JP7174109B2 - 腫瘍溶解性ウイルスベクター及びその使用 - Google Patents

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    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年1月27日に出願された米国特許仮出願第62/287,619号の優先権を主張するものであり、その内容全体は、参照により本明細書に援用される。
配列表に関する記述
本出願に関連する配列表は、紙媒体の代わりにテキスト形式で提供され、参照により本明細書に援用される。配列表を含むテキストファイルの名称は、ONCR_001_01WO_ST2.txtである。テキストファイルは、7KBであり、2017年1月26日に作成され、EFS-Webを介して電子提出された。
発明の分野
本開示は、がんの治療及び予防のための組み換えウイルスベクターに関する。ウイルスベクターは、次の側面:腫瘍抑制性マイクロRNA(miRNA)標的配列をウイルスゲノムに挿入することによるウイルス複製制限、がん促進性miRNA機能の破壊、がん微小環境リモデリング、及び/またはプロテアーゼ活性化抗体をウイルス粒子に組み込むことによるがん細胞標的化のうちの1つ以上を利用する。
現在の標的化がん治療薬は、腫瘍タンパク質発現プロファイルの不均質性に起因して、狭い範囲のがんにのみ有効である。更に、多くのがん治療は、既存のウイルスベクター、化学療法、放射線及び手術を含め、正常な非がん性細胞の健康及び生存を維持しながらがん性細胞を選択的に治療するには、特異性に欠け、望ましくないオフターゲット効果を生じることがある。そのため、複数のがんに広く有効であり、がん性細胞を選択的に排除することができるがん治療法が当該技術分野において求められている。
腫瘍溶解性ウイルスは、がん細胞に優先的に感染するウイルスであり、複数のがん治療前臨床試験及び臨床試験に使用されている。腫瘍溶解性ウイルスの使用は、健康な細胞が非特異的にウイルス感染するリスクを伴い、非がん性細胞及び組織の死をもたらす。しかし、正常組織とがん性組織で差次的に発現する経路、タンパク質及び遺伝子を利用するようにウイルスを遺伝子操作することで、これらのウイルスの特異性を高め、オフターゲット感染及び細胞死を制限することができる。
マイクロRNA(miRNAまたはmiR)は、その標的メッセンジャーRNAに向かい、分解または翻訳抑制を行うことによって遺伝子発現を制御する、内因性の小さなノンコーディングRNAである。miRNAは、正常な細胞プロセスと密接に関係しているため、miRNAの制御異常は、がんを含む広範な疾患の一因となる。多くのmiRNA遺伝子は、がん関連ゲノム領域または脆弱部位に位置しており、miRNAががんにおいて中心的役割を果たすという証拠を更に強めている。miRNAは、正常組織と比較してがん組織で差次的に発現し、腫瘍形成との因果関係を有し得る。この異なる腫瘍種での差次的miRNA発現を利用することによって、本明細書に記載されるがん治療は、腫瘍溶解性ウイルスの複製が特定のmiRNAまたはmiRNA群の発現に基づいて制御されており、広範囲の安全性及び有効プロファイルを有する。更に、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスはまた、腫瘍全体にわたるウイルス伝播を促進するタンパク質、例えば、細胞外マトリックスを制御する遺伝子及びタンパク質の発現を変更させるタンパク質などを発現し得、これによって、その治療効果が増大し得る。
本発明は、がんの治療及び予防に有用な組み換えウイルスベクターに関する。腫瘍溶解性ウイルスベクターは、次の側面:腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列をウイルスゲノムに挿入することによって、ウイルスベクター複製をがん細胞または腫瘍細胞に制限すること、1つ以上の遺伝子であって、その産物(複数可)ががん促進性miRNA及び/またはがん細胞外マトリックスの機能を破壊する、1つ以上の遺伝子をウイルスゲノムに組み込むこと、ならびにプロテアーゼ活性化抗体をウイルス粒子に組み込むことによって、ベクターをがん/腫瘍細胞に対して高度に選択的に標的化することを、個別にまたは組み合わせて含む。
いくつかの実施形態において、本発明は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列のコピーを1つ以上含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。いくつかの実施形態において、ウイルスは、単純ヘルペスウイルス、アデノウイルス、ポリオウイルス、ワクシニアウイルス、麻疹ウイルス、水疱性口内炎ウイルス、オルトミクソウイルス、パルボウイルス、マラバウイルスまたはコクサッキーウイルスである。いくつかの実施形態において、ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子は、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、表3から選択されるmiRの標的配列である。いくつかの実施形態において、1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’非翻訳領域(UTR)または3’UTRに組み込まれる。
いくつかの実施形態において、本発明は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列のコピーを1つ以上含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスであって、ウイルスの複製は、第2の細胞におけるウイルスの複製と比較して、第1の細胞において減少または減衰する、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。いくつかの実施形態において、第1の細胞は、1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、第2の細胞における腫瘍抑制性miRの発現と比較して上昇している。いくつかの実施形態において、第1の細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルは、第2の細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%高い。いくつかの実施形態において、第2の細胞は、1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、第1の細胞における腫瘍抑制性miRの発現と比較して低下している。いくつかの実施形態において、第2の細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルは、第1の細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%低い。いくつかの実施形態において、第2の細胞は、がん性細胞である。
いくつかの実施形態において、本発明は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列のコピーを1つ以上含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスであって、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-124、miR-451a、miR-143-3p及びmiR-559に対するものである、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、膵癌、肺癌及び/または結腸癌の治療に使用される。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、miR-124、miR-451、miR-143-3p、miR-1及びmiR-559に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、miR-124、miR-451、miR-145-5p及びmiR-559に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、任意のがん種に由来する腫瘍の治療に使用される。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、miR-205p、miR-141-5p、miR-31-5p及びmiR-124に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、シュワン腫の治療に使用される。更なる実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ICP4、ICP27、UL19及び/またはUL30遺伝子座に挿入される。
いくつかの実施形態において、本発明は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列のコピーを1つ以上含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスであって、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-136-3p、miR-432-5p、miR-1-3p、miR-127-3p、miR-379-5p、miR-493-5p、miR-223-5p、miR-223-5p、miR-136-5p、miR-451a、miR-487b-3p、miR-370-3p、miR-410-3p、miR-431-3p、miR-4485-3p、miR-4485-5p、miR-127-5p、miR-409-3p、miR-338-3p、miR-559、miR-411-5p、miR-133a-5p、miR-143-3p、miR-376b-3p、miR-758-3p、miR-1、miR-101、miR-1180、miR-1236、miR-124-3p、miR-125b、miR-126、miR-1280、miR-133a、miR-133b、miR-141、miR-143、miR-144、miR-145、miR-155、miR-16、miR-18a、miR-192、miR-195、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-203、miR-205、miR-214、miR-218、miR-23b、miR-26a、miR-29c、miR-320c、miR-34a、miR-370、miR-409-3p、miR-429、miR-451b、miR-490-5p、miR-493、miR-576-3p及び/またはmiR-99aに対する標的配列である、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、膀胱癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-1251-5p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-124-3p、miR-448、miR-138-2-3p、miR-490-5p、miR-129-1-3p、miR-1264、miR-3943、miR-490-3p、miR-383-5p、miR-133b、miR-129-2-3p、miR-128-2-5p、miR-133a-3p、miR-129-5p、miR-1-3p、miR-885-3p、miR-124-5p、miR-759、miR-7158-3p、miR-770-5p、miR-135a-5p、miR-885-5p、let-7g-5p、miR-100、miR-101、miR-106a、miR-124、miR-124a、miR-125a、miR-125a-5p、miR-125b、miR-127-3p、miR-128、miR-129、miR-136、miR-137、miR-139-5p、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-146b-5p、miR-149、miR-152、miR-153、miR-195、miR-21、miR-212-3p、miR-219-5p、miR-222、miR-29b、miR-31、miR-3189-3p、miR-320、miR-320a、miR-326、miR-330、miR-331-3p、miR-340、miR-342、miR-34a、miR-376a、miR-449a、miR-483-5p、miR-503、miR-577、miR-663、miR-7、miR-7-5p、miR-873、let-7a、let-7f、miR-107、miR-122、miR-124-5p、miR-139、miR-146a、miR-146b、miR-15b、miR-16、miR-181a、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-185、miR-199a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-203、miR-204、miR-205、miR-218、miR-23b、miR-26b、miR-27a、miR-29c、miR-328、miR-34c-3p、miR-34c-5p、miR-375、miR-383、miR-451、miR-452、miR-495、miR-584、miR-622、miR-656、miR-98、miR-124-3p、miR-181b-5p、miR-200b及び/またはmiR-3189-3pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、脳癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-10b-5p、miR-126-3p、miR-145-3p、miR-451a、miR-199b-5p、miR-5683、miR-3195、miR-3182、miR-1271-5p、miR-204-5p、miR-409-5p、miR-136-5p、miR-514a-5p、miR-559、miR-483-3p、miR-1-3p、miR-6080、miR-144-3p、miR-10b-3p、miR-6130、miR-6089、miR-203b-5p、miR-4266、miR-4327、miR-5694、miR-193b、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-107、miR-10a、miR-10b、miR-122、miR-124、miR-1258、miR-125a-5p、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-129、miR-130a、miR-132、miR-133a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-146b、miR-147、miR-148a、miR-149、miR-152、miR-153、miR-15a、miR-16、miR-17-5p、miR-181a、miR-1826、miR-183、miR-185、miR-191、miR-193a-3p、miR-195、miR-199b-5p、miR-19a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-205、miR-206、miR-211、miR-216b、miR-218、miR-22、miR-26a、miR-26b、miR-300、miR-30a、miR-31、miR-335、miR-339-5p、miR-33b、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374a、miR-379、miR-381、miR-383、miR-425、miR-429、miR-450b-3p、miR-494、miR-495、miR-497、miR-502-5p、miR-517a、miR-574-3p、miR-638、miR-7、miR-720、miR-873、miR-874、miR-92a、miR-98、miR-99a、mmu-miR-290-3p及び/またはmmu-miR-290-5pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、乳癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-143、miR-145、miR-17-5p、miR-203、miR-214、miR-218、miR-335、miR-342-3p、miR-372、miR-424、miR-491-5p、miR-497、miR-7、miR-99a、miR-99b、miR-100、miR-101、miR-15a、miR-16、miR-34a、miR-886-5p、miR-106a、miR-124、miR-148a、miR-29a及び/またはmiR-375に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、子宮頸癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-133a-5p、miR-490-5p、miR-124-3p、miR-137、miR-655-3p、miR-376c-3p、miR-369-5p、miR-490-3p、miR-432-5p、miR-487b-3p、miR-342-3p、miR-223-3p、miR-136-3p、miR-136-3p、miR-143-5p、miR-1-3p、miR-214-3p、miR-143-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-127-3p、miR-133a-3p、miR-145-5p、miR-145-3p、miR-199a-5p、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-101、miR-126、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-192、miR-200c、miR-21、miR-214、miR-215、miR-22、miR-25、miR-302a、miR-320、miR-320a、miR-34a、miR-34c、miR-365、miR-373、miR-424、miR-429、miR-455、miR-484、miR-502、miR-503、miR-93、miR-98、miR-186、miR-30a-5p、miR-627、let-7a、miR-1、miR-124、miR-125a、miR-129、miR-1295b-3p、miR-1307、miR-130b、miR-132、miR-133a、miR-133b、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-150-5p、miR-154、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-18a、miR-191、miR-193a-5p、miR-194、miR-195、miR-196a、miR-198、miR-199a-5p、miR-203、miR-204-5p、miR-206、miR-212、miR-218、miR-224、miR-24-3p、miR-26b、miR-27a、miR-28-3p、miR-28-5p、miR-29b、miR-30a-3p、miR-30b、miR-328、miR-338-3p、miR-342、miR-345、miR-34a-5p、miR-361-5p、miR-375、miR-378、miR-378a-3p、miR-378a-5p、miR-409-3p、miR-422a、miR-4487、miR-483、miR-497、miR-498、miR-518a-3p、miR-551a、miR-574-5p、miR-625、miR-638、miR-7、miR-96-5p、miR-202-3p、miR-30a及び/またはmiR-451に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、結腸癌または大腸癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-130a、miR-130b、miR-134、miR-143、miR-145、miR-152、miR-205、miR-223、miR-301a、miR-301b、miR-30c、miR-34a、miR-34c、miR-424、miR-449a、miR-543及び/またはmiR-34bに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、子宮内膜癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-125b、miR-138、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-16-1、miR-16-1-3p、miR-16-2、miR-181a、miR-181b、miR-195、miR-223、miR-29b、miR-34b、miR-34c、miR-424、miR-10a、miR-146a、miR-150、miR-151、miR-155、miR-2278、miR-26a、miR-30e、miR-31、miR-326、miR-564、miR-27a、let-7b、miR-124a、miR-142-3p、let-7c、miR-17、miR-20a、miR-29a、miR-30c、miR-720、miR-107、miR-342、miR-34a、miR-202、miR-142-5p、miR-29c、miR-145、miR-193b、miR-199a、miR-214、miR-22、miR-137及び/またはmiR-197に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、血液癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-1、miR-145、miR-1826、miR-199a、miR-199a-3p、miR-203、miR-205、miR-497、miR-508-3p、miR-509-3p、let-7a、let-7d、miR-106a、miR-126、miR-1285、miR-129-3p、miR-1291、miR-133a、miR-135a、miR-138、miR-141、miR-143、miR-182-5p、miR-200a、miR-218、miR-28-5p、miR-30a、miR-30c、miR-30d、miR-34a、miR-378、miR-429、miR-509-5p、miR-646、miR-133b、let-7b、let-7c、miR-200c、miR-204、miR-335、miR-377及び/またはmiR-506に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、腎癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-100、miR-101、miR-105、miR-122、miR-122a、miR-1236、miR-124、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-1271、miR-128-3p、miR-129-5p、miR-130a、miR-130b、miR-133a、miR-134、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-141、miR-142-3p、miR-143、miR-144、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150-5p、miR-15b、miR-16、miR-181a-5p、miR-185、miR-188-5p、miR-193b、miR-195、miR-195-5p、miR-197、miR-198、miR-199a、miR-199a-5p、miR-199b、miR-199b-5p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-202、miR-203、miR-204-3p、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-21、miR-21-3p、miR-211、miR-212、miR-214、miR-217、miR-218、miR-219-5p、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-29b-1、miR-29b-2、miR-29c、miR-302b、miR-302c、miR-30a、miR-30a-3p、miR-335、miR-338-3p、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-365、miR-370、miR-372、miR-375、miR-376a、miR-377、miR-422a、miR-424、miR-424-5p、miR-433、miR-4458、miR-448、miR-450a、miR-451、miR-485-5p、miR-486-5p、miR-497、miR-503、miR-506、miR-519d、miR-520a、miR-520b、miR-520c-3p、miR-582-5p、miR-590-5p、miR-610、miR-612、miR-625、miR-637、miR-675、miR-7、miR-877、miR-940、miR-941、miR-98、miR-99a、miR-132及び/またはmiR-31に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、肝癌を治療するために使用される。更なる実施形態において、肝癌は、肝細胞癌である。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-143-3p、miR-126-3p、miR-126-5p、miR-1266-3p、miR-6130、miR-6080、miR-511-5p、miR-143-5p、miR-223-5p、miR-199b-5p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-142-5p、miR-144、miR-150-5p、miR-142-3p、miR-214-3p、miR-214-5p、miR-199a-5p、miR-145-3p、miR-145-5p、miR-1297、miR-141、miR-145、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-29b、miR-381、miR-409-3p、miR-429、miR-451、miR-511、miR-99a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-101、miR-133b、miR-138、miR-142-5p、miR-144、miR-1469、miR-146a、miR-153、miR-15a、miR-15b、miR-16-1、miR-16-2、miR-182、miR-192、miR-193a-3p、miR-194、miR-195、miR-198、miR-203、miR-217、miR-218、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29c、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-365、miR-449a、miR-449b、miR-486-5p、miR-545、miR-610、miR-614、miR-630、miR-660、miR-7515、miR-9500、miR-98、miR-99b、miR-133a、let-7a、miR-100、miR-106a、miR-107、miR-124、miR-125a-3p、miR-125a-5p、miR-126、miR-126、miR-129、miR-137、miR-140、miR-143、miR-146b、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-152、miR-154、miR-155、miR-17-5p、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-186、miR-193b、miR-199a、miR-204、miR-212、miR-221、miR-224、miR-27a、miR-27b、miR-29a、miR-30a、miR-30b、miR-30c、miR-30d、miR-30d-5p、miR-30e-5p、miR-32、miR-335、miR-338-3p、miR-340、miR-342-3p、miR-361-3p、miR-373、miR-375、miR-4500、miR-4782-3p、miR-497、miR-503、miR-512-3p、miR-520a-3p、miR-526b、miR-625及び/またはmiR-96に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、肺癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7b、miR-101、miR-125b、miR-1280、miR-143、miR-146a、miR-146b、miR-155、miR-17、miR-184、miR-185、miR-18b、miR-193b、miR-200c、miR-203、miR-204、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-211、miR-218、miR-26a、miR-31、miR-33a、miR-34a、miR-34c、miR-376a、miR-376c、miR-573、miR-7-5p、miR-9及び/またはmiR-98に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、黒色腫を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7d、miR-218、miR-34a、miR-375、miR-494、miR-100、miR-124、miR-1250、miR-125b、miR-126、miR-1271、miR-136、miR-138、miR-145、miR-147、miR-148a、miR-181a、miR-206、miR-220a、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-32、miR-323-5p、miR-329、miR-338、miR-370、miR-410、miR-429、miR-433、miR-499a-5p、miR-503、miR-506、miR-632、miR-646、miR-668、miR-877及び/またはmiR-9に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、口腔癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7i、miR-100、miR-124、miR-125b、miR-129-5p、miR-130b、miR-133a、miR-137、miR-138、miR-141、miR-145、miR-148a、miR-152、miR-153、miR-155、miR-199a、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-212、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-409-3p、miR-411、miR-429、miR-432、miR-449a、miR-494、miR-497、miR-498、miR-519d、miR-655、miR-9、miR-98、miR-101、miR-532-5p、miR-124a、miR-192、miR-193a及び/またはmiR-7に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、卵巣癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-216a-5p、miR-802、miR-217、miR-145-3p、miR-143-3p、miR-451a、miR-375、miR-214-3p、miR-216b-3p、miR-432-5p、miR-216a-3p、miR-199b-5p、miR-199a-5p、miR-136-3p、miR-216b-5p、miR-136-5p、miR-145-5p、miR-127-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-559、miR-129-2-3p、miR-4507、miR-1-3p、miR-148a-3p、miR-101、miR-1181、miR-124、miR-1247、miR-133a、miR-141、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150、miR-150-5p、miR-152、miR-15a、miR-198、miR-203、miR-214、miR-216a、miR-29c、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-373、miR-375、miR-410、miR-497、miR-615-5p、miR-630、miR-96、miR-132、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-126、miR-135a、miR-143、miR-144、miR-150、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-217、miR-218、miR-337、miR-494及び/またはmiR-98に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、膵癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-3p、let-7c、miR-100、miR-101、miR-105、miR-124、miR-128、miR-1296、miR-130b、miR-133a-1、miR-133a-2、miR-133b、miR-135a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-154、miR-15a、miR-187、miR-188-5p、miR-199b、miR-200b、miR-203、miR-205、miR-212、miR-218、miR-221、miR-224、miR-23a、miR-23b、miR-25、miR-26a、miR-26b、miR-29b、miR-302a、miR-30a、miR-30b、miR-30c-1、miR-30c-2、miR-30d、miR-30e、miR-31、miR-330、miR-331-3p、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374b、miR-449a、miR-4723-5p、miR-497、miR-628-5p、miR-642a-5p、miR-765及び/またはmiR-940に対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、前立腺癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-183、miR-204、miR-34a、miR-365b-3p、miR-486-3p及び/またはmiR-532-5pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、網膜芽細胞腫を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-143-3p、miR-133b、miR-1264、miR-448、miR-1298-5p、miR-490-5p、miR-138-2-3p、miR-144-3p、miR-144-5p、miR-150-5p、miR-129-1-3p、miR-559、miR-1-3-p、miR-143-5p、miR-223-3p、miR-3943、miR-338-3p、miR-124-3p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-451a、miR-142-5p、miR-133a-3p、miR-145-5p及び/またはmiR-145-3pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、膠芽腫を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-143-3p、miR-223-3p、miR-6080、miR-208b-3p、miR-206、miR-133a-5p、miR-133b、miR-199a-5p、miR-199b-5p、miR-145-3p、miR-145-5p、miR-150-5p、miR-142-3p、miR-144-3p、miR-144-5p、miR-338-3p、miR-214-3p、miR-559、miR-133a-3p、miR-1-3p、miR-126-3p、miR-142-5p、miR-451a、miR-199a-3p及び/またはmiR-199b-3pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、頭頸部癌を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列は、miR-133b、miR-208b-3p、miR-6130、miR-141-5p、miR-31-3p、miR-1293、miR-129-2-3p、miR-129-5p、miR-124-3p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-490-3p、miR-488-3p、miR-935、miR-124-5p、miR-122-3p、miR-122-5p、miR-1-3p、miR-133a-3p、miR-375、miR-141-3p、miR-31-5p、miR-205-5p、miR-200c-3p及び/またはmiR-203a-3pに対する標的配列である。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、シュワン腫を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、本発明は、(a)ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列、(b)1つ以上のタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする1つ以上のポリヌクレオチドであって、当該タンパク質もしくはオリゴヌクレオチドは、miR、遺伝子もしくはTIMPの発現を減少させるか、その機能を阻害する、ポリヌクレオチド、(c)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体、及び/または(d)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体をコードするポリヌクレオチドのうちの1つ以上を含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。いくつかの実施形態において、miRは、がん促進性miRまたは微小環境リモデリングmiRである。いくつかの実施形態において、がん促進性miRは、表4に列挙されるmiRから選択される。いくつかの実施形態において、遺伝子は、がん遺伝子である。いくつかの実施形態において、がん遺伝子は、表7に列挙される遺伝子から選択される。いくつかの実施形態において、微小環境リモデリングmiRは、表5に列挙されるmiRから選択される。いくつかの実施形態において、TIMPは、TIMP1、TIMP2、TIMP3及びTIMP4から選択される。いくつかの実施形態において、(b)のオリゴヌクレオチドは、shRNAまたはデコイオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、
いくつかの実施形態において、本発明は、(a)ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列、(b)1つ以上のタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする1つ以上のポリヌクレオチドであって、当該タンパク質もしくはオリゴヌクレオチドは、miR、遺伝子もしくはTIMPの発現を低下させるか、その機能を阻害する、ポリヌクレオチド、(c)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体、及び/または(d)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体をコードするポリヌクレオチドのうちの1つ以上を含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスであって、当該タンパク質は、ヌクレアーゼ、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、抗免疫抑制タンパク質または免疫原性抗原である、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。いくつかの実施形態において、ヌクレアーゼは、クラスター化された規則的な間隔のある短い回文の繰り返し配列(CRISPR)関連エンドヌクレアーゼ、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)または転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)から選択される。いくつかの実施形態において、CRISPR関連エンドヌクレアーゼは、SpCas9、SpCas9-HF1、SpCas9-HF2、SpCas9-HF3、SpCas9-HF4、SaCas9、FnCpf、FnCas9、eSpCas9、C2C1、C2C3、Cpf1、Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas6、Cas7、Cas8、Cas9、Cas10、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1、Cse2、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3及びCsf4から選択される。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、tracr-RNA(trRNA)及びcrispr-RNA(crRNA)をコードする非相同ポリヌクレオチドを更に含み、crRNAは、miRまたはTIMPをコードするゲノムDNA配列を標的にし、trRNAは、CRISPR関連エンドヌクレアーゼの結合及び活性化を促進する。
いくつかの実施形態において、抗免疫抑制タンパク質は、抗制御性T細胞(Treg)タンパク質または抗骨髄由来免疫抑制細胞(MDSC)タンパク質である。いくつかの実施形態において、抗免疫抑制タンパク質は、VHH由来遮断剤またはVHH由来BiTEである。
いくつかの実施形態において、タンパク質は、抗腫瘍免疫応答を誘導する。更なる実施形態において、タンパク質は、EpCAM、葉酸、IFNβ、抗CTLA-4、抗PD1、A2A、抗FGF2、抗FGFR/FGFR2b、抗SEMA4D、CCL5、CD137、CD200、CD38、CD44、CSF-1R、CXCL10、CXCL13、エンドセリンB型受容体、IL-12、IL-15、IL-2、IL-21、IL-35、ISRE7、LFA-1、NG2(SPEG4としても知られる)、SMADタンパク質、STING、TGFβ及びVCAM1から選択される。
いくつかの実施形態において、本発明は、(a)ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列、(b)1つ以上のタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする1つ以上のポリヌクレオチドであって、当該タンパク質もしくはオリゴヌクレオチドは、miR、遺伝子もしくはTIMPの発現を減少させるか、その機能を阻害する、ポリヌクレオチド、(c)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体、及び/または(d)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体をコードするポリヌクレオチドのうちの1つ以上を含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスであって、少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体は、ウイルスの糖タンパク質エンベロープに組み込まれる、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。いくつかの実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、システインカテプシン、アスパラギン酸カテプシン、カリクレイン(hK)、セリンプロテアーゼ、カスパーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)及びディスインテグリンメタロプロテアーゼ(ADAM)から選択されるプロテアーゼによって活性化される。いくつかの実施形態において、プロテアーゼは、カテプシンK、カテプシンB、カテプシンL、カテプシンE、カテプシンD、hK1、PSA(hK3)、hK10、hK15、uPA、uPAR、MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7、MMP-8、MMP-9、MMP-10、MMP-11、MMP-12、MMP-13、MMP-14、MMP-15、MMP-16、MMP-17、MMP-18、MMP-19、MMP-20、MMP-21、MMP-23A、MMP-23B、MMP-24、MMP-25、MMP-26、MMP-27、MMP-28または表6に列挙されるプロテアーゼから選択される。
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現されるタンパク質に結合する。いくつかの実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、NKG2D、c-met、HGFR、CD8、ヘパラン硫酸、VSPG4(NG2としても知られる)、EGFR、EGFRvIII、CD133、CXCR4、がん胎児性抗原(CEA)、CLC-3、アネキシンII、ヒトトランスフェリン受容体またはEpCAMに結合する。
いくつかの実施形態において、miR標的配列及び/または1つ以上のポリヌクレオチドは、ウイルスゲノムの遺伝子座に挿入される。いくつかの実施形態において、ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、少なくとも1つのポリヌクレオチドは、内部反復接合領域(二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT、ICP4及びICP47プロモーターのそれぞれを1コピー含む)、ICP0、LAT、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12からなる群から選択される1つ以上のウイルス遺伝子座に挿入されるか、これらの遺伝子座の間に挿入される。
いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスをコードする核酸分子を提供する。いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスのウイルスストックを提供する。いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスと、薬学的に許容される担体とを含む、組成物を提供する。
いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物に対して、がん性細胞を、腫瘍溶解性ウイルスが当該がん性細胞に感染し、当該がん性細胞内で複製するのに十分な条件下で曝露することを含み、がん性細胞内における腫瘍溶解性ウイルスの複製が細胞死をもたらす、がん性細胞を殺傷する方法を提供する。いくつかの実施形態において、がん性細胞は、1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、非がん性細胞における腫瘍抑制性miRの発現と比較して低下している。いくつかの実施形態において、がん性細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルは、非がん性細胞における腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%低い。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスの複製は、1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現の低いがん性細胞において、増加または維持される。いくつかの実施形態において、ウイルス複製は、非がん性細胞におけるウイルス複製と比較して、がん性細胞において少なくとも5%多い。いくつかの実施形態において、細胞は、in vivoである。いくつかの実施形態において、細胞は、腫瘍内である。
いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物を対象に投与することを含む、がんの治療を必要とする対象において、がんを治療する方法を提供する。いくつかの実施形態において、対象は、マウス、ラット、ウサギ、ネコ、イヌ、ウマ、非ヒト霊長類またはヒトである。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物は、静脈内、皮下、腫瘍内、筋肉内、または鼻腔内投与される。いくつかの実施形態において、がんは、肺癌、乳癌、卵巣癌、子宮頸癌、前立腺癌、精巣癌、大腸癌、結腸癌、膵癌、肝癌、胃癌、頭頸部癌、甲状腺癌、悪性神経膠腫、膠芽腫、黒色腫、B細胞慢性リンパ球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)及び辺縁帯リンパ腫(MZL)から選択される。いくつかの実施形態において、肺癌は、小細胞肺癌または非小細胞肺癌である。いくつかの実施形態において、肝癌は、肝細胞癌(HCC)である。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される:
(項目1)
ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列のコピーを1つ以上含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルス。
(項目2)
前記ウイルスが、単純ヘルペスウイルス、アデノウイルス、ポリオウイルス、ワクシニアウイルス、麻疹ウイルス、水疱性口内炎ウイルス、オルトミクソウイルス、パルボウイルス、マラバウイルスまたはコクサッキーウイルスである、項目1に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目3)
前記ウイルスが、単純ヘルペスウイルスであり、ウイルス複製に必要とされる前記1つ以上のウイルス遺伝子が、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12からなる群から選択される、項目1または2に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目4)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、表3から選択されるmiRに対する標的配列である、項目1~3のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目5)
前記1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる前記1つ以上のウイルス遺伝子の5’非翻訳領域(UTR)または3’UTRに組み込まれる、項目1~4のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目6)
第1の細胞における前記ウイルスの複製が、第2の細胞における前記ウイルスの複製と比較して、減少または減衰する、項目1~5のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目7)
前記第1の細胞は、前記1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、前記第2の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現と比較して上昇している、項目6に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目8)
前記第1の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルが、前記第2の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%高い、項目7に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目9)
前記第1の細胞が非がん性細胞である、項目6に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目10)
前記第2の細胞は、前記1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、前記第1の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現と比較して低下している、項目6に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目11)
前記第2の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルが、前記第1の細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%低い、項目10に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目12)
前記第2の細胞ががん性細胞である、項目6に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目13)
miR-124、miR-451a、miR-143-3p及びmiR-559に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目14)
膵癌、肺癌及び/または結腸癌を治療するための項目13に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目15)
miR-124、miR-451、miR-143-3p、miR-1及びmiR-559に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目16)
miR-124、miR-451、miR-145-5p及びmiR-559に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目17)
任意のがん種に由来する腫瘍を治療するための項目15及び/または16に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目18)
miR-205p、miR-141-5p、miR-31-5p及びmiR-124に対する腫瘍抑制性miR標的配列を含む、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目19)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ICP4、ICP27、UL19及び/またはUL30遺伝子座に挿入される、項目1~18のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目20)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-136-3p、miR-432-5p、miR-1-3p、miR-127-3p、miR-379-5p、miR-493-5p、miR-223-5p、miR-223-5p、miR-136-5p、miR-451a、miR-487b-3p、miR-370-3p、miR-410-3p、miR-431-3p、miR-4485-3p、miR-4485-5p、miR-127-5p、miR-409-3p、miR-338-3p、miR-559、miR-411-5p、miR-133a-5p、miR-143-3p、miR-376b-3p、miR-758-3p、miR-1、miR-101、miR-1180、miR-1236、miR-124-3p、miR-125b、miR-126、miR-1280、miR-133a、miR-133b、miR-141、miR-143、miR-144、miR-145、miR-155、miR-16、miR-18a、miR-192、miR-195、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-203、miR-205、miR-214、miR-218、miR-23b、miR-26a、miR-29c、miR-320c、miR-34a、miR-370、miR-409-3p、miR-429、miR-451b、miR-490-5p、miR-493、miR-576-3p及び/またはmiR-99aに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目21)
膀胱癌を治療するための項目20に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目22)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-1251-5p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-124-3p、miR-448、miR-138-2-3p、miR-490-5p、miR-129-1-3p、miR-1264、miR-3943、miR-490-3p、miR-383-5p、miR-133b、miR-129-2-3p、miR-128-2-5p、miR-133a-3p、miR-129-5p、miR-1-3p、miR-885-3p、miR-124-5p、miR-759、miR-7158-3p、miR-770-5p、miR-135a-5p、miR-885-5p、let-7g-5p、miR-100、miR-101、miR-106a、miR-124、miR-124a、miR-125a、miR-125a-5p、miR-125b、miR-127-3p、miR-128、miR-129、miR-136、miR-137、miR-139-5p、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-146b-5p、miR-149、miR-152、miR-153、miR-195、miR-21、miR-212-3p、miR-219-5p、miR-222、miR-29b、miR-31、miR-3189-3p、miR-320、miR-320a、miR-326、miR-330、miR-331-3p、miR-340、miR-342、miR-34a、miR-376a、miR-449a、miR-483-5p、miR-503、miR-577、miR-663、miR-7、miR-7-5p、miR-873、let-7a、let-7f、miR-107、miR-122、miR-124-5p、miR-139、miR-146a、miR-146b、miR-15b、miR-16、miR-181a、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-185、miR-199a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-203、miR-204、miR-205、miR-218、miR-23b、miR-26b、miR-27a、miR-29c、miR-328、miR-34c-3p、miR-34c-5p、miR-375、miR-383、miR-451、miR-452、miR-495、miR-584、miR-622、miR-656、miR-98、miR-124-3p、miR-181b-5p、miR-200b及び/またはmiR-3189-3pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目23)
脳癌を治療するための項目22に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目24)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-10b-5p、miR-126-3p、miR-145-3p、miR-451a、miR-199b-5p、miR-5683、miR-3195、miR-3182、miR-1271-5p、miR-204-5p、miR-409-5p、miR-136-5p、miR-514a-5p、miR-559、miR-483-3p、miR-1-3p、miR-6080、miR-144-3p、miR-10b-3p、miR-6130、miR-6089、miR-203b-5p、miR-4266、miR-4327、miR-5694、miR-193b、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-107、miR-10a、miR-10b、miR-122、miR-124、miR-1258、miR-125a-5p、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-129、miR-130a、miR-132、miR-133a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-146b、miR-147、miR-148a、miR-149、miR-152、miR-153、miR-15a、miR-16、miR-17-5p、miR-181a、miR-1826、miR-183、miR-185、miR-191、miR-193a-3p、miR-195、miR-199b-5p、miR-19a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-205、miR-206、miR-211、miR-216b、miR-218、miR-22、miR-26a、miR-26b、miR-300、miR-30a、miR-31、miR-335、miR-339-5p、miR-33b、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374a、miR-379、miR-381、miR-383、miR-425、miR-429、miR-450b-3p、miR-494、miR-495、miR-497、miR-502-5p、miR-517a、miR-574-3p、miR-638、miR-7、miR-720、miR-873、miR-874、miR-92a、miR-98、miR-99a、mmu-miR-290-3p及び/またはmmu-miR-290-5pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目25)
乳癌を治療するための項目24に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目26)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-143、miR-145、miR-17-5p、miR-203、miR-214、miR-218、miR-335、miR-342-3p、miR-372、miR-424、miR-491-5p、miR-497、miR-7、miR-99a、miR-99b、miR-100、miR-101、miR-15a、miR-16、miR-34a、miR-886-5p、miR-106a、miR-124、miR-148a、miR-29a及び/またはmiR-375に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目27)
子宮頸癌を治療するための項目26に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目28)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-133a-5p、miR-490-5p、miR-124-3p、miR-137、miR-655-3p、miR-376c-3p、miR-369-5p、miR-490-3p、miR-432-5p、miR-487b-3p、miR-342-3p、miR-223-3p、miR-136-3p、miR-136-3p、miR-143-5p、miR-1-3p、miR-214-3p、miR-143-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-127-3p、miR-133a-3p、miR-145-5p、miR-145-3p、miR-199a-5p、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-101、miR-126、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-192、miR-200c、miR-21、miR-214、miR-215、miR-22、miR-25、miR-302a、miR-320、miR-320a、miR-34a、miR-34c、miR-365、miR-373、miR-424、miR-429、miR-455、miR-484、miR-502、miR-503、miR-93、miR-98、miR-186、miR-30a-5p、miR-627、let-7a、miR-1、miR-124、miR-125a、miR-129、miR-1295b-3p、miR-1307、miR-130b、miR-132、miR-133a、miR-133b、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-150-5p、miR-154、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-18a、miR-191、miR-193a-5p、miR-194、miR-195、miR-196a、miR-198、miR-199a-5p、miR-203、miR-204-5p、miR-206、miR-212、miR-218、miR-224、miR-24-3p、miR-26b、miR-27a、miR-28-3p、miR-28-5p、miR-29b、miR-30a-3p、miR-30b、miR-328、miR-338-3p、miR-342、miR-345、miR-34a-5p、miR-361-5p、miR-375、miR-378、miR-378a-3p、miR-378a-5p、miR-409-3p、miR-422a、miR-4487、miR-483、miR-497、miR-498、miR-518a-3p、miR-551a、miR-574-5p、miR-625、miR-638、miR-7、miR-96-5p、miR-202-3p、miR-30a及び/またはmiR-451に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目29)
結腸癌または大腸癌を治療するための項目28に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目30)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-130a、miR-130b、miR-134、miR-143、miR-145、miR-152、miR-205、miR-223、miR-301a、miR-301b、miR-30c、miR-34a、miR-34c、miR-424、miR-449a、miR-543及び/またはmiR-34bに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目31)
子宮内膜癌を治療するための項目30に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目32)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-125b、miR-138、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-16-1、miR-16-1-3p、miR-16-2、miR-181a、miR-181b、miR-195、miR-223、miR-29b、miR-34b、miR-34c、miR-424、miR-10a、miR-146a、miR-150、miR-151、miR-155、miR-2278、miR-26a、miR-30e、miR-31、miR-326、miR-564、miR-27a、let-7b、miR-124a、miR-142-3p、let-7c、miR-17、miR-20a、miR-29a、miR-30c、miR-720、miR-107、miR-342、miR-34a、miR-202、miR-142-5p、miR-29c、miR-145、miR-193b、miR-199a、miR-214、miR-22、miR-137及び/またはmiR-197に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目33)
血液癌を治療するための項目32に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目34)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-1、miR-145、miR-1826、miR-199a、miR-199a-3p、miR-203、miR-205、miR-497、miR-508-3p、miR-509-3p、let-7a、let-7d、miR-106a、miR-126、miR-1285、miR-129-3p、miR-1291、miR-133a、miR-135a、miR-138、miR-141、miR-143、miR-182-5p、miR-200a、miR-218、miR-28-5p、miR-30a、miR-30c、miR-30d、miR-34a、miR-378、miR-429、miR-509-5p、miR-646、miR-133b、let-7b、let-7c、miR-200c、miR-204、miR-335、miR-377及び/またはmiR-506に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目35)
腎癌を治療するための項目34に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目36)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-100、miR-101、miR-105、miR-122、miR-122a、miR-1236、miR-124、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-1271、miR-128-3p、miR-129-5p、miR-130a、miR-130b、miR-133a、miR-134、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-141、miR-142-3p、miR-143、miR-144、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150-5p、miR-15b、miR-16、miR-181a-5p、miR-185、miR-188-5p、miR-193b、miR-195、miR-195-5p、miR-197、miR-198、miR-199a、miR-199a-5p、miR-199b、miR-199b-5p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-202、miR-203、miR-204-3p、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-21、miR-21-3p、miR-211、miR-212、miR-214、miR-217、miR-218、miR-219-5p、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-29b-1、miR-29b-2、miR-29c、miR-302b、miR-302c、miR-30a、miR-30a-3p、miR-335、miR-338-3p、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-365、miR-370、miR-372、miR-375、miR-376a、miR-377、miR-422a、miR-424、miR-424-5p、miR-433、miR-4458、miR-448、miR-450a、miR-451、miR-485-5p、miR-486-5p、miR-497、miR-503、miR-506、miR-519d、miR-520a、miR-520b、miR-520c-3p、miR-582-5p、miR-590-5p、miR-610、miR-612、miR-625、miR-637、miR-675、miR-7、miR-877、miR-940、miR-941、miR-98、miR-99a、miR-132及び/またはmiR-31に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目37)
肝癌を治療するための項目36に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目38)
前記肝癌が肝細胞癌である、項目37に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目39)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-143-3p、miR-126-3p、miR-126-5p、miR-1266-3p、miR-6130、miR-6080、miR-511-5p、miR-143-5p、miR-223-5p、miR-199b-5p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-142-5p、miR-144、miR-150-5p、miR-142-3p、miR-214-3p、miR-214-5p、miR-199a-5p、miR-145-3p、miR-145-5p、miR-1297、miR-141、miR-145、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-29b、miR-381、miR-409-3p、miR-429、miR-451、miR-511、miR-99a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-101、miR-133b、miR-138、miR-142-5p、miR-144、miR-1469、miR-146a、miR-153、miR-15a、miR-15b、miR-16-1、miR-16-2、miR-182、miR-192、miR-193a-3p、miR-194、miR-195、miR-198、miR-203、miR-217、miR-218、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29c、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-365、miR-449a、miR-449b、miR-486-5p、miR-545、miR-610、miR-614、miR-630、miR-660、miR-7515、miR-9500、miR-98、miR-99b、miR-133a、let-7a、miR-100、miR-106a、miR-107、miR-124、miR-125a-3p、miR-125a-5p、miR-126、miR-126、miR-129、miR-137、miR-140、miR-143、miR-146b、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-152、miR-154、miR-155、miR-17-5p、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-186、miR-193b、miR-199a、miR-204、miR-212、miR-221、miR-224、miR-27a、miR-27b、miR-29a、miR-30a、miR-30b、miR-30c、miR-30d、miR-30d-5p、miR-30e-5p、miR-32、miR-335、miR-338-3p、miR-340、miR-342-3p、miR-361-3p、miR-373、miR-375、miR-4500、miR-4782-3p、miR-497、miR-503、miR-512-3p、miR-520a-3p、miR-526b、miR-625及び/またはmiR-96に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目40)
肺癌を治療するための項目39に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目41)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7b、miR-101、miR-125b、miR-1280、miR-143、miR-146a、miR-146b、miR-155、miR-17、miR-184、miR-185、miR-18b、miR-193b、miR-200c、miR-203、miR-204、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-211、miR-218、miR-26a、miR-31、miR-33a、miR-34a、miR-34c、miR-376a、miR-376c、miR-573、miR-7-5p、miR-9及び/またはmiR-98に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目42)
黒色腫を治療するための項目41に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目43)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7d、miR-218、miR-34a、miR-375、miR-494、miR-100、miR-124、miR-1250、miR-125b、miR-126、miR-1271、miR-136、miR-138、miR-145、miR-147、miR-148a、miR-181a、miR-206、miR-220a、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-32、miR-323-5p、miR-329、miR-338、miR-370、miR-410、miR-429、miR-433、miR-499a-5p、miR-503、miR-506、miR-632、miR-646、miR-668、miR-877及び/またはmiR-9に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目44)
口腔癌を治療するための項目43に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目45)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7i、miR-100、miR-124、miR-125b、miR-129-5p、miR-130b、miR-133a、miR-137、miR-138、miR-141、miR-145、miR-148a、miR-152、miR-153、miR-155、miR-199a、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-212、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-409-3p、miR-411、miR-429、miR-432、miR-449a、miR-494、miR-497、miR-498、miR-519d、miR-655、miR-9、miR-98、miR-101、miR-532-5p、miR-124a、miR-192、miR-193a及び/またはmiR-7に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目46)
卵巣癌を治療するための項目45に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目47)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-216a-5p、miR-802、miR-217、miR-145-3p、miR-143-3p、miR-451a、miR-375、miR-214-3p、miR-216b-3p、miR-432-5p、miR-216a-3p、miR-199b-5p、miR-199a-5p、miR-136-3p、miR-216b-5p、miR-136-5p、miR-145-5p、miR-127-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-559、miR-129-2-3p、miR-4507、miR-1-3p、miR-148a-3p、miR-101、miR-1181、miR-124、miR-1247、miR-133a、miR-141、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150、miR-150-5p、miR-152、miR-15a、miR-198、miR-203、miR-214、miR-216a、miR-29c、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-373、miR-375、miR-410、miR-497、miR-615-5p、miR-630、miR-96、miR-132、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-126、miR-135a、miR-143、miR-144、miR-150、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-217、miR-218、miR-337、miR-494及び/またはmiR-98に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目48)
膵癌を治療するための項目47に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目49)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-3p、let-7c、miR-100、miR-101、miR-105、miR-124、miR-128、miR-1296、miR-130b、miR-133a-1、miR-133a-2、miR-133b、miR-135a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-154、miR-15a、miR-187、miR-188-5p、miR-199b、miR-200b、miR-203、miR-205、miR-212、miR-218、miR-221、miR-224、miR-23a、miR-23b、miR-25、miR-26a、miR-26b、miR-29b、miR-302a、miR-30a、miR-30b、miR-30c-1、miR-30c-2、miR-30d、miR-30e、miR-31、miR-330、miR-331-3p、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374b、miR-449a、miR-4723-5p、miR-497、miR-628-5p、miR-642a-5p、miR-765及び/またはmiR-940に対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目50)
前立腺癌を治療するための項目49に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目51)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-183、miR-204、miR-34a、miR-365b-3p、miR-486-3p及び/またはmiR-532-5pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目52)
網膜芽細胞腫を治療するための項目51に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目53)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-143-3p、miR-133b、miR-1264、miR-448、miR-1298-5p、miR-490-5p、miR-138-2-3p、miR-144-3p、miR-144-5p、miR-150-5p、miR-129-1-3p、miR-559、miR-1-3-p、miR-143-5p、miR-223-3p、miR-3943、miR-338-3p、miR-124-3p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-451a、miR-142-5p、miR-133a-3p、miR-145-5p及び/またはmiR-145-3pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目54)
膠芽腫を治療するための項目53に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目55)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-143-3p、miR-223-3p、miR-6080、miR-208b-3p、miR-206、miR-133a-5p、miR-133b、miR-199a-5p、miR-199b-5p、miR-145-3p、miR-145-5p、miR-150-5p、miR-142-3p、miR-144-3p、miR-144-5p、miR-338-3p、miR-214-3p、miR-559、miR-133a-3p、miR-1-3p、miR-126-3p、miR-142-5p、miR-451a、miR-199a-3p及び/またはmiR-199b-3pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目56)
頭頸部癌を治療するための項目55に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目57)
前記腫瘍抑制性miR標的配列が、miR-133b、miR-208b-3p、miR-6130、miR-141-5p、miR-31-3p、miR-1293、miR-129-2-3p、miR-129-5p、miR-124-3p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-490-3p、miR-488-3p、miR-935、miR-124-5p、miR-122-3p、miR-122-5p、miR-1-3p、miR-133a-3p、miR-375、miR-141-3p、miR-31-5p、miR-205-5p、miR-200c-3p及び/またはmiR-203a-3pに対する標的配列である、項目1~12のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目58)
シュワン腫を治療するための項目57に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目59)
(a)ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列、
(b)1つ以上のタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする1つ以上のポリヌクレオチドであって、前記タンパク質もしくはオリゴヌクレオチドは、miR、遺伝子もしくはTIMPの発現を減少させるか、その機能を抑制する、前記ポリヌクレオチド、
(c)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体、及び/または
(d)少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体をコードするポリヌクレオチドのうちの1つ以上を含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルス。
(項目60)
(b)の前記miRが、がん促進性miRまたは微小環境リモデリングmiRである、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目61)
前記がん促進性miRが、表4に列挙されるmiRから選択される、項目60に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目62)
(b)の前記遺伝子が、がん遺伝子である、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目63)
前記がん遺伝子が、表7に列挙される遺伝子から選択される、項目62に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目64)
前記微小環境リモデリングmiRが、表5に列挙されるmiRから選択される、項目60に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目65)
(b)の前記TIMPが、TIMP1、TIMP2、TIMP3及びTIMP4から選択される、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目66)
(b)の前記オリゴヌクレオチドが、shRNAまたはデコイオリゴヌクレオチドである、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目67)
(b)の前記タンパク質が、ヌクレアーゼ、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、抗免疫抑制タンパク質または免疫原性抗原である、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目68)
前記ヌクレアーゼが、クラスター化された規則的な間隔のある短い回文の繰り返し配列(CRISPR)関連エンドヌクレアーゼ、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)または転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)から選択される、項目67に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目69)
前記CRISPR関連エンドヌクレアーゼが、SpCas9、SpCas9-HF1、SpCas9-HF2、SpCas9-HF3、SpCas9-HF4、SaCas9、FnCpf、FnCas9、eSpCas9、C2C1、C2C3、Cpf1、Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas6、Cas7、Cas8、Cas9、Cas10、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1、Cse2、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3及びCsf4から選択される、項目68に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目70)
tracr-RNA(trRNA)及びcrispr-RNA(crRNA)をコードする非相同ポリヌクレオチドを更に含み、前記crRNAは、miRまたはTIMPをコードするゲノムDNA配列を標的にし、前記trRNAは、CRISPR関連エンドヌクレアーゼの結合及び活性化を促進する、項目69に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目71)
前記抗免疫抑制タンパク質が、抗制御性T細胞(Treg)タンパク質または抗骨髄由来抑制細胞(MDSC)タンパク質である、項目67に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目72)
前記抗免疫抑制タンパク質が、VHH由来遮断剤またはVHH由来BiTEである、項目67に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目73)
(b)の前記タンパク質が、抗腫瘍免疫応答を誘導する、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目74)
前記タンパク質が、EpCAM、葉酸、IFNβ、抗CTLA-4、抗PD1、A2A、抗FGF2、抗FGFR/FGFR2b、抗SEMA4D、CCL5、CD137、CD200、CD38、CD44、CSF-1R、CXCL10、CXCL13、エンドセリンB型受容体、IL-12、IL-15、IL-2、IL-21、IL-35、ISRE7、LFA-1、NG2(SPEG4としても知られる)、SMADタンパク質、STING、TGFβ及びVCAM1から選択される、項目73に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目75)
(c)または(d)の前記少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体が、ウイルス糖タンパク質エンベロープに組み込まれる、項目59に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目76)
前記プロテアーゼ活性化抗体が、システインカテプシン、アスパラギン酸カテプシン、カリクレイン(hK)、セリンプロテアーゼ、カスパーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)及びディスインテグリンメタロプロテアーゼ(ADAM)から選択されるプロテアーゼによって活性化される、項目59または75に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目77)
前記プロテアーゼが、カテプシンK、カテプシンB、カテプシンL、カテプシンE、カテプシンD、hK1、PSA(hK3)、hK10、hK15、uPA、uPAR、MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7、MMP-8、MMP-9、MMP-10、MMP-11、MMP-12、MMP-13、MMP-14、MMP-15、MMP-16、MMP-17、MMP-18、MMP-19、MMP-20、MMP-21、MMP-23A、MMP-23B、MMP-24、MMP-25、MMP-26、MMP-27、MMP-28または表6に列挙されるプロテアーゼから選択される、項目76に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目78)
前記プロテアーゼ活性化抗体が、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現されるタンパク質に結合する、項目59または75に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目79)
前記プロテアーゼ活性化抗体が、NKG2D、c-met、HGFR、CD8、ヘパラン硫酸、VSPG4(NG2としても知られる)、EGFR、EGFRvIII、CD133、CXCR4、がん胎児性抗原(CEA)、CLC-3、アネキシンII、ヒトトランスフェリン受容体またはEpCAMに結合する、項目78に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目80)
(a)の前記miR標的配列、(b)の前記1つ以上のポリヌクレオチド及び/または(d)の前記1つ以上のポリヌクレオチドが、前記ウイルスゲノムの遺伝子座に挿入される、項目59~79のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目81)
前記ウイルスが、単純ヘルペスウイルスであり、前記少なくとも1つのポリヌクレオチドが、内部反復接合領域(二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT、ICP4及びICP47プロモーターのそれぞれを1コピー含む)、ICP0、LAT、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12からなる群から選択される1つ以上のウイルス遺伝子座に挿入されるか、これらの遺伝子座の間に挿入される、項目80に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目82)
先行項目のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルスをコードする、核酸分子。
(項目83)
項目1~81のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルスを含む、ウイルスストック。
(項目84)
項目1~81のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルスと、薬学的に許容される担体とを含む、組成物。
(項目85)
がん性細胞を殺傷する方法であって、項目1~81のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物に対して、前記がん性細胞を、前記腫瘍溶解性ウイルスが前記がん性細胞に感染し、前記がん性細胞内で複製するのに十分な条件下で曝露することを含み、前記がん性細胞内における前記腫瘍溶解性ウイルスの複製が細胞死をもたらす、前記方法。
(項目86)
前記がん性細胞は、前記1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現が、非がん性細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現と比較して低下している、項目85に記載の方法。
(項目87)
前記がん性細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルが、前記非がん性細胞における前記腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%低い、項目86に記載の腫瘍溶解性ウイルス。
(項目88)
前記腫瘍溶解性ウイルスの複製が、前記1つ以上の腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる前記腫瘍抑制性miRの発現の低いがん性細胞において、増加または維持される、項目85~87のいずれかに記載の方法。
(項目89)
前記ウイルス複製が、前記非がん性細胞における前記ウイルス複製と比較して、前記がん性細胞において少なくとも5%多い、項目88に記載の方法。
(項目90)
前記細胞がin vivoである、項目85~89のいずれかに記載の方法。
(項目91)
前記細胞が腫瘍内にある、項目90に記載の方法。
(項目92)
項目1~81のいずれかに記載の腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物を対象に投与することを含む、がんの治療を必要とする前記対象において、がんを治療する方法。
(項目93)
前記対象が、マウス、ラット、ウサギ、ネコ、イヌ、ウマ、非ヒト霊長類またはヒトである、項目85~92のいずれか一項に記載の方法。
(項目94)
前記腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物が、静脈内、皮下、腫瘍内、筋肉内、または鼻腔内投与される、項目92または93に記載の方法。
(項目95)
前記がんが、肺癌、乳癌、卵巣癌、子宮頸癌、前立腺癌、精巣癌、大腸癌、結腸癌、膵癌、肝癌、胃癌、頭頸部癌、甲状腺癌、悪性神経膠腫、膠芽腫、黒色腫、B細胞慢性リンパ球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)及び辺縁帯リンパ腫(MZL)から選択される、項目92に記載の方法。
(項目96)
前記肺癌が、小細胞肺癌または非小細胞肺癌である、項目95に記載の方法。
(項目97)
前記肝癌が、肝細胞癌(HCC)である、項目96に記載の方法。
がん性及び非がん性脳組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性膀胱組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性乳房組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性結腸組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 膠芽腫及び非がん性脳組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性頭頸部組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性肺組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 がん性及び非がん性膵臓組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 シュワン腫組織及び非シュワン腫組織における、選択された25のmiRNAに対応するmiRNA発現プロファイルのヒートマップを示す。 非がん性組織(正常)と比較した全腫瘍種(CA)におけるmiR-451a発現の下方制御を示す。 全腫瘍種(CA)におけるmiR-1発現の下方制御、非がん性組織(正常)におけるmiR-1の中程度の発現、及び非がん性頭頸部組織(H&N)におけるmiR-1の高発現を示す。 全腫瘍種(CA)におけるmiR-559発現の下方制御、非がん性組織(正常)におけるmiR-559の低発現、及び非がん性肺組織におけるmiR-559の高発現を示す。 全腫瘍種(CA)におけるmiR-145-5p発現の下方制御、及び非がん性組織(正常)の大部分におけるmiR-145-5pの高発現を示す。 結腸、肺及び膵臓の腫瘍種(CA)におけるmiR-143-3p発現の下方制御、ならびに非がん性組織(正常)の大部分におけるmiR-143-3pの高発現を示す。 実施例2に記載される、miRNAの発現及び減衰のレポーター遺伝子系を示す。図15Aは、miRNA発現プラスミドの発現を誘導するpTetR tetリプレッサープラスミドの模式図を示す。図15Bは、tet誘導性mCherry及びmiRNA発現カセットを含有するpTF-002 miRNA発現プラスミドの模式図を示す。図15Cは、不安定化GFP(dsGFP)の読み出しを可能にするpTF-004miRNA減衰レポーター遺伝子の模式図を示す。 図15に示され、かつ実施例2に記載されるレポーター系を使用した、miR-122の発現及び減衰を示す。 図15に示され、かつ実施例2に記載されるレポーター系を使用した、miR-122、miR-184、miR-34a及びLet7a媒介性GFP減衰を例示する。円で囲んだウェルは、GFP発現レベルの低下を示す。 図15に示され、かつ実施例2に記載されるレポーター系を使用した、mCherry発現によって示されるmiR-122、miR-184、miR-34a及びLet7aの発現を例示する。 図15に示され、かつ実施例2に記載されるレポーター系を使用した、miR-122、miR-124、miR-145、miR-199及びmiR-451媒介性GFP減衰を例示する。円で囲んだウェルは、GFP発現レベルの低下を示す。 図15に示され、かつ実施例2に記載されるレポーター系を使用した、mCherry発現によって示されるmiR-122、miR-124、miR-145、miR-199及びmiR-451の発現を例示する。 miR-122及びmiR-184のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-34a及びmiR-184のGFP蛍光減衰の定量を示す。 Let7a及びmiR-184のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-124及びmiR-184のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-145及びmiR-184のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-199及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-125及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-126及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-127及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-133及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 miR-223及びmiR-451のGFP蛍光減衰の定量を示す。 ICP27及びICP4遺伝子に挿入された、様々なmiRNAに対する標的配列を含む、miR減衰型HSV構築物を示す。 非がん性(有糸分裂後肺)細胞及びがん性(A253)細胞におけるmiR-125によるHSV減衰を例示する。 非がん性(PM肺)細胞及びがん性(A253)肺細胞におけるmiR-125によるHSV減衰のqPCRに基づく定量を示す。 HCC1395細胞とA253細胞におけるmiR-145によるHSV減衰の蛍光に基づく定量を例示する。 HCC1395細胞とA253細胞におけるmiR-145によるHSV減衰のqPCRに基づく定量を示す。 正常肺細胞におけるmiR-199a-5pとmiR-143-3pによるHSV減衰の蛍光に基づく定量を例示する。 正常肺細胞におけるmiR-199a-5pとmiR-143-3pによるHSV減衰のqPCRに基づく定量を示す。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのICP4-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を例示する。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのICP27-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのUL19-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのUL19-TmiRNA・ICP27-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのUL19-TmiRNA・ICP4-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 がんまたは良性過剰増殖性疾患の治療のためのUL19-TmiRNA・ICP27-TmiRNA・ICP4-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 がんの治療のためのICP4-TmiRNA減衰型ゲノム編集HSVベクターの模式図を示す。 がんの治療のためのICP4-TmiRNA減衰型ゲノム編集微小環境リモデリングHSVベクターの模式図を示す。 膵癌、肺癌及び結腸癌の治療のためのICP4-TmiRNA・ICP27-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 複数のがん種の治療のためのICP4-TmiRNA・ICP27-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。 シュワン腫の治療のためのICP4-TmiRNA・ICP27-TmiRNA減衰型HSVベクターの模式図を示す。
いくつかの態様において、本発明は、ウイルスベクター複製を腫瘍細胞に効果的に制限するために、miRNAの差次的発現プロファイルを利用する。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるウイルスベクターはまた、腫瘍増殖、転移の減少、及び/またはウイルス伝播の増強を可能にする腫瘍微小環境リモデリングのために、特定のmiRNAの発現を破壊する。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるウイルスベクターは、腫瘍細胞への標的化を容易にするために、ウイルスベクター上の表面分子を使用することを包含する。これらの側面を個別にまたは組み合わせて適用して、広範ながん種を1つのウイルスベクターで治療することが潜在的に可能なウイルスベクターを開発することができる。したがって、本発明は、更に、疾患及び障害(例えば、がん)の治療及び予防に使用するための組み換え腫瘍溶解性ウイルスベクターを包含する。いくつかの実施形態において、本発明は、広範ながんの治療に適した安全かつ有効的な組み換えウイルスベクターを可能にするために、内因性マイクロRNA(miRNA)を利用する。
本明細書で使用される節の見出しは、単に構成目的のものであり、記載される主題を限定するものと解釈されるべきではない。特許、特許出願、記事、書籍及び論文を含むが、これらに限定されない、本明細書で引用される全ての文書または文書の一部は、その全体があらゆる目的のために参照により本明細書に明確に援用される。援用される文書または文書の一部のうちの1つ以上が、本出願における用語の定義と矛盾する用語の定義をしている場合、本出願に示される定義が優先される。しかし、本明細書で引用される任意の参考文献、記事、出版物、特許、特許公報及び特許出願の言及は、世界の任意の国で、それらが有効な先行技術を構成し、または共通の一般知識の一部を形成するという承認または何らかの示唆の形態ではなく、そのように解釈されるべきではない。
本発明の記載において、任意の濃度範囲、パーセンテージ範囲、比率範囲または整数範囲は、特に指定のしない限り、列挙される範囲内の任意の整数の値を含み、必要に応じて、その分数(整数の1/10及び1/100など)を含むものと理解される。本明細書で使用される「a」及び「an」という用語は、特に指定のない限り、列挙される構成成分のうちの「1つ以上」を指すことを理解されたい。選択肢(例えば、「または」)の使用は、選択肢の一方、両方またはその任意の組み合わせのいずれかを意味することを理解されたい。本明細書で使用される、用語「include(含む)」及び「comprise(含む)」は、同義的に使用される。本明細書で使用されるとき、「複数」は、1つ以上の構成成分(例えば、1つ以上のmiRNA標的配列)を指し得る。
腫瘍溶解性ウイルス
いくつかの実施形態において、本発明は、1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列の1つ以上のコピーが、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを提供する。本明細書で使用されるとき、「腫瘍溶解性ウイルス」という用語は、がん細胞に感染するように改変されているか、天然に優先的にがん細胞に感染する、ウイルスを指す。腫瘍溶解性ウイルスの例は、当該技術分野において知られており、限定するものではないが、単純ヘルペスウイルス、アデノウイルス、ポリオウイルス、ワクシニアウイルス、麻疹ウイルス、水疱性口内炎ウイルス、オルトミクソウイルス、パルボウイルス、マラバウイルスまたはコクサッキーウイルスが挙げられる。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルスベクター中に組み込まれる。「ベクター」という用語は、別の核酸分子を輸送または運搬することができる核酸分子を指すために本明細書で使用される。輸送される核酸は、通常、ベクター核酸分子に連結される(例えば、挿入される)。ベクターは、細胞内で自律複製を誘導する配列を有し得るか、宿主細胞DNAへの組み込みを可能にするのに十分な配列を有し得る。ウイルスベクターは、時に、「組み換えウイルス」または「ウイルス」と称されることがある。「腫瘍溶解性ウイルス」及び「腫瘍溶解性ベクター」という用語は、本明細書において区別なく用いられる。特定の実施形態において、組み換えウイルスベクターは、PCT国際公開第WO2015/066042号(その全体を参照により援用する)に記載されている、腫瘍選択的にベクター複製ができる単純ヘルペスウイルスである。
「マイクロRNA」、「miRNA」及び「miR」という用語は、本明細書において区別なく用いられ、その標的メッセンジャーRNA(mRNA)に向かい、分解または翻訳抑制を行うことによって遺伝子発現を制御する、内因性の小さなノンコーディングRNAを指す。miRは、複数のがん種を含む広範な病態において、差次的に発現される。いくつかの態様において、所与のがん種またはがん組織のがん細胞は、非がん性対照細胞と比較して、miRの差次的発現を示す。本明細書で使用されるとき、「oncomiR」という用語は、発がん、悪性転換または転移に(正または負のいずれかで)関係するmiRを指す。いくつかの態様において、特定のoncomiRの発現レベルは、特定のがんの発生または維持に関係している。このようなmiRは、本明細書において、「がん促進性miR」と称される。
いくつかの実施形態において、がん促進性miRの発現は、非がん性対照と比較して、がん性細胞または組織において上昇する。例えば、がん性細胞におけるがん促進性miRの発現は、非がん性細胞または組織におけるがん促進性miRの発現と比較して、少なくとも5%上昇し得る。いくつかの実施形態において、がん促進性miRの発現は、非がん性細胞または組織におけるがん促進性miRの発現と比較して、少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、400%、500%、1000%またはそれ以上、上昇する。いくつかの態様において、がん性細胞または組織は、非がん性対照細胞または対照組織で発現されないがん促進性miRを発現し得る。いくつかの実施形態において、がん促進性miRの発現は、異なるがん種に由来するがん性細胞と比較して、がん性細胞または組織において上昇する。例えば、あるがん性細胞におけるがん促進性miRの発現は、異なるがん種に由来するがん性細胞と比較して少なくとも5%上昇し得る。いくつかの実施形態において、がん促進性miRの発現は、異なるがん種に由来するがん性細胞と比較して、少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、400%、500%、1000%またはそれ以上、上昇する。がん組織でしばしば過剰発現されるがん促進性miRNAの例には、miR-21、miR-155及びmiR-17-92が挙げられるが、これらに限定されない。がん促進性miRの更なる例は、表4に列挙される。
いくつかの実施形態において、特定のoncomiRの発現は、発がん及び/または転移の予防及び/または遅延に関係する。このようなoncomiRは、その発現ががんの発生を予防または抑制することから、本明細書において、「腫瘍抑制miR」または「腫瘍抑制性miR」と称される。いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miRの発現低下は、がんを引き起こすことがある。したがって、いくつかの態様において、腫瘍抑制性miRは、健康な細胞で発現され、がん性細胞では発現されない。いくつかの態様において、特定の腫瘍抑制性miRの発現は、がん性細胞と比較して、健康な細胞において上昇する。例えば、健康な(例えば、非がん性)細胞における腫瘍抑制性miRの発現は、がん性細胞における腫瘍抑制性miRの発現と比較して、少なくとも5%上昇し得る。いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miRの発現は、がん性細胞における腫瘍抑制性miRの発現と比較して、少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、400%、500%、1000%またはそれ以上、上昇する。いくつかの実施形態において、腫瘍抑制性miRの発現は、体内の異なる組織種または位置に由来する正常細胞と比較して、正常細胞または正常組織において上昇する。例えば、ある正常細胞における腫瘍抑制性miRの発現は、体内の異なる組織種または位置に由来する正常細胞と比較して、少なくとも5%上昇し得る。いくつかの実施形態において、ある正常細胞における腫瘍抑制性miRの発現は、体内の異なる組織種または位置に由来する正常細胞と比較して、少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、400%、500%、1000%またはそれ以上、上昇する。腫瘍抑制性miRNAの例には、miR-15a、miR-16-1、miR-34及びlet-7ファミリーのmiRNAが挙げられるが、これらに限定されない。腫瘍抑制性miRの更なる例は、表3及び表8に列挙される。
がんの病原は、不均質かつ多遺伝子性のプロセスである。したがって、特定の経路の活性化及び特定の遺伝子の発現は、ある状況においては、がん発生をもたらすことがあり、異なる状況において活性化または発現したときには、異なる結果または反対の結果を生じることがある。したがって、特定の遺伝子またはmiRを、「がん遺伝子」もしくは「がん促進性miR」または「腫瘍抑制遺伝子」もしくは「腫瘍抑制性miR」と特徴付けることは、二者択一の区別ではなく、状況に依存することが多い。例えば、miR-152bは、大部分の血液悪性腫瘍では、がん促進性miRとして機能するが、多くの固形腫瘍では、腫瘍抑制性miRとして機能する。更に、特定のmiRは、がん性細胞及び非がん性細胞の両方で高度に発現される場合がある。例えば、miR-155は、正常細胞で高度に発現され、マクロファージ極性化において重要な役割を果たすが、がん細胞においても高度に発現される。したがって、本明細書に記載されるmiR減衰型ゲノム編集・微小環境リモデリング腫瘍溶解性ウイルスの開発は、ある細胞集団または組織における特定のmiRまたはmiR群の別の細胞集団または組織と比較した差次的発現を基礎とする。当業者であれば、腫瘍抑制性miRという用語が、一般に、がん性細胞または組織と比較して非がん性細胞または組織で高度に発現されるmiRを指すこと、また、がん促進性miRという用語が、一般に、非がん性細胞または組織と比較してがん性細胞または組織で高度に発現されるmiRを指すことを理解するであろう。当業者であれば、更に、あるがん種において腫瘍抑制性miRと特徴付けられたmiRが、別のがん種において腫瘍抑制性miRとして機能する場合もあれば、機能しない場合もあること、また、あるがん種においてがん促進性miRとして特徴付けられたmiRが、別のがん種においてがん促進性miRとして機能する場合もあれば、機能しない場合もあることを理解するであろう。
表1は、選択された12のoncomiR(9つの腫瘍抑制遺伝子及び3つのがん促進性miRNA)と多数のがんとの関係を示す。3,410のoncomiRとがんとの関係の一覧を表2に示す。miRNAは、細胞増殖及びアポトーシスの制御に関与するタンパク質の多くの転写物を制御する。制御されるタンパク質には、従来のがん原タンパク質ならびにRas、Myc、Bcl2、PTEN及びp53などの腫瘍抑制因子が含まれる。したがって、miRNAの異常発現は、多くの場合、がんの発生に関与しており、がん促進性miRNAを阻害するか、減少した腫瘍抑制miRNAを置き換えるかのいずれかによって、治療的に修正することができる。更に、がん性細胞と非がん性細胞における特定のoncomiRの差次的発現は、がん治療薬をがん細胞に特異的に標的にする手段として利用することができる。したがって、いくつかの実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスベクターは、次の特性:腫瘍抑制性miRNA標的配列をウイルスゲノムに挿入することによって、ウイルスベクター複製をがん細胞もしくは腫瘍細胞に制限すること、1つ以上のポリヌクレオチドであって、その産物(複数可)ががん促進性miRNA及び/もしくはがん細胞外マトリックスの機能を破壊する、1つ以上のポリヌクレオチドをウイルスゲノムに組み込むこと、ならびに/またはベクターをがん細胞及び/もしくは腫瘍細胞に対して高度に選択的に標的化するために、プロテアーゼ活性化抗体をウイルス粒子に組み込むことを、個別にまたは組み合わせて含み得る。
本発明の一態様は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列(例えば、表3または表8に列挙されるmiRNAから選択されるmiRNA)のコピーを複数含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルス(またはウイルスベクター)を含む。ある特定の実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つ、少なくとも7つ、少なくとも8つ、少なくとも9つ、または少なくとも10のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された腫瘍抑制性miRNA標的配列を含み得る。正常(非がん性)細胞において発現される腫瘍抑制miRNAは、このような標的配列に結合し、miRNA標的配列を含有するウイルス遺伝子の発現を抑制することができ、これにより、健康な非がん性細胞におけるウイルス複製が制限される。このような組み換え腫瘍溶解性ウイルス及び/またはベクターは、本明細書において、腫瘍抑制性miRを発現しない細胞またはその発現が低下している細胞と比較して、組み込まれた腫瘍抑制性miR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRを発現する細胞において、ウイルス複製が減少または減衰することから、「miR減衰型」または「複製制限型」と称される。ウイルス複製は、ウイルス複製に必要とされる主要遺伝子に腫瘍抑制性miRNAを組み込むことによって、腫瘍抑制性miRNAを発現する正常な二倍体細胞において条件的に抑制することができ、腫瘍抑制性miRNAを発現しない細胞において、通常とおり進行され得る。このような実施形態において、健康な非がん性細胞は、正常細胞から、組み換えウイルスベクターによる感染の溶解作用から保護される。
ある特定の実施形態において、1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列は、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の1つ以上の遺伝子の5’非翻訳領域(UTR)及び/または3’UTRに組み込まれる。腫瘍抑制性miRNAは、正常な二倍体細胞において、腫瘍抑制性miRNA標的配列を含む、操作された3’または5’ノンコーディング配列に結合することができるが、これらの腫瘍抑制性miRNAは、形質転換細胞または悪性細胞において欠如している。したがって、ウイルス複製は、腫瘍抑制性miRNAを欠く細胞またはその発現が低下している細胞で進行し得る。いくつかの実施形態において、少なくとも1つの腫瘍抑制性miR標的配列は、複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子に組み込まれる。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、複製に必要とされる1つのウイルス遺伝子に組み込まれた、同一の腫瘍抑制性miR標的配列の複数コピーを含み得る。例えば、腫瘍抑制性miR標的配列の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のコピーが、複製に必要とされるウイルス遺伝子に組み込まれ得る。特定の実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列の2~6つのコピーが、複製に必要とされるウイルス遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれる。更なる実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列の4つのコピーが、複製に必要とされるウイルス遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれる。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、複製に必要とされる複数のウイルス遺伝子に組み込まれた、同じ腫瘍抑制性miR標的配列の複数コピーを含み得る。例えば、腫瘍抑制性miR標的配列の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のコピーが、ウイルス複製に必要とされる1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の遺伝子に組み込まれ得る。特定の実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列の2~6つのコピーが、複製に必要とされる2つ以上のウイルス遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれる。更なる実施形態において、腫瘍抑制性miR標的配列の少なくとも4つのコピーが、複製に必要とされる2つ以上のウイルス遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれる。
いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、複製に必要とされる1つのウイルス遺伝子に組み込まれた、2つ以上の腫瘍抑制性miRに対する標的配列を含み得る。例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の異なる腫瘍抑制性miRに対する標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1つの遺伝子に組み込まれ得る。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、複製に必要とされる複数のウイルス遺伝子に組み込まれた、2つ以上の腫瘍抑制性miRに対する標的配列を含み得る。例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の異なる腫瘍抑制性miRに対する標的配列が、ウイルス複製に必要とされる1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の遺伝子に組み込まれ得る。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、少なくとも2つの異なる腫瘍抑制性miR(例えば、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10の異なる腫瘍抑制性miR)に対する複数の標的配列(例えば、1つの標的配列の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10のコピー)を含み得る。このような実施形態において、第1の腫瘍抑制性miRに対する複数の標的配列は、複製に必要とされる第1の遺伝子に組み込まれ得、第2の腫瘍抑制性miRに対する複数の標的配列は、複製に必要とされる第2の遺伝子に組み込まれ得、第3の腫瘍抑制性miRに対する複数の標的配列は、複製に必要とされる第3の遺伝子に組み込まれ得るなどである。特定の実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスベクターは、複製に必要とされる第1の遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれた、第1の腫瘍抑制性miR標的配列の少なくとも2つ~少なくとも8つのコピーと、複製に必要とされる第2の遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれた、第2の腫瘍抑制性miR標的配列の少なくとも2つ~少なくとも8つのコピーと、複製に必要とされる第3の遺伝子の3’または5’UTRに組み込まれた、第3の腫瘍抑制性miR標的配列の少なくとも2つ~少なくとも8つのコピーとを含む。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載されるmiR減衰型腫瘍溶解性ウイルスは、組み込まれたmiR標的配列のうちの1つ以上に結合することができる腫瘍抑制性miRを発現する細胞において、ウイルス複製が減少する。「ウイルス複製」は、所与の時間内に特定の細胞または細胞集団で生じるウイルス複製サイクルの総数を指す。いくつかの実施形態において、ウイルス複製は、所与の時間にわたる総ウイルス力価を評価することによって、または存在するウイルスゲノムのコピー数を評価することによって(例えば、配列決定によって)、直接測定することができる。いくつかの実施形態において、ウイルスベクターは、蛍光レポーター遺伝子などの検出可能な標識を追加で含み得る。このような実施形態において、ウイルス複製は、レポーター遺伝子の蛍光強度またはレポーター遺伝子を発現する細胞の数を測定することによって、評価することができる。いくつかの実施形態において、ウイルス複製は、所与の時間にわたって生細胞の数を評価することによって、間接的に測定することができる。例えば、ウイルス複製のレベルは、経時的な生細胞の数と逆相関すると想定される。
本明細書で使用される「ウイルス複製の減少」は、ウイルス複製のレベルが、第2の細胞または第2の細胞集団と比較して、第1の細胞または第1の細胞集団で低いことを指す。いくつかの実施形態において、第1の細胞または第1の細胞集団におけるウイルス複製のレベルは、第2の細胞または細胞集団におけるウイルス複製のレベルと比較して、少なくとも5%低下する。いくつかの実施形態において、第1の細胞または第1の細胞集団におけるウイルス複製のレベルは、第2の細胞または細胞集団におけるウイルス複製のレベルと比較して、少なくとも5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%またはそれ以上低下する。いくつかの実施形態において、第1の細胞または第1の細胞集団におけるウイルス複製は、第2の細胞または細胞集団におけるウイルス複製と比較して、完全に阻害される。
いくつかの実施形態において、第1の細胞または第1の細胞集団におけるウイルス複製の減少は、複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子に組み込まれた1つ以上のmiR標的配列に結合することができる腫瘍抑制性miRの発現と相関する。したがって、いくつかの実施形態において、組み込まれたmiR標的配列に対応する腫瘍抑制性miRの発現は、複製遺伝子の発現を阻害または減少させ、これにより、ウイルス複製を阻害または減少させる。いくつかの実施形態において、第2の細胞または第2の細胞集団は、腫瘍抑制性miRを発現しないか、その発現レベルが低下している。いくつかの実施形態において、組み込まれたmiR標的配列に対応する腫瘍抑制性miRの発現が欠如または低下していることにより(例えば、がん細胞内)、ウイルス複製の進行が可能となる。いくつかの実施形態において、第2の細胞または細胞集団における腫瘍抑制性miRの発現レベルは、第1の細胞または集団における腫瘍抑制性miRの発現レベルよりも少なくとも5%低い。いくつかの実施形態において、第2の細胞または細胞集団における腫瘍抑制性miRの発現レベルは、第1の細胞または集団における腫瘍抑制性miRの発現レベルと比較して、少なくとも5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%またはそれ以上、低下する。いくつかの実施形態において、第2の細胞は、腫瘍抑制性miRを発現しない。特定の実施形態において、第1の細胞は、非がん性細胞であり、第2の細胞は、がん性細胞である。
いくつかの態様において、腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピー(例えば、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つまたはそれ以上のコピー)は、ウイルスゲノムの遺伝子座にタンデムで挿入される。このような実施形態において、標的配列の複数コピーは、リンカー配列またはスペーサー配列によって分離されてもよい。いくつかの実施形態において、リンカー配列及び/またはスペーサー配列は、4つ以上のヌクレオチドを含む。例えば、スペーサー配列またはリンカー配列は、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25個以上のヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態において、リンカー配列またはスペーサー配列は、約5~約20個のヌクレオチドを含む。更なる実施形態において、リンカー配列またはスペーサー配列は、約8~約16個のヌクレオチドを含む。本発明を決して限定するものではないが、例示的な実施形態として、腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座にタンデムで挿入された次のサブユニット:(a)第1の腫瘍抑制性miRNAに対する標的配列-リンカー配列もしくはスペーサー配列-第1の腫瘍抑制性miRNAに対する標的配列、または(b)第1の腫瘍抑制性miRNAに対する標的配列-リンカー配列もしくはスペーサー配列-第2の腫瘍抑制性miRNAに対する標的配列の1つ以上を少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、少なくとも6つ、少なくとも7つ、少なくとも8つ、少なくとも9つまたは少なくとも10含み得る。いくつかの実施形態において、miRNA標的配列は、miRNAの逆相補鎖である。
いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルス(HSV)であり、ウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子は、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及び/またはUS12である。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルス(HSV)であり、1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列は、ICP0、ICP4、UL19及びICP27遺伝子のうちの1つ以上に組み込まれる。ある特定の実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスベクターは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上の遺伝子(例えば、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11またはUS12)の5’または3’UTRに組み込まれた1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列(例えば、表3に列挙される腫瘍抑制性miRのいずれか)を含む、HSVである(例えば、図39~49)。
いくつかの実施形態において、複製制限型ウイルスベクター(例えば、miR減衰型ウイルスベクター)は、少なくとも1つのlet-7標的配列を含み、肺癌を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-15a及び/または少なくとも1つのmiR-16Aの標的配列を含み、B細胞慢性リンパ球性白血病を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-125b、少なくとも1つのmiR-145、少なくとも1つのmiR-21及び/または少なくとも1つのmiR-155の標的配列を含み、乳癌を治療するために使用される。他の実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-143及び/または少なくとも1つのmiR-145の標的配列を含み、大腸癌を治療するために使用される。ある特定の実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-181a、少なくとも1つのmiR-181b及び/または少なくとも1つのmiR-181cの標的配列を含み、膠芽腫を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-199a、少なくとも1つのmiR-195、少なくとも1つのmiR-199a、少なくとも1つのmiR-200a及び/または少なくとも1つのmiR-125aの標的配列を含み、肝癌(例えば、肝細胞癌)を治療するために使用される。
特定の実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-451a標的配列、少なくとも1つのmiR-143-3p標的配列、少なくとも1つのmiR-559標的配列及び少なくとも1つのmiR-124標的配列を含み、膵臓、肺及び/または結腸癌の治療に使用される。このような実施形態において、miR-451a、miR-143-3p、miR-559及びmiR-124に対する標的配列は、ウイルス複製に必要とされる2つ以上の遺伝子(例えば、ICP4及びICP27)に組み込まれる。更なる特定の実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-451a標的配列、少なくとも1つのmiR-145-5p標的配列、少なくとも1つのmiR-559標的配列、及び少なくとも1つのmiR-124標的配列を含み、本明細書に記載される任意のがん種の治療に使用される。このような実施形態において、miR-451a、miR-145-5p、miR-559及びmiR-124に対する標的配列は、ウイルス複製に必要とされる2つ以上の遺伝子(例えば、ICP4及びICP27)に組み込まれる。更なる特定の実施形態において、複製制限型ウイルスベクターは、少なくとも1つのmiR-205p標的配列、少なくとも1つのmiR-141-5p標的配列、少なくとも1つのmiR-31-5p標的配列、及び少なくとも1つのmiR-124標的配列を含み、シュワン腫の治療に使用される。このような実施形態において、miR-205p、miR-141-5p、miR-31-5p及びmiR-124に対する標的配列は、ウイルス複製に必要とされる2つ以上の遺伝子(例えば、ICP4及びICP27)に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-136-3p、miR-432-5p、miR-1-3p、miR-127-3p、miR-379-5p、miR-493-5p、miR-223-5p、miR-223-5p、miR-136-5p、miR-451a、miR-487b-3p、miR-370-3p、miR-410-3p、miR-431-3p、miR-4485-3p、miR-4485-5p、miR-127-5p、miR-409-3p、miR-338-3p、miR-559、miR-411-5p、miR-133a-5p、miR-143-3p、miR-376b-3p、miR-758-3p、miR-1、miR-101、miR-1180、miR-1236、miR-124-3p、miR-125b、miR-126、miR-1280、miR-133a、miR-133b、miR-141、miR-143、miR-144、miR-145、miR-155、miR-16、miR-18a、miR-192、miR-195、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-203、miR-205、miR-214、miR-218、miR-23b、miR-26a、miR-29c、miR-320c、miR-34a、miR-370、miR-409-3p、miR-429、miR-451、miR-490-5p、miR-493、miR-576-3p及び/またはmiR-99aに対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、膀胱癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-1251-5p、miR-219a-5p、miR-219a-2-3p、miR-124-3p、miR-448、miR-138-2-3p、miR-490-5p、miR-129-1-3p、miR-1264、miR-3943、miR-490-3p、miR-383-5p、miR-133b、miR-129-2-3p、miR-128-2-5p、miR-133a-3p、miR-129-5p、miR-1-3p、miR-885-3p、miR-124-5p、miR-759、miR-7158-3p、miR-770-5p、miR-135a-5p、miR-885-5p、let-7g-5p、miR-100、miR-101、miR-106a、miR-124、miR-124a、miR-125a、miR-125a-5p、miR-125b、miR-127-3p、miR-128、miR-129、miR-136、miR-137、miR-139-5p、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-146b-5p、miR-149、miR-152、miR-153、miR-195、miR-21、miR-212-3p、miR-219-5p、miR-222、miR-29b、miR-31、miR-3189-3p、miR-320、miR-320a、miR-326、miR-330、miR-331-3p、miR-340、miR-342、miR-34a、miR-376a、miR-449a、miR-483-5p、miR-503、miR-577、miR-663、miR-7、miR-7-5p、miR-873、let-7a、let-7f、miR-107、miR-122、miR-124-5p、miR-139、miR-146a、miR-146b、miR-15b、miR-16、miR-181a、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-185、miR-199a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-203、miR-204、miR-205、miR-218、miR-23b、miR-26b、miR-27a、miR-29c、miR-328、miR-34c-3p、miR-34c-5p、miR-375、miR-383、miR-451、miR-452、miR-495、miR-584、miR-622、miR-656、miR-98、miR-124-3p、miR-181b-5p、miR-200b及び/またはmiR-3189-3pに対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、脳癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。ある特定の実施形態において、脳癌は、星細胞腫、膠芽腫または神経膠腫である。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-10b-5p、miR-126-3p、miR-145-3p、miR-451a、miR-199b-5p、miR-5683、miR-3195、miR-3182、miR-1271-5p、miR-204-5p、miR-409-5p、miR-136-5p、miR-514a-5p、miR-559、miR-483-3p、miR-1-3p、miR-6080、miR-144-3p、miR-10b-3p、miR-6130、miR-6089、miR-203b-5p、miR-4266、miR-4327、miR-5694、miR-193b、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-107、miR-10a、miR-10b、miR-122、miR-124、miR-1258、miR-125a-5p、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-129、miR-130a、miR-132、miR-133a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-146b、miR-147、miR-148a、miR-149、miR-152、miR-153、miR-15a、miR-16、miR-17-5p、miR-181a、miR-1826、miR-183、miR-185、miR-191、miR-193a-3p、miR-195、miR-199b-5p、miR-19a-3p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-205、miR-206、miR-211、miR-216b、miR-218、miR-22、miR-26a、miR-26b、miR-300、miR-30a、miR-31、miR-335、miR-339-5p、miR-33b、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374a、miR-379、miR-381、miR-383、miR-425、miR-429、miR-450b-3p、miR-494、miR-495、miR-497、miR-502-5p、miR-517a、miR-574-3p、miR-638、miR-7、miR-720、miR-873、miR-874、miR-92a、miR-98、miR-99a、mmu-miR-290-3p及び/またはmmu-miR-290-5pに対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、乳癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-143、miR-145、miR-17-5p、miR-203、miR-214、miR-218、miR-335、miR-342-3p、miR-372、miR-424、miR-491-5p、miR-497、miR-7、miR-99a、miR-99b、miR-100、miR-101、miR-15a、miR-16、miR-34a、miR-886-5p、miR-106a、miR-124、miR-148a、miR-29a及び/またはmiR-375に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、子宮頸癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-133a-5p、miR-490-5p、miR-124-3p、miR-137、miR-655-3p、miR-376c-3p、miR-369-5p、miR-490-3p、miR-432-5p、miR-487b-3p、miR-342-3p、miR-223-3p、miR-136-3p、miR-136-3p、miR-143-5p、miR-1-3p、miR-214-3p、miR-143-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-127-3p、miR-133a-3p、miR-145-5p、miR-145-3p、miR-199a-5p、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-100、miR-101、miR-126、miR-142-3p、miR-143、miR-145、miR-192、miR-200c、miR-21、miR-214、miR-215、miR-22、miR-25、miR-302a、miR-320、miR-320a、miR-34a、miR-34c、miR-365、miR-373、miR-424、miR-429、miR-455、miR-484、miR-502、miR-503、miR-93、miR-98、miR-186、miR-30a-5p、miR-627、let-7a、miR-1、miR-124、miR-125a、miR-129、miR-1295b-3p、miR-1307、miR-130b、miR-132、miR-133a、miR-133b、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-150-5p、miR-154、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-18a、miR-191、miR-193a-5p、miR-194、miR-195、miR-196a、miR-198、miR-199a-5p、miR-203、miR-204-5p、miR-206、miR-212、miR-218、miR-224、miR-24-3p、miR-26b、miR-27a、miR-28-3p、miR-28-5p、miR-29b、miR-30a-3p、miR-30b、miR-328、miR-338-3p、miR-342、miR-345、miR-34a-5p、miR-361-5p、miR-375、miR-378、miR-378a-3p、miR-378a-5p、miR-409-3p、miR-422a、miR-4487、miR-483、miR-497、miR-498、miR-518a-3p、miR-551a、miR-574-5p、miR-625、miR-638、miR-7、miR-96-5p、miR-202-3p、miR-30a及び/またはmiR-451に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、結腸癌または大腸癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-130a、miR-130b、miR-134、miR-143、miR-145、miR-152、miR-205、miR-223、miR-301a、miR-301b、miR-30c、miR-34a、miR-34c、miR-424、miR-449a、miR-543及び/またはmiR-34bに対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、子宮内膜癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-125b、miR-138、miR-15a、miR-15b、miR-16、miR-16-1、miR-16-1-3p、miR-16-2、miR-181a、miR-181b、miR-195、miR-223、miR-29b、miR-34b、miR-34c、miR-424、miR-10a、miR-146a、miR-150、miR-151、miR-155、miR-2278、miR-26a、miR-30e、miR-31、miR-326、miR-564、miR-27a、let-7b、miR-124a、miR-142-3p、let-7c、miR-17、miR-20a、miR-29a、miR-30c、miR-720、miR-107、miR-342、miR-34a、miR-202、miR-142-5p、miR-29c、miR-145、miR-193b、miR-199a、miR-214、miR-22、miR-137及び/またはmiR-197に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、血液癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。いくつかの実施形態において、血液癌は、白血病、リンパ腫または骨髄腫である。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-1、miR-145、miR-1826、miR-199a、miR-199a-3p、miR-203、miR-205、miR-497、miR-508-3p、miR-509-3p、let-7a、let-7d、miR-106a、miR-126、miR-1285、miR-129-3p、miR-1291、miR-133a、miR-135a、miR-138、miR-141、miR-143、miR-182-5p、miR-200a、miR-218、miR-28-5p、miR-30a、miR-30c、miR-30d、miR-34a、miR-378、miR-429、miR-509-5p、miR-646、miR-133b、let-7b、let-7c、miR-200c、miR-204、miR-335、miR-377及び/またはmiR-506に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、腎癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-100、miR-101、miR-105、miR-122、miR-122a、miR-1236、miR-124、miR-125b、miR-126、miR-127、miR-1271、miR-128-3p、miR-129-5p、miR-130a、miR-130b、miR-133a、miR-134、miR-137、miR-138、miR-139、miR-139-5p、miR-140-5p、miR-141、miR-142-3p、miR-143、miR-144、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150-5p、miR-15b、miR-16、miR-181a-5p、miR-185、miR-188-5p、miR-193b、miR-195、miR-195-5p、miR-197、miR-198、miR-199a、miR-199a-5p、miR-199b、miR-199b-5p、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-202、miR-203、miR-204-3p、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-21、miR-21-3p、miR-211、miR-212、miR-214、miR-217、miR-218、miR-219-5p、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-29b-1、miR-29b-2、miR-29c、miR-302b、miR-302c、miR-30a、miR-30a-3p、miR-335、miR-338-3p、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-365、miR-370、miR-372、miR-375、miR-376a、miR-377、miR-422a、miR-424、miR-424-5p、miR-433、miR-4458、miR-448、miR-450a、miR-451、miR-485-5p、miR-486-5p、miR-497、miR-503、miR-506、miR-519d、miR-520a、miR-520b、miR-520c-3p、miR-582-5p、miR-590-5p、miR-610、miR-612、miR-625、miR-637、miR-675、miR-7、miR-877、miR-940、miR-941、miR-98、miR-99a、miR-132及び/またはmiR-31に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、肝癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。いくつかの実施形態において、肝癌は、肝細胞癌である。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-143-3p、miR-126-3p、miR-126-5p、miR-1266-3p、miR-6130、miR-6080、miR-511-5p、miR-143-5p、miR-223-5p、miR-199b-5p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-451a、miR-142-5p、miR-144、miR-150-5p、miR-142-3p、miR-214-3p、miR-214-5p、miR-199a-5p、miR-145-3p、miR-145-5p、miR-1297、miR-141、miR-145、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-29b、miR-381、miR-409-3p、miR-429、miR-451、miR-511、miR-99a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-1、miR-101、miR-133b、miR-138、miR-142-5p、miR-144、miR-1469、miR-146a、miR-153、miR-15a、miR-15b、miR-16-1、miR-16-2、miR-182、miR-192、miR-193a-3p、miR-194、miR-195、miR-198、miR-203、miR-217、miR-218、miR-22、miR-223、miR-26a、miR-26b、miR-29c、miR-33a、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-365、miR-449a、miR-449b、miR-486-5p、miR-545、miR-610、miR-614、miR-630、miR-660、miR-7515、miR-9500、miR-98、miR-99b、miR-133a、let-7a、miR-100、miR-106a、miR-107、miR-124、miR-125a-3p、miR-125a-5p、miR-126、miR-126、miR-129、miR-137、miR-140、miR-143、miR-146b、miR-148a、miR-148b、miR-149、miR-152、miR-154、miR-155、miR-17-5p、miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b、miR-181b-1、miR-181b-2、miR-181c、miR-181d、miR-184、miR-186、miR-193b、miR-199a、miR-204、miR-212、miR-221、miR-224、miR-27a、miR-27b、miR-29a、miR-30a、miR-30b、miR-30c、miR-30d、miR-30d-5p、miR-30e-5p、miR-32、miR-335、miR-338-3p、miR-340、miR-342-3p、miR-361-3p、miR-373、miR-375、miR-4500、miR-4782-3p、miR-497、miR-503、miR-512-3p、miR-520a-3p、miR-526b、miR-625及び/またはmiR-96に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、肺癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7b、miR-101、miR-125b、miR-1280、miR-143、miR-146a、miR-146b、miR-155、miR-17、miR-184、miR-185、miR-18b、miR-193b、miR-200c、miR-203、miR-204、miR-205、miR-206、miR-20a、miR-211、miR-218、miR-26a、miR-31、miR-33a、miR-34a、miR-34c、miR-376a、miR-376c、miR-573、miR-7-5p、miR-9及び/またはmiR-98に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、黒色腫を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7d、miR-218、miR-34a、miR-375、miR-494、miR-100、miR-124、miR-1250、miR-125b、miR-126、miR-1271、miR-136、miR-138、miR-145、miR-147、miR-148a、miR-181a、miR-206、miR-220a、miR-26a、miR-26b、miR-29a、miR-32、miR-323-5p、miR-329、miR-338、miR-370、miR-410、miR-429、miR-433、miR-499a-5p、miR-503、miR-506、miR-632、miR-646、miR-668、miR-877及び/またはmiR-9に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、口腔癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7i、miR-100、miR-124、miR-125b、miR-129-5p、miR-130b、miR-133a、miR-137、miR-138、miR-141、miR-145、miR-148a、miR-152、miR-153、miR-155、miR-199a、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-212、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-409-3p、miR-411、miR-429、miR-432、miR-449a、miR-494、miR-497、miR-498、miR-519d、miR-655、miR-9、miR-98、miR-101、miR-532-5p、miR-124a、miR-192、miR-193a及び/またはmiR-7に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、卵巣癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-216a-5p、miR-802、miR-217、miR-145-3p、miR-143-3p、miR-451a、miR-375、miR-214-3p、miR-216b-3p、miR-432-5p、miR-216a-3p、miR-199b-5p、miR-199a-5p、miR-136-3p、miR-216b-5p、miR-136-5p、miR-145-5p、miR-127-3p、miR-199a-3p、miR-199b-3p、miR-559、miR-129-2-3p、miR-4507、miR-1-3p、miR-148a-3p、miR-101、miR-1181、miR-124、miR-1247、miR-133a、miR-141、miR-145、miR-146a、miR-148a、miR-148b、miR-150、miR-150-5p、miR-152、miR-15a、miR-198、miR-203、miR-214、miR-216a、miR-29c、miR-335、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-373、miR-375、miR-410、miR-497、miR-615-5p、miR-630、miR-96、miR-132、let-7a、let-7a-1、let-7a-2、let-7a-3、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f-1、let-7f-2、let-7g、let-7i、miR-126、miR-135a、miR-143、miR-144、miR-150、miR-16、miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-217、miR-218、miR-337、miR-494及び/またはmiR-98に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、膵癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、let-7a-3p、let-7c、miR-100、miR-101、miR-105、miR-124、miR-128、miR-1296、miR-130b、miR-133a-1、miR-133a-2、miR-133b、miR-135a、miR-143、miR-145、miR-146a、miR-154、miR-15a、miR-187、miR-188-5p、miR-199b、miR-200b、miR-203、miR-205、miR-212、miR-218、miR-221、miR-224、miR-23a、miR-23b、miR-25、miR-26a、miR-26b、miR-29b、miR-302a、miR-30a、miR-30b、miR-30c-1、miR-30c-2、miR-30d、miR-30e、miR-31、miR-330、miR-331-3p、miR-34a、miR-34b、miR-34c、miR-374b、miR-449a、miR-4723-5p、miR-497、miR-628-5p、miR-642a-5p、miR-765及び/またはmiR-940に対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、前立腺癌を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の5’UTRまたは3’UTRに挿入された、miR-101、miR-183、miR-204、miR-34a、miR-365b-3p、miR-486-3p及び/またはmiR-532-5pに対する1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピーを含む。この腫瘍溶解性ウイルスは、網膜芽細胞腫を治療するための方法及び組成物に使用され得る。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子は、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12からなる群から選択される。
いくつかの場合において、本発明の組み換えウイルスベクターは、単純ヘルペスウイル
ス(HSV)であり、ICP47遺伝子に対するプロモーターの他に、二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT及びICP4のそれぞれを1コピー含む、内部反復(接合)領域の欠失を更に含む。
ある特定の実施形態において、本発明の組み換えウイルスベクターは、直接感染及び/または水平伝播のいずれかによる細胞内侵入が増強されたHSVである。一態様において、本発明のHSVベクターは、HSV感染の典型的なメディエーター以外の細胞タンパク質(例えば、ネクチン-1、HVEMまたはヘパラン硫酸/コンドロイチン硫酸プロテオグリカン以外の細胞タンパク質)との相互作用を介して、細胞に直接感染することができる。ある特定の実施形態において、本発明の組み換えウイルスベクターは、HSVであり、通常以外の受容体を介したベクター侵入を容易にする、gBまたはgH遺伝子変異を更に含む。別の態様において、本発明は、典型的にHSVの水平伝播に抵抗性であるgD受容体を欠く細胞などの細胞において水平伝播を示す、変異gH糖タンパク質を更に含む、HSVベクターを提供する。いくつかの実施形態において、本発明のHSVベクターは、米国特許出願公開第2013/0096186号(その全体を参照により本明細書に援用する)に記載されている変異gBまたはgHタンパク質のうちの1つ以上を含む。ある特定の態様において、HSVベクター中の変異侵入タンパク質は、ウイルス侵入に関与する、gB、gHなどの糖タンパク質であり、変異HSVベクターは、両タンパク質の変異体を含み得る。しかしながら、変異侵入タンパク質は、HSVベクターの細胞への侵入に作用する任意のタンパク質であってよい。ある特定の実施形態において、変異侵入タンパク質は、gD以外であるが、HSVベクターは、リガンドまたは他の所望の変異を含有するような変異gDを追加で含み得る。本発明のHSVベクターにおいて使用されるgBまたはgH糖タンパク質の非限定的な変異は、次の残基:gB:D285、gB:A549、gB:S668、gH:N753及びgH:A778のうちの1つ以上に存在する。いくつかの実施形態において、本発明のHSVベクターは、gB:D285とgB:A549の両方、gH:N753とgH:A778の両方、ならびに/またはgB:S668、gH:N753及びgH:A778のそれぞれに変異を含む。ある特定の実施形態において、HSVベクターは、2つ以上(例えば、3つ以上、4つ以上)のこのような変異を含有し、HSVベクターは、これら5つの全ての残基に変異を含み得る。一実施形態において、HSVベクターは、gB:285、gB;549、gH:753及びgH:778に変異を有する。変異は、本明細書において、HSV-1株KOSの誘導株K26GFPのgD、gB及びgH遺伝子のコドン(アミノ酸)ナンバリングを基準に示す。以下の表に示されるように、K26GFPのgB及びgHの配列は、GenBank(#AF311740(参照により本明細書に援用する))に開示されているgB及びgH(GenBank#X03896(参照により本明細書に援用する))の配列とは異なる。
Figure 0007174109000001
ただし、K26GFPは、GenBank X03896のヌクレオチド2,079~2,102に対応する遺伝子領域に更なる差異を含有し得る。したがって、KOS誘導株K26GFPまたはGenBankアクセッション番号AF311740のいずれかの配列を、本明細書で考察されるgB変異の参照配列として使用できることが理解されるだろう。また、KOS誘導株K26GFPまたはGenBankアクセッション番号X03896のいずれかの配列を、本明細書で考察されるgH変異の参照配列として使用できることが理解されるだろう。しかしながら、本発明のHSVベクターは、任意のHSV株のgB及びgHにおける相同の変異を含み得る。
いくつかの態様において、HSVベクターに含めるための侵入タンパク質の変異は、置換変異であるが、変異は、置換変異体に限定されない。ある特定の実施形態において、HSVベクターに使用される変異gBまたはgH糖タンパク質は、gB:D285N、gB:A549T、gB:S668N、gH:N753K、gH:A778Vからなる置換変異からなる群から選択される。ある特定の態様において、HSVベクターは、これらの置換(2つ以上のこのような置換(例えば、3つ以上、4つ以上または全て)など)の組み合わせを含み、gB:D285N/gB:A549T二重変異体、gH:N753K/gH:A778V二重変異体、及びgB:S668N/gH:N753K/gH:A778V三重変異体が実施形態の例である。一実施形態において、HSVベクターは、gB:D285N/gB:A549T/gH:N753K/gH:A778Vを含む。
ある特定の態様において、HSVベクターは、変異gB及び/または変異gH糖タンパク質を含み、糖タンパク質中の変異は、少なくとも2つの残基における置換変異であり、ベクターがHSV-1 K26GFPであるとき、少なくとも2つの残基は、gB:D285、gB:A549、gB:S668、gH:N753及びgH:A778からなる群から選択されるか、ベクターが相同HSVであるとき、少なくとも2つの残基は、gB:D285、gB:A549、gB:S668、gH:N753及びgH:A778に対応するアミノ酸から選択され、gB:D285残基は、VYPYXEFVL(配列番号1)中のXに対応し、gB:A549残基は、KLNPNXIAS(配列番号2)中のXに対応し、gB:S668残基は、ITTVXTFID(配列番号3)中のXに対応し、gH:N753残基は、VDTDXTQQQ(配列番号4)中のXに対応し、gH:A778残基は、VPSTXLLLF(配列番号5)中のXに対応し、HSVベクターは、HSV-1またはHSV-2ベクターである。
一態様において、本発明は、miRNA、遺伝子またはメタロプロテアーゼ組織阻害剤(TIMP)の発現を低下させるか、その機能を阻害する、タンパク質またはオリゴヌクレオチド(例えば、shRNA、デコイオリゴヌクレオチドまたはantagomir)をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスを包含する。このような組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、本明細書において、「ゲノム編集」または「微小環境リモデリング」ウイルスまたはベクターと称される。コードされるタンパク質またはオリゴヌクレオチドは、タンパク質(例えば、TIMP)を分解の標的にすること(例えば、ユビキチン化及びプロテアソーム分解によって、またはリソソーム分解標的化)、同種受容体との相互作用を遮断すること(例えば、ブロッキング抗体もしくはその抗原結合断片またはペプチド阻害剤)、メッセンジャーRNA転写物を分解すること(例えば、低分子干渉RNAまたは低分子ヘアピンRNA)、及び/または特定のmiR、遺伝子もしくはタンパク質をコードするゲノムDNA配列を改変すること(例えば、エンドヌクレアーゼによって)を含む任意数の方法で、miRNA、遺伝子またはTIMPの発現を低下させるか、その機能を阻害することができる。
特定の実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、発がんまたは転移に関与するmiRまたは遺伝子(例えば、がん促進性miRまたはがん遺伝子)の発現を低下させる。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、がん促進性miRNA(例えば、表4に列挙されるmiRNAのうちの1つ以上)であるmiRNAの発現または機能を低下させるタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、がん促進性miRNAの発現または機能を低下させるタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、複数のがん促進性miRNAの発現または機能を低下させる複数のタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-17-92の発現を低下させ、肺癌(例えば、小細胞肺癌)を治療するために使用される。他の実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-221及び/またはmiR-21の発現を低下させ、膠芽腫を治療するために使用される。ある特定の実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-155及び/またはmiR-17-92の発現を低下させ、リンパ腫(例えば、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫または慢性リンパ球性白血病)を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-221、miR-222及び/またはmiR-146の発現を低下させ、甲状腺癌を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-372及び/またはmiR-373の発現を低下させ、精巣癌(例えば、精巣胚細胞腫瘍)を治療するために使用される。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR-18及び/またはmiR-224の発現を低下させ、肝癌(例えば、肝細胞癌)を治療するために使用される。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組み換えウイルスベクターは、腫瘍細胞外マトリックス(ECM)を分解するために使用され得、これにより、いくつかの態様において、ウイルス伝播が増強される。マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)は、亜鉛依存性プロテアーゼであり、その活性に基づいて、コラゲナーゼ、ゼラチナーゼ、ストロムライシン及びマトリライシンに分類される。これらのプロテアーゼは、通常、酵素前駆体(チモーゲン)として分泌され、プロペプチドのプロドメインのタンパク質分解除去によって活性化される。がんにおいてMMPが果たす主要な役割は、ECMの分解であり、これにより、腫瘍浸潤及び転移が促進される。MMPはまた、腫瘍進行、上皮間葉転換(EMT)及び血管新生にも関与する。MMPは、miRNAだけでなく、4つのプロテアーゼ阻害剤ファミリー(TIMP1、TIMP2、TIMP3及びTIMP4)を含むTIMPによって制御される。本発明の組み換えウイルスベクターを用いて、MMPファミリーを負に制御するmiRNAまたはTIMPを破壊することによって、広範な腫瘍微小環境を弱めることができる。miRNA/MMP相互作用の例は、表5に示される。これらの相互作用の多くは、複数のMMPが単一のmiRNAによって制御されることを示しており、例えば、let-7は、MMP-2、MMP-9及びMMP-14を制御し、miR-143は、MMP-2、MMP-9及びMMP-13を制御し、miR-218は、MMP-2、MMP-7及びMMP-9を制御する。更に、大多数のMMPは、単一のTIMPマスタースイッチによって制御され得、例えば、TIMP1は、既知のMMPのほぼ全てを阻害することが知られており、また広範な細胞種で細胞増殖を促進し、TIMP2は、MMP-14及びMMP-2と相互作用する。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、微小環境リモデリングmiRNA(例えば、表5に列挙されるmiRNAのうちの1つ以上)であるmiRNAの発現または機能を低下させるタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、1つの微小環境リモデリングmiRNAの発現または機能を低下させる。いくつかの実施形態において、タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9または10以上の微小環境リモデリングmiRNAの発現または機能を低下させる。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、複数の微小環境リモデリングmiRNAの発現または機能を低下させる複数のタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、複数のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される戦略は、MMPを負に制御するmiRNAまたはTIMPの発現または機能をノックダウンまたは破壊する本発明の組み換えウイルスベクターによって活用され得る。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、TIMP1、TIMP2、TIMP3及びTIMP4から選択されるTIMPの発現を低下させる。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、遺伝子の発現または機能を減少させるタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする、少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、遺伝子は、がん遺伝子(例えば、表7に列挙される遺伝子から選択される遺伝子)である。いくつかの態様において、遺伝子は、がん促進性miR(例えば、表4に列挙されるmiRNA)、微小環境リモデリングmiR(例えば、表5に列挙されるmiRNA)、またはECM分解の負の制御因子(例えば、TIMP)をコードする。遺伝子の発現及び/または機能の低下は、転写レベル(例えば、ゲノムDNA配列の変異、欠失またはサイレンシング)または翻訳レベル(例えば、mRNA分解を介した遺伝子産物の産生の阻害)で達成され得る。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、遺伝子配列の変異、欠失または転写抑制を可能にすることによって遺伝子の発現または機能を低下させるヌクレアーゼをコードする、1つ以上のポリヌクレオチドを含む。具体的な実施形態において、ヌクレアーゼは、クラスター化された規則的な間隔のある短い回文の繰り返し配列(CRISPR)関連エンドヌクレアーゼ、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)または転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)から選択される。非限定的な例において、CRISPR関連エンドヌクレアーゼは、SpCas9、SpCas9-HF1、SpCas9-HF2、SpCas9-HF3、SpCas9-HF4、SaCas9、FnCpf、FnCas9、eSpCas9、C2C1、C2C3、Cpf1、Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas6、Cas7、Cas8、Cas9(Csn1及びCsx12としても知られる)、Cas10、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1、Cse2、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3及びCsf4から選択される。
本発明の組み換えウイルスベクターは、細菌系に基づいた遺伝子操作ヌクレアーゼ系であり、哺乳動物ゲノムを操作するために使用することができる、CRISPR(クラスター化された規則的な間隔のある短い回文の繰り返し配列)/Cas(CRISPR関連)ヌクレアーゼ系を利用してもよい。一般に、この系は、Casヌクレアーゼと、ガイドRNA(gRNA)とを含む。gRNAは、標的ゲノムDNA配列に特異的なcrispr-RNA(crRNA)と、Cas結合を促進するtracrRNA(trRNA)との2つの部分からなる。crRNA及びtrRNAは、別個のRNAオリゴヌクレオチドとして存在してもよいし、同じRNAオリゴヌクレオチド中に存在してもよい(単一ガイドRNA(sgRNA)と呼ばれる)。本明細書で使用されるとき、「ガイドRNA」または「gRNA」という用語は、個々のtrRNAと、個々のcrRNAとの組み合わせまたはsgRNAのいずれかを指す。例えば、Jinek et al.(2012)Science 337:816-821;Cong et al.(2013)Science 339:819-823;Mali et al.(2013)Science 339:823-826;Qi et al.(2013)Cell 152:1173-1183;Jinek et al.(2013),eLife 2:e00471;David Segal(2013)eLife 2:e00563;Ran et al.(2013)Nature Protocols 8(11):2281-2308;Zetsche et al.(2015)Cell 163(3):759-771;PCT国際公開第WO2007/025097号、同第WO2008/021207号、同第WO2010/011961号、同第WO2010/054108号、同第WO2010/054154号、同第WO2012/054726号、同第WO2012/149470号、同第WO2012/164565号、同第WO2013/098244号、同第WO2013/126794号、同第WO2013/141680号及び同第WO2013/142578号;米国特許出願公開第2010-0093617号、同第2013-0011828号、同第2010-0257638号、同第2010-0076057号、同第2011-0217739号、同第2011-0300538号、同第2013-0288251号及び同第2012-0277120号;ならびに米国特許第8,546,553号(そのそれぞれの全体を参照により本明細書に援用する)を参照されたい。
複数のクラス1のCRISPR-Cas系(I型及びIII型系を含む)が特定され、細部にわたって機能的に特徴付けられ、エフェクター複合体の複雑な構造及び力学が明らかになっている(Brouns et al.,2008、Marraffini and Sontheimer,2008、Hale et al.,2009、Sinkunas et al.,2013、Jackson et al.,2014、Mulepati et al.,2014)。加えて、Cas9ファミリーの相同RNA誘導エンドヌクレアーゼをエフェクターとして利用する、いくつかのクラス2のII型CRISPR-Cas系も特定され、実験的に特徴付けられている(Barrangou et al.,2007、Garneau et al.,2010、Deltcheva et al.,2011、Sapranauskas et al.,2011、Jinek et al.,2012、Gasiunas et al.,2012)。最近では、一般に第2のクラス2のV型と言われるCRISPR-Cas系がいくつかの細菌ゲノムで特定されている。一般にV型と言われるCRISPR-Cas系は、Cpf1(Prevotella及びFrancisella 1由来CRISPR)と呼ばれる、約1,300の大きなアミノ酸タンパク質を含有する。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスは、miRNAまたはTIMPを標的にするtrRNA及びcrRNAをコードする、少なくとも1つのポリヌクレオチドを更に含む。いくつかの場合において、trRNA及びcrRNAをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドは、ウイルスゲノム上の遺伝子座に挿入される。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、合成インスレーターまたは天然ウイルス(例えば、HSV)インスレーターを含む境界配列である。ある特定の実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、RNA結合部位をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドは、内部反復接合領域(二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT、ICP4及びICP47プロモーターのそれぞれを1コピー含む)、ICP0、LAT、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12を含む、1つ以上の遺伝子座に、または1つ以上の遺伝子座の間に挿入される。一実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルス(HSV)であり、RNA結合部位をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドは、UL3とUL4のオープンリーディングフレームの間の遺伝子座に挿入される(例えば、図45及び図46)。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE)、抗免疫抑制タンパク質または免疫原性抗原であるタンパク質をコードする、少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。本明細書で使用されるとき、「抗免疫抑制タンパク質」は、免疫抑制経路を阻害するタンパク質である。本発明は、抗制御性T細胞(Treg)タンパク質または抗骨髄由来抑制細胞(MDSC)タンパク質である抗免疫抑制タンパク質を発現する、腫瘍溶解性ウイルスを包含する。いくつかの実施形態において、抗免疫抑制タンパク質は、VHH由来遮断剤またはVHH由来BiTEである。本明細書で使用されるとき、「免疫原性抗原」は、炎症性または免疫原性の免疫応答を高めるタンパク質を指す。特定の実施形態において、抗免疫抑制及び免疫原性抗原は、抗腫瘍免疫応答を誘導する。このようなタンパク質の例には、免疫チェックポイント受容体(例えば、CTLA4、LAG3、PD1、PDL1及びその他)に結合し阻害する抗体もしくはその抗原結合断片、炎症促進性サイトカイン(例えば、IFNγ、IFNα、IFNβ、TNFα、IL-12、IL-2、IL-6、IL-8、GM-CSF及びその他)、または活性化受容体(例えば、FcγRI、FcγIIa、FcγIIIa、共刺激受容体及びその他)に結合し活性化するタンパク質が挙げられる。特定の実施形態において、タンパク質は、EpCAM、葉酸、IFNβ、抗CTLA-4、抗PD1、A2A、抗FGF2、抗FGFR/FGFR2b、抗SEMA4D、CCL5、CD137、CD200、CD38、CD44、CSF-1R、CXCL10、CXCL13、エンドセリンB型受容体、IL-12、IL-15、IL-2、IL-21、IL-35、ISRE7、LFA-1、NG2(SPEG4としても知られる)、SMAD、STING、TGFβ及びVCAM1から選択される。
ある特定の実施形態において、miRNA、遺伝子またはTIMPの発現を低下させるために標的化されたタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドは、組み換え腫瘍溶解性ウイルスのウイルスゲノムの遺伝子座に挿入される。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、合成インスレーターまたは天然ウイルス(例えば、HSV)インスレーターを含む境界配列である。ある特定の実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、RNA結合部位をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドは、内部反復接合領域(二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT、ICP4及びICP47プロモーターのそれぞれを1コピー含む)、ICP0、LAT、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12を含む、1つ以上の遺伝子座に、または1つ以上の遺伝子座の間に挿入される。一実施形態において、ウイルスは、単純ヘルペスウイルス(HSV)であり、少なくとも1つのポリヌクレオチドがUL3とUL4のオープンリーディングフレームの間の遺伝子座に挿入される(例えば、図45及び図46)。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体を含む。プロテアーゼ活性化抗体(Metzら(Protein Eng Des Sel,25(10):571-80,2012)が記載するものなど)は、保護キャップのプロテアーゼ切断を受けた後、活性化され、標的にのみ結合する。いくつかの場合において、腫瘍微小環境は、健康な周辺組織とは大きく異なる一連のプロテアーゼを有する。例えば、プロテアーゼカテプシンBは、乳癌、子宮頸癌、結腸癌、大腸癌、胃癌、頭頸部癌、肝癌、肺癌、黒色腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌及び甲状腺癌を含む、多数のがんで過剰発現される。ヒト分解産物の総体は、ヒト細胞によって合成されるプロテアーゼの完全な一覧からなり、最も多いものから最も少ないものへの順序でメタロプロテアーゼ(MMP)、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、スレオニンプロテアーゼ及びアスパラギン酸プロテアーゼの5つの大きなクラスに分類される、少なくとも569のプロテアーゼから構成される(Lopez-Otin et al.,Nat Rev Cancer,7(10):800-8,2007)。特に、MMPによって特異的に切断されるプロテアーゼ抗体は、MMPが細胞外及び細胞周辺領域に存在することから、本明細書に記載される組み換えウイルスベクターを腫瘍微小環境に標的化する優れた手段として役立ち得る。表6は、がんで過剰発現されるプロテアーゼをまとめたものであり、これらのプロテアーゼを利用することで、プロテアーゼ活性化抗体を用いてシュードタイプ化される組み換えウイルスベクターの特異的結合が可能となる。
ある特定の実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、ウイルス糖タンパク質エンベロープ中に組み込まれる。プロテアーゼ活性化抗体は、治療指数を上げ、かつオフターゲット感染を少なくするために、本発明の組み換えウイルスベクター(例えば、HSVベクター)の糖タンパク質エンベロープ中に組み込むことができる。HSVベクターの場合、いくつかの実施形態において、糖タンパク質は、gCまたはgDであり得る。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、プロテアーゼ活性化抗体をコードする少なくとも1つのポリヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、システインカテプシン、アスパラギン酸カテプシン、カリクレイン(hK)、セリンプロテアーゼ、カスパーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)及びディスインテグリン及びメタロプロテアーゼ(ADAM)から選択されるプロテアーゼによって活性化される。いくつかの実施形態において、プロテアーゼは、カテプシンK、カテプシンB、カテプシンL、カテプシンE、カテプシンD、hK1、PSA(hK3)、hK10、hK15、uPA、uPAR、MMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-7、MMP-8、MMP-9、MMP-10、MMP-11、MMP-12、MMP-13、MMP-14、MMP-15、MMP-16、MMP-17、MMP-18、MMP-19、MMP-20、MMP-21、MMP-23A、MMP-23B、MMP-24、MMP-25、MMP-26、MMP-27、MMP-28または表6に列挙されるプロテアーゼから選択される。
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ活性化抗体は、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現されるタンパク質に結合する。ある特定の態様において、プロテアーゼ活性化抗体は、NKG2D、c-met、HGFR、CD8、ヘパラン硫酸、VSPG4(NG2としても知られる)、EGFR、EGFRvIII、CD133、CXCR4、がん胎児性抗原(CEA)、CLC-3、アネキシンII、ヒトトランスフェリン受容体またはEpCAMに結合する。ある特定の場合において、異なる腫瘍組織型への標的化を確実に行うために、単一のウイルスベクター粒子中に複数のプロテアーゼ活性化抗体を組み込むことができる。例えば、少なくとも1、2、3、4、6、7、8、9、10またはそれ以上のプロテアーゼ活性化抗体は、ウイルス糖タンパク質エンベロープ中に組み込まれ得る。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のプロテアーゼ活性化抗体をコードする、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現される第1のタンパク質に結合する第1のプロテアーゼ活性化抗体と、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現される第2のタンパク質に結合する第2のプロテアーゼ活性化抗体とを含む。更なる実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、非がん細胞または非がん微小環境よりもがん細胞またはがん微小環境で高度に発現される複数のタンパク質に結合する複数のプロテアーゼ活性化抗体を含む。腫瘍溶解性ウイルスは、例えば、プロテアーゼ活性化抗体を含み、抗体は、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体である。いくつかの実施形態において、腫瘍溶解性ウイルスは、完全長免疫グロブリン、scFv、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、ダイアボディ、トリアボディ、ミニボディ、単一ドメイン抗体または多重特異性抗体である抗体を含む。
いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス複製に必要とされる1つ以上のウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性マイクロRNA(miR)標的配列、1つ以上のタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする1つ以上のポリヌクレオチドであって、当該タンパク質またはオリゴヌクレオチドは、miR、遺伝子もしくはTIMPの発現を低下させるか、その機能を阻害する、オリゴヌクレオチド、少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体、及び/または少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体をコードするポリヌクレオチドのうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、非がん性細胞におけるウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピー、及び/またはがん促進性miRNAもしくはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第1のポリヌクレオチド、及び/または微小環境リモデリングmiRNAもしくはTIMPの発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第2のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、非がん性細胞におけるウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピー、及び/またはがん促進性miRNAもしくはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチド、及び/または少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体を含む。更なる実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、非がん性細胞におけるウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピー、及び/または微小環境リモデリングmiRNAもしくはTIMPの発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチド、及び/または少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体を含む。一実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、非がん性細胞におけるウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子の遺伝子座に挿入された1つ以上の腫瘍抑制性miRNA標的配列の複数コピー、及び/またはがん促進性miRNAもしくはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第1のポリヌクレオチド、及び/または微小環境リモデリングmiRNAもしくはTIMPの発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第2のポリヌクレオチド、及び/または少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体を含む。いくつかの具体的な実施形態において、本段落に記載される腫瘍溶解性ウイルスは、単純ヘルペスウイルスであり、非がん性細胞においてウイルス複製に必要とされるウイルス遺伝子は、UL1、UL5、UL6、UL7、UL8、UL9、UL11、UL12、UL14、UL15、UL17、UL18、UL19、UL20、UL22、UL25、UL26、UL26.5、UL27、UL28、UL29、UL30、UL31、UL32、UL33、UL34、UL35、UL36、UL37、UL38、UL39、UL40、UL42、UL48、UL49、UL52、UL53、UL54、ICP0、ICP4、ICP22、ICP27、ICP47、γ-34.5、US3、US4、US5、US6、US7、US8、US9、US10、US11及びUS12である。
ある特定の態様において、本発明は、がん促進性miRNAまたはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする第1のポリヌクレオチドと、微小環境リモデリングmiRNAまたはTIMPの低下発現を目的にしたタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードする第2のポリヌクレオチドとを含む、組み換え腫瘍溶解性ウイルスに関する。他の実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、がん促進性miRNAまたはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドと、少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体とを含む。いくつかの実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、微小環境リモデリングmiRNAまたはTIMPの発現低下を目的にしたタンパク質またはオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドと、少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体とを含む。一実施形態において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、がん促進性miRNAもしくはがん遺伝子の発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第1のポリヌクレオチド、及び/または微小環境リモデリングmiRNAもしくはTIMPの発現低下を目的にしたタンパク質もしくはオリゴヌクレオチドをコードする第2のポリヌクレオチド、及び/または少なくとも1つのプロテアーゼ活性化抗体を含む。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスは、ヘルペスウイルス(例えば、単純ヘルペスウイルス(例えば、HSV-1またはHSV-2))、アデノウイルス、ポリオウイルス、ワクシニアウイルス、麻疹ウイルス、水疱性口内炎ウイルス、オルトミクソウイルス、パルボウイルス、マラバウイルスまたはコクサッキーウイルスである。HSV系ベクター及びその構築物のための方法は、例えば、米国特許第7,078,029号、同第6,261,552号、同第5,998,174号、同第5,879,934号、同第5,849,572号、同第5,849,571号、同第5,837,532号、同第5,804,413号及び同第5,658,724号、ならびに国際特許出願第WO91/02788号、同第WO96/04394号、同第WO98/15637号及び同第WO99/06583号に記載されており、それらの全体を参照により本明細書に援用する。HSVの配列は、公開されており(NCBIアクセッション番号NC_001806;McGoech et al.,J.Gen.Virol,69(PT 7),1531-1574(1988)も参照)、本発明のHSV系ベクターの設計を容易にし得る。
本発明はまた、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスをコードする核酸分子も包含する。
組成物及び使用方法
本発明のある特定の態様は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスを含む、ストック及び組成物に関する。いくつかの態様において、本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスを含む、ウイルスストックに関する。いくつかの実施形態において、ウイルスストックは、均質なストックである。ウイルスストックの調製及び分析は、当該技術分野においてよく知られている。例えば、ウイルスストックは、ウイルスベクターを形質導入した細胞を含有するローラーボトル中で製造することができる。次いで、ウイルスストックをニコデンツ連続的密度勾配で精製し、等分し、必要時まで保存することができる。ウイルスストックは、主に、ウイルス遺伝子型ならびにウイルスストックの調製に使用するプロトコル及び細胞株に応じて、力価が大きく変動する。
特定の実施形態において、本明細書で企図されるウイルスストック(例えば、HSV系ベクターウイルスストック)の力価は、少なくとも約10プラーク形成単位(pfu)、例えば、少なくとも約10pfu、または更により好ましくは少なくとも約10pfuである。ある特定の実施形態において、力価は、少なくとも約10pfu、または少なくとも約10pfuであり得、少なくとも約1010pfuまたは少なくとも約1011pfuの高力価ストックが最も好ましい。
本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスまたは核酸分子と、薬学的に許容される担体とを含む、組成物を更に企図する。「薬学的に許容される」という文言は、対象(例えば、ヒト)に投与されたとき、アレルギー反応または同様の有害反応を起こさない分子実体及び組成物を指す。本明細書で使用される「組成物」という用語は、対象及び/または細胞に投与または送達することができる、本明細書に記載される1つ以上の腫瘍溶解性ウイルスまたは核酸分子の製剤を指す。典型的に、製剤は、その誘導体及び/またはプロドラッグ、溶媒和物、立体異性体、ラセミ体もしくは互変異性体を、任意の生理学的に許容される担体、希釈剤及び/または賦形剤とともに含む、生理学的に許容される全ての組成物を含む。「治療組成物」または「医薬組成物」(本明細書において区別なく用いられる)は、特定の疾患または障害の治療のために患者及び/または対象及び/または細胞に投与または送達することができる、1つ以上の剤の組成物である。
本明細書で開示される組成物は、中性形態または塩形態に製剤化され得る。「薬学的に許容される塩」には、酸付加塩と塩基付加塩の両方が含まれる。薬学的に許容される塩には、酸付加塩(タンパク質の遊離アミノ基と形成されるもの)、例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸などの無機酸と形成されるもの、及び限定するものではないが、酢酸、2,2-ジクロロ酢酸、アジピン酸、アルギン酸、アスコルビン酸、アスパラギン酸、ベンゼンスルホン酸、安息香酸、4-アセトアミド安息香酸、ショウノウ酸、カンファー-10-スルホン酸、カプリン酸、カプロン酸、カプリル酸、炭酸、ケイ皮酸、クエン酸、シクラミン酸、ドデシル硫酸、エタン-1,2-ジスルホン酸、エタンスルホン酸、2-ヒドロキシエタンスルホン酸、ギ酸、フマル酸、ガラクタル酸、ゲンチシン酸、グルコヘプトン酸、グルコン酸、グルクロン酸、グルタミン酸、グルタル酸、2-オキソ-グルタル酸、グリセロリン酸、グリコール酸、馬尿酸、イソ酪酸、乳酸、ラクトビオン酸、ラウリン酸、マレイン酸、リンゴ酸、マロン酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、ムチン酸、ナフタレン-1,5-ジスルホン酸、ナフタレン-2-スルホン酸、1-ヒドロキシ-2-ナフトエ酸、ニコチン酸、オレイン酸、オロト酸、シュウ酸、パルミチン酸、パモ酸、プロピオン酸、ピログルタミン酸、ピルビン酸、サリチル酸、4-アミノサリチル酸、セバシン酸、ステアリン酸、コハク酸、酒石酸、チオシアン酸、pトルエンスルホン酸、トリフルオロ酢酸、ウンデシレン酸などの有機酸と形成されるものが含まれる。遊離カルボキシル基と形成される塩は、例えば、ナトリウム、カリウム、リチウム、アンモニウム、カルシウム、マグネシウム、鉄、亜鉛、銅、マンガン、アルミニウムの塩などの無機塩基から誘導することもできる。有機塩基から誘導される塩には、一級、二級及び三級アミン、天然置換アミンを含む置換アミン、環状アミン、ならびに塩基性イオン交換樹脂、例えば、アンモニア、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ジエチルアミン、トリエチルアミン、トリプロピルアミン、ジエタノールアミン、エタノールアミン、デアノール、2-ジメチルアミノエタノール、2-ジエチルアミノエタノール、ジシクロヘキシルアミン、リシン、アルギニン、ヒスチジン、カフェイン、プロカイン、ヒドラバミン、コリン、ベタイン、ベネタミン、ベンザチン、エチレンジアミン、グルコサミン、メチルグルカミン、テオブロミン、トリエタノールアミン、トロメタミン、プリン、ピペラジン、ピペリジン、N-エチルピペリジン、ポリアミン樹脂の塩などが含まれるが、これらに限定されない。特に好ましい有機塩基は、イソプロピルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、トリメチルアミン、ジシクロヘキシルアミン、コリン及びカフェインである。溶液は、配合されたら、剤形と適合した様式により、治療上有効な量で、投与される。製剤は、注射液、薬物放出カプセル剤などの様々な剤形で容易に投与される。
本明細書で使用されるとき、「担体」は、あらゆる全ての溶媒、分散媒、ビヒクル、コーティング剤、希釈剤、抗菌剤及び抗真菌剤、等張化剤及び吸収遅延剤、緩衝剤、担体液、懸濁液、コロイドなどを含む。このような媒体及び剤を薬学的活性物質に使用することは、当該技術分野においてよく知られている。任意の従来の媒体または剤は、有効成分と適合性がない場合を除き、治療組成物で使用されることが企図される。補助的な有効成分もまた、組成物中に組み込むことができる。
本明細書で使用されるとき、「薬学的に許容される担体」には、限定するものではないが、生理学的に適合性のある、あらゆる補助剤、担体、賦形剤、滑剤、甘味剤、希釈剤、保存剤、色素/着色剤、風味向上剤、界面活性剤、湿潤剤、分散剤、懸濁化剤、安定剤、等張化剤、溶媒、界面活性剤、分散媒、コーティング剤、抗菌剤及び抗真菌剤、等張化剤及び吸収遅延剤など、ヒト及び/または飼育動物への使用が許容されるものとして米国食品医薬品局から承認を受けている、薬学的に許容される細胞培養培地及び/または乳化剤が含まれる。例示的な薬学的に許容される担体には、ラクトース、グルコース及びスクロースなどの糖、トウモロコシデンプン及びジャガイモデンプンなどのデンプン、カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロースなどのセルロース及びその誘導体、トラガカント、モルト、ゼラチン、タルク、カカオバター、ワックス、動物性及び植物性脂肪、パラフィン、シリコーン、ベントナイト、ケイ酸、酸化亜鉛、ピーナッツ油、綿実油、サフラワー油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油及びダイズ油などの油、プロピレングリコールなどのグリコール、グリセリン、ソルビトール、マンニトール及びポリエチレングリコールなどのポリオール、オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル、寒天、水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤、アルギン酸、パイロジェンフリー水、等張食塩水、リンゲル溶液、エチルアルコール、リン酸緩衝液、ならびに医薬製剤に採用される他の適合物質が挙げられるが、これらに限定されない。任意の従来の媒体及び/または剤は、本開示の剤と適合性がない場合を除き、治療組成物で使用されることが企図される。補助的な有効成分もまた、組成物中に組み込むことができる。
湿潤剤、乳化剤、ならびに滑沢剤、例えば、ラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなど、ならびに着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香味剤、及び芳香剤、防腐剤、ならびに酸化防止剤もまた、組成物中に存在し得る。
薬学的に許容される酸化防止剤の例としては、(1)水溶性酸化防止剤、例えば、アス
コルビン酸、塩酸システイン、重硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、亜硫酸ナトリウムなど(2)油溶性酸化防止剤、例えば、パルミチン酸アスコルビル、ブチル化ヒドロキシアニソール(BHA)、ブチル化ヒドロキシトルエン(BHT)、レシチン、没食子酸プロピル、α-トコフェロールなど、及び(3)金属キレート剤、例えば、クエン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ソルビトール、酒石酸、リン酸などが挙げられる。
一実施形態において、担体を含む組成物は、非経口投与、例えば、血管内(静脈内または動脈内)、腹腔内または筋肉内投与に適している。薬学的に許容される担体には、注入可能な滅菌溶液または滅菌分散液を即時調製するための滅菌水溶液または滅菌分散液及び滅菌粉末が含まれる。薬学的活性物質のためのこのような媒体及び薬剤を使用することは、当該技術分野において周知である。任意の従来の媒体または剤は、ウイルスベクターまたは核酸分子と適合性がない場合を除き、本発明の医薬組成物で使用されることが企図される。
本発明の組成物は、単独または1つ以上の他の治療モダリティーとの組み合わせのいずれかで細胞または動物に投与するために、薬学的に許容される溶液または生理学的に許容される溶液中に配合された、本明細書に記載される1つ以上のポリペプチド、ポリヌクレオチド、ポリヌクレオチドを含むベクター、感染細胞などを含み得る。所望であれば、本発明の組成物は、例えば、サイトカイン、成長因子、ホルモン、小分子または様々な薬学的活性剤などの他の剤と組み合わせて投与することができることも理解される。組成物中に更に含めることができる他の構成成分には、その追加の剤が、意図された治療を果たす組成物の機能に悪影響を与えない限り、実質的に制限はない。
本発明の医薬組成物において、薬学的に許容される賦形剤及び担体液の配合は、当業者によく知られており、同様に、本明細書に記載される特定の組成物を様々な治療レジメンで使用するのに適した投薬及び治療レジメンの策定も当業者によく知られている。溶液は、配合されたら、剤形と適合した様式により、症状の改善または治癒をもたらす治療上有効な量で、投与される。製剤は、摂取可能な溶液、薬物放出カプセル剤などの様々な剤形で容易に投与される。用量については、治療がなされる対象の状態に応じて、いくらかの変動が生じ得る。いずれにせよ、投与を担当する者が個々の対象に適切な用量を決定することができる。更に、ヒトへの投与の場合、調製物は、FDA生物学的製剤評価研究センターが要求する、無菌性、一般的安全性及び純度の基準を満たすものである。投与経路は、通常、治療される疾患の位置及び性質によって変わり、例えば、皮内、経皮吸収、真皮下、非経口、経鼻、静脈内、筋肉内、鼻腔内、皮下、経皮、気管内、腹腔内、腫瘍内、灌流、洗浄、直接注射及び経口による投与が含まれ得る。
ある特定の状況では、例えば、米国特許第5,543,158号;米国特許第5,641,515号及び米国特許第5,399,363号(それぞれの全体を参照により本明細書に明示的に援用する)に記載されているように、本明細書で開示される組成物、組み換えウイルスベクター及び核酸分子を非経口、静脈内、筋肉内または更に腹腔内により送達するのが望ましいであろう。遊離塩基または薬理学的に許容される塩である活性化合物の溶液は、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性剤と適切に混合された水中で調製することができる。分散液はまた、グリセロール、液状ポリエチレングリコール及びこれらの混合物中、及び油中で調製することができる。これらの調製物は、通常の保存条件及び使用条件下で、微生物の発育を阻止するための保存剤を含有する。
注射用途に好適な医薬形態には、注入可能な滅菌溶液または滅菌分散液を即時調製するための滅菌水溶液または滅菌分散液及び滅菌粉末が含まれる(米国特許第5,466,468号;その全体を参照により本明細書に明示的に援用する)。全ての場合において、当該形態は、無菌でなければならず、容易に注射できる程度の流動性を有する必要がある。これは、製造及び保管の条件下で安定でなければならず、細菌及び真菌等の微生物の混入作用から保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール及び液状ポリエチレングリコールなど)、その好適な混合物及び/または植物油を含有する、溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤の使用によって、分散液の場合には必要とされる粒径の維持によって、また界面活性剤の使用によって、維持され得る。微生物作用の阻止は、種々の抗菌剤及び抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどによって促進することができる。多くの場合、等張剤、例えば、糖または塩化ナトリウムを含むことが好ましいであろう。注射可能な組成物の吸収の延長は、吸収を遅延させる作用物質、例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンの組成物中の使用によってもたらされ得る。タンパク質を有効成分として含有する水性組成物の調製は、当該技術分野においてよく理解されている。典型的に、このような組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかの注射剤として調製され、また、注射前に液体中に溶解または懸濁するのに好適な固体形態も調製することができる。調製物は、乳化することもできる。
水溶液での非経口投与の場合、例えば、溶液を必要に応じて好適に緩衝化する必要があり、最初に十分な生理食塩水またはグルコースで液体希釈剤を等張にする必要がある。これらの特定の水溶液は、静脈内、筋肉内、皮下及び腹腔内の投与に特に好適である。これに関して、採用することができる無菌水性媒体は、本開示に照らして、当業者に知られている。例えば、1用量を1mlのNaCl等張液中に溶解し、1000mlの皮下注射液に加えるか、予定注射部位に注射することができる(例えば、Remington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition.Baltimore,MD:Lippincott Williams&Wilkins,2000参照)。用量については、治療がなされる対象の状態に応じて、いくらかの変動が必然的に生じ得る。いずれにせよ、投与を担当する者が個々の対象に適切な用量を決定する。更に、ヒトへの投与の場合、調製物は、FDA生物学的製剤評価オフィスが要求する、無菌性、発熱性、一般的安全性及び純度の基準を満たす必要がある。
無菌注射用溶液は、上述の様々な他の成分とともに、活性化合物を必要な量で適切な溶媒中に組み込み、必要に応じて、その後濾過滅菌することにより調製することができる。一般に、分散液は、滅菌された様々な有効成分を、基本的な分散媒と、上記の成分のうち必要とされる他の成分とを含有する無菌ビヒクル中に組み込むことにより調製することができる。無菌注射用溶液の調製のための無菌粉末の場合、その調製の好ましい方法は、予め無菌濾過した溶液から有効成分と任意の所望の追加成分とを合わせた粉末が得られる、真空乾燥及び凍結乾燥技術である。
ある特定の実施形態において、組成物は、鼻腔内スプレー、吸入及び/または他のエアゾール送達ビヒクルによって送達され得る。経鼻エアゾールスプレーを介してポリヌクレオチド及びペプチド組成物を肺に直接送達するための方法は、例えば、米国特許第5,756,353号及び米国特許第5,804,212号(それぞれの全体を参照により本明細書に明示的に援用する)に記載されている。同様に、鼻腔内用微小粒子樹脂(Takenaga et al.,1998)及びリゾホスファチジル-グリセロール化合物(米国特許第5,725,871号;その全体を参照により本明細書に明示的に援用する)を使用した薬物の送達も薬学分野においてよく知られている。同様に、ポリテトラフルオロエチレン支持マトリックス形態での経粘膜による薬物送達は、米国特許第5,780,045号(その全体を参照により本明細書に明示的に援用する)に記載されている。
ある特定の実施形態において、送達は、本発明の組成物を好適な宿主細胞に導入するために、リポソーム、ナノカプセル、微粒子、ミクロスフェア、脂質粒子、小胞などを、任意選択によりCPPポリペプチドと混合して使用することによって行うことができる。特に、本発明の組成物は、脂質粒子、リポソーム、小胞、ナノスフェア、ナノ粒子などのいずれかに封入された状態での送達用に製剤化され得る。そのような送達ビヒクルの製剤化及び使用は、既知の従来技術を使用して実施することができる。本発明の製剤及び組成物は、単独または1つ以上の他の治療モダリティーとの組み合わせのいずれかで細胞または動物に投与するために、薬学的に許容される溶液または生理学的に許容される溶液(例えば、培養培地)中に配合された、本明細書に記載される1つ以上のポリペプチド、ポリヌクレオチド及び小分子を含み得る。所望であれば、本発明の組成物は、例えば、細胞、他のタンパク質もしくはポリペプチドまたは様々な薬学的活性剤などの他の剤と組み合わせて投与することができることも理解される。
特定の一実施形態において、本発明による製剤または組成物は、本明細書で企図される任意数のポリヌクレオチドまたはウイルスベクターの組み合わせと接触させた細胞を含む。
ある特定の態様において、本発明は、ウイルスベクター系を送達するのに好適な製剤または組成物を提供する。
ex vivo送達のための例示的な製剤は、当該技術分野において知られている様々なトランスフェクション剤(リン酸カルシウムなど)、エレクトロポレーション、熱ショック及び各種リポソーム製剤(すなわち、脂質媒介トランスフェクション)の使用も含み得る。リポソームは、水性流体の一部を閉じ込めた脂質二重層である。DNAは、カチオン性リポソームの外表面と自然に会合し(その電荷によって)、これらのリポソームは、細胞膜と相互作用する。
本発明の特定の実施形態は、薬学分野でよく知られているもの、例えば、Remington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition.Baltimore,MD:Lippincott Williams&Wilkins,2000に記載されているものなどの他の製剤を含み得る。
ある特定の態様において、本発明は、1つ以上の薬学的に許容される担体(添加剤)及び/または希釈剤(例えば、薬学的に許容される細胞培養培地)とともに配合された、本明細書に記載される治療上有効な量の1つ以上のウイルスベクターまたはポリヌクレオチドを含む、薬学的に許容される組成物を提供する。本明細書で使用されるとき、「治療上有効な量」は、所望の生理学的成果及び/または生物学的成果を達成するのに必要とされる、本明細書に記載される組成物または組み換えウイルスの量を指す。ウイルス、ウイルスストックまたは組成物の「治療上有効な量」は、個体の病態、年齢、性別及び体重、ならびに個体において所望の応答を誘導する幹細胞及び前駆細胞の能力などの因子に応じて変動し得る。治療上有効な量はまた、治療上有益な効果が、ウイルスまたは形質導入した治療細胞の任意の毒性または有害作用を上回るものでもある。「治療上有効な量」という用語は、対象(例えば、患者)を「治療する」のに有効な量を含む。治療上有効な量は、プラーク形成単位(pfu)の総数(例えば、少なくとも1e~少なくとも1e20、特に約1e~約1e15、より詳細には約1e~約1e12pfu)、またはウイルスゲノムの数(例えば、少なくとも1e~少なくとも1e20、特に約1e~約1e15、より詳細には約1e~約1e12ウイルスゲノム)によって定量することができる。当業者であれば、治療上有効な量が、投与されるウイルスの種類、製剤の性質、投与経路、治療される疾患の性質及び/もしくは重症度ならびに/または対象の全般的な健康状態及び満足状態に基づいて変動することを理解するであろう。
本発明のいくつかの態様は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルスまたはその組成物に対して、がん性細胞を、腫瘍溶解性ウイルスが当該がん性細胞に感染し、当該がん性細胞内で複製するのに十分な条件下で曝露することを含み、がん性細胞内における腫瘍溶解性ウイルスの複製が細胞死をもたらす、がん性細胞を殺傷する方法を包含する。ある特定の実施形態において、がん性細胞は、非がん性細胞と比較して、腫瘍抑制性miRの発現が低下している。いくつかの実施形態において、本方法によって殺傷されるがん性細胞は、in vivoである。ある特定の実施形態において、本方法によって殺傷されるがん性細胞は、腫瘍内にある。
本発明は、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルス、ウイルスストックまたは組成物の予防上有効な量または治療上有効な量を対象に投与することを含む、がんの治療を必要とする対象において、がんを治療する方法に関する。「対象」は、本明細書で使用されるとき、本明細書で開示される組み換えウイルスベクター、組成物及び方法で治療することができる疾患、障害または状態の症状を示す、任意の動物を含む。好適な対象(例えば、患者)には、実験動物(マウス、ラット、ウサギまたはモルモットなど)、家畜(ウマまたはウシなど)及び飼育動物またはペット(ネコまたはイヌなど)が含まれる。非ヒト霊長類及び好ましくはヒト患者が含まれる。
「投与」は、本明細書において、腫瘍溶解性ウイルス、ウイルスストックもしくはその組成物を対象に導入すること、または腫瘍溶解性ウイルス、ウイルスストックもしくはその組成物を細胞及び/もしくは組織と接触させることを指す。投与は、注射、灌注、吸入、摂取、電気浸透、血液透析、イオントフォレシス及び当該技術分野において知られている他の方法によって実施することができる。投与経路は、通常、治療される疾患の位置及び性質によって変わり、例えば、耳介、頬側、結膜、皮膚、歯、子宮頸管内、副鼻腔内、気管内、腸内、硬膜外、間質内、関節内、動脈内、腹内、耳介内、胆管内、気管支内、嚢内、海綿内、脳内、槽内、角膜内、歯冠内、冠動脈内、頭蓋内、皮内、脊髄内、腺管内、十二指腸内、十二指腸内、硬膜内、心外膜内、表皮内、食道内、胃内、歯肉内、肝内、回腸内、病巣内、舌内、管腔内、リンパ腺内、乳腺内、骨髄内、髄膜内、筋肉内、鼻腔内、節内、眼内、網内、卵巣内、腹腔内、心膜内、胸膜内、前立腺内、肺内、第一胃内、洞内、脊髄内、滑液嚢内、腱内、精巣内、気管内、髄腔内、胸郭内、小管内、腫瘍内、鼓室内、子宮内、腹腔内、脈管内、脳室内、膀胱内、前庭内、静脈内、硝子体内、喉頭部、経鼻、経鼻胃、経口、眼、口咽頭、非経口、経皮、関節周囲、硬膜外、神経周囲、歯周、呼吸器、尿細管後、直腸、脊髄、クモ膜下、結膜下、皮下、真皮下、歯肉下、舌下、粘膜下、網膜下、局所、経皮吸収、経心内膜、経粘膜、経胎盤、経気管、経鼓膜、尿管、尿道及び/または膣灌流、洗浄、直接注射ならびに経口による投与が挙げられる。
本明細書で使用される「治療すること」及び「治療」という用語は、対象の疾患もしくは状態、または疾患もしくは状態の症状が改善するように、本明細書に記載される組み換えウイルスまたはその組成物の治療上有効な量を対象に投与することを指す。改善は、疾患もしくは状態、または疾患もしくは状態の症状の任意の改善または治療である。改善は、観察可能または測定可能な改善であってもよいし、対象の全般的な満足感の改善であってもよい。したがって、当業者は、治療により疾患状態が改善し得るが、疾患の完全な治癒ではないことがあることを認識している。「予防上有効な量」は、所望の予防結果を達成するのに有効なウイルス、ウイルスストックまたは組成物の量を指す。本明細書で使用されるとき、「予防」は、疾患症状の完全な予防、疾患症状の発生遅延、または後続して発症する疾患症状の重症度の緩和を意味し得る。典型的であって、必ずしもそうではないが、予防上有効な量は、疾患の早期段階前または早期段階において対象に使用される予防用量であるので、治療上有効な量よりも少ない。
本明細書における「がん」は、無秩序な細胞成長を典型的に特徴とする、哺乳類の生理学的状態を指すか、当該状態を記述するものである。がんの例には、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫(脂肪肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、平滑筋肉腫、脊索腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮腫、横紋筋肉腫、線維肉腫、粘液肉腫、軟骨肉腫を含む)、神経内分泌腫瘍、中皮腫、滑膜腫、シュワン腫、髄膜腫、腺癌、黒色腫及び白血病またはリンパ系悪性腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。このようながんのより具体的な例には、扁平上皮細胞癌(例えば、扁平細胞上皮癌)、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌及び肺扁平上皮癌、小細胞肺癌を含む肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌を含む胃癌(gastric/stomach)、膵癌、膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝癌、膀胱癌、ヘパトーマ、乳癌、結腸癌、直腸癌、大腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺、腎癌(kidney/renal)、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝癌、肛門癌、陰茎癌、精巣癌、食道癌、胆道腫瘍、ユーイング腫瘍、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳頭状癌、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、ヘパトーマ、胆管癌、絨毛癌、精上皮腫、胎児性癌、ウィルムス腫瘍、精巣腫瘍、肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫、乏突起膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、ワルデンストレームマクログロブリン血症、骨髄異形成疾患、重鎖病、神経内分泌腫瘍、シュワン腫及び他の癌腫ならびに頭頸部癌が挙げられる。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される腫瘍溶解性ウイルス(例えば、HSV)、ウイルスストックまたは組成物は、肺癌(例えば、小細胞肺癌または非小細胞肺癌)、乳癌、卵巣癌、子宮頸癌、前立腺癌、精巣癌、大腸癌、結腸癌、膵癌、肝癌(例えば、肝細胞癌(HCC))、胃癌、頭頸部癌、甲状腺癌、悪性神経膠腫、膠芽腫、黒色腫、B細胞慢性リンパ球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)及び辺縁帯リンパ腫(MZL)から選択されるがんを治療するために使用される。
ある特定の態様において、本発明は、本明細書で開示される図面または実施形態のいずれか1つに示される腫瘍溶解性ウイルスベクターに関する。
以下の実施例は、本発明の各種実施形態を例示するためのものであり、いかなる形でも本発明を限定することを意味しない。本実施例は、本明細書に記載の方法も含め、例示的なものであり、本発明の範囲を限定する意図はない。特許請求の範囲によって定義される本発明の趣旨内に包含される、本記載の実施形態に対する改変、変形及び他の変更が具体的に企図される。
実施例1-正常細胞及び悪性細胞のmiR配列分析
miRの差次的発現は、多くのがんの特徴である(Lu et al,Nature,2005)。8つの異なるがん細胞株で概ね高度に差次的に発現されるmiRを決定するために実験を実施した。差次的発現は、非がん性対照組織との比較によって決定した。合計で108のサンプルについて配列決定を行った。サンプルの詳細を以下の表に示す。
Figure 0007174109000002
選択された細胞種でのHSV減衰に適した妥当なmiRNA標的配列の特定を容易にするために、がん系及び非がん対照組織のmiRNA配列プロファイリングを実施した。膀胱、結腸、乳房、膵臓、肺、頭頸部、シュワン腫、膠芽腫、脳、肝臓及び骨髄を含む、がん細胞及び非がん細胞について、ダイサー処理されたRNAのシーケンシングライブラリーを調製した。これらのmiRNAシーケンシングライブラリーを全RNAに対して正規化し、シーケンシングリード最大3eリード/ラン用HiSeq V4化学試薬により、HiSeq 2500超ハイスループットシーケンシングシステム(Illumina)を使用して、配列決定した。Basespace(Illumina)のmiRNA解析ツールを使用して、シーケンシングのランから得たFASTQファイルを解析した。正常の平均値、がんの平均値を算出し、正常とがんの比を上から下に並べ替えることによって、順位付けを行った。ゼロ及びゼロに変換した負の値を含む自然対数値を用いてヒートマップを作成した(スケール:黒色が高発現、白色が低発現)。サンプル全体にわたる正規化データは、所与のサンプルにおける正規化したmiRNA読み取り数として表した。正規化は、比較する他のサンプルを基準とした所与のサンプルの総読み取り数に関する。
図1は、25のmiRNAの非がん性脳組織及びがん性脳組織におけるmiRNA発現プロファイルヒートマップを例示する。非がん性及びがん性の膀胱(図2)、乳房(図3)、結腸(図4)、脳(図5)、頭頸部(図6)、肺(図7)、膵臓(図8)、及びシュワン腫(図9)組織について、各例において25のmiRNAに対応する、miRNA発現プロファイルヒートマップの更なる例を示す。図10は、miR-451aレベルが、非がん性組織と比較して、全ての腫瘍種で下方制御されることを示し、汎腫瘍抑制miRNAであることを表している。図11は、miR-1が、試験した全ての腫瘍種で下方制御され、非がん性組織で中程度のレベルで存在し、頭頸部組織では高レベルで存在することを示している。図12は、miR-559が、試験した全ての腫瘍種で下方制御され、非がん性組織で概ね低レベルで存在し、非がん性肺組織では高レベルで存在することを示している。図13は、miR-145-5pが、試験した全ての腫瘍種で下方制御され、試験した非がん性組織種の大部分で概ね高レベルで存在することを示している。図14は、miR-143-3pが結腸、肺及び膵臓の腫瘍で下方制御され、全ての正常組織種及びいくつかの乳房腫瘍株で高レベルで存在することを示している。miRNAデータ解析により、新規かつ予想外のmiRNA発現プロファイルを表す、少なくとも11のmiRNAが明らかになった。これらは、これまでの文献で特定されていないものである。
特定されたこれらのmiRNAの多くは、汎腫瘍特異性または多腫瘍特異性である。例えば、miR-451a、miR-559、miR-1、miR-145-3p及びmiR143-3pの発現は、対照組織と比較して、試験した全てのがん細胞株にわたって、概ね下方制御された。これは、特にmiR-451aに顕著であり、全ての正常組織種で高発現され、全てのがん種で実質的に下方制御されていることから、汎特異的腫瘍抑制性miRNAであることを表している。miR-559の発現は、正常肺組織を除く正常組織種で低く、正常組織におけるmiR-1及びmir-145-3pの発現は、様々であった。差の大きさ及び絶対発現レベルのばらつきにもかかわらず、がん細胞株の各miRの平均発現は、対応する正常組織のレベルと比較して、実質的に低かった。これらのmiRNAは、様々ながん種を広く治療することができる汎腫瘍HSVビリオンの作製候補である。
miR-451a、miR-559、miR-1、miR-145-3p及びmiR143-3pの平均発現は、正常対照と比較して、がん細胞株でより低いが、この発現低下は、全てのがん細胞株にわたって完全に一様ではなかった。例えば、試験した正常膀胱サンプルの2/3は、miR-145-3pの発現上昇を示したが、残りのサンプルにおける発現は、がん細胞株で観察された平均と実質的に同様であった。同様の結果が乳癌細胞株でも観察された。全ての乳癌サンプルの平均読み取り数は106であったが、12のサンプルのうち5つが1000を超える正規化読み取り数であり、そのうちの2つは、40,000を超える数値であった。
これらのデータは、広範な腫瘍種を治療の対象とすることができる単一のmiR減衰型腫瘍溶解性ウイルスを作製できる可能性を示している。例えば、miR-124、miR-451a、miR-559、miR-1及びmiR-145-3pに対する標的配列を含む構築物を、試験した全ての腫瘍種(例えば、膀胱、結腸、乳房、膵臓、肺、頭頸部、シュワン腫及び膠芽腫)の治療に使用することができる。種々のがん種におけるmiR発現レベルのばらつきは、miR発現によって、または更なるバイオマーカーの使用によって、患者を層化する必要性が存在し得ることを示している。
実施例2-miRNAによる遺伝子減衰を迅速にアッセイするためのレポーター系の構築及びその使用
実質的に任意のmiRNA標的配列と同種miRNAを使用したmiRNAによる遺伝子減衰を評価するために、レポーター系を開発した。この系において(図15に示す)、miRNA(すなわち、hsa-miR-122)によって認識される標的配列は、不安定化緑色蛍光タンパク質(dsGFP)の3’UTRに挿入した。更に、mCherryをmiRNA発現の対照として使用し、同種miRNAをテトラサイクリン(tet)誘導性プロモーターを介して発現させた。mCherryも発現するtet抑制性ベクターpcDNA5 Frt/Toに全ての発現ベクターをクローニングした(pTF002)。発現用miRNAは全て、ヒトゲノムDNAから遺伝子合成によって作製し、pTF002にクローニングした。減衰レポーター遺伝子ベクターを作製するために、dsGFPをcDNA3.1+にクローニングし、ベクターpTF004を作製した。減衰ベクターは、8~16ヌクレオチドで分離された、目的のmiRNA配列の逆相補鎖の4つのタンデムリピートを含有する。標準的な分子生物学技術を使用して、合成生成したオリゴヌクレオチドをpTF004のdsGFP遺伝子の3'UTRに挿入することによって、プラスミドを構築した。1日目に、Lipofectamine 2000を製造元のプロトコル(Invitrogen)に従って使用し、miRNA減衰及びレポーター遺伝子発現プラスミド(各0.15μg、合計0.3μgのCMVプロモーター含有プラスミド)をHEK293TetR細胞にトランスフェクトした。2日目に、テトラサイクリン5ng/mlで細胞を処理し、最大72時間インキュベートした。インキュベーション後、GFP及びmCherry蛍光シグナルをSpectraMax(登録商標)i3x Minimaxマルチモードマイクロプレートリーダー(Molecular Devices)を使用して毎日検出し、Softmax ProまたはMetamorphイメージングソフトウェア(Molecular Devices)を使用して解析した。露光5~6ms、GFP(541nmのチャンネル)露光10ms、及びmCherry(713nmのチャンネル)200~1500msで位相画像を取得した。
図16は、tetを介してmiR-122発現を誘導したときの、24時間におけるmiR-122媒介性GFP発現減衰を例示する。対照構築物miR-184、miR-34a及びLet7aは、GFPレベルを減衰せず、tetの不在下でもGFP減衰は観察されなかった。図17は、各miR標的配列を個々に、またmiR-122/Let7a、miR-122/Let7a/miR-34a、またはmiR-122/Let7a/miR-184のカセット組み合わせで使用した、miR-122、miR-184、miR-34a及びLet7aの発現とGFP減衰を示す。GFPの低下は、適切なmiRと同種の標的配列が一緒に存在するときにのみ観察される(円で囲んだウェル)。図18は、非減衰対照であり、miR-122、miR-184、miR-34a及びLet7aの発現とmCherryの発現を示す。
図19は、各標的配列を個々に使用した、miR-122、miR-124、miR-145、miR-199及びmiR-451の発現とGFP減衰を示す(円で囲んだウェル)。図20は、上記例の非減衰対照であり、各標的配列を個々に使用した、miR-122、miR-124、miR-145、miR-199及びmiR-451の発現とmCherryの発現を示す。図21は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-122またはmiR-184標的配列が存在するとき、miR-122及びmiR-184がGFP蛍光を減衰させることを示している。図22は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-34aまたはmiR-184標的配列が存在するとき、miR-34a及びmiR-184がGFP蛍光を減衰させることを示している。図23は、トランスフェクションから72時間後に、同種のLet-7aまたはmiR-184標的配列が存在するとき、Let-7a及びmiR-184がGFP蛍光を減衰させることを示している。図24は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-124またはmiR-184標的配列が存在するとき、miR-124及びmiR-184がGFP蛍光を減衰させることを示している。図25は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-124またはmiR-184標的配列が存在するとき、miR-124及びmiR-184がGFP蛍光を減衰させることを示している。図26は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-199またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-199及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。図27は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-125またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-125及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。図28は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-126またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-126及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。図29は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-127またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-127及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。図30は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-133またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-133及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。図31は、トランスフェクションから72時間後に、同種のmiR-223またはmiR-451標的配列が存在するとき、miR-223及びmiR-451がGFP蛍光を減衰させることを示している。
このように、これらのデータは、miR発現が、同種のmiR標的配列を発現する遺伝子の特異的減衰をもたらすことができることを示している。
実施例3-miRNA減衰型HSVの作製
miRNA標的配列と同種miRNAのペアに対するレポーター遺伝子による検証の後、miRNA減衰カセットを含有するHSV系ウイルスを作製した。細菌人工染色体(BAC)上のHSV-1 KOS株の完全長ゲノムクローンであるKOS-37 BACに一連の改変を記載されているように行った(Mazzacurati et al.,Mol Ther.,2015)。その産物であるKGBACは、ICP47遺伝子のプロモーターの他に、二倍体遺伝子ICP0、ICP34.5、LAT及びICP4のそれぞれを1コピー含有する内部反復(接合)領域を欠失したものである。この欠失により、欠失させた4遺伝子の残りのコピーに対する操作が容易になり、ウイルスの腫瘍溶解活性を向上させる導入遺伝子の導入を可能にするスペースが豊富に得られ、神経毒性因子ICP34.5の発現を低下させることによって腫瘍特異性が高まる。ICP47発現の排除は、ウイルス特異的T細胞による、感染したがん細胞の免疫認識に有益である。KGBACはまた、2Aペプチド配列を介して糖タンパク質C(gC)ORFに融合したGFPオープンリーディングフレーム(ORF)も含有し、後期(複製後)のウイルス遺伝子発現をモニタリングできるようにした。最後に、KGBACは、通常以外の受容体を介したHSV侵入の増強を示した、gB遺伝子の変異ペアを含有する。図32に示されるように、miRNA標的配列カセットを2A5B-MMP9のICP4及び/またはICP27遺伝子の3'UTRに組み換えて、ONCR-003、ONCR-010、ONCR-011、ONCR-012、ONCR-013、ONCR-014、ONCR-015、ONCR-016、ONCR-017、ONCR-018、ONCR-019、ONCR-020、ONCR-021及びONCR-022を作製した。Vero-Cre細胞のトランスフェクションによって、全てのBAC構築物をウイルス粒子に変換し、同時にloxP部位の間に位置するBAC配列を除去した。プラーク精製後、ウイルスストックを調製し、Vero細胞で力価を決定した。
実施例4-miRNA減衰型HSVを使用したウイルス感染力アッセイ
正常細胞及びがん性細胞におけるウイルスの感染力及び複製についてアッセイするために、miRNA減衰型HSV粒子を以下のin vitroアッセイで試験した。1日目に、各感染細胞種について、HSV粒子を導入して0.01の多重感染度(MOI)を達成した。2~5日目に、SpectraMax(登録商標)i3x Minimaxマルチモードマイクロプレートリーダー(Molecular Devices)を使用してGFPを検出することによってウイルス感染力をアッセイし、Softmax ProまたはMetamorphイメージングソフトウェア(Molecular Devices)を使用して解析した。あらゆる潜在的な非特異的自家蛍光シグナルを評価するために、露光5~6ms、GFP(541nmのチャンネル)露光10ms、及びmCherry(713nmのチャンネル)200~1500msを使用して位相画像を取得した。
ONCR-011複製は、図33(GFP陽性細胞定量による読み出し)及び図34(定量PCRによる読み出し)に示されるように、有糸分裂後の肺組織で大幅に減衰され、これは、ICP27遺伝子中にmiR-125カセットが存在することと、これらの細胞におけるmiR-125aのレベルが高い(3000個超)ことに起因する。ONCR-011及び対照ウイルスのONCR-003は、ICP4遺伝子中にmiR-124標的配列を含有するが、miR-124は低レベル(100個未満)で存在することから、ウイルス複製の減衰は不十分であった。ONCR-011及びONCR-003の両方は、頭頸部がん細胞(A253)で支障なく複製された。これは、これらの細胞がmiR-125a及びmiR-124の両方を低レベル(100個未満)で含むためである。ONCR-013複製は、図35(GFP陽性細胞定量による読み出し)及び図36(定量PCRによる読み出し)に示されるように、HCC1395細胞で大幅に減衰したが、A253細胞では減衰しなかった。ONCR-014複製は、図37(GFP陽性細胞定量による読み出し)及び図38(定量PCRによる読み出し)に示されるように、非がん性肺組織で大幅に減衰した。
実施例5-膵癌、肺癌または結腸癌に罹患している患者の治療
本明細書に開示される組成物及び方法を使用して、膵癌、肺癌または結腸癌に罹患している患者を治療する。図39~44に示されるように、1つ以上のmiRNA標的配列をUL19、ICP4、ICP27(または他のウイルス遺伝子)に組み込むことによって減衰化したHSV系ウイルスストックを作製することができる。いくつかの場合において、図45~46に示されるように、miRNA標的配列に加えて、腫瘍破壊及び/または微小環境リモデリングのためのゲノム編集能力をウイルスに操作する。具体例において、ICP4及びICP27に組み込まれたmiR-124、miR-451a、miR-143-3p及びmiR-559の減衰カセットを含有するHSV系ストックを、実施例3に記載の方法に従って作製する。miRNA標的配列カセットは、図47に示されるように、ICP4(miR-124)及びICP27(miR-451a、miR-143-3p、miR-559)遺伝子の3'UTRに導入される。Vero-Cre細胞のトランスフェクションによって、BAC構築物をウイルス粒子に変換し、同時にloxP部位の間に位置するBAC配列を除去する。プラーク精製後、ウイルスストックを更に精製し、緩衝液交換を行い、Vero細胞で力価を決定する。膵癌、肺癌または結腸癌に罹患している患者にin vivo投与する場合、HSV粒子を薬学的に許容される安定化剤とともにリン酸緩衝液(PBS)中で調製する。治療日に、薬学的に許容される担体(体積1.0mL)中の10個のベクターゲノムを腫瘍内注射によって投与する。標準治療手順を使用して、患者の具体的な予後に基づき、適切な時間間隔で腫瘍退縮について患者をモニタリングする。
実施例6-脳癌、膀胱癌、乳癌または頭頸部癌に罹患している患者の治療
本明細書に開示される組成物及び方法を使用して、脳癌、膀胱癌、乳癌または頭頸部癌に罹患している患者を治療する。miR-124、miR-451a、miR-145-3p及びmiR-559の減衰カセットを含有するHSV系ウイルスストックを実施例3に記載の方法に従って作製する。miRNA標的配列カセットは、図48に示されるように、ICP4(miR-124)及びICP27(miR-451a、miR-145-3p、miR-559)遺伝子の3'UTRに導入される。Vero-Cre細胞のトランスフェクションによって、BAC構築物をウイルス粒子に変換し、同時にloxP部位の間に位置するBAC配列を除去する。プラーク精製後、ウイルスストックを更に精製し、緩衝液交換を行い、Vero細胞で力価を決定する。脳癌、膀胱癌、乳癌または頭頸部癌に罹患している患者にin vivo投与する場合、HSV粒子を薬学的に許容される安定化剤とともにリン酸緩衝液(PBS)中で調製する。治療日に、薬学的に許容される担体(体積1.0mL)中の10個のベクターゲノムを腫瘍内注射によって投与する。標準治療手順を使用して、患者の具体的な予後に基づき、適切な時間間隔で腫瘍退縮について患者をモニタリングする。
実施例7-シュワン腫に罹患している患者の治療
本明細書に開示される組成物及び方法を使用して、シュワン腫に罹患している患者を治療する。miR-124-3p、miR-205-5p、miR-141-5p及びmiR-31-5pの減衰カセットを含有するHSV系ウイルスストックを実施例3に記載の方法に従って作製する。miRNA標的配列カセットは、図49に示されるように、ICP4(miR-124)及びICP27(miR-205-5p、miR-141-5p、miR-31-5p)遺伝子の3'UTRに組み換えられた。Vero-Cre細胞のトランスフェクションによって、BAC構築物をウイルス粒子に変換し、同時にloxP部位の間に位置するBAC配列を除去する。プラーク精製後、ウイルスストックを更に精製し、緩衝液交換を行い、Vero細胞で力価を決定した。シュワン腫に罹患している患者にin vivo投与する場合、HSV粒子を薬学的に許容される安定化剤とともにリン酸緩衝液(PBS)中で調製する。治療日に、薬学的に許容される担体(体積1.0mL)中の10個のベクターゲノムを腫瘍内注射によって投与する。標準治療手順を使用して、患者の具体的な予後に基づき、適切な時間間隔で腫瘍退縮について患者をモニタリングする。
本発明の好ましい実施形態を本明細書に示し、記載しているが、当該実施形態は、例としてのみ提供されることは、当業者には明らかであろう。当業者であれば、本発明を逸脱することなく、多数の変形形態、変更及び置換を実施することができる。本明細書に記載される本発明の実施形態に対する種々の代替手段が、本発明の実施において採用され得ることを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義し、特許請求の範囲内の方法及び構造ならびにそれらの等価物を包含することが意図される。
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Claims (19)

  1. 少なくとも2つの異なるmiR標的配列を含む組換え単純ヘルペスウイルス(HSV)であって、前記組換えHSVのゲノムのICP4遺伝子座が少なくとも1つのmiR-124標的配列を含み、前記組換えHSVゲノムのICP27遺伝子座が少なくとも1つのmiR標的配列を含、組換えHSV。
  2. 前記少なくとも1つのmiR-124標的配列が、前記ICP4遺伝子座の5’非翻訳領域(UTR)または3’UTRに組み込まれる、請求項1に記載の組換えHSV。
  3. つ以上のmiR-124標的配列が前記組換えHSVゲノムの前記ICP4遺伝子座に挿入される、
    請求項1または請求項2に記載の組換えHSV。
  4. 前記組換えHSVの複製が、第2の細胞における前記組換えHSVの複製と比較して、第1の細胞において減少または減衰し、前記第1の細胞が正常細胞であり、前記第2の細胞ががん性細胞である、請求項1~3のいずれか一項に記載の組換えHSV。
  5. 前記第2の細胞におけるmiR-124の内因性発現が、前記第1の細胞におけるmiR-124の内因性発現と比較して減少する、請求項4に記載の組換えHSV。
  6. 前記第1の細胞における前記組換えHSVの複製が、前記第2の細胞における前記組換えHSVの複製と比較して、少なくとも50%減少する、請求項5に記載の組換えHSV。
  7. 前記がん性細胞のがんが、大腸癌、膵癌、乳癌、肝癌、口腔癌、卵巣癌、前立腺癌、脳癌
    、子宮頸癌および肺癌からなる群から選択される、請求項4~6のいずれか一項に記載の組換えHSV。
  8. (i)少なくとも1つの追加のmiR標的配列が前記ICP4遺伝子座に組み込まれ、前記追加のmiR標的配列が、前記miR-124標的配列以外の配列である;または
    (ii)少なくとも1つのmiR-122標的配列が前記ICP27遺伝子座に組み込まれる、
    請求項1~7のいずれか一項に記載の組換えHSV。
  9. サイトカインおよび抗免疫抑制タンパク質から選択されるタンパク質をコードする非相同ポリヌクレオチド配列をさらに含む、請求項1~8のいずれか一項に記載の組換えHSV。
  10. 前記サイトカインがIL-12であり、前記抗免疫抑制タンパク質が、抗PD1タンパク質および抗CTLA4タンパク質から選択される、請求項9に記載の組換えHSV。
  11. 前記非相同ポリヌクレオチド配列が、UL3とUL4オープンリーディングフレームの間の前記組換えHSVゲノムに挿入される、請求項9または請求項10に記載の組換えHSV。
  12. 内部接合領域に、ICP0、ICP34.5、LATおよびICP4遺伝子のそれぞれの1コピーの欠失をさらに含む、請求項1~11のいずれか一項に記載の組換えHSV。
  13. 請求項1~12のいずれか一項に記載の組換えHSVをコードする核酸分子。
  14. 請求項1~12のいずれかに記載の組換えHSVを含むウイルスストック。
  15. 請求項1~12のいずれかに記載の組換えHSVと、薬学的に許容される担体とを含む、組成物。
  16. 医薬として使用するための、請求項1~12のいずれかに記載の組換えHSVを含む組成物または請求項15に記載の組成物。
  17. がんの治療または予防における使用のための、請求項1~12のいずれかに記載の組換えHSVを含む組成物または請求項15に記載の組成物。
  18. がんの治療または予防における使用のための、請求項8に記載の組換えHSVを含む組成物であって、
    (i)前記治療または予防が、がん性細胞を、前記組換えHSVが前記がん性細胞に感染し、当該がん性細胞内で複製するのに十分な条件に曝露することを含み、前記がん性細胞内での前記組換えHSVの複製が細胞死をもたらすか;あるいは
    (ii)対象がマウスまたはヒトであるか;あるいは
    (iii)前記組成物が、静脈内、皮下、腫瘍内、または筋肉内投与されるか;あるいは(iv)前記がんが、肺癌、乳癌、卵巣癌、子宮頸癌、前立腺癌、精巣癌、大腸癌、結腸癌、膵癌、肝癌、胃癌、頭頸部癌、甲状腺癌、悪性神経膠腫、膠芽腫、黒色腫、B細胞慢性リンパ球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)および辺縁帯リンパ腫(MZL)から選択される、
    組成物。
  19. 請求項17に記載の使用のための組成物であって、
    (i)前記治療または予防が、がん性細胞を、前記組換えHSVが前記がん性細胞に感染し、当該がん性細胞内で複製するのに十分な条件に曝露することを含み、前記がん性細胞内での前記組換えHSVの複製が細胞死をもたらすか;あるいは
    (ii)対象がマウスまたはヒトであるか;あるいは
    (iii)前記組成物が、静脈内、皮下、腫瘍内、または筋肉内投与されるか;あるいは(iv)前記組成物が、大腸癌、膵癌、乳癌、肝癌、口腔癌、卵巣癌、前立腺癌、脳癌、子宮頸癌および肺癌から選択される、
    組成物。
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Families Citing this family (43)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108884448B (zh) 2016-01-27 2022-12-30 昂克诺斯公司 溶瘤病毒载体及其用途
AU2017290828A1 (en) 2016-06-30 2019-01-24 Virogin Biotech Canada Ltd Pseudotyped oncolytic viral delivery of therapeutic polypeptides
US10682425B2 (en) * 2016-12-14 2020-06-16 The Regents Of The University Of California Engineered B lymphocytes and compositions having micro-RNA and methods for making and using them
EP3594329A4 (en) * 2017-04-19 2021-02-24 The University Of Tokyo GENETICALLY MODIFIED COXSACKIE VIRUS, AND PHARMACEUTICAL COMPOSITION
CN110546263B (zh) * 2017-04-28 2024-03-05 东丽株式会社 用于检测卵巢肿瘤的试剂盒、装置和方法
EP3658165A4 (en) * 2017-07-26 2021-09-01 Oncorus, Inc. ONCOLYTIC VIRUS VECTORS AND USES THEREOF
GB201714430D0 (en) * 2017-09-07 2017-10-25 Micol Romain Compositions and processes for targeted delivery and expression and modulation of therapeutic components in tissue
CN111065732A (zh) 2017-09-11 2020-04-24 Imba-莫利库尔生物技术研究所 肿瘤类器官模型
TWI666321B (zh) * 2017-10-23 2019-07-21 大陸商深圳市亦諾微醫藥科技有限公司 用於癌症治療的溶瘤性單純皰疹病毒(oHSV)專性載體及其建構體的建構
CN107723367A (zh) * 2017-10-27 2018-02-23 青岛大学 miRNA‑885‑3p的应用和应用其的产品
CN107674918A (zh) * 2017-11-10 2018-02-09 上海交通大学医学院 has‑mir‑195‑5p作为生物标志物在制备肺癌诊断试剂盒中的应用
WO2019133847A1 (en) 2017-12-29 2019-07-04 Oncorus, Inc. Oncolytic viral delivery of therapeutic polypeptides
EP3755344A1 (en) 2018-02-19 2020-12-30 Combined Therapeutics, Inc. Compositions and methods for organ-protective expression and modulation of coding ribonucleic acids
CA3096938A1 (en) 2018-04-10 2019-10-17 Ottawa Hospital Research Institute Microrna-based compositions and methods used in disease treatment
MA52542A (fr) * 2018-04-13 2021-02-24 Bluebird Bio Inc Thérapie cellulaire adoptive
CN108707625B (zh) * 2018-07-03 2021-09-21 云笛生物科技有限公司 mir-124和HER2-shRNA双基因表达盒病毒载体、构建方法、病毒、应用
CN109091492A (zh) * 2018-08-02 2018-12-28 广州安镝声生物医药科技有限公司 lncRNA H19的靶miRNA miR-106b-5p及其应用
CN109091491A (zh) * 2018-08-02 2018-12-28 广州安镝声生物医药科技有限公司 lncRNA H19的靶miRNA miR19a-3p及其应用
CN111117973A (zh) * 2018-10-30 2020-05-08 中国科学院武汉病毒研究所 一种受microRNA调控的重组溶瘤肠道病毒71型及应用
WO2020102285A1 (en) * 2018-11-13 2020-05-22 Oncorus, Inc. Encapsulated polynucleotides and methods of use
TWI690597B (zh) * 2018-11-14 2020-04-11 國立中央大學 泌尿上皮癌的檢測套組及檢測方法
KR20210098483A (ko) * 2018-11-29 2021-08-10 바이로진 바이오테크 캐나다 리미티드 신경독성이 감소된 hsv 벡터
KR20200069259A (ko) * 2018-12-06 2020-06-16 국립암센터 nc886을 포함하는 암살상 바이러스 활성 증진 또는 생산 증진용 조성물
CN113453699A (zh) * 2019-01-04 2021-09-28 昂克诺斯公司 包封的rna多核苷酸及使用方法
CN109762903B (zh) * 2019-01-31 2022-02-01 山东大学齐鲁医院 miR-1246和/或TERF2IP在诊治胶质瘤中的应用
CN110283794B (zh) * 2019-05-30 2021-04-23 伍泽堂 重组溶瘤病毒以及制备方法、应用和药物
CN112011570B (zh) * 2019-05-31 2023-04-18 北京合生基因科技有限公司 特异杀伤肿瘤细胞的溶瘤病毒系统及其应用
JP2022541197A (ja) * 2019-07-16 2022-09-22 ユニヴェルシテ・コート・ダジュール 腫瘍溶解性ウイルスに対する対象の感受性又は抵抗性を評価する方法、組換えウイルス、その調製、及び使用
CA3150053A1 (en) * 2019-08-05 2021-02-11 Virogin Biotech Canada Ltd Genetically modified enterovirus vectors
CN110468132B (zh) * 2019-08-15 2022-11-25 西南大学 一种sgRNA及转基因表达载体、表达品系、筛选方法
CN110433171B (zh) * 2019-08-20 2022-08-19 中山大学附属第六医院 miRNA-1293在制备抗结直肠肿瘤药物中的应用
US20220380735A1 (en) 2019-10-10 2022-12-01 Oncorus, Inc. Dual viruses and dual oncolytic viruses and methods of treatment
KR102320430B1 (ko) * 2020-01-29 2021-11-03 서울대학교병원 수모세포종에 대한 miR-135b, miR-135a 및 이들의 표적 유전자 AMOTL2의 용도
CA3179339A1 (en) * 2020-04-14 2021-10-21 Eidgenossische Technische Hochschule Zurich Cell classifier circuits and methods of use thereof
CN113583977A (zh) * 2020-04-30 2021-11-02 杭州康万达医药科技有限公司 可受微小rna调控的分离的重组溶瘤痘病毒及其应用
CN115066261A (zh) * 2020-06-05 2022-09-16 上海宝济药业有限公司 一种酶和病毒的药物组合及其应用
BR112023001563A2 (pt) 2020-07-31 2023-10-10 Combined Therapeutics Inc Composições e métodos para vacinação melhorada
WO2022100898A1 (en) * 2020-11-13 2022-05-19 Technische Universität Berlin Mir-375- and mir-1-regulated coxsackievirus b3 has no pancreas and heart toxicity but strong antitumor efficiency in colorectal carcinomas
CN116744951A (zh) * 2020-12-25 2023-09-12 苏州系统医学研究所 一种包含溶瘤病毒的组合物及其在肿瘤治疗中的应用
WO2023034867A1 (en) * 2021-08-31 2023-03-09 Oncorus, Inc. Engineered oncolytic herpesviruses
CN113637761A (zh) * 2021-10-15 2021-11-12 北京百奥思科生物医学技术有限公司 用于黑色素瘤诊断和治疗的miRNA标志物及其相关产品
WO2023142040A1 (en) * 2022-01-29 2023-08-03 Virogin Biotech Canada Ltd. Transcriptional and translational dual regulated oncolytic herpes simplex virus vectors
CN115381849A (zh) * 2022-06-27 2022-11-25 浙江大学 抗口腔肿瘤药物活性成分及其用途

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015066042A1 (en) 2013-10-28 2015-05-07 University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education Oncolytic hsv vector

Family Cites Families (90)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5244792A (en) 1984-04-06 1993-09-14 Chiron Corporation Expression of recombinant glyoprotein B from herpes simplex virus
JPH0668B2 (ja) 1985-08-30 1994-01-05 財団法人化学及血清療法研究所 単純ヘルペスウイルス遺伝子が組込まれた組換えプラスミド
GB8918616D0 (en) 1989-08-15 1989-09-27 Univ Glasgow Herpes simplex virus type 1 mutant
US5725871A (en) 1989-08-18 1998-03-10 Danbiosyst Uk Limited Drug delivery compositions comprising lysophosphoglycerolipid
US5707644A (en) 1989-11-04 1998-01-13 Danbiosyst Uk Limited Small particle compositions for intranasal drug delivery
US5466468A (en) 1990-04-03 1995-11-14 Ciba-Geigy Corporation Parenterally administrable liposome formulation comprising synthetic lipids
US5849571A (en) 1990-10-10 1998-12-15 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Latency active herpes virus promoters and their use
US5849572A (en) 1990-10-10 1998-12-15 Regents Of The University Of Michigan HSV-1 vector containing a lat promoter
US5399363A (en) 1991-01-25 1995-03-21 Eastman Kodak Company Surface modified anticancer nanoparticles
US5756353A (en) 1991-12-17 1998-05-26 The Regents Of The University Of California Expression of cloned genes in the lung by aerosol-and liposome-based delivery
WO1993023011A1 (en) 1992-05-18 1993-11-25 Minnesota Mining And Manufacturing Company Transmucosal drug delivery device
US5879934A (en) 1992-07-31 1999-03-09 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Herpes simplex virus strains for gene transfer
US5804413A (en) 1992-07-31 1998-09-08 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Herpes simplex virus strains for gene transfer
US5658724A (en) 1992-07-31 1997-08-19 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Herpes simplex virus strains deficient for the essential immediate early genes ICP4 and ICP27 and methods for their production, growth and use
US5543158A (en) 1993-07-23 1996-08-06 Massachusetts Institute Of Technology Biodegradable injectable nanoparticles
GB9415319D0 (en) 1994-07-29 1994-09-21 Medical Res Council HSV viral vector
GB9415369D0 (en) 1994-07-29 1994-09-21 Lynxvale Ltd Mutant virus
IE80468B1 (en) 1995-04-04 1998-07-29 Elan Corp Plc Controlled release biodegradable nanoparticles containing insulin
US6261552B1 (en) 1997-05-22 2001-07-17 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Herpes simplex virus vectors
GB9700411D0 (en) 1997-01-10 1997-02-26 Univ London Eukaryotic gene expression cassette and uses thereof
US6071742A (en) 1997-03-05 2000-06-06 Board Of Regents Of The University Of Nebraska Coxsackie virus as a vector for delivery of anti-inflammatory cytokines
US5998174A (en) 1997-05-12 1999-12-07 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Multigene vectors
WO1999006583A1 (en) 1997-07-31 1999-02-11 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Targeted hsv vectors
ES2251120T3 (es) 1997-12-17 2006-04-16 Immunex Corporation Glicoproteinas de superficie celular asociadas a los linfomas b humanos-ulbp, adn y polipeptidos.
EP1002864A1 (en) 1998-11-10 2000-05-24 Universita' degli studi di Bologna HIgR and related V domain for the manufacture of a medicament for preventing or treating HSV-1, HSV-2 and BHV infections
US6897057B1 (en) 1999-08-31 2005-05-24 The General Hospital Corporation Cell-specific and/or tumor-specific promoter retargeting of herpes γ 34.5 gene expression
GB9930418D0 (en) 1999-12-22 2000-02-16 Neurovex Ltd Replication incompetent herpes virus vectors
WO2002076216A1 (en) 2001-03-27 2002-10-03 Medigene, Inc. Viral vectors and their use in therapeutic methods
WO2002088327A1 (en) 2001-04-06 2002-11-07 Mount Sinai School Of Medicine Of New York University Methods for viral oncoapoptosis in cancer therapy
CA2462790A1 (en) 2001-10-04 2003-04-10 Immunex Corporation Ul16 binding protein 4
KR100900249B1 (ko) 2001-12-07 2009-05-29 포항공과대학교 산학협력단 SIVmac239의 면역원성 플라스미드 및 이들을 함유한AIDS DNA 백신
US8927251B2 (en) 2002-10-07 2015-01-06 The University Of Chicago Targeting of herpes simplex virus to specific receptors
GB0406389D0 (en) 2004-03-22 2004-04-21 Istituto Superiore Di Sanito Recombinant herpes simplex virus and uses therefor
US7473418B2 (en) 2004-03-25 2009-01-06 Cell Genesys, Inc. Pan cancer oncolytic vectors and methods of use thereof
EP1793851B1 (en) 2004-08-20 2016-10-05 Viralytics Limited Methods and compositions for treatment of hematologic cancers
WO2006050211A2 (en) 2004-10-28 2006-05-11 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Peripherally delivered glutamic acid decarboxylase gene therapy for spinal cord injury pain
CN101132798B (zh) 2005-01-17 2011-04-27 溶瘤病毒有限公司 核酸分子在制备用于治疗黑色素瘤的药物中的应用及其组合物
KR20130114758A (ko) 2005-05-27 2013-10-17 오스페달레 산 라파엘 에스.알.엘. Mi-rna를 포함하는 유전자 벡터
DK2336362T3 (en) 2005-08-26 2019-01-21 Dupont Nutrition Biosci Aps USE OF CRISPR-ASSOCIATED GENES (CAS)
US8980246B2 (en) 2005-09-07 2015-03-17 Sillajen Biotherapeutics, Inc. Oncolytic vaccinia virus cancer therapy
US20080008686A1 (en) 2006-07-10 2008-01-10 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Tetracycline repressor regulated oncolytic viruses
PL2049663T3 (pl) 2006-08-11 2015-08-31 Dow Agrosciences Llc Homologiczna rekombinacja za pośrednictwem nukleazy z palcami cynkowymi
US20100111873A1 (en) 2007-02-20 2010-05-06 Russell Stephen J Treating cancer with viral nucleic acid
CA2687301C (en) 2007-05-09 2016-08-23 Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultural And Mechanical College Synthetic herpes simplex viruses type-1 for treatment of cancers
US20080289058A1 (en) 2007-05-14 2008-11-20 University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education Targeted delivery of glycine receptors to excitable cells
WO2009111892A1 (en) 2008-03-14 2009-09-17 Ottawa Health Research Institute Microrna mediated oncolytic targeting
US8703120B2 (en) 2008-05-29 2014-04-22 The General Hospital Corporation Use of oncolytic herpes viruses for killing cancer stem cells
ES2667622T3 (es) 2008-05-29 2018-05-11 Alma Mater Studiorum - Università di Bologna Virus del herpes simple (VHS) con tropismo modificado, utilizaciones y procedimiento de preparación del mismo
GB0810912D0 (en) 2008-06-13 2008-07-23 Inst Animal Health Ltd Vector
US8546553B2 (en) 2008-07-25 2013-10-01 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Prokaryotic RNAi-like system and methods of use
US20100076057A1 (en) 2008-09-23 2010-03-25 Northwestern University TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA
WO2010054108A2 (en) 2008-11-06 2010-05-14 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Cas6 polypeptides and methods of use
MX337838B (es) 2008-11-07 2016-03-22 Dupont Nutrition Biosci Aps Secuencias de repetidos palindromicos cortos regularmente intercalados agrupados de bifidobacterias.
CA2755245A1 (en) 2009-03-13 2010-09-16 Egen, Inc. Compositions and methods for the delivery of biologically active rnas
US20100297072A1 (en) 2009-05-19 2010-11-25 Depinho Ronald A Combinations of Immunostimulatory Agents, Oncolytic Virus, and Additional Anticancer Therapy
WO2011125469A1 (ja) 2010-04-09 2011-10-13 国立大学法人東京大学 マイクロrna制御組換えワクシニアウイルス及びその使用
WO2011130749A2 (en) 2010-04-16 2011-10-20 University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education Identification of mutations in herpes simplex virus envelope glycoproteins that enable or enhance vector retargeting to novel non-hsv receptors
WO2012006181A2 (en) 2010-06-29 2012-01-12 Mount Sinai School Of Medicine Compositions and methods for inhibiting oncogenic micrornas and treatment of cancer
EP2630156B1 (en) 2010-10-20 2018-08-22 DuPont Nutrition Biosciences ApS Lactococcus crispr-cas sequences
CA2834375C (en) 2011-04-27 2020-07-14 Amyris, Inc. Methods for genomic modification
WO2012164565A1 (en) 2011-06-01 2012-12-06 Yeda Research And Development Co. Ltd. Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes
PL3351261T3 (pl) 2011-10-11 2021-12-06 Universität Zürich Lek złożony zawierający IL-12 i środek do blokowania cząsteczek hamujących komórki T w terapii nowotworów
US11951157B2 (en) 2011-10-11 2024-04-09 Universitat Zurich Methods of treating malignant tumour with IL-12 and anti-PD-1 antibody
EP2591796A1 (en) 2011-11-10 2013-05-15 Universität Zürich Combination medicament comprising IL-12 and an anti-CTLA-4 ligand for tumor therapy
US20130156808A1 (en) 2011-11-22 2013-06-20 Stipan Jonjic Vaccine comprising beta-herpesvirus
GB201122458D0 (en) 2011-12-30 2012-02-08 Univ Wageningen Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof
US20140363469A1 (en) * 2012-01-19 2014-12-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Viral attenuation and vaccine production
EP3272356A1 (en) 2012-02-24 2018-01-24 Fred Hutchinson Cancer Research Center Compositions and methods for the treatment of hemoglobinopathies
US9637739B2 (en) 2012-03-20 2017-05-02 Vilnius University RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex
WO2013141680A1 (en) 2012-03-20 2013-09-26 Vilnius University RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX
JP6605957B2 (ja) 2013-01-04 2019-11-13 シトムクス セラピューティクス,インコーポレイティド 生体系におけるプロテアーゼ活性を検出するための組成物及び方法
EP3011034B1 (en) 2013-06-17 2019-08-07 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components
US10174341B2 (en) 2013-07-17 2019-01-08 University of Pittsburgh—of the Commonwealth System of Higher Education Non-toxic HSV vectors for efficient gene delivery applications and complementing cells for their production
SG11201607130RA (en) 2014-02-27 2016-09-29 Viralytics Ltd Combination method for treatment of cancer
PL3169341T3 (pl) 2014-07-16 2019-12-31 Transgene Sa Wirus onkolityczny do ekspresji modulatorów punktu kontroli immunologicznej
WO2016141320A2 (en) 2015-03-05 2016-09-09 Northwestern University Non-neuroinvasive viruses and uses thereof
US10083137B2 (en) 2015-04-02 2018-09-25 Atmel Corporation Peripheral interface circuit for serial memory
EP3365062A4 (en) 2015-10-19 2019-07-17 Cold Genesys, Inc. METHODS OF TREATING SOLID OR LYMPHATIC TUMORS BY POLYTHERAPY
SG11201805835WA (en) 2016-01-08 2018-08-30 Replimune Ltd Modified oncolytic virus
CN108884448B (zh) 2016-01-27 2022-12-30 昂克诺斯公司 溶瘤病毒载体及其用途
EP3426271A4 (en) 2016-03-10 2019-10-16 Cold Genesys, Inc. METHODS OF TREATING SOLID OR LYMPHATIC TUMORS BY POLYTHERAPY
AU2016403583B2 (en) 2016-04-22 2020-05-28 Immvira Co., Limited Construction of oncolytic herpes simplex viruses (oHSV) obligate vector and constructs for cancer therapy
JP7200104B2 (ja) 2016-08-01 2023-01-06 ヴァイロジン バイオテック カナダ リミテッド 免疫系刺激分子を発現する腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルスベクター
CA3033613A1 (en) 2016-08-09 2018-02-15 Almohanad ALKAYYAL Oncolytic rhabdovirus expressing il12
WO2018049261A1 (en) 2016-09-09 2018-03-15 Icellhealth Consulting Llc Oncolytic virus expressing immune checkpoint modulators
WO2018085461A1 (en) 2016-11-01 2018-05-11 Dnatrix, Inc. Combination therapy for treatment of brain cancers
US11298420B2 (en) 2016-12-21 2022-04-12 Memgen, Llc Armed oncolytic viruses
EP3565578A1 (en) 2016-12-21 2019-11-13 Memgen LLC Armed replication-competent oncolytic adenoviruses
GB201700350D0 (en) 2017-01-09 2017-02-22 Replimune Ltd Altered virus
EP3658165A4 (en) 2017-07-26 2021-09-01 Oncorus, Inc. ONCOLYTIC VIRUS VECTORS AND USES THEREOF

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015066042A1 (en) 2013-10-28 2015-05-07 University Of Pittsburgh - Of The Commonwealth System Of Higher Education Oncolytic hsv vector

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Virology Journal,2013年,vol.10, article:241

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BR112018015390A2 (pt) 2018-12-18
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