JP2022527569A - 治療剤の標的化送達のための多価リガンドクラスター - Google Patents

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Abstract

標的化リガンドクラスターおよびそれらを調製する方法が記載される。標的化リガンドクラスターは、没食子酸のフェノール性ヒドロキシル基に結合している第1のリンカー、および第1のリンカーのそれぞれに結合している1つまたは複数の標的化リガンドを含み得る。標的化リガンドクラスターは、没食子酸のカルボン酸に結合している第2のリンカー、および第2のリンカーに結合している保護基、ホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも1つも含み得る。【選択図】図3

Description

関連する出願
本出願は、2019年3月21日に出願した米国特許仮出願第62/821,628号および2019年12月23日に出願した米国特許仮出願第62/952,607号の米国特許法119条(e)に基づく利益を主張し、それぞれの開示は全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、組成物、および治療分子送達におけるこれらの使用方法に部分的に関する。
オリゴヌクレオチドは、高分子量でポリアニオン性のクラスの化合物である。これらは、一般に、非常に低い膜透過性を有する。ゆえに標的リガンドは、in vivo送達組織特異性および細胞取り込みを向上させるために、多くの場合にオリゴヌクレオチド化合物にコンジュゲートされる。一部の場合には、多価リガンドクラスターが、標的化組織への送達を向上させるのに単一リガンドより有利である。例えば、多価N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)リガンドクラスターは、アシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に個別のGalNAcリガンドより有意に高い結合親和性を有し、ゆえに治療オリゴヌクレオチドを肝臓に送達するのに高い効率を有する。ASGPRは、肝細胞において有意に発現し、受容体エンドサイトーシスを介する効率的な取り込みを媒介することができる。N-アセチルガラクトサミンリガンドおよびリガンドクラスターは、肝細胞へのオリゴヌクレオチド薬物の送達を促進することができる。
本発明の態様によると、式2の標的化リガンドクラスターを含む化合物が提供される:
Figure 2022527569000002
[式中、リンカーAは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、リンカーBは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し、Rは、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキル、イソプロピル基を含み、またはRは窒素原子を介してRと連結して環を形成し、Rは、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキル、イソプロピル基を含み、またはRは窒素原子を介してRと連結して環を形成し、Rは、亜リン酸およびリン酸保護基、または2-シアノエチル基を含む]。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む。ある特定の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む。一部の実施形態では、リン酸保護基は、メチル、アリル、2-シアノエチル、4-シアノ-2-ブテニル、2-シアノ-1,1-ジメチルエチル、2-(トリメチルシリル)エチル、2-(S-アセチルチオ)エチル、2-(S-ピバロイルチオ)エチル、2-(4-ニトロフェニル)エチル、2,2,2-トリクロロエチル、2,2,2-トリクロロ-1,1-ジメチルエチル、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロピル、フルオレニル-9-メチル、2-クロロフェニル、4-クロロフェニル、および2,4-ジクロロフェニルのうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、
Figure 2022527569000003
の1つまたは複数を含み、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である。ある特定の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、
Figure 2022527569000004
の1つまたは複数を含み、
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、Rは、H、メチル(Me)、エチル(Et)、シクロプロピルを含み、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成し、Rは、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成する。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、
Figure 2022527569000005
の1つまたは複数を含み、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iのうちの1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWのうちの1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つは、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドも含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iである。
本発明の別の態様によると、上述の化合物の任意の実施形態を含む組成物が提供される。一部の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、上述の標的化リガンドクラスターの任意の実施形態を含む組成物が提供される。ある特定の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、式3の構造を含む化合物が提供される:
Figure 2022527569000006
[式中、Xは、酸素(O)および硫黄(S)のうちの少なくとも1つであり、Yは、O、S、およびNHのうちの少なくとも1つであり、リンカーAは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、リンカーBは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合している。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、低分子干渉RNA(siRNA)、一本鎖siRNA、マイクロRNA(miRNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、メッセンジャーRNA(mRNA)、リボザイム、プラスミド、免疫刺激核酸、アンタゴミル、およびアプタマーのうちの少なくとも1つを含む。ある特定の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む。ある特定の実施形態では、独立して選択されるリンカーAは、
Figure 2022527569000007
の1つまたは複数を含み、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、
Figure 2022527569000008
の1つまたは複数を含み、
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、Rは、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成し、Rは、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成する。一部の実施形態では、独立して選択されるリンカーBは、
Figure 2022527569000009
の1つまたは複数を含み、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である]。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iのうちの1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWのうちの1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つは、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む。一部の実施形態では、化合物は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iである。
本発明の別の態様によると、上述の化合物の任意の実施形態を含む組成物が提供される。一部の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、式1の標的化クラスターを含む化合物が提供される:
Figure 2022527569000010
[式中、TLは、N-アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、およびN-イソ-ブタノイルガラクトサミンが含まれるが、これらに限定されない1つまたは複数の標的化リガンドであり、1つまたは複数のTLは、同じ標的化リガンドクラスターの1つまたは複数の他のTLと異なっていてもよく、リンカーAは独立して選択され、1つまたは複数の二官能性スペーサーを含み、リンカーAの一方の末端は標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、リンカーBは独立して選択され、二官能性スペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドに結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し、Wは、H、保護基、ホスホラミダイト、またはオリゴヌクレオチドである]。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iの1つまたは複数を含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWの1つまたは複数を含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つは、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドも含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む。
本発明の別の態様によると、上述の化合物の任意の実施形態を含む組成物が提供される。一部の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、上述の標的化リガンドクラスターの任意の実施形態を含む組成物が提供される。ある特定の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、没食子酸に由来する構造モチーフ、没食子酸の各ヒドロキシル基のリンカー、および没食子酸のアミド基のリンカーを含む標的化リガンドクラスターが提供され、リンカーの少なくとも1つは、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む。一部の実施形態では、標的化クラスターは、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドも含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iのうちの1つとして記載される化合物を含む。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWのうちの1つとして記載される化合物を含む。
本発明の別の態様によると、没食子酸のフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している1つまたは複数の独立して選択される第1のリンカーと、第1のリンカーのそれぞれに結合している1つまたは複数の独立して選択される標的化リガンドと、没食子酸のカルボン酸に結合している第2のリンカーと、第2のリンカーに結合している保護基およびホスホラミダイトのうちの少なくとも1つとを含む、標的化リガンドクラスターが提供される。一部の実施形態では、第1のリンカーは、エーテル結合を介してフェノール性ヒドロキシル基に結合している。一部の実施形態では、1つまたは複数の標的化リガンドは、N-アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、およびN-イソ-ブタノイルガラクトサミンのうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、第2のリンカーは、アミド結合を介してカルボン酸に結合している。ある特定の実施形態では、第1のリンカーは、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、アラルキニル基、1つまたは複数のヘテロ原子、1つまたは複数の脂肪族複素環、1つまたは複数のヘテロアリール、1つまたは複数のアミノ酸、1つまたは複数のヌクレオチド、および1つまたは複数の糖類のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、第2のリンカーは、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、アラルキニル基、1つまたは複数のヘテロ原子、1つまたは複数の脂肪族複素環、1つまたは複数のヘテロアリール、1つまたは複数のアミノ酸、1つまたは複数のヌクレオチド、および1つまたは複数の糖類のうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、3つの第1のリンカーは、没食子酸の異なるフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iのうちの少なくとも1つを含む。ある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWのうちの少なくとも1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドも含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む。
本発明の別の態様によると、上述の標的化リガンドクラスターの任意の実施形態を含む組成物が提供される。ある特定の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体をさらに含む。
本発明の別の態様によると、標的化リガンドクラスターを調製する方法であって、没食子酸にエステル化反応を実施して、没食子酸のtert-ブチルエステルを含む第1の化合物を生成するステップと、SN2反応または光延反応を実施して、没食子酸エステルのフェノール性ヒドロキシ基にリンカーAを結合して、第2の化合物を生成するステップと、第2の化合物にグリコシル化反応を実施して、第3の化合物を生成するステップと、第3の化合物に脱保護反応を実施して、第4の化合物を生成するステップと、第4の化合物にアミドカップリング反応を実施して、第5の化合物を生成するステップと、第5の化合物にリン酸化反応を実施するステップとを含む方法が提供される。一部の実施形態では、本方法は、核酸分子を標的化リガンドクラスターに結合し、それによってリガンドクラスター/核酸複合体を形成するステップも含む。ある特定の実施形態では、リガンドクラスター/核酸複合体は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む。
本発明の別の態様によると、標的化リガンドクラスター/核酸複合体が提供され、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、a)没食子酸のフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している1つまたは複数の独立して選択される第1のリンカーを含む標的化リガンドクラスター、b)第1のリンカーのそれぞれに結合している1つまたは複数の独立して選択される標的化リガンド、c)没食子酸のカルボン酸に結合している第2のリンカー、およびd)第2のリンカーに結合している保護基およびホスホラミダイトのうちの少なくとも1つを含み、標的化リガンドクラスターは核酸と結合して、標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する。一部の実施形態では、3つの第1のリンカーが、没食子酸の異なるフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している。一部の実施形態では、2つ以上の独立して選択される第1のリンカーがあり、1つまたは複数が、それぞれ他の第1のリンカーと同じである。ある特定の実施形態では、2つまたは3つの第1のリンカーが他の第1のリンカーと異なっている。一部の実施形態では、核酸はRNA分子、必要に応じてsiRNA分子を含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む。
本発明の別の態様によると、リガンドA~Iのいずれか1つとして記載される化合物が提供される。
本発明の別の態様によると、1つまたは複数のリガンドA~Iを含む組成物が提供される。ある特定の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体も含む。
本発明の別の態様によると、1つまたは複数のリガンドJ~WWを含む組成物が提供される。一部の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体も含む。
本発明の別の態様によると、任意の上述の標的化リガンドクラスターの実施形態を含む組成物が提供され、標的化リガンドクラスターはsiRNAにコンジュゲートされている。ある特定の実施形態では、この組成物は薬学的に許容される担体も含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドA~Iのうちの1つを含む。一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、リガンドJ~WWのうちの1つを含む。一部の実施形態では、siRNAにコンジュゲートしている標的化リガンドクラスターは、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iのうちの1つを含む。
本発明の別の態様によると、細胞における標的遺伝子の発現を低減する方法であって、標的遺伝子を発現することができる細胞を、任意の上述の標的化リガンドクラスターの実施形態と接触させることを含み、標的化リガンドクラスターが、標的遺伝子の発現を低減するsiRNAを含む方法が提供される。ある特定の実施形態では、細胞は、肝臓細胞、心臓細胞、腎臓細胞、免疫系細胞、筋肉細胞、または神経細胞である。一部の実施形態では、細胞はin vitro細胞である。一部の実施形態では、細胞はin vivo細胞である。ある特定の実施形態では、細胞は対象の中にある。一部の実施形態では、対象はヒトである。一部の実施形態では、接触させることは、組成物を対象に投与することを含む。ある特定の実施形態では、細胞および/または対象における標的遺伝子の発現は、疾患または状態に関連し、標的遺伝子の発現を低減することは、疾患または状態を処置することである。
本発明の別の態様によると、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iの1つとして記載される化合物が提供される。
本発明の別の態様によると、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iの1つまたは複数を含み、薬学的に許容される担体も含む組成物が提供される。
リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 リガンドA~WWとして記載される標的化リガンドクラスターの実施形態を提供する。Mito GalNAcホスホラミダイトの構造の実施形態が、リガンドA~リガンドIとして確認される標的化リガンドクラスターで示されている。 ある特定の研究で使用された配列および配列修飾を示す。示されているセンス鎖は、AACUCAAUAAAGUGCUUUGAA(配列番号1)およびLaacucaAuAAAgugcuuuga(配列番号2)である。示されているアンチセンス鎖は、UUCAAAGCACUUUAUUGAGUUUC(配列番号3)およびucaaAgCAcuuuAuUgaguuc(配列番号4)である。配列において、小文字は2’-MeOヌクレオチドを示し、大文字は2’-Fヌクレオチドを示し、星印()はホスホロチオエートを示し、「L」は標的リガンドを示す。 PBS処置群に正規化された、Mito-GalNAcコンジュゲートsiRNA処置群における血漿中の残存FXIIのパーセンテージを示す棒グラフを提供する。グラフは、3つの時点:GalNaCコンジュゲートsiRNA処置を投与した5日、14日および30日後の血漿中の残存FXIIのパーセントを示す。投与された9個のGalNAcコンジュゲートsiRNAは、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、およびMITO-Iであり、5日目(左側の棒)、14日目(中央の棒)および30日目(右側の棒)のデータがそれぞれ示されている。
本開示は、siRNAが含まれるが、これに限定されないオリゴヌクレオチド剤を送達する足場として没食子酸を使用する化合物を提供する。本開示は、没食子酸を足場として使用する、目的の作用剤にコンジュゲートされ得る、および目的の作用剤の細胞への送達を促進することができる化合物を作製および使用する方法も提供する。本発明の一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターが調製され、核酸剤(または、他の目的の作用剤)に連結される。本明細書で使用される場合、用語「標的化リガンドクラスター/核酸複合体」は、核酸に連結されている本発明の標的化リガンドクラスターを意味し、その非限定的な例は、siRNAである。本発明の一部の態様では、標的化リガンドクラスターは、本明細書に記載されているように調製され、1つまたは複数の核酸剤に連結され、こうして標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成し、この複合体が細胞と接触して、1つまたは複数の核酸剤が、接触された細胞内に送達される。本明細書で使用される場合、用語「標的化リガンドクラスター」および「リガンドクラスター」は、交換可能に使用され得る。本発明は、部分的には、没食子酸に由来する構造モチーフを有する化合物を含み、これはまた、没食子酸を足場として使用する化合物と本明細書において呼ばれる。本発明のそのような化合物のある特定の実施形態を1つまたは複数の目的の作用剤に連結して、目的の作用剤の細胞および/または対象への送達に使用することができる。一部の実施形態では、治療剤が、本発明の組成物および方法の実施形態を使用して細胞および/または対象に送達される。
定義
特定されない限り、以下の用語は以下の意味を有する。
「コンジュゲート」または「コンジュゲート基」は、オリゴヌクレオチドまたは他のオリゴマーに結合した原子または原子の基を意味する。一般にコンジュゲート基は、これらが結合している化合物の、薬物動態、薬物力学、結合、吸収、細胞分布、細胞取り込み、電荷、および/またはクリアランス特性が含まれるが、これらに限定されない1つまたは複数の特性を修飾する。
「連結された」は、2つの分子の接続に言及するとき、2つの分子が共有結合によって直接的もしくは間接的に連結していること、または2つの分子が非共有結合(例えば、水素結合もしくはイオン結合)を介して会合していることを意味する。化合物Aが化合物Bに直接的に連結している例は、A-Bと表すことができる。化合物Aが化合物Bに間接的に連結している例は、A-C-Bと表すことができ、ここで化合物Aは化合物Cを介して化合物Bに間接的に連結している。2つ以上の中間化合物が、化合物の間接的な連結の状況に存在し得ることが理解される。一部の実施形態では、用語「連結された」が非共有結合を介した2つの分子の会合を指す場合、2つの異なる分子の会合は、生理学的に許容される緩衝剤(例えば、リン酸緩衝食塩水)中で1×10-4M未満(例えば、1×10-5M未満、1×10-6M未満、または1×10-7M未満)のKnを有する。
「核酸」は、モノマーヌクレオチドから構成される分子を指す。核酸は、リボ核酸(RNA)、デオキシリボ核酸(DNA)、一本鎖核酸(ssDNA)、二本鎖核酸(dsDNA)、低分子干渉リボ核酸(siRNA)、およびマイクロRNA(miRNA)を含む。核酸は、単一分子内にこれらのエレメントの任意の組合せも含み得る。核酸は、天然の核酸、非天然の核酸、または天然と非天然の核酸の組合せを含み得る。核酸は、ヌクレオチド配列またはポリヌクレオチドと本明細書において呼ばれることもある。
「オリゴマー」は、5個まで、10個まで、15個まで、20個まで、または20個を超えるヌクレオチドまたはヌクレオチド塩基対を含有するヌクレオチド配列である。一部の実施形態では、オリゴマーは、細胞内の発現標的核酸または標的遺伝子のコード配列に少なくとも部分的に相補的である核酸塩基配列を有する。一部の実施形態では、オリゴマーは、遺伝子を発現する細胞に送達されると、基礎遺伝子の発現を阻害することができる。遺伝子発現は、in vitroまたはin vivoで阻害され得る。本発明の方法および複合体に含まれ得るオリゴマーの非限定的な例は、オリゴヌクレオチド、一本鎖オリゴヌクレオチド、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド、低分子干渉RNA(siRNA)、一本鎖siRNA、二本鎖RNA(dsRNA)、マイクロRNA(miRNA)、低分子ヘアピン型RNA(shRNA)、リボザイム、干渉RNA分子、ダイサー基質、アンチセンスオリゴヌクレオチド、メッセンジャーRNA(mRNA)、リボザイム、プラスミド、免疫刺激核酸、アンタゴミル、およびアプタマーである。
「オリゴヌクレオチド」は、連結したヌクレオチドのポリマーを意味し、ヌクレオチドはそれぞれ独立して修飾され得る、または非修飾であり得る。
「一本鎖オリゴヌクレオチド」は、一本鎖オリゴマーを意味し、本発明のある特定の実施形態では、一本鎖オリゴヌクレオチドは、標的mRNAに少なくとも部分的に相補的である配列、すなわち、哺乳動物の生理学的条件下(または、同等のin vitro条件下)で水素結合を介して標的mRNAとハイブリダイズすることができる配列を含んでもよい。一部の実施形態では、一本鎖オリゴヌクレオチドは一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドである。
「siRNA」は、低分子干渉RNAまたはサイレンシングRNAである。siRNAは、二本鎖RNA分子のクラスであり、20~25個の(または、より短い)塩基対の長さであってもよく、RNA干渉(RNAi)経路内で作動するマイクロRNA(miRNA)に類似している。siRNAは、転写後のmRNAを分解し、翻訳を防止することによって、siRNAに相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現を干渉する。siRNAは、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)を誘導してメッセンジャーRNA(mRNA)を切断することによって、遺伝子発現を停止させるように細胞内で作用する。
特定の官能基および化学用語の定義が、下記により詳細に記載される。本発明の目的において、化学エレメントは、Periodic Table of the Elements、CAS版、Handbook of Chemistry and Physics、第75版、表紙裏に従って確認され、特定の官能基は、一般に、それに記載されたように定義される。加えて、有機化学の一般原則、ならびに特定の官能性部分および反応性は、Organic Chemistry、Thomas Sorrell、University Science Books、Sausalito、1999;SmithおよびMarch March’s Advanced Organic Chemistry、第5版、John Wiley & Sons、Inc.、New York、2001;Larock、Comprehensive Organic Transformations、VCH Publishers、Inc.、New York、1989;Carruthers、Some Modern Methods of Organic Synthesis、第3版、Cambridge University Press、Cambridge、1987に記載されている。
特に記述のない限り、本明細書に描写される構造は、1つまたは複数の同位体濃縮原子の存在だけが異なる化合物を含むことも意図される。例えば、重水素もしくはトリチウムによる水素の置き換え、または13Cもしくは14Cによる炭素の置き換えだけが異なる描写構造を有する化合物は、本発明の範囲内である。そのような化合物は、例えば、分析ツールとして、生物学的アッセイにおけるプローブとして、または本発明による治療剤として有用であり得る。
式中、隣接して結合している部分の立体化学が特定されない場合は単結合である、非存在もしくは単結合である、および/または単もしくは二重結合である。
値の範囲が列挙される場合には、範囲内の各値および部分範囲が包含されることが意図される。例えば、「C1~6」は、C、C、C、C、C、C、C1~6、C1~5、C1~4、C1~3、C1~2、C2~6、C2~5、C2~4、C2~3、C3~6、C3~5、C3~4、C4~6、C4~5、およびC5~6を包含することが意図される。
用語「精製された」、「実質的に精製された」、および「単離された」は、本発明に有用な化合物が、化合物が天然の状態で通常会合する他の異なる化合物を含まないものであることを指し、これにより化合物は、所定の試料または組成物の少なくとも0.5重量%、1重量%、5重量%、10重量%、20重量%、50重量%、75重量%、80重量%、85重量%、90重量%、95重量%、96重量%、97重量%、98重量%、99重量%、99.5重量%、99.9重量%の質量を構成する。一実施形態では、これらの用語は、所定の試料または組成物の少なくとも95重量%、98重量%、99重量%、または99.9重量%の質量を構成する化合物を指す。
用語「脂肪族」は、飽和および不飽和、非芳香族、直鎖(例えば、非分岐鎖)、分岐鎖、非環式および環式(例えば、炭素環式)の炭化水素を両方とも含み、これらは必要に応じて1つまたは複数の官能基で置換されている。当業者に理解されるように、「脂肪族」には、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、およびシクロアルキニル部分が本明細書に含まれることが意図されるが、これらに限定されない。ゆえに用語「アルキル」には、直鎖、分岐鎖、および環式のアルキル基が含まれる。他の一般的用語、例えば「アルケニル」、「アルキニル」などに類似の慣用例が当てはまる。さらに、用語「アルキル」、「アルケニル」、「アルキニル」などは、置換基および非置換基を両方とも包含する。ある特定の実施形態では、「脂肪族」は、1~20個の炭素原子を有する脂肪族基(環式、非環式、置換、非置換、分岐鎖、または非分岐鎖)を示すために使用される。脂肪族基の置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「アルキル」は、単一水素原子の除去によって1~20個の炭素原子を含有する炭化水素部分に由来する、飽和、直鎖、または分岐鎖炭化水素基を指す。一部の実施形態では、本発明に用いられるアルキル基は、1~20個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルキル基は、1~15個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルキル基は、1~10個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルキル基は、1~8個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルキル基は、1~5個の炭素原子を含有する。アルキル基の例には、メチル(例えば、非置換メチル(Me))、エチル(例えば、非置換エチル(Et))、プロピル(例えば、非置換プロピル(Pr))、n-プロピル、イソプロピル、ブチル(例えば、非置換ブチル(Bu))、n-ブチル、イソ-ブチル、sec-ブチル、sec-ペンチル、イソ-ペンチル、tert-ブチル、n-ペンチル、ネオペンチル、n-ヘキシル、sec-ヘキシル、n-ヘプチル、n-オクチル、n-デシル、n-ウンデシル、ドデシルなどが含まれるが、これらに限定されず、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。アルキル基の置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「アルケニル」は、単一水素原子の除去によって少なくとも1つの炭素-炭素二重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素部分に由来する一価基を示す。ある特定の実施形態では、本発明に用いられるアルケニル基は、2~20個の炭素原子を含有する。一部の実施形態では、本発明に用いられるアルケニル基は、2~15個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルケニル基は、2~10個の炭素原子を含有する。なお他の実施形態では、アルケニル基は、2~8個の炭素原子を含有する。さらに他の実施形態では、アルケニル基は、2~5個の炭素原子を含有する。アルケニル基には、例えば、エテニル、プロペニル、ブテニル、1-メチル-2-ブテン-1-イルなどが含まれ、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。アルケニル基の置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「アルキニル」は、単一水素原子の除去によって少なくとも1つの炭素-炭素三重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素に由来する一価基を指す。ある特定の実施形態では、本発明に用いられるアルキニル基は、2~20個の炭素原子を含有する。一部の実施形態では、本発明に用いられるアルキニル基は、2~15個の炭素原子を含有する。別の実施形態では、用いられるアルキニル基は、2~10個の炭素原子を含有する。なお他の実施形態では、アルキニル基は、2~8個の炭素原子を含有する。なお他の実施形態では、アルキニル基は、2~5個の炭素原子を含有する。代表的なアルキニル基には、エチニル、2-プロピニル(プロパルギル)、1-プロピニルなどが含まれるが、これらに限定されず、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。アルキニル基の置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。例示的な炭素原子の置換基には、ハロゲン、--CN、--NO、--N、--SOH、--SOH、--OH、--ORaa、--ON(Rbb、--N(Rbb、--N(Rbb +X.-、--N(ORcc)Rbb、--SH、--SRaa、--SSRcc、--C(=O)Raa、--COH、--CHO、--C(ORcc、--COaa、--OC(=O)Raa、--OCOaa、--C(=O)N(Rbb、--OC(=O)N(Rbb、--RbbC(=O)Raa、--NRbbCOaa、--NRbbC(=O)N(Rbb、--C(=NRbb)Raa、--C(=NRbb)ORaa、--OC(=NRbb)Raa、--OC(=NRbb)ORaa、--C(NRbb)N(Rbb、--OC(=NRbb)N(Rbb、--NRbbC(=NRbb)N(Rbb、--C(=O)NRbbSOaa、--NRbbSOaa、--SON(Rbb、--SOaa、--SOORaa、--OSOaa、--S(=O)Raa、--OS(=O)Raa、--Si(Raa、--OSi(Raa--C(=S)N(Rbb、--C(=O)SRaa、--C(=S)SRaa、--SC(=S)SRaa、--SC(=O)SRaa、--OC(=O)SRaa、--SC(=O)ORaa、--SC(=O)Raa、--P(=O)(Raa、--P(=O)(ORcc、--OP(=O)(Raa、--OP(=O)(ORcc、--P(=O)(N(Rbb、--OP(=O)(N(Rbb、--NRbbP(=O)(Raa、--NRbbP(=O)(ORcc、--NRbbP(=O)(N(Rbb、--P(Rcc、--P(ORcc、--P(Rcc 、--P(ORcc 、--P(Rcc、--P(ORcc、--OP(Rcc、--OP(Rcc 、--OP(ORcc、--OP(ORcc 、--OP(Rcc、--OP(ORcc、--B(Raa、--B(ORcc、--BRaa(ORcc)、C1~10アルキル、C1~10ペルハロアルキル、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリールが含まれるが、これらに限定されず、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRdd基で独立して置換され、Xは対イオンであり、または炭素原子の2つのジェミナル水素は、基=O、=S、=NN(Rbb、=NNRbbC(=O)Raa、=NNRbbC(=O)ORaa、=NNRbbS(=O)aa、=NRbb、もしくは=NORccで置き換えられ、それぞれの場合にRaaは、C1~10アルキル、C1~10ペルハロアルキル、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリールから独立して選択され、または2つのRaa基は、連結して3~14員ヘテロシクリルもしくは5~14員ヘテロアリール環を形成し、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRdd基で独立して置換され、それぞれの場合にeは、水素、--OH、--ORaa、--N(Rcc、--CN、--C(=O)Raa、--C(=O)N(Rcc、--COaa、--SOaa、--C(=NRcc)ORaa、--C(=NRcc)N(Rcc、--SON(Rcc、--SOcc、--SOORcc、--SORaa、--C(=S)N(Rcc、--C(=O)SRcc、--C(=S)SRcc、--P(=O)(Raa、--P(=O)(ORcc、--P(=O)(N(Rcc、C1~10アルキル、C1~10ペルハロアルキル、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリールから独立して選択され、または2つのRbb基は、連結して3~14員ヘテロシクリルもしくは5~14員ヘテロアリール環を形成し、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRdd基で独立して置換され、Xは対イオンであり、それぞれの場合にRccは、水素、C1~10アルキル、C1~10ペルハロアルキル、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリールから独立して選択され、または2つのRcc基は、連結して3~14員ヘテロシクリルもしくは5~14員ヘテロアリール環を形成し、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRdd基で独立して置換され、それぞれの場合にRddは、ハロゲン、--CN、--NO、--N、--SOH、--SOH、--OH、--ORee、--ON(Rff、--N(Rff、--N(Rff 、--N(ORee)Rff、--SH、--SRee、--SSRee、--C(=O)Ree、--COH、--COee、--OC(=O)Ree、--OCOee、--C(=O)N(Rff、--OC(=O)N(Rff、--NRffC(=O)Ree、--NRffCOee、--NRffC(=O)N(Rff、--C(=NRff)ORee、--OC(=NRff)Ree、--OC(=

NRff)ORee、--C(=NRff)N(Rff、--OC(=NRff)N(Rff、--NRffC(=NRff)N(Rff、--NRffSOee、--SON(Rff、--SOee、--SOORee、--OSOee、--S(=O)Ree、--Si(Ree、--OSi(Ree、--C(=S)N(Rff、--C(=O)SRee、--C(=S)SRee、--SC(=S)SRee、--P(=O)(ORee、--P(=O)(Ree、--OP(=O)(Ree、--OP(=O)(ORee、C1~6アルキル、C1~6ペルハロアルキル、C2~6アルケニル、C2~6アルキニル、ヘテロC1~6アルキル、ヘテロC2~6アルケニル、ヘテロC2~6アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~10員ヘテロシクリル、C6~10アリール、5~10員ヘテロアリールから独立して選択され、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRgg基で独立して置換され、または2つのジェミナルRdd置換基は、連結して=Oもしくは=Sを形成することができ、Xは対イオンであり、それぞれの場合にReeは、C1~6アルキル、C1~6ペルハロアルキル、C2~6アルケニル、C2~6アルキニル、ヘテロC1~6アルキル、ヘテロC2~6アルケニル、ヘテロC2~6アルキニル、C3~10カルボシクリル、C6~10アリール、3~10員ヘテロシクリル、および3~10員ヘテロアリールから独立して選択され、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、もしくは5つのRgg基で独立して置換され、それぞれの場合にRffは、水素、C1~6アルキル、C1~6ペルハロアルキル、C2~6アルケニル、C2~6アルキニル、ヘテロC1~6アルキル、ヘテロC2~6アルケニル、ヘテロC2~6アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~10員ヘテロシクリル、C6~10アリール、および5~10員ヘテロアリールから独立して選択され、または2つのRff基は、連結して3~10員ヘテロシクリルもしくは5~10員ヘテロアリール環を形成し、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、または5つのRgg基で独立して置換され、それぞれの場合にRggは、ハロゲン、--CN、--NO、--N、--SOH、--SOH、--OH、--OC1~6アルキル、--ON(C1~6アルキル)、--N(C1~6アルキル)、--N(C1~6アルキル) 、--NH(C1~6アルキル) 、--NH(C1~6アルキル)、--NH 、--N(OC1~6アルキル)(C1~6アルキル)、--N(OH)(C1~6アルキル)、--NH(OH)、--SH、--SC1~6アルキル、--SS(C1~6アルキル)、--C(=O)(C1~6アルキル)、--COH、--CO(C1~6アルキル)、--OC(=O)(C1~6アルキル)、--OCO(C1~6アルキル)、--C(=O)NH、--C(=O)N(C1~6アルキル)、--OC(=O)NH(C1~6アルキル)、--NHC(=O)(C1~6アルキル)、--N(C1~6アルキル)C(=O)(C1~6アルキル)、--NHCO(C1~6アルキル)、--NHC(=O)N(C1~6アルキル)、--NHC(=O)NH(C1~6アルキル)、--NHC(=O)NH、--C(=NH)O(C1~6アルキル)、--OC(=NH)(C1~6アルキル)、--OC(=NH)OC1~6アルキル、--C(=NH)N(C1~6アルキル)、--C(=NH)NH(C1~6アルキル)、--C(=NH)NH、--OC(=NH)N(C1~6アルキル)、--OC(NH)NH(C1~6アルキル)、--OC(NH)NH、--NHC(NH)N(C1~6アルキル)、--NHC(=NH)NH、--NHSO(C1~6アルキル)、--SON(C1~6アルキル)、--SONH(C1~6アルキル)、--SONH、--SO1~6アルキル、--SOOC1~6アルキル、--OSO1~6アルキル、--SOC1~6アルキル、--Si(C1~6アルキル)、--OSi(C1~6アルキル)、--C(=S)N(C1~6アルキル)、C(=S)NH(C1~6アルキル)、C(=S)NH、--C(=O)S(C1~6アルキル)、--C(=S)SC1~6アルキル、--SC(=S)SC1~6アルキル、--P(=O)(OC1~6アルキル)、--P(=O)(C1-6アルキル)、--OP(=O)(C1~6アルキル)、--OP(=O)(OC1~6アルキル)、C1~6アルキル、C1~6ペルハロアルキル、C2~6アルケニル、C2~6アルキニル、ヘテロC1~6アルキル、ヘテロC2~6アルケニル、ヘテロC2~6アルキニル、C3~10カルボシクリル、C6~10アリール、3~10員ヘテロシクリル、5~10員ヘテロアリールから独立して選択され、または2つのジェミナルRgg置換基は、連結して=Oもしくは=Sを形成することができ、Xは対イオンである。
用語「アミノ」は、式(--NH)の基を指す。「置換アミノ」は、一置換アミン(--NHR)または二置換アミン(--NR )のいずれかを指し、R置換基は、安定した部分の形成を生じる本明細書に記載されている任意の置換基である(例えば、適切なアミノ保護基、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、アミノ、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。ある特定の実施形態では、二置換アミノ基(--NR )のR置換基は、5~6員複素環式環を形成する。
用語「アルコキシ」は、式(--OR)の「置換ヒドロキシル」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアルキル基であり、酸素部分が親分子に直接結合している。
用語「アルキルチオキシ」は、式(--SR)の「置換チオール」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアルキル基であり、硫黄部分が親分子に直接結合している。
用語「アルキルアミノ」は、式(--NR )の「置換アミノ」を指し、Rは、独立して水素、または必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアルキル基であり、窒素部分が親分子に直接結合している。
用語「アリール」は、3~20個の環原子を有する安定した単環式または多環式環系を指し、その全ての環原子は炭素であり、置換されていても、非置換であってもよい。本発明のある特定の実施形態では、「アリール」は、1、2、または3つの芳香族環を有する単環式、二環式、または三環式C~C20芳香族環系を指し、フェニル、ビフェニル、ナフチルなどが含まれるが、これらに限定されず、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。アリールの置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「アリールアルキル」は、アリール置換アルキル基を指し、用語「アリール」および「アルキル」は、本明細書に定義されており、アリール基はアルキル基に結合し、これが親分子に結合している。例示的なアリールアルキル基は、ベンジルおよびフェネチルである。
用語「アリールオキシ」は、式(--OR)の「置換ヒドロキシル」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアリール基であり、酸素部分が親分子に直接結合している。
用語「アリールアミノ」は、式(--NR )の「置換アミノ」を指し、Rは、独立して水素、または必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアリール基であり、窒素部分が親分子に直接結合している。
用語「アリールチオキシ」は、式(--SR)の「置換チオール」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたアリール基であり、硫黄部分が親分子に直接結合している。
用語「ハロ」および「ハロゲン」は、フッ素(フルオロ、--F)、塩素(クロロ、--Cl)、臭素(ブロモ、--Br)、およびヨウ素(ヨード、--I)から選択される原子を指す。
用語「ヘテロ脂肪族」は、本明細書に定義された脂肪族部分を指し、飽和および不飽和、非芳香族、直鎖(例えば、非分岐鎖)、分岐鎖、非環式、環式(例えば、炭素環式)、または多環式の炭化水素を両方とも含み、これらは必要に応じて1つまたは複数の官能基で置換され、1つまたは複数の酸素、硫黄、窒素、リン、またはケイ素原子を、例えば、炭素原子の代わりに含有する。ある特定の実施形態では、ヘテロ脂肪族部分は、1つまたは複数の置換基により1つまたは複数の水素原子を独立して置き換えることによって置換される。当業者に理解されるように、「ヘテロ脂肪族」には、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルケニル、およびヘテロシクロアルキニル部分が本明細書に含まれることが意図されるが、これらに限定されない。ゆえに用語「ヘテロ脂肪族」には、用語「ヘテロアルキル」、「ヘテロアルケニル」、「ヘテロアルキニル」などが含まれる。さらに、用語「ヘテロアルキル」、「ヘテロアルケニル」、「ヘテロアルキニル」などは、置換された基および非置換である基の両方を包含する。ある特定の実施形態では、「ヘテロ脂肪族」は、1~20個の炭素原子を有するヘテロ脂肪族基(環式、非環式、置換、非置換、分岐鎖、または非分岐鎖)を示すために使用される。ヘテロ脂肪族基の置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、スルフィニル、スルホニル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「ヘテロアルキル」は、本明細書に定義されたアルキル部分を指し、1つまたは複数の酸素、硫黄、窒素、リンまたはケイ素原子を、例えば、炭素原子の代わりに含有する。
用語「ヘテロアルケニル」は、本明細書に定義されたアルケニル部分を指し、1つまたは複数の酸素、硫黄、窒素、リンまたはケイ素原子を、例えば、炭素原子の代わりに含有する。
用語「ヘテロアルキニル」は、本明細書に定義されたアルキニル部分を指し、1つまたは複数の酸素、硫黄、窒素、リンまたはケイ素原子を、例えば、炭素原子の代わりに含有する。
用語「ヘテロアルキルアミノ」は、式(--NR )の「置換アミノ」を指し、Rは、独立して水素、または必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアルキル基であり、窒素部分が親分子に直接結合している。
用語「ヘテロアルキルオキシ」は、式(--OR)の「置換ヒドロキシル」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアルキル基であり、酸素部分が親分子に直接結合している。
用語「ヘテロアルキルチオキシ」は、式(--SR)の「置換チオール」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアルキル基であり、硫黄部分が親分子に直接結合している。
用語「カルボシクリル」または「炭素環式」は、3~14個の環炭素原子(「C3~14カルボシクリル」)および0個のヘテロ原子を非芳香族環系に有する非芳香族環式炭化水素基の基を指す。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、3~10個の環炭素原子を有する(「C3~10カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、3~8個の環炭素原子を有する(「C3~8カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、3~7個の環炭素原子を有する(「C3~7カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、3~6個の環炭素原子を有する(「C3~6カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、4~6個の環炭素原子を有する(「C4~6カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、5~6個の環炭素原子を有する(「C5~6カルボシクリル」)。一部の実施形態では、カルボシクリル基は、5~10個の環炭素原子を有する(「C5~10カルボシクリル」)。例示的なC3~6カルボシクリル基には、限定されることなく、シクロプロピル(C)、シクロプロペニル(C)、シクロブチル(C)、シクロブテニル(C)、シクロペンチル(C)、シクロペンテニル(C)、シクロヘキシル(C)、シクロヘキセニル(C)、シクロヘキサジエニル(C)などが含まれる。例示的なC3~8カルボシクリル基には、限定されることなく、上述のC3~6カルボシクリル基、ならびにシクロヘプチル(C)、シクロヘプテニル(C)、シクロヘプタジエニル(C)、シクロヘプタトリエニル(C)、シクロオクチル(C)、シクロオクテニル(C)、ビシクロ[2.2.1]ヘプタニル(C)、ビシクロ[2.2.2]オクタニル(C)などが含まれる。例示的なC3~10カルボシクリル基には、限定されることなく、上述のC3~8カルボシクリル基、ならびにシクロノニル(C)、シクロノネニル(C)、シクロデシル(C10)、シクロデセニル(C10)、オクタヒドロ-1H-インデニル(C)、デカヒドロナフタレニル(C10)、スピロ[4.5]デカニル(C10)などが含まれる。前述の例が例示しているように、ある特定の実施形態では、カルボシクリル基は、単環式(「単環式カルボシクリル」)または多環式(例えば、二環式系(「二環式カルボシクリル」)もしくは三環式系(「三環式カルボシクリル」)などの、縮合、架橋、もしくはスピロ環系を含む)のいずれかであり、飽和であり得る、あるいは1つまたは複数の炭素-炭素二重または三重結合を含有し得る。「カルボシクリル」には、上記に定義されたカルボシクリル環が1つまたは複数のアリールまたはヘテロアリール基に縮合し、結合点がカルボシクリル環にある環系も含まれ、そのような場合、炭素の数は、炭素環式環系の炭素の数を指定し続ける。特定されない限り、それぞれの場合にカルボシクリル基は、独立して非置換である(「非置換カルボシクリル」)、または1つもしくは複数の置換基で置換されている(「置換カルボシクリル」)。ある特定の実施形態では、カルボシクリル基は、非置換C3~14カルボシクリルである。ある特定の実施形態では、カルボシクリル基は、置換C3~14カルボシクリルである。
一部の実施形態では、「カルボシクリル」は、3~14個の環炭素原子を有する単環式飽和カルボシクリル基(「C3~14シクロアルキル」)である。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、3~10個の環炭素原子を有する(「C3~10シクロアルキル」)。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、3~8個の環炭素原子を有する(「C3~8シクロアルキル」)。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、3~6個の環炭素原子を有する(「C3~6シクロアルキル」)。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、4~6個の環炭素原子を有する(「C4~6シクロアルキル」)。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、5~6個の環炭素原子を有する(「C5~6シクロアルキル」)。一部の実施形態では、シクロアルキル基は、5~10個の環炭素原子を有する(「C5~10シクロアルキル」)。C5~6シクロアルキル基の例には、シクロペンチル(C)およびシクロヘキシル(C)が含まれる。C3~6シクロアルキル基の例には、前述のC5~6シクロアルキル基、ならびにシクロプロピル(C)およびシクロブチル(C)が含まれる。C3~8シクロアルキル基の例には、前述のC3~6シクロアルキル基、ならびにシクロヘプチル(C)およびシクロオクチル(C)が含まれる。特定されない限り、それぞれの場合にシクロアルキル基は、独立して非置換である(「非置換シクロアルキル」)、または1つもしくは複数の置換基で置換されている(「置換シクロアルキル」)。ある特定の実施形態では、シクロアルキル基は、非置換C3~14シクロアルキルである。ある特定の実施形態では、シクロアルキル基は、置換C3~14シクロアルキルである。
用語「複素環式」、「複素環」、または「ヘテロシクリル」は、環式ヘテロ脂肪族基を指す。複素環式基は、非芳香族、部分不飽和、または完全飽和の3~12員環系を指し、原子が3~8個のサイズの単環、ならびに二環式系および三環式系を含み、これらは、非芳香族環に縮合した芳香族5または6員のアリールまたはヘテロアリール基を含んでもよい。これらの複素環式環には、酸素、硫黄、および窒素から独立して選択される1~3個のヘテロ原子を有するものが含まれ、窒素および硫黄ヘテロ原子は、必要に応じて酸化されていてもよく、窒素ヘテロ原子は、必要に応じて四級化されていてもよい。ある特定の実施形態では、複素環式という用語は、非芳香族5、6もしくは7員環、または多環式基を指し、環原子の少なくとも1個は、O、SおよびNから選択されるヘテロ原子であり(窒素および硫黄ヘテロ原子は、必要に応じて酸化されていてもよい)、残りの環原子は炭素であり、基は、環原子のいずれかを介して分子の残りの部分に連結される。ヘテロシクリル基には、酸素、硫黄、および窒素から独立して選択される1~3個のヘテロ原子を有する縮合5、6、または7員環を含む二環式または三環式の基が含まれるが、これらに限定されず、(i)各5員環は0~2つの二重結合を有し、各6員環は0~2つの二重結合を有し、各7員環は0~3つの二重結合を有し、(ii)窒素および硫黄ヘテロ原子は、必要に応じて酸化されていてもよく、(iii)窒素ヘテロ原子は、必要に応じて四級化されていてもよく、(iv)上記の複素環式環のいずれかは、アリールまたはヘテロアリール環に縮合されていてもよい。例示的な複素環には、アザシクロプロパニル、アザシクロブタニル、1,3-ジアザチジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、アゾカニル、チアラニル、チエタニル、テトラヒドロチオフェニル、ジチオラニル、チアシクロヘキサニル、オキシラニル、オキセタニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロプラニル、ジオキサニル、オキサチオラニル、モルホリニル、チオキサニル、テトラヒドロナフチルなどが含まれ、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、スルフィニル、スルホニル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「ヘテロアリール」は、3~20個の環原子を有する安定した芳香族単環式または多環式環系を指し、1個の環原子は、S、O、およびNから選択され、0、1または2個の環原子は、S、O、およびNから独立して選択される追加のヘテロ原子であり、残りの環原子は炭素であり、基は、環原子のいずれかを介して分子の残りの部分に連結される。例示的なヘテロアリールには、ピロリル、ピラゾリル、イミダゾリル、ピリジニル(ピリジル)、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニル、トリアジニル、テトラジニル、ピイロリジニル、インドリル、キノリニル、イソキノリニル、ベンゾイミダゾリル、インダゾリル、キノリニル、イソキノリニル、キノリジニル、シンノリニル、キナゾリニル、フタラジニル、ナフトリジニル、キノキサリニル、チオフェニル、チアナフテニル、フラニル、ベンゾフラニル、ベンゾチアゾリル、チアゾリニル、イソチアゾリル、チアジアゾリニル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、オキサジアジオリル、オキサジアジオリルなどが含まれるが、これらに限定されず、これらは1つまたは複数の置換基を有していてもよい。ヘテロアリールの置換基には、安定した部分の形成を生じる、本明細書に記載されているいずれかの置換基が含まれるが、これらに限定されない(例えば、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、スルフィニル、スルホニル、オキソ、イミノ、チオオキソ、シアノ、イソシアノ、アミノ、アジド、ニトロ、ヒドロキシル、チオール、ハロ、脂肪族アミノ、ヘテロ脂肪族アミノ、アルキルアミノ、ヘテロアルキルアミノ、アリールアミノ、ヘテロアリールアミノ、アルキルアリール、アリールアルキル、脂肪族オキシ、ヘテロ脂肪族オキシ、アルキルオキシ、ヘテロアルキルオキシ、アリールオキシ、ヘテロアリールオキシ、脂肪族チオキシ、ヘテロ脂肪族チオキシ、アルキルチオキシ、ヘテロアルキルチオキシ、アリールチオキシ、ヘテロアリールチオキシ、アシルオキシなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。
用語「ヘテロアリールアミノ」は、(--NR )の「置換アミノ」を指し、Rは、独立して水素、または必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアリール基であり、窒素部分が親分子に直接結合している。
用語「ヘテロアリールオキシ」は、式(--OR)の「置換ヒドロキシル」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアリール基であり、酸素部分が親分子に直接結合している。
用語「ヘテロアリールチオキシ」は、式(--SR)の「置換チオール」を指し、Rは、必要に応じて置換されている本明細書に定義されたヘテロアリール基であり、硫黄部分が親分子に直接結合している。
用語「ヒドロキシル」または「ヒドロキシル」は、基--OHを指す。用語「置換ヒドロキシル」または「置換ヒドロキシル」は、その延長線上で、親分子に直接結合している酸素原子が、水素以外の基で置換されているヒドロキシル基を指し、--ORaa、--ON(Rbb、--OC(=O)SRaa、--OC(=O)Raa、--OCOaa、--OC(=O)N(Rbb、--OC(=NRbb)Raa、--OC(=NRbb)ORaa、--OC(=NRbb)N(Rbb、--OS(=O)Raa、--OSOaa、--OSi(Raa、--OP(Rcc、--OP(Rcc 、--OP(ORcc、--OP(ORcc 、--OP(=O)(Raa、--OP(=O)(ORcc、および--OP(=O)(N(Rbb))から選択される基が含まれ、ここでX、Raa、Rbb、およびRccは本明細書に定義された通りである。
用語「イミノ」は、安定した部分の形成を生じる、Rが水素、または本明細書に記載されている任意の置換基に相当する式(=NR)の基を指す(例えば、適切なアミノ保護基、脂肪族、アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロ脂肪族、複素環式、アリール、ヘテロアリール、アシル、アミノ、ヒドロキシル、アルキルアリール、アリールアルキルなどであり、それぞれ、さらに置換されていても、いなくてもよい)。ある特定の実施形態では、イミノは=NHを指し、Rは水素である。
用語「ニトロ」は、式(--NO)の基を指す。
用語「オキソ」は、式(=O)の基を指す。
「保護基」は、当該技術においてよく知られており、全体が参照により本明細書に組み込まれるGreene’s Protective Groups in Organic Synthesis、P.G.M.WutsおよびT.W.Greene、第4版、Wiley-Interscience、2006に詳細に記載されているものが含まれる。
窒素原子は、原子価が許容する限り置換されても、非置換であってもよく、第一級、第二級、第三級および第四級窒素原子が含まれる。例示的な窒素原子の置換基には、水素、--OH、--ORaa、--N(Rcc、--CN、--C(=O)Raa、--C(=O)N(Rcc、--COaa、--SOaa、--C(=NRbb)Raa、--C(=NRcc)ORaa、--C(=NRcc)N(Rcc、--SON(Rcc、--SOcc、--SOORcc、--SORaa、--C(=S)N(Rcc、--C(=O)SRcc、--C(=S)SRcc、--P(=O)(ORcc、--P(=O)(Raa、--P(=O)(N(Rcc、C1~10アルキル、C1~10ペルハロアルキル、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリールが含まれるが、これらに限定されず、またはN原子に結合した2つのRcc基は、連結して3~14員ヘテロシクリルもしくは5~14員ヘテロアリール環を形成し、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、または5つのRdd基で独立して置換され、Raa、Rbb、Rcc、およびRddは、上記に定義された通りである。
ある特定の実施形態では、窒素原子に存在する置換基は、窒素保護基である(本明細書において、「アミノ保護基」とも呼ばれる)。窒素保護基には、--OH、--ORaa、--N(Rcc、--C(=O)Raa、--C(=O)N(Rcc、--COaa、--SOaa、--C(=NRcc)Raa、--C(=NRcc)ORaa、--C(=NRcc)N(Rcc、--SON(Rcc、--SOcc、--SOORcc、--SORaa、--C(=S)N(Rcc、--C(=O)SRcc、--C(=S)SRcc、C1~10アルキル(例えば、アラルキル、ヘテロアラルキル)、C2~10アルケニル、C2~10アルキニル、ヘテロC1~10アルキル、ヘテロC2~10アルケニル、ヘテロC2~10アルキニル、C3~10カルボシクリル、3~14員ヘテロシクリル、C6~14アリール、および5~14員ヘテロアリール基が含まれるが、これらに限定されず、ここで各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、ヘテロアルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アラルキル、アリール、およびヘテロアリールは、0、1、2、3、4、または5つのRdd基で独立して置換され、Raa、Rbb、Rcc、およびRddは、本明細書に定義された通りである。窒素保護基は、当該技術においてよく知られており、参照により本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis、T.W.GreeneおよびP.G.M.Wuts、第3版、John Wiley&Sons、1999に詳細に記載されているものが含まれる。
例えば、アミド基(例えば、--C(=O)Raa)などの窒素保護基には、ホルムアミド、アセトアミド、クロロアセトアミド、トリクロロアセトアミド、トリフルオロアセトアミド、フェニルアセトアミド、3-フェニルプロパンアミド、ピコリンアミド、3-ピリジルカルボキサミド、N-ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、ベンズアミド、p-フェニルベンズアミド、o-ニトフェニルアセトアミド、o-ニトロフェノキシアセトアミド、アセトアセトアミド、(N’-ジチオベンジルオキシアシルアミノ)アセトアミド、3-(p-ヒドロキシフェニル)プロパンアミド、3-(o-ニトロフェニル)プロパンアミド、2-メチル-2-(o-ニトロフェノキシ)プロパンアミド、2-メチル-2-(o-フェニルアゾフェノキシ)プロパンアミド、4-クロロブタンアミド、3-メチル-3-ニトロブタンアミド、o-ニトロシンアミド(nitrocinnamide)、N-アセチルメチオニン誘導体、o-ニトロベンズアミド、およびo-(ベンゾイルオキシメチル)ベンズアミドが含まれるが、これらに限定されない。
カルバメート基(例えば、--C(=O)ORaa)などの窒素保護基には、メチルカルバメート、エチルカルバメート、9-フルオレニルメチルカルバメート(Fmoc)、9-(2-スルホ)フルオレニルメチルカルバメート、9-(2,7-ジブロモ)フルオロエニルメチルカルバメート、2,7-ジ-t-ブチル-[9-(10,10-ジオキソ-10,10,10,10-テトラヒドロチオキサンチル)]メチルカルバメート(DBD-Tmoc)、4-メトキシフェナシルカルバメート(Phenoc)、2,2,2-トリクロロエチルカルバメート(Troc)、2-トリメチルシリルエチルカルバメート(Teoc)、2-フェニルエチルカルバメート(hZ)、1-(1-アダマンチル)-1-メチルエチルカルバメート(Adpoc)、1,1-ジメチル-2-ハロエチルカルバメート、1,1-ジメチル-2,2-ジブロモエチルカルバメート(DB-t-BOC)、1,1-ジメチル-2,2,2-トリクロロエチルカルバメート(TCBOC)、1-メチル-1-(4-ビフェニリル)エチルカルバメート(Bpoc)、1-(3,5-ジ-t-ブチルフェニル)-1-メチルエチルカルバメート(t-Bumeoc)、2-(2’-および4’-ピリジル)エチルカルバメート(Pyoc)、2-(N,N-ジシクロヘキシルカルボキサミド)エチルカルバメート、t-ブチルカルバメート(BOCまたはBoc)、1-アダマンチルカルバメート(Adoc)、ビニルカルバメート(Voc)、アリルカルバメート(Alloc)、1-イソプロピルアリルカルバメート(Ipaoc)、シンナミルカルバメート(Coc)、4-ニトロシンナミルカルバメート(Noc)、8-キノリルカルバメート、N-ヒドロキシピペリジニルカルバメート、アルキルジチオカルバメート、ベンジルカルバメート(Cbz)、p-メトキシベンジルカルバメート(Moz)、p-ニトベンジルカルバメート、p-ブロモベンジルカルバメート、p-クロロベンジルカルバメート、2,4-ジクロロベンジルカルバメート、4-メチルスルフィニルベンジルカルバメート(Msz)、9-アントリルメチルカルバメート、ジフェニルメチルカルバメート、2-メチルチオエチルカルバメート、2-メチルスルホニルエチルカルバメート、2-(p-トルエンスルホニル)エチルカルバメート、[2-(1,3-ジチアニル)]メチルカルバメート(Dmoc)、4-メチルチオフェニルカルバメート(Mtpc)、2,4-ジメチルチオフェニルカルバメート(Bmpc)、2-ホスホニオエチルカルバメート(Peoc)、2-トリフェニルホスホニオイソプロピルカルバメート(Ppoc)、1,1-ジメチル-2-シアノエチルカルバメート、m-クロロ-p-アシルオキシベンジルカルバメート、p-(ジヒドロキシボリル)ベンジルカルバメート、5-ベンゾイソオキサゾリルメチルカルバメート、2-(トリフルオロメチル)-6-クロモニルメチルカルバメート(Tcroc)、m-ニトロフェニルカルバメート、3,5-ジメトキシベンジルカルバメート、o-ニトロベンジルカルバメート、3,4-ジメトキシ-6-ニトロベンジルカルバメート、フェニル(o-ニトロフェニル)メチルカルバメート、t-アミルカルバメート、S-ベンジルチオカルバメート、p-シアノベンジルカルバメート、シクロブチルカルバメート、シクロヘキシルカルバメート、シクロペンチルカルバメート、シクロプロピルメチルカルバメート、p-デシルオキシベンジルカルバメート、2,2-ジメトキシアシルビニルカルバメート、o-(N,N-ジメチルカルボキサミド)ベンジルカルバメート、1,1-ジメチル-3-(N,N-ジメチルカルボキサミド)プロピルカルバメート、1,1-ジメチルプロピニルカルバメート、ジ(2-ピリジル)メチルカルバメート、2-フラニルメチルカルバメート、2-ヨードエチルカルバメート、イソボリンルカルバメート、イソブチルカルバメート、イソニコチニルカルバメート、p-(p’-メトキシフェニルアゾ)ベンジルカルバメート、1-メチルシクロブチルカルバメート、1-メチルシクロヘキシルカルバメート、1-メチル-1-シクロプロピルメチルカルバメート、1-メチル-1-(3,5-ジメトキシフェニル)エチルカルバメート、1-メチル-1-(p-フェニルアゾフェニル)エチルカルバメート、1-メチル-1-フェニルエチルカルバメート、1-メチル-1-(4-ピリジル)エチルカルバメート、フェニルカルバメート、p-(フェニルアゾ)ベンジルカルバメート、2,4,6-トリ-t-ブチルフェニルカルバメート、4-(トリメチルアンモニウム)ベンジルカルバメート、ならびに2,4,6-トリメチルベンジルカルバメートが含まれるが、これらに限定されない。
スルホンアミド基(例えば、--S(=O)aa)などの窒素保護基には、p-トルエンスルホンアミド(Ts)、ベンゼンスルホンアミド、2,3,6-トリメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mtr)、2,4,6-トリメトキシベンゼンスルホンアミド(Mtb)、2,6-ジメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Pme)、2,3,5,6-テトラメチル-4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mte)、4-メトキシベンゼンスルホンアミド(Mbs)、2,4,6-トリメチルベンゼンスルホンアミド(Mts)、2,6-ジメトキシ-4-メチルベンゼンスルホンアミド(iMds)、2,2,5,7,8-ペンタメチルクロマン-6-スルホンアミド(Pmc)、メタンスルホンアミド(Ms)、ベータ-トリメチルシリルエタンスルホンアミド(SES)、9-アントラセンスルホンアミド、4-(4’,8’-ジメトキシナフチルメチル)ベンゼンスルホンアミド(DNMBS)、ベンジルスルホンアミド、トリフルオロメチルスルホンアミド、およびフェナシルスルホンアミドが含まれるが、これらに限定されない。
他の窒素保護基には、フェノチアジニル-(10)-アシル誘導体、N’-p-トルエンスルホニルアミノアシル誘導体、N’-フェニルアミノチオアシル誘導体、N-ベンゾイルフェニルアラニル誘導体、N-アセチルメチオニン誘導体、4,5-ジフェニル-3-オキサゾリン-2-オン、N-フタルイミド、N-ジチアスクシンイミド(Dts)、N-2,3-ジフェニルマレイミド、N-2,5-ジメチルピロール、N-1,1,4,4-テトラメチルジシリルアザシクロペンタン付加物(STABASE)、5置換1,3-ジメチル-1,3,5-トリアザシクロヘキサン-2-オン、5置換1,3-ジベンジル-1,3,5-トリアザシクロヘキサン-2-オン、1置換3,5-ジニトロ-4-ピリドン、N-メチルアミン、N-アリルアミン、N-[2-(トリメチルシリル)エトキシ]メチルアミン(SEM)、N-3-アセトキシプロピルアミン、N-(1-イソプロピル-4-ニトロ-2-オキソ-3-ピロリン(pyroolin)-3-イル)アミン、第四級アンモニウム塩、N-ベンジルアミン、N-ジ(4-メトキシフェニル)メチルアミン、N-5-ジベンゾスベリルアミン、N-トリフェニルメチルアミン(Tr)、N-[(4-メトキシフェニル)ジフェニルメチル]アミン(MMTr)、N-9-フェニルフルオレニルアミン(PhF)、N-2,7-ジクロロ-9-フルオレニルメチレンアミン、N-フェロセニルメチルアミノ(Fcm)、N-2-ピコリルアミノN’-オキシド、N-1,1-ジメチルチオメチレンアミン、N-ベンジリデンアミン、N-p-メトキシベンジリデンアミン、N-ジフェニルメチレンアミン、N-[(2-ピリジル)メシチル]メチレンアミン、N--(N’,N’-ジメチルアミノメチレン)アミン、N,N’-イソプロピリデンジアミン、N-p-ニトロベンジリデンアミン、N-サリチリデンアミン、N-5-クロロサリチリデンアミン、N-(5-クロロ-2-ヒドロキシフェニル)フェニルメチレンアミン、N-シクロヘキシリデンアミン、N-(5,5-ジメチル-3-オキソ-1-シクロヘキセニル)アミン、N-ボラン誘導体、N-ジフェニルボロン酸(diphenylborinic acid)誘導体、N-[フェニル(ペンタアシルクロム-またはタングステン)アシル]アミン、N-銅キレート、N-亜鉛キレート、N-ニトロアミン、N-ニトロソアミン、アミンN-オキシド、ジフェニルホスフィンアミド(Dpp)、ジメチルチオホスフィンアミド(Mpt)、ジフェニルチオホスフィンアミド(Ppt)、ジアルキルホスホルアミデート、ジベンジルホスホルアミデート、ジフェニルホスホルアミデート、ベンゼンスルフェンアミド、o-ニトロベンゼンスルフェンアミド(Nps)、2,4-ジニトロベンゼンスルフェンアミド、ペンタクロロベンゼンスルフェンアミド、2-ニトロ-4-メトキシベンゼンスルフェンアミド、トリフェニルメチルスルフェンアミド、および3-ニトロピリジンスルフェンアミド(Npys)が含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、酸素原子に存在する置換基は、酸素保護基である(本明細書において、「ヒドロキシル保護基」とも呼ばれる)。酸素保護基には、--Raa、--N(Rbb、--C(=O)SRaa、--C(=O)Raa、--COaa、--C(=O)N(Rbb、--C(=NRbb)Raa、--C(=NRbb)ORaa、--C(=NRbb)N(Rbb、--S(=O)Raa、--SOaa、--Si(Raa、-P(Rcc、--P(Rcc 、--P(ORcc、--P(ORcc 、--P(=O)(Raa、--P(=O)(ORcc、および--P(=O)(N(Rbbが含まれるが、これらに限定されず、ここで、X、Raa、Rbb、およびRccは本明細書に定義された通りである。酸素保護基は、当該技術においてよく知られており、参照により本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis、T.W.GreeneおよびP.G.M.Wuts、第3版、John Wiley&Sons、1999に詳細に記載されているものが含まれる。例示的な酸素保護基には、メチル、メトキシルメチル(MOM)、メチルチオメチル(MTM)、t-ブチルチオメチル、(フェニルジメチルシリル)メトキシメチル(SMOM)、ベンジルオキシメチル(BOM)、p-メトキシベンジルオキシメチル(PMBM)、(4-メトキシフェノキシ)メチル(p-AOM)、グアイアコールメチル(GUM)、t-ブトキシメチル、4-ペンテニルオキシメチル(POM)、シロキシメチル、2-メトキシエトキシメチル(MEM)、2,2,2-トリクロロエトキシメチル、ビス(2-クロロエトキシ)メチル、2-(トリメチルシリル)エトキシメチル(SEMOR)、テトラヒドロピラニル(THP)、3-ブロモテトラヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、1-メトキシシクロヘキシル、4-メトキシテトラヒドロピラニル(MTHP)、4-メトキシテトラヒドロチオピラニル、4-メトキシテトラヒドロチオピラニルS,S-ジオキシド、1-[(2-クロロ-4-メチル)フェニル]-4-メトキシピペリジン-4-イル(CTMP)、1,4-ジオキサン-2-イル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオフラニル、2,3,3a,4,5,6,7,7a-オクタヒドロ-7,8,8-トリメチル-4,7-メタノベンゾフラン-2-イル、1-エトキシエチル、1-(2-クロロエトキシ)エチル、1-メチル-1-メトキシエチル、1-メチル-1-ベンジルオキシエチル、1-メチル-1-ベンジルオキシ-2-フルオロエチル、2,2,2-トリクロロエチル、2-トリメチルシリルエチル、2-(フェニルセレニル)エチル、t-ブチル、アリル、p-クロロフェニル、p-メトキシフェニル、2,4-ジニトロフェニル、ベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル、3,4-ジメトキシベンジル、o-ニトロベンジル、p-ニトロベンジル、p-ハロベンジル、2,6-ジクロロベンジル、p-シアノベンジル、p-フェニルベンジル、2-ピコリル、4-ピコリル、3-メチル-2-ピコリルN-オキシド、ジフェニルメチル、p,p’-ジニトロベンズヒドリル、5-ジベンゾスベリル、トリフェニルメチル、アルファ-ナフチルジフェニルメチル、p-メトキシフェニルジフェニルメチル、ジ(p-メトキシフェニル)フェニルメチル、トリ(p-メトキシフェニル)メチル、4-(4’-ブロモフェナシルオキシフェニル)ジフェニルメチル、4,4’,4’’-トリス(4,5-ジクロロフタルイミドフェニル)メチル、4,4’,4’’-トリス(レブリノイルオキシフェニル)メチル、4,4’,4’’-トリス(ベンゾイルオキシフェニル)メチル、3-(イミダゾール-1-イル)ビス(4’,4’’-ジメトキシフェニル)メチル、1,1-ビス(4-メトキシフェニル)-1’-ピレニルメチル、9-アントリル、9-(9-フェニル)キサンテニル、9-(9-フェニル-10-オキソ)アントリル、1,3-ベンゾジチオラン-2-イル、ベンゾイソチアゾリルS,S-ジオキシド、トリメチルシリル(TMS)、トリエチルシリル(TES)、トリイソプロピルシリル(TIPS)、ジメチルイソプロピルシリル(IPDMS)、ジエチルイソプロピルシリル(DEIPS)、ジメチルテキシルシリル、t-ブチルジメチルシリル(TBDMS)、t-ブチルジフェニルシリル(TBDPS)、トリベンジルシリル、トリ-p-キシリルシリル、トリフェニルシリル、ジフェニルメチルシリル(DPMS)、t-ブチルメトキシフェニルシリル(TBMPS)、ホルメート、ベンゾイルホルメート、アセテート、クロロアセテート、ジクロロアセテート、トリクロロアセテート、トリフルオロアセテート、メトキシアセテート、トリフェニルメトキシアセテート、フェノキシアセテート、p-クロロフェノキシアセテート、3-フェニルプロピオネート、4-オキソペンタノエート(レブリネート)、4,4-(エチレンジチオ)ペンタノエート(レブリノイルジチオアセタール)、ピバロエート、アダマントエート、クロトネート、4-メトキシクロトネート、ベンゾエート、p-フェニルベンゾエート、2,4,6-トリメチルベンゾエート(メシトエート)、メチルカーボネート、9-フルオレニルメチルカーボネート(Fmoc)、エチルカーボネート、2,2,2-トリクロロエチルカーボネート(Troc)、2-(トリメチルシリル)エチルカーボネート(TMSEC)、2-(フェニルスルホニル)エチルカーボネート(Psec)、2-(トリフェニルホスホニオ)エチルカーボネート(Peoc)、イソブチルカーボネート、ビニルカーボネート、アリルカーボネート、t-ブチルカーボネート(BOCまたはBoc)、p-ニトロフェニルカーボネート、ベンジルカーボネート、p-メトキシベンジルカーボネート、3,4-ジメトキシベンジルカーボネート、o-ニトロベンジルカーボネート、p-ニトロベンジルカーボネート、S-ベンジルチオカーボネート、4-エトキシ-1-ナフチル(napththyl)カーボネート、メチルジチオカーボネート、2-ヨードベンゾエート、4-アジドブチレート、4-ニトロ-4-メチルペンタノエート、o-(ジブロモメチル)ベンゾエート、2-ホルミルベンゼンスルホネート、2-(メチルチオメトキシ)エチル、4-(メチルチオメトキシ)ブチレート、2-(メチルチオメトキシメチル)ベンゾエート、2,6-ジクロロ-4-メチルフェノキシアセテート、2,6-ジクロロ-4-(1,1,3,3-テトラメチルブチル)フェノキシアセテート、2,4-ビス(1,1-ジメチルプロピル)フェノキシアセテート、クロロジフェニルアセテート、イソブチレート、モノスクシノエート、(E)-2-メチル-2-ブテノエート、o-(メトキシアシル)ベンゾエート、a-ナフトエート、ニトレート、アルキルN,N,N’,N’-テトラメチルホスホロジアミデート、アルキルN-フェニルカルバメート、ボレート、ジメチルホスフィノチオイル、アルキル2,4-ジニトロフェニルスルフェネート、スルファート、メタンスルホネート(メシレート)、ベンジルスルホネート、およびトシレート(Ts)が含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、硫黄原子に存在する置換基は、硫黄保護基である(本明細書において、「チオール保護基」とも呼ばれる)。硫黄保護基には、--Raa、--N(Rbb、--C(=O)SRaa、--C(=O)Raa、--COaa、--C(=O)N(Rbb、--C(=NRbb)Raa、--C(=NRbb)ORaa、--C(=NRbb)N(Rbb、--S(=O)Raa、--SOaa、--Si(Raa、-P(Rcc、--P(Rcc 、--P(ORcc、--P(ORcc 、--P(=O)(Raa、--P(=O)(ORcc、および--P(=O)(N(Rbbが含まれるが、これらに限定されず、ここで、Raa、Rbb、およびRccは本明細書に定義された通りである。硫黄保護基は、当該技術においてよく知られており、参照により本明細書に組み込まれるProtecting Groups in Organic Synthesis、T.W.GreeneおよびP.G.M.Wuts、第3版、John Wiley&Sons、1999に詳細に記載されているものが含まれる。
「対イオン」または「アニオン性対イオン」は、電子的中性を維持するために陽性荷電基に会合した陰性荷電基である。アニオン性対イオンは、一価であり得る(すなわち、1つの形式陰電荷を含む)。アニオン性対イオンは、多価であり(すなわち、2つ以上の形式陰電荷を含み)、例えば、二価または三価であり得る。対イオンの例には、ハロゲン化物イオン(例えば、F、Cl、Br、I)、NO 、ClO 、OH、HPO 、HCO 、HSO 、スルホン酸イオン(例えば、メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸、10-ショウノウスルホン酸塩、ナフタレン-2-スルホン酸塩、ナフタレン-1-スルホン酸-5-スルホン酸塩、エタン-1-スルホン酸-2-スルホン酸塩など)、カルボン酸イオン(例えば、酢酸塩、プロピオン酸塩、安息香酸塩、グリセリン酸塩、乳酸塩、酒石酸塩、グリコール酸塩、グルコン酸塩など)、BF 、PF 、PF 、AsF 、SbF 、B[3,5-(CF、B(C 、BPh 、Al(OC(CF 、およびカルボランアニオン(例えば、CB1112 または(HCB11MeBr)が含まれる。多価であり得る例示的な対イオンには、CO 2-、HPO 2-、PO 3-、B 2-、SO 2-、S 2-、カルボン酸アニオン(例えば、酒石酸塩、クエン酸塩、フマル酸塩、マレイン酸塩、リンゴ酸塩、マロン酸塩、グルコン酸塩、コハク酸塩、グルタル酸塩、アジピン酸塩、ピメリン酸塩、スベリン酸塩、アゼライン酸塩、セバシン酸塩、サリチル酸塩、フタル酸塩、アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩など)およびカルボランが含まれる。
用語「互変異性体」または「互変異性」は、水素原子の少なくとも1回の形式的移動(formal migration)および原子価の少なくとも1回の変化(例えば、単結合から二重結合、三重結合から単結合、またはこれらの逆)によっても生じる2つ以上の相互転換可能な化合物を指す。互変異性体の正確な比は、温度、溶媒およびpHを含むいくつかの要素によって決まる。互変異性化(すなわち、互変異性対をもたらす反応)は、酸または塩基により触媒され得る。例示的な互変異性化には、ケト-エノール、アミド-イミド、ラクタム-ラクチム、エナミン-イミンおよびエナミン-(異なるエナミン)の互変異性化が含まれる。
用語「多形体」は、化合物(またはその塩、水和物もしくは溶媒和物)の結晶形態を指す。全ての多形体は、同じ元素組成を有する。異なる結晶形態は、通常、異なるX線回折パターン、赤外線スペクトル、融点、密度、硬度、結晶形状、光学および電気的特性、安定性、ならびに溶解性を有する。再結晶溶媒、結晶化速度、保管温度および他の要素によって、1種類の結晶形が優位を占めることがある。化合物の様々な多形体を、異なる条件下での結晶化により調製することができる。
次の略語が全体を通して使される:N-アセチル-ガラクトサミン(GalNAc);薄層クロマトグラフィー(TLC);液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS);高速液体クロマトグラフィー(HPLC);ジクロロエタン(DCE);ジクロロメタン(DCM);トリメチルシリルトリフロオロメタンスルホネート(TMSOTf);N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド(DIC);ジメチルアミノピリジン(DMAP);酢酸エチル(EA);ジメチルスルホキシド(DMSO);トリフルオロ酢酸(TFA);アセトニトリル(ACN);2-(1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルアミニウムテトラフルオロボレート(TBTU);テトラヒドロフラン(THF);ジメトキシトリチル(DMT);孔径制御ガラス(controlled pore glass)(CPG);5-エチルチオ-1H-テトラゾール(ETT);フェニルアセチルジスルフィド(PADS);トリメチルアミン(TEA);ヘキサフルオロイソプロパノール(HFIP);ヘキシルアミン(HA);リン酸緩衝食塩水(PBS);およびイオン対逆相(IP-RP)。
標的化リガンドクラスター
式1
本発明の少なくとも一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは式1の一般的な構造を有する:
Figure 2022527569000011
[式中、TLは、これらに限定されないが:N-アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、およびN-イソ-ブタノイルガラクトサミンを含む1つまたは複数の標的化リガンドであり;1つまたは複数のTLは、同じ標的化リガンドクラスターの1つまたは複数の他のTLと異なっていてもよく;
リンカーAは1つまたは複数の二官能性スペーサーであり、リンカーAの一方の末端は標的化リガンドに結合し、他方の末端は、エーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し;
リンカーBは二官能性スペーサーであり、リンカーBの一方の末端は、ホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドに結合し、他方の末端は、アミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し;
Wは、H、保護基、ホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドである]。
式2
少なくとも一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスターは、以下の式2の一般的な構造を含む:
Figure 2022527569000012
[式中、リンカーAは少なくとも1つのスペーサーであり、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端は、エーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し;少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含んでいてもよく;少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含み;
リンカーBは少なくとも1つのスペーサーであり、リンカーBの一方の末端は、ホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端は、アミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し;少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含んでいてもよく;少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含み;
は、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキルであってもよいか、またはRは、窒素原子を介してRと連結して環を形成していてもよく;少なくとも一部の実施形態では、Rはイソプロピル基であってもよく;
は、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキルであってもよいか、またはRは、窒素原子を介してRと連結して環を形成していてもよく;少なくとも一部の実施形態では、Rはイソプロピル基であってもよく;少なくとも一部の実施形態では、Rは、ホスファイトおよびホスフェート保護基であってもよく;少なくとも一部の実施形態では、ホスフェート保護基は、メチル、アリル、2-シアノエチル、4-シアノ-2-ブテニル、2-シアノ-1,1-ジメチルエチル、2-(トリメチルシリル)エチル、2-(S-アセチルチオ)エチル、2-(S-ピバロイルチオ)エチル、2-(4-ニトロフェニル)エチル、2,2,2-トリクロロエチル、2,2,2-トリクロロ-1,1-ジメチルエチル、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロピル、フルオレニル-9-メチル、2-クロロフェニル、4-クロロフェニル、および2,4-ジクロロフェニルのうちの少なくとも1つを含んでいてもよく;少なくとも一部の実施形態では、Rは、2-シアノエチル基であってもよい]。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは:
Figure 2022527569000013
[式中、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよい]
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは:
Figure 2022527569000014
[式中、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;
は、H、メチル(Me)、エチル(Et)、シクロプロピルであってもよいか、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成していてもよく;
は、H、Me、Et、シクロプロピルであってもよいか、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成してもよい]
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは:
Figure 2022527569000015
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい
[式中、mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよい]。
式3
少なくとも一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターを含む本発明の化合物は以下の式3の一般的な構造を含む:
Figure 2022527569000016
[式中、オリゴヌクレオチドは、低分子干渉RNA(siRNA)、一本鎖siRNA、マイクロRNA(miRNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、メッセンジャーRNA(mRNA)、リボザイム、プラスミド、免疫刺激核酸、アンタゴミル、およびアプタマーのうちの少なくとも1つを含み;
Xは、酸素(O)および硫黄(S)のうちの少なくとも1つであり;
Yは、O、S、およびNHのうちの少なくとも1つであり;
リンカーAは少なくとも1つのスペーサーであり、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端は、エーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し;少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含んでいてもよく;少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含み;
リンカーBは少なくとも1つのスペーサーであり、リンカーBの一方の末端は、ホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端は、アミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し;少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含んでいてもよく;少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む]。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーAは:
Figure 2022527569000017
[式中、
mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;
nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよい]
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは:
Figure 2022527569000018
[式中、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;
は、H、Me、Et、シクロプロピルであってもよいか、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成していてもよく;
は、H、Me、Et、シクロプロピルであってもよいか、またはRは、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成してもよい]
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい。
少なくとも一部の実施形態では、リンカーBは:
Figure 2022527569000019
[式中、mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよく;nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であってもよい]
のうちの1つまたは複数を含んでいてもよい。
本発明の標的化リガンドクラスターに含まれる各リンカーAは、独立して選択してもよく、(1)標的化リガンドクラスター中のリンカーAは互いに全て同じであること、(2)標的化リガンドクラスター中のリンカーAのうちの2つは互いに同じであり、1つはその2つと異なること;または(3)標的化リガンドクラスター中の3つのリンカーAはそれぞれ他と異なることを意味することは理解されるであろう。2つ以上のリンカーBを含む本発明の標的化リガンドクラスターにおいて、各リンカーBは独立して選択され、(4)標的化リガンドクラスター中の全てのリンカーBは互いに同じであること、(5)標的化リガンドクラスター中のリンカーBのうちの2つまたはそれを超えるものは互いに同じであり、少なくとも1つのリンカーBは、その2つまたはそれを超えるものとは異なること、または(6)標的化リガンドクラスター中の各リンカーBは、標的化リガンドクラスター中の他の全てのリンカーBとは異なることを意味することは理解されるであろう。「第1のリンカー」および「リンカーA」という用語は、本明細書において同じ意味で使用してもよい。「第2のリンカー」および「リンカーB」という用語は、本明細書において同じ意味で使用してもよい。本明細書で使用される場合、「標的化リガンドクラスター」および「リガンドクラスター」という用語は、区別せずに使用してもよい。
本発明のGalNAcホスホラミダイト標的化リガンドクラスターの実施形態は、標準的なオリゴヌクレオチド合成および脱保護方法を用いて使用してもよいことが現在実証されている。GalNAc標的化リガンドクラスターを含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc基のアセチル保護基を除去する標準的な手順を使用して脱保護してもよい。本発明の方法のある特定の実施形態は、オリゴヌクレオチドを本発明のGalNAc標的化リガンドクラスターにコンジュゲートさせること含む。本発明の方法の一部の実施形態では、保護されたGalNAc標的化リガンドホスホラミダイトがコンジュゲーション方法において使用され、そのような方法は、効率的なコンジュゲートに使用することができ、高収率および高純度レベルのコンジュゲートされた生成物をもたらす。本明細書における様々な例は、GalNACホスホラミダイト標的化リガンドクラスターを含む。本発明の一部の実施形態では、標的化リガンドクラスターは、本明細書において示されるリガンドA~WWに示すようなホスホラミダイトを含んでいてもよい。リガンドA、リガンドB、リガンドC、リガンドD、リガンドE、リガンドF、リガンドG、リガンドH、リガンドI、リガンドJ、リガンドK、リガンドL、リガンドM、リガンドN、リガンドO、リガンドP、リガンドQ、リガンドR、リガンドS、リガンドT、リガンドU、リガンドV、リガンドW、リガンドX、リガンドY、リガンドZ、リガンドJJ、リガンドKK、リガンドLL、リガンドMM、リガンドNN、リガンドOO、リガンドPP、リガンドQQ、リガンドRR、リガンドSS、リガンドTT、リガンドUU、リガンドVV、およびリガンドWWが本明細書において示される。これらの40個のリガンドは、リガンドA~WWと本明細書において称される場合があり、またはサブセットは、様々なリガンド番号を示すことによっておよび/もしくは1つまたは複数の個体リガンド番号を示すことによって参照してもよい。
本明細書において他の箇所で記載されているように、式1または式2の標的化リガンドクラスターは、オリゴヌクレオチド化合物に結合させてもよい。本発明の標的化リガンドクラスターおよびオリゴヌクレオチドの結合を記載する場合、「結合された」、「結合」、および「結合する」という用語は、用語:「コンジュゲートされた」、「コンジュゲート」、および「コンジュゲートする」;ならびに「連結された」、「連結している」、および「連結」とそれぞれ本明細書において区別せずに使用してもよい。
本発明の標的化リガンドクラスターの一部の実施形態は、リガンドA~WWとして本明細書において示される(図1)。本発明の組成物および/または方法のある特定の実施形態では、標的化リガンドクラスターはリガンドA~WW(これは本明細書において「化合物A~WW」とも称される場合がある)のうちの1つを含み、これが核酸分子におよび/または核酸を含む化合物に結合される。一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスターは少なくとも1つの核酸分子に結合され、得られた複合体は、本明細書において「標的化リガンドクラスター/核酸複合体」と称される場合がある。本発明の一部の実施形態では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体中に含まれる核酸分子はオリゴヌクレオチドを含む。本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の一般式は式3として本明細書において示され、これはオリゴヌクレオチドに結合された標的化リガンドクラスターを示す。本発明のリガンドクラスター/核酸複合体の非限定的な例としては:MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、およびMITO-Iがある。
本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の一部の実施形態では、FXII siRNAを含むsiRNAを含む。本発明の標的化リガンドクラスターは、FXII siRNA以外のsiRNA分子にコンジュゲートされていてもよいことは理解されるであろう。siRNA分子は、siRNAに標的とされる遺伝子に基づいて、本発明の標的化リガンドクラスターとコンジュゲートさせるために選択してもよい。したがって、細胞および/または対象における例えば「タンパク質A」の発現を減少させることが目的である場合、siRNAを選択し、本発明の標的化リガンドクラスターに結合させ、細胞および/または対象に投与してもよい。選択されたsiRNAはタンパク質A遺伝子の発現を減少させることができるため、siRNAの選択は少なくとも部分的であってもよく、その遺伝子は選択されたsiRNAの「標的遺伝子」と称してもよい。本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の実施形態は、細胞および/または対象に投与され、機能性siRNAを細胞および/または対象に送達することができ、結果として生じたsiRNAの存在がsiRNAの標的遺伝子の発現を減少させる。
1つまたは複数のPEGリンカーを含む化合物
本発明の少なくとも一部の実施形態では、ポリエチレングリコール(PEG)は、本明細書の式1における「リンカーA」および/または「リンカーB」として使用してもよい。リンカーAは、式1の単一の化合物が、単一のPEGリンカーA、2つの異なるPEGリンカーA、または3つの異なるPEGリンカーAを有することができるように個々に選択してもよい。さらに、様々な分子量のPEGを使用してもよく、1つのPEGリンカーAは、同じ化合物の第2のPEGリンカーAと同じ(または類似の)または異なる分子量を有していてもよい。
上記の様々な例示化合物において示されるように(式1を参照として使用すると)、PEGは、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合するPEGによって、TLを没食子酸に結合させることができる。すなわち、本発明の少なくとも一部の実施形態では、酸素のみが、PEGと没食子酸の芳香族官能基との間に位置することができる。特定の非限定的な例では、本発明の少なくとも一部の実施形態では、窒素原子(または窒素含有官能基)は、PEGと没食子酸の芳香族官能基との間に位置することはできない。
合成
本開示による化合物の、本明細書において合成とも称される調製は様々なステップを含んでいてもよい。本発明の少なくとも一部の実施形態では、調製はエステル化反応から始まる。本発明の少なくとも一部の実施形態では、エステル化反応に続いて求核置換(SN2)反応、次いで続いてグリコシル化反応、次いで続いて(例えば、t-ブチルエステルの)脱保護反応が行われる。本発明の少なくとも一部の実施形態では、脱保護反応に続いてアミドカップリング反応が行われる。本発明の少なくとも一部の実施形態では、アミドカップリング反応に続いてリン酸化反応が行われる。当業者であれば、前述の例示的な調製方法は、使用される出発および中間材料に応じて変更してもよいことを理解するであろう。
合成スキーム1
一般式2(以下および例1において示される)に基づいて本発明の化合物を調製するための方法の実施形態は「合成スキーム1」として同定される。合成スキーム1、ならびに足場として没食子酸を使用する標的化リガンドクラスターの実施形態を調製および使用するために使用してもよい追加の合成方法のさらなる詳細は、例1において提供される。本明細書における例は、本発明の標的化リガンドクラスターのある特定の実施形態を調製するための合成方法も示し、例えば、リガンドA~WWを含む本発明のリガンドを調製するための合成方法の実施形態は、本明細書において例の項に示される。
合成スキーム1は、一般式1を有する標的化リガンドクラスターを調製するための合成手段を示す。合成スキーム1に示す化合物および中間体は、割り当てられたローマ数字(i)~(vii)で同定される。化合物および/または中間体は、ローマ数字の代わりにアラビア数字を用いて本明細書において他の箇所で同定してもよく、ローマ数字(i)~(vii)を有する化合物の特性の説明も、対応するアラビア数字が付された化合物および/または中間体にそれぞれ適用されることは理解されるであろう。
Figure 2022527569000020
合成スキーム2
一般式1を含む化合物を調製するための方法の実施形態は以下の合成において図示され、「スキーム2」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製しても、示された手順を使用して作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。詳細に関しては例を参照されたい。例えば、合成スキーム2において、化合物6は、合成スキーム1において示される「化合物(iv)」に対応し、化合物7は合成スキーム1において示される「化合物(v)」に対応する。
Figure 2022527569000021
合成スキーム3
一般式1を含む化合物を調製するための方法の実施形態は以下の合成において図示され、「スキーム3」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製しても、示された手順を使用して作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。さらなる詳細に関しては例を参照されたい。合成スキーム3において、化合物6’は、合成スキーム1で示す「化合物(iv)」に対応し、化合物7’は、合成スキーム1において示される「化合物(v)」に対応する。
Figure 2022527569000022
合成スキーム4
一般式1を含み、「化合物A」として本明細書において示す化合物を調製するための方法の実施形態は以下の合成において図示され、「スキーム4」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製しても、示された手順を使用して作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。以下に示される合成スキーム4は化合物7から開始し、この化合物は、合成スキーム2で示すように調製してもよい。詳細に関しては例を参照されたい。
Figure 2022527569000023
調製および使用のある特定の要素
本発明の標的化リガンドクラスターのある特定の実施形態は、オリゴヌクレオチド剤を細胞、組織、および器官に送達するために調製し、使用してもよい。送達することができる作用剤の非限定的な例としては、治療剤、例えばsiRNAがある。本発明の標的化リガンドクラスターを使用する送達方法は、本発明の標的リガンドクラスターにコンジュゲートされたsiRNAおよび他の作用剤をin vitroおよびin vivoで細胞に送達するために使用することができる。本発明の標的化リガンドクラスターは、作用剤、例えばこれらに限定されないが、核酸を含む作用剤を細胞に送達するための送達ビヒクルとして使用することができる。本明細書で使用される場合、「標的化リガンドクラスター/核酸複合体」という用語は、核酸を含む作用剤に連結された本明細書において記載される標的化リガンドクラスターを意味する。本発明の一部の実施形態では、核酸はsiRNAである。
本発明の一部の態様では、標的化リガンドクラスターは、対象における細胞に作用剤を送達するために使用してもよい。標的化リガンドクラスター/核酸剤を対象に投与する手段は当技術分野で既知の方法を含んでいてもよい。非限定的な例として、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、直接注射することによってまたは注入ポンプを使用することによってin vivoで局所的に送達してもよい。本発明の一部の態様では、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は医薬組成物の状態であり、薬剤と称してもよい。一部の実施形態では、本発明の薬剤は、対象における疾患状況の症状を阻止するか、出現をモジュレートするか、処置するか、または軽減するのに有効な量で対象に投与される。
細胞および対象
本明細書で使用される場合、対象は、これらに限定されないが、イヌ、ネコ、ウマ、ヤギ、ウシ、ヒツジ、齧歯動物、および霊長類、例えば、サルを含むヒトまたは脊椎哺乳動物を意味するべきである。したがって、本発明は、ヒトおよび非ヒト対象における疾患または状態を処置するために使用してもよい。例えば、本発明の方法および組成物は、獣医用途ならびにヒト用阻止および処置レジメンにおいて使用してもよい。ある特定の実施形態では、対象は家畜である。
「対象」という用語は任意の動物を指す。ある特定の実施形態では、対象は哺乳動物である。ある特定の実施形態では、対象はヒト(例えば、男性、女性、または子供)である。ヒトはどちらの性別であってもよく、発達の任意の段階であってもよい。ある特定の実施形態では、対象は処置されることになる状態または疾患と診断されている。他の実施形態では、対象は状態または疾患を発症するリスクがある。ある特定の実施形態では、対象は実験動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ブタ、または霊長類)である。実験動物は、遺伝子操作されていてもよい。
送達の評価
本発明のある特定の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は細胞に送達され、それと接触される。本発明の一部の実施形態では、接触される細胞は培養物中にあり、他の実施形態では、接触される細胞は対象中にある。本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体と接触させてもよい細胞のタイプとしては、これらに限定されるものではないが:肝臓細胞、筋肉細胞、心臓細胞、循環細胞、神経細胞、グリア細胞、脂肪細胞(fat cells)、皮膚細胞、造血細胞、上皮細胞、免疫系細胞、内分泌細胞、外分泌細胞、内皮細胞、精子、卵母細胞、筋肉細胞、脂肪細胞(adipocytes)、腎臓細胞、肝細胞、または膵臓細胞がある。一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体と接触される細胞は肝臓細胞である。
本発明の一部の実施形態では、生物学的試料を得、本発明の標的化リガンドクラスターを使用して核酸の送達に関して評価してもよい。「生物学的試料」という用語は、組織試料(例えば、組織切片および組織の針生検材料);細胞試料(例えば、細胞学的塗抹標本(例えば、Papまたは血液塗抹標本)または顕微解剖によって得られた細胞の試料);生物全体の試料(例えば、酵母または細菌の試料);または細胞フラクション、フラグメントまたは小器官(例えば、細胞を溶解し、これらの構成要素を遠心分離または他の方法によって分離することで得られる)を含む任意の試料を指す。生物学的試料の他の例としては、血液、血清、尿、精液、糞便、脳脊髄液、間質液、粘膜、涙液、汗、膿、生検組織(例えば、外科的生検または針生検によって得られる)、乳頭吸引液、母乳、膣液、唾液、スワブ(例えば、頬側スワブ)、または最初の生物学的試料由来の生体分子を含む任意の材料がある。
投与および処置
本発明のある特定の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、対象において核酸を細胞に送達するための標的化リガンドクラスターの使用を含む方法において対象に投与してもよい。一部の実施形態では、核酸は、オリゴヌクレオチドであり、一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは阻害剤RNA、または送達時にsiRNAの標的遺伝子の発現を減少させるように選択されたsiRNA分子を含む。本発明のある特定の実施形態は、対象の細胞における遺伝子の発現と関連する疾患または状態を処置する方法であって、標的化リガンドクラスター/核酸複合体の投与が遺伝子の発現を減少させ、対象における疾患または状態を処置する方法を含む。本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の投与は、所定の方法を使用して行ってもよい。
本明細書で使用される場合、「投与する」、「投与すること」、または「投与」という用語は、埋込、吸収、摂取、注射、吸入、または本発明の化合物もしくはその医薬組成物を導入する別のものを指す。「処置」、「処置する」、および「処置すること」という用語は、本明細書において記載される「病理学的状態」(例えば、疾患、障害、もしくは状態、またはこれらの1つもしくは複数の徴候または症候)を逆転させること、軽減すること、発症を遅延させること、または進行を阻害することを指す。一部の実施形態では、処置は、疾患または状態の1つまたは複数の徴候または症候が発症した後かまたは観察された後に投与してもよい。他の実施形態では、処置は、疾患または状態の徴候または症候の非存在下で投与してもよい。例えば、処置は、症候の発症前に(例えば、症候歴を考慮しておよび/または遺伝的または他の感受性因子を考慮して)感受性が強い個体に投与してもよい。処置は、例えば再発を遅延させるかまたは阻止するために、症候が解消した後も続けてもよい。「状態」、「病理学的状態」、「疾患」、および「障害」という用語は区別せずに使用される。
投薬量
本開示の標的化リガンドクラスター/核酸複合体を使用して送達してもよい医薬および医薬組成物に関する投薬量レベルは、所定の実験により当業者によって判定してもよい。少なくとも一部の実施形態では、単位用量は、約0.01mg/kgから約100mg/kg体重の間のsiRNAを含んでいてもよい。あるいは、用量は、10mg/kgから25mg/kg体重、または1mg/kgから10mg/kg体重、または0.05mg/kgから5mg/kg体重、または0.1mg/kgから5mg/kg体重、または0.1mg/kgから1mg/kg体重、または0.1mg/kgから0.5mg/kg体重、または0.5mg/kgから1mg/kg体重であってもよい。臨床試験は治療的組成物に関する投薬量レベルを評価するために通常使用される。
本発明の標的化リガンドクラスターを含む医薬組成物は、無菌の注射可能な水性懸濁液または溶液であっても、凍結乾燥形態であってもよい。本開示の医薬組成物および医薬は、薬学的に有効な用量で対象に投与してもよい。
投与方法
本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体のための様々な投与経路が利用可能である。選択される特定の送達様式は、処置される特定の状態および治療的有効性に必要な投薬量に依存することになる。本発明の方法は、一般的に言えば、医学的に許容される任意の投与様式を使用して行ってもよく、臨床的に許容することができない有害効果をもたらすことなく有効なレベルの処置をもたらす任意の様式を意味する。本発明の一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、経口、経腸、経粘膜、経皮、および/または非経口経路で投与してもよい。「非経口」という用語は、皮下、髄腔内、静脈内、筋肉内、腹腔内、および胸骨内注射、または注入技術を含む。他の経路としては、これらに限定されるものではないが、(例えば、胃鼻管を介した)鼻、皮膚、膣、直腸、および舌下がある。本発明の送達経路は、髄腔内、脳室内、または頭蓋内を含んでいてもよい。本発明の一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、遅延放出マトリックス内に配置してもよく、マトリックスを対象に配置することによって投与してもよい。
本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、製剤の状態で投与してもよく、その製剤は、薬学的に許容される濃度の塩、緩衝剤、保存剤、適合する担体、アジュバント、および必要に応じて他の治療的成分を通常含み得る薬学的に許容される溶液の状態で投与される場合がある。本発明の方法によれば、標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、医薬組成物の状態で投与してもよい。一般的に、医薬組成物は、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体および薬学的に許容される担体を含む。薬学的に許容される担体は当業者に周知であり、所定の方法を使用して選択し、利用してもよい。本明細書で使用される場合、薬学的に許容される担体は、活性成分の生物活性の有効性、例えば、送達される核酸、例えば、それが向けられる疾患または状態を阻止および/または処置するためのsiRNAの能力に干渉しない非毒性材料を意味する。
薬学的に許容される担体は、希釈剤、フィラー、塩、緩衝液、安定化剤、可溶化剤および当技術分野において周知の他の材料を含んでいてもよい。例示的な薬学的に許容される担体は、米国特許第5,211,657号に記載されており、他のものは当業者であれば既知である。そのような調製物は、塩、緩衝剤、保存剤、適合する担体、および必要に応じて他の治療剤を通常含んでいてもよい。薬において使用される場合、塩は薬学的に許容されるべきであるが、薬学的に許容されない塩は、薬学的に許容されるその塩を調製するために好都合に使用してもよく、発明の範囲から除外されるものではない。
「薬学的に許容される塩」という用語は、健全な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー応答などを示すことなくヒトおよび他の動物の組織との接触における使用に好適な塩を指し、妥当な利点/リスク比率に見合ったものである。薬学的に許容される塩は当技術分野において周知である。例えば、Bergeらは、J. Pharmaceutical Sciences, 1977, 66, 1-19において薬学的に許容される塩を詳細に記載しており、これは参照により本明細書に組み込まれるものとする。本発明の化合物の薬学的に許容される塩としては、好適な無機および有機の酸および塩基由来のものがある。塩は、化合物の最終的な単離および精製中にまたは遊離塩基の形態の適切な化合物と好適な酸とを反応させることによって個別に調製してもよい。薬理学的におよび薬学的に許容される塩としては、これらに限定されるものではないが、以下の酸:塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、マレイン酸、酢酸、サリチル酸、クエン酸、ギ酸、マロン酸、コハク酸などから調製されるものがある。また、薬学的に許容される塩は、アルカリ金属またはアルカリ土類塩、例えば、ナトリウム、カリウムまたはカルシウム塩として調製される場合がある。
代表的な酸付加物塩としては、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、L-アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸、ベンゼンスルホン酸塩(ベシル酸塩)、重硫酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、ジグルコン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、ゲンチシン酸塩、グルタル酸塩、グリセロリン酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、馬尿酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩(イセチオン酸塩)、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、DL-マンデル酸塩、メシチレンスルホン酸塩、メタンスルホン酸塩、ナフチレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、シュウ酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、ホスホン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ピログルタミン酸塩、コハク酸塩、スルホン酸塩、酒石酸塩、L-酒石酸塩、トリクロロ酢酸塩、トリフルオロ酢酸塩、リン酸塩、グルタミン酸塩、重炭酸塩、パラトルエンスルホン酸塩(p-トシル酸塩)、およびウンデカン酸塩がある。また、本明細書において開示される化合物における塩基性基は、メチル、エチル、プロピル、およびブチルの塩化物、臭化物、およびヨウ化物;ジメチル、ジエチル、ジブチル、およびジアミル硫酸化物;デシル、ラウリル、ミリスチル、およびステリルの塩化物、臭化物、およびヨウ化物;およびベンジルおよびフェネチル臭化物で四級化されていてもよい。治療上許容される塩を形成するために用いてもよい酸の例としては、無機酸、例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、およびリン酸;および有機酸、例えば、シュウ酸、マレイン酸、コハク酸、およびクエン酸がある。
本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、医薬組成物、例えば本明細書において記載されるものの状態で投与してもよい。本発明の医薬組成物は、通常加溶媒分解反応によって溶媒と結合した本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体を含んでいてもよい。この物理的結合としては水素結合があり得る。従来の溶媒としては、水、メタノール、エタノール、酢酸、DMSO、THF、ジエチルエーテルなどがある。本発明の化合物は、例えば結晶形態の状態で調製してもよく、溶媒和物であってもよい。好適な溶媒和物としては、薬学的に許容される溶媒和物があり、さらに化学量論の溶媒和物と非化学量論の溶媒和物の両方を含む。ある特定の場合では、溶媒和物は、例えば、1つまたは複数の溶媒分子が結晶固体の結晶格子中に組み込まれている場合に単離することができるであろう。「溶媒和物」は溶液相と単離可能な溶媒和物の両方を包含する。代表的な溶媒和物としては、水和物、エタノール付加物(ethanolates)、およびメタノール付加物(methanolates)がある。
「水和物」という用語は、水と結合した化合物を指す。典型的には、化合物の水和物中に含まれる水分子の数は、水和物における化合物分子の数に対して明確な比率である。したがって、化合物の水和物は、例えば一般式RxHOによって表してもよく、ここでRは化合物であり、xは0を超える数である。所与の化合物は、例えば、一水和物(xは1である)、低水和物(xは0を超え、1より小さい数である、例えば、半水和物(R.0.5HO))、および多水和物(xは1を超える数、例えば、二水和物(R.2HO)および六水和物(R.6H))を含む2つ以上のタイプの水和物が形成される場合がある。
投与
本発明の一部の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、組織に直接投与してもよい。直接的な組織投与は、直接注射することによってまたは他の当技術分野で既知の手段によって達成してもよい。本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は1回で投与しても、あるいは複数回の投与で投与してもよい。複数回投与される場合、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は異なる経路を介して投与してもよい。例えば、最初の(または最初の数回の)投与は、罹患した組織または臓器に直接的行ってもよく、同時に後の投与は、全身的に行ってもよい。
本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、全身的に投与することが望ましい場合、注射による、例えばボーラス注射または連続注入による非経口投与用に製剤化してもよい。注射用製剤は、単位投薬量形態で、例えば、保存剤が添加されているかまたは添加されていないかにかかわらず、アンプルでまたは複数回用量容器で提示してもよい。医薬組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁剤、溶液またはエマルションのような形態をとっていてもよく、製剤化用剤、例えば懸濁化剤、安定化剤および/または分散剤を含んでいてもよい。
非経口投与のための調製物としては、無菌の水性または非水性溶液剤、懸濁剤、およびエマルション剤がある。非水性溶媒の例は、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油、例えばオリーブ油、および注射可能な有機エステル、例えばオレイン酸エチルである。水性担体としては、生理食塩水および緩衝媒体を含む、水、アルコール/水溶液、エマルションまたは懸濁剤がある。非経口ビヒクルとしては、塩化ナトリウム溶液、リンゲルデキストロース、デキストロースおよび塩化ナトリウム、乳酸ナトリウム加リンゲル、または固定油がある。静脈内ビヒクルとしては、流体および栄養素補充液、電解質補充液(例えば、リンゲルデキストロースがベースのもの)などがある。保存剤および他の添加物、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キレート化剤、および不活性ガスなども存在していてもよい。低用量は、他の投与形態、例えば静脈内投与から得られることになる。対象における応答が、適用された最初の用量で不十分であるという場合、患者の耐容性が可能な範囲で高用量(または異なるより局在化された送達経路による事実上の高用量)を用いてもよい。1つまたは複数の本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の適切な全身性または局在性レベルを達成するために必要に応じて1日あたり複数回の用量を使用して、所望のレベルの核酸、例えば所望のレベルのsiRNAを得てもよい。
非生分解性と生分解性の両方の高分子マトリックスは、1つまたは複数の本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体を細胞および/または対象に送達するために使用することができる。一部の実施形態では、マトリックスは、生分解性であってもよい。マトリックスポリマーは、天然または合成ポリマーであってもよい。ポリマーは、放出が所望される期間、一般的におおよそ数時間から数年またはそれより長い時間に基づいて選択してもよい。典型的には、数時間から3から12か月の間の範囲の期間にわたって放出を使用することができる。ポリマーは必要に応じて、水中でその重量の最大約90%を吸収することができるヒドロゲルの形態であり、さらに、必要に応じて多価イオンまたは他のポリマーと架橋されている。
本発明のある特定の実施形態では、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体は、高分子マトリックスが拡散されることによる、または分解されることによる生体内分解性埋込体を使用して送達してもよい。そのような使用のための例示的な合成ポリマーは当技術分野において周知である。生分解性ポリマーおよび非生分解性ポリマーを使用して、当業者に既知の方法を使用して本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体のうちの1つまたは複数を送達してもよい。そのような方法をまた使用して、1つまたは複数の本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体を送達して処置してもよい。追加の好適な送達系としては、徐放、遅延放出または持続放出送達系があり得る。そのような系は、本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の繰り返し投与を回避することができ、対象および医療提供者にとっての利便性が高まる。多くのタイプの放出送達系が利用可能であり、当業者であれば既知である(例えば、:米国特許第5,075,109号;同第4,452,775号;同第4,675,189号;同第5,736,152号;同第3,854,480号;同第5,133,974号;および同第5,407,686号を参照のこと(これらそれぞれの教示は参照により本明細書に組み込まれるものとする))。さらに、ポンプベースのハードウェア送達系を使用してもよく、その一部は埋込体に適応される。
長期持続放出埋込体の使用は、対象の予防的処置に、および本発明の標的化リガンドクラスターを使用して送達されるsiRNAを用いて阻止および/または処置されることになる再発性疾患または状態を発症するリスクがある対象に特に好適であり得る。長期放出は、本明細書で使用される場合、埋込体が少なくとも30日、60日、90日またはそれを超える日数の間治療的レベルの活性成分を送達するように構築され、配置されていることを意味する。長期持続放出埋込体は当業者であれば周知であり、上述の放出システムの一部を含む。
1つまたは複数の本発明の標的化リガンドクラスター/核酸複合体の治療用製剤は、所望の純度を有する標的化リガンドクラスター/核酸複合体と、必要に応じて薬学的に許容される担体、賦形剤または安定化剤[Remington’s Pharmaceutical Sciences 21stedition, (2006)]とを混合することによって凍結乾燥製剤または水性溶液の形態に調製して、保存してもよい。許容される担体、賦形剤、または安定化剤は、用いられる投薬量および濃度でレシピエントに対して非毒性であり、その許容される担体、賦形剤、または安定化剤としては、これらに限定されるものではないが:緩衝液、例えば、ホスフェート、シトレート、および他の有機酸;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;保存剤(例えば、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えば、メチルまたはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、またはリシン;単糖類、二糖類、およびグルコース、マンノース、またはデキストリンを含む他の炭水化物;キレート化剤、例えばEDTA;糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトール;塩形成対イオン、例えばナトリウム;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);および/または非イオン性界面活性剤、例えばTWEEN(登録商標)、PLURONICS(登録商標)またはポリエチレングリコール(PEG)がある。
本開示のsiRNAコンジュゲート(本明細書において標的化リガンドクラスター/核酸複合体とも称される)は、医薬組成物として製剤化してもよい。医薬組成物は、単独でまたは他の作用剤と組み合わせて医薬として使用してもよい。本開示のsiRNAコンジュゲートはまた、個別にまたは付随して(例えば、組合せ単位用量として)投与される他の治療的化合物と組み合わせて投与してもよい。少なくとも一部の実施形態では、本開示は、生理学的に/薬学的に許容される賦形剤、例えば、安定化剤、保存剤、希釈剤、緩衝剤などの中に本開示による1つまたは複数のsiRNAコンジュゲートを含む医薬組成物を含む。
本発明の医薬組成物は、単独で、互いに組み合わせて、および/または他の薬物療法または疾患もしくは状態を呈する対象に投与される他の処置レジメンと組み合わせて投与してもよい。本発明の実施形態において使用される医薬組成物は、好ましくは無菌であり、核酸、例えばsiRNAが向けられる疾患または状態を阻止または処置するために有効な量の標的化リガンドクラスター/核酸複合体を含む。
対象に投与される場合に疾患または状態を処置するのに十分な本発明の医薬組成物の用量は、異なるパラメーターに従って、特に使用される投与様式および対象の状況に従って選択してもよい。他の因子は所望の処置期間を含んでいてもよい。対象における応答が、適用された最初の用量で不十分である場合、患者の耐容性が可能な範囲で高用量(または異なるより局在化された送達経路による事実上の高用量)を用いてもよい。本発明の一部の実施形態では、所定の手段を使用して、例えば臨床試験において判定されている投薬量が使用される。
実施例
本明細書において記載される本発明をより深く理解することができるように、以下の例が示される。本出願において記載する実施例は、本明細書において提供される方法および組成物を例示するために提供され、その範囲を限定するとして決して解釈されるものではない。
スキーム1 標的化リガンドクラスターの実施形態の合成
一般式2を含む標的化リガンドクラスター化合物を調製するための方法の実施形態は、「スキーム1」として同定される以下の合成において図示される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。以下の方法を使用して、一般式2を含む標的化リガンドクラスター化合物を調製した。
一般的な合成材料および方法
没食子酸(スキーム1における化合物(i))から出発し、Leiro, V.; et al. J. Mater. Chem. B, 2017, 5, 4901に記載されている手順を使用して、没食子酸[化合物(ii)]のtert-ブチルエステルを合成しており、その内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれるものとする。
化合物(iii)は、化合物(ii)およびリンカーA誘導体を好適な脱離基と、標準的なSN2反応条件(例えば、触媒量のKIの存在下および非プロトン性溶媒中、塩基としてのKCO)下で反応させることによって合成することができる。
化合物(iv)は、化合物(iii)を、GalNAc(例えば、(3aR,5R,6R,7R,7aR)-5-(アセトキシメチル)-2-メチル-3a,6,7,7a-テトラヒドロ-5H-ピラノ[3,2-d]オキサゾール-6,7-ジイルジアセテート)由来のグリコシル化前駆体で、ルイス酸またはブレンステッド酸(例えば、10-(R)-カンファースルホン酸)の存在下で処置することによって調製することができる。
tBuエステル基の脱保護は、トリフルオロ酢酸(TFA)またはギ酸で処置することによって、GalNAc部分に影響を与えることなく行うことができる。したがって、化合物(vi)を酸(TFAまたはギ酸)で処置すると、化合物(v)を得ることができる。
化合物(v)とアミノアルコール(リンカーB)との間のアミドカップリング反応によって化合物(vi)を生成することができる。
最後に、ホスホラミド化合物(vii)は、化合物(vi)を、2-シアノエチルN,N-ジイソプロピルクロロホスホラミダイトおよび触媒量の1H-テトラゾールで処置することによって合成してもよい。化合物(vii)を使用して、標準的な固相オリゴヌクレオチド合成条件下でGalNAcリガンドクラスターコンジュゲートオリゴヌクレオチドを合成してもよい。
Figure 2022527569000024
スキーム2-標的化リガンドクラスターの実施形態の合成および特性評価
一般式1を含む化合物を調製するための方法の実施形態は以下の合成において図示され、「スキーム2」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。以下の方法を使用して一般式1を含む標的化リガンドクラスター化合物を調製した。
Figure 2022527569000025
合成スキーム3-標的化リガンドクラスターの実施形態の合成および特性評価
一般式1を含む化合物を調製するための方法の実施形態は以下の合成において図示され、「スキーム3」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。以下の方法を使用して一般式1を含む標的化リガンドクラスター化合物を調製した。
Figure 2022527569000026
合成スキーム4-標的化リガンドクラスターの実施形態の合成および特性評価
以下の合成スキームを使用して、一般式1を含む化合物「A」の化合物の実施形態を調製した。合成スキーム4は「スキーム4」として同定される。出発材料および中間体は、市販の供給源から購入しても、既知の手順から作製してもよいか、または他に示される。反応スキームのステップを行う順序は変更してもよい。以下の方法を使用して一般式1を含む標的化リガンドクラスター化合物を調製した。
Figure 2022527569000027
化合物2の調製
Figure 2022527569000028
DCE(250mL)中の化合物1(25.0g、64.2mmol)の溶液に、TMSOTf(17.1g、77.1mmol、13.9mL)をN雰囲気下0℃で滴加した。混合物を20℃で40時間撹拌した。TLCによって、化合物1はほぼ残っておらず、1つの新規のスポットが形成されたことが示された(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.51)。反応物を、NaHCO(1000mL)を添加することによってクエンチし、DCM(1000mL*3)で抽出した。有機相を無水NaSOで乾燥し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン/メタノール=100/1から60/1)で精製して、化合物2を得た。この反応をさらに3回繰り返し、これらの4回のランからの最終生成物を合わせて、合計45.0グラムの化合物2(137mmol、収率53.2%)を淡黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ ppm 5.97 (d, J=7.03 Hz, 1 H), 5.43 (t, J=3.01 Hz, 1 H), 4.89 (dd, J=7.40, 3.39 Hz, 1 H), 4.18 - 4.24 (m, 1 H), 4.14 - 4.18 (m, 1 H), 4.05 - 4.11 (m, 1 H), 3.97 (td, J=7.15, 1.25 Hz, 1 H), 2.08 - 2.11 (m, 3 H), 2.04 (s, 6 H), 2.03 (d, J=1.25 Hz, 3 H).
化合物4の調製
Figure 2022527569000029
THF(200mL)中の、化合物3(20.0g、118mmol、47.6mL)、2-メチルプロパン-2-オール(17.4g、235mmol、22.5mL)の溶液に、DIC(22.3g、176mmol、27.3mL)を添加し、0℃で1時間撹拌した。次いでDMAP(1.44g、11.8mmol)を混合物に添加し、さらに20℃で17時間撹拌した。TLC(酢酸エチル:石油エーテル=1:1、R=0.25)によって、大部分の化合物3は消費され、極性が低い1つの主要な新規のスポットが検出されたことが示された。反応混合物を、HCl(1N、100mL)を添加することによって中和し、次いでEA(500mL*3)で抽出した。合わせた有機層を無水NaSOで乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);330g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出液は0~100%酢酸エチル/石油エーテル勾配@100mL/分)で精製して、化合物4(9.00g、39.8mmol、収率33.8%)を淡黄色液状物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 9.18 (br s, 2 H), 8.83 (br s, 1 H), 6.88 (s, 2 H), 1.49 (s, 9 H).
化合物5の調製
Figure 2022527569000030
DMSO(60.0mL)中の化合物4(2.00g、8.84mmol)の溶液に、KCO(4.89g、35.4mmol)、およびKI(440mg、2.65mmol)を添加した。反応混合物を70℃に加熱した。次いで2-(2-(2-ブロモエトキシ)エトキシ)エタン-1-オール(7.53g、35.4mmol)を混合物に添加し、混合物をN雰囲気下、70℃で4時間撹拌した。LC-MSによって、所望のm/z(計算値MW:622.70、実測値m/z:567.2[(M-t-Bu)+H]、640.3[(M+HO)+H])を有する1つの主要ピークが検出されたことが示された。反応混合物を分取HPLC(中性条件)で精製して、化合物5(3.50g、5.62mmol、収率63.6%)を茶色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 7.17 (s, 2 H), 4.58 (t, J=5.44 Hz, 3 H), 4.08 - 4.16 (m, 6 H), 3.73 - 3.78 (m, 4 H), 3.65 - 3.69 (m, 2 H), 3.58 - 3.63 (m, 4 H), 3.52 - 3.57 (m, 6 H), 3.45 - 3.51 (m, 8 H), 3.39 - 3.43 (m, 6 H), 1.53 (s, 9 H).
化合物6の調製
Figure 2022527569000031
無水DCE(150mL)中の化合物2(9.52g、28.9mmol)の溶液を、4Åモレキュラーシーブとともに20℃で5分間撹拌した。次いで化合物5(4.50g、7.23mmol)を添加し、撹拌を30分間継続した。[(1R,4S)-7,7-ジメチル-2-オキソ-ノルボルナン-1-イル]メタンスルホン酸(6.04g、26.02mmol、3.6eq)をN雰囲気下、10分にわたって滴加した。混合物を50℃で2時間撹拌した。LC-MSによって、化合物5は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1610.61、実測値m/z:805.9[M/2+H]、1611.5[M+H])が検出されたことが示された。反応混合物を珪藻土に通して濾過した。濾液を、NaHCO(300mL)を添加することによってクエンチし、DCM(300mL*3)で抽出した。有機相を無水NaSOで乾燥し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(ISCO(登録商標);330g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶出液は0~10%メタノール/ジクロロメタン@100mL/分)で精製して、化合物6(10.3g、6.40mmol、収率88.5%)を淡黄色固形物として得た。
化合物7の調製
Figure 2022527569000032
DCM(17.5mL)中の化合物6(3.43g、2.13mmol)の溶液にTFA(27.0g、236mmol、17.5mL)を添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物6は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1554.50、実測値m/z:778.4[M/2+H])が検出されたことが示された。反応混合物を減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物7(4.80g、3.09mmol、収率48.3%)を白色固形物として得た。
化合物8Aの調製
Figure 2022527569000033
THF(5.00mL)中の化合物7(500mg、322μmol)の溶液に、EtN(65.1mg、643μmol、89.5μL)を添加した。次いでTBTU(103mg、322μmol)および4-アミノシクロヘキサノール(37.1mg、322μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1651.66、実測値m/z:826.5[M/2+H]、1652.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8A(420mg、254μmol、収率79.1%)を白色固形物として得た。
リガンドAの調製
Figure 2022527569000034
反応準備:化合物8Aを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.00mL)中の化合物8A(420mg、254μmol)の溶液に、化合物9(153mg、509μmol、162μL)および2H-テトラゾール(0.45M、622μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.53)によって、化合物8Aは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れた。得られた混合物をDCM(15mL*3)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加した。得られた混合物を撹拌し、濾過した。固形物をMTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドA(210mg、113μmol、収率44.6%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.15 (br d, J=7.78 Hz, 1 H), 7.79 (d, J=9.29 Hz, 3 H), 7.17 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.26 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.17, 3.39 Hz, 3 H), 4.55 (d, J=8.53 Hz, 3 H), 4.14 (br t, J=4.52 Hz, 4 H), 3.98 - 4.08 (m, 12 H), 3.83 - 3.92 (m, 4 H), 3.64 - 3.82 (m, 13 H), 3.45 - 3.63 (m, 24 H), 2.77 (t, J=5.77 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (d, J=1.25 Hz, 9 H), 1.54 - 1.74 (m, 6 H), 1.16 (d, J=6.78 Hz, 11 H). 31P NMR: δ ppm 145.70.
化合物8Bの調製
Figure 2022527569000035
THF(5.00mL)中の化合物7(500mg、322μmol)の溶液に、EtN(65.1mg、643μmol、89.5μL)を添加した。次いでTBTU(103mg、322μmol)および4-アミノシクロヘキサノール(37.1mg、322μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1651.55、実測値m/z:826.5[M/2+H]、1652.6[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8B(395mg、239μmol、収率74.4%)を白色固形物として得た。
リガンドBの調製
Figure 2022527569000036
反応準備:化合物8Bを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(3.00mL)中の化合物8B(288mg、174μmol)の溶液に化合物9(105mg、349μmol、111μL)を添加し、2H-テトラゾール(0.45M、426μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.51)によって、化合物8Bは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドB(235mg、127μmol、収率72.8%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.06 (br d, J=7.53 Hz, 1 H), 7.80 (br d, J=9.29 Hz, 3 H), 7.14 (s, 2 H), 5.21 (d, J=2.76 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.17, 2.89 Hz, 3 H), 4.55 (d, J=8.53 Hz, 3 H), 4.14 (br s, 4 H), 3.98 - 4.08 (m, 11 H), 3.83 - 3.93 (m, 3 H), 3.73 - 3.82 (m, 9 H), 3.64 - 3.72 (m, 4 H), 3.46 - 3.63 (m, 24 H), 2.76 (t, J=5.90 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (s, 9 H), 1.41 (br s, 4 H), 1.14 (br d, J=6.53 Hz, 12 H). 31P NMR: δ ppm 144.77.
化合物8Cの調製
Figure 2022527569000037
THF(5.00mL)中の化合物7(500mg、322μmol)の溶液にEtN(65.1mg、643μmol、89.5μL)を添加した。次いでTBTU(103mg、322μmol)およびピペリジン-4-オール(32.5mg、322μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1637.63、実測値m/z:819.5[M/2+H]、1637.6[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8C(390mg、238μmol、収率74.0%)を白色固形物として得た。
リガンドCの調製
Figure 2022527569000038
反応準備:化合物8Cを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.00mL)中の化合物8C(390mg、238μmol)の溶液に化合物9(144mg、476μmol、151μL)を添加し、2H-テトラゾール(0.45M、582μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.51)によって、化合物8Cは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドC(270mg、147μmol、収率61.7%)を白色固形物として得た。1H NMR: (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 7.79 (br d, J=9.03 Hz, 3 H), 6.66 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.26 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.17, 3.39 Hz, 3 H), 4.53 - 4.58 (m, 3 H), 4.10 (br d, J=4.77 Hz, 5 H), 3.97 - 4.07 (m, 12 H), 3.82 - 3.93 (m, 4 H), 3.71 - 3.80 (m, 9 H), 3.65 - 3.70 (m, 3 H), 3.54 - 3.62 (m, 12 H), 3.52 (dt, J=5.27, 2.89 Hz, 12 H), 2.76 (t, J=5.77 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.75 - 1.79 (m, 9 H), 1.57 (br s, 2 H), 1.09 - 1.17 (m, 14 H). 31P NMR: δ ppm 145.39.
化合物8Dの調製
Figure 2022527569000039
THF(5.00mL)中の化合物7(500mg、322μmol)の溶液にEtN(65.1mg、643μmol、89.5μL)を添加し、次いでTBTU(103mg、322μmol)および6-アミノヘキサン-1-オール(37.7mg、322μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1653.67、実測値m/z:827.4[M/2+H]、1654.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8D(420mg、254μmol、収率79.0%)を白色固形物として得た。
リガンドDの調製
Figure 2022527569000040
反応準備:化合物8Dを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.00mL)中の化合物8D(420mg、254μmol)の溶液に、化合物9(153mg、508μmol、161μL)を添加し、2H-テトラゾール(0.45M、621μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.51)によって、化合物8Dは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドD(270mg、146μmol、収率57.3%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.34 (br s, 1 H), 7.80 (d, J=9.29 Hz, 3 H), 7.16 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.51 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.17, 3.39 Hz, 3 H), 4.55 (d, J=8.53 Hz, 3 H), 4.13 (br d, J=5.02 Hz, 4 H), 4.00 - 4.07 (m, 11 H), 3.83 - 3.93 (m, 4 H), 3.74 - 3.82 (m, 8 H), 3.66 (br t, J=4.52 Hz, 3 H), 3.58 - 3.63 (m, 1 H), 3.59 (br d, J=4.77 Hz, 7 H), 3.46 - 3.57 (m, 18 H), 2.75 (t, J=5.90 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.87 - 1.90 (m, 1 H), 1.76 (s, 9 H), 1.46 - 1.59 (m, 4 H), 1.34 (br s, 4 H), 1.09 - 1.16 (m, 12 H). 31P NMR: δ ppm 146.28.
化合物8Eの調製
Figure 2022527569000041
THF(5.00mL)中の化合物7(500mg、322μmol)の溶液にEtN(65.1mg、643μmol、89.5μL)を添加した。次いでTBTU(103mg、322μmol)および2-(2-アミノエトキシ)エタノール(33.8mg、322μmol、32.2μL)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1641.62、実測値m/z:821.4[M/2+H]、1641.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8E(414mg、252.19μmol、収率78.41%)を白色固形物として得た。
リガンドEの調製
Figure 2022527569000042
反応準備:化合物8Eを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.00mL)中の化合物8E(414mg、252μmo)の溶液に化合物9(152mg、504μmol、160μL)を添加し、2H-テトラゾール(0.45M、616μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.52)によって、化合物8Eは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、20℃未満で濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドE(213mg、116μmol、収率45.9%)を白色固形物として得た。1H NMR: (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.45 (br t, J=5.50 Hz, 1 H), 7.80 (d, J=9.13 Hz, 3 H), 7.18 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.13 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.26, 3.25 Hz, 3 H), 4.55 (d, J=8.50 Hz, 3 H), 4.10 - 4.18 (m, 4 H), 3.96 - 4.09 (m, 11 H), 3.83 - 3.93 (m, 3 H), 3.64 - 3.82 (m, 13 H), 3.46 - 3.62 (m, 28 H), 2.73 (t, J=5.69 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (s, 9 H), 1.11 (t, J=6.00 Hz, 12 H). 31P NMR: δ ppm 147.28.
化合物8Fの調製
Figure 2022527569000043
THF(7.00mL)中の化合物7(700mg、450μmol)の溶液にEtN(91.1mg、901μmol、125μL)を添加した。次いでTBTU(145mg、450μmol)および2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エタノール(67.2mg、450μmol)を混合物に添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1685.67、実測値m/z:843.5[M/2+H]、1685.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(50mL)中に溶解し、HCl(1N、2*25mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*30mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8F(640mg、380μmol、収率84.3%)を白色固形物として得た。
リガンドFの調製
Figure 2022527569000044
反応準備:化合物8Fを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(6.00mL)中の化合物8F(540mg、320μmol)の溶液に化合物9(193mg、641μmol、203μL)を添加し、次いで2H-テトラゾール(0.45M、783μL)を反応混合物に滴加した。混合物をN雰囲気下、10~15 0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.53)によって、化合物8Fは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドF(412mg、218μmol、収率68.2%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.46 (br t, J=5.44 Hz, 1 H), 7.80 (d, J=9.26 Hz, 3 H), 7.18 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.38 Hz, 3 H), 4.97 (dd, J=11.26, 3.38 Hz, 3 H), 4.55 (d, J=8.50 Hz, 3 H), 4.13 (br t, J=4.38 Hz, 4 H), 3.98 - 4.07 (m, 11 H), 3.83 - 3.92 (m, 3 H), 3.73 - 3.82 (m, 8 H), 3.71 (td, J=4.19, 2.38 Hz, 2 H), 3.64 - 3.69 (m, 3 H), 3.46 - 3.62 (m, 33 H), 2.75 (t, J=5.94 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (s, 9 H), 1.19 (br d, J=6.38 Hz, 2 H), 1.12 (dd, J=6.69, 4.19 Hz, 10 H). 31P NMR: δ ppm 147.35.
化合物5’の調製
Figure 2022527569000045
DMSO(40.0mL)中の化合物4(2.00g、8.84mmol)の溶液にKCO(4.89g、35.4mmol)およびKI(440mg、2.65mmol)を添加し、温度が70℃に加温されるまで撹拌した。次いで2-(2-ブロモエトキシ)エタノール(5.98g、35.4mmol)を混合物に添加した。混合物を70℃で4時間撹拌した。LC-MSによって、化合物4は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:490.54、実測値m/z:491.2[M+H])が検出されたことが示された。反応混合物を分取HPLC(中性条件)で精製して、化合物5’(3.40g、6.93mmol、収率78.4%)を淡茶色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d): δ ppm 7.29 (s, 2 H), 3.86 - 3.91 (m, 4 H), 3.80 - 3.85 (m, 2 H), 3.71 - 3.78 (m, 6 H), 3.63 - 3.69 (m, 6 H), 1.67 (s, 9 H).
化合物6’の調製
Figure 2022527569000046
無水DCE(120mL)中の化合物2(12.1g、36.7mmol)を4Åモレキュラーシーブとともに20℃で5分間撹拌した。化合物5’(3.00g、6.12mmol)を添加し、撹拌を30分間継続した。次いで[(1R,4S)-7,7-ジメチル-2-オキソ-ノルボルナン-1-イル]メタンスルホン酸(5.11g、22.0mmol)をN雰囲気下、10分にわたって滴加した。混合物を50℃で2時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン/メタノール=10:1、R=0.36[ブロモクレゾールグリーン])によって、化合物5’は消費され、わずかに残っており、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。TLCによれば、反応物は清浄であった。残渣をNaHCO(300mL)およびDCM(300mL*3)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaCl溶液で洗浄し、乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣をカラムクロマトグラフィー(SiO、ジクロロメタン:(ジクロロメタン/メタノール=10:1)=0:100)で精製して、化合物6’(8.80g、5.95mmol、収率97.3%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d): δ ppm 7.26 (s, 2 H), 7.24 - 7.26 (m, 1 H), 6.82 (d, J=9.54 Hz, 1 H), 6.69 (d, J=8.78 Hz, 2 H), 5.33 - 5.37 (m, 3 H), 5.22 (dd, J=11.04, 3.26 Hz, 2 H), 5.12 (dd, J=11.29, 3.26 Hz, 1 H), 4.83 (d, J=8.53 Hz, 1 H), 4.77 (d, J=8.53 Hz, 2 H), 4.07 - 4.26 (m, 15 H), 3.92 - 4.03 (m, 6 H), 3.78 - 3.91 (m, 7 H), 3.67 - 3.77 (m, 8 H), 2.14 - 2.18 (m, 9 H), 2.03 - 2.06 (m, 9 H), 1.96 - 2.00 (m, 9 H), 1.87 - 1.95 (m, 9 H), 1.59 (s, 9 H).
化合物7’の調製
Figure 2022527569000047
DCM(43.0mL)中の化合物6’(8.60g、5.82mmol)の溶液にTFA(66.2g、581mmol、43.0mL)を0℃下で添加した。混合物を20 0~20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物6’は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1422.34、実測値m/z:711.8[M/2+H]、1422.4[M+H])が検出されたことが示された。反応混合物を減圧下で濃縮して、残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物7’(4.60g、3.23mmol、収率55.6%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 7.78 - 7.86 (m, 2 H), 7.78 - 7.86 (m, 1 H), 7.22 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.26 Hz, 3 H), 4.94 - 5.01 (m, 3 H), 4.53 - 4.59 (m, 3 H), 4.07 - 4.16 (m, 6 H), 4.02 (s, 9 H), 3.84 - 3.93 (m, 4 H), 3.72 - 3.83 (m, 7 H), 3.65 - 3.69 (m, 2 H), 3.56 - 3.65 (m, 10 H), 2.10 (s, 9 H), 1.96 - 2.02 (m, 1 H), 1.99 (s, 8 H), 1.86 - 1.91 (m, 9 H), 1.76 (s, 9 H).
化合物8Gの調製
Figure 2022527569000048
THF(5.00mL)中の化合物7’(500mg、352μmol)の溶液にEtN(71.1mg、703μmol、97.9μL)を添加した。次いでTBTU(113mg、352μmol)および4-アミノシクロヘキサノール(40.5mg、352μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7’は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1519.50、実測値m/z:760.4[M/2+H]、1519.4[M+H]+)が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8G(430mg、283μmol、収率80.5%)を白色固形物として得た。
リガンドGの調製
Figure 2022527569000049
反応準備:化合物8Gを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.00mL)中の化合物8G(430mg、283μmol)の溶液に、化合物9(171mg、566μmol、180μL)および2H-テトラゾール(0.45M、692μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.52)によって、化合物8Gは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドG(370mg、215μmol、収率76.0%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.13 - 8.19 (m, 1 H), 8.16 (br d, J=7.53 Hz, 1 H), 7.78 - 7.86 (m, 3 H), 7.18 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.51 Hz, 3 H), 4.98 (dd, J=11.29, 3.26 Hz, 3 H), 4.53 - 4.60 (m, 3 H), 4.13 (br t, J=4.39 Hz, 4 H), 3.99 - 4.07 (m, 12 H), 3.86 - 3.94 (m, 3 H), 3.71 - 3.86 (m, 10 H), 3.53 - 3.69 (m, 14 H), 2.77 (t, J=5.90 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.77 (s, 9 H), 1.54 - 1.73 (m, 6 H), 1.16 (d, J=6.78 Hz, 12 H), 1.10 (s, 2 H). 31P NMR: δ ppm 145.74.
化合物8Hの調製
Figure 2022527569000050
THF(5.00mL)中の化合物7’(500mg、352μmol)の溶液にEtN(71.1mg、703μmol、97.9μL)を添加した。次いでTBTU(113mg、352μmol)および2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エタノール(52.4mg、352μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7’は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1553.52、実測値m/z:777.3[M/2+H]、1554.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8H(458mg、295μmol、収率83.9%)を白色固形物として得た。
リガンドHの調製
Figure 2022527569000051
反応準備:化合物8Hを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(4.70mL)中の化合物8H(458mg、295μmol)の溶液に化合物9(178mg、590μmol、187μL)および2H-テトラゾール(0.45M、721μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.52)によって、化合物8Hは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドH(250mg、143μmol、収率48.4%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.36 (br s, 1 H), 7.77 - 7.88 (m, 3 H), 7.17 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.26 Hz, 3 H), 4.93 - 5.02 (m, 3 H), 4.52 - 4.62 (m, 3 H), 4.12 (br t, J=4.52 Hz, 4 H), 4.03 (s, 12 H), 3.86 - 3.94 (m, 3 H), 3.78 - 3.85 (m, 3 H), 3.70 - 3.77 (m, 5 H), 3.52 - 3.69 (m, 16 H), 3.22 (br d, J=6.78 Hz, 2 H), 2.75 (t, J=5.90 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (s, 9 H), 1.47 - 1.58 (m, 4 H), 1.33 (br s, 4 H), 1.06 - 1.19 (m, 12 H). 31P NMR: δ ppm 147.36.
化合物8Iの調製
Figure 2022527569000052
THF(5.00mL)中の化合物7’(500mg、352μmol)の溶液にEtN(71.1mg、703μmol、97.9μL)を添加した。次いでTBTU(113mg、352μmol)および6-アミノヘキサン-1-オール(41.2mg、352μmol)を混合物に添加した。混合物をN雰囲気下、20℃で1時間撹拌した。LC-MSによって、化合物7’は完全に消費され、所望のm/zを有する1つの主要ピーク(計算値MW:1521.52、実測値m/z:761.3[M/2+H]、1522.5[M+H])が検出されたことが示された。混合物をDCM(100mL)中に溶解し、HCl(1N、2*50mL)で洗浄し、有機相をNaHCO(2*50mL)の飽和溶液、水(3*50mL)で洗浄し、次いで減圧下で濃縮して残渣を得た。残渣を分取HPLC(A:HO中の0.075%TFA、B:ACN)で精製して、化合物8I(473mg、311μmol、収率88.4%)を白色固形物として得た。
リガンドIの調製
Figure 2022527569000053
反応準備:化合物8Iを無水MeCN(共沸蒸留)で5回乾燥させた。MeCNおよびDCMを、球状の4Åモレキュラーシーブで一晩乾燥させた。
0℃のDCM(5.00mL)中の化合物8I(473mg、311μmol)の溶液に化合物9(187mg、622μmol、197μL)および2H-テトラゾール(0.45M、691μL)をN雰囲気下で滴下した。次いで混合物を0~15℃で1時間撹拌した。TLC(ジクロロメタン:メチルアルコール=10:1、R=0.53)によって、化合物8Iは完全に消費され、1つの新規のスポットが形成されたことが示された。混合物を-20~-10℃に冷却し、次いで飽和NaHCO(8mL)に0~5℃でゆっくりと注ぎ入れ、DCM(10mL*2)で洗浄し、分離後、水性層をDCM(15mL)で抽出し、次いで有機層をブライン(15mL)で洗浄し、NaSOで乾燥し、濾過し、温度を20℃未満に維持しながら濃縮した。残渣をDCM(2mL)中に溶解し、撹拌したMTBE 20mL(-10℃)に室温で滴加し、撹拌し、濾過し、MTBE(10mL*3)で洗浄し、高真空で乾燥させた。この精製手順をさらに2回繰り返して、リガンドI(350mg、203μmol、収率65.4%)を白色固形物として得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ ppm 8.36 (br s, 1 H), 7.77 - 7.88 (m, 3 H), 7.17 (s, 2 H), 5.21 (d, J=3.26 Hz, 3 H), 4.93 - 5.02 (m, 3 H), 4.52 - 4.62 (m, 3 H), 4.12 (br t, J=4.52 Hz, 4 H), 4.03 (s, 12 H), 3.86 - 3.94 (m, 3 H), 3.78 - 3.85 (m, 3 H), 3.70 - 3.77 (m, 5 H), 3.52 - 3.69 (m, 16 H), 3.22 (br d, J=6.78 Hz, 2 H), 2.75 (t, J=5.90 Hz, 2 H), 2.10 (s, 9 H), 1.99 (s, 9 H), 1.89 (s, 9 H), 1.76 (s, 9 H), 1.47 - 1.58 (m, 4 H), 1.33 (br s, 4 H), 1.06 - 1.19 (m, 12 H). 31P NMR: δ ppm 146.32.
GalNAcクラスターコンジュゲートFXII siRNAの合成
各リガンドA~Iに関して実験を行い、それぞれがFXII siRNAにコンジュゲートさせたGalNAcクラスターとしての役割を果たした。
方法
センスおよびアンチセンス鎖の合成および精製
全てのセンスおよびアンチセンス鎖を、ホスホラミダイト中間体を使用した標準的な固相オリゴヌクレオチド合成技術に基づいて合成した。AKTAオリゴパイロットプラス10シンセサイザー(GE Healthcare)を使用した。合成は、制御された多孔ガラス(Universal CPG、ロード:36.2μmol/g、1000Å)で作製された固体支持体で行った。全ての2’-修飾ホスホラミダイトは市販の供給源から購入した。特に、以下の2’-Fおよび2’-O-メチルホスホラミダイトを使用した:DMT-2’-F-Bz-dAホスホラミダイト、DMT-2’-F-dUホスホラミダイト、DMT-2’-F-ibu-dGホスホラミダイト、DMT-2’-F-Ac-dCホスホラミダイト、DMT-2’-OMe-Bz-Aホスホラミダイト、DMT-2’-OMe-Uホスホラミダイト、DMT-2’-OMe-ibu-Gホスホラミダイト、DMT-2’-OMe-Ac-Cホスホラミダイト。アミダイトを無水アセトニトリル(100mM)中に溶解し、モレキュラーシーブ(3Å)で乾燥させた。ETT(5-エチルチオ-1H-テトラゾール、アセトニトリル中600mM)を活性化剤として使用した。センスおよびアンチセンス鎖の合成を3μmol規模で行った。固相合成サイクルを表1に示す。
Figure 2022527569000054
GalNAcリガンドクラスターのFXII siRNAのセンス鎖へのカップリングは、不活性雰囲気下、グローブボックス中、手動で行った。無水アセトニトリル(3mL)中のCPG支持センス鎖(3μmol)をモレキュラーシーブ(3Å)で30分間乾燥させた。無水アセトニトリル(1mL、モレキュラーシーブ(3Å)で30分間乾燥させた)および活性化因子(ETT、0.5mL、アセトニトリル中0.6M、モレキュラーシーブ(3Å)によって30分間乾燥させた)中のリガンドクラスター(24μmol、8eq.)を添加した。反応混合物を室内温度で1.5時間振とうした。溶媒を、シリンジによってCPGから除去した。得られたCPG支持樹脂をPADS(ピリジン/アセトニトリル1/1、v/v中0.16M)を用いて20℃で処置した。反応混合物を20℃で20分間保持した。CPG支持体を濾過することによってアセトニトリル(5mL×4)で洗浄して、CPG支持体上に対応するセンス鎖を生成した。
CPG支持センスまたはアンチセンス鎖(3μmol)をアセトニトリル(5mL)中の20%(v/v)ジエチルアミンで、20℃で10分間処置した。樹脂を濾過によってアセトニトリル(5mL×3)で洗浄した。CPG支持体を、1:1の体積の40%メチルアミン水溶液および35%水酸化アンモニウム溶液(1.5mL)で、65℃で10分間処置した。混合物を濾過し、濾液を、遠心真空濃縮器を用いて40℃で濃縮した。粗製オリゴヌクレオチド生成物を白色固形物として得た。
粗製オリゴヌクレオチドを、Durashell C18(L)カラム10×100mm、粒子サイズ5μmを使用したHPLCで精製した。移動相AはMilli Q水中の220mM HFIPおよび8.8mM TEA、pH7.5であり、移動相Bはメタノールであった。勾配は移動相B 16分で5%から29%であり、流速は3.5mL/分であった。カラム温度は50℃を保持した。
センスおよびアンチセンス鎖のアニールおよびsiRNAの精製
センス鎖と、等モルのアンチセンスセンス鎖とを、ホスフェート緩衝食塩水(pH7.4)中で混合して二本鎖を形成した。アニール温度を20℃で設定した。オリゴヌクレオチドの濃度は3μmol/400μl 1×PBSであった。アニール溶液をHPLCでモニターした。
二本鎖を、Durashell C18(L)カラム10×100mm、粒子サイズ5μmを使用したIP-RP HPLCで精製した。移動相Aは、5%アセトニトリルを含むMilli Q水中の100mM HFIPおよび20mM HAであり、移動相Bはアセトニトリル中の20%Milli Q水であった。勾配は移動相B 18分で18%から35%であり、流量は4mL/分であった。カラム温度は17℃で設定した。所望の二本鎖を含むフラクションを収集し、凍結乾燥して、最終生成物を得た。
GalNAcコンジュゲートFXII siRNA
凝固因子XII(FXII)siRNAの配列およびヌクレオチド修飾は文献(Liuら、(2019)RNA 25、255-263)から採用した。センス鎖:L*aacucaAuAAAgugcuuug*a*a(配列番号2);アンチセンス鎖:u*U*caaAgCAcuuuAuUgaguu*u*c(配列番号4)(5’から3’までの大文字および小文字は、2-デオキシ-2-フルオロ(2’-F)、および2’-O-メチル(2’-OMe)リボ糖修飾をそれぞれ示し;(*)はホスホロチオエート連結(PS)を示す)。LはMito GalNAcリガンドクラスターを示す。GalNAcコンジュゲートFXII siRNAを合成するために使用されるMito GalNAcホスホラミダイトの代表的な構造を図1に示し、調製され、試験された代表的なGalNAcコンジュゲートFXII siRNAに関する情報を表2に示す。研究において使用されたsiRNA配列に関する情報を図2に提供する。
Figure 2022527569000055
マウスにおけるGalNAcコンジュゲートFXII siRNA試験
導入
凝固因子XII(FXII)をモデルとして使用して、siRNAの、細胞、組織、および対象への送達を評価した。本発明の標的化リガンド複合体の異なる実施形態をFXII siRNAにコンジュゲートさせ、in vivoで投与する実験を行った。siRNAの効果を、投与後周期的にモニターした。モニタリングの1つの手段は、FXII siRNAにコンジュゲートされた標的化リガンド複合体のうちの1つが投与されたマウスから採取した血清中のFXIIレベルを判定することであった。
方法
標的化リガンドクラスター/核酸複合体
Mito-AからMito-Iとして示される標的化リガンドクラスター/核酸複合体はそれぞれsiRNAにコンジュゲートされた異なる標的化リガンドクラスターを含む。標的化リガンドクラスター/核酸複合体はMito GalNAcコンジュゲートFXII siRNAと称した。本研究における標的化リガンドクラスターは:リガンドA、リガンドB、リガンドC、リガンドD、リガンドE、リガンドF、リガンドG、リガンドH、およびリガンドIであった(各構造に関しては図1を参照のこと)。実験で使用された各Mito GalNAcコンジュゲートFXII siRNAは、本明細書において実施例31に記載したFXII siRNAにコンジュゲートされたMito-A~Mito-Iのうちの1つを含んでおり、本明細書において:Mito-A、Mito-B、Mito-C、Mito-D、Mito-E、Mito-F、Mito-G、Mito-H、およびMito-Iと称する。複合体に関するさらなる情報は本明細書において他の箇所で提供される。
In vivo試験
実験を行って、in vivoでのFXII siRNAの効果を評価した。雄C57BL/6マウス(Jackson Labs)に、単回用量のPBS、またはPBS中に3mg/kgで製剤化されたMito GalNAcコンジュゲートFXII siRNAを皮下(S.C.)で投与した(1群当たりn=3)。Mito-A~Mito-Iを含む複合体を調製し、試験した。投与後、5、14、および30日目に、血漿試料を採取した。血漿中のFXIIレベルを、製造業者の取扱説明書に従って、Molecular Innovations製のELISAキットを使用して評価した。次いでMito GalNAcコンジュゲートFXII siRNA(Mito-A~Mito-I)で処置された群に関して計算された血漿FXII濃度を、PBS処置された群の平均に対して正規化した。複合体Mito-AからMito-Iにそれぞれに含まれるリガンドA~Iの構造は、図1において提供される。
Figure 2022527569000056
表3および図3はin vivo試験からのデータを提供する。結果は、投与後、5日目、14日目、および30日目において採取された血清におけるFXII残量のパーセントを示す。データは、Mito-AからMito-Iをそれぞれ投与した後に得られた。結果は、100%のままであったFXIIのPBSレベルと比較して、Mito-A~Mito-Iの全てに関して血漿におけるFXIIに有意な減少を示した。研究の結果は、標的化リガンドクラスターが、機能siRNAの効果的なin vivoでの送達をもたらしたことを実証した。
等価物
本発明のいくつかの実施形態を本明細書において記載し、示してきたが、当業者であれば、機能を実行しおよび/または本明細書において記載される結果および/または利点のうちの1つまたは複数を得るための様々な他の手段および/または構造を容易に想定することになり、それぞれのそのような変形および/または改変は本発明の範囲内であるとみなされる。より一般的には、当業者であれば、本明細書において記載される全てのパラメーター、寸法、材料、および配置は例示的であることを意味し、実際のパラメーター、寸法、材料、および/または配置は、本発明の教示が使用される特定の適用に依存するであろうことを容易に理解するであろう。当業者であれば、本明細書において記載される本発明の具体的な実施形態に対する多くの等価物を認識するか、または所定の実験のみを使用して確認することができるであろう。したがって、前述の実施形態はほんの一例として提示されており、添付の特許請求の範囲およびその等価物の範囲内であることは理解されるべきであり;本発明は、特に記載され、請求される以外の他のもので行ってもよい。本発明は、本明細書において記載される個々の特徴、系、物品、材料、および/または方法をそれぞれ対象とする。さらに、2つまたはそれを超えるそのような特徴、系、物品、材料、および/または方法の任意の組合せは、そのような特徴、系、論文、材料、および/または方法が相互に矛盾しない場合、本発明の範囲内に含まれる。
全ての定義は、本明細書において定義され、使用される場合、辞書の定義、参照により組み込まれる文書内の定義、および/または定義された用語の通常の意味を制御するように理解されるべきである。
不定冠詞「a」および「an」は、明細書および特許請求の範囲において本明細書で使用される場合、相反することが明らかに示されない限り、「少なくとも1つ」を意味すると理解されるべきである。
「および/または」という句は、明細書および特許請求の範囲において本明細書で使用される場合、そのように連結された要素の「いずれかまたは両方」を意味し、すなわち、要素は一部の場合には結合的に存在し、他の場合では分離的に存在することが理解されるべきである。「および/または」という節によって具体的に同定された要素以外の他の要素は、相反することが明らかに示されない限り、具体的に同定されたこれらの要素に関連するかどうかにかかわらず、必要に応じて存在していてもよい。
本出願において挙げられるまたは参照される全ての参考文献、特許および特許出願ならびに刊行物は、その内容が参照により本明細書に組み込まれるものとする。

Claims (78)

  1. 式2の標的化リガンドクラスターを含む化合物
    Figure 2022527569000057
    であって、式中、
    リンカーAは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、
    リンカーBは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し、
    は、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキル、イソプロピル基を含み、またはRは窒素原子を介してRと連結して環を形成し、
    は、C1~C6アルキル、C3~C6シクロアルキル、イソプロピル基を含み、またはRは窒素原子を介してRと連結して環を形成し、
    は、亜リン酸およびリン酸保護基、または2-シアノエチル基を含む、化合物。
  2. 独立して選択されるリンカーAが、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む、請求項1に記載の化合物。
  3. 独立して選択されるリンカーAが、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む、請求項1に記載の化合物。
  4. 独立して選択されるリンカーBが、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む、請求項1に記載の化合物。
  5. 独立して選択されるリンカーBが、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む、請求項1に記載の化合物。
  6. リン酸保護基が、メチル、アリル、2-シアノエチル、4-シアノ-2-ブテニル、2-シアノ-1,1-ジメチルエチル、2-(トリメチルシリル)エチル、2-(S-アセチルチオ)エチル、2-(S-ピバロイルチオ)エチル、2-(4-ニトロフェニル)エチル、2,2,2-トリクロロエチル、2,2,2-トリクロロ-1,1-ジメチルエチル、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロピル、フルオレニル-9-メチル、2-クロロフェニル、4-クロロフェニル、および2,4-ジクロロフェニルのうちの少なくとも1つを含む、請求項1に記載の化合物。
  7. 独立して選択されるリンカーAが、
    Figure 2022527569000058
    の1つまたは複数を含み、
    mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり;nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である、請求項1に記載の化合物。
  8. 独立して選択されるリンカーBが、
    Figure 2022527569000059
    の1つまたは複数を含み、
    nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、
    が、H、メチル(Me)、エチル(Et)、シクロプロピルを含み、またはRが、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成し、
    が、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRが、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成する、請求項1に記載の化合物。
  9. 独立して選択されるリンカーBが、
    Figure 2022527569000060
    の1つまたは複数を含み、
    mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり;nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である、請求項1に記載の化合物。
  10. 標的化リガンドクラスターが、リガンドA~Iのうちの1つを含む、請求項1に記載の化合物。
  11. 標的化リガンドクラスターが、リガンドJ~WWのうちの1つを含む、請求項1に記載の化合物。
  12. 標的化リガンドクラスターが没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つが、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む、請求項1に記載の化合物。
  13. 標的化リガンドクラスターが、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドをさらに含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する、請求項1に記載の化合物。
  14. 標的化リガンドクラスター/核酸複合体が、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iである、請求項13に記載の化合物。
  15. 請求項1から14のいずれか一項に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  16. 式3の構造を含む化合物
    Figure 2022527569000061
    であって、式中、
    Xは、酸素(O)および硫黄(S)のうちの少なくとも1つであり、
    Yは、O、S、およびNHのうちの少なくとも1つであり、
    リンカーAは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーAの一方の末端はGalNAc標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、
    リンカーBは独立して選択され、少なくとも1つのスペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドのリン原子に結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合する、化合物。
  17. オリゴヌクレオチドが、低分子干渉RNA(siRNA)、一本鎖siRNA、マイクロRNA(miRNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、メッセンジャーRNA(mRNA)、リボザイム、プラスミド、免疫刺激核酸、アンタゴミル、およびアプタマーのうちの少なくとも1つを含む、請求項16に記載の化合物。
  18. 独立して選択されるリンカーAが、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む、請求項16に記載の化合物。
  19. 独立して選択されるリンカーAが、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む、請求項16に記載の化合物。
  20. 独立して選択されるリンカーBが、PEG、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基のうちの少なくとも1つを含む、請求項16に記載の化合物。
  21. 独立して選択されるリンカーBが、1つまたは複数のヘテロ原子、脂肪族複素環、ヘテロアリール、アミノ酸、ヌクレオチド、および糖類を含む、請求項16に記載の化合物。
  22. 独立して選択されるリンカーAが、
    Figure 2022527569000062
    の1つまたは複数を含み、
    mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり;nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である、請求項16に記載の化合物。
  23. 独立して選択されるリンカーBが、下記:
    Figure 2022527569000063
    の1つまたは複数を含み、
    nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり、
    が、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRが、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成し、
    が、H、Me、Et、シクロプロピルを含み、またはRが、炭素原子を介してRと連結して3~6員環を形成する、請求項16に記載の化合物。
  24. 独立して選択されるリンカーBが、
    Figure 2022527569000064
    の1つまたは複数を含み、
    mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数であり;nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12の整数である、請求項16に記載の化合物。
  25. 標的化リガンドクラスターが、リガンドA~Iのうちの1つを含む、請求項16に記載の化合物。
  26. 標的化リガンドクラスターが、リガンドJ~WWのうちの1つを含む、請求項16に記載の化合物。
  27. 標的化リガンドクラスターが没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つが、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む、請求項16に記載の化合物。
  28. 化合物が、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iである、請求項16に記載の化合物。
  29. 請求項16から28のいずれか一項に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  30. 式1の標的化リガンドクラスターを含む化合物
    Figure 2022527569000065
    であって、式中、
    TLは、N-アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、およびN-イソ-ブタノイルガラクトサミンが含まれるが、これらに限定されない1つまたは複数の標的化リガンドであり、
    1つまたは複数のTLは、同じ標的化リガンドクラスターの1つまたは複数の他のTLと異なっていてもよく、
    リンカーAは独立して選択され、1つまたは複数の二官能性スペーサーを含み、リンカーAの一方の末端は標的化リガンドに結合し、他方の末端はエーテル結合を介して没食子酸のフェノール性ヒドロキシ基に結合し、
    リンカーBは独立して選択され、二官能性スペーサーを含み、リンカーBの一方の末端はホスホラミダイトまたはオリゴヌクレオチドに結合し、他方の末端はアミド結合を介して没食子酸のカルボン酸に結合し、
    Wは、H、保護基、ホスホラミダイト、またはオリゴヌクレオチドである、化合物。
  31. 標的化リガンドクラスターが、リガンドA~Iのうちの1つを含む、請求項30に記載の化合物。
  32. 標的化リガンドクラスターが、リガンドJ~WWのうちの1つを含む、請求項30に記載の化合物。
  33. 標的化リガンドクラスターが没食子酸を含み、独立して選択されるリンカーAの少なくとも1つが、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む、請求項30に記載の化合物。
  34. 標的化リガンドクラスターが、標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドをさらに含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する、請求項30に記載の化合物。
  35. 標的化リガンドクラスター/核酸複合体が、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む、請求項34に記載の化合物。
  36. 請求項30から35のいずれか一項に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  37. 没食子酸に由来する構造モチーフと、
    没食子酸の各ヒドロキシル基のリンカーと、
    没食子酸のアミド基のリンカーと
    を含み、リンカーの少なくとも1つが、没食子酸のヒドロキシル基の酸素に直接結合しているポリエチレングリコール(PEG)を含む、標的化リガンドクラスター。
  38. 標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドをさらに含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する、請求項37に記載の標的化リガンドクラスター。
  39. 標的化リガンドクラスターが、リガンドA~Iのうちの1つとして記載される化合物を含む、請求項37に記載の標的化リガンドクラスター。
  40. 標的化リガンドクラスターが、リガンドJ~WWのうちの1つとして記載される化合物を含む、請求項37に記載の標的化リガンドクラスター。
  41. 没食子酸のフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している1つまたは複数の独立して選択される第1のリンカーと、
    第1のリンカーのそれぞれに結合している1つまたは複数の独立して選択される標的化リガンドと、
    没食子酸のカルボン酸に結合している第2のリンカーと、
    第2のリンカーに結合している保護基およびホスホラミダイトのうちの少なくとも1つと
    を含む標的化リガンドクラスター。
  42. 第1のリンカーが、エーテル結合を介してフェノール性ヒドロキシル基に結合している、請求項40に記載の標的化リガンドクラスター。
  43. 1つまたは複数の標的化リガンドが、N-アセチルガラクトサミン、ガラクトース、ガラクトサミン、N-ホルミル-ガラクトサミン、N-プロピオニルガラクトサミン、N-n-ブタノイルガラクトサミン、およびN-イソ-ブタノイルガラクトサミンのうちの少なくとも1つを含む、請求項40または41に記載の標的化リガンドクラスター。
  44. 第2のリンカーが、アミド結合を介してカルボン酸に結合している、請求項40から42のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  45. 第1のリンカーが、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、アラルキニル基、1つまたは複数のヘテロ原子、1つまたは複数の脂肪族複素環、1つまたは複数のヘテロアリール、1つまたは複数のアミノ酸、1つまたは複数のヌクレオチド、および1つまたは複数の糖類のうちの少なくとも1つを含む、請求項40から43のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  46. 第2のリンカーが、ポリエチレングリコール(PEG)、アルキル基、シクロアルキル基、アルケニル基、シクロアルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、アラルキニル基、1つまたは複数のヘテロ原子、1つまたは複数の脂肪族複素環、1つまたは複数のヘテロアリール、1つまたは複数のアミノ酸、1つまたは複数のヌクレオチド、および1つまたは複数の糖類のうちの少なくとも1つを含む、請求項40から44のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  47. 3つの第1のリンカーが、没食子酸の異なるフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している、請求項40から45のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  48. リガンドA~Iのうちの1つを含む、請求項40から46のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  49. リガンドJ~WWのうちの1つを含む、請求項40から46のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  50. 標的化リガンドクラスターに結合したオリゴヌクレオチドをさらに含み、それによって標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する、請求項40から48のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター。
  51. 標的化リガンドクラスター/核酸複合体が、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む、請求項40に記載の標的化リガンドクラスター。
  52. 請求項40から50のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスターを含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  53. 標的化リガンドクラスターを調製する方法であって、
    没食子酸にエステル化反応を実施して、没食子酸のtert-ブチルエステルを含む第1の化合物を生成するステップと、
    SN2反応または光延反応を実施して、没食子酸エステルのフェノール性ヒドロキシ基にリンカーAを結合して、第2の化合物を生成するステップと、
    第2の化合物にグリコシル化反応を実施して、第3の化合物を生成するステップと、
    第3の化合物に脱保護反応を実施して、第4の化合物を生成するステップと、
    第4の化合物にアミドカップリング反応を実施して、第5の化合物を生成するステップと、
    第5の化合物にリン酸化反応を実施するステップと
    を含む方法。
  54. 核酸分子を標的化リガンドクラスターに結合し、それによってリガンドクラスター/核酸複合体を形成するステップをさらに含む、請求項52に記載の方法。
  55. 標的化リガンドクラスター/核酸複合体が、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む、請求項53に記載の方法。
  56. a)没食子酸のフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している1つまたは複数の独立して選択される第1のリンカーを含む標的化リガンドクラスターと、
    b)第1のリンカーのそれぞれに結合している1つまたは複数の独立して選択される標的化リガンドと、
    c)没食子酸のカルボン酸に結合している第2のリンカーと、
    d)第2のリンカーに結合している保護基およびホスホラミダイトのうちの少なくとも1つと
    を含み、標的化リガンドクラスターが核酸と結合して、標的化リガンドクラスター/核酸複合体を形成する、標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  57. 3つの第1のリンカーが、没食子酸の異なるフェノール性ヒドロキシル基にそれぞれ結合している、請求項55に記載の標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  58. 2つ以上の独立して選択される第1のリンカーがあり、1つまたは複数がそれぞれ他の第1のリンカーと同じである、請求項55または56に記載の標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  59. 2つ、または3つの第1のリンカーが、他の第1のリンカーと異なる、請求項55から57のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  60. 核酸が、RNA分子、必要に応じてsiRNA分子を含む、請求項57または58に記載の標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  61. MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物を含む、請求項55から59のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスター/核酸複合体。
  62. リガンドA~Iのいずれか1つとして記載される化合物。
  63. 1つまたは複数の請求項61に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  64. リガンドJ~WWのいずれか1つとして記載される化合物。
  65. 1つまたは複数の請求項63に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  66. siRNAにコンジュゲートしている請求項1から14および30から35のいずれか一項に記載の標的化リガンドクラスターを含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
  67. 標的化リガンドクラスターが、リガンドA~Iのうちの1つを含む、請求項65に記載の組成物。
  68. 標的化リガンドクラスターが、リガンドJ~WWのうちの1つを含む、請求項65に記載の組成物。
  69. siRNAにコンジュゲートしている標的化リガンドクラスターが、MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iのうちの1つを含む、請求項65に記載の組成物。
  70. 細胞において標的遺伝子の発現を低減する方法であって、
    標的遺伝子を発現することができる細胞を、標的遺伝子の発現を低減するsiRNAを含む請求項65から68のいずれか一項に記載の組成物と接触させるステップ
    を含む方法。
  71. 細胞が、肝臓細胞、心臓細胞、腎臓細胞、免疫系細胞、筋肉細胞、または神経細胞である、請求項69に記載の方法。
  72. 細胞が、in vitroの細胞である、またはin vivoにある、請求項69または70に記載の方法。
  73. 細胞が対象内にある、請求項69から71のいずれか一項に記載の方法。
  74. 対象がヒトである、請求項72に記載の方法。
  75. 接触させるステップが、組成物を対象に投与するステップを含む、請求項72または73に記載の方法。
  76. 細胞における標的遺伝子の発現が、疾患または状態に関連し、標的遺伝子の発現を低減することが、疾患または状態を処置する、請求項69から74のいずれか一項に記載の方法。
  77. MITO-A、MITO-B、MITO-C、MITO-D、MITO-E、MITO-F、MITO-G、MITO-H、またはMITO-Iとして記載される化合物。
  78. 1つまたは複数の請求項76に記載の化合物を含み、薬学的に許容される担体を必要に応じてさらに含む、組成物。
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