JP7200104B2 - 免疫系刺激分子を発現する腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルスベクター - Google Patents

免疫系刺激分子を発現する腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルスベクター Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本特許出願は、2016年8月1日出願の米国仮特許出願第62/369,646号の、米国特許法第119条(e)項の下での利益を請求し、この仮特許出願は、すべての目的のためにその全体がこの参照により本明細書の開示に含まれる。
本発明は概して、免疫系を刺激する分子を発現する腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス(oHSV)ベクターに関する。
腫瘍溶解性ウイルス(OV)は、ウイルス溶解性複製の経過による癌細胞溶解を特徴とする殺滅機序である腫瘍溶解を通して癌細胞を特異的に破壊する治療兵器である。このウイルスによる直接的な細胞殺滅に加えて。種々のOVのうち、単純ヘルペスウイルス1型(「HSV-1」)系OVが、最も進歩しており、例えば、ヘルペスウイルス系OV(T-Vec)が、黒色腫の治療のために米国食品医薬品局によって承認されている。HSVベクターの代表的な例としては、米国特許第7,223,593号、第7,537,924号、第7,063,835号、第7,063,851号、第7,118,755号、第8,277,818号、および第8,680,068号に説明されているHSVベクターが挙げられる。
本発明は、現行の商用腫瘍溶解性ウイルスの短所を克服し、追加の予期せぬ利益をさらに提供する。
簡潔に述べると、本開示は、IL12、IL15および/またはIL受容体15アルファサブユニットのうちの1つ以上についての発現カセットを含むHSVベクターに関する。一実施形態内で、発現カセットは、IL12、IL15およびIL受容体15アルファサブユニットの全部を発現する。好ましい実施形態内で、発現カセットは、マウスまたはヒトIL12、マウスまたはヒトIL15、およびマウスまたはヒトIL15受容体アルファサブユニットを発現する。さらに他の実施形態内で、発現カセットは、マウスまたはヒトIL12、hIL15、ならびにマウスおよびh15受容体アルファサブユニットを発現する。
一実施形態内で、発現カセットは、IL12、IL15およびIL受容体15アルファサブユニットの全部を発現する。一実施形態内で、発現カセットは、mIL12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットを含む。他の実施形態内で、発現カセットは、hIL12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットを含む。ある特定の実施形態において、自己開裂性2Aペプチドをコードする核酸配列は、mIL12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットについてのコード配列間でインフレームに位置する。他の実施形態において、HSVベクターは、自己開裂性2Aペプチドをコードする。他の実施形態において、1つ以上のIRES配列は、マウスまたはヒトIL12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットについてのコード配列間に位置する。実施形態において、hIL15およびhIL15受容体アルファサブユニットは、IRES配列を用いて共発現し、ある特定の実施形態において、hIL15およびhIL15受容体アルファサブユニットは、二方向プロモーターによって発現させられる。この二方向プロモーターは、いくつかの実施形態において二方向CMVであってもよい。さらに他の実施形態において、hIL15およびhIL15受容体アルファサブユニットのそれぞれに、Lys5またはGlu5をコードする核酸配列が後続する。ある特定の実施形態において、hIL15受容体アルファサブユニットは、バリアント1、バリアント2、バリアント3およびバリアント4からなる群より選択される。
ベクターは、1つ以上のPD-L1ブロッキングペプチドについての発現カセットをさらに含み得、複数のPD-L1ブロッキングペプチド間にあるペプチドリンカーまたは1つ以上のIRES配列(またはこれらの両方)をコードする配列をさらに含み得る。いくつかの実施形態において、HSVベクターは、PD-L1ブロッキングペプチドの3’末端へ連結したFcドメインをコードする配列をさらに含み得る。さらに他の実施形態において、PD-L1ブロッキングペプチドは、UL3ウイルス遺伝子とUL4ウイルス遺伝子との間に挿入される。
ある特定の実施形態において、発現カセットは、HSVゲノムの末端反復領域に挿入される。実施形態において、HSVベクターは、ICP4またはICP27調節領域においてNFκBおよびOCT4/SOX2増強要素をさらに含む。HSVベクターは、ICP34.5遺伝子の欠失を有し得る。他の実施形態において、ICP34.5遺伝子は、腫瘍細胞において過少発現するmiRNAの標的配列を含有する3’UTRによって調節される。
発現カセットは、少なくとも1つの二方向CMVプロモーターを含み得る。発現カセットは、少なくとも1つの細胞プロモーターを含み得る。
いくつかの実施形態において、mIL12/hIL15/hIL15受容体アルファサブユニットについての発現カセットは、元のウイルス配列がカセットによって置き換えられた末端反復領域に挿入される。
HSVベクターは、HSV-1またはHSV-2のいずれかであり得る。
この発明の概要は、後述の発明を実施するための形態においてさらに詳述される簡素化された形態のある特定の概念を紹介するために提供されている。別段の明らかな記載がない限り、この発明の概要は、請求される対象の鍵となるまたは必須の特長を特定するよう意図するものではなく、請求される対象の範囲を制限するよう意図するものでもない。
1つ以上の実施形態の詳細は、後述の発明を実施するための形態において明らかにされる。1つの例示的な実施形態と関連して例証され説明される特長は、他の実施形態の特長と組み合わされ得る。したがって、本明細書に説明する種々の実施形態のいかなるものも、さらなる実施形態を提供するために組み合わされることができる。実施形態の態様は、本明細書で特定されるような種々の特許、出願および公開物の概念を採用することが必要な場合、なおもさらなる実施形態を提供するよう改変することができる。他の特長、目的および利点は、本発明の明細書、図面、および特許請求の範囲から明らかとなるであろう。
本開示の例示的な特長、本開示の性質および種々の利点は、種々の実施形態の添付の図面および後述の発明を実施するための形態から明らかであろう。非限定的および非網羅的な実施形態が添付の図面に関して説明されており、この中で類似の標識または参照番号は、別段の指定がない限り、種々の見解のいたるところにある類似の部分を指す。図面における要素の大きさおよび相対的な位置は、必ずしも尺度通りに描かれていない。例えば、種々の要素の形状は、図面のレジビリティを改善するよう選択、拡大、および配置される。描かれている要素の詳細な形状は、図面における認識を容易にするために選択されている。1つ以上の実施形態は、添付の図面に関して後述される。
例示的なoHSVベクターの概略図である。 ウイルスhVG161について改変されたICP34.5領域(配列番号572)の概略図を示す。 ウイルスhVG161について改変されたUL54プロモーター領域(配列番号573)の概略図を示す。 PD-L1ブロッカーが挿入されたhVG161ウイルスゲノム(配列番号574)の概略図を示す。 hVG161で改変したTR領域(配列番号575)の概略図を示す。 細胞のhVG161感染後のIL-12発現についてのELISAおよびウェスタンブロットのデータを示す。 細胞のhVG161感染後のIL-15発現についてのELISAおよびウェスタンブロットのデータを示す。 細胞のhVG161感染後のIgG4発現についてのELISAおよびウェスタンブロットのデータを示す。 (A)二方向CMVプロモーターがIL-15RαおよびIL-15のSushiドメインの発現を駆動する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~C)DNA配列および概略図(配列番号557)である。 (A)二方向CMVプロモーターがIL-15およびIL-15Rαバリアント4の発現を駆動する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~C)DNA配列および概略図(配列番号558)である。 (A)二方向CMVプロモーターがIL-15-K5およびIL-15Rα Sushiドメイン-E5の発現を駆動する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~C)DNA配列および概略図(配列番号559)である。 (A)二方向CMVプロモーターがIL-15-K5およびIL-15Rαバリアント4-E5の発現を駆動する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号560)である。 (A)EF1αプロモーターがIL-15-IRES-IL-15Rα Sushiドメインの発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号561)である。 (A)EF1αプロモーターがIL-15-IRES-IL-15Rαバリアント4の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号562)である。 (A)EF1αプロモーターがIL-15K5-IRES-IL-15Rα SushiドメインE5の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号563)である。 (A)EF1αプロモーターがIL-15K5-IRES-IL-15Rαバリアント4E5の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号564)である。 (A)CMVプロモーターがIL-12-p2A-IL-15-p2A-IL-15Rα Sushiドメインの発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~E)DNA配列および概略図(配列番号565)である。 (A)CMVプロモーターがIL-12-p2A-IL-15-p2A-IL-15Rαバリアント1の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~E)DNA配列および概略図(配列番号566)である。 (A)CMVプロモーターがIL-12-p2A-IL-15K5-p2A-IL-15Rα SushiドメインE5の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号567)である。 (A)CMVプロモーターがIL-12-p2A-IL-15K5-p2A-IL-15Rαバリアント1-E5の発現を制御する例示的なコンストラクトの概略図、ならびに(B~D)DNA配列および概略図(配列番号568)である。 ブロッキングペプチドによるPD-1に対するPD-L1結合の阻害率を示すチャートである。 抗CD3で刺激したヒト末梢血単核細胞による標的細胞の細胞毒性に対するPD-L1抑制ペプチドの効果を示す。 ヒト末梢血単核細胞におけるIFNγおよびTNFαの産生に対するIL-12単独、IL-15Rα単独、ならびにIL-12および1L-15Rαをまとめるという効果を示す。 末梢血単核細胞によるU87およびMDA-MB-231腫瘍細胞の細胞毒性に対するIL-12およびIL-15Rαの効果を示す。 VG161-PLBhおよびVG161-15hによる細胞感染の結果を示す。 種々のコンストラクトについてのインビトロアッセイの結果を示す。図26A~26Bは、IL-12、IL-15、およびPD-L1ブロッカーを保有するIL-TF-Fcプラスミドを用いた細胞トランスフェクションの結果を示す。図26C~26Dは、hVG161を含む種々の変異ウイルスによる細胞感染の結果を示す。 ヒト腫瘍細胞株およびベロ細胞株に対するhVG161およびHSV-345についての細胞生存率アッセイの結果を示す。 種々のコンストラクトについてのインビトロアッセイの結果を示す。図28A~28Eは、マウス腫瘍細胞株およびベロ細胞株に対するmVG161およびHSV-345についての細胞生存率アッセイの結果を示し、図28F~28Jは、CT26マウス腫瘍細胞のmVG161またはVG001感染後の導入遺伝子発現の特徴づけを示す。 種々の細胞株のhVG161またはVG001感染後の導入遺伝子発現のインビトロでの特徴づけの結果を示す。 種々のヒト癌細胞をインビトロで殺滅するhVG161の能力を評価するアッセイの結果を示す。 mVG161およびhVG161コンストラクトについてのインビボアッセイの結果を示す。 3つの異なるヒト細胞株に対する異なるウイルスについての成長曲線を示す。 マウス腫瘍細胞株およびベロ細胞株に対するmVG161およびHSV-345の成長曲線を示す。 ヒト腫瘍細胞株およびベロ細胞株に対するhVG161およびHSV-345の成長曲線を示す。 ウイルス改変の効果を示す。 インビトロでの効能データを提供する。 インビボでのデータを提供する。 免疫応答におけるVG161mの効果に関するデータを提供する。
本開示は、以下の本発明の好ましい実施形態の詳細な説明および本明細書に含まれる実施例に対する参照によってより容易に理解され得る。
本開示の概要
本開示は、以下の本発明の好ましい実施形態の詳細な説明および本明細書に含まれる実施例に対する参照によってより容易に理解され得る。簡潔に述べると、本開示は、免疫刺激分子を発現する腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス1型または2型ベクターを提供する。代表的なベクターは、IL-12、IL-15およびIL-15Rαのうちの1つ以上をコードする発現カセットを含む。ある特定のベクターは、マウスまたはヒトIL-12、マウスまたはヒトIL-15、およびマウスまたはヒトIL-15Rαをコードする。ある特定の実施形態内で、ベクターは、マウスまたはヒトIL-12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットをコードする。他の実施形態内で、ベクターは、hIL-12、HIL15およびHIL15受容体アルファサブユニットをコードする。これら3つのタンパク質は、1個、2個、または3個の転写産物上に発現し得る。同じ転写産物上に発現するとき、転写後プロセシングが続いて起こり、個々のタンパク質の発現を結果として生じる。このような場合、コード領域はIRES配列、または自己開裂性2Aペプチドをコードする配列によって分離されている。コード領域は、二方向プロモーターによって発現し得る。HSVベクターは場合により、分泌することができる1つ以上のPD-L1ペプチドを発現する。
A.oHSVベクター
腫瘍溶解性ウイルスとは、好ましくは選択的様式で癌細胞を溶解するであろう(腫瘍溶解性)ウイルスである。非分裂細胞よりも分裂細胞において選択的に複製するウイルスはしばしば、腫瘍溶解性である。本明細書における使用に適している腫瘍溶解性ウイルスには、単純ヘルペスウイルス1型および2型が含まれる。
単純ヘルペスウイルス(HSV)1型および2型は、ヒトに感染するヘルペスウイルス科のメンバーである。HSVゲノムは、一義的な長い(UL)領域および一義的な短い(US)領域と呼ばれる2つの一義的な領域を含有する。これらの領域のそれぞれは、一対の逆になった末端反復配列によって隣接されている。約75個の既知のオープンリーディングフレームがある。ウイルスゲノムは、例えば、癌療法における使用のための腫瘍溶解性ウイルスを開発するために操作されてきた。HSVの腫瘍選択的複製は、HSV ICP34.5(γ34.5とも呼ばれる)遺伝子の変異によって与えられ得る。HSVは、2コピーのICP34.5を含有する。ICP34.5遺伝子の片方または両方のコピーを不活性化させる変異体は、神経毒性を欠失している、すなわち非病原性/非神経毒性であり、腫瘍溶解性であることが既知である。
適切な腫瘍溶解性HSVは、何らかの実験室株または臨床上の単離物を含む、HSV-1またはHSV-2のいずれかに由来し得る。いくつかの実施形態において、oHSVは、実験室株であるHSV-1株17、HSV-1株F、またはHSV-2株HG52のうちの1つであり得、またはこの1つに由来し得る。他の実施形態において、oHSVは、被実験室株JS-1であり得、またはこれに由来し得る。他の適切なHSV-1ウイルスには、この後述のすべてが全体としてこの参照により含まれるHrrR3(Goldsten and Weller,J.Virol.62,196-205,1988)、G2O7(Mineta et al.Nature Medicine.1(9):938-943,1995、Kooby et al.The FASEB Journal,13(11):1325-1334,1999)、G47Delta(Todo et al.Proceedings of the National Academy of Sciences.2001;98(11):6396-6401)、HSV 1716(Mace et al.Head&Neck,2008;30(8):1045-1051、Harrow et al.Gene Therapy.2004;11(22):1648-1658)、HF10(Nakao et al.Cancer Gene Therapy.2011;18(3):167-175)、NV1020(Fong et al.Molecular Therapy,2009;17(2):389-394)、T-VEC(Andtbacka et al.Journal of Clinical Oncology,2015:33(25):2780-8)、J100(Gaston et al.PloS one,2013;8(11):e81768)、M002(Parker et al.Proceedings of the National Academy of Sciences,2000;97(5):2208-2213)、NV1042(Passer et al.Cancer Gene Therapy.2013;20(1):17-24)、G2O7-IL2(Carew et al.Molecular Therapy,2001;4(3):250-256)、rQNestin34.5(Kambara et al.Cancer Research,2005;65(7):2832-2839)、G47Δ-mIL-18(Fukuhara et al.Cancer Research,2005;65(23):10663-10668)、ならびに「HSV Vectors with Enhanced Replication in Cancer Cells」という表題のPCT/US2017/030308、および「Compositions and Methods of Using Stat1/3 Inhibitors with Oncolytic Herpes Virus」という表題のPCT/US2017/018539というPCT出願に開示されているベクターが含まれる。
oHSVベクターは、少なくとも1つのγ34.5遺伝子の修飾、変異、または欠失を有し得る。このベクターは、未処置のγ34.5遺伝子を欠いている。いくつかの実施形態において、いずれの遺伝子も欠失しており、変異しており、または修飾されている。他の実施形態において、片方は欠失しており、もう片方は変異しまたは修飾されている。いずれかの天然のγ34.5遺伝子は欠失していることができる。一実施形態において、γ34.5遺伝子とICP4遺伝子とを含む末端反復は、欠失している。ヌクレオチドの変更、挿入および欠失のような変異は、遺伝子を発現不可能にしたり、生成物を不活性化したりする。γ34.5遺伝子は、その3’UTRにおいてmiRNA標的配列を用いて修飾されている。標的配列は、正常な対応物よりも腫瘍細胞において低レベルで発現するmiRNAを結合する。いくつかの実施形態において、修飾されまたは変異したγ34.5遺伝子(複数可)は、インビトロで構築され、oHSVベクターへとウイルス遺伝子(複数可)に対する置き換え物として挿入される。修飾されまたは変異したγ34.5遺伝子が唯一のγ34.5遺伝子の置き換え物であるとき、もう片方のγ34.5は欠失している。γ34.5遺伝子は、外来性プロモーターを有するなど、さらなる変化を含み得る。
oHSVは、ウイルスの病原性またはそのウイルスの複製能に影響し得る変異、例えば、欠失、置換、挿入)を不能にすることを含み得るさらなる変異を有し得る。例えば、変異は、ICP6、ICPO、ICP4、ICP27、ICP47、ICP24、ICP56のうちのいずれか1つ以上においてなされ得る。好ましくは、これらの遺伝子のうちの1つにおける(場合により、適宜遺伝子のいずれのコピーにもおける)変異は、HSVの不能(または能力の低下)をもたらして、対応する機能的ポリペプチドを発現させる。いくつかの実施形態において、ウイルス遺伝子のプロモーターは、標的細胞において選択的に活性がある、または誘導因子の送達の際に誘導性がある、または細胞事象もしくは特定の環境において誘導性があるプロモーターと置換され得る。特定の実施形態において、腫瘍特異的プロモーターは、HSVの複製に必須のウイルス遺伝子の発現を駆動する。ある特定の実施形態において、ICP4もしくはICP27またはこの両者の発現は、外来性プロモーター、例えば、腫瘍特異的プロモーターによって制御される。例示的な腫瘍特異的プロモーターとしては、サバイビンまたはテロメラーゼが挙げられ、他の適切な腫瘍特異的プロモーターは、単一の腫瘍タイプに特異的であり得、当該技術分野で既知である。他の要素が存在してもよい。いくつかの場合において、NF-kB/OCT4/SOX2エンハンサーのようなエンハンサーは、例えば、ICP4もしくはICP27またはこの両者の調節領域に存在する。同様に、FGFのような成長因子遺伝子由来の5’UTRのような5’UTRは、外来性であり得る。
oHSVは、本来非HSVである遺伝子およびヌクレオチド配列も有し得る。例えば、プロドラッグをコードする配列、サイトカインまたは他の免疫刺激因子、腫瘍特異的プロモーター、誘導性プロモーター、エンハンサー、宿主細胞と相同的な配列はとりわけ、oHSVゲノム中にあり得る。例示的な配列は、IL12、IL15、OX40L、PD-L1ブロッカーまたはPD-1ブロッカーをコードする。生成物をコードする配列については、発現に必要なまたは望ましいプロモーター配列および他の調節配列(例えば、エンハンサー、ポリアデニル化シグナル配列)へ作用するように連結される。
ウイルス遺伝子の調節領域は、発現に影響する応答要素を含むよう修飾され得る。例示的な応答要素としては、NF-κB、Oct-3/4-SOX2、エンハンサー、サイレンサー、cAMP応答要素、CAATエンハンサー結合配列、および絶縁因子に対する応答要素が挙げられる。他の応答要素も含まれ得る。ウイルスプロモーターは、異なるプロモーターと置き換えられ得る。プロモーターの選択は、HSVベクターの提唱される使用、患者、病状または容態の治療、および誘導因子の適用しやすさ(誘導性プロモーターについての)のようないくつかの因子によるであろう。癌の治療については、概してプロモーターが置き換えられるとき、細胞特異的または組織特異的または腫瘍特異的プロモーターを用いるであろう。腫瘍特異的、細胞特異的および組織特異的プロモーターは、当該技術分野で既知である。他の遺伝子要素は、同様に修飾され得る。例えば、ウイルス遺伝子の5’UTRは、外来性UTRと置き換えられ得る。
B.免疫刺激分子
oHSVベクターは、1つ以上の免疫刺激分子(例えば、IL-12、IL-15、およびIL-15Rα)をコードする核酸配列を含む。例示的なIL-12、IL-15、およびIL-15Rαのアミノ酸配列は、配列表(配列番号1~6)に提示される。アミノ酸配列をコードするいかなるDNA配列も適切であるが、概して、コドンは、oHSVを受容する予定の対象種において優先的に発現するために選択されるであろう。
1.IL-12
インターロイキン12(IL-12)は主として、細菌(例えば、リポ多糖)、病原体または活性化型T細胞に応答して、樹状細胞、マクロファージ、および単球によって産生される。IL-12は、IFNガンマ産生、細胞増殖を誘導することができ、ナチュラルキラー細胞およびT細胞を活性化することができる。T細胞からTh1細胞への分化にとっても必須である。IL-12は、腫瘍の成長を抑制することもできる。マウスIL-12は、マウスおよびヒトの両細胞に対して等しく活性があり、いずれもoHSVベクターにおける使用に適している。
生物活性のあるIL-12は、ジスルフィド架橋によって共有結合した35kDa(p35)および40kDa(p40)サブユニットから構成されたヘテロ二量体分子である。この2つのサブユニットの同時発現は、ヘテロ二量体を生成するのに必要である。oHSVベクターにおいて、IL-12発現は種々の方法で達成され得る。この2つのサブユニットは、それぞれプロモーターを用いて別個のコンストラクトにおいて発現することができるか、または二方向プロモーターから1つのコンストラクトにおいて発現することができるか、またはコード領域間にあるIRESもしくは自己開裂性ペプチドのような要素を有する1つのコンストラクトから発現することができる。あるいは、サブユニットは、一本鎖として発現することができる。例えば、機能的な一本鎖であるIL-12融合タンパク質は、p40およびp35についてのコード領域を、通常、Ser5、(Gly4Ser)3またはGly6Ser(例えば、Lieschke et al.Nature Biotechnology 15:35,1997、Lode et al.PNAS 95:2475,1998)のような、SerもしくはGlyまたはSerおよびGlyの組み合わせから構成されるリンカーで連結することによって生成することができる(代替的な融合コンストラクトについてはWO2015/095249も参照されたい)。リンカーの配列および長さは概して、ドメインの最大可撓性を可能にするよう選択される(Chen et al.,Adv Drug Deliv Rev.65:1357,2013)。コンピュータプログラムを使用して、リンカー配列を選択することができる。1つのこのようなプログラムは、LINKER(Crasto and Feng,Protein Eng Design&Selection 13:309)と呼ばれる。例示的な一本鎖IL-12は、配列番号1のアミノ酸配列を有する。アミノ酸の置換、挿入および欠失は、IL-12が機能を保有している限り、なされ得る。
2.IL-15
IL-15は、ナチュラルキラー細胞およびT細胞の活性化および増殖を調節し、かつ他の生物活性を有してもよいサイトカインである。少なくとも2つのアイソフォームがあり、これらは単一ペプチドの配列が異なっており、同一の成熟タンパク質配列を有する。長めのシグナルペプチドを有するアイソフォーム(時にLSP-IL15と呼ばれる)の配列は、GenBank(NCBI)受託番号NP000576を有しており、短めのシグナルペプチドを有するアイソフォーム(時にSSP-IL15と呼ばれる)は、受託番号NP751915を有している。いずれのアイソフォームもoHSVベクターにおける使用に適している。多型において認められるようなアミノ酸の挿入、欠失および置換は、このタンパク質がIL-15を結合している限り、あり得る。
いくつかの実施形態において、IL-15およびIL-15Rαはそれぞれ、選択的に二量体化することになっている多重コイルであるC末端ペプチドを有している。いくつかの適切なペプチドが教示されている(例えば、Tripet et al.Protein Engineering 9:1029,1996、Aronsson et al.,Sci Rep 5:14063,2015を参照されたい)。典型的には、多重コイルのアミノ酸配列は、hpphpppパターンにおいて疎水性(h)および極性(p)残基からなる7回反復を有する。2つの例示的な多重コイルは、Kコイル(KVSALKE、配列番号7)およびEコイル(EVSALEK、配列番号8)である。概して、3~6個の直列コピーが使用される。本明細書のいくつかの実施形態において、それぞれの5個の直列コピーが使用される。K5(KVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKE、配列番号9)およびE5(EVSALEKEVSALEKEVSALEKEVSALEKEVSALEK、配列番号10)。KコイルおよびEコイルは、逆に帯電するよう設計されたので、IL-15は、1つの多重コイルと融合し、IL-15Rαは、逆に帯電した多重コイルへ融合する。E5へ融合した例示的なSushiドメインは配列番号12に示されており、E5へ融合した例示的なIL-15Rαバリアント4は配列番号13に示されており、E5へ融合した例示的なIL-15Rαバリアント1は配列番号14に示されており、K5へ融合した例示的なIL-15は配列番号15に示されている。
3.IL-15Rαサブユニット
インターロイキン15受容体アルファサブユニット(IL-15Rα)は、IL-15を結合する複合体の3つのサブユニットのうちの1つである。アルファサブユニットは、高い親和性でIL-15を結合し、他のサブユニットとは無関係にIL-15へ結合することができる。少なくとも4つのバリアント(アイソフォーム)があり、本明細書ではバリアント1(NP 002180.1)(配列番号3)、バリアント2(NP 751950.2)(配列番号4)、バリアント3(NP 001230468.1)(配列番号5)、およびバリアント4(NP_001243694)(配列番号6)と呼ぶ。アルファサブユニットは、IL-15結合活性を保有している最短領域であるSushiドメイン(別名補体制御タンパク質(CCP)、短鎖共通反復(SCR)またはSUSHI反復)を含有する。典型的なSushiドメインは、2つのジスルフィド結合を形成する4個のシステインを含有する約60~70個のアミノ酸であり、タンパク質間相互作用における共通のモチーフである。IL-15RαのSushiドメインは、残基31~約95を包含する(バリアント1に対する参照における)(配列番号11)。他のバリアントにおけるSushiドメインの位置は既知である。sIL-15Rαにおけるシステインのいずれかのアミノ酸置換は、インビボでの急性炎症および異質遺伝子的抗原に対するT細胞応答を阻害する能力を消失させる(Wei et al.J Immunol.167:277,2001)。
oHSVベクターは、IL-15Rα、IL-15Rαのバリアント、またはSushiドメインをコードする核酸配列を含む。概して、このタンパク質は、リーダーペプチドを用いて発現させられ、いくつかの実施形態において、リーダーペプチドは、IL-15Rαに由来する。他のリーダーペプチドは、当該技術分野で既知である。アミノ酸置換は、このタンパク質がIL-15を結合している限り、存在し得る。天然の置換、多型は既知である。
4.PD-L1ブロッキングペプチド
プログラム死リガンド1(PD-L1)は、おそらくPD-1受容体を結合する作用として、免疫系を抑制する上での役割を担っている。タンパク質間相互作用を遮断することは、癌療法を改善するために示されてきた。
oHSVベクターは、PD-L1ブロッキングペプチド結合を発現し得る。適切なペプチドには、TAHPSPSPRSAGQF(配列番号16)、EYRMSPSNQT(配列番号17)、YYRMSPSNQT(配列番号18)、TRYPSPSPKPEGRF(配列番号19)、およびWNRLSPSNQT(配列番号20)が含まれる。他の適切なペプチドには、表4にあるペプチド(配列番号21~500)が含まれる。概して、ブロッキングペプチドは、リーダー配列を用いて発現させられる。リーダー配列は、当該技術分野で十分に既知である。リーダー配列には、免疫グロブリンカッパ鎖リーダー配列(METDTLLLWVLLLWVPGSTG、配列番号501)およびIL-2リーダー配列(MYRMQLLSCIALSLALVTNS、配列番号502)が含まれる。1個を超えるブロッキングペプチドが存在するとき、典型的には、ペプチドは、可撓性を与えるリンカーペプチドによって分離されるであろう。リンカーは通常、GlyまたはSerまたはGly/Serが豊富である。適切なリンカーの例は、(配列番号503~519)に示されている(Chichili et al.Protein Science 22:153,2013も参照されたい)。1コピーまたは2コピーまたは3コピーまたはそれより多数のコピーのペプチドがあり得る。多重コピーは通常、直列であり、コピー間にリンカーを有し得る。ブロッキングペプチドは、ペプチドのC末端にFc配列も、またはヒンジ領域の有無の下にある免疫グロブリンFc配列も含み得る。Fc領域のいかなるものも適切であるが、概して、Fcは、IgG下位クラスのうちの1つ、例えば、ヒトIgG1、ヒトIgG2、ヒトIgG3、およびヒトIgG4またはこれらのマウス対応物に由来するであろう。
C.要素の組織化
IL-12、IL-15およびIL-15Rαという分子は、oHSVベクターにおける種々の異なる立体配置にあることができる。例えば、分子のそれぞれは、別個のプロモーター/調節領域から個別に発現し得、または1つもしくは2つの別個のプロモーター/調節領域から共発現し得る。
ある特定の実施形態において、この分子のうちの2個または3個は、1つのプロモーターから単一の転写産物において発現し、これらのコード配列は、IRES(配列内リボソーム進入部位)配列によって分離されている。IRES領域は、真核リボソーム翻訳開始複合体を誘引し、したがって、mRNAの中間において、通常利用される5’末端キャップ構造とは無関係に翻訳を開始することができる。適切なIRES配列は十分に既知であり、多くは、実験的に認証されたIRES配列のIRESiteデータベースにおいて認められ得る(例えば、http://iresite.org/IRESite_web.php?page=browse_plasmids(2016年5月26日アクセス)を参照されたい)。
種々の実施形態において、3個の遺伝子は、何らかの順序で存在し、1つ以上のIRES配列によって分離されている。IRES配列は、同一であってもなくてもよい。さらなる配列は、遺伝子/IRES接合部またはIRES/IRES接合部に存在し得る。
ある特定の実施形態において、分子のうちの2個または3個は、1つのプロモーター由来の単一の転写産物において発現し、このコード配列は、1個以上の自己開裂性2Aペプチドによって分離されている。これらのペプチドは、短鎖(約18~22個のアミノ酸)であり、コード配列間にインフレームで挿入されている。翻訳中、リボソームは、2AペプチドのC末端におけるグリシル-プロリルペプチド結合の合成をスキップし、2Aペプチドとそのすぐ下流のタンパク質との間に開裂をもたらす。結果として、リボソームは、等モルレベルの多重遺伝子産物を同じmRNAから生成する。「開裂」は、C末端におけるgly-pro残基間に生じ、上流のシストロンがそのC末端へ付加された追加の残基を有するであろうが、下流のシストロンは、プロリンで始まるであろう。例示的なp2Aペプチド配列は、配列番号520~535において示されている。
この分子の共発現をもたらす別の手段は、二方向プロモーターを使用することである。二方向プロモーターは、ヒトゲノムの共通の特長である(Trinklein et al.Genome Res 14:62,2004)。二方向プロモーターは、両方向に転写を開始し、典型的には、両遺伝子を調節する共有された要素を含有している。天然の二方向プロモーターに加えて、二方向になるようにプロモーターが合成されている。1つのこのようなプロモーターは、二方向CMVである。pBI-CMV1は、関心対象の2つのタンパク質の恒常的発現を可能にする哺乳類二方向発現ベクターである。タンパク質発現は、2つの恒常的に活性のある最小ヒトサイトメガロウイルスプロモーターであるPminCMV1および反対向きのPminCMV2のうちの1つによって駆動される。二方向CMVプロモーターの例示的なDNA配列は、配列番号536である。
二方向プロモーターは(例えば、二方向CMVプロモーター)は主として、hIL15およびIL-15Rα(またはSushiドメイン)の共発現を達成するために使用される。2つの分子がIRESまたはp2A配列を用いて共発現するとき、概して、hIL15およびIL-15Rα(またはSushiドメイン)であろう。これらの場合において、IL-12およびPD-L1ブロッキングペプチドは、二方向プロモーターを用いて、またはIRESもしくはp2A配列を有する多重シストロン性転写産物として共発現し得、あるいはこれらのブロッキングペプチド自体のプロモーター/調節領域から個別に発現し得る。
他のプロモーターを使用してもよい。細胞プロモーター、ウイルスプロモーターなどが適切である。プロモーターは、恒常的または誘導性または細胞/組織特異的であり得る。多くのプロモーターが十分に既知である。有用であり得る1つの特定のプロモーターは、恒常的なEF-1αプロモーターである。
配列は、1つ以上の発現カセットにおいて組み立てられる。例は、いくつかの発現カセットの例示版を提供する。発現カセットは、決定的な機能(例えば、複製)を崩壊させない何らかの位置にあるHSVゲノムへと挿入され得る。ある特定の実施形態において、このカセットは、反復を最初に欠失させた後に、内部のまたは末端の反復領域の中に挿入される。挿入に適した他の領域には、例えば、UL3およびUL4ウイルス遺伝子、UL50およびUL51遺伝子のようなウイルス遺伝子間に、ならびにUS1およびUS2間に含まれる。
ある特定の実施形態において、PD-L1ブロッキングペプチドを発現するカセットは、ウイルス遺伝子間(例えば、UL3およびUL4、UL50およびUL51ならびに/またはUS1およびUS2)に挿入される。他の実施形態において、IL-12、IL-15およびIL-15Rαを発現するカセットは、末端反復領域に代わって挿入され、PD-L1ペプチドを発現するカセットは、UL3遺伝子とUL4遺伝子との間に挿入される。
D.治療用組成物
例えば、癌のような疾患の作用を予防、治療、または改善させるために使用され得る治療用組成物が提供される。より詳細には、本明細書に説明する少なくとも1つの腫瘍溶解性ウイルスを含む治療組成物が提供される。代表例としては、IL12、IL15および/またはIL受容体15アルファサブユニットのうちの1つ以上についての発現カセットを有するoHSVが挙げられる。一実施形態内で、発現カセットは、IL12、IL15およびIL受容体15アルファサブユニットの全部を発現する。好ましい実施形態内で、発現カセットは、マウスまたはヒトIL12、hIL15、およびhIL15受容体アルファサブユニットを含む。
ある実施形態において、組成物はさらに、医薬として許容され得る担体を含むであろう。「医薬として許容され得る担体」は、腫瘍溶解性ウイルスの生物活性の有効性に干渉せず、投与される対象に対して毒性がない何らかの担体、希釈剤または賦形剤を包含するよう意味する(概して、Remington:The Science and Practice of Pharmacy,Lippincott Williams & Wilkins;21st ed.(May 1,2005およびThe United States PharmacopE1A:The National Formulary(USP40-NF35および付録を参照されたい)。
本明細書に説明する腫瘍溶解性ウイルスの場合、適切な医薬担体の非限定例としては、リン酸緩衝塩類溶液、水、エマルション(油/水エマルションなど)、種々の種類の湿潤剤、滅菌溶液などが挙げられる。さらなる医薬として許容され得る担体には、ゲル、生体吸着性マトリックス材料、腫瘍溶解性ウイルスを含有する植え込み素子、または何らかの他の適切なビヒクル、送達もしくは分散の手段もしくは材料(複数可)が含まれる。このような担体は、従来法によって製剤することができ、有効用量で対象へ投与することができる。さらなる医薬として許容され得る賦形剤には、水、塩類溶液、ポリエチレングリコール、ヒアルロン酸およびエタノールが含まれるが、これらに限定されない。医薬として許容され得る塩は、その点で含まれることもでき、例えば、鉱酸塩(塩化水素塩、臭化水素塩、リン酸塩、硫酸塩など)および有機酸の塩(酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩など)である。oHSVを標的担体へ送達するために使用され得るこのような医薬として許容され得る(医薬等級の)担体、希釈剤および賦形剤は好ましくは、組成物を受容する個体(対象)において免疫応答を誘導しないであろう(し、好ましくは、過度の毒性なしで投与されるであろう)。
本明細書に提供する組成物は、種々の濃度で提供することができる。例えば、約106~約109pfuの範囲の腫瘍溶解性ウイルスの薬用量を提供することができる。さらなる実施形態内で、剤形は、約106~約109pfu/mlの範囲であり得、治療の2~3週間ごとに、最大4mlは、大きな病変(例えば、5cm超)を有する患者へ注射され、小さな病変(例えば、0.5cm未満)を有する患者においては、より少量(例えば、最大0.1ml)である。
本発明のある特定の実施形態内で、標準よりも少量の薬用量を利用してもよい。すなわち、ある特定の実施形態内で、約106pfu/ml未満(最大4mlが患者へ2~3週間ごとに注射される)を患者へ投与することができる。
組成物は、安定した保存性を招来する温度で保存され得、室温(約20℃)、4℃、-20℃、-80℃、および液体N2中が含まれる。インビボでの使用に企図された組成物は概して、保存料を有していないので、貯蔵は概して、より低温であろう。組成物は乾燥(例えば、凍結乾燥済み)または液状で保存され得る。
E.投与
本明細書に説明する組成物に加えて、このような組成物を用いて癌を治療しまたは改善させる種々の方法が提供され、この方法は、対象へ本明細書に説明する有効用量または有効量のHSVベクターを投与するステップを含む。
「有効用量」および「有効量」という用語は、標的の癌の治療をもたらすのに十分な腫瘍溶解性ウイルスの量、例えば、標的の腫瘍の大きさもしくは量を減少させるのに有効な量、またはそうでなければ、標的の腫瘍細胞の成長速度を妨げるのに有効な量を指す。より詳細には、このような用語は、所望の結果を得るために必要な薬用量および治療期間で有効である腫瘍溶解性ウイルスの量を指す。例えば、癌を治療する脈絡において、本明細書に説明する組成物の有効量とは、緩解を誘導し、腫瘍量を減少させ、および/または腫瘍伝播もしくは癌の成長を予防する量である。有効量は、対象の病状、齢、性別、および体重、ならびに医薬製剤、投与経路などの因子によって変化し得るが、それにもかかわらず、当業者によって定常的に判断されることができる。
治療用組成物は、癌と診断されたまたは癌に罹患している疑いのある対象へ投与される。対象は、ヒトまたは非ヒト動物であり得る。
組成物は、癌を治療するために使用される。本明細書で使用する「治療する」または「治療すること」または「治療」という用語は、臨床結果を含む有益なまたは所望の結果を得るためのアプローチを意味する。有益なまたは所望の臨床結果には、検出可能であろうと検出不可能であろうと、1つ以上の症状または容態の緩和または改善、疾患の程度の低減、疾患の安定した(すなわち、悪化していない)状態、疾患の伝播の予防、疾患の再発の低下、および寛解(部分であろうと完全であろうと)が含まれることができるが、これらに限定されない。「治療すること」または「治療」という用語は、治療を受けなかった場合に予想される生存と比較して、生存を延長することもまた意味し得る。
癌の代表的な形態には、癌腫、白血病、リンパ腫、骨髄腫および肉腫が含まれる。さらなる例としては、胆管癌、脳(例えば、膠芽腫)、乳房、子宮頸部、大腸、中枢神経系(例えば、聴神経腫瘍、星状細胞腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、膠芽腫、血管芽腫、髄芽腫、髄膜腫、神経芽腫、乏突起膠腫、松果体腫および網膜芽細胞腫)、子宮内膜表層、造血細胞(例えば、白血病およびリンパ腫)、腎臓、喉頭、肺、肝臓、口腔、卵巣、膵臓、前立腺、皮膚(例えば、黒色腫および扁平上皮癌)および甲状腺の癌が挙げられるが、これらに限定されない。癌は、固形腫瘍(例えば、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫および骨肉腫などの肉腫)、びまん性(例えば、白血病)、またはいくつかのこれらの組み合わせ(例えば、固形腫瘍および播種性またはびまん性癌細胞の両方を有する転移性癌)を含むことができる。癌は、従来の治療(例えば、従来の化学療法および/または放射線療法)に対して耐性もあり得る。
良性腫瘍および望ましくない細胞増殖に関する他の容態も治療され得る。
本明細書に説明するoHSVは、例えば、経口、局所、非経口、全身、静脈内、筋肉内、眼内、髄腔内、腫瘍内、皮下、または経皮である経路によって付与され得る。ある特定の実施形態内で、腫瘍溶解性ウイルスは、カニューレによって、カテーテルによって、または直接注射によって送達され得る。投与部位は、腫瘍内または腫瘍から遠位の部位であり得る。投与経路はしばしば、標的とされる癌の種類によるであろう。
腫瘍溶解性ウイルスの最適なまたは適切な薬用量投与計画は、当該技術分野の技術内で、患者データと、患者観察と、例えば、対象の大きさ、体表面積、齢、性別、および投与される詳細な腫瘍溶解性ウイルス、投与の時刻および経路、治療される癌の種類、患者の全身レベルの健康状態、ならびに患者が服用している他の薬物療法を含む種々の臨床因子とに基づいて、主治医によって容易に判断することができる。ある特定の実施形態によると、本明細書に説明する腫瘍溶解性ウイルスを使用した対象の治療は、例えば、エトポシド、イホスファミド、アドリアマイシン、ビンクリスチン、ドキシサイクリンなどの化学療法薬を用いた化学療法など、さらなる種類の療法と組み合わせられ得る。
oHSVは、臨床上の使用のための薬剤および医薬組成物として製剤され得、医薬として許容され得る担体、希釈剤、賦形剤またはアジュバントと組み合わせられ得る。製剤は、投与経路に少なくとも一部よるであろう。適切な製剤は、滅菌した媒体中にウイルスと阻害剤とを含み得る。製剤は、流体状、ゲル状、ペースト状または固形であり得る。製剤は、対象または医学的専門家へ提供される
治療有効量は好ましく投与される。これは、対象に対する利益を示すのに十分な量である。投与される実際の量および投与の時間経過は、癌の性質、対象の容態、送達の部位、および他の因子に少なくとも一部よるであろう。
本発明のさらに他の実施形態内で、腫瘍溶解性ウイルスは、腫瘍内に、または腫瘍の外科的摘出後に投与することができる。
以下の実施例は、説明として提唱されるのであって、制限としてではない。
実施例
コンストラクトはすべて、化学合成を含む標準的な組換え技術を用いて作製される。
例示的なoHSVベクターの概略図
図1Aおよび図1Bは、代表的なoHSVベクターの例示的な概略図を提供する。
例示的なコンストラクト
本実施例において、種々のコンストラクトおよびその配列が提示される。
hVG161は、修飾されたICP34.5領域(図2、配列番号572)と、修飾されたUL54プロモーター調節領域(図3、配列番号573)と、UL3とUL4との間の遺伝子間領域内のPD-L1ブロッカーの挿入(図4、配列番号574)と、IL-12、IL-15、およびIL-15受容体アルファサブユニットをコードする発現カセットを保有する修飾された末端反復(TR)領域(図5、配列番号575)とを含む。これら4つのウイルスは、修飾され部分的に欠失したICP34.5領域も有する。
mVG161は、hVG161の機能的に同一のマウス版であるが、例外は、hVG161がヒトIL-12とヒトPD-L1ブロッカーとを保有するウイルスゲノム上の同じ位置において、mVG161がIL-12のマウス版とマウスPD-L1ブロッカーとを保有することである。
以後の実施例において使用する略語
TF-Fc:Fcへ融合してVG161の構築に使用されるPD-L1ブロッキングペプチド。
IL-TF-Fc:IL-12と、IL-15と、PD-L1ブロッカーとを保有するプラスミド。
HSV-345:ICP34.5欠失ウイルス。
OS-ICP27 2-11:VG161の構築に使用されなかったICP27(OS-ICP27)のプロモーター調節領域内に挿入されたOct4/Sox2結合部位と生存プロモーター(OS)とを有するICP34.5欠失ウイルス。
OS-ICP27 5-7:VG161の構築に使用されなかったOS-ICP27変異を有するICP34.5欠失ウイルス。
NO-ICP27 1-4-4(NO-ICP27-145としても既知):ICP27の転写開始部位の145bp上流の位置にあり、VG161の構築に使用されたICP27のプロモーター調節領域内に挿入されたNF-kB応答要素とOct4/Sox2結合部位(NO)(NO-ICP27)とを有するICP34.5欠失ウイルス。
NO-ICP27 5-2-2(NO-ICP27-99としても既知):ICP27の転写開始部位の99bp上流の位置にあり、VG161の構築に使用されなかったICP27のプロモーター調節領域内に挿入されたNF-kB応答要素とOct4/Sox2結合部位(NO)(NO-ICP27)とを有するICP34.5欠失ウイルス。
VG001(VG160としても既知):VG161の構築に使用された骨格ウイルス(IL-12/IL-15発現カセットの挿入にその後の使用されるウイルスゲノムの欠失した末端反復領域内の空のMCSを隣接している外来性プロモーターとポリ(A)とを保有するNO-ICP27 1-4-4変異体)。
VG001-15h(VG161-15hとしても既知):ヒトIL-15を保有するVG001。
VG001-1215h(VG161-1215hとしても既知):ヒトIL-12とヒトIL-15とを保有するVG001。
VG001-PLBh(VG161-PLBhとしても既知):UL3とUL4との間の遺伝子間領域内に挿入されたヒトPD-L1ブロッカーを保有するVG001。
8-8-15RA1-PDL1b:ヒトIL-15とヒトPD-L1ブロッカーとを保有するVG001。
VG161-1215PLBm(mVG161としても既知):マウスIL-12と、ヒトIL-15と、マウスPD-L1ブロッカーと、を保有するVG001。
VG161-1215PLBh(hVG161またはVG161としても既知):ヒトIL-12と、ヒトIL-15と、ヒトPD-L1ブロッカーと、を保有するVG001。
hVG161による細胞の感染後のIL-12の発現
本実施例において、IL-12発現のウェスタンブロットおよびELISAのデータを示す。
図6Aは、VG161-1215PLBhウイルス感染後のウェスタンブロットを示す。H460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を24時間感染させた。細胞溶解物を調製し、12%SDS-PAGEゲル上で泳動し、PVDF膜へと転写した。膜を抗ヒトIL-12抗体、次いでHRP結合抗マウスIgG二次抗体を用いてブロットし、Bio-Rad ImageLabシステムを用いてメイジを検出し、解析した。
図6B~図6Cは、ヒトIL-12の産生がVG161-1215PLBhウイルス感染後に上方調節されることを示す。LS174TまたはH460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を48時間感染させた。感染した細胞の上清を収集し、抗ヒトIL-12捕捉抗体でコーティングした96ウェルImmuno Maxisorp平底プレートへ結合させた。ビオチン化抗ヒトIL-12抗体、アビジン-セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)、および3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)基質を介して結合を検出した。吸光度の測定は、プレートリーダーを介して450nmで回収した。培養上清中のヒトIL-12の濃度をヒトIL-12の標準曲線に基づいて計算した。
hVG161による細胞の感染後のIL-15の発現
本実施例において、IL-15発現のウェスタンブロットおよびELISAのデータを示す。
図7Aは、VG161-1215PLBhウイルス感染後のウェスタンブロットの結果を示す。H460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を24時間感染させた。細胞溶解物を調製し、12%SDS-PAGEゲル上で泳動し、PVDF膜へ転写した。膜を抗ヒトIL-15抗体、次いでHRP結合抗マウスIgG二次抗体を用いてブロットし、Bio-Rad ImageLabシステムを用いて画像を検出し解析した。
図7B~図7Cは、ヒトIL-15の産生がVG161-1215PLBhウイルス感染後に上方調節されることを示す。LS174TまたはH460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を48時間感染させた。感染した細胞の上清を収集し、抗ヒトIL-15捕捉抗体でコーティングした96ウェルImmuno Maxisorp平底プレートへ結合させた。結合は、ビオチン化抗ヒトIL-15抗体、アビジン-セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)、および3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)基質を介して検出した。吸光度の測定は、プレートリーダーを介して450nmで回収した。培養上清中のヒトIL-15の濃度は、ヒトIL-15の標準曲線に基づいて計算した。
実施例6
hVG161による細胞の感染後のIgG4の発現
本実施例において、IgG4発現のウェスタンブロットおよびELISAのデータを示す。
図8Aは、VG161-1215PLBhウイルス感染後のウェスタンブロットの結果を示す。H460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を24時間感染させた。細胞溶解物を調製し、12%SDS-PAGEゲル上で泳動し、PVDF膜へ転写した。膜をHRP結合抗ヒトIgG抗体でブロットし、Bio-Rad ImageLabシステムを用いて画像を検出し解析した。
図8B~図8Cは、ヒトPD-L1ブロッカー(ヒトFcドメインへ融合)の産生がVG161-1215PLBhウイルス感染後に上方調節されることを示す。LS174TまたはH460腫瘍細胞にVG161-1215PLBまたはVG001ウイルス(MOI=1)を48時間感染させた。感染した細胞の上清を収集し、抗ヒトIgG4捕捉抗体でコーティングした96ウェルImmuno Maxisorp平底プレートへ結合させた。ビオチン化抗ヒトIgG4抗体、アビジン-セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)、および3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)基質を介して結合を検出した。吸光度の測定は、プレートリーダーを介して450nmで回収した。培養上清中のヒトIgG4の濃度は、ヒトIgG4標準曲線に基づいて計算した。
PD-L1ブロッキングペプチドを含むコンストラクト
PD-L1ブロッキングペプチドは、Igκ鎖リーダー配列(配列番号501)を用いて作製した。2つ以上のブロッキングペプチドが同じコンストラクトの中にあるとき、これらをGly-Serの豊富な配列(Gly4Ser)3(配列番号503)と連結させた。以下のコンストラクトを作製する。
TF単独:METDTLLLWVLLLWVPGSTGTAHPSPSPRSAGQF(配列番号537)、
ET+TF:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGEYRMSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTAHPSPSPRSAGQF(配列番号538)、
YT+TF:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGYYRMSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTAHPSPSPRSAGQF(配列番号539)、
マウスTF:METDTLLLWVLLLWVPGSTGTRYPSPSPKPEGRF(配列番号540)、
マウスWT+TF:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGWNRLSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTRYPSPSPKPEGRF(配列番号541)。
三重TF+ET:
METDTLLLWVLLLWVPGSTGTAHPSPSPRSAGQFTAHPSPSPRSAGQFTAHPSPSPRSAGQFGGGGSGGGGSGGGGSEYRMSPSNQTEYRMSPSNQTEYRMSPSNQT(配列番号542)
METDTLLLWVLLLWVPGSTGEYRMSPSNQTEYRMSPSNQTEYRMSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTAHPSPSPRSAGQFTAHPSPSPRSAGQFTAHPSPSPRSAGQF(配列番号543)。
他のコンストラクトは、IL-2シグナル配列(MYRMQLLSCIALSLALVTNS(配列番号502)と、ヒトIgG4 Fc領域(ヒンジ領域を有する)(配列番号544)またはマウスIgG1 Fc領域(ヒンジ領域を有する)(配列番号545)とを用いて作製する。コンストラクトは以下である。
TF単独:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSTAHPSPSPRSAGQFISAMVRSPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号546)
ET+TF:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSEYRMSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTAHPSPSPRSAGQFISAMVRSPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号547)
YT+TF:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSYYRMSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTAHPSPSPRSAGQFISAMVRSPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号548)
マウスTF:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSTRYPSPSPKPEGRFISAMVRSGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK(配列番号549)
マウスWT+TF:
MYRMQLLSCIALSLALVTNSWNRLSPSNQTGGGGSGGGGSGGGGSTRYPSPSPKPEGRFISAMVRSGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK(配列番号550)。
二方向CMVプロモーターの制御下にあるIL-15とIL-15Rαとを含むコンストラクト
本実施例において、種々のコンストラクトを作製して、二方向CMVプロモーターの制御下にあるIL-15とIL-15Rαとを共発現させる。
コンストラクト1において、二方向CMVプロモーターは、IL-15RαおよびIL-15のSushiドメインの発現を駆動する(図9、配列番号557)。
コンストラクト2において、二方向CMVプロモーターは、IL-15およびIL-15Rαバリアント4の発現を駆動する(図10、配列番号558)。
コンストラクト3において、二方向CMVプロモーターは、IL-15-K5およびIL-15Rα Sushiドメイン-E5の発現を駆動する。(図11、配列番号559)。
コンストラクト4において、二方向CMVプロモーターは、IL-15-K5およびIL-15Rαバリアント4-E5の発現を駆動する(図12、配列番号560)。
EF1αプロモーターの制御下にあるIL-15遺伝子とIL-15Rα遺伝子とを含むコンストラクト
本実施例において、種々のコンストラクトを作製して、EF1αプロモーターの制御下にある多重シストロン性転写産物においてIL-15とIL-15Rαとを発現させる(配列番号551)。IL-15およびIL-15Rαは、例示的なIRES配列によって連結されている(配列番号552)。
コンストラクト1において、EF1αプロモーターは、IL-15-IRES-IL-15Rα Sushiドメインの発現を制御する。(図13、配列番号561。)
コンストラクト2において、EF1αプロモーターは、IL-15-IRES-IL-15Rαバリアント4の発現を制御する(図14、配列番号562。)
コンストラクト3において、EF1αプロモーターは、IL-15K5-IRES-IL-15Rα SushiドメインE5の発現を制御する。(図15、配列番号563。)
コンストラクト4において、EF1αプロモーターは、IL-15K5-IRES-IL-15Rαバリアント4E5の発現を制御する。(図16、配列番号564。)
CMVプロモーターの制御下にあるIL-12遺伝子と、IL-15遺伝子と、IL-15Rα遺伝子と、を含むコンストラクト
本実施例において、種々のコンストラクトを作製して、CMVプロモーターの制御下にある多重シストロン性転写産物においてIL-12、IL-15およびIL-15Rαを発現させる。IL-12、IL-15およびIL-15Rαは、例示的なp2A配列によって連結されている(配列番号554)。
コンストラクト1において、CMVプロモーター(配列番号553)は、IL-12-p2A-IL-15-p2A-IL-15Rα Sushiドメインの発現を制御する。(図17、配列番号565、569。)
コンストラクト2において、CMVプロモーターは、IL-12-p2A-IL-15-p2A-IL-15Rαバリアント1の発現を制御する(図180、配列番号566、570。)
コンストラクト3において、CMVプロモーターは、IL-12-p2A-IL-15K5-p2A-IL-15Rα SushiドメインE5の発現を制御する。(図19、配列番号567、571。)
コンストラクト4において、CMVプロモーターは、IL-12-p2A-IL-15K5-IRES-IL-15Rαバリアント1E5の発現を制御する。(図20、配列番号568、572。)
UL3とUL4との間に挿入されたPD-L1ブロッカーを含むコンストラクト
本実施例において、コンストラクトを作製して、塩基829と塩基830との間のUL3とUL4との間の遺伝子間領域内にPD-L1ブロッキングペプチドを発現させる。配列番号556においては、塩基1~675:UL3コード配列、塩基676~829:UL3とUL4との間にありPD-L1ブロッカーカセットの上流にある領域、塩基830~833:UL3とUL4との間にあり、PD-L1ブロッカーカセットの下流にある領域、塩基834~1433:UL4コード配列である。
PD-1に対するヒトPD-L1のブロッキングペプチドによる阻害
組換えヒトPD-L1 Fcタンパク質を96ウェルの平底プレートの底部へ4℃で一晩コーティングした。一晩のプレートコーティングの後、異なるPD-L1ブロッカーをプレートの各ウェルへと添加し、室温で2時間インキュベートした後、組換えヒトPD-1 Fcタンパク質を添加した。ビオチン化抗ヒトIgG抗体およびストレプトアビジン-HRPをその後核ウェルへと添加し、PD-L1に対するヒトPD-1の結合を、TMB基質を添加することによって検出した。発色は、マイクロプレートリーダーによって450nmの波長で測定した。阻害百分率は、ペプチド合成していない対照と比較することによって計算した。図21は、2つの異なる濃度(3および10μM)のペプチドET、ET+TF、YT、YT+TF、TW、TW+TF、WT、WT+TFおよびTFによる阻害百分率を示す。10μΜで、阻害は約22%~約48%の範囲であった。
ブロッキングペプチドによるPD-L1結合のブロッキングは腫瘍細胞に対する細胞毒性を高める
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を抗CD3抗体プラスヒトIL-2で24時間刺激した後、異なる合成されたPD-L1ブロッカーおよびカルセイン-AM標識標的細胞とともに4時間インキュベートした。細胞培養上清を4時間のインキュベーション後に収集し、放出されたカルセイン-AM蛍光をマイクロプレートリーダーによって測定した。細胞毒性百分率を次式に基づいて計算した:[(試料の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100。
図22A~図22Dは、4つの異なる腫瘍細胞、すなわちH460、U87、LS147TおよびMDA-MB-231の細胞についての結果を示す。細胞毒性の上昇は、いくつかの細胞に関してTFを除くペプチド全部について統計的に有意であった。
サイトカイン産生に及ぼすIL-12およびIL-15の相乗効果
ヒトPBMCを培地対照、IL-12単独、IL-15RA単独、またはIL-12、IL-15、およびIL-15Rα1の組み合わせプラス抗IL-12または抗IL-15中和抗体とともに48時間インキュベートした。細胞培養上清を収集して、ヒトIFNγおよびTNFαの産生をELISAによって測定した。
図23Aおよび図23Bは、サイトカイン産生の結果を示す。IL-12およびIL-15Rα1の組み合わせは、サイトカインヒトIFNγおよびTNFαの統計的に有意な増加を生じた。産生は、抗IL-12抗体を用いて阻害された。
腫瘍細胞に対する細胞毒性に及ぼすIL-12およびIL-15の相乗効果
ヒトPBMCを腫瘍標的細胞および培地対照、IL-12単独、IL-15RA単独、またはIL-12、IL-15、およびIL-15RA1の組み合わせプラス抗IL-12または抗IL-15中和抗体とともに24時間共インキュベートした。細胞培養上清を収集して、LDHアッセイにより細胞毒性を測定した。細胞毒性百分率は、次式に基づいて計算した:[(試料の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100。
図24Aおよび図24Bは、IL-12およびIL-15がまとまって、統計的に有意な様式で細胞毒性を上昇させたことを示す。MDA-MB-231細胞株に関して、抗IL-12抗体または抗IL-15抗体の添加は、この効果を有意に低下させた。
ウイルスVG161-PLBhおよびVG161-15hのインビトロ有効性
本実施例において、3×104個のH460またはLS174T腫瘍細胞を96ウェルプレートの各ウェルへ播種し、37℃で一晩培養した。翌日、播種した細胞にVG001骨格、VG161-PLBh、またはVG161-15hウイルス(MOI=1)を24時間感染させ、ヒトIL-12、ヒトIL-15、およびヒトIgG4の産生を評価した(図25A~図25C)。3×105個のヒトPBMCをその後培養物へ24時間添加してLDHアッセイによって細胞毒性を評価し(図25D)、または48時間添加してELISAによってヒトIFNg産生を評価した(図25E)。細胞毒性アッセイについて、細胞毒性百分率は、次式に基づいて計算した:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%。培地のみとともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートした上清を最大放出として使用した。
種々のコンストラクトのインビトロ有効性
図26A~図26Dは、種々のコンストラクトについてのインビトロアッセイの結果を示す。
図26A~図26Bは、IL-12、IL-15、およびPD-L1ブロッカーを保有するIL-TF-Fcプラスミドを用いた細胞トランスフェクションの結果を示す。図26A~図26Bにおいて、異なる腫瘍細胞株にIL-TF-FcプラスミドDNAを24時間トランスフェクトし、ヒトPBMCをその後培養物へ添加した。細胞上清をLDHアッセイによる細胞毒性の定量化のために24時間後に(図26A)、ELISAアッセイによるヒトIFNg産生の検出のために48時間後に収集した(図26B)。
図26C~図26Dは、hVG161を含む種々の変異ウイルスを用いた細胞感染の結果を示す。ウイルスでコードされたIL12、IL15、およびPD-L1ブロッカーは、IFNg産生および細胞毒性を相乗的に高める。H460腫瘍細胞を96ウェルプレートの各ウェルに播種し、37℃で一晩培養した。翌日、播種した細胞に示されたウイルスをMOI=1で24時間感染させた。ヒトPBMCをその後培養物へ添加し、24時間共培養して細胞毒性をLDHによって評価し(図26C)または48時間共培養してELISAによるヒトIFNg産生について評価した(図26D)。細胞毒性アッセイについて、細胞毒性の百分率は次式に基づいて計算した:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%。培地のみとともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最大放出として使用した。
図27A~図27Eにおいて、9個の異なるヒト腫瘍細胞株(プラスベロ細胞)のパネルにVG161-1212PLBh(VG161h)ウイルスおよびHSV-345ウイルスをMOI0、0.04、0.2、1、および5で感染させた。細胞生存率は、感染48時間後のMTTアッセイを用いて定量した。
図28A~図28Jは、種々のコンストラクトについてのインビトロアッセイの結果を示す。図28A~図28Eは、マウス腫瘍細胞株およびベロ細胞株に関するmVG161およびHSV-345についての細胞生存率アッセイの結果を示し、図28F~図28Jは、CT26マウス腫瘍細胞のmVG161またはVG001の感染後の導入遺伝子発現の特徴づけを示す。
図28A~図28Eにおいて、6つの異なるマウス腫瘍細胞株(プラスベロ細胞)のパネルにVG161mウイルスおよびHSV-345ウイルスをMOI0、0.04、0.2、1、および5で感染させた。細胞生存率は、感染48時間後にMTTアッセイを用いて定量した。
図28F~図28Jにおいて、3×104個のCT26腫瘍細胞を96ウェルプレートの各ウェルへ播種し、37℃で一晩培養した。翌日、播種した細胞にVG001骨格ウイルスまたはVG161-1215PLBmウイルス(MOI=1)を24時間感染させ、マウスIL-12、ヒトIL-15、およびマウスIgGの産生を評価した。Balb/cマウス由来の3×105個の脾細胞をその後、培養物へと添加し、24時間共インキュベートしてLDHアッセイによって細胞毒性を評価し、または48時間共インキュベートしてELISAによってマウスIFNg産生を評価した。細胞毒性アッセイについては、細胞毒性の百分率は、次式に基づいて計算した:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%。培地のみとともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最大放出として使用した。
図29A~図29Eにおいて、3×104個のH460、LS174T、またはUMUC3腫瘍細胞を96ウェルプレートの各ウェルへ播種し、37℃で一晩培養した。翌日、播種した細胞にVG001骨格ウイルスおよびVG161-1215hウイルス(MOI=1)を24時間感染させ、ヒトIL-12、ヒトIL-15、およびヒトIgG4の産生を評価した(18R)。3×105個のヒトPBMCをその後培養物へ添加し、24時間共インキュベートしてLDHアッセイによって細胞毒性を評価し(18S)、または48時間共インキュベートしてELISAによってヒトIFNγ産生を評価した(18T)。細胞毒性アッセイについて、細胞毒性の百分率は、次式に基づいて計算した:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%。培地のみとともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートした腫瘍細胞から収集した上清を最大放出として使用した。
図30A~図30Gにおいて、VG161-1215PLBh(hVG161)ウイルスの抗腫瘍効果を、U87、MCF7、H460、LNCaP、LS174T、MDA、およびPC3を含む種類ヒト癌細胞において、感染72時間後に0~5の範囲のMOIで評価した。細胞生存百分率は、MTTアッセイによって定量した。VG161-1215PLBhウイルスは、検査したヒト腫瘍細胞株すべてにおいて頑強な細胞殺滅能を呈する。
VG161ウイルスコンストラクトのインビボでの有効性
図31A~図31Bにおいて、A20マウスB細胞リンパ腫腫瘍を有するBALB/cマウスに合計1×10^7PFU/個体のVG161-1215PLBm(mVG161)ウイルスもしくはVG001骨格ウイルスのいずれかを、またはPBS(ビヒクル対照)を腫瘍内に5回注射した。腫瘍の大きさの測定は、注射後の示される時刻に実施した。VG161-1215PLBmで処置したマウスは、PBSで処置したマウスと比較して、腫瘍体積の有意な(P<0.05)減少を呈した。
図31C~図31Dにおいて、CT26マウス結腸癌腫瘍を有するBALB/cマウスに、合計5×10^6PFU/個体のVG161-1215PLBm(mVG161)ウイルスもしくはVG001骨格ウイルスのいずれか、またはPBS(ビヒクル対照)を腫瘍内に5回注射した。腫瘍の大きさの測定は、注射後の示される時刻に実施した。VG161-1215PLBmを用いて処置したマウスは、PBSで処置したマウスと比較して、腫瘍体積の有意な(P<0.05)減少を呈した。
図31E~図31Gにおいて、マウスにおける異種移植片ヒト前立腺腫瘍のoHSV処置を評価した。12匹のマウスの右下脇腹にLNCaPヒト前立腺腫瘍細胞を植え込んだ。植え込み35日後に、6匹の無作為に選択した群に合計5×10^7PFU/個体のVG161-1215PLBh(hVG161)ウイルスを腫瘍内に2回注射したのに対し、残りの6匹は、ビヒクル対照として機能し、等容積のPBSを2回注射した。腫瘍の大きさの測定は、2つの異なる方法を用いて実施した。カリパー測定は、ウイルスまたはPBSの注射の時点の腫瘍体積と比較して、与えられた時点での腫瘍体積の倍数変化として表される(図31E)。VG161-1215PLBhウイルスを用いて処置した腫瘍保持マウスは、本研究の経過中に頑強な腫瘍の退縮を呈し、15日間の終了時には腫瘍の大きさが50%超減少したのに対し、ビヒクルで処置したマウスは、同じ時間幅の間に腫瘍体積がおよそ3倍増加したことを示した。動物全体の生体発光撮像システム(IVIS Imaging System、Xenogen社、カリフォルニア州マウンテンビュー市)を用いて腫瘍成長も監視した。シグナル強度は、1秒当たりの検出される光子全部の合計として定量した(図31F)。IVISシステムを用いた腫瘍成長の定量的撮像は、PBS処置した対照と比較してoHSV処置した動物における腫瘍の大きさのさらにより劇的な減少を示し、蛍光は、腫瘍植え込み50日後までに検出不可能なレベルにまで低下した(図32G、左側が2匹のビヒクル対照で右側が2匹のoHSV処置マウス)。
細胞株におけるhVG161の複製
図32A~図32C、図33A~図33Dおよび図34A~図34Eにおける成長曲線および細胞毒性データは、hVG161ウイルスが、親HSV-345ウイルスと同様に複製することを示す。これらのデータは、ウイルスがマウス腫瘍細胞株においてヒト細胞株と比較して同様には成長しないことも示したが、HSV-1は、マウス細胞においてほとんど成長しないことが既知である。
ウイルス修飾の評価
ヒトPBMCを培地単独、組換えIL-12単独、組換えIL-15単独、またはIL-12プラス異なる形態のIL-15/IL-15RA1複合体で、抗IL-12(6mg/ml)または抗IL-15(0.5mg/ml)中和抗体の有無の下で48時間刺激した。培養上清をその後、図35Aおよび図35Bに示されるELISAアッセイを用いたヒトIFNgおよびヒトTNFαの産生について収集した。
腫瘍細胞に対する細胞毒性を評価するために、カルセイン-AM標識腫瘍細胞を、刺激したヒトPBMCとともに24時間共インキュベートした。放出した蛍光の測定のために、上清を収集した。培地のみとともにインキュベートしたカルセイン標識腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートしたカルセイン標識腫瘍細胞から収集した上清を最大放出として使用した。細胞毒性の百分率は、式:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%に基づいて計算した。U87腫瘍細胞についての細胞毒性結果は、図35Cに示しており、MDA-MB-231腫瘍細胞は、図35Dとして示す。
インビトロ有効性データ
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を培地単独、組換えIL-12単独、組換えIL-15単独、またはIL-12プラスIL-15/IL-15RA1複合体を用いて、抗IL-12(6mg/ml)または抗IL-15(0.5mg/ml)の有無の下で48時間刺激した。培養上清をその後、図36Aおよび図36Bに示すようなELISAアッセイを用いたヒトIFNgおよびヒトTNFa産生のために収集した。
腫瘍細胞に対する細胞毒性を評価するために、1×104個のカルセイン-AM標識腫瘍細胞を1×105個の刺激したヒトPBMCとともに24時間共インキュベートした。上清を放出された蛍光の測定のために収集した。培地のみとともにインキュベートしたカルセイン標識腫瘍細胞から収集した上清を最小放出として使用し、溶解緩衝液とともにインキュベートしたカルセイン標識腫瘍細胞から収集した上清を最大放出として使用した。細胞毒性の百分率は、式:[(実際の読み取り-最小放出)/(最大放出-最小放出)]×100%に基づいて計算した。U87腫瘍細胞についての細胞毒性結果は図36Cとして示し、MDA-MB-231腫瘍細胞についての結果は図36Dとして示す。
VG161hに感染した腫瘍細胞は、ヒトIL-12、ヒトIL-15/IL15Ra、およびヒトIgG4を産生する。
簡潔には、LNCaP細胞をヌードマウスに植え込み、ビヒクル、ICP27-、またはVG161hウイルスの注射を受けた。血清および腫瘍の試料を注射120時間後に収集し、ヒトIL-12、ヒトIL-15/IL-15Rα、およびヒトIgG4の産生をELISAによって評価した。結果は図37Aに示す。
Fadu細胞をヌードマウスに植え込み、ビヒクル、VG160、またはVG161hウイルスの注射を受けた。腫瘍試料を注射24時間後に収集し、ヒトIL-12、ヒトIL-15/IL-15Ra、およびヒトIgG4の産生をELISAによって評価した。結果は図37Bに示す。
免疫応答におけるVG161mの効果
CT26結腸癌細胞をbalb/cマウスに植え込み、PBS、VG160、またはVG161mウイルスの注射を受けた。腫瘍試料を注射24時間後に収集し、CD8+T細胞、CD4+T細胞、またはNK細胞の百分率をフローサイトメトリーによって評価した。結果は、図38A~図38Cに示す。
以下は、本開示のさらなる例示的な実施形態である。
1)IL12、IL15および/またはIL受容体15アルファサブユニットのうちの1つ以上を発現するHSVベクター。一実施形態内で、HSVベクターは、IL12、IL15およびIL受容体15アルファサブユニットを発現する発現カセットを含む。種々の実施形態内で、発現するIL12、IL15およびIL15受容体アルファサブユニット配列は、哺乳類起源(例えば、マウス起源またはヒト起源)である。好ましい実施形態内で、発現カセットは、マウスまたはヒトIL12、マウスまたはヒトIL15、およびマウスまたはヒトIL15受容体アルファサブユニットを発現する。さらに他の実施形態内で、発現カセットは、マウスまたはヒトIL12、hIL15ならびにマウスおよびh15受容体アルファサブユニットのいずれかを発現する。
2)自己開裂性2Aペプチドをコードする核酸配列が、IL12、IL15、およびIL15受容体アルファサブユニットについてのコード配列の間でインフレームに位置する、実施形態1のHSVベクター。好ましい実施形態内で、IL12はマウスまたはヒト配列であり、IL15はヒト配列であり、IL15受容体アルファサブユニットはヒト配列である。
3)核酸配列が、VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP、QCTNYALLKLAGDVESNPGP、ATNF-SLLKQAGDVEENPGP、HYAGYFADLLIHDIETNPGP、GIFN-AHYAGYFADLLIHDIETNPGP、KAVRGYHADYYKQRLIHDVEMNPGP、GATNF-SLLKLAGDVELNPGP、EGRGSLLTCGDVEENPGP、AARQMLLLLSGDVETNPGP、FLRKRTQLLMSGDVESNPGP、GSWTDILLLLSGDVETNPGP、TRAEUEDELIRAGIESNPGP、AKFQIDKILISGDVELNPGP、SKFQIDKILISGDIELNPGP、SSIIRTKMLVSGDVEENPGPおよびCDAQRQKLLLSGDIEQNPGPからなる群より選択される自己開裂性2Aペプチドをコードする、実施形態2のHSVベクター
4)1つ以上のIRESが、IL12、IL15、およびIL15受容体アルファサブユニットについてのコード配列の間に位置する、実施形態1~3のいずれか1つのHSVベクター。好ましい実施形態内で、IL12はマウスまたはヒト配列であり、IL15はヒト配列であり、IL15受容体アルファサブユニットはヒト配列である。
5)IL15およびIL15受容体アルファサブユニットが、IRES配列を用いて共発現する、実施形態1~4のいずれか1つのHSVベクター。好ましい実施形態内で、IL12はマウスまたはヒト配列であり、IL15はヒト配列であり、IL15受容体アルファサブユニットはヒト配列である。
6)IL15およびIL15受容体アルファサブユニットが二方向プロモーターによって発現する、実施形態1~5のいずれか1つのHSVベクター。好ましい実施形態内で、IL12はマウスまたはヒト配列であり、IL15はヒト配列であり、IL15受容体アルファサブユニットはヒト配列である。
7)二方向プロモーターが二方向CMVである、実施形態6のHSVベクター。
8)IL15およびIL15受容体アルファサブユニットのそれぞれに、Lys5またはGlu5をコードする核酸配列が後続する、実施形態1~7のいずれか1つのHSVベクター。好ましい実施形態内で、IL12はマウスまたはヒト配列であり、IL15はヒト配列であり、IL15受容体アルファサブユニットはヒト配列である。
9)hIL15受容体アルファサブユニットが、バリアント1、バリアント2、バリアント3およびバリアント4からなる群より選択される、実施形態1~8のいずれか1つのHSVベクター。
10)1つ以上のPD-L1ブロッキングペプチドについての発現カセットをさらに含み、または当該発現カセットが、1つ以上のPD-L1ブロッキングペプチドを発現する、実施形態1~9のいずれか1つのHSVベクター。
11)複数のPD-L1ブロッキングペプチド間のペプチドリンカーをコードする配列をさらに含む、実施形態1~10のいずれか1つのHSVベクター。
12)複数のPD-L1ブロッキングペプチド間に1つ以上のIRES配列をさらに含む、実施形態1~11のいずれか1つのHSVベクター。
13)PD-L1ブロッキングペプチドの3’末端へ連結されたFcドメインをコードする配列をさらに含む、実施形態1~12のいずれか1つのHSVベクター。
14)発現カセットが、HSVゲノムの内部反復領域または末端反復領域のいずれかに挿入される、実施形態1~13のいずれか1つのHSVベクター。
15)PD-L1ブロッキングペプチドをコードする配列が、例えば、UL3ウイルス遺伝子とUL4ウイルス遺伝子、UL50遺伝子とUL51遺伝子、および/またはUS1とUS2との間などのウイルス遺伝子間に挿入される、実施形態10のHSVベクター。
16)ICP4またはICP27調節領域におけるNFkBおよびOCT4/SOX2増強要素をさらに含む、実施形態1~15のいずれか1つのHSVベクター。
17)ICP34.5遺伝子が欠失している、実施形態1~16のいずれか1つのHSVベクター。
18)発現カセットが、少なくとも1つの二方向CMVプロモーターを含む、実施形態1~17のいずれか1つのHSVベクター。
19)発現カセットが、少なくとも1つの細胞プロモーターを含む、実施形態1~18のいずれか1つのHSVベクター。
20)IL12/IL15/IL15受容体アルファサブユニットについての発現カセットが、元のウイルス配列がカセットによって置き換えられた内部反復領域または末端反復領域のいずれかへ挿入される、実施形態1~19のいずれか1つのHSVベクター。
21)HSVがHSV-1またはHSV-2のいずれかである、実施形態1~20のいずれかのHSVベクター。
22)ICP34.5遺伝子が、腫瘍細胞において過少発現するmiRNAの標的配列を含有する3’UTRによって調節される、実施形態1~21のいずれか1つのHSVベクター。
23)実施形態1~22のいずれか1つによるHSVベクターと、医薬として許容され得る担体と、を含む、医薬組成物。
24)実施形態1~22のいずれか1つによるHSVベクター、または実施形態23による医薬組成物を患者へ投与することを含む、癌を治療する方法。
25)当該癌が、癌腫、白血病、リンパ腫、骨髄腫および肉腫からなる群より選択される、実施形態24による方法。
本明細書で参照または言及される特許、公開物、科学文献、ウェブサイト、ならびに他の文書および材料はすべて、本発明の属する分野の当業者の技術レベルを示しており、それぞれのこのような参照される文書ならびに材料は、その全体がここに参照によって組み込まれたかまたはその全体が本明細書で明らかとなったかのような場合と同じ程度まで、参照により本明細書により組み込まれる。発明者は、いかなるこのような特許、公開物、科学文献、ウェブサイト、電子的に入手可能な情報、ならびに他の参照される材料または文書からのいかなるならびにすべての材料ならびに情報を本明細書へと物理的に組み込む権利を留保する。
本特許の記載された説明部分には、特許請求の範囲が含まれる。さらに、元の特許請求全部ならびに何らかのおよびすべての優先権文書からの特許請求の範囲全部を含む特許請求の範囲はすべて、本明細書の記載された説明部分へと本明細書によりそのすべてが参照により組み込まれ、発明者は、記載された説明または本出願の何らかの他の部分へと、いかなるおよびすべてのこのような特許請求の範囲を物理的に組み込む権利を留保する。したがって、例えば、いかなる状況下でも、本特許は、本特許の記載された説明部分においてこれらの語において請求項の正確な言語運用が明らかにされていないという主張に関して請求項について記載された説明を申し立てによると提供しないものとして解釈され得る。
特許請求の範囲は、法律によって解釈されるであろう。しかしながら、いかなる請求項または部分を解釈する、申し立てられたまたは認識された容易さまたは困難さにもかかわらず、いかなる状況下でも、本特許をもたらす1つのまたは複数の出願の遂行の間に請求項またはその何らかの部分の何らかの調整または修正は、従来技術の一部を形成しない本特許の何らかのおよびすべての等価物に対する何らかの権利を喪失したものとして解釈され得ない。
本明細書に開示する特長の全部は、何らかの組み合わせにおいて組み合わされ得る。したがって、別段の明確な記載がない限り、開示されるそれぞれの特長は、汎用シリーズの等価物または類似の特長の一例に過ぎない。
本発明が本発明を実施するための形態とともに説明されてきたが、上述の説明は、本発明の範囲を説明するよう企図されているのであって、制限するよう企図されてはおらず、このことは、添付の特許請求の範囲によって定義されることは理解されることになっている。したがって、上述から、本発明の具体的な非限定実施形態が本明細書で説明目的のために説明されてきたが、種々の変更が本発明の趣旨および範囲から逸れることなく行われ得ることは認識されるであろう。他の態様、利点、および変更は、後続の特許請求の範囲の範囲内であり、本発明は、添付の特許請求の範囲以外によって制限されない。
本明細書に説明される具体的な方法および組成物は、好ましい非限定実施形態を代表しており、例示的であって、本発明の範囲に関する制限として企図するものではない。他の目的、態様、および実施形態は、本明細書の考慮の下で当業者に生じるであろうし、特許請求の範囲によって定義されるような本発明の趣旨内に包含される。種々の置換および変更が本発明の範囲および趣旨から逸脱することなく、本明細書に開示される本発明に対してなされ得ることは当業者にとって容易に明らかであろう。本明細書に実例として説明されている本発明は、本明細書に具体的に開示されていないものを必須として何らかの1つのもしくは複数の要素、または1つのもしくは複数の制限がない状態で適切に実施され得る。したがって、例えば、本明細書の各場合において、本発明の非限定的実施形態または実施例において、「を含んでいる(comprising)」、「を含んでいる(including)」、「含有している」などの用語は、発展的に広めにかつ制限なしで読まれることになっている。本明細書に実例として説明する方法およびプロセスは適切には、異なる順序のステップで実施され得、これらは本明細書に記載のまたは特許請求の範囲におけるステップの順序に必ずしも拘束されるわけではない。
採用されてきた用語および表現は、説明の用語として使用されており、制限の用語として使用されるものではなく、このような用語および表現の使用において、示され説明された特長またはその部分の何らかの等価物を排除するために、このような用語および表現の使用において意図がないが、請求されるような本発明の範囲内で種々の変更が可能であることは認識される。したがって、本発明は、種々の非限定的な実施形態ならびに/または好ましい非限定実施形態および任意の特長によって具体的に開示されているが、当業者によって頼られ得るいかなるおよびすべての変更および変化も、添付の特許請求の範囲によって定義されるものとして本発明の範囲内であるとみなされることは理解されるであろう。本発明は、本明細書で広範にかつ包括的に説明されてきた。包括的な開示内に収まるさらに狭い種および下位の包括的な群分けのそれぞれも、本発明の一部を形成する。このことには、削除された材料が本明細書で具体的に列挙されていようとなかろうとにかかわらず、部類からいかなる対象も取り除くという仮定または負の制限を伴って本発明の包括的な説明が含まれている。
本明細書で使用する場合、および添付の特許請求の範囲において、「a」、「an」、および「the」という単数形には、別段の明確な記載がない限り、複数の参照物が含まれており、さもなければ、「Xおよび/またはY」は、「X」または「Y」または「X」および「Y」の両方を意味し、名詞の後に続く「s」という文字は、その名詞の複数形も単数形も指し示す。さらに、本発明の特長または態様がマーカッシュ群の点で説明されている場合、本発明がマーカッシュ群のいかなる個々のメンバーおよび複数のメンバーのいかなる下位群の点においても包含しそれにより説明されることは意図されており、当業者はそのことを認識しているであろうし、発明者は、マーカッシュ群のいかなる個々のメンバーまたは複数のメンバーのいかなる下位群にも具体的に言及するために、出願または特許請求の範囲を改定する権利を留保する。
他の非限定実施形態は、以下の特許請求の範囲内にある。本特許は、本明細書に具体的におよび/または明らかに開示されている具体的な例または非限定的な実施形態もしくは方法に限定されると解釈することはできない。いかなる状況下でも、本特許は、何らかの審査官または何らかの他の公務員あるいは特許商標事務所の被雇用者によってなされるいかなる陳述も、発明者によって応答して記載されたものに明らかに採用された資格または留保なしで具体的でない限り、このような陳述によって制限されるよう解釈されることはできない。

Claims (18)

  1. i)IL12、
    ii)IL15、および、
    iii)IL15受容体のアルファサブユニット、
    を発現する発現カセットを含む、腫瘍溶解性HSVベクター。
  2. 自己開裂性2Aペプチドをコードする核酸配列が、
    i)IL12、
    ii)IL15、および/または、
    iii)IL15受容体のアルファサブユニット、
    についてのコード配列間でインフレームに位置する、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  3. 核酸配列が、VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP、QCTNYALLKLAGDVESNPGP、ATNF-SLLKQAGDVEENPGP、HYAGYFADLLIHDIETNPGP、GIFN-AHYAGYFADLLIHDIETNPGP、KAVRGYHADYYKQRLIHDVEMNPGP、GATNF-SLLKLAGDVELNPGP、EGRGSLLTCGDVEENPGP、AARQMLLLLSGDVETNPGP、FLRKRTQLLMSGDVESNPGP、GSWTDILLLLSGDVETNPGP、TRAEUEDELIRAGIESNPGP、AKFQIDKILISGDVELNPGP、SKFQIDKILISGDIELNPGP、SSIIRTKMLVSGDVEENPGPおよびCDAQRQKLLLSGDIEQNPGPからなる群より選択される自己開裂性2Aペプチドをコードする、請求項2に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  4. 1つ以上のIRES配列が、
    i)IL12、
    ii)IL15、および/または
    iii)IL15受容体アルファサブユニット
    についてのコード配列間に位置する、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  5. i)IL12、
    ii)IL15および、
    iii)IL15受容体アルファサブユニット、
    の1以上が、二方向プロモーターによって発現する、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  6. IL15受容体アルファサブユニットが、バリアント1、バリアント2、バリアント3およびバリアント4からなる群より選択されるhIL15受容体アルファサブユニットである、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  7. さらにPD-L1ブロッキングペプチドを発現する、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  8. 複数のPD-L1ブロッキングペプチド間のペプチドリンカーをコードする配列をさらに含む、請求項7に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  9. PD-L1ブロッキングペプチドの3’末端へ連結したFcドメインをコードする配列をさらに含む、請求項7に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  10. 発現カセットが、HSVゲノムの内部反復領域または末端反復領域中、US1とUS2遺伝子、UL3とUL4ウイルス遺伝子、または、UL50とUL51遺伝子の間に挿入される、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  11. ICP4またはICP27調節領域においてNFkBおよびOCT4/SOX2増強要素をさらに含む、請求項1~10のいずれか1項に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  12. ICP34.5遺伝子が欠失している、請求項1~10のいずれか1項に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  13. 発現カセットがCMVプロモーターまたはEL-1αプロモーターを含む、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  14. HSVが、HSV-1またはHSV-2のいずれかである、請求項1~13のいずれかに記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  15. ICP34.5遺伝子が、腫瘍細胞において過少発現するmiRNAの標的配列を含有する3’UTRによって調節される、請求項1に記載の腫瘍溶解性HSVベクター。
  16. 請求項1~15のいずれか1項に記載の腫瘍溶解性HSVベクターを含む、医薬組成物。
  17. 請求項1~15のいずれか1項に記載の腫瘍溶解性HSVベクターを含む、癌治療用医薬組成物。
  18. 癌が、癌腫、白血病、リンパ腫、骨髄腫および肉腫からなる群より選択される、請求項17に記載の医薬組成物。
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