JP2019526527A - 標的化リガンド - Google Patents

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Abstract

化合物、該化合物をそのインビボ標的に導くのに有用であるような治療用化合物に連結され得る新規標的化リガンドが記載されている。本明細書中に開示した標的化リガンドは、遺伝子発現を調節するために、RNAi剤などの発現阻害オリゴマー化合物を肝臓細胞に標的化するのに役立つ。本明細書中に開示した標的化リガンドは、治療用化合物に結合されると、治療向け、診断向け、標的バリデーション、およびゲノム探索の用途を含めたさまざまな用途に使用され得る。本明細書中に開示した標的化リガンドを含んで成る組成物は、発現阻害オリゴマー化合物に連結されると、肝細胞などの肝臓の細胞における標的核酸配列の発現を媒介でき、そしてそれは、細胞、組織、または生物体における遺伝子発現または活性の阻害に応答する疾患または障害の治療に有用であり得る。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年9月2日に出願された米国特許仮出願第62/383,221号および2017年2月8日に出願された米国特許仮出願第62/456,339号による優先権を主張するものであり、そのそれぞれの内容の全体を参照によって本明細書中に援用する。
背景
多くの化合物が、治療効果を有するかまたは診断目的で有用となるためには、特定位置に(例えば、所望の(単数もしくは複数の)細胞に)送達される必要がある。生体内において治療用化合物を送達することを試みる場合には、こうしたことが頻繁にある。さらに、特定位置に効率的に化合物を送達できることは、該化合物の投与によって引き起こされる可能性がある意図しない結果(標的を外れた効果など)を制限するかまたは潜在的に排除する。生体内の所望の位置に治療用化合物などの化合物の送達を容易にする1つの方法は、標的化リガンドに化合物を連結されたかまたは取り付けることである。
標的化リガンドを使用することで標的化され得る治療用化合物のクラスの1つが、オリゴマー化合物である。標的核酸に対して少なくとも部分的に相補的なヌクレオチド配列を含むオリゴマー化合物が、生体外および生体内の両方において標的の機能および活性を変更することが示された。標的核酸(mRNAなど)を含有する細胞に送達されたとき、オリゴマー化合物は、該標的の発現を調節して、標的核酸の変更された転写または翻訳をもたらすことが示された。特定の事例では、前記オリゴマー化合物は、核酸標的を阻害すること、および/または標的核酸の分解を引き起こすことによって遺伝子の発現を低減し得る。
標的核酸がmRNAであれば、発現阻害オリゴマー化合物がmRNA標的の発現を調節し得る1つの機構は、RNA干渉による。RNA干渉とは、RNAまたはRNA様分子(化学的に修飾されたRNA分子など)が分解によって遺伝子発現を抑制することができる生物学的プロセスである。転写後遺伝子サイレンシングのプロセスは、外来遺伝子の発現を予防するために使用される、進化的に保存された細胞防御機構であると考えられる。
合成RNAおよびRNA様分子は、生体内においてRNA干渉を誘発することが示された。例えば、Elbashirら(Nature 2000, 411, 494-98)は、培養哺乳動物細胞において21ヌクレオチドの合成RNA分子の二本鎖の導入によって引き起こされたRNAiを記載している。RNAi応答機構を引き起こす可能性のある合成のRNAまたはRNA様分子のタイプは、修飾ヌクレオチドおよび/または1もしくは複数の非ホスホジエステル結合から成ってもよい。
さらに、(修飾ヌクレオチドを含み、かつ、1もしくは複数の非ホスホジエステル結合を有する可能性もある)一本鎖RNAおよびRNA様分子は、標的mRNAなどの標的核酸の発現を変更する可能性もある。
概要
ヒト患者または動物などの対象の体内の特定の臓器または組織、例えば、特定の標的部位への治療用化合物の送達を促進する可能性のある標的化リガンドを、本明細書中に開示する。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物の標的送達を促進し得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、肝臓への発現阻害オリゴマー化合物の送達を促進する。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、1もしくは複数の標的化部分、1もしくは複数のテザー、1もしくは複数の分岐点基、および1もしくは複数のリンカーを含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る。本明細書中に開示した標的化リガンドにおける使用に好適なリンカーは「剛性」リンカーを含み、そしてそれは、1もしくは複数の標的化部分と、それもしくはそれらが連結される治療用化合物との間の潜在的な相互作用を低減するために標的化リガンド全体に十分な安定性および剛性を与える。加えて、本明細書中に開示した標的化リガンドにおける使用に好適な「剛性」リンカーは、ホスホラミダイト化合物(本明細書中では「ホスホラミダイト含有化合物」とも呼ばれる)として標的化リガンドを効率的に合成するのに有用である。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、1もしくは複数の標的化部分、1もしくは複数のテザー、およびリンカー置換部分を有する1もしくは複数の分岐点基を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る。該リンカー置換部分は、分岐点基内に位置し、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル、シクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリル基、または共有結合で連結されたその組み合わせを含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る。分岐点基内にリンカー置換部分を有することで、標的化リガンド全体に十分な安定性と剛性を提供することによって、本明細書中に開示した「剛性」リンカーのものに類似した特性を与える。加えて、標的化リガンドにおける使用に好適なリンカー置換部分を有する分岐点基は、ホスホラミダイト化合物として標的化リガンドを効率的に合成するのに有用である。
リンカー、分岐点基、1もしくは複数のテザー、および1もしくは複数の標的化部分を含み、式Iの構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る標的化リガンドを本明細書中に開示する:
{式中、nは、1〜4の整数(例えば、1か、2、3または4)であり、かつ、式中、該リンカーは、以下から成る群から選択される構造である:
(式中、n’は、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10であり、そして、存在する場合、それぞれのZ’は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、またはスルフヒドリルから成る群から選択され)(構造7);
(式中、n”は、0、1、2、3、4(例えば、1、2、3、または4)であり、そして、存在する場合、それぞれのZ”は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、またはスルフヒドリルから成る群から選択され)(構造8);および
(式中、Vは、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、または置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、あるいは任意の、共有結合で連結されたその組み合わせを含む)(構造9)}。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、リンカー置換部分を有する分岐点基を含む。
リンカー置換部分を有する分岐点基、1もしくは複数のテザー、および1もしくは複数の標的化部分を含む、式IIの構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る標的化リガンドを本明細書中に開示する:
{式中、nは、1〜4の整数(例えば、1、2、3、または4)であり、そして、式中、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、または置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、あるいは任意のその組み合わせを含む該リンカー置換部分が、分岐点基内に位置する}。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、治療用化合物などの化合物、例えば、発現阻害オリゴマー化合物に、例えば、該発現阻害オリゴマー化合物の3’または5’末端に、直接的または間接的に連結され得る。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物としては、1もしくは複数の修飾ヌクレオチドが挙げられる。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖RNAi剤などのRNAi剤である。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端にて、ホスファート基、ホスホロチオアート基、またはホスホナート基を介してRNAi剤に連結される。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、1もしくは複数の標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、標的化部分としてN−アセチルガラクトサミンを含む。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1003);
(構造1008);
(構造1023);または
(構造1027)。
標的化リガンドおよび発現阻害オリゴマー化合物を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る組成物を本明細書中に開示する。標的化リガンドおよびRNAi剤を含む組成物を本明細書中に開示する。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドおよびRNAi剤を含む、本明細書中に開示した組成物は、以下の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1002a);
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1003a);
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1005a);
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1008a);
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1012a);または
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1027a)。
標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物を本明細書中に開示する。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、以下の構造式によって表される構造を有する:
(構造1001b);
(構造1002b);
(構造1003b);
(構造1004b);
(構造1005b);
(構造1006b);
(構造1007b);
(構造1008b);
(構造1009b);
(構造1010b);
(構造1012b);
(構造1013b);
(構造1014b);
(構造1015b);
(構造1016b);
(構造1017b);
(構造1018b);
(構造1019b);
(構造1020b);
(構造1021b);
(構造1022b);
(構造1023b);
(構造1024b);
(構造1025b);
(構造1026b);または
(構造1027b)。
本明細書中に開示した標的化リガンドを含む医薬組成物もまた開示する。
化合物の投与から恩恵を受ける疾患または障害を治療する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された化合物を対象に投与することを含む該方法を開示する。
対象における標的核酸の発現を阻害する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物の治療量を投与することを含む該方法を本明細書中に開示する。
生体内で肝臓に発現阻害オリゴマー化合物を送達する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物を対象に投与することを含む該方法を本明細書中に開示する。
標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物を製造するプロセスまたは方法であって、(i)リンカーを分岐点基に共有結合で連結し、そして(ii)ホスホラミダイト形成試薬を用いたホスフィチル化(phosphytylation)反応によって、リンカーをホスホラミダイトのリン原子に連結し、それによって、ホスホラミダイト化合物を形成することを含む該方法、を本明細書中に開示する。
本明細書中に使用される場合、「連結された」という用語は、二分子間の接続を指すとき、2つの分子が共有結合によってつなぎ合わせられているか、または2つの分子が非共有結合(例えば、水素結合またはイオン結合)を介して結合されていることを意味する。「連結された」という用語が非共有結合を介した二分子間の結合を指すいくつかの例では、2つの異なった分子間の結合は、生理学的に許容し得るバッファー(例えば、ホスファート緩衝生理食塩水)中で1×10−4M未満(例えば、1×10−5M未満、1×10−6M未満、または1×10−7M未満)のKを有する。
本明細書中に使用される場合、「直接的に連結された」という用語は、あらゆる原子または原子群の介在なしに、第二の化合物または基に連結された第一の化合物または基を指す。本明細書中に使用される場合、「間接的に連結された」という用語は、例えば、連結基などの介在基、化合物、または分子によって第二の化合物または基に連結された第一の化合物を指す。特に明記しない限り、本明細書中で使用される「連結された」という用語は、それらの用語が本明細書中に規定されているように「直接的に連結された」と「間接的に連結された」の両方を含む。
本明細書中に使用される場合、「オリゴマー化合物」は、約10〜50個のヌクレオチドまたはヌクレオチド塩基対を含むヌクレオチド配列である。いくつかの実施形態において、オリゴマー化合物は、細胞内で発現されている標的核酸または標的遺伝子内のコード配列に対して少なくとも部分的に相補的な核酸塩基配列を有する。いくつかの実施形態において、遺伝子を発現する細胞への送達時に、前記オリゴマー化合物は、原因となる遺伝子の発現を阻害することができるので、本明細書中で「発現阻害オリゴマー化合物」と呼ばれる。遺伝子発現は、インビトロであってもまたはインビボであっても阻害され得る。「オリゴマー化合物」としては、これだけに限定されるものではないが:オリゴヌクレオチド、一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、低分子干渉RNA(siRNA)、二本鎖RNA(dsRNA)、マイクロRNA(miRNA)、低分子ヘアピン型RNA(shRNA)、リボザイム、干渉RNA分子、およびダイサー基質、が挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「オリゴヌクレオチド」という用語は、そのそれぞれが独立に修飾されていても、または修飾されていなくてもよい連結されたヌクレオシドのポリマーを意味する。
本明細書中に使用される場合、「一本鎖オリゴヌクレオチド」という用語は、標的mRNAに対して少なくとも部分的に相補的である、すなわち、哺乳動物の生理的条件(または、インビトロにおける匹敵した条件)下で水素結合形成によって標的mRNAにハイブリダイズできる配列を有する一本鎖オリゴマー化合物を意味する。いくつかの実施形態において、一本鎖オリゴヌクレオチドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドである。
本明細書中に使用される場合、「RNAi剤」とは、配列特異的な様式で標的mRNAのメッセンジャーRNA(mRNA)転写産物の翻訳を低減するかまたは阻害することができるRNAまたはRNA様(例えば、化学的に修飾されたRNA)オリゴヌクレオチド分子を含む剤を意味する。本明細書中に使用される場合、RNAi剤は、RNA干渉機構を通して機能する(すなわち、哺乳動物細胞のRNA干渉経路機構(RNA誘導型サイレンシング複合体またはRISC)との相互作用によりRNA干渉を引き起こす)か、または(単数もしくは複数の)任意の代替機構もしくは経路によって機能する。その用語が本明細書中に使用されるとき、RNAi剤が主にRNA干渉機構を通して機能していると考えられるが、開示したRNAi剤は、ある特定の経路または作用機序に縛られたり、または制限されたりすることはない。RNAi剤としては、これだけに限定されるものではないが:一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、低分子干渉RNA(siRNA)、二本鎖RNA(dsRNA)、マイクロRNA(miRNA)、低分子ヘアピン型RNA(shRNA)、およびダイサー基質が挙げられる。本明細書中に記載したRNAi剤は、標的とされたmRNAに対して少なくとも部分的に相補的な鎖を有するオリゴヌクレオチドから成る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載したRNAi剤は、二本鎖であって、かつ、アンチセンス鎖と該アンチセンス鎖に対して少なくとも部分的に相補的なセンス鎖から成る。RNAi剤は、修飾ヌクレオチド、および/または1もしくは複数の非ホスホジエステル結合から成ってもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載したRNAi剤は一本鎖である。
本明細書中に使用される場合、「抑制」、「低減」、「阻害」、「下方制御」、または「ノックダウン」という用語は、所定の遺伝子の発現を指すとき、その中で該遺伝子が転写される細胞、細胞群、組織、臓器、または対象における遺伝子から転写されるRNAのレベル、またはmRNAから翻訳されるポリペプチド、タンパク質またはタンパク質サブユニットのレベルによって計測される遺伝子の発現が、該細胞、細胞群、組織、臓器、または対象が本明細書中に記載した標的化リガンドに連結されたオリゴマー化合物を用いて治療されたときに、そうした治療を受けなかった第二の細胞、細胞群、組織、臓器、または対象と比較して、低減されることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「配列」または「ヌクレオチド配列」という用語は、標準的なヌクレオチド命名法を使用した文字の連なりを用いて記載した核酸塩基またはヌクレオチドの連なりまたは順序を意味する。
本明細書中に使用される場合であって、かつ、別段の指示がなければ、「相補的」という用語は、第二のヌクレオチド配列(例えば、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは二本鎖RNAi剤のアンチセンス鎖)と関連した第一のヌクレオチド配列(例えば、RNAi剤のセンス鎖または標的mRNA)を記載するのに使用されるとき、特定の条件下で、第二のヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドとハイブリダイズして(哺乳動物の生理的条件(または、インビトロにおける匹敵する条件)下で塩基対水素結合を形成して)、そして、二本鎖または二重らせん構造を形成する第一のヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの能力を意味する。相補的配列は、ワトソンークリック塩基対または非ワトソンークリック塩基対を含み、かつ、天然もしくは修飾ヌクレオチド、または少なくともハイブリダイズする能力に関する上記要件を実現する範囲で、ヌクレオチド模倣体を含む。
本明細書中に使用される場合、「完璧に相補的」または「完全に相補的」とは、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべて(100%)が第二のポリヌクレオチドの連続配列の同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。前記連続配列は、第一または第二のヌクレオチド配列のすべてまたは一部を含んでもよい。
本明細書中に使用される場合、「部分的に相補的」とは、ハイブリダイズした核酸塩基配列の対において、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべてではなく、少なくとも70%が、第二のポリヌクレオチドの連続配列の同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「実質的に相補的」とは、ハイブリダイズした核酸塩基配列の対において、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべてではなく、少なくとも85%が、第二のポリヌクレオチドの連続配列で同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。
本明細書中に使用される「相補的」、「完全に相補的」、および「実質的に相補的」という用語は、二本鎖RNAi剤のセンス鎖とアンチセンス鎖との間、二本鎖RNAi剤のアンチセンス鎖と標的mRNAの配列との間、または一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的mRNAの配列との間で合致する塩基に関して使用されてもよい。
本明細書中に使用される場合、「治療する」、「治療」などの用語は、対象の疾患の1もしくは複数の症状の数、重症度、および/または頻度からの解放またはそれらの緩和を提供するために採られた方法またはステップを意味する。
本明細書中に使用される場合、オリゴマー化合物を指すとき、「細胞内に導入」という語句は、細胞内にオリゴマー化合物を機能的に送達することを意味する。「機能的な送達」という語句は、前記オリゴマー化合物が期待された生物学的活性、例えば、遺伝子発現の配列特異的な阻害、を有することができる様式で該オリゴマー化合物を細胞に送達することを意味する。
特に明記がない限り、本明細書中で使用される記号
の使用は、(単数もしくは複数の)任意の基が本明細書中に記載した本発明の範囲によるものに連結され得ることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「異性体」という用語は、同一の分子式を有するが、それらの原子の性質もしくは結合の並びまたは空間内のそれらの原子の配置が異なる化合物を指す。空間内のそれらの原子の配置が異なる異性体は「立体異性体」と呼ばれる。互いに鏡像でない立体異性体は「ジアステレオ異性体」と呼ばれ、そして、重ね合わせることができない鏡像である立体異性体は「鏡像異性体」、もしくは時には、光学異性体と呼ばれる。4つの非同一置換基に接着された炭素原子は「キラル中心」と呼ばれる。
本明細書中に使用される場合、そこで不斉中心が存在し、それによって、鏡像異性体、ジアステレオマー、または他の立体異性の立体配置を示す各構造に関して、特定の立体構造を有するとして構造が特異的に同定されることなしに、本明細書中に開示した各構造は、それらの光学的に純粋、かつ、ラセミ形態を含めた斯かるすべての見込まれる異性体を表すことを意図する。例えば、本明細書中に開示した構造は、ジアステレオマーの混合物、ならびにただ一つの立体異性体を網羅することを意図する。
「置換された」という用語は、本明細書中に使用される場合、示された原子、通常、炭素、酸素、または窒素原子上の任意の1もしくは複数の水素が、示された原子の標準イオン価を超えないことを条件として、本明細書中に規定される任意の基で置換され、そして、該置換が安定化合物をもたらすことを意味する。置換基の制限されることのない例としては、C1−C6アルキル、C2−C6アルケニル、C2−C6アルキニル、シアノ、ヒドロキシル、オキソ、カルボキシル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール、ケト、アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、ヘテロアリールオキシカルボニル、またはハロ(例えば、F、Cl、Br、I)が挙げられる。置換基がケトまたはオキソ(すなわち、=O)であるとき、原子上の2つの(2)水素が置換される。環の二重結合は、本明細書中に使用される場合、2つの隣接している環原子(例えば、C=C、C=N、N=Nなど)の間で形成される二重結合である。
本開示のいくつかの化合物は、本開示の範囲内に包含されることも意図する互変異性型で存在し得る。「互変異性体」とは、その構造が原子の配置において著しく異なるが、容易かつ急速な平衡状態で存在する化合物である。本開示の化合物が異なった互変異性体として示されてもよいことは、理解されるべきである。化合物が互変異性型を有するとき、すべての互変異性型が該開示の範囲内にあり、かつ、該化合物の名称があらゆる互変異性型を除外しないことを意図することもまた、理解されなければならない。
本開示の化合物および医薬的に許容され得る塩は、ケトン−エノール、アミド−ニトリル、ラクタム−ラクチム、ヘテロ環式環(例えば、核酸塩基グアニン、チミン、およびシトシン)のアミド−イミド酸互変異性、アミン−エナミンとエナミン−エナミン、および幾何異性体、ならびにその混合物を含めた1もしくは複数の互変異性型で存在し得る。グルコースと他の糖類によって示される環状鎖互変異性は、同じ分子内のヒドロキシ基(−OH)と反応して環(環形状)の形態をもたらす、糖鎖分子内のアルデヒド基(−CHO)の結果として生じる。すべての斯かる互変異性型が本開示の範囲内に含まれる。互変異性体は、溶液中に互変異性セットの混合物として存在する。固体では、通例、1種類の互変異性体が支配的である。1種類の互変異性体が記載されたとしても、本開示は、本明細書中に開示した化合物のすべての互変異性体を含む。互変異性化により相互転換可能である互変異性体の概念は互変異性と呼ばれる。互変異性では、電子および水素原子の同時シフトが起こる。
互変異性化は:塩基:1.脱プロトン反応;2.脱局在化陰イオン(例えば、エノラート)の形成;3.陰イオンの異なった位置でのプロトン化;酸:1.プロトン化;2.脱局在化陽イオンの形成;3.陽イオンに隣接した異なった位置での脱プロトン反応、によって触媒される。
本明細書中に使用される場合、「アルキル」という用語は、別段の定めがない限り、1〜10個の炭素原子を有する、線状または分岐の、脂肪族飽和炭化水素基を指す。例えば、「C1−C6アルキル」としては、線状または分岐配置の、1、2、3、4、5、または6個の炭素を有するアルキル基が挙げられる。本明細書中に使用される場合、「アミノアルキル」という用語は、標準イオン価によって許容される1もしくは複数のアミノ基で任意の位置にて置換された、先に規定されたアルキル基を指す。前記アミノ基は、非置換であっても、一置換であっても、または二置換であってもよい。
本明細書中に使用される場合、「シクロアルキル」という用語は、別段の定めがない限り、3〜14個の炭素原子を有する飽和または不飽和の非芳香族炭化水素環基を意味する。シクロアルキルの例としては、これだけに限定されるものではないが、シクロプロピル、メチルシクロプロピル、2,2−ジメチル−シクロブチル、2−エチル−シクロペンチル、シクロヘキシルなどが挙げられる。シクロアルキルは、複数のスピロ環または融合環を含んでもよい。シクロアルキル群は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「アルケニル」という用語は、別段の定めがない限り、少なくとも1つの炭素−炭素二重結合を含み、2〜10個の炭素原子を有する、線状または分岐の非芳香族炭化水素基を指す。最大5つの炭素−炭素二重結合が、斯かる群に存在し得る。例えば、「C2−C6」アルケニルは、2〜6個の炭素原子を有するアルケニルラジカルと規定される。アルケニルの例としては、これだけに限定されるものではないが、エテニル、プロペニル、ブテニル、およびシクロヘキセニルが挙げられる。アルケニル基の線状、分岐、または環状部分は、二重結合を含んでもよく、および標準イオン価によって許容される任意の位置にて任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される、または五置換される。「シクロアルケニル」という用語は、特定の数の炭素原子および少なくとも1つの炭素−炭素二重結合を有する単環式炭化水素基を意味する。
本明細書中に使用される場合、「アルキニル」という用語は、別段の定めがない限り、2〜10個の炭素原子を含み、および少なくとも1つの炭素−炭素三重結合を含む、線状または分岐の、炭化水素基を指す。最大5つの炭素−炭素三重結合が存在してもよい。よって、「C2−C6アルキニル」は、2〜6個の炭素原子を有するアルキニルラジカルを意味する。アルキニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、エチニル、2−プロピニル、および2−ブチニルが挙げられる。アルキニル基の線状または分岐部分は、標準イオン価によって許容される三重結合を含んでもよく、そして、標準イオン価によって許容される任意の位置にて任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「アルコキシル」または「アルコキシ」は、酸素架橋によって取り付けられた示された数の炭素原子を伴った、先に規定されるアルキル基を指す。C1−6アルコキシは、C、C、C、C、C、およびCアルコキシ基を含むことが意図される。C1−8アルコキシは、C、C、C、C、C、C、C、およびCアルコキシ基を含むことが意図される。アルコキシの例としては、これだけに限定されるものではないが、メトキシ、エトキシ、n−プロポキシ、i−プロポキシ、n−ブトキシ、s−ブトキシ、t−ブトキシ、n−ペントキシ、s−ペントキシ、n−ヘプトキシ、およびn−オクトキシが挙げられる。本明細書中に使用される場合、「ケト」とは、カルボニル架橋によって取り付けられた本明細書中に規定される、任意のアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、またはアリール基を指す。ケト基の例としては、これだけに限定されるものではないが、アルカノイル(例えば、アセチル、プロピオニル、ブタノイル、ペンタノイル、ヘキサノイル)、アルケノイル(例えば、アクリロイル)、アルキノイル(例えば、エチノイル、プロピノイル、ブチノイル、ペンチノイル、ヘキシノイル)、アリーロイル(例えば、ベンゾイル)、ヘテロアリーロイル(例えば、イミダゾロイル、キノリノイル、ピリジノイル、ピロロイル)が挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アルコキシカルボニル」は、カルボニル架橋(すなわち、−C(O)O−アルキル−)によって取り付けられた、先に規定される任意のアルコキシ基を指す。アルコキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、イソ−プロポキシカルボニル、n−プロポキシカルボニル、t−ブトキシカルボニル、ベンジルオキシカルボニルまたはn−ペントキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アリールオキシカルボニル」は、オキシカルボニル架橋(すなわち、−C(O)O−アリール−)によって取り付けられた、本明細書中に規定される任意のアリール基を指す。アリールオキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、フェノキシカルボニルおよびナフチルオキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「ヘテロアリールオキシカルボニル」は、オキシカルボニル架橋(すなわち、−C(O)O−ヘテロアリール−)によって取り付けられた、本明細書中に規定される任意のヘテロアリール基を指す。ヘテロアリールオキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、2−ピリジルオキシカルボニル、2−オキサゾリルオキシカルボニル、4−チアゾリルオキシカルボニル、またはピリミジニルオキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アリール」または「芳香族」とは、その中の少なくとも1つの環が芳香族である、各環に最大7つの原子から成る任意の安定した単環式または多環式炭素環である。アリール基の例としては、これだけに限定されるものではないが、フェニル、ナフチル、アントラセニル、テトラヒドロナフチル、インダニル、およびビフェニルが挙げられる。アリール置換基が二環式であり、1つの環が非芳香族である場合では、取り付けには芳香族環を介していることが理解される。アリール基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「ヘテロアリール」という用語は、その中の少なくとも1つの環が芳香族であり、およびO、N、およびSから成る群から選択される1〜4個のヘテロ原子を含む、各環に最大7つの原子から成る安定した単環式または多環式環である。ヘテロアリール基の例としては、これだけに限定されるものではないが、アクリジニル、カルバゾリル、シンノリニル、キノキサリニル、ピロラゾリル、インドリル、ベンゾトリアゾリル、フラニル、チエニル、ベンゾチエニル、ベンゾフラニル、ベンズイミダゾロニル、ベンズオキサゾロニル、キノリニル、イソキノリニル、ジヒドロイソインドロニル、イミダゾピリジニル、イソインドロニル、インダゾリル、オキサゾリル、オキサジアゾリル、イソキサゾリル、インドリル、ピラジニル、ピリダジニル、ピリジニル、ピリミジニル、ピロリル、テトラヒドロキノリンが挙げられる。「ヘテロアリール」はまた、任意の含窒素ヘテロアリールのN−オキシド誘導体を含むこともまた理解される。ヘテロアリール置換基が二環式であり、1つの環が非芳香族であるかまたはヘテロ原子を含まない場合では、取り付けには芳香族環を介するか、またはヘテロ原子含有環を介することが理解される。ヘテロアリール基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「複素環化合物」、「複素環式」または「ヘテロシクリル」という用語は、多環式基を含めた、O、N、およびSから成る群から選択される1〜4つのヘテロ原子を含有する3〜14員の芳香族または非芳香族複素環を意味する。本明細書中に使用される場合、「複素環式」という用語もまた、用語「複素環化合物」および「ヘテロシクリル」と同義であると見なされ、本明細書中に記載した同じ定義を有すると理解される。「ヘテロシクリル」は、上記のヘテロアリールだけでなく、そのジヒドロおよびテトラヒドロ類似体も含む。ヘテロシクリル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、そのアゼチジニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾフラザニル、ベンゾピラゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、カルバゾリル、カルボリニル、シンノリニル、フラニル、イミダゾリル、インドリニル、インドリル、インドラジニル、インダゾリル、イソベンゾフラニル、イソインドリル、イソキノリル、イソチアゾリル、イソキサゾリル、ナフトピリジニル、オキサジアゾリル、オキソオキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾリン、オキソピペラジニル、オキソピペリジニル、オキソモルホリニル、イソキサゾリン、オキセタニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドピリジニル、ピリダジニル、ピリジル、ピリジノニル、ピリミジル、ピリミジノニル、ピロリル、キナゾリニル、キノリル、キノキサリニル、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオピラニル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラゾリル、テトラゾロピリジル、チアジアゾリル、チアゾリル、チエニル、トリアゾリル、1、4−ジオキサニル、ヘキサヒドロアゼピニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピリジン−2−オニル、ピロリジニル、モルホリニル、チオモルホリニル、ジヒドロベンゾイミダゾリル、ジヒドロベンゾフラニル、ジヒドロベンゾチオフェニル、ジヒドロベンズオキサゾリル、ジヒドロフラニル、ジヒドロイミダゾリル、ジヒドロインドリル、ジヒドロイソキサゾリル、ジヒドロイソチアゾリル、ジヒドロオキサジアゾリル、ジヒドロオキサゾリル、ジヒドロピラジニル、ジヒドロピラゾリル、ジヒドロピリジニル、ジヒドロピリミジニル、ジヒドロピロリル、ジヒドロキノリニル、ジヒドロテトラゾリル、ジヒドロチアジアゾリル、ジヒドロチアゾリル、ジヒドロチエニル、ジヒドロトリアゾリル、ジヒドロアゼチジニル、ジオキシドチオモルホリニル、メチレンジオキシベンゾイル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、およびN−オキシドが挙げられる。ヘテロシクリル置換基の取り付けは、炭素原子を介して、またはヘテロ原子を介して起こり得る。ヘテロシクリル基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
当業者は、本明細書中に開示した化合物および組成物が、該化合物または組成物が置かれる環境によってプロトン化または脱プロトン化状況で特定の原子(例えば、N、O、またはS原子)を有することを容易に理解するかまたは認識するであろう。従って、本明細書中に使用される場合、本明細書中に開示した構造は、例えば、OH、SH、またはNHなどの特定の官能基がプロトン化または脱プロトン化され得ると想定する。本明細書中の開示は、当業者によって容易に理解されるように、環境のpHに基づくプロトン化の状況にかかわらず開示した化合物および組成物を網羅することを意図する。
本明細書中の請求項で使用される場合、「から成る」という語句は、請求項で指定されていないあらゆる成分、ステップ、または構成要素を除外する。
本明細書中の請求項で使用されるとき、「から実質的に成る」という語句は、請求項の範囲を、指定された材料またはステップ、および請求項に記載されている発明の(単数もしくは複数の)基本的および新規特徴に物質的に影響しないものに限定する。
別段の規定がない限り、本明細書中に使用されるすべて技術用語および学術用語は、本願発明が属する技術分野の当業者により通常理解されるものと同じ意味を有する。本明細書中に記載した方法および材料に類似したもしくはそれと同等な方法および材料は、本発明の実施または試験において使用することができるが、好適な方法および材料が以下に記載されている。本明細書中で言及されたすべての刊行物、特許出願、特許および他の参照文献は、それらの全体が参照によって本明細書中に援用される。矛盾する場合には、定義を含めた本明細書が支配するであろう。加えて、材料、方法、および実施例は、単なる例証であり、限定することを意図するものではない。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明、および請求項から明らかであろう。
図1は、化合物11(実施例1で以下に記載されており、かつ、本明細書中の構造1005bの化学構造を有する)のH NMRスペクトルである。 図1Aは、本明細書中の構造1004b(実施例1で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図2は、化合物19(実施例2で以下に記載されており、かつ、本明細書中の構造1008bの化学構造を有する)の31P NMRスペクトルである。 図2Aは、化合物19のH NMRスペクトルである。 図2Bは、化合物14(実施例2で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図2Cは、化合物15(実施例2で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図2Dは、化合物16(実施例2で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図2Eは、化合物17(実施例2で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図2Fは、化合物18(実施例2で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図3は、化合物30(実施例3で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図4は、化合物38(実施例4で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図5は、化合物44(実施例5で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図6は、化合物47(実施例6で以下に記載されている)のH NMRスペクトルである。 図7は、ボトル内のPEGリンカー−GalNAcホスホラミダイト含有化合物(実施例7で以下に記載されている)の写真である。 図8は、ボトル内の構造1008bのホスホラミダイト含有化合物(実施例7で以下に記載されている)の写真である。 図9は、PEGリンカー−GalNAc構造(実施例8で以下に記載されている)の31P NMRスペクトルである。 図10は、野性型マウスにおける正規化マウス第12因子(mF12)タンパク質レベル(実施例11で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図11は、野性型マウスにおける正規化マウス第12因子(F12)タンパク質レベル(実施例12で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図12は、Lp(a)トランスジェニック(Tg)マウスにおける正規化リポタンパク質(a)(Lp(a))粒子レベル(実施例13で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図13は、apo(a)トランスジェニック(Tg)マウスにおける正規化apo(a)レベル(実施例14で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図14は、Lp(a)Tgマウスにおける正規化Lp(a)粒子レベル(実施例15で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図15は、野性型マウスにおける正規化マウスF12タンパク質レベル(実施例16で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図16は、Lp(a)Tgマウスにおける正規化Lp(a)粒子レベル(実施例17で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図17は、apo(a)Tgマウスにおける正規化apo(a)レベル(実施例18で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図18は、Lp(a)Tgマウスにおける正規化Lp(a)粒子レベル(実施例19で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図19は、カニクイザルにおける正規化Lp(a)粒子レベル(実施例20で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図20は、カニクイザルにおける正規化cF12タンパク質レベル(実施例21で以下に記載されている)を例示するグラフである。 図21は、PiZトランスジェニックマウスにおける正規化AAT(Z−AAT)タンパク質レベル(実施例22で以下に記載されている)を例示するグラフである。
詳細な説明
治療用または診断用化合物などの化合物に連結された標的化リガンドを本明細書中に記載する。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された化合物は、発現阻害オリゴマー化合物などの治療用化合物を含むか、またはそれらから成る。前記標的化リガンドは、所望の位置の標的核酸または標的遺伝子に対して治療用化合物を標的化するために使用できる。標的化リガンドおよび治療用化合物を含む組成物、例えば標的化リガンドおよび発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る組成物などもまた、本明細書中に記載する。
本明細書中に記載した新しい標的化リガンドは、治療用化合物の送達を容易にするための、これまでに知られている標的化リガンドを超える利点を提供する。これらの利点としては、例えば、製造の容易さおよび効率に対する改善が挙げられ、同時にまた、効果的な標的化もしくは生体分布、インビボおよび/またはビトロにおける十分な安定性、そして/あるいは、オリゴヌクレオチド治療薬送達に望ましい他の改善も提供する。該新しい標的化リガンドはまた、ホスホラミダイト化合物としての合成に特に好適であり、そしてそれは、製造のコストおよび負担を削減し、かつ、化合物、特に発現阻害オリゴマー化合物(RNAi剤など)への標的化リガンドの取り付けを簡便にする一方で、類似した、または場合によっては、改善された、治療用化合物の送達および/または有効性を提供する。
標的化リガンド
標的化リガンドは、1もしくは複数の標的化基または標的化部分から成り、そしてそれは、それらが連結された化合物の薬物動力学的または生体分布特性を高める、および該複合化組成物の細胞もしくは組織特異的分配または細胞特異的取り込みを改善するのに役立つ可能性がある。一般に、標的化リガンドは、それに連結された治療用化合物の、所望の標的部位への送達を誘導する際の助けとなる。場合によっては、標的化部分は、細胞または細胞受容体に結合して、該治療用化合物の細胞内への侵入を容易にするためにエンドサイトーシスを開始し得る。標的化部分としては、細胞受容体、細胞表面分子または抗体に対して親和性を有する化合物を挙げることができる。標的化部分を含むさまざまな標的化リガンドが、細胞および特定の細胞受容体に剤を標的化するために治療薬および他の化合物に連結され得る。標的化部分のタイプとしては、炭水化物、コレステロールおよびコレステリル基、ならびにステロイドが挙げられる。細胞受容体に結合できる標的化部分としては、ガラクトース、ガラクトース誘導体(N−アセチル−ガラクトサミンなど)、マンノース、およびマンノース誘導体などのサッカリド;他の炭水化物;グリカン;ハプテン;ビタミン;フォラート;ビオチン;アプタマー;ならびに、例えばRGD含有ペプチド、インスリン、EGF、およびトランスフェリンなどのペプチドが挙げられる。
アシアロ糖タンパク受容体(ASGPR)に結合することが知られている標的化部分は、肝臓へのオリゴマー化合物の送達を誘導する際に特に有用である。アシアロ糖タンパク受容体は、肝細胞を含めた肝臓細胞において豊富に発現される。ASGPRを標的化する細胞受容体標的化部分としては、ガラクトースおよびガラクトース誘導体が挙げられる。特に、2、3、または4つのN−アセチル−ガラクトサミン(GalNAcまたはNAG)から成るクラスタを含むガラクトース誘導体のクラスタは、肝臓細胞内への特定の化合物の取り込みを容易にできる。オリゴマー化合物に結合されたGalNAcクラスタは、N−アセチル−ガラクトサミン糖が肝臓細胞の表面のアシアロ糖タンパク受容体に結合できる肝臓に組成物を誘導するのに役立つ。アシアロ糖タンパク受容体への結合は、受容体介在性エンドサイトーシスを開始し、それによって、該化合物の細胞内への侵入が容易になると考えられる。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、1、2、3、4、または4つより多くの標的化部分を含んでもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された1、2、3、4、または4つより多くの標的化部分を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された1、2、3、4、または4つより多くの標的化部分を含み得、ここで、それぞれの標的化部分がテザーを介して分岐点基に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された1、2、3、4、または4つより多くのアシアロ糖タンパク受容体(ASGPR)標的化部分を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された1、2、3、4、または4つより多くのASGPRの標的化部分を含み得、ここで、それぞれのASGPR標的化部分がテザーを介して分岐点基に連結される。
いくつかの実施形態において、分岐点基はリンカーに連結される。いくつかの実施形態において、分岐点基はリンカー置換部分を含み、かつ、分岐点基は治療用化合物に連結される。いくつかの実施形態において、分岐点基はオリゴマー化合物に連結される。いくつかの実施形態において、分岐点基は発現阻害オリゴマー化合物に連結される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、以下の式Iによって表される:
{式中、nは、1〜4の整数(例えば、1、2、3または4)である}(式I)。いくつかの実施形態において、式Iのnは1〜3、1〜2、2〜4、2〜3、または3〜4の整数である。
式Iのリンカーは、リンカーのもう一方の末端の治療用化合物に(または、標的化リガンドがホスホラミダイト化合物として合成されるときには、ホスホラミダイトのリン原子に)リンカーの片端の分岐点基を接続する、(単数もしくは複数の)シクロアルキル、シクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、もしくはヘテロシクリル基、または共有結合で連結されるその組み合わせから選択される1もしくは複数の置換もしくは非置換部分を含む基である。いくつかの実施形態において、切断可能部分などの1もしくは複数の追加基(ホスファート基またはジスルフィド結合を含む基など)または(単数もしくは複数の)ホスホロチオアートまたはホスホナート連結を形成する基が、治療用化合物とリンカーの間に挿入される。リンカーは、それらが式Iの1もしくは複数の標的化部分と、それが連結される治療用化合物との間の相互作用を低減するように標的化リガンド全体に十分な安定性および剛性を与えるという点において「剛性」である。これは、次に、標的部位と標的化部分との相互作用を改善し得る。加えて、本明細書中に開示した標的化リガンドにおける使用のためのリンカーは、ホスホラミダイト化合物として標的化リガンドを合成するために特異的に設計され、そしてそれが、オリゴマー化合物の5’末端への標的化リガンドの効果的な連結を可能にする。
式Iの分岐点基は、1もしくは複数の標的化部分の(1もしくは複数のテザーを介した)リンカーへの取り付けを可能にする任意の基である。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、以下の式IIによって表される:
{式中、nは、1〜4の整数(例えば、1、2、3または4)である}。いくつかの実施形態において、式IIのnは1〜3、1〜2、2〜4、2〜3、または3〜4の整数である。
式IIでは、分岐点基は、リンカー置換部分を介して治療用化合物への(または、標的化リガンドがホスホラミダイト化合物として合成されるときには、ホスホラミダイトのリン原子への)(1もしくは複数のテザーを介した)1もしくは複数の標的化部分の取り付けを可能にする任意の基である。本明細書中に使用される場合、分岐点基は、該分岐点基が(本明細書中に開示した式Iの剛性リンカーと同じ機能を満たす、該分岐点基内に、融合された)1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル、シクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、もしくはヘテロシクリル基、またはその組み合わせを含むとき、リンカー置換部分を含む。
式IおよびIIの1もしくは複数のテザーは、標的化部分と分岐点基との間の連結に柔軟性および/または長さをさらに加え得るスペーサーとして役立つ基である。該テザーは、分岐点基に標的化部分を連結されるのに効果的な方法を提供する。本明細書中に開示した標的化リガンドに関して、それぞれの標的化部分に少なくとも1つのテザーが存在する。いくつかの実施形態において、分岐点基と標的化部分との間には、複数の(すなわち、2以上)のテザーが存在する。
式IおよびIIの標的化部分は、それらが連結される治療用化合物の薬物動力学的または生体分布特性を強化するのに役立つ、ならびに、複合化組成物の細胞または組織特異的分配および細胞特異的取り込みを改善するのに役立つ基である。標的化部分は、細胞受容体もしくは細胞表面分子または抗体に対して親和性を有する化合物を含み得る。標的化部分のタイプとしては、炭水化物、コレステロールおよびコレステリル基、ならびにステロイドが挙げられる。細胞受容体に結合できる標的化部分としては、例えばガラクトース、ガラクトース誘導体(N−アセチルガラクトサミンなど)、マンノース、マンノース誘導体などのサッカリド;他の炭水化物;グリカン;ハプテン;ビタミン;フォラート;ビオチン;アプタマー;ならびに、例えばRGD含有ペプチド、インスリン、EGF、およびトランスフェリンなどのペプチドが挙げられる。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、治療用化合物に連結され得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、追加リンカーおよび/または切断可能部分を介して治療用化合物に連結され、そしてそれは、次に、治療用化合物に連結される。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、治療用化合物自体に結合される。
いくつかの実施形態において、治療用化合物はオリゴマー化合物である。いくつかの実施形態において、治療用化合物は、発現阻害オリゴマー化合物である。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、RNAi剤である。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖RNAi剤である。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の3’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のアンチセンス鎖の5’末端または3’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、一本鎖RNAi剤の5’末端または3’末端に直接的または間接的に連結される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の末端ヌクレオシドの5’末端にて、ホスファート基、ホスホナート基、ホスホロチオアート基、または他のヌクレオシド間連結基を介して二本鎖RNAi剤に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、切断可能部分を含む。いくつかの実施形態において、切断可能部分は、ホスファート基または切断され得る他のヌクレオシド間連結基を含むか、またはそれらから成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、切断可能部分を介して治療用化合物に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、追加基または切断可能部分を含む基に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、切断可能部分に連結され、そしてそれは、次に、発現阻害オリゴマー化合物に連結される。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、ホスホラミダイト化合物である。本明細書中に記載した標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、ホスホラミダイト合成について当該技術分野で一般的に知られている方法を使用して、治療用化合物または他の基に標的化リガンドを容易に取り付けるのに有用であり得る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、当該技術分野で一般的に知られている方法を使用して、発現阻害オリゴマー化合物に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンド含有ホスホラミダイトは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に連結される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドに連結される発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、一本鎖オリゴヌクレオチドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドに直接的に連結される。いくつかの実施形態において、追加基は、標的化リガンドと一本鎖オリゴヌクレオチドの間に挿入される。
いくつかの実施形態において、RNAi剤に連結される標的化リガンドは、標的化部分または標的化部分として1若しくは複数のN−アセチル−ガラクトサミン糖を含む。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドは、ポリエチレングリコール(PEG)を含めたテザーを含む。いくつかの実施形態において、テザーはPEGから成る。いくつかの実施形態において、テザーは、1〜10個のエチレングリコール単位を有するPEGを含む。いくつかの実施形態において、テザーは、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のエチレングリコール単位を有するPEGを含む。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した任意の標的化リガンドに連結される発現阻害オリゴマー化合物は、RNAi剤を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、直接的または間接的に、RNAi剤に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、RNAi剤に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、(単数もしくは複数の)追加基がRNAi剤と標的化リガンドのリンカーとの間に挿入される場合、間接的にRNAi剤に連結される。いくつかの実施形態において、第二のリンカーは、前記リンカーと治療用化合物との間に含まれる。
リンカー
本明細書中に開示した標的化リガンドは、式Iに示す、リンカーを含むか、あるいは、分岐点基は、式IIに示す、リンカー置換部分を含む。
前記リンカーは、片端で分岐点基に連結され、およびもう一方の末端で治療用化合物に(または、該標的化リガンドがホスホラミダイト化合物として合成されるとき、ホスホラミダイトのリン原子に)連結される原子群である。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、片端で分岐点基に連結され、および次に発現阻害オリゴマー化合物に結合される(単数もしくは複数の)基にもう一方の末端で結合される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、オリゴマー化合物に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結され、そしてそれは、次に、オリゴマー化合物に連結される。切断可能部分の例としては、これだけに限定されるものではないが、例えば、ホスファート基、ジスルフィド部分を含めた基、および/または切断され得る他のヌクレオシド間結合が挙げられる。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結されない。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、ホスホロチオアート基またはホスホナート基に連結される。
式Iによる本明細書中に開示した標的化リガンドに関して、リンカーは「剛性」リンカーである。剛性リンカーは、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル、シクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、もしくはヘテロシクリル基、または共有結合で連結されるその組み合わせを含む連結基である。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造1)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造2)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造3)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造4)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造5)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造6a)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造6b)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造6c)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
(構造6d)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
{式中、n’は、0〜10(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)の整数であり、そして、存在している各Z’に関して、Z’は独立に選択され、かつ、Z’は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、およびスルフヒドリルから成る群から選択される}(構造7)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
{式中、n”は、0〜4(例えば、1、2、3または4)の整数であり、そして、存在している各Z”に関して、Z”は独立に選択され、かつ、Z”は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、およびスルフヒドリルから成る群から選択される}(構造8)。
いくつかの実施形態において、式Iの標的化リガンドは、次の構造式を有するリンカーを含むか、またはそれらから成る:
{式中、Vは、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、もしくはヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、または任意の、共有結合で連結されたその組み合わせを含むか、またはそれらから成る}(構造9)。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドにおける使用に好適なリンカーは、片端に末端カルボン酸部分(または、その活性化エステル)があり、かつ、もう一方の末端に末端アルコール部分がある剛性構造を含む化合物から作り出される。いくつかの実施形態において、該アルコール部分は、二級アルコールである。いくつかの実施形態において、該アルコール部分は、三級アルコールである。いくつかの実施形態において、該アルコール部分は、一級アルコールである。該カルボン酸部分(またはその活性化エステル)は、分岐点基への取り付けに好適であるが、その一方で、該アルコール部分は、ホスホラミダイト形成試薬を用いたホスフィチル化反応によるホスホラミダイトのリン原子への取り付けに好適である。ホスホラミダイト形成試薬を使用したホスフィチル化反応の例は、本明細書中の実施例に記載されている。本明細書中に開示したリンカー構造は、ホスホラミダイト化合物としての標的化リガンドの調製に好適である。
いくつかの実施形態において、前記リンカーは発現阻害オリゴマー化合物、すなわち、二本鎖RNAi剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の3’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖RNAi剤のアンチセンス鎖の3’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖RNAi剤のアンチセンス鎖の5’末端に連結される。
いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結される。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物の末端のホスファート基は、切断可能部分として役立ち得る。いくつかの実施形態において、独立に選択される切断可能部分は、リンカーに連結される。本明細書中に使用される場合、切断可能部分は、細胞外で安定しているが、標的細胞内に入ると切断される基である。切断可能部分は、例えばpHなどの特定の条件下で、または分解を促進する分子−もしくはレドックス剤などの特定の切断剤の切断を受けやすい。
いくつかの実施形態において、前記切断可能部分は、pHの影響を受けやすい可能性がある。例えば、エンドソームおよびリソソームは、一般的に、ヒト血液(約7.35〜7.45のpH)より高い酸性のpH(約4.5〜6.5のpH)を有することが知られており、そのことが切断可能部分の切断を促進し得る。
いくつかの実施形態において、切断可能部分はホスファート基である。ホスファート基は、ホスファート基を分解するかまたは加水分解することが知られている剤によって切断され得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、式IIに示すように、リンカーの代わりに、リンカー置換基を含む分岐点基を含む。リンカーがリンカー置換部分で置換されるとき、該リンカー置換部分は分岐点基の一部である。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示したリンカーおリンカー置換部分は、標的化リガンドの単一異性体のみの取り込みを許容し、そしてそれが、オリゴヌクレオチド治療薬の追加的な利点を提供し得る。
分岐点基
本明細書中に開示した標的化リガンドは、少なくとも1つの分岐点基を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドの分岐点基は、リンカーに連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドの分岐点基は、片端でリンカーに連結され、および分岐点基は(単数もしくは複数の)他の末端で1若しくは複数のテザーに連結される。いくつかの実施形態において、分岐点基は、(単数もしくは複数の)追加基を介して発現阻害オリゴマー化合物に連結される。いくつかの実施形態において、分岐点基はリンカー置換部分を含み、かつ、発現阻害オリゴマー化合物に連結される。
本明細書中に開示した分岐点基は、1若しくは複数の標的化部分の取り付けを許容し、さらに本明細書中に開示したリンカーへの取り付けを許容する任意の基であるか、あるいは、該分岐点基がリンカー置換部分を含む場合には、該分岐点基は、例えば発現阻害オリゴマー化合物などの治療用化合物への取り付けを許容するリンカー置換部分を含む任意の基である。
本明細書中に開示した、式Iの分岐点基に関して、リンカーへの複合体形成前に、分岐点基を作り出すのに役立つ分岐点基は、リンカーへのそれぞれの所望の連結のための一端のアミン、およびテザーへのそれぞれの所望の連結のための一端のカルボン酸部分(またはその活性化エステル)を有する。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドとしては、次の構造式から選択される構造を有する分岐点が挙げられる:
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式を有する分岐点を含む:
{式中、nは、1〜20の整数である}(構造209)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式を有する分岐点を含む:
{式中、mは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、そして、nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)である}(構造210)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する分岐点を含む:
{式中、mは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;xは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)であり;yは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;zは、1〜4の整数(例えば、1、2、3または4)であり;そして、Kは、置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、および置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、または共有結合で連結されるその組み合わせから成る群から選択される}(構造211)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式を有する分岐点を含む:
{式中、mは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;xは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)であり;そして、yは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)である}(構造212)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式を有する分岐点を含む:
{式中、mは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり;xは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)であり;yは、1〜10の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10)であり;そして、Gは、
;または5、6、7、8、もしくは9原子の環サイズを有する任意の置換もしくは非置換環または複素環式構造、例えば、置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、または置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)から成る群から選択される}(構造213)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
{式中、nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)である}(構造214)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
{式中、nは、0〜20の整数(例えば、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、そして、Qは:
から成る群から選択される}(構造215)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
(構造216)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
(構造217)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
(構造218)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点基を含む:
{式中、nは、1〜7から選択される整数(例えば、1、2、3、4、5、6または7)である}(構造219)。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは1である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは2である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは3である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは4である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは5である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは6である。いくつかの実施形態において、構造219におけるnは7である。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、リンカー置換基を含む分岐点基を含む。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するリンカー置換部分を含む分岐点基を含む:
(構造220)、または
(構造221)。
テザー
本明細書中に開示した標的化リガンドは、1若しくは複数のテザーを含む。テザーは、分岐点基とそれぞれの標的化部分との間に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で標的化リガンドに直接的に、およびもう一方の末端で分岐点基に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で直接的に標的化リガンドに、およびもう片方の末端で間接的に分岐点基に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で標的化リガンドに間接的に、およびもう一方の末端で分岐点基に間接的に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、3つのテザーおよび3つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、4つのテザーおよび4つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、1つのテザーおよび1つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、複数のテザーおよび複数の標的化部分を含む。
いくつかの実施形態において、追加テザーまたは他の基が、式Iまたは式IIのテザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二のテザーが、式Iまたは式IIのテザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二のテザーと第三のテザーが、式Iまたは式IIのテザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二、第三、および第四のテザーが、式Iまたは式IIのテザーと標的化部分との間に挿入される。本明細書中に開示される場合、あらゆる標的化部分に関して少なくとも1つのテザーが存在する。いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分に関して2つ以上のテザーが存在する。本明細書中に開示した標的化リガンドは、斯かる組成物を網羅することを意図している。
いくつかの実施形態において、追加基が、式Iまたは式IIのテザーと分岐点基との間に挿入され得る。
本明細書中に開示される場合、前記テザーは、標的化部分と、分岐点基、リンカー、および治療用化合物との間の連結にさらなる柔軟性および/または長さを加え得るスペーサーとして役立つ。いくつかの実施形態において、テザーとしては、アルキル基(シクロアルキル基を含む)、アルケニル基(シクロアルケニル基を含む)、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、またはアラルキニル基が挙げられる。いくつかの実施形態において、前記テザーとしては、1若しくは複数のヘテロ原子、複素環化合物、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、またはサッカリドが挙げられる。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、そして、Xは、O、S、またはNHである}(構造301)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造302)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
(構造302a)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、およびXは、O、S、またはNHである}(構造303)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、およびXは、O、S、またはNHである}(構造304)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造305)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む:
{式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造306)。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、2つ以上のテザーのタイプを含む。いくつかの実施形態において、前記テザーは、フレキシブル親水性スペーサー(例えば、U.S.5,885,968;およびBiessen et al. J. Med. Chem. 1995, 39, 1538-1546、その両方を全体として参照により本明細書中に援用する)として機能し、そして、PEGスペーサーを含む。他の実施形態において、前記PEGスペーサーは、1〜20個のエチレン単位(PEG〜PEG20)を有する。例えば、前記PEGスペーサーは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のエチレン単位を有する。
標的化部分:
本明細書中に開示した標的化リガンドは、1〜4、または4つより多くの標的化部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、ガラクトースクラスタであってもよい。本明細書中に使用される場合、ガラクトースクラスタリングは、2〜4つの末端ガラクトース誘導体を有する標的化リガンドを含む。本明細書中に使用される場合、ガラクトース誘導体という用語は、ガラクトースのそれと同等かまたはそれを越えるアシアロ糖タンパク受容体に対する親和性を有する、ガラクトースおよびガラクトース誘導体の両方を含む。ガラクトース誘導体は、一種の標的化部分であるサッカリド糖である。末端ガラクトース誘導体は、サッカリドのC−1炭素を通してテザーに連結される。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する3つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体(N−アセチル−ガラクトサミンなど)から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として3つの末端N−アセチル−ガラクトサミン(GalNAcまたはNAG)を含む。例えば、構造1001、1002、1004および1008のそれぞれは、標的化部分としての3つの末端N−アセチル−ガラクトサミンを有する標的化リガンドである。
いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分は、ガラクトサミン誘導体、すなわち、N−アセチル−ガラクトサミンを含む。標的化部分として使用され得る、アシアロ糖タンパク受容体に対して親和性を有する他のサッカリドは:ガラクトース、ガラクトサミン、N−ホルミル−ガラクトサミン、N−プロピオニル−ガラクトサミン、N−n−ブタノイルガラクトサミン、およびN−イソ−ブタノイルガラクトサミン、を含めた一覧から選択され得る。アシアロ糖タンパク受容体に対する多くのガラクトース誘導体の親和性は、研究されているか(例えば:Iobst, S.T. and Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686を参照、それを全体として参照により本明細書に援用する)、または当該技術分野で周知の、一般的に使用される方法を使用して容易に測定される。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、細胞を標的化する部分である。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、N−アセチル−ガラクトサミンを含む:
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、3つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、4つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、1つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、2つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、4つ以上の標的化部分を含む。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、ガラクトース、ガラクトサミン、N−ホルミル−ガラクトサミン、N−アセチル−ガラクトサミン、N−プロピオニル−ガラクトサミン、N−n−ブタノイルガラクトサミン、またはN−イソ−ブタノイルガラクトサミンのうちの1もしくは複数を含む。
例えば、いくつかの実施形態において、構造1001〜1027のいずれかのN−アセチル−ガラクトサミン標的化部分は、代替の標的化部分で置換され得る。斯かる代替の標的化部分としては、例えば、ガラクトース、ガラクトサミン、N−ホルミル−ガラクトサミン、N−アセチル−ガラクトサミン、N−プロピオニル−ガラクトサミン、N−n−ブタノイルガラクトサミン、またはN−イソ−ブタノイルガラクトサミンが挙げられる。
さらに、いくつかの実施形態において、構造1001〜1027の標的化部分は、例えば、他の炭水化物;グリカン;ハプテン;ビタミン;フォラート;ビオチン;アプタマー;ならびに/あるいは、例えばRGD含有ペプチド、インスリン、EGF、および/またはトランスフェリンなどのペプチドで置換され得る。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、N−アセチル−ガラクトサミン三量体の形態である。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、N−アセチル−ガラクトサミン四量体の形態である。
代表的な標的化リガンド構造、および標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物
本明細書中に開示した標的化リガンドは、1若しくは複数の標的化部分、テザー、分岐点基、およびリンカーから成り得る。本明細書中に開示した標的化リガンドは、1、2、3、4、または4つより多くの標的化部分から成り得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、ホスホラミダイト化合物の形態となるように合成される。ホスホラミダイトは、RNAおよびDNAの化学合成において広く使用される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示したホスホラミダイト含有標的化リガンドは、二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に加えられる。前記標的化リガンドが発現阻害オリゴマー化合物の5’末端に連結されるべきとき、ホスホラミダイトとして標的化リガンドを調製することは、特に有利であり得る。理論によって拘束されることを望むものではないが、ホスホラミダイトとして前記標的化リガンドを調製することは、該標的化リガンドが発現阻害オリゴマー化合物の5’末端に連結されるとき、最後の成分としての標的化リガンドの連結を許容し(それによって、製造コストを削減する)、ならびに該標的化リガンドが二本鎖RNAi剤のセンス鎖の5’末端に取り付けられるとき、標的化リガンドがRISC内へのセンス鎖の添加を潜在的に遮断することを可能にすることが理解される。発現阻害オリゴマー化合物が二本鎖RNAi剤であるとき、前記標的化リガンドは、該標的化リガンドがRNAi剤のセンス鎖の5’末端に連結されるべきとき、ホスホラミダイト化合物として調製され得る。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1001)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1001a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、SまたはNHである}(構造1001a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1001b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1002)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1002a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1002a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1002b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1003)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1003a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1003a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1003b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1004)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1004a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1004a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1004b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1005)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1005a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1005a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1005b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1006)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1006a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1006a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1006b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1007)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1007a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1007a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1007b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1008)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1008a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1008a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1008b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1009)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1009a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1009a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1009b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1010)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1010a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1010a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1010b)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を含む:
{式中、Jは、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル、シクロアルケニル、アリール、ヘテロアリール、もしくはヘテロシクリル基、または共有結合で連結されるその組み合わせを含むか、またはそれらから成り;Yは、OまたはSであり;そして、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;そしてY’は、O、S、またはNHである}(構造1011)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1012)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1012a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1012a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1012b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1013)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1013a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1013a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1013b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1014)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1014a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1014a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1014b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1015)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1015a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1015a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1015b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1016)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1016a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1016a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1016b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1017)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1017a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1017a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1017b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1018)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1018a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1018a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1018b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1019)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1019a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1019a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1019b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1020)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1020a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1020a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1020b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1021)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1021a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1021a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1021b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1022)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1022a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1022a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1022b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1023)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1023a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1023a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1023b)。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示したとおり、分岐点基が少なくとも1つのアリール、シクロアルキル、および/または複素環基を含むのであれば、標的化リガンドのリンカーが不存在であってもよい。分岐点基内に位置する1もしくは複数のアリール、シクロアルキル、および/または複素環基を有することは、リンカー置換基として役立つ。いくつかの実施形態において、分岐点基内の1もしくは複数のアリール、シクロアルキル、および/または複素環基は、分岐点基内の(単数もしくは複数の)中央連絡点と発現阻害オリゴマー化合物との間に配置される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1024)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1024a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1024a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1024b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1025)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1025a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1025a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1025b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1026)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1026a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1026a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1026b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する:
(構造1027)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る}(構造1027a)。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結され、かつ、次の構造式によって表される構造を有する:
{式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み;Yは、OまたはSであり;そして、Y’は、O、S、またはNHである}(構造1027a(i))。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である:
(構造1027b)。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、ガラクトースクラスタの形態である。本明細書中に使用される場合、ガラクトースクラスタリングは、2〜4つの末端ガラクトース誘導体を有する標的化リガンドを含む。本明細書中に使用される場合、ガラクトース誘導体という用語は、ガラクトースのそれと同等かまたはそれを越えるアシアロ糖タンパク受容体に対する親和性を有する、ガラクトースおよびガラクトース誘導体の両方を含む。ガラクトース誘導体は、一種の標的化部分であるサッカリド糖である。末端ガラクトース誘導体は、サッカリドのC−1炭素を通してテザーに連結されてもよい。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する3つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体(N−アセチル−ガラクトサミンなど)から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として3つの末端N−アセチル−ガラクトサミン(GalNAcまたはNAG)を含む。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する4つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体(N−アセチル−ガラクトサミンなどの)から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として4つの末端N−アセチル−ガラクトサミン(GalNAcまたはNAG)を含む。
いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分は、ガラクトサミン誘導体、すなわち、N−アセチル−ガラクトサミンを含む。標的化部分として使用され得る、アシアロ糖タンパク受容体に対して親和性を有する他のサッカリドは:ガラクトース、ガラクトサミン、N−ホルミル−ガラクトサミン、N−アセチル−ガラクトサミン、N−プロピオニル−ガラクトサミン、N−n−ブタノイルガラクトサミン、およびN−イソ−ブタノイルガラクトサミン、を含めた一覧から選択され得る。アシアロ糖タンパク受容体に対する多くのガラクトース誘導体の親和性は、研究されているか(例えば:Iobst, S.T. and Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686を参照)、または当該技術分野で周知の、一般的に使用される方法を使用して容易に測定される。
3つの末端N−アセチル−ガラクトサミンを指すとき、当該技術分野で一般的に使用される用語としては、三分岐型(tri-antennary)、三価、および三量体が挙げられる。
4つの末端N−アセチルガラクトサミンを指すとき、当該技術分野で一般的に使用される用語としては、四分岐型(tetra-antennary)、四価、および四量体が挙げられる。
オリゴマー化合物
本明細書中に開示した標的化リガンドは、オリゴマー化合物に連結され得る。いくつかの実施形態において、前記オリゴマー化合物は、発現阻害オリゴマー化合物である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、RNAi剤である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖RNAi剤である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドである。前記発現阻害オリゴマー化合物は、当該技術分野で一般的に使用される方法を使用することで合成され得る。
前記発現阻害オリゴマー化合物は、1若しくは複数の修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチド塩基(または、核酸塩基)は、すべての核酸の構成要素であり、かつ、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)、チミン(T)、およびウラシル(U)を含む複素環式ピリミジンまたはプリン化合物である。本明細書中に使用される場合、「ヌクレオチド」という用語は、修飾ヌクレオチドまたはヌクレオチド模倣体、脱塩基部位、または代用置換部分を含み得る。本明細書中に使用される場合、「修飾ヌクレオチド」は、リボヌクレオチド(2’−ヒドロキシルヌクレオチド)以外のヌクレオチド、ヌクレオチド模倣体、脱塩基部位、または代用置換部分である。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドとしては、2’−修飾ヌクレオチド(すなわち、5員糖環の2’位置にてヒドロキシル基以外の基を有するヌクレオチド)を含む。修飾ヌクレオチドとしては、これだけに限定されるものではないが:2’−修飾ヌクレオチド、2’−O−メチルヌクレオチド(本明細書中ではヌクレオチド配列内の小文字「n」とも表される)、2’−デオキシ−2’−フルオロヌクレオチド(本明細書中ではNfと表され、また、本明細書中に2’−フルオロヌクレオチドとも表される)、2’−デオキシヌクレオチド(本明細書中ではdNとも表される)、2’−メトキシエチル(2’−O−2−メトキシルエチル)ヌクレオチド(本明細書中ではNMまたは2’−MOEとも表される)、2’−アミノヌクレオチド、2’−アルキルヌクレオチド、3’−3’連結(反転)ヌクレオチド(本明細書中ではinvdN、invN、invn、invXとも表される)、ヌクレオチドを含む非天然型塩基、ロックされたヌクレオチド、架橋ヌクレオチド、ペプチド核酸、2’、3’−セコヌクレオチド模倣体(ロックされていない核酸塩基類似体、本明細書中ではNUNAまたはNUNAとも表される)、ロックされたヌクレオチド(本明細書中ではNLNAまたはNLNAとも表される)、3’−O−メトキシ(2’−ヌクレオチド間連結)ヌクレオチド(本明細書中では3’−OMenとも表される)、2’−F−アラビノヌクレオチド(本明細書中ではNfANAまたはNfANAとも表される)、モルホリノヌクレオチド、ビニルホスホナートデオキシリボヌクレオチド(本明細書中ではvpdNとも表される)、ビニルホスホナートヌクレオチド、および脱塩基ヌクレオチド(本明細書中ではXまたはAbとも表される)が挙げられる。一様に修飾されることは、所定の化合物のすべての位置において必要とされるわけでない。逆に、2つ以上の修飾が、ただ一つの発現阻害オリゴマー化合物の中に、またはその単一ヌクレオチドの中にさえ組み込まれ得る。前記発現阻害オリゴマー化合物は、当該技術分野で知られている方法によって合成および/または修飾され得る。各ヌクレオチドの修飾は、他のヌクレオチドの修飾から独立している。
修飾核酸塩基としては、合成および天然型核酸塩基、例えば、5−置換ピリミジン、6−アザピリミジン、N−2−、N−6−、O−6−置換プリン(例えば、2−アミノプロピルアデニン)、5−プロピニルウラシル、5−プロピニルシトシン、5−メチルシトシン(5−me−C)、5−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6−メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2−プロピルおよび他のアルキル誘導体、2−チオウラシル、2−チオチミン、2−チオシトシン、5−ハロウラシル、5−ハロシトシン、5−プロピニルウラシル、5−プロピニルシトシン、6−アゾ−ウラシル、6−アゾ−シトシン、6−アゾ−チミン、5−ウラシル(偽ウラシル)4−チオウラシル、8−ハロ、8−アミノ、8−チオール、8−チオアルキル、8−ヒドロキシル、および他の8−置換アデニンおよびグアニン、5−置換ウラシルおよびシトシン(例えば、5−ハロウラシルおよびシトシン(例えば、5−ブロムウラシルおよび5−ブロモシトシン)、5−トリフルオロメチルウラシル、5−トリフルオロメチルシトシン)、7−メチルグアニン、7−メチルアデニン、8−アザグアニン、8−アザアデニン、7−デアザグアニン、7−アザグアニン、3−デアザグアニン、および3−アザグアニンが挙げられる。
本明細書中に記載した発現阻害オリゴマー化合物において、任意の修飾ヌクレオチドは、ホスファート含有または非ホスファート含有共有結合性ヌクレオシド間結合によって連結され得る。修飾ヌクレオシド間結合または骨格としては、これだけに限定されるものではないが、5’−ホスホロチオアート(本明細書中ではヌクレオチドの前の小文字「s」とも表され、sN、sn、sNf、またはsdNとも表される)、キラルホスホロチオアート、ホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキル−ホスホトリエステル、3’−アルキレンホスホナートおよびキラルホスホナートを含めたメチルおよび他のアルキルホスホナート、ホスフィナート、3’−アミノホスホルアミダートおよびアミノアルキルホスホルアミダートを含めたホスホルアミダート、チオノホスホルアミダート、チオノアルキル−ホスホナート、チオノアルキル−ホスホトリエステル、モルホリノ連結、通常3’−5’連結を有するボラノホスホナート、ボラノホスホナートの2’−5’連結類似体、ならびに逆極性を有するボラノホスホナートが挙げられ、ここで、ヌクレオシド単位の隣接対は、3’−5’から5’−3’にまたは2’−5’から5’−2’に連結される。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合または骨格は、リン原子を欠いている。リン原子を欠いている修飾ヌクレオシド間結合としては、これだけに限定されるものではないが、短鎖アルキルもしくはシクロアルキル糖間連結、混合性ヘテロ原子とアルキルもしくはシクロアルキル糖間連結、または1若しくは複数の短鎖ヘテロ原子もしくは複素環式糖間連結が挙げられる。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間骨格としては、これだけに限定されるものではないが、シロキサン骨格、スルフィド骨格、スルホキシド骨格、スルフォン骨格、ホルムアセチルおよびチオホルムアセチル骨格、メチレンホルムアセチルおよびチオホルムアセチル骨格、アルケン−含有骨格、スルファマート骨格、メチレンイミノおよびメチレンヒドラジノ骨格、スルホナートおよびスルホンアミド骨格、アミド骨格、ならびに混成N、O、S、およびCH成分を有する他の骨格が挙げられる。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖RNAi剤であり、少なくとも部分的に互いに相補的な(少なくとも70%相補的な)センス鎖とアンチセンス鎖とを含む。前記アンチセンス鎖は、標的mRNAの配列に対して完全に相補的(100%相補的)であるか、または少なくとも実質的に相補的(少なくとも85%相補的)である配列を有する領域を含む。二本鎖RNAi剤のセンス鎖およびアンチセンス鎖の長さは、それぞれ16〜30ヌクレオチドの長さであり得る。前記センスおよびアンチセンス鎖は同じ長さであっても、またはそれらが異なった長さであってもいずれでもよい。いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、長さが約19ヌクレオチドであるが、それに対して、前記アンチセンス鎖は長さが約21ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センス鎖は長さが約21ヌクレオチドであるが、それに対して、前記アンチセンス鎖は長さが約23ヌクレオチドである。他の実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖は、それぞれ独立に長さが17〜21ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、センスとアンチセンス鎖の両方が、長さがそれぞれ21〜26ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖の両方が、長さがそれぞれ26ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖は、それぞれ独立に長さが17〜26ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、二本鎖RNAi剤は、約16、17、18、19、20、21、22、23または24ヌクレオチドの二本鎖の長さを有する。前記センス鎖とアンチセンス鎖との間の完全または実質的に相補的なこの領域は、長さが典型的には15〜25ヌクレオチド(例えば、長さが15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25ヌクレオチド)であり、該アンチセンス鎖の5’末端または5’末端付近で起こる。
本明細書中に開示したリガンドに結合される発現阻害オリゴマー化合物は、任意選択かつ独立に、(延長として)追加の1、2、3、4、5、または6ヌクレオチドをコア配列の3’末端、5’末端、または3’および5’末端の両方に含む。これらの追加的ヌクレオチドは、存在する場合、前記標的化されているmRNAの対応配列に対して相補的であっても、またはそうでなくてもよい。
いくつかの実施形態において、二本鎖RNAi剤が本明細書中に開示した標的化リガンドに結合されるとき、追加のセンス鎖追加ヌクレオチドは、存在する場合、前記標的化されているmRNAの対応配列に対して同一であっても、またはそうでなくてもよい。それが存在する場合、前記追加のアンチセンス鎖追加ヌクレオチドは、それが存在する場合、前記センス鎖の対応する追加ヌクレオチドに対して相補的であっても、またはそうでなくてもよい。
二本鎖RNAi剤は、アンチセンス鎖をセンス鎖とアニーリングすることによって形成できる。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、RNAi剤のセンス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかの3’または5’末端にてRNAi剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、センス鎖の5’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、センス鎖の3’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、不安定結合、切断可能結合、または可逆的結合を介してRNAi剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記不安定結合、切断可能結合、または可逆的結合は、前記RNAi剤と標的化リガンドとの間に追加された切断可能部分に含まれる。
いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、標的mRNAの発現を阻害するためにRNA干渉機構を利用する。いくつかの実施形態において、前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、RNA干渉以外の機構を通して標的核酸発現を低減する際に活性である。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に結合された前述の標的化リガンドが投与される対象における標的の遺伝子発現レベルおよび/またはmRNAレベルは、投与前の対象または標的化リガンド複合体を与えていない対象に対して、少なくとも約5%、例えば、少なくとも約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または98%低減される。前記対象の遺伝子発現レベルおよび/またはmRNAレベルは、該対象の細胞、細胞群、および/または組織において低減され得る。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に結合された前述の標的化リガンドが投与された対象のタンパク質レベルは、前記標的化リガンド複合体を投与する前の対象または前記標的化リガンド複合体を与えていない対象に対して、少なくとも約5%、例えば、少なくとも約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または98%低減される。前記対象のタンパク質レベルは、該対象の細胞、細胞群、組織、血液、および/または他の体液で低減され得る。遺伝子発現、mRNA、またはタンパク質レベルにおける低減は、当該技術分野で知られている任意の方法でも評価できる。mRNAレベルおよび/またはタンパク質レベルの低減または減少は、本明細書中では、標的化された遺伝子の発現を阻害すること、減少すること、または低減することともみなされる。
開示される標的化リガンドと共に使用される特異的発現阻害オリゴマー化合物が、当該技術分野で知られている。特に、多数の参照文献が、肝臓への組成物の送達のために本明細書中に開示した標的化リガンドに結合され得る発現阻害オリゴマー化合物を開示する。制限されることのない例としては、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of LPAと題された米国特許出願第15/281,309号(上記文献を全体として参照により本明細書に援用する)が挙げられ、本明細書中に開示した標的化リガンドと共に使用するのに好適である(リポタンパク質(a)粒子の部分であるapo(a)タンパク質、それによるリポタンパク質(a)粒子(Lp(a))の発現を阻害するための)ヒトアポリポタンパク質(a)遺伝子[LPA]を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示する。前記apo(a)遺伝子[LPA]は、ヒトおよびヒト以外の霊長動物の肝臓で主に発現される。同様に、例えば、RNAi Therapy for Hepatitis B Virus Infectionと題された米国特許出願第15/229,314号(上記文献もまた全体として参照により本明細書に援用する)は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、B型肝炎ウイルスを標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。前記B型肝炎ウイルスは、厳密な肝指向性の、二本鎖DNA含有ウイルスであり、ヘパドナウイルス科のファミリーに属する、ヘパドナウイルスの一員に分類される。さらに、別の例として、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Factor XIIと題された、米国特許出願第15/229,314号(上記文献を全体として参照により本明細書に援用する)は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、第XII因子(または、第12因子、F12)遺伝子を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。第XII因子は、主に肝臓で発現されて、血液で見つけられたセリンプロテアーゼである。さらに、別の例として、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Alpha-1 AntiTrypsinと題された、米国特許出願第14/740,307号(上記文献を全体として参照により本明細書に援用する)は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、α−1アンチトリプシン(または、AAT)遺伝子を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。AATは、セルピンスーパーファミリーの属するプロテアーゼインヒビターであり、通常AATタンパク質は、肝細胞によって肝臓で主に合成され、そして、血中に分泌される。さらに、Organic Compositions to Treat APOC3-Related Diseasesと題されたWO2016/01123(上記文献を全体として参照により本明細書に援用する)は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、ヒトアポリポタンパク質III(APOC3)を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。アポリポタンパク質C−IIIは、トリグリセリドに富む粒子の肝臓取り込みを阻害すると考えられるリポタンパク質の構成要素である。本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適であり得る、発現阻害オリゴマー化合物を含めた様々な治療用化合物を開示している更なる参照文献もまた、当該技術分野で見つけることができる。これらとしては、これだけに限定されるものではないが、肝臓に対して標的化することが望ましい組成物が挙げられる。
医薬組成物と処方
本明細書中に開示した標的化リガンドは、オリゴマー化合物に連結されるとき、該化合物の投与から恩恵を受けるであろう疾患または障害に罹患している対象(例えば、ヒトまたは哺乳動物)を治療するために使用できる。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されるとき、標的mRNAの発現の低減または阻害から恩恵を受けるであろう疾患または障害に罹患している対象(例えば、ヒト)を治療するために使用できる。前記対象は、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結される、RNAi剤などの任意の1若しくは複数の発現阻害オリゴマー化合物の治療的有効量を投与される。前記対象は、ヒト、患者、またはヒト患者である可能性がある。前記対象は、成人、思春期の人、小児、または幼児であってもよい。発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物は、疾患の治療療法のための方法を提供するために使用できる。斯かる方法は、ヒトまたは動物への、本明細書中に記載した医薬組成物の投与を含む。
本明細書中に開示した医薬組成物および方法は、細胞、細胞群、組織、または対象の標的mRNAのレベルを減少させ得:前記対象に、標的化リガンドに連結される、本明細書中に記載した発現阻害オリゴマー化合物の治療的有効量を投与し、それによって、対象の標的mRNAの発現を阻害する。いくつかの実施形態において、前記対象は、前記標的細胞または組織における標的遺伝子の病原性上方制御を有すると以前に同定された。
いくつかの実施形態において、医薬組成物は、標的化リガンドに連結される、少なくとも1つの発現阻害オリゴマー化合物を含む。これらの医薬組成物は、標的細胞、細胞群、組織、または生物体における前記標的mRNAの発現の阻害において特に有用である。前記医薬組成物は、標的mRNAのレベルの低減、または標的遺伝子の発現の阻害から恩恵を受けるであろう疾患または障害に罹患している対象を治療するために使用される。前記医薬組成物は、標的mRNAのレベルの低減、または標的遺伝子の発現の阻害から恩恵を受けるであろう疾患または障害を発症する危険性のある対象を治療するために使用できる。一実施形態において、前記方法は、治療される対象に対して、RNAi剤などの発現阻害オリゴマー化合物に連結した、本明細書中に記載した標的化リガンドを含む組成物を投与することを含む。いくつかの実施形態において、1若しくは複数の医薬的に許容される賦形剤(ビヒクル、担体、希釈剤、および/または送達ポリマーを含む)は、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む医薬組成物に加えられ、それによって、ヒトに対するインビボ送達に好適な医薬製剤を形成する。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物は、標的mRNAの発現に関連している臨床像を治療するかまたは管理するために使用される。または、いくつかの実施形態において、1もしくは複数の医薬組成物の治療的または予防的有効量が、斯かる治療、予防またはマネジメントを必要としている対象に投与される。いくつかの実施形態において、オリゴマー化合物に共有結合で連結された任意の複合化リガンドの投与は、対象の疾患の症状の数、重症度、および/または頻度を減少させるのに使用できる。
発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物が、標的mRNAの発現の低減または阻害から恩恵を受けるであろう疾患または障害に罹患している対象における少なくとも1つの症状を治療するために使用できる。いくつかの実施形態において、前記対象は、本明細書中に記載した標的化リガンドに連結されたRNAi剤などの発現阻害オリゴマー化合物を含む1若しくは複数の医薬組成物の治療的有効量を投与され、それによって、該症状が治療される。他の実施形態において、前記対象は、1もしくは複数の発現阻害オリゴマー化合物の予防的有効量を投与され、それによって、少なくとも1つの症状が予防される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物が投与される対象における標的mRNAの発現またはそのレベルは、医薬組成物を与えていない対象に対して、少なくとも約5%、例えば、少なくとも約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または98%低減される。前記対象における遺伝子発現レベルは、該対象の細胞、細胞群、および/または組織で低減され得る。いくつかの実施形態において、mRNAのレベルが低減される。他の実施形態において、発現タンパク質レベルが低減される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物が投与される対象のタンパク質のレベルは、医薬組成物を与えていない対象に対して、少なくとも約5%、例えば、少なくとも約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または98%低減される。発現、mRNAレベル、またはタンパク質レベルにおける低減は、当該技術分野で知られている任意の方法によって評価できる。mRNAレベルおよび/またはタンパク質レベルの低減または減少は、本明細書中では、標的RNAの低減もしくは減少、または標的mRNAの発現を阻害することもしくは低減することと言われる。
投与経路は、発現阻害オリゴマー化合物を身体と接触させる経路である。一般に、哺乳動物の治療のための薬剤および核酸を投与する方法は、当該技術分野で周知であり、かつ、本明細書中に記載した組成物の投与に適用できる。本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物は、特定の経路に適切に適合させて調製物によって任意の好適な経路を介して投与できる。よって、本明細書中に記載した医薬組成物は、例えば、静脈内、筋肉内、皮内、皮下、関節内、または腹腔内に注射によって投与できる。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、吸入を介して投与される。
本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物を含む医薬組成物は、当該技術分野で知られているオリゴヌクレオチド送達技術を使用することで細胞、細胞群、腫瘍、組織、または対象に送達できる。一般に、(インビトロまたはインビボにおける)核酸分子を送達するための当該技術分野で認識されている任意の好適な方法が、本明細書中に記載した組成物を用いた使用に適合させることができる。例えば、送達は、局所的投与、(例えば、直接注入、移植、または局部投与)、全身投与、あるいは、頭蓋内(例えば、脳室内、脳実質内、およびくも膜下腔内)、筋肉内、経皮的、気道(エアゾール)、経鼻、経口、直腸、または局所(頬側および舌下を含む)投与を含めた、皮下、静脈、腹腔、または非経口経路によることができる。特定の実施形態において、前記組成物は、皮下、または静脈内注入または注射によって投与される。
従って、いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、1もしくは複数の医薬的に許容される賦形剤を含んでもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、対象への投与のために処方できる。
本明細書中に使用される場合、医薬組成物または薬物は、薬理学的有効量の、1若しくは複数の前述の治療用化合物および少なくとも1つの医薬的に許容される賦形剤を含む。医薬的に許容される賦形剤(賦形剤)とは、薬物送達システムに意図的に含まれる、医薬品有効成分(API、治療薬、例えば、F12 RNAi剤)以外の物質である。賦形剤は、意図された投薬量にて治療効果を発揮しないか、または発揮することが意図されていない。賦形剤は、a)製造中に前記薬物送達システムの加工の助けとなる、b)安定性、生物学的利用能またはAPIの患者の受容性を保護、補助、または強化、c)生成物の同定を助ける、および/またはd)保管もしくは使用中のAPIの送達の総合的な安全性、有効性のその他の特質を強化するように機能し得る。医薬的に許容される賦形剤は、不活性物質であっても、またはそうでなくてもよい。
賦形剤としては、これだけに限定されるものではないが:吸収促進薬、固結防止剤、泡止め剤、抗酸化剤、結合剤、緩衝化剤、担体、被覆剤、着色料、送達増強剤、送達ポリマー、デキストラン、デキストロース、希釈剤、崩壊剤、乳化剤、鎖延長剤、増量剤、香味料、流動促進剤、湿潤剤、滑沢剤、オイル、ポリマー、保存料、生理食塩水、塩、溶媒、糖、懸濁化剤、徐放性マトリックス、甘味料、増粘剤、等張化剤、ビヒクル、撥水剤、および湿潤剤が挙げられる。
注射用途に好適な医薬組成物としては、無菌の水性溶液(水に可溶性である場合)または分散液、および無菌の注射溶液または分散液の即時調製用の無菌の粉末が挙げられる。静脈内投与に関して、好適な担体としては、生理的塩類溶液、静菌性水、Cremophor ELTM(BASF、Parsippany, NJ)またはホスファート緩衝生理食塩水(PBS)が挙げられる。それは、製造および保管の条件下で安定していなければならず、さらに、細菌や真菌などの微生物の混入作用に対して保護されなければならない。前記担体は、例えば水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール)、ならびに好適なその混合物を含めた溶媒または分散媒質であり得る。適切な流動性は、例えばレシチンなどの被覆の使用によって、分散液の場合には、必要な粒度の維持管理によって、および界面活性化剤の使用によって維持できる。多くの場合、組成物中に、等張剤、例えば糖、マンニトールやソルビトールなどのポリアルコール、および塩化ナトリウムを含むことは望ましい。注射用組成物の持続的吸収は、組成物に吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアホスファートアルミニウムおよびゼラチンを含ませることによってもたらすことができる。
滅菌注射可能溶液は、必要に応じて、先に列挙した成分のうちの1つまたは組み合わせとともに、適当な溶媒中で必要な量の活性化合物を組み込み、続いて、濾過滅菌することによって、調製され得る。一般的に、分散液は、基本的な分散媒と、先に列挙される成分から必要な他の成分とを含有する滅菌ビヒクル中に活性化合物を組み込むことによって調製される。滅菌注射可能溶液を調製するための滅菌粉末の場合、調製方法は、真空乾燥および凍結乾燥することを含み、これによって、あらかじめ滅菌濾過したその溶液から、活性化合物および任意のさらなる所望の成分の粉末を得る。
関節内投与に好適な処方は、微結晶性形態、例えば、微結晶の水性懸濁液の形態で存在し得る薬剤の無菌の水性製剤の形態であってもよい。リポゾーム製剤または生分解性ポリマー系が、関節内および眼投与の両方に向けて薬剤を提供するためにも使用できる。
目の治療を含めた局所投与に好適な処方としては、液状または準液状製剤、例えば塗布剤、ローション、ゲル、外用薬、水中油または油中水型乳剤(例えばクリーム、軟膏剤もしくはペースト剤など)など;あるいは点眼薬などの溶液または懸濁液、が挙げられる。皮膚表面への局所投与のための処方は、例えばローション、クリーム、軟膏剤または石鹸などの皮膚科学的に許容される担体で薬剤を分散することによって調製できる。適用を局在化し、かつ、除去を妨げるために皮膚を覆うフィルムまたは層を形成することができる担体は有効である。内部組織の表面への局所投与に関して、前記剤は、液状組織接着剤または組織表面への吸着を促進することが知られている他の物質中に分散されることができる。例えば、ヒドロキシプロピルセルロースまたはフィブリノーゲン/トロンビン溶液が、有益となるように使用できる。あるいは、ペクチン含有処方などの組織被覆溶液が使用できる。
吸入治療に関して、スプレー缶、ネブライザー、またはアトマイザーを用いて分注される散剤(自己噴射型またはスプレー処方)の吸入が使用できる。斯かる処方は、散剤吸入デバイスまたは自己噴射型散剤分注処方からの肺内投与のための微細粉末の形態であってよい。自己噴射型溶液およびスプレー処方の場合、効果は、所望のスプレー特性を有する(すなわち、所望の粒度を有するスプレーは生じさせることができる)弁を選択することによって、または制御された粒度に懸濁された散剤として有効成分を組み込むことによって達成できる。吸入による投与に関して、前記化合物はまた、好適な噴射剤、例えば二酸化炭素などのガスを含有している加圧型コンテナもしくはディスペンサー、またはネブライザーからのエアゾールスプレーの形態でも送達できる。全身投与はまた、経粘膜または経皮的手段によっても可能である。経粘膜または経皮投与に関して、透過するべき障壁に対して適当な湿潤剤が、処方に使用できる。斯かる湿潤剤は、一般的に、当該技術分野で知られており、例えば、経粘膜投与のために、洗浄薬および胆汁酸塩が含まれる。経粘膜投与は、鼻腔用スプレーまたは坐剤の使用によって達成できる。経皮投与に関して、活性化合物は、典型的に、当該技術分野で一般的に知られている軟膏剤、軟膏、ゲル、またはクリームに処方される。
前記活性化合物は、移植片およびマイクロカプセル化された送達系を含む徐放性処方物等の、身体からの迅速な排出に対してこの化合物を保護する担体を用いて調製できる。酢酸エチレンビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸等の生分解性、生体適合性ポリマーが使用されてもよい。このような処方物の調製のための方法は、当業者には明らかである。リポソーム懸濁物もまた、薬学的に許容される担体として使用することができる。これらは、例えば、米国特許第4,522,811号に記載されるような、当業者に既知の方法に従って調製することができる。
経口または非経口組成物は、投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で処方されてもよい。本明細書で使用される投薬単位形態は、治療される対象に対する単位投薬量として好適な物理的に分離した単位を指し、各単位は、必要とされる薬学的担体と関連して所望の治療効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含有する。本開示の投薬単位形態についての詳細は、活性化合物の固有の特徴、および達成されるべき治療効果、および個人の治療のための斯かる活性化合物を合成する当該技術分野における固有の制限によって決定され、かつ直接依存する。さらに、投与は、ボーラスの定期的な注射によってできるか、または外部リザーバ(例えば、静脈内バッグ)からの静脈内、筋肉内、または腹腔内投与によってより連続しておこなわれることができる。
本開示の方法に関連して、ファーマコゲノミクス(すなわち、個人の遺伝子型と、外来化合物または薬剤に対するその個人の応答との相関に関する研究)が検討され得る。治療薬の代謝の差は、薬理学的活性薬物の用量と血中濃度との関係を変更することによって、重度の毒性または治療不全につながる可能性がある。よって、医師または臨床医は、薬剤を投与するか決定する、ならびに該薬剤を用いた治療の投薬量および/または治療計画を調整する際に関連ファーマコゲノミクス研究で得た知識を適用することを検討できる。
医薬組成物は、医薬組成物の中で一般的に見出された他の追加成分を含むことができる。斯かる追加成分としては、これだけに限定されるものではないが、止痒剤、収斂剤、局部麻酔剤、または抗炎症薬(例えば、抗ヒスタミン剤、ジフェンヒドラミンなど)が挙げられる。本明細書中に規定したRNAi剤を発現するかまたは含む細胞、組織または摘出臓器が「医薬組成物」として使用され得ることもまた、想像される。本明細書中に使用される場合、「薬理学的有効量」、「治療的有効量」、または単に「有効量」は、薬理学的、または治療学的または予防的結果を生じさせるようなRNAi剤の量を指す。
一般的に、活性化合物の有効量は、約0.1〜約100mg/kg体重/日、例えば、約1.0〜約50mg/kg体重/日の範囲内にある。いくつかの実施形態において、活性化合物の有効量は、1用量あたり約0.25〜約5mg/kg体重の範囲内にある。いくつかの実施形態において、有効成分の有効量は、1用量あたり約0.5〜約3mg/kg体重の範囲にある。投与される量もまた、患者の総合的な健康状態、送達される化合物の相対的生物学的効率、薬剤の処方、処方中の賦形剤の存在およびタイプ、ならびに投与経路といった変数に依存する可能性がある。また、投与された初回投与量は、所望の血中濃度または組織レベルを早急に達成するために、高レベルの上を超えて増量されてもよいか、または初回投与量は最適条件よりわずかであってもよいことも、理解すべきである。
疾患の治療または疾患の治療のための薬物または組成物の形成に関して、標的化リガンドに連結されたRNAi剤などの発現阻害オリゴマー化合物を含む、本明細書中に記載の医薬組成物は、賦形剤、またはこれだけに限定されるものではないが:第二のまたはその他の発現阻害オリゴマー化合物、小分子薬剤、抗体、抗体フラグメント、および/またはワクチンを含めた第二の治療薬または治療と組み合わせられ得る。
前述の標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されるとき、および医薬的に許容される賦形剤またはアジュバントに加えられるとき、キット、コンテナ、パック、またはディスペンサーにパッケージされることができる。本明細書中に記載した医薬組成物は、充填済みシリンジまたはバイアルにパッケージされることができる。
先に提供した実施形態は、次の制限されることのない例を用いてここで例示される。
以下の実施例は、本明細書中に開示した特定の実施形態を限定するものではなく、例示することを意図している。
次の実施例の合成に関する実験的詳細に使用される略語の一部を以下に規定する:hまたは時間=時間;min=分;mol=モル;mmol=ミリモル;M=モル;μM=マイクロモル;g=グラム;μg=マイクログラム;rtまたはRT=室温;L=リットル;mL=ミリリットル;wt=重量;EtO=ジエチルエーテル;THF=テトラヒドロフラン;DMSO=ジメチルスルホキシド;EtOAc=酢酸エチル;EtNまたはTEa=トリエチルアミン;i−PrNEt、DIPEAまたはDIEA=ジイソプロピルエチルアミン;CHClまたはDCM=塩化メチレン;CHCl=クロロホルム;CDCl=重水素化クロロホルム;CCl=四塩化炭素;MeOH=メタノール;EtOH=エタノール;DMF=ジメチルホルムアミド;BOC=t−ブトキシカルボニル;CBZ=ベンジルオキシカルボニル;TBS=t−ブチルジメチルシリル;TBSCl=t−ブチルジメチルシリルクロリド;TFA=トリフルオロ酢酸;DMAP=4−ジメチルアミノピリジン;NaN=アジ化ナトリウム;NaSO=硫酸ナトリウム;NaHCO=重炭酸ナトリウム;NaOH=水酸化ナトリウム;MgSO=硫酸マグネシウム;KCO=炭酸カリウム;KOH=水酸化カリウム;NHOH=水酸化アンモニウム;NHCl=塩化アンモニウム;SiO=シリカ;Pd−C=パラジウム炭素;HCl=塩化水素または塩酸;NMM=N−メチルモルホリン;H=水素ガス;KF=フッ化カリウム;EDC−HCl=N−(3−ジメチルアミノプロピル)−N’−エチルカルボジイミドヒドロクロリド;MTBE=メチル−tert−ブチルエーテル;MeOH=メタノール;Ar=アルゴン;SiO=シリカ;RT=保持時間。
さらに、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適な、発現阻害オリゴマー化合物の例を、以下の実施例内のさまざまな表中に記載する。以下の表記を、本明細書中に開示した表中に記載する配列に関して修飾ヌクレオチドを示すのに使用する:
N = 2’−OH(非修飾)リボヌクレオチド(fまたはd指示のない大文字)
n = 2’−OMe修飾ヌクレオチド
nf = 2’−フルオロ修飾ヌクレオチド
dN = 2’−デオキシヌクレオチド
UNA = 2’,3’−セコヌクレオチド模倣体(ロックされていない核酸塩基類似体)
LNA = ロックされたヌクレオチド
NfANA = 2’−F−アラビノヌクレオチド
NM = 2’−メトキシエチルヌクレオチド
XまたはAb = 脱塩基リボース
R = リビトール
(invdN) = 反転デオキシリボヌクレオチド(3’−3’結合ヌクレオチド)
(invAb) = 反転脱塩基ヌクレオチド
(invX) = 反転脱塩基ヌクレオチド
(invn) = 反転2’−OMeヌクレオチド
s = ホスホロチオアート基結合ヌクレオチド
vpdN = ビニルホスホナートデオキシリボヌクレオチド
(3’OMen)= 3’−OMeヌクレオチド
(5Me−Nf)= 5’−Me,2’−フルオロヌクレオチド
cPrp = シクロプロピルホスホナート
本開示の化合物は、当業者に知られている合成化学技術を使用して作製できる。
実施例1.標的化リガンド、ホスホラミダイト化合物、構造1005b、1004b、および1002bの合成
構造1005b、構造1004b、および構造1002bのホスホラミダイト含有化合物を、4−cis−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸(本明細書中では化合物8)を化合物、構造1005bを合成するのに使用した、4−trans−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸(本明細書中では化合物8a)を化合物、構造1004bを合成するのに使用した、および4−cis−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸と(本明細書中では化合物8)と4−trans−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸(本明細書中では化合物8a)の混合物を化合物、構造1002bを合成するのに使用したという相違のみで、以下の手順に従って合成した。
1)2−アミノ−3−[4−({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)フェニル]プロパン酸(化合物2)の調製
炭酸銅塩基(1.67グラム(g)、7.59mmol)を、水(100mL)中の1(7.00g、30.34mmol)の溶液にゆっくり加えた。得られた混合物を、溶解が観察されるまで80℃に加熱した。得られた濃紺色の溶液を、25〜30℃に冷まし、次に、水(10mL)中の溶液としての水酸化ナトリウム(1.21g、30.34mmol)で処理し、そしてそれが、アミノ酸−銅複合体の沈殿をもたらした。懸濁液を周囲温度にて1時間撹拌し、その後、THF(20mL)中のクロロギ酸ベンジル(6.21g、36.41mmol)の溶液を5分間にわたって滴下して処理した。混合物を、1〜2時間撹拌し、次に、濾過した。濡れたケーキを、EtOAc中で粉砕し、再度、濾過して、脱水するのを助けた。次に、青色の固形物を、200mLの水が入ったフラスコに加え、10mLの濃HClで処理した。スラリーを、18時間撹拌し、次に、濾過し、そして、水で洗浄し、白色の固形物として4.5gの化合物2を得た(45%の収率、95のAP)。R=5.8分。
2)三酸(化合物3)の調製
1.5MのNaOH(100mL)中の2(6.00g、18.27mmol)のスラリーを、その時点で溶液が形成される60℃に加熱した。次に、溶液を、1.5MのNaOH(20mL)で溶解したブロモ酢酸(10.15g、73.20mmol)の溶液で処理した。溶液を、60℃にて2時間撹拌した(HPLCによると2=NMT5%)。反応が完了した時点で、溶液を、10℃に冷まし、そして、pH=1.7に達するまで、1MのHClを加えた。スラリーを2〜3時間静置し、その後、濾過し、そして、脱イオン水で洗浄した。固形物を真空で乾燥させて、3.01gの三酸3(50%、94のAP)を得た。R=6.94分。
3)TFPエステル(化合物4)の調製
DCM(50mL)中の3(3.00g、6.75mmol)と2,3,5,6−テトラフルオロフェノール(3.99g、24.30mmol)の溶液を10℃に冷やし、分割したN−(3−ジエチルアミノプロピル)−N’−エチルカルボジイミドヒドロクロリド(4.66g、24.30mmol)で5分間にわたり処理した。次に、溶液を、20分間にわたって周囲温度まで加温し、3時間撹拌した。完了後に(3<10のAP)、反応混合物を、飽和重炭酸ナトリウム(20mL)で洗浄し、続いて塩水(20mL)で洗浄し、そして、ロータリーエバポレターにより濃縮した。得られたオイルを、5−20%のEtOAc/ヘキサンの溶媒グラジエントを使用したフラッシュカラムにより精製して、無色のオイルとして2.6gの4を得た(40%、94のAP)。R=12.99分
4)アミントシラート(化合物5)の調製
適切な大きさの圧力反応器に、THFと、それに続く、CbZ保護アミン(1.0eq、NAGZ)とp−TsOH−HO(1.0当量)を充填する(10倍量)。溶液を窒素で3回脱気する。10%のPd/C(5.0wt%)を充填し、次に、窒素で3回脱気する。水素で3回脱気する。水素を40〜50psiの圧力まで充填する。20〜30℃にて3時間撹拌し、次に、窒素で3回脱気し、IPCアッセイようにサンプル抽出する(仕様≦0.5%のNAG−Z、仕様が満たされない場合には、40〜50psiのH下で1〜2時間撹拌し、その後、再アッセイする)。珪藻土を通して濾過して触媒を取り除き、THF(4倍量)で洗浄する。合わせた濾液を濃縮し、Ti≦40℃を維持しながら、減圧下で約2倍量まで洗浄する。DCM(3.8倍量)で希釈し、その後、2倍量まで再び濃縮する。DCM希釈と再濃縮を繰り返し、その後、DCM(3.8倍量)で希釈する。KF分析用にサンプル抽出する(仕様KF≦0.05%、KF仕様が満たされない場合には、濃度とDCMでの希釈を繰り返す)。KF仕様を満たした後、溶液を、白色の泡沫状固形物まで濃縮する。100%の未修正収率。p−TsOH−HOの代わりにトリフルオロ酢酸を用いる類似反応もまた実施してもよく、互換的に使用できる。
5)トリ−NAG(化合物6)の調製
活性化エステル4(2.15g、2.41mmol)とアミントシラート5(4.10g、6.75mmol)を、ジクロロメタン(22mL)中に溶解し、10℃に冷やした。次に、溶液を、5分間にわたりトリエチルアミン(1.37g、13.54mmol)を滴下して処理し、その後、周囲温度まで加温し、そして、2時間保持した。反応混合物を、飽和重炭酸ナトリウム(10mL)と、それに続いて塩水(10mL)で洗浄した。溶液を、硫酸マグネシウム上で乾燥させ、濾過し、そして、ロータリーエバポレターにより濃縮して、無色のオイルを得た。検査後に、〜10%のデスアシル不純物をHPLCによって検出した。不純物を、未希釈の無水酢酸(90mL)とトリエチルアミン(6mL)中で1時間撹拌して、再アシル化した。次に、無水酢酸を減圧下で取り除き、得られたオイルを、ジクロロメタン中に再溶解し、そして、重炭酸ナトリウム水溶液で洗浄した。溶液を、オイルまで濃縮し、そして、グラジエント溶出(2.5−25%のMeOH/DCM)を使用したフラッシュクロマトグラフィーを介して精製して、白色の固形物として1.98gの6を得た(47%、96のAP)。R=7.57分;デスアシル不純物=7.18分
6)アミン塩(化合物7)の調製
保護アミン6(1.98g、1.06mmol)とp−トルエンスルホン酸一水和物(202mg、1.06mmol)を、無水エタノール(30mL)中に溶解し、そして、窒素雰囲気下に置いた。フラスコに、5%のパラジウム炭素(198mg、0.106mmol)を加え、そして、そのフラスコを、真空下に置き、水素で数回逆充填した(back-filled)。ひとたび水素雰囲気下で、反応物を周囲温度にて撹拌すれば、4時間以内にまたはHPLCによって開始物質が検出されなくなるまで、完了されることがわかった。触媒を、セライトのベッドを通して濾過し、そして、濾液を、0.2ミクロンのメンブランフィルターに通して、微粒子を取り除いた。溶液を、減圧下で濃縮乾固して、灰色の固形物として2.01gの7を得た(100%、98のAP)。R=5.82;p−トルエンスルホン酸R=2.4および3.1分
7)活性化リンカー(化合物9および9a)の調製
cis−4−ヒドロキシシクロヘキシルカルボン酸8(合成に関しては、構造1005)(4.00g、27.7mmol)と2,3,5,6−テトラフルオロフェノール(5.53g、33.3mmol)を、24mLのジクロロメタン中に溶解し、そして、0℃に冷やした。[先に述べたように、cis−4−ヒドロキシシクロヘキシルカルボン酸(化合物8)を、構造1005を処方するためのリンカーとして使用する一方で、trans−4ヒドロキシシクロヘキシルカルボン酸(化合物8b)は、cis−異性体と置換してもよく、そしてそれが、合成の残りのための同じ手順に従った、構造1004bの合成に通じる:
]。
この溶液に、EDC−HCl(6.38g、33.3mmol)を加えた。溶液を、22℃まで加温し、そして、12時間撹拌した。反応を飽和NaHCO水溶液(50mL)でクエンチし、そして、層を分離した。有機層を、飽和塩水(50mL)で洗浄し、NaSOを用いて乾燥させた。乾燥剤を濾過し、そして、溶液を、約20mLまで濃縮し、そしてそれは、ゆっくりと固まった(種晶が促進する)。固形物を、5%のMTBE/ヘキサン(50mL)でスラリー化し、そして、濾過して、69%の収率および95%の純度で5.6gの生成物9を得た。
8)リンカー連結(化合物10の調製)
NAGアミン塩7(5.00g、2.88mmol)と2,3,5,6−テトラフルオロフェニルcis−4−ヒドロキシシクロヘキサンカルボキシラート9(1.68g、5.77mmol)を、25mLのジクロロメタン中に溶解し、そして、0℃に冷やした。この溶液に、トリエチルアミン(1.60mL、11.55mmol)を加えた。溶液を、室温まで加温し、HPLCによって観察しながら、5時間撹拌した。反応を、飽和NaHCO水溶液(35mL)でクエンチし、そして、層を分離した。有機層を、飽和塩水(35mL)で洗浄し、そして、NaSOを用いて乾燥させた。乾燥剤を濾過し、そして、溶液を、グラジエント溶出(0−20%のMeOH/DCM)を使用したフラッシュクロマトグラフィーを介して濃縮および精製して、白色の固形物として3.90gの化合物10を与えた(80%)。R=6.16分。あるいは、次の実施例2に示すように、TFPエステルを使用せずにリンカーの直接連結を実施することもできる。
9)化合物11の調製
化合物10(1.87g、1.11mmol)を、20mLのジクロロメタンと2−シアノエチル中に溶解し、そして、N,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホラミダイト(0.84g、2.77mmol)を加えた。得られた溶液を5℃に冷ました。この溶液に、4,5−ジシアノイミジアゾール(0.026g、0.22mmol)を加えた。溶液を室温まで加温し、そして、1時間撹拌した。次に、変換の程度をHPLCによってチェックした(開始物質の2〜%の残留を示した)。追加の2−シアノエチル,N,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホラミダイト(0.14g、0.46mmol)を加え、そして、反応物を、さらに2.5時間撹拌した(著しい変化はHPLCでは観察されなかった)。反応を、飽和NaHCO水溶液(20mL)でクエンチし、そして、層を分離した。有機層を、NaHCO水溶液(20mL)、そして飽和塩水(2×20mL)で洗浄し、そして、NaSOを用いて乾燥させた。乾燥剤を濾過し、そして、溶液を濃縮して、白色の固形物として2.34gの化合物11を得た。
100mgの未精製の11を、30分間、ジクロロメタン中の2%のトリエチルアミンでシリカゲル充填カラムを最初に溶出し、続いて、そのカラムに未精製の11を添加し、そして、グラジエント溶出(0−20%の2% トリエチルアミン:メタノール/2% トリエチルアミン:ジクロロメタン)を使用して精製することによるフラッシュカラムクロマトグラフィーで精製した。最終生成物である化合物11(本明細書中に規定させる構造1005bの化学構造を有する)を2%のトリエチルアミン:ジクロロメタン(画分2)中に溶出して、80mgの白色の固形物を得た。
図1は、化合物11(本明細書中の構造1005b)のH NMRスペクトルを示す。
図1Aは、先のステップ7に説明する代替合成に続く、化合物11のtrans異性体(本明細書中の構造1004b)のH NMRスペクトルを示す。
実施例2.標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物、構造1008bの合成
1)トリ−tert−ブチルN−[N−(ベンジルオキシカルボニル)−L−γ−グルタミル]−L−グルタミン酸(化合物14)の調製
熱電対、磁気撹拌子、窒素入口、および粉末用漏斗を備えた、窒素でフラッシュした、250mLの3つ口平底フラスコに、12(10.00g、29.64mmol)を加え、続いて、THF(100mL、10vol.)を加えた。得られた溶液を、撹拌し、そして、N−メチルモルホリン(7.82mL、71.15mmol、2.4当量)を加えた(反応混合物のKF:163ppm)。
粉末用漏斗をゴム隔壁に置き換え、そして、前記混合物を、氷浴を使用して0℃に冷却した。ポット温度を4.0℃未満に維持したまま、クロロギ酸イソブチル(iBuCOCl、3.85mL、4.05g、29.64mmol、1.0当量)を、シリンジによって、反応混合物に滴下して10分間かけて加えた。添加に続いて、その混合物をさらに40分間撹拌し、そして、前記隔壁を粉末用漏斗に置き換えた。前記反応混合物に、4.0℃未満のポット温度を維持しながら、15分間かけて13(8.767g、29.64mmol、1.0当量)を分割して加えた(発熱性の添加)。13の添加に続いて、氷浴および粉末用漏斗を取り外し、そして、残りの一連のステップ中、反応物を周囲温度に加温した。13の添加に続いて、透明で、無色の溶液を25分間静置した。
反応物のサンプル(98μLを、5mLメスフラスコ内で5.0mLのACNに希釈)を、13の添加開始の40分後に採取し、そして、RP−HPLCによって変換パーセントに関して分析した。12の23%が残っていることがわかったので、反応の60分後に、追加のiBuCOCl(1.16mL、1.21g、30mol%)および13(2.63g、30mol%)を連続して加えた。サンプルがHPLCによって99%超の変換を示すまで、前記溶液をさらに60分間寝かせた。総反応時間は、13の最初の添加開始から2.5時間であった。
前記反応液を、氷浴中で3℃に冷却した0.5MのHCl(aq)(125mL)の撹拌溶液に注ぎ入れ、約5分間撹拌した。クエンチした反応混合物を酢酸エチル(100mL、10vol.;NMMの完全除去のために確実に水層が酸性であることをチェックする)で抽出し、層を分離し、有機相を塩水(100mL、10vol.)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、粗目フリット漏斗を介して500mLの平底フラスコ内に濾過し、そして、真空中で濃縮し、再度、粘度が高い無色のオイルを得た。前記オイルを、MTBE(100mL、10vol.)中に溶解し、そして、真空中で濃縮し、再度、粘度が高い無色のオイルを得た。
撹拌したオイル(〜600rpm)に、ヘキサン(100mL、10vol.)を加えた。白色のもやが溶液中に現れ、その後それは、さらなる撹拌によって見えなくなった。種晶を加え、そして、その混合物を40分間撹拌し、その間に、白色結晶をゆっくり形成した。
20分以内では、スラリーは撹拌を妨害できるくらい濃く、そして、追加のヘキサン(50mL、5vol.)を加えた。40分後に、スラリーを、粗目フリット漏斗を介して濾過し、ヘキサン(それぞれ〜10mL)で3回洗浄し、そして、1時間漏斗内で風乾し、微細な白色粉末(15.64g、91%)として14を得た。図2Bは、化合物14に関するH NMRスペクトルを示す。
1)N−[N−(ベンジルオキシカルボニル)−L−γ−グルタミル]−L−グルタミン酸(15)の調製
オーバーヘッドスターラー、粉末用漏斗、熱電対、および加熱マントルを備えた、3000mLの3つ口平底フラスコに、3(72.57g、125.4mmol)およびギ酸(試薬用グレード、>95%、1.45L、20体積当量)を加えた。粉末用漏斗を、N入口を備えた栓で置き換え、そして、得られた溶液を、RP−HPLCによって観察しながら、45℃に加熱し、1時間撹拌した。2.0面積%未満のモノ−t−ブチルエステルが残っているとき、反応が完了したと考えた。
反応物のサンプルをギ酸添加の60分後に採取し、そして、そのサンプルを、残っているモノ−t−ブチルエステルのパーセンテージに関してRP−HPLCによって分析した。前記分析は、90分後に1.8%のモノ−t−Buエステルが残っていることを示したので、反応物を室温に冷ました。
反応物を、トルエンおよびアセトニトリル(ACN、それぞれ1500mL)で希釈し、そして、混合物を真空中で濃縮した。ギ酸を、1:1 ACN:トルエン(〜600mL)で、そして、ACN(それぞれ〜500mL)で2回、共沸により取り除いた。前記物質を高真空で一晩乾燥させて、白色の泡沫状固体化合物(54.3g、定量収量、254nmにて96.8面積%)を得た。図2Cは、化合物15に関するH NMRスペクトルを示す。
3)トリ−NAG−ビス−Glu−NHZ(化合物16)の調製
1リットルの平底フラスコに、NAG−アミンp−トシラート塩(5、59.19g、97.6mmol、4.13当量)およびZ−ビス−Glu三酸塩基(15、10.01g、23.6mmol補正純度、1.0当量)を加えた。前記混合物を、アセトニトリル(500mL;溶液のKF=1283ppm)中に溶解し、そして、真空中で濃縮して、共沸により水を取り除いた。残渣を、新しいアセトニトリル(400mL)中に溶解し、撹拌子を入れ、そして、熱電対を備えた、窒素フラッシュした1リットルの3つ口平底フラスコに移した。水分含量を、KF(257ppm)によって計測した。
窒素下で撹拌した溶液に、粉末用漏斗を介してTBTU(28.20g、87.8mmol、3.7当量)を加えた。反応温度を25℃未満に維持したまま、DIPEA(34.0mL、25.2g、8.0当量)を、シリンジによって20分間かけて滴下して加えた(5℃の発熱を添加中に観察した)。混合物を、HPLCで観察しながら、DIPEA添加の開始から2時間撹拌した。78分時点の分析では、開始物質の完全な消費を示した。
2時間後に、真空中で溶媒を取り除いた。得られた粘度の高いオイルを、ジクロロメタン(1000mL)中に溶解し、1.0NのHCl(aq)(3×500mL)で洗浄し、NaHCO3(aq)(3×500mL)で飽和状態にした。有機層を、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、真空中で濃縮して、オフホワイト色の蝋質固形物(33.5g)を得た。
フラッシュカラムクロマトグラフィーを、330gのISCO RediSep Rf Goldシリカカラムを使用したISCO CombiFlash自動化精製システムにより実施した。原料を、CHCl(〜200mL)中の溶液として添加した。溶出液A:CHCl;溶出液B:MeOHから成る勾配を成すグラジエントを利用し、合計36の画分を回収した(それぞれ250〜500mL)。生成物含有画分を濃縮し、18.75gの16(97.0%の純度)を得た。混合画分では12.2gの16(78.8%の純度)を得た。
図2Dは、化合物16に関するH NMRスペクトルを示す。
4)トリ−NAG−ビス−Glu−NH(化合物17)の調製
撹拌子が入っている1000mLの3つ口平底フラスコにメタノール(200mL、13vol.)を充填した。撹拌溶媒に、化合物16(15.44g、9.02mmol補正純度)を加え、続いて、追加のメタノール(200mL、13vol.)とトリフルオロ酢酸(1.40mL、18.1mmol、2.0当量)を加えた。混合物を約10分間撹拌した。混合物に、10%のPd/C(50%湿量基準、1.547g、10% w/w)を加えた。ヘッドスペースを、水素ガス(バルーン)でフラッシュし、そして、混合物を、RP−HPLCで観察しながら、周囲温度にて2時間撹拌した。
75分後に、反応物からサンプル抽出し(100μL)、そして、1mLシリンジフイルター(10mm、0.1μmのGHP膜)内で1:1アセトニトリル:HO(900μL)と混合した。HPLCクロマトグラムは、開始物質の残留がない、96面積%超の純度を示した。次に、反応混合物を、窒素でフラッシュし、セライトベッドを通して1000mLの清潔な平底フラスコ内に濾過した。反応器を、メタノール(50mL)とジクロロメタン(50mL)ですすぎ、そして、すすぎ液もまた濾過した。わずかに濁った濾液を、真空中で部分的に濃縮した。セライトベッドの追加のすすぎを、メタノール(50mL)とジクロロメタン(50mL)を使用して実施した;これらを、残渣と組み合わせて、0.2μmのGHPメンブランフィルターを通して別の1000mLの清潔な平底フラスコ内に濾過した。トルエン副産物を共沸により取り除けるように、膜をアセトニトリル(50mL)ですすいだ。溶液を真空中で濃縮して、オフホワイト色の泡沫状固形物として17(14.15g、HPLCにより97.3面積%純度)を得た。
図2Eは、化合物17に関するH NMRスペクトルを示す。
5)トリ−NAG−ビス−Glu−NH−リンカー(化合物18)の調製
磁気撹拌、熱電対、および窒素ブランケットを備えた500mLの3つ口平底フラスコに、17(93.7%純度、20.00g、11.4mmol)とジクロロメタン(150mL)を充填した。撹拌溶液に、cis−4−ヒドロキシシクロヘキサン−1−カルボン酸(1.730g、12.0mmol、1.05当量)を加え、続いて、TBTU(4.036g、12.6mmol、1.10当量)を加えた。溶液を、氷−塩水浴を使用して−9℃に冷やし、そして、内部温度を−5℃未満に維持しながら、DIPEA(6.97mL、5.17g、40.0mmol、3.5当量)を7分間にわたり滴下して加えた。1.7℃の発熱を添加中に観察した。DIPEAの添加が完了した時点で、反応物を−9℃にて90分間撹拌し、そしてその時点で、HPLC分析(方法B)は、17の完全な消費を示した。
110分後に、反応を、飽和NHCl(aq)(400mL)の添加によってクエンチした。層を分離し、そして、水層をジクロロメタン(2x200mL)によって抽出した。合わせた有機層を、飽和NaHCO3(aq)と塩水(400mL)の1:1混合物で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、真空中で約125mLまで濃縮した。少量のメタノールを、溶解性を確保するために使用した。得られたオイルを、撹拌MTBEが(1600mL)が入った3Lの平底フラスコに、細流で加え、白色の沈殿物を形成した。ジクロロメタン(〜20mL)とMTBE(〜200mL)を用いた起源フラスコのすすぎ液をスラリーに加え、次に、それを、1時間寝かせ(age)、その後、600mLの粗目ガラスフリット漏斗を通して真空濾過した。濡れたケーキを、漏斗内でMTBE(2×200mL)中に再スラリー化し、濾過し、そして、恒量まで高真空ラインにより乾燥させて、白色の粉末として未精製の18を得た(16.22g、86%の未修正収率)。
未精製の18(17.16g、以前のロットと合わせた)を、330gのISCO RediSep Rf Goldシリカカラムを使用したISCO CombiFlash EZPrep自動化精製システムにより精製した。原料を、8%のMeOH/CHCl(〜160mL)中の溶液として添加した。溶出液A:CHCl;溶出液B:50%のMeOH:CHClのグラジエントを、33の画分を生じさせるのに利用した。生成物含有画分を濃縮して、10.13g(98.1%の純度、59%の回収率)の18を得た。混合画分を貯留して、追加の6.52g(86.1%の純度)の18を得、そしてそれを再精製できる。
図2Fは、化合物18に関するH NMRスペクトルを示す。
6)標的化リガンド、ホスホラミダイト(化合物19)の調製
化合物18(13.0g、7.87mmol)を、無水ジクロロメタン(195mL)中に溶解し、窒素雰囲気下に置いた。この混合物に、DIPEA(4.11mL、23.61mmol)と、無水ジクロロメタン(5mL)中の2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルクロロホスホロジアミダイト(2.45mL、11.02mmol)の溶液を、5分間にわたり滴下して加えた。反応混合物を、HPLCで観察しながら(<1%のSM残留)、室温にて1時間撹拌した。反応を、飽和NaHCO水溶液(150mL)でクエンチした。有機層を分離し、飽和NaHCO水溶液(1×150mL)、および塩水(1×150mL)で洗浄し、そして、NaSOを用いて乾燥させた。乾燥剤が濾過し、溶液を、シリカカラムをジクロロメタン(+1%のトリエチルアミン)で30分間最初に処理し、続いて、そのカラムに未精製の最終生成物、化合物19(本明細書中の構造1008の化学構造を有する)を添加し、そして、30分間にわたりグラジエント溶出(0−20% MeOH(+1%のTEA)/CHCl(+1%のTEA))を使用して精製することによるフラッシュクロマトグラフィーを介して濃縮し、精製して、白色の固形物として11.1gの化合物19を得た(76%の収率、純度96.6%)。
図2は、化合物19に関する31P NMRスペクトルを示す。図2Aは、化合物19に関するH NMRスペクトルを示す。図2および図2Aは共に、化合物19の構造(本明細書中の構造1008b)と一致する。
実施例3.標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物、構造1025の合成
1)化合物21の調製
MeOH(350mL)中の化合物20(40g、221mmol、1.00eq)の溶液に、0〜5℃にて滴下してSOCl(52.5g、442mmol、32mL、2.00eq)を加えた。溶液を、60℃に加熱し、そして、16時間撹拌した。TLC(5滴のHOAcを伴ったDCM/MeOH=5/1、Rf=0.43)は、消費した開始材料を示し、およびLCMS(ET12452−6−P1A)は、形成された生成物を示した。混合物を減圧下で濃縮し、白色の固形物として未精製の化合物21(52.4g、未精製)を得た。
1H NMR: (ET12452-6-p1c DMSO Bruker_B_400MHz) δ 9.45 (s, 1 H), 8.55 (br s, 3 H), 7.00 (br d, J = 8.0 Hz, 2 H), 6.72 (d, J = 8.0 Hz, 2 H), 4.17 (br s, 1 H), 3.67 (s, 3 H), 3.01 (qd, J = 14.2, 6.5 Hz, 2 H)
2)化合物22の調製
MeOH(230mL)中の化合物21(52.4g、226mmol、1.00eq)の溶液に、0℃にて滴下してTEA(68.7g、679mmol、94mL、3.00eq)、BocO(59.2g、271mmol、62.4mL、1.20eq)を加え、その混合物を、0℃にて0.5時間撹拌し、その後、25℃にて16時間撹拌した。TLC(石油エーテル/EtOAc=1/1、Rf=0.80)は新しい主要スポットを示したので、大部分の開始材料が消費された。混合物を濃縮し、その後、シリカカラム(石油エーテル/EtOAc=1:1)によって精製して、白色の固形物として化合物22(57.4g、86%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-8-p1g CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 6.97 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 6.74 (br d, J = 8.0 Hz, 2 H), 5.65 (br s, 1 H), 5.01 (br d, J = 8.0 Hz, 1 H), 4.49 - 4.59 (m, 1 H), 3.72 (s, 3 H), 2.92 - 3.09 (m, 2 H), 1.43 (s, 9 H)。
3)化合物23の調製
アセトン(170mL)中に溶解した化合物22(35g、119mmol、1.00eq)の溶液に、KCO(21.3g、154mmol、1.30eq)とBnBr(24.3g、142mmol、16.9mL、1.20eq)を加え、その反応混合物を、還流温度(60℃)にて14時間加熱した。TLC(石油エーテル/EtOAc=3/1、Rf=0.80)は、開始材料が消費されたことおよび新しいスポットが形成されたことを示した。HO(500mL)を5℃にて混合物に加え、0.5時間撹拌し、その後、濾過し、HO(80mL3)で洗浄し、減圧下で乾燥させて、白色の固形物として化合物23(43g、88%の収率、93%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12452-9-p1a CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.31 - 7.46 (m, 5 H), 7.05 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 6.91 (d, J = 9.0 Hz, 2 H), 5.05 (s, 2 H), 4.97 (br d, J = 8.0 Hz, 1 H), 4.50 - 4.60 (m, 1 H), 3.72 (s, 3 H), 2.96 - 3.11 (m, 2 H), 1.43 (s, 9 H)
4)化合物24の調製
EtOAc(215mL)中の化合物23(43g、112mmol、1.00eq)の溶液に、HCl/EtOAc(4M、215mL、7.71eq)を滴下し加え、その混合物を25℃にて9時間撹拌した。TLC(石油エーテル/EtOAc=3/1、Rf=0.10)は、開始材料が消費されたことおよび新しいポットが形成されたことを示した。混合物を、濾過し、EtOAc(30mL3)で洗浄し、減圧下で乾燥させて、白色の固形物として化合物24(35g、97%の収率、99%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12452-12-p1a MeOD Varian_D_400MHz) δ 7.40 - 7.45 (m, 2 H), 7.34 - 7.39 (m, 2 H), 7.29 - 7.33 (m, 1 H), 7.17 (d, J = 8.8 Hz, 2 H), 7.00 (d, J = 8.8 Hz, 2 H), 5.09 (s, 2 H), 4.26 (dd, J = 7.3, 6.0 Hz, 1 H), 3.81 (s, 3 H), 3.07 - 3.23 (m, 2 H)
5)化合物26の調製
化合物24(15.5g、48.2mmol、1.00eq)を、CHCN(40mL)とNaOH(1.5M、70.6mL、2.20eq)中に溶解し、次に、化合物25(13.4g、96.3mmol、6.94mL、2.00eq)を15℃にて加えた、pHチェック:〜2.5。次に、4NのNaOHをpH=13まで加えた。溶液を70℃に加熱した。30分後、pHが6未満に下がり、4NのNaOH(pH11〜13)で再び調整した。追加の化合物25(6.69g、48.2mmol、3.47mL、1.00eq)を、分割して加え(二回)、その都度、pHを11〜13に調整した。混合物を70℃にて14時間加熱した。LCMS(ET12452−30−P1A、Rt=0.749分)は、生成物が形成されたことを示した。混合物を15℃に冷まし、次に、4NのHClでpH1に調整し、濾過し、そして、HO(80mL2)で洗浄し、乾燥させた。残渣を、THF(600mL)で溶解し、次に、ET12452−27、ET12452−19のバッチと共に6分の1に濃縮し、次に、DCM(500mL)と共に撹拌し、そして、濾過し、フイルターを乾燥させて、白色の固形物として化合物26(35.5g、87%の収率、97%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12452-30-p1r MeOD Varian_D_400MHz) δ 7.40 - 7.45 (m, 2 H), 7.36 (t, J = 7.4 Hz, 2 H), 7.27 - 7.32 (m, 1 H), 7.17 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 6.91 (d, J = 8.6 Hz, 2 H), 5.49 (s, 1 H), 5.05 (s, 2 H), 3.71 (t, J = 7.6 Hz, 1 H), 3.61 (s, 4 H), 3.07 (dd, J = 14.1, 7.5 Hz, 1 H), 2.86 - 2.96 (m, 1 H), 2.03 (s, 2 H)
6)化合物27の調製
ピリジン(250mL)中の化合物26(15g、38.7mmol、1.00eq)、化合物26A(25.7g、155mmol、4.00eq)の溶液に、EDCI(29.7g、155mmol、4.00eq)を5℃にて加えた。混合物を30℃にて12時間撹拌した。LCMS(ET12452−59−P1A、Rt=1.053分)は、主として生成物を示した。混合物を、濃縮し、その後、DCM(200mL)で溶解し、飽和NaHCO(80mL4)、塩水(80mL2)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、シリカカラム(石油エーテル/EtOAc=3:1、Rf=0.75)によって精製し、化合物26Aを伴った生成物を得、その後、DCM(200mL)で溶解し、飽和NaHCO(80mL4)および塩水(80mL2)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、オフホワイト色のゴムとして化合物27(19.8g、61%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-59-p1g CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.36 - 7.46 (m, 4 H), 7.30 - 7.35 (m, 1 H), 7.24 (d, J = 8.7 Hz, 2 H), 6.97 - 7.07 (m, 3 H), 6.94 (d, J = 8.7 Hz, 2 H), 5.05 (s, 2 H), 4.13 - 4.26 (m, 5 H), 3.25 (d, J = 7.5 Hz, 2 H), 2.06 (s, 1 H), 1.25 - 1.29 (m, 1 H)
7)化合物27−2の調製
化合物27−1(230g、1.53mol、205mL、1.00eq)を、N雰囲気下で乾燥DCM(1.6L)に溶解した。溶液を、氷浴で0℃に冷やし、そして、TEA(232g、2.3mol、318mL、1.50eq)を加えた。それに続いて、DCM(500mL)中のTosCl(233g、1.22mol、0.80eq)を、冷やした反応混合物に加えた。添加後に、溶液を、20℃まで加温し、そして、5時間撹拌した。TLC(石油エーテル/EtOAc=1:1、Rf=0.15)は、開始材料が消費されたことを示し、およびHPLC(ET12452−15−P1L、Rt=1.71分)は、2つのピークを示した。反応混合物を、0℃にてHO(500mL)の添加によってクエンチし、次に、2つの反応物を、CHCl(800mL)で抽出した。合わせた有機層を、HO(1L)および塩水(1L)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、シリカカラム(石油エーテル/EtOAc=1:1)によって精製し、黄色のオイルとして化合物27−2(338g、36%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-15-p1z1 CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 7.79 (d, J = 8.0 Hz, 2 H), 7.34 (d, J = 8.5 Hz, 2 H), 4.12 - 4.19 (m, 2 H), 3.67 - 3.72 (m, 4 H), 3.60 (s, 4 H), 3.55 - 3.58 (m, 2 H), 2.44 (s, 3 H), 2.32 (s, 1 H)
8)化合物27−3Aの調製
化合物27−3−1(230g、591mmol、1.00eq)を、20℃にてDCM(700mL)中に懸濁し、TMSOTf(197g、886mmol、160mL、1.50eq)をN下で加えた。混合物の色がピンク色に変化した。混合物を、50℃に加熱し、そして、1.5時間撹拌した。次に、反応混合物を、20℃に冷やし、そして、14時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=20:1、Rf=0.6)は、開始材料が消費されたことを示した。混合物を、0〜5℃にてNaHCO水溶液(600mL)中に注ぎ入れ、そして、15分間撹拌した。混合物の色が黄色に変化した。混合物を、DCM(500mL)で抽出し、NaHCO水溶液(500mL)、水(500mL2)および塩水(500mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、茶色のオイルとして化合物27−3A(189g、92%の未精製の純度)を得た。
1H NMR: (ET12452-28-p1c CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 6.00 (d, J = 6.6 Hz, 1 H), 5.47 (t, J = 3.0 Hz, 1 H), 4.91 (dd, J = 7.5, 3.3 Hz, 1 H), 4.17 - 4.28 (m, 2 H), 4.08 - 4.14 (m, 1 H), 3.97 - 4.03 (m, 1 H), 2.13 (s, 3 H), 2.05 - 2.09 (m, 9 H)
9)化合物27−4Aの調製
DCM(1.5L)中の化合物27−3A(189g、574mmol、1.00eq)、化合物7−2(140g、460mmol、0.80eq)および4A MOLECULAR SIEVE(150g)の混合物に、N雰囲気下でTMSOTf(63.8g、287mmol、51.9mL、0.50eq)を加え、混合物を25℃にて8時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=20:1、Rf=0.46)は、開始材料が消費されたことを示し、およびLCMS(ET12452−35−P1A、Rt=0.76分)は、生成物が形成されたことを示した。混合物を、濾過して、シーブを取り除き、その後、冷NaHCO水溶液(1000mL)でクエンチし、DCMで抽出し(800mL2)、分離した有機層を飽和NaHCO(800mL)、HO(800mL2)および塩水(800mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。次に、シリカカラム(DCM/MeOH=20:1)によって精製して、黄色のオイルとして化合物27−4A(285g、73%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-35-p1g CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 7.81 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 7.37 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 6.30 (br d, J = 9.5 Hz, 1 H), 5.28 - 5.35 (m, 1 H), 5.08 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 1 H), 4.81 (d, J = 8.6 Hz, 1 H), 4.09 - 4.29 (m, 5 H), 3.86 - 3.98 (m, 3 H), 3.68 - 3.81 (m, 3 H), 3.56 - 3.66 (m, 5 H), 2.46 (s, 3 H), 2.16 (s, 3 H), 2.04 (s, 3 H), 1.98 (s, 3 H), 1.95 (s, 3 H)
10)化合物27−4の調製
DMSO(1.4L)中の化合物27−4A(285g、450mmol、1.00eq)の溶液に、10℃にてNaN(38.1g、586mmol、1.30eq)を加え、そして、その混合物を60℃にて16時間撹拌した。LCMS(ET12452−37−P1A、Rt=0.67分)は、生成物が形成されたことおよび開始材料が消費されたことを示した。混合物を、HO(1500mL)中に注ぎ入れ、EtOAc(1L5)で抽出し、HO(800mL3)および塩水(800mL、3)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、および濃縮して、赤色のオイルとして化合物27−4(168g、未精製)を得た。
1H NMR: (ET12452-37-p1c CDCl3 Bruker_B_400MHz) δ 6.12 (br d, J = 9.4 Hz, 1 H), 5.32 (d, J = 2.9 Hz, 1 H), 5.06 (dd, J = 11.3, 3.4 Hz, 1 H), 4.78 (d, J = 8.7 Hz, 1 H), 4.08 - 4.27 (m, 5 H), 3.82 - 3.94 (m, 3 H), 3.61 - 3.77 (m, 10 H), 3.45 - 3.50 (m, 2 H), 2.16 (s, 3 H), 2.05 (d, J = 1.5 Hz, 5 H), 1.99 (d, J = 4.5 Hz, 6 H), 1.26 (t, J = 7.2 Hz, 2 H)
11)化合物27Aの調製
EtOAc/MeOH(4:1)(640mL)中の化合物27−4(79g、156mmol、1.00eq)の溶液に、Pd(OH)/C(7.9g)を加え、その混合物を、H(30psi)雰囲気下で15℃にて4時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=20:1)は、開始材料が消費されたことを示し、およびLCMS(ET12452−53−P1C、Rt=2.55分)は、生成物が形成されたことを示した。2つの並行した反応を、セライトで濾過し、DCM(500mL5)およびMeOH(200mL3)で洗浄し、濃縮して、こげ茶色のオイルとして化合物27A(140g、未精製)を得た。
1H NMR: (ET12452-53-p1c CDCl3 Varian_D_400MHz) δ 7.02 (br d, J = 9.3 Hz, 1 H), 5.29 - 5.34 (m, 1 H), 5.09 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 1 H), 4.80 (d, J = 8.6 Hz, 1 H), 4.09 - 4.24 (m, 3 H), 3.82 - 3.95 (m, 3 H), 3.52 - 3.70 (m, 10 H), 2.91 (td, J = 5.2, 2.8 Hz, 1 H), 2.15 (s, 3 H), 2.05 (s, 4 H), 1.98 (d, J = 6.4 Hz, 6 H)
12)化合物28の調製
TEA(12.1g、119mmol、16.5mL、5.00eq)を、DCM(160mL)中の化合物27(19.8g、23.8mmol、1.00eq)と化合物27A(57g、119mmol、5.00eq)を含有する撹拌溶液に加えた。それを30℃にて16時間撹拌した。LCMS(ET12452−64−P1A、Rt=1.21分)は、生成物が形成したことを示した。DCM(100mL)で希釈し、そして、飽和NaHCO/飽和塩水(1:1、2×80mL)で洗浄した。有機層を、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、茶色の固形物として未精製の生成物を得た。
未精製の生成物を、AcO(42mL)、CHCN(62.5mL)およびPy(82.3g、1.04mol、84mL、23.96eq)で溶解し、混合物を25℃にて12時間撹拌した。HPLC(ET12452−65−P1A、Rt=2.54分)は、ほとんど生成物を示した。CHCNを留去し、その後、DCM(400mL)で希釈し、そして、飽和NaHCO(100mL4)で洗浄した。有機層を、分離し、そして、0.1MのHCl/飽和塩水(1:1、100mL4)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、シリカカラム(DCM/MeOH=10:1、Rf=0.45)によって精製し、生成物を得、その後、p−HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 25050mm10μm;移動相:[水(10mMのNHHCO)−ACN];B%:25%−55%、23分)によってさらに精製して、黄色の固形物としての化合物28(28.8g、58%の収率、98%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12452-65-p1j DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.00 - 8.09 (m, 3 H), 7.81 (d, J = 9.0 Hz, 3 H), 7.29 - 7.45 (m, 5 H), 7.10 (d, J = 8.6 Hz, 2 H), 6.89 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 5.21 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 5.04 (s, 2 H), 4.97 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 3 H), 4.54 (d, J = 8.4 Hz, 3 H), 4.02 (s, 9 H), 3.83 - 3.92 (m, 3 H), 3.73 - 3.81 (m, 3 H), 3.53 - 3.61 (m, 4 H), 3.44 - 3.52 (m, 17 H), 3.42 (br d, J = 4.4 Hz, 2 H), 3.35 - 3.40 (m, 6 H), 3.07 - 3.27 (m, 11 H), 2.74 - 2.87 (m, 2 H), 2.09 (s, 9 H), 1.99 (s, 10 H), 1.89 (s, 9 H), 1.77 (s, 9 H)
13)化合物29の調製
THF(250mL)中の化合物28(9.7g、5.48mmol、1.00eq)の溶液に、乾燥Pd/C(5.5g、5.48mmol)を加え、その混合物を、H雰囲気下(50psi)で40℃にて6.5時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=10:1、Rf=0.3)は、開始材料が消費されたことを示した。2つの並行反応物を、濾過し、THF(300mL4)およびDCM(200mL3)で洗浄し、そして、濃縮した。残渣を、ET12452−78のバッチを用いたp−HPLC(カラム:Phenomenex Gemini C18 25050mm10μm;移動相:[水(0.1%のTFA)−ACN];B%:15%−45%、20分)によって精製し、白色の固形物として化合物29(14g、63%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-80-p1j DMSO Varian_D_400MHz) δ 9.19 (s, 1 H), 7.99 - 8.10 (m, 3 H), 7.83 (d, J = 9.3 Hz, 3 H), 6.95 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 6.62 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 5.76 (s, 2 H), 5.21 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J = 11.2, 3.3 Hz, 3 H), 4.54 (d, J = 8.6 Hz, 3 H), 4.03 (s, 9 H), 3.83 - 3.92 (m, 3 H), 3.73 - 3.81 (m, 3 H), 3.53 - 3.61 (m, 4 H), 3.44 - 3.52 (m, 16 H), 3.43 (br d, J = 4.4 Hz, 3 H), 3.36 - 3.39 (m, 3 H), 3.26 - 3.33 (m, 4 H), 3.05 - 3.24 (m, 9 H), 2.65 - 2.82 (m, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 2.00 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.77 (s, 9 H)
14)化合物30の調製
化合物29(8g、4.77mmol、1.00eq)を、DCM(65mL)で溶解し、そして、化合物29A(2.88g、9.54mmol、3mL、2.00eq)を加えた。得られた溶液を5℃に冷やした。この溶液に、2Hテトラゾール(0.45M、11.7mL、1.10eq)を加えた。溶液を、15℃まで加温し、そして、3.5時間撹拌した。TLC(DCM/MeOH=5:1、Rf=0.52)は、開始材料が消費されたことを示し、およびHPLC(ET12452−82−P1A、Rt=2.69分)は、生成物が形成されたことを示した。DCM(50mL)で希釈し、NaHCO(30mL)でクエンチし、その水溶液を、DCMで抽出し(30mL2)、合わせた有機層を飽和NaHCO(30mL2)、HO(30mL)および塩水(30mL2)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、DCM(30mL)で溶解し、その後、ヘキサン(150mL)を0℃にて滴下して加え、15分間撹拌し、その後、冷やし、有機層を注ぎ出し、そして、オイルを、DCM(30mL)で再び溶解し、ヘキサン(150mL)を滴下して加え、その手順を7回繰り返し、減圧下で乾燥させて、白色の固形物として化合物30(5.5g、55%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12452-83-p1b DMSO Varian_D_400MHz) δ 7.97 - 8.09 (m, 3 H), 7.78 (d, J = 9.3 Hz, 3 H), 7.06 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 6.86 (d, J = 8.2 Hz, 2 H), 5.73 (s, 2 H), 5.18 (d, J = 3.3 Hz, 3 H), 4.94 (dd, J = 11.1, 3.4 Hz, 3 H), 4.51 (d, J = 8.4 Hz, 3 H), 3.99 (s, 9 H), 3.79 - 3.89 (m, 4 H), 3.70 - 3.78 (m, 4 H), 3.59 - 3.69 (m, 2 H), 3.49 - 3.58 (m, 4 H), 3.44 (s, 16 H), 3.40 (br d, J = 4.2 Hz, 3 H), 3.32 - 3.37 (m, 5 H), 3.24 - 3.28 (m, 1 H), 3.05 - 3.22 (m, 9 H), 2.78 (br t, J = 5.8 Hz, 4 H), 2.07 (s, 9 H), 1.96 (s, 9 H), 1.86 (s, 9 H), 1.74 (s, 9 H), 1.15 (d, J = 6.8 Hz, 6 H), 1.09 (d, J = 6.8 Hz, 6 H)
図3は、化合物30(本明細書中の構造1025b)に関するH NMRスペクトルを示す。
実施例4:標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物、構造1014bの合成
1)化合物32の調製
ACN(260.00mL)中の化合物31(24.71g、87.85mmol、1.00eq)、化合物31A、EDCI(39.07g、203.82mmol、2.32eq)、ピリジン(19.39g、245.11mmol、19.79mL、2.79eq)の溶液を、25℃にて2時間撹拌した。TLC(石油エーテル/酢酸エチル=1/1、所望の生成物;Rf=0.7)は、所望の生成物が形成されたことを示した。混合物を、300mLのEtOAcに加え、NaHCO(100mL2)、100mLの塩水で洗浄し、NaSOを用いて乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、残渣を得た。未精製の生成物を、シリカカラム(石油エーテル/酢酸エチル=100/1〜3/1)で精製して、黄色のオイルとして化合物32(60.00g、79.25mmol、90.20%の収率、97.19%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12600-89-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ ppm 7.52 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.27-7.38 (m, 5H), 4.99 (s, 2H), 4.26-4.42 (m, 3H), 3.80-4.15 (m, 8H), 2.27 (br s, 2H), 1.78-1.88 (m, 1H), 1.66 (br dd, J = 14.4, 7.2 Hz, 1H), 1.37-1.41 (m, 35H)
2)化合物33の調製
ギ酸(800.00mL)中の化合物32(45.00g、61.15mmol、1.00eq)の溶液を、45℃にて6時間撹拌した。LCMS(et12600−90−p1a、MS=511)は、所望の生成物が形成されたことを示した。混合物を濃縮して、残渣を得た。残渣を1000mLのDCMで洗浄して、白色の固形物として化合物33(30.00g、54.71mmol、89.47%の収率、93.27%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12600-90-p1a DMSO Bruker_B_400MHz) δ 12.75 (br s, 3H), 7.53 (br d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.29-7.38 (m, 5H), 4.99 (d, J = 3.6 Hz, 2H), 4.27-4.38 (m, 2H), 4.12 (br s, 2H), 3.84-4.07 (m, 6H), 2.30 (br t, J = 7.2 Hz, 2 H), 2.07 (s, 1H), 1.59-1.88 (m, 2H), 1.39 (t, J = 5.6 Hz, 1H)
3)化合物34の調製
ACN(90mL)中の化合物33(15g、29.33mmol、1.00eq)、化合物33A(29.22g、175.98mmol、6.00eq)、ピリジン(11.60g、146.65mmol、11.84mL、5.00eq)の溶液に、EDCI(28.11g、146.65mmol、5.00eq)を加え、その後、その混合物を25℃1時間撹拌した。TLC(石油エーテル/酢酸エチル=3/1)は、所望の生成物が形成されたことを示した。混合物に500mLのDCMを加え、NaHCO(200mL2)、100mLの塩水で洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、残渣を得た。シリカカラム(石油エーテル/酢酸エチル=4/1)で精製し、黄色の固形物としての化合物34(28g)を得た。
4)化合物35の調製
DCM(140mL)中の化合物34(16.57g、15.01mmol、1eq)、化合物34Aの溶液に、TEA(9.12g、90.08mmol、12.49mL、6.00eq)を加え、その後、その混合物を25℃にて16時間撹拌した。LCMS(et12600−98−p1g)は、所望の生成物が形成されたことを示した。混合物を、200mLのDCMに注ぎ、100mLのNaHCO、100mLの塩水で洗浄し、NaSOを用いて乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、残渣を得た。調製用HPLC(カラム: Phenomenex Gemini C18 25050 10u;移動相:[水(10mMのNHHCO)−ACN];B%:15%−45%、20分)で精製して、黄色の固形物として化合物5(11g、4.65mmol、30.98%の収率、99.5%の純度)を得た。
1H NMR: (ET12600-98-p1a1 DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.65-8.71 (m, 1H), 8.51 (br s, 1H), 8.18-8.25 (m, 1H), 8.11 (br s, 1H), 7.80 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 7.47 (br d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.28-7.40 (m, 5H), 5.75 (s, 4H), 5.22 (d, J = 3.2 Hz, 4H), 4.95-5.03 (m, 6H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 3.98-4.06 (m, 15H), 3.88 (dt, J = 11.2, 8.8 Hz, 7H), 3.78 (dt, J=10, 5.2 Hz, 5H), 3.54-3.62 (m, 6H), 3.46-3.53 (m, 25H), 3.41 (q, J = 5.6 Hz, 9H), 3.23 (br dd, J = 11.6, 5.6 Hz, 8H), 2.10 (s, 12H), 2.00 (s, 12H), 1.89 (s, 12H), 1.77 (s, 12H)
5)化合物36の調製
MeOH(10mL)中の化合物35(10g、4.25mmol、1eq)、TFA(484.52mg、4.25mmol、314.62μL、1eq)の溶液に、10%のPd(OH)/C(3.00g)を加え、その後、その混合物を、H(50Psi)下で20℃にて4時間撹拌した。LCMS(et12600−107−p1a、Rt=2.195)は、所望の生成物が形成されたことを示した。混合物を、濾過し、そして、濃縮して、黄色の固形物としての化合物36(3.60mmol、8g、84.84%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12600-107-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.68 (br t, J = 5.2 Hz, 1H), 8.46 (br t, J = 5.2 Hz, 1H), 8.21-8.27 (m, 1H), 8.15 (br d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.84 (br d, J = 9.2 Hz, 4H), 5.22 (d, J = 3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.56 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.24 (br s, 1H), 3.99-4.14 (m, 23H), 3.84-3.94 (m, 7H), 3.74-3.83 (m, 5H), 3.55-3.62 (m, 5H), 3.51 (s, 25H), 3.38-3.46 (m, 9H), 3.20-3.30 (m, 9H), 3.17 (d, J = 5.2 Hz, 14H), 2.11 (s, 12H), 2.00 (s, 13H), 1.89 (s, 12H), 1.78 (s, 12H)
6)化合物37の調製
バッチに関しては並行であった。DCM(6mL)中の化合物36(2g、857.18μmol、1.00eq、TFA)、化合物36A(626.23mg、2.14mmol、2.50eq)の溶液に、TEA(312.26mg、3.09mmol、427.75μL、3.60eq)を加え、その後、その混合物を25℃にて16時間撹拌した。LCMSは、所望の生成物が形成されたことを示した。すべての反応混合物を合わせ、200mLのDCM中に溶解し、30mLのNaHCO上に注ぎ、30mLの塩水で洗浄し、NaSOを用いて乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、残渣を得た。調製用HPLC(カラム: Phenomenex Gemini C18 25050 10u;移動相:[水(10mMのNHHCO)−ACN];B%:15%−45%、20分)で精製して、白色の固形物として化合物37(3.20mmol、7.5g、93.27%の収率)を得た。
1H NMR: (ET12600-111-p1a DMSO Varian_D_400MHz) δ 8.66 (s, 1H), 8.51 (br s, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.91 (br d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.80 (d, J=9.2 Hz, 4H), 5.22 (d, J =3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J=11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.47 (br s, 1H), 4.30 (s, 1H), 4.25 (d, J = 3.2 Hz, 1H), 4.03 (s, 11H), 3.97 (br s, 2H), 3.84-3.92 (m, 7H), 3.73-3.82 (m, 6H), 3.55-3.62 (m, 5H), 3.47-3.54 (m, 24H), 3.41 (q, J = 5.6 Hz, 9H), 3.23 (br dd, J = 11.2, 5.6 Hz, 8H), 2.19 (br s, 1H), 2.10 (s, 12H), 2.00 (s, 13H), 1.89 (s, 12H), 1.77 (s, 13H), 1.61 (br s, 3H), 1.40 (br d, J=11.2 Hz, 4H)
8)化合物38の調製
DCM(26.4mL)中の化合物37(4.4g、1.88mmol、1eq)および化合物37A(1.13g、3.75mmol、1.19mL、2eq)を加えた。得られた溶液を5℃に冷やした。この溶液に、2Hテトラゾール(0.45M、4.59mL、1.1eq)を加えた。溶液を20℃まで加温し、そして、2時間撹拌した。混合物を、100mLのDCM中に溶解し、20mLのNaHCOでクエンチし、DCM(50mL2)で抽出し、20mLのNaHCO、20mLの塩水で洗浄し、NaSOを用いて乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、残渣を得た。残渣を、DCM(25mL、0.2%のTEA)で溶解し、その後、ヘキサン(125mL、0.2%のTEA)を0℃にて滴下して加え、15分間撹拌し、その後、冷やし、有機層を注ぎ出し、そして、オイルをDCM(30mL)で再び溶解し、ヘキサン(150mL)を滴下して加え、手順を3回繰り返し、減圧下で乾燥させた。20mLのDCMを白色の固形物に加え、それを30℃にて減圧下で乾燥させて、白色の固形物として38(4.8g、1.83mmol、67.34%の収率、97.15%の純度)を得た。LCMS:[M−iPrN]/2、1222.8。
1H NMR: (DMSO, Varian_400MHz) δ 8.67 (br s, 1H), 8.52 (br s, 1H), 8.20 (br s, 1H), 8.08 (br s, 1H), 7.98 (br d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.79 (br d, J=9.2 Hz, 4H), 5.21 (d, J=3.2 Hz, 4H), 4.98 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 4H), 4.55 (d, J = 8.4 Hz, 4H), 4.47 (br s, 1H), 4.29 (br d, J = 17.6 Hz, 1H), 3.94-4.11 (m, 16H), 3.83-3.94 (m, 8H), 3.78 (br dd, J = 10.4, 5.2 Hz, 6H), 3.64-3.74 (m, 3H), 3.54-3.63 (m, 8H), 3.50 (br s, 26H), 3.36-3.44 (m, 9H), 3.14-3.29 (m, 9H), 2.75 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 2.15-2.27 (m, 4H), 2.10 (s, 13H), 2.00 (s, 13H), 1.82-1.95 (m, 15H), 1.77 (s, 14H), 1.59-1.73 (m, 4H), 1.45 (br d, J = 14.4Hz, 4H), 1.14 (d, J = 6.4 Hz, 12H)
図4は、化合物38(本明細書中の構造1014b)に関するH NMRスペクトルを示す。
実施例5:標的化リガンド、ホスホラミダイト化合物、構造1006bおよび1007bの合成
構造1006bおよび構造1007bのホスホラミダイト含有化合物を、4−cis−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸(本明細書中では化合物8)を構造1006bを合成するのに使用した、および4−trans−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸(本明細書中では化合物8a)を構造1007bを合成するのに使用したという相違のみで、以下の同じ手順に従って合成した。
1)化合物41の調製
ACN(3mL)中のZ−Glu−(OtBu)−OH39(445mg、1.32mmol)、ジ−tert−ブチルイミノジアセタート40(340mg、1.39mmol)、EDC(319mg、1.66mmol、1.23eq)およびPy(3eq、0.33mL)の溶液を、RTにて1時間撹拌し、酢酸エチルで希釈し、NaHCO(2×)で洗浄した。有機層を、MgSOで乾燥させ、そして、留去した。次に、未精製物を、DCM(5mL)中に溶解し、そして、TFA(5mL)を加えた。それを、RTにて16時間撹拌し、その後、留去した。フォーム/沈殿物が形成されるまで、酢酸エチルを加え、留去した4×。未精製の41を、TFP活性化ステップにそのまま使用した。Rt=3.78分、90%の純度。LCMS(ES、M/z):379.0[M+H]
2)化合物42の調製
ACN(3.5mL)中の未精製の三酸41(〜1.30mmol)、TFP(7eq、9.10mmol、1.51g)、TEA(4eq、0.723mL)およびEDC(3.3eq、4.29mmol、0.82g)の溶液を、RTにて1時間撹拌し、DCM(250mL)で希釈し、飽和NaHCO(2×100mL)で洗浄した。有機相を、NaSO上で乾燥させ、濃縮し、そして、シリカカラムで精製した。生成物である活性化トリ−TFPエステルを、hex(5−20%)中のAcOEtで溶出して、微量のTFPと共に、550mgの生成物を得た。Rt=7.06分。
TEA(400μL、2.9mmol)を、DCM(6mL)中のトリ−TFPエステル(540mg、0.642mmol)とGalNac−Peg−NH2XTsOH(2.89mmol、1.88g)を含有した撹拌溶液に加えた。それを、RTにて16時間撹拌し、DCM(200mL)で希釈し、飽和NaHCO/飽和塩水(1:1、2×150mL)で洗浄した。有機層をNaSO上で乾燥させて、留去して、白色の固形物が残った。固形物を、DCM中に溶解し、そして、シリカカラムで精製した。DCM(0−10%)中のMeOHを用いた溶出で、748mg、95.4%の純度および〜100mg、80%の純度のトリ−GalNAc42、36%の収率、2ステップ、を得た。LCMS(ES、M/z):1777.5[M]、Rt=4.67分。
3)化合物43の調製
10%のPd/C、活性化マトリックス(30mg)を、THF(4mL)とTFE(4mL)中のCbz保護アミン42(715mg、0.402mmol)とTsOH(74.5mg、0.402mmol)の溶液に加えた。次に、水素雰囲気(バルーン)を、水素での引き込み真空(pulling vacuum)および逆充填(back filling)によって構築した。それを、水素雰囲気下で24時間撹拌し、セライトを通して濾過し、DCM(2×10mL)で洗浄し、そして、留去して、白色の固形物としてアルコールCが残った。LCMS(ES、M/z):1644.2[M+H]、Rt=4.67分。
脱保護中間体(0.4mmol)および4−cis−ヒドロキシシクロヘキサンカルボン酸のTFPエステル(350mg、1.20mmol)を、DCM(2.5mL)中に溶解し、そして、TEA(3.5eq、0.195mL)を加えた。それをRTにて16時間撹拌した。次に、それを、DCM(100mL)で希釈し、そして、飽和NaHCO/飽和塩水(1:1、100mL×2)で洗浄した。有機相を、NaSO上で乾燥させ、濃縮し、そして、シリカカラムで精製した。生成物を、DCM中のMeOH(2−20%)で溶出して、430mgの>95%の純度の43、61%の収率を得た。Rt=4.20分。LCMS:(ES、M/z):1771.26[M+H]
4)化合物44の調製
2−シアノエチルN,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホロジアミダイト(1.5eq、110μL、0.343mmol)を、0℃にて無水DCM(2.4mL)中のアルコール43(405mg、0.229mmol、真空乾燥)とテトラゾール(0.50eq、0.25mL、0.112mmol、ACN中に0.45M)の撹拌溶液に加えた。それを、RTにて1時間撹拌し、そして、追加のテトラゾール(0.125ml)と2−シアノエチルN,N,N’,N’−テトライソプロピルホスホロジアミダイト(0.10mL)を加えた。撹拌を30分間続け、次に、それを、DCM(200mL)で希釈し、そして、飽和NaHCO/飽和塩水(1:1、200mL)で洗浄した。有機層を、NaSO/MgSO上で乾燥させ、留去し、その後、無水DCMで溶解し、再び留去して、白色の固形物44、408mgが残った、HPLC純度92%、83%の収率。LCMS:(ES、M/z):1870.4[M−iPrN]
図5は、化合物44に関するH NMRスペクトルを示す(本明細書中の構造1007b)。
実施例6:標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物、構造1027bの合成
1)化合物45の調製
TEA(5.3mmol、0.735mL、4.00eq)を、DCM(9mL)中の化合物27(1.1g、1.32mmol、1.00eq)と化合物45A(3.20g、5.29mmol、4.00eq)を含有する撹拌溶液に加えた。それを30℃にて16時間撹拌した。LCMS(ET12452−64−P1A、Rt=1.21分)は、生成物が形成したことを示した。DCM(100mL)で希釈し、そして、飽和NaHCO/飽和塩水(1:1、2×80mL)で洗浄した。有機層を、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮して、茶色の固形物として未精製の生成物を得た。
未精製の生成物を、AcO(3mL)、CHCN(6mL)およびPy(6mL)で溶解し、そして、混合物を25℃にて16時間撹拌した。CHCNを留去し、その後、それを、DCMで希釈し、そして、飽和NaHCOで4回洗浄した。有機層を、分離し、そして、0.1MのHCl/飽和塩水で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、シリカカラム(DCM/MeOH=10:1、Rf=0.45)によって精製して、白色の固形物として生成物45(1.47g、68%の収率、96%の純度)を得た。
4)化合物46の調製
THF/TFE(1:1、5mL)中の化合物45(1.425g、0.871mmol、1.00eq)の溶液に、10%のPd/C(24mg)を加え、そして、その混合物をH雰囲気下で40℃にて30時間撹拌した。TLC(10:1、DCM/MeOH=Rf=0.3)は、開始材料が消費されたことを示した。それを、濾過し、THF(5mL×3)、DCM(5mL×3)で洗浄し、そして、濃縮した。残渣をシリカカラムで精製した。DCM/MeOHで溶出して、白色の固形物として化合物46(1.013g、75%の収率、95%の純度)を得た。LCMS:(ES、M/z):1547.5[M+H]
5)化合物47の調製
化合物46(970mg、0.627mmol、1.00eq)をDCM(4.2mL)中に溶解し、そして、化合物46A(0.941mmol、0.298mL、1.5eq)を加えた。得られた溶液を5℃に冷やし、ジシアノイミダゾール(DCI)(23.1mg、0.188mmol、0.3eq)。溶液を、15℃まで加温し、そして、2時間撹拌した。TLC(5:1、DCM/MeOH=Rf=0.52)は、開始材料が消費されたことを示し、およびHPLCは、生成物が形成されたことを示した。それを、DCM(50mL)で希釈し、飽和NaHCO(30mL)、HO(30mL)および塩水(30mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。残渣を、DCM(2mL)で溶解し、ヘキサン(120mL)に加えた。白色の沈殿物を濾過して、白色の固形物として化合物47(0.975g、93%の収率、82%の収率)を得た。LCMS:(ES、M/z):1747.5[M+H]
図6は、化合物47に関するH NMRスペクトルを示す(本明細書中の構造1027b)。
実施例7.標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物、構造1026bの合成
1)三酸49の調製
1.5MのNaOH(100mL)中の4−ブロモ−アヒルリゾチームフェニルアラニンヒドロクロリド(5.0g、17.8mmol)の溶液に、ブロモ酢酸(8.17g、58.8mmol)を加えた。溶液を、1時間60℃に加熱し、そして、水酸化ナトリウムペレットの添加によってpHを12より高く維持した。完了時に、反応物を15℃に冷まし、pHを1.75〜2.00に調整し、そして、濾過可能な固形物が観察されるようになるまで、オイル状懸濁液を2時間寝かせた。固形物は、濾過し、水で数回洗浄して、白色の固形物(6.0g、93%の収率)の分離がもたらされた。
2)ビアリール三酸50の調製
アリールブロミド49(4.2g、11.6mmol)とボロン酸50(2.8g、12.2mmol)を、DMF/水(168mL)の1:1混合物中に溶解し、そして、10分間脱気した。その溶液を、炭酸カリウム(8.0g、116.2mmol)とPdCl2(dppf)(0.476g、0.6mmol)で処理し、そして、反応器を、窒素雰囲気下に置いて、5時間40℃に加熱した。完了時に、pHを12に調整し、そして、水相を2×(20mL)酢酸エチルで洗浄した。次に、pHを1.75〜2.00に調整し、そして、15℃に冷ました。得られた固形物を、濾過し、水で数回洗浄してすべての無機物を取り除いて、51(4.8g、89%の収率)を得た。
1)トリ−TFPエステル52の調製
ジクロロメタン(50mL)中の三酸51(5.0g、10.7mmol)とテトラフルオロフェノール(6.5g、38.8mmol)のスラリーを、0℃に冷やし、そして、EDCヒドロクロリド(7.45g、38.8mmol)で処理した。スラリーを、周囲温度まで暖め、そして、18時間撹拌した。反応完了時に、反応物を水で洗浄し、有機層を、オイルまで濃縮し、シリカカラムで精製して、TFPエステル52(1.63g、16%の収率)を得た。
2)トリ−NAG保護アルコール54の調製
ジクロロメタン(5mL)中のトリ−TFPエステル52(1.00g、1.10mmol)とNAGアミントシラート53(2.15g、3.33mmol)の溶液を、0℃に冷やし、そして、トリエチルアミン(0.66g、6.6mmol)で処理した。溶液を、2時間にわたり周囲温度まで加温した。完了時に、反応混合物を、水で洗浄し、オイルまで濃縮した。未精製のオイルを、無水酢酸(30mL)中に溶解し、そして、その溶液を、1mLのトリエチルアミンで処理した。3時間後に、有機層を高真空下で取り除き、オイル54(1.7g、85%の収率)を得た。
3)フェノール55の調製
ベンジル保護アルコール54(2.0g、1.08mmol)を、エタノール(23mL)中に溶解し、そして、窒素雰囲気下に置いた。溶液に、10%のPd/C(0.7g、30mol%)を加えた。スラリーを、周囲温度にて8時間撹拌し、そして、触媒をセライトパッドによって取り除いた。有機層を高真空下で取り除いて、白色の固形物55(1.4g、74%の収率)を得た。
4)化合物56の調製
ジクロロメタン(10mL)中のフェノール55(1.3g、0.74mmol)とホスホラミダイト試薬(0.364mg、1.11mmol)の溶液を、0℃に冷やし、そして、4,5−ジシアノイミダゾールで処理し、その後、2時間にわたって周囲温度まで加温した。完了時に、反応混合物を、飽和重炭酸ナトリウム(10mL)で、続いて、水(10mL)で洗浄し、そして、有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥させた。有機層を減圧下で濃縮して、白色の固形物(1.4g、93%の収率)を得た。
実施例7の化合物56は、本明細書中の構造1026bである。
実施例8.標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物の物理特性
本明細書中に開示した剛性リンカー構造を有していない特定のGalNAcリガンドホスホラミダイト化合物は、多くの共通溶媒中でのゲル化傾向を示した。
構造1008bの、同じ標的化部分(N−アセチル−ガラクトサミン)、テザー、および分岐点基を有するGalNAc構造の挙動を例示する写真を図7に添付したが、本明細書中に開示した構造1008bの剛性リンカーの代わりにPEGリンカーを含む。PEGリンカー−GalNAcホスホラミダイト化合物を、モレキュラーシーブ上、0.1M希釈にて、ACN:DMFの3:1混合物中に12時間保持した。PEGリンカー−GalNAcは、この高度に極性の溶媒系中で顕著なゲル化を示す。このPEGリンカー−GalNAcホスホラミダイト化合物に関して、溶解性を維持するために、ACN:DMFの
1:1までの混合物を使用する必要がある。
DMFなどの高度に極性の溶媒を必要とすることなく、アセトニトリル中に0.05Mで完全に溶解されるホスホラミダイト化合物、構造1008bを示す写真を、図8に添付する。PEGリンカー−GalNAc構築物と異なって、構造1008bの剛性リンカーを含むホスホラミダイト化合物は、溶解性を維持するために高度に極性の溶媒の危険性がないか、またはそれを必要としない。より低い濃度にてボトル中で溶解されるにもかかわらず、これは、本明細書中に開示された剛性リンカーを含む構造が、オリゴヌクレオチド合成に典型的に使用される共通溶媒中により可溶性であり、かつ、ゲル化を予防するために高度に極性の溶媒の添加を必要としないことの例証となる。
実施例9.標的化リガンド、ホスホラミダイト含有化合物の純度
実施例2で先に述べたように、図2Aは、構造1008bのホスホラミダイト化合物の31P NMRスペクトルを示す。図2Aは、ホスホラミダイトの正しいシフトを表す単一ピークを示す。加水分解ピークを含めた他のピークは示されず、そしてそれは、高度に純粋な化合物を示す。
図9は、PEGリンカー−GalNAc構造の31P NMRスペクトルを示し、そしてそれは、別の方法では、構造1008bと同じ分岐点、テザー、および標的化部分を含む。それに関して図9のスペクトルが得られたホスホラミダイトの化学構造は、図9に示されている。
図9は複数の不純物ピークを示し、そしてそれは、加水分解された副産物が存在するように見えるピークを含む。
実施例10.オリゴヌクレオチド組成合成
A.合成
RNAi剤を、オリゴヌクレオチド合成で使用される固相上のホスホラミダイト技術に従って合成された。スケールに応じて、MerMade96E(Bioautomation)またはMerMadel2(Bioautomation)を使用した。合成は、制御細孔ガラス(CPG、500Åまたは600Å、Prime Synthesis, Aston, PA, USAから得られる)からなる固体支持体上で行った。すべてのRNA、2’−修飾RNA、およびUNAホスホラミダイトは、Thermo Fisher Scientific(Milwaukee, WI, USA)から購入した。具体的には、以下の2’−O−メチルホスホラミダイトを使用した:(5’−O−ジメトキシトリチル−N6−(ベジゾイル)−2’−O−メチル−アデノシン−3’−O−(2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノ)ホスホラミダイト、5’−O−ジメトキシ−トリチル−N4−(アセチル)−2’−O−メチル−シチジン−3’−O−(2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノ)ホスホラミダイト、(5’−O−ジメトキシトリチル−N2−(イソブチリル)−2’−O−メチル−グアノシン−3’−O−(2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノ)ホスホルアミダイト、および5’−O−ジメトキシトリチル−2’−O−メチル−ウリジン−3’−O−(2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノ)ホスホラミダイト。標的化リガンド含有ホスホラミダイトを、無水ジクロロメタンまたは無水アセトニトリル(50mM)に溶解したが、他のすべてのアミダイトを無水アセトニトリル(50mM)に溶解し、そして、モレキュラーシーブ(3Å)を加えた。活性化剤溶液として5−ベンジルチオ−1H−テトラゾール(BTT、アセトニトリル中250mM)または5−エチルチオ−1H−テトラゾール(ETT、アセトニトリル中250mM)を使用した。カップリング時間は10分(RNA)、15分(標的化リガンド)、90秒(2’OMe)、および60秒(2’F)であった。ホスホロチオエート結合を導入するために、無水アセトニトリル中の3−フェニル1,2,4−ジチアゾリン−5−オン(POS、Poly Org, Inc., Leominster, MA, USAから入手した)の100mM溶液を使用した。
B.支持体に結合したオリゴマーの切断と脱保護
固相合成の終了後、乾燥した固体支持体を、水中の40wt%メチルアミンと28%水酸化アンモニウム溶液(Aldrich)の1:1容量溶液で30℃で2時間処理した。溶液を蒸発させ、固体残渣を水で復元した(下記参照)。
C.精製
未精製オリゴマーを、TKSgel SuperQ-5PW1 3uカラムおよびShimadzu LC-8システムを使用した陰イオン交換HPLCにより精製した。緩衝液Aは20mMのTris、5mMのEDTA、pH9.0であり、20%のアセトニトリルを含有し、緩衝液Bは緩衝液Aと同じであるが1.5Mの塩化ナトリウムを添加した。260nmにおけるUVトレースを記録した。適切な画分を貯留し、次に100mMの重炭酸アンモニウムpH6.7および20%のアセトニトリルから成る泳動バッファーと共に、セファデックスG‐25媒体を充填したGE Healthcare XK16/40カラムを使用したサイズ排除HPLCに流した。
D.アニーリング
0.2×PBS(リン酸緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることにより相補鎖を混合して、RNAi剤を形成した。この溶液を70℃のサーモミキサーに入れ、95℃に加熱し、95℃で5分間保持し、ゆっくりと室温まで冷却した。一部のRNAi剤を凍結乾燥し、−15〜−25℃で保存した。二本鎖濃度は、0.2×PBS中で紫外−可視分光計で溶液の吸光度を測定することにより決定した。次に260nmでの溶液の吸光度に変換係数および希釈率を掛けて、二本鎖濃度を決定した。特に断りのない限り、すべての変換係数は0.037mg/(mL・cm)であった。いくつかの実験では、変換係数を、実験的に決定された吸光係数から計算した。
実施例11.野性型マウスにおける、F12発現阻害オリゴマー化合物を使用したGalNAc標的化リガンドの3’および5’センス鎖付着部位の比較
センス鎖の3’および5’末端の間のGalNAcリガンドの付着部位における差を評価するために、以下の表1に示した配列を有する、F12(本明細書中でF12 RNAi剤とも呼ばれる)に向けられた発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)を調製した:
表1.実施例11のF12発現阻害オリゴマー化合物(RNAi剤二本鎖)
上記の、表1では、以下の表記を使用する:
(NAG15)=
(NAG18)=
F12 RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG15)または(NAG18))に連結したF12 RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG15)または(NAG18))に連結したF12 RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中の2種類のF12 RNAi剤(AD02803またはAD02807)のうちの一方の3mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり三(3)匹の野性型マウスが存在する。先に示したとおり、AD02803は、センス鎖の3’末端に取り付けられた(NAG15)を含むが、それに対して、AD2807は、センス鎖の5’末端に取り付けられた(NAG18)を含む。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、8、15、22、および29日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA(登録商標)(Perkin Elmer)によって、血清中の循環マウスF12タンパク質(mF12)レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。特定の採血日における発現を、それと同じ日付の生理食塩水対照群の平均に対して正規化した。
図10はこの試験の結果を示す。最も低いとき(22日目)には、AD02803は、循環F12レベルの約70%の低減を示したが、それに対して、AD02807は、80%超の低減を示した。29日目にて、AD2807処置マウスと比較して、AD02803処置マウスがベースラインへのより早い復帰を示したので、該データはまたノックダウン効果の長さの差も示している。これらのデータは、センス鎖の5’末端におけるGalNAcリガンドの連結が、3’センス鎖における連結より優れていることを裏付けている。
実施例12.野性型マウスにおける、F12発現阻害オリゴマー化合物を使用したGalNAc標的化リガンドの3’および5’センス鎖付着部位の更なる比較
二本鎖の発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)のセンス鎖の3’および5’末端のGalNAcリガンドの付着部位を更に評価するために、以下の表3に示した配列を有する、F12に向けられた組成物を調製した:
表2.実施例12のF12発現阻害オリゴマー化合物(RNAi剤二本鎖)
上記の、表2では、以下の表記を使用する:
(NAG20)=
F12 RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG20))に連結したF12 RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG20))に連結したF12 RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中の2種類のF12 RNAi剤(AD02815またはAD02816)のうちの一方の3mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり三(3)匹の野性型マウスが存在する。表2で先に示したとおり、AD2815は、センス鎖の5’末端に取り付けられた(NAG20)を含むが、それに対して、AD02816は、センス鎖の3’末端に取り付けられた(NAG20)を含む。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、8、15、22、および29日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA(登録商標)(Perkin Elmer)によって、血清中の循環マウスF12タンパク質(mF12)レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。特定の採血日における発現を、それと同じ日付の生理食塩水対照群の平均に対して正規化した。
図11はこの実験の結果を示す。最も低いとき(22日目)には、AD02816は、循環F12タンパク質レベルの約60%の低減を示したが、それに対して、AD02815は、79%の低減を示した。29日目において、AD02815処置マウスは、生理食塩水レベルから71%のノックダウンを示したが、それに対して、AD02816処置マウスは、40%のノックダウンを示す。これらのデータは、センス鎖の5’末端におけるGalNAcリガンドの連結を支持している。
実施例13.Lp(a)トランスジェニック(Tg)マウスにおける、構造1003の標的化リガンドに連結したLp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
以下の表3に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖Lp(a)RNAi剤)を調製した:
表3.実施例13のLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
上記の、表3では、以下の表記を使用する:
(NAG25)=
(NAG29)=
(NAG29)は、本明細書中で構造1003によって表される化学構造を有する。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Lp(a)トランスジェニック(Tg)マウス(Frazer KA et al 1995, Nature Genetics 9:424-431)を、インビボにおいて複合化N−アセチル−ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖RNAi剤の有効性を評価するために使用した。このマウスは、5’および3’の追加配列を伴った(apo(a)タンパク質をコードする)完全なLPA遺伝子を含有するYAC含有からヒトapo(a)、ならびにヒトapoB−100を発現し、それによって、ヒト化Lp(a)粒子(これ以降「Lp(a)Tgマウス」とも呼ばれる)を産生する(Callow MJ et al 1994, PNAS 91:2130-2134)。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)または(NAG29))に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の5’末端にてそれぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)または(NAG29))に連結したLp(a)RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のそれぞれのLp(a)RNAi剤(AD03547またはAD03549)のうちの一方の1mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり四(4)匹のLp(a)Tgマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、−1(投与前)、5、11、16、22、29、および36日目に採取した。血清中の循環Lp(a)粒子レベルを計算することによって、ノックダウンを測定した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の投与前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
結果を図12に示す。AD03549(NAG25)は、最も低いとき(16日目)71%のノックダウンを示し、そして、AD03547(NAG29)は、最も低いとき(11日目)81%のノックダウンを示した。両トリガーは、最低の時点以降、36日目に26%未満のノックダウンを有する、類似した回復カーブを示した。これらのデータは、実施例13に示したGalNAcリガンドが、単回の1mg/kgの用量を用いたLp(a)Tgマウスにおいて、初期ノックダウン活性とノックダウンの持続性の両方で共通点があることを裏付けている。
実施例14.構造1002および1004の標的化リガンドに連結したLp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)の投与後のapo(a)トランスジェニック(Tg)マウスにおけるApo(a)ノックダウン
以下の表4に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖Lp(a)RNAi剤)を調製した:
表4.実施例14のLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
先の表4では、以下の表記を使用する:
(NAG28)=
(NAG30)=
さらに、(NAG25)は、先の実施例13に示したものと同じ構造を有する。(NAG28)は、本明細書中の構造1002に表される化学構造を有する。(NAG30)は、本明細書中の構造1004に表される化学構造を有する。(NAG28)は、cis−およびtrans−異性体の混合物を含む一方で、(NAG30)は、trans−異性体に排他的である。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例14に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Apo(a)トランスジェニック(Tg)マウスを、インビボにおいて複合化N−アセチル−ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖RNAi剤の有効性を評価するために使用した。Apo(a)Tgマウス(Frazer KA et al 1995, Nature Genetics 9:424-431)は、5’および3’の両方の追加配列を伴った(apo(a)タンパク質をコードする)完全なLPA遺伝子を含有するYAC含有からヒトapo(a)(これ以降「apo(a)Tgマウス」とも呼ばれる)を産生する。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG28)、または(NAG30))に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の5’末端にてそれぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG28)、または(NAG30))に連結したLp(a)RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、SC注射は、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のRNAi剤(AD03536、AD03538、またはAD03540)の0.5mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスを、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり三(3)匹のapo(a)Tgマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、−1(投与前)、8、15、22、および29日目に採取した。apo(a)のELISA(Abcam)を使用して、マウスからの血清をアッセイすることによって、ノックダウンを測定した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の投与前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を、平均の標準誤差として示す。
結果を図13に示す。最も低いときは、試験したすべてのRNAiについて15日目であった。最も低いときでは、AD03536はapo(a)タンパク質の74%のノックダウンを示し、AD03538はapo(a)タンパク質の74%のノックダウンを示し、およびAD03540はapo(a)タンパク質の71%のノックダウンを示した。29日目に、たった16%のノックダウンを示したAD03536(NAG25含有)を除いて、すべてのRNAi剤が、apo(a)タンパク質レベルの>48%のノックダウンを示す。これらのデータは、NAG構造が初期ノックダウン活性に関して、29日目において数字的により優れたノックダウンを示すリンカー構造NAG28およびNAG30を含有するRNAi剤と同様に機能することを裏づけている。
実施例15.構造1005および1008の標的化リガンドに連結したLp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)の投与後のLp(a)トランスジェニック(Tg)マウスにおけるLp(a)ノックダウン
以下の表5に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖Lp(a)RNAi剤)を調製した:
表5.実施例15のLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
先の表5では、以下の表記を使用する:
(NAG31)=
(NAG37)=
さらに、(NAG25)は、先に実施例13に示したものと同じ構造である。
(NAG31)は、本明細書中の構造1005に表される化学構造を有する。(NAG37)は、本明細書中の構造1008に表される化学構造を有する。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Lp(a)Tgマウスを、インビボにおいて複合化N−アセチル−ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖RNAi剤の有効性を評価するために使用した。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG31)または(NAG37))に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG31)、または(NAG37))に連結したLp(a)RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、SC注射を、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のRNAi剤(AD03536、AD03629またはAD04170)の3mg/kg(mpk)の用量のいずれかを、200μl溶液/20gマウスにて、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり四(4)匹のLp(a)Tgマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、−1(投与前)、8、15、22、29、および36日目に採取した。血清中の循環Lp(a)粒子レベルを計算することによって、ノックダウンを測定した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の投与前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
得られたデータを図14に示す。AD03536は、最低のとき(15日目)Lp(a)レベルの95%のノックダウンを示し、そして、36日目に76%のノックダウンを維持した。AD03629は、最低のとき(8日目)Lp(a)レベルの97%のノックダウンを示し、そして、36日目に90%のノックダウンを維持した。AD04170は、最低のとき(8日目)Lp(a)レベルの97%のノックダウンを示し、そして、36日目に78%のノックダウンを維持した。
実施例16:構造1005、1008、1025、および1027構造1003の標的化リガンドに連結したF12発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)の投与後の、野生型マウスにおけるF12ノックダウン
GalNAc標的化リガンド(NAG25)[AD04162];(NAG37)[AD04623];(NAG31)[AD04512];(NAG33)[AD04650]または(NAG38)[AD04651]に、ホスホロチオアート連結によって5’末端にて結合した、F12発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖F12 RNAi剤)を調製した。それぞれ二本鎖RNAi剤が、F12を対象とした。
以下の表記は、GalNAc標的化リガンド構造について使用される:
(NAG25)=
(NAG31)=
(NAG33)=
(NAG37)=
(NAG38)=
(NAG31)は、本明細書中の構造1005によって表される化学構造を有する。(NAG33)は、本明細書中の構造1025によって表される化学構造を有する。(NAG37)は、本明細書中の構造1008によって表される化学構造を有する。(NAG38)は、本明細書中の構造1027によって表される化学構造を有する。
配列および修飾パターンは、先に示したように、F12 RNAi剤のそれぞれのセンス鎖の5’末端に位置するGalNAc標的化リガンド構造に存在する組成物の相違のみで、AD04162、AD04623、AD04512、AD04650、およびAD04651に関して同一であった。
F12 RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例16に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのGalNAc標的化リガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG31)、(NAG33)、(NAG37)、または(NAG38))に結合したF12 RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、(NAG25)、(NAG31)、(NAG33)、(NAG37)、または(NAG38))に連結されるF12 RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中の5種類の二本鎖(AD04162、AD04623、AD04512、AD04650、およびAD04651)のうちのいずれか1つの1mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり四(4)匹の野性型マウスが存在する。先に示したとおり、AD04162は構造(NAG25)を含み、AD04623は構造(NAG37)を含み、AD04512は構造(NAG31)を含み、AD04650は構造(NAG33)を含み、およびAD04651は構造(NAG38)を含む。すべてのGalNAc標的化リガンドが、それぞれの個別のRNAi剤のセンス鎖の5’末端に取り付けられる。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、−1(投与前)、8、15および22日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA(登録商標)(Perkin Elmer)によって、血清中の循環マウスF12タンパク質(mF12)レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。それぞれの時点における各動物のmF12レベルを、その動物における前処理発現レベルで割って、「投与前に対して正規化した」発現率を決定した。次に、個々の動物に関する「投与前日に対して正規化した」比率を、生理食塩水対照群のすべてのマウスの平均「投与前日に対して正規化した」比率で割ることによって、特定の時点における発現を、生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群の発現に対して正規化されたそれぞれの時点における発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
この試験からの結果を図15に示す。最も低いときは、試験したすべてのRNAi剤で8日目であった。最低時には、AD04162はmF12の90%のノックダウンを示し、AD04623はmF12の94%のノックダウンを示し、AD04512はmF12の94%のノックダウンを示し、AD04650はmF12の92%のノックダウンを示し、およびAD04651はmF12の87%のノックダウンを示した。22日目にて、たった74%のノックダウンを示したAD04162(NAG25含有)を除いて、RNAi剤のすべてが、>82%のmF12レベルのノックダウンを示す。これらのデータは、NAG構造が初期ノックダウン活性に関して、22日目にて数字的により優れたmF12ノックダウンを示す本明細書中に開示した剛性リンカー構造またはリンカー置換部分(すなわち、NAG31、NAG33、NAG37、およびNAG38)を含有するRNAi剤と同様に機能することを裏づけている。
実施例17.Lp(a)Tgマウスにおける、構造1004および1005の標的化リガンドに連結したLp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
以下の表6に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖Lp(a)RNAi剤)を調製した:
表6.実施例17のLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
表6では、(NAG30)は、先の実施例14で示したのと同じ化学構造であり、および(NAG31)は、先に実施例15で示したのと同じ化学構造である。NAG30は、本明細書中の構造1004によって表される化学構造を有する。NAG31は、本明細書中の構造1005によって表される化学構造を有する。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Lp(a)Tgマウスを、インビボにおいて複合化N−アセチル−ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖RNAi剤の有効性を評価するために使用した。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、NAG30またはNAG31)に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の5’末端にてそれぞれのGalNAcリガンド(すなわち、NAG30またはNAG31)に連結したLp(a)RNAi剤を、SC注射によって送達した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のLp(a)RNAi剤(AD03629またはAD03540)のうちの一方の1mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり四(4)匹のLp(a)Tgマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、−1(投与前)、8、15、22、29、36および43日目に採取した。血清中の循環Lp(a)粒子レベルを計算することによって、ノックダウンを測定した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の投与前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
結果を図16に示す。最も低いときは、試験した両RNAi剤について15日目であった。AD03629は、最も低いときでは、Lp(a)レベルの89%のノックダウンを示したが、一方で、AD03540は、最も低いときには、Lp(a)レベルの85%のノックダウンを示した。両RNAi剤とも、36日目までに類似の回復カーブを示した。しかしながら、43日目には、AD03540が、Lp(a)レベルの16%のノックダウンを示したのに対して、AD03629は、Lp(a)レベルの55%のノックダウンを示した。
実施例18.構造1007、1025、および1026の標的化リガンドに連結したLp(a)発現阻害オリゴマー化合物の投与後のapo(a)TgマウスにおけるApo(a)ノックダウン
以下の表7に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)を調製した:
表7.実施例18のLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
先の表7では、以下の表記を使用する:
(NAG33)=
(NAG34)=
(NAG35)=
(NAG33)は、本明細書中の構造1025によって表される化学構造を有する。(NAG34)は、本明細書中の構造1026によって表される化学構造を有する。(NAG35)は、本明細書中の構造1007によって表される化学構造を有する。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例18に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Apo(a)トランスジェニック(Tg)マウスを、インビボにおいて複合化N−アセチル−ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖RNAi剤の有効性を評価するために使用した。
それぞれのGalNAcリガンド(すなわち、NAG33、NAG34またはNAG35)に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのGalNAc標的化リガンド(すなわち、NAG33、NAG34またはNAG35)に連結したLp(a)RNAi剤を、SC注射によって投与した。1日目に、SC注射は、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のRNAi剤(AD03721、AD03722、またはAD03723)の1mg/kg(mpk)の用量のいずれかを含む、200μl溶液/20gマウスを、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。1処置群あたり三(3)匹のapo(a)Tgマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、−1(投与前)、8、15、22、および29日目に採取した。血清中の循環apo(a)タンパク質レベルをアッセイすることによってノックダウンを測定した。血清中のヒトapo(a)タンパク質レベルは、apo(a)のELISA(Abcam)を使用して、マウスからの血清をアッセイすることによって観察した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の投与前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。実験誤差を、平均の標準誤差として示す。
得られたデータを図17に示す。最も低いときは、試験したすべてのRNAi剤について15日目であった。AD03721は、最も低いときでは、apo(a)タンパク質レベルの91%のノックダウンを示し、およびAD03722は、最も低いときでは、apo(a)タンパク質レベルの81%のノックダウンを示し、そして一方、AD03723は、最も低いときでは、apo(a)タンパク質レベルの90%のノックダウンを示した。AD03721およびAD03722処置マウスの両方が、各時点にてほとんど同一のノックダウンを示し、その一方で、AD03723処置マウスは、試験した各時点にて数字的により低いノックダウンを示し、処理後のapo(a)タンパク質レベルの回復は、類似の軌跡を示した。例えば、29日目に、AD03721処置マウスはapo(a)レベルの76%のノックダウンを示し、AD03723処置マウスはapo(a)レベルの83%のノックダウンを示し、そして一方、AD03722処置マウスはapo(a)レベルの61%のノックダウンを示した。これらのデータは、構造NAG33およびNAG35を含有するRNAi剤が29日目に数字的により優れたノックダウンを示して、NAG33、NAG34およびNAG35構造すべてがノックダウン活性を示すことを裏づけている。
実施例19.Lp(a)Tgマウスにおける、1mg/kgおよび3mg/kgにて投与される、構造1008の標的化リガンドに連結したLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)の用量応答
本明細書中に記載したLp(a)トランスジェニックマウスを、インビボにおいてN−アセチル−ガラクトサミンリガンドを結合した二本鎖RNAi剤の有効性を評価するのに使用した。実施例15で先に記載した、二本鎖ID:AD04170を有するLp(a)に対するRNAi剤を製造した。先に記載したように、Lp(a)二本鎖ID:AD04170は、センス鎖の5’末端にて取り付けられた(NAG37)標的化リガンド(構造1008)を含む。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
標的化リガンド構造1008に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
標的化リガンド構造1008に連結したLp(a)RNAi剤を、皮下(SC)注射によって投与した。1日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のRNAi剤の1mg/kg(mpk)または緩衝化生理食塩水中のRNAi剤の3mg/kg(mpk)のいずれかの用量を含む、200μl溶液/20gマウスのSC注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚におこなった。
対照血清(処理前)サンプルを、1日目に注射前のマウスから採取した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により決定した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、−1日目における)その動物の処理前発現レベルで割って、「−1日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「−1日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「−1日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
結果を図18に示す。図18に示すように、用量依存的相関は、全時点にわたってLp(a)RNAi剤に関して明らかである。
実施例20:カニクイザルにおける、構造1003および1004の標的化リガンドに連結したLP(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
以下の表8に示した配列を有する、Lp(a)発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)を調製した:
表8.実施例20のLp(a)発現阻害オリゴマー化合物(RNAi剤二本鎖)
Lp(a)RNAi剤、AD03547は、実施例13に示したものと同じであり、かつ、(NAG29)に結合される。Lp(a)RNAi剤、AD3668は、(NAG30)に結合された。(NAG30)は、実施例14に示した化学構造を有する。(NAG29)は、本明細書中の構造1003によって表される。(NAG30)は、本明細書中の構造1004によって表される。
Lp(a) RNAi剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E(登録商標)(Bioautomation)またはMerMade12(登録商標)(Bioautomation)のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例10に記載の方法に従って、0.2×PBS(ホスファート緩衝化生理食塩水、1×、Corning, Cellgro)中で等モルRNA溶液(センスおよびアンチセンス)を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
構造1003または構造1004を有する本明細書中に開示した標的化リガンドに結合したLp(a)RNAi剤を、作製し、そして、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
対照血清(処理前)サンプルを、14、7、および1日目(投薬前)に注射前のカニクイザルから採取した。Lp(a)粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas(登録商標)Integra400(Roche Diagnostics)により決定した。正規化のために、ある時点での各動物に関するLp(a)レベルを、(この場合、14、7、および1日目(投薬前)における)その動物の処理前発現レベルの平均で割って、「投与前に対して正規化した」発現率を決定した。
1日目に、カニクイザルマカク(カニクイザル)霊長動物に、3mg/kgのLp(a)RNAi剤、AD03668またはLp(a)RNAi剤、AD03547のいずれかを、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結したLp(a)RNAi剤を用いて、皮下注射した。1処置群あたり、二(2)匹のサルに投与した。
結果を図19に報告する。構造1003(AD03547)または構造1004(AD03668)のいずれかに結合したLp(a)RNAiトリガーは、カニクイザルにおいてノックダウンを示した。
実施例21:カニクイザルにおける、構造1008の標的化リガンドに連結したF12発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
F12に合わせて異なる配列を有し、かつ、センス鎖の5’末端でGalNAc標的化リガンド構造1008[(NAG37)]に連結されたF12RNAi剤を、作製し、そして、皮下(SC)注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーに組み合わせた。
1日目に、カニクイザルマカク(カニクイザル)霊長動物に、3mg/kgの、異なる配列構造および異なる修飾パターンを有する六(6)種類の異なるLp(a)RNAi剤:AD04623、AD04624、AD04625、AD04626、AD04627、またはAD04628のうちの1つを皮下に注射した。1処置群あたり二(2)匹のサルに投薬した。
ノックダウンを観察するために、処置したカニクイザルからの血清サンプルを、−7日目および1日目(投与前)、ならびに8、15、および22日目に採取した。ノックダウンを、ヒトF12のELISAキット(Molecular Innovations)によって血清中の循環cyno F12タンパク質(cF12)レベルを定量化することによって計測した。それぞれの時点における各動物のcF12レベルを、その動物における発現の処置前レベル(−7日目と1日目の平均)で割って、「投与前に対して正規化した」発現率を決定した。実験誤差を標準偏差として示す。
図20に結果を示す。AD04625およびAD04623が、計測した全時点にわたって最大のノックダウンを示して、NAG37(構造1008)に連結されたそれぞれF12 RNAi剤は、カニクイザルにおいてノックダウンを示した。
実施例22:PiZトランスジェニックマウスにおける、構造1008の標的化リガンドに連結したα−1アンチトリプシン発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)
インビボにおいてα−1アンチトリプシン(AAT)遺伝子に向けられたRNAi剤を評価するために、トランスジェニックPiZマウス・モデル(PiZマウス)を使用した。PiZマウスは、ヒトPiZ AAT変異対立遺伝子およびモデルヒトAATD(Carlson et al., Journal of Clinical Investigation 1989)を有する。
以下の表9に示した配列を有する、AAT発現阻害オリゴマー化合物(二本鎖RNAi剤)を調製した:
表9.実施例22のAAT発現阻害オリゴマー化合物(RNAi剤二本鎖)
(NAG37)は、先の実施例16に示した化学構造を有する。
AAT RNAi剤を、医薬的に許容される生理食塩バッファー中で調製し、そして、AAT遺伝子発現のノックダウンを評価するために、PiZマウスには、背部の肩間の弛んだ皮膚内に、200μlの溶液/20gマウスの皮下(SC)注射によって投与した。各マウスのは、3mg/kg(mpk)のAD04463の単回SC投与量を与えた。3匹のマウスに、AAT RNAi剤を投与した(n=3)。
血漿サンプルを、−1日目、1日目(投与前)、8日目、および15日目のAAT(Z−AAT)タンパク質レベルについて描図し、そして、分析した。AATレベルを、1日目(投与前)のAAT血漿レベルに対して正規化した。タンパク質レベルを、ELISAキットによって血漿中の循環ヒトZ−AATレベルを定量化することによって計測した。
平均した正規化AAT(Z−AAT)レベルを図21に示す。本明細書中の構造1008の標的化リガンドに連結したAAT RNAi剤は、PiZトランスジェニックマウスにおいてノックダウンを示した。
他の実施形態
本発明を、その詳細な説明と併せて説明したが、前述の説明は例示を意図するものであり、添付の特許請求の範囲により定義される本発明の範囲を限定するものではないことを理解されたい。他の態様、利点、および変更は、以下の請求項の範囲内である。

Claims (47)

  1. リンカー、分岐点基、1もしくは複数のテザー、および1もしくは複数の標的化部分を含み、式Iの構造を含む標的化リガンド:
    {式中、nは、1〜4の整数であり、かつ、式中、該リンカーは、以下から成る群から選択される構造である:
    (式中、n’は、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10であり、そして、存在する場合、それぞれのZ’は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、またはスルフヒドリルから成る群から選択され)(構造7);
    (式中、n”は、0、1、2、3、4であり、そして、存在する場合、それぞれのZ”は独立に:C−Cアルキル、C−Cアルケニル、C−Cアルキニル、C−Cアルコキシ、置換C−Cアルキル、C−Cアミノアルキル、置換C−Cアルケニル、置換C−Cアルキニル、置換もしくは非置換アミノ、カルボキシル、置換C−Cアルコキシ、置換C−Cアミノアルキル、ハロゲン(例えば、F)、ヒドロキシル、アミド、置換アミド、シアノ、置換もしくは非置換ケト、置換もしくは非置換アルコキシカルボニル、置換もしくは非置換アリールオキシカルボニル、置換もしくは非置換ヘテロアリールオキシカルボニル、またはスルフヒドリルから成る群から選択され)(構造8);および
    (式中、Vは、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、または置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、あるいは任意の、共有結合で連結されたその組み合わせを含む)(構造9)}。
  2. 前記リンカーが、以下から成る群から選択される構造である、請求項1に記載の標的化リガンド:
  3. 前記リンカーが、以下のとおりである、請求項1または2に記載の標的化リガンド:
  4. 前記分岐点基が、以下から成る群から選択される構造である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の標的化リガンド:
    {式中、nは、1〜20の整数である}(構造209);
    {式中、mは、0〜20の整数であり、そして、nは、0〜20の整数である}(構造210);
    {式中、mは、0〜20の整数であり;nは、0〜20の整数であり;xは、1〜10の整数であり;yは、1〜10の整数であり;zは、1〜4の整数であり;そして、Kは、置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、および置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、または共有結合で連結されるその組み合わせから成る群から選択される}(構造211);
    {式中、mは、0〜20の整数であり;nは、0〜20の整数であり;xは、1〜10の整数であり;そして、yは、1〜10の整数である}(構造212);
    {式中、mは、0〜20の整数であり;nは、0〜20の整数であり;xは、1〜10の整数であり;yは、1〜10の整数であり;Gは:
    ;または5、6、7、8、もしくは9原子の環サイズを有する任意の置換もしくは非置換環または複素環式構造、例えば、置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、またはヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)から成る群から選択される}(構造213);
    {式中、nは、0〜20の整数である}(構造214);
    {式中、nは、0〜20の整数であり、そして、Qは:
    から成る群から選択される}(構造215);
    (構造216);
    (構造217);
    (構造218);
    {式中、nは、1〜7から選択される整数である}(構造219)。
  5. 前記分岐点基が、以下のとおりである、請求項1〜4のいずれか1項に記載の標的化リガンド:
    (構造205)または
    (構造216)。
  6. 前記テザーが、以下から成る群から独立に選択される、請求項1〜5のいずれか1項に記載の標的化リガンド:
    {式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、そして、Xは、O、S、またはNHである}(構造301);
    {式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造302);
    (構造302a);
    {式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、およびXは、O、S、またはNHである}(構造303);
    {式中、nは、1〜20の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20)であり、およびXは、O、S、またはNHである}(構造304);
    {式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造305);および
    {式中、Xは、O、S、またはNHである}(構造306)。
  7. 前記標的化部分が:N−アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N−ホルミル−ガラクトサミン、N−プロピオニル−ガラクトサミン、N−n−ブタノイルガラクトサミン、およびN−イソ−ブタノイルガラクトサミンから成る群から独立に選択される、請求項1〜6のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  8. 前記標的化部分が、N−アセチルガラクトサミンである、請求項7に記載の標的化リガンド。
  9. 前記標的化部分が、グリカン、ハプテン、ビタミン、フォラート、ビオチン、アプタマー、ならびにペプチド、例えばRGD含有ペプチド、インスリン、EGF、およびトランスフェリンなど、から独立に選択される、請求項7に記載の標的化リガンド。
  10. 前記式Iのnが3である、請求項1〜9のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  11. 前記式Iのnが4である、請求項1〜9のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  12. 前記標的化リガンドが、発現阻害オリゴマー化合物に連結される、請求項1〜11のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  13. 前記発現阻害オリゴマー化合物が、RNAi剤である、請求項12に記載の標的化リガンド。
  14. 前記RNAi剤が二本鎖である、請求項13に記載の標的化リガンド。
  15. 前記RNAi剤が、1もしくは複数の修飾ヌクレオチドを含む、請求項14に記載の標的化リガンド。
  16. 前記標的化リガンドが、次のものから選択される構造を含む、請求項1に記載の標的化リガンド:
    (構造1001);
    (構造1002);
    (構造1003);
    (構造1004);
    (構造1005);
    (構造1006);
    (構造1007);
    (構造1008);
    (構造1009);
    (構造1010);
    (構造1012);
    (構造1013);
    (構造1014);
    (構造1015);
    (構造1016);
    (構造1017);
    (構造1018);
    (構造1019);
    (構造1020);
    (構造1021);
    (構造1022);
    (構造1023);および
    (構造1024)。
  17. その構造が、以下から選択される、請求項1に記載の標的化リガンド:
    (構造1003);および
    (構造1008)。
  18. 前記標的化リガンドが、RNAi剤に連結される、請求項1〜17のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  19. 前記RNAi剤が、二本鎖である、請求項18に記載の標的化リガンド。
  20. 前記二本鎖RNAi剤が、該RNAi剤のセンス鎖の5’末端にて標的化リガンドに連結される、請求項19に記載の標的化リガンド。
  21. 前記RNAi剤が、ホスファート基、ホスホロチオアート基、またはホスホナート基を介して標的化リガンドのリンカーに連結される、請求項18〜20のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  22. 前記標的化リガンドが、発現阻害オリゴマー化合物に連結され、ここで、該標的化リガンドと該発現阻害オリゴマー化合物の構造が、以下から成る群から選択される構造によって表される、請求項1に記載の標的化リガンドを含む組成物:
    (構造1001a);
    (構造1002a);
    (構造1003a);
    (構造1004a);
    (構造1005a);
    (構造1006a);
    (構造1007a);
    (構造1008a);
    (構造1009a);
    (構造1010a);
    (構造1024a);
    (構造1012a);
    (構造1013a);
    (構造1014a);
    (構造1015a);
    (構造1016a);
    (構造1017a);
    (構造1018a);
    (構造1019a);
    (構造1020a);
    (構造1021a);
    (構造1022a);および
    (構造1023a);
    {式中、各構造におけるRは、発現阻害オリゴマー化合物を含む}。
  23. 前記標的化リガンドが、ホスファート基、ホスホロチオアート基、またはホスホナート基を介して発現阻害オリゴマー化合物に連結される、請求項22に記載の組成物。
  24. 前記発現阻害オリゴマー化合物が、RNAi剤である、請求項22または23に記載の組成物。
  25. 前記RNAi剤が、二本鎖RNAi剤である、請求項24に記載の組成物。
  26. 前記標的化リガンドが、RNAi剤のセンス鎖の5’末端に連結される、請求項25に記載の組成物。
  27. 以下から成る群から選択される構造を有する化合物:
    (構造1001b);
    (構造1002b);
    (構造1003b);
    (構造1004b);
    (構造1005b);
    (構造1006b);
    (構造1007b);
    (構造1008b);
    (構造1009b);
    (構造1010b);
    (構造1024b);
    (構造1012b);
    (構造1013b);
    (構造1014b);
    (構造1015b);
    (構造1016b);
    (構造1017b);
    (構造1018b);
    (構造1019b);
    (構造1020b);
    (構造1021b);
    (構造1022b);
    (構造1023b);
    (構造1025b);
    (構造1026b);および
    (構造1027b)。
  28. リンカー置換部分を有する分岐点基、1もしくは複数のテザー、および1もしくは複数の標的化部分を含む、式IIの構造を含む標的化リガンド:
    {式中、nは、1〜4の整数であり、そして、式中、1もしくは複数の置換もしくは非置換シクロアルキル(例えば、シクロヘキシル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘプチル、シクロオクチルなど)、置換もしくは非置換シクロアルケニル(例えば、シクロヘキセニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘプテニル、シクロオクテニル、シクロヘキサジエニル、シクロペンタジエニル、シクロヘプタジエニル、シクロオクタジエニルなど)、置換もしくは非置換アリール(例えば、フェニル、ナフチル、ビナフチル、アントラセニルなど)、置換もしくは非置換ヘテロアリール(例えば、ピリジル、ピリミジニル、ピロール、イミダゾール、フラン、ベンゾフラン、インドールなど)、または置換もしくは非置換ヘテロシクリル(例えば、テトラヒドロフラン、テトラヒドロピラン、ピペリジン、ピロリジンなど)、あるいは任意のその組み合わせを含む該リンカー置換部分が、分岐点基内に位置する}。
  29. 前記リンカー置換部分を有する分岐点基が、以下から選択される、請求項28に記載の標的化リガンド:
    (構造220)、および
    (構造221)。
  30. 以下から選択される構造を含む、請求項29に記載の標的化リガンド:
    (構造1025)
    (構造1026)
    (構造1027)。
  31. 前記標的化リガンドが、発現阻害オリゴマー化合物に連結される、請求項28〜30のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  32. 発現阻害オリゴマー化合物に連結された前記標的化リガンドが、以下の構造を有する、請求項31に記載の標的化リガンド:
    {式中、Rは、発現阻害オリゴマー化合物を含む}(構造1027a)。
  33. 前記発現阻害オリゴマー化合物が、RNAi剤である、請求項28〜32のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  34. 前記RNAi剤が、二本鎖である、請求項33に記載の標的化リガンド。
  35. 前記RNAi剤が、1もしくは複数の修飾ヌクレオチドを含む、請求項34に記載の標的化リガンド。
  36. 対象における標的核酸の発現を阻害する方法であって、請求項1〜21または28〜35のいずれか1項に記載の標的化リガンドのいずれかに連結した発現阻害オリゴマー化合物の治療量を該対象に投与することを含む方法。
  37. 治療薬を哺乳動物細胞内に導入する方法であって、哺乳動物細胞を、該治療薬に連結した、請求項1〜21または28〜35のいずれか1項に記載の標的化リガンドと接触させることを含む方法。
  38. 前記細胞が対象の体内に存在する、請求項37に記載の方法。
  39. 前記対象がヒトである、請求項38に記載の方法。
  40. 前記治療薬が、発現阻害オリゴマー化合物である、請求項37〜39のいずれか1項に記載の方法。
  41. 前記発現阻害オリゴマー化合物が、二本鎖RNAi剤である、請求項40に記載の方法。
  42. 治療用化合物の投与から恩恵を受けるであろう疾患または障害を治療する方法であって、その治療を必要としている対象に、治療用化合物に連結した請求項1〜21または28〜35のいずれか1項に記載の標的化リガンドの治療量を投与することを含む方法。
  43. 治療用化合物の投与から恩恵を受けるであろう疾患または障害を治療する方法であって、その治療を必要としている対象に、請求項22〜26のいずれか1項に記載の組成物の治療量を投与することを含む方法。
  44. 請求項1〜21のいずれか1項に記載の標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物を製造する方法であって:
    (i)リンカーのカルボン酸部分(または、活性化エステル)を、分岐点基上に位置する末端アミンに共有結合で連結し、そして、
    (ii)ホスホラミダイト形成試薬を用いたホスフィチル化反応によって、リンカーをホスホラミダイトのリン原子に連結し;それによって、標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物を形成することを含む該方法。
  45. 前記ホスホラミダイト試薬が、以下から選択される、請求項44に記載の方法:
  46. 薬剤として使用するための、治療薬に連結された、請求項1〜21または29〜36のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
  47. 哺乳動物細胞内に治療薬を導入する際に使用するための、対象における標的核酸の発現を阻害するための、または治療薬の投与から恩恵を受けるであろう疾患もしくは障害を治療するための、治療薬に連結された、請求項1〜21または29〜36のいずれか1項に記載の標的化リガンド。
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