KR20210070305A - Arc 기반 캡시드 및 이의 용도 - Google Patents

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KR20210070305A
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콜린 말론
이안 페이콘
잭 길버트
안드레이 피스아레브
아담 프라이테스
제시카 크리스프
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브이엔브이 뉴코 인크.
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Abstract

특정 실시양태에서, 재조합 Arc 및 내인성 Gag 폴리펩티드, 및 재조합 Arc 및 내인성 Gag 폴리펩티드를 사용하는 방법이 본원에 개시된다.

Description

ARC 기반 캡시드 및 이의 용도
상호 참조
본 출원은 2018년 9월 18일에 출원된 미국 가특허 출원 번호 62/733,015의 이익을 주장하며, 이는 그 전체가 본원에 참조로 포함된다.
개시내용의 요약
특정 실시양태에서, 재조합 및 조작된 Arc 폴리펩티드 및 재조합 및 조작된 내인성 Gag(endo-Gag) 폴리펩티드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 또한 로딩된 또는 비어있는 Arc 기반 캡시드 및 endo-Gag 기반 캡시드, 및 캡시드를 제조하는 방법이 포함된다. 또한, Arc 기반 캡시드 및 endo-Gag 기반 캡시드를 관심 부위에 전달하는 방법이 포함된다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드 및 치료제를 포함하는 캡시드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 치료제는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 핵산은 RNA이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 서열번호 1인 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 인간 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 포함하고, 여기서 재조합 Arc 폴리펩티드는 래트 Arc 폴리펩티드 또는 인간 Arc 폴리펩티드가 아닌, 캡시드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 카고(cargo)를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 카고는 RNA이다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 벡터가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 벡터는 치료제를 추가로 코딩한다. 일부 실시양태에서, 치료제는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 핵산은 RNA이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 서열번호 1인 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 인간 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하고, 여기서 재조합 Arc 폴리펩티드는 래트 Arc 폴리펩티드 또는 인간 Arc 폴리펩티드가 아닌, 벡터가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 벡터는 카고를 추가로 코딩한다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 카고는 RNA이다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드 및 치료제를 포함하는 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하는, 카고를 세포에 전달하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 치료제는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 핵산은 RNA이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 서열번호 1인 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 인간 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 세포는 진핵 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 척추동물 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 포유동물 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 인간 세포이다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 세포는 핵산에 의해 코딩되는 유전자를 발현한다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 포함하는 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 재조합 Arc 폴리펩티드는 래트 Arc 폴리펩티드 또는 인간 Arc 폴리펩티드가 아닌, 카고를 세포에 전달하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 카고를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 카고는 RNA이다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 세포는 진핵 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 척추동물 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 포유동물 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 인간 세포이다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 세포는 핵산에 의해 코딩되는 유전자를 발현한다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드 및 치료제를 포함하는 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하는, 핵산을 세포로 형질감염시키는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 치료제는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 핵산은 RNA이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 서열번호 1인 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 인간 내인성 Gag 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열 또는 m) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 포함하는 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하고, 여기서 재조합 Arc 폴리펩티드는 래트 Arc 폴리펩티드 또는 인간 Arc 폴리펩티드가 아닌, 핵산을 세포로 형질감염시키는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 카고를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산이다. 일부 실시양태에서, 카고는 RNA이다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다. 일부 실시양태에서, 재조합 Arc 폴리펩티드는 a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 Arc 폴리펩티드이다. 일부 실시양태에서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드는 a) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; b) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; c) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; d) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; e) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; f) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; g) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는 h) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, 카고 결합 도메인 및 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로부터의 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛을 포함하는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 핵산 결합 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 소분자에 결합하는 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 단백질, 펩티드, 또는 항체 또는 이의 결합 단편에 결합하는 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 펩티드모방체 또는 뉴클레오티드모방체에 결합하는 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛은 서열번호 1의 CA N-로브(lobe) 및/또는 CA C-로브에 상응하는 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 상이한 종의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로부터의 제2 캡시드 형성 서브유닛을 추가포 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 캡시드 형성 서브유닛은 서열번호 1의 N-로브 및/또는 C-로브에 상응하는 폴리펩티드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛 및 제2 캡시드 형성 서브유닛은 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균 또는 식물로부터 선택되는 Arc 또는 endo-Gag의 종으로부터 각각 독립적으로 선택된다. 일부 실시양태에서, 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛 및 제2 캡시드 형성 서브유닛은 2개의 상이한 종으로부터의 것이다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 C-말단에 융합된다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 N-말단에 융합된다. 일부 실시양태에서, 제2 캡시드 형성 서브유닛은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 C-말단에 융합된다. 일부 실시양태에서, 제2 캡시드 형성 서브유닛은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 N-말단에 융합된다. 일부 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 N-말단에 융합되고 제2 캡시드 형성 서브유닛은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 C-말단에 융합된다. 실시양태에서, 카고 결합 도메인은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 C-말단에 융합되고 제2 캡시드 형성 서브유닛은 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛의 N-말단에 융합된다. 일부 실시양태에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 제2 폴리펩티드를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 제2 폴리펩티드는 직접적으로 또는 링커를 통해 적어도 하나의 캡시드 형성 서브유닛에 융합된다. 일부 실시양태에서, 제2 폴리펩티드는 직접적으로 또는 링커를 통해 카고 결합 도메인에 융합된다. 일부 실시양태에서, 제2 폴리펩티드는 단백질 또는 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 실시양태에서, 단백질은 인간 단백질 또는 바이러스 단백질이다. 일부 실시양태에서, 단백질은 인간 Gag-유사 단백질이다. 일부 실시양태에서, 단백질은 관심 표적 수용체에 결합하도록 설계된 드 노보 조작된 단백질이다. 일부 실시양태에서, 제2 폴리펩티드는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드에 의해 형성된 캡시드의 관심 표적 부위로의 전달을 안내한다.
특정 실시양태에서, 캡시드 형성, 핵산 결합 또는 전달과 관련되지 않은 부분이 제거된 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 부분은 뉴클레오티드 결합 도메인이 인간 Arc RNA 결합 도메인이 아니라면 매트릭스(MA) 도메인, 역전사효소(RT) 도메인, 뉴클레오티드 결합 도메인, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, 부분은 CA C-로브 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, 부분은 N-말단 결실, C-말단 결실, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, N-말단 결실은 최대 10개 아미노산, 20개 아미노산, 30개 아미노산 또는 50개 아미노산의 결실을 포함한다. 일부 실시양태에서, C-말단 결실은 최대 10개 아미노산, 20개 아미노산, 30개 아미노산 또는 50개 아미노산의 결실을 포함한다.
특정 실시양태에서, 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드일 수 있는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 및 조작된 Arc 또는 endo-Gag에 의해 형성되는 캡시드에 의해 캡슐화되는 카고를 포함하는 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산 분자이다. 일부 실시양태에서, 핵산 분자는 DNA, RNA, 또는 DNA와 RNA의 혼합물이다. 일부 실시양태에서, DNA 및 RNA는 각각 독립적으로 단일 가닥, 이중 가닥, 또는 단일 및 이중 가닥의 혼합물이다. 일부 실시양태에서, 카고는 소분자이다. 일부 실시양태에서, 카고는 단백질이다. 일부 실시양태에서, 카고는 펩티드이다. 일부 실시양태에서, 카고는 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 실시양태에서, 카고는 펩티드모방체 또는 뉴클레오티드모방체이다. 일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 상이한 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 하나 이상의 종으로부터의 하나 이상의 추가의 캡시드 서브유닛을 포함한다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비-Arc 단백질로부터의 하나 이상의 추가의 캡시드 서브유닛을 포함한다. 일부 실시양태에서, 하나 이상의 추가의 캡시드 서브유닛은 코피아(Copia) 단백질, ASPRV1 단백질, SCAN 도메인 패밀리로부터의 단백질, 부신생물성 Ma 항원 패밀리에 의해 코딩되는 단백질(예컨대, PNMA5, PNMA6, PNMA6A 및 PNMA6B), 레트로트랜스포존 Gag-유사 패밀리로부터의 단백질(예컨대, RTL3, RTL6, RTL8A, RTL8B), 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시양태에서, 하나 이상의 추가의 캡시드 서브유닛은 BOP, LDOC1, MOAP1, PEG10, PNMA3, PNMA5, PNMA6A, PNMA6B, RTL3, RTL6, RTL8A, RTL8B, 및 ZNF18을 포함한다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 적어도 1 nm, 2 nm, 3 nm, 4 nm, 5 nm, 10nm, 15 nm, 20 nm, 25 nm, 30 nm, 50 nm, 80 nm, 100 nm, 120 nm, 150 nm, 200 nm, 250 nm, 300 nm, 500 nm, 600 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 약 1 nm 내지 약 600 nm, 약 1 nm 내지 약 500 nm, 약 1 nm 내지 약 200 nm, 약 1 nm 내지 약 100 nm, 약 1 nm 내지 약 50 nm, 또는 약 1 nm 내지 약 30 nm의 직경을 갖는다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 감소된 표적외(off-target) 효과를 갖는다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 표적외 효과를 갖지 않는다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 생체외에서 형성된다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 시험관내에서 형성된다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 또는 조작된 내인성 Gag 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 중합체가 본원에 개시된다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 또는 조작된 내인성 Gag 폴리펩티드를 코딩하는 핵산 중합체를 포함하는 벡터가 본원에 개시된다.
특정 실시양태에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 또는 복수의 재조합 또는 조작된 endo-Gag 폴리펩티드를 로딩된 캡시드를 생성하기에 충분한 시간 동안 용액에서 카고와 함께 인큐베이션하는 단계를 포함하는, 로딩된 Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 제조하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 방법은 카고와 함께 인큐베이션하기 전에 복수의 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 포함하는 용액을 복수의 비-Arc 또는 비-endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛과 혼합하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 복수의 비-Arc 또는 비-endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 또는 10:1의 비로 혼합된다. 일부 실시양태에서, 복수의 비-Arc 또는 비-endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 1:2, 1:3, 1:4, 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 또는 1:10의 비로 혼합된다. 일부 실시양태에서, 방법은 카고와 함께 인큐베이션하기 전에 복수의 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 포함하는 용액을 복수의 비-Arc 또는 endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛과 혼합하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, 복수의 비-Arc 또는 endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 또는 10:1의 비로 혼합된다. 일부 실시양태에서, 복수의 비-Arc 또는 비-endo-Gag 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 1:2, 1:3, 1:4, 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 또는 1:10의 비로 혼합된다. 일부 실시양태에서, 복수의 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 박테리아 세포 시스템, 곤충 세포 시스템, 또는 포유동물 세포 시스템으로부터 수득된다. 일부 실시양태에서, 복수의 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 무세포 시스템으로부터 수득된다. 일부 실시양태에서, 복수의 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 박테리아 세포 시스템, 곤충 세포 시스템, 또는 포유동물 세포 시스템으로부터 수득된다. 일부 실시양태에서, 복수의 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 무세포 시스템으로부터 수득된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 기반 또는 endo-Gag 캡시드는 전신 투여용으로 제제화된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 국소 투여용으로 제제화된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비경구 투여용으로 제제화된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 경구 투여용으로 제제화된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 국부 투여용으로 제제화된다. 일부 실시양태에서, 로딩된 Arc 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 설하 또는 에어로졸 투여용으로 제제화된다.
특정 실시양태에서, 관심 부위의 세포를 Arc 기반 또는 Arc 기반 캡시드의 세포 흡수를 촉진하기에 충분한 시간 동안 Arc 기반 또는 Arc 기반 캡시드와 접촉시키는 단계를 포함하는, 카고를 관심 부위에 전달하기 위한 조작된 또는 재조합 Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드의 용도가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 세포는 종양 세포이다. 일부 실시양태에서, 종양 세포는 고형 종양 세포이다. 일부 실시양태에서, 고형 종양 세포는 방광암, 유방암, 뇌암, 결장직장암, 신장암, 간암, 폐암, 췌장암, 전립선암, 피부암, 위암 또는 갑상선암으로부터의 세포이다. 일부 실시양태에서, 종양 세포는 혈액 악성종양으로부터의 것이다. 일부 실시양태에서, 혈액 악성종양은 B 세포 악성종양, 또는 T 세포 악성종양이다. 일부 실시양태에서, 혈액 악성종양은 만성 림프구성 백혈병(CLL), 소 림프구성 림프종(SLL), 미만성 거대 B 세포 림프종(DLBCL), 소포 림프종, 맨틀 세포 림프종, 버킷 림프종, 피부 T 세포 림프종, 또는 말초 T 세포 림프종이다. 일부 실시양태에서, 세포는 체세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 줄기 세포 또는 전구 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 중간엽 줄기 또는 전구 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 조혈 줄기 또는 전구 세포이다. 일부 실시양태에서, 세포는 근육 세포, 피부 세포, 혈액 세포, 또는 면역 세포이다. 일부 실시양태에서, 표적 단백질은 과발현되거나 세포에서 고갈된다. 일부 실시양태에서, 세포의 표적 유전자는 하나 이상의 돌연변이를 갖는다. 일부 실시양태에서, 세포는 손상된 스플라이싱 메커니즘을 포함한다. 일부 실시양태에서, 용도는 생체내 용도이다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 캡시드는 대상체에게 전신 투여된다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 대상체에게 국소 투여를 통해 투여된다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 대상체에게 비경구 투여된다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 캡시드는 대상체에게 경구적으로 투여된다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 대상체에게 국부로 투여된다. 일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 대상체에게 설하 또는 에어로졸 투여를 통해 투여된다. 일부 실시양태에서, 용도는 시험관내 또는 생체외 용도이다.
특정 실시양태에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드, 말단절단된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드, 재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 코딩하는 벡터, 또는 Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 포함하는 키트가 본원에 개시된다.
본 개시내용의 다양한 측면은 첨부된 청구범위에서 구체적으로 설명된다. 본 개시내용의 특징 및 이점에 대한 더 나은 이해는 본 개시내용의 원리가 활용되는 예시적인 실시양태를 설명하는 하기의 상세한 설명 및 하기 첨부 도면을 참조함으로써 얻어질 것이다.
도 1은 예시적인 Arc 폴리펩티드의 표현이다.
도 2는 예시적인 조작된 Arc 폴리펩티드의 표현이다.
도 3은 (A) 특정 카고(예컨대, RNA 페이로드)을 운반하거나 (B) 기능외(off-function) 효과를 제거하기 위해 Arc 폴리펩티드를 조작하는 예시적인 방법을 예시한다.
도 4a는 HisTrap 컬럼으로부터 이미다졸 구배로의 용출에 의한 6xHis 태그부착된 인간 Arc의 단리를 도시한다.
도 4b는 NaCl 구배로 용출된 모노 Q 컬럼 상의 잔류 핵산으로부터 6xHis 태그부착된 인간 Arc의 분리를 도시한다.
도 5는 네거티브 염색된 인간 Arc 캡시드의 투과 전자 현미경 이미지를 도시한다.
도 6은 재조합적으로 발현된 Arc 동원체(ortholog)로부터 형성된 네거티브 염색된 캡시드의 투과 전자 현미경 이미지를 도시한다.
도 7은 재조합적으로 발현된 endo-Gag 단백질로부터 형성된 네거티브 염색된 캡시드의 투과 전자 현미경 이미지를 도시한다.
도 8은 HeLa 세포에 의한 Alexa594 표지된 Arc 캡시드의 선택적 내재화를 도시한다.
도 9는 Arc 캡시드에 의한 Cre RNA의 HeLa 세포로의 전달을 도시한다.
도 10은 이종 RNA 페이로드를 전달하는 능력에 대해 Arc 및 endo-Gag 유전자 후보를 스크리닝하는 방법을 예시한다.
진단 또는 치료제를 관심 부위에 정밀하게 투여하는 것은 지속적인 도전을 제시하였다. 핵산을 세포에 전달하는 이용 가능한 방법은 무수한 한계를 갖는다. 예컨대, 유전자 요법에 자주 사용되는 AAV 바이러스 벡터는 면역원성이고, < 3kb의 제한된 페이로드 용량을 갖고, 열악한 생체 분포를 겪고, 직접 주사로만 투여할 수 있으며, 통합에 의해 숙주 유전자를 파괴할 위험이 있다. 비-바이러스 방법은 상이한 한계를 갖는다. 리포솜은 주로 간에 전달된다. 세포외 소포는 < 1 kb의 제한된 페이로드 용량, 제한된 확장성 및 정제 어려움을 갖는다. 따라서, 치료 페이로드를 전달하는 새로운 방법에 대한 필요성이 인식된다.
대부분의 분자는 신체에 고유한 친화력을 가지고 있지 않다. 다른 경우에서, 투여된 작용제는 청소를 위해 간 및 신장에 축적되거나 의도하지 않은 조직 또는 세포 유형에 축적된다. 전달을 개선하는 방법은 소수성 화합물 또는 중합체로 선택한 작용제를 코팅하는 것을 포함한다. 이러한 접근법은 순환에서 상기 작용제의 지속기간을 증가시키고 세포 흡수를 위한 소수성을 증대시킨다. 반면에, 이 접근법은 카고를 전달을 위한 관심 부위로 적극적으로 보내지 않는다.
요법이 필요한 부위를 명확하게 표적으로 하기 위해, 치료 화합물은 임의적으로 표적 세포의 표면에 디스플레이되는 수용체를 인식하고 결합하는 리간드, 항체 및 압타머와 같은 모이어티에 융합된다. 관심 세포에 도달하면, 치료 화합물은 임의적으로 세포내 표적에 추가로 전달된다. 예컨대, 치료 RNA는 세포의 세포질의 리보솜과 접촉하면 단백질로 번역될 수 있다.
Arc(활성 조절되는 세포골격 관련된 단백질)는 α-아미노-3-히드록시-5-메틸이속사졸-4-프로피온산(AMPA) 유형 글루타메이트 수용체의 세포내이입 트래피킹을 조절한다. Arc 활성은 시냅스 강도 및 뉴런 가소성과 관련이 있다. 실험 뮤린 모델에서 Arc 손실의 표현형은 결손이 있는 장기 기억 형성 및 감소된 뉴런 활성 및 가소성을 포함하였다.
Arc는 레트로바이러스 Gag 단백질과 유사한 분자 특성을 나타낸다. Arc 유전자는 Ty3/gypsy 레트로트랜스포존으로부터 유래되었을 수 있다. 내인성 Gag(endo-Gag) 단백질은 Arc를 포함하여 진핵 유기체에 내인성인 임의의 단백질이며, 바이러스 Gag 단백질에 대해 예측된 주석이 달린 유사성을 갖는다. 예시적인 endo-Gag 단백질은 문헌(Campillos M, Doerks T, Shah PK, and Bork P, Computational characterization of multiple Gag-like human proteins, Trends Genet. 2006 Nov;22(11):585-9)에 개시되어 있다. endo-Gag 단백질은 임의적으로 원핵 또는 진핵 세포, 또는 박테리아, 효모, 곤충, 척추동물, 포유동물 또는 인간 세포를 포함하는 임의의 숙주 세포에 의해 재조합적으로 발현된다. 본원에서 기재되는 바와 같이, 일부 실시양태에서 endo-Gag 단백질은 endo-Gag 캡시드로 조립된다.
특정 실시양태에서, 관심 카고의 전달을 위해 캡시드로 조립되는 Arc 및 endo-Gag 폴리펩티드가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 또한 관심 카고의 전달을 위해 캡시드로 조립되는 조작된 Arc 및 endo-Gag 폴리펩티드가 본원에 기재된다. 추가의 실시양태에서, 관심 카고의 전달을 위한 캡시드, 예컨대 Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드가 본원에 기재된다.
Arc 폴리펩티드 및 내인성 Gag 폴리펩티드
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드가 본원에 개시된다. 특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드가 본원에 개시된다. endo-Gag 서열은 이 섹션에 기재된 임의의 유형의 조작된 Arc 폴리펩티드를 형성하기 위한 Arc 서열에 대한 임의적 대체물이라는 것을 이해해야 한다.
일부 예에서, Arc는 비-인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 예에서, Arc 폴리펩티드는 전장 Arc 폴리펩티드(예컨대, 전장 비-인간 Arc 폴리펩티드)를 포함한다. 다른 예에서, Arc 폴리펩티드는 캡시드의 형성에 참여하는 말단절단된 Arc 폴리펩티드와 같은 비-인간 Arc의 단편을 포함한다. 추가의 예에서, Arc 폴리펩티드는 비-인간 Arc 폴리펩티드의 하나 이상의 도메인을 포함하고, 여기서 도메인 중 적어도 하나는 캡시드의 형성에 참여한다. 추가의 예에서, Arc 폴리펩티드는 재조합 Arc 폴리펩티드이다.
일부 예에서, endo-Gag는 비-인간 endo-Gag 폴리펩티드이다. 일부 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 전장 endo-Gag 폴리펩티드(예컨대, 전장 비-인간 endo-Gag 폴리펩티드)를 포함한다. 다른 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 캡시드의 형성에 참여하는 말단절단된 endo-Gag 폴리펩티드와 같은 비-인간 endo-Gag의 단편을 포함한다. 추가의 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 비-인간 endo-Gag 폴리펩티드의 하나 이상의 도메인을 포함하고, 여기서 도메인 중 적어도 하나는 캡시드의 형성에 참여한다. 추가의 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 재조합 endo-Gag 폴리펩티드이다.
일부 실시양태에서, Arc는 인간 Arc에 고유하지 않은 카고에 결합하도록 변형된 적어도 그의 RNA 결합 도메인을 갖는 인간 Arc 폴리펩티드이다. 일부 예에서, Arc 폴리펩티드는 인간 Arc 단백질에 고유하지 않은 카고에 결합하도록 변형된 적어도 그의 RNA 결합 도메인을 갖는 전장 인간 Arc 폴리펩티드를 포함한다. 다른 예에서, Arc 폴리펩티드는 적어도 그의 RNA 결합 도메인에 변형(들)을 포함하는 인간 Arc 단편을 포함한다. 추가의 예에서, Arc 폴리펩티드는 인간 Arc 폴리펩티드의 하나 이상의 도메인을 포함하고, 여기서 도메인 중 적어도 하나는 캡시드의 형성에 참여하고, 여기서 RNA 결합 도메인은 천연 인간 Arc 단백질은 결합하지 않는 카고에 결합하도록 변형된다. 추가의 예에서, Arc 폴리펩티드는 재조합 인간 Arc 폴리펩티드이며, 적어도 RNA 결합 도메인은 인간 Arc 단백질에 고유하지 않은 카고를 로딩할 수 있도록 변형된다.
일부 실시양태에서, Endo-Gag는 인간 endo-Gag에 고유하지 않은 카고에 결합하도록 변형된 적어도 그의 RNA 결합 도메인을 갖는 인간 Endo-Gag 폴리펩티드이다. 일부 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 인간 endo-Gag 단백질에 고유하지 않은 카고에 결합하도록 변형된 적어도 그의 RNA 결합 도메인을 갖는 전장 인간 endo-Gag 폴리펩티드를 포함한다. 다른 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 천연 인간 endo-Gag 단백질이 결합하지 않는 카고에 결합하도록 적어도 그의 RNA 결합 도메인에 변형(들)을 포함하는 인간 endo-Gag 단편을 포함한다. 추가의 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 인간 endo-Gag 폴리펩티드의 하나 이상의 도메인을 포함하고, 여기서 도메인 중 적어도 하나는 캡시드의 형성에 참여하고 여기서 RNA 결합 도메인은 인간 endo-Gag 단백질에 고유하지 않은 카고에 결합하도록 변형된다. 추가의 예에서, endo-Gag 폴리펩티드는 재조합 인간 endo-Gag 폴리펩티드이고, 적어도 RNA 결합 도메인은 인간 endo-Gag 단백질에 고유하지 않은 카고를 로딩할 수 있도록 변형된다.
일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드이다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 조작된 폴리펩티드는 전장 야생형 폴리펩티드와 서열이 동일하지 않은 재조합 폴리펩티드이다. 일부 예에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 제1 종으로부터의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 단편 및 제2 종의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로부터의 적어도 추가의 단편을 포함한다. 일부 경우에서, 제1 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 동물계, 식물계, 진균 또는 원생생물계의 계의 구성원으로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제1 종은 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 척추동물, 진핵생물, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제2 Arc 폴리펩티드는 제1 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드와 동일하거나 상이한 동물계, 식물계, 진균 또는 원생생물계의 계의 구성원으로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제2 종은 제1 종과 상이한 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 척추동물, 진핵생물, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다.
일부 실시양태에서, 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드로서의 발현하기 위한 예시적인 포유동물 Arc 또는 endo-Gag 단백질은 호모 사피엔스(homo sapiens) 종으로부터 것이다. 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드로서의 발현을 위한 영장류 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 추가의 예시적인 종은 고릴라(gorilla), 판고 아벨리(pongo abelii), 판 파니쿠스(pan paniscus), 마카카 네메스트리나(macaca nemestrina), 클로로세부스 사바에우스(chlorocebus sabaeus), 파피오 아누비스(papio anubis), 리노피테쿠스 록셀라나(rhinopithecus roxellana), 마카카 파시쿨라리스(macaca fascicularis), 노마스쿠스 류코게니스(nomascus leucogenys), 칼리트릭스 자쿠스(callithrix jacchus), 아오투스 난시마에(aotus nancymaae), 세부스 카푸시누스 이미타토르(cebus capucinus imitator), 사이미리 볼리비엔시스 볼리베엔시스(saimiri boliviensis boliviensis), 오톨레무르 가르네티이(otolemur garnettii), 마카카 물라타(macaca mulatta), 및 마카카 파시쿨라리스(macaca fascicularis)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 설치류 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 푸코미스 다마렌시스(fukomys damarensis), 미크로세버스 무리누스(microcebus murinus), 헤테로세팔루스 글라베르(heterocephalus glaber), 프로피테쿠스 코퀘렐리(propithecus coquereli), 마르모타 마르모타 마르모타(marmota marmota marmota), 갈레오프테루스 바리에가투스(galeopterus variegatus), 카비아 포르셀루스(cavia porcellus), 디포도미스 오르디이(dipodomys ordii), 옥토돈 데구스(octodon degus), 카스토르 카나덴시스 나노스팔락스 갈릴리(castor canadensis nannospalax galili), 카를리토 시리차(carlito syrichta), 친칠라 라니게라(chinchilla lanigera), 무스 무스쿨루스(mus musculus), 익티도미스 트리데셈리네아투스(ictidomys tridecemlineatus), 라투스 노르베기쿠스(rattus norvegicus), 미크로투스 오크로가스테르(microtus ochrogaster), 오톨레무르 가르네티이(otolemur garnettii), 메리오네스 운구이쿨라투스(meriones unguiculatus), 크리세툴루스 그리세우스(cricetulus griseus), 라투스 노르베기쿠스(rattus norvegicus), 네오토마 레피다(neotoma lepida), 자쿨루스 자쿨루스(jaculus jaculus), 무스텔라 푸토리우스 푸로(mustela putorius furo), 메소크리세투스 아우라투스(mesocricetus auratus), 투파이아 치넨시스(tupaia chinensis), 크리세툴루스 그리세우스(cricetulus griseus), 크리소클로리스 아시아티카(chrysochloris asiatica), 엘레판툴루스 에드와르디이(elephantulus edwardii), 에리나세우스 에우로파에우스(erinaceus europaeus), 오초토나 프린셉스(ochotona princeps), 소렉스 아라네우스(sorex araneus), 모노델피스 도메스티카(monodelphis domestica), 에키노프스 텔파이리(echinops telfairi), 및 콘딜루라 크리스타타(condylura cristata)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 불페스 불페스(vulpes vulpes), 카니스 루푸스 딘고(canis lupus dingo), 펠리스 카투스(felis catus), 판테라 파르두스(panthera pardus), 칼로리누스 우르시누스(callorhinus ursinus), 오도베누스 로스마루스 디베르겐스(odobenus rosmarus divergens), 에쿠우 아시누스(equus asinus), 수스 스크로파(sus scrofa), 마니스 자바이카(manis javanica), 세라토테리움 시뭄 시뭄(ceratotherium simum simum), 렙토니코테스 웨델리이(leptonychotes weddellii), 엔히드라 루트리스 케뇨니(enhydra lutris kenyoni), 리포테스 복실리페르(lipotes vexillifer), 보스 그룬니엔스(bos grunniens), 부발루스 부발리스(bubalus bubalis), 카멜루스 드로메다리우스(camelus dromedarius), 비쿠그나 파코스(vicugna pacos), 오르시누스 오르카(orcinus orca), 네오모나쿠스 샤우인슬란디(neomonachus schauinslandi), 투르시오프스 트룬카투스(tursiops truncatus), 보스 타우루스(bos taurus), 카프라 히르쿠스(capra hircus), 델피나프테루스 레우카스(delphinapterus leucas), 오비스 아리에스 무시몬(ovis aries musimon), 발라에노프테라 아쿠토로스트라타 스캄모니(balaenoptera acutorostrata scammoni), 네오포카에나 아시아에오리엔탈리스 아시아에오리엔탈리스(neophocaena asiaeorientalis asiaeorientalis), 미니오프테루스 나탈렌스시(miniopterus natalensis), 프테로푸스 알렉토(pteropus alecto), 피세테르 카토돈(physeter catodon), 록소돈타 아프리카나(loxodonta africana), 오릭테로푸스 아페르 아페르(orycteropus afer afer), 보스 무투스(bos mutus), 데스모두스 로툰두스(desmodus rotundus), 히포시데로스 아르미게르(hipposideros armiger), 아일루로포다 멜라노레우카(ailuropoda melanoleuca), 트리케쿠스 마나투스 라티로스트리스(trichechus manatus latirostris), 로우세투스 라티로스트리스(rousettus latirostris), 로우세투스 아에집티아쿠스(rousettus aegyptiacus), 에프테시쿠스 푸스쿠스(eptesicus fuscus), 리놀로푸스 시니쿠스(rhinolophus sinicus), 세르부스 엘라푸스 히펠라푸스(cervus elaphus hippelaphus), 오도코일레우스 비르기니아누스 텍사누스(odocoileus virginianus texanus), 판톨로프스 호드그소니이(pantholops hodgsonii), 카멜루스 박트리아누스(camelus bactrianus), 사르코필루스 하리시이(sarcophilus harrisii), 파스콜락토스 시네레우스(phascolarctos cinereus), 및 오르니토린쿠스 아나티누스(ornithorhynchus anatinus)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 조류 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 갈루스 갈루스(gallus gallus), 코르부스 코르닉스(corvus cornix), 코르닉스(cornix), 파루스 메이저(parus major), 코르부스 브라키린코스(corvus brachyrhynchos), 드로마이우스 노바에홀란디아에(dromaius novaehollandiae), 및 아프테릭스 로위(apteryx rowi)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 파충류 Arc 단백질의 예시적인 종 목록은 피톤 비비타투스(python bivittatus), 포고나 비티셉스(pogona vitticeps), 아놀리스 카롤리넨시스(anolis carolinensis), 프로토보트로프스 무크로스쿠아마투스(protobothrops mucrosquamatus), 앨리게이터 시넨시스(alligator sinensis), 크로코딜루스 포로수스(crocodylus porosus), 가비알리스 간게티쿠스(gavialis gangeticus), 앨리게이터 미시시피엔시스(alligator mississippiensis), 펠로디스쿠스 시넨시스(pelodiscus sinensis), 테라페네 멕시카나 트리운구이스(terrapene mexicana triunguis), 크리세미스 픽타 벨리이(chrysemys picta bellii), 첼로니아 미다스(chelonia mydas), 나노라나 파케리(nanorana parkeri), 제노푸스 트로피칼리스(xenopus tropicalis), 제노푸스 라에비스(xenopus laevis), 및 라티메리아 칼룸나에(latimeria chalumnae)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 어류 Arc 단백질의 예시적인 종 목록은 온코린쿠스 미키스(oncorhynchus mykiss), 아칸토크로미스 폴리아칸투스(acanthochromis polyacanthus), 온코린쿠스 키수치(oncorhynchus kisutch), 카라시우스 아우라투스(carassius auratus), 및 아우스트로푼둘루스 림나에우스(austrofundulus limnaeus)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 곤충 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 드로소필라 세라타(drosophila serrata), 드로소필라 비펙티나타(drosophila bipectinata), 솔레놉시스 인빅타(solenopsis invicta), 템노토락스 쿠르비스피노수스(temnothorax curvispinosus), 드로소필라 멜라노가스테르(drosophila melanogaster), 아그릴루스 플라니페니스(agrilus planipennis), 캄포노투스 플로리다누스(camponotus floridanus), 포고노미르멕스 바르바투스(pogonomyrmex barbatus), 닐라파르바타 루겐스(nilaparvata lugens), 봄빅스 모리(bombyx mori), 트리볼리움 카스타네움(tribolium castaneum), 및 렙티노타르사 데셈리네아타(leptinotarsa decemlineata)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 식물 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 스피나시아 올레라세아(spinacia oleracea) 및 에리트란테 구타타(erythranthe guttata)를 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 진균 단백질의 예시적인 종 목록은 사카로미세스 세레비시아에(Saccharomyces cerevisiae), 리조푸스 델레마르(rhizopus delemar), 푸사리움 옥시스포룸(fusarium oxysporum), 크립토코쿠스 네오포르만스(cryptococcus neoformans), 리조파구스 일레굴라리스(rhizophagus irregularis), 푸사리움 푸지쿠로이(fusarium fujikuroi), 칸디다 알비칸스(candida albicans), 트리코피톤 루브룸(trichophyton rubrum), 피레노포라 트리티시-레펜티스(pyrenophora tritici-repentis), 리조푸스 미크로스포루스(rhizopus microsporus), 리족토니아 솔라니(rhizoctonia solani), 아스페르길루스 플라부스(aspergillus flavus), 베르티실리움 달리아에(verticillium dahliae), 푸사리움 베르티실리오이데스(fusarium verticillioides), 아스페르길루스 니게르(aspergillus niger), 푸사리움 그라미네아룸(fusarium graminearum), 아스페르길루스 푸미가투스(aspergillus fumigatus), 지모셉토리아 트리티시(zymoseptoria tritici), 및 트리코데르마 하르지아눔(trichoderma harzianum)을 포함한다.
재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드로서의 발현을 위한 원생생물 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 예시적인 종 목록은 엔타모에바 히스톨리티카(entamoeba histolytica), 파울리넬라 미크로포라(paulinella micropora), 구일라르디아 테타(guillardia theta), 옥시르히스 마리나(oxyrrhis marina), 세미나비스 로부스타(seminavis robusta), 유글레나 론가(euglena longa), 나에글레리아 그루베리(naegleria gruberi), 및 트리코모나스 바기날리스(trichomonas vaginalis)를 포함한다.
일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag는 캡시드 조립/형성(CA) 도메인, 카고 결합 도메인(예컨대, RNA 결합 도메인) 및 임의적으로 매트릭스(MA) 도메인, 역전사효소(RT) 도메인, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에서, CA 도메인은 N-로브 도메인 및 C-로브 도메인으로 더 나뉜다. 일부 경우에서, 카고 결합 도메인은 RNA 결합 도메인, DNA 결합 도메인, 단백질 결합 도메인, 펩티드 결합 도메인, 항체 결합 도메인, 소분자 결합 도메인, 또는 펩티드모방체/뉴클레오티드모방체 결합 도메인을 포함한다. 예시적인 카고 결합 도메인은 GPCR, 항체 또는 이의 결합 단편, 지단백질, 인테그린, 티로신 키나제, DNA 결합 단백질, RNA 결합 단백질, 뉴클레아제, 리가제, 프로테아제, 인테그라제, 이소머라제, 포스파타제, GTPase, 아로마타제, 에스테라제, 어댑터 단백질, G-단백질, GEF, 사이토카인, 인터류킨, 인터류킨 수용체, 인터페론, 인터페론 수용체, 카스파제, 전사 인자, 신경영양 인자 및 그들의 수용체, 성장 인자 및 그들의 수용체, 신호 인식 입자 및 수용체 성분, 세포외 매트릭스 단백질, 막의 통합 성분, 리보솜 단백질, 번역 신장 인자, 번역 개시 인자, GPI 고정된 단백질, 조직 인자, 디스트로핀, 우트로핀, 디스트로브레빈, 이들의 임의의 융합, 조합, 서브유닛, 유도체 또는 도메인으로부터의 도메인을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 캡시드 형성 또는 핵산 결합에 관여하지 않는 하나 이상의 비-필수 영역은 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 생성하기 위해 Arc 또는 endo-Gag 단백질로부터 제거된다. 이러한 경우에서, 하나 이상의 비-필수 영역, 예컨대 N-말단 영역(예컨대, 최대 10개 아미노산, 최대 20개 아미노산, 최대 30개 아미노산, 또는 최대 50개 아미노산), C-말단 영역(예컨대, 최대 10개 아미노산, 최대 20개 아미노산, 최대 30개 아미노산, 또는 최대 50개 아미노산), RT 도메인, MA 도메인, 또는 이들의 조합이 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 생성하기 위해 Arc 또는 endo-Gag 단백질로부터 삭제된다. 일부 경우에서, 캡시드 조립/형성 및 카고 결합과 관련된 필수 영역만 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드에 잔류한다. 추가의 경우에서, 캡시드 조립/형성에 관여하는 필수 영역(예컨대, N-로브 및/또는 C-로브)만 Arc 폴리펩티드에 잔류한다.
특정 실시양태에서, RT 도메인, MA 도메인, 및/또는 내인성 RNA 결합 도메인은 다른 카고 결합 도메인으로 대체된다: 예컨대, DNA 결합 도메인, 단백질 결합 도메인, 펩티드 결합 도메인, 항체 결합 도메인, 소분자 결합 도메인, 펩티드모방체 결합 도메인, 또는 뉴클레오티드모방체 결합 도메인으로 대체된다. 일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 캡시드 형성, 핵산 결합, 또는 전달에 관여하는 도메인의 말단절단 또는 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 MA 도메인, CA N-로브, CA C-로브, 카고 결합 도메인, 및 RT 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 MA 도메인, CA N-로브, CA C-로브, RT 도메인 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 MA 도메인, RT 도메인, 카고 결합 도메인, CA N-로브 및 CA C-로브를 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 카고 결합 도메인, MA 도메인, RT 도메인, CA N-로브 및 CA C-로브를 포함한다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 예에서, 각각의 도메인은 각각의 2개의 플랭킹 도메인에 직접 또는 간접적으로 융합된다.
일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 MA 도메인, CA N-로브, CA C-로브, 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 MA 도메인, CA N-로브, CA C-로브, 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 경우에서, Arc 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 MA 도메인, 카고 결합 도메인, CA N-로브 및 CA C-로브 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 카고 결합 도메인, MA 도메인, CA N-로브, 및 CA C-로브를 포함한다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 예에서, 각각의 도메인은 각각의 2개의 플랭킹 도메인에 직접 또는 간접적으로 융합된다.
일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 CA N-로브, CA C-로브 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 CA N-로브, CA C-로브 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 카고 결합 도메인, CA N-로브 및 CA C-로브를 포함한다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 예에서, 각각의 도메인은 각각의 2개의 플랭킹 도메인에 직접 또는 간접적으로 융합된다.
일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 CA N-로브 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 CA N-로브 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 카고 결합 도메인 및 CA N-로브를 포함한다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 경우에서, 2개의 도메인은 직접 또는 간접적으로 서로 융합된다.
일부 실시양태에서, Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 조작된 Arc 폴리펩티드를 생성하기 위해 하나 이상의 추가의 종으로부터의 카고 결합 도메인, CA 도메인, MA 도메인, 또는 RT 도메인을 포함하도록 조작된다. 예컨대, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 제1 종으로부터의 카고 결합 도메인, CA 도메인, MA 도메인, 또는 RT 도메인 및 제2 종으로부터의 카고 결합 도메인, CA 도메인, MA 도메인, 또는 RT 도메인을 포함한다. 일부 경우에서, 제1 종은 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제2 종은 제1 종과 상이한 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다.
일부 예에서, 조작된 또는 endo-Gag Arc 폴리펩티드는 제1 종으로부터의 카고 결합 도메인 및 제2 종으로부터의 CA 도메인(예컨대, CA N-로브 및 임의적으로 CA C-로브)을 포함한다. 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 임의적으로 제1 종 또는 제2 종으로부터의 MA 도메인 및 RT 도메인을 포함한다. 일부 경우에서, 제1 종은 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제2 종은 제1 종과 상이한 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다.
일부 예에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 카고 결합 도메인, 제1 CA 도메인, 제2 CA 도메인, 및 임의적으로 MA 도메인 및/또는 RT 도메인을 포함한다. 일부 경우에서, 카고 결합 도메인, 제1 CA 도메인, 및 임의적으로 MA 도메인 및/또는 RT 도메인은 제1 종으로부터의 것이고 제2 CA 도메인은 제2 종으로부터의 것이다. 일부 경우에서, 제1 CA 도메인은 제1 종으로부터의 것이고 카고 결합 도메인, 제2 CA 도메인, 및 임의적으로 MA 도메인 및/또는 RT 도메인은 제2 종으로부터의 것이다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 예에서, 각각의 도메인은 각각의 2개의 인접한 도메인에 직접 또는 간접적으로 융합된다.
일부 예에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 카고 결합 도메인, 제1 CA 도메인 및 제2 CA 도메인을 포함한다. 일부 경우에서, 카고 결합 도메인 및 제1 CA 도메인은 제1 종으로부터의 것이고 제2 CA 도메인은 제2 종으로부터의 것이다. 일부 경우에서, 제1 CA 도메인은 제1 종으로부터의 것이고 카고 결합 도메인 및 제2 CA 도메인은 제2 종으로부터의 것이다. 이러한 경우에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 카고 결합 도메인, 제1 CA 도메인 및 제2 CA 도메인을 포함한다. 이러한 경우에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 제1 CA 도메인, 카고 결합 도메인, 및 제2 CA 도메인을 포함한다. 이러한 경우에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 N-말단에서 C-말단으로 제1 CA 도메인, 제2 CA 도메인, 및 카고 결합 도메인을 포함한다. 일부 예에서, 도메인은 캡시드 조립 및 카고 결합을 방해하지 않는 순서로 배열된다. 일부 예에서, 각각의 도메인은 각각의 2개의 플랭킹 도메인에 직접 또는 간접적으로 융합된다.
일부 예에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 제2 폴리펩티드를 추가로 포함한다. 일부 예에서, 제2 폴리펩티드는 링커를 통해 카고 결합 도메인, 제1 CA 도메인, 제2 CA 도메인, 존재하는 경우 MA 도메인, 또는 존재하는 경우 RT 도메인 중 하나 이상에 직접 또는 간접적으로 융합된다. 일부 경우에서, 제2 폴리펩티드는 단백질(예컨대, 인간 단백질), 항체 또는 이의 결합 단편, 바이러스 단백질, Gag-유사 단백질(예컨대, 인간 Gag-유사 단백질), 또는 관심 표적 수용체에 결합하도록 설계된 드 노보 조작된 단백질을 포함한다. 일부 예에서, 항체 또는 이의 결합 단편은 인간화 항체 또는 이의 결합 단편, 뮤린 항체 또는 이의 결합 단편, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편, 모노클로날 항체 또는 이의 결합 단편, 다중특이적 항체 또는 이의 단편 결합, 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편, 1가 Fab', 2가 Fab2, F(ab)'3 단편, 단일 쇄 가변 단편(scFv), 비스-scFv, (scFv)2, 디아바디, 미니바디, 나노바디, 트리아바디, 테트라바디, 디술파이드 안정화된 Fv 단백질(dsFv), 단일 도메인 항체(sdAb), Ig NAR, 낙타류 항체 또는 이의 결합 단편, 또는 이의 화학적으로 변형된 유도체를 포함한다. 일부 예에서, 제2 폴리펩티드는 조작된 Arc 폴리펩티드에 의해 형성된 캡시드를 관심 표적 부위에 전달하는 것을 안내한다.
일부 실시양태에서, (예컨대, Arc 폴리펩티드 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 코딩하는) 본 개시 내용의 핵산 서열 또는 아미노산 서열은 본원에 제공된 아미노산 서열과 적어도 70% 상동성, 적어도 71% 상동성, 적어도 72% 상동성, 적어도 73% 상동성, 적어도 74% 상동성, 적어도 75% 상동성, 적어도 76% 상동성, 적어도 77% 상동성, 적어도 78% 상동성, 적어도 79% 상동성, 적어도 80% 상동성, 적어도 81% 상동성, 적어도 82% 상동성, 적어도 83% 상동성, 적어도 84% 상동성, 적어도 85% 상동성, 적어도 86% 상동성, 적어도 87% 상동성, 적어도 88% 상동성, 적어도 89% 상동성, 적어도 90% 상동성, 적어도 91% 상동성, 적어도 92% 상동성, 적어도 93% 상동성, 적어도 94% 상동성, 적어도 95% 상동성, 적어도 96% 상동성, 적어도 97% 상동성, 적어도 98% 상동성, 적어도 99% 상동성, 적어도 99.1% 상동성, 적어도 99.2% 상동성, 적어도 99.3% 상동성, 적어도 99.4% 상동성, 적어도 99.5% 상동성, 적어도 99.6% 상동성, 적어도 99.7% 상동성, 적어도 99.8% 상동성, 적어도 99.9% 또는 적어도 99.99% 상동성을 갖는다. NCBI BLAST, 클루스탈(Clustal) W, MAFFT, 클루스탈 오메가(Clustal Omega), AlignMe, 프랄린(Praline) 또는 또 다른 적절한 방법 또는 알고리즘과 같은 2개 이상의 서열 간의 상동성을 결정하기 위해 다양한 방법 및 소프트웨어 프로그램이 사용된다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 1의 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 2의 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 범고래 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 3의 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 흰꼬리 사슴 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 4의 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 오리너구리 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 5의 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 거위 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 6의 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 달마티안 펠리칸(Dalmatian pelican) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 7의 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 흰꼬리 수리 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 8의 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 킹 코브라 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 9의 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 조기어류(Ray finned fish) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 10의 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 향유 고래 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 11의 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 칠면조 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 12의 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 중앙 턱수염 도마뱀(central bearded dragon) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 13의 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 양쯔강 악어(chinese alligator) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 14의 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 미국 악어(American alligator) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, Arc 폴리펩티드는 서열번호 15의 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 일본 게코(Japanese gekko) 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 16의 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 PNMA3 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 17의 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 PNMA5 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 18의 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 PNMA6A 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 19의 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 PNMA6B 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 20의 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 RTL3 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 21의 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 RTL6 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 22의 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 RTL8A 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 23의 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 RTL8B 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 24의 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 BOP 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 25의 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 LDOC1 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 26의 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 ZNF18 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 27의 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 MOAP1 폴리펩티드이다.
특정 실시양태에서, endo-Gag 폴리펩티드는 서열번호 28의 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 서열을 갖는 인간 PEG10 폴리펩티드이다.
일부 경우에서, 재조합 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 도 1에 예시되는 Arc 폴리펩티드이다.
일부 경우에서, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 도 2에 예시되는 조작된 Arc 폴리펩티드이다.
링커
특정 실시양태에서, 본 개시 내용의 폴리펩티드는 링커를 포함한다. 일부 실시양태에서, 링커는 펩티드 링커이다. 일부 예에서, 링커는 경성 링커이다. 다른 예에서, 링커는 연성 링커이다. 일부 경우에서, 링커는 비-절단 가능한 링커이다. 다른 경우에서, 링커는 절단 가능한 링커이다. 추가의 경우에서, 링커는 선형 구조 또는 비-선형 구조(예컨대, 사이클릭 구조)를 포함한다.
특정 실시양태에서, 비-절단 가능한 링커는 다양한 길이의 짧은 펩티드를 포함한다. 예시적인 비-절단 가능한 링커는 (EAAAK)n(서열번호 70) 또는 (EAAAR)n(서열번호 71)을 포함하며, 여기서 n은 1 내지 5이고, 글루탐산-프롤린 잔기 또는 리신-프롤린 반복의 최대 30개 잔기이다. 일부 실시양태에서, 비-절단 가능한 링커는 (GGGGS)n(서열번호 72) 또는 (GGGS)n(서열번호 73)을 포함하며, 여기서 n은 1 내지 10이고; KESGSVSSEQLAQFRSLD(서열번호 74); 또는 EGKSSGSGSESKST(서열번호 75)이다. 일부 실시양태에서, 비-절단 가능한 링커는 폴리-Gly/Ala 중합체를 포함한다.
특정 실시양태에서, 링커는 절단 가능한 링커, 예컨대 세포외 절단 가능한 링커 또는 세포내 절단 가능한 링커이다. 일부 예에서, 링커는 특정 조건의 존재 또는 특정 환경(예컨대, 생리적 조건 하)에서의 절단을 위해 설계된다. 예컨대, 특정 효소에 의하는 것과 같은 특정 조건에 의한 절단을 위한 링커의 설계는 특정 위치에 대한 세포 흡수의 표적화를 가능하게 한다.
일부 실시양태에서, 링커는 pH 민감성 링커이다. 한 예에서, 링커는 염기성 pH 조건 하에서 절단된다. 다른 예에서, 링커는 산성 pH 조건 하에서 절단된다.
일부 실시양태에서, 링커는 트롬빈, 메탈로프로테아제, 푸린, 카텝신 B, 괴사 효소(예컨대, 칼파인) 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는 세린 프로테아제와 같은 내인성 효소(예컨대, 프로테아제)에 의해 생체내에서 절단된다. 예시적인 절단 가능한 링커는 GGAANLVRGG(서열번호 76); SGRIGFLRTA(서열번호 77); SGRSA(서열번호 78); GFLG(서열번호 79); ALAL(서열번호 80); FK; PIC(Et)F-F(서열번호 81)(여기서 C(Et)는 S-에틸시스테인을 나타냄); PR(S/T)(L/I)(S/T)(서열번호 82); DEVD(서열번호 83); GWEHDG열번호 84); RPLALWRS(서열번호 85); 또는 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
캡시드
일부 실시양태에서, 캡시드가 본원에 개시된다. 일부 예에서, 캡시드는 Arc 폴리펩티드 및/또는 endo-Gag 폴리펩티드, 예컨대 코피아 단백질, ASPRV1 단백질, SCAN 도메인 패밀리로부터의 단백질, 부신생물성 Ma 항원 패밀리에 의해 코딩되는 단백질, 레트로트랜스포존 Gag-유사 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합, 또는 이들의 조합을 포함한다. 예시적인 endo-Gag 폴리펩티드는 BOP, LDOC1, MOAP1, PEG10, PNMA3, PNMA5, PNMA6A, PNMA6B, RTL3, RTL6, RTL8A, RTL8B, 및 ZNF18이다. 일부 예에서, Arc 폴리펩티드, 코피아 단백질, ASPRV1 단백질, SCAN 도메인 패밀리로부터의 단백질, 부신생물성 Ma 항원 패밀리에 의해 코딩되는 단백질, 및 레트로트랜스포존 Gag-유사 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합은 각각 독립적으로 전장 폴리펩티드이다. 다른 예에서, Arc 폴리펩티드, 코피아 단백질, ASPRV1 단백질, SCAN 도메인 패밀리로부터의 단백질, 부신생물성 Ma 항원 패밀리에 의해 코딩되는 단백질, 및 레트로트랜스포존 Gag-유사 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합은 각각 독립적으로, 예컨대 캡시드의 서브유닛을 형성할 수 있는, 이의 기능적 단편이다.
Arc 기반 캡시드 및 endo-Gag 기반 캡시드
일부 실시양태에서, 캡시드는 Arc 기반 캡시드를 포함한다. 일부 실시양태에서, 캡시드는 endo-Gag 기반 캡시드를 포함한다. 일부 예에서, Arc 기반 및/또는 endo-Gag 캡시드는 상술된 복수의 재조합 Arc 폴리펩티드 및/또는 endo-Gag 폴리펩티드, 상술된 복수의 조작된 Arc 폴리펩티드 및/또는 endo-Gag 폴리펩티드, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 경우에서, Arc 기반 캡시드는 복수의 재조합 Arc 폴리펩티드를 포함한다. 다른 경우에서, Arc 기반 캡시드는 복수의 조작된 Arc 폴리펩티드를 포함한다. 일부 경우에서, endo-Gag 기반 캡시드는 복수의 재조합 endo-Gag 폴리펩티드를 포함한다. 다른 경우에서, endo-Gag 기반 캡시드는 복수의 조작된 endo-Gag 폴리펩티드를 포함한다.
일부 실시양태에서, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 제1 종으로부터의 제1 복수의 Arc 및/또는 endo-Gag 폴리펩티드 및 적어도 제2 종으로부터의 제2 복수의 Arc 및/또는 endo-Gag 폴리펩티드를 포함한다. 일부 경우에서, 제1 종은 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다. 일부 경우에서, 제2 종은 제1 종과 상이한 진핵생물, 척추동물, 인간, 포유동물, 설치류, 조류, 파충류, 어류, 곤충, 진균, 또는 식물로부터 선택된다.
일부 예에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 10:1, 20:1, 50:1, 또는 100:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 2:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 4:1이다. 일부 경우에서, 복수의 제1 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 5:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 8:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 복수의 제2 Arc 폴리펩티드의 비는 10:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 20:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 50:1이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 100:1이다. 일부 예에서, 비는 몰 농도의 비교이다. 일부 예에서, 비는 캡시드 형성 서브유닛의 수의 비교이다(예컨대, 각각의 또는 조작된 Arc 폴리펩티드는 캡시드 서브유닛을 형성함).
일부 예에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:2, 1:3, 1:4, 1 : 5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 1:10, 1:20, 또는 1:50이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:2이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1 : 5이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:8이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:10이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:20이다. 일부 경우에서, 제1 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드 대 제2 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드의 비는 1:50이다. 일부 예에서, 비는 몰 농도의 비교이다. 일부 예에서, 비는 캡시드 형성 서브유닛의 수의 비교이다(예컨대, 각각의 재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드는 캡시드 서브유닛을 형성함).
일부 실시양태에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 및 복수의 비-Arc 단백질을 포함한다. 비-Arc 단백질의 예시적인 종은 코피아, ASPRV1, SCAN 도메인 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합, 부신생물성 Ma 항원 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합, 및 레트로트랜스포존 Gag-유사 패밀리로부터 선택되는 단백질 또는 단백질의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 비-Arc 단백질의 예시적인 종은 BOP, LDOC1, MOAP1, PEG10, PNMA3, PNMA5, PNMA6A, PNMA6B, RTL3, RTL6, RTL8A, RTL8B, 및 ZNF18을 포함한다.
일부 예에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1이다. 7:1, 8:1, 9:1, 10:1, 20:1, 50:1 또는 100:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 2:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 4:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 5:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 8:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 10:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 20:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 50:1이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 100:1이다. 일부 예에서, 비는 몰 농도의 비교이다. 일부 예에서, 비는 캡시드 형성 서브유닛의 수의 비교이다(예컨대, 각각의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드는 캡시드 서브유닛을 형성함).
일부 예에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:2, 1:3, 1:4, 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 1:10, 1:20, 또는 1:50이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:2이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:5이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:8이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:10이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:20이다. 일부 경우에서, 복수의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드 대 복수의 비-Arc 단백질의 비는 1:50이다. 일부 예에서, 비는 몰 농도의 비교이다. 일부 예에서, 비는 캡시드 형성 서브유닛의 수의 비교이다(예컨대, 각각의 재조합 또는 조작된 Arc 폴리펩티드는 캡시드 서브유닛을 형성함).
일부 실시양태에서, 캡시드는 적어도 1 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 적어도 2 nm, 3 nm, 4 nm, 5 nm, 10 nm, 15 nm, 20 nm, 25 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 150 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 600 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 적어도 5 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 적어도 10 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 20 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 30 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 40 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 50 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 80 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 100 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 200 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 300 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 400 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 500 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 적어도 600 nm, 또는 그 초과의 직경을 갖는다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 최대 1 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 2 nm, 3 nm, 4 nm, 5 nm, 10 nm, 15 nm, 20 nm, 25 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 150 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 600 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 5 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 최대 10 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 20 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 30 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 40 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 50 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 80 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 100 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 200 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 400 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 500 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 최대 600 nm, 또는 그 미만의 직경을 갖는다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 약 1 nm, 2 nm, 3 nm, 4 nm, 5 nm, 10 nm, 15 nm, 20 nm, 25 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 150 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 또는 600 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 5 nm의 직경을 갖는다. 일부 경우에서, 캡시드는 약 10 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 20 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 30 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 40 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 50 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 80 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 100 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 200 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 300 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 400 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 500 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 600 nm의 직경을 갖는다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 약 1 nm 내지 약 600 nm의 직경을 갖는다. 일부 예에서, 캡시드는 약 2 nm 내지 약 500 nm, 약 2 nm 내지 약 400 nm, 약 2 nm 내지 약 300 nm, 약 2 nm 내지 약 200 nm, 약 2 nm 내지 약 100 nm, 약 2 nm 내지 약 50 nm, 약 2 nm 내지 약 30 nm, 약 20 nm 내지 약 400 nm, 약 20 nm 내지 약 300 nm, 약 20 nm 내지 약 200 nm, 약 20 nm 내지 약 100 nm, 약 20 nm 내지 약 50 nm, 약 20 nm 내지 약 30 nm, 약 30 nm 내지 약 500 nm, 약 30 nm 내지 약 400 nm, 약 30 nm 내지 약 300 nm, 약 30 nm 내지 약 200 nm, 약 30 nm 내지 약 100 nm, 약 30 nm 내지 약 50 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 약 50 nm 내지 약 100 nm, 약 2 nm 내지 약 25 nm, 약 2 nm 내지 약 20 nm, 약 2 nm 내지 약 10 nm, 약 5 nm 내지 약 25 nm, 약 5 nm 내지 약 20 nm, 약 5 nm 내지 약 10 nm, 약 10 nm 내지 약 25 nm, 또는 약 10 nm 내지 약 20 nm의 직경을 갖는다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 감소된 표적외 효과를 갖는다. 일부 경우에서, 표적외 효과는 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% 또는 0.5% 미만이다. 일부 경우에서, 표적외 효과는 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% 또는 0.5% 이하이다.
일부 경우에 캡시드는 표적외 효과를 갖지 않는다.
특정 실시양태에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드의 형성은 생체외 또는 시험관내에서 발생한다.
일부 예에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 생체내에서 조립된다.
일부 예에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 실온에서 안정하다. 일부 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비어 있다. 다른 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 로딩된다(예컨대, 카고 및/또는 치료제, 예컨대 DNA 또는 RNA가 로딩됨).
일부 예에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 약 2℃ 내지 약 37℃의 온도에서 안정하다. 일부 예에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 약 2℃ 내지 약 8℃, 약 2℃ 내지 약 4℃, 약 20℃ 내지 약 37℃, 약 25℃ 내지 약 37℃, 약 20℃ 내지 약 30℃, 약 25℃ 내지 약 30℃, 또는 약 30℃ 내지 약 37℃의 온도에서 안정하다. 일부 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비어 있다. 다른 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 로딩된다(예컨대, 카고 및/또는 치료제, 예컨대 DNA 또는 RNA가 로딩됨).
일부 예에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 적어도 약 1일, 2일, 4일, 5일, 7일, 14일, 28일, 30일, 60일, 2개월, 3개월, 4개월, 5개월, 6개월, 12개월, 18개월, 24개월, 3년, 5년, 또는 그 초과 동안 안정하다. 일부 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 최소 분해, 예컨대 분해되는 Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드의 총 집단을 기준으로 하여 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, 0.5% 미만을 갖는다. 일부 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비어 있다. 다른 경우에서, Arc 및/또는 endo-Gag 기반 캡시드는 로딩된다(예컨대, 치료제, 예컨대 DNA 또는 RNA가 로딩됨).
추가의 캡시드
일부 실시양태에서, 캡시드는 코피아 단백질을 포함한다. 일부 예에서, 코피아 단백질은 드로소필라 멜라노가스테르(Drosophila melanogaster)(UniProtKB-P04146), 세라티티스 카피타테(Ceratitis capitate)(UniProtKB-W8BHY5) 또는 드로소필라 시물란스(Drosophila simulans)(UniProtKB-Q08461)로부터의 것이다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 단백질 ASPRV1을 포함한다. ASPRV1 단백질은 피부 장벽의 발달 및 유지에 참여하는 구조 단백질이다. 일부 예에서, 단백질 ASPRV1은 호모 사피엔스(UniProtKB-Q53RT3)로부터의 것이다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 SCAN 도메인 패밀리로부터의 단백질을 포함한다. SCAN 도메인은 징크 핑거 전사 인자의 슈퍼패밀리이다. SCAN 도메인은 루이신 풍부 영역(LeR)으로도 알려져 있으며 자가-회합 또는 다른 단백질과의 선택적 회합을 매개하는 단백질 상호 작용 도메인으로 기능한다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 부신생물성 Ma 항원 패밀리로부터의 단백질을 포함한다. 부신생물성 Ma 항원 패밀리는 neurO- 및 고환-특이적 단백질의 약 14개의 구성원을 포함한다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 레트로트랜스포존 Gag-유사 유전자에 의해 코딩되는 단백질을 포함한다.
일부 실시양태에서, 캡시드는 BOP, LDOC1, MOAP1, PEG10, PNMA3, PNMA5, PNMA6A, PNMA6B, RTL3, RTL6, RTL8A, RTL8B, 및/또는 ZNF18을 포함한다.
카고
일부 실시양태에서, 본 개시 내용의 조성물(예컨대, 캡시드)은 카고를 포함한다. 일부 실시양태에서, 카고는 치료제이다. 일부 실시양태에서, 카고는 핵산 분자, 소분자, 단백질, 펩티드, 항체 또는 이의 결합 단편, 펩티드모방체, 또는 뉴클레오티드모방체이다. 일부 예에서, 카고는, 예컨대 하나 이상의 약물을 포함하는 치료 카고이다. 일부 예에서, 카고는 프로파일링을 위한 진단 도구, 예컨대 하나 이상의 마커(예컨대, 하나 이상의 질환 표현형과 관련된 마커)를 포함한다. 추가의 예에서, 카고는 이미징 도구를 포함한다.
일부 예에서, 카고는 핵산 분자이다. 예시적인 핵산 분자는 DNA, RNA, 또는 DNA와 RNA의 혼합물을 포함한다. 일부 예에서, 핵산 분자는 DNA 중합체이다. 일부 경우에서, DNA는 단일 가닥 DNA 중합체이다. 다른 경우에서, DNA는 이중 가닥 DNA 중합체이다. 추가의 경우에서, DNA는 단일 및 이중 가닥 DNA 중합체의 하이브리드이다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 RNA 중합체, 예컨대 단일 가닥 RNA 중합체, 이중 가닥 RNA 중합체, 또는 단일 및 이중 가닥 RNA 중합체의 하이브리드이다. 일부 예에서, RNA는 안티센스 올리고리보뉴클레오티드, siRNA, mRNA, tRNA, rRNA, snRNA, shRNA, 마이크로RNA 또는 비-코딩 RNA를 포함하고/하거나 코딩한다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 DNA와 RNA의 하이브리드를 포함한다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 임의적으로 DNA, RNA, 또는 DNA와 RNA의 하이브리드를 포함하는 안티센스 올리고뉴클레오티드이다.
일부 예에서, 핵산 분자는 mRNA 분자를 포함하고/하거나 코딩한다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 RNAi 분자를 포함하고/하거나 코딩한다. 일부 경우에서, RNAi 분자는 마이크로RNA(miRNA) 분자이다. 다른 경우에서, RNAi 분자가 siRNA 분자이다. miRNA 및/또는 siRNA는 임의적으로 이중 가닥 또는 헤어핀으로서 또한 임의적으로 전구체 분자로 캡슐화된다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 핵산 기반 요법에 사용하기 위한 것이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 유전자 발현 조절(예컨대, mRNA 번역 또는 분해 조정), RNA 스플라이싱 조정 또는 RNA 간섭을 위한 것이다. 일부 경우에서, 핵산 분자는 유전자 발현 조절, RNA 스플라이싱 조정, 또는 RNA 간섭에 사용하기 위한 안티센스 올리고뉴클레오티드, 마이크로RNA 분자, siRNA 분자, mRNA 분자를 포함하고/하거나 코딩한다.
일부 예에서, 핵산 분자는 유전자 편집에 사용하기 위한 것이다. 예시적인 유전자 편집 시스템은 CRISPR-Cas 시스템, 징크 핑거 뉴클레아제(ZFN) 시스템, 및 전사 활성화제-유사 이펙터 뉴클레아제(TALEN) 시스템을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 경우에서, 핵산 분자는 CRISPR-Cas 시스템, ZFN 시스템, 또는 TALEN 시스템에 관여하는 성분을 포함하고/하거나 코딩한다.
일부 경우에서, 핵산 분자는 치료 및/또는 예방 백신 생성을 위한 항원 생성에 사용하기 위한 것이다. 예컨대, 핵산 분자는 발현되고 바람직한 면역 반응(예컨대, 전염증 면역 반응, 항염증 면역 반응, B 세포 반응, 항체 반응, T 세포 반응, CD4+ T 세포 반응, CD8+ T 세포 반응, Th1 면역 반응, Th2 면역 반응, Th17 면역 반응, Treg 면역 반응, 또는 이들의 조합)을 유도하는 항원을 코딩한다.
일부 경우에서, 핵산 분자는 핵산 효소를 포함한다. 핵산 효소는 촉매 활성을 갖는 RNA 분자(예컨대, 리보자임) 또는 DNA 분자(예컨대, 데옥시리보자임)이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 리보자임이다. 다른 예에서, 핵산 분자는 데옥시리보자임이다. 일부 경우에서, 핵산 분자는 바이오센서 및/또는 분자 스위치로 기능하는 MNAzyme이다(예컨대, 문헌(Mokany, et al., "MNAzymes, a versatile new class of nucleic acid enzymes that can function as biosensors and molecular switches," JACS 132(2): 1051-1059 (2010)) 참조).
일부 예에서, 핵산 분자의 예시적인 표적은 UL123(인간 시토메갈로바이러스), APOB, AR(안드로겐 수용체) 유전자, KRAS, PCSK9, CFTR, 및 SMN(예컨대, SMN2)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 5개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 1000, 1500, 2000, 3000, 4000, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 10개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 12개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 15개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 18개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 19개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 20개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 21개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 22개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 23개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 24개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 25개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 26개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 27개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 28개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 29개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 30개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 40개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 50개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 100개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 200개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 300개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 500개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 1000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 2000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 3000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 4000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 5000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 적어도 8000개 뉴클레오티드 또는 그 초과이다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 길이가 최대 12개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 1000, 1500, 2000, 3000, 4000, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 15개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 18개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 19개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 20개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 21개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 22개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 23개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 24개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 25개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 26개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 27개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 28개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 29개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 30개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 40개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 50개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 100개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 200개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 300개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 500개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 1000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 2000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 3000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 4000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 5000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 최대 8000개 뉴클레오티드 또는 그 미만이다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 길이가 약 5개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 1000, 1500, 2000, 3000, 4000, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 10개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 12개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 15개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 18개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 19개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 20개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 21개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 22개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 23개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 24개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 25개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 26개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 27개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 28개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 29개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 30개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 40개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 50개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 100개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 200개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 300개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 500개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 1000개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 2000개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 3000개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 4000개 뉴클레오티드이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 길이가 약 5000개 뉴클레오티드이다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 약 5개 내지 약 10,000개 뉴클레오티드 길이다. 일부 예에서, 핵산 분자는 약 5 내지 약 9000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 8000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 7000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 6000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 5000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 4000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 3000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 2000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 1000개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 500개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 100개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 50개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 40개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 30개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 25개 뉴클레오티드 길이, 약 5 내지 약 20개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 8000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 7000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 6000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 5000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 4000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 3000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 2000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 1000개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 500개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 100개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 50개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 40개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 30개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 25개 뉴클레오티드 길이, 약 10 내지 약 20개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 8000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 7000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 6000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 5000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 4000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 3000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 2000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 1000개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 500개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 100개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 50개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 40개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 30개 뉴클레오티드 길이, 약 18 내지 약 25개 뉴클레오티드 길이, 약 12 내지 약 50개 뉴클레오티드 길이, 약 20 내지 약 40개 뉴클레오티드 길이, 약 20 내지 약 30개 뉴클레오티드 길이, 또는 약 25 내지 약 30개 뉴클레오티드 길이이다.
일부 실시양태에서, 핵산 분자는 천연, 합성, 또는 인공 뉴클레오티드 유사체 또는 염기를 포함한다. 일부 경우에서, 핵산 분자는 DNA, RNA 및/또는 뉴클레오티드 유사체의 조합을 포함한다. 일부 경우에서, 합성 또는 인공 뉴클레오티드 유사체 또는 염기는 리보스 모이어티, 포스페이트 모이어티, 뉴클레오시드 모이어티, 또는 이들의 조합 중 하나 이상에서 변형을 포함한다.
일부 실시양태에서, 상술된 뉴클레오티드 유사체 또는 인공 뉴클레오티드 염기는 리보스 모이어티의 2' 히드록실기에서 변형을 갖는 핵산을 포함한다. 일부 예에서, 변형은 H, OR, R, 할로, SH, SR, NH2, NHR, NR2 또는 CN을 포함하며, 여기서 R은 알킬 모이어티이다. 예시적인 알킬 모이어티는 할로겐, 황, 티올, 티오에테르, 티오에스테르, 아민(1차, 2차 또는 3차), 아미드, 에테르, 에스테르, 알콜 및 산소를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 예에서, 알킬 모이어티는 변형을 추가로 포함한다. 일부 예에서, 변형은 아조기, 케토기, 알데히드기, 카르복실기, 니트로기, 니트로소기, 니트릴기, 헤테로사이클(예컨대, 이미다졸, 히드라지노 또는 히드록실아미노)기, 및 이소시아네이트 또는 시아네이트기, 또는 황 함유 기(예컨대, 술폭사이드, 술폰, 술파이드 또는 디술파이드)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 경우에서, 알킬 모이어티는 헤테로 치환을 추가로 포함한다. 일부 예에서, 헤테로사이클릭기의 탄소는 질소, 산소 또는 황으로 치환된다. 일부 예에서, 헤테로사이클릭 치환은 모르폴리노, 이미다졸, 및 피롤리디노를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 2' 히드록실기에서의 변형은 2'-O-메틸 변형 또는 2'-O-메톡시 에틸(2'-O-MOE) 변형이다. 일부 경우에서, 2'-O-메틸 변형은 리보스 모이어티의 2' 히드록실기에 메틸기를 추가하는 반면, 2'O-메톡시에틸 변형은 리보스 모이어티의 2' 히드록실기에 메톡시에틸기를 추가한다.
일부 예에서, 2' 히드록실기에서의 변형은 프로필 링커를 포함하는 연장된 아민기가 아민기를 2'산소에 결합하는 2'-O-아미노프로필 변형이다. 일부 예에서, 이 변형은 슈가당 아민기로부터 하나의 양전하를 도입함으로써 올리고뉴클레오티드 분자의 포스페이트 유래된 전체 음전하를 중화시키고 그에 따라 양쪽성 이온 특성으로 인해 세포 흡수 특성을 개선한다.
일부 예에서, 2' 히드록실기에서의 변형은 2' 탄소에 결합된 산소 분자가 메텔린기에 의해 4' 탄소에 연결됨으로써 2'-C,4'-C-옥시-메틸렌 연결된 비사이클릭 리보뉴클레오티드 단량체를 형성하는 잠금 또는 브리징된 리보스 변형(예컨대, 잠금 핵산 또는 LNA)이다.
일부 실시양태에서, 2' 히드록실기에서의 추가의 변형은 2'-데옥시, T-데옥시-2'-플루오로, 2'-O-아미노프로필(2'-O-AP), 2'-O-디메틸아미노에틸(2'-O-DMAOE), 2'-O-디메틸아미노프로필(2'-O-DMAP), T-O-디메틸아미노에틸옥시에틸(2'-O-DMAEOE), 또는 2'-ON-메틸아세트아미도(2'-O-NMA)를 포함한다.
일부 실시양태에서, 뉴클레오티드 유사체는 변형된 염기, 예컨대 5-프로피 닐우리딘, 5-프로피닐시티딘, 6-메틸아데닌, 6-메틸구아닌, N,N,-디메틸아데닌, 2-프로필아데닌, 2 프로필구아닌, 2-아미노아데닌, 1-메틸이노신, 3-메틸우리딘, 5-메틸시티딘, 5-메틸우리딘 및 5 위치에 변형을 갖는 다른 뉴클레오티드, 5-(2-아미노) 프로필 우리딘, 5-할로시티딘, 5-할로우리딘, 4-아세틸시티딘, 1-메틸아데노신, 2-메틸아데노신, 3-메틸시티딘, 6-메틸우리딘, 2-메틸구아노신, 7-메틸구아노신, 2,2-디메틸구아노신, 5-메틸아미노에틸우리딘, 5-메틸옥시우리딘, 데아자뉴클레오티드(예컨대, 7-데아자-아데노신, 6-아조우리딘, 6-아조시티딘, 또는 6-아조티미딘), 5-메틸-2-티오우리딘, 다른 티오 염기(예컨대, 2-티오우리딘, 4-티오우리딘, 및 2-티오시티딘), 디히드로우리딘, 슈도우리딘, 큐오신, 아르케오신, 나프틸 및 치환된 나프틸기, 임의의 O- 및 N-알킬화 퓨린 및 피리미딘(예컨대, N6-메틸아데노신, 5-메틸카르보닐메틸우리딘, 우리딘 5-옥시아세트산, 피리딘-4-온, 또는 피리딘-2-온), 페닐 및 변형된 페닐기, 예컨대 아미노페놀 또는 2,4,6-트리메톡시 벤젠, G-클램프 뉴클레오티드로 작용하는 변형된 시토신, 8-치환된 아데닌 및 구아닌, 5-치환된 우라실 및 티민, 아자피리미딘, 카르복시히드록시알킬 뉴클레오티드, 카르복시알킬아미노알킬 뉴클레오티드, 및 알킬카르보닐알킬화 뉴클레오티드를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 변형된 뉴클레오티드는 또한 슈가 모이어티와 관련하여 변형된 뉴클레오티드 뿐만 아니라 리보실이 아닌 슈가 또는 이의 유사체를 갖는 뉴클레오티드를 포함한다. 예컨대, 슈가 모이어티는 일부 경우에서 만노스, 아라비노스, 글루코피라노스, 갈락토피라노스, 4'-티오리보스, 및 다른 슈가, 헤테로사이클, 또는 카르보사이클이거나 이에 기초한다. 용어 뉴클레오티드는 또한 범용 염기를 포함한다. 예로서, 범용 염기는 3-니트로피롤, 5-니트로인돌, 또는 네불라린을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 뉴클레오티드 유사체는 모르폴리노, 펩티드 핵산(PNA), 메틸포스포네이트 뉴클레오티드, 티올포스포네이트 뉴클레오티드, 2'-플루오로 N3-P5'-포스포르아미다이트, 또는 1',5'-안히드로헥시톨 핵산(HNA)을 추가로 포함한다. 모르폴리노 또는 포스포로디아미데이트 모르폴리노 올리고(PMO)는 구조가 천연 핵산 구조를 모방하지만 정상적인 슈가 및 포스페이트 구조와는 다른 합성 분자를 포함한었다. 일부 예에서, 5원 리보스 고리는 4개의 탄소, 1개의 질소 및 1개의 산소를 함유하는 6원 모르폴리노 고리로 치환된다. 일부 경우에서, 리보스 단량체는 포스페이트기 대신 포스포르디아미데이트기에 의해 연결된다. 이러한 경우에서, 골격 변경은 모든 양전하 및 음전하를 제거하여 하전된 올리고뉴클레오티드에 사용되는 것과 같은 세포 전달제의 도움 없이 세포막을 통과할 수 있는 모르폴리노 중성 분자를 만든다.
일부 실시양태에서, 펩티드 핵산(PNA)은 슈가 고리 또는 포스페이트 결합을 함유하지 않으며 염기는 올리고글리신-유사 분자에 의해 부착되고 적절하게 이격되어 골격 전하를 제거한다.
일부 실시양태에서, 하나 이상의 변형은 임의적으로 뉴클레오티드간 결합에서 발생한다. 일부 예에서, 변형된 뉴클레오티드간 결합은 포스포로티오에이트; 포스포로디티오에이트; 메틸포스포네이트; 5'-알킬렌포스포네이트; 5'-메틸포스포네이트; 3'-알킬렌 포스포네이트; 보론트리플루오리데이트; 3'-5' 결합 또는 2'-5' 결합의 보라노포스페이트 에스테르 및 셀레포스페이트; 포스포트리에스테르; 티오노알킬포스포트리에스테르; 수소 포스포네이트 결합; 알킬 포스포네이트; 알킬포 포노티오에이트; 아릴포스포노티오에이트; 포스포로셀레노에이트; 포스포로디셀레노에이트; 포스피네이트; 포스포르아데이트; 3'-알킬포스포르아미데이트; 아미노알킬포스포르아미데이트; 티오노포스포르아미데이트; 포스포로피페라지데이트; 포스포로아닐로 티오에이트; 포스포로아닐리데이트; 케톤; 술폰; 술폰아미드; 카르보네이트; 카르바메이트; 메틸렌히드라조; 메틸렌디메틸히드라조; 포름아세탈; 티오포름아세탈; 옥심; 메틸렌이미노; 메틸렌메틸이미노; 티오아미데이트; 리보아세틸기와의 결합; 아미노에틸 글리신; 실릴 또는 실록산 결합; 예컨대, 포화 또는 불포화 및/또는 치환 및/또는 헤테로 원자를 함유하는 1 내지 10개의 탄소의 헤테로 원자가 있거나 없는 알킬 또는 시클로알킬 결합; 모르폴리노 구조, 아미드 또는 폴리아미드와의 결합(여기서 염기는 골격의 아자 질소에 직접 또는 간접적으로 부착됨); 및 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 하나 이상의 변형은 변형이 중성 또는 하전되지 않은 골격을 생성하는 변형된 포스페이트 골격을 포함한다. 일부 예에서, 포스페이트 골격은 알킬화에 의해 변형되어 하전되지 않은 또는 중성 포스페이트 골격을 생성한다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 알킬화는 메틸화, 에틸화 및 프로필화를 포함한다. 일부 경우에서, 알킬화와 관련하여 본원에서 사용되는 알킬기는 1 내지 6개의 탄소 원자를 함유하는 선형 또는 분지형 포화 탄화수소기를 지칭한다. 일부 예에서, 예시적인 알킬기는 메틸, 에틸, N-프로필, 이소프로필, N-부틸, 이소부틸, sec-부틸, tert-부틸, N-펜틸, 이소펜틸, 네오펜틸, 헥실, 이소헥실, 1,1-디메틸부틸, 2,2-디메틸부틸, 3,3-디메틸부틸, 및 2-에틸부틸기를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 경우에서, 변형된 포스페이트는 미국 특허 번호 9481905에 기재된 포스페이트기이다.
일부 실시양태에서, 추가의 변형된 포스페이트 골격은 메틸 포스포네이트, 에틸 포스포네이트, 메틸티오포스포네이트, 또는 메톡시 포스포네이트를 포함한다. 일부 경우에서, 변형된 포스페이트는 메틸포스포네이트이다. 일부 경우에서, 변형된 포스페이트는 에틸포스포네이트이다. 일부 경우에서, 변형된 포스페이트는 메틸 티오포스포네이트이다. 일부 경우에서, 변형된 포스페이트는 메톡시포스포네이트이다.
일부 실시양태에서, 하나 이상의 변형은 임의적으로 리보스 모이어티, 포스페이트 골격 및 뉴클레오시드의 변형, 또는 3' 또는 5' 말단에서 뉴클레오티드 유사체의 변형을 추가로 포함한다. 예컨대, 3' 말단은 임의적으로 3' 양이온 기를 포함하거나 3'-3'연결로 3'-말단에서 뉴클레오시드를 반전시킨다. 또 다른 대안에서, 3'-말단은 임의적으로 아미노알킬기, 예컨대 3'C 5-아미노 알킬 dT와 접합된다. 추가의 대안에서, 3'-말단은 임의적으로 비염기 부위, 예컨대 비퓨린 또는 비피리미딘 부위와 접합된다. 일부 예에서, 5'-말단은 아미노알킬기, 예컨대 5'-O-알킬아미노 치환체와 접합된다. 일부 경우에서, 5'-말단은 비염기 부위, 예컨대 비퓨린 또는 비피리미딘 부위와 접합된다.
일부 실시양태에서, 예시적인 핵산 카고는 포미비르센, 미포메르센, AZD5312(AstraZeneca), 누시네르센 및 SB010(Sterna Biologicals)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
소분자
일부 실시양태에서, 카고는 소분자이다. 일부 예에서, 소분자는 억제제(예컨대, 팬(pan) 억제제 또는 선택적 억제제)이다. 다른 예에서, 소분자는 활성화제이다. 추가의 경우에서, 소분자는 효능제, 길항제, 부분 효능제, 혼합 효능제/길항제 또는 경쟁적 길항제이다.
일부 실시양태에서, 소분자는 진통제, 항불안제, 항부정맥제, 항박테리아제, 항생제, 항응고제 및 혈전용해제, 항경련제, 항우울제, 지사제, 항구토제, 항진균제, 항히스타민제, 항고혈압제, 항염증제, 항신생물제, 항정신병제, 해열제, 항바이러스제, 바르비투레이트, 베타 차단제, 기관지 확장제, 감기 치료제, 코르티코스테로이드, 기침 억제제, 세포독성제, 충혈제거제, 이뇨제, 거담제, 호르몬, 혈당강하제, 면역억제제, 완하제, 근육 이완제, 성 호르몬, 수면제, 또는 신경안정제의 부류에 속하는 약물이다.
일부 실시양태에서, 소분자는 억제제, 예컨대 티로신 키나제 경로 또는 세린/트레오닌 키나제 경로와 같은 키나제 경로의 억제제이다. 일부 경우에서, 소분자는 이중 단백질 키나제 억제제이다. 일부 경우에서, 소분자는 지질 키나제 억제제이다.
일부 경우에서, 소분자는 뉴라미니다제 억제제이다.
일부 경우에서, 소분자는 탄산 안히드라제 억제제이다.
일부 실시양태에서, 소분자의 예시적인 표적은 혈관 내피 성장 인자 수용체 1(VEGFR1), 혈관 내피 성장 인자 수용체 2(VEGFR2), 혈관 내피 성장 인자 수용체 3(VEGFR3), 섬유모세포 성장 인자 수용체 1(FGFR1), 섬유모세포 성장 인자 수용체 2(FGFR2), 섬유모세포 성장 인자 수용체 3(FGFR3), 섬유모세포 성장 인자 수용체 4(FGFR4), 사이클린 의존적 키나제 4(CDK4), 사이클린 의존적 키나제 6(CDK6), 수용체 티로신 키나제, 포스포이노시티드 3-키나제(PI3K) 이소형(예컨대, PI3Kδ, p110δ로도 알려짐), 야누스 키나제 1(JAK1), 야누스 키나제 3(JAK3), 혈소판 유래된 성장 인자 수용체(PDFG-R) 패밀리로부터의 수용체, 및 탄산 안히드라제(예컨대, 탄산 안히드라제 I)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 소분자는 바이러스 단백질, 예컨대 바이러스 외피 단백질을 표적으로 한다. 일부 실시양태에서, 소분자는 숙주 세포에 대한 바이러스 흡착을 감소시킨다. 일부 실시양태에서, 소분자는 숙주 세포로의 바이러스 진입을 감소시킨다. 일부 실시양태에서, 소분자는 숙주 또는 숙주 세포에서 바이러스 복제를 감소시킨다. 일부 실시양태에서, 소분자는 바이러스 조립을 감소시킨다.
일부 실시양태에서, 예시적인 소분자 카고는 렌바티닙, 팔보시클립, 레고라페닙, 이델랄리십, 토파시티닙, 닌테다닙, 자나미비르, 에톡졸아미드, 및 아르테미시닌을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
단백질
일부 실시양태에서, 카고는 단백질이다. 일부 예에서, 단백질이 전장 단백질이다. 다른 예에서, 단백질은 단편, 예컨대 기능적 단편이다. 일부 경우에서, 단백질이 자연 발생 단백질이다. 추가의 경우에서, 단백질은 드 노보 조작된 단백질이다. 추가의 경우에서, 단백질은 융합 단백질이다. 추가의 경우에서, 단백질은 재조합 단백질이다. 예시적인 단백질은 Fc 융합 단백질, 항응고제, 혈액 인자, 골 형태형성 단백질, 효소, 성장 인자, 호르몬, 인터페론, 인터류킨, 및 혈전용해제를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 단백질은 효소 대체 요법에 사용하기 위한 것이다.
일부 경우에서, 단백질은 치료 및/또는 예방 백신 생성을 위한 항원 생성에 사용하기 위한 것이다. 예컨대, 단백질은 바람직한 면역 반응(예컨대, 전염증 면역 반응, 항염증 면역 반응, B 세포 반응, 항체 반응, T 세포 반응, CD4+ T 세포 반응, CD8+ T 세포 반응, Th1 면역 반응, Th2 면역 반응, Th17 면역 반응, Treg 면역 반응, 또는 이들의 조합)을 유도하는 항원을 포함한다.
일부 예에서, 예시적인 단백질 카고는 로미플로스팀, 리라글루타이드, 인간 성장 호르몬(rHGH), 인간 인슐린(BHI), 난포 자극 호르몬(FSH), 인자 VIII, 에리트로포이에틴(EPO), 과립구 콜로니 자극 인자(G-CSF), 알파-갈락토시다제 A, 알파-L-이두로니다제, N-아세틸갈락토스아민-4-술파타제, 도르나제 알파, 조직 플라스미노겐 활성화제(TPA), 글루코세레브로시다제, 인터페론-베타-1a, 인슐린-유사 성장 인자 1(IGF-1) 또는 라스부리카제를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
펩티드
일부 실시양태에서, 카고는 펩티드이다. 일부 경우에서, 펩티드는 자연 발생 펩티드이다. 다른 예에서, 펩티드는 인공적으로 조작된 펩티드 또는 재조합 펩티드이다. 일부 경우에서, 펩티드는 G-단백질 커플링된 수용체, 이온 채널, 미생물, 항 미생물 표적, 촉매 또는 다른 Ig 패밀리 수용체, 세포내 표적, 막 고정된 표적 또는 세포외 표적을 표적으로 한다.
일부 경우에서, 펩티드는 적어도 2개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 10개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 15개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 20개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 30개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 40개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 50개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 60개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 70개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 80개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 90개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 적어도 100개의 아미노산을 포함한다.
일부 경우에서, 펩티드는 최대 3개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 최대 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 10개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 15개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 20개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 30개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 40개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 50개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 60개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 70개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 80개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 90개의 아미노산을 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드가 최대 100개의 아미노산을 포함한다.
일부 경우에서, 펩티드는 약 1 내지 약 10 kDa를 포함한다. 일부 경우에서, 펩티드는 약 1 내지 약 9 kDa, 약 1 내지 약 6 kDa, 약 1 내지 약 5 kDa, 약 1 내지 약 4 kDa, 약 1 내지 약 3 kDa, 약 2 내지 약 8 kDa, 약 2 내지 약 6 kDa, 약 2 내지 약 4 kDa, 약 1.2 내지 약 2.8 kDa, 약 1.5 내지 약 2.5 kDa, 또는 약 1.5 내지 약 2 kDa를 포함한다.
일부 실시양태에서, 펩티드는 사이클릭 펩티드이다. 일부 예에서, 사이클릭 펩티드는 마크로사이클릭 펩티드이다. 다른 예에서, 사이클릭 펩티드는 제한된 펩티드이다. 사이클릭 펩티드는, 예컨대 헤드-대-테일, 헤드-대-측쇄, 측쇄-대-테일 및 측쇄-대-측쇄 결합과 같은 다양한 결합으로 조립된다. 일부 예에서, 사이클릭 펩티드(예컨대, 마크로사이클릭 또는 제한된 펩티드)는 분자량이 약 500 달톤 내지 약 2000 달톤이다. 다른 예에서, 사이클릭 펩티드(예컨대, 마크로사이클릭 또는 제한된 펩티드)는 약 10개 아미노산 내지 약 100개 아미노산, 약 10개 아미노산 내지 약 70개 아미노산, 또는 약 10개 아미노산 내지 약 50개 아미노산 범위이다.
일부 경우에서, 펩티드는 치료 및/또는 예방 백신 생성을 위한 항원 생성에 사용하기 위한 것이다. 예컨대, 펩티드는 바람직한 면역 반응(예컨대, 전염증 면역 반응, 항염증 면역 반응, B 세포 반응, 항체 반응, T 세포 반응, CD4+ T 세포 반응, CD8+ T 세포 반응, Th1 면역 반응, Th2 면역 반응, Th17 면역 반응, Treg 면역 반응, 또는 이들의 조합)을 유도하는 항원을 포함한다.
일부 실시양태에서, 펩티드는 천연 아미노산, 비천연 아미노산, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 예에서, 아미노산 잔기는 아미노기 및 카르복실기를 모두 함유하는 분자를 지칭한다. 적합한 아미노산은 제한 없이 자연 발생 아미노산의 D- 및 L-이성체 뿐만 아니라 유기 합성 또는 다른 대사 경로에 의해 제조되는 비-자연 발생 아미노산을 포함한다. 본원에서 사용되는 바와 같이 용어 아미노산은 제한 없이 α-아미노산, 천연 아미노산, 비-천연 아미노산, 및 아미노산 유사체를 포함한다.
일부 예에서, α-아미노산은 α-탄소로 지정된 탄소에 결합된 아미노기 및 카르복실기를 모두 함유하는 분자를 지칭한다.
일부 예에서, β-아미노산은 β 배치의 아미노기 및 카르복실기를 모두 함유하는 분자를 지칭한다.
일부 실시양태에서, 아미노산 유사체는 라세미 혼합물이다. 일부 예에서, 아미노산 유사체의 D 이성체가 사용된다. 일부 경우에서, 아미노산 유사체의 L 이성체가 사용된다. 일부 예에서, 아미노산 유사체는 R 또는 S 배치의 키랄 중심을 포함한다.
일부 실시양태에서, 예시적인 펩티드 카고는 페기네사티드, 인슐린, 부신피질자극 호르몬(ACTH), 칼시토닌, 옥시토신, 바소프레신, 옥트레올리드 및 류프로렐린을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 예시적인 펩티드 카고는 텔라반신, 달바반신, 오리타반신, 아니둘라푼진, 란레오티드, 파시레오티드, 로미뎁신, 리나클로티드 및 페기네사티드를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
항체
일부 실시양태에서, 카고는 항체 또는 이의 결합 단편이다. 일부 경우에서, 항체 또는 이의 결합 단편은 인간화 항체 또는 이의 결합 단편, 뮤린 항체 또는 이의 결합 단편, 키메라 항체 또는 이의 결합 단편, 모노클로날 항체 또는 이의 결합 단편, 이중특이적 항체 또는 이의 결합 단편, 1가 Fab', 2가 Fab2, F(ab)'3 단편, 단일 쇄 가변 단편(scFv), 비스-scFv, (scFv)2, 디아바디, 미니바디, 나노바디, 트리아바디, 테트라바디, 디술파이드 안정화된 Fv 단백질(dsFv), 단일 도메인 항체(sdAb), Ig NAR, 낙타류 항체 또는 이의 결합 단편, 또는 이의 화학적으로 변형된 유도체를 포함한다.
일부 예에서, 항체 또는 결합 단편은 세포 표면 단백질을 인식한다. 일부 예에서, 세포 표면 단백질은 암 세포에 의해 발현되는 항원이다. 일부 예에서, 세포 표면 단백질은 네오에피토프이다. 일부 예에서, 세포 표면 단백질은 야생형 단백질과 비교하여 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 예시적인 암 항원은 알파 태아단백질, ASLG659, B7-H3, BAFF-R, 브레비칸, CA125(MUC16), CA15-3, CA19-9, 암배아 항원(CEA), CA242, CRIPTO(CR, CR1, CRGF, CRIPTO, TDGF1, 기형암종 유래된 성장 인자), CTLA-4, CXCR5, E16(LAT1, SLC7A5), FcRH2(IFGP4, IRTA4, SPAP1A(SH2 도메인 함유 포스파타제 앵커 단백질 1a), SPAP1B, SPAP1C)), 표피 성장 인자, ETBR, Fc 수용체-유사 단백질 1(FCRH1), GEDA, HLA-DOB(MHC 부류 II 분자의 베타 서브유닛(Ia 항원), 인간 융모 성선자극 호르몬, ICOS, IL-2 수용체, IL20Rα, 면역 글로불린 슈퍼패밀리 수용체 전위 관련된 2(IRTA2), L6, 루이스 Y, 루이스 X, MAGE-1, MAGE-2, MAGE-3, MAGE 4, MART1, 메소텔린, MDP, MPF(SMR, MSLN), MCP1(CCL2), 대식구 억제 인자(MIF), MPG, MSG783, 뮤신, MUC1-KLH, Napi3b(SLC34A2), 넥틴-4, Neu 온코진 산물, NCA, 태반 알칼리성 포스파타제, 전립선 특이적 막 항원(PMSA), 전립선 산 포스파타제, PSCA hlg , 항-트랜스페린 수용체, p97, 퓨린성 수용체 P2X 리간드 게이팅된 이온 채널 5(P2X5), LY64(림프구 항원 64(RP105), gp100, P21, 전립선의 6개의 막횡단 상피 항원(STEAP1), STEAP2, Sema 5b, 종양 관련된 당단백질 72(TAG-72), TrpM4(BR22450, FLJ20041, TRPM4, TRPM4B, 일시적 수용체 전위 양이온 채널, 서브패밀리 M, 멤버 4) 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 세포 표면 단백질은 분화 클러스터(CD) 세포 표면 마커를 포함한다. 예시적인 CD 세포 표면 마커는 CD1, CD2, CD3, CD4, CD5, CD6, CD7, CD8, CD9, CD10, CD11a, CD11b, CD11c, CD11d, CDw12, CD13, CD14, CD15, CD15s, CD16, CDw17, CD18, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD26, CD27, CD28, CD29, CD30, CD31, CD32, CD33, CD34, CD35, CD36, CD37, CD38, CD39, CD40, CD41, CD42, CD43, CD44, CD45, CD45RO, CD45RA, CD45RB, CD46, CD47, CD48, CD49a, CD49b, CD49c, CD49d, CD49e, CD49f, CD50, CD51, CD52, CD53, CD54, CD55, CD56, CD57, CD58, CD59, CDw60, CD61, CD62E, CD62L(L-셀렉틴), CD62P, CD63, CD64, CD65, CD66a, CD66b, CD66c, CD66d, CD66e, CD71, CD79(예컨대, CD79a, CD79b), CD90, CD95(Fas), CD103, CD104, CD125(IL5RA), CD134(OX40), CD137(4-1BB), CD152(CTLA-4), CD221, CD274, CD279(PD-1), CD319(SLAMF7), CD326(EpCAM) 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, 예시적인 항체 또는 이의 결합 단편은 잘루투무맙(HuMax-EFGr, Genmab), 아바고보맙(Menarini), 아비투주맙(Merck), 아데카투무맙(MT201), 알라시주맙 페골, 알레투주맙(Campath®, 맙캄파쓰, 또는 캄파쓰-1H; 류코시트), 알로무네(BioTransplant), 아마툭시맙(Morphotek, Inc.), 항-VEGF(Genetech), 아나투모맙 마페나톡스, 아폴리주맙(hu1D10), 아스크린바쿠맙(Pfizer Inc.), 아테졸리주맙(MPDL3280A; Genentech/Roche), B43.13(오바렉스, AltaRex Corporation), 바실릭시맙(Simulect®, Novartis), 벨리무맙(Benlysta®, GlaxoSmithKline), 베바시주맙(Avastin®, Genentech), 블리나투모맙(블린시토, AMG103; Amgen), BEC2(ImGlone Systems Inc.), 카를루맙(Janssen Biotech), 카투막소맙(Removab, Trion Pharma), CEAcide(Immunomedics), 세툭시맙(Erbitux®, ImClone), 시타투주맙 보가톡스(VB6-845), 시툭투무맙(IMC-A12, ImClone Systems Inc.), 코나투무맙(AMG 655, Amgen), 다세투주맙(SGN-40, huS2C6; Seattle Genetics, Inc.), 다라투무맙(Darzalex®, Janssen Biotech), 데투모맙, 드로지투맙(Genentech), 두르발루맙(MedImmune), 두시기투맙(MedImmune), 에드레콜로맙(MAb17-1A, 파노렉스, Glaxo Wellcome), 엘로투주맙(EmplicitiTM, Bristol-Myers Squibb), 에미베투주맙(Eli Lilly), 에나바투주맙(Facet Biotech Corp.), 엔포르투맙 보도틴(Seattle Genetics, Inc.), 에노블리투주맙(MGA271, MacroGenics, Inc.), 엔시툭수맙(Neogenix Oncology, Inc.), 에프라투주맙(림포시드, Immunomedics, Inc.), 에르투막소맙(Rexomun®, Trion Pharma), 에타라시주맙(아베그린, MedImmune), 파를레투주맙(MORAb-003, Morphotek, Inc), FBTA05(림포문, Trion Pharma), 피클라투주맙(AVEO Pharmaceuticals), 피기투무맙(CP-751871, Pfizer), 플란보투맙(ImClone Systems), 프레솔리무맙(GC1008, Aanofi-Aventis), 푸툭시맙, 글락시맙, 가니투맙(Amgen), 기렌툭시맙(Rencarex®, Wilex AG), IMAB362(클라우딕시맙, Ganymed Pharmaceuticals AG), 이말루맙(Baxalta), IMC-1C11(ImClone Systems), IMC-C225(Imclone Systems Inc.), 임가투주맙(Genentech/Roche), 인테투무맙(Centocor, Inc.), 이필리무맙(Yervoy®, Bristol-Myers Squibb), 이라투무맙(Medarex, Inc.), 이사툭시맙(SAR650984, Sanofi-Aventis), 라베투주맙(CEA-CIDE, Immunomedics), 렉사투무맙(ETR2-ST01, Cambridge Antibody Technology), 린투주맙(SGN-33, Seattle Genetics), 루카투무맙(Novartis), 루밀릭시맙, 마파투무맙(HGS-ETR1, Human Genome Sciences), 마투주맙(EMD 72000, Merck), 밀라투주맙(hLL1, Immunomedics, Inc.), 미투모맙(BEC-2, ImClone Systems), 나르나투맙(ImClone Systems), 네시투무맙(PortrazzaTM, Eli Lilly), 네스바쿠맙(Regeneron Pharmaceuticals), 니모투주맙(h-R3, BIOMAb EGFR, TheraCIM, 테랄록, 또는 CIMAher; Biotech Pharmaceutical Co.), 니볼루맙(Opdivo®, Bristol-Myers Squibb), 오비누투주맙(가지바 또는 가지바로; Hoffmann-La Roche), 오카라투주맙(AME-133v, LY2469298; Mentrik Biotech, LLC), 오파투무맙(Arzerra®, Genmab), 오나르투주맙(Genentech), 온툭시주맙(Morphotek, Inc.), 오레고보맙(오바렉스®, AltaRex Corp.), 오틀레르투주맙(Emergent BioSolutions), 파니투무맙(ABX-EGF, Amgen), 판코맙(Glycotope GMBH), 파르사투주맙(Genentech), 파트리투맙, 펨브롤리주맙(Keytruda®, Merck), 펨투모맙(테라긴, Antisoma), 페르투주맙(페르제타, Genentech), 피딜리주맙(CT-011, Medivation), 폴라투주맙 보도틴(Genentech/Roche), 프리투무맙, 라코투모맙(Vaxira®, Recombio), 라무시루맙(Cyramza®, ImClone Systems Inc.), 리툭시맙(Rituxan®, Genentech), 로바투무맙(Schering-Plough), 세리반투맙(Sanofi/Merrimack Pharmaceuticals, Inc.), 시브로투주맙, 실툭시맙(SylvantTM, Janssen Biotech), 스마트 MI95(Protein Design Labs, Inc.), 스마트 ID10(Protein Design Labs, Inc.), 타발루맙(LY2127399, Eli Lilly), 타플리투모맙 팝톡스, 테나투모맙, 테프로투무맙(Roche), 테툴로맙, TGN1412(CD28-SuperMAB 또는 TAB08), 티가투주맙(CD-1008, Daiichi Sankyo), 토시투모맙, 트라스투주맙(Herceptin®), 트레멜리무맙(CP-672,206; Pfizer), 투코투주맙 셀몰류킨(EMD Pharmaceuticals), 우블리툭시맙, 우렐루맙(BMS-663513, Bristol-Myers Squibb), 볼로식시맙(M200, Biogen Idec), 및 자툭시맙을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 항체 또는 이의 결합 단편은 항체-약물 접합체(ADC)이다. 일부 경우에서, ADC의 페이로드는, 예컨대 아우리스타틴 유도체, 메이탄신, 메이탄시노이드, 탁산, 칼리케아미신, 세마도틴, 두오카르마이신, 피롤로벤조디아제핀(PDB) 또는 투불리신을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 예에서, 페이로드는 모노 메틸 아우리스타틴 E(MMAE) 또는 모노메틸 아우리스타틴 F(MMAF)를 포함한다. 일부 예에서, 페이로드는 DM2(메르탄신) 또는 DM4를 포함한다. 일부 예에서, 페이로드는 피롤로벤조디아제핀 이량체를 포함한다.
추가의 카고
일부 실시양태에서, 카고는 펩티드모방체이다. 펩티드모방체는 펩티드를 모방하도록 설계된 작은 단백질-유사 중합체이다. 일부 예에서, 펩티드모방체에는 D- 펩티드를 포함한다. 다른 예에서, 펩티드모방체는 L-펩티드를 포함한다. 예시적인 펩티드모방체는 펩토이드 및 β-펩티드를 포함한다.
일부 실시양태에서, 카고는 뉴클레오티드모방체이다.
벡터 및 발현 시스템
특정 실시양태에서, 상술된 Arc 폴리펩티드, endo-Gag 폴리펩티드, 조작된 Arc 및 조작된 endo-Gag 폴리펩티드는 플라스미드 벡터에 의해 코딩된다. 일부 실시양태에서, 벡터는 진핵 또는 원핵 공급원으로부터 유래된 임의의 적합한 벡터를 포함한다. 일부 경우에서, 벡터는 박테리아(예컨대, 이. 콜라이(E. coli)), 곤충, 효모(예컨대, 피키아 파스토리스(Pichia pastoris)), 조류, 또는 포유동물 공급원으로부터 수득된다.
예시적인 박테리아 벡터는 pACYC177, pASK75, pBAD 벡터 시리즈, pBADM 벡터 시리즈, pET 벡터 시리즈, pETM 벡터 시리즈, pGEX 벡터 시리즈, pHAT, pHAT2, pMal-c2, pMal-p2, pQE 벡터 시리즈, pRSET A, pRSET B, pRSET C, pTrcHis2 series, pZA31-Luc, pZE21-MCS-1, pFLAG ATS, pFLAG CTS, pFLAG MAC, pFLAG Shift-12c, pTAC-MAT-1, pFLAG CTC, 또는 pTAC-MAT-2를 포함한다.
예시적인 곤충 벡터는 pFastBac1, pFastBac DUAL, pFastBac ET, pFastBac HTa, pFastBac HTb, pFastBac HTc, pFastBac M30a, pFastBact M30b, pFastBac, M30c, pVL1392, pVL1393, pVL1393 M10, pVL1393 M11, pVL1393 M12, FLAG 벡터, 예컨대 pPolh-FLAG1 또는 pPolh-MAT 2, 또는 MAT 벡터, 예컨대 pPolh-MAT1, 또는 pPolh-MAT2를 포함한다.
일부 경우에서, 효모 벡터는 Gateway® pDESTTM 14 벡터, Gateway® pDESTTM 15 벡터, Gateway® pDESTTM 17 벡터, Gateway® pDESTTM 24 벡터, Gateway® pYES-DEST52 벡터, pBAD-DEST49 Gateway® 목표 벡터, pAO815 피키아 벡터, pFLD1 피키 파스토리스(Pichi pastoris) 벡터, pGAPZA,B, & C 피키아 파스토리스 벡터, pPIC3.5K 피키아 벡터, pPIC6 A, B, & C 피키아 벡터, pPIC9K 피키아 벡터, pTEF1/Zeo, pYES2 효모 벡터, pYES2/CT 효모 벡터, pYES2/NT A, B, & C 효모 벡터, 또는 pYES3/CT 효모 벡터를 포함한다.
예시적인 조류 벡터는 pChlamy-4 벡터 또는 MCS 벡터를 포함한다.
포유동물 벡터의 예는 일시적 발현 벡터 또는 안정한 발현 벡터를 포함한다. 포유동물 일시적 발현 벡터는 p3xFLAG-CMV 8, pFLAG-Myc-CMV 19, pFLAG-Myc-CMV 23, pFLAG-CMV 2, pFLAG-CMV 6a,b,c, pFLAG-CMV 5.1, pFLAG-CMV 5a,b,c, p3xFLAG-CMV 7.1, pFLAG-CMV 20, p3xFLAG-Myc-CMV 24, pCMV-FLAG-MAT1, pCMV-FLAG-MAT2, pBICEP-CMV 3, 또는 pBICEP-CMV 4를 포함한다. 포유동물 안정한 발현 벡터는 pFLAG-CMV 3, p3xFLAG-CMV 9, p3xFLAG-CMV 13, pFLAG-Myc-CMV 21, p3xFLAG-Myc-CMV 25, pFLAG-CMV 4, p3xFLAG-CMV 10, p3xFLAG-CMV 14, pFLAG-Myc-CMV 22, p3xFLAG-Myc-CMV 26, pBICEP-CMV 1, 또는 pBICEP-CMV 2를 포함한다.
일부 예에서, 무세포 시스템은 세포로부터의 세포질 및/또는 핵 성분의 혼합물이며 시험관내 핵산 합성에 사용된다. 일부 경우에서, 무세포 시스템은 원핵 세포 성분 또는 진핵 세포 성분을 사용한다. 때때로, 핵산 합성은, 예컨대 드로소필라 세포, 제노푸스 난자, 또는 HeLa 세포(ATCC® CCL-2™)를 기반으로 하는 무세포 시스템에서 수득된다. 예시적인 무세포 시스템은 이. 콜라이 S30 추출물 시스템, 이. 콜라이 T7 S30 시스템, 또는 PURExpress®를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
숙주 세포
일부 실시양태에서, 숙주 세포는 천연 유래 세포 또는 유전자조작으로 변형된 세포와 같은 임의의 적합한 세포를 포함한다. 일부 예에서, 숙주 세포는 생성 숙주 세포이다. 일부 예에서, 숙주 세포는 진핵 세포이다. 다른 예에서 숙주 세포는 원핵 세포이다. 일부 경우에서, 진핵 세포는 진균(예컨대, 효모 세포), 동물 세포, 또는 식물 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 원핵 세포가 박테리아 세포이다. 박테리아 세포의 예는 그람 양성 박테리아 또는 그람 음성 박테리아를 포함한다. 일부 실시양태에서 그람 음성 박테리아는 혐기성, 막대형, 또는 둘 다이다.
일부 경우에서, 그람 양성 박테리아는 악티노박테리아(Actinobacteria), 피르미쿠테스(Firmicutes), 또는 테네리쿠테스(Tenericutes)를 포함한다. 일부 경우에서, 그람 음성 박테리아는 아퀴피카에(Aquificae), 데이노코쿠스-페르무스(Deinococcus-Thermus), 피브로박테레스-클로로비/박테로이데테스(Fibrobacteres-Chlorobi/Bacteroidetes)(FCB군), 푸소박테리아(Fusobacteria), 겜마티모나데테스(Gemmatimonadetes), 니트로스피라에(Nitrospirae), 플란크토미세테스-베루코미크로비아/클라미디아에(Planctomycetes-Verrucomicrobia/Chlamydiae)(PVC군), 프로테오박테리아(Proteobacteria), 스피로카에테스(Spirochaetes) 또는 시네르기스테테스(Synergistetes). 일부 실시양태에서, 박테리아는 아시도박테리아(Acidobacteria), 클로로플렉시(Chloroflexi), 크리시오게네테스(Chrysiogenetes), 시아노박테리아(Cyanobacteria), 데페리박테레스(Deferribacteres), 딕티오글로미(Dictyoglomi), 테르모데술포박테리아(Thermodesulfobacteria) 또는 테르모토가에(Thermotogae)를 포함한다. 일부 실시양태에서, 박테리아 세포는 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli), 클로스트리디움 보툴리눔(Clostridium botulinum) 또는 콜라이 바실리(Coli bacilli)이다.
예시적인 원핵 숙주 세포는 BL21, Mach1TM, DH10BTM, TOP10, DH5α, DH10BacTM, OmniMaxTM, MegaXTM, DH12STM, INV110, TOP10F', INVαF, TOP10/P3, ccdB 서바이벌(Survival), PIR1, PIR2, Stbl2TM, Stbl3TM, 또는 Stbl4TM을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 동물 세포는 척추동물 또는 무척추동물로부터의 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 동물 세포는 해양 무척추동물, 어류, 곤충, 양서류, 파충류, 포유동물, 또는 인간으로부터의 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 진균 세포는 맥주 효모, 빵 효모 또는 와인 효모와 같은 효모 세포를 포함한다.
진균은 효모, 몰드(mold), 사상균, 담자균 또는 접합균과 같은 자낭균을 포함한다. 일부 예에서, 효모는 아스코미코타(Ascomycota) 또는 바시디오미코타(Basidiomycota)를 포함한다. 일부 경우에서, 아스코미코타는 사카로미코티나(Saccharomycotina)(진정한 효모, 예컨대 사카로미세스 세레비시아에(빵 효모)) 또는 타프리노미코티나(Taphrinomycotina)(예컨대, 쉬조사카로미세테스(Schizosaccharomycetes)(분열 효모))를 포함한다. 일부 경우에서, 바시디오미코타(Basidiomycota)는 아가리코미코티나(Agaricomycotina)(예컨대, 트레멜로미세테스(Tremellomycetes)) 또는 푸시니오미코티나(Pucciniomycotina)(예컨대, 미크로보트리요미세테스(Microbotryomycetes))를 포함한다.
예시적 효모 또는 사상균은, 예컨대 사카로미세스, 쉬조사카로미세스, 칸디다, 피키아, 한세눌라(Hansenula), 클루이베로미세스(Kluyveromyces), 지고사카로미세스(Zygosaccharomyces), 야로위아(Yarrowia), 트리코스포론(Trichosporon), 로도스포리디(Rhodosporidi), 아스페르길루스(Aspergillus), 푸사리움(Fusarium), 또는 트리코데르마(Trichoderma) 속을 포함한다. 예시적 효모 또는 사상균은, 예컨대 사카로미세스 세레비시아에, 쉬조사카로미세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 칸디다 우틸리스(Candida utilis), 칸디다 보이디니(Candida boidini), 칸디다 알비카스(Candida albicans), 칸디다 트로피칼리스(Candida tropicalis), 칸디다 스텔라토이데아(Candida stellatoidea), 칸디다 글라블라타(Candida glabrata), 칸디다 크루세이(Candida krusei), 칸디다 파라프실로시스(Candida parapsilosis), 칸디다 구일리에르몬디이(Candida guilliermondii), 칸디다 비스와나티이(Candida viswanathii), 칸디다 루시타니아에(Candida lusitaniae), 로도토룰라 무실라기노사(Rhodotorula mucilaginosa), 피키아 메타놀리카(Pichia metanolica), 피키아 안구스타(Pnichia angusta), 피키아 파스토리스(Pichia pastoris), 피키아 아노말라(Pichia anomala), 한세눌라 폴리모르파(Hansenula polymorpha), 클루이베로미세스 락티스(Kluyveromyces lactis), 지고사카로미세스 로욱시이(Zygosaccharomyces rouxii), 야로위아 리폴리티카(Yarrowia lipolytica), 트리코스포론 풀루란스(Trichosporon pullulans), 로도스로리디움 토루-아스페르길루스 니거(Rhodosporidium toru-Aspergillus niger), 아스페르길루스 니둘란스(Aspergillus nidulans), 아스페르길루스 아와모리(Aspergillus awamori), 아스페르길루스 오리자에(Aspergillus oryzae), 트리코데르마 레세이(Trichoderma reesei), 야로위아 리폴리티카(Yarrowia lipolytica), 브레타노미세스 브룩셀렌시스(Brettanomyces bruxellensis), 칸디다 스텔라타(Candida stellata), 쉬조사카로미세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 토룰라스포라 델브루엑키이(Torulaspora delbrueckii), 지고사카로미세스 바일리이(Zygosaccharomyces bailii), 크립토코쿠스 네오포르만스(Cryptococcus neoformans), 크립토코쿠스 가티이(Cryptococcus gattii), 또는 사카로미세스 보울라르디이(Saccharomyces boulardii) 종을 포함한다.
예시적인 효모 숙주 세포는 GS115, KM71H, SMD1168, SMD1168H 및 X-33과 같은 피키아 파스토리스 효모 균주; 및 INVSc1과 같은 사카로미세스 세레비시아에 효모 균주를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 추가의 동물 세포는 연체동물, 절지동물, 환형동물 또는 해면동물로부터 수득되는 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 추가의 동물 세포는 포유동물 세포, 예컨대 인간, 영장류, 유인원, 말, 소, 돼지, 개, 고양이 또는 설치류로부터의 세포이다. 일부 경우에서, 설치류는 마우스, 래트, 햄스터, 게르빌, 햄스터, 친칠라, 팬시 래트 또는 기니피그를 포함한다.
예시적인 포유동물 숙주 세포는 293A 세포주, 293FT 세포주, 293F 세포 , 293 H 세포, CHO DG44 세포, CHO-S 세포, CHO-K1 세포, Expi293FTM 세포, Flp-InTM T-RExTM 293 세포주, Flp-InTM-293 세포주, Flp-InTM-3T3 세포주, Flp-InTM-BHK 세포주, Flp-InTM-CHO 세포주, Flp-InTM-CV-1 세포주, Flp-InTM-Jurkat 세포주, FreeStyleTM 293-F 세포, FreeStyleTM CHO-S 세포, GripTiteTM 293 MSR 세포주, GS-CHO 세포주, HepaRGTM 세포, T-RExTM Jurkat 세포주, Per.C6 세포, T-RExTM-293 세포주, T-RExTM-CHO 세포주, 및 T-RExTM-HeLa 세포주를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 포유동물 숙주 세포는 1차 세포이다. 일부 예에서, 포유동물 숙주 세포는 안정한 세포주, 또는 관심 유전 물질을 자체 게놈에 통합하고 여러 세대의 세포 분열 후에 유전 물질의 산물을 발현할 수 있는 능력을 가진 세포주이다. 일부 경우에서, 포유동물 숙주 세포는 일시적 세포주, 또는 관심 유전 물질을 자체 게놈에 통합하지 않고 여러 세대의 세포 분열 후에 유전 물질의 산물을 발현할 능력이 없는 세포주이다.
예시적인 곤충 숙주 세포는 드로소필라 S2 세포, Sf9 세포, Sf21 세포, High Five™ 세포 및 expresSF+® 세포를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 예에서, 식물 세포는 조류로부터의 세포를 포함한다. 예시적인 곤충 세포주는 클라미도모나스 레이하르드티이(Chlamydomonas reinhardtii), 또는 시네코코쿠스 엘론가투스 PPC 7942(Synechococcus elongatus PPC 7942)로부터의 스트레인을 포함한다.
사용 방법
특정 실시양태에서, 카고를 캡슐화하는 캡시드를 제조하는 방법이 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 방법은 복수의 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드, 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드, 및/또는 재조합 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 로딩된 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 생성하기에 충부한 시간 동안 용액에서 카고와 함께 인큐베이션하는 단계를 포함한다.
일부 예에서, 방법은 카고와 함께 인큐베이션하기 전에 복수의 조작된 및/또는 재조합 Arc 폴리펩티드를 포함하는 용액을 복수의 비-Arc 캡시드 형성 서브유닛과 혼합하는 단계를 포함한다. 일부 경우에서, 복수의 비-Arc 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 조작된 및/또는 재조합 Arc 폴리펩티드와 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 또는 10:1의 비로 혼합된다. 다른 경우에서, 복수의 비-Arc 캡시드 형성 서브유닛은 복수의 조작된 및/또는 재조합 Arc 폴리펩티드와 1:2, 1:3, 1:4, 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 또는 1:10의 비로 혼합된다.
일부 경우에서, 로딩된 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 생성하기에 충분한 시간은 적어도 약 5분, 적어도 약 10분, 적어도 약 20분, 적어도 약 30분, 적어도 약 1시간, 적어도 약 2시간, 적어도 약 4시간, 적어도 약 6시간, 적어도 약 10시간, 적어도 약 12시간, 적어도 약 24시간, 또는 그 초과이다.
일부 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 약 2℃ 내지 약 37℃의 온도에서 제조된다. 일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 약 2℃ 내지 약 8℃, 약 2℃ 내지 약 4℃, 약 20℃ 내지 약 37℃, 약 25℃ 내지 약 37℃, 약 20℃ 내지 약 30℃, 약 25℃ 내지 약 30℃, 또는 약 30℃ 내지 약 37℃의 온도에서 제조된다.
일부 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 실온에서 제조된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 전신 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 국소 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 비경구(예컨대, 동맥내, 관절내, 피내, 병변내, 근육내, 안내, 골내 주입, 복강내, 척추강내, 정맥내, 유리체내, 또는 피하) 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 국부 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 경구 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 설하 투여용으로 추가로 제제화된다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 에어로졸 투여용으로 추가로 제제화된다.
특정 실시양태에서, 또한 관심 부위로 카고를 전달하기 위한 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드의 용도가 본원에 기재된다. 일부 예에서, 방법은 관심 부위의 세포를 캡시드의 세포 흡수를 촉진하기에 충분한 시간 동안 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드와 접촉시키는 단계를 포함한다.
일부 경우에서, 세포는 근육 세포, 피부 세포, 혈액 세포, 또는 면역 세포(예컨대, T 세포 또는 B 세포)이다.
일부 예에서, 세포는 종양 세포, 예컨대 고형 종양 세포 또는 혈액 악성종양으로부터의 세포이다. 일부 경우에서, 고형 종양 세포는 방광암, 유방암, 뇌암, 결장직장암, 신장암, 간암, 폐암, 췌장암, 전립선암, 피부암, 위암, 또는 갑상선암으로부터의 세포이다. 일부 경우에서, 혈액 악성종양으로부터의 세포는 B 세포 악성종양 또는 T 세포 악성종양으로부터의 것이다. 일부 경우에서, 세포는 백혈병, 림프종, 골수종, 만성 림프구성 백혈병(CLL), 소 림프구성 림프종(SLL), 미만성 거대 B 세포 림프종(DLBCL), 소포 림프종, 맨틀 세포 림프종, 버킷 림프종, 피부 T 세포 림프종, 말초 T 세포 림프종, 다발성 골수종, 형질세포종, 급성 림프아구성 백혈병(ALL), 급성 골수성 백혈병(AML) 또는 만성 골수성 백혈병(CML)으로부터의 것이다.
일부 실시양태에서, 세포는 체세포이다. 일부 예에서, 세포는 혈액 세포, 피부 세포, 결합 조직 세포, 뼈 세포, 근육 세포, 또는 기관으로부터의 세포이다.
일부 실시양태에서, 세포는 상피 세포, 결합 조직 세포, 근육 세포, 또는 뉴런이다.
일부 예에서, 세포는 내배엽 세포, 중배엽 세포, 또는 외배엽이다. 일부 예에서, 내배엽은 호흡기, 장, 간, 담낭, 췌장, 랑게르한스섬, 갑상선 또는 후장의 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 중배엽은 골연골전구세포, 근육 세포, 소화계로부터의 세포, 신장 줄기 세포, 생식계로부터의 세포, 순환계로부터의 세포(예컨대, 내피 세포)를 포함한다. 외배엽으로부터의 예시적인 세포는 상피 세포, 뇌하수체 전엽 세포, 말초 신경계 세포, 신경내분비계 세포, 눈 세포, 중추 신경계 세포, 뇌실막 세포, 또는 송과체 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 중추 및 말초 신경계로부터 유래되는 세포는 뉴런, 슈반 세포, 위성 아교 세포, 희돌기아교세포 또는 성상 세포를 포함한다. 일부 경우에서, 뉴런은 인터뉴런, 피라미드 뉴런, 가바성(gabaergic) 뉴런, 도파민성 뉴런, 세로토닌성 뉴런, 글루타메이트성 뉴런, 척수로부터의 운동 뉴런, 또는 억제성 척수 뉴런을 추가로 포함한다.
일부 실시양태에서, 세포는 줄기 세포 또는 전구 세포이다. 일부 경우에서, 세포가 중간엽 줄기 또는 전구 세포이다. 다른 경우에서, 세포는 조혈 줄기 또는 전구 세포이다.
일부 경우에서, 표적 단백질은 세포에서 과발현되거나 세포에서 고갈된다. 일부 경우에서, 표적 단백질은 세포에서 과발현된다. 추가의 경우에서, 표적 단백질은 세포에서 고갈된다.
일부 경우에서, 세포의 표적 유전자는 하나 이상의 돌연변이를 갖는다.
일부 경우에서, 세포는 손상된 스플라이싱 메커니즘을 포함한다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 전신 투여된다.
다른 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 국소적으로 투여된다.
일부 실시양태에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 비경구적으로, 경구적으로, 국부적으로, 설하를 통해, 또는 에어로졸에 의해 투여된다. 일부 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 비경구적으로 투여된다. 다른 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 경구적으로 투여된다. 추가의 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 이를 필요로 하는 대상체에게 국부적으로, 설하를 통해, 또는 에어로졸에 의해 투여된다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 관심 부위로의 표적 전달을 위해 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드와 조합된다. 일부 예에서, 전달 성분은 담체, 예컨대 미셀, 리포솜, 또는 미세소포와 같은 세포외 소포; 또는 바이러스 외피를 포함한다.
일부 예에서, 전달 성분은 자체 전달 성분을 포함하지 않는(예컨대, 제2 폴리펩티드가 존재하지 않는) Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드에 대한 1차 전달 비히클의 역할을 한다. 이러한 경우에서, 전달 성분은 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 관심 표적 부위로 유도하고 임의적으로 세포내 흡수를 촉진한다.
다른 예에서, 전달 성분은 Arc 기반 캡시드의 제2 폴리펩티드의 표적 특이성 및/또는 민감도를 향상시킨다. 이러한 경우에서, 전달 성분은 표적 부위에 대한 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드의 특이성 및/또는 친화성을 향상시킨다. 추가의 경우에서, 전달 성분은 특이성 및/또는 친화성을 약 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배, 20배, 30배, 50배, 100배, 200배, 500배, 또는 그 초과로 향상시킨다. 추가의 경우에서, 전달 성분은 특이성 및/또는 친화성을 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 200%, 500%, 또는 그 초과로 향상시킨다. 또한, 전달 성분은 임의적으로 표적외 효과를 약 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배, 20배, 30배, 50배, 100배, 200배, 500배, 또는 그 초과로 감소시킨다. 또한, 전달 성분은 임의적으로 표적외 효과를 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 200%, 500%, 또는 그 초과로 감소시킨다.
추가의 예에서, 전달 성분은 Arc 기반 캡시드를 일반적인 표적 영역(예컨대, 종양 미세환경)으로 수송하는 제1 비히클의 역할을 하고 Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드의 제2 폴리펩티드는 Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드를 특정 표적 부위로 유도하고 임의적으로 세포내 흡수를 촉진하는 제2 전달 분자의 역할을 한다. 이러한 경우에서, 전달 성분은 표적외 효과를 약 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배, 20배, 30배, 50배, 100배, 200배, 500배, 또는 그 초과로 감소시킨다. 이러한 경우에서, 전달 성분은 표적외 효과를 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 200%, 500%, 또는 그 초과로 감소시킨다.
추가의 예에서, 전달 성분은 Arc 기반 캡시드를 관심 표적 부위로 수송하는 제1 비히클의 역할을 하고, Arc 기반 또는 endo-Gag 기반 캡시드의 제2 폴리펩티드는 세포내 흡수를 촉진하는 제2 전달 분자의 역할을 한다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 세포외 소포를 포함한다. 일부 예에서, 세포외 소포는 미세소포, 리포솜 또는 미셀을 포함한다. 일부 예에서, 세포외 소포는 약 10 nm 내지 약 2000 nm, 약 10 nm 내지 약 1000 nm, 약 10 nm 내지 약 800 nm, 약 20 nm 내지 약 600 nm, 약 30 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 80 nm 내지 약 100 nm의 직경을 갖는다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 미세소포를 포함한다. 순환하는 미세소포 또는 미세입자로도 알려진 미세소포는 인지질을 포함하는 막 결합된 소포이다. 일부 예에서, 미세소포는 약 50 nm 내지 약 1000 nm, 약 100 nm 내지 약 800 nm, 약 200 nm 내지 약 500 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 400 nm의 직경을 갖는다.
일부 예에서, 미세소포는 세포막 역전, 세포외배출, 흘림(shedding), 블레빙(blebbing), 또는 출아(budding)로부터 유래된다. 일부 경우에서, 미세소포는 분화된 세포로부터 생성된다. 다른 예에서, 미세소포는 미분화된 세포로부터, 예컨대 모세포, 전구 세포 또는 줄기 세포에 의해 생성된다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 리포솜을 포함한다. 일부 예에서, 리포솜은 관심 부위 또는 영역으로의 표적 전달을 위해 리포솜의 표면에 존재하는 복수의 리포펩티드를 포함한다. 일부 경우에서, 리포솜이 표적 세포와 융합되어 리포솜의 내용물이 표적 세포로 비워진다. 일부 경우에서, 리포솜이 식세포성 세포에 의해 세포내이입된다. 세포내이입은 리소좀 지질의 리소좀내 분해 및 캡슐화된 작용제의 방출로 이어진다.
통합에 적합한 예시적인 리포솜은 다층 소포(MLV), 올리고층 소포(OLV), 단층 소포(UV), 작은 단층 소포(SUV), 중간 크기 단층 소포(MUV), 큰(large) 단층 소포(LUV), 거대(giant) 단층 소포(GUV), 다낭(multivesicular) 소포(MVV), 역상 증발법으로 제조된 단일 또는 올리고층 소포(REV), 역상 증발법으로 제조된 다층 소포(MLV-REV), 안정한 다수층(plurilamellar) 소포(SPLV), 냉동 및 해동된 MLV(FATMLV), 압출 방법으로 제조된 소포(VET), 프렌치 프레스에 의해 제조된 소포(FPV), 융합에 의해 제조된 소포(FUV), 탈수-재수화 소포(DRV), 및 버블솜(BSV)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 예에서, 리포솜은 알피폴(Amphipol)(A8-35)을 포함한다. 리포솜 제조 기술은, 예컨대 문헌(COLLOIDAL DRUG DELIVERY SYSTEMS, vol. 66 (J. Kreuter ed., Marcel Dekker, Inc. (1994)))에 기재되어 있다.
제조 방법에 따라, 리포솜은 단층 또는 다층이고, 직경이 약 20 nm부터 약 1000 nm 초과로 크기가 다양하다.
일부 예에서, 본원에 제공된 리포솜은 또한 담체 지질을 포함한다. 일부 실시양태에서, 담체 지질은 인지질이다. 리포솜을 형성할 수 있는 담체 지질은 디팔미토일포스파티딜콜린(DPPC), 포스파티딜콜린(PC; 레시틴), 포스파티드산(PA), 포스파티딜글리세롤(PG), 포스파티딜에탄올아민(PE), 또는 포스파티딜세린(PS)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 다른 적합한 인지질은 추가로 디스테아로일포스파티딜콜린(DSPC), 디미리스토일포스파티딜콜린(DMPC), 디팔미토일포스파티딜글리세롤(DPPG), 디스테아로일포스파티딜글리세롤(DSPG), 디미리스토일포스파티딜글리세롤(DMPCG); 디미리스토일포스파티드산(DMPA), 디스테아로일포스파티드산(DSPA), 디팔미토일포스파티딜세린(DPSP), 디미리스토일포스파티딜세린(ASD), 디스테아로일포스파티딜세린(DSPS), 디팔미토일포스파티딜에탄올아민(DPPE), 디미리스토일포스파티딜에탄올아민(DMPE), 디스테아로일포스파티틸에탄올아민(DSPE) 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일부 실시양태에서, 리포솜은 리포솜 형성을 조정하는 스테롤(예컨대, 콜레스테롤)을 추가로 포함한다. 담체 지질은 임의적으로 비-포스페이트 극성 지질이다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 미셀을 포함한다. 일부 예에서, 미셀은 약 2 nm 내지 약 250 nm, 약 20 nm 내지 약 200 nm, 약 20 nm 내지 약 100 nm, 또는 약 50 내지 약 100 nm의 직경을 갖는다.
일부 경우에서, 미셀은 소수성 코어가 친수성 쉘로 둘러싸여진 코어 쉘 구조를 특징으로 하는 중합체 미셀이다. 일부 경우에서, 친수성 쉘은 친수성 중합체 또는 공중합체 및 pH 민감성 성분을 추가로 포함한다.
예시적인 친수성 중합체 또는 공중합체는 폴리(N-치환된 아크릴아미드), 폴리(N-아크릴로일 피롤리딘), 폴리(N-아크릴로일 피페리딘), 폴리(N-아크릴-L-아미노산 아미드), 폴리(에틸 옥사졸린), 메틸셀룰로스, 히드록시프로필 아크릴레이트, 히드록시알킬 셀룰로스 유도체 및 폴리(비닐 알콜), 폴리(N-이소프로필 아크릴아미드), 폴리(N-비닐-2-피롤리돈), 폴리에틸렌글리콜 유도체, 및 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
pH 민감성 모이어티는 알킬아크릴산, 예컨대 메타크릴산, 에틸아크릴산, 프로필 아크릴산 및 부틸 아크릴산과 같은 알킬 아크릴산, 또는 아미노산, 예컨대 글루탐산을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 경우에서, 소수성 모이어티는 미셀의 코어를 구성하고, 예컨대 옥타 데실 아크릴레이트와 같은 단일 알킬 쇄 또는 포스파티딜에탄올아민 또는 디옥타데실아민과 같은 이중 쇄 알킬 화합물을 포함한다. 일부 경우에서, 소수성 모이어티는 임의적으로 폴리(락트산) 또는 폴리(e-카프롤락톤)와 같은 수불용성 중합체이다.
pH 민감성을 나타내는 중합체성 미셀도 고려되며, 예컨대 메타크릴산, 메타크릴산 에스테르 및 아크릴산 에스테르, 폴리비닐 아세테이트 프탈레이트, 히드록시프로필 메틸 셀룰로스 프탈레이트, 셀룰로스 아세테이트 프탈레이트, 또는 셀룰로스 아세테이트 트리멜리테이트로부터의 공중합체를 포함하지만 이에 제한되지 않는 pH-민감성 중합체를 사용하여 형성된다.
일부 실시양태에서, 전달 성분은 바이러스 외피를 포함한다. 바이러스 외피는 당단백질, 인지질, 및 숙주로부터 수득되는 추가의 단백질을 포함한다. 일부 예에서, 바이러스 외피는 광범위한 표적 세포에 대해 허용된다. 다른 경우에서, 바이러스 외피는 허용되지 않으며 관심 표적 세포에 특이적이다. 일부 경우에서, 바이러스 외피는 세포-특이적 결합 단백질 및 임의적으로 표적 세포로의 카고의 융합을 돕는 융합형성 분자를 포함한다. 일부 경우에서, 바이러스 외피는 내인성 바이러스 외피를 포함한다. 다른 경우에서, 바이러스 외피는 하나 이상의 외래 단백질을 포함하는 변형된 외피이다.
일부 예에서, 바이러스 외피는 DNA 바이러스로부터 유래된다. 예시적인 외피 DNA 바이러스는 헤르페스비리다에(Herpesviridae), 폭스비리다에(Poxviridae), 및 헤파드나비리다에(Hepadnavirdae) 과로부터의 바이러스를 포함한다.
다른 경우에서, 바이러스 외피는 RNA 바이러스로부터 유래된다. 예시적인 외피 RNA 바이러스는 부냐비리다에(Bunyaviridae), 코로나비리다에(Coronaviridae), 필로비리다에(Filoviridae), 플라비비리다에(Flaviviridae), 오르토믹소비리다에(Orthomyxoviridae), 파라믹소비리다에(Paramyxoviridae), 라브도비리다에(Rhabdoviridae) 및 토가비리다에(Togaviridae) 과로부터의 바이러스를 포함한다.
추가의 예에서, 바이러스 외피는 레트로비리다에(Retroviridae) 과로부터의 바이러스로부터 유래된다.
일부 실시양태에서, 바이러스 외피는 종양용해성 바이러스, 예컨대 헤르페스비리다에(Herpesviridae)(예컨대, HSV1) 또는 폭스비리다에(Poxviridae)(예컨대, 박시니아 바이러스 및 믹소마 바이러스) 과로부터의 종양용해성 DNA 바이러스; 또는 라브도비리다에(Rhabdoviridae)(예컨대, VSV) 또는 파라믹소비리다에(Paramyxoviridae)(예컨대, MV 및 NDV) 과로부터의 종양용해성 RNA 바이러스로부터의 것이다.
일부 예에서, 바이러스 외피는 항원 또는 세포 표면 분자에 결합하는 외래 또는 조작된 단백질을 추가로 포함한다. 표적화를 위한 예시적인 항원 및 세포 표면 분자는 P-당단백질, Her2/Neu, 에리트로포이에틴(EPO), 표피 성장 인자 수용체(EGFR), 혈관 내피 성장 인자 수용체(VEGF-R), 카드헤린, 암배아 항원(CEA), CD4. CD8, CD19. CD20, CD33, CD34, CD45, CD117(c-kit), CD133, HLA-A. HLA-B, HLA-C, 케모카인 수용체 5(CCRS), 줄기 세포 마커 ABCG2 수송체, 난소암 항원 CA125, 면역글로불린, 인테그린, 전립선 특이적 항원(PSA), 전립선 줄기 세포 항원(PSCA), 수지상 세포 특이적 세포간 부착 분자 3-그래빙 비-인테그린(DC-SIGN), 티로글로불린, 과립구-대식구 콜로니 자극 인자(GM-CSF), 근원성 분화 촉진 인자-1(MyoD-1), Leu-7(CD57), LeuM-1, 모노클로날 항체 Ki-67(Ki-67)에 의해 정의되는 세포 증식 관련된 인간 핵 항원, 바이러스 외피 단백질, HIV gp120 또는 트랜스페린 수용체를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
일부 실시양태에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 시험관 내 사용을 위한 것이다.
일부 예에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 생체외 사용을 위한 것이다.
일부 경우에서, Arc 기반 캡시드 또는 endo-Gag 기반 캡시드는 생체내 사용을 위한 것이다.
키트/제조 물품
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 하나 이상의 방법과 함께 사용하기 위한 키트 및 제조 물품이 본원에 개시된다. 이러한 키트는 바이알, 튜브 등과 같은 하나 이상의 용기를 수용하도록 구획화된 캐리어, 패키지 또는 용기를 포함하며, 각각의 용기(들)는 본원에 기재된 방법에 사용되는 개별 요소 중 하나를 포함한다. 적합한 용기는, 예컨대 병, 바이알, 주사기 및 시험관을 포함한다. 일 실시양태에서, 용기는 유리 또는 플라스틱과 같은 다양한 물질로부터 형성된다.
예컨대, 용기(들)는 상술된 재조합 또는 조작된 Arc 또는 endo-Gag 폴리펩티드를 포함한다. 이러한 키트는 임의적으로 본원에 기재된 방법에서의 사용과 관련된 식별 설명 또는 라벨 또는 지침을 포함한다. 예컨대, 키트는 전형적으로 내용물이 나열된 라벨 및/또는 사용 지침, 및 사용 지침을 갖는 패키지 삽입물을 포함한다. 전형적으로 지침 세트도 포함될 것이다.
특정 용어
달리 정의되지 않는 한, 본원 사용된 모든 기술 및 과학 용어는 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 상세한 설명은 단지 예시적이고 설명적인 것이며 청구된 임의의 주제를 제한하지 않는다는 것을 이해해야 한다. 본 출원에서, 단수의 사용은 특별히 달리 언급되지 않는 한 복수를 포함한다. 명세서에서 사용되는 바와 같이, 단수 형태는 문맥이 달리 명확하게 지시하지 않는 한 복수 지시 대상을 포함한다는 점에 유의해야 한다. 본 출원에서 "또는"의 사용은 달리 명시되지 않는 한 "및/또는"을 의미한다. 또한, 용어 "포함하는" 뿐만 아니라 "포함한다" 및 "포함되는"과 같은 다른 형태의 사용은 제한적이지 않다.
본 발명의 다양한 특징이 단일 실시양태의 맥락에서 설명될 수 있지만, 특징은 또한 개별적으로 또는 임의의 적절한 조합으로 제공될 수 있다. 반대로, 본 발명은 명확성을 위해 별도의 실시양태의 맥락에서 본원에서 설명될 수 있지만, 본 발명은 또한 단일 실시양태로 구현될 수 있다.
본 명세서에서 "일부 실시양태", "일 실시양태", "한 실시양태" 또는 "다른 실시양태"에 대한 언급은, 실시양태와 관련하여 설명된 특정 특징, 구조 또는 특성이 본 발명의 적어도 일부 실시양태에 포함되며 반드시 모든 실시양태에 필요한 것은 아니라는 것을 의미한다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 범위 및 양은 "약" 특정 값 또는 범위로 표현될 수 있다. 약은 또한 정확한 양을 포함한다. 따라서, "약 5 μL"는 "약 5 μL" 및 "5 μL"을 의미한다. 일반적으로, 용어 "약"은 실험 오차 내에 있을 것으로 예상되는 양을 포함한다.
본원에 사용된 섹션 제목은 조직화 목적으로만 사용되며 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되어서는 안된다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 본원에 기재된 CA N-로브의 서열은 인간 CA N-로브에 상응한다. 일부 예에서, 인간 CA N-로브는 서열번호 1의 잔기 207-278을 포함한다. 일부 예에서, 본원에 기재된 CA N-로브는 서열번호 1의 잔기 207-278과 약 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 서열 동일성을 포함한다. 일부 경우에서, 본원에 기재된 CA N-로브는 인간 CA N-로브와 구조적 유사성을 공유한다. 예컨대, 본원에 기재된 CA N-로브는 인간 CA N-로브와 약 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 구조적 유사성을 공유한다. 일부 경우에서, CA N-로브는 높은 구조적 유사성(예컨대, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 구조적 유사성)을 공유하지만 높은 서열 동일성은 공유하지 않는다(예컨대, 서열 동일성은 80% 미만, 70% 미만, 60% 미만, 50% 미만, 40% 미만 또는 30% 미만임). 일부 경우에서, CA N-로브는 서열번호 1의 잔기 207-278을 포함한다.
본원에서 사용되는 바와 같이, 본원에 기재된 CA C-로브의 서열은 인간 CA C-로브에 상응한다. 일부 예에서, 인간 CA C-로브는 서열번호 1의 잔기 278-370을 포함한다. 일부 예에서, 본원에 기재된 CA C-로브는 서열번호 1의 잔기 278-370과 약 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 서열 동일성을 포함한다. 일부 경우에서, 본원에 기재된 CA C-로브는 인간 CA C-로브와 구조적 유사성을 공유한다. 예컨대, 본원에 기재된 CA C-로브는 인간 CA C-로브와 약 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 구조적 유사성을 공유한다. 일부 경우에서, CA C-로브는 높은 구조적 유사성(예컨대, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% 98% 또는 99% 구조적 유사성)을 공유하지만 높은 서열 동일성은 공유하지 않는다(예컨대, 서열 동일성은 80% 미만, 70% 미만, 60% 미만, 50% 미만, 40% 미만 또는 30% 미만임). 일부 경우에서, CA C-로브는 서열번호 1의 잔기 278-370을 포함한다.
본원에 사용된 용어 "개체(들)", "대상체(들)" 및 "환자(들)"는 임의의 포유동물을 의미한다. 일부 실시양태에서, 포유동물은 인간이다. 일부 실시양태에서, 포유동물은 비-인간이다. 어떠한 용어도 의료 종사자(예컨대, 의사, 등록 간호사, 임상 간호사, 의사 보조원, 잡역부 또는 호스피스 작업자)의 감독(예컨대, 지속적 또는 간헐적)에 의해 특징지어지는 상황에 요구되거나 이에 제한되지 않는다.
실시예
이들 실시예는 예시 목적으로만 제공되며 본원에 제공된 청구범위의 범위를 제한하지 않는다.
실시예 1 - 재조합 Arc 단백질 및 조작된 Arc 단백질을 코딩하는 DNA 벡터의 구축
Arc 발현을 위한 재조합 DNA 벡터를 구축하기 위해, 개시 메티오닌을 제외한 전장 cDNA 오픈 리딩 프레임을 클로닝 벡터에 삽입한 후 표준 방법에 따라 발현 벡터에 전달한다. endo-Gag 단백질을 발현하기 위한 재조합 DNA 벡터를 구축하는 데에도 동일한 접근법이 이용된다. 인간 Arc cDNA는 주석이 달린 매트릭스 도메인(MA) 및 캡시드 도메인을 포함한다. 캡시드 도메인은 N-말단 로브(NTD) 및 C-말단 로브(CTD)를 갖는다. 도 1은 인간 Arc 단백질의 구조 및 비단뱀, 오리너구리 및 오르카(Orca)의 예측되는 Arc 구조를 예시한다.
조작된 Arc 단백질을 코딩하는 cDNA는 임의적으로 상이한 종으로부터의 Arc 서열을 재조합함으로써(도 2), 다른 단백질로부터의 기능 도메인을 Arc 단백질에 삽입함으로써(도 3a), Arc 단백질의 서열을 변형함으로써(도 3b), 및/또는 도 2-3에 예시된 접근법의 임의의 조합에 의해 생성된다. 조작된 endo-Gag 단백질을 코딩하는 cDNA도 마찬가지로 상이한 종으로부터의 endo-Gag 서열을 재조합함으로써, 다른 단백질로부터의 기능 도메인을 endo-Gag 단백질에 삽입함으로써, endo-Gag 단백질의 서열을 변형함으로써, 및/또는 이들 접근법의 임의의 조합에 의해 생성된다. 또한, 조작된 endo-Gag 단백질은 임의적으로 Arc 서열을 함유하고 조작된 Arc 단백질은 임의적으로 endo-Gag 서열을 함유한다. 조작된 Arc 및 endo-Gag 단백질 단량체는 캡시드로 조립된다.
표 1의 Arc 및 endo-Gag 단백질을 코딩하는 cDNA를 pET-41 a(+)(EMD Millipore (Novagen) Cat# 70566) 로부터 유래되는 발현 벡터에 삽입하였다. pET-41 a (+)의 전체 클로닝 부위를 제거하고, 서열번호 58의 아미노산 서열을 갖는 대안적 N-말단 태그를 코딩하는 서열번호 57의 뉴클레오티드 서열을 갖고 6xHis 태그(서열번호 59), 6개 아미노산 스페이서(서열번호 60), 및 AcTEV™ 절단 부위(서열번호 61)를 포함하는 DNA로 대체하였다. 시작 메티오닌 코돈이 없는 Arc 및 endo-Gag 오픈 리딩 프레임을 깁슨(Gibson) 조립에 의해 AcTEV™ 절단 부위 뒤에 삽입하였다(Gibson DG, Young L, Chuang RY, Venter JC, Hutchison CA 3rd, Smith HO (2009). "Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases". Nature Methods. 6 (5): 343-345). 발현 및 AcTEV™ 절단 후, 생성된 Arc 또는 endo-Gag 단백질의 N-말단은 AcTEV™ 절단 부위로부터 단일 잔기 글리신을 갖는다.
서열번호 57
Figure pct00001
서열번호 58
Figure pct00002
서열번호 59
Figure pct00003
서열번호 60
Figure pct00004
서열번호 61
Figure pct00005
Figure pct00006
Figure pct00007
실시예 2 - Arc 및 endo-Gag 단백질의 발현 및 정제
Arc 및 endo-Gag 오픈 리딩 프레임을 포함하는 발현 벡터 구축물을 Rosetta 2 (DE3)pLysS 이. 콜라이 균주(Millipore Sigma, Cat# 71403)로 형질전환시켰다. Arc 또는 endo-Gag 발현을 0.1mM IPTG로 유도된 후 16℃에서 16시간 인큐베이션하였다. 세포 펠렛을 20mM 인산나트륨 pH 7.4, 0.1M NaCl, 40mM 이미다졸, 1mM DTT, 및 10% 글리세롤에서 초음파 처리에 의해 용해시켰다. 용해물을 과량의 TURBO DNase(Thermo Fisher Scientific, Cat# AM2238), RNase 칵테일(Thermo Fisher Scientific, Cat# AM2286) 및 벤조나제 뉴클레아제(Millipore Sigma, Cat# 71205)로 처리하여 핵산을 제거하였다. NaCl 농도를 0.5M로 조정하기 위해 NaCl을 용해물에 첨가한 다음 원심분리 및 여과하여 세포 파편을 제거하였다. 6xHis 태그부착된 재조합 단백질을 HisTrap HP 컬럼(GE Healthcare, Cat# 17-5247-01)에 로딩하고, 버퍼 A(20mM 인산나트륨 pH 7.4, 0.5M NaCl, 40mM 이미다졸 및 10% 글리세롤)로 세척하고, 버퍼 B의 선형 구배(20mM 인산나트륨 pH 7.4, 0.5M NaCl, 500mM 이미다졸, 및 10% 글리세롤)로 용출하였다. 수집 튜브에 용출물 1ml당 10μl의 0.5M EDTA pH 8.0을 미리 보충하였다. 생성된 Arc 또는 endo-Gag 단백질은 SDS-PAGE 분석에 의해 나타나는 바와 같이 일반적으로 95% 초과로 순수하며, 1L의 박테리아 배양물당 최대 50mg의 수율을 갖는다(도 4a).
모노 Q 5/50 GL 컬럼(GE Healthcare, Cat# 17516601)에서 음이온 교환 크로마토그래피로 잔류 핵산을 제거하였다. 컬럼에 로딩하기 전에, 재조합 단백질을 제조업자의 프로토콜에 따라 "피어스(Pierce) 단백질 농축기 PES, 10K MWCO, 5-20 ml"(Thermo Scientific, Cat#88528)를 사용하여 버퍼 C(20 mM Tris-HCl pH 8.0, 100 mM NaCl, 및 10% 글리세롤)로 버퍼 교환하였다. 로딩 후, 모노 Q 수지를 2ml의 버퍼 C로 세척하였다. Arc 및 endo-Gag 단백질을 버퍼 D의 선형 구배(20mM Tris-HCl pH 8.0, 500mM NaCl 및 10% 글리세롤)를 사용하여 용출하였다. RNA는 Arc로부터 효율적으로 분리되고 600mM NaCl에서 용출되었다(도 4b).
N-말단 6xHis 태그 및 스페이서를 10kDa MWCO PES 농축기를 사용하여 모노 Q 정제된 Arc의 농축 피크 분획으로부터 제거한 다음 10% v/v의 AcTEV™ 프로테아제(Invitrogen™ #12575023)로 처리하였다. 절단 효율은 SDS-PAGE 검정에 의해 나타나는 바와 같이 99% 초과이다. 이어서, 단백질을 HisTrap 버퍼 A로 희석하고 HisTrap HP 수지로 세척한다. 생성된 정제된 Arc는 N-말단 글리신 잔기를 가지며 개시 메티오닌을 함유하지 않는다.
실시예 3 - 캡시드 조립
절단된 Arc 단백질(1mg/mL)을 20kDa MWCO 투석 카세트에 로딩하고 실온에서 1M 인산나트륨(pH 7.5)에서 밤새 투석하였다. 다음날, 용액을 카세트로부터 꺼내고 마이크로원심분리기 튜브로 옮기고 탁상용 원심분리기에서 5분 동안 최대 속도로 회전시켰다. 상청액을 100kDa MWCO 재생 셀룰로스 아미콘 한외여과 원심 농축기로 옮겼다. 버퍼를 PBS pH 7.5로 교환하고 부피를 20배 감소시켰다.
캡시드 조립을 투과 전자 현미경으로 검정하였다. EM 그리드(탄소 지지 필름, 사각 그리드, 400 메쉬 5-6 nm, 구리, CF400-Cu-UL)는 글로 방전에 의해 제조되었다. 정제된 Arc의 5 μL 샘플을 20초 동안 그리드에 적용한 다음 여과지를 사용하여 빨아들였다. 이어서, 그리드를 MilliQ H2O로 세척하고 H2O 중의 1% 우라닐 아세테이트 5μL로 30초 동안 염색한 다음 1분 동안 공기 건조시켰다. Arc 캡시드의 이미지를 가탄(Gatan) 4k x 4k 원뷰(OneView) 카메라가 장착된 FEI Talos L120C TEM을 사용하여 획득하였다. 도 5는 농축된 인간 Arc 캡시드를 도시한다. 도 6은 다른 척추동물 종으로부터 재조합적으로 발현된 Arc 동원체로부터 형성된 캡시드를 도시한다. 도 7은 다른 척추동물 종으로부터 재조합적으로 발현된 endo-Gag 유전자로부터 형성된 캡시드를 도시한다.
실시예 4 - Arc 캡시드의 선택적 세포 내재화
단리된 재조합 인간 Arc 단백질(0.5mg/ml)로부터 조립된 캡시드를 PBS(pH 8.5) 중의 NHS 에스테르 Alexa Fluor™ 594-NHS 염료(Invitrogen™ #A20004)(DMSO에 용해됨) 50몰 과량과 반응시켜 형광 표지하였다. 어둠 속에서 2시간 동안 반응을 진행시켰다. Alexa594 표지된 캡시드를 PBS(pH 7.5)로 밤새 어둠 속에서 실온에서 적어도 2회의 버퍼 교환과 함께 투석하여 임의의 표지되지 않은 염료를 제거하였다.
HeLa 세포(ATCC® CCL-2™)를 실험 24시간 전에 96 웰 플레이트에 시딩하여 처리를 위해 ~80% 합류에 도달하였다. 이어서, 표지된 캡시드를 0.05mg/ml의 최종 캡시드 농도로 완전한 조직 배양 배지에 스파이킹하였다. 처리를 37℃에서 4시간 동안 진행된 다음, 이미징 전에 10ug/ml 훽스트(Hoechst) 핵 염료를 함유하는 이미징 배지(DMEM, 페놀 레드 없음, 10% FBS 및 20mM HEPES 포함)로 세포를 3회 세척한다. 형광 현미경 검사에서 점상 염색 패턴을 나타내었으며, 이는 Arc 캡시드가 HeLa 세포에 의해 내재화되었음을 시사한다(도 8). 동일한 조건 하에 Alexa Fluor™ 594 표지된 소 혈청 알부민(BSA)(최종 농도 0.05 mg/ml) 또는 45.6 μM Alexa Fluor™ 594를 투여한 후 세포내 염색이 거의 또는 전혀 관찰되지 않았다.
실시예 5 - Arc 캡시드에 의한 이종 RNA 전달
(1M 인산나트륨으로의 투석에 의한) 캡시드 형성 동안 과량의 RNA에서 스파이킹함으로써 인간 Arc 캡시드에 Cre RNA를 로딩하였다. Cre RNA 로딩된 캡시드를 37℃에서 4시간 동안 0.05 mg/ml의 최종 캡시드 농도로 생물학적 삼중으로 HeLa 세포에 투여하였다. 이어서, RNA 추출 전에 세포를 얼음 냉각된 1xPBS로 3회 세척하였다(Invitrogen™ TRIzol™ 시약 # 15596026). 정제된 세포 관련된 RNA를 qPCR에 의해 기술적 삼중으로 정량화하고, 값을 세포 GAPDH 수준으로 정규화하고, 단백질 정제로부터 이어질 수 있는 에쉐리키아 콜라이 rrsA mRNA 및 Arc RNA와 비교하였다. 표 2는 PCR 반응에 사용된 프라이머를 나타낸다. 검출된 세포 관련된 Cre RNA의 양은 Arc 캡시드에 Cre RNA를 로딩한 경우 Cre RNA가 로딩되지 않은 대조군 캡시드와 비교하여 >27배 더 높았다(도 9).
Figure pct00008
도 10은 Arc 또는 endo-Gag 캡시드에 의한 이종 RNA의 전달을 입증하는 대안적인 방법을 예시한다. 6xHis-태그부착된 Arc 또는 endo-Gag 유전자를 숙주 세포에서 발현시킨다. 생성된 Arc 단량체를 캡시드 형성 조건 하에서 번역 가능한 Cre mRNA와 혼합하여 Cre mRNA 로딩된 캡시드를 형성한다. Cre 로딩된 캡시드를 LoxP-루시페라제 리포터 마우스에 투여한다. Cre mRNA가 마우스 세포에 성공적으로 전달되고 Cre 리컴비나제 단백질이 후속 번역되면 리포터의 LoxP 부위가 재조합되어 임의적으로 루시페린 투여 시 생물발광 이미징에 의해 검출되는 루시페라제 발현이 유도된다. 이 방법은 후보 Arc 및 endo-Gag 유전자의 전달 가능성을 시험하는 데 이용된다. 양성 루시퍼라제 신호는 후보 Arc 또는 endo-Gag 유전자가 이종 카고를 통합하고 그 카고를 표적 세포에 전달하는 캡시드로 조립할 수 있는 Arc 또는 endo-Gag 단백질을 코딩함을 나타낸다.
본 발명의 바람직한 실시양태가 본원에 제시되고 설명되었지만, 이러한 실시양태는 단지 예로서 제공된다는 것이 당업자에게 명백할 것이다. 이제 본 발명을 벗어나지 않고 다양한 변형, 변화 및 대체가 당업자에게 떠오를 것이다. 본원에 기재된 본 발명의 실시양태에 대한 다양한 대안이 본 발명을 실시하는 데 사용될 수 있음을 이해해야 한다. 하기의 청구범위는 본 발명의 범위를 정의하고, 이들 청구범위 내의 방법 및 구조 및 그 균등물이 이에 의해 커버되는 것으로 의도된다.
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SEQUENCE LISTING <110> VNV NEWCO INC. <120> ARC-BASED CAPSIDS AND USES THEREOF <130> 54838-702.601 <140> PCT/US2019/051786 <141> 2019-09-18 <150> 62/733,015 <151> 2018-09-18 <160> 85 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 396 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Gly Glu Leu Asp His Arg Thr Ser Gly Gly Leu His Ala Tyr Pro Gly 1 5 10 15 Pro Arg Gly Gly Gln Val Ala Lys Pro Asn Val Ile Leu Gln Ile Gly 20 25 30 Lys Cys Arg Ala Glu Met Leu Glu His Val Arg Arg Thr His Arg His 35 40 45 Leu Leu Ala Glu Val Ser Lys Gln Val Glu Arg Glu Leu Lys Gly Leu 50 55 60 His Arg Ser Val Gly Lys Leu Glu Ser Asn Leu Asp Gly Tyr Val Pro 65 70 75 80 Thr Ser Asp Ser Gln Arg Trp Lys Lys Ser Ile Lys Ala Cys Leu Cys 85 90 95 Arg Cys Gln Glu Thr Ile Ala Asn Leu Glu Arg Trp Val Lys Arg Glu 100 105 110 Met His Val Trp Arg Glu Val Phe Tyr Arg Leu Glu Arg Trp Ala Asp 115 120 125 Arg Leu Glu Ser Thr Gly Gly Lys Tyr Pro Val Gly Ser Glu Ser Ala 130 135 140 Arg His Thr Val Ser Val Gly Val Gly Gly Pro Glu Ser Tyr Cys His 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cgtggccagt gaccggaccc agcccgag 1188 <210> 30 <211> 1188 <212> DNA <213> Orcinus orca <400> 30 ggggaattgg atcaacgtac taccggtggc cttcacgcat accctgcacc acgcgggggc 60 cctgtcgcga agccaaatgt catcctgcag attgggaagt gccgggctga gatgctggag 120 cacgtccgtc ggacgcatcg tcatcttctt actgaggtgt caaaacaggt ggagcgtgaa 180 ctcaaaggct tgcaccgcag cgttgggaaa cttgaaagca acttagatgg ctatgtgccg 240 actggcgaca gccagcgttg gcgtaagtcc atcaaagcat gtttgtgtcg ttgccaggaa 300 acgattgcaa acctggagcg ttgggtcaaa cgggagatgc atgtctggcg tgaagtattt 360 tatcgtttag agcgttgggc cgatcgttta gagagcatgg gtggtaagta ccctgtgggg 420 agcaaccctt ctcggcatac gacgtcagtc ggtgttggcg ggccggagtc ctacggtcat 480 gaagcggaca cctacgacta taccgtaagc ccttatgcta ttaccccacc acctgcggcc 540 ggcgaattac ctggccagga agccgttgag gctcaacaat accctccttg ggggctgggc 600 gaggatggtc aacctagccc aggggtagac acgcaaatct ttgaggaccc acgggagttt 660 ctttcccacc tggaagaata cctgcgtcag gttggtggga gcgaagaata ctggctgtca 720 caaattcaaa accatatgaa tggtcctgca aaaaaatggt gggaatataa acagggttcc 780 gtgaaaaact gggttgagtt taaaaaggag tttcttcaat attccgaggg cgccctcagt 840 cgggaggcgg tccaacgcga gttggacttg ccacagaaac agggggaacc actcgatcaa 900 ttcctttggc ggaaacgtga cctttaccag acattgtacg tggatgcaga tgaggaagaa 960 attatccaat atgttgtggg gaccctgcag ccgaaactga aacgtttcct tcgcccgccg 1020 ctgcctaaaa cgttggaaca acttattcag aaaggtatgg aggtcgagga tggcttagaa 1080 caagtcgcag agccggcctc gccacacttg cctacagagg aggaatcgga ggcgctgacc 1140 ccagcactta catcagagtc agtggcatca gaccggacac aaccagag 1188 <210> 31 <211> 1170 <212> DNA <213> Odocoileus virginianus texanus <400> 31 ggggagttag atcaccgtac aacggggggg ttgcacgcat accctgctcc acgtggcggg 60 ccggcagcta agccaaacgt aatcctgcag attgggaagt gccgggcaga gatgttggag 120 cacgtccggc ggacccaccg gcacctcctg gctgaagtgt ctaaacaagt agaacgggaa 180 ctcaaaggtc ttcatcgtag cgtcgggaaa ttggaatcga atttggacgg gtatgttcct 240 acaggcgact cacagcggtg gaaaaagagc atcaaggcct gcctgagtcg ctgccaggag 300 acgattgcta acctcgaacg ctgggttaag cgggagatgc acgtttggcg cgaagtcttc 360 taccggctgg 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<400> 32 ggggaattag accgcctgaa cccaagctca ggcctgcatc catcctctgg tttgcatcca 60 tacccaggtc tccggggcgg ggcaaccgcg aagcctaatg tcattttgca aattggcaaa 120 tgccgtgcgg aaatgcttga acacgtccgc aaaactcacc gtcatctcct cacagaagta 180 tcgcgccaag tagaacgcga gctcaaaggc cttcacaaaa gtgttggcaa gttggaatca 240 aatcttgatg ggtacgtacc gtcaagcgac tcccaacgct ggaagaaaag cattaaggcg 300 tgcttatccc gttgccaaga gacgattgcg catttagaac gctgggttaa acgtgaaatg 360 aatgtatggc gtgaggtgtt ctaccgtttg gaacgttggg cggaccgtct ggaggctatg 420 ggcggtaagt atcctgccgg tgagcaggcc cggcgtacag tttcagtggg cgttgggggc 480 cctgagacat gttgtccagg ggatgaaagt tatgattgtc cgatttctcc gtatgcagtt 540 ccaccttcca ccggcgagtc tccggaatcc ttagaccaag gggatcagca ctatcagcag 600 tggtttgccc tcccggagga gtcccctgtt agccctgggg ttgataccca gatctttgaa 660 gatcctcgcg agtttttacg tcatctggag aagtacctga aacaagtcgg cgggacagag 720 gaagactggc tttctcaaat ccagaatcac atgaatgggc cggcgaagaa gtggtgggag 780 tacaagcaag ggagtgttaa gaattggctt gaatttaaga aggaattttt acagtattcg 840 gagggcacac 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ggcgttgccg tcaacaaggt cctcggattc cgatttgggc agcggccaac 60 tatgccaacg cccacccgtg gcaacaaatg gataaggctt cgccaggcgt tgcttacaca 120 cctttggttg atccttggat tgagcggcct tgttgcggtg acacggtttg tgtgcgcacc 180 acaatggaac agaagagcac agcgtcaggc acttgtggtg gtaagcctgc tgagcgtggt 240 cctctcgcgg ggcatatgcc gagctcacgc ccacatcggg ttgatttctg ttgggttcct 300 ggtagcgacc caggcacatt cgacggcagt ccatggctct tagatcgctt tttggcgcaa 360 cttggtgatt acatgagttt tcactttgaa cactaccagg acaatatcag ccgtgtctgc 420 gagattcttc gtcggttaac gggccgcgct caggcatggg ctgctcctta cctggacggg 480 gaccttccac tgccagacga ctacgaattg ttttgtcaag accttaagga ggtagtacag 540 gaccctaaca gtttcgccga gtatcacgcc gtggtgactt gtccactccc tcttgcttcg 600 tcccaacttc ctgtagctcc tcagcttccg gtggtacgcc aataccttgc gcgcttcttg 660 gagggccttg ctttggatat gggtacggcg cctcggtcac tcccggccgc tatggccaca 720 ccggcagtct ccggctcgaa ctccgtttct cgttctgcct tatttgaaca acaactcaca 780 aaggaatcca ctccaggccc gaaagagcca cctgttctcc ctagctcgac ttgctctagc 840 aaaccgggtc ctgtcgaacc agccagttca caacctgaag aggctgctcc taccccggtg 900 ccgcgtttgt cagagtcggc taacccaccg gctcagcgtc cagaccctgc tcaccctggt 960 ggtcctaaac cacaaaaaac cgaagaggaa gttttagaaa ctgaggggga ccaggaagtt 1020 agcctgggga cgccgcagga ggtcgtagaa gcgccggaaa caccaggtga accaccgctc 1080 agccctgggt tc 1092 <210> 53 <211> 438 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 53 ggggttgatg aattggtgct cttgttgcac gcgctgttaa tgcgccatcg ggcgctttcc 60 attgaaaatt ctcagttgat ggagcaactt cgcttgttgg tctgcgaacg ggcgagcctt 120 cttcgtcagg tacgtccgcc gagctgtcca gtgccatttc ctgagacttt taacggggag 180 tcatcacggt tacctgagtt catcgtccaa accgcaagct atatgttagt taatgaaaat 240 cgcttttgca atgacgcaat gaaagtcgct tttttgatta gccttcttac tggtgaagca 300 gaagaatggg tcgtcccata cattgagatg gattcaccaa ttcttgggga ctaccgtgcg 360 ttcttggatg agatgaagca gtgttttggg tgggacgatg atgaagatga cgacgatgag 420 gaagaggagg atgactat 438 <210> 54 <211> 1647 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 54 gggcctgtgg atttaggtca ggctttgggg ttgttgccat ccctcgctaa ggccgaagat 60 tcccaattta gcgaaagcga tgcagcttta caggaggaat tgtcttctcc ggaaaccgca 120 cggcaacttt ttcgtcaatt tcgctatcaa gtcatgtcgg ggcctcatga aacactgaaa 180 cagttacgga agttatgttt tcagtggctg caacctgaag tccatacaaa ggaacaaatc 240 ctcgaaattc tgatgctgga acagttcttg accattctgc ctggtgaaat tcagatgtgg 300 gtccgcaagc agtgccctgg tagtggggag gaggcggtta cgttagtaga atccctgaaa 360 ggtgatccac aacggctctg gcaatggatc tccatccaag tcctgggtca ggatatcctg 420 tctgagaaaa tggagtcacc ttcttgccag gtgggcgaag tggagccaca cctggaagtt 480 gtacctcagg aactggggtt agagaattca tcttcagggc cgggggaact tctttcgcac 540 atcgtgaaag aggagtctga cactgaagca gagttggcgt tagcggcatc ccagccagct 600 cgtttggaag aacggctgat tcgggatcag gaccttgggg cgtccctcct cccggcagca 660 ccgcaggagc aatggcgtca attagacagc actcaaaaag aacaatattg ggacctgatg 720 ctggagacct acggcaaaat ggtatccggc gcgggtatct cacacccgaa gtccgattta 780 acgaactcaa ttgagttcgg tgaagagttg gcaggtattt atttacatgt aaacgaaaag 840 attccgcggc ctacctgcat tggtgaccgc caagaaaacg acaaagaaaa ccttaatttg 900 gaaaaccatc gtgaccagga attattacat gccagctgcc aggcctcggg cgaagtgcca 960 tcccaggcat cgttacgtgg cttctttacc gaggacgaac ctggttgctt cggcgaaggg 1020 gagaaccttc ctgaggcact tcagaatatc caggatgagg ggactggcga acagctgagc 1080 ccgcaagaac gcattagtga aaaacagttg ggtcaacatt tgccaaatcc gcactcgggg 1140 gagatgtcga cgatgtggct tgaagaaaaa cgggagacca gccagaaagg ccaaccacgt 1200 gcaccaatgg cgcagaaatt gccaacgtgc cgcgaatgtg gcaaaacgtt ttatcgcaat 1260 agtcaactta tctttcacca acgcacacac accggtgaga catattttca atgcaccatc 1320 tgcaaaaagg cgtttctccg gtcatctgat ttcgtgaaac atcagcggac tcatactggc 1380 gaaaaacctt gtaaatgtga ctattgtggc aagggcttta gtgattttag cgggcttcgg 1440 catcacgaga agatccatac cggcgagaag ccatacaagt gtccaatctg tgagaaatct 1500 ttcatccagc gcagtaattt taaccgccac caacgggttc acaccggtga aaagccttat 1560 aaatgctcgc attgtggcaa gagcttcagc tggagctcct cgctcgataa gcatcaacgt 1620 tcacatctgg ggaagaagcc gttccaa 1647 <210> 55 <211> 1053 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 55 gggactctcc gcttacttga ggattggtgt cgggggatgg acatgaaccc acgtaaggcc 60 cttcttatcg ccgggatttc ccagtcatgt tcagtcgccg agattgaaga ggcgctccaa 120 gccgggcttg ctcctttagg cgagtatcgt ctccttgggc ggatgtttcg ccgcgatgaa 180 aatcgcaaag tagcgttggt tggtctcaca gctgaaacta gccatgcgct tgtacctaaa 240 gaaattcctg gtaaaggcgg gatctggcgg gttattttta aaccaccgga cccggacaat 300 acgtttcttt ctcgtttgaa tgagttcctc gcgggcgagg ggatgacggt gggggaactt 360 agtcgtgctc ttggtcacga aaatgggtca ttagaccctg aacagggtat gattccggaa 420 atgtgggcgc cgatgctggc acaggctctg gaggctctcc aaccggcttt acagtgcctt 480 aagtacaaga agctgcgcgt tttttcaggg cgcgagtctc cagagccggg tgaggaggaa 540 ttcggccgtt ggatgttcca taccacccag atgatcaaag cgtggcaggt gccggatgtc 600 gagaaacgcc gccggctgtt ggaatcactc cgcgggccgg cacttgacgt tattcgggtt 660 ctgaaaatta acaacccgtt aattacggta gatgaatgtt tgcaagcact tgaagaggtc 720 tttggggtga ctgacaatcc tcgggaattg caagtaaaat acttaacgac ctaccataag 780 gacgaggaga aattatcagc ctacgtactg cggctggaac cgctgctgca gaagctcgtc 840 cagcgggggg ctattgaacg ggacgctgtt aatcaggctc gcctggatca ggtaatcgct 900 ggggcggtac ataaaactat ccgccgtgag ctgaacctgc ctgaagacgg gccggcgcca 960 ggctttcttc aactcctcgt tttgattaag gattacgagg cagctgaaga ggaggaagca 1020 ttacttcagg ccattcttga agggaacttt act 1053 <210> 56 <211> 2124 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 56 gggacagaac ggcgtcgcga cgaattaagt gaagaaatta ataatcttcg tgaaaaggtt 60 atgaaacaga gtgaggaaaa caacaatctt caatcccaag tccagaaact cactgaggag 120 aatactacac tccgtgagca agttgaacct acacctgaag atgaagatga cgacattgag 180 ttgcggggcg cagcagccgc agccgcgcct ccgccgccga tcgaggagga atgcccggag 240 gatttaccgg aaaaatttga tggtaatccg gacatgttag cgccattcat ggcccagtgc 300 caaattttta tggaaaagtc tacgcgcgat tttagtgtag atcgcgtacg tgtatgtttt 360 gtgacgagca tgatgactgg tcgcgcagcc cgttgggcgt cagcgaaatt ggagcggtcg 420 cactacctga tgcataatta cccggcgttc atgatggaga tgaaacacgt gtttgaagac 480 ccgcagcggc gggaggtggc caaacgcaag atccggcggt tgcggcaggg catgggcagc 540 gtaattgatt atagtaatgc gtttcaaatg attgcgcagg atctggattg gaatgaacct 600 gctctcattg atcaatatca tgaagggctt agtgaccata ttcaagagga actctctcac 660 ctggaagtgg ctaaatctct ctccgccctt attggccaat gcattcatat tgagcgccgt 720 cttgcacgtg ctgctgccgc tcggaaaccg cgtagtccac cacgggcttt agtgctccca 780 catatcgcgt cacaccatca agtagatcct actgagccag tggggggtgc acgcatgcgc 840 ttaacccaag aagaaaagga acgtcgtcgt aagctgaatt tatgcctgta ctgcggcact 900 ggtggccatt atgccgataa ctgtcctgcc aaagccagta agtcaagccc ggctgggaaa 960 cttccaggtc ctgccgtcga gggcccttct gctaccggcc cagagattat ccgctccccg 1020 caagacgatg cgtcgtcgcc tcatctccag gtaatgctcc aaatccacct ccctggccgg 1080 cacacactct ttgtccgggc gatgattgac tctggggcgt ctggtaattt tattgatcac 1140 gagtatgttg ctcaaaatgg tatccctctc cggatcaaag actggcctat tctggttgaa 1200 gccatcgatg gccgtccgat cgcgagcggt cctgtggttc atgaaacgca tgacctcatc 1260 gttgatctgg gtgaccaccg tgaagtatta tcctttgatg tgactcagtc accgtttttt 1320 ccagttgttt tgggcgtccg ttggctttcg actcacgatc ctaacatcac gtggtcgaca 1380 cggtcgattg tcttcgattc ggaatattgt cgttatcatt gccgcatgta ttcaccaatt 1440 ccgccgtctc tcccgccgcc tgcgccgcaa cctcctctgt attacccggt ggacggttac 1500 cgtgtttacc agccagttcg ctactactac gtacaaaacg tgtacacgcc tgttgatgaa 1560 cacgtgtacc cagatcaccg cctggtcgac cctcatattg agatgatccc gggtgcgcac 1620 tcgatcccat cgggccatgt ttattccttg tctgagccag aaatggccgc cttacgggat 1680 tttgtggccc ggaatgtcaa agacggcctg attaccccga caattgcacc aaacggtgct 1740 caggtgttgc aggtgaagcg gggctggaag ttgcaagtca gctatgattg tcgtgcgcca 1800 aacaacttca ctattcagaa ccaatatcca cgtctcagca tccctaatct cgaggaccag 1860 gcacatcttg caacatatac tgaatttgta cctcagattc ctggctatca gacttatcct 1920 acgtatgctg cctacccaac atacccggta ggtttcgcat ggtacccagt aggccgggac 1980 gggcagggcc gctctttata tgttcctgtc atgattacat ggaacccgca ttggtaccgc 2040 cagcctccgg tcccacagta cccacctcct caacctccac cacctccgcc gcctcctcca 2100 ccgccacctt cttactcgac atta 2124 <210> 57 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 57 atgcatcacc atcaccatca cggctcaggg tctggtagcg aaaatctgta cttccagggg 60 <210> 58 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 58 Met His His His His His His Gly Ser Gly Ser Gly Ser Glu Asn Leu 1 5 10 15 Tyr Phe Gln Gly 20 <210> 59 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 6xHis tag <400> 59 His His His His His His 1 5 <210> 60 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 60 Gly Ser Gly Ser Gly Ser 1 5 <210> 61 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 61 Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly 1 5 <210> 62 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 62 aagctcattt cctggtatga caacga 26 <210> 63 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 63 agggtctctc tcttcctctt gtgct 25 <210> 64 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 64 gctcaacctg ggaactgcat ctgat 25 <210> 65 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 65 taatcctgtt tgctccccac gcttt 25 <210> 66 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 66 ggcccctcag ctccagtgat tc 22 <210> 67 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 67 cctgttgtca ctctcctggc tctga 25 <210> 68 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 68 gccaagacat aagaaacctc gcct 24 <210> 69 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer <400> 69 gtgaatcaac atcctccctc cgtc 24 <210> 70 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Peptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(25) <223> This sequence may encompass 1-5 "Glu Ala Ala Ala Lys" repeating units <400> 70 Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Glu 1 5 10 15 Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys 20 25 <210> 71 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Peptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(25) <223> This sequence may encompass 1-5 "Glu Ala Ala Ala Arg" repeating units <400> 71 Glu Ala Ala Ala Arg Glu Ala Ala Ala Arg Glu Ala Ala Ala Arg Glu 1 5 10 15 Ala Ala Ala Arg Glu Ala Ala Ala Arg 20 25 <210> 72 <211> 50 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Polypeptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(50) <223> This sequence may encompass 1-10 "Gly Gly Gly Gly Ser" repeating units <400> 72 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 35 40 45 Gly Ser 50 <210> 73 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Polypeptide <220> <221> MISC_FEATURE <222> (1)..(40) <223> This sequence may encompass 1-10 "Gly Gly Gly Ser" repeating units <400> 73 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 1 5 10 15 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 20 25 30 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 35 40 <210> 74 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Peptide <400> 74 Lys Glu Ser Gly Ser Val Ser Ser Glu Gln Leu Ala Gln Phe Arg Ser 1 5 10 15 Leu Asp <210> 75 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 75 Glu Gly Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr 1 5 10 <210> 76 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 76 Gly Gly Ala Ala Asn Leu Val Arg Gly Gly 1 5 10 <210> 77 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 77 Ser Gly Arg Ile Gly Phe Leu Arg Thr Ala 1 5 10 <210> 78 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 78 Ser Gly Arg Ser Ala 1 5 <210> 79 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 79 Gly Phe Leu Gly 1 <210> 80 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 80 Ala Leu Ala Leu 1 <210> 81 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic Peptide <220> <221> MOD_RES <222> (3)..(3) <223> S-ethylcysteine <400> 81 Pro Ile Cys Phe Phe 1 5 <210> 82 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <220> <221> MOD_RES <222> (3)..(3) <223> Ser or Thr <220> <221> MOD_RES <222> (4)..(4) <223> Leu or Ile <220> <221> MOD_RES <222> (5)..(5) <223> Ser or Thr <400> 82 Pro Arg Xaa Xaa Xaa 1 5 <210> 83 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 83 Asp Glu Val Asp 1 <210> 84 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 84 Gly Trp Glu His Asp Gly 1 5 <210> 85 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide <400> 85 Arg Pro Leu Ala Leu Trp Arg Ser 1 5

Claims (24)

  1. 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드 및 치료제를 포함하는 캡시드.
  2. 제1항에 있어서, 치료제가 핵산인 캡시드.
  3. 제2항에 있어서, 핵산이 RNA인 캡시드.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 재조합 Arc 폴리펩티드가 서열번호 1인 아미노산 서열 또는 서열번호 1과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 Arc 폴리펩티드인 캡시드.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 재조합 Arc 폴리펩티드가
    a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    j 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열
    을 포함하는 Arc 폴리펩티드인 캡시드.
  6. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드가 인간 내인성 Gag 폴리펩티드인 캡시드.
  7. 제6항에 있어서, 재조합 인간 내인성 Gag 폴리펩티드가
    a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열
    을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드인 캡시드.
  8. 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 포함하고, 재조합 Arc 폴리펩티드는 래트 Arc 폴리펩티드 또는 인간 Arc 폴리펩티드가 아닌, 캡시드.
  9. 제8항에 있어서, 카고(cargo)를 추가로 포함하는 캡시드.
  10. 제9항에 있어서, 카고가 핵산인 캡시드.
  11. 제10항에 있어서, 카고가 RNA인 캡시드.
  12. 제9항에 있어서, 카고가 치료제인 캡시드.
  13. 제8항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 재조합 Arc 폴리펩티드가
    a) 서열번호 2인 아미노산 서열 또는 서열번호 2와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    b) 서열번호 3인 아미노산 서열 또는 서열번호 3과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    c) 서열번호 4인 아미노산 서열 또는 서열번호 4와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    d) 서열번호 5인 아미노산 서열 또는 서열번호 5와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    e) 서열번호 6인 아미노산 서열 또는 서열번호 6과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    f) 서열번호 7인 아미노산 서열 또는 서열번호 7과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    g) 서열번호 8인 아미노산 서열 또는 서열번호 8과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    h) 서열번호 9인 아미노산 서열 또는 서열번호 9와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    i) 서열번호 10인 아미노산 서열 또는 서열번호 10과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    j) 서열번호 11인 아미노산 서열 또는 서열번호 11과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    k) 서열번호 12인 아미노산 서열 또는 서열번호 12와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    l) 서열번호 13인 아미노산 서열 또는 서열번호 13과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    m) 서열번호 14인 아미노산 서열 또는 서열번호 14와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    n) 서열번호 15인 아미노산 서열 또는 서열번호 15와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열
    을 포함하는 Arc 폴리펩티드인 캡시드.
  14. 제8항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드가
    a) 서열번호 16인 아미노산 서열 또는 서열번호 16과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    b) 서열번호 17인 아미노산 서열 또는 서열번호 17과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    c) 서열번호 18인 아미노산 서열 또는 서열번호 18과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    d) 서열번호 19인 아미노산 서열 또는 서열번호 19와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    e) 서열번호 20인 아미노산 서열 또는 서열번호 20과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열;
    f) 서열번호 21인 아미노산 서열 또는 서열번호 21과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    g) 서열번호 22인 아미노산 서열 또는 서열번호 22와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    h) 서열번호 23인 아미노산 서열 또는 서열번호 23과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    i) 서열번호 24인 아미노산 서열 또는 서열번호 24와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    j) 서열번호 25인 아미노산 서열 또는 서열번호 25와 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    k) 서열번호 26인 아미노산 서열 또는 서열번호 26과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    l) 서열번호 27인 아미노산 서열 또는 서열번호 27과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열; 또는
    m) 서열번호 28인 아미노산 서열 또는 서열번호 28과 적어도 90% 동일한 아미노산 서열
    을 포함하는 내인성 Gag 폴리펩티드인 캡시드.
  15. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항의 재조합 Arc 폴리펩티드 또는 재조합 내인성 Gag 폴리펩티드를 코딩하는 DNA를 포함하는 벡터.
  16. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항의 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하는, 카고를 세포에 전달하는 방법.
  17. 제16항에 있어서, 세포가 진핵 세포인 방법.
  18. 제16항에 있어서, 세포가 척추동물 세포인 방법.
  19. 제16항에 있어서, 세포가 포유동물 세포인 방법.
  20. 제16항에 있어서, 세포가 인간 세포인 방법.
  21. 제16항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 카고가 핵산인 방법.
  22. 제21항에 있어서, 세포가 핵산에 의해 코딩되는 유전자를 발현하는 것인 방법.
  23. 제16항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 카고가 치료제인 방법.
  24. 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항의 캡시드를 세포에 투여하는 단계를 포함하는, 핵산을 세포로 형질감염시키는 방법.
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