JPH09505309A

JPH09505309A - 細菌感染の治療および予防のための化合物および医薬組成物

Info

Publication number: JPH09505309A
Application number: JP7514666A
Authority: JP
Inventors: フルトグレン，スコット; キューン，メタ; シュイ，チォン; オッグ，デレク; ハリス，マーク; レピスト，マッティ; ジョーンズ，チャールズ・ハル; キールベリ，ヤン
Original assignee: Washington University in St Louis WUSTL
Current assignee: Washington University in St Louis WUSTL
Priority date: 1993-11-18
Filing date: 1994-11-18
Publication date: 1997-05-27
Also published as: CA2176808A1; DE69433901D1; DE69433901T2; US6153396A; EP0730601A1; EP0730601B1; WO1995014028A2; ES2225834T3; AU704114B2; AU1184495A; WO1995014028A3; ATE271060T1; DK0730601T3; US6001823A

Abstract

(57)【要約】組織付着性細菌により引き起こされる疾病の治療および／または予防のための新規方法を開示する。ペリプラズム分子チャペロンと相互作用することにより、繊毛の集合を妨害または阻害し、そのことにより、細菌の感染性を低下させることが行われる。薬剤のスクリーニング法ならびにかかる薬剤のデノボ設計法も開示され、該方法は、高分子間の結合自由エネルギーの近似計算を包含する新規コンピューター薬剤モデリング法による。最終的には、ペリプラズム分子チャペロンと相互作用しうると考えられる新規ピラノシドも開示する。

Description

【発明の詳細な説明】細菌感染の治療および予防のための化合物および医薬組成物本発明は、補助金番号Ｒ０１ＡＩ２９５４９（Ｓ.Ｊ.Ｈ.）およびトレーニング補助金ＡＩ０７１７２（ともにＮＩＨから与えられた）による米国政府の援助により行われた。発明の分野本発明は、組織付着性繊毛形成細菌により引き起こされる、繊毛サブユニットとペリプラズムチャペロンとの間の結合との相互作用による疾患の治療および／または予防方法に関する。さらに本発明は、ペリプラズムチャペロンと相互作用しうる物質を同定／設計する方法、およびペリプラズムチャペロンにおける結合部位を同定する方法に関する。結局、本発明は、ペリプラズムチャペロンと相互作用しうる新規物質ならびにペリプラズムチャペロンと相互作用しうる物質からなる医薬調製物に関する。発明の背景病原性グラム陰性細菌は、菌血症、細菌関連下痢、髄膜炎および（非常によくあることだが）尿路感染、例えば、腎盂腎炎、膀胱炎、尿道炎等のごとき多くの病理学的状態を引き起こす。尿路感染は女性の罹患率の主な原因の１つである。女性における尿路感染の総体的な重要性にもかかわらず、これらの疾患の治療および／または予防するためにほんの少ししか努力がされていない。通常には、慣用的な抗生物質を用いてこれらの感染症が治療されており、例えば、ペニシリン、セファロスポリン、アミノグリコシド、スルホンアミドおよびテトラサイクリンを用いる治療が用いられている。尿路感染の特別な場合において、ニトロフラントインおよびナリジキシン酸のごとき尿防腐剤も用いられている。しかしながら、抗生物質耐性の出現は、将来的に尿路感染をうまく治療する能力が妨げられるであろう。これらの尿路病原体における多重抗生物質耐性が増大している。尿路感染症の女性の評価および治療の年間費用は１０億ドルを超える。さらに、病院での感染に当てられる１年間の４０億ドル費用の約４分の１が尿路感染症の結果である。尿路感染の発生原因のうち、グラム陰性細菌の中ではエシェリシア・コリ（Escherichia coli）が明らかに目立っている。病原性グラム陰性細菌、特にエシェリシア・コリ、ヘモフィルス・インフルエンザエ（Haemophilus influenzae）、サルモネラ・エンテリディテイス（Salmon alla enteriditis）、サルモネラ・ティフィムリウム（Salmonalla typhimurium ）、ボルデテラ・ペルツシス（Bordetella pertussis）、イェルシニア・ペスチス（Yersinia pestis）、イェルシニア・エンテロコリチカ（Yersinia enteroco litica）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter Pylori）およびクレブシエラ・ニューモニアエ（Klabsiella pneumoniae）は、種々の上皮組織への付着能にその感染性の原因がある。よって、例えば、イー・コリは、腎臓からの１方向の尿の流れの流出効果にもかかわらず、上部尿路における上皮細胞に付着する。上に示したように、上記細菌は種々の疾患に関連している。尿路感染（イー・コリ）、急性下痢（イー・コリ、ワイ・エンテロコリチカおよびサルモネラｓｐｐ）、髄膜炎（イー・コリおよびエイチ・インフルエンザエ）、痙攣性の咳（ビー・ペルツシス）、ペストおよび他の呼吸管感染（ケイ・ニューモニアエ、エイチ・インフルエンザエ）および消化性潰瘍（エイチ・ピロリ）。上記のごとき多くの細菌感染症の開始および継続は、細胞外コロニー形成、内部移行または他の細胞応答が起こるかどうかを指令する結合イベントを促進する、近接可能な配置となった微生物の表面上への付着素の提供が必要であると考えられる。付着素は、しばしば、繊毛、ふさ、または原線維（これら３つの用語を本明細書においては入れ替えて用いる）として知られる長い、薄い、フィラメント状の、ヘテロポリマー性蛋白付属物の構成成分である。細菌付着イベントは、しばしば、繊毛に存在することの多い付着素と、しばしば膜結合複合糖質における炭水化物構造からなる宿主細胞上の特異的受容体構造との間の立体化学的適合の結果である。イー・コリの尿路感染症の病原菌株は、尿路上皮細胞に存在する受容体に結合するＰおよび１型繊毛を発現する。Ｐ繊毛の先端に存在する付着素ＰａｐＧ（ポリペプチドＧに結合した繊毛）は、糖脂質のグロボシリーズ（globoseries）に存在するＧａｌα（１−４）Ｇａｌ部分に結合するが、１型付着素ＦｉｍＨは、糖脂質および糖蛋白に存在するＤ−マンノースに結合する。付着性Ｐ繊毛は、イー・コリの腎盂腎症株に関連した発病力の決定因子であり、１型繊毛は、膀胱炎を引き起こすイー・コリにおいてよりありふれている。少なくとも１１個の遺伝子が機能的Ｐ繊毛の生合成および発現に関与している。全ギャップ遺伝子クラスターのＤＮＡ配列が決定されている。Ｐ繊毛は、繊毛ロッド（rods）に末端どうしで結合している柔軟性のある付着性原線維からなる混成ヘテロポリマー線維である。繊毛ロッドは右巻きヘリカルシリンダー（helical cylinder）となるよう配列されたＰａｐＡ蛋白サブユニットの連続からなる。各繊毛ロッドの遠位末端から伸長する先端原線維は、大部分がオープンヘリカルコンホーメーション（op en helical conformation）となるよう配列されたＰａｐＥサブユニットの連続からなることが見いだされた。ＰａｐＧ付着素は先端原線維の遠位末端に局在化しており、その位置は真核細胞上の糖脂質受容体を認識するその能力を最大にすると考えられる。２種の主要でない繊毛成分ＰａｐＦおよびＰａｐＫは先端原線維に見いだされる特殊化されたアダプター蛋白である。ＰａｐＦは付着素部分を原線維に結合させるが、ｐａｐＫは原線維を繊毛ロッドに結合させる。Ｐ繊毛線維の混成構造は、ＰａｐＧ付着素を真核細胞受容体に提供するために尿路感染病原性イー・コリにより用いられる戦略を明らかにする。堅固なＰａｐＡロッドは、ＬＰＳおよび細菌細胞表面における他の成分により引き起こされる妨害から遠ざけて付着素を伸長させるが、柔軟性のある原線維はＰａｐＧを立体的に自由にして尿路上皮上のジガラクトシド部分を認識しこれに結合するようにする。少しの例外があるが、１型繊毛の構造上の組織化はＰ繊毛について記載されたものと非常に類似している。１型繊毛において、マンノース結合原線維先端はＦｉｍＨとして知られているグラム陰性病原体の発病性に関連した繊毛の集合はペリプラズムチャペロンの機能を必要とする。分子チャペロンはすべての細胞（原核および真核）の活性成分である。チャペロン（Chaperon）は、種々の細胞コンパートメントにおける蛋白の折り畳み、輸送および排出をはじめとする種々の細胞機能に役立っている（ゲシング（Gething）および（Sambrook），１９９２年）。よって、ペリプラズムチャペロンは、その作用を細菌のペリプラズム空間において果たしている分子チャペロンである。ＰａｐＤおよびＦｉｍＣは、それぞれ、Ｐおよび１型繊毛の集合を媒介するペリプラズムチャペロンである。詳細な構造分析は、ＰａｐＤがグラム陰性細菌におけるペリプラズムチャペロンの保存されたファミリーのプロトタイプメンバーであることを明らかにした。これらのチャペロンは、ペリプラズム空間中へ輸送され集合可能な複合体となる相互作用サブユニットにキャップおよび隔離をするために細菌により用いられる一般的戦略の一部である機能を有しており、非生産性相互作用を不利なものとしている。ｐａｐＤの３次元構造の決定は、それがブーメラン型に配向された２個の免疫グロブリン様ドメインからなり、裂け目を形成していることを明らかにした。ＰａｐＤは各繊毛サブユニット型が原形質膜から出て来た場合にこれらに結合し、集合可能でネイティブ様コンホーメーションとなっているこれらに伴って、原形質膜からＰａｐＣからなる外膜集合部位へと移行する。ＰａｐＣは、チャペロン−サブユニット複合体を受け取り、サブユニットを取り込むか、またはチャペロン複合体から一定の方向に成長中の繊毛中へと移行させるため、分子の案内係と呼ばれている。タイプIVクラスの繊毛の例外があるが、すべての他の遺伝学的に十分に特徴づけられたグラム陰性原核細胞の繊毛システムはＰａｐＤに対する遺伝子アナログを含んでいる（ノーマーク（Normark）ら，１９８６年；フルトグレン（Hultgre n）ら,１９９１年）（さらに表Ａ参照）。ＦａｎＥ、ｆａｅＥ、ｓｆａＥ、ＣｌｐＥおよびｆ１７−Ｄが配列決定されており（リンターマンス(Lintermans) ,１９９０年；シュモール（Schmoll）ら，１９９０年；バーチン・ワイ（Bertin Y）ら,１９９３年；バッカー（Bakker）ら,１９９１年）、イー・コリにおいて、それぞれＫ９９、Ｋ８８、ＳおよびＦ１７繊毛の集合に必要な繊毛チャペロンをコードしている。クレブシエラ・ニューモニアエの３型繊毛およびヘモフィルス・インフルエンザエのｂ型繊毛の集合は、それぞれ、ｍｒｋＢおよびｈｉｆＢ遺伝子産物を必要とする（ゲルラッハ（Gerlach）ら,１９８９年；アレン（Alle n）ら,１９９１年）。これらのチャペロンすべての構造−機能相関関係が、それらのアミノ酸配列およびＰａｐＤ結晶構造からの情報を用いて分析された（アンダース・ホルムグレン（Anders Holmgren）ら,１９９２年）。その結果は、このクラスの蛋白において進化的に保存されている分子の複雑さへの洞察を提供し、免疫グロブリンに対する有意な構造上の類似性を示唆した。よって、ＰａｐＤは、細菌繊毛の正しい超分子集合に必要なペリプラズムチャペロン蛋白のファミリーのプロトタイプメンバーである。イー・コリにおけるＰａｐＤのごときチャペロンは、ペリプラズム空間中へと輸送される上記繊毛蛋白に結合し、それらを集合可能な複合体中に隔離し、ペリプラズムにおけるサブユニットの非生産性凝集を防止するのに必要である（ドッドソン（Dodson）ら,１９９３年）。チャペロンとの相互作用がない場合、繊毛サブユニットは凝集し、蛋白分解的に分解される（キューン（Huehn）、ノーマーク（Normark）およびフルトグレン（Hultgren）,１９９１年）。ＤｅｇＰプロテアーゼがチャペロン不存在下の繊毛サブユニットの分解に大いにかかわっていることが最近になって見いだされた（シュトラウフ（Strauch）、ジョンソン（Johnson）およびベックウィズ（Beck with）,１９８９年）。この知見は、標準的方法により調製された原形質膜、外膜およびペリプラズムの蛋白のウェスタンブロッティングにおいて単一特異性抗血清を用いての、チャペロンの存在または不存在において発現された繊毛サブユニットの運命の探求を可能にした。チャペロン不存在下のｄｅｇＰ４１株（ＤｅｇＰ^-のイー・コリ株）におけるｐａｐＧまたはｐａｐＡの発現は、原形質膜におけるこれらの蛋白の蓄積のため、細菌に対して毒性があり、チャペロンはペリプラズム空間中へのサブユニットの輸送に必要であることが示唆された。増殖欠損の重大性は繊毛サブユニットの発現レベルに関連しており、一般的には、ＰａｐＡよりもＰａｐＧに劇的に関連している。誘導可能なアラビノースプロモーターの調節下でのＰａｐＤの同時発現は、ｄｅｇＰ４１株におけるサブユニット発現に関連した増殖欠損を救助し、ペリプラズム中へのＰａｐＧの輸送を可能にする。現在にいたるまで、チャペロンの分子認識モチーフについてはほとんど研究されていなかった。ＳｅｃＢ、ＧｒｏＥＬおよびＤＮａＫのごとき細胞質チャペロンは、配列に依存した様式で、折り畳まれていない蛋白の多様なグループに結合する（ゲシング（Gething）およびサムブルック（Sambrook）,１９９２年）。最近、ＤＮａＫは主に標的のペプチド骨格を介して結合し（ランドリー（Landry）ら,１９９２年）、ＧｒｏＥＬは側鎖の疎水性および標的配列が両親媒性α−ヘリックスを形成する能力により依存しうること（ランドリー（Landry）およびギーラッシュ（Gierasch）,１９９１年）が示唆された。しかしながら、ＰａｐＤは、折り畳まれたコンホーメーションのその標的蛋白に結合すると思われるという点で異なっている（キューン（Kuehn）ら,１９９１年）。ＰａｐＤの３次元構造は以前に解明されている（ホルムグレン（Holmgren）おメイン間に亀裂を有するブーメランに似ているように配置された２個の球状ドメインからＰａｐＤがなっていることを示す。各ドメインは、２個の逆へ移行β− プリーテッドシート（β-pleated sheets）により形成されるβ−バーレル（β- barrel）構造であり、免疫グロブリンの折り畳みのトポロジーに類似のトポロジーを有している。ＰａｐＤのＮ末端ドメインはＩｇ可変ドメインに最も似ているが、ＰａｐＤのＣ末端ドメインはＣＤ４（ワング（Wang）ら,１９９０年、リュー（Ryu）ら,１９９０年）およびヒト・成長ホルモン受容体（デ・フォス（De V os）ら,１９９２年）に似ている。ＰａｐＤおよび類似の免疫グロフリン様構造を有すると予想されるいくつかのペリプラズムチャペロンの構造比較は、この蛋白ファミリー中の一定不変の、高度に保存された、および種々な残基を同定した（ホルムグレン（Holmgren）ら, １９９２年）。もっとも保存的な残基は全体の構造およびドメイン相互配向の維持に関与していると思われる。しかしながら、２個の保存的な残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２は表面に露出しており、ドメイン間の亀裂に向かって配向している。Ａｒｇ−８アミノ酸の部位特異的突然変異は、それが少なくとも繊毛サブユニット結合ポケットの一部を形成していることを示した（ホルムグレン（Ho lmgren）ら,１９９２年；キューン（Kuehn）ら,１９９３年）。多くの上記繊毛サブユニット蛋白の配列分析により、それらがＣ末端における相同性をはじめとする多くの共通した特徴を有することが示された（実施例２参照）。配列におけるこれらの類似点は、そのペリプラズムチャペロンへの結合のごときすべての繊毛蛋白に共通したいくつかの機能に関与していると考えられる。実際、ｐ−繊毛付着素ＰａｐＧのＣ末端領域は、インビボにおけるＰａｐＤへの結合において重要であることがすでに示されている（フルトグレン（Hultgren ）ら,１９８９年）。表Ａは１６種のペリプラズム蛋白を掲載しており、すべてのものが病原性細菌における細胞表面構造の集合に関与し、すべてがＰａｐＤと有意な相同性を有している。要約すると、ＰａｐＤの３次元構造ならびにＰａｐＤと他のペリプラズムチャペロンの機能は知られているが、ＰａｐＤと繊毛サブユニットとの間の結合の正確なモチーフは現在まで知られていなかった。発明の開示本発明によれば、ＰａｐＤおよび他の関連チャペロンの上記特性は、それらを、繊毛により付着する細菌の病原性を主として減じるように設計された薬剤の興味深い標的としている。例えば、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合をブロックする薬剤（それによりインタクトな繊毛の集合を妨害する）は、インタクトな繊毛の形成を妨害し、それにより宿主上皮に付着する細菌の能力を減じるであろう。かかる薬剤を設計するために、チャペロンと繊毛蛋白の間の結合モチーフを詳細に知って、この結合をブロックしうる化合物を効率的に同定する方法を開発することは大いに価値がある。本発明の１の態様は、繊毛形成細菌における少なくとも１つのタイプの繊毛サブユニットと少なくとも１つのタイプの分子チャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進し、ペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合過程の間に分子チャペロンが繊毛サブユニットに結合することを特徴とする、組織付着性繊毛を形成する細菌により引き起こされる疾患の治療および／または予防方法に関する。本明細書の用語「繊毛」、「フィムブリア」、または「原線維」は、多くの組織付着性病原性細菌、すなわち、グラム陰性細菌の外膜に埋め込まれた原線維のヘテロポリマー構造に関する。本明細書においては、用語「繊毛」、「フィムブリア」、または「原線維」を互いに入れ替えて使用する。上で説明したように、繊毛は、インタクトな繊毛の固有の機能的部分を構成している多くの「繊毛サブユニット」からなる。非常に重要な繊毛サブユニットは「付着素」であり、繊毛サブユニットは細菌の組織結合能に関与している。用語「分子チャペロン」は、生細胞においてペプチドへの結合に関与して多くの方法でペプチドを成熟させる分子を意味する。多くの分子チャペロンはペプチドのネイティブなコンホーメーションへの折り畳みプセスに関与しているが、他のチャペロンは細胞中への、あるいは細胞中からのペプチドの輸送に関与している。特殊化された分子チャペロンは「ペリプラズムチャペロン」であり、それは「ペリプラズム空間」（細菌内膜と外膜との間の空間）においてその主な作用を行う細菌の分子チャペロンである。ペリプラズムチャペロンはインタクトな繊毛の正しい集合プロセスに関与している。本明細書の簡単な用語「チャペロン」は、断らないかぎり、分子チャペロン、ペリプラズムチャペロンを意味する。語句「１のタイプの」を用いる場合、問題としている繊毛サブユニットまたはチャペロンが独特な種であることを意味する。しかしながら、異なる種のペリプラズム分子チャペロン間において非常に相同性があるという事実は、例えば化合物を用いる１のタイプのチャペロンの妨害は、他のチャペロンの妨害においても当該化合物を使用することを可能にする。語句「繊毛形成細菌において繊毛サブユニットと少なくとも１の分子チャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進する」は、チャペロンとその本来のリガンド、すなわち繊毛サブユニットとの間の正常な相互作用が、完全にまたは実質的に完全に妨害され、あるいは阻害され、あるいは別の様式で表現され、チャペロンへの繊毛サブユニットの結合が測定可能に低いという程度まで低下していることを示す。同様に、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合促進は、ペリプラズム空間におけるネイティブな条件と実質的に同じ条件（ｐＨ、イオンおよび他の分子の濃度）においてチャペロンが繊毛サブユニットと相互作用する場合よりもチャペロンへの繊毛サブユニットの結合が測定可能に高いものであるべきである。結合の程度の測定値は、当業者に知られた方法（微小熱量測定、ラジオイムノアッセイ、酵素によるイムノアッセイ等）によりインビトロにおいて決定されうる。上記によれば、繊毛サブユニットとチャペロンとの間の正常な相互作用の防止または阻害は、繊毛の集合に対する実質的な制限効果を有するであろう。しかしながら、繊毛サブユニットとチャペロンとの間の結合の促進は、細菌に対して破壊的なものでもありうる。実施例２からわかるように、異なる繊毛サブユニットは異なるアフィニティーでＰａｐＤに結合し、この狭くバランスしたシステムに影響し、さらに繊毛の集合速度および効率を制限するかもしれない。繊毛サブユニットとチャペロンとの間の穏やかな変化でさえも繊毛の集合に対して劇的な衝撃を有し、よって細菌の付着能に劇的な衝撃を有する可能性があると考えられる。例えば、チャペロンと１の繊毛サブユニットとの間の結合における変化が、チャペロンと通常は該チャペロンに結合する繊毛サブユニットとの間の正常なオーダーのアフィニティーが変化するようなものである場合、繊毛の集合のオーダーは繊毛サブユニットとチャペロンとの間のアフィニティーに依存しているので、繊毛の正常な集合は混乱させられるはずである。チャペロンに対して高アフィニティーを有する繊毛サブユニットは、より低いアフィニティーを有する他の繊毛サブユニットに先立って結合するかもしれない。よって、繊毛サブユニットとペリプラズム分子チャペロンとの間の結合の防止、阻害または促進は、繊毛の集合を損なう効果を有し、それにより通常は繊毛を発現している微生物の感染性が減じられる。繊毛サブユニット間の結合の防止、阻害または促進を多くの方法で行うことができる。組織付着性繊毛形成細菌により引き起こされる疾患の治療および／または予防の本発明による好ましい方法は、ペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合プロセスの間に、分子チャペロンへの繊毛サブユニットの結合を防止、阻害または促進する様式で、繊毛サブユニットに結合する少なくとも１のタイプの分子チャペロンと相互作用することができる有効量の物質を、それを必要とする対象に投与することである。該物質は、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用、それゆえ繊毛の集合に対して上記効果の１つを有するいずれの化合物であってもよい。特に興味深い物質は、チャペロンの繊毛サブユニット結合部分と相互作用する可能性のある物質であるが、チャペロンの他の部位との相互作用も繊毛サブユニットとチャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進するかもしれない。これは、サブユニットとチャペロンとの間の正常な結合に対する直接的な立体的ブロッキングの効果でありうるが、チャペロンのコンホーメーション変換の効果でもありうる。本発明方法に使用する物質の同定方法を以下に示す。物質とチャペロンとの間の相互作用は、物質のチャペロンへの共有結合であっても、また非共有結合であってもよい。用語「それを必要とする対象」は、本明細書の文脈においては、ヒトをはじめとするいかなる動物であってよく、該動物は病原性であると考えられる組織付着性繊毛形成細菌に感染している、あるいは感染している可能性がある動物である。用語「有効量の」は、大部分の患者において、病原性細菌により引き起こされた疾患が治癒する効果、あるいは物質が予防的に与えられた場合に疾患が明らかとなることを防止する効果のいずれかを有する、問題としている物質の量を意味する。さらに、用語「有効量」は、投与された対象において穏やかな副作用しか引き起こさないかまたは副作用を起こさない量で物質を与えること、あるいは物質が与えられた疾患の重さに関する医学的および薬理学的観点からみると副作用が耐えられるものであることを意味する。物質の投与経路は投与に関するいずれの慣用的経路、すなわち、経口、静脈内、筋肉内、皮内、皮下等であってよい。経口経路が好ましい。かかる物質の用量は、患者または動物に抗細菌剤を投与する場合に通常用いる用量すなわち、１日につき体重１ｋｇあたり１μｇ〜１０００μｇであると考えられる。用量は、一部には、物質の投与経路に依存するであろう。経口経路を用いる場合、物質の吸収は重要な因子である。低い吸収性は、胃腸消化管における高い濃度が必要であり、よって高用量が必要である。中枢神経系（ＣＮＳ）の感染を治療する場合のかかる物質の用量は、物質の脳関門透過性に依存するであろう。ペニシリンを用いる細菌性髄膜炎の治療においてよく知られているように、ＣＮＳにおける有効濃度を得るためには非常に高用量が必要である。物質の適当な用量は、適当かつ許容される動物モデルにおいて有効用量レベル（例えば、ＥＤ₅₀）および毒性用量レベル（例えば、ＴＤ₅₀）ならびに致死用量レベル（例えば、ＬＤ₅₀またはＬＤ₁₀）が確立されている動物モデル試験を行うことにより適当に評価されるであろう。さらに、かかる動物試験において物質が有効であると判明した場合、対象を用いる臨床試験を行うべきである。グッド・クリニカル・プラクティス（Good Clinical Practice）の標準的方法に基づいてかかる臨床試験を行うべきであることはいうまでもない。繊毛サブユニットとチャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進する好ましい方法は、チャペロンに対して上記効果を有する物質を投与することであるが、他の方法も可能である。例えば、同じ理由のため、１のタイプの繊毛サブユニットと相互作用する物質が上記効果を有する可能性もある。しかしながら、チャペロンとの相互作用は、インタクトな繊毛を構成しているすべてではないにしても大部分の繊毛サブユニットが繊毛中に集合することに対して影響する可能性があるので、チャペロンとの相互作用が細菌の感染性を抑制することに関して最も効果的となるであろうと考えられる。下記実施例から明らかなように、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合に関する大部分のデータを、イー・コリ由来のＰａｐＤチャペロンとの間の相互作用を研究することにより得た。しかしながら、多くの組織付着性細菌は、そのＣ末端部分における相同性を実質的に共有している繊毛を発現することがわかっているので、さらに現在までに単離された種々のペリプラズムチャペロン間において実質的な相同性が示されているので（表Ａ参照）、いくつかの物質および物質のクラスが存在するペリプラズムチャペロンの大部分と相互作用する可能性があり、よって、物質が細菌感染した患者に投与される場合、これらのチャペロンを有する細菌により引き起こされる疾患の治療および／または予防において有用であろうと考えることは正当である。よって、治療および／または予防のための本発明方法は、特に、ヘモフィルスｓｐｐ（Haemophilus spp）、ヘリコバクターｓｐｐ（Helicobacter spp）、シュードモナス・アエルギノザ（Pseudomonas aeruginosa）、マイコプラズマｓｐｐ（Mycoplasma spp）、およびエシャリシアｓｐｐ（Escherichia spp ）、サルモネラｓｐｐ（Salmonella spp）、ボルデテラｓｐｐ（Bordetella spp）、イェルシニアｓｐｐ（Yersinia spp）、プロテウスｓｐｐ（Proteu s spp）ならびにクレブシエラｓｐｐ（Klebsialla spp）を含むすべての腸内細菌科のメンバーからなる群より選択される細菌により感染された患者において使用することが意図される。この点について、特に、イー・コリ（E.coli）、ワイ・ペスチス（Y.pestis）、ワイ・エンテロコリチカ（Y.enterocolitica）、ビー・ペルツシス（B.pertussis）、ケイ・ニューモニアエ（K.pneumoniae）、エス・ティフィムリウム（S.typhimurium）、エス・ティフィ（S.typhi）、エス・パラティフィ（S.paratyphii）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）、プロテウス・ミラビリス（Proteus mirabilis）およびヘモフィルス・インフルエンザエ（Haemophilus influenzae）からなる群より選択される細菌は、本発明方法の使用により治療および／または予防されうる感染を引き起こす感染物であると見なされる。したがって、本発明の重要な態様において、ＰａｐＤ、ＦｉｍＣ、ＳｆａＥ、ＦａｅＥ、ＦａｎＥ、Ｃｓ３−１、Ｆ１７Ｄ、Ｃ１ｐＥ、ＥｃｐＤ、Ｍｒｋｂ、ＦｉｍＢ、ＳｅｆＢ、ＨｉｆＢ、ＭｙｆＢ、ＰｓａＢ、ＰｅｆＤ、ＹｅｈＣ、ＭｒｐＤ、ＣｓｓＣ、ＮｆａＥ、ＡｇｇＤおよびＣａｆ１Ｍからなる群から選択されるチャペロンへの繊毛サブユニットの結合が防止、阻害または促進される。上述のごとく、本発明の好ましい具体例において、ペリプラズムを通る繊毛サブユニットの輸送の間および／または繊毛の集合のプロセスの間において繊毛サブユニットへの結合に通常は関与している分子チャペロン中の結合部位との相互作用を行うことにより、結合の防止、阻害または促進を行う。説明したように、本発明に関して、ｐａｐＤと、繊毛サブユニットＰａｐＧのＣ末端の１９個のアミノ酸（Ｇ１'〜１９'）を構成しているペプチドとの間の結合モチーフが決定された。本明細書に詳細に記載されているように、他のチャペロンはこの結合部位においてＰａｐＤと実質的は相同性を共有している。よって、かかる結合部位は、ペリプラズムチャペロンと相互作用することが意図された薬剤の標的として大いに興味深い。それゆえ、上記本発明方法の好ましい具体例において、影響を受ける結合部位はＧ１'〜１９'に結合する部位である。よって、本発明の重要な態様は、上記方法であって、該方法において結合部位は、繊毛サブユニットのカルボキシル末端部分が結合しうる部位であり、該部位は、ＰａｐＤにおける不変残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２と実質的に同じ部位ポイントおよび繊毛サブユニットのカルボキシル末端のβ−ストランドと相互作用しうるポリペプチドフラグメントからなり、該相互作用により結合部位のＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２部位ポイントにおいて該サブユニットの結合が安定化される。本発明の特に好ましい態様は上記方法であって、該方法において、結合部位は本明細書記載のＰａｐＤのＧ蛋白結合部位である。用語「部位ポイント」は、十分に知られている、他のかかる化学基に対するサイズ、電荷、疎水性／親水性、極性、水素結合の方向ならびに３次元位置（距離および角度）のごとき物理／化学的特性を有する化学基をいう。よって、Ａｒｇ −８およびＬｙｓ−１１２と「実質的に同じ」である部位ポイントは、これら２つのアミノ酸と同じ十分に知られた物理／化学特性を実質的に共有している化学基である。用語「不変残基」は、アミノ酸の正しいタイプに関していかなる変化もなく、さらに蛋白におけるその機能においても実質的に何ら変化がない多くの蛋白に見いだされうるアミノ酸残基をいう。大多数の関連蛋白における不変残基の存在は、通常、かかる残基の生物学的重要性を示唆するものである。なぜなら、これらの残基を欠く変異は、明らかにインタクトな蛋白の機能を欠くものでもあるからである。本明細書に記載のごとく、すべてのペリプラズム分子チャペロンは、Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２と等価なアミノ酸残基を共有している。それゆえ、これら２つの残基は繊毛形成細菌にとりかなり重要であると考えられる。「繊毛サブユニットのカルボキシ末端部分のβ−ストランドと相互作用しうるポリペプチドフラグメント」は、チャペロンの一部（結合部位の一部でもある）が繊毛サブユニットのβ−ストランドと相互作用しうることを示す。この相互作用は、繊毛サブユニットとチャペロンとの間の結合における安定化因子として役立ち、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の全モチーフの非常に重要な一部分と見なされる。さらに、β−ストランドが繊毛サブユニットの正しい折り畳みのための鋳型として役立つことが、最近、本発明者らにより予想された（実施例１０参照）。本明細書で説明するように、すべてではないが多くの既知繊毛サブユニットのＣ末端部分は、実質的な相同性を共有しており、そのことは、結合が起こり安定化するための繊毛サブユニットならびにチャペロンの３次元構造の重要性に関するもう１つの示唆である。実施例から明らかなように、ＰａｐＤのドメイン２に存在するもう１つの結合部位が同定された。この結合部位は、融合蛋白ＭＢＰ−Ｇ１'〜１４０'ならびにＰａｐＧのＣ末端アミノ酸残基１２５'〜１４０'から構成される短鎖ペプチドと相互作用する。よって、さらにこの結合部位は、ペリプラズムチャペロンと相互作用することを意図された薬剤の標的として大いに興味深い。それゆえ、上記本発明方法の好ましい具体例は、影響を受けた結合部位が２つの上記ペプチドのいずれかに結合する方法である。疾患の治療および／または予防において物質を投与することからなる上記方法は、繊毛サブユニットとペリプラズム分子チャペロンとの間の相互作用の防止、阻害または促進を導く効果を奏することのできる物質の同定またはデノボ設計に依存することが理解されよう。さらに、これらの物質が治療上有効であるチャンスは多いことが重要である。よって、本発明の１の態様は、ペリプラズム分子チャペロンと相互作用しうる潜在的に治療上有用な物質を同定する方法であって、それにより、ペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用を防止、阻害または促進する方法であり、該方法は以下の工程の少なくとも１つからなる：１）物質によるペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用の可能性な防止、阻害または促進が、ａ）固定化された形態のペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログおよび可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物からなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、またはｂ）固定化された形態の繊毛サブユニットまたはその等価物および可溶化形態のペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、またはｃ）可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、またはｄ）可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる結合エネルギーの変化を測定し、次いで、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合エネルギーの変化が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定することにより調べられるアッセイにおいて候補物質を試験し、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合または結合エネルギーの変化が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定する。２）ペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用に対する可能な防止、阻害または促進が、生組織付着性繊毛形成細菌からなる系に物質を添加し、次いで、該細菌の増殖速度を調べ、該物質が添加されなかった対応系と比較した場合の増殖速度の低下がペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の防止、阻害または促進を示すこと、または生組織付着性繊毛形成細菌からなる系に物質を添加し、次いで、該細菌の組織付着を調べ、該物質が添加されなかった対応系と比較した場合の組織付着の減少がペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の防止、阻害または促進を示すことにより調べられるアッセイにおいて候補物質を試験し、該物質の添加後に増殖速度または組織付着の低下・減少が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定する。３）インビトロにおいてペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用を防止、阻害または促進することが確認された物質を実験動物に投与し、該物質の投与の前に、同時に、または後に組織付着性繊毛形成細菌を実験動物に接種し、次いで、該細菌により引き起こされる疾患を予防および／または治療および／または改善する物質をペリプラズム分子チャペロンと適当に相互作用しうる物質として選択する用語「繊毛サブユニットの等価物」は、例えば、繊毛サブユニットとその等価物がチャペロンへの結合に関して競争することを示すことにより、繊毛サブユニットがチャペロンに結合するのと同等の様式でチャペロンに結合することが確認されている化合物を意味する。繊毛サブユニットの好ましい等価物はＧ１'〜１９'ＷＴ、ＭＢＰ−Ｇ１'〜１４０'およびＧ１２５'〜１４０'であり、それらすべてが本明細書に詳細に記載されている。「チャペロンのアナログ」は、該チャペロンの繊毛サブユニットへの結合に対応する様式で少なくとも１つの繊毛サブユニットに結合する能力を有するすべての物質をいう。チャペロンのかかるアナログは、インタクトなチャペロンの切断形態（例えば、ＰａｐＤの２個のドメインの１つ）であってもよく、あるいは、例えばプローブ、マーカーまたは別の部分に結合したチャペロンの修飾形態であってもよい。最終的には、チャペロンのアナログを単離することができるが、チャペロンの結合部位の全機能の一部の機能を有するものであるか、またはかかる結合部位を模倣する合成物質である。上記固定化方法は、付着表面または宿主または抗体のごとき受容体分子への非共有結合、あるいはポリマーまたはペプチドのごときスペーサー分子への共有結合であってよい。上記工程１ａ）において、例えば、繊毛サブユニットまたはその等価物を標識すること、あるいは繊毛サブユニットまたはその等価物と反応しうる標識リガンド（抗体のごとき）の手段、あるいはPharmacia BiaCore^Rアッセイのごとき結合程度の決定による屈折率の手段のような、多くの方法により、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合する繊毛サブユニットまたはその等価物を検出することができる。したがって、工程１ｂ）において、例えば、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを標識すること、あるいはペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと反応しうる標識リガンド（抗体のごとき）の手段、あるいはPharma cia BiaCore^Rアッセイのごとき結合程度の決定による屈折率の手段のような、多くの方法により、繊毛サブユニットまたはその等価物に結合するペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを検出することができる。工程１ｃ）において、繊毛サブユニット／チャオン複合体を分離することにより（超遠心、限界濾過、サイズ排除クロマトグラフィーのごとき液体クロマトグラフィー、または電気泳動により）、繊毛サブユニットまたはその等価物に結合するペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを検出してもよい。短いＰａｐＧフラグメントがＰａｐＤに結合した場合の、このフラグメントの蛍光の変化による方法を下に記載する。この方法は本発明方法における好ましいアッセイである。工程１ｃ）における結合エネルギーの決定を、好ましくは、よく知られた微小熱量測定法を用いる微小熱量系において行う。上に示した工程は３つの目的に役立つ。工程１）におけるアッセイのタイプは、候補物質がチャペロンと相互作用する能力に注目するものである。標識された物質、チャペロンまたは抗体を用いる場合において、標識は放射性標識、蛍光または吸光性標識、セイヨウワサビ・ペルオキシダーゼのごとき酵素、ビオチンのごときリガンド、あるいは当業者に知られた他のすべての慣用的な標識系であってよい。液体シンチレーションカウンター、ガンマカウンター、または放射活性用の他のすべての慣用的な検出系において放射性標識を測定することができる。酵素に対する特異的基質の存在または不存在（光学密度の測定、残存基質または生成物の化学反応性等）により酵素標識を検出する。蛍光顕微鏡または蛍光エミッションの簡単な測定により蛍光標識を検出することができる。特定波長の光の吸収を測定することにより光吸収性標識を検出することができる。ストレプトアビジンへの結合によりビオチンを検出してもよい。１）における超遠心または限界濾過による高分子複合体の分離を、上記のごとく標識されている複合体の１成分により検出することができる。よって、繊毛サブユニット／等価物の結合および非結合の割合を知ることができるが、該検出工程は、複合体の１成分への抗体の結合およびこの抗体のその後の検出にも依存するかもしれない。いずれの慣用的クロマトグラフィー法（ＨＰＬＣ、ＦＰＬＣ、サイズ排除等）を用いてもよい。電気泳動による分離を、例えば、キャピラリー電気泳動により行ってもよい。工程２）におけるアッセイはすべて、インビトロにおける細菌活性に対する候補物質の影響に関連している。アッセイの過程において細菌の増殖速度の低下を示すことまたは細胞もしくは合成表面への付着の減少を示すことはチャペロンとの相互作用の影響には寄与しないが、この種のデモンストレーションはかかる化合物の潜在的治療上有用性の評価を提供する。細菌を画線した固体寒天プレート上のコロニーを計数することにより、液体増殖培地中の細菌密度を計測することにより（ＯＤ₆₀₀の測定）、細菌細胞にのみ含まれているＮＡＤ(Ｐ)Ｈ、ＡＴＰ、またはアミノ酸のごとき物質の蛍光を測定することにより、あるいは当業者に知られた他のすべての慣用的な検出系により、増殖速度の測定を行うことができる。付着性細菌を単離した後、同様の方法で細菌の付着の測定を行うことができる。好ましくは、赤血球細胞または受容体で被覆したラテックスビーズを凝集させる細菌の能力を測定することにより、受容体を被覆したマイクロタイタープレートへの細菌の付着を測定することにより、あるいは他の合成表面への細菌の付着を測定することにより、付着の測定を行う。上記方法の好ましい具体例において、生きている組織付着性繊毛形成細菌はプロテアーゼ欠損株であり、該プロテアーゼは、少なくとも部分的に繊毛サブユニットの分解に関与するものである。１の特に好ましいタイプの株はイー・コリのｄｅｇＰ４１株である。本明細書に記載したように、ｄｅｇＰ４１株は、ＰａｐＤにより繊毛サブユニットがペリプラズム空間中に解放されない場合にイー・コリの繊毛サブユニットの分解に関与するＤｅｇＰプロテアーゼの活性を欠いており、かくして、繊毛サブユニットの蓄積が細胞にとり有毒である場合にｄｅｇＰ４１株はＰａｐＤの有効性の変化に感受性がある。等価なプロテアーゼが他の繊毛発現細菌中に存在すると考えられる。工程３）における動物試験を行ってインビボにおける候補物質の潜在的治療上有用性を示す。さらに、上記のごとく、かかる動物実験は、ヒトにおけるコントロールされた臨床試験において候補物質が最終的に試験される前の、有効量および毒性の関する前もっての値を確認するものでもある。さらに、動物モデルから物質の吸収に関するデータならびに物質の代謝および排泄に関するデータを得ることができるので、動物実験は、医薬調製物中の物質の慣用的な処方ならびに好ましい投与経路を提供する。好ましくは、実験動物はマウス、ラット、ネコ、イヌ、サル、ウマ、ウシ、ブタ、またはニワトリである。用語「分子チャペロンと適当に相互作用しうる」は、分子チャペロンと相互作用しうることとは別に、物質がインビボ系において効果を奏することができること、すなわち、その結合能のほかに、物質が生物学的な系、特に患者に適合性を示すことを意味する。上記インビボにおける研究、特に動物モデルにおける実験は、チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の防止、阻害または促進における物質の潜在的な治療上の有効性に関する最良のインジケーターであるが、治療能力を有する化合物の開発に際して上述のインビトロにおけるアッセイは重要な先鞭として役立つことを忘れてはならない。インビボアッセイにのみ頼るならば、おそらく実際にチャペロン／繊毛サブユニット相互作用に対する所望の効果を示す化合物がインビボアッセイによるスクリーニングから漏れるであろう。なぜなら、これらの化合物は、例えば、生物学的膜を透過する能力を欠いている可能性があるからである。インビトロアッセイを用いる場合、先導化合物を見いだすさらに大きなチャンスが残っている。本明細書記載のインビトロアッセイにおいて試験される物質の効果の評価（この点において、特に実施例参照）は、多くの因子に依存している。小型分子はむしろ高いモル濃度で添加されてチャペロン／繊毛サブユニット相互作用に対して影響を及ぼすことができる（小型分子はやはり興味ある先導化合物である）が、大型分子はむしろ低いモル濃度においてさえも著しい効果を示しうることが当業者により理解されるであろう。一般的に、本明細書記載のいずれのインビトロアッセイも、候補物質を試験する場合、ポジティブな結果が得られると考えられ（すなわち、試験された物質が「有意な」効果を示す）、以下の条件が満足されるはずである：化合物は繊毛サブユニット／チャペロン相互作用（または繊毛サブユニット／チャペロン相互作用と十分相関のある等価な系における相互作用）に対して有意な効果を示すべきであり、該有意な効果は疑いもなく物質とチャペロンとの間の相互作用によるものであり、チャペロンと物質との間の非特異的相互作用（例えば、物質が添加された場合、物理的および化学的環境の急激な変化によるもの）でない。奏された効果について非特異的相互作用を排除する１の方法は、化学的に同等な物質（分子量、電荷／極性および大まかな３次元コンホーメーション（球状、繊維状）等に関して）である少なくとも１の対照を使用することである。対照がアッセイにおいて実質的に物質と同じ効果を生じない場合、物質をアッセイ陽性物質であると見なさなければならない。実施例に記載したアッセイはすべて、上記本発明方法における試験系として役立ちうるアッセイのタイプの良い例である。しかしながら、蛍光標識した繊毛サブユニット変異体を用いる実施例１０において記載されている方法を工程１ｃ）に用いるのが好ましい。このアッセイを以下に簡単に説明する： −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる第１の系に物質を添加し、 −次いで、環境的に感受性のある蛍光プローブで標識された繊毛サブユニットまたはその等価物を添加し、 −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと繊毛サブユニットまたはその等価物との間の結合量を示す特定の波長における蛍光エミッションを測定し、次いで、 −実質的に同じ濃度の該分子チャペロンまたはそのアナログおよび該繊毛サブユニットまたはその等価物を含むが、実質的に該物質を含んでいない対応する第２の系において測定される蛍光エミッションと、該測定された蛍光エミッションとを比較する。第１および第２の系の間の蛍光エミッションの有意差はペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと物質との間の相互作用を示すものである。このアッセイの利点は、それを、チャペロン／繊毛サブユニット系に対する試験物質び影響の定量的測定のために使用できることである。このアッセイを用いて本発明者らは、例えば、ＰａｐＧアナログとＰａｐＤとの間の結合定数を決定した。第２の系において繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズムチャペロンならびにその等価物との間のモル比を変化させて蛍光エミッション測定を複数回行うことにより、定量的測定を行うことができ、それにより、測定した蛍光エミッションのデータから、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合定数を評価する。このようにして得られたデータから、実施例１１にある並行したやり方で物質の結合定数を決定することも可能である。潜在的に治療上有用な物質を同定するための上に示した方法は、物質の実際の存在のしかたに左右されることが理解されよう。通常は、上記方法に供する前に候補物質を精製もしくは合成することが必要である。しかしながら、チャペロンと適当に相互作用しうる物質が同定される前に多くのかかる候補物質が試験される可能性があるので、上記方法に供される前にかかる物質を同定することは興味深いことであり、そのことにより、精製および／または合成工程における供給源の消費が減少する。それゆえ、さらに本発明は、前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好な推定結合エネルギーを用いて、チャペロンと相互作用しうる（例えば、チャペロンに結合する）物質Ｘを同定および／または設計する方法であって、１）潜在的にチャペロン中の部位と相互作用しうる物質Ａを選択し、次いで、その３次元構造画像を得て、２）物質Ａとチャペロン中の部位との間の結合自由エネルギーを推定し、３）物質Ａとチャペロン中の部位との間の推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好である場合には、物質Ａを物質Ｘと同定し、４）物質Ａとチャペロン中の部位との間の推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値と等しくないかまたはそれより良好でない場合には、３次元構造画像を修飾し、次いで、かくして修飾された物質Ｂとチャペロン中の部位との間の結合自由エネルギーを推定し、５）得られる物質Ｘとチャペロン中の部位との間で決定される推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好になるまで工程４を繰り返すからなる方法に関する。上記方法にさらに２つの工程を加えることが可能である。ここで、実際の結合自由エネルギーを決定して実験上の結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値よりも良好であることを確認する。以下の２つの工程を用いる：６）化学物質Ｘの試料およびチャペロンの試料を用意し、化学物質Ｘとチャペロンとの間の結合自由エネルギーを測定し（例えば、上記微小熱量測定法による）、次いで、化学物質Ｘとチャペロンとの間の測定された結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好であることを確認し、次いで、所望により、７）チャペロンと適当に相互作用しうる物質を同定するための上記方法に物質Ｘを供して、物質Ｘがチャペロンと相互作用しうる潜在的に治療上有用な物質であることを証明する。かくして、候補物質とチャペロンとの間の結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値よりも実際に良好であることが証明される。さらに工程７）により、候補物質が治療上有用である十分なチャンスを有していることが確認される。語句「結合自由エネルギーを推定する」は、結合自由エネルギーを、実際の結合自由エネルギーを決定する実験を行うよりもむしろ計算により決定することを意味する。結合自由エネルギーを決定する１の（理論的な）方法は、相互作用している物質の関する自由エネルギー摂動（ＦＥＰ）計算を行うことによるが、膨大な計算のために、かかるアプローチは、結果として、下記の経験的な近似法を用いることが好ましいこととなる。用語「よりも良好」は、結合自由エネルギーが、しきい値として選択された結合自由エネルギーよりも高い値を有することを意味する。そのことは、ΔＧが、選択されたしきい値よりも数値的に高いことを意味する。あるいは、言い換えると、その用語は、物質とチャペロンとの間の結合が、溶液中で物質とチャペロンが別個に懸濁されているよりもエネルギー的に好ましいことを意味する。上で示した本発明方法において結合エネルギーを推定するためには、以下の方法を用いるのが特に好ましい：＜Ｖ^el _X-s＞_B−＜Ｖ^el _X-s＞_A、すなわち２つの状態における物質Ｘとその周囲（ｓと表示）との間のポテンシャルエネルギーに対する極性相互作用からの寄与間であると定義される平均エネルギー変化＜ΔＶ^el _X-s＞を評価する。１の状態（Ａ）は、化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、他の状態（Ｂ）は、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合した化学物質が溶媒に取り囲まれている状態である。＜Ｖ^vdw _X-s＞_B−＜Ｖ^vdw _X-s＞_A、すなわち２つの状態における物質Ｘとその周囲（ｓと表示）との間のポテンシャルエネルギーに対する非極性相互作用からの寄与間であると定義される平均エネルギー変化＜ΔＶ^vdw _X-s＞を評価する。１の状態（Ａ）は、化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、他の状態（Ｂ）は、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合した化学物質が溶媒に取り囲まれている状態である。次いで、上記２つの平均エネルギー変化の修正された組み合わせとしての絶対結合自由エネルギーを計算する。本明細書の数式において、シンボル＜＞は分子力学平均を意味する。インデックスＸ−ｓは、化合物−溶媒（または化合物−周囲）を意味し、文字「Ｘ」は化学物質Ｘを示す。通常は、物質Ｘはペリプラズムチャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の阻害剤として機能するであろうが、本明細書で議論するように、繊毛サブユニットとチャペロンとの間の結合が促進されるような様式で化合物または薬剤がチャペロンに影響することもありうる。上段の「ｅｌ」は極性または静電気的エネルギーを意味するが、上段の「ｖｄｗ」は「ファン・デル・ワールス」を示し、これは非極性相互作用に関するもう１つの命名である。シンボルΔ は、状態Ａにおける量が状態Ｂにおける量から減じられることを示す。この意味からすると、用語「ペリプラズム分子チャペロンのアナログ」は、ペリプラズム分子チャペロンの興味ある部分を模倣（結合特性に関して）するすべての物質であると広い意味で理解されるはずであり、アナログと化学物質または基または複数の化学物質（例えば、薬剤候補）との相互作用が研究される。よって、簡単には、アナログとは、インビボにおけるチャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合を模倣する様式で化学物質と相互作用しうると見なされる他のすべての化合物であるが、最も頻繁には、アナログは比較的大型の分子であり、言い換えると、蛋白またはオリゴヌクレオチドのごとき高分子であり、化学物質と比較して大型である。しかしながら、もちろん、アナログと相互作用する化学物質はそれ自体高分子である。この意味において、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログは、好ましくは、繊毛の集合に関連した少なくとも１つの興味深い結合特性を示すペリプラズムチャペロンまたはそのアナログである。結語自由エネルギーを決定するための上に示したアプローチに関する根拠を以下に説明する。結果として極性溶液に関して電荷の生成に応答した２次自由エネルギー関数が得られる静電気力についての線形応答近似を出発点として採用する。これは、例えば、電子移動反応に関するマーカス（Marcus）の理論（マーカス,１９６４年）から得られる良く知られた結果である。２つの状態ＡおよびＢを用いる系について、２つのポテンシャルエネルギー関数Ｖ_AおよびＶ_Bにより、等しい曲率の調和自由エネルギー関数の近似の範囲内で以下の関係式（リー（Lee）ら,１９９２年およびそこに引用された文献参照）：［式中、ΔＧ_ABはＢとＡとの間の自由エネルギー差、λは対応する再構成エネルギー、＜＞_iはポテンシャルｉの最小値近傍で評価された平均値を示す］が得られる。よって、式：［式中、ΔＶはエネルギー差Ｖ_B−Ｖ_Aを示す］である。単一イオンの水和を考慮する場合、この式はΔＧ^el _sol＝1/2＜Ｖ^el _X-s＞、すなわち、溶媒和エネルギーに対する静電気的寄与が対応イオン溶媒相互作用の半分に等しいことを示すことができる（ワーシェル（Warshel）およびラッセル（Russell）,１９８４年；ルー（Roux）ら,１９９０年）。さて、結合の問題に戻ると、この結果を以下のように利用することができる：各溶媒和プロセス、すなわち、水中および蛋白内部における溶媒和について、２つの状態を、第１の状態が真空中および与えられた環境においてすでに形成された無極性空洞中（例えば、レナード−ジョーンズ（ L ennard-Jones）ポテンシャルにより形成される）における物質を有するものであると考えることができる。第２の状態は水または水和蛋白により囲まれたインタクトな物質に対応する。次いで、線形応答近似は、再度、ΔＧ^el _bind≒1/2＜Ｖ^e ^l _X-s ＞［式中、Ｖ^el _X-sは溶質−溶媒静電気項である］を与える。ゆえに、結合自由エネルギーに対する静電気的寄与を、ΔＧ^el _bind≒1/2＜Ｖ^el _X-s＞（Δは蛋白と水との間の差を意味する）により近似することができ、かくして、溶媒和された物質および物質−蛋白複合体に関する２つのＭＤシミュレーションから得ることができる。線形応答近似の結果の正当性は、イオン溶媒和の場合おいて、例えば、ルー（ Roux）ら（１９９０年）の研究において確認されている。等式ｂの近似を確実にする単純な系についていくつかのさらなる計算を行った。球状の水系（オクビスト（Aqvist）,１９９０年）におけるＮａ⁺およびＣａ²⁺イオンを荷電させることに対するＦＥＰ／ＭＤ刺激から得た自由エネルギーを７５ｐｓＭＤ軌道からの対応する＜Ｖ^el _X-s＞と比較することによりこれらの試験を行った。これにより、＜Ｖ^el _X-s＞をΔＧ^el _solを関連づける得られた因子はＮａ⁺に関しては０.４９、Ｃａ²⁺に関しては０.５２の値が得られ、両方の値は1/2という推定結果に近かった。水中のＯＰＬＳポテンシャル（ヨルゲンセン（Jorgensen）,１９８６年）により行われるメタノール分子の荷電についての同様の試験は、ΔＧ^el _sol／＜Ｖ^el _X-s＞比０.４３を示した。重要な問題は、いかにして無極性相互作用および結合自由エネルギーに対する疎水性効果（ΔＧ^vdw _bindという）を説明するかである。理想的な場合、無極性（またはファン・デル・ワールス）相互作用エネルギーからのこの寄与を評価することは可能なはずである。シャンドラー（Chandler）および共同研究者（シャンドラーら,１９８３年；プラット（Pratt）およびシャンドラー,１９７７年）の液体理論をうまく用いて疎水性効果を分析し、いくつかの無極性分子に関する転移エネルギー（プラットおよびシャンドラー,１９７７年）を計算したが、蛋白の活性部位のごとき不均一な環境における溶媒和についてその種の分析処理が可能であると思われる。しかしながら、種々の炭化水素化合物に関する実験上の溶媒和自由エネルギーは、それ自身の液体中ならびに水中における炭素鎖の長さにほぼ直線的に依存する（ベン−ネイム（Ben-Naim）およびマーカス（Marcus） ,１９８４年）。Ｈ₂Ｏおよび無極性ファン・デル・ワールス溶媒に溶媒和されたｎ−アルカンのＭＤシミュレーションを行い、平均溶質−溶媒相互作用エネルギーが鎖中の炭素数に伴ってほぼ直線的に変化することも示された（もちろん、異なる溶媒中では関係が異なる）。よって、＜ΔＧ^vdw _bind＞からのΔＧ^vdw _bindの単純な直線的近似により無極性結合寄与を説明することが可能であると思われる。例えば、σを溶媒のサイズのいくつかの適当な測定値であると考え、溶質−溶媒ファン・デル・ワールス相互作用エネルギーおよび対応する無極性自由エネルギー寄与（水中および蛋白中の双方での）がσに直線的に依存する場合には、次いで、が得られる。純粋に理論的な考え方から確実な方法で該２つの量を関係づける因子を導出することは困難であると思われるので、アプローチ法として、実験的な結合のデータを再現できるかかる関係を決定するための経験的な試行を採用する。よって、によって近似される結合自由エネルギーは本発明の１の具体例であり、パラメーターαは経験的キャリブレーションにより決定される。上で議論したように、＜Ｖ^el _X-s＞に関する係数についての理論的推定値は1/2 であるが、この係数を経験的パラメーターとして取り扱うことも実際上有用でありうる。このことは、［式中、両パラメーターαおよびβは経験的キャリブレーションにより決定される］によって近似される結合自由エネルギーを導く。最終的に、いくつかの場合には、さらなる定数項を等式１に加えて、等式を：［式中、ｃは、化学物質のゼロサイズへの外挿を反映する定数であり、すなわち、化学物質のゼロサイズに向けて移動させた場合、回帰線は明確に原点から派生する］とすることが適当であると思われる。さらにパラメーターｃを用いて、例えば、誘導される分極の無視、生じ得るカフィールドの欠損等により発生しうる系のエラーを修正してもよい。これらの場合、通常は、ｃは−１０ないし１０ｋｃａｌ／ｍｏｌ、典型的には−３ないし３ｋｃａｌ／ｍｏｌ、例えば−２ないし２ｋｃａｌ／ｍｏｌ、さらに例えば、−１ないし１ｋｃａｌ／ｍｏｌの値と仮定されよう。しかしながら、多くの場合において、逸脱の程度が予想値の有用性に対してあまり重要でないので、ｃを適当にゼロにセットすることができると予想される。さらに静電気的係数ｉを経験的パラメーターとして取り扱う場合、結合自由エネルギーの近似は、その最も一般的な形態、すなわち：［式中、α、βおよびｃはいずれも経験的キャリブレーションにより決定されうる］であると仮定される。上記方法に用いられる溶媒は、適当には、そして最もしばしば、水のような水性溶媒であるが、例えば、メタノール、エタノール、アセトン、アセトニトリル、クロロホルム、ヘキサン等、またはそれらの混合物、あるいはかかる溶媒またはそれらの混合物の水との組み合わせのような他の適当な溶媒を出発点として採用することは本発明の範囲内である。溶媒が受容体分子および物質を溶解または溶媒和しうるものである限り（この意味において、このことは、十分量のペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログが沈殿を生成せずに溶媒と混合でき、いくつかの適当な方法による結語自由エネルギーの決定を可能にすることを意味する）、溶媒の選択は予想値に対してあまり重要でないが、物質と受容体分子との相互作用が起こりうる溶媒環境を変化させること（例えば、イオン強度を変化させることにより）が有利な場合がありうる。薬剤のごとき化学物質とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の相互作用が実際の薬剤の使用において起こりうる環境が人体である場合には、例えば、溶媒としてヒト・血漿を模倣することは特に適当である可能性がある。２分子間の結合自由エネルギーを決定するための上記方法についてのすべての議論は、国際特許出願ＰＣＴ／ＩＢ９４／００２５７およびオクビストら,１９９４年において見いだされる。これ２つの文献を参照により本明細書に記載されているものと見なす。結合自由エネルギーを決定するための上の参照方法を実施例３に用いて、ＰａｐＤの結合部位に結合するチャンスの多い化合物を同定する。このことは、化合物を実際に合成する前に、最後の理論的段階として上記計算を行ったことを意味する。チャペロンと相互作用しうる物質を同定するための上記方法は、結合部位が繊毛の集合に関与することが知られている場合に潜在的に薬理学的価値を有する物質を同定することにおいて特に有効であることが理解されよう。それゆえ、物質が潜在的に相互作用することができ、結合自由エネルギーが予想される部位が分子チャペロンの繊毛サブユニット結合部分、例えば、ｐａｐＤ、ＦｉｍＣ、ＳｆａＥ、ＦａｅＥ、ＦａｎＥ、Ｃｓ３−２７、Ｆ１７Ｄ、Ｃ１ｐＥ、ＥｃｐＤ、Ｍｒｋｂ、ＦｉｍＢ、ＳｅｆＢ、ＨｉｆＢ、ＭｙｆＢ、ＰｓａＢ、ＰｅｆＤ、ＹｅｈＣ、ＭｒｐＤ、ＣｓｓＣ、ＮｆａＥ、ＡｇｇＤおよびＣａｆ１Ｍ、またはかかる繊毛サブユニット結合部位のアナログよりなる群から選択される分子チャペロンの繊毛サブユニット結合部位であることが好ましい。なぜなら、これらのチャペロンにおける繊毛サブユニット結合部位は非常に相同性を示すからである。結合部位がＰａｐＤまたはそのアナログの繊毛サブユニットであることが特に好ましい。実施例から明らかなように、チャペロン結合モチーフの重要部分が見いだされ、このモチーフに対応するペプチドが合成されＰａｐＤとともに結晶化されてＰａｐＤの作用機構に関する構造的根拠が得られている。ＰａｐＤ−付着素認識界面の分子の詳細は、サブユニット結合および毒性決定因子を病原性細菌表面に移行させることにおける全繊毛チャペロンスーパーファミリーにおける保存された亀裂の機能を明確に示す。本質的には、ＰａｐＤペプチド結晶構造は細菌の病原性における基本的なプロセスの「スナップ写真」、すなわち、微生物表面上への付着素の提供に不可欠なチャペロンとの付着素の相互作用を示す。かくして、本発明者らは、Ｘ線結晶回折法により、ＰａｐＤと繊毛サブユニットＰａｐＧとの間の結合機構を調べ、それにより、繊毛とそのペリプラズムチャペロンとの間の結合に関与する決定された結合部位の不可欠な部分を同定し、かくして、抗細菌化合物を阻害するチャペロンのドラッグデザインを可能にする方法を提供した。上記の疎外的リガンドに対する有望な結合部位の位置を決定し（詳細には実施例１および２参照）、コンピュータープログラム「ＰＬＩＭ」および「ＰＬＩＭ＿ＤＢＳ」（シンビコンＡＢ（Symbicon AB）により開発された）を用いて結合部位に結合することのできる化合物のファミリーに対する鋳型を見いだした。ＰＬＩＭは、熱力学的判断基準を用いて蛋白に対する推定上のリガンドを構築する蛋白リガンド相互作用モデラーである。該プログラムは、蛋白と、分子の周囲の規則的な格子上の異なる点に連続的に置かれる試料プローブとの間の相互作用エネルギーを計算する。各位置および方向について、プローブと蛋白の原子との間の相互作用エネルギーが計算される。エネルギー値が保存され、特定のプローブに関する最適位置が書き出される（基本的な計算はグッドフィールド（Good field）（１９８５年）およびボーバイヤー（Boobbyer）（１９８９年）により記載されており、市販プロクラムＧＲＩＤにおいて実行される。ＰＬＩＭ実行は、エネルギー値が化学プローブに関連した個々の点に変換され、例えばデータベース検索プログラムへの簡単な出力を可能にするという点でいくぶん異なる）。次いで、選択したプローブ原子を格子上のエネルギー最小位置に取り込むことにより該プログラムはリガンドを構築する。使用者は、いずれの原子および基をプローブとして使用すべきか、そして、いずれの判断基準を用いてリガンド中に取り込まれる原子および基を決定すべきかを選択する。エネルギーは、本明細書記載の静電気、ファン・デル・ワールス、および水素結合の寄与の合計として計算される。ＰＬＩＭは実行されて、結合部位近傍領域における好ましい化学基の多くの示唆された位置および方向を生じる。電荷、水素結合による方向づけ、および拡張された原子半径のような物理学的特性を有するこれらの基を、以後、「部位ポイント」という。次いで、ＰＬＩＭ＿ＤＥＳを用いて部位ポイントのこれらの基の位置に合致する既知分子構造に関するデータベースを検索することにより、潜在的なリガンドの検索を行う。ＰＩＬＭ＿ＤＥＳのコアはサブグラフの同形性（ウルマン（Ullman）（１９７６年）およびブリント（Brint）（１９８７年）参照）に関するアルゴリズムである。該アルゴリズムにおいて、３つの部位ポイントが距離マトリックス（「パターンマトリックス」）として表される。該プログラムは、データベース中の各記載事項から形成される距離マトリックス中の距離パターンを探す。該パターンが見いだされたならば、記載事項を部位ポイント上に重ね、対応原子タイプが記載事項に合致したならば、その方向をヒットリスト（hit-list）に保存する。この基本的なスキームに加えて、表面の相補性に関する多くのオプションを用いることができ、すなわち、疎水性および立体的性質に関して蛋白表面に合致する記載事項のみをセーブする。よって、ＰＬＩＭ＿ＤＢＳは、３次元分子コーディネートセットを集め、ある原子パターンを含む記載事項を探すことにより検索を行うデータベースサーチャーである。このパターンは、原子タイプ、および空間位置ならびに方向に関して細分される。例えば、ｓｐ２酸素から４.２オングストロームであって該酸素から５.６オングストロームのヒドロキシル基から５.１オングストロームであるｓｐ３炭素原子を含む化合物を求めて検索が行われる。該検索の厳密性を、距離の判断基準についての耐性および合致する原子のタイプを変化させ、例えば、酸素から４.２オングストロームより少し遠いｓｐ２炭素をヒットと見なすことにより、使用者が調整することができる。次いで、見いだされたそれらのヒットを、どれほどうまく標的原子が実際の分子に重なるか、さらには化合物の分子表面が蛋白の結合ポケットの分子表面に対してどれほど相補的であるかランク付けする。ＰＬＩＭ＿ＤＢＳ検索からの結果により、部位ポイント上に重なる分子構造およびそれらの原子コーディネートの一覧、および一定のスコア(「適合の良好さ」) が検索される。該手順は構造のポジショニングを最適化しようとするものではなく、さらに分子機構または力学の計算を行うものでもない。蛋白および抽出される構造の両方は堅固なボディーとして取り扱われる。データベース検索からの構造は、蛋白およびその表面に関して、通常に使用される分子モデリングパッケージを用いてグラフィックスシステム上に示される。通常には、構造は、蛋白に関するいくつかの好ましくない相互作用を示すか、または空間を満たすための基、例えば疎水性ポケットを欠いている。それゆえ、データベース検索からの構造は、有機化学者により修飾され改良されるべき鋳型であると見なされる。さらにこのプロセスは、合成が容易であって合成キャパシティーが限られる場合に特に興味深い化合物を選択することを包含する。かくして、これらのデータベースのヒットのうちの最良のものは、コンピューター−グラフィックモデリングシステムを用いて視覚的に試験され、これらのうちで最も有望なものが物理化学的理由の多さに応じて選択される。小型分子３Ｄビルダー（マクミミック（MacMimic））を用いて鋳型を修飾する。各鋳型は、例えば、「ｈｄｏ」と記された化合物のクラスのもととなる。シムビコム（Symbicom）により開発されたプログラムＡＲＶＳ＿ＪＡＫＴを用いて、特定の番号（例えば、ｈｄｏ＿３）を割り当てられた各修飾物およびその座標ならびに説明が、ツリー構造（tree structure）中に蓄えられる。蛋白構造の専門家と有機化学者との間の連携で設計を行って実際に化合物を合成する科学者にとり利用可能な最良の道具を得る。蛋白−リガンド複合体の安定性を研究するために本明細書に記載された分子力学的自由エネルギー計算（オクビストら,１９９４年；オクビストおよびメディナ（Medina）,１９９３年を用いてこれらの修飾の有効性を最終的に評価する。分子チャペロンと相互作用しうる物質の同定／設計のための上記方法の有効性を最大にするためには、物質Ａが、選択された結合部位に結合しうる物質である可能性があることが好ましい。ｐａｐＤのようなチャペロンと相互作用すべき物質を選択するための上記方法の観点からすると、以下の工程を行うことにより物質Ａが選択される場合に、本発明によってこれが行われうる。 −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログにおける部位と相互作用しうるリガンドと同時結晶化させ、相互作用する場合にはＸ線結晶回折法によりペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログおよびリガンドの３次元コンホーメーションを確立し、 −上で確立されたペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログのコンホーメーションを用いて、結合の間にリガンドと相互作用するペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログにおける部位の３次元的画像を確立し、 −多数の個々の化学基、Ｘ１を選択し、化学基と、リガンドと相互作用するチャペロンまたはそのアナログにおける部位との間の結合自由エネルギーＸ１化学基の可能な空間分配を決定し、 −分子の３次元的画像からなるデータベースから、上記可能な空間的分配においてＸ１化学基を有する分子を抽出し、 −所望によりデータベースから抽出した分子の３次元的画像を修飾し、次いで、所望により修飾された分子を物質Ａとして同定する。本発明によれば、リガンドが、通常には、ペリプラズム空間を通る繊毛サブユニットの輸送中および／または繊毛の集合中にチャペロンと相互作用する繊毛サブユニットまたはその一部である場合に上記工程は特に好ましい。ペリプラズムチャペロンと相互作用しうる物質を同定するための上述の方法を用いることにより、設計段階において有望であることがわかったいくつかのクラスの物質が同定された。ＰａｐＤに対する阻害剤／エンハンサーを設計するためのドラッグデザインはの努力は、Ｇ−ペプチドが結合することが観察される分子の領域に対して集中させられてきた。現在は、推定上の阻害剤（ｂｐｙ＿９、下記参照）をリファレンス構造として用いてこの領域は詳細に記載されるであろう。中央の荷電したＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２の側鎖により結合部位は支配されており、ｂｐｙ＿９のサルフェート部分に結合する。Ｉｌｅ−１５４、Ｉｌｅ−１９４およびTｈｒ−７の側鎖により形成される小さく、狭い疎水性ポケット（ポケット１）がこれに隣接しており、それに対してｂｐｙ＿９の２−エチル基か詰まっている。糖位置２に結合しており、Ｔｈｒ−７から水素結合を受け取るかまたは与えることのできる、あるいは１９８番の骨格カルボニルに水素結合を与えることのできる存在可能な置換基を伴ったフェニル環と同じほどの大きさの基をここに供することができる。残基Ｌｅｕ−４、Ｉｌｅ−１１１、Ｔｈｒ−７およびＴｈｒ−１０９からなるさらに大型のポケット（ポケット２）が存在し、その中にｂｐｙ＿９のフェニル環が入っている。このサブ−サイトを満たすための足場となる炭化水素の６−位においてナフタレンと同じほどの大きさの基を、Ｔｈｒ−１０９、または残基Ｌｅｕ−４、Ａｒｇ−６もしくはＬｙｓ−１１０の極性骨格原子のいずれかと水素結合を形成しうる置換基で置換することができる。次いで、糖の３位において置換されている２−フェナンスリルのごとき３環式のシステムを供することのできる、−８７およびＬｙｓ−１１０ならびにＬｙｓ−１１２の脂肪族領域を含む長く、短いパッチ（パッチ３）が存在する。Ｔｙｒ−８７またはＬｙｓ−１１０の骨格に対する水素結合に対する置換基を、Ｌｙｓ−１１０およびＬｙｓ−１１２の側鎖を補うための負に荷電した基と同様に考えることができる。Ｔｙｒ−８７は、ニトロアリールのごとき電子欠乏π−システムへの潜在的な電荷転移ドナーである。いくつかの同種のチャペロン（ＳｆａＢ、ＭｒｋＢ、ＨｉｆＢおよびＦｉｍＣ）のモデルを、ＰａｐＤ構造から作ることができ、モデル構造間の相違は阻害剤の設計を反映し、提案されたリガンドは注目されるすべての構造に結合するはずである。例えば、Ａｒｇ−２００の荷電側鎖をリガンドの酸性基で補うことが考えられるが、他の構造の２つがＡｓｐをこの位置に有するために、該残基は良い候補とは考えられない。Ｌｙｓ−１１２、Ｔｈｒ−７およびＩｌｅ−１１と同様にＡｒｇ−８は十分に保存されている。Ｔｙｒ−８７は３つの構造においてＴｒｐとなるが、このことによってはパッチ３の全体としての性質は変化しない。実際、ＰａｐＤは、１０９−１１０におけるそのＴｈｒ−Ｌｙｓ配列に関しては独自であり、他の４つの構造はここにＳｅｒ−Ａｒｇがあるが、さらに、これらの保存的変化は設計の基準を有意に変更するものではない。Ｇ蛋白との結合に関与する結合部位と相互作用する物質は、ペリプラズムチャペロンの阻害剤／エンハンサーとしての明白な候補であるが、ペリプラズムチャペロンの他の部位と相互作用しうる分子はこの点に関して興味深いことも理解されよう。すなわち、ＰａｐＤにおける１のＧ蛋白結合部位以外の部位との相互作用が、ＰａｐＤのペリプラズムチャペロンとしての作用を防止、阻害または促進する可能性がある。上記のごとく、１のファミリーの物質（本明細書ではｂｐｙファミリーと呼ぶ）は本発明の重要な態様である。よって、本発明は、一般式：［式中、Ｖ₁はＯ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＣＨ₂、Ｃ(ＯＨ)Ｈ、ＣＯまたはＣＳ；Ｗ₁はＯ、Ｓ、ＳＯ₂、ＳＯ₃、ＣＨ₂またはＮＨ；Ｒ₁はＨ；Ｃ_1〜24アルキル、Ｃ_1〜24アルケニルまたはＣ_1〜24アルキニル（アルキル、アルケニルおよびアルキニルはＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよい）；アシル；または−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s −Ｈ（ここにｓ＝１、２、３）；Ｒ₂は式：（式中、Ａは−ＣＨ−(ＣＨ₂)_n−、または−ＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n-1−（ｎ＞０）Ｂは−(ＣＨ₂)_m−または＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−（ｍ＞０）；Ｘ₂はＮ、ＣＨまたはＣ（Ｂが＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−である場合）Ｙ₂はＯ、Ｓ、ＮＨ、Ｈ₂またはＨ（ｎ＝１）；４＞ｍ＋ｎ＞０、ｎ＜３、ｍ＜３）で示される基あるか、あるいはＲ₂は式：（式中、Ａは−ＣＨ−(ＣＨ₂)_n−、または−ＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n-1−（ｎ＞０）Ｂは−(ＣＨ₂)_m−または＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−（ｍ＞０）；Ｘ'₂はＯ、ＮＨ、ＣＨ₂またはＳ（ｐ＝０の場合）；ＮまたはＣＨ（ｐ＝１）；あるいはＣ（ｐ＝１でＢが＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−の場合）；Ｖ₂、Ｚ₂およびＷ₂は独立してＨ、ＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂ 、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂、−ＳＯ₂ＮＨ₂であるか、またはＶ₂およびＺ₂、またはＺ₂ およびＷ₂は一緒になって−ＮＨＣ(Ｏ)ＮＨ−、−Ｃ(Ｏ)ＮＨＣ(Ｏ)−、−ＮＨＳ(Ｏ₂)ＮＨ−、−Ｃ(Ｏ)ＮＨＯ、−Ｃ(Ｓ)ＮＨＯ−、−Ｓ(Ｏ₂)ＮＨＯ−、または−Ｓ(Ｏ₂)ＮＨＣ(Ｏ)−；４＞ｍ＋ｎ＞０、ｎ＜３、ｍ＜３）で示される基であるか、あるいはＲ₂は基−Ｗ₅−（Ｃ_1〜5アルキルまたはＣ_2〜5アルケニルまたはＣ₂ _〜5 アルキニル）、ここにＷ₅は結合であるかまたは−Ｏ−、−Ｓ−、−ＳＯ₂− 、および−ＮＨＣ(Ｏ)−から選択され、Ｃ_1〜5アルキル、Ｃ_2〜5アルケニルまたはＣ_2〜5アルキニル部分はＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、 −ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される３個までの基で置換されていてもよく； −Ｚ₁−Ｒ₃は−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、−ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂ (ＯＨ)、−ＮＨ−ＣＯ−ＣＯＯＨ、−ＳＰＯ(ＯＨ)₂、−ＣＨ₂ＣＯＯＨ、テトラゾール−５−イルもしくはテトラゾール−５−イルメチル、またはその塩であるか；あるいはＺ₁は−Ｏ−、−Ｓ−、−ＮＨ−、または−ＣＨ₂−であり、Ｒ₃は式: （式中、Ｄは−ＣＨ₂−、−ＣＯ−、−ＳＯ₂−、−ＮＨ−ＳＯ₂−、−ＮＨ−ＣＯ−、−Ｏ−ＰＯ(ＯＨ)−またはその塩；Ｚ₃はＨ、ＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂、− ＳＯ₂ＮＨ₂、−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、−ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂( ＯＨ)、−ＣＯＯＨ、テトラゾリル−５−イルもしくはテトラゾリル−５−イルメチルまたはその塩（ただし、Ｄが−ＣＨ₂−、−ＣＯ−、−ＳＯ₂−、−ＮＨＳＯ₂−または−ＮＨＣＯ−である場合にはＺ₃は−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、 −ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂(ＯＨ)、−ＣＯＯＨ、テトラゾリル−５−イルもしくはテトラゾリル−５−イルメチルまたはその塩）；Ｘ₃およびＹ₃は独立してＨ、ＮＯ₂、ＳＯ₂ＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＣＦ₃またはＦ；Ｕ₄−Ｗ₄は−ＣＨＣＨ−、ＣＨ₂ＣＨ₂−、−Ｃ(ＯＨ)ＣＨ−、−ＣＨＣ(ＯＨ) −、−ＣＨ(ＯＨ)ＣＨ₂−、−ＣＨ₂ＣＨ(ＯＨ)−、−ＣＨ(ＯＨ)ＣＨ(ＯＨ)−、 −Ｃ(Ｏ)ＮＨ−、ＮＨＣ(Ｏ)−を意味する）で示される基；Ｙ₁は−Ｏ−または−Ｓ−；Ｒ₄はＨであるか、またはＹ₁がＳの場合はＳ(ＣＨ₂)_qＮ(Ｒ₉)₃ ⁺であり、ｑは２〜４の数、ここにＲ₉はＨまたはＣＨ₃；Ｒ₅はＨ；Ｃ_1〜6アルキル、Ｃ_2〜6アルケニルまたはＣ_2〜6アルキニルであり、Ｃ_1〜6アルキル、Ｃ_2〜6アルケニルまたはＣ_2〜6アルキニル部分はＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂または−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されていてもよく；あるいはＲ₅は所望によりアリールまたはヘテロサイクリル部分においてＯＨ、Ｆ、Ｃｌ、ＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＮＨＣＯＨおよびＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個、２個または３個の置換基で置換されていてもよいアリール、アリール(Ｃ_1〜2)アルキル、ヘテロサイクリルまたはヘテロサイクリル (Ｃ_1〜2)アルキル；Ｘ₁は−Ｏ−、−Ｓ−または−ＮＨ−；Ｒ₆はＨであるか、あるいはＸ₁がＮＨである場合にはアシル、ＨＯＣＮＨ−Ｖａｌ−Ｍｅｔ−、ＨＯＣＮＨ−Ｉｌｅ−(Ｓ,Ｓ)−ジオキソ−メチオニルまたはＨＯＣＮＨ−Ｖａｌ−(ピラン−４−オン−２−イル)−アラニルを意味する］で示される新規化合物またはかかる化合物の塩に関する。ｈｄｏ−ファミリーと呼ばれるもう１つの物質のファミリーも合成した。それゆえ、本発明は一般式：［式中、ＸはＯ、Ｐ、Ｐ(Ｏ)、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＣＨ₂、Ｃ(ＯＨ)Ｈであるか、または基ＮＱ₁₁(ここにＱ₁₁はＨ、ＯＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル) ；Ｚ₁₁は結合、Ｏ、ＣＨ₂、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂であるか、または基ＮＱ₁₂（ここにＱ₁₂はＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル）；Ｒ₁₁はＨ；−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、 −ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよいＣ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニル；アシル；または−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s−Ｈ（ここにｓ＝１、２、３）であるか；あるいはＲ₁₁はＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃または−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃（ここにＱ₁₃は−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリールまたはヘテロアリール基であり、ｎ'≧０）；Ｒ₁₂およびＲ₁₃は独立してＯＨ、Ｈ、Ｆ、Ｃｌ、ＯＷ₁₁またはＯ(ＣＯ)Ｗ₁₁（ここにＷ₁₁はＣ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニルまたはＣ_2〜24アルキニル）であるか、あるいは−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、− ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリールまたはヘテロアリール基；Ｚ₁₂は結合、Ｏ、Ｓ、またはＣＨ₂；Ｒ₁₄は−(ＣＨ₂)_n,,−Ｑ₁₄（ここにＱ₁₄は−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリール基またはヘテロアリール基であり、ｎ''は０、１、２、または３）；Ｚ₁₃は結合、Ｏ、ＣＨ₂、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＮＱ₁₄Ｑ₁₅（ここにＱ₁₄はＨ、Ｃ_1〜24 アシルまたはＣ_1〜24アルキル、Ｑ₁₅はＣＯまたは−Ｃ(Ｏ)Ｗ₁₂、ここにＷ₁₂はＯまたはＮＷ₁₃、ここにＷ₁₃はＨ、ＯＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル）；Ｒ₁₅はＨ；Ｃ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニルまたはＣ_2〜24アルキニル（アルキル、アルケニルおよびアルキニルは−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、 −ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、 −ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよい）；アシルまたは−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s−Ｈ（ここにｓ＝１、２または３）であるか、あるいはＲ₁₅はＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃または−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃（ここにＱ₃は前記定義に同じ、ｎ'≧０）］で示される新規化合物またはかかる化合物の塩に関する。本文脈において、「Ｃ_1-5、Ｃ_1-6およびＣ_1-24アルキル」なる語は、直鎖または分枝状または環状であってもよいそれぞれ１〜５個、１〜６個および１〜２４個の炭素原子を有するアルキル基を意味し、例えばメチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、tertブチル、ヘキシル、オクチル、ドデシル、シクロペンチル、シクロヘキシルなどが挙げられる。また、本明細書において「Ｃ_2-5、Ｃ_2-6およびＣ_2-24アルケニル」なる語は、直鎖または分枝状または環状であってもよく該鎖または環内のいずれの位置に二重結合が存在していてもよい、それぞれ２〜５および２〜２４個の炭素原子を有するモノまたはポリ不飽和アルキル基を意味し、例えばビニル、１−プロペニル、２−プロペニル、ヘキセニル、デセニル、１,３−ヘプタジエニル、シクロヘキセニルなどが挙げられる。該置換基のいくつかはシスおよびトランスの両配置にて存在する。本発明の範囲はシスおよびトランスの両形態を含む。本文脈において、「Ｃ_2-5、Ｃ_2-6およびＣ_2-24アルキニル」なる語は、それぞれ２〜５個および２〜２４個の炭素原子を有する１以上の三重結合を含む直鎖または分枝状アルキル基を意味し、例えばエチニル、１−プロペニル、２−プロピニル、２−ブチニル、１,６−ヘプタジイニルなどが挙げられる。「Ｃ_1-6およびＣ_1-24アルコキシ」なる語は、オキシ官能基を含む上記と同意義のアルキル基を示す。本文脈において、「アリール」なる語はフェニルおよびナフチルを意味する。「ヘテロアリール」なる語は、少なくとも１個の非炭素原子がπ結合系に寄与する環状芳香環系を意味する。置換アリール基としては、例えば、３−ニトロフェニル、３−ヒドロキシフェニル、４−ヒドロキシフェニル、３,４−ジヒドロキシフェニル、３−カルボキサミドフェニル、３−ホルムアミジルフェニル、３−アセトアミジルフェニル、３−フルオロナフタ−２−イル、７−フルオロナフチル、３,７−ジフルオロナフチル、３−ヒドロキシナフチル、７−ヒドロナフチル、３,７−ジヒドロキシナフチル、３−フルオロ−７−ヒドロキシナフチル、７−フルオロ−３−ヒドロキシナフチル、４−フルオロナフタ−２−イル、６−フルオロナフタ−イル、８ −フルオロナフタ−２−イル、４,６−ジフルオロナフタ−２−イルなどが挙げられる。ヘテロ環およびヘテロアリール基としては、例えば、ピロリル、フラニル、２ ,３−ジヒドロフラニル、テトラヒドロフラニル、チエニル、２,３−ジヒドロチエニル、テトラヒドロチエニル、イミダゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、ピラゾリル、インドリル、ピラジニル、ジオキソラニル、ジオキサニル、１,３,５ −チオキサニル、テトラヒドロチアピラニル、ジチオラニル、ピラゾリジニル、イミナゾリジニル、sym−トリアジニル、sym−テトラジニル、キナゾリニル、プテリジニル、イソインドリル、１,２,４−トリアゾリル、１,２,３−トリアゾリル、ベンズイミダゾリル、インダゾリル、ベンゾフラニル、イソベンゾフラニル、ベンゾチオフェニル、チエノチオフェニル、イソキサゾリル、１,２,５−オキサジアゾリル、イソチアゾリル、１,３,４−チアジアゾリル、ベンゾキサゾリル、ベンゾチアゾリル、アザインドリル、オキソインドリル、ヒドロキシインドリル、Ｎ−オキシイソキノリルなどが挙げられる。本文脈において、「アシル」なる語（例、Ｃ_1-24アシル）は、カルボニルまたはスルホニル基および有機部よりなるカルボン酸またはスルホン酸部のアシル残基を示す意である。アシル基としては、例えば、Ｃ_1-24アルカノイル（例、ホルミル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、バレリル、イソバレリル、ピバロイルおよびヘキサノイル）、Ｃ_1-24アルケノイル（例、アクリロイル、メタクリロイル、クロトノイル、イソクロトノイル、２−ペンテノイル、３ −ペンテノイル、２−メチルペンテノイル、３−ペンテノイル、３−フェニルプロペノイル、２−フェニル−トランス−プロペノイル、２,４−ヘキサジエノイル）、Ｃ_1-24アルキノイル（例、プロピオニル、２−ブチノイル、３−ブチノイル、２−メチル−３−ブチノイル、２,２−ジメチルブチノイル、２−ペンチノイル、３−ペンチノイル、２−ペンチン−４−トランス−エノイル）、Ｃ_1-24アルコキシカルボニル（例、メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、プロポキシカルボニル、ブトキシカルボニルおよびt−ブトキシカルボニル）、Ｃ_1-24アルケニルオキシカルボニル（例、シス−２−ブテニルオキシカルボニル、１−メチル−２−プロペニルオキシカルボニル、１,１−ジメチル−２−プロペニルオキシカルボニル、トランス−２−ブテニルオキシカルボニル）、アロイル（例、ベンゾイル）、ヘテロ環状カルボニル（例、２−フロイル、３−フロイル、２− フラノイル、３−フラノイル、２−ピロールカルボキシル、３−ピロールカルボキシル、２−テノイル、３−テノイル、２−インドールカルボキシル、３−インドールカルボキシル、１−ナフタノイルおよび２−ナフタノイル）などが挙げられる。「塩」なる語は、例えば有機酸付加塩（例、酢酸塩、吉草酸塩、サリチル酸塩、ガラクツロン酸塩、グルコン酸塩、タンニン酸塩、トリフルオロ酢酸塩、マレイン酸塩、酒石酸塩、メタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ギ酸塩、チオシアン酸塩およびトルエンスルホン酸塩）、無機酸付加塩（例、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、二塩酸塩、二臭化水素酸塩、二ヨウ化水素酸塩、硫酸塩、硫酸水素塩、ハロ硫酸塩（例、ヨードスルファート）、硝酸塩、リン酸塩および炭酸塩）のような塩、またはアミノ酸（例、アルギニン、アスパラギン酸およびグルタミン酸）との塩、またはアルカリ金属塩（例、ナトリウム塩およびカリウム塩）およびアルカリ土類金属塩（例、カルシウム塩およびマグネシウム塩）のような金属塩、アンモニウム塩、有機アルカリ塩（例、トリメチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ピリジン塩、ピコリン塩、ジシクロヘキシルアミン塩およびＮ,Ｎ'−ジベンジルエチレンジアミン塩）、およびその水和物よりなる意である。置換基Ｒ₅がヘテロシクリル（heterocyclyl）を示す場合、該置換基は好ましくは式 [式中、¹Ｘは−ＣＨ−、−ＣＨ₂−、−Ｏ−、−Ｎ−、−Ｓ−、−Ｓ→Ｏ、−Ｎ →Ｏまたは−ＣＯ−、Ｙは−ＣＨ−または−ＮＨ−、およびＺは−ＣＨ−、−ＣＨ₂−、−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｎ−、−ＣＯ−、−Ｓ→Ｏ−または−Ｎ→Ｏ]で表されるヘテロシクリル基を示し、特にインデン−７−イル、ベンゾフラン−４−イル、イソベンゾフラン−４−イル、チオナフテン−４−イル、イソチオナフテン −４−イル、２−オキソ−インデン−７−イル、２−オキソ−インデン−４−イル、インデン−４−イル、ベンゾフラン−７−イル、イソベンゾフラン−７−イル、チオナフテン−７−イル、イソチオナフテン−７−イル、１−オキソチオナフテン−４−イル、１−オキソ−チオナフテン−７−イル、アンスラン−４−イル、アンスラン−７−イル、チオアンスラン−４−イル、チオアンスラン−７− イル、ベンズチオゾール−４−イル、ベンゾチオゾール−７−イル、２Ｈ−２− イソベンゾ−１,３−ジオン−７−イル、イソベンゾフラン−５−イル、イソベンゾフラン−６−イル、３Ｈ−２−オキソ−ベンゾフラン−５−イル、３Ｈ−２ −オキソ−ベンゾフラン−６−イル、３Ｈ−２−オキソチオナフテン−５−イル、３Ｈ−２−オキソチオナフテン−６−イル、インドール−５−イル、インドール−６−イル、３Ｈ−２−オキソインドール−５−イル、３Ｈ−２−オキソインドール−６−イル、３Ｈ−２−オキソベンゾキサゾール−５−イル、３Ｈ−２− オキソベンゾキサゾール−６−イル、ベンゾチアゾール−５−イル、ベンゾチアゾール−６−イル、２−オキソベンゾ−１,３−ジチオール−５−イル、２ −オキソベンゾ−１,３−ジチオール−６−イル、３Ｈ−２−オキソベンズイミダゾール−５−イル、３Ｈ−２−オキソベンズイミダゾール−６−イル、ベンゾキサチオール−５−イル、ベンゾキサチオール−６−イル、３Ｈ−２−オキソベンズチアゾール−５−イルおよび３Ｈ−２−オキソベンズチオゾール−６−イルよりなる群から選ばれる基である。また、置換基Ｒ₅は、好ましくは、式で表される基、または式で表される基である。ヘテロシクリルである置換基Ｒ₂は、特に好ましくは、イソベンゾフラン−５ −イル、イソベンゾフラン−６−イル、３Ｈ−２−オキソ−ベンゾフラン−５− イル、３Ｈ−２−オキソ−ベンゾフラン−６−イル、３Ｈ−２−オキソチオナフテン−５−イル、３Ｈ−２−オキソチオナフテン−６−イル、インドール−５− イル、インドール−６−イル、３Ｈ−２−オキソインドール−５−イル、３Ｈ− ２−オキソインドール−６−イル、３Ｈ−２−オキソベンゾキサゾール−５−イル、３Ｈ−２−オキソベンゾキサゾール−６−イル、ベンゾチアゾール−５−イル、ベンゾチアゾール−６−イル、２−オキソベンゾ−１,３−ジチオール−５ −イル、２−オキソベンゾ−１,３−ジチオール−６−イル、３Ｈ−２−オキソベンズイミダゾール−５−イル、３Ｈ−２−オキソベンズイミダゾール−６−イル、ベンゾキサチオール−５−イル、ベンゾキサチオール−６−イル、３Ｈ−２ −オキソベンズチアゾール−５−イルおよび３Ｈ−２−オキソベンズチオゾール −６−イルよりなる群より選ばれる。アルキル、アルケニルまたはアルキニル部Ｒ₁に存在する置換基の正確な数は、炭素鎖の長さに依存し、例えばPapD−リガンド複合体のようなチャペロン−リガンド−複合体ではＲ₁は周囲の水性媒体中に伸張するため、該置換基の目的は基Ｒ₁全体を水に適合させることである。したがって、例えば炭素数４個以下のようなかなり短い炭素鎖の場合、特に該置換基が末端に位置する場合は上記極性置換基の１つで十分であるが、より長い鎖の場合は例えば炭素原子１つおきに存在するようなより多数の置換基が必要であり得ると考えられる。４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチリデン−α−Ｄ−グルコヘキソピラノシドまたは４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチリデン−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシドグリコシド：（ここでは好ましい例として用いるが、他のアリールメチリデンまたはビニリデンアセタール類を用いてもよい）は、以下のとおり製造することができる。ペル（過）アシル化グルコースを例えば酢酸またはジクロロメタンのような適当な溶媒中、例えば臭化水素または塩化水素と反応させてペル−Ｏ−アシル化グリコシルブロミドまたはクロリドを形成させる(Ｏ−アシル化およびグリコシルハライド合成：エム・エル・ウォルフロム(M．L．Wolfrom)およびエイ・トンプソン(A ．Thompson)，Methods in Carbohydrate Chemistry，Vol．2，211-215，R.L.Whi stler and L．Wolfrom編，Academic Press，New York，1963; ジー・ヘウィット (G．Hewit)およびジー・フレッチャー・ジュニアー(G．Fletcher Jr.)，同書， 226-268; およびアール・ユー・レミオクス(R．U．Lemieux)，同書，223-224)。必要ならば適当に保護されたアグリコンアルコールまたはチオール(H-W₁R₁-PG₁ またはH-W₁R₁)(保護基：プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W．Greeneおよび P．G．M．Wuts編，John Wiley & Sons，Inc.，New York，1991)を、例えばボロントリフルオリドエーテラート（アール・ジェイ・フェリアー(R．J．Ferrier) およびアール・エイチ・ファーネオクス(R．H．Furneaux)，Carbohydr．マグヌソン(G．Magnusson)およびジー・ノオリ(G．Noori)，Carbohydr．Res 116 （1983）303-307）またはトリメチルシリルトリフルオロメタンスルホナート（ティー・オガワ(T．Ogawa)，ケイ・ベップ(K．Beppu)，エス・ナカバヤシ(S．Na kabayashi)，Carbohydr．Res.，93（1981）C6-C9）のようなルイス酸をプロモーターとして用いて、該ペル−Ｏ−アシル化グルコースと反応させる。反応は、例えばクロロホルム、ジクロロメタンまたはトルエンのような適当な溶媒中で行う。問題の該単糖誘導体がペル−Ｏ−アシル化グリコシルブロミドまたはクロリドである場合、例えば銀トリフルオロメタンスルホナートまたは水銀（II）塩（エイチ・ポールセン(H．Paulsen)，Angew．Chem．Int．Ed．Engl.，21(1982)155-1 73）のようなプロモーターを使用することができ、該反応は例えばジクロロメタンまたはトルエンのような適当な溶媒中で行う。メタノール中、または例えばジクロロメタンまたはテトラヒドロフランのような共溶媒を含有するメタノール中でナトリウムメトキシドを用いて脱Ｏ−アシル化（エイ・トンプソン(A．Thomps on)，エム・エル・ウォルフロム(M．L．Wolfrom)およびイー・パスキュ(E．Pasc u)，215〜220頁，Methods in Carbohydrate Chemistry，Vol II，R．L．Whistle rおよびM．L.，E．Wolfrom編，Academic Press，New York，1963）した後、グルコースW₁R₁またはW₁R₁PG₁-グリコシドを得る。ついで、例えばジメチルホルムアミド、アセトニトリルまたはテトラヒドルフランのような極性非プロトン性溶媒中、４−メトキシベンズアルデヒドジメチルアセタールおよび酸を反応させることにより（ジェイ・ジェイ・パットロニ(J ，J，Patroni)ら，Aust．J．Chem．1988，(41)，91-102; アセタール形成の他の方法については、エイ・エヌ・デベルダー(A．N．de Belder)，1979，adv．Carb ohydr．Chem．Biochem.，34，179およびそこで引用されている参照文献を参照されたし）、４,６−(４'−メトキシ)ベンジリデンアセタールを得る。ついで、スルホン酸エステルを経由してエポキシドＢ１またはＢ２を得る。すなわち、マンノエポキシドＢ１は、グルコシド誘導体Ａをジメチルホルムアミド中、水素化ナトリウムおよびp−トルエンスルホニルイミダゾールと反応させることにより（ディー・ヒックス(D．Hicks)およびビー・フレイザー− ライド(B．Fraser-Reid); Synthesis 1974，203）、またはテトラヒドロフラン中、水素化ナトリウムおよびp−トルエンスロホニルクロリドと反応させることにより（ブイ・エス・マルシー(V．S．Murthy)ら、Synthetic Commun．1993，23 (3)，285-289）得ることができる。アロエポキシドＢ２は、グルコシド誘導体Ａをピリジン中、メチルスルホニルまたはp−トルエンスルホニルクロリドと反応させ、得られたメチルスルホン酸ジエステルをエタノール中、ナトリウムエトキシドで処理することにより製造することができる（ワイ・アリ(Y．Ali)、エイ・シー・リチャードソン(A．C．Ric hardson)，Carbohydrate Res．1967，5，441-448; エヌ・リヒトマイヤー(N．Ri chtmeyer)，Methods in Carbohydrate Chemistry，Vol 1，107）。エポキシドＢ１またはＢ２を適当な求核剤と反応させて、ジアキシアル置換アロヘキソピラノシドＣ１およびＣ２を得ることができる（エポキシドの使用に関する一般的文献としては、例えばジェイ・ゴルジンスキー・スミス(J．Gorzynski Smith)，Synthesis，1984，8，62 9-656，マサムネ・エス(Masamune S.)，チョイ・ダブリュー(Choy W.)，ピーターセン・ジェイ・エス(Petersen J S)およびシタ・エル・アール(Sita L R)，An gew，Chem．Int．Ed．Engl.，1985，24，1-76; エイ・エス・ラオ(A．S．Rao)ら，Tetrahedron Lett.，1983，39，2323を参照されたし）。所望の最終生成物の炭化水素部に結合したＲ₂およびＺ₁（上記の定義のとおり）の最初の原子が窒素（＝求核原子）である場合、好ましい求核体Nu₁またはNu₂ はアジド（N3^-）である。該エポキシドを沸騰２−メトキシエタノール中、ナトリウムアジドおよび塩化アンモニウムで処理する(アール・ディー・グスリー(R ．D．Guthrie)およびディー・マルフィー(D．Murphy); J．Chem．Soc．1963，52 88-5294）。該求核原子が酸素または硫黄の場合、エポキシド開裂の好ましい一般的方法は、エーテル中、中性アルミナの存在下での適当に保護されたアルコールまたはチオールによる処理を含む（ジー・エイチ・ポズナー(G．H．Posner)およびディー・ズィー・ロジャース(D．Z．Rogers)，J．Am．Chem．Soc．1977，99，8208; ジー・エイチ・ポズナー(G．H．Posner)，ディー・ズィー・ロジャース(D．Z．Rog ers)およびエイ・ロメロ(A．Romero)，Isr．J．Chem．1979，18，259; およびジー・エイチ・ポズナー(G．H．Posner)，エム・ヒュルス(M．Hulce)およびアール・ケイ・ローズ(R．K．Rose)，Synth．Commun．1981，11，737）。該求核原子が炭素の場合、最も一般的に使用される試薬は、有機マグネシウム、有機リチウム、有機銅、有機アルミニウムおよび有機ホウ素化合物である（ジェイ・ゴルジンスキー・スミス(J．Gorzynski Smith)，Synthesis，1984，8，62 9- 656およびそこに引用されている文献）。生成物がアロヘキソピラノシドＣ１である場合、２−ヒドロキシ官能基は、後の工程でＲ₂官能基の導入を可能にする保護基で保護するか（図には示していないが、Ｒ₂がエステルの場合が好ましい）、あるいは必要ならば適当に保護された官能基Ｒ₂を導入してＤ１を得る。例えば以下を参照されたし：ＯＨ基からエーテルまたはエステルへ（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Gro ups in Organic Synthesis），T．W．GreeneおよびP．G．M．Wuts編，John Wile y & Sons，Inc.，New York，1991）；ＯＨ基からカーボナートへ（ジェイ・マーチ(J．March)，Advanced Organic Chemistry-Reaction Mechanisms，and Struct ure，3rd Edn．John Wiley & Sons，New York，347(1985)およびそこで引用されている文献）；ＯＨ基からカルバマートへ（ジェイ・マーチ(J．March)，Advanc ed Organic Chemistry-Reaction Mechanisms，and Structure，3rd Edn．John W iley & Sons，New York，791-792(1985)およびそこで引用されている文献）；エキソメチレン誘導体を経由しついで水素化し、または他の経路を経由してＯＨ基からアルキル基へ（エイチ・オウ・エイチ・ハウス(H．O．H．House)，Modern S ynthetic Reactions，2nd Edn．W．A．Benjamin，Inc.，Menlo Park，C.A.，1-1 30(1972)およびそこで引用されている文献；ジェイ・ヨシムラ(J．Yoshimura)， Adv．Carbohydr．Chem．Biochem.，42(1984)69-134）；および種々の経路によるＯＨ基のヘテロ環基との交換（エイ・アール・カトリツキー(A．R．Katritzky) ，Handbook of Heterocyclic Chemistry，Pergamon Press，Oxford，1985）。生成物がアロヘキソピラノシドＣ２の場合、該３−ヒドロキシ官能基を、後の工程でZ₁-R₃官能基の導入を可能にする保護基で保護して型Ｄ２で表される中間体を得る（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W．Greeneおよび P．G．M．Wuts編，John Wiley & Sons，Inc.，New York，1991）か、またはマンノヘキソピラノシド中間体Ｄ３ [式中、Nu₁は官能基Z₁-ＯＨ基を以下のように保護またはマスクした形態である：ＯＨ基をエーテルまたはエステルに（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W． GreeneおよびP．G．M．Wuts編，John Wiley & Sons，Inc.，New York，1991）；ＯＨ基をアジド基に（ジェイ・マーチ(J．March)，Advanced Organic Chemistry -Reaction Mechanisms，and Structure，3rd Edn．John Wiley & Sons，New Yor k，380(1985)およびそこで引用されている文献；エイチ・エイチ・バエア(H．H ．Baer)，Pure Appl．Chem.，61(7)（1989）1217-1234およびそこで引用されている文献）；アジド経由または他の経路でＯＨ基をアミノ基に（マーチ(March) ，Advanced Organic Chemistry-Reaction Mechanisms，and Structure，3rd Edn ．John Wiley & Sons，New York，1106，798-800(1985)およびそこで引用されている文献；エイチ・エイチ・バエア(H．H．Baer)，Pure Appl．Chem.，61(7)（1 989）1217-1234およびそこで引用されている文献）]へ変換する。ついで、４,６−Ｏ−アセタール官能基を還元的に開いて、Ｒ₆がエーテルの場合に官能基Ｒ₆を、または６位にヒドロキシ官能基を有する中間体Ｆ１、Ｆ２またはＦ３を得る（アセタールの還元的開裂、ガレッグ・ピー・ジェイ(Garegg P J)およびハルトバーグ・エイチ(Hultberg H)，Carbohydr．Res．1981，93，c10 -11; ガレッグ・ピー・ジェイ(Garegg P J)，ハルトバーグ・エイチ(Hultberg H )およびワリン・エス(Wallin S)，Carbohydr．Res．1982，108，97-101; リプタック・エイ(Liptak A)，ジョダル・アイ(Jodal I)，ナナシ・ピー(Nanasi P)，C arbohydr．Res．1975，44，1-11; ベイカー・ディー・シー(Baker D C)，ホートン・ディー(Horton D)，ティンダル・シー・ジー(Tindall C G)，Methods in Ca rbohydr．Chem.，1976 Vol 6，3-6; ミカミ・ティー(Mikami T)，アサノ・エイチ(Asano H)，ミツノブ・オウ(Mitsunobu O)，Chem．Lett．1987，10，2033-203 6; イー・ケイ・エム，ガレッグ・ピー・ジェイ(Ek M，Garegg P J)，ハルトバーグ・エイチ(Hultberg H)，オスカーソン・エス・ジェイ(Oscarsson S．J.)Car bohyd．Chem．1983,2，305-311; ハンター・アール(Hunter R)，バーテルズ・ビー(Bartels B)，マイケル・ジェイ・ピー(Michael J P)，Tetrahedron Lett．19 91,32,1095-1098; ラオ・エス・ピー(Rao S P)，グリンドレー・ティー・ビー(G rindley T B)Carbohyd．Res．1991，218，83-93; ハンター・アール(Hunter,R) ，バーテルズ，ビー・ジェイ(Bartels，B．J.)J．Chem．Soc．Chem．Commun．19 91，2887-2888）。例えば、型Ｄ１、Ｄ２またはＤ３の中間体をアセトニトリル中でシアン化水素化ホウ素ナトリウムおよびクロロトリスメチルシランで（アール・ジョハンソン (R．Johansson））およびビー・サミュエルソン（B．Samuelsson）,J．Chem．So c．Perkin Trans．1，1984，2371-2374）またはホウ素−トリメチルアミン複合体およびアルミニウムトリクロリドで処理する。該反応の位置化学的な結果は、しばしば溶媒依存的であった（イー・ケイ・エム，ガレッグ・ピー・ジェイ(Ek M，Garegg P J)，ハルトバーグ・エイチ(Hultberg H)，オスカーソン・エス・ジェイ(Oscarsson S．J.)Carbohyd．Chem．1983,2，305-311）。型Ｄ１、Ｄ２またはＤ３の対応する６−アルコール中間体の酸化により、好ましくはスワン法により（マンクソ・エイ・ジェイ(Mancuso A J)，スワン・ディー(Swern D)Synthesis，1981，165-185; ティッドウェル・ティー(Tidwell T)Sy nthesis，1990，857-870; 他の酸化法についてはエイ・エイチ・ハインズ(A．H ．Haines)，1988，Methods for the Oxidation of Organic Compounds，Chapter 2，Academic Press，San Diegoおよびそこで引用されている参照文献を参照されたし）、型Ｇ１、Ｇ２またはＧ３のアルデヒド中間体を得る。つぎの工程で、型Ｇ１、Ｇ２またはＧ３の中間体のアルデヒド官能基に炭素求核体を付加する。好ましくは、適当に保護されたアルキルリチウムまたはアリールリチウム試薬またはグリニャール試薬をエーテルまたは炭化水素溶媒中、該アルデヒドに加えて２級アルコールＨ１、Ｈ２およびＨ３を得る。アルデヒドと有機リチウムおよび有機マグネシウム化合物との反応に関しては、ジェイ・マーチ(J．March)，Advanced Organic Chemistry-Reaction Mechanis ms，and Structure，3rd Edn．John Wiley & Sons，New York，347(1985)およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。アルデヒドと有機リチウムおよび有機マグネシウムおよび他の炭素求核体との反応に関しては、エバンス・ディー・エイ(Evans D A)，Aldrichim．Acta，1982 ， 15，23およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。アリール置換フェニルリチウムおよびグリニャール試薬の使用および調製の具体例に関しては、アメス・エム・エム(Ames M M)，カスタグノリ・ジュニアー・エヌ、ジェイ(Castagnoli Jr．N，J.)，Labelled Compd.，1974,10(2)、195-205 ; DE3807910 A1; ミルズ・アール・ジェイ(Mills R J)，スニークス・ブイ(Snie ckus V)Polynucl．Aromat．Hydrocarbons，[Pap．Int．Symp.]，8th Meeting 19 83，913-24，Cooke MおよびDennis A J編，Battelle Press 1985:Columbus，Ohi o; イリイェ・アール(Iriye R)，フルカワ・ケイ(Furukawa K)，ニシダ・アール (Nishida R)，キム・シー(Kim C)，フカミ・エイチ(Fukami H)Biosci．Biotechn ol．Biochem．1992,56(11)，1773-5; Comber M F，Sargent M V U，J．Chem．So c.，Chem．Commun.，1991,(3)，190-2; ヒライ・ティー(Hirai T)，ヨシザワ・エイ(Yoshizawa A)，ニシヤマ・アイ(Nishiyama I)，フクマサ・エム(Fukumasa M)，シラトリ・エヌ(Shiratori N)，ヨコヤマ・エイ(Yokoyama A)，EP341686A2; リーソン・ピー・ディー(Leeson P D)，エメット・ジェイ・シー(Emmett J C) ，シャー・ブイ・ピー(Shah V P)，ショウェル・ジー・エイ，ノベリ・アール(N ovelli R)，プレイン・エイチ・ディー(Prain H D)，ベンソン・エム・ジー(Ben son M G)，エリス・ディー(Ellis D)，ピアース・エヌ・ジェイ(Pearce N J)，アンダーウッド・エイ・エイチ(Underwood A H)，J．Med，Chem．1989，32(2)、 320-36); メルツァー・ピー・シー(Meltzer P C)，リアング・エイ・ワイ(Liang A Y)，ブラウネル・エイ・エル(Brownell A L)，エルマレー・ディー・アール( Elmaleh D R)，マドラス・ビー・ケイ(Madras B K)，J．Med．Chem.，36(7)、85 5-62; ウィラード・エイ・ケイ(Willard A K)，ノベロ・エフ・シー(Novello F C)，ホフマン・ダブリュー・エフ(Hoffman W F)，クラゴエ・ジュニアー・イー・ジェイ(Cragoe Jr E J.)米国特許第４,４５９,４２３号を参照されたし。さらにヘテロ環化合物へ合成できる置換フェニルリチウム試薬に関しては、ラング・エイチ・ジェイ(Lang H J)，マスチャウェック・アール(Muschaweck R)， AU514406 B2; ラング・エイチ・ジェイ(Lang H J)，マスチャウェック・アール( M uschaweck R)，ロポット・エム(Hropot M)，HU19761; ラング・エイチ・ジェイ( Lang H J)，マスチャウェック・アール(Muschaweck R)，ロポート・エム(Hropot M)，DE2737195を参照されたし。ヘテロ芳香族アリールリチウムおよびグリニャール試薬に関しては、ヤング・ワイ(Yang Y)，マーティン・エイ・アール(Martin A R)，ネルソン・ディー・エル(Nelson D L)，レーガン・ジェイ(Regan J)，Heterocycles，1992，34(6)，11 69-75を参照されたし。アルデヒドからの２級アルコールの立体選択的合成のための他の有機金属試薬の例としては、以下のものが挙げられる。クロチルモリブデン複合体によるホモアリルアルコール：フォーラー・ジェイ・ダブリュー(Faller J W)，ジョン・ジェイ・エイ(John J A)，マジーリ・エム・アール(Mazzieri M R)，Tetrahedron Lett．1989,30,1769-1772; チタン複合体によるホモアリルアルコール：リーディカー・エム(Riediker M) ，ドゥサラー・アール・オウ(Duthaler R O)，Angew．Chem．Int．Ed．Engl.，1 989,28,494-495; シリル保護３−リチオピロールによる３−ピロリルアルコール：ブレイ・ビー・エル(Bray B L)，マシーズ・ピー・エイチ(Mathies P H)，ネフ・アール(Naef R)，ソラス・ディー・アール(Solas D R)，ティッドウェル・ティー・ティー(T idwell T T)，アーティス・ディー・アール(Artis D R)，ムチョウスキー・ジェイ・エム(Muchowski J M)，J．Org．Chem.，1990,55,6317-6328; Ｅ−ビニルアランによるアリルアルコール：エイ・ピー・コジコウスキー(A P Kozikowski)およびジアン−ピン・ウ(Jiang-Ping Wu)，Tetrahedron Lett．199 0，30，4309-4312およびそこで引用されている参照文献; ビニルスタンナンによるトランス−アリルジオール：コーリー・イー・ジェイ (Corey E J)，ウォレンバーグ・アール・エイチ(Wollenberg R H)，J．Org．Che m.，1975,40,2265-2266; α−リチオピロリジンアミジンによるピロリジンカルビノール：サンナー・エム・エイ(Sanner M A)Tetrahedron Lett．1989,30,1909-1912; 590およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。ついで、負に荷電した官能基であるZ₁-D-Rを導入するために３位の置換基（Nu₁ またはOPG₁）を求核体に変換する。まず、２級６−アルコールＨ１、Ｈ２およびＨ３を保護し（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W．GreeneおよびP．G．M．Wuts編，John Wiley & Sons，Inc. ，New York，1991）、またはアミノ官能基に変換する（X₁-R₆がペプチド官能基を形成する場合）（OH基からアジドを経由して、または他の経路でアミノ基へ：例えばマーチ(March)，Advanced Organic Chemistry-Reaction Mechanisms，and Structure，3rd Edn．John Wiley & Sons，New York，1106，798-800(1985)およびそこで引用されている参照文献; エイチ・エイチ・バエア(H．H．Baer)，Pu re Appl．Chem.，61(7)(1989)1217-1234およびそこで引用されている参照文献を参照されたし）。ペプチド合成に関しては、グロス(Gross)およびマイエンホファー(Meienhofer )，The Peptides，３vol.，Academic Press，New York，1979-1981; グラント・ジー・エイ(Grant G A)ら，Synthetic Peptides，A Users Guide，1992，W．A． Freeman and Company，New Yorkおよびそこで引用されている参照文献を参照されたし。該３位を脱保護してアルコール、チオールまたはアミン中間体１１、１２または１３にする（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W．GreeneおよびP．G．M．w uts編,John Wiley & Sons，Inc.，New York，1991およびそこで引用されている参照文献）。例えば、R₂-PG₁がエーテル官能基の組み合わせでありQ₁がアジドであるＩ１をピリジンおよび水中にて硫化水素ガスで処理する（ティー・アダシ(T．Adashi) ，ワイ・ヤマダ(Y．Yamada)，アイ・イノウエ(I．Inoue)およびエム・サネヨシ( M．Saneyoshi)，Synthesis，1977，45）。アジド還元の他の方法に関しては、プーペイコ・エヌ・イー(Poopeiko N E)，プリコタ・ティー・アイ(Prikota T I) ，ミクハイロプロ・アイ・エイ(Mikhailopulo I A)，Synlett，1991,5,342; サマノ・エム・シー(Samano M C)，ロビンズ・エム・ジェイ(Robins M J)Tetrahed ron Lett．1991，32，6293-6296; ラコトマノマナ・エヌ(Rakotomanomana N)，ラコンベ・ジェイ−エム(Lacombe J-M)，パビア・エイ(Pavia A)，Carbohydr．R es.，1990，197，318-323; マリック・エイ・エイ(Malik A A)，プレストン・エス・ビー(Preston S B)，アーチボールド・ティー・ジー(Archibald T G)，コーエン・エム・ピー(Cohen M P)，バウム・ケイ(Baum K)，Synthesis，1989，450- 451; マイチ・エス(Maiti S)，スペバック・ピー(Spevak P)，レディー・エヌ(R eddy N)，Synt．Commun．1988，18，1201-1206; ベイリー・エイチ(Bayley H)，スタンドリング・ディー・エヌ(Standring D N)，ノウレス・ジェイ・アール(Kn owles J R)，Tetrahedron Lett.，1978，39，3633-3634を参照されたし。中間体１１、１２または１３を、三酸化硫黄−ピリジンまたは−トリエチルアミン複合体で硫酸化して中間体Ｊ２、Ｊ４およびＪ６を得る（例えば、ジェイ・バステン(J．Basten)，ジー・ジャウランド(G．Jaura nd)，ビー・オルデ−ハンター(B．Olde-Hanter)，エム・ペティトウ(M．Petitou )およびシー・エイ・エイ・バン・ベーケル(C.A.A．van Boeckel)，Bioorg．Med ．Chem．Lett，1992，2(9)，901-904およびそこで引用されている参照文献；ジェイ・バステン(J．Basten)，ジー・ジャウランド(G．Jaurand)，ビー・オルデ −ハンター(B．Olde-Hanter)，ピー・ドゥチャウソイ(P．Duchaussoy)，エム・ペティトウ(M．Petitou)およびシー・エイ・エイ・バン・ベーケル(C.A.A．van Boeckel)，Bioorg．Med．Chem．Lett，1992，2(9)，905-910およびそこティー・ケイ(Lindhorst，TK)，チエム・ジェイ(Thiem，J.)，ビル・ブイ(Vill ，V)，Carbohydr．Res．1992，230，245-256を参照されたし）、またはカップリングさせてホスホエステル中間体Ｊ１、Ｊ３およびＪ５を形成させる。リン−窒素結合は酸に不安定であることが知られているため、ホスホジエステル最終生成物につながる中間体が好ましい（エム・セリム(M．Selim)およびティー・エヌ・タン(T．N．Thanh)，C．R．Seances Acad．Sci，1960，2377）。例えば、アルコール中間体１１、１２または１３を、クロロホルムおよびピリジン中、２,２,２−トリクロロエチル２−クロロフェニルホスホクロリダートで処理してリン酸トリエステルを形成させる。亜鉛粉末で処理することにより該２ ,２,２−トリクロロエチル基を除去し、得られたリン酸ジエステルを３−ニトロ −１−(２,４,６−トリイソプロピルベンゼンスルホニル)−１,２,４−トリアゾールで活性化し、アルコールR₃-OHでカップリングして中間体Ｊ１、Ｊ３およびＪ５を形成させる。湿ったピリジン中、ピリジン−２−アルドキシムおよびＮ ,Ｎ,Ｎ,Ｎ−テトラメチルグアニジンで処理することにより該２−クロロフェニル基を除去する（例えば、ピー・ジェイ・ガレッグ(P．J．Garegg)，アール・ジョハンソン(R．Johansson)，アイ・リンド(I．Lindh)およびビー・サミュエルソン(B．Samuelson)，Carbohydr．Res．1986，150，285-289を参照されたし）。あるいは、亜リン酸トリエステルアプローチにより、アルコール中間体１１、１２または１３を、アセトニトリル中、フェニルクロロ−Ｎ,Ｎ−ジイソプロピルホスホラミダイトで処理して、炭水化物ホスホアミダイトを形成させる。クロマトグラフィーにより精製した後、これらを例えばピリジニウムp−トルエンスルホナートのような弱酸の存在下にてアルコールR₃-OHにさらし、tert−ブチルヒドロペルオキシドで処理してリン酸ジエステルＪ１、Ｊ３およびＪ５（PG₃＝H ）を形成させる（エイチ・エヌ・カロ(H．N．Caro)，エム・マーティン−ロマス (M． 240，119-131およびそこで引用されている参照文献）。ＤＮＡ合成におけるホスホジエステルを検討するためには、ナラング・エス（ Narang S），Tetrahedron，1983，39，1-22およびディー・ダブリュー・ヒュッチンソン（D．W．Hutchinson），1991，Chemistry of Nucleosides and Nucleos ides and Nucleotides中，Chapter 3，vol 2，B．Townsend編，Plenum Press，N ew Yorkおよびそこで引用されている参照文献を参照されたし。炭水化物ホスホジエステル合成についての他の例に関しては、例えばイチカワ・ワイ（Ichikawa Y），シム・エム・エム(Sim M M)，ウォング・シー・エイチ（Wong C H），J． Org．Chem．1992，57，2943-2946およびシュミット・アール・アール(Schmidt R R)，ブラウン・エイチ(Braun H)，ジャング・ケイ−エイチ(Jung K-H)，Tetrah edron Lett．1992，33，1585-1588を参照されたし。修飾ホスホジエステル結合の合成に関しては、アール・エス・バルマ(R．S．Varma)，1993，Synlett，621- 636およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。アリールホスホン酸エステルおよびアミドＪ１、Ｊ３およびＪ５（ここでR₃はアルキルまたは芳香族基である）を得るためには、アリールホスホン酸R₃-PO₃H₂ を、例えばカルボジイミド試薬でアルコール中間体１１、１２または１３にカップリングする、またはピリジン中、ホスホン酸ジクロリドをアルコール中間体１１、１２または１３で処理する（ティー・エイチ・シッダール(T．H．Siddal II I)およびシー・エイ・プロハスカ(C．A．Prohaska)，J．Am．Chem．1962，84，3 467)。トリアルキルホスファイトおよびアルキルハライドからアルブゾフ反応により該アルキルホスホン酸トリエステルを形成させる（アルブゾフ(Arbuzov)，Pure Appl．Chem．1964，9，307-335，ジェイ・マーチ(J．March)，Advanced Organic Chemistry-Reaction Mechanisms，and Structure，3rd Edn．John Wiley & Son s，New York，347(1985)およびそこで引用されている参照文献）。三塩化リンを経由するアリールホスホン酸トリエステルの製造に関しては、例えばケイ・サッセ（K．Sasse），Methoden der Organichen Chemie(Houben-Weyl )，4th ed．Vol．12/1，Georg Thieme，Stuttgart，1963，p．314およびp．392 およびそこで引用されている参照文献；ジー・エム・コソラポフ(G．M．Kosolap off)，Org．React．6，273(1951)およびそこで引用されている参照文献；エル・ディー・フリードマン(L．D．Freedman)およびジー・オウ・ドーク(G．O．Doak) ，Chem．Rev．1957,57,479およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。有機マグネシウムまたは有機リチウム試薬を経由するアリールホスホン酸トリエステルの製造に関しては、例えば、ケイ・サッセ（K．Sasse），Methoden der Organichen Chemie(Houben-Weyl)，4th ed．Vol．12/1，Georg Thieme，Stuttg art，1963，p．372およびそこで引用されている参照文献；ジー・エム・コソラポフ(G．M．Kosolapoff)，Org．React．6，273(1951)およびそこで引用されている参照文献を参照されたし。中間体Ｊ１、Ｊ２、Ｊ３、Ｊ４、Ｊ５およびＪ６を脱保護して最終生成物を得（プロテクティブ・グループス・イン・オーガニック・シンセシス（Protective Groups in Organic Synthesis），T．W．GreeneおよびP．G．M．Wuts編，John Wiley & Sons，Inc.，New York，1991）、それらのナトリウムまたはカリウム塩に変換する。上記化合物はPapDおよび他のペリプラズムチャペロン中の部位と相互作用する能力を有すると仮定することが正当化される。これが真実であることを確認するためには、実施例に記載するような検定を行うべきである。したがって、本発明の好ましい化合物は、G1'-19'WTのPapDに対する結合の防止、阻害または促進を起こす、および／またはPapDに対する融合ペプチドMBP-G1 '-140の結合の防止、阻害または促進、および／またはPapDに対するペプチドG12 5'-140'（これは配列番号２０の配列を有する）の結合の防止、阻害または促進を起こす、および／または接近PapDの付加により通常生じるPapD-PapG複合体の回復を阻害する能力を有する、上記のような化合物である。ある物質が上記作用のうちの１つを示すことを確認するために用いる検定は、好ましくは、本明細書の実施例に記載されている検定のうちの１つである。該化合物が実際に繊毛集合を阻害する能力を有することを確認するために、勿論、本発明の方法における上記の他の検定を使用することもできる。検定を行う際に考慮すべき１つの重要な点は、該チャペロンがインビボで果たしている役割である。該チャペロンは既にサブユニットの細胞膜を通って輸送中である繊毛サブユニットに結合する。したがって、チャペロンに結合する場合、繊毛サブユニットはいくぶん開いている（すなわち、その最終的な折りたたまれたコンホメーションではない）と考えられる。繊毛集合の過程はインビボで比較的速いことが知られているが、完全に折りたたまれた繊毛サブユニット（またはそのアナログ）とチャペロンPapDとの間の結合の速度論は遅い過程であることが本発明者らにより観察された。インビトロでのチャペロン／繊毛サブユニット複合体の集合の速度を上げるためには、検定の前にいくぶん苛酷な変性条件を繊毛サブユニット（またはそのアナログ）に課すことが考えられる。かかる変性は、繊毛サブユニットを物理的ストレス（例、温度上昇、圧力変化、放射線照射など）または化学的環境の変化（例、イオン強度の変化、pＨの変化、変性剤またはジスルフィド還元化合物の添加）に付すことにより得ることができるであろう。「変性剤」という表現は、ポリペプチド分子よりなる液相中に溶質の１つとして存在する場合、該ポリペプチド分子の折りたたまれた状態を不安定化して、該ポリペプチド鎖が部分的にまたは完全に開いた状態にする化合物を意味する。変性剤により奏された変性作用は、溶液中の変性剤の濃度の増加につれて増大するが、さらに溶液中の他の溶質の存在により、または物理学的パラメーター、例えば温度または圧力の変化により増強されたり緩和されたりし得る。用いる適当な変性剤としては、例えば、尿素、グアニジン−ＨＣｌ、例えばジメチルホルムアミドのようなジ−C_1-6アルキルホルムアミドおよびジ−C_1-6-アルキルスルホンが挙げられる。ジスルフィド還元化合物としては、例えば、グルタチオニル−２−チオピリジルジスルフィド、２−チオコリル−２−チオピリジルジスルフィド、２−メルカプトエタノール−２−チオピリジルジスルフィドおよびメルカプトアセタート− ２−チオピリジルジスルフィドが挙げられる。一連の観察により、チャペロンに結合する間に繊毛サブユニットがいくぶん開くという仮定が立証される。クエーン(Kuehn)ら，1991に記載されているとおり、接近PapDを加えて変性させた後、PapD-PapG複合体を回復させることが可能である。さらに、毛管電気泳動により得られた予備結果の示すところによれば、融合蛋白MBP-G1'-140'の変性は単一形態の融合蛋白を与えるが、変性前の毛管電気泳動においては２形態の融合蛋白(PapDと相互作用できない１つの主要物、およびPapDと相互作用できる１つの少量物)が観察される。したがって、非変性形態の融合蛋白の場合と同様、該変性融合蛋白は本明細書に記載されている異なる競合検定において優位の基質として作用すると考えられる。したがって、本発明の好ましい具体例において、本発明の化合物は、PapDに対する繊毛サブユニットまたはそのアナログのいずれかの変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはPapDに対するMBP-G1'-140'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはPapDに対するG125'-14 0'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こす。実施例に示すとおり、PapDおよび他のチャペロンと相互作用し得るはずの化合物は、既に同定され合成されている。また、すべてピラノシドであるこれらの化合物も本発明の重要な部分である。エチル２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１−チオ−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；エチル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１ −チオ−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；メチルグリコリル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；２−(ヒドロキシ)エチル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコピラノシド；ナトリウムグリコリル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシドメチル２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチレン−α− Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル-４,６−Ｏ−(４ '−メトキシ)フェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−４,−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−６−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−４,−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−６(Ｓ)−フェニル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２,３−アンヒドロ−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン−α−Ｄ− マンノピラノシド；メチル３−アジド−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン− α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４ −Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩；メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４ −Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−tブチルオキサミド−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−オキサミド −α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル３−アジド−６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；およびメチル６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ−２−Ｏ− エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩。勿論、他の化合物も、チャペロン中の部位との相互作用剤となし得る。実施例７から明らかなとおり、修飾ペプチドも本発明の方法において有用であることわかるだろう。上記から明らかなとおり、繊毛集合体と相互作用するように影響され得るチャペロン中の部位の同定は、ペリプラズムチャペロンと相互作用する能力を有する化合物の同定、単離および合成のための本明細書に記載の方法における重要な出発点である。したがって、本発明はまた、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを、該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合するリガンドと共に共結晶化し、該チャペロン／リガンド相互作用の三次元構造を分析し、それにより該リガンドに結合した場合の該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログの三次元構造を分析し、該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと該リガンドとの間の分子間相互作用に関与する部位ポイントを決定し、およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログのこのようにして決定された部位ポイントを該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログ中の結合部位として同定することを特徴とする分子チャペロン中の結合部位を同定する方法に関する。本明細書中で用いる「リガンド」なる語は、宿主または受容体分子（この場合はチャペロン）に結合する基質を意味する。該結合は非特異的相互作用ではなく、これはリガンドと宿主または受容体分子との間の結合モチーフが存在することを意味する。すなわち、該リガンドの試料と該宿主または受容体分子の試料とを互いに接触させる場合、該リガンドと該宿主または受容体分子との間に形成される複合体は、実質的にすべて、同じ分子間相互作用を示すであろう。上記のとおり、本発明の１つの具体例は、繊毛サブユニットと分子チャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進する能力を有する物質を投与することである。したがって、本発明は、ペリプラズム分子チャペロンに対する繊毛サブユニットの結合が防止、阻害または促進されるように、ペリプラズム間隙を通しての繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合過程の間に繊毛サブユニットに結合する少なくとも１つのタイプのペリプラズム分子チャペロンと相互作用する能力を有する物質を活性化合物として含んでなり、少なくとも１種の医薬上許容される担体または賦形剤を組み合わせてなる医薬組成物に関する。好ましくは、かかる物質は、本発明による物質または本発明の方法により同定／設計される物質である。したがって、本発明においては、該医薬および本明細書に記載の医薬は、本発明の治療方法で記載したものと同じ細菌種により起こった同じ状態の治療および／または予防のためである。したがって、本発明の治療方法で用いる物質、本発明の物質または本発明の方法により同定される物質を活性化合物として含んでなり、少なくとも１種の医薬上許容される担体または賦形剤を組み合わせてなる医薬組成物は、本発明の一部である。また、本発明のかかる医薬組成物は、本発明の物質または本発明により同定される物質により奏される医薬作用を増強し得る少なくとも１種の追加的医薬物質を含んでいてもよい。追加的医薬物質は、ステロイドホルモン、消毒剤、解熱剤などであってもよい。好ましくは、かかる追加的物質は、抗菌剤である。かかる抗菌剤は、ペニシリン、セファロスポリン、アミノグリコシド、スルホンアミド、テトラサイクリン、クロラムフェニコール、ポリミキシン、抗マイコバクテリア薬および尿防腐剤よりなる群より便宜に選択される。また、本発明は、医薬として使用するための、本発明の方法で用いる物質ならびに本発明の物質および本発明の方法により同定された物質に関する。該医薬は抗菌的治療および／または予防、特に組織−接着繊毛形成細菌により起こる疾患の治療および／または予防用であることが好ましく、該医薬は尿道感染症の治療および／または予防用である場合が特に好ましい。最後に、本発明は、本発明の方法に用いる物質ならびに本発明の物質および本発明の方法により同定された物質の、細菌感染症の治療および／または予防用医薬組成物の製造のための使用に関する。図面の説明図１：PapDは、ELISAマイクロタイタープレート中および溶液中で被覆された繊毛サブユニット関連ペプチドに結合する。本研究で使用する精製された合成ペプチドの配列は、フレンマー・ケイ(Flemmer K)、ウォールス・ビー(Walse B)、ロイ・エス(Roy S)およびキールバーグ・ジェイ(Kihlberg J)の調製中の原稿に独立して記載されている。ＡおよびＢ：マイクロタイターウェル上で表１からのペプチドを被覆し、実施例２に記載のELISA検定におけるPapDに対するその結合能に関して試験した。この検定においてPapDに対するG1'-19'WTの結合に影響を及ぼさない２.５％酢酸（AA）に水不溶性ペプチドを溶解した。各グラフは、二重ウェルの平均を表す。図２：繊毛サブユニット関連ペプチドの結合は、酵素的蛋白分解に対する保護を与え、PapGに対するPapDの結合を妨害する。Ａ上方：PapD（１５μｇ）をPBS（レーンD）と、または１.５μgのトリプシン（レーンDおよびTr）と３７℃で２０分間インキュベートし、２０％SDS-PAGEに付した。全長PapD(PapD)、トリプシン(Tr、PapD(N)のNH₂末端断片および残基100 (C)から始まるPapDのCOOH末端断片が示される)に対応する帯がクーマシーブルーにより染色された。Ａ下方：PapDのトリプシン切断の速度は、G1'-19'WT、G1'-16'WTまたはK1'-19 'WTペプチドとの前インキュベーションに際して減少したが、G2'-21'アミドペプチドは全く影響を及ぼさなかった。５０μgの精製PapDを２０倍モル過剰のG1'-1 9'WT、G1'-16'WT、K1'-19'WTまたはG2'-21'アミドペプチド（これらのペプチド中のいずれのトリプシン切断部位も、それらがPapDに干渉しないと予想されたそれらのアミノ末端に生じる）、または等容量の水と共に２５℃で１５分間前インキュベートした。ついで、各試料を３.２μgのトリプシンと共に３７℃でインキュベートした。０、５、１０、２０、３０および４０分後にアリコートを除去し、消化を停止させるためにSDS-PAGE試料緩衝液中で煮沸した。該試料を１５％SD S-PAGEゲルに付し、示されている全長PapDに対応するクーマシーブルー染色帯のデンシトメトリーにより全長PapDの残存量を測定した。Ｂ：G1'-19'WT、G1'-16'WT、K1'-19'WTおよびG2'-21'アミドと共にインキュベートしたPapDを、還元され変性されたPapD-PapGに加え、各試料中の回復したPap D-PapG複合体の量を実施例２に記載されているとおりに定量した。％阻害は、無処理PapDで回復したPapD-PapG複合体の量と比較した場合の、ペプチド処理PapD で回復したPapD-PapG複合体の量を示す。グラフは、４個の実験の平均を示す。P apDおよびPapD-PapG複合体はエフ・リンドバーグ(F．Lindberg)ら、J．Bacterio l．171，6052(1989)およびエス・ジェイ・ハルトグレン(S．J．Hultgren)ら、Pr oc．Natl．Acad．Sci．USA 86，4357(1989)の記載のとおりに調製した。図３：３.０Åの分解能まで測定した、G1-19WTペプチドと共に共結晶化された PapDの三次元構造の立体像。該ペプチドは、PapDの裂け目中のG1 β鎖に沿って伸張コンホメーションで結合し、末端カルボキレート基はPapDの残基Arg-8およびLys-112と水素結合を形成している。図４：G1-19WTペプチドCOOH末端および隣接PapD残基の３.０Å分解能電子密度の立体像であり、精密化された（refined）構造と重なり合う。係数（2|Fo|-|Fc |）を用いて電子密度地図を算出し、１σで等高線を付けた。図５：二重の非結晶学的関連複合体との相互作用を示すPapD-ペプチド複合体の立体像。図６：天然PapD（太線）およい複合PapD（細線）のCOOH末端ドメインの重ね合わせであり、この２個の構造はヒンジ曲がり角において１３°の差異を示す。該構造は、LSQオプションザプログラムＯ(LSQ option the program O)を用いて重ね合わせた。該COOH末端ドメインの９８個のCa原子に関して得られた二乗平均は０.６６Åであった。図７：インビトロでPapD Arg-8、Lys-112およびThr-7突然変異体がPapGに結合しPapD-PapG複合体を回復させる能力。図２Ｂに記載されているとおりに０.４μ gのPapD-PapG複合体を還元し変性させた。ついで、変性されたPapD-PapG複合体を０〜６３０ngの精製野生型(WT)または突然変異体PapDで希釈した。試料中で回復したPapD-PapGの量を図２Ｂのとおりに測定し、回復したPapD-PapGの最大量の割合としてグラフ化した。グラフ化された値は、３個の実験の平均を示す。野生型および突然変異体PapDおよびPapD-PapG複合体は、エフ・リンドバーグ(F．L indberg)ら、J．Bacteriol．171，6052(1989)およびエス・ジェイ・ハルトグレン(S．J．Hultgren)ら、Proc．Natl．Acad．Sci．USA 86，4357(1989)の記載のとおりに精製した。図８：６−ヒドロキシドーパミン、hdo_O、およびhdoファミリーの他の群。Pa pDの結合部位に結合するよう意図された化合物のファミリーの構築の出発点としてhdo_Oを使用した。hdo_4：「アリール(aryl)」は３,４−ジヒドロキシフェニルを示す。hdo_6：「アリール」は３,４−ジヒドロキシフェニル基である。 hdo_7：「アリール」は３−ヒドロキシフェニル基である。 hdo_8：「アリール」は３−ニトロフェニル基である。 hdo_9：「アリール」はフェニル基である。図９：hdoファミリーおよびそのPapDとの相互作用。Ａ：「アリール」はフェニル基、ヘテロ芳香環、または一方の側で蛋白との疎水的接触を、他方で溶媒水との相互作用を得るために非対称に極性置換基を有する置換フェニル基である。Ｂ：Ｒが水素またはアルキルである「アリール」の例；「Ｘ」は酸素原子、硫黄原子またはアミノ基、および「ＣＧ」は負に荷電した基、例えばカルボキシル基、テトラゾイル基、ホスファート基、ホスファートエステルまたはスルファート基である。Ｃ：基ＣＧの例。図１０：種々の群のhdoファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１１：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１２：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１３：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１４：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１５：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１６：種々の群のbpyファミリーの製造のための一般的反応スキーム。図１７：種々の長さのPapGのＣ末端ペプチド断片の、PapDと融合蛋白 MBP-G1'-140'との間の結合に対する阻害作用に関するグラフ。 G1'-8'断片は、より短いG1'-6'およびG1'-7'断片より有意に高い該結合に対する阻害作用を示す。図１８：G1'-8'（ここで８個のアミノ酸残基が同時に一回セリン(S)またはアラニン(A)で置換されている）の種々のアナログの、PapDと融合蛋白MBP-G1'-140 'との間の結合に対する阻害作用に関するグラフ。 G1'-8'中の残基４'、５'および６'の置換効果は、これらの残基の置換によりより弱い阻害ペプチドとなるため、これらの残基がPapDとの相互作用において重要であることを示す。図１９：G1'-8'（ここで該８個のアミノ酸残基は、同時に一回、Ｎ末端セリンの付加と同時に欠失している）の種々のアナログの、PapDと融合蛋白MBP-G1'-14 0'との間の結合に対する阻害作用に関するグラフ。この実験でもまた、アミノ酸残基４'、５'および６'の重要性が強調される。これらの位置の欠失のためにより弱い阻害ペプチドになるからである。図２０：実施例１０で使用するMBP/G融合構築物、PapG-切頭体および合成ペプチド。空白の箱はPapGの一次配列を示す。４個のCys残基の位置が示される。線影をつけた棒はMBPを示す。各融合体につき、MBPのCOOH末端に融合したPapGの出発および終了残基を示す。また、各PapG-切頭体の終結残基をも示す。MBP/G融合蛋白の名称を挙げてある。図の下部には、黒色の箱がPapD相互作用部位に局在し、該実施例で使用する４個のペプチドの配列が挙げてある（配列番号１９〜２２をも参照されたし）。図２１：インビボでのPapD-MBP/G相互作用。 PapDおよび各MBP/G融合体を含有するペリプラズム抽出物をアミロースアフィニティークロマトグラフィーに付した。該溶出物を、Ａ）１２．５％クーマシーブルー染色ＳＤＳポリアクリルアミドゲル；Ｂ）抗−PapD抗血清を用いるウエスタンブロット；またはＣ）銀染色ＩＥＦゲル上で分析した。図２１Ａ、ＢおよびＣでは、PapDおよびMBP(レーン１)、PapDおよびMBP-G1'-19'(レーン２)、PapDおよびMBP-G1'-81'(レーン３)、PapDおよびMBP-G1'-140'(レーン４)を含有するペリプラズム抽出物から試料を精製した。共精製されたPapDの位置が示されている。また、MBP単独およびMBP/G融合切頭体をもMBP/G融合体と共に共精製する。SDS -PAGE上で最も移動の遅い帯の分子量は、それぞれの全長MBP/G融合蛋白に対応する。同じ理由から、IEFゲル（Ｃ）上にはいくつかの帯が見られるであろう。図２Ｃ、レーン４においてpＩ５.２の唯一の帯が検出された。この帯を切り出し、ＳＤＳ試料緩衝液中で煮沸し、抗−PapDおよび抗−MBP抗血清によるウエスタンブロットにより分析した。それは、MBP-G1'-140'およびPapDの両方からなっていた（図２Ｄ、レーン１）。図２２：インビボでのMBP/G融合体の発現によるチャペロン機能の阻害。 pFJ22(papDJKEFGA)およびMBP/G融合体をコードするプラスミドを担持する株を１mM IPTGで誘導した。繊毛サブユニットおよびMBP(レーン１)、またはMBP-G1'- 19'(レーン２)、またはMBP-G1'-81'(レーン３)、またはMBP-G1'-140'(レーン４) を含有するペリプラズム抽出物を、抗−PapA抗血清(A)または抗−PapD-PapG抗血清(B)または抗−tipフィビリラム抗血清(Ｃ)を用いるウエスタンブロットにより分析した。この検定において、サブユニットはチャペロンの相互作用の非存在下では分解するため、該サブユニットの存在はチャペロンサブユニット相互作用が生じたことを示す。PapA、PapGおよびPapFサブユニットの存在は、MBP-G1'-140' と共発現された場合に著しく減少することに注目すべきである。図２３：インビトロでのMBP/G融合蛋白に対するPapDの結合。（Ａ）PapDを１μgのアミロースアフィニティー精製ＭＢＰ(レーン)、MBP-G1' -19'(レーン２)、MBP-G1'-81'(レーン３)、またはMBP-G1'-140'(レーン４)と共にインキュベートし、銀染色IEFゲル上で複合体形成を評価した。MBP/G融合体、 PapDおよびPapD-MBP-G1'-140'複合体の位置を示す。（Ｂ）アミロースアフィニティー精製MBP/G融合蛋白をマイクロタイタープレートのウェルへ被覆した。ウェル中のMBP/G蛋白の濃度を示す。固定化蛋白に対する５０pmol／５０mlのPapDの結合を、抗−PapD抗血清を用いるELISAにより定量した。図２４：酸性天然ゲル電気泳動によるPapD-PapG2切頭複合体の同定。 PapDおよびPapG、PapG2またはPapG3（それぞれレーン２、３および４）を含有するペリプラズムをガルα(1-4)ガルクロマトグラフィーに付し、酸性天然ゲル電気泳動、ついで抗−PapD(Ａ)および抗−PapG(Ｂ)抗血清を用いるウエスタンブロット上で溶出物を分析した。精製されたPapD-PapG複合体をレーン１中にローディングした。図２５：PapDにより認識されるPapG上の第２部位の特徴付け。残基１５６'から１２０'のPapG領域で重複する４個の合成ペプチド（図２０に示す）をマイクロタイタープレートのウェルに被覆した。ウェル中の各ペプチドの濃度を示す。固定化ペプチドに対する２００pmol／５０mlのPapDの結合を、抗 −PapD抗血清を用いるELISAにより定量した。実施例実施例１ PapDとG1'-19'WTとの間の結合のモチーフの同定材料および方法エィ・ホルムグレン(A．Holmgren)ら、J．Mol．Biol．203，279(1988)の記載のとおりにPapDを調製し、ワシントン大学医学部分子微生物部門（Department o f Molecular Microbiology，Washington University School of Medicine，St． Louis，USA）から入手した。 Fmoc固相合成、ついで逆相HPLCによる精製によりペプチドG1'-19'WTを調製した。該ペプチドはルンド大学化学部（Department of Chemistry，University of Lund，Lund，Sweden）から入手した。表１は、本出願の結合検定で使用されるペプチドを示す。本出願においては、PapD以外のペプチド由来(例、PapG由来またはPapK由来)のアミノ酸残基またはペプチド断片を’を付けて、例えば「GI'-19'WT」または「プロ(pro)−１'」のように表示して、かかる残基をPapDのアミノ酸残基から区別する。さらに、番号付けは、非PapDペプチドのＣ末端からである。すなわち、G1 '-19'は、PapGの１９個のＣ末端アミノ酸残基を示す。 PapD−ペプチド複合体の結晶化２０％ＰＥＧ８０００、０.１Ｍカコジラート緩衝液（pＨ５.０）および０.２Ｍ酢酸カルシウムに対する蒸気拡散によりPapD−ペプチド複合体の結晶を得た。該結晶ドロップは、等容量の容器および蛋白溶液を含有していた。該蛋白溶液（１７mg/ml）は、１：１モル比のPapDおよびペプチドを２０mM MES(２−[Ｎ−モルホリノ]エタンスルホン酸)(ｐＨ６.５)および１．０％β−オクチルグルコシド中に含有していた。Ｘ線結晶学 PapDと該蛋白との複合体の得られた結晶を密封石英−ガラス毛細管内にすえ付け、まず、それをＸ線プレセッションカメラ上で精査し、それにより結晶の逆格子の空間的に非歪曲な像を表す写真フィルム上にＸ線回折パターンの像を得ることにより特徴づけした。この像の標準的分析により、該結晶が、格子寸法：a＝１３０.７Å、b＝８３.５Å、c＝５９.２Åおよびβ＝１１７.２°の単斜晶空間群Ｃ２および不斉単位中の２個の分子を有し、回転陽極およびＣu Ｋα標的を有する実験室Ｘ線源上で２.９Åの分解能まで分解することが確かめられた。実験データの収集および加工Ｘ線結晶学により分子の原子構造を分解するためには、回折極大の位置および強度を測定しなければならない。フオング−ハムリン・マルチワイアー・エリア −デテクター・システム(Huong-Hamlin multiwire area-detector system)(Xuon gら、1995)上、PapD−ペプチド結晶に関する強度データを収集した。単一の結晶からすべてのデータを入手し、最初にマドネス・ソフトウェア・パッケージ(MAD NES software package)(Messerschmit and Pflugrath、1987)を用いて加工を行った。該データのマージングおよびスケーリングは、CCP4パッケージからのロタバタ(ROTAVATA)およびアグロバタ(AGROVATA)を用いて行った（CCP4，The SERC(U K)Collaborative Project No．4，A Suite of Programs for Prptein Crystallo graphy，Darebury Laboratory，UK）。最終データセットは、２０.０〜３.０Å 分解能のデータに関して、６.８％のRsymを有する９５９２個の独立し (式中、Ｉ_hiおよびＩ_hはそれぞれ個々のおよび平均の構造因子の強度である)]。三次元構造の分解分子置換の標準法を行うプログラムXPLORを用いてPapD-ペプチド複合体の構造を分解した。用いた探索モデルは、PapDの精密化された(refined)２.０Åの分解構造であった。８.０Å〜４.０Å分解能のデータを用いることにより、自己回転機能は、はっきりした非結晶学的な二回軸を与え、交差回転の最大の２個のピークは、パターソン相関(PC)精密化(refinement)により正確な分解を与えた。また、並進機能(translation function)における最大ピークからも正確な分解が得られ、Ｒ−因子は８.０〜４.０Å分解データについて３９.０％であった（Ｒ− と定義される）。精密化は、不斉単位中の２個のPapD分子の全４個のドメインを独立に精密化して同じデータに関して３６.４％のＲ−因子になる後続の剛体により得た。グラフィックスプログラムＯを用いてこの段階の|Fo|-|Fc|電子密度地図を検討することにより、PapDの裂け目中のペプチドに対応し該蛋白の表面に沿って走るはっきりとした密度が示された。該ペプチドの配向は該電子密度から簡単に決定されたが、始めは、該ペプチドの最後の１０個のＣ末端アミノ酸を密度にモデル化することができた。構造の精密化(refinement)および分析 XPLORによる疑似アニール精密化(simulated annealing refinement)をこの段階で開始した。８.０〜３.０Å分解能データに関して１８.２％の電流モデルのためのＲ因子を得るためにさらに４個のペプチドアミノ酸を加えて、モデル構築および精密化のいくつかの追加的循環を行った。現段階での精密化モデル（これは水分子を全く含まず、該ペプチドの最初の５Ｎ末端のアミノ酸を含まない）は、０.０２０の結合長および４.２°の結合角についての理想的幾何からの二乗平均（rms）偏差を有する。該ペプチドは、ドメイン間の裂け目内で固定されているＣ末端pro-1'および提唱されている(６)サブユニット結合部位と伸長コンホメーションにて結合することが見いだされている。該ペプチドカルボキシ末端とPapDの２個の不変的な正に荷電した残基Arg-8およびLys-112との間に水素結合が形成される。今回、部位特異的突然変異誘発により、Arg-8およびLys-112がインビトロおよびインビボ（実施例２)参照）両方の繊毛サブユニットの結合に必須であることが確認された。P ro-1'側鎖は、この裂け目中でPapDの両ドメインからの残基：Thr-7，Thr-152，I le-152，Thr-170およびIle-194とファンデルワールス的接触をつくる。隣接ペプチド残基Phe-2'は、Ｎ末端ドメインの２個のβシート間に形成された浅いポケット中にあり、Leu-4，Thr-7，Thr-109およびIle-111と疎水的相互作用をする。ついで該ペプチドはＮ末端ドメインの表面に沿って走り、鎖Ｇ１と平行なβ鎖相互作用を形成する。このようにして、該ペプチドのMet-8'からPhe-2'とPapDのGln- 104からLys-110との間に７個の主鎖水素結合が形成され、該ペプチドヘpapDのβ シートを伸張させる。Ｃ末端残基Phe-2'およびPro-1'を除けば、該ペプチドの側鎖とPapDとの間の接触は相対的にほとんどない。鎖Ｇ１への主鎖水素結合により主要な相互作用が提供される。しかしながら、該βシート内、特に該ペプチドのMet-8'およびMet-6' と鎖Ｇ１のLeu-103，Ile-105およびLeu-107との間にはいくつかの疎水的相互作用がある。計算により、残基２'、４'、６'および８'の４個の疎水ペプチド側鎖が、該ペプチドと該蛋白との間の全埋表面積(total buried surface area)(５８２Å²)の２０％に寄与することが示された。したがって、たとえ該複合体の主要安定化が水素結合により提供されるのであっても、疎水相互作用は無意味なものではなく、繊毛関連ペプチドおよびサブユニットに対するPapDの特異性を説明するものの一部分と考えられている。この説は、G1'-19'WTペプチドと比べてペプチドG2'-2 1'アミドに対するPapDの結合の減少により実験的に支持される(図１Ｂおよび表Ｃ)。PapDのArg-8およびLys-112に対するG2'-21'アミド（これはPro-1'を欠く）のCOOH末端の水素結合は主鎖水素結合を許容するが、該ペプチド中の４個の疎水性側鎖をそのPapD中のサブサイトから移動させ、その結果、結合強度が減少する。該結晶内で、第１のPapD−ペプチド複合体に隣接する第２の該複合体を配置する非結晶学的二回対称の結果、該PapD−ペプチドβシートはさらに伸張されてその２個のペプチド鎖が逆平行β鎖として相互作用するようになる。本モデルでは、その２個のペプチドの間に８個の主鎖水素結合が形成される。以下の表を参照されたし。このように、混合βシートがその２個の複合体の間につくられ、１０個のβ鎖へ伸張する（図５）。その２個の非結晶学的に関連したPapD分子自体の間の接触は全く観察されず、それらは共に、該結晶内の同様の環境中に位置し、同様の数の分子間接触を有していた。その２個の非結晶学的に関連しているペプチドの間の算出された埋表面積は５２０Å²であり、これは該蛋白とペプチドとの間に埋もれた表面積と同様の値であった。すべての証拠は、PapDが溶液中でペプチドまたは天然PapGと単量体の複合体を形成することを示すため、この「二量化」は結晶パッキング（crystal packing）の結果のようである。 PapDと該ペプチドとの間の水素結合パターンはSer-9'で壊れるが、該ペプチドがF1-G1ループを超えて走るSer-11'まで、該ペプチドは依然としてPapDとファンデルワールス的接触を保持するが、Glu-13'まで該非結晶学的関連ペプチドに対する水素結合を保持する(表Ｂ)。該ペプチドの最後に分解されたアミノ酸は、該非結晶学的関連PapDの結合裂け目の近くに位置するGly-14'である。３個の正に荷電した残基を含む最初の５個のアミノ末端アミノ酸は密度を有さず、したがって該結晶構造中で乱されたに違いない。これと合致して、該ペプチドのアミノ末端は、溶液中のPapDへの結合には重要でない。なぜなら、アミノ末端の１２個のアミノ酸を欠くG1'-7'WTペプチドは、固定化G1'-19'WTペプチドに対するPapD結合の有効な阻害剤であることが判明しているからである(表Ｃおよび実施例２)) 。該ペプチド複合体中の個々のPapDドメインの構造は、天然PapDのものと同じでら、お互いに関して該ドメインの有意な移動があり、１３°のジョークロージング(jaw-closing)またはヒンジ屈曲(hinge bending)の動きがPapDブーメランの角をより鋭くする（図６）。このコンホメーション変化がペプチドの結合またはその２個の結晶構造の異なる結晶パッキングの結果であるか否かは明らかでない。天然のPapD構造では、長いF1-G1ループについて得られた電子密度は残基９６および１０２の間で低く、これは、それが結晶中でやや柔軟であり乱されていることを示唆する。しかしながら、該ペプチド複合体においてはこのループはより良く分解されており、これは該ペプチドの結合がこのループをより堅固にすることを示すものである。天然PapDおよび該ペプチド複合体のNH₂-末端ドメインを重ね合わすことにより、その２個の構造の間にF1-G1ループ位中の有意な差があることが示される（110NH₂末端Ｃα原子のrmsは１.８４Åであり、Leu-103に関して約９Åの最大主鎖移動がある）。該ペプチド複合体では、該ループは一方の末端でNH₂末端ドメインのβバレルからねじれることが観察され、これにより鎖Ｇ１と該ペプチドとの間のより広範な接触を促進する。その２個のドメインのヒンジベンディングに関しては、このループ移動がペプチド結合または結晶パッキングの結果であるかどうかを確信を持って言うことは未だできない。F1-G1ループのやや開いたコンホメーションは、それが主に後者であることを示唆する。それでも、PapDとペプチドまたは繊毛サブユニットとの間の同様の相互作用が溶液中で起こる証拠は、天然PapGおよびG1'-19'WTペプチドの両方の結合によりPapDのF 1-G1ループがトリプシン切断から保護された後、プロテアーゼ保護実験により提供される(実施例２および図Ａ)。実施例２ PapDと他のPapペプチドのカルボキシル末端との間の結合Ｐ繊毛サブユニット蛋白PapG、PapE、PapF、PapKおよびPapHの１９カルボキシル末端残基にそれぞれ対応するG1'-19'WT、E1'-19'WT、F1'-19'WT、K1'-19'WTおよびH1'-19'WTペプチド（表１を参照されたし）を合成した（グラント(Grant)ら、1992およびそので引用されている参照文献を参照されたし）。該ペプチド中の残基は、カルボキシル末端残基を１とし、アミノ末端残基で終結するように番号付けした。また、長さ（G1'-16'WT，G1'-11'WT，G1'-7'WT）または配列（G2'-21'アミド，G1'-19'SV，G1'-19'NH₂）において野生型のPapGカルボキシル末端配列から逸脱するペプチドも合成した。本発明者らは、酵素結合イムノソルベント検定法(ELISA)を用いて、マイクロタイタープレートのウェル上で被覆された各ペプチドに結合するPapDの能力を調べた。水または５０％酢酸中のペプチドの５mg/ml保存溶液を、ＰＢＳ中の２.５pmol ／５０μlの濃度まで希釈した。該ペプチド溶液の５０μlをマイクロタイターウェル(ヌンク−イムノ・プレート・マキシソープ(Nunc-Immuno P1ate Maxisorp)) 上へ４℃で一夜被覆した。平板中の溶液を捨て、該ウェルをＰＢＳ(１２０mMNaC 1／2.7mM KC1/10mM リン酸緩衝液塩，pＨ7.4)中の２００μlの３％牛血清アルブミン（BSA，Sigma）で２５℃で２時間ブロックした。平板をＰＢＳで激しく３度洗浄し、５０μlの指示量の精製PapDでインキュベートした(リンドバーグ(L indberg)ら、1989)。ＰＢＳで３回洗浄した後、該ウェルを３％ＢＳＡ／ＰＢＳ中の１：５００希釈の抗−PapDウサギ抗血清(リンドバーグ(Lindberg)ら、 1989 )と共に２５℃で４５分間インキュベートした。ＰＢＳで３回洗浄した後、３％ＢＳＡ／ＰＢＳ中のアルカリ性ホスファターゼ（シグマ）に共役させた１：１０００希釈のヤギ抗−ウサギＩgＧと共に該ウェルを２５℃で４５分間インキュベートした。ＰＢＳで３回、展開緩衝液（１０mMジエタノールアミンpＨ９.５,０. ５mM MgCl₂）で３回洗浄後、展開緩衝液（１０mg/ml）中の５０μlの濾過されたｐ-ニトロフェニルホスフェート基質(シグマ)を加えた。暗室中、２５℃で６０分間インキュベートした後、４０５nmの吸光度を読み取った。さらに、ペプチドコンホメーションがプラスチックマイクロタイタープレートへの結合により影響されていた可能性があるため、可溶性阻害ELISAにおいて水溶性ペプチドがG1'-19'WT被覆ウェルに対するPapD結合を阻害する能力を調べた。マイクロタイターウェルを２.５pmol／５０μlのG1'-19'WTペプチドの５０μl により４℃で一夜被覆した。該ウェルをＰＢＳで洗浄し、３％牛血清アルブミン（ＢＳＡ）でブロックした。２５倍過剰モルの各試験ペプチドを１００pmolのPa pDと共に３０分間前インキュベートし、ついで該PapD-ペプチド溶液を被覆ウェルに加え、３％ＢＳＡ／ＰＢＳの存在下、２５℃で４５分間インキュベートした。これに続く一次抗体、二次抗体および展開工程は上記のとおりである。G1'-19 'WTに対するPapDの結合を該ペプチドが阻害する能力は、ペプチド存在下のPapD 結合量を水存在下のPapD結合量で割ることにより算出した。０％阻害は、H₂Oで前インキュベートされたPapDの結合より結合が大きい値を含む。野生型、変異体および異なる長さのペプチドに対するPapD結合の結果を図１Ａ、ＢおよびＣに示す。これに示されるとおり、該ペプチドはPapGペプチドに対しては良く結合し、Pa pE、PapFおよびPapKに対しては中程度であるが、PapHおよび無作為の疎水性ペプチドMSに対しては全く結合しなかった（図１Ａ）。これらの結果は、該チャペロンが部分的にこれらのサブユニットのカルボキシル末端に結合することにより PapG、PapE、PapFおよびPapKを認識することを示唆する。PapDがPapHペプチドと相互作用しないことは、PapHに対してPapDが異なって結合することを示す。これは、おそらくPapHの重合ターミネーターとしての機能によるものであろう（バガ (Baga)ら、1987）。一般に、固定化G1'-19'WTに対するPapD結合を阻害するペプチドの能力は、PapDが個々の固定化ペプチドについて有する親和性に対応した（図１、％阻害）が、これは、可溶性および固定化ペプチドとのPapDの相互作用が同様であることを示すものである。実施例１から示されるとおり、PapDのG1'-19'WTペプチドとの共結晶化により、PapD-ペプチド相互作用の分子的基礎について研究した。要約すると、１９アミノ酸ペプチドがチャペロン裂け目中に該ペプチドのカルボキシ末端とすべてのペリプラズムチャペロン中で不変である（ホルムグレン(Holmgren)ら、1992）Ar g-8およびLys-112との間の水素結合により固定されている。該ペプチドは、平行 β鎖としてPapDのG1鎖に結合し、少なくとも１０個のバックボーン水素結合を形成し、F1からG1ループへの指令となる。 PapGペプチド上のカルボキシル末端プロリンのアミド(G2'-21'アミド)による置換は、溶液中のPapDに対する結合を壊し、固定化ペプチドに対するPapDの結合を約７５％減少させた（図１Ｂ）。これに対して、カルボキシレート基のみをアミドで置換してG1'-19'NH₂ペプチドを作ることは、固定化または可溶阻害ELISA 検定のいずれにおいても、PapDに対する結合に影響を及ぼさなかった（図１Ｂ）。これらの結果は、不変的なArg-8およびLys-112裂け目残基と水素結合を形成するようにカルボキラート基を配置させるのに末端プロリンがおそらく必要であろうことを示す。また、PapDは、固定化されたより短いペプチドであるG1'-16'WTおよびG1'-11' WTに結合し、G1'-16WTおよびG1'-7'WTペプチドは、溶液中の固定化されたG1'-19 'WTペプチドに対するPapDの結合を阻害した。表Ｃは、G1'-19'WT被覆ウェルに対する１００pmol／ウェルのPapDの結合を阻害する２５倍過剰モルの水溶性ペプチドの能力を示す。％阻害は、該ペプチド存在下で結合するPapDの水存在下の場合と比較したパーセントを示し、重複して行った２個の実験の平均である。 PapDは、固定化G1'-7'WTペプチドには結合しない。これはおそらく、このペプチドが短すぎてマイクロタイターウェルおよびPapDに結合しないためであろう。したがって、ペプチドのPapD結合にはわずか７個のカルボキシル末端残基が必要なようである。全体的にこれらの結果は、PapD-ペプチド複合体形成の間にPapD のG1鎖に沿って該ペプチドを「ジッパーリング」させるのに、PapD裂け目中のカルボキラート基の固定化相互作用に加えて７個のカルボキシル末端残基が必要であるモデルを支持する。保存残基であるカルボキシル末端からの２位および１４位のフェニルアラニンおよびグリシン残基を、それぞれ、セリンおよびバリンで置換してペプチドG1'- 19'SVを作りPapDに対する結合を３６％減少させた。これはマイクロタイタープレート中のそれほど効率的でない被覆または提示によるものであろう。なぜなら、G1'-19'SVが、ペプチドG1'-19'WTと同程度に効率的な可溶性PapD阻害剤であるからである(図１Ｂ)。これらの残基は繊毛へのPapGの取り込みに非常に重要であるため、インビボのPapDサブユニット相互作用の場合と比べて、それらはサブユニット間重合相互作用および繊毛集合においてより重要であると考えられている。トリプシンによる部分消化は、F1-G1ループ中のPapDをそれぞれ残基Leu-103およびLys-99で切断する。４.５μgのトリプシンまたは０.４５μgのキモトリプシンのいずれかと３７℃ で２０時間インキュベーションすることにより、４００μgのPapDを部分消化した。該PapD消化物をC-18 HPLCカラム(ベックマン(Beckaman))に付し、０.０１％トリフルオロ酢酸中の０〜１００％のアセトニトリル勾配で２個の主要断片を溶出した。SDS-PAGE上の分子量およびアミノ末端配列により該PapD断片を同定した。約１４kDaのトリプシンおよびキモトリプシン断片のＮ末端アミノ酸配列を、L ys-99（トリプシンについて）およびLeu-103（キモトリプシンについて）の後の切断に対応するPapDのそれぞれ残基１００〜１０８および１０４〜１０９として同定した。該消化物中の１１および１２kDaの帯のＮ末端配列はPapDのＮ末端配列と同一であった。 G1'-19'WT、G1'-16'WTおよびK1'-19'WTペプチド（しかしG2'-21'アミドペプチドは違う）は、PapDのトリプシン切断速度を時間とともに減少させた（図２Ａ）。これらのデータは、ペプチドに対するPapDの結合がループに対する接触を改変し、それにより保護を改変して切断を形成したことを示す。この効果は、PapD− ペプチド結晶構造中で観察されるPapDのF1-G1ループの指令に関連している可能性があり、溶液中で、両ペプチドがG1β−鎖に沿って伸張し、PapDのF1-G1ループと相互作用することを示唆する。キューン（Ｋuehn）ら、プロシーディングズ・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ・イン・ユー・エス・エイ(Ｐroc．Ｎatl．Ａcad．Ｓci．ＵＳＡ)，10586（1991）に記載されているように、ネガティブＰapＤは、還元・変性されたＰapＧに結合し、インビトロでＰapＤ-ＰapＧ複合体を復原することができる。この再構築のアッセイは、インビトロでＰapＤ活性を阻害するペプチドの能力を決定するために用いた。Ｇ１'-７'ＷＴペプチドの溶解度が限られていることから、かかるアッセイにおいて、このペプチドの試験が妨げられている。Ｇ１'-１９'ＷＴ、Ｇ１'-１６'ＷＴおよびＫ１'-１９'ＷＴペプチドの量が増大すると、ＰapＤによるＰapＤ-ＰapＧ複合体の復原が阻害されるのが、Ｇ２'- ２１'アミドペプチドは全く影響を及ぼさない（図２Ｂ）。ＰapＤがＰapＧに結合することを妨げるＧ１'-１９'ＷＴ、Ｇ１'-１６'ＷＴおよびＫ１'-１９'ＷＴペプチドの能力は、これらのペプチドがＰapＤのサブユニット結合部位に結合することを示した。ＰapＤによるＰapＤ-ＰapＧ複合体の復原を阻害するペプチドの能力は、以下のように試験した。０.３μｇのＰapＤ-ＰapＧ複合体を、４Ｍ尿素／１０ｍＭジチオスレイトール（ＤＴＴ）と共に、２５℃で２０分間インキュベートすることによって還元・変性し、１.２μｇ（５０ピコモル）のＰapＤを、５〜１４.５μ ｇ（２.５〜７.２５ナノモル）のペプチドと共に、２５℃で１０分間インキュベートした。次いで、ＰapＤ-ペプチド溶液を、還元・変性したＰapＤ-ＰapＧに添加し、２５℃で１０分間インキュベートし、ＩＥＦ３-９ゲル（ファルマシア(Ｐ harmacia)）にかけた。各試料中の復原されたＰapＤ-ＰapＧの量は、ＤＧ複合体のｐＩに対応する銀染色ＩＥＦバンドのデンシトメトリーによって定量した。ＰapＤ-ペプチドの結晶構造がＰapＤ-繊毛（pilus）サブユニット間の相互作用界面の一部を反映したものであるか否かを試験するために、ＰapＤ-ペプチド間の相互作用に重要であると予想されるＰapＤの厳密に保存された裂溝（cleft ）の残渣における部位特異的な変異が構築された(変異の位置は図３に示す)。そのヒドロキシル基がサブユニットへのＰapＤ結合に重要な水素結合を形成するか否かを試験するために、高度に保存されたＴhr-７をバリンに変化させた(Ｔhr- ７-Ｖal)。この変異は、側鎖の立体的な体積を維持しながら、ヒドロキシル基を除去した。繊毛サブユニットの末端カルボキシレート基への水素結合がチャペロン認識過程の重要な特徴であるか否かを試験するために、Ｌys-１１２およびＡrg-８における変異を設計した。不変的なＬys-１１２残渣は、側鎖のパッキングを維持しながら、帯電した側鎖を除去するためにアニリンに変化させ(Ｌys-１１２-Ａla) 、また、帯電した基を親水性基で置き換えるためにメチオニンに変化させた(Ｌy s−１１２-Ｍet)。不変的なＡrg-８は、サブユニットを結合してインビボでの繊毛の組立てを仲介するＰapＤの能力を必要とすることがすでに示されている(スロニム（Ｓlonim）ら、1992)。ＰapＤ（図３）のドメイン２における可変的な残渣であるＧlu-１６７／Ｅ１６７は、この結晶構造におけるＰapＤとペプチドとの間の相互作用に関与するとは思われず、この残渣における変異は、インビボでのＰapＤ機能に対して、殆どまたは全く影響を及ぼさないことが示されている( スロニム（Ｓlonim）ら、1992)。ドメイン２の縁部におけるこの負に帯電した残渣がＰapＤ-ペプチド間の相互作用において何らかの役割を果たしているか否かを試験するために、Ｅ１６７をヒスチジンに変化させた(Ｅ１６７Ｈ)。変異体の全ては、野生型ＰapＤに類似した安定な蛋白として、細胞周辺腔に分泌された。さらに、精製された変異体ＰapＤに関するカチオン交換ＦＰＬＣカラムからの溶出プロフィールおよび電気泳動特性は、これらの変異がＰapＤの全体構造に影響を及ぼさないという予想を仮定すれば(データは示さず)、野生型蛋白に類似していた。繊毛サブユニットに結合し、インビボでの繊毛の組立てを調節する変異体の能力は、インビトロでＧ１'−１９'ＷＴペプチドおよびＰapＧに結合するそれらの能力と相関していた。野生型ＰapＤは、Ｇ１'-１９'ＷＴペプチドを結合し、おそらくＰapＤ-ペプチド複合体における正味の正電荷の増加により、ネガティブポリアクリルアミドゲルアッセイにおいて、負の電極に向かう移動度のシフト起こした(ラム（Ｌam）およびカルダーウッド(Ｃalderwood)、1992)。対照的に、Ａrg-８-Ｇly、Ａrg-８-ＡlaおよびＬys-１１２-Ａla ＰapＤ変異体をＧ１'-１９'ＷＴペプチドと共にインキュベートしたとき、それらはネガティブＰＡＧＥアッセイにおいて移動度のシフトを起こさなかったが、このことは、ＰapＤにおけるこれらの変異がペプチド結合を解消したことを示している。同様に、Ａrg- ８およびＬys-１１２における変異は、ＰapＧに結合し、インビボでＰapＤ-Ｐap Ｇ複合体を再構築するＰapＤの能力（図７）と、繊毛サブユニットに結合し、インビボで繊毛の組立てを調節するＰapＤの能力（表２参照）を解消した。インビトロおよびインビボでの結果と結晶構造との顕著な一貫性は、保存された残渣Ａrg-８およびＬys-１１２による繊毛サブユニットの停留性がＰapＤ様のチャペロンと繊毛の生体発生との間の相互作用の重要な部分であることを示す。部位特異的変異誘発は、バイオ-ラッド（Ｂio-Ｒad）のインビトロ変異誘発キット用い、製造業者の指示に従って実施した。papＤ遺伝子（配列番号１）に変異を導入するために、以下のプライマーを用いた。 papＤにおける変異は配列決定によって確認し、修飾されたpapＤ遺伝子は、他のpapＤ変異について以前に報告されたように(スロニム（Ｓlonim）ら、1992)、誘発性Ｐ_tacプロモーターの下でベクターpＭＭＢ９１にクローン化した。これらのプラスミドは、残基番号および変異したアミノ酸に従って、pＴhr-７-Ｖal、p Ｌys-１１２-ＡlaおよびpＬys-１１２-Ｍetと命名した。プラスミドpＬＳ１０１は、野生型papＤ遺伝子を含む同質遺伝子型の構築物であり、プラスミドpＥ１６７Ｈ、pＲ８ＧおよびpＲ８Ａは、それぞれＧlu-１６７をＨisに、ならびに、Ａr g-８をＧlyおよびＡlaに変化させる点変異を有するＰapＤをコードする遺伝子を含有する。本実施例および実施例１に示したデータは、結晶構造に見い出されるＰapＤ- ペプチド間の相互作用がインビボでのＰapＤ-繊毛サブユニット間の相互作用界面を反映していることを示す。これらの相互作用は、チャペロンが、様々なグループの蛋白に結合する新規な認識パラダイムにおいて、それらの免疫グロブリン様ドメインを利用する機構を、初めて規定する。ＰapＤ残基Ａrg-８およびLys- １１２は、２つのドメイン間の裂溝のβ鎖に位置するが、繊毛蛋白のカルボキシル末端に対する分子アンカーとして役立つことによって、チャペロン認識において重要な役割を果たしている。Ａrg-８およびＬys-１１２が細胞周辺のチャペロンの中で非常によく保存されているという事実は、おそらく他のプロテインサブユニットの末端カルボキシレート基に結合する「活性部位」を形成する際に、それらが普遍的な役割を果たしていることを示している。ＰapＤのβ鎖に沿ったバックボーンの水素結合は、引き続いて、サブユニットのカルボキシル末端の長手方向に沿って強い配列非依存性の相互作用を与える。チャペロンのＧ１ β鎖における保存された交互の疎水性残基と繊毛サブユニットのカルボキシル末端の保存された交互の疎水性残基の「ジッパーリング(zippering)」相互作用は、この結合に強度および特異性を付加する。それゆえ、他の免疫グロブリン様蛋白（アミット（Ａmit）ら、1988およびデ・フォス（de Ｖos）ら、1992）とは異なり、ＰapＤはその免疫グロブリン様構造のβ鎖およびドメイン間の裂溝の特徴を利用し、数種類の異なる蛋白への結合に対する認識機構を与える。抗体のループ領域における可変的な残基は、広範囲な抗体結合レパートリーから必要とされる精巧な特異性を与える。同様に、ＰapＤのＦ１-Ｇ１ループにおける残基は、細胞周辺のチャペロン系列のメンバー間で長さおよび組成が様々であることが見い出されているので(ホルムグレン（Ｈolmgren）ら、1992)、チャペロンの結合に特異性を与える。実施例３ＰapＤの結合部位に結合することができる化合物の設計実施例１および２に記載のように、阻害性リガンドに対する有望な結合部位の位置を決定した後、コンピュータープログラム「ＰＬＩＭ」および「ＰＬＩＭ_ ＤＢＳ」(シンビコム・エイ・ビー（Ｓymbicom ＡＢ）によって開発された)を用いて、結合部位に結合することができる化合物の系列に対するテンプレートを見い出した(上記の一般的な記載を参照)。ＰＬＩＭは、ＮＨ、ＮＨ₂、Ｏ、ＯＨおよびＣプローブに対する低エネルギーの結合位置を探索しながら、ＰapＤの高解像度構造のＡrg-８領域周辺の２０Ａボックス上を走査した。ＰＬＩＭを走査した結果、Ａrg-８およびＬys-１１２の近くの領域に数多くの好ましい化学基（部位点）の位置および配向が示唆された。約５０個の部位が同定され、次いで、これら部位点のトリプレットおよびカルテットは、それら相互の適合性について選択された。すなわち、それらは、適当な幾何学的関係−実際の分子に見い出すことができた距離および配向−を有しなければならない。次いで、ＰＬＩＭ_ＤＢＳを用いて、これらの部位点グループの位置に適合する公知の分子構造についてのデータベースを調べることによって、可能性のあるリガンドの探索を行った。コンピューターグラフィック・モデリング・システムを用いて、データベース上で最も適合したものを視覚的に調べ、豊富な理化学的推論によって、これらのうち最も有望なものを選択した。結合を向上させ合成を簡単化するために、上記のように修飾を行った。例えば、結合部位の疎水性表面に良好な相補性を与えるためにフェニル環を付加したり、ＰＬＩＭの範囲外にあった蛋白上の帯電した基に結合させるために帯電した基を付加したり、しばしば毒性のサブ構造を除去したり、また、基を合成上の理由から機能的に類似したものと置き換えたりした。多くのこのような判定を行うことにより、特性の組合せの異なる２つの系列の化合物（hdoおよびbpy）が得られた。これらの修飾の効力は、最終的には、蛋白-リガンド複合体の安定性を研究するために、ここに記載のように、分子動力学的な自由エネルギーの計算を用いて評価した(アクヴィスト（Åqvist）ら、1994)。そうして、一方の系列から２つの構造と、他方の系列からの１つの構造とについて、合成および試験を行う価値があると思われた。ここで、これら系列の化合物の数多くのメンバーの開発について、詳細に説明する。第１の系列（ここでは、hdoと呼ぶ）は、hdo_０（図８）と記す６-ヒドロキシドーパミンに関するデータベースの記録から誘導した。この分子は、ヒドロキシル基からの水素結合供与によって、Ａrg-８およびＬys-１１２のＰapＤ側鎖およびＬys-１１０のバックボーンに結合する。一級アミノ基がＴhr-１７０の側鎖に水素結合する。誘導体hdo_１（図８）は、残基Ｉle-１１１、Ｌeu-４、およびＴhr-７の一部によって形成される蛋白中の疎水性裂溝を埋めるために、ヒドロキシル基を、Ａ rg-８およびＬys-１１２との電荷相互作用を有することができるカルボン酸で置き換え、かつ、この位置のパラ位にあるヒドロキシルを新しいフェニル環で置き換えることによって、この基礎構造から生成した。hdo_４（図８）は、元々の芳香環を糖で置き換え、類似した相対的な幾何学を維持するように、ヒドロキシル、一級アミンおよびカルボン酸置換基を結合させ、次いで、溶媒に対して親水性の面がこの領域に存在するようにヒドロキシル基を新しいベンゼン環の一方の側に付加することによって、hdo_１から生成した。この点で、上記構造は、分子動力学シュミレーションに時間を投資するのに充分なほど説得力があるように見えた。その結果は、アミノ基が、実際には、Ｐap ＤのＴhr-７のγ炭素に結合せず、蛋白側鎖よりむしろ水分子と水素結合を形成する必要条件を満足することから、優先的に溶液中に向かうということを示唆した。かくして、アミン基は単独で供与するヒドロキシル基によって置き換えたが、この工程はやはり合成を簡単化した。その結果は構造hdo_６（図８）である。ベンゼン環上のヒドロキシル置換パターンによって毒性が認められる公算があることから、パラ位のヒドロキシル基を除去して構造hdo_７（図８）を与え、また、合成をさらに容易にするために、この環上の残りのヒドロキシル基をニトロ基によって置き換えた(hdo_８、図８)。上記のニトロ基を取り外した最終的な化合物についても、可能性が検討され、 hdo_９（図８）として区別された。 hdo_９について、別の分子動力学的シュミレーションを行った。その結果は、予想された相互作用が実際に起こり、溶液中で維持されることを示唆した。プログラム「ミスフィット（Ｍiss_Ｆit）」による軌跡の統計的な分析は、リガンドの立体配座がこの実験の間に実質的には変化せず、また、起こる変化はすべての有意な相互作用を維持する蛋白構造中の相補的なシフトによって補償されることを示した。 hdo_８の動力学シュミレーションは、メタ位にニトロ基の置換した環に対する適当な分子力学パラメーターが利用できないので複雑になった。このことから、分子動力学シュミレーションによる評価は信頼し難いものとなり、これはhdo_９を追跡する決定に影響を及ぼした。 hdo系列の設計段階の間に考慮された可能性の範囲は、図９に概要を示す。第２の系列は、bpyとして区別され、ここではbpy_０と記す(メチル-Ｏ,Ｎ,Ｎ- アゾキシ)-メチル-β-Ｄ-グルコピラノシドサイカシン（カワミナミ（Ｋawa min ami）ら，1981）に関するデータベースの記録から誘導された。データベースに保存されている立体配座は、Ｐlim_ＤＢＳ探索によって捜し出せるほど充分に近いが、ＰapＤ部位への結合に関して最適なものではなかった。内部の捩れ角をわずかに調節すると、結合パターンが若干向上した。ペプチトを模倣するように機能性を付与する足場として中央の炭水化物を用いるアプローチの先例が存在することに留意するのは興味あることである(ヒルシュマン（Ｈirschmann）ら、1992)。次いで、蛋白中の疎水性裂溝を埋めるように、フェニル環を６位に付加することによって、誘導体bpy_１を生成した。４-ＯＨ基は、６-フェニル基の電子に富む中央部分と好ましい双極子相互作用を形成し、また、６-ＯＨ .. ０５と共に、分子内水素結合は所望のＣ５-Ｃ６ロタマー（rotamer）を安定化するはずである。リガンドにおける２位のヒドロキシル基と相互作用するはずであるＬys-１１２およびＡrg-８側鎖が、帯電した基と一層よく相互作用し、それゆえ、bpy_２は、このヒドロキシルをスルフェートで置き換えることによって、bpy_３は、それを環状ホスフェートで置き換えることによって、また、bpy_５は、それを非環状ホスフェートで置き換えることによって、生成することが決定された。 bpy_４は、スルフェート基がＡrg-８側鎖と相互作用するより高い可能性を有するように、bpy_２から３-ヒドロキシル基を除去することによって生成し、また、bpy_６は、bpy_５から３-ヒドロキシル基を除去することによって同様に生成した。以下の式は、bpy_１-bpy_６を示す。次いで、小さい疎水性ポケットおよび断片（patches）に、または、リガンド上の１位の近くにあって溶媒に曝される疎水性残基に考察を加えた。蛋白のこれらの部分と接触することができ、好ましくは溶媒とも相互作用するアグリコンを捜した。これらの考察から、１位のアゾキシ基が２-ヒドロキシ-４-メチルシクロペンチル基で置き換えられ、bpy_７が得られた。この点で、分子動力学実験を行った。その結果は、この構造がよく結合するが、シクロペンタンと蛋白との間に期待される疎水性接触が維持されないことを示唆した。かくして、bpy_９は、シクロペンタン基を除去し、内部安定性のためにα-メチル基で置き換えたbpy_７から生成した。その代わり、２位にアキシアルなエトキシ基の付加によって、さらに疎水性接触を試みた。電荷はエクアトリアルな２位からアキシアルな３位に移動させたが、この移動はアキシアルな１位の酸素への水素結合を供与することができるＮＨ結合の導入によって確立した。１〜３位における機能の立体化学的な配置は、今や、この構造に立体配座の硬さおよび合成の簡単化を付与する。さらに動力学実験を行った。このとき、bpy_９が、設計の間に予想された方式と同様に、蛋白と安定な複合体を形成することを示唆した。さらなる発展上記のことに調和させて推論を用いることによって、さらに多くの化合物を（ hdo_系列およびbpy_系列の両方から）設計した。興味ある化合物は、ここに記載の一般式ＩおよびIIによって示されるものである。この分析から得られる最も有望な化合物が合成された。実施例４を参照。上記の方法を用いて設計された化合物をさらに開発する際に、興味深いことには、たとえＡrg-８がＰapＤのインビボでの機能に必須であっても、設計された化合物とＰapＤとの間の結合の安定性が、この化合物とＡrg-８残基との間の相互作用に、ほんのわずかしか依存しないらしいことが見い出された。他方、設計された化合物とＰapＤとの間の相互作用の安定性は、依然として、Ｌys-１１２およびβ-鎖との相互作用に、非常に大きく依存する。これらの観察結果から、ＰapＤと繊毛サブユニットとの間の安定な結合が、２つの分子のβシート間の相互作用に、非常に大きく依存するという驚くべき観察結果が確証される。実施例４ＰapＤの結合部位に結合することができるhdo系列の化合物の合成一般的な方法 ¹Ｈ-および¹³Ｃ-ＮＭＲスペクトルは、特に断らない限り、バリアン（Ｖarian ）のジェミニ（Ｇemini）３００スペクトロメーターにより、ＣＤＣｌ₃中、３００および７５ＭＨｚで記録した。それぞれ７.２５および７７.０ｐｐｍにおける非重水素化溶媒からのシグナルは、内部参照シグナルとして用いた。旋光度は、パーキン・エルマー（Ｐekin Ｅlmer）の２４１ポーラリメーターを用いて測定した。薄層クロマトグラフィーは、メルク（Ｍerck）のディー・シー-フェルティヒ- プラッテン（ＤＣ-Ｆertig-platten）（キーゼルゲル（Ｋiselgel）６０Ｆ₂₅₄ ０.２５ｍｍ）上で行い、１０％硫酸を噴霧した後、高温で炭化させるか、および／または、モリブダトリン酸水和物／Ｃｅ(ＳＯ₄)₂／希Ｈ₂ＳＯ₄を噴霧した後、加熱することによって、スポットを可視化した(モリブダトリン酸水和物＝Ｈ₃ ［Ｐ(Ｍｏ₃Ｏ₁₀)₄］×Ｈ₂Ｏ、イー・メルク(Ｅ.Ｍerck)、ダルムシュタット、ドイツ)。エチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシドエチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４,６-Ｏ-ベンジリデン-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシド（１５０ｍｇ、０.２９ミリモル）を、ボラン-ジメチルアミン複合体（６８ｍｇ、１.１６ミリモル）と共に、乾燥トルエン（２０Å）に溶解した。粉末にした４Åモレキュラーシーブ（１８０ｍｇ）を添加し、この混合物を室温で２０分間撹拌した。三塩化アルミニウム（１５４ｍｇ、１.１６ミリモル）を添加し、出発物質の消失後(約１０分、シリカのｔｌｃトルエン／アセトニトリル４：１)、この混合物を濾過し、溶液が清澄になるまで、ダウエックス（Ｄowex）(Ｈ⁺)イオン交換樹脂で処理し、再び濾過した。濾液を濃縮し、メタノールと共に２回、同時にエバポレートし、２００ｍｇの残渣を得た。これは、シリカ上でのクロマトグラフィー（トルエン-アセトニトリル８：１）によって、６０ｍｇ（４０％）のエチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシドを得た。 ¹Ｈ-ＮＭＲ（ＣＤＣｌ₃，δ）:８.０-７.２(ｍｍ，１５Ｈ)，５.７５(ｔ，９. ４Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ３)，５.３７(ｔ，９.８Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ２)，４.７４(ｄ，９. ８Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ１)，４.６１(ｓ，２Ｈ)，４.０２-３.９５および３.８５-３ .７６(２ｂｍ，２Ｈ，２Ｈ６)，３.９４(ｔ，９.５Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ４)，３.６３ (ｄｄｄ，９.７Ｈｚ，３.９Ｈｚ，２.６Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ５)，２.７４(２ｑ，７. ５Ｈｚ，２Ｈ)，１.２５(ｔ；７.５Ｈｚ，３Ｈ)。エチル６-Ｏ-アセチル-２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β- Ｄ-グルコヘキソピラノシドエチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシド（２００ｍｇ、０.３８ミリモル）を、ピリジンおよび無水酢酸の氷冷した混合物（１：１、６Å）に溶解した。この混合物を撹拌し、一晩で室温に戻した。この混合物をジクロロメタンで希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液および水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。溶媒を減圧下で除去し、残渣をシリカゲル上でのフラッシュクロマトグラフィー（トルエン-アセトニトリル６：１）に付し、２０４ｍｇ（９３％）のエチル６-Ｏ-アセチル-２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシドを得た。 ¹Ｈ-ＮＭＲ（ＣＤＣｌ₃，δ）:８.０-７.２(ｍｍ，１５Ｈ)，５.７５(ｔ，９. ２Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ３)，５.４０(ｔ，９.８Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ２)，４.７１(ｄ，１０.０Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ１)，４.５９および４.５５(２ｄ，１０.８Ｈｚ，２Ｈ，ｂｚｌ-ＣＨ₂)，４.４４(ｄｄ，１２.０Ｈｚ，１.９Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ６)，４.２７(ｄｄ，１２.２Ｈｚ，４.６Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ６')，３.８７(ｔ，９.５Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ４)，３.７７(ｄｄｄ，９.７Ｈｚ，４.６Ｈｚ，１.９Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ５)，２.７３(ｍ，２Ｈ)，２.０９(ｓ，３Ｈ)，１.２６(ｔ，３Ｈ)。メチルグリコリル６-Ｏ-アセチル-２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-β -Ｄ-グルコヘキソピラノシド６-Ｏ-アセチル-２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシド（６００ｍｇ、１.０４ミリモル）およびＮ-ヨードスクシンイミド（４６８ｍｇ、２.０８ミリモル、＜０.１ミリバールで３時間乾燥させた）を、室温の乾燥アセトニトリル（７Å、アルミナを通過させた）に溶解した。グリコール酸メチル（１６１μｌ、２.０８ミリモル）を添加し、この混合物を室温で２５分間撹拌し、次いで、氷浴で冷却した。トリフルロロメチル硫酸（１８μｌ、０.２１ミリモル）を注意深く添加した。出発物質の完全な転換が１０分後に起こった(tlc：シリカトルエン-アセトニトリル４：１)。ジクロロメタンの添加によって反応をクエンチし、この混合物をジクロロメタンで希釈し、水、炭酸水素ナトリウムで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。溶媒を減圧下で除去し、残渣をシリカ上のクロマトグラフィー（トルエン-アセトニトリル１１：１）に付し、５６０ｍｇ（８６％）のエチル６-Ｏ-アセチル-２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシドを得た。エチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４-Ｏ-ベンジル-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシド（hdo_９：１）エチル２,３-Ｏ-ジベンゾイル-４,６-Ｏ-ベンジリデン-１-チオ-β-Ｄ-グルコヘキソピラノシド（ケミカル・アブストラクツ(Ｃhemical Ａbstracts)、RN 1993）を、ボラン-ジメチルアミン複合体（６８ｍｇ、１.１６ミリモル）と共に、乾燥トルエン（２０ｍｌ）に溶解した(図６の反応「ａ」)。粉末にした４Åモレキュラーシーブ（１８０ｍｇ）を添加し、この混合物を室温で２０分間撹拌した。三塩化アルミニウム（１５４ｍｇ、１.１６ミリモル）を添加し、出発物質の消失後(約１０分間、シリカのtlc トルエン／アセトニトリル４：１)、この混合物を濾過し、溶液が清澄になるまでダウエックス（Ｄowex）(Ｈ⁺)イオン交換樹脂で処理し、再び濾過した。濾液を濃縮し、メタノールと共に２回、同時にエバポレートし、２００ｍｇの残渣を得た。これはシリカ上でのクロマトグラフィー（トルエン-アセトニトリル８：１）によって、６０ｍｇ(４０％)のhdo_９：１を得た。 ¹Ｈ-ＮＭＲ（ＣＤＣｌ₃，δ）:８.０-７.２(ｍｍ，１５Ｈ)，５.７５(t，９. ４Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ３)，５.３７(ｔ，９.８Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ２)，４.７４(ｄ，９. ８Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ１)，４.６１(ｓ，２Ｈ)，４.０２-３.９５および３.８５-３ .７６(２ｂｍ，２Ｈ，２Ｈ６)，３.９４(ｔ，９.５Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ４)，３.６３ (ｄｄｄ，９.７Ｈｚ，３.９Ｈｚ，２.６Ｈｚ，１Ｈ，Ｈ５)，２.７４(２ｑ，７. ５Ｈｚ，２Ｈ)，１.２５(ｔ；７.５Ｈｚ，３Ｈ)。エチル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１− チオ−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９：２）エチル２,３−−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１−チオ−β−Ｄ− グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９：１）（２００mg、０.３８mmol）をピリジンおよび無水酢酸の氷冷混合物（１：１、６ml）に溶解させた。該混合物を撹拌し、室温で一晩放置した。該混合物をジクロロメタンで希釈し、炭酸水素ナトリウム飽和水溶液および水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。該溶媒を減圧下で除去し、残留物をシリカゲル上でのフラッシュクロマトグラフィーに付して（トルエン−アセトニトリル、６：１）、ｈｄｏ＿９：２を２０４mg（９０％）得た。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：８.０−７.２(ｍｍ,１５Ｈ)、５.７５(ｔ,９. ２Ｈz,１Ｈ,Ｈ３)、５.４０(ｔ,９.８Ｈｚ,１Ｈ,Ｈ２)、４.７１(ｄ,１０.０Ｈz ,１Ｈ,Ｈ１)、４.５９および４.５５(２ｄ,１０.８Ｈz,２Ｈ,ｂｚｌ−ＣＨ２)、４.４４(ｄｄ,１２.０Ｈz,１.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、４.２７(ｄｄ,１２.２Ｈz, ４.６Ｈz,１Ｈ,Ｈ６')、３.８７(t,９.５Ｈz,１Ｈ,Ｈ４)、３.７７(ｄｄｄ,９. ７Ｈz,４.６Ｈz,１.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ５)、２.７３(ｍ,２Ｈ)、２.０９(ｓ,３Ｈ)、１.２６(ｔ,３Ｈ)。メチルグリコリル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９：３）６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１−チオ −β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９：２）（６００mg、１.０４mmo l）およびＮ−ヨードスクシンイミド（４６８mg、２.０８mmol、＜０.１mbarで３時間乾燥させた）を、室温で乾燥アセトニトリル（７ml、アルミナに通した）に溶解させた。グリコール酸メチル（１６１μl、２.０８mmol）を添加し、該混合物を室温で２５分間撹拌し、次いで、氷浴上で冷却した。トリフルオロメチルスルホン酸（１８μl、０.２１mmol）を注意深く添加した。出発物質の完全な変換は、１０分後に生じた（ｔｌｃ：シリカトルエン−アセトニトリル、４：１）トリエチルアミンの添加により該反応をクエンチし、該混合物をジクロロメタンで希釈し、水、炭酸水素ナトリウムで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。溶媒を減圧下で除去し、残留物をシリカ上でのクロマトグラフィーに付して(トルエン−アセトニトリル、１１：１)、ｈｄｏ＿９：３を５６０mg（８６％）得た。ナトリウムグリコリル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９）メチルグリコリル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド（ｈｄｏ＿９：３）（３５０mg、０. ５９mmol）を７Å２５mＭナトリウムメトキシド（メタノール）に溶解させ、室温で２０時間、または、硫酸炭化によってｔｌｃで非常に遅く動くスポットが検出されるまで（シリカ、トルエン−アセトニトリル、４：１）撹拌する。グリコール酸メチル加水分解前に、この溶液の少量（＝ｉ）をｔｌｃ参照として保持した。水酸化ナトリウム（１５mg）および水（２００μl）を添加し、８時間、または全ての「ｉ」が消費されるまで（ｔｌｃシリカ、酢酸エチル−エタノール −酢酸、８：３：１）、撹拌を続けた。該反応物を酢酸でpＨを４.０にすることによってクエンチした。溶媒を減圧下で除去し、残留物（６５０mg）を、シリカ上でフラッシュクロマトグラフィーに付した（酢酸エチル−エタノール−酢酸、８：３：１）。Ｒ_f−範囲０.１５−０.２５における物質を回収し、濃縮して、アモルファス白色固体１７８mg（９２％）を得た。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤ₃ＯＤ，３.３１ppmでのメタノールに対する相対的なδ）：７.４５(ｍ,５Ｈ)、４.６５(ｄ,１１.０Ｈz,１Ｈ)、４.３６(ｄ,１６.０Ｈz,１Ｈ)、４.３２(ｄ,７.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.１１(ｄ,１５.８Ｈz,１Ｈ)、３.８２(ｄｄ,２.０Ｈz,１２.１Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、３.６５(ｄｄ,４.８Ｈz,１２.１Ｈz ,１Ｈ,Ｈ６)、３.５９(ｔ,９.０Ｈz,１Ｈ,Ｈ３またはＨ４) この物質は、まだ多量の酢酸を含有していたので、５０mgを水に再溶解させ、凍結乾燥させて、水含量２４.５モル等量（¹Ｈ−ＮＭＲ）を有するが酢酸を含まない物質３０mgを得た。この物質を再度水に溶解させ、１等量の水酸化ナトリウムを添加し、該溶液を凍結乾燥させて、標記化合物２２mgを得た。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤ₃ＯＤ，３.３１ppmでのメタノールに対する相対的なδ）：７.４０−７.２２(ｍ,５Ｈ)、４.９５(ｄ,１０.８Ｈz,４.９３で残留物ＨＤＯによって重複)、４.６５(ｄ,１１.０Ｈz，１Ｈ)、４.３４(ｄ,１６.０Ｈz,１Ｈ)、４.３２(ｄ,７.５Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.１０(ｄ,１５.８Ｈz)、３.８２(ｄｄ,１. ８Ｈz,１１.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、３.６６(ｄｄ,４.８Ｈz,１２.１Ｈz,１Ｈ,Ｈ６) 、３.５９(ｔ,８.８Ｈz,１Ｈ,Ｈ３)、３.４１(ｔ,９.７hz,１Ｈ,Ｈ４)、３.１５ −３.０６(ｍ,２Ｈ,Ｈ５,Ｈ２)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤ₃ＯＤ，４９.０ppmでのメタノールに対する相対的なδ）：１７６.１、１４０.０、１２９.３、１２９.１、１２８.６、１０４.３、７９ .１、７８.１、７７.２、７５.７、７５.２、６８.４、６２.３。２−(ヒドロキシ)エチル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコピラノシド（ｈｄｏ＿２３）室温で５分間、チオグリコシドエチル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１−チオ−β−Ｄ−グルコピラノシド（ｈｄｏ＿９：２）（０.２１０ｇ、０.３７２mmol）、エチレングリコール（０.１２５ml、２. ２３２mmol）およびモレキュラーシーブ（０.３ｇ、４Å）のジクロロメタン− ジエチルエーテル（３ml、１：２）中混合物にジクロエタン−ジエチルエーテル（２ml、１：１）中のＮ−ヨードスクシンイミド（０.１０９ｇ、０.４８４mmol ）およびトリフリックアシッド（６.６μl、０.０７４４mmol）を添加した。２５分後、ＴＬＣは、チオグリコシドの約２０％変換を示し、かくして、さらにジクロロエタン−ジエチルエーテル（２ml、１：１）中のＮ−ヨードスクシンイミド（０.１０９ｇ、０.４８４mmol）およびトリフリックアシッド（６.６μl、０ .０７４４mmol）を５分間添加した。さらに３０分後、該反応混合物を、セライトの層を介して、炭酸水素ナトリウムおよび重亜硫酸ナトリウムの水溶液中に濾過した。有機層を分離し、水で洗浄し、乾燥させ(Ｎa₂ＳＯ₄)、濃縮した。残留物をトルエンで２回共蒸発させ、ナトリウムメトキシド（１０ml、０.２Ｍ（を含有するメタノールに溶解させ、５０℃で１時間維持し、蒸発させた。残留物をカラムクロマトグラフィー（ＳiＯ₂、クロロホルム−メタノール−水、１００：１５：１）に付して、ｈｄｏ＿２３（３３mg、３０％）を得た。 [α]²² _D＋０.９°（ｃ１.４，メタノール）ＴＬＣ：Ｒｆ０.２９（クロロホルム−メタノール−水、１００：１５：１）。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤ₃ＯＤ，４９.０ppmでのメタノールに対して相対的なδ） δ：１３９.９、１２９.２、１２９.０、１２８.６１０４.４（Ｃ−１）、７９. ２、７８.２、７７.０、７５.７、７５.４、７２.３、６２.３、６２.３ppm。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤ₃ＯＤ，３.３１ppmでのメタノールに対して相対的なδ）δ ：７.４５−７.２５(ｍ,５Ｈ)、４.９５(ｄ,１１.０Ｈz，１Ｈ，ベンジル)、４. ６５(ｄ,１１.０Ｈz,１Ｈ,ベンジル)、４.２９(ｄ,７.７ｈz,１Ｈ,Ｈ−１) ｐｐｍ。実施例５ＰａｐＤの結合部位への結合能を有するｂｐｙファミリーの化合物の合成メチル４'−メトキシフェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド、４,６−、２,３−エンドおよび２,３−エキソモノアセタールの混合物［パトロニ（Ｐatroni）ら、１９８８を参照のこと］メチルα−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（３８.８g、２００mmol）およびｐ− トルエンスルホン酸（２００mg）をジメチルホルムアミド（３００ml）に溶解させ、窒素流下、１００℃で撹拌した。ジメチルホルムアミド（３００ml）中の４ −メトキシ−ベンズアルデヒドジメチルアセタール（３７.７g、２４０mmol）を３時間かけて滴下した。出発物質がまだ残存していたので（ｔｌｃ、シリカ、酢酸エチル）、撹拌および加熱を２時間継続した。反応混合物の組成物は、その時点で視覚変化を示さず(ｔｌｃ、シリカ、酢酸エチル)、該反応物を炭酸カリウム（２.１５g）でクエンチした。減圧下、溶媒を除去し、残留物をシリカ（酢酸エチル）を介して濾過して、塩および出発物質を除去した。濃縮した溶出液をメチルｔ−ブチルエーテル（１１g、１８％）と一緒にトリチュレートするとモノアセタールが沈殿し(¹Ｈ−ＮＭＲ)、これを濾過によって回収した。濾液をフラッシュクロマトグラフィーに付して、さらにモノアセタール混合物２０gおよび２, ３；４,６−ジアセタール（エンド／エキソ＝１：１）１７gを得た。メチル２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチレン−α− Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：１）メチル４'−メトキシフェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド、４,６−、２,３−エンドおよび２,３−エキソモノフェニルメチレンアセタールの混合物(１１.３g、３６.２mmol)、ヨウ化エチル(４.３５ml、５４.３mmol)および硫酸水素テトラブチルアンモニウム（２.４８g、７.２４mmol）を塩化メチレン（５００ml）に溶解させた。これに水酸化ナトリウム（２.５g、１４０mmol ）の水（５０ml）中溶液を添加し、該混合物を還流させながら４日間、毎日ヨウ化エチル（２.４ml）および２０％水酸化ナトリウム（１ml）を添加しつつ加熱した。この後、反応混合物の組成物における視覚的変化は、ｔｌｃ（トルエン−酢酸エチル、２：１）によって検出できなかった。該混合物を冷却し、相を分離し、有機相を水（３×）で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。減圧下、溶媒を除去し、残留物をシリカ上でのフラッシュクロマトグラフィー（トルエン −酢酸エチル、６：１）に付した。ｔｌｃ（トルエン−酢酸エチル、２：１）によるＲ_f＝０.４０を有する成分を含有するフラクションをプールし、前記と同様に再度クロマトグラフィーに付して、標記化合物３.１５g（２６％）を得た。ｔｌｃによるＲ_f＝０.３２を有する成分を含有するフラクションは、モノエチル化モノフェニルメチレンアセタール位置異性体の混合物からなることが判明した(¹ Ｈ−ＮＭＲ)。 [α]²⁰ _D＝＋１１.２°（ｃ１.０２，ＣＨＣｌ₃） ¹Ｈ−ＮＭＲ(ＣＤＣl₃，δ)：７.４２(symm.m,２Ｈ)、６.８８(symm.m,２Ｈ) 、５.５３(s,１Ｈ)、４.７７(ｄ,１.３Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.２４(ｄｄ,４.２Ｈz ,９.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、４.０２(ｄｔ,４.０Ｈz,８.８Ｈz,１Ｈ,Ｈ５)、３.８３ (ｄｄ,１.８Ｈz,９.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、３.８０−３.６９(ｓおよびoverl.m,６Ｈ,１−ＯＭe,Ｈ３,Ｈ４,２−Ｏ−ＣＨＨＣＨ₃)、３.６６(ｄｄ,１.３Ｈz,３.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ₂)、３.６４−３.５５(ｍ,１Ｈ,２−Ｏ−ＣＨＨＣＨ₃)、３.６９ (ｓ,３Ｈ,Ａr−ＯＭe)、２.４８(ｄ,１Ｈ，ＯＨ)、１.２６(ｔ,７.０Ｈz,３Ｈ, ２−Ｏ−ＣＨ₂ＣＨ₃)。 ¹ＨＮＭＲ（ＣＤＣl₃，Ｃl₃ＣＣＯＮＣを添加，δ）：８.５４(１Ｈ,アシルカルバメートＮＨ)、７.３８(symm.m,２Ｈ)、６.８８(symm.m,２Ｈ)、５.５２( ｓ,１Ｈ)、５.２７(ｄｄ,３.５ｈz,１０.３Ｈz,１Ｈ,Ｈ３)、４.７６(ｄ,１.６Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.３２−４.２０(ｍ,１Ｈ)、4.１３(symm.m,１Ｈ,Ｈ５)、３. ９７(ｄｄ,１.８Ｈz,３.５Ｈz,１Ｈ,Ｈ２)、３.９１−３.８０(ｍ,１Ｈ)、３.７９(ｓ,３Ｈ,１−ＯＭe)、３.７７−３.５４(ｍ,３Ｈ)、３.４１(ｓ,３Ｈ, Ａr−ＯＭe)、１.２３(ｔ,７.０Ｈz,３Ｈ)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：１６０.１、１２９.９、１２７.６、１１３. ６、１０２.０、９９.３、７９.４、７８.８、６８.７、６７.２、６３.２、５５.２、５４.９、１５.４。Ｃ₁₇Ｈ₂₅Ｏ₇についての理論値：Ｃ；５９.８Ｈ；７.３８。メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−４,６−Ｏ−( ４'−メトキシ)フェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド(ｂｐｙ＿９：２) メチル２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチレン−α− Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：１）（０.９８g、２.８８mmol）をトリエチルアミン（６００μl、４.３２mmol）と一緒に乾燥塩化メチレン（１８ ml）に溶解させ、該混合物を氷冷した。塩化メチレン（２ml）中のｔ−ブチル− ジメチルシリルトリフルオロメチルスルホナート（７９５μl、３.４５mmol）を滴下し、該反応混合物を冷却しつつ、室温で一晩放置した(ｔｌｃシリカトルエン−メチルｔ−ブチルエーテル、４：１)。過剰のシリル化剤をメタノール（３ml）の添加によって分解し、該混合物をシリカ上でのフラッシュクロマトグラフィー（トルエン−メチルｔ−ブチルエーテル、４０：１）に付して（ｂｐｙ＿９：２）１.４０g（１００％）を得た。 ¹Ｈ−ＮＭＲ(ＣＤＣl₃，δ):７.４０(symm.m,２Ｈ)、６.８７(symm.m,２Ｈ)、５.５３(ｓ.１Ｈ)、４.７０(ｄ,１.３Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.２１(ｄｄ,４.６Ｈz, ９.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、４.１０(ｄｄ,３.３Ｈz,９.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ３)、３.９１( ｔ,９.５Ｈｚ,１Ｈ,Ｈ４)、３.９０−３.７９(s overl.ｍ,５Ｈ,Ｈ６,２−ＯＣＨＨＣＨ₃)、３.５５(ｄｄ,１.５Ｈz,３.３Ｈz,１Ｈ,Ｈ２)、３.６７(ｓ,３Ｈ, Ａr-ＯＭe)、１.２４(ｔ,７.０Ｈz,３Ｈ)、０.８８(ｓ,９Ｈ)、０.０８(ｓ,３Ｈ )、０.０３(ｓ,３Ｈ)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：１５９.９、１３０.３、１２７.５、１１３. ４、１０１.８、１０１.２、７９.９、７９.１、７０.３、６８.８、６８.２、６４.１、５５.２、５４.８、２５.８、１８.３、１５.６、−４.４、 −４.９。メチル−２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−４,−Ｏ−( ４'−メトキシ)−ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：３）およびメチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−６−Ｏ−(４' −メトキシ)−ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：８）アセトニトリル（１５０ml、４Åモレキュラーシーブで乾燥させた）にメチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：２）（３.６１g、７.９５mmol）を溶解させ、３Åモレキュラーシーブ粉末（６ｇ）添加し、該混合物を、窒素雰囲気下、−３０℃に冷却させ、１５分間撹拌した。シアノホウ水素化ナトリウム（３.０４g、４７.７mmol）を添加し、クロロトリメチルシラン（７.９５ml、４７.７mmol）の乾燥アセトニトリル（５０ml、４ Åモレキュラーシーブで乾燥させた）中溶液を１時間かけて滴下した。−３０℃ で２時間撹拌し続け、次いで、温度を０℃に上昇させた。１時間後、ｔｌｃ（トルエン−酢酸エチル、４：１）は、出発物質の完全な変換を示した。該混合物をセラ浄した。合わせた濾液を炭酸水素ナトリウム飽和水溶液、塩化ナトリウム飽和水溶液で洗浄し、減圧下、濃縮した。残留物をシリカ上でのフラッシュクロマトグラフィー（トルエン−酢酸エチル、４：１、次いで、１：１）に付して、ｂｐｙ＿９：８（＝ｂｐｙ＿２１：１）５７８mg（１６％）および（ｂｐｙ＿９：３）２.３４g（６５％）を得た。ｂｐｙ＿９：３（ＣＯＳＹ、ＨＥＴＣＯＲからの多少のアサインメント）： ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：７.２５(symm.m,２Ｈ)、６.８７(symm.m,２Ｈ )、４.８１(ｄ,１１.０Ｈz,１Ｈ)、４.６６(ｄ,１.８Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.５１(ｄ,１０.８Ｈz,１Ｈ)、４.０２(ｄｄ,３.１Ｈz,５.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ３)、３.８０(ｓ,３Ｈ,１−ＯＭe)、３.７９−３.６０(ｍ,５Ｈ,Ｈ４,２Ｈ６,２−ＯＣＨ₂ＣＨ₃)、３.５４(ｄｄｄ,２.９Ｈz,４.８Ｈz,９.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ５)、３.４６(ｄｄ,２.０Ｈz,３.３Ｈz,１Ｈ,Ｈ２)、３.３３(ｓ,３Ｈ,Ａr−ＯＭe)、２.１０および１.８６(ｓｖ.ｂｒ.ｓ,＝１Ｈ,６−ＯＨ)、１.２３(ｔ,６.８Ｈz,３Ｈ) 、０.９５(ｓ,９Ｈ)、０.１２(ｓ,６Ｈ)。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，Ｃl₃ＣＣＯＮＣを添加した，δ）：８.４０(ｓ,１Ｈ ,アシルカルバメートＮＨ)、７.２４(symm.m,２Ｈ,Ａr Ｈ３',５')、６.８６(sy mm.m,２Ｈ,Ａr Ｈ２',Ｈ６')、４.８２(ｄ,１１.２Ｈz,１Ｈ)、４.６７(ｓ,２. ０Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.４３−４.３２(ｍ,２Ｈ,２Ｈ６)、４.０８−３.９８(ｍ, １Ｈ,Ｈ３)、３.７８(ｓ,３Ｈ,１−ＯＭe)、３.７７−３.６１(ｍ,４Ｈ,Ｈ５,２ −ＯＣＨ ₂ＣＨ₃,Ｈ４)、３.４６(ｄｄ,１.８Ｈz,３.１Ｈz,１Ｈ,Ｈ２)、３.３４ (ｓ,３Ｈ,Ａr−ＯＭe)、１.２２(ｔ,７.０Ｈz,３Ｈ)、０.９６(ｓ,９Ｈ)、０.１４(ｓ,３Ｈ)、０.１３(ｓ,３Ｈ)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：１５９.１、１３０.７、１２９.３、１１３. ８、９９.８、７９.５、７５.７、７４.７、７３.０、７２.２、６７.４、６２. ５、５５.２、５４.７、１８.０、１５.７、４.３、−４.６。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，Ｃl₃ＣＣＯＮＣを添加した，δ）：１５９.３(Ａr Ｃ４')、１５７.４、１４９.３、１３０.２(Ａr Ｃ２')、１２９.６(Ａr Ｃ３', Ｃ５')、１１３.８(Ａr Ｃ２',Ｃ６')、９９.６(Ｃ１)、７９.２(Ｃ２)、７４. ５６^*(４−ＯＣＨ₂Ａｒまたは２−ＣＨ₂ＣＨ₃)、７４.５^*(４−ＯＣＨ₂Ａrまたは２−ＣＨ ₂ＣＨ₃)、７３.２(Ｃ３)、６９.７(Ｃ５)、６７.２(Ｃ４)、６６.３ (Ｃ６)、５５.２(１−ＯＭe)、５４.９(Ａr−ＯＭe)、２５.９(ＣＭe ₃)、１８. ０(ＣＭe₃)、１５.６、−４.３、−４.７。ｂｐｙ＿９：８： ¹Ｈ−ＮＭＲ(ＣＤＣl₃，δ)：７.２８(symm.m,２Ｈ)、６.８６(symm.m,２Ｈ) 、４.７０(ｄ,１.８Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.５５(ｄ,１１.７Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、４.５１(ｄ,１１.６Ｈz,１Ｈ,Ｈ６)、３.８９−３.５５および３.７９(ｍおよびｓ,７Ｈ,Ｈ３,Ｈ４,Ｈ５,２−ＯＣＨ ₂ＣＨ₃,１−ＯＭe)、３.４４(ｄｄ,１.８Ｈz,２. ９Ｈz,１Ｈ,２Ｈ)、３.５６(ｓ,３Ｈ,Ａr−ＯＭe)、２.２９(ｄ,２.０Ｈz,１Ｈ, ４−ＯＨ)、１.２０(ｔ,７.０Ｈz,３Ｈ)、０.９２(ｓ,９Ｈ)、０.１３(ｓ,３Ｈ) 、０.１２(ｓ,３Ｈ)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：１５９.１、１３０.３、１２９.３、１１３. ７、９９.７、７８.９、７３.１９^*、７３.１６^*、７１.３、７０.３、６９.１、６７.２、５５.２、５４.８、２５.８、１８.２、１５.６、−４.５、−４.６。^*ガウス重量関数を用いてＦＩＤを増強することによって分割した。メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−４,−Ｏ−(４ '−メトキシ)−ベンジル−６(Ｓ)−フェニル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：４）［酸化参照ディ・エフ・テイバー（Ｄ.Ｆ.Ｔaber）ら、ジャーナル・オブ・オーガニック・ケミストリー(Ｊ.Ｏrg.Ｃhem.)、５２、５６２１−２、１９８７］メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−ｔ−ブチルシリル−４,−Ｏ-(４'− メトキシ)ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド（ｂｐｙ＿９：３）（２００mg、０.４３８mmol）およびジメチルスルホキシド（６４.０μl、０.８７６ mmol）をジクロロメタン（２.５ml、４Åモレキュラーシーブで乾燥させた）に溶解させ、該溶液を氷浴上で冷却した。五塩化リン（１２４mg、０.８７６mmol ）を素早く添加し、得られた撹拌懸濁液をＲＴに維持した(１時間)。該混合物を再度氷冷し、トリエチルアミン（２１５μl、１.５３mmol）を添加してゲル状懸濁液の即時溶解を生じた。氷浴を外し、該混合物をＲＴで１時間撹拌し、酢酸エチルで希釈し、０.２Ｍリン酸二水素ナトリウム水溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下(＜０.０２mbar)、濃縮した。残留物をテトラヒドロフラン（２ml、４Åモレキュラーシーブで乾燥させた）を溶解し、撹拌し、−２０℃ に冷却した。テトラヒドロフラン中塩化フェニルマグネシウム（２５重量％溶液３４５μl、０.６５７mmol、ジャンセン(Ｊanssen)、ベルギー）を滴下した(３分間)。該反応をｔｌｃ（トルエン−酢酸エチル、４：１）でモニターし、１０％硫酸アンモニウム水溶液（３ml）でクエンチした。該混合物を酢酸エチルで希釈し、水で２回洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下、濃縮した。残留物をシリカ上でのフラッシュクロマトグラフィー（トルエン−メチルｔ−ブチルエーテル、２０：１）に付した。ｔｌｃ（トルエン−酢酸エチル、４：１）によるＲ_f＝０.４４を有する成分を含有するフラクションをプールし、減圧下、濃縮して、標記化合物６５mg（３０％）を得た。ＲおよびＳジアステレオマーのＭＭ２(９１)［バーカート（Ｂurkert）およびアリンジャー(Ａllinger)、１９８２］による分子メカニズム計算およびカープラス（Ｋarplus）方程式［ボスナー−バイ(Ｂothner−Ｂy)、１９６５］による次なる計算は、¹Ｈ−ＮＭＲＪ_5-6が各々４.８および６.２であると予想した。この差異は、立体化学の示唆以外であるには非常に小さい。さらにまた、Ｈ６シグナルは、あまり分割されず、Ｈ５シグナルは、他の共鳴によって厳密に重複している。しかしながら、¹Ｈ−ＣＯＳＹＨ４−Ｈ５交差ピークは、Ｊ_4-5＋Ｊ_5-6 の合計を含有し、Ｊ_4-5がＨ４−共鳴において観察可能であるので、Ｊ_5-6は、値６.８Ｈzを指定され得る。これは、単離した生成物が６−(Ｓ)立体化学を有することを示す。４−メトキシベンジル基の除去後、算出したカップリング定数は、各々、５. ５Ｈzおよび１２.９Ｈzになる。 ¹Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：７.４４−７.１９(ｍ,７Ｈ)、６.８９(symm. ｍ,２Ｈ)、５.００(ｂｒ.ｍ,１Ｈ,Ｈ６)、４.９０(ｄ,１０.８Ｈz,１Ｈ)、４.６６(ｄ,１０.８Ｈz,１Ｈ)、４.５８(ｄ,１.８Ｈz,１Ｈ,Ｈ１)、４.０４(ｄｄ,３. １Ｈz,９.０Ｈz)、３.９９(ｔ,９.２Ｈz,１Ｈ,Ｈ４)、３.８１および３.８２− ３.５６(ｓおよびｍ,６Ｈ,１−ＯＭe,２−ＣＨ ₂ＣＨ₃),５Ｈ)、３.４４(ｄｄ,２ .０Ｈz,２.９Ｈz,１Ｈ,Ｈ２)、２.８４(ｓ,３Ｈ,Ａr−ＯＭe)、１.２４(ｔ,３Ｈ )、１.９７(ｓ,９Ｈ)、０.１５(ｓ,３Ｈ)、０.１３(ｓ,３Ｈ)。 ¹³Ｃ−ＮＭＲ（ＣＤＣl₃，δ）：１５９.０、１４２.５、１３０.８、１２９.２、１２７.７、１２６.７、１２６.６、１２５.７、１１３.７、９９. ５、７９.８、７６.１、７４.５、７３.０、７０.９、６７.９、５５.１、５４. １、２５.８、１７.９、１５.４、−４.５、−４.８。メチル２,３−アンヒドロ−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン−α−Ｄ− マンノピラノシド（ｂｐｙ＿９：９）水素化ナトリウム（２.６g、６５mmol、鉱油中６５％分散物）のＮ,Ｎ−ジメチルホルムアミド（１５０ml）中撹拌懸濁液にメチル４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−グルコピラノシド（９.３６ｇ、３０mmol）のＮ,Ｎ−ジメチルホルムアミド（６５ml）中溶液を撹拌しつつ添加した。該混合物を４５分間撹拌し、ｐ−トルエンスルホニルイミダゾール（７.２４g、３３mmol）を添加した、２時間撹拌し続け、該混合物を氷水中に注いだ。沈殿物を濾過し、真空乾燥させて、粗製ｂｐｙ＿９：）（７/７g）を得た。メタノール（２５０ml）から２回再結晶して、ｂｐｙ＿９：９（３.５８g）を得た。母液をクロマトグラフィー（ＳiＯ₂、酢酸エチル−ヘプタン、２：３）に付し、次いで、メタノール（１５０ml）から結晶化させて、さらにｂｐｙ＿９：９（１.８７g）を得た。ｂｐｙ＿９：９の合計収量は、５.４５g（６１％）であった。融点１５２−１５３.５℃（メタノール） [α]²² _D：９６.４°（ｃ１.８、クロロホルム） ¹ＨＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：７.４３および６.９１(ＡＢパターン、さらに結合、２Ｈ、Ｊ_AB＝８.７Ｈz)、５.３５(ｓ,１Ｈ.ＡrＣＨ)、４.９０(ｓ,１Ｈ,Ｈ −１)、４.３０−４.１９(sym.ｍ,１Ｈ)、３.８２(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃ＯＡr)、３.７８−３.６４(３Ｈ)、３.４９−３.４６(４Ｈ)、３.４８(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、３. １８(ｄ,１Ｈ,Ｊ３.７Ｈz,Ｈ−２／Ｈ−３)ｐｐｍ。 ¹³ＣＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：１６０.３、１２９.６、１２７.５、１１３.７、１０２.４、９６.９、７４.８、６９.４、６１.７、５５,７、５５.３、５３. ８および５０.５ｐｐｍ。メチル３−アジド−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−アルトロピラノシド（ｂｐｙ＿９：１０）２−メトキシエタノール（２５ml）および水（５ml）の混合物中、メチル２, ３−アンヒドロ−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジルデン−α−Ｄ−マンノピラノシド(ｂｐｙ＿９：９、２.３５g、８mmol)、アジ化ナトリウム（２.０８g、３２mmol）および塩化アンモニウム（０.８６g、１６mmol）を１１０℃で５時間撹拌した。懸濁液が徐々に溶解して、濁った溶液が得られた。次いで、該混合物を酢酸エチルとＮaＯＨ（０.２５Ｍ、１００ml）とに分配させた。水性相を酢酸エチルで２回抽出し、次いで、ＮaＣl飽和水溶液で抽出し、乾燥させ(Ｎa₂ＳＯ₄) 、濾過し、濃縮した。クロマトグラフィー（ＳiＯ₂、酢酸エチル−ヘプタン、２：３〜２：１）に付して、ｂｐｙ＿９：１０（１.９７g、７３％）を得た。分析試料を酢酸エチル−ヘプタンから結晶化した。融点９１−９３℃（ＥｔＯＡc／ヘプタン） [α]²² _D：＋２６.１°（ｃ１.１、クロロホルム） ¹ＨＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：７.４４および６.９１(さらに結合したＡＢパターン,２Ｈ,Ｊ_AB＝８.６Ｈz)、５.５７(ｓ,１Ｈ,ＡrＣＨ)、４.５６(ｓ,１Ｈ,Ｈ −１)、４.４３−４.２１(２Ｈ)、４.１６−４.０８(１Ｈ)、４.０３(非分割ｄｄ,１Ｈ,Ｊ₁＝Ｊ₂＝３Ｈz)、３.９１(ｂｓ,１Ｈ,Ｈ−２)、３.８３−３.７４(４Ｈ)、３.８０(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、３.４３(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、２.３６(ｂｓ,１Ｈ,ＯＨ)ｐｐｍ。 ¹³ＣＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：１６０.３、１２９.５、１２７.５、１１３.７、１０２.３、１０１.４、７５.８、６９.８、６９.０、６０.１、５９.０、５５.７および５５.３ｐｐｍ。ｂｐｙ＿９：１０の試料のアセチル化（無水酢酸−ピリジン、３：５）により、以下の¹ＨＮＭＲスペクトルを有するアセテートを得た(アサインメントは、対応するホモニュークリアＣＯＳＹスペクトルによって確認された)： ¹ＨＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：７.４３および６.９１(さらに結合したＡＢパターン,２Ｈ,Ｊ_AB＝８.８Ｈz)、５.５９(ｓ,１Ｈ,ＡrＣＨ)、４.９７(ｄｄ,１Ｈ, Ｊ＝２.２および０.９Ｈz,Ｈ−２)、４.５７(ｓ,１Ｈ,Ｈ−１)、４.３６(２Ｈ, Ｈ−６およびＨ−４)、４.０９−４.０１(２Ｈ,Ｈ−６およびＨ−３)、３.８４ −３.７４(２Ｈ,ＣＨ₃ＯおよびＨ−５)、３.８１(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、３.４４( ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、２.１５(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃ＣＯ)ｐｐｍ。メチル３−アジド−２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン −α−Ｄ−アルトロピラノシド（ｂｐｙ＿９：１１）メチル３−アジド−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−アルトロピラノシド(ｂｐｙ＿９：１０、１.７g、５mmol)、酸化バリウム（３.０g、１９.６mmol）およびヨウ化エチル（５ml、６２mmol）をジメチルスルホキシド（５ml）中で撹拌した。水（１０μl）を添加し、１６時間撹拌し続けた。次いで、該混合物を酢酸エチルと水とに分配させた。水性相を酢酸エチルで２回抽出し、合わせた有機相を水で２回、次いで、ＮaＣl飽和水溶液で洗浄し、乾燥させ（Ｎa₂ＳＯ₄)、濾過し、濃縮した。クロマトグラフィー（ＳiＯ₂、酢酸エチル−ヘプタン、１：３）に付して、油状物としてｂｐｙ＿９：１１（１.７g、９２％) を得た。 [α]²² _D：１９.１°（ｃ１.６、クロロホルム） ¹ＨＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：７.４４および６.９１(ＡＢパターン,さらに結合した,２Ｈ,Ｊ_AB＝８.６Ｈz)、５５.５７(ｓ,２Ｈ,ＡrＣＨ)、４.６３(ｂｓ,１Ｈ ,Ｈ−１)。(sym.ｍ.２Ｈ)、３.５２(ｄｄ,１Ｈ,Ｊ＝２.４および０.９Ｈz,Ｈ− ３)、３.３４(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、１.２５(ｔ,３Ｈ,Ｊ＝６.９Ｈz,ＣＨ ₃ＣＨ₂) ｐｐｍ。 ¹³ＣＮＭＲ（ＣＤＣl₃）δ：１６０.１、１２９.６、１２７.４、１１３.６、１０２.１、９９.６、７７.０、７６.１、６９.０、６６.５、５８.７、５８. １、５５.５、５５.２および１５.３ppm。メチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロ−ピラノシド［アール・ヨハンソン（Ｒ.Ｊohansson）およびビー・サムエルソン(Ｂ.Ｓamu elsson)；Ｊ.Ｃhem.Ｓoc.Ｃommun.１９８４、２０１−２０２を参照のこと］メチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−ｐ−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−アルトロピラノシド（ｂｐｙ＿９：１１）(２.４１g 、６.６mmol)、シアノホウ水素化ナトリウム（２.５g、３９.６mmol）およびモレキュラーシーブ粉末（５g）を、０℃で、アセトニトリル（１３０ml）中で撹拌した。塩化トリメチルシリル（５.０ml、４０mmol）のアセトニトリル（４５m l）中溶液を５５分間かけて添加した。さらに１.５時間撹拌した後、冷却浴を外し、２１時間撹拌し続けた。該混合物をセライトを介して濾過し、濾液を酢酸エチルとＮaＨＣＯ₃とに分配させた。有機相をＮaＨＣＯ₃飽和水溶液で２回、次いで、ＮaＣl飽和水溶液で洗浄し、乾燥させ(Ｎa₂ＳＯ₄＋ＮaＨＣＯ₃)、濾過し、蒸発させた。クロマトグラフィー（ＳiＯ₂、酢酸エチル−ヘプタン、２：７→２：１および酢酸エチル−トルエン、１：２→２：１）に２回付して、油状物として標記化合物（２.３２g、９２％）を得た。 [α]²² _D：＋１１３.６°（ｃ１.４，クロロホルム） ¹ＨＮＭＲデータ（ＣＤＣl₃）δ：７.３０および６.８９(ＡＢパターン,さらに結合した,４Ｈ,Ｊ＝８.８Ｈz)、４.６２および４.５６(ＡＢパターン,２Ｈ,Ｊ＝１１.３Ｈz,ベンジルＨ)、４.５８(非分割ｄ,実質的に結合した,１Ｈ,Ｊ＜２Ｈz,Ｈ−１)、４.００−３.８４(３Ｈ,Ｈ−３,Ｈ−４およびＨ−５)、３.８１( ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃ＯＡr)、３.８４−３.７(２Ｈ,Ｈ−６)、３.６２−３.４３(３Ｈ, ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ−２)、３.３８(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃Ｏ)、１.９９(ｂｓ,１Ｈ,ＯＨ)および１.１９(ｔ,３Ｈ,Ｊ＝７.０Ｈz,ＣＨ₂ＣＨ ₃)ｐｐｍ。 ¹³ＣＮＭＲデータ（ＣＤＣl₃）δ：１５９.６、１２９.９、１２９.６、１１３.９、９９.９、７６.９、７２.２、７１.９、６７.７、６６.３、６２.４、５８.６、５５.４、５５.３および１５.４ｐｐｍ。メチル３−アジド−６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル− ４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシドメチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（１.４７g、４mmol）のピリジン（３５ml ）中溶液を０℃で撹拌した。塩化ベンゾイル（１.２ml、１０.３mmol）を添加し、温度を室温に上昇させた。１.５時間撹拌し続け、次いで、該混合物を０℃に冷却した。メタノール（１０ml）を添加し、該混合物を室温でさらに２０分間撹拌し、蒸発させ、酢酸エチルと水とに分配させた。有機相を、水、ＮaＨＣＯ₃飽和水溶液、水、ＮaＣl飽和水溶液で連続して洗浄し、乾燥させ(Ｎa₂ＳＯ₄)、濾過し、蒸発させた。クロマトグラフィー（ＳiＯ₂、酢酸エチル−ヘプタン、１：４）に付して、ベンゾアート（１.６４g、８７％）を得た。 [α]²² _D：＋０.９５°（ｃ１.０，クロロホルム） ¹ＨＮＭＲデータ（ＣＤＣl₃）δ：８.０４−７.９８(ｍ,２Ｈ)、７.５６(ｔｔ,１Ｈ,Ｊ＝７.５および１.３Ｈz)、７.４３(ｔ,さらに結合した,２Ｈ,Ｊ＝７. ５Ｈz）、７.２６および６.８３(ＡＢパターン,さらに結合した,４Ｈ,Ｊ＝８.６Ｈz）、４.６２および４.５０(ＡＢパターン,２Ｈ,Ｊ＝１１.３Ｈz,ＡrＣＨ ₂)、４.６３(ｄ,さらに結合した,Ｊ＝１.３Ｈz,Ｈ−１)、４.５４(ＡＢＸ系のＡ部分 ,１Ｈ,Ｊ＝１１.８および２.７Ｈz,Ｈ−６_a)、４.４７(ＡＢＸ系のＢ部分,１Ｈ, Ｊ＝１１.８および５.５Ｈz,Ｈ−６_b)、４.２７(ｄｄｄ,１Ｈ,Ｊ＝８.４,５.５および２.７Ｈz,Ｈ−５)、３.９９−３.９２(２Ｈ,Ｈ−３およびＨ−４)、３.７４(ｓ,３Ｈ,ＣＨ₃ＯＡr)、３.６７−３.４８(３Ｈ,ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ−２)および１.２２(ｔ,３Ｈ,Ｊ＝７.０Ｈz,ＣＨ₂ＣＨ ₃)ｐｐｍ。 ¹³ＣＮＭＲデータ（ＣＤＣl₃）δ：１６６.２、１５９.５、１３２.９、１３０.１、１２９.９、１２９.６、１２９.２、１２８.３、１１３.９、９９.６、７６.７２、７２.０、７１.７、６２.３、６２.２、６４.１、５８.５、５５.４、５５.２および１５.４ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩（エイチ・ピー・ベッセル（H.P.Wessel）；ジェイ・カーボヒドロ・ケム（J.Carb ohydr.Chem.）、第１１巻（８）、（１９９２年）、１０３９−１０５２頁と比較せよ）。テトラヒドロフラン（４０ｍｌ）中のメチル３−アジド−６−Ｏ−ベンゾイル −３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（６２０ｍｇ、１.３１ミリモル）の撹拌した溶液に、水（２６５ｍｌ）およびトリフェニルホスフィン（１.７ｇ、６.５ミリモル）を添加した。その溶液を２４時間撹拌し、次いで、１２ｍｌに濃縮した。残渣をメタノール（１０ｍｌ）および水（３ｍｌ）で希釈した。次いで、撹拌した溶液にトリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（３７０ｍｇ、２.７ミリモル）を添加した。ｐＨを、１ＭＮａＯＨ水溶液で８.５に調整した。数分後沈澱が生じ、それをテトラヒドロフラン（３ｍｌ）およびメタノール（４ｍｌ）を添加することによって溶解した。反応混合物を０.５時間撹拌し、その後さらにトリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（８６ｍｇ）を添加した。１５分間撹拌し続けた。反応の間、１ＭＮａＯＨ水溶液を添加することにより、ｐＨを８ないし９に維持した。次いで、混合物を水（７ｍｌ）で希釈し、有機溶媒を減圧下エバポレートした。さらに水（５ｍｌ）を添加し、懸濁液を凍結乾燥し、クロマトグラフィーを行って（ＳｉＯ₂、クロロホルム−メタノール−水１００：１５：１−７０：３０：５）、水からの凍結乾燥後に、おそらくはナトリウム塩の形態のスルファミノ化合物が得られた（６６８ｍｇ、９２％）。試料を水性アセトンから結晶化した。融点１１２−１１５℃（水性アセトン） [α]_D ²²；＋１５６.４°（C ０.５、水）¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤ₃ＯＤ）δ：７.９４−７.８９（ｍ、２Ｈ）、２Ｈ、７. ６４−７.５６（ｍ、１Ｈ）、７.４４（ｍ、２Ｈ）、７.２８および６.７３（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８.６ＨZ）、４.７１および４.４９（ＡＢパターン、２Ｈ、Ｊ＝１１.４ＨZ、ＡｒＣＨ ₂）４.６８（ｂｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.５１（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１１.６および２.４ＨZ、Ｈ−６a ）、４.４４（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１１.６および４.４ＨZ、Ｈ−６b）、４.０９（分析できずｄｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝４.３および１ＨZ、Ｈ−３）、４.００−３.９２（２Ｈ、Ｈ−５およびＨ−２）、３.８６（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝９.９および４.２ＨZ、Ｈ−４）、３.７１−３.５４（５Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＣＨ₃ＯＡｒ）、３ .６５（ｓ、ＣＨ₃ＯＡｒ）、３.４０（ｓ、３Ｈ、ＣＨ₃Ｏ）、および１.１７（ｔ、３Ｈ、Ｊ＝７.０ＨZ、ＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（ＣＤ₃ＯＤ）δ：１６７.８、１６０.８、１３４.２、１３１.４、１３０.９、１３０.６、１２９.５、１１４.７、１０１.６、７７.０３、７０.０２、６９.２、６７.０、６６.４、６５.２、５５.６、５５.５、５０. ６、および１５.８ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ −α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩（ｂｐｙ＿３０）メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロ−ピラノシドナトリウム塩（３３４ｍｇ、２.０ミリモル）を氷酢酸中（５５ｍｌ）、０.２３ＭＰａおよび室温で、触媒として５％炭素上パラジウムを使用して６時間加水素分解した。濾過および凍結乾燥により残渣が得られ、クロマトグラフィーを行った（ＳｉＯ₂ 、クロロホルム−メタノール−水１００：１５：１−７０：３０：５）。産物を水に溶解し、陽イオン交換樹脂（バイオ−レックス（ＢＩＯ−ＲＥＸ）７０、２００−４００メッシュ、アンモニウム形態）に通し、凍結乾燥し、標記化合物を得た（２２２ｍｇ、８６％）。 [α]_D ²²；＋５５.７°（C １.３、水）¹ ＨＮＭＲデータ（ピリジン−ｄ₅）δ：８.２３−８.１７（２Ｈ）、７.５２− ７.４５（１Ｈ）、７.４２−７.３５（２Ｈ）、５.０９（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１１ .６５および１.５４ＨZ、Ｈ−６a）、４.８２（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１１.４３および６.８１ＨZ、Ｈ−６b）、４.８２（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.６６（分析できずｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝３.５および３.５ＨZ、Ｈ−３）、４.３６（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１０.１１および３.９６ＨZ、Ｈ−４）、４.３２−４.２３（１Ｈ、Ｈ− ５）、４.１８（ｄ、１Ｈ、Ｊ＝３.０８ＨZ、Ｈ−２）、３.６０−３.４４（２Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃）、３.１６（ｓ、３Ｈ、ＣＨ₃Ｏ）、および１.００(ｔ、３Ｈ、Ｊ＝７.０ＨZ、ＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。¹ ＨＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、２.３５ｐｐｍでのアセトン参照）δ：８.２２−８. １７（２Ｈ）、７.８３（ｔｔ、１Ｈ、Ｊ＝７.５および＜２ＨZ）、７.７２−７ .６５（２Ｈ）、４.９７（ＨＤＯ）、４.９３（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.８１（ｄｄ、実質的にカップリング、１Ｈ、Ｊ＝１２および１.７ＨZ、Ｈ−６a）、４. ６５（ｄｄ、実質的にカップリング、１Ｈ、Ｊ＝１２および５.５ＨZ、Ｈ−６b ）、４.１８−４.１５（２Ｈ、Ｈ−４およびＨ−５）、４.０５（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝３.３および１.４ＨZ、Ｈ−２）、３.９５−３.７５（ｓｙｍ、ｍ、２Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃）、３.９４−３.９１（ｍ、１Ｈ、Ｈ−３）３.５４（ｓ、３Ｈ、ＣＨ₃Ｏ）、および１.３５（ｔ、３Ｈ、Ｊ＝７ＨZ、ＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ（¹ＨＮＭＲスペクトラムシグナルの帰属はコジー（ＣＯＳＹ）実験に基づいて行われた）。¹³ ＣＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、３３.１９ｐｐｍでのアセトン参照）δ：１７１.４、１３６.９、１３２.５、１３２.１、１３１.７、１０２.５、７８.４、６９. ９、６９.１、６７.４、６５.７、５８.１、５６.０、および１７.５ｐｐｍ。メチル３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４− Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシドピリジン（８ｍｌ）中のメチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル− ４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（４７６ｍｇ、１ .３ミリモル）の溶液を０℃で撹拌した。塩化ピバロイル（３９０μｌ、３.２５ミリモル）を添加し、温度を室温に上昇させた。１.５時間撹拌し続け、次いで、混合物を０℃に冷却した。メタノール（１０ｍｌ）を添加し、混合物をさらに室温で２０分間撹拌し、エバポレートし、酢酸エチルおよび水に分配した。有機層を水、飽和ＮａＨＣＯ₃水溶液、水、飽和ＮａＣｌ水溶液で順に洗浄し、乾燥し（Ｎａ₂ＳＯ₄）、濾過し、エバポレートした。クロマトグラフィー（ＳｉＯ₂、メチルタート−ブチルエーテル−ヘプタン１：４）および（Ｃ−１８ローバー（Lobar）、メルク（Merck）、アセトニトリル−水４：１）を行って、ピバロン酸塩（４３１ｍｇ、７５％）を得た。¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：７.２８および６.８９（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８.６ＨZ）、４.６０および４.４９（ＡＢパターン、２Ｈ、Ｊ＝１１.０ＨZ、ＡｒＣＨ ₂）４.５７（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.３９（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１４.５および５.３ＨZ、Ｈ−６a）、４.１３（２Ｈ、Ｈ −６bおよびＨ−４）、３.９３（ｍ、１Ｈ、Ｈ−３）、３.８４−３.７８（４Ｈ、Ｈ−５およびＭｅＯＡｒ）、３.６４−３.４５（３Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ− ２）、３.３９（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、および１.２２−１.１５（ｓおよびｔ、１２Ｈ、Ｊ＝７.０ＨZ、Ｃ（ＣＨ₃）₃、およびＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：１７８.１、１５９.６、１２９.９、１１３.９、９９.５（Ｃ−１）、７６.７（Ｃ−２）、７２.５（Ｃ−５）、７１.９（ＡｒＣＨ₂）、６６.４（Ｃ−４）、６６.２（ＣＨ₂ＣＨ₃）、６３.６(Ｃ−６) 、５８.５、５５.３、５５.２、３８.８、２７.２および１５.４ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩（エイチ・ピー・ベッセル（H．P．Wessel）；ジェイ・カーボヒドロ・ケム（J. C arbohydr．Chem.）、第１１巻（８）、（１９９２年）、１０３９−１０５２頁と比較）。テトラヒドロフラン（２０ｍｌ）中のメチル３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル −３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（３００ｍｇ、０.６８３ミリモル）の撹拌した溶液に、水（１５０ｍｌ）およびトリフェニルホスフィン（０.９０ｇ、３.３ミリモル）を添加した。その溶液を２４時間撹拌し、次いで、５ｍｌに濃縮した。残渣をメタノール（５ｍｌ）および水（１ｍｌ）で希釈した。この溶液の半分を対応するオキサム酸塩の製造に使用した（４８.１８２参照）。次いで、撹拌した残り半分の溶液（０.３４２ミリモル）に、トリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（９９ｍｇ、０.７１９ミリモル）を添加した。ｐＨを、１ＭＮａＯＨ水溶液で８.５に調整した。数分後沈澱が生じ、それをテトラヒドロフラン（０.７ｍｌ）およびメタノール（１ｍｌ）を添加することによって溶解した。反応混合物を０.５時間撹拌し、その後さらにトリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（４５ｍｇ）を添加した。１５分間撹拌し続けた。反応の間、１ＭＮａＯＨ水溶液を添加することにより、ｐＨを８ないし９に維持した。次いで、混合物を水（２ｍｌ）で希釈し、有機溶媒を減圧下エバポレートした。さらに水（５ｍｌ）を添加し、懸濁液を凍結乾燥し、クロマトグラフィーを行って（ＳｉＯ₂、クロロホルム−メタノール−水１００：１５：１−８０：２０：１）、水からの凍結乾燥後に、おそらくはナトリウム塩の形態のスルファミノ化合物が得られた（１６１ｍｇ、８０％）。¹ ＨＮＭＲデータ（ｄｍｓｏ−Ｄ₆）δ：７.２４および６.８７（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８.８ＨZ）、４.６９および４.２４（ＡＢパターン、２Ｈ、Ｊ＝１０.８ＨZ、ＡｒＣＨ ₂）、４.５８（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.２９（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝１１.４および１.７ＨZ、Ｈ−６a）、４.０５−３. ９６（２Ｈ、Ｈ−６bおよびＮＨ）、３.８３−３.７６（ｍ、２Ｈ、Ｈ−２およびＨ−３）、３.７６−３.７３（４Ｈ、ｓおよびｍ、Ｈ−５およびＭｅＯＡｒ）、３.５４−３.４０（３Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ−４）、３.２７（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、および１.１２−１.０２（ｓおよびｔ、１２Ｈ、Ｊ＝７.０ＨZ、Ｃ（ＣＨ₃）₃、およびＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ −α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩（ｂｐｙ＿３７）メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩（１５３ｍｇ、０.２５９ミリモル）を氷酢酸中（８ｍｌ）、０.２３ＭＰａおよび室温で、触媒として５％炭素上パラジウムを使用して、６時間加水素分解した。濾過および凍結乾燥により残渣が得られ、クロマトグラフィー（ＳｉＯ₂、０. １％ＮＨ₃と共に、クロロホルム−メタノール−水８０：２０：１）を行い、標記化合物を得た（７７.２ｍｇ、７４％）。¹ ＨＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、２.３５ｐｐｍでのアセトン参照）δ：４.８３（ＨＤＯ）、４.７８（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.４３（ｄｄ、実質的にカップリング、１Ｈ、Ｊ＝１１.５および１.１ＨZ、Ｈ−６a）、４.３０（ｄｄ、実質的にカップリング、１Ｈ、Ｊ＝１１.５および５.１ＨZ、Ｈ−６b）、３.９５−３.９１（２Ｈ、Ｈ−４およびＨ−５）、３.８９（ｄｄ、１Ｈ、Ｊ＝３.３および１.３ＨZ、Ｈ−２）、３.８０−３.６２（ｍ、３Ｈ、Ｈ−３およびＣＨ ₂ＣＨ₃）、３. ４２（ｓ、３Ｈ、ＣＨ₃Ｏ）、および１.２４−１.２１（ｓおよびｔ、１２Ｈ、Ｊ＝７ＨZ、^tＢｕおよびＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ（¹ＨＮＭＲスペクトラムシグナルの帰属はコジー（ＣＯＳＹ）実験に基づいて行われた）。¹³ ＣＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、３３.１９ｐｐｍでのアセトン参照）δ：１８８.３、１０６.２、８２.２、７３.８、７２.８、７０.６、６９.３、６１.９、５９. ８、４５.６、３７.１、および２１.３ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−ｔブチルオキサミド−α−Ｄ−アルトロピラノシドテトラヒドロフラン（１ｍｌ）中に溶解された塩化オキザリル（１２０μｌ、１.３７ミリモル）を−２６℃に冷却した。テトラヒドロフラン（２ｍｌ）中のｔ−ブタノール（１３１ｍｇ、１.７７ミリモル）およびピリジン（１５４μｌ、１.９１ミリモル）の溶液を滴下し、混合物を−２６℃で１５分間撹拌し、その間に最初に生じた黄色みがかった沈澱は白色になった。減圧下、３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル− ４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（１５０ｍｇ、０ .３４２ミリモル）の還元からのテトラヒドロフラン溶液から溶媒を除去した。残渣をテトラヒドロフラン（２.５ｍｌ）およびピリジン（１５４μｌ）に再溶解し、上記の冷却した溶液に滴下し、−２６℃で１時間撹拌した。水（２ｍｌ）を添加し、混合物をｔ−ブチルメチルエーテル（１５ｍｌ）で希釈し、水、飽和重炭酸ナトリウムおよびブラインで洗浄した。有機溶液を硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒を減圧下除去した。残渣をクロマトグラフィー（ＳｉＯ₂、ｔ−ブチルメチルエーテル−トルエン１：８）し、１８７ｍｇ、１００％の標記化合物を得た。¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：８.２５(ｄ、１Ｈ、１０.１ＨZ、３−ＮＨ) 、７.２６および６.８５（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８. ６ＨZ）、４.８２および４.７１（ｍおよびｄ、２Ｈ、１０.５ＨZ、Ｈ−３およびＡｒＣＨ ₂）、４.６９（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.４２（ｄｄ、１Ｈ、１.７および１１.７ＨZ、Ｈ−６a）、４.３１（ｄ、１Ｈ、１０.５ＨZ、ＡｒＣＨ ₂）、４.１６（ｄｄ、１Ｈ、６.２および１１.７ＨZ、Ｈ−６b）、３.８８（ｄｄｄ、１Ｈ、１.８、５.９および１０.３ＨZ、Ｈ−５）、３.８１−３.７５（ｄｄおよびｓ、４Ｈ、Ｈ−４およびＡｒＯＭｅ）、３.６４−３.４９（ｍ、２Ｈ、ＣＨ ₂ ＣＨ₃）、３.４７−３.４３（ｄｄおよびｓ、４Ｈ、１.３および３.１ＨZ、Ｈ− ２および１−ＯＭｅ）、１.５５（ｓ、９Ｈ、オキザメートＣ（ＣＨ₃）₃）、１. １９および１.１８（ｓおよびｔ、１２Ｈ、７ＨZ、６−Ｏピバロエート、ｔＢｕおよびＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：１７８.１、１５９.４、１５９.１、１５７.４、１３０.３、１２９.４、１１３.８、９８.９、８４.２、７７.２３、７５.９、７０.８、６９.５、６５.８、６５.７、６３.４、５５.２、５５.１、４５.７、３８.８、２７.７、２７.１、１５.３ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−オキサミド− α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩（ｂｐｙ＿５４）メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−３−ｔブチルオキサミド−α−Ｄ−アルトロピラノシド（１８０ｍｇ、３３２マイクロモル）を酢酸−エタノール混合物（１：１、６ｍｌ）中に溶解し、炭素上パラジウム（５％、２５０ｍｇ）を添加し、一晩３９ｐｓｉでの加水素分解に適用した。触媒をセライトパッド上に濾過除去し、エタノールで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、ジクロロメタン（２.４ｍｌ）に再溶解した。トリフルオロ酢酸（９６０μｌ）を添加し、混合物を室温で４.５時間撹拌した。水（３ｍｌ）およびアンモニア（３Ｍ、３００μｌ）を添加し、反応混合物を減圧下濃縮し、凍結乾燥した。残渣をクロマトグラフィー（ＳｉＯ₂、０. １％ＮＨ₃と共に、クロロホルム−メタノール−水８０：２０：１）し、標記化合物１１７.１ｍｇ、８９％を得た。¹ ＨＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、２.３５ｐｐｍでのアセトン参照）δ：４.８０（ＨＤＯ）、４.７８（ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.４５−４.３５（ｍ、２Ｈ、Ｈ−３およびＨ−６a）、４.２６（ｄｄ、１Ｈ、４.４および１２.１ＨZ、Ｈ−６b）、４.０７−３.９６（ｍ、２Ｈ、Ｈ−４およびＨ−５）、３.７７−３.５８（ｍ、３Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ−２）、３.４５（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、１.２０ −１.１３（ｓおよびｔ、１２Ｈ、６−Ｏ−ピバロエート、^tＢｕおよびＣＨ₂ＣＨ ₃ ）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（Ｄ₂Ｏ、３３.１９ｐｐｍでのアセトン参照）δ：１８８.１、１７１.９、１７１.４、１０５.７、８２.４、７３.７、７２.９、７０.３、６９.７、６２.０、５６.１、４５.９、３７.０、２１.２ｐｐｍ。メチル３−アジド−６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ −２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシドピリジン（４９６μｌ）およびジクロロメタン（２ｍｌ）中のメチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ− アルトロピラノシド（４７６ｍｇ、１.３ミリモル）の溶液を０℃で撹拌した。塩化メタンスルホニル（３８０μｌ、４.９０ミリモル）を添加し、温度を室温に上昇させた。５時間撹拌し続け、次いで、混合物を０℃に冷却した。水（１ｍｌ）を添加し、混合物をさらに室温で２０分間撹拌し、エバポレートし、酢酸エチルおよび水に分配した。有機層を水、飽和ＮａＨＣＯ₃水溶液、水、飽和ＮａＣｌ水溶液で順に洗浄し、乾燥し（Ｎａ₂ＳＯ₄）、濾過し、エバポレートした。クロマトグラフィー（ＳｉＯ₂、メチルタート−ブチルエーテル−トルエン１：９）を行って、２１６ｍｇ（７９％）のメシル酸塩を黄色みがかった油状物質として得た。Ｎ−トリイソプロピルシリルピロール−３−カルボン酸（４８４ｍｇ、１.８１ミリモル）および１,８−ジアザシシクロ［５.４.０］ウンデク−７−エン（２５５μｌ）をジメチルホルムアミド（１ｍｌ）中に溶解し、ジメチルホルムアミド（１ｍｌ）中の上記メシル酸塩の溶液に添加した。混合物を９０℃で一晩加熱し、クロマトグラフィー（２１０ｇ、Ｃ−８ローバー、メルク、アセトニトリル−水３：２）に適用し、３０ｍｇ、１６％のピロロイルエステルを得た。¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：８.７３(ｂｒ.ｓ、１Ｈ、ピロール、ＮＨ) 、７.３９（ｓｙｍｍ.ｍ、１Ｈ、ピロールＨ−４）、７.２７および６.８５（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８.８ＨZ）、３.７４（ｓｙｍｍ.ｍ、１Ｈ、ピロール、Ｈ−２）、３.６４（ｓｙｍｍ.ｍ、１Ｈ、ピロールＨ−５）、４.６３−４.４９（ｓおよび２ｄ、３Ｈ、Ｈ−１およびＡｒＣＨ ₂)、４.４８−４.３６（ｍ、２Ｈ、２Ｈ−６）、４.２２（ｓｙｍｍ.ｍ、１Ｈ、Ｈ −５）、３.９４−３.８４(ｍ、２Ｈ、Ｈ−３およびＨ−４）、３.７８（ｓ、３Ｈ、ＡｒＯＭｅ）、３.６８−３.５５（ｍ、３Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃およびＨ−２）、３.４０（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、１.２０（ｔ、３Ｈ、６.８ＨZ、ＣＨ₂ＣＨ ₃ ）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（ＣＤＣｌ₃）δ：１６４.６、１５９.５、１２９.９、１２９.４、１２３.６、１１.７、１１６.１、１１３.９、１０９.９、９９.９、７６.９、７２.５、７２.０、６６.８、６６.３、６３.０、５８.９、５５.３、５５.２、１５.４ｐｐｍ。メチル６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩（ｂｐｙ＿４０）テトラヒドロフラン（１ｍｌ）中の３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−ｐ−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド（３０ｍｇ、６１マイクロモル）の撹拌した溶液に、水（１１μｌ）およびトリフェニルホスフィン（８３ｍｇ、３０５マイクロモル）を添加した。その溶液を２４時間撹拌し、水（１ｍｌ）で希釈した。次いで、トリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（９ｍｇ、０.７２マイクロモル）を添加した。ｐＨを、１ＭＮａＯＨ水溶液で８.５に調整した。数分後沈澱が生じ、それをテトラヒドロフラン（０.７ｍｌ）およびメタノール（１ｍｌ）を添加することによって溶解した。反応混合物を０.５時間撹拌し、その後さらにトリメチルアミンサルファートリオキシド複合体（９ｍｇ）を添加した。１５分間撹拌し続けた。反応の間、１ＭＮａＯＨ水溶液を添加することにより、ｐＨを８ないし９に維持した。次いで、混合物を水（２ｍｌ）で希釈し、ｔ−ブチルメチルエーテルで洗浄し、凍結乾燥し、クロマトグラフィーを行って（ＳｉＯ₂、クロロホルム−メタノール−水８０：２０：１）、水からの凍結乾燥後に、おそらくはナトリウム塩の形態のスルファミノ化合物が得られた（３０.６ｍｇ、９３％）。¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤ₃ＯＤ）δ：７.３５（解析できず、ｄｄ、ＡＢＸパターンのｘ部分、１Ｈ、ＪAX＋ＪBX＝３.５ＨZ、ピロールＨ−２）、７.２９および６.７９（ＡＢパターン、さらにカップリング、４Ｈ、Ｊ＝８.６ＨZ）、６.７５（ｄｄ、１Ｈ、２.０および２.９ＨZ、ピロールＨ−４）、６.５１（ｄｄ、１Ｈ、１.３および２.９ＨZ、ピロールＨ−５）、４.７１および４.４６（ＡＢパターン、２Ｈ、Ｊ＝１１.４ＨZ、ＡｒＣＨ ₂）、４.６６（ｂｓ、１Ｈ、Ｈ− １）、４.３９および４.３３（２ｄｄ、２Ｈ、２.６、５.１および１１.７ＨZ、２Ｈ−６）、４.０４（ｍ、１Ｈ、Ｈ−３）、３.９７−３.８７（ｍおよびｄｄ、２Ｈ、１.１および３.１ＨZ、Ｈ−５およびＨ−２）、３.８０（ｄｄ、１Ｈ、４.４および１０.１ＨZ、Ｈ−４）、３.７３（ｓ、３Ｈ、ＡｒＯＭｅ）、３. ６８−３.５２（ｍ、２Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃）、３.３９（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、１.１５（ｔ、３Ｈ、７.０ＨZ、ＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。¹³ ＣＮＭＲデータ（ＣＤ₃ＯＤ）δ：１６７.３２、１６０.９、１３１.３、１３１.０、１２５.３、１２０.１、１１６.３、１１４.７、１１０.２、１０１. ７、７７.２、１０.４、６９.９、６７.２、６６.４、５５.６、５５.５、５０. ９、および１５.８ｐｐｍ。残渣をメタノール（１５ｍｌ）に溶解し、炭素上パラジウム（５％、５０ｍｇ）を添加し、混合物を３０ｐｓｉで３時間加水素分解した。触媒を濾過除去し、濾液を減圧下濃縮し、メタノール−水（１：１、０.６ｍｌ）中のアンモニア（２％）に再溶解し、クロマトグラフィー（３ｍｌＣ−１８スペルコ（Supelco ）、メタノール−水２：３）を行った。貯留した産物含有画分からメタノールを減圧下除去し、残渣を凍結乾燥し、６.２ｍｇの標記化合物をアンモニウム塩として得た。¹ ＨＮＭＲデータ（ＣＤ₃ＯＤ）δ：７.３５（ｍ、１Ｈ、ピロールＨ−２）、６.７５（ｄｄ、１Ｈ、２.０および２.９ＨZ、ピロールＨ−４）、６.５５（ｄｄ、１Ｈ、１.３および２.９ＨZ、ピロールＨ−５）、４.６７（ｂｒ.ｓ、１Ｈ、Ｈ−１）、４.５５（ｄｄ、１Ｈ、１.３および１１.４ＨZ、Ｈ−６a）、４.３１（ｄｄ、１Ｈ、５.９および１１.６ＨZ、Ｈ−６b）、３.８６−３.７６（ｍ、４Ｈ、Ｈ−２、Ｈ−３、Ｈ−４、Ｈ−５）、３.７５−３.５６（ｍ、２Ｈ、ＣＨ ₂ＣＨ₃）、３.４０（ｓ、３Ｈ、１−ＯＭｅ）、１.２１（ｔ、３Ｈ、ＨZ 、ＣＨ₂ＣＨ ₃）ｐｐｍ。実施例６チャペロンの結合の阻害に関する化合物の試験におけるチャペロンのアッセイおよびその使用強くＰａｐＤに結合するペプチドまたはペプチド模倣物を最終的に同定するために、良好なアッセイが必要である。マルトース結合蛋白（ＭＢＰ）は、ＰａｐＤによって認識されるように発明者らにより加工された。遺伝子の３'末端に融合した配列をコードするリンカーアームを伴ったＭＢＰをコードする市販プラスミドｐＭＡＬ−Ｐ２を用いた。ＭＢＰはペリプラズム空間中に分泌され、アミロース樹脂を用いたアフィニティークロマトグラフィーにより容易に精製される。ＭＢＰは、２０ｍＭマルトースでカラムから溶出される。ＭＢＰと同時に発現された場合、ＰａｐＤはＭＢＰと同時に溶出されないが、ＭＢＰにＰａｐＧのＣＯＯＨ末端を融合させた場合には、ＭＢＰに結合したＰａｐＤを生じ、アフィニティーカラムから同時に溶出される複合体を形成する。この方法を用いて、ＰａｐＧのカルボキシ末端の１４０個（ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'）および１３４個（ＭＢＰ−Ｇ１３４'）のアミノ酸をＭＢＰに融合させると、マルトースアフィニティークロマトグラフィーにより精製される強力なＰａｐＤ−ＭＢＰ複合体の形成を引き起こすことが見いだされた。ＭＢＰ融合物とＰａｐＤとの間の複合体は、ＰａｐＤ−ＰａｐＧ複合体の安定性と同様、３Ｍまでの尿素中で安定であることが示され、このことは、ＰａｐＧのＣＯＯＨ末端１３４個のアミノ酸が、おそらくチャペロン認識モチーフの大部分を含むことを示すものである。さらに、これら２つの残基の変異によりＭＢＰ融合蛋白へのＰａｐＤの結合が消失したので、ＭＢＰ融合蛋白への結合は、本明細書記載のごとく、普遍的なチャペロンアンカリング残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２に依存することが証明された。Ｐ繊毛産生細胞中に融合蛋白を同時に発現させることによりＭＢＰ−Ｇ融合物が繊毛の集合およびそのことによる細菌の付着を阻害する能力を試験することも興味深い。ＰａｐＤがＭＢＰ−Ｇ融合物に結合する場合、それは繊毛サブユニットとは別に滴定され、よって繊毛形成を減少または消失するであろう。この方法は、表面に局在する付着素の集合を妨げることによりチャペロン結合ペプチドが病原毒性を消失しうるという考えを正当なものにするための１つの機構であろう。この分析を用いて、Ｐ−繊毛産生株において、ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'およびＭＢＰ−Ｇ１３４'融合物の同時発現は、細菌の赤血球細胞への結合および凝血を引き起こす能力を完全に失わせることが見いだされた。さらに、ＨＢ１０１／ｐＰＡＰ５−細菌中でＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'融合物の同時発現後、電子顕微鏡によって細菌表面上の繊毛と見られるものを検出することは不可能であったことが、最近本発明者らにより示された。このことは、繊毛サブユニットと分子チャペロンとの間の結合の防止／阻害もまたインタクトな繊毛の集合を妨げるという本発明により示された理論に関する証拠である。これらの結果は、図３に示す結晶構造の生物学的妥当性を支持するものであり、カルボキシ末端認識部位を当該蛋白に融合させることによって他の蛋白をＰａｐＤにより認識させるように加工することができることを示している。ＭＢＰ− Ｇ１３４'およびＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'融合物を精製して、ＰａｐＤとの相互作用を測定するためのインビトロアッセイを確立した。精製融合蛋白をマイクロタイタープレートのウェル上に被覆し、ＰａｐＤが融合蛋白に結合する能力をＥＬＩＳＡ法により試験する。このアッセイは、チャペロンにより認識されるＰａｐＧ上のドメインへのＰａｐＤの結合を阻害する化合物の能力を試験することを可能にするので、重要である。さらに、精製融合蛋白をファルマシア・バイオコア^R（Pharmacia BioCore^R）アッセイにおいて用いてＰａｐＤへの結合を定量することができ、本発明化合物に関する阻害アッセイを確立する。カルボキシ末端ペプチドはすでに、チャペロン認識モチーフの一部に対応することが示唆されている。よって、カルボキシ末端ペプチドがＥＬＩＳＡアッセイにおいてＭＢＰ− Ｇ１'−１４０'融合物へのＰａｐＤの結合を阻害できるかどうかを調べることができる。この高スループット（through-put）アッセイの開発は、ペプチドライブラリー、化学合成物質ライブラリー、天然化合物、およびペプチド模倣物をそれらのチャペロン結合阻害能に関してスクリーニングすることを可能にする。さらに、このアッセイを用いて、既知ペリプラズムチャペロンが共通の認識型を用いるのかどうかを試験することができる。化合物のＭＢＰ−Ｇ融合物への結合を阻害する能力について試験することに加えて、ＰａｐＤ−ペプチド相互作用を測定する他のアッセイを確立した。例えば、マイクロタイタープレートのウェル上に被覆されたペプチドへのＰａｐＤの結合を測定するためにＥＬＩＳＡを開発した。このアッセイにおいて、８量体ペプチドＧ１'−８'ＷＴは、１９量体のＧ１ '−１９'ＷＴと同等の有効な阻害剤であり、該８量体はＰａｐＤの結合部位に対するアフィニティが増大した修飾化合物を設計するための最適な出発点であることが明かとなった（実施例７参照）。また、上記のごとく、ネイティブなＰａｐＤは、還元され変性したＰａｐＧに結合でき、再構成アッセイ（キューン（Kuehn）ら、１９９１年）においてインビトロでＰａｐＤ−ＰａｐＧ複合体を回復させることができる。このアッセイはインビボでのＰａｐＤの認識機能を反映すると提案されており、インビトロにおいて化合物がＰａｐＤのＰａｐＧへの結合を阻害する能力を決定するために用いられるであろう。例えば、カルボキシル末端ＰａｐＧペプチドは、このアッセィにおいてＰａｐＧへのＰａｐＤの結合を阻害することが示されており、それがＰａｐＤの繊毛サブユニット結合部位を占領することを確認する。ＰａｐＤ−ペプチド相互作用を調べるもう１つの方法は、よく知られている蛋白の開裂が起こる速度を減少させる化合物の能力を試験することである。例えば、トリプシンでの部分消化はＰａｐＤを残基Ｌｙｓ−９９において開裂してＰ１−Ｇ１ループとする（図３に示す「Ｔ」部位参照）。ＰａｐＤのトリプシン開裂速度はＰａｐＧおよびＰａｐＫペプチドと共にＰａｐＤをプレインキュベートすることによって低下させられた（実施例２と比較）。観察された結合ペプチドによるＰａｐＤの保護は、Ｆ１−Ｇ１ループの局部的コンフォーメーションの変化、あるいは該ペプチドによるループの物理的接触によるのかもしれない。よって、新たな化合物がＰａｐＤに結合し、その認識機能を妨害する能力に関する最初のスクリーニングとしてこれらのアッセイを用いてもよい。ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'融合物へのＰａｐＤの結合を阻害する強力な結合化合物は、ＰａｐＤと同時結晶化されて、ＰａｐＤにより用いられる認識表面の構造的基礎を提供するであろう。新しい結晶グラフィックのデータが利用できるようになると、チャペロンの繊毛サブユニットへの結合能および繊毛の集合を媒介する能力に対する部位特異的突然変異の影響を調べることにより、重大なＰａｐＤ−阻害剤またはＰａｐＤ−エンハンサーの相互作用の関連性が試験されるであろう。この重要な情報は、いかにしてチャペロンがサブユニットおよびチャペロン−サブユニット相互作用を認識するのかを決定することを可能にするであろう。定量的なチャペロン結合アッセイも開発した。Ｓｅｒ−９'がＣｙｓにより置換されている修飾ＰａｐＧペプチドを合成した。ペプチドに結合したＰａｐＤの結晶構造から、Ｓｅｒ−９'の側鎖はＰａｐＤと相互作用しないことが予想された。その代わりに、この側鎖は溶媒に向けられていたが、Ｓｅｒ−９'はＰａｐＤとペプチドととの間の相互作用ジッパーの最後のアミノ酸に隣接していた。次いで、環境的に感受性のある蛍光プローブ５−ＩＡＦ（５−ヨードアセトアミドフルオレセイン）を、Ｃｙｓ残基上のスルフヒドリル基を介してペプチドに共有結合させ、標識されたペプチドを精製した。もちろん、他のいかなる適切な環境的に感受性のある蛍光プローブを使用してもよい。ＰａｐＤをペプチドに添加することは、蛍光強度の著しい減少およびエミッション極大の変化を引き起こすことがわかった。この情報を用いて、ＰａｐＤ−ペプチド相互作用に関する結合定数を計算した。濃度を上昇させながらＰａｐＤを添加した後の５１４ｎｍにおける蛍光強度の変化を測定した。ＰａｐＤ濃度に対して蛍光強度をプロットすることにより、２.５ｘ１０^-6Ｍという結合定数が計算された（市販コンピュータープログラム「カレイダグラフ（Kaleidagraph）」により計算を行った）。よって、競合的にＰａｐＤに結合する物質の添加が競合物質が系においてより少ないかまたは存在しない状況と比較して蛍光の増加を引き起こすので、定量的様式でＰａｐＤに結合する他の物質の結合定数を評価することが可能である。ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'をここに記載のＰａｐＧペプチドの代わりに用いて、類似のアッセイ系が開発されよう。この融合蛋白はＰａｐＤにおける２つの結合部位と相互作用することがわかったので、１）第二の結合部位（ドメイン２上にある）に対する結合アフィニティーを定量すること、および、２）当該２つの結合部位のいずれかと相互作用する化合物をスクリーニングし、その相互作用を定量することが可能であろう。もちろん、適当な環境的感受性のあるプローブを用いて部位２ペプチドを標識することにより、上記と同じ方法論を用いて結合定数を決定することが可能になるであろう。ＤｅｇＰプロテアーゼがチャペロン非存在下において繊毛サブユニットの分解に大いに関与しているという発見は、ｄｅｇＰ４１株を、本発明化合物によってＰａｐＤに及ぼされる影響のインビボ試験系についての興味ある候補にする。ＤｅｇＰ^-細菌は蓄積している繊毛サブユニットを分解することができないのでチャペロンと繊毛サブユニットの間の結合を防止、阻害または促進する物質をｄｅｇＰ４１株を含む系に投与する場合、該物質は、少量でさえも細菌に対して毒性があるはずである。ｄｅｇＰ４１株を用いてＰａｐＤのドメイン２上の今まで未知の結合部位を同定したことに留意すること、実施例１０参照。しかしながらかかるアッセイは、試験される物質がその効果を発揮する前にペリプラズム空間に入ることができることを要求する。チャペロン−サブユニット相互作用に対する所望の効果を有するが、例えば、親水的すぎてペリプラズム空間に入ることのできない物質を、このタイプのアッセイは「無視」するであろうから、この事実は、このタイプのアッセイを先導化合物に関するスクリーニングアッセイとしてはあまり適当でないものにする。他方、当該系は、本明細書記載のインビトロアッセイにおいてうまく作用することがすでにわかっている物質の臨床的潜在能力を評価するためにうまく適するであろう。モデルＰａｐＤ系を設定すれば、上記実験をもちろんＰａｐＤ様ファミリーのチャペロンの他のメンバーを包含するように拡張することができる。このようにして、チャペロン認識およびグラム陰性細菌におけるチャペロン認識型の分子的根拠についての一般的要求事項を確立することが可能となるであろう。分子チャペロンとの相互作用の決定のためのいくつかの特別なアッセイを、実施例１０において詳細に記載する。実施例７ＰａｐＤおよび他の繊毛集合チャペロンの結合部位に結合し得るペプチドおよびペプチド模倣物の設計チャペロン−サブユニット相互作用についてさらに情報を得るために、全ＰａｐＧ蛋白および他の繊毛サブユニットと重複するペプチドを合成することが考えられる。さらに、化学ペプチドライブラリーおよびファージディスプレイライブラリーの両方を用いて入手可能なチャペロンに結合するペプチドのプローブ化を行うべきである。ペプチドはチャペロンへの結合に重大に影響し得る別々の環境に存在するので、２つの該ライブラリーは相捕的なものである。実際には、天然アミノ酸のいくつかが除外される場合、あるいは１個または２個の残基が不変のままである場合には、化学ライブラリーはすべての可能なヘキサペプチドおよびヘプタペプチドおよびオクタペプチドに限られる。チャペロンの樹脂ビーズへの直接結合、および、対象とするペプチドの配列決定により、このライブラリーを評価することができる。ファージディスプレイライブラリーは、ファージ機能を保持しており、かつ表面上に外来ペプチドを現している、いわゆる「融合ファージ」のＰＩＩＩ蛋白中に約１０¹⁰個のペプチドを含んでいる。ペプチド含有ファージがマイクロタイタープレートのウェル中に被覆されたＰａｐＤに結合する能力を、実施例６記載の方法を用いるＥＬＩＳＡにおいて検出することができる。結合に関して陽性のファージを増幅し、精製し、次いで、ＰａｐＤに結合する能力について再試験するであろう。結合に関して陽性のファージのペプチド挿入物の配列を決定し、対応するペプチドを合成し、次いで、実施例６に記載のごとく、ＰａｐＤのＭＢＰ−Ｇ融合物への結合を阻害するそれらの能力について試験するであろう。上に概説した研究の結果は、「チャペロン阻害剤」として作用するリガンドの設計および評価にとりもっとも重要であるだろう。これにも関わらず、ＰａｐＤ −ＰａｐＧ１９量体ペプチド複合体の結晶構造は、現段階においてすでにチャペロン阻害剤としての小型ペプチドおよびペプチド模倣物に関する系統的名研究を開始するためのチャペロン−リガンド相互作用に十分な洞察を与える。ＰａｐＤに対するＰａｐＧ８量体ペプチド（ＰａｐＧ１９量体ペプチドと同等、実施例６と比較）の高い阻害能は、かかる研究の可能性を明らかにし、チャペロンに関して提案された結合部位の保存的特徴は、かかる阻害剤が十分に広い特異性を有し得ることを示す。ＰａｐＤによるＰａｐＧ１９量体の認識における特異性は、ペプチドのカルボキシル末端のＰａｐＤの裂け目の残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２への固定、および、ペプチド中の別の疎水性残基とＰａｐＤ中の相補的な疎水性残基との間の引き続いての「ジッパー」相互作用により提供されることが示唆された。以下の実験はこの仮説を支持する。まず、固定残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２における突然変異により、インビボにおけるサブユニット結合が失われた。第二に、欠失ペプチドのＣ末端がＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２に固定された場合に、ペプチドとＰａｐＤとの間の疎水的な「ジッパー」相互作用が記録されないため、ＰａｐＧ１９量体におけるＣ末端残基の欠失は、ＰａｐＤへの結合の実質的な減少を引き起こす。ＰａｐＤとペプチド（または繊毛サブユニット）との間の結合における特異性に関する「ジッパー」仮説は、以下の実験を行うことにより予備的に調べられた。Ｇ１'−５'、Ｇ１'−６'、Ｇ１'−７'、Ｇ１'−８'、Ｇ１'−１１'、Ｇ１'− １６'およびＧ１'−１９'からなるＰａｐＧのＣ末端由来の一連の長さのペプチドを調製した。Ｇ１'−８'について置換シリーズおよび欠失シリーズも合成した。置換シリーズにおいて、Ｐｒｏ−１'、Ｐｈｅ−２'、Ｌｅｕ−４'、Ｖａｌ− ５'、Ｍｅｔ−６'およびＭｅｔ−８'をＳｅｒにより置換し、Ｓｅｒ−３'およびＴｈｒ−７'をＡｌａにより置換した（即ち、疎水性アミノ酸を極性のあるＳｅｒにより置換し、親水性アミノ酸をＡｌａにより置換した）。欠失シリーズにおいては、Ｇ１'−８'中の１個の残基を欠失させ、８個のアミノ酸のペプチド長を維持するため、同時にネイティブＰａｐＧの位置９'において見いだされるセリンを付加した。ペプチドはすべてＦｍｏｃ固相法により合成し、逆相ＨＰＬＣにより精製した。次いで、ペプチドがＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'融合蛋白へのＰａｐＤの結合を阻害する能力を、以下のＥＬＩＳＡ試験を用いて調べた。ＰＢＳ中のＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'蛋白の貯留溶液をＰＢＳで０.１μＭにまで希釈した。マイクロタイタープレートのウェルを５０μｌの該蛋白溶液で４℃ で一晩被覆した。ウェルをＰＢＳで洗浄し、２００μｌのＰＢＳ中の３％ウシ・血清アルブミン（ＢＳＡ）で２５℃で２時間ブロッキングした。プレートをＰＢＳで３回激しく洗浄し、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ中１−５μＭＰａｐＤ蛋白５０μｌと共に２５℃で４５分間インキュベーションした。ＰａｐＤを各ペプチドと共に（１：２５の割合）３０分間プレインキュベーションし、次いで、ウェルに添加した。ＰＢＳで３回洗浄した後、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ中のウサギ・抗ＰａｐＤ抗血清の１：５００希釈物と共にウェルを２５℃で４５分間インキュベーションした。ＰＢＳで３回洗浄した後、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ中のアルカリホスファターゼに結合したウサギ・ＩｇＧに対するヤギ・抗血清の１：１０００希釈物と共にウェルを２５℃で４５分間インキュベーションした。ＰＢＳで３回、さらに発色用緩衝液（１０ｍＭジエタノールアミン、０.５ｍＭＭｇＣｌ₂）で３回洗浄した後、濾過した発色用緩衝液中の１ｍｇ／ｍｌｐ−ニトロフェニルホスフェート５０ μｌを添加し、反応物を、もし必要ならば暗所において、２５℃で１時間またはそれ以上インキュベーションし、次いで、４０５ｎｍにおける吸光度を読んだ。該３シリーズのペブチドの阻害力を図１７−１９に示し、各シリーズに関して行った実験の数を図中に示す。図中の各ペプチドに関する縦線は実験データの統計学的分析後に得られた９５％信頼度の間隔である。長さのシリーズの評価により明らかなように、ペプチドＧ１'−８'、Ｇ１'−１１'およびＧ１'−１６'は、より短いＧ１'−６'およびＧ１'−７'よりも有意に有効である（図１７）。この観察結果は、Ｇ１'−１９'と複合体を形成したＰａｐＤの結晶構造と非常によく適合し、Ｇ１'−１９'中のＣ末端の８つの残基がＰａｐＤに水素結合していることを示す。より短いペプチドＧ１'−６'およびＧ１'−７'はこの水素結合パターンを実現できず、それ故より阻害活性の低いペプチドである（図１８）。置換シリーズはそれらの置換により阻害能力のより低いペプチドになるため、Ｇ１'− ８'における残基４'、５'および６'はＰａｐＤと重要な接触を形成することを明らかにしている（図１８）。欠失シリーズも、ＰａｐＤとの複合体形成についてＧ１'−８'における残基４'、５'および６'の重要な役割を示した（図１９）。しかしながら、欠失シリーズに関して得られた結果は、欠失がＧ１'−８'のＣ末端からＮ末端へと移行するにつれ、欠失シリーズのメンバーが阻害能の増加を示すという「ジッパー」仮説を支持しなかった。これらの予備的な結果から明らかなように、アッセイにおいて得られた結果は、各実験において平均からの大きな偏差を示す。ここで議論したように、このことに対する１つの理由は、ＰａｐＤと正しくフォールディングした繊毛サブユニットおよびかかるただしくフォールディングしたサブユニット蛋白のアナログとの間の結合の遅い動力学であるといえよう。それゆえ、少なくとも部分的に繊毛サブユニット（アナログ）を変性させるために十分強力な変性効果を導入することによりアッセイを修飾することが考えられる。このことにより、アッセイ結果における誤差が減るであろうと考えられる。大きな誤差に対するもう１つの理由は、ＥＬＩＳＡにおいて用いたＢＳＡに対するペプチドの結合であるといえよう。それ故、ＢＳＡを他の高分子に置き換えることが検討されるであろう。ＰａｐＤへのペプチドの結合に関する「ジッパー機構」が確認できる場合、ＰａｐＧ８量体のＰｒｏ−１'、Ｐｈｅ−２７、Ｌｅｕ−４'、Ｍｅｔ−６'、およびＭｅｔ−８'が疎水性アミノ酸Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｍｅｔ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、ＴｙｒおよびＨｉｓにより置換されている限定的合成ペプチドライブラリーを用いて、ペプチドチャペロン結合を最適化することができる。Ｄアミノ酸およびＮ−メチル化アミノ酸のごとき非天然アミノ酸ならびに脂肪族および種々の芳香族鎖を含むアミノ酸も化学ライブラリーに含まれるであろう。これら５つの位置に関して最適なアミノ酸の組み合わせは、この実施例において以下に記載するチャペロン阻害剤の合成に用いられよう。「ジッパー機構」が確認されない場合、概説した方法は、ＰａｐＤへの結合にとり重要であることが示されている残基に適用されるであろう。チャペロンの活性部位中にドッキングした後に、チャペロンと共有結合を形成するチャペロン阻害剤が開発されるであろう。ＰａｐＤ−ペプチド複合体の結晶構造は、ペプチドのＣ末端カルボキシル基がチャペロンのＬｙｓ−１１２およびＡｒｇ−８に水素結合しており、ペプチドのＶａｌ−５'の側鎖はＰａｐＤのもう一つのＬｙｓの側鎖アミノ基に近接していることを示す。最適化された８量体ペプチドのこれらの位置へのハロゲン化アルキル、アルデヒド、酸ハライドおよび活性エステルのごとき反応性基の導入は、ＰａｐＤのリジンへの共有結合の形成を引き起こし、このようにしてペプチド誘導体は高アフィニティー阻害剤を構成する。阻害剤は、残基５（Ｃ末端から数えて）および／またはＣ末端カルボキシル基が以下に示すように修飾されている９量体またはそれより短いペプチドを基礎とする。アルデヒドとリジン側鎖との間のかかる相互作用は、鎌状赤血球貧血に対する有力な薬剤候補を与えた。ＰａｐＤ−ペプチド結晶において、ペプチドはチャペロンにおけるβシートの伸長を形成する。それゆえ、ペプチドにβシート様コンフォメーションを与える制限は好ましい結合エントロピー変化を生じるであろう。環状βシートのミニチュアを構成しているコンフォメーション的に制限されたペプチドまたは互いに共有結合した１つのアミノ酸により分割されるアミノ酸側鎖を有するペプチドは、最適化された８量体ペプチドに基づいて調製されるであろう。共有結合した側鎖を有するペプチドは、以下に示すフラグメントにより置換された３つの連続的なアミノ酸を有するであろう。興味深い阻害剤は、チャペロンと共に同時結晶化され、その複合体はさらにＮＭＲスペクトル法により分析されるてあろう。薬剤として使用されるペプチドおよびペプチド模倣物は、ペプチド結合を化入れるする蛋白分解酵素によって迅速に代謝され得る。キモトリプシンは芳香族および大型の疎水性側鎖を伴うアミノ酸のカルボキシル側のペプチド結合を選択的に開裂する。それゆえ、ＰａｐＧ８量体において、Ｍｅｔ−８'−Ｔｈｒ−７'、Ｍｅｔ−６'−Ｖａｌ−５'およびＰｈｅ−２'−Ｐｒｏ−１'のアミド結合は蛋白分解に対して特に感受性があり、代謝的に安定なペプチド同等物によって置換されるべきである。かかるペプチド同等物の例を以下に示す。実施例８ペリプラスミックチャペロンの繊毛により付着する細菌の感染力における役割チャペロンを補助する繊毛集合の毒力における特異的役割は、繊毛化された野生型と、チャペロンの活性部位における部位一定方向性変異によって繊毛化されていない同質遺伝子変異体との付着性および病原性を比較することにより測定することができる。ＰａｐＤのサブユニット結合部位を構成するＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２のような残基の変異は、点突然変異を同じ菌株の染色体のＰａｐＧ遺伝子に導入することに成功したと同じ方法を用いて臨床的単離体の菌株ＤＳ１７の細菌染色体に組み換えることができる。イー・コリの菌株ＤＳ１７は、新生児病棟内で伝染的に蔓延し、数種のケースの腎盂腎炎を誘起する。加えて、該菌株は、カニクイザルの腎盂腎炎モデルにて急性腎感染症を誘起することが判明した。ＤＳ１７は典型的なＰａｐＧ付着素を発現するＰａｐＧ遺伝子との一のＰａｐ遺伝子群を含有する。それはまた、マンノース結合付着素、ＦｉｍＨを含有する典型的な１型繊毛を発現する。１型繊毛は膀胱炎における重要な毒力決定因子であると示唆されている。したがって、さらにＦｉｍＣチャペロンのサブユニット結合部位における部位一定方向性変異体を産生し、この考えを試験すべきである。チャペロン活性部位と結合する化合物は繊毛集合を遮断し、かくして付着を防止すると考えられる。この考えが正当であるならば、Ａｒｇ−８およびＬｙｓ− １１２にあるような十分に限定されたチャペロン変異体もまた、レセプター結合を破壊するであろう。種々のチャペロン変異体のレセプター結合活性が、実施例２および６に記載のレセプター結合ＥＬＩＳＡ検定にて測定された。１型繊毛介在結合を測定するために、マンノースをマイクロタイタープレートのウェルに結合させる。種々のＦｉｍＣおよびＰａｐＤチャペロン変異体の固定化レセプターへの付着は、ＥＬＩＳＡ実験にてイー・コリＤＳ１７に対する抗体を用いて定量される。さらには、スモールＰａｐＤ結合ペプチドのＤＳ１７における繊毛集合を遮断する、すなわち、レセプター結合を破壊する能力を試験する。菌株ＤＳ１７をショートＰａｐＤ結合または非結合ペプチドの存在下で増殖させ、ついでＥＬＩＳＡ実験にてレセプターに結合するその能力について試験する。これらの実験は抗チャペロン阻害剤がin vitroにて細菌付着を防止する考えの正当性を確認する上で重要な進歩を遂げるであろう。それから、発病におけるチャペロン−集合付着素の役割が確立されるであろう。Ｐ繊毛を発現するイー・コリと腎盂腎炎の間の因果関係は、最近まで、単に疫学的データに基づいているにすぎなかった。Ｐ繊毛形成の菌株ＤＳ１７が腎盂腎炎をカニクイザルの正常な尿路にて生じさせることがわかっている。菌株ＤＳ１７のＰａｐＧ遺伝子の変異を対立遺伝子を置換することにより生じさせ、発病におけるＰａｐＧ付着素の要件を試験するのに誘導菌株ＤＳ１７−８を形成させた。ＤＳ１７−８は、ＰａｐＧ先端付着素を欠くＰ−繊毛の発現をもたらすＰａｐＧのコドン３７の後に１個の塩基対欠失を有する。この変異体はin vitroにてグロボシド受容体に結合できず、in situにおける付着モデルのヒトまたはカニクイザル由来の腎細胞に結合できなかった。カニクイザルにおけるＤＳ１７とそのＰａｐＧ変異株ＤＳ１７−８の間の毒力を比較した。腎盂腎炎におけるＰａｐＧ付着素の役割を研究するために、５匹のサルをイー・コリ菌株ＤＳ１７で感染させたのに対して、細胞観察挿入尿管カテーテルを介して６匹のサルに変異株ＤＳ１７−８を投与し、その２群の間に有意な違いがあることを明らかにした。変異株ＤＳ１７−８を受けたサルでは細菌尿が平均６.８日あったのに対して、野生型株ＤＳ１７のサルでは２１日であった。野生型菌株では腎臓クリアランスもまた著しく低く、同質遺伝子ＰａｐＧ変異株を受容したサルではなく、野生型菌株を受けたサルにて腎機能が有意に低下した。感染した腎臓の病理評価は、野生型を受けた群との比較にて変異群における炎症作用の有意な減少および病理変化を示す機能実験を確認した。かくして、霊長類の正常な尿管にて腎盂腎炎を生じさせるのに、Ｐ繊毛の先端でＧａｌα１−４Ｇａｌ結合する付着素が必要であると結論付けられる。今まで、特異的細菌感染における繊毛に結合した付着素の役割についてこのような直接的証明はなされていない。興味深いことに、前記した実験にて、底部尿管でのコロニー形成について、または急性膀胱炎の発病についてＰａｐＧ付着素が必要であるという証拠は認められなかった。両方の菌株はワギナにてコロニーを形成し、腸にて生存し、膀胱感染を誘起する。かくして、ＰａｐＧは腎盂腎炎を誘起する臨界的毒性決定因子であるが、膀胱炎にて重要であるか明らかではない。しかし、このことは、Ｐ繊毛のまたは１型のようなもう一つ別の型の繊毛の他の成分が膀胱炎の要件であるという可能性を排除するものではない。これらの仮説は、ＰａｐＤまたはＦｉｍＣのＡｒｇ−８の部位定方向性変異体を含有する同質遺伝子ＤＳ１７変異株の毒性を試験することにより研究されるであろう。変異株は、おそらく、Ｐ繊毛と１型繊毛の集合能に欠陥があるであろう。ＰａｐＤ変異株がサル膀胱炎モデルにて非毒性であるならば、それは、イー・コリが膀胱感染を生じさせるのに、ＰａｐＧ以外のＰ繊毛のある成分が要件であることを示唆するかもしれない。例えば、先端フィブリルラム、ＰａｐＥの主成分は、フィブロネクチンに結合することがわかっており、フィブロネクチンは膀胱炎における重要因子とすることができる。同様に、ＦｉｍＣ変異株が非毒性であるならば、それは膀胱炎の誘起におけるマンノース結合１型繊毛の役割を確認することとなる。これらの点変異の腎盂腎炎または膀胱炎のいずれかの誘起におけるＤＳ１７の毒力の破壊能は、チャペロン阻害剤についてのその治療的可能性を確認するであろう。実施例９ＰａｐＤとＫ１'−１９'ＷＴの間の結合のモチーフの同定ＰａｐＤ−Ｇ１'−１９'ＷＴ結晶構造にて観察されるような（実施例１参照）ピリンサブユニットのＣ−末端ペプチドのＰａｐＤに対する結合モードの普遍性を確認するために、第２のＰａｐＤ−ペプチド複合体をＸ−線結晶学により研究した。堅固な結合がＰａｐＫの野生型Ｃ−末端１９アミノ酸から誘導されるペプチド（Ｋ１'−１９'ＷＴ、配列番号：１８および本明細書にてＣ−末端Ａｒｇ− １'からＮ−末端Ｌｙｓ−１９'まで番号を付す）について観察されるため、第２のＰａｐＤ複合体ではこれをペプチドとして用いていると決定された。入手する物質；蛋白質＆ペプチドＰａｐＤを前記（Holmgrenら、１９８８）したように調製し、米国、セントルイス、ワシントン医科大学、分子微生物学科、スコット・ハルツレン（Scott Hu ltgren）博士より得た。ペプチドＫ１'−１９'ＷＴをＦｍｏｃ固相合成法により調製し、逆相ＨＰＬＣにより精製し、スウェーデン国、ランド、ランド大学、化学科、ジャン・キルバーグ（Jan Kihlberg）博士より入手した。ＰａｐＤ−ペプチド複合体の結晶化多数の異なる実験条件を以前にＰａｐＤ−Ｇ１'−１９'ＷＴ結晶を得るのに用いた実験条件について検討した後、ＰａｐＤ−Ｋ１'−１９'ＷＴ複合体の最良の結晶を、２０％ＰＥＧ８０００、０.１ＭＭＥＳ（pＨ６.５）に対する蒸気拡散法により成長させた。結晶化ドロップは等量のレザバーおよび蛋白質溶液を含有した。該蛋白質溶液（１５ｍｇ／ｍｌ）は、１.０％β−オクチルグルコシド（ β−ＯＧ）を含む２０ｍＭＭＥＳ（pＨ６.５）中にＰａｐＤをペプチドに対して１：１のモル比で含有した。これらの結晶を密封したクオーツガラスキャピラリー管の内部に固定し、最初、Ｘ−線プレセッションカメラで試験することにより特徴付けた。かかる映像を標準分析に付し、前記した結晶が、単位次元、ａ＝５７.１Å、ｂ＝１５３.２Å 、ｃ＝１３５.４Åおよびα＝β＝γ＝９０°、非対称単位中に２分子を有する斜方晶系空間群、Ｃ２２２１（すなわち、Ｃ２であるＰａｐＤ−Ｇ１'−１９'ＷＴ結晶と異なる）を有し、および回転対陰極およびＣu Ｋ_α標的を有するＬａｂＸ−線源上、２.７Å分解に回折することが証明された。実験データの収集＆処理ＰａｐＤ−Ｋ−ペプチド結晶に関する強度データを、アップサラ、シンビコム（Symbicom）ＡＢの、Ｒ−ＡＸＩＳＨ領域−検出器システム（Ｒ−ＡＸＩＳ由来）にて収集した。すべてのデータを単結晶より入手し、最初、ＤＥＮＳＯソフトウェアパッケージ（Otwinsky，１９９３）で処理した。しかしながら、該データのマージングおよびスケーリングは、ＣＣＰ４パッケージ（ＣＣＰ４、１９７９）からのＲＯＴＡＶＡＴＡおよびＡＧＲＯＶＡＴＡを用いて行った。最終データは２０.０と２.７Å分解の間のデータについて８.７％のＲｓｙｍを有する１５, ９８９独立性反射作用を有した。３次元構造の構造決定複合体の構造を、プログラムＸＰＬＯＲを用いる標準分子置換法により解決した（Brunger，１９９２）。実験モデルとして、精製した２.０Å分解構造のＰａｐＤを用いた（HolmgrenおよびBranden，１９８９）。８.０〜４.０Å分解データを用いると、自己回転機能は再び明確な非結晶学二回軸を付与した。トランスレーション機能における最大ピークもまた正確な解答を付与した。トランスレーション機能に付した後、Ｒ−ファクターは８.０〜４.０Åの分解データでは３６.７％であった。その後、固定体を精製し、そのすべてにおいて非対称単位の２ＰａｐＤ分子の４ドメインを独立して精製し、同一データで３３.６％のＲ −ファクターを得た。この段階でのグラフィックプログラムＯ（JonesおよびKjeldgaard，１９９４）を用いる｜Ｆo｜−｜Ｆc｜電子密度マップの試験は、ＰａｐＤクレフトにおけるＫ−ペプチドに対応し、Ｇ−蛋白質にて見られる型に類似の型にて蛋白質の表面に沿って広がる明瞭な密集状態を明らかにした。ペプチドの方向性は、電子密度より容易に測定されるが、最初、該ペプチドの最後の１２Ｃ−末端アミノ酸だけを密度にてモデル化できるにすぎなかった。精製および構造分析ＸＰＬＯＲを用いるシミュレートしたアニール精製（Brunger，１９９２）をこの段階で開始した。さらにモデル構築および精製の数回のサイクルを、ペプチドのＮ末端に加えられたさらに２個のペプチドのアミノ酸で実施し、８.０〜２. ７Å分解データでの１９.２％のモデルに対するＲ−ファクターを得た。この段階の精製のモデル（水分子を有さず、該ペプチドの最初の５個のＮ−末端アミノ酸を有しない）は、結合長について０.０１９および結合角について３.８°の理想ジオメトリーに由来の根平均自乗（ｒｍｓ）偏差を有する。２種のＰａｐＤ−ペプチド複合体が異なる空間群にて説明されているにもかかわらず、その全体の構造は、ＰａｐＤ−Ｇ１'−１９ＷＴ構造について前記した形式と実質的に同じ形式にてＰａｐＤと相互作用するペプチドと非常に類似することが判明した。かくして、Ｋ１'−１９ＷＴペプチドは、再び、ドメイン間クレフトおよびサブユニット結合部位の範囲内にアンカーされたＣ−末端Ａｒｇ− １'と伸長したコンホメーションにて結合することが明らかにされた。また、水素結合がペプチドのカルボキシ末端とＰａｐＤの２つの不変正電荷残基、Ａｒｇ −８およびＬｙｓ−１１２の間に形成される。ついで、Ｋ１'−１９ＷＴペプチドがＮ−末端ドメインの表面に沿って広がり、鎖Ｇ１と平行なβ−鎖相互作用を形成する。このように、９主鎖の間にて、ペプチドの１０'〜２'残基とＰａｐＤのＶａｌ−１０２〜Ｌｙｓ−１１０の間に水素結合が形成され、かくしてＰａｐＤのβ−シートよりペプチドに伸長する。加えて、二量体結合がＰａｐＤ−Ｇ１'−１９ＷＴ結晶構造に見られる単位格子に類似する格子内の２種のＰａｐＤ−ペプチド複合体の間で観察される。第２のＰａｐＤ−ペプチド複合体を第１の複合体に隣接して配置する非結晶学上の２回回転対称の結果として、β−シートが伸長され、その結果、２つの結合ペプチド鎖が、抗−平行β−鎖として、再び合計１０のβ−鎖からなる２つの複合体の間に形成される混合β−シートと相互作用する。２つのＰａｐＤ−ペプチド複合体の間の主たる違いは、単に、ＰａｐＤ−Ｋ１'−１９ＷＴ構造において、非結晶学上関連する複合体のペプチドが２種の残基をそのパートナーのＣＯＯＨ末端により近く位置させるというだけである。こうして、８個の水素結合がＰａｐＤ −Ｇ１'−１９ＷＴ複合体のペプチドの間に形成されるが、ＰａｐＤ−Ｋ１'−１９ＷＴでは合計１０個の水素結合が観察される。Ｃ−末端残基Ｔｙｒ-２'およびＡｒｇ−１'は別として、ペプチドの側鎖とＰａｐＤの間でも相対的にほとんど接触はない。主な相互作用は、主鎖のＧ１鎖に対する水素結合により得られる。しかしながら、特にペプチドのＴｙｒ-６'とＧ１鎖のＩｌｅ−１０５およびＬｅｕ−１０７の間のβ−シート内に多数の疎水性相互作用がある。実施例１０ＰａｐＤにおける第２の結合部位の同定および新規検定の発達序論チャペロン結合検定は、ＰａｐＧのＣＯＯＨ末端の増長を含む、ＭＢＰ／Ｇ融合を用いるＰａｐＤ−ＰａｐＧ相互作用を叙述するために発達した。ＰａｐＧのＣＯＯＨ末端の増長を欠くＰａｐＧ切形蛋白質に結合するＰａｐＤの能力もまた試験した。実験操作細菌株ＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質を含む研究における宿主菌株として、イー・コリ菌株ＨＢ１０１（Maniatisら、１９８２）を用いた。宿主として菌株ＤＨ５αを用い、ＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質（Hanahan、１９８３）およびＰａｐＧ切形を構築した。ＫＳ４７４（ｄｅｇＰ：：ｋａｎ）（Strauchら、１９８９）は、J.Beckwithにより提供され、ＰａｐＧ切形蛋白質を発現させるのに用いられた。プラスミド構築イー・コリ発現プラスミドｐＭＡＬ−ｐ２（米国、マサチューセッツ州、ビバリー、ニューイングランド・バイオラブス）を、基本的にマニアティス（Maniat is）の操作（Maniatisら、１９８２）を用い、ｐＭＡＬ−ｐ４、ｐＭＡＬ／Ｇ１ '−１９'、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−８１'およびｐＭＡＬ／Ｇ１'−１４０'を構築するために用いた。ｐＭＡＬ−ｐ２によりコードされるｍａｌＥ遺伝子は、３'末端に融合したｌａｃＺα配列を有する。プラスミドｐＭＡＬ−ｐ２をＳａｌＩで消化し、クレノーで充填した（Maniatisら、１９８２）。フラグメントを連結し、得られたｐＭＡＬ−ｐ４と称されるプラスミドは、ｍａｌＥとｌａｃＺα配列の間に停止コドンを有する。プラスミドｐＭＡＬ−ｐ４をＨｉｎｄIIIで消化し、クレノーで充填し、得られたプラスミドをＣｌａＩリンカー、５'ＣＣＡＴＣＧＡＴＧＧ３'（米国、マサチューセッツ州、ビバリー、ニューイングランド・バイオラブス）と連結し、プラスミドｐＭＡＬ−ｐ５を生成する。プライマー２３９６９（５'ＣＣＣＣＣＣＴＧＣＡＧＡＴＣＡＧＡＴＴＡＡＧＣＡＧＣＴＡＣＣＴＧＣ３'、配列番号：２３）およびプライマー２３５５７（５'ＣＣＣＣＴＧＣＡＧＴＡＡＡＡＡＴＡＴＣＴＣＴＧＣＴＣＡＧＡＡＡＴＡＣ３'、配列番号：２５）を、鋳型としてｐＰＡＰ５（ハル(Hull)ら、１９８１；リンドバーグ（Lind berg）ら、１９８４）を用いるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）に用いた。ＰａｐＧのアミノ酸残基１'−８１'および１'−１４０'の領域をコードするＤＮＡフラグメントを、各々、プライマー２３５５７および２３５５９ならびにプライマー２３９６９および２３５５９を用いるＰＣＲ反応より得た。増幅ＤＮＡフラグメントを精製し、ＰｓｔＩおよびＣｌａＩで制限し、ＰｓｔＩおよびＣｌａＩ制限ｐＭＡＬ−ｐ５フラグメントに連結し、各々、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−８１'およびｐＭＡＬ／Ｇ１'−１４０'を構築した。ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１９'を形成するのに、２種のヌクレオチドオリゴマー（５'ＧＧＡＡＡＧＡＧＡＡＡＡＣＣＣＧＧＧＧＡＧＣＴＡＴＣＴＧＧＴＴＣＴＡＴＧＡＣＴＡＴＧＧＴＴＣＴＧＡＧＴＴＴＣＣＣＣＴＧＡＴ３'、配列番号：２７）を化学合成し、アニールした。ＰａｐＧのカルボキシ末端１'−１９'アミノ酸残基の配列を有するアニールＤＮＡフラグメントをＰｓｔＩ−ＣｌａＩｐＭＡＬ−ｐ５フラグメントに連結し、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１９'を生成する。この研究にて用いる構築物はすべて、製造業者の指示（米国、オハイオ州、クレーブランド、ＵＳＢ）に従って、シーケエンス・バージョン・２.０を用いるＤＮＡ配列決定分析により確認した。ｐＨＪ１４（ＰａｐＧ３）を、ｐＨＪ８（Ｐ_tacプロモータープラスミド、ｐＭＭＢ６６におけるｗｔＰａｐＧ）をＢａｍＨＩおよびＢｇｌIIで消化し、およそ５００個のヌクレオチドを除去し、大きなフラグメントを精製して再連結した。まずｐａｐＧをＥｃｏＲＩおよびＢａｍＨＩでｐＵＣ１９にクローンし、ＨｉｎｃIIで消化しておよそ最後の３００個のヌクレオチドを除去し、再連結することによりｐＨＪ２３（ＰａｐＧ２）を形成させた。ついで、ＥｃｏＲＩ−ＨｉｎｃIIフラグメントをｐＭＭＢ６６にクローンし、ｐＨＪ２３を生成した。ＭＢＰ／Ｇ融合の誘発および部分精製ＭＢＰまたはＭＢＰ／Ｇ融合遺伝子プラスミドを有する菌株を、１ｍＭイソプロピルチオガラクトシド（ＩＰＴＧ）を含むＬＢブロス培養体中で誘導した。ペリプラスミック抽出物を記載（Slonimら、１９９２）に従って調製した。１０分の１の容量の１０ｘリン酸緩衝液セイライン（ＰＢＳ、１２０ｍＭＮaＣl、２. ７ｍＭＫＣl、１０ｍＭＮa₂ＨＰＯ₄および２ｍＭＫＨ₂ＰＯ₄、pＨ７.４）をそのペリプラスミック抽出物に加えた。ついで、アミロース樹脂を該ペリプラスミック抽出物に１：５の割合で添加した。該混合物を４℃で一夜振動させ、その後、ビーズをＰＢＳで５回洗浄した。４℃で１時間振動させることで、ＭＢＰまたはＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質をＰＢＳ中２０ｍＭマルトースで溶出させた。蛋白質濃度をＢio−Ｒad ＤＣ蛋白質検定キット（米国、カリフォルニア州、ハーキュレス、バイオーラド・ラボラトリース（Bio-Rad Laboratories））を用いて測定した。全長の融合蛋白質の濃度をさらに、標品として既知濃度のウシアルブミン（ＢＳＡ）を用いるクマシー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルで定量し、濃度計スキャンに付した。ＰａｐＤおよびＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質の間の相互作用の特徴化ＨＢ１０１／ｐＬＳ１０１／ｐＭＡＬ−ｐ４、ＨＢ１０１／ｐＬＳ１０１／ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１９'、ＨＢ１０１／ｐＬＳ１０１／ｐＭＡＬ／Ｇ１'−８１'およびＢＨ１０１／ｐＬＳ１０１／ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１４０'由来のＭＢＰまたはＭＢＰ／Ｇ融合調製物を、等電点電気泳動（ＩＥＦ）ｐＩ３−９ゲル（スウェーデン、ファルマシア、ファルマシア・ファスト・システム（Pharmacia Phast Sy stem））または１２.５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥに適用し、つづいて銀染色、クマシーブルー染色または記載（クーン（Kuehn）ら、１９９１）されているように抗ＰａｐＤ抗血清を用いるイムノブロットに付した。ＨＢ１０１／ｐＬＳ１０１／ｐＭＡＬ−Ｇ１４０由来の部分精製したＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'調製物（１μｇ）を、０−５Ｍ尿素中、２５℃で５分間インキュベートすることにより、ＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体の尿素中での安定性を測定した。蛋白質を銀染色を用いるＩＥＦ（ｐＩ３−９）により分析した。ＩＥＦゲル上のＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体を濃度計（デジタル・イメージング・システム、Ｉｓ−１０００）により定量した。 in vitroにおけるＰａｐＤとＭＢＰ／Ｇ融合の間の相互作用を、精製したＰａｐＤ（１μｇ）およびアミロースビーズアフィニティー精製したＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質（１μｇ）をＰＢＳ（４μｌ）中にて３０分間インキュベートし、ついでＩＥＦ（ｐＩ３−９）に付し、つづいて銀染色した。より定量的であるもう一つ別のin vitro検定は、後記するＥＬＩＳＡである。ＰａｐＤとＰａｐＧ切形体の間の相互作用の特徴化ＰａｐＤおよびＰａｐＧ−切形体をＫＳ４７４にて共同発現させ、その切形体を０.５ｍＭＩＰＴＧでＯＤ₆₀₀０.６にて誘発し、アラビノースプロモーターの制御下にあるＰａｐＤを０.２％アラビノースで誘発した。１時間誘発した後、前記したように（Kuehnら、１９９１）、ペリプラスミック抽出物を調製し、Ｇａｌα（１−４）Ｇａｌビーズと一緒に４℃で一夜振動し、１５μｇ／ｍｌＧａｌα（１−４）Ｇａｌ−ＴＭＳＥＴ溶液で溶出した。溶出液を酸性天然ゲル電気泳動（Strikerら、１９９４）により、つづいて抗−ＰａｐＤおよび抗−ＰａｐＧ抗血清を用いるウェスタンブロットにより分析した。赤血球凝集価種々のＭＢＰ／Ｇ融合プラスミドを有するＨＢ１０１／ｐＦＪ３をトリプチカーゼ・ソイ・アガー（米国、メリーランド州、コッキースビル、ベクトン・ディキンソン（Becton Dickinson）、ＴＳＡ）上で３回継代し、Ｐ−繊毛発現を誘発した。最終継代で、ＭＢＰ／Ｇ融合体の発現を１００μＭＩＰＴＧ含有のＴＳＡ上で誘発させた。ついで、種々の菌株由来の細胞を収集し、ＨＡ力価を記載（Jacob-Dubuissonら、１９９３ｂ）に従って測定した。繊毛調製および定量ＴＳＡプレートより得られた細胞を収集した。繊毛を前記した操作（Jacob-Du buissonら、１９９３ｂ）を用いて同量の細胞より調製した。これらの繊毛調製物を４Ｍ尿素を含むLammeli試料緩衝液中にて煮沸し、ついでクマシーブルー染色したＳＤＳポリアクリルアミドゲル上で分析した。相対的な繊毛化量をＰａｐＡ帯の濃度計スキャンにより定量した。ＥＬＩＳＡ検定ＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質のＰＢＳ中ストック溶液をＰＢＳで４０ピコモル／５０ μｌに希釈した。４０ピコモル／５０μｌのＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質溶液を連続的にＰＢＳに希釈し、各５０μｌの溶液を用いて９６−ウェルＮunt Ｉmmunoplate （デンマーク、ロスキルドＤＫ−４０００、インター・メッド（Inter Med））のウェルを４℃で一夜コートした。ついで該ウェルをＰＢＳで洗浄し、２００μ ｌのＰＢＳ中３％ＢＳＡを用いて２５℃で２時間ブロックした。該プレートをＰＢＳで勢いよく３回洗浄し、５０μｌの３％ＢＳＡ−ＰＢＳ中５０ピコモルのＰａｐＤで希釈したＰａｐＤ（５０μｌ）と一緒に２５℃で４５分間インキュベートした。ＰＢＳで３回洗浄した後、該ウェルをウサギ抗−ＰａｐＤ抗血清の３％ＢＳＡ−ＰＢＳの１：５００希釈体で２５℃で４５分間インキュベートした。ＰＢＳで３回洗浄した後、該ウェルをヤギ抗血清のアルカリ性ホスファターゼ／３％ＢＳＡ−ＰＢＳに結合させたウサギＩｇＧに対する１：１０００希釈体で２５ ℃で４５分間インキュベートした。ＰＢＳで３回洗浄し、顕色用緩衝液（１０ｍＭジエタノールアミン、０.５ｍＭＭgＣl₂）で３回洗浄した後、顕色用緩衝液中濾過した１ｍｇ／ｍｌのｐ−ニトロフェニルホスフェート（５０μｌ）（米国、ミズリー州、セントルイス、シグマ（Sigma））を添加した。反応物を暗所中２５℃で１時間インキュベートし、４０５ｎｍでの吸光度を読み取った。別の部位のペプチドを検定する場合、すべてのペプチドをジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ、米国、ミズリー州、セントルイス、シグマ）に溶かし、最終濃度２ｍＭとした。ストック溶液をＰＢＳにて適当な濃度に希釈し、マイクロタイターのウェルに４℃で一夜コートした。すべてのペプチド溶液を同一のＤＭＳＯ濃度に調整した。その後の工程は前記した操作に従った。結果ＭＢＰ／Ｇ融合ＰａｐＤ相互作用に対して本質的なＰａｐＧにおける決定因子を同定するために、マルトース結合蛋白質をコードする、ＭａｌＥ遺伝子と、ＰａｐＧのＣＯＯＨ−末端残基１'−１９'、１'−８１'および１'−１４０'をコードする配列の間でフレーム融合にて３種を構築した（図２０）。得られたキメラ蛋白質は、各々、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'、ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'およびＭＢＰ／Ｇ１'− １４０'と称せられ、ＭＢＰ／Ｇ融合に存在するＰａｐＧの領域を示す。ＰａｐＤが、最近、in vitroにてＰａｐＤのＣ−末端１９アミノ酸からなるペプチドに結合することがわかったため（Kuehnら）、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'を作製した。ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'およびＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'を作製し、ＰａｐＤによる認識についてのジスルフィド結合（ＰａｐＧのＣ１９６−Ｃ２２８）の必要性を試験した。同様に位置するジスルフィド結合が、実質的に、すべての繊毛サブユニットにて見られた（Simonsら、１９９０）。ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'は２個のシステイン残基を欠き、それに対してＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'はジスルフィド結合を含有した（図２０）。 in vivoにおけるＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ相互作用ＰａｐＤのＭＢＰ／Ｇ融合への結合能を、アミロースアフィニティークロマトグラフィーを用いて研究した（KellermannおよびFerenci、１９８２）。ＰａｐＤをプラスミドｐＬＳ１０１（Slonimら、１９９２）より、各ＭＢＰ／Ｇ融合で共同発現させた。ＭＢＰ／Ｇ蛋白質およびＰａｐＤ含有の各菌株に由来のペリプラスミック抽出物をアミロースアフィニティークロマトグラフィーに付し、溶出液をＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図２１Ａ）および抗−ＰａｐＤ抗血清を用いるウェスタンブロット（図２１Ｂ）より分析した。この検定において、ＰａｐＤの共同溶出はＰａｐＤのＭＢＰ／Ｇ蛋白質との相互作用能を表した。ウェスタンブロットは、ＰａｐＤが３種のすべての融合蛋白質と共同溶出したが（図２１Ｂ、レーン２、３および４）、ＭＢＰ対照とは共同溶出しないこと（図２１Ａおよび２１Ｂ、レーン１）を明らかにした。しかし、共同出液のクマシーブルー染色ゲル（図２１Ａ、レーン４）と同様に、ウェスタンブロット（図２１Ｂ、レーン４）にて観察できるように、ＰａｐＤはＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合とより一層強く相互作用した。かくして、ＰａｐＤはＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'蛋白質と強く相互作用し、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'およびＭＢＰ／Ｇ１'−８１'蛋白質とほんのわずかに相互作用したにすぎなかった。銀染色した等電点電気泳動（ＩＥＦ）ゲルの溶出液を分析し、ＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体が、ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'（〜４.４）とＰａｐＤ（〜９.１）の間の中間の値である５.２の等電点（ｐＩ）で移動する（図２１Ｃ、レーン４）ことがわかった。非染色帯を削り取り、その物質をＳＤＳ−ＰＡＧＥに加え、抗−ＰａｐＤおよび抗−ＭＢＰ抗血清を用いるウェスタンブロットにより分析することにより、この帯がＰａｐＤとＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'の両方を含有することが確認された（図２１Ｄ）。ＰａｐＤを用いて共同発現させた場合、ＭＢＰ、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'またはＭＢＰ／Ｇ１'−８１'の溶出液にて安定した複合体を検出することは不可能であった（図２１Ｃ、レーン１、２および３）。ＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体の安定性を、１５ｍＭＤＴＴの存在下、尿素濃度の関数として測定した。ＰａｐＤ−ＰａｐＧおよびＰａｐＤ− ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体は共に、これらの条件下で同じように行動し、２Ｍ尿素中でインキュベートした後に解離させた（データ示さず）。これらの特徴により、ＰａｐＤ−ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'複合体はＰａｐＤ−ＰａｐＧ複合体と同様に安定であった。ＭＢＰ／Ｇ蛋白質の発現は繊毛形成を阻害するＰａｐＤはＰ−繊毛の形成に必須である（Hultgrenら、１９９１）。ペリプラズムにおけるＰａｐＤ濃度の減少が、繊毛形成の付随する減少を誘起することが証明されている（Slonimら、１９９２）。ｐａｐオペロンとの形質転換にて共同発現されたチャペロンサブユニット複合体形成を阻害することによるＭＢＰ／Ｇ融合体の繊毛形成遮断能を試験した。プラスミドｐＭＡＬ−ｐ４、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１９'、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−８１'およびｐＭＡＬ／Ｇ１'−１４０'は、ベクターｐＡＣＹＣ１８４におけるそれ自身のプロモーターの調整下、ｐａｐオペロンを含有するＨＢ１０１／ｐＦＪ３菌株に形質転換された（Jacob-Dubuissonら、１９９３ｂ）。ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよび抗−ＭＢＰ抗血清でのウェスタンブロットにより決定されるように（データ示さず）、各ＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質をペリプラズムに局在化させた。赤血球凝集（ＨＡ）検定を、ｐａｐオペロンをＭＢＰ（ｐＭＡＬ−ｐ４）、または各ＭＢＰ／Ｇ融合体のいずれかと共同発現する細胞上で行った。ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合体のｐａｐオペロンとの共同発現は、ＭＢＰ対照と比較してＨＡ力価を３０倍減少させた（表３参照）。ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'およびＭＢＰ／Ｇ１'−１９'融合体のｐａｐオペロンとの共同発現はＨＡ力価にてほんのわずかな効果を有した（表３）。ＭＢＰ／Ｇ１ '−１４０'のｐａｐオペロンとの共同発現は、細胞より精製することができる繊毛の数を９０％まで減少させるのに対して、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'およびＭＢＰ／Ｇ１'−８１'はＭＢＰ単独の場合と比較して形成される繊毛の数を約５０％まで減少させた（表３）。電子顕微鏡にて、ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合を発現する細胞は、ＭＢＰを共同発現する十分に繊毛化された細胞と比較してほとんどまたは全く繊毛を有しないことを確認した（データ示さず）。本発明者らはＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合のｐａｐオペロンとの共同発現が、サブユニットより離れているＰａｐＤを滴定し、こうしてサブユニットを凝集および蛋白質加水分解変性の失活経路に推し進めることにより繊毛形成を阻害すると仮定した（Hultgrenら、１９８９；Holmgren、１９９２）。この仮定を以下のように試験した。ｐＭＡＬ−ｐ４、ｐＭＡＬ／Ｇ１'−１９'、ｐＭＡＬ／Ｇ１' −８１'またはｐＭＡＬ／Ｇ１'−１４０'をｐＦＪ２２を有するＢＨ１０１に形質転換させた（Jacob-Dubuissonら、１９９４）。プラスミドｐＦＪ２２は、Ｐ_t _ac プロモーターの制御下、ｐａｐＤＪＫＥＦＧＡをコードする。ＨＢ１０１／ｐＦＪ２２にて、繊毛サブユニットは、先導体であるＰａｐＣが不在のため、ペリプラスミック空間に蓄積する。各繊毛サブユニット型の発達結果に対する各融合を発現する効果をウェスタンブロットにより測定した（図２２）。ＭＢＰ／Ｇ１ '−１４０'融合を共同発現する細胞中のＰａｐＧ、ＰａｐＡおよびＰａｐＦの量の有意な減少が、ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合が、ＰａｐＤと相互作用し、繊毛サブユニットと離れてトラップすることでチャペロン−サブユニット複合体形成を遮断することから見いだされた。理解されないため、ＰａｐＫおよびＰａｐＥの安定性に対して何の効果もなかった。にもかかわらず、融合は、臨界的なチャペロン−サブユニット複合体の形成を妨げることにより繊毛形成遮断能を有した。 in vitroにおけるチャペロン結合検定ＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質に結合するＰａｐＤを、さらに２種の異なるin vitro検定にて試験した。最１の検定にて、精製したＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質またはＭＢＰをＰａｐＤとインキュベートし、複合体形成を銀染色ＩＥＦゲルで分析した。ＰａｐＤはＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合蛋白質に結合し、in vivoにて形成される複合体に見られるのと同じｐＩ（５.２）に移動する安定な複合体を形成した（図２３Ａ、レーン４）。対照的に、ＰａｐＤと、ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'、ＭＢＰ／Ｇ１'−１９'またはＭＢＰ対照との間で複合体は検出されなかった（図２３Ａ、レーン１、２および３）。第２の検定にて、本発明者らはマイクロタイターウェルに固定された３種の異なるＭＢＰ／Ｇ融合蛋白質とのＰａｐＤの結合能を試験し、抗−ＰａｐＤ抗血清を用いる固相酵素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）にてその相互作用を定量した（図２３Ｂ）。ＰａｐＤはＭＢＰ／Ｇ１'−１９'に弱く、ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'に対してわずかに強く結合するが、ＭＢＰ／Ｇ１'− １４０'に非常に強く結合した。ＰａｐＤはＭＢＰ対照と結合しなかった。ＭＢＰ／Ｇ１'−８１'およびＭＢＰ／Ｇ１'−１９'融合と比較した場合、ＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合についてＰａｐＤの親和力の劇的な増加は、ＰａｐＧの８１' ないし１４０'残基がＰａｐＤの強結合について臨界的であることを示唆した。ＰａｐＤの不変クレフト残基Ａrg−８およびＬys−１１２が、繊毛サブユニットを結合させるのに必須であるチャペロン・クレフトにて分子アンカーを形成することがわかった（Slonimら、１９９２；Kuehnら、１９９３）。これら残基の変異は、ＰａｐＤのサブユニットおよび介在繊毛集合との結合能を破壊するか、または著しく減少させた（Kuehnら、１９９３）。Ａｒｇ−８ＡおよびＬｙｓ− １１２Ａ変異体ＰａｐＤ蛋白質は、in vivoおよびin vitroの両方にてＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合蛋白質への結合能を著しく減少させることを示した（データ示さず）。これらの結果はＰａｐＤとＭＢＰ／Ｇ１'−１４０'融合の間の相互作用が生物学的に関連していることを立証する。上流部位は独立した結合決定因子である本発明者らは、上流ＰａｐＤ結合部位の限界を叙述し、独立した部位として機能する能力があるかどうかを試験するために、ＰａｐＤの３つのＰａｐＧＣＯＯＨ末端切形蛋白質（図２０に図示）への結合能を試験した。切形蛋白質を、ＰａｐＧ１遺伝子座にカナマイシンカセットを有する（ｄｅｇＰ４１変異体）ＫＳ４７４菌株にてＰａｐＤと共同発現させた（Strauchら、１９８９）。ＰａｐＧ２およびＰａｐＧ３切形体は共に発現し、ＫＳ４７４にて安定していたが、ＰａｐＧ１切形体（最後の１４個の残基を除去）は限定減成を受けた(データ示さず) 。複合体形成を、酸天然アクリルアミドゲル上のペリプラスミック抽出物を分析することにより検定した（Strikerら、１９９４）。抗ＰａｐＤおよび抗ＰａｐＧ抗血清を用いてウェスタンブロット法にてＰａｐＤ−ＰａｐＧ複合体を検出した（図２４）。ＰａｐＤ−ＰａｐＧ複合体を、その大きさ、形状および電化の違いにより、これらゲル上の単独のＰａｐＤより分割する（Strikerら、１９９４）。ＰａｐＤは全長ＰａｐＧならびにＰａｐＧ２切形体との複合体を形成した（図２４Ａ、レーン２および３）。複合体帯もまた、抗ＰａｐＧ抗血清により認識された（図２４Ｂ、レーン２および３）。ＰａｐＤは、アミノ酸１４５で限界をなす、ＰａｐＧ３切形体との複合体を形成しなかった（図２４Ａ＆Ｂ、レーン４）。この情報は第２のＰａｐＤ結合部位の終点を記述している（図２０に示す）。ＰａｐＧ切形体とＭＢＰ／Ｇ融合データを合すると、ＰａｐＤにより認識されるＰａｐＧ上の第２の部位はＰａｐＧの１１７'ないし１４１'残基の間の部位に存することがわかった。１２０'ないし１５６'残基の間の領域に対応する４つの重複ペプチドを合成し、ＥＬＩＳＡ検定にてＰａｐＤに結合するその能力について試験した。このような計略はＣＯＯＨ末端ＰａｐＤ結合部位の研究における成功を立証した（Kuehnら、１９９３）。１２５'ないし１４０'残基に対応するが、他の３つのペプチドに対応しないペプチドをＥＬＩＳＡにてＰａｐＤに結合させた（図２５）。これらのデータは、ＰａｐＤがＰａｐＧの両面を認識することを示す。ＰａｐＤはＣＯＯＨ−末端とのベータ鎖ジッパーリング相互作用を形成するが、また１２５'−１４０'残基を含有する領域を認識する。検討および結論結論にて、チャペロン結合検定をＰａｐＧのカルボキシ末端のマルトース結合蛋白質への融合（ＭＢＰ／Ｇ融合）を用いて展開し、チャペロン−サブユニット複合体形成がさらなる相互作用を必要とするかどうかを研究した。ＰａｐＤはＰａｐＧのＣ−末端１４０アミノ酸含有のＭＢＰ／Ｇ融合（ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'）に強く結合するが、ＭＢＰ−Ｇ１'−８１'にほんのわずかに結合するだけで、Ｃ−末端の８１'および１４０'残基の領域がＰａｐＤ−ＰａｐＧの強い相互作用について要求されるさらなる情報を有することを立証した。ＰａｐＤが１１７'−３１４'残基（ＰａｐＧの最初の１９８Ｎ−末端アミノ酸残基からなる切形体に対応）を含有するＰａｐＧＣ−末端切形体と相互作用するが、１７０' −３１４'残基（ＰａｐＧの最初の１４５Ｎ−末端アミノ酸残基からなる切形体に対応）を含有する切形体と相互作用しないことが明らかにされた。これらの結果は一緒になって、繊毛サブユニットのＣ−末端と相互作用しない第２の独立したＰａｐＤ相互作用部位が存在することを示唆する。この仮定はさらにはＰａｐＧの第２の部位領域に重複する４種のペプチドのうちの一がＰａｐＤによって認識されるという事実により確認される。最後の結果もまた、上流部位の機能がＣＯＯＨ末端チャペロン結合部位において二次効果を発揮するものであるという可能性を排除する。というのもこの領域は独立してＰａｐＤ結合の促進能を有するからである。未変性サブユニットで真実であることと異なり、ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'はＰａｐＤの不在下においてさえ折り畳むことができ、ペリプラスミック空間にて溶解したままである；この折り畳みは分子内ジスルフィド結合の形成を意味する。このことはサブユニットそれ自体がＰａｐＤに結合した場合に高度に折り畳まれることを示す初期のデータと一致する（Kuehnら、１９９１；Strikerら、１９９４）。しかしながら、サブユニットが折り畳まれた後にＰａｐＤがin vivoにてサブユニットに結合するかどうか、あるいは折り畳みがＰａｐＤとの相互作用の関係にて生じているかどうか未だにわかっていない。最後に、Ｐ繊毛を生成する細胞におけるＭＢＰ／Ｇ融合の発現が、ＰａｐＤに結合し、チャペロン−サブユニット複合体形成を防止することによって、繊毛集合を種々の程度まで阻害した。その融合の繊毛集合を遮断する能力は、融合蛋白質の長さが増加するにつれて増加した。ＭＢＰ−Ｇ１'−８１'およびＭＢＰ−Ｇ１'−１９'は弱阻害剤であるが、ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'は繊毛集合の強力な阻害剤であった。このことは、残基１４０'−８１'がＰａｐＤとＰａｐＧの間の強い相互作用に必須の領域を有するという知見と一致する。発明者らによる最近の研究は、ＰａｐＧおよびこの切形ＰａｐＤを発現するｄｅｇＰ４１菌株（ＫＳ４７４）におけるドメイン１のない修飾ＰａｐＤポリペプチドのin vivoにおける同時発現が、１）この細胞株におけるＰａｐＧ毒性の抑制、および２）ＰａｐＧのペリプラスミック空間への効果的な分配をもたらす。しかし、ＰａｐＤから放出された後、繊毛サブユニットは正確に折り畳まれていない。発明者らは、繊毛サブユニットとＰａｐＤの間の結合がＰａｐＤのドメイン１および２に結合するサブユニットにより起こると示唆する。サブユニットとドメイン１の間の結合はサブユニットが正確に折り畳まれるのに重要であり、サブユニットとドメイン２の間の結合はサブユニットのペリプラズムへの輸送にて重要である。ＰａｐＤノドメイン２がまたサブユニットの折り畳みに関連しているかどうかわかっていない。前記した結果はＰａｐＤのＡrg−８およびＬys−１１２を含むこととは別に少なくとも１つの結合部位の存在を示す強力なインジケーターであり、この新規な知見はＰａｐＤと繊毛サブユニットの間の相互作用にて非常に重要であるため、作用するこの結合部位は前記した抗菌効果を有すると考えられる。このように、本明細書に記載された方法と同様の方法にてＰａｐＤのこの第２の結合部位の結合のモチーフを明らかにし、さらには無傷の繊毛の集合が防止、阻害または促進されるように最後にはこの部位との相互作用能を有する化合物を合成するためにこの第２の結合部位との相互作用能を有する化合物を設計／同定することを計画する。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁶ 識別記号庁内整理番号ＦＩＡ６１Ｋ 31/65 9454−4ＣＡ６１Ｋ 31/65 31/70 9051−4Ｃ 31/70 38/00 ＡＤＺ 8615−4ＣＣ０７Ｈ 5/06 Ｃ０７Ｈ 5/06 8615−4Ｃ 15/04 Ａ 15/04 9356−4ＨＣ０７Ｋ 5/06 Ｃ０７Ｋ 5/06 9356−4Ｈ 9/00 9/00 9051−4ＣＡ６１Ｋ 37/02 ＡＤＺＣ１２Ｎ 15/09 ＺＮＡ 9162−4ＢＣ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ (81)指定国ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，ＩＴ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＭＬ，ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＴ，ＡＵ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＨＵ，ＪＰ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＫ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＧ，ＭＮ，ＭＷ，ＮＬ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＩ，ＳＫ，ＴＴ，ＵＡ，ＵＳ，ＵＺ，ＶＮ (72)発明者キューン，メタアメリカ合衆国63112ミズーリ州、セント・ルイス、クララ・アベニュー605番 (72)発明者シュイ，チォンアメリカ合衆国63139ミズーリ州、セント・ルイス、ジャニュアリー・アベニュー 3201番 (72)発明者オッグ，デレクスウェーデン、エス―752 37、ウプサラ、アルティレーリガーテン16ビー番 (72)発明者ハリス，マークスウェーデン、エス―756 45、ウプサラ、ノールビーカルヴェーゲン２番 (72)発明者レピスト，マッティスウェーデン、エス―224 73、ルンド、フリーイェルヴェーゲン257番 (72)発明者ジョーンズ，チャールズ・ハルアメリカ合衆国63110ミズーリ州、セント・ルイス、ムーアランズ・ドライブ1104 エイ番 (72)発明者キールベリ，ヤンスウェーデン、エス―240 10、ダールビー、ハーブレヴェーゲン16番

Claims

【特許請求の範囲】１．繊毛形成細菌における少なくとも１つのタイプの繊毛サブユニットと少なくとも１つのタイプの分子チャペロンとの間の結合を防止、阻害または促進することを特徴とし、ペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合プロセスの間にペリプラズム分子チャペロンが繊毛サブユニットに結合するものである、組織付着性繊毛を形成する細菌により引き起こされる疾患の治療および／または予防方法。２．ペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合プロセスの間に、ペリプラズム分子チャペロンへの繊毛サブユニットの結合を防止、阻害または促進する様式で、繊毛サブユニットに結合する少なくとも１のタイプのペリプラズム分子チャペロンと相互作用することができる有効量の物質を、それを必要とする対象に投与することを特徴とする請求項１記載の方法。３．細菌が、ヘモフィルスｓｐｐ（Haemophilus spp）、ヘリコバクターｓｐｐ（Helicobacter spp）、シュードモナス・アエルギノザ（Pseudomonas ae ruginosa）、マイコプラズマｓｐｐ（Mycoplasma spp）、およびエシャリシアｓｐｐ（Escherichia spp）、サルモネラｓｐｐ（Salmonella spp）、ボルデテラｓｐｐ（Bordetella spp）、イェルシニアｓｐｐ（Yersinia spp）、クレブシエラｓｐｐ（Klebsialla spp）ならびにプロテウスｓｐｐ（Proteu s spp）を含むすべての腸内細菌科のメンバーからなる群より選択される請求項１または２記載の方法。４．ペリプラズム分子チャペロンが、ＰａｐＤ、ＦｉｍＣ、ＳｆａＥ、ＦａｅＥ、ＦａｎＥ、Ｃｓ３−１、Ｆ１７Ｄ、Ｃ１ｐＥ、ＥｃｐＤ、Ｍｒｋｂ、ＦｉｍＢ、ＳｅｆＢ、ＨｉｆＢ、ＭｙｆＢ、ＰｓａＢ、ＰｅｆＤ、ＹｅｈＣ、ＭｒｐＤ、ＣｓｓＣ、ＮｆａＥ、ＡｇｇＤおよびＣａｆ１Ｍからなる群から選択されるペリプラズム蛋白である請求項１〜３のいずれかに記載の方法。５．ペリプラズムを通る繊毛サブユニットの輸送の間および／または繊毛の集合のプロセスの間において、繊毛サブユニットへの結合に通常は関与しているペリプラズム分子チャペロン中の結合部位との相互作用を行うことにより、結合の防止、阻害または促進を行う請求項１〜４のいずれかに記載の方法。６．結合部位が、繊毛サブユニットのカルボキシル末端部分が結合しうる部位であり、該部位は、ＰａｐＤにおける不変残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２と実質的に同じ部位ポイントおよび繊毛サブユニットのカルボキシル末端のβ− ストランドと相互作用しうるポリペプチドフラグメントからなり、該相互作用により結合部位のＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２部位ポイントにおいて該サブユニットの結合が安定化される請求項５記載の方法。７．結合部位が、ペプチドＧ１２５'−１４０'および／または融合蛋白ＭＢＰ −Ｇ１'−１４０'および／またはペプチドＧ１'−１９'が結合しうるものである請求項５記載の方法。８．下記工程の少なくとも１つ：１）物質によるペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用の可能性な防止、阻害または促進が、固定化された形態のペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログおよび可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物からなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、または固定化された形態の繊毛サブユニットまたはその等価物および可溶化形態のペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、または可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合の変化を調べること、または可溶化形態の繊毛サブユニットまたはその等価物およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる系に該物質を添加し、該物質の添加により生じる結合エネルギーの変化を測定し、次いで、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合エネルギーの変化が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定することにより調べられるアッセイにおいて候補物質を試験し、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合または結合エネルギーの変化が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定する。２）ペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用に対する可能な防止、阻害または促進が、生組織付着性繊毛形成細菌からなる系に物質を添加し、次いで、該細菌の増殖速度を調べ、該物質が添加されなかった対応系と比較した場合の増殖速度の低下がペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の防止、阻害または促進を示すこと、または生組織付着性繊毛形成細菌からなる系に物質を添加し、次いで、該細菌の組織付着を調べ、該物質が添加されなかった対応系と比較した場合の組織付着の減少がペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の結合の防止、阻害または促進を示すことにより調べられるアッセイにおいて候補物質を試験し、該物質の添加後に増殖速度または組織付着の低下・減少が観察される場合に該物質を潜在的に治療上有用であると同定する。３）インビトロにおいてペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用を防止、阻害または促進することが確認された物質を実験動物に投与し、該物質の投与の前に、同時に、または後に組織付着性繊毛形成細菌を実験動物に接種し、次いで、該細菌により引き起こされる疾患を予防および／または治療および／または改善する物質をペリプラズム分子チャペロンと適当に相互作用しうる物質として選択するからなる、ペリプラズム分子チャペロンと相互作用しうる潜在的に治療上有用な物質を同定する方法であって、それにより、ペリプラズム分子チャペロンと繊毛サブユニットとの間の相互作用を防止、阻害または促進する方法。９．工程１におけるアッセイが、 −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログからなる第１の系に物質を添加し、 −次いで、環境的に感受性のある蛍光プローブで標識された繊毛サブユニットまたはその等価物を添加し、 −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと繊毛サブユニットまたはその等価物との間の結合量を示す特定の波長における蛍光エミッションを測定し、次いで、 −実質的に同じ濃度の該分子チャペロンまたはそのアナログおよび該繊毛サブユニットまたはその等価物を含むが、実質的に該物質を含んでいない対応する第２の系において測定される蛍光エミッションと、該測定された蛍光エミッションとを比較することからなり、第１および第２の系の間の蛍光エミッションの有意差がペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと物質との間の相互作用を示すものである請求項８記載の方法。１０．第２の系における蛍光エミッションの測定を、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンならびにその等価物との間のモル比を変化させて複数回行い、それに基づいて、繊毛サブユニットまたはその等価物とペリプラズム分子チャペロンまたはその等価物との間の結合定数を測定した蛍光エミッションのデータから評価する請求項９記載の方法。１１．第１の系における蛍光エミッションの測定を、物質とペリプラズム分子チャペロンおよびその等価物との間のモル比を変化させて複数回行い、その後、物質とペリプラズム分子チャペロンおよびその等価物との間の結合定数を測定した蛍光エミッションのデータから評価する請求項９または１０記載の方法。１２．繊毛サブユニットの等価物がＧ１'−１９'ＷＴ、ＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'、またはＧ１２５'−１４０'であり、ペリプラズム分子チャペロンがＰａｐＤである請求項８〜１１のいずれかに記載の方法。１３．生きている、組織付着性繊毛形成細菌がプロテアーゼ欠損株であり、該プロテアーゼは繊毛サブユニットの分解に少なくとも部分的に関与するものである請求項８〜１２のいずれかに記載の方法。１４．プロテアーゼ欠損株がｄｅｇＰ４１株である請求項１３記載の方法。１５．前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好な推定結合エネルギーを用いて、チャペロンと相互作用しうる（例えば、チャペロンに結合する）物質Ｘを同定および／または設計する方法であって、１）潜在的にチャペロン中の部位と相互作用しうる物質Ａを選択し、次いで、その３次元構造画像を得て、２）物質Ａとチャペロン中の部位との間の結合自由エネルギーを推定し、３）物質Ａとチャペロン中の部位との間の推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好である場合には、物質Ａを物質Ｘと同定し、４）物質Ａとチャペロン中の部位との間の推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値と等しくないかまたはそれより良好でない場合には、３次元構造画像を修飾し、次いで、かくして修飾された物質Ｂとチャペロン中の部位との間の結合自由エネルギーを推定し、５）得られる物質Ｘとチャペロン中の部位との間で決定される推定結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好になるまで工程４を繰り返すからなる方法。１６．前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好な結合エネルギーを用いて、ペリプラズム分子チャペロンと相互作用しうる、例えば、チャペロンに結合しうる物質Ｙを同定および／または設計する方法であって、１）請求項１５の方法に従って物質Ｘを同定し、２）化学物質Ｘの試料およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログの試料を用意し、化学物質Ｘとペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の結合自由エネルギーを測定し、化学物質Ｘとペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログとの間の測定された結合自由エネルギーが前以て決定されたしきい値に等しいかまたはそれより良好であることを確認し、次いで、物質Ｘを物質Ｙと同定し、さらに所望により、３）物質Ｙが、ペリプラズム分子チャペロンと相互作用しうる潜在的に治療上有用な物質であることを証明するために請求項８〜１４のいずれかによる方法に物質Ｙを供するからなる方法。１７．＜Ｖ^el _X-s＞_B−＜Ｖ^el _X-s＞_A、すなわち２つの状態における物質Ｘとその周囲（ｓと表示）との間のポテンシャルエネルギーに対する極性相互作用からの寄与間であると定義される平均エネルギー変化＜ΔＶ^el _X-s＞を評価し、ここに、１の状態（Ａ）は、化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、他の状態（Ｂ）は、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合した化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、＜Ｖ^vdw _X-s＞_B−＜Ｖ^vdw _X-s＞_A、すなわち２つの状態における物質Ｘとその周囲（ｓと表示）との間のポテンシャルエネルギーに対する非極性相互作用からの寄与間であると定義される平均エネルギー変化＜ΔＶ^vdw _X-s＞を評価し、ここに、１の状態（Ａ）は、化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、他の状態（Ｂ）は、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合した化学物質が溶媒に取り囲まれている状態であり、次いで、上記２つの平均エネルギー変化の修正された組み合わせとしての絶対結合自由エネルギーを計算することにより結合自由エネルギーを推定する請求項１５または１６記載の方法。１８．ペリプラズム分子チャペロンにおける部位が、ｐａｐＤ、ＦｉｍＣ、ＳｆａＥ、ＦａｅＥ、ＦａｎＥ、Ｃｓ３−２７、Ｆ１７Ｄ、Ｃ１ｐＥ、ＥｃｐＤ、Ｍｒｋｂ、ＦｉｍＢ、ＳｅｆＢ、ＨｉｆＢ、ＭｙｆＢ、ＰｓａＢ、ＰｅｆＤ、ＹｅｈＣ、ＭｒｐＤ、ＣｓｓＣ、ＮｆａＥ、ＡｇｇＤおよびＣａｆ１Ｍ、またはかかる繊毛サブユニット結合部位のアナログよりなる群から選択されるペリプラズム分子チャペロンの繊毛サブユニット結合部位のごときペリプラズム分子チャペロンの繊毛サブユニット結合部分である請求項１７記載の方法。１９．ペリプラズム分子チャペロン中の部位がＰａｐＤの繊毛サブユニット結合部位またはそのアナログである請求項１８記載の方法。２０．下記工程： −ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログにおける部位と相互作用しうるリガンドと同時結晶化させ、相互作用する場合にはＸ線結晶回折法によりペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログおよびリガンドの３次元コンホーメーションを確立し、 −上で確立されたペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログのコンホーメーションを用いて、結合の間にリガンドと相互作用するペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログにおける部位の３次元画像を確立し、 −多数の個々の化学基、Ｘ１を選択し、化学基と、リガンドと相互作用するチャペロンまたはそのアナログにおける部位との間の結合自由エネルギーＸ１化学基の可能な空間分配を決定し、 −分子の３次元画像からなるデータベースから、上記可能な空間的分配においてＸ１化学基を有する分子を抽出し、 −所望によりデータベースから抽出した分子の３次元画像を修飾し、次いで、所望により修飾された分子を物質Ａとして同定するを行うことにより物質Ａを選択する請求項１５〜１９のいずれかに記載の方法。２１．リガンドが、通常にはペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合プロセスの間にペリプラズムチャペロンが相互作用する繊毛サブユニットまたはその一部である請求項２０記載の方法。２２．一般式：［式中、Ｖ₁はＯ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＣＨ₂、Ｃ(ＯＨ)Ｈ、ＣＯまたはＣＳ；Ｗ₁はＯ、Ｓ、ＳＯ₂、ＳＯ₃、ＣＨ₂またはＮＨ；Ｒ₁はＨ；Ｃ_1〜24アルキル、Ｃ_1〜24アルケニルまたはＣ_1〜24アルキニル（アルキル、アルケニルおよびアルキニルはＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよい）；アシル；または−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s −Ｈ（ここにｓ＝１、２、３）；Ｒ₂は式：（式中、Ａは−ＣＨ−(ＣＨ₂)_n−、または−ＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n-1−（ｎ＞０）Ｂは−(ＣＨ₂)_m−または＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−（ｍ＞０）；Ｘ₂はＮ、ＣＨまたはＣ（Ｂが＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−である場合）Ｙ₂はＯ、Ｓ、ＮＨ、Ｈ₂またはＨ（ｎ＝１）；４＞ｍ＋ｎ＞０、ｎ＜３、ｍ＜３）で示される基あるか、あるいはＲ₂は式：（式中、Ａは−ＣＨ−(ＣＨ₂)_n−、または−ＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n-1−（ｎ＞０）Ｂは−(ＣＨ₂)_m−または＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−（ｍ＞０）；Ｘ'₂はＯ、ＮＨ、ＣＨ₂またはＳ（ｐ＝０の場合）；ＮまたはＣＨ（ｐ＝１）；あるいはＣ（ｐ＝１でＢが＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_m-1−の場合）；Ｖ₂、Ｚ₂およびＷ₂は独立してＨ、ＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂ 、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂、−ＳＯ₂ＮＨ₂であるか、またはＶ₂およびＺ₂、またはＺ₂ およびＷ₂は一緒になって−ＮＨＣ(Ｏ)ＮＨ−、−Ｃ(Ｏ)ＮＨＣ(Ｏ)−、−ＮＨＳ(Ｏ₂)ＮＨ−、−Ｃ(Ｏ)ＮＨＯ、−Ｃ(Ｓ)ＮＨＯ−、−Ｓ(Ｏ₂)ＮＨＯ−、または−Ｓ(Ｏ₂)ＮＨＣ(Ｏ)−；４＞ｍ＋ｎ＞０、ｎ＜３、ｍ＜３）で示される基であるか、あるいはＲ₂は基−Ｗ₅−（Ｃ_1〜5アルキルまたはＣ_2〜5アルケニルまたはＣ₂ _〜5 アルキニル）、ここにＷ₅は結合であるかまたは−Ｏ−、−Ｓ−、−ＳＯ₂− 、および−ＮＨＣ(Ｏ)−から選択され、Ｃ_1〜5アルキル、Ｃ_2〜5アルケニルまたはＣ_2〜5アルキニル部分はＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、 −ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される３個までの基で置換されていてもよく； −Ｚ₁−Ｒ₃は−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、−ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂ (ＯＨ)、−ＮＨ−ＣＯ−ＣＯＯＨ、−ＳＰＯ(ＯＨ)₂、−ＣＨ₂ＣＯＯＨ、テトラゾール−５−イルもしくはテトラゾール−５−イルメチル、またはその塩であるか；あるいはＺ₁は−Ｏ−、−Ｓ−、−ＮＨ−、または−ＣＨ₂−であり、Ｒ₃は式: （式中、Ｄは−ＣＨ₂−、−ＣＯ−、−ＳＯ₂−、−ＮＨ−ＳＯ₂−、−ＮＨ−ＣＯ−、−Ｏ−ＰＯ(ＯＨ)−またはその塩；Ｚ₃はＨ、ＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂、− ＳＯ₂ＮＨ₂、−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、−ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂( ＯＨ)、−ＣＯＯＨ、テトラゾリル−５−イルもしくはテトラゾリル−５−イルメチルまたはその塩（ただし、Ｄが−ＣＨ₂−、−ＣＯ−、−ＳＯ₂−、−ＮＨＳＯ₂−または−ＮＨＣＯ−である場合にはＺ₃は−ＳＯ₂(ＯＨ)、−ＰＯ(ＯＨ)₂、 −ＯＳＯ₂(ＯＨ)、−ＮＨＳＯ₂(ＯＨ)、−ＣＯＯＨ、テトラゾリル−５−イルもしくはテトラゾリル−５−イルメチルまたはその塩）；Ｘ₃およびＹ₃は独立してＨ、ＮＯ₂、ＳＯ₂ＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＣＦ₃またはＦ；Ｕ₄−Ｗ₄は−ＣＨＣＨ−、ＣＨ₂ＣＨ₂−、−Ｃ(ＯＨ)ＣＨ−、−ＣＨＣ(ＯＨ) −、−ＣＨ(ＯＨ)ＣＨ₂−、−ＣＨ₂ＣＨ(ＯＨ)−、−ＣＨ(ＯＨ)ＣＨ(ＯＨ)−、 −Ｃ(Ｏ)ＮＨ−、ＮＨＣ(Ｏ)−を意味する）で示される基；Ｙ₁は−Ｏ−または−Ｓ−；Ｒ₄はＨであるか、またはＹ₁がＳの場合はＳ(ＣＨ₂)_qＮ(Ｒ₉)₃ ⁺であり、ｑは２〜４の数、ここにＲ₉はＨまたはＣＨ₃；Ｒ₅はＨ；Ｃ_1〜6アルキル、Ｃ_2〜6アルケニルまたはＣ_2〜6アルキニルであり、Ｃ_1〜6アルキル、Ｃ_2〜6アルケニルまたはＣ_2〜6アルキニル部分はＯＨ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₂ＮＨ₂または−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されていてもよく；あるいはＲ₅は所望によりアリールまたはヘテロサイクリル部分においてＯＨ、Ｆ、Ｃｌ、ＮＨ₂、ＣＯＮＨ₂、ＮＨＣＯＨおよびＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個、２個または３個の置換基で置換されていてもよいアリール、アリール(Ｃ_1〜2)アルキル、ヘテロサイクリルまたはヘテロサイクリル (Ｃ_1〜2)アルキル；Ｘ₁は−Ｏ−、−Ｓ−または−ＮＨ−；Ｒ₆はＨであるか、あるいはＸ₁がＮＨである場合にはアシル、ＨＯＣＮＨ−Ｖａｌ−Ｍｅｔ−、ＨＯＣＮＨ−Ｉｌｅ−(Ｓ，Ｓ)−ジオキソ−メチオニルまたはＨＯＣＮＨ−Ｖａｌ−(ピラン−４−オン−２−イル)−アラニルを意味する］で示される新規化合物またはその塩。２３．一般式：［式中、ＸはＯ、Ｐ、Ｐ(Ｏ)、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＣＨ₂、Ｃ(ＯＨ)Ｈであるか、または基ＮＱ₁₁(ここにＱ₁₁はＨ、ＯＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル) ; Ｚ₁₁は結合、Ｏ、ＣＨ₂、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂であるか、または基ＮＱ₁₂（ここにＱ₁₂はＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル）；Ｒ₁₁はＨ；−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、 −ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよいＣ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニル；アシル；または−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s−Ｈ（ここにｓ＝１、２、３）であるか；あるいはＲ₁₁はＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃または−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃（ここにＱ₁₃は−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリールまたはヘテロアリール基であり、ｎ'≧０）；Ｒ₁₂およびＲ₁₃は独立してＯＨ、Ｈ、Ｆ、Ｃｌ、ＯＷ₁₁またはＯ(ＣＯ)Ｗ₁₁（ここにＷ₁₁はＣ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニルまたはＣ_2〜24アルキニル）であるか、あるいは−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、− ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリールまたはヘテロアリール基；Ｚ₁₂は結合、Ｏ、Ｓ、またはＣＨ₂；Ｒ₁₄は−(ＣＨ₂)_n,,−Ｑ₁₄（ここにＱ₁₄は−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、−ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、−ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂で置換されているアリール基またはヘテロアリール基であり、ｎ''は０、１、２、または３）；Ｚ₁₃は結合、Ｏ、ＣＨ₂、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ₂、ＮＱ₁₄Ｑ₁₅（ここにＱ₁₄はＨ、Ｃ_1〜24 アシルまたはＣ_1〜24アルキル、Ｑ₁₅はＣＯまたは−Ｃ(Ｏ)Ｗ₁₂、ここにＷ₁₂ はＯまたはＮＷ₁₃、ここにＷ₁₃はＨ、ＯＨ、Ｃ_1〜24アシルまたはＣ_1〜24アルキル）；Ｒ₁₅はＨ；Ｃ_1〜24アルキル、Ｃ_2〜24アルケニルまたはＣ_2〜24アルキニル（アルキル、アルケニルおよびアルキニルは−ＯＨ、−ＣＯＯＨ、−Ｆ、−Ｃｌ、 −ＣＯＮＨ₂、−ＣＳＮＨ₂、−ＣＯＮＨＯＨ、−ＣＳＮＨＯＨ、−ＮＨＣＨＯ、 −ＮＨＣＯＮＨ₂、−ＮＨＣＳＮＨ₂、−ＮＨＳＯ₃ＮＨ₂および−ＳＯ₂ＮＨ₂から独立して選択される１個またはそれ以上の置換基で置換されていてもよい）；アシルまたは−(ＣＨ₂ＣＨ₂Ｏ)_s−Ｈ（ここにｓ＝１、２または３）であるか、あるいはＲ₁₅はＣＨ＝ＣＨ−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃または−(ＣＨ₂)_n,−Ｑ₁₃（ここにＱ₃は前記定義に同じ、ｎ'≧０）］で示される新規化合物またはその塩。２４．ＰａｐＤに対する繊毛サブユニットまたはそのアナログのいずれかの変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはＰａｐＤに対するＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはＰａｐＤに対するＧ１２５'−１４０'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こす請求項２２または２３記載の化合物。２５．エチル２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１−チオ−β− Ｄ−グルコヘキソピラノシド；エチル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−１ −チオ−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；メチルグリコリル６−Ｏ−アセチル−２,３−Ｏ−ジベンゾイル−４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；２−(ヒドロキシ)エチル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコピラノシド；ナトリウムグリコリル４−Ｏ−ベンジル−β−Ｄ−グルコヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−(４'−メトキシ)フェニルメチレン−α− Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−４,６−Ｏ−( ４'−メトキシ)フェニルメチレン−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−４,−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−６−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２−Ｏ−エチル−３−Ｏ−ジメチル−t−ブチルシリル−４,−Ｏ−(４' −メトキシ)ベンジル−６(Ｓ)−フェニル−α−Ｄ−マンノヘキソピラノシド；メチル２，３−アンヒドロ−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン−α−Ｄ− マンノピラノシド；メチル３−アジド−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−２−Ｏ−エチル−４,６−Ｏ−p−メトキシベンジリデン− α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル３−アジド−６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４ −Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩；メチル６−Ｏ−ベンゾイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル３−アジド−６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４ −Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドナトリウム塩；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−３−tブチルオキサミド−α−Ｄ−アルトロピラノシド；メチル６−Ｏ−ピバロイル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−３−オキサミド −α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩；メチル３−アジド−６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ−２−Ｏ−エチル−４−Ｏ−p−メトキシベンジル−α−Ｄ−アルトロピラノシド；およびメチル６−Ｏ−ピロール−３'−イルカルボキシル−３−デオキシ−２−Ｏ− エチル−３−スルファミノ−α−Ｄ−アルトロピラノシドアンモニウム塩。からなる群より選択される新規ピラノシドまたはその塩。２６．ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログを、該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログに結合するリガンドと共に共結晶化し、該チャペロン／リガンド相互作用の三次元構造を分析し、それにより該リガンドに結合した場合の該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログの三次元構造を分析し、該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログと該リガンドとの間の分子間相互作用に関与する部位ポイントを決定し、およびペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログのこのようにして決定された部位ポイントを該ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログ中の結合部位として同定することを特徴とする分子チャペロン中の結合部位を同定する方法に関することからなる、ペリプラズム分子チャペロンまたはそのアナログにおける結合部位を同定する方法。２７．ペリプラズム分子チャペロンに対する繊毛サブユニットの結合が防止、阻害または促進されるように、ペリプラズム間隙を通しての繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合過程の間に繊毛サブユニットに結合する少なくとも１つのタイプのペリプラズム分子チャペロンと相互作用する能力を有する物質を活性化合物として含んでなり、少なくとも１種の医薬上許容される担体または賦形剤を組み合わせてなる医薬組成物。２８．請求項２２〜２５のいずれかに記載の物質または請求項８〜２１のいずれかに記載の方法により同定される物質を活性化合物として含んでなり、少なくとも１種の医薬上許容される担体または賦形剤を組み合わせてなる医薬組成物。２９．さらに少なくとも１種の医薬物質からなる請求項２８記載の医薬組成物。３０．少なくとも１種のさらなる医薬物質が、ペニシリン、セファロスポリン、アミノグリコシド、スルホンアミド、テトラサイクリン、クロラムフェニコール、ポリミキシン、抗マイコバクテリア薬および尿防腐剤である請求項２９記載の医薬組成物。３１．ペリプラズム空間を通るこれらの繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合プロセスの間に繊毛サブユニットに結合する少なくとも１つのタイプのペリプラズム分子チャペロンと相互作用することができ、かかる様式でペリプラズム分子チャペロンへの繊毛サブユニットの結合を防止、阻害または促進する、医薬として使用される物質。３２．結合部位が、繊毛サブユニットのカルボキシル末端部分が結合しうる部位であり、該部位は、ＰａｐＤにおける不変残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２と実質的に同じ部位ポイントおよび繊毛サブユニットのカルボキシル末端のβ −ストランドと相互作用しうるポリペプチドフラグメントからなり、該相互作用により結合部位のＡｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２部位ポイントにおいて該サブユニットの結合を安定化する請求項３１記載の物質。３３．PapDに対する繊毛サブユニットまたはそのアナログのいずれかの変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはＰａｐＤに対するＭＢＰ−Ｇ１'−１４０'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こし、および／またはＰａｐＤに対するＧ１２５'−１４０'の変性形態の結合の防止、阻害または促進を起こす請求項３２記載の物質。３４．請求項８〜２１のいずれかに記載の方法により同定された、あるいは請求項２２〜２５のいずれかに記載の化合物である、請求項３１〜３３のいずれかに記載の物質。３５．細菌感染の治療および／または予防のための医薬組成物の製造のための、ペリプラズム分子チャペロンに対する繊毛サブユニットの結合が防止、阻害または促進されるように、ペリプラズム間隙を通しての繊毛サブユニットの輸送の間および／またはインタクトな繊毛の集合過程の間に繊毛サブユニットに結合する少なくとも１つのタイプのペリプラズム分子チャペロンと相互作用する能力を有する物質の使用。３６．結合部位が、繊毛サブユニットのカルボキシル末端部分が結合しうる部位であり、該部位は、ＰａｐＤにおける不変残基Ａｒｇ−８およびＬｙｓ−１１２と実質的に同じ部位ポイント、および繊毛サブユニットのカルボキシル末端の β−ストランドと相互作用しうるポリペプチドフラグメントからなり、該相互作用により結合部位のＡｒｇ−８およびLｙｓ−１１２部位ポイントにおいて該サブユニットの結合を安定化する請求項３５記載の使用。３７．物質が請求項８〜２１のいずれかに記載の方法により同定されたものであるか、あるいは物質が請求項２２〜２５のいずれかに記載の化合物である請求項３５または３６記載の使用。