JPH0614780A - α型DNAポリメラーゼ遺伝子のクローニング方法 - Google Patents

α型DNAポリメラーゼ遺伝子のクローニング方法

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JPH0614780A
JPH0614780A JP19471392A JP19471392A JPH0614780A JP H0614780 A JPH0614780 A JP H0614780A JP 19471392 A JP19471392 A JP 19471392A JP 19471392 A JP19471392 A JP 19471392A JP H0614780 A JPH0614780 A JP H0614780A
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JP
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dna polymerase
gene
lys
dna
leu
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Application number
JP19471392A
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English (en)
Inventor
Yuki Taguchi
由紀 田口
Yoshizumi Ishino
良純 石野
Ikunoshin Katou
郁之進 加藤
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Takara Shuzo Co Ltd
Original Assignee
Takara Shuzo Co Ltd
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Publication date
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 α型DNAポリメラーゼ遺伝子(以下、α遺
伝子と略記する)をクローニングする方法、及び新規な
α遺伝子を提供する。 【構成】 (a)α遺伝子を、配列表の配列番号1又は
2で表されるプライマーを用いて増幅させる工程、
(b)増幅DNAをプローブとし、それにハイブリダイ
ズするα遺伝子をクローニングする工程、を包含するα
遺伝子のクローニング方法。図4で表される制限酵素地
図を有し、その長さが約2.6kbであるDNAを含有す
る単離された、あるいは該遺伝子にハイブリダイズ可能
なα遺伝子。 【効果】 該α遺伝子を用い、遺伝子工学研究用試薬と
して有用なDNAポリメラーゼの遺伝子工学的製造が可
能である。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、遺伝子工学研究用試薬
として有用なα型DNAポリメラーゼをコードする遺伝
子のクローニング方法、及びクローニングされたα型D
NAポリメラーゼ遺伝子に関する。
【0002】
【従来の技術】DNAポリメラーゼは、そのアミノ酸配
列からヒトDNAポリメラーゼαを代表とするα型DN
Aポリメラーゼと、大腸菌DNAポリメラーゼを代表す
るポルI型DNAポリメラーゼとに大きく分類すること
ができる。これらは、種々の阻害剤に対する感受性でも
区別でき、α型DNAポリメラーゼは、例えばアフィジ
コリン( aphidicolin )やブチルアニリノウラシル( b
utylanilinouracil ) によって選択的に阻害される。α
型DNAポリメラーゼは、DNAの複製において主要な
役割を果たす酵素で、ヒト由来DNAポリメラーゼα、
酵母由来DNAポリメラーゼI、単純ヘルペスウイルス
由来DNAポリメラーゼ、ヒトサイトメガロウイルス由
来DNAポリメラーゼ、エプスタイン−バーウイルス由
来DNAポリメラーゼ、ワクチニアウイルス由来DNA
ポリメラーゼ、大腸菌由来のポリメラーゼII、アデノウ
イルス2型由来DNAポリメラーゼ、PRD1ファージ
由来DNAポリメラーゼ、φ29ファージ由来DNAポ
リメラーゼ等が知られている。しかし、一般的にα型D
NAポリメラーゼは、存在量が少ない上に不安定であ
り、構造的にも他のタンパク質と複合体を形成している
ため、高度に純化した精製標品を得ることは難しく、そ
の詳細な解析はなされていない。一般にDNAポリメラ
ーゼはその起源による酵素特異性を有しており、その性
質を生かした利用法がある。例えば、スルホロバス ソ
ルファタリカス( Sulfolobus solfataricus )は生育至
適温度が80℃である高熱性古細菌であり、この細菌由
来のα型DNAポリメラーゼは高温で安定であることが
予想され、遺伝子工学研究用試薬として有用な用途が期
待される。
【0003】しかしながら、該DNAポリメラーゼは、
菌体内にごく微量しか存在しないためこれまで単離され
た該酵素に関する報告はその活性の測定にとどまり〔ロ
ッシM.( Rossi, M.)ら、システマティック アンド
アプライド マイクロバイオロジー( Systematic and
Applied Microbiology )、第7巻、第337〜341頁
(1986)〕、詳細については明らかでない。また、
この酵素の遺伝子構造やアミノ酸配列についても不明で
あり、遺伝子の単離及び当該遺伝子をベクターに結合し
て遺伝子工学的に発現させる方法についても明らかにさ
れていない。
【0004】
【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、新規
なα型DNAポリメラーゼ遺伝子を特定し、該遺伝子を
簡便に効率よくクローニングする方法、及び該方法によ
り単離された新規α型DNAポリメラーゼ遺伝子を提供
することにある。
【0005】
【課題を解決するための手段】本発明を概説すれば、本
発明の第1の発明は、α型DNAポリメラーゼのクロー
ニング方法に関し、α型DNAポリメラーゼ遺伝子をク
ローニングする方法において、下記工程: (a)α型DNAポリメラーゼ遺伝子を、配列表の配列
番号1〜6で表されるプライマーから選択されるプライ
マーを用い、増幅させる工程、(b)増幅DNAをプロ
ーブとして用い、該プローブにハイブリダイズするα型
DNAポリメラーゼ遺伝子をクローニングする工程、を
包含することを特徴とする。本発明の第2の発明は、単
離されたα型DNAポリメラーゼ遺伝子に関し、図面の
図4で表される制限酵素地図を有し、その長さが約2.
6kbであるDNAを含有することを特徴とする。また、
本発明の第3の発明は、第2の発明のα型DNAポリメ
ラーゼ遺伝子にハイブリダイズ可能なα型DNAポリメ
ラーゼ遺伝子に関する。
【0006】本発明者らは、目的のα型DNAポリメラ
ーゼの遺伝子構造やアミノ酸配列を解析することなく、
短時間に効率よく、α型DNAポリメラーゼ遺伝子のク
ローニングを行う方法として、α型DNAポリメラーゼ
遺伝子の増幅に使用可能なプライマーを創製することに
成功し、該プライマーを用いることによって、未知のα
型DNAポリメラーゼ遺伝子の一部を増幅できること、
及び該増幅遺伝子をプローブとして用いることによって
目的のα型DNAポリメラーゼ遺伝子が効率よくクロー
ニングできること、及びクローニングした遺伝子を用い
α型DNAポリメラーゼを遺伝子工学的に効率よく得る
ことができることを見出し、本発明を完成させた。
【0007】以下、本発明を具体的に説明する。まず、
公知のα型DNAポリメラーゼのアミノ酸配列を比較
し、共通のアミノ酸配列を示す領域を基にしてミックス
プライマーを合成する。α型DNAポリメラーゼのアミ
ノ酸配列については例えば、ジ エンボ ジャーナル
( The EMBOJournal ) 、第7巻、第37〜47頁(19
88)、プロシーディングズ オブザ ナショナル ア
カデミー オブ サイエンシーズ オブ ザ USA
( Proceedings of the National Academy of Sciences
of the USA)、第85巻、第3772〜3776
頁(1988)、プロシーディングズ オブ ザ ナシ
ョナル アカデミー オブ サイエンシーズ オブ ザ
USA、第82巻、第7969〜7973頁(198
5)、ジャーナル オブ ヴィロロジー( Journal of
Virology )、第61巻、第125〜133頁(198
7)、ジ エンボジャーナル、第6巻、第169〜17
5頁(1987)にそれぞれ記載されている、ヒト由来
DNAポリメラーゼα、酵母由来DNAポリメラーゼ
I、単純ヘルペスウイルス由来DNAポリメラーゼ、ヒ
トサイトメガロウイルス由来DNAポリメラーゼ、エプ
スタイン−バーウイルス由来DNAポリメラーゼのアミ
ノ酸配列、またウォン T. S. -F.らによって報告され
た、これらに共通のアミノ酸配列〔ウォン T. S. -F.(
Wang T. S. -F.) ら、ザ ファーセブ ジャーナル( T
heFASEB Journal )、第3巻、第14〜21頁(198
9)〕等より、本発明において使用するミックスプライ
マー作製用のα型DNAポリメラーゼの共通アミノ酸配
列を選定する。
【0008】配列表の配列番号1に、ヒト由来DNAポ
リメラーゼα、酵母由来DNAポリメラーゼI、由来ヘ
ルペスウイルス由来DNAポリメラーゼ、ヒトサイトメ
ガロウイルス由来DNAポリメラーゼ、エプスタイン−
バーウイルス由来DNAポリメラーゼに共通の配列表の
配列番号7で表されるアミノ酸配列より作製されたミッ
クスプライマーの配列を示す。次に該配列を基に、GC
含量の低い、例えば配列表の配列番号2で表すAT型の
ミックスプライマーを、またGC含量の高い、例えば配
列表の配列番号3で表すGC型のミックスプライマーを
それぞれ作製することができる。このAT型のミックス
プライマーはGC含量の低いα型DNAポリメラーゼ遺
伝子の増幅に、GC型のミックスプライマーはGC含量
の高いα型DNAポリメラーゼ遺伝子の増幅に適してい
る。
【0009】配列表の配列番号4に、ヒト由来DNAポ
リメラーゼα、ヒトサイトメガロウイルス由来DNAポ
リメラーゼ、エプスタイン−バーウイルス由来DNAポ
リメラーゼに共通の配列表の配列番号8で表されるアミ
ノ酸配列より作製されたミックスプライマーの配列を示
す。該配列を基に、GC含量の少ない、例えば配列表の
配列番号5で表すAT型のミックスプライマーを、また
GC含量の多い、例えば配列表の配列番号6で表すGC
型のミックスプライマーをそれぞれ作製することができ
る。この場合もAT型のミックスプライマーはGC含量
の低いα型DNAポリメラーゼ遺伝子の増幅に、GC型
のミックスプライマーはGC含量の高いDNAポリメラ
ーゼ遺伝子の増幅に適している。
【0010】なお、本発明で使用できるα型DNAポリ
メラーゼ遺伝子の増幅用プライマーとしては、該遺伝子
の共通配列にハイブリダイズし、該遺伝子を効率よく増
幅できるものであれば良く、上記ミックスプライマーを
改変したものでも良く、また、他の共通配列より構築し
たものでも良い。また、該プライマーを用い、α型DN
Aポリメラーゼ遺伝子を増幅する方法としては、該遺伝
子を効率よく増幅できる方法であれば良く、例えば、ポ
リメラーゼ チェイン リアクション(PCR)法又は
その改良法を用いればよい。PCR法に使用するプライ
マー対としては上記ミックスプライマーを組合せて用い
ても良く、また該プライマーを他の遺伝子構造、例えば
ベクター由来のプライマーと組合せ用いても良い。例え
ば、配列番号2及び5で示すAT型のミックスプライマ
ーは、GC含量の低い染色体DNAからα型DNAポリ
メラーゼ遺伝子をクローニングする際に選択すればよ
く、また、配列番号3及び6で示すGC型のミックスプ
ライマーは、GC含量の高い染色体DNAからα型DN
Aポリメラーゼ遺伝子をクローニングする際に選択すれ
ばよい。また、GC含量が中程度若しくはGC含量につ
いての情報が得られない場合は、配列番号1及び4で示
す中間型のミックスプライマーを用いればよい。
【0011】例えば、上述のAT型のミックスプライマ
ーの組合せでスルホロバス ソルファタリカス由来の、
GC型のミックスプライマーの組合せでバチルス カル
ドテナックス( Bacillus caldotenax )由来の、中間型
のミックスプライマーの組合せで大腸菌、バチルス カ
ルドリティカス(B.caldolyticus )、バチルス ズブ
チリス(B.subtilis )、ラクトバチルス ブルガリカ
ス( Lactobacillus bulgaricus ) 、ラクトバチルス
カゼイ(L.casei ) 由来のα型DNAポリメラーゼ遺
伝子又は該遺伝子と推定される遺伝子をPCR法にて効
率よく増幅することができ、これらのプライマー対はα
型DNAポリメラーゼ遺伝子のクローニングに有用なP
CR用プライマー対として使用することができる。
【0012】α型DNAポリメラーゼ遺伝子のクローニ
ング、及び該遺伝子を含む形質転換体、α型DNAポリ
メラーゼ遺伝子の取得は、次に例示する工程により行う
ことができる。 (1)α型DNAポリメラーゼ産生能を有する細胞、ウ
イルス、あるいはファージから染色体DNAを抽出す
る。 (2)α型DNAポリメラーゼに共通な領域の情報を基
に作成した、配列表の配列番号1〜6で表されるプライ
マーから選択されるプライマーを用い、(1)で得たD
NAを鋳型としてPCRを行う。 (3)(1)で得たDNAを適当な制限酵素で切断し、
これに対して(2)で得たDNA断片をプローブとして
スクリーニングを行い、目的とするDNA断片を回収す
る。 (4)ベクターを制限酵素で開裂し、この開裂部位に
(3)で得たDNA断片を結合させる。 (5)DNA断片を結合させたベクターを宿主に導入
し、目的のDNA断片を含む形質転換体を選択する。 (6)(5)で得た形質転換体からプラスミドを取り出
し、目的のDNA断片を切り出して制限酵素地図を作成
し、これを基に必要に応じ目的の遺伝子全体を含む連続
した一本の断片に再編成し、(4)と同様の要領で発現
ベクターに結合させる。 (7)(6)で得た目的のDNA断片を含む発現ベクタ
ーを(5)と同じ要領で宿主に導入し、形質転換体を得
る。 (8)(7)で得た形質転換体を培養し、培養菌体より
DNAポリメラーゼを生産する。
【0013】本発明に使用する菌株、ウイルス、ファー
ジとしては、α型DNAポリメラーゼを産生するもので
あれば何でもよく、例として、スルホロバス ソルファ
タリカスP1株〔ドイッチェ ザムルンク フォン ミ
クロオルガニスメン(Deutsche Sammlung von Mikroorg
anismen ) の保存菌株:DSM1616T 〕、バチルス
カルドテナックスYT−G株〔ドイッチェ ザムルン
ク フォン ミクロオルガニスメンの保存菌株:DSM
406〕、大腸菌HB101株がある。
【0014】以下、該菌株を例として説明する。上記D
NA供与体であるスルホロバス ソルファタリカスP1
株(DSM1616T )由来DNAは、80℃で静置培
養した該培養菌体より抽出し、バチルスカルドテナック
スYT−G株〔DSM406)由来DNAは、70℃で
振とう培養した該培養菌体より抽出し、大腸菌HB10
1株由来DNAは、37℃で振とう培養した該培養菌体
より抽出する。抽出、精製、制限酵素による切断等は、
例えば、1982年 コールドスプリング ハーバー
ラボラトリー発行、T.マニアティス(T.Maniatis )
ほか著、モレキュラー クローニング、ア ラボラトリ
ー マニュアル( Molecular Cloning, A Laboratory
Manual )、第75〜178頁に記載されている方法を用
いることができる。
【0015】本発明者らは、GC含量の低いスルホロバ
ス ソルファタリカスP1株(約36%)には配列表の
配列番号2及び5に示す2種のオリゴヌクレオチドをプ
ライマーとし、GC含量の高いバチルス カルドテナッ
クスYT−G株(約65%)には配列表の配列番号3及
び6に示す2種のオリゴヌクレオチドをプライマーと
し、大腸菌HB101株(約49%)には配列表の配列
番号1及び4に示す2種のオリゴヌクレオチドをプライ
マーとし、それぞれの染色体DNAを鋳型に用いて、P
CR法により特異的なDNA断片が増幅することを見出
した。得られた断片の塩基配列から推定されるアミノ酸
配列は、公知の他のα型DNAポリメラーゼと類似して
いた。したがって、該DNA断片をプローブに用いてハ
イブリダイゼーションを行うことにより目的のDNAを
選択することができる。
【0016】以下には、スルホロバス ソルファタリカ
スについて述べる。まず、サザンハイブリダイゼーショ
ンを行い、目的のα型DNAポリメラーゼ遺伝子がスル
ホロバス ソルファタリカスDNAのどの制限酵素断片
上に存在するかを分析し、次に選択した制限酵素例えば
EcoRI、Hind III等を用いて分解したスルホロバス ソ
ルファタリカスDNAをプラスミドベクターにDNAリ
ガーゼを用いて組込む。プラスミドベクターとしては公
知のものが使用でき、例えばpUC18 、pUC19 、pTV118N
、pTV119N 等が挙げられるがこれらに限定されるもの
ではない。
【0017】次いで、これら組換えプラスミドを宿主大
腸菌に導入させる。宿主大腸菌としては、形質転換能を
有するものであれば野生株、変異株のいずれも使用でき
るが、制限系変異株で修飾系野生株(r- 、m+ )であ
ることが望ましい。形質転換体をプラスミドベクターの
特性、例えばpUC系ベクターの場合アンピシリン耐性
を有するコロニーを選択することにより、クローン化さ
れたDNAの集団を調製することができる。次に、上記
集団の中から目的の断片を有するクローンを選択する。
選択の方法はベクターの種類によってコロニーハイブリ
ダイゼーションあるいはプラークハイブリダイゼーショ
ンを用いればよい。
【0018】以上の操作によりα型DNAポリメラーゼ
遺伝子を含む約7kbのHind III断片がpTV119N に組込ま
れたクローン体を得た。サブクローニングされたDNA
断片の制限酵素地図を図2に示す。次に、このクローン
体の部分的なシークエンス結果を基にα型DNAポリメ
ラーゼ遺伝子を含む約3.8kbの領域をこのクローン体
から切り出し、発現ベクターpTV118N に組込んだ。該プ
ラスミドをpSPA101 と命名した。
【0019】プラスミドpSPA101 を有する大腸菌を培養
し、菌体の粗抽出液を得た。該抽出液は75℃、30分
処理後も十分量のDNAポリメラーゼ活性を示し、発現
ベクターのみを有する大腸菌粗抽出液ではこのような活
性を有しないことより、pSPA101 上に耐熱性DNAポリ
メラーゼ産生情報が存在し、かつ、大腸菌内で該情報を
有する遺伝子が発現していると結論した。また、該DN
Aポリメラーゼの活性がアフィジコリンにより阻害され
ることにより、α型のDNAポリメラーゼであることを
確認した。
【0020】プラスミドpSPA101 の構築工程を図1に示
す。DNAポリメラーゼ遺伝子は、プラスミドpSPA101
上の約3.8kbのDNA断片中にコードされており、該
断片の制限酵素地図を図3に示す。
【0021】プラスミドpSPA101 を保有する大腸菌を培
養し、耐熱性α型DNAポリメラーゼを発現させた培養
菌体より、耐熱性α型DNAポリメラーゼの採取を行う
ことができる。培養菌体より、例えば、超音波処理、熱
処理、ジエチルアミノエチル(DEAE)セルロースカ
ラムクロマトグラフィー、ヘパリン−トヨパール( Hep
arin−TOYOPEARL ) カラムクロマトグラフィーの各処理
を行い、α型DNAポリメラーゼをSDS−ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)でほぼ単一
のバンドとなるまで精製することができる。得られたD
NAポリメラーゼは、DNA合成活性を有し、その活性
はアフィジコリンにより阻害される。
【0022】精製タンパク質のアミノ酸分析を行い、そ
のN末端のアミノ酸配列を決定することができる。その
配列を配列表の配列番号9に示す。このアミノ酸配列、
分子量等より前述3.8kb断片中の翻訳可能領域を、本
発明のα型DNAポリメラーゼの構造遺伝子と決定し、
該DNAポリメラーゼの全アミノ酸配列を明らかにし
た。その塩基配列とアミノ酸配列を配列表の配列番号1
0に示す。
【0023】部位特異的変異の手法により、プラスミド
pSPA101 から約3.8kbの断片中の5′側非翻訳領域を
すべて除いた発現プラスミドを構築し、該プラスミドを
pSPA102 と命名した。図4にpSPA102 にクローニングさ
れている約2.6kbのDNA断片の制限酵素地図を、図
5にプラスミドpSPA102 の構築工程を示す。
【0024】以上、詳細に説明した様に、本発明によれ
ば、従来のα型DNAポリメラーゼ遺伝子のクローニン
グに必要であった、被検物α型DNAポリメラーゼ活性
の確認、該ポリメラーゼの生産、精製、単離、部分アミ
ノ酸配列の決定、プローブの作製等の工程が不要であ
り、被検物遺伝子より、目的のα型DNAポリメラーゼ
を効率よく、簡便に単離することができる。
【0025】
【実施例】以下に本発明の実施例を挙げるが、本発明は
これら実施例に限定されるものではない。
【0026】実施例1 α型DNAポリメラーゼ遺伝子クローニング用プローブ
の調製 (1)プライマーの調製 配列表の配列番号1〜6に示した6種類のミックスプラ
イマーをDNA合成機で合成し、精製した。次に、これ
らのプライマーのうち配列表の配列番号1及び配列番号
4に示したプライマーをそれぞれ100pmolとバチルス
カルドリティカス、バチルス ズブチリス、ラクトバ
チルス ブルガリカス、ラクトバチルス カゼイからそ
れぞれ調製したDNA0.5μgを用いて全量100μ
lで94℃30秒、40℃2分、72℃1分のPCRを
35サイクル行った。5μlをとりアガロースゲル電気
泳動で分析した結果、いずれもDNA断片が特異的に増
幅していた。
【0027】(2)スルホロバス ソルファタリカス染
色体DNAの調製 スルホロバス ソルファタリカスP1株を400mlの培
地(酵母エキス1.0g/l、カザミノ酸1.0g/
l、KH2 PO4 3.1g/l、(NH42 SO4
2.5g/l、MgSO4 ・7H2 O 0.20g/
l、CaCl2 ・2H 2 O 0.25g/l、MnCl
2 ・4H2 O 1.8mg/l、Na247・10H2
O 4.5mg/l、ZnSO4 ・7H2 O 0.22m
g/l、CuCl2 ・2H2 O 0.050mg/l、N
2 MoO4 ・2H2 O 0.030mg/l、VOSO
4 ・2H2 O 0.030mg/l、CoSO4 ・7H2
O 0.010mg/l、pH4.1)で80℃一夜静置
培養し、集菌した菌体を4mlの25%ショ糖、0.05
Mトリス−HCl(pH8.0)に懸濁し、リゾチーム
(5mg/ml)を800μl加えて20℃、1時間放置し
た。SET溶液〔20mMトリス−HCl(pH8.
0)、1mM EDTA、150mM NaCl〕を24ml
加えた後、5%SDS溶液を4mlとプロティナーゼK
(10mg/ml)を400μl加えて37℃、1時間放置
した。フェノール抽出、クロロホルム抽出の後、エタノ
ールを加えて長鎖DNAを不溶化し、滅菌したつまよう
じで巻取って回収した。以上の操作により、約185μ
gのDNAが得られた。
【0028】(3)バチルス カルドテナックス染色体
DNAの調製 バチルス カルドテナックスYT−G株を125mlのL
培地(バクトトリプトン10g/l、酵母エキス5g/
l、NaCl 5g/l、pH7.2)で65℃一夜振
とう培養し、集菌した菌体から(1)と同様の操作によ
り、約3.1mgのDNAを回収した。
【0029】(4)大腸菌染色体DNAの調製 大腸菌HB101株を100mlのL培地で37℃一夜振
とう培養し、集菌した菌体から(1)と同様の操作によ
り、約5mgのDNAを回収した。
【0030】(5)PCRを用いた特異的DNA断片の
増幅 配列表の配列番号2及び配列番号5に示した2種類のミ
ックスプライマーをそれぞれ100pmolと(2)で調製
したスルホロバス ソルファタリカスDNA0.5μg
を用いて全量100μlで94℃30秒、40℃2分、
72℃1分のPCRを35サイクル行った。5μlをと
りアガロースゲル電気泳動で分析した結果、約400塩
基対のDNA断片が特異的に増幅していた。同様にして
配列表の配列番号3及び配列番号6に示した2種類のミ
ックスプライマーを用いた場合は非特異的な増幅のみが
認められた。
【0031】次に、配列表の配列番号3及び配列番号6
に示した2種類のミックスプライマーをそれぞれ100
pmolと(3)で調製したバチルス カルドテナックスD
NA0.5μgを用いて同様にPCRを行ったところ、
約300塩基対のDNA断片が特異的に増幅していた。
同様にして配列表の配列番号2及び配列番号5に示した
2種類のミックスプライマーを用いた場合は非特異的な
増幅のみが認められた。
【0032】次に配列表の配列番号1及び配列番号4に
示した2種類のミックスプライマーをそれぞれ100pm
olと(4)で調製した大腸菌DNA0.5μgを用いて
同様にPCRを行ったところ、約400塩基対のDNA
断片が特異的に増幅していた。
【0033】これらのDNA断片をHindIIで開裂したpU
C118に組込みジデオキシ法により塩基配列を分析した。
得られた塩基配列から推定されるアミノ酸配列は、公知
の他のα型DNAポリメラーゼと類似していた。したが
って、該DNA断片をプローブとして用いることができ
る。
【0034】実施例2 スルホロバス ソルファタリカス由来α型DNAポリメ
ラーゼ遺伝子のクローニング (1)ゲノミックサザン法による目的遺伝子の検索 スルホロバス ソルファタリカスDNAを1つの酵素に
つき4μgを用いてBamHI、EcoRI、Hind III、 PstI
で分解し、アガロースゲル電気泳動に供した。ゲル中の
DNAをナイロン膜に移し、実施例1−(5)で得た約
400塩基のDNAをプローブに用いてハイブリダイゼ
ーションを行った。プローブはランダムプライミング法
により放射性標識した。ハイブリダイゼーションは、6
×SSC、1%SDS、5×デンハーツ溶液、100μ
g/mlの子牛胸腺DNA中で65℃5時間行った。1×
SSC、0.1%SDS溶液中で1時間洗浄した後、X
線フィルムに感光し、オートラジオグラムをとった。約
9kbのBamHI断片、約8kbのEcoRI断片、約6.5kbの
Hind III断片、約9kbの PstI断片が陽性を示した。
【0035】(2)DNAポリメラーゼ遺伝子を含むD
NA断片のクローン化 (1)で陽性を示したDNA断片のうち、EcoRI(約8
kb)及びHind III(約6.5kb)の断片をプラスミドベ
クターにクローン化するため、スルホロバス ソルファ
タリカスDNAをそれぞれ5μgずつ各酵素で分解し、
目的の大きさのDNAをアガロースゲルより回収した。
回収は、ガラスビーズ吸着法を用いた。pTV119N プラス
ミドをそれぞれ同じ酵素で開環し、アルカリ性ホスファ
ターゼ(BAP)で末端のリン酸基を除去した。回収し
たDNAをこのベクターにDNAリガーゼを用いて結合
した後、大腸菌JM109に導入した。得られた形質転
換体の集団の中からコロニーハイブリダイゼーションに
よって目的のクローンを選択した。ナイロン膜上に生育
させた形質転換体のコロニーを0.5N水酸化ナトリウ
ム、1.5M塩化ナトリウム溶液で変性させた後、1M
トリス−HCl(pH7.0)、1.5M塩化ナトリウ
ム溶液で中和し、紫外線照射でDNAを膜上に固定し
た。プローブ調製及びハイブリダイゼーションの条件は
(1)に準じた。HindIII の86個のコロニーより、1
個の陽性コロニーを得た。
【0036】(3)クローン化断片の制限酵素分析、部
分シークエンス、及びDNAポリメラーゼ遺伝子発現用
プラスミドの再構築 (2)で得た陽性クローンのDNA断片について、制限
酵素地図を作製し、一部の塩基配列を決定した結果、上
記クローンには目的のDNAポリメラーゼ遺伝子をコー
ドする領域がすべて含まれ、更に制限酵素部位をうまく
選択することにより5′及び3′側の非翻訳領域の一部
を除けることが判明した。図1に示すように、(2)で
得た陽性クローンから切り出したDNA断片とpTV118N
ベクターを連結させ、DNAポリメラーゼ遺伝子を含む
約3.8kbのDNA断片を組込んだプラスミドを構築
し、pSPA101 と命名した。
【0037】なお、図1はpSPA101 の構築を示す工程図
である。また、図3は、pSPA101 にクローニングされて
いるDNAポリメラーゼ遺伝子を含む SmaI− PstI断
片の制限酵素地図を示す図である。
【0038】次に、該プラスミドで大腸菌JM109株
を形質転換し、形質転換体Escherichia coli JM109/pS
PA101 を得た。
【0039】(4)形質転換体の培養及び粗抽出液の調
製 上記組換えプラスミドを有する大腸菌 JM109/pSPA101
をアンピシリンが50μg/mlの濃度で存在するL培地
5mlに植菌し、37℃で培養した。培養液の濁度が0.
6(A660 )のとき、誘導物質であるイソプロピル−β
−D−チオガラクトシド(IPTG)を添加し、更に1
5時間培養を行った。培養液を集菌し、50mMトリス−
HCl(pH7.5)、1mM EDTA、4μMパラア
ミジノフェニルメタンスルホニルフルオライド(p−A
PMSF)、0.5μg/mlロイペプチン( leupeptin
e ) に懸濁し、超音波処理を行った。遠心分離して上清
を回収し、これに10mMトリス−HCl(pH8.
0)、1mMEDTA、50mM塩化カリウム、0.5%ト
ライトンX100 (Triton X100)を加え、75℃で30分
間静置した後再度遠心分離して上清を回収し、粗抽出液
とした。
【0040】(5)DNAポリメラーゼ活性の測定 反応液として67mMリン酸カリウム(pH7.4)、3
mM塩化マグネシウム、1mM 2−メルカプトエタノー
ル、20μM活性化DNA、200μM dATP、d
GTP、dCTP、100μM TTP、100μM
3H〕TTPを用意し、この溶液100μlに対して
適当量の(4)で得た粗抽出液を加え、70℃で10分
間反応させた後、氷中に静置した。この反応液から50
μlをDEAEフィルター上に移し、5%リン酸水素二
ナトリウムで数回洗浄した後、70%エタノールで置換
し、フィルターを乾燥して液体シンチレーションカウン
ターでフィルター上の放射活性を測定した。1mlの培養
液から約1単位のDNAポリメラーゼが得られた。
【0041】(6)アフィジコリン感受性の測定 (5)の方法に準じてDNAポリメラーゼ活性を測定す
る際に、0〜200μg/mlのアフィジコリンを加え、
活性に及ぼす影響を調べた。図6に示すように、アフィ
ジコリン濃度に依存してポリメラーゼ活性の減少がみら
れた。
【0042】(7)プラスミドpSPA101 を導入した大腸
菌による耐熱性DNAポリメラーゼの生産 大腸菌 JM109/pSPA101 の30リットルの培養液より精
製を開始し、(4)で示した方法により、250mlの粗
抽出液を得た。これをDE緩衝液〔50mMトリス−HC
l(pH7.5)、1mM EDTA、4μMのp−AP
MSF、0.5μg/mlロイペプチン、0.02%トラ
イトンX100 〕で平衡化したDE53−(ワットマン
社)カラム100mlに添加し、非吸着画分を集めた。こ
れを更に同緩衝液で平衡化したヘパリン−トヨパールカ
ラム(東ソー)に添加し、0M〜1MNaClの直線濃
度勾配で溶出し活性画分を集めた。このようにして得た
酵素標品をSDS−PAGEで分析したところ、分子量
約9万ダルトンのほぼ単一なバンドを与えた。
【0043】(8)アミノ酸シークエンサーによるN末
端アミノ酸配列の決定 (7)で得られた酵素標品をアミノ酸シークエンサーに
かけ、配列表の配列番号9に示すN末端アミノ酸配列を
決定した。
【0044】(9)発現プラスミドpSPA102 の構築 上記プラスミドpSPA101 から3.8kb断片中の5′側非
翻訳領域を部位特異的変異の手法により除去した。図5
にその工程を示す。まず、配列表の配列番号11に示す
オリゴヌクレオチドを合成し、サイト−ダイレクテッド
ミュータジェネシスシステム ミュータン−K〔宝酒
造(株)〕を用いて、DNAポリメラーゼ遺伝子の開始
コドン(ATG)の部位に NcoIサイトを導入した。得
られたプラスミドを NcoI消化して連結することによ
り、5′側非翻訳領域を欠失したプラスミドを得た。こ
のプラスミドには、開始コドンと第2番目のコドン(A
CT)の間に余分な塩基(G)が付加されているので、
配列表の配列番号12に示すオリゴヌクレオチドを用い
て上記の部位特異的変異の手法でこれを除去し、翻訳の
フレームの合ったプラスミドを構築した。該プラスミド
をpSPA102 を命名した。該プラスミドで大腸菌JM10
9株を形質転換し、形質転換体Escherichia coli JM109
/pSPA102 を得た。
【0045】(10)DNAポリメラーゼの構造遺伝子を
含むスルホロバス ソルファタリカス染色体DNA断片
の塩基配列の決定 プラスミドpSPA101 から種々の大きさの欠失変異体ある
いは適当な制限酵素断片を調製し、それらを鋳型にして
ジデオキシ法により塩基配列を解読していった。得られ
たデータをつなぎ合せ、最終的に配列表の配列番号10
に示す全長の塩基配列を決定した。(8)で決定したN
末端アミノ酸配列と本塩基配列より、本発明のDNAポ
リメラーゼの構造遺伝子及びアミノ酸配列を明らかにす
ることができた。
【0046】
【発明の効果】以上、詳細に説明したように本発明によ
り新規なDNAポリメラーゼ遺伝子の簡便で効率のよい
クローニング方法、及び該遺伝子が提供される。また、
単離された遺伝子を用い、遺伝子工学研究用試薬として
有用なDNAポリメラーゼの遺伝子工学的製造法も提供
される。
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:NO 配列: WSNYTNTAYC CNWSNATHAT 20 配列番号:2 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:NO 配列: WSHYTDTAYC CDWSDATHAT 20 配列番号:3 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:NO 配列: WSSYTSTACC CSWSSATCAT 20 配列番号:4 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:YES 配列: TCNGTRTCNC CRTARATNAC 20 配列番号:5 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:YES 配列: TCDGTATCDC CRTARATNAC 20 配列番号:6 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:YES 配列: TCSGTRTCSC CGTAGATVAC 20 配列番号:7 配列の長さ:7 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列番号:8 配列の長さ:7 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列番号:9 配列の長さ:10 配列の型:アミノ酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:N末端フラグメント 配列番号:10 配列の長さ:2649 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:genomic DNA 起源: 生物名:スルホロバス ソルファタリカス(Sulofolobus
solfataricus) 配列: ATG ACT AAG CAA CTT ACC TTA TTT GAT ATT CCT TCA TCT AAA CCC 45 Met Thr Lys Gln Leu Thr Leu Phe Asp Ile Pro Ser Ser Lys Pro 1 5 10 15 GCT AAG AGT GAA CAA AAT ACT CAA CAA TCG CAA CAG AGT GCT CCC 90 Ala Lys Ser Glu Gln Asn Thr Gln Gln Ser Gln Gln Ser Ala Pro 20 25 30 GTT GAG GAA AAA AAG GTA GTT AGG AGG GAA TGG CTT GAA GAG GCT 135 Val Glu Glu Lys Lys Val Val Arg Arg Glu Trp Leu Glu Glu Ala 35 40 45 CAG GAA AAT AAG ATA TAC TTC CTA TTG CAA GTA GAT TAT GAT GGT 180 Gln Glu Asn Lys Ile Tyr Phe Leu Leu Gln Val Asp Tyr Asp Gly 50 55 60 AAG AAA GGT AAG GCT GTA TGT AAG CTA TTC GAT AAA GAA ACT CAA 225 Lys Lys Gly Lys Ala Val Cys Lys Leu Phe Asp Lys Glu Thr Gln 65 70 75 AAG ATC TAT GCC CTA TAT GAT AAT ACT GGA CAT AAG CCC TAC TTT 270 Lys Ile Tyr Ala Leu Tyr Asp Asn Thr Gly His Lys Pro Tyr Phe 80 85 90 CTA GTA GAT CTT GAA CCT GAT AAA GTA GGT AAA ATA CCT AAG ATT 315 Leu Val Asp Leu Glu Pro Asp Lys Val Gly Lys Ile Pro Lys Ile 95 100 105 GTT AGA GAT CCA TCT TTT GAT CAC ATA GAG ACT GTG AGT AAG ATA 360 Val Arg Asp Pro Ser Phe Asp His Ile Glu Thr Val Ser Lys Ile 110 115 120 GAC CCG TAT ACT TGG AAT AAA TTC AAA TTA ACT AAA ATC GTT GTT 405 Asp Pro Tyr Thr Trp Asn Lys Phe Lys Leu Thr Lys Ile Val Val 125 130 135 AGA GAT CCC CTA GCA GTG AGA AGA TTA AGG AAT GAT GTT CCA AAA 450 Arg Asp Pro Leu Ala Val Arg Arg Leu Arg Asn Asp Val Pro Lys 140 145 150 GCG TAT GAG GCT CAC ATA AAA TAT TTT AAC AAC TAC ATG TAT GAC 495 Ala Tyr Glu Ala His Ile Lys Tyr Phe Asn Asn Tyr Met Tyr Asp 155 160 165 ATA GGT CTA ATC CCC GGT ATG CCT TAT GTT GTT AAG AAT GGG AAG 540 Ile Gly Leu Ile Pro Gly Met Pro Tyr Val Val Lys Asn Gly Lys 170 175 180 TTA GAA AGT GTC TAT TTG TCT TTG GAC GAG AAA GAT GTT GAG GAG 585 Leu Glu Ser Val Tyr Leu Ser Leu Asp Glu Lys Asp Val Glu Glu 185 190 195 ATT AAG AAA GCC TTC GCT GAT TCA GAT GAA ATG ACT AGA CAA ATG 630 Ile Lys Lys Ala Phe Ala Asp Ser Asp Glu Met Thr Arg Gln Met 200 205 210 GCA GTC GAT TGG CTT CCC ATA TTT GAA ACT GAA ATA CCT AAA ATA 675 Ala Val Asp Trp Leu Pro Ile Phe Glu Thr Glu Ile Pro Lys Ile 215 220 225 AAA AGG GTT GCG ATA GAT ATT GAG GTA TAT ACA CCA GTT AAG GGT 720 Lys Arg Val Ala Ile Asp Ile Glu Val Tyr Thr Pro Val Lys Gly 230 235 240 AGA ATC CCA GAC TCT CAG AAG GCT GAG TTT CCA ATT ATA AGT ATA 765 Arg Ile Pro Asp Ser Gln Lys Ala Glu Phe Pro Ile Ile Ser Ile 245 250 255 GCA TTA GCG GGG AGT GAT GGA TTA AAG AAG GTT CTT GTA TTA AAT 810 Ala Leu Ala Gly Ser Asp Gly Leu Lys Lys Val Leu Val Leu Asn 260 265 270 AGG AAT GAT GTC AAT GAA GGG AGT GTA AAA CTT GAT GGA ATA TCG 855 Arg Asn Asp Val Asn Glu Gly Ser Val Lys Leu Asp Gly Ile Ser 275 280 285 GTT GAG AGA TTT AAT ACA GAG TAC GAA CTG TTA GGG AGA TTT TTT 900 Val Glu Arg Phe Asn Thr Glu Tyr Glu Leu Leu Gly Arg Phe Phe 290 295 300 GAT ATA CTG TTA GAA TAT CCG ATA GTT CTT ACA TTC AAT GGA GAC 945 Asp Ile Leu Leu Glu Tyr Pro Ile Val Leu Thr Phe Asn Gly Asp 305 310 315 GAT TTT GAT TTA CCT TAC ATT TAC TTT AGG GCG TTA AAG TTA GGT 990 Asp Phe Asp Leu Pro Tyr Ile Tyr Phe Arg Ala Leu Lys Leu Gly 320 325 330 TAT TTT CCA GAG GAA ATT CCC ATA GAT GTA GCT GGT AAG GAT GAA 1035 Tyr Phe Pro Glu Glu Ile Pro Ile Asp Val Ala Gly Lys Asp Glu 335 340 345 GCC AAG TAT CTA GCT GGT CTT CAT ATA GAC TTG TAC AAA TTC TTC 1080 Ala Lys Tyr Leu Ala Gly Leu His Ile Asp Leu Tyr Lys Phe Phe 350 355 360 TTT AAT AAG GCA GTG AGG AAT TAT GCA TTT GAG GGA AAG TAT AAT 1125 Phe Asn Lys Ala Val Arg Asn Tyr Ala Phe Glu Gly Lys Tyr Asn 365 370 375 GAA TAC AAT TTA GAT GCA GTT GCA AAG GCC TTA TTA GGG ACA TCA 1170 Glu Tyr Asn Leu Asp Ala Val Ala Lys Ala Leu Leu Gly Thr Ser 380 385 390 AAA GTT AAG GTA GAT ACG CTA ATA TCT TTC TTA GAT GTA GAA AAA 1215 Lys Val Lys Val Asp Thr Leu Ile Ser Phe Leu Asp Val Glu Lys 395 400 405 TTA ATA GAA TAT AAC TTT AGG GAT GCC GAA ATC ACA CTT CAG CTT 1260 Leu Ile Glu Tyr Asn Phe Arg Asp Ala Glu Ile Thr Leu Gln Leu 410 415 420 ACT ACA TTT AAT AAC GAC CTA ACT ATG AAG TTA ATT GTA TTG TTT 1305 Thr Thr Phe Asn Asn Asp Leu Thr Met Lys Leu Ile Val Leu Phe 425 430 435 TCT AGA ATT TCT AGA CTA GGA ATT GAG GAA TTA ACT CGG ACA GAA 1350 Ser Arg Ile Ser Arg Leu Gly Ile Glu Glu Leu Thr Arg Thr Glu 440 445 450 ATA TCT ACT TGG GTA AAG AAT TTA TAT TAT TGG GAA CAT AGA AAA 1395 Ile Ser Thr Trp Val Lys Asn Leu Tyr Tyr Trp Glu His Arg Lys 455 460 465 AGA AAT TGG TTA ATT CCT CTT AAG GAA GAA ATC TTA GCG AAA TCC 1440 Arg Asn Trp Leu Ile Pro Leu Lys Glu Glu Ile Leu Ala Lys Ser 470 475 480 TCT AAT ATA AGA ACT TCT GCT CTA ATA AAG GGA AAA GGA TAT AAA 1485 Ser Asn Ile Arg Thr Ser Ala Leu Ile Lys Gly Lys Gly Tyr Lys 485 490 495 GGC GCA GTA GTT ATA GAC CCA CCT GCT GGA ATA TTC TTT AAC ATA 1530 Gly Ala Val Val Ile Asp Pro Pro Ala Gly Ile Phe Phe Asn Ile 500 505 510 ACT GTT TTA GAT TTT GCA TCA CTA TAT CCT TCA ATA ATT AGA ACG 1575 Thr Val Leu Asp Phe Ala Ser Leu Tyr Pro Ser Ile Ile Arg Thr 515 520 525 TGG AAT CTT AGT TAC GAG ACT GTA GAC ATT CAA CAA TGT AAG AAG 1620 Trp Asn Leu Ser Tyr Glu Thr Val Asp Ile Gln Gln Cys Lys Lys 530 535 540 CCC TAT GAA GTA AAG GAT GAG ACA GGG GAG GTG CTA CAT ATA GTT 1665 Pro Tyr Glu Val Lys Asp Glu Thr Gly Glu Val Leu His Ile Val 545 550 555 TGC ATG GAT AGG CCA GGT ATA ACA GCA GTA ATA ACT GGG TTA CTA 1710 Cys Met Asp Arg Pro Gly Ile Thr Ala Val Ile Thr Gly Leu Leu 560 565 570 AGA GAC TTC AGA GTA AAG ATA TAC AAA AAG AAA GCG AAG AAC CCT 1755 Arg Asp Phe Arg Val Lys Ile Tyr Lys Lys Lys Ala Lys Asn Pro 575 580 585 AAT AAT AGT GAG GAA CAA AAA CTA CTC TAT GAC GTA GTA CAG AGA 1800 Asn Asn Ser Glu Glu Gln Lys Leu Leu Tyr Asp Val Val Gln Arg 590 595 600 GCA ATG AAA GTA TTC ATA AAT GCT ACT TAC GGT GTA TTT GGA GCT 1845 Ala Met Lys Val Phe Ile Asn Ala Thr Tyr Gly Val Phe Gly Ala 605 610 615 GAA ACA TTT CCG TTA TAT GCG CCA GCT GTA GCG GAG AGT GTT ACT 1890 Glu Thr Phe Pro Leu Tyr Ala Pro Ala Val Ala Glu Ser Val Thr 620 625 630 GCA CTG GGG AGA TAC GTT ATT ACC AGT ACC GTA AAG AAA GCT AGG 1935 Ala Leu Gly Arg Tyr Val Ile Thr Ser Thr Val Lys Lys Ala Arg 635 640 645 GAA GAA GGT TTA ACT GTA TTA TAC GGT GAT ACT GAT TCT TTA TTC 1980 Glu Glu Gly Leu Thr Val Leu Tyr Gly Asp Thr Asp Ser Leu Phe 650 655 660 CTC CTT AAT CCT CCC AAG AAT AGT TTA GAA AAT ATT ATA AAA TGG 2025 Leu Leu Asn Pro Pro Lys Asn Ser Leu Glu Asn Ile Ile Lys Trp 665 670 675 GTT AAA ACT ACT TTC AAT TTA GAT TTG GAA GTT GAT AAA ACC TAC 2070 Val Lys Thr Thr Phe Asn Leu Asp Leu Glu Val Asp Lys Thr Tyr 680 685 690 AAG TTT GTG GCT TTT TCT GGA TTG AAG AAG AAT TAC TTT GGA GTA 2115 Lys Phe Val Ala Phe Ser Gly Leu Lys Lys Asn Tyr Phe Gly Val 695 700 705 TAC CAA GAC GGG AAG GTT GAT ATA AAG GGG ATG TTA GTG AAG AAG 2160 Tyr Gln Asp Gly Lys Val Asp Ile Lys Gly Met Leu Val Lys Lys 710 715 720 AGA AAC ACG CCG GAA TTT GTA AAG AAG GTA TTT AAC GAG GTA AAG 2205 Arg Asn Thr Pro Glu Phe Val Lys Lys Val Phe Asn Glu Val Lys 725 730 735 GAG CTA ATG ATC TCC ATA AAC TCG CCA AAC GAT GTG AAG GAG ATT 2250 Glu Leu Met Ile Ser Ile Asn Ser Pro Asn Asp Val Lys Glu Ile 740 745 750 AAA AGA AAA ATT GTA GAC GTA GTT AAA GGA TCA TAT GAA AAA CTA 2295 Lys Arg Lys Ile Val Asp Val Val Lys Gly Ser Tyr Glu Lys Leu 755 760 765 AAA AAC AAA GGA TAC AAT CTG GAC GAA TTA GCG TTT AAA GTA ATG 2340 Lys Asn Lys Gly Tyr Asn Leu Asp Glu Leu Ala Phe Lys Val Met 770 775 780 CTA TCG AAG CCT TTA GAT GCG TAC AAA AAG AAC ACT CCC CAA CAC 2385 Leu Ser Lys Pro Leu Asp Ala Tyr Lys Lys Asn Thr Pro Gln His 785 790 795 GTA AAG GCA GCT CTA CAA CTT AGA CCA TTT GGA GTT AAC GTA TTA 2430 Val Lys Ala Ala Leu Gln Leu Arg Pro Phe Gly Val Asn Val Leu 800 815 820 CCA CGA GAT ATA ATA TAC TAT GTT AAG GTT AGA TCT AAA GAT GGA 2475 Pro Arg Asp Ile Ile Tyr Tyr Val Lys Val Arg Ser Lys Asp Gly 825 830 835 GTG AAA CCA GTA CAA CTA GCT AAA GTT ACT GAA ATA GAC GCA GAG 2520 Val Lys Pro Val Gln Leu Ala Lys Val Thr Glu Ile Asp Ala Glu 840 845 850 AAA TAT TTA GAA GCG TTA AGA AGT ACG TTT GAG CAA ATC TTA AGG 2565 Lys Tyr Leu Glu Ala Leu Arg Ser Thr Phe Glu Gln Ile Leu Arg 855 860 865 GCA TTC GGA GTC TCT TGG GAT GAG ATA GCA GCC ACA ATG TCG ATA 2610 Ala Phe Gly Val Ser Trp Asp Glu Ile Ala Ala Thr Met Ser Ile 870 875 880 GAT TCG TTC TTT TCA TAC CCA AGT AAA GGA AAT AGT TAA 2649 Asp Ser Phe Phe Ser Tyr Pro Ser Lys Gly Asn Ser 885 890 配列番号:11 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:NO 配列: ATATGTTAGA AACCATGGAC TAAGCAACTT 30 配列番号:12 配列の長さ:24 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成DNA) アンチセンス:NO 配列: AAACAGACCA TGACTAAGCA ACTT 24
【図面の簡単な説明】
【図1】pSPA101 の構築を示す工程図である。
【図2】クローニングされた約7kbのDNA断片の制限
酵素地図を示す図である。
【図3】pSPA101 にクローニングされている約3.8kb
のDNA断片の制限酵素地図を示す図である。
【図4】pSPA102 にクローニングされている約2.6kb
のDNA断片の制限酵素地図を示す図である。
【図5】pSPA102 の構築を示す工程図である。
【図6】クローニングされたDNAポリメラーゼ遺伝子
のアフィジコリンに対する感受性を示す図である。

Claims (3)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 α型DNAポリメラーゼ遺伝子をクロー
    ニングする方法において、下記工程: (a)α型DNAポリメラーゼ遺伝子を、配列表の配列
    番号1〜6で表されるプライマーから選択されるプライ
    マーを用い、増幅させる工程、(b)増幅DNAをプロ
    ーブとして用い、該プローブにハイブリダイズするα型
    DNAポリメラーゼ遺伝子をクローニングする工程、を
    包含することを特徴とするα型DNAポリメラーゼ遺伝
    子のクローニング方法。
  2. 【請求項2】 図面の図4で表される制限酵素地図を有
    し、その長さが約2.6kbであるDNAを含有すること
    を特徴とする単離されたα型DNAポリメラーゼ遺伝
    子。
  3. 【請求項3】 請求項2記載のα型DNAポリメラーゼ
    遺伝子にハイブリダイズ可能なα型DNAポリメラーゼ
    遺伝子。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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