NO20130115L - Farmasøytisk sammensetning omfattende et intestinalt kolesterolbindende protein. - Google Patents

Farmasøytisk sammensetning omfattende et intestinalt kolesterolbindende protein.

Info

Publication number
NO20130115L
NO20130115L NO20130115A NO20130115A NO20130115L NO 20130115 L NO20130115 L NO 20130115L NO 20130115 A NO20130115 A NO 20130115A NO 20130115 A NO20130115 A NO 20130115A NO 20130115 L NO20130115 L NO 20130115L
Authority
NO
Norway
Prior art keywords
protein
cholesterol
kda
biological material
compound
Prior art date
Application number
NO20130115A
Other languages
English (en)
Inventor
Werner Kramer
Wendelin Frick
Original Assignee
Sanofi Aventis Deutschland
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Publication of NO20130115L publication Critical patent/NO20130115L/no
Application filed by Sanofi Aventis Deutschland filed Critical Sanofi Aventis Deutschland

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/06Antihyperlipidemics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Obesity (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Oppfinnelsen beskriver en fremgangsmåte for å isolere et intestinalprotein som er i stand til å binde kolesterol og/eller hemmere av kolesterolopptak.

Description

Oppfinnelsen vedrører en blant annet en farmasøytisk sammensetning og et medikament inneholdende et intestinalt kolesterolbindende protein.
Fremgangsmåte for å isolere et intestinalt kolersterolbindende protein.
Oppfinnelsen vedrører en fremgangsmåte for å isolere et intestinalt protein som er involvert i intestinal kolesterolabsorpsjon og evnen til å binde kolesterol absorpsjonshemmere.
Hos mennesker så er i gjennomsnitt ca. 50% av kolesterolet til stede i hunen av tarmen. Det mtraluniinale kolesterolet kommer hovedsakelig fra kosten og fra gallen. Ca. 2 g kolesterol hver dag blir utskilt fra gallen. Den intestinale kolesterolabsorpsjonen avhenger veldig av tilstedeværelsen av gallesalter. Effekten av administreringen av hemmere av igjen opptaket av gallesalter eller av gallesalt kompleksdannere er dermed å hemme intestinal kolesterolabsorpsjon.
Hemming av intestinal kolesterolabsorpsjon er et viktig formål for behandlingen av lipid forstyrrelse, arteriosklerose og kardiovaskulære forstyrrelser. Den alminnelige meningen blant eksperter er at intestinal kolesterolabsorpsjon finner sted ved fysiokjemisk diffusjon.
En rekke observasjoner i sammenheng med kolesteroltransport som indikerer at et protein er involvert er kjente. Intestinal kolesterolabsorpsjon er utsatt for individuell variabilitet. Biokjemiske data fra in vitro eksperimenter indikerer at proteiner er involvert i kolesterolutbytting mellom små unilamellære vesikler og "brush border"-vesiklene i tarmen. Det var mulig å observere store forskjeller i den intestinale absorpsjonen av plantesteroler slik som p-sitosterol og campesterol som avviker bare i en metylgruppe (P-sitosterol) og en etylgruppe (campesterol). Hos mennesker så viste P-sitosterol blant annet en hemming av kolesterolabsorpsjon. Det finnes to veldig aktive klasser med forbindelser som hemmer intestinal kolesterolabsorpsjon ved luminal administrering. Forbindelsene er på den ene siden forbindelser utledet fra saponin, slik som tiquesid og pamaquesid, og på den annen side visse derivater av 2-azetidinoner. Derivater av 2-azetidinoner som hemmere av kolesterolabsorpsjon er beskrevet i Clader et al., J. Med. Chem. 39, 3684-3693,1996. For formålene i den oppfinnelsen, er absorpsjon ment å bety festing av en substans til et protein og transport av denne substans ved hjelp av dette protein.
Intestinal absorpsjon av kolesterol bidrar signifikant til serum-kolesterolhomeostase. Hemmere av intestinal kolesterolabsorpsjon som Ezetimbe eller Pamaqueside har vist deres effektivitet som nye kolesterolsenkende midler i kliniske utprøvinger. Deres molekylære virkningsmåte så vel som mekanismene for intestinal kolesterolabsorpsjon er til tross for enorme vitenskapelige anstrengelser fremdeles ukjente og blir diskutert kontroversielt. Generelt så antas en passiv diffusjon av kolesterol over plasmamembranene og den intestinale børste grensecellemembranen, men det er økende bevis for en proteinstyrt prosess for intestinal kolesterolabsorpsjon: Kolesterolabsorpsjon viser en sterk artsforskjell og strukturelltett relaterte plantesteroler som p-sitosterol eller campesterol med sammenliknbare fysikokjemiske karakteristika blir i motsetning til kolesterol bare dårlig absorbert noe som gjør en enkel diffusjonsprosess usannsynlig. Eksistensen av spesifikke transporthemmere for kolesterol, 2-azetidinoider og sterol glykosider, med uttalt struktur-aktivitets-slekstsskap tyder sterkt på en proteinstyrt prosess for intestinal kolesterolabsorpsjon.
Kolesterol er en allsidig forbindelse som er vital (i små mengder) for funksjoneringen av den humane kroppen. Bare dyr produserer det; ingen planteprodukt inneholder kolesterol med mindre et dyrebasert produkt, slik som flesk, er blitt tilsatt til det i prosesseringen. Hos mennesker tjener kolesterol tre hovedfunksjoner. Det blir anvendt av visse kjertler for å produsere steroider eller kortisonliknende hormoner, inkludert kjønnshormoner. Det hjelper leveren til å produsere gallesyre, som er essensielt for fordøyelsen av fett. Sist men ikke minst så er det en hovedkomponent i cellemembraner og strukturer, en type byggesteiner for kroppsvev. Uten kolesterol ville ikke pattedyrliv kunne eksistere.
Problemet med kolesterol oppstår når kroppen har for mye av det, eller har deponeringer av det på gale stedene. Koronar hjertesykdom er et resultat når kolesterol er deponert på innsiden av veggene av hjertets koronararterier, hovedleverandørene av oksygen til
hjertets eget muskelvev. Der bidrar det til dannelsen av fettliknende, seige blokkeringer kalt plakk. Denne oppbygging av plakk blir kalt arteriesklerose, herding av arteriene, og arteriosklerose. Kolesterol kan også deponeres innen arteriene andre steder i kroppen, hvor det kan bidra til at slag oppstår (fra blokkerte arterier i hjernen) og perifer vaskulær sykdom (fra arterieblokkering i bena).
For å reise gjennom kroppen må kolesterol pakkes i spesielle molekyler som kalles lipoproteiner. Lipidene eller fettkolesterolkomponentene er pakket på innsiden av en vannløselig proteinkappe. Forskjellige typer lipoproteiner inneholder forskjellige lipoproteiner fra en dynamisk økonomi innen kroppen, transporterer kolesterol til noe vev og fjerner det fra andre. Den hovedkolesterolbærende forbindelsen i kroppen er lavtetthetsprotein, eller LDL-kolesterol. LDL blir ofte referert til som det "dårlige kolesterol" fordi det synes å spille en nøkkelrolle i å deponere kolesterol innen arteriene. Det blir kalt lavtetthets fordi det har veldig lite protein, det mest tette innholdet av molekylet, og er sammensatt hovedsakelig av fett. Høye nivåer av LDL er koplet til en øket risiko for koronar hjertesykdom. Høytetthets lipoprotein, ellr HDL, blir ofte kalt "godt kolesterol" fordi det synes som om det hjelper til med å fjerne kolesterol fra arterieveggene og transporterer det til leveren for utskilling. I motsetning til LDL-kolesterol, er lave nivåer av HDL assosiert med en øket risiko for koronar hjertesykdom mens høyere nivåer av HDL synes å beskytte mot sykdommen.
Andre undergrupper av kolesterolpartikler inkluderer chylomikroner som blir produsert av tarmcellene når fett blir fordøyet, og veldig lav tetthetsprotein (VLDL), produsert av leveren som en viktig forløper for LDL-kolesterol produksjon. VLDL er hovedlipoproteinet som transporterer triglyseridene som produseres av leveren.
For formålet med å bestemme hjertesykdomsrisiko, er LDL og HDL nøkler.
Når man har alle bevisene for at høyfett, høykolesteroldiett bidrar til forhøyede nivåer av kolesterol i blodet og at høyt blodkolesterol er en bestemt risikofaktor for hjertesykdom, kan det synes naturlig å anta at å senke blodkolesterol ved diett eller på andre måter vil redusere den risikoen.
Det er et tema i oppfinnelsen å tilveiebringe en fremgangsmåte for å isolere et protein som er involvert i intestinal kolesterolabsorpsjon og som er det molekylære proteinmålet for kolesterolabsorpsjonshemmere. En slik fremgangsmåte er ment å bidra med store fordeler for terapeutiske innsatser for å kontrollere forhøyede kolesterolnivåer.
Oppfinnelsen vedrører en fremgangsmåte for å isolere et protein hvor
a) biologisk materiale blir tilveiebrakt,
b) det biologiske materialet fra a) blir inkubert med en fotoreaktiv 2-azetidinon forbindelse som er radioaktivt merket og som er i stand til spesifikt å binde
seg til nevnte protein,
c) det biologiske materialet er løselig og celledebris blir fjernet,
d) supernatanten blir tilsatt til en innretning som innehar hvete, spire lektinagarose, e) eluatet av hvete spire lektinagarosen fra d) blir applisert på en hydroksylapatitt kolonne som blir eluert ved hjelp av en for svak
buffergradient
f) de radioaktivt merkede fraksjonene fra e) blir lagt på en preparativ SDS-PAOE, g) de radioaktivt merkede fraksjonene ble samlet og muligens presipitert.
Det biologiske materialet blir tatt helst fira tarmvev eller celler fra en tarmcellekultur
eller ideelt børstegrenseceller fra et menneske, en rotte, en mus eller en kanin.
De fotoreaktive 2-azetidinon forbindelsene har helst den følgende strukturen (Kramer, W. et al. (2000) FEBS Letters 487,293-297)
hvor R velges fra en av de følgende gruppene a) til e):
Forbindelsene i formel la, b og c er blitt omtalt i DE 10042447 Al som ble publisert den 28. mars 2002. Syntese av forbindelsen av formel ld og e er beskrevet i de etterfølgende eksemplene.
En fotolabil gruppe i et molekyl kan anvendes for å produsere kovalente bindinger til et molekyl, helst et protein, som er lokalisert i den direkte nærheten. For dette formål blir en forbindelse med den fotolabile gruppen initielt brakt i den direkte nærhet av molekylet som den kovalente forbindelsen skal produseres med. Dette kan for eksempel finne sted gjennom en annen del av forbindelsen som tjener som en spesifikk hemmer av et protein, helst en hemmer av kolesterolabsorpsjon. Etter kontakten mellom forbindelsen og molekylet stråles det med UV-lys. Strålingen med UV-lys aktiverer den fotolabile gruppen og initierer produksjonen av en kovalent forbindelse til det interagerende molekylet, spesielt til et protein. Passende som fotolabil gruppe er for eksempel diazirin, azido eller karbonylfunksjonelle grupper.
Det er mulig å bruke for stråling en konvensjonell UV-lampe lik den som for eksempel anvendes for å visualisere polynukleotider med interkalerende etidiumbromid eller for å sterilisere laboratorieoverflater, eller en fotokjemisk reaktor som er mulig å skaffe til veie for eksempel fra "The Southern Ultraviolet Company, Hamden, CT". Ødeleggelsen av celler etter stråling med UV-lys ble utført ved å anvende konvensjonelle fremgangsmåter. Eksempler på det er repetert frysing og tining, behandling av cellene med ultralyd, anvendelsene av en fransk presse eller tilsettingen av en detergent og enzymer. Fraksjoneringen av proteinene av cellelysatet kan utføres for eksempel ved presipitering med ammoniumsulfat, ved differensial sentrifugering eller ved å bruke kromatografiske teknikker. Kromatografiske teknikker som er passende for dette formål er for eksempel denaturering eller ikke-denaturerende polyakrylamid gelelektroforese i en eller to dimensjoner, høyt trykk flytende kromatografi, ioneutbyttingskromatografi eller affinitetskromatografi. Disse teknikkene er kjent for fagfolk og behandles i detalj for eksempel i "Current Protocols in Protein Science", John E. Caligan; Ben M. Dunn; Hidde L. Ploegh; David W. Speicher; Paul T. Wingfield; Wiley and Sons; ISBNO-471-11184-8.
Helst så finner deteksjonen av et protein etter en fraksjonering sted ved hjelp av radioaktiv merking av forbindelsen som inneholder en hemmer av intestinal kolesterolabsorpsjon og en fotolabil gruppe. En radioaktiv isotop som kan anvendes for dette formål er for eksempel<3>H eller<14>C. En passende deteksjonsmetode er for eksempel deteksjon av proteinet som inneholder en kovalent bundet forbindelse ved hjelp av et filmmateriale anvendt for røntgenfotografering etter at proteinet er blitt introdusert på en polyakrylamid gel ved hjelp av polyakrylamid gelelektroforese. Andre passende deteksjonsmetoder er flytende scintillasjonstelling eller flatsengsskanning.
Biologisk materiale består fortrinnsvis av intestinale celler. De intestinale cellene kan tilveiebringes for eksempel ved disseksjon av tarm fra dyr og etterfølgende rensing, enzymatisk ødeleggelse av bindevevet og suspensjon av enkle celler i isotone bufferløsninger. Intestinalt vev som er passende for tilveiebirngelsene av intestinale celler er blant annet de korresponderende delene av dyrene som er igjen etter slakting. Intestinale celler kan også tilveiebringes fra humant tarmvev etter at deler av tarmen er blitt ervervet ved operasjon. De intestinale cellene kan også bestå av intestinale cellekulturer tilveiebrakt for formålet i oppfinnelsen ved bruk av celledyrkingsteknikker. Deler av intestinale celler kan være organeller fra de intestinale cellene. Organellene er helst membraner av de intestinale cellene. Membraner av de intestinale cellene kan skaffes til veie ved differensial sentrifugering etter ødeleggelse av disse cellene. Deler av cellene er helst også proteinfraksjoner. Tilveiebringelse av intestinale celler eller deler av intestinale celler er intestinale celler som helst består av celler fra "brush border" til det intestinale vevet hos pattedyrorganismer.
Pattedyrorganismer som disse intestinale cellene skaffes til veie fra inkluderer helst men er ikke begrenset til mennesker, aper, storfe, griser, rotter, mus, kaniner, hamstere og andre virveldyrarter. Disse cellene kan tilveiebringes ved å lage cellesuspensjoner fra "brush border" vevet i tarmen hos slike organismer. Passende tarmmateriale blir for eksempel skaffet til veie ved kirurgiske prosedyrer. Andre kilder kan komme fra deler av dyr som blir igjen etter slakting. Celler fra en tarmcellelinje er likeverdig passende. For å lage passende cellepreparasjoner, så kan tarmvevet utsettes for enzymbehandling for å frigjøre enkle celler og deretter gjennomgå differensial sentrifugering. De resulterende cellene eller organellene blir deretter tatt opp i passende vandig medium. Disse vandige mediene kan inneholde buffersubstanser, salter, proteiner og i tillegg hjelpemidler.
Oppfinnelsen vedrører også en fremgangsmåte for å isolere et bindende protein for kolesterolabsorpsjonshemmere som er involvert i intestinal kolesterolabsorpsjon hvor
a) biologisk materiale blir tilveiebrakt,
b) det biologiske materialet fra a) blir inkubert med en fotoreaktiv hemmer av kolesterolopptak som er radioaktivt merket eller som er merket med biotin.
c) det biologiske materialet fra b) er løselig og celledebris blir fjernet,
d) supernatanten blir utsatt for kromatografiske prosedyrer eller blir tilsatt til streptavidin-agarose,
e) eluatet blir tilsatt til en SDS-PAGE,
f) proteiner som vandrer i et størrelsesområde på 140 til 150 kDa blir skåret ut,
eluert og muligens refoldet.
Det biologiske materialet blir helst tatt fra tarmvev eller celler fra en intestinal cellekultur eller ideelt "brush border" celler fra et menneske, en rotte, en mus eller en kanin.
Hemmer en av kolesterolopptak som er biotinmerket har helst strukturen:
Oppfinnelsen vedrører også et protein med evnen til spesifikt å binde kolesterolabsorberende hemmere som er blitt isolert ved hjelp av en fremgangsmåte i oppfinnelsen som tidligere nevnt. Proteinet har helst en størrelse på 140 til 150 kDa og aller helst en størrelse på 145 kDa. Proteinet er muligens glykosylert.
Molekylvekten til proteinene blir bestemt til et visst område med usikkerhet som er forårsaket av SDS-polyakrylamid gelelektroforesefremgangsmåten som anvendes, men er også kjent for andre korresponderende fremgangsmåter. Variasjonene i molekylvektene er i området opp til ± 10%. De bestemte verdiene representerer gjennomsnittet av flere eksperimenter. I tilfelle med proteinet med den bestemte molekylvekten på 145 kDa, ble bestemmelsene av molekylvekten i 10 eksperimenter utført uavhengig av hverandre ved hjelp av SDS-polyakrylamid gelelektroforese og resulterte i et gjennomsnitt på 145,3 kDa med et standard avvik på ± 7,55 kDa.
Detaljer av passende fremgangsmåter for å sjekke glykosylering kan finnes av fagfolk i "Carbohydrate Biotechnology Protocols, Methods in Biotechnology, 10 (1999) Humana Press, ISBN 0-89603-563-8, red. C. Bucke".
Oppfinnelsen vedrører videre et kompleks som er dannet av et protein ifølge oppfinnelsen og en forbindelse som har den følgende strukturen.
Oppfinnelsen vedrører videre en farmasøytisk sammensetning som omfatter et protein ifølge oppfinnelsen og farmasøytiske akseptable forbindelser og/eller hjelpemidler for formulering av et medikament. Slike substanser er vanligvis kjent og beskrevet for eksempel i Remingtons Pharmaceutical Sciences, femte utgave av Mack Publishing Company.
Oppfinnelsen vedrører også en farmasøytisk sammensetning som omfatter et kompleks av et protein i oppfinnelsen og en forbindelse som tidligere nevnt så vel som farmasøytisk akseptable forbindelser for formulering av et medikament.
Oppfinnelsen inkluderer også anvendelsen av et protein ifølge oppfinnelsen for produksjonen av en farmasøytisk sammensetning for behandling av en sykdom som er koblet til forhøyede kolesterolnivåer. Slike sykdommer er for eksempel overvekt, arteriosklerose, høyt blodtrykk, hjertefeil og andre. Et kolesterolnivå på 199 mg/dl er å betrakte som forhøyet.
Oppfinnelsen inkluderer også anvendelsen av et kompleks av et protein ifølge oppfinnelsen og en forbindelse som tidligere nevnt for å produsere en farmasøytisk sammensetning for behandling av en sykdom som er koblet til forhøyede kolesterolnivåer.
Oppfinnelsen vedrører også anvendelsen av et protein ifølge oppfinnelsen for å identifisere en forbindelse som hemmer kolesterolgjenopptak hvor a) biologisk materiale blir tilveiebrakt som inneholder proteinet ifølge oppfinnelsen,
b) en forbindelse blir tilveiebrakt,
c) det biologiske materialet og forbindelsen blir brakt i kontakt,
d) mengden av kolesterol tatt opp av det biologiske materialet fra c) blir bestemt. e) resultatet fra d) blir sammenliknet med resultatene fra et kontrolleksperiment hvori kolesterolopptaket blir bestemt fra biologisk materiale som har det
samme slaget og/eller vevsspesiifsiteten som det biologiske materialet fra a) men som ikke blir brakt i kontakt med en forbindelse i b),
f) resultatene fra e) indikerer en forbindelse som hemmer kolesterolgjenopptak når redusert kolesterolopptak fra cellene som er brakt i kontakt med en
forbindelse fra b) blir bestemt.
Oppfinnelsen vedrører også et medikament som omfatter en forbindelse som er identifisert ved en slik fremgangsmåte så vel som farmasøytiske akseptable hjelpemidler for behandling av en sykdom som er koplet til forhøyede kolesterolnivåer.
Molekylvekten av en slik forbindelse er helst i området fra 100 til 50000 Da og mer ønskelig mellom 100 og 5000 Da. Denne forbindelse kunne være en kolesterolanalog, et protein, et peptid eller en fettsyre inneholdende en forbindelse.
Tilveiebringelsen av en forbindelse finner for eksempel sted ved kjemisk syntese. Forbindelsen kan være del av en samling med kjemiske forbindelser lik de som er et resultat fra oppbevaring og katalogiseringen av de kjemiske forbindelsene fra fullstendige synteseprogrammer ("forbindelsesbiblioteker"). Forbindelsen kan i andre tilfeller være produsert ved hjelp av en mikroorganisme, spesielt en bakterie, en sopp eller en dyre- eller planteart (naturlige substanser). I tilfellet med en naturlig substans, så kan tilveiebirngingen også finne sted ved isolering fra de passende organismene. Kontakten mellom et protein og en forbindelse finner i de fleste tilfellene sted i vandige løsninger som en viss del av et løsemiddel slik som for eksempel dimetylsulfoksid eller etanol er blitt tilsatt. De vandige løsningene kan også inneholde buffersubstanser, ioner eller stabiliserende tilsettinger slik som proteiner, glyserol eller andre. Spesielt konstante betingelser, for eksempel temperaturen, pH, ionebetingelsene, konsentrasjonen av proteinet eller forbindelsen, eller volumet, kan være fordelaktige for kontakten. For eksempel så det dermed være ønskelig å holde temperaturen konstant ved 37°C i løpet av kontakten. Bestemmelsen av bindingen av forbindelsen til proteinet etter at kontakten har funnet sted, for eksempel ved interaksjon med kolesterol eller kolesterolabsorpsjonshemmere som er radioaktivt merket på en annen måte, ved å anvende erstatning av kolesterolet eller kolesterolabsorpsjonshemmere som et mål for affiniteten av forbindelsen for proteinet.
Eksempler
Syntese av 5-(2-okso-heksahydro-tieno [3,4-d)imidazol-6-yl)-pentansyre[2-(4-azido-fenyl)-1-(4{4-3-(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl] - fenylkarbamoyl}-butylkarbamoyl)-etyl]amid.
Numrene 1 til 14 innen den følgende passasjen refererer seg til det generelle reaksjonsskjema i figur 1.
Syntese av den biotinmerkede fotoreaktive kolesterhemmeren (5-(2-okso-heksahydro-tieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentansyre[2-(4-azido-fenyl)-1 -(4- {4-(3 -(3-hydroksy-3 - fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl]-fenylkarbamoyl} - butylkarbamoyl)-etyl]-amid).
Numrene 1 til 14 innen den følgende passasjen vedrørende syntesen av nevnte biotinmerkede fotreaktive kolesterolhemmer refererer seg til reaksjonsskjemaet i figur 1 og figur 2.
3-[5-(tert-bulyl-mmetyl-silanyloksy)-5-fenyl-pentanoyl]-4-fenyl-oksazolidin-2-on(l)
30 g 3-(-hydroksy-5-fenyl-pentanoyl)-4-fenyl-oksazolidin-2-on bir løst i 50ml DMF. Etter tilsetting av 14,3 g imidazol og 19 g tert-butyl-dimetylsilyklorid i 25 ml DMF blir reaksjonen rør ved romtemperatur inntil alle kombonentene er løst (2-4 timer). Reaksjonsløsningen blir fordampet, og etter vann blir tilsatt ble den ekstrahert med eddiksyre etylester. Etter tørking av den organiske fasen ved hjelp av magnesiumsulfat og fordamping blir forbindelse 1 skaffet tilveie: C26H35N04Si(453,6) MS (ESI<4>) 476 (M + Na<+>).
(4-metoksy-benzyliden)-(4-nitro-fenyl)-amin (2).
Til 50 g (370 mmol) av anisaldehyd i 160 ml isopropanol blir 51 g (370 mmol) para-nitroanilin tilsatt. Etter 2 timer ved 80°C presipiterte produktet. Reaksjonsbalanding blir nedkjølt til romtemperatur og filtrert. Det gjenværende ble vasket med isopropanol. Etter tørking ble 62,9 g av produkt 2 skaffet til veie (utbytte på 66%) i form av gule krystaller: C14H13N2O3(257,27).
3-{5-(tert-butyl-dimetyl-silanyloksy)-2-[(4-metoksyfenyl)-(4-nitro-fenylamino)-metyl]-5-fenyl-pentanoyl} -4-fenyl-oksazolidin-2-on (3).
Til 5,4 g (12,0 mmol) av produkt 1 og 6,2 g (24 mmol) av produkt 2 i 135 ml metylenklorid blir 8 ml diisopropyletylamin tilsatt ved 10°C og 4,8 ml trimetylsilylklorid blir tilsatt dråpevis. Etter 1 time blir 14 ml av en 1 molar løsning av titantetraklorid i metylenklorid tilsatt dråpevis ved -10°C. Det blir rørt 3 timer ved -10°C og videre oppbevart i 12 timer ved -30°C uten røring. Etterpå ble 8 ml eddiksyre og 150 ml av en 7% vandig løsning med vinsyre tilsatt og det ble rørt i videre 2 timer ved romtemperatur. Etter tilsettingen av 50 ml av en 20% vandig løsning av natriumhydrogensulfitt ble det rørt i ytterligere 1 time og ekstrahert med metylenklorid. Den organiske fasen blir tørket ved hjelp av magnesiumsuflat, fordampet og renset ved kromatografi på silikagel/etylacetat/heptan = 1/3- > 1/1, 6,3 g (74%) av produkt 3 blir skaffet til veie i form av en lysegul fast forbindelse: C4oH47N307Si (709,92) MS (ESf) 710 (M + H<4>) 3-[3-(tert-butyl-d4metyl-silanyloksy)-3-fenylpropyl]-4-(3-metoksyfenyl)-l-(4-nitro-fenyl)-azetidin-2-on (4)
En blanding som omfatter 6,1 g (8,6 mmol) av produkt 3, 7,3 ml bistrimetylsilylacetamid, 0,5 g tetrabutylammoniumfluorid og 100 ml tert-butylmetyleter blir rørt under en argonatmosfære i 10 timer ved romtemperatur. Etter avslutningen av reaksjonen blir 5 ml eddiksyre tilsatt langsomt ved kjøling med is og fordampet. Det gjenværende blir separert ved hjelp av kromatografi for silicagel
(etylacetat/heptan = Vi). 3,3 g (70%) av produkt 4 blir skaffet til veie i form av en lys gul forbindelse i fast form: CsiHag^OsSi (546,74) MS (ESI4) 547,3 (M + H<4>).
1 -(4-amino-fenyl)-3 - [3 -(tert-butyl-dimetylsilanyloksy)-3 -fenylpropyl] -4-(3 - metoksyfenyl)-azetidin-2-on (5).
En reaksjon blir utført med 3,0 g(5,5 mmol) av produkt 4 i 50 ml etylacetat og 1,0 g palladiumtrekull 10% i 2 timer ved 5 bar av en hydrogenatmosfære ved å anvende en autoklave. Reaksjonsløsningen blir filtrert, fordampet og separert ved hjelp av kromatografi på silikagel (metylenklorid/metanol = 10/1). 2,4 g (86%) av produkt 5 blir skaffet til veie i form av en fargeløs forbindels i fast form: CaiHrø^C^SDi (516,76) MS (ESI4) 517,4 (M + H4).
1 -(4-amino-fenyl)-3 -(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-4-(3 -metoksyfenyl)-azetidin-2-on (6)
15 ml av 2N vandig saltsyre blir tilsatt til 2,3 g av produkt 5 i 20 ml tetrahydrofuran og rørt i 2 timer. En vandig løsning av natriumhydrogenkarbonat blir tilsatt i reksjonen og ekstrahert ved etylacetat. Den organiske fasen blir tørket ved hjelp av magnesiumsulfat, fordampet og renset ved hjelp av kromatografi på silicagel (etylacetat/heptan = 1/1 - > 1/0). 1,1 g av produkt 6 ble skaffet til veie i form av en fargeløs for bindelse i fast form: C25H26N2O3(402,50) MS (ESI4) 403,2 (M + H<4>). (4- {4- [3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl] - fenylkarbamoyl} -butyl)-karbamidsyre-9H-fluoren-9-ylmetylester (8). 0,8 g (2,0 mmol) av produkt 6 og 1,35 g (4,0 mmol) 5-(Fmoc-amino)-valeriansyre 7 (Fluka) blir løst i 15 ml DMF (dimetylformamid). Trinnvis blir det følgende tilsatt: 4,8 g av TOTU (Fluka), 1,6 g av Oxime (hydroksyimino-cyanoucetisyre-etylester; Fluka) og 5,5 ml NEM (4-etyl-morfolin). Etter 1 time ved romtemperatur ble reaksjonen fortynnet med 100 ml etylacetat og vasket i 3 timer med vann. Den organiske fasen blir tørket ved magnesiumsulfat, filtrert og fordampet. Residiene blir renset ved hjelp av "flash"-kromatografi (etylacetat/n-heptan 2:1). 0,58 g (41%) av produkt 8 blir skaffet til veie i form av en amorf fast forbindelse: C45H45N306(723,8) MS (ESf) 724,4 (M + H<+>). 5-amino-pentansyre- {4- [3 -(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-l-yl]-fenyl}-amid (9). 570 mg (0,78 mmol) av produkt 8 og 0,8 ml av dietylamin ble løst i 5 ml DMF (diemtylformamid). Den blir fordampet etter 1 time ved romtemperatur. Det gjenværende rensede "flash"-kromatografi (metylenkloridVmetanol/kons. ammoniakk 30:10:3) 220 mg (56%) av produkt 9 blir skaffet til veie i form av en amorf fast forbindelse: C3oH35N304(501,63) MS (ESI<4>) 502,3 (M + H<+>). [2-(4-azidofenyl)-1 -(4 {4- [3 -(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-mtoksyfenyl)-4-okso-azetidin-l-yl]-fenylkarbamoyl}-butylkarbamoyl)-etyl]-karbamonsyre-9H-fluoren-9-ylmetylester (11). 200 mg (0,40 mmol) av produkt 9 og 340 mg (0,79 mmol) av Fmoc-p-azido-Phe-OH 10 (Bachem) blir løst i 4 ml DMF (dimetylformamid) og reagerte ifølge produksjonen av produkt 8. 300 mg (82%) av produkt 11 blir skaffet til veie i form av en amorf fast forbindelse: C54H53N7O7(912,7) MS (ESI4) 912,5 (M + H<4>). 5-[2-amino-3 -(4-azidofenyl)-propionylaino] -pentansyre {4-[3 -(3 -hydroksy-3 - fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl] -fenyl} -amid (12) 300 mg (0,33 mmol) av produktet 11 og 0,8 ml av dietylamin ble løst i 4 ml DMF (dimetylformamid) og reagerte ifølge produksjonen av forbindele 9. 42 mg (19%) av forbindelse 12 blir skaffet til veie i formen av en amorf fast forbindelse: C39H43N7O5(689,82) MS (ESI<4>) 690,3 (M + H<4>). 5-(2-okso-heksahydrotieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentansyre-[2-(4-azidofenyl)-l-(4-{4-[3 -(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl] - fenylkarbamoyl} -butylkarbamoyl)-etyl] -amid (14). 40 mg (0,058 mmol) av forbindelse 12 og 60 mg av D-biotinyl-N-hydroksysuccinimid 13 (Bachem) blir løst i 0,5 ml DMF (dimetylformamid). Den ble fordampet etter 1 time ved romtemperatur. Det gjenværende blir renset ved "flash"-kromatografi (metylenklorid/metanol/kons. ammoniakk 30:5:1). 29 mg (55%) av forbindelse 14 blir skaffet til veie i form av en amorf fast forbindelse: C49H57N9O7S (912,12) MS (ESI<4>916,6 (M + H<4>).
Fotoaffmitetsmerking og bindingsstudier:
Vesikler fra "brush border"-vev i tunntarmen hos kaniner ble isolert ved hjelp av fremgangsmåter som er kjent for fagfolk (Kramer et al. J. Biol. Chem. 268, 18035-18046 (1993)). Fotoaffinitetsmerkingen ved å anvende en radioaktiv merket forbindelse i formelen 1 a), eller formel 1 b), eller, formel 1 c), eller formel 1 d), eller formel 1 e), i oppfinnelsen ble utført i en fotokjemisk reaktor av Rayonet RPR-lOO-typen (tilgjengelig fra "The Suthern Ultraviolet Company, Hamden, CT"). "brush border"-membranvesiklene derfra (100 til 200 ug protein) ble inkubert med en av forbindelsene i et volum på 200 ul i 10 mM Tris/Hepesbuffer (pH7,4), 100 mM NaCl, 100 mM mannitol ved 20°C i mørke i 5 minutter. I stedet for "brush border"-vesiklene er det også mulig å anvende organeller, spesielt membranene fra dem. Utsagnene heretter anvendes tilsvarende til dette. Inkubasjonen i mørke ble etterfulgt av stråling med UV-lys på 254 nm i 20 sekunder eller 60 sekunder. "Brush border"-vesiklene ble deretter vasket to ganger med det nevnte buffer. Proteinene ble presipiter ved konvensjonelle teknikker slik som for eksempel tilsetting av etanol, tilsetting av et salt eller detergen, varming, repetert frysing og tining, eller annen passende fremgangsmåte kjent for fagfolk, og fraksjonert ve SDS-polyakrylamid gelelektroforese. De radioaktivt merkede proteinene var detekterbare ved hjelp av LSC eller fluorgrafi. Affiniteten til de merkede proteinene var "brush border"-vevet for forbindelsene var i området fra 1 til 100 nM.
Dyr og membranpreparasjoner:
Hannlig New Zealand hvite kaniner som veide 4-5 kg(Harlem Winkelmann, Borchem, Tyskland) ble holdt på "Altronin" standard diett C 2023 ("Altronin" Lage, Tyskland) etter behag. "Brush border"-membranvesikler fra magen, duodenum, jejunum, ileum, cecum, colon, rektum og nyre ble laget ved Mg^-presipiteringsfremgangsmåten. Rottelever mikrosomer og rotteadipocyttmembraner ble laget ifølge standard teknikker.
Hemming av kolesterolabsorpsjon:
Intestinal kolesterolabsorpsjon ble bestemt ved hjelp av en modifikasjon av Zilversmit/Hughes-fremgangsmåten. Hannlige NMRI-mus (Charles River Deutschland GmbH, Salzfeld, Tyskland) holdt på regulær mat ("Altronin", Lage, Tyskland) ble sultet i 12 timer. 0,5 ml av en løsning på 0,5% metylcellulose/5% Solutol (BASF, Ludwigshafen, Tyskland) som verktøy med eller u teten 3 mg av den respektive kolesterolabsorpsjonshemmeren ble brukt ved "gavage" til hvert dyr etterfulgt av 0,25 ml av "Intralipid" (Pharmacia & Upjohn, Erlangen, Tyskland) løsning som inneholdt 0,24 uCi [<14>C]kolesterol og 0,25 uCi[<3>H]sitosterol. Dyrene (fem mus per gruppe) ble holdt i metabolismebur og avføring ble samlet. Etter 24 timer ble dyrene drept og radioaktiviteten i avføringen og leveren ble bestemt ved forbrenningsanalyse.
Løsing av det 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonhemmere: Kanintynntarm "brush border"-membranvesikler ble vasket flere ganger i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/300 mM mannitol etter fotoaffinitetsmerking. Den resulterende pelleten ble løst ved en proteinkonsentrasjon på 1 mg/ml i 60 minutter ved 4°C i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/75 mM KC1/5 mM MgCl2/l nM EGTA/1 mM DTT/1% (w/v) n-oktylglukosid/1% Triton X-100/1% (w/v) ("løsningsbuffer"). Alternativt så kunne membranproteinene løses ved en proteinkonsentrasjon på 10 mg/ml med 1% SDS i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4) ved 4°C i 10 minutter etterfult av en 1:10 fortynning med 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/l% n-oktylglukosid. Etter sentrifugering ble supernatantene som inneholdt løste membranproteinet blandet og fortynnet med de passende bufferne for kromatografi, og inneholdt 1% n-oktylglukosid som detergent.
Rensing av det radioaktivt merkede 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonshemmere etter fotoaffinitetsmerking med fotoreaktiv 2-azetidinon C-l:
Fotoaffinitetsmerking
8 prøver med kanin ileale "brush border"-membranvesikler (250 ug protein) ble inkubert med 66 nM (0,3 uCi) av [<3>H]C-1 i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/100 mM NaCl/100 mM mannitol i 30 minutter ved 20°C i mørke. Etter stråling i 30 sekunder ved 254 nm i en Rayonet RPR 100 fotokjemisk reaktor utstyrt med 4 RPR 2537 A lamper (The Southern Ultraviolet Company, Hamden, CT, USA) så ble prøvene samlet og etter sentrifugering så ble membranvesiklene resuspendert i 2 ml 10 mM Trs/Hepes-buffer (pH 7,4)/300 mM mannitol og sentrifugert etter 20 minutter ved 20°C. Denne prosedyren ble repetert tre ganger. Den resulterende pelleten ble løst med 2 ml "løsningsbuffer". Etter sentrifugering ble en 40 ul alikvot med supernatant fjernet og analiysert på SDS PAGE og deretter skåret ut fra gelen for å analysere inkorporering av radioaktivitet inn i membranproteinene.
Hvetekim lektin affinitetskromatografi
Supernatanten som inneholdt løselig membranproteiner ble tilsatt til 0,5 ml hvetekim lektin agarosegel. Etter 30 minutter ved 20°C ble kulene samlet ved sentrifugering og
vasket 3 ganger med 2 ml av 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/100 nM NaCl/100 mM mannitol/1 % (v/v) n-oktylglukosid. Absorberte proteiner ble eluert med 4 deler 2 ml av 10 nM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/100 mM NaCl/100 mM mannitol/300 mM N-acetyl-D-glukoseamin; i alle eluatene ble aktivitetene av aminopeptidase N og sukrase målt og ra 100 ul alikvoter av hver fraksjon ble protein presipitert og analyser ved hjelp av SDS-PAGE.
Hydroksylapatitt kromatografi
N-acetylglukoseamineluatene fra hvetekim lektin kromatografien ble fortynnet 10 ganger med mM natriumfosfatbuffer (pH 7,4)/l% (v/v) n-oktylglukosid og applisert på en hydroksylapatittkolonne (10 cm høy, 1 cm diameter) ekvilibrert med 10 mM natriumfosfatbuffer (pH 7,4)/l% (v/v) n-oktylglukosid ved en hastighet konstant på 0,25 ml/min og samling av 1 ml fraksjoner. Deretter ble proteinene eluert som følger: 10 ml 10 mM natriumfosfatbuffr (pH 7,4)/l% (v/v) n-oksylglukosid etterfult av de følgende fosfatgradientene: 15 ml med 10 til 250 mM, 15 ml med 250 til 700 mM og 10 ml med 700 til 1000 mM fosfat. I hver fraksjon ble aktiviteten av aminopeptidase N og sukrase og radioaktivitet bestemt. For hver fraksjon ble 100 ul fjernet og protein ble presipitert etterfult av SDS-PAGE med konsekvent bestemmelse av distribusjonen av radioaktivt merkede proteiner ved å skjære gelene i 2 mm deler.
Preparativ SDS gelelektroforese
Fraksjonene som inneholdt det radioaktivt merkede 145 kDa-proteinet ble samlet og proteinet ble presipitert med kloroform/metanol. Etter oppløsning i SDS-prøvebuffer (62,5 mM Tris/HCl (pH 6,8) 2% SDS/5%/2-merkaptoetanol/10% glyserol/0,001% bromfenolblått ble prøven sentrifugert og den klare supernatanten ble applisert på separasjonsgelen till en preparativ 7,5% SDS-gel (diameter 28 mm; lengde av separasjonsgel: 5 cm). Elektroforese ble utført ved 500 V (40 mM, 6W) og eluatet ble fraksjonert til 1,5 ml fraksjoner. 150 ul-alikvoter av hver fraksjon ble anvendt for analyser av protdrisammensetning ved hjelp av SDS-PAGE.
Rensing av det 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonshemmere ved hjelp av streptavidinbiotin affinitetskromatografi: 10 prøver av kaninileale "brush border"-membranvesikler (200 ug protein) ble inkubert med 200 uM biotinmerket kolesterolhemmer C-4 i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/100 mM NaCl/100 mM mannitol i 30 minutter i mørke ved 20°C etterfulgt av stråling ved 254 nm i 30 sekunder i en Rayonet RPR-100 fotokjemisk reaktor utstyrt med 4 RPR 2537 Å-lamper. Etter samling ble vesiklene vasket 3 ganger med 2 ml Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/300 mM mannitol. Sluttpelleten ble suspendert i 2 ml "løsningsbuffer" i 1 time ved 4°C. Etter sentrifugering ble den klare supernatanten blandet med 0,5 ml streptavidin-agarosekuler og holdt under røring i 4°C i 2 timer. Etter sentrifugering ble kulene inkubert med 2 ml 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/300 mM mannitol/1 % n-oktylglukosid/4 mM PMSF/4 mM iodacetamid/4 mM EDTA/i 10 minutter ved 4°C etterfulgt av sentrifugering. Etter å ha repetert denne prosedyre to ganger, ble proteinene eluert fra strepatavidin-agarosekulene med 3 deler å 2 ml av den ovenfor nevnte bufferen som inneholdt 5 mM biotin. Fra alle eluatene ble alikvoter fjernet for bestemmelsen av den enzymatiske aktiviteten av aminopeptidase N og sukrase og for analyse ved SDS-PAGE. For endelig rensing ble biotineluatene som inneholdt det kovalent modifiserte 145 kDa bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonshemmere oppnådd ved preparativ SDS-elektroforese som beskrevet over.
Enzymatisk fragmentering:
Det 145 kDa-proteinet isolert ved begge prosedyrene ble presipitert med klorofor/metanol og gjenløst i 3 ul Tris/HCl-buffer (pH 6,8)/6,2% SDS/0,5% 2-merkaptoetanol/0,0005% bromfenolblått. Enzymatisk fragmentering ble utført ved å tilsette 5 uk av en frisk laget løsning av chymotrypsin (35 ng/ml) i den ovenfor nevnte bufferen og inkubasjon ved 30°C i 1 time. Reaksjonen ble stoppet ved å tilsette en SDS-prøvebuffer son inneholdt 4 mM EDTA/4 mM PMSF/4 mM iodacetamid og oppvarming i 5 minutter til 95°C etterfult av SDS-PAGE på Tris/Tricine-geler.
SDS Gelelektroforese
SDS-PAGE ble utført i vertikale plategeler(20 x 17 x 0,15 cm) ved å anvende et elektroforesesystem LE 2/4 (Amersham Pharmacia Biotech, Freiburg, Tyskland) med gelkonsentrasjoner på 7-10,5 % med et forhold på 97,2% akrylamid og 2,8% N,N-metylenbisakrylamid eller for analytiske formål i på forhånd støpte NOVEX-geler (4-12%, 12% eller 15%, Invitrogen (Groningen, Nederland) ved å anvende en elektroforese system Xcelle II fra Novex. Elektroforetisk separasjon av peptidfragmenter ble utført i Tris/Tricin-geler (16,5%) ifølge Schåggre & Jagow. Etter elektroforese ble gelene fiksert til 12,5% trikloreddiksyre etterfulgt av farging med Serva Blue R 250. For bestemmelse av distribusjonen av radioaktivitet, ble individuelle gelfelter kuttet til 2 mm deler, protein ble hydrolysert med 250 ul av vevesløser Biolute S og flytende scintillasjonstelling ved å anvende 4 ml scintillator Quickszint 501.
Oppløselighet av Idet 145 kDa-bindende proteinet for kolesterol absorpsjonshemmere: En nødvendighet for rensing av det 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonshemmere er en tilfredsstillende løsning av dette integralmembranproteinet i en ikke-denaturert tilstand. Løsningseksperimenter med en rekke detergenter viste at med SDS så kunne rundt 80-90% og med Zwittergent 9-13 så kunne ca. 60% av det fotomerkede proteinet løses mens med CHAPS, NP-40, diitonin og Triton-X-114 så kunne ingen signifikant løsning oppnås. 1%-løsning av ikkeioniske detergenter som Triton-X-100, n-oktylglukosid, decylmaltosid, dodecylmaltosid eller kloresterolhemisuksinat/dodecylmaltosid i 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,)/300 mM mannitol førte bare til delvis løsning av det 145 kDa-proteinet og dets rensning ble dermed hemmet. To protokoller ble til slutt funnet å gi 60-80% løsning av det 145 kDa-proteinet som muliggjorde en rensingsprosedyre: a) løsning med 1% SDS med etterfølgende fortynning med 1% n-oktylglukosid til en startkonsentrasjon på 0,1% SDS/1% n-oktylglukosid. b) løsning med 10 mM Tris/Hepes-buffer (pH 7,4)/75 mM KC1/5 mM MgCl2/l mM EGTA/1 mM DTT / 1% Triton X-100/1% n-oktylglukosid ("løsningsbuffer"). Læøsningsprosedyren tillot en vellykket fraksjonering av "brush border"-membranproteiner ved kromatografisk prosedyre.
Design av biotinmerket 2-azetidinon-fotoaffinitetsprobe:
For en en-trinns rensing av målproteinet for kolesterolabsorpsjonshemmerne så har vi koplet den biotininneholdende fotolabile gruppen N-(biotinyl)-4-azidofenylalanin vi et avstandsstykke til paraposisjonen av N-fenyl eller benzylaminoringen til 2-azetidinon kolestorabsorberende hemmere. Strukturaktivitetsslektskap har vist at denne posisjonen tillater betydelig kjemisk modifikasjon som opprettholder in vivo potensialet for å hemme intestinal kolesterolabsorpsjon. Etter bruk av den biotinmerkede fotoaffinitetsmerke C-4 på NMRI-mus så ble intestinal kolesterolabsorpsjon doseavhengig hemmet, noe som indikerer en biologisk effektivitet av den biotinmerkede fotolabile kolesterolabsorberende hemmer, en nødvendighet for å identifisere proteinet eller proteinene som er involvert i intestinal kolesterolabsorpsjon av denne probe. Fotoaffinitetsmerking av kanin tynntarm BBMV med azidobenzoylderivatet [<3>H]C-1 i nærværet av økende konsentrasjoner av den biotinmerkede kolesterolhemmeren C-4 resulterte i en konsentrasjonsavhengig nedgang i graden av merking av det 145 kDa-proteinet noe som indikerer en spesifikk interaksjon mellom C-4 og det 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonens hemmere i "brush border"-membranen til tynntarmenterocytter.
Rensing av det 145 kDa-bindende proteinet fotomerket med den tritium-merkede 2-azetidinon kolesterolabsorpsjonhemmer C-l: Det fotoerkede 145 kDa-bindende proteinet er lokalisert i et molekylvektsområde hvor veldig tilstedeværende membranproteiner i "brush border"-membranene som sukrase/siomaltasekomplekset eller aminopeptidates N vandrer på SDS-geler og gjør derfor en fullstendig separasjon fra disse proteinene obligatorisk for sekvensbestemmelse. Den biokjemiske undersøkelsen identifiserte det 145 kDa-proteinet som et glykosylert integrert membranprotein med et skift på molekylær masse fr 145 kDa tail 110 ka ved deglykosylering med N-glykanase. We undersøkte derfor forskjellige lektiner som potensielle ligander for affinitetskromatografi. Med hvetekim lektinagarose ble en fullstendig retardasjon av det fotomerkede 145 kDa-proteinet oppnådd mens 70 til 80% av den enzymatiske aktiviteten til sukrase og aminopeptidase N ble eluert. Med N-acetylglukosamin kunne hele mengden av det radiomerkede 145 kDa-proteinet elueres sammen med 30-50% av aminopeptidase N og sukraseaktivitet. Totalt så ble en 4-5 ganger anrikning av det 145 kDa-bindende proteinet for kolesterolabsorpsjonshemmere oppnådd. For en videre rensing ble en rekke forskjellige prosedyrer evaluert. Ioneutbyttekromatografi på Mono Q eller Mono S kolonner førte til fullstendig separasjon fra sukrase/isomaltase men bare delvis fra aminopeptidase N mens ingen klar separasjon kunne oppnås med metallgelaterende kromatografi. Med hydroksylapatitt kromatografi kunne en sterk anrikning av det 145 kDa-proteinet og separasjon fra sukrase og aminopeptidase N oppnås. En optimalisert fosfatgradientprofil førte til en nesten fullstendig separasjon av det 145 kDa-proteinet fra andre membranproteiner; Det 145 kDa-proteinet ble eluert ved høye fosfatkonsentrasjoner og var fri for signifikante enzymatiske aktiviteter fra sukrase eller aminopeptidase N. Sluttrensning ble oppnådd ved preparativ SDS-PAGE av eluatene fra hydroksylapatittkromatografi. Den estimerte mengden av rent 145 kDa-proteinet var 1 - 3% av materialet som ble applisert på hydroksylapaitttkolonnen noe som indikerer at en anrikningsfaktor > 150 < 500-ganger med hensyn til "brush border"-membrane og 2500-10000 ganger med hensyn til enterocytt totalprotein ble oppnådd.
Rensing av det 145 kDa-bindende proteient for kolesterolabsorpsjonshemmere ved streptavidinbiotin affinitetskromatograf etter fotoaffinitetsmerking med en biotinmerket fotolabil kolesterolabsorpsjonshemmer.
Kanin tynntarm BBMV ble inkubert med 200 uM av C-4 og krysskobling ble oppnådd ved ultrafiolett stråling ved 254 nm. Etter løsning ble de kovalente modifiserte proteinene som inneholdt de biotinmerkede 2-azetidinon kolesterolabsorpsjonshemmerne ekstrahert med streptavidinkuler. Etter kraftig vasking ble bunnede proteiner eluert med 10 mM løsning av biotin og analysert ved SDS-PAGE. Hovedsakelig så ble et protein med Mr 145 kDa holdt tilbake av streptavidinkulene mens ingen proteiner ble detektert ved ultrafiolett stråling ble utelatt noe som indikerer at 145 kDa-protein er det primære bindingsproteient for den biotinmerkede fotolabile kolesterolabsorpsjonshemmeren C-4. Biotinekstraktene fra streptavidinkulene inneholdt ikke detekterbare enzymatiske aktiviteter av sukrase/isomaltase eller aminopeptidase N noe som indikerer at det eluerte 145 kDa-proteinet antakelig representerer en enkel proteindel modifisert ved kovalent binding av den biotinmerkede kolesterolabsorpsjonshemmeren. Nærvær av 200 uM av andre kolesterolabsorpsjonshemmere som ezetimib under fotomerkingen med C-4 reduserte mengden av 145 kDa-protein som var mulig å ekstrahere med streptavidinkuler og som indikerer en direkte konkurranse mellom kolesteroabsorpsjonshemmere med C-4 for identiske bindingsseter; i motsetning til dette så influerte ikke substrater for andre intestinale næringstransportører for gallesyrer, fettsyrer, glukose, oligopeptider eller aminosyrer mengden ekstraherbart 145 kDa-protein. Når disse merkingseksperimentene ble utført med cellemembraner fra forskjellige organer så viste det at bare ved merking av BBMV fra kanin tynntarm - duodenum, jejunom og ileum -, så kunne et 145 kDa-protein ekstraheres med etter merking av BBMV fra mage, cecum, colon, rectum, nyre, lever eller adipocytter som ble ingen 145 kDa-protein holdt igjen av streptavidinkuler. Derfor kunne det 145 kDa-bindende proteinet bare renses fra de anatomiske stedene hvor intestinal kolesterolabsorpsjon finner sted. Duodenum, jejunum og ileum. Det 145 kDa-proteinet som er renset med hvetekil lektin- og hydroksylapatitt kromatografi og ved streptavidin-biotinaffinitetskromatografi kan ikke skilles på SDS-geler. Etter enzymatisk fragmentering med chymotrypsin fikk man et nesten identisk peptidmønster med en rekke peptider i det molekylære masseområde på 4-35 kDa noe som indiker at de 145-proteinene som var renset med begge tilnærmingsmåtene er identiske og inneholder hovedsakelig om ikke bare utelukkende en proteindel.
Fig. 1: Del 1 av reaksjonsskjema for syntese av 5-(2-okso-heksahydro-tieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentansyre[2-(4-azido-fenyl)-1 -(4 {4-3 -(3 -hydroksy-3 -fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-l-yl]-fe^ (14).
Fig. 1: Del 2 av reaksjonsskjemaet for syntese av 5-(2-okso-heksahydro-tieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentansyre[2-(4-azido-fenyl)-l-(4{4-3-(3-hydroksy-3-fenylpropyl)-2-(4-metoksyfenyl)-4-okso-azetidin-1 -yl] -fenylkarbamoyl} -butylkarbamoyl)-etyl] amid (14).

Claims (13)

1. Kompleks dannet av et protein med evnen til å binde spesifikt til kolesterolabsorbsjonsinhibitorer som har blitt isolert med en fremgangsmåte karakterisert ved at a) biologisk materiale tilveiebringes, b) det biologiske materiale i a) blir inkubert med en fotoreaktiv 2-azetidinonforbindelse som er radioaktivt merket og som er i stand til spesifikt å binde til nevnte protein, c) det biologiske materialet oppløses og celledebriset fjernes, d) supernatanten tilsettes på en innretning som rommer hvetekimlektinagarose, e) eluatet fra hvetekimlektinagarosen i d) anvendes på en hydroksylapatittkolonne, f) de radioaktivt merkede fraksjonene fra e) blir satt på en preparativ SDS-PAGE, g) de radioaktivt merkede fraksjonene blir oppsamlet og muligens presipitert, eller som har blitt isolert ved en fremgangsmåte der a) biologisk materiale blir tilveiebrakt, b) det biologiske materialet fra a) blir inkubert med en fotoreaktiv hemmer av kolesterolopptak som er radioaktivt merket eller som er biotinmerket, c) det biologiske materialet i b) blir løst og celledebriset blir fjernet, d) supernatanten blir underkastet kromatorafiske prosedyrer eller blir satt på streptavidin-agarose, e) eluatet blir satt på en SDS-PAGE, f) proteinene som vandrer i et område fra 140 til 150 kDa blir skåret ut, eluert og muligens refoldet, og en forbindelse med Formel I:
2. Kompleks, karakterisert ved at det er dannet av proteinet ifølge krav 1 og en forbindelse som har strukturen
3. Komplekset i følge krav 1 eller 2, karakterisert ved at det biologiske materialet er tarmvev eller celler fra tarmcellekultur eller mellomtarm børstekant ("ileal brush border") celler fra enten et menneske, eller en rotte, en mus eller en kanin.
4. Komplekset i følge et hvilket som helst av kravene 1 eller 3, karakterisert ved at den fotoreaktive 2-azetidinonforbindelsen har den følgende strukturen fra formel I:
der R skal velges fra en av de følgende gruppene a) til e):
5. Komplekset ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 4, karakterisert ved at den fotoreaktive hemmeren av kolesterolopptak som er biotinmerket har den følgende strukturen:
6. Komplekset ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 5, karakterisert ved at proteinene har en størrelse på 140 til 150 kDa.
7. Komplekset ifølge krav 6, karakterisert ved at proteinet har en størrelse på 145 kDa.
8. Komplekset ifølge et hvilket som helst kravene 1 til 7 , karakterisert ved at proteinet er glykosylert.
9. Komplekset ifølge et hvilket som helst kravene 1 til 8, karakterisert ved at proteinet er i kompleks med en forbindelse som har strukturen til Formel I
der R skal velges fra en av de følgende gruppene d) til e):
10. Komplekset i følge krav 2 eller 9, karakterisert ved at Fremgangsmåten er en fremgangsmåte for å isolere et glykosylert protein med en størrelse på 145kDa +/- 7,55kDa som bestemt ved SDS polyakrylamid gelelektroforese der a) børstekant vev fra tynntarmen tilveiebringes, b) børstekantvevet i a) inkuberes med en fotoreaktiv 2-azetidinonforbindelse som er radioaktivt merket, c) det biologiske materialet løses og celledebriet fjernet, d) supernatanten settes på en innretning som rommer hvetekim lektinagarose, e) eluatet fra hvetekimlektinagarosen i d) settes på en hydroxylapatitt kolonne, f) de radioaktive merkede fraksjonene fra e) blir satt på en preparativ SDS-PAGE, g) de radioaktive merkede fraksjonene blir samlet opp og muligens presipitert, der den fotoreaktiv 2-azetidinon forbindelsen har følgende struktur til Formel I der R skal velges fra en av de følgende gruppene a) til e):
11. Komplekset i følge 2 eller 9, karakterisert ved at fremgangsmåten er en fremgangsmåte for å isolere et glykosylert protein med en størrelse på 145 kDa +/- 7.55 kDa som bestemt ved SDS polyakrylgelektroforese der a) børstekant vev fra tynntarmen blir tilveiebrakt, b) børstekantvevet i a) blir inkubert med en fotoreaktiv 2-azetidinon forbindelse som er biotinmerket, c) det biologiske materialet fra b) blir løst og celledebriset fjernet, d) supernatanten blir satt på en streptavidin-agarose, e) eluatet blir satt på en SDS-PAGE, f) proteinene som vandrer i et område fra 145 kDa +/- blir skåret ut, eluert og muligens refoldet, der det fotoreaktive 2-azetidinon forbindelsen som er biotin-merket har følgende struktur.
12. Farmasøytisk sammensetning, karakterisert ved at den omfatter komplekset ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 11 og farmasøytisk akseptable forbindelser for formulering av et medikament.
13 Anvendelse av et kompleks ifølge et hvilket som helst av kravene 1 til 11 for å produsere en farmasøytisk sammensetning ifølge krav 12 for behandling av en sykdom som er koblet til forhøyede kolesterolnivåer.
NO20130115A 2002-08-06 2013-01-18 Farmasøytisk sammensetning omfattende et intestinalt kolesterolbindende protein. NO20130115L (no)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP02017504 2002-08-06
PCT/EP2003/008290 WO2004014947A1 (en) 2002-08-06 2003-07-28 Method for isolating an intestinal cholesterol binding protein

Publications (1)

Publication Number Publication Date
NO20130115L true NO20130115L (no) 2005-05-02

Family

ID=31502689

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NO20051169A NO333437B1 (no) 2002-08-06 2005-03-04 Fremgangsmate for a isolere et intestinalt kolesterolbindende protein, sammensetning samt anvendelse av sammensetningen
NO20130115A NO20130115L (no) 2002-08-06 2013-01-18 Farmasøytisk sammensetning omfattende et intestinalt kolesterolbindende protein.

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NO20051169A NO333437B1 (no) 2002-08-06 2005-03-04 Fremgangsmate for a isolere et intestinalt kolesterolbindende protein, sammensetning samt anvendelse av sammensetningen

Country Status (17)

Country Link
US (2) US7435727B2 (no)
EP (1) EP1529061B1 (no)
JP (1) JP4575772B2 (no)
KR (1) KR101095288B1 (no)
CN (1) CN1330667C (no)
AT (1) ATE386053T1 (no)
AU (1) AU2003253341C1 (no)
BR (1) BR0313217A (no)
CA (1) CA2493487C (no)
DE (1) DE60319093T2 (no)
HK (1) HK1082509A1 (no)
IL (2) IL166492A (no)
MX (1) MXPA05001264A (no)
NO (2) NO333437B1 (no)
RU (1) RU2345089C2 (no)
WO (1) WO2004014947A1 (no)
ZA (1) ZA200500053B (no)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB0215579D0 (en) 2002-07-05 2002-08-14 Astrazeneca Ab Chemical compounds
US7135556B2 (en) 2002-07-19 2006-11-14 Schering Corporation NPC1L1 (NPC3) and methods of use thereof
DE602004029715D1 (de) 2003-12-23 2010-12-02 Astrazeneca Ab Diphenylazetidinonderivate mit die cholesterinabsorption hemmender wirkung
JP4590417B2 (ja) 2004-01-16 2010-12-01 メルク・シャープ・エンド・ドーム・コーポレイション Npc1l1(npc3)およびこのリガンドの同定方法
JP2008546784A (ja) 2005-06-20 2008-12-25 シェーリング コーポレイション ヒスタミンh3アンタゴニストとして有用なピペリジン誘導体
SA06270191B1 (ar) 2005-06-22 2010-03-29 استرازينيكا ايه بي مشتقات من 2- أزيتيدينون جديدة باعتبارها مثبطات لامتصاص الكوليسترول لعلاج حالات فرط نسبة الدهون في الدم
WO2007100807A2 (en) 2006-02-24 2007-09-07 Schering Corporation Npc1l1 orthologues
AR060623A1 (es) 2006-04-27 2008-07-02 Astrazeneca Ab Compuestos derivados de 2-azetidinona y un metodo de preparacion
CN1869704B (zh) * 2006-06-14 2010-06-30 厦门大学 快速鉴定与病原菌互作的宿主蛋白的方法

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4710469A (en) * 1986-05-02 1987-12-01 Merck & Co., Inc. Novel phosphotyrosyl protein phosphatase
ATE140483T1 (de) * 1988-11-10 1996-08-15 Genetics Inst Natürlicher killerzellen-stimulationsfaktor
ATE209251T1 (de) 1990-05-16 2001-12-15 Genetics Inst Knochen- und knorpel-bildung hervorrufende proteine
US5264372A (en) * 1991-03-15 1993-11-23 Amylin Pharmaceuticals, Inc. Receptor-based screening methods for amylin agonists and antagonists
US5518911A (en) * 1995-01-06 1996-05-21 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Human PAK65
JP3088681B2 (ja) * 1997-05-22 2000-09-18 宮城県 形質膜局在シアリダーゼ及びそれをコードするdna
US6383734B1 (en) * 1998-09-30 2002-05-07 Advanced Research And Technology Institute, Inc. Method to determine inhibition of PAK3 activation of Raf-1
JP2000166545A (ja) * 1998-12-07 2000-06-20 Snow Brand Milk Prod Co Ltd 胆汁酸活性化リパーゼ
AU3566200A (en) 1999-04-01 2000-10-23 Astrazeneca Uk Limited Human signal transduction serine/threonine protein kinase
WO2000063703A1 (en) * 1999-04-16 2000-10-26 Schering Corporation Use of azetidinone compounds
DE10042447A1 (de) * 2000-08-29 2002-03-28 Aventis Pharma Gmbh Protein aus dem Darm von Wirbeltieren, welches Cholesterin absorbiert, sowie Verwendung dieses Proteins zur Identifizierung von Inhibitoren des intestinalen Cholesterintransports

Also Published As

Publication number Publication date
JP2006512054A (ja) 2006-04-13
US7786103B2 (en) 2010-08-31
CA2493487A1 (en) 2004-02-19
CA2493487C (en) 2013-01-22
NO20051169L (no) 2005-05-02
IL199409A (en) 2010-12-30
RU2345089C2 (ru) 2009-01-27
KR101095288B1 (ko) 2011-12-16
BR0313217A (pt) 2005-06-14
ATE386053T1 (de) 2008-03-15
RU2005106238A (ru) 2005-08-27
WO2004014947A1 (en) 2004-02-19
EP1529061A1 (en) 2005-05-11
KR20060015443A (ko) 2006-02-17
NO333437B1 (no) 2013-06-03
US20040126812A1 (en) 2004-07-01
US20080167451A1 (en) 2008-07-10
CN1668642A (zh) 2005-09-14
IL166492A0 (en) 2006-01-15
AU2003253341C1 (en) 2009-09-24
US7435727B2 (en) 2008-10-14
CN1330667C (zh) 2007-08-08
AU2003253341B2 (en) 2009-04-23
EP1529061B1 (en) 2008-02-13
MXPA05001264A (es) 2005-04-28
DE60319093T2 (de) 2009-02-05
AU2003253341A1 (en) 2004-02-25
DE60319093D1 (de) 2008-03-27
JP4575772B2 (ja) 2010-11-04
HK1082509A1 (en) 2006-06-09
IL166492A (en) 2010-12-30
ZA200500053B (en) 2006-07-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
NO20130115L (no) Farmasøytisk sammensetning omfattende et intestinalt kolesterolbindende protein.
US6794359B2 (en) Vertebrate intestinal protein which absorbs cholesterol, its inhibitors and mehtod of identifying the same
DE69837678T2 (de) Compositions zur inhibierung der proliferation glatter muskulatur und verfahren zur diagnose von arteriosklerose
MacDermott et al. Glycoprotein synthesis and secretion by mucosal biopsies of rabbit colon and human rectum
DE69433901T2 (de) Verbindungen und pharmazeutische zusammensetzungen zur behandlung und prophylaxe bakterieller infektionen
DE102005029845B4 (de) Verfahren zur Diagnose von rheumatischen Erkrankungen
Hoogenboom et al. Absorption of a mutagenic metabolite released from protein-bound residues of furazolidone
Friedemann et al. Effect of methionine-35 oxidation on the aggregation of amyloid-β peptide
WELLS et al. The localization of hyaluronan in normal and rejected human kidneys
DE69736351T4 (de) Methoden und mittel zur hemmung der cdk4-aktivität
Oursler et al. Native, not nitrated, cytochrome c and mitochondria-derived hydrogen peroxide drive osteoclast apoptosis
Kisilevsky et al. Pathogenesis of amyloidosis
Murariu et al. Synthesis and mass spectrometric characterization of a metal-affinity decapeptide: Copper-induced conformational changes
DE10053506A1 (de) Mittel zur Prävention von Organschäden, die durch Aminoglykoside induziert werden
Pittel et al. Differential long-term effect of AF64A on [3H] ACh synthesis and release in rat hippocampal synaptosomes
Al Omireeni et al. EFFECT OF MAGNESIUM CHLORIDE AND SODIUM FLUORIDE ON VARIOUS HYDROXYPROLINE FRACTIONS IN RAT KIDNEYS
KR20000037812A (ko) 엔지오제닌 및 플라즈민의 저해제
JPH0740935B2 (ja) C末端アミド化に関与する酵素ならびにその製造方法および使用
WO2000020572A2 (de) Gewebebindende peptide, ihre identifizierung, herstellung und verwendung

Legal Events

Date Code Title Description
FC2A Withdrawal, rejection or dismissal of laid open patent application