KR20010081991A - 돼지 써코바이러스 및 파보바이러스 백신 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 적어도 하나의 돼지 써코바이러스 항원, 바람직하게는 타입 Ⅱ의 항원, 및 적어도 하나의 돼지 파보바이러스 항원을 포함하는, 돼지의 전신소모성 증후군(PMWS)에 대한 항원성 제조물 및 백신에 관한 것이다.
Description
본 명세서에는 여러 가지 문헌이 인용되고 있고, 본 명세서에 인용된 문헌에도 여러 가지 문헌이 참조되거나 인용되고 있다. 이들 문헌 중 어느 것도 실제로 본 발명의 본 발명의 종래 기술이라고 인정하지 않는다. 본 명세서에서 인용된 모든 문헌 및 본 명세서에서 인용된 문헌에 참조되거나 인용된 모든 문헌은 참고문헌으로 인용된다.
PCV("Porcine CircoVirus")는 원래 돼지 신장 세포주 PK/15에서 비세포병원성 오염원으로 검출되었다. 이 바이러스는 닭 빈혈증 바이러스(CAV: Chicken Anaemia Virus)와 PBFDV 바이러스(Pscittacine Beak and Feather Disease Virus)와 함께, 써코바이러스(Circovirus) 종으로 분류된다. 이것은 1.76 내지 2.31 kb의 원형의 단일 사슬의 DNA 형태의 게놈을 포함하는 공통 특징을 가진 소형(15 내지 24 ㎚)의 논엔벨로프 바이러스(nonenveloped virus)이다. 본래 이 게놈은 약 30kDa 크기의 폴리펩티드를 코딩한다고 여겨졌다(Toddet al., Arch Virol 1991, 117; 129-135). 그러나 최근의 연구에서는 보다 복잡한 전사가 알려졌다(Meehan B. M.et al., 1997, 78; 221-227). 또한 공지된 3종류의 써코바이러스간에 뉴클레오타이드 서열 또는 일반 항원성 결정인자에서의 현저한 상동성이 밝혀지지 않았다.
PK/15 세포에서 유래된 PCV는 병원성이 아닌 것으로 여겨지고 있으며, 이 서열은 B.M. Meehan 등의 J. Gen. Virol 1997 (78) 221-227에 공지되어 있다. 아주 최근에서야 일부 학자들이 PCV의 균주들이 병원성일 수 있으며 PMWS 증후군과 관련되어 있을 수 있다고 생각하고 있다(Gupi P.S. Nayaret al., Can. Vet. J, vol. 38, 1997; 385-387 및 Clark E.G., Proc. Am. Assoc. Swine Prac. 1997; 499-501). Nayar 등은 PCR 기술을 이용하여 PMWS 증후군을 가진 돼지에서 PCV DNA를 검출하였다.
캐나다, 미국, 및 프랑스에서 검출된 PMWS 증후군은 점진적인 체중의 감소 및 빈호흡, 호흡곤란, 및 황달과 같은 임상적 증상으로 특징지어 지고 있다. 병인학적 관점에서, 림프세포 또는 육아종의 침윤, 림프절증 및 드물게 간염 및 림프세포 또는 육아종 신염과 같은 증상을 동반한다(Clark E.G., Proc. Am. Assoc. Swine Prac. 1997; 499-501; La Semaine Veterinaire No. 26, supplement to La Semaine Veterinaire 1996 (834); La Semaine Veterinaire 1997 (857); 54; Gupi P.S. Nayaret al., Can Vet. J, vol. 38, 1997; 385-387).
본 발명은 PMWS 증후군(돼지 전신소모성 증후군(Porcine Multisystemic Wasting Syndrome), 즉, 이유 후 전신소모성 증후군(Post-Weaning Multisystemic Wasting Syndrome))에 대한 백신에 관한 것이다.
도 1은 Imp. 1011-48121 균주 게놈의 DNA 서열이다.
도 2는 Imp. 1011-48285 균주 게놈의 DNA 서열이다.
도 3은 Imp. 999 균주 게놈의 DNA 서열이다.
도 4는 Imp. 1010 균주 게놈의 DNA 서열이다.
도 5는 도 1 내지 4에 따르는 4가지 서열과 PCV PK/15 균주 서열의 배열이다.
서열 목록
SEQ ID No: 1Imp 1011-48121 균주 게놈의 DNA 서열.
SEQ ID No: 2Imp 1011-48285 균주 게놈의 DNA 서열.
SEQ ID No: 3Imp 999 균주 게놈의 DNA 서열.
SEQ ID No: 4Imp 1010 균주 게놈의 DNA 서열.
SEQ ID No: 5PK/15 균주 게놈의 DNA 서열.
출원인은 캐나다, 미국(캘리포니아주), 및 프랑스(브리타니)에 위치한 농장에서 얻은 폐 또는 신경절 샘플로부터 5개의 새로운 PCV 균주를 분리하는데 성공하였다. 이들 바이러스는 PMWS 증후군을 앓는 돼지의 병변에서 검출하였지만, 건강한 돼지에서는 검출하지 않았다.
출원인은 프랑스에서 얻은 2개의 균주 외에도, 캐나다 및 미국에서 얻은 균주 등 총 4종류의 게놈들을 서열화하였다. 이 균주는 뉴클레오타이드 수준에서 서로 매우 강한 상동성(96% 이상)을 보이고, PK/15 균주와는 매우 약한 상동성(약 76%)을 보인다. 따라서 새로운 균주들은 새로운 돼지 써코바이러스를 표현하기 위해 타입 Ⅱ로 설정하고, 기존의 PK/15는 타입 Ⅰ으로 설정하였다.
정제하여 준비한 5개의 균주를 부다페스트 조약에 의거하여 ECACC(European Collection of Cell Cultures, Centre for Applied Microbiology & Research, 영국 Wiltshire SP4 0JG Salisbury Porton Down 소재)에 1997년 10월 2일 목요일자로
- 수탁번호 V97100219 (본 명세서에서는 Imp. 1008PCV라 칭함)
- 수탁번호 V97100218 (본 명세서에서는 Imp. 1010PCV라 칭함)
- 수탁번호 V97100217 (본 명세서에서는 Imp. 999PCV라 칭함)을 기탁하고,
1998년 1월 16일 금요일자로
- 수탁번호 V98011608 (본 명세서에서는 Imp. 1011-48285라 칭함)
- 수탁번호 V98011609 (본 명세서에서는 Imp. 1011-48121라 칭함)을 기탁하였다.
출원인은 돼지의 전신소모성 증후군을 실험실에서 재현하려는 실험에서 돼지써코바이러스와 혼합된 돼지 파보바이러스가 이 질병을 더 악화시킬 수 있다는 것을 관찰하였다.
따라서, 본 발명의 대상은 돼지 파보바이러스의 백신과 혼합된 돼지 써코바이러스, 특히 타입 Ⅰ 또는 타입 Ⅱ, 바람직하게는 타입 Ⅱ를 사용하는 돼지의 예방접종에 관한 것이다. 이것은 돼지 써코바이러스 백신과 돼지 파보바이러스 백신을 2종 백신의 혼합형 접종, 혹은 동시 접종의 방법으로 돼지에게 예방접종하는 것을 의미한다.
관련 파보바이러스 균주는 VR-742의 번호로 ATCC 콜렉션에 수탁된 NADL-2 균주이다. 돼지 파보바이러스에 대한 면역화 방법은 당업자에게 잘 알려져 있고 돼지 파보바이러스에 대한 백신은 상업적으로 시판되고 있다. 예를 들면 Parvovax™(MERIAL사 제품으로, 돼지 파보바이러스에 대한 불활성화 백신)이 언급될 수 있다. 또한, P. Vannier et A. Laval., Point. Vet. 1993, 25(151), 53-60; G. Florentet al.; 및 Proceedings of the Ninth Congress of Pig Veterinary Society, July 15-18, 1986, Barcelona, Spain을 참조할 수 있다. DNA 백신에 관해서는 WO-A-98-03658을 참조할 수 있다.
따라서 본 발명의 대상은, 적어도 하나의 돼지 써코바이러스 항원(바람직하게 타입 Ⅱ 써코바이러스) 및 적어도 하나의 돼지 파보바이러스 항원을 포함하는, PMWS 증후군에 대한 항원성 제조물에 관한 것이다. 본 발명에 있어, 돼지 써코바이러스 항원(바람직하게 타입 Ⅱ 써코바이러스) 및 돼지 파보바이러스 항원은 각각 약독화된 생 전체 항원, 불활성화된 전체 항원, 부분 항원, 재조합 생 벡터 및 DNA벡터를 포함하는 군으로부터 선택되는 항원으로 구성된다. 본 발명에 있어 조합물은, 모든 적합한 항원 또는 항원성 제조물 형태를 사용하는 것을 의미하며, 주어진 한 조합물에서 반드시 동일한 형태를 사용할 필요가 없다는 것을 나타낸다. 또한, 상기의 항원 제제는 자체로 공지되어 있고 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 부형제를 포함할 수 있고, 선택적으로 수의학적 관점에서 수용가능한 보조제를 포함할 수 있다.
본 발명의 대상은 또한, PMWS 증후군에 대한 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 기재된 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 부형제 및 선택적으로 수용가능한 보조제 내의 써코바이러스 + 파보바이러스의 유효량을 포함한다. 면역원성 조성물은 방위면역 또는 비방위면역 반응을 일으키며, 백신 조성물은 방위면역 반응을 일으키므로, "면역원성 조성물"이라는 용어에는 방위면역성 조성물을 포함할 수 있기 때문에 백신 조성물이 포함된다.
본 발명의 대상은 또한 개별적으로 포장된, 돼지 써코바이러스에 대한 항원 제제, 면역원성 조성물, 또는 백신 및 돼지 파보바이러스에 대한 항원 제제 또는 면역원성 조성물, 또는 백신을 포함하는 면역학적 또는 백신용 키트에 관한 것이다. 상기 키트는 항원 제제, 면역원성 조성물 및 백신에 대해 상기에서 설정된 다양한 특징을 가질 수 있다.
본 발명의 대상은 또한 PMWS 증후군에 대한 면역화 또는 예방접종 방법에 관한 것으로, 돼지 써코바이러스에 대한 면역원성 조성물 또는 백신의 투여 및 돼지 파보바이러스에 대한 면역원성 조성물 또는 백신의 투여, 혹은 동일한 제제에 양바이러스에 특이적인 항원 제제를 포함하는 2가의 면역원성 조성물 또는 백신을 투여하는 단계를 포함한다. 본 발명의 면역화 또는 예방접종 방법은 특히 상기에서 정의된 백신을 사용한다.
본 발명의 대상은 또한 상기에서 특정하게 한정되어 있는 바와 같이, 파보바이러스에 대한 항원 제제, 면역원성 조성물, 또는 백신을 돼지 써코바이러스에 대한 항원 제제, 면역원성 조성물, 또는 백신과 혼합하여 PMWS 증후군의 예방을 위해 사용하고자 하는 제약학적 조성물의 제조에 사용하는 용도에 관한 것이다.
써코바이러스 항원성 제조물의 제조를 위해 세포, 특히 예를 들면 PK/15 세포의 세포주에 계대접종시킨 후 써코바이러스를 얻을 수 있다. 배양 상층액 또는 추출물은, 선택적으로 표준 방법으로 정제되어 항원 제제에 사용될 수 있다.
약독화된 항원성 제조물 및 약독화된 면역원성 조성물 또는 백신의 제조에 있어, 약독화 과정은 종래의 방법으로 수행되는 데, 예를 들면 세포에 계대접종, 바람직하게 돼지 세포에 계대접종, 특히 PK/15 세포와 같은 세포주에 계대접종(예를 들면 50 내지 150, 특히 100의 정도로 계대접종)시키는 방법으로 실시된다. 이들 면역원성 조성물 및 백신은 일반적으로 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 희석제를, 선택적으로 수의학적 관점에서 수용가능한 보조제, 또는 선택적으로 동결전조 안정제를 포함한다.
이들 항원성 제조물, 면역원성 조성물 및 백신은 문제의 약독화 바이러스를 103내지 107TCID50 포함한다.
이들은 불활성화된 전체 항원을 기반으로 한 항원성 제조물, 면역원성 조성물, 및 백신일 수 있다. 불활성화된 면역원성 조성물 및 백신은 또한 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 희석제를, 선택적으로 수의학적 관점에서 수용가능한 보조제를 추가로 포함할 수 있다.
본 발명에 따르는 써코바이러스는, 혹시 존재할 수 있는 단편과 함께 당업자에게 알려진 공지 기술에 따라 불활성화된다. 이 불활성화는 화학적 방법으로, 예를 들면 항원을 포름알데히드(포르말린), 파라포름알데히드, β-프로피오락톤 또는 에틸렌이민 또는 이의 유도체들과 같은 화학물질에 노출시켜 실시하는 것이 바람직할 것이다. 본 명세서에서 바람직한 불활성화 방법은 화학물질, 특히 에틸렌이민 또는 β-프로피오락톤에 노출하는 것이다.
본 발명에 있어서 불활성화된 항원성 제조물 및 불활성화된 면역원성 조성물 및 백신에는 보조제의 보충이 선호되며, 바람직하게는 당업자에게 공지된 방법에 따라 에멀젼의 형태, 예를 들면 수중유적형 또는 유중수적형으로 제공되는 보조제가 사용된다. 이때, 보조제는 종래의 보조제 화합물로서의 단순 혼합 특성뿐 아니라, 실제 활성 성분으로서의 특성도 가질 수 있다.
사용할 수 있는 보조제로는 예를 들면 수산화알루미늄, 사포닌(예를 들면 Quillaja saponin 또는 Quil A; Vaccine Design, The Subunit and Adjuvant Approach, 1995, Michael F. Powel 및 Mark J. Newman 감수, Plennum Press, New-York and London, p210 참조), Avridine™(Vaccine Design p.148), DDA(Dimethyldioctadecylammonium Bromide, Vaccine Design p.157),Polyphosphazene(Vaccine Design p.204) 또는 미네랄 오일계통의 수중유적형 에멀젼, 스쿠알린(예를 들면, SPT 에멀젼, Vaccine Design p.147), 스쿠알린(예를 들면, MF59, Vaccine Design p.183), 대사가능한 오일 계통의 유중수적형 에멀젼(바람직하게는 WO-A-94 20071에 따름), 및 US-A-5,422,109에 기재된 에멀젼 등을 예로 들 수 있다. 또한 보조제들의 조합물, 예를 들면 에멀젼과 혼합된 Avridine™ 또는 DDA를 선택할 수 있다.
이들 항원 제제, 면역원성 조성물 및 백신은 문제의 불활성화된 전체 바이러스를 105내지 108TCID50 포함하는 것이 바람직할 것이다.
상기 기재된 생백신용 보조제는 불활성화된 백신용으로 제공된 것들 중에서 선택될 수 있으며, 에멀젼의 형태가 바람직하다. 불활성화된 백신용으로 지정된 것으로는 WO-A-9416681에 기재된 것들이 포함될 수 있다.
동결건조 안정제로는 SPGA(Bovarniket al., J. Bacteriology 59, 509, 950), 소르비톨, 만니톨, 전분, 슈크로즈, 덱스트란 또는 글루코스와 같은 탄수화물, 알부민 또는 카제인과 같은 단백질, 이들 화합물의 유도체, 또는 알칼리 금속인산염과 같은 완충제를 예로 들어 언급할 수 있다.
본 발명에 따르는 항원성 제조물, 면역원성 조성물 및 백신은, 본 발명에 따르는 하나 이상의 써코바이러스 및/또는 파보바이러스 중에서 하나 이상의 활성 성분(항원)으로 구성될 수 있다.
출원인은 또한 SEQ ID No: 1∼4로 명명된, 4가지 타입 Ⅱ 돼지 써코바이러스분리물의 게놈을 얻었다. 균주 PK-15의 서열은 SEQ ID No: 5로 제공된다. 본 발명은 자동적으로 등가의 서열을 자동적으로 포함한다는 것은 부언할 필요도 없는 것으로, 이 경우 서열은 기재된 서열 및 그 서열로 코딩되어 있는 폴리펩타이드의 기능성 또는 균주 특이성이 변하지 않는 서열들을 의미하여, 물론 코드의 변성으로 달라진 서열도 포함할 것이다.
본 발명은 또한 심한 가혹조건하에서 상기 서열과 혼성화할 수 있거나 및/또는 본 발명의 균주와 높은 상동성을 가진다는 점에서 등가의 서열을 포함한다.
이들 서열과 이들의 단편은 적합한 벡터를 사용하여 생체외 또는 생체내 폴리펩타이드 발현에 바람직하게 이용될 수 있다.
특히, 본 발명에 있어, DNA 단편들을 구성하는 해독개시영역들(open reading frame: ORF)(ORF1-13)이 타입 Ⅱ 써코바이러스의 게놈 서열상에서 밝혀졌으며, 이 효과를 위해 사용될 수 있다. 본 발명은 이들 ORFs(해당 아미노산 서열) 중 적어도 하나를 포함하는 모든 폴리펩티드에 관한 것이다. 바람직하게는, 본 발명은 원칙적으로 ORF4, ORF7, ORF10 또는 ORF13을 포함하는 단백질에 관한 것이다.
서브유닛의 생체의(in vitro) 발현을 위해서 발현수단으로 대장균(E. coli) 또는baculovirus가 바람직하게 사용될 수 있다(US-A-4,745,051). 코딩 서열(들) 또는 그 단편들은 바쿨로바이러스 게놈(예를 들면, thebaculovirusAutographa californica Nuclear Polyhedrosis Virus AcNPV)에 삽입되어 곤충 세포 예를 들면Spodoptera frugiperda SF9(ATCC CRL 1711로 기탁)에서 증식시킬 수 있다. 서브유닛은 이스트(예를 들면Saccharomyces cerevisiae) 또는 포유류 세포 (예를 들면CHO, BHK)와 같은 진핵세포에서 생산될 수도 있다.
본 발명의 대상은 또한 상기 발현 수단에 의해 생체외에서 생산되고, 이어서 선택적으로 종래의 방법에 따라 정제되는 폴리펩티드 서브유닛 용도에 관한 것이다. 서브 유닛 면역원성 조성물 및 백신들은 상기의 방법으로 얻어지는 적어도 하나의 폴리펩티드 또는 단편을 포함하며, 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 희석제 및 선택적으로 수의학적 관점에서 수용가능한 보조제를 함께 포함한다.
재조합 생체형 또는 DNA형 면역원성 조성물 및 백신을 생산하기 위해 생체내 발현을 할 경우, 코딩 서열(들) 또는 이들의 단편들은 폴리펩티드(들)의 발현을 허용하는 조건하에서 적합한 발현 벡터에 삽입된다. 적합한 생 벡터로서, 본 기술 분야의 당업자에게 공지된 기술에 따라서 바람직하게는 돼지에 비병원성인(자연적으로 비병원성이거나 비병원성이 됨) 생 바이러스를 사용하여 돼지에서 증식시킬 수 있다. 특히 Aujeszky 병 바이러스와 같은 돼지 헤르페스바이러스, 돼지 아데노바이러스, 폭스바이러스(poxviruses), 특히 백시니아 바이러스, 아비폭스 바이러스, 카나리폭스 바이러스, 돼지폭스 바이러스등을 사용할 수 있다. DNA 벡터들도 벡터로 사용할 수도 있다(WO-A-9011092, WO-A-9319813, WO-A-9421797, WO-A-9520660).
따라서, 본 발명의 대상은 벡터들 및 재조합 생체형 또는 DNA(폴리뉴클레오타이드)형의 면역원성 조성물 또는 제조된 백신, 이들의 제제 및 이들의 용도, 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 희석제를 추가로 포함하는 면역원성 조성물 및 백신에 관한 것이다.
정의하자면, DNA 면역원성 조성물 또는 백신은, 항원성 폴리펩티드를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 생체내에서 혼입하고 발현하는 원형 백신 플라스미드, 고차코일 등, 또는 직선상 DNA 분자 등의 DNA 벡터를 포함한다.
재조합 및 DNA형의 면역원성 조성물 및 백신은 보조제를 포함할 수도 있다.
혼합된 면역화 또는 예방접종 프로그램의 내용에서, 돼지 써코바이러스 및 돼지 파보바이러스에 대한 면역화 또는 예방접종을 다른 돼지의 병원체, 특히 PMWS 증후군과 관련된 병원체에 대한 면역화 또는 예방접종을 병행할 수 있다. 따라서 본 발명에 따르는 면역원성 조성물 또는 백신은 PRRS(Porcine Reproductory and Respiratory Syndrome) 및/또는Mycoplasma hyopneumoniae및/또는E. coli, 및/또는 Atrophic Rhinitis, 및/또는 Pseudorabies(Aujeszky's 병) 바이러스 및/또는 돼지 인플루엔자 및/또는Actinobacillus pleuropneumoniae및/또는 돼지 콜레라, 및 이의 조합물로부터 선택되는, 다른 돼지 병원체에 해당하는 결합가(valency)를 포함할 수도 있다. 바람직하게, 본 발명에 따르는 면역화 또는 예방접종의 프로그램 및 백신들은 써코바이러스 및 파보바이러스에 대한 면역화 또는 예방접종과 PRRS(WO-A-93/07898, WO-A-94/18311, FR-A-2 709 966; C. Charreyreet al., 영국 Birmingham에서 1998년 7월 5-9일에 열린 15th IPVS Congress의 회보, p 139) 및/또는 Mycoplasma hyopneumoniae(EP-A-597 852, EP-A-550 477, EP-A-571 648; O. Martinonet al., p 157, 284, 285 및 G. Reynaudet al., p 150, 상기 참조된 모든 자료는 15th IPVS Congress의 회보에 기재된 것임) 및/또는 돼지 인플루엔자에 대한 면역화 또는 예방접종을 아우를 것이다. 따라서 모든 적합한 형태의 면역원성 조성물 또는 백신, 특히 모든 시판되고 있는 백신을 사용하여 상기 기재된 돼지 써코바이러스 및 돼지 파보바이러스에 대한 면역원성 조성물 또는 백신과 혼합하는 것이 가능하다.
따라서, 본 발명의 대상은 다가의 면역원성 조성물들 및 백신들, 다중백신 키트들, 및 상기 혼합된 면역화 또는 예방접종 프로그램을 활용할 수 있도록 하는 혼합된 면역화 또는 예방접종 방법에 관한 것이다.
이하에서 본 발명은 다음의 도면을 참조로 하여 비제한적인 실시예에 의해 보다 상세하게 설명될 것이다.
실시예 1
돼지 써코바이러스 균주의 배양 및 분리
조직 샘플은 프랑스, 캐나다, 및 미국에서 새끼 돼지의 폐와 림프절에서 수집하였다. 이들 새끼 돼지는 이유후 전신소모성 증후군의 전형적인 임상적 증후를 보였다. 바이러스의 분리를 위해서, 조직 샘플은 해부직후 -70℃에서 동결시켰다.
바이러스의 분리를 위해, 약 15% 조직샘플을 Earle's 염(EMEM, BioWhittaker UK Ltd. 제품, 영국 Wokingham 소재), 페니실린(100 IU/㎖) 및 스트렙토마이신(100 ㎍/㎖)을 포함한 최소 배지(MEM-SA medium)에 현탁 준비한 후 멸균된 모르타르와 막자를 이용하여 멸균 모래로 조직을 분쇄하였다. 분쇄한 준비물은 MEM-SA 내에서 회수되여 +4℃, 3000 g에서 30분동안 원심분리하여 상층액을 회수하였다.
세포 배양물을 접종하기 전에 100 ㎕의 클로로포름을 각 상층액 2 ㎖에 첨가하고 실온에서 10분동안 연속적으로 혼합하였다. 혼합물을 미세원심분리관(microcentrifuge tube)으로 옮겨, 10분동안 3000 g에서 원심분리하고, 상층액을 회수하였다. 이 상층액은 바이러스 분리 실험을 위한 접종물로 사용하였다.
모든 바이러스 분리 연구는 돼지 써코바이러스(PCV), 페스티바이러스, 돼지 아데노바이러스, 및 돼지 파보바이러스(Allan G.et al., Pathogenesis of porcine circovirus experimental infection of colostrum-deprived piglets andexamination of pig foetal material. Vet. Mircobiol. 1995, 44, 49-64) 등으로 오염되지 않은 것으로 알려진 PK/15 세포 배양물에서 수행하였다.
돼지 써코바이러스의 분리는 다음의 방법으로 실행하였다:
단일층의 PK/15 세포를 포화상태의 배양물로부터 트립신 첨가(트립신-버신 혼합물)에 의해 분리하여, 페스티바이러스로 오염되지 않은 송아지 태아의 혈청 15%를 함유한 MEM-SA 배지(MEM-G 배지)에 ㎖당 약 400,000 세포를 종말 농도로 현탁 회수하였다. 이 세포 현탁액의 10 ㎖ 분취량을 상기 기재된 접종물의 2 ㎖의 분취량과 혼합하여 최종 혼합물을 2개의 25 ㎠의 Falcon 플라스크 내에 6 ㎖ 용량으로 나누어 담았다. 이들 배양물은 이후 +37℃에서 18시간동안 10% CO2를 포함하는 대기하에서 배양시켰다.
배양 후, 반-포화상 단일층의 배양 배지를 300 mM의 D-글루코자민(Cat #G48175, 영국 Poole 소재의 Sigma-Aldrich Company Limited)으로 처리하고(Tischr I.et al., Arch. Virol., 19879639-57), 배양은 +37℃에서 48-72 시간의 추가 기간동안 계속하였다. 이 최종 배양 후에, 각 접종물의 2개의 Falcons 중 하나에 동결/해동 싸이클을 3회 연속 실행하였다. 남은 Falcon의 PK/15 세포는 트립신-버신(versene) 용액으로 처리후, 20 ㎖의 MEM-G 배지에서 재현탁하여 400,000 세포/㎖ 농도로 75 ㎠ Falcon에 접종시켰다. 새로이 접종된 플라스크는 동결/해동 싸이클 후에 얻은 해당 용출물 5㎖을 첨가하여 "중복감염"시켰다.
실시예 2
면역형광법 또는
in situ
혼성화법에 의한 돼지 써코바이러스 검출용 세포 배양물 샘플의 제조
"중복감염된" 현탁액 5㎖를 회수하여 멸균된 무지방 유리 커버슬립을 가진 55 ㎜ 지름의 페트리 디시에 접종하였다. 플라스크 내 및 유리 커버슬립 상에 있는 배양물을 +37℃에서 배양시키고 실시예 1에 기재된 바와 같이 글루코자민으로 처리하였다. 유리 커버슬립 상의 배양물은 글루코자민으로 처리하고 24 내지 48시간 후에 회수하여, 실온에서 10분 동안 아세톤으로 또는 4시간 동안 10% 완충된 포름알데히드로 고정하였다. 고정 후, 모든 유리 커버슬립을 -70℃에서 실리카겔 상에 저장한 후,in situ혼성화 연구 및 면역세포화학적 라벨링 연구에 이용하였다.
실시예 3
in situ
혼성화에 의한 PCV 서열의 검출방법
질병에 걸린 돼지로부터 수집하고 포름알데히드로 고정한 조직상에in situ혼성화를 실시하고, 또한 바이러스 분리를 위해 접종하고(실시예 2 참조) 유리 커버슬립상에 고정한 세포 배양물의 제조물에in situ혼성화를 실시하였다.
PK/15 돼지 써코바이러스(PCV) 및 감염성 닭 빈혈 바이러스(CAV)에 해당하는 전체 게놈 프로브를 사용하였다. PCV 게놈의 복제형을 함유한 플라스미드 pPCV1은 단독 1.7 킬로 염기쌍(kbp) 삽입물의 형태로 클론화하였고(Meehan B.et al., Sequence of porcine circovirus DNA: affinities with plant circoviruses, J. Gen. Virol. 1997,78, 221-227), PCV용 특정 바이러스의 DNA 공급원으로 사용하였다. 유사종의 플라스미드인 pCAA1는 조류의 써코바이러스 CAV의 2.3 kbp 복제형을포함하여 음성 대조물로 이용하였다. 2개의 플라스미드 각각의 글리세롤 보관액은 알칼리 용해법(Sambrook J.et al., Molecular cloning; A Laboratory Manual. 2nd Edition, Clod Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1989)에 따라 플라스미드를 생산하고 정제하는 데 이용하였으며, 이들은 프로브 제조용 템플릿으로 사용되었다. PCV 및 CAV의 완전 게놈을 표식하는 써코바이러스 프로브는 상기에서 언급된 정제된 플라스미드(각 프로브당 1 ㎍) 및 시판되는 비방사성 라벨링 키트("DIG DNA 라벨링 키트" 영국 Lewes 소재의 Boehringer Mannheim사 제품)를 사용하여 공급자의 권고사항에 따라 랜덤하게 헥사뉴클레오티드 프라이머로부터 제조되었다.
디곡시게닌(digoxigenin)-라벨된 프로브를 멸균수 50-100 ㎕에 첨가 후in situ혼성화에 사용하였다.
포름알데히드로 고정된 감염된 세포 배양물의 제조물과 마찬가지로, 파라핀으로 포장되고 포름알데히드로 고정된 질병에 걸린 돼지 조직 샘플을 다음의 방법에 따라 PCV 핵산을 검출하기 위해 준비하였다:
파라핀으로 봉해진 조직 블록으로부터 5 ㎛ 두께의 섹션을 절단하여 파라핀을 제거하고, 이어서 용액내 알콜 농도를 연속적으로 감소시켜 가면서 세포를 재수화(rehydrated)하였다. 포름알데히드로 고정시킨 조직 섹션 및 세포 배양물은 +37℃에서 0.5% 단백질분해효소 K와 5 mM EDTA(pH 7.6)를 포함한 0.05M 트리스-HCl 버퍼 용액내에서 각각 15 분 및 5분동안 배양하였다. 슬라이드는 이후 1% 글리신 용액이 함유된 멸균 증류수 내에 30초 동안 침수시키고, 0.01 M PBS 버퍼(인산염 완충된 식염수)(pH 7.2)로 2회 세척하고 멸균 증류수로 5분 동안 최종 세척하였다. 이들은 대기 상에서 최종적으로 건조하고 프로브와 접촉 반응시켰다.
각 조직/프로브 제조물은 깨끗한 무지방 유리 커버슬립으로 덮고 +90℃ 오븐 내에서 10분동안 방치후, 1분간 얼음 조각상에 접촉 방치시키고 최종적으로 +37℃에서 18시간동안 배양하였다. 제조물은 이후 2X 구연산나트륨염(SSC) 버퍼에 잠시 침지하여 보호용 유리 커버슬립을 제거하고 이어서 2X SSC 버퍼로 5분간 2회 세척하고, 최종적으로 PBS 버퍼로 5분간 2회 세척하였다.
세척 후, 제조물은 0.1 M 말레인산, 0.15M NaCl(pH 7.5)(말레인산 버퍼)에서 10분동안 침지시키고 이어서 +37℃에서 1% 차단제(Cat # 1096176, 영국 East sussex Lewis 소재의 Boehringer Mannheim UK사 제품)를 포함한 말레인산 버퍼 용액에서 20분간 배양하였다.
제조물은 이후 차단제 완충액에 1/250배 희석된 항-디곡시게닌 모노클론 항체(Boehringer Manheim) 용액을 사용하여 +37℃에서 1시간동안 반응시키고 PBS로 세척후, 최종적으로 +37℃에서 30분간 비오틴이 융합된 항-마우스 면역글로블린 항체로 배양하였다. 제조물은 PBS로 세척하고 내인성 퍼옥시다제 활성은 실온에서 20분간 0.5% 과산화수소를 포함한 PBS 용액으로 처리하여 차단하였다. 제조물은 다시 PBS로 세척하고, 사용 직전에 준비된 3-아미노-9-디에틸카르바졸(AEC) 기질(영국 Cambridge 소재의 Cambridge Bioscience)로 처리하였다.
흐르는 물로 최종 세척 후, 제조물은 헤마톡실린으로 대조 염색시키고, 흐르는 물 아래에서 "청색화"시킨 후, 봉입액(GVA Mount, 영국 Cambridge 소재의Cambridge Bioscience)으로 현미경용 유리 커버슬립 상에 고정하였다. 실험 대조군은 부적절한 음성 프로브(CAV) 및 양성 프로브(PCV)를 병에 걸린 돼지 및 병에 걸리지 않은 돼지로부터 얻어진 샘플에 반응시켜 얻을 수 있었다.
실시예 4
면역현광법으로 PCV를 검출하는 기술
아세톤으로 고정된 모든 세포 배양물 제조물의 초기 스크리닝은 성장한 돼지 혈청 풀의 1/100 희석물을 이용하여 간접 면역형광법(IIF)으로 수행하였다. 이 혈청 풀은 북아일랜드 산의 25마리의 성장한 암퇘지에서 얻은 혈청을 포함하고, PCV, 돼지 파보바이러스, 돼지 아데노바이러스, 및 PRRS 바이러스를 포함하는 다양한 돼지 바이러스에 대한 항체를 포함하는 것으로 알려졌다. IIF방법은 PBS로 희석된 혈청을 +37℃에서 1시간동안 세포 배양물에 접촉시킨 후, PBS로 2회 세척하여 수행되었다. 이후, 세포 배양물은 형광성 이소티오시아네이트와 접합된 토끼의 항-돼지 면역글로블린 항체를 PBS로 1/80 희석시킨 용액 내에서 1시간 동안 염색하고, PBS로 세척후 글리세롤 완충액내에서 고정한 후 자외선 하에서 현미경으로 관찰하였다.
실시예 5
질병에 걸린 돼지 조직에서
in situ
혼성화의 결과
PCV 게놈 프로브를 이용한in situ혼성화는 프랑스, 캐나다, 및 캘리포니아의 전신소모성 병변을 가진 새끼돼지로부터 수집하여 포름알데히드로 고정화시킨 조직들을 사용하여 수행되었고 여러 가지 병변의 연구에서 병변과 관련된 PCV 핵산의 존재를 보여주었다. PCV 게놈 프로브를 병에 걸리지 않은 돼지로부터 수집한 조직에 사용한 경우 또는 CAV 프로브를 병에 걸린 돼지 조직에 사용한 경우에서는 증후가 관찰되지 않았다. PCV 핵산의 존재는 캘리포니아 세끼 돼지의 폐의 병변을 침윤한 여러 가지 단핵 세포의 세포질 및 핵에서 동정되었다. PCV 핵산의 존재는 또한 폐렴세포, 기관지 및 기관세지의 상피세포에서 관찰되고 동맥, 소정맥, 및 림프의 혈관의 내피세포에서 관찰되었다.
질병에 걸린 프랑스의 돼지에서 PCV 핵산의 존재는 다양한 소낭의 림프세포의 세포질 및 림프절의 동양혈관내의 단핵세포에서 검출되었다. PCV 핵산은 또한 우발성 합포(occasional syncytia)에서도 관찰되었다. 이들 검출 결과에 의하여, 캘리포니아 돼지 폐, 프랑스 돼지 장간막 림프절 및 캐나다 돼지 기관의 샘플을 새로운 돼지 써코바이러스 균주를 분리시키기 위해 선택하였다.
실시예 6
새로운 돼지 써코바이러스 균주의 세포 배양 및 면역형광법에 의한 검출 결과
전신소모성 증후군의 임상적 증후를 보이는 프랑스산 새끼 돼지(Imp. 1008 균주), 캘리포니아산 새끼 돼지(Imp. 999 균주) 및 캐나다산 새끼 돼지(Imp. 1010 균주)로부터 수집된 샘플로 접종된 세포 배양물에서 세포변성효과(cytopathic effect: CPE)는 관찰되지 않았다. 그러나 접종된 세포 배양물에서 얻어진 제조물을 아세톤을 이용하여 고정한 후 실시한, 돼지의 폴리클론 혈청의 풀을 이용한 면역 라벨화 결과 캘리포니아산 새끼 돼지의 폐(Imp. 999 균주), 프랑스산 새끼 돼지의 종격 림프절(Imp. 1008 균주), 및 캐나다산 새끼 돼지의 기관(Imp.1010 균주)을 이용하여 접종한 배양물의 경우 많은 세포에서 핵 형광성을 보였다.
실시예 7
돼지 써코바이러스 게놈 DNA의 추출
CAV의 복제형을 클론화하기 위해 기재된 바(Todd. D.et al., Dot blot hybridization assay for chicken anaemia agent using a cloned DNA probe. J. Clin. Microbiol. 1991,29, 933-939)와 같이, 감염시킨 PK/15 세포 배양물(실시예 1 참조)(75 ㎠의 10개의 Falcon Flask)을 이용, 72-76시간 배양후 회수하고 글루코사민으로 처리하여 돼지 써코바이러스(PCV)의 새로운 균주의 복제형을 제조하였다. 이들 복제형의 이중 사슬의 DNA는 Hirt 방법(Hirt B. Selective extraction of polyoma virus DNA from infected cell cultures, J. Mol. Biol. 1967,36, 365-369)을 개선하여 Molitor에 의해 기술된 바(Molitor T.W.et al., Porcine parvovirus DNA: characterization of the genomic and replicative form DNA of two virus isolates, Virology, 1984,137, 241-254)에 따라 추출하였다.
실시예 8
돼지 써코바이러스 Imp. 999 균주의 게놈의 복제형의 제한 맵
Hirt 발명에 따라 추출된 DNA(1-5 ㎍)을 공급자의 권고사항에 따라 S1 뉴클레아제(Amersham)로 처리하고, 이어서 DNA를 여러 가지 제한 효소(영국 East Sussex Lewis 소재의 Boehringer Mannheim사 제)로 절단한 후, 분해 산물을 Todd 등에 의해 설명된 바(Purification and biochemical characterization of chickenanemia agent, J. Gen. Virol. 1990,71, 819-823)와 같이 에티디움 브로마이드의 존재하의 1.5% 아가로즈 겔상에서 전기영동법으로 분해시켰다. Imp. 999 균주의 배양물로부터 추출된 DNA는 한개의 EcoRI 자리, 2개의 SacI 자리를 소유하고 PstI 자리를 소유하지 않는다. 이로부터 이 제한 프로파일은 한 개의 PstI 자리를 소유하나 EcoRI 자리를 소유하지 않은 PCV PK/15 균주(Meehan B.et al., Sequence of porcine circovirus DNA; affinities with plant circoviruses, 1997,78, 221-227)의 제한 프로파일과 차이가 있음을 알 수 있다.
실시예 9
돼지 써코바이러스 Imp. 999 균주의 게놈의 클론화
제한 효소인 EcoRI에 의해 PCV Imp.999 균주의 이중 사슬 복제형을 절단하여 얻은 약 1.8 kbp의 제한 단편을 1.5% 아가로스 겔에서 전기영동(실시예 3 참조)으로 분리 후 Qiagen 시판용 키트(QIAEXII Gel Extraction Kit, Cat #20021, QIAGEN Ltd., 영국 West Sussex Crawley 소재)를 사용하여 정제하였다. 이 EcoRI-EcoRI 제한 단편은 일반적인 클로닝방법(Sambrook J.et al., Molecular cloning: A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1989)에 따라, 미리 동일한 제한 효소로 절단 및 탈인산화된 벡터 pGEM-7(Promega, Medical Supply Company, 아일랜드 Dublin 소재)에 결찰시켰다. 얻어진 플라스미드로 표준 방법에 따라Esherichia coliJM109 숙주 균주(Stratagene사 제품, 미국 La Jolla 소재)를 형질전환시켰다. 또한 PCV Imp.999 균주의 EcoRI-EcoRI 제한 단편은 벡터 pBlueScript SK+(Stratagene Inc.제품, 미국 La Jolla 소재)의 EcoRI 자리로도 클론화되었다. 각 숙주 균주에서 얻어진 클론 중에서, 예상된 크기의 단편을 포함하는 적어도 2개의 클론을 선택하였다. 얻어진 클론을 배양하여, 표준 플라스미드 제조방법 및 정제방법에 따라 Imp.999 균주의 전체 게놈을 포함하는 플라스미드를 소량(2 ㎖) 또는 다량(250 ㎖)으로 정제하였다.
실시예 10
PCV Imp.999 균주의 게놈 DNA(이중 사슬 복제형)의 서열화
2개의 EcoRI Imp.999 클론(클론 pGEM-7/2 및 pGEM-7/8)의 염기 서열은, 공급자의 권고사항에 따라 "AmpliTaq DNA 폴리머라제 FS"(Cat #402079 PE Applied Biosystems, 영국 Warrington 소재)의 서열화 키트와 Applied BioSystems AB1373A 자동 서열화 장치를 사용하여 Sanger's 다이데옥시뉴클레오타이드(dideoxynucleotide)방법에 따라 결정하였다. 초기 서열화 반응은 M13 "전진(forward)" 및 "복역(reverse)" 광범위 프라이머들에 의해 실행하였다. 이어지는 서열화 반응은 "DNA walking" 방법에 따라 이루어졌다. 이들 후속 서열화에 필수적인 올리고뉴클레오타이드는 Life Technologies사(Inchinnan Business Park, 영국 Paisley 소재)에서 합성되었다.
생성된 서열을 조합하여 MacDNASIS 버전 3.2 소프트웨어(Cat # 22020101, Appligene 제품, 영국 Durham 소재)에 의해 분석하였다. 여러 ORF이 "National Center for Biotechnology Information"(NCBI 제품, 미국 메릴랜드주 Bethesda 소재) 서버에서 공급되는 BLAST 알고리즘에 의해 분석되었다.
전체 서열(EcoRI-EcoRI 단편)은 SEQ ID No: 3(도 3)에 나타내었다. 이것은 상기 균주의 전체 서열로서, 첫 번째 뉴클레오타이드가 G인 EcoRI 자리에서 임의로 시작한다.
본 발명에 따르는 다른 3가지 분리물의 서열(SEQ ID No: 1, 2 및 4와 도 1, 2 및 4 참조)도 유사한 방법으로 얻어졌다.
이들 4개의 균주들의 게놈의 크기는 다음과 같다:
Imp. 1011-48121 1767개의 뉴클레오타이드
Imp. 1011-48285 1767개의 뉴클레오타이드
Imp. 999 1768개의 뉴클레오타이드
Imp. 1010 1768개의 뉴클레오타이드
실시예 11
PCV Imp.999 균주의 서열 분석
Imp.999 균주에서 얻어진 서열을 사용하여 GenBank 데이터뱅크에 포함된 서열에 대한 상동성을 검사했는데, 검출된 현저한 상동성은 유일하게 PK/15 균주(수탁번호 Y09921 및 U49186)(도 5 참조)의 서열에서 보였으며, 약 76%(핵산 수준에서)의 상동성이었다.
아미노산 수준의 상동성 검색의 경우, 데이터뱅크(NABI 서버에서 BLAST X 알고리즘)와 6개 상(phases)에서 서열 번역물과의 상동성을 검색한 결과 GenBank U49186 서열에 의해 코딩된 식물의 써코바이러스와 유사한 BBTV 바이러스의 이론적인 레플리카제에 해당하는 ORF(GenBank 동정 번호 1841515)와 94% 상동성을 보일수 있었다.
데이터뱅크에 포함된 다른 서열들은 PCV Imp.999 균주에서 얻어진 서열과 현저한 상동성을 보여주지 못했다.
전신소모성 증후군의 임상적 징후를 보이는 캘리포니아산 새끼돼지에서 수집한 병변을 이용하여 배양된 Imp.999 균주에서 얻어진 서열의 분석 결과, 바이러스 분리물이 새로운 돼지 써코바이러스 균주라는 것을 명확하게 나타난다.
실시예 12
서열의 비교 분석
4개의 새로운 PCV 균주의 뉴클레오타이드 서열을 PCV PK/15 균주 서열과 함께 배열하였다(도 5). 4개의 새로운 균주와 이전의 PK/15 균주를 비교한 상동성 매트릭스를 구성하였고 그 결과는 다음과 같다:
1: Imp. 1011-48121
2: Imp. 1011-48285
3: Imp. 999
4: Imp. 1010
5: PK/15
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
| 1 | 1.0000 | 0.9977 | 0.9615 | 0.9621 | 0.7600 |
| 2 | 1.0000 | 0.9621 | 0.9632 | 0.7594 | |
| 3 | 1.0000 | 0.9949 | 0.7560 | ||
| 4 | 1.0000 | 0.7566 | |||
| 5 | 1.0000 |
2개의 프랑스산 균주 Imp.1011-48121 및 Imp.1011-48285 사이의 상동성은 99% 이상(0.9977)이었다.
2개의 북미산 균주 Imp.999와 Imp.1010 사이의 상동성은 또한 99% 이상(0.9949)이었다. 프랑스산 균주들과 북미산 균주들 사이의 상동성은 96%보다 약간 컸다.
이들 모든 균주와 PK/15 사이의 상동성은 75 내지 76% 정도에 그쳤다.
따라서, 본 발명에 따르는 균주는 PK/15 균주에 의해 대표되는 타입과 구별되는 새로운 타입의 돼지 써코바이러스의 전형이라는 것이 추론된다. PMWS 증후군을 보이는 돼지에서 분리된 상기의 새로운 형태는, 타입 Ⅱ 돼지 써코바이러스로 명칭하였고, PK/15는 타입 Ⅰ으로 표현된다. 상기 타입 Ⅱ에 속하는 균주들은 지리적으로 거리가 먼 지역에서 분리되었다는 사실에도 불구하고 현저한 뉴클레오타이드 서열 상동성을 보인다.
실시예 13
새로운 PCV 균주의 게놈에 의해 코딩된 단백질의 분석
Imp. 1010 분리물의 뉴클레오타이드 서열은 전신소모성 증후군과 관련된 기타 써코바이러스 균주의 전형으로 고려되었다. 이 서열은 BLASTX 알고리즘(Altschulet al., J. Mol. Biol. 1990.215. 403-410) 및 MacVector 6.0소프트웨어(Oxford Molecular Group 제품, 영국 Oxford OX4 4GA 소재)의 일련의 프로그램에 의해 보다 상세하게 분석되었다. 상기 서열상에서 20개 이상의 아미노산을 가지는 13개의 ORF를 밝혀낼 수 있었으며 이들 13개의 ORF는 다음과 같다:
| 명칭 | 개시점 | 종결점 | 사슬 | ORF의 크기(뉴클레오타이드(nt)) | 단백질 크기(아미노산(aa)) |
| ORF1 | 103 | 210 | 센스 | 108 nt | 35 aa |
| ORF2 | 1180 | 1317 | 센스 | 138 nt | 45 aa |
| ORF3 | 1363 | 1524 | 센스 | 162 nt | 53 aa |
| ORF4 | 398 | 1342 | 센스 | 945 nt | 314 aa |
| ORF5 | 900 | 1079 | 센스 | 180 nt | 59 aa |
| ORF6 | 1254 | 1334 | 센스 | 81 nt | 26 aa |
| ORF7 | 1018 | 704 | 안티센스 | 315 nt | 104 aa |
| ORF8 | 439 | 311 | 안티센스 | 129 nt | 42 aa |
| ORF9 | 190 | 101 | 안티센스 | 90 nt | 29 aa |
| ORF10 | 912 | 733 | 안티센스 | 180 nt | 59 aa |
| ORF11 | 645 | 565 | 안티센스 | 81 nt | 26 aa |
| ORF12 | 1100 | 1035 | 안티센스 | 66 nt | 21 aa |
| ORF13 | 314 | 1381 | 안티센스 | 702 nt | 213 aa |
각 ORF의 개시점과 종결점은 균주 1010의 게놈인 도 4(SEQ ID No. 4)의 서열에 따른 것으로, ORF 1∼13의 상기 한계는 균주 999와 동일하다. 이들은 또한 균주 1011-48121과 1011-48285와도 ORF 3 및 13을 제외하고는 동일하다.
ORF3 1432-1539, 센스, 108 nt, 35 aa
ORF13 314-1377, 안티센스, 705 nt, 234 aa
이들 13개의 ORF중에서, 4개는 클론화된 바이러스 PCV PK-15의 게놈에 위치한 동종 ORF와 현저한 상동성을 가지는 데 이 4개의 각 ORF가 전신소모성 증후군과 관련된 모든 써코바이러스 분리물의 게놈에 존재한다는 것이 분석되었다. 이들 4개의 ORF는 다음과 같다:
| 명칭 | 개시점 | 종결점 | 사슬 | ORF의 크기(뉴클레오타이드(nt)) | 단백질 크기(아미노산(aa)) | 분자량 |
| ORF4 | 398 | 1342 | 센스 | 945 nt | 314 aa | 37.7 kDa |
| ORF7 | 1018 | 704 | 안티센스 | 315 nt | 104 aa | 11.8 kDa |
| ORF10 | 912 | 733 | 안티센스 | 180 nt | 59 aa | 6.5 kDa |
| ORF13 | 314 | 1381 | 안티센스 | 702 nt | 233 aa | 27.8 kDa |
각 ORF의 개시점과 종결점은 도 4(SEQ ID No. 4)에 나타난 서열에 따르며, ORF의 크기(뉴클레오타이드(nt) 상에서)는 종결 코돈을 포함한다.
PCV Imp.1010과 PCV PK-15 분리물의 게놈 조직 간 비교에서 상기 4개의 ORF사 2개의 바이러스의 게놈에서 보존됨이 밝혀졌다. 아래의 표는 관찰된 상동성의 정도를 나타낸다:
| ORF Imp. 1010/ORF PCV PK-15 | 상동성 % |
| ORF4/ORF1 | 86% |
| ORF13/ORF2 | 66.4% |
| ORF7/ORF3 | 61.5%(오버랩의 수준에서(104 aa)) |
| ORF10/ORF4 | 83%(오버랩 수준에서(59 aa)) |
ORF4 Imp.1010과 ORF1 PK-15 사이에서 가장 큰 서열 상동성이 관찰되었다(86% 상동성). 이 단백질은 아마도 바이러스 DNA의 복제에 관련될 것이고 바이러스 복제에 필수적일 것으로 예측되었다(Meehanet al., J. Gen. Virol. 1997.78. 221-227; Mankertzet al., J. Gen. Virol. 1998.79. 381-384).
ORF13 Imp.1010과 ORF2 PK-15 사이의 서열 상동성은 덜 강하지만(66.4% 상동성), 이들 2가지 ORF 각각은 조류의 써코바이러스인 CAV의 주요 구조 단백질의 N-말단 영역에 동일한 고 보존된(highly conserved) N-말단 기본 영역을 갖는다(Meehanet al., Arch. Virol. 1992.124. 301-319). 또한, ORF7 Imp. 1010과 ORF3 PK-15 간 및 ORF10 Imp.1010과 ORF4 PK-15 간에서도 큰 차이가 관찰되었다. 각기 경우에서, Imp.1010 분리물의 ORF7과 ORF10을 PCV PK-15의 ORF3과 ORF4와 비교한 경우, Imp.1010 분리물의 ORF7과 ORF10의 C-말단 영역의 결손이 있다. 가장 큰 서열 상동성은 ORF7/ORF3의 N-말단 영역(오버랩의 수준에서 61.5% 상동성) 및 ORF10/ORF4의 N-말단 영역(오버랩 수준에서 83% 상동성)에서 관찰되었다.
돼지 써코바이러스의 게놈 조직은, 게놈 자체의 극단적인 조밀성으로 인하여 상당히 복잡하다. 주요한 구조 단백질은 돼지 써코바이러스 게놈의 동일 사슬상에 위치한 여러 가지 RF(reading frame) 간의 접목에서 유래할 것으로 추측된다. 따라서 상기 표에 기재된 바와 같이 모든 ORF(ORF 1 내지 ORF13에 이루는)가 타입 Ⅱ 돼지 써코바이러스에 의해 코딩된 항원성 단백질의 전체 또는 일부를 나타낼 수 있으며, 따라서 특정 진단 및/또는 예방접종에 사용가능한 잠재적인 항원으로 고려될 수 있다. 따라서 본 발명은 이들 ORF중 적어도 하나를 포함하는 모든 단백질을 포함하는 것이다. 바람직하게 본 발명은 ORF4, ORF7, ORF10, 또는 ORF13을 필수적으로 포함하는 단백질에 관한 것이다.
실시예 14
새로운 균주로부터 클론화된 PCV 게놈의 감염 특성
Imp.999 분리물의 완전 게놈(복제형)을 포함하는 플라스미드 pGEM-7/8을 사용하여 Meehan B.et al.(Characterization of viral DNAs from cells infected with chicken anemia agent: sequence analysis of the cloned replicative form and transfection capabilities of cloned genome fragments. Arch. Virol. 1992,124, 301-319)의 방법에 따라 PK/15세포를 형질감염시켰다. 오염되지 않은 PK/15 세포를 형질감염시킨 후 첫 번째 계대접종하여 면역형광분석(실시예 4 참조)한 결과, 클론 pGEM7/8의 플라스미드가 감염형 PCV 바이러스의 생산을 유도할 수 있다는 것이 밝혀졌다. 감염형 PCV 유전 물질을 포함하는 클론이 사용가능해졌으므로, 바이러스 게놈상에 유용가능한 모든 조직을 실시하여 개선된 PCV 바이러스(돼지에서 약독화되거나 결손형의)를 조성한 후, 재조합 백신의 생산 또는 진단 키트용 항원의 생산에 사용할 수 있게 되었다.
실시예 15
생체외(in vitro) 배양에 의한 PCV 항원의 생산
오염되지 않은 PK/15 세포의 배양 및 바이러스 증식을 실시예 1에서와 동일한 방법에 따라 실시하였다. 감염된 세포는 37℃에서 배양 4일후 트립신첨가한 후 회수하고 계수하였다. 다음의 계대접종은 ㎖당 400,000개의 감염된 세포로 접종하였다.
실시예 16
바이러스 항원의 불활성화
바이러스 배양 말기에 바이러스로 감염된 세포를 회수하여 초음파(Branson Sonifier)를 이용하거나 또는 회전날개 스테이터형 콜로이드 밀(UltraTurrax, IKA)로 용균하였다. 이후 현탁액을 30분간 3700 g에서 원심분리하였다. 바이러스 현탁액은 +37℃에서 18시간동안 0.1% 에틸렌이민으로 불활성화하거나 또는 +28℃에서 24시간동안 0.5% 베타-프로피오락톤으로 불활성화하였다. 불활성화 전의 바이러스 농도 적정이 불필요할 경우,바이러스 현탁액은 300 kDa 차단막(Millipore PTMK300)을 이용한 한외여과에 의해 농축시켰다. 불활성화된 바이러스 현탁액은+5℃에서 저장하였다.
실시예 17
미네랄오일계 에멀젼 형태의 백신의 제조
백신은 다음의 조성에 따라 제조된다:
- 불활성화된 돼지 써코바이러스의 현탁액: 250 ㎖
- Montanide™ ISA 70(SEPPIC): 750 ㎖
수상 및 유상을 여과에 의해 개별적으로 살균하였다. Silverson 터빈 유화기에 의해서 성분을 혼합하고 균질화하여 유화시켰다.
백신 1회량은 약 107.5TCID50을 포함한다. 백신 1회량의 용량은 피부내 경로 투여시 0.5 ㎖이고, 근육내 경로 투여시 2 ㎖이다.
전신소모성 증후군에 대한 예방접종 프로그램에서, 이 백신은 Parvovax™ 백신과 혼합하여 사용한다.
실시예 18
대사가능한 오일계 에멀젼 형태의 백신의 제조
백신은 다음의 조성에 따라 제조된다:
- 불활성화된 돼지 써코바이러스의 현탁액: 200 ㎖
- Dehymuls HRE 7 (Henkel): 60 ㎖
- Radia 7204 (Oleofina): 740 ㎖
수상 및 유상을 여과에 의해 개별적으로 살균하였다. Silverson 터빈 유화기에 의해서 성분을 혼합하고 균질화하여 유화시켰다.
백신 1회량은 약 107.5TCID50을 포함한다. 백신 1회량의 용량은 근육내 경로 투여시 2 ㎖이다.
전신소모성 증후군에 대한 예방접종 프로그램에서 이 백신을 Parvovax™ 백신과 혼합하여 사용한다.
실시예 19
초면역 혈청(PCV-T), PK/15로 제조된 모노클론 항체 F99의 패널, 및 캐나다산 균주(PCV-C)로 제조된 초면역 혈청을 사용한 미국 및 프랑스산 PCV 바이러스 균주들과 PK/15 오염물에 관한 간접 면역형광법의 결과
바이러스
| PK/15 | 미국 | 프랑스 | |
| PCV-T 항혈청 | ≥6400 | 200 | 800 |
| PCV-C 항혈청 | 200 | ≥6.400 | ≥6.400 |
| F99 1H4 | ≥10 000 | <100 | 100 |
| F99 4B10 | ≥10 000 | <100 | <100 |
| F99 2B7 | ≥10 000 | 100 | <100 |
| F99 2E12 | ≥10 000 | <100 | <100 |
| F99 1C9 | ≥10 000 | <100 | 100 |
| F99 2E1 | ≥10 000 | <100 | <100 |
| F99 1H4 | ≥10 000 | 100 | <100 |
* 간접 면역형광법에서 양의 반응을 제공하는 모노클론 항체 또는 혈청의 최종 희석분율의 역수(Reciprocal)
실시예 20
돼지 전신소모성 증후군의 실험산물 - 프로토콜 1
제왕절개로 꺼내어 분리 시설에서 3일간 사육한 무균 상태의 새끼 돼지를PCV 바이러스 용액으로 접종하였다. 사용된 타입 Ⅱ PCV 바이러스는 Imp 1010 분리물 및 질병에 걸린 돼지의 림프절 균질물에서 얻은 바이러스였다. 5개의 실험군을 만들고, 다음의 방법에 따라 1.5 ㎖의 바이러스 용액을 구강비강의 경로로 3일된 새끼 돼지 모두에게 접종시켰다:
| 실험군 | 개체수 | 바이러스 | 함량 |
| A | 6 | 림프절 균질물 | ND |
| B | 5 | Imp.1010(낮은 계대접종) | 102TCID50 |
| C | 4 | Imp.1010(높은 계대접종) | 102TCID50 |
| D | 2 | PCV 바이러스가 없는 PK15 세포의 용출 | --- |
| E | 3 | --- | --- |
실험 실시의 결과:
5주 관찰기간동안, B 군의 한 마리가 실질적으로 기진한 것을 제외하고 다른 새끼 돼지 들은 임상적 증후를 발현하지 않았다. 해부에 의해 A, B, 및 C 군의 돼지는 림프절, 특히 하악, 기관지, 장간막, 장골, 및 대퇴의 신경절에서 이상증식 현상(D 및 E군의 돼지보다 2 내지 10배가 더 많다)을 보였다. 이 이상증식현상 단세포 및 대식세포에 의한 침윤에 의해 발생하는 피층 영역의 상당한 팽창으로 연결된다.
A, B, 및 C 군의 새끼 돼지들은 기관지 림프조직상에 이상증식현상도 나타냈다.
A, B, 및 C 군 각각에서 한 마리의 돼지는 폐렴을 보였다. B 군의 새끼 돼지 한 마리는 실질적으로 기진한 것으로 보였고, A 군의 새끼 돼지 한 마리는 위궤양을 보였다.
또한, A, B, 및 C 군의 모든 동물은 위와 장의 근육 피막에 근육염을 보였다.
A, B, 및 C 군의 대부분의 동물은 심근염, 림프세포, 대식세포, 및 호산구의 침윤에 의한 다수의 병소를 가진 간염, 및 피질 및 수질의 간질성 신염을 보였다.
C 군의 세끼 돼지 한 마리는 크기가 정상보다 크고 표면에 산발적인 선명한 병소를 가진 간을 가지고 있었다.
D 및 E 군의 세끼 돼지에서는 병변이 발견되지 않았다.
써코바이러스는 A, B, 및 C 군의 돼지 기관에서 분리하였다.
실시예 21
돼지 전신소모성 증후군의 실험 재현 - 프로토콜 2 및 3
태어나면서 어미로부터 분리시킨 보통의 새끼 돼지에게 타입 Ⅱ PCV, 돼지 파보바이러스, 또는 이들 두 바이러스의 혼합물의 바이러스 용액을 접종하였다.
사용된 타입 Ⅱ PCV 바이러스는 Imp.1010 및 Imp.1011 분리물(균주 48121)이었다.
사용된 PPV 바이러스는 캐나다산 분리물인 Imp.1005였다. 이 바이러스는(서열화된 게놈의 1/3에) 공지된 돼지 파보바이러스 균주(PPV 균주 NADL-2 및 Kresse 균주)와 동일한 서열을 가졌다.
2가지 실험 프로토콜을 실행하였다.
프로토콜 2
3일된 새끼 돼지로 3개의 군을 만들었다. 다음의 방법에 따라 1 ㎖의 바이러스 용액을 구강비강의 경로로 새끼 돼지 모두에게 접종시켰다:
| 실험군 | 개체수 | 바이러스 | 함량 |
| A | 5 | Imp.1010 | 107TCID50 |
| B | 5 | Imp.1010 + Imp.1005 | 5×106TCID50 |
| C (대조군) | 2 | --- | --- |
실험 실시의 결과:
A 군: 2마리의 새끼 돼지가 접종 21일후 사망하였고, 한 마리는 접종 24일 후에 인도적으로 도살되었다.
B 군: 1마리의 새끼 돼지가 접종 23일 후에 사망하였고, 한 마리는 접종 24일 후에 인도적으로 도살되었다.
감염후 사망한 새끼 돼지에 실시된 해부에서 실질적으로 육안으로 분별되는 병변이 발견되었다: 즉, 흉막강의 체액, 폐부종, 신장에서 출혈, 신장의 핀헤드 형상의 허연 병변, 간괴사 등으로 이들 병변은 현장의 경우에서 관찰되는 것과 동일하였다.
도살된 돼지에서 실행한 해부에서는 육안으로 관찰되는 병변이 보이지 않았다.
A 및 B 군에서 도살된 돼지뿐 아니라 감염된 후 사망한 A 및 B 군의 돼지로부터 제거된 기관에 실행된 조직학적 실험에서, 현장의 동물에서 관찰되는 돼지 전신소모성 증후군의 병변의 전형적이고 완전한 병변이 확인되었다: 즉, 간 괴사, 림프절 괴사, 췌장 괴사, 신장의 병소의 괴사 및 심각한 출혈, 폐의 합포의 존재, 핵삽입물의 존재에 의한 간세포의 심한 괴사를 볼 수 있었다.
다량의 PCV 항원이 이들 모든 병변(사망하거나 도살된 돼지)에서 발견되었지만 PPV 항원의 존재는 이들 동일한 병변에서 검출할 수 없었다. C 군의 대조군 새끼 돼지들에게서는 어떠한 병변도 발견되지 않았다.
프로토콜 3
4 주된 새끼 돼지로 4개의 군을 만들었다. 다음의 방법에 따라 1 ㎖의 바이러스 용액을 구강비강의 경로로 새끼 돼지 모두에게 접종시켰다:
| 실험군 | 개체수 | 바이러스 | 함량 |
| A(대조군) | 2 | --- | --- |
| B | 4 | Imp.1005 (PPV) | 105.3TCID50 |
| C | 4 | Imp.1011 (PCV) | 105TCID50 |
| D | 4 | Imp.1005+Imp.1011 | 105+ 5×104TCID50 |
실험 실시의 결과:
한 마리의 "대조군" 새끼 돼지 및 각 실험 군(B, C, 및 D)에서 2 마리의 새끼 돼지가 접종 2주후 인도적으로 도살되어 해부가 실시되었다. 현저한 면역조직학적 병변이 D 군(PCV + PPV 공동감염)의 2마리의 새끼 돼지에서 관찰되었다. 돼지 파보바이러스와 관련된 혈청전환(seroconversion)이 D 군의 모든 돼지에서 관찰되었지만, 이들 병변에서 돼지 파보바이러스의 존재를 검출할 수 없었다. 대조군의 돼지 및 다른 군의 돼지에서는 육안으로 관찰되거나 또는 조직학적인 병변을 관찰할 수 없었다.
따라서 PCV + PPV 조합을 통해 돼지 전신소모성 증후군의 전형적인 조직학적 병변을 재현하는 것이 가능하다는 것이 밝혀졌다. 이들 2가지 실험 프로토콜에 의해, PCV 단독의 접종으로도 PCV + PPV 혼합물의 경우와 마찬가지로 심각한 돼지 전신소모성 증후군의 다소간 재현을 유발시키지만, 돼지 써코바이러스만이 병변에서 검출될 수 있었다. 반면, PPV 단독으로 감염시킨 경우(B 군의 프로토콜 3)는 육안으로 관찰할 수 있거나 또는 조직학적인 병변을 유도하지 못하였는데, 이는 PCV와 공존시 4주된 돼지에서 병변이 발견되는 것(D 군의 프로토콜 3)과 대조적이다.
Claims (16)
- 돼지 써코바이러스 항원 및 돼지 파보바이러스 항원을 포함하는 PMWS 증후군에 대한 항원 제조물.
- 제1항에 있어서,타입 Ⅱ 돼지 써코바이러스 항원을 포함하는 항원 제조물.
- 제2항에 있어서,타입 Ⅱ 돼지 써코바이러스 항원이 다음의 번호로 ECACC에 기탁된 제조물들을 포함하는 군으로부터 선택되는 써코바이러스 항원인 항원 제조물:- 수탁번호 V97100219- 수탁번호 V97100218- 수탁번호 V97100217- 수탁번호 V98011608 및- 수탁번호 V98011609.
- 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,돼지 써코바이러스 항원 및 돼지 파보바이러스 항원이 각각 독립적으로 약독화된 생 전체 항원, 불활성화된 전체 항원, 서비유닛 항원, 재조합 생벡터 및 DNA벡터로 이루어진 군으로부터 선택되는 항원을 포함하는 항원 제조물.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서,다른 돼지 병원에 해당하는 결합가(valency)를 추가로 포함하는 항원 제조물.
- 제5항에 있어서,PRRS, Mycoplasma hyopneumoniae, Actinobacillus pleuropneumoniae, E. coli, Atrophic Rhinitis, 유사광견병, 돼지 콜레라, 돼지 인플루엔자및 이의 조합물로 이루어지는 군으로부터 선택되는 다른 결합가를 포함하는 항원 제조물.
- 제5항에 있어서,PRRS인 다른 결합가를 포함하는 항원 제조물.
- 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 따르는 항원 제조물의 유효량을, 수의학적 관점에서 수용가능한 비히클 또는 부형제와 함께 포함하는 PMWS 증후군에 대한 백신.
- 제8항에 있어서,수의학적 관점에서 수용가능한 보조제를 포함하는 백신.
- 제8항 또는 제9항에 있어서,여러 가지 돼지 써코바이러스의 항원을 포함하는 백신.
- 제8항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서,ORF 1 내지 13으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 한 개의 써코바이러스 ORF에 의해 코딩되는 써코바이러스 항원을 포함하는 백신.
- 제11항에 있어서,ORF 4, 7, 10, 및 13으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 한 개의 써코바이러스 ORF에 의해 코딩되는 써코바이러스 항원을 포함하는 백신.
- 제8항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서,돼지에 병원성이 없고 돼지에서 증식할 수 있는 생 바이러스 및 DNA 벡터로 이루어진 군으로부터 발현 벡터가 선택되며, 이 발현 벡터는 상기 ORF를 포함하고 발현하는 발현 벡터를 포함하는 백신.
- 제13항에 있어서,바이러스 벡터가 돼지 헤르페스 바이러스, 돼지 아데노바이러스, 및 폭스바이러스로 이루어진 군으로부터 선택되는 바이러스인 백신.
- 제14항에 있어서,바이러스 벡터가 Aujesky's 질병 바이러스, 백시니아 바이러스, 아비폭스 바이러스, 카나리폭스 바이러스, 및 돼지 폭스 바이러스로 이루어진 군으로부터 선택되는 바이러스인 백신.
- 제8항 내지 제15항 중 어느 한 항에 따르는 돼지 써코바이러스에 대한 백신 및 돼지 파보바이러스에 대한 백신을 개별적으로 포장하여 포함하는 예방접종 키트.
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