RO117267B1 - Secventa de acid nucleic si peptida codificata de aceasta, pentru diagnostic si tratament - Google Patents
Secventa de acid nucleic si peptida codificata de aceasta, pentru diagnostic si tratament Download PDFInfo
- Publication number
- RO117267B1 RO117267B1 RO93-01493A RO9301493A RO117267B1 RO 117267 B1 RO117267 B1 RO 117267B1 RO 9301493 A RO9301493 A RO 9301493A RO 117267 B1 RO117267 B1 RO 117267B1
- Authority
- RO
- Romania
- Prior art keywords
- sequence
- nucleic acid
- type
- region
- sequences
- Prior art date
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 277
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 101
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims description 252
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims description 252
- 239000002253 acid Substances 0.000 title description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 title description 5
- 238000011282 treatment Methods 0.000 title description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 180
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 180
- 210000000746 body region Anatomy 0.000 claims abstract description 26
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 208000005176 Hepatitis C Diseases 0.000 claims abstract 2
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 24
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 24
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 21
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 18
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 11
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 claims description 10
- 241000711549 Hepacivirus C Species 0.000 claims description 9
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 6
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 claims description 5
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 4
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 abstract description 11
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 abstract description 2
- 238000000576 coating method Methods 0.000 abstract description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 160
- 238000009954 braiding Methods 0.000 description 141
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 54
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 35
- 239000000047 product Substances 0.000 description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 description 23
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 22
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 22
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 20
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 19
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 19
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 18
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 17
- -1 HCV nucleic acid Chemical class 0.000 description 15
- 229920001184 polypeptide Chemical group 0.000 description 14
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 13
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 10
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 9
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 9
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 8
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 8
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 8
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 8
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 7
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 7
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 7
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 6
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 6
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 5
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 5
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 5
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 5
- 238000011160 research Methods 0.000 description 5
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 5
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 5
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 5
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 5
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 4
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 4
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 4
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 4
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 4
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 4
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 4
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 3
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 3
- 108010076039 Polyproteins Proteins 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 3
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 3
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 3
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 3
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 3
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QMXCRMQIVATQMR-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-pyridin-2-ylsulfanylpropanoate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCSC1=CC=CC=N1 QMXCRMQIVATQMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 2
- 101150026173 ARG2 gene Proteins 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010019791 Hepatitis post transfusion Diseases 0.000 description 2
- 241000709721 Hepatovirus A Species 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- 101100005166 Hypocrea virens cpa1 gene Proteins 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 2
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001105470 Valenzuela Species 0.000 description 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 2
- 101100379634 Xenopus laevis arg2-b gene Proteins 0.000 description 2
- NWMHDZMRVUOQGL-CZEIJOLGSA-N almurtide Chemical compound OC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CO[C@@H]([C@H](O)[C@H](O)CO)[C@@H](NC(C)=O)C=O NWMHDZMRVUOQGL-CZEIJOLGSA-N 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 239000010836 blood and blood product Substances 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- NZNMSOFKMUBTKW-UHFFFAOYSA-N cyclohexanecarboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1CCCCC1 NZNMSOFKMUBTKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 208000029570 hepatitis D virus infection Diseases 0.000 description 2
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 2
- 239000011049 pearl Substances 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N succinimide Chemical compound O=C1CCC(=O)N1 KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 1,2-bis(ethenyl)benzene;1-ethenyl-2-ethylbenzene;styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1.CCC1=CC=CC=C1C=C.C=CC1=CC=CC=C1C=C NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOJKKJKETHYEAC-UHFFFAOYSA-N 6-Maleimidocaproic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCN1C(=O)C=CC1=O WOJKKJKETHYEAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 102100030356 Arginase-2, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 101100282617 Bovine herpesvirus 1.1 (strain Cooper) gC gene Proteins 0.000 description 1
- 241000744472 Cinna Species 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100027723 Endogenous retrovirus group K member 6 Rec protein Human genes 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000710831 Flavivirus Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 208000005331 Hepatitis D Diseases 0.000 description 1
- 101000792835 Homo sapiens Arginase-2, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000945318 Homo sapiens Calponin-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000652736 Homo sapiens Transgelin Proteins 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241001068914 Melicope knudsenii Species 0.000 description 1
- 108700015872 N-acetyl-nor-muramyl-L-alanyl-D-isoglutamine Proteins 0.000 description 1
- 108700020354 N-acetylmuramyl-threonyl-isoglutamine Proteins 0.000 description 1
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 108010020346 Polyglutamic Acid Proteins 0.000 description 1
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000702670 Rotavirus Species 0.000 description 1
- WINXNKPZLFISPD-UHFFFAOYSA-M Saccharin sodium Chemical compound [Na+].C1=CC=C2C(=O)[N-]S(=O)(=O)C2=C1 WINXNKPZLFISPD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101100404032 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) arg6 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 102000019197 Superoxide Dismutase Human genes 0.000 description 1
- 108010012715 Superoxide dismutase Proteins 0.000 description 1
- 206010043376 Tetanus Diseases 0.000 description 1
- 102000009843 Thyroglobulin Human genes 0.000 description 1
- 108010034949 Thyroglobulin Proteins 0.000 description 1
- 102100031013 Transgelin Human genes 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 229940125691 blood product Drugs 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- KDPAWGWELVVRCH-UHFFFAOYSA-N bromoacetic acid Chemical compound OC(=O)CBr KDPAWGWELVVRCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000309464 bull Species 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N diethyl pyrocarbonate Chemical compound CCOC(=O)OC(=O)OCC FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 239000004931 filters and membranes Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 230000005021 gait Effects 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 150000002357 guanidines Chemical class 0.000 description 1
- 108060003552 hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003456 ion exchange resin Substances 0.000 description 1
- 229920003303 ion-exchange polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 239000000891 luminescent agent Substances 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L magnesium carbonate Chemical compound [Mg+2].[O-]C([O-])=O ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000001095 magnesium carbonate Substances 0.000 description 1
- 229910000021 magnesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 108700007621 mifamurtide Proteins 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 150000002989 phenols Chemical class 0.000 description 1
- 229920001515 polyalkylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920002643 polyglutamic acid Polymers 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 230000000379 polymerizing effect Effects 0.000 description 1
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 230000017702 response to host Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- YYGNTYWPHWGJRM-AAJYLUCBSA-N squalene Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-AAJYLUCBSA-N 0.000 description 1
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- TYFQFVWCELRYAO-UHFFFAOYSA-L suberate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCCCCCC([O-])=O TYFQFVWCELRYAO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 description 1
- JJAHTWIKCUJRDK-UHFFFAOYSA-N succinimidyl 4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate Chemical compound C1CC(CN2C(C=CC2=O)=O)CCC1C(=O)ON1C(=O)CCC1=O JJAHTWIKCUJRDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 150000007970 thio esters Chemical class 0.000 description 1
- 229960002175 thyroglobulin Drugs 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 238000003260 vortexing Methods 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/04—Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- A61K38/08—Peptides having 5 to 11 amino acids
- A61K38/09—Luteinising hormone-releasing hormone [LHRH], i.e. Gonadotropin-releasing hormone [GnRH]; Related peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/162—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
- C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/24011—Flaviviridae
- C12N2770/24211—Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
- C12N2770/24222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Public Health (AREA)
- Immunology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
Inventia se refera la o secventa de acid nucleic care nu se gaseste in mod normal in natura si contine o secventa nucleotidica de cel putin 8 nucleotide corespunzatoare unei secvente nucleotidice din genomul virusului hepatitei C, in care secventa de cel putin 8 nucleotide 2, 4 ... 6, 10 ... 12, 14 ... 16, 18 ... 22 din fig. 2a ... 2e, secventa regiunii 1 a invelisului, numerotata 24 ... 32 din fig. 3, secventele regiunii 5'UT, numerotate 34 ... 39 si 41 ... 51 din fig. 4a ... 4d si secventele regiunii corpului central, numerotate 52 ... 57 si 58 ... 66 din fig. 5a ... 5i. De asemenea, inventia descrie o peptida codificata de aceasta secventa de acid nucleic mentionata, capabila sa genereze o reactie imuna intr-o gazda si folosita ca agent imunogen.
Description
Prezenta invenție se referă la secvențe de acid nucleic pentru diagnostic și tratament și la peptide codificate de acestea cu utilizare în fabricarea produselor imunogene.
Se cunoaște prototipul izolat al virusului hepatitei C, care a fost caracterizat în cererea de brevet US 122714 (vezi.de asemenea, publicația EP 318216). Așa cum se folosește în prezenta invenție, termenul “HCV” include izolate noi ale acelea și specii virale. Cererea de brevet US 122714 se referă la termenul “HCV-1.
HCV este o boală transmisibilă deosebită de alte forme ale bolilor ficatului datorate virusurilor, incluzând pe cele cauzate de virusurile cunoscute ale hepatitei, ca virusul hepatitei A (HAV), virusul hepatitei B (HBV) și virusul hepatitei delta (HDV), la fel ca și hepatita indusă de citomegalovirus (HMV) sau de virusul Epstein-Barr (EBV).
Inițial, HCV a fost identificată la indivizi care au primit transfuzii de sânge.
De asemenea, se cunoaște că necesitatea preciziei este importantă pentru metodele specifice de examinare și identificare a purtătorilor de HCV și a sângelui contaminat cu HCV sau a produselor din sânge. Hepatita post-transfuzională (PTH) se întâlnește, la aproximativ 10% din pacienții transfuzați și HCV este răspunzător pentru, peste 90 % din aceste cazuri. Boala evoluează frecvent spre distrugerea cronică a ficatului (25... 55 %).
îngrijirea pacientului ca și prevenirea transmiterii HCV prin sânge și produse din sânge sau prin contact personal necesită instrumente sigure de examinare, diagnostic și prognoză pentru a detecta acizii nucleici, antigenele și anticorpii înrudiți cu HCV.
Problema, pe care o rezolvă invenția, este prezentarea unor informații genetice pentru noi secvențe de acid nucleic ale aceleași specii virale HCV, precum și peptidele codificate de acestea.
Secvența de acid nucleic care nu se găsește în mod normal în natură, conform invenției, conține o secvență de cel puțin 8 nucleotide, corespunzătoare unei secvențe nucleotidice din genomul virusului hepatitei C, care este aleasă dintre secvențele regiunii NS 5 numerotate 2, 4-6, 10-12, 14-16, 18-22 (fig. 2a-2e); secvența regiunii 1 a învelișului, numerotată 24-32; secvențele regiunii 5'UT numerotate 34-39 și 4151 (gig.4a-4d) și secvențele regiunii corpului central, numerotate 52-57 și 58-88 (fig.5a-5i).
Peptida, conform invenției, este codificată de o secvență nucleotidică de 8 sau mai multe nucleotide corespunzând unei secvențe din genomul virusului hepatitei C, secvența non-HCV-1 fiind selecționată dintre secvențele regiunii NS 5 numerotate 2, 4-6, 1D-12, 14-16 și 18-22 (fig.2d), secvența regiunii 1 a învelișului, numerotată 2432 (fig.3) și secvențele regiunii corpului central, numerotate 53-57 și 58-66 (fig.5a).
Prin aplicarea invenției se pot obține preparate imunogene noi pentru diagnosticul și terapia maladiilor provocate de HCV.
Informațiile din prezenta invenție prezintă câteva genotipuri HCV. Astfel, informația genetică a virusului HCV nu poate fi identică în totalitate pentru toate HCV, ci cuprinde grupuri cu informații genetice diferite.
Informația genetică este stocată în filamente analoage moleculelor ADN și
ARN. ADN-ul constă în lanțuri de deoxiribonucleotide, iar ARN-ul constă din lanțuri de ribonucleotide legate covalent. Fiecare nucleotidă este caracterizată prin una din următoarele patru baze: adenină (A), guanină (G), timină (T) și citozină (C). Bazele sunt
RO 117267 Bl complementare în sensul că. datorită orientării grupelor funcționale, unele baze se împerechează, atrăgându-se una pe alta prin legături de hidrogen și interacțiuni. Adenina dintr-o bandă ADN se împerechează cu timină dintr-o bandă complementară opusă. Guanina dintr-o bandă AND se împerechează cu citozină dintr-o bandă comple- 50 mentară opusă. în ARN timină este înlocuită prin uracil (U), care se împerechează cu adenina din banda complementară opusă. Codul genetic al organismelor vii este conținut în secvențe de baze perechi. Celulele vii interpretează, transcriu și translează informația acidului nucleic pentru a produce peptide și proteine.
Genomul HCV este cuprins într-o singură catenă pozitivă de ARN. Genomul 55 posedă un cadru translațional deschis de citire continuă. (ORS) codifică o poliproteină de aproximativ 3OOO aminoacizi. în (ORF) proteina (le) apare ca fiind codificată în aproximativ primul sfert al regiunii N-terminale, cu majoritatea poliproteinei responsabilă pentru proteinele nestructurale.
Poliproteină HCV cuprinde, de la regiunea amino terminală spre regiunea 60 carboxi terminală, proteina nucleocapsidei (C), proteina de înveliș (E) și proteinele nestructurale (NS) 1,2 (b), 3,4 (b) și 5.
HCV de diferite genotipuri poate codifica proteine care prezintă un răspuns modificat spre sistemele imune gazdă. HCV cu diferite genotipuri se detectează dificil prin tehnici de imunodiagnostic și sonde de acid nucleic care nu sunt orientate specific 65 spre un astfel de genotip.
Definițiile pentru termenii folosiți în prezenta invenție, sunt enumerate mai jos, pentru o mai ușoară înțelegere.
Termenul “corespunzător” înseamnă omolog la, sau complementar la o secvență particulară de acid nucleic. între acizi nucleici și peptide, corespunzător se 70 referă la aminoacizii unei peptide într-o succesiune derivată de la secvența unui acid nucleic sau a complementului său.
Termenul “acid nucleic care nu se întâlnește în mod natural” se referă la o porțiune a acidului nucleic genomic ADNc, acid nucleic semisintetic sau acid nucleic de origine sintetică, care, în virtutea originii sale sau a rezultatului manipulării: (1) nu este 75 asociat în totalitate cu acid nucleic cu care el este asociat în natură, (2) este legat la un acid nucleic sau alt agent chimic, altul decât cel la care el este legat în natură, sau (3) nu este întâlnit în natură.
în mod asemănător, termenul “peptidă care nu se întâlnește în mod natural “ se referă la o porțiune a unei peptide sau proteine mari întâlnite în mod natural sau 80 peptidă semisintetică sau sintetică, care în virtutea originii sale sau a manipulării: (1) nu este asociată în totalitate la o peptidă cu care ea este asociată în natură, și (2) este legată la peptide, grupări funcționale sau agenți chimici, alții decât cei la care este legată în natură sau (3) nu se întâlnește în natură.
Termenul “primer” se referă la un acid nucleic care este capabil să inițieze 85 sinteza unui acid nucleic mai mare atunci când este plasat în condiții corespunzătoare. Primerul este complet sau substanțial complementar la o regiune a acidului nucleic de copiat. Astfel, în condiții care determină hibridizarea, primerul se va fixa la o regiune complementară a unui acid nucleic mai mare. Adăugând reactanți adecvați, primerul se extinde prin agentul de polimerizare pentru a forma o copie a acidului 90 nucleic mai mare.
RO 117267 Bl
Termenul “legătură pereche” se referă la orice pereche de moleculă care prezintă afinitate mutuală sau capacitate de legare. Termenul “ligand” se referă la o moleculă a legăturii pereche și termenul “antiligand” sau “receptor” sau “țintă” se referă la molecula opusă a legăturii pereche. De exemplu, cu respectarea acizilor nucleici, o legătură pereche poate cuprinde doi acizi nucleici complementari. Unul din acizii nucleici poate fi desemnat ligandul și celălalt este desemnat antiligand, receptor sau țintă. Desemnarea ca ligand sau antiligand este convenită la întâmplare. Alte legături perechi cuprind prin exemplificare, antigeni și anticorpi, medicamente și locurile lor receptoare, enzimele și substraturile lor, pentru a numi doar câteva.
Termenul “marcat” se referă la o jumătate moleculară capabilă să fie recunoscută incluzând prin exemplificare, dar fără limitare, izotopii radioactivi, enzimele, agenții luminiscenți, agenții de precipitare și coloranții.
Termenul “suport” include suporturi convenționale, ca filtre și membrane, precum și suporturi recuperabile care pot fi substanțial dispersate într-un mediu și îndepărtate sau separate din mediu prin imobilizare, filtrare, separare sau altele. Termenul “mijloace de suport” se referă la suporturi capabile să fie asociate la acizi nucleici, peptide sau anticorpi prin partenerii lor de legare sau prin legături covalente sau necovalente.
Au fost identificate și izolate unele tulpini HCV. Când s-au comparat cu secvența izolatului inițial derivat din SUA (HCV-1, vezi Q.-L.Choo și alții (1989), Science 244:359-362, Q.-L-Choo și alții (1990), Brit. Med. Bull. 46:423-441, Q.-L-Choo și alții, Proc. Natl.Acad.Sci.88: 2451-2455 (1991) și publicația de Brevet European EP 318216 citată mai sus), s-a găsit că un izolat japonez (“HCV J1) diferă semnificativ în ambele secvențe nucleotidice și polipeptidice din regiunile NS3 și NS4. Această concluzie a fost extinsă mai târziu la regiunile NS5 și de înveliș (E1/S și E2/NS1 (vezi K.Taksuchi și alții J.Gen. Virol. (1990) 71:3027-3033, Z.Kubo, Nuci. Acids. Res.(1989), 17: 10367-10372 și K.Takeuchi și alții, Gene (1990), 91:287-291). Fostul grup de izolate, identificat inițial în SUA este numit în prezenta invenție “Genotip Γ, iar grupul ulterior de izolate, identificate inițial în Japonia este numit aici “Genotip II”.
Invenția prezintă și compoziții care cuprind acizi nucleici și peptide corespunzătoare genomului viral HCV care definește diferite genotipuri. De asemenea, prezenta invenție prezintă metode de folosire a compozițiilor corespunzătoare secvențelor genomului viral care definesc diferite genotipuri descrise.
Acidul nucleic din prezenta invenție, corespunzător genomului viral HCV, care definește diferite genotipuri, are aplicabilitate folosit în sonde pentru analize de hibridizare ale acidului nucleic, ca primer pentru reacții care cuprind sinteza acidului nucleic, ca parteneri de legare pentru separarea acidului nucleic viral HCV de alți constituenți care pot fi prezenți și ca acid nucleic antisens pentru prevenirea transcripției sau translației acidului nucleic viral.
realizare a invenției prezintă o compoziție care cuprinde un acid nucleic care nu este întâlnit în mod natural și care are o secvență de acid nucleic, de cel puțin, 8 nucleotide corespunzătoare unei secvențe nucleotidice non-HCV-1 din genomul virusului hepatitei C. De preferință, secvența nucleotidică este aleasă dintr-o secvență prezentă, în cel puțin o regiune, care constă din regiunea NS 5, regiunea învelișului
1, regiunea 5'UT și regiunea corpului central.
RO 117267 Bl
De preferință, respectând secvențele care corespund regiunii NS 5, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 2-22, secvența numerotata 1 corespunzând la HCV-1. Secvențele numerotate 1-22 sunt definite în lista de secvențe prezentată în invenție.
De preferință, respectând secvențele care corespund regiunii învelișului 1, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 24-32, secvența numărului 23 corespunzând la HCV-1. Secvențele numerotate 23-32 sunt enumerate în lista de secvențe ale invenției.
Respectând secvențele care corespund regiunilor 5'UT, de preferință, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 38-51. Secvența numărul 33 corespunde la HCV-1. Secvențele 33-51 sunt menționate în lista de secvențe ale invenției.
De preferință, respectând secvențele care corespund regiunii corpului central, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 53-66, secvența numărul 52 corespunzând la HCV-1. Secvențele 52-66 sunt prezentate în lista de secvențe ale prezentei invenții.
Compozițiile prezentei invenții formează produse de hibridizare cu acidul nucleic, care, corespunde diferitelor genotipuri ale HCV.
HCV a avut cel puțin cinci genotipuri la care se va face referință în această invenție, prin desemnările G1-GV. Primul genotip, Gl, este exemplificat prin secvențele numerotate 1-6, 23-25, 33-38 și 52-57. Al doilea genotip, Gll, este exemplificat prin secvențele numerotate 7-12, 26-28, 39-45 și 58-64. Al treilea genotip, Glii, este exemplificat prin secvențele numerotate 13-17, 32, 46-47 și 65-66. Al patrulea genotip, GIV, este exemplificat prin secvențele numerotate 20-22, 29-31 și 48-49. Al cincilea genotip, GV, este exemplificat prin secvențele numerotate 18, 19, 50 și 51.
O realizare a invenției prezintă compoziții care cuprind un acid nucleic care are o secvență corespunzătoare la una sau mai multe secvențe care exemplifică un genotip al HCV.
Realizări ale invenției de față prezintă, de asemenea, o metodă de formare a unui produs de hibridizare cu acid nucleic care are o secvență corespunzătoare acidului nucleic al HCV. O metodă cuprinde etapele plasării acidului nucleic care nu este întâlnit în mod natural, care are o secvență non-HCV-1, corespunzătoare acidului nucleic HCV în condiții în care se poate produce hibridizarea. Acidul nucleic absent în mod natural este capabil să formeze un produs de hibridizare cu acidul nucleic HCV, în condiții de hibridizare. Metoda următoare cuprinde etapa de impunere a condițiilor pentru formarea unui produs de hibridizare în prezența acidului nucleic corespunzător unei regiuni a genomului HCV.
Formarea unui produs de hibridizare a fost utilă pentru detectarea prezenței unuia sau mai multor genotipuri ale HCV. De preferință, acidul nucleic absent în mod natural, formează un produs de hibridizare cu acidul nucleic al HCV în una sau mai multe regiuni care cuprind regiunea NS 5, regiunea învelișului 1, regiunea 5'UT și regiunea corpului central. Pentru a detecta produsul de hibridizare, se folosește asocierea acidului nucleic absent în mod natural cu un marker. Formarea produsului de hibridizare este detectată prin separarea produsului hibridizării de acidul nucleic absent în mod natural, marcat, care nu a format un produs de hibridizare.
Formarea unui produs de hibridizare a avut utilitate ca mijloc de separare a unuia sau mai multor genotipuri de acid nucleic al HCV de alți constituenți potențial
140
145
150
155
160
165
170
175
180
RO 117267 Bl prezenți. Pentru astfel de aplicații, este folositoare asocierea acidului nucleic absent în mod natural, cu un suport pentru separarea de alți constituenți ai produsului de hibridizare rezultat.
“Analizele sandwich “ ale acidului nucleic folosesc un acid nucleic asociat cu un marker și un al doilea acid nucleic asociat cu un suport. Un mod de realizare a invenției prezintă o cercetare sandwich care cuprinde doi acizi nucleici, ambii având secvențe care corespund la acizii nucleici HCV; totuși, cel puțin un acid nucleic absent în mod natural a avut o secvență corespunzătoare acidului nucleic HCV, non-HCV-1. Cel puțin un acid nucleic este capabil de asociere cu un marker și altul este capabil de asociere cu un suport. Suportul asociat acidului absent în mod natural, se folosește pentru separarea produsului de hibridizare care include un acid nucleic HCV și acidul nucleic artificial, care are o secvență non-HCV-1.
Un mod de realizare a prezentei invenții descrie o metodă de detectare a unuia sau mai multor genotipuri ale HCV. Metoda cuprinde etapele de plasare a acidului nucleic artificial în condițiile în care este posibilă hibridizarea. Acidul nucleic artificial este capabil să formeze un produs de hibridizare cu acid nucleic de la unul sau mai multe genotipuri ale HCV.
Primul genotip, Gl, este identificat prin secvențele numerotate 1-6, 23-25, 3338 și 52-57. Al doilea genotip, Gll, este exemplificat prin secvențele numerotate 7-12, 26-28, 39-45 și 58-64. Al treilea genotip, Glii, este exemplificat prin secvențele numerotate 13-17, 32, 46-47 și 65-66. Al patrulea genotip, GIV, este exemplificat prin secvențele numerotate 20-22 și 29-31. Al cincilea genotip, GV, este exemplificat prin secvențele numerotate 18, 19, 50 și 51.
Produsul hibridizării acidului nucleic HCV cu acidul nucleic artificial care are secvența non-HCV-1, corespunzătoare secvențelor din genomul HCV a fost util pentru inițierea unei reacții pentru sinteza acidului nucleic.
Produsul hibridizării acidului nucleic HCV cu un acid nucleic artificial care are o secvență corespunzătoare unui genotip HCV particular, a fost util pentru inițierea unei reacții pentru sinteza acidului nucleic al acelui genotip.într-un mod de realizare, acidul nucleic sintetizat este un indiciu al prezenței unuia sau mai multor genotipuri ale HCV.
Sinteza acidului nucleic poate facilita, de asemenea, donarea acidului nucleic în vectorii de expresie care sintetizează proteinele virale.
Realizarea prezentelor metode are utilitate ca agenți antisens pentru prevenirea transcripției sau translației acidului nucleic viral. Formarea unui produs de hibridizare al acidului nucleic artificial, care are secvențe ce corespund unui genotip particular al genomului HCV secvențiat cu acidul nucleic HCV poate bloca translația sau transcripția unui astfel de genotip. Se pot obține agenți terapeutici care să includă toate cele cinci genotipuri.
realizare suplimentară a invenției prezintă o compoziție care cuprinde o peptidă care nu se întâlnește în natură, peptidă compusă din trei sau mai mulți aminoacizi care corespunde unui acid nucleic având o secvență non-HCV-1. De preferință, respectând peptidele corespunzătoare unui acid nucleic care are o secvență non-HCV1, a regiunii NS 5, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 2-22, secvența numerotată 1 corespunzând HCV-1. Secvențele numerotate 1-22 sunt definite în lista de secvențe de mai jos.
RO 117267 Bl
De preferință, respectând peptidele corespunzătoare acidului nucleic care are o secvență non-HCV-1 a regiunii învelișului 1, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 24-32, secvența numărul 23 corespunzând HCV-1. Secvențele numerotate 23-32 sunt menționate în lista de secvențe.
De preferință, respectând peptidele corespunzătoare care au o secvență nonHCV -1 orientată spre regiunea corpului central, secvența este aleasă dintre secvențele numerotate 53-66, secvența numărul 52 corespunzând HCV-1. Secvența 52-66 sunt prezentate în lista de secvențe ale prezentei invenții.
realizare suplimentară a invenției prezintă compoziții de peptide corespunzătoare secvențelor de acid nucleic al unui genotip al HCV. Primul genotip, Gl, este indentificat prin secvențele numerotate 1-6, 23-25, 33-38 și 52-57. Al doilea genotip, Gll, este exemplificat prin secvențele numerotate 7-12, 26-28, 39-45 și 58-64. Al treilea genotip, Glii, este exemplificat prin secvențele numerotate 13-17, 32, 46-47 și 65-66. Al patrulea genotip, GIV, este exemplificat prin secvențele numerotate 2022, 29-31 și 48-49. Al cincilea genotip, GV, este exemplificat prin secvențele numerotate 18, 19, 50 și 51.
Peptidele artificiale, ale prezentei invenții, se utilizează drept componente ale unui vaccin. Informația de secvență, a invenției de față, permite desemnarea vaccinurilor pentru toate sau doar pentru unele dintre diferitele genotipuri ale HCV. Orientarea unui vaccin spre un genotip particular permite ca tratamentul profilactic să fie făcut în așa fel, încât să mărească la maximum protecția față de acei agenți întâlniți. Orientarea unui vaccin, față de mai mult decât un genotip, permite acestui vaccin să fie mai cuprinzător.
Compozițiile de peptide sunt, de asemenea, utile pentru dezvoltarea de anticorpi specifici pentru proteinele HCV. O realizare a invenției de față prezintă o astfel de compoziție, un anticorp pentru peptide corespunzătoare unei secvențe non-HCV-1 a genomului HCV. De preferință, secvența non-HCV-1 este o secvență dintr-o regiune aleasă dintre regiunea NS 5, regiunea învelișului 1 și regiunea corpului central. Aici nu sunt peptide asociate cu regiunea 5'UT, netranslatate.
De preferință, respectând anticorpii direcționați spre peptidele regiunii NS 5, peptida corespunde unei secvențe dintre secvențele numerotate 2-22. Preferabil, respectând anticorpii orientați spre o peptidă corespunzătoare regiunii învelișului 1, peptida corespunde unei secvențe dintre secvențele numerotate 24-32. De preferință, respectând anticorpii orientați spre peptidele corespunzătoare regiunii corpului central, peptida corespunde unei secvențe dintre secvențele numerotate 53-66.
Anticorpii direcționați spre peptide care reflectă un genotip particular au utilizare pentru detectarea unor astfel de genotipuri ale HCV și ca agenți terapeutici.
într-un mod de realizare a invenției se prezintă un anticorp orientat spre o peptidă corespunzând acidului nucleic care are secvențe ale unui genotip particular.
Primul genotip, Gl, este indentificat prin secvențele numerotate 1-6, 23-25,
33-38 și 52-57. Al doilea genotip, Gll, este exemplificat prin secvențele numerotate
7-12, 26-28, 39-45 și 58-64. Al treilea genotip, Glii, este exemplificat prin secvențele numerotate 13-17, 32, 46-47 și 65-66. Al patrulea genotip, GIV, este exemplificat prin secvențele numerotate 20-22, 29-31 și 48-49. Al cincilea genotip, GV, este exemplificat prin secvențele numerotate 18, 19, 50 și 51.
230
235
240
245
250
255
260
265
270
RO 117267 Bl
Specialiștii din domeniu vor recunoaște cu ușurința, posibilitatea prezentării compozițiilor prezentei invenții împreună cu instrucțiunile pentru utilizare, sub forma unei truse pentru realizarea hibridizării acidului nucleic sau pentru reacții imunochimice.
Prezenta invenție va fi descrisă în detaliu ca un acid nucleic care are secvențe corespunzătoare genomului HCV, peptide înrudite și parteneri de legare pentru diagnostic și aplicații terapeutice.
Conform invenției, se folosesc, cu excepția cazurilor când se indică altfel, tehnici convenționale ale chimiei, biologiei moleculare, microbiologiei, ADN-ului recombinant și imunologiei, care sunt cunoscute în domeniu. Astfel de tehnici sunt explicate pe larg în literatură. Vezi, de exemplu, Maniatis, Fitsch & Sambrook, Molecular Cloning; A Laboratory Manual (1982); Dan Cloning, Volumele I și II (D.N. Glover ed. 1985); Oligonucleotide Synthesis (M.l. Gait ed. 1984); Nucleic Acid Hybridization (B.D. Hames & S.l. Higgins ed. 1984); seriile, Methodsîn Enzymology (Academic Press, Inc.), în special voi. 154 și 155 (WU și Grossman, ed.).
Stocurile ADNc sunt derivate de la secvențele de acid nucleic prezente în plasma unui cimpanzeu infectat HCV. Construcția unuia dintre aceste stocuri, stocul c” (ATCC nr.40.394) este descrisă în publicația PCT WO 90/14394). Secvențele stocului relevante pentru invenția de față sunt prezentate aici ca secvențele cu numerele 1, 25, 33 și 52.
Acizii nucleici izolați sau sintetizați, în concordanță cu prezenta invenție sunt utilizați, prin exemplificare, dar fără limitare, ca sonde, primeri, gene antisens și la dezvoltarea de sisteme de expresie pentru sinteza peptidelor corespunzătoare unor astfel de secvențe.
Secvențele de acid nucleic descrise definesc genotipuri HCV respectând patru regiuni ale genomului viral. Cele patru regiuni de interes special sunt regiunea NS 5, regiunea învelișului 1, regiunea 5' UT și regiunea corpului central. Secvențele menționate în prezenta invenție ca secvențe numerotate 1-22 sugerează cel puțin cinci genotipuri în regiunea NS 5. Fiecare secvență numerotată 1-22 este derivată de la acidul nucleic care are 340 nucleotide din regiunea NS 5.
Prin grupările secvențelor definite prin secvențele numerotate 1-23, se definesc cinci genotipuri. Pentru simplificare, în prezenta invenție, diferitele genotipuri sunt însemnate prin cifre romane și litera “G”.
Primul genotip, Gl, este identificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 1-6. Al doilea genotip, Gll, este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 7-12. Al treilea genotip, Glii, este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 13-17. Al patrulea genotip, GIV, este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 20-22. Al cincilea genotip, GV, este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 18 și 19.
Secvențele menționate, în prezenta invenție, ca secvențe numerotate 23-32 sugerează cel puțin patru genotipuri în regiunea învelișului 1 al HCV. Fiecare secvență numerotată 23-32 este derivată de la acidul nucleic care are 100 de nucleotide în regiunea învelișului 1.
Primul genotip al grupului învelișului 1 (G1) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 23-25. Al doilea genotip din regiunea învelișului 1 (Gll) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 26-28. Al treilea genotip
RO 117267 Bl
325 al regiunii de înveliș 1 (Glii) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 32. Al patrulea genotip de înveliș 1 (GIV) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 29-31.
Secvențele menționate în prezenta invenție numerotate 33-51 sugerează cel puțin trei genotipuri în regiunea 5'UV a HCV. Fiecare secvență numerotată 33-51 este derivată din acidul nucleic care are 252 nucleotide în regiunea 5'UT, deși secvențele 50 și 51 sunt într-un fel mai scurte de aproximativ 180 nucleotide.
Primul genotip 5'UT (Gl) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 33-38. Al doilea genotip 5'UT (Gll) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 39-45. Al treilea genotip 5'(GIII) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 46-47. Al patrulea genotip 5'UT (GIV) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 50 și 51.
Secvențele numerotate 48-62 sugerează cel puțin trei genotipuri în regiunea corpului central al HCV.
Primul genotip al regiunii corpului central (Gl) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 52-57. Al doilea genotip al regiunii corpului central (Gll) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 58-64. Al treilea genotip al regiunii corpului central (Glii) este exemplificat prin secvențe dintre secvențele numerotate 65 și 66. Secvențele numerotate 52-65 au 549 nucleotide. Secvența numerotată 66 are 510 nucleotide.
Diferitele genotipuri descrise respectând fiecare regiune sunt consecvente. Astfel, HCV având trăsături ale primului genotip cu respectarea regiunii NS 5 va fi în mare parte conform cu trăsăturile primului genotip al regiunii învelișului 1, regiunii 5'UT și al regiunii corpului central.
Acidul nucleic izolat sau sintetizat în conformitate cu secvențele numerotate 1 66 poate fi folosit ca sonde, primeri, liganzi de captură și agenți antisens. Acidul nucleic va avea în mod normal aproximativ 8 sau mai multe nucleotide pentru specificitate, ca și capacitatea de a forma produse hibridizate stabile.
Sonde. Un acid nucleic izolat sau sintetizat în conformitate cu o secvență care definește un genotip particular al unei regiuni a genomului HCV poate fi folosit ca o sondă pentru a detecta un astfel de genotip, sau poate fi folosit în combinație cu alte sonde de acid nucleic pentru a determina substanțial toate genotipurile HCV.
Cu informația de secvență menționată în prezenta invenție sunt indentificate secvențe de 8 sau mai multe nucleotide care asigură exclusivitatea sau inclusivitatea dorită cu respectarea diferitelor genotipuri din HCV și secvențe de acid nucleic străin, foarte probabil să fie întâlnite în timpul condițiilor de hibridizare.
Specialiștii în domeniu vor recunoaște cu ușurință că secvențele de acid nucleic vor fi prevăzute cu un marker, astfel, încât să ușureze detectarea unui produs de hibridizare.
Ligand de captură. Pentru utilizare ca ligand de captură, acidul nucleic ales în modul descris mai sus cu respectarea sondelor, poate fi ușor asociat cu suporturi. Modul în care acidul nucleic ca ester este asociat cu suporturi este binecunoscut. Acidul nucleic care are secvențe corespunzătoare unei secvențe dintre secvențele numerotate 2-66 are utilitate pentru separarea acidului nucleic viral al unui genotip diferit al HCV. Acidul nucleic, izolat sau sintetizat în conformitate cu secvențe dintre secvențele numerotate 1-66, folosit în combinații, are utilitate pentru capturarea aproape în întregime, a acidului nucleic al tuturor genotipurilor HCV.
330
335
340
345
350
355
360
365
RO 117267 Bl
Primeri. Acidul nucleic, izolat sau sintetizat, în conformitate cu secvențele descrise aici, este util ca primer pentru amplificarea secvențelor HCV. Conform tehnicilor reacției în lanț a polimerazei (PCR), secvențele de acid nucleic de 8 sau mai multe nucleotide corespunzătoare la una sau mai multe secvențe dintre secvențele numerotate 1-66, legate cu enzime și reactivi adecvați, sunt utile pentru a crea copii ale acidului nucleic viral. Mai mulți primeri care au secvențe diferite corespunzătoare la mai mult decât un genotip, pot fi folosiți pentru a creea copii ale acidului nucleic viral pentru astfel de genotipuri. Copiile se pot folosi în analize de diagnostic pentru detectarea virusului HCV. Copiile pot fi, de asemenea, încorporate în vectori de donare și expresie pentru generarea de polipeptide corespunzătoare acidului nucleic sintetizat prin PCR, așa cum se va descrie în continuare.
Antisens. Acidul nucleic izolat sau sintetizat conform cu secvențele descrise, se poate folosi ca agent antisens pentru prevenirea expresiei HCV.
Acidul nucleic corespunzător unui genotip al HCV este depus într-un purtător adecvat unui lipozom pentru introducerea într-o celulă infectată cu HCV. Un acid nucleic care are 8 sau mai multe nucleotide are posibilitatea să se lege la acidul nucleic viral sau la ARN-ul mesager viral. De preferință, acidul nucleic antisens este compus din 40 sau mai multe nucleotide pentru asigurarea stabilității necesare unui produs de hibridizare al acidului nucleic viral sau a ARN-ului mesager viral. Metodele pentru încărcarea acidului nucleic antisens sunt cunoscute în domeniu, așa cum se exemplifică în brevetul US 4241046/23.12.1980 a lui Papahadjopoulos și colectiv.
Sinteza de peptide. Acidul nucleic izolat sau sintetizat în conformitate cu secvențele descrise se poate folosi pentru generarea de peptide. Secvențele exemplificate prin secvențele numerotate 1 -32 și 52-66 pot fi donate în vectori potriviți sau pot fi folosite pentru a izola acid nucleic. Acidul nucleic izolat se combină cu linkeri ADN adecvați și se donează într-un vector corespunzător; vectorul se folosește pentru transformarea unui organism gazdă adecvat, cum ar fi, E.coli și peptida se codifică prin secvențele izolate.
Tehnici de donare moleculară sunt descrise în lucrarea Molecular Cloning: A Loboratory Manual, Maniatis și alții; Coldspring Harbor Laboratory (1982).
Peptida izolată a fost utilizată ca substanță antigenică pentru dezvoltarea de vaccinuri și anticorpi direcționați spre genotipul particular al HCV.
Vaccinuri și anticorpi. Materialele peptidice, conform invenției, sunt utile pentru dezvoltarea de anticorpi și vaccinuri.
Accesibilitatea secvențelor ADNc sau a secvențelor nucleotidice derivate de la acestea (incluzând segmente modificări ale secvenței), permite construirea de vectori de expresie care codifică regiuni antigenice active ale peptidei codificate în oricare catenă. Regiunile antigenice active pot fi derivate din regiunea NS 5, regiunile învelișului 1 și regiunea corpului central.
Fragmentele care codifică peptidele dorite sunt derivate de la clonele ADNc prin folosirea (restricția de) digestiei de restricție convențională sau prin metode sintetice și ligate în vectori care pot, de exemplu, să conțină porțiuni de secvențe fuzionate, precum beta-galactozidaza sau superoxidismutaza (SOD), de preferință, SOD. Metode și vectori care pot fi folosiți pentru producerea de polipeptide care conțin secvențe fuzionate ale SOD sunt descrise în publicația EP 0196056, din 01.10.1986.
RO 117267 Bl
Orice porțiune a ADNc HCV, care conține un cadru de citire deschis, în orice sens al catenei, poate fi obținută ca o peptidă recombinantă, asemenea unei proteine mature sau fuzionate; alternativ, o peptidă codificată în ADNc, poate fi asigurată prin sinteză chimică.
ADN-ul care codifică peptida dorită în forma fuzionată sau matură, și atunci când conține și atunci când nu conține o secvență semnal care să permită secretarea, poate fi ligat în vectori de expresie adecvați pentru orice gazdă convenabilă. Ambele sisteme gazdă, eucariotic și procariotic sunt folosite <în prezent pentru formarea peptidelor recombinante. Peptida este apoi izolată din celulele lizate sau din mediul de cultură și apoi, purificate. Purificarea se poate face prin tehnici cunoscute în domeniu, de exemplu, extracție diferențială, fracționare salină, cromatografie pe rășini schimbătoare de ioni, cromatografie de afinitate, centrifugare și altele asemenea. A se vedea, de exemplu, Methods in Enzymology pentru o varietate de metode de purificare a proteinelor. Astfel de peptide pot fi folosite pentru diagnosticare sau, acelea care dau rezultate pentru neutralizarea anticorpilor, se pot formula ca vaccinuri. Anticorpii apăruți împotriva acestor peptide pot fi, de asemenea, folosiți în diagnostice, sau pentru imunoterapie pasivă sau pentru izolarea și identificarea HCV.
regiune antigenică a unei peptide este, în general, relativ mică- tipic 8-10 amînoacizi sau mai puțin, în lungime. Fragmente, nu mai mici de cinci amînoacizi pot caracteriza o regiune antigenică. Aceste segmente pot corespunde regiunii NS 5, regiunii învelișului 1 și regiunii corpului central al genomului HCV. Regiunea 5' UT nu este cunoscută ca fiind translată. Prin urmare, folosind ADNc solubil al acestei regiuni, ADNc care codifică segmente scurte ale peptidelor HCV, corespunzătoare la astfel de regiuni, pot fi exprimate recombinant, fie ca proteine fuzionate, fie ca peptide izolate. în plus, secvențe scurte de amînoacizi pot fi obținute convenabil prin sinteză chimică. Ca urmare, când peptida sintetizată este configurată corect, astfel, încât să asigure epitopul corect, dar ea nu este prea mică pentru a fi imunogenă, peptida poate fi legată la un purtător corespunzător. Pentru obținerea unor astfel de legături sunt cunoscute tehnici în domeniu, incluzând formarea de legături disulfidice folosind N-succinimidil-3-(2-piridiltio)propionat (SPOP) și succinimidil 3-(N-maleinimido-metil) ciclohexan-1-carboxilat (SMCC) obținute de la Pierce Company, Rockford, lllinois, (dacă peptida pierde un grup sulfhidric, acesta poate fi asigurat prin adăugarea unui rest cisteinic). Acești reactivi dau naștere la o legătură disulfidică între ei și restul cisteinic al peptidei pe o proteină și o legătură amidică printr-un amino-epsilon pe o lizină sau alte grupe amino libere. Sunt cunoscuți diverși agenți formatori de disulfid/amidă. Vezi de exemplu Immun. Rev. (1982), 62: 185. Alți agenți bifuncționali de cuplare formează mai degrabă un tioester decât o legătură disulfidică. Mulți dintre acești agenți formatori de tioesteri sunt accesibili comercial și includ esteri reactivi ai acidului 6maleimidocaproic, acidului 2-bromoacetic, acidului 2-iodoacetic, acidului 4-(Nmaleimido-metil)ciclohexan-1-carboxilic și alții asemănători. Grupările carboxil pot fi activate prin combinarea lor cu succinimidă, acid 1-hidroxil-2-nitro-sulfonic sau sare de sodiu. Metode suplimentare de cuplare a antigenilor folosesc sistemul rotavirus “peptidă legată”, descris în publicația EP 0245149.
Poate fi folosit orice purtător care nu induce el însuși producerea de anticorpi dăunători pentru gazdă. Purtători adecvați sunt, de obicei, macromolecule mari, metabolizate lent precum proteine; polizaharide precum latex funcțional, sepharoză,
415
420
425
430
435
440
445
450
455
RO 117267 Bl agaroză, celuloză, celuloză perlată și altele; aminoacizi polimerici ca acid poliglutamic, polilizină și altele; copolimeri de aminoacizi și particule virale inactive. Substratele proteice folosite sunt în special, albuminele serice, hemocianina, molecule de imunoglobulină, tiroglobulină, ovalbumină, toxoizi tetanici și alte proteine binecunoscute specialiștilor în domeniu.
Peptidele care cuprind secvențe de aminoacizi HCV care codifică cel puțin un epitop viral derivat din NS 5, învelișul 1 și regiunea corpului central sunt utilizate ca reactivi imunologici. Regiunea 5'UT nu este cunoscută a fi translată. De exemplu, peptidele care cuprind astfel de secvențe scurtate pot fi folosite ca reactivi în imunocercetări, de asemenea, aceste peptide sunt subunități antigene în compozițiile pentru producerea de antiser sau vaccinuri. în timp ce secvențe scurtate pot fi produse prin diferite tratamente cunoscute ale proteinei virale native, este în general, preferat să fie obținute peptide sintetice sau recombinante care cuprind secvența HCV. Peptidele care cuprind aceste secvențe scurte HCV pot fi formate în întregime din secvențe HCV (unul sau mai mulți epitopi, învecinați sau distanțați) sau secvențe HCV și secvențe heteroloage dintr-o proteină fuzionată. Folosirea secvențelor heteroloage include secvențe care asigură secreția dintr-o gazdă recombinantă crescând reactivitatea imunologică a epitopului (lor) HCV, sau facilitând cuplarea polipeptidei la un suport de imunocercetare sau un purtător de vaccin. A se vedea, de exemplu, publicația EP 110201, brevetul US 4722840, publicația EP 259148; brevetul US 4629783.
Mărimea peptidelor care cuprind secvențe scurte HCV poate varia foarte mult, mărimea minimă fiind o secvență de mărime suficientă pentru a asigura un epitop HCV, în timp ce mărimea maximă nu este definită. Pentru comoditate, mărimea maximă nu este substanțial mai mare decât cea necesară pentru a asigura epitopii doriți HCV și funcția (ile) secvenței heteroloage, oricare ar fi. Tipic, secvențele aminoacide HCV scurte vor fi în gama, de aproximativ 5 până la 100 aminoacizi în lungime. Mai precis, totuși, secvența HCV va fi, de maximum, aproximativ 50 aminoacizi. De obicei, este de dorit să se aleagă secvențe HCV cu cel puțin 10, 12 sau 15 aminoacizi până la un maxim în jur de 20 sau 25 aminoacizi.
Secvențele aminoacide HCV care cuprind epitopi pot fi identificate pe mai multe căi. De exemplu, întreaga secvență a proteinei corespunzătoare fiecărei regiuni NS 5, înveliș 1 și corpului central, poate fi selectată prin prepararea unei serii de peptide scurte care împreună cuprind întreaga secvență de proteină a unor astfel de regiuni, începându-se de exemplu, cu peptide de 100 aminoacizi ar fi doar o chestiune de rutină să se testeze fiecare peptidă pentru prezența epitopului (lor) care prezintă o reactivitate dorită și apoi, să se testeze progresiv fragmente mai mici și să se suprapună fragmentele de la o peptidă identificată dini00 aminoacizi pentru a configura epitopul de interes. Cercetarea unor astfel de peptide printr-un imunotest este la îndemâna specialistului în domeniu. Este cunoscută, de asemenea, realizarea unei analize pe computer a unei secvențe proteice pentru identificarea epitopilor și apoi, prepararea de peptide care cuprind regiunile identificate.
Imunogenitatea epitopilor HCV poate fi, de asemenea, îmbunătățită prin prepararea lor în sinteze fuzionate în drojdii sau mamifere, asamblate cu particule care formează proteina, precum, de exemplu, cele asociate cu antigenul de suprafață al hepatitei B. (Vezi, de exemplu, brevetul US 4722840). Construcțiile în care epitopul HCV este legat direct la particule formatoare de proteină care codifică secvențe produc
RO 117267 Bl hibrizi imunogeni cu respectarea epitopului HCV. în plus, toți vectorii preparați includ epitopi specifici față de HCV, care au diferite grade de imunogenitate, precum, de exemplu, peptidă pre-S. Astfel, particulele construite de la particulele formatoare de proteină care includ secvențe HCV sunt imunogene față de HCV și HBV.
Antigenul de suprafață al hepatitei (HBSAg) s-a demonstrat a fi format în particule în S.Cerevisiae (P.Valenzuela) și alții (1982),ca și în, de exemplu, celule de mamifere (P.Valenzuela) și alții (1984). Formarea unor astfel de particule a arătat mărirea imunogenității subunității monomere. Construcțiile pot să includă, de asemenea, epitopul imunodominant al HBSAg, care cuprinde 55 de aminoacizi ai regiunii de presuprafață (pre-S), Neurath și alții (1984). Construcții de particule pre-SΉBSAg exprimabile în drojdie sunt prezentate în publicația EP 174444, din 19 martie 1986. Hibrizi care includ secvențe heteroloage virale pentru expresie în drojdie sunt prezentați în publicația EP 175261, din 26 martie 1986. Aceste construcții pot fi exprimate, de asemenea, în celule de mamifere precum celule ovariene de hamster chinezesc (CHO), celule care folosesc un vector SV 40-dihidrofolatreductoză (Michelle și alții, 1984).
în plus, porțiuni din particula formatoare de proteină care codifică secvența pot fi înlocuite cu codoni care codifică un epitop HCV. în această înlocuire regiunile care nu sunt necesare pentru medierea agregării subunităților pentru a forma particule imunogene în drojdie, pot fi îndepărtate eliminând astfel siturile antigene adiționale HBV de la competiție cu epitopul HCV.
Vaccinuri. Pot fi preparate vaccinuri de la una sau mai multe peptide imunogene derivate dela HCV. Homologia observată între HCV și flavivirusuri asigură informația referitoare peptidelor care sunt probabil cele mai eficiente ca vaccinuri ca și regiunile genomului în care ele sunt codificate.
Vaccinuri multivalente împotriva HCV pot să cuprindă unul sau mai mulți epitopi de la una sau mai multe proteine derivate din regiunile NS 5, învelișul 1 și corpul central. Regiunea 5'Ut nu este cunoscută ca fiind translată.
Prepararea vaccinurilor care conțin o peptidă imunogenă ca ingredient activ este cunoscută pentru un specialist în domeniu. De obicei, astfel de vaccinuri sunt preparate ca injectabile, fie ca soluții, fie ca suspensii, forme solide potrivite pentru solubilizare sau suspendare în lichid înaintea injectării putând fi, de asemenea, preparate. Preparatul poate fi, de asemenea, emulsionat sau proteina poate fi încapsulată în lipozom. Ingredientele imunogene active sunt adeseori amestecate cu excipiente acceptabile farmaceutic și compatibile cu ingredientul activ. Excipientele adecvate sunt, de exemplu, apă, soluție salină, dextroză, glicerol, etanol, sau combinații ale acestora. în plus, dacă se dorește, vaccinul poate conține cantități mici de substanțe auxiliare, precum agenți hidrofili sau emulgatori, agenți de tamponare a pH-ului și/sau adjuvanți care măresc eficacitatea vaccinului. Exemple de adjuvanți care pot fi eficienți includ, dar nu se limitează la: hidroxid de aluminiu, N-acetil-muranil-L-treonil-T-izoglutamină (thr-MDP), N-acetil-nor-muranil-L-alanil-D-izoglutamină (CGP 11637, cunoscut ca nor-MDP), N-acetilmuranil-L·alani^D-izoglutamil-N-alanil-2-(1-2-dipalmitoil-s,n-glicero-
3-hidroxifosforiloxi)-etilamina (CGP 19835 A, cunoscut ca NTP-PE) și RIBI care conține trei componente extrase din bacterii, monofosforillipid A, dimitolat de zaharoză și structuri din perete celular (MPL +PDM +CNS) într-o emulsie 2% squalen/Tween 80.
505
510
515
520
525
530
535
540
545
550
RO 117267 Bl
Eficacitatea unui adjuvant poate fi determinata prin măsurarea cantității anticorpilor îndreptați împotriva unei peptide imunogene care cuprinde o secvență antigenă
HCV rezultată prin administrarea acestei peptide în vaccinuri care sunt cuprinse, de asemenea, în diverși adjuvanți.
Vaccinurile sunt administrate convențional parenteral prin injectare, de exemplu, atât subcutanat, cât și intramuscular.
Suplimentar, formulările care sunt potrivite pentru alte moduri de administrare includ supozitoare și, în unele cazuri, formulări orale. Pentru supozitoare, lianții și purtătorii tradiționali pot include, de exemplu, polialchilenglicoli sau trigliceride; astfel de supozitoare pot fi formate din amestecuri care conțin ingredientul activ în domeniu 0,5 până la 10 %, de preferință, 1 ...2 %. Formulările orale includ excipiente folosite, de obicei, ca de exemplu, sortimente farmaceutice de manitol, lactoză, amidon, stearat de magneziu, zaharină sodică, celuloză, carbonat de magneziu și alții asemenea.
Invenția este avantajoasă prin faptul că prezintă informații genetice pentru noi secvențe de acid nucleic ale speciei virale HCV, precum și pentru peptidele codificate ale acestora.
în continuare se dau 5 exemple de realizare a invenției, în legătură și cu fig. 1 ...5, care reprezintă:
- fig.1, schema organizării genetice a HCV;
- fig.2, secvențele de acid nucleic numerotate 1-22, secvențe care sunt derivate de la regiunea NS 5 a genomului viral HCV;
- fig.3, secvențele de acid nucleic numerotate 23-32, secvențe care sunt derivate de la regiunea învelișului 1 a genomului viral HCV;
- fig.4, secvențele de acid nucleic numerotate 33-51, secvențe care sunt derivate de la regiunea 5'UT a genomului viral HCV și
- fig.5, secvențele de acid nucleic numerotate 52-66, secvențe care sunt derivate de la regiunea corpului central al genomului viral HCV.
Lista de secvențe prezintă secvențele numerotate 1-147.
Exemplul 1. Detectarea ARN-ului HCV din seruri
ARN-ul se extrage din seruri folosind sare de guanidină, fenoli și cloroform, în conformitate cu instrucțiunile fabricantului trusei (RNAzol™ Bkit, Cinna/Biotecx). ARNul extras se precipită cu izopropanol și se spală cu etanol. Se prelucrează un total de 25 pl seruri pentru izolarea ARN. ARN-ul purificat se resuspendă în 5 pl dietilpirocarbonat apos pentru sinteza în continuare a ADNc.
Exemplul 2. Sinteza ADNc și reacția În lanț a polimerazei [PCR]
Tabelul 1 listează secvența și poziția (cu referire la HCV 1) a tuturor primerilor PCR și a sondelor folosite în aceste exemple. Semnificația literelor pentru nucleotide este consecventă cu 37 C.F.R. 551 821-1825. Astfel, literele A,C,G,T și U sunt folosite în sensul obișnuit de adenină, citozină, guanină, timină și uracil. Litera M înseamnă A sau C; R înseamnă A sau G; W înseamnă A sau T/U; S înseamnă C sau G; Y înseamnă C sau T/U; K înseamnă G sau T/U; V înseamnă A sau C sau G, nu T/U; H înseamnă A sau C sau T/U, nu G; D înseamnă A sau G sau T/U, nu C; B înseamnă C sau G sau T/U, nu A; N înseamnă (A sau C sau G sau T/U) sau (necunoscut). în continuare, se prezintă tabelul 1:
RO 117267 Bl
595
Tabelul 1
| Secvența numărul | Secvența (5'-3‘) | Poziția nucleotidei |
| 67 | CAAACGTAACACCAACCGRCGCCCACAGG | 374-402 |
| 68 | ACAGAYCCGCAKAGRTTCCCCACG | 1182-1169 |
| 69 | GGAACCTCGAGGTAGACGTCAGCCTATCCC | 509 - 538 |
| 70 | GCAACCTCGTGGAAGGCGACAACCTATCCC | 509 - 538 |
| 71 | GTCACCAATGATTGCCCTAACTCGAGTATT | 948-977 |
| 72 | GTCACGAACGACTGCTCCAACTCAAG | 948 - 973 |
| 73 | TGGACATGATCGCTGGWGCYCACTGGGG | 1375-1402 |
| 74 | TGGAYATGGTGGYGGGGGCYCACTGGGG | 1375-1402 |
| 75 | ATGATGAACTGGTGVCCYAC | 1308-1327 |
| 76 | ACCTTVGCCCAGTTSCCCRCCATGGA | 1453 - 1428 |
| 77 | AACCCACTCTATGYCCGGYCAT | 205 - 206 |
| 78 | GAATCGCTGGGGTGACCG | 171 - 188 |
| 79 | CCATGAATCACTCCCCTGTGAGGAACTA | 30-57 |
| 80 | TTGCGGGGGCACGCCCAA | 244 - 227 |
600
605
610
Pentru sinteza ADNc și amplificarea PCR, a fost dezvoltat de către PerkinElmer/Cetus (gene Amp® RNA PCR kit), următorul protocol. S-au folosit pentru a iniția reacția de transcipție reversă (RT) un hexamer și primeri oarecare, dar având secvență cu complementaritate specifică față de HCV. Toate procesele, exceptând adăugarea și amestecarea componentelor reacției, s-au realizat într-o centrifugă termostatată (MJ Reserch, Inc). Reacția de sinteză a primei catene ADNc s-a inactivat, la 99°C pentru 5 min și apoi, s-a răcit, la 5O°C pentru 5 min, înainte de adăugarea componentelor de reacție pentru amplificarea în continuare. După cinci cicluri inițiale, de 97°C pentru 1 min, 50°C pentru 2 min și 72°C pentru 3 min, 30 cicluri de 94°C pentru 1 min, 55°C pentru 2 min și 72°C pentru 3 min, urmată apoi, de 7 min a elongației, la 72°C.
Pentru analiza de genotip, s-au folosit ca primeri în reacția PCR, secvențele 67 și 68. Acești primeri amplifică un segment corespunzător regiunilor corpului central și învelișului. După amplificare, produsele de reacție s-au separat pe un gel de agaroză și apoi s-au transferat pe o membrană de nylon. Produsele de reacție imobilizate au permis să se hibridizeze cu un acid nucleic marcat P32, care corespunde la Genotipul I (corpul central al învelișului 1). Acidul nucleic care corespunde Genotipului I cuprinde secvențe numerotate 69 (corp central), 71 (înveliș) și 73 (înveliș). Acidul nucleic care corespunde Genotipului II cuprinde secvențele numerotate 70 (corp central), 72 (înveliș) și 74 (înveliș).
Sondele genotipului I au hibridizat numai la produsul amplificat din izolate care au avut secvența Genotipului I. Similar, sondele Genotipului II au hibridizat numai la produsul amplificat din izolate care au avut secvența Genotipului II.
615
620
625
630
635
RO 117267 Bl în alt experiment, produsele PCR au fost generate folosind secvențele 79 și 80.
Produsele au fost analizate cum s-a descris mai sus, exceptând secvența numărul 73 folosită pentru a detecta Genotipul I, secvența numărul 74 folosita pentru a detecta
Genotipul III și secvența numărul 78 (5'UT) folosită pentru a detecta Genotipul IV.
Fiecare secvență a hibridizat într-un genotip în mod specific.
Exemplul 3. Detectarea de HCV GI-GIV folosind o cercetare de hibridizare sandwich pentru ARN HCV în acest exemplu este descrisă o cercetare de hibridizare sandwich cu acid nucleic aflat în fază de soluție. Cercetarea folosește câteva sonde cu efect de captură și detecție. 0 sondă captură de acid nucleic este capabilă să asocieze o sondă complementară legată la un suport solid și acidul nucleic HCV pentru a efectua captura. 0 sondă de detecție de acid nucleic a avut un prim segment (A) care se leagă la acidul nucleic HCV și un al doilea segment (B) care se hibridizează la un al doilea acid nucleic de amplificare. Acidul nucleic de amplificare a avut un prim segment (B') care hibridizează la segmentul (B) al sondei de acid nucleic și cuprinde, de asemenea, 15 repetiții ale unui segment (C). Segmentul C al acidului nucleic de amplificare este capabil de hibridizare la 3 acizi nucleici marcați.
Secvențe de acid nucleic care corespund la secvențele nucleotidice ale genei învelișului 1 a Grupului I de izolate HCV sunt menționate în secvențele numerotate 8189. Tabelul 2 menționează domeniul genomului HCV la care corespund secvențele de acid nucleic și folosirea preferată a secvențelor.
Tabelul 2
| Tipul de sondă | Secvența nr. | Complement al nr. nucleotidelor |
| marcat | 81 | 879-911 |
| marcat | 82 | 912-944 |
| captură | 83 | 945-977 |
| marcat | 84 | 978-1010 |
| marcat | 85 | 1011-1043 |
| marcat | 86 | 1044-1076 |
| marcat | 87 | 1077-1108 |
| captură | 88 | 1110-1142 |
| marcat | 89 | 1143-1147 |
| marcat | 90 | 1176-1208 |
| marcat | 91 | 1209-1241 |
| marcat | 92 | 1242-1274 |
| captură | 93 | 1275-1307 |
| marcat | 94 | 1308-1340 |
| marcat | 95 | 1341-1373 |
| marcat | 96 | 1374-1406 |
| marcat | 97 | 1407-1439 |
| captură | 98 | 1440-1472 |
| marcat | 99 | 1473-1505 |
RO 117267 Bl
Secvențele de acid nucleic care corespund la secvențele nucleotidice ale genei învelișului 1 al Grupului II de izolate HCV sunt prezentate în secvențele 100-118. 680
Tabelul 3 prezintă domeniul genomului HCV la care corespunde acidul nucleic și folosirea preferată a secvențelor.
Tabelul 3
| Tipul de sondă | Secvența nr. | Complement al nr. nucleotidelor |
| marcat | 1OO | 879-911 |
| marcat | 101 | 912-944 |
| captură | 102 | 945-977 |
| marcat | 103 | 978-1010 |
| marcat | 104 | 1011-1043 |
| marcat | 105 | 1044-1076 |
| marcat | 106 | 1077-1109 |
| captură | 107 | 1110-1142 |
| marcat | 108 | 1143-1175 |
| marcat | 109 | 1176-1208 |
| marcat | 110 | 1209-1241 |
| marcat | 111 | 1242-1274 |
| captură | 112 | 1275-1307 |
| marcat | 113 | 1308-1340 |
| marcat | 114 | 1341-1373 |
| marcat | 115 | 1374-1406 |
| marcat | 116 | 1407-1439 |
| captură | 117 | 1440-1472 |
| marcat | 118 | 1473-1505 |
685
690
695
700
705
Secvențele de acid nucleic care corespund la secvențele nucleotidice din regiunea genei C și 5'UT sunt secvențele 119-145. Tabelul 4 identifică secvența cu folosire preferată.
710
Tabelul 4
| Tipul sondei | Secvența nr. |
| captură | 119 |
| marcat | 120 |
| marcat | 121 |
715
RO 117267 Bl
Tabelul 4 [continuare)
| Tipul sondei | Secvența nr. |
| marcat | 122 |
| captură | 123 |
| marcat | 124 |
| marcat | 125 |
| marcat | 126 |
| captură | 127 |
| marcat | 128 |
| marcat | 129 |
| marcat | 130 |
| captură | 131 |
| marcat | 132 |
| marcat | 133 |
| marcat | 134 |
| marcat | 135 |
| captură | 136 |
| marcat | 137 |
| marcat | 138 |
| marcat | 139 |
| captură | 140 |
| marcat | 141 |
| marcat | 142 |
| marcat | 143 |
| captură | 144 |
| marcat | 145 |
Sonda de captură și detectarea specifică a segmentelor HCV și respectiv, numele lor, așa cum s-a folosit în această cercetare au fost după cum urmează:
Secvențe captură sunt secvențele numerotate 119-122 și 141-144.
Secvențele numerotate 119-140 sunt secvențe de detecție.
Fiecare secvență conține în plus față de secvențele substanțial complementare la secvențele HCV, o extensie (B) la 5', care extensie (B) este complementară la un segment al celui de al doilea acid nucleic de amplificare. Secvența de extensie (B) este identificată în lista de secvențe cu secvența având numărul 146 și este reprodusă mai jos:
AGGCATAGGACCCGTGTCTT
RO 117267 Bl
Fiecare secvență de captură conține în plus față de secvențele substanțial complementare la secvențele HCV, o secvență complementară la ADN legat la o fază solidă. Secvența complementară la ADN legată la un suport solid s-a realizat în aval de secvența de captură. Secvența complementară la ADN-ul legat la suport este menționată ca secvența numărul 147 și este reprodusă în continuare:
CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG.
Plăcile de microtitrare s-au preparat după cum urmează: S-au procurat benzi White Microlite 1 Removawell (plăci,de microtitrare din polistiren, cu nouăzeci și șase godeuri/placă) de la Dynatech Inc.
Fiecare godeu s-a umplut cu 200 pl HCI 1N și s-a incubat la temperatura camerei 12-20 min. Plăcile au fost apoi spălate de 4 ori cu 1 x PBS și godeurile au fost aspirate pentru îndepărtarea lichidului. Godeurile au fost apoi umplute cu 200 pl NaOH 1N și incubate, la temperatura camerei pentru 15-20 min. Plăcile au fost spălate de 4 ori cu 1 x PBS și godeurile s-au aspirat pentru îndepărtarea lichidului.
Poli(Phe-Lys) s-a procurat de la Sigma Chemicals Inc. Această polipeptidă a avut un raport molar de 1:1 Phe:Lys și o greutate moleculară medie de 47900 g/mol. Ea a avut o lungime medie de 309 aminoacizi și conținea 155 amine/mol. S-a amestecat 1 mg/ml soluție de polipeptidă cu NaCI/1 x PBS 2M la o concentrație finală de 0,1 mg/ml (pH=6,0). S-a adăugat un volum de 200 pl din această soluție în fiecare godeu. Placa a fost învelită în plastic pentru a preveni uscarea și s-a incubat peste noapte, la 30°C. Placa a fost apoi spălată de 4 ori cu 1 x PBS și godeurile s-au aspirat pentru îndepărtarea lichidului. Următoarea procedură s-a folosit pentru a lega acidul nucleic pe plăci, o secvență complementară la secvența nr.147, numit în continuare acid nucleic imobilizat. Sinteza acidului imobilizat având o secvență complementară la secvența nr. 133 s-a descris în EP A 883096976. S-a dizolvat o cantitate de 20 mg suberat de disuccinimidil în 300 pl dimetilformamidă (DMF). S-a adăugat o cantitate de 26 unități 0D2B0 acid nucleic imobilizat la 100 μΙ tampon de cuplare (fosfat de sodiu 50 mM, pH= 7,8). Amestecul de cuplare a fost apoi adăugat la soluția DSS-DMF și agitat cu un agitator magnetic, timp, de 30 min. S-a echilibrat o coloană NAP-25 cu fosfat de sodiu 10 mM, pH=6,5. Amestecul de cuplare soluție DSS-DMF s-a adăugat la 2 ml fosfat de sodiu 10 mM, pH=6,5, la 4°C. Amestecul a fost supus turbionării pentru amestecare și s-a depus pe coloana NAP-25 echilibrată. Acidul nucleic imobilizat activat DDS ADN s-a eluat în coloană cu 3,5 ml de fosfat de sodiu 10 mM, pH=6,5. O cantitate de 5,6 unități 0D26O de acid nucleic imobilizat activat DSS AND s-a adăugat la 1500 ml fosfat de sodiu mM, pH=7,8. Un volum de 50 μΙ din această soluție s-a adăugat la fiecare godeu și plăcile s-au incubat peste noapte. Placa a fost apoi spălată de 4 ori cu 1 x PBS și godeurile au fost aspirate pentru îndepărtarea lichidului.
Golirea finală a plăcilor a fost realizată după cum urmează: S-a adăugat un volum de NaOH 0,2 N, care conține 0,5% (g/v) SDS la fiecare godeu. Placa s-a învelit în plastic și s-a incubat, la 65°C pentru 60 min. Placa a fost apoi spălată de 4 ori cu 1 x PBS și godeurile au fost aspirate pentru îndepărtarea lichidului. Placa golită s-a păstrat cu perle deshidratate, la 2...8°C. Probele de seruri de cercetat s-au analizat folosind PCR, urmată de analiza de secvență pentru a determina genotipul.
Prepararea probei constă în distribuirea a 50 μΙ probe serice și 150 μΙ tampon
P-K (2 mg/ml proteinază Kîn 53 mM tris-HCI, pH=8,0/ NaCI 0,6 /citrat de sodiu
0,06 M/8 mM, EDTA, pH=8,0/SDS 1,3%/16 pg/ml ADN din spermă de somon
755
760
765
770
775
780
785
790
795
RO 117267 Bl sonicată/formamidă 7%/sondă de captură 50 (moli/sonda de detecție 160 (mol), la fiecare godeu. Plăcile s-au agitat pentru amestecarea conținuturilor în godeuri, s-au acoperit și s-au incubat 16 h, la 62°C.
După o perioadă suplimentară, de 10 min, la temperatura camerei, conținutul fiecărui godeu s-a aspirat pentru a îndepărta tot fluidul și godeurile s-au spălat de 2 ori cu tampon de spălare (SDS 0,1%/NaCI 0,015 M /citrat de sodiu 0,0015 M, S-a adăugat apoi la fiecare godeu acid nucleic de amplificare (50 pl de soluție 0,7 (mol/pl în NaCI 0,48 M/citrat de sodiu 0,048 M/SDS 0,1 %/”reactiv de blocare “ 0,5 % (Boehringer Mannheim, nr.catalog 1096 176). După acoperirea plăcilor și agitarea pentru amestecarea conținuturilor în godeuri, plăcile s-au incubat 30 min, la 52°C.
După o perioadă suplimentară, de 10 min, la temperatura camerei, godeurile s-au spălat cum s-a descris mai sus.
S-a adăugat apoi acid nucleic marcat cu alcalinfosfatază, descris în EP 883096976, la fiecare godeu (50 pl godeu de 2,66 (mol/μΙ). După incubarea, la 52°C, timp, de 15 min și 10 min, la temperatura camerei, godeurile s-au spălat de 2 ori ca mai sus și apoi, de 3 ori cu NaCI 0,015 M /citrat de sodiu 0,0015 M. S-a folosit o enzimă dioxetan activată (Schaap și alții, Tet. Lett. (1987) 28, 1159-1162 și publicația EP A 0254051), obținută de la Lumigen Inc. S-au adăugat la fiecare godeu 50 pl Lumiphos 530 (Lumigen). Godeurile au fost ușor lovite, astfel, încât reactivul să cadă spre bază și s-au rotit pentru a distribui uniform reactivii. S-au acoperit godeurile și s-au incubat, la 37°C pentru 20-40 min.
Plăcile s-au citit apoi pe un luminometru Dynatech ML 1000. Ieșirea s-a dat cu întreaga lumină produsă în timpul reacției.
Cercetarea a detectat fiecare probă de ser pozitiv, indiferent de genotip.
Exemplul 4. Expresia polipeptidei codificată În secvențe definite prin genotipuri diferite
Polipeptidele HCV codificate printr-o secvență dintre secvențele 1-66 s-au exprimat ca o polipeptidă fuzionată cu superoxid dismutaza (SOD). Un ADNc care poartă astfel de secvențe se subcloneazăîntr-un vector de expresie pSODcfl (Steimer și alții, (1986).
La început, ADN-ul izolat din SODcfl se tratează cu BamHI și SODcfl se tratează cu BamHI și Ecorl, și în continuare, se leagă într-un ADN liniar creat prin enzimele de restricție:
GAT CCT GGA ATT CTG ATA AGA
CCT TAA GAC TAT TTT AA 3
După donare, se izolează plasmida care conține insertul.
Plasmidul care conține insertul se restricționează cu EcoRI. ADNc HCV este legat în această plasmidă ADN Ecorl liniarizată. Amestecul ADN se folosește pentru transformarea tulpinii E.coii D1210 (Sadler și alții (1980). Polipeptidele se izolează pe geluri.
Exemplul 5. Antigenitatea polipeptidelor
Antigenitatea polipeptidelor formate în Secțiunea IV s-a evaluat după cum urmează. Se pregătesc suporturi de polietilenă pe un bloc într-o matriță 812. (Caselco
Mimetopes, Victoria Australia) prin plasarea suporturilor (piperidină 20% v/v în dimetilformamidă (DMF), pentru 30 min, la temperatura camerei. Suporturile s-au îndepărtat, s-au spălat în DMF 5 min, apoi s-au spălat de 4 ori (2 min/spălare).
RO 117267 Bl
Suporturile s-au lăsat pentru uscare la aer,cel puțin 10 min, apoi s-au supus unei spălări finale în DMF (5 min). S-a dizolvat 1-hidroxibenzotriazol (367 mg HOBt) în DMF (80 pl) pentru a se folosi în cuplarea polipeptidelor protejate Fmoc preparate în
Secțiunea IV.
Aminoacizii protejați sunt plasați într-o placă cu godeuri pentru microtitrare 850 împreună cu HOBt și blocul cu suporturi s-a plasat peste placă, imersând suporturile în godeuri. Ansamblul este apoi închis într-un ambalaj de plastic lăsat să reacționeze, la 25°C, timp, de 18 h, pentru a cupla mai întâi aminoacizii la suporturi. Blocul este apoi îndepărtat și suporturile se spală cu DMF (2 min), MeOH (4x2 min) și din nou, cu DMF (2 min) pentru curățirea și desfacerea aminoacizilor legați. Procedura se 855 repetă pentru fiecare aminoacid suplimentar cuplat, până când se prepară toți octamerii.
Capetele N-terminale libere sunt apoi acetilate pentru compensarea amidelor libere, astfel, încât majoritatea epitopilor la care lipsește terminația N să nu aibă asociată o încărcătură pozitivă. Acetilarea este realizată prin umplerea godeurilor unei 860 plăci de microtitrare cu DMF/anhidridă acetică/trietilamină (5:2:1 v/v/v) și care permite suporturilor să reacționeze în godeuri, timp, de 90 min, la 2O°C. Suporturile sunt apoi spălate cu DMF (2 min) și cu MeOH (4x2 min) și uscate la aer, cel puțin 10 min.
Partea catenei care protejează grupările este îndepărtată prin tratarea supor- 865 turilor cu acid trifluoracetic/fenol/ditioetan (95:2,5:1,5 v/v/v) în ambalaje de polipropilenă, timp, de 4 h, la temperatura camerei. Suporturile sunt apoi spălate în diclormetan (2x2 min) 5%, diizopropiletilamină(diclormetan (2x5 min), diclormetan (5 min.) și uscate la aer, cel puțin 10 min. Suporturile sunt apoi spălate în apă (2 min), MeOH (18 h), uscate în vid și depozitate în ambalaje de plastic etanșe pe 870 silicagel. IV.B.15.b.Assay of Peptides.
Suporturile purtătoare de octamer sunt tratate prin sonicare, timp, de 30 min într-un tampon de dislocare (dodecilsulfat de sodiu 1%, 2-mercaptoetanol 0,1%, NaH2P04 0,1 M), la 60°C. Apoi, suporturile sunt imersate de câteva ori în apă (60°C), apoi în MeOH fierbinte (2 min) și lăsate să se usuce la aer. 875
După aceea, suporturile sunt preacoperite, timp, de 1 h, la 25°Cîn godeurile de microtitrare care conțin 200 pl tampon blocant (ovalbumină 1 %, BSA 1 %, Tween 0,1% și NaH3 0,05 % în PBS), cu agitare. Se imersează apoi suporturile în godeuri care, conțin 175 pl antiser obținut de la pacienți umani diagnosticați ca având HCV și se lasă la incubat, la 4°C peste noapte. Formarea unui complex între anticorpii 880 policlonali ai serurilor și polipeptidelor inițiază răspunsul imun in vivo dat de peptide. Astfel, peptidele sunt apte pentru dezvoltarea de vaccinuri.
Este evident pentru specialiști, că pot fi făcute multe variații și modificări fără îndepărtarea de conceptul și întinderea domeniului invenției prezente.
885 LISTA DE SECVENȚE (1) Informații generale:
(i) Solicitant: Tai-An Cha (ii) Titlul invenției: Secvențe genomice HCV pentru diagnostice și 890 terapeutici
RO 117267 Bl
895
900
905
910
915 ^20
925
930
935 (iii) Număr de secvențe: 147 (iv) Adresa pentru corespondență:
(A) Adresa: Wolf, Greenfield & Sacks, P.C.
(B) Strada: 600 Atlantic Avenue (C) Oraș: Boston (D) Stat: Massachusetts (E) Țara: SUA (F) Zip: 02210 (v) Forma citibilă pe computer:
(A) Tipul de mediu: Dischetă, 5,25 inch (B) Computer: IBM compatibil (C) Sistemul de operare: MS-DOS versiune 3.3 (D) Soft: Word Perfect 5.1 (vi) Date curente ale cererii:
(A) Numărul cererii: Neaccesibil (B) Data depozitului: Neaccesibil (C) Clasificare: Neaccesibilă (vii) Date privind prioritatea cererii:
(A) Cerere numărul: 07/697 326 (B) Data depozitului: 8 mai 1991 (viii) Informații privind agentul:
(A) Nume: Caniuk, Anthony J.
(B) Numărul de înregistrare: 29 809 (C) Referință: C 0772/7000 (ix) Informații privind telecomunicații:
(A) Telefon: (617) 720-3500 (B) Telefax: (617) 720-2441 (C) Telex: Ezekiel (2) Informație pentru secvența nr. 1:
(i) Caracteristici de formare:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: (ATCC 40394) (c) Izolat individual: ns5hcvl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 1
CTCCACAGTC ACTGAGAGCG ACATCCGTAC GGAGGAGGCA
ATCTACCAAT GTTGTGACCT CGACCCCCAA GCCCGCGTGG
CCATCAAGTC CCTCACCGAG AGGCTTTATG TTGGGGGCCC
TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AGAACTGCGG CTATCGCAGG
TGCCGCGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAACA
CCCTCACTTG CTACATCAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC
CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC
GACITAGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGG GTCCAGGAGG
ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC
120
160
200
240
280
320
340
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.2: (i)
940 (ii) (vi) (xi)
Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) : Topologie: lineară Tipul moleculei ADN Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5i21 Descrierea secvenței: Secvența nr.2:
945
CTCCACAGTC ATTTACCAAT CCATCAAGTC
ACTGAGAGCG GTTGTGACCT CCTCACTGAG
ACATCCGTAC
GGACCCCCAA
AGGCTTTATG
GGAGGAGGCA
GCCCGCATGG
TCGGGGGCCC
120
950
TCTTACCAAT TGCCGCGCGA
TCAAGGGGGG GCGGCGTACT
AGAACTGCGG
GACAACTAGC
CTACCGCAGG
TGTGGTAACA
160
200
955
CCCTCACTTG CGCAGGGCTC GACTTAGTCG ACGCGGCGAG
CTACATCAAG
CAGGACTGCA
GCCCGGGCAG
CCATGCTTGT (2) (xi)
CCTGTCGAGC
GTGTGGCGAC
240
280
TTATCTGTGA CCTGAGAGCC
AAGTGCGGGG
GTCCAGGAGG
320
340
960
Informație pentru Secvența nr.3:
(i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară Tipul moleculei: ADN Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5ptl Descrierea secvenței: Secvența nr.3
965
970
CTCCACAGTC
ATCTACCAAT
ACTGAGAGCG ACATCCGTAC
GTTGTGATCT
CCATCAAGTC
CCTCACTGAG
GGACCCCCAA
AGGCTTTACG
GGAGGAGGCA
GCCCGCGTGG
TTGGGGGCCC
120
TCTTACCAAT
TCAAGGGGGG
TGCCGGGCGA
CCCTCACTTG
GCGGCGTACT
CTACATCAAG
AGAACTGCGG
GACAACTAGC
GCCCGGGCAG
CTACCGCAGG
TGTGGTAATA
CCTGTCGAGC
160
200
240
975
CGCAGGGCTC
CGGGACTGCA
CCATGCTCGT
GTGTGGTGAC
280
GACTTGGTCG
ACGCGGCGAG
TTATCTGTGA
GAGTGCGGGG
GTCCAGGAGG
320
CCTGAGAGCC
340
980 (2) Informație pentru Secvența nr.4 (i) Caracteristicile secvenței:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic
985
RO 117267 Bl (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5gm2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 4
CTCTACAGTC ACTGAGAACG ACATCCGTAC GGAGGAGGCA40
ATTTACCAAT GTTGTGACCT GGACCCCCAA GCCCGCGTGG80
CCATCAAGTC CCTCACTGAG AGGCTTTATG TTGGGGGCCC120
CCTTACCAAT TCAAGGGGGG AAAACTGCGG CTATCGCAGG160
TGCCGCGCGA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAACA200
CCCTCACTTG CTACATTAAG GCCCGGGCAG CCTGTCGAGC240
CGCAGGGCTC CAGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC280
GACTTAGTCG TTATCTGTGA GAGTGCGGGA GTCCAGGAGG320
ACGCGGCGAA CTTGAGAGCC340 (2) Informație pentru Secvența nr.5 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5usl7 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.5
CTCCACAGTC ACTGAGAGCG ATATCCGTAC GGAGGAGGCA 40 ATCTACCAGT GTTGTGACCT GGACCCCCAA GCCCGCGTGG 80 CCATCAAGTC CCTCACCGAG AGGCTTTATG TCGGGGGCCC 120 TCTTACCAAT TCAAGGGGGG AAAACTGCGG CTATCGCAGG 160 TGCCGCGCAA GCGGCGTACT GACAACTAGC TGTGGTAACA 200 CCCTCACTTG TTACATCAAG GCCCAAGCAG CCTGTCGAGC 240 CGCAGGGCTC CGGGACTGCA CCATGCTCGT GTGTGGCGAC 280 GACTTAGTCG TTATCTGTGA AAGTCAGGGA GTCCAGGAGG 320 ATGCAGCGAA CCTGAGAGCC 340 (2) Informație pentru Secvența nr:6 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară
RO 117267 Bl
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | |
| (vi) | Sursa inițială: (C) Izolat individual: ns5sp2 | |
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr.6 | 1035 |
ACTGAGAGCG
ATATCCGTAC
GGAGGAGGCA
CTCTACAGTC
ATCTACCAAT
GTTGTGACCT
GGACCCCGAA
GCCCGTGTGG
CCATCAAGTC
CCTCACTGAG
AGGCTTTATG
TTGGGGGCCC
120
TCTTACCAAT TCAAGGGGGG TGCCGCGCAA GCGGCGTACT CCCTCACTTG TTACATCAAG CGCAGGGCTC CAGGACTGCA
AGAACTGCGG
GACGACTAGC
GCCCGGGCAG CCATGCTCGT
CTACCGCAGG
TGTGGTAATA
CCTGTCGAGC
160
200
240
1040
GACCTAGTCG TTATCTGCGA ACGCGGCGAG CCTGAGAGCC
AAGTGCGGGG
GTGTGGCGAC
GTCCAGGAGG
280
320
340
1045 (2J Informație pentru Secvența nr.7 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5jl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.7
1050
1055
CTCCACAGTC atttaccaat
ACTGAGAATG
GTTGTGACTT
ACACCCGTGT
GGCCCCCGAA
TGAGGAGTCA
GCCAGACAGG
CCATAAGGTC
GCTCACAGAG
CGGCTCTATG
TCGGGGGTCC
120
1060
TATGACTAAC
TGCCGCGCGA
TCCAAAGGGC
AGAACTGCGG
GCGGCGTGCT
GACGACTAGC
CTATCGCCGG
TGCGGTAATA
160
200
CCCTCACATG
TGCCAAGCTC
CTACCTGAAG
CAGGACTGCA
GCCACAGCGG
CCTGTCGAGC
240
GACCTTGTCG
TTATCTGTGA
ACGCGGCAAG
CCTACGAGCC
CGATGCTCGT
AAGCGCGGGG
GAACGGAGAC
AACCAAGAGG
280
320
340
1065 (2) Informație pentru Secvența nr.8 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5kl
1070
1075
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.8
CTCAACGGTC ACTGAGAATG ACATCCGTGT TGAGGAGTCA atttaccaaa gttgtgactt ggcccccgag gccagacaag CCATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTACA TCGGGGGCCC CCTGACTAAT TCAAAAGGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGA TGCCGCGCCA GCGGTGTGCT GACGACTAGC TGCGGTAATA CCCTCACATG TTACTTGAAG GCCACTGCGG CCTGTAGAGC TGCGAAGCTC CAGGACTGCA CGATGCTCGT GTGCGGAGAC GACCTTGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGA ACCCAGGAGG ATGCGGCGAG CCTACGAGTC (2) Informație pentru Secvența nr.9 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5kl.l (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.9
CTCAACGGTC ACCGAGAATG ACATCCGTGT TGAGGAGTCA ATTTATCAAT GTTGTGCCTT GGCCCCCGAG GCTAGACAGG CCATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTATA TCGGGGGCCC CCTGACCAAT TCAAAGGGGC AGAACTGCGG TTATCGCCGG TGCCGCGCCA GCGGCGTACT GACGACCAGC TGCGGTAATA CCCTTACATG TTACTTGAAG GCCTCTGCAG CCTGTCGAGC CGCGAAGCTC CAGGACTGCA CGATGCTCGT GTGTGGGGAC GACCTTGTCG TTATCTGTGA AAGCGCGGGA ACCCAGGAGG ACGCGGCGAA CCTACGAGTC
120
160
200
240
280
320
340
120
160
200
240
280
320
340 (2) Informație pentru Secvența nr. 10 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns 5 gh6
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 10
CTCAACGGTC ATTTACCAAT CCATAAGGTC CCTGACTAAT TGCCGCGCGA CCCTCACATG TGCAAAGCTC GACCTTGTCG ACGCGGCGAG
ACTGAGAGTG
GTTGT6ACTT
GCTCACCGAG
TCAAAAGGGC GCGGCGTGCT ttacttgaag CAGGACTGCA TTATCTGCGA CCTACGAGTC
ACATCCGTGT
GGCCCCCGAA CGACTTTATA AGAACTGCGG GACGACTAGC GCCTCTGCAG CGATGCTCGT GAGCGCGGGA
CGAGGAGTCG
GCCAGGCAGG TCGGGGGCCC TTATCGCCGG TGCGGTAATA
CCTGTCGAGC
GAACGGGGAC
ACCCAAGAGG
120
180
200
240
280
320
340
1125
1130
1135 (2) Informație pentru Secvența nr. 11 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns 5spl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 11
1140
1145
CTCCACAGTC
ACTGAGAGTG
ACATCCGTGT
TGAGGAGTCA
ATTTACCAAT
GTTGTGACTT
GGCCCCCGAA
GCCAGACAGG
CTATAAGGTC CCTGACTAAT -TGCCGCGCAA
CCCTCACATG
GCTCACAGAG
TCAAAAGGGC
GCGGCGTGCT
TTACTTGAAG
CGGCTGTACA
AGAACTGCGG
GACGACTAGC
GCCTCTGCGG
TCGGGGGTCC
CTATCGCCGG TGCGGTAACA
CCTGTCGAGC
120
160
240
1150
TGCGAAGCTC
GACCTTGTCG
CAGGACTGCA
CGATGCTCGT
GTGCGGTGAC
280
TTATCTGTGA
GAGCGCGGGA
ACCCAAGAGG
320
1155
ACGCGGCGAG
CCTACGAGTC
340
| (2) Informație pentru Secvența nr. 12 | ||
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire; simplă (D) Topologie: lineară | 1160 |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | 1165 |
| (vi) | Sursa inițială (C) Izolat individual: ns5sp3 |
RO 117267 Bl (xi] Descrierea secvenței: Secvența nr. 12
CTCAACAGTC ACTGAGAGTG ACATCCGTGT TGAGGAGTCA ATCTACCAAT GTTGTGACTT GGCCCCCGAA GCCAGACAGG CTATAAGGTC GCTCACAGAG CGGCTTTACA TCGGGGGTCC CCTGACTAAT TCAAAAGGGC AGAACTGCGG CTATCGCCGG TGCCGCGCAA GCGGCGTGCT GACGACTAGC TGCGGTAATA CCCTCACATG TTACCTGAAG GCCAGTGCGG CCTGTCGAGC TGCGAAGCTC CAGGACTGCA CAATGCTCGT GTGCGGTGAC GACCTTGTCG TTATCTGTGA GAGCGCGGGG ACCCAAGAGG ACGCGGCGAG CCTACGAGTC (2) Informație pentru Secvența nr. 13 (i) Caracteristici de secvență:
(A] Lungime: 340 nucleotide (B] Tip: acid nucleic (CJ împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi] Sursa inițială:
(C] Izolat individual: ns5k2 (xi) Descrierea secvenței; Secvența nr. 13
CTCAACCGTC ACTGAGAGAG ACATCAGAAC TGAGGAGTCC ATATACCGAG CCTGCTCCCT GCCTGAGGAG GCTCACATTG CCATACACTC GCTGACTGAG AGGCTCTACG TGGGAGGGCC CATGTTCAAC AGCAAGGGCC AGACCTGCGG GTACAGGCGT TGCCGCGCCA GCGGGGTGCT CACCACTAGC ATGGGGAACA CCATCACATG CTATGTAAAA GCCCTAGCGG CTTGCAAGGC TGCAGGGATA GTTGCACCCT CAATGCTGGT ATGCGGCGAC OACTTAGTTG TCATCTCAGA AAGCCAGGGG ACTGAGGAGG ACGAGCGGAA CCTGAGAGCT (2) Informație pentru Secvența nr. 14 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5arg8
120
140
200
240
280
320
340
120
160
200
240
280
320
340
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 14
1215
CTCTACAGTC ACGTAAAAGG ACATCACATC CTAGGAGTCC40
ATCTACCAGT CCTGTTCACT GCCCGAGGAG GCTCGAACTG80
CTATACACTC ACTGACTGAG AGACTATACG TAGGGGGGCC120
CATGACAAAC AGCAAGGGCC AATCCTGCGG GTACAGGCGT160
TGCCGCGCGA GCGCAGTGCT CACCACCAGC ATGGGCAACA200
CACTCACGTG CTACGTAAAA GCCAQGGCGG CGTGTAACGC240
CGCGGGGATT GTTGCTCCCA CCATGCTGGT GTGCGGTGAC280
GACCTGGTCG TCATCTCAGA GAGTCAAGGG GCTGAGGAGG320
ACGAGCAGAA CCTGAGAGTC340 (2) Informație pentru Secvența nr. 15 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5ilo (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 15
1220
1225
1230
1235
CTCTACAGTC ACAGAGAGGG ACATCAGAAC CGAGGAGTCC
ATCTATCTGT CCTGCTCACT GCCTGAGGAG GCCCGAACTG
CTATACACTC ACTGACTGAG AGACTGTACG TAGGGGGGCC
120
CATGACAAAC
TGCCGCGCGA CGCTCACGTG CGCGGGCATT GACCTGGTTG ATGAGCGGAA
AGCAAGGGGC GCGGAGTGCT CTACGTSAAA GTTGCTCCCA TCATCTCAGA CCTGAGAGTC
AATCCTGCGG
GTACAGGCGT
160
1240
CACCACCAGC
GCCAGAGCGG
CCATGTTGGT
GAGTCAGGGG
ATGGGCAACA
CGTGTAACGC
GTGCGGCGAC
GTCGAGGAAG
200
240
280
320
1245
340 (2) Informație pentru Secvența nr. 16 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip; acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5arg6
1250
1255
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.16
CTCTACAGTC ATCTATCTGT CCATACACTC CATGACAAAC TGCCGCGCGA CACTCACGTG CGCGGGCATT GACCTAGTCG ATGAGCGAAA
ACGGAGAGGG CCTGTTCACT ACTGACTGAG AGCAAAGGGC GCGGAGTGCT CTACGTGAAA GTTGCCCCCA TCATCTCAGA CCTGAGAGCT
ACATCAGAAC GCCTGAGGAG AGGCTGTACG AATCCTGCGG CACCACCAGC GCTAAAGCGG CCATGTTGGT GAGTCAAGGG
CGAGGAGTCC GCTCGAACTG TAGGGGGGCC GTACAGGCGT ATGGGTAACA CATGTAACGC GTGCGGCGAC GTCGAGGAGG
120
160
200
240
280
320
340 (2) Informație pentru Secvența nr. 17 (i) Caracteristici de secvență (A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5k2b (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.17
CTCAACCGTC ATATATCAGG CTATCCACTC CATGACAAAC TGCCGCGCCA CCATGACATG TGCAGGGATC GACCTGGTCG ACGAGCGAAA
ACGGAGAGGG GTTGTTCCCT GCTCACTGAG AGCAAGGGAC GCGGGGTCTT CTACATCAAA GTGGACCCTA TCATCTCGGA CCTGAGAGCT
ACATAAGAAC GCCTCAGGAG AGACTCTACG AATCCTGCGG CACCACCAGC GCCCTTGCAG TCATGCTGGT GAGCGAAGGT
AGAAGAATCC GCTAGAACTG TAGGAGGGCC TTACAGGCGT ATGGGGAATA CGTGCAAAGC GTGTGGAGAC AACGAGGAGG
120
160
200
240
280
320
340 (2) Informație pentru Secvența nr. 18 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5sa283
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 18
1305
CTCGACCGTT
ATTTACCAAT CAATACGGTC CATGTATAAC TGCCGCGCCA CCATGACGTG
CGCAAAGCTC
GATAAAGCGA
ACCGAACATG CATTGTACTT ACTCACCCAA AGCAAGGGGC GCGGCGTCTT CTACATTAAG CAGGACTGCA CCTGAGAGCC
ACATAATGAC GCAGCCTGAG CGCCTGTACT AACAATGTGG CACCACTAGT GCTTTAGCCT
CGCTCCTGGT
TGAAGAGTCT GCGCGTGTGG GTGGAGGCCC ttatcgtaga atgggcaaca cctgtagagc
GTGTGGTGAT
120
160
200
240
320
340
1310
1315 (2) Informație pentru Secvența nr.19 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5sal56 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.19
CTCGACCGTT ACCGAACATG ACATAATGAC TGAAGAGTCC 40 ATTTACCAAT CATTGTACTT GCAGCCTGAG GCACGCGCGG 80 CAATACGGTC ACTCACCCAA CGCCTGTACT GTGGAGGCCC 120 CATGTATAAC AGCAAGGGGC AACAATGTGG TTACCGTAGA 160 TGCCGCGCCA GCGGCGTCTT CACCACCAGT ATGGGCAACA 200 CCATGACGTG CTACATCAAG GCTTCAGCCG CCTGTAGAGC 240 TGCAAAGCTC CAGGACTGCA CGCTCCTGGT GTGTGGTGTG 280 ACCTTGGTGG CCATTTGCGA GAGCCAAGGG ACGCACGAGG 320 ATGAAGCGTG CCTGAGAGTC 340
1320
1325
1330
1335
| (2) Informație pentru Secvența nr.2O | ||
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 1340 |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | 1345 |
| (vi) | Sursa inițială: (C) Izolat individual: ns5i11 |
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.2O
CTCTACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG ATATACCAGT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAAAG TGATCTCCTC CCTCACGGAG CGGCTTTACT GCGGGGGCCC TATGTTCAAC AGCAAGGGGG CCCAGTGTGG TTATCGCCGT TGCCGTGCTA GTGGAGTCCT GCCTACCAGC TTCGGCAACA CAATCACTTG TTACATCAAG GCTAGAGCGG CTTCGAAGGC CGCAGGCCTC CGGAACCCGG ACTTTCTTGT CTGCGGAGAT GATCTGGTCG TGGTGGCTGA GAGTGATGGC GTCGACGAGG ATAGAGCAGC CCTGAGAGCC (2) Informație pentru Secvența nr.21 (i) Caracteristica de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ns5i4 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.21
CTCGACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG ATATACCAAT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAAAG TGATCTCCTC CCTCACGGAG CGGCTTTACT GCGGGGGCCC TATGTTCAAT AGCAAGGGGG CCCAGTGTGG TTATCGCCGT TGCCGTGCTA GTGGAGTTCT GCCTACCAGC TTCGGCAACA CAATCACTTG TTACATCAAG GCTAGAGCGG CTGCGAAGGC CGCAGGGCTC CGGACCCCGG ACTTTCTCGT CTGCGGAGAT GATCTGGTTG TGGTGGCTGA GAGTGATGGC GTCGACGAGG ATAGAACAGC CCTGCGAGCC
120
160
200
240
280
320
340
120
160
200
240
280
320
340 (2) Informație pentru Secvența nr.22 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 340 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual:ns5gh8
1395
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.22
CTCAACTGTC ACTGAACAGG ACATCAGGGT GGAAGAGGAG40
ATATACCAAT GCTGTAACCT TGAACCGGAG GCCAGGAAAG80
TGATCTCCTC CCTCACGGAA CGGCTTTACT GCGGGGGCCC120
TATGTTCAAC AGCAAGGGGG CCCAGTGTGG TTATCGCCGT160
TGCCGTGCCA GTGGAGTTCT GCCTACCAGC TTCGGCAACA200
CAATCACTTG TTACATCAAA GCTAGAGCGG CTGCCGAAGC240
CGCAGGCCTC CGGAACCCGG ACTTTCTTGT CTGCGGAGAT280
GATCTGGTTG TGGTGGCTGA GAGTGATGGC GTCAATGAGG320
ATAGAGCAGC CCTGGGAGCC340
1400 (2) Informație pentru Secvența nr.23 (i) Caracteristici de secvență (A) Lungime: 100 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: (ATCC 40394) (C) Izolat individual: hcv 1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.23
GACGGCGTTG GTAATGGCTC AGCTGCTCCG GATCCCACAA40
GCCATCTTGG ACATGATCGC TGGTGCTCAC TGGGGAGTCC80
TGGCGGGCAT AGCGTATTTC100 (2) Informație pentru Secvența nr.24 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 10O nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: linear (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us5 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.24
GACGGCGTTG GTGGTAGCTC AGGTACTCCG GATCCCACAA40
GCCATCATGG ACATGATCGC TGGAGCCCAC TGGGGAGTCC80
TGGCGGGCAT AGCGTATTTC100 (2) Informație pentru Secvența nr.25 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 1OO nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: linear
1405
1410
1415
1420
1425
1430
1435
RO 117267 Bl (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.25
AACGGCGCTG GTAGTAGCTC AGCTGCTCAG GGTCCCGCAA 40 GCCATCGTGG ACATGATCGC TGGTGCCCAC TGGGGAGTCC 80 TAGCGGGCAT AGCGTATTTT 100 (2) Informație pentru Secvența nr.26 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 100 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us4 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.26
GACAGCCCTA GTGGTATCGC AGTTACTCCG GATCCCACAA 40 GCCGTCATGG ATATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAGTCC 80 TGGCGGGCCT TGCCTACTAT 100 (2) Informație pentru Secvența nr.27 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 1DO nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Individual izolat: ARG2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.27
AGCAGCCCTA GTGGTGTCGC AGTTACTCCG GATCCCACAA 40 AGCATCGTGG ACATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAGTCC 80 TGGCGGGCCT TGCTTACTAT 100 (2) Informație pentru Secvența nr.28 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 1OO nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: DNA (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: 115
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.28
GGCAGCCCTA GTGGTGTCGC AGTTACTCCG GATCCCGCAA40
GCTGTCGTGG ACATGGTGGC GGGGGCCCAC TGGGGAATCC80
TAGCGGGTCT TGCCTACTAT100
| (2) Informație pentru Secvența nr.29 | ||
| () | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 1OO nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 1490 |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | |
| (vi) | Sursa inițială: | 1495 |
(C) Izolat inițial: GH8 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.29
TGTGGGTATG GTGGTGGCGC ACGTCCTGCG TTTGCCCCAG 40 ACCTTGTTCG ACATAATAGC CGGGGCCCAT TGGGGCATCT 80 TGGCGGGCTT GGCCTATTAC 100 (2) Informație pentru Secvența nr.30
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 10O nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 1505 | |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | ||
| (vi) | Sursa inițială: (C) Izolat inițial: I4 | 1510 | |
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr.3O | ||
| TGTGGGTATG GTGGTAGCAC ACGTCCTGCG TCTGCCCCAG | 40 | ||
| ACCTTGTTCG ACATAATAGC CGGGGCCCAT TGGGGCATCT | 80 | ||
| TGGCAGGCCT AGCCTATTAC | 100 | 1515 |
(2) Informația pentru Secvența nr.31
| (i) Caracteristici de secvență: | ||
| (A) Lungime: 10O nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă | 1520 | |
| (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: (C) Izolat inițial: 111 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.31 | 1525 | |
| TGTGGGTATG GTGGTGGCGC AAGTCCTGCG TTTGCCCCAG | 40 | |
| ACCTTGTTCG ACGTGCTAGC CGGGGCCCAT TGGGGCATCT | 80 | |
| TGGCGGGCCT GGCCTATTAC | 100 |
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.32 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 10O nucleotide (B) Tip: acid nucleic (CJ împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: 110 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.32
TACCACTATG CTCCTGGCAT ACTTGGTGCG CATCCCGGAG GTCATCCTGG ACATTATCAC GGGAGGACAC TGGGGCGTGA TGTTTGGCCT GGCTTATTTC (2) Informație pentru Secvența nr.33 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: (ATCC 40394) (C) Izolat individual: hcv1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.33
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT AGACCGTGCA CC (2) Informație pentru Secvența nr.34 (i) Caracteristici de Secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us5
100
120
160
200
240
252
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.34
1575
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCCA ggacgaccgg GTCCTTTCTT GGATCAACCC120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA CC252 (2) Informație pentru Secvența nr.35 (i) Caracteristici de Secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursă inițială:
(A) Izolat individual: aus1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.35
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCACGCCCC CGCAAGATCA160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA CC252 (2) Informația pentru Secvența nr.36 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
1580
1585
1590
1595
1600
1605
1610 (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: ADN (C) Izolat individual: sp2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.36
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC 120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240
AGACCGTGCA CC 252
1615
RO 117267 Bl
1620
1625
1630
1635
1640 \
1645
1650
1655
1660 (2) Informație pentru Secvența nr.37 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (CJ împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială (C) Izolat individual: gm2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.37
GTTAGTATGA CGGGAGAGCC GGAATTGCCA GCTCAATGCC CTAGCCGAGT TGCCTGATAG AGACCGTGCA
GTGTCGTGCA ATAGTGGTCT GGACGACCGG TGGAGATTTG AGTGTTGGGT GGTGCTTGCG CC
GCCTCCAGGA GCGGAACCGG GTCCTTTCTT GGCGTGCCCC CGCGAAAGGC AGTGCCCCGG
CCCCCCCTCC TGAGTACACC GGATCAACCC CGCAAGACTG CTTGTGGTAC GAGGTCTCGT
120
160
200
240
252 (2) Informație pentru Secvența nr.38 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: i21 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.38
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT AGACCGTGCA CC (2) Informație pentru Secvența nr.39 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us4
120
160
200
240
252
1665
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.39
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA CC252 (2) Informație pentru Secvența nr.40 (i) Caracteristici de secvență:
1670
1675 (A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
1680 (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: jh1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.4D
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA TC252 (2) Informație pentru Secvența nr.41 (i) Caracteristici de secvență:
1685
1690
1695 (A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
1700
1705 (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: nac5 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.41
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC 40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC 80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC 120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG 160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC 200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT 240
AGACCGTGCA CC 252
1710
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.42 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: arg2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.42
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT AGACCGTGCA CC (2) Informație pentru Secvența nr.43 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: sp1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.43
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT AGACCGTGCA CC (2) Informație pentru Secvența nr.44 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: gh1
120
160
200
240
252
120
160
200
240
252
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.44
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GGATCAACCC120
GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGACTG160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA CC252
1760
1765 (2) Informație pentru Secvența nr.45 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vii) Sursa inițială:
(C) Izolat Individual: il5 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.45
1770
1775
GTTAGTATGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG GGAATTGCCA GGACGACCGG GTCCTTTCTT GCTCAATGCC TGGAGATTTG GGCGTGCCCC CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG AGACCGTGCA CC
| CCCCCCCTCC | 40 | |
| TGAGTACACC | 80 | 1780 |
| GGATCAACCC | 120 | |
| CGCGAGACTG | 160 | |
| CTTGTGGTAC | 200 | |
| GAGGTCTCGT | 240 | |
| 252 | 1785 |
(2) Informație pentru Secvența nr.46 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (CJ împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: ilO (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.46
1790
1795
| CCCCCCCTCC | 40 | |
| TGAGTACACC | 80 | |
| GGATAAACCC | 120 | 1800 |
| CGCAAGACTG | 160 | |
| CTTGTGGTAC | 200 | |
| GAGGTCTCGT | 240 |
GCTAGTATCA GTGTCGTACA GCCTCCAGGC
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG
GGAATTGCCG GGAAGACTGG GTCCTTTCTT
ACTCTATGCC CGGCCATTTG GGCGTGCCCC
CTAGCCGAGT AGCGTTGGGT TGCGAAAGGC
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG
AGACCGTGCA TC
252
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.47 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: arg6a (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.47
GTTAGTATGA GTCTCGTACA GCCTCCAGGC CCCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATTGCTG GGAAGACTGG GTCCTTTCTT GGATAAACCC120
ACTCTATGCC CAGCCATTTG GGCGTGCCCC CGCAAGACTG160
CTAGCCGAGT AGCGTTGGGT TGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA TC252 (2) Informație pentru Secvența nr.48 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: s21 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.48
GTTAGTACGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CTCCCCCTCC40
CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG TGAGTACACC80
GGAATCGCTG GGGTGACCGG GTCCTTTCTT GGAGCAACCC120
GCTCAATACC CAGAAATTTG GGCGTGCCCC CGCGAGATCA160
CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC CTTGTGGTAC200
TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG GAGGTCTCGT240
AGACCGTGCA AC252 (2) Informație pentru Secvența nr.49 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 252 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat inițial: gj61329
RO 117267 Bl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.49
GTTAGTACGA GTGTCGTGCA GCCTCCAGGA CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG GGAATCGCTG GGGTGACCGG GTCCTTTCTT GCTCAATACC CAGAAATTTG GGCGTGCCCC CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT CGCGAAAGGC TGCCTGATAG GGTGCTTGCG AGTGCCCCGG AGACCGTGCA AC
| CCCCCCCTCC | 40 | |
| TGAGTACACC | 80 | |
| GGAGTAACCC | 120 | 1855 |
| CGCGAGATCA | 160 | |
| CTTGTGGTAC | 200 | |
| GAGGTCTCGT | 240 |
252
1860 (2) Informație pentru Secvența nr.5O (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 180 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: sa3 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.5O
1865
GTTAGTATGA GTGTCGAACA GCCTCCAGGA CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG GGAATTGCCG GGATGACCGG GTCCTTTCTT GCTCAATGCC CGGAGATTTG GGCGTGCCCC CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT
1870
| CCCCCCCTCC | 40 |
| TGAGTACACC | 80 |
| GGATAAACCC | 120 |
| CGCGAGACTG | 160 |
| 1875 | |
| 180 |
(2) Informație pentru Secvența nr.51 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 180 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: sa4 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.51
1880
GTTAGTATGA GTGTCGAACA GCCTCCAGGA CGGGAGAGCC ATAGTGGTCT GCGGAACCGG GGAATTGCCG GGATGACCGG GTCCTTTCTT GCTCAATGCC CGGAGATTTG GGCGTGCCCC CTAGCCGAGT AGTGTTGGGT
1885
| CCCCCCCTCC | 40 | |
| TGAGTACACC | 80 | |
| GGATAAACCC | 120 | 1890 |
| CGCGAGACTG | 160 |
180 (2) Informație pentru Secvența nr.52 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic
1895
RO 117267 Bl (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: (ATCC 40394)
Izolat individual: hcvl (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.52
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAAAAAA AACAAACGTA40
ACACCAACCO TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG80
CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGA AAGACTTCCG160
AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCCAA200
GGCTCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG240 •EACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGC TGCGGGTGGG280
CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG320
GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA400
TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC440
TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC480
GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT520
TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT549 (2) Informație pentru Secvența nr.53 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungimea: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us5 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.53
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
ACACCAACCO TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG80
CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG160
AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CTATCCCCAA200
GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG240
TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT TGCGGGTGGG280
CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGTTG320
GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCACA400
TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC440
TGCCAGGGCT CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC480
GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT520
TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT549
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.54 fi] Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide 1945 (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: lineară (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială: , 1950 (C) Izolat individual: aus1 (xi) Descrierea secvenței: S
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTTAAGT CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TACCCCTGGC CCCTCTATGG TAATGAGGGT CGGGATGGCT CCTGTCCCCC CGTGGCTCTC GGGCCCTACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG AAGGTCATCG ATACCCTCAC GTGCGGCTTC TGGGGTACAT TCCGCTCGTT GGCGCCCCTC TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATCTTCCT TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTTCTCTCT nr.54
| ACCAAACGTA | 40 | |
| TCCCGGGTGG | 80 | |
| GCCGCGCAGG | 120 | 1955 |
| AAGACTTCCG | 160 | |
| CTATCCCTAA | 200 | |
| TCAGCCCGGG | 240 | |
| TGCGGATGGG | 280 | |
| GGCCTAGTTG | 320 | 1960 |
| CAATTTGGGT | 360 | |
| GCCGACCACA | 400 | |
| TTGGGGGCGC | 440 | |
| TCTGGAAGAC | 480 | |
| GGTTGCTCTT | 520 549 | 1965 |
(2) Informație pentru Secvența nr.55 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: sp2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.55
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG80
CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CACGACGAGG AAGACTTCCG160
AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT AGACGTCAGC CCATCCCCAA200
GGCTCGTCGA CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG240
TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGC TGCGGGTGGG280
CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG320
GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA400
TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC440
TGCCAGAGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC480
GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCC GGTTGCTCTT520
TCTCTATCTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT549
1970
1975
1980
1985
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.56 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: gm2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.56
ATGAGCACGA ATCCTAAACC ACACCAACCG TCGCCCACAG CGGTCAGATC GTTGGTGGAG GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG AGCGGTCGCA ACCTCGAGGT GGCACGTCGG CCCGAGGGTA TACCCTTGGC CCCTCTATGG CGGGATGGCT CCTGTCTCCC GGGCCCCACA GACCCCCGGC AAGGTCATCG ATACCCTTAC TGGGGTACAT ACCGCTCGTC TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GGCGTGAACT ATGCAACAGG TCTCTATCTT CCTTCTGGCC
TCAAAGAAGA ACCAAACGTA40
GACGTCAAGT TCCCGGGTGG80
TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
CGCGACGAGG AAGACTTCCG160
AGACGTCAGC CTATCCCCAA200
GGACCTGGGC TCAGCCCGGG240
CAATGAGGGT TGCGGGTGGG280
CGCGGCTCTC GGCCTAACTG320
GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
GTGCGGCTTC GCCGACCTCA400
GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC440
GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC480
GAACCTTCCT GGTTGCTCTT520
CTGCTCTCT549 (2) Informație pentru Secvența nr.57 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: i21 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.57
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
ACACCAACCG TCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGTGG80
CGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
GGCCCTAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAGACTTCCG160
AGCGGTCGCA ACCTCGTGGT AGACGCCAGC CTATCCCCAA200
GGCGCGTCGG CCCGAGGGCA GGACCTGGGC TCAGCCCGGG240
TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT TGCGGGTGGG280
CGGGATGGCT CCTGTCTCCC CGTGGCTCTC GGCCTAGCTG320
GGGCCCCACA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA400
TGGGGTACAT ACCGCTCGTC GGCGCCCCTC TTGGAGGCGC440
TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAAGAC480
GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAACCTTCCT GGTTGCTCTT520
TTTCTATTTT CCTTCTGGCC CTGCTCTCT549
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.58 (i) Caracteristici de secvența:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic 2040 (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: us4 2045 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.58
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTTAAGT TGGCCAGGTC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC GGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGCTCTC GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG aaggtcatcg ataccctcac atgcggcttc TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TGCCAGGGCC TTGGCGCATG GCGTCCGGGT GGCGTGAACT ACGCAACAGG GAATCTGCCC TTTCTATCTT CCTCTTGGCT CTGCTGTCC
| ACCAAACGTA | 40 | |
| TCCCGGGCGG | 80 | |
| GCCGCGCAGG | 120 | |
| AAGACTTCCG | 160 | 2050 |
| CTATCCCCAA | 200 | |
| TCAGCCCGGG | 240 | |
| ATGGGGTGGG | 280 | |
| GGCCTAGTTG | 320 | |
| taatttgggt | 360 | 2055 |
| GCCGACCTCA | 400 | |
| TTAGGGGCGC | 440 | |
| TCTGGAGGAC | 480 | |
| GGTTGCTCCT | 520 | |
| 549 | 2060 |
(2) Informație pentru Secvența nr.59 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă 2065 (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: jh1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.59 2070
ATGAGCACAA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC GGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAACGAGGGT CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGCTCTC GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC TGGGGTACAT TCCGCTTGTC GGCGCCCCCC TGCCAGGGCC CTGGCACATG GTGTCCGGGT GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATTTGCCC TCTCTATCTT CCTCTTGGCT CTGCTGTCC
| ACCAAACGTA | 40 | |
| TCCCGGGCGG | 80 | |
| GCCGCGCAGG | 120 | |
| AAGACTTCCG | 160 | |
| CTATCCCCAA | 200 | 2075 |
| TCAGCCCGGG | 240 | |
| ATGGGGTGGG | 280 | |
| GGCCTAGTTG | 320 | |
| TAATTTGGGT | 360 | |
| GCCGACCTCA | 400 | |
| TAGGGGGCGC | 440 | 2080 |
| TCTGGAGGAC | 480 | |
| GGTTGCTCTT | 520 549 |
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.6O (i) Caracteristici de secvența:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (CJ împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolatul individual: nac5 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.6D
ATGAGCACAA ATCCTAAACC ACACCAACCG TCGCCCACAG TGGTCAGATC GTTGGTGGAG GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAGGATGGCT CCTGTCACCC GGGCCCCACG GACCCCCGGC AAGGTCATCG ATACCCTCAC TGGGGTACAT TCCGCTCGTC TGCCAGGGCC CTGGCACATG GGCGTGAACT ATGCAACAGG TCTCTATCTT CCTCTTGGCT
CCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
GACGTCAAGT TCCCGGGCGG80
TTTACCTGTT GCCGCGCAGG120
CGCGACTAGG AAGACTTCCG160
AGGCGACAAC CTATCCCCAA200
GGTCCTGGGC TCAGCCCGGG240
CAACGAGGGT ATGGGGTGGG280
CGCGGCTCCC GGCCTAGTTG320
GTAGGTCGCG TAATTTGGGT360
ATGCGGCTTC GCCGACCTCA400
GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC440
GTGTCCGGGT TCTGGAGGAC480
GAATTTGCCT GGTTGCTCTT520
CTGCTGTCC549 (2) Informație pentru Secvența nr.61 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(CJ Izolat individual: arg2 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.61
ATGAGCACGA ATCCTAAACC ACACCAACCG CCGCCCACAG TGGTCAGATC GTTGGTGGAG GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA GGCTCGCCAG CCCGAGGGTA TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAGGGTGGCT CCTGTCCCCC GGGCCCCACA GACCCCCGGC AAGGTCATCG ATACCCTCAC TGGGGTACAT TCCGCTCGTC TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GGCGTGAACT ATGCAACAGG TCTCTATCTT CCTCTTGGCT
TCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
GACGTCAAGT TCCCGGGCGG80
TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
CGCGACTAGG AAGACTTCCG160
AGGCGACAAC CTATCCCCAA200
GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG240
CAATGAGGGT ATGGGGTGGG280
CGCGGCTCCC GGCCTAGTTG320
GTAGGTCGCG TAATTTGGGT360
ATGCGGCTTC GCCGACCTCA<00
GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC440
GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC480
GAATCTGCCC GGTTGCTCTT520
TTGCTGTCC549
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.62 (i) Caracteristici de secvență: 2130 (A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN 2135 (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: sp1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.62
| ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG | 40 80 | 2140 |
| TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG | 120 | |
| GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG | 160 | |
| AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA | 200 | |
| GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG | 240 | |
| TATCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT CTGGGGTGGG | 280 | 2145 |
| CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGCGGCTCTC GGCCTAGCTG | 320 | |
| GGGCCCTACC GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAACTTGGGT | 360 | |
| AAGGTCATCG ATACCCTTAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA | 400 | |
| TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TTAGGGGCGC | 440 | |
| TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC | 480 | 9 1 ζΩ |
| GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATTTGCCC GGTTGCTCTT | 520 | Z J.DU |
| TCTCTATCTT CCTCTTGGCT TTGCTGTCC | 549 |
(2) Informație pentru Secvența nr.63 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: gh1 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.63
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA40
ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG80
TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACTTGTT GCCGCGCAGG120
GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG160
AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA200
GGCTCGCCGG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG240
TACCCTTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG280
CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGTGGTTCTC GGCCTAGTTG320
GGGCCCCACG GACCCCCGGC GTAGGTCGCG CAATTTGGGT360
AAGATCATCG ATACCCTCAC GTGCGGCTTC GCCGACCTCA400
TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCC TAGGGGGCGC440
TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC480
GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATCTGCCC GGTTGCTCCT520
TTTCTATCTT CCTTCTGGCT TTGCTGTCC549
2155
2160
2165
2170
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.64 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: i15 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.64
ATGAGCACGA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAACGTA 40 ACACCAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG 80 TGGTCAGATC GTTGGTGGAG TTTACCTGTT GCCGCGCAGG 120 GGCCCCAGGT TGGGTGTGCG CGCGACTAGG AAGACTTCCG 160 AGCGGTCGCA ACCTCGTGGA AGGCGACAAC CTATCCCCAA 200 GGCTCGCCAG CCCGAGGGCA GGGCCTGGGC TCAGCCCGGG 240 TACCCCTGGC CCCTCTATGG CAATGAGGGT ATGGGGTGGG 280 CAGGATGGCT CCTGTCACCC CGCGGCTCCC GGCCTAGTTG 320 GGGCCCCAAA GACCCCCGGC GTAGGTCGCG TAATTTGGGT 360 AAGGTCATCG ATACCCTCAC ATGCGGCTTC GCCGACCTCA 400 TGGGGTACAT TCCGCTCGTC GGCGCCCCCT TAGGGGGCGC 440 TGCCAGGGCC CTGGCGCATG GCGTCCGGGT TCTGGAGGAC 480 GGCGTGAACT ATGCAACAGG GAATCTACCC GGTTGCTCTT 520 TCTCTATCTT CCTCTTGGCT TTGCTGTCC 549 (2) Informație pentru Secvența nr.65 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 549 nucleotide (B) Tip: acid nucleic
C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (vi) Sursa inițială:
(C) Izolat individual: i10 (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.65
ATGAGCACAA ATCCTAAACC TCAAAGAAAA ACCAAAAGAA 40
ACACTAACCG CCGCCCACAG GACGTCAAGT TCCCGGGCGG80
TGGCCAGATC GTTGGCGGAG TATACTTGCT GCCGCGCAGG120
GGCCCGAGAT TGGGTGTGCG CGCGACGAGG AAAACTTCCG160
AACGATCCCA GCCACGCGGA AGGCGTCAGC CCATCCCTAA200
AGATCGTCGC ACCGCTGGCA AGTCCTGGGG AAGGCCAGGA240
TATCCTTGGC CCCTGTATGG GAATGAGGGT CTCGGCTGGG280
CAGGGTGGCT CCTGTCCCCC CGTGGCTCTC GCCCTTCATG320
GGGCCCCACT GACCCCCGGC ATAGATCGCG CAACTTGGGT360
AAGGTCATCG ATACCCTAAC GTGCGGTTTT GCCGACCTCA400
TGGGGTACAT TCCCGTCATC GGCGCCCCCG TTGGAGGCGT440
TGCCAGAGCT CTCGCCCACG GAGTGAGGGT TCTGGAGGAT480
GGGGTAAATT ATGCAACAGG GAATTTGCCC GGTTGCTCTT520
TCTCTATCTT TCTCTTAGCC CTCTTGTCT549
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.66 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 510 nucleotide 2225 (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN
| (vi) (xi] | Sursa inițială: (C) Izolat individual: arg6 Descrierea secvenței: Secvența nr.66 | 2230 | |||
| ATGAGCACAA | ATCCTCAACC | TCAAAGAAAA | ACCAAAAGAA | 40 | |
| ACACTAACCG | CCGCCCACAG | GACGTCAAGT | TCCCGGGCGG | 80 | 2235 |
| TGGTCAGATC | GTTGGCGGAG | TATACTTGTT | GCCGCGCAGG | 120 | |
| GGCCCCAGGT | TGGGTGTGCG | CGCGACGAGG | AAAACTTCCG | 160 | |
| AACGGTCCCA | GCCACGTGGG | AGGCGCCAGC | CCATCCCCAA | 200 | |
| AGATCGGCGC | ACCACTGGCA | AGTCCTGGGG | GAAGCCAGGA | 240 | 2240 |
| TACCCTTGGC | CCCTGTATGG | GAATGAGGGT | CTCGGCTGGG | 280 | |
| CAGGGTGGCT | CCTGTCCCCC | CGCGGTTCTC | GCCCTTCATG | 320 | |
| GGGCCCCACT | GACCCCCGGC | ATAGATCACG | CAACTTGGGT | 360 | |
| AAGGTCATCG | ATACCCTAAC | GTGTGGTTTT | GCCGACCTCA | 400 | |
| TGGGGTACAT | TCCCGTCGGT | GGTGCCCCCG | TTGGTGGTGT | 440 | 2245 |
| CGCCAGAGCC | CTTGCCCATG | GGGTGAGGGT | TCTGGAAGAC | 480 | |
| GGGATAAATT | ATGCAACAGG | GAATCTGCCC | 510 |
(2) Informație pentru Secvența nr.67 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 29 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.67
CAAACGTAAC ACCAACCGRC GCCCACAGG 29 (2) Informație pentru Secvența nr.68 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 24 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.68
2250
2255
2260
2265
ACAGAYCCGC AKAGRTCCCC CACG
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.69 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 30 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.69
CGAACCTCGA GGTAGACGTC AGCCTATCCC 30 (2) Informație pentru Secvența nr.7O (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 30 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierera secvenței: Secvența nr.7O
GCAACCTCGT GGAAGGCGAC AACCTATCCC 30 (2) Informație pentru Secvența nr.71 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 30 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierera secvenței: Secvența nr.71
GTCACCAATG ATTGCCCTAA CTCGAGTATT 30 (2) Informație pentru Secvența nr.72 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 26 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.72
GTCACGAACG ACTGCTCCAA CTCAAG (2) Informația pentru Secvența: 73 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 28 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
RO 117267 Bl
| (ii) Tipul moleculei: ADN | 2315 | |
| (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.73 | ||
| TGGACATGAT CGCTGGWGCY CACTGGGG | 28 | |
| (2) Informația pentru Secvența nr.74 | ||
| (i) Caracteristici de secvența: (A) Lungime: 28 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară | 2320 | |
| (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.74 | 2325 | |
| TGGAYATGGT GGYGGGGGCY CACTGGGG | 28 | |
| (2) Informație pentru Secvența nr.75 | ||
| (i) Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 20 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară | 2330 | |
| (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.75 | 2335 | |
| ATGATGAACT GGTCVCCYAC | 20 | |
| (2) Informație pentru Secvența nr.76 | ||
| (i) Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 26 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară | 2340 | |
| (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.76 | 2345 | |
| ACCTTVGCCC AGTTSCCCRC CATGGA | 26 | |
| (2) Informație pentru Secvența nr.77 | ||
| (i) Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 22 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară | 2350 | |
| (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.77 | 2355 | |
| AACCCACTCT ATGYCCGGYC AT | 22 | |
| (2) Informație pentru Secvența nr.78 | ||
| (i) Caracteristici de secvență: | 2360 |
(A) Lungime: 18 nucleotide
RO 117267 Bl (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii] Tipul moleculei: ADN (xi] Descrierea secvenței: Secvența nr.78
GAATCGCTGG GGTGACCG 18 (9) Informație pentru Secvența nr. 79 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 28 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.79
CCATGAATCA CTCCCCTGTG AGGAACTA 28 (2) Informație pentru Secvența nr.8O (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 18 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.8O
TTGCGGGGGC ACGCCCAA 18 (2) Informație pentru Secvența nr.81 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.81
YGAAGCGGGC ACAGTCARRC AAGARAGCAG GGC 33 (2) Informație pentru Secvența nr.82 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.82
RTARAGCCCY GWGGAGTTGC GCACTTGGTR GGC
RO 117267 Bl
2410 (2) Informație pentru Secvența nr.83 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.83
RATACTCGAG TTAGGGGCAAT CATTGGTGAC RTG (2) Informație pentru Secvența nr.84 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.84
AGYRTGCAGG ATGGYATCRK BCGYCTCGTA CAC (2) Informație pentru Secvența nr.85 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.85
GTTRCCCTCR CGAACGCAAG GGACRCACCC CGG (2) Informație pentru Secvența nr.86 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.86
CGTRGGGGTY AYCGCCACCC AACACCTCGA GRC (2) Informație pentru Secvența nr.87 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.87
CGTYGYGGGG AGTTTGCCRT CCCTGGTGGC YAC
2415
2420
2425
2430
2435
2440
2445
2450
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.88 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.88
CCCGACAAGC AGATCGATFT GACGTCGAAG CTG (2) Informație pentru Secvența nr.89 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.89
CCCCACGTAG ARGGCCGARC AGAGRGTGGC GCY (2) Informație pentru Secvența nr.9O (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.9O
YTGRCCGACA AGAAAGACAG ACCCGCAYAR GTC (2) Informație pentru Secvența nr.91 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucletide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.91
CGTCCAGTGG YGCCTGGGAG AGAAGGTGAA CAG (2) Informație pentru Secvența nr.92 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: nucleotide (C) împletire: simplă (D) Topologie: liniară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.92
GCCGGGATAG ATRGARCAAT TGCARYCTTG CGT
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.93 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.93
CATATCCCAT GCCATGCGGT GACCCGTTAY ATG (2) Informație pentru Secvența nr.94 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.94
YACCAAYGCC GTCGTAGGGC ACCARTTCAT CAT (2) Informație pentru Secvența nr.95 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.95
GATGGCTTGT GGGATCCGGA GYASCTGAGC YAY (2) Informație pentru Secvența nr.96 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.96
GACTCCCAG TGRGCWCCAG CGATCATRTC CAW (2) Informație pentru Secvența nr.97 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.97
CCCCACCATG GAGAAATACG CTATGCCCGC YAG
2500
2505
2510
2515
2520
2525
2530
2535
2540
RO 117267 Bl (2) Informație pentru Secvența nr.98 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.98
TAGYAGCAGY ACTACYARGA CCTTCGCCCA GTT (2)
Informație pentru Secvența nr.99 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.99
GSTGACGTGR GTKTCYGCGT CRACGCCGGC RAA Informație pentru Secvența nr. 10O (i) Caracteristici de secvență (A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) împletire: simplă (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.1OO GGAAGYTGGG ATGGTYARRC ARGASAGCAR AGC (2) Informație pentru Secvența nr. 101 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.1O1 GTAYAYYCCG GACRCGCTGC GCACTTCRTA AGC (2) Informație pentru Secvența nr. 102 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.102 (2) Informație pentru Secvența nr.1O3 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic
RO 117267 Bl
| (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | |||
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | ||
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr. 103 | 2595 | |
| RGYRTGCATG ATCAYGTCCG YYGCCTCATA. CAC | |||
| (2) | Informație pentru Secvența nr. 104 | ||
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 2600 | |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | ||
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr. 104 | ||
| RTTGTYYTCC CGRACGARG GCACGCACCC RGG | 2605 | ||
| (2) | Informație pentru Secvența nr. 105 | ||
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 3.3 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie:lineară | 2610 | |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | ||
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr.1O5 | ||
| CGTGGGRGTS AGCGCYACCC AGCARCGGGA GSW. | |||
| (2) | Informație pentru Secvența nr. 106 | 2615 |
(i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară 2620 (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.1O6
YGTRGTGGGG AYGCTGKHRT TCCTGGCCGC VAR (2) Informație pentru Secvența nr. 107
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 2625 |
| (ii) | Tipul moleculei: ADN | 2630 |
| (xi) | Descrierea secvenței: Secvența nr.1O7 CCCRACGAGC AARTCGACRT GRCGTCGTAW TGT | |
| (2) Informație pentru Secvența nr. 108 | ||
| (i) | Caracteristici de secvență: (A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară | 2635 |
RO 117267 Bl (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 108 YCCCACGTAC ATAGCSGAMS AGARRGY CGY (2) Informație pentru Secvența nr. 109 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 109
CTGGGAGAYR AGRAAAACAG ATCCGCARAG RTC (2) Informație pentru Secvența nr. 110 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.110 YGTCTCRTGC CGGCCAGSBG AGAAGGTGAA YAG (2) Informație pentru Secvența nr. 111 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.111
GCCGGGATAG AKKGAGCART TGCAKTCCTG YAC (2) Informație pentru Secvența nr. 112 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 112
CATATCCCAAA GCCATRCGRT GGCCTGAYAC CTG (2) Informație pentru Secvența nr. 113 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
RO 117267 Bl
2685 (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 113 CACTARGGCT OYYOTRGGYG ACCAGTTCAT CAT (2) Informație pentru Secvența nr. 114 (I) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.114
GACRGCTTGT GGGATCCGGA GTAACTGCGA YAC (2) Informație pentru Secvența nr. 115 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 115 GACTCCCCAG TGRGCCCCCG CCACCATRTC CAT (2) Informație pentru Secvența nr. 116 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.116
SCCCACCATG GAWWAGTAGC CAAGGCCCGC YAG (2) Informație pentru Secvența nr. 117 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) împletire: simplă (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvență: Secvența nr. 117
GAGTAGCATC ACAATCAADA CCTTAGCCCA GTT (2) Informație pentru Secvența nr. 118 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
2690
2695
2700
2705
2710
2715
2720
2725
RO 117267 Bl (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 118 YGWCRYGYRG GTRTKCCCGT CAACGCCGGC AAA (2) Informație pentru Secvența nr. 119 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 119
TCCTCACAGG GGAGTGATTC ATGGTGGAGT GTC (2) Informație pentru Secvența nr. 12D (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime; 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 120 ATGGCTAGAC GCTTTCTGCG TGAAGACAGT AGT (2) Informație pentru Secvența nr. 121 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.121
GCCTGGAGGC TGCACGRCAC TCATACTAAC GCC (2) Informație pentru Secvența nr. 122 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 122
GCCAGACCAC TATGGCTCTY CCGGGAGGGG GGG (2) Informație pentru Secvența nr. 123 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
RO 117267 Bl
2775 (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 123 TCRTCCYGGC AATTCCGGTG TACTCACCGG TTC (2) Informație pentru Secvența nr. 124 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 124
GCATTGAGCG GGTTDATCCA AGAAAGGACC CGG (2) Informație pentru Secvența nr. 125 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 125 AGCAGTCTYG CGGGGGCACG CCCAARTCTC CAG (2) Informație pentru Secvența nr. 126 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 126 ACAAGGCCTT TCGCGACCCA ACACTACTCG GCT (2) Informație pentru Secvența nr: 127 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 127
GGGGCACTCG CAAGCACCCT ATCAGGCAGT ACC (2) Informație pentru Secvența nr. 128 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
2780
2785
2790
2795
2800
2805
2810
2815
RO 117267 Bl (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.128 YGTGCTCATG RTGCACGGTC TACGAGACCT CCC (2) Informație pentru Secvența nr. 129 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleuclei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.129
GTTACGTTTG KTTYTTYTTT GRGGTTTRGG AWT (2) Informație pentru Secvența nr. 130 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.130
CGGGAACTTR ACGTCCTGTG GGCGRCGGTT GGT (2) Informație pentru Secvența nr. 131 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.131 CARGTAAACT CCACCRACGA TCTGRCCRCC RCC (2) Informație pentru Secvența nr. 132 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 132
RCGCACACCC AAYCTRGGGC CCCTGCGCGG CAA (2) Informație pentru Secvența nr. 133 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
RO 117267 Bl
2865 (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.133 AGGTTGCGAC CGCTCGGAAG TCTTYCTRGT CGC (2) Informație pentru Secvența nr. 134 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 134
RCGHRCCTTG GGGATAGGCT GACGTWACC TCG (2) Informație pentru Secvența nr. 135 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 136
RCGHRCCTTG GGGATAGGTT GTCGCCWTCC ACG (2) Informație pentru Secvența nr. 136 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.136
YCCRGGCTGR GCCCACRYCC TRCCCTCGGR YYG (2) Informație pentru Secvența nr. 137 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 137
BSHRCCCTCR TTRCCRTAGA GGGGCCADGG RTA (2) Informație pentru Secvența nr. 138 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
2870
2875
2880
2885
2890
2895
2900
2905
RO 117267 Bl (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 138
GCCRCGGGGW GACAGGAGGCC ATCCYGCCCA CCC (2) Informație pentru Secvența nr. 139 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr. 139
CCGGGGGTCY GTGGGGCCCC AYCTAGGCCG RGA (2) Informație pentru Secvența nr. 140 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.140
ATCGATGACC TTACCCAART TRCGCGCCT RCG (2) Informație pentru Secvența nr.141 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.141
CCCCATGAGR TCGGCGAAGC CGCAYGTRAG GGT (2) Informație pentru Secvența nr. 142 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.142
GCCYCCWARR GGGGCGCCGA CGAGCGGWAT RTA (2) Informație pentru Secvența nr. 143 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară
RO 117267 Bl
2955 (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.143 AACCCGGACR CCRTGYGCCA RGGCCCTGGC AGC (2) Informație pentru Secvența nr. 144 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.144 RTTCCCTGTT GCATAGTTCA CGCCGTCYTC CAG (2) Informație pentru Secvența nr. 145 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.145
CARRAGGAAG AKAGAGAAAG AGCAACCRGG MAR (2) Informație pentru Secvența nr. 146 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.146
AGGCATAGGA CCCGTGTCTT (2) Informație pentru Secvența nr. 147 (i) Caracteristici de secvență:
(A) Lungime: 33 nucleotide (B) Tip: acid nucleic (C) împletire: simplă (D) Topologie: lineară (ii) Tipul moleculei: ADN (xi) Descrierea secvenței: Secvența nr.147
Claims (21)
1. Secvență de acid nucleic care nu se găsește în mod normal în natură, conținând o secvență nucleotidică de cel puțin 8 nucleotide corespunzătoare unei secvențe nucleotidice non-HCV din genomul virusului hepatitei C, caracterizată prin aceea că secvența, de cel puțin 8 nucleotide este aleasă dintre: secvențele regiunii
2960
2965
2970
2975
2980
2985
2990
2995
RO 117267 Bl
NS5 numerotate 2, 4...6, 10...12, 14...16, 18...22 (fig.2a-2e); secvența regiunii
1 a învelișului, numerotata 24...32 (fig.3); secvențele regiunii 5'UT, numerotate
34.. .39 și 41...51 (fig.4a-4d); și secvențele regiunii corpului central, numerotate
52.. .57 și 58...66 (fig.5a...5i).
2. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde la unul sau mai multe genotipuri ale virusului hepatitei C.
3. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe a unui prim genotip care este definit de secvențele numerotate 1...6în regiunea NS5 (fig.2d), 23...25 în regiunea 1 a învelișului (fig.3),
33.. .38 în regiunea 5'UT (fig.4a) și 52-57 în regiunea corpului central (fig.5a).
4. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe a unui al doilea genotip care este definit de secvențele numerotate 7...12 în regiunea NS5 (fig.2d), 26-28 în regiunea 1 a învelișului (fig.3), 39...45 în regiunea 5'UT (fig.4a) și 58-64 în regiunea corpului central (fig.5a).
5. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe a unui al treilea genotip care este definit de secvențele numerotate 13... 17 în regiunea NS5 (fig.2d), 32 în regiunea 1 a învelișului (fig.3), 46...47 în regiunea 5'UT (fig.4a) și 65...66 în regiunea corpului central (fig.5a).
6. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe a unui al patrulea genotip care este definit în secvențele numerotate 20...22 în regiunea NS5 (fig.2d), 29...31 în regiunea 1 a învelișului (fig.3) și 48...49 în regiunea 5'UT (fig.4a).
7. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe a unui al cincilea genotip care este definit de secvențele numerotate 18...19 în regiunea NS5 (fig.2e) și 50...51 în regiunea 5'UT (fig. 4a).
8. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că este capabilă de inițierea unei reacții de sinteză a acidului nucleic care are o secvență de nucleotide corespunzătoare virusului hepatitei C.
9. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea posedă mijloacele de marcare pentru detectarea unui produs de hibridizare.
10. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea posedă mijloace suport pentru separarea produsului de hibridizare din soluție.
11. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea previne trascripția sau traslația acidului nucleic viral.
12. Secvență de acid nucleic, conform revendicării 1, caracterizată prin aceea că ea este folosită pentru detectarea unuia sau mai multor genotipuri ale virusului hepatitei C prin formarea unui produs de hibridizare cu acidul nucleic al acestui virus.
13. Peptidă codificată de o secvență de acid nucleic conținând o secvență nucleotidică de 8 sau mai multe nucleotide, corespunzând unei secvențe din genomul hepatitei C, definit în revendicarea 1, caracterizată prin aceea că secvența non-HCV-1
RO 117267 Bl este selecționată dintre secvențele regiunii NS5 numerotate 2, 4...6, 10..12,
14...16 și 18...22 (fig.2d); secvența regiunii 1 a învelișului, numerotată 24...32 (fig.3) și secvențele regiunii corpului central, numerotate 53...57 și 58...66 (fig.5a).
14. Peptidă, conform revendicării 13, caracterizata prin aceea că are o secvență nucleotidică corespunzătoare unuia sau mai multor genotipuri ale virusului hepatitei C.
15. Peptidă, conform revendicării 14, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe de nucleotide corespunzătoare unui prim genotip care este definit de secvențele numerotate 1...6 în regiunea NS5 (fig.2d), 23...35 în regiunea 1 a învelișului (fig.3) și 52...57 în regiunea corpului central (fig.5a).
16. Peptidă, conform revendicării 14, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe de nucleotide corespunzătoare unui al doilea genotip care este definit de secvențele numerotate 7...12 în regiunea NS5 (fig.2d), 26...28 în regiunea 1 a învelișului (fig.3) și 58...64 în regiunea corpului central (fig.5a).
17. Peptidă, conform revendicării 14, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe de nucleotide corespunzătoare unui al treilea genotip care este definit de secvențele numerotate 13...17 în regiunea NS5 (fig.2d), 32 în regiunea 1 a învelișului (fig.3) și 65...66 în regiunea corpului central (fig.5a).
18. Peptidă, conform revendicării 14, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe de nucleotide corespunzătoare unui al patrulea genotip care este definit de secvențele numerotate 20...22 în regiunea NS5 (fig.2d) și 39...31 în regiunea 1 a învelișului (fig.3).
19. Peptidă, conform revendicării 14, caracterizată prin aceea că ea corespunde unei secvențe de nucleotide corespunzătoare unui al cincilea genotip care este definit de secvența numerotată 18... 19 în regiunea NS5 (fig.2d).
20. Peptidă, conform revendicării 13, caracterizată prin aceea că ea este capabilă să genereze o reacție imună într-o gazdă.
21. Peptidă, conform revendicării 13, caracterizată prin aceea că este folosită pentru dezvoltarea de anticorpi specifici pentru proteinele HCV.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US69732691A | 1991-05-08 | 1991-05-08 | |
| PCT/US1992/004036 WO1992019743A2 (en) | 1991-05-08 | 1992-05-08 | Hcv genomic sequences for diagnostics and therapeutics |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RO117267B1 true RO117267B1 (ro) | 2001-12-28 |
Family
ID=24800701
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RO93-01493A RO117267B1 (ro) | 1991-05-08 | 1992-05-08 | Secventa de acid nucleic si peptida codificata de aceasta, pentru diagnostic si tratament |
Country Status (20)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (2) | EP1394256A3 (ro) |
| JP (7) | JPH06508026A (ro) |
| KR (1) | KR100193801B1 (ro) |
| AT (1) | ATE252154T1 (ro) |
| BG (3) | BG64627B1 (ro) |
| CA (1) | CA2108466C (ro) |
| CZ (2) | CZ288722B6 (ro) |
| DE (1) | DE69233234T2 (ro) |
| DK (1) | DK0585398T3 (ro) |
| ES (1) | ES2207633T3 (ro) |
| FI (1) | FI115725B (ro) |
| HU (1) | HU227548B1 (ro) |
| IE (1) | IE921482A1 (ro) |
| NO (1) | NO309532B1 (ro) |
| PL (2) | PL169880B1 (ro) |
| PT (1) | PT100472B (ro) |
| RO (1) | RO117267B1 (ro) |
| RU (1) | RU2155228C2 (ro) |
| SK (1) | SK284205B6 (ro) |
| WO (1) | WO1992019743A2 (ro) |
Families Citing this family (34)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0532167A3 (en) * | 1991-08-09 | 1993-03-31 | Immuno Japan Inc. | Non-a, non-b hepatitis virus genome, polynucleotides, polypeptides, antigen, antibody and detection systems |
| US5428145A (en) * | 1991-08-09 | 1995-06-27 | Immuno Japan, Inc. | Non-A, non-B, hepatitis virus genome, polynucleotides, polypeptides, antigen, antibody and detection systems |
| EP0532258A2 (en) * | 1991-09-09 | 1993-03-17 | Immuno Japan Inc. | Oligonucleotides and determination system of HCV genotypes |
| DE610436T1 (de) * | 1991-11-21 | 1995-08-03 | Common Services Agency | Detektion des Hepatis-C Virus. |
| US6709828B1 (en) | 1992-03-06 | 2004-03-23 | N.V. Innogenetics S.A. | Process for the determination of peptides corresponding to immunologically important epitopes and their use in a process for determination of antibodies or biotinylated peptides corresponding to immunologically important epitopes, a process for preparing them and compositions containing them |
| US6667387B1 (en) | 1996-09-30 | 2003-12-23 | N.V. Innogenetics S.A. | HCV core peptides |
| AU4387193A (en) * | 1992-05-29 | 1993-12-30 | Abbott Laboratories | Ligase chain reaction starting with rna sequences |
| DK0662157T3 (da) * | 1992-09-10 | 2001-08-27 | Isis Pharmaceuticals Inc | Præparater og fremgangsmåde til behandling af Hepatitis C-virus-associerede sygdomme |
| US6423489B1 (en) * | 1992-09-10 | 2002-07-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for treatment of Hepatitis C virus-associated diseases |
| JPH06153961A (ja) * | 1992-11-27 | 1994-06-03 | Imuno Japan:Kk | Ｃ型肝炎ウイルス部分遺伝子、ならびにｃ型肝炎ウイルス遺 伝子の高感度検出法 |
| US7258977B1 (en) | 1992-11-27 | 2007-08-21 | Innogenetics N.V. | Process for typing of HCV isolates |
| JP4251407B2 (ja) | 1992-11-27 | 2009-04-08 | イノゲネテイクス・エヌ・ブイ | Ｈｃｖ単離物のタイピング法 |
| CA2139100C (en) * | 1993-04-27 | 2009-06-23 | Geert Maertens | New sequences of hepatitis c virus genotypes and their use as therapeutic and diagnostic agents |
| US7255997B1 (en) | 1993-04-27 | 2007-08-14 | N.V. Innogenetics S.A. | Sequences of hepatitis C virus genotypes and their use as therapeutic and diagnostic agents |
| JPH0775585A (ja) * | 1993-06-14 | 1995-03-20 | Immuno Japan:Kk | Ｃ型肝炎ウイルス関連オリゴヌクレオチドならびにｃ型肝炎 ウイルス遺伝子型判定方法 |
| US5882852A (en) * | 1993-06-29 | 1999-03-16 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Hepatitic C virus (HCV) core gene nucleotide sequences and related methods of detecting major and minor genotypes of HCV isolates |
| US5514539A (en) | 1993-06-29 | 1996-05-07 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 gene of 51 isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines |
| US7070790B1 (en) | 1993-06-29 | 2006-07-04 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 and core genes of isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines |
| US5885771A (en) * | 1993-10-29 | 1999-03-23 | Srl, Inc. | Antigenic peptide compound and immunoassay |
| JPH10503364A (ja) * | 1994-05-10 | 1998-03-31 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレーション | Ｃ型肝炎ウイルスのアンチセンス阻害 |
| ES2176342T5 (es) | 1994-10-21 | 2010-02-09 | Innogenetics N.V. | Secuencias del genotipo 7 del virus de la hepatitis c y su utilizacion como agentes profilacticos, terapeuticos y de diagnosticos. |
| US5851759A (en) * | 1996-04-19 | 1998-12-22 | Chiron Corporation | Heteroduplex tracking assay (HTA) for genotyping HCV |
| IT1284847B1 (it) * | 1996-06-07 | 1998-05-22 | Sorin Biomedica Diagnostics Sp | Procedimento per la rivelazione di acidi nucleici specifici di hcv |
| AU1232099A (en) * | 1997-11-04 | 1999-05-24 | Roche Diagnostics Gmbh | Specific and sensitive method for detecting nucleic acids |
| US6680059B2 (en) | 2000-08-29 | 2004-01-20 | Tripep Ab | Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof |
| KR100801123B1 (ko) | 2000-08-17 | 2008-02-05 | 트리펩 아베 | 리바비린 함유 백신 및 이것의 사용 방법 |
| RU2286172C2 (ru) | 2000-08-17 | 2006-10-27 | Трипеп Аб | Вакцины, содержащие рибавирин, и способы их использования |
| US7022830B2 (en) | 2000-08-17 | 2006-04-04 | Tripep Ab | Hepatitis C virus codon optimized non-structural NS3/4A fusion gene |
| US6586584B2 (en) | 2001-01-29 | 2003-07-01 | Becton, Dickinson And Company | Sequences and methods for detection of Hepatitis C virus |
| US7196183B2 (en) | 2001-08-31 | 2007-03-27 | Innogenetics N.V. | Hepatitis C virus genotype, and its use as prophylactic, therapeutic and diagnostic agent |
| ES2596753T3 (es) | 2003-08-29 | 2017-01-11 | Fujirebio Europe N.V. | Nuevo clado del virus de la hepatitis C y secuencias prototipo del mismo |
| CN1977050B (zh) | 2004-01-07 | 2012-09-05 | 第三次浪潮技术公司 | 丙型肝炎病毒基因型的确定 |
| KR100733186B1 (ko) * | 2005-05-31 | 2007-06-27 | 재단법인 목암생명공학연구소 | Ｈｃｖ 유전자에 특이적인 작은 간섭 ｒｎａ 및 그를유효성분으로 포함하는 ｃ형 간염 치료제 |
| US8071561B2 (en) | 2007-08-16 | 2011-12-06 | Chrontech Pharma Ab | Immunogen platform |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0318216B2 (en) * | 1987-11-18 | 2001-08-29 | Chiron Corporation | NANBV diagnostics |
| SU1645302A1 (ru) * | 1989-01-05 | 1991-04-30 | Московский Научно-Исследовательский Институт Педиатрии И Детской Хирургии Минздрава Рсфср | Способ дифференциальной индикации вирусспецифических нуклеотидных последовательностей вируса герпеса простого типа 1 и 2. |
| KR0185373B1 (ko) * | 1989-03-17 | 1999-05-01 | 로버트 피. 블랙버언 | Hcv 폴리단백질에서 유래되는 hcv 아미노산 서열 부분을 포함하는 폴리펩티드 및 그 사용 |
| CA2032381C (en) * | 1989-12-18 | 2006-02-21 | Peter E. Highfield | Viral agent |
| WO1991014779A1 (fr) * | 1990-03-28 | 1991-10-03 | Mitsui Toatsu Chemicals, Incorporated | Diagnostic du virus de l'hepatite |
| ATE194844T1 (de) * | 1990-04-06 | 2000-08-15 | Genelabs Tech Inc | Hepatitis c-virus-epitope |
| NZ238681A (en) * | 1990-06-25 | 1992-03-26 | Univ Osaka Res Found | Non-a, non-b hepatitis virus particles and their production |
| EP0464287A1 (en) * | 1990-06-25 | 1992-01-08 | The Research Foundation for Microbial Diseases of Osaka University | Non-A, non-B hepatitis virus genomic cDNA and antigen polypeptide |
| EP0510952A1 (en) * | 1991-04-26 | 1992-10-28 | Immuno Japan Inc. | Oligonucleotide primers and their application for high-fidelity detection of non-a, non-b hepatitis virus |
-
1992
- 1992-05-08 CA CA002108466A patent/CA2108466C/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-05-08 RU RU93058449/13A patent/RU2155228C2/ru active
- 1992-05-08 ES ES92913881T patent/ES2207633T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1992-05-08 DE DE69233234T patent/DE69233234T2/de not_active Revoked
- 1992-05-08 AT AT92913881T patent/ATE252154T1/de not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 PT PT100472A patent/PT100472B/pt not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 HU HU9303166A patent/HU227548B1/hu unknown
- 1992-05-08 PL PL92301282A patent/PL169880B1/pl unknown
- 1992-05-08 JP JP4512055A patent/JPH06508026A/ja not_active Withdrawn
- 1992-05-08 KR KR1019930703367A patent/KR100193801B1/ko not_active Expired - Lifetime
- 1992-05-08 PL PL92312096A patent/PL170151B1/pl unknown
- 1992-05-08 RO RO93-01493A patent/RO117267B1/ro unknown
- 1992-05-08 EP EP03013389A patent/EP1394256A3/en not_active Withdrawn
- 1992-05-08 EP EP92913881A patent/EP0585398B1/en not_active Revoked
- 1992-05-08 CZ CZ19961210A patent/CZ288722B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 DK DK92913881T patent/DK0585398T3/da active
- 1992-05-08 WO PCT/US1992/004036 patent/WO1992019743A2/en not_active Ceased
- 1992-05-08 SK SK1232-93A patent/SK284205B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1992-05-08 CZ CZ19932377A patent/CZ288720B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1992-07-01 IE IE148292A patent/IE921482A1/en not_active IP Right Cessation
-
1993
- 1993-11-05 NO NO934019A patent/NO309532B1/no not_active IP Right Cessation
- 1993-11-05 BG BG101876A patent/BG64627B1/bg unknown
- 1993-11-05 BG BG98200A patent/BG62142B1/bg unknown
- 1993-11-08 FI FI934937A patent/FI115725B/fi not_active IP Right Cessation
-
1997
- 1997-09-04 BG BG101876A patent/BG101876A/xx unknown
-
2002
- 2002-05-10 JP JP2002134997A patent/JP2003009891A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002135000A patent/JP2003009893A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002134999A patent/JP2003009892A/ja not_active Withdrawn
- 2002-05-10 JP JP2002134998A patent/JP2003024090A/ja not_active Withdrawn
-
2004
- 2004-06-04 JP JP2004167859A patent/JP2004290204A/ja not_active Withdrawn
-
2008
- 2008-03-05 JP JP2008055639A patent/JP2008178416A/ja active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RO117267B1 (ro) | Secventa de acid nucleic si peptida codificata de aceasta, pentru diagnostic si tratament | |
| US6214583B1 (en) | HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics | |
| RU2148587C1 (ru) | Полипептид и способ его получения, реагент для иммуноанализа, способ определения присутствия антител и способ индукции иммунного ответа | |
| EP0804584B2 (en) | Sequences of hepatitis c virus genotype 7 and their use as prophylactic, therapeutic and diagnostic agents | |
| IE83867B1 (en) | HCV genomic sequences for diagnostics and therapeutics | |
| US7557199B2 (en) | Hepatitis C virus vaccine | |
| JP4296174B2 (ja) | Ｇ型肝炎ウイルスおよびその分子クローニング |