JP7440940B2 - Plk1の選択的分解誘導化合物 - Google Patents
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- C07D417/14—Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having nitrogen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D415/00 containing three or more hetero rings
-
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- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
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-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
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Description
ット効果(off-target effect)による副作用を引き起こす可能性がある。特にBRD4活性の強力な阻害は、薬理学的効果と共に血液毒性や胃腸毒性などのオンターゲット毒性(on target toxicity)が必然的に伴うということがすでに広く知られていることを鑑みると、前記文献に記載されたPROTAC化合物がBRD4を効果的に分解すればするほど、臨床的副作用が大きくなると予想される(文献[Bolden et al.Cell Reports、2014]等)。
本願発明は、PLK1(Polo-like kinase 1)の選択的分解を誘導する新規化合物を提供する。具体的には、本願発明は、PLK1結合部分及びE3ユビキチンリガーゼ結合部分が化学リンカーによって結合されている二官能性化合物を提供する。
ULMは、CRBNまたはVHL E3ユビキチンリガーゼ結合部分であり、
PTMは、以下の式IIで表されるPLK1結合部分であり、
[式II]
{前記式IIにおいて、
R1は、水素、C1-5アルキルまたはC3-6シクロアルキルであり、
R1Aは、水素またはC1-3アルキルであり、
R2は、水素、ハロゲン、C1-6アルキルまたは-OR2Aであり、
R2Aは、1つ以上のハロゲンまたはヒドロキシ基で置換されることができるC1-4アルキルまたはC3-6シクロアルキルであり、
R3は、水素、ハロゲン、-NO2 、-CN、-OH、C1-4アルキルまたは-OC1-4アルキルであり、
R4は、単結合、
からなる群から選択され、
R5は、水素またはC1-4アルキルである。}
はリンカーにPTMを結合する共有結合を示す。
本願発明の一実施例によれば、ULMは、CRBN E3ユビキチンリガーゼ結合部分である。
E3ユビキチンリガーゼに結合するという事実が知られてから(文献[Ito et al.、2010])、レナリドミドやポマリドミドを含む多数の免疫調節性イミド薬(immunomodulatory imide drug;IMiD)がCRBN結合能を有することが報告された(文献[Chamberlain and Brian.2019]、文献[Akuffo et al.2018])、文献[Burslem et al.2018]等)。
ここで、
は、
からなる群から選択された環であり;
X1は、単結合、-CH2-、-NH-、-O-、-CH2CH2-、-CC-、-CO-、-COO-、-NHCO-または-CONH-であり;
X2は、-CH2-、-CH(C1-4アルキル)-、-NH-、-N(C1-4アルキル)-、-O-、-CO-、-CH2-CH2-、-NH-CH2-、-NH-CH(C1-4アルキル)-、-N=CH-、-N =C(C1-4アルキル)-または-N=N-であり;
X3は、水素またはC1-4アルキルであり;
X4は、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、CN、NH2 、NO2、OH、COH、COOHまたはCF3である。
[式A-2]
ここで、
X2は、-CH2-、-CH(C1- 4アルキル)-、-CO-または-N=N-であり;
X3は、水素またはC1 -3アルキルである。
野において一部公知されている。例えば、Ala-Leu-Ala-(Hy)Pro-Tyr-Ile-Proヘプタペプチド(文献[Schneekloth et al.、2004])、Leu-Ala-(Hy)Pro-Tyr-Ileペンタペプチド(文献[Rodriguez-Gonzalez et al.、2008])のようなペプチドが知られてから、これを改良した低分子VHL E3ユビキチンリガーゼ結合化合物が報告されている(文献[Buckley et al.J .Am .Chem .Soc.2012]、文献[Buckley et al.Ang.Chem .Int.Ed.2012]、文献[Galdeano et al.、2014]、文献[Soares et al.2017]等)。
ここで、
nは、1~3の整数であり;
は、五員環~六員環シクロアルキル、フェニル、五員環~六員環ヘテロシクロアルキルまたは五員環~六員環ヘテロアリールであり、ここで、前記ヘテロシクロアルキルまたはヘテロアリールは、N、OまたはS原子を1~3個含み;
Y1は、水素またはC1-4アルキルであり;
Y2はC1-4アルキル、ヒドロキシ(C1-4アルキル)、-(C0-2アルキル)-COH、C3-8シクロアルキル、またはフェニルであり;
Y3は、水素、
または
であり、
Y4は、水素、ハロゲン、C1-4アルキル、-O(C1-4アルキル)、C3-6シクロアルキルまたは四員環~六員環ヘテロシクロアルキルであり[ここで、ハロゲン、-OH、-CN、-NHCOH、-NHCOCH3、-COHまたは-COCH3で任意に置換されることができる。];
Y5は、水素またはC1-4アルキルである。
は、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、オキサジアゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、及びテトラヒドロフランからなる群から選択された五員環ヘテロアリール環であり;
Y1は、水素またはC1-3アルキルであり;
Y4は、水素またはハロゲンで置換することができるC1-4アルキルまたはC3-5シクロアルキルである。
一実施例において、前記式B-2-1で表されるVHL E3ユビキチンリガーゼは、
次の群から選択される。
を介してリンカーが共有結合によって結合されることができる。
が示されていない場合、E3ユビキチンリガーゼリガンド結合化合物の部分内の1つの水素が単結合で置換されてリンカーに連結され得る。
本願発明の式Iで表される化合物において、標的タンパク質リガンド機能を実行する部分であるPTMは、上述の式IIで表されるPLK1(Polo-like kinase 1)結合部分である。
[式III]
ここで、
R1は、C1-5アルキルまたはC3-7シクロアルキルであり、
R2は、水素または-OR2Aであり、
R2Aは、C1-6アルキル、C3-7シクロアルキル、CF3または(C1-3アルキレン)-OHであり、
R3は、水素またはハロゲンである。
一実施例において、PTM部分は、化合物1~175に含まれているPTM部分である。
本願発明の一実施例よれば、式Iで定義されるリンカーは、次の式Lで表される。
[式L]
ここで、
はそれぞれ独立して、結合であり、
LULM 、LPTM及びLINTは、それぞれ独立して、ヌル(null)、単結合、-CH2-、-NH-、-O-、-S-、-SO-、-SO2-、-CO-、-CH2CH2-、-CHCH-、-CC-、-CH2CH2O-、-OCH2CH2-、-CH2CH2S-、-SCH2CH2-、-COO-、-CONH-、-NHCO-及び
からなる群から選択され、1以上のC1-6アルキル、C3-8シクロアルキル、ハロゲン、ヒドロキシ、アミン、ニトロ、シアノ、またはハロアルキルで任意に置換されること
ができ、{ここで、
は、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールである。}、
pは、1~30の整数である。
であってもよい。
{ここで、LU1は、単結合、-CH2-、-CH2CH2-、-CH=CH-、-CC-、-NH-、-NCH3-、-CO-、-NHCO-及び-O-からなる群から選択され、
LU2は、単結合、-CH2-、-NH-、-O-、-CO-及び-CONH-からなる群から選択され、
は、ヌル(null)または三員環~十員環シクロアルキル、四員環~十員環ヘテロシクロアルキル、六員環~十員環アリールまたは五員環~十員環ヘテロアリールからなる群から選択される。}
は、-CH2-、-CC-、-NH-、- NHCO-、-NHCO-CH2-O-、-NH-CH2-CONH-、-O-、-OCH2-CONH-、
であってもよい。
{ここで、LP1は、単結合、-O-、-S-、-NH-、-N(C1-4アルキル)-、-CH2-、-CH(C1-4アルキル)-、-CH2NH-、及び-CH2CH2-からなる群から選択され、
LP2は、単結合、-CO-、-COCH2-、-NHCO-、-NHCOCH2-、-HET-及び-HET-CH2-からなる群から選択され、ここで、HETは、N、SまたはO原子を1個以上有する五員環~六員環ヘテロシクリルまたはヘテロアリールであり、
は、ヌル(null)、アミン基で置換されたC1-8アルキル;または三員環~十員環シクロアルキル、四員環~十員環ヘテロシクロアルキル、六員環~十員環アリール、及び五員環~十員環ヘテロアリールからなる群から選択された環である。}
は、
からなる群から選択され、例えば、
である。
は
である
{ここで、X1は、CHまたはNであり、X2及びX3は、それぞれ独立して水素、CH3またはCH2CH3である}。
は、
からなる群から選択され、例えば、
である。
は、
であってもよい。
{ここで、
は、ヌル(null);または三員環~十員環シクロアルキル、四員環~十員環ヘテロシクロアルキル、六員環~十員環アリール、及び五員環~十員環ヘテロアリールからなる群から選択された環であり、
LINT1及びLINT2は、それぞれ独立して-CH2-、-NH-、-NCH3-、-O-、-S-、-SO-、-SO2-、-CO-、-CH2CH2O-、-OCH2CH2-、-CH2CH2S-、-SCH2CH2-、-COO-、-CONH-及び-NHCO-からなる群から選択され、
q及びrは、それぞれ独立して1~10の整数である。}
本願発明において、上述の式Iで表される化合物、その立体異性体またはその薬学的に許容可能な塩は、有機化学の技術分野において公知された合成方法または通常の技術者に自明な変形及び修飾技術により、以下の反応式1~3のような反応により製造されることができる。
本願発明の一実施例は、式Iで表される化合物またはその薬学的に許容可能な塩を含むPLK1の分解誘導用組成物である。式Iは、前記で定義された通りである。
塩を、in vitroでサンプルに投与することによりPLK1タンパク質を分解する方法である。前記サンプルは、ヒトを含む哺乳動物の細胞、細胞培養物、体液または組織であることができるが、これらに限定されるものではない。
LCMS:Shimadzu LCMS-2020
NMR:BRUKER AVANCEIII/400MHz
HPLC:Shimadzu LC-20ABとShimadzu LC-20AD、Agilent 1100 LC、Agilent 1200 LC、Agilent 1290 LC
LCMSデータは、エレクトロスプレーイオン化(electron spray ionization)装置が備えられたShimadzu LCMS-2020で記録した。水中の0.0375%TFA(溶媒A)及びアセトニトリル中の0.01875%TFA(溶媒B)を移動相として用いた。カラムとしては、Kinetex EVO C18(2.1*30)mm、5umを用いた。
HPLC分析には、Shimadzu LC-20AB、Shimadzu LC-20AD、Agilent 1100 LC、Agilent 1200 LC、またはAgilent 1290 LCを用いており、水中の0.0375%TFA(溶媒A)とアセトニトリル中の0.01875%TFA(溶媒B)または水中の0.025%NH3・H2O(溶媒A)とアセトニトリル(溶媒B)を移動相として用いた。カラムは、XBridge C18(2.1*50)mm、5umまたはKinetex C18 LCカラム(4.6*50)mm、5umまたはEclipse plus C18(4.6*150)mm、3.5umまたはWaters Xbridge(登録商標)C18(4.6*150)mm、3.5μmを用いた。
1H NMRスペクトルは、Bruker AVANCEIII400MHz/5mm
Probe(BBO)で記録した。
-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-(1-(2-(2-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(化合物1)の合成
.30(s、1H)、8.24(d、J=13.3Hz、1H)、8.02(s、1H)、7.90-7.81(m、1H)、7.62-7.54(m、1H)、7.23-7.11(m、2H)、7.03(d、J=7.1Hz、1H)、6.60(br t、J=5.5Hz、1H)、5.10-4.99(m、1H)、4.88-4.75(m、1H)、4.07(br t、J=13.8Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.75-3.69(m、1H)、3.65-3.59(m、2H)、3.56-3.48(m、18H)、3.47-3.44(m、2H)、3.33-3.21(m、3H)、2.88-2.79(m、2H)、2.62-2.54(m、2H)、2.48-2.42(m、2H)、2.10-1.92(m、6H)、1.81-1.68(m、5H)、1.67-1.47(m、5H)。
ナトリウムで乾燥させ、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=2/1~1/1)によって精製し、表題化合物(2.5g、8.53mmol、47.11%収率、99%純度)を白色の固形物として得た。
撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つの主要なピークを確認した。混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、酢酸エチル(100%)~DCM/メタノール(10%))によって精製し、表題化合物(1.46g、2.38mmol、83.17%収率、98%純度)を緑色の油状物として得た。MS(M+H)+=602.3
8.5Hz、1H)、6.73(br dd、J=7.7、14.9Hz、1H)、6.50(t、J=5.5Hz、1H)、5.01-4.82(m、2H)、4.15-4.05(m、1H)、4.02-3.88(m、5H)、3.78-3.73(m、4H)、3.71-3.65(m、4H)、3.50(q、J=5.4Hz、2H)、3.44(s、3H)、3.25-3.15(m、5H)、3.02-2.96(m、1H)、2.88-2.76(m、4H)、2.55-2.47(m、2H)、2.19-2.05(m、5H)、1.87-1.72(m、6H)、1.69-1.56(m、2H)。
81%収率、100%純度)。
4.82(m、1H)、4.08(t、J=13.9Hz、2H)、3.96-3.87(m、4H)、3.23-3.02(m、6H)、2.90-2.83(m、1H)、2.78-2.70(m、2H)、2.69-2.41(m、4H)、2.06-1.88
(m、5H)、1.86-1.39(m、13H)。
-ジオン(6.4g、24.49mmol)の溶液にヒドラジン水和物(14.42g、244.91mmol、14.00mL、85%純度 in H2O)を加え、混合物を80℃で4時間撹拌した。TLC(酢酸エチル:メタノール =10:1)は、出発物質が完全に消費されたことを示し、大抵の極性を有する一つの主要な新規なスポットが検出された。反応混合物を真空濃縮し、ほとんどの溶媒を除去し、残渣をDCM(50mL)で希釈し、濾過し、濾過物を真空濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(20g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶離液0~14%メタノール/酢酸エチル勾配@100mL/分)によって精製し、表題化合物(1.3g、9.91mmol、40.45%収率)を黄色の油状物として得た。
)、7.02(d、J=7.0Hz、1H)、6.51(t、J=5.9Hz、1H)、5.05(dd、J=5.4Hz、J=12.8Hz、1H)、4.02-3.96(m、2H)、3.25(q、J=6.7Hz、2H)、2.94-2.82(m、1H)、2.68-2.51(m、2H)、2.40(s、3H)、2.07-1.99(m、1H)、1.60-1.44(m、4H)、1.32-1.19(m、6H)。
カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B %:26%-56%、10分)によって精製した後、分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:27%~57%、10分)によって精製した。溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(181.6mg、169.09μmol、17.11%収率、96%純度、TFA塩)を黄色の固形物として得た。
8.28(s、1H)、8.25(d、J=13.4Hz、1H)、8.05(s、1H)、8.09-8.01(m、2H)、7.58(dd、J=7.2、8.4Hz、1H)、7.21-7.15(m、1H)、7.09(d、J=8.5Hz、1H)、7.02(d、J=6.9Hz、1H)、6.51(t、J=5.8Hz、1H)、5.04(dd、J=5.4、12.7Hz、1H)、4.86-4.77(m、1H)、4.06(br t、J=13.9Hz、3H)、3.96-3.83(m、5H)、3.32(s、3H)、3.15(br d、J=11.0Hz、2H)、2.91-2.84(m、1H)、2.71-2.55(m、5H)、2.04-1.87(m、5H)、1.80-1.45(m、13H)、1.30(br d、J=12.1Hz、8H)。
-2.99(m、3H)、2.94-2.84(m、1H)、2.63-2.57(m、1H)、2.29-1.87(m、6H)、1.86-1.50(m、12H)、1.39-1.22(m、10H)。
8.13(s、1H)、7.62-7.54(m、1H)、7.25-7.15(m、1H)、7.12-7.06(m、1H)、7.05-7.00(m、1H)、6.52(s、1H)、5.05(dd、J1=12.7Hz、J2=5.4Hz、1H)、4.83(t、J=8.3Hz、1H)、4.13-4.06(m、2H)、3.91(s、3H)、3.52(d、J=10.9Hz、2H)、3.33(s、3H)、3.31-2.26(m、2H)、3.13-2.95(m、4H)、2.93-2.84(m、1H)、2.62-2.56(m、1H)、2.17-1.85(m、6H)、1.84-1.68(m、4H)、1.66-1.54(m、8H)、1.36-1.25(m、12H)。
.24(m、3H)、2.94 -2.85(m、1H)、2.80(d、J=11.4Hz、2H)、2.64 -2.55(m、2H)、2.22(t、J=7.3Hz、2H)、2.04- 1.90(m、5H)、1.82-1.69(m、4H)、1.66-1.50(m、8H)、1.49-1.13(m、18H)。
前記反応式に基づいて、上述した実施例と同様の方法で、表題化合物(142.5mg、142.34μmol、17.87%収率)を黄色の固形物として得た。
、2.48-2.31(m、2H)、2.26-2.04(m、7H)、1.86-1.69(m、6H)、1.53-1.49(m、2H)、1.45-1.39(m、2H)、1.36-1.22(m、22H)。
58.13μmol、85.97%収率、91%純度)を黄色の固形物として得た。
.82(dd、J=7.9、14.7Hz、1H)、6.72-6.65(m、1H)、4.98-4.90(m、1H)、4.90-4.82(m、1H)、4.33-4.12(m、1H)、3.97(s、3H)、3.96-3.88(m、2H)、3.63-3.43(m、6H)、3.42(s、3H)、3.03-2.56(m、8H)、2.17-2.07(m、6H)、1.97-1.86(m、6H)、1.75-1.52(m、8H)
)、エチルプロプ-2-エノエート(44.44g、443.85mmol、48.25mL)の溶液を25℃で12時間撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物を濾過し、濾過物を真空下で濃縮した。粗生成物を逆相HPLC(0.1%FA条件、MeCN/水)によって精製し、表題化合物(9.04g、粗製)を無色の油状物として得た。MS(M+H)+=281.0
物をH2(50psi)下で、60℃で24時間撹拌した。TLC(酢酸エチル/メタノール =10/1)で反応物が残っていることと、所望の生成物が検出されたことを確認した。混合物を濾過し、濾過物を真空下で濃縮し、表題化合物(1.9g、4.52mmol、79.17%収率)を無色の油状物として得た。
形物として得た。
、J=15.2Hz、1H)、8.06(s、1H) 、7.87(s、1H) 、7.49-7.45(m、2H)、7.07(d、J=6.8Hz、1H)、6.92-6.87(m、2H)、6.54-6.51(m、1H)、4.97-4.94(m、1H)、4.89-4.83(m、1H)、4.34-4.16(m、1H)、3.94-3.91(m、5H)、3.78-3.77(m、3H)、3.70-3.65(m、2H)、3.49-3.41(m、11H)、3.19-3.11(m、2H)、2.81-2.78(m、3H)、2.31-2.25(m、2H)、2.19-2.07(m、5H)、1.78-1.71(m、6H)、1.62-1.49(m、6H)、1.42-4.33(m、2H)、1.32-1.21(m、6H)。
4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシ安息香酸(120mg、257.83μmol)の溶液にHATU(98.03mg、257.83μmol)とDIPEA(99.97mg、773.49μmol、134.73μL)を加えた。混合物を20℃で10分間攪拌し、DMF(2mL)中の2-(2-(2-(4-アミノピペリジン-1-イル)エトキシ)エトキシ)-N-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アセトアミド(168.10mg、粗製)の溶液を20℃で滴下した。生成された混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を水(10mLx3)で希釈し、酢酸エチル(10mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:3_Phenomenex Luna C18
75*30mm*3um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:34%~54%、7分)に精製した後、凍結乾燥し、表題化合物(105.3mg、95.10μmol、36.88%収率、96%純度、TFA)を白色の固体物として得た。
35(s、1H)、8.74(d、J=8.4Hz、1H)、8.30(s、1H)、8.24(d、J=13.6Hz、1H)、8.03(s、1H)、7.89-7.84(m、2H)、7.63(d、J=7.2Hz、1H)、7.18(d、J=6.4Hz、1H)、5.18-5.14(m、1H)、4.86-4.77(m、1H)、4.14-4.08(m、5H)、3.91(s、4H)、3.76-3.69(m、1H)、3.61-3.57(m、3H)、3.46-3.43(m、1H)、2.88-2.86(m、2H)、2.63-2.54(m、2H)、2.15-2.10(m、2H)、2.05-1.95(m、2H)、1.76-1.73(m、5H)、1.65-1.61(m、10H)、1.47-1.39(m、5H)、1.28-1.19(m、9H)。
エーテル:酢酸エチル=10:1~1:1)によって精製し、表題化合物(4.4g、粗製)を緑色の固形物として得た。MS(M-56+H)+=332.0
-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)アセトアミド)エトキシ)エチル4-メチルベンゼンスルホン酸(787.00mg、3.93mmol)とtert-ブチルN-(4-ピペリジル)カルバメート(787.00mg、3.93mmol)との溶液にDIPEA(1.02g、7.86mmol、1.37mL)とNaI(196.34mg、1.31mmol)を加えた。反応混合物を100℃で16時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つのピーク(72%)を確認した。混合物を減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(1000メッシュシリカゲル、eluted with 石油エーテル:酢酸エチル=5:1~0:1;酢酸エチル:メタノール=10:1)によって精製し、表題化合物(0.8g、1.31mmol、49.82%収率、98%純度)を緑色の固形物として得た。MS(M+H)+=601.2
(d、J=8.4Hz、1H)、5.06(dd、J=5.4、12.4Hz、2H)、4.07(m、2H)、3.99-3.95(m、5H)、3.85-3.79(m、2H)、3.72(m、2H)、3.68-3.63(m、4H)、3.60(s、3H)、3.55(m、2H)、3.50-3.42(m、3H)、3.41(s、3H)、3.36(m、2H)、3.25-3.10(m、2H)、2.93-2.81(m、1H)、2.79-2.67(m、2H)、2.35-1.86(m、8H)、1.84-1.63(m、6H)。
)、4.13(br d、J=12.5Hz、2H)、4.10-3.95(m、3H)、3.91(s、3H)、3.79(br d、J=12.8Hz、1H)、3.63-3.59(m、2H)、3.58-3.50(m、12H)、3.46(br d、J=6.0Hz、2H)、3.33(s、3H)、3.09(br t、J=11.9Hz、1H)、2.93-2.83(m、1H)、2.80-2.71(m、1H)、2.62-2.55(m、2H)、2.06-1.91(m、3H)、1.89-1.78(m、2H)、1.77-1.65(m、2H)、1.68-1.56(m、4H)、1.55-1.45(m、1H)、1.44-1.33(m、1H)。
(s、1H)、8.25(d、J=13.4Hz、1H)、8.04(s、1H)、7.87(dd、J=3.4、7.5Hz、1H)、7.69(br t、J=5.9Hz、1H)、7.62-7.54(m、1H)、7.21-7.11(m、2H)、7.04(d、J=7.0Hz、1H)、6.61(t、J=5.6Hz、1H)、5.09-5.03(m、1H)、4.87-4.77(m、1H)、4.08(br t、J=13.7Hz、2H)、3.92(s、3H)、3.80-3.68(m、1H)、3.64-3.58(m、2H)、3.53
t、J=10.9Hz、2H)、2.06-1.93(m、3H)、1.85-1.58(m、10H)。
混合物を90℃で16時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと所望の質量を有するピークが検出されていないことを確認した。TLC(二酸化ケイ素、石油エーテル:酢酸エチル=5:1)によって出発物質が完全に消費されたことと、2つの新規なスポットが検出されたことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~10/1)によって精製し、表題化合物(6.5g、25.28mmol、84.43%収率)を黄色の油状物として得た。
確認した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(30mLx3)で抽出した。有機層を塩水(30mLx3)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/1~0/1~ジクロロメタン/メタノール=1/0~10/1)によって精製し、表題化合物(825mg、1.49mmol、27.19%収率、98%純度)を黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=542.2
Hz、1H)、5.19-5.10(m、1H)、4.89-4.75(m、1H)、4.13-4.02(m、2H)、3.91(s、3H)、3.81-3.63(m、2H)、3.33(s、3H)、2.94-2.81(m、3H)、2.69-2.54(m、3H)、2.38-2.32(m、2H)、2.09-1.93(m、5H)、1.81-1.46(m、12H)
、1H)、5.20-5.12(m、1H)、5.07-5.00(m、1H)、4.13(t、J=12.9Hz、2H)、4.01(s、3H)、3.72-3.63(m、2H)、3.42(s、3H)、3.23-3.08(m、4H)、2.96-2.85(m、1H)、2.83-2.71(m、2H)、2.55(t、J=7.3Hz、2H)、2.30(d、J=14.6Hz、2H)、2.22-2.05(m、4H)、1.94-1.71(m、12H)、1.55-1.42(m、6H)
前記反応式に基づいて、上述した実施例と同様の方法で、表題化合物(202.8mg、221.31μmol、51.50%収率、97%純度)を黄色の個体物として得た。
3.40(s、3H)、3.25-3.17(m、1H)、2.89-2.79(m、2H)、2.78-2.68(m、2H)、2.54(t、J=6.7Hz、2H)、2.15-1.92(m、8H)、1.87-1.62(m、7H)、1.58-1.44(m、2H)
る一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=5/1~0/1)によって精製し、表題化合物(2.3g、4.71mmol、94.10%収率、99%純度)を白色の固形物として得た。MS(M+H)+=484.4
0℃で2時間攪拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物にTEA(223.59mg、2.21mmol、307.56μL)を加え、20℃で1時間撹拌した。反応混合物を真空状態で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%~40%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(393mg、547.12μmol、74.28%収率、97%純度)を白色の固形物として得た。MS(M+H)+=697.2
ル(10g、41.14mmol)とカリウム;トリフルオロ(ビニル)ホウ酸(6.61g、49.36mmol)の混合物に炭酸カリウム(17.06g、123.41mmol)及びPd(dppf)Cl2(1.50g、2.06mmol)を一度に20℃でN2下で加えた。懸濁液を真空下で脱気し、N2で数回パージし、生成された混合物を100℃で16時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。TLC(二酸化ケイ素、石油エーテル:酢酸エチル=10:1)によって2-(4-ブロモフェニル)酢酸エチルが完全に消費されたことと、2つの新規なスポットが検出されたことを確認した。反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(100mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~100/1)によって精製し、2-(4-ビニルフェニル)酢酸エチル(5.3g、25.91mmol、62.99%収率、93%純度)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=191.5
ン-4-イル)アセトアミド(8)の合成
79.29mmol)の溶液に炭酸カリウム(35g、253.25mmol)及び3-ブロモプロキシ-tert-ブチル-ジメチル-シラン(25.78g、101.80mmol)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つの主要なピークを確認した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=10:1-0:1)によって精製し、表題化合物(8.2g、27.20mmol、34.30%収率、99%純度)を淡黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=299.1
673.77μmol、37.90%収率)を淡黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=594.5
5-2.83(m、1H)、2.81-2.73(m、2H)、2.62-2.54(m、2H)、2.22-2.14(m、2H)、2.06-1.87(m、6H)、1.83-1.72(m、5H)、1.64-1.47(m、6H)
ウムで乾燥し、濾過し、濃縮し、表題化合物(1.40g、粗製)を淡黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=387.1
-6-オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5 -b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシ安息香酸(200mg、429.71μmol)の溶液にHATU(400mg、1.05mmol)、DIPEA(445.20mg、3.44mmol、600μL)と4-((2-(2-(4-((4-アミノピペリジン-1-イル)メチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)エトキシ)エチル)アミノ)-2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(350mg、585.78μmol、2HCl)を加えた。混合物を25℃で16時間撹拌した。LCMSによって所望の質量で46%のピークを確認した。反応混合物に水(10mL)を加え、混合物を酢酸エチル(30mLx2)で抽出した。合わせた有機層を塩水90mL(30mLx3)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:3_Phenomenex Luna C18 75*30mm*3um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:32%~52%、7分、カラム温度:30℃)によって精製し、次いで凍結乾燥し、表題化合物(101.3mg、0.0886mmol、20.62%収率、95%純度、TFA)を淡黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=972.7
3(m、2H)、2.11-1.91(m、6H)、1.78-1.55(m、8H)。
9(m、2H)、4.13-4.09(m、1H)、4.08(t、J=13.8Hz、2H)、4.02-3.93(m、2H)、3.91(s、3H)、3.33(s、3H)、3.30-3.03(m、4H)、2.65-2.53(m、4H)、2.22-2.12(m、2H)、2.10-2.00(m、2H)、2.00-1.90(m、2H)、1.80-1.68(m、4H)、1.66-1.56(m、4H)
.46μmol、3.19%収率、98%純度)を黄色の固形物として得た。
(3.48g、34.43mmol、4.79mL)とTosCl(3.28g、17.21mmol)を一度に20℃で加え、生成された混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=5/1~0/1)によって精製し、表題化合物(2.4g、6.16mmol、53.70%収率)を黄色の油状物として得た。MS(M+Na)+=412.1
ロピル)メチル)ピペリジン-4-イル)カルバメート(6)の合成
(60mL)で希釈し、濾過した。濾液を真空下で濃縮し、表題化合物(920mg、粗製)を白色の油状物として得た。MS(M+H)+=284.3
-6-オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5 -b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシ安息香酸(200mg、429.71μmol)の溶液にHATU(163.39mg、429.71μmol)とDIPEA(111.08mg、859.43μmol、149.70μL)を加えた。混合物を20℃で10分間攪拌し、DMF(4mL)とDIPEA(111.08mg、859.43μmol、149.70μL)中の4-((((1S、2R)-2-((4-アミノピペリジン-1-イル)メチル)シクロプロピル)メチル)アミノ)-2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(226.63mg、粗製、HCl)の溶液を20℃で滴下した。生成された混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を水(12mL)で希釈し、酢酸エチル(12mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18
150*40mm*15um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:30%~40%、10分)によって精製し、分取HPLC(カラム:3_Phenomenex Luna C18 75*30mm*3um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:34%~54%、7分)によって精製した後、凍結乾燥し、表題化合物(104mg、100.79μmol、23.45%収率、97%純度、TFA)を黄色の固形物として得た。
の油状物として得た。MS(M+H)+=436.1
(30mL)を注ぎ、酢酸エチル(20mLx3)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル/メタノール=10/1)によって精製し、表題化合物(0.12g、193.77μmol、17.84%収率、97%純度)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=601.3
=7.2Hz、1H)、7.08(d、J=8.8Hz、1H)、7.02(d、J=6.8Hz、1H)、6.75-6.71(m、1H)、5.07-5.04(m、1H)、4.84-4.79(m、1H)、4.11-4.03(m、3H)、3.91(s、3H)、3.73-3.65(m、2H)、3.52-3.45(m、4H)、2.91-2.80(m、3H)、2.65-2.58(m、2H)、2.58-2.55(m、4H)、2.45-2.42(m、2H)、2.26(s、3H)、2.01-1.98(m、6H)、1.77-1.72(m、5H)、1.70-1.60(m、4H)、1.49-1.41(m、3H)。
H)、8.00(s、1H)、7.74(s、1H)、7.54(d、J=8.3Hz、1H)、7.48(d、J=7.2Hz、1H)、6.97-6.91(m、1H)、6.71(dd、J=2.1、8.3Hz、1H)、6.68-6.60(m、1H)、5.33-5.24(m、1H)、4.88-4.72(m、2H)、4.04-3.92(m、1H)、3.90(s、3H)、3.87-3.80(m、2H)、3.67(t、J=5.0Hz、2H)、3.62-3.53(m、6H)、3.37-3.30(m、5H)、2.91-2.61(m、5H)、2.56(t、J=5.4Hz、2H)、2.27-2.11(m、2H)、2.08-1.95(m、5H)、1.77-1.63(m、5H)、1.55-1.47(m、3H)。
、J1=8.4Hz、J2=2.1Hz、1H)、5.05-5.00(m、2H)、4.09(t、J=13.1Hz、3H)、4.01-3.95(m、3H)、3.83-3.79(m、2H)、3.74-3.62(m、16H)、3.53-3.46(m、1H)、3.44-3.35(m、7H)、3.19-3.13(m、1H)、2.92-2.81(m、1H)、2.75-2.70(m、1H)、2.35-2.21(m、2H)、2.18-2.02(m、4H)、1.98-1.77(m、4H)、1.78-1.67(m、4H)。
81mmol)との混合物にPd(PPh3)2Cl2(380.97mg、520.67μmol)、CuI(198.32mg、1.04mmol)とTEA(5.27g、52.07mmol、7.25mL)を加え、混合物を60℃で0.5時間マイクロ波、N2下で撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。反応混合物を濃縮した。残渣をシリカゲルカラム(酢酸エチル)によって精製し、表題化合物(2g、4.09mmol、78.64%収率)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=489.1
2-テトラオキサペンタデカ-14-イン-1-イル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(70mg、68.76μmol)の溶液にPd/C(20mg、10%純度)を加え、生成された混合物を25℃で12時間H2(15psi)下で撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物をパイロット(50mgスケール)と合わせて、濾過した。濾液を濃縮し、残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Synergi C18 150*25mm*10um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:19%~49%、分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(23mg、21.60μmol、31.42%収率、96%純度 、FA塩)を白色の固体物として得た。
-2.83(m、1H)、2.81-2.64(m、2H)、2.18-2.09(m、4H)、1.90-1.77(m、4H)、1.76-1.65(m、4H)。
-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-(1-(2-(2-(2-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)オキシ)アセトアミド)エトキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(化合物56)の合成
って精製し、表題化合物(1.63g、3.18mmol、61.45%収率、99%純度)を白色の固体物として得た。MS(M+H)+=508.1
、3H)、4.13-4.05(m、4H)、3.91(s、3H)、3.77-3.74(m、2H)、3.61-3.58(m、2H)、3.57(br d、J=1.7Hz、2H)、3.53-3.47(m、22H)、3.47-3.43(m、2H)、3.33(s、3H)、3.31(br d、J=5.7Hz、2H)、3.29-3.25(m、2H)、3.21-3.03(m、2H)、2.94-2.85(m、1H)、2.64-2.54(m、2H)、2.07-2.03(m、2H)、1.99-1.95(m、2H)、1.86-1.69(m、4H)、1.68-1.57(m、4H)。
11.31mL)との溶液にCbzCl(21.50g、126.02mmol、17.91mL)を0℃で加え、反応混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つのピーク(60%)を確認した。反応混合物を水(100mL)に希釈し、酢酸エチル(100mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を真空下で濃縮し、表題化合物(22g、粗製)を無色の油状物として得た。
)とtert-ブチル(1-(5-アミノメチル)ピペリジン-4-イル)カルバメート(515.42mg、1.81mmol)との溶液にHATU(686.61mg、1.81mmol)とDIPEA(583.46mg、4.51mmol、786.34μL)を加えた。反応混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つの主要なピークを確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、真空下で濃縮し、表題化合物(1g、粗製)を褐色の油状物として得た。MS(M+H)+=600.2
H)、8.21(s、1H)、7.83(dd、J=7.4、8.4Hz、1H)、7.56(d、J=7.0Hz、1H)、7.46(d、J=8.5Hz、1H)、7.33(d、J=6.6Hz、1H)、5.14(dd、J=5.6、12.4Hz、1H)、4.93(br d、J=8.4Hz、1H)、4.78(s、2H)、4.18-4.00(m、3H)、3.99(s、3H)、3.52-3.43(m、2H)、3.40(s、3H)、3.39-3.35(m、2H)、3.03-2.67(m、7H)、2.23-2.06(m、5H)、1.91-1.63(m、12H)、1.49-1.39(m、2H)。
ラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=100/1~10/1)によって精製し、表題化合物(7.8g、32.09mmol、98.17%収率)を白色の油状物として得た。
,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)オキシ)酢酸(1g、3.01mmol)、ベンジル(7-アミノヘプチル)カルバメート(1.03g、3.91mmol)、EDCI(865.43mg、4.51mmol)、HOBt(610.01mg、4.51mmol)及びTEA(913.63mg、9.03mmol、1.26mL)の混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(20mLx3)で抽出した。有機層を塩水(20mLx3)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=3/1~0/1)によって精製し、表題化合物(1.7g、2.67mmol、88.84%収率、91%純度)を黄色の油状物として得た。
、2.19-2.04(m、4H)、1.99-1.86(m、2H)、1.85-1.78(m、2H)、 1.76-1.65(m、4H)、1.62-1.48(m、4H)、1.44-1.28(m、6H)。
5-メチル-6-オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド)ピペリジン-1-イル)メチル)ベンジルカルバメート(6)の合成
ol)の溶液にHATU(188.82mg、496.59μmol)とDIPEA(175.04mg、1.35mmol、235.90μL)を加えた。混合物を20℃で10分間攪拌し、DMF(2mL)中のN-(1-(3-(アミノメチル)ベンジル)ピペリジン-4-イル)-4-((9-シクロペンチル-7,7-ジフルオロ-5-メチル-6-オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ) -2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(316.05mg、474.02μmol)の溶液を加え、生成された混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を水(12mL)で希釈し、酢酸エチル(12mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:3_Phenomenex Luna C18
75*30mm*3um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:32%~52%、7分)に精製した後、凍結乾燥し、2つのバッチの生成物を59%と42%の純度で得た。これらを分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:46%~76%、10分)で再精製し、溶離液を合わせて凍結乾燥し、LCMS及びHPLCで75%純度の生成物を得た。これを分取HPLC(カラム:3_Phenomenex Luna C18 75*30mm*3um;移動相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:32%~52%、7分)に再精製した後、凍結乾燥し、表題化合物(9.5mg、9.59μmol、2.12%収率、99%純度 、TFA)を白色の固形物として得た。
.99mmol)を20℃で加えた。次いでCbzCl(7.22g、42.34mmol、6.02mL)を20℃で滴下し、生成された混合物を20℃で16時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(70mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~3/1)によって精製し、表題化合物(4.4g、12.33mmol、32.03%収率、90%純度)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=321.0
)、8.64(d、J=1.8Hz、1H)、8.27(d、J=13.4Hz、1H)、8.21(s、1H)、8.03(s、1H)、7.86-7.78(m、1H)、7.56(d、J=7.2Hz、1H)、7.46(d、J=8.6Hz、1H)、7.34(d、J=6.6Hz、1H)、5.13(dd、J=5.4、12.8Hz、1H)、5.05-4.90(m、2H)、4.81-4.74(m、1H)、4.63(s、2H)、4.44(s、2H)、4.25-4.04(m、3H)、3.98(s、3H)、3.69-3.45(m、2H)、3.40(s、3H)、3.26-3.11(m、2H)、2.93-2.83(m、1H)、2.80-2.67(m、2H)、2.31-2.18(m、2H)、2.17-2.06(m、3H)、1.98-1.66(m、8H)。
で滴下し、生成された混合物を25℃で12時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。TLC(二酸化ケイ素、石油エーテル:酢酸エチル=5:1)によって出発物質が完全に消費されたことと、2つの新規なスポットが検出されたことを確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mLx3)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~5/1)によって精製し、表題化合物(6.8g、20.60mmol、76.66%収率、97%純度)を得た。MS(M+H)+=320.0
mol)とDIPEA(2.38g、18.39mmol、3.20mL)を一度に20℃でN2下で加え、生成された混合物を60℃で16時間撹拌した。LCMSによってすべての出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。TLC(二酸化ケイ素、石油エーテル:酢酸エチル=1:2)によって出発物質が完全に消費されたことと、3つの新規なスポットが検出されたことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1/2)によって精製し、表題化合物(2.4g、4.50mmol、73.35%収率)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=534.3
て出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮し、表題化合物(1.5g、粗製、HCl)を黄色の固形物として得た。
C18 150*25*10um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:31%~57%、13分)で再精製した後、凍結乾燥し、表題化合物(81.2mg、72.42μmol、69.25%収率、95%純度)を白色の固形物として得た。
ロ-5-メトキシベンズアミドの合成
120mL)で20℃で30分間固形化した後、濾過した。ケーキを減圧下で乾燥して、表題化合物(8g、18.54mmol、91.68%収率)を白色の固形物として得た。MS(M+H)+=432.3
ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(化合物65)の合成
炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:48%~81%、9分;カラム温度:30℃)によって精製し、次いで凍結乾燥し、表題化合物(123.3mg、127.28μmol、39.49%収率、93%純度)を淡黄色の固形物として得た。
ジン-1-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(200mg、527.97μmol、HCl塩)の溶液にDIEA(204.71mg、1.58mmol、275.89μL)とtert-ブチル(1-(2-クロロエチル)ピペリジン-4-イル)カルバメート(194.23mg、739.16μmol)を加え、混合物を15℃で16時間撹拌した。LCMSによって15%の反応物が残っていることと、66%の所望の質量が検出されたことを確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(50mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(80mLx5)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(12g SepaFlash(登録商標)Silica Flash Column、溶離液0~18%メタノール/酢酸エチル勾配@60mL/分)によって精製し、表題化合物(110mg、193.44μmol、36.64%収率)を黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=569.6.
トキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
ol、2.29mL)を加え、生成された混合物を60℃で12時間撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(300mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(100mLx1)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、 減圧下で濃縮し、表題化合物(5.55g、粗製)を黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=333.4
リジン-3-イル)-1-オキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(化合物75)の合成
.2Hz、1H)、5.12(dd、J=5.0、13.3Hz、1H)、4.89-4.75(m、1H)、4.27-4.11(m、2H)、4.11-4.02(m、2H)、3.92(s、3H)、3.79-3.67(m、1H)、3.33-3.29(m、3H)、3.15-3.08(m、2H)、2.98-2.88(m、1H)、2.81(br d、J=11.4Hz、2H)、2.65-2.59(m、1H)、2.35-2.28(m、1H)、2.24(br t、J=7.4Hz、2H)、2.08-1.89(m、5H)、1.90-1.65(m、4H)、1.68-1.48(m、8H)、1.45-1.22(m、10H)。
Flash Column、溶離液0~15%酢酸エチル/メタノール@30mL/分)によって精製し、表題化合物(1.6g、3.05mmol、84.18%収率、94%純度)を黄色の油状物として得た。MS(M+H)+=494.2
-イル)アミノ)オクチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
、J=8.5Hz、1H)、5.86(dd、J1=11.9Hz、J2=5.2Hz、1H)、4.90-4.73(m、1H)、4.07(t、J=13.9Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.78-3.65(m、1H)、3.33(s、3H)、3.25-3.20(m、2H)、2.99-2.88(m、1H)、2.80(d、J=11.1Hz、2H)、2.70-2.61(m、2H)、2.28-2.18(m、3H)、2.01-1.88(m、4H)、1.82-1.68(m、4H)、1.66-1.44(m、8H)、1.43-1.23(m、10H)。
5-イル)ベンジル)ピロリジン-2-カルボキサミド(360mg、770.84μmol、HCl塩)とDIPEA(222.60mg、1.72mmol、300.00μL)の溶液を加え、混合物を20℃で14時間攪拌した。LCMSによって出発物質が残っていることと、所望の質量が微量検出されたことを確認した。さらにHATU(647.47mg、1.70mmol)を加え、混合物を40℃で14時間撹拌した。LCMSによって所望の質量が検出されたことを確認した。混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(10mLx3)で抽出した。合わせた有機層を水(10mL)と塩水(10mLx2)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(5g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶離液50~100%酢酸エチル/石油エーテル~0~50%メタノール/酢酸エチル勾配@50mL/分)によって精製した後、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge C18 150*50mm*10um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:26%~56%、分)で再精製し、表題化合物(80mg、100.14μmol、11.76%収率、95%純度)を黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=759.8.
し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um; 移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム )-ACN];B%:43%~73%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(23.8mg、20.44μmol、21.37%収率、95%純度)を白色の固形物として得た。
(t、J=6.0Hz、1H)、8.29(s、1H)、8.23(d、J=13.3Hz、1H)、8.02(s、1H)、7.86(br s、1H)、7.44-7.35(m、5H)、7.18(d、J=6.8Hz、1H)、5.15(d、J=3.4Hz、1H)、4.85-4.77(m、1H)、4.56(d、J=9.7Hz、1H)、4.47-4.32(m、3H)、4.28-4.19(m、1H)、4.07(br t、J=13.8Hz、2H)、3.96(s、2H)、3.90(s、3H)、3.69-3.43(m、15H)、2.82(br s、2H)、2.43(s、3H)、2.10-1.85(m、7H)、1.82-1.44(m、12H)、0.96-0.91(m、9H)。
1H)、4.07(br t、J=13.9Hz、2H)、3.97(s、2H)、3.91(s、3H)、3.66-3.57(m、6H)、3.56-3.52(m、4H)、3.50-3.45(m、6H)、3.33(br s、3H)、2.83(br d、J=11.4Hz、2H)、2.44(s、3H)、2.11-1.99(m、4H)、1.98-1.86(m、3H)、1.82-1.67(m、5H)、1.67-1.48(m、7H)、0.97-0.91(s、9H)。
前記反応式に基づいて、上述した実施例と同様の方法で、表題化合物(31.7mg、25.34μmol、9.83%収率、99%純度)を白色の固形物として得た。
CMSによって76%の所望の質量を確認した。混合物溶液を減圧下で濃縮した。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(1000メッシュシリカゲル、溶離液石油エーテル/酢酸エチル=10/1~0/1)によって精製し、2-((8-(4-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)ピペリジン-1-イル)オクチル)オキシ)酢酸エチル(4.5g、粗製)を黄色の油状物として得て、次の段階で直接用いた。MS(M+H)+=415.2
ート(0.5g、625.73μmol)の溶液にHCl/ジオキサン(4M、10mL、63.93eq)を25℃で加えた。生成された混合物を25℃で0.5時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つの主要なピークを確認した。混合物溶液を減圧下で濃縮し、表題化合物(380mg、粗製、HCl)を褐色の固形物として得て、次の段階に直接用いた。MS(M+H)+=699.4
(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)-1-((S)-2-(1-フルオロシクロプロパン-1-カルボキサミド)-3,3-ジメチルブタノイル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキサミドの合成
)の合成
得た。MS(M+H)+=775.6.
-(4-アミノピペリジン-1-イル)エトキシ)エトキシ)-4-(4-メチルアゾール-5-イル)ベンジル)-1-((S)-2-(1-フルオロシクロプロパンカルボキサミド)-3,3-ジメチルブタノイル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキサミド(120mg、137.00μmol、HCl塩)とDIPEA(44.52mg、344.47μmol、60μL)の溶液を加え、混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSによって所望の質量が検出されたことを確認した。混合物を水(10mL)で希釈し、酢酸エチル(10mLx3)で抽出した。合わせた有機層を水(10mL)と塩水(10mLx2)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:49%~79%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(32.0mg、26.43μmol、20.50%収率、95%純度)を白色の固形物として得た。
Hz、1H)、7.18(d、J=6.8Hz、1H)、7.04(d、J=1.4Hz、1H)、6.97(s、1H)、5.17(d、J=3.6Hz、1H)、4.91-4.77(m、1H)、4.59(d、J=8.8Hz、1H)、4.51(t、J=8.2Hz、1H)、4.39-4.27(m、2H)、4.25-4.15(m、3H)、4.07(br t、J=14.0Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.84-3.77(m、2H)、3.77-3.56(m、6H)、3.56-3.41(m、6H)、2.92-2.78(m、2H)、2.42-2.51(m、4H)、2.07(br d、J=8.8Hz、3H)、1.95(brd、J=4.0Hz、3H)、1.81-1.69(m、4H)、1.67-1.45(m、7H)、1.43-1.30(m、2H)、1.21(br dd、J=3.6、8.8Hz、2H)、0.95(s、9H)。
、5.19(s、1H)、4.90-4.75(m、1H)、4.65-4.43(m、2H)、4.42-4.25(m、2H)、4.25-4.12(m、3H)、4.08(t、J=13.9Hz、2H)、3.94-3.87(m、4H)、3.79(t、J=4.6Hz、2H)、3.75-3.65(m、2H)、3.65-3.60(m、3H)、3.59-3.53(m、3H)、3.53-3.45(m、7H)、2.82(d、J=10.9Hz、2H)、2.47-2.41(m、5H)、2.12-1.99(m、3H)、1.98-1.88(m、3H)、1.80-1.69(m、4H)、1.66-1.57(m、4H)、1.56-1.46(m、2H)、1.42-1.31(m、2H)、1.25-1.22(m、1H)、1.22-1.19(m、1H)、0.95(s、9H)。
9Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.82-3.76(m、2H)、3.75-3.68(m、1H)、3.65-3.59(m、3H)、3.57-3.53(m、2H)、3.52-3.46(m、11H)、3.30(s、3H)、2.86-2.80(m、2H)、2.47-2.44(m、5H)、2.11-1.89(m、8H)、1.81-1.69(m、3H)、1.67-1.47(m、5H)、1.42-1.31(m、2H)、1.26-1.18(m、2H)、0.95(s、9 H)。
-6-オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5- b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシ安息香酸(60mg、128.91μmol)の溶液にHATU(122.54mg、322.27μmol)とDIPEA(33.32mg、257.82μmol、44.91μL)を加え、混合物を20℃で10分間撹拌した。次いでDMF(2mL)中の(2S、4R)-N-(2-((8-(4-アミノピペリジン-1-イル)オクチル)オキシ)-4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)-1-((S)-2-(1-フルオロシクロプロパンカルボキサミド)-3,3-ジメチルブタノイル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキサミド(120.57mg、154.69μmol、HCl塩)の溶液とDIPEA(33.32mg、257.82μmol、44.91μL)を加え、生成された混合物を25℃で12時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つの主要なピークを確認した。混合物溶液を減圧下で濃縮した。粗生成物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:62%~92%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(58.4mg、47.10μmol、36.53%収率、96%純度)を白色固形物として得た。
g、9.74mmol、93%純度)の溶液にトルエン(6mL)とメタノール (6mL)中のTMSCHN2(2M、7.30mL)の溶液をゆっくりと加え、混合物を15℃で2時間撹拌した。TLC(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=2/1)によって微量の出発物質が残っていることと、低極性の一つの主要な新規なスポットが検出されたことを確認した。反応混合物に水(80mL)を加えてクエンチし、次いで酢酸エチル(100mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(150mLx2)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、真空下で濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(25g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶離液12~50%酢酸エチル/石油エーテル勾配@65mL/分)によって精製し、表題化合物(1.1g、4.52mmol、46.44%収率)を褐色の固形物として得た。
-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-5-エトキシ-2-フルオロベンゾエート(80mg、162.11μmol)の溶液に水酸化ナトリウム(H2O中の2M 、2mL)を加え、混合物を25℃で16時間撹拌した。LCMSによって反応物が完全に消費されたことと、90%の所望の質量が検出されたことを確認した。反応混合物にHCl溶液(1M)を加えてクエンチし、pHを5に調整した。生成された混合物を真空下で濃縮し、表題化合物(310mg、646.57μmol、398.84%収率)を褐色の固形物として得て、次の段階に直接用いた。MS(M+H)+=480.1.
1.45(m、3H)。
4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-イソプロポキシ安息香酸(306.93mg、621.98μmol)、4-((2-(2-(2-(4-アミノピペリジン-1-イル)エトキシ)エトキシ)エチル)アミノ)-2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(83mg、148.09μmol、2HCl塩)とHATU(84.46mg、222.14μmol)との溶液にDIEA(95.70mg、740.45μmol、128.97μL)を加え、混合物を15℃で2時間撹拌した。LCMSによって反応物が完全に消費されたことと、82%の所望の質量が検出されたことを確認した。反応混合物を濾過し、濾液を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge BEH C18 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:53%~83%、10分)によって精製し、表題化合物(38.4mg、38.28μmol、25.85%収率、96%純度)を黄色の固形物として得た。
-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(211.11mg、402.88μmol、HCl塩)を加え、生成された混合物を15℃で3時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つのピーク(78%)を確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(40mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:18%~48%、10分)、次いで分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:38%~68%、8分)によって精製し、表題化合物(60mg、60.56μmol、16.54%収率、95%純度)を黄色の固形物として得た。
望の質量を有する一つのピーク(87%)を確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(40mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~55%、10分)、次いで分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:42%~ 72%、8分)によって精製し、表題化合物(69.1mg、69.45μmol、13.10%収率、98%純度)を黄色の固形物として得た。
釈し、酢酸エチル(40mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:25%~55%、10分)によって精製し、92%純度の生成物172.5mgを得た。塩基性イオン交換樹脂で処理し、凍結乾燥し、表題化合物(134.9mg、125.64μmol、35.42%収率、91%純度)を黄色の固形物として得た。
ピペリジン-3-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(119.83mg、228.67μmol、HCl塩)を加え、生成された混合物を15℃で3時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つのピーク(84%)を確認した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(40mLx2)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過した。濾液を真空下で濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex luna C18 150*40mm*15um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:22%~52%、10分)によって精製した。生成物を塩基性イオン交換樹脂で処理し、凍結乾燥し、表題化合物(64.7mg、59.53μmol、28.64%収率、91%純度)を黄色の固形物として得た。
09-2.93(m、2H)、2.90-2.75(m、2H)、2.74-2.60(m、3H)、2.31-2.21(m、2H)、2.16-2.07(m、3H)、2.06-2.00(m、2H)、1.88-1.50(m、9H)。
-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-(1-(2-(2-(2-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-(2-ヒドロキシエトキシ)ベンズアミド(化合物97)の合成
、J=11.9Hz、2H)、2.11-2.01(m、3H)、2.00-1.92(m、2H)、1.78-1.52(m、8H)。
層のpHを4に調整した後、 酢酸エチル(50mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮し、表題化合物(540mg、2.26mmol、61.88%収率)を黄色の固形物として得た。
シ)ベンズアミド(化合物99)の合成
μLtra 150*50mm*3um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:35%~55%、10分、カラム温度:30℃)によって精製し、次いで分取HPLC(カラム:Unisil 3-100 C18 μLtra 150*50mm*3um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~50%、10分、カラム温度:30℃)で再精製し、凍結乾燥し、表題化合物(29.0 mg、12.28μmol、7.97%収率、92%純度、FA)を淡黄色の固形物として得た。
6.65mL)との溶液に、炭酸カリウム(180.16g、1.30mol)を加え、混合物を80℃で16時間撹拌した。TLCによって反応が完了したことを確認し、反応混合物を濾過した。濾液を真空下で濃縮し、表題化合物(56.5g、378.60mmol、87.14%収率)を黄色の油状物として得た。
g、174.17mmol)を加え、混合物を25℃で16時間撹拌した。TLCによって反応が完了したことを確認した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~5/1)によって精製し、表題化合物(11g、24.33mmol、6.98%収率、78%純度)を黄色の固形物として得た。MS(M+H)+=353.1
トキシ-ベンゾエート(1.03g、5.16mmol)の溶液にTsOH(1.78g、10.32mmol)を加え、混合物を100℃で16時間撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物に水(100mL)を入れ、酢酸エチル(100mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(300mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~2/1)によって精製し、表題化合物(1.5g、3.24mmol、94.25%収率、98%純度)を白色の固形物として得た。
アミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)ピペリジン-4-イル)カルバメート(590mg、1.00mmol)の溶液にHCl/ジオキサン(4M、10mL)を加え、反応混合物を25℃で3時間撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。反応混合物を真空下で濃縮し、表題化合物(0.7g、1.44mmol、143.01%収率)を黄色の固形物として得た。
mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Phenomenex Gemini-NX C18 75*30mm*3um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:18%~48%、7分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥した。固体を飽和炭酸水素ナトリウム(20mL)を入れ、酢酸エチル(20mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し濃縮し、表題化合物(86.4mg、90.30μmol、74.62%収率、95%純度)を黄色の固形物として得た。
2-テトラオキサテトラデシル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-(1-(4-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)ブタノイル)ピペリジン-4-イル)ベンズアミドの合成
攪拌し、反応混合物にDMF(2mL)及びDIPEA(80.50mg、622.89μmol、108.50μL)中の4-((4-(4-アミノピペリジン-1-イル)-4-オキソブチル)アミノ)-2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)イソインドリン-1,3-ジオン(163.74mg、342.59μmol、HCl)の溶液を滴下した。生成された混合物を20℃で1時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと所望の質量が検出されたことを確認した。反応混合物を水(12mL)で希釈し、酢酸エチル(12mLx3)で抽出した。有機層を塩水(12mLx3)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Unisil 3-100 C18 μLtra150*50mm*3um; 移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:32%~62%、10分)によって精製し、次いで凍結乾燥し、表題化合物(185.8mg、214.33μmol、68.82%収率、97%純度)を黄色の固形物として得た。
、塩水(100mLx3)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、減圧下で濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~0/1)によって精製し、表題化合物(10.4g、27.92mmol、96.39%収率、97%純度)を緑色の固形物として得た。
気下で加え、生成された混合物をH2(15psi)下で20℃で16時間撹拌した。TLCによって反応が完了したことを確認した。反応混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮し、表題化合物(120mg、粗製)を白色の固形物として得た。
アゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシ安息香酸(165.31mg、355.18μmol)の混合物にHATU(270.10mg、710.37μmol)とDIPEA(137.72mg、1.07mmol、185.60μL)を加え、生成された混合物を20℃で12時間撹拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物に水(20mL)を入れ、酢酸エチル(20mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣を分取HPLC(カラム:Unisil 3-100 C18 μLtra150*50mm*3um;移動相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%~50%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥して、表題化合物(151.3mg、152.23μmol、42.86%収率、98%純度、FA塩)を黄色の固形物として得た。
.51(m、4H)。
26-3.24(m、2H)、2.85-2.75(m、1H)、2.71-2.50(m、3H)、2.32-2.16(m、1H)、2.11-2.08(m、3H)、1.78-1.71(m、10H)、1.60-1.50(m、2H)。
07(t、J=13.9Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.51-3.35(m、9H)、2.94-2.82(m、1H)、2.72(dd、J1=9.1Hz、J2=7.3Hz、1H)、2.65-2.53(m、3H)、2.48-2.37(m、5H)、2.18-2.09(m、1H)、2.05-1.91(m、3H)、1.85-1.77(m、2H)、1.73-1.67(m、4H)、1.66-1.56(m、4H)。
アセトアミド(3)の合成
圧下で濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(12g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶離液0~5%メタノール/酢酸エチル勾配@60mL/分)によって精製し、表題化合物(160mg、272.74μmol、38.09%収率)を黄色の固形物として得た。
Hz、1H)、8.09-7.94(m、2H)、7.57(dd、J1=7.5、J2=8.2Hz、1H)、7.19(d、J=6.7Hz、1H)、7.05(d、J=7.0Hz、1H)、6.93(t、J=5.5Hz、1H)、6.84(d、J=8.6Hz、1H)、5.07(dd、J1=5.4、J2=12.9Hz、1H)、4.89-4.74(m、1H)、4.39-4.27(m、1H)、4.07(t、J=13.9Hz、2H)、4.01-3.78(m、5H)、3.48(t、J=5.9Hz、2H)、3.45-3.39(m、2H)、3.33(s、3H)、3.30-3.25(m、2H)、2.95-2.83(m、1H)、2.79(dd、J1=7.3、J2=9.3Hz、1H)、2.69-2.60(m、2H)、2.59-2.52(m、4H)、2.45-2.40(m、1H)、2.17-2.08(m、1H)、2.07-1.90(m、3H)、1.78-1.52(m、7H)。
。
6(m、7H)、3.55-3.36(m、5H)、2.96-2.79(m、1H)、2.65- 2.51(m、5H)、2.19-1.86(m、5H)、1.78-1.52(m、6H)。
、4.88-4.78(m、1H)、4.50-4.39(m、1H)、4.13-4.04(m、4H)、3.92(s、3H)、3.75-3.70(m、1H)、3.62(br d、J=4.8Hz、2H)、3.57-3.50(m、12H)、3.49-3.44(m、4H)、3.34(br s、3H)、2.91-2.87(m、1H)、2.59- 2.51(m、2H)、2.21-2.13(m、1H)、2.08-1.88(m、5H)、1.78-1.69(m、2H)、1.68-1.55(m、4H)。
.42(m、1H)、3.38-3.36(m、1H)、3.29-3.23(m、5H)、2.94-2.82(m、1H)、2.62-2.51(m、2H)、2.35-2.24(m、2H)、2.18-1.89(m、5H)、1.76-1.56(m、10H)。
0H)、2.71-2.52(m、1H)、2.29-2.18(m、2H)、2.11-1.85(m、4H)、1.78-1.68(m、2H)、1.67-1.49(m、8H)、1.41-1.30(m、2H)。
H)、7.01(dd、J=4.4、7.0Hz、1H)、6.53(q、J=5.8Hz、1H)、5.08-5.01(m、1H)、4.86-4.76(m、1H)、4.52-4.35(m、1H)、4.07(t、J=13.8Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.79-3.36(m、3H)、3.31-3.22(m、3H)、2.94-2.82(m、1H)、2.63-2.51(m、4H)、2.30-1.77(m、8H)、1.76-1.68(m、2H)、1.65-1.50(m、8H)、1.43-1.31(m、2H)。
前記反応式に基づいて、上述した実施例と同様の方法で、表題化合物(39.1mg、40.71μmol、12.63%収率、94%純度)を淡黄色の固形物として得た。
4-イル)アミノ)エトキシ)エチル)アセトアミド(200mg、382.42μmol、HCl塩)を加え、生成された混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMSによって所望の質量を有する一つのピーク(55% )を確認した。混合物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:38%~68%、10分)と分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM 炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:40%~70%、10分)によって精製し、表題化合物(15.8mg、15.72μmol、36.70%収率、92.920%純度)を黄色の固形物として得た。
2(dd、J=3.9、7.0Hz、1H)、6.79-6.71(m、1H)、5.15-5.05(m、1H)、4.91-4.76(m、1H)、4.55-4.44(m、1H)、4.13(t、J=14.0Hz、2H)、3.96(s、3H)、3.39-3.37(m、3H)、3.34-3.26(m、3H)、3.25-3.16(m、2H)、3.10-3.03(m、1H)、3.00-2.90(m、1H)、2.88-2.80(m、2H)、2.69-2.62(m、3H)、2.30-2.21(m、1H)、2.10-1.99(m、3H)、1.83-1.62(m、10H)。
ソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)アゼチジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミド(3)の合成
)。
オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-((1-(2-(2-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エチル)ピペリジン-2-イル)メチル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
1.89(m、4H)、1.75-1.43(m、11H)、1.40-1.18(m、5H)。
0Hz、1H)、4.29-4.15(m、1H)、3.89(br t、J=13.3Hz、3H)、3.40(s、3H)、3.37(br d、J=4.6Hz、3H)、3.21(br t、J=12.4Hz、1H)、2.93-2.80(m、4H)、2.72(br s、4H)、2.64-2.55(m、2H)、2.27-1.95(m、6H)、1.80-1.39(m、10H)。
3(m、2H)、2.02-1.82(m、4H)、1.79-1.54(m、7H)。
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-((3R)-1-(3-(4-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)ピペラジン-1-イル)プロパノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
アミドの合成
オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-((3R)-1-(5-(4-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)ピペラジン-1-イル)ペンタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-((3S)-1-(2-(4-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-5-イル)ピペラジン-1-イル)アセチル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-((3S)-1-(3-(4-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-5-イル)ピペラジン-1-イル)プロパノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-((3R)-1-(3-(4-(2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-5-イル)ピペラジン-1-イル)プロパノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
キソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-5-イル)ピペラジン-1-イル)ブタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
キソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-5-イル)ピペラジン-1-イル)ペンタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
キソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-4-オキソブタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
59-2.53(m、2H)、 2.52-2.50(m、1H)、2.14-1.87(m、5H)、1.77-1.68(m、2H)、1.68-1.57(m、4H)
25.17μmol、14.08%収率、97%純度)を黄色の固形物として得た。
3(m、1H)、4.54-4.35(m、1H)、4.04(t、J=14.1Hz、2H)、3.85-3.64(m、3H)、3.63-3.52(m、5H)、3.51-3.41(m、3H)、3.41-3.33(m、3H)、3.30-3.22(m、1H)、2.95-2.83(m、1H)、2.64-2.56(m、3H)、2.56-2.52(m、3H)、2.24-2.08(m、1H)、2.04-1.91(m、4H)、1.76-1.68(m、2H)、1.65-1.54(m、4H)。
8.36-8.20(m、3H)、8.03(s、1H)、7.68(dd、J1=3.2、J2=8.5Hz、1H)、7.33(br s、1H)、7.28-7.21(m、1H)、7.19(dd、J1=1.6、J2=6.6Hz、1H)、5.07(dd、J1=5.4、J2=13.1Hz、1H)、4.90-4.72(m、1H)、4.54-4.35(m、1H)、4.07(br t、J=13.9Hz、2H)、3.91(s、3H)、3.76-3.55(m、6H)、3.54-3.38(m、9H)、2.94-2.82(m、1H)、2.70-2.56(m、2H)、2.44-2.37(m、2H)、2.34-2.26(m、2H)、2.19-2.05(m、1H)、2.05-1.89(m、4H)、1.80-1.68(m、4H)、1.68-1.54(m、4H)。
@60mL/分)によって精製し、表題化合物(1.36g、2.99mmol、51.66%収率)を黄色の固形物として得た。
量が検出されたことを確認した。混合物にTEAを0℃で加え、pHを>7に調整し、溶媒のほとんどをN2で吹き飛ばした。残渣をDMFに希釈し、分取HPLC(カラム:Waters Xbridge 150*25mm*5um;移動相:[水(10mM炭酸水素アンモニウム)-ACN];B%:11%~41%、10分)によって精製し、溶離液を凍結乾燥し、表題化合物(110mg、210.51μmol、65.54%収率)を黄色の固形物として得た。
ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)-5-オキソペンタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
、4H)、3.91(s、3H)、3.72(dd、J=6.6、10.3Hz、1H)、3.64-3.52(m、1H)、3.51-3.42(m、1H)、3.34-3.40(m、2H)、3.26-3.32(m、2H)、2.93-2.80(m、1H)、2.63-2.51(m、2H)、2.2 1-2.29(m、2H)、2.20-2.04(m、3H)、2.03-1.87(m、4H)、1.67-1.78(m、4H)、1.66-1.53(m、4H)。
ィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=5/1~1/1)によって精製し、表題化合物(687mg、1.46mmol、40.39%収率、98%純度)を緑色の油状物として得た。MS(M-100+H)+=361.3
ゼピン-2-イル)アミノ)-N-(2-(2-(2-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エチル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
、4H)。
2-アザスピロ[3.3]ヘプタン-6-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
7%の所望の質量が検出されたことを確認した。反応混合物を別のバッチ(30mgスケール)と合わせ、真空下で濃縮した。残渣をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(4g SepaFlash(登録商標)シリカフラッシュカラム、溶離液25~41%酢酸エチル/石油エーテル勾配@60mL/分)によって精製し、表題化合物(190mg、288.01μmol、134.05%収率)を褐色の固形物として得た。MS(M+H)+=660.6.
拌した。LCMSによって反応が完了したことを確認した。混合物に水(450mL)を入れ、酢酸エチル(450mLx3)で抽出した。合わせた有機層を塩水(1000mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=1/0~0/1)によって精製し、表題化合物(12g、30.90mmol、84.73%収率)を白色の固形物として得た。MS(M+H)+=389.1
し、硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(二酸化ケイ素、石油エーテル/酢酸エチル=8/1~2/1)によって精製し、表題化合物(8.3g、35.43mmol、82.61%収率、97%純度)を白色の固形物として得た。MS(M+H)+=228.4
5.12(s、2H)、3.94(s、3H)。
-イン-1-イル)カルバメート(810mg、1.64mmol、89%純度)の溶液にPd/C(0.4mg、164.03μmol、10%純度)をN2下で加えた。懸濁液を真空下で脱気し、H2で数回パージした。混合物をH2(15psi)下で20℃で16時間撹拌した。LCMSによって出発物質が完全に消費されたことと、所望の質量を有する一つのピークが検出されたことを確認した。反応混合物をTHF(20mL)で希釈し、濾過した。濾液を真空下で濃縮して、表題化合物(449mg、1.01mmol、61.72%収率)を白色の固形物として得た。MS(M-100+H)+=344.3
(s、3H)、3.33(s、3H)、3.27-3.21(m、2H)、2.97-2.86(m、1H)、2.67-2.56(m、3H)、2.46-2.36(m、1H)、2.05-1.90(m、3H)、1.74-1.48(m、10H)、1.42-1.32(m、4H)。
、3.37-3.36(m、3H)、3.26-3.21(m、2H)、2.97-2.87(m、1H)、2.67-2.63(m、2H)、2.48-2.38(m、2H)、2.05-1.93(m、3H)、1.73-1.50(m、10H)、1.37-1.29(m、6H)。
、2H)、1.79-1.68(m、6H)、1.65-1.55(m、4H)。
オキソ-6,7,8,9-テトラヒドロ-5H-ピリミド[4,5-b][1,4]ジアゼピン-2-イル)アミノ)-N-(1-(23-((2-(2,6-ジオキソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)アミノ)-3,6,9,12,15,18,21-ヘプタオキサトリコシル)ピペリジン-4-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
-3.51(m、6H)、3.51-3.48(m、19H)、3.48-3.44(m、4H)、2.90-2.81(m、3H)、2.63-2.52(m、4H)、2.47-2.43(m、2H)、2.09-2.00(m、3H)、1.99-1.92(m、2H)、1.81-1.69(m、4H)、1.66-1.50(m、6H)。
キソピペリジン-3-イル)-1,3-ジオキソイソインドリン-4-イル)-2,6-ジアザスピロ[3.3]ヘプタン-2-イル)ブタノイル)ピロリジン-3-イル)-2-フルオロ-5-メトキシベンズアミドの合成
H)、3.79-3.70(m、1H)、3.62-3.53(m、1H)、3.52-3.42(m、2H)、3.38-3.34(m、2H)、3.33-3.32(m、3H)、3.27-3.20(m、4H)、2.92-2.81(m、1H)、2.61-2.54(m、2H)、2.47-2.42(m、1H)、2.36-2.29(m、2H)、2.26-2.17(m、2H)、2.03-1.86(m、4H)、1.76-1.56(m、6H)、1.53-1.43(m、2H)。
s、2H)、2.17-2.02(m、4H)、1.84-1.68(m、4H)、1.65-1.52(br s、4H)。
1.HeLa細胞株の培養
HeLa細胞株を韓国細胞株銀行から購入した。培養細胞の継代(Passage)をP115~P125に維持した。
セルカウントのためにサーモフィッシャーサイエンティフィック社のセルカウンター(cULM counter)(Catalog#AMQAX1000)と0.4%トリパンブルー(Trypan blue)溶液を用いた。
12ウェルプレート(SPL社)の各ウェル毎に2×105個の細胞を播種し、細胞を
培地で総量2mLにして培養した。
SDS-PAGE及びウエスタンブロッティングの場合、1X RIPA溶解バッファー(Rockland、カタログ番号MB-030-0050;ロット番号39751)、100Xプロテアーゼ阻害剤カクテル(Quartett、カタログ番号PPI1015;ロット番号PCO50038424)、Pierce(商標) プロテインアッセイBCAキット(ThermoScientific、カタログ番号23225;ロット番号UC276876)、アルブミンスタンダード(ThermoScientific、カタログ番号23209;ロット番号UB269561)、4~15%Mini-PROTEAN TGX染色フリーゲル(Bio-rad、カタログ番号4568085;ロット番号L007041B)、10X Tris/Glycine/SDSバッファー(Bio-rad、カタログ番号1610732;ロット番号10000044375B);10X TBS(Bio-rad、カタログ番号1706435;ロット番号1 000045140B)、10%Tween 20溶液(カタログ番号1610781;ロット番号L004152B)、Color protein standard broad
range(NEB、カタログ番号P7719S;ロット番号10040349)、4X Laemmliサンプルバッファー(Bio-rad、カタログ番号1610747;ロット番号L004133B)、β-メルカプトエタノール(Sigma-Aldrich、カタログ番号M3148;ロット番号60-4-2)、SuperBlock (商標) T20(TBS)ブロッキングバッファー(ThermoScientific、カタログ番号37536;ロット番号UC282578)、1Mアジ化ナトリウム溶液(Sigma-Aldrich、カタログ番号08591-1mL-F;ロット番号BCBV4989)、α-Rabbit pAb to Ms IgG(abcam、カタログ番号ab97046;ロット番号GR3252115-1)、α -Goat pAb
to Rb IgG(CST、カタログ番号7074S;ロット番号28)、α -GAPDH(abcam、カタログ番号ab8245;ロット番号GR3275542-2)、α- PLK1(CST、カタログ番号208G4)、α-BRD4(CST、カタログ番号13440S)、ECL (商標) Primeウェスタンブロッティング試薬(GE Healthcare、カタログ番号RPN2232;ロット番号17001655)、Ponceau S溶液(Sigma-Aldrich、カタログ番号P7170;ロット番号SLBV4112)、Difco (商標) Skim milk(BD、カタログ番号232100;ロット番号8346795)、iBlot (登録商標)
2 NC Regular stacks(Invitrogen社、カタログ番号IB23001;ロット番号2NR110619-02)を用いた。
液を回収した。その後、1mLの細胞を収集液を8,000rpmで120秒間遠心分離し、上澄み液を除去した。0.2mLのPBSで洗浄した後、PBSを除去した。
次に、BCAアッセイを用いて標準曲線を取得し、曲線の式を代入することにより溶解物中のタンパク質の質量を定量化した。混合物には20μLの標準溶液またはサンプル溶液、200μLのBCAまたはブラッドフォード溶液を用いて、37℃で30分間インキュベーションし、562nmの吸光度で測定した。サンプルは、各ウェル当り15μgになるように、4Xサンプルバッファーを添加してサンプルを用意した。
上述した実験の結果、本願発明の実施例における化合物のDmaxとDC50の数値は、下記の表のように測定した。
本願発明の化合物2~4は(タンパク質標的部分がBI系列のPLK1阻害剤分子である)比較化合物1と2に比べPLK1分解能に優れている点に加えて、PLK1以外の標的タンパク質であるBrd4に対する分解能を示さないので、標的タンパク質に対する選択的分解能も優れているという点が確認された(図2)。これは、本願発明の化合物が選択的PLK1分解能に優れていることを証明する。
Claims (5)
- 化合物1~175からなる群から選択される化合物、その立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩。
- PLK1タンパク質の分解を誘導する二官能性である、請求項1に記載の化合物、その立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩。
- PLK1タンパク質の選択的分解を誘導する、請求項2に記載の化合物、その立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩。
- 請求項1~3のいずれか一項に記載の化合物、その立体異性体またはこれらの薬学的に許容可能な塩を含む、PLK1関連疾患の予防または治療用組成物。
- PLK1関連疾患は、癌、良性腫瘍、神経疾患からなる群から選択された1種以上である、請求項4に記載の組成物。
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