TW201811375A - 標靶性配體 - Google Patents
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Abstract
本文描述可連接至化合物(諸如治療化合物)之新穎標靶性配體,其可用於將該等化合物引導至活體內標靶。本文揭示之標靶性配體可用以將抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑)靶向肝臟細胞以調節基因表現。本文揭示之標靶性配體在結合至治療化合物時可用於各種應用中,包括用於治療、診斷、標靶確認及基因體發現應用中。包括本文揭示之標靶性配體之組合物在結合至抑制表現之寡聚化合物時可介導肝臟細胞(諸如肝細胞(hepatocytes))中標靶核酸序列之表現,可用於治療對於細胞、組織或生物體中基因表現或活性之抑制有反應之疾病或病症。
Description
本發明係關於標靶性配體、其組合物及使用方法。
許多化合物需遞送至特異性位置(例如,遞送至所需細胞)以發揮治療效應或適用於診斷目的。此常見於嘗試活體內遞送治療化合物之情況。此外,能夠將化合物高效遞送至特異性位置可限制或潛在消除可由化合物之投與所引起之非預期結果(諸如脫靶效應)。一種活體內促進化合物(諸如治療化合物)遞送至所需位置之方法係藉由使該化合物連接或結合至標靶性配體。 可使用標靶性配體靶向之治療化合物之一種類別為寡聚化合物。已顯示具有與標靶核酸至少部分互補之序列之寡聚化合物改變該標靶活體外及活體內兩者之功能及活性。當遞送至含有標靶核酸(諸如mRNA)之細胞時,已顯示寡聚化合物調節標靶之表現,從而改變標靶核酸之轉錄或轉譯。在某些實例中,該寡聚化合物可藉由抑制核酸標靶及/或觸發標靶核酸之降解來減少基因之表現。 若標靶核酸為mRNA,則一種使抑制表現之寡聚化合物可調節mRNA標靶之表現之機制係通過RNA干擾。RNA干擾係一種使RNA或RNA樣分子(諸如經化學修飾之RNA分子)可通過降解使基因表現沉默之生物過程。認為轉錄後基因沉默之過程係用以阻止外源基因之表現之進化上保守之細胞防禦機制。 已顯示合成RNA及RNA樣分子引起活體內RNA干擾。例如,Elbashir等人,(Nature 2000, 411, 494-98)描述藉由在培養之哺乳動物細胞中引入合成21-核苷酸RNA分子之雙鏈體所誘發之RNAi。可觸發RNAi反應機制之合成RNA或RNA樣分子之類型可由經修飾之核苷酸及/或一或更多個非磷酸二酯鍵組成。 另外,單股RNA及RNA樣分子(其等亦可包括經修飾之核苷酸及具有一或更多個非磷酸二酯鍵)亦可改變標靶核酸(諸如標靶mRNA)之表現。
本文揭示可增強治療化合物遞送至個體(諸如人類病患或動物)內之特異性標靶位點(例如,特異性器官或組織)之標靶性配體。在一些實施例中,本文描述之標靶性配體可增強抑制表現之寡聚化合物之標靶性遞送。在一些實施例中,該等標靶性配體可增強抑制表現之寡聚化合物遞送至肝臟。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體包括以下或由以下組成:一或更多個標靶性部分、一或更多個系鏈、一或更多個分支點基團及一或更多個連接子。適用於本文揭示之標靶性配體之連接子包括「剛性」連接子,其可賦予全部標靶性配體足夠之穩定性及剛性以減少在標靶性部分與其連接之治療化合物之間之潛在相互作用。另外,適用於本文揭示之標靶性配體中之該等「剛性」連接子適用於高效合成呈亞磷醯胺化合物形式之標靶性配體(本文中亦稱為「含有亞磷醯胺之化合物」)。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體包括以下或由以下組成:一或更多個標靶性部分、一或更多個系鏈及一或更多個具有連接子置換部分之分支點基團。該連接子置換部分包括以下或由以下組成且位於該分支點基團內:一或更多個經取代或未經取代之環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環基或其共價連接之組合。分支點基團內具有連接子置換部分藉由向整體標靶性配體提供足夠之穩定性及剛性而賦予與本文揭示之「剛性」連接子之彼等性質類似之性質。另外,適用於標靶性配體中之具有連接子置換部分之分支點基團適用於高效合成呈亞磷醯胺化合物形式之標靶性配體。 本文揭示包含式I結構之標靶性配體:,其包含連接子、分支點基團、一或更多個系鏈及一或更多個標靶性部分,其中n為1至4之整數,及其中該連接子選自由以下組成之群之結構:(結構1);(結構2);(結構3);(結構4);(結構5);(結構6a);(結構6b);(結構6c);(結構6d);,其中n為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,及當存在時,各Z′獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如,F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構7);,其中n為0、1、2、3、4,及當存在時,各Z''獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如,F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構8);及,其中V包含一或更多個經取代或未經取代之環烷基(例如,環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如,環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如,苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如,吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或經取代或未經取代之雜環基(例如,四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何共價連接之組合。(結構9)。 在一些實施例中,該等標靶性配體包括具有連接子置換部分之分支點基團。 本文揭示包含式II結構之標靶性配體:,其包含具有連接子置換部分之分支點基團、一或更多個系鏈及一或更多個標靶性部分,其中n為介於1至4之間之整數,及其中該連接子置換部分包括一或更多個經取代或未經取代之環烷基(例如,環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如,環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如,苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如,吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或經取代或未經取代之雜環基(例如,四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何組合且位於分支點基團內。 本文揭示之標靶性配體可直接或間接連接至化合物(諸如治療化合物,例如,抑制表現之寡聚化合物),例如,連接至該抑制表現之寡聚化合物之3’或5’末端。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物包括一或更多個經修飾之核苷酸。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物為RNAi劑(諸如雙股RNAi劑)。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係經由磷酸酯基、硫代磷酸酯基或膦酸酯基與雙股RNAi劑之正義股之5’末端連接而連接至該RNAi劑。 本文揭示之標靶性配體包括一或更多個標靶性部分。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體包括N-乙醯基-半乳胺糖作為標靶性部分。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1003);(結構1008);(結構1023);或(結構1027)。 本文揭示包括標靶性配體及抑制表現之寡聚化合物之組合物。本文揭示包括標靶性配體及RNAi劑之組合物。 在一些實施例中,包括標靶性配體及RNAi劑之本文揭示之組合物具有由以下表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1002a);,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1003a);,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1005a);,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1008a);,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1012a);或,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1027a)。 本文揭示包括標靶性配體之亞磷醯胺化合物。 在一些實施例中,包括本文揭示之標靶性配體之亞磷醯胺化合物具有由以下表示之結構:(結構1001b);(結構1002b);(結構1003b);(結構1004b);(結構1005b);(結構1006b);(結構1007b);(結構1008b);(結構1009b);(結構1010b);(結構1012b);(結構1013b);(結構1014b);(結構1015b);(結構1016b);(結構1017b);(結構1018b);(結構1019b);(結構1020b);(結構1021b);(結構1022b);(結構1023b);(結構1024b);(結構1025b);(結構1026b);或(結構1027b)。 本文亦揭示包括本文揭示之標靶性配體之醫藥組合物。 本文揭示治療將受益於化合物之投與之疾病或病症之方法,該方法包括向個體投與連接至本文揭示之標靶性配體之化合物。 本文揭示抑制個體中標靶核酸之表現之方法,該方法包括投與治療有效量之連接至本文揭示之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物。 本文揭示將抑制表現之寡聚化合物活體內遞送至肝臟之方法,該方法包括向個體投與連接至本文揭示之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物。 如本文使用,術語「連接」當涉及兩個分子間之連接時意謂該等兩個分子係藉由共價鍵連接或該等兩個分子係經由非共價鍵(例如,氫鍵或離子鍵)相連。在其中術語「連接」係指兩個分子經由非共價鍵相連之一些實例中,在生理上可接受之緩衝劑(例如,磷酸鹽緩衝鹽水)中,兩個不同分子間之相連具有小於1 x 10-4
M (例如,小於1 x 10-5
M、小於1 x 10-6
M或小於1 x 10-7
M)之KD
。 如本文使用,術語「直接連接」係指第一化合物或基團連接至第二化合物或基團而無需任何介入原子或原子基團。如本文使用,術語「間接連接」係指第一化合物通過中間基團、化合物或分子(諸如,例如,連接基團)連接至第二化合物或基團。除非另有說明,否則如本文使用之術語「連接」包括「直接連接」及「間接連接」兩者,而彼等術語如本文定義。 如本文使用,「寡聚化合物」係含有約10至50個核苷酸或核苷酸鹼基對之核苷酸序列。在一些實施例中,寡聚化合物具有與細胞內之經表現標靶核酸或標靶基因中之編碼序列至少部分互補之核酸鹼基序列。在一些實施例中,該等寡聚化合物一經遞送至表現基因之細胞即可抑制潛在基因之表現,及在本文中稱為「抑制表現之寡聚化合物」。該基因表現可經活體外或活體內抑制。「寡聚化合物」包括(但不限於):寡核苷酸、單股寡核苷酸、單股反義寡核苷酸、短干擾RNA(siRNA)、雙股RNA(dsRNA)、微小RNA(miRNA)、短髮夾RNA(shRNA)、核糖核酸酵素、干擾RNA分子及切丁酶受質。 如本文使用,術語「寡核苷酸」意謂具有經連接之核苷(其等中之各者可經獨立修飾或未經修飾)之聚合物。 如本文使用,術語「單股寡核苷酸」意謂具有與標靶mRNA至少部分互補之序列之單股寡聚化合物,其可在哺乳動物生理條件(或相當活體外條件)下通過氫鍵鍵合雜交至標靶mRNA。在一些實施例中,單股寡核苷酸係單股反義寡核苷酸。 如本文使用,「RNAi劑」意謂含有RNA或RNA樣(例如,經化學修飾之RNA)寡核苷酸分子之試劑,其可降解或抑制標靶mRNA之傳訊RNA (mRNA)轉錄本以序列特異性方式進行之轉譯。如本文使用,RNAi劑可通過RNA干擾機制(即,通過與哺乳動物細胞之RNA干擾途徑機械(由RNA誘發之沉默複合體或RISC)相互作用誘發RNA干擾)或藉由任何替代機制或途徑起作用。儘管據信如本文使用之術語RNAi劑主要通過RNA干擾機制起作用,但本文揭示之RNAi劑不受任何特定作用途徑或作用機制束縛或限制。RNAi劑包括(但不限於):單股寡核苷酸、單股反義寡核苷酸、短干擾RNA(siRNA)、雙股RNA(dsRNA)、微小RNA(miRNA)、短髮夾RNA(shRNA)及切丁酶受質。本文描述之RNAi劑係由具有與標靶mRNA至少部分互補之股之寡核苷酸組成。在一些實施例中,本文描述之RNAi劑為雙股RNAi劑,及由反義股及與反義股至少部分互補之正義股組成。RNAi劑可由經修飾之核苷酸及/或一或更多個非磷酸二酯鍵組成。在一些實施例中,本文描述之RNAi劑為單股。 如本文使用,術語「沉默」、「減少」、「抑制」、「下調」或「基因減弱(knockdown)」當涉及給定基因之表現時意謂當細胞、細胞群、組織、器官或個體經連接至本文描述之標靶性配體之寡聚化合物治療時,與未經過或尚未經過如此治療之第二細胞、細胞群、組織、器官或個體相比,以藉由自該基因轉錄之RNA之含量或於其中該基因經轉錄之該細胞、細胞群、組織、器官或個體中自mRNA轉譯之多肽、蛋白質或蛋白質次單元之含量來衡量之基因之表現減少。 如本文使用,術語「序列」或「核苷酸序列」意謂使用標準核苷酸命名法以一連串字母描述之核酸鹼基或核苷酸之次序或順序。 如本文使用,及除非另有指示,否則術語「互補」當用以相對於第二核苷酸序列(例如,單股反義寡核苷酸或雙股RNAi劑反義股)描述第一核苷酸序列(例如,RNAi劑正義股或標靶mRNA)時意謂寡核苷酸或聚核苷酸(包括第一核苷酸序列)雜交(在哺乳動物生理條件(或相當活體外條件)下形成鹼基對氫鍵)及在某些條件下與寡核苷酸或聚核苷酸(包括第二核苷酸序列)形成雙鏈體或雙螺旋結構之能力。互補序列在至少至就雜交能力而言滿足上文要求之程度上包括沃森-克裡克(Watson-Crick)鹼基對或非沃森-克裡克鹼基對及包括天然或經修飾之核苷酸或核苷酸模擬物。 如本文使用,「完美互補」或「完全互補」意謂第一聚核苷酸之連續序列中所有(100%)鹼基將與第二聚核苷酸之連續序列中相同數量之鹼基雜交。該連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之所有或部分。 如本文使用,「部分互補」意謂於核酸鹼基序列之雜交對中,第一聚核苷酸之連續序列中至少70%(但非所有)鹼基將與第二聚核苷酸之連續序列中相同數量之鹼基雜交。 如本文使用,「大體上互補」意謂於核酸鹼基序列之雜交對中,第一聚核苷酸之連續序列中至少85%(但非所有)鹼基將與第二聚核苷酸之連續序列中相同數量之鹼基雜交。本文之術語「互補」、「完全互補」及「大體上互補」可相對於雙股RNAi劑之正義股與反義股間;雙股RNAi劑之反義股與標靶mRNA之序列間或單股反義寡核苷酸與標靶mRNA之序列間之鹼基匹配使用。 如本文使用,術語「治療(treat、treatment)」及類似語意謂經採取以提供個體之疾病之一或更多個症狀之數量、嚴重性及/或頻率之減輕或緩和之方法或步驟。 如本文使用,片語「引入細胞內」當涉及寡聚化合物時意謂將寡聚化合物功能遞送至細胞內。片語「功能遞送」意謂以使寡聚化合物具有預期生物活性(例如,基因表現之序列特異性抑制)之方式將該寡聚化合物遞送至細胞。 除非另有說明,否則如本文使用之符號之用途意謂根據本文描述之本發明之範圍之任何基團可連接至該符號。 如本文使用,術語「異構物」係指具有相同分子式,但性質或其等原子之結合之序列或其等原子之空間排佈不同之化合物。其等原子之空間排佈不同之異構物被稱為「立體異構物」。彼此非鏡像之立體異構物被稱為「非鏡像異構物」,及非可重疊鏡像之立體異構物被稱為「鏡像異構物」,或有時光學異構物。結合至四個不相同取代基之碳原子被稱為「對掌性中心」。 如本文使用,除非在結構上特定識別為具有特定構形,否則就各結構(其中存在非對稱中心且因此產生鏡像異構物、非對映異構物或其他立體異構構形)而言,本文揭示之各結構意欲表示所有此等可能異構物,其等包括其等光學純及外消旋形式。 如本文使用之術語「經取代」意謂指定原子(碳、氧或氮原子)上之任何一或更多個氫係經如本文定義之任何基團置換,只要指定原子之正常化合價未超出及取代導致穩定之化合物。取代基之非限制性實例包括C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、氰基、羥基、側氧基、羧基、環烷基、環烯基、雜環基、雜芳基、芳基、酮基、烷氧基羰基、芳氧基羰基、雜芳氧基羰基或鹵素(例如,F、Cl、Br、I)。當取代基為酮基或側氧基(即,=O)時,則該原子上之兩(2)個氫係經置換。如本文使用,環雙鍵係於兩個相鄰環原子之間形成之雙鍵(例如,C=C、C=N、N=N等)。 本發明之一些化合物可以互變異構形式存在,其亦意欲包含於本發明之範圍內。「互變異構物」係其等結構中原子排佈顯著不同,但以簡單及快速平衡存在之化合物。應瞭解本發明之化合物可描述為不同互變異構物。亦應瞭解當化合物具有互變異構形式時,所有互變異構形式意欲包含於本發明之範圍內,及該等化合物之命名不排除任何互變異構形式。 本發明之化合物及醫藥上可接受之鹽可以一或更多種互變異構形式存在,其等包括酮-烯醇、醯胺-腈、內醯胺-內醯亞胺、雜環狀環(例如,核酸鹼基鳥嘌呤、胸腺嘧碇及胞嘧啶)中之醯胺-醯亞胺酸互變異構、胺-烯胺及烯胺-烯胺及幾何異構物及其混合物。藉由葡萄糖及其他糖顯示之環-鏈互變異構性作為糖鏈分子中之醛基(-CHO)與相同分子中之羥基(-OH)之一者反應以使其具有環狀(環形)形式之結果產生。所有此等互變異構形式係包括於本發明之範圍內。互變異構物作為溶液中建立之互變異構組之混合物存在。在固體形式中,通常一種互變異構物佔優勢。甚至雖然可能已描述一種互變異構物,但本發明包括本文揭示之化合物之所有互變異構物。可與互變異構化互換之互變異構物之概念被稱為互變異構性。在互變異構性中,發生電子及氫原子之同時轉移。 互變異構化係藉由以下催化:鹼:1.去質子化;2.離域陰離子(例如,烯醇鹽)之形成;3.於陰離子之不同位置處質子化;酸:1.質子化;2.離域陽離子之形成;3.於與陽離子相鄰之不同位置處去質子化。 如本文使用,除非另有規定,否則術語「烷基」係指具有1至10個碳原子之飽和脂族烴基(直鏈或分支鏈)。例如,「C1-C6烷基」包括具有1、2、3、4、5或6個呈直鏈或分支鏈排佈之碳之烷基。如本文使用,術語「胺基烷基」係指如上文定義之烷基,其如正常化合價所允許於任何位置處經一或更多個胺基取代。該等胺基可未經取代、經單取代或二取代。 如本文使用,除非另有規定,否則術語「環烷基」意謂具有3至14個碳原子之飽和或不飽和非芳族烴環基。環烷基之實例包括(但不限於)環丙基、甲基-環丙基、2,2-二甲基-環丁基、2-乙基-環戊基、環己基等。環烷基可包括多個螺環或稠合環。環烷基係如正常化合價允許於任何位置上視需要經單、二、三、四或五取代。 如本文使用,除非另有規定,否則術語「烯基」係指含有至少一個碳-碳雙鍵且具有2至10個碳原子之非芳族烴基(直鏈或分支鏈)。多達五個碳-碳雙鍵可存在於此等基團中。例如,「C2-C6」烯基定義為具有2至6個碳原子之烯基。烯基之實例包括(但不限於)乙烯基、丙烯基、丁烯基及環己烯基。該烯基之直鏈、分支鏈或環狀部分可含有雙鍵且及如正常化合價允許於任何位置上視需要經單、二、三、四或五取代。術語「環烯基」意謂具有指定數量之碳原子及至少一個碳-碳雙鍵之單環狀烴基。 如本文使用,除非另有規定,否則術語「炔基」係指含有2至10個碳原子且含有至少一個碳-碳三鍵之烴基(直鏈或分支鏈)。可存在多達5個碳-碳三鍵。因此,「C2-C6炔基」意謂具有2至6個碳原子之炔基。炔基之實例包括(但不限於)乙炔基、2-丙炔基及2-丁炔基。該炔基之直鏈或分支鏈部分可含有如正常化合價允許之三鍵,及如正常化合價允許於任何位置上可視需要經單、二、三、四或五取代。 如本文使用,「烷氧基(alkoxyl或alkoxy)」係指其中指定數量碳原子通過氧橋連接之如上文定義之烷基。C1–6
烷氧基意欲包括C1
、C2
、C3
、C4
、C5
及C6
烷氧基。C1–8
烷氧基意欲包括C1
、C2
、C3
、C4
、C5
、C6
、C7
及C8
烷氧基。烷氧基之實例包括(但不限於)甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基、正丁氧基、第二丁氧基、第三丁氧基、正戊氧基、第二戊氧基、正庚氧基及正辛氧基。 如本文使用,「酮基」係指通過羰基橋連接之如本文定義之任何烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基、雜環基、雜芳基或芳基。酮基之實例包括(但不限於)烷醯基(例如,乙醯基、丙醯基、丁醯基、戊醯基、己醯基)、烯醯基(例如,丙烯醯基)、炔醯基(例如,乙炔醯基、丙炔醯基、丁炔醯基、戊炔醯基、己炔醯基)、芳醯基(例如,苯甲醯基)、雜芳醯基(例如,吡咯基、咪唑基、喹啉基、吡啶基)。 如本文使用,「烷氧基羰基」係指通過羰基橋連接之如上文定義之任何烷氧基(即,-C(O)O-烷基)。烷氧基羰基之實例包括(但不限於)甲氧基羰基、乙氧基羰基、異丙氧基羰基、正丙氧基羰基、第三丁氧基羰基、苯甲氧基羰基或正戊氧基羰基。 如本文使用,「芳氧基羰基」係指通過氧基羰基橋連接之如本文定義之任何芳基(即,-C(O)O-芳基)。芳氧基羰基之實例包括(但不限於)苯氧基羰基及萘氧基羰基。 如本文使用,「雜芳氧基羰基」係指通過氧基羰基橋連接之如本文定義之任何雜芳基(即,-C(O)O-雜芳基)。雜芳氧基羰基之實例包括(但不限於)2-吡啶氧基羰基、2-噁唑氧基羰基、4-噻唑氧基羰基或嘧啶氧基羰基。 如本文使用,「芳基」或「芳族」意謂各環中具有多達7個原子之任何穩定單環狀或多環狀碳環,其中至少一個環為芳族環。芳基之實例包括(但不限於)苯基、萘基、蒽基、四氫萘基、二氫茚基及聯苯。在其中芳基取代基為雙環狀取代基及一個環為非芳族之情況下,應瞭解連接係經由該芳族環。芳基係如正常化合價允許於任何位置上視需要經單、二、三、四或五取代。 如本文使用,術語「雜芳基」表示各環中具有多達7個原子之穩定單環狀或多環狀環,其中至少一個環為芳族環且含有1至4個選自由以下組成之群之雜原子:O、N及S。雜芳基之實例包括(但不限於)吖啶基、哢唑基、噌啉基、喹喔啉基、吡唑基、吲哚基、苯并三唑基、呋喃基、噻吩基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、苯并咪唑酮基、苯并噁唑酮基、喹啉基、異喹啉基、二氫異吲哚酮基、咪唑并吡啶基、異吲哚酮基、吲唑基、噁唑基、噁二唑基、異噁唑基、吲哚基、吡嗪基、噠嗪基、吡啶基、嘧啶基、吡咯基、四氫喹啉。亦瞭解「雜芳基」包括任何含氮雜芳基之N-氧化物衍生物。在其中該雜芳基取代基為雙環狀及一個環為非芳族環或不含有雜原子之情況下,應瞭解連接係經由芳族環或經由含有雜原子之環。雜芳基係如正常化合價允許於任何位置上視需要經單、二、三、四或五取代。 如本文使用,術語「雜環」、「雜環狀」或「雜環基」意謂含有1至4個選自由O、N及S組成之群之雜原子之3至14員芳族或非芳族雜環(包括多環狀基團)。如本文使用,亦認為術語「雜環狀」與術語「雜環」及「雜環基」同義及應瞭解亦具有本文闡述之相同定義。「雜環基」包括上文提及之雜芳基,及其二氫及四氫類似物。雜環基之實例包括(但不限於)氮雜環丁烷基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并呋咱基、苯并吡唑基、苯并三唑基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、哢唑基、哢啉基、噌啉基、呋喃基、咪唑基、吲哚啉基、吲哚基、吲哚吖嗪基(indolazinyl)、吲唑基、異苯并呋喃基、異吲哚基、異喹啉基、異噻唑基、異噁唑基、萘并吡啶基、噁二唑基、側氧基噁唑啶基、噁唑基、噁唑啉基、側氧基哌嗪基、側氧基吡咯啶基、側氧基嗎啉基、異噁唑啉基、氧雜環丁烷基、吡喃基、吡嗪基、吡唑基、噠嗪基、吡啶并吡啶基、噠嗪基、吡啶基、吡啶酮基、嘧啶基、嘧啶酮基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、喹喔啉基、四氫吡喃基、四氫呋喃基、四氫噻喃基、四氫異喹啉基、四唑基、四唑并吡啶基、噻二唑基、噻唑基、噻吩基、三唑基、1,4-二氧雜環己基、六氫氮雜基(hexahydroazepinyl)、哌嗪基、哌啶基、吡啶-2-酮基、吡咯啶基、嗎啉基、硫嗎啉基、二氫苯并咪唑基、二氫苯并呋喃基、二氫苯并噻吩基、二氫苯并噁唑基、二氫呋喃基、二氫咪唑基、二氫吲哚基、二氫異噁唑基、二氫異噻唑基、二氫噁二唑基、二氫噁唑基、二氫吡嗪基、二氫吡唑基、二氫吡啶基、二氫嘧啶基、二氫吡咯基、二氫喹啉基、二氫四唑基、二氫噻二唑基、二氫噻唑基、二氫噻吩基、二氫三唑基、二氫氮雜環丁烷基、二氧硫嗎啉基、亞甲基二側氧基苯甲醯基、四氫呋喃基及四氫噻吩基及其N-氧化物。雜環基取代基之連接可經由碳原子或經由雜原子發生。雜環基係如正常化合價允許於任何位置上視需要經單、二、三、四或五取代。 一般技術者將容易瞭解及知曉本文揭示之化合物及組合物可具有呈質子化或去質子化狀態之某些原子(例如,N、O或S原子),其取決於其中放置該化合物或組合物之環境。因此,如本文使用,本文揭示之結構設想某些官能基(例如,OH、SH或NH)可經質子化或去質子化。如一般技術者將容易瞭解,本文之揭示內容意欲涵蓋本文揭示之化合物及組合物,無論其等基於環境之pH之質子化狀態。 除非另有定義,否則本文使用之所有技術及科學術語具有與本發明所屬領域之一般技術者通常瞭解相同之含義。儘管與本文描述之方法及材料類似或等效之方法及材料可用於本發明之實務或測試中,但下文描述合適之方法及材料。本文提及之所有公開案、專利申請案、專利案及其他參考文獻以全文引用之方式併入本文中。在互相矛盾之情況下,以本說明書(包括定義)為準。另外,材料、方法及實例僅為說明而非意欲限制本發明。 本發明之其他特徵及優點可自下列詳細說明書及自申請專利範圍中顯而易見。
本申請案主張2016年9月2日申請之美國臨時專利申請案序列第62/383,221號及2016年2月8日申請之美國臨時專利申請案序列第62/456,339號之權利,其等之各者之內容以全文引用之方式併入本文中。 本文描述連接至化合物(諸如治療或診斷化合物)之標靶性配體。在一些實施例中,連接至本文描述之標靶性配體之化合物包括諸如抑制表現之寡聚化合物之治療化合物或由諸如抑制表現之寡聚化合物之治療化合物組成。該等標靶性配體可用以將治療化合物靶向標靶核酸或標靶基因之所需位置。本文亦描述包括標靶性配體及治療化合物之組合物,諸如包括標靶性配體及抑制表現之寡聚化合物或由標靶性配體及抑制表現之寡聚化合物組成之組合物。 本文描述之新穎標靶性配體提供優於先前已知標靶性配體之優點以促進治療化合物之遞送。此等優點包括(例如)製造之容易性及高效性之改善,同時亦提供高效標靶性或生物分佈;活體內及/或活體外之足夠穩定性及/或滿足寡核苷酸治療產品遞送所需之其他改善。該等新穎標靶性配體亦特別適用於作為亞磷醯胺化合物合成,其減少製造成本及負擔,及促進標靶性配體對化合物(尤其抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑))之便捷連接,同時提供類似或在一些情況下經改善之治療化合物之遞送及/或效用。標靶性配體
標靶性配體係由一或更多個標靶性基團或標靶性部分組成,標靶性配體可有助於增強其等連接之化合物之藥物動力或生物分佈性質,及改善結合之組合物之細胞或組織特異性分佈及細胞特異性攝取。一般而言,標靶性配體有助於引導其連接之治療化合物遞送至所需標靶位點。在一些實例中,該標靶性部分可結合至細胞或細胞受體,及引發胞吞以促進治療化合物進入該細胞內。標靶性部分可包括對細胞受體或細胞表面分子或抗體具有親和力之化合物。含有標靶性部分之各種標靶性配體可連接至治療劑及其他化合物以將該劑靶向細胞及特異性細胞受體。標靶性部分之類型包括醣、膽固醇及膽固醇基及類固醇。可結合至細胞受體之標靶性部分包括醣,諸如半乳糖、半乳糖衍生物(諸如N-乙醯基-半乳胺糖)、甘露糖及甘露糖衍生物;其他醣;聚醣;半抗原;維生素;葉酸鹽;生物素;適配體;及肽(諸如含有RGD之肽)、胰島素、EGF及轉鐵蛋白。 已知結合至去唾液酸糖蛋白受體(ASGPR)之標靶性部分特別適用於引導寡聚化合物遞送至肝臟。去唾液酸糖蛋白受體大量表現於肝臟細胞(包括肝細胞)上。靶向ASGPR之細胞受體標靶性部分包括半乳糖及半乳糖衍生物。特別地,半乳糖衍生物之團簇(包括由二、三或四個N-乙醯基-半乳胺糖(GalNAc或NAG)組成之團簇)可促進肝臟細胞攝取某些化合物。結合至寡聚化合物之GalNAc團簇用於引導組合物至肝臟,其中N-乙醯基-半乳胺糖糖類可結合至肝臟細胞表面上之去唾液酸糖蛋白受體。咸信結合至去唾液酸糖蛋白受體引發受體介導之胞吞,藉此促進該化合物進入該細胞之內部。 本文揭示之標靶性配體可包括一、二、三、四或四個以上標靶性部分。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體可包括一、二、三、四或四個以上標靶性部分連接至分支點基團。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體可包括一、二、三、四或四個以上標靶性部分連接至分支點基團,其中各標靶性部分係經由系鏈連接至該分支點基團。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體可包括一、二、三、四或四個以上連接至分支點基團之去唾液酸糖蛋白受體(ASGPR)標靶性部分。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體可包括一、二、三、四或四個以上連接至分支點基團之ASGPR標靶性部分,其中各ASGPR標靶性部分係經由系鏈連接至該分支點基團。 在一些實施例中,分支點基團係連接至連接子。在一些實施例中,該分支點基團包括連接子置換部分,及該分支點基團係連接至治療化合物。在一些實施例中,該分支點基團係連接至寡聚化合物。在一些實施例中,該分支點基團係連接至抑制表現之寡聚化合物。 在一些實施例中,標靶性配體係藉由下式I表示:,其中n為1至4之整數(例如,1、2、3或4) (式I)。在一些實施例中,式I中之n為1至3、1至2、2至4、2至3或3至4之整數。 式I連接子係包括一或更多個經取代或未經取代之選自以下之部分之基團:環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環基,或其共價連接之組合,其將連接子一端上之分支點基團連接至該連接子另一端上之治療化合物(或當該標靶性配體以亞磷醯胺化合物形式合成時連接至亞磷醯胺之磷原子)。在一些實施例中,一或更多個額外之基團諸如可裂解部分(諸如磷酸酯基或含有雙硫鍵之基團)或形成硫代磷酸酯或膦酸酯鍵之基團係嵌入於治療化合物與連接子之間。該等連接子呈「剛性」所以其等向全部標靶性配體賦予足夠之穩定性及剛性以減少式I標靶性部分與其連接之治療化合物之間之相互作用。此進一步可改善標靶性部分與標靶位點之相互作用。另外,用於本文揭示之標靶性配體中之連接子係經特別設計以用於合成亞磷醯胺化合物形式之標靶性配體,此能夠使該標靶性配體高效連接至寡聚化合物之5’末端。 式I分支點基團係能夠使一或更多個標靶性部分(經由一或更多個系鏈)連接至連接子之任何基團。 在一些實施例中,該標靶性配體係藉由下式II表示:,其中n為1至4之整數(例如,1、2、3或4)。在一些實施例中,式II中之n為1至3、1至2、2至4、2至3或3至4之整數。 在式II中,分支點基團係能夠使一或更多個標靶性部分(經由一或更多個系鏈)經由連接子置換部分連接至治療化合物(或當標靶性配體係以亞磷醯胺化合物形式合成時連接至亞磷醯胺之磷原子)之任何基團。如本文使用,當該分支點基團包括一或更多個經取代或未經取代之環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環基或其組合(包括稠合基團)於分支點基團內時,分支點基團包括連接子置換部分,其發揮與如本文揭示之式I剛性連接子相同之作用。 一或更多個式I及II系鏈係充當間隔之基團,其等可進一步向標靶性部分與分支點基團之間之連接添加可撓性及/或長度。該系鏈提供將標靶性部分連接至該分支點基團之高效方法。就本文揭示之標靶性配體而言,各標靶性部分具有至少一個系鏈。在一些實施例中,分支點基團與標靶性部分之間具有多個(即,兩個或更多個)系鏈。 式I及II標靶性部分係有助於增強其等連接之治療化合物之藥物動力或生物分佈性質之基團,及改善經結合之組合物之細胞或組織特異性分佈及細胞特異性攝取。標靶性部分可包括對細胞受體或細胞表面分子或抗體具有親和力之化合物。標靶性部分之類型包括醣、膽固醇及膽固醇基及類固醇。可結合至細胞受體之標靶性部分包括醣,諸如半乳糖、半乳糖衍生物(諸如N-乙醯基-半乳胺糖)、甘露糖及甘露糖衍生物;其他醣;聚醣;半抗原;維生素;葉酸鹽;生物素;適配體;及肽(諸如含有RGD之肽)、胰島素、EGF及轉鐵蛋白。 本文揭示之標靶性配體可連接至治療化合物。在一些實施例中,該標靶性配體係經由額外之連接子及/或可裂解部分(其然後連接至該治療化合物)連接至該治療化合物。在一些實施例中,標靶性配體拼接至該治療化合物本身。 在一些實施例中,該治療化合物係寡聚化合物。在一些實施例中,該治療化合物係抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係RNAi劑。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係雙股RNAi劑。 在一些實施例中,標靶性配體係直接或間接連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端。在一些實施例中,該標靶性配體係直接或間接連接至雙股RNAi劑之正義股之3’末端。在一些實施例中,該標靶性配體係直接或間接連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端或3’末端。在一些實施例中,該標靶性配體係直接或間接連接至單股RNAi劑之5’末端或3’末端。 在一些實施例中,標靶性配體係經由磷酸酯、膦酸酯、硫代磷酸酯或其他核苷間連接基團與雙股RNAi劑之正義股之末端核苷之5’末端連接而連接至該雙股RNAi劑。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體包括可裂解部分。在一些實施例中,可裂解部分包括磷酸酯或其他可裂解核苷間連接基團或由磷酸酯或其他可裂解核苷間連接基團組成。在一些實施例中,該標靶性配體經由可裂解部分連接至治療化合物。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係連接至一個或複數個包括可裂解部分之額外基團。在一些實施例中,該標靶性配體係連接至可裂解部分(其然後連接至抑制表現之寡聚化合物)。 在一些實施例中,該標靶性配體係含有亞磷醯胺之化合物。包括本文描述之標靶性配體之亞磷醯胺化合物可用於使用此項技術中通常已知用於亞磷醯胺合成之方法將該標靶性配體輕易結合至治療化合物或結合至其他基團。在一些實施例中,使用此項技術中通常已知的方法將包括該標靶性配體之亞磷醯胺化合物連接至抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,將含有亞磷醯胺之標靶性配體連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端。 在一些實施例中,連接至標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物包括單股寡核苷酸。在一些實施例中,該單股寡核苷酸係單股反義寡核苷酸。在一些實施例中,該標靶性配體係直接連接至單股反義寡核苷酸。在一些實施例中,將額外之基團嵌入於標靶性配體與單股寡核苷酸之間。 在一些實施例中,連接至RNAi劑之標靶性配體包括一或更多個N-乙醯基-半乳胺糖糖類作為標靶性部分或標靶性部分。 在一些實施例中,連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體包括系鏈,其包括聚乙二醇(PEG)。在一些實施例中,系鏈由PEG組成。在一些實施例中,系鏈包括具有1至10個乙二醇單元之PEG。在一些實施例中,系鏈包括具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個乙二醇單元之PEG。 在一些實施例中,連接至本文揭示之標靶性配體中之任何一者之抑制表現之寡聚化合物包括RNAi劑。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係直接或間接連接至RNAi劑。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係直接連接至RNAi劑。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係間接連接至RNAi劑,因為額外之基團係嵌入於RNAi劑與標靶性配體之連接子之間。在一些實施例中,第二連接子係包括於連接子與治療化合物之間。連接子
本文揭示之標靶性配體包含連接子(如式I中顯示)或或者分支點基團包括連接子置換部分(如式II中顯示)。 連接子係一端連接至分支點基團及另一端連接至治療化合物(或當標靶性配體係以亞磷醯胺化合物形式合成時連接至亞磷醯胺之磷原子)之原子之基團。在一些實施例中,該連接子係一端連接至分支點基團,及另一端拼接至一個或複數個基團,其(等)然後拼接至抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,該連接子係直接連接至寡聚化合物。在一些實施例中,該連接子係連接至可裂解部分,其然後將連接至寡聚化合物。可裂解部分之實例包括(例如)磷酸酯基、包括二硫化物部分之基團及/或其他可裂解核苷間鍵。在一些實施例中,該連接子係非連接至可裂解部分。在一些實施例中,該連接子係連接至硫代磷酸酯或膦酸酯基。 就根據式I之本文揭示之標靶性配體而言,連接子為「剛性」連接子。剛性連接子為包括一或更多個經取代或未經取代之環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環基或其共價連接之組合之連接基團。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構1)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構2)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構3)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構4)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構5)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構6a)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構6b)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構6c)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:(結構6d)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:,其中n為0至10之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10),及就各Z′存在時而言,Z′係經獨立選擇,及Z′獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如,F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構7)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:,其中n為0至4之整數(例如,1、2、3或4),及就各Z''存在時而言,Z''係經獨立選擇,及Z''獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如,F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構8)。 在一些實施例中,式I標靶性配體包括具有下列結構之連接子或由具有下列結構之連接子組成:,其中V包括以下或由以下組成:一或更多個經取代或未經取代之環烷基(例如,環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、環烯基(例如,環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、芳基(例如,苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、雜芳基(例如,吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或雜環基(例如,四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何共價連接之組合。(結構9)。 在一些實施例中,適用於本文揭示之標靶性配體中之連接子係產生自包括一端具有末端羧酸部分(或其活性酯)及另一端具有末端乙醇部分之剛性結構之化合物。在一些實施例中,該乙醇部分係二級醇。在一些實施例中,該乙醇部分係三級醇。在一些實施例中,該乙醇部分係一級醇。該羧酸部分(或其活性酯)係適用於對分支點基團之結合,而該乙醇部分係適用於通過使用亞磷醯胺形成試劑之亞磷酸化之結合至亞磷醯胺之磷原子。本文揭示之連接子結果係適用於製備作為亞磷醯胺化合物之標靶性配體。 在一些實施例中,連接子係連接至為雙股RNAi劑之抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,該連接子係連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端。在一些實施例中,該連接子係連接至雙股RNAi劑之正義股之3’末端。在一些實施例中,該連接子係連接至雙股RNAi劑之反義股之3’末端。在一些實施例中,該連接子係連接至雙股RNAi劑之反義股之5’末端。 在一些實施例中,該連接子係連接至可裂解部分。在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物之末端磷酸酯基可充當可裂解部分。在一些實施例中,經獨立選擇之可裂解部分係連接至連接子。如本文使用,可裂解部分係於細胞外穩定,但一經進入標靶性細胞內即裂解之基團。可裂解部分易在某些條件(諸如pH)或某些裂解劑(諸如促進降解之分子)或氧化還原劑下裂解。 在一些實施例中,可裂解部分係雙硫鍵,其易受pH影響。例如,已知胞內體及溶酶體通常具有比人類血液(約7.35至7.45之pH)更酸性pH (約4.5至6.5之pH),及因此可促進可裂解部分之裂解。 在一些實施例中,可裂解部分係磷酸酯基。磷酸酯基可藉由已知降解或水解磷酸酯基之試劑裂解。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體包含分支點基團,其包括連接子置換基團,而非連接子,如式II中顯示。當該連接子係經連接子置換部分置換,則該連接子置換部分為該分支點基團之一部分。 在一些實施例中,本文揭示之連接子及連接子置換部分允許併入僅標靶性配體之單一異構物,其可為寡核苷酸治療產品提供額外之優點。分支點基團
本文揭示之標靶性配體包含至少一個分支點基團。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體之分支點基團係連接至連接子。在一些實施例中,該分支點基團之一端係連接至連接子,及該分支點基團之另一端係連接至一或更多個系鏈。在一些實施例中,該分支點基團係經由額外之基團連接至抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,該分支點基團包括連接子置換部分及係連接至抑制表現之寡聚化合物。 本文揭示之分支點基團可具有允許一或更多個標靶性部分之結合及進一步允許對本文揭示之連接子之結合之任何基團,或或者,若該分支點基團包含連接子置換部分,則該分支點基團可為包括允許至治療化合物(諸如抑制表現之寡聚化合物)之結合之連接子置換部分之任何基團。 就本文揭示之式I之分支點基團而言,在結合至連接子前,有助於形成該分支點基團之分支點基團化合物針對對連接子之各所需連接具有一個端胺,及針對對系鏈之各所需連接具有一個末端羧酸部分(或其活性酯)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有選自下列之結構之分支點:(結構201);(結構202);(結構203);(結構204);(結構205);(結構206);(結構207);(結構208)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點:,其中n為1至20之整數(結構209)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點:,其中m為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20)(結構210)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括由下列表示之結構之分支點:,其中m為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);x為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10);y為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);z為1至4之整數(例如,1、2、3或4);及K選自由以下組成之群:經取代或未經取代之環烷基(例如,環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如,環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如,苯基、萘基、聯萘基、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如,吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)及經取代或未經取代之雜環基(例如,四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其共價連接之組合(結構211)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點:,其中m為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);x為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10);及y為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10)(結構212)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點:,其中m為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20);x為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10);y為1至10之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或10);及G選自由以下組成之群:;;;;;;;或任何經取代或未經取代之具有5、6、7、8或9個原子之環大小之環狀或雜環狀結構,例如,經取代或未經取代之環烷基(例如,環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如,環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如,苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如,吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或經取代或未經取代之雜環基(例如,四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)(結構213)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:,其中n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20)(結構214)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:,其中n為0至20之整數(例如,0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及Q選自由以下組成之群:;;;;;;;及(結構215)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:(結構216)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:(結構217)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:(結構218)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之分支點基團:,其中n為選自1至7之整數(例如,1、2、3、4、5、6或7)(結構219)。在一些實施例中,結構219中之n為1。在一些實施例中,結構219中之n為2。在一些實施例中,結構219中之n為3。在一些實施例中,結構219中之n為4。在一些實施例中,結構219中之n為5。在一些實施例中,結構219中之n為6。在一些實施例中,結構219中之n為7。 在一些實施例中,該標靶性配體包括分支點基團,其包括連接子置換基團。 在一些實施例中,該標靶性配體包括分支點基團,其包括具有由下列表示之結構之連接子置換部分:(結構220)或(結構221)。系鏈
本文揭示之標靶性配體包含一或更多個系鏈。系鏈係連接分支點基團與各標靶性部分。在一些實施例中,該系鏈一端直接連接至標靶性配體及另一端直接連接至分支點基團。在一些實施例中,該系鏈一端直接連接至標靶性配體,及另一端間接連接至分支點基團。在一些實施例中,該系鏈一端間接連接至標靶性配體及另一端間接連接至分支點基團。在一些實施例中,本文描述之標靶性配體包括三個系鏈及三個標靶性部分。在一些實施例中,本文描述之標靶性配體包括四個系鏈及四個標靶性部分。在一些實施例中,本文描述之標靶性配體包括一個系鏈及一個標靶性部分。在一些實施例中,本文描述之標靶性配體包括多個系鏈及多個標靶性部分。 在一些實施例中,另外之系鏈或其他基團係嵌入於系鏈與式I或式II標靶性部分之間。在一些實施例中,第二系鏈係嵌入於系鏈與式I或式II標靶性部分之間。在一些實施例中,第二系鏈及第三系鏈係嵌入於系鏈與式I或式II標靶性部分之間。在一些實施例中,第二、第三及第四系鏈係嵌入於系鏈與式I或式II標靶性部分之間。如本文揭示,每個標靶性部分存在至少一個系鏈。在一些實施例中,各標靶性部分存在多於一個系鏈。本文揭示之標靶性配體欲涵蓋此等組合物。 在一些實施例中,另外之基團可嵌入於系鏈與式I或式II分支點基團之間。 如本文揭示,系鏈充當間隔,其可進一步向標靶性部分與分支點基團、連接子及治療化合物間之連接添加可撓性及/或長度。在一些實施例中,該系鏈包括烷基(包括環烷基)、烯基(包括環烯基)、炔基、芳基、芳烷基、芳烯基或芳炔基。在一些實施例中,該系鏈包括一或更多個雜原子、雜環、雜芳基、胺基酸、核苷酸或醣。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中n為1至20之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH(結構301)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中X為O、S或NH(結構302)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:(結構302a)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中n為1至20之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH。(結構303)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中n為1至20之整數(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH。(結構304)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中X為O、S或NH(結構305)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括具有下列結構之系鏈:,其中X為O、S或NH(結構306)。 在一些實施例中,該標靶性配體包括多於一種類型之系鏈。在一些實施例中,該系鏈充當可撓性親水性間隔(參見,例如,U.S. 5,885,968;及Biessen等人,J. Med. Chem. 1995, 39, 1538-1546,以全文引用之方式將其等中之兩者均併入本文中),及包括PEG間隔。在其他實施例中,該PEG間隔具有1至20個伸乙基單元(PEG1
至PEG20
)。例如,該PEG間隔具有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個伸乙基單元。標靶性部分
本文揭示之標靶性配體可包括一至四個或多於四個標靶性部分。 在一些實施例中,該標靶性配體可為半乳糖團簇。如本文使用,半乳糖團簇包括具有二至四個末端半乳糖衍生物之標靶性配體。如本文使用,術語半乳糖衍生物包括半乳糖及具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力等於或大於半乳糖針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之半乳糖衍生物。半乳糖衍生物係醣類糖,其為標靶性部分之一種類型。末端半乳糖衍生物係通過該醣之C-1碳連接至系鏈。 在一些實施例中,該標靶性配體係由三個各具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之末端半乳胺糖或半乳胺糖衍生物(諸如N-乙醯基-半乳胺糖)組成。在一些實施例中,該標靶性配體包括三個作為標靶性部分之末端N-乙醯基-半乳胺糖(GalNAc或NAG)。例如,結構1001、1002、1003及1004中之各者為具有三個作為標靶性部分之末端N-乙醯基-半乳胺糖之標靶性配體。 在一些實施例中,各標靶性部分包括半乳胺糖衍生物,其係N-乙醯基-半乳胺糖。可用作標靶性部分之具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之其他醣可選自包括以下之列表:半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基半乳胺糖及N-異丁醯基半乳胺糖。許多半乳糖衍生物針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力已經研究(參見,例如,Iobst, S.T.及Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686,以全文引用之方式併入本文中)或使用此項技術中熟知及常用之方法易於進行測定。 在一些實施例中,該標靶性部分為細胞-標靶性部分。 在一些實施例中,該標靶性部分包括N-乙醯基-半乳胺糖:在一些實施例中,該標靶性配體包括三個標靶性部分。在一些實施例中,該標靶性配體包括四個標靶性部分。在一些實施例中,該標靶性配體包括一個標靶性部分。在一些實施例中,該標靶性配體包括兩個標靶性部分。在一些實施例中,該標靶性配體包括四個或更多個標靶性部分。 在一些實施例中,該標靶性部分包括以下中之一或更多者:半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基-半乳胺糖、N-乙醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基半乳胺糖或N-異丁醯基半乳胺糖。 例如,在一些實施例中,結構1001至1027中之任何一者中之N-乙醯基-半乳胺糖標靶性部分可經替代標靶性部分置換。此等替代標靶性部分包括(例如)半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基-半乳胺糖、N-乙醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基半乳胺糖或N-異丁醯基半乳胺糖。 另外,在一些實施例中,結構1001至1027之標靶性部分可經(例如)其他醣;聚醣;半抗原;維生素;葉酸鹽;生物素;適配體及/或肽(諸如含有RGD之肽);胰島素;EGF及/或轉鐵蛋白置換。 在一些實施例中,該標靶性配體係以N-乙醯基-半乳胺糖三聚物之形式。在一些實施例中,該標靶性配體係以N-乙醯基-半乳胺糖四聚物之形式。代表性標靶性配體結構及包括標靶性配體之亞磷醯胺化合物
本文揭示之標靶性配體可由一或更多個標靶性部分、系鏈、分支點基團及連接子組成。本文揭示之標靶性配體可由一、二、三、四或多於四個標靶性部分組成。 在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體係合成為亞磷醯胺化合物之形式。亞磷醯胺廣泛用於RNA及DNA之化學合成中。在一些實施例中,本文揭示之含亞磷醯胺之標靶性配體係添加至雙股RNAi劑之正義股之5’端。當標靶性配體連接至抑制表現之寡聚化合物之5’末端時可尤其有利於製備呈亞磷醯胺形式之標靶性配體。不希望受理論束縛,應瞭解當標靶性配體連接至抑制表現之寡聚化合物之5’末端時製備呈亞磷醯胺形式之標靶性配體容許標靶性配體作為最後組分來連接(因此減少製造成本)及潛在允許該標靶性配體在該標靶性配體連接至雙股RNAi劑之正義股之5’末端時阻礙將正義股裝載至RISC內。當抑制表現之寡聚化合物為雙股RNAi劑時,當標靶性配體連接至RNAi劑之正義股之5’末端時,該標靶性配體可製備成亞磷醯胺化合物。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1001)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1001a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1001a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1001b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1002)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1002a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1002a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1002b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1003)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1003a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1003a(i))。 在一些實施例中,標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1003b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1004)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1004a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1004a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1004b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1005)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1005a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1005a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1005b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1006)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1006a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1006a(i))。 在一些實施例中,標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1006b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1007)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1007a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1007a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1007b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1008)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1008a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1008a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1008b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1009)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1009a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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或NH-
。(結構1009a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1009b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1010)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1010a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1010a(i))。 在一些實施例中,標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1010b)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且包括由下列表示之結構:,其中J包括以下或由以下組成:一或更多個經取代或未經取代之環烷基、環烯基、芳基、雜芳基或雜環基或其共價連接之組合;Y係O或S;R包括抑制表現之寡聚化合物;及Y'係O-
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(結構1011)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1012)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1012a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1012a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1012b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1013)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1013a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1013a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1013b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1014)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1014a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
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。(結構1014a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1014b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1015)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1015a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1015a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1015b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1016)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1016a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
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。(結構1016a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1016b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1017)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1017a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1017a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1017b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1018)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1018a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1018a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1018b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1019)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1019a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1019a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1019b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1020)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1020a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1020a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1020b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1021)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1021a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1021a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1021b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1022)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1022a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1022a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1022b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1023)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1023a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1023a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1023b)。 在一些實施例中,如本文揭示,標靶性配體之連接子可不存在,只要分支點基團包括至少一個芳基、環烷基及/或雜環狀基團。具有位於該分支點基團內之一或更多個芳基、環烷基及/或雜環狀基團充當連接子置換基團。在一些實施例中,該分支點基團內之一或更多個芳基、環烷基及/或雜環狀基團係放置於該分支點基團之中央連接點與抑制表現之寡聚化合物之間。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1024)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1024a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1024a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1024b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1025)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1025a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1025a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1025b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構: (結構1026)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1026a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
、S-
或NH-
。(結構1026a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1026b)。 在一些實施例中,該標靶性配體具有由下列表示之結構:(結構1027)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物。(結構1027a)。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係連接至標靶性配體且具有由下列表示之結構:,其中R由抑制表現之寡聚化合物組成或包括抑制表現之寡聚化合物;Y係O或S;及Y'係O-
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。(結構1027a(i))。 在一些實施例中,該標靶性配體係具有由下列表示之結構之含有亞磷醯胺之化合物:(結構1027b)。 在一些實施例中,該標靶性配體係以半乳糖團簇之形式。如本文使用,半乳糖團簇包括具有二至四個末端半乳糖衍生物之標靶性配體。如本文使用,術語半乳糖衍生物包括半乳糖及具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力等於或大於半乳糖針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之半乳糖衍生物兩者。半乳糖衍生物係醣類糖,其為標靶性部分之一種類型。末端半乳糖衍生物可通過該醣之C-1碳連接至系鏈。 在一些實施例中,該標靶性配體係由三個各具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之末端半乳胺糖或半乳胺糖衍生物(諸如N-乙醯基-半乳胺糖)組成。在一些實施例中,該標靶性配體包括三個作為標靶性部分之末端N-乙醯基-半乳胺糖(GalNAc或NAG)。 在一些實施例中,該標靶性配體係由四個各具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之末端半乳胺糖或半乳胺糖衍生物(諸如N-乙醯基-半乳胺糖)組成。在一些實施例中,該標靶性配體包括四個作為標靶性部分之末端N-乙醯基-半乳胺糖(GalNAc或NAG)。 在一些實施例中,各標靶性部分包括半乳胺糖衍生物,其係N-乙醯基-半乳胺糖。可用作標靶性部分之具有針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力之其他醣可選自包括以下之列表:半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基-半乳胺糖、N-乙醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基半乳胺糖及N-異丁醯基半乳胺糖。許多半乳糖衍生物針對去唾液酸糖蛋白受體之親和力已經研究(參見例如:Iobst, S.T.及Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686)或使用此項技術中熟知及常用之方法易於進行測定。 當涉及三個末端N-乙醯基-半乳胺糖時此項技術中常用之術語包括三觸角、三價及三聚物。 當涉及四個末端N-乙醯基-半乳胺糖時此項技術中常用之術語包括四觸角、四價及四聚物。寡聚化合物
本文揭示之標靶性配體可連接至寡聚化合物。在一些實施例中,該寡聚化合物係抑制表現之寡聚化合物。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係RNAi劑。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係雙股RNAi劑。在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係單股寡核苷酸。該抑制表現之寡聚化合物可使用此項技術中常用之方法合成。 該等抑制表現之寡聚化合物可包括一或更多個經修飾之核苷酸。核苷酸鹼基(或核酸鹼基)係雜環狀嘧啶或嘌呤化合物,其係所有核酸之組成且包括腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧碇(T)及尿嘧啶(U)。如本文使用,術語「核苷酸」可包括經修飾之核苷酸或核苷酸模擬物、鹼基位點或替代置換部分。如本文使用,「經修飾之核苷酸」係核苷酸、核苷酸模擬物、鹼基位點或除核糖核苷酸(2'-羥基核苷酸)外之替代置換部分。在一些實施例中,經修飾之核苷酸包括2'-經修飾之核苷酸(即,於五員糖環之2'位置處具有除羥基外之基團之核苷酸)。經修飾之核苷酸包括(但不限於):2'-經修飾之核苷酸、2'O甲基核苷酸(本文表示為核苷酸序列中之小寫字母「n」)、2'-脫氧-2'-氟核苷酸(本文表示為Nf,本文亦表示為2'-氟核苷酸)、2'-脫氧核苷酸(本文表示為dN)、2'-甲氧基乙基(2'-O-2-甲氧基乙基)核苷酸(本文表示為NM或2'-MOE)、2'-胺基核苷酸、2'-烷基核苷酸、3'至3'連接(反向)核苷酸(本文表示為invdN、invN、invn、invX)、非天然鹼基(包括核苷酸、鎖定核苷酸、橋接核苷酸、肽核酸)、2',3'-斷核苷酸模擬物(解鎖核酸鹼基類似物,本文表示為NUNA
或NUNA)、鎖定核苷酸(本文表示為NLNA
或NLNA)、3'-O-甲氧基(經2'核苷間酸連接之)核苷酸(本文表示為3'-OMen)、2'-F-阿拉伯糖基核苷酸(本文表示為NfANA或NfANA
)、嗎啉基核苷酸、乙烯基膦酸酯脫氧核糖核苷酸(本文表示為vpdN)、乙烯基膦酸酯核苷酸及鹼基核苷酸(本文表示為X或Ab)。給定化合物中非所有位置必需待均勻修飾。反之,多於一種修飾可併入單一抑制表現之寡聚化合物中或甚至其單一核苷酸中。抑制表現之寡聚化合物可藉由此項技術中已知的方法合成及/或修飾。各核苷酸處之修飾係獨立於其他核苷酸之修飾。 經修飾之核酸鹼基包括合成及天然核酸鹼基,諸如5-經取代之嘧啶、6-氮雜胞嘧啶、N-2-、N-6-及O-6-經取代之嘌呤(例如,2胺基丙基腺嘌呤)、5-丙炔基尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5羥基甲基胞嘧啶、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、腺嘌呤及鳥嘌呤之6-甲基及其他烷基衍生物、腺嘌呤及鳥嘌呤之2-丙基及其他烷基衍生物、2-硫尿嘧啶、2-硫胸腺嘧碇、2-硫胞嘧啶、5-鹵尿嘧啶、5-鹵胞嘧啶、5丙炔基尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、6-偶氮基-尿嘧啶、6-偶氮基-胞嘧啶、6-偶氮基-胸腺嘧碇、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4硫尿嘧啶、8-鹵、8胺基、8-硫醇、8-硫烷基、8-羥基及其他8-經取代之腺嘌呤及鳥嘌呤、5-經取代之尿嘧啶及胞嘧啶(例如,5-鹵尿嘧啶及胞嘧啶(例如,5-溴尿嘧啶及5-溴胞嘧啶)、5-三氟甲基尿嘧啶、5-三氟甲基胞嘧啶)、7-甲基鳥嘌呤、7-甲基腺嘌呤、8-氮雜鳥嘌呤、8-氮雜腺嘌呤、7脫氮鳥嘌呤、7脫氮腺嘌呤、3-脫氮鳥嘌呤及3-脫氮腺嘌呤。 就本文描述之抑制表現之寡聚化合物而言,任何經修飾之核苷酸可藉由含有磷酸酯或含有非磷酸酯之共價核苷間連接進行連接。經修飾之核苷間連接或主鏈包括(但不限於)5’硫代磷酸酯基(本文表示為核苷酸前之小寫字母「s」,如於sN、sn、sNf或sdN中)、對掌性硫代磷酸酯、硫磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、胺基烷基-磷酸三酯、甲基及其他烷基膦酸酯(包括3′-伸烷基膦酸酯及對掌性膦酸酯、次膦酸酯)、胺基磷酸酯(包括3′-胺基胺基磷酸酯及胺基烷基胺基磷酸酯、硫羰基胺基磷酸酯)、硫羰基烷基-膦酸酯、硫羰基烷基磷酸三酯、嗎啉基連接、具有正常3'-5'連接之硼烷磷酸酯、硼烷磷酸酯之經2'-5'連接之類似物及具有反向極性之硼烷磷酸酯,其中相鄰核苷單元對係經3'-5'連接至5'-3'或2'-5'連接至5'-2'。在一些實施例中,經修飾之核苷間連接或主鏈缺乏磷原子。缺乏磷原子之經修飾之核苷間連接包括(但不限於)短鏈烷基或環烷基糖間連接、混合雜原子及烷基或環烷基糖間連接或一或更多個短鏈雜原子或雜環狀糖間連接。在一些實施例中,經修飾之核苷間主鏈包括(但不限於)矽氧烷主鏈、硫化物主鏈、亞碸主鏈、碸主鏈、甲醯基及硫甲醯基主鏈、亞甲基甲醯基及硫甲醯基主鏈、含有烯烴之主鏈、胺磺酸鹽主鏈、亞甲基亞胺基及亞甲基肼基主鏈、磺酸酯及磺醯胺主鏈、醯胺主鏈及具有混合N、O、S及CH2
組分之其他主鏈。 在一些實施例中,抑制表現之寡聚化合物係雙股RNAi劑,且包括彼此至少部分互補(至少70%互補)之正義股及反義股。該反義股含有具有與標靶mRNA中之序列完美互補(100%互補)或至少大體上互補(至少85%互補)之序列之區。雙股RNAi劑正義股及反義股之長度各可為16至30個核苷酸之長度。該等正義股及反義股之長度可相同或可不同。在一些實施例中,該正義股為之長度約19個核苷酸而該反義股之長度為約21個核苷酸。在一些實施例中,該正義股之長度為約21個核苷酸而該反義股之長度為約23個核苷酸。在其他實施例中,該等正義股及反義股之長度各獨立為17至21個核苷酸。在一些實施例中,正義股及反義股兩者之長度各為21至26個核苷酸。在一些實施例中,正義股及反義股兩者之長度各為26個核苷酸。在一些實施例中,正義股及反義股兩者之長度各獨立為17至26個核苷酸。在一些實施例中,雙股RNAi劑具有約16、17、18、19、20、21、22、23或24個核苷酸之雙鏈體長度。此於正義股與反義股之間完美或大體上互補之區之長度通常為15至25個核苷酸(例如,長度為15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸)及出現於反義股之5′末端處或反義股之5′末端附近。 結合至本文揭示之配體之抑制表現之寡聚化合物視需要且獨立包括於核心序列之3' 末端、5'末端或3'及5'末端兩者處之額外之1、2、3、4、5或6個核苷酸(作為延長)。此等額外之核苷酸(若存在)可與標靶mRNA中相應之序列互補或可與標靶mRNA中相應之序列不互補。 在一些實施例中,當雙股RNAi劑係結合至本文揭示之標靶性配體時,額外之正義股額外之核苷酸(若存在)可與標靶mRNA中相應之序列相同或不同。額外之反義股額外之核苷酸(若存在)可與正義股之相應之額外之核苷酸(若存在)互補或可與正義股之相應之額外之核苷酸(若存在)不互補。 雙股RNAi劑可藉由用正義股退火反義股形成。 在一些實施例中,標靶性配體係於RNAi劑之正義股或反義股之3'或5'末端處連接至RNAi劑。在一些實施例中,該標靶性配體係連接至正義股之5’末端。在一些實施例中,該標靶性配體係連接至正義股之3'末端。在一些實施例中,該標靶性配體係經由不穩定、可裂解或可逆鍵連接至該RNAi劑。在一些實施例中,該不穩定、可裂解或可逆鍵係包括於添加於RNAi劑與標靶性配體之間之可裂解部分中。 在一些實施例中,該抑制表現之寡聚化合物係單股寡核苷酸。在一些實施例中,該單股寡核苷酸利用RNA干擾機制以抑制標靶mRNA之表現。在一些實施例中,該等單股寡核苷酸致力於通過除RNA干擾外之機制減少標靶核酸之表現。 在一些實施例中,投與結合至抑制表現之寡聚化合物之所描述之標靶性配體之個體中標靶之基因表現含量及/或mRNA含量相對於投與前之個體或未接受標靶性配體結合物之個體係減少至少約5%,例如,減少至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%。個體中基因表現含量及/或mRNA含量可於該個體之細胞、細胞群及/或組織中經減少。在一些實施例中,已經投與結合至抑制表現之寡聚化合物之所描述之標靶性配體之個體中蛋白含量相較於投與該標靶性配體結合物前之個體或未接受該標靶性配體結合物之個體係減少至少約5%,例如,減少至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%。該個體中蛋白含量可於該個體之細胞、細胞群、組織、血液及/或其他流體中經減少。基因表現、mRNA或蛋白含量之減少可藉由此項技術中已知的任何方法評估。本文將mRNA含量及/或蛋白含量之減少或減小共同稱為經靶向基因之抑制、減小或減少。 此項技術中已知可與本文揭示之標靶性配體一起使用之抑制特異性表現之寡聚化合物。特定言之,許多參考文獻揭示抑制表現之寡聚化合物,其等可結合至本文揭示之標靶性配體以向肝臟遞送組合物。非限制性實例包括美國專利申請案序列第15/281,309號(標題為Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of LPA,該案以全文引用之方式併入本文中)揭示靶向人類載脂蛋白(a)基因[LPA] (以抑制apo(a)蛋白之表現,其係脂蛋白(a)顆粒之一部分,及藉此抑制脂蛋白(a)顆粒(Lp(a))之表現)之各種雙股抑制表現之寡聚化合物,其等適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用。同樣地,例如,美國專利申請案序列第15/229,314號(標題為RNAi Therapy for Hepatitis B Virus Infection,該案亦以全文引用之方式併入本文中)揭示靶向乙型肝炎病毒之各種雙股抑制表現之寡聚化合物,其等係適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用。此外,作為另一實例,美國專利申請案序列第15/229,314號(標題為Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Factor XII,該案以全文引用之方式併入本文中)揭示靶向因子XII (或因子12,F12)基因之各種雙股抑制表現之寡聚化合物,其等係適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用。另外,作為另一實例,美國專利申請案序列第14/740,307號(標題為Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Alpha-1 AntiTrypsin,該案以全文引用之方式併入本文中)揭示靶向α-1抗胰蛋白酶(或AAT)基因之各種雙股抑制表現之寡聚化合物,其等適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用。此外,WO 2016/01123(標題為Organic Compositions to Treat APOC3-Related Diseases,該案以全文引用之方式併入本文中)揭示靶向人類載脂蛋白III (APOC3)之各種雙股抑制表現之寡聚化合物,其等係適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用。揭示可適用於與本文揭示之標靶性配體一起使用之各種治療化合物(包括抑制表現之寡聚化合物)之額外參考文獻亦可發現於此項技術中。此等包括(但不限於)其中需要靶向肝臟之組合物。醫藥組合物及調配物
本文揭示之標靶性配體當連接至寡聚化合物時可用以治療患有將受益於該化合物之投與之疾病或病症之個體(例如,人類或哺乳動物)。在一些實施例中,本文揭示之標靶性配體當連接至抑制表現之寡聚化合物時可用以治療患有受益於標靶mRNA之表現之減少或抑制之疾病或病症之個體(例如,人類)。該個體係被投與治療有效量之連接至本文揭示之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑)中之任何一者或更多者。該個體可為人類、病患或人類病患。該個體可為成人、青少年、兒童或胎兒。包括連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體之本文描述之醫藥組合物可用以提供用於治療性治療疾病之方法。此等方法包括向人類或動物投與本文描述之醫藥組合物。 本文描述之醫藥組合物及方法可減小細胞、細胞群、組織或個體中標靶mRNA之含量,其包括:向該個體投與治療有效量之連接至標靶性配體之本文描述之抑制表現之寡聚化合物,藉此抑制個體中標靶mRNA之表現。在一些實施例中,該個體先前已識別為患有靶向細胞及組織中標靶基因之病原上調。 在一些實施例中,醫藥組合物包括至少一種連接至標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物。此等醫藥組合物特別適用於抑制標靶細胞、細胞群、組織或生物體中標靶mRNA之表現。該等醫藥組合物可用以治療患有將受益於標靶mRNA之含量之減少或標靶基因之表現之抑制之疾病或病症之個體。該等醫藥組合物可用以治療處於發展將受益於標靶mRNA之含量之減少或標靶基因之表現之抑制之疾病或病症之風險下之個體。在一個實施例中,該方法包括向待治療之個體投與包括如本文描述連接至抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑)之標靶性配體之組合物。在一些實施例中,將一或更多種醫藥上可接受之賦形劑(包括載體、載劑、稀釋劑及/或遞送聚合物)添加至包括連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體之醫藥組合物中,藉此形成適用於向活體內遞送至人類之醫藥調配物。 在一些實施例中,包括連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體之本文描述之醫藥組合物係用於治療或管理與標靶mRNA之表現相關聯之臨床表現。在一些實施例中,向需要此治療(預防或管理)之個體投與治療或預防有效量之醫藥組合物中之一或更多者。在一些實施例中,共價連接至寡聚化合物之經結合之配體中之任何一者之投與可用以減少個體中疾病症狀之數量、嚴重性及/或頻率。 包括連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體之本文描述之醫藥組合物可用以治療患有將受益於標靶mRNA之表現之減少或抑制之疾病或病症之個體中至少一種症狀。在一些實施例中,該個體係被投與治療有效量之一或更多種醫藥組合物,其等包括連接至本文描述之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑),藉此治療症狀。在其他實施例中,該個體係被投與預防有效量之抑制表現之寡聚化合物中之一或更多者藉此預防至少一種症狀。 在一些實施例中,投與連接至本文揭示之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物之個體中標靶mRNA之表現或含量相對於未接受該醫藥組合物之個體係減少至少約5%,例如,但至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%。該個體中基因表現含量可於該個體之細胞、細胞群及/或組織中經減少。在一些實施例中,mRNA之含量係減少。在其他實施例中,經表現之蛋白含量係減少。在一些實施例中,投與連接至本文揭示之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物之個體中蛋白質之含量相對於未接受該醫藥組合物之個體減少至少約5%,例如,但至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%。表現、mRNA含量或蛋白含量之減少可藉由此項技術中任何已知的方法評估。本文將mRNA含量及/或蛋白含量之減少或減小共同稱為標靶RNA之減少或減小或標靶mRNA之表現之抑制或減少。 投與途徑為可使抑制表現之寡聚化合物與身體接觸之投與途徑。一般而言,投與藥物及核酸以用於治療哺乳動物之方法係此項技術中熟知且可應用至投與本文描述之組合物。連接至本文描述之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物可經由任何合適之途徑以為特定途徑適當定制之製劑進行投與。因此,本文描述之醫藥組合物可藉由注射投與,例如,靜脈內、肌內、皮內、關節內或腹腔內注射。在一些實施例中,本文描述醫藥組合物及係經由吸入投與。 包括連接至本文描述之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物之醫藥組合物可使用此項技術中已知的寡核苷酸遞送技術遞送至細胞、細胞群、腫瘤、組織或個體。一般而言,此項技術中公認之任何適用於遞送核酸分子(活體外或活體內)之方法可經調適以與本文描述之組合物一起使用。例如,遞送可為藉由局部投與(例如,直接注射、植入或局部投與)、全身投與或皮下、靜脈內、腹腔內或非經腸途徑,其等包括顱內(例如,心室內、腦實質內及囊內)、肌內、經皮、氣道(氣溶膠)、經鼻、經口、經直腸或局部(包括口腔內及舌下)投與。在某些實施例中,該等組合物係藉由皮下或靜脈內輸液或注射進行投與。 因此,在一些實施例中,本文描述之醫藥組合物可包含一或更多種醫藥上可接受之賦形劑。在一些實施例中,本文描述之醫藥組合物可經調配以用於向個體投與。 如本文使用,醫藥組合物或藥劑包括藥理學有效量之本文描述之治療化合物中之至少一者及一或更多種醫藥上可接受之賦形劑。醫藥上可接受之賦形劑(賦形劑)係除活性醫藥成分(API,治療產品,例如,F12 RNAi劑)外之物質,其等特意包括於藥物遞送系統中。賦形劑在預期劑量下不發揮或非意欲發揮治療效應。賦形劑可發揮作用以a)有助於在製造期間處理藥物遞送系統,b)保護、支持或增強API之穩定性、生物利用度或病患接受度,c)協助產品識別,及/或d)在儲存或使用期間增強API遞送之整體安全性、有效性之任何其他屬性。醫藥上可接受之賦形劑可為或可不為惰性物質。 賦形劑包括(但不限於):吸收增強劑、抗黏附劑、消泡劑、抗氧化劑、黏合劑、緩衝劑、載劑、包衣劑、著色劑、遞送增強劑、遞送聚合物、聚葡萄醣、右旋糖、稀釋劑、崩解劑、乳化劑、增量劑、填料、調味劑、助流劑、保濕劑、潤滑劑、油、聚合物、防腐劑、生理鹽水、鹽、溶劑、糖類、懸浮劑、緩釋基質、甜味劑、增稠劑、等滲劑、載劑、憎水劑及潤濕劑。 適用於注射用途之醫藥組合物包括無菌水溶液(其中可溶於水)或分散系及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末。就靜脈內投與而言,合適之載劑包括生理鹽水、抑菌水、Cremophor ELTM (BASF, Parsippany, NJ)或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。其在製造及儲存條件下應穩定及應抵抗微生物(諸如細菌及真菌)之污染作用而保存。該載劑可為含有(例如)水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇及液體聚乙二醇)及其合適混合物之溶劑或分散介質。適當流動性可(例如)藉由使用諸如卵磷脂之包衣、在分散液之情況下藉由所需粒徑之維持及藉由使用表面活性劑來維持。在許多情況下,其將較佳於該組合物中包括等滲劑,例如,糖、多元醇(諸如甘露醇、山梨醇)及氯化鈉。可注射組合物之延長吸收可藉由於該組合物中包括延遲吸收之試劑(例如,硬脂酸鋁及明膠)來實現。 無菌可注射溶液可藉由將溶於適當溶劑中之所需量活性化合物與(視需要)上文列舉之成分中之一者或組合合併,接著過濾器殺菌而製成。通常,分散液係藉由將活性化合物併入無菌載劑內而製成,該無菌載劑含有鹼性分散介質及來自彼等上文列舉者之所需其他成分。在用於製備無菌可注射溶液之無菌粉末之情況下,製備方法包括真空乾燥及冷凍乾燥,其產生具有活性成分加來自先前經無菌過濾之溶液之任何額外之所需成分之粉末。 適用於關節內投與之調配物可呈藥物之無菌水性製劑之形式(其可為微晶形式,例如,呈水性微晶懸浮液之形式)。亦可使用脂質體調配物或可生物降解聚合物系統以呈現用於關節內及眼投與兩者之藥物。 適用於局部投與(包括眼治療)之調配物包括液體或半液體製劑,諸如擦劑、洗劑、凝膠、塗料(applicant)、水包油或油包水乳液(諸如霜劑、軟膏或糊劑);或溶液或懸浮液(諸如滴劑)。用於向皮膚表面局部投與之調配物可藉由分散該藥物及皮膚學上可接受之載劑(諸如洗劑、霜劑、軟膏或皂)。可於皮膚上形成薄膜或層以局部化塗佈及抑制移除之載劑係有用的。就向內部組織表面之局部投與而言,可將該藥劑分散於液體組織黏附劑或已知增強對組織表面之吸附之其他物質中。例如,羥基丙基纖維素或纖維蛋白原/凝血酶溶液可用以提供優勢。或者,可使用塗佈組織之溶液(諸如含有果膠之調配物)。 就吸入治療而言,可使用以噴霧罐、噴霧器或霧化器分散之粉末(自推進或噴霧調配物)吸入。此等調配物可呈細微粉末之形式,以用於自粉末吸入裝置或自推進粉末分散調配物之肺投與。在自推進溶液及噴霧調配物之情況下,效應可藉由選擇具有所需噴霧特徵(即,可產生具有所需粒徑之噴霧)之閥或藉由併入可控粒徑之呈經懸浮粉末形式之活性成分達成。就藉由吸入之投與而言,該等化合物亦可以來自含有合適之推進劑(例如,諸如二氧化碳之氣體)或噴霧器之壓力容器或分散器之氣溶膠噴霧之形式遞送。 全身投與亦可藉由透黏膜或經皮方式進行。就透黏膜或經皮投與而言,適用於滲透屏障之滲透劑係用於調配物中。此等滲透劑係此項技術中通常已知且包括(例如用於透黏膜投與)洗滌劑及膽鹽。透黏膜投與可通過使用經鼻噴霧或栓劑完成。就經皮投與而言,活性化合物通常係調配成軟膏、藥膏、凝膠或乳劑,如此項技術中通常已知。 活性化合物可使用載劑製備,該等載劑將保護該化合物抵抗來自身體之快速消除,諸如控釋調配物,其包括植入物及微囊化遞送系統。可使用可生物降解、可生物相容之聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原、聚原酸酯及聚乳酸。熟習此項技術者將知曉用於製備此等調配物之方法。脂質體懸浮液亦可用作醫藥上可接受之載劑。此等可根據熟習此項技術者已知的方法製備,例如,如描述於美國專利案第4,522,811號中。 經口或非經腸組合物可以易於投與及劑量均勻之劑量單元形式調配。劑量單元形式係指適合作為單一劑量用於待治療之個體之物理離散單元;各單元含有經計算以產生與所需醫藥載劑相關聯之所需治療效應之預定量活性化合物。用於本發明之劑量單元形式之規格係取決於及直接依賴於活性化合物之獨特特徵及待達成之治療效應及混合此活性化合物以用於治療個體之技術中固有之限制。此外,投與可藉由大丸劑之週期性注射進行,或可藉由自外部容器(例如,靜脈內袋)靜脈內、肌內或腹腔內投與而變得更連續。 結合本發明之方法,可考慮藥物基因組學(即,個體之基因型與該個體對外來化合物或藥物之反應間之關係之研究)。治療劑之新陳代謝之差異藉由改變藥理學活性藥物之劑量與血液濃度間之關係可導致劇烈毒性或治療失效。因此,醫師或臨床醫師可考慮應用相關藥物基因組學研究中獲得之知識以判定是否投與藥物及自由量裁該藥物治療之劑量及/或治療方案。 醫藥組合物可含有醫藥組合物中通常發現之其他額外之組分。此等額外之組分包括(但不限於):止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑或消炎劑(例如,抗組胺藥、苯海拉明等)。亦設想表現或包含本文定義之RNAi劑之細胞、組織或經分離器官可用作「醫藥組合物」。如本文使用,「藥理學有效量」、「治療有效量」或簡單「有效量」係指RNAi劑產生藥理學、治療或預防結果之量。 通常,活性化合物之治療有效量將在自約0.1至約100 mg/kg體重/天之範圍內,例如,自約1.0至約50 mg/kg體重/天。在一些實施例中,活性化合物之有效量將在自每劑量約0.25至約5 mg/kg體重之範圍內。在一些實施例中,活性成分之有效量將在自每劑量約0.5至約3 mg/kg體重之範圍內。投與量將亦很可能取決於諸如以下之此等變量:病患之整體健康狀態、經遞送之化合物之相對生物效用、藥物之調配、調配物中賦形劑之存在及類型及投與途徑。同樣地,應瞭解投與之初始計量可增加超越上文上限水平以迅速達成所需血液-含量或組織含量,或初始計量可小於最佳化計量。 就疾病之治療或就用於治療疾病之藥劑或組合物之調配而言,包括連接至標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物(諸如RNAi劑)之本文描述之醫藥組合物可與賦形劑或第二治療劑或治療(包括(但不限於):第二或其他抑制表現之寡聚化合物、小分子藥物、抗體、抗體片段及/或疫苗)組合。 本文描述之標靶性配體當連接至抑制表現之寡聚化合物時及當添加至醫藥上可接受之賦形劑或佐劑中時可包裝於套組、容器、包裝或分散器中。本文描述之醫藥組合物可包裝於預填充之注射器或小瓶中。 上文提供之實施例現用下列非限制性實例進行闡述。 實例 下列實例係非限制性的及意欲闡述本文揭示之某些實施例。 下文定義實例之合成之下列實驗細節中使用之縮寫之一些:h或hr =小時;min =分鐘;mol =莫耳;mmol =毫莫耳;M =莫耳;μM =微莫耳;g =公克;μg =微克;rt或RT =室溫;L=公升; mL =毫升;wt =重量;Et2
O =乙醚;THF =四氫呋喃;DMSO =二甲亞碸;EtOAc =乙酸乙酯;Et3
N或TEa =三乙胺;i-Pr2
NEt或DIPEA或DIEA =二異丙基乙基胺;CH2
Cl2
或DCM =二氯甲烷;CHCl3
=氯仿;CDCl3
=氘化氯仿;CCl4
=四氯化碳;MeOH =甲醇;EtOH =乙醇;DMF =二甲基甲醯胺;BOC =第三丁氧基羰基;CBZ =苯甲氧基羰基;TBS =第三丁基二甲基矽基;TBSCl =第三丁基二甲基氯矽烷;TFA =三氟乙酸;DMAP = 4-二甲基胺基吡啶;NaN3
=疊氮化鈉;Na2
SO4
=硫酸鈉;NaHCO3
=碳酸氫鈉;NaOH =氫氧化鈉;MgSO4
=硫酸鎂;K2
CO3
=碳酸鉀;KOH =氫氧化鉀;NH4
OH =氫氧化銨;NH4
Cl =氯化銨;SiO2
=二氧化矽;Pd-C =碳載鈀;HCl =氯化氫或鹽酸;NMM = N-甲基嗎啉;H2
=氫氣;KF =氟化鉀;EDC-HCl = N-(3-二甲基胺基丙基)-N'-乙基碳二亞胺鹽酸鹽;MTBE =甲基第三丁基醚;MeOH =甲醇;Ar =氬;SiO2
=二氧化矽;RT
=滯留時間。 另外,適合與本文揭示之標靶性配體一起使用之例示性抑制表現之寡聚化合物闡述於下列實例之各種表中。下列符號用以指示用於本文揭示之表中所闡述之序列之經修飾之核苷酸: N = 2'-OH (未經修飾)核糖核苷酸(無f或d指示之大楷字母) n = 2'-OMe修飾之核苷酸 Nf = 2'-氟修飾之核苷酸 dN = 2'-脫氧核苷酸 NUNA
= 2',3'-斷核苷酸模擬物(解鎖核酸鹼基類似物) NLNA
= 鎖定核苷酸 NfANA
= 2'-F-阿拉伯糖基核苷酸 NM = 2'-甲氧基乙基核苷酸 X或Ab = 無鹼基核糖 R = 核糖醇 (invdN) = 反向脫氧核糖核苷酸(3'-3'連接之核苷酸) (invAb) = 反向無鹼基核苷酸 (invX) = 反向無鹼基核苷酸 (invn) = 反向2'-OMe核苷酸 s = 硫代磷酸酯連接之核苷酸 vpdN = 乙烯基膦酸酯脫氧核糖核苷酸 (3'OMen) = 3'-OMe核苷酸 (5Me-Nf) = 5'-Me, 2'-氟核苷酸 cPrp = 環丙基膦酸酯 本發明之化合物可使用熟習此項技術者已知的合成化學技術製備。 實例1.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1005b及1004b之合成。 結構1005b及結構1004b之含有亞磷醯胺之化合物係根據下列程序合成,及唯一差異為使用4-順式羥基環己烷羧酸(本文之化合物8)以合成化合物結構1005b,及使用4-反式羥基環己烷羧酸(本文之化合物8a)以合成化合物結構1004b。 1) 2-胺基-3-[4-({[(苯甲氧基)羰基]胺基}甲基)苯基]丙酸(化合物2)之製備。將鹼式碳酸銅(1.67公克,7.59 mmol)緩慢添加至1 (7.00 g, 30.34 mmol)於水(100 mL)中之溶液中。將所得混合物加熱至80℃直至可見溶解。將所得深藍色溶液冷卻至25至30℃及然後用呈溶於水(10 mL)中之溶液形式之氫氧化鈉(1.21 g, 30.34 mmol)處理,此導致胺基酸-銅錯合物之沈澱。在周圍溫度下將懸浮液攪拌1小時,接著歷時5分鐘用氯甲酸苄基酯(6.21 g, 36.41 mmol)於THF (20 mL)中之溶液逐滴處理。將該混合物攪拌1至2 h,然後過濾。將濕濾餅研磨於EtOAc中及再次過濾以助於移除水。然後將藍色固體添加至含有200 mL水之燒瓶中及用10 mL濃HCl處理。將漿液攪拌18 h,然後過濾及用水清洗,此獲得4.5 g呈白色固體之化合物2 (45%產率,95 AP)。RT
= 5.8 min。 2) 三元酸(化合物3)之製備。將2 (6.00 g, 18.27 mmol)於1.5M NaOH (100 mL)中之漿液加熱至60℃,在該時間點下形成溶液。該溶液然後用溴乙酸(10.15 g, 73.20 mmol)溶解於1.5M NaOH (20 mL)中之溶液處理。在60℃下將該溶液攪拌2 h (藉由HPLC,2 = NMT 5%)。反應一經完成,使該溶液冷卻至10℃及添加1M HCl直至達成pH = 1.7。讓漿液靜置2至3小時,接著過濾及用去離子水清洗。在真空下乾燥該等固體,其導致3.01 g三元酸3 (50 %, 94 AP)。RT
= 6.94 min。 3) TFP-酯(化合物4)之製備。將3 (3.00 g, 6.75 mmol)及2,3,5,6-四氟苯酚(3.99 g, 24.30 mmol)於DCM (50 mL)中之溶液冷卻至10℃及用N-(3-二甲基胺基丙基)-N’-乙基碳二亞胺鹽酸鹽(4.66 g, 24.30 mmol)分批處理5分鐘。然後讓該溶液在20分鐘內升溫至周圍溫度及攪拌3 h。反應完成(3 < 10 AP)後,該反應混合物用飽和碳酸氫鈉(20 mL)清洗,接著用鹽水(20 mL)清洗及在旋轉蒸發儀上濃縮。所得油係於急驟管柱上使用5-20% EtOAc/己烷之溶劑梯度來純化,此導致2.6 g呈無色油之4 (40 %, 94 AP)。RT
= 12.99 min。 4) 對甲苯磺酸胺(化合物5)之製備。向適當尺寸之壓力反應器進料(10體積)THF,接著添加受CbZ保護之胺(1.0當量,NAG-Z)及對TsOH-H2
O (1.0當量)。用氮將溶液脫氣三次。進料10% Pd/C (5.0重量%)及然後用氮脫氣三次。用氫脫氣三次。進料氫至40至50 psi之壓力。在20至30℃下攪拌三小時,然後用氮脫氣三次及將樣品用於IPC分析(規格≤ 0.5% NAG-Z,若規格未滿足,則在H2
下在40至50 psi下攪拌1至2 hr,然後再分析)。過濾通過矽藻土以移除觸媒,用THF (4體積)清洗。濃縮合併之濾液及在真空下清洗至約2體積並保持Ti ≤ 40℃。用DCM (3.8體積)稀釋及然後再濃縮至2體積。重複DCM稀釋及再濃縮,然後用DCM (3.8體積)稀釋。將樣品用於KF分析(規格KF ≤ 0.05%,若KF規格未滿足,則重複濃縮及用DCM稀釋)。在滿足KF規格後,濃縮該溶液至白色泡沫狀固體。未校正產率為100%。用三氟乙酸代替對TsOH-H2
O之類似反應亦可進行及可交換使用。 5) 三NAG (化合物6)之製備。將活性酯4 (2.15 g, 2.41 mmol)及對甲苯磺酸胺5 (4.10 g, 6.75 mmol)溶解於二氯甲烷(22 mL)中及冷卻至10℃。該溶液用三乙胺(1.37 g, 13.54 mmol)逐滴處理5分鐘及然後容許升溫至周圍溫度及保持2 h。反應混合物用飽和碳酸氫鈉(10 mL)清洗及接著用鹽水(10 mL)清洗。該溶液於硫酸鎂上乾燥,過濾及在旋轉蒸發儀上濃縮以產生無色油。處理後,藉由HPLC實測~10%去醯基雜質。該雜質係藉由於純乙酸酐(90 mL)及三乙胺(6 mL)中攪拌1 h再醯化。該乙酸酐然後在減壓下移除及將所得油再溶解於二氯甲烷中及用碳酸氫鈉水溶液清洗。將該溶液濃縮成油及經由急驟層析術使用梯度溶離(2.5至25% MeOH/DCM)純化,此產生1.98 g呈白色固體之6 (47%, 96 AP)。RT
= 7.57 min;去醯基雜質= 7.18 min。 6) 胺鹽(化合物7)之製備。將受保護之胺6 (1.98 g, 1.06 mmol)及單水合對甲苯磺酸(202 mg, 1.06 mmol)溶解於絕對乙醇(30 mL)中及放置於氮氣氛下。向燒瓶中添加5%碳載鈀(198 mg, 0.106 mmol)及將該燒瓶放置於真空下及回填氫數次。一經在氫氣氛下,容許在周圍溫度下攪拌該反應及發現於4 h內完成或直至藉由HPLC無法偵測到起始材料。使觸媒過濾通過矽藻土層及濾液經過0.2微米膜過濾器以移除微細顆粒。將該溶液在減壓下濃縮至乾燥,此導致2.01 g呈灰色固體之7 (100%, 98 AP)。RT
= 5.82;對甲苯磺酸RT
= 2.4及3.1 min。 7) 活化連接子(化合物9及9a)之製備。將順式4-羥基環己基羧酸8 (用於合成結構1005) (4.00 g, 27.7 mmol)及2,3,5,6-四氟苯酚(5.53 g, 33.3 mmol)溶解於24 mL二氯甲烷中及冷卻至0℃。[如上文指示,當順式4-羥基環己基羧酸(化合物8)用作連接子以調配結構1005時,反式4-羥基環己基羧酸(化合物8b)可代替順式異構物,此導致結構1004b之合成,此遵循針對以下合成之剩餘物之相同程序:]。 向此溶液中添加EDC-HCl (6.38 g, 33.3 mmol)。讓該溶液加升溫至22℃及攪拌12小時。該反應用飽和水性NaHCO3
(50 mL)中止及分離各層。有機層用飽和鹽水(50 mL)清洗及用Na2
SO4
乾燥。過濾乾燥劑及將該溶液濃縮至約20 mL,其經緩慢固化(種晶將有所幫助)。將該等固體於5% MTBE/己烷(50 mL)中形成漿液及過濾以產生5.6 g產物9,產率為69%及純度為95%。 8) 連接子偶合(化合物10之製備)。將NAG胺鹽7 (5.00 g, 2.88 mmol)及順式4-羥基環己烷羧酸2,3,5,6-四氟苯酯9 (1.68 g, 5.77 mmol)溶解於25 mL二氯甲烷中及冷卻至0℃。向此溶液中添加三乙胺(1.60 mL, 11.55 mmol)。讓該溶液升溫至室溫及攪拌5小時,及藉由HPLC進行監測。該反應用飽和NaHCO3
水溶液(35 mL)中止及分離各層。有機層用飽和鹽水(35 mL)清洗及用Na2
SO4
乾燥。過濾乾燥劑及濃縮該溶液及經由急驟層析術使用梯度溶離(0至20% MeOH/DCM)純化,此產生3.90 g呈白色固體材料之化合物10 (80%)。RT
= 6.16 min。或者,可進行該連接子之直接偶合而無需使用TFP酯,如下文實例2中所示。 9) 化合物11之製備。將化合物10 (1.87 g, 1.11 mmol)溶解於20 mL二氯甲烷中及添加2-氰基乙基N,N,N’,N’-四異丙基亞磷醯胺(0.84 g, 2.77 mmol)。將所得溶液冷卻至5℃。向此溶液中添加4,5-二氰基咪唑(0.026 g, 0.22 mmol)。讓該溶液升溫至室溫及攪拌1小時。轉化程度然後藉由HPLC (其指示2~%剩餘起始材料)檢查。添加額外之2-氰基乙基N,N,N’,N’-四異丙基亞磷醯胺(0.14 g, 0.46 mmol)及將該反應再攪拌2.5 h (藉由HPLC可見無顯著變化)。該反應用飽和NaHCO3
水溶液(20 mL)中止及分離各層。有機層用NaHCO3
水溶液(20 mL)及飽和鹽水(2 x 20 mL)清洗及用Na2
SO4
乾燥。過濾乾燥劑及濃縮該溶液以產生2.34 g呈白色固體材料之化合物11。 100 mg粗產物11係藉由急驟管柱層析術純化,其藉由首先以溶於二氯甲烷中之2%三乙胺溶離經二氧化矽凝膠填充之管柱30 min,接著於該管柱上裝載粗產物11及使用梯度溶離(0至20%之2%三乙胺:甲醇/2%三乙胺:二氯甲烷)純化。最終產物化合物11 (其具有本文定義之結構1005b之化學結構)溶離於2%三乙胺:二氯甲烷(溶離份2)以產生80 mg白色固體材料。 圖1顯示化合物11(本文之結構1005b)之1
H NMR譜。 圖1A顯示針對化合物11(本文之結構1004b)之反式異構物(其遵循上文步驟7中闡述之替代合成)之1
H NMR譜。 實例2.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1008b之合成。 1) N-[N-(苯甲氧基羰基)-L-γ-麩胺醯基]-L-麩胺酸三第三丁基酯(化合物14)之製備向氮沖刷之配備熱電偶、磁力攪拌棒、氮入口及粉末漏斗之250- mL 3頸圓底燒瓶中添加12 (10.00 g, 29.64 mmol),接著添加THF (100 mL, 10體積)。攪拌所得溶液,及添加N-甲基嗎啉(7.82 mL, 7.19 g, 71.15 mmol, 2.4當量) (反應混合物之KF:163 ppm)。 粉末漏斗用橡膠隔膜代替,及使用冰浴將混合物冷卻至0℃。歷時10分鐘經由注射器將氯甲酸異丁酯(iBuCOCl, 3.85 mL, 4.05 g, 29.64 mmol, 1.0當量)滴加至反應混合物中,維持小於4.0℃之鍋溫度。添加後,將該混合物攪拌40分鐘以上,及該隔膜用粉末漏斗代替。歷時15分鐘向該反應混合物中分批添加13 (8.767 g, 29.64 mmol, 1.0當量),維持小於4.0℃ (放熱增加)之鍋溫度。添加13後,移除冰浴及粉末漏斗,及在剩餘步驟之過程期間讓該反應升溫至周圍溫度。添加13後讓澄清無色溶液靜置25分鐘。 反應樣品在開始添加13後之40分鐘獲取及藉由RP-HPLC分析轉化率。發現剩餘23%之12,因此在反應60分鐘後,順序添加額外之iBuCOCl (1.16 mL, 1.21 g, 30 mol%)及13 (2.63 g, 30 mol%)。讓該溶液再靜置60分鐘,直至樣品藉由HPLC顯示大於99%轉化。總反應時間為自最初添加13開始之2.5小時。 在3℃下將反應溶液倒入於冰浴中冷卻之0.5 M HCl(aq)
(125 mL)之攪拌溶液內及攪拌約5分鐘。經中止之反應混合物用乙酸乙酯(100 mL, 10體積;檢查以確保水層呈酸性以完全移除NMM)萃取,及有機相用鹽水(100 mL, 10體積)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,於粗濾漏斗上過濾,進入500- mL圓底燒瓶內,及在真空中濃縮,提供稠的無色油。將該油溶解於MTBE (100 mL, 10體積)中及在真空中再次濃縮,產生稠的無色油。 向攪拌油(~600 rpm)中添加己烷(100 mL, 10體積)。溶液中出現白霧,其然後在進一步攪拌後消失。添加種晶,及容許將該混合物攪拌40分鐘,在該攪拌時間期間內,緩慢形成白色晶體。於20分鐘內,添加額外之己烷(50 mL, 5體積)。40分鐘後,漿液於粗濾漏斗上過濾,用己烷清洗3次(各~10 mL),及於該漏斗中空氣乾燥1小時,提供呈白色粉末之14 (15.64 g, 91%)。 圖2B顯示化合物14之1
H NMR譜。 2) N-[N-(苯甲氧基羰基)-L-γ-麩胺醯基]-L-麩胺酸(化合物15)之製備向配備頂置攪拌器、粉末漏斗、熱電偶及加熱套之3000-mL 3頸圓底燒瓶中添加14 (72.57 g, 125.4 mmol)及甲酸(試劑級>95%, 1.45 L, 20體積當量)。粉末漏斗係經具有N2
入口之塞子代替,及將所得溶液加熱至45℃及攪拌1小時,及藉由RP-HPLC進行監測。當剩餘小於2.0面積%單第三丁基酯時認為該反應完成。 添加甲酸60分鐘後獲取反應樣品,及該樣品藉由RP-HPLC分析單第三丁基酯剩餘之百分率。該分析顯示90分鐘後剩餘1.8%單第三丁基酯,及將該反應冷卻至室溫。 反應用甲苯及乙腈(各1500 mL)稀釋,及使該混合物在真空中濃縮。甲酸用1:1 ACN:甲苯(~600 mL)共沸移除,及用ACN (各~500 mL)共沸移除兩次。材料係於高真空下乾燥整夜以提供白色泡沫狀固體(54.3 g,定量產率,於254 nm下96.8面積%)。 圖2C顯示化合物15之1
H NMR譜。 3) 三-NAG-雙-Glu-NHZ (化合物16)之製備。向1公升圓底燒瓶中添加對甲苯磺酸NAG-胺(5, 59.19 g, 97.6 mmol, 4.13當量)及Z-雙-Glu三酸(15, 10.01 g, 23.6 mmol純度校正,1.0當量)。將該混合物溶解於乙腈(500 mL;溶液之KF = 1283 ppm)中及在真空中濃縮以共沸移除水。將殘餘物溶解於新製乙腈(400 mL)中及將其轉移至氮沖刷之1公升3頸圓底燒瓶中,該圓底燒瓶含有攪拌棒且配備熱電偶。水含量係藉由KF (257 ppm)量測。 經由粉末漏斗向正在氮下攪拌之溶液中添加TBTU (28.20 g, 87.8 mmol, 3.7當量)。經由注射器歷時20分鐘滴加DIPEA (34.0 mL, 25.2 g, 8.0當量),維持反應溫度低於25℃ (在添加期間可見5℃之放熱)。自開始添加DIPEA起將該混合物攪拌2小時,及藉由HPLC監測。於78分鐘下之分析顯示起始材料之完全消耗。 兩小時後,在真空中移除溶劑。將所得稠油溶解於二氯甲烷(1000 mL)中及用1.0 N HCl(aq)
(3 x 500 mL)及飽和NaHCO3(aq)
(3 x 500 mL)清洗。有機層係於Na2
SO4
上乾燥,過濾及在真空中濃縮以提供灰白色蠟狀固體(33.5 g)。 急驟管柱層析術係使用330-g ISCO RediSep Rf Gold二氧化矽管柱於ISCO CombiFlash自動純化系統上進行。將粗材料以溶於CHCl3
(~200 mL)中之溶液形式裝載。利用溶離劑A: CHCl3
;溶離劑B: MeOH之傾斜梯度及收集總計36種溶離份(各250至500 mL)。濃縮含有產物之溶離份及產生18.75 g (97.0%純度)之16。混合溶離份產生12.2 g (78.8%純度)之16。 圖2D顯示化合物16之1
H NMR譜。 4) 三-NAG-雙-Glu-NH2
(化合物17)之製備。在含有攪拌棒之1000 mL 3頸圓底燒瓶中裝載甲醇(200 mL, 13體積)。向攪拌溶劑中添加化合物16 (15.44 g, 9.02 mmol經純度校正),接著添加額外之甲醇(200 mL, 13體積)及三氟乙酸(1.40 mL, 18.1 mmol, 2.0當量)。將該混合物攪拌約10分鐘。向該混合物中添加10% Pd/C (50%濕基,1.547 g, 10% w/w)。頂部空間用氫氣(氣球)沖刷,及容許在周圍溫度下將該混合物攪拌2小時,及藉由RP-HPLC偵測。 於75分鐘後,對反應取樣(100 µL)及在1- mL注射過濾器(10 mm, 0.1 µm GHP膜)中與1:1乙腈:H2
O (900 µL)混合。HPLC層析圖顯示大於96面積%純度,及無剩餘起始材料。然後該反應混合物用氮沖刷及於矽藻土床上乾燥過濾至乾淨1000-mL圓底燒瓶內。反應容器用甲醇(50 mL)及二氯甲烷(50 mL)沖洗,及亦過濾沖洗物。在真空中部分濃縮微濁濾液。矽藻土床之額外沖洗係使用甲醇(50 mL)及二氯甲烷(50 mL)進行;此等係與殘餘物組合及於0.2-µm GHP膜過濾器上過濾進入另一乾淨1000-mL圓底燒瓶內。該膜用乙腈(50 mL)沖洗使得甲苯副產物可經共沸移除。在真空中濃縮該溶液以提供呈灰白色泡沫狀固體之17 (14.15 g,藉由HPLC,97.3面積%純度)。 圖2E顯示化合物17之1
H NMR譜。 5) 三-NAG-雙-Glu-NH-連接子(化合物18)之製備。在配備磁力攪拌器、熱電偶及氮氣罩之500 mL 3頸圓底燒瓶中裝載17 (93.7%純度,20.00 g, 11.4 mmol)及二氯甲烷(150 mL)。向攪拌溶液中添加順式4-羥基環己烷-1-羧酸(1.730 g, 12.0 mmol, 1.05當量),接著添加TBTU (4.036 g, 12.6 mmol, 1.10當量)。使用冰-鹽水浴將該溶液冷卻至-9℃,及歷時7分鐘滴加DIPEA (6.97 mL, 5.17 g, 40.0 mmol, 3.5當量),保持內部溫度低於-5℃。在添加期間可見1.7℃之放熱。DIPEA之添加一經完成,則在-9℃下將該反應攪拌90分鐘,在該時間點下之HPLC分析(方法B)顯示17之完全消耗。 於110分鐘後,反應係藉由添加飽和NH4
Cl(aq)
(400 mL)中止。分離各層,及水層用二氯甲烷(2 x 200 mL)萃取。經組合之有機層用飽和NaHCO3(aq)
及鹽水(400 mL)之1:1混合物清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及在真空中濃縮至約125 mL。使用少量甲醇以確保溶解性。將所得油以細流之形式添加至含有攪拌MTBE (1600 mL)之3-L圓底燒瓶中,形成白色沈澱。將源燒瓶中用二氯甲烷(~20 mL)及MTBE (~200 mL)沖洗後之沖洗物添加至漿液中,然後讓該漿液老化1小時,接著在600- mL粗玻璃燒結漏斗上真空過濾。將濕濾餅於漏斗中之MTBE (2 x 200 mL)中重新形成漿液,過濾,及於高真空線上乾燥至恆定質量,提供呈白色粉末之粗產物18 (16.22 g, 86%未校正產率)。 粗產物18 (17.16 g,與先前批次組合)係使用330-g ISCO RediSep Rf Gold二氧化矽管柱於ISCO CombiFlash EZPrep自動純化系統上純化。將粗材料以溶於8% MeOH/CH2
Cl2
(~160 mL)中之溶液形式裝載。溶離劑A: CH2
Cl2
;利用溶離劑B: 50% MeOH:CH2
Cl2
之梯度以產生33種溶離份。濃縮含有產物之溶離份以提供10.13 g (98.1%純度,59%回收率)之18。匯集混合溶離份以產生額外之6.52 g (86.1%純度)之18,其可經再純化。 圖2F顯示化合物18之1
H NMR譜。 6) 標靶性配體亞磷醯胺(化合物19)之製備將化合物18 (13.0 g, 7.87 mmol)溶解於無水二氯甲烷(195 mL)中及放置於氮氣氛下。歷時5分鐘向此混合物中滴加DIPEA (4.11 mL, 23.61 mmol)及2-氰基乙基-N,N-二異丙基氯亞磷醯二胺(2.45 mL, 11.02 mmol)於無水二氯甲烷(5 mL)之溶液。在室溫下將該反應混合物攪拌1 h同時藉由HPLC (<1% SM剩餘)偵測。 反應係用飽和NaHCO3
水溶液(150 mL)中止。分離有機層,用飽和NaHCO3
水溶液(1 x 150 mL)及鹽水(1 x 150 mL)清洗,及用Na2
SO4
乾燥。過濾乾燥劑及濃縮該溶液並藉由首先用二氯甲烷(+1%三乙胺)處理二氧化矽管柱30分鐘,接著將最終粗產物(化合物19 (其具有本文之結構1008之化學結構))裝載於該管柱上經由急驟層析術純化及使用梯度溶離(0至20% MeOH (+1%TEA)/CH2
Cl2
(+1%TEA))歷時30 min純化,此產生11.1 g呈白色固體材料之化合物19 (76%產率,純度96.6%)。 圖2顯示化合物19之31
P NMR譜。圖2A顯示化合物19之1
H NMR譜。圖2及圖2A均與化合物19之結構(本文之結構1008b)一致。 實例3.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1025之合成。 1) 化合物21之製備。在0至5℃下向化合物20 (40 g, 221 mmol, 1.00當量)於MeOH (350 mL)中之溶液中滴加SOCl2
(52.5 g, 442 mmol, 32 mL, 2.00當量)。將該溶液加熱至60℃並攪拌16小時。TLC (DCM/MeOH = 5/1及5滴HOAc, Rf
= 0.43)顯示消耗起始材料及LCMS (ET12452-6-P1A)顯示形成產物。在真空下濃縮該混合物以產生呈白色固體之粗化合物21 (52.4 g,粗)。1
H NMR: (ET12452-6-p1c DMSO Bruker_B_400MHz) δ 9.45 (s, 1 H), 8.55 (br s, 3 H), 7.00 (br d, J = 8.0 Hz, 2 H), 6.72 (d, J = 8.0 Hz, 2 H), 4.17 (br s, 1 H), 3.67 (s, 3 H), 3.01 (qd, J = 14.2, 6.5 Hz, 2 H)。 2) 化合物22之製備。在0℃下向化合物21 (52.4 g, 226 mmol, 1.00當量)於MeOH (230 mL)中之溶液中滴加TEA (68.7 g, 679 mmol, 94 mL, 3.00當量)、Boc2
O (59.2 g, 271 mmol, 62.4 mL, 1.20當量),在0℃下將該混合物攪拌0.5 h,然後在25℃下攪拌16小時。TLC (石油醚/EtOAc = 1/1, Rf
= 0.80)顯示形成新主要點及消耗大部分起始材料。濃縮該混合物,然後藉由二氧化矽管柱(石油醚/EtOAc = 1:1)純化以提供呈白色固體之化合物22 (57.4 g, 86%產率)。1
H NMR: (ET12452-8-p1g CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 6.97 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 6.74 (br d, J = 8.0 Hz, 2 H), 5.65 (br s, 1 H), 5.01 (br d, J = 8.0 Hz, 1 H), 4.49 - 4.59 (m, 1 H), 3.72 (s, 3 H), 2.92 - 3.09 (m, 2 H), 1.43 (s, 9 H)。 3) 化合物23之製備。向溶解於丙酮(170 mL)中之化合物22 (35 g, 119 mmol, 1.00當量)之溶液中添加K2
CO3
(21.3 g, 154 mmol, 1.30當量)及BnBr (24.3 g, 142 mmol, 16.9 mL, 1.20當量),將該反應混合物加熱至回流(60℃),歷時14小時。TLC (石油醚/EtOAc = 3/1, Rf
= 0.80)顯示消耗起始材料及形成新點。在5℃下將H2
O (500 mL)添加至該混合物中及攪拌0.5 h,然後過濾及用H2
O (80 mL*3)清洗,在真空下乾燥以產生呈白色固體之化合物23 (43 g, 88%產率,93%純度)。1
H NMR: (ET12452-9-p1a CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.31 - 7.46 (m, 5 H), 7.05 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 6.91 (d, J = 9.0 Hz, 2 H), 5.05 (s, 2 H), 4.97 (br d, J = 8.0 Hz, 1 H), 4.50 - 4.60 (m, 1 H), 3.72 (s, 3 H), 2.96 - 3.11 (m, 2 H), 1.43 (s, 9 H)。 4) 化合物24之製備。向化合物23 (43 g, 112 mmol, 1.00當量)於EtOAc (215 mL)中之溶液中滴加HCl/EtOAc (4 M, 215 mL, 7.71當量),在25℃下將該混合物攪拌9小時。TLC (石油醚/EtOAc = 3/1, Rf
= 0.10)顯示消耗起始材料及形成新點。過濾該混合物及用EtOAc (30 mL*3)清洗,在真空下乾燥以產生呈白色固體之化合物24 (35 g, 97%產率,99%純度)。1
H NMR: (ET12452-12-p1a MeOD Varian_D_400MHz) δ 7.40 - 7.45 (m, 2 H), 7.34 - 7.39 (m, 2 H), 7.29 - 7.33 (m, 1 H), 7.17 (d, J = 8.8 Hz, 2 H), 7.00 (d, J = 8.8 Hz, 2 H), 5.09 (s, 2 H), 4.26 (dd, J = 7.3, 6.0 Hz, 1 H), 3.81 (s, 3 H), 3.07 - 3.23 (m, 2 H)。 5) 化合物26之製備。將化合物24 (15.5 g, 48.2 mmol, 1.00當量)溶解於CH3
CN (40 mL)及NaOH (1.5 M, 70.6 mL, 2.20當量)中,然後在15℃下添加化合物25 (13.4 g, 96.3 mmol, 6.94 mL, 2.00當量),pH檢查:~2.5。然後添加4 N NaOH直至pH = 13。在70℃下加熱該溶液。在30 min後,pH下降至6以下,用4 N NaOH (pH 11-13)再次調整。分批(兩次)添加額外之化合物25 (6.69 g, 48.2 mmol, 3.47 mL, 1.00當量)及每次將pH調整至11-13。在70℃下將該混合物加熱14小時。LCMS (ET12452-30-P1A, Rt = 0.749 min)顯示形成產物。將該混合物冷卻至15℃,然後用4N HCl調整至pH 1,過濾及用H2
O (80 mL*2)清洗,乾燥。殘餘物用THF (600 mL)溶解及然後用ET12452-27、ET12452-19批次濃縮第六次,然後用DCM (500 mL)攪拌及過濾,乾燥過濾物以產生呈白色固體之化合物26 (35.5 g, 87%產率,97%純度)。1
H NMR: (ET12452-30-p1r MeOD Varian_D_400MHz) δ 7.40 - 7.45 (m, 2 H), 7.36 (t, J = 7.4 Hz, 2 H), 7.27 - 7.32 (m, 1 H), 7.17 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 6.91 (d, J = 8.6 Hz, 2 H), 5.49 (s, 1 H), 5.05 (s, 2 H), 3.71 (t, J = 7.6 Hz, 1 H), 3.61 (s, 4 H), 3.07 (dd, J = 14.1, 7.5 Hz, 1 H), 2.86 - 2.96 (m, 1 H), 2.03 (s, 2 H)。 6) 化合物27之製備。在5℃下向化合物26 (15 g, 38.7 mmol, 1.00當量)、化合物26A (25.7 g, 155 mmol, 4.00當量)於吡啶(250 mL)之溶液中添加EDCI (29.7 g, 155 mmol, 4.00當量)。在30℃下將該混合物攪拌12小時。LCMS (ET12452-59-P1A, Rt = 1.053 min)顯示大部分產物。濃縮該混合物,然後用DCM (200 mL)溶解,用飽和NaHCO3
(80 mL*4),鹽水(80 mL*2)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係藉由二氧化矽管柱(石油醚/EtOAc = 3:1, Rf = 0.75)純化以提供具有化合物26A之產物,然後用DCM (200 mL)溶解,用飽和NaHCO3
(80 mL*4)及鹽水(80 mL*2)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮以產生呈灰白色樹膠之化合物27 (19.8 g, 61%產率)。1
H NMR: (ET12452-59-p1g CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.36 - 7.46 (m, 4 H), 7.30 - 7.35 (m, 1 H), 7.24 (d, J = 8.7 Hz, 2 H), 6.97 - 7.07 (m, 3 H), 6.94 (d, J = 8.7 Hz, 2 H), 5.05 (s, 2 H), 4.13 - 4.26 (m, 5 H), 3.25 (d, J = 7.5 Hz, 2 H), 2.06 (s, 1 H), 1.25 - 1.29 (m, 1 H)。 7) 化合物27-2之製備。在N2
氣氛下將化合物27-1 (230 g, 1.53 mol, 205 mL, 1.00當量)溶解於無水DCM (1.6 L)中。用冰浴將該溶液冷卻至0℃及添加TEA (232 g, 2.3 mol, 318 mL, 1.50當量)。接著將於DCM (500 mL)中之TosCl (233 g, 1.22 mol, 0.80當量)添加至經冷卻之反應混合物中。添加後,讓該溶液升溫至20℃及攪拌5小時。TLC (石油醚/EtOAc = 1:1, Rf
= 0.15)顯示消耗起始材料及HPLC (ET12452-15-P1L, Rt
= 1.71 min)顯示2個峰。該反應混合物係藉由在0℃下添加H2
O (500 mL)中止,及然後該等2次反應係用CH2
Cl2
(800 mL)萃取。經組合之有機層係用H2
O (1 L)及鹽水(1 L)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係藉由二氧化矽管柱(石油醚/EtOAc = 1:1)純化以產生呈黃色油之化合物27-2 (338 g, 36%產率)。1
H NMR: (ET12452-15-p1z1 CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.79 (d, J = 8.0 Hz, 2 H), 7.34 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 4.12 - 4.19 (m, 2 H), 3.67 - 3.72 (m, 4 H), 3.60 (s, 4 H), 3.55 - 3.58 (m, 2 H), 2.44 (s, 3 H), 2.32 (s, 1 H)。 8) 化合物27-3A之製備。在20℃下將化合物27-3-1 (230 g, 591 mmol, 1.00當量)懸浮於DCM (700 mL)中及在N2
下添加TMSOTf (197 g, 886 mmol, 160 mL, 1.50當量)。混合物顏色變為粉色。將該混合物加熱至50℃及攪拌1.5小時。然後將該反應混合物冷卻至20℃及攪拌14小時。TLC (DCM/MeOH = 20:1, Rf = 0.6)顯示消耗起始材料。在0~5℃下將該混合物倒入NaHCO3
水溶液 (600 mL)內及攪拌15 min。該混合物顏色變為黃色。該混合物係用DCM (500 mL)萃取,用NaHCO3
水溶液(500 mL),水(500 mL*2)及鹽水(500 mL)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮以提供呈棕色油之化合物27-3A (189 g,粗產物,92%純度)。1
H NMR: (ET12452-28-p1c CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 6.00 (d, J = 6.6 Hz, 1 H), 5.47 (t, J = 3.0 Hz, 1 H), 4.91 (dd, J = 7.5, 3.3 Hz, 1 H), 4.17 - 4.28 (m, 2 H), 4.08 - 4.14 (m, 1 H), 3.97 - 4.03 (m, 1 H), 2.13 (s, 3 H), 2.05 - 2.09 (m, 9 H)。 9) 化合物27-4A之製備。在N2
氣氛下向化合物27-3A (189 g, 574 mmol, 1.00當量)、化合物7-2 (140 g, 460 mmol, 0.80當量)及4A MOLECULAR SIEVE (150 g)於DCM (1.5 L)中之混合物中添加TMSOTf (63.8 g, 287 mmol, 51.9 mL, 0.50當量),在25℃下將該混合物攪拌8小時。TLC (DCM/MeOH = 20:1, Rf = 0.46)顯示消耗起始材料及LCMS (ET12452-35-P1A, Rt = 0.76 min)顯示形成產物。過濾該混合物以移除篩,然後用冷NaHCO3
水溶液(1000 mL)中止,用DCM (800 mL*2)萃取,經分離之有機層係用飽和NaHCO3
(800 mL)、H2
O (800 mL*2)及鹽水(800 mL)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。然後藉由二氧化矽管柱(DCM/MeOH = 20:1)純化以提供呈黃色油之化合物27-4A (285 g, 73%產率)。1
H NMR: (ET12452-35-p1g CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 7.81 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 7.37 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 6.30 (br d, J = 9.5 Hz, 1 H), 5.28 - 5.35 (m, 1 H), 5.08 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 1 H), 4.81 (d, J = 8.6 Hz, 1 H), 4.09 - 4.29 (m, 5 H), 3.86 - 3.98 (m, 3 H), 3.68 - 3.81 (m, 3 H), 3.56 - 3.66 (m, 5 H), 2.46 (s, 3 H), 2.16 (s, 3 H), 2.04 (s, 3 H), 1.98 (s, 3 H), 1.95 (s, 3 H)。 10) 化合物27-4之製備。在10℃下向化合物27-4A (285 g, 450 mmol, 1.00當量)於DMSO (1.4 L)中之溶液中添加NaN3
(38.1 g, 586 mmol, 1.30當量),在60℃下將該混合物攪拌16小時。LCMS (ET12452-37-P1A, Rt = 0.67 min)顯示形成產物及消耗起始材料。將該混合物倒入H2
O (1500 mL)內,用EtOAc (1 L*5)萃取,用H2
O (800 mL*3)及鹽水(800 mL*3)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮以產生呈紅色油之化合物27-4 (168 g,粗產物)。1
H NMR: (ET12452-37-p1c CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 6.12 (br d, J = 9.4 Hz, 1 H), 5.32 (d, J = 2.9 Hz, 1 H), 5.06 (dd, J = 11.3, 3.4 Hz, 1 H), 4.78 (d, J = 8.7 Hz, 1 H), 4.08 - 4.27 (m, 5 H), 3.82 - 3.94 (m, 3 H), 3.61 - 3.77 (m, 10 H), 3.45 - 3.50 (m, 2 H), 2.16 (s, 3 H), 2.05 (d, J = 1.5 Hz, 5 H), 1.99 (d, J = 4.5 Hz, 6 H), 1.26 (t, J = 7.2 Hz, 2 H)。 11) 化合物27A之製備。向化合物27-4 (79 g, 156 mmol, 1.00當量)於EtOAc/MeOH (4:1) (640 mL)中之溶液中添加Pd(OH)2
/C (7.9 g),在15℃下在H2
(30 psi)氣氛下將該混合物攪拌4小時。TLC (DCM/MeOH = 20:1)顯示消耗起始材料及LCMS (ET12452-53-P1C, Rt = 2.55 min)顯示形成產物。2個平行反應係用矽藻土過濾及用DCM (500 mL*5)及MeOH (200 mL*3)清洗,濃縮以產生呈深棕色油之化合物27A (140 g,粗產物)。1
H NMR: (ET12452-53-p1c CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 7.02 (br d, J = 9.3 Hz, 1 H), 5.29 - 5.34 (m, 1 H), 5.09 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 1 H), 4.80 (d, J = 8.6 Hz, 1 H), 4.09 - 4.24 (m, 3 H), 3.82 - 3.95 (m, 3 H), 3.52 - 3.70 (m, 10 H), 2.91 (td, J = 5.2, 2.8 Hz, 1 H), 2.15 (s, 3 H), 2.05 (s, 4 H), 1.98 (d, J = 6.4 Hz, 6 H). 12) 化合物28之製備。將TEA (12.1 g, 119 mmol, 16.5 mL, 5.00當量)添加至含有化合物27 (19.8 g, 23.8 mmol, 1.00當量)及化合物27A (57 g, 119 mmol, 5.00當量)於DCM (160 mL)中之攪拌溶液中。在30℃下將其攪拌16小時。LCMS (ET12452-64-P1A, Rt = 1.21 min)顯示形成產物。用DCM (100 mL)稀釋及用飽和NaHCO3
/飽和鹽水(1:1, 2 x 80 mL)清洗。有機層係於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮以產生呈棕色固體之粗產物。 將粗產物溶解於Ac2
O (42 mL)、CH3
CN (62.5 mL)及Py (82.3 g, 1.04 mol, 84 mL, 23.96當量)中,在25℃下將該混合物攪拌12小時。HPLC (ET12452-65-P1A, Rt = 2.54 min)顯示大部分產物。蒸發去除CH3
CN,然後用DCM (400 mL)稀釋及用飽和NaHCO3
(100 mL*4)清洗。分離有機層及用0.1M HCl/飽和鹽水(1:1, 100 mL*4)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係藉由二氧化矽管柱(DCM/MeOH = 10:1, Rf = 0.45)純化以產生產物,然後藉由p-HPLC (管柱:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10 um;移動相:[水(10mM NH4
HCO3
)-ACN];B%: 25%-55%,23min)進一步純化以產生呈黃色固體之化合物28 (28.8 g, 58%產率,98%純度)。1
H NMR: (ET12452-65-p1j DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.00 - 8.09 (m, 3 H), 7.81 (d, J = 9.0 Hz, 3 H), 7.29 - 7.45 (m, 5 H), 7.10 (d, J = 8.6 Hz, 2 H), 6.89 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 5.21 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 5.04 (s, 2 H), 4.97 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 3 H), 4.54 (d, J = 8.4 Hz, 3 H), 4.02 (s, 9 H), 3.83 - 3.92 (m, 3 H), 3.73 - 3.81 (m, 3 H), 3.53 - 3.61 (m, 4 H), 3.44 - 3.52 (m, 17 H), 3.42 (br d, J = 4.4 Hz, 2 H), 3.35 - 3.40 (m, 6 H), 3.07 - 3.27 (m, 11 H), 2.74 - 2.87 (m, 2 H), 2.09 (s, 9 H), 1.99 (s, 10 H), 1.89 (s, 9 H), 1.77 (s, 9 H)。 13) 化合物29之製備。向化合物28 (9.7 g, 5.48 mmol, 1.00當量)於THF (250 mL)中之溶液中添加無水Pd/C (5.5 g, 5.48 mmol),在40℃下在H2
氣氛(50 psi)下將該混合物攪拌6.5小時。TLC (DCM/MeOH = 10:1, Rf = 0.3)顯示消耗起始材料。過濾2個平行反應及用THF (300 mL*4)及DCM (200 mL*3)清洗,濃縮。殘餘物係藉由p-HPLC (管柱:Phenomenex luna C18 250*50mm*10 um;移動相:[水(0.1% TFA)-ACN];B%: 15%-45%, 20min)以ET12452-78批料純化以提供呈白色固體之化合物29 (14 g, 63%產率)。1
H NMR: (ET12452-80-p1j DMSO Varian_D_400MHz) δ 9.19 (s, 1 H), 7.99 - 8.10 (m, 3 H), 7.83 (d, J = 9.3 Hz, 3 H), 6.95 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 6.62 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 5.76 (s, 2 H), 5.21 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 3 H), 4.54 (d, J = 8.6 Hz, 3 H), 4.03 (s, 9 H), 3.83 - 3.92 (m, 3 H), 3.73 - 3.81 (m, 3 H), 3.53 - 3.61 (m, 4 H), 3.44 - 3.52 (m, 16 H), 3.43 (br d, J = 4.4 Hz, 3 H), 3.36 - 3.39 (m, 3 H), 3.26 - 3.33 (m, 4 H), 3.05 - 3.24 (m, 9 H), 2.65 - 2.82 (m, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 2.00 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.77 (s, 9 H)。 14) 化合物30之製備。將化合物29 (8 g, 4.77 mmol, 1.00當量)溶解於DCM (65 mL)中及添加化合物29A (2.88 g, 9.54 mmol, 3 mL, 2.00當量)。將所得溶液冷卻至5℃。向此溶液中添加2H-四唑(0.45 M, 11.7 mL, 1.10當量)。讓該溶液升溫至15℃及攪拌3.5小時。TLC (DCM/MeOH = 5:1, Rf = 0.52)顯示消耗起始材料及HPLC (ET12452-82-P1A, Rt = 2.69 min)顯示形成產物。用DCM (50 mL)稀釋,用NaHCO3
(30 mL)中止,水層係用DCM (30 mL*2)萃取,經組合之有機層係用飽和NaHCO3
(30 mL*2),H2
O (30 mL)及鹽水(30 mL*2)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係用DCM (30 mL)溶解,然後在0℃下滴加己烷(150 mL)及攪拌15 min,然後用乾冰冷凍,倒出有機層及油係用DCM (30 mL)再次溶解及滴加己烷(150 mL),重複程序7次,在真空下乾燥以提供呈白色固體之化合物30 (5.5 g, 55%產率)。1
H NMR: (ET12452-83-p1b DMSO Varian_D_400MHz) δ 7.97 - 8.09 (m, 3 H), 7.78 (d, J = 9.3 Hz, 3 H), 7.06 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 6.86 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 5.73 (s, 2 H), 5.18 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 4.94 (dd, J = 11.1, 3.4 Hz, 3 H), 4.51 (d, J = 8.4 Hz, 3 H), 3.99 (s, 9 H), 3.79 - 3.89 (m, 4 H), 3.70 - 3.78 (m, 4 H), 3.59 - 3.69 (m, 2 H), 3.49 - 3.58 (m, 4 H), 3.44 (s, 16 H), 3.40 (br d, J = 4.2 Hz, 3 H), 3.32 - 3.37 (m, 5 H), 3.24 - 3.28 (m, 1 H), 3.05 - 3.22 (m, 9 H), 2.78 (br t, J = 5.8 Hz, 4 H), 2.07 (s, 9 H), 1.96 (s, 9 H), 1.86 (s, 9 H), 1.74 (s, 9 H), 1.15 (d, J = 6.8 Hz, 6 H), 1.09 (d, J = 6.8 Hz, 6 H)。 圖3顯示化合物30(本文之結構1025b)之1
H NMR譜。 實例4:含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1014b之合成。 1) 化合物32之製備。在25℃下將化合物31 (24.71 g, 87.85 mmol, 1.00當量)、化合物31A、EDCI (39.07 g, 203.82 mmol, 2.32當量)、吡啶(19.39 g, 245.11 mmol, 19.79 mL, 2.79當量)於ACN (260.00 mL)中之溶液攪拌2小時。TLC (石油醚/乙酸乙酯=1/1,所需產物;Rf=0.7)顯示形成所需產物。將該混合物添加至300 mL EtOAc中,用NaHCO3
(100 mL *2),100 mL鹽水清洗,用Na2
SO4
乾燥,過濾及濃縮以產生殘餘物。粗產物係用二氧化矽管柱(石油醚/乙酸乙酯=100/1~3/1)純化以產生呈黃色油之化合物32 (60.00 g, 79.25 mmol, 90.20%產率,97.19%純度)。1
H NMR: (ET12600-89-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ ppm 7.52 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.27-7.38 (m, 5H), 4.99 (s, 2H), 4.26-4.42 (m, 3H), 3.80-4.15 (m, 8H), 2.27 (br s, 2H), 1.78-1.88 (m, 1H), 1.66 (br dd, J = 14.4, 7.2 Hz, 1H), 1.37-1.41 (m, 35H)。 2) 化合物33之製備。在45℃下將化合物32 (45.00 g, 61.15 mmol, 1.00當量)於甲酸(800.00 mL)中之溶液攪拌6小時。LCMS (et12600-90-p1a, MS=511)顯示形成所需產物。濃縮混合物以產生殘餘物。該殘餘物係用1000 mL DCM清洗以產生呈白色固體之化合物33 (30.00 g, 54.71 mmol, 89.47%產率,93.27%純度)。1
H NMR: (ET12600-90-p1a DMSO Bruker_B_400MHz) δ 12.75 (br s, 3H), 7.53 (br d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.29-7.38 (m, 5H), 4.99 (d, J = 3.6 Hz, 2H), 4.27-4.38 (m, 2H), 4.12 (br s, 2H), 3.84-4.07 (m, 6H), 2.30 (br t, J = 7.2 Hz, 2 H), 2.07 (s, 1H), 1.59-1.88 (m, 2H), 1.39 (t, J = 5.6 Hz, 1H)。 3) 化合物34之製備。向化合物33 (15 g, 29.33 mmol, 1.00當量)、化合物33A (29.22 g, 175.98 mmol, 6.00當量)、吡啶(11.60 g, 146.65 mmol, 11.84 mL, 5.00當量)於ACN (90 mL)中之溶液中添加EDCI (28.11 g, 146.65 mmol, 5.00當量),然後在25℃下將該混合物攪拌1小時。TLC (石油醚/乙酸乙酯=3/1)顯示形成所需產物。向該混合物中添加500 mL DCM,用NaHCO3
(200 mL*2),100 mL鹽水清洗,用Na2
SO4
乾燥,過濾及濃縮以產生殘餘物。用二氧化矽管柱(石油醚/乙酸乙酯=4/1)純化以產生呈黃色固體之化合物34 (28 g)。 4) 化合物35之製備。向化合物34 (16.57 g, 15.01 mmol, 1當量)、化合物34A於DCM (140 mL)中之溶液中添加TEA (9.12 g, 90.08 mmol, 12.49 mL, 6.00當量),然後在25℃下將該混合物攪拌16小時。LCMS (et12600-98-p1g)顯示形成所需產物。將該混合物倒於200 mL DCM上,用100 mL NaHCO3
、100 mL鹽水清洗,用Na2
SO4
乾燥,過濾及濃縮以產生殘餘物。用製備型HPLC (管柱:Phenomenex Gemini C18 250*50 10u;移動相:[水(10mM NH4
HCO3
)-ACN];B%: 15%-45%,20min)純化以產生呈黃色固體之化合物5 (11 g, 4.65 mmol, 30.98%產率,99.5%純度)。1
H NMR: (ET12600-98-p1a1 DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.65-8.71 (m, 1H), 8.51 (br s, 1H), 8.18-8.25 (m, 1H), 8.11 (br s, 1H), 7.80 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 7.47 (br d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.28-7.40 (m, 5H), 5.75 (s, 4H), 5.22 (d, J = 3.2 Hz, 4H), 4.95-5.03 (m, 6H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 3.98-4.06 (m, 15H), 3.88 (dt, J = 11.2, 8.8 Hz, 7H), 3.78 (dt, J=10, 5.2 Hz, 5H), 3.54-3.62 (m, 6H), 3.46-3.53 (m, 25H), 3.41 (q, J = 5.6 Hz, 9H), 3.23 (br dd, J = 11.6, 5.6 Hz, 8H), 2.10 (s, 12H), 2.00 (s, 12H), 1.89 (s, 12H), 1.77 (s, 12H)。 5) 化合物36之製備。向化合物35 (10 g, 4.25 mmol, 1當量)、TFA (484.52 mg, 4.25 mmol, 314.62 uL, 1當量)於MeOH (10 mL)中之溶液中添加10% Pd(OH)2
/C (3.00 g),然後在20℃下在H2 (50 Psi)下將該混合物攪拌4小時。LCMS (et12600-107-p1a, Rt=2.195)顯示形成所需產物及過濾該混合物及濃縮以產生呈黃色固體之化合物36 (8 g, 3.60 mmol, 84.84%產率)。1
H NMR: (ET12600-107-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.68 (br t, J = 5.2 Hz, 1H), 8.46 (br t, J = 5.2 Hz, 1H), 8.21-8.27 (m, 1H), 8.15 (br d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.84 (br d, J = 9.2 Hz, 4H), 5.22 (d, J = 3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.56 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.24 (br s, 1H), 3.99-4.14 (m, 23H), 3.84-3.94 (m, 7H), 3.74-3.83 (m, 5H), 3.55-3.62 (m, 5H), 3.51 (s, 25H), 3.38-3.46 (m, 9H), 3.20-3.30 (m, 9H), 3.17 (d, J = 5.2 Hz, 14H), 2.11 (s, 12H), 2.00 (s, 13H), 1.89 (s, 12H), 1.78 (s, 12H)。 6) 化合物37之製備。分批平行進行。向化合物36 (2 g, 857.18 umol, 1.00當量,TFA)、化合物36A (626.23 mg, 2.14 mmol, 2.50當量)於DCM (6 mL)中之溶液中添加TEA (312.26 mg, 3.09 mmol, 427.75 uL, 3.60當量),然後在25℃下將該混合物攪拌16小時。LCMS顯示形成所需產物。組合所有反應混合物,將其溶解於200 mL DCM中,將其倒於30 mL NaHCO3
上,用30 mL鹽水清洗,用Na2
SO4
乾燥,過濾及濃縮以產生殘餘物。用製備型HPLC (管柱:Phenomenex Gemini C18 250*50 10u;移動相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%: 15%-45%,20min)純化以產生呈白色固體之化合物37 (7.5 g, 3.20 mmol, 93.27%產率)。1
H NMR: (ET12600-111-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.66 (s, 1H), 8.51 (br s, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.91 (br d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.80 (d, J=9.2 Hz, 4H), 5.22 (d, J =3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J=11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.47 (br s, 1H), 4.30 (s, 1H), 4.25 (d, J = 3.2 Hz, 1H), 4.03 (s, 11H), 3.97 (br s, 2H), 3.84-3.92 (m, 7H), 3.73-3.82 (m, 6H), 3.55-3.62 (m, 5H), 3.47-3.54 (m, 24H), 3.41 (q, J = 5.6 Hz, 9H), 3.23 (br dd, J = 11.2, 5.6 Hz, 8H), 2.19 (br s, 1H), 2.10 (s, 12H), 2.00 (s, 13H), 1.89 (s, 12H), 1.77 (s, 13H), 1.61 (br s, 3H), 1.40 (br d, J=11.2 Hz, 4H)。 8) 化合物38之製備。添加於DCM (26.4 mL)中之化合物37 (4.4 g, 1.88 mmol, 1當量)及化合物37A (1.13 g, 3.75 mmol, 1.19 mL, 2當量)。將所得溶液冷卻至5℃。向此溶液中添加2H-四唑(0.45 M, 4.59 mL, 1.1當量)。讓該溶液升溫至20℃及攪拌2小時。將該混合物溶解於100 mL DCM中,用20 mL NaHCO3
中止,用DCM (50 mL*2)萃取,用20 mL NaHCO3
、20 mL鹽水清洗,用Na2
SO4
乾燥,過濾及濃縮以產生殘餘物。該殘餘物係用DCM (25 mL, 0.2% TEA)溶解,然後在0℃下滴加己烷(125 mL, 0.2% TEA)及攪拌15 min,然後用乾冰冷凍,倒出有機層及油係用DCM (30 mL)再次溶解及滴加己烷(150 mL),重複程序3次,在真空下乾燥。將20 mL DCM添加至白色固體中,在真空下在30℃下乾燥以產生呈白色固體之38 (4.8 g, 1.83 mmol, 67.34%產率,97.15%純度)。LCMS: [M-iPr2
N]+
/2, 1222.8.1
H NMR: (DMSO, Varian_400MHz) δ 8.67 (br s, 1H), 8.52 (br s, 1H), 8.20 (br s, 1H), 8.08 (br s, 1H), 7.98 (br d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.79 (br d, J=9.2 Hz, 4H), 5.21 (d, J=3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.47 (br s, 1H), 4.29 (br d, J = 17.6 Hz, 1H), 3.94-4.11 (m, 16H), 3.83-3.94 (m, 8H), 3.78 (br dd, J = 10.4, 5.2 Hz, 6H), 3.64-3.74 (m, 3H), 3.54-3.63 (m, 8H), 3.50 (br s, 26H), 3.36-3.44 (m, 9H), 3.14-3.29 (m, 9H), 2.75 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 2.15-2.27 (m, 4H), 2.10 (s, 13H), 2.00 (s, 13H), 1.82-1.95 (m, 15H), 1.77 (s, 14H), 1.59-1.73 (m, 4H), 1.45 (br d, J = 14.4Hz, 4H), 1.14 (d, J = 6.4 Hz, 12H)。 圖4顯示化合物38(本文之結構1014b)之1
H NMR譜。 實例5:標靶性配體亞磷醯胺化合物結構1006b及1007b之合成。 具有結構1006b及結構1007b之含有亞磷醯胺之化合物係根據下列相同程序合成,及唯一差異為使用4-順式羥基環己烷羧酸(本文之化合物8)以合成結構1006b,及使用4-反式羥基環己烷羧酸(本文之化合物8a)以合成結構1007b。 1) 化合物41之製備。在RT下將Z-Glu-(OtBu)-OH 39 (445 mg, 1.32 mmol)、亞胺基二乙酸二第三丁基酯40 (340 mg, 1.39 mmol)、EDC (319 mg, 1.66 mmol, 1.23當量)及Py (3當量,0.33 mL)於ACN (3 mL)中之溶液攪拌1h,用乙酸乙酯稀釋及用NaHCO3 (2x)清洗。有機層係用MgSO4乾燥及蒸發。接著將粗產物溶解於DCM (5 mL)中及添加TFA (5 mL)。在RT下將其攪拌16 h及然後蒸發。添加乙酸乙酯及蒸發4次直至形成泡沫/沈澱。粗產物41係直接用於TFP活化步驟中。Rt
= 3.78 min, 90%純度。LCMS (ES, M/z): 379.0 [M+H]+
。 2) 化合物42之製備。在RT下將粗產物三元酸41 (~1.30 mmol)、TFP (7當量,9.10 mmol, 1.51 g)、TEA (4當量,0.723 mL)及EDC (3.3當量,4.29 mmol, 0.82 g)於ACN (3.5 mL)中之溶液攪拌1 h,用DCM (250 mL)稀釋及用飽和NaHCO3
(2 x 100 mL)清洗。有機相係於Na2
SO4
上乾燥,濃縮及於二氧化矽管柱上純化。產物活化之三-TFP酯用於己烷(5至20%)中之AcOEt溶離以產生550 mg產物,及痕量TFP。Rt
= 7.06 min。 將TEA (400 uL, 2.9 mmol)添加至含有於DCM (6 mL)中之三-TFP酯(540 mg, 0.642 mmol)及GalNac-Peg3
-NH2
x TsOH (2.89 mmol, 1.88 g)之攪拌溶液中。在RT下將其攪拌16 h,用DCM (200 mL)稀釋及用飽和NaHCO3
/飽和鹽水(1:1, 2 x 150 mL)清洗。有機層係於Na2
SO4
上乾燥,蒸發留下白色固體。將該固體溶解於DCM中及於二氧化矽管柱上純化。用於DCM (0-10%)中之MeOH溶離產生748 mg, 95.4%純度及~100 mg, 80%純度三-GalNAc 42, 36%產率,2個步驟。LCMS (ES, M/z): 1777.5 [M]+
, Rt
= 4.67 min。 3) 化合物43之製備。將經10% Pd/C活化之基質(30 mg)添加至受Cbz保護之胺42 (715 mg, 0.402 mmol)及TsOH (74.5 mg, 0.402 mmol)於THF (4 mL)及TFE (4 mL)之溶液中。接著,氫氣氛(氣球)係藉由抽真空及回填氫建立。在氫氣氛下將其攪拌24 h,濾過矽藻土,用DCM (2 x 10 mL)清洗及蒸發留下呈白色固體之乙醇C。LCMS (ES, M/z): 1644.2 [M+H]+
, Rt
= 4.67 min。 將4-順式羥基環己烷羧酸(350 mg, 1.20 mmol)之去保護中間物(0.4 mmol)及TFP酯溶解於DCM (2.5 mL)中及添加TEA (3.5當量,0.195 mL)。在RT下將其攪拌16 h。接著,用DCM (100 mL)稀釋,用飽和NaHCO3
/飽和鹽水(1:1, 100 mLx2)清洗。有機相係於Na2
SO4
上乾燥,濃縮及於二氧化矽管柱上純化。產物係用於DCM (2至20%)中之MeOH溶離以產生430 mg之> 95%純度43,61%產率。Rt
= 4.20 min。LCMS: (ES, M/z): 1771.26 [M+H]+
。 4) 化合物44之製備。在0℃下將N,N,N′,N′-四異丙基亞磷醯二胺2-氰基乙酯(1.5當量,110 uL, 0.343 mmol)添加至乙醇43 (405 mg, 0.229 mmol,經真空乾燥)及四唑(0.50當量,0.25 mL, 0.112 mmol, 0.45M,溶於ACN中)於無水DCM (2.4 mL)中之攪拌溶液中。在RT下將其攪拌1,及添加額外之四唑(0.125 mL)及N,N,N′,N′-四異丙基亞磷醯二胺2-氰基乙酯(0.10 mL)。攪拌持續30 min,接著用DCM (200 mL)將其稀釋及用飽和NaHCO3
/飽和鹽水(1:1, 200 mL)清洗。有機層係於Na2
SO4
/MgSO4
上乾燥,蒸發,然後溶解於無水DCM中及再次蒸發留下白色固體44,408 mg,HPLC純度92%,83%產率。LCMS: (ES, M/z): 1870.4 [M-iPr2
N]+
。 圖5顯示化合物44(本文之結構1006b)之1
H NMR譜。 實例6:含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1027b之合成。 1) 化合物45之製備。將TEA (5.3 mmol, 0.735 mL, 4.00當量)添加至含有化合物27 (1.1 g, 1.32 mmol, 1.00當量)及化合物45A (3.20 g, 5.29 mmol, 4.00當量)於DCM (9 mL)中之攪拌溶液中。在30℃下將其攪拌16小時。用DCM (100 mL)稀釋及用飽和NaHCO3
/飽和鹽水清洗。有機層係於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮以產生呈棕色固體之粗產物。 將粗產物溶解於Ac2
O (3 mL)、CH3
CN (6 mL)及Py (6 mL)中及在25℃下將該混合物攪拌16小時。蒸發去除CH3
CN,然後用DCM將其稀釋及用飽和NaHCO3
清洗四次。分離有機層及用0.1M HCl/飽和鹽水清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係藉由二氧化矽管柱(DCM/MeOH = 10:1, Rf = 0.45)純化以產生呈白色固體之產物45 (1.47 g, 68%產率,96%純度)。 4) 化合物46之製備。向化合物45 (1.425 g, 0.871 mmol, 1.00當量)於THF/TFE (1:1, 5 mL)中之溶液中添加10% Pd/C (24mg),及在40℃下在H2
氣氛下將該混合物攪拌30 h。TLC (DCM/MeOH = 10:1, Rf = 0.3)顯示消耗起始材料。將其過濾,用THF (5 mLx3)、DCM (5 mLx3)清洗及濃縮。殘餘物係於二氧化矽管柱上純化。用DCM/MeOH溶離以產生呈白色固體之化合物46 (1.013 g, 75%產率,95%純度)。LCMS: (ES, M/z): 1547.5 [M+H]+
。 5) 化合物47之製備。將化合物46 (970 mg, 0.627 mmol, 1.00當量)溶解於DCM (4.2 mL)中及添加化合物46A (0.941 mmol, 0.298 mL, 1.5當量)。將所得溶液冷卻至5℃及二氰基咪唑(DCI) (23.1 mg, 0.188 mmol, 0.3當量)。讓該溶液升溫至15℃及攪拌2小時。TLC (DCM/MeOH = 5:1, Rf = 0.52)顯示消耗起始材料及HPLC顯示形成產物。用DCM (50 mL)將其稀釋,用飽和NaHCO3
(30 mL)、H2
O (30 mL)及鹽水(30 mL)清洗,於Na2
SO4
上乾燥,過濾及濃縮。殘餘物係用DCM (2 mL)溶解及添加至己烷(120 mL)中。濾除白色沈澱以提供呈白色固體之化合物47 (0.975 g, 93%純度,82%產率)。LCMS: (ES, M/z): 1747.5 [M+H]+
。 圖6顯示化合物47(本文之結構1027b)之1
H NMR譜。 實例7.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物結構1026b之合成。 1) 三元酸49之製備。向4-溴-DL-苯丙胺酸鹽酸鹽(5.0 g, 17.8 mmol)於1.5M NaOH (100 mL)中之溶液中添加溴乙酸(8.17 g, 58.8 mmol)。將該溶液加熱至60℃,歷時1小時,藉由添加氫氧化鈉小球保持pH大於12。一經完成,將該反應冷卻至15℃及將pH調整至1.75至2.00及將油性懸浮液老化2小時直至可見可過濾固體。過濾該等固體及用水清洗數次,導致白色固體(6.0 g, 93%產率)之分離。 2) 聯芳基三元酸50之製備。將芳基溴49 (4.2 g, 11.6 mmol)及硼酸50 (2.8 g, 12.2 mmol)溶解於DMF/水(168 mL)之1:1混合物中及脫氣10分鐘。溶液用碳酸鉀(8.0 g, 116.2 mmol)及PdCl2(dppf) (0.476 g, 0.6 mmol)處理及將反應容器放置於氮氣氛下及加熱至40℃,歷時5小時。一經完成,將pH調整至12及水相係用2 x (20 mL)乙酸乙酯清洗。然後將pH調整至1.75至2.00及冷卻至15℃。過濾所得固體及用水清洗數次以移除任何無機物以提供51 (4.8 g, 89%產率)。 1) 三-TFP酯52之製備。將三酸51 (5.0 g, 10.7 mmol)及四氟苯酚(6.5 g, 38.8 mmol)於二氯甲烷(50 mL)中之漿液冷卻至0℃及用EDC鹽酸鹽(7.45 g, 38.8 mmol)處理。將漿液升溫至周圍溫度及攪拌18小時。反應一經完成,反應係用水清洗及將有機層濃縮至油及於二氧化矽管柱上純化,其導致TFP酯52 (1.63 g, 16%產率)。 2) 受三-NAG保護之乙醇54之製備。將三-TFP酯52 (1.00 g, 1.10 mmol)及NAG-對甲苯磺酸胺53 (2.15 g, 3.33 mmol)於二氯甲烷(5 mL)中之溶液冷卻至0℃及用三乙胺(0.66 g, 6.6 mmol)處理。讓該溶液升溫至周圍溫度,歷時2小時。一經完成,該反應混合物係用水清洗及濃縮至油。將粗油溶解於乙酸酐(30 mL)中及該溶液係用1 mL三乙胺處理。3小時後,在高真空下移除有機物,其導致油54 (1.7 g, 85%產率)。 3) 苯酚55之製備。將受苄基保護之乙醇54 (2.0 g, 1.08 mmol)溶解於乙醇(23 mL)中及放置於氮氣氛下。向溶液中添加10% Pd/C (0.7 g, 30 mol%)。在周圍溫度下將漿液攪拌8小時及觸媒係經由矽藻土墊移除。在高真空下移除有機物,此導致白色固體55 (1.4 g, 74%產率)。 4) 化合物56之製備。將苯酚55 (1.3 g, 0.74 mmol)及亞磷醯胺試劑(0.364 mg, 1.11 mmol)於二氯甲烷(10 mL)中之溶液冷卻至0℃及用4,5-二氰基咪唑處理及然後容許升溫至周圍溫度,歷時2小時。一經完成,該反應混合物係用飽和碳酸氫鈉(10 mL),接著用水(10 mL)清洗及有機層係於硫酸鈉上乾燥。在減壓下濃縮有機物,此導致白色固體(1.4 g, 93%產率)。 實例7之化合物56係本文之結構1026b。 實例8.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物之物理性質。 不具有本文揭示之剛性連接子結構之某些GalNAc配體亞磷醯胺化合物已顯示於許多常用溶劑中趨於形成凝膠。隨附圖7係闡述具有與結構1008b相同之標靶性部分(N-乙醯基-半乳胺糖)、系鏈及分支點基團,但包括PEG連接子而非本文揭示之結構1008b之剛性連接子之GalNAc結構之行為之照片。將該PEG連接子-GalNAc亞磷醯胺化合物係以0.1 M稀釋經分子篩於ACN:DMF之3:1混合物中維持12小時。該PEG連接子-GalNAc於此高度極性溶劑系統中顯示顯著膠化。就此PEG連接子-GalNAc亞磷醯胺化合物而言,必須使用ACN:DMF之高達1:1混合物以維持溶解性。 隨附圖8係闡述以0.05 M完全溶解於乙腈中而無高度極性溶劑(諸如DMF)之風險或需要之亞磷醯胺化合物結構1008b之圖。儘管以較低濃度溶解於瓶中,但此闡述包含本文揭示之剛性連接子之結構係更可溶於通常用於寡核苷酸合成之常用溶劑中,及無需添加高度極性溶劑以防止膠化。 實例9.含有標靶性配體亞磷醯胺之化合物之純度。 如上文指示,圖2A顯示具有結構1008b之亞磷醯胺化合物之31
P NMR譜。圖2A顯示展示亞磷醯胺之精確位移之單一峰。未顯示其他峰(包括水解峰),其等指示高純度化合物。 圖9顯示PEG連接子-GalNAc結構之31
P NMR譜,PEG連接子-GalNAc結構原本包括與結構1008b相同之分支點、系鏈及標靶性部分。圖9顯示多個雜質峰,其等包括彼等呈現為經水解之副產物者。 實例10.寡核苷酸組合物合成。 A. 合成:RNAi劑係於用於寡核苷酸合成中之固相上根據亞磷醯胺技術合成。取決於合成規模,可使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)。合成法係於由可控孔徑玻璃(CPG, 500 Å或600Å,獲得自Prime Synthesis, Aston, PA, USA)製成之固體載體上進行。所有RNA及2'-經修飾之RNA亞磷醯胺係購買自Thermo Fisher Scientific (Milwaukee, WI, USA)。具體言之,使用下列2'-O-甲基亞磷醯胺:(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N6
-(苯甲醯基)-2'-O-甲基-腺核苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基-胺基)亞磷醯胺、5'-O-二甲氧基-三苯甲基-N4
-(乙醯基)-2'-O-甲基-胞苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基-胺基)亞磷醯胺、(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N2
-(異丁醯基)-2'-O-甲基-鳥苷-3'-O-(2-氰基-乙基-N,N-二異丙基胺基)亞磷醯胺及5'O-二甲氧基-三苯甲基-2'-O-甲基-尿苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基胺基)亞磷醯胺。2'-脫氧-2'-氟-亞磷醯胺與2'-O-甲基RNA醯二胺攜載相同保護基團。將含有標靶性配體之亞磷醯胺溶解於無水二氯甲烷或無水乙腈(50 mM)中,同時將所有其他醯二胺溶解於無水乙腈(50 mM)中及添加分子篩(3Å)。使用5-苄基硫-1H-四唑(BTT, 250 mM,溶於乙腈中)或5-乙基硫-1H-四唑(ETT, 250 mM,溶於乙腈中)作為活化劑溶液。偶合時間為10 min (RNA)、15 min (標靶性配體)、90秒(2'OMe)及60秒(2'F)。為引入硫代磷酸酯鍵,採用1,2,4-二噻唑啉-5-酮3苯酯(POS,獲得自PolyOrg, Inc., Leominster, MA, USA)於無水乙腈中之100 mM溶液。 B. 經載體結合之寡聚物之裂解及去保護:在固相合成終止後,經乾燥之固體載體係用40重量%甲胺水溶液及28%氫氧化銨溶液(Aldrich)之1:1體積溶液在30℃下處理兩小時。蒸發該溶液及將固體殘餘物復原於水中(參見下文)。 C. 純化:粗寡聚物係使用TKS凝膠SuperQ-5PW 13 u管柱及Shimadzu LC-8系統藉由陰離子交換HPLC純化。緩衝劑A為20 mM Tris,5 mM EDTA,pH 9.0且含有20%乙腈及緩衝劑B係與緩衝劑A相同,及添加1.5 M氯化鈉。記錄260 nm下之UV圖譜。匯集適當之溶離份,然後使用經Sephadex G25介質填裝之GE Healthcare XK 16/40管柱及100 mM碳酸氫銨(pH 6.7)及20%乙腈之運行緩衝劑於粒徑排阻HPLC上運行。 D. 退火。互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成RNAi劑而經混合。將此溶液放置於在70℃下之熱混合器中,加熱至95℃,在95℃下維持 5 min,及緩慢冷卻至室溫。凍乾一些RNAi劑並儲存於-15至-25℃下。雙鏈體濃度係藉由於0.2× PBS中在UV-Vis分光光度計上量測溶液吸光度測定。260 nm下之溶液吸光度然後乘以轉換因子及稀釋因子以測定雙鏈體濃度。除非另有說明,否則所有轉換因子為0.037 mg/(mL∙cm)。就一些實驗而言,轉換因子係計算自實驗測定之消光係數。 實例11. 於野生型小鼠中使用抑制F12表現之寡聚化合物比較GalNAc標靶性配體之3’及5’正義股結合位點。 為評估GalNAc配體之結合位點中正義股之3’與5’末端之間之差異,製備針對F12之抑制表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑) (本文稱為F12 RNAi劑),其等具有下表1中闡述之序列: 表1.實例11之抑制F12表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在上表1中,使用下列記法: (NAG15)=(NAG 18)=F12 RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 結合至個別GalNAc配體(即,(NAG15)或(NAG18))之F12 RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG15)或(NAG18))之F12 RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中3 mg/kg (mpk)劑量之兩種F12 RNAi劑(AD02803或AD02807)中之一者。每個治療組有三(3)隻野生型小鼠。如上文顯示,AD02803包括結合至正義股之3’末端之(NAG15),而AD 2807包括結合至正義股之5’末端之(NAG18)。 在第8、15、22及29天自經治療之小鼠獲取血清樣品以監測基因減弱。基因減弱係藉由以內部研發之mF12 alphaLISA® (Perkin Elmer)定量血清中之循環小鼠F12蛋白(mF12)含量進行量測。特定流血日期下之表現係經標準化至相同日期下生理鹽水對照組之平均值。 圖10顯示來自此研究之結果。在最低點(第22天)處,AD02803顯示循環F12含量之約70%減小,而AD02807顯示大於80%減小。資料亦顯示基因減弱效應之長度差異,如在第29天,經AD02803治療之小鼠相較於經AD2807治療之小鼠顯示較快返回至基線。此等資料支持正義股之5’末端上之GalNAc配體之連接勝過於3’正義股處之連接。 實例12. 於野生型小鼠中使用抑制F12表現之寡聚化合物進一步比較GalNAc標靶性配體之3’及5’正義股結合位點。 為進一步評估GalNAc配體於雙股抑制表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)之正義股之3’及5’末端上之結合位點,製備具有下表2中闡述之序列之針對F12基因之組合物: 表2.實例12之抑制F12表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在上表2中,使用下列記法: (NAG20)=F12 RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 結合至個別GalNAc配體(即,(NAG 20))之F12 RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG 20))之F12 RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中3 mg/kg (mpk)劑量之兩種RNAi劑(AD02815或AD02816)中之一者。每個治療組有三(3)隻野生型小鼠。如上文於表2中顯示,AD02815包括結合至正義股之5’末端之(NAG20),而AD02816包括結合至正義股之3’末端之(NAG20)。 在第8、15、22及29天自經治療之小鼠獲取血清樣品以監測基因減弱。基因減弱係藉由以內部研發之mF12 alphaLISA® (Perkin Elmer)定量血清中之循環小鼠F12蛋白(mF12)含量進行量測。特定流血日期下之表現係經標準化至相同日期下生理鹽水對照組之平均值。 圖11顯示來自此研究之結果。在最低點(第22天)處,AD02816顯示循環F12含量之約60%減小,而AD02807顯示79%減小。資料亦顯示基因減弱作用之長度差異。在第29天,自生理鹽水含量,經AD02816治療之小鼠顯示40%基因減弱,而經AD02815治療之小鼠顯示71%基因減弱。此等資料支持GalNAc配體於正義股之5’末端處之連接。 實例13.Lp(a)轉基因(Tg)小鼠中連接至具有結構1003之標靶性配體之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股Lp(a) RNAi劑),其等具有下表3中闡述之序列: 表3.實例13之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在上表3中,使用下列記法: (NAG25)=(NAG 29)=(NAG29)具有藉由本文之結構1003表示之化學結構。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 使用Lp(a)轉基因(Tg)小鼠(Frazer KA等人,1995, Nature Genetics 9:424-431)以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。此小鼠表現來自含有完全LPA基因(編碼apo(a)蛋白)及5’及3’兩者之額外序列之YAC之人類apo(a),及人類apoB-100,藉此產生人類化Lp(a)顆粒(下文中稱為「Lp(a) Tg小鼠」)。(Callow MJ等人,1994, PNAS 91:2130-2134)。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG 25)或(NAG29))之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 於正義股之5’末端處連接至個別GalNAc配體(即,(NAG25)或(NAG29))之Lp(a) RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中1 mg/kg (mpk)劑量之個別Lp(a) RNAi劑(AD03547或AD03549)。每個治療組有四(4)隻Lp(a) Tg小鼠。 在第1 (預劑量)、5、11、16、22、29及36天自經治療之小鼠獲取血清樣品。基因減弱係藉由計算血清中循環Lp(a)顆粒含量測定。Lp(a)顆粒含量係於Cobas® Integra 400 (Roche Diagnostics)上根據製造商之建議量測。就標準化而言,各動物於一時間點下之Lp(a)含量除以該動物(在此情況下,在第-1天)中表現之預劑量含量以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。然後特定時間點下之表現藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率而標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 結果顯示於圖12中。AD03549 (NAG25)在最低點(第16天)處顯示71%基因減弱,及AD03547 (NAG29)在最低點(第11天)處顯示81%基因減弱。兩種觸發物於最低點後均顯示類似回收曲線,及在第36天顯示小於26%基因減弱。此等資料支持實例13中顯示之GalNAc配體在以單一1 mg/kg劑量使用之Lp(a) Tg小鼠中在初始基因減弱活性及基因減弱之持續時間方面係相當的。 實例14.投與連接至標靶性配體結構1002及1004之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)後apo(a)轉基因(Tg)小鼠中之Apo(a)基因減弱。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股Lp(a) RNAi劑),其等具有下表4中闡述之序列: 表4.實例14之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在上表4中,使用下列記法: (NAG28) =(NAG30)=另外,(NAG 25)具有與實例13中顯示之相同化學結構。 (NAG28)具有藉由本文之結構1002表示之化學結構。(NAG30)具有藉由本文之結構1004表示之化學結構。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 使用Apo(a)轉基因(Tg)小鼠以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。Apo(a) Tg小鼠(Frazer KA等人,1995, Nature Genetics 9:424- 431)表現來自含有完全LPA基因(編碼apo(a)蛋白)及5’及3’兩者之額外序列之YAC之人類apo(a) (下文中稱為「apo(a) Tg小鼠」)。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG 25)、(NAG28)或(NAG30))之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 於正義股之5’末端處連接個別GalNAc配體(即,(NAG 25)、(NAG28)或(NAG30))之Lp(a) RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中0.5 mg/kg (mpk)劑量之RNAi劑(AD03536、AD03538或AD03540)。每個治療組有三(3)隻apo(a) Tg小鼠。 在第-1 (預劑量)、8、15、22及29天自經治療之小鼠獲取血清樣品。基因減弱係藉由使用針對apo(a)之ELISA(Abcam)分析該小鼠之血清來測定。就標準化而言,各動物於一時間點下之apo(a)含量除以該動物中表現之預治療含量(在此情況下,在第-1天)以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。然後特定時間點下之表現藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率而標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。以平均值之標準偏差之形式給定實驗誤差。 結果顯示於圖13中。就所有經測試之RNAi劑而言,最低點為第15天。在最低點處,AD03536顯示apo(a)蛋白之74%基因減弱,AD03538顯示apo(a)蛋白之74%基因減弱,及AD03540顯示apo(a)蛋白之71%基因減弱。在第29天,所有RNAi劑均顯示apo(a)蛋白含量之>48%基因減弱,除AD03536 (含有NAG25)外,其顯示僅16%基因減弱。此等資料支持NAG結構在初始基因減弱活性方面表現類似,及含有連接子結構NAG28及NAG30之RNAi劑於第29天顯示數值較大之基因減弱。 實例15.投與連接至具有結構1005及1008之標靶性配體之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)後Lp(a) Tg小鼠中之Lp(a)基因減弱。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股Lp(a) RNAi劑),其等具有下表5中闡述之序列: 表5.實例15之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙股)。
在上表5中,使用下列記法: (NAG31)=(NAG37)=另外,(NAG25)係與上文實例13中顯示之相同結構。 (NAG31)具有藉由本文之結構1005表示之化學結構。(NAG37)具有藉由本文之結構1008表示之化學結構。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 使用Lp(a) Tg小鼠以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG25)、(NAG31)或(NAG37))之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG 25)、(NAG31)或(NAG37))之Lp(a) RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中3 mg/kg (mpk)劑量之RNAi劑(AD03536、AD03629或AD04170)。每個治療組有四(4)隻Lp(a) Tg小鼠。 在第-1 (預劑量)、8、15、22、29及36天自經治療之小鼠獲取血清樣品。基因減弱係藉由計算血清中循環Lp(a)顆粒含量測定。Lp(a)顆粒含量係於Cobas® Integra 400 (Roche Diagnostics)上根據製造商之建議量測。就標準化而言,各動物於一時間點下之Lp(a)含量除以該動物中表現之預劑量含量(在此情況下,在第-1天)以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。然後特定時間點下之表現藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率以標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 所得資料顯示於圖14中。AD03536在最低點(第15天)處顯示Lp(a)含量之95%基因減弱,及在第36天維持76%之基因減弱。AD03629在最低點(第8天)處顯示Lp(a)含量之97%基因減弱,及在第36天維持90%之基因減弱。AD04170在最低點(第8天)處顯示Lp(a)含量之97%基因減弱,及在第36天維持78%之基因減弱。 實例16.投與連接至具有結構1005、1008、1025及1027之標靶性配體之抑制F12表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)後野生型小鼠中之F12基因減弱。 製備抑制F12表現之寡聚化合物(雙股F12 RNAi劑),其等於5’末端處經由硫代磷酸酯鍵結合至GalNAc標靶性配體(NAG25)s [AD04162];(NAG37)s [AD04623];(NAG31)s [AD04512];(NAG33)s [AD04650]或(NAG38)s [AD04651]。 針對GalNAc標靶性配體結構使用下列記法: (NAG25)s=(NAG31)s=(NAG33)s=(NAG37)s =(NAG38)s =(NAG31)s具有藉由本文之結構1005表示之化學結構。(NAG33)s具有藉由本文之結構1025表示之化學結構。(NAG37)s具有藉由本文之結構1008表示之化學結構。(NAG38)s具有藉由本文之結構1027表示之化學結構。用於AD04162、AD04623、AD04512、AD04650及AD04651之序列及修飾模式相同,及組合物中之唯一差異係GalNAc標靶性配體結構位於各F12 RNAi劑之正義股之5’末端處,如上文顯示。 F12 RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 結合至個別GalNAc標靶性配體(即,(NAG25)s、(NAG31)s、(NAG33)s、(NAG37)s或(NAG38)s)之F12 RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 連接至個別GalNAc配體(即,(NAG25)s、(NAG31)s、(NAG33)s、(NAG37)s或(NAG38)s)之F12 RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中1 mg/kg (mpk)劑量之五個雙鏈體(AD04162、AD04623、AD04512、AD04650及AD04651)中之一者。每個治療組有四(4)隻野生型小鼠。如上文顯示,AD04162包括結構(NAG25)s,AD04623包括結構(NAG37)s,AD04512包括結構(NAG31)s,AD04650包括結構(NAG33)s,及AD04651包括結構(NAG38)s。所有GalNAc標靶性配體係結合於各個別RNAi劑之正義股之5’末端處。 在第-1 (預劑量)、8、15及22天自經治療之小鼠獲取血清樣品以監測基因減弱。基因減弱係藉由以內部研發之mF12 alphaLISA® (Perkin Elmer)定量血清中之循環小鼠F12蛋白(mF12)含量進行量測。各動物於個別時間點下之mF12含量除以該動物中表現之預治療含量以測定「標準化至預劑量」之表現之比率。然後特定時間點下之表現藉由個別動物之「標準化至每日預劑量」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至每日預劑量」比率以標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 此研究之結果顯示於圖15中。就所有經測試之RNAi劑而言,最低點為第8天。在最低點處,AD04162顯示mF12之90%基因減弱,AD04623顯示mF12之94%基因減弱,AD04512顯示mF12之94%基因減弱,AD04650顯示mF12之92%基因減弱及AD04651顯示mF12之87%基因減弱。在第22天,所有RNAi劑顯示mF12含量之>82%基因減弱,除AD04162 (含有NAG25)外,其顯示僅74%基因減弱。此等資料支持NAG結構相對於初始基因減弱活性表現類似,及含有本文揭示之剛性連接子結構或連接子置換部分(即,NAG31、NAG33、NAG37及NAG38)之RNAi劑於第22天顯示數值較大之mF12基因減弱。 實例17.Lp(a) Tg小鼠中連接至具有結構1004及1005之標靶性配體之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑),其等具有下表6中闡述之序列: 表6.實例17之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在表6中,(NAG30)係如上文實例14中顯示之相同化學結構,及(NAG31)係如上文實例15中顯示之相同化學結構。 NAG30具有藉由本文之結構1004表示之化學結構。NAG31具有藉由本文之結構1005表示之化學結構。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 使用如本文描述之Lp(a) Tg小鼠以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。 連接至個別GalNAc配體(即,NAG30或NAG31)之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 於正義股之5’末端處連接至個別GalNAc配體(即,NAG30或NAG31)之Lp(a) RNAi劑係經由SC注射遞送。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中1 mg/kg (mpk)劑量之Lp(a) RNAi劑(AD03629或AD03540)。每個治療組有四(4)隻Lp(a) Tg小鼠。 在第-1 (預劑量)、8、15、22、29、36及43天自經治療之小鼠獲取血清樣品。基因減弱係藉由計算血清中循環Lp(a)顆粒含量測定。Lp(a)顆粒含量係於Cobas® Integra 400 (Roche Diagnostics)上根據製造商之建議量測。就標準化而言,各動物於一時間點下之Lp(a)含量除以該動物中表現之預劑量含量(在此情況下,在第-1天)以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。特定時間點下之表現然後藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率以標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 結果顯示於圖16中。就經研究之兩種RNAi劑而言,最低點為第15天。AD03629於最低點處顯示Lp(a)含量之89%基因減弱,而AD03540於最低點處顯示Lp(a)含量之85%基因減弱、兩種RNAi劑至第36天均顯示類似回收曲線。然而,在第43天,雖然AD03540顯示Lp(a)含量之16%基因減弱,但AD03629顯示Lp(a)含量之55%基因減弱。 實例18.在投與連接至標靶性配體結構1007、1025及1026之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物後apo(a) Tg小鼠中之Apo(a)基因減弱。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑),其等具有下表7中闡述之序列: 表7.實例18之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
在上表7中,使用下列記法: (NAG33)=(NAG34)=(NAG35)=(NAG33)具有藉由本文表示之結構1025之化學結構。(NAG34)具有藉由本文之結構1026表示之化學結構。(NAG35)具有藉由本文之結構1007表示之化學結構。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 使用Apo(a)轉基因(Tg)小鼠以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。 連接至個別GalNAc配體(即,NAG33、NAG34或NAG35)之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 結合至個別GalNAc標靶性配體(即,NAG33、NAG34或NAG35)之Lp(a) RNAi劑係藉由SC注射投與。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水或含於緩衝生理鹽水中1 mg/kg (mpk)劑量之RNAi劑(AD03721、AD03722或AD03723)。每個治療組有三(3)隻apo(a) Tg小鼠。 在第-1 (預劑量)、8、15、22及29天自經治療之小鼠獲取血清樣品。基因減弱係藉由分析血清中之循環apo(a)蛋白含量測定。血清中之人類apo(a)蛋白含量係藉由使用針對apo(a)之ELISA (Abcam)分析該小鼠之血清以進行監測。就標準化而言,各動物於一時間點下之apo(a)含量除以該動物中表現之預治療含量(在此情況下,在第-1天)以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。特定時間點下之表現然後藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率以標準化至生理鹽水對照組。實驗誤差係以平均值之標準偏差之形式給定。 所得資料係顯示於圖17中。就所有經研究之RNAi劑而言,最低點為第15天。AD03721於最低點處顯示apo(a)蛋白含量之91%基因減弱,AD03722於最低點處顯示apo(a)蛋白含量之81%基因減弱,而AD03723於最低點處顯示apo(a)蛋白含量之90%基因減弱。治療後apo(a)蛋白含量之回收率顯示類似軌跡,及經AD03721及AD03723治療之小鼠於各時間點處下均顯示幾乎相同之基因減弱,然而經AD03722治療之小鼠於經測試之各時間點下顯示數值較小之基因減弱。例如,在第29天,經AD03721治療之小鼠顯示apo(a)含量之76%基因減弱,經AD03723治療之小鼠顯示apo(a)含量之83%基因減弱,而經AD03722治療之小鼠顯示apo(a)含量之61%基因減弱。此等資料支持NAG33、NAG34及NAG35結構在初始基因減弱活性方面表現類似,及含有結構NAG33及NAG35之RNAi劑於第29天顯示數值較大之基因減弱。 實例19.以1 mg/kg及3 mg/kg給藥之連接至具有結構1008之標靶性配體之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)於Lp(a) Tg小鼠中之劑量反應 使用如本文描述之Lp(a)轉基因小鼠以評估具有經結合之N-乙醯基-半乳胺糖配體之雙股RNAi劑於活體內之效用。製造如上文闡述於實例15中之針對Lp(a)之具有雙鏈體ID: AD04170之RNAi劑。如上文闡述,Lp(a)雙鏈體ID: AD04170包括於正義股之5’末端處結合之NAG37標靶性配體(結構1008)。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 連接至標靶性配體結構1008之Lp(a) RNAi劑係組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 結合至標靶性配體結構1008之Lp(a) RNAi劑係藉由皮下(SC)注射投與。在第1天,SC注射係在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內投與200 µl溶液/20 g小鼠,該溶液含有生理鹽水之劑量、含於緩衝生理鹽水中1 mg/kg (mpk)之RNAi劑、或含於緩衝生理鹽水中3 mg/kg (mpk)之RNAi劑。 對照血清(預治療)樣品係取樣自在第-1天預注射之小鼠。Lp(a)顆粒含量係於Cobas® Integra 400 (Roche Diagnostics)上根據製造商之建議測定。就標準化而言,各動物於一時間點下之Lp(a)含量除以該動物中表現之預治療含量(在此情況下,在第-1天)以測定「標準化至第-1天」之表現之比率。特定時間點下之表現然後藉由個別動物之「標準化至第-1天」之比率除以生理鹽水對照組中所有小鼠之平均「標準化至第-1天」比率以標準化至生理鹽水對照組。此導致各時間點之表現標準化至對照組中之表現。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 結果顯示於圖18中。如圖18中顯示,針對Lp(a) RNAi劑跨所有時間點,劑量依賴性關係為明顯的。 實例20:食蟹猴中連接至具有結構1003及1004之標靶性配體之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)。 製備抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑),其等具有下表8中闡述之序列: 表8.實例20之抑制Lp(a)表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
Lp(a) RNAi劑AD03547係與實例13中顯示相同,及係結合至(NAG29)。Lp(a) RNAi劑AD3668係結合至(NAG30)。(NAG30)具有實例14中顯示之化學結構。NAG 29係藉由本文之結構1003表示。NAG30係藉由本文之結構1004表示。 Lp(a) RNAi劑之各股係於用於寡核苷酸合成中之固相上使用MerMade96E® (Bioautomation)或MerMade12® (Bioautomation)根據亞磷醯胺技術來合成,及互補股係藉由於0.2× PBS (磷酸鹽緩衝生理鹽水,1×, Corning, Cellgro)中組合等莫耳RNA溶液(正義及反義)以形成該等雙鏈體而經混合,此遵循通常描述於本文之實例10中之方法。 製造結合至本文揭示之具有結構1003或結構1004之標靶性配體之Lp(a) RNAi劑並將其等組合於如此項技術中已知用於皮下(SQ)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。 對照血清(預治療)樣品係取樣自在第-14、-7及1天(預劑量)預注射之食蟹猴。Lp(a)顆粒含量係於Cobas® Integra 400 (Roche Diagnostics)上根據製造商之建議測定。就標準化而言,各動物於一時間點下之Lp(a)含量除以該動物中表現之預治療含量(在此情況下,在第-14、-7及1天(預劑量))之平均值以測定「標準化至預劑量」之表現之比率。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 在第1天,對食蟹猴(食蟹獼猴)靈長類動物以3 mg/kg之Lp(a) RNAi劑AD03668或Lp(a) RNAi劑AD03547皮下注射連接至本文揭示之標靶性配體之Lp(a) RNAi劑。每個治療組兩(2)隻猴係經給藥。 結果報告於圖19中。結合至結構1003或結構1004之Lp(a) RNAi觸發物均顯示食蟹猴中之基因減弱。 實例21:食蟹猴中連接至具有結 構1008之標靶性配體之抑制F12表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)。 製造具有針對F12之變化序列且於正義股之5’末端處結合至GalNAc標靶性配體結構1008 [(NAG37)s]之F12 RNAi劑並將其等組合於如此項技術中已知用於皮下(SC)注射之醫藥上可接受之緩衝劑中。(NAG37)s係上文實例16中顯示之結構。 在第1天,對食蟹猴(食蟹獼猴)靈長類動物皮下注射3 mg/kg具有不同序列及不同修飾模式之六(6)個不同Lp(a) RNAi劑中之一者:AD04623、AD04624、AD04625、AD04626、AD04627或AD04628。每個治療組兩(2)隻猴係經給藥。 在第-7及1天(預劑量),及在第8、15及22天自經治療之食蟹猴獲取血清樣品以監測基因減弱。基因減弱係藉由以人類F12 ELISA套組(Molecular Innovations)定量血清中循環食蟹猴F12蛋白(cF12)含量進行量測。各動物於個別時間點下之cF12含量除以該動物中表現之預治療含量(第-7及1天之平均值)以測定「標準化至預劑量」之表現之比率。實驗誤差係以標準偏差之形式給定。 圖20顯示結果。連接至NAG37(結構1008)之F12 RNAi劑中之各者顯示食蟹猴中之基因減弱。 實例22.PiZ轉基因小鼠中連接至具有結構1008之標靶性配體之抑制α-1抗胰蛋白酶表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑)。 為評估活體內針對α-1抗胰蛋白酶(AAT)基因之RNAi劑,使用轉基因PiZ小鼠模型(PiZ小鼠)。PiZ小鼠具有人類PiZ AAT突變對偶基因及模型人類AATD (Carlson等人,Journal of Clinical Investigation 1989)。製備抑制AAT表現之寡聚化合物(雙股RNAi劑),其等具有下表9中闡述之序列: 表9.實例22之抑制AAT表現之寡聚化合物(RNAi劑雙鏈體)。
(NAG37)s具有如上文實例16顯示之化學結構。 AAT RNAi劑係製備於醫藥上可接受之生理鹽水緩衝劑中及藉由在背部肩膀之間之鬆弛皮膚內皮下(SC)注射200 µl溶液/20 g小鼠而向PiZ小鼠投與以評估AAT基因表現之基因減弱。各小鼠接受單一SC劑量之3 mg/kg (mpk)之AD04460。三隻(n = 3)小鼠給藥AAT RNAi劑。 抽取血漿樣品並於第-1、1 (預劑量)、8及15天分析AAT (Z-AAT)蛋白含量。將AAT含量標準化至第1天(預劑量) AAT血漿含量。蛋白含量係藉由以ELISA套組定量血漿中循環人類Z-AAT含量進行量測。 平均標準化之AAT (Z-AAT)含量係顯示於圖21中。連接至具有本文之結構1008之標靶性配體之AAT RNAi劑顯示PiZ轉基因小鼠中之基因減弱。 其他實施例 應瞭解儘管已結合詳細說明書描述本發明,但前述描述意欲闡述及非限制由隨附申請專利範圍之範圍界定之本發明之範圍。其他態樣、優點及修飾係位於下列申請專利範圍之範圍內。
圖1為化合物11(其係描述於下文實例1中且具有本文之結構1005b之化學結構)之1
H NMR譜。 圖1A為本文之結構1004b(其係描述於下文實例1中)之1
H NMR譜。 圖2為化合物19(其係描述於下文實例2中且具有本文之結構1008b之化學結構)之31
P NMR譜。 圖2A為化合物19之1
H NMR譜。 圖2B為化合物14(其係描述於下文實例2中)之1
H NMR譜。 圖2C為化合物15(其係描述於下文實例2中)之1
H NMR譜。 圖2D為化合物16(其係描述於下文實例2中)之1
H NMR譜。 圖2E為化合物17(其係描述於下文實例2中)之1
H NMR譜。 圖2F為化合物18(其係描述於下文實例2中)之1
H NMR譜。 圖3為化合物30(其係描述於下文實例3中)之1
H NMR譜。 圖4為化合物38(其係描述於下文實例4中)之1
H NMR譜。 圖5為化合物44(其係描述於下文實例5中)之1
H NMR譜。 圖6為化合物47(其係描述於下文實例6中)之1
H NMR譜。 圖7為瓶中含有PEG連接子-GalNAc亞磷醯胺之化合物(其係下文描述於實例7中)之照片。 圖8為瓶中含有結構1008b亞磷醯胺之化合物 (其係描述於下文實例7中)之照片。 圖9為PEG連接子-GalNAc結構(其係描述於下文實例8中)之31
P NMR譜。 圖10為圖解說明標準化小鼠因子12 (mF12)蛋白含量(其係描述於下文實例11中)之圖。 圖11為圖解說明標準化小鼠因子12 (F12)蛋白含量(其係描述於下文實例12中)之圖。 圖12為圖解說明標準化脂蛋白(a) (Lp(a))顆粒含量(其係描述於下文實例13中)之圖。 圖13為繪示標準化apo(a)含量(其係描述於下文實例14中)之圖。 圖14為繪示標準化Lp(a)顆粒含量(其係描述於下文實例15中)之圖。 圖15為繪示標準化小鼠F12蛋白含量(其係描述於下文實例16中)之圖。 圖16為繪示標準化Lp(a)顆粒含量(其係描述於下文實例17中)之圖。 圖17為繪示標準化apo(a)含量(其係描述於下文實例18中)之圖。 圖18為繪示標準化Lp(a)顆粒含量(其係描述於下文實例19中)之圖。 圖19為繪示食蟹猴中標準化Lp(a)顆粒含量(其係描述於下文實例20中)之圖。 圖20為繪示食蟹猴中標準化cF12蛋白含量(其係描述於下文實例21中)之圖。 圖21為圖解說明PiZ轉基因小鼠中標準化AAT (Z-AAT)蛋白含量(其係描述於下文實例22中)之圖。
Claims (46)
- 一種標靶性配體,其包含式I結構:,其包含連接子、分支點基團、一或更多個系鏈(tethers)及一或更多個標靶性部分,其中n為1至4之整數,及其中該連接子為選自由以下組成之群之結構:(結構1);(結構2);(結構3);(結構4);(結構5);(結構6a);(結構6b);(結構6c);(結構6d);,其中n為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,及當存在時,各Z′係獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構7);,其中n為0、1、2、3、4,及當存在時,各Z''係獨立地選自由以下組成之群:C1-C6烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6烷基、C1-C6胺基烷基、經取代之C2-C6烯基、經取代之C2-C6炔基、經取代或未經取代之胺基、羧基、經取代之C1-C6烷氧基、經取代之C1-C6胺基烷基、鹵素(例如F)、羥基、醯胺基、經取代之醯胺基、氰基、經取代或未經取代之酮基、經取代或未經取代之烷氧基羰基、經取代或未經取代之芳氧基羰基、經取代或未經取代之雜芳氧基羰基及巰基(結構8);及,其中V包含一或更多個經取代或未經取代之環烷基(例如環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或經取代或未經取代之雜環基(例如四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何共價連接之組合(結構9)。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該連接子係選自由以下組成之群之結構:(結構1)、(結構2)、(結構6a)、(結構6b)、(結構6c);及(結構6d)。
- 如請求項2之標靶性配體,其中該連接子為:(結構6a)。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該分支點基團為選自由以下組成之群之結構:(結構201);(結構202);(結構203);(結構204);(結構205);(結構206);(結構207);(結構208);,其中n為1至20之整數(結構209);,其中m為0至20之整數,及n為0至20之整數(結構210);,其中m為0至20之整數;n為0至20之整數;x為1至10之整數;y為1至10之整數;z為1至4之整數;及K選自由以下組成之群:經取代或未經取代之環烷基(例如環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)及經取代或未經取代之雜環基(例如四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何組合(結構211);,其中m為0至20之整數;n為0至20之整數;x為1至10之整數;及y為1至10之整數(結構212);,其中m為0至20之整數;n為0至20之整數;x為1至10之整數;y為1至10之整數;G選自由以下組成之群:、、、、、、;或任何經取代或未經取代之環狀或雜環結構,其具有5、6、7、8或9個原子之環大小,例如經取代或未經取代之環烷基(例如環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、環烯基(例如環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、芳基(例如苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、雜芳基(例如吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或雜環基(例如四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)(結構213);,其中n為0至20之整數(結構214);,其中n為0至20之整數,及Q選自由以下組成之群:、、、、、、或(結構215);(結構216);(結構217);(結構218);,其中n為選自1至7之整數(結構219)。
- 如請求項4之標靶性配體,其中該分支點基團為:(結構205)或(結構216)。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該系鏈係獨立地選自由以下組成之群:,其中n為1至20之整數(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH(結構301);,其中X為O、S或NH(結構302);(結構302a);,其中n為1至20之整數(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH(結構303);,其中n為1至20之整數(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20),及X為O、S或NH(結構304);,其中X為O、S或NH(結構305);及,其中X為O、S或NH(結構306)。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該標靶性部分係獨立地選自由以下組成之群:N-乙醯基-半乳胺糖、半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基半乳胺糖及N-異丁醯基半乳胺糖。
- 如請求項7之標靶性配體,其中該標靶性部分為N-乙醯基-半乳胺糖。
- 如請求項7之標靶性配體,其中該標靶性部分係獨立選自聚醣、半抗原、維生素、葉酸鹽、生物素、適配體(aptamers)及肽(諸如含有RGD之肽)、胰島素、EGF及轉鐵蛋白。
- 如請求項7至9中任一項之標靶性配體,其中n為3。
- 如請求項7至9中任一項之標靶性配體,其中n為4。
- 如請求項1至9中任一項之標靶性配體,其中該標靶性配體係連接至抑制表現之寡聚化合物。
- 如請求項12之標靶性配體,其中該抑制表現之寡聚化合物為RNAi劑。
- 如請求項13之標靶性配體,其中該RNAi劑為雙股。
- 如請求項14之標靶性配體,其中該RNAi劑包括一或更多個經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該標靶性配體包含選自以下之結構:(結構1001);(結構1002);(結構1003);(結構1004);(結構1005);(結構1006);(結構1007);(結構1008);(結構1009);(結構1010);(結構1024);(結構1012);(結構1013);(結構1014);(結構1015);(結構1016);(結構1017);(結構1018);(結構1019);(結構1020);(結構1021);(結構1022);及(結構1023)。
- 如請求項1之標靶性配體,其中該結構係選自:(結構1003);及(結構1008)。
- 如請求項1至9、16及17中任一項之標靶性配體,其中該標靶性配體係連接至RNAi劑。
- 如請求項18之標靶性配體,其中該RNAi劑為雙股。
- 如請求項19之標靶性配體,其中該雙股RNAi劑係於該RNAi劑之正義股之5’末端連接至該標靶性配體。
- 如請求項20之標靶性配體,其中該RNAi劑係經由磷酸酯基、硫代磷酸酯基或膦酸酯基連接至該標靶性配體之連接子。
- 一種組合物,其包含如請求項1之標靶性配體,其中該標靶性配體係連接至抑制表現之寡聚化合物,其中該標靶性配體及抑制表現之寡聚化合物之結構係由選自由以下組成之群之結構表示:(結構1001a);(結構1002a);(結構1003a);(結構1004a);(結構1005a);(結構1006a);(結構1007a);(結構1008a);(結構1009a);(結構1010a);(結構1024a);(結構1012a);(結構1013a);(結構1014a);(結構1015a);(結構1016a);(結構1017a);(結構1018a);(結構1019a);(結構1020a);(結構1021a);(結構1022a);及(1023a);其中各結構中之R包括抑制表現之寡聚化合物。
- 如請求項22之組合物,其中該標靶性配體係經由磷酸酯基、硫代磷酸酯基或膦酸酯基連接至該抑制表現之寡聚化合物。
- 如請求項22或23之組合物,其中該抑制表現之寡聚化合物為RNAi劑。
- 如請求項24之組合物,其中該RNAi劑為雙股RNAi劑。
- 如請求項25之組合物,其中該標靶性配體係連接至RNAi劑之正義股之5’末端。
- 一種化合物,其具有選自由以下組成之群之結構:(結構1001b);(結構1002b);(結構1003b);(結構1004b);(結構1005b);(結構1006b);(結構1007b);(結構1008b);(結構1009b);(結構1010b);(結構1024b);(結構1012b);(結構1013b);(結構1014b);(結構1015b);(結構1016b);(結構1017b);(結構1018b);(結構1019b);(結構1020b);(結構1021b);(結構1022b);及(結構1023b)。
- 一種化合物,其具有選自由以下組成之群之結構:(結構1025b);(結構1026b);及(結構1027b)。
- 一種標靶性配體,其包含式II結構:,其包含具有連接子置換部分之分支點基團、一或更多個系鏈及一或更多個標靶性部分,其中n為介於1至4之間之整數,及其中該連接子置換部分包括一或更多個經取代或未經取代之環烷基(例如環己基、環丙基、環丁基、環戊基、環庚基、環辛基等)、經取代或未經取代之環烯基(例如環己烯基、環丁烯基、環戊烯基、環庚烯基、環辛烯基、環己二烯基、環戊二烯基、環庚二烯基、環辛二烯基等)、經取代或未經取代之芳基(例如苯基、萘基、聯萘、蒽基等)、經取代或未經取代之雜芳基(例如吡啶基、嘧啶基、吡咯、咪唑、呋喃、苯并呋喃、吲哚等)或經取代或未經取代之雜環基(例如四氫呋喃、四氫哌喃、哌啶、吡咯啶等)或其任何組合,位於分支點基團內。
- 如請求項29之標靶性配體,其中具有連接子置換部分之分支點基團係選自:(結構220)及(結構221)。
- 如請求項30之標靶性配體,其包含選自以下之結構:(結構1025)、(結構1026)及(結構1027)。
- 如請求項29至31中任一項之標靶性配體,其中該標靶性配體係連接至抑制表現之寡聚化合物。
- 如請求項32之標靶性配體,其中連接至抑制表現之寡聚化合物之標靶性配體具有下列結構:,其中R包括抑制表現之寡聚化合物(結構1027a)。
- 如請求項32之標靶性配體,其中該抑制表現之寡聚化合物為RNAi劑。
- 如請求項34之標靶性配體,其中該RNAi劑為雙股。
- 如請求項35之標靶性配體,其中該RNAi劑包括一或更多個經修飾之核苷酸。
- 一種結合至如請求項1至21及29至36中任一項之標靶性配體之抑制表現之寡聚化合物在製造用於抑制個體中標靶核酸表現之藥劑之用途。
- 一種如請求項1至21及29至36中任一項之標靶性配體在製造用於將治療劑引入哺乳動物細胞內之藥劑之用途,其中該標靶性配體係連接至該治療劑。
- 如請求項38之用途,其中該細胞係存在於個體中。
- 如請求項39之用途,其中該個體為人類。
- 如請求項38之用途,其中該治療劑為抑制表現之寡聚化合物。
- 如請求項41之用途,其中該抑制表現之寡聚化合物為雙股RNAi劑。
- 一種連接至治療化合物之如請求項1至21及29至36中任一項之標靶性配體在製造用於治療將受益於投與治療化合物之疾病或病症之藥劑之用途。
- 一種如請求項22至26中任一項之組合物在製造用於治療將受益於投與治療化合物之疾病或病症之藥劑之用途。
- 一種製造包括如請求項1之標靶性配體之亞磷醯胺(phosphoramidite)化合物之方法,該方法包括以下步驟:(i)將該連接子之羧酸部分(或其活化酯)共價連接至位於分支點基團上之端胺,及(ii)經由使用亞磷醯胺形成試劑之亞磷酸化(phosphitylation)將該連接子連接至亞磷醯胺之磷原子。
- 如請求項45之方法,其中該核苷亞磷醯胺試劑係選自:及。
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