108111354-A0304-0009
被大規模純化的IgG (包含兩個對照組)之安定性係如前面所述的在不相同的壓力狀況之後被評估：在PBS中進行5次凍融循環之後，在D10F培養基中於40℃下培育一週之後，在D10F培養基中於50℃下培育一週之後，以及在PBS中於50℃下培育一週之後。受壓力的樣品(stressed samples)之效能被拿來跟在4℃下培育一週之後的相同樣品(對照組)之效能做比較。為了那個目的，來自該等100 mL產品之純化的IgG在PBS中被稀釋至0.2 mg/mL並且被分成兩批(batches)：一批用於在PBS中、於0.2 mg/mL之下的安定性試驗(4℃、3xFT以及50℃)，一批在D10F中被稀釋至0.1 mg/mL以供如前面所述的在4℃、40℃和50℃之下的壓力試驗。關於樣品IgG1 H，一為0.194 mg/mL的濃度被使用。
在這些加速壓力狀況之後，對於被該3個Fab片段所辨識的抗原之結合活性係如前面所述的在ELISA中來予以分析。曲線下面積被計算並且列表(參見圖10)。對於每個結合活性，相較於被儲存在4℃下的對照組樣品之活性的壓力後剩餘結合活性百分比(percentage remaining binding activity after stress)被計算。該等樣品係根據這些有關於在各個壓力狀況下對於每個標的物之結合活性的百分比來予以排序。高於平均值的該等百分比被表明而且每個樣品表現出高於平均值的次數被加起來並且被呈現於圖10中的表格之最後一欄中。這顯示：如藉由該3個Fab臂在壓力後的結合活性來予以測量的，該等建構物的安定性存在有一個範圍。示範例6 ： 18 個多價 IgG 建構物的安定性分析
在圖10中所鑑定出的18個多價IgG建構物上執行如先前在示範例5中所述的安定性分析。此外，4個對照組抗體被使用，它們具有重鏈結合領域包含有先前被描述於WO 2018/056821 A1 (在此被併入本案以作為參考)中的MF6744 (序列辨識編號:91)、MF1337 (序列辨識編號:28和序列辨識編號:288)，以及MF1122 (序列辨識編號:26和序列辨識編號:286)，被偶合至一個cLC，亦即： 使用Fab MF6744/cLC的單特異性抗-CD137抗體； 使用Fab MF1122/cLC的單特異性抗-纖維蛋白原抗體； 使用Fab MF1337/cLC的單特異性抗-破傷風類毒素抗體；以及 含有Fab MF1122/cLC和Fab MF1337/cLC的雙特異性抗-纖維蛋白原x抗-破傷風類毒素抗體作為一個DEKK雙特異性對照組。
就安定性分析而被測試的樣品之名單被提供於下面的表10之中。表 10. 就安定性分析而被測試的樣品之名單： 18 個多價抗體以及 4 個對照組抗體
Figure 108111354-A0304-0010
18個多價抗體以及4個對照組抗體之安定性係跟隨在4種不相同的狀況之後被分析。於是，該等22個樣品(18個三價+4個對照組)在PBS中被稀釋至0.2 mg/mL並且被施予下列處理： 在4℃之下歷時1個月(T0)，這被視為參考； 在50℃之下歷時7天； 在80℃之下5次的凍融(FT)循環；或 在室溫下進行4小時的400 rpm振盪(shaking)。
在這4種狀況的每一者之後，安定性係使用7種不相同的方法來予以分析，亦即：紫外- 可見吸收光譜法 (UV-Vis absorption spectroscopy) ： 如在Eckhardt, 1994: Mulinacci, 2011b and Peters, 2013中所解說的，在減去(subtraction)背景緩衝液吸收(background buffer absorption)以及由於聚集體(aggregates)的光散射(light-scatter)之後，吸光度(absorbance)係在350 nm之下被測試，俾以提供該等樣品的聚集狀態(aggregation state)之資料；90° 光散射譜法 (90° light-scattering spectroscopy) ： 在溶液中，光的散射強度(scatter intensity)可被不相同的因素所影響，諸如蛋白質濃度、折射率(refractive index)、粒子尺寸和形狀(particle size and shape)以及入射光(incident light)的波長(wavelength)。如Cappelle, 2005; Demeule, 2007a and b; Mulinacci, 2011a and 2013; Luca, 2010; Patois, 2011 and 2012; Peters 2013之中所報導的，這個方法被使用俾以研究蛋白質聚集(protein aggregation)；色胺酸內在螢光發射 (Tryptophan intrinsic fluorescence emission) ，被表示為相較於 T0 的變化 % (% change) ： 對環境的疏水性和剛性之變化可經由色胺酸的螢光發射來予以測量(Capelle, 2005; Demeule, 2007a and b and 2009; Mulinacci, 2011a and b; Luca, 2010; Patois, 2011; Peters, 2013)；1,8-ANS 螢光發射，被表示為相較於 T0 的變化 % ： 作為一個未荷電小型疏水性螢光探針(uncharged small hydrophobic fluorescent probe)，1-苯胺基萘-8-磺酸(1-anilinonaphthalene- 8-sulfonic acid，1,8-ANS)當被結合至蛋白質、蛋白質聚集體、清潔劑微胞(detergent micelles)、可浸出物(leachables)、胞膜(membranes)和細胞組份中的靜電囊袋(electrostatic pockets)之時在水中變成螢光性，而因此可以被用來研究胞膜表面和蛋白質(Demeule, 2009; Mulinacci, 2011a and b; Luca 2010)；尼羅紅 (Nile Red) 螢光發射，被表示為相較於 T0 的變化 % ： 作為一個未荷電小型疏水性螢光探針，尼羅紅被環境的極性(polarity)所影響而可以被用來分析蛋白質降解(protein degradation)、蛋白質聚集、脂質結構(lipid structures)、蛋白質去摺疊(protein unfolding)(Sackett and Wolff, 1987)；尼羅紅螢光顯微鏡法 (fluorescence microscopy) ，其中粒子數目 /1 μL 被測量： 尼羅紅被用來染色(stain)樣品俾以視覺化(visualize)蛋白質聚集體來供使用一個萊卡DMi8顯微鏡(Leica DMi8 microscope)的螢光顯微鏡法(Demeule, 2007a and b, and 2009; Mulinacci, 2011b and 2013; Patois 2011)；動態光散射 (Dynamic light-scattering) ，被表示為相較於 T0 的單體( 強度計算) 變化 % [% monomer (intensity calculation) change] ： 動態光散射係使用一個NanoFlex儀器(NanoFlex instrument)來予以測量。通經光纖(optical fiber)的雷射(laser)被散射並且從粒子被反射(reflected)朝向偵測器(detector)，該偵測器測量被散射的光強度(scattered light intensity)俾以決定粒子的尺寸分布曲線(size distribution profile)。
這些方法的讀出(readout)係有關於該等蛋白質的聚集、片段化(fragmentation)以及去摺疊，這是該等蛋白質的安定性之一測量(measure)。結果顯示：在400 rpm下振盪4小時對於抗體的安定性具有最大衝擊。對照組單特異性PG1337/MF1337抗體是受到壓力狀況影響最大者。因此，由於所有的18個多價建構物以及該雙特異性對照組含有PG1337/MF1337 Fab，所有的結果係以被設定作為門檻(threshold)的PG1337來予以標準化(normalized)。
該等分子的安定性係藉由將所有7種方法在4種不相同狀況的期間之計分(scores)組合而予以計算出。該等結果可在圖12中被看到並且顯示：該等建構物具有一個範圍的安定性，這對於一系列的三特異性分子而言證明了比對照組雙特異性IgG要優越的安定性。示範例7 ：生物資訊連接子特徵鑑定(Bioinformatic Linker Characterization)
如下面表11中所闡述的以及圖13中所描繪的8個連接子被進一步地特徵鑑定(characterized)。使用卡帕斯與舒茲可撓曲性預測度方法[它對於序列中的每一個胺基酸來計算(computes)可撓曲性指數之平均值]而獲得有關這些序列之每一者的一個可撓曲性預測度。如Karplus PA, Schulz GE. Prediction of Chain Flexibility in Proteins - A tool for the Selection of Peptide Antigens. Naturwissenschaften 1985, 72:212-3 (http://tools.immuneepitope.org/bcell/)中所述的，該可撓曲性預測度係衍生自蛋白質結構中的每一個胺基酸之平均性質(average properties)。在表11中，我們將一個連接子標示為剛性(R)如果KS計分是1.015或更低，部分可撓曲的如果KS計分是從大約1.015至大約1.04。一個可撓曲序列，為了本發明之目的，是一個具有一高於1.04的卡帕斯與舒茲可撓曲性預測度之序列。表 11: 8 個連接子以及如根據卡帕斯與舒茲所測定的可撓曲性
Figure 108111354-A0304-0011
使用羅瑟塔局部結構預測(Rosetta local structure prediction)來獲得這些分子之一第二種生物資訊預測(bioinformatic prediction)。如Gront D, Kulp DW, Vernon RM, Strauss CEM, Baker D (2011) Generalized Fragment Picking in Rosetta: Design, Protocols and Applications. PLoS ONE 6(8): e23294. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0023294中所述的，在此羅瑟塔片段撿出器(Rosetta fragment picker)被使用以提供局部結構預測。為了該預測工具的這個使用，一為40個殘基之最低數目被偏好，而因此甘胺酸殘基(glycine residues)在該等連接子的末端處被引入以使該等序列各有40個殘基之長，以該連接子序列位在中間。這些連接子係就二級結構(secondary structure)來予以特徵鑑定，將該等序列運行通經羅瑟塔片段管線(Rosetta fragment pipeline)[該管線在蛋白質資料庫(Protein Data Bank)中找到在結構上接近的局部序列匹配]並且使用這些接近的序列-序列匹配來預測局部結構。對於上述8個序列的每一者，居中的片段(centered fragment)接而被視覺化。圖13。
該等結果之彙總被闡述於下面的表12中：F = 可撓曲的；M = 中等的(medium)；R = 剛性；C = 螺旋(coil) = 可撓曲的；H = 螺旋(helix) = 剛性；以及E = 股線(strand) = 中等的，這證明了與根據預測的二級結構之卡帕斯與舒茲計分(Karplus and Schultz score)是一致的。表 12 ：可撓曲性結果的彙總
Figure 108111354-A0304-0012
 示範例8 ：抗-CD3 、PD-L1 以及EGFR 結合領域的產生 被使用於免疫的小鼠( Mice used for immunization )
如下面所見的，為了結合至CD3、EGFR和PD-L1的人類抗體之產生，就該人類共同輕鏈和一個人類重鏈(HC)微小基因座(minilocus)(包含有一群挑選的人類V基因節段、所有的人類Ds和所有的人類Js)而為基因轉殖的小鼠(參見WO 2009/157771，在此被併入本案以作為參考)可以用編碼該等蛋白質的DNA或重組型DNA來予以免疫。這些小鼠被稱為“MeMo® ”小鼠。有關於特異性重鏈可變區，或者具有此處所揭示的序列之三價多聚體，它們可藉由具有本領域中的通常技藝之人士所知道的方式來予以生成。蛋白質 免疫 (Protein immunizations)
“MeMo® ”小鼠係藉由皮下注射(subcutaneous injections)而用重組型蛋白質和Gerbu佐劑MM (Gerbu adjuvant MM)(Gerbu Biotechnik c#3001)來予以免疫。重組型huPDL1-His (SinoBiological; cat.no. 10084-H08H)蛋白質被使用於免疫。小鼠係用在一為100 μL的總容積內混合以40 µL佐劑之配於PBS內的40 μg重組型蛋白質來予以免疫。隨後，在第14和28天當日，小鼠係用在一為50 μL的總容積內加有20 µL佐劑之配於PBS內的20 μg重組型蛋白質來予以補強。小鼠血清在第35天之時被收集以測定血清力價(serum titers)。具有低血清力價的小鼠接受額外週期(additional cycles)的補強注射免疫(booster immunizations)和血清分析(serum analyses)。每一個週期係由兩次的每週使用配於50 µL PBS中的20 µg重組型蛋白質之免疫繼而在一週之後收集血清以供力價分析(titer analysis)所構成。對人類和獼猴(macaque)標的物顯示出高血清力價的小鼠接受一個由連續3天使用配於50 µL PBS中的20 µg重組型蛋白質之每天注射所構成之最後補強免疫。在最後注射之後一天，小鼠淋巴組織(lymphoid tissue)被收集。DNA 免疫 (DNA immunizations)
“MeMo® ”小鼠係藉由DNA刺青術(DNA tattooing)使用一個微色素沉著裝置(micropigmentation device)來予以免疫。DNA刺青免疫(DNA tattoo immunizations)係用20 μg的編碼標的抗原之質體DNA (plasmid DNA)來予以執行。小鼠係用編碼人類標的物PD-L1的DNA來予以免疫。關於PD-L1免疫，Treg細胞係藉由對小鼠注射以0.5 mg的抗-CD25抗體PC61.5來打破耐受性(tolerance)而在免疫的開始之前4天被耗盡(depleted)。小鼠在第0、3、6、14、17、28和31天之被免疫。小鼠血清在第35天之時被收集以測定血清力價。對人類和/或獼猴標的物具有低血清反應性(serum reactivity)的小鼠接受額外週期的使用人類、大鼠(rat)或獼猴DNA抗原之補強注射免疫以及血清分析。每一個週期係由兩次的每週DNA免疫繼而在一週之後收集血清以供力價分析所構成。對表現人類和獼猴標的物之細胞顯示出血清反應性的小鼠接受一個最後補強免疫，繼而在3天後收集淋巴組織。淋巴組織的回收 (Recovery of lymphoid tissue)
從被成功免疫的所有小鼠體內取出脾臟和引流淋巴結(draining lymph nodes)。從脾臟和腹股溝淋巴結(inguinal lymph nodes)產生單細胞懸浮液(single cell suspensions)，而隨後這些組織被溶解(lysed)於Trizol LS試劑(Trizol LS reagent)中並予以儲存在-80℃之下直到使用之時。藉由RT-PCR轉殖(RT-PCR cloning)來自被成功免疫的小鼠之VH基因來產生“免疫”噬菌體抗體庫(‘immune’ phage antibody repertoires)，腹股溝淋巴結被使用以供“免疫”噬菌體抗體庫之建構。為此，從被Trizol LS溶解的淋巴組織萃取出RNA，而1 µg的總RNA (total RNA)被使用於一個使用一種IgG-CH1特異性引子(IgG-CH1 specific primer)的RT反應(RT reaction)中。基本上如Markset al .,J Mol Biol ., 1991 Dec 5;222(3):581-97所述的，所形成的cDNA接而被使用，俾以使用內部開發的VH-特異性引子(in-house developed VH-specific primers)來擴增(amplify) VH-編碼cDNA的多株庫(polyclonal pool)。如de Haardet al .,J Biol Chem. , 1999 Jun 25; 274(26):18218-30所述的，為供Fab片段在噬菌體上的顯示，所形成的PCR產物(PCR product)接而被轉殖至一個噬菌粒載體(phagemid vector)中，但有例外是：該輕鏈對於每個抗體而言是相同的並且為該載體所編碼。在連接之後，該等噬菌粒被用來轉形大腸桿菌TG1菌體(E. coli TG1 bacteria)，而被轉形的細菌被平板接種在含有安比西林和葡萄糖的LB-瓊脂105平板上。所有的噬菌體庫(phage libraries)含有>106 個轉形體(transformants)並且具有一個>80%的插入物頻率(insert frequency)。根據已建立的操作程序(established protocols)，細菌在過夜生長之後被收穫並且被用來製備噬菌體(de Haardet al .,J Biol Chem ., 1999 Jun 25;274(26):18218-30)。標靶 抗體 (Targeting antibodies)
使用先前所描述的方法而從產生自被成功地標的物-免疫的(target-immunised) MeMo® 小鼠之噬菌體抗體庫來獲得EGFR-和PD-L1 cLC抗體。再者，用來產生用於EGFR抗體(包含人類抗-EGFR抗體)之抗體可變領域VH鏈的方法已經被描述於在此被併入本案以作為參考之審查中申請案(pending applications)：WO 2015/130173 A1；WO 2015/130172 A1。用 CDR3 來免疫 Memo® 小鼠
為了結合至CD3的人類抗體之產生，就該人類共同輕鏈和一個人類重鏈(HC)微小基因座(minilocus)(包含有一群挑選的人類V基因節段、所有的人類Ds和所有的人類Js)而為基因轉殖的小鼠(參見WO 2009/157771，在此被併入本案以作為參考)係使用含有TCR/CD3的脂質球(TCR/CD3 containing lipoparticles)(Intergral Molecular)來予以免疫。這些小鼠被稱為“MeMo® ”小鼠。有關於特異性重鏈可變區，或者具有此處所揭示的序列之三價多聚體，它們可藉由具有本領域中的通常技藝之人士所知道的方式來予以生成。
MeMo® 小鼠被免疫以含有Hek293T-衍生的人類5D5M TCR/CD3之脂質球，繼而為人類T細胞，以供一個抗-TCR/CDR3免疫反應之產生以及抗-TCR/CD3抗體群組產生(anti-TCR/CD3 antibody panel generation)。
脂質球直接從細胞表面集結(concentrate)構形上完整的胞膜蛋白質(conformationally intact membrane proteins)，允許這些複雜的蛋白質有如供抗體免疫和篩選之可溶性高濃度蛋白質來予以操作(manipulated)。
在本研究中被使用以供免疫的脂質球含有5D5M TCRαβ組合。胺基酸序列(序列辨識編號:289和序列辨識編號:290)。
該5D5M TCRαβ組合之Hek293T-衍生的TCR/CD3脂質球係藉由瞬時轉染至HEK293T細胞(Intergral Molecular)中而被合成、轉殖和使用以供產生含有這個TCR/CD3組合的脂質球。
5D5M TCRα (序列辨識編號:289) MWGVFLLYVSMKMGGTTGQNIDQPTEMTATEGAIVQINCTYQTSGFNGLFWYQQHAGEAPTFLSYNVLDGLEEKGRFSSFLSRSKGYSYLLLKELQMKDSASYLCAVMDSNYQLIWGAGTKLIIKPDIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESSCDVKLVEKSFETDTNLNFQNLSVIGFRILLLKVAGFNLLMTLRLWSS
5D5M TCRβ (序列辨識編號:290) MRIRLLCCVAFSLLWAGPVIAGITQAPTSQILAAGRRMTLRCTQDMRHNAMYWYRQDLGLGLRLIHYSNTAGTTGKGEVPDGYSVSRANTDDFPLTLASAVPSQTSVYFCASSEAGGNTGELFFGEGSRLTVLEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFFPDHVELSWWVNGKEVHSGVSTDPQPLKEQPALNDSRYCLSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRADCGFTSVSYQQGVLSATILYEILLGKATLYAVLVSALVLMAMVKRKDF
MeMo® 小鼠被使用於使用TCR/CD3脂質球以及初代人類T細胞(primary human T cells)的免疫。
免疫排程表(immunization schedule)包含在第35、56、77和98天之時點(points)，於該等時點抗原-特異性Ig血清力價被偵測，其係藉由使用QTG-衍生的3SDX TCR/CD3陽性和陰性脂質球(positive and -negative lipoparticles)之ELISA(使用抗小鼠IgG偵測)以及藉由使用CD3c5E-Fc融合蛋白質(CD3c5E-Fc fusion protein)作為一正對照組之ELISA。在第35天被抽取出(drawn)的血清中被觀察到的反應性將會決定那些小鼠發展出一個相關的抗-TCR/CD3反應。
對於所有被免疫的小鼠，用於抗體探索(antibody discovery)的淋巴材料(lymphoid material)被收集和儲存，當有下列情況： 對於人類TCR/CD3的力價係為1/300 (在使用脂質球的ELISA中)；或 對於人類TCR/CD3的力價係為>1/300和>1/100而且在最後的補強注射免疫期間當中不會增高。使用 脂質球的初打免疫 (Priming immunisation)
為了促發(prime) MeMo® 小鼠對於TCR/CD3的體液性免疫反應(humoral immune response)，含有人類5D5M TCRαβ組合的脂質球被使用於免疫。脂質球和Gerbu佐劑一起被使用於第一次和第二次注射。使用多株T 細胞的補強注射免疫
小鼠係藉由細胞懸浮液的皮下注射來予以免疫。第一次的補強注射免疫品(第28天)包括一個由配於PBS中的細胞和佐劑所構成的混合物，而所有隨後的注射品是僅由配於PBS中的細胞所所構成。在第35天之時對人類TCR/CD3已發展出血清IgG力價係為1/300 (藉由使用脂質球的ELISA來予以測定)的小鼠在第42、43和44天當天接受使用細胞的額外注射。不符合這些標準的小鼠接受使用細胞的補強注射免疫(第42天和第49天)。所有隨後的免疫皆是當作配於PBS中的細胞之皮下注射被給予。在最後的免疫之後，小鼠被犧牲，為了血清而予以放血，而脾臟和左側腹股溝淋巴結被收集。在 ELISA 中篩選來自被免疫的小鼠之血清
藉由ELISA使用含有TCR/CD3的脂質球以及“空(null)”脂質球來篩選期中血清IgG力價(interim serum IgG titers)。藉由使用抗-小鼠IgG染色法來測定血清IgG力價，因為這個染色法被顯示是最為靈敏的(most sensitive)。
CD3結合可變領域係使用如序列辨識編號:92-154中所出示的一個CD3 MF的重鏈可變區之胺基酸序列或該重鏈可變區之CDR區而被製造出。來自噬菌粒載體的 VH- 編碼 cDNAs 至 IgG- 表現載體 的再轉殖 (re-cloning)
所有的標的物-特異性選殖株(target-specific clones)之VH-編碼cDNAs被定序。根據序列相同性和簇團分析(cluster analysis)之一群挑選的獨特選殖株接而被再轉殖至不相同的IgG表現載體，使用Sfi I-Bst EII或Sfi I/Xho I消化(digestion)以及根據標準化的分子生物學技術(standardised molecular biological techniques)來完成具有被消化的cDNAs之庫(pool)至IgG表現質體之中的連接。來自培養物上澄液的抗體之純化
含有抗體的培養基被收穫並且離心俾以移除細胞碎片(cell debris)。隨後蛋白質A Sepharose珠粒被加入至該培養基。該培養基和蛋白質A Sepharose珠粒連同抗體被培育俾以允許結合。
在培育之後，藉由一個真空過濾器(vacuum filter)，該等珠粒從該培養基被分離出並且清洗。該等抗體係藉由使用洗提緩衝液(elution buffer)的培育而從該等珠粒被洗提出(eluted)。
選擇性地，被純化的IgG之緩衝液被交換(exchanged)/脫鹽。緩衝液交換 (Buffer exchange)
為了要將被純化的IgG脫鹽，使用一個濾板(filter plate)或濾柱(filter column)來離心抗體分餾物。該濾板或濾柱被離心以減少該抗體分餾物的容積。隨後，PBS或所需要的緩衝液被加入至該分餾物，俾以用一低鹽緩衝液來替換該緩衝液。選擇性地，該離心步驟繼之以加入緩衝液被重複，以便進一步將該抗體的儲存緩衝液脫鹽。示範例 9 ：具有一腫瘤細胞抗原位在短或長臂上的三特異性抗體之產生
三特異性抗體係藉由兩個編碼具有不相同VH領域的IgG之質體的短暫共轉染(transient co-transfection)、使用用於三特異性抗體之有效的異二聚體化與形成之CH3工程化技術來予以產生。共同輕鏈也被共轉染於相同的細胞中，其係位在相同的質體或者另一個質體上。在我們的共審查中申請案(co-pending applications)(例如WO 2013/157954以及WO 2013/157953，在此被併入本案以作為參考)中，我們已揭示從一個單細胞來生成多特異性抗體的方法和方式，而因此有利於多特異性抗體的形成勝過單特異性抗體的形成之方式被提供。這些方法也可以有利地被運用在本發明中以供多價建構物多聚體(包含三特異性抗體)的產生。
特別地，用以佔優勢地生成三特異性全長的IgG分子之較佳變化是有關於一個人類野生型序列在位置351和366的胺基酸取代，例如位在第1個CH3領域(“KK-變異體”重鏈)中的L351K和T366K (根據EU編號法來編號)，以及位在位置351和368的胺基酸取代，例如位在第2個CH3領域(“DE-變異體”重鏈)中的L351D和L368E，反之亦然。先前在我們的共審查中申請案之內被證明的是：帶負電荷的(negatively charged) DE-變異體重鏈和帶正電荷的(positively charged) KK-變異體重鏈優先地配對以形成異二聚體(所謂的“DEKK”分子)。DE-變異體重鏈或KK-變異體重鏈的同質二聚體化(DE-DE同質二聚體或KK-KK同質二聚體)由於位在相同重鏈之間的CH3-CH3介面中的帶電荷殘基之間的強烈排斥而幾乎不會發生。
根據本發明，該免疫細胞銜接結合領域或該腫瘤抗原結合領域可以被置放在該多價分子的任何位置(包含該長臂或該短臂的遠端或內部位置)上，而異二聚體化技術可以被應用俾以有利地產生該三特異性分子勝過單特異性、雙價同質二聚體或四特異性(quadrospecific)同質二聚體。
首先，已被證實的是：一個腫瘤細胞抗原結合領域可以被置放在該長臂或該短臂的遠端或內部區域之處。
對於此處所述的三特異性和/或三價抗體之每一者，表現係藉由被調適的293細胞之懸浮生長而被完成，該等細胞被培養於位在一個振盪器盤(shaker plateau)上的T125培養瓶(T125 flasks)內直到一為3.0x106 個細胞/mL的密度。細胞在一為0.3-0.5x106 個活細胞/mL的密度之下被播種至一個24深孔培養盤的每一個孔之內。該等細胞被短暫轉染以一個由兩種編碼不相同的抗體、被轉殖至專屬載體系統之內的質體所構成之混合物。在轉染7天之後，細胞上澄液被收穫並且被過濾通經一個0.22 µm過濾器。無菌的上澄液被儲存在4℃之下直到該等三特異性抗體的純化之時。
關於一個具有一個免疫銜接結合領域位在該長臂的內部位置以及一個腫瘤細胞抗原位在該短臂的三特異性分子之一示範例，編碼用於CD3結合領域(MF8078)的VH基因、本發明的一個連接子以及一個破傷風類毒素(TT)結合領域(MF1337)的DNA被轉殖到一個編碼該帶正電荷的CH3領域(KK)的載體之內，而編碼用於EGFR結合領域(MF8233)的VH基因之DNA被轉殖到一個編碼該帶負電荷的CH3領域(DE)的載體之內，而因此編碼一個具有EGFRxCD3:TT的三特異性分子。用於該3個結合領域的重鏈可變區被闡述於表13中，而關於這些三特異性分子的活性被描述於圖15a和16a中。關於這些三特異性分子，每一個重鏈可變區配對以一個共同輕鏈(序列辨識編號:29)。表 13.
Figure 108111354-A0304-0013
關於一個具有一個免疫銜接結合領域位在該長臂的內部位置以及一個腫瘤細胞抗原位在該長臂的遠端位置的三特異性分子之一示範例，編碼用於CD3結合領域(MF8078)的VH基因、本發明的一個連接子之DNA以及編碼用於EGFR結合領域(MF8233)的VH基因之DNA被轉殖到一個編碼該帶正電荷的CH3領域(KK)的載體之內，而編碼用於甲狀腺球蛋白結合領域(“Thyro”)(MF1025)的VH基因之DNA被轉殖到一個編碼該帶負電荷的CH3領域(DE)的載體之內，而因此編碼一個具有ThyroxCD3:EGFR的三特異性分子。圖14b。用於該3個結合領域的重鏈可變區被闡述於表14中，而關於這些三特異性分子的活性被描述於圖15b和16b中。關於這些三特異性分子，每一個重鏈可變區與一個共同輕鏈配對(序列辨識編號:29)。表 14.
Figure 108111354-A0304-0014
 示範例 10 ：將腫瘤細胞抗原結合領域置放在 T 細胞銜接三價分子的短臂或長臂上的效果 細胞株
BxPC3是一種人類胰臟癌(pancreatic cancer)細胞株。
HCT-116是一種人類結腸癌(colon carcinoma)細胞株。
上述系列的三特異性IgGs係在24孔生成法(24 well production)之下被產生，該24孔生成法將11個不相同的連接子併入至含有一個抗-EGFR結合領域位在短臂上(圖14a和表13)以及一個抗-EGFR結合領域位在長臂上(圖14b和表14)的三特異性分子(trispecifics)以及一系列的對照組抗體之內。這些分子已就它們引起T細胞活化的能力以及在一個細胞毒性分析(cytotoxicity assay)來予以評估。
根據標準技術使用Ficoll和EasySep人類T細胞分離套組(Ficoll and EasySep human T cell isolation kit)而從來自健康的供給者(healthy donors)之全血(whole blood)分離出靜止T細胞(resting T cells)，藉由抗-CD3抗體使用流動式細胞測量術分析(flow cytometric analysis)來檢查>95% T細胞純度(T cell purity)以及隨後予以冷凍保存(cryopreserved)。關於一個細胞毒性分析，冷凍保存的T細胞被解凍(thawed)並且被使用，如果在解凍之時它們的存活率(viability)藉由標準錐蟲藍染色法(standard Trypan Blue staining)來予以測定是>90%。細胞毒性分析簡而言之，被解凍的靜止T細胞和BxPC3 (圖15)或HCT116 (圖16和17)標的細胞以一為5:1的E:T比例被共培養(co-cultured)歷時48小時。關於該等三價抗體，一個從一濃度為4 μg/mL開始的6步驟3倍稀釋系列(6-step 3 fold dilution series)被使用。EGFRxCD3雙特異性抗體被使用作為一正對照組；模擬x模擬:模擬、模擬xCD3:模擬和EGFRx模擬:模擬三價抗體被使用為特異性對照組。T細胞活化係使用流動式細胞測量術(flow cytometry)來予以定量(quantified)；CD4和CD8 T細胞係根據CD4和CD8表現來予以閘控(gated)並且隨後藉由測量T細胞上的CD25和CD69表現來分析它們的活化狀態(activation status)。標的細胞溶解係藉由測量透過CellTiterGlo (Promega)來予以評估的ATP位準來測量活細胞的分率(fraction)而被測定。ATP位準，藉由在一個Envision微盤式分析儀上的發光來予以測量，結果為相對光單位(RLU)數值，該等RLU數值係使用GraphPad Prism予以分析。
關於每一個樣品的標的細胞溶解係如下來予以計算： 殺死%=(100- (RLU樣品/RLU無IgG) x 100)
這些有關於T細胞活化(參見圖15)和細胞毒性(圖16)的數據證明該等三特異性抗體是有功能的。如圖15和16中所顯示的，模擬xCD3:EGFR以及EGFRxCD3:模擬三特異性分子被證明係能夠誘發EGFR標靶特異性T細胞活化和細胞毒性。就T細胞活化(圖15)和細胞毒性(圖16)這兩者而言，當該抗-EGFR Fab被置放在該長臂的遠端位置上，該模擬xCD3:EGFR三特異性分子顯示出增強的活性勝過雙特異性EGFRxCD3和具有EGFR結合領域位在該短臂上以及該CD3與模擬TT (MF1337)結合領域位在該長臂上的三特異性分子(參見圖14a)這兩者。
再者，如圖17b-d所顯示的，根據具有EGFR和CD3位在該長臂上的該等三特異性抗體之活性，該等連接子可以被裝入(binned)至與相對高的細胞激素生成相關的那些[IgG1 UH (序列辨識編號:2)、IgG1 MH (序列辨識編號:11)、IgG2A MH (序列辨識編號:4)和IgG1 G4S (序列辨識編號:12)]以及與相對低的細胞激素生成相關的那些[IgG1 UL (序列辨識編號:14)、IgG2A H (序列辨識編號:15)、IgG2B R (序列辨識編號:21)、IgG2A R (序列辨識編號:20)、IgG1 H (序列辨識編號:19)、IgG1R (序列辨識編號:23)]之中。連接子使用上的變化以及在細胞毒性上的衝擊是不太明顯的。圖17a。示範例 11 ：具有一個免疫細胞銜接結合領域位在該短臂或長臂上的三特異性抗體之產生
根據本發明，該免疫細胞銜接結合領域可以被置放在該多價分子的任何位置(包含該長臂或該短臂的遠端或內部位置)上，而異二聚體化技術可以被應用俾以有利地產生該三價分子。參見圖18 (CD3結合領域位在該短臂上)、圖19 (CD3結合領域位在長臂內部上)和圖25 (CD3結合領域位在長臂遠端上)。
舉例來說，一個免疫銜接領域被置放在該短臂之處，其中編碼用於該CD3結合領域(MF8078)的VH基因之DNA被轉殖到一個編碼該帶正電荷的CH3領域(KK)的載體之內，而編碼用於該EGFR結合領域[MF9988 (序列辨識編號:218)或MF9891 (序列辨識編號:191)]的VH基因、該連接子IgG2A MH以及用於該PD-L1結合領域[MF5380 (序列辨識編號:173)或MF5444 (序列辨識編號:164)]之VH基因的DNA被轉殖到一個編碼該帶負電荷的CH3領域(DE)的載體之內。圖18 (CD3xPD-L1:EGFR)。表 15.
Figure 108111354-A0304-0015
任擇地，一個免疫銜接領域被置放在該長臂的內部位置之處，其中編碼用於一個CD3結合領域(MF8078)的VH基因、該連接子IgG2A MH (序列辨識編號:4)以及一個用於一個PD-L1結合領域[MF5444 (序列辨識編號:164)、MF5380 (序列辨識編號:173)、MF5377 (序列辨識編號:155)]之VH基因的DNA被轉殖到一個編碼該帶正電荷的CH3領域(KK)的載體之內，而編碼用於一個EGFR結合領域[MF9886 (序列辨識編號:200)、MF9988 (序列辨識編號:218)、MF9891 (序列辨識編號:191)或MF9873 (序列辨識編號:209)]之VH基因的DNA被轉殖到一個編碼該帶負電荷的CH3領域(DE)的載體之內。圖19 (EGFRxCD3:PD-L1)。表 16.
Figure 108111354-A0304-0016
任擇地，一個免疫銜接領域被置放在該長臂的遠端位置上，其中編碼用於一個CD3結合領域[MF8078 (序列辨識編號:110)、MF8508 (序列辨識編號:128)或MF8057 (序列辨識編號:92)]的VH基因、一個連接子IgG 1H (序列辨識編號:19)以及一個用於一個纖維蛋白原結合領域(“Fibri”)(MF1025)之VH基因的DNA被轉殖到一個編碼該帶正電荷的CH3領域(KK)的載體之內，而編碼用於一個EGFR結合領域(MF8233)之VH基因的DNA被轉殖到一個編碼該帶負電荷的CH3領域(DE)的載體之內。圖24 (EGFRxFibri:CD3)。表 17.
Figure 108111354-A0304-0017
關於上面所述以及被闡述於圖18、19和24之中的該等三特異性分子之每一者，每一個重鏈可變區與一個共同輕鏈配對(序列辨識編號:29)。
如下面予以進一步描述的，每一種CD3結合領域安置(placement)被證明在產生對抗表現一個或多個暴露在細胞外的腫瘤細胞抗原之細胞的T細胞細胞毒性或活化之下是有效的。示範例 12 ：關於 EGFRxCD3:PD-L1 的三特異性型式經由 CD3 之有效的雙重腫瘤抗原結合以及 T 細胞銜接 細胞株：
MDA-MB-231細胞(ATCC® HTB-26)是乳癌細胞；衍生自轉移的位址(metastatic site)。
三特異性抗體係根據在圖19處的型式被生成以透過細胞毒性來分析此分子可達成同時的腫瘤抗原標靶和T細胞銜接的能力。這些抗體係藉由上面所述的技術而被產生。
具有一個範圍之親和力(從相對高至低)的4個抗-EGFR Fabs (MF9886、MF9988、MF9891、MF9873)被使用於該短臂並且被組合以用於該遠端長臂之也含有一個範圍之親和力的不相同抗-PD-L1 Fabs (MF5444、MF5380和MF5377)。該抗-CD3 Fab與連接子被保持恆定，使用MF8078以及連接子IgG2 AMH (序列辨識編號:4)。
關於EGFR和PD-L1親和力之排序係分別地根據來自表18和19的數據；該排序係根據相對於一個如下面所述之參考抗-EGFR和抗-PD-L1抗體的結合。表 18. 具有重鏈 MF9886 、 MF9988 、 MF9891 、 MF9873 之 EGFR 組 (EGFR panel) 單特異性雙價 EGFR 抗體
Figure 108111354-A0304-0018
EGFR重鏈的親和力排序係根據這些單特異性雙價抗體，相較於一個具有重鏈MF8233之單特異性雙價抗體的正對照組，去結合如上面所闡述的表現EGFR之細胞之相對能力(relative ability)。表 19. 具有重鏈 MF5444 、 MF5380 和 MF5377 之 PD-L1 組單特異性雙價 PD-L1 抗體
Figure 108111354-A0304-0019
該等PD-L1重鏈臂之相對親和力排序係根據在ELISA中結合人類PD-L1之能力。為此，ELISA盤被塗覆以從10 µg/mL開始之呈一個8步驟3倍滴定稀釋範圍(8-step, 3-fold titration diulation range)的huPD-L1-His (Sinobiological)。隨後地，每一個PD-L1 Fab的結合係有如一個PD-L1xTT IgG 5 µg/mL來予以評估。關於結合的EC50 值被測定並且就存在於每一個ELISA盤上的抗-PD-L1 RG7446 MPDL3280A (參見US 2010/0203056)所測定的結合EC50 來予以標準化。
這些三特異性EGFRxCD3:PD-L1分子接而根據之前在此針對兩個對於腫瘤細胞抗原具有不相同的抗原密度之細胞株(HCT116和MDA-MB-231)所描述的方法來測試它們去誘發細胞毒性的能力。這些細胞株的表現曲線(expression profiles)係藉由FACS染色法(FACS staining)使用對照組抗體[西妥昔單抗(cetuximab)用於EGFR，以及MPDL3280A用於PD-L1)來予以測定，有關於感興趣的抗原之表現當平均螢光強度(mean fluorescence intensity，MFI)是3倍高於背景信號(background signal)之時被認為是陽性的。對於PD-L1係以3次重複(triplicates)來執行，而對於EGFR係以4次重複(quadruplicates)來執行，而且結果係如下面所闡述的被當作MFI來報導。表 20.
Figure 108111354-A0304-0020
這個檢查該等三特異性分子對抗這些細胞株的細胞毒性之研究顯示出該等EGFRxCD3:PD-L1三特異性分子的全部3個結合領域能夠同時結合該兩個腫瘤細胞抗原和CD3，而使得該等三特異性分子的該兩個腫瘤抗原結合領域在T細胞銜接之時促成細胞毒性。圖20和21 (對抗MDA-MB-231細胞)以及圖22 (對抗HCT116細胞)。這些三特異性分子大抵上顯示出增強的功能活性勝過該雙特異性EGFRxCD3x模擬以及該等模擬xCD3xPD-L1對照組，以該三特異性分子9873x8078:5377顯示出最大的百分比溶解(largest percent lysis)。圖21。在此被測試的該等三特異性分子在對抗MDA-MB-231細胞(相較於HCT116細胞具有相對高之標的抗原位準)是最有效的。圖21和22。示範例 13 ：關於 CD3xPD-L1:EGFR 的三特異性型式經由 CD3 之有效的雙重腫瘤抗原結合以及 T 細胞銜接
三特異性抗體係根據在圖18處的型式被生成，俾以進一步顯示在免疫銜接領域係存在於該短臂上的情況下之同時的腫瘤抗原標靶。這些抗體係藉由上面所述的技術而被產生。關於這個型式，如同就CD3xPD-L1:EGFR分子而觀察到的，當藉由FACS在MDA-MB-231細胞上來進行測量時，雙重的抗原標靶-相關的結合被證明，而使得隨著增高的PD-L1親和力，存在有標的細胞結合之一持續的增強。圖23a。對於具有該CD3xPD-L1:EGFR之型式的這些三特異性分子之中的某些，同時的雙重抗原結合和免疫細胞銜接已被證明在BxPC3細胞的細胞毒性上係具有一相加效應勝過結合一個單一抗原和CD3 (重鏈序列未示出)之分子，驗證這些分子要同時地銜接全部3個結合臂之能力。圖23b。關於這些數據的細胞毒性分析之操作程序已被描述於上。示範例 14 ：關於 EGFRx 纖維蛋白原 :CD3 的三特異性型式經由位在遠端長臂處的 CD3 之有效的 T 細胞活化
Jurkat-NFAT-RE-luc2細胞(Promega)是一種被基因工程化的Jurkat T細胞株，它表現一個被一個NFAT-反應要素(NFAT-response element，NFAT-RE)所驅動的螢光素酶報導子(luciferase reporter)。
HT29 (ATCC HTB-38)是一種人類結腸癌細胞。
一個有關於將CD3結合領域置放在該長臂的遠端區域上的研究被執行，使用一為EGFR (MF8233)x纖維蛋白原(MF1122):CD3(MF8078)的三價分子。圖24。在Jurkat-NFAT-RE-luc2細胞執行一個針對標的細胞 HT29的T細胞活化分析，俾以建立有關於這個型式的功能性T細胞活化能力。報導子分析(reporter assay)簡述：Jurkat效應子T細胞與標的細胞在一個濃度範圍的三特異性抗體和對照組抗體之存在下被共培養。在5個小時的培育之後，使用Bio-Glo螢光素酶分析系統(Bio-Glo Luciferase Assay System)(Promega)，報導細胞(reporter cells)的螢光素酶活性被測量以作為一有關於T細胞活化之讀出。發光活性係在一個Envision微盤式分析儀上予以測量，結果為相對光單位(RLU)數值，該等RLU數值係使用GraphPad Prism予以分析。
如圖25中所顯示的，T細胞藉由EGFRxFibri:CD3三特異性分子之活化被證明係在相等於或大於正對照組的位準之下，該正對照組是一個之前被證明產生(engender)圖15a中的T細胞活化之EGFRxCD3抗體。示範例 15 ：關於一系列的 CD3 結合領域與連接子經由 CD3 之有效的腫瘤抗原結合以及 T 細胞銜接
一組的EGFRxCD3:EGFR雙特異性三價分子被產生(圖26)俾以證明跨越各式各樣的不相同CD3、免疫細胞銜接結合領域以及8個不相同的連接子之腫瘤標靶和T細胞銜接的功效。每個三價分子含有兩個相同的抗-EGFR結合領域(MF9891)位在該短臂和遠端長臂位置處，以及該CD3結合領域位在該內部長臂位置處。關於這個研究，藉由先前所述的方法，一種係為Jurkat-NFAT-RE-luc2細胞的報導細胞株以及標的細胞HCT116 [中間物EGFR表現(intermediate EGFR expression)]和MDA-MB-231被用來測量T細胞活化。關於一個負對照組，使用一個來自不相同超級簇團的CD3結合領域之三價分子被生成為模擬xCD3x模擬或雙特異性[EGFR (MF8233)xTT (MF1337)](4,000 ng/mL)。讀出係仰賴在5個小時的培育之後的報導子活化(reporter activation)。
來自變化的超級簇團之每一個被測試的CD3結合領域證明了使用HCT116細胞之報導子活性，而以一個來自超級簇團7的CD3結合領域證明有最低的相對報導子活性，同時證明了一系列的(a spectrum of)根據連接子臂之活性。相反地，不管連接子臂是誰，該兩個來自超級簇團1的CD3結合領域(MF8058和MF8078)以及一個來自超級簇團4的CD3結合領域(MF8508)證明了相對一致的活性。最後，一個屬於超級簇團1的CD3結合領域(MF8057)證明了相對低的報導子活性，這提供某種與不相同連接子相關聯的分化。參見圖27。這些數據之一回顧指出：跨越超級簇團，含有IgG1 MH連接子的三價分子看來一致地是最有效的。
同樣地，來自變化的超級簇團之每一個被測試的CD3結合領域證明了使用MDA-MB-231細胞之報導子活性，而以來自超級簇團7的CD3結合領域證明有相對低的相對報導子活性，隨同一系列的根據所用的連接子之活性。相反地，3個來自超級簇團1的CD3結合領域(MF8057、MF8058和MF8078)以及來自超級簇團4的CD3結合領域證明了極為相似的活性，不管所用的連接子是誰。參見圖28。 表21 用於雙特異性分子的產生之IgG重鏈。表21A：CH1區。表21B：鉸鏈區。表21C：CH2區。表21D：含有L235G和G236R緘默化取代的CH2。表21E：含有 取代L351K和T366K (KK)的CH3領域。表21F：含有 取代L351D和L368E (DE)的CH3領域。 表21A CH1： gctagcaccaagggcccatcggtcttccccctggcaccctcctccaagagcacctctggg A S T K G P S V F P L A P S S K S T S G ggcacagcggccctgggctgcctggtcaaggactacttccccgaaccggtgacggtgtcg G T A A L G C L V K D Y F P E P V T V S tggaactcaggcgccctgaccagcggcgtgcacaccttcccggctgtcctacagtcctca W N S G A L T S G V H T F P A V L Q S S ggactctactccctcagcagcgtcgtgaccgtgccctccagcagcttgggcacccagacc G L Y S L S S V V T V P S S S L G T Q T tacatctgcaacgtgaatcacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtt (序列辨識編號:291) Y I C N V N H K P S N T K V D K R V (序列辨識編號:292) 表21B 鉸鏈： gagcccaaatcttgtgacaaaactcacacatgcccaccgtgccca (序列辨識編號:293) E P K S C D K T H T C P P C P (序列辨識編號:294) 表21C CH2： gcacctgaactcctggggggaccgtcagtcttcctcttccccccaaaacccaaggacacc A P E L L G G P S V F L F P P K P K D T ctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtggtggtggacgtgagccacgaagac L M I S R T P E V T C V V V D V S H E D cctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcataatgccaagacaaag P E V K F N W Y V D G V E V H N A K T K ccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcctgcac P R E E Q Y N S T Y R V V S V L T V L H caggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcc Q D W L N G K E Y K C K V S N K A L P A cccatcgagaaaaccatctccaaagccaaa (序列辨識編號:295) P I E K T I S K A K (序列辨識編號:296) 表21D 含有L235G和G236R緘默化取代的CH2： gcacctgaactcggcaggggaccgtcagtcttcctcttccccccaaaacccaaggacacc A P E L G R G P S V F L F P P K P K D T ctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtggtggtggacgtgagccacgaagac L M I S R T P E V T C V V V D V S H E D cctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcataatgccaagacaaag P E V K F N W Y V D G V E V H N A K T K ccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcctgcac P R E E Q Y N S T Y R V V S V L T V L H caggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcc Q D W L N G K E Y K C K V S N K A L P A cccatcgagaaaaccatctccaaagccaaa (序列辨識編號:297) P I E K T I S K A K (序列辨識編號:298) 表21E CH3：DEKK的KK gggcagccccgagaaccacaggtgtacaccaagcccccatcccgggaggagatgaccaag G Q P R E P Q V Y T K P P S R E E M T K aaccaggtcagcctgaagtgcctggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgtggag N Q V S L K C L V K G F Y P S D I A V E tgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactcc W E S N G Q P E N N Y K T T P P V L D S gacggctccttcttcctctatagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcagggg D G S F F L Y S K L T V D K S R W Q Q G aacgtcttctcatgctccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagc N V F S C S V M H E A L H N H Y T Q K S ctctccctgtctccgggttga (序列辨識編號:299) L S L S P G – (序列辨識編號:300) 表21F CH3：DEKK的DE gggcagccccgagaaccacaggtgtacaccgaccccccatcccgggaggagatgaccaag G Q P R E P Q V Y T D P P S R E E M T K aaccaggtcagcctgacctgcgaggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgtggag N Q V S L T C E V K G F Y P S D I A V E tgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactcc W E S N G Q P E N N Y K T T P P V L D S gacggctccttcttcctctatagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcagggg D G S F F L Y S K L T V D K S R W Q Q G aacgtcttctcatgctccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagc N V F S C S V M H E A L H N H Y T Q K S ctctccctgtctccgggttga (序列辨識編號:301) L S L S P G – (序列辨識編號:302)
為便於參考，就圖15至28，當描述三特異性分子(trispecific molecules)之時，下面的型式被使用：MFAxMFB:MFC或者抗原Ax抗原B:抗原C (AntigenAxAntigenB:AntigenC)，而使得MFA或抗原A接續以x構成該“短臂(short arm)”，同時該x表示二聚體化(dimerization)，接續以MFB或抗原B描述該長臂(long arm)的內部位置(interior position)，接續以一個“:”指明一個連接子接續以MFC或抗原C描述位在該長臂的遠端領域(distal domain)之處的MFC或抗原C。在術語“模擬(mock)”就一個多價分子的背景而被使用的情況下，它意指這樣的分子的一個結合領域，它能夠結合一個不存在於它被測試之給定分析中的抗原。典型地，此處所用之模擬結合領域(mock binding domains)結合破傷風毒素(tetanus toxin，TT)、纖維蛋白原(fibrinogen，Fibri)或甲狀腺球蛋白(thyroglobulin，Thyro)。
圖1(a-u)闡述本發明的多價抗體之型式，包含不相同的結合領域結構、連接子以及主體抗體部分。
圖2a闡述被使用於在載體MV1626內轉殖(cloning)建構物的VH1-CH1-連接子-VH2插入物(insert)之一示意圖(schematic diagram)。雖未被示出，可瞭解到的是：該載體亦可編碼被連接至該VH2的CH3-CH2-CH1區。圖2b顯示一個三特異性抗體，其中VH1結合一個破傷風類毒素(tetanus toxoid)抗原，VH2結合一個纖維蛋白原抗原以及VH3結合一個甲狀腺球蛋白。
圖3闡述該MV1626載體之一示意圖。
圖4闡述MG1025C377表現載體之一示意圖。
圖5闡述被用來供轉殖至MV1626之內的插入物之序列的排比(alignment)。注意，為了明確性目的，該排比只有涵蓋CH1-連接子。
圖6闡述MV1057載體之一示意圖。
圖7闡述MV1260載體之一示意圖。
圖8闡述在非還原條件(non-reducing conditions)(上方)以及還原條件(reducing conditions)(下方)中的SDS-PAGE凝膠(gels)。
圖9闡述24個多價建構物的篩選數據(screening data)。
圖10闡述18個多價建構物的篩選數據。
圖11A：共同輕鏈胺基酸序列。圖11B：共同輕鏈可變領域DNA序列以及轉譯(translation) (IGKV1-39/jk1)。圖11C：共同輕鏈恆定區DNA序列以及轉譯。圖11D：IGKV1-39/jk5共同輕鏈可變領域轉譯。圖11E：V-區IGKV1-39A；圖11F：該共同輕鏈的CDR1、CDR2以及CDR3。
圖12：18個多價IgG建構物以及4個對照組抗體(control antibodies)在4種不同條件下被分析的安定性分析(stability analysis)。
圖13：8個連接子的生物資訊模型化(bioinformatic modeling)。
圖14：兩個銜接元三特異性型式，帶有一個長臂內部免疫細胞結合領域和一個短臂腫瘤細胞抗原結合領域(14a)或者一個長臂遠端腫瘤細胞抗原結合領域和一個短臂腫瘤細胞抗原結合領域(14b)。
圖15：BxPC3細胞[中位EGFR表現(median EGFR expression)]中的T細胞活化，其係藉由以CD25和CD69的表現來作為下面這兩種型式之一讀出(read out)的流動式細胞測量術(flow cytometry)：EGFR位在短臂上(在圖15a處的EGFRxCD3:TT)以及EGFR位在長臂上(在圖15b處的ThyroxCD3:EGFR)。雙特異性抗體(EGFRxCD3)被用來作為一個正對照組(positive control)。
圖16：HCT116細胞(中位EGFR表現)中的T細胞細胞毒性(T cell cytotoxicity)係藉由測量ATP位準而被決定，藉由CellTiterGlo來對EGFRxCD3:TT (圖16a)和ThyroxCD3:EGFR (圖16b)這兩者進行評估。上方圖片(top charts) ATP位準，藉由在一個Envision微盤式分析儀(Envision Microplate reader)上的發光(luminescence)來予以測量，結果為相對光單位(Relative light unit，RLU)數值，該等RLU數值係使用GraphPad Prism予以分析，而下方圖片(bottom chart)係有關於根據下面方程式(equation)的殺死百分比(percent killing)：殺死%= (100- (RLU樣品/RLU無IgG) x 100)。
圖17：連接子對於HCT116細胞中的T細胞細胞毒性之效應(圖17a)。關於一系列的連接子之標的細胞溶解(target cell lysis)與細胞激素釋放(cytokine release)之比較已就IL-2 (圖17b)、IFN-γ (圖17c)以及TNF-α (圖17d)來予以證明。
圖18:帶有坐落在短臂上的CD3結合領域之CD3xPD-L1:EGFR三特異性T細胞銜接元分子的構形(configuration)。
圖19：帶有坐落在長臂之內部區域(internal region)上的CD3結合領域之EGFRxCD3:PD-L1三特異性T細胞銜接元分子的構形。
圖20：對抗MDA-MB-231細胞的T細胞細胞毒性活性數據被提供，比較了三特異性分子(組合一個CD3結合領域和兩個腫瘤細胞抗原結合領域)以及三特異性對照組(帶有一個腫瘤細胞抗原結合領域、一個模擬領域和一個CD3結合領域)和前面所述的正對照組。
圖21：對抗MDA-MB-231細胞的T細胞細胞毒性活性數據被提供，比較了三特異性分子(組合一個CD3結合領域和兩個腫瘤細胞抗原結合領域)與三特異性對照組(帶有一個腫瘤細胞抗原結合領域、一個模擬領域和一個CD3結合領域)，其中該等三特異性分子包含有腫瘤細胞抗原結合領域對於標靶EGFR和PD-L1係包含有一個範圍的親和力。
圖22：對抗HCT116細胞的T細胞細胞毒性活性數據被提供，比較了三特異性分子(組合一個CD3結合領域和兩個腫瘤細胞抗原結合領域)與三特異性對照組(帶有一個腫瘤細胞抗原結合領域、一個模擬領域和一個CD3結合領域)，其中該等三特異性分子包含有腫瘤細胞抗原結合領域對於標靶EGFR和PD-L1係包含有一個範圍的親和力。
圖23a：針對MDA-MB-231細胞的FACS數據被顯示為有關於一個範圍的PD-L1親和力和一個範圍的EGFR親和力之曲線下面積(area under the curve，AUC)，證明了雙重-抗原結合(dual-antigen binding)與腫瘤抗原結合領域之增高的親和力相關。
圖23b：針對BxPC3細胞的T細胞細胞毒性活性數據被提供，為某些具有CD3xPD-L1:EGFR之型式的三特異性分子作證明。同時的雙重抗原結合和免疫細胞銜接(immune cell engagement)發生，對結合一個單一抗原與CD3的分子(CD3xEGFR:模擬或者CD3x模擬:PD-L1)之細胞毒性具有一相加效應(additive effect)。特異性重鏈序列未被顯示。
圖24：帶有坐落在長臂之遠端區域上的CD3結合領域之EGFRx纖維蛋白原:CD3三特異性T細胞銜接元分子的構形。
圖25：針對HT29細胞的T細胞活化數據被提供，並且證明了相較於圖15中所用的正對照組EGFRxCD3雙特異性抗體，藉由各種不同的使用不相同CD3結合領域之EGFRx纖維蛋白原:CD3三特異性T細胞銜接元分子的T細胞活化。
圖26：帶有相同的EGFR結合領域(MF9891)之EGFRxCD3:EGFR雙特異性三價分子的構形。
圖27：在HCT116細胞中的T細胞活化活性係就一系列的雙特異性三價EGFRxCD3:EGFR分子[帶有相同的EGFR結合領域(MF9891)與來自不相同超級簇團(superclusters)之相異CD3結合領域偕同一個範圍的連接子]來予以測量。
圖28：在MDA-MB-231細胞中的T細胞活化活性係就一系列的雙特異性三價EGFRxCD3:EGFR分子[帶有相同的EGFR結合領域(MF9891)與來自不相同超級簇團之相異CD3結合領域偕同一個範圍的連接子]來予以測量。
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(無)

Claims (83)

  1. 一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分藉由一個連接子而被連接至該至少一個附加的結合領域， 其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及 其中該連接子包含有一個鉸鏈序列或一個衍生自一鉸鏈序列的序列。
  2. 如請求項1的多價抗體，其中至少一個附加的結合領域包含有一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域。
  3. 如請求項1的多價抗體，其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區並且藉由連接該主體抗體部分的一個可變區與該CH1區的該連接子而被連接至該主體抗體部分。
  4. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該共同可變區係呈一個包含有VL-CL的共同輕鏈之形式。
  5. 如請求項4的多價抗體，其中該共同輕鏈包含有序列辨識編號:29的序列。
  6. 如請求項1至3之中任一項的多價抗體，其中該共同可變區係呈一個包含有VH-CH1的共同重鏈之形式。
  7. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的各個結合領域結合一個不相同的表位。
  8. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其結合至少3個不相同的表位。
  9. 一種多價抗體，其包含有： – 一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；以及 – 至少一個附加的結合領域， 其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區並且藉由連接該主體抗體部分的一個可變區與該CH1區的該連接子而被連接至該主體抗體部分，以及 其中該多價抗體結合至少3個不相同的表位。
  10. 如請求項9的多價抗體，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區。
  11. 如請求項9或10的多價抗體，其中至少一個附加的結合領域包含有一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域。
  12. 如請求項10或11的多價抗體，其中該共同可變區係呈一個包含有VL-CL的共同輕鏈之形式。
  13. 如請求項12的多價抗體，其中該共同輕鏈包含有序列辨識編號:29的序列。
  14. 如請求項10或11的多價抗體，其中該共同可變區係呈一個包含有VH-CH1的共同重鏈之形式。
  15. 如請求項10至14之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的各個結合領域結合一個不相同的表位。
  16. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子包含有一個如序列辨識編號:1至24之中的任何一者所闡述的序列或一個對序列辨識編號:1至24之中的任何一者具有至少大約85%序列相同性的多胜肽。
  17. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分是一個全長的免疫球蛋白。
  18. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的該等結合領域是Fab領域。
  19. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該抗體的主體部分包含有一個第一CH3領域與一個第二CH3領域二聚體化，當中的第一個包含有一個胺基酸殘基離胺酸位在位置351和366之處或者對應於此等的位置之處，而當中的第二個包含有天冬胺酸位在351之處以及麩胺酸位在368之處或者位在對應於此等的位置之處的胺基酸殘基。
  20. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該抗體的該等結合領域之該等共同可變區係由一個核酸所編碼，該核酸係得自於、衍生自或根據一個由一基因轉殖的囓齒動物所編碼的核酸，在該基因轉殖的囓齒動物的生殖系內包含有一個重排的可變鏈核酸序列。
  21. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的各個Fab領域係經由一個連接子而被連接至一個附加的結合領域。
  22. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的一個結合領域之N-端末端經由一個連接子而被連接至一個附加的結合領域的C-端末端。
  23. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的第一結合領域之一N-端末端經由一個連接子而被連接至一個第一附加的結合領域之一C-端末端，以及其中該主體抗體部分的第二結合領域之一N-端末端經由一個連接子而被連接至一個第二附加的結合領域之一C-端末端。
  24. 如請求項1至22項之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體部分的第一結合領域之一N-端末端經由一個連接子而被連接至一個第一附加的結合領域之一C-端末端，以及其中一個第二附加的結合領域之一C-端末端經由一個連接子而被連接至該第一附加的結合領域之一N-端末端。
  25. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其能夠結合至至少4個不相同的表位。
  26. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其能夠結合至至少兩個不相同的抗原。
  27. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中至少一個附加的結合領域是一個Fab領域，而相較於該主體抗體部分之CH1，該附加的Fab領域包含有一個屬於不相同次型(subclass)的CH1。
  28. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子是短的、長的、帶電荷的、剛性的或可撓曲的。
  29. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子的胺基酸序列包含有一個天然存在的序列或者包含有一個衍生自一個天然存在的序列之序列。
  30. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子包含有一個中間鉸鏈區序列。
  31. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子包含有一個上方以及一個下方鉸鏈序列。
  32. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該連接子包含有一個螺旋形成序列。
  33. 如請求項1至27之中任何一項的多價抗體，其中該連接子包含有一個如序列辨識編號:1至24之中任何一者的胺基酸序列。
  34. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1領域。
  35. 如前述請求項之中任何一項的多價抗體，其中該等結合領域之中的至少一者特異性地結合至位在一個免疫效應子細胞上的一個抗原。
  36. 如請求項35的多價抗體，其中該免疫效應子細胞是一種T細胞。
  37. 如請求項36的多價抗體，其中位在該T細胞上的抗原是CD3。
  38. 如請求項35至37之中任何一項的多價抗體，其中該等結合領域之中的至少一者特異性地結合至位在一個異常的細胞上的一個抗原。
  39. 如請求項38的多價抗體，其中至少兩個結合領域特異性地結合至位在一個異常的細胞上的一個抗原。
  40. 一種如請求項39的多價抗體，其中該至少兩個結合領域特異性地結合至位在一個異常的細胞上的至少兩個不相同的抗原。
  41. 如請求項40的多價抗體，其中該至少兩個結合領域特異性地結合至至少EGFR和PD-L1。
  42. 如請求項35至41之中任何一項的多價抗體，其中一個第一結合領域特異性地結合PD-L1，一個第二結合領域特異性地結合CD3，以及一個第三結合領域特異性地結合至EGFR。
  43. 如請求項38至42之中任何一項的多價抗體，其中該異常的細胞是一種腫瘤細胞。
  44. 如請求項35至43之中任何一項的多價抗體，其中該主體抗體包含有結合領域1和2，以及其中該附加的結合領域3被連接至該結合領域1，以及其中一個可選擇性附加的結合領域4被連接至該結合領域2。
  45. 如請求項44的多價抗體，其中結合領域1是一個CD3結合領域，而結合領域2和3結合至不相同的標的細胞抗原。
  46. 如請求項44的多價抗體，其中結合領域2是一個CD3結合領域，而結合領域1和3結合至不相同的標的細胞抗原。
  47. 如請求項44的多價抗體，其中結合領域3是一個CD3結合領域，而結合領域1和2結合至不相同的標的細胞抗原。
  48. 如請求項44至47之中任何一項的多價抗體，其包含有結合另外一個不相同的標的細胞抗原的一個結合領域4。
  49. 如請求項44至48之中任何一項的多價抗體，其中該等標的細胞抗原結合領域之中的第一個結合PD-L1、EGFR、CD137、CLEC12A、纖維蛋白原或甲狀腺球蛋白。
  50. 如請求項44至49之中任何一項的多價抗體，其中該第一個和第二個標的細胞結合領域結合不相同的抗原。
  51. 如請求項50的多價抗體，其中該等標的細胞抗原結合領域之中的第一個和第二個結合選自於PD-L1、EGFR、CD137、CLEC12A、纖維蛋白原和甲狀腺球蛋白的抗原。
  52. 如請求項44至51之中任何一項的多價抗體，其中該CD3結合領域包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF8057、MF8058、MF8078、MF8397、MF8508、MF9249或MF9267的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。
  53. 如請求項44至49之中任何一項的多價抗體，其中該CD3結合領域包含有一個重鏈可變區，其帶有MF8057、MF8058、MF8078、MF8397、MF8508、MF9249或MF9267的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
  54. 如請求項44至50之中任何一項的多價抗體，其中一個標的細胞抗原結合領域是一個PD-L1結合領域。
  55. 如請求項51的多價抗體，其中該PD-L1結合領域包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF5377、MF5444或MF5380的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。
  56. 如請求項51的多價抗體，其中該PD-L1結合領域包含有一個重鏈可變區，其帶有MF5377、MF5444或MF5380的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
  57. 如請求項44至53之中任何一項的多價抗體，其中一個標的細胞抗原結合領域是一個EGFR結合領域。
  58. 如請求項54的多價抗體，其中該EGFR結合領域包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF8233、MF9891、MF9886、MF9873或MF9988的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。
  59. 如請求項54的多價抗體，其中該EGFR結合領域包含有一個重鏈可變區，其帶有MF8233、MF9891、MF9886、MF9873或MF9988的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
  60. 如請求項44至56之中任何一項的多價抗體，其中一個標的細胞抗原結合領域是一個CLEC12A結合領域。
  61. 如請求項57的多價抗體，其中該CLEC12A結合領域包含有一個重鏈可變區，其包含有CDR1、CDR2和CDR3，它們帶有MF4327的CDR1、CDR2和CDR3之胺基酸序列。
  62. 如請求項57的多價抗體，其中該CLEC12A結合領域包含有一個重鏈可變區，其帶有MF4327的VH之胺基酸序列，且在一個或多個非為CDRs的位置處具有0至10個(較佳為0至5個)胺基酸插入、刪除、取代、加入或此等之一組合。
  63. 如請求項52至59之中任何一項的多價抗體，其包含有一個CD3結合領域、一個EGFR結合領域以及一個PD-L1結合領域。
  64. 一種用於多價抗體之製備的方法，該方法包括： 提供包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為一個如請求項1至60之中任何一項的多價抗體；以及 在用以提供該等多肽胜之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞。
  65. 一種用於多價抗體之製備的方法，該方法包括： 提供包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子，其包含有一個鉸鏈序列或一個衍生自一鉸鏈序列的序列， 在用以提供該主體抗體部分、該至少一個附加的結合領域以及該至少一個連接子之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，以及其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區。
  66. 一種用於多價抗體之製備的方法，該方法包括： 提供包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子， 在用以提供該主體抗體部分、該至少一個附加的結合領域以及該至少一個連接子之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及其中該多價抗體結合至至少3個不相同的表位。
  67. 一種用於多價抗體之製備的方法，該方法包括： 提供包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列之細胞，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子， 在用以提供該主體抗體部分、該至少一個附加的結合領域以及該至少一個連接子之表現以及它們的組裝成為一個多價抗體之條件下來培養該宿主細胞， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及其中每一個結合領域包含一個得自於、根據或衍生自一個已經歷因應抗原刺激之體細胞重組之核酸的重排可變區以與該共同可變區形成一個Fab領域。
  68. 一種如請求項61至64之中任何一項的方法，其中至少一個附加的結合領域包含有一個Fv領域、一個Fab領域或一個經修飾的Fab領域。
  69. 一種如請求項61至65之中任何一項的方法，其中至少一個附加的結合領域包含有一個CH1區。
  70. 一種如請求項61至66之中任何一項的方法，其中該共同可變區係呈一個包含有VL-CL的共同輕鏈之形式。
  71. 一種如請求項67的方法，該共同輕鏈包含有序列辨識編號:29的序列。
  72. 一種如請求項61至67之中任何一項的方法，其中該共同可變區係呈一個包含有VH-CH1的共同重鏈之形式。
  73. 一種如請求項61至69之中任何一項的方法，其中該主體抗體部分的各個結合領域結合一個不相同的表位。
  74. 一種細胞，其包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列，該等多胜肽能夠組裝成為一個如請求項1至60之中任何一項的多價抗體。
  75. 一種細胞，其包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子，其包含有一個鉸鏈序列或一個衍生自一鉸鏈序列的序列， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，以及其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區。
  76. 一種細胞，其包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及其中該多價抗體結合至至少3個不相同的表位。
  77. 一種細胞，其包含有一個或多個編碼多胜肽的核酸序列，該等多胜肽能夠組裝成為：(i)一個包含有兩個結合領域的主體抗體部分；(ii)至少一個附加的結合領域；以及(iii)至少一個連接子， 其中當組裝之時，該主體抗體部分藉由一個連接子被連接至該至少一個附加的結合領域，其中該主體抗體部分的各個結合領域以及該至少一個附加的結合領域之每一者全部都具有一個共同可變區，以及其中每一個共同可變區已和它的同源區共同演化。
  78. 一種多胜肽，其包含有一個如序列辨識編號:3至5、7至11或13至24之中任何一者所闡述的胺基酸序列，或一個對此等序列辨識編號之任何一者具有至少大約85%序列相同性的多胜肽。
  79. 一種核酸序列，其編碼一個如請求項75的多胜肽。
  80. 一種載體，其包含有一個如請求項76的核酸序列。
  81. 一種藥學組成物，其包含有一如請求項1至60之中任何一項的多價抗體以及一藥學上可接受的載體和/或稀釋劑。
  82. 一種如請求項1至60之中任何一項的多價抗體，其供用於人類或動物透過療法的治療。
  83. 一種用於一個罹患一種醫療病況的人類或動物之治療的方法，該方法包括對該人類或動物投予一治療有效量的一種如請求項1至60之中任何一項的抗體。
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