KR20080024234A - 사람의 오르판 g 단백질 커플링 수용체 - Google Patents

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KR20080024234A
KR20080024234A KR1020087003578A KR20087003578A KR20080024234A KR 20080024234 A KR20080024234 A KR 20080024234A KR 1020087003578 A KR1020087003578 A KR 1020087003578A KR 20087003578 A KR20087003578 A KR 20087003578A KR 20080024234 A KR20080024234 A KR 20080024234A
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아레나 파마슈티칼스, 인크.
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Abstract

본원에 개시된 발명은 막통과 수용체, 더욱 자세히는, 사람의 내생 오르판 G 단백질 커플링 수용체에 관한 것이다.
GPCRs, 오르판 G 단백질 커플링 수용체, 막통과 수용체

Description

사람의 오르판 G 단백질 커플링 수용체{Human Orphan G Protein-Coupled Receptors}
도 1a 및 1b는 본원에서 제공한 몇몇 도트 블롯 (dot-blot)을 위한 참고 "격자형 표"를 나타낸 도면 (또한, 각각 도 2a 및 2b를 참조).
도 2a 및 2b는 각각 hCHN3 및 hCHN8에서 얻은 몇몇 도트 블롯 분석의 결과를 나타낸 도면 (또한, 각각 1a 및 1b를 참조).
도 3은 hRUP3의 RT-PCR 분석 결과를 나타낸 도면.
도 4는 hRUP4의 RT-PCR 분석 결과를 나타낸 도면.
도 5는 hRUP6의 RT-PCR 분석 결과를 나타낸 도면.
본원에 개시된 발명은 막통과 수용체, 더욱 자세히는 사람의 내생 오르판(orphan) G 단백질 커플링 수용체 ("GPCRs")에 관한 것이다.
비록 사람에게는 다수의 수용체 종류가 존재하지만, 단연 가장 풍부하고 치료에 관련된 것은 G 단백질 커플링 수용체 (GPCR 또는 GPCRs) 종류로 대표된다. 사람 게놈 내에는 대략 100,000개의 유전자가 있는 것으로 추산되고, 이들 중에서 도 약 2% 또는 2,000개의 유전자가 GPCRs를 암호화하는 것으로 추산된다. GPCRs를 포함하는 수용체에서, 내생 리간드가 확인된 수용체는 "공지된" 수용체라 지칭되는 반면, 내생 리간드가 확인되지 않은 수용체는 "오르판(orphan)" 수용체라 지칭된다. GPCRs는 제약 제품의 발달에 있어서 중요한 영역이다. 100 개의 공지된 GPCRs 중 약 20 개로부터 모든 처방 의약품의 60%가 개발되었다. 이러한 우수성은 단지 의미론적인 것이 아니라, GPCRs의 경우에 특별한 것이다. 따라서, 오르판 GPCRs는 제약 산업에는 19 세기 후반의 캘리포니아주의 금광과 같은 것으로-성장, 팽창, 향상 및 발달의 기회이다.
GPCRs는 공통된 구조적 특징을 공유한다. 이들 수용체 모두는 7 개의 알파 나선을 형성하는 22 내지 24 개의 소수성 아미노산으로 된 7 개의 서열을 가지며, 알파 나선 각각은 막에 걸쳐있다 (걸쳐있는 각 나선은 숫자로 확인되며, 즉, 막통과-1 (TM-1), 막통과-2 (TM-2) 등이다). 막통과 나선들은 세포막의 외부 또는 "세포외" 쪽에서 막통과-2와 막통과-3 사이, 막통과-4 와 막통과-5 사이, 및 막통과-6 과 막통과-7 사이가 아미노산 가닥에 의해 연결되어 있다 (이들은 각각 "세포외" 구역 1, 2 및 3 (EC-1, EC-2 및 EC-3). 막통과 나선들은 또한 세포막의 내부 또는 "세포내" 쪽에서 막통과-1 과 막통과-2 사이, 막통과-3 과 막통과-4 사이 및 막통과-5와 막통과-6 사이가 아미노산 가닥에 의해 연결되어 있다 (이들은 각각 "세포내" 구역 1, 2 및 3 (IC-1, IC-2 및 IC-3)으로 지칭된다). 수용체의 "카르복시" ("C") 말단은 세포 내부의 세포내 공간에 존재하고, 수용체의 "아미노"("N") 말단은 세포외의 세포외 공간에 존재한다.
일반적으로, 내생 리간드가 수용체와 결합할 때 (흔히 수용체의 "활성화"로 지칭됨), 세포내 구역의 구조가 변화하여 세포내 구역과 세포내 "G-단백질" 사이의 커플링이 가능하게 한다. GPCRs는 G 단백질에 비해 상대적으로 "혼잡한" 것으로 보고되어 있는데, 즉, GPCR은 하나 이상의 G 단백질과 상호작용할 수 있다는 것이다. 케나킨(Kenakin, T.)의 문헌 [43 Life Sciences 1095 (1988)] 참조. 비록 다른 G 단백질이 존재하더라도, 지금까지는 Gq, Gs, Gi 및 Go가 확인된 G 단백질들이다. G 단백질과 커플링하는 내생 리간드에 의해 활성화된 GPCR은 신호 캐스캐이드 ("신호전달"로 지칭됨) 과정을 시작한다. 정상적인 환경하에서는, 신호전달은 최종적으로는 세포 활성화 또는 세포 억제라는 결과를 가져온다. 수용체의 카르복시 말단 뿐 아니라 IC-3 고리도 G 단백질과 상호작용하는 것으로 생각된다.
생리적 환경하에서는, GPCRs는 세포막에서 두 가지 다른 구조 즉, "비활성화" 상태 및 "활성화" 상태사이의 평형 상태로 존재한다. 비활성화 상태의 수용체는 세포내의 신호전달 경로에 연계되어 생물학적 반응을 나타낼 수 없다. 활성화 상태로 수용체의 구조가 변화하면 전달 경로에 연계되어 (G-단백질을 통해) 생물학적 반응을 나타내는 것이 가능하게 된다. 수용체는 내생 리간드 또는 약물과 같은 화합물에 의해 활성화 상태로 안정화될 수 있다.
<발명의 요약>
본원에 개시된 것은 사람의 내생 오르판 G 단백질 커플링 수용체이다.
과활성화된 수용체 또는 저활성화된 수용체에 기인하는 질병에서는, 치료용 약물에 기대하는 것은 각각 수용체의 활성화 상태를 감소 또는 수용체의 활성을 증가시키는 작용을 하는 화합물이고, 내생 리간드에 길항제인 약물을 필요로 하는 것은 아니다. 이는 활성화 수용체 상태의 활성을 감소 또는 증가시키는 화합물은 내생 리간드와 동일한 위치에 결합하는 것을 필요로 하는 것은 아니기 때문이다. 따라서, 본 발명의 방법에 따라 교시되는 바와 같이, 치료 화합물을 찾기 위한 어떠한 검색도 리간드 비의존적 활성화 상태에 대해 화합물을 스크리닝하는 것에서 시작하여야만 한다.
수용체에 관하여 전개하는 과학 문헌은 수용체에 대해 다양한 효과를 갖는 리간드를 지칭하는 다수의 용어를 채택하였다. 명확성 및 일관성을 위해, 하기 정의가 본원을 통해 사용될 것이다. 이 정의들이 본 용어에 대한 다른 정의와 상충될 때, 하기 정의가 이를 통제할 것이다.
본원에 사용된 아미노산 약어는 표 1에 설명되어 있다.
알라닌 ALA A
아르기닌 ARG R
아스파라긴 ASN N
아스파르트산 ASP D
시스테인 CYS C
글루탐산 GLU E
글루타민 GLN Q
글리신 GLY G
히스티딘 HIS H
이소루신 ILE I
루신 LEU L
리신 LYS K
메티오닌 MET M
페닐알라닌 PHE F
프롤린 PRO P
세린 SER S
트레오닌 THR T
트립토판 TRP W
티로신 TYR Y
발린 VAL V
"조성물"은 1 이상의 성분을 갖는 물질을 의미한다.
"내생"은 포유류가 자연적으로 생산하는 물질을 의미할 것이다. 예를 들자면, "수용체" 라는 용어에 관하여 (하지만 이에 한정되지는 않음) "내생"은 포유류 (예를 들자면, 사람, 하지만 이에 한정되지는 않음) 또는 바이러스에 의해 자연적으로 생산되는 것을 의미할 것이다. 반대로, 이러한 관계에서 "비내생"이라는 용어는 포유류 (예를 들자면, 사람, 하지만 이에 한정되지는 않음) 또는 바이러스에 의해 자연적으로 생산되지 않는 것을 의미할 것이다.
"숙주 세포"는 이에 삽입된 플라스미드 및(또는) 벡터를 가질 수 있는 세포를 의미할 것이다. 원핵 숙주 세포의 경우에, 플라스미드는 전형적으로 숙주 세포가 복제되는 동안 스스로 복제된다 (일반적으로, 플라스미드는 그 후 진핵 숙주 세포에 도입하기 위해 단리된다); 진핵 숙주 세포의 경우에, 플라스미드는 진핵 숙주 세포가 복제될 때 플라스미드가 복제되도록 숙주 세포의 세포 DNA로 통합된다. 바람직하게는, 본원에 개시된 본 발명의 목적을 달성하기 위해서는, 숙주 세포는 진핵 세포, 보다 바람직하게는 포유류이고, 가장 바람직하게는 293, 293T 및 COS-7 세포로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
"리간드"는 내생 자연 발생 수용체에 특이적인 내생 자연 발생 분자를 의미할 것이다.
"비오르판 수용체"는 내생 자연 발생 리간드에 특이적인 내생 자연 발생 분자를 의미하는데, 여기서 리간드가 수용체에 결합하게 되면 세포내 신호 전달 경로를 활성화시킬 것이다.
"오르판 수용체"는 그 수용체에 특이적인 내생 리간드가 확인되지 않았거나 공지되지 않은 내생 수용체를 의미할 것이다.
"플라스미드"는 벡터 및 cDNA의 조합물을 의미할 것이다. 일반적으로, 플라스미드는 cDNA를 단백질로 복제 및(또는) 발현시킬 목적으로 숙주 세포내로 도입된다.
cDNA에 관해서 "벡터"는 1 이상의 cDNA를 혼입할 수 있고 숙주 세포내로 혼입될 수 있는 환형 DNA를 의미할 것이다.
하기 설명 부분의 차례는 표상적인 능률을 위해 설정된 것이고 아래의 특허 청구 범위 및 기재 내용을 한정하는 것을 의도하는 것이 아니고 또한 그렇게 해석되지 않아야 한다.
A. 사람 GPCRs 의 확인
사람 게놈 프로젝트(Human Genome project)를 수행한 결과 사람 게놈 내에 위치한 핵산 서열에 관한 과다한 정보를 확인하게 되었다. 이는 어떤 특정 게놈 서열이 사람 단백질을 번역하는 오픈-리딩 프레임 정보를 포함하거나 또는 포함할 수 있는지의 여부에 대한 이해 또는 인지 없이 유전 서열 정보를 얻을 수 있게 하는 작업이다. 사람 게놈 내의 핵산 서열을 확인하기 위한 몇 가지 방법이 당업계에서 통상의 기술을 가진 자의 범위 내에 해당된다. 한정하지 않고 예를 들면, 본원에 개시된 다양한 GPCRs는 진뱅크
Figure 112008011086884-PAT00001
(GenBank
Figure 112008011086884-PAT00002
) 데이타베이스를 검토함으로써 발견되는 반면, 다른 GPCRs는 미리 서열분석된 GPCR의 핵산 서열을 이용하여 EST 데이타베이스를 블라스트
Figure 112008011086884-PAT00003
(BLAST
Figure 112008011086884-PAT00004
) 검색함으로써 발견된다. 하기의 표 2는 개시된 내생 오르판 GPCRs를 GPCR의 각각의 상동성 GPCR과 함께 나열한다.
개시된 사람 오르판 GPCRs 확인된 평가 번호 오픈 리딩 프레임 (염기쌍) 지정된 GPCR에 대한 상동성 퍼센트 상동성 GPCR에 대한 참조 (평가 번호)
hARE-3 AL033379 1,260 bp 52.3% LPA-R U92642
hARE-4 AC006087 1,119 bp 36% P2Y5 AF000546
hARE-5 AC006255 1,104 bp 32% 오리지아스 라티페스 (Oryzias latipes) D43633
hGPR27 AA775870 1,128 bp
hARE-1 AI090920 999 bp 43% KIAA0001 D13626
hARE-2 AA359504 1,122 bp 53% GPR27
hPPR1 H67224 1,053 bp 39% EBI1 L31581
hG2a AA754702 1,113 bp 31% GPR4 L36148
hRUP3 AL035423 1,005 bp 30% 드로소필라 멜라노가스터 (Drosophila melanogaster) 2133653
hRUP4 AI307658 1,296 bp 32% pNPGPR 28% 제브라피시 (Zebra fish) Ya 29% 제브라 피시 Yb NP_004876 AAC41276 및 AAB94616
hRUP5 AC005849 1,413 bp 25% DEZ 23% FMLPR Q99788 P21462
hRUP6 AC005871 1,245 bp 48% GPR66 NP_006047
hRUP7 AC007922 1,173 bp 43% H3R AF140538
hCHN3 EST36581 1,113 bp 53% GPR27
hCHN4 AA804531 1,077 bp 32% 트롬빈 4503637
hCHN6 EST2134670 1,503 bp 36% edg-1 NP_001391
hCHN8 EST764455 1,029 bp 47% KIAA0001 D13626
hCHN9 EST1541536 1,077 bp 41% LTB4R NM_000752
hCHN10 EST1365839 1,055 bp 35% P2Y NM_002563
수용체 상동성은 사람 신체 내에서 개시된 수용체의 역할에 대한 이해를 할 수 있게 한다는 의미에서 유용하다. 부가적으로, 이러한 상동성은 개시된 오르판 GPCRs에 대해 자연 활성화제일 수 있는 가능한 내생 리간드에 관한 식견을 제공할 수 있다.
B. 수용체 스크리닝
수용체의 종래 연구는 항상 수용체에 영향을 줄 수 있는 길항제 및 다른 분자를 찾는 발견을 행하기 전에 내생 리간드가 먼저 확인되어야 한다는 (역사에 기초한) 우선적 가정으로부터 수행되었기 때문에, 내생 리간드 확인 (이는, 주로, 수용체의 내생 리간드를 요하는 수용체-결합 검정을 행하는 수단을 제공할 목적임)에 관한 기술은 지난 몇 년간 더욱 쉽게 이용할 수 있다. 길항제를 먼저 알 수 있는 경우일지라도, 연구는 이미 내생 리간드를 찾는 것으로 확장되었다. 이러한 사고 방식은 구조적으로 활성화된 수용체가 발견된 후에도 수용체 검색을 고집하였다. 여태까지 인지하지 못했던 것은 수용체의 효현제(아고니스트), 부분 효현제 및 역 (inverse) 효현제를 발견하기 위해 가장 유용한 것은 수용체의 활성화 상태라는 것이다. 과활성화된 수용체 또는 저활성화된 수용체에 기인하는 질병에서는, 치료용 약물에 기대하는 것은 각각 수용체의 활성화 상태를 감소 또는 수용체의 활성을 증가시키는 작용을 하는 화합물이고, 내생 리간드에 길항제인 약물을 필요로 하는 것은 아니다. 이는 활성화 수용체 상태의 활성을 감소 또는 증가시키는 화합물은 내생 리간드와 동일한 위치에 결합하는 것을 필요로 하는 것은 아니기 때문이다. 따라서, 본 발명의 방법에 따라 교시되는 바와 같이, 치료 화합물을 찾기 위한 어떠한 검색도 리간드 비의존적 활성화 상태에 대해 화합물을 스크리닝하는 것에서 시작하여야만 한다.
당업계에 공지된 바와 같이, GPCRs는 수용체의 내생 리간드가 그에 결합하지 않고 있을 지라도 내생 상태에서 "활성"일 수 있다. 상기 자연적-활성 수용체는 특히, 역 효현제의 직접 확인(즉, 수용체의 내생 리간드를 요하지 않는 것)을 위해 스크리닝할 수 있다. 별법으로, 수용체는 예를 들어, 수용체의 내생 리간드 없이도 활성인 수용체의 비내생형이 되도록 수용체의 돌연변이를 통해 "활성화"될 수 있다.
본원에 개시된 사람 오르판 GPCRs의 내생 또는 비내생의 구조적으로 활성화된 형에 대한 후보 화합물 스크리닝은 수용체의 내생 리간드의 사용을 필요로 함이 없이, 이 세포 표면 수용체에 작용하는 후보 화합물을 직접 확인할 수 있게 해준다. 인체 내의 본원에 개시된 사람 GPCRs의 내생형이 발현 및(또는) 과발현된 영역을 측정함에 따라, 수용체의 발현 및(또는) 과발현과 연관된 관련 질병/장애 상태를 측정하는 것이 가능하다. 이러한 접근법은 본원에 개시되어 있다.
돌연변이의 발생에 있어서, 그것은 본원에 개시된 사람 오르판 GPCRs의 구조적 활성화가 전형적으로 TM6/IC3 경계면 근처에 있는 GPCR의 TM6 내에 위치하는 것으로 추정되는 프롤린 잔기 (상기 프롤린 잔기는 잘 보존되는 것으로 보임)로부터의 거리에 근거한다는 것을 입증해 줄 수 있다. 상기 잔기로부터 아미노산 잔기 16번째에 위치한 아미노산 잔기 (아마, 수용체의 IC3 구역에 위치하는 것일 것임)를 가장 바람직하게는 리신 잔기로 돌연변이시킴으로써 그러한 활성화가 얻어질 것이다. 다른 아미노산 잔기들도 상기 목적을 달성하기 위한 이 위치에서의 돌연변이에 유용할 것이다.
C. 질병/장애 확인 및(또는) 선택
바람직하게는, 사람 오르판 GPCR의 DNA 서열은 (a) 조직 mRNA에 대한 도트 블롯(dot-blot) 분석용, 및(또는) (b) 조직 샘플에서의 수용체 발현의 RT-PCR 확인용 프로브를 만들기 위해 사용될 수 있다. 조직 공급원, 또는 병든 조직에서의 수용체의 존재 또는 정상 조직에 비해 병든 조직에서 증가된 농도의 수용체의 존재는 바람직하게는 그 질병과 관련된 질병 (이를 포함하나, 이에 한정되지 않음)과 치료 지침과의 상관관계를 확인하는데 사용될 수 있다. 수용체는 이 방법에 의해 기관의 구역들에 잘 국재화될 수 있다. 수용체가 국재화된 특정 조직에 대한 공지된 기능에 근거하여, 수용체의 추정되는 기능적 역할을 추론할 수 있을 것이다.
D. 후보 화합물의 스크리닝
1. 포괄( generic ) GPCR 스크리닝 검정 기술
G 단백질 수용체가 구조적으로 활성화되었을 때 (즉, 수용체에 결합하는 내생 리간드 없이 활성화되었을 때), 수용체는 G 단백질 (예를 들면, Gq, Gs, Gi, Go)에 결합하고 GTP가 G 단백질에 결합하는 것을 자극한다. 이어서, G 단백질은 GTP 분해효소(GTPase)로 작용하고 GTP를 서서히 GDP로 가수분해하고, 이에 의해 수용체는 정상 조건하에서 불활성화 된다. 그러나, 구조적으로 활성화된 수용체는 지속적으로 GDP를 GTP로 변화시킨다. GTP의 가수분해 불가능한 유사체인 [35S]GTP
Figure 112008011086884-PAT00005
S는 구조적으로 활성화된 수용체를 발현하는 막과의 증가된 결합을 모니터하기 위해 이용될 수 있다. [35S]GTP
Figure 112008011086884-PAT00006
S는 리간드의 부재 및 존재하에 막과의 G 단백질의 커플링을 모니터하기 위해 사용될 수 있다는 것이 보고되어 있다. 당업계에 공지되어 이용가능한 다른 예들 중에서도, 이러한 모니터링의 한 예로는 트레이너(Traynor) 및 나홀스키(Nahorski)에 의해 1995년에 보고된 것이 있다. 상기 검정 시스템의 바람직한 이용은 후보 화합물의 초기 스크리닝을 위한 것이데, 이는 상기 시스템이 수용체의 세포내 도메인과 상호작용하는 특정 G 단백질에 상관없이 모든 G 단백질 커플링 수용체에 일반적으로 적용될 수 있기 때문이다.
2. 특정 GPCR 스크리닝 검정 기술
일단 후보 화합물이 "포괄(generic)" G 단백질 커플링 수용체 검정 (즉, 효현제, 부분 효현제, 또는 역 효현제인 화합물을 선택하는 검정)을 이용하여 확인되면, 상기 화합물이 수용체 부위에서 상호작용하는지를 확인하는 추가적인 스크리닝이 바람직하다. 예를 들면, "포괄" 검정에 의해 확인된 화합물은 수용체에 결합하지 않고, 대신에 세포내 도메인에서 G 단백질을 단지 "탈커플링(uncoupling)"할 수 있다.
a. Gs 및 Gi
Gs는 효소 아데닐릴 시클라제(adenylyl cyclase)를 자극한다. 반대로, Gi (및 Go)는 상기 효소를 억제한다. 아데닐릴 시클라제는 ATP를 cAMP로 전환하는 것을 촉매한다. 따라서, Gs 단백질과 커플링하는 구조적으로 활성화된 GPCRs는 cAMP의 세포 수준의 증가와 연관되어 있다. 반면에, Gi (또는 Go) 단백질과 커플링한 구조적으로 활성화된 GPCRs는 cAMP의 세포 수준의 감소와 연관되어 있다. 일반적으로, 니콜스 (Nichols, J.G.) 등의 문헌["시냅스 전달의 간접적 메카니즘", 제 8장, 뉴런에서 뇌까지(제 3판), Sinauer Associates, Inc. (1992)] 참조. 따라서, cAMP를 탐지하는 검정은 후보 화합물이 예를 들면, 수용체에 대해 역 효현제 (즉, 이러한 화합물은 cAMP의 수준을 감소시킬 것임) 인지를 결정하기 위해 활용될 수 있다. cAMP를 측정하기 위해 당업계에 공지된 다양한 접근법을 활용할 수 있다. 가장 바람직한 접근법은 ELISA에 기초한 포맷에서 항-cAMP 항체를 이용하는 것이다. 활용될 수 있는 다른 유형의 검정은 전체 세포 이차 메신저 리포터 시스템 검정이다. 유전자의 프로모터가 특정 유전자가 코딩하는 단백질이 발현되게 한다. cAMP는 cAMP 반응성 요소라 불리는 프로모터 특정 부위에 결합하고 유전자가 발현되게 하는 cAMP-반응성 DNA 결합 단백질 또는 전사 인자 (CREB)의 결합을 촉진함으로써 유전자가 발현되게 한다. 리포터 유전자 예를 들면,
Figure 112008011086884-PAT00007
-갈락토시다제 또는 루시페라제 앞에 다수의 cAMP 반응 요소를 포함하는 프로모터를 갖는 보고 시스템을 제작할 수 있다. 따라서, 구조적으로 활성화된 Gs에 연결된 수용체는 유전자를 리포터 단백질의 유전자 및 발현을 활성화시키는 cAMP의 축적을 일으킨다.
Figure 112008011086884-PAT00008
-갈락토시다제 또는 루시페라제와 같은 보고 단백질은 표준 생화학 검정 (첸 (Chen) 등, 1995)을 이용하여 검출될 수 있다.
b. Go 및 Gq.
Gq 및 Go는 효소 포스포리파아제 C의 활성화와 연관되어, 또한 인지질 PIP2를 가수분해하여, 두 가지 세포내 메신저인 디아실글리세롤 (DAG) 및 이노시톨 1,4,5-트리포스페이트 (IP3)를 방출한다. IP3의 축적 증가는 Gq- 및 Go-연관 수용체의 활성화와 연관되어 있다. 일반적으로, 니콜스(Nichols, J.G.) 등의 문헌["시냅스 전달의 간접적 메카니즘", 제 8장, 뉴런에서 뇌까지 (제 3판), Sinauer Associates, Inc. (1992)] 참조. IP3 축적을 탐지하는 검정은 후보 화합물이 예를 들면, Gq- 또는 Go-연관 수용체의 역 효현제인지 (즉, 이러한 화합물은 IP3의 수준을 감소시킬 것임)를 결정하는데 활용될 수 있다. Gq-연관된 수용체는 Gq-의존적 포스포리파아제 C가 AP1 요소를 포함하는 유전자를 활성화시킨다는 점에서 AP1 리포터 검정을 사용하여 검사할 수 있다. 따라서, 활성화된 Gq-연관된 수용체는 상기 유전자의 발현의 증가를 입증하는데, 여기서 그에 대한 역 효현제는 발현의 감소를 입증하고, 효현제는 발현의 증가를 입증한다. 상기 검출용으로 시판되는 검정이 이용가능하다.
3. GPCR 융합 단백질
내생의 구조적으로 활성화된 오르판 GPCR, 또는 비내생의 구조적으로 활성화된 오르판 GPCR를 역 효현제, 효현제 및 부분 효현제를 직접 확인하기 위한 후보 화합물의 스크리닝에 이용하는 것은 명확히 수용체가 비록 그에 결합되는 내생 리간드의 부재하에서도 활성이라는 점에서 독특한 도전이다. 따라서, 활성화된 수용체에 의해 얻어지는 신호를 증가시킬 수 있는 접근법을 활용하는 것은 때로 유용하다. 바람직한 접근법은 GPCR 융합 단백질을 이용하는 것이다.
일반적으로, 상기한 검정 기술 (뿐 아니라 다른 것도) 이용하여, GPCR이 구조적으로 활성화되는지 또는 되어있는지가 일단 확인되면, 내생 GPCR과 커플링하는 지배적 G 단백질을 결정하는 것이 가능하다. G 단백질과 GPCR의 커플링은 평가할 수 있는 신호전달 경로를 제공한다. 포유류 발현 시스템을 이용하여 스크리닝하는 것이 가장 바람직하기 때문에, 상기 시스템은 그 안에 내생 G 단백질을 갖는다고 기대된다. 따라서, 명확히, 상기 시스템에서는, 구조적으로 활성화된 오르판 GPCR이 지속적으로 신호전달할 것이다. 이러한 관점에서, 예를 들면, 수용체의 역 효현제 등이 존재할 때, 수용체가 역 효현제와 접촉할 때, 특히 스크리닝과 관련하여, 수용체를 더 쉽게 구별할 수 있는 것이 더욱 유망하도록 상기 시그날이 증가되는 것이 바람직하다.
GPCR 융합 단백질은 G 단백질의 GPCR과의 커플링 효율을 증가시키는 것을 의도한다. 비록 GPCR 융합 단백질은 내생의 구조적으로 활성화된 GPCR도 이용할 수 있지만 (및 바람직하게 이용됨), GPCR 융합 단백질은 비내생의 구조적으로 활성화된 GPCR로 스크리닝하는데 바람직한데, 이는 상기 접근법이 상기 스크리닝 기술에서 가장 바람직하게 활용되는 신호를 증가시키기 때문이다. 현저한 "신호 대 잡음" 비율을 촉진하는데 있어서 중요하다. 이러한 현저한 비율은 바람직하게는 본원에 개시된 후보 화합물의 스크리닝에 중요하다.
GPCR 융합 단백질의 발현에 유용한 구조체를 제작하는 것은 당업계에서 통상의 기술을 가진 자의 범위 내에 든다. 시판되는 발현 벡터 및 시스템은 연구자들의 특정한 요구에 적합한 다양한 접근법을 제공한다. 이러한 GPCR 융합 단백질 구조체에 대한 중요한 척도는 GPCR 서열 및 G 단백질 서열이 모두 프레임 내에 존재하여야 한다 (바람직하게는, GPCR 서열이 G 단백질 서열의 상류에 존재한다)는 것과 GPCR의 "정지" 코돈이 GPCR의 발현시에 G 단백질도 또한 발현될 수 있도록 결실 또는 치환되어야 한다는 것이다. GPCR은 G 단백질과 직접 연결될 수도 있거나, 또는 그 둘 사이에 스페이서(spacer) 잔기 (바람직하게는, 약 12개 이하, 이 숫자는 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 의해 쉽게 확인될 수 있음)들이 있을 수 있다. 사용되지 않는 일부 제한 부위가발현시 효과적으로 스페이서가 된다는 점에서, 스페이서의 사용이 (편의상) 바람직하다. 가장 바람직하게는, GPCR과 커플링하는 G 단백질은 GPCR 융합 단백질 구조체를 생성하기에 앞서 확인된다. 극소수의 G 단백질이 확인되었기 때문에, G 단백질 서열을 포함하는 구조체 (즉, 보편적 G 단백질 구조체)를 이에 내생 GPCR을 삽입하는데 이용하는 것이 바람직하다. 이는 다른 서열을 갖는 다양한 다른 내생 GPCRs의 대규모 스크리닝과 관련하여 효율성을 제공한다.
E. 기타 유용성
본원에 개시된 사람 오르판 GPCRs의 바람직한 용도는 역 효현제, 효현제 또는 부분 효현제로서의 (바람직하게는 약제로서의 용도를 위해) 후보 화합물의 직접 확인하는데에 있을 것이지만, 사람 GPCRs의 이러한 형은 또한 검색 환경에 유용할 수 있다. 예를 들면, GPCRs를 혼입하는 시험관내 및 생체내 시스템은 사람의 정상 및 질병 상태 모두에서 상기 수용체가 행하는 역할을 더 명료하게 하고 이해하는데 유용할 수 있을 뿐 아니라, 신호전달 캐스케이드를 이해하는데 적용되므로 구조적 활성화의 역할을 이해하는데 유용할 수 있다. 사람 오르판 GPCRs의 가치는, 신체 내의 상기 수용체의 위치(들)를 확인함으로써, GPCRs가 수용체에 대한 내생 리간드가 확인되기 전에 사람 신체 내에서의 이러한 수용체의 역할을 이해하는데 사용될 수 있다는 점에서 검색 도구로서의 그의 유용성이 증가된다는 것이다. 개시된 수용체의 다른 용도는 그 중에서도 특히 본원의 검토에 기초하여 당업자들에게 명백해진다.
실시예
하기 실시예는 본 발명을 한정하지 않고 명백히 할 목적으로 제시된 것이다. 특정 핵산 및 아미노산 서열이 본원에 개시되어 있지만, 당업계에서 통상의 지식을 가진 자는 하기에 보고된 것과 동일하거나 또는 실질적으로 유사한 결과를 얻으면서 상기 서열에 일부 변형을 가할 능력을 가진 것으로 믿어진다. 하기에서 달리 지시되지 않는 한, 개시된 내생의 오르판 사람 GPCRs에 대한 모든 핵산 서열은 모두 서열분석되고 입증되었다. 동등한 수용체의 목적으로, 당업계에서 통상의 지식을 가진 자는 기능적으로 동등한 수용체를 얻기 위해서 개시된 서열에 보존적 치환을 가할 수 있다는 것을 쉽게 인식할 것이다.
<실시예1>
내생의 사람 GPCRs
1. 사람 GPCRs 의 확인
개시된 내생의 사람 GPCRs 몇 가지를 진뱅크 데이타베이스 정보를 검토한 것에 기초하여 확인하였다. 데이타베이스를 검색하는 동안, 아래에 입증한 바와 같이 하기 cDNA 클론을 확인하였다.
개시된 사람 오르판 GPCRs 평가 번호 완전한 DNA 서열 (염기쌍) 오픈 리딩 프레임 (염기쌍) 핵산 서열 확인 번호 아미노산 서열 번호
hARE-3 AL033379 111,389 bp 1,260 bp 1 2
hARE-4 AC006087 226,925 bp 1,119 bp 3 4
hARE-5 AC006255 127,605 bp 1,104 bp 5 6
hRUP3 AL035423 140,094 bp 1,005 bp 7 8
hRUP5 AC005849 169,144 bp 1,413 bp 9 10
hRUP6 AC005871 218,807 bp 1,245 bp 11 12
hRUP7 AC007922 158,858 bp 1,173 bp 13 14
다른 개시된 내생의 사람 GPCRs는 하기 EST 클론을 질문 서열로 사용하여 EST 데이타베이스 (dbest)의 BLAST 검색을 수행하여 확인하였다. 확인된 하기 EST 클론은 사람 게놈 라이브러리를 스크리닝하기 위한 탐침으로 사용하였다.
개시된 사람 오르판 GPCRs 질문 (서열) 확인된 EST 클론/ 평가 번호 오픈 리딩 프레임 (염기쌍) 핵산 서열 아미노산 서열
hGPCR27 생쥐 GPCR27 AA775870 1,125 bp 15 16
hARE-1 TDAG 1689643 AI090920 999 bp 17 18
hARE-2 GPCR27 68530 AA359504 1,122 bp 19 20
hPPR1 소 PPR1 238667 H67224 1,053 bp 21 22
hG2a 생쥐 1179426 하기 실시예 2(a) 참고 1,113 bp 23 24
hCHN3 N.A. EST 36581 (전체 길이) 1,113 bp 25 26
hCHN4 TDAG 1184934 AA804531 1,077 bp 27 28
hCHN6 N.A. EST 2134670 (전체 길이) 1,503 bp 29 30
hCHN8 KIAA0001 EST 764455 1,029 bp 31 32
hCHN9 1365839 EST 1541536 1,077 bp 33 34
hCHN10 생쥐 EST 1365839 인간 1365839 1,005 bp 35 36
hRUP4 N.A. AI307658 1,296 bp 37 38
(N.A.= 적용할 수 없음.)
2. 전체 길이 클로닝
a. hG2a (서열 확인 번호 23 & 24)
생쥐 EST 클론 1179426을 세 개의 아미노산을 제외하고 hG2a 코딩 서열을 모두 포함하는 사람 게놈 클론을 얻기 위해 사용하였다. 상기 코딩 서열의 5' 말단을 5'레이스
Figure 112008011086884-PAT00009
(5'RACE
Figure 112008011086884-PAT00010
)를 사용하여 얻었으며, PCR용 주형은 클론테크의 사람 비장 마라톤-레디
Figure 112008011086884-PAT00011
(Clontech's Human Spleen Marathon-ready
Figure 112008011086884-PAT00012
) cDNA 였다. 개시된 사람 G2a는 하기의 서열 확인 번호 39 및 서열 확인 번호 40에 보인 바와 같은 제 1 회 및 제 2 회 PCR을 위한 G2a cDNA 특이적 프라이머를 사용한 PCR에 의해 증폭하였다.
Figure 112008011086884-PAT00013
어드벤티지
Figure 112008011086884-PAT00014
(Advantage
Figure 112008011086884-PAT00015
) GC 폴리머라제 키트 (클론테크(Clontech), 제조 지시문은 후술될 것임)를 사용하여 94℃에서 30초간, 이어서 94℃에서 5초간 및 72℃에서 4분간 5회 사이클, 및 94℃에서 5초간 및 70℃에서 4분간의 30회 사이클로 PCR을 수행하였다. 약 1.3Kb의 PCR 단편을 아가로즈 겔에서 정제하였고, Hind III 및 Xba I로 소화하였고 발현 벡터 pRC/CMV2 (인비트로겐, Invitrogen) 내로 클로닝하였다. 클로닝된 삽입체를 T7 시쿼나제
Figure 112008011086884-PAT00016
(Sequenase
Figure 112008011086884-PAT00017
) 키트 (USB 아머샴(USB Amersham), 제조 지시문은 후술될 것임)를 사용하여 서열분석하였고, 서열을 제시된 서열과 비교하였다. 사람 G2a의 발현은 P32-표지된 단편으로 RNA 도트 블롯 (클론테크(Clontech), 제조 지시문은 후술될 것임)을 탐침 검사하여 탐지하였다.
b. hCHN9 (서열 확인 번호 33 & 34)
EST 클론 1541536의 서열분석은 hCHN9이 단지 개시 코돈만 갖는 (즉, 종결 코돈이 없는) 부분 cDNA 클론이라는 것을 나타내었다. hCHN9을 데이타 베이스(nr)에 대해 "블라스트(blast)"하기 위해 사용하였을 때, hCHN9의 3' 서열은 루코트리엔 B4 수용체 cDNA의 5' 비번역 구역에 대해 100% 상동성이고, 이 구역은 hCHN9 코딩 서열을 갖는 프레임에 종결 코돈을 포함한다. LTB4R cDNA의 5' 비번역 구역이 hCHN9의 3' 서열인지를 결정하기 위해, hCHN9에서 발견된 개시 코돈에 접하는 5' 서열 및 LTB4R 5' 비번역 구역에서 발견된 종결 코돈의 주변에 위치한 3' 서열에 기초한 프라이머를 사용하여 PCR을 수행하였다. 활용된 5' 프라이머 서열은 다음의 서열 확인 번호 41 및 서열 확인 번호 42와 같았다.
Figure 112008011086884-PAT00018
제조업자가 제공한 완충계, 각 프라이머 0.25μM 및 각 4개의 뉴클레오티드 0.2 mM과 함께 주형으로서 흉선 cDNA 및 rTth 폴리머라제 (펄킨 엘머, Perkin Elmer)를 사용하여 PCR을 수행하였다. 사이클 조건은 94℃에서 1 분간, 65℃에서 1 분간 및 72℃에서 1 분 및 10 초간의 30 회 사이클이었다. 서술한 크기와 일치하는 1.1 kb의 단편을 PCR에서 얻었다. 이 PCR 단편은 pCMV (하기 참조)에 서브클로닝하여 서열분석하였다(서열 확인 번호 33 참조).
c. hRUP 4 (서열 확인 번호 37 & 38)
전체 길이 hRUP 4를 사람 뇌 cDNA (클론테크, Clontech)를 주형으로 한 RT-PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00019
태크플러스™(TaqPlus™) 프리시젼™(Precision™) 폴리머라제 (스트라타진 (Stratagene), 제조 지시문은 후술될 것임)를 사용하여 다음 사이클에 따라 PCR을 수행하였다: 94℃에서 2 분간, 94℃에서 30초간, 55℃에서 30초간, 72℃에서 45초간, 및 72℃에서 10분간. 사이클 2 내지 4를 30회 반복하였다.
PCR 생성물을 1% 아가로스 겔 상에서 분리하여, 500bp PCR 단편을 단리하고, pCRII-TOPO 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)로 클로닝하고 T7 DNA 시쿼나제™ (Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham) 및 SP6/T7 프라이머 (스트라타진, Stratagene)를 사용하여 서열분석하였다. PCR 단편은 실제 다른 GPCRs와 유사성을 갖는 연속적 오픈 리딩 프레임을 갖는 대안적인 접목 형태의 AI307658이라는 것이 서열 분석으로 밝혀졌다. 상기 PCR 단편의 완성된 서열은 다음의 서열 확인 번호 45와 같다.
Figure 112008011086884-PAT00020
상기 서열에 기초하여, 두 개의 센스 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트
Figure 112008011086884-PAT00021
및 두 개의 안티센스 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트
Figure 112008011086884-PAT00022
를 제조 지시문에 따라 사람 뇌 마라톤-레디™(Marathon-Ready™) cDNA (클론테크(Clontech), Cat# 7400-1)를 주형으로 한 3'- 및 5'-레이스 PCR에 사용하였다. 레이스 PCR (RACE PCR)에서 만든 DNA 단편을 pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)로 클로닝하였고, SP6/T7 프라이머 (스트라타진, Stratagene) 및 몇 개의 내부 프라이머를 사용하여 서열분석하였다. 3' 레이스 생성물은 폴리(A) 꼬리 및 TAA 정지 코돈으로 끝나는 완전한 오픈 리딩 프레임을 포함한다. 5' 레이스 생성물은 불완전한 5' 말단 (즉, ATG 개시 코돈이 존재하지 않음)을 포함한다.
신규 5' 서열, 올리고 3 및 다음의 프라이머 (서열 확인 번호 50)를 제 2회의 5' 레이스 PCR에 사용하였고, PCR 생성물을 상기와 같이 분석하였다.
Figure 112008011086884-PAT00023
제 3회의 5' 레이스 PCR을 다음의 안티센스 프라이머 (서열 확인 번호 51 및 52)를 사용하여 수행하였다.
Figure 112008011086884-PAT00024
5' 레이스 PCR 생성물의 서열은 개시 코돈 ATG의 존재를 밝혔고, 이 후의5' 레이스 PCR은 더 이상의 5' 서열을 만들지 못했다. 완성된 5' 서열은 하기의 센스 프라이머 (서열 확인 번호 53)및 올리고 4를 프라이머로 사용한 RT-PCR 및 사람 뇌 및 심장 cDNA 주형 (클론테크 (Clontech), Cat# 7404-1)으로부터 산출한 650bp PCR 생성물의 서열분석에 의해 확인하였다.
Figure 112008011086884-PAT00025
완성된 3' 서열은 올리고 2 및 하기의 안티센스 프라이머 (서열 확인 번호 54)를 사용한 RT-PCR 및 사람 뇌 및 심장 cDNA 주형 (클론테크 (Clontech), Cat# 7404-1)으로부터 산출한 670bp PCR 생성물의 서열분석에 의해 확인하였다.
*
Figure 112008011086884-PAT00026
d. hRUP5 (서열 확인 번호 9 & 10)
전체 길이 hRUP5는 ATG 개시 코돈 상류의 센스 프라이머 (서열 확인 번호 55), 및 정지 코돈으로 TCA를 포함하는 안티센스 프라이머 (서열 확인 번호 56) (이들은 하기의 서열을 가진다) 및 주형으로 사람 말초 백혈구 cDNA (클론테크, Clontech)를 사용한 RT-PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00027
어드벤티지
Figure 112008011086884-PAT00028
(Advantage
Figure 112008011086884-PAT00029
) cDNA 폴리머라제 (클론테크, Clontech)를 제 2 단계 내지 제 4 단계가 30번 반복되는 다음의 사이클에 의해 50 ㎕ 반응물 중에서 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 30 초간, 94℃에서 15 초간, 69℃에서 40 초간, 72℃에서 3 분간, 및 72℃에서 7 분간. 1.4kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)로 클로닝하였고, T7 DNA 시쿼나제™(Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham)를 사용하여 완전히 서열분석하였다. 서열 확인 번호 9 참조.
e. hRUP6 (서열 확인 번호 11 &12)
전체 길이 hRUP6를 하기의 프라이머 (서열 확인 번호 57 및 58) 및 주형으로 사람 흉선 마라톤-레디™ (Marathon-Ready™) cDNA (클론테크, Clontech)를 사용하여 RT-PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00030
어드벤티지™ (Advantage™) cDNA 폴리머라제 (클론테크 (Clontech), 제조자의 지시문에 따름)을 하기 사이클에 따라 50 ㎕ 반응물 중에서의 증폭용으로 사용하였다; 94℃에서 30 초간, 94℃에서 5 초간, 66℃에서 40 초간, 72℃에서 2.5 초간 및 72℃에서 7 분간. 사이클 2 내지 4를 30 회 반복하였다. 1.3 kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)으로 클로닝하였고, ABI 빅 다이 터미네이터™ (Big Dye Terminator™) 키트 (피.이. 바이오시스템, P.E.Biosystem)을 사용하여 완전히 서열분석하였다 (서열 확인 번호 11 참조).
f. hRUP7 (서열 확인 번호 13 & 14)
전체 길이 RUP7을 하기의 프라이머 (서열 확인 번호 59 및 60) 및 주형으로 사람 말초 백혈구 cDNA (클론테크, Clontech)를 사용하여 RT-PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00031
Figure 112008011086884-PAT00032
어드벤티지™ (Advantage™) cDNA 폴리머라제 (클론테크 (Clontech)를 단계 2 내지 단계 4가 30 회 반복되는 하기 사이클에 따라 50㎕ 반응물 중에서의 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 2 분간, 94℃에서 15 초간, 60℃에서 20 초간 및 72℃에서 2 분간, 72℃에서 10 분간. 1.25 Kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)으로 클로닝하였고, ABI 빅 다이 터미네이터™ (Big Dye Terminator™) 키트 (피.이. 바이오시스템, P.E.Biosystem)을 사용하여 완전히 서열분석하였다 (서열 확인 번호 13 참조).
g. hARE-5 (서열 확인 번호 5 & 6)
전체 길이 hARE-5를 하기의 hARE5 특이적 프라이머 (서열 확인 번호 69 및 70) 및 주형으로 사람 게놈 DNA를 사용하여 PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00033
태크플러스 프리시전™ (TaqPlus Precision™) cDNA 폴리머라제 (스트라타진, Stratagene)을 단계 2 내지 단계 4가 35 회 반복되는 다음 사이클에 의한 증폭용으로 사용하였다: 96℃에서 2 분간, 96℃에서 20 초간, 58℃에서 30 초간 및 72℃에서 2 분간, 72℃에서 10 분간.
서술한 크기의 1.1Kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)으로 클로닝하였고, T7 DNA 시쿼나제™ (Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham)을 사용하여 완전히 서열 분석하였다 (서열 확인 번호 5 참조).
h. hARE-4 (서열 확인 번호 3 & 4)
전체 길이 hARE-4를 하기의 hARE-4 특이적 프라이머 (서열 확인 번호 67 및 68) 및 주형으로 사람 게놈 DNA를 사용하여 PCR로 클로닝하였다.
Figure 112008011086884-PAT00034
태크 DNA (Taq DNA) 폴리머라제 (스트라타진, Stratagene) 및 5% DMSO를 단계 2 내지 단계 3이 35 회 반복되는 하기 사이클에 따라 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 3 분간, 94℃에서 30 초간, 59℃에서 2 분간 및 72℃에서 10 분간.
서술한 크기의 1.12Kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)으로 클로닝하였고, T7 DNA 시쿼나제™ (Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham)을 사용하여 완전히 서열분석하였다 (서열 확인 번호 3 참조).
i. hARE-3 ( 서열 확인 번호 1 & 2)
전체 길이 hARE-3을 하기의 hARE-3 특이적 프라이머 (서열 확인 번호 65 및 66) 및 주형으로 사람 게놈 DNA를 사용하여 PCR로 클로닝하였다.
5'-gatcaagcttCCATCCTACTGAAACCATGGTC-3' 서열 확인 번호 65 (센스, HIND III 위에 걸리는 것을 나타내는 저급 뉴클레오티드 경우, 시작 코돈으로 ATG) 및 5'-gatcagatctCAGTTCCAATATTCACACCACCGTC-3' 서열 확인 번호 66 (안티센스, Xba I 위에 걸리는 것을 나타내는 저급 뉴클레오티드 경우, 종결 코돈으로 TCA
태크플러스 프리시전™ (TaqPlus Precision™) DNA 폴리머라제 (스트라타진, Stratagene)을 단계 2 내지 단계 4가 35 회 반복되는 하기 사이클에 따라 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 3 분간, 94℃에서 1 분간, 55℃에서 1 분간 및 72℃에서 2 분간, 72℃에서 10 분간.
서술한 크기의 1.3 Kb PCR 단편을 단리하였고, Hind III 및 Xba I으로 절단하여, Hind III 및 Xba I 부위에서 pRC/CMV2 벡터 (인비트로젠, Invitrogen) 내로 클로닝하였고 T7 DNA 시쿼나제™ (Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham)를 사용하여 완전히 서열분석하였다 (서열 확인 번호 1 참조).
j. hRUP3 (서열 확인 번호 7 & 8)
전체 길이 hRUP3를 하기의 hRUP3 특이적 프라이머 (서열 확인 번호 71 및 72) 및 주형으로 사람 게놈 DNA를 사용하여 PCR로 클로닝하였다.
5'-GTCCTGCCACTTCGAGACATGG-3' 서열 확인 번호 71 (센스, 시작 코돈으로 ATG) 및 5'-GAAACTTCTCTGCCCTTACCGTC-3' 서열 확인 번호 72 (안티센스, 종결 코돈 TAA의 3')
태크플러스 프리시전™ (TaqPlus Precision™) DNA 폴리머라제 (스트라타진, Stratagene)를 단계 2 내지 단계 4가 35 회 반복되는 하기 사이클에 따라 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 3 분간, 94℃에서 1 분간, 58℃에서 1 분간 및 72℃에서 2 분간, 72℃에서 10 분간.
서술한 크기의 1.0Kb PCR 단편을 단리하였고, pCRII-TOPO™ 벡터 (인비트로젠, Invitrogen)으로 클로닝하였고, T7 DNA 시쿼나제™ (Sequenase™) 키트 (암샴, Amsham)를 사용하여 완전히 서열분석하였다 (서열 확인 번호 7 참조).
<실시예 2>
수용체 발현
비록 당업계에서 단백질을 발현하는데 다양한 세포가 이용가능하더라도, 포유류 세포를 활용하는 것이 가장 바람직하다. 이의 일차적 이유는 실용적인 면에 근거를 둔다. 즉, GPCR 발현을 위해 예를 들면, 효모 세포의 이용 (가능한 경우라면)은 포유류 시스템에는 발달되어 있는 수용체-커플링, 유전-메카니즘 및 분비 경로를 포함하지 않을 수 있는 (실제로, 효모의 경우는 포함하지 않음) 비포유류 세포를 프로토콜에 도입하며, 따라서, 비포유류 세포에서 얻어진 결과는 (잠재적 유용성이 있기는 하지만) 포유류 세포에서 얻어진 결과보다 바람직하지 않다. 비록 활용되는 특이적 포유류 세포는 당업자의 특정한 요구에 근거를 두고 있지만, 포유류 세포 중에서도 COS-7, 293 및 293T 세포가 특히 바람직하다. 개시된 GPCRs의 일반적 발현 과정은 하기와 같다.
제 1 일 째에는, 150 ㎜ 판 당 1×107 293T 세포를 플레이팅하였다. 제 2 일 째에는, 두 개의 반응 관을 준비하였다 (각 관에 대해 하기 비율은 각 판에 대한 것 임). 관 A는 1.2 ㎖ 혈청 미함유 DMEM (미국 캘리포니아주 어빈 소재의 어빈 사이언티픽 (Irvine Scientific)) 중에 20 ㎍ DNA (예를 들면, pCMV 벡터, 수용체 cDNA를 갖는 pCMV 벡터 등)를 혼합함으로써 제조하였다. 관 B는 1.2 ㎖ 혈청 미함유 DMEM 중에 120 ㎕ 리포펙타민 (Gibco BRL)을 혼합함으로써 제조하였다. 관 A 및 B를 (여러번) 역으로 혼합하였고, 이어서 실온에서 30-45 분간 배양하였다. 혼합물은 "트랜스펙션 (transfection) 혼합물"로 지칭할 수 있다. 플레이팅한 293T 세포를 PBS로 1회 세척하였고, 이어서 10 ㎖의 혈청 미함유 DMEM을 가하였다. 2.4 ㎖의 트랜스펙션 혼합물을 세포에 가하였고, 이어서 37℃/5% CO2에서 4 시간 동안 배양하였다. 이어서, 트랜스펙션 혼합물은 흡입에 의해 제거하였고, 이어서 25 ㎖의 DMEM/10% 소 태아 혈청을 가하였다. 이어서, 세포를 37℃/5% CO2에서 배양하였다. 72 시간 배양 후에, 세포를 수확하여 분석에 이용할 수 있었다.
<실시예 3>
개시된 사람 GPCRs 의 조직 분포
본원에 개시된 GPCRs의 조직 분포를 측정하기 위하여 여러 가지의 접근법을 사용할 수 있다.
1. 도트 - 블롯 분석법
시판되는 사람 조직 도트-블롯 포맷을 사용하여, 내생의 오르판 GPCRs를 그 수용체가 국재화되어 있는 영역을 측정하기 위해 탐침으로 검사하였다. 실시예 1의 GPCRs로부터 얻은 cDNA 단편 (방사선 표지됨)을 탐침으로 사용하였다 (또는 사용할 수 있다): 방사선 표지된 탐침은 프라임-잇 II
Figure 112008011086884-PAT00035
(Prime-It II
Figure 112008011086884-PAT00036
) 랜덤 프라이머 라벨링 키트 (스트라타진, #300385)를 제조자의 지시문에 따라 사용하고 완전한 수용체 cDNA (벡터로부터 절제함)를 사용하여 생성하였다 (또는 생성할 수 있다). 사람 RNA 마스터 블롯
Figure 112008011086884-PAT00037
(Master Blot
Figure 112008011086884-PAT00038
) (클론테크, #7770-1)을 내생의 사람 GPCR 방사선 표지된 탐침으로 혼성화하였고, 제조자의 지시문에 따라 엄격한 조건하에서 세척하였다. 블롯을 코닥 (Kodak) 바이오맥스
Figure 112008011086884-PAT00039
(BioMax
Figure 112008011086884-PAT00040
) 오토라디오그라피 필름에 밤새도록 -80℃에서 노출하였다. 결과를 여러 가지 수용체에 대해 표 3 및 4에 요약하였다 (다양한 조직 및 그 위치를 확인하는 격자형 표에 대해서는 각각 도 1a 및 1b 참조). 예시적인 도트-블롯을 각각 hCHN3 및 hCHN8을 사용하여 얻은 결과에 대해 도 2a 및 2b에 나타내었다.
오르판 GPCR 조직 분포 ( 도트 - 블롯의 다른 조직에 비해, 최고 수준)
hGPCR27 태아 뇌, 경막, 뇌하수체, 미상핵
hARE-1 비장, 말초 백혈구, 태아 비장
hPPR1 뇌하수체, 심장, 침샘, 소장, 고환
hRUP3 췌장
hCHN3 태아 뇌, 경막, 후두 피질
hCHN9 췌장, 소장, 간
hCHN10 신장, 갑상선
오르판 GPCR 조직 분포 ( 도트 - 블롯의 다른 조직에 비해, 최고 수준)
hARE-3 좌소뇌, 우소뇌, 고환, 측위(Accumbens)
hGPCR3 뇌량, 미상핵, 간, 심장, 심실중격
hARE-2 좌소뇌, 우소뇌, 흑질
hCHN8 좌소뇌, 우소뇌, 신장, 폐
2. RT - PCR
a. hRUP3
hRUP3 mRNA의 조직 분포를 확인하기 위하여, RT-PCR을 hRUP3 특이적 프라이머 및 사람 복수 조직 cDNA 패널 (MTC, 클론테크)를 주형으로 사용하여 수행하였다. Taq DNA 폴리머라제 (스트라타진)을 PCR 반응에 활용하였고, 다음의 반응 사이클을 40 ㎕ 반응 중에서 사용하였다: 94℃에서 2 분간; 94℃에서 15 초간; 55℃에서 30초간; 72℃에서 1 분간; 72℃에서 10 분간. 프라이머는 다음의 서열 확인 번호 61 및 62이다:
Figure 112008011086884-PAT00041
20 ㎕의 반응물을 1% 아가로스겔에 적하하였다; 결과는 도 3에 나타내었다.
도 3의 데이타에 의해 지지되는 바와 같이, 사용되는 cDNA 패널 중의 16 개 사람 조직 (뇌, 결장, 심장, 신장, 폐, 난소, 췌장, 태반, 전립선, 골격, 소장, 비장, 고환, 흉선 백혈구 및 간) 중에서 단일 hRUP3 띠는 오직 췌장의 경우만 명확하였다. 다른 GPCRs를 갖는 hRUP3의 단백질 서열에 대한 부가적인 비교 분석은 hRUP3가 소분자 내생 리간드를 갖는 GPCRs와 관련이 있다는 것을 암시하며, 따라서 hRUP3의 내생 리간드가 소분자라고 예측된다.
b. hRUP4
프라이머로 hRUP4 올리고 8 및 4를 사용하고 주형으로 사람 복수 조직 cDNA 패널 (MTC, 클론테크)를 사용하여 RT-PCR을 수행하였다. Taq DNA 폴리머라제 (스트라타진)를 40 ㎕ 반응물 중에서 다음의 사이클에 따라 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 30 초간, 94℃에서 10 초간, 55℃에서 30 초간, 72℃에서 2 분간, 및 72℃에서 5 분간. 사이클 2 내지 4 는 30 회 반복함.
20 ㎕의 반응물을 1% 아가로스겔에 적하하여 RT-PCR 생성물을 분석하였고, hRUP4 mRNA가 많은 사람 조직에서 발현되며, 심장 및 신장에서 가장 강하게 발현된다는 것을 발견하였다 (도 4 참조). PCR 단편이 확실한 것임을 확인하기 위하여, hRUP4의 5' 말단으로부터 유래한 300bp 단편을 서던 블롯 분석에 탐침으로 사용하였다. 탐침을 32P-dCTP로 프라임 잇 II
Figure 112008011086884-PAT00042
(Prime-It II
Figure 112008011086884-PAT00043
) 랜덤 프라이머 라벨링 키트 (스트라타진)를 사용하여 표지하였고, 프로브퀀트
Figure 112008011086884-PAT00044
(ProbeQuant
Figure 112008011086884-PAT00045
) G-50 마이크로칼럼 (아머샴)을 사용하여 정제하였다. 12 시간의 예비 혼성화에 이어 밤새도록 42℃에서 혼성화하였다. 블롯을 최종적으로 65℃에서 0.1×SSC로 세척하였다. 서던 블롯으로 PCR 단편이 hRUP4임을 확인하였다.
c. hRUP5
Figure 112008011086884-PAT00046
상기의 hRUP5 특이적 프라이머 (서열 확인 번호 63 및 64) 및 주형으로 사람 복수 조직 cDNA 패널 (MTC, 클론테크)를 사용하여 RT-PCR을 수행하였다. Taq DNA 폴리머라제 (스트라타진)를 40 ㎕ 반응물 중에서 다음의 사이클에 따라 증폭용으로 사용하였다: 94℃에서 30 초간, 94℃에서 10 초간, 62℃에서 1.5 분간, 및 72℃에서 5 분간, 사이클 2 내지 3을 30회 반복함. 20 ㎕의 반응물을 1.5% 아가로스겔에 적하하여 RT-PCR 생성물을 분석하였고, hRUP5 mRNA는 오직 말초 혈액 백혈구에서만 발현된다는 것을 발견하였다 (데이타는 제시하지 않음).
d. hRUP6
hRUP6의 발현 및 조직 분포를 측정하기 위해 RT-PCR을 적용하였다. AC005871 및 GPR66 세그멘트의 정렬에 기초하여, 사용한 올리고뉴클레오티드는 다음의 서열 (서열 확인 번호 73 및 74)을 가지고,
Figure 112008011086884-PAT00047
사람 복수 조직 cDNA 패널 (MTC, 클론테크)를 주형으로 사용하였다. PCR을 태크플러스 프리시전
Figure 112008011086884-PAT00048
폴리머라제 (스트라타진; 제조 지시문에 따름)를 사용하여 40 ㎕ 반응물 중에서 다음의 사이클에 따라 수행하였다: 94℃에서 30 초간; 94℃에서 5 초간; 66℃에서 40 초간, 72℃에서 2.5 분간, 및 72℃에서 7 분간; 사이클 2 내지 4는 30 회 반복함.
20 ㎕의 반응물을 1.2% 아가로스겔에 적하하여 RT-PCR 생성물을 분석하였고, hRUP6을 나타내는 특이적 760bp DNA 단편은 흉선에서 현저히 발현되었고, 심장, 신장, 폐, 전립선, 소장 및 고환에서는 덜 발현되었다. (도 5 참조).
본원에서 언급한 각 특허, 출원 및 간행물은 본원에 전체로서 참고문헌으로 인용되었음을 의도한다.
당업계의 숙련자는 본 발명의 정신으로부터 벗어남이 없이 많은 변화 및 변형이 본 발명의 바람직한 실시태양에 가해질 수 있음을 알 것이다. 상기 모든 변화는 본 발명 및 하기의 특허 청구 범위의 범위 내에 있음을 의미한다.
비록 다양한 벡터가 당업계에서 입수할 수 있지만, 내생 및 비내생의 사람 GPCRs에 활용할 목적으로는, 활용되는 벡터가 pCMV인 것이 가장 바람직하다. 이 벡터는 특허절차상 미생물 기탁의 국제적 승인에 관한 부다페스트 조약의 규정에 따라 아메리칸 타입 컬처 콜렉션 (ATCC) 에 1998년 10월 13일자로 기탁하였다 (미국 20110-2209 버지니아주 마나사스 유니버시티 블러바드 10801). DNA는 ATCC에서 실험하였고 존재함이 확인되었다. ATCC는 pCMV에 기탁 번호 ATCC #203351을 부여하였다.
본원에 개시된 사람 오르판 GPCRs의 내생 또는 비내생의 구조적으로 활성화된 형에 대한 후보 화합물 스크리닝은 수용체의 내생 리간드의 사용을 필요로 함이 없이, 이 세포 표면 수용체에 작용하는 후보 화합물을 직접 확인할 수 있게 해준다. 인체 내의 본원에 개시된 사람 GPCRs의 내생형이 발현 및(또는) 과발현된 영역을 측정함에 따라, 수용체의 발현 및(또는) 과발현과 연관된 관련 질병/장애 상태를 측정하는 것이 가능하다.
SEQUENCE LISTING <110> Arena Pharmaceuticals, Inc. <120> Human Orphan G Protein Coupled Receptors <130> AREN0051 <140> PCT/US99/23687 <141> 1999-10-13 <150> 60/109,213 <151> 1998-11-20 <150> 60/120,416 <151> 1999-02-16 <150> 60,121,851 <151> 1999-02-26 <150> 60,123,946 <151> 1999-03-12 <150> 60/123,949 <151> 1999-03-12 <150> 60/136,436 <151> 1999-05-28 <150> 60/136,437 <151> 1999-05-28 <150> 60/136,439 <151> 1999-05-28 <150> 60/136,567 <151> 1999-05-28 <150> 60/137,127 <151> 1999-05-28 <150> 60/137,131 <151> 1999-05-28 <150> 60/141,448 <151> 1999-06-29 <150> 60/156,653 <151> 1999-09-29 <150> 60/156,333 <151> 1999-09-29 <150> 60/156,555 <151> 1999-09-29 <150> 60/156,634 <151> 1999-09-29 <150> 60/157,280 <151> 1999-10-01 <150> 60/157,294 <151> 1999-10-01 <150> 60/157,281 <151> 1999-10-01 <150> 60/157,293 <151> 1999-10-01 <150> 60/157,282 <151> 1999-10-01 <150> 09/417,044 <151> 1999-10-12 <150> 09/416,760 <151> 1999-10-12 <160> 74 <170> PatentIn Ver. 2.1 <210> 1 <211> 1260 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 atggtcttct cggcagtgtt gactgcgttc cataccggga catccaacac aacatttgtc 60 gtgtatgaaa acacctacat gaatattaca ctccctccac cattccagca tcctgacctc 120 agtccattgc ttagatatag ttttgaaacc atggctccca ctggtttgag ttccttgacc 180 gtgaatagta cagctgtgcc cacaacacca gcagcattta agagcctaaa cttgcctctt 240 cagatcaccc tttctgctat aatgatattc attctgtttg tgtcttttct tgggaacttg 300 gttgtttgcc tcatggttta ccaaaaagct gccatgaggt ctgcaattaa catcctcctt 360 gccagcctag cttttgcaga catgttgctt gcagtgctga acatgccctt tgccctggta 420 actattctta ctacccgatg gatttttggg aaattcttct gtagggtatc tgctatgttt 480 ttctggttat ttgtgataga aggagtagcc atcctgctca tcattagcat agataggttc 540 cttattatag tccagaggca ggataagcta aacccatata gagctaaggt tctgattgca 600 gtttcttggg caacttcctt ttgtgtagct tttcctttag ccgtaggaaa ccccgacctg 660 cagatacctt cccgagctcc ccagtgtgtg tttgggtaca caaccaatcc aggctaccag 720 gcttatgtga ttttgatttc tctcatttct ttcttcatac ccttcctggt aatactgtac 780 tcatttatgg gcatactcaa cacccttcgg cacaatgcct tgaggatcca tagctaccct 840 gaaggtatat gcctcagcca ggccagcaaa ctgggtctca tgagtctgca gagacctttc 900 cagatgagca ttgacatggg ctttaaaaca cgtgccttca ccactatttt gattctcttt 960 gctgtcttca ttgtctgctg ggccccattc accacttaca gccttgtggc aacattcagt 1020 aagcactttt actatcagca caactttttt gagattagca cctggctact gtggctctgc 1080 tacctcaagt ctgcattgaa tccgctgatc tactactgga ggattaagaa attccatgat 1140 gcttgcctgg acatgatgcc taagtccttc aagtttttgc cgcagctccc tggtcacaca 1200 aagcgacgga tacgtcctag tgctgtctat gtgtgtgggg aacatcggac ggtggtgtga 1260 <210> 2 <211> 419 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Val Phe Ser Ala Val Leu Thr Ala Phe His Thr Gly Thr Ser Asn 1 5 10 15 Thr Thr Phe Val Val Tyr Glu Asn Thr Tyr Met Asn Ile Thr Leu Pro 20 25 30 Pro Pro Phe Gln His Pro Asp Leu Ser Pro Leu Leu Arg Tyr Ser Phe 35 40 45 Glu Thr Met Ala Pro Thr Gly Leu Ser Ser Leu Thr Val Asn Ser Thr 50 55 60 Ala Val Pro Thr Thr Pro Ala Ala Phe Lys Ser Leu Asn Leu Pro Leu 65 70 75 80 Gln Ile Thr Leu Ser Ala Ile Met Ile Phe Ile Leu Phe Val Ser Phe 85 90 95 Leu Gly Asn Leu Val Val Cys Leu Met Val Tyr Gln Lys Ala Ala Met 100 105 110 Arg Ser Ala Ile Asn Ile Leu Leu Ala Ser Leu Ala Phe Ala Asp Met 115 120 125 Leu Leu Ala Val Leu Asn Met Pro Phe Ala Leu Val Thr Ile Leu Thr 130 135 140 Thr Arg Trp Ile Phe Gly Lys Phe Phe Cys Arg Val Ser Ala Met Phe 145 150 155 160 Phe Trp Leu Phe Val Ile Glu Gly Val Ala Ile Leu Leu Ile Ile Ser 165 170 175 Ile Asp Arg Phe Leu Ile Ile Val Gln Arg Gln Asp Lys Leu Asn Pro 180 185 190 Tyr Arg Ala Lys Val Leu Ile Ala Val Ser Trp Ala Thr Ser Phe Cys 195 200 205 Val Ala Phe Pro Leu Ala Val Gly Asn Pro Asp Leu Gln Ile Pro Ser 210 215 220 Arg Ala Pro Gln Cys Val Phe Gly Tyr Thr Thr Asn Pro Gly Tyr Gln 225 230 235 240 Ala Tyr Val Ile Leu Ile Ser Leu Ile Ser Phe Phe Ile Pro Phe Leu 245 250 255 Val Ile Leu Tyr Ser Phe Met Gly Ile Leu Asn Thr Leu Arg His Asn 260 265 270 Ala Leu Arg Ile His Ser Tyr Pro Glu Gly Ile Cys Leu Ser Gln Ala 275 280 285 Ser Lys Leu Gly Leu Met Ser Leu Gln Arg Pro Phe Gln Met Ser Ile 290 295 300 Asp Met Gly Phe Lys Thr Arg Ala Phe Thr Thr Ile Leu Ile Leu Phe 305 310 315 320 Ala Val Phe Ile Val Cys Trp Ala Pro Phe Thr Thr Tyr Ser Leu Val 325 330 335 Ala Thr Phe Ser Lys His Phe Tyr Tyr Gln His Asn Phe Phe Glu Ile 340 345 350 Ser Thr Trp Leu Leu Trp Leu Cys Tyr Leu Lys Ser Ala Leu Asn Pro 355 360 365 Leu Ile Tyr Tyr Trp Arg Ile Lys Lys Phe His Asp Ala Cys Leu Asp 370 375 380 Met Met Pro Lys Ser Phe Lys Phe Leu Pro Gln Leu Pro Gly His Thr 385 390 395 400 Lys Arg Arg Ile Arg Pro Ser Ala Val Tyr Val Cys Gly Glu His Arg 405 410 415 Thr Val Val <210> 3 <211> 1119 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 atgttagcca acagctcctc aaccaacagt tctgttctcc cgtgtcctga ctaccgacct 60 acccaccgcc tgcacttggt ggtctacagc ttggtgctgg ctgccgggct ccccctcaac 120 gcgctagccc tctgggtctt cctgcgcgcg ctgcgcgtgc actcggtggt gagcgtgtac 180 atgtgtaacc tggcggccag cgacctgctc ttcaccctct cgctgcccgt tcgtctctcc 240 tactacgcac tgcaccactg gcccttcccc gacctcctgt gccagacgac gggcgccatc 300 ttccagatga acatgtacgg cagctgcatc ttcctgatgc tcatcaacgt ggaccgctac 360 gccgccatcg tgcacccgct gcgactgcgc cacctgcggc ggccccgcgt ggcgcggctg 420 ctctgcctgg gcgtgtgggc gctcatcctg gtgtttgccg tgcccgccgc ccgcgtgcac 480 aggccctcgc gttgccgcta ccgggacctc gaggtgcgcc tatgcttcga gagcttcagc 540 gacgagctgt ggaaaggcag gctgctgccc ctcgtgctgc tggccgaggc gctgggcttc 600 ctgctgcccc tggcggcggt ggtctactcg tcgggccgag tcttctggac gctggcgcgc 660 cccgacgcca cgcagagcca gcggcggcgg aagaccgtgc gcctcctgct ggctaacctc 720 gtcatcttcc tgctgtgctt cgtgccctac aacagcacgc tggcggtcta cgggctgctg 780 cggagcaagc tggtggcggc cagcgtgcct gcccgcgatc gcgtgcgcgg ggtgctgatg 840 gtgatggtgc tgctggccgg cgccaactgc gtgctggacc cgctggtgta ctactttagc 900 gccgagggct tccgcaacac cctgcgcggc ctgggcactc cgcaccgggc caggacctcg 960 gccaccaacg ggacgcgggc ggcgctcgcg caatccgaaa ggtccgccgt caccaccgac 1020 gccaccaggc cggatgccgc cagtcagggg ctgctccgac cctccgactc ccactctctg 1080 tcttccttca cacagtgtcc ccaggattcc gccctctga 1119 <210> 4 <211> 372 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Met Leu Ala Asn Ser Ser Ser Thr Asn Ser Ser Val Leu Pro Cys Pro 1 5 10 15 Asp Tyr Arg Pro Thr His Arg Leu His Leu Val Val Tyr Ser Leu Val 20 25 30 Leu Ala Ala Gly Leu Pro Leu Asn Ala Leu Ala Leu Trp Val Phe Leu 35 40 45 Arg Ala Leu Arg Val His Ser Val Val Ser Val Tyr Met Cys Asn Leu 50 55 60 Ala Ala Ser Asp Leu Leu Phe Thr Leu Ser Leu Pro Val Arg Leu Ser 65 70 75 80 Tyr Tyr Ala Leu His His Trp Pro Phe Pro Asp Leu Leu Cys Gln Thr 85 90 95 Thr Gly Ala Ile Phe Gln Met Asn Met Tyr Gly Ser Cys Ile Phe Leu 100 105 110 Met Leu Ile Asn Val Asp Arg Tyr Ala Ala Ile Val His Pro Leu Arg 115 120 125 Leu Arg His Leu Arg Arg Pro Arg Val Ala Arg Leu Leu Cys Leu Gly 130 135 140 Val Trp Ala Leu Ile Leu Val Phe Ala Val Pro Ala Ala Arg Val His 145 150 155 160 Arg Pro Ser Arg Cys Arg Tyr Arg Asp Leu Glu Val Arg Leu Cys Phe 165 170 175 Glu Ser Phe Ser Asp Glu Leu Trp Lys Gly Arg Leu Leu Pro Leu Val 180 185 190 Leu Leu Ala Glu Ala Leu Gly Phe Leu Leu Pro Leu Ala Ala Val Val 195 200 205 Tyr Ser Ser Gly Arg Val Phe Trp Thr Leu Ala Arg Pro Asp Ala Thr 210 215 220 Gln Ser Gln Arg Arg Arg Lys Thr Val Arg Leu Leu Leu Ala Asn Leu 225 230 235 240 Val Ile Phe Leu Leu Cys Phe Val Pro Tyr Asn Ser Thr Leu Ala Val 245 250 255 Tyr Gly Leu Leu Arg Ser Lys Leu Val Ala Ala Ser Val Pro Ala Arg 260 265 270 Asp Arg Val Arg Gly Val Leu Met Val Met Val Leu Leu Ala Gly Ala 275 280 285 Asn Cys Val Leu Asp Pro Leu Val Tyr Tyr Phe Ser Ala Glu Gly Phe 290 295 300 Arg Asn Thr Leu Arg Gly Leu Gly Thr Pro His Arg Ala Arg Thr Ser 305 310 315 320 Ala Thr Asn Gly Thr Arg Ala Ala Leu Ala Gln Ser Glu Arg Ser Ala 325 330 335 Val Thr Thr Asp Ala Thr Arg Pro Asp Ala Ala Ser Gln Gly Leu Leu 340 345 350 Arg Pro Ser Asp Ser His Ser Leu Ser Ser Phe Thr Gln Cys Pro Gln 355 360 365 Asp Ser Ala Leu 370 <210> 5 <211> 1107 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 atggccaact ccacagggct gaacgcctca gaagtcgcag gctcgttggg gttgatcctg 60 gcagctgtcg tggaggtggg ggcactgctg ggcaacggcg cgctgctggt cgtggtgctg 120 cgcacgccgg gactgcgcga cgcgctctac ctggcgcacc tgtgcgtcgt ggacctgctg 180 gcggccgcct ccatcatgcc gctgggcctg ctggccgcac cgccgcccgg gctgggccgc 240 gtgcgcctgg gccccgcgcc atgccgcgcc gctcgcttcc tctccgccgc tctgctgccg 300 gcctgcacgc tcggggtggc cgcacttggc ctggcacgct accgcctcat cgtgcacccg 360 ctgcggccag gctcgcggcc gccgcctgtg ctcgtgctca ccgccgtgtg ggccgcggcg 420 ggactgctgg gcgcgctctc cctgctcggc ccgccgcccg caccgccccc tgctcctgct 480 cgctgctcgg tcctggctgg gggcctcggg cccttccggc cgctctgggc cctgctggcc 540 ttcgcgctgc ccgccctcct gctgctcggc gcctacggcg gcatcttcgt ggtggcgcgt 600 cgcgctgccc tgaggccccc acggccggcg cgcgggtccc gactccgctc ggactctctg 660 gatagccgcc tttccatctt gccgccgctc cggcctcgcc tgcccggggg caaggcggcc 720 ctggccccag cgctggccgt gggccaattt gcagcctgct ggctgcctta tggctgcgcg 780 tgcctggcgc ccgcagcgcg ggccgcggaa gccgaagcgg ctgtcacctg ggtcgcctac 840 tcggccttcg cggctcaccc cttcctgtac gggctgctgc agcgccccgt gcgcttggca 900 ctgggccgcc tctctcgccg tgcactgcct ggacctgtgc gggcctgcac tccgcaagcc 960 tggcacccgc gggcactctt gcaatgcctc cagagacccc cagagggccc tgccgtaggc 1020 ccttctgagg 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Val Val 130 135 140 Cys Leu Ala Val Cys Ala Phe Ile Val Leu Glu Asn Leu Ala Val Leu 145 150 155 160 Leu Val Leu Gly Arg His Pro Arg Phe His Ala Pro Met Phe Leu Leu 165 170 175 Leu Gly Ser Leu Thr Leu Ser Asp Leu Leu Ala Gly Ala Ala Tyr Ala 180 185 190 Ala Asn Ile Leu Leu Ser Gly Pro Leu Thr Leu Lys Leu Ser Pro Ala 195 200 205 Leu Trp Phe Ala Arg Glu Gly Gly Val Phe Val Ala Leu Thr Ala Ser 210 215 220 Val Leu Ser Leu Leu Ala Ile Ala Leu Glu Arg Ser Leu Thr Met Ala 225 230 235 240 Arg Arg Gly Pro Ala Pro Val Ser Ser Arg Gly Arg Thr Leu Ala Met 245 250 255 Ala Ala Ala Ala Trp Gly Val Ser Leu Leu Leu Gly Leu Leu Pro Ala 260 265 270 Leu Gly Trp Asn Cys Leu Gly Arg Leu Asp Ala Cys Ser Thr Val Leu 275 280 285 Pro Leu Tyr Ala Lys Ala Tyr Val Leu Phe Cys Val Leu Ala Phe Val 290 295 300 Gly Ile Leu Ala Ala Ile Cys Ala Leu Tyr Ala Arg Ile Tyr Cys Gln 305 310 315 320 Val Arg Ala Asn Ala Arg Arg Leu Pro Ala Arg Pro Gly Thr Ala Gly 325 330 335 Thr Thr Ser Thr Arg Ala Arg Arg Lys Pro Arg Ser Leu Ala 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<211> 334 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 36 Met Leu Gly Ile Met Ala Trp Asn Ala Thr Cys Lys Asn Trp Leu Ala 1 5 10 15 Ala Glu Ala Ala Leu Glu Lys Tyr Tyr Leu Ser Ile Phe Tyr Gly Ile 20 25 30 Glu Phe Val Val Gly Val Leu Gly Asn Thr Ile Val Val Tyr Gly Tyr 35 40 45 Ile Phe Ser Leu Lys Asn Trp Asn Ser Ser Asn Ile Tyr Leu Phe Asn 50 55 60 Leu Ser Val Ser Asp Leu Ala Phe Leu Cys Thr Leu Pro Met Leu Ile 65 70 75 80 Arg Ser Tyr Ala Asn Gly Asn Trp Ile Tyr Gly Asp Val Leu Cys Ile 85 90 95 Ser Asn Arg Tyr Val Leu His Ala Asn Leu Tyr Thr Ser Ile Leu Phe 100 105 110 Leu Thr Phe Ile Ser Ile Asp Arg Tyr Leu Ile Ile Lys Tyr Pro Phe 115 120 125 Arg Glu His Leu Leu Gln Lys Lys Glu Phe Ala Ile Leu Ile Ser Leu 130 135 140 Ala Ile Trp Val Leu Val Thr Leu Glu Leu Leu Pro Ile Leu Pro Leu 145 150 155 160 Ile Asn Pro Val Ile Thr Asp Asn Gly Thr Thr Cys Asn Asp Phe Ala 165 170 175 Ser Ser Gly Asp Pro Asn Tyr Asn Leu Ile Tyr Ser Met Cys Leu Thr 180 185 190 Leu Leu Gly Phe Leu Ile Pro Leu Phe Val Met Cys Phe Phe Tyr Tyr 195 200 205 Lys Ile Ala Leu Phe Leu Lys Gln Arg Asn Arg Gln Val Ala Thr Ala 210 215 220 Leu Pro Leu Glu Lys Pro Leu Asn Leu Val Ile Met Ala Val Val Ile 225 230 235 240 Phe Ser Val Leu Phe Thr Pro Tyr His Val Met Arg Asn Val Arg Ile 245 250 255 Ala Ser Arg Leu Gly Ser Trp Lys Gln Tyr Gln Cys Thr Gln Val Val 260 265 270 Ile Asn Ser Phe Tyr Ile Val Thr Arg Pro Leu Ala Phe Leu Asn Ser 275 280 285 Val Ile Asn Pro Val Phe Tyr Phe Leu Leu Gly Asp His Phe Arg Asp 290 295 300 Met Leu Met Asn Gln Leu Arg His Asn Phe Lys Ser Leu Thr Ser Phe 305 310 315 320 Ser Arg Trp Ala His Glu Leu Leu Leu Ser Phe Arg Glu Lys 325 330 <210> 37 <211> 1296 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 37 atgcaggcgc ttaacattac cccggagcag ttctctcggc tgctgcggga ccacaacctg 60 acgcgggagc agttcatcgc tctgtaccgg ctgcgaccgc tcgtctacac cccagagctg 120 ccgggacgcg ccaagctggc cctcgtgctc accggcgtgc tcatcttcgc cctggcgctc 180 tttggcaatg ctctggtgtt ctacgtggtg acccgcagca aggccatgcg caccgtcacc 240 aacatcttta tctgctcctt ggcgctcagt gacctgctca tcaccttctt ctgcattccc 300 gtcaccatgc tccagaacat ttccgacaac tggctggggg gtgctttcat ttgcaagatg 360 gtgccatttg tccagtctac cgctgttgtg acagaaatgc tcactatgac ctgcattgct 420 gtggaaaggc accagggact tgtgcatcct tttaaaatga agtggcaata caccaaccga 480 agggctttca caatgctagg tgtggtctgg ctggtggcag tcatcgtagg atcacccatg 540 tggcacgtgc aacaacttga gatcaaatat gacttcctat atgaaaagga acacatctgc 600 tgcttagaag agtggaccag ccctgtgcac cagaagatct acaccacctt catccttgtc 660 atcctcttcc tcctgcctct tatggtgatg cttattctgt acagtaaaat tggttatgaa 720 ctttggataa agaaaagagt tggggatggt tcagtgcttc gaactattca tggaaaagaa 780 atgtccaaaa tagccaggaa gaagaaacga gctgtcatta tgatggtgac agtggtggct 840 ctctttgctg tgtgctgggc accattccat gttgtccata tgatgattga atacagtaat 900 tttgaaaagg aatatgatga tgtcacaatc aagatgattt ttgctatcgt gcaaattatt 960 ggattttcca actccatctg taatcccatt gtctatgcat ttatgaatga aaacttcaaa 1020 aaaaatgttt tgtctgcagt ttgttattgc atagtaaata aaaccttctc tccagcacaa 1080 aggcatggaa attcaggaat tacaatgatg cggaagaaag caaagttttc cctcagagag 1140 aatccagtgg aggaaaccaa aggagaagca ttcagtgatg gcaacattga agtcaaattg 1200 tgtgaacaga cagaggagaa gaaaaagctc aaacgacatc ttgctctctt taggtctgaa 1260 ctggctgaga attctccttt agacagtggg cattaa 1296 <210> 38 <211> 431 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 38 Met Gln Ala Leu Asn Ile Thr Pro Glu Gln Phe Ser Arg Leu Leu Arg 1 5 10 15 Asp His Asn Leu Thr Arg Glu Gln Phe Ile Ala Leu Tyr Arg Leu Arg 20 25 30 Pro Leu Val Tyr Thr Pro Glu Leu Pro Gly Arg Ala Lys Leu Ala Leu 35 40 45 Val Leu Thr Gly Val Leu Ile Phe Ala Leu Ala Leu Phe Gly Asn Ala 50 55 60 Leu Val Phe Tyr Val Val Thr Arg Ser Lys Ala Met Arg Thr Val Thr 65 70 75 80 Asn Ile Phe Ile Cys Ser Leu Ala Leu Ser Asp Leu Leu Ile Thr Phe 85 90 95 Phe Cys Ile Pro Val Thr Met Leu Gln Asn Ile Ser Asp Asn Trp Leu 100 105 110 Gly Gly Ala Phe Ile Cys Lys Met Val Pro Phe Val Gln Ser Thr Ala 115 120 125 Val Val Thr Glu Met Leu Thr Met Thr Cys Ile Ala Val Glu Arg His 130 135 140 Gln Gly Leu Val His Pro Phe Lys Met Lys Trp Gln Tyr Thr Asn Arg 145 150 155 160 Arg Ala Phe Thr Met Leu Gly Val Val Trp Leu Val Ala Val Ile Val 165 170 175 Gly Ser Pro Met Trp His Val Gln Gln Leu Glu Ile Lys Tyr Asp Phe 180 185 190 Leu Tyr Glu Lys Glu His Ile Cys Cys Leu Glu Glu Trp Thr Ser Pro 195 200 205 Val His Gln Lys Ile Tyr Thr Thr Phe Ile Leu Val Ile Leu Phe Leu 210 215 220 Leu Pro Leu Met Val Met Leu Ile Leu Tyr Ser Lys Ile Gly Tyr Glu 225 230 235 240 Leu Trp Ile Lys Lys Arg Val Gly Asp Gly Ser Val Leu Arg Thr Ile 245 250 255 His Gly Lys Glu Met Ser Lys Ile Ala Arg Lys Lys Lys Arg Ala Val 260 265 270 Ile Met Met Val Thr Val Val Ala Leu Phe Ala Val Cys Trp Ala Pro 275 280 285 Phe His Val Val His Met Met Ile Glu Tyr Ser Asn Phe Glu Lys Glu 290 295 300 Tyr Asp Asp Val Thr Ile Lys Met Ile Phe Ala Ile Val Gln Ile Ile 305 310 315 320 Gly Phe Ser Asn Ser Ile Cys Asn Pro Ile Val Tyr Ala Phe Met Asn 325 330 335 Glu Asn Phe Lys Lys Asn Val Leu Ser Ala Val Cys Tyr Cys Ile Val 340 345 350 Asn Lys Thr Phe Ser Pro Ala Gln Arg His Gly Asn Ser Gly Ile Thr 355 360 365 Met Met Arg Lys Lys Ala Lys Phe Ser Leu Arg Glu Asn Pro Val Glu 370 375 380 Glu Thr Lys Gly Glu Ala Phe Ser Asp Gly Asn Ile Glu Val Lys Leu 385 390 395 400 Cys Glu Gln Thr Glu Glu Lys Lys Lys Leu Lys Arg His Leu Ala Leu 405 410 415 Phe Arg Ser Glu Leu Ala Glu Asn Ser Pro Leu Asp Ser Gly His 420 425 430 <210> 39 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 ctgtgtacag cagttcgcag agtg 24 <210> 40 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 gagtgccagg cagagcaggt agac 24 <210> 41 <211> 31 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 41 cccgaattcc tgcttgctcc cagcttggcc c 31 <210> 42 <211> 32 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 42 tgtggatcct gctgtcaaag gtcccattcc gg 32 <210> 43 <211> 20 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 43 tcacaatgct aggtgtggtc 20 <210> 44 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 44 tgcatagaca atgggattac ag 22 <210> 45 <211> 511 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 45 tcacaatgct aggtgtggtc tggctggtgg cagtcatcgt aggatcaccc atgtggcacg 60 tgcaacaact tgagatcaaa tatgacttcc tatatgaaaa ggaacacatc tgctgcttag 120 aagagtggac cagccctgtg caccagaaga tctacaccac cttcatcctt gtcatcctct 180 tcctcctgcc tcttatggtg atgcttattc tgtacgtaaa attggttatg aactttggat 240 aaagaaaaga gttggggatg gttcagtgct tcgaactatt catggaaaag aaatgtccaa 300 aatagccagg aagaagaaac gagctgtcat tatgatggtg acagtggtgg ctctctttgc 360 tgtgtgctgg gcaccattcc atgttgtcca tatgatgatt gaatacagta attttgaaaa 420 ggaatatgat gatgtcacaa tcaagatgat ttttgctatc gtgcaaatta ttggattttc 480 caactccatc tgtaatccca ttgtctatgc a 511 <210> 46 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 46 ctgcttagaa gagtggacca g 21 <210> 47 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 47 ctgtgcacca gaagatctac ac 22 <210> 48 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 48 caaggatgaa ggtggtgtag a 21 <210> 49 <211> 23 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 49 gtgtagatct tctggtgcac agg 23 <210> 50 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 50 gcaatgcagg tcatagtgag c 21 <210> 51 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 51 tggagcatgg tgacgggaat gcagaag 27 <210> 52 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 52 gtgatgagca ggtcactgag cgccaag 27 <210> 53 <211> 23 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 53 gcaatgcagg cgcttaacat tac 23 <210> 54 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 54 ttgggttaca atctgaaggg ca 22 <210> 55 <211> 23 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 55 actccgtgtc cagcaggact ctg 23 <210> 56 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 56 tgcgtgttcc tggaccctca cgtg 24 <210> 57 <211> 29 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 57 caggccttgg attttaatgt cagggatgg 29 <210> 58 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 58 ggagagtcag ctctgaaaga attcagg 27 <210> 59 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 59 tgatgtgatg ccagatacta atagcac 27 <210> 60 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 60 cctgattcat ttaggtgaga ttgagac 27 <210> 61 <211> 21 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 61 gacaggtacc ttgccatcaa g 21 <210> 62 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 62 ctgcacaatg ccagtgataa gg 22 <210> 63 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 63 ctgacttctt gttcctggca gcagcgg 27 <210> 64 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 64 agaccagcca gggcacgctg aagagtg 27 <210> 65 <211> 32 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 65 gatcaagctt ccatcctact gaaaccatgg tc 32 <210> 66 <211> 35 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 66 gatcagatct cagttccaat attcacacca ccgtc 35 <210> 67 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 67 ctggtgtgct ccatggcatc cc 22 <210> 68 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 68 gtaagcctcc cagaacgaga gg 22 <210> 69 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 69 cagcgcaggg tgaagcctga gagc 24 <210> 70 <211> 24 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 70 ggcacctgct gtgacctgtg cagg 24 <210> 71 <211> 22 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 71 gtcctgccac ttcgagacat gg 22 <210> 72 <211> 23 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 72 gaaacttctc tgcccttacc gtc 23 <210> 73 <211> 26 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 73 ccaacaccag catccatggc atcaag 26 <210> 74 <211> 27 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 74 ggagagtcag ctctgaaaga attcagg 27

Claims (11)

  1. 서열 번호 2, 서열 번호 4, 서열 번호 6, 서열 번호 8, 서열 번호 10, 서열 번호 12, 서열 번호 14, 서열 번호 16, 서열 번호 18, 서열 번호 20, 서열 번호 22, 서열 번호 24, 서열 번호 26, 서열 번호 28, 서열 번호 30, 서열 번호 32, 서열 번호 34, 서열 번호 36 및 서열 번호 38로 구성된 군으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하며, G 단백질 커플링 수용체(G-protein coupled receptor)를 코딩하는, 단리된 폴리뉴클레오티드.
  2. 제1항에 있어서, 뉴클레오티드 서열이, 서열 번호 1, 서열 번호 3, 서열 번호 5, 서열 번호 7, 서열 번호 9, 서열 번호 11, 서열 번호 13, 서열 번호 15, 서열 번호 17, 서열 번호 19, 서열 번호 21, 서열 번호 23, 서열 번호 25, 서열 번호 27, 서열 번호 29, 서열 번호 31, 서열 번호 33, 서열 번호 35 및 서열 번호 37로 구성된 군으로부터 선택되는 단리된 폴리뉴클레오티드.
  3. 제1항 또는 제2항에 따른 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터.
  4. 제3항에 있어서, 상기 벡터가 발현 벡터이고, 제1항 또는 제2항에 따른 폴리뉴클레오티드가 프로모터에 작동가능하게 연결된 벡터.
  5. 제3항에 따른 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포.
  6. 제4항에 따른 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포.
  7. 제1항 또는 제2항에 따른 단리된 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 G 단백질 커플링 수용체 폴리펩티드를 포함하는, 제5항의 재조합 숙주 세포의 단리된 막.
  8. (a) 제4항에 따른 발현 벡터를 숙주 세포에 트랜스펙션시켜 트랜스펙션된 숙주 세포를 생성하는 단계; 및
    (b) 상기 발현 벡터로부터 G 단백질 커플링 수용체가 발현되도록 하기에 충분한 조건 하에서 상기 트랜스펙션된 숙주 세포를 배양하는 단계
    를 포함하는, G 단백질 커플링 수용체의 제조 방법.
  9. 서열 번호 2, 서열 번호 4, 서열 번호 6, 서열 번호 8, 서열 번호 10, 서열 번호 12, 서열 번호 14, 서열 번호 16, 서열 번호 18, 서열 번호 20, 서열 번호 22, 서열 번호 24, 서열 번호 26, 서열 번호 28, 서열 번호 30, 서열 번호 32, 서열 번호 34, 서열 번호 36 및 서열 번호 38로 구성된 군으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함하는, 단리되거나 재조합된, G 단백질 커플링 수용체 폴리펩티드.
  10. (a) 제9항에 따른 G 단백질 커플링 수용체를 포함하는 재조합 숙주 세포 또는 그의 막을 후보 화합물과 접촉시키는 단계; 및
    (b) 상기 화합물이 G 단백질 커플링 수용체를 억제하거나 자극할 수 있는 능력을 측정하는 단계
    를 포함하는, G 단백질 커플링 수용체를 억제하거나 자극할 수 있는 1종 이상의 화합물을 확인하는 방법.
  11. 제9항에 따른 G 단백질 커플링 수용체를 포함하는 숙주 세포 또는 그의 막을 제공하고, 상기 G 단백질 커플링 수용체에 대한 후보 화합물을 스크리닝하는 것을 포함하는, 제약 제제를 위한 후보 화합물을 스크리닝하는 방법.
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