TW200914618A - Process for preparing chiral compounds - Google Patents

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Description

200914618 九、發明說明: |[ 發明背景 本發明係關於一種用於製備掌性化合物之2-去氡核化 5 物-5-填酸酸醇縮酶(DERA)化學酶催化方法。 I:先前技術】 _ 曾經說明DERA(去氧核糖醛醇縮酶)家族之醛醇縮酶 用於化學酶催化方法。參考US Pat. No. 5,795,749, WO / 03/006656 WO 2004/027075 ' WO 2005/012246 ; Gijsen, l〇 H.J.M.,等人,JACS,1994, 116, 8422-8423 ; Gijsen, H.J.M., 等人 ’ JACS,1995, 117, 7585-7591 ; Greenberg, W.A·,等人, PNAS, 2004, 101, 5788-5793, US Pat No. 6,964,863^. Biotechonol J. 101,pgs 537-548 (2006)。但其中若干方法所 仔總產率低且產物混合物不良。此外’該等方法受限於特 15定基質。如此技藝界需要有可有效且有效率地用於其他基 質之化學酶催化方法。 I C 明内容j ' 發明概要 本發明係關於-種方法,包含下述步驟,乙趁與可於 20選自於由3_鄰苯二甲醯亞胺基丙醛、N-甲醯基胺基丙 醛、3-丁二醯亞胺基_丙醛或N_diB〇c_3_胺基丙醛所組成之 組群中之N經保護之胺基經基f,於_縮酶催化輪醇縮 合條件下反應來形成相對應之内半縮醛。 本發明亦係關於_種方法,其中該酸醇縮轉為2·去氧 200914618 核糖-5-磷酸醛醇縮酶(DERA)。 本發明亦係關於一種方法’其中該醛醇縮酶為DERA 04包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之胺 基酸序列;
5 DERA 06包含SEQ ID NO: 3之核;酸序列或SEQ ID NO: 18之胺基酸序列; DERA 101包含SEQ ID NO: 8之核^:酸序列或SEQ ID NO: 23之胺基酸序列; DERA 102包含SEQ ID NO: 9之核答酸序列或SEQ ID 10 NO: 24之胺基酸序列; DERA 103包含SEQ ID NO: 1〇之核誓酸序列或SEQ ID NO: 25之胺基酸序列; DERA 104包含SEQ ID NO: 11之核誓酸序列或SEQ ID NO: 26之胺基酸序列;
15 DERA 105包含SEQ ID NO: 12之核答酸序列或SEQ ID NO: 27之胺基酸序列; DERA 106包含SEQ ID NO: 13之核苔酸序列或SEQ ID NO: 28之胺基酸序列; DERA 107包含SEQ ID NO: 14之核苔酸序列或SEQ ID 20 NO: 29之胺基酸序列; DERA 108包含SEQ ID NO: 15之核;酸序列或SEQ ID NO: 30之胺基酸序列; 或其具有胺基酸序列相同度至少約為20%之醛醇縮 200914618 特定言之,本發明亦係關於一種方法’其中該DERA (Μ 包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之胺基 酸序列;DERA 06包含SEQ ID NO: 3之核苷酸序列或SEQ ID NO: 18之胺基酸序列或DERA 102包含SEQ ID NO: 9之 5 核苷酸序列或SEQ ID NO: 24之胺基酸序列。 更特定言之,本發明亦係關於一種方法,其中該DERA 04包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之胺 基酸序列。 更特定言之,本發明亦係關於一種方法,其中該DERA 10 1〇2包含SEQ ID NO: 9之核苷酸序列或SEQ ID NO: 24之胺 基酸序列。 本發明亦係關於一種方法,其中該N經保護之胺基醛基 質為3-鄰苯二甲醯亞胺基丙醛。 本發明亦係關於一種方法,其中該N經保護之胺基醛基 15 質為甲醯基-3-胺基丙醛或3-丁二醯亞胺基丙醛。 本發明亦係關於一種方法,其中該N經保護之胺基醛基 質為N-diBoc-3-胺基丙醛。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: (a) 醛與可於選自於由3_鄰苯二曱醯亞胺基丙醛、N-曱 2〇 酿 A , 患胺基丙醛、3_丁二醯亞胺基_丙醛或N_diBoc-3-胺基 丙駿所組成之組群中之N經保護之胺基醛基質,於醛醇縮酶 催化劑醇縮合條件下反應來形成相對應之内半縮醛; (b) 氧化如此所形成之内半縮醛獲得相對應之内酯; (e)如此所形成之内酯與異丙醇及丙酮於酸性催化下 200914618 反應獲得相對應之丙酮化物異丙酯; (d)以鹼處理如此形成之丙酮化物異丙酯而獲得相對 應之胺基丙酮化物異丙酯。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: 5 (a)醛與可於選自於由3-鄰苯二甲醯亞胺基丙醛、N-曱 酿基-3-胺基丙醛、3-丁二醯亞胺基_丙醛或N_diBoc-3-胺基 丙酸所組成之組群中之N經保護之胺基醛基質,於醛醇縮酶 催化劑齡醇縮合條件下反應來形成相對應之内半縮醛; (b)氧化如此所形成之内半縮醛獲得相對應之内酯; 10 (c)如此所形成之内酯與環戊酮反應獲得相對應之亞 環戊基鄰苯二甲醯亞胺基異丙酯;及 (d)以驗處理如此所形成之亞環戊基鄰苯二曱醯亞胺 基異丙S旨而獲得相對應之胺基亞環戊基異丙酯。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: 15 (a)搭與可於選自於由3-鄰苯二甲醯亞胺基丙醛、N-甲 酿基胺基丙醛、3-丁二醯亞胺基-丙醛或N-diBoc-3-胺基 丙酸所組成之組群中之N經保護之胺基醛基質,於醛醇縮酶 催化劑盤醇縮合條件下反應來形成相對應之内半縮醛; (b)於催化去氫條件下將如此所形成之内半縮醛去氫 20而獲得相對應之庚酸; y (c)以一%己基胺處理如此所形成之3,5_二羥基庚酸而 形成相對應之鹽; t ; K4催化下反應如此所形成之鹽與原甲酸三異 曰及丙酮而獲得相對應之丙_化物異丙S旨;及 200914618 (e)以鹼處理如此所形成之丙酮化物異丙酯而獲得相 對應之胺基二環己基胺異丙酿。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: (a) 醛與可於選自於由3_鄰苯二甲醯亞胺基丙醛、曱 5酸基-3-胺基丙盤' 3_丁二醯亞胺基_丙酸或N_diB〇c_3-胺基 丙醛所組成之組群中經保護之胺基醛基質,於醛醇縮酶 催化劑駿醇縮合條件下反應來形成相對應之内半縮齡; (b) 於催化去氫條件下將如此所形成之内半縮醛去氫 而獲得相對應之3,5_二羥基庚酸; 1〇 (C)以二環己基胺處理該3,5-二羥基庚酸獲得相對之鹽 及 (d) 如此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應而獲得相 對應之丙酮化物異丙酯;及 (e) 以驗處理如此所形成之丙酮化物異丙醋而獲得相 15 對應之胺基丙酮化物異丙酯。 本發明亦係關於一種方法,包含下述步驟,於DERA 10卜 DERA 102、DERA 103、DERA 104、DERA 105、DERA l〇6、DERA 107或DERA 108醛醇縮酶催化醛醇縮合條件 下,醛與胺基醛基質或N經保護之胺基醛基質反應而形成相 20 對應之内半縮醛。 本發明亦係關於一種方法,其中該胺基醛或該N經保護 之胺基醛為N-Boc-3-胺基丙醛、3-胺基丙醛、胺基乙醛、 N-CBz_3-胺基丙醛、N-乙醯基-3-胺基丙醛、N-Fmoc-3-胺基 丙酸或N-Fmoc-胺基乙搭。 200914618 特別本發明亦係關於一種方法,其中該N-經保護之胺 基路為N-Boc-3-胺基丙搭。 更特別本發明亦係關於一種方法,其中該胺基醛或該 N_經保護之胺基醛為N-CBz-3-胺基丙搭或N-Fmoc-3-胺基 5 丙搭。 更特別本發明亦係關於一種方法,其中該胺基醛或該 N_經保護之胺基醛為N-CBz-3-胺基丙醛。
本發明亦係關於一種方法,其中該醛醇縮酶為DERA 102。
10 本發明係關於一種方法,包含下述步驟,於DERA UH、DERA 102、DERA 103、DERA 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107或DERA 108醛醇縮酶催化之醛醇縮合條件 下’讓醛與胺基醛基質或N經保護之胺基醛基質反應而形成 相對應之内半縮醛,及氧化如此所形成之内半縮醛,而獲 15 得相對應之内酯。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: ⑻於DERA 1(Π、DERA 102、DERA 103、DERA 104、 DERA 105、DERA 106、DERA 107或DERA 108醛醇縮酶催 化之醛醇縮合條件下,讓醛與胺基醛基質或N經保護之胺基 2〇 醛基質反應而形成相對應之内半縮醛; (b) 於催化去氫條件下去氫化如此所形成之内半縮醛 獲得相對應之3,5-二羥基庚酸; (c) 以二環己基胺處理如此所形成之3 5_二羥基庚酸而 形成相對應之鹽;及 10 200914618 (d)如此所形成之鹽與原曱酸三異丙酯反應獲得相對 應之丙酮化物異丙酯。 本發明係關於一種方法,包含下列步驟: (a) 於DERA 1CU、DERA 102、DERA 103、DERA 104、 • 5 DERA 105、DERA 106、DERA 107或DERA 108醛醇縮酶催 化之路醇縮合條件下,讓醛與胺基醛基質或N經保護之胺基 - 搭基質反應而形成相對應之内半縮醛; (b) 氧化如此所形成之内半縮醛而獲得相對應之3,5-二 / 羥基庚酸; 10 (c)以二環己基胺處理3,5-二羥基庚酸而形成相對應之 鹽;及 (d)如此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應獲得相對 應之丙酮化物異丙酯。 本發明係關於一種方法包含下列步驟,醛與通式(I)之 15胺基醛基質化合物: 〇 C FTR'N、 (CH2)n 、H (I) 其中: n=l、2、3或4 ; R’為氫或N保護基; 20 R”為氫或N保護基;或R’及R”與其附接之氮共同形成5 員或6員雜環部分。 於 DERA 1(H、DERA 102、DERA 103、DERA 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107或DERA 108醛醇縮酶催化之醛 11 200914618 醇縮合條件下反應而形成相對應之内半縮醛。 本發明亦係關於化合物2-[2-(4,6-二羥基-四氫哌喃-2-基)]-異嗤-1,3-二嗣。 特定言之,本發明亦係關於一種下式化合物
QH
、ΌΗ 〇 本發明亦係關於一種下式化合物 ΟΗ
本發明亦係關於一種下式化合物
10 本發明亦係關於一種下式化合物 Ο OH ΟΗ Ο
本發明亦係關於一種下式化合物 Ο OH ΟΗ 0
本發明亦係關於一種下式化合物 12 200914618
本發明亦係關於一種下式化合物
本發明亦係關於一種下式化合物
本發明亦係關於一種下式化合物
本發明亦係關於一種下式化合物
13 200914618 本發明亦係關於4_氟-α-[2-甲基-1-酮基丙基]_τ_酮基 -Ν,/3-二苯基苯丁醯胺之結晶形式,其特徵在於具有約 9.〇、12.7、2〇.2、22.6及25.2度2-0之粉末又光繞射峰。 本發明亦係關於(2R-反)-5-(4-氟笨基)_2_(ι_曱基乙 5基)_N,4-二苯基四氫-4-羥基-6-酮基-2Η-α底喃-2-基)乙 基]-1Η·-比咯-3-羧醯胺之結晶形式,其特徵在於具有約 12.7、16.8、21.1及25.5度2-6»之粉末X光繞射峰。 圖式簡單說明 第1圖為4-氟-[2-曱基-1_酮基丙基]j同基A』.二 10苯基苯丁醯胺之實驗性粉末X光繞射圖案。橫座標刻度為度 2-0。縱座標為計數強度。 第2圖為4-氟-[2-曱基-1-酮基丙基]·酮基七,万-二 笨基笨丁醯胺之差動掃描量熱術(DSC)之溫度描記圖。 第3A圖及第3B圖為4-氟_α-[2-甲基-1-酮基丙基]_ 15酮基_Ν,Θ-二苯基苯丁醯胺之紅外線(FTIR)光譜。 第4A圖及第4B圖為4-氟-〇: -[2-曱基-1-酮基丙基]_ y · 酮基-N,/3-二苯基苯丁醯胺之拉曼光譜。 第5圖為(2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-曱基乙基)-N,4-二 苯基-1-[2-(四氫-4-羥基·6-酮基-2H-旅喃-2-基)乙基]-1H-吡 20咯羧醯胺之實驗性粉末X光繞射圖案。橫座標刻度為度 2-0。縱座標為計數強度。 第6圖為4-氟-α-[2-甲基_1_酮基丙基]-y -酮基_Ν, 7 _二 苯基苯丁醯胺之差動掃描量熱術(DSC)之溫度描記圖。 第7A圖及第7B圖為4-氟-〇; -[2-甲基-1-酮基丙基]-r - 200914618 酮基-M,/3 -二苯基苯丁醯胺之紅外線(FTIR)光譜。 第8A圖及第8B圖為氟-α-[2-甲基-1-嗣基丙基]_r . 酮基一苯基苯丁醯胺之拉曼光譜。 【貧施方式】 5較佳實施例之詳細說明 ^Λ. 除非另行指示,否則下列術語定義如後: 」或一個」專詞用於此處係指所指稱之物件之 單數形或複數形。 1〇 t如此處使用「醛醇縮酶催化之醛醇縮合條件」一詞係 心技藝界已知之可藉如此所述之酸醇縮梅催化之任一種酸 醇縮合條件。 用於本發明之醛也可為於如此處所述之醛醇縮酶存在 下,與如此處所述之基質進行醛醇縮合之任一種醛。適當 15醛之貫例為乙醛,但非限於乙醛。 用於本發明之基質可為任一種胺基醛或]^經保護之胺 基醛。此種胺基醛或N經保護之胺基醛將於醛醇縮酶催化之 醛醇縮合條件下與醛反應,各自說明如此處。 胺基醛之適當N保護基包括但非限於鄰苯二曱醯亞胺 〇基、N-曱醯*、丁二醢亞胺基、二丁氧幾基(di_B⑽、节氧 %基(CBz)、丁氧幾基(B〇c)、9_苟基甲氧幾基(Fm〇c)、节基、 及二节基。 適當胺基醛基質之實例包括但非限於: 15 200914618 Ο Η2Ν^ 吵八丫㈠Ph、 Η Ο )γΗΝ 〜ΧΗ 〇 3-胺基丙醛,胺基乙醛,N-CBz-3-胺基丙醛, 〇 〇 Λ 、Η 〇 人 Η Ή 乙醯基-3-胺基丙醛, Ν-曱醯基-3-胺基丙盤, 火人 Ο 0
N-Fmoc-3-胺基丙搭, N-Boc-3-胺基丙醛, 〇 Η
Ή
N-diBoc-3-胺基丙搭 及 3-丁二醯亞胺基丙醛 於本發明之一個實施例中,該胺基醛基質為3-鄰苯二 甲醯亞胺基丙醛、N-曱醯基-3-胺基丙醛、N-Boc-3-胺基丙 醛、3-丁二醯亞胺基-丙醛或N-diBoc-3-胺基丙醛。於本發 5 明之另一個實施例中,該胺基醛基質為N-CBz-3-胺基丙醛 或N-Fmoc-3-胺基丙酸·。於本發明之另一個實施例中,該胺 基醛基質為3-胺基丙醛。於本發明之另一個實施例中,該 胺基醛基質為胺基-乙醛。於本發明之另一個實施例中,該 胺基醛基質為N-CBz-3-胺基丙醛(市售得自亞力胥公司 16 200914618 (Aldrich))。於本發明之另一個實施例中,該胺基醛基質為 N-乙醯基-3-胺基丙醛。於本發明之另—個實施例中,該胺 基酸基質為N-Fmoc-3-胺基丙經。 兩種N-Fmoc-胺基醛皆係透過相對應之N_Fnioc_胺基 5醇之h準迪斯馬丁 (Dess-Martin)氧化獲得。 N-乙醯基_3_胺基丙醛係藉二步驟式程序得自3_胺基 -1-丙醇:3-胺基_1_丙醇藉乙酸甲_N_乙醯化,接著為迪斯 馬丁氧化,獲得期望產物具有正確的ESI_MS [m+h]+ 116 25 及[M+Na]+ 138.20。 10 用於本發明之醛醇縮酶可為對胺基醛基質、N經保護之 胺基酿基質或吼咯醛基質,各自係如此處所述具有醛醇縮 酶活性之任一種酶。於本發明之一個實施例中’醛醇縮酶 為2-去氧核糖-5-磷酸醛醇縮酶(DERA)。適當DERA醛醇縮 酶之實例包括但非限於: 15 DERA 03 (大腸桿菌(E coli·))(市面上得自西格瑪亞力 胥公司(Sigma Aldrich),密蘇里州聖路易); DERA 04 (William A. Greenberg,等人,PNAS, (2004), 101卷,16期,5788-5793頁或其修改版本); DERA 06 (基因存庫存取號碼np_294929或其修改版 20 本); DERA 08 (基因存庫存取號碼np_465519或其修改版 本); DERA 11 (基因存庫存取號碼Np_439273); DERA 12 (基因存庫存取號碼NP_229359); 17 200914618 DERA 15 (Haruhiko Sakuraba等人,生物化學期刊 (2003),278卷,12期,l〇799_1〇8〇6頁); DERA 101 (基因存庫存取號碼ΝΡ_906068·1或其修改 版本); 5 10 15 DERA 102 (基因存庫存取號碼ΝΡ_813976·1或其修改 版本); DERA 103 (基因存庫存取號碼ΝΡ_01130044·1或其修 改版本); DERA 104 (基因存庫存取號碼γρ_924715·1或其修改 版本); DERA 105 (基因存庫存取號碼ΥΡ_148352·1或其修改 版本); DERA 106 (基因存庫存取號碼ΝΡ 471437.1或其修改 版本); DERA 107 (基因存庫存取號碼ΝΡ_242218.1·1或其修 改版本);及 DERA 108 (基因存庫存取號碼ΖΡ_00875069.1或其修 改版本)。 於本發明之一個實施例中,該醛醇縮酶為具有與此處 20 所述之DERA醛醇縮酶至少約20%,較佳至少70%胺基酸序 列相同度之醛醇縮酶。於本發明之一個實施例中,DERA 醛醇縮酶為DERA 04、DERA 06或DERA 102。於本發明之 一個實施例中,DERA醛醇縮酶為DERA 102。
根據本發明,DERA 101、DERA 102、DERA 103、DERA 18 200914618 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107及DERA 108係藉 實例1 - 3 0所列舉之其核苷酸序列及胺基酸序列識別。 特定言之,DERA 03為具有SEQ ID NO: 1核苷酸序列 及SEQIDNO:16胺基酸序列之經醇縮酶。
5 DERA 04為具有SEQ ID NO: 2核苔酸序列及SEQ ID - NO:17胺基酸序列之醛醇縮酶。
, DERA 06為具有SEQ ID NO: 3核苔酸序列及SEQ ID NO:18胺基酸序列之醛醇縮酶。
r DERA 08為具有SEQ ID NO: 4核苷酸序列及SEQ ID 10 NO:19胺基酸序列之醛醇縮酶。 DERA 11為具有SEQ ID NO·· 5核苷酸序列及SEQ ID NO:20胺基酸序列之醛醇縮酶。 DERA 12為具有SEQ ID NO: 6核苷酸序列及SEQ ID NO:21胺基酸序列之醛醇縮酶。
15 DERA 15為具有SEQ ID NO: 7核苷酸序列及SEQ ID NO:22胺基酸序列之醛醇縮酶。
(' DERA 101為具有SEQ ID NO: 8核苷酸序列及SEQ ID * NO:23胺基酸序列之醛醇縮酶。 DERA 102為具有SEQ ID NO: 9核苷酸序列及SEQ ID 20 NO:24胺基酸序列之酸醇縮酶。 DERA 103為具有SEQ ID NO: 10核苔酸序列及SEQ ID NO:25胺基酸序列之駿醇縮酶。 DERA 104為具有SEQ ID NO· 11核苷酸序列及SEQ ID NO:26胺基酸序列之醛醇縮酶。 19 200914618 DERA 105為具有SEQ id NO: 12核苷酸序列及SEQ ID NO:27胺基酸序列之酸醇縮酶。 DERA 106為具有SEQ ID NO: 13核苷酸序列及SEQ ID N 0:2 8 fe基酸序列之搭醇縮酶。
5 DERA 107為具有SEQ ID NO: 14核苷酸序列及SEQ ID NO:29胺基酸序列之醒醇縮酶。
DERA 108為具有SEQ ID NO: 15核苷酸序列及SEQ ID NO:30胺基酸序列之醛醇縮酶。 此處所述DERA醛醇縮酶可藉技藝界已知之任一種手 10段製備,包括但非限於於重組大腸桿菌中蛋白質表現之標 準方案(Sambrook及RusseU ’分子選殖:實驗室手冊第3版, 冷泉港,紐約2001年p熟諳技藝人士瞭解依據選殖條件而 定,可能需要或可能導致已知DERA醛醇縮酶之修改版 本’且係涵盖於本發明。 15 下列反應圖舉例說明本發明^
製備例A
於製備例A中,經由於苄基三甲基氫氧化銨(崔頓B (Tnton-B))存在下讓鄰苯二甲醯亞胺與丙烯醛反應而製備 20 3_鄰苯二甲醯亞胺基丙醛。反應係於約53°C至約67.5。(:較佳 於約60 C之溫度攪拌約30分鐘至約3小時,較佳約9〇分鐘時 間。 20 2〇〇9l46i8
製備例B Η2Ν" ο人 Η+ 〇人 Ο —於製僑例Β中,經由甲酸乙酯與1_胺基_3,3_二曱氧基丙 應及以酸處理如此所形成之醯胺,製備Ν-曱醯基-3-胺 基丙醛。
製備例C
η2ν〜X〆—(叫0义X I 〇 0 於製備例C中,經由1-胺基-3,3-二甲氧基丙烷與b〇C酐反 及以心處理如此所形成之酸胺而製備N-Boc-3-胺基丙酸·。 10
製備例D h2nt
(ΒΟ〇2〇 DMAP I Ο Η+ Ο 'Ν 、 15 於製備例D中,經由於4-二(甲基胺基比咬存在下讓ι_ 胺基-3,3-二甲氧基丙烧與BOC酐反應,及以酸處理如此所 形成之醯胺而製備N-di-Boc-3-胺基丙醛。 製備例E 3-丁二醯亞胺基丙醛 於催化作用之乙氧化鈉及極性質子溶劑如乙醇存在 下,添加丙烯醛至丁二醯亞胺溶液。反應混合物於約10°C 至約40°C,較佳約20-30°C溫度攪拌約20小時至約60小時, 較佳約48小時時間。 21 20 200914618 反應圖1
反應圖1大致說明本發明所涵蓋之方法。如反應圖“斤 示,DERA醛醇縮酶與其他適當溶劑諸如曱基第三丁基醚 5 (MTBE)及水存在下,催化3_鄰苯二曱醯亞胺基丙醛與2莫耳 乙醛間之兩次循序醛醇縮合反應,獲得經保護之期望之胺 基内半縮酸 (A)。適當DERA酸醇縮酶包括但非限於DERA 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107及DERA 108,較 佳為DERA04及DERA 102。乙醛經約7小時至約12小時,較 10佳約10小時時間添加至3-鄰苯二曱醯亞胺基丙醛與DERA 酸醇縮酶之混合物。如此所形成之混合物進一步於約irc 至約3(TC之溫度,較佳約22°C之溫度攪拌約20小時至約60 小時,較佳約48小時間。 胺基-内半縮酸"(A)可進行催化(例如銘-碳或飽-碳)去氫 15反應而形成羧酸(C),然後進行内酯化反應而形成(B)。 22 200914618 技藝界已知之將(A)轉成(〇之任一種催化去氫手段皆 係涵蓋於本發明之範圍。適當催化劑之實例包括但非限於 Pt/C、Pd/C、Pt/Bi/C、Pd/Bi/C及任何其他去氫催化劑。於 本發明之一個實施例中,催化去氫係使用空氣或氧氣作為 終端氧化劑於約pH 7至約pH 10進行。 10 15 20 技藝界已知之將叛酸(C)轉成内酯(b)之任一種内酯化 手奴皆係涵蓋於本發明,包括但非限於使用酸性催化劑諸 如但非限於鹽酸、硫酸、甲磺酸(MSA)、對甲苯磺酸(TSA) 及技藝界已知之任何其他内酯化酸。特定言之,7-(1,3-二 酮基-1,3-二氫-異吲哚_2_基)_3,5_二羥基-庚酸(c)經由於乙 酸乙酯存在下以無水鹽酸處理(c)而轉成相對應之2_[2_(‘ t基6-綱基’氫·。辰喃_2_基>異吲二酮⑻。反應於 室溫搜拌於約1小時至約4小時,較佳約2-3小時間時間。 尸另外,經由使用技藝界已知之任—種達成期望之轉化 的氧化^段,進行内半祕(A)氧化成為⑽⑻或㈣ ()特定5之,2-[2-(4,6-二經基_四氫0底咕_2_刻異〇引口朶 Μ·二酮(A)經由於氧化劑諸如次氣酸鈉存在下氧化⑷而 轉成相對應之2仰铺相基^氫⑽士基)]. _反應於約1〇C至約30°C,較佳約23t溫度授 料小時至約6小時,較佳約4小時時^仰,卜二羥基 綱射·切綱諸如次 虱馱鈉、磷酸鹽缓衝劑、極性 ㈣好惰性溶_如二甲亞礙 及醇啫如異丙醇存在下氧化 1 )也了轉成相對應之7-(1,3-一阳基-1,3-二氫·異吲嗓_2_基 ,—搜基-庚酸(C)。反應係 23 200914618 於室溫及約5至約6之pH維持約2小時至約6小時,較佳約4 小時時間。 7-(1,3-二酮基-1,3-二氫-異吲嵘-2-基)-3,5-二羥基-庚酸 (C)係經由於乙酸乙酯存在下以二環己基胺處理(C)而轉成 5 相對應之二環己基胺(DCA)鹽(D)。然後DCA鹽(D)經由於丙 酮及曱磺酸存在下,讓(D)與DCM、原曱酸三異丙酯反應而 轉成鄰苯二曱醯亞胺基丙酮化物異丙酯(E)。 鄰苯二曱醯亞胺基丙酮化物異丙酯(E)也可經由於丙 酮及曱磺酸(MSA)存在下讓2-[2-(4-羥基-6-酮基-四氫-哌喃 10 -2-基)]-異吲嵘-1,3-二酮(B)與異丙醇反應而製備。反應混合 物於室溫於約1至約2較佳約1.5之pH攪拌約20小時至約28 小時,較佳約24小時時間。 鄰苯二甲醯亞胺基丙酮化物異丙酯(E)經由以鹼諸如 第一胺亦即烷基胺、二胺諸如伸乙基二胺或羥基胺,於極 15 性質子溶劑諸如甲醇存在下處理(E ),( E)被脫保護而獲得相 對應之胺基丙酮化物異丙酯(F)。反應混合物於室溫攪拌約 30分鐘至約4小時,較佳約2小時時間。 胺基丙酮化物異丙酯(F)進一步與式II 4-氟-α -[2-曱基 -1-酮基丙基]-<7 -酮基-Ν,/5-二苯基苯丁醯胺反應
20 II 獲得下式III含相對應之吡咯環之丙酮化物異丙酯 24 200914618
in 根據本發明’如熟諳技藝人士已知,透過外消旋標準 品之化學製備及相關掌性層析方法之發展,可驗證酶催化 步驟之立體選擇性。 5 4_氟_[2-曱基_1_§同基丙基]-τ __基_凡石-二苯基苯 丁醯胺之PXRD圖案顯示於第1圖。 主峰(大於13%相對強度)顯示於表1。曱基 1酮基丙基]-酮基-Ν,/5-二苯基笨丁醯胺顯示特徵繞射 峰於9.0、12.7、20·2、22.6及25.2度20 ±〇·ι度。dsc溫度描 1〇記圖顯示於第2圖。4_氟-«-[2-甲基基丙基]_7_酮基_N, 石-二苯基苯丁醯胺顯示於213°C±2°C有個鮮明的吸熱峰。 FT-IR光譜顯示於第3圖。FT-IR峰值表列舉於表2。^氣-“ _[2-甲基-1-酮基丙基]酮基_N,/5-二苯基苯丁醯胺顯示 特徵峰於696、1492、1327、843、1151厘米-ι(依此種順序)。 15 FT~拉曼光譜顯示於第4圖。FT-拉曼峰值表列舉於表3。4_ 氟-α-[2-甲基酮基丙基酮基_N,万_二苯基笨丁醯胺 择頁示特徵峰於1004、115、877、1601厘米.1。 25 200914618 表1 : 4-氟-α-[2-曱基-1-酮基丙基]-τ-酮基-Ν,/3-二苯基苯 丁醯胺之主PXRD峰 角2-Θ (度) 相對強度(%) 角2-Θ (度) 相對強度(%) 7.6 22.8 25.2 54.3 9.0 84.3 25.5 49.2 11.8 18.4 26.0 23.0 12.7 93.8 29.9 30.6 14.7 12.8 27.1 51.8 16.4 18.5 27.6 13.4 18.0 41.1 28.4 20.2 18.8 100.0 28.5 21.4 18.9 78.0 28.7 21.1 19.6 19.0 28.9 20.0 20.2 86.4 29.4 13.3 20.5 46.6 32.7 17.4 20.7 31.1 33.4 27.7 21.1 25.0 36.4 13.6 22.6 55.9 37.3 13.5 22.9 14.2 37.8 13.9 23.2 14.0 38.6 20.3 23.5 17.0 39.4 13.6 24.0 18.0 39.8 13.9 24.7 17.5 表2 · 4-亂-α -[2-甲基-1- S同基丙基]-τ -嗣基-Ν,/3 -二本基苯 5 丁醯胺之FT-IR峰 實驗誤差為±2厘米u (w :弱,m :中,s :強) 波數(厘米胃1) 3290w* 1506w 1151w 683w 3083w 1492m 1099w 3025w 1466w 1037w 2969w 1448m 1012w 2927w 1407w 992m 2871w 1381m 875w 1720w 1327m 843m 1683w 1279m 809w 1649s 1227m 754s 1594m 1207m 736w 1546m 1174w 696s 26 200914618 表3 : 4-氟-α-[2-甲基-1-酮基丙基]-/5-酮基-N,/5-二苯基苯 丁酿胺之FT-拉曼峰 實驗誤差為±2厘米―1 (w :弱,m :中,s :強) 波數(厘米’ 3301w* 1449w 877w 3084s 1352w 843w 3069s 1330w 813w 3060m 1310w 633w 3042w 1281w 619w 2975w 1245w 307w 2938w 1229w 290w 2918w 1210w 234w 2871w 1176m 186w 1722s 1159w 158m 1684w 1154w 115vs 1652w 1033w 87vs 1601s 1004s 70vs 1546w 911w 5 (2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)-N,4-二苯基 -1-[2-(四鼠-4 -起基-6-嗣基 -211-°底喃-2 -基)乙基]-1 Η-σ比洛-3-羧醯胺之PXRD圖案顯示於第5圖。主峰(大於12%相對強度) 顯示於表4。(2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)-Ν,4-二苯 基-1-[2-(四氮-4 -輕基-6-S同基-211-°底喃-2 -基)乙基]-1 Η-σ比略· 10 -3-羧醯胺顯示特徵繞射峰於6.3、12.7、16.8、21.1及25.5 度20±〇.1度。DSC溫度描記圖顯示於第6圖。(2R-反)-5-(4-氣苯基)-2-(1-甲基乙基)-N,4-二苯基-1-[2-(四鼠-4-經基-6_ 嗣基- 2Η-α底喃-2-基)乙基]-1 H-atb嘻-3-竣酿胺顯不鮮明吸熱 峰於166°C±2°C。FT-IR光譜顯示於第7圖。FT-IR峰值表列 27 200914618 舉於表5。(2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)_队4_二苯基 四氫-4-羥基-6-酮基-2H-吸喃_2·基)乙基]_1H-吡咯 羧醯胺顯示特徵峰於851、1220、1〇47、757、1153厘米'](依 此順序)。FT-拉曼光譜顯示於第8圖。FT_拉曼峰值表列舉於 5表6 ’(2R_反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-曱基乙基)_N,4_二苯基 -1-[2-(四氫_4_羥基_6_酮基_2Η_Π底喃_2·基)乙基]_1H_吡咯_3_ 羧酿胺顯示特徵峰於1531、997、114、99、1605厘米'】。 表4 : 反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)-N,4-二苯基-1- [2_(四氫·4'羥基-6-酮基-2H-哌喃-2-基)乙基]-1H-吡咯-3-羧 10 醯胺之主PXRD峰 相對強度(%) 角2-0 (度) 相對強度(%) 66.9 25.0 17.8 13.7 25.5 41.3 18.7 26.7 29.7 14.1 26.9 28.4 21.4 27.2 19.3 35.5 27.8 33.9 82.0 28.4 12.5 84.3 29.5 22.7 47.4 31.4 12.2 21.3 31.9 17.9 100.0 32.5 14.3 76.5 32.8 15.1 35.2 33.5 14.2 56.7 34.7 15.8 19.8 36.3 18.1 47.6 36.6 13.2 61.6 37.5 14.1 48.0 38.3 15.6 27.7 39.5 13.2 21.0 角2-Θ (度) 6.3 8.8 10.4 11.1 12.3 12.7 16.8 17.7 17.9 18.3 18.9 19.1 20.0 20.1 20.3 20.7 20.8 21.1 22.8 24.3 28 200914618 表5 : (2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)-N,4-二苯基-1-[2-(四鼠-4 -經基-6-網基- 喃-2-基)乙基]-1 Η-σ比洛-3-魏 S藍胺之FT-IR蜂 實驗誤差為±2厘米」(w :弱,m :中,s :強) 波數(厘米’ 3431w* 1497w 1161w 851s 2961w 1485m 1153m 804m 2937w 1433s 1097w 795w 2927w 1387m 1083m 775w 1699s 1349w 1069m 757s 1662s 1312m 1047m 736m 1591m 1269w 996w 710s 1559w 1235m 988w 691s 1524m 1220s 885w 664m 1509s 1172m 869w 表6 : (2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙基)-N,4-二苯基-1-[2·(四氮-4 -經基-6- 3同基-211-0瓜喃-2-基)乙基]-1H-17比嘻-3 -竣 酿胺之FT·拉曼♦ 實驗誤差為±2厘米―1 (w :弱,m :中,s :強) 波數(厘米’ 3433w* 1531s 997m 411w 3064m 1514m 902w 391w 3049m 1482m 861w 371w 2984w 1414m 836w 231w 2963w 1401w 824w 198w 2940w 1368w 805w 172w 2929w 1315w 731w 157m 2908w 1301w 701w 114vs 1701w 1239m 638w 99vs 1664s 1178w 618w 57vs 1605s 1155w 524w 61vs 1559w 1036w 504w 29 200914618 反應圖2
如反應圖2所示,經由2-[2-(4-經基-6-S同基-四氫°底喃-2-基)-異吲嵘-1,3-二酮(Β)與環戊酮及異丙醇於硫酸鎂及曱磺 5 酸(MSA)存在下反應而製備亞環戊基鄰苯二曱醯亞胺基異 丙酯(G)。反應混合物於室溫於約1至約2,較佳約1.5之pH 攪拌約20小時至約28小時,較佳約24小時。 亞環戊基鄰苯二曱醯亞胺基異丙酯(G)經由使用鹼諸 如第一胺亦即烧基胺、二胺諸如伸乙基二胺或經基胺於極 10 性質子性溶劑諸如甲醇存在下處理而將(G)脫保護獲得相 對應之胺基亞環戊基異丙酯(H)。反應混合物於室溫攪拌約 30分鐘至約4小時,較佳約2小時時間。 如此所形成之胺基亞環戊基異丙酯(H)進一步與式II 4-氣-(2 -[2-甲基-1 -自同基丙基]-τ 嗣基-N,/3 -二苯基苯丁酿胺 15 反應。 30 200914618
F
反應圖3
反應圖3大致說明本發明涵蓋之方法。如反應圖3所 示,DERA醛醇縮酶催化選自於由N-甲醯基-3-胺基丙醛、 3-丁二醯亞胺基丙醛、N-diBoc-3-胺基丙醛、N-Boc-3-胺基 丙醛、胺基乙醛、N-CBz-3-胺基丙醛、N-乙醯基-3-胺基丙 10 酸、N-Fmoc-3-胺基丙路或N-Fmoc-胺基乙搭所組成之組群 中之N經保護之胺基丙醛基質(亦即Rl=保護基)與2莫耳乙 醛於適當助溶劑如甲基第三丁基醚(MTBE)及水存在下之 31 200914618 兩項循序醛醇縮合反應來獲得經保護之期望之胺基-内半 縮醛(I)。適當DERA醛醇縮酶包括但非限於DERA 04、DERA 06、DERA ΗΠ、DERA 102、DERA 103、DERA 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107或DERA 108,較佳為DERA 04 5 及DERA 02。乙醛以約7小時至約12小時較佳約1〇小時時間 添加至N經保護之胺基醛與DERA醛醇酶之混合物。如此所 形成之混合物進一步於約15°C至約3(TC較佳約22°C之溫度 攪拌約20小時至約60小時,較佳約48小時時間。 胺基-内半縮經(I)進行催化(例如Pt/C、Pd/C)去氫而形 1〇 成羧酸(K),然後進行内酯化反應而形成(j)。 技藝界已知可將(I)轉成(K)之任一種催化去氫手段皆 係涵蓋於本發明。適當催化劑之實例包括但非限於Pt/C、 Pd/C、Pt/Bi/C、Pd/Bi/C及任何其他去氫催化劑。於本發明 之一個實施例中,使用空氣或氧氣作為終端氧化劑於約pH 15 7至約pH 10進行催化去氫反應。 技藝界已知將羧酸(K)轉成内酯(J)之任一種已知之内 醋化手段皆係涵蓋於本發明,包括但非限於使用酸性催化 劑諸如但非限於鹽酸、硫酸、曱磺酸(MSA)、對甲苯磺酸 (TSA)及技藝界已知之任何其他内酯化酸類。 2〇 $外,經由使用技藝界已知將達成期望之轉化之任何 氧化手段,可進行將内半縮醛⑴氧化成為内酯(J)或羧酸 (K)。 32 200914618 反應圖4 〜少-H il DERA-102 RHN〆 + 2八- R= H, CBz, B〇c, Fmoc, t 基或二苄基
Rhn
誨催化胺基醛或N經
Oh 如反應圖4所示,DERA醛醇縮 護之胺基醛與2莫耳乙醛間之醛醇縮合反應而獲得期望 保 之
胺基-内半縮醛(M)。 下列非限制性實例舉例說明本發明。 實例1 7.-『2-(4,6-二經某-四氤-°底喊-2-基)-異
OH
V0H 10 於3-鄰苯二甲醯亞胺-丙醛(1⑽克,49.2毫莫耳)於2〇毫 升第三丁基甲基醚(MTBE)之懸浮液内,於2rc以激烈攪拌 添加DERA 04溶解產物之溶液(52.0毫升,1〇,4〇〇單位製 自13.0克DERA 04濕細胞於磷酸鹽緩衝液,pH 7 〇 〇 Q1M) 及磷酸鹽緩衝液(102毫升,pH 7.0, 0.01 μ)伴以於22(>c激烈 15攪拌。乙醛(4_8克,108.2毫莫耳,亞力胥公司)溶解於水(1〇 毫升)藉程式規劃幫浦經10小時時間連續添加入反應混合 物。反應混合物之pH以1.0 N氫氧化納滴定維持於。反應 混合物又於22°C授拌10小時’藉高壓液相層析術(HPLC)監 視轉化。20小時後,基於高麼液相層析術分析,耗用約95% 20起始物料,製造5〇_55%期望之内半縮醛,所得反應混合物 33 200914618 直接用於隨後氧化步驟。内半縮醛之LC-ESIMS : m/z [M+H]+ 292.3。 實例2 i-『2-(4-羥基-6-酮基-四氫-哌喃_2_|)_異0引峻_丨.3_二酮
於粗產物内半縮醛(200毫升;根據實例1製備)之懸浮液 内以攪拌添加二甲亞颯(10毫升然後以3〇分鐘時間逐滴添 加次氯酸鈉(1.5當量,8.3克,亞力胥公司)於水(18毫升)之 溶液。溫度控制於20-25°C之範圍。反應混合物之pH須維持 10高於4·〇。經4小時後加入丙酮(2〇〇毫升)。反應混合物於〇_5 °C攪拌1小時,然後於布克納漏斗通過矽藻土襯墊(1〇克)過 渡。過遽所付之遽餅以丙嗣洗蘇(5 〇毫升兩次)。組合丙嗣過 濾液於減壓下經濃縮去除丙酮及第三丁基甲基醚 (MTBE)。其餘水溶液調整至pH約為4.0及以乙酸乙酯(1〇〇 15耄升三次)萃取。組合乙酸乙酯溶液以硫酸鎂脫水及於減壓 下濃縮至約100毫升)’於硫酸鎂(2克)存在下以無水鹽酸(〇 6 毫升,4M於二噚吡處理及於室溫攪拌4小時。然後反應混 合物以飽和碳酸氫鈉-食鹽水洗滌及以硫酸鈉脫水。乙酸乙 酯溶液濃縮至50毫升,然後添加5〇毫升庚烷。所形成之固 20體經過濾、及以庚烧(2〇毫升)洗務,於烤爐中乾燥獲得内酯, 呈白色固體(40%-45%共三步驟,95%化學純度,ee>99%, de>86%) ° LC-ESIMS [M+Na]+ m/z 312.0 ° ]H NMR (CDC13, 34 200914618 400 MHz): δ 7.82 (m, 2H), 7.68 (m, 2H), 4.78 (m, 1H), 4.41 (m, 1H), 3.84 (m, 2H), 2.65 (m, 2H), 1.94-2.14 (m, 3H), 1.81 (m, 1H)。13C NMR (CDC13, 100 MHz) δ 170.15, 168.61 (2), 134.32 (2), 132.20 (2), 123.58 (2), 73.82 (2), 62.85, 38.63, 5 35.70, 34.47, 34.40。 實例3 2-f2-(4,6-二羥某-四氪-哌喃-2-某V異吲〇朵_1,3_二酮
於含DERA 102之大腸桿菌細胞懸浮液(4克濕細胞懸浮 1〇 於190毫升磷酸鹽缓衝液,PH 7.0, 0.01 M)内藉程式規劃之 幫浦以10小時時間添加3-鄰苯二曱醯亞胺基-丙醛(2,〇克, 9_8毫莫耳)及乙醛(〇_96克,21.8毫莫耳,亞力胥公司)於二 甲亞颯(15毫升)之混合物。反應混合物又於22。(:授拌14小 時。藉高壓液相層析術(HPLC)監視反應之進行。經24小時 15 後’反應混合物以乙酸乙酯(100毫升兩次)萃取。藉離心分 離二層後’有機層經脫水及蒸發,獲得粗產物内半縮酸(1 6 克,45-50%),呈固體,直接用於次一氧化步驟。内半縮趁 之LC-ESIMS : m/z [M+H]+ 292.3。 實例4 2〇 7-(1,3-二酮基-1.3-二1-異吲峻-2-某)-3.5-二鉋1电@
200914618 於粗產物内半縮醛(1.6克;根據實例3製備)於異丙醇 (4.8毫升)及二曱亞砜(1.〇毫升)及26毫升磷酸鹽緩衝液 6_0,0.01 M)之混合物内於室溫添加次氯酸鈉(0.9克,亞力 胥公司)於水(2毫升)之溶液。反應混合物之pH維持於5 〇至 5 6.0。4小時後’反應混合物以1 N氫氧化鈉中和至pH 7 〇, 及以乙酸乙酯30毫升萃取。去除有機層後,水層以in鹽酸 酸化至pH 4_0及以乙酸乙酯(30毫升三次)萃取。含粗產物酸 之組合有機層於冷溫度(5-10°C)以二環己基胺(1.5毫升)處 理,獲得相對應之二環己基胺鹽(1_5克,約90%純度)。 10 LC-ESIMS : m/z [M+Na]+ 330.0。NMR (CDC13, 400 MHz) 5 7.59 (m, 4H), 3.88 (m, 1H), 3.58 (m, 1H), 3.56 (m, 2H), 3.03 (m, 2H), 2.07-2.19 (m, 2H), 1.40-1.82 (m, 14H), 0.80-1.20 (m, 10H)。13C NMR (CDC13, 100 MHz) δ 180.22, 170.82, 134.65 (2), 131.52 (2), 123.32 (2), 67.36, 67.31, 15 53.23 (2), 44.87, 43.14, 34.82, 34.57, 29.14 (4), 24.64 (2), 24.04 (4) 〇 實例5 _2-|~2-i4-敍甚^-6-嗣基-四氫-°底。南-2-某)1-異p引嗓-1,3-二酮
20 粗產物酸(1.0克,根據實例4製備)以乙酸乙酯(20毫升) 以無水鹽酸於二呤咄(4 Μ ’ 50微升)處理,反應混合物於室 溫攪拌2-3小時。反應混合物以水(pH 7.0,50毫升兩次)洗 36 200914618 滌。有機層以硫酸鈉脫水及蒸發,獲得期望之内酯呈白色 固體(0.94克,約94%化學純度,>99% ee,>93% de)。 實例6 鄰笼二甲醯凸胗基丙酮化物
鄰苯二甲醯亞胺基内酯(5.0克,17.3毫莫耳)懸浮於甲苯 《 (100毫升)。添加ΙΡΛ (6.6毫升’ 86.0毫莫耳,5當量),丙酮 (6.3毫升,86.0毫莫耳’ 5當量),硫酸鎂(5.0克)及甲磺酸(0.4 毫升,6.0毫莫耳’ 0.35當量)。ρΗ=1·5 (要求小於2)。混合 10 物於室溫授拌24小時。反應以三乙基胺(〇·9毫升,6.5毫莫 耳)淬媳,混合物通過第四級燒結漏斗過遽、,以甲笨(2〇毫升) 洗務。爐'液以飽和水性被目文虱納(20¾升)洗條,以疏酸鎂脫 水,過濾及於減壓下濃縮,獲得無色油,6.88克,1〇0%。 實例7 15 胺基丙酮化物異丙酯
伸乙基二胺 ----3^ MeOH
' Ί,16.8毫 I 溶解於曱醇(65毫升,10體積)。逐滴加入伸乙武 果耳) 克,168毫莫耳,10當量)及溶液於室溫攪拌。土〜胺(10.1 1小時後,HPLC分析指示不含起始物軿 2小時後,反 37 20 200914618 應混合物於旋轉蒸發器上於減壓下濃縮。殘餘物分溶於甲 苯(65毫升,1〇體積)及水(65毫升,10體積),攪拌15分鐘然 後讓其放置15分鐘。混濁水相再度以甲笨(65毫升)萃取,攪 動15分鐘然後讓其放置15分鐘。組合甲苯萃取物以水(65毫 5升)洗滌,攪動15分鐘然後讓其放置丨5分鐘。甲苯萃取物於 減壓下濃縮獲得油產物,2.85克,65_〇°/〇產率。 實例8 咐^各某丙酮化物異丙酯(AIE)
10 4-氟曱基-1-酮基丙基酮基-N,/5-二苯基苯 丁醯胺(4.64克,11.1毫莫耳,1_〇3當量)稱量入一頸5〇毫升 圓底瓶内。加入胺基丙酮化物異丙酯(2·80克,10·8毫莫耳) 於第三丁基甲基醚(MTBE ; 11毫升)’接著以四氫呋喃沖洗 (4.2毫升)。加入三乙基胺(1 〇9克,毫莫耳,1當量)’漿 15液加熱至5〇°C。加入特戊酸(U〇克,10.8毫莫耳,1當量) 及混合物回流(67_68。〇加熱88小時。冷卻時,於減壓下去 除揮發物,殘餘物攝取於異丙醇(ιρΑ; 17_5毫升)及加熱至 80°c。需要額外量ΙρΑ(ι〇毫升)來獲得澄清溶液。讓溶液冷 备P至室泪,+ 未出現結晶化。溶液以真正產物播種晶種及出 20現結晶化作用。漿液冷卻至〇υ及維持30分鐘。產物收集於 38 200914618 等級2燒結漏斗及以異丙醇(亦即IPA ;三次使用10毫升)洗 滌。產物於40-50°C於減壓下乾燥18小時,獲得淡黃色固體 (4.15克,60.0%產率)。 實例9 5 亞環戊基-鄰笨二甲醯亞胺基-異丙酯
鄰笨二甲醯亞胺基内酯(5.0克,17.3毫莫耳)懸浮於曱苯 (50毫升)。添加IPA (6.6毫升,86.0毫莫耳,5當量),環戊酮 (3.0克,34·8毫莫耳,2當量),硫酸鎂(5.0克)及曱磺酸(0.4 10 毫升,6.0毫莫耳,0·35當量)。pH為1.5 (要求pH小於2)。混 合物於室溫攪拌24小時。反應以三乙基胺(0.9毫升,6.5毫 莫耳)淬熄,混合物通過第4級燒結漏斗過濾,以曱苯(20毫 升)洗滌。濾液以飽和水性碳酸氫鈉(20毫升)洗滌,以硫酸 鎂脫水,過濾及於減壓下濃縮獲得無色油,7.18克,100%。 15 實例10 胺基亞環戊基異丙酯
亞環戊基-鄰苯二甲醯亞胺基-異丙酯(10.0克,24.1毫莫 耳)溶解於曱醇(50毫升,5體積)。逐滴加入伸乙基二胺(2.9 39 200914618 克,48.2毫莫耳,2當量),溶液於室溫攪拌。 1小時後’高壓液相層析術(HPLC)分析指示不含起始物 料。2小時後,反應混合物於旋轉蒸發器上於減壓下濃縮。 殘餘物分溶於甲苯(1〇0,10體積)及水(1〇毫升,1〇體積), 5攪動15分鐘然後讓其放置15分鐘。混濁水相以甲苯(65毫升) 再度卒取,攪動15分鐘然後讓其放置15分鐘。組合曱苯萃 取物以水(65毫升)洗滌,攪動15分鐘然後讓其放置15分鐘。 曱苯萃取物於減壓下濃縮,獲得產物呈油,6.45克,94%產 率。重要地須確保不存在有來自於粗產物之伸乙基二胺, 10原因在於可能導致於隨後之巴爾諾爾(Paal-Knorr)反應中雜 質(雙吡咯)之形成。 實例11 地咯亞環戊基異丙酯frTF、
15 4·說_[2_甲基小酮基丙基]-τ -酮基-Ν,/3 -二苯基笨 丁醯胺(4.64克’ 11.1毫莫耳,1〇3當量)稱量入一頸5〇毫升 圓底瓶内。加入胺基亞環戊基異丙酯(3.〇8克,10.8毫莫耳) 於ΜΤΒΕ (11毫升),接著以四氫呋喃沖洗(4.2毫升)。加入三 乙基胺(1_〇9克’ 10.8毫莫耳,i當量”漿液加熱至5〇°c。加 2〇 入特戊酸(I·10克’ 10.8毫莫耳,1當量)及混合物回流(67-68 40 200914618 °C)加熱88小時。冷卻時,於減壓下去除揮發物,殘餘物攝 取於異丙醇(17.5毫升)及加熱至8〇°C。需要額外量異丙醇 (10毫升)來獲得澄清溶液。讓溶液冷卻至室溫,未出現結晶 化。溶液以真正產物播種晶種及出現結晶化作用。黎液冷 5 卻至〇°C及維持30分鐘。產物收集於等級2燒結漏斗及以異 丙醇(三次使用10毫升)洗滌。產物於40-50°C於減壓下乾燥 18小時,獲得淡黃色固體(4.31克,60.0%產率)。藉高壓液 相層析術測定之純度大於99%純質。 實例12 1〇 瑕-『2-^_基_ 1 _嗣某丙基ι_ τ -¾同基-N,/5 -二笨某苯丁酿胺 反應溶劑使用至少4週期抽真空,每次使用氮氣解除真 空來轉成惰性氣氛。250升四氫吱喃經喷霧噴嘴進給入反應 容器。喷霧球噴嘴確保反應容器全部各區皆經過滲透,特 別為容器内部頂面’擾動器裝置也存在於反應容器内側。 15四氫咬喃洗液經過瀝乾’收集用於循環廢料。 當反應容器為無水480千克2-亞苄基異丁醯基乙醯胺 (BIBEA)時’ 60千克乙基羥基乙基甲基溴化噻唑鑕(MTB或 乙基經基乙基MTB) ’ 200升216千克4-氟苄醛及120千克三 乙基胺進給至反應容器,以攪拌加熱至6〇。(:至7〇。(::。反應 20混合物老化16小時至24小時,溫度維持於65+/-5。(:。然後 内容物冷卻至65 +/-5°C歷54分鐘至66分鐘。600升異丙醇進 給至反應混合物,混合物加熱至約lOOt:達成溶液狀態。 600升去離子水以30分鐘時間進給至反應容器,同時將 /皿又維持於65+/-5C。批料老化物於54分鐘至66分鐘,内 41 200914618 谷物以每小時15/20 °C之速率以2小時至4小時時間冷卻至 25 +/- 5C °批料於此溫度老化至少】小時,内容物進一步冷 卻至0+/-5t及老化至少】小時。 批料於過濾器上分離及以異丙醇洗滌。產物於減壓下 5於50+/-5°C乾燥至水含量低於0.5%。然後内容物冷卻至約 低於30°C隨後排放。
實例13 生-紙-α -|~2-甲基-1-酮基丙某卜r -酮甚_N. /3 -二笨基笨丁醯 胺之PXRD ° 粉末X光繞射圖案係使用裝配有自動化試樣更換器、Θ -Θ測角器、自動光束發散裂縫及pSD凡鐵克(Vantec)·〗檢測 器之布魯克-AXS公司(Bruker-AXS Ltd·)。D4粉末X光繞射 以測定粉末X光繞射圖案。經由將試樣架設於低背景矽晶圓 试件座上,試樣準備接受分析。試件旋轉同時以於4〇千伏 15特/30毫安培操作之x光管照射銅K-«(波長=1.5406埃)。使 用測角器以連續模設定為每0.018度階〇2秒計數,經歷2度 至55度之2Θ角範圍進行分析。峰值係使用布魯克_挪公 司Evaluation軟體選定,具有臨界值為丨及峰寬度〇 3度2@。 資料係於21°C收集。 熟諳技藝人士瞭解下表!内部各個峰之相對強度由於 多項因素而改變,該等因素諸如於χ光束中晶體之取向效 應’或接受分析之材料純度,或試樣之結晶程度。峰位置 也可於試樣高度《變化,但峰位置實質上_如給定之 表中界定。 42 200914618 實例14
4-氟-α -『2-甲某-1-酮基丙基1- r -酮基-N,/g -二茉某笼丁醯 胺之DSC 3· 1Π毫克4-氟-α -[2-甲基_1-酮基丙基]-丫 -酮基_n,/5 -5 二苯基苯丁醯胺使用附有取樣器及4孔側壁通風鋁盤及鋁 蓋附有氮氣流之伯京艾瑪公司(Perkin Elmer)戴蒙(Diamond) DSC,以每分鐘20°C由10°C加熱至25(TC。 實例15
4-氟-α-「2-甲基-1-酮基丙基Ι-y-酮基-N, /3-二笑基笨丁醯 10 胺之 FT-IR 使用裝配有杜拉沙伯(DurasampllR,)單一反射ATR附件 (於硒化鋅基材上之鑽石表面)及d-TGS KBr檢測器之塞莫 尼克(ThermoNicolet)尼塞斯(Nexus) FTIR光度計測得IR光 譜。光譜係以2厘米-1解析度及共同添加256掃描收集。使用 15 HaPP-Genzel變跡法。因FT-IR光譜係使用單一反射ATR記 錄,故未獲得試樣製備品。使用ATRFT-IR將造成紅外光帶 I 之相對強度與使用KBr圓疑或尼久(nujol moll)試樣製備品 之穿透式FT-IR光譜不同。由於ATR-FT-IR之本質,於較低 波數之帶比於較高波數之帶更強。除非另行註明,否則實 20 驗誤差為±2厘米-1。使用ThermoNicolet Omnic 6.0a軟體拾取 峰值。強度分派係與光譜中之主帶相關,因此並非基於距 基準線所測得之絕對質。 實例16 4_-氟-α -「2-甲基-1-酮某丙基1- y -酮基-N, β -二装華y 丁嘴 43 200914618
胺之FT-垃晏TR 拉曼光§晋係使用裝配有1064奈米NdYAG雷射及LN-錯 檢測器之附有Ramil模組FT拉曼光譜儀之布魯克(Bruker)微 特斯(Vertex) 7 0收集拉曼光譜。全部光譜皆使用2厘米-!解析 5 度及Blackman-Harris 4期變跡法記錄。光譜係使用3〇〇毫瓦 及4096共同加成掃描收集。試樣置於玻璃瓶内,暴露於雷 射輻射。資料係以呈拉曼位移(厘米’之函數之強度表示, 且使用得自參考燈之白光譜,對儀器反應及頻率相依性散 射作校準。布魯克拉曼校準函數用來進行校準。(布魯克軟 10體-〇pUS 6·0)。除非另行指示,否則實驗誤差為±2厘米 使用ThermoNicolet Omic 6.0a軟體拾取峰值。強度分派係與 光譜中之主帶相關’因而並非基於距基準線測得之絕對值。 實例17 HR-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-甲基乙某)-N-4-二茉基-1-「2-(四 15 氫-4-麵基-6-酮基-211-°底°南-2-某)乙基1-1H-吨鳴~-3-翔醯胺 如四面體函件’ 2279 (1992)所述製備之50克亞異丙基 第三丁酯(TBIN) ’ 13.25克濕綿鎳催化劑,28%氨溶液(137.5 毫升)及375毫升異丙醇(IPA)添加至加壓容器。混合物以5〇 psi氫氣還原,然後經過濾及於減壓下濃縮。所得油溶解於 20 250毫升溫熱甲苯,以水洗滌及再度於減壓下濃縮獲得胺基 酯。胺基酯,85克4-氟-α-[2-甲基-1-酮基丙基]-γ-酮基 /5-二苯基苯丁醯胺(US Pat· No. 5,155,251 及Bauman Κ丄 Butler D.E·,Deering C.F·等人,四面體函件 1992 ; 33:2283-2284,二參考文件全文以引用方式併入此處),12.5 44 200914618 克特戊酸,137.5毫升四氫。夫喃及137 5毫升己烧類進給至氨 氣惰性氣氛之加壓容器内,容器經密封及加熱至饥㈣ 小時。冷卻後,溶液以400亳升甲基第三丁基哪ΤΒΕ)稀 釋,首先以稀水性氫氧化鈉洗膝,接著以稀水性鹽酸洗蘇。 5然後混合物於減壓下濃縮獲得丙酮化物酯。 丙酮化物醋溶解於275毫升溫熱甲醇,添加水性鹽酸(5 克37%鹽酸於75毫升水)。混合物於坑授掉製造二元醇 酉曰d後100毫升甲基第二丁基趟及水性氫氧化納(15〇毫升 水及25克水性氫氧化鈉)添加至其巾,混合物於3(rc授 掉製造鈉鹽。加入600毫升水,混合物以W5毫升甲基第 三丁基驗洗兩次。 於此種情況下,混合物於大氣壓下蒸餾至机批料溫 度。持續蒸餾至混合物之曱醇含量降至〇 4 w/v。批料於 75-85%攪拌18小時,然後冷卻、酸化及萃取入875毫升甲 15苯。混合物回流加熱4小時,以共沸蒸餾去除水。於冷卻後, 混合物經過濾,以曱苯洗滌及直接乾燥。分離標題化合物, 呈白色固體(產率37.9克)。 實例18 反)-5-(4-氟苯_基^_(1_甲基乙某)_N4_二茉基小!·^^
20 A +羥基-6-酮棊迎-吸喃-2-基)乙某i_ 1H-吡咯-3-錄 之 PXRD 粉末X光繞射圖案係使用裝配有自動化試樣更換器、θ -6»測角器、自動光束發散裂縫及pSD凡鐵克-1檢測器之布 魯克-AXS公司。D4粉末X光繞射以測定粉末X光繞射圖 45 200914618 案:經由將試樣架設於低背景妙晶圓試件座上試樣準備 接,分析。試件旋轉同時以於千伏特/3G毫安培操作之χ 一、‘、、、射銅Κ α (波長= ι_5406埃)。使用測角器以連續模設 5 ^每咖度階0.2秒計數,經歷2度至55度之2Θ角範圍進 5仃分析。峰值係使用布魯克-AXS公司Evaluation軟體選定, 具有臨界值為1及導寬度〇·3度2Θ。資料係於2rc收集。 ,熟諳技藝人士瞭解下表1内部各個峰之相對強度由於 員口素而改受,該等因素諸如於X光束中晶體之取向效 應,或接受分析之材料純度,或試樣之結晶程度。峰位置 也可於试樣高度遷移變化,但峰位置實質上維持如給定之 表中界定。 、、二由使用其他波長所產生之額外PXRD®案被視為本 ^之結晶材料之PXRD圖案之其它代表例,因而亦屬本發 明之範圍。 15實例19 t~~~乙某、K4-二茉某-1-「2-(四 乙某 1-1H-吡咯-3-羧醯胺
^DSC 2 “ 893毫I5式樣使用W有取樣器及4孔側壁通風銘盤及 现附有氮氣流之伯#艾瑪公司戴蒙dsc,以每分鐘2(rc 由l〇°C加熱至3〇〇。〇。 實例20 ^~~~)二基 ι_ 吡略-3-麴醯胺 46 200914618
之 FT-IR 使用裝配有杜拉沙伯(DurasampllR’)單一反射ATR附件 (於硒化鋅基材上之鑽石表面)及d-TGS KBr檢測器之塞莫 尼克(ThermoNicolet)尼塞斯(Nexus) FTIR光度計測得说光 5 5醤。光5普係以2厘采解析度及共同添加256掃描收集。使用
Happ-Genzel變跡法。因FT-IR光譜係使用單一反射ATR纪 錄,故未獲得試樣製備品。使用ATRFT-IR將造成紅外光帶 之相對強度與使用KBr圓錠或尼久摩(nuj〇i moll)試樣事備 品之穿透式FT-IR光譜不同。由於ATR-FT-IR之本質,於較 1〇低波數之帶比於較高波數之帶更強。除非另行註明,否則 實驗誤差為±2厘米―1。使用ThermoNicolet Omnic 6.〇a軟體才入 取峰值。強度分派係與光譜中之主帶相關,因此並非基於 距基準線所測得之絕對質。 實例21 15 反1:5-(4-氟笨基)-2-(1-甲基己羊)_ν·4-二笑 酮基-2Η-哌喃-2-幕)乙某1-1Η-吡吹乂 之FT-相:晏 拉曼光譜係使用裝配有1064奈米NdYAG雷射及Ln錯 檢測器之附有Ramil模組FT拉曼光譜儀之布魯克微特斯 20收集拉曼光譜。全部光譜皆使用2厘米―1解析度及 Blackman-Harris 4期變跡法記錄。光譜係使用3〇〇毫瓦及 4096共同加成掃描收集。試樣置於玻璃瓶内,暴露於雷射 輻射。資料係以呈拉曼位移(厘米-1)之函數之強度表示,且 使用得自參考燈之白光譜,對儀器反應及頻率相依性散射 47 200914618 作校準。布魯克拉曼校準函數用來進行校準。(布魯克軟體 -OPUS 6.0)。除非另行指示,否則實給装墓盔+9际止_丨
譜中之主帶相關,因而並非基於距基準線測得之絕對值 5 實例22 鄰茉二甲醯亞胺縮醛
50.0克鄰苯二曱醯亞胺化鉀(丨當量)於4〇〇毫升(8髀 積)N,N-二曱基甲酿胺於室溫形成為漿液。於室溫於漿液内 10逐滴添加3->臭丙路一曱縮酸54.4克(1.1當量)〇反應維持約15 小時稱作為完成。添加2-曱基四氫呋喃250毫升及水250毫 升及授拌’讓其沉降及分離。水層以1〇〇毫升2-MTHF再洗 兩次,有機層經組合及以70%飽和食鹽水洗務去除水。然 後有機層以硫酸鈉脫水,於大氣壓下蒸餾成為漿液。白色 15 漿液於低溫0-5。(:形成粒化1小時,於紙張覆蓋的难克納漏 斗上過滤及以2-MTHF洗務。白色固體於低於4〇於減歷烤 爐乾综,獲得46.5%產率之標題產物。 實例23 3-鄰苯二甲醯亞胺某丙醛
48 200914618 15.0克鄰苯二甲醯亞胺縮醛〇當量)添加至7〇〇毫升(約 47體積)冰醋酸及70毫升(約5倍體積)水。此反應於室溫至高 達30°C維持48小時,稱作為完成。添加飽和碳酸氫鈉至pH 7,以500毫升2-MTHF萃取,以5〇〇毫升2-MTHF再度萃取。 5然後有機層以硫酸鈉脫水,減壓蒸餾成為漿液。白色漿液 於低溫0-5°C粒化10小時’於經過濾紙覆蓋之布克納漏斗上 過濾及以2-MTHF洗滌。白色固體於真空爐内於室溫乾燥, 獲得47%產率標題產物。 實例24 10 SEQIDNO: 1-DERA03之核菩 g变序列 atgactgatctgaaagcaagcagcctgcgtgcactgaaattgatggacctgaccaccctgaatg acgacgacaccgacgagaaagtgatcgccctgtgtcatcaggccaaaactccggtcggcaat accgccgctatctgtatctatcctcgctttatcccgattgctcgcaaaactctgaaagagcagggc accccggaaatccgtatcgctacggtaaccaacttcccacacggtaacgacgacatcgacatc 15 gcgctggcagaaacccgtgcggcaatcgcctacggtgctgatgaagttgacgttgtgttcccgta ccgcgcgctgatggcgggtaacgagcaggttggttttgacctggtgaaagcctgtaaagaggct tgcgcggcagcgaatgtactgctgaaagtgatcatcgaaaccggcgaactgaaagacgaagc gctgatccgtaaagcgtctgaaatctccatcaaagcgggtgcggacttcatcaaaacctctaccg gtaaagtggctgtgaacgcgacgccggaaagcgcgcgcatcatgatggaagtgatccgtgata 20 tgggcgtagaaaaaaccgttggtttcaaaccggcgggcggcgtgcgtactgcggaagatgcgc agaaatatctcgccattgcagatgaactgttcggtgctgactgggcagatgcgcgtcactaccgc tttggcgcttccagcctgctggcaagcctgctgaaagcgctgggtcacggcgacggtaagagcg ccagcagctactaa 實例25 25 SEQ ID NO: 2-DERA04之核苷酸序列 atgggtaatatcgcgaaaatgattgatcacaccctcttaaaacccgaagcaaccgaacaacaa attgtacaattatgcacggaagcgaaacaatatggctttgcagcagtatgcgtaaatccgacatg ggttaaaaccgccgcacgtgaattaagcgggacagacgttcgtgtgtgtactgtaattggatttcc cttgggcgctacgactccagaaactaaagcattcgaaactactaacgcgattgaaaatggagc 30 acgggaagtagatatggtaattaatattggtgcattgaaatctggacaagatgaactggtggaac gtgatattcgtgccgttgttgaagctgcagcaggccgcgcgcttgtgaaagtaattgtagaaaca gcccttcttactgatgaagaaaaagttcgcgcttgtcaattagcagtaaaagcgggtgccgattat gtgaagacgtcgacaggatttagcggtggtggtgcaacggtggaagatgtggctttaatgcgga 49 200914618 aaacggttggtgatcgtgcaggggtcaaagcaagcggcggagtacgtgactggaaaacagca gaagcaatgattaacgcaggagcaacgcgcattggcacaagttctggagtagcaatcgtaaca ggtggaaccggccgggcagactattaa 實例26 5 SEQ ID NO: 3-DERA06之核苷酸序列 atgggactcgcctcctacatcgaccacacgctgcttaaggccaccgccacgctcgccgacatcc gcacgctgtgtgaggaagcccgcgagcactcgttctacgcggtgtgcatcaacccggtctttatt ccccacgcccgcgcctggctcgaaggcagcgacgtgaaggtcgccaccgtctgcggctttccc ctcggcgccatcagctccgagcagaaagctctggaagcccgcctgagcgccgaaacgggcg 10 ccgacgaaatcgatatggtcatccacatcggctcggcgcttgccggcgactgggacgcggtgg aagccgacgtgcgggcagtgcgccgcgcggtgcccgagcaggtgctcaaggtgattatcgaa acctgctacctgaccgacgagcaaaagcgcttggcgactgaggtcgccgtacagggcggcgc cgacttcgtgaagacgagcacaggcttcggcaccggcggcgccaccgtggacgacgtgcgcc tgatggcggaagtgatcgggggccgcgccggactcaaggcggcgggcggcgtccgcactcct 15 gccgacgcgcaagccatgatcgaggcgggcgcgacccggctgggcacctcgggcggcgtgg gtctggtgtcgggcggcgaaaacggagccggctactga 實例27
SEQ ID NO: 4-DERA08之核苷酸序歹,J atgggaattgctaaaatgatcgatcacactgctttaaaaccagacacaacgaaagaacaaattt 20 taacactaacaaaagaagcaagagaatacggttttgcttccgtatgcgtaaatccaacttgggta aaactatccgctgaacaacttgctggagcagaatctgtagtatgtactgttatcggtttcccactag gagcgaatacccctgaagtaaaagcatttgaagtaaaagatgctatccaaaacggtgcaaaag aagtggatatggttattaatatcggcgcactaaaagacaaagacgacgaactagtagaacgtg atattcgcgctgtagtcgatgctgccaaaggaaaagcattagtaaaagtaattatcgaaacttgc 25 ctattaacagacgaagaaaaagttcgcgcatgtgaaatcgctgtaaaagcgggaacagacttc gttaaaacatccactggattctccacaggtggcgcaactgccgaagatatcgccttaatgcgtaa aactgtaggaccaaacatcggcgtaaaagcatctggtggggttcgtacgaaagaagacgtaga aaaaatgatcgaagcaggcgcaactcgtattggcgcaagtgcaggtgtcgcaattgtttccggc gaaaaaccagccaaaccagataattactaa 30 實例28 SEQ ID NO: 5-DERA11之核苷酸序列 atgacatcaaatcaacttgctcaatatatcgatcacaccgcacttaccgcagaaaaaaatgaac aagatatttcgacactctgtaatgaagcgattgaacacggattttattctgtatgtatcaattctgctt atattccactcgctaaagaaaaacttgctggctcaaatgtaaaaatttgcaccgtagttggattcc 35 ctttgggggcgaatttaacctcagtcaaagcatttgaaacgcaagaatctattaaagcgggtgca aatgaaattgatatggtgattaatgtaggttggataaaatcgcaaaaatgggatgaagtaaaac 50 200914618 aagatattcaagcggtatttaatgcttgtaatggcacgccattaaaagtgattttagaaacttgtttg ctcactaaagatgaaatagtgaaagcctgcgaaatttgtaaagaaatcggtgtagcttttgttaaa acatcaacaggctttaataaaggtggtgcgaccgtagaagatgttgcattgatgaaaaacacgg tcggcaatattggtgttaaagcatcaggtggtgtgcgtgatactgaaactgcacttgcaatgatta 5 aggcgggtgcgactcgcattggtgcaagcgctggcattgcgattattagcggtactcaagacact caaagcacttactaa 實例29 SEQ ID NO·· 6-DERA12之核苷酸序列 atgatagagtacaggattgaggaggcagtagcgaagtacagagagttctacgaattcaagccc 10 gtcagagaaagcgcaggtattgaagatgtgaaaagtgctatagagcacacgaatctgaaacc gtttgccacaccagacgatataaaaaaactctgtcttgaagcaagggaaaatcgtttccatgga gtctgtgtgaatccgtgtlatgtgaaactggctcgtgaagaactcgaaggaaccgatgtgaaagt cgtcaccgttgttggttttccactgggagcgaacgaaactcggacgaaagcccatgaggcgattt tcgctgttgagagtggagccgatgagatcgatatggtcatcaacgttggcatgctcaaggcaaa 15 ggagtgggagtacgtttacgaggatataagaagtgttgtcgaatcggtgaaaggaaaagttgtg aaggtgatcatcgaaacgtgctatctggatacggaagagaagatagcggcgtgtgtcatttcca aacttgctggagctcatttcgtgaagacttccacgggatttggaacaggaggggcgaccgcaga agacgttcatctcatgaaatggatcgtgggagatgagatgggtgtaaaagcttccggagggatc agaaccttcgaggacgctgttaaaatgatcatgtacggtgctgatagaataggaacgagttcgg 20 gagttaagatcgttcaggggggagaagagagatatggaggttga 實例30 SEQ ID NO: 7-DERA15之核苷酸序列 atgccgtcggccagggatatactgcagcagggtctagacaggctagggagccctgaggacctc gcctcgaggatagactctacgctactaagccctagggctacggaggaggacgttaggaatcttg 25 tgagagaggcgtcggactacgggtttagatgcgcggttctgactccagtgtacacagtaaagatt tctgggctggctgagaagcttggtgtgaagctatgtagcgttataggctttcccctgggccaggcc ccgctcgaggtaaagctagttgaggcacaaactgttttagaggctggggctactgagcttgatgtt gtcccccatctctcactaggccccgaagctgtttacagggaggtctcagggatagtgaagttggc gaaaagctatggagccgttgtgaaagtaatattagaagcgccactctgggatgacaaaacgct 30 ctccctcctggtggactcgtcgaggagggcgggggcggatatagtgaagacaagcaccgggg tctatacaaagggtggtgatccagtaacggtcttcaggctggccagtcttgccaagccccttggta tgggtgtaaaggcaagcggcggtataaggagtggcatcgacgccgtcctcgccgtaggagctg gcgcggatatcatagggacaagcagtgctgtaaaggttttggagagcttcaaatccctagtctaa 實例31 35 SEQ ID NO: 8-DERA101 之核苷酸序列 51 200914618 atggctgcaaacaaatatgaaatggccttcgcacagttcgatccagctgaaagcgaagaacgc atcctgctgaaaactgaccagatcattcgtgaccactattcccgtttcgacactccagaaactaa aaagttcctgcatggcgttatcgatctgacgtctctgaacgccaccgactctgaggaatctatcac taaattcaccgaatctgtaaacgatttcgaagataccgacccgactatccctagcgttgcggcga 5 tctgcgtttatccgaactttgtcagcaccgtgcgtgaaaccctgactgccgagaatgtgaaagttg caagcgtcagcggttgcttcccggcctcccagagcttcatcgaagtgaaactggcagaaaccg cactggcggttagcgacggtgcggatgaaattgacattgttctgaacatgggtaaattcctgtccg gtgattacgaggccgcagccactgagatcgaggaacagatcgctgcggcgaagggtgcgacc gtaaaagttatcctggagactggtgctctgaagacgccggaaaacattcgccgcgcaaccatcc 10 tgtctctgttttgtggcgcccatttcgttaaaacctctactggcaaaggctacccgggcgcctctctg gaagcagcttacactatgtgtaaagtcctgaaacagtactacggcctgttcggtgaagttcgtgg catcaagctgagcggcggtatccgtaccaccgaagacgcggttaagtactactgcctgatcgaa acgctgctgggcaaagaatggctgaccccggcgtacttccgcatcggcgcctcctctctggttga tgctctgcgccaggatattatggtttaa 15 實例32 SEQ ID NO: 9-DERA102之核苷酸序列
Atggaactgaaccgcatgattgaccacactattctgaaaccggaagccaccgaggcggctgtg cagaaaattatcgatgaagctaaagaatacaacttcttcagcgtctgtatcaacccgtgttgggtt gcttttgcctccgagcagctggctgatactgatgttgccgtctgtaccgtaatcggtttcccgctggg 20 cgcgaacacgccggaggttaaagcgtacgaagcagctgacgccattaaaaacggtgctaatg aggtggatatggtgatcaatattggtgctctgaaatcccaacagtacgactacgtgcgccaagac atccagggtgtggttgacgccgcaaaaggtaaagcactggttaaagttatcatcgaaactgccct gctgaccgatgaagagaaagttaaggcttgcgaactggcgaaagaagcaggcgctgatttcgt gaaaaccagcaccggtttttccactggcggtgcaaaagttgctgacattcgtctgatgcgcgaaa 25 ccgtgggtccggatatgggcgttaaagcatccggtggcgtacacaacgcagaagaagcactg gccatgatcgaagcgggcgcaactcgtatcggcgcttccaccggtgtagccatcgtaagcggtg ctactggtgagggtaccaaatggtaa 實例33 SEQIDNO: 10-DERA103之核苷酸序列 30 atgactattgaatccgctatcgcgctggcacctgcagaacgtgctgttaacctgattggtagcgac ctgaccgaaaaatctctgaaactgcacctggaaggcctgtctggtgtcgacgcggttggtctgga acagcgtgctgccggtctgtccacccgctctatcaaaaccacctccaaagcttgggccctggac accatcatcaaactgatcgatctgactactctggagggcgcagatactccgggcaaggttcgttc tctggctgcgaaagcaatgctgccggacgcctctgatgtgtccgctccgcaggtggcagctgtgt 35 gcgtttacggtgatatggtgccatacgcggcggaagcactgggctcctcttggtctaatggttctg acaacggcattaacgttgctgcggtggcaactgcgttcccatccggtcgcagctccctgccaatc aaaatcgctgacaccaaggaagccgttgcccacggtgctgacgaaatcgacatggtaatcgat cgtggtgcgttcctgagcggcaaatacggtgttgtgttcgaccagatcgtagctgtgaaagaagc 52 200914618 ttgccgccgcgaaaacggcacttacgcgcacctgaaagttatcctggaaaccggcgaactgaa cacctatgacaacgtccgccgtgcctcctggctggcgatcctggcgggtggtgactttgtgaaaa cctctaccggcaaggttagcccggccgcaaccctgccggttacgctgctgatgctggaagtcgtt cgcgattggcatgtgctgactggcgagaaaatcggtgtgaaaccagccggtggtatccgctcct 5 ccaaagacgcgattaaatacctggtcaccgtggcggaaaccgtaggtgaagagtggctgcaa ccgcacctgtttcgctttggcgcctcctccctgctgaacgacgttctgatgcagcgtcagaagctgt ctaccggccactactccggcccagattacgtgaccatcgactaa 實例34 SEQIDNO: 11-DERA104之核苔酸序列 10 atgtcttctactccaactattctggatccggcgtttgaggacgttacccgttctgaagcatctctgcgc cgtttcctgcacggcctgccgggtgtcgatcaggtgggcgcagaggcccgtgccgctggtctggc aacccgttccattaaaacgtccgcaaaagaatttgcactggacctggcgattcgtatggttgacctg accacgctggagggccaggatacgccgggtaaggttcgtgccctgagcgcgaaagcaatgcgt ccggatccgtctgatccaacctgtcctgctactgctgctgtatgtgtttacccggacatggttggcatc 15 gcgaaacaggcgctgggtactagcggcgtacacgtagctgctgtggctactgctttcccgtctggc cgtgccgctctggacatcaaactggcggacgttcgtgatgcggtggacgcaggcgctgacgaaa tcgatatggttatcgaccgcggtgcttttctggctggtcgttaccaacacgtatacgacgaaattgttg cggtgcgcgaagcctgccgccgtgaaaacggtgaaggcgctcacctgaaggtaatcttcgagac tggtgagctgcagacctacgacaacgttcgccgtgcgagctggctggcgatgatggctggtgcac 20 acttcgttaaaacgtccaccggcaaagtccagccggcagctaccctgccggttaccctggttatgc tgcaggccgtacgtgactttcgtggcgcaacgggccgtatggttggcgttaaacctgctggcggtat ccgtaccgccaaggacgcaatcaaatacctggttatggtaaacgaggtagcgggcgaagattgg ctggacccggactggtttcgttttggtgcatctactctgctgaacgacctgctgatgcagcgtacgaa gatgaaaaccggccgttacagcggcccagactactttaccctggactaa 25 實例35 SEQ ID NO: 12-DERA105之核苷酸序列 atggaactgatcactcagccgtcttgttgggtattttccgtctttttccgccgtcagtacggctggctg gtttttgtggaaggtgcttggtacgatggtcgccgtcaaactttccacctggatggtaacggccgc aaaggcttcctgcgcatgactatgaatatcgcaaaaatgatcgatcacaccctgctgaaaccgg 30 aagcgactgagcagcagatcgtacaactgtgcaccgaagctaaacagtatggttttgcttccgttt gtgtgaaccctacgtgggtgaaaaccgccgcacgcgaactgtctggtaccgacgttcgtgtttgt accgtaattggcttcccgctgggcgcgactaccccagaaaccaaagcgttcgaaactaccaac gcgatcgaaaacggcgctcgtgaagtcgacatggtaatcaacattggcgctctgaaatctggtc aggacgaactggtagagcgtgacatccgcgccgtcgtagaagctgcggcaggccgtgcactg 35 gtaaaagtaatcgttgaaaccgctctgctgactgatgaagagaaagttcgtgcgtgtcagctggc ggttaaagctggtgcagattacgtgaaaacgagcactggtttctccggtggtggcgctactgtcg aagacgtggcgctgatgcgtaaaaccgtaggcgatcgcgcaggcgttaaagcgagcggcggt gttcgtgattggaagactgccgaagctatgattaacgcaggcgcgactcgtatcggcacttctag cggcgtggcaattgttactggcggcaccggtcgcgctgacactaaatggtaa 53 200914618 實例36 SEQ ID NO: 13-DERA106之核苔酸序列 atgactatcgctaaaatgattgatcacacggcgctgaagccagataccaccaaagaacaaatc ctgacgctgaccaaagaagcacgtgaatatggctttgctagcgtctgtgtgaatccgacttgggt 5 gaaactgtctgcggaacagctgagcggcgctgaatctgtggtgtgcaccgtcatcggttttccgct gggcgcgaatactccggaagtgaaggcattcgaagtaaaaaacgctatcgaaaacggcgcg aaggaagtagatatggttatcaacattggtgctctgaaggataaggacgacgaactggtggaac gtgatatccgtgccgtcgtggatgctgctaaaggtaaagcgctggtgaaagtcattatcgaaacc tgcctgctgaccgatgaagagaaggtccgtgcttgcgaaatcgccgtgaaagctggcactgattt 10 cgttaaaacttctactggcttttctactggtggcgcgactgcagaagacatcgcactgatgcgtaa gactgtcggtccgaacatcggtgtaaaagcgtccggtggtgttcgtactaaagaagacgttgag aagatgatcgaagcgggtgccacccgtatcggcgcttctgcaggtgtggcaatcgtatccggtg aaaaaccggcgaaacctgacaacaccaagtggtaa 實例37 15 SEQIDNO: 14-DERA 107之核苷酸序列 atgtctcgctctattgcacaaatgatcgatcacaccctgctgaaacctaataccaccgaagacca gatcgtgaaactgtgcgaagaggctaaagaatactctttcgcctccgtatgcgtcaacccaacgt gggtcgcgctggcagcgcagctgctgaaagacgctcctgatgtgaaagtgtgcactgttatcgg cttcccactgggtgcaaccacgcctgaagtaaaagcgtttgaaaccactaacgcaatcgagaa 20 cggcgcaacggaggttgatatggttatcaacatcggtgccctgaaggacaaacagtacgaact ggttggtcgtgatatccaggctgttgtgaaggcagcagaaggcaaagccctgaccaaagtgatt atcgaaacctccctgctgaccgaagaagaaaagaaggcggcttgtgaactggcggtaaaagc aggtgctgatttcgtcaaaacgtctaccggtttctctggtggcggtgcaaccgcagaagacattgc cctgatgcgtaaggttgttggtcctaacctgggcgttaaggccagcggcggtgtgcgtgacctgtc 25 tgacgcgaaggcgatgattgacgcgggcgcgactcgtatcggcgcttccgcaggtgttgcgatc gttaatggtgaacgctctgaaggttccacgaaatggaccgcagctggtgcggcgacgacgtgc gcttgtacgggcggctaa 實例38 SEQ ID NO: 15-DERA 108之核苷酸序列 30 atgaaactgaacaaatacatcgatcacaccatcctgaaaccggaaacgactcaggaacaggt ggagaaaatcctggctgaagcgaaagaatacgatttcgcgtccgtctgcgttaacccgacgtgg gtagctctggcagctgaaagcctgaaagatagcgacgtcaaagtctgcactgtcatcggcttcc cgctgggcgctaacactccggcagtgaaggcgttcgaaactaaagacgctattagcaacggcg cggatgaaatcgacatggtgattaacatcggcgcactgaaaacgggtaactacgatctggttct 35 ggaagatattaaggctgtcgttgcagcaagcggcgataaactggtaaaggtaatcatcgaagc gtgcctgctgaccgacgatgaaaaggttaaagcgtgccagctgtctcaggaagcgggcgctga 54 200914618 ctacgtcaagacgagcactggcttctctaccggcggtgcgacggtcgcagatgttgctctgatgc gtaaaactgttggcccggacatgggcgtaaaagcgtctggcggtgcgcgctcttacgaagacg ctatcgcgttcattgaagctggcgcaagccgtattggcgccagctctggcgtggcgatcatgaat ggtgcgcaggctgatggcgacaccaagtggtaa 5 實例39 SEQIDNO: 16-DERA03之胺基酸序列
Mtdlkassiralklmdlttlndddtdekvialchqaktpvgntaaiciy ' prfipiarktlkeqgtpeiriatvtnfphgnddidialaetraaiayga devdvvfpyralmagneqvgfdlvkackea caaanvllkviietgelkd " 10 ealirkaseisikagadfiktstgkvavnatpesarimmevirdmgvek tvgfkpaggvrtaedaqkylaiadelfgadwadarhyrfgassllasll kalghgdgkrsassy. 實例40 SEQIDNO: 17-DERA04之胺基酸序列 15 Mgniakmidhtllkpeateqqivqlcteakqygfaavcvnptwvktaar elsgtdvrvctvigfplgattpet kafettnaiengarevdmvinigal ksgqdelverdiravveaaagralvkvivetalltdeekvracqlavka gadyvktstgf sgggatvedvalmrktvgdragvkasggvrdwktaeam inagatrigtssgvaivtggtgrady. 20 實例41 SEQIDNO: 18-DERA06之胺基酸序列
Mglasyidhtllkatatladirtlceearehsfyavcinpvfipharaw legsdvkvatvcgfplgaisseqkalearlsaetgadeidmvihigsal agdwdaveadvravrravpeqvlkviietcyltdeqkrlatevavqgga 25 dfvktstgfgtggatvddvrlmaeviggraglkaaggvrtpadaqamie agatrlgtsggvglvsggengagy. 實例42 SEQIDNO: 19-DERA08之胺基酸序列
Mgiakmidhtalkpdttkeqiltltkeareygfasvcvnptwvklsaeq 30 lagaesvvctvigfplgantpevkafevkdaiqnga kevdmvinigalk dkddelverdiravvdaakgkalvkviietclltdeekvraceiavkag tdfvktstgfstggataedialmrktvgpnigvkasggvrt kedvekmi 55 200914618 eagatrigasagvaivsgekpakpdny. 實例43 SEQ ID NO: 20-DERA11之胺基酸序列
Mtsnqlaqyidhtaltaekneqdistlcneaiehgfysvcinsayipla 5 keklagsnvkictvvgfplganltsvkafetqesi kaganeidmvinvg wiksqkwdevkqdiqavfnacngtplkviletclltkdeivkaceicke igvafvktstgfnkggatvedvalmkntvgnigvkasggvrdtetalam ikagatrigasagiaiisgtqdtqsty. 實例44 10 SEQ ID NO:21_DERA12之胺基酸序列
Mieyrieeavakyrefyefkpvresagiedvksaiehtnlkpfatpddi kklclearenrfhgvcvnpcyvklareelegtdvkvvtvvgfplganet rtkaheai favesgadeidmvinvgmlkakeweyvyedirsvvesvkgk vvkviietcyldteekiaacvisklagahfvktstgfgtggataedvhl 15 mkwivgdemgvkasggirtfedavkmimygadrigts sgvkivqggeer ygg· 實例45 SEQ ID NO:22-DERA15之胺基酸序列
Mpsardilqqgldrlgspedlasridstil sprateedvrnlvreasdy 20 gfrcavltpvytvkisglaeklgvklcsvigfplgqaplevklveaqtv leagateldvvphlslgpeavyrevsgivklaksygavvkvileaplwd dktlsllvdssrragadivktstgvytkggdpvtvfrlaslakplgmgv kasggirsgidavlavgagadiigtssavkvlesfkslv. 實例46 25 SEQ ID NO:23-DERA101 之胺基酸序列 maankyemafaqfdpaeseerillktdqiirdhysrfdtpetkkflhgv idltslnatdseesitkftesvndfedtdptipsvaaicvypnfvstvr etltaenvkvasvsgcfpasqs fievklaetalavsdgadeidivlnmg kflsgdyeaaateieeqiaaakgatvkviletgalktpenirratilsl 30 fcgahfvktstgkgypgasleaaytmckvlkqyyglfgevrgiklsggi rttedavkyyclietllgkewltpayfrigasslvdalrqdimv. 56 200914618 實例47 SEQ ID NO:24-DERA102之胺基酸序列 melnrmi dht ilkpeateaavqkiideakeynffsvcinpcwvafaseq ladtdvavctvigfplgantpevkayeaadaiknganevdmvinigalk 5 sqqydyvrqdiqgvvdaakgkalvkviietalltdeekvkacelakeag adfvktstgfstgga kvadirImretvgpdmgvkasggvhnaeealami eagatrigastgvaivsgatgegtkw, 實例48 SEQ ID NO:25-DERA103之胺基酸序列 10 mtiesaialapaeravnligsdltekslklhleglsgvdavgleqraag lstrsikttskawaldtiiklidlttlegadtpgkvrslaakamlpdas dvsapqvaavcvygdmvpyaaealgs swsngsdnginvaavatafpsgr sslpikiadtkeavahgadeidmvidrgaflsgkygvvfdqivavkeac rrengtyahlkviletgelntydnvrraswlailaggdfvktstgkvsp 15 aatIpvtllmlevvrdwhvltgekigvkpaggirsskdaikylvtvaet vgeewlqphlfrfgassllndvlmqrqklstghysgpdyvtid. 實例49 SEQ ID NO’.26-DERA104之胺基酸序列 msstptildpafedvtrseaslrrflhglpgvdqvgaearaaglatrsi 20 ktsakefaldlairmvdlttlegqdtpgkvralsakamrpdpsdptcpa taavcvypdmvgiakqalgtsgvhvaavatafpsgraaldikladvrda vdagadeidmvidrgaflagryqhvydeivavreacrrengegahlkvi fetgelqtydnvrraswlammagahfvktstgkvqpaatlpvt1vmlqa vrdfrgatgrmvgvkpaggirtakdaiky1vmvnevagedwldpdwf rf 25 gastllndllmqrt kmktgrysgpdyftld. 實例50 SEQ ID NO: 27-DERA105之胺基酸序列 melitqpscwvf svf frrqygwlvfvegawydgrrqtfhldgngrkgf1 rmtmniakmidht11kpeateqqivqlcteakqygfasvcvnptwvkta 30 arelsgtdvrvetvigfplgattpet kafettnaiengarevdmvinig alksgqdelverdiravveaaagralvkvivetalltdeekvracqlav kagadyvktstgfsgggatvedvalmrktvgdragvkasggvrdwktae aminagatrigtssgvaivtggtgradtkw. 57 200914618 實例51 SEQ ID NO:28-DERA106之胺基酸序列 mtiakmidhtalkpdttkeqiltltkeareygfasvcvnptwvklsaeq lsgaesvvctvigfplgantpevkafevkna i enga kevdmvi ni ga1k 5 dkddelverdiravvdaakgkalvkviietclltdeekvraceiavkag tdfvktstgfstggataedialmrktvgpnigvkasggvrtkedve kmi eagatrigasagvaivsgekpakpdntkw. 實例52
SEQ ID NO:29-DERA107之胺基酸序歹|J 10 msrsiaqmidhtllkpnttedqivklceeakeysfasvcvnptwvalaa qllkdapdvkvctvigfplgattpevkafettnaiengatevdmvinig alkdkqyelvgrdiqavvkaaegkaltkviietsllteeekkaacelav kagadfvktstgfsgggataedialmrkvvgpnlgvkasggvrdlsdak amidagatrigasagvaivngersegstkwtaagaattcactgg. 15 實例53 SEQ ID N0:30-DERA108之胺基酸序列 mklnkyidhtilkpe11qeqve ki1aea keydfasvcvnptwva1aaes lkdsdvkvctvigfpigantpavkafet kdai sngadeidmvinigalk tgnydlvledikavvaasgdklvkviieaclltddekvkacqlsqeaga 20 dyvktstgfstggatvadvalmr ktvgpdmgvka sggars yeda i af ie agasrigassgvaimngaqadgdtkw. 本案引用之全部公開文獻包括但非限於已核發之專利 案、專利申請案及期刊文章,全文以引用方式併入此處。 雖然前文已經參照所揭示之實施例說明本發明,但熟 25諳技藝人士方便瞭解特定實驗例細節僅供舉例說明本發明 之用。如此本發明僅受隨附之申請專利範圍所限。 【圖式簡單說明】 第1圖為4Ια·[2-曱基-1-酮基丙基]个酮基-N,/S-二 苯基苯丁醯胺之實驗性粉末χ光繞射圖案“黃座標刻度為度 58 200914618 2-0。縱座標為計數強度。 第2圖為4-氟-α-[2-曱基-1-酮基丙基]-酮基-Ν,/3·二 苯基苯丁醯胺之差動掃描量熱術(D S C)之溫度描記圖。 第3Α圖及第3Β圖為4-氟-α -[2-甲基-1-酮基丙基]-γ -5 酮基-N,/S-二苯基苯丁醢胺之紅外線(FTIR)光譜。 第4A圖及第4B圖為4-氟-α -[2-曱基-1-酮基丙基]-γ -酮基-N,/3-二苯基苯丁醯胺之拉曼光譜。 第5圖為(2R-反)-5-(4-氟苯基)-2-(1-曱基乙基)-N,4-二 苯基-1-[2-(四氫-4-羥基-6-酮基-2H-。底喃-2-基)乙基]-1H-吡 10 咯-3-羧醯胺之實驗性粉末X光繞射圖案。橫座標刻度為度 2-0。縱座標為計數強度。 第6圖為4-氟-α -[2-甲基-1-酮基丙基]-r -酮基-N, τ -二 苯基苯丁醯胺之差動掃描量熱術(DSC)之溫度描記圖。 第7A圖及第7B圖為4-氟-α -[2-曱基-1-酮基丙基]-r -15 酮基-N,/3-二苯基苯丁醯胺之紅外線(FTIR)光譜。 第8A圖及第8B圖為4-氟-[2-甲基-1-酮基丙基]-τ -酮基-N,y5-二苯基苯丁醯胺之拉曼光譜。 【主要元件符號說明】 (無) 59 200914618 序列表 <110〉 Pfizer Inc:
Bauer, David W O'Nei11, Padraig M.
Watson, Timothy J.
Hu, Shanghui <120>製備掌性化合物的方法
<130> PC33600A <150〉 60/953,725 <151〉 2007-08-03 <160〉 30 <170> Patentln version 3.5
<210〉 1 <211> 780 <212> DNA <213〉大腸桿菌 Escherichia coli <400〉 1 atgactgatc tgaaagcaag cagcctgcgt gcactgaaat tgatggacct gaccaccctg 60 aatgacgacg acaccgacga gaaagtgatc gccctgtgtc atcaggccaa aactccggtc 120 ggcaataccg ccgctatctg tatctatcct cgctttatcc cgattgctcg caaaactctg 180 aaagagcagg gcaccccgga aatccgtatc gctacggtaa ccaacttccc acacggtaac 240 gacgacatcg acatcgcgct ggcagaaacc cgtgcggcaa tcgcctacgg tgctgatgaa 300 gttgacgttg tgttcccgta ccgcgcgctg atggcgggta acgagcaggt tggttttgac 360 ctggtgaaag cctgtaaaga ggcttgcgcg gcagcgaatg tactgctgaa agtgatcatc 420 gaaaccggcg aactgaaaga cgaagcgctg atccgtaaag cgtctgaaat ctccatcaaa 480 gcgggtgcgg acttcatcaa aacctctacc ggtaaagtgg ctgtgaacgc gacgccggaa 540 agcgcgcgca tcatgatgga agtgatccgt gatatgggcg tagaaaaaac cgttggtttc 600 aaaccggcgg gcggcgtgcg tactgcggaa gatgcgcaga aatatctcgc cattgcagat 660 gaactgttcg gtgctgactg ggcagatgcg cgtcactacc gctttggcgc ttccagcctg 720 ctggcaagcc tgctgaaagc gctgggtcac ggcgacggta agagcgccag cagctactaa 780 <210> 2 <211> 669 <212> DNA <213〉人造序列 <220〉 <223>分離自環境樣本之隨機DNA <400〉 2 atgggtaata tcgcgaaaat gattgatcac accctcttaa aacccgaagc aaccgaacaa 60 1 200914618 caaattgtac aattatgcac ggaagcgaaa caatatggct ttgcagcagt atgcgtaaat 120 ccgacatggg ttaaaaccgc cgcacgtgaa ttaagcggga cagacgttcg tgtgtgtact 180 gtaat tggat ttcccttggg cgctacgact ccagaaacta aagcattcga aactactaac 240 gcgattgaaa atggagcacg ggaagtagat atggtaatta atattggtgc attgaaatct 300 ggacaagatg aactggtgga acgtgatatt cgtgccgttg ttgaagctgc agcaggccgc 360 gcgcttgtga aagtaattgt agaaacagcc cttcttactg atgaagaaaa agttcgcgct 420 tgtcaattag cagtaaaagc gggtgccgat tatgtgaaga cgtcgacagg atttagcggt 480 ggtggtgcaa cggtggaaga tgtggcttta atgcggaaaa cggttggtga tcgtgcaggg 540 gtcaaagcaa gcggcggagt acgtgactgg aaaacagcag aagcaatgat taacgcagga 600 gcaacgcgca ttggcacaag ttctggagta gcaatcgtaa caggtggaac cggccgggca 660 gactattaa 669
<210〉 3 <211〉 663 <212> DNA <213〉 Deinococcus radiodurans <400〉 3 atgggactcg cctcctacat cgaccacacg ctgcttaagg ccaccgccac gctcgccgac 60 atccgcacgc tgtgtgagga agcccgcgag cactcgttct acgcggtgtg catcaacccg 120 gtctttattc cccacgcccg cgcctggctc gaaggcagcg acgtgaaggt cgccaccgtc 180 tgcggctttc ccctcggcgc catcagctcc gagcagaaag ctctggaagc ccgcctgagc 240 gccgaaacgg gcgccgacga aatcgatatg gtcatccaca tcggctcggc gcttgccggc 300 gactgggacg cggtggaagc cgacgtgcgg gcagtgcgcc gcgcggtgcc cgagcaggtg 360 ctcaaggtga ttatcgaaac ctgctacctg accgacgagc aaaagcgctt ggcgactgag 420 gtcgccgtac agggcggcgc cgacttcgtg aagacgagca caggcttcgg caccggcggc 480 gccaccgtgg acgacgtgcg cctgatggcg gaagtgatcg ggggccgcgc cggactcaag 540 gcggcgggcg gcgtccgcac tcctgccgac gcgcaagcca tgatcgaggc gggcgcgacc 600 cggctgggca cctcgggcgg cgtgggtctg gtgtcgggcg gcgaaaacgg agccggctac 660 tga 663
<210〉 4 <211〉 672 <212> DNA <213〉單胞生成性李斯特氏菌Listeria monocytogenes <400〉 4 atgggaattg ctaaaatgat cgatcacact gctttaaaac cagacacaac gaaagaacaa 60 2 200914618 at11taacac taacaaaaga agcaagagaa tacggttttg cttccgtatg cgtaaatcca 120 acttgggtaa aactatccgc tgaacaactt gctggagcag aatctgtagt atgtactgtt 180 atcggtttcc cactaggagc gaatacccct gaagtaaaag catttgaagt aaaagatgct 240 atccaaaacg gtgcaaaaga agtggatatg gttattaata tcggcgcact aaaagacaaa 300 gacgacgaac tagtagaacg tgatattcgc gctgtagtcg atgctgccaa aggaaaagca 360 ttagtaaaag taattatcga aacttgccta ttaacagacg aagaaaaagt tcgcgcatgt 420 gaaatcgctg taaaagcggg aacagacttc gttaaaacat ccactggatt ctccacaggt 480 ggcgcaactg ccgaagatat cgccttaatg cgtaaaactg taggaccaaa catcggcgta 540 aaagcatctg gtggggttcg tacgaaagaa gacgtagaaa aaatgatcga agcaggcgca 600 actcgtattg gcgcaagtgc aggtgtcgca attgtttccg gcgaaaaacc agccaaacca 660 gataattact aa 672 <210〉 5 <211> 672 <212> DNA <213〉流行性感冒嗜血桿菌Haemophilus influenzae <400> 5 atgacatcaa atcaacttgc tcaatatatc gatcacaccg cacttaccgc agaaaaaaat 60 gaacaagata tttcgacact ctgtaatgaa gcgattgaac acggatttta ttctgtatgt 120 atcaattctg cttatattcc actcgctaaa gaaaaacttg ctggctcaaa tgtaaaaatt 180 tgcaccgtag ttggattccc tttgggggcg aatttaacct cagtcaaagc atttgaaacg 240 caagaatcta ttaaagcggg tgcaaatgaa attgatatgg tgattaatgt aggttggata 300 aaatcgcaaa aatgggatga agtaaaacaa gatattcaag cggtatttaa tgcttgtaat 360 ggcacgccat taaaagtgat tttagaaact tgtttgctca ctaaagatga aatagtgaaa 420 gcctgcgaaa 11tgtaaaga aatcggtgta gcttttgtta aaacatcaac aggctttaat 480 aaaggtggtg cgaccgtaga agatgttgca ttgatgaaaa acacggtcgg caatattggt 540 gttaaagcat caggtggtgt gcgtgatact gaaactgcac ttgcaatgat taaggcgggt 600 gcgactcgca ttggtgcaag cgctggcatt gcgattatta gcggtactca agacactcaa 660 agcacttact aa 672
<210〉 6 <211> 747 <212> DNA <213> Thermotoga maritima <400〉 6 atgatagagt acaggattga ggaggcagta gcgaagtaca gagagttcta cgaattcaag 60 3 200914618 cccgtcagag aaagcgcagg tattgaagat gtgaaaagtg ctatagagca cacgaatctg 120 aaaccgtttg ccacaccaga cgatataaaa aaactctgtc ttgaagcaag ggaaaatcgt 180 ttccatggag tctgtgtgaa tccgtgttat gtgaaactgg ctcgtgaaga actcgaagga 240 accgatgtga aagtcgtcac cgttgttggt tttccactgg gagcgaacga aactcggacg 300 aaagcccatg aggcgatttt cgctgttgag agtggagccg atgagatcga tatggtcatc 360 aacgttggca tgctcaaggc aaaggagtgg gagtacgttt acgaggatat aagaagtgtt 420 gtcgaatcgg tgaaaggaaa agttgtgaag gtgatcatcg aaacgtgcta tctggatacg 480 gaagagaaga tagcggcgtg tgtcatttcc aaacttgctg gagctcattt cgtgaagact 540 tccacgggat ttggaacagg aggggcgacc gcagaagacg ttcatctcat gaaatggatc 600 gtgggagatg agatgggtgt aaaagcttcc ggagggatca gaaccttcga ggacgctgtt 660 aaaatgatca tgtacggtgc tgatagaata ggaacgagtt cgggagttaa gatcgttcag 720 gggggagaag agagatatgg aggttga 747
<210〉 7 <211> 708 <212> DNA <213〉半月形產氣腺菌Aeropyrumpernix <400> 7 atgccgtcgg ccagggatat actgcagcag ggtctagaca ggctagggag ccctgaggac 60 ctcgcctcga ggatagactc tacgctacta agccctaggg ctacggagga ggacgttagg 120 aatcttgtga gagaggcgtc ggactacggg tttagatgcg cggttctgac tccagtgtac 180 acagtaaaga tttctgggct ggctgagaag cttggtgtga agctatgtag cgttataggc 240 tttcccctgg gccaggcccc gctcgaggta aagctagttg aggcacaaac tgttttagag 300 gctggggcta ctgagcttga tgttgtcccc catctctcac taggccccga agctgtttac 360 agggaggtct cagggatagt gaagttggcg aaaagctatg gagccgttgt gaaagtaata 420 ttagaagcgc cactctggga tgacaaaacg ctctccctcc tggtggactc gtcgaggagg 480 gcgggggcgg atatagtgaa gacaagcacc ggggtctata caaagggtgg tgatccagta 540 acggtcttca ggctggccag tcttgccaag ccccttggta tgggtgtaaa ggcaagcggc 600 ggtataagga gtggcatcga cgccgtcctc gccgtaggag ctggcgcgga tatcataggg 660 acaagcagtg ctgtaaaggt tttggagagc ttcaaatccc tagtctaa 708
<210〉 8 <211> 870 <212> DNA <213〉牙周病菌 Porphyromonas gingival is 4 200914618 <400> 8 atggctgcaa acaaatatga aatggccttc gcacagttcg atccagctga aagcgaagaa 60 cgcatcctgc tgaaaactga ccagatcatt cgtgaccact attcccgttt cgacactcca 120 gaaactaaaa agttcctgca tggcgttatc gatctgacgt ctctgaacgc caccgactct 180 gaggaatcta tcactaaatt caccgaatct gtaaacgatt tcgaagatac cgacccgact 240 atccctagcg ttgcggcgat ctgcgtttat ccgaactttg tcagcaccgt gcgtgaaacc 300 ctgactgccg agaatgtgaa agttgcaagc gtcagcggtt gcttcccggc ctcccagagc 360 ttcatcgaag tgaaactggc agaaaccgca ctggcggtta gcgacggtgc ggatgaaatt 420 gacattgttc tgaacatggg taaattcctg tccggtgatt acgaggccgc agccactgag 480 atcgaggaac agatcgctgc ggcgaagggt gcgaccgtaa aagttatcct ggagactggt 540 gctctgaaga cgccggaaaa cattcgccgc gcaaccatcc tgtctctgtt ttgtggcgcc 600 catttcgtta aaacctctac tggcaaaggc tacccgggcg cctctctgga agcagcttac 660 actatgtgta aagtcctgaa acagtactac ggcctgttcg gtgaagttcg tggcatcaag 720 ctgagcggcg gtatccgtac caccgaagac gcggttaagt actactgcct gatcgaaacg 780 ctgctgggca aagaatggct gaccccggcg tacttccgca tcggcgcctc ctctctggtt 840 gatgctctgc gccaggatat tatggtttaa 870 <210〉 9 <211〉 669 <212〉 DNA + <213> 糞腸球菌 Enterococcus faecalis <400〉 9 atggaactga accgcatgat tgaccacact attctgaaac cggaagccac cgaggcggct 60 gtgcagaaaa ttatcgatga agctaaagaa tacaacttct tcagcgtctg tatcaacccg 120 tgttgggttg cttttgcctc cgagcagctg gctgatactg atgttgccgt ctgtaccgta 180 atcggtttcc cgctgggcgc gaacacgccg gaggttaaag cgtacgaagc agctgacgcc 240 attaaaaacg gtgctaatga ggtggatatg gtgatcaata ttggtgctct gaaatcccaa 300 cagtacgact acgtgcgcca agacatccag ggtgtggttg acgccgcaaa aggtaaagca 360 ctggttaaag ttatcatcga aactgccctg ctgaccgatg aagagaaagt taaggcttgc 420 gaactggcga aagaagcagg cgctgatttc gtgaaaacca gcaccggttt ttccactggc 480 ggtgcaaaag ttgctgacat tcgtctgatg cgcgaaaccg tgggtccgga tatgggcgtt 540 aaagcatccg gtggcgtaca caacgcagaa gaagcactgg ccatgatcga agcgggcgca 600 actcgtatcg gcgcttccac cggtgtagcc atcgtaagcg gtgctactgg tgagggtacc 660 aaatggtaa 669 5 200914618 <210〉 10 <211> 1014 <212〉 DNA, + <213〉海洋放線菌 marine actinobacterium <400> 10 atgactattg aatccgctat cgcgctggca cctgcagaac gtgctgttaa cctgattggt 60 agcgacctga ccgaaaaatc tctgaaactg cacctggaag gcctgtctgg tgtcgacgcg 120 gttggtctgg aacagcgtgc tgccggtctg tccacccgct ctatcaaaac cacctccaaa 180 gcttgggccc tggacaccat catcaaactg atcgatctga ctactctgga gggcgcagat 240 actccgggca aggttcgttc tctggctgcg aaagcaatgc tgccggacgc ctctgatgtg 300 tccgctccgc aggtggcagc tgtgtgcgtt tacggtgata tggtgccata cgcggcggaa 360 gcactgggct cctcttggtc taatggttct gacaacggca ttaacgttgc tgcggtggca 420 actgcgttcc catccggtcg cagctccctg ccaatcaaaa tcgctgacac caaggaagcc 480 gttgcccacg gtgctgacga aatcgacatg gtaatcgatc gtggtgcgtt cctgagcggc 540 aaatacggtg ttgtgttcga ccagatcgta gctgtgaaag aagcttgccg ccgcgaaaac 600 ggcacttacg cgcacctgaa agttatcctg gaaaccggcg aactgaacac ctatgacaac 660 gtccgccgtg cctcctggct ggcgatcctg gcgggtggtg actttgtgaa aacctctacc 720 ggcaaggtta gcccggccgc aaccctgccg gttacgctgc tgatgctgga agtcgttcgc 780 gattggcatg tgctgactgg cgagaaaatc ggtgtgaaac cagccggtgg tatccgctcc 840 tccaaagacg cgattaaata cctggtcacc gtggcggaaa ccgtaggtga agagtggctg 900 caaccgcacc tgtttcgctt tggcgcctcc tccctgctga acgacgttct gatgcagcgt 960 cagaagctgt ctaccggcca ctactccggc ccagattacg tgaccatcga ctaa 1014 <210〉 11 <211〉 975 <212> DNA ^ <213〉諾氏菌屬 Nocardioides species <400> 11 atgtcttcta ctccaactat tctggatccg gcgtttgagg acgttacccg ttctgaagca 60 tctctgcgcc gtttcctgca cggcctgccg ggtgtcgatc aggtgggcgc agaggcccgt 120 gccgctggtc tggcaacccg ttccattaaa acgtccgcaa aagaatttgc actggacctg 180 gcgattcgta tggttgacct gaccacgctg gagggccagg atacgccggg taaggttcgt 240 gccctgagcg cgaaagcaat gcgtccggat ccgtctgatc caacctgtcc tgctactgct 300 gctgtatgtg tttacccgga catggttggc atcgcgaaac aggcgctggg tactagcggc 360 gtacacgtag ctgctgtggc tactgctttc ccgtctggcc gtgccgctct ggacatcaaa 420 6 200914618 ctggcggacg ttcgtgatgc ggtggacgca ggcgctgacg aaatcgatat ggttatcgac 480 cgcggtgctt ttctggctgg tcgttaccaa cacgtatacg acgaaattgt tgcggtgcgc 540 gaagcctgcc gccgtgaaaa cggtgaaggc gctcacctga aggtaatctt cgagactggt 600 gagctgcaga cctacgacaa cgttcgccgt gcgagctggc tggcgatgat ggctggtgca 660 cacttcgtta aaacgtccac cggcaaagtc cagccggcag ctaccctgcc ggttaccctg 720 gttatgctgc aggccgtacg tgactttcgt ggcgcaacgg gccgtatggt tggcgttaaa 780 cctgctggcg gtatccgtac cgccaaggac gcaatcaaat acctggttat ggtaaacgag 840 gtagcgggcg aagattggct ggacccggac tggtttcgtt ttggtgcatc tactctgctg 900 aacgacctgc tgatgcagcg tacgaagatg aaaaccggcc gttacagcgg cccagactac 960 tttaccctgg actaa 975
<210〉 12 <211> 828 <212> DNA <213> Geobacillus kaustophilus <400> 12 atggaactga tcactcagcc gtcttgttgg gtattttccg tctttttccg ccgtcagtac 60 ggctggctgg tttttgtgga aggtgcttgg tacgatggtc gccgtcaaac tttccacctg 120 gatggtaacg gccgcaaagg cttcctgcgc atgactatga atatcgcaaa aatgatcgat 180 cacaccctgc tgaaaccgga agcgactgag cagcagatcg tacaactgtg caccgaagct 240 aaacagtatg gttttgcttc cgtttgtgtg aaccctacgt gggtgaaaac cgccgcacgc 300 gaactgtctg gtaccgacgt tcgtgtttgt accgtaattg gcttcccgct gggcgcgact 360 accccagaaa ccaaagcgtt cgaaactacc aacgcgatcg aaaacggcgc tcgtgaagtc 420 gacatggtaa tcaacattgg cgctctgaaa tctggtcagg acgaactggt agagcgtgac 480 atccgcgccg tcgtagaagc tgcggcaggc cgtgcactgg taaaagtaat cgttgaaacc 540 gctctgctga ctgatgaaga gaaagttcgt gcgtgtcagc tggcggttaa agctggtgca 600 gattacgtga aaacgagcac tggtttctcc ggtggtggcg ctactgtcga agacgtggcg 660 ctgatgcgta aaaccgtagg cgatcgcgca ggcgttaaag cgagcggcgg tgttcgtgat 720 tggaagactg ccgaagctat gattaacgca ggcgcgactc gtatcggcac ttctagcggc 780 gtggcaattg ttactggcgg caccggtcgc gctgacacta aatggtaa 828
<210〉 13 <211> 678 <212> DNA <2Ϊ3>接種李斯特氏菌Listeria innocua <400> 13 7 200914618 atgactatcg ctaaaatgat tgatcacacg gcgctgaagc cagataccac caaagaacaa atcctgacgc tgaccaaaga agcacgtgaa tatggctttg ctagcgtctg tgtgaatccg acttgggtga aactgtctgc ggaacagctg agcggcgctg aatctgtggt gtgcaccgtc atcggttttc cgctgggcgc gaatactccg gaagtgaagg cattcgaagt aaaaaacgct atcgaaaacg gcgcgaagga agtagatatg gttatcaaca ttggtgctct gaaggataag gacgacgaac tggtggaacg tgatatccgt gccgtcgtgg atgctgctaa aggtaaagcg ctggtgaaag tcattatcga aacctgcctg ctgaccgatg aagagaaggt ccgtgcttgc . gaaatcgccg tgaaagctgg cactgatttc gttaaaactt ctactggctt ttctactggt - ggcgcgactg cagaagacat cgcactgatg cgtaagactg tcggtccgaa catcggtgta aaagcgtccg gtggtgttcg tactaaagaa gacgttgaga agatgatcga agcgggtgcc acccgtatcg gcgcttctgc aggtgtggca atcgtatccg gtgaaaaacc ggcgaaacct gacaacacca agtggtaa
<210〉 14 <211> 723 <212> DNA <213〉嗜鹽芽孢桿菌 Bacillus halodurans <400〉 14 atgtctcgct ctattgcaca aatgatcgat cacaccctgc tgaaacctaa taccaccgaa gaccagatcg tgaaactgtg cgaagaggct aaagaatact ctttcgcctc cgtatgcgtc aacccaacgt gggtcgcgct ggcagcgcag ctgctgaaag acgctcctga tgtgaaagtg tgcactgtta tcggcttccc actgggtgca accacgcctg aagtaaaagc gtttgaaacc actaacgcaa tcgagaacgg cgcaacggag gttgatatgg ttatcaacat cggtgccctg ^ aaggacaaac agtacgaact ggttggtcgt gatatccagg ctgttgtgaa ggcagcagaa - ggcaaagccc tgaccaaagt gattatcgaa acctccctgc tgaccgaaga agaaaagaag gcggcttgtg aactggcggt aaaagcaggt gctgattteg tcaaaacgtc taccggtttc tctggtggcg gtgcaaccgc agaagacatt gccctgatgc gtaaggttgt tggtcctaac ctgggcgtta aggccagcgg cggtgtgcgt gacctgtctg aegegaagge gatgattgac gegggegega ctcgtatcgg cgcttccgca ggtgttgcga tcgttaatgg tgaaegetet gaaggttcca cgaaatggac cgcagctggt geggegaega cgtgcgcttg taegggegge taa
<210> 15 <211> 669 <212> DNA <213> 蘇氏鏈球菌 Streptococcus suis 200914618 <400〉 15 atgaaactga acaaatacat cgatcacacc atcctgaaac cggaaacgac tcaggaacag 60 gtggagaaaa tcctggctga agcgaaagaa tacgatttcg cgtccgtctg cgttaacccg 120 acgtgggtag ctctggcagc tgaaagcctg aaagatagcg acgtcaaagt ctgcactgtc 180 atcggcttcc cgctgggcgc taacactccg gcagtgaagg cgttcgaaac taaagacgct 240 attagcaacg gcgcggatga aatcgacatg gtgattaaca tcggcgcact gaaaacgggt 300 aactacgatc tggttctgga agatattaag gctgtcgttg cagcaagcgg cgataaactg 360 gtaaaggtaa tcatcgaagc gtgcctgctg accgacgatg aaaaggttaa agcgtgccag 420 ctgtctcagg aagcgggcgc tgactacgtc aagacgagca ctggcttctc taccggcggt 480 gcgacggtcg cagatgttgc tctgatgcgt aaaactgttg gcccggacat gggcgtaaaa 540 gcgtctggcg gtgcgcgctc ttacgaagac gctatcgcgt tcattgaagc tggcgcaagc 600 cgtattggcg ccagctctgg cgtggcgatc atgaatggtg cgcaggctga tggcgacacc 660 aagtggtaa 669
<210> 16 <211> 259 <212> PRT <213〉大腸桿菌 Escherichia coli <400> 16
Met Thr Asp Leu Lys Ala Ser Ser Leu Arg Ala Leu Lys Leu Met Asp 1 5 10 15
Leu Thr Thr Leu Asn Asp Asp Asp Thr Asp Glu Lys Val He Ala Leu 20 25 30
Cys His Gin Ala Lys Thr Pro Val Gly Asn Thr Ala Ala lie Cys lie 35 40 45
Tyr Pro Arg Phe lie Pro lie Ala Arg Lys Thr Leu Lys Glu Gin Gly 5〇 55 60
Thr Pro Glu lie Arg He Ala Thr Val Thr Asn Phe Pro His Gly Asn 65 70 75 80
Asp Asp lie Asp He Ala Leu Ala Glu Thr Arg Ala Ala He Ala Tyr 85 90 95
Gly Ala Asp Glu Val Asp Val Val Phe Pro Tyr Arg Ala Leu Met Ala 100 105 110 9 200914618
Gly Asn Glu Gin Val Gly Phe Asp Leu Val Lys Ala Cys Lys Glu Ala 115 120 125
Cys Ala Ala Ala Asn Val Leu Leu Lys Val lie lie Glu Thr Gly Glu 130 135 140
Leu Lys Asp Glu Ala Leu lie Arg Lys Ala Ser Glu lie Ser lie Lys 145 150 155 160
Ala Gly Ala Asp Phe lie Lys Thr Ser Thr Gly Lys Val Ala Val Asn 165 170 175
Ala Thr Pro Glu Ser Ala Arg lie Met Met Glu Val lie Arg Asp Met 180 185 190
Gly Val Glu Lys Thr Val Gly Phe Lys Pro Ala Gly Gly Val Arg Thr / 195 200 205 % .
Ala Glu Asp Ala Gin Lys Tyr Leu Ala He Ala Asp Glu Leu Phe Gly 210 215 220
Ala Asp Trp Ala Asp Ala Arg His Tyr Arg Phe Gly Ala Ser Ser Leu 225 230 235 240
Leu Ala Ser Leu Leu Lys Ala Leu Gly His Gly Asp Gly Lys Ser Ala 245 250 255
Ser Ser Tyr <210> 17 <211> 222 <212〉 PRT <213〉人造序列 <220〉 <223>分離自環境樣本之隨機DNA <400> 17
Met Gly Asn lie Ala Lys Met He Asp His Thr Leu Leu Lys Pro Glu 15 10 15
Ala Thr Glu Gin Gin He Val Gin Leu Cys Thr Glu Ala Lys Gin Tyr
Gly Phe Ala Ala Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Lys Thr Ala Ala 35 40 45 10 200914618
Arg Glu Leu Ser Gly Thr Asp Val Arg Val Cys Thr Val lie Gly Phe 50 55 60
Pro Leu Gly Ala Thr Thr Pro Glu Thr Lys Ala Phe Glu Thr Thr Asn 65 70 75 80
Ala lie Glu Asn Gly Ala Arg Glu Val Asp Met Val lie Asn lie Gly 85 90 95
Ala Leu Lys Ser Gly Gin Asp Glu Leu Val Glu Arg Asp lie Arg Ala 100 105 110
Val Val Glu Ala Ala Ala Gly Arg Ala Leu Val Lys Val lie Val Glu 115 120 125
Thr Ala Leu Leu Thr Asp Glu Glu Lys Val Arg Ala Cys Gin Leu Ala 130 135 140
Val Lys Ala Gly Ala Asp Tyr Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Ser Gly 145 150 155 160
Gly Gly Ala Thr Val Glu Asp Val Ala Leu Met Arg Lys Thr Val Gly 165 170 175
Asp Arg Ala Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Asp Trp Lys Thr 180 185 190
Ala Glu Ala Met lie Asn Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly Thr Ser Ser 195 200 205
Gly Val Ala He Val Thr Gly Gly Thr Gly Arg Ala Asp Tyr 210 215 220
<210> 18 <211> 220 <212〉 PRT <213> Deinococcus radiodurans <400> 18
Met Gly Leu Ala Ser Tyr He Asp His Thr Leu Leu Lys Ala Thr Ala 15 10 15
Thr Leu Ala Asp He Arg Thr Leu Cys Glu Glu Ala Arg Glu His Ser 20 25 30
Phe Tyr Ala Val Cys lie Asn Pro Val Phe He Pro His Ala Arg Ala 35 40 45 11 200914618
Trp Leu Glu Gly Ser Asp Val Lys Val Ala Thr Val Cys Gly Phe Pro 50 55 60
Leu Gly Ala lie Ser Ser Glu Gin Lys Ala Leu Glu Ala Arg Leu Ser 65 70 75 80
Ala Glu Thr Gly Ala Asp Glu He Asp Met Val lie His lie Gly Ser 85 90 95
Ala Leu Ala Gly Asp Trp Asp Ala Val Glu Ala Asp Val Arg Ala Val 100 105 110
Arg Arg Ala Val Pro Glu Gin Val Leu Lys Val lie lie Glu Thr Cys 115 120 125
Tyr Leu Thr Asp Glu Gin Lys Arg Leu Ala Thr Glu Val Ala Val Gin 130 135 140
Gly Gly Ala Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Gly Thr Gly Gly 145 150 155 160
Ala Thr Val Asp Asp Val Arg Leu Met Ala Glu Val He Gly Gly Arg 165 170 175
Ala Gly Leu Lys Ala Ala Gly Gly Val Arg Thr Pro Ala Asp Ala Gin 180 185 190
Ala Met lie Glu Ala Gly Ala Thr Arg Leu Gly Thr Ser Gly Gly Val 195 200 205
Gly Leu Val Ser Gly Gly Glu Asn Gly Ala Gly Tyr 210 215 220
<210> 19 <211> 223 <212> PRT <213〉單胞生成性李斯特氏菌Listeria monocytogenes <400> 19
Met Gly lie Ala Lys Met lie Asp His Thr Ala Leu Lys Pro Asp Thr 15 10 15
Thr Lys Glu Gin lie Leu Thr Leu Thr Lys Glu Ala Arg Glu Tyr Gly 20 25 30
Phe Ala Ser Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Lys Leu Ser Ala Glu 35 40 45 12 200914618
Gin Leu Ala Gly Ala Glu Ser Val Val Cys Thr Val He Gly Phe Pro
Leu Gly Ala Asn Thr Pro Glu Val Lys Ala Phe Glu Val Lys Asp Ala 65 70 75 80
He Gin Asn Gly Ala Lys Glu Val Asp Met Val lie Asn He Gly Ala 85 90 95
Leu Lys Asp Lys Asp Asp Glu Leu Val Glu Arg Asp lie Arg Ala Val 100 105 110
Val Asp Ala Ala Lys Gly Lys Ala Leu Val Lys Val lie He Glu Thr 115 120 125
Cys Leu Leu Thr Asp Glu Glu Lys Val Arg Ala Cys Glu lie Ala Val 130 135 140
Lys Ala Gly Thr Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Ser Thr Gly 145 150 155 160
Gly Ala Thr Ala Glu Asp He Ala Leu Met Arg Lys Thr Val Gly Pro 165 170 175
Asn He Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Thr Lys Glu Asp Val 180 185 190
Glu Lys Met lie Glu Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly Ala Ser Ala Gly
Val Ala He Val Ser Gly Glu Lys Pro Ala Lys Pro Asp Asn Tyr 210 215 220
<210〉 20 <211> 223 <212> PRT <213〉流行性感冒嗜血桿菌Haemophilus influenzae <400〉 20
Met Thr Ser Asn Gin Leu Ala Gin Tyr lie Asp His Thr Ala Leu Thr 15 10 15
Ala Glu Lys Asn Glu Gin Asp He Ser Thr Leu Cys Asn Glu Ala lie 20 25 30
Glu His Gly Phe Tyr Ser Val Cys He Asn Ser Ala Tyr He Pro Leu 13 200914618 35 40 45
Ala Lys Glu Lys Leu Ala Gly Ser Asn Val Lys lie Cys Thr Val Val 50 55 60
Gly Phe Pro Leu Gly Ala Asn Leu Thr Ser Val Lys Ala Phe Glu Thr 65 70 75 80
Gin Glu Ser lie Lys Ala Gly Ala Asn Glu lie Asp Met Val He Asn 85 90 95
Val Gly Trp lie Lys Ser Gin Lys Trp Asp Glu Val Lys Gin Asp lie 100 105 110
Gin Ala Val Phe Asn Ala Cys Asn Gly Thr Pro Leu Lys Val lie Leu 115 120 125
Glu Thr Cys Leu Leu Thr Lys Asp Glu lie Val Lys Ala Cys Glu lie 130 135 140
Cys Lys Glu lie Gly Val Ala Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Asn 145 150 155 160
Lys Gly Gly Ala Thr Val Glu Asp Val Ala Leu Met Lys Asn Thr Val 165 170 175
Gly Asn lie Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Asp Thr Glu Thr 180 185 190
Ala Leu Ala Met lie Lys Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly Ala Ser Ala 195 200 205
Gly He Ala lie lie Ser Gly Thr Gin Asp Thr Gin Ser Thr Tyr 210 215 220
<210> 21 <211> 248 <212〉 PRT <213> Thermotoga maritima <400〉 21
Met lie Glu Tyr Arg lie Glu Glu Ala Val Ala Lys Tyr Arg Glu Phe 10 15
Tyr Glu Phe Lys Pro Val Arg Glu Ser Ala Gly lie Glu Asp Val Lys 20 25 30 14 200914618
Ser Ala lie Glu His Thr Asn Leu Lys Pro Phe Ala Thr Pro Asp Asp 35 40 45 lie Lys Lys Leu Cys Leu Glu Ala Arg Glu Asn Arg Phe His Gly Val 50 55 60
Cys Val Asn Pro Cys Tyr Val Lys Leu Ala Arg Glu Glu Leu Glu Gly 65 70 75 80
Thr Asp Val Lys Val Val Thr Val Val Gly Phe Pro Leu Gly Ala Asn 85 90 95
Glu Thr Arg Thr Lys Ala His Glu Ala He Phe Ala Val Glu Ser Gly 100 105 110
Ala Asp Glu lie Asp Met Val lie Asn Val Gly Met Leu Lys Ala Lys 115 120 125
Glu Trp Glu Tyr Val Tyr Glu Asp lie Arg Ser Val Val Glu Ser Val 130 135 140
Lys Gly Lys Val Val Lys Val lie lie Glu Thr Cys Tyr Leu Asp Thr 145 150 155 160
Glu Glu Lys He Ala Ala Cys Val lie Ser Lys Leu Ala Gly Ala His 165 170 175
Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Gly Thr Gly Gly Ala Thr Ala Glu 180 185 190
Asp Val His Leu Met Lys Trp He Val Gly Asp Glu Met Gly Val Lys 195 200 205
Ala Ser Gly Gly He Arg Thr Phe Glu Asp Ala Val Lys Met lie Met 210 215 220
Tyr Gly Ala Asp Arg lie Gly Thr Ser Ser Gly Val Lys lie Val Gin 225 230 235 240
Gly Gly Glu Glu Arg Tyr Gly Gly 245
<210〉 22 <211〉 235 <212> PRT <213〉半月形產氣膿菌Aeropyrumpernix <400> 22 15 200914618
Met Pro Ser Ala Arg Asp lie Leu Gin Gin Gly Leu Asp Arg Leu Gly 15 10 15
Ser Pro Glu Asp Leu Ala Ser Arg lie Asp Ser Thr Leu Leu Ser Pro 20 25 30
Arg Ala Thr Glu Glu Asp Val Arg Asn Leu Val Arg Glu Ala Ser Asp 35 40 45
Tyr Gly Phe Arg Cys Ala Val Leu Thr Pro Val Tyr Thr Val Lys lie 50 55 60
Ser Gly Leu Ala Glu Lys Leu Gly Val Lys Leu Cys Ser Val lie Gly 65 70 75 80 / Phe Pro Leu Gly Gin Ala Pro Leu Glu Val Lys Leu Val Glu Ala Gin ' 85 90 95
Thr Val Leu Glu Ala Gly Ala Thr Glu Leu Asp Val Val Pro His Leu 100 105 110
Ser Leu Gly Pro Glu Ala Val Tyr Arg Glu Val Ser Gly lie Val Lys 115 120 125
Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ala Val Val Lys Val lie Leu Glu Ala Pro 130 135 140
Leu Trp Asp Asp Lys Thr Leu Ser Leu Leu Val Asp Ser Ser Arg Arg 145 150 155 160
Ala Gly Ala Asp lie Val Lys Thr Ser Thr Gly Val Tyr Thr Lys Gly 165 170 175
Gly Asp Pro Val Thr Val Phe Arg Leu Ala Ser Leu Ala Lys Pro Leu 180 185 190
Gly Met Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly lie Arg Ser Gly lie Asp Ala 195 200 205
Val Leu Ala Val Gly Ala Gly Ala Asp lie lie Gly Thr Ser Ser Ala 210 215 220
Val Lys Val Leu Glu Ser Phe Lys Ser Leu Val 225 230 235 <210> 23 16 200914618 <211〉 289 <212> PRT + <213> 牙周病菌 Porphyromonas gingival is <400〉 23
Met Ala Ala Asn Lys Tyr Glu Met Ala Phe Ala Gin Phe Asp Pro Ala 15 10 15
Glu Ser Glu Glu Arg He Leu Leu Lys Thr Asp Gin He lie Arg Asp 20 25 30
His Tyr Ser Arg Phe Asp Thr Pro Glu Thr Lys Lys Phe Leu His Gly 35 40 45
Val lie Asp Leu Thr Ser Leu Asn Ala Thr Asp Ser Glu Glu Ser lie 50 55 60
Thr Lys Phe Thr Glu Ser Val Asn Asp Phe Glu Asp Thr Asp Pro Thr 65 70 75 80
He Pro Ser Val Ala Ala lie Cys Val Tyr Pro Asn Phe Val Ser Thr 85 90 95
Val Arg Glu Thr Leu Thr Ala Glu Asn Val Lys Val Ala Ser Val Ser 100 105 110
Gly Cys Phe Pro Ala Ser Gin Ser Phe lie Glu Val Lys Leu Ala Glu 115 120 125
Thr Ala Leu Ala Val Ser Asp Gly Ala Asp Glu lie Asp He Val Leu 130 135 140
Asn Met Gly Lys Phe Leu Ser Gly Asp Tyr Glu Ala Ala Ala Thr Glu 145 150 155 160
He Glu Glu Gin lie Ala Ala Ala Lys Gly Ala Thr Val Lys Val He 165 170 175
Leu Glu Thr Gly Ala Leu Lys Thr Pro Glu Asn lie Arg Arg Ala Thr 180 185 190 lie Leu Ser Leu Phe Cys Gly Ala His Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly 195 200 205
Lys Gly Tyr Pro Gly Ala Ser Leu Glu Ala Ala Tyr Thr Met Cys Lys 210 215 220 17 200914618
Val Leu Lys Gin Tyr Tyr Gly Leu Phe Gly Glu Val Arg Gly lie Lys 225 230 235 240
Leu Ser Gly Gly lie Arg Thr Thr Glu Asp Ala Val Lys Tyr Tyr Cys 245 250 255
Leu lie Glu Thr Leu Leu Gly Lys Glu Trp Leu Thr Pro Ala Tyr Phe 260 265 270
Arg lie Gly Ala Ser Ser Leu Val Asp Ala Leu Arg Gin Asp lie Met 275 280 285
Val <210> 24 <211> 222 <212> PRT ^ <213〉糞腸球菌 Enterococcus faecalis <400〉 24
Met Glu Leu Asn Arg Met lie Asp His Thr lie Leu Lys Pro Glu Ala 15 10 15
Thr Glu Ala Ala Val Gin Lys lie He Asp Glu Ala Lys Glu Tyr Asn 20 25 30
Phe Phe Ser Val Cys lie Asn Pro Cys Trp Val Ala Phe Ala Ser Glu 35 40 45
Gin Leu Ala Asp Thr Asp Val Ala Val Cys Thr Val lie Gly Phe Pro 50 55 60
Leu Gly Ala Asn Thr Pro Glu Val Lys Ala Tyr Glu Ala Ala Asp Ala 65 70 75 80 lie Lys Asn Gly Ala Asn Glu Val Asp Met Val lie Asn lie Gly Ala 85 90 95
Leu Lys Ser Gin Gin Tyr Asp Tyr Val Arg Gin Asp lie Gin Gly Val 100 105 110
Val Asp Ala Ala Lys Gly Lys Ala Leu Val Lys Val lie lie Glu Thr 115 120 125
Ala Leu Leu Thr Asp Glu Glu Lys Val Lys Ala Cys Glu Leu Ala Lys 130 135 140 18 200914618
Glu Ala Gly Ala Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Ser Thr Gly 145 150 155 160
Gly Ala Lys Val Ala Asp lie Arg Leu Met Arg Glu Thr Val Gly Pro 165 170 175
Asp Met Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val H1S Asn Ala Glu Glu Ala
Leu Ala Met lie Glu Ala Gly Ala Thr Arg He Gly Ala Ser Thr Gly 195 200 205
Val Ala lie Val Ser Gly Ala Thr Gly Glu Gly Thr Lys Trp <210〉 25 <211> 337 <212〉 PRT 务 <213> 海洋放線菌 marine actinobacterium <400〉 25
Met Thr He Glu Ser Ala lie Ala Leu Ala Pro Ala Glu Arg Ala Val 15 10 15
Asn Leu He Gly Ser Asp Leu Thr Glu Lys Ser Leu Lys Leu His Leu 20 25 30
Glu Gly Leu Ser Gly Val Asp Ala Val Gly Leu Glu Gin Arg Ala Ala 35 40 45
Gly Leu Ser Thr Arg Ser lie Lys Thr Thr Ser Lys Ala Trp Ala Leu 50 55 60
Asp Thr lie He Lys Leu lie Asp Leu Thr Thr Leu Glu Gly Ala Asp 65 70 75 80
Thr Pro Gly Lys Val Arg Ser Leu Ala Ala Lys Ala Met Leu Pro Asp 85 90 95
Ala Ser Asp Val Ser Ala Pro Gin Val Ala Ala Val Cys Val Tyr Gly 100 105 110
Asp Met Val Pro Tyr Ala Ala Glu Ala Leu Gly Ser Ser Trp Ser Asn 115 120 125
Gly Ser Asp Asn Gly lie Asn Val Ala Ala Val Ala Thr Ala Phe Pro 130 135 140 19 200 914618
Ser Gly Arg Ser Ser Leu Pro lie Lys He Ala Asp Thr Lys Glu Ala 145 150 155 160
Val Ala His Gly Ala Asp Glu lie Asp Met Val lie Asp Arg Gly Ala 165 170 175 e s u Le e ph Π Gl p s A e ph 11 oa 8 V '~- va VJ G1 Γ s Ly yo 18 Gl
va na -- <—-oa 9 VI
Lys Glu Ala Cys Arg Arg Glu Asn Gly Thr Tyr Ala His Leu Lys Val 195 200 205 lie Leu Glu Thr Gly Glu Leu Asn Thr Tyr Asp Asn Val Arg Arg Ala 210 215 220 i
Ser Trp Leu Ala lie Leu Ala Gly Gly Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr 225 230 235 240
Gly Lys Val Ser Pro Ala Ala Thr Leu Pro Val Thr Leu Leu Met Leu 245 250 255
Glu Val Val Arg Asp Trp His Val Leu Thr Gly Glu Lys lie Gly Val 260 265 270
Lys Pro Ala Gly Gly lie Arg Ser Ser Lys Asp Ala lie Lys Tyr Leu 275 280 285
Val Thr Val Ala Glu Thr Val Gly Glu Glu Trp Leu Gin Pro His Leu 290 295 300
Phe Arg Phe Gly Ala Ser Ser Leu Leu Asn Asp Val Leu Met Gin Arg 305 310 315 320
Gin Lys Leu Ser Thr Gly His Tyr Ser Gly Pro Asp Tyr Val Thr lie 325 330 335
Asp <210> 26 <211〉 324 <212> PRT <213〉諾氏菌屬 Nocardioides species <400〉 26
Met Ser Ser Thr Pro Thr lie Leu Asp Pro Ala Phe Glu Asp Val Thr 20 200914618 15 10 15
Arg Ser Glu Ala Ser Leu Arg Arg Phe Leu His Gly Leu Pro Gly Val 20 25 30
Asp Gin Val Gly Ala Glu Ala Arg Ala Ala Gly Leu Ala Thr Arg Ser 35 40 45
He Lys Thr Ser Ala Lys Glu Phe Ala Leu Asp Leu Ala lie Arg Met 50 55 60
Val Asp Leu Thr Thr Leu Glu Gly Gin Asp Thr Pro Gly Lys Val Arg 65 70 75 80
Ala Leu Ser Ala Lys Ala Met Arg Pro Asp Pro Ser Asp Pro Thr Cys 85 90 95
Pro Ala Thr Ala Ala Val Cys Val Tyr Pro Asp Met Val Gly lie Ala 100 105 110
Lys Gin Ala Leu Gly Thr Ser Gly Val His Val Ala Ala Val Ala Thr 115 120 125
Ala Phe Pro Ser Gly Arg Ala Ala Leu Asp He Lys Leu Ala Asp Val 130 135 140
Arg Asp Ala Val Asp Ala Gly Ala Asp Glu lie Asp Met Val He Asp 145 150 155 160
Arg Gly Ala Phe Leu Ala Gly Arg Tyr Gin His Val Tyr Asp Glu He 165 170 175
Val Ala Val Arg Glu Ala Cys Arg Arg Glu Asn Gly Glu Gly Ala His 180 185 190
Leu Lys Val lie Phe Glu Thr Gly Glu Leu Gin Thr Tyr Asp Asn Val 195 200 205
Arg Arg Ala Ser Trp Leu Ala Met Met Ala Gly Ala His Phe Val Lys 210 215 220
Thr Ser Thr Gly Lys Val Gin Pro Ala Ala Thr Leu Pro Val Thr Leu 225 230 235 240
Val Met Leu Gin Ala Val Arg Asp Phe Arg Gly Ala Thr Gly Arg Met 245 250 255 21 200914618
Val Gly Val Lys Pro Ala Gly Gly lie Arg Thr Ala Lys Asp Ala He 260 265 270
Lys Tyr Leu Val Met Val Asn Glu Val Ala Gly Glu Asp Trp Leu Asp 275 280 285
Pro Asp Trp Phe Arg Phe Gly Ala Ser Thr Leu Leu Asn Asp Leu Leu 290 295 300
Met Gin Arg Thr Lys Met Lys Thr Gly Arg Tyr Ser Gly Pro Asp Tyr 305 310 315 320
Phe Thr Leu Asp <210〉 27 <211> 275 <212> PRT <213> Geobaci1lus kaustophilus <400〉 27
Met Glu Leu lie Thr Gin Pro Ser Cys Trp Val Phe Ser Val Phe Phe 10 15
Arg Arg Gin Tyr Gly Trp Leu Val Phe Val Glu Gly Ala Trp Tyr Asp 20 25 30
Gly Arg Arg Gin Thr Phe His Leu Asp Gly Asn Gly Arg Lys Gly Phe 35 40 45
Leu Arg Met Thr Met Asn lie Ala Lys Met He Asp His Thr Leu Leu 50 55 60
Lys Pro Glu Ala Thr Glu Gin Gin lie Val Gin Leu Cys Thr Glu Ala 65 70 75 80
Lys Gin Tyr Gly Phe Ala Ser Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Lys 85 90 95
Thr Ala Ala Arg Glu Leu Ser Gly Thr Asp Val Arg Val Cys Thr Val 100 105 110 lie Gly Phe Pro Leu Gly Ala Thr Thr Pro Glu Thr Lys Ala Phe Glu 115 120 125
Thr Thr Asn Ala lie Glu Asn Gly Ala Arg Glu Val Asp Met Val lie 130 135 140 22 200914618
Asn lie Gly Ala Leu Lys Ser Gly Gin Asp Glu Leu Val Glu Arg Asp 145 150 155 160
He Arg Ala Val Val Glu Ala Ala Ala Gly Arg Ala Leu Val Lys Val 165 170 175
He Val Glu Thr Ala Leu Leu Thr Asp Glu Glu Lys Val Arg Ala Cys 180 185 190
Gin Leu Ala Val Lys Ala Gly Ala Asp Tyr Val Lys Thr Ser Thr Gly 195 200 205
Phe Ser Gly Gly Gly Ala Thr Val Glu Asp Val Ala Leu Met Arg Lys 210 215 220
Thr Val Gly Asp Arg Ala Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Asp 225 230 235 240
Trp Lys Thr Ala Glu Ala Met He Asn Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly 245 250 255
Thr Ser Ser Gly Val Ala lie Val Thr Gly Gly Thr Gly Arg Ala Asp 260 265 270
Thr Lys Trp 275
<210> 28 <211> 225 <212> PRT <213〉接種李斯特氏菌Listeria innocua <400> 28
Met Thr lie Ala Lys Met lie Asp His Thr Ala Leu Lys Pro Asp Thr 1 5 10 15
Thr Lys Glu Gin lie Leu Thr Leu Thr Lys Glu Ala Arg Glu Tyr Gly 20 25 30
Phe Ala Ser Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Lys Leu Ser Ala Glu 35 40 45
Gin Leu Ser Gly Ala Glu Ser Val Val Cys Thr Val lie Gly Phe Pro
Leu Gly Ala Asn Thr Pro Glu Val Lys Ala Phe Glu Val Lys Asn Ala 23 200914618 65 70 75 80 lie Glu Asn Gly Ala Lys Glu Val Asp Met Val lie Asn lie Gly Ala 85 90 95
Leu Lys Asp Lys Asp Asp Glu Leu Val Glu Arg Asp lie Arg Ala Val 100 105 110
Val Asp Ala Ala Lys Gly Lys Ala Leu Val Lys Val lie lie Glu Thr 115 120 125
Cys Leu Leu Thr Asp Glu Glu Lys Val Arg Ala Cys Glu lie Ala Val 130 135 140
Lys Ala Gly Thr Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Ser Thr Gly 145 150 155 160
Gly Ala Thr Ala Glu Asp lie Ala Leu Met Arg Lys Thr Val Gly Pro 165 170 175
Asn lie Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Thr Lys Glu Asp Val 180 185 190
Glu Lys Met lie Glu Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly Ala Ser Ala Gly 195 200 205 3 o 11 T. H A 2 , H va va e s
Ly Γ Th Π s A p s 00 r 2 P2 s - 1 X o pr s Ly u 5 1-i -— G2 V- G1 P5 r 2 T 2
<210> 29 <211> 240 <212> PRT <2Ϊ3> 嗜鹽芽抱桿菌 Bacillus halodurans <400> 29
Met Ser Arg Ser lie Ala Gin Met lie Asp His Thr Leu Leu Lys Pro 15 10 15
Asn Thr Thr Glu Asp Gin lie Val Lys Leu Cys Glu Glu Ala Lys Glu 20 25 30
Tyr Ser Phe Ala Ser Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Ala Leu Ala 35 40 45 24 200914618
Ala Gin Leu Leu Lys Asp Ala Pro Asp Val Lys Val Cys Thr Val lie 50 55 60
Gly Phe Pro Leu Gly Ala Thr Thr Pro Glu Val Lys Ala Phe Glu Thr 65 70 75 80
Thr Asn Ala He Glu Asn Gly Ala Thr Glu Val Asp Met Val lie Asn 85 90 95
He Gly Ala Leu Lys Asp Lys Gin Tyr Glu Leu Val Gly Arg Asp lie 100 105 110
Gin Ala Val Val Lys Ala Ala Glu Gly Lys Ala Leu Thr Lys Val lie 115 120 125 lie Glu Thr Ser Leu Leu Thr Glu Glu Glu Lys Lys Ala Ala Cys Glu 130 135 140
Leu Ala Val Lys Ala Gly Ala Asp Phe Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe 145 150 155 160
Ser Gly Gly Gly Ala Thr Ala Glu Asp He Ala Leu Met Arg Lys Val 165 170 175
Val Gly Pro Asn Leu Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Val Arg Asp Leu 180 185 190
Ser Asp Ala Lys Ala Met lie Asp Ala Gly Ala Thr Arg lie Gly Ala 195 200 205
Ser Ala Gly Val Ala lie Val Asn Gly Glu Arg Ser Glu Gly Ser Thr 210 215 220
Lys Trp Thr Ala Ala Gly Ala Ala Thr Thr Cys Ala Cys Thr Gly Gly 225 230 235 240 <210〉 30 <211> 222 <212> PRT + <213〉蘇氏鏈球菌 Streptococcus suis <400> 30
Met Lys Leu Asn Lys Tyr He Asp His Thr lie Leu Lys Pro Glu Thr 15 10 15
Thr Gin Glu Gin Val Glu Lys He Leu Ala Glu Ala Lys Glu Tyr Asp 20 25 30 25 200914618
Phe Ala Ser Val Cys Val Asn Pro Thr Trp Val Ala Leu Ala Ala Glu 35 40 45
Ser Leu Lys Asp Ser Asp Val Lys Val Cys Thr Val lie Gly Phe Pro 50 55 60
Leu Gly Ala Asn Thr Pro Ala Val Lys Ala Phe Glu Thr Lys Asp Ala 65 70 75 80 lie Ser Asn Gly Ala Asp Glu lie Asp Met Val lie Asn lie Gly Ala 85 90 95
Leu Lys Thr Gly Asn Tyr Asp Leu Val Leu Glu Asp lie Lys Ala Val 100 105 110
Val Ala Ala Ser Gly Asp Lys Leu Val Lys Val lie He Glu Ala Cys 115 120 125
Leu Leu Thr Asp Asp Glu Lys Val Lys Ala Cys Gin Leu Ser Gin Glu 130 135 140
Ala Gly Ala Asp Tyr Val Lys Thr Ser Thr Gly Phe Ser Thr Gly Gly 145 150 155 160
Ala Thr Val Ala Asp Val Ala Leu Met Arg Lys Thr Val Gly Pro Asp 165 170 175
Met Gly Val Lys Ala Ser Gly Gly Ala Arg Ser Tyr Glu Asp Ala lie 180 185 190
Ala Phe lie Glu Ala Gly Ala Ser Arg lie Gly Ala Ser Ser Gly Val 195 200 205
Ala lie Met Asn Gly Ala Gin Ala Asp Gly Asp Thr Lys Trp 26

Claims (1)

  1. 200914618 十、申請專利範圍: 1. 一種方法’包含下述步驟:使乙酸·與選自於由3_鄰苯二 甲酿亞胺基丙路、N-曱S&基-3 -胺基丙酸·、3 -丁二醯亞胺 基-丙路或N-diBoc-3-胺基丙搭所組成之組群中之n經保 5 護之胺基越基質,於搭醇縮酶催化之醒·醇縮合條件下反 應來形成相對應之内半縮醛(lactol)。 2. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該醛醇縮酶為2-去 氧核糖-5-磷酸醛醇縮酶(DERA)。 3. 如申請專利範圍第2項之方法,其中該醛醇縮酶為DERA 10 04包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之 胺基酸序列; 3之核苷酸序列或SEQ 8之核苷酸序列或SEQ 9之核苷酸序列或SEQ 10之核苷酸序列或SEQ 11之核苷酸序列或SEQ 12之核苷酸序列或SEQ 13之核苷酸序列或SEQ DERA 06 包含SEQ ID NO: ID NO: 18之胺基酸序列; 15 20 DERA 101 包含SEQ ID NO: ID NO: 23之胺基酸序列; DERA 102包含SEQ ID NO: ID NO: 24之胺基酸序列; DERA 103 包含SEQ ID NO: ID NO: 25之胺基酸序列; DERA 104包含SEQ ID NO: ID NO: 26之胺基酸序列; DERA 105 包含SEQ ID NO: ID NO: 27之胺基酸序列; DERA 106 包含SEQ ID NO: 1 200914618 ID NO: 28之胺基酸序列; DERA 107包含SEQ IDNO: 14之核苷酸序列或SEQ ID NO: 29之胺基酸序列; DERA 108包含SEQ ID NO: 15之核苷酸序列或SEQ 5 ID NO: 30之胺基酸序列; 或其具有胺基酸序列相同度至少約為20%之醛醇 縮酶。 4. 如申請專利範圍第2項之方法,其中該DERA 04包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之胺基酸序 10 列;DERA06包含SEQIDNO: 3之核苷酸序列或SEQID NO: 18之胺基酸序列或DERA 102包含SEQ ID NO: 9之 核苷酸序列或SEQ ID NO: 24之胺基酸序列。 5. 如申請專利範圍第2項之方法,其中該DERA 04包含SEQ ID NO: 2之核苷酸序列或SEQ ID NO: 17之胺基酸序列。 15 6.如申請專利範圍2項之方法,其中該DERA 102包含SEQ ID NO: 9之核苷酸序列或SEQ ID NO: 24之胺基酸序列。 7·如申請專利範圍第1項之方法,其中該N經保護之胺基醛 基質為3-鄰苯二甲醯亞胺基丙醛。 8·如申請專利範圍第1項之方法,其中該N經保護之胺基駿 20 基質為N-甲醯基-3-胺基丙醛或3-丁二醯亞胺基丙醛。 9.如申請專利範圍第1項之方法,其中該N經保護之胺基輕 基貝為N~diB〇c -3-胺基丙酸。 10·如申請專利範圍第1項之方法,進一步包括氧化如此所 形成之内半縮酸而獲得相對應之内醋。 2 200914618 11. 如申請專利範圍第10項之方法,進一步包括如此所形成 之内酯與異丙醇及丙酮反應獲得相對應之丙酮化物異 丙酉旨。 12. 如申請專利範圍第10項之方法,進一步包括如此所形成 5 之内酯與環戊酮及異丙醇反應而獲得相對應之亞環戊 基鄰苯二甲醯亞胺基異丙酯。 13. 如申請專利範圍第1項之方法,進一步包括: (a) 催化去氫條件下去氫化如此所形成之内半縮醛 獲得相對應之3,5-二羥基庚酸; 10 (b)二環己基胺處理如此所形成之3,5-二羥基庚酸 而形成相對應之鹽;及 (c)此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應獲得相對 應之丙酮化物異丙酉旨。 14. 如申請專利範圍第1項之方法,進一步包括: 15 (a)化如此所形成之内半縮醒·而獲得相對應之3,5- 二羥基庚酸; (b) 二環己基胺處理3,5-二羥基庚酸而形成相對應 之鹽;及 (c) 此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應獲得相對 20 應之丙酮化物異丙酉旨。 15. 如申請專利範圍第11、13或14項之方法,進一步包括以 鹼處理如此所形成之丙酮化物異丙酯,其中該N經保護 之胺基醛基質為3-鄰苯二甲醯亞胺基丙醛,而獲得相對 應之胺基丙酮化物異丙酯。 200914618 16. 如申請專利範圍第12項之方法,進一步包括以鹼處理如 此所得之亞環戊基鄰苯二甲醯亞胺基異丙酯而獲得相 對應之胺基亞環戊基異丙酯。 17. 如申請專利範圍第15或16項之方法,其中該鹼為伸乙基 . 5 二胺。 ; 18. —種方法,包含於DERA 101、DERA 102、DERA 103、 DERA 104、DERA 105、DERA 106、DERA 107或 DERA 108醛醇縮酶催化之醛醇縮合條件下,讓醛與胺基醛基 f 質或N經保護之胺基醛基質反應而形成相對應之内半縮 10 醛之步驟。 19.如申請專利範圍第18項之方法,其中該胺基醛或該N經 保護之胺基醛為N-Boc-3-胺基丙醛、3-胺基丙醛、胺基 乙醛、N-CBz-3-胺基丙醛、N-乙醯基-3-胺基丙醛、 N-Fmoc-3-胺基丙醛、或N-Fmoc-胺基乙醛。 15 20.如申請專利範圍第18項之方法,其中該N經保護之胺基 酸為N-Boc-3-胺基丙酸·。 ( 21.如申請專利範圍第18項之方法,其中該胺基醛或該N經 保護之胺基醛為N-CBz-3-胺基丙醛或N-Fmoc-3-胺基丙 醛。 20 22.如申請專利範圍第18項之方法,其中該胺基醛或該N經 保護之胺基醛為N-CBz-3-胺基丙醛。 23_如申請專利範圍第18項之方法,其中該醛醇縮酶為 DERA 102。 24.如申請專利範圍第18項之方法,進—步包括氧化如此所 200914618 形成之内半縮搭而獲得相對應之内醋。 25.如申請專利範圍第24項之方法,進一步包括如此所形成 之内酯與異丙醇及丙酮反應獲得相對應之丙酮化物異 丙酉旨。 5 26.如申請專利範圍第24項之方法,進一步包括如此所形成 之内酯與環戊酮及異丙醇反應而獲得相對應之亞環戊 基鄰苯二甲醯亞胺基異丙酯。 27.如申請專利範圍第18項之方法,進一步包括: (a) 催化去氫條件下去氫化如此所形成之内半縮醛 10 獲得相對應之3,5-二羥基庚酸; (b) 二環己基胺處理如此所形成之3,5-二羥基庚酸 而形成相對應之鹽;及 (c) 此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應獲得相對 應之丙酮化物異丙自旨。 15 28.如申請專利範圍第18項之方法,進一步包括: (a) 化如此所形成之内半縮醒而獲得相對應之3,5-二羥基庚酸; (b) 二環己基胺處理3,5-二羥基庚酸而形成相對應 之鹽;及 20 (c)此所形成之鹽與原甲酸三異丙酯反應獲得相對 應之丙酮化物異丙醋。 29. —種方法,包含下述步驟:讓醛與通式(I)之胺基醛基質 化合物: 200914618 ο
    Η (I) 其中: η=1、2、3 或 4 ; R’為氫或Ν保護基; R”為氫或Ν保護基;或R’及R”與其附接之氮共同形 成5員或6員雜環部分, / 10 於DERA ΗΠ、DERA 102、DERA 103、DERA 104、 DERA 105、DERA 106、DERA 107或 DERA 108醛醇縮 酶催化之醛醇縮合條件下反應而形成相對應之内半縮 搭。 30. 如申請專利範圍第29項之方法,其中η為1或2。 31. 如申請專利範圍第29項之方法,其中該醛醇縮酶為 DERA 102。 32. ~~種2-[2-(4,6-二經基四氮·α底喃-2-基)-異σ引π朶-1,3-二 15 \ 酮。 33_如申請專利範圍第32項之化合物,其中該化合物為
    34.如申請專利範圍第32項之化合物,其中該化合物為
    6 200914618 35. 種下式化合物
    36. 種下式化合物 Ο OH OH 0
    5 37. 種下式化合物
    38. 種下式化合物
    39. 種下式化合物
    40. 一種下式化合物 7 10 200914618
    41. 一種下式化合物
    42. —種下式化合物
    43. —種4-氟-α -[2-甲基-1-酮基丙基]_ r _酮基_N,点_二苯基 本丁醢胺之結晶形式’其特徵在於具有約9.〇、12.7、 20.2、22.6及25.2度2-0之粉末χ光繞射峰。 44. -種(2R-反)-5-(4·敦笨基)刊_甲*乙基)_Ν4二苯基 1〇 _1-[2_(四氯I經基冬啊基_2_基)乙基 嘻-3-叛醯胺之結晶形式,其特徵在於具有約am、 16.8 ' 21_1及25.5度2-Θ之粉末χ光繞射蜂。 8
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