JP7485642B2 - 治療化合物用の標的化リガンド - Google Patents

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１６年３月７日に出願された米国特許仮出願第６２／３０４，６５２号、２０１６年８月４日に出願された米国特許仮出願第６２／３７０，７５４号、および２０１６年１１月２８日に出願された米国特許仮出願第６２／４２６，９１６号による優先権を主張するものであり、そのそれぞれの内容の全体を参照によって本明細書中に援用する。
背景
多くの化合物が、治療効果を有するかまたは診断目的で有用となるためには、特定位置に（例えば、所望の（単数もしくは複数の）細胞に）送達される必要がある。生体内において治療化合物を送達することを試みる場合には、こうしたことが頻繁にある。さらに、特定位置に効率的に化合物を送達できることは、該化合物の投与によって引き起こされる可能性がある意図しない結果（オフターゲット効果など）を制限するかまたは潜在的に排除する。生体内の所望の位置に治療化合物などの化合物の送達を容易にする１つの方法は、標的化リガンドに化合物を連結されたかまたは取り付けることである。
標的化リガンドを使用することで標的化され得る治療化合物のクラスの１つが、オリゴマー化合物である。標的核酸に対して少なくとも部分的に相補的なヌクレオチド配列を含むオリゴマー化合物が、生体外および生体内の両方において標的の機能および活性を変更することが示された。標的核酸（ｍＲＮＡなど）を含有する細胞に送達されたとき、オリゴマー化合物は、該標的の発現を調節して、標的核酸の変更された転写または翻訳をもたらすことが示された。特定の事例では、前記オリゴマー化合物は、核酸標的を阻害すること、および／または標的核酸の分解を引き起こすことによって遺伝子の発現を低減し得る。
標的核酸がｍＲＮＡであれば、発現阻害オリゴマー化合物がｍＲＮＡ標的の発現を調節し得る１つの機構は、ＲＮＡ干渉による。ＲＮＡ干渉とは、ＲＮＡまたはＲＮＡ様分子（化学的に修飾されたＲＮＡ分子など）が分解によって遺伝子発現を抑制することができる生物学的プロセスである。転写後遺伝子サイレンシングのプロセスは、外来遺伝子の発現を予防するために使用される、進化的に保存された細胞防御機構であると考えられる。
合成ＲＮＡおよびＲＮＡ様分子は、生体内においてＲＮＡ干渉を誘発することが示された。例えば、Elbashirら（Nature 2000, 411, 494-98）は、培養哺乳動物細胞において２１ヌクレオチドの合成ＲＮＡ分子の二本鎖の導入によって引き起こされたＲＮＡｉを記載している。ＲＮＡｉ応答機構を引き起こす可能性のある合成のＲＮＡまたはＲＮＡ様分子のタイプは、修飾ヌクレオチドおよび／または１若しくは複数の非ホスホジエステル結合から成ってもよい。
さらに、（修飾ヌクレオチドを含み、かつ、１若しくは複数の非ホスホジエステル結合を有する可能性もある）一本鎖ＲＮＡおよびＲＮＡ様分子は、標的ｍＲＮＡなどの標的核酸の発現を変更する可能性もある。
概要
ヒト患者または動物などの対象の体内の特定の臓器または組織、例えば、特定の標的部位への治療化合物の送達を促進する可能性のある標的化リガンドを、本明細書中に開示する。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物の標的送達を促進し得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、肝臓への発現阻害オリゴマー化合物の送達を促進する。
本明細書中に開示した標的化リガンド（targeting ligand）は、１若しくは複数の標的化部分（targeting moiety）、１若しくは複数のテザー、１若しくは複数の分岐点基（branch point group）、および１若しくは複数のリンカーを含むか、またはそれらから成る。
式Ａの一般構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る標的化リガンドが本明細書中に開示した：
｛式中、ｎは、１～４の整数（例えば、１、２、３または４）である｝。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、式Ｂの構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る：
Figure 0007485642000002
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）であり；Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨであり；および標的化部分は：Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、およびＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミンから成る群から選択される｝。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、以下の構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る：
Figure 0007485642000003
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数である｝（構造１）。
いくつかの実施形態において、開示した標的化リガンドは、以下の構造から選択される構造を含むか、それらから成るか、または実質的にそれらから成る：
Figure 0007485642000004
 （構造１０１）；
Figure 0007485642000005
 （構造１０２）；および
Figure 0007485642000006
 （構造１０３）。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、１若しくは複数の標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、前記標的化部分としてＮ－アセチル－ガラクトサミンを含む。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、治療化合物などの化合物、例えば、発現阻害オリゴマー化合物に、例えば、該発現阻害オリゴマー化合物の３’または５’末端に、直接的または間接的に連結され得る。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物としては、１若しくは複数の修飾ヌクレオチドが挙げられる。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖ＲＮＡｉ剤などのＲＮＡｉ剤である。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端にて、ホスファート基、ホスホロチオアート基、またはホスホナート基を介してＲＮＡｉ剤に連結される。
標的化リガンドおよび発現阻害オリゴマー化合物を含む組成物を本明細書中に開示する。標的化リガンドおよびＲＮＡｉ剤を含む組成物を本明細書中に開示する。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドおよびＲＮＡｉ剤を含む、本明細書中に開示した組成物は、以下の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000007
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０１ａ）；
Figure 0007485642000008
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０２ａ）；および
Figure 0007485642000009
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０３ａ）。
標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物を本明細書中に開示する。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、以下の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000010
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）である｝（構造１ｄ）；
Figure 0007485642000011
 （構造１０１ｄ）；
Figure 0007485642000012
 （構造１０２ｄ）；または
Figure 0007485642000013
 （構造１０３ｄ）。
本明細書中に開示した標的化リガンドを含む医薬組成物もまた開示する。
治療用オリゴマー化合物の投与により有益性をもたらすだろう疾患または障害を治療する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された治療用オリゴマー化合物を対象に投与することを含む該方法を開示する。
対象における標的核酸の発現を阻害する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物の治療量を投与することを含む該方法を本明細書中に開示する。
生体内で肝臓に発現阻害オリゴマー化合物を送達する方法であって、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物を対象に投与することを含む該方法を本明細書中に開示する。
本明細書中に使用される場合、「連結された」という用語は、二分子間の接続を指すとき、２つの分子が共有結合によってつなぎ合わせられているか、または２つの分子が非共有結合（例えば、水素結合またはイオン結合）を介して結合されていることを意味する。「連結された」という用語が非共有結合を介した二分子間の結合を指すいくつかの例では、２つの異なった分子間の結合は、生理学的に許容し得るバッファー（例えば、ホスファート緩衝生理食塩水）中で１×１０－４Ｍ未満（例えば、１×１０－５Ｍ未満、１×１０－６Ｍ未満、または１×１０－７Ｍ未満）のＫＤを有する。
本明細書中に使用される場合、「直接的に連結された」という用語は、あらゆる原子または原子群の介在なしに、第二の化合物または基に連結された第一の化合物または基を指す。本明細書中に使用される場合、「間接的に連結された」という用語は、例えば、連結基などの介在基、化合物、または分子によって第二の化合物または基に連結された第一の化合物を指す。特に明記しない限り、本明細書中で使用される「連結された」という用語は、それらの用語が本明細書中に規定されているように「直接的に連結された」と「間接的に連結された」の両方を含む。
本明細書中に使用される場合、「オリゴマー化合物」は、約１０～５０個のヌクレオチドまたはヌクレオチド塩基対を含むヌクレオチド配列である。いくつかの実施形態において、オリゴマー化合物は、細胞内で発現されている標的核酸または標的遺伝子内のコード配列に対して少なくとも部分的に相補的な核酸塩基配列を有する。いくつかの実施形態において、遺伝子を発現する細胞への送達時に、前記オリゴマー化合物は、原因となる遺伝子の発現を阻害することができるので、本明細書中で「発現阻害オリゴマー化合物」と呼ばれる。遺伝子発現は、インビトロであってもまたはインビボであっても阻害され得る。「オリゴマー化合物」としては、これだけに限定されるものではないが：オリゴヌクレオチド、一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子ヘアピン型ＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、リボザイム、干渉ＲＮＡ分子、およびダイサー基質、が挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「オリゴヌクレオチド」という用語は、そのそれぞれが独立に修飾されていても、または修飾されていなくてもよい連結されたヌクレオシドのポリマーを意味する。
本明細書中に使用される場合、「一本鎖オリゴヌクレオチド」という用語は、標的ｍＲＮＡに対して少なくとも部分的に相補的である、すなわち、哺乳動物の生理的条件（または、インビトロにおける匹敵した条件）下で水素結合形成によって標的ｍＲＮＡにハイブリダイズできる配列を有する一本鎖オリゴマー化合物を意味する。いくつかの実施形態において、一本鎖オリゴヌクレオチドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドである。
本明細書中に使用される場合、「ＲＮＡｉ剤」とは、配列特異的な様式で標的ｍＲＮＡのメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）転写産物の翻訳を低減するかまたは阻害することができるＲＮＡまたはＲＮＡ様（例えば、化学的に修飾されたＲＮＡ）オリゴヌクレオチド分子を含む剤を意味する。本明細書中に使用される場合、ＲＮＡｉ剤は、ＲＮＡ干渉機構を通して機能する（すなわち、哺乳動物細胞のＲＮＡ干渉経路機構（ＲＮＡ誘導型サイレンシング複合体またはＲＩＳＣ）との相互作用によりＲＮＡ干渉を引き起こす）か、または（単数もしくは複数の）任意の代替機構もしくは経路によって機能する。その用語が本明細書中に使用されるとき、ＲＮＡｉ剤が主にＲＮＡ干渉機構を通して機能していると考えられるが、開示したＲＮＡｉ剤は、ある特定の経路または作用機序に縛られたり、または制限されたりすることはない。ＲＮＡｉ剤としては、これだけに限定されるものではないが：一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子ヘアピン型ＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、およびダイサー基質が挙げられる。本明細書中に記載したＲＮＡｉ剤は、標的とされたｍＲＮＡに対して少なくとも部分的に相補的な鎖を有するオリゴヌクレオチドから成る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載したＲＮＡｉ剤は、二本鎖であって、かつ、アンチセンス鎖と該アンチセンス鎖に対して少なくとも部分的に相補的なセンス鎖から成る。ＲＮＡｉ剤は、修飾ヌクレオチド、および／または１若しくは複数の非ホスホジエステル結合から成ってもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載したＲＮＡｉ剤は一本鎖である。
本明細書中に使用される場合、「抑制」、「低減」、「阻害」、「下方制御」、または「ノックダウン」という用語は、所定の遺伝子の発現を指すとき、その中で該遺伝子が転写される細胞、細胞群、組織、臓器、または対象における遺伝子から転写されるＲＮＡのレベル、またはｍＲＮＡから翻訳されるポリペプチド、タンパク質またはタンパク質サブユニットのレベルによって計測される遺伝子の発現が、該細胞、細胞群、組織、臓器、または対象が本明細書中に記載した標的化リガンドに連結されたオリゴマー化合物を用いて治療されたときに、そうした治療を受けなかった第二の細胞、細胞群、組織、臓器、または対象と比較して、低減されることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「配列」または「ヌクレオチド配列」という用語は、標準的なヌクレオチド命名法を使用した文字の連なりを用いて記載した核酸塩基またはヌクレオチドの連なりまたは順序を意味する。
本明細書中に使用される場合であって、かつ、別段の指示がなければ、「相補的」という用語は、第二のヌクレオチド配列（例えば、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは二本鎖ＲＮＡｉ剤のアンチセンス鎖）と関連した第一のヌクレオチド配列（例えば、ＲＮＡｉ剤のセンス鎖または標的ｍＲＮＡ）を記載するのに使用されるとき、特定の条件下で、第二のヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドとハイブリダイズして（哺乳動物の生理的条件（または、インビトロにおける匹敵する条件）下で塩基対水素結合を形成して）、そして、二本鎖または二重らせん構造を形成する第一のヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドの能力を意味する。相補的配列は、ワトソンークリック塩基対または非ワトソンークリック塩基対を含み、かつ、天然もしくは修飾ヌクレオチド、または少なくともハイブリダイズする能力に関する上記要件を実現する範囲で、ヌクレオチド模倣体を含む。
本明細書中に使用される場合、「完璧に相補的」または「完全に相補的」とは、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべて（１００％）が第二のポリヌクレオチドの連続配列の同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。前記連続配列は、第一または第二のヌクレオチド配列のすべてまたは一部を含んでもよい。
本明細書中に使用される場合、「部分的に相補的」とは、ハイブリダイズした核酸塩基配列の対において、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべてではなく、少なくとも７０％が、第二のポリヌクレオチドの連続配列の同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「実質的に相補的」とは、ハイブリダイズした核酸塩基配列の対において、第一のポリヌクレオチドの連続配列の塩基のすべてではなく、少なくとも８５％が、第二のポリヌクレオチドの連続配列で同数の塩基にハイブリダイズすることを意味する。
本明細書中に使用される「相補的」、「完全に相補的」、および「実質的に相補的」という用語は、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖とアンチセンス鎖との間、二本鎖ＲＮＡｉ剤のアンチセンス鎖と標的ｍＲＮＡの配列との間、または一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的ｍＲＮＡの配列との間で合致する塩基に関して使用されてもよい。
本明細書中に使用される場合、「治療する」、「治療」などの用語は、対象の疾患の１若しくは複数の症状の数、重症度、および／または頻度からの解放またはそれらの緩和を提供するために採られた方法またはステップを意味する。
本明細書中に使用される場合、オリゴマー化合物を指すとき、「細胞内に導入」という語句は、細胞内にオリゴマー化合物を機能的に送達することを意味する。「機能的な送達」という語句は、前記オリゴマー化合物が期待された生物学的活性、例えば、遺伝子発現の配列特異的な阻害、を有することができる様式で該オリゴマー化合物を細胞に送達することを意味する。
特に明記がない限り、本明細書中で使用される記号
の使用は、（単数もしくは複数の）任意の基が本明細書中に記載した本発明の範囲によるものに連結され得ることを意味する。
本明細書中に使用される場合、「異性体」という用語は、同一の分子式を有するが、それらの原子の性質もしくは結合の並びまたは空間内のそれらの原子の配置が異なる化合物を指す。空間内のそれらの原子の配置が異なる異性体は「立体異性体」と呼ばれる。互いに鏡像でない立体異性体は「ジアステレオ異性体」と呼ばれ、そして、重ね合わせることができない鏡像である立体異性体は「鏡像異性体」、もしくは時には、光学異性体と呼ばれる。４つの非同一置換基に接着された炭素原子は「キラル中心」と呼ばれる。
本明細書中に使用される場合、そこで不斉中心が存在し、それによって、鏡像異性体、ジアステレオマー、または他の立体異性の立体配置を示す各構造に関して、特定の立体構造を有するとして構造が特異的に同定されることなしに、本明細書中に開示した各構造は、それらの光学的に純粋、かつ、ラセミ形態を含めた斯かるすべての見込まれる異性体を表すことを意図する。例えば、本明細書中に開示した構造は、ジアステレオマーの混合物、ならびにただ一つの立体異性体を網羅することを意図する。
「置換された」という用語は、本明細書中に使用される場合、示された原子、通常、炭素、酸素、または窒素原子上の任意の１若しくは複数の水素が、示された原子の標準イオン価を超えないことを条件として、本明細書中に規定される任意の基で置換され、そして、該置換が安定化合物をもたらすことを意味する。置換基の制限されることのない例としては、Ｃ１－Ｃ６アルキル、Ｃ２－Ｃ６アルケニル、Ｃ２－Ｃ６アルキニル、シアノ、ヒドロキシル、オキソ、カルボキシル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、アリール、ケト、アルコキシカルボニル、アリールオキシカルボニル、ヘテロアリールオキシカルボニル、またはハロ（例えば、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、Ｉ）が挙げられる。置換基がケトまたはオキソ（すなわち、＝Ｏ）であるとき、原子上の２つの（２）水素が置換される。環の二重結合は、本明細書中に使用される場合、２つの隣接している環原子（例えば、Ｃ＝Ｃ、Ｃ＝Ｎ、Ｎ＝Ｎなど）の間で形成される二重結合である。
本開示のいくつかの化合物は、本開示の範囲内に包含されることも意図する互変異性型で存在し得る。「互変異性体」とは、その構造が原子の配置において著しく異なるが、容易かつ急速な平衡状態で存在する化合物である。本開示の化合物が異なった互変異性体として示されてもよいことは、理解されるべきである。化合物が互変異性型を有するとき、すべての互変異性型が該開示の範囲内にあり、かつ、該化合物の名称があらゆる互変異性型を除外しないことを意図することもまた、理解されなければならない。
本開示の化合物および医薬的に許容され得る塩は、ケトン－エノール、アミド－ニトリル、ラクタム－ラクチム、ヘテロ環式環（例えば、核酸塩基グアニン、チミン、およびシトシン）のアミド－イミド酸互変異性、アミン－エナミンとエナミン－エナミン、および幾何異性体、ならびにその混合物を含めた１若しくは複数の互変異性型で存在し得る。グルコースと他の糖類によって示される環状鎖互変異性は、同じ分子内のヒドロキシ基（－ＯＨ）と反応して環（環形状）の形態をもたらす、糖鎖分子内のアルデヒド基（－ＣＨＯ）の結果として生じる。すべての斯かる互変異性型が本開示の範囲内に含まれる。互変異性体は、溶液中に互変異性セットの混合物として存在する。固体では、通例、１種類の互変異性体が支配的である。１種類の互変異性体が記載されたとしても、本開示は、本明細書中に開示した化合物のすべての互変異性体を含む。互変異性化により相互転換可能である互変異性体の概念は互変異性と呼ばれる。互変異性では、電子および水素原子の同時シフトが起こる。
互変異性化は：塩基：１．脱プロトン反応；２．脱局在化陰イオン（例えば、エノラート）の形成；３．陰イオンの異なった位置でのプロトン化；酸：１．プロトン化；２．脱局在化陽イオンの形成；３．陽イオンに隣接した異なった位置での脱プロトン反応、によって触媒される。
本明細書中に使用される場合、「アルキル」という用語は、別段の定めがない限り、１～１０個の炭素原子を有する、線状または分岐の、脂肪族飽和炭化水素基を指す。例えば、「Ｃ１－Ｃ６アルキル」としては、線状または分岐配置の、１、２、３、４、５、または６個の炭素を有するアルキル基が挙げられる。本明細書中に使用される場合、「アミノアルキル」という用語は、標準イオン価によって許容される１若しくは複数のアミノ基で任意の位置にて置換された、先に規定されたアルキル基を指す。前記アミノ基は、非置換であっても、一置換であっても、または二置換であってもよい。
本明細書中に使用される場合、「シクロアルキル」という用語は、別段の定めがない限り、３～１４個の炭素原子を有する飽和または不飽和の非芳香族炭化水素環基を意味する。シクロアルキルの例としては、これだけに限定されるものではないが、シクロプロピル、メチルシクロプロピル、２，２－ジメチル－シクロブチル、２－エチル－シクロペンチル、シクロヘキシルなどが挙げられる。シクロアルキルは、複数のスピロ環または融合環を含んでもよい。シクロアルキル群は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「アルケニル」という用語は、別段の定めがない限り、少なくとも１つの炭素－炭素二重結合を含み、２～１０個の炭素原子を有する、線状または分岐の非芳香族炭化水素基を指す。最大５つの炭素－炭素二重結合が、斯かる群に存在し得る。例えば、「Ｃ２－Ｃ６」アルケニルは、２～６個の炭素原子を有するアルケニルラジカルと規定される。アルケニルの例としては、これだけに限定されるものではないが、エテニル、プロペニル、ブテニル、およびシクロヘキセニルが挙げられる。アルケニル基の線状、分岐、または環状部分は、二重結合を含んでもよく、および標準イオン価によって許容される任意の位置にて任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される、または五置換される。「シクロアルケニル」という用語は、特定の数の炭素原子および少なくとも１つの炭素－炭素二重結合を有する単環式炭化水素基を意味する。
本明細書中に使用される場合、「アルキニル」という用語は、別段の定めがない限り、２～１０個の炭素原子を含み、および少なくとも１つの炭素－炭素三重結合を含む、線状または分岐の、炭化水素基を指す。最大５つの炭素－炭素三重結合が存在してもよい。よって、「Ｃ２－Ｃ６アルキニル」は、２～６個の炭素原子を有するアルキニルラジカルを意味する。アルキニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、エチニル、２－プロピニル、および２－ブチニルが挙げられる。アルキニル基の線状または分岐部分は、標準イオン価によって許容される三重結合を含んでもよく、そして、標準イオン価によって許容される任意の位置にて任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「アルコキシル」または「アルコキシ」は、酸素架橋によって取り付けられた示された数の炭素原子を伴った、先に規定されるアルキル基を指す。Ｃ１－６アルコキシは、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５、およびＣ６アルコキシ基を含むことが意図される。Ｃ１－８アルコキシは、Ｃ１、Ｃ２、Ｃ３、Ｃ４、Ｃ５、Ｃ６、Ｃ７、およびＣ８アルコキシ基を含むことが意図される。アルコキシの例としては、これだけに限定されるものではないが、メトキシ、エトキシ、ｎ－プロポキシ、ｉ－プロポキシ、ｎ－ブトキシ、ｓ－ブトキシ、ｔ－ブトキシ、ｎ－ペントキシ、ｓ－ペントキシ、ｎ－ヘプトキシ、およびｎ－オクトキシが挙げられる。本明細書中に使用される場合、「ケト」とは、カルボニル架橋によって取り付けられた本明細書中に規定される、任意のアルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクリル、ヘテロアリール、またはアリール基を指す。ケト基の例としては、これだけに限定されるものではないが、アルカノイル（例えば、アセチル、プロピオニル、ブタノイル、ペンタノイル、ヘキサノイル）、アルケノイル（例えば、アクリロイル）、アルキノイル（例えば、エチノイル、プロピノイル、ブチノイル、ペンチノイル、ヘキシノイル）、アリーロイル（例えば、ベンゾイル）、ヘテロアリーロイル（例えば、イミダゾロイル、キノリノイル、ピリジノイル、ピロロイル）が挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アルコキシカルボニル」は、カルボニル架橋（すなわち、－Ｃ（Ｏ）Ｏ－アルキル－）によって取り付けられた、先に規定される任意のアルコキシ基を指す。アルコキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、イソ－プロポキシカルボニル、ｎ－プロポキシカルボニル、ｔ－ブトキシカルボニル、ベンジルオキシカルボニルまたはｎ－ペントキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アリールオキシカルボニル」は、オキシカルボニル架橋（すなわち、－Ｃ（Ｏ）Ｏ－アリール－）によって取り付けられた、本明細書中に規定される任意のアリール基を指す。アリールオキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、フェノキシカルボニルおよびナフチルオキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「ヘテロアリールオキシカルボニル」は、オキシカルボニル架橋（すなわち、－Ｃ（Ｏ）Ｏ－ヘテロアリール－）によって取り付けられた、本明細書中に規定される任意のヘテロアリール基を指す。ヘテロアリールオキシカルボニル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、２－ピリジルオキシカルボニル、２－オキサゾリルオキシカルボニル、４－チアゾリルオキシカルボニル、またはピリミジニルオキシカルボニルが挙げられる。
本明細書中に使用される場合、「アリール」または「芳香族」とは、その中の少なくとも１つの環が芳香族である、各環に最大７つの原子から成る任意の安定した単環式または多環式炭素環である。アリール基の例としては、これだけに限定されるものではないが、フェニル、ナフチル、アントラセニル、テトラヒドロナフチル、インダニル、およびビフェニルが挙げられる。アリール置換基が二環式であり、１つの環が非芳香族である場合では、取り付けには芳香族環を介していることが理解される。アリール基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「ヘテロアリール」という用語は、その中の少なくとも１つの環が芳香族であり、およびＯ、Ｎ、およびＳから成る群から選択される１～４個のヘテロ原子を含む、各環に最大７つの原子から成る安定した単環式または多環式環である。ヘテロアリール基の例としては、これだけに限定されるものではないが、アクリジニル、カルバゾリル、シンノリニル、キノキサリニル、ピロラゾリル、インドリル、ベンゾトリアゾリル、フラニル、チエニル、ベンゾチエニル、ベンゾフラニル、ベンズイミダゾロニル、ベンズオキサゾロニル、キノリニル、イソキノリニル、ジヒドロイソインドロニル、イミダゾピリジニル、イソインドロニル、インダゾリル、オキサゾリル、オキサジアゾリル、イソキサゾリル、インドリル、ピラジニル、ピリダジニル、ピリジニル、ピリミジニル、ピロリル、テトラヒドロキノリンが挙げられる。「ヘテロアリール」はまた、任意の含窒素ヘテロアリールのＮ－オキシド誘導体を含むこともまた理解される。ヘテロアリール置換基が二環式であり、１つの環が非芳香族であるかまたはヘテロ原子を含まない場合では、取り付けには芳香族環を介するか、またはヘテロ原子含有環を介することが理解される。ヘテロアリール基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
本明細書中に使用される場合、「複素環化合物」、「複素環式」または「ヘテロシクリル」という用語は、多環式基を含めた、Ｏ、Ｎ、およびＳから成る群から選択される１～４つのヘテロ原子を含有する３～１４員の芳香族または非芳香族複素環を意味する。本明細書中に使用される場合、「複素環式」という用語もまた、用語「複素環化合物」および「ヘテロシクリル」と同義であると見なされ、本明細書中に記載した同じ定義を有すると理解される。「ヘテロシクリル」は、上記のヘテロアリールだけでなく、そのジヒドロおよびテトラヒドロ類似体も含む。ヘテロシクリル基の例としては、これだけに限定されるものではないが、そのアゼチジニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾフラザニル、ベンゾピラゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾチオフェニル、ベンゾオキサゾリル、カルバゾリル、カルボリニル、シンノリニル、フラニル、イミダゾリル、インドリニル、インドリル、インドラジニル、インダゾリル、イソベンゾフラニル、イソインドリル、イソキノリル、イソチアゾリル、イソキサゾリル、ナフトピリジニル、オキサジアゾリル、オキソオキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾリン、オキソピペラジニル、オキソピペリジニル、オキソモルホリニル、イソキサゾリン、オキセタニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドピリジニル、ピリダジニル、ピリジル、ピリジノニル、ピリミジル、ピリミジノニル、ピロリル、キナゾリニル、キノリル、キノキサリニル、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオピラニル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラゾリル、テトラゾロピリジル、チアジアゾリル、チアゾリル、チエニル、トリアゾリル、１、４－ジオキサニル、ヘキサヒドロアゼピニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピリジン－２－オニル、ピロリジニル、モルホリニル、チオモルホリニル、ジヒドロベンゾイミダゾリル、ジヒドロベンゾフラニル、ジヒドロベンゾチオフェニル、ジヒドロベンズオキサゾリル、ジヒドロフラニル、ジヒドロイミダゾリル、ジヒドロインドリル、ジヒドロイソキサゾリル、ジヒドロイソチアゾリル、ジヒドロオキサジアゾリル、ジヒドロオキサゾリル、ジヒドロピラジニル、ジヒドロピラゾリル、ジヒドロピリジニル、ジヒドロピリミジニル、ジヒドロピロリル、ジヒドロキノリニル、ジヒドロテトラゾリル、ジヒドロチアジアゾリル、ジヒドロチアゾリル、ジヒドロチエニル、ジヒドロトリアゾリル、ジヒドロアゼチジニル、ジオキシドチオモルホリニル、メチレンジオキシベンゾイル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、およびＮ－オキシドが挙げられる。ヘテロシクリル置換基の取り付けは、炭素原子を介して、またはヘテロ原子を介して起こり得る。ヘテロシクリル基は、標準イオン価によって許容される任意の位置にて、任意選択で一置換、二置換、三置換、四置換、または五置換される。
当業者は、本明細書中に開示した化合物および組成物が、該化合物または組成物が置かれる環境によってプロトン化または脱プロトン化状況で特定の原子（例えば、Ｎ、Ｏ、またはＳ原子）を有することを容易に理解するかまたは認識するであろう。従って、本明細書中に使用される場合、本明細書中に開示した構造は、例えば、ＯＨ、ＳＨ、またはＮＨなどの特定の官能基がプロトン化または脱プロトン化され得ると想定する。本明細書中の開示は、当業者によって容易に理解されるように、環境のｐＨに基づくプロトン化の状況にかかわらず開示した化合物および組成物を網羅することを意図する。
本明細書中の請求項で使用される場合、「から成る」という語句は、請求項で指定されていないあらゆる成分、ステップ、または構成要素を除外する。
本明細書中の請求項で使用されるとき、「から実質的に成る」という語句は、請求項の範囲を、指定された材料またはステップ、および請求項に記載されている発明の（単数もしくは複数の）基本的および新規特徴に物質的に影響しないものに限定する。
別段の規定がない限り、本明細書中に使用されるすべて技術用語および学術用語は、本願発明が属する技術分野の当業者により通常理解されるものと同じ意味を有する。本明細書中に記載した方法および材料に類似したもしくはそれと同等な方法および材料は、本発明の実施または試験において使用することができるが、好適な方法および材料が以下に記載されている。本明細書中で言及されたすべての刊行物、特許出願、特許および他の参照文献は、それらの全体が参照によって本明細書中に援用される。矛盾する場合には、定義を含めた本明細書が支配するであろう。加えて、材料、方法、および実施例は、単なる例証であり、限定することを意図するものではない。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明、および請求項から明らかであろう。
図１は、（実施例１で以下に記載されている）化合物３の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図２は、（実施例１で以下に記載されている）化合物４の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図３は、（実施例１で以下に記載されている）化合物６の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図４は、（実施例１で以下に記載されている）化合物７の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図５は、（実施例１で以下に記載されている）化合物９の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図６は、化合物１０（本明細書中の構造１０１ｄであり、実施例１で以下に記載されている）の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図７は、化合物１３（本明細書中の構造１０３ｄであり、実施例２で以下に記載されている）の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図８は、化合物１６（本明細書中の構造１０２ｄであり、実施例３で以下に記載されている）の１Ｈ ＮＭＲスペクトルである。 図９は、構造１０３ｄ（実施例５で以下に記載されている）に結合されたＡＭ０３７０４のＨＰＬＣクロマトグラフである。 図１０は、構造１０１ｄ（実施例５で以下に記載されている）に結合されたＡＭ０３７０４のＨＰＬＣクロマトグラフである。 図１１は、構造１０２ｄ（実施例５で以下に記載されている）に結合されたＡＭ０３７０４のＨＰＬＣクロマトグラフである。 図１２は、（実施例６で以下に記載されている）野性型マウスにおける正規化マウス第１２因子（ｍＦ１２）タンパク質レベルを例示するグラフである。 図１３は、（実施例７で以下に記載されている）野性型マウスにおける正規化マウス第１２因子（Ｆ１２）タンパク質レベルを例示するグラフである。 図１４は、（実施例８で以下に記載されている）Ｌｐ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスにおける正規化リポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））粒子レベルを例示するグラフである。 図１５は、（実施例９で以下に記載されている）Ｌｐ（ａ）Ｔｇマウスにおける正規化リポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））粒子レベルを例示するグラフである。 図１６は、（実施例１０で以下に記載されている）ａｐｏ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスにおける正規化ａｐｏ（ａ）レベルを例示するグラフである。 図１７は、（実施例１２で以下に記載されている）カニクイザルにおける正規化ｃＦ１２タンパク質レベルを例示するグラフである。 図１８は、（実施例１３で以下に記載されている）ＰｉＺトランスジェニックマウスにおける正規化ＡＡＴ（Ｚ－ＡＡＴ）タンパク質レベルを例示するグラフである。 図１９は、（実施例１４で以下に記載されている）野性型マウスにおける正規化マウス第１２因子（Ｆ１２）タンパク質レベルを例示するグラフである。
詳細な説明
治療用または診断用の発現阻害オリゴマー化合物などの化合物に連結された新規標的化リガンドを本明細書中に記載する。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された化合物は、ＲＮＡｉ剤である治療化合物を含むか、またはそれらから成る。前記標的化リガンドは、所望の位置の標的核酸または標的遺伝子に対して治療化合物を標的化するために使用できる。標的化リガンドおよび治療化合物を含む組成物、例えば標的化リガンドおよび発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る組成物などもまた、本明細書中に記載する。
本明細書中に開示した新しい標的化リガンドは、効果的な標的化もしくは生体分布、インビボもしくはインビトロにおける十分な安定性を提供し、かつ、製造のコストおよび負担を低減する、ホスホラミダイトとしての合成に好適であり、かつ、ＲＮＡｉ剤などの発現阻害オリゴマー化合物に連結された以前に検討された標的化リガンドを上回る有効性を高め得る。
標的化リガンド
標的化リガンドは、１若しくは複数の標的化基または標的化部分から成り、そしてそれは、それらが連結された化合物の薬物動力学的または生体分布特性を高める、および該複合化組成物の細胞もしくは組織特異的分配または細胞特異的取り込みを改善するのに役立つ可能性がある。一般に、標的化リガンドは、それに連結された治療化合物の、所望の標的部位への送達を誘導する際の助けとなる。場合によっては、標的化部分は、細胞または細胞受容体に結合して、該治療化合物の細胞内への侵入を容易にするためにエンドサイトーシスを開始し得る。標的化部分としては、細胞受容体、細胞表面分子または抗体に対して親和性を有する化合物を挙げることができる。標的化部分を含むさまざまな標的化リガンドが、細胞および特定の細胞受容体に剤を標的化するために治療薬および他の化合物に連結され得る。標的化部分のタイプとしては、炭水化物、コレステロールおよびコレステリル基、ならびにステロイドが挙げられる。細胞受容体に結合できる標的化部分としては、ガラクトース、ガラクトース誘導体（Ｎ－アセチル－ガラクトサミンなど）、マンノース、およびマンノース誘導体などのサッカリド；他の炭水化物；グリカン；ハプテン；ビタミン；フォラート；ビオチン；アプタマー；ならびに、例えばＲＧＤ含有ペプチド、インスリン、ＥＧＦ、およびトランスフェリンなどのペプチドが挙げられる。
アシアロ糖タンパク受容体（ＡＳＧＰＲ）に結合することが知られている標的化部分は、肝臓へのオリゴマー化合物の送達を誘導する際に特に有用である。アシアロ糖タンパク受容体は、肝細胞を含めた肝臓細胞において豊富に発現される。ＡＳＧＰＲを標的化する細胞受容体標的化部分としては、ガラクトースおよびガラクトース誘導体が挙げられる。特に、２、３、または４つのＮ－アセチル－ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃまたはＮＡＧ）から成るクラスタを含むガラクトース誘導体のクラスタは、肝臓細胞内への特定の化合物の取り込みを容易にできる。オリゴマー化合物に結合されたＧａｌＮＡｃクラスタは、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン糖が肝臓細胞の表面のアシアロ糖タンパク受容体に結合できる肝臓に組成物を誘導するのに役立つ。アシアロ糖タンパク受容体への結合は、受容体介在性エンドサイトーシスを開始し、それによって、該化合物の細胞内への侵入が容易になると考えられる。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、１、２、３、４、または４つより多くの標的化部分を含んでもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された１、２、３、４、または４つより多くの標的化部分を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された１、２、３、４、または４つより多くの標的化部分を含み得、ここで、それぞれの標的化部分がテザーを介して分岐点基に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、分岐点基に連結された１、２、３、４、または４つより多くのアシアロ糖タンパク受容体（ＡＳＧＰＲ）標的化部分を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、
分岐点基に連結された１、２、３、４、または４つより多くのＡＳＧＰＲの標的化部分を含み得、ここで、それぞれのＡＳＧＰＲ標的化部分がテザーを介して分岐点基に連結される。
本明細書中に記載した標的化リガンドは、以下の式Ｉによって表される：
｛式中、ｎは、１～４の整数（例えば、１、２、３または４）である｝（式Ｉ）。いくつかの実施形態において、式Ｉのｎは１～３、１～２、２～４、２～３、または３～４の整数である。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、オリゴマー化合物などの治療化合物に連結され得る。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、追加リンカーおよび／または切断可能部分を介して治療化合物に連結され、そしてそれは、次に、治療化合物に連結される。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、治療化合物自体に結合される。
いくつかの実施形態において、前記治療化合物は、発現阻害オリゴマー化合物である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、ＲＮＡｉ剤である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖ＲＮＡｉ剤である。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の３’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のアンチセンス鎖の５’末端または３’末端に直接的または間接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、一本鎖ＲＮＡｉ剤の５’末端または３’末端に直接的または間接的に連結される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の末端ヌクレオシドの５’末端にて、ホスファート基、ホスホナート基、ホスホロチオアート基、または他のヌクレオシド間連結基を介して二本鎖ＲＮＡｉ剤に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、切断可能部分を含む。いくつかの実施形態において、切断可能部分は、ホスファート基または切断され得る他のヌクレオシド間連結基を含むか、またはそれらから成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、切断可能部分を介して治療化合物に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、追加基または切断可能部分を含む基に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、切断可能部分に連結され、そしてそれは、次に、発現阻害オリゴマー化合物に連結される。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、ホスホラミダイト化合物（本明細書中で「ホスホラミダイト含有化合物」とも呼ばれる）である。本明細書中に記載した標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、ホスホラミダイト合成について当該技術分野で一般的に知られている方法を使用して、治療化合物または他の基に標的化リガンドを容易に取り付けるのに有用であり得る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物は、当該技術分野で一般的に知られている方法を使用して、発現阻害オリゴマー化合物に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンド含有ホスホラミダイトは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に連結される。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドに連結される発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、一本鎖オリゴヌクレオチドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドに直接的に連結される。いくつかの実施形態において、追加基は、標的化リガンドと一本鎖オリゴヌクレオチドの間に挿入される。
いくつかの実施形態において、ＲＮＡｉ剤に連結される標的化リガンドは、標的化部分または標的化部分として１若しくは複数のＮ－アセチル－ガラクトサミン糖を含む。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドは、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を含めたテザーを含む。いくつかの実施形態において、テザーはＰＥＧから成る。いくつかの実施形態において、テザーは、１～１０個のエチレングリコール単位を有するＰＥＧを含む。いくつかの実施形態において、テザーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０個のエチレングリコール単位を有するＰＥＧを含む。
いくつかの実施形態において、ＲＮＡｉ剤に連結される標的化リガンドは、リンカーとしてのポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を含む。いくつかの実施形態において、前記リンカーはＰＥＧを含む。いくつかの実施形態において、前記リンカーはＰＥＧから成る。いくつかの実施形態において、リンカーは、１～２０個のエチレングリコール単位を有するＰＥＧを含む。いくつかの実施形態において、テザーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のエチレングリコール単位を有するＰＥＧを含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した任意の標的化リガンドに連結される発現阻害オリゴマー化合物は、ＲＮＡｉ剤を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、直接的または間接的に、ＲＮＡｉ剤に連結される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、ＲＮＡｉ剤に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、（単数もしくは複数の）追加基がＲＮＡｉ剤と標的化リガンドのリンカーとの間に挿入される場合、間接的にＲＮＡｉ剤に連結される。いくつかの実施形態において、第二のリンカーは、前記リンカーと治療化合物との間に含まれる。
標的化リガンド構造、および標的化リガンドを含むホスホラミダイト化合物。
本明細書中に開示した標的化リガンドは、１若しくは複数の標的化部分、テザー、分岐点基、およびリンカーから成り得る。本明細書中に開示した標的化リガンドは、１、２、３、４、または４つより多くの標的化部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、ホスホラミダイト化合物の形態となるように合成される。ホスホラミダイトは、ＲＮＡおよびＤＮＡの化学合成において広く使用される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示したホスホラミダイト含有標的化リガンドは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に加えられる。前記標的化リガンドが発現阻害オリゴマー化合物の５’末端に連結されるべきとき、ホスホラミダイトとして標的化リガンドを調製することは、特に有利であり得る。理論によって拘束されることを望むものではないが、ホスホラミダイトとして前記標的化リガンドを調製することは、該標的化リガンドが発現阻害オリゴマー化合物の５’末端に連結されるとき、最後の成分としての標的化リガンドの連結を許容する（それによって、製造コストを削減する）だけでなく、ならびに該標的化リガンドが二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に取り付けられるとき、標的化リガンドがＲＩＳＣ内へのセンス鎖の添加を潜在的に遮断することを可能にすることが理解される。発現阻害オリゴマー化合物が二本鎖ＲＮＡｉ剤であるとき、前記標的化リガンドは、該標的化リガンドがＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に連結されるべきとき、ホスホラミダイト化合物として調製され得る。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、以下の式Ｂによって表される：
Figure 0007485642000016
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数であり；Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨであり；および標的化部分は、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、またはＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミンから成る群から選択される｝（式Ｂ）。いくつかの実施形態において、ｎは６である。いくつかの実施形態において、ｎは８である。いくつかの実施形態において、ｎは４である。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000017
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）である｝（構造１）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、構造１｛式中、ｎ＝６｝によって表される構造を有する。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、構造１｛式中、ｎ＝８｝によって表される構造を有する。いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、構造１｛式中、ｎ＝４｝によって表される構造を有する。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000018
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１ａ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000019
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000020
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１ｃ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000021
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）である｝（構造１ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を含むか、またはそれらから成る：
Figure 0007485642000022
 （構造１０１）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000023
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０１ａ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000024
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０１ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000025
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０１ｃ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000026
 （構造１０１ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を含むか、またはそれらから成る：
Figure 0007485642000027
 （構造１０２）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000028
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０２ａ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000029
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０２ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000030
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０２ｃ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000031
 （構造１０２ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を含むか、またはそれらから成る：
Figure 0007485642000032
 （構造１０３）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000033
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物を含むか、またはそれらから成る｝（構造１０３ａ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000034
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０３ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000035
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含む｝（構造１０３ｃ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000036
 （構造１０３ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000037
 （構造２）。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000038
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み；Ａは、ＯまたはＳであり；およびＡ’は、Ｏ－、Ｓ－、またはＮＨ－である｝（構造２ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000039
 （構造２ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000040
 （構造３）。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000041
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み；Ａは、ＯまたはＳであり；およびＡ’は、Ｏ－、Ｓ－、またはＮＨ－である｝（構造３ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000042
 （構造３ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000043
 （構造４）。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000044
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み；Ａは、ＯまたはＳであり；およびＡ’は、Ｏ－、Ｓ－、またはＮＨ－である｝（構造４ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000045
 （構造４ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000046
 （構造５）。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000047
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み；Ａは、ＯまたはＳであり；およびＡ’は、Ｏ－、Ｓ－、またはＮＨ－である｝（構造５ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000048
 （構造５ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000049
 （構造６）。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、標的化リガンドに連結されていて、かつ、次の構造式によって表される構造を有する：
Figure 0007485642000050
 ｛式中、Ｚは、発現阻害オリゴマー化合物から成るか、またはそれらを含み；Ａは、ＯまたはＳであり；およびＡ’は、Ｏ－、Ｓ－、またはＮＨ－である｝（構造６ｂ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造式によって表される構造を有するホスホラミダイト含有化合物である：
Figure 0007485642000051
 （構造６ｄ）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、ガラクトースクラスタの形態である。本明細書中に使用される場合、ガラクトースクラスタリングは、２～４つの末端ガラクトース誘導体を有する標的化リガンドを含む。本明細書中に使用される場合、ガラクトース誘導体という用語は、ガラクトースのそれと同等かまたはそれを越えるアシアロ糖タンパク受容体に対する親和性を有する、ガラクトースおよびガラクトース誘導体の両方を含む。ガラクトース誘導体は、一種の標的化部分であるサッカリド糖である。末端ガラクトース誘導体は、サッカリドのＣ－１炭素を通してテザーに連結されてもよい。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する３つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体（Ｎ－アセチル－ガラクトサミンなど）から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として３つの末端Ｎ－アセチル－ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃまたはＮＡＧ）を含む。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する４つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体（Ｎ－アセチル－ガラクトサミンなどの）から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として４つの末端Ｎ－アセチル－ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃまたはＮＡＧ）を含む。
いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分は、ガラクトサミン誘導体、すなわち、Ｎ－アセチル－ガラクトサミンを含む。標的化部分として使用され得る、アシアロ糖タンパク受容体に対して親和性を有する他のサッカリドは：ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、およびＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミン、を含めた一覧から選択され得る。アシアロ糖タンパク受容体に対する多くのガラクトース誘導体の親和性は、研究されているか（例えば：Iobst, S.T. and Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686を参照）、または当該技術分野で周知の、一般的に使用される方法を使用して容易に測定される。
３つの末端Ｎ－アセチル－ガラクトサミンを指すとき、当該技術分野で一般的に使用される用語としては、三分岐型（tri-antennary）、三価、および三量体が挙げられる。
リンカー
本明細書中に開示した標的化リガンドは、リンカーを含む。
前記リンカーは、片端で分岐点基に連結され、およびもう一方の末端で治療化合物に（または、該標的化リガンドがホスホラミダイト化合物として合成されるとき、ホスホラミダイト形成試薬を用いた亜ホスファート化反応によってホスホラミダイトのリン原子に）連結される原子群である。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、片端で分岐点基に連結され、および次に発現阻害オリゴマー化合物に結合される（単数もしくは複数の）基にもう一方の末端で結合される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、オリゴマー化合物に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結され、そしてそれは、次に、オリゴマー化合物に連結される。切断可能部分の例としては、これだけに限定されるものではないが、例えば、ホスファート基、ジスルフィド部分を含めた基、および／または切断され得る他のヌクレオシド間結合が挙げられる。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結されない。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、ホスホロチオアート基またはホスホナート基に連結される。
いくつかの実施形態において、前記リンカーは、ポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）部分から成るか、またはそれらを含む。リンカー内へのＰＥＧ部分の組み込みは、置換または非置換アルキル鎖から成るかまたはそれらを含むリンカーなどの他の特定のリンカーを上回る有利な特性を与える。例えば、リンカー内へのＰＥＧ部分の組み込みは、アルキル鎖リンカーを含む化合物と比較して、ヌクレオチド合成に一般的に使用される溶媒中の標的化リガンド含有ホスホラミダイト化合物の溶解性を増強し、そしてそれは、簡易化された製造プロセスをもたらし得る。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するリンカーを含む：
Figure 0007485642000052
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）である｝（構造１００１）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するホスファート基に連結されるリンカーを含む：
Figure 0007485642000053
 ｛式中、ｎは、１～２０から選択される整数である｝（構造１００２）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するホスホロチオアート基に連結されるリンカーを含む：
Figure 0007485642000054
 ｛式中、ｎは、１～２０から選択される整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０）である｝（構造１００３）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するリンカーを含む：
Figure 0007485642000055
 （構造１００４）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するホスファート基に連結されるリンカーを含む：
Figure 0007485642000056
 （構造１００５）。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、次の構造を有するホスホロチオアート基に連結されるリンカーを含む：
Figure 0007485642000057
 （構造１００６）。
いくつかの実施形態において、前記リンカーは発現阻害オリゴマー化合物、すなわち、二本鎖ＲＮＡｉ剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖の３’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のアンチセンス鎖の３’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記リンカーは、二本鎖ＲＮＡｉ剤のアンチセンス鎖の５’末端に連結される。
いくつかの実施形態において、前記リンカーは、切断可能部分に連結される。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物の末端のホスファート基は、切断可能部分として役立ち得る。いくつかの実施形態において、独立に選択される切断可能部分は、リンカーに連結される。本明細書中に使用される場合、切断可能部分は、細胞外で安定しているが、標的細胞内に入ると切断される基である。切断可能部分は、例えばｐＨなどの特定の条件下で、または分解を促進する分子－もしくはレドックス剤などの特定の切断剤の切断を受けやすい。
いくつかの実施形態において、前記切断可能部分は、ｐＨの影響を受けやすい可能性がある。例えば、エンドソームおよびリソソームは、一般的に、ヒト血液（約７．３５～７．４５のｐＨ）より高い酸性のｐＨ（約４．５～６．５のｐＨ）を有することが知られており、そのことが切断可能部分の切断を促進し得る。
いくつかの実施形態において、切断可能部分はホスファート基である。ホスファート基は、ホスファート基を分解するかまたは加水分解することが知られている剤によって切断され得る。
分岐点基
本明細書中に開示した標的化リガンドは、少なくとも１つの分岐点基を含む。本明細書中に開示した標的化リガンドの分岐点基は、リンカーに取り付けられる。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドの分岐点基は、片端でリンカーに連結され、および分岐点基は（単数もしくは複数の）他の末端で１若しくは複数のテザーに連結される。いくつかの実施形態において、前記分岐点基は、リンカーおよび１若しくは複数のテザーに取り付けられる。いくつかの実施形態において、前記分岐点基は、発現阻害オリゴマー化合物に間接的に（例えば、リンカーを介して）取り付けられる。いくつかの実施形態において、前記分岐点基は、（単数もしくは複数の）追加基を介して発現阻害オリゴマー化合物に連結される。
本明細書中に開示した分岐点基は、１若しくは複数の標的化部分の取り付けを許容し、さらにリンカーへの取り付けを許容する任意の基である。
本明細書中に開示した分岐点基は、２、３、または４個のガラクトース誘導体の取り付けを許容し、さらに分岐点のリンカーへの取り付けを許容する任意の基である。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有する分岐点を含む：
Figure 0007485642000058
 （構造２００１）、
Figure 0007485642000059
 （構造２００２）。
テザー
本明細書中に開示した標的化リガンドは、１若しくは複数のテザーを含む。テザーは、分岐点基とそれぞれの標的化部分との間に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で標的化リガンドに直接的に、およびもう一方の末端で分岐点基に直接的に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で直接的に標的化リガンドに、およびもう片方の末端で間接的に分岐点基に連結される。いくつかの実施形態において、前記テザーは、片端で標的化リガンドに間接的に、およびもう一方の末端で分岐点基に間接的に連結される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、３つのテザーおよび３つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、４つのテザーおよび４つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、１つのテザーおよび１つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した標的化リガンドは、複数のテザーおよび複数の標的化部分を含む。
いくつかの実施形態において、追加テザーまたは他の基が、前記テザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二のテザーが、テザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二のテザーと第三のテザーが、テザーと標的化部分との間に挿入される。いくつかの実施形態において、第二、第三、および第四のテザーが、テザーと標的化部分との間に挿入される。本明細書中に開示される場合、あらゆる標的化部分に関して少なくとも１つのテザーが存在する。いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分に関して２つ以上のテザーが存在する。本明細書中に開示した標的化リガンドは、斯かる組成物を網羅することを意図している。
いくつかの実施形態において、追加基が、テザーと分岐点基との間に挿入され得る。
本明細書中に開示される場合、前記テザーは、標的化部分と、分岐点基、リンカー、および治療化合物との間の連結にさらなる柔軟性および／または長さを加え得るスペーサーとして役立つ。いくつかの実施形態において、テザーとしては、アルキル基（シクロアルキル基を含む）、アルケニル基（シクロアルケニル基を含む）、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、またはアラルキニル基が挙げられる。いくつかの実施形態において、前記テザーとしては、１若しくは複数のヘテロ原子、複素環化合物、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、またはサッカリドが挙げられる。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000060
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０）であり、そして、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨである｝（構造３０１）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000061
 ｛式中、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨ－である｝（構造３０２）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000062
 （構造３０２ａ）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000063
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０）であり、およびＸは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨである｝（構造３０３）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000064
 ｛式中、ｎは、１～２０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０）であり、およびＸは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨである｝（構造３０４）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000065
 ｛式中、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨである｝（構造３０５）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、次の構造を有するテザーを含む：
Figure 0007485642000066
 ｛式中、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＨである｝（構造３０６）。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、２つ以上のテザーのタイプを含む。いくつかの実施形態において、前記テザーは、フレキシブル親水性スペーサー（例えば、Ｕ．Ｓ．５，８８５，９６８；およびBiessen et al. J. Med. Chem. 1995, 39, 1538-1546、その両方を全体として参照により本明細書中に援用する）として機能し、そして、ＰＥＧスペーサーを含む。他の実施形態において、前記ＰＥＧスペーサーは、１～２０個のエチレン単位（ＰＥＧ１～ＰＥＧ２０）を有する。例えば、前記ＰＥＧスペーサーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個のエチレン単位を有する。
標的化部分：
本明細書中に開示した標的化リガンドは、１～４、または４つより多くの標的化部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、標的化リガンドは、ガラクトースクラスタであってもよい。本明細書中に使用される場合、ガラクトースクラスタリングは、２～４つの末端ガラクトース誘導体を有する標的化リガンドを含む。本明細書中に使用される場合、ガラクトース誘導体という用語は、ガラクトースのそれと同等かまたはそれを越えるアシアロ糖タンパク受容体に対する親和性を有する、ガラクトースおよびガラクトース誘導体の両方を含む。ガラクトース誘導体は、一種の標的化部分であるサッカリド糖である。末端ガラクトース誘導体は、サッカリドのＣ－１炭素を通してテザーに連結される。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、アシアロ糖タンパク受容体に対してそれぞれ親和性を有する３つの末端ガラクトサミンまたはガラクトサミン誘導体（Ｎ－アセチル－ガラクトサミンなど）から成る。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、標的化部分として３つの末端Ｎ－アセチル－ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃまたはＮＡＧ）を含む。
例えば、構造１、１０１、１０２、および１０３のそれぞれは、標的化部分としての３つの末端Ｎ－アセチル－ガラクトサミンを有する標的化リガンドである。
いくつかの実施形態において、それぞれ標的化部分は、ガラクトサミン誘導体、すなわち、Ｎ－アセチル－ガラクトサミンを含む。標的化部分として使用され得る、アシアロ糖タンパク受容体に対して親和性を有する他のサッカリドは：ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、およびＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミン、を含めた一覧から選択され得る。アシアロ糖タンパク受容体に対する多くのガラクトース誘導体の親和性は、研究されているか（例えば：Iobst, S.T. and Drickamer, K. J.B.C. 1996, 271, 6686を参照、それを全体として参照により本明細書に援用する）、または当該技術分野で周知の、一般的に使用される方法を使用して容易に測定される。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、細胞を標的化する部分である。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、Ｎ－アセチル－ガラクトサミンを含む：
Figure 0007485642000067
 ／
Figure 0007485642000068
 。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、３つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、４つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、１つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、２つの標的化部分を含む。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、４つ以上の標的化部分を含む。
いくつかの実施形態において、前記標的化部分は、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、またはＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミンのうちの１もしくは複数を含む。
例えば、いくつかの実施形態において、構造１～６のいずれかのＮ－アセチル－ガラクトサミン標的化部分は、代替の標的化部分で置換され得る。いくつかの実施形態において、構造１０１、１０２または１０３のいずれかのＮ－アセチル－ガラクトサミン標的化部分は、代替の標的化部分で置換され得る。斯かる代替の標的化部分としては、例えば、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ－ホルミル－ガラクトサミン、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン、Ｎ－プロピオニル－ガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブタノイルガラクトサミン、またはＮ－イソ－ブタノイルガラクトサミンが挙げられる。
さらに、いくつかの実施形態において、構造１～６の標的化部分は、例えば、他の炭水化物；グリカン；ハプテン；ビタミン；フォラート；ビオチン；アプタマー；ならびに／あるいは、例えばＲＧＤ含有ペプチド、インスリン、ＥＧＦ、および／またはトランスフェリンなどのペプチドで置換され得る。
いくつかの実施形態において、構造１０１、１０２、または１０３の標的化部分は、例えば、他の炭水化物；グリカン；ハプテン；ビタミン；フォラート；ビオチン；アプタマー；ならびに／あるいは、例えばＲＧＤ含有ペプチド、インスリン、ＥＧＦ、および／またはトランスフェリンなどのペプチドで置換され得る。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン三量体の形態である。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、Ｎ－アセチル－ガラクトサミン四量体の形態である。
オリゴマー化合物
本明細書中に開示した標的化リガンドは、オリゴマー化合物に連結され得る。いくつかの実施形態において、前記オリゴマー化合物は、発現阻害オリゴマー化合物である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、ＲＮＡｉ剤である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖ＲＮＡｉ剤である。いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドである。前記発現阻害オリゴマー化合物は、当該技術分野で一般的に使用される方法を使用することで合成され得る。
前記発現阻害オリゴマー化合物は、１若しくは複数の修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチド塩基（または、核酸塩基）は、すべての核酸の構成要素であり、かつ、アデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、シトシン（Ｃ）、チミン（Ｔ）、およびウラシル（Ｕ）を含む複素環式ピリミジンまたはプリン化合物である。本明細書中に使用される場合、「ヌクレオチド」という用語は、修飾ヌクレオチドまたはヌクレオチド模倣体、脱塩基部位、または代用置換部分を含み得る。本明細書中に使用される場合、「修飾ヌクレオチド」は、リボヌクレオチド（２’－ヒドロキシルヌクレオチド）以外のヌクレオチド、ヌクレオチド模倣体、脱塩基部位、または代用置換部分である。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオチドとしては、２’－修飾ヌクレオチド（すなわち、５員糖環の２’位置にてヒドロキシル基以外の基を有するヌクレオチド）を含む。修飾ヌクレオチドとしては、これだけに限定されるものではないが：２’－修飾ヌクレオチド、２’－Ｏ－メチルヌクレオチド（本明細書中ではヌクレオチド配列内の小文字「ｎ」とも表される）、２’－デオキシ－２’－フルオロヌクレオチド（本明細書中ではＮｆと表され、また、本明細書中に２’－フルオロヌクレオチドとも表される）、２’－デオキシヌクレオチド（本明細書中ではｄＮとも表される）、２’－メトキシエチル（２’－Ｏ－２－メトキシルエチル）ヌクレオチド（本明細書中ではＮＭまたは２’－ＭＯＥとも表される）、２’－アミノヌクレオチド、２’－アルキルヌクレオチド、３’－３’連結（反転）ヌクレオチド（本明細書中ではｉｎｖｄＮ、ｉｎｖＮ、ｉｎｖｎ、ｉｎｖＸとも表される）、ヌクレオチドを含む非天然型塩基、ロックされたヌクレオチド、架橋ヌクレオチド、ペプチド核酸、２’、３’－セコヌクレオチド模倣体（ロックされていない核酸塩基類似体、本明細書中ではＮＵＮＡまたはＮＵＮＡとも表される）、ロックされたヌクレオチド（本明細書中ではＮＬＮＡまたはＮＬＮＡとも表される）、３’－Ｏ－メトキシ（２’－ヌクレオチド間連結）ヌクレオチド（本明細書中では３’－ＯＭｅｎとも表される）、２’－Ｆ－アラビノヌクレオチド（本明細書中ではＮｆＡＮＡまたはＮｆＡＮＡとも表される）、モルホリノヌクレオチド、ビニルホスホナートデオキシリボヌクレオチド（本明細書中ではｖｐｄＮとも表される）、ビニルホスホナートヌクレオチド、および脱塩基ヌクレオチド（本明細書中ではＸまたはＡｂとも表される）が挙げられる。一様に修飾されることは、所定の化合物のすべての位置において必要とされるわけでない。逆に、２つ以上の修飾が、ただ一つの発現阻害オリゴマー化合物の中に、またはその単一ヌクレオチドの中にさえ組み込まれ得る。前記発現阻害オリゴマー化合物は、当該技術分野で知られている方法によって合成および／または修飾され得る。各ヌクレオチドの修飾は、他のヌクレオチドの修飾から独立している。
修飾核酸塩基としては、合成および天然型核酸塩基、例えば、５－置換ピリミジン、６－アザピリミジン、Ｎ－２－、Ｎ－６－、Ｏ－６－置換プリン（例えば、２－アミノプロピルアデニン）、５－プロピニルウラシル、５－プロピニルシトシン、５－メチルシトシン（５－ｍｅ－Ｃ）、５－ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２－アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６－メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの２－プロピルおよび他のアルキル誘導体、２－チオウラシル、２－チオチミン、２－チオシトシン、５－ハロウラシル、５－ハロシトシン、５－プロピニルウラシル、５－プロピニルシトシン、６－アゾ－ウラシル、６－アゾ－シトシン、６－アゾ－チミン、５－ウラシル（偽ウラシル）４－チオウラシル、８－ハロ、８－アミノ、８－チオール、８－チオアルキル、８－ヒドロキシル、および他の８－置換アデニンおよびグアニン、５－置換ウラシルおよびシトシン（例えば、５－ハロウラシルおよびシトシン（例えば、５－ブロムウラシルおよび５－ブロモシトシン）、５－トリフルオロメチルウラシル、５－トリフルオロメチルシトシン）、７－メチルグアニン、７－メチルアデニン、８－アザグアニン、８－アザアデニン、７－デアザグアニン、７－アザグアニン、３－デアザグアニン、および３－アザグアニンが挙げられる。
本明細書中に記載した発現阻害オリゴマー化合物において、任意の修飾ヌクレオチドは、ホスファート含有または非ホスファート含有共有結合性ヌクレオシド間結合によって連結され得る。修飾ヌクレオシド間結合または骨格としては、これだけに限定されるものではないが、５’－ホスホロチオアート（本明細書中ではヌクレオチドの前の小文字「ｓ」とも表され、ｓＮ、ｓｎ、ｓＮｆ、またはｓｄＮとも表される）、キラルホスホロチオアート、ホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキル－ホスホトリエステル、３’－アルキレンホスホナートおよびキラルホスホナートを含めたメチルおよび他のアルキルホスホナート、ホスフィナート、３’－アミノホスホルアミダートおよびアミノアルキルホスホルアミダートを含めたホスホルアミダート、チオノホスホルアミダート、チオノアルキル－ホスホナート、チオノアルキル－ホスホトリエステル、モルホリノ連結、通常３’－５’連結を有するボラノホスホナート、ボラノホスホナートの２’－５’連結類似体、ならびに逆極性を有するボラノホスホナートが挙げられ、ここで、ヌクレオシド単位の隣接対は、３’－５’から５’－３’にまたは２’－５’から５’－２’に連結される。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合または骨格は、リン原子を欠いている。リン原子を欠いている修飾ヌクレオシド間結合としては、これだけに限定されるものではないが、短鎖アルキルもしくはシクロアルキル糖間連結、混合性ヘテロ原子とアルキルもしくはシクロアルキル糖間連結、または１若しくは複数の短鎖ヘテロ原子もしくは複素環式糖間連結が挙げられる。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間骨格としては、これだけに限定されるものではないが、シロキサン骨格、スルフィド骨格、スルホキシド骨格、スルフォン骨格、ホルムアセチルおよびチオホルムアセチル骨格、メチレンホルムアセチルおよびチオホルムアセチル骨格、アルケン－含有骨格、スルファマート骨格、メチレンイミノおよびメチレンヒドラジノ骨格、スルホナートおよびスルホンアミド骨格、アミド骨格、ならびに混成Ｎ、Ｏ、Ｓ、およびＣＨ２成分を有する他の骨格が挙げられる。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物は、二本鎖ＲＮＡｉ剤であり、少なくとも部分的に互いに相補的な（少なくとも７０％相補的な）センス鎖とアンチセンス鎖とを含む。前記アンチセンス鎖は、標的ｍＲＮＡの配列に対して完全に相補的（１００％相補的）であるか、または少なくとも実質的に相補的（少なくとも８５％相補的）である配列を有する領域を含む。二本鎖ＲＮＡｉ剤のセンス鎖およびアンチセンス鎖の長さは、それぞれ１６～３０ヌクレオチドの長さであり得る。前記センスおよびアンチセンス鎖は同じ長さであっても、またはそれらが異なった長さであってもいずれでもよい。いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、長さが約１９ヌクレオチドであるが、それに対して、前記アンチセンス鎖は長さが約２１ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センス鎖は長さが約２１ヌクレオチドであるが、それに対して、前記アンチセンス鎖は長さが約２３ヌクレオチドである。他の実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖は、それぞれ独立に長さが１７～２１ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、センスとアンチセンス鎖の両方が、長さがそれぞれ２１～２６ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖の両方が、長さがそれぞれ２６ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記センスとアンチセンス鎖は、それぞれ独立に長さが１７～２６ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、二本鎖ＲＮＡｉ剤は、約１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４ヌクレオチドの二本鎖の長さを有する。前記センス鎖とアンチセンス鎖との間の完全または実質的に相補的なこの領域は、長さが典型的には１５～２５ヌクレオチド（例えば、長さが１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５ヌクレオチド）であり、該アンチセンス鎖の５’末端または５’末端付近で起こる。
本明細書中に開示したリガンドに結合される発現阻害オリゴマー化合物は、任意選択かつ独立に、（延長として）追加の１、２、３、４、５、または６ヌクレオチドをコア配列の３’末端、５’末端、または３’および５’末端の両方に含む。これらの追加的ヌクレオチドは、存在する場合、前記標的化されているｍＲＮＡの対応配列に対して相補的であっても、またはそうでなくてもよい。
いくつかの実施形態において、二本鎖ＲＮＡｉ剤が本明細書中に開示した標的化リガンドに結合されるとき、追加のセンス鎖追加ヌクレオチドは、存在する場合、前記標的化されているｍＲＮＡの対応配列に対して同一であっても、またはそうでなくてもよい。それが存在する場合、前記追加のアンチセンス鎖追加ヌクレオチドは、それが存在する場合、前記センス鎖の対応する追加ヌクレオチドに対して相補的であっても、またはそうでなくてもよい。
二本鎖ＲＮＡｉ剤は、アンチセンス鎖をセンス鎖とアニーリングすることによって形成できる。
いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、ＲＮＡｉ剤のセンス鎖またはアンチセンス鎖のいずれかの３’または５’末端にてＲＮＡｉ剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、センス鎖の５’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、センス鎖の３’末端に連結される。いくつかの実施形態において、前記標的化リガンドは、不安定結合、切断可能結合、または可逆的結合を介してＲＮＡｉ剤に連結される。いくつかの実施形態において、前記不安定結合、切断可能結合、または可逆的結合は、前記ＲＮＡｉ剤と標的化リガンドとの間に追加された切断可能部分に含まれる。
いくつかの実施形態において、前記発現阻害オリゴマー化合物は、一本鎖オリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、標的ｍＲＮＡの発現を阻害するためにＲＮＡ干渉機構を利用する。いくつかの実施形態において、前記一本鎖オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ干渉以外の機構を通して標的核酸発現を低減する際に活性である。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に結合された前述の標的化リガンドが投与される対象における標的の遺伝子発現レベルおよび／またはｍＲＮＡレベルは、投与前の対象または標的化リガンド複合体を与えていない対象に対して、少なくとも約５％、例えば、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％低減される。前記対象の遺伝子発現レベルおよび／またはｍＲＮＡレベルは、該対象の細胞、細胞群、および／または組織において低減され得る。いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に結合された前述の標的化リガンドが投与された対象のタンパク質レベルは、前記標的化リガンド複合体を投与する前の対象または前記標的化リガンド複合体を与えていない対象に対して、少なくとも約５％、例えば、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％低減される。前記対象のタンパク質レベルは、該対象の細胞、細胞群、組織、血液、および／または他の体液で低減され得る。遺伝子発現、ｍＲＮＡ、またはタンパク質レベルにおける低減は、当該技術分野で知られている任意の方法でも評価できる。ｍＲＮＡレベルおよび／またはタンパク質レベルの低減または減少は、本明細書中では、標的化された遺伝子の発現を阻害すること、減少すること、または低減することともみなされる。
開示される標的化リガンドと共に使用される特異的発現阻害オリゴマー化合物が、当該技術分野で知られている。特に、多数の参照文献が、肝臓への組成物の送達のために本明細書中に開示した標的化リガンドに結合され得る発現阻害オリゴマー化合物を開示する。制限されることのない例としては、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of LPAと題された米国特許出願第１５／２８１，３０９号（上記文献を全体として参照により本明細書に援用する）が挙げられ、本明細書中に開示した標的化リガンドと共に使用するのに好適である（リポタンパク質（ａ）粒子の部分であるａｐｏ（ａ）タンパク質、それによるリポタンパク質（ａ）粒子（Ｌｐ（ａ））の発現を阻害するための）ヒトアポリポタンパク質（ａ）遺伝子［ＬＰＡ］を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示する。前記ａｐｏ（ａ）遺伝子［ＬＰＡ］は、ヒトおよびヒト以外の霊長動物の肝臓で主に発現される。同様に、例えば、RNAi Therapy for Hepatitis B Virus Infectionと題された米国特許出願第１５／２２９，３１４号（上記文献もまた全体として参照により本明細書に援用する）は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、Ｂ型肝炎ウイルスを標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。前記Ｂ型肝炎ウイルスは、厳密な肝指向性の、二本鎖ＤＮＡ含有ウイルスであり、ヘパドナウイルス科のファミリーに属する、ヘパドナウイルスの一員に分類される。さらに、別の例として、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Factor XIIと題された、米国特許出願第１５／２２９，３１４号（上記文献を全体として参照により本明細書に援用する）は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、第ＸＩＩ因子（または、第１２因子、Ｆ１２）遺伝子を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。第ＸＩＩ因子は、主に肝臓で発現されて、血液で見つけられたセリンプロテアーゼである。さらに、別の例として、Compositions and Methods for Inhibiting Gene Expression of Alpha-1 AntiTrypsinと題された、米国特許出願第１４／７４０，３０７号（上記文献を全体として参照により本明細書に援用する）は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、α－１アンチトリプシン（または、ＡＡＴ）遺伝子を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。ＡＡＴは、セルピンスーパーファミリーの属するプロテアーゼインヒビターであり、通常ＡＡＴタンパク質は、肝細胞によって肝臓で主に合成され、そして、血中に分泌される。さらに、Organic Compositions to Treat APOC3-Related Diseasesと題されたＷＯ２０１６／０１１２３（上記文献を全体として参照により本明細書に援用する）は、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適である、ヒトアポリポタンパク質ＩＩＩ（ＡＰＯＣ３）を標的化する様々な二本鎖発現阻害オリゴマー化合物を開示している。アポリポタンパク質Ｃ－ＩＩＩは、トリグリセリドに富む粒子の肝臓取り込みを阻害すると考えられるリポタンパク質の構成要素である。本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適であり得る、発現阻害オリゴマー化合物を含めた様々な治療化合物を開示している更なる参照文献もまた、当該技術分野で見つけることができる。これらとしては、これだけに限定されるものではないが、肝臓に対して標的化することが望ましい組成物が挙げられる。
医薬組成物と処方
本明細書中に開示した標的化リガンドは、オリゴマー化合物に連結されるとき、該化合物の投与により有益性をもたらすだろう疾患または障害に罹患している対象（例えば、ヒトまたは哺乳動物）を治療するために使用できる。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されるとき、標的ｍＲＮＡの発現の低減または阻害により有益性をもたらすだろう疾患または障害に罹患している対象（例えば、ヒト）を治療するために使用できる。前記対象は、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結される、ＲＮＡｉ剤などの任意の１若しくは複数の発現阻害オリゴマー化合物の治療的有効量を投与される。前記対象は、ヒト、患者、またはヒト患者である可能性がある。前記対象は、成人、思春期の人、小児、または幼児であってもよい。発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物は、疾患の治療療法のための方法を提供するために使用できる。斯かる方法は、ヒトまたは動物への、本明細書中に記載した医薬組成物の投与を含む。
本明細書中に開示した医薬組成物および方法は、細胞、細胞群、組織、または対象の標的ｍＲＮＡのレベルを減少させ得：前記対象に、標的化リガンドに連結される、本明細書中に記載した発現阻害オリゴマー化合物の治療的有効量を投与し、それによって、対象の標的ｍＲＮＡの発現を阻害する。いくつかの実施形態において、前記対象は、前記標的細胞または組織における標的遺伝子の病原性上方制御を有すると以前に同定された。
いくつかの実施形態において、医薬組成物は、標的化リガンドに連結される、少なくとも１つの発現阻害オリゴマー化合物を含む。これらの医薬組成物は、標的細胞、細胞群、組織、または生物体における前記標的ｍＲＮＡの発現の阻害において特に有用である。前記医薬組成物は、標的ｍＲＮＡのレベルの低減、または標的遺伝子の発現の阻害により有益性をもたらすだろう疾患または障害に罹患している対象を治療するために使用される。前記医薬組成物は、標的ｍＲＮＡのレベルの低減、または標的遺伝子の発現の阻害により有益性をもたらすだろう疾患または障害を発症する危険性のある対象を治療するために使用できる。一実施形態において、前記方法は、治療される対象に対して、ＲＮＡｉ剤などの発現阻害オリゴマー化合物に連結した、本明細書中に記載した標的化リガンドを含む組成物を投与することを含む。いくつかの実施形態において、１若しくは複数の医薬的に許容される賦形剤（ビヒクル、担体、希釈剤、および／または送達ポリマーを含む）は、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む医薬組成物に加えられ、それによって、ヒトに対するインビボ送達に好適な医薬製剤を形成する。
いくつかの実施形態において、発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物は、標的ｍＲＮＡの発現に関連している臨床像を治療するかまたは管理するために使用される。または、いくつかの実施形態において、１もしくは複数の医薬組成物の治療的または予防的有効量が、斯かる治療、予防またはマネジメントを必要とする対象に投与される。いくつかの実施形態において、オリゴマー化合物に共有結合で連結された任意の複合化リガンドの投与は、対象の疾患の症状の数、重症度、および／または頻度を減少させるのに使用できる。
発現阻害オリゴマー化合物に連結された標的化リガンドを含む前述の医薬組成物が、標的ｍＲＮＡの発現の低減または阻害により有益性をもたらすだろう疾患または障害に罹患している対象における少なくとも１つの症状を治療するために使用できる。いくつかの実施形態において、前記対象は、本明細書中に記載した標的化リガンドに連結されたＲＮＡｉ剤などの発現阻害オリゴマー化合物を含む１若しくは複数の医薬組成物の治療的有効量を投与され、それによって、該症状が治療される。他の実施形態において、前記対象は、１もしくは複数の発現阻害オリゴマー化合物の予防的有効量を投与され、それによって、少なくとも１つの症状が予防される。
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物が投与される対象における標的ｍＲＮＡの発現またはそのレベルは、医薬組成物を与えていない対象に対して、少なくとも約５％、例えば、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％低減される。前記対象における遺伝子発現レベルは、該対象の細胞、細胞群、および／または組織で低減され得る。いくつかの実施形態において、ｍＲＮＡのレベルが低減される。他の実施形態において、発現タンパク質レベルが低減される。いくつかの実施形態において、本明細書中に開示した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物が投与される対象のタンパク質のレベルは、医薬組成物を与えていない対象に対して、少なくとも約５％、例えば、少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９８％低減される。発現、ｍＲＮＡレベル、またはタンパク質レベルにおける低減は、当該技術分野で知られている任意の方法によって評価できる。ｍＲＮＡレベルおよび／またはタンパク質レベルの低減または減少は、本明細書中では、標的ＲＮＡの低減もしくは減少、または標的ｍＲＮＡの発現を阻害することもしくは低減することと言われる。
投与経路は、発現阻害オリゴマー化合物を身体と接触させる経路である。一般に、哺乳動物の治療のための薬剤および核酸を投与する方法は、当該技術分野で周知であり、かつ、本明細書中に記載した組成物の投与に適用できる。本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物は、特定の経路に適切に適合させて調製物によって任意の好適な経路を介して投与できる。よって、本明細書中に記載した医薬組成物は、例えば、静脈内、筋肉内、皮内、皮下、関節内、または腹腔内に注射によって投与できる。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、吸入を介して投与される。
本明細書中に記載した標的化リガンドに連結された発現阻害オリゴマー化合物を含む医薬組成物は、当該技術分野で知られているオリゴヌクレオチド送達技術を使用することで細胞、細胞群、腫瘍、組織、または対象に送達できる。一般に、（インビトロまたはインビボにおける）核酸分子を送達するための当該技術分野で認識されている任意の好適な方法が、本明細書中に記載した組成物を用いた使用に適合させることができる。例えば、送達は、局所的投与、（例えば、直接注入、移植、または局部投与）、全身投与、あるいは、頭蓋内（例えば、脳室内、脳実質内、およびくも膜下腔内）、筋肉内、経皮的、気道（エアゾール）、経鼻、経口、直腸、または局所（頬側および舌下を含む）投与を含めた、皮下、静脈、腹腔、または非経口経路によることができる。特定の実施形態において、前記組成物は、皮下、または静脈内注入または注射によって投与される。
従って、いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、１もしくは複数の医薬的に許容される賦形剤を含んでもよい。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載した医薬組成物は、対象への投与のために処方できる。
本明細書中に使用される場合、医薬組成物または薬物は、薬理学的有効量の、１若しくは複数の前述の治療化合物および少なくとも１つの医薬的に許容される賦形剤を含む。医薬的に許容される賦形剤（賦形剤）とは、薬物送達システムに意図的に含まれる、医薬品有効成分（ＡＰＩ、治療薬、例えば、Ｆ１２ ＲＮＡｉ剤）以外の物質である。賦形剤は、意図された投薬量にて治療効果を発揮しないか、または発揮することが意図されていない。賦形剤は、ａ）製造中に前記薬物送達システムの加工の助けとなる、ｂ）安定性、生物学的利用能またはＡＰＩの患者の受容性を保護、補助、または強化、ｃ）生成物の同定を助ける、および／またはｄ）保管もしくは使用中のＡＰＩの送達の総合的な安全性、有効性のその他の特質を強化するように機能し得る。医薬的に許容される賦形剤は、不活性物質であっても、またはそうでなくてもよい。
賦形剤としては、これだけに限定されるものではないが：吸収促進薬、固結防止剤、泡止め剤、抗酸化剤、結合剤、緩衝化剤、担体、被覆剤、着色料、送達増強剤、送達ポリマー、デキストラン、デキストロース、希釈剤、崩壊剤、乳化剤、鎖延長剤、増量剤、香味料、流動促進剤、湿潤剤、滑沢剤、オイル、ポリマー、保存料、生理食塩水、塩、溶媒、糖、懸濁化剤、徐放性マトリックス、甘味料、増粘剤、等張化剤、ビヒクル、撥水剤、および湿潤剤が挙げられる。
注射用途に好適な医薬組成物としては、無菌の水性溶液（水に可溶性である場合）または分散液、および無菌の注射溶液または分散液の即時調製用の無菌の粉末が挙げられる。静脈内投与に関して、好適な担体としては、生理的塩類溶液、静菌性水、Cremophor ELTM（ＢＡＳＦ、Parsippany, NJ）またはホスファート緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。それは、製造および保管の条件下で安定していなければならず、さらに、細菌や真菌などの微生物の混入作用に対して保護されなければならない。前記担体は、例えば水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール）、ならびに好適なその混合物を含めた溶媒または分散媒質であり得る。適切な流動性は、例えばレシチンなどの被覆の使用によって、分散液の場合には、必要な粒度の維持管理によって、および界面活性化剤の使用によって維持できる。多くの場合、組成物中に、等張剤、例えば糖、マンニトールやソルビトールなどのポリアルコール、および塩化ナトリウムを含むことは望ましい。注射用組成物の持続的吸収は、組成物に吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアホスファートアルミニウムおよびゼラチンを含ませることによってもたらすことができる。
滅菌注射可能溶液は、必要に応じて、先に列挙した成分のうちの１つまたは組み合わせとともに、適当な溶媒中で必要な量の活性化合物を組み込み、続いて、濾過滅菌することによって、調製され得る。一般的に、分散液は、基本的な分散媒と、先に列挙される成分から必要な他の成分とを含有する滅菌ビヒクル中に活性化合物を組み込むことによって調製される。滅菌注射可能溶液を調製するための滅菌粉末の場合、調製方法は、真空乾燥および凍結乾燥することを含み、これによって、あらかじめ滅菌濾過したその溶液から、活性化合物および任意のさらなる所望の成分の粉末を得る。
関節内投与に好適な処方は、微結晶性形態、例えば、微結晶の水性懸濁液の形態で存在し得る薬剤の無菌の水性製剤の形態であってもよい。リポゾーム製剤または生分解性ポリマー系が、関節内および眼投与の両方に向けて薬剤を提供するためにも使用できる。
目の治療を含めた局所投与に好適な処方としては、液状または準液状製剤、例えば塗布剤、ローション、ゲル、外用薬、水中油または油中水型乳剤（例えばクリーム、軟膏剤もしくはペースト剤など）など；あるいは点眼薬などの溶液または懸濁液、が挙げられる。皮膚表面への局所投与のための処方は、例えばローション、クリーム、軟膏剤または石鹸などの皮膚科学的に許容される担体で薬剤を分散することによって調製できる。適用を局在化し、かつ、除去を妨げるために皮膚を覆うフィルムまたは層を形成することができる担体は有効である。内部組織の表面への局所投与に関して、前記剤は、液状組織接着剤または組織表面への吸着を促進することが知られている他の物質中に分散されることができる。例えば、ヒドロキシプロピルセルロースまたはフィブリノーゲン／トロンビン溶液が、有益となるように使用できる。あるいは、ペクチン含有処方などの組織被覆溶液が使用できる。
吸入治療に関して、スプレー缶、ネブライザー、またはアトマイザーを用いて分注される散剤（自己噴射型またはスプレー処方）の吸入が使用できる。斯かる処方は、散剤吸入デバイスまたは自己噴射型散剤分注処方からの肺内投与のための微細粉末の形態であってよい。自己噴射型溶液およびスプレー処方の場合、効果は、所望のスプレー特性を有する（すなわち、所望の粒度を有するスプレーは生じさせることができる）弁を選択することによって、または制御された粒度に懸濁された散剤として有効成分を組み込むことによって達成できる。吸入による投与に関して、前記化合物はまた、好適な噴射剤、例えば二酸化炭素などのガスを含有している加圧型コンテナもしくはディスペンサー、またはネブライザーからのエアゾールスプレーの形態でも送達できる。全身投与はまた、経粘膜または経皮的手段によっても可能である。経粘膜または経皮投与に関して、透過するべき障壁に対して適当な湿潤剤が、処方に使用できる。斯かる湿潤剤は、一般的に、当該技術分野で知られており、例えば、経粘膜投与のために、洗浄薬および胆汁酸塩が含まれる。経粘膜投与は、鼻腔用スプレーまたは坐剤の使用によって達成できる。経皮投与に関して、活性化合物は、典型的に、当該技術分野で一般的に知られている軟膏剤、軟膏、ゲル、またはクリームに処方される。
前記活性化合物は、移植片およびマイクロカプセル化された送達系を含む徐放性処方物等の、身体からの迅速な排出に対してこの化合物を保護する担体を用いて調製できる。酢酸エチレンビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸等の生分解性、生体適合性ポリマーが使用されてもよい。このような処方物の調製のための方法は、当業者には明らかである。リポソーム懸濁物もまた、薬学的に許容される担体として使用することができる。これらは、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるような、当業者に既知の方法に従って調製することができる。
経口または非経口組成物は、投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で処方されてもよい。本明細書で使用される投薬単位形態は、治療される対象に対する単位投薬量として好適な物理的に分離した単位を指し、各単位は、必要とされる薬学的担体と関連して所望の治療効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含有する。本開示の投薬単位形態についての詳細は、活性化合物の固有の特徴、および達成されるべき治療効果、および個人の治療のための斯かる活性化合物を合成する当該技術分野における固有の制限によって決定され、かつ直接依存する。さらに、投与は、ボーラスの定期的な注射によってできるか、または外部リザーバ（例えば、静脈内バッグ）からの静脈内、筋肉内、または腹腔内投与によってより連続しておこなわれることができる。
本開示の方法に関連して、ファーマコゲノミクス（すなわち、個人の遺伝子型と、外来化合物または薬剤に対するその個人の応答との相関に関する研究）が検討され得る。治療薬の代謝の差は、薬理学的活性薬物の用量と血中濃度との関係を変更することによって、重度の毒性または治療不全につながる可能性がある。よって、医師または臨床医は、薬剤を投与するか決定する、ならびに該薬剤を用いた治療の投薬量および／または治療計画を調整する際に関連ファーマコゲノミクス研究で得た知識を適用することを検討できる。
医薬組成物は、医薬組成物の中で一般的に見出された他の追加成分を含むことができる。斯かる追加成分としては、これだけに限定されるものではないが、止痒剤、収斂剤、局部麻酔剤、または抗炎症薬（例えば、抗ヒスタミン剤、ジフェンヒドラミンなど）が挙げられる。本明細書中に規定したＲＮＡｉ剤を発現するかまたは含む細胞、組織または摘出臓器が「医薬組成物」として使用され得ることもまた、想像される。本明細書中に使用される場合、「薬理学的有効量」、「治療的有効量」、または単に「有効量」は、薬理学的、または治療学的または予防的結果を生じさせるようなＲＮＡｉ剤の量を指す。
一般的に、活性化合物の有効量は、約０．１～約１００ｍｇ／ｋｇ体重／日、例えば、約１．０～約５０ｍｇ／ｋｇ体重／日の範囲内にある。いくつかの実施形態において、活性化合物の有効量は、１用量あたり約０．２５～約５ｍｇ／ｋｇ体重の範囲内にある。いくつかの実施形態において、有効成分の有効量は、１用量あたり約０．５～約３ｍｇ／ｋｇ体重の範囲にある。投与される量もまた、患者の総合的な健康状態、送達される化合物の相対的生物学的効率、薬剤の処方、処方中の賦形剤の存在およびタイプ、ならびに投与経路といった変数に依存する可能性がある。また、投与された初回投与量は、所望の血中濃度または組織レベルを早急に達成するために、高レベルの上を超えて増量されてもよいか、または初回投与量は最適条件よりわずかであってもよいことも、理解すべきである。
疾患の治療または疾患の治療のための薬物または組成物の形成に関して、標的化リガンドに連結されたＲＮＡｉ剤などの発現阻害オリゴマー化合物を含む、本明細書中に記載の医薬組成物は、賦形剤、またはこれだけに限定されるものではないが：第二のまたはその他の発現阻害オリゴマー化合物、小分子薬剤、抗体、抗体フラグメント、および／またはワクチンを含めた第二の治療薬または治療と組み合わせられ得る。
前述の標的化リガンドは、発現阻害オリゴマー化合物に連結されるとき、および医薬的に許容される賦形剤またはアジュバントに加えられるとき、キット、コンテナ、パック、またはディスペンサーにパッケージされることができる。本明細書中に記載した医薬組成物は、充填済みシリンジまたはバイアルにパッケージされることができる。
先に提供した実施形態は、次の制限されることのない例を用いてここで例示される。
以下の実施例は、本明細書中に開示した特定の実施形態を限定するものではなく、例示することを意図している。
次の実施例の合成に関する実験的詳細に使用される略語の一部を以下に規定する：ｈまたは時間＝時間；ｍｉｎ＝分；ｍｏｌ＝モル；ｍｍｏｌ＝ミリモル；Ｍ＝モル；μＭ＝マイクロモル；ｇ＝グラム；μｇ＝マイクログラム；ｒｔまたはＲＴ＝室温；Ｌ＝リットル；ｍＬ＝ミリリットル；ｗｔ＝重量；Ｅｔ２Ｏ＝ジエチルエーテル；ＴＨＦ＝テトラヒドロフラン；ＤＭＳＯ＝ジメチルスルホキシド；ＥｔＯＡｃ＝酢酸エチル；Ｅｔ３ＮまたはＴＥａ＝トリエチルアミン；ｉ－Ｐｒ２ＮＥｔ、ＤＩＰＥＡまたはＤＩＥＡ＝ジイソプロピルエチルアミン；ＣＨ２Ｃｌ２またはＤＣＭ＝塩化メチレン；ＣＨＣｌ３＝クロロホルム；ＣＤＣｌ３＝重水素化クロロホルム；ＣＣｌ４＝四塩化炭素；ＭｅＯＨ＝メタノール；ＥｔＯＨ＝エタノール；ＤＭＦ＝ジメチルホルムアミド；ＢＯＣ＝ｔ－ブトキシカルボニル；ＣＢＺ＝ベンジルオキシカルボニル；ＴＢＳ＝ｔ－ブチルジメチルシリル；ＴＢＳＣｌ＝ｔ－ブチルジメチルシリルクロリド；ＴＦＡ＝トリフルオロ酢酸；ＤＭＡＰ＝４－ジメチルアミノピリジン；ＮａＮ３＝アジ化ナトリウム；Ｎａ２ＳＯ４＝硫酸ナトリウム；ＮａＨＣＯ３＝重炭酸ナトリウム；ＮａＯＨ＝水酸化ナトリウム；ＭｇＳＯ４＝硫酸マグネシウム；Ｋ２ＣＯ３＝炭酸カリウム；ＫＯＨ＝水酸化カリウム；ＮＨ４ＯＨ＝水酸化アンモニウム；ＮＨ４Ｃｌ＝塩化アンモニウム；ＳｉＯ２＝シリカ；Ｐｄ－Ｃ＝パラジウム炭素；ＨＣｌ＝塩化水素または塩酸；ＮＭＭ＝Ｎ－メチルモルホリン；Ｈ２＝水素ガス；ＫＦ＝フッ化カリウム；ＥＤＣ－ＨＣｌ＝Ｎ－（３－ジメチルアミノプロピル）－Ｎ’－エチルカルボジイミドヒドロクロリド；ＭＴＢＥ＝メチル－ｔｅｒｔ－ブチルエーテル；ＭｅＯＨ＝メタノール；Ａｒ＝アルゴン；ＳｉＯ２＝シリカ；ＲＴ＝保持時間。
さらに、本明細書中に開示した標的化リガンドとの使用に好適な、代表的な発現阻害オリゴマー化合物を、以下の実施例内のさまざまな表中に記載する。以下の表記を、本明細書中に開示した表中に記載する配列に関して修飾ヌクレオチドを示すのに使用する：
Ｎ ＝ ２’－ＯＨ（非修飾）リボヌクレオチド（ｆまたはｄ指示のない大文字）
ｎ ＝ ２’－ＯＭｅ修飾ヌクレオチド
ｎｆ ＝ ２’－フルオロ修飾ヌクレオチド
ｄＮ ＝ ２’－デオキシヌクレオチド
ＮＵＮＡ ＝ ２’，３’－セコヌクレオチド模倣体（ロックされていない核酸塩基類似体）
ＮＬＮＡ ＝ ロックされたヌクレオチド
ＮｆＡＮＡ ＝ ２’－Ｆ－アラビノヌクレオチド
ＮＭ ＝ ２’－メトキシエチルヌクレオチド
ＸまたはＡｂ ＝ 脱塩基リボース
Ｒ ＝ リビトール
（ｉｎｖｄＮ） ＝ 反転デオキシリボヌクレオチド（３’－３’結合ヌクレオチド）
（ｉｎｖＡｂ） ＝ 反転脱塩基ヌクレオチド
（ｉｎｖＸ） ＝ 反転脱塩基ヌクレオチド
（ｉｎｖｎ） ＝ 反転２’－ＯＭｅヌクレオチド
ｓ ＝ ホスホロチオアート基結合ヌクレオチド
ｖｐｄＮ ＝ ビニルホスホナートデオキシリボヌクレオチド
（３’ＯＭｅｎ） ＝ ３’－ＯＭｅヌクレオチド
（５Ｍｅ－Ｎｆ） ＝ ５’－Ｍｅ，２’－フルオロヌクレオチド
ｃＰｒｐ ＝ シクロプロピルホスホナート
本開示の化合物は、当業者に知られている合成化学技術を使用して作製できる。
実施例１．標的化リガンド、ホスホラミダイト化合物、構造１０１ｂの合成
１）トリ－ｔｅｒｔ－ブチルＮ－［Ｎ－（ベンジルオキシカルボニル）－Ｌ－γ－グルタミル］－Ｌ－グルタミン酸（３）の調製
Figure 0007485642000069
熱電対、磁気撹拌子、窒素入口、および粉末用漏斗を備えた、窒素でフラッシュした、２５０ｍＬの３つ口平底フラスコに、１（１０．００ｇ、２９．６４ｍｍｏｌ）を加え、続いて、ＴＨＦ（１００ｍＬ）を加えた。得られた溶液を、撹拌し、そして、Ｎ－メチルモルホリン（７．８２ｍＬ、７１．１５ｍｍｏｌ）を加えた。
粉末用漏斗をゴム隔壁に置き換え、そして、前記混合物を、氷浴を使用して０℃に冷却した。ポット温度を４．０℃未満に維持したまま、クロロギ酸イソブチル（ｉＢｕＣＯＣｌ、３．８５ｍＬ、２９．６４ｍｍｏｌ、１．０当量）を、反応混合物に滴下して１０分間かけて加えた。添加に続いて、その混合物をさらに４０分間撹拌し、そして、前記隔壁を粉末用漏斗に置き換えた。前記反応混合物に、４．０℃未満のポット温度を維持しながら、１５分間かけて２（８．７６７ｇ、２９．６４ｍｍｏｌ、１．０当量）を分割して加えた。２の添加に続いて、氷浴および粉末用漏斗を取り外し、そして、残りの一連のステップ中、反応物を周囲温度に加温した。２の添加に続いて、透明で、無色の溶液を２５分間寝かせた（aged）。
反応物のサンプル（９８μＬを、５ｍＬメスフラスコ内で５．０ｍＬのＡＣＮに希釈）を、２の添加開始の４０分後に採取し、そして、ＲＰ－ＨＰＬＣによって変換パーセントに関して分析した。１の２３％が残っていることがわかったので、反応の６０分後に、追加のｉＢｕＣＯＣｌ（１．１６ｍＬ、３０ｍｏｌ％）および２（２．６３ｇ、３０ｍｏｌ％）を連続して加えた。サンプルがＨＰＬＣによって９９％超の変換を示すまで、前記溶液をさらに６０分間寝かせた。総反応時間は、２の最初の添加開始から２．５時間であった。
前記反応液を、氷浴中で３℃に冷却した０．５ＭのＨＣｌ（ａｑ）の撹拌溶液に注ぎ入れ、約５分間撹拌した。クエンチした反応混合物を５００ｍＬの分液漏斗に移し、そして、酢酸エチル（１００ｍＬ）を加えた。層を分離し、有機相を塩水（１００ｍＬ）で洗浄し、上でＭｇＳＯ４乾燥させ、５００ｍＬの平底フラスコ内に濾過し、そして、真空中で濃縮し、再度、粘度が高い無色のオイルを得た。前記オイルを、ＭＴＢＥ（１００ｍＬ）中に溶解し、そして、真空中で濃縮し、再度、粘度が高い無色のオイルを得た。
撹拌したオイルに、ヘキサン（１００ｍＬ）を加えた。白色のもやが溶液中に現れ、その後それは、さらなる撹拌によって見えなくなった。種晶を加え、そして、その混合物を４０分間撹拌し、その間に、白色結晶をゆっくり形成した。
２０分以内では、スラリーは撹拌を妨害できるくらい濃く、そして、追加のヘキサン（５０ｍＬ）を加えた。４０分後に、スラリーを、粗目フリット漏斗を介して濾過し、ヘキサン（それぞれ～１０ｍＬ）で３回洗浄し、そして、１時間漏斗内で風乾し、微細な白色粉末（１５．６４ｇ、９１％）として３を得た。化合物３の１Ｈ ＮＭＲを図１に示す。７５グラムスケールでは、収率は純度９９％で９１７％であった。
２）Ｎ－［Ｎ－（ベンジルオキシカルボニル）－Ｌ－γ－グルタミル］－Ｌ－グルタミン酸（４）の調製
Figure 0007485642000070
オーバーヘッドスターラー、粉末用漏斗、熱電対、および加熱マントルを備えた、３０００ｍＬの３つ口平底フラスコに、３（７２．５７ｇ、１２５．４ｍｍｏｌ）およびギ酸（試薬用グレード、＞９５％、１．４５Ｌ、２０体積当量）を加えた。粉末用漏斗を、栓／Ｎ２で置き換え、そして、得られた溶液を、ＲＰ－ＨＰＬＣによって観察しながら、４５℃に加熱し、１時間撹拌した。２．０面積％未満のモノ－ｔ－ブチルエステルが残っているとき、反応が完了したと考えた。
反応物のサンプル（５０μＬを９５０μＬのＨ２Ｏに希釈）をギ酸添加の６０分後に採取し、そして、そのサンプルを、残っているモノ－ｔ－ブチルエステルのパーセントに関してＲＰ－ＨＰＬＣによって分析した。前記分析は、１．８％のモノ－ｔ－Ｂｕエステルが残っていることを示し；そのため、９０分の時点で、熱を冷ました。
反応物を、トルエンおよびアセトニトリル（ＡＣＮ、それぞれ１５００ｍＬ）で希釈し、そして、混合物を真空中で濃縮した。ギ酸を、１：１ ＡＣＮ：トルエン（～６００ｍＬ）で、そして、ＡＣＮ（それぞれ～５００ｍＬ）で２回、共沸により取り除いた。前記物質を高真空で一晩乾燥させて、白色の泡沫状固体化合物４（５４．３ｇ、定量収量）を得た。化合物４（Ｌ／Ｎ１３２１－０６３Ｂ）の１Ｈ ＮＭＲを図２に示す。
３）Ｎ－［Ｎ－（ベンジルオキシカルボニル）－Ｌ－γ－グルタミル］－Ｌ－グルタミン酸、トリ－［ＮＡＧ－ＰＥＧ２］－アミド（６）の調製
Figure 0007485642000071
１リットルの平底フラスコに、ＮＡＧ－アミンｐ－トシラート塩（５、５９．１９ｇ、９７．６ｍｍｏｌ、４．１３当量）およびＺ－ビス－Ｇｌｕ三酸塩基（４、１０．０１ｇ、２３．６ｍｍｏｌ、１．０当量）を加えた。前記混合物を、アセトニトリル（５００ｍＬ）中に溶解し、そして、真空中で濃縮して、共沸により水を取り除いた。残渣を、新しいアセトニトリル（４００ｍＬ）中に溶解し、撹拌子を入れ、そして、熱電対を備えた、窒素フラッシュした１リットルの３つ口平底フラスコに移した。水分含量を、ＫＦ（２５７ｐｐｍ）によって計測した。
窒素下で撹拌した溶液に、粉末用漏斗を介してＴＢＴＵ（２８．２０ｇ、８７．８ｍｍｏｌ、３．７当量）を加えた。漏斗上の残りのＴＢＴＵを、追加のアセトニトリル（１００ｍＬ）を使用して反応物をすすいだ。反応温度を２５℃未満に維持したまま、ＤＩＰＥＡ（３４．０ｍＬ、２５．２ｇ、８．０当量）を、シリンジによって２０分間かけて滴下して加えた。混合物を、ＨＰＬＣで観察しながら、ＤＩＰＥＡ添加の開始から２時間撹拌した。７８分時点の分析では、開始物質の完全な消費を示した。
２時間後に、真空中で溶媒を取り除いた。得られた粘度の高いオイルを、ジクロロメタン（１０００ｍＬ）中に溶解し、１．０ＮのＨＣｌ（ａｑ）（３×５００ｍＬ）で洗浄し、ＮａＨＣＯ３（ａｑ）（３×５００ｍＬ）で飽和状態にした。有機層を、Ｎａ２ＳＯ４上で乾燥させ、濾過し、そして、真空中で濃縮して、オフホワイト色の蝋質固形物（３３．５ｇ）を得た。
フラッシュカラムクロマトグラフィーを、溶出液としてクロロホルムおよびメタノールを使用したISCO CombiFlash自動化精製システムにより実施した。ＵＶクロマトグラム（２２０ｎｍ）に基づいて生成物を含むと推測されたすべての画分を、ＨＰＬＣで分析し、生成物の少なくとも９７．０％のＡＵＣを含むすべての画分を貯留し、濃縮して、１８．７５ｇ（９７．０％の純度）の６を得た。純度の低い画分を貯留して、さらに１２．２ｇ（７８．８％の純度）の６を得た。６の総収率は７０．９％であった。化合物６の１Ｈ ＮＭＲを図３に示す。
４）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ２トシラート塩（７）の調製
Figure 0007485642000072
ｐ－ＴｓＯＨ－Ｈ２Ｏ（０．６５７ｇ、３．４６ｍｍｏｌ）を伴ったＭｅＯＨ（１５５ｍＬ）中の化合物６（５．７３７ｇ、３．４６ｍｍｏｌ）を、６時間、Ｐｄ／Ｃ１０％（６８８ｍｇ）の存在下で水素化した。ＴＬＣ（ＣＨＣｌ３：ＭｅＯＨ＝８．５：１．５）では、反応がその時までに完成したことを確認した。反応フラスコをＡｒで満たし、ＥｔＯＨを加え（２００ｍＬ）、そして、その溶液を、セライトケーキを通して濾過した。生成物を、濃縮し、そして、真空中で乾燥させた。収量４．８１ｇの生成物、トシラート塩７。化合物７の１Ｈ ＮＭＲを図４に示す。
５）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ６－ＯＨ（９）の調製：
Figure 0007485642000073
手順Ａ（トリ－ＮＡＧアミン塩７が９６％未満の純度である場合）：ＮＡＧアミン塩７（～９０％の純度、１８．５０ｇ、１０．９０ｍｍｏｌ）およびＨＯ－ＰＥＧ６－ＣＯ２ＴＦＰエステル８（６．５７ｇ、１３．０８ｍｍｏｌ）を、ジクロロメタン（１８５ｍＬ）中に溶解し、そして、０℃に冷やした。この溶液に、トリエチルアミン（６．１０ｍＬ、４３．５９ｍｍｏｌ）を加えた。その溶液を、室温まで温め、そして、ＨＰＬＣで観察しながら、１８時間撹拌した。反応を、飽和した水性ＮａＨＣＯ３および塩水（１：１、１４０ｍＬ）でクエンチし、ＲＴにて３０分間撹拌し、そして、層を分離した。その有機層を、飽和した水性ＮａＨＣＯ３（３×１４０ｍＬ）および塩水（１：１）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４を用いて乾燥させた。前記乾燥剤を濾別し、そして、溶液を、濃縮し、そして、フラッシュクロマトグラフィーによって精製し、そしてそれで、白色の固形物として９（１３．５６ｇ、６７％）を得た。化合物９の１Ｈ ＮＭＲを図５に示す。
フラッシュカラムクロマトグラフィーを、溶出液としてジクロロメタンおよびメタノールを使用したISCO CombiFlash自動化精製システムにより実施した。純度の高い画分を貯留し、濃縮して、１３．５６ｇの９（９９％の純度）を得た。純度の低い画分を貯留して、
４．９ｇの９（～９５％の純度）を得た。
手順Ｂ（トリ－ＮＡＧアミン塩７が９６％超の純度である場合）：ＤＣＭ（４０ｍＬ）中の生成物７（１．９４ｇ、１．２７２ｍｍｏｌ）を、ＨＯ－ＰＥＧ６－ＣＯ２ＴＦＰエステル８（７６７ｍｇ、１．５２６ｍｍｏｌ）およびＤＩＰＥＡ（４４３μＬ、２．５４４ｍｍｏｌ）と共に、Ａｒ下で１６時間撹拌した。その反応混合物を、真空中で濃縮し、ＣＨＣｌ３中に溶解し、そして、撹拌しているＥｔ２Ｏ（９０ｍＬ）に滴下して加えた。沈殿物を、分離し、Ｅｔ２Ｏ（３×３５ｍＬ）ですすぎ、そして、真空中で乾燥させた。収量２．２７５ｇ（９６％）。
６）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ６ホスホラミダイト（１０）の調製：
化合物９（６．６２ｇ、３．５６ｍｍｏｌ）および４，５－ジシアノイミダゾール（０．１１ｇ、０．８９ｍｍｏｌ）を、無水ジクロロメタン（２３０ｍＬ）中に溶解し、そして、窒素雰囲気下に置いた。この混合物に、無水ジクロロメタン（５ｍＬ）中の２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（「Ｐｈｏｓ試薬」、１．４６ｍＬ、４．６２ｍｍｏｌ）の溶液を、５分間かけて滴下して添加した。その反応混合物を、ＨＰＬＣで観察しながら室温で３時間撹拌した（＜１％のＳＭ残留）。
前記反応混合物を、飽和した水性ＮａＨＣＯ３（２×１５０ｍＬ）、Ｈ２Ｏ（ｖ／ｖ、２×１５０ｍＬ）中の３％ ＤＭＦ、Ｈ２Ｏ（３×１５０ｍＬ）、および塩水（１×１５０ｍＬ）で洗浄し、そして、その有機層を、Ｎａ２ＳＯ４を用いて乾燥させた。乾燥剤を濾別し、そして、その溶液を真空中で濃縮して、未精製の生成物を得た。未精製の生成物を、５％のトルエン－ヘキサン（５０ｍＬ）中に懸濁し、５分間撹拌し、その後、溶媒をデカントした。そのプロセスを、５％のトルエン－ヘキサン（１×５０ｍＬ）およびヘキサン（２×５０ｍＬ）を用いて繰り返した。固形物を真空によって乾燥させて、白色の固形物として６．６９ｇの１０を得た（９１％）（化合物１０）。化合物１０（本明細書中の構造１０１ｄ）の１Ｈ ＮＭＲを図６に示す。
実施例２．標的化リガンド、ホスホラミダイト化合物、構造１０３ｄの合成
１）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ４－ＯＨ（１２）の調製：
Figure 0007485642000074
上記実施例１からの、生成物７（２．４４ｇ、１．４４ｍｍｏｌ）を、ＤＣＭ（３０ｍＬ）中に溶解し、そして、アルゴン雰囲気下に置いた。前記溶液に、ＨＯ－ＰＥＧ４－ＣＯ２ＴＦＰエステル１１（７１７ｍｇ、１．７３ｍｍｏｌ）およびＤＩＰＥＡ（５０２μＬ、２．８８ｍｍｏｌ）を加えた。得られた混合物を１６時間撹拌した。その反応混合物を、真空中で濃縮し、そして、ＣＨＣｌ３中に再溶解した。次に、その溶液を、撹拌しているＥｔ２Ｏ（９０ｍＬ）に滴下して加えた。沈殿物を、分離し、Ｅｔ２Ｏですすぎ、そして、真空中で乾燥させて、２．６０ｇ（１０２％）の生成物１２を得、そしてそれを更なる精製なしで使用した。
２）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ４ホスホラミダイト（１３）の調製：
生成物１２（１．８０ｇ、１．０１ｍｍｏｌ）を、ピリジンと共に２回共留去した後、無水ジクロロメタン（２５ｍＬ）中に溶解し、アルゴン雰囲気下に置いた。その溶液に、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド（８７ｍｇ、０．５１ｍｍｏｌ）および２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（４５８ｍｇ、１．５２ｍｍｏｌ）を加えた。その反応混合物を、ＴＬＣ（ＣＨＣｌ３：ＭｅＯＨ：Ｅｔ３Ｎ ９５：５：２）で観察しながら、室温で５時間撹拌した。すべての開始物質が消費された時点で、その反応混合物を、ＤＣＭ（２５０ｍＬ）で希釈し、飽和した水性ＮａＨＣＯ３（１００ｍＬ）、そして、飽和した水性塩水（１００ｍＬ）で洗浄した。有機層を、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、そして、濃縮した。未精製物をカラムクロマトグラフィー（ＤＣＭ：ＭｅＯＨ：Ｅｔ３Ｎ ９７：３：２）で精製して、１．０４ｇ（５３％）の化合物１３を得た。化合物１３（本明細書中の構造１０３ｄ）の１Ｈ ＮＭＲを図７に示す。
実施例３．標的化リガンド、ホスホラミダイト化合物、構造１０２ｄの合成
１）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ４－ＯＨ（１５）の調製：
Figure 0007485642000075
上記実施例１からの、生成物７（３．０９ｇ、１．８２ｍｍｏｌ）を、ＤＣＭ（３０ｍＬ）中に溶解し、そして、アルゴン雰囲気下に置いた。前記溶液に、ＨＯ－ＰＥＧ８－ＣＯ２ＴＦＰエステル１４（１．２９ｇ、２．１８ｍｍｏｌ）およびＤＩＰＥＡ（６３４μＬ、３．６４ｍｍｏｌ）を加えた。得られた混合物を１６時間撹拌した。その反応混合物を、真空中で濃縮し、そして、ＣＨＣｌ３中に再溶解した。次に、その溶液を、撹拌しているＥｔ２Ｏ（１８０ｍＬ）に滴下して加えた。沈殿物を、分離し、Ｅｔ２Ｏですすぎ、そして、真空中で乾燥させて、３．５４ｇ（９９％）の生成物１５を得、そしてそれを更なる精製なしで使用した。
２）トリ－ＮＡＧ－ビス－Ｇｌｕ－ＮＨ－ＰＥＧ８ホスホラミダイト（１６）の調製：
生成物１５（１．７９ｇ、０．９２ｍｍｏｌ）を、ピリジンと共に２回共留去した後、無水ジクロロメタン（２５ｍＬ）中に溶解し、アルゴン雰囲気下に置いた。その溶液に、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド（７９ｍｇ、０．４６ｍｍｏｌ）および２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト（４１６ｍｇ、１．３８ｍｍｏｌ）を加えた。その反応混合物を、ＴＬＣ（ＣＨＣｌ３：ＭｅＯＨ：Ｅｔ３Ｎ ９５：５：２）で観察しながら、室温で３時間撹拌した。すべての開始物質が消費された時点で、その反応混合物を、真空中で濃縮し、そして、ＤＣＭで再溶解した。次に、その溶液を、撹拌しているＥｔ２Ｏ（９０ｍＬ）に滴下して加えた。沈殿物を分離し、Ｅｔ２Ｏですすぎ、そして、乾燥させた。未精製物をカラムクロマトグラフィー（ＣＨＣｌ３：ＭｅＯＨ：Ｅｔ３Ｎ ９７：３：２）で精製して、９５０ｍｇ（４８％）の化合物１６を得た。化合物１６（本明細書中の構造１０２ｄ）の１Ｈ ＮＭＲを図８に示す。
実施例４．オリゴヌクレオチド組成合成
Ａ．合成
ＲＮＡｉ剤を、オリゴヌクレオチド合成で使用される固相上のホスホラミダイト技術に従って合成された。スケールに応じて、MerMade96E（Bioautomation）またはMerMadel2（Bioautomation）を使用した。合成は、制御細孔ガラス（ＣＰＧ、５００Åまたは６００Å、Prime Synthesis, Aston, PA, USAから得られる）からなる固体支持体上で行った。すべてのＲＮＡ、２’－修飾ＲＮＡ、およびＵＮＡホスホラミダイトは、Thermo Fisher Scientific（Milwaukee, WI, USA）から購入した。具体的には、以下の２’－Ｏ－メチルホスホラミダイトを使用した：（５’－Ｏ－ジメトキシトリチル－Ｎ６－（ベジゾイル）－２’－Ｏ－メチル－アデノシン－３’－Ｏ－（２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルアミノ）ホスホラミダイト、５’－Ｏ－ジメトキシ－トリチル－Ｎ４－（アセチル）－２’－Ｏ－メチル－シチジン－３’－Ｏ－（２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルアミノ）ホスホラミダイト、（５’－Ｏ－ジメトキシトリチル－Ｎ２－（イソブチリル）－２’－Ｏ－メチル－グアノシン－３’－Ｏ－（２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルアミノ）ホスホルアミダイト、および５’－Ｏ－ジメトキシトリチル－２’－Ｏ－メチル－ウリジン－３’－Ｏ－（２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルアミノ）ホスホラミダイト。標的化リガンド含有ホスホラミダイトを、無水ジクロロメタンまたは無水アセトニトリル（５０ｍＭ）に溶解したが、他のすべてのアミダイトを無水アセトニトリル（５０ｍＭ）に溶解し、そして、モレキュラーシーブ（３Å）を加えた。活性化剤溶液として５－ベンジルチオ－１Ｈ－テトラゾール（ＢＴＴ、アセトニトリル中２５０ｍＭ）または５－エチルチオ－１Ｈ－テトラゾール（ＥＴＴ、アセトニトリル中２５０ｍＭ）を使用した。カップリング時間は１０分（ＲＮＡ）、１５分（標的化リガンド）、９０秒（２’ＯＭｅ）、および６０秒（２’Ｆ）であった。ホスホロチオエート結合を導入するために、無水アセトニトリル中の３－フェニル１，２，４－ジチアゾリン－５－オン（POS、Poly Org, Inc., Leominster, MA, USAから入手した）の１００ｍＭ溶液を使用した。
Ｂ．支持体に結合したオリゴマーの切断と脱保護
固相合成の終了後、乾燥した固体支持体を、水中の４０ｗｔ％メチルアミンと２８％水酸化アンモニウム溶液（Aldrich）の１：１容量溶液で３０℃で２時間処理した。溶液を蒸発させ、固体残渣を水で復元した（下記参照）。
Ｃ．精製
未精製オリゴマーを、TKSgel SuperQ-5PW1 3uカラムおよびShimadzu LC-8システムを使用した陰イオン交換ＨＰＬＣにより精製した。緩衝液Ａは２０ｍＭのＴｒｉｓ、５ｍＭのＥＤＴＡ、ｐＨ９．０であり、２０％のアセトニトリルを含有し、緩衝液Ｂは緩衝液Ａと同じであるが１．５Ｍの塩化ナトリウムを添加した。２６０ｎｍにおけるＵＶトレースを記録した。適切な画分を貯留し、次に１００ｍＭの重炭酸アンモニウムｐＨ６．７および２０％のアセトニトリルから成る泳動バッファーと共に、セファデックスＧ‐２５媒体を充填したGE Healthcare XK16/40カラムを使用したサイズ排除ＨＰＬＣに流した。
Ｄ．アニーリング
０．２×ＰＢＳ（リン酸緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることにより相補鎖を混合して、ＲＮＡｉ剤を形成した。この溶液を７０℃のサーモミキサーに入れ、９５℃に加熱し、９５℃で５分間保持し、ゆっくりと室温まで冷却した。一部のＲＮＡｉ剤を凍結乾燥し、－１５～－２５℃で保存した。二本鎖濃度は、０．２×ＰＢＳ中で紫外－可視分光計で溶液の吸光度を測定することにより決定した。次に２６０ｎｍでの溶液の吸光度に変換係数および希釈率を掛けて、二本鎖濃度を決定した。特に断りのない限り、すべての変換係数は０．０３７ｍｇ／（ｍＬ・ｃｍ）であった。いくつかの実験では、変換係数を、実験的に決定された吸光係数から計算した。
実施例５．異なった長さのＰＥＧリンカーを伴った標的化リガンドを含むホスホラミダイト含有化合物の特性
以下の標的化リガンドホスホラミダイト化合物を、実施例１～４において先に開示した方法に従って合成した：
Figure 0007485642000076
 （構造１０１ｄ）；
Figure 0007485642000077
 （構造１０２ｄ）；
Figure 0007485642000078
 （構造１０３ｄ）。
構造１０１ｄ、１０２ｄ、および１０３ｄのホスホラミダイト化合物のそれぞれを、一本鎖オリゴヌクレオチドＡＭ０３７０４－ＳＳの５’末端における結合のための１６の同等物で送達し、そしてそれは、Ｆ１２を標的化する二本鎖ＲＮＡｉ剤を合成する際に使用し得るセンス鎖である。ＡＭ０３７０４は、以下の表に示したヌクレオチド配列を有する：
表１．実施例５のセンス鎖配列
Figure 0007485642000079
前記組成物は、ジクロロメタン（ＤＣＭ）中に可溶化され、そして、シーブ上で乾燥させた。構造１０３ｄ（すなわち、ＰＥＧ－４リンカーを有する）のホスホラミダイト化合物は、０．０５Ｍおよび０．２５Ｍの両方でゲル化の問題を提示した。図９に示したように、これらの条件下、非常に少量の標的化リガンド構造１０３ｄだけを、オリゴヌクレオチドＡＭ０３７０４－ＳＳの５’末端に結合させることができる。
構造１０１ｄおよび１０２ｄの両方が、オリゴヌクレオチドへの標的化リガンドの結合を示した。図９は、構造１０１ｄに結合したＡＭ０３７０４のＨＰＬＣクロマトグラフを示す。構造１０１の標的化リガンドに関して、標的化リガンド複合オリゴヌクレオチド（ＦＬＰ＝完全長の生成物）の約７８％が形成された。図１０は、構造１０２ｄに結合したＡＭ０３７０４に関するＨＰＬＣクロマトグラフを示す。標的化リガンド複合オリゴヌクレオチドの約４０％が形成され、それに対して、オリゴヌクレオチドの約６０％が非結合のまま残った。
驚いたことに、かつ、意外にも、１６の同等物にて、構造１０１ｄは、配列の５’末端におけるオリゴヌクレオチドへの複合体形成に関して、構造１０２ｄおよび構造１０３ｄの両方を実質的にしのぐ。さらに、構造１０１ｄおよび１０２ｄの両方が、構造１０３ｄと比較して優れた溶解性を示した。先に述べたように、構造１０３ｄは、標準的な濃度、およびオリゴヌクレオチド合成に典型的な溶媒条件を使用して溶解することは難しかった。（構造１０３ｄのホスホラミダイト化合物を使用することによって）構造１０３の標的化リガンドを有する発現阻害オリゴマー化合物に連結した標的化リガンドの製造は、より攻撃的な極性溶媒の添加を必要とした。
実施例６．野性型マウスにおける、Ｆ１２発現阻害オリゴマー化合物を使用したＧａｌＮＡｃ標的化リガンドの３’および５’センス鎖付着部位の比較
センス鎖の３’および５’末端の間のＧａｌＮＡｃリガンドの付着部位における差を評価するために、以下の表２に示した配列を有する、Ｆ１２（本明細書中でＦ１２ ＲＮＡｉ剤とも呼ばれる）に向けられた発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表２．実施例６のＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（ＲＮＡｉ剤二本鎖）
Figure 0007485642000080
上記の、表２では、以下の表記を使用する：
（ＮＡＧ１５）＝
Figure 0007485642000081
 （ＮＡＧ１８）＝
Figure 0007485642000082
（ＮＡＧ１８）は、本明細書中で構造２によって表される化学構造を有する。
Ｆ１２ ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ１５）または（ＮＡＧ１８））に連結したＦ１２ ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンドに連結したＦ１２ ＲＮＡｉ剤を、ＳＣ注射によって送達した。１日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中の２種類のＦ１２ ＲＮＡｉ剤（ＡＤ０２８０３またはＡＤ０２８０７）のうちの一方の３ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量のいずれかを含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスのＳＣ注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に行った。１処置群あたり三（３）匹の野性型マウスが存在する。先に示したとおり、ＡＤ０２８０３は、センス鎖の３’末端に取り付けられた（ＮＡＧ１５）を含むが、それに対して、ＡＤ２８０７は、センス鎖の５’末端に取り付けられた（ＮＡＧ１８）を含む。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、８、１５、２２、および２９日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA（登録商標）（Perkin Elmer）によって、血清中の循環マウスＦ１２タンパク質（ｍＦ１２）レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。特定の採血日における発現を、それと同じ日付の生理食塩水対照群の平均に対して正規化した。
図１２はこの試験の結果を示す。最も低いとき（２２日目）には、ＡＤ０２８０３は、循環Ｆ１２レベルの約７０％の低減を示したが、それに対して、ＡＤ０２８０７は、８０％超の低減を示した。２９日目にて、ＡＤ２８０７処置マウスと比較して、ＡＤ０２８０３処置マウスがベースラインへのより早い復帰を示したので、該データはまたノックダウン効果の長さの差も示している。これらのデータは、センス鎖の５’末端におけるＧａｌＮＡｃリガンドの連結が、３’センス鎖における連結より優れていることを裏付けている。
実施例７．野性型マウスにおける、Ｆ１２発現阻害オリゴマー化合物を使用したＧａｌＮＡｃ標的化リガンドの３’および５’センス鎖付着部位の更なる比較
二本鎖の発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）のセンス鎖の３’および５’末端のＧａｌＮＡｃリガンドの付着部位を更に評価するために、以下の表３に示した配列を有する、Ｆ１２に向けられた組成物を調製した：
表３．実施例７のＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（ＲＮＡｉ剤二本鎖）
Figure 0007485642000083
上記の、表３では、以下の表記を使用する：
（ＮＡＧ２０）＝
Figure 0007485642000084
（ＮＡＧ２０）は、本明細書中で構造４によって表される化学構造を有する。
Ｆ１２ ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ２０））に連結したＦ１２ ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンドに連結したＦ１２ ＲＮＡｉ剤を、ＳＣ注射によって送達した。１日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中の２種類のＦ１２ ＲＮＡｉ剤（ＡＤ０２８１５またはＡＤ０２８１６）のうちの一方の３ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量のいずれかを含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスのＳＣ注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に行った。１処置群あたり三（３）匹の野性型マウスが存在する。表３で先に示したとおり、ＡＤ２８１５は、センス鎖の５’末端に取り付けられた（ＮＡＧ２０）を含むが、それに対して、ＡＤ０２８１６は、センス鎖の３’末端に取り付けられた（ＮＡＧ２０）を含む。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、８、１５、２２、および２９日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA（登録商標）（Perkin Elmer）によって、血清中の循環マウスＦ１２タンパク質（ｍＦ１２）レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。特定の採血日における発現を、それと同じ日付の生理食塩水対照群の平均に対して正規化した。
図１３はこの実験の結果を示す。最も低いとき（２２日目）には、ＡＤ０２８１６は、循環Ｆ１２タンパク質レベルの約６０％の低減を示したが、それに対して、ＡＤ０２８１５は、７９％の低減を示した。２９日目において、ＡＤ０２８１５処置マウスは、生理食塩水レベルから７１％のノックダウンを示したが、それに対して、ＡＤ０２８１６処置マウスは、４０％のノックダウンを示す。これらのデータは、センス鎖の５’末端におけるＧａｌＮＡｃリガンドの連結を支持している。
実施例８．Ｌｐ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスにおける、構造１０１の標的化リガンドに連結したＬｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
以下の表５に示した配列を有する、Ｌｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表４．実施例８のＬＰ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
Figure 0007485642000085
上記の、表４では、以下の表記を使用する：
（ＮＡＧ２５）＝
Figure 0007485642000086
 （ＮＡＧ２９）＝
Figure 0007485642000087
（ＮＡＧ２５）は、本明細書中で構造１０１によって表される化学構造を有する。
Ｌｐ（ａ） ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Ｌｐ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウス（Frazer KA et al 1995, Nature Genetics 9:424-431）を、インビボにおいて複合化Ｎ－アセチル－ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖ＲＮＡｉ剤の有効性を評価するために使用した。このマウスは、５’および３’の追加配列を伴った（ａｐｏ（ａ）タンパク質をコードする）完全なＬＰＡ遺伝子を含有するＹＡＣ含有からヒトａｐｏ（ａ）、ならびにヒトａｐｏＢ－１００を発現し、それによって、ヒト化Ｌｐ（ａ）粒子（これ以降「Ｌｐ（ａ）Ｔｇマウス」とも呼ばれる）を産生する（Callow MJ et al 1994, PNAS 91:2130-2134）。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ２５）または（ＮＡＧ２９））に連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の５’末端にてそれぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ２５）または（ＮＡＧ２９））に連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、ＳＣ注射によって送達した。１日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のそれぞれのＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤（ＡＤ０３５４７またはＡＤ０３５４９）のうちの一方の１ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量のいずれかを含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスのＳＣ注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に行った。１処置群あたり四（４）匹のＬｐ（ａ）Ｔｇマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、－１（投与前）、５、１１、１６、２２、２９、および３６日目に採取した。血清中の循環Ｌｐ（ａ）粒子レベルを計算することによって、ノックダウンを測定した。Ｌｐ（ａ）粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas（登録商標）Integra400（Roche Diagnostics）により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するＬｐ（ａ）レベルを、（この場合、－１日目における）その動物の投与前発現レベルで割って、「－１日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「－１日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「－１日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
結果を図１４に示す。ＡＤ０３５４９（ＮＡＧ２５）は、最も低いとき（１６日目）７１％のノックダウンを示し、そして、ＡＤ０３５４７（ＮＡＧ２９）は、最も低いとき（１１日目）８１％のノックダウンを示した。両トリガーは、最低の時点以降、３６日目に２６％未満のノックダウンを有する、類似した回復カーブを示した。これらのデータは、示したＧａｌＮＡｃリガンドが、単回の１ｍｇ／ｋｇの用量を用いたＬｐ（ａ）Ｔｇマウスにおいて、初期ノックダウン活性とノックダウンの持続性の両方で共通点があることを裏付けている。
実施例９．構造１０１の標的化リガンドに連結したＬｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）の投与後のＬｐ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスにおけるＬｐ（ａ）ノックダウン
以下の表５に示した配列を有する、Ｌｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表５．実施例９のＬＰ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
Figure 0007485642000088
表５では、（ＮＡＧ２５）は、先に実施例８に示したものと同じ構造であり、本明細書中の構造１０１に表される化学構造を有する。
Ｌｐ（ａ） ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Ｌｐ（ａ）Ｔｇマウスを、インビボにおいて複合化Ｎ－アセチル－ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖ＲＮＡｉ剤の有効性を評価するために使用した。
標的化リガンド構造１０１に連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の５’末端にて標的化リガンドに連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、ＳＣ注射によって送達した。１日目に、ＳＣ注射を、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のＲＮＡｉ剤ＡＤ０３２７２のいずれかの１ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量を含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスにて、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。１処置群あたり四（４）匹のＬｐ（ａ）Ｔｇマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、－１（投与前）、８、１５、２２、２９、３６、および４３日目に採取した。血清中の循環Ｌｐ（ａ）粒子レベルを計算することによって、ノックダウンを測定した。Ｌｐ（ａ）粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas（登録商標）Integra400（Roche Diagnostics）により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するＬｐ（ａ）レベルを、（この場合、－１日目における）その動物の投与前発現レベルで割って、「－１日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「－１日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「－１日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
結果を図１５に示す。ＡＤ０３２７２は、最も低いとき（１５日目）８８％のノックダウンを示し、そして、２９日目に７５％のノックダウンが残った。これらのデータは、構造１００８の標的化リガンドが、肝臓に対してＬＰＡ標的化ＲＮＡｉ剤を標的化することができ、そして、トランスジェニックマウスにおいて単回の１ｍｇ／ｋｇの投与量を用いて＞８５％のノックダウンを得ることができることを裏付けている。
実施例１０．構造１０１、１０２、および１０３の標的化リガンドに連結したＬｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）の投与後のａｐｏ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスにおけるアポリポタンパク質（ａ）（ａｐｏ（ａ））ノックダウン
以下の表４に示した配列を有する、Ｌｐ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表６．実施例１０のＬＰ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
Figure 0007485642000089
先の表６では、以下の表記を使用する：
（ＮＡＧ２６）＝
Figure 0007485642000090
 ；（ＮＡＧ２７）＝
Figure 0007485642000091
さらに、（ＮＡＧ２５）は、先に実施例８に示したものと同じ構造であり、本明細書中の構造１０１に表される化学構造を有する。（ＮＡＧ２６）は、本明細書中の構造１０２に表される化学構造を有する。（ＮＡＧ２７）は、本明細書中の構造１０３に表される化学構造を有する。表８で先に示したとおり、選択された異なる標的化リガンドを除いて、組成物は同一である。
Ｌｐ（ａ） ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例１０に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
Ａｐｏ（ａ）トランスジェニック（Ｔｇ）マウスを、インビボにおいて複合化Ｎ－アセチル－ガラクトサミンリガンドを伴った二本鎖ＲＮＡｉ剤の有効性を評価するために使用した。Ａｐｏ（ａ）Ｔｇマウス（Frazer KA et al 1995, Nature Genetics 9:424-431）は、５’および３’の両方の追加配列を伴った（ａｐｏ（ａ）タンパク質をコードする）完全なＬＰＡ遺伝子を含有するＹＡＣ含有からヒトａｐｏ（ａ）（これ以降「ａｐｏ（ａ）Ｔｇマウス」とも呼ばれる）を産生する。
それぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ２５）、（ＮＡＧ２６）、または（ＮＡＧ２７））に連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
センス鎖の５’末端にてそれぞれのＧａｌＮＡｃリガンド（すなわち、（ＮＡＧ２５）、（ＮＡＧ２６）、または（ＮＡＧ２７））に連結したＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤を、ＳＣ注射によって送達した。１日目に、ＳＣ注射は、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のそれぞれのＲＮＡｉ剤（ＡＤ０３２７５、ＡＤ０３３４１、またはＡＤ０３４２１）の１ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量のいずれかを含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスを、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。１処置群あたり三（３）匹のａｐｏ（ａ）Ｔｇマウスが存在する。
処置マウスからの血清サンプルを、－１（投与前）、８、１５、２２、２９、３６、および４３日目に採取した。ａｐｏ（ａ）のELISA（Abcam）を使用して、血清中の循環ａｐｏ（ａ）タンパク質レベルを観察することによって、ノックダウンを測定した。Ｌｐ（ａ）粒子レベルを、製造業者の推奨に従って、Cobas（登録商標）Integra400（Roche Diagnostics）により計測した。正規化のために、ある時点での各動物に関するＬｐ（ａ）レベルを、（この場合、－１日目における）その動物の投与前発現レベルで割って、「－１日目に対して正規化した」発現率を決定した。次に、生理食塩水対照群におけるすべてのマウスに関する平均「－１日目に対して正規化した」比によって個々の動物に関する「－１日目に対して正規化した」比率を割ることによって、特定の時点での発現を生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群における発現に対して正規化したそれぞれの時点に対する発現をもたらした。実験誤差を、平均の標準誤差として示す。
結果を図１６に示す。標的化リガンド構造１０１（ＮＡＧ２５）を含む、Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤ＡＤ０３２７５は、最も低いとき（２２日目）８２％のノックダウンを示し、そして、２９日目に７２％のノックダウンが残った。標的化リガンド構造１０２（ＮＡＧ２６）を含む、Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤ＡＤ０３３４１は、最も低いとき（１５日目）８７％のノックダウンを示すが、しかしながら、２９日目のノックダウンは４５％であり、投与前のａｐｏ（ａ）レベルに戻るまで増加することを示している。標的化リガンド構造１０３（ＮＡＧ２７）を含む、Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤ＡＤ０３４２１は、最も低いとき（１５日目）７０％のノックダウンを示し、そして、２９日目では５０％のノックダウンを示した。これらのデータは、構造１０１（ＮＡＧ２５）、構造１０２（ＮＡＧ２６）、および構造１０３（ＮＡＧ２７））がすべて、類似したノックダウン活性を示すことを裏付けている。しかしながら、これらのデータはまた、ＡＤ０３２７５（構造１０１（ＮＡＧ２５））が優れた持続期間を有し、かつ、構造１０２（ＮＡＧ２６）および構造１０３（ＮＡＧ２７）より良好なノックダウン（２９日目に７２％のノックダウン）を維持することを示している。
実施例１１．カニクイザルにおける、標的化リガンド構造１０１に連結したＬＰ（ａ）発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
構造１０１によって表される標的化リガンドに連結した５種類の異なるＬＰＡ ＲＮＡｉ剤を、カニクイザルマカク（カニクイザル（Macaca fascicularis））霊長動物におけるそれらの性能を評価するために調製した：ＡＤ０３４６０、ＡＤ０３５３６、ＡＤ０３８５１、ＡＤ０３８５３、およびＡＤ０４１１０。
Ｌｐ（ａ） ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
五（５）種類のＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤のすべての標的化リガンドを、一般的に本明細書中に記載され、そして、当該技術分野で知られている非ヌクレオシドホスホラミダイト合成を使用して、センス鎖の５’末端に加えた。Ｌｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤のそれぞれの標的化リガンドを、以下のホスホラミダイト化合物を使用したそれぞれのＲＮＡｉ剤の５’末端に連結した：
Figure 0007485642000092
 （構造１０１ｄ）。
ＡＤ０３４６０およびＡＤ０３５３６を含む標的化リガンド（ＮＡＧ２５）は、それぞれのＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に結合した。（ＮＡＧ２５）は、先の実施例８に示したのと同じ構造を有する。
ＡＤ０３８５１、ＡＤ０３８５３、およびＡＤ０４１１０を含む標的化リガンド（ＮＡＧ２５）ｓは、それぞれのＲＮＡｉ剤のセンス鎖の５’末端に結合した。
（ＮＡＧ２５）ｓ＝
Figure 0007485642000093
 。
血液サンプルを、８日目および１５日目のリポタンパク質（ａ）レベルについて描図し、そして、分析した。Ｌｐ（ａ）レベルを、３つの投与前の値の平均に対して正規化した。正規化Ｌｐ（ａ）レベルを、以下の表中に報告する：
Figure 0007485642000094
これらのデータは、有意なノックダウンが、本明細書中の構造１０１の同じ標的化リガンド構造に結合した複数の異なるＬｐ（ａ）ＲＮＡｉ剤の２ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量にてカニクイザルで達成されたことを示している。
実施例１２：カニクイザルにおける、構造１０１の標的化リガンドに連結したＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
以下の表８に示した配列を有する、Ｆ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖Ｆ１２ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表８．実施例１２のＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
Figure 0007485642000095
先の表８では、（ＮＡＧ２５）は、実施例８に示したものと同じ構造を表し、本明細書中の構造１０１によって表される。
Ｌｐ（ａ） ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例４に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
センス鎖の５’末端にて標的化リガンドに連結したＦ１２ＲＮＡｉ剤を、作製し、そして、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーに組み合わせた。
１日目に、カニクイザルマカク（カニクイザル）霊長動物に、３ｍｇ／ｋｇのＡＤ０３６３５と共に皮下に注射した。１処置群あたり三（３）匹のサルに投薬した。
ノックダウンを観察するために、処置したカニクイザルからの血清サンプルを、－７日目および１日目（投与前）、ならびに８、１５、および２２日目に採取した。ノックダウンを、ヒトＦ１２のELISAキット（Molecular Innovations）によって血清中の循環ｃｙｎｏ Ｆ１２タンパク質（ｃＦ１２）レベルを定量化することによって計測した。それぞれの時点における各動物のｃＦ１２レベルを、その動物における発現の処置前レベル（－７日目と１日目の平均）で割って、「投与前に対して正規化した」発現率を決定した。実験誤差を標準偏差として示す。
図１７は結果を示している。（ＮＡＧ２５）（本明細書中の構造１０１）に連結したＦ１２ ＲＮＡｉ剤は、カニクイザルにおいてノックダウンを示した。
実施例１３：ＰｉＺトランスジェニックマウスにおける、構造１０１の標的化リガンドに連結したα－１アンチトリプシン発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
インビボにおいてα－１アンチトリプシン（ＡＡＴ）遺伝子に向けられたＲＮＡｉ剤を評価するために、トランスジェニックＰｉＺマウス・モデル（ＰｉＺマウス）を使用した。ＰｉＺマウスは、ヒトＰｉＺ ＡＡＴ変異対立遺伝子およびモデルヒトＡＡＴＤ（Carlson et al., Journal of Clinical Investigation 1989）を有する。
以下の表９に示した配列を有する、ＡＡＴ発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表９．実施例１３のＡＡＴ発現阻害オリゴマー化合物（ＲＮＡｉ剤二本鎖）
Figure 0007485642000096
表９では、（ＮＡＧ２５）ｓは、先の実施例１１に示した化学構造を有する。
ＡＡＴ ＲＮＡｉ剤を、医薬的に許容される生理食塩バッファー中で調製し、そして、ＡＡＴ遺伝子発現のノックダウンを評価するために、ＰｉＺマウスには、背部の肩間の弛んだ皮膚内に、２００μｌの溶液／２０ｇマウスの皮下（ＳＣ）注射によって投与した。各マウスのは、５ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）のＡＤ０４４５４の単回ＳＣ投与量を与えた。３匹のマウスに、ＡＡＴ ＲＮＡｉ剤を投与した（ｎ＝３）。
血漿サンプルを、－１日目、１日目（投与前）、８日目、および１５日目のＡＡＴ（Ｚ－ＡＡＴ）タンパク質レベルについて描図し、そして、分析した。ＡＡＴレベルを、１日目（投与前）のＡＡＴ血漿レベルに対して正規化した。タンパク質レベルを、ELISAキットによって血漿中の循環ヒトＺ－ＡＡＴレベルを定量化することによって計測した。
平均した正規化ＡＡＴ（Ｚ－ＡＡＴ）レベルを図１８に示す。本明細書中の構造１０１の標的化リガンドに連結したＡＡＴ ＲＮＡｉ剤は、ＰｉＺトランスジェニックマウスにおいてノックダウンを示した。
実施例１４：構造１０１の標的化リガンドに連結したＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）の投与後の、野生型マウスにおけるＦ１２ノックダウン
以下の表１０に示した配列を有する、Ｆ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖Ｆ１２ＲＮＡｉ剤）を調製した：
表１０．実施例１４のＦ１２発現阻害オリゴマー化合物（二本鎖ＲＮＡｉ剤）
Figure 0007485642000097
表１０では、（ＮＡＧ２５）は、実施例８に示した化学構造を有し、本明細書中に開示した構造１０１によって表される。
Ｆ１２ ＲＮＡｉ剤のそれぞれの鎖は、MerMade96E（登録商標）（Bioautomation）またはMerMade12（登録商標）（Bioautomation）のいずれかを使用したオリゴヌクレオチド合成に使用される固相におけるホスホラミダイト技術に従って合成し、そして、相補鎖を、本明細書中に一般的に実施例１０に記載の方法に従って、０．２×ＰＢＳ（ホスファート緩衝化生理食塩水、１×、Corning, Cellgro）中で等モルＲＮＡ溶液（センスおよびアンチセンス）を組み合わせることによって混合して、二本鎖を形成した。
それぞれのＧａｌＮＡｃ標的化リガンド（すなわち、（ＮＡＧ２５））に結合したＦ１２ ＲＮＡｉ剤を、皮下（ＳＣ）注射のために当該技術分野で知られている医薬的に許容されるバッファーと組み合わせた。
前記組成物をＳＣ注射によって送達した。１日目に、生理食塩水、または緩衝化生理食塩水中のＡＤ０３６３２の３ｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量のいずれかを含む、２００μｌ溶液／２０ｇマウスのＳＣ注射を、背部の肩間の弛んだ皮膚に投与した。１処置群あたり三（３）匹の野性型マウスが存在する。先に示したとおり、ＡＤ０３６３２は、センス鎖の５’末端に連結された構造（ＮＡＧ２５）を含む。
ノックダウンを観察するために、治療したマウスの血清サンプルを、－１（投与前）、８、１５、２２、２９、および３６日目に採取した。内部に発現したmF12 alphaLISA（登録商標）（Perkin Elmer）によって、血清中の循環マウスＦ１２タンパク質（ｍＦ１２）レベルを定量化することによって、ノックダウンを計測した。それぞれの時点における各動物のｍＦ１２レベルを、その動物における前処理発現レベルで割って、「投与前に対して正規化した」発現率を決定した。次に、個々の動物に関する「投与前日に対して正規化した」比率を、生理食塩水対照群のすべてのマウスの平均「投与前日に対して正規化した」比率で割ることによって、特定の時点における発現を、生理食塩水対照群に対して正規化した。これは、対照群の発現に対して正規化されたそれぞれの時点における発現をもたらした。実験誤差を標準偏差として示す。
この試験からの結果を図１９に示す。本明細書中に開示した標的化リガンド構造１０１を含んで成るＡＤ０３６３２は、すべての時点を通じて有意なノックダウンを示す。
他の実施形態
本発明を、その詳細な説明と併せて説明したが、前述の説明は例示を意図するものであり、添付の特許請求の範囲により定義される本発明の範囲を限定するものではないことを理解されたい。他の態様、利点、および変更は、以下の請求項の範囲内である。

Claims (19)

  1. ４，５－ジシアノイミダゾールの存在下で、
    を、
    ２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト
    と反応させて
    を生成することを含む、化合物１０の調製方法。
  2. トリエチルアミンの存在下で、
    を、
    （式中、ＴＦＰはテトラフルオロフェニルである）と反応させて化合物９を生成することを更に含む、請求項１に記載の方法。
  3. Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの存在下で、
    を、
    （式中、ＴＦＰはテトラフルオロフェニルである）と反応させて化合物９を生成することを更に含む、請求項１に記載の方法。
  4. Ｐｄ／Ｃ及びｐ－トルエンスルホン酸の存在下で、Ｈ２で
    を水素化してトシラート塩７を生成することを更に含む、請求項２又は３に記載の方法。
  5. ２－（１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－１，１，３，３－テトラメチルアミニウム テトラフルオロボレート（ＴＢＴＵ）及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）の存在下で、
    を、
    と反応させて化合物６を生成することを更に含む、請求項４に記載の方法。
  6. をギ酸と反応させて化合物４を生成することを更に含む、請求項５に記載の方法。
  7. クロロギ酸イソブチル及びＮ－メチルモルホリン（ＮＭＭ）の存在下で、
    を、
    と反応させて化合物３を生成することを更に含む、請求項６に記載の方法。
  8. クロロギ酸イソブチル及びＮ－メチルモルホリン（ＮＭＭ）の存在下で、
    を、
    と反応させて
    を生成し；
    化合物３をギ酸と反応させて
    を生成し；
    ２－（１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－１，１，３，３－テトラメチルアミニウム テトラフルオロボレート（ＴＢＴＵ）及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）の存在下で、化合物４を
    と反応させて
    を生成し；
    Ｐｄ／Ｃ及びｐ－トルエンスルホン酸の存在下で、Ｈ２で化合物６を水素化して
    を生成し；
    トリエチルアミンの存在下で、トシラート塩７を
    （式中、ＴＦＰはテトラフルオロフェニルである）と反応させて
    を生成し；
    ４，５－ジシアノイミダゾールの存在下で、化合物９を
    ２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト
    と反応させて
    を生成することを含む、化合物１０の調製方法。
  9. クロロギ酸イソブチル及びＮ－メチルモルホリン（ＮＭＭ）の存在下で、
    を、
    と反応させて
    を生成し；
    化合物３をギ酸と反応させて
    を生成し；
    ２－（１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－１，１，３，３－テトラメチルアミニウム テトラフルオロボレート（ＴＢＴＵ）及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）の存在下で、化合物４を
    と反応させて
    を生成し；
    Ｐｄ／Ｃ及びｐ－トルエンスルホン酸の存在下で、Ｈ２で化合物６を水素化して
    を生成し；
    Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの存在下で、トシラート塩７を
    （式中、ＴＦＰはテトラフルオロフェニルである）と反応させて
    を生成し；
    ４，５－ジシアノイミダゾールの存在下で、化合物９を
    ２－シアノエチル－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトライソプロピルホスホロジアミダイト
    と反応させて
    を生成することを含む、化合物１０の調製方法。
  10. 以下の構造を含む標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩：
    に結合した発現阻害オリゴマー化合物を含む、対象における標的核酸の発現を阻害するための医薬組成物。
  11. 発現阻害オリゴマー化合物に連結した、以下の構造を含む標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩：
    を含む、発現阻害オリゴマー化合物を哺乳動物細胞に導入するための医薬組成物であって、前記標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩は哺乳動物細胞に接触しており、哺乳動物細胞はヒト対象に存在する、医薬組成物。
  12. 発現阻害オリゴマー化合物がＲＮＡｉ剤である、請求項１１に記載の医薬組成物。
  13. 発現阻害オリゴマー化合物の投与により有益性をもたらすであろう疾患又は障害を治療するための医薬組成物であって、
    発現阻害オリゴマー化合物に連結した、以下の構造を含む標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩：
    を治療量で含む、医薬組成物。
  14. 発現阻害オリゴマー化合物がＲＮＡｉ剤である、請求項１３に記載の医薬組成物。
  15. 以下の構造を含む標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩：
    又は、
  16. 前記標的化リガンドが発現阻害オリゴマー化合物に更に連結される、請求項１５に記載の標的化リガンド。
  17. 以下の構造から成る群から選択される化合物又はその医薬的に許容され得る塩：
    （式中、Ｚは発現阻害オリゴマー化合物から成るかまたはそれを含み、ＡはＯまたはＳであり、かつ、Ａ’はＯ－、Ｓ－、またはＮＨ－である）；
    （式中、Ｚは発現阻害オリゴマー化合物から成るかまたはそれを含み、ＡはＯまたはＳであり、かつ、Ａ’はＯ－、Ｓ－、またはＮＨ－である）；
    （式中、Ｚは発現阻害オリゴマー化合物から成るかまたはそれを含み、ＡはＯまたはＳであり、かつ、Ａ’はＯ－、Ｓ－、またはＮＨ－である）；
    （式中、Ｚは発現阻害オリゴマー化合物から成るかまたはそれを含み、ＡはＯまたはＳであり、かつ、Ａ’はＯ－、Ｓ－、またはＮＨ－である）；及び
    （式中、Ｚは発現阻害オリゴマー化合物から成るかまたはそれを含み、ＡはＯまたはＳであり、かつ、Ａ’はＯ－、Ｓ－、またはＮＨ－である）。
  18. 以下の構造から成る群から選択される化合物又はその医薬的に許容され得る塩：
  19. 以下の構造から成る群から選択される構造を含む標的化リガンド又はその医薬的に許容され得る塩：
    及び
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