JPWO2011093097A1 - 抗dll3抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
(1)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(2)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(3)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(4)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(5)配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(6)配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(7)配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(8)配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(9)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(10)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(11)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(12)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(13)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入された抗体であって、(1)から(12)のいずれかに記載の抗体と同等の活性を有する抗体;
(14)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体が結合するDLL3タンパク質のエピトープと同じエピトープに結合する抗体、
を提供する。
(a)被験者から単離された試料を提供する工程、
(b)上記試料におけるDLL3タンパク質又はDLL3遺伝子の発現量を検出する工程、
を提供する。好ましくは、本発明の診断方法は肺癌を診断するためのものである。本発明はまた、上述のいずれかの抗体を含む癌の診断薬を提供する。
DLL3(Delta-like 3)のアミノ酸配列は公知であり、例えばヒトDLL3のアミノ酸配列は配列番号:1(NM_016941)、マウスDLL3のアミノ酸配列は配列番号:2、(NM_007866)に記載されている。
本発明で用いられる抗DLL3抗体は、DLL3タンパク質に結合すればよく、その由来、種類、形状などは特に限定されない。具体的には、非ヒト動物由来の抗体(例えば、マウス抗体、ラット抗体、ラクダ抗体)、ヒト由来のヒト抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体などの抗体が使用できる。本発明において使用される抗DLL3抗体はポリクローナル抗体でもモノクローナル抗体でもよいが、モノクローナル抗体であることが好ましい。
(1)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体(DL301);
(2)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体(DL306);
(3)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体(DL309);
(4)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体(DL312);
(5)配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL301);
(6)配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL306);
(7)配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL309);
(8)配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL312);
(9)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL301);
(10)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL306);
(11)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL309);
(12)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体(DL312);
(13)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入された抗体であって、(1)から(12)のいずれかに記載の抗体と同等の活性を有する抗体;および
(14)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体が結合するDLL3タンパク質のエピトープと同じエピトープに結合する抗体。
疎水性アミノ酸(A、I、L、M、F、P、W、Y、V)、
親水性アミノ酸(R、D、N、C、E、Q、G、H、K、S、T)、
脂肪族側鎖を有するアミノ酸(G、A、V、L、I、P)、
水酸基含有側鎖を有するアミノ酸(S、T、Y)、
硫黄原子含有側鎖を有するアミノ酸(C、M)、
カルボン酸及びアミド含有側鎖を有するアミノ酸(D、N、E、Q)、
塩基含有側鎖を有するアミノ酸(R、K、H)、
芳香族含有側鎖を有するアミノ酸(H、F、Y、W)
(括弧内はいずれもアミノ酸の一文字標記を表す)。
抗体がヒトに投与されるべきものである場合、ヒトに対する異種抗原性を低下させること等を目的として人為的に改変した遺伝子組換え型抗体とすることができる。遺伝子組換え型抗体とは、例えば、キメラ(Chimeric)抗体、ヒト化(Humanized)抗体などを含む。これらの改変抗体は、公知の方法を用いて製造することができる。
キメラ抗体とは、互いに由来の異なる可変領域と定常領域を連結した抗体をいう。例えば、マウス抗体の重鎖、軽鎖の可変領域と、ヒト抗体の重鎖、軽鎖の定常領域からなる抗体は、マウス−ヒト−異種キメラ抗体である。マウス抗体の可変領域をコードするDNAをヒト抗体の定常領域をコードするDNAと連結させ、これを発現ベクターに組み込むことによって、キメラ抗体を発現する組換えベクターが作製できる。該ベクターにより形質転換された組換え細胞を培養し、組み込まれたDNAを発現させることによって、培養中に生産される当該キメラ抗体を取得できる。
一般にキメラ抗体が、ヒト以外の動物由来抗体の可変領域とヒト抗体由来の定常領域とから構成されるのに対して、ヒト化抗体は、ヒト以外の動物由来抗体の相補性決定領域(CDR;complementarity determining region)と、ヒト抗体由来のフレームワーク領域(FR;framework region)及びヒト抗体由来の定常領域とから構成される。ヒト化抗体は、再構成(reshaped)ヒト抗体とも称される。具体的には、ヒト以外の動物、たとえばマウス抗体のCDRをヒト抗体に移植したヒト化抗体などが公知である。ヒト化抗体はヒト体内における抗原性が低下しているため、本発明の治療剤の有効成分として有用である。
本発明の抗体には、DLL3タンパク質に結合する限り、IgG(IgG1、IgG2、IgG4など)に代表される二価抗体だけでなく、一価抗体、若しくはIgMに代表される多価抗体も含まれる。本発明の多価抗体には、全て同じ抗原結合部位を有する多価抗体、又は、一部もしくは全て異なる抗原結合部位を有する多価抗体が含まれる。
本発明の抗体は、抗体の全長分子に限られず、DLL3タンパク質に結合する限り、低分子化抗体又はその修飾物であってもよい。
ダイアボディーは、遺伝子融合により構築された二価(bivalent)の抗体断片を指す(Holliger P et al., Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90: 6444-6448 (1993)、EP404,097号、WO93/11161号等)。ダイアボディーは、2本のポリペプチド鎖から構成されるダイマーである。通常、ダイマーを構成するポリペプチド鎖は、各々、同じ鎖中で重鎖可変領域及び軽鎖可変領域がリンカーにより結合されている。ダイアボディーにおけるリンカーは、一般に、重鎖可変領域と軽鎖可変領域が互いに結合できない位に短い。具体的には、リンカーを構成するアミノ酸残基は、例えば、5残基程度である。そのため、同一ポリペプチド鎖上にコードされる重鎖可変領域と軽鎖可変領域とは、単鎖可変領域フラグメントを形成できず、別の単鎖可変領域フラグメントと二量体を形成する。その結果、ダイアボディーは2つの抗原結合部位を有することとなる。
scFvは、抗体の重鎖可変領域と軽鎖可変領域とを連結することにより得られる。scFvにおいて、重鎖可変領域と軽鎖可変領域は、リンカー、好ましくはペプチドリンカーを介して連結される(Huston, J. S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, 1988, 85, 5879-5883)。scFvにおける重鎖可変領域及び軽鎖可変領域は、本明細書に記載されたいずれの抗体由来であってもよい。可変領域を連結するペプチドリンカーには、特に制限はない。例えば3から25残基程度からなる任意の一本鎖ペプチドをリンカーとして用いることができる。具体的には、たとえば後述のペプチドリンカー等を用いることができる。
scFv-FcはscFvにFc領域を融合させた低分子化抗体である(Cellular & Molecular Immunology 2006; 3: 439-443)。scFv-Fcに用いられるscFvの由来は特に限定されないが、例えばIgM由来のscFvを用いることができる。また、Fcの由来は特に限定されないが、例えばヒトIgG(ヒトIgG1など)を用いることができる。従って、scFv-Fcの好ましい態様の例として、IgM抗体のscFv断片と、ヒトIgG1のCH2(たとえば、Cγ2)とCH3(たとえば、Cγ3)をヒトIgG1のヒンジ領域(Hγ)で連結させたscFv-Fcを挙げることができる。
sc(Fv)2は、2つの重鎖可変領域(VH)及び2つの軽鎖可変領域(VL)をリンカー等で結合して一本鎖にした低分子化抗体である(Hudson et al、J Immunol. Methods 1999;231:177-189)。sc(Fv)2は、例えば、scFvをリンカーで結ぶことによって作製できる。4つの抗体可変領域を結合する場合には、通常、3つのリンカーが必要となる。
[VL]リンカー[VH]リンカー[VH]リンカー[VL]
[VH]リンカー[VL]リンカー[VL]リンカー[VH]
[VH]リンカー[VH]リンカー[VL]リンカー[VL]
[VL]リンカー[VL]リンカー[VH]リンカー[VH]
[VL]リンカー[VH]リンカー[VL]リンカー[VH]
Ser
Gly・Ser
Gly・Gly・Ser
Ser・Gly・Gly
Gly・Gly・Gly・Ser (配列番号61)
Ser・Gly・Gly・Gly (配列番号62)
Gly・Gly・Gly・Gly・Ser (配列番号63)
Ser・Gly・Gly・Gly・Gly (配列番号64)
Gly・Gly・Gly・Gly・Gly・Ser (配列番号65)
Ser・Gly・Gly・Gly・Gly・Gly (配列番号66)
Gly・Gly・Gly・Gly・Gly・Gly・Ser (配列番号67)
Ser・Gly・Gly・Gly・Gly・Gly・Gly (配列番号68)
(Gly・Gly・Gly・Gly・Ser)n
(Ser・Gly・Gly・Gly・Gly)n
[nは1以上の整数である]。
[VH]ペプチドリンカー(15アミノ酸)[VL]ペプチドリンカー(15アミノ酸)[VH]ペプチドリンカー(15アミノ酸)[VL]。
ジスクシンイミジルスベレート(DSS)、
ビス(スルホスクシンイミジル)スベレート(BS3)、
ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)(DSP)、
ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート)(DTSSP)、
エチレングリコールビス(スクシンイミジルスクシネート)(EGS)、
エチレングリコールビス(スルホスクシンイミジルスクシネート)(スルホ−EGS)、
ジスクシンイミジル酒石酸塩(DST)、ジスルホスクシンイミジル酒石酸塩(スルホ−DST)、
ビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(BSOCOES)、及び
ビス[2-(スルホスクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(スルホ-BSOCOES)など。
(1)細胞障害活性
癌などの細胞増殖性疾患の治療においては、抗体は、そのエフェクター活性を維持していることが望ましい。すなわち、本発明における好ましい抗体は、DLL3に対する結合親和性とエフェクター機能の両方を有する。抗体のエフェクター機能には、抗体依存性細胞介在性細胞傷害(antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity:ADCC)活性及び補体依存性細胞傷害(complement-dependent cytotoxicity:CDC)活性が含まれる。本発明における治療用の抗体は、特に好ましくは、ADCC活性をエフェクター機能として備える。
CBA/Nマウスなどから脾臓を摘出し、RPMI1640培地(Invitrogen社製)中で脾臓細胞が分離される。10%ウシ胎児血清(FBS、HyClone社製)を含む同培地で洗浄後、細胞濃度を5×106/mlに調製することによって、エフェクター細胞が調製できる。
Baby Rabbit Complement(CEDARLANE社製)を10% FBS含有培地(Invitrogen社製)にて10倍希釈し、補体溶液が調製できる。
DLL3タンパク質を発現する細胞を0.2 mCiの51Cr-クロム酸ナトリウム(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)とともに、10% FBS含有DMEM培地中で37℃にて1時間培養することにより該標的細胞を放射性標識できる。DLL3タンパク質を発現する細胞としては、DLL3タンパク質をコードする遺伝子で形質転換された細胞、小細胞肺癌細胞株等を利用することができる。放射性標識後、細胞を10% FBS含有RPMI1640培地にて3回洗浄し、細胞濃度を2×105/mlに調製することによって、該標的細胞が調製できる。
抗体に化学療法剤、毒性ペプチド或いは放射性化学物質などの細胞傷害性物質を結合することも可能である。このような抗体修飾物(以下、抗体コンジュゲートと称する。)は、得られた抗体に化学的な修飾を施すことによって得ることができる。なお、抗体の修飾方法はこの分野においてすでに確立されている。
さらに、本発明の抗体は二重特異性抗体(bispecific antibody)であってもよい。二重特異性抗体とは、異なるエピトープを認識する可変領域を同一の抗体分子内に有する抗体を言う。本発明において、二重特異性抗体はDLL3分子上の異なるエピトープを認識する抗原結合部位を有することができる。このような二重特異性抗体は、1分子のDLL3に対して2分子の抗体分子が結合できる。その結果、より強力な細胞傷害作用を期待できる。
本発明の抗体は糖鎖が改変された抗体であってもよい。抗体の糖鎖を改変することにより抗体の細胞傷害活性を増強できることが知られている。糖鎖が改変された抗体としては、例えば、糖鎖が修飾された抗体(WO99/54342など)、糖鎖に付加するフコースが欠損した抗体(WO00/61739、WO02/31140など)、バイセクティングGlcNAcを有する糖鎖を有する抗体(WO02/79255など)などが公知である。
また、本発明の抗体はインターナライズ活性を有していてもよい。本発明において「インターナライズ活性を有する抗体」とは、DLL3に結合した際に細胞内(細胞質内、小胞内、他の小器官内など)に輸送される抗体を意味する。
1. モノクローナル抗体産生ハイブリドーマによる抗DLL3抗体の作製
モノクローナル抗体産生ハイブリドーマは、公知技術にしたがい、以下のようにして作製できる。まず、DLL3タンパク質、あるいは後述するその部分ペプチドを感作抗原として使用し、通常の免疫方法にしたがって動物を免疫する。得られた免疫細胞を通常の細胞融合法によって公知の親細胞と融合させてハイブリドーマを得る。さらにこのハイブリドーマから、通常のスクリーニング法により、目的とする抗体を産生する細胞をスクリーニングすることによって抗DLL3抗体を産生するハイブリドーマを選択する。選択したハイブリドーマから所望の抗DLL3モノクローナル抗体を得る。具体的には、以下のようにして行う。
まず、DLL3遺伝子を発現させることによって、抗体取得の感作抗原として使用されるDLL3タンパク質が取得できる。すなわち、DLL3をコードする遺伝子配列を公知の発現ベクターに挿入して適当な宿主細胞を形質転換させた後、その宿主細胞中又は培養上清中から、目的のヒトDLL3タンパク質を公知の方法で精製する。精製した天然のDLL3タンパク質、あるいは、DLL3タンパク質の所望の部分ポリペプチドを異なるポリペプチドと融合した融合タンパク質を免疫原として利用することもできる。免疫原とする融合タンパク質を製造するために、例えば、抗体のFc断片やペプチドタグなどを利用することができる。融合タンパク質を発現するベクターは、所望の二種類又はそれ以上のポリペプチド断片をコードする遺伝子をインフレームで融合させ、当該融合遺伝子を発現ベクターに挿入することにより作製することができる。融合タンパク質の作製方法はMolecular Cloning 2nd ed.(Sambrook,J et al., Molecular Cloning 2nd ed., 9.47-9.58, Cold Spring Harbor Lab. press, 1989)に記載されている。
DLL3タンパク質あるいはその部分ペプチドを感作抗原として、哺乳動物を免疫する。免疫される哺乳動物は、特に限定されないが、モノクローナル抗体を細胞融合法によって得るためには、細胞融合に使用する親細胞との適合性を考慮して免疫動物を選択するのが好ましい。一般的には、げっ歯類の動物が免疫動物として好ましい。具体的には、マウス、ラット、ハムスター、あるいはウサギを免疫動物とすることができる。その他、サル等を免疫動物とすることもできる。
モノクローナル抗体は、DNA免疫(DNA Immunization)によっても得ることができる。DNA免疫とは、免疫動物中で抗原タンパク質をコードする遺伝子が発現できるような態様で構築されたベクターDNAを当該免疫動物に投与し、免疫抗原を免疫動物の生体内で発現させることによって、免疫刺激を与える方法である。蛋白質抗原を投与する一般的な免疫方法と比べて、DNA免疫には、次のような優位性を期待できる。
・DLL3のような膜蛋白質の構造を維持して免疫刺激を与えることができる。
・免疫抗原を精製する必要が無い。
上述のように哺乳動物が免疫され、血清中における所望の抗体量の上昇が確認された後に、哺乳動物から免疫細胞が採取され、細胞融合に付される。好ましい免疫細胞としては、特に脾細胞が使用できる。
P3x63Ag8U.1(Current Topics in Microbiology and Immunology(1978)81, 1-7)、
NS-1(Kohler. G. and Milstein, C. Eur. J. Immunol.(1976)6, 511-519)、
MPC-11(Margulies. D.H. et al., Cell(1976)8, 405-415)、
SP2/0(Shulman, M. et al., Nature(1978)276, 269-270)、
FO(de St. Groth, S. F. etal., J. Immunol. Methods(1980)35, 1-21)、
S194(Trowbridge, I. S. J. Exp. Med.(1978)148, 313-323)、
R210(Galfre, G. et al., Nature(1979)277, 131-133)等。
以上のようにして作製されるモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマは、通常の培養液中で継代培養することができる。また、該ハイブリドーマを液体窒素中で長期にわたって保存することもできる。
(1)抗体遺伝子のクローニング
抗体産生細胞からクローニングされた抗体遺伝子を利用することにより、遺伝子工学的手法を用いて、抗体を作製することもできる。クローニングした抗体遺伝子は、適当なベクターに組み込んで宿主に導入することによって抗体として発現させることができる。抗体遺伝子の単離と、ベクターへの導入、そして宿主細胞の形質転換のための方法は既に確立されている(例えば、Vandamme, A. M. et al., Eur.J. Biochem.(1990)192, 767-775参照)。
・グアニジン超遠心法(Chirgwin, J. M. et al., Biochemistry(1979)18, 5294-5299)
・AGPC法(Chomczynski, P.et al., Anal. Biochem.(1987)162, 156-159)。
抗DLL3抗体を製造するために、クローニングされた抗体遺伝子を、発現制御領域の制御下で発現するように発現ベクターに組み込む。抗体を発現するための発現制御領域とは、例えば、エンハンサーやプロモーターを含む。次いで、この発現ベクターで適当な宿主細胞を形質転換することによって、抗DLL3抗体をコードするDNAを発現する組換え細胞を得ることができる。
i) 哺乳類細胞:CHO、COS、ミエローマ、BHK(baby hamster kidney)、Hela、Vero、HEK293、Ba/F3、HL-60、Jurkat、SK-HEP1など
ii) 両生類細胞:アフリカツメガエル卵母細胞など
iii) 昆虫細胞:sf9、sf21、Tn5など。
酵母:サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces serevisiae)などのサッカロミセス(Saccharomyces )属、メタノール資化酵母(Pichia pastoris)などのPichia属、糸状菌:アスペスギルス・ニガー(Aspergillus niger)などのアスペルギルス(Aspergillus)属。
これらの発現ベクターを宿主細胞に導入し、次に、形質転換された宿主細胞をインビトロ又はインビボで培養して目的とする抗体を産生させる。宿主細胞の培養は公知の方法に従い行う。例えば、培養液として、DMEM、MEM、RPMI1640、IMDMを使用することができ、牛胎児血清(FCS)等の血清補液を併用することもできる。
組換え型抗体の産生には、上記宿主細胞に加えて、トランスジェニック動物を利用することもできる。すなわち目的とする抗体をコードする遺伝子を導入された動物から、目的とする抗体を得ることができる。例えば、抗体遺伝子は、乳汁中に固有に産生されるタンパク質をコードする遺伝子の内部にインフレームで挿入することによって融合遺伝子として構築できる。乳汁中に分泌されるタンパク質として、たとえば、ヤギβカゼインなどを利用することができる。抗体遺伝子が挿入された融合遺伝子を含むDNA断片はヤギの胚へ注入され、該注入胚が雌のヤギへ導入される。胚を受容したヤギから生まれるトランスジェニックヤギ(又はその子孫)が産生する乳汁からは、所望の抗体を乳汁タンパク質との融合タンパク質として取得できる。また、トランスジェニックヤギから産生される所望の抗体を含む乳汁量を増加させるために、ホルモンがトランスジェニックヤギに適宜使用できる(Ebert, K.M. et al., Bio/Technology(1994)12, 699-702)。
DLL3は小細胞肺癌の癌組織で高発現していることから、抗DLL3抗体は癌細胞特異的な細胞傷害活性を有する。したがって、抗DLL3抗体は、DLL3を発現する癌の治療に有用である。
また、本発明はDLL3タンパク質又はDLL3タンパク質をコードする遺伝子を検出することを特徴とする癌の診断方法を提供する。DLL3は癌組織あるいは癌細胞株において顕著な発現亢進が確認されている。したがって、DLL3は、癌を特異的に検出するためのマーカーとして有用である。
(a)被験者から単離された試料を提供する工程、
(b)上記試料におけるDLL3タンパク質又はDLL3遺伝子の発現量を検出する工程。
(c)上記DLL3タンパク質又はDLL3遺伝子の発現量に基づいて、被験者が癌である可能性を評価する工程、
を含んでも良い。
本発明の方法の1つの態様においては、試料中のDLL3タンパク質を検出することにより癌の診断が行われる。DLL3タンパク質の検出はDLL3タンパク質を認識する抗体を用いて行われることが好ましい。
・単にDLL3タンパク質が存在するか否かの測定
・DLL3タンパク質が一定の量以上存在するか否かの測定
・DLL3タンパク質の量を他の試料(例えば、コントロール試料など)と比較する測定など。
(2) (1)で検出されたDLL3の発現レベルが、対照と比較して高い場合に被検者が癌を有すると判定される工程。
酵素結合免疫吸着法(ELISA)、
ラジオイムノアッセイ(RIA)、
エンザイムイムノアッセイ(EIA)、
蛍光イムノアッセイ(FIA)、
発光イムノアッセイ(LIA)、
免疫沈降法(IP)、
免疫比濁法(TIA)、
ウエスタンブロット(WB)、
免疫組織化学(IHC)法、
免疫拡散法(SRID)、
ドットブロット法、
スロットブロット法。
本発明の方法の別の態様においては、DLL3のポリヌクレオチドの発現を検出する。本発明において検出されるポリヌクレオチドは特に限定されないが、mRNAが好ましい。本発明において検出とは、定量的又は定性的な検出を含む。例えば、定性的な検出として、次のような測定操作を挙げることができる。
・単にDLL3のmRNAが存在するか否かの測定、
・DLL3のmRNAが一定の量以上存在するか否かの測定、
・DLL3のmRNAの量を他の試料(例えば、コントロール試料など)と比較する測定など。
本発明は、被検試料中のDLL3タンパク質を検出するための試薬を含む、癌の診断のための診断薬又はキットも提供する。本発明の診断薬は、少なくとも抗DLL3抗体を含む。
ヒトDLL3 mRNAの臨床癌、癌細胞株、各種正常臓器における遺伝子発現分布を Human Exon 1.0 ST Array (Affymetrix社) を用いて解析した。発現解析において、13例の小細胞肺癌癌摘出組織の腫瘍部、3種類の小細胞肺癌細胞株、及び49種類の正常組織(Clontech 社、Ambion社、STRATAGENE社、Cell APPLICATIONS社、Panomics社、CHEMICON社、BioChain Institute社から購入)に由来するtotal RNAを使用した。全ての臨床癌摘出組織の腫瘍部及び癌細胞株(ATCCから購入)については、Trizol (Invitrogen)を用いて製品添付の方法に従ってtotal RNA抽出を実施した。上述のtotal RNA 1μgを用い、GeneChip Whole Transcript (WT) Sense Target Labeling Assay Manual (Affymetrix)に準じて遺伝子発現解析実験を実施、Human Exon 1.0 ST Array Dataの数値化は、Affymetrix社提供のExACT (Exon Array Computational Tool)ソフトウェアを用いて実施した。
配列番号:1および57で示されるヒトDLL3 cDNA(NM_016941)をヒト胎児脳cDNAライブラリよりPCR増幅し、哺乳動物発現ベクターpMCNにクローニングした。pMCNは、マウスCMVプロモータ(GenBank: U68299)下で外来遺伝子を発現させることが可能である。pMCNベクターはジェネティシン耐性遺伝子をもっている。ヒトDLL3発現ベクターでCHO細胞株DG44(Invitrogen)を形質転換した。ジェネティシン存在下で薬剤耐性細胞を選抜した。ヒトDLL3蛋白質を安定発現するクローン化細胞を市販抗DLL3抗体(R&D Systems, MAB4315)で選抜し、ヒトDLL3/DG細胞を樹立した。同様にしてヒトDLL3発現ベクターでマウスIL-3依存性 pro B 細胞株Ba/F3を形質転換し、ヒトDLL3/BaF3細胞を樹立した。
Balb/c(日本チャールス・リバー)およびMRL/MpJJmsSlc-lpr/lpr(日本エスエルシー)マウスに6〜7週令より免疫を行った。初回免疫時にはフロイント完全アジュバント(ベクトン・ディッキンソン)を用いてエマルジョンを作製し0.1mg ヒトDLL3-Fc/headとなるように皮下に抗原蛋白質を投与した。二週置いたのち、週一回合計3〜6回のフロイント不完全アジュバントで作製した抗原エマルジョンを作製し0.05mg/headの容量で皮下投与した。血清抗体価上昇の認められたマウス個体に対し0.05mgの抗原蛋白質を静脈内に投与した。3日後にその脾臓細胞を摘出し、マウスミエローマ細胞P3-X63Ag8U1(ATCC)と細胞数比で約3:1の割合で混合し、ポリエチレングリコール(PEG)法にて細胞融合した。遠心操作によりPEGを除去したのち、1x HAT media supplemet(シグマ)、0.5x BM-Condimed H1 Hybridomacloning supplement(ロシュダイアグノスティック)、10%牛胎児血清を含むRPMI1640培地に懸濁し、細胞濃度を調製したのち96ウェルプレートに細胞を播き込んだ。ハイブリドーマコロニー形成を確認した後、培養上清中に含まれる抗DLL3抗体の有無をヒトDLL3-Fcをコートしたプレートを用いてELISA解析した。陽性ウェルに含まれるハイブリドーマ細胞を限界希釈法によりクローン化し、抗DLL3抗体を産生するハイブリドーマ株を樹立した。モノクローナル抗体のアイソタイプをIsoStrip(ロシュダイアグノスティック)を用いて決定した。
抗DLL3抗体の、カルセインラベルしたDLL3発現細胞に対する抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC)誘導活性を調べた。DLL3を発現する、ヒトDLL3/BaF3および小細胞肺癌細胞株NCI-H1184(ATCC)を、20μg/ml Calcein-AM(Dojindo, 349-07201)存在下で90分間培養し、遠心、洗浄することで、カルセインラベルしたターゲット細胞を準備した。96ウェルプレート(Coster 3799)に1x104のターゲット細胞を播き込んだ。つづいて適切な終濃度になるように調製された抗体を添加して室温にて15分間インキュベートした。各ウェルに5x104のエフェクター細胞を添加し、反応プレートを37℃、CO2インキュベーター中にてインキュベートした。エフェクター細胞にはマウスFcγR3-ヒトFcγR3キメラ分子を発現するNK92細胞(WO 2008/093688)が用いられた。4時間インキュベートした後、遠心したプレートの各ウェルより100μlの培養上清を回収し、蛍光強度をARVO SX(Wallac)を用いて測定した。
ADCC[%]=(A-C)/(B-C) × 100
ここでAは各ウェルにおける蛍光強度、Bは終濃度1% Nonidet P-40で細胞溶解した上清中の蛍光強度平均値、Cは培地のみ添加した場合の蛍光強度平均値である。各々の実験条件において3点測定し、平均値と標準偏差を算出した。図4は終濃度2.5μg/mlで抗体を添加した場合のDLL3/BaF3細胞に対するADCC誘導活性を示す。コントロール抗体であるIgG1, IgG2bにADCC活性が認められなかった一方で、DL301, DL306, DL312にADCC誘導活性が認められた。市販モノクローナル抗体MAB4315には明瞭なADCC誘導活性は認められなかった。図5は、DLL3/BaF3とNCI-H1184に対しDL301, DL306, D312抗体が用量依存的にADCCを誘導することを示す。
抗DLL3抗体を産生するハイブリドーマ全RNAよりSmart 5’-RACE cDNAライブラリ(Clontech)を作製した。全RNA調製はRNeasy Miniカラム(Qiagen)を用いて行った。cDNAライブラリ作製は製造者の指示に従った。抗体定常領域配列に相補するプライマーを使い、抗体可変領域配列(VH, VL)をPCR増幅した。PCR増幅したフラグメントをpCR2.1TOPOにクローニングし、その塩基配列を決定した。得られたVH、VL配列とヒトIgG1定常領域配列からなるキメラ抗体発現ベクターを構築した。軽鎖、重鎖はともに一つの哺乳動物細胞発現ベクターに組み込まれ、両者はマウスCMVプロモータ下で転写される。表1は同定した抗体可変領域配列とそのCDR配列、マウス抗体全長配列、キメラ抗体配列の配列番号の対応を示す。
キメラ抗体とマウス抗体の抗原分子に対する結合競合をELISA法で解析した(図8(b))。Nuncイムノプレートに1ウェルあたり10ngのヒトDLL3-Fcを添加し固層化した。終濃度50ng/mlのキメラ抗体および適切に希釈されたマウス抗体の混和物をDLL3-Fc蛋白質固層化プレートに添加した。プレートを室温にて1時間インキュベートした後、洗浄、アルカリフォスファターゼ標識した抗ヒト抗体を添加してインキュベートした。インキュベーション後、Sigma104を添加し、吸光度を測定した。キメラ抗体の抗原分子への結合はもととなるマウスモノクローナル抗体のそれと競合的であった。DL301マウス抗体以外の抗体はDL301キメラ抗体の抗原への結合を阻害しなかった。DL312マウス抗体以外の抗体はDL312キメラ抗体の抗原への結合を阻害しなかった。したがって、DL301、DL312はそれぞれユニークなエピトープに結合することが示された。DL305, DL308, DL309マウス抗体はそれぞれほぼ同程度にDL309キメラ抗体の抗原への結合を阻害した。したがってこれら3抗体のエピトープは同一であると考えられる。ADCC誘導活性が認められたDL306マウス抗体は、DL301キメラ抗体、DL309キメラ抗体、DL312キメラ抗体の抗原への結合を阻害しなかった。DL306はDL301,DL309,DL312とは独立なエピトープを認識していることが示された。
DL306キメラ抗体発現ベクターをCOS-7細胞に導入し、一過的にキメラ抗体を発現させた。COS-7培養上清中のキメラ抗体がヒトDLL3蛋白質に結合することをフローサイトメトリー法で確認した。COS-7培養上清中のキメラ抗体濃度をサンドイッチELISA法で算出した。この際既知濃度のヒトキメラ抗体を濃度算出のスタンダートとして利用した。FACS buffer(1% 牛胎児血清を含むPBS)に懸濁されたヒトDLL3/BaF3細胞に終濃度1μg/mlとなるようキメラ抗体を添加した。30分間4℃にてインキュベーション、洗浄、FITCラベルした抗ヒト抗体(Beckman-Coulter)と反応させ、フローサイトメーターFACSCaliburで結合を解析した。図10に示したように、キメラ抗体DL306はヒトDLL3/BaF3に結合し、親株であるBa/F3細胞には結合しなかった。
ヒトキメラおよびマウスIgG2a組換え抗DLL3抗体の、カルセインラベルしたDLL3発現細胞に対する抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC)誘導活性を調べた。DLL3を発現する、ヒトDLL3/BaF3および小細胞肺癌細胞株NCI-H1184(ATCC)を、20μg/ml Calcein-AM(Dojindo, 349-07201)存在下で90分間培養し、遠心、洗浄することで、カルセインラベルしたターゲット細胞を準備した。96ウェルプレート(Coster 3799)に1x104のターゲット細胞を播き込んだ。つづいて適切な終濃度になるように調製された抗体を添加して室温にて15分間インキュベートした。各ウェルに5x104のエフェクター細胞を添加し、反応プレートを37℃、CO2インキュベーター中にてインキュベートした。低フコース化マウスIgG2a組換え抗体のエフェクター細胞としてマウスFcγR4ヒトFcγR3キメラ分子(WO 2008/093688)を発現するNK92細胞が用いられた。ヒトキメラ組換え抗体のエフェクター細胞としてヒトFcγR3分子を発現するNK92細胞が用いられた。4時間インキュベートした後、遠心したプレートの各ウェルより100μlの培養上清を回収し、蛍光強度をARVO SXを用いて測定した。ADCC誘導活性を実施例4に記載した方法にて算出した。
図12は、DLL3/BaF3とNCI-H1184に対し低フコース化組換えマウスIgG2a抗体DL301, DL306, D312が用量依存的にADCCを誘導することを示す。
Claims (13)
- DLL3タンパク質に結合する抗体。
- 細胞傷害活性を有することを特徴とする請求項1に記載の抗体。
- 細胞傷害活性が、抗体依存性細胞傷害活性(ADCC活性)である請求項2に記載の抗体。
- インターナライズ活性を有することを特徴とする請求項1〜3いずれかに記載の抗体。
- 細胞傷害性物質が結合していることを特徴とする請求項1〜4いずれかに記載の抗体。
- 配列番号:1に記載のアミノ酸配列を有するヒトDLL3において、216番目のアミノ酸〜492番目までのアミノ酸の領域を認識することを特徴とする、請求項1〜5いずれかに記載の抗体。
- 以下のいずれかに記載のDLL3タンパク質に結合する抗体:
(1)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(2)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(3)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(4)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体;
(5)配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(6)配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(7)配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(8)配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(9)配列番号12に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号13に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号14に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号18に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号19に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号20に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(10)配列番号24に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号25に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号26に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号30に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号31に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号32に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(11)配列番号36に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号37に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号38に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号42に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号43に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号44に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(12)配列番号48に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR1、配列番号49に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR2、及び配列番号50に記載のアミノ酸配列を有する重鎖CDR3を含む重鎖可変領域、および配列番号54に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR1、配列番号55に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR2、及び配列番号56に記載のアミノ酸配列を有する軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体;
(13)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入された抗体であって、(1)から(12)のいずれかに記載の抗体と同等の活性を有する抗体;または
(14)(1)から(12)のいずれかに記載の抗体が結合するDLL3タンパク質のエピトープと同じエピトープに結合する抗体。 - 請求項1〜7のいずれかに記載の抗体を有効成分として含む医薬組成物。
- 抗癌剤である請求項8に記載の医薬組成物。
- 肺癌を対象とする抗癌剤である請求項9に記載の医薬組成物。
- 以下の工程を含む癌の診断方法
(a)被験者から単離された試料を提供する工程、
(b)上記試料におけるDLL3タンパク質又はDLL3遺伝子の発現量を検出する工程。 - 肺癌を診断するためのものである、請求項11に記載の診断方法。
- 請求項1〜7のいずれかに記載の抗体を含む癌の診断薬。
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