JP7068169B2 - 条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド及びその使用方法 - Google Patents

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Description

相互参照
本出願は、２０１６年１月８日に出願された米国仮特許出願第６２／２７６，７２５号の利益を主張するものであり、当該出願の全体を参照により本明細書に援用する。
連邦政府の助成による研究に関する陳述
本発明は、米国国立衛生研究所助成金番号Ｒ０１ ＣＡ１９６２７７、Ｐ５０ ＧＭ０８１８７９及びＲ０１ ＧＭ０５５０４０による政府の助成を受けてなされた。政府は、本発明において一定の権利を有する。
テキストファイルとして提供される配列表の参照による援用
２０１７年１月６日に作成された２，００５ＫＢのサイズのテキストファイル「ＵＣＳＦ－５２４ＷＯ＿ｓｅｑｌｉｓｔ＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」の配列表が本明細書とともに提出される。テキストファイルの内容は、その全体が参照により本明細書に援用される。
緒言
細胞ベースの養子免疫療法において、患者から単離された免疫細胞は、後に当該細胞が患者に戻されたときに新しい治療的機能を果たすことを可能にする合成タンパク質を発現するように改変することができる。そのような合成タンパク質の例は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）及び操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）である。現在使用されているＣＡＲの一例は、細胞外認識ドメイン（例えば、抗原結合ドメイン）、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインの融合である。抗原が結合すると、ＣＡＲの細胞内シグナル伝達部分は、免疫細胞において、腫瘍細胞の死などを誘導する細胞傷害性分子の放出などの活性関連応答を開始することができる。しかしながら、そのようなＣＡＲは、薬理学的に制御することができない。そのようなＣＡＲ及び操作されたＴＣＲの安全なヒト試験及び臨床使用には、これらの高度に操作されたタンパク質及びタンパク質複合体の強力な刺激活性に対する十分な制御が必要である。いくつかの場合において、設計により刺激する受容体からの活性化が好ましくないか、望ましくなくなったか、もはや必要とされなくなった場合に、免疫細胞活性化を阻害、停止または調節するために制御が必要とされる。
概要
本開示は、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドを提供する。条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ヘテロ二量体のポリペプチドの二量体化を誘導する二量体化物質の存在下で活性である。本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、様々な研究及び治療法に有用であり、それらの方法も提供される。
本開示は、ａ）二量体化対の第１のメンバー及び第１の異種ポリペプチドを含む第１のキメラポリペプチドと、ｂ）二量体化対の第２のメンバー及び第２の異種ポリペプチドを含む第２のキメラポリペプチドとを含むヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを提供し、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）α鎖であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＴＣＲβ鎖である。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ヘテロ二量体の第１のポリペプチドであり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドである。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＣ末端部分であり、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼの酵素機能を回復させる。いくつかの場合において、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼは、クラス２のＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓエンドヌクレアーゼである。いくつかの場合において、クラス２のＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓエンドヌクレアーゼは、ＩＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質、Ｖ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質またはＶＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質である。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、酵素のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、酵素のＣ末端部分であり、第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、酵素の酵素活性を回復させる。いくつかの場合において、酵素は、キナーゼ、プロテアーゼ、ホスファターゼまたはカスパーゼである。いくつかの場合において、第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドは、二量体化物質によって媒介される二量体化の際に近接すると活性を示すが、個別には活性を示さない。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＣ末端部分であり、第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、抗原受容体のシグナル伝達活性を回復させる。いくつかの場合において、ａ）第１の異種ポリペプチドは、受容体のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＣ末端部分であり、二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、受容体のシグナル伝達活性を回復させる。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000001
Figure 0007068169000002
から選択される。
本開示は、ａ）第１のキメラポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のキメラポリペプチドと、ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のキメラポリペプチドとを含むか、ａ）第１のキメラポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のキメラポリペプチドと、ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のキメラポリペプチドとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化因子の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付活性受容体を提供する。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、特異的結合対の第１のメンバーと膜貫通ドメインとの間に介在するヒンジ領域を含む。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、抗体もしくは抗体断片、リガンド、受容体または非抗体ベースの認識足場である。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、免疫グロブリンＩｇＧヒンジ領域またはＣＤ８由来のヒンジである。いくつかの場合において、第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ、ＯＸ－４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２及びＣＤ２８から選択される。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＺＡＰ７０及びＣＤ３－ζから選択される。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000003
Figure 0007068169000004
から選択されるペプチドである。いくつかの場合において、ｉ）第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢに由来し、ｉｉ）二量体化対の第１及び第２のメンバーは、ＰＰＡＲγ及びＳＲＣ３であり、ｉｉ）シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭを含む。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、一本鎖Ｆｖである。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、細胞上、固体表面上、または脂質二重層に存在するエピトープに結合する。いくつかの場合において、細胞は、がん細胞である。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞内抑制ドメインである。いくつかの場合において、細胞内抑制ドメインは、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ４、ＨＰＫ１、ＳＨＰ１、ＳＨＰ２、Ｓｔｓ１及びＣｓｋからなる群から選択されるタンパク質に由来する。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）であって、以下：二量体化対の第１のメンバーを含む合成刺激性ＩＣＲであって、二量体化対の第１のメンバーは合成刺激性ＩＣＲに連結されている、合成刺激性ＩＣＲと、細胞内抑制ドメインに連結された二量体化対の第２のメンバーを含む合成ＩＣＲリプレッサーとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、合成刺激性ＩＣＲと合成ＩＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化因子の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）を提供する。いくつかの場合において、合成刺激性ＩＣＲは、細胞内共刺激ドメインを含む。いくつかの場合において、細胞内共刺激ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＯＸ－４０、ＢＴＬＡ、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ及びＨＶＥＭからなる群から選択される。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは、合成刺激性ＩＣＲに細胞内で連結され、二量体化対の第２のメンバーは、細胞内抑制ドメインに細胞内で連結されている。いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通ドメインを更に含む。いくつかの場合において、二量体化対の第２のメンバーは、膜貫通ドメインに細胞内で連結されている。いくつかの場合において、二量体化対の第２のメンバーは、細胞外であり、膜貫通ドメインを介して細胞内抑制ドメインに連結されている。いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲは、可溶性抗原と結合する。いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲは、細胞表面抗原と結合する。いくつかの場合において、細胞内抑制ドメインは、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ４、ＨＰＫ１、ＳＨＰ１、ＳＨＰ２、Ｓｔｓ１及びＣｓｋからなる群から選択されるタンパク質に由来する抑制ドメインである。いくつかの場合において、合成刺激性ＩＣＲは、ＣＤ３－ζシグナル伝達ドメイン、ＺＡＰ７０シグナル伝達ドメイン及び免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）からなる群から選択される細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000005
Figure 0007068169000006
から選択される。いくつかの場合において、合成刺激性ＩＣＲは、合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）またはその一部である。いくつかの場合において、合成刺激性ＩＣＲは、合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）またはその一部である。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって以下：ａ）合成刺激性ＣＡＲであって、ｉ）細胞外認識ドメイン、ｉｉ）細胞外認識ドメインに連結された膜貫通ドメイン、ｉｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）細胞内刺激ドメインを含む、合成刺激性ＣＡＲと、ｂ）合成ＣＡＲリプレッサーであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメインを含む、合成ＣＡＲリプレッサーとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、合成刺激性ＣＡＲと合成ＣＡＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導するリガンドの存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。いくつかの場合において、合成ＣＡＲリプレッサーは、二量体化対の第２のメンバーに連結された膜貫通ドメイン、細胞内抑制ドメイン、またはその両方を更に含む。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000007
Figure 0007068169000008
から選択される。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）であって、以下：ａ）合成刺激性ＴＣＲであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、ｉｉｉ）少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖を含む操作されたＴＣＲポリペプチドであって、少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖は、膜貫通ドメインまたは二量体化対の第１のメンバーに連結されている、操作されたＴＣＲポリペプチドを含む、合成刺激性ＴＣＲと、ｂ）合成ＴＣＲリプレッサーであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメインを含む、合成ＴＣＲリプレッサーとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、合成刺激性ＴＣＲと合成ＴＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を提供する。いくつかの場合において、合成ＴＣＲリプレッサーは、二量体化対の第２のメンバーに連結された膜貫通ドメイン、細胞内抑制ドメイン、またはその両方を更に含む。いくつかの場合において、操作されたＴＣＲポリペプチドは、ＴＣＲγ鎖を更に含む。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000009
Figure 0007068169000010
から選択される。
本開示は、ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって、以下：ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含むか、ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、特異的結合対の第１のメンバーと膜貫通ドメインとの間に介在するヒンジ領域を含む。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、抗体もしくは抗体断片、リガンド、または受容体である。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、免疫グロブリンＩｇＧヒンジ領域またはＣＤ８由来のヒンジである。いくつかの場合において、第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ、ＯＸ－４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２及びＣＤ２８から選択される。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＺＡＰ７０及びＣＤ３－ζから選択される。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤは、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、
Figure 0007068169000011
Figure 0007068169000012
から選択される。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、一本鎖Ｆｖである。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、細胞上、固体表面上、または脂質二重層に存在するエピトープに結合する。いくつかの場合において、細胞は、がん細胞である。
本開示は、上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたは受容体を産生するように遺伝子改変された哺乳動物細胞を提供する。いくつかの場合において、細胞は、幹細胞、前駆細胞、または幹細胞もしくは前駆細胞に由来する細胞である。いくつかの場合において、細胞は、Ｔリンパ球またはＮＫ細胞である。
本開示は、上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性受容体またはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、ヌクレオチド配列は、プロモーターに機能的に連結されている。いくつかの場合において、プロモーターは、誘導性プロモーターである。いくつかの場合において、プロモーターは、細胞型特異的または組織特異的プロモーターである。いくつかの場合において、プロモーターは、Ｔリンパ球特異的プロモーターまたはＮＫ細胞特異的プロモーターである。いくつかの場合において、核酸は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで転写されたＲＮＡである。本開示は、核酸を含む組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、ウイルスベクター、例えば、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクターまたはアデノ随伴ウイルスベクターである。
本開示は、真核細胞の活性を調節する方法であって、ａ）上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたは受容体を真核細胞において発現させる工程と、ｂ）細胞をリガンドと接触させる工程とを含む、方法を提供する。
本開示は、Ｔリンパ球の活性を調節する方法であって、Ｔリンパ球を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーと接触させる工程を含み、Ｔリンパ球は、上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性受容体を産生するように遺伝子改変され、ヘテロ二量体条件付活性受容体は、二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーの存在下で二量体化して、Ｔリンパ球の活性を調節し、これにより、調節されたＴリンパ球が生じる、方法を提供する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、抗原である。いくつかの場合において、接触させる工程は、ｉｎ ｖｉｖｏで生じる。いくつかの場合において、Ｔリンパ球は、活性化され、これにより、活性化されたＴリンパ球が生じる。いくつかの場合において、活性化されたＴリンパ球は、標的細胞の殺傷を媒介する。いくつかの場合において、活性化されたＴリンパ球は、ＩＬ－２及び／またはＩＦＮ－γを産生する。いくつかの場合において、標的細胞は、がん細胞である。
本開示は、請求項６６～６８のいずれか一項に記載の細胞を作製する方法であって、上記もしくは本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性受容体もしくはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを用いて哺乳動物細胞を遺伝子改変する工程、または上記もしくは本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性受容体をコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを用いて哺乳動物細胞を遺伝子改変する工程を含む、方法を提供する。いくつかの場合において、遺伝子改変は、ｅｘ ｖｉｖｏで実施される。いくつかの場合において、細胞は、Ｔリンパ球、幹細胞、ＮＫ細胞、前駆細胞、幹細胞に由来する細胞、または前駆細胞に由来する細胞である。
本開示は、個体のがんを治療する方法であって、ｉ）上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを用いて、個体から得たＴリンパ球を遺伝子改変する工程であって、ヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲの抗原結合ドメインは、個体のがん細胞上のエピトープに対して特異的であり、当該遺伝子改変は、ｅｘ ｖｉｖｏで実施される、遺伝子改変する工程と、ｉｉ）遺伝子改変されたＴリンパ球を個体に導入する工程と、ｉｉｉ）有効量の二量体化物質を個体に投与する工程とを含み、二量体化物質は、ヘテロ二量体条件付活性受容体の二量体化を誘導し、当該二量体化は、遺伝子改変されたＴリンパ球の活性化及びがん細胞の殺傷をもたらし、これにより、がんを治療する、方法を提供する。いくつかの場合において、二量体化物質は、核内ホルモン受容体のＬＢＤとコレギュレーターを結合させる核内ホルモンである。
本開示は、宿主細胞の活性を調節する方法であって、宿主細胞を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーと接触させる工程を含み、Ｔリンパ球は、上記または本明細書に別途記載されるヘテロ二量体条件付活性受容体を産生するように遺伝子改変され、ヘテロ二量体条件付活性受容体は、二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーの存在下で二量体化して、宿主細胞の少なくとも１つの活性を調節する、方法を提供する。いくつかの場合において、活性は、増殖、細胞生存、アポトーシス、遺伝子発現または免疫活性化である。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、抗原である。
図１Ａ～１Ｆは、ミネラルコルチコイド受容体（ＭＲ）のアミノ酸配列を示す。図１Ａ：完全長ＭＲアミノ酸配列、図１Ｂ～１Ｅ：ＭＲのリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）のアミノ酸配列、図１Ｆ：様々な種のＭＲのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：７０～８４）。 図２Ａ～２Ｉは、アンドロゲン受容体（ＡＲ）のアミノ酸配列を示す。図２Ａ：完全長ＡＲアミノ酸配列、図２Ｂ～２Ｉ：ＡＲのＬＢＤのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８５～９３）。 図３Ａ～３Ｄは、プロゲステロン受容体（ＰＲ）のアミノ酸配列を示す。図３Ａ：完全長ＰＲアミノ酸配列、図３Ｂ～３Ｃ：ＰＲのＬＢＤのアミノ酸配列、図３Ｄ：様々な種のＰＲのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：９４～１０３）。 図４Ａ～４Ｄは、甲状腺ホルモン受容体β（ＴＲβ）のアミノ酸配列を示す。図３Ａ：完全長ＰＲアミノ酸配列、図３Ｂ～３Ｃ：ＴＲβのＬＢＤのアミノ酸配列、図３Ｄ：様々な種のＴＲβのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１０４～１１８）。 図５Ａ～５Ｈは、エストロゲン受容体α（ＥＲα）のアミノ酸配列を示す。図５Ａ：完全長ＥＲαアミノ酸配列、図５Ｂ～５Ｇ：ＥＲαのＬＢＤのアミノ酸配列、図５Ｈ：様々な種のＥＲαのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１１９～１３３）。 図６Ａ～６Ｃは、エストロゲン受容体β（ＥＲβ）のアミノ酸配列を示す。図６Ａ：完全長ＥＲβアミノ酸配列、図６Ｂ：ＥＲβのＬＢＤのアミノ酸配列、図６Ｃ：様々な種のＥＲβのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１３４～１４３）。 図７Ａ～７Ｅは、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ（ＰＰＡＲ－γ）のアミノ酸配列を示す。図７Ａ：完全長ＰＰＡＲ－γアミノ酸配列、図７Ｂ～７Ｄ：ＰＰＡＲ－γのＬＢＤのアミノ酸配列、図７Ｅ：様々な種のＰＰＡＲ－γのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１４４～１５７）。 図８Ａ～８Ｃは、グルココルチコイド受容体（ＧＲ）のアミノ酸配列を示す。図８Ａ：完全長ＧＲアミノ酸配列、図８Ｂ：ＧＲのＬＢＤのアミノ酸配列、図８Ｃ：様々な種のＧＲのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１５８～１６６）。 図９Ａ～９Ｃは、ビタミンＤ受容体（ＶＤＲ）のアミノ酸配列を示す。図９Ａ：完全長ＶＤＲアミノ酸配列、図９Ｂ：ＶＤＲのＬＢＤのアミノ酸配列、図９Ｃ：様々な種のＶＤＲのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１６７～１７２）。 図１０Ａ～１０Ｃは、甲状腺ホルモン受容体α（ＴＲα）のアミノ酸配列を示す。図１０Ａ：完全長ＴＲαアミノ酸配列、図１０Ｂ：ＴＲαのＬＢＤのアミノ酸配列、図１０Ｃ：様々な種のＴＲαのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１７３～１８５）。 図１１Ａ～１１Ｃは、レチノイン酸受容体β（ＲＡＲβ）のアミノ酸配列を示す。図１１Ａ：完全長ＲＡＲβアミノ酸配列、図１１Ｂ：ＲＡＲβのＬＢＤのアミノ酸配列、図１１Ｃ：様々な種のＲＡＲβのＬＢＤの複数の配列アライメント（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１８６～１９６）。 三要素ヘテロ二量体化モジュールとしての核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）、コレギュレーターペプチド及び小分子を特徴とするオンスイッチＣＡＲの模式図である。 ＰＰＡＲγをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物の模式図である。 ロシグリタゾン二量体化因子（１０マイクロモル）の存在下または非存在下で、Ｋ５６２標的細胞（指定の＋／－ ＣＤ１９ Ａｇ）と１８時間共培養した後のオンスイッチＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞（指定のレンチウイルス構築物で形質導入した細胞）によるＩＬ－２サイトカイン産生を示す。 エストロゲン受容体αをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物の模式図である。 図１６Ａ～１６Ｂは、小分子二量体化因子（４－ヒドロキシタモキシフェンまたはラパログＡＰ２１９６７）の存在下または非存在下で、ＣＤ１９または無関係の抗原（「メソ」）を発現するＫ５６２標的細胞と２４時間共培養した後のＥＲ ＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞によるＣＤ６９のアップレギュレーションを示す。ＣＤ１９を発現するＫ５６２細胞の存在下でのみ、ＥＲ ＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞のＣＤ６９発現が４－ヒドロキシタモキシフェンにより強く誘導される（ＥＣ５０ 約１００ｎＭ）。ラパマイシンＣＡＲ及び不活化ラパマイシンＣＡＲをそれぞれ陽性対照及び陰性対照として試験した。不活化ラパマイシンＣＡＲは、シグナル伝達を行わないように、ＩＴＡＭドメイン中に変異を含む。図１６Ｂに示されるデータ系列は、後から前に、ＣＤ１９抗原＋４－ヒドロキシタモキシフェン１０μＭ、１μＭ、１００ｎＭ、１０ｎＭ、１ｎＭ、０ｎＭ、メソ抗原＋１０μＭ ラパログ、及びメソ抗原＋０μＭ ラパログである。 エストロゲン受容体βをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物の模式図を記載する。 図１８Ａ～１８Ｂは、小分子二量体化因子（４－ヒドロキシタモキシフェンまたはラパログ）の存在下または非存在下で、ＣＤ１９または無関係の抗原（「メソ」）を発現するＫ５６２標的細胞と２４時間共培養した後に測定した、ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲベースのオンスイッチＣＡＲを発現する初代ヒトＴ細胞によるＣＤ６９のアップレギュレーションを示す。ＣＤ６９発現は、二量体化因子の用量に依存して誘導される。図１８Ｂに示されるデータ系列は、後から前に、ＣＤ１９抗原＋４－ヒドロキシタモキシフェン１０μＭ、１μＭ、１００ｎＭ、１０ｎＭ、１ｎＭ、０ｎＭ、メソ抗原＋１０μＭ ラパログ、及びメソ抗原＋０μＭ ラパログである。 ＬＢＤ、コレギュレーター及び二量体化物質の種々の可能な組み合わせを示す表を記載する。 図２０Ａ～２０Ｃは、Ｌｙｎキナーゼのアミノ酸配列（図２０Ａ）、ＬｙｎキナーゼのＮ末端部分のアミノ酸配列（図２０Ｂ）、及びＬｙｎキナーゼのＣ末端部分のアミノ酸配列（図２０Ｃ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１９７～１９９）。 Ｆａｋキナーゼのアミノ酸配列を記載する（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２００）。 図２２Ａ～２２Ｂは、ＦＸＲのアミノ酸配列（図２２Ａ）及びＦＸＲのＬＢＤのアミノ酸配列（図２２Ｂ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０１～２０２）。 図２３Ａ～２３Ｂは、ＬＸＲαのアミノ酸配列（図２３Ａ）及びＬＸＲαのＬＢＤのアミノ酸配列（図２３Ｂ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０３～２０４）。 図２４Ａ～２４Ｂは、ＲＯＲγのアミノ酸配列（図２４Ａ）及びＲＯＲγのＬＢＤのアミノ酸配列（図２４Ｂ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０５～２０６）。 図２５Ａ～２５Ｂは、ＲＸＲαのアミノ酸配列（図２５Ａ）及びＲＸＲαのＬＢＤのアミノ酸配列（図２５Ｂ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０７～２０８）。 図２６Ａ～２６Ｂは、ＰＸＲのアミノ酸配列（図２６Ａ）及びＰＸＲのＬＢＤのアミノ酸配列（図２６Ｂ）を示す（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２０９～２１０）。 表１（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２１１～２７８）を記載する。 化膿レンサ球菌（Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ）Ｃａｓ９のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２７９）を記載する。 様々なコレギュレーターポリペプチドのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８０～３０２）を記載する。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 図２９の説明を参照のこと。 ＣＤ１９特異的ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲオンスイッチＣＡＲを発現する初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞による標的細胞殺傷を示す。 例示的なＩＬ－２ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０３～３１３）を記載する。 例示的なＩＬ－３ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１４～３１７）を記載する。 例示的なＩＬ－６ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１８～３２６）を記載する。 例示的なＩＬ－１２ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２７～３２９）を記載する。 例示的なプロラクチンファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３０～３３４）を記載する。 例示的なインターフェロンファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３５～３３８）を記載する。 例示的なＩＬ－１０ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３９～３４５）を記載する。 例示的なＩＬ－１７ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４６～３５０）を記載する。 例示的な免疫グロブリン様スーパーファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５１～３６１）を記載する。 例示的な腫瘍壊死因子ファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６２～３９２）を記載する。 例示的なケモカイン受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９３～４０９）を記載する。 例示的なＴＧＦ－βファミリー受容体のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１０～４１２）を記載する。 例示的な受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ）のアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１３～４６９）を記載する。
定義
「ポリヌクレオチド」及び「核酸」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかである、任意の長さのヌクレオチドの重合形態を指す。したがって、本用語は、限定するものではないが、一本鎖、二本鎖もしくは多鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ－ＲＮＡハイブリッド、またはプリン及びピリミジン塩基もしくは他の天然、化学的もしくは生化学的修飾、非天然もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含む重合体を含む。
「機能的に連結される」は、そのように記載された構成要素が、意図された様式で機能することを可能にする関係にある並置を指す。例えば、プロモーターは、その転写または発現に影響を与える場合、コーディング配列に機能的に連結されている。
「ベクター」または「発現ベクター」は、別のＤＮＡセグメント、すなわち、「インサート」が接続され、接続されたセグメントの複製を細胞内で引き起こすことができる、プラスミド、ファージ、ウイルスまたはコスミドなどのレプリコンである。
「異種」とは、本明細書で使用されるとき、未変性（例えば、天然）の核酸またはタンパク質にはみられないヌクレオチドまたはポリペプチド配列をそれぞれ意味する。
「抗体」及び「免疫グロブリン」という用語は、任意のアイソタイプの抗体または免疫グロブリン、抗原への特異的結合を保持している抗体断片を含み、これらには、Ｆａｂ、Ｆｖ、ｓｃＦｖ及びＦｄ断片、キメラ抗体、ヒト化抗体、一本鎖抗体（ｓｃＡｂ）、単一ドメイン抗体（ｄＡｂ）、単一ドメイン重鎖抗体、単一ドメイン軽鎖抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体、ならびに抗体及び非抗体タンパク質の抗原結合（本明細書において抗原結合とも称される）部分を含む融合タンパク質が含まれるが、これらに限定されない。抗体は、例えば、放射性同位体、検出可能な生成物をもたらす酵素、蛍光タンパク質などを用いて検出可能に標識され得る。抗体は、特異的結合対のメンバー、例えば、ビオチン（ビオチン－アビジン特異的結合対のメンバー）などの他の部分に更に結合され得る。抗体はまた、限定するものではないが、ポリスチレンのプレートまたはビーズなどを含む、固体支持体に結合され得る。また、本用語には、Ｆａｂ’、Ｆｖ、Ｆ（ａｂ’）２及び／または抗原への特異的結合を保持している他の抗体断片、ならびにモノクローナル抗体も包含される。本明細書で使用されるとき、モノクローナル抗体は、同一の細胞群によって産生される抗体であり、その全てが細胞複製の繰り返しにより単一細胞から産生される。すなわち、細胞のクローンは、単一の抗体種のみを産生する。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術を使用して産生され得るが、当業者に知られている他の産生方法も使用することができる（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリーに由来する抗体）。抗体は、一価または二価であり得る。抗体は、Ｉｇ単量体であってよく、これは、４つのポリペプチド鎖（ジスルフィド結合によって連結された２つの重鎖と２つの軽鎖）からなる「Ｙ型」分子である。
本明細書で使用される「ヒト化免疫グロブリン」という用語は、異なる起源の免疫グロブリンの部分を含む免疫グロブリンであって、少なくとも１つの部分がヒト起源のアミノ酸配列を含む、免疫グロブリンを指す。例えば、ヒト化抗体は、必要な特異性を有するマウスなどの非ヒト起源の免疫グロブリンに由来する部分と、ヒト起源の免疫グロブリン配列に由来する部分とを含み得（例えば、キメラ免疫グロブリン）、これらは、従来技術（例えば、合成）によって化学的に一緒に接続され得るか、遺伝子工学技術を使用して連続するポリペプチドとして作製され得る（例えば、連続するポリペプチド鎖を生成するように、タンパク質部分をコードするキメラ抗体のＤＮＡを発現させることができる）。ヒト化免疫グロブリンの別の例は、非ヒト起源の抗体に由来するＣＤＲと、ヒト起源の軽鎖及び／または重鎖に由来するフレームワーク領域とを含む１つ以上の免疫グロブリン鎖を含有する免疫グロブリンである（例えば、フレームワークの変更を伴うまたは伴わないＣＤＲグラフト抗体）。キメラまたはＣＤＲグラフト化一本鎖抗体もまた、ヒト化免疫グロブリンという用語に包含される。例えば、Ｃａｂｉｌｌｙらの米国特許第４，８１６，５６７号、Ｃａｂｉｌｌｙらの欧州特許第０，１２５，０２３Ｂ１号、Ｂｏｓｓらの米国特許第４，８１６，３９７号、Ｂｏｓｓらの欧州特許第０，１２０，６９４Ｂ１号、Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ，Ｍ．Ｓ．らのＷＯ８６／０１５３３、Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ，Ｍ．Ｓ．らの欧州特許第０，１９４，２７６Ｂ１号、Ｗｉｎｔｅｒの米国特許第５，２２５，５３９号、Ｗｉｎｔｅｒの欧州特許第０，２３９，４００Ｂ１号、Ｐａｄｌａｎ，Ｅ．Ａ．らの欧州特許出願第０，５１９，５９６Ａ１号を参照されたい。また、一本鎖抗体に関しては、Ｌａｄｎｅｒらの米国特許第４，９４６，７７８号、Ｈｕｓｔｏｎの米国特許第５，４７６，７８６号、及びＢｉｒｄ，Ｒ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４２：４２３－４２６（１９８８））を参照されたい。
「ナノボディ」（Ｎｂ）という用語は、本明細書で使用されるとき、天然に生じる重鎖抗体に由来する最小の抗原結合断片または単一可変ドメイン（ＶＨＨ）を指し、当業者に知られている。ナノボディは、ラクダ科にみられる、重鎖のみの抗体に由来する（Ｈａｍｅｒｓ－Ｃａｓｔｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９３；Ｄｅｓｍｙｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９６）。「ラクダ科」免疫グロブリンファミリーでは、ポリペプチド軽鎖の欠如が認められる。「ラクダ科」は、旧世界のラクダ科（Ｃａｍｅｌｕｓ ｂａｃｔｒｉａｎｕｓ及びＣａｍｅｌｕｓ ｄｒｏｍｅｄａｒｉｕｓ）及び新世界のラクダ科（例えば、Ｌｌａｍａ ｐａｃｃｏｓ、Ｌｌａｍａ ｇｌａｍａ、Ｌｌａｍａ ｇｕａｎｉｃｏｅ及びＬｌａｍａ ｖｉｃｕｇｎａ）を含む。単一可変ドメイン重鎖抗体は、本明細書において、ナノボディまたはＶＨＨ抗体と称される。
「抗体断片」は、インタクト抗体の一部、例えば、インタクト抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ'、Ｆ（ａｂ'）２及びＦｖ断片；ダイアボディ；直鎖抗体（Ｚａｐａｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７－１０６２（１９９５））；ドメイン抗体（ｄＡｂ；Ｈｏｌｔ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２１：４８４）；一本鎖抗体分子；ならびに抗体断片から形成された多重特異性抗体が挙げられる。抗体をパパイン消化すると、それぞれが単一の抗原結合部位を有する「Ｆａｂ」断片と呼ばれる２つの同一の抗原結合断片と、容易に結晶化する能力を反映した表記である残留「Ｆｃ」断片とが生成される。ペプシン処理では、２つの抗原結合部位を有し、抗原に依然として架橋することができるＦ（ａｂ'）２断片が得られる。
「Ｆｖ」は、完全な抗原認識部位及び抗原結合部位を含有する最小の抗体断片である。この領域は、１つの重鎖可変ドメインと１つの軽鎖可変ドメインが非共有結合で緊密に結合した二量体からなる。この構成において、各可変ドメインの３つのＣＤＲが相互作用してＶＨ－ＶＬ二量体の表面上に抗原結合部位を画定する。全体として、６つのＣＤＲが、抗体に抗原結合特異性を付与する。しかしながら、単一の可変ドメイン（または抗原に対して特異的なＣＤＲを３つしか含まない半分のＦｖ）であっても、親和性は全結合部位よりも低くなるが、抗原を認識し結合する能力を有する。
「Ｆａｂ」断片はまた、軽鎖の定常ドメインと、重鎖の第１の定常ドメイン（ＣＨ１）とを含有する。Ｆａｂ断片は、重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシル末端に、抗体ヒンジ領域に由来する１つ以上のシステインを含む数個の残基が付加されている点で、Ｆａｂ'断片とは異なる。Ｆａｂ’－ＳＨとは、定常ドメインのシステイン残基（複数可）が遊離チオール基を持つＦａｂ’の本明細書における表記である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、元来、その断片間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として作製された。抗体断片の他の化学的カップリングも知られている。
任意の脊椎動物種に由来する抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、κ及びλと呼ばれる２つの明確に異なる種類のうちの１つに割り当てられ得る。免疫グロブリンは、その重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンには、５つの主要なクラス、すなわちＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭがあり、これらのクラスのいくつかは、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ及びＩｇＡ２のサブクラス（アイソタイプ）に更に分類することができる。サブクラスは、タイプ、例えば、ＩｇＧ２ａ及びＩｇＧ２ｂに更に分けることができる。
「一本鎖Ｆｖ」または「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは、単一ポリペプチド鎖中に存在する。いくつかの実施形態において、Ｆｖポリペプチドは、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間にポリペプチドリンカーを更に含み、このリンカーにより、ｓＦｖは、抗原結合に望ましい構造を形成することが可能になる。ｓＦｖの概説については、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ｐｐ．２６９－３１５（１９９４）を参照されたい。
「ダイアボディ」という用語は、２つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片であって、同じポリペプチド鎖（ＶＨ－ＶＬ）中に、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に連結された重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む、断片を指す。同じ鎖上の２つのドメイン間の対形成ができないような短いリンカーを使用することにより、ドメインを別の鎖の相補的ドメインと対形成させ、２つの抗原結合部位を形成させている。ダイアボディについては、例えば、ＥＰ４０４，０９７；ＷＯ９３／１１１６１、及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８において、より詳細に記載されている。
本明細書で使用されるとき、「ヒンジ領域」という用語は、隣接するポリペプチド領域に構造的柔軟性及び間隔を与える、柔軟性のあるポリペプチド連結領域（本明細書において「ヒンジ」または「スペーサー」とも称される）を指し、天然または合成ポリペプチドから構成され得る。免疫グロブリン（例えば、ＩｇＧ１）に由来する「ヒンジ領域」は、一般に、ヒトＩｇＧ１のＧｌｕ２１６からＰｒｏ２３０に延びる領域として定義される（Ｂｕｒｔｏｎ（１９８５）Ｍｏｌｅｃ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，２２：１６１－２０６）。他のＩｇＧアイソタイプのヒンジ領域は、重鎖間ジスルフィド（Ｓ－Ｓ）結合を形成する最初と最後のシステイン残基を同じ位置に配置することによって、ＩｇＧ１配列に合わせることができる。ヒンジ領域は、自然発生または非自然発生のものであってよく、限定するものではないが、米国特許第５，６７７，４２５号に記載される改変ヒンジ領域が含まれる。ヒンジ領域は、ＣＨ１ドメインのものとは異なるクラスまたはサブクラスの抗体に由来する完全なヒンジ領域を含み得る。「ヒンジ領域」という用語は、ＣＤ８、ならびに隣接する領域に柔軟性及び間隔を与えることにおいて類似の機能を提供する他の受容体に由来する領域を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「親和性」という用語は、２つの作用物質（例えば、抗体及び抗原）の可逆的結合の平衡定数を指し、解離定数（ＫＤ）で表される。親和性は、無関係のアミノ酸配列に対する抗体の親和性よりも、少なくとも１倍超、少なくとも２倍超、少なくとも３倍超、少なくとも４倍超、少なくとも５倍超、少なくとも６倍超、少なくとも７倍超、少なくとも８倍超、少なくとも９倍超、少なくとも１０倍超、少なくとも２０倍超、少なくとも３０倍超、少なくとも４０倍超、少なくとも５０倍超、少なくとも６０倍超、少なくとも７０倍超、少なくとも８０倍超、少なくとも９０倍超、少なくとも１００倍超、もしくは少なくとも１，０００倍超、またはそれ以上であり得る。抗体の標的タンパク質に対する親和性は、例えば、約１００ナノモル（ｎＭ）～約０．１ｎＭ、約１００ｎＭ～約１ピコモル（ｐＭ）、または約１００ｎＭ～約１フェムトモル（ｆＭ）以上であり得る。本明細書で使用されるとき、「アビディティ」という用語は、希釈後における２つ以上の物質の複合体の解離抵抗性を指す。「免疫反応性」及び「優先的結合」という用語は、抗体及び／または抗原結合断片に関して、本明細書中で区別なく使用される。
「結合」という用語は、例えば、共有結合性、静電性、疎水性、ならびにイオン性及び／または水素結合相互作用（塩橋及び水橋などの相互作用を含む）による２つの分子間の直接的会合を指す。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの細胞外ドメイン中に存在する特異的結合対の第１のメンバーは、特異的結合対の第２のメンバーに特異的に結合する。「特異的結合」は、少なくとも約１０－７Ｍ超、例えば、５×１０－７Ｍ、１０－８Ｍ、５×１０－８Ｍ超の親和性を有する結合を指す。「非特異的結合」は、約１０－７Ｍ未満、例えば、１０－６Ｍ、１０－５Ｍ、１０－４Ｍなどの親和性を有する結合を指す。
「ポリペプチド」、「ペプチド」及び「タンパク質」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、任意の長さのアミノ酸の重合形態を指し、これらには、遺伝子的にコードされた及び非遺伝子的にコードされたアミノ酸、化学的または生化学的に修飾されたまたは誘導体化されたアミノ酸、ならびに修飾されたペプチド骨格を有するポリペプチドが含まれ得る。本用語は、限定するものではないが、異種アミノ酸配列との融合タンパク質、異種及び同種リーダー配列との融合体（Ｎ末端メチオニン残基含有または非含有）；免疫学的にタグ付けされたタンパク質などを含む、融合タンパク質を包含する。
「単離された」ポリペプチドは、その自然環境の成分から特定、分離及び／または回収されたものである。その自然環境の混入成分は、ポリペプチドの診断上または治療上での使用を妨げ得る物質であり、酵素、ホルモン及び他のタンパク質性または非タンパク質性溶質を含み得る。いくつかの実施形態において、ポリペプチドは、（１）Ｌｏｗｒｙ法で決定されたときの抗体重量が９０重量％超、９５重量％超または９８重量％超、例えば、９９重量％超になるまで、（２）スピニングカップ配列決定装置の使用により、Ｎ末端または内部アミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度になるまで、または（３）クマシーブルー染色またはシルバー染色を使用する、還元条件もしくは非還元条件下におけるドデシル硫酸ナトリウム－ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ－ＰＡＧＥ）によって均質性が得られるまで、精製され得る。単離されたポリペプチドには、組み換え細胞内のｉｎ ｓｉｔｕポリペプチドが含まれる。これは、ポリペプチドの自然環境の少なくとも１つの構成成分が存在しないためである。いくつかの場合において、単離されたポリペプチドは、少なくとも１つの精製ステップによって精製され得る。
「モジュール」という用語は、本明細書で使用されるとき、いくつかの機能、特に生物学的機能に関連する、連続的なポリペプチド配列またはその断片を指す。
「ドメイン」及び「モチーフ」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、１つ以上の特定の機能を有する構造ドメインと、構造化されないが１つ以上の特定の機能を保持する、ポリペプチドの非構造セグメントの両方を指す。例えば、構造ドメインは、ポリペプチドの特定の機能に寄与する三次元構造を備える、折り畳まれたポリペプチド中の連続的または不連続的な複数のアミノ酸またはその一部を包含し得るが、これらに限定されない。他の場合において、ドメインは、折り畳まれないポリペプチドまたは不定形のポリペプチドの特定の機能を維持する複数の２つ以上のアミノ酸またはその部分を含む、ポリペプチドの非構造セグメントを含み得る。この定義内には、不定形または非構造であるが、標的または結合パートナーと会合すると、構造化するか、決まった形を取るドメインが包含される。天然の非構造ドメイン及び天然の非構造タンパク質のドメイン非限定的な例は、例えば、Ｄｙｓｏｎ＆Ｗｒｉｇｈｔ．Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ ６：１９７－２０８に記載されている。
本明細書中で区別なく使用される「キメラ抗原受容体」及び「ＣＡＲ」という用語は、免疫細胞の活性化を誘発または阻害することができる人工の多モジュール分子を指し、一般に、限定するものではないが、細胞外ドメイン（例えば、リガンド／抗原結合ドメイン）、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。「ＣＡＲ」という用語は、ＣＡＲ分子に特に限定するものではなく、ＣＡＲバリアントも含む。ＣＡＲバリアントには、ＣＡＲの細胞外部分（例えば、リガンド結合部分）と細胞内部分（例えば、細胞内シグナル伝達部分）が２つの別個の分子上に存在する分割ＣＡＲが含まれる。ＣＡＲバリアントにはまた、条件付きで活性化可能なＣＡＲであるオンスイッチＣＡＲが含まれ、当該ＣＡＲは、例えば、分割ＣＡＲを含み、分割ＣＡＲの２つの部分の条件付ヘテロ二量体化が薬理学的に制御される。ＣＡＲバリアントにはまた、一次ＣＡＲの活性を増幅または抑制することができる二次ＣＡＲ結合ドメインを含む、二重特異性ＣＡＲが含まれる。ＣＡＲバリアントにはまた、例えば、二重特異性ＣＡＲシステムの構成成分として使用することができる、抑制性キメラ抗原受容体（ｉＣＡＲ）が含まれ得、この場合、二次ＣＡＲ結合ドメインの結合が一次ＣＡＲ活性化の抑制をもたらす。ＣＡＲ分子及びその誘導体（すなわち、ＣＡＲバリアント）は、例えば、ＰＣＴ国際出願第ＵＳ２０１４／０１６５２７号；Ｆｅｄｏｒｏｖ ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉ Ｔｒａｎｓｌ Ｍｅｄ（２０１３）；５（２１５）：２１５ｒａ１７２；Ｇｌｉｅｎｋｅ ｅｔ ａｌ．Ｆｒｏｎｔ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ（２０１５）６：２１；Ｋａｋａｒｌａ＆Ｇｏｔｔｓｃｈａｌｋ ５２ Ｃａｎｃｅｒ Ｊ（２０１４）２０（２）：１５１－５；Ｒｉｄｄｅｌｌ ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｊ（２０１４）２０（２）：１４１－４；Ｐｅｇｒａｍ ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｊ（２０１４）２０（２）：１２７－３３；Ｃｈｅａｄｌｅ ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｖ（２０１４）２５７（１）：９１－１０６；Ｂａｒｒｅｔｔ ｅｔ ａｌ．Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｍｅｄ（２０１４）６５：３３３－４７；Ｓａｄｅｌａｉｎ ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｄｉｓｃｏｖ（２０１３）３（４）：３８８－９８；Ｃａｒｔｅｌｌｉｅｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｍｅｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ（２０１０）９５６３０４に記載されており、これらの開示の全体を参照により本明細書に援用する。
本明細書で使用されるとき、「免疫細胞」という用語は、概して、骨髄で産生される造血幹細胞（ＨＳＣ）に由来する白血球（ｗｈｉｔｅ ｂｌｏｏｄ ｃｅｌｌ）、白血球（ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ）を含む。「免疫細胞」は、例えば、リンパ球（Ｔ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞）及び骨髄由来細胞（好中球、好酸球、好塩基球、単球、マクロファージ、樹状細胞）を含む。
「Ｔ細胞」は、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害活性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、Ｔ制御性細胞（Ｔｒｅｇ）及びγδＴ細胞を含む、ＣＤ３を発現する全てのタイプの免疫細胞を含む。
「細胞傷害性細胞」は、ＣＤ８＋Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞及び好中球を含み、これらの細胞は、細胞傷害性応答を媒介することができる。
本明細書で使用されるとき、「幹細胞」という用語は、概して、分化可能細胞または多能性幹細胞を含む。「幹細胞」は、例えば、胚幹細胞（ＥＳ）、間葉系幹細胞（ＭＳＣ）、人工多能性幹細胞（ｉＰＳ）及び分化決定された前駆細胞（造血幹細胞（ＨＳＣ）；骨髄由来細胞、神経前駆細胞など）を含む。
本明細書で使用されるとき、「治療」、「治療すること」、「治療する」などの用語は、所望の薬理学的及び／または生理学的効果を得ることを指す。効果は、疾患もしくはその症状を完全にもしくは部分的に防ぐという点で、予防的であり得、かつ／または疾患及び／もしくは疾患に帰属する有害な影響に対する部分的もしくは完全な治癒という点で、治療的であり得る。「治療」は、本明細書で使用されるとき、哺乳動物、特にヒトにおける疾患のあらゆる治療を含み、（ａ）疾患にかかりやすい可能性があるが、罹患の診断をまだ受けていない対象において発症を防ぐこと、（ｂ）疾患を抑制すること、すなわち、その発症を阻止すること、及び（ｃ）疾患を軽減すること、すなわち、疾患を後退させることを含む。
「個体」、「対象」、「宿主」及び「患者」、という用語は、本明細書中で区別なく使用され、限定するものではないが、ネズミ類（ラット、マウス）、非ヒト霊長類、ヒト、イヌ類、ネコ類、有蹄類（例えば、ウマ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ）、ウサギ類などを含む哺乳動物を指す。いくつかの場合において、個体は、ヒトである。いくつかの場合において、個体は、非ヒト霊長類である。いくつかの場合において、個体は、げっ歯類、例えば、ラットまたはマウスである。いくつかの場合において、個体は、ウサギ類、例えば、ウサギである。
「治療上有効な量」または「効果的な量」は、作用物質の量または２つの作用物質の合計量であって、疾患を治療するために哺乳動物または他の対象に投与されたとき、疾患に対するかかる治療をもたらすのに十分な量を指す。「治療上有効な量」は、作用物質（複数可）、疾患及びその重症度、ならびに治療対象の年齢、体重などに応じて変動し得る。
本明細書で使用されるとき、「ヘテロマー」という用語は、２種以上のサブユニットを含有するポリペプチドまたはタンパク質を指す。そのようなヘテロマーポリペプチドは、いくつかの場合において、「ヘテロマー」と称され得る。ヘテロマーポリペプチドは、２つ以上の異なるポリペプチドを含有し得、異なるポリペプチドは、同一でない２つのポリペプチドとして少なくとも定義されるが、かかる異なるポリペプチドは、類似及び／または同一アミノ酸配列の１つ以上の部分を含んでもよいし、含まなくてもよい。いくつかの場合において、ヘテロマーの２つ以上のポリペプチドは、同一のアミノ酸配列を共有しないか、同一のドメインを共有しない。ヘテロマーは、いくつかの場合において、２つの異なるポリペプチドまたは２つの異なる種類のポリペプチドからなり得、ヘテロ二量体と称され得る。いくつかの場合において、ヘテロマーは、３つの異なるポリペプチドまたは３つの異なる種類のポリペプチドからなり得、ヘテロ三量体と称され得る。いくつかの場合において、ヘテロマーは、２つ以上の異なるポリペプチドまたは２つ以上の異なる種類のポリペプチドからなり得、限定するものではないが、例えば、３つ以上の異なるポリペプチド、４つ以上の異なるポリペプチド、５つ以上の異なるポリペプチド、６つ以上の異なるポリペプチド、７つ以上の異なるポリペプチド、８つ以上の異なるポリペプチドなどが含まれる。
本明細書で使用される「合成」という用語は、一般に、人工的に誘導されたポリペプチドまたは天然に発生しない核酸をコードするポリペプチドを指す。そのような合成ポリペプチド及び／または核酸は、例えば、単一のアミノ酸、単一のヌクレオチドなどを含む、基礎となるサブユニットから新規に組み立てることができ、あるいは、天然のものであれ、例えば、組み換え方法により人工的に誘導されたものであれ、既存のポリペプチドまたはポリヌクレオチドから誘導することができる。
「組み換え」という用語は、本明細書で使用されるとき、その起源または操作によって、天然では会合しているポリヌクレオチド配列の全てまたは一部と会合していない核酸分子、例えば、ゲノム、ｃＤＮＡ、ウイルス、半合成及び／または合成起源のポリヌクレオチドを意味する。タンパク質またはポリペプチドに関して使用される組み換えという用語は、組み換えポリヌクレオチドからの発現によって産生されたポリペプチドを意味する。宿主細胞またはウイルスに関して使用される組み換えという用語は、組み換えポリヌクレオチドが導入された宿主細胞またはウイルスを意味する。組み換えはまた、物質が異種物質（例えば、細胞、核酸、タンパク質またはベクター）の導入によって改変された物質（例えば、細胞、核酸、タンパク質またはベクター）に関して言及するために本明細書で使用される。
「生体試料」は、個体または個体集団から得られた様々な種類の試料を包含し、診断、モニタリングまたはスクリーニングアッセイに使用することができる。この定義は、血液及び生物起源の他の液体試料、生検試料もしくは組織培養物などの固体組織試料、またはこれらに由来する細胞及びその子孫を包含する。この定義はまた、個々の試料の混合もしくはプール、試薬による処理、可溶化、または細胞、ポリヌクレオチド、ポリペプチドなどのある特定の構成成分の濃縮など、その入手後に何らかの方法で操作された試料も含む。「生体試料」という用語は、臨床試料を包含し、培養細胞、細胞上清、細胞溶解物、血清、血漿、生体液及び組織試料も含む。「生体試料」という用語は、尿、唾液、脳脊髄液、間質液、眼液、滑液、血漿及び血清などの血液画分などを含む。「生体試料」という用語はまた、固体組織試料、組織培養試料及び細胞試料も含む。
本発明を更に説明する前に、本発明が、記載される特定の実施形態に限定されないことを理解されたい。それは、そのような実施形態が、当然のことながら多様であり得るからである。また、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的にしており、本発明の範囲が添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるため、限定を意図するものではないことも理解されたい。
値の範囲が記載される場合、その範囲の上限値と下限値との間にある、別途明確な記載がない限りはその下限値の単位の１０分の１までの各値、及びその指定範囲内の任意の他の指定値または間にある値は、本発明内に包含されることが理解される。これらのより狭い範囲の上限値及び下限値は、指定範囲内の除外される任意の特定の限界値に従って、より狭い範囲に独立して含まれ得、また本発明内に包含される。指定範囲が限界値の一方または両方を含む場合、当該含まれる限界値の一方または両方を除いた範囲もまた本明細書に含まれる。
別途の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されている意味と同一の意味を有する。本明細書に記載のものと同様または同等の任意の方法及び材料を本発明の実施または検証に使用することができるが、好ましい方法及び材料を以下に記載する。本明細書で言及される全ての公開物は、当該公開物に関連して引用される方法及び／または材料を開示及び記載するために、参照により本明細書に援用される。
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」及び「その（ｔｈｅ）」は、別途明記されない限り、複数の指示物を含むことに留意すべきである。したがって、例えば、「二量体化物質」への言及は、複数のかかる二量体化物質を含み、「抗原結合ドメイン」への言及は、１つ以上の抗原結合ドメイン及び当業者に知られているその同等物を含むなどとなる。更に、特許請求の範囲は、何らかの任意選択の要素を除外して作成される場合があることにも留意されたい。したがって、本陳述は、請求項の要素の詳述に関連する「単独で」、「のみ」などの排他的用語の使用または「否定による」限定の使用に対する先行記述として働くことが意図される。
明確を期すために、本発明のある特定の特長が別個の実施形態の文脈で記載されるが、１つの実施形態で組み合わせて提供され得ることも認識される。逆に、煩雑になるのを避けるために、本発明の様々な特長が１つの実施形態の文脈で記載されるが、これもまた別個にまたは任意の好適な部分的組み合わせで提供され得る。本発明に関する実施形態の全ての組み合わせが本発明に明確に包含され、ありとあらゆる組み合わせが個別にかつ明示的に開示されたかのように本明細書に開示される。加えて、種々の実施形態及びその要素の全ての部分的組み合わせもまた本発明に明示的に包含され、ありとあらゆるそのような部分的組み合わせが個別にかつ明示的に本明細書に開示されたかのように本明細書に開示される。
本明細書で考察される公開物は、本出願の出願日以前の開示についてのみ記載される。本明細書におけるいかなる記載も、本発明が先行発明に基づいてかかる公開物に先行する権利がないという自認を構成するものではない。更に、記載される公開日は、実際の公開日とは異なる場合があり、これは個別に確認する必要がある場合がある。
詳細な説明
本開示は、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドを提供する。条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ヘテロ二量体のポリペプチドの二量体化を誘導する二量体化物質の存在下で活性である。本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、様々な研究及び治療法に有用であり、これらについても提供される。
条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド
本開示は、ａ）二量体化対の第１のメンバー及び第１の異種ポリペプチドを含む第１のキメラポリペプチドと、ｂ）二量体化対の第２のメンバー及び第２の異種ポリペプチドを含む第２のキメラポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを提供する。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含む。他の場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの機能は、ＬＢＤの由来である核内ホルモン受容体のＤＮＡ結合機能または転写活性化機能を利用しない。言い換えれば、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの機能は、ＬＢＤの由来である核内ホルモン受容体のいかなるＤＮＡ結合機能とも無関係である。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化は、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのＬＢＤの由来である核内ホルモン受容体のドメイン（例えば、ＤＮＡ結合ドメイン）に帰属する転写活性化機能をもたらさない。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、核内ホルモン受容体のＤＮＡ結合ドメイン（例えば、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのＬＢＤの由来である核内ホルモン受容体のＤＮＡ結合ドメインを含む）を含有しない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、いくつかの場合において、活性化であり得る。本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、いくつかの場合において、リプレッサー活性を有し得る。例えば、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドが細胞膜中に存在し、細胞がＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質と接触した場合、いくつかの場合において、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、細胞を活性化させる。例えば、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドが細胞膜中に存在し、細胞がＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質と接触した場合、いくつかの場合において、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、細胞内の活性または細胞による活性を抑制する。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化は、二量体化物質の存在に依存する。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化は、二量体化物質及び第２の物質（例えば、抗原）の存在に依存する。条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの性質に応じて、かつ／または二量体化物質の性質に応じて、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化は、細胞の活性の活性化（条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドが細胞内に存在する場合）、または細胞の活性の抑制（条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドが細胞内に存在する場合）をもたらすことができる。条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの性質に応じて、かつ／または二量体化物質の性質に応じて、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化は、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド中に存在する異種ポリペプチドの活性の活性化をもたらすことができるか、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド中に存在する異種ポリペプチドの活性の抑制をもたらすことができる。
「条件付活性」とは、当該ヘテロ二量体ポリペプチドに帰属する活性が、例えば、ポリペプチドのヘテロ二量体部分の二量体化などの条件に依存することを意味する。例えば、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドの活性は、二量体化物質の存在に条件的に依存し得る。そのような場合、ヘテロ二量体ポリペプチドは、二量体化物質の存在下で「活性化可能」であり、すなわち、活性化され得る（例えば、抗原などのポリペプチドの特異的結合対の第２のメンバーの結合により）。条件付活性可能ポリペプチドは、概して、二量体化物質の非存在下では活性化可能ではなく、すなわち、当該ポリペプチドは、機能のためのいくつかの追加条件が満たされているかどうか、例えば、ポリペプチドの特異的結合対の第２のメンバー（抗原など）が存在し、かつ／または結合しているかにかかわらず、二量体化物質の非存在下で活性化することができない。
例えば、関連する二量体化物質の存在に条件的に依存し得る当該ポリペプチドに帰属する活性は、多様であり得、上記及び以下に更に詳述されるように、概して、活性化活性及び抑制活性の両方を含む任意の活性を含み得る。一例として、条件付活性オンスイッチキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、以下で詳述されるように、二量体化物質と、ポリペプチドが結合する特異的結合対の関連メンバーの両方の存在下で、オンスイッチＣＡＲからシグナル伝達が生じて、オンスイッチＣＡＲを備えた細胞（例えば、免疫細胞）を活性化することができるような形で、関連する二量体化物質の存在下で活性化可能であり得る。反対の場合、すなわち、関連する二量体化物質の非存在下では、オンスイッチＣＡＲを発現する細胞の活性化をもたらすシグナル伝達は、オンスイッチＣＡＲが結合する特異的結合対の関連メンバーの存在にかかわらず、生じない。別の例として、条件付活性オフスイッチＣＡＲに帰属する抑制は、以下に更に詳述されるように、二量体化物質と、ポリペプチドが結合する特異的結合対の関連メンバーの両方の存在下で、オフスイッチＣＡＲが、オフスイッチＣＡＲを備えた細胞（例えば、免疫細胞）の活性を抑制することができるような形で、関連する二量体化物質の存在下で活性化可能であり得る。反対の場合、すなわち、関連する二量体化物質の非存在下では、オフスイッチＣＡＲを発現する細胞の活性化の抑制をもたらすオフスイッチＣＡＲの活性化は、オフスイッチＣＡＲが結合する特異的結合対の関連メンバーの存在にかかわらず、生じない。
相互作用ポリペプチド
当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、互いに近接したとき、例えば、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質によって第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドが二量体化したときに活性を示す任意のポリペプチドであってよい。第１及び第２の異種ポリペプチドは、例えば、互いに近接していないときには、その活性を個別には示さない。言い換えれば、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドの活性は、２つのポリペプチドの組み立てに依存する。例えば、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドは受容体であり、第２の異種ポリペプチドは共受容体である。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドはＴ細胞受容体（ＴＣＲ）α鎖であり、第２の異種ポリペプチドはＴＣＲβ鎖である。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ヘテロ二量体の第１のポリペプチドであり、第２の異種ポリペプチドはＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドである。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、カスパーゼである。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドはポリペプチドの第１のサブユニットであり、第２の異種ポリペプチドはポリペプチドの第２のサブユニットである。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドは酵素であり、第２の異種ポリペプチドは酵素のポリペプチド基質である。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドは足場ポリペプチド（例えば、ＬＡＴ、ＳＬＰ７６など）であり、第２の異種ポリペプチドは足場ポリペプチドに条件的に結合するポリペプチドである。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドはシグナル伝達アダプタータンパク質（例えば、ＭｙＤ８８、Ｇｒｂ２、ＳＨＣ１）であり、第２の異種ポリペプチドはシグナル伝達アダプタータンパク質に条件的に結合するポリペプチドである。いくつかの場合において、第１及び第２の異種ポリペプチドは、二量体化依存性細胞表面受容体（例えば、サイトカイン受容体、受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ）など）またはその一部である。いくつかの場合において、第１及び第２の異種ポリペプチドは、同じ二量体化依存性細胞表面受容体（例えば、同じサイトカイン受容体、同じＲＴＫなど）または二量体化依存性細胞表面受容体の同じ部分である。
いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、異なるアミノ酸配列を有する。
分割生成物
いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、互いに近接したとき、例えば、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質によって第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドが二量体化したときに、親ポリペプチドの活性を示す、単一の親ポリペプチドの分割生成物である。例えば、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチドは親ポリペプチドのＮ末端部分であり、第２の異種ポリペプチドは親ポリペプチドのＣ末端部分である。親ポリペプチドのＮ末端部分及びＣ末端部分は、互いに近接していない状態で分割されているときには、親ポリペプチドの活性を個別に示さない。例えば、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、キナーゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、プロテアーゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、蛍光タンパク質の分割生成物である。例えば、Ｇｈｏｓｈ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１２２：５６５８を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、ユビキチンの分割生成物である。例えば、Ｊｏｈｎｓｓｏｎ ａｎｄ Ｖａｒｓｈａｖｓｋｙ（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：１０３４０を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、ラクタマーゼポリペプチド分割生成物である。例えば、Ｇａｌａｒｎｅａｕ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０：６１９を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、ルシフェラーゼの分割生成物である。例えば、Ｌｕｋｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０１：１２２８８；Ｒｅｍｙ ａｎｄ Ｍｉｃｈｎｉｃｋ（２００６）Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ３：９７７、及びＰａｕｌｍｕｒｕｇａｎ ａｎｄ Ｇａｍｂｈｉｒ（２００３）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．７５：１５８４を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、カスパーゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、ホスファターゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、エンドヌクレアーゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼの分割生成物である。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、タバコエッチウイルス（ＴＥＶ）の分割生成物である。例えば、Ｇｒａｙ ｅｔ ａｌ．（２０１０）Ｃｅｌｌ １４２：６３７を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、チロシンホスファターゼの分割生成物である。例えば、Ｃａｍａｃｈｏ－Ｓｏｔｏ ｅｔ ａｌ．（２０１４）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１３６：１７０７８を参照されたい。別の例として、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、Ｃａｓ９ポリペプチドの分割生成物である。例えば、Ｚｅｔｃｈｅ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３３：１３９を参照されたい。
上述のように、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、キナーゼの分割生成物である。非限定的な例として、チロシンキナーゼが親ポリペプチドであり得、親チロシンキナーゼの分割生成物が第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドであり得る。例えば、チロシンキナーゼは、図２０Ａに示されるアミノ酸配列のうち、第１の異種ポリペプチドがＥ３９３で終了するチロシンキナーゼのＮ末端部分であり、第２の異種ポリペプチドがＤ３９４で始まるチロシンキナーゼのＣ末端部分であるように、アミノ酸Ｅ３９３とＤ３９４の間または種々のチロシンキナーゼの対応する部位で分割することができる。一例として、第１の異種ポリペプチドは、図２０Ｂに示されるアミノ酸配列を含むことができ、第２の異種ポリペプチドは、図２０Ｃに示されるアミノ酸配列を含むことができる。別の例として、チロシンキナーゼは、図２１に示されるアミノ酸配列のうち、第１の異種ポリペプチドがＥ５７２で終了するチロシンキナーゼのＮ末端部分であり、第２の異種ポリペプチドがＤ５７３で始まるチロシンキナーゼのＣ末端部分であるように、アミノ酸Ｅ５７２とＤ５７３の間または種々のチロシンキナーゼの対応する部位で分割することができる。例えば、Ｃａｍａｃｈｏ－Ｓｏｔｏ ｅｔ ａｌ．（２０１４）Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１３６：３９９５を参照されたい。チロシンキナーゼには、例えば、Ｌｙｎ、Ｆａｋ、Ｓｒｃ及びＰＫＡが含まれる。チロシンキナーゼには、例えば、ＡＢＬ１、ＡＢＬ１（Ｔ３１５Ｉ）、ＡＣＶＲ１、ＡＫＴ１、ＡＬＫ、ＡＵＲＫＡ、ＡＸＬ、ＢＴＫ、ＣＡＭＫ２Ｄ、ＣＤＫ１Ｂ、ＣＤＫ２Ａ、ＣＤＫ４Ｄ１、ＣＳＫ、ＣＳＮＫ１Ｇ３、ＥＧＦＲ、ＥＰＨＡ４、ＥＰＨＢ４、ＥＲＢＢ４、ＦＧＦＲ１、ＦＧＦＲ２、ＦＧＦＲ３、ＦＧＦＲ３（Ｋ６５０Ｅ）、ＦＧＦＲ４、ＦＬＴ３（Ｄ８３５Ｙ）、ＩＧＦ１Ｒ、ＧＳＫ３Ｂ、ＩＮＳＲ、ＩＲＡＫ４、ＪＡＫ１、ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、ＫＤＲ、ＫＩＴ、ＬＣＫ、ＬＹＮ、ＭＡＰ３Ｋ８、ＭＡＰＫ１、ＭＡＰＫ１０、ＭＡＰＫ１４、ＭＡＰＫＡＰＫ２、ＭＡＰＫＡＰＫ５、ＭＥＴ、ＭＫＮＫ１、ＭＫＮＫ２、ＰＡＫ２、ＰＤＧＦＲａ、ＰＤＰＫ１、ＰＩＭ２、ＰＫＮ１、ＰＫＮ２、ＰＬＫ１、ＰＲＫＡＣＡ、ＰＲＫＣＡ、ＰＲＫＣＱ、ＲＥＴ、ＲＯＣＫ２、ＲＰＳ６ＫＢ１、ＳＲＣ、ＳＹＫ、ＴＹＫ２、ＷＮＫ１、ＺＡＰ７０、ＰＩＫＳＣＤ、ＰＩＫ３ＣＧ、ＭＴＯＲ、ＰＩＫ３Ｃ３、ＰＩＫ３ＣＡ、ＰＩＫ３ＣＢ及びＰＩＫ４ＣＢが含まれる。好適なチロシンキナーゼには、ＳＹＫ、ＬＣＫ、ＩＲＫ（＝ＩＮＳＲ＝インスリン受容体）、ＩＧＦ－１受容体、ＭＫ２、ＺＡＰ－７０、Ａｕｒｏｒａ－２、ＰＲＡＫ、ＲＯＣＫ、ＣＡＫ、ｃＭＥＴ、ＩＲＡＫ１、ＩＲＡＫ２、ＢＬＫ、ＢＭＸ、ＢＴＫ、ＦＲＫ、ＦＧＲ、ＦＹＮ、ＨＣＫ、ＩＴＫ、ＬＹＮ、ＴＥＣ、ＴＸＫ、ＹＥＳ、ＡＢＬ、ＳＲＣ、ＥＧＦ－Ｒ（＝ＥｒｂＢ－１）、ＥｒｂＢ－２（＝ＮＥＵ＝ＨＥＲ２）、ＥｒｂＢ－３、ＥｒｂＢ－４、ＦＡＫ、ＦＧＦ１Ｒ（＝ＦＧＲ－１）、ＦＧＦ２Ｒ（＝ＦＧＲ－２）、ＩＫＫ－１（＝ＩＫＫ－α＝ＣＨＵＫ）、ＩＫＫ－２（＝ＩＫＫβ）、ＭＥＴ（＝ｃ－Ｍｅｔ）、ＮＩＫ、ＰＧＤＦ受容体α、ＰＤＧＦ受容体β、ＴＩＥ１、ＴＩＥ２（＝ＴＥＫ）、ＶＥＧＦＲ１（＝ＦＬＴ－１）、ＶＥＧＦＲ２（＝ＫＤＲ）、ＦＬＴ－３、ＦＬＴ－４、ＫＩＴ、ＣＳＫ、ＪＡＫ１、ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、ＴＹＫ２、ＲＩＰ、ＲＩＰ－２、ＬＯＫ、ＴＡＫＩ、ＲＥＴ、ＡＬＫ、ＭＬＫ３、ＣＯＴ、ＴＲＫＡ、ＰＹＫ２、ＥＰＨＢ４、ＲＯＮ、ＧＳＫ３、ＵＬ１３、ＯＲＦ４７、ＡＴＭ、ＣＤＫ（全てのサブタイプを含む）、ＰＫＡ、ＰＫＢ（全てのＰＫＢサブタイプを含む）（＝ＡＫＴ－１、ＡＫＴ－２、ＡＫＴ－３）、ＰＫＣ（全てのＰＫＣサブタイプを含む）、ＲＥＤＫ、ＳＡＰＫ、ＰＩＭ、ＰＤＫ、ＰＩＭ、ＥＲＫ及びＢＡＲＫ、ならびにこれらのキナーゼの全てのサブタイプが含まれる。
上述のように、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、カスパーゼの分割生成物である。Ｃｈｅｌｕｒ ａｎｄ Ｃｈａｌｆｉｅ（２００７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０４：２２８３．いくつかの場合において、カスパーゼは、アポトーシス性カスパーゼである。
上述のように、いくつかの場合において、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、Ｃａｓ９ポリペプチドの分割生成物である。Ｃａｓ９ポリペプチドは、図２８に示すアミノ酸配列に対して、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。いくつかの場合において、Ｃａｓ９は、触媒的に不活性なＣａｓ９（「ｄＣａｓ９」）であり、例えば、この場合、ｄＣａｓ９は、図２８に示されるアミノ酸配列または別のＣａｓ９ポリペプチドの対応するアミノ酸に対して、Ｄ１０Ａ及びＨ８４０Ａの置換を含む。
特異的結合対及び細胞外認識ドメイン
本開示は、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドを提供する。条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、細胞の原形質膜上に発現される場合、１）抗原または細胞外ドメインと相互作用する他の部分、及び２）ヘテロ二量体のポリペプチドの二量体化を誘導する二量体化物質の存在下で活性である。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含む。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含む。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含み、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。
したがって、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバーであって、核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む、二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバーであって、核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含む、二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含む。他の場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバーであって、核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含む、二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバーであって、核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む、二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含む。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含む。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターである。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性オンスイッチキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性オフスイッチＣＡＲである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）である。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）であって、以下：二量体化対の第１のメンバーを含む合成刺激性ＩＣＲであって、二量体化対の第１のメンバーは合成刺激性ＩＣＲに連結されている、合成刺激性ＩＣＲと、細胞内抑制ドメインに連結された二量体化対の第２のメンバーを含む合成ＩＣＲリプレッサーとを含み、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）を提供する。合成刺激性ＩＣＲと合成ＩＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導するリガンド（二量体化物質）の存在下で二量体化する。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって、以下：ａ）合成刺激性ＣＡＲであって、ｉ）細胞外認識ドメイン、ｉｉ）細胞外認識ドメインに連結された膜貫通ドメイン、ｉｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）細胞内刺激ドメインを含む、合成刺激性ＣＡＲと、ｂ）合成ＣＡＲリプレッサーであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメインを含む、合成ＣＡＲリプレッサーとを含む、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。合成刺激性ＣＡＲと合成ＣＡＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する。
本開示は、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）であって、以下：ａ）合成刺激性ＴＣＲであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、ｉｉｉ）少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖を含む操作されたＴＣＲポリペプチドであって、少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖は、膜貫通ドメインまたは二量体化対の第１のメンバーに連結されている、ＴＣＲポリペプチドを含む、合成刺激性ＴＣＲと、ｂ）合成ＴＣＲリプレッサーであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメインを含む、合成ＴＣＲリプレッサーとを含む、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を提供する。二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。合成刺激性ＴＣＲと合成ＴＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する。
本開示は、ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって、以下：Ｉ）ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含むか、ＩＩ）ａ）第１のポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）第２のポリペプチドであって、ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のポリペプチドとを含む、ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を提供する。二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターを含むか、二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコアクチベーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む。第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する。
条件付活性オンスイッチＣＡＲ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性オンスイッチキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。
特異的結合対のメンバー
上述のように、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、特異的結合対の第１のメンバーを含む第１のポリペプチドを含む。特異的結合対の第２のメンバーは、細胞の表面上に存在し得る。特異的結合対の第２のメンバーは、不溶性支持体などに固定化され得、細胞（例えば、標的細胞、非標的細胞など）の表面上に発現され得る。特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性であり得る。特異的結合対の第２のメンバーは、細胞外環境（例えば、細胞外マトリックス）内に存在し得る。特異的結合対の第２のメンバーは、人工マトリックス内に存在し得る。特異的結合対の第２のメンバーは、無細胞環境内に存在し得る。
特異的結合対の好適な第１のメンバーには、抗体ベースの認識足場、抗体（すなわち、抗原結合抗体断片を含む、抗体ベースの認識足場）、非抗体ベースの認識足場、抗原（例えば、内因性抗原、外因性抗原など）、受容体のリガンド、受容体、非抗体ベースの認識足場の標的、Ｆｃ受容体（例えば、ＦｃγＲＩＩＩａ、ＦｃγＲＩＩＩｂなど）、細胞外マトリックス構成成分などが含まれるが、これらに限定されない。
特異的結合対には、例えば、抗原と抗体の特異的結合対（第１のメンバーが第２のメンバー（抗原）に特異的に結合する抗体（または抗体ベースの認識足場）であるか、第１のメンバーが抗原であり、第２のメンバーが抗原に特異的に結合する抗体（または抗体ベースの認識足場）である）、リガンドと受容体の特異的結合対（第１のメンバーがリガンドであり、第２のメンバーがリガンドに結合する受容体であるか、第１のメンバーが受容体であり、第２のメンバーが受容体に結合するリガンドである）、非抗体ベースの認識足場と標的の特異的結合対（第１のメンバーが非抗体ベースの認識足場であり、第２のメンバーが非抗体ベースの認識足場に結合する標的であるか、第１のメンバーが標的であり、第２のメンバーが標的に結合する非抗体ベースの認識足場である）、接着分子と細胞外マトリックスの結合対、Ｆｃ受容体とＦｃの結合対（第１のメンバーが、Ｆｃ受容体である第２のメンバーに結合する免疫グロブリンＦｃを含むか、第１のメンバーが、免疫グロブリンＦｃを含む第２のメンバーに結合するＦｃ受容体である）、及び受容体と共受容体の結合対（第１のメンバーが、共受容体である第２のメンバーに特異的に結合する受容体であるか、第１のメンバーが、受容体である第２のメンバーに特異的に結合する共受容体である）が含まれる。
抗原結合ドメイン
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な抗原結合ドメインは、任意の抗原結合ポリペプチドであってよく、多種多様なものが当該技術分野において知られている。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）である。他の抗体による認識ドメイン（ｃＡｂ ＶＨＨ（ラクダ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ＩｇＮＡＲ ＶＨ（サメ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ｓｄＡｂ ＶＨ（単一ドメイン抗体可変ドメイン）及び「ラクダ化」抗体可変ドメインも使用に適している。いくつかの場合において、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴｖ、ＶαＶβを含有する一本鎖２ドメインＴＣＲ）などのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）ベースの認識ドメインもまた使用に適している。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な抗原結合ドメインは、様々な抗原結合特異性を有し得る。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、がん細胞によって発現される（合成される）抗原（すなわち、がん細胞関連抗原）中に存在するエピトープに対して特異的である。がん細胞関連抗原は、例えば、乳癌細胞、Ｂ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、Ｂ細胞性非ホジキンリンパ腫（Ｂ－ＮＨＬ）細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫細胞、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、黒色腫細胞、慢性リンパ性白血病細胞、急性リンパ性白血病細胞、神経芽細胞腫細胞、神経膠腫、膠芽腫、髄芽腫、大腸癌細胞などに関連する抗原であり得る。がん細胞関連抗原は、非がん性細胞によって発現されることもある。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインが結合することができる抗原の非限定的な例には、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３８、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ／ＥＲＢＢ２、ＣＡ１２５、ＭＵＣ－１、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＣＤ４４表面接着分子、メソテリン、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）、高分子黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、ＧＤ２などが挙げられる。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインは、がん関連抗原を標的にし得る。いくつかの場合において、本開示の抗原結合ドメインは、がん関連抗原に対して特異的な抗体またはその一部を含み得る。がん関連抗原の非限定的な例には、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３８、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ、ＥＲＢＢ２、ＣＡ１２５、ＭＵＣ－１、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＣＤ４４表面接着分子、メソテリン、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）、高分子黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、ＧＤ２などが挙げられるが、これらに限定されない。がん関連抗原にはまた、例えば、４－１ＢＢ、５Ｔ４、腺癌抗原、α－フェトプロテイン、ＢＡＦＦ、Ｂ－リンパ腫細胞、Ｃ２４２抗原、ＣＡ－１２５、炭酸脱水酵素９（ＣＡ－ＩＸ）、Ｃ－ＭＥＴ、ＣＣＲ４、ＣＤ１５２、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２００、ＣＤ２２、ＣＤ２２１、ＣＤ２３（ＩｇＥ受容体）、ＣＤ２８、ＣＤ３０（ＴＮＦＲＳＦ８）、ＣＤ３３、ＣＤ４、ＣＤ４０、ＣＤ４４ ｖ６、ＣＤ５１、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ７４、ＣＤ８０、ＣＥＡ、ＣＮＴＯ８８８、ＣＴＬＡ－４、ＤＲＳ、ＥＧＦＲ、ＥｐＣＡＭ、ＣＤ３、ＦＡＰ、フィブロネクチンエクストラドメイン－Ｂ、葉酸受容体１、ＧＤ２、ＧＤ３ガングリオシド、糖タンパク質７５、ＧＰＮＭＢ、ＨＥＲ２／ｎｅｕ、ＨＧＦ、ヒト細胞分散因子受容体キナーゼ、ＩＧＦ－１受容体、ＩＧＦ－Ｉ、ＩｇＧ１、Ｌ１－ＣＡＭ、ＩＬ－１３、ＩＬ－６、インスリン様成長因子Ｉ受容体、インテグリンα５β１、インテグリンαｖβ３、ＭＯＲＡｂ－００９、ＭＳ４Ａ１、ＭＵＣ１、ムチンＣａｎＡｇ、Ｎ－グリコリルノイラミン酸、ＮＰＣ－１Ｃ、ＰＤＧＦ－Ｒα、ＰＤＬ１９２、ホスファチジルセリン、前立腺癌細胞、ＲＡＮＫＬ、ＲＯＮ、ＲＯＲ１、ＳＣＨ ９００１０５、ＳＤＣ１、ＳＬＡＭＦ７、ＴＡＧ－７２、テネイシンＣ、ＴＧＦβ２、ＴＧＦ－β、ＴＲＡＩＬ－Ｒ１、ＴＲＡＩＬ－Ｒ２、腫瘍抗原ＣＴＡＡ１６．８８、ＶＥＧＦ－Ａ、ＶＥＧＦＲ－１、ＶＥＧＦＲ２及びビメンチンが含まれる。
いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子を伴うタンパク質（例えば、ペプチド）の断片を含む標的に特異的に結合し得る。ＭＨＣ分子は、細胞内で発現されたタンパク質と細胞外で発現されたタンパク質の両方のタンパク質のペプチド断片を提示するので、ＭＨＣ－ペプチド複合体を指向する特異的結合メンバーは、細胞内の抗原及び細胞外で発現された抗原に対する標的化を可能にする。
細胞内で発現される標的タンパク質（例えば、細胞質で発現されるもの（すなわち、細胞質タンパク質）、核で発現されるもの（すなわち、核タンパク質）など）は、細胞内抗原（例えば、細胞質抗原、核抗原など）と称され得る。したがって、本開示の抗原結合ドメインは、いくつかの場合において、ＭＨＣと複合体化した細胞内抗原断片（例えば、ペプチド－ＭＨＣ複合体、いくつかの場合において、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）－ペプチド複合体とも記載される）に対して特異的であり得る。
ペプチド－ＭＨＣ複合体を標的にする抗原結合ドメインが指向し得る例示的なタンパク質標的及び各タンパク質標的のＭＨＣにおける例示的なペプチドを以下の表２に記載する。
（表２）抗ペプチド－ＭＨＣ標的
Figure 0007068169000013
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインは、表２の細胞内がん抗原ペプチドを有するペプチド－ＭＨＣに特異的に結合する抗体（例えば、ｓｃＦｖ）の一部であるか、それを含む。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインは、Ｄｈａｎｉｋ ｅｔ ａｌ．ＢＭＣ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ（２０１６）１７：２８６（当該開示の全体を参照により本明細書に援用する）に記載されているペプチド－ＭＨＣ、例えば、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＨＬＳＰＩＤＣＥＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９６））－ＭＨＣ複合体、ＵＭＯＤＬ１ペプチド（例えば、ＬＴＳＭＷＳＰＡＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９７））－ＭＨＣ複合体、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＨＬＤＨＰＨＰＡＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９８））－ＭＨＣ複合体、ＭＡＧＥＣ２ペプチド（例えば、ＳＬＳＶＭＳＳＮＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４９９））－ＭＨＣ複合体、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＭＭＡＷＳＤＮＫＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５００））－ＭＨＣ複合体、ＣＯＸ７Ｂ２ペプチド（例えば、ＴＱＩＧＩＥＷＮＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０１））－ＭＨＣ複合体、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＣＬＦＥＭＱＤＰＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０２））－ＭＨＣ複合体、ＵＭＯＤＬ１ペプチド（例えば、ＹＬＳＨＰＳＣＮＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０３））－ＭＨＣ複合体、ＣＯＸ７Ｂ２ペプチド（例えば、ＧＩＥＷＮＬＳＰＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０４））－ＭＨＣ複合体、ＭＡＧＥＡ１１ペプチド（例えば、ＧＬＧＣＳＰＡＳＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０５））－ＭＨＣ複合体、ＲＰＥ６５ペプチド（例えば、ＲＱＡＦＥＦＰＱＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０６））－ＭＨＣ複合体、ＲＰＥ６５ペプチド（例えば、ＲＱＡＦＥＦＰＱＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０７））－ＭＨＣ複合体、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＧＭＷＴＤＴＦＥＦ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０８））－ＭＨＣ複合体、ＴＲＩＭ５１ペプチド（例えば、ＹＬＮＷＱＤＴＡＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５０９））－ＭＨＣ複合体、ＭＡＧＥＡ１１ペプチド（例えば、ＶＬＷＧＰＩＴＱＩ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１０））－ＭＨＣ複合体、ＮＬＲＰ４ペプチド（例えば、ＴＬＤＨＴＧＶＶＶ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１１））－ＭＨＣ複合体、ＲＰＥ６５ペプチド（例えば、ＴＭＧＶＷＬＨＩＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１２））－ＭＨＣ複合体、ＲＰＥ６５ペプチド（例えば、ＴＭＧＶＷＬＨＩＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１３））－ＭＨＣ複合体、ＭＡＧＥＣ２ペプチド（例えば、ＫＶＷＶＱＧＨＹＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１４））－ＭＨＣ複合体、ＵＭＯＤＬ１ペプチド（例えば、ＫＩＮＣＮＮＦＲＬ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１５））－ＭＨＣ複合体などを含むがこれらに限定されない、ペプチド－ＭＨＣに特異的に結合する抗体（例えば、ｓｃＦｖ）の一部であるか、それを含む。
リガンド
いくつかの場合において、当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な特異的結合対のメンバーは、受容体のリガンドである。リガンドには、サイトカイン（例えば、ＩＬ－１３、など）、成長因子（例えば、ヘレグリン、血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）など）、インテグリン結合ペプチド（例えば、配列Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐを含むペプチド）などが含まれるが、これらに限定されない。
当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの特異的結合対のメンバーがリガンドである場合、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、二量体化因子と特異的結合対の第２のメンバーの両方の存在下で活性化することができ、特異的結合対の第２のメンバーは、リガンドの受容体である。例えば、リガンドがＶＥＧＦである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性ＶＥＧＦ受容体を含むＶＥＧＦ受容体であり得る。別の例として、リガンドがヘレグリンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、Ｈｅｒ２であり得る。
受容体
上述のように、いくつかの場合において、当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドに含まれる特異的結合対のメンバーは、受容体、例えば、リガンドの受容体、共受容体などである。受容体は、受容体のリガンド結合断片であり得る。好適な受容体には、成長因子受容体（例えば、ＶＥＧＦ受容体）、キラー細胞レクチン様受容体サブファミリーＫメンバー１（ＮＫＧ２Ｄ）ポリペプチド（ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ及びＵＬＢ６の受容体）、サイトカイン受容体（例えば、ＩＬ－１３受容体、ＩＬ－２受容体など）、Ｈｅｒ２、ＣＤ２７、天然細胞傷害受容体（ＮＣＲ）（例えば、ＮＫＰ３０（ＮＣＲ３／ＣＤ３３７）ポリペプチド（ＨＬＡ－Ｂ関連転写物３（ＢＡＴ３）及びＢ７－Ｈ６の受容体）など）などが含まれるが、これらに限定されない。
抗体ベースの認識足場
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、抗体である。抗体は、任意の抗原結合抗体ベースのポリペプチドであってよく、多種多様なものが当該技術分野において知られている。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）である。他の抗体による認識ドメイン（ｃＡｂ ＶＨＨ（ラクダ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ＩｇＮＡＲ ＶＨ（サメ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ｓｄＡｂ ＶＨ（単一ドメイン抗体可変ドメイン）及び「ラクダ化」抗体可変ドメインも使用に適している。いくつかの場合において、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴｖ、ＶαＶβを含有する一本鎖２ドメインＴＣＲ）などのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）ベースの認識ドメインもまた使用に適している。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの特異的結合対のメンバーが抗体ベースの認識足場である場合、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、特異的結合対の第２のメンバーの存在下で活性化することができ、特異的結合対の第２のメンバーは、抗体ベースの認識足場が結合する抗原である。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドに含めるのに好適な抗体は、様々な抗原結合特異性を有し得る。
いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、がん細胞によって発現される（合成される）抗原（すなわち、がん細胞関連抗原）中に存在するエピトープに対して特異的である。がん細胞関連抗原は、例えば、乳癌細胞、Ｂ細胞リンパ腫、膵癌、ホジキンリンパ腫細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、Ｂ細胞性非ホジキンリンパ腫（Ｂ－ＮＨＬ）細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫細胞、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、黒色腫細胞、慢性リンパ性白血病細胞、急性リンパ性白血病細胞、神経芽細胞腫細胞、神経膠腫、膠芽腫、髄芽腫、大腸癌細胞などに関連する抗原であり得る。がん細胞関連抗原は、非がん性細胞によって発現されることもある。
いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、例えば、本明細書に記載される抗原を含む、組織特異的抗原中に存在するエピトープに対して特異的である。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、例えば、本明細書に記載される抗原を含む、疾患関連抗原中に存在するエピトープに対して特異的である。
当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインが結合することができる抗原の非限定的な例には、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３８、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ／ＥＲＢＢ２、ＣＡ１２５、ＭＵＣ－１、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＣＤ４４表面接着分子、メソテリン、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）、高分子黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、ＧＤ２などが挙げられる。
当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの抗原結合ドメインが結合することができる抗原の非限定的な例には、例えば、カドヘリン（ＣＤＨ１－２０）、インテグリン（α及びβアイソフォーム）、エフリン、ＮＣＡＭ、コネクシン、ＣＤ４４、シンデカン、ＣＤ４７、ＤＧα／β、ＳＶ２、プロトカドヘリン、Ｆａｓ、デクチン－１、ＣＤ７、ＣＤ４０、ニューレグリン、ＫＩＲ、ＢＴＬＡ、Ｔｉｍ－２、Ｌａｇ－３、ＣＤ１９、ＣＴＬＡ４、ＣＤ２８、ＴＩＧＩＴ及びＩＣＯＳが挙げられる。
いくつかの場合において、抗体は、サイトカインに対して特異的である。いくつかの場合において、抗体は、サイトカイン受容体に対して特異的である。いくつかの場合において、抗体は、成長因子に対して特異的である。いくつかの場合において、抗体は、成長因子受容体に対して特異的である。いくつかの場合において、抗体は、細胞表面受容体に対して特異的である。
いくつかの場合において、抗体は、細胞表面標的に対して特異的であり、細胞表面標的の非限定的な例には、ＣＤ１９、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２、ＣＤ２２、ＥＮＰＰ３、ＥＧＦＲ、ＣＤ２０、ＣＤ５２、ＣＤ１１ａ及びα－インテグリンが挙げられる。
いくつかの場合において、抗体ベースの足場が結合する抗原（特異的結合対の第２のメンバー）は、可溶性である。いくつかの場合において、抗原は、膜結合しており、例えば、いくつかの場合において、抗原は、細胞の表面上に存在する。いくつかの場合において、抗原は、不溶性支持体上に固定化されており、不溶性支持体は、種々の材料（例えば、ポリエチレン、ポリスチレン、ポリビニルピロリドン、ポリカーボネート、ニトロセルロースなど）のいずれかを含むことができ、不溶性支持体は、種々の形態、例えば、プレート、組織培養皿、カラムなどであり得る。いくつかの場合において、抗原は、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）内に存在する（例えば、抗原は、ＥＣＭ構成成分である）。いくつかの場合において、抗原は、人工マトリックス内に存在する。いくつかの場合において、抗原は、無細胞環境内に存在する。
非抗体ベースの認識足場
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、非抗体ベースの認識足場である。本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの特異的結合対のメンバーが非抗体ベースの認識足場である場合、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、特異的結合対の第２のメンバーの存在下で活性化することができ、特異的結合対の第２のメンバーは、非抗体ベースの認識足場に結合する標的である。
非抗体ベースの認識足場には、例えば、アフィボディ、操作されたＫｕｎｉｔｚドメイン、モノボディ（アドネクチン）、アンチカリン、設計されたアンキリンリピートドメイン（ＤＡＲＰｉｎ）、システインリッチポリペプチド（例えば、システインリッチノッチンペプチド）の結合部位、アビマー、アフィリンなどが含まれる。例えば、Ｇｅｂａｕｅｒ ａｎｄ Ｓｋｅｒｒａ（２００９）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．１３：２４５を参照されたい。
非抗体ベースの足場（本明細書中、「抗体模倣分子」とも称される）は、人工的に多様化された結合部位を有する結合分子のライブラリーから標的結合バリアントを選択または単離することによって特定され得る。多様化されたライブラリーは、完全にランダムなアプローチ（例えば、エラープローンポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、エクソンシャッフリングまたは指向性進化）を使用して作製され得、または当該技術分野で知られている設計戦略が援用され得る。例えば、結合部位がその関連する標的分子と相互作用するときに通常関与するアミノ酸部分を、当該結合部位をコードする核酸内の対応する位置に縮重コドン、トリヌクレオチド、ランダムペプチドまたはループ全体を挿入することによってランダム化することができる（例えば、米国特許出願公開第２００４０１３２０２８号参照）。アミノ酸位置の場所は、標的分子を含むタンパク質実体における結合部位の結晶構造を調べることによって特定することができる。ランダム化のための位置候補には、結合部位のループ、平面、ヘリックス及び結合キャビティが含まれる。ある特定の実施形態において、多様化の候補に有望である結合部位内のアミノ酸は、免疫グロブリンの折り畳みとの相同性によって特定され得る。例えば、フィブロネクチンのＣＤＲ様ループ内の残基をランダム化して、フィブロネクチン結合分子のライブラリーを作製することができる（例えば、Ｋｏｉｄｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２８４：１１４１－１１５１（１９９８）参照）。ランダム化され得る結合部位の他の部分には、平面が含まれる。ランダム化の後、多様化されたライブラリーを選択またはスクリーニング手順に供して、所望の結合特性を有する結合分子を得ることができる。例えば、選択は、ファージディスプレイ、酵母ディスプレイまたはリボソームディスプレイなどの当該技術分野において知られている方法によって達成することができる。
例えば、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、フィブロネクチン結合分子に由来する結合部位を含む。フィブロネクチン結合分子（例えば、フィブロネクチンＩ、ＩＩまたはＩＩＩ型ドメインを含む分子）は、免疫グロブリンとは対照的に、鎖内ジスルフィド結合に依存しないＣＤＲ様ループを提示する。ＦｎＩＩＩループは、有用な治療用ツールを開発するために、ランダム変異、ならびに標的結合、選択及び更なる変異の反復ラウンドの指向性進化法に供することができる領域を含む。フィブロネクチンベースの「指定可能な」治療用結合分子（「ＦＡＴＢＩＭ」）を、標的抗原またはエピトープに特異的と結合するように開発することができる。フィブロネクチン結合ポリペプチドを作製するための方法は、例えば、ＷＯ０１／６４９４２ならびに米国特許第６，６７３，９０１号、同第６，７０３，１９９号、同第７，０７８，４９０号及び同第７，１１９，１７１号に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、アフィボディに由来する結合部位を含む。アフィボディは、ブドウ球菌プロテインＡ（ＳＰＡ）の免疫グロブリン結合ドメインに由来する（例えば、Ｎｏｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１５：７７２－７７７（１９９７）参照）。アフィボディは、特定の標的と結合する固有の結合部位を有する抗体模倣物である。アフィボディは、小さく（例えば、５８アミノ酸を有する３つのαヘリックスからなり、約６ｋＤａのモル質量を有する）、不活性な形態（Ｆｃ機能なし）を有し得、標的化部分としてヒトでの試験に成功している。アフィボディ結合部位は、ＳＰＡのドメイン（例えば、ドメインＢ）に由来するＳＰＡ関連タンパク質（例えば、プロテインＺ）に突然変異を起こさせ、標的抗原またはエピトープに対する結合親和性を有する変異ＳＰＡ関連ポリペプチドを選択することによって合成することができる。アフィボディ結合部位を作製するための他の方法は、米国特許第６，７４０，７３４号及び同第６，６０２，９７７号ならびにＷＯ００／６３２４３に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、アンチカリンに由来する結合部位を含む。アンチカリンは、ヒトリポカリンに由来する抗体機能性模倣物である。リポカリンは、ステロイド、ビリン、レチノイド及び脂質などの疎水性小分子と結合し、これを輸送する、天然結合タンパク質のファミリーである。アンチカリンの主要構造は、野生型リポカリンに類似している。このタンパク質構造の中央の要素は、その開放端で４つのループを支持する、８本の逆平行鎖のβバレル構造である。これらのループは、リポカリンの天然結合部位を形成し、大規模なアミノ酸置換によってｉｎ ｖｉｔｒｏで再形成することができ、これにより、新規の結合特異性がもたらされる。アンチカリンは、そのリガンドに対して高い親和性及び特異性を有し、かつ速い結合反応速度を有するため、その機能特性は、抗体の機能特性と類似している。アンチカリンは、例えば、米国特許第７，７２３，４７６号に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、システインリッチポリペプチドに由来する結合部位を含む。システインリッチドメインは、いくつかの場合において、αヘリックス、βシートまたはβバレル構造を形成しない。いくつかの場合において、ジスルフィド結合は、ドメインの三次元構造体への折り畳みを促進する。いくつかの場合において、システインリッチドメインは、少なくとも２つのジスルフィド結合、例えば、少なくとも３つのジスルフィド結合を有する。例示的なシステインリッチポリペプチドは、Ａドメインタンパク質である。Ａドメイン（「補体型リピート」とも呼ばれることもある）は、約３０～５０または３０～６５アミノ酸を含有する。いくつかの場合において、このドメインは、約３５～４５アミノ酸を含み、いくつかの場合において、約４０アミノ酸を含む。３０～５０アミノ酸中、システイン残基は、約６個存在する。６個のシステインのうち、ジスルフィド結合は、典型的に、次のシステインの間にみられる：Ｃ１とＣ３、Ｃ２とＣ５、Ｃ４とＣ６。Ａドメインは、リガンド結合部分を構成する。このドメインのシステイン残基は、ジスルフィド結合して、機能的に独立したコンパクトで安定した部分を形成する。これらのリピートクラスターは、リガンド結合ドメインを構成し、差示的クラスタリングにより、リガンド結合に関する特異性を付与することができる。Ａドメインを含有する例示的なタンパク質には、例えば、補体成分（例えば、Ｃ６、Ｃ７、Ｃ８、Ｃ９及びＩ因子）、セリンプロテアーゼ（例えば、エンテロペプチダーゼ、マトリプターゼ及びコリン）、膜貫通タンパク質（例えば、ＳＴ７、ＬＲＰ３、ＬＲＰ５及びＬＲＰ６）及びエンドサイトーシス受容体（例えば、ソルチリン関連受容体、ＬＤＬ受容体、ＶＬＤＬＲ、ＬＲＰ１、ＬＲＰ２及びＡｐｏＥＲ２）が含まれる。所望の結合特異性を有するＡドメインタンパク質を作製するための方法は、例えば、ＷＯ０２／０８８１７１及びＷＯ０４／０４４０１１に開示されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、リピートタンパク質に由来する結合部位を含む。リピートタンパク質は、互いに積み重なって連続するドメインを形成する、小さい（例えば、約２０～約４０アミノ酸残基）構造単位または反復の連続コピーを含有するタンパク質である。リピートタンパク質は、タンパク質におけるリピート数を調整することによって、特定の標的結合部位に適するように改変することができる。例示的なリピートタンパク質には、設計されたアンキリンリピートタンパク質（すなわち、ＤＡＲＰｉｎ）（例えば、Ｂｉｎｚ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２２：５７５－５８２（２００４）参照）またはロイシンリッチリピートタンパク質（すなわち、ＬＲＲＰ）（例えば、Ｐａｎｃｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ、４３０：１７４－１８０（２００４）参照）が含まれる。別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、ＤＡＲＰｉｎを含む。
本明細書で使用されるとき、「ＤＡＲＰｉｎ」という用語は、高度に特異的、かつ高親和性の標的タンパク質結合を典型的に示す、遺伝子操作された抗体模倣タンパク質を指す。ＤＡＲＰｉｎは、当初は、天然アンキリンタンパク質から誘導された。いくつかの場合において、ＤＡＲＰｉｎは、アンキリンタンパク質の３、４または５つのリピートモチーフを含む。いくつかの場合において、アンキリンリピート単位は、３０～３４アミノ酸残基からなり、タンパク質間相互作用を媒介するように機能する。いくつかの場合において、各アンキリンリピートは、ヘリックスターンヘリックスの立体構造を示し、そのようなタンデムリピートの連続がほぼ直鎖状の配列にまとめられ、比較的柔軟なループによって接続されたヘリックスターンヘリックス群を形成する。いくつかの場合において、アンキリンリピートタンパク質の全体構造は、リピート内及びリピート間の疎水性相互作用及び水素結合相互作用によって安定化される。アンキリンリピートの反復性及び細長い性質は、タンパク質安定性、折り畳み及びアンフォールディングならびに結合特異性において、アンキリンリピートタンパク質の固有の特徴のための分子基盤を提供する。ＤＡＲＰｉｎドメインの分子量は、４または５リピートのＤＡＲＰｉｎでそれぞれ約１４または１８ｋＤａ～であり得る。ＤＡＲＰｉｎについては、例えば、米国特許第７，４１７，１３０号に記載されている。いくつかの場合では、アンキリンリピート単位の三次構造は、βヘアピン、それに続く２つの逆平行のαヘリックスから構成され、リピート単位を次のリピート単位に接続するループで終わる特徴を共有する。アンキリンリピート単位で構築されるドメインは、当該リピート単位を、伸長させ湾曲した構造に積み重ねることによって形成することができる。ウミヤツメ及び他の無顎魚類の適応免疫系の一部に由来するＬＲＲＰ結合部位は、それらが、リンパ球の成熟中に、一連のロイシンリッチリピート遺伝子の組み換えによって形成されるという点で抗体に似ている。ＤＡＲｐｉｎまたはＬＲＲＰ結合部位を作製するための方法は、ＷＯ０２／２０５６５及びＷＯ０６／０８３２７５に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、Ｓｒｃ相同性ドメイン（例えば、ＳＨ２またはＳＨ３ドメイン）、ＰＤＺドメイン、β－ラクタマーゼ、高親和性プロテアーゼ阻害因子、またはサソリ毒などの小さなジスルフィド結合タンパク質足場に由来する結合部位を含む。これらの分子に由来する結合部位を作製するための方法は、当該技術分野において開示されており、例えば、Ｐａｎｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７７：２１６６６－２１６７４（２００２）、Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，１７：１７０－１７５（１９９９）；Ｌｅｇｅｎｄｒｅ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ．，１１：１５０６－１５１８（２００２）；Ｓｔｏｏｐ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２１：１０６３－１０６８（２００３）、及びＶｉｔａ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，９２：６４０４－６４０８（１９９５）を参照されたい。更に他の結合部位は、ＥＧＦ様ドメイン、クリングルドメイン、ＰＡＮドメイン、Ｇｌａドメイン、ＳＲＣＲドメイン、Ｋｕｎｉｔｚ／ウシ膵臓トリプシン阻害因子ドメイン、Ｋａｚａｌ型セリンプロテアーゼ阻害因子ドメイン、トレフォイル（Ｐ型）ドメイン、フォン・ヴィレブランド因子Ｃ型ドメイン、アナフィラトキシン様ドメイン、ＣＵＢドメイン、サイログロブリンＩ型リピート、ＬＤＬ受容体クラスＡドメイン、スシドメイン、リンクドメイン、トロンボスポンジンＩ型ドメイン、免疫グロブリン様ドメイン、Ｃ型レクチンドメイン、ＭＡＭドメイン、フォン・ヴィレブランド因子Ａ型ドメイン、ソマトメジンＢドメイン、ＷＡＰ型４ジスルフィドコアドメイン、Ｆ５／８Ｃ型ドメイン、ヘモペキシンドメイン、ラミニン型ＥＧＦ様ドメイン、Ｃ２ドメイン、単量体または三量体形態のテトラネクチン由来の結合ドメイン、及び当業者に知られている他のそのようなドメイン、ならびにこれらの誘導体及び／またはバリアントからなる群から選択される結合ドメインに由来し得る。例示的な非抗体ベースの足場及びその作製方法は、Ｓｔｅｍｍｅｒらの米国特許出願公開第２００６０２３４２９９号「Ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｃａｆｆｏｌｄｓ ａｎｄ ｕｓｅｓ ｔｈｅｒｅｏｆ」（２００６年１０月１９日）及びＨｅｙ，ｅｔ ａｌ．，Ａｒｔｉｆｉｃｉａｌ，Ｎｏｎ－Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｂｉｎｄｉｎｇ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｆｏｒ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ ａｎｄ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ＴＲＥＮＤＳ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ｖｏｌ．２３，Ｎｏ．１０，Ｔａｂｌｅ ２ ａｎｄ ｐｐ．５１４－５２２（２００５年１０月）にも見出すことができる。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、Ｋｕｎｉｔｚドメインを含む。本明細書で使用される「Ｋｕｎｉｔｚドメイン」という用語は、ある特定のプロテアーゼ、例えば、セリンプロテアーゼを阻害する、保存されたタンパク質ドメインを指す。Ｋｕｎｉｔｚドメインは、比較的小さく、典型的に、約５０～６０アミノ酸長であり、約６ｋＤａの分子量を有する。Ｋｕｎｉｔｚドメインは、典型的に塩基性電荷を担持し、折り畳まれたペプチドのコンパクトで安定した性質に寄与するジスルフィド結合を形成する、２、４、６または８個以上の配置を特徴とする。例えば、多くのＫｕｎｉｔｚドメインは、３つのジスルフィド結合を形成する、６つの保存されたシステイン残基を有する。Ｋｕｎｉｔｚドメインのジスルフィドリッチα／β折り畳みは、２、３（典型的に）または４つ以上のジスルフィド結合を含み得る。
Ｋｕｎｉｔｚドメインは、安定化され（例えば、３つのジスルフィド結合）、かつ強固なコンファメーションの主要決定基であるＰ１残基を特徴付ける反応性部位領域を含有する、セイヨウナシ形の構造を有する。これらの阻害因子は、Ｐ１残基を活性部位の溝に挿入することによって、標的タンパク質（例えば、セリンプロテアーゼ）がその生理学的に関連する巨大分子基質に接近するのを競合的に妨げる。プロテアーゼ阻害ループ中のＰ１残基は、主要特異性決定基を提供し、特定のＫｕｎｉｔｚタンパク質が標的プロテアーゼに対して有する阻害活性の大部分を決定する。一般に、反応性部位（Ｐ）のＮ末端側のほうがＰ’のＣ末端側よりもエネルギー的に重要である。ほとんどの場合、リシンまたはアルギニンがＰ１の位置を占めることにより、タンパク質基質中のこれらの残基に隣接する残基を切断するプロテアーゼを阻害する。他の残基、特に阻害因子のループ領域中の残基は、結合の強さに寄与する。一般に、安定したプロテアーゼ阻害因子タンパク質実体の形成において、標的タンパク質中の約１０～１２アミノ酸残基とプロテアーゼ中の２０～２５残基が直接接触し、約６００～９００Ａの埋没領域をもたらす。Ｋｕｎｉｔｚドメインは、Ｐ部位中の残基及び周辺残基を変更することによって、最適なタンパク質を標的にするように設計することができる。Ｋｕｎｉｔｚドメインは、例えば、米国特許第６，０５７，２８７号に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、アフィリンである。アフィリンは、タンパク質及び低分子化合物に対する特異的親和性のために設計された小さい抗体模倣タンパク質である。新規アフィリンは、異なるヒト由来足場タンパク質にそれぞれ基づく２つのライブラリーから極めて迅速に選択することができる。アフィリンは、免疫グロブリンタンパク質に対していかなる構造的相同性も示さない。一般に使用されるアフィリン足場には２つあり、１つは、γ結晶のヒトの水晶体構造タンパク質であり、もう１つは、「ユビキチン」スーパーファミリータンパク質である。２つのヒト足場は両方とも、極めて小さく、高温安定性を示し、ｐＨ変化及び変性剤に対してほとんど抵抗性である。この高い安定性は、主に、これらのタンパク質の広範なβシート構造に起因する。γ結晶由来タンパク質の例は、ＷＯ２００１０４１４４に記載されており、「ユビキチン様」タンパク質の例は、ＷＯ２００４１０６３６８に記載されている。
別の例として、いくつかの場合において、非抗体ベースの足場は、アビマーである。アビマーは、ｉｎ ｖｉｔｒｏエクソンシャッフリング及びファージディスプレイによって、ヒト細胞外受容体ドメインの大規模ファミリーから進化し、これにより、結合特性及び阻害特性を有するマルチドメインタンパク質を生成する。独立した複数の結合ドメインの連結により、アビディティの創出が示され、従来の単一エピトープ結合タンパク質と比較して親和性及び特異性の改善をもたらす。ある特定の実施形態において、アビマーは、それぞれが３０～３５アミノ酸で、スペーサー領域ペプチドによって連結されている２つ以上のペプチド配列からなる。個々の配列は、様々な膜受容体のＡドメインに由来し、ジスルフィド結合及びカルシウムによって安定化された強固な構造を有する。各Ａドメインは、標的タンパク質のある特定のエピトープに結合することができる。同じタンパク質の異なるエピトープに結合するドメインの組み合わせは、当該タンパク質への親和性を増加させるものであり、この作用はアビディティとして知られる（名称の由来）。ナノモル以下の親和性を有するアビマーが様々な標的に対して得られている。あるいは、ドメインを、異なる標的タンパク質上のエピトープに対して指向させることができる。アビマーに関する更なる情報は、米国特許出願公開第２００６／０２８６６０３号、同第２００６／０２３４２９９号、同第２００６／０２２３１１４号、同第２００６／０１７７８３１号、同第２００６／０００８８４４号、同第２００５／０２２１３８４号、同第２００５／０１６４３０１号、同第２００５／００８９９３２号、同第２００５／００５３９７３号、同第２００５／００４８５１２号、同第２００４／０１７５７５６号に見出すことができる。
非抗体ベースの足場の好適な標的には、抗体ベースの足場が結合することができる、上述の抗原のいずれかが含まれる。
いくつかの場合において、非抗体ベースの足場が結合する標的（特異的結合対の第２のメンバー）は、可溶性である。いくつかの場合において、標的は、膜結合しており、例えば、いくつかの場合において、標的は、細胞の表面上に存在する。いくつかの場合において、標的は、不溶性支持体上に固定化されており、不溶性支持体は、種々の材料（例えば、ポリエチレン、ポリスチレン、ポリビニルピロリドン、ポリカーボネート、ニトロセルロースなど）のいずれかを含むことができ、不溶性支持体は、種々の形態、例えば、プレート、組織培養皿、カラムなどであり得る。いくつかの場合において、標的は、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）内に存在する（例えば、抗原は、ＥＣＭ構成成分である）。いくつかの場合において、標的は、人工マトリックス内に存在する。いくつかの場合において、標的は、無細胞環境内に存在する。
細胞接着分子
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、細胞接着分子（ＣＡＭ）、すなわち、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）の構成成分と結合するか、細胞表面分子と結合するポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、ＣＡＭの細胞外領域である。いくつかの場合において、ＣＡＭは、カルシウム非依存性接着分子であり、例えば、いくつかの場合において、ＣＡＭは、免疫グロブリンスーパーファミリーＣＡＭである。いくつかの場合において、ＣＡＭは、カルシウム依存性接着分子であり、例えば、ＣＡＭは、インテグリン、カドヘリンまたはセレクチンである。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、インテグリンである。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、カドヘリン、例えば、Ｅ－カドヘリン、Ｐ－カドヘリン、Ｎ－カドヘリン、Ｒ－カドヘリン、Ｍ－カドヘリンなどである。いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、セレクチン、例えば、Ｅ－セレクチン、Ｌ－セレクチンまたはＰ－セレクチンである。ＣＡＭの結合断片を特異的結合対の第１のメンバーに使用することができる。
特異的結合対の第１のメンバーがＣＡＭである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、ＥＣＭの構成成分またはＣＡＭに結合する細胞表面分子である。例えば、特異的結合対の第１のメンバーがインテグリンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、コラーゲン、フィブリノゲン、フィブロネクチンまたはビトロネクチンの構成成分である。別の例として、特異的結合対の第１のメンバーがカドヘリンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、カドヘリンが結合する細胞表面抗原である。別の例として、特異的結合対の第１のメンバーがセレクチンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、フコシル化炭水化物である。
リガンド
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、受容体のリガンドである。リガンドには、ポリペプチド、核酸、糖タンパク質、小分子、炭水化物、脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖体などが含まれる。いくつかの場合において、リガンドは、可溶性である。
リガンドには、サイトカイン（例えば、ＩＬ－１３、など）、成長因子（例えば、ヘレグリン、血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）など）、ペプチドホルモン、インテグリン結合ペプチド（例えば、配列Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐを含むペプチド）、Ｎ－グリカンなどが含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの特異的結合対のメンバーがリガンドである場合、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、特異的結合対の第２のメンバーの存在下で活性化することができ、特異的結合対の第２のメンバーは、リガンドの受容体である。例えば、リガンドがＶＥＧＦである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性ＶＥＧＦ受容体を含むＶＥＧＦ受容体であり得る。あるいは、特異的結合対の第１のメンバーはＶＥＧＦ受容体であり得、特異的結合対の第１のメンバーはＶＥＧＦであり得る。別の例として、リガンドがヘレグリンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、Ｈｅｒ２であり得る。
特異的結合対の第１のメンバーがリガンドである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、リガンドと結合する分子であり、例えば、特異的結合対の第２のメンバーは、リガンドに特異的に結合する抗体、リガンドの受容体などである。
特異的結合対の第１のメンバーがリガンドである場合、いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバー（リガンドと結合する分子）は、可溶性である。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーが膜結合しており、例えば、いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、細胞の表面上に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、不溶性支持体上に固定化されており、不溶性支持体は、種々の材料（例えば、ポリエチレン、ポリスチレン、ポリビニルピロリドン、ポリカーボネート、ニトロセルロースなど）のいずれかを含むことができ、不溶性支持体は、種々の形態、例えば、プレート、組織培養皿、カラムなどであり得る。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、無細胞環境内に存在する。
抗原
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、抗体が特異的に結合する抗原である。抗原は、任意の抗原、例えば、天然（内因性）抗原、合成抗原（例えば、天然抗原とはもはや同じでないように改変されたもの、その天然状態から改変されたものなど）などであり得る。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの特異的結合対のメンバーが抗原である場合、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、特異的結合対の第２のメンバーの存在下で活性化することができ、この場合、特異的結合対の第２のメンバーは、抗原に結合する抗体（抗体ベースの認識足場）である。
いくつかの場合において、抗原は、疾患関連抗原、例えば、がん関連抗原、自己免疫疾患関連抗原、病原体関連抗原、炎症関連抗原などである。
例えば、特異的結合対の第２のメンバーががん関連抗原に対して特異的な抗体である場合、抗原は、がん関連抗原であり得、がん関連抗原には、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３８、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ／ＥＲＢＢ２、ＣＡ１２５、ＭＵＣ－１、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＣＤ４４表面接着分子、メソテリン、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）、高分子黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、ＧＤ２などが含まれる。がん関連抗原にはまた、例えば、４－１ＢＢ、５Ｔ４、腺癌抗原、α－フェトプロテイン、ＢＡＦＦ、Ｂ－リンパ腫細胞、Ｃ２４２抗原、ＣＡ－１２５、炭酸脱水酵素９（ＣＡ－ＩＸ）、Ｃ－ＭＥＴ、ＣＣＲ４、ＣＤ１５２、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２００、ＣＤ２２、ＣＤ２２１、ＣＤ２３（ＩｇＥ受容体）、ＣＤ２８、ＣＤ３０（ＴＮＦＲＳＦ８）、ＣＤ３３、ＣＤ４、ＣＤ４０、ＣＤ４４ ｖ６、ＣＤ５１、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ７４、ＣＤ８０、ＣＥＡ、ＣＮＴＯ８８８、ＣＴＬＡ－４、ＤＲＳ、ＥＧＦＲ、ＥｐＣＡＭ、ＣＤ３、ＦＡＰ、フィブロネクチンエクストラドメイン－Ｂ、葉酸受容体１、ＧＤ２、ＧＤ３ガングリオシド、糖タンパク質７５、ＧＰＮＭＢ、ＨＥＲ２／ｎｅｕ、ＨＧＦ、ヒト細胞分散因子受容体キナーゼ、ＩＧＦ－１受容体、ＩＧＦ－Ｉ、ＩｇＧ１、Ｌ１－ＣＡＭ、ＩＬ－１３、ＩＬ－６、インスリン様成長因子Ｉ受容体、インテグリンα５β１、インテグリンαｖβ３、ＭＯＲＡｂ－００９、ＭＳ４Ａ１、ＭＵＣ１、ムチンＣａｎＡｇ、Ｎ－グリコリルノイラミン酸、ＮＰＣ－１Ｃ、ＰＤＧＦ－Ｒα、ＰＤＬ１９２、ホスファチジルセリン、前立腺癌細胞、ＲＡＮＫＬ、ＲＯＮ、ＲＯＲ１、ＳＣＨ ９００１０５、ＳＤＣ１、ＳＬＡＭＦ７、ＴＡＧ－７２、テネイシンＣ、ＴＧＦβ２、ＴＧＦ－β、ＴＲＡＩＬ－Ｒ１、ＴＲＡＩＬ－Ｒ２、腫瘍抗原ＣＴＡＡ１６．８８、ＶＥＧＦ－Ａ、ＶＥＧＦＲ－１、ＶＥＧＦＲ２及びビメンチンが含まれる。
抗原は、炎症性疾患に関連し得る。炎症性疾患に関連する抗原の非限定的な例には、例えば、ＡＯＣ３（ＶＡＰ－１）、ＣＡＭ－３００１、ＣＣＬ１１（エオタキシン－１）、ＣＤ１２５、ＣＤ１４７（ベイシジン）、ＣＤ１５４（ＣＤ４０Ｌ）、ＣＤ２、ＣＤ２０、ＣＤ２３（ＩｇＥ受容体）、ＣＤ２５（ＩＬ－２受容体のα鎖）、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ５、ＩＦＮ－α、ＩＦＮ－γ、ＩｇＥ、ＩｇＥ Ｆｃ領域、ＩＬ－１、ＩＬ－１２、ＩＬ－２３、ＩＬ－１３、ＩＬ－１７、ＩＬ－１７Ａ、ＩＬ－２２、ＩＬ－４、ＩＬ－５、ＩＬ－５、ＩＬ－６、ＩＬ－６受容体、インテグリンα４、インテグリンα４β７、ＬＦＡ－１（ＣＤ１１ａ）、ミオスタチン、ＯＸ－４０、スクレロスチン、ＳＯＳＴ、ＴＧＦβ１、ＴＮＦ－α及びＶＥＧＦ－Ａが挙げられる。
特異的結合対の第１のメンバーが抗原である場合、特異的結合対の第２のメンバーは、抗体ベースの足場（例えば、抗体）または非抗体ベースの足場であり得る。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、細胞の表面上に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、不溶性支持体上に固定化されている。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性である。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、細胞外環境（例えば、細胞外マトリックス）内に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、人工マトリックス内に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、無細胞環境内に存在する。
非抗体ベースの認識足場の標的
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、非抗体ベースの足場の標的である。標的には、例えば、ポリペプチド、核酸、糖タンパク質、小分子、炭水化物、脂質、糖脂質、リポタンパク質、リポ多糖体などが含まれる。
特異的結合対の第１のメンバーが非抗体ベースの足場の標的である場合、特異的結合対の第２のメンバーは、非抗体ベースの足場である。
受容体
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、受容体である。いくつかの場合において、受容体は、成長因子受容体である。いくつかの場合において、受容体は、サイトカイン受容体である。いくつかの場合において、受容体は、細胞上の共受容体に結合する細胞表面受容体である。いくつかの場合において、受容体は、神経伝達物質受容体である。いくつかの場合において、受容体は、細胞外マトリックス構成成分に結合する。いくつかの場合において、受容体は、免疫グロブリンＦｃ受容体である。
好適な受容体には、成長因子受容体（例えば、ＶＥＧＦ受容体）、キラー細胞レクチン様受容体サブファミリーＫメンバー１（ＮＫＧ２Ｄ）ポリペプチド（ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ及びＵＬＢ６の受容体）、サイトカイン受容体（例えば、ＩＬ－１３受容体、ＩＬ－２受容体など）、上皮成長因子（ＥＧＦ）受容体、Ｈｅｒ２、ＣＤ２７、天然細胞傷害受容体（ＮＣＲ）（例えば、ＮＫＰ３０（ＮＣＲ３／ＣＤ３３７）ポリペプチド（ＨＬＡ－Ｂ関連転写物３（ＢＡＴ３）及びＢ７－Ｈ６の受容体）など）、Ｔ細胞抗原受容体、ジヒドロ葉酸受容体、キメラサイトカイン受容体、Ｆｃ受容体、細胞外マトリックス受容体（例えば、インテグリン）、細胞接着受容体（例えば、カドヘリン）、正の共受容体（例えば、ＣＤ２８）及び負の（免疫抑制性）共受容体（例えば、ＰＤ１）の両方を含む免疫調節受容体、サイトカイン受容体、ならびに免疫調節分子の受容体（例えば、ＴＧＦβ）、などが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの場合において、受容体は、野生型受容体と比較して切断されている。
特異的結合対の第１のメンバーが受容体である場合、特異的結合対の第２のメンバーは受容体の標的であり、標的は受容体のリガンドまたは共受容体であり得る。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、細胞の表面上に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、不溶性支持体上に固定化されている。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性である。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、細胞外環境（例えば、細胞外マトリックス）内に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、人工マトリックス内に存在する。いくつかの場合において、特異的結合対の第２のメンバーは、無細胞環境内に存在する。
ヒンジ領域
いくつかの場合において、当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１のポリペプチドは、ヒンジ領域（本明細書中、「スペーサー」とも称される）を含み、ヒンジ領域は、抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとの間に介在する。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、免疫グロブリン重鎖ヒンジ領域である。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、受容体に由来するヒンジ領域ポリペプチド（例えば、ＣＤ８由来ヒンジ領域）である。
ヒンジ領域は、約４アミノ酸～約５０アミノ酸、例えば、約４アミノ酸～約１０アミノ酸、約１０アミノ酸～約１５アミノ酸、約１５アミノ酸～約２０アミノ酸、約２０アミノ酸～約２５アミノ酸、約２５アミノ酸～約３０アミノ酸、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、または約４０アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有し得る。
好適なスペーサーは、容易に選択することができ、４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸を含む、１アミノ酸（例えば、Ｇｌｙ）～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、３アミノ酸～１２アミノ酸などの複数の好適な長さのいずれかであり得、１、２、３、４、５、６または７アミノ酸であり得る。
例示的なスペーサーには、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６）及び（ＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１７）（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、及び当該技術分野において知られている他の柔軟性のあるリンカーが含まれる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーを使用することができ、ＧｌｙとＳｅｒの両方は、比較的非構造的であり、したがって、構成成分間の中間テザーとして機能することができる。グリシンポリマーを使用することができ、グリシンは、更にアラニンよりも極めて多くのφ－ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ない（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）参照）。例示的なスペーサーは、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１８）、ＧＧＳＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１９）、ＧＳＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２０）、ＧＳＧＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２１）、ＧＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２２）、ＧＳＳＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２３）などを含むアミノ酸配列を含み得る。
いくつかの場合において、当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１のポリペプチド中のヒンジ領域は、少なくとも１つのシステインを含む。例えば、いくつかの場合において、ヒンジ領域は、配列Ｃｙｓ－Ｐｒｏ－Ｐｒｏ－Ｃｙｓを含み得る。第１の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのヒンジ領域中のシステインは、存在する場合、第２の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド中のヒンジ領域とのジスルフィド結合を形成するために利用可能であり得る。
免疫グロブリンのヒンジ領域のアミノ酸配列は、当該技術分野において知られており、例えば、Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１６２、及びＨｕｃｋ ｅｔ ａｌ．（１９８６）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１４：１７７９を参照されたい。非限定的な例として、免疫グロブリンのヒンジ領域は、次のアミノ酸配列のうちの１つを含み得る：ＤＫＴＨＴ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２４）、ＣＰＰＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２５）、
Figure 0007068169000014
（例えば、Ｇｌａｓｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８０：４１４９４参照）、
Figure 0007068169000015
（ヒトＩｇＧ１ヒンジ）、
Figure 0007068169000016
（ヒトＩｇＧ２ヒンジ）、
Figure 0007068169000017
（ヒトＩｇＧ３ヒンジ）、
Figure 0007068169000018
（ヒトＩｇＧ４ヒンジ）など。
ヒンジ領域は、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４のヒンジ領域のアミノ酸配列を含み得る。ヒンジ領域は、野生型（天然）ヒンジ領域と比較して、１つ以上のアミノ酸置換及び／または挿入及び／または欠失を含み得る。例えば、ヒトＩｇＧ１ヒンジのＨｉｓ２２９は、Ｔｙｒで置換することができ、これにより、ヒンジ領域は、配列
Figure 0007068169000019
を含む。例えば、Ｙａｎ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８７：５８９１を参照されたい。
ヒンジ領域は、ヒトＣＤ８に由来するアミノ酸配列を含み得、例えば、ヒンジ領域は、アミノ酸配列：
Figure 0007068169000020
またはそのバリアントを含み得る。
膜貫通ドメイン
本開示のＣＡＲの第１及び第２のポリペプチドは、真核細胞膜への挿入のための膜貫通ドメインを含む。第１のポリペプチドの膜貫通ドメインは、抗原結合ドメインと共刺激ドメインとの間に介在する。第１のポリペプチドがヒンジ領域を含む場合、膜貫通ドメインは、ヒンジ領域と共刺激ドメインとの間に介在し、したがって、第１のポリペプチドは、アミノ末端（Ｎ末端）からカルボキシル末端（Ｃ末端）に向かって順番に、抗原結合ドメイン、ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、第１の共刺激ドメイン及び二量体化因子結合対の第１のメンバーを含む。
第２のポリペプチドの膜貫通ドメインは、ポリペプチドのＮ末端またはＮ末端付近にあり、したがって、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端に向かって順番に、膜貫通ドメイン、第２の共刺激ドメイン、二量体化因子結合対の第２のメンバー及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
真核細胞（例えば、哺乳動物細胞）の細胞膜へのポリペプチドの挿入を提供する任意の膜貫通（ＴＭ）ドメインが使用に適している。１つの非限定的な例として、
Figure 0007068169000021
のＴＭ配列を使用することができる。好適なＴＭ配列の更なる非限定的な例には、ａ）ＣＤ８β由来：
Figure 0007068169000022
、ｂ）ＣＤ４由来：
Figure 0007068169000023
、ｃ）ＣＤ３ζ由来：
Figure 0007068169000024
、ｄ）ＣＤ２８由来：
Figure 0007068169000025
、ｅ）ＣＤ１３４（ＯＸ４０）由来：
Figure 0007068169000026
、及びｆ）ＣＤ７由来：
Figure 0007068169000027
が挙げられる。
リンカー
いくつかの場合において、当該ＣＡＲの第１のポリペプチドは、任意の２つの隣接するドメインの間にリンカーを含む。例えば、リンカーは、第１のポリペプチドの膜貫通ドメインと第１の共刺激ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、第１のポリペプチドの第１の共刺激ドメインと二量体化因子結合対の第１のメンバーとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、第２のポリペプチドの膜貫通ドメインと第２の共刺激ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、第２のポリペプチドの第２の共刺激ドメインと二量体化因子結合対の第２のメンバーとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、第２のポリペプチドの二量体化因子結合対の第２のメンバーと細胞内シグナル伝達ドメインとの間に配置され得る。
リンカーペプチドは、様々なアミノ酸配列のうちのいずれかを有し得る。タンパク質は、概して柔軟性のあるスペーサーペプチドによって連結され得るが、他の化学連結を除外するものではない。リンカーは、約６～約４０アミノ酸長、または約６～約２５アミノ酸長のペプチドであり得る。これらのリンカーは、タンパク質を連結するために、合成リンカーコードオリゴヌクレオチドを使用して生成することができる。ある程度の柔軟性を有するペプチドリンカーが使用され得る。連結ペプチドは、好適なリンカーが概して柔軟性のあるペプチドをもたらす配列を有するということに留意した上で、実質的には任意のアミノ酸配列を有し得る。柔軟性のあるペプチドの作製には、グリシン及びアラニンなどの小さなアミノ酸が有用である。そのような配列の作製は、当業者には日常の手法である。
好適なリンカーは、容易に選択することができ、１アミノ酸（例えば、Ｇｌｙ）～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸を含む、３アミノ酸～１２アミノ酸などの好適な異なる長さのいずれかであり得、１、２、３、４、５、６または７アミノ酸であり得る。
例示的な柔軟性リンカーには、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、ＧＳＧＧＳｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６）及びＧＧＧＳｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１７）（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、及び当該技術分野において知られている他の柔軟性リンカーが含まれる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーは、当該アミノ酸がいずれも比較的非構造的であり、したがって、構成成分間の中間テザーとして機能することができるので、興味深い。グリシンポリマーは、グリシンが更にアラニンよりも極めて多くのφ－ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ないため、特に興味深い（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）参照）。例示的な柔軟性リンカーには、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１８）、ＧＧＳＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１９）、ＧＳＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２０）、ＧＳＧＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２１）、ＧＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２２）、ＧＳＳＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２３）などが含まれる。当業者であれば、上記の任意の要素に結合されるペプチドの設計が、完全にまたは部分的に柔軟性であるリンカーを含むことができ、したがって、リンカーが、柔軟性リンカーだけではなく、柔軟性のより低い構造をもたらす１つ以上の部分を含み得ることを認識するであろう。
調節ドメイン
本開示のＣＡＲでの使用に好適な調節ドメインには、共刺激ドメインが含まれる。調節ドメインは、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドに存在しても存在しなくてもよい。したがって、本開示の特定の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド（または本開示の多鎖型条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのうちの１つ以上のポリペプチド鎖）は、０～６個またはそれ以上の調節ドメインを含み得る。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、全体的に、０、１、２、３、４、５、６個またはそれ以上の調節ドメインを含み得る。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、個々に、０、１、２、３、４、５、６個またはそれ以上の調節ドメインを含み得る。特定の調節ドメインが条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの１つのポリペプチド鎖中に存在し得るが、別の鎖には存在しなくてもよい。いくつかの場合において、特定の調節ドメインが２鎖型条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの両方の鎖に存在し得る。更に、ポリペプチド上またはポリペプチド内の調節ドメインの位置は、特定の調節ドメインがポリペプチドの終端（例えば、Ｎ末端またはＣ末端の終端）またはポリペプチド内の本質的に任意の適切な位置、例えば、膜貫通ドメインに隣接する位置、細胞内シグナル伝達ドメインに隣接する位置、１つ以上の他の調節ドメインに隣接する位置などに配置され得るので、大きく変わり得る。
いくつかの場合において、当該ＣＡＲの第１のポリペプチド上の調節ドメインは、ＣＡＲの第２のポリペプチドの調節ドメインと実質的に同じアミノ酸配列を有する。例えば、いくつかの場合において、ＣＡＲの第１のポリペプチド上の調節ドメインは、ＣＡＲの第２のポリペプチド上の調節ドメインのアミノ酸配列に対して、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を含む。当該ＣＡＲの第１のポリペプチドの調節ドメインは、当該ＣＡＲの第２のポリペプチドの調節ドメインと実質的に同じ長さを有し得、例えば、第１及び第２の調節ドメインは、互いの長さが１０アミノ酸未満、または５アミノ酸未満異なり得る。いくつかの場合において、第１及び第２の調節ドメインは、同じ長さを有する。
当該ＣＡＲの第１及び第２のポリペプチド中に含めるのに好適な調節ドメインは、約３０アミノ酸～約７０アミノ酸（ａａ）の長さを有し得、例えば、調節ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有し得る。他の場合において、調節ドメインは、約７０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約２００アミノ酸、または２００アミノ酸超の長さを有し得る。
本開示のＣＡＲでの使用に好適な共刺激ドメインは、概して、受容体に由来するポリペプチドである。いくつかの実施形態において、共刺激ドメインは、ホモ二量体化する。当該共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質の細胞内部分であり得る（すなわち、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質に由来し得る）。好適な共刺激ポリペプチドの非限定的な例には、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＯＸ－４０、ＢＴＬＡ、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ及びＨＶＥＭが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、当該ＣＡＲの第１のポリペプチド上の共刺激ドメインは、ＣＡＲの第２のポリペプチドの共刺激ドメインと実質的に同じアミノ酸配列を有する。例えば、いくつかの場合において、ＣＡＲの第１のポリペプチド上の共刺激ドメインは、ＣＡＲの第２のポリペプチド上の共刺激ドメインのアミノ酸配列に対して、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を含む。当該ＣＡＲの第１のポリペプチドの共刺激ドメインは、当該ＣＡＲの第２のポリペプチドの共刺激ドメインと実質的に同じ長さを有し得、例えば、第１及び第２の共刺激ドメインは、互いの長さが１０アミノ酸未満、または５アミノ酸未満異なり得る。いくつかの場合において、第１及び第２の共刺激ドメインは、同じ長さを有する。
当該ＣＡＲの第１及び第２のポリペプチド中に含めるのに好適な共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約７０アミノ酸（ａａ）の長さを有し得、例えば、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有し得る。他の場合において、共刺激ドメインは、約７０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約２００アミノ酸、または２００アミノ酸超の長さを有し得る。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質４－１ＢＢ（ＴＮＦＲＳＦ９、ＣＤ１３７、４－１ＢＢ、ＣＤｗ１３７、ＩＬＡなどとしても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000028
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＣＤ２８（Ｔｐ４４としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000029
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＩＣＯＳ（ＡＩＬＩＭ、ＣＤ２７８及びＣＶＩＤ１としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000030
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＯＸ－４０（ＴＮＦＲＳＦ４、ＲＰ５－９０２Ｐ８．３、ＡＣＴ３５、ＣＤ１３４、ＯＸ４０、ＴＸＧＰ１Ｌとしても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000031
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＢＴＬＡ（ＢＴＬＡ１及びＣＤ２７２としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000032
。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＣＤ２７（Ｓ１５２、Ｔ１４、ＴＮＦＲＳＦ７及びＴｐ５５としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000033
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＣＤ３０（ＴＮＦＲＳＦ８、Ｄ１Ｓ１６６Ｅ及びＫｉ－１としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１６０アミノ酸、または約１６０アミノ酸～約１８５アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000034
。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＧＩＴＲ（ＴＮＦＲＳＦ１８、ＲＰ５－９０２Ｐ８．２、ＡＩＴＲ、ＣＤ３５７及びＧＩＴＲ－Ｄとしても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000035
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質ＨＶＥＭ（ＴＮＦＲＳＦ１４、ＲＰ３－３９５Ｍ２０．６、ＡＴＡＲ、ＣＤ２７０、ＨＶＥＡ、ＨＶＥＭ、ＬＩＧＨＴＲ及びＴＲ２としても知られる）の細胞内部分に由来する。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000036
。これらの実施形態のいくつかにおいて、第１及び第２の両ポリペプチドの共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
二量体化対
上述のように、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは２つのポリペプチド鎖を含み、その１つ目は二量体化対の第１のメンバーを含み、２つ目は二量体化対の第２のメンバーを含む。二量体化対のメンバーの一方は、核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み得、二量体化対の他方のメンバーは、同じ核内ホルモン受容体のコレギュレーターペプチドを含み得る。二量体化対の第１及び第２のメンバーは、二量体化物質（例えば、核内ホルモンまたは核内ホルモンの機能的誘導体もしくはアナログ；本明細書中、「二量体化因子」とも称される）の存在下で、互いに結合し得、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの２つのポリペプチド鎖の二量体化をもたらし得る。二量体化対の第１のメンバーまたは二量体化対の第２のメンバーは、「二量体化ドメイン」と称されることもある。
リガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）
核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメインは、ＥＲα、ＥＲβ、ＰＲ、ＡＲ、ＧＲ、ＭＲ、ＲＡＲα、ＲＡＲβ、ＲＡＲγ、ＴＲα、ＴＲβ、ＶＤＲ、ＥｃＲ、ＲＸＲα、ＲＸＲβ、ＲＸＲγ、ＰＰＡＲα、ＰＰＡＲβ、ＰＰＡＲγ、ＬＸＲα、ＬＸＲβ、ＦＸＲ、ＰＸＲ、ＳＸＲ、ＣＡＲ、ＳＦ－１、ＬＲＨ－１、ＤＡＸ－１、ＳＨＰ、ＴＬＸ、ＰＮＲ、ＮＧＦ１－Ｂα、ＮＧＦ１－Ｂβ、ＮＧＦ１－Ｂγ、ＲＯＲα、ＲＯＲβ、ＲＯＲγ、ＥＲＲα、ＥＲＲβ、ＥＲＲγ、ＧＣＮＦ、ＴＲ２／４、ＨＮＦ－４、ＣＯＵＰ－ＴＦα、ＣＯＵＰ－ＴＦβ及びＣＯＵＰ－ＴＦγを含むがこれらに限定されない、種々の核内ホルモン受容体のいずれかに由来し得る。
核内ホルモン受容体の略語を次に示す。ＥＲ：エストロゲン受容体、ＰＲ：プロゲステロン受容体、ＡＲ：アンドロゲン受容体、ＧＲ：グルココルチコイド受容体、ＭＲ：ミネラルコルチコイド受容体、ＲＡＲ：レチノイン酸受容体、ＴＲα，β：甲状腺受容体、ＶＤＲ：ビタミンＤ３受容体、ＥｃＲ：エクジソン受容体、ＲＸＲ：レチノイン酸Ｘ受容体、ＰＰＡＲ：ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体、ＬＸＲ：肝臓Ｘ受容体、ＦＸＲ：ファルネソイドＸ受容体、ＰＸＲ／ＳＸＲ：プレグナンＸ受容体／ステロイド及び生体異物受容体、ＣＡＲ：構成的アドロストラン受容体、ＳＦ－１：ステロイド産生因子１、ＤＡＸ－１：Ｘ染色体上遺伝子量感受性性転換副腎低形成先天的必須領域遺伝子１、ＬＲＨ－１：肝臓受容体ホモログ１、ＳＨＰ：低分子ヘテロ二量体パートナー、ＴＬＸ：テイルレス遺伝子、ＰＮＲ：光受容体特異的核内受容体、ＮＧＦ１－Ｂ：神経成長因子、ＲＯＲ：ＲＡＲ関連オーファン受容体、ＥＲＲ：エストロゲン関連受容体、ＧＣＮＦ：胚細胞核因子、ＴＲ２／４：精巣受容体、ＨＮＦ－４：肝細胞核因子、ＣＯＵＰ－ＴＦ：トリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子。
いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体の単一のＬＢＤを含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを２つ含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体の３つのＬＢＤを含む。本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖が核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含む場合、いくつかの場合において、複数のＬＢＤは、同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、２つ以上のＬＢＤは、直接的に、またはリンカーによって隔てられて、タンデムに並んでいる。
ミネラルコルチコイド受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ミネラルコルチコイド受容体（ＭＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１Ａに示されるアミノ酸配列を有するＭＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｆに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
別の非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｓ８１０Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図１Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｓ８１０Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図１Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000037
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000038
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000039
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000040
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000041
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000042
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
アンドロゲン受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、アンドロゲン受容体（ＡＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２Ａに示されるアミノ酸配列を有するＡＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｆ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｆ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ及びＦ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ及びＦ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＡＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000043
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１９アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１９アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＡＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000044
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１９アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１９アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
プロゲステロン受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、プロゲステロン受容体（ＰＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図３Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５６アミノ酸の長さを有し、例えば、２５６アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000045
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000046
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
甲状腺ホルモン受容体β
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、甲状腺ホルモン受容体β（ＴＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図４Ａに示されるアミノ酸配列を有するＴＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｄに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２６０アミノ酸の長さを有し、例えば、２６０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２４６アミノ酸の長さを有し、例えば、２４６アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ３／ＳＲＣ３ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000047
を含むコレギュレーターペプチドである。他の場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ３／ＳＲＣ３ポリペプチドである。いくつかの場合において、コレギュレーターペプチドは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000048
を含む。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000049
を含むコレギュレーターペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
エストロゲン受容体α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、エストロゲン受容体α（ＥＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図５Ａに示されるアミノ酸配列を有するＥＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｈに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、または２００アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有し、例えば、２２９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有し、例えば、３１４アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有し、例えば、２３８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｅに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１８０アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、または２００アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有し、例えば、２２９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｆに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有し、例えば、３１４アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｇに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有し、例えば、２３８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000050
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１６アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１６アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000051
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１６アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１６アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000052
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１３アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１３アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000053
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１３アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１３アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
エストロゲン受容体β（ＥＲβ）
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、エストロゲン受容体α（ＥＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図６Ａに示されるアミノ酸配列を有するＥＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＥＲβのＬＢＤは、図６Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲβのＬＢＤは、図６Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000054
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１７アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000055
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１７アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ（ＰＰＡＲ－γ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図７Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＰＡＲ－γのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｅに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１５０アミノ酸～２０２アミノ酸の長さを有する（例えば、１５０アミノ酸～１６０アミノ酸、１６０アミノ酸～１７０アミノ酸、１７０アミノ酸～１９０アミノ酸、または１９０アミノ酸～２０２アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２７１アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000056
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～２８アミノ酸、２８アミノ酸～２９アミノ酸、２９アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000057
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～２８アミノ酸、２８アミノ酸～２９アミノ酸、２９アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000058
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000059
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000060
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000061
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
グルココルチコイド受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、グルココルチコイド受容体（ＧＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図８Ａに示されるアミノ酸配列を有するＧＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＧＲのＬＢＤは、図８Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＧＲのＬＢＤは、図８Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有し、例えば、２４７アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000062
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000063
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
ビタミンＤ受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ビタミンＤ受容体（ＶＤＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図９Ａに示されるアミノ酸配列を有するＶＤＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＶＤＲのＬＢＤは、図９Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３１０アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＶＤＲのＬＢＤは、図９Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３０３アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３０３アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000064
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000065
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列ＬＬＲＹＬＬＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６０）を含むＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約８アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
甲状腺ホルモン受容体α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、甲状腺ホルモン受容体α（ＴＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１０Ａに示されるアミノ酸配列を有するＴＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＴＲαのＬＢＤは、図１０Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２４５アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、２１０アミノ酸～２３０アミノ酸、または２３０アミノ酸～２４５アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲαのＬＢＤは、図１０Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、２１０アミノ酸～２３０アミノ酸、または２３０アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
ＴＲαに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
レチノイン酸受容体β
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイン酸受容体β（ＲＡＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１１Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＡＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＡＲβのＬＢＤは、図１１Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～約２３５アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３５アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＲＡＲβのＬＢＤは、図１１Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～約２３１アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３１アミノ酸の長さを有する）。
ＲＡＲβに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000066
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000067
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＲＡＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
ファルネソイドＸ受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ファルネソイドＸ受容体（ＦＸＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２２Ａに示されるアミノ酸配列を有するＦＸＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＦＸＲのＬＢＤは、図２２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１００アミノ酸～約１３６アミノ酸の長さを有する（例えば、１００アミノ酸～１１０アミノ酸、１１０アミノ酸～１２０アミノ酸、または１２０アミノ酸～１３６アミノ酸の長さを有する）。
ＦＸＲに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＬＸＲ－α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、肝臓Ｘ受容体α（ＬＲＸα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２３Ａに示されるアミノ酸配列を有するＬＲＸαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＬＲＸαのＬＢＤは、図２３Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～約２６６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、２２０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２６６アミノ酸の長さを有する）。
ＬＲＸαに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＲＯＲγ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイド関連オーファン受容体γ（ＲＯＲγ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２４Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＯＲγのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＯＲγのＬＢＤは、図２４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～約２６１アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、２２０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２６１アミノ酸の長さを有する）。
ＲＯＲγに対して好適なコレギュレーターは、ＮＣＯＲＮＲペプチド
Figure 0007068169000068
である。
ＲＯＲγに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＲＸＲ－α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイドＸ受容体α（ＲＸＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＸＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＯＲγのＬＢＤは、図２５Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する）。
ＲＸＲαに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＰＸＲ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＸＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸１４３～４２８に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２０５～４３４に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＸＲのＬＢＤは、図２６Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～約３０２アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～２９０アミノ酸、または２９０アミノ酸～３０２アミノ酸の長さを有する）。
ＰＸＲに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
コレギュレーターポリペプチド
好適なコレギュレーターポリペプチドは、完全長の天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドの断片を含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、合成または組み換え核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。
好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～２０００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～５０アミノ酸、例えば、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、５０アミノ酸～１００アミノ酸、例えば、５０アミノ酸～６０アミノ酸、６０アミノ酸～７０アミノ酸、７０アミノ酸～８０アミノ酸、８０アミノ酸～９０アミノ酸、または９０アミノ酸～１００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、１００アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～３００アミノ酸、３００アミノ酸～４００アミノ酸、４００アミノ酸～５００アミノ酸、５００アミノ酸～６００アミノ酸、６００アミノ酸～７００アミノ酸、７００アミノ酸～８００アミノ酸、８００アミノ酸～９００アミノ酸、または９００アミノ酸～１０００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、１０００アミノ酸～２０００アミノ酸の長さを有し得る。
好適なコレギュレーターポリペプチドには、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５が含まれるが、これらに限定されない。
そのようなコレギュレーターに関する国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）アクセッション番号には、次のものが含まれる：ＳＲＣ１（ＮＰ＿００３７３４）、ＧＲＩＰ１（ＮＰ＿００６５３１）、ＡＩＢ１（ＮＰ＿００６５２５）、ＰＧＣ１ａ（ＮＰ＿０３７３９３）、ＰＧＣ１ｂ（ＮＰ＿５７３５７０）、ＰＲＣ（ＮＰ＿０５５８７７）、ＴＲＡＰ２２０（ＮＰ＿００４７６５）、ＡＳＣ２（ＮＰ＿０５４７９０）、ＣＢＰ（ＮＰ＿００４３７１）、Ｐ３００（ＮＰ＿００１４２０）、ＣＩＡ（ＮＰ＿０６６０１８）、ＡＲＡ７０（ＮＰ＿００５４２８）、ＴＩＦ１（ＮＰ＿００３８４３）、ＮＳＤ１（ＮＰ＿０７１９００）、ＳＭＡＰ（ＮＰ＿００６６８７）、Ｔｉｐ６０（ＮＰ＿００６３７９）、ＥＲＡＰ１４０（ＮＰ＿８６１４４７）、Ｎｉｘ１（ＮＰ＿１１３６６２）、ＬＣｏＲ（ＮＰ＿１１５８１６）、Ｎ－ＣｏＲ（ＮＰ＿００６３０２）、ＳＭＲＴ（ＮＰ＿００６３０３）、ＲＩＰ１４０（ＮＰ＿００３４８０）及びＰＲＩＣ２８５（ＮＰ＿２０８３８４）。
好適なコレギュレーターポリペプチドの例は、図２９～５１Ｂに記載される。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図２９に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３１に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３２に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３３に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３４に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３５に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３６Ａ～３６Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３７Ａ～３７Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３６Ａ～３６Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３９に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４１に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４２Ａ～４２Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４３に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４４に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４５に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４６に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４７に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４８Ａ～４８Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４９Ａ～４９Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図５０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図５１Ａ～５１Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
好適なコレギュレーターペプチドには、ステロイド受容体コアクチベーター（ＳＲＣ）－１、ＳＲＣ－２、ＳＲＣ－３、ＴＲＡＰ２２０－１、ＴＲＡＰ２２０－２、ＮＲ０Ｂ１、ＮＲＩＰ１、ＣｏＲＮＲｂｏｘ、αβＶ、ＴＩＦ１、ＴＩＦ２、ＥＡ２、ＴＡ１、ＥＡＢ１、ＳＲＣ１－１、ＳＲＣ１－２、ＳＲＣ１－３、ＳＲＣ１－４ａ、ＳＲＣ１－４ｂ、ＧＲＩＰ１－１、ＧＲＩＰ１－２、ＧＲＩＰ１－３、ＡＩＢ１－１、ＡＩＢ１－２、ＡＩＢ１－３、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＡＳＣ２－１、ＡＳＣ２－２、ＣＢＰ－１、ＣＢＰ－２、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０－１、ＡＲＡ７０－２、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、ＣｏＲＮＲ１（Ｎ－ＣｏＲ）、ＣｏＲＮＲ２、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０－Ｃ、ＲＩＰ１４０－１、ＲＩＰ１４０－２、ＲＩＰ１４０－３、ＲＩＰ１４０－４、ＲＩＰ１４０－５、ＲＩＰ１４０－６、ＲＩＰ１４０－７、ＲＩＰ１４０－８、ＲＩＰ１４０－９、ＰＲＩＣ２８５－１、ＰＲＩＣ２８５－２、ＰＲＩＣ２８５－３、ＰＲＩＣ２８５－４及びＰＲＩＣ２８５－５が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターペプチドはＬＸＸＬＬモチーフを含み、配列中、Ｘは任意のアミノ酸であり、コレギュレーターペプチドは、８アミノ酸～５０アミノ酸、例えば、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１２アミノ酸、１２アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する。
好適なコレギュレーターペプチドの非限定的な例は、次のとおりである。
Figure 0007068169000069
Figure 0007068169000070
Figure 0007068169000071
更なる例は、実施例１、実施例２及び実施例３に記載される。
いくつかの場合において、所与のＬＢＤは、２つ以上の異なるコレギュレーターポリペプチドと対を形成することができる。例えば、図１９に示されるように、ＰＰＡＲγは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。別の例として、ＥＲαは、ＣｏＲＮＲ、αβＶまたはＴＡ１と対を形成することができる。別の例として、ＥＲβは、ＣｏＲＮＲ、αβＶまたはＴＡ１と対を形成することができる。別の例として、ＡＲは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。別の例として、ＰＲは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３、ＴＲＡＰ２２０、ＮＲ０Ｂ１、ＰＧＣ１Ｂ、ＮＲＩＰ１、ＥＡ２またはＥＡＢ１と対を形成することができる。別の例として、ＴＲβは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。
いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドは、複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む。本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、複数のコレギュレーターペプチドは、直接的に、またはリンカーによって隔てられて、タンデムに並び得る。いくつかの場合において、ポリペプチド鎖中に存在する２つ以上のコレギュレーターペプチドは、アミノ酸配列が互いに同一である。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、ポリペプチド鎖は、２つのコレギュレーターペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、ポリペプチド鎖は、３つのコレギュレーターペプチドを含む。そのような場合、第２のポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含み得る。例えば、第２のポリペプチド鎖が核内ホルモン受容体のＬＢＤを２つ含む場合、２つのＬＢＤは、アミノ酸配列が互いに同一であり得る。
細胞内シグナル伝達ドメイン
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインには、条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの活性化（すなわち、抗原及び二量体化物質による活性化）に応答して、明確な検出可能なシグナル（例えば、細胞による１つ以上のサイトカインの産生増加、標的遺伝子の転写変化、タンパク質の活性変化、細胞挙動の変化、例えば、細胞死、細胞増殖、細胞分化、細胞生存、細胞シグナル伝達応答の調節など）をもたらす任意の所望のシグナル伝達ドメインが含まれる。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの細胞内シグナル伝達ドメイン（複数可）は、活性化されると、シグナル伝達機能をもたらし、そのため、いくつかの場合において、シグナル伝達（ｓｉｇｎａｌ ｔｒａｎｓｄｕｃｉｎｇ）ドメインと称されることがある。いくつかの実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも１つ（例えば、１、２、３、４、５、６つなど）の以下に記載するＩＴＡＭモチーフを含む。いくつかの実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＤＡＰ１０／ＣＤ２８型シグナル伝達鎖を含む。いくつかの実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、膜結合条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドに共有結合しているのではなく、細胞質に拡散している。
ＩＴＡＭ
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）含有細胞内シグナル伝達ポリペプチドを含む。ＩＴＡＭモチーフは、ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉであり、配列中、Ｘ１及びＸ２は、独立して、任意のアミノ酸である（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６４）。いくつかの場合において、当該ＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、１、２、３、４または５つのＩＴＡＭモチーフを含む。いくつかの場合において、ＩＴＡＭモチーフは、細胞内シグナル伝達ドメイン中で２回繰り返され、ＩＴＡＭモチーフの１つ目と２つ目は、６～８アミノ酸によって互いに隔てられており、例えば、（ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉ）（Ｘ３）ｎ（ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉ）（配列中、ｎは６～８の整数であり、６～８個のＸ３のそれぞれは任意のアミノ酸であってよい）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６５）である。いくつかの場合において、当該ＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、３つのＩＴＡＭモチーフを含む。
好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭモチーフを含有するポリペプチドに由来するＩＴＡＭモチーフ含有部分であり得る。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、任意のＩＴＡＭモチーフ含有タンパク質に由来するＩＴＡＭモチーフ含有ドメインであり得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、その由来となるタンパク質全体の全配列を含有する必要はない。好適なＩＴＡＭモチーフ含有ポリペプチドの例には、ＤＡＰ１２、ＦＣＥＲ１Ｇ（Ｆｃε受容体Ｉ γ鎖）、ＣＤ３Ｄ（ＣＤ３δ）、ＣＤ３Ｅ（ＣＤ３ε）、ＣＤ３Ｇ（ＣＤ３γ）、ＣＤ３Ｚ（ＣＤ３ζ）及びＣＤ７９Ａ（抗原受容体複合体関連タンパク質α鎖）が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＤＡＰ１２（ＴＹＲＯＢＰ、ＴＹＲＯタンパク質チロシンキナーゼ結合タンパク質、ＫＡＲＡＰ、ＰＬＯＳＬ、ＤＮＡＸ活性化タンパク質１２、ＫＡＲ関連タンパク質、ＴＹＲＯタンパク質チロシンキナーゼ結合タンパク質、キラー活性化受容体関連タンパク質、キラー活性化受容体関連タンパク質などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列（４つのアイソフォーム）のうちのいずれかに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000072
Figure 0007068169000073
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＤＡＰ１２アミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000074
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＦＣＥＲ１Ｇ（ＦＣＲＧ、Ｆｃε受容体Ｉ γ鎖、Ｆｃ受容体γ鎖、ｆｃ－ε ＲＩ－γ、ｆｃＲγ、ｆｃｅＲＩγ；高親和性免疫グロブリンε受容体サブユニットγ、免疫グロブリンＥ受容体、高親和性γ鎖などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000075
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＦＣＥＲ１Ｇアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000076
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３δ鎖（ＣＤ３Ｄ、ＣＤ３－デルタ、Ｔ３Ｄ、ＣＤ３抗原デルタサブユニット、ＣＤ３δ、ＣＤ３ｄ抗原デルタポリペプチド（ＴｉＴ３複合体）、ＯＫＴ３δ鎖、Ｔ細胞受容体Ｔ３δ鎖、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３δ鎖などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１７０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000077
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＣＤ３δアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000078
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ε鎖（ＣＤ３ｅ、Ｔ細胞表面抗原Ｔ３／Ｌｅｕ－４ε鎖、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ε鎖、ＡＩ５０４７８３、ＣＤ３、ＣＤ３ε、Ｔ３ｅなどとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約２０５アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000079
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＣＤ３εアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000080
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３γ鎖（ＣＤ３Ｇ、Ｔ細胞受容体Ｔ３γ鎖、ＣＤ３－Γ、Ｔ３Ｇ、γポリペプチド（ＴｉＴ３複合体）などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１８０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000081
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＣＤ３γアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000082
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ζ鎖（ＣＤ３Ｚ、Ｔ細胞受容体Ｔ３ζ鎖、ＣＤ２４７、ＣＤ３－Ζ、ＣＤ３Ｈ、ＣＤ３Ｑ、Ｔ３Ｚ、ＴＣＲＺなどとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１６０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000083
Figure 0007068169000084
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＣＤ３ζアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列のうちのいずれかに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000085
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＣＤ７９Ａ（Ｂ細胞抗原受容体複合体関連タンパク質α鎖、ＣＤ７９ａ抗原（免疫グロブリン関連α）、ＭＢ－１膜糖タンパク質、ｉｇ－α、膜結合免疫グロブリン関連タンパク質、表面ＩｇＭ関連タンパク質などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約２００アミノ酸、または約２００アミノ酸～約２２０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000086
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、完全長ＣＤ７９Ａアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000087
ＤＡＰ１０／ＣＤ２８
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＤＡＰ１０／ＣＤ２８型シグナル伝達鎖を含む。
ＤＡＰ１０シグナル伝達鎖の一例は、アミノ酸配列
Figure 0007068169000088
である。いくつかの実施形態において、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000089
の全長に対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ＣＤ２８シグナル伝達鎖の一例は、アミノ酸配列
Figure 0007068169000090
である。いくつかの実施形態において、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000091
の全長に対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ＺＡＰ７０
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＺＡＰ７０ポリペプチド、例えば、次のアミノ酸配列のうちの約３００アミノ酸～約４００アミノ酸、約４００アミノ酸～約５００アミノ酸、または約５００アミノ酸～６１９アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。
Figure 0007068169000092
Figure 0007068169000093
追加配列
当該条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチドは、１つ以上の追加のポリペプチドドメインを更に含むことができ、そのようなドメインには、シグナル配列、エピトープタグ、親和性ドメイン及び検出可能なシグナルを生成するポリペプチドが含まれるが、これらに限定されない。
シグナル配列
当該ＣＡＲ、例えば、当該ＣＡＲの第１のポリペプチドでの使用に好適なシグナル配列には、天然シグナル配列、合成（例えば、人工）シグナル配列などを含む、任意の真核生物シグナル配列が含まれる。
エピトープタグ
好適なエピトープタグには、ヘマグルチニン（ＨＡ；例えば、ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９４）、ＦＬＡＧ（例えば、ＤＹＫＤＤＤＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９５）、ｃ－ｍｙｃ（例えば、ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９６）などが含まれるが、これらに限定されない。
親和性ドメイン
親和性ドメインは、結合パートナー（例えば、同定または精製に有用な固体支持体上に固定されたものなど）と相互作用することができるペプチド配列を含む。発現タンパク質に融合されたヒスチジンなどの複数の連続する単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列を、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムへの高親和性結合による組み換えタンパク質のワンステップ精製に使用することができる。例示的な親和性ドメインには、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９７）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９８）、Ｃ－ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９９）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６００）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０１）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０２）、ＧＳＴ、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０３）、Ｐｈｅ－Ｈｉｓ－Ｈｉｓ－Ｔｈｒ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：０６４）、キチン結合ドメイン、Ｓペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、
Figure 0007068169000094
、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、レコベリン、Ｓ－モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋ及びカルレチニンに由来するものなどのカルシウム結合ドメイン、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列ならびにマルトース結合タンパク質が含まれる。
検出可能なシグナル生成ポリペプチド
好適な検出可能なシグナル生成タンパク質には、例えば、蛍光タンパク質、検出可能なシグナルを生成物として生成する反応を触媒する酵素などが含まれる。
好適な蛍光タンパク質には、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）またはそのバリアント、ＧＦＰの青色蛍光変異体（ＢＦＰ）、ＧＦＰのシアン蛍光変異体（ＣＦＰ）、ＧＦＰの黄色蛍光変異体（ＹＦＰ）、改良型ＧＦＰ（ＥＧＦＰ）、改良型ＣＦＰ（ＥＣＦＰ）、改良型ＹＦＰ（ＥＹＦＰ）、ＧＦＰＳ６５Ｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、Ｔｏｐａｚ（ＴＹＦＰ）、Ｖｅｎｕｓ、Ｃｉｔｒｉｎｅ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、ＧＦＰｕｖ、不安定化ＥＧＦＰ（ｄＥＧＦＰ）、不安定化ＥＣＦＰ（ｄＥＣＦＰ）、不安定化ＥＹＦＰ（ｄＥＹＦＰ）、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、Ｔ－Ｓａｐｐｈｉｒｅ、ＣｙＰｅｔ、ＹＰｅｔ、ｍＫＯ、ＨｃＲｅｄ、ｔ－ＨｃＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ２、ＤｓＲｅｄモノマー、Ｊ－Ｒｅｄ、ダイマー２、ｔ－ダイマー２（１２）、ｍＲＦＰ１、ポシロポリン、Ｒｅｎｉｌｌａ ＧＦＰ、Ｍｏｎｓｔｅｒ ＧＦＰ、ｐａＧＦＰ、Ｋａｅｄｅタンパク質及びＫｉｎｄｌｉｎｇタンパク質、フィコビリタンパク質及びフィコビリタンパク質結合体（Ｂ－フィコエリトリン、Ｒ－フィコエリトリン及びアロフィコシアニンを含む）が含まれるが、これらに限定されない。蛍光タンパク質の他の例には、ｍＨｏｎｅｙｄｅｗ、ｍＢａｎａｎａ、ｍＯｒａｎｇｅ、ｄＴｏｍａｔｏ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＴａｎｇｅｒｉｎｅ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ１、ｍＲａｓｐｂｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ２、ｍＰｌｕｍ（Ｓｈａｎｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２：９０５－９０９）などが含まれる。花虫類種に由来する種々の蛍光及び有色タンパク質のいずれか、例えば、Ｍａｔｚ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：９６９－９７３に記載されているものなども使用に適している。
好適な酵素には、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β－ガラクトシダーゼ（ＧＡＬ）、グルコース－６－リン酸デヒドロゲナーゼ、β－Ｎ－アセチルグルコサミニダーゼ、β－グルクロニダーゼ、インベルターゼ、キサンチンオキシダーゼ、ホタルルシフェラーゼ、グルコースオキシダーゼ（ＧＯ）などが含まれるが、これらに限定されない。
例示的な条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のキメラポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のキメラポリペプチドと、ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のキメラポリペプチドとを含み、ここで、ｉ）第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢに由来し、ｉｉ）二量体化対の第１及び第２のメンバーは、それぞれＳＲＣ３及びＰＰＡＲγ ＬＢＤであり、ｉｉｉ）シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭを含む。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドの１つのコピーを含む。いくつかの場合において、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドは、２０アミノ酸～２５アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドは、７５アミノ酸～８０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、単一のＳＲＣ３コレギュレーターペプチドを含む。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドの２つのコピーを含む。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドの３つのコピーを含む。いくつかの場合において、ＳＲＣ３コレギュレーターペプチドのコピーのそれぞれは、２０アミノ酸～２５アミノ酸の長さを有する。
例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ｉ）一本鎖Ｆｖ、ｉｉ）膜貫通ポリペプチド、及びｉｉｉ）アミノ酸配列
Figure 0007068169000095
（配列中、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す）を含むポリペプチドを含む、第１のポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000096
配列中、ＰＰＡＲγ ＬＢＤを下線（一重下線）で示し、ＣＤ８α ＴＭドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢを太字で示し、ＣＤ３ζを斜字体太字で示す。
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、ＣＤ１９に対して特異的なｓｃＦｖであり、第１のポリペプチド鎖は、抗ＣＤ１９ｓｃＦｖと第１の調節ドメインとの間に膜貫通ドメインを含み、第１の調節ドメインは、４－１ＢＢである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含む、第１のポリペプチド鎖を含む。
Figure 0007068169000097
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000098
Figure 0007068169000099
配列中、ＰＰＡＲγ ＬＢＤを下線（一重下線）で示し、ＣＤ８α ＴＭドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢを太字で示し、ＣＤ３ζを斜字体太字で示す。
別の例として、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含む、第１のポリペプチド鎖を含む。
Figure 0007068169000100
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000101
配列中、ＰＰＡＲγ ＬＢＤを下線（一重下線）で示し、ＣＤ８α ＴＭドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢを太字で示し、ＣＤ３ζを斜字体太字で示す。
別の例として、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含む、第１のポリペプチド鎖を含む。
Figure 0007068169000102
Figure 0007068169000103
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000104
配列中、ＰＰＡＲγ ＬＢＤを下線（一重下線）で示し、ＣＤ８α ＴＭドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢを太字で示し、ＣＤ３ζを斜字体太字で示す。
別の例として、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ａ）第１のキメラポリペプチドであって、ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、ｉｉ）第１の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及びｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメインを含む、第１のキメラポリペプチドと、ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、ｉ）膜貫通ドメイン、ｉｉ）第２の調節ドメイン、ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及びｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメインを含む、第２のキメラポリペプチドとを含み、ここで、ｉ）第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢに由来し、ｉｉ）二量体化対の第１及び第２のメンバーは、それぞれＣｏＲＮＲ及びＥＲα ＬＢＤであり、ｉｉｉ）シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭを含む。いくつかの場合において、二量体化対の第１のメンバーは、ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドの１つのコピーを含む。いくつかの場合において、ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドは、６０アミノ酸～７０アミノ酸の長さを有する。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、単一のＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドを含む。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドの２つのコピーを含む。いくつかの場合において、第１のキメラポリペプチドは、ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドの３つのコピーを含む。いくつかの場合において、ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドのコピーのそれぞれは、１５アミノ酸～２０アミノ酸の長さを有する。
例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、ｉ）一本鎖Ｆｖ、ｉｉ）膜貫通ポリペプチド、及びｉｉｉ）アミノ酸配列
Figure 0007068169000105
を含む第１のポリペプチド鎖を含むポリペプチドを含む。配列中、４－１ＢＢアミノ酸配列を斜字体太字で示し、３×ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドを下線で示す。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000106
配列中、ＴＭポリペプチドを二重下線で示し、４－１ＢＢアミノ酸配列を斜字体太字で示し、ＥＲ ＬＢＤを下線（一重下線）で示す。
いくつかの場合において、特異的結合対の第１のメンバーは、ＣＤ１９に対して特異的なｓｃＦｖであり、第１のポリペプチド鎖は、抗ＣＤ１９ｓｃＦｖと第１の調節ドメインとの間に膜貫通ドメインを含み、第１の調節ドメインは、４－１ＢＢである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含む、第１のポリペプチド鎖を含む。
Figure 0007068169000107
配列中、抗ＣＤ１９ｓｃＦｖを太字で示し、ＴＭ領域を二重下線で示し、４－１ＢＢポリペプチドを斜字体太字で示し、３×ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。いくつかの場合において、第２のポリペプチド鎖は、次のアミノ酸配列を含む。
Figure 0007068169000108
Figure 0007068169000109
配列中、ＴＭポリペプチドを二重下線で示し、４－１ＢＢアミノ酸配列を斜字体太字で示し、ＥＲ ＬＢＤを下線（一重下線）で示す。
二量体化物質
好適な二量体化物質（二量体化因子、二量体化剤とも称される）は、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１のポリペプチド中の核内ホルモン受容体のＬＢＤと結合し、かつ条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第２のポリペプチド中のコレギュレーターペプチドと結合する。二量体化物質のＬＢＤ及びコレギュレーターペプチドへの結合は、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとを二量体化させるように機能する。
好適な二量体化物質は、当該技術分野において知られており、任意の周知の二量体化物質を使用することができる。
二量体化物質の例には、コルチコステロン（１１β，２１－ジヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、デオキシコルチコステロン（２１－ヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、コルチゾール（１１β，１７，２１－トリヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、１１－デオキシコルチゾール（１７，２１－ジヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、コルチゾン（１７，２１－ジヒドロキシ－４－プレグネン－３，１１，２０－トリオン）、１８－ヒドロキシコルチコステロン（１１β，１８，２１－トリヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、１．α．－ヒドロキシコルチコステロン（１α，１１β，２１－トリヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、アルドステロン１１β，２１－ジヒドロキシ－３，２０－ジオキソ－４－プレグネン－１８－アールの、１８，１１－ヘミタール、アンドロステンジオン（４－アンドロステン－３，１７－ジオン）、４－ヒドロキシ－アンドロステンジオン、１１β－ヒドロキシアンドロステンジオン（１１β－４－アンドロステン－３，１７－ジオン）、アンドロスタンジオール（３－β，１７－β－アンドロスタンジオール）、アンドロステロン（３α－ヒドロキシ－５α－アンドロスタン－１７－オン）、エピアンドロステロン（３β－ヒドロキシ－５α－アンドロスタン－１７－オン）、アドレノステロン（４－アンドロステン－３，１１，１７－トリオン）、デヒドロエピアンドロステロン（３β－ヒドロキシ－５－アンドロステン－１７－オン）、デヒドロエピアンドロステロンサルフェート（３β－スルホキシ－５－アンドロステン－１７－オン）、テストステロン（１７β－ヒドロキシ－４－アンドロステン－３－オン）、エピテストステロン（１７α－ヒドロキシ－４－アンドロステン－３－オン）、５α－ジヒドロテストステロン（１７β－ヒドロキシ－５α－アンドロスタン－３－オン５β－ジヒドロテストステロン、５－β－ジヒドロキシテストステロン（１７β－ヒドロキシ－５β－アンドロスタン－３－オン）、１１β－ヒドロキシテストステロン（１１β，１７β－ジヒドロキシ－４－アンドロステン－３－オン）、１１－ケトテストステロン（１７β－ヒドロキシ－４－アンドロステン－３，１７－ジオン）、エストロン（３－ヒドロキシ－１，３，５（１０）－エストラトリエン－１７－オン）、エストラジオール（１，３，５（１０）－エストラトリエン－３，１７β－ジオール）、エストリオール１，３，５（１０）－エストラトリエン－３，１６α，１７β－トリオール、プレグネノロン（３－β－ヒドロキシ－５－プレグネン－２０－オン）、１７－ヒドロキシプレグネノロン（３－β，１７－ジヒドロキシ－５－プレグネン－２０－オン）、プロゲステロン（４－プレグネン－３，２０－ジオン）、１７－ヒドロキシプロゲステロン（１７－ヒドロキシ－４－プレグネン－３，２０－ジオン）、プロゲステロン（プレグナ－４－エン－３，２０－ジオン）、Ｔ３及びＴ４が挙げられる。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがミネラルコルチコイド受容体（ＭＲ）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、スピロノラクトン及びエプレレノンが含まれるが、これらに限定されない。
スピロノラクトンは、次の構造の化合物である。
Figure 0007068169000110
スピロノラクトンは、１０～３５ｍｇ／日の範囲、例えば、２５ｍｇ／日の用量で投与され得る。
エプレレノンは、次の構造の化合物である。
Figure 0007068169000111
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがアンドロゲン受容体（ＡＲ）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、酢酸シプロテロン、ヒドロキシフルタミド、エンザルタミド、ＡＲＮ－５０９、３，３'－ジインドリルメタン（ＤＩＭ）、ベキスロステリド、ビカルタミド、Ｎ－ブチルベンゼン－スルホンアミド（ＮＢＢＳ）、デュタステリド、エプリステリド、フィナステリド、フルタミド、イゾンステリド、ケトコナゾール、Ｎ－ブチルベンゼン－スルホンアミド、ニルタミド、メゲストロール、ステロイド性抗アンドロゲン及びツロステリドが含まれるが、これらに限定されない。
酢酸シプロテロンは、次式の化合物である。
Figure 0007068169000112
フルタミドは、次式の化合物である。
Figure 0007068169000113
ヒドロキシフルタミドは、次式の化合物である。
Figure 0007068169000114
エンザルタミドは、次式の化合物である。
Figure 0007068169000115
ＡＲＮ－５０９は、次式の化合物である。
Figure 0007068169000116
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがプロゲステロン受容体（ＰＲ）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、ミフェプリストン（ＲＵ－４８６、１１β－［４Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノフェニル］－１７β－ヒドロキシ－１７－（１－プロピニル）－エストラ－４，９－ジエン－３－オン）、リロプリストン（１１β－（４Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノフェニル）－１７β－ヒドロキシ－１７－（（Ｚ）－３－ヒドロキシプロペニル）エストラ－４，９－ジエン－３－オン）、オナプリストン（１１β－（４Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノフェニル）－１７α－ヒドロキシ－１７－（３－ヒドロキシプロピル）－１３α－エストラ－４，９－ジエン－３－オン）、アソプリスニル（ベンズアルデヒド、４－［（１１β，１７β）－１７－メトキシ－１７－（メトキシメチル）－３－オキソエストラ－４，９－ジエン－１１－イル］－１－（Ｅ）－オキシム、Ｊ８６７）、Ｊ９１２（４－［１７β－ヒドロキシ－１７α－（メトキシメチル）－３－オキソエストラ－４，９－ジエン－１１β－イル］ベンズアルデヒド－（１Ｅ）－オキシム）及びＣＤＢ－２９１４（１７α－アセトキシ－１１β－（４－Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノフェニル）－１９－ノルプレグナ－４，９－ジエン－３，２０－ジオン）が含まれるが、これらに限定されない。他の好適な二量体化物質には、例えば、ＪＮＪ－１２５０１３２、（６α，１１β，１７β）－１１－（４－ジメチルアミノフェニル）－６－メチル－４'，５'－ジヒドロスピロ［エストラ－４，９－ジエン－１７，２'（３'Ｈ）－フラン］－３－オン（ＯＲＧ－３１７１０）、（１１β，１７α）－１１－（４－アセチルフェニル）－１７，２３－エポキシ－１９，２４－ジノルコラ－４，９－，２０－トリエン－３－オン（ＯＲＧ－３３６２８）、（７β，１１β，１７β）－１１－（４－ジメチルアミノフェニル－７－メチル］－４'，５'－ジヒドロスピロ［エストラ－４，９－ジエン－１７，２'（３'Ｈ）－フラン］－３－オン（ＯＲＧ－３１８０６）、ＺＫ－１１２９９３、ＯＲＧ－３１３７６、ＯＲＧ－３３２４５、ＯＲＧ－３１１６７、ＯＲＧ－３１３４３、ＲＵ－２９９２、ＲＵ－１４７９、ＲＵ－２５０５６、ＲＵ－４９２９５、ＲＵ－４６５５６、ＲＵ－２６８１９、ＬＧ１１２７、ＬＧ１２０７５３、ＬＧ１２０８３０、ＬＧ１４４７、ＬＧ１２１０４６、ＣＧＰ－１９９８４Ａ、ＲＴＩ－３０２１－０１２、ＲＴＩ－３０２１－０２２、ＲＴＩ－３０２１－０２０、ＲＷＪ－２５３３３、ＺＫ－１３６７９６、ＺＫ－１１４０４３、ＺＫ－２３０２１１、ＺＫ－１３６７９８、ＺＫ－９８２２９、ＺＫ－９８７３４、ＺＫ－１３７３１６、４－［１７β－メトキシ－１７α－（メトキシメチル）－３－オキソエストラ－４，９－ジエン－１１β－イル］ベンズアルデヒド－１－（Ｅ）－オキシム、４－［１７β－メトキシ－１７α－（メトキシメチル）－３－オキソエストラ－４，９－ジエン－１１β－イル］ベンズアルデヒド－１－（Ｅ）－［Ｏ－（エチルアミノ）カルボニル］オキシム、４－［１７β－メトキシ－１７α－（メトキシメチル）－３－オキソエストラ－４，９－ジエン－１１β－イル］ベンズアルデヒド－１－（Ｅ）－［Ｏ－（エチルチオ）カルボニル］オキシム、（Ｚ）－６'－（４－シアノフェニル）－９，１１α－ジヒドロ－１７β－ヒドロキシ－１７α－［４－－（１－オキソ－３－メチルブトキシ）－１－ブテニル］４'Ｈ－ナフト［３'，２'，１'；１０，９，１１］エストラ－４－エン－３－オン、１１β－（４－アセチルフェニル）－１７β－ヒドロキシ－１７α－（１，１，２，２，２－ペンタ－フルオロエチル）エストラ－４，９－ジエン－３－オン、１１β－（４－アセチルフェニル）－１９，２４－ジノル－１７，２３－エポキシ－１７α－コラ－４，９，２０－トリエン－３－オン、（Ｚ）－１１β，１９－［４－（３－ピリジニル）－ｏ－フェニレン］－１７β－ヒドロキシ－１７α－［３－ヒドロキシ－１－プロペニル］－４－アンドロステン－３－オン、１１β－［４－（１－メチルエテニル）フェニル］－１７α－ヒドロキシ－１７β－β－ヒドロキシプロピル）－１３α－エストラ－４，９－ジエン－３－オン、４'，５'－ジヒドロ－１１β－［４－（ジメチルアミノ）フェニル］－６β－メチルスピロ［エストラ－４，－９－ジエン－１７β，２'（３'Ｈ）－フラン］－３－オン及びドロスピレノンが含まれる。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドが甲状腺受容体β（ＴＲβ）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、Ｔ３（３，５，３'－トリヨード－Ｌ－サイロニン）、ＫＢ－１４１（３，５－ジクロロ－４－（４－ヒドロキシ－３－イソプロピルフェノキシ）フェニル酢酸）、ソベチロム（ＧＣ－１としても知られる）（３，５－ジメチル－４－（４'－ヒドロキシ－３'－イソプロピルベンジル）－フェノキシ酢酸）、ＧＣ－２４（３，５－ジメチル－４－（４'－ヒドロキシ－３'－ベンジル）ベンジルフェノキシ酢酸）、４－ＯＨ－ＰＣＢ１０６（４－ＯＨ－２'，３，３'，４'，５'－ペンタクロロビフェニル）、エプロチローム、ＭＢ０７８１１（（２Ｒ，４Ｓ）－４－（３－クロロフェニル）－２－［（３，５－ジメチル－４－（４′－ヒドロキシ－３′－イソプロピルベンジル）フェノキシ）メチル］－２－オキシド－［１，３，２］－ジオキサホスホナン）、ＱＨ２及び（３，５－ジメチル－４－（４′－ヒドロキシ－３′－イソプロピルベンジル）フェノキシ）メチルホスホン酸（ＭＢ０７３４４）が含まれるが、これらに限定されない。
エプロチロームは、次の構造を有する。
Figure 0007068169000117
ＱＨ２は、次の構造を有する。
Figure 0007068169000118
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがエストロゲン受容体α（ＥＲα）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、タモキシフェン、４－ＯＨ－タモキシフェン、ラロキシフェン、ラソフォキシフェン、バゼドキシフェン、ファルソデックス（ｆａｌｓｏｄｅｘ）、クロミフェン、フェマレル（ｆｅｍａｒｅｌｌｅ）、オルメロキシフェン、トレミフェン、オスペミフェン及びエチニルエストラジオールが含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがエストロゲン受容体β（ＥＲβ）のＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、エストラジオール（Ｅ２；または１７－β－エストラジオール）及びエチニルエストラジオールが含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＰＰＡＲγのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、チアゾリジンジオン（例えば、ロシグリタゾン、ピオグリタゾン、ロベグリタゾン、トログリタゾン）、ファルグリタザル、アレグリタザル及びフェノフィブリン酸が含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＧＲのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質は、選択的ＧＲアゴニスト（ＳＥＧＲＡ）または選択的ＧＲモジュレーター（ＳＥＧＲＭ）であり得る。本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＧＲのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、ベンゾピラノキノリンＡ２７６５７５、Ｍａｐｒａｃｏｒａｔ、ＺＫ２１６３４８、５５Ｄ１Ｅ１、デキサメタゾン、プレドニゾロン、プレドニゾン、メチルプレドニゾロン、フルチカゾンプロピオネート、ベクロメタゾン－１７－モノプロピオン酸、ベタメタゾン、リメキソロン、パラメタゾン及びヒドロコルチゾンが含まれるが、これらに限定されない。
非限定的な例を以下に示す。
Figure 0007068169000119
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＶＤＲのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質は、１，２５－ジヒドロキシビタミンＤ３（カルシトリオール）、パリカリトール（ｐａｒｉｃａｌｉｔｏｌ）、ドキセルカルシフェロール、２５－ヒドロキシビタミンＤ３（カルシフェジオール）、コレカルシフェロール、エルゴカルシフェロール、タカルシオール、２２－ジヒドロエルゴカルシフェロール、（６Ｚ）－タカルシオール、２－メチレン－１９－ノル－２０（Ｓ）－１α－ヒドロキシ－ビスホモプレグナカルシフェロール、１９－ノル－２６，２７－ジメチレン－２０（Ｓ）－２－メチレン－１α，２５－ジヒドロキシビタミンＤ３、２－メチレン－１α，２５－ジヒドロキシ－（１７Ｅ）－１７（２０）－デヒドロ－１９－ノル－ビタミンＤ３、２－メチレン－１９－ノル－（２４Ｒ）－１α，２５－ジヒドロキシビタミンＤ２、２－メチレン－（２０Ｒ，２５Ｓ）－１９，２６－ジノル－１α，２５－ジヒドロキシビタミンＤ３、２－メチレン－１９－ノル－１α－ヒドロキシ－プレグナカルシフェロール、１α－ヒドロキシ－２－メチレン－１９－ノル－ホモプレグナカルシフェロール、（２０Ｒ）－１α－ヒドロキシ－２－メチレン－１９－ノル－ビスホモプレグナカルシフェロール、２－メチレン－１９－ノル－（２０Ｓ）－１α－ヒドロキシ－トリスホモプレグナカルシフェロール、２－メチレン－２３，２３－ジフルオロ－１α－ヒドロキシ－１９－ノル－ビスホモプレグナカルシフェロール、２－メチレン－（２０Ｓ）－２３，２３－ジフルオロ－１α－ヒドロキシ－１９－ノル－ビスホモプレグナン－カルシフェロール、（２－（３'ヒドロキシプロピル－１'，２'－イデン）－１９，２３，２４－トリノル－（２０Ｓ）－１α－ヒドロキシビタミンＤ３、２－メチレン－１８，１９－ジノル－（２０Ｓ）－１α，２５－ジヒドロキシビタミンＤ３などであり得る。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＲＡＲβのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質は、レチノイン酸、ａｌｌ－ｔｒａｎｓ－レチノイン酸、９－ｃｉｓ－レチノイン酸、タミバロテン、１３－ｃｉｓ－レチノイン酸、（２Ｅ，４Ｅ，６Ｚ，８Ｅ）－３，７－ジメチル－９－（２，６，６－トリメチル－１－シクロヘキセニル）ノナ－２，４，６，－８－テトラエン酸、９－（４－メトキシ－２，３，６－トリメチル－フェニル）－３，７－ジメチル－ノナ－２，４，６，８－テトラエン酸、６－［３－（１－アダマンチル）－４－メトキシフェニル］－２－ナフトエ酸、４－［１－（３，５，５，８，８－ペンタメチル－テトラリン－２－イル）エテニル］安息香酸、レチノ安息香酸、エチル６－［２－（４，４－ジメチルチオクロマン－６－イル）エチニル］ピリジン－３－カルボキシレート、レチノイルｔ－ブチレート、レチノイルピナコール及びレチノイルコレステロールであり得る。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＦＸＲのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、オベチコール酸、ＬＹ２５６２１７５（６－（４－（（５－シクロプロピル－３－（２，６－ジクロロフェニル）イソオキサゾール－４－イル）メトキシ）ピペリジン－１－イル）－１－メチル－１Ｈ－インドール－３－カルボン酸）及びＧＷ４０６４（３－［２－［２－クロロ－４－［［３－（２，６－ジクロロフェニル）－５－（１－メチルエチル）－４－イソオキサゾリル］メトキシ］フェニル］エテニル］安息香酸）が含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＬＸＲαのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、Ｔ０９０１３１７（Ｎ－（２，２，２－トリフルオロエチル）－Ｎ－［４－［２，２，２－トリフルオロ－１－ヒドロキシ－１－（トリフルオロメチル）エチル］フェニル］ベンゼンスルホンアミド）、ＧＷ３９６５（３－［３－［［［２－クロロ－３－（トリフルオロメチル）フェニル］メチル］（２，２－ジフェニルエチル）アミノ］プロポキシ］ベンゼン酢酸塩酸塩）及びＬＸＲ－６２３が含まれるが、これらに限定されない。
ＬＸＲ－６３２は、次の構造を有する。
Figure 0007068169000120
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＲＯＲγのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、ＧＮＥ－３５００（２７、１－｛４－［３－フルオロ－４－（（３Ｓ，６Ｒ）－３－メチル－１，１－ジオキソ－６－フェニル－［１，２］チアジナン－２－イルメチル）－フェニル］－ピペラジン－１－イル｝－エタノン）が含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＲＯＲγのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、７β，２７－ジヒドロキシコレステロール及び７α，２７－ジヒドロキシコレステロールが含まれるが、これらに限定されない。
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＲＸＲαのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質には、９－ｃｉｓレチノイン酸、ＬＧＤ１００２６８、ＣＤ３２５４（３－［４－ヒドロキシ－３－（５，６，７，８－テトラヒドロ－３，５，５，８，８－ペンタメチル－２－ナフタレニル）フェニル］－２－プロペン酸）及びＣＤ２９１５（Ｓｏｒｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｓｋｉｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．１０：１４４）が含まれるが、これらに限定されない。
ＬＧＤ１００２６８は、次の構造を有する。
Figure 0007068169000121
本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドがＰＸＲのＬＢＤと、対応するコレギュレーターペプチドとを含む場合、好適な二量体化物質は、リファンピシン、クロトリマゾール及びロバスタチンであり得る。
条件付活性オフスイッチＣＡＲ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性オフスイッチＣＡＲである。本開示の条件付活性オフスイッチＣＡＲはまたヘテロマー条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）とも称される。本開示の条件付活性オフスイッチＣＡＲは、合成刺激性ＩＣＲに連結された二量体化対の第１のメンバーを含む合成刺激性ＩＣＲと、細胞内抑制ドメインに連結された二量体化対の第２のメンバーを含む合成ＩＣＲリプレッサーとを含む。本開示のヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、概して、二量体化物質を導入すると、合成ＩＣＲリプレッサーが合成刺激性ＩＣＲと二量体化して、合成刺激性ＩＣＲによる活性化を抑制するように構成された、合成刺激性ＩＣＲ及び合成ＩＣＲリプレッサーを含み得る。ヘテロ二量体条件付活性オフスイッチＣＡＲポリペプチドの例は、例えば、ＰＣＴ国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０６２６１２号（当該開示の全体を参照により本明細書に援用する）に記載のものが挙げられるが、これらに限定されない。
ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの構成は、合成刺激性ＩＣＲの抑制が望まれる特定の状況に応じて異なり得る。いくつかの場合において、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの刺激性部分はヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの部分１と称され得る。いくつかの場合において、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲのリプレッサー部分はヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの部分２と称され得る。したがって、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、刺激性部分（例えば、合成刺激性ＩＣＲ、部分１など）及びリプレッサー部分（例えば、合成ＩＣＲリプレッサー、部分２など）を含む様々なモジュールを含む、多モジュールタンパク質またはタンパク質複合体を総称的に指し、これらの様々なモジュールが同じタンパク質内のある箇所に存在するか否か、また存在していたか否かにはかかわらず、かつ様々なモジュールが同一または異なる核酸構築物から発現されるか否かにはかかわらない。
当業者であれば、第１及び第２の部分（例えば、刺激性部分及び抑制性部分）が二量体化対の第１及び第２の部分を個別に含み、二量体化対の当該部分は、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの第１の部分と第２の部分との間で交換可能であり得ることを本開示から認識するであろう。また、当業者であれば、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの個々のドメインが、本明細書に記載されるように活性化可能及び抑制可能となる機能を維持したまま、多くの場合、順序及び／または配向で再配置され得ることを本開示から容易に認識するであろう。したがって、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの特定の構成に関する記載には、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲのモジュールがヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの主要機能を無効にすることなく再配置されることも含まれる。そのような再配置には、特定の任意選択のモジュール（例えば、リンカー、レポーターなどを含む）の包含または除外であって、当該モジュールの包含またはヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲからの除外に起因するヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの主要機能の無効をもたらさない包含または除外も含まれ得る。
合成刺激性ＩＣＲ
本明細書に記載されるように、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、簡単に「刺激性ＩＣＲ」または「刺激性部分」とも本明細書中で称される、合成刺激性ＩＣＲを含む。当該刺激性ＩＣＲは、その構築物が指向する免疫細胞刺激の特定の状況に応じて異なり得、刺激性ＩＣＲを発現する免疫細胞の活性化を媒介するように概ね機能し得る。したがって、刺激性ＩＣＲは、特定のシグナルを受容すると、そのシグナルを細胞内に伝達して、刺激性ＩＣＲを発現する免疫細胞を活性化するように機能する細胞外ドメインを含む。
そのため、いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲの細胞外構成成分は、以下に更に詳述される、特異的結合対の１つのメンバーを含有する細胞外認識ドメインを含み得る。特異的結合対には、抗原と抗体の結合対、リガンドと受容体の結合対などが含まれるが、これらに限定されない。したがって、本開示の細胞外認識ドメインでの使用に好適な特異的結合対のメンバーには、抗原、抗体、リガンド及びリガンド結合受容体が含まれる。刺激性ＩＣＲでの使用に好適な細胞外認識ドメインは、例えば、上記の条件付活性ヘテロ二量体オンスイッチＣＡＲに関係して上に述べたものを含む、例えば、特異的結合対のメンバー（例えば、特異的結合対の抗原結合ドメイン含有メンバー）が含まれるが、これらに限定されない。
刺激性ＩＣＲは、１つ以上の細胞外ドメインの活性化の際に、刺激性ＩＣＲを発現する免疫細胞の活性化をもたらす細胞内シグナル伝達を媒介する、１つ以上の細胞内刺激ドメインを更に含む。シグナル伝達ドメインとして有用なドメインは、例えば、活性化させる細胞の具体的な種類及び活性化の所望の程度を含む、免疫細胞活性化の特定の状況に応じて異なり得る。刺激ドメインの例示的な非限定的な例には、以下に更に詳述するが、例えば、共刺激分子を含む免疫刺激性分子、免疫受容体などに由来するドメイン及びそのモチーフが挙げられるが、これらに限定されない。刺激性ＩＣＲでの使用に好適な細胞内刺激ドメインには、例えば、上記の条件付活性ヘテロ二量体オンスイッチＣＡＲに関係して上に述べたものを含む、例えば、調節ドメイン及びその一部が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲは、限定するものではないが、例えば、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）及び誘導体、操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）及び誘導体などを含む、治療的免疫系調節のために設計された、操作された、または合成された免疫制御構築物であり得るか、これらに由来し得る。合成ＩＣＲのベースとして有用な操作されたＣＡＲ、ＴＣＲ及びその誘導体には、例えば、結合パートナーがＣＡＲ、ＴＣＲまたはその誘導体に結合すると活性化され、かつ活性化すると、細胞内にシグナルを伝達して、ＣＡＲ、ＴＣＲまたはその誘導体を発現する免疫細胞を活性化する、活性化可能であるＣＡＲ、ＴＣＲ及びその誘導体が含まれる。いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲは、結合パートナーの刺激性ＩＣＲへの結合による活性化が、活性化シグナルの伝達には更なるイベント（例えば、刺激性ＩＣＲの構成成分の二量体化を含む）を必要とするような条件付で活性化可能であってもよい。
刺激性ＩＣＲは、以下に詳述するように、二量体化対のドメイン（例えば、第１のメンバーまたは第２のメンバー）を更に含む。有用な二量体化対は、所望の二量体化因子、及び刺激性ＩＣＲ内の二量体化対のメンバーの所望の相対的位置に応じて異なり得る。概して、刺激性ＩＣＲ内の二量体化対の第１のメンバーの存在は、二量体化因子の導入の際に、ＩＣＲリプレッサーに存在する二量体化対の第２のメンバーとの二量体化を媒介し、これにより、ＩＣＲリプレッサーは、二量体化したときに、刺激性ＩＣＲによるあらゆる免疫細胞活性化を抑制する。
いくつかの場合において、刺激性ＩＣＲは、追加ドメインを更に含み得る。そのような追加ドメインは、機能性であり得、例えば、刺激性ＩＣＲの免疫細胞活性化機能に直接的に寄与するか、非機能性であり得、例えば、刺激性ＩＣＲの活性化機能に直接的に寄与しない。非機能性追加ドメインには、免疫細胞機能を活性化する刺激性ＩＣＲの能力に直接影響しない様々な目的（限定するものではないが、例えば、構造的機能、リンカー機能などを含む）を有するドメインが含まれ得る。
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）
いくつかの場合において、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、ＣＡＲを部分的または全体的に含み得るか、改変により、ＣＡＲが条件付きで抑制可能であるように改変されたＣＡＲで本質的にあり得る。そのような場合、ＣＡＲ含有ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＣＡＲ、または簡単に抑制可能ＣＡＲと称され得る。免疫細胞活性化機能を有するあらゆるＣＡＲは、限定するものではないが、例えば、本明細書に記載されるＣＡＲバリアントを含む、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用であり得る。
いくつかの場合において、ＣＡＲは、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲの構成成分として使用するために、二量体化ドメイン（例えば、二量体化対のメンバー）のＣＡＲへの導入または挿入により改変され得る。そのような場合、ＣＡＲは、改変に従って、二量体化因子ドメイン含有ＣＡＲまたは二量体化可能ＣＡＲと称され得る。
二量体化因子ドメインは、例えば、任意の簡便な位置に二量体化因子ドメインのコーディング配列をＣＡＲのコーディング配列中に導入することによって、ＣＡＲアミノ酸配列中に挿入され得る。ただし、その挿入がＣＡＲの主要な機能性ドメイン（例えば、細胞外認識ドメイン、免疫活性化ドメイン（複数可）などを含む）に悪影響を及ぼさず、かつ／または二量体化因子ドメインの二量体化機能に悪影響を及ぼさない場合に限る。
いくつかの場合において、二量体化因子は、ＣＡＲの細胞外部分に挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、ＣＡＲの細胞内部分に挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの細胞外認識ドメインに連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの膜貫通ドメインに連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化は因子、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの膜貫通ドメインの細胞外側に連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの膜貫通ドメインの細胞内側に連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの免疫刺激ドメインに連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲの共刺激ドメインに連結されるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲのＮ末端になるように挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子は、挿入後に、二量体化因子がＣＡＲのＣ末端になるように挿入され得る。
ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲが改変されたＣＡＲを部分的または全体的に含むか、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲが改変されたＣＡＲで本質的にある場合において、ＣＡＲは、細胞外認識ドメインと、刺激ドメインと、膜貫通ドメインとを含有し得る。そのようなＣＡＲは、リンカー領域及び／またはヒンジ領域を任意選択で含み得る。ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの一部としてのＣＡＲは、単一のポリペプチド内に含まれてもよいし、２つ以上のポリペプチドにわたって「分割」されてもよい。
細胞外認識ドメイン
抑制可能ＣＡＲは、特異的結合対のメンバーを含む。特異的結合対には、抗原と抗体の結合対、リガンドと受容体の結合対などが含まれるが、これらに限定されない。したがって、本開示の抑制可能ＣＡＲでの使用に好適な特異的結合対のメンバーには、抗原、抗体、リガンド及びリガンド結合受容体が含まれる。
抗原結合ドメイン
本開示の抑制可能ＣＡＲでの使用に好適な抗原結合ドメインは、任意の抗原結合ポリペプチドであってよく、多種多様なものが当該技術分野において知られている。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）である。他の抗体による認識ドメイン（ｃＡｂ ＶＨＨ（ラクダ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ＩｇＮＡＲ ＶＨ（サメ抗体可変ドメイン）及びヒト化型、ｓｄＡｂ ＶＨ（単一ドメイン抗体可変ドメイン）及び「ラクダ化」抗体可変ドメインも使用に適している。いくつかの場合において、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴｖ、ＶαＶβを含有する一本鎖２ドメインＴＣＲ）などのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）ベースの認識ドメインもまた使用に適している。そのようなＴＣＲ認識ドメインは、存在する場合、以下に更に詳述されるように、抑制可能ＣＡＲの構成成分ではなく、抑制可能な操作されたＴＣＲとしてである。
本開示の抑制可能ＣＡＲでの使用に好適な抗原結合ドメインは、様々な抗原結合特異性を有し得る。いくつかの場合において、抗原結合ドメインは、がん細胞によって発現される（合成される）抗原（すなわち、がん細胞関連抗原）中に存在するエピトープに対して特異的である。がん細胞関連抗原は、例えば、乳癌細胞、Ｂ細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、Ｂ細胞性非ホジキンリンパ腫（Ｂ－ＮＨＬ）細胞、卵巣癌細胞、前立腺癌細胞、中皮腫細胞、肺癌細胞（例えば、小細胞肺癌細胞）、黒色腫細胞、慢性リンパ性白血病細胞、急性リンパ性白血病細胞、神経芽細胞腫細胞、神経膠腫、膠芽腫、髄芽腫、大腸癌細胞などに関連する抗原であり得る。がん細胞関連抗原は、非がん性細胞によって発現されることもある。
当該抑制可能ＣＡＲの抗原結合ドメインが結合することができる抗原の非限定的な例には、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３８、ＣＤ３０、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ／ＥＲＢＢ２、ＣＡ１２５、ＭＵＣ－１、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、ＣＤ４４表面接着分子、メソテリン、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）、高分子黒色腫関連抗原（ＨＭＷ－ＭＡＡ）、ＭＡＧＥ－Ａ１、ＩＬ－１３Ｒ－ａ２、ＧＤ２などが挙げられる。当該抑制可能ＣＡＲの抗原結合ドメインが結合することができる抗原の更なる例には、条件付活性オンスイッチＣＡＲに関して上に述べたものが含まれるが、これらに限定されない。
リガンド
いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲでの使用に好適な特異的結合対のメンバーは、受容体のリガンドである。リガンドには、サイトカイン（例えば、ＩＬ－１３、など）、成長因子（例えば、ヘレグリン、血管内皮細胞増殖因子（ＶＥＧＦ）など）、インテグリン結合ペプチド（例えば、配列Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐを含むペプチド）などが含まれるが、これらに限定されない。
当該抑制可能ＣＡＲの特異的結合対のメンバーがリガンドである場合、抑制可能ＣＡＲは、二量体化因子物質と特異的結合対の第２のメンバーの両方の存在下で活性化することができ、特異的結合対の第２のメンバーは、リガンドの受容体である。例えば、リガンドがＶＥＧＦである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、可溶性ＶＥＧＦ受容体を含むＶＥＧＦ受容体であり得る。別の例として、リガンドがヘレグリンである場合、特異的結合対の第２のメンバーは、Ｈｅｒ２であり得る。
受容体
上述のように、いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲに含まれる特異的結合対のメンバーは、受容体、例えば、リガンドの受容体、共受容体などである。受容体は、受容体のリガンド結合断片であり得る。好適な受容体には、成長因子受容体（例えば、ＶＥＧＦ受容体）、キラー細胞レクチン様受容体サブファミリーＫメンバー１（ＮＫＧ２Ｄ）ポリペプチド（ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ及びＵＬＢ６の受容体）、サイトカイン受容体（例えば、ＩＬ－１３受容体、ＩＬ－２受容体など）、Ｈｅｒ２、ＣＤ２７、天然細胞傷害受容体（ＮＣＲ）（例えば、ＮＫＰ３０（ＮＣＲ３／ＣＤ３３７）ポリペプチド（ＨＬＡ－Ｂ関連転写物３（ＢＡＴ３）及びＢ７－Ｈ６の受容体）など）などが含まれるが、これらに限定されない。
刺激ドメイン
当該抑制可能ＩＣＲの刺激性ＣＡＲでの使用に好適な刺激ドメインは、３アミノ酸線状モチーフのように短いポリペプチド及びタンパク質全体のように長いポリペプチドの任意の機能性単位であってよく、刺激ドメインの大きさは、当該ドメインがその機能を維持するのに十分な大きさであり、抑制可能ＣＡＲの他の構成成分と適合するのに十分に小さくなければならないという点でのみ制限される。したがって、刺激ドメインは、３アミノ酸長～１０００アミノ酸以上の大きさの範囲であり得、いくつかの場合において、約３０アミノ酸～約７０アミノ酸（ａａ）の長さを有し得、例えば、刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有し得る。他の場合において、刺激ドメインは、約７０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約２００アミノ酸、または２００アミノ酸超の長さを有し得る。
いくつかの場合において、「共刺激ドメイン」は、本開示の抑制可能ＣＡＲの刺激ドメインとして有用である。共刺激は、概して、一次の特異的刺激が伝播される二次的非特異的活性化機序を指す。共刺激の例には、Ｔ細胞受容体を介した抗原特異的シグナル伝達後の抗原非特異的Ｔ細胞共刺激及びＢ細胞受容体を介したシグナル伝達後の抗原非特異的Ｂ細胞共刺激が挙げられる。共刺激、例えば、Ｔ細胞共刺激及び関与因子については、Ｃｈｅｎ＆Ｆｌｉｅｓ．Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ（２０１３）１３（４）：２２７－４２に記載されており、当該開示の全体を参照により本明細書に援用する。共刺激ドメインは、概して、受容体に由来するポリペプチドである。いくつかの実施形態において、共刺激ドメインは、ホモ二量体化する。当該共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質の細胞内部分であり得る（すなわち、共刺激ドメインは、膜貫通タンパク質に由来し得る）。好適な共刺激ポリペプチドの非限定的な例には、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＯＸ－４０、ＢＴＬＡ、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ及びＨＶＥＭが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの場合において、共刺激ドメイン、例えば、本開示の抑制可能ＣＡＲに使用される共刺激ドメインには、表１に列挙される共刺激ドメインが含まれ得る。いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲの共刺激ドメインは、本明細書に記載される共刺激ドメインに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、刺激性ＣＡＲは、表１に列挙される膜貫通タンパク質の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、表１に列挙されるアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５、アミノ酸約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、または約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、同一または異なるポリペプチド上に存在する２つ以上の刺激ドメインを含有し得る。いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲが２つ以上の刺激ドメインを含有する場合、刺激ドメインは、実質的に同じアミノ酸配列を有し得る。例えば、いくつかの場合において、第１の刺激ドメインは、第２の刺激ドメインのアミノ酸配列に対して、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲが２つ以上の刺激ドメインを含有する場合、当該抑制可能ＣＡＲの刺激ドメインは、実質的に同じ長さを有し得、例えば、第１及び第２の刺激ドメインは、互いの長さが１０アミノ酸未満、５アミノ酸未満異なり得る。いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲが２つ以上の刺激ドメインを含有する場合、第１及び第２の刺激ドメインは同じ長さを有する。いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲが２つ以上の刺激ドメインを含有する場合、２つの刺激ドメインは同じである。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質４－１ＢＢ（ＴＮＦＲＳＦ９、ＣＤ１３７、４－１ＢＢ、ＣＤｗ１３７、ＩＬＡなどとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000122
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＣＤ２８（Ｔｐ４４としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000123
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＩＣＯＳ（ＡＩＬＩＭ、ＣＤ２７８及びＣＶＩＤ１としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000124
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＯＸ－４０（ＴＮＦＲＳＦ４、ＲＰ５－９０２Ｐ８．３、ＡＣＴ３５、ＣＤ１３４、ＯＸ４０、ＴＸＧＰ１Ｌとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000125
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＢＴＬＡ（ＢＴＬＡ１及びＣＤ２７２としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000126
。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＣＤ２７（Ｓ１５２、Ｔ１４、ＴＮＦＲＳＦ７及びＴｐ５５としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000127
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＣＤ３０（ＴＮＦＲＳＦ８、Ｄ１Ｓ１６６Ｅ及びＫｉ－１としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１６０アミノ酸、または約１６０アミノ酸～約１８５アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000128
。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＧＩＴＲ（ＴＮＦＲＳＦ１８、ＲＰ５－９０２Ｐ８．２、ＡＩＴＲ、ＣＤ３５７及びＧＩＴＲ－Ｄとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000129
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、膜貫通タンパク質ＨＶＥＭ（ＴＮＦＲＳＦ１４、ＲＰ３－３９５Ｍ２０．６、ＡＴＡＲ、ＣＤ２７０、ＨＶＥＡ、ＨＶＥＭ、ＬＩＧＨＴＲ及びＴＲ２としても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共刺激ドメインを含有し得る。例えば、好適な共刺激ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000130
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共刺激ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、少なくとも１つ（例えば、１、２、３、４、５、６つなど）の細胞内シグナル伝達モチーフを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含み得る。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達モチーフは、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）であり得る。いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達モチーフ、例えば、ＩＴＡＭモチーフは、１つ以上のＩＴＡＭモチーフを含有するシグナル伝達分子に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン内にある。他の場合において、ＩＴＡＭは、例えば、アミノ酸配列の変異によって、新たなアミノ酸配列内に誘導される（例えば、合成的に生成される）。
ＩＴＡＭモチーフは、ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉであり、配列中、Ｘ１及びＸ２は、独立して、任意のアミノ酸である（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６４）。いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、１、２、３、４または５つのＩＴＡＭモチーフを含む。いくつかの場合において、ＩＴＡＭモチーフは、細胞内シグナル伝達ドメイン中で２回繰り返され、ＩＴＡＭモチーフの１つ目と２つ目は、６～８アミノ酸によって互いに隔てられており、例えば、（ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉ）（Ｘ３）ｎ（ＹＸ１Ｘ２Ｌ／Ｉ）（配列中、ｎは６～８の整数であり、６～８個のＸ３のそれぞれは任意のアミノ酸であってよい）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６５）である。いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、３つのＩＴＡＭモチーフを含む。
好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭモチーフを含有するポリペプチドに由来するＩＴＡＭモチーフ含有部分であり得る。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、任意のＩＴＡＭモチーフ含有タンパク質に由来するＩＴＡＭモチーフ含有ドメインであり得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、その由来となるタンパク質全体の全配列を含有する必要はない。好適なＩＴＡＭモチーフ含有ポリペプチドの例には、ＤＡＰ１２、ＦＣＥＲ１Ｇ（Ｆｃε受容体Ｉ γ鎖）、ＣＤ３Ｄ（ＣＤ３δ）、ＣＤ３Ｅ（ＣＤ３ε）、ＣＤ３Ｇ（ＣＤ３γ）、ＣＤ３Ｚ（ＣＤ３ζ）及びＣＤ７９Ａ（抗原受容体複合体関連タンパク質α鎖）が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＤＡＰ１２（ＴＹＲＯＢＰ、ＴＹＲＯタンパク質チロシンキナーゼ結合タンパク質、ＫＡＲＡＰ、ＰＬＯＳＬ、ＤＮＡＸ活性化タンパク質１２、ＫＡＲ関連タンパク質、ＴＹＲＯタンパク質チロシンキナーゼ結合タンパク質、キラー活性化受容体関連タンパク質、キラー活性化受容体関連タンパク質などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列（４つのアイソフォーム）のうちのいずれかに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000131
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＤＡＰ１２アミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000132
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＦＣＥＲ１Ｇ（ＦＣＲＧ、Ｆｃε受容体Ｉ γ鎖、Ｆｃ受容体γ鎖、ｆｃ－ε ＲＩ－γ、ｆｃＲγ、ｆｃｅＲＩγ；高親和性免疫グロブリンε受容体サブユニットγ、免疫グロブリンＥ受容体、高親和性γ鎖などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000133
Figure 0007068169000134
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＦＣＥＲ１Ｇアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000135
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３δ鎖（ＣＤ３Ｄ、ＣＤ３－デルタ、Ｔ３Ｄ、ＣＤ３抗原デルタサブユニット、ＣＤ３δ、ＣＤ３ｄ抗原デルタポリペプチド（ＴｉＴ３複合体）、ＯＫＴ３δ鎖、Ｔ細胞受容体Ｔ３δ鎖、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３δ鎖などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１７０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000136
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＣＤ３δアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000137
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ε鎖（ＣＤ３ｅ、Ｔ細胞表面抗原Ｔ３／Ｌｅｕ－４ε鎖、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ε鎖、ＡＩ５０４７８３、ＣＤ３、ＣＤ３ε、Ｔ３ｅなどとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインポリペプチドは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約２０５アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000138
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＣＤ３εアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000139
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３γ鎖（ＣＤ３Ｇ、Ｔ細胞受容体Ｔ３γ鎖、ＣＤ３－Γ、Ｔ３Ｇ、γポリペプチド（ＴｉＴ３複合体）などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列のうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１８０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000140
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＣＤ３γアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000141
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞表面糖タンパク質ＣＤ３ζ鎖（ＣＤ３Ｚ、Ｔ細胞受容体Ｔ３ζ鎖、ＣＤ２４７、ＣＤ３－Ζ、ＣＤ３Ｈ、ＣＤ３Ｑ、Ｔ３Ｚ、ＴＣＲＺなどとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１５０アミノ酸、または約１５０アミノ酸～約１６０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000142
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＣＤ３ζアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列のうちのいずれかに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000143
いくつかの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、ＣＤ７９Ａ（Ｂ細胞抗原受容体複合体関連タンパク質α鎖、ＣＤ７９ａ抗原（免疫グロブリン関連α）、ＭＢ－１膜糖タンパク質、ｉｇ－α、膜結合免疫グロブリン関連タンパク質、表面ＩｇＭ関連タンパク質などとしても知られる）に由来する。例えば、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列（２つのアイソフォーム）のいずれかのうちの約１００アミノ酸～約１１０アミノ酸（ａａ）、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約２００アミノ酸、または約２００アミノ酸～約２２０アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000144
同様に、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、完全長ＣＤ７９Ａアミノ酸配列のＩＴＡＭモチーフ含有部分を含み得る。したがって、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、配列中、ＩＴＡＭモチーフを太字及び下線で示す。
Figure 0007068169000145
いくつかの場合において、抑制可能ＣＡＲは、ＤＡＰ１０／ＣＤ２８型シグナル伝達鎖に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含有し得る。本開示の抑制可能ＣＡＲでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＤＡＰ１０／ＣＤ２８型シグナル伝達鎖を含む。
ＤＡＰ１０シグナル伝達鎖の一例は、アミノ酸配列
Figure 0007068169000146
である。いくつかの実施形態において、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000147
の全長に対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
ＣＤ２８シグナル伝達鎖の一例は、アミノ酸配列
Figure 0007068169000148
である。いくつかの実施形態において、好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000149
の全長に対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
本開示のＣＡＲでの使用に好適な細胞内シグナル伝達ドメインは、ＺＡＰ７０ポリペプチド、例えば、次のアミノ酸配列のうちの約３００アミノ酸～約４００アミノ酸、約４００アミノ酸～約５００アミノ酸、または約５００アミノ酸～６１９アミノ酸の連続するストレッチに対して、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。
Figure 0007068169000150
膜貫通ドメイン
真核細胞（例えば、哺乳動物細胞）の細胞膜へのポリペプチドの挿入を提供する任意の膜貫通（ＴＭ）ドメインが使用に適している。１つの非限定的な例として、
Figure 0007068169000151
のＴＭ配列を使用することができる。好適なＴＭ配列の更なる非限定的な例には、ａ）ＣＤ８β由来：
Figure 0007068169000152
、ｂ）ＣＤ４由来：
Figure 0007068169000153
、ｃ）ＣＤ３ζ由来：
Figure 0007068169000154
、ｄ）ＣＤ２８由来：
Figure 0007068169000155
、ｅ）ＣＤ１３４（ＯＸ４０）由来：
Figure 0007068169000156
、及びｆ）ＣＤ７由来：
Figure 0007068169000157
が挙げられる。
リンカー
いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲは、任意の２つの隣接するドメインの間にリンカーを含む。例えば、リンカーは、抑制可能ＣＡＲの膜貫通ドメインと第１の細胞内機能性ドメイン、例えば、共刺激ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、抑制可能ＣＡＲの第１の細胞内機能性ドメインと二量体化ドメインのメンバーとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、二量体化ドメインのメンバーと第２の細胞内機能性ドメイン、例えば、免疫細胞活性化ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、抑制可能ＣＡＲの任意のドメインと任意の追加ドメイン（例えば、ＣＡＲの主要免疫活性化機能に関与しないドメイン、限定するものではないが、例えば、レポータードメイン、タグドメインなどを含む）との間に配置され得る。
リンカーは、抑制可能ＣＡＲの主要な活性（例えば、細胞外結合に際して活性化される抑制可能ＣＡＲの能力、ＩＣＲリプレッサー二量体化ドメインに結合する抑制可能ＣＡＲの二量体化ドメインの能力を含む）を無効にしない限り、抑制可能ＣＡＲ中、好適な構成で利用することができる。
リンカーペプチドは、様々なアミノ酸配列のうちのいずれかを有し得る。タンパク質は、概して柔軟性のあるスペーサーペプチドによって連結され得るが、他の化学連結を除外するものではない。リンカーは、約６～約４０アミノ酸長、または約６～約２５アミノ酸長のペプチドであり得る。これらのリンカーは、タンパク質を連結するために、合成リンカーコードオリゴヌクレオチドを使用して生成することができる。ある程度の柔軟性を有するペプチドリンカーが使用され得る。連結ペプチドは、好適なリンカーが概して柔軟性のあるペプチドをもたらす配列を有するということに留意した上で、実質的には任意のアミノ酸配列を有し得る。柔軟性のあるペプチドの作製には、グリシン及びアラニンなどの小さなアミノ酸が有用である。そのような配列の作製は、当業者には日常の手法である。
好適なリンカーは、容易に選択することができ、４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸を含む、１アミノ酸（例えば、Ｇｌｙ）～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、３アミノ酸～１２アミノ酸などの好適な異なる長さのいずれかであり得、１、２、３、４、５、６または７アミノ酸であり得る。
例示的な柔軟性リンカーには、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、ＧＳＧＧＳｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６）及びＧＧＧＳｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１７）（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、及び当該技術分野において知られている他の柔軟性リンカーが含まれる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーは、当該アミノ酸がいずれも比較的非構造的であり、したがって、構成成分間の中間テザーとして機能することができるので、興味深い。グリシンポリマーは、グリシンが更にアラニンよりも極めて多くのφ－ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ないため、特に興味深い（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）参照）。例示的な柔軟性リンカーには、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１８）、ＧＧＳＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１９）、ＧＳＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２０）、ＧＳＧＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２１）、ＧＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２２）、ＧＳＳＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２３）などが含まれる。当業者であれば、上記の任意の要素に結合されるペプチドの設計が、完全にまたは部分的に柔軟性であるリンカーを含むことができ、したがって、リンカーが、柔軟性リンカーだけではなく、柔軟性のより低い構造をもたらす１つ以上の部分を含み得ることを認識するであろう。
ヒンジ領域
いくつかの場合において、当該抑制可能ＣＡＲの第１のポリペプチドは、ヒンジ領域（本明細書中、「スペーサー」とも称される）を含み、ヒンジ領域は、抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとの間に介在する。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、免疫グロブリン重鎖ヒンジ領域である。いくつかの場合において、ヒンジ領域は、受容体に由来するヒンジ領域ポリペプチド（例えば、ＣＤ８由来ヒンジ領域）である。
ヒンジ領域は、約４アミノ酸～約５０アミノ酸、例えば、約４アミノ酸～約１０アミノ酸、約１０アミノ酸～約１５アミノ酸、約１５アミノ酸～約２０アミノ酸、約２０アミノ酸～約２５アミノ酸、約２５アミノ酸～約３０アミノ酸、約３０アミノ酸～約４０アミノ酸、または約４０アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有し得る。
好適なスペーサーは、容易に選択することができ、４アミノ酸～１０アミノ酸、５アミノ酸～９アミノ酸、６アミノ酸～８アミノ酸、または７アミノ酸～８アミノ酸を含む、１アミノ酸（例えば、Ｇｌｙ）～２０アミノ酸、２アミノ酸～１５アミノ酸、３アミノ酸～１２アミノ酸などの複数の好適な長さのいずれかであり得、１、２、３、４、５、６または７アミノ酸であり得る。
例示的なスペーサーには、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン－セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１６）及び（ＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１７）（式中、ｎは、少なくとも１の整数である）を含む）、グリシン－アラニンポリマー、アラニン－セリンポリマー、及び当該技術分野において知られている他の柔軟性のあるリンカーが含まれる。グリシン及びグリシン－セリンポリマーを使用することができ、ＧｌｙとＳｅｒの両方は、比較的非構造的であり、したがって、構成成分間の中間テザーとして機能することができる。グリシンポリマーを使用することができ、グリシンは、更にアラニンよりも極めて多くのφ－ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ない（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｅｍ．１１１７３－１４２（１９９２）参照）。例示的なスペーサーは、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１８）、ＧＧＳＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５１９）、ＧＳＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２０）、ＧＳＧＧＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２１）、ＧＧＧＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２２）、ＧＳＳＳＧ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５２３）などを含むアミノ酸配列を含み得る。
いくつかの場合において、例えば、抑制可能ＣＡＲの刺激性ＩＣＲ部分が２つ以上のポリペプチド間で分割される場合、抑制可能ＣＡＲは、少なくとも１つのシステインを含むヒンジ領域を含み得る。例えば、いくつかの場合において、ヒンジ領域は、配列Ｃｙｓ－Ｐｒｏ－Ｐｒｏ－Ｃｙｓを含み得る。第１のポリペプチド、例えば、抑制可能ＣＡＲの第１の部分のヒンジ領域中のシステインは、存在する場合、第２のポリペプチド、例えば、抑制可能ＣＡＲの第２の部分中のヒンジ領域とのジスルフィド結合を形成するために利用可能であり得る。
免疫グロブリンのヒンジ領域のアミノ酸配列は、当該技術分野において知られており、例えば、Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１６２、及びＨｕｃｋ ｅｔ ａｌ．（１９８６）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１４：１７７９を参照されたい。非限定的な例として、免疫グロブリンのヒンジ領域は、次のアミノ酸配列のうちの１つを含み得る：
Figure 0007068169000158
（例えば、Ｇｌａｓｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８０：４１４９４参照）、
Figure 0007068169000159
（ヒトＩｇＧ１ヒンジ）、
Figure 0007068169000160
（ヒトＩｇＧ２ヒンジ）、
Figure 0007068169000161
（ヒトＩｇＧ３ヒンジ）、
Figure 0007068169000162
（ヒトＩｇＧ４ヒンジ）など。
ヒンジ領域は、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４のヒンジ領域のアミノ酸配列を含み得る。ヒンジ領域は、野生型（天然）ヒンジ領域と比較して、１つ以上のアミノ酸置換及び／または挿入及び／または欠失を含み得る。例えば、ヒトＩｇＧ１ヒンジのＨｉｓ２２９は、Ｔｙｒで置換することができ、これにより、ヒンジ領域は、配列
Figure 0007068169000163
を含む。例えば、Ｙａｎ ｅｔ ａｌ．（２０１２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８７：５８９１を参照されたい。
ヒンジ領域は、ヒトＣＤ８に由来するアミノ酸配列を含み得、例えば、ヒンジ領域は、アミノ酸配列
Figure 0007068169000164
またはそのバリアントを含み得る。
二量体化ドメイン
上述のように、本開示のヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）は、二量体化対の第１のメンバーと、二量体化対の第２のメンバーとを含む。二量体化対のメンバーの一方は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み得、二量体化対の他方のメンバーは、同じ核内ホルモン受容体のコレギュレーターペプチドを含み得る。二量体化対のメンバーは、二量体化物質（例えば、核内ホルモンまたは核内ホルモンの機能的誘導体もしくはアナログ）の存在下で、互いに結合し得、本開示の条件付抑制可能合成ＩＣＲの２つのポリペプチド鎖の二量体化をもたらし得る。二量体化対の第１のメンバーまたは二量体化対の第２のメンバーは、「二量体化ドメイン」と称されることもある。
リガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）
核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメインは、ＥＲα、ＥＲβ、ＰＲ、ＡＲ、ＧＲ、ＭＲ、ＲＡＲα、ＲＡＲβ、ＲＡＲγ、ＴＲα、ＴＲβ、ＶＤＲ、ＥｃＲ、ＲＸＲα、ＲＸＲβ、ＲＸＲγ、ＰＰＡＲα、ＰＰＡＲβ、ＰＰＡＲγ、ＬＸＲα、ＬＸＲβ、ＦＸＲ、ＰＸＲ、ＳＸＲ、ＣＡＲ、ＳＦ－１、ＬＲＨ－１、ＤＡＸ－１、ＳＨＰ、ＴＬＸ、ＰＮＲ、ＮＧＦ１－Ｂα、ＮＧＦ１－Ｂβ、ＮＧＦ１－Ｂγ、ＲＯＲα、ＲＯＲβ、ＲＯＲγ、ＥＲＲα、ＥＲＲβ、ＥＲＲγ、ＧＣＮＦ、ＴＲ２／４、ＨＮＦ－４、ＣＯＵＰ－ＴＦα、ＣＯＵＰ－ＴＦβ及びＣＯＵＰ－ＴＦγを含むがこれらに限定されない、種々の核内ホルモン受容体のいずれかに由来し得る。
核内ホルモン受容体の略語を次に示す。ＥＲ：エストロゲン受容体、ＰＲ：プロゲステロン受容体、ＡＲ：アンドロゲン受容体、ＧＲ：グルココルチコイド受容体、ＭＲ：ミネラルコルチコイド受容体、ＲＡＲ：レチノイン酸受容体、ＴＲα，β：甲状腺受容体、ＶＤＲ：ビタミンＤ３受容体、ＥｃＲ：エクジソン受容体、ＲＸＲ：レチノイン酸Ｘ受容体、ＰＰＡＲ：ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体、ＬＸＲ：肝臓Ｘ受容体、ＦＸＲ：ファルネソイドＸ受容体、ＰＸＲ／ＳＸＲ：プレグナンＸ受容体／ステロイド及び生体異物受容体、ＣＡＲ：構成的アドロストラン受容体、ＳＦ－１：ステロイド産生因子１、ＤＡＸ－１：Ｘ染色体上遺伝子量感受性性転換副腎低形成先天的必須領域遺伝子１、ＬＲＨ－１：肝臓受容体ホモログ１、ＳＨＰ：低分子ヘテロ二量体パートナー、ＴＬＸ：テイルレス遺伝子、ＰＮＲ：光受容体特異的核内受容体、ＮＧＦ１－Ｂ：神経成長因子、ＲＯＲ：ＲＡＲ関連オーファン受容体、ＥＲＲ：エストロゲン関連受容体、ＧＣＮＦ：胚細胞核因子、ＴＲ２／４：精巣受容体、ＨＮＦ－４：肝細胞核因子、ＣＯＵＰ－ＴＦ：トリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子。
いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体の単一のＬＢＤを含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを２つ含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体の３つのＬＢＤを含む。本開示のヘテロ二量体ポリペプチドのポリペプチド鎖が核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含む場合、いくつかの場合において、複数のＬＢＤは、同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、２つ以上のＬＢＤは、直接的に、またはリンカーによって隔てられて、タンデムに並んでいる。
ミネラルコルチコイド受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ミネラルコルチコイド受容体（ＭＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１Ａに示されるアミノ酸配列を有するＭＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｆに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
別の非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｓ８１０Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図１Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～２９９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＭＲのＬＢＤは、図１Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｓ８１０Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図１Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000165
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000166
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000167
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000168
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000169
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＭＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000170
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
アンドロゲン受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、アンドロゲン受容体（ＡＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２Ａに示されるアミノ酸配列を有するＡＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｆ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｆ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ及びＦ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、または２７５アミノ酸～３０１アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＡＲのＬＢＤは、図２Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｔ８７７Ａ及びＦ８７６Ｌ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図２Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＡＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000171
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１９アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１９アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＡＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000172
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１９アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１９アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸を有する）。
プロゲステロン受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、プロゲステロン受容体（ＰＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図３Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５６アミノ酸の長さを有し、例えば、２５６アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＲのＬＢＤは、図３Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有し、例えば、２４８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000173
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000174
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
甲状腺ホルモン受容体β
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、甲状腺ホルモン受容体β（ＴＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図４Ａに示されるアミノ酸配列を有するＴＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｄに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２５０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２６０アミノ酸の長さを有し、例えば、２６０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲβのＬＢＤは、図４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２４６アミノ酸の長さを有し、例えば、２４６アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ３／ＳＲＣ３ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000175
を含むコレギュレーターペプチドである。他の場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ３／ＳＲＣ３ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000176
を含むコレギュレーターペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＴＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
エストロゲン受容体α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、エストロゲン受容体α（ＥＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図５Ａに示されるアミノ酸配列を有するＥＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｈに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４０アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、または２００アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有し、例えば、２２９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有し、例えば、３１４アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有し、例えば、２３８アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｅに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１８０アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、または２００アミノ酸～２２９アミノ酸の長さを有し、例えば、２２９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｆに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約２５０アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１４アミノ酸の長さを有し、例えば、３１４アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲαのＬＢＤは、図５Ｇに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、Ｄ３５１Ｙ置換を有し（アミノ酸ナンバリングは、図５Ａに示されるアミノ酸配列に基づく）、約１９０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有し、例えば、２３８アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000177
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１６アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１６アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000178
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１６アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１６アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000179
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１３アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１３アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲαのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000180
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１３アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１３アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
エストロゲン受容体β（ＥＲβ）
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、エストロゲン受容体α（ＥＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図６Ａに示されるアミノ酸配列を有するＥＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＥＲβのＬＢＤは、図６Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＥＲβのＬＢＤは、図６Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２３５アミノ酸、または２３５アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＥＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000181
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１７アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＥＲβのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000182
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、１７アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体γ（ＰＰＡＲ－γ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図７Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＰＡＲ－γのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｅに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１５０アミノ酸～２０２アミノ酸の長さを有する（例えば、１５０アミノ酸～１６０アミノ酸、１６０アミノ酸～１７０アミノ酸、１７０アミノ酸～１９０アミノ酸、または１９０アミノ酸～２０２アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｃに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＰＰＡＲ－γのＬＢＤは、図７Ｄに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２６９アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２５０アミノ酸、または２５０アミノ酸～２７１アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000183
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～２８アミノ酸、２８アミノ酸～２９アミノ酸、２９アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000184
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２５アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２５アミノ酸～２８アミノ酸、２８アミノ酸～２９アミノ酸、２９アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000185
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000186
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約１７アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000187
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＰＰＡＲ－γのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000188
を含むコレギュレーターペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約２１アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、２１アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。
グルココルチコイド受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、グルココルチコイド受容体（ＧＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図８Ａに示されるアミノ酸配列を有するＧＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＧＲのＬＢＤは、図８Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、２２５アミノ酸～２３０アミノ酸、２３０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＧＲのＬＢＤは、図８Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２５アミノ酸、または２２５アミノ酸～２４７アミノ酸の長さを有し、例えば、２４７アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000189
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000190
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＧＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
ビタミンＤ受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ビタミンＤ受容体（ＶＤＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図９Ａに示されるアミノ酸配列を有するＶＤＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＶＤＲのＬＢＤは、図９Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３１０アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３１０アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＶＤＲのＬＢＤは、図９Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～３０３アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～３００アミノ酸、または３００アミノ酸～３０３アミノ酸の長さを有する）。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000191
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ１／ＳＲＣ１ポリペプチドである。
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列
Figure 0007068169000192
Figure 0007068169000193
またはその断片を含む、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。例えば、いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第１のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第２のメンバーは、アミノ酸配列ＬＬＲＹＬＬＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６６８）を含むＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドであり、コレギュレーターペプチドは、約８アミノ酸～約５０アミノ酸の長さを有する（例えば、コレギュレーターペプチドは、約８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２３アミノ酸、２３アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する）。いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対の第２のメンバーがＶＤＲのＬＢＤである場合、二量体化対の第１のメンバーは、ＮＣＯＡ２／ＳＲＣ２ポリペプチドである。
甲状腺ホルモン受容体α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、甲状腺ホルモン受容体α（ＴＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１０Ａに示されるアミノ酸配列を有するＴＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＴＲαのＬＢＤは、図１０Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２４５アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、２１０アミノ酸～２３０アミノ酸、または２３０アミノ酸～２４５アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＴＲαのＬＢＤは、図１０Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２４３アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２１０アミノ酸、２１０アミノ酸～２３０アミノ酸、または２３０アミノ酸～２４３アミノ酸の長さを有する）。
レチノイン酸受容体β
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイン酸受容体β（ＲＡＲβ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図１１Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＡＲβのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＡＲβのＬＢＤは、図１１Ｃに示されるアミノ酸配列のうちの１つに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～約２３５アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３５アミノ酸の長さを有する）。
１つの非限定的な例として、ＲＡＲβのＬＢＤは、図１１Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１８０アミノ酸～約２３１アミノ酸の長さを有する（例えば、１８０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、または２２０アミノ酸～２３１アミノ酸の長さを有する）。
ＲＡＲβに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ファルネソイドＸ受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、ファルネソイドＸ受容体（ＦＸＲのＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２２Ａに示されるアミノ酸配列を有するＦＸＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＦＸＲのＬＢＤは、図２２Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１００アミノ酸～約１３６アミノ酸の長さを有する（例えば、１００アミノ酸～１１０アミノ酸、１１０アミノ酸～１２０アミノ酸、または１２０アミノ酸～１３６アミノ酸の長さを有する）。
ＦＸＲに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＬＸＲ－α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、肝臓Ｘ受容体α（ＬＲＸα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２３Ａに示されるアミノ酸配列を有するＬＲＸαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＬＲＸαのＬＢＤは、図２３Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～約２６６アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、２２０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２６６アミノ酸の長さを有する）。
ＬＸＲαに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＲＯＲγ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイド関連オーファン受容体γ（ＲＯＲγ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２４Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＯＲγのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＯＲγのＬＢＤは、図２４Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２００アミノ酸～約２６１アミノ酸の長さを有する（例えば、２００アミノ酸～２２０アミノ酸、２２０アミノ酸～２４０アミノ酸、または２４０アミノ酸～２６１アミノ酸の長さを有する）。
ＲＯＲγに対して好適なコレギュレーターは、ＮＣＯＲＮＲペプチド
Figure 0007068169000194
である。
ＲＯＲγに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＲＸＲ－α
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、レチノイドＸ受容体α（ＲＸＲα）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列を有するＲＸＲαのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＲＯＲγのＬＢＤは、図２５Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約１９０アミノ酸～約２３８アミノ酸の長さを有する（例えば、１９０アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～２１０アミノ酸、または２１０アミノ酸～２３８アミノ酸の長さを有する）。
ＲＸＲαに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
ＰＸＲ
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドの二量体化対のメンバーとして含めるのに好適なＬＢＤは、プレグナンＸ受容体（ＰＸＲ）のＬＢＤである。例えば、いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列を有するＰＸＲのＬＢＤに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸１４３～４２８に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、ＬＢＤは、図２６Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２０５～４３４に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
１つの非限定的な例として、ＰＸＲのＬＢＤは、図２６Ｂに示されるアミノ酸配列に対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得、約２５０アミノ酸～約３０２アミノ酸の長さを有する（例えば、２５０アミノ酸～２７５アミノ酸、２７５アミノ酸～２９０アミノ酸、または２９０アミノ酸～３０２アミノ酸の長さを有する）。
ＰＸＲに対して好適なコレギュレーターペプチドは、ＳＲＣ１ポリペプチドまたはその断片（例えば、ＳＲＣ１ポリペプチドに由来する８アミノ酸～５０アミノ酸長のペプチド）である。
コレギュレーターペプチド
好適なコレギュレーターポリペプチドは、完全長の天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドの断片を含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、合成または組み換え核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。
好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～２０００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～５０アミノ酸、例えば、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、５０アミノ酸～１００アミノ酸、例えば、５０アミノ酸～６０アミノ酸、６０アミノ酸～７０アミノ酸、７０アミノ酸～８０アミノ酸、８０アミノ酸～９０アミノ酸、または９０アミノ酸～１００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、１００アミノ酸～２００アミノ酸、２００アミノ酸～３００アミノ酸、３００アミノ酸～４００アミノ酸、４００アミノ酸～５００アミノ酸、５００アミノ酸～６００アミノ酸、６００アミノ酸～７００アミノ酸、７００アミノ酸～８００アミノ酸、８００アミノ酸～９００アミノ酸、または９００アミノ酸～１０００アミノ酸の長さを有し得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、１０００アミノ酸～２０００アミノ酸の長さを有し得る。
好適なコレギュレーターポリペプチドには、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５が含まれるが、これらに限定されない。
そのようなコレギュレーターに関する国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）アクセッション番号には、次のものが含まれる：ＳＲＣ１（ＮＰ＿００３７３４）、ＧＲＩＰ１（ＮＰ＿００６５３１）、ＡＩＢ１（ＮＰ＿００６５２５）、ＰＧＣ１ａ（ＮＰ＿０３７３９３）、ＰＧＣ１ｂ（ＮＰ＿５７３５７０）、ＰＲＣ（ＮＰ＿０５５８７７）、ＴＲＡＰ２２０（ＮＰ＿００４７６５）、ＡＳＣ２（ＮＰ＿０５４７９０）、ＣＢＰ（ＮＰ＿００４３７１）、Ｐ３００（ＮＰ＿００１４２０）、ＣＩＡ（ＮＰ＿０６６０１８）、ＡＲＡ７０（ＮＰ＿００５４２８）、ＴＩＦ１（ＮＰ＿００３８４３）、ＮＳＤ１（ＮＰ＿０７１９００）、ＳＭＡＰ（ＮＰ＿００６６８７）、Ｔｉｐ６０（ＮＰ＿００６３７９）、ＥＲＡＰ１４０（ＮＰ＿８６１４４７）、Ｎｉｘ１（ＮＰ＿１１３６６２）、ＬＣｏＲ（ＮＰ＿１１５８１６）、Ｎ－ＣｏＲ（ＮＰ＿００６３０２）、ＳＭＲＴ（ＮＰ＿００６３０３）、ＲＩＰ１４０（ＮＰ＿００３４８０）及びＰＲＩＣ２８５（ＮＰ＿２０８３８４）。
好適なコレギュレーターポリペプチドの例は、図２９～５１Ｂに記載される。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図２９に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３１に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３２に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３３に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３４に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３５に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３６Ａ～３６Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３７Ａ～３７Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３６Ａ～３６Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図３９に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４１に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４２Ａ～４２Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４３に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４４に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４５に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４６に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４７に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４８Ａ～４８Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図４９Ａ～４９Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図５０に記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターポリペプチドは、８アミノ酸～１０アミノ酸、１０アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有し、図５１Ａ～５１Ｂに記載されるアミノ酸配列の連続する８～５０アミノ酸のストレッチに対して、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有する。
好適なコレギュレーターペプチドには、ステロイド受容体コアクチベーター（ＳＲＣ）－１、ＳＲＣ－２、ＳＲＣ－３、ＴＲＡＰ２２０－１、ＴＲＡＰ２２０－２、ＮＲ０Ｂ１、ＮＲＩＰ１、ＣｏＲＮＲｂｏｘ、ａｂＶ、ＴＩＦ１、ＴＩＦ２、ＥＡ２、ＴＡ１、ＥＡＢ１、ＳＲＣ１－１、ＳＲＣ１－２、ＳＲＣ１－３、ＳＲＣ１－４ａ、ＳＲＣ１－４ｂ、ＧＲＩＰ１－１、ＧＲＩＰ１－２、ＧＲＩＰ１－３、ＡＩＢ１－１、ＡＩＢ１－２、ＡＩＢ１－３、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＡＳＣ２－１、ＡＳＣ２－２、ＣＢＰ－１、ＣＢＰ－２、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０－１、ＡＲＡ７０－２、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、ＣｏＲＮＲ１（Ｎ－ＣｏＲ）、ＣｏＲＮＲ２、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０－Ｃ、ＲＩＰ１４０－１、ＲＩＰ１４０－２、ＲＩＰ１４０－３、ＲＩＰ１４０－４、ＲＩＰ１４０－５、ＲＩＰ１４０－６、ＲＩＰ１４０－７、ＲＩＰ１４０－８、ＲＩＰ１４０－９、ＰＲＩＣ２８５－１、ＰＲＩＣ２８５－２、ＰＲＩＣ２８５－３、ＰＲＩＣ２８５－４及びＰＲＩＣ２８５－５が含まれるが、これらに限定されない。
そのようなコレギュレーターに関する国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）アクセッション番号には、次のものが含まれる：ＳＲＣ１（ＮＰ＿００３７３４）、ＧＲＩＰ１（ＮＰ＿００６５３１）、ＡＩＢ１（ＮＰ＿００６５２５）、ＰＧＣ１ａ（ＮＰ＿０３７３９３）、ＰＧＣ１ｂ（ＮＰ＿５７３５７０）、ＰＲＣ（ＮＰ＿０５５８７７）、ＴＲＡＰ２２０（ＮＰ＿００４７６５）、ＡＳＣ２（ＮＰ＿０５４７９０）、ＣＢＰ（ＮＰ＿００４３７１）、Ｐ３００（ＮＰ＿００１４２０）、ＣＩＡ（ＮＰ＿０６６０１８）、ＡＲＡ７０（ＮＰ＿００５４２８）、ＴＩＦ１（ＮＰ＿００３８４３）、ＮＳＤ１（ＮＰ＿０７１９００）、ＳＭＡＰ（ＮＰ＿００６６８７）、Ｔｉｐ６０（ＮＰ＿００６３７９）、ＥＲＡＰ１４０（ＮＰ＿８６１４４７）、Ｎｉｘ１（ＮＰ＿１１３６６２）、ＬＣｏＲ（ＮＰ＿１１５８１６）、Ｎ－ＣｏＲ（ＮＰ＿００６３０２）、ＳＭＲＴ（ＮＰ＿００６３０３）、ＲＩＰ１４０（ＮＰ＿００３４８０）及びＰＲＩＣ２８５（ＮＰ＿２０８３８４）。
いくつかの場合において、好適なコレギュレーターペプチドは、ＬＸＸＬＬモチーフを含み、配列中、Ｘは任意のアミノ酸であり、コレギュレーターペプチドは、１２アミノ酸～５０アミノ酸、例えば、１２アミノ酸～１５アミノ酸、１５アミノ酸～２０アミノ酸、２０アミノ酸～２５アミノ酸、２５アミノ酸～３０アミノ酸、３０アミノ酸～３５アミノ酸、３５アミノ酸～４０アミノ酸、４０アミノ酸～４５アミノ酸、または４５アミノ酸～５０アミノ酸の長さを有する。
好適なコレギュレーターペプチドの非限定的な例は、次のとおりである。
Figure 0007068169000195
Figure 0007068169000196
Figure 0007068169000197
いくつかの場合において、所与のＬＢＤは、２つ以上の異なるコレギュレーターポリペプチドと対を形成することができる。例えば、図１９に示されるように、ＰＰＡＲγは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。別の例として、ＥＲαは、ＣｏＲＮＲ、αβＶまたはＴＡ１と対を形成することができる。別の例として、ＥＲβは、ＣｏＲＮＲ、αβＶまたはＴＡ１と対を形成することができる。別の例として、ＡＲは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。別の例として、ＰＲは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３、ＴＲＡＰ２２０、ＮＲ０Ｂ１、ＰＧＣ１Ｂ、ＮＲＩＰ１、ＥＡ２またはＥＡＢ１と対を形成することができる。別の例として、ＴＲβは、ＳＲＣ１、ＳＲＣ２、ＳＲＣ３またはＴＲＡＰ２２０と対を形成することができる。
いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドは、複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む。本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、複数のコレギュレーターペプチドは、直接的に、またはリンカーによって隔てられて、タンデムに並び得る。いくつかの場合において、ポリペプチド鎖中に存在する２つ以上のコレギュレーターペプチドは、アミノ酸配列が互いに同一である。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、ポリペプチド鎖は、２つのコレギュレーターペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体ポリペプチドが複数（２つ以上）のコレギュレーターペプチドを含むポリペプチド鎖を含む場合、ポリペプチド鎖は、３つのコレギュレーターペプチドを含む。そのような場合、第２のポリペプチド鎖は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを複数（２つ以上）含み得る。例えば、第２のポリペプチド鎖が核内ホルモン受容体のＬＢＤを２つ含む場合、２つのＬＢＤは、アミノ酸配列が互いに同一である。
好適な二量体化物質は、上記のとおりである。
操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）
いくつかの場合において、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、操作されたＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を部分的または全体的に含み得るか、改変により、操作されたＴＣＲが条件付きで抑制可能であるように改変された操作されたＴＣＲで本質的にあり得る。そのような場合、操作されたＴＣＲを含有するヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＴＣＲ、または簡単に抑制可能ＴＣＲと称され得る。
免疫細胞活性化機能を有する任意の操作されたＴＣＲが本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲでの使用に有用であり得、限定するものではないが、例えば、抗原特異的ＴＣＲ、モノクローナルＴＣＲ（ＭＴＣＲ）、一本鎖ＭＴＣＲ、高親和性ＣＤＲ２変異ＴＣＲ、ＣＤ１結合ＭＴＣＲ、高親和性ＮＹ－ＥＳＯ ＴＣＲ、ＶＹＧ ＨＬＡ－Ａ２４テロメラーゼＴＣＲ、例えば、ＰＣＴ国際出願第ＷＯ２００３／０２０７６３号、同第ＷＯ２００４／０３３６８５号、同第ＷＯ２００４／０４４００４号、同第ＷＯ２００５／１１４２１５号、同第ＷＯ２００６／０００８３０号、同第ＷＯ２００８／０３８００２号、同第ＷＯ２００８／０３９８１８号、同第ＷＯ２００４／０７４３２２号、同第ＷＯ２００５／１１３５９５号、同第ＷＯ２００６／１２５９６２号；Ｓｔｒｏｍｍｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｖ．２０１４；２５７（１）：１４５－６４；Ｓｃｈｍｉｔｔ ｅｔ ａｌ．Ｂｌｏｏｄ．２０１３；１２２（３）：３４８－５６；Ｃｈａｐｕｌｓ ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉ Ｔｒａｎｓｌ Ｍｅｄ．２０１３；５（１７４）：１７４ｒａ２７；Ｔｈａｘｔｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｈｕｍ Ｖａｃｃｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２０１４；１０（１１）：３３１３－２１（ＰＭＩＤ：２５４８３６４４）；Ｇｓｃｈｗｅｎｇ ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｖ．２０１４；２５７（１）：２３７－４９（ＰＭＩＤ：２４３２９８０１）；Ｈｉｎｒｉｃｈｓ ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｖ．２０１４；２５７（１）：５６－７１（ＰＭＩＤ：２４３２９７８９）；Ｚｏｅｔｅ ｅｔ ａｌ．Ｆｒｏｎｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１３；４：２６８（ＰＭＩＤ：２４０６２７３８）；Ｍａｒｒ ｅｔ ａｌ．Ｃｌｉｎ Ｅｘｐ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１２；１６７（２）：２１６－２５（ＰＭＩＤ：２２２３５９９７）；Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．２０１２；６４（８）：７５６－６２（ＰＭＩＤ：２２１７８９０４）；Ｃｈｈａｂｒａ ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｗｏｒｌｄ Ｊｏｕｒｎａｌ．２０１１；１１：１２１－９（ＰＭＩＤ：２１２１８２６９）；Ｂｏｕｌｔｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｃｌｉｎ Ｅｘｐ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００５；１４２（３）：４５４－６０（ＰＭＩＤ：１６２９７１５７）；Ｓａｍｉ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ Ｄｅｓ Ｓｅｌ．２００７；２０（８）：３９７－４０３；Ｂｏｕｌｔｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．２００３；１６（９）：７０７－１１；Ａｓｈｆｉｅｌｄ ｅｔ ａｌ．ＩＤｒｕｇｓ．２００６；９（８）：５５４－９；Ｌｉ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００５；２３（３）：３４９－５４；Ｄｕｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ．２００６；１５（４）：７１０－２１；Ｌｉｄｄｙ ｅｔ ａｌ．Ｍｏｌ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０１０；４５（２）；Ｌｉｄｄｙ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ Ｍｅｄ．２０１２；１８（６）：９８０－７；Ｏａｔｅｓ，ｅｔ ａｌ．Ｏｎｃｏｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．２０１３；２（２）：ｅ２２８９１；ＭｃＣｏｒｍａｃｋ，ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２０１３ Ａｐｒ；６２（４）：７７３－８５；Ｂｏｓｓｉ ｅｔ ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２０１４；６３（５）：４３７－４８及びＯａｔｅｓ，ｅｔ ａｌ．Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１５ Ｏｃｔ；６７（２ Ｐｔ Ａ）：６７－７４に記載のものが含まれる（当該開示の全体を参照により本明細書に援用する）。
いくつかの場合において、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲは、例えば、ＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲ、またはＮＹ－ＥＳＯ－１もしくはＮＹ－ＥＳＯ－１由来ペプチドに結合するＴＣＲを含み得る。例えば、いくつかの場合において、ＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲは、アミノ酸配列：ＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７０）を有するペプチドに結合する、操作されたＴＣＲであり得る。
いくつかの場合において、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲは、そのリガンドに対して高い親和性（限定するものではないが、例えば、１００μＭ以下のＫＤ、限定するものではないが、例えば、１０μＭ以下のＫＤまたは１μＭ以下のＫＤ）を有する操作されたＴＣＲであり得るか、それに由来し得る。いくつかの場合において、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲは、ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７１）に対して高い親和性（限定するものではないが、ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７２）に対して、例えば、１００μＭ以下のＫＤ、限定するものではないが、例えば、１０μＭ以下のＫＤまたは１μＭ以下のＫＤ）を有する操作されたＴＣＲであり得るか、それに由来し得る。ＫＤの測定は、任意の既知の方法、限定するものではないが、例えば、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ）によって行うことができる。
いくつかの場合において、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲは、そのリガンドからの解離速度（ｋｏｆｆ）が遅い（限定するものではないが、例えば、０．１Ｓ－１より遅いｋｏｆｆ、限定するものではないが、例えば、１×１０－２Ｓ－１より遅いｋｏｆｆまたは１×１０－３Ｓ－１より遅いｋｏｆｆを有する）操作されたＴＣＲであり得るか、それに由来し得る。いくつかの場合において、本明細書に記載されるヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲは、ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７３）からの解離速度が遅い（例えば、１００μＭ以下のＫＤ、限定するものではないが、ペプチドＳＬＬＭＷＩＴＱＣ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７４）からの解離速度が、例えば、０．１Ｓ－１より遅いｋｏｆｆ、限定するものではないが、例えば、１×１０－２Ｓ－１より遅いｋｏｆｆまたは１×１０－３Ｓ－１より遅いｋｏｆｆを有する）操作されたＴＣＲであり得るか、それに由来し得る。ｋｏｆｆの測定は、任意の既知の方法、限定するものではないが、例えば、表面プラズモン共鳴（Ｂｉａｃｏｒｅ）によって行うことができる。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの構成成分として使用するために、二量体化ドメイン（例えば、二量体化因子対のメンバー）の操作されたＴＣＲへの導入または挿入により改変され得る。そのような場合、操作されたＴＣＲは、改変に従って、二量体化因子ドメイン含有ＴＣＲまたは二量体化可能ＴＣＲと称され得る。
二量体化因子ドメインは、例えば、任意の簡便な位置に二量体化因子ドメインのコーディング配列を操作されたＴＣＲのコーディング配列中に導入することによって、操作されたＴＣＲアミノ酸配列中に挿入され得る。ただし、その挿入が操作されたＴＣＲの主要な機能性ドメイン（例えば、ＴＣＲα鎖ドメイン、ＴＣＲβ鎖ドメイン、ＴＣＲＣＤ３鎖ドメイン、ＴＣＲζ鎖ドメイン、ＴＣＲ ＣＤ３－ζ鎖ドメイン ＴＣＲ細胞外ドメイン、ＴＣＲ細胞内ドメイン、ＴＣＲ可変領域ドメイン、ＴＣＲ定常領域ドメイン、ＴＣＲ ＩｇＳＦドメインなど、またはその機能を含む）に悪影響を及ぼさず、かつ／または二量体化因子ドメインの二量体化機能に悪影響を及ぼさない場合に限る。
操作されたＴＣＲは、１つ以上のε鎖、σ鎖またはγ鎖を含み得るか、いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、１つ以上のε鎖、σ鎖またはγ鎖を含まなくてもよく、代わりに、内因的に発現されるε鎖、σ鎖またはγ鎖に依存してもよい。いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、１つ以上のＣＤ３－ζ鎖を含まなくてもよく、代わりに、内因的に発現されるＣＤ３－ζに依存してもよい。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲの細胞外部分に挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化因子ドメイン（二量体化対の第１または第２のメンバー）は、操作されたＴＣＲの細胞内部分に挿入され得る。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲのα鎖に挿入または連結され得る。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインがα鎖に細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがα鎖膜貫通ドメインの細胞質側に連結される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインがα鎖に細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがα鎖膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインがα鎖膜貫通ドメインとα鎖定常領域ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲのβ鎖に挿入または連結され得る。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインがβ鎖に細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがβ鎖膜貫通の細胞質側に連結される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインがβ鎖に細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがβ鎖膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインがβ鎖膜貫通ドメインとβ鎖定常領域ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲの融合α－ＣＤ３－ζ鎖に挿入または連結され得、この場合、例えば、ＣＤ３－ζ鎖は、完全長ＣＤ３－ζ（例えば、ＴＣＲ：ζ融合）である。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合α－ＣＤ３－ζ鎖に細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインが融合α－ＣＤ３－ζ鎖のＣＤ３－ζ膜貫通ドメインと他の細胞内ドメイン（例えば、１つ以上の細胞内ＩＴＡＭドメインを含む）との間に挿入される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合α－ＣＤ３－ζ鎖に細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζ膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインが細胞外α鎖ドメインと融合ＣＤ３－ζの膜貫通ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲの融合β－ＣＤ３－ζ鎖に挿入または連結され得、この場合、例えば、ＣＤ３－ζ鎖は、完全長ＣＤ３－ζ（例えば、ＴＣＲ：ζ融合）である。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合β－ＣＤ３－ζ鎖に細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインが融合β－ＣＤ３－ζ鎖のＣＤ３－ζ膜貫通ドメインと他の細胞内ドメイン（例えば、１つ以上の細胞内ＩＴＡＭドメインを含む）との間に挿入される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合β－ＣＤ３－ζ鎖に細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζ膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインが細胞外β鎖ドメインと融合ＣＤ３－ζの膜貫通ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲの融合α－ＣＤ３－ζドメイン（例えば、操作されたＴＣＲα－ζ＋β－ζ融合中）に挿入または連結され得る。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合α－ＣＤ３－ζドメインに細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζドメインの１つ以上のドメインとα鎖の膜貫通ドメインとの間に挿入される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合α－ＣＤ３－ζドメインに細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがα鎖膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインがα鎖膜貫通ドメインとα鎖定常領域ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作されたＴＣＲの融合β－ＣＤ３－ζドメイン（例えば、操作されたＴＣＲα－ζ＋β－ζ融合中）に挿入または連結され得る。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合β－ＣＤ３－ζドメインに細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζドメインの１つ以上のドメインとβ鎖の膜貫通ドメインとの間に挿入される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが融合β－ＣＤ３－ζドメインに細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがβ鎖膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインがβ鎖膜貫通ドメインとβ鎖定常領域ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、操作された一本鎖ＴＣＲの鎖に挿入または連結され得る（例えば、操作された一本鎖ＴＣＲ：ζ融合中；この場合、例えば、ＴＣＲα鎖可変ドメインは、完全長ＣＤ３－ζ鎖に融合されたＴＣＲβ鎖に連結される）。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが操作された一本鎖ＴＣＲに細胞内で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζ鎖の１つ以上のドメインとＣＤ３－ζ鎖の膜貫通ドメインとの間に挿入される場合が含まれる。いくつかの場合において、二量体化因子ドメインは、挿入または連結後に、二量体化因子ドメインが操作された一本鎖ＴＣＲに細胞外で連結されるように挿入または連結され、例えば、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζ鎖膜貫通ドメインの細胞外側に連結される場合、二量体化因子ドメインがＣＤ３－ζ鎖膜貫通ドメインとβ鎖定常領域ドメインとの間に挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、単一の二量体化因子ドメインのみが、条件付きで抑制可能な操作されたＴＣＲ中に存在し得、例えば、単一の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲのα鎖に連結または挿入される場合、単一の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲのβ鎖に連結または挿入される場合、単一の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲのＣＤ３－ζ鎖に連結または挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、２つ以上の二量体化因子ドメインが、条件付きで抑制可能な操作されたＴＣＲ中に存在し得る。例えば、２つの二量体化因子ドメインが、条件付きで抑制可能な操作されたＴＣＲ中に存在し得、例えば、第１の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲのα鎖に連結または挿入され、第２の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲのβ鎖に連結または挿入される場合、第１の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲの第１のＣＤ３－ζ鎖に連結または挿入され、第２の二量体化因子ドメインが操作されたＴＣＲの第２のＣＤ３－ζ鎖に連結または挿入される場合などが含まれる。
いくつかの場合において、条件付抑制可能ＴＣＲの操作されたＴＣＲは、限定するものではないが、例えば、１つ以上のバリアントＴＣＲ鎖または変異ＴＣＲ鎖を含むＴＣＲバリアントを含む、操作されたＴＣＲバリアントであり得る。いくつかの場合において、条件付抑制可能ＴＣＲの操作されたＴＣＲは、限定するものではないが、非修飾α鎖、非修飾β鎖などを含む、１つ以上の非修飾鎖を含み得る。いくつかの場合において、条件付抑制可能ＴＣＲの操作されたＴＣＲは、限定するものではないが、例えば、ネズミ化α鎖、ネズミ化β鎖などを含む、１つ以上のネズミ化鎖を含み得る。いくつかの場合において、条件付抑制可能ＴＣＲの操作されたＴＣＲは、限定するものではないが、例えば、システイン修飾α鎖、システイン修飾β鎖などを含む、１つ以上のシステイン修飾鎖を含み得る。いくつかの場合において、条件付抑制可能ＴＣＲの操作されたＴＣＲは、バリアントＴＣＲ鎖の組み合わせを含み得、限定するものではないが、ネズミ化鎖とシステイン修飾鎖との組み合わせが含まれ、限定するものではないが、例えば、ネズミ化α鎖とシステイン修飾α鎖、ネズミ化β鎖とシステイン修飾β鎖、ネズミ化α鎖とシステイン修飾β鎖、ネズミ化β鎖とシステイン修飾α鎖などが含まれる。
ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲが改変されたＴＣＲを部分的または全体的に含むか、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲが改変されたＴＣＲで本質的にある場合において、ＴＣＲは、細胞外ドメインを有する非修飾ＴＲＣ鎖または修飾ＴＣＲ鎖中に存在する細胞外ドメインと、非修飾ＴＣＲ鎖または修飾ＴＣＲ鎖中に存在する１つ以上の細胞内刺激ドメインと、当該細胞外ドメイン含有鎖または細胞内ドメイン含有鎖の膜貫通ドメインとを含有し得る。そのようなＴＣＲは、リンカー領域及び／またはヒンジ領域を任意選択で含み得る。ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲの一部としてのＴＣＲは、単一のポリペプチド（例えば、操作された一本鎖ＴＣＲ）またはその各種鎖及び部分内に含まれてもよいし、２つ以上のポリペプチドにわたって「分割」されてもよい。
ＴＣＲ鎖
多くの天然型ＴＣＲは、αβまたはγδのヘテロ二量体の形態で存在する。しかしながら、組み換えＴＣＲまたは操作されたＴＣＲは、単一のＴＣＲα鎖またはＴＣＲβ鎖を含み得、ペプチドＭＨＣ分子に結合し得る。ある特定の実施形態において、抑制可能ＩＣＲの操作されたＴＣＲは、α鎖可変ドメインとＴＣＲβ鎖可変ドメインの両方を含む。本開示の抑制可能ＩＣＲに有用な操作されたＴＣＲの各鎖は、多様であり得、任意の好適な天然もしくは合成もしくは組み換えもしくは変異体の１つもしくは複数のＴＣＲ鎖またはこれらの組み合わせを含み得る。
当業者には明らかであるように、例えば、α鎖配列及び／またはＴＣＲβ鎖配列を含む、ＴＣＲ鎖配列中の変異（複数可）は、置換、欠失または挿入のうちの１つ以上であり得る。これらの変異は、任意の適切な方法、限定するものではないが、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、制限酵素クローニングまたはライゲーション非依存性クローニング（ＬＩＣ）手法に基づく方法を使用して実施することができる。これらの方法は、限定するものではないが、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ＆Ｒｕｓｓｅｌｌ，（２００１）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ－Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（３ｒｄ Ｅｄ．）ＣＳＨＬ Ｐｒｅｓｓ ａｎｄ Ｒａｓｈｔｃｈｉａｎ，（１９９５）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ６（１）：３０－６を含む、多くの標準的な分子生物学テキストに詳述されている。
本明細書で使用されるとき、「可変ドメイン」という用語は、例えば、Ｔ ｃｅｌｌ ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｆａｃｔｓｂｏｏｋ，（２００１）ＬｅＦｒａｎｃ ａｎｄ ＬｅＦｒａｎｃ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓに記載されるように、ＴＣＲα鎖のＴＲＡＣ遺伝子及びＴＣＲβ鎖のＴＲＢＣ１またはＴＲＢＣ２のいずれかによってコードされる定常ドメイン内に含まれない、所与のＴＣＲの全てのアミノ酸を包含することを意味する。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、ＩＧ４α鎖アミノ酸配列
Figure 0007068169000198
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有するか、それに由来する、少なくとも１つのＴＣＲα鎖ドメインを有する。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、ＩＧ４α鎖Ａ９５：ＬＹ変異体アミノ酸配列
Figure 0007068169000199
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有するか、それに由来する、少なくとも１つのＴＣＲα鎖ドメインを有する。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、ＩＧ４β鎖アミノ酸配列
Figure 0007068169000200
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有するか、それに由来する、少なくとも１つのＴＣＲβ鎖ドメインを有する。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、ＩＧ４β鎖Ｇ５１Ａ変異体アミノ酸配列
Figure 0007068169000201
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有するか、それに由来する、少なくとも１つのＴＣＲβ鎖ドメインを有する。
いくつかの場合において、ＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲは、α鎖細胞外配列
Figure 0007068169000202
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有する、少なくとも１つのＴＣＲα鎖可変ドメインを有する。いくつかの場合において、α鎖細胞外配列は、次のアミノ酸置換のうちの１つ以上を含有する：Ｔ９５Ｌ及びＳ９６Ｙ。
いくつかの場合において、ＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲは、β鎖細胞外配列
Figure 0007068169000203
に対して、少なくとも７０％同一であるか、例えば少なくとも７５％同一であるか、例えば少なくとも８０％同一であるか、例えば少なくとも８５％同一であるか、例えば少なくとも９０％同一であるか、例えば少なくとも９５％同一であるか、１００％同一であるアミノ酸配列を有する、少なくとも１つのＴＣＲβ鎖可変ドメインを有する。
いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、システイン間に導入されたジスルフィド結合を含む。例えば、システイン間のジスルフィド結合は、操作された２つの鎖の置換アミノ酸間、限定するものではないが、例えば、ＴＣＲのα鎖とβ鎖との間に導入され得る。いくつかの場合において、操作されたＴＣＲは、操作されたＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲの２つの鎖の置換アミノ酸のシステイン間、限定するものではないが、例えば、操作されたＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲのα鎖とβ鎖との間にジスルフィド結合を含む、ＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲであり得る。例えば、いくつかの場合において、操作されたＮＹ－ＥＳＯ－１結合ＴＣＲは、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６７９～６８０のうちのα鎖Ｔ１６２及びβ鎖Ｓ１６９を置換したシステイン間のジスルフィド結合を含み得る。
リンカー
いくつかの場合において、当該条件付抑制可能ＴＣＲは、任意の２つの隣接するドメインまたは人工的に連結された鎖の間にリンカーを含む。例えば、リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲのα鎖の膜貫通ドメインの細胞内位置と二量体化因子ドメインとの間に配置され得る。いくつかの場合において、リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲのβ鎖の膜貫通ドメインの細胞内位置と二量体化因子ドメインとの間に配置され得る。いくつかの場合において、リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲのα鎖の膜貫通ドメインと、連結されたＣＤ３－ζ鎖の第１の細胞内機能性ドメインとの間に配置され得る。いくつかの場合において、リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲのβ鎖の膜貫通ドメインと、連結されたＣＤ３－ζ鎖の第１の細胞内機能性ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲの任意ドメインと任意の追加ドメイン（例えば、条件付抑制可能ＴＣＲの主要免疫活性化機能に関与しないドメイン、限定するものではないが、例えば、レポータードメイン、タグドメインなどを含む）との間に配置され得る。
リンカーは、条件付抑制可能ＴＣＲの主要な活性（例えば、免疫細胞を活性化する条件付抑制可能ＴＣＲの能力、合成ＩＣＲリプレッサーの二量体化ドメインに結合する条件付抑制可能ＴＣＲの二量体化ドメインの能力などを含む）を無効にしない限り、条件付抑制可能ＴＣＲ中、好適な構成で利用することができる。
２つ以上のリンカーを含む好適なリンカー（例えば、２つ以上のリンカーは同じでも異なってもよく、複数のリンカーが３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上である場合などを含み、全てのリンカーが異なり、複数のリンカーが、１つを超える位置で利用されるいくつかのリンカーと１つの位置のみで特異的に利用されるいくつかのリンカーの混合を含む場合などを含む）を当該条件付抑制可能ＴＣＲに利用することができ、例えば、ＣＡＲでの使用が許容される本明細書に記載されるリンカーを含む。
合成ＩＣＲリプレッサー
本明細書に記載されるように、ヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、簡単に「ＩＣＲリプレッサー」または「抑制性部分」とも本明細書中で称される、合成ＩＣＲリプレッサーを含む。当該抑制性ＩＣＲは、その構築物が指向する免疫細胞抑制の特定の状況に応じて異なり得、刺激性ＩＣＲ及びＩＣＲリプレッサーを発現する活性化または活性化可能免疫細胞の抑制を媒介するように概ね機能し得る。したがって、ＩＣＲリプレッサーは、二量体化物質が存在するときに、ＩＣＲリプレッサー及び刺激性ＩＣＲに存在する互いの二量体化ドメインが二量体化する際の刺激性ＩＣＲに帰属する免疫細胞活性化を抑制するように機能する抑制ドメインを含む。
したがって、ＩＣＲリプレッサーは、刺激性ＩＣＲを発現する免疫細胞の免疫細胞活性化の抑制をもたらす細胞内シグナル伝達を媒介する１つ以上の細胞内抑制ドメインを含む。抑制ドメインとして有用なドメインは、例えば、例えば、抑制させる活性化細胞の具体的な種類及び抑制の所望の程度を含む、免疫細胞活性化及び抑制の特定の状況に応じて異なり得る。抑制ドメインの例示的な非限定的な例には、以下に更に詳述するが、例えば、共抑制分子、免疫チェックポイント分子、免疫寛容分子などを含む、免疫受容体に由来するドメイン及びそのモチーフが挙げられるが、これらに限定されない。
ＩＣＲリプレッサーは、以下に詳述するように、二量体化対のドメインを更に含む。有用な二量体化ドメインは、所望の二量体化因子、及びＩＣＲリプレッサー内の二量体化ドメインの所望の相対的位置に応じて異なり得る。概して、刺激性ＩＣＲ内の二量体化対の第１のドメインの存在は、二量体化因子の導入の際に、ＩＣＲリプレッサーに存在する二量体化対の第２のドメインとの二量体化を媒介し、これにより、ＩＣＲリプレッサーは、二量体化したときに、刺激性ＩＣＲによる免疫細胞活性化を抑制する。
ＩＣＲリプレッサーは、任意選択により、膜貫通ドメインを含み得る。したがって、本明細書に記載されるＩＣＲリプレッサーは、膜に係留されていてもいなくてもよい。このように、ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通ドメインまたはその一部を含有し得、したがって、膜結合ＩＣＲリプレッサーであり得る。他の場合において、ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通ドメインを欠いてもよく、したがって、細胞質ＩＣＲリプレッサーであり得る。本開示のＩＣＲリプレッサーに有用なそのような膜貫通ドメインは、本明細書で更に記載される。
いくつかの場合において、ＩＣＲリプレッサーは、追加ドメインを更に含み得る。そのような追加ドメインは、機能性であり得、例えば、ＩＣＲリプレッサーの免疫細胞活性化抑制機能に直接的に寄与するか、非機能性であり得、例えば、ＩＣＲリプレッサーの抑制機能に直接的に寄与しない。非機能性追加ドメインには、免疫細胞活性化を抑制するＩＣＲリプレッサーの能力に直接影響しない様々な目的（限定するものではないが、例えば、構造的機能、リンカー機能などを含む）を有するドメインが含まれ得る。
細胞内抑制ドメイン
当該抑制可能ＩＣＲの合成ＩＣＲリプレッサーでの使用に好適な刺激ドメインは、３アミノ酸線状モチーフのように短く、タンパク質全体のように長いポリペプチドの任意の機能性単位であってよく、刺激ドメインの大きさは、当該ドメインがその機能を維持するのに十分な大きさであり、抑制可能ＩＣＲの他の構成成分と適合するのに十分に小さくなければならないという点でのみ制限される。したがって、抑制ドメインは、３アミノ酸長～１０００アミノ酸以上の大きさの範囲であり得、いくつかの場合において、約３０アミノ酸～約７０アミノ酸（ａａ）の長さを有し得、例えば、抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有し得る。他の場合において、刺激ドメインは、約７０アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約２００アミノ酸、または２００アミノ酸超の長さを有し得る。
いくつかの場合において、「共抑制ドメイン」は、本開示の合成ＩＣＲリプレッサーに有用である。そのような共抑制ドメインは、概して、受容体に由来するポリペプチドである。共抑制は、概して、共刺激を妨げる、主要な抗原特異的活性化機序の二次的抑制を指す。共抑制、例えば、Ｔ細胞共抑制及び関与因子については、Ｃｈｅｎ＆Ｆｌｉｅｓ．Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ（２０１３）１３（４）：２２７－４２及びＴｈａｖｅｎｔｈｉｒａｎ ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｃｌｉｎ Ｃｅｌｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ（２０１２）Ｓ１２に記載されており、当該開示の全体を参照により本明細書に援用する。いくつかの実施形態において、共抑制ドメインは、ホモ二量体化する。当該共抑制ドメインは、膜貫通タンパク質の細胞内部分であり得る（すなわち、共抑制ドメインは、膜貫通タンパク質に由来し得る）。好適な共抑制ポリペプチドの非限定的な例には、ＣＴＬＡ－４及びＰＤ－１が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの場合において、共抑制ドメイン、例えば、本開示の合成ＩＣＲリプレッサーに使用される共抑制ドメインには、表１を記載する図２７に列挙される共抑制ドメインが含まれ得る。いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーの共抑制ドメインは、本明細書に記載される共抑制ドメインに対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質ＰＤ－１（ＣＤ２７９、プログラム細胞死１などとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000204
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、または約９５アミノ酸～約１００アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質ＣＴＬＡ４（ＣＤ１５２、細胞傷害性Ｔリンパ球タンパク質４、細胞傷害性Ｔリンパ球関連抗原４などとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000205
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質ＨＰＫ１（ＭＡＰ４Ｋ１、マイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼキナーゼキナーゼ１、造血前駆細胞キナーゼ、ＭＡＰＫ／ＥＲＫキナーゼキナーゼキナーゼ１、ＭＥＫキナーゼキナーゼ１、ＭＥＫＫＫ１などとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000206
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５アミノ酸、約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸、約１９０アミノ酸～約１９５アミノ酸、約１９５アミノ酸～約２００アミノ酸、約２００アミノ酸～約２０５アミノ酸、約２０５アミノ酸～約２１０アミノ酸、約２１０アミノ酸～約２１５アミノ酸、約２１５アミノ酸～約２２０アミノ酸、約２２０アミノ酸～約２２５アミノ酸、約２２５アミノ酸～約２３０アミノ酸、約２３０アミノ酸～約２３５アミノ酸、約２３５アミノ酸～約２４０アミノ酸、約２４０アミノ酸～約２４５アミノ酸、約２４５アミノ酸～約２５０アミノ酸、約２５０アミノ酸～約２５５アミノ酸または約２５５アミノ酸～約２５８アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質ＳＨＰ１（ＰＴＮ６、チロシンタンパク質ホスファターゼ非受容体型６、造血細胞タンパク質チロシンホスファターゼ、タンパク質チロシンホスファターゼ１Ｃ、ＰＴＰ－１Ｃ、ＳＨ－ＰＴＰ１、ＨＣＰ、ＰＴＰ１Ｃなどとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000207
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５アミノ酸、約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸、約１９０アミノ酸～約１９５アミノ酸、約１９５アミノ酸～約２００アミノ酸、約２００アミノ酸～約２０５アミノ酸、約２０５アミノ酸～約２１０アミノ酸、約２１０アミノ酸～約２１５アミノ酸、約２１５アミノ酸～約２２０アミノ酸、約２２０アミノ酸～約２２５アミノ酸、約２２５アミノ酸～約２３０アミノ酸、約２３０アミノ酸～約２３５アミノ酸、約２３５アミノ酸～約２４０アミノ酸、約２４０アミノ酸～約２４５アミノ酸、約２４５アミノ酸～約２５０アミノ酸、約２５０アミノ酸～約２５５アミノ酸、約２５５アミノ酸～約２６０アミノ酸、約２６０アミノ酸～約２６５アミノ酸、約２６５アミノ酸～約２７０アミノ酸または約２７０アミノ酸～約２７２アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質ＳＨＰ２（ＰＴＮ１１、チロシンタンパク質ホスファターゼ非受容体型１１、タンパク質チロシンホスファターゼ１Ｄ、ＰＴＰ－１Ｄ、タンパク質チロシンホスファターゼ２Ｃ、ＰＴＰ－２Ｃ、ＳＨ－ＰＴＰ２、ＳＨＰ－２、ＳＨ－ＰＴＰ３、ＰＴＰ２Ｃ、ＳＨＰＴＰ２などとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000208
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５アミノ酸、約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸、約１９０アミノ酸～約１９５アミノ酸、約１９５アミノ酸～約２００アミノ酸、約２００アミノ酸～約２０５アミノ酸、約２０５アミノ酸～約２１０アミノ酸、約２１０アミノ酸～約２１５アミノ酸、約２１５アミノ酸～約２２０アミノ酸、約２２０アミノ酸～約２２５アミノ酸、約２２５アミノ酸～約２３０アミノ酸、約２３０アミノ酸～約２３５アミノ酸、約２３５アミノ酸～約２４０アミノ酸、約２４０アミノ酸～約２４５アミノ酸、約２４５アミノ酸～約２５０アミノ酸、約２５０アミノ酸～約２５５アミノ酸、約２５５アミノ酸～約２６０アミノ酸、約２６０アミノ酸～約２６５アミノ酸、約２６５アミノ酸～約２７０アミノ酸または約２７０アミノ酸～約２７５アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質Ｓｔｓ１（ＵＢＳ３Ｂ、ユビキチン関連及びＳＨ３ドメイン含有タンパク質Ｂ、Ｃｂｌ相互作用タンパク質ｐ７０、Ｔ細胞受容体シグナル伝達１サプレッサー、ＳＴＳ－１、Ｔ細胞ユビキチンリガンド２、ＴＵＬＡ－２、チロシンタンパク質ホスファターゼＳＴＳ１／ＴＵＬＡ２、ＵＢＡＳＨ３Ｂ、ＫＩＡＡ１９５９などとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000209
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５アミノ酸、約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸、約１９０アミノ酸～約１９５アミノ酸、約１９５アミノ酸～約２００アミノ酸、約２００アミノ酸～約２０５アミノ酸、約２０５アミノ酸～約２１０アミノ酸、約２１０アミノ酸～約２１５アミノ酸、約２１５アミノ酸～約２２０アミノ酸、約２２０アミノ酸～約２２５アミノ酸、約２２５アミノ酸～約２３０アミノ酸、約２３０アミノ酸～約２３５アミノ酸、約２３５アミノ酸～約２４０アミノ酸、約２４０アミノ酸～約２４５アミノ酸、約２４５アミノ酸～約２５０アミノ酸、約２５０アミノ酸～約２５５アミノ酸、約２５５アミノ酸～約２６０アミノ酸、約２６０アミノ酸～約２６５アミノ酸または約２６５アミノ酸～約２７０アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、膜貫通タンパク質Ｃｓｋ（チロシンタンパク質キナーゼＣＳＫ、Ｃ－Ｓｒｃキナーゼ、タンパク質－チロシンキナーゼＣＹＬなどとしても知られる）の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る：
Figure 0007068169000210
Figure 0007068169000211
。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５アミノ酸、約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸、約１９０アミノ酸～約１９５アミノ酸、約１９５アミノ酸～約２００アミノ酸、約２００アミノ酸～約２０５アミノ酸、約２０５アミノ酸～約２１０アミノ酸、約２１０アミノ酸～約２１５アミノ酸、約２１５アミノ酸～約２２０アミノ酸、約２２０アミノ酸～約２２５アミノ酸、約２２５アミノ酸～約２３０アミノ酸、約２３０アミノ酸～約２３５アミノ酸、約２３５アミノ酸～約２４０アミノ酸、約２４０アミノ酸～約２４５アミノ酸、約２４５アミノ酸～約２５０アミノ酸または約２５０アミノ酸～約２５５アミノ酸の長さを有する。
いくつかの場合において、合成ＩＣＲリプレッサーは、表１に列挙される膜貫通タンパク質の細胞内部分に由来する細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、共抑制ドメインを含有し得る。例えば、好適な共抑制ドメインは、表１に列挙されるアミノ酸配列に対して、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。これらの実施形態のいくつかにおいて、共抑制ドメインは、約３０アミノ酸～約３５アミノ酸、約３５アミノ酸～約４０アミノ酸、約４０アミノ酸～約４５アミノ酸、約４５アミノ酸～約５０アミノ酸、約５０アミノ酸～約５５アミノ酸、約５５アミノ酸～約６０アミノ酸、約６０アミノ酸～約６５アミノ酸、または約６５アミノ酸～約７０アミノ酸、約７０アミノ酸～約７５アミノ酸、約７５アミノ酸～約８０アミノ酸、約８０アミノ酸～約８５アミノ酸、約８５アミノ酸～約９０アミノ酸、約９０アミノ酸～約９５アミノ酸、約９５アミノ酸～約１００アミノ酸、約１００アミノ酸～約１０５アミノ酸、約１０５アミノ酸～約１１０アミノ酸、約１１０アミノ酸～約１１５アミノ酸、約１１５アミノ酸～約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸～約１２５アミノ酸、約１２５アミノ酸～約１３０アミノ酸、約１３０アミノ酸～約１３５アミノ酸、約１３５アミノ酸～約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸～約１４５アミノ酸、約１４５アミノ酸～約１５０アミノ酸、約１５０アミノ酸～約１５５アミノ酸、約１５５アミノ酸～約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸～約１６５、アミノ酸約１６５アミノ酸～約１７０アミノ酸、約１７０アミノ酸～約１７５アミノ酸、約１７５アミノ酸～約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸～約１８５アミノ酸、または約１８５アミノ酸～約１９０アミノ酸の長さを有する。
膜貫通ドメイン
真核細胞（例えば、哺乳動物細胞）の細胞膜へのポリペプチドの挿入を提供する任意の膜貫通（ＴＭ）ドメインが使用に適している。１つの非限定的な例として、
Figure 0007068169000212
のＴＭ配列を使用することができる。好適なＴＭ配列の更なる非限定的な例には、ａ）ＣＤ８β由来：
Figure 0007068169000213
、ｂ）ＣＤ４由来：
Figure 0007068169000214
、ｃ）ＣＤ３ζ由来：
Figure 0007068169000215
、ｄ）ＣＤ２８由来：
Figure 0007068169000216
、ｅ）ＣＤ１３４（ＯＸ４０）由来：
Figure 0007068169000217
、及びｆ）ＣＤ７由来：
Figure 0007068169000218
が挙げられる。
リンカー
いくつかの場合において、当該合成ＩＣＲリプレッサーは、任意の２つの隣接するドメインの間にリンカーを含む。例えば、リンカーは、合成ＩＣＲリプレッサーの膜貫通ドメイン（存在する場合）と、第１の細胞内機能性ドメイン、例えば、共抑制ドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、合成ＩＣＲリプレッサーの第１の細胞内機能性ドメインと二量体化ドメインのメンバーとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、合成ＩＣＲリプレッサーの膜貫通ドメイン（存在する場合）と二量体化ドメインのメンバーとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、二量体化ドメインのメンバーと第２の細胞内機能性ドメイン、例えば、免疫細胞を負に制御するドメインとの間に配置され得る。別の例として、リンカーは、合成ＩＣＲリプレッサーの任意のドメインと任意の追加ドメイン（例えば、合成ＩＣＲリプレッサーの主要免疫抑制機能に関与しないドメイン、限定するものではないが、例えば、レポータードメイン、タグドメインなどを含む）との間に配置され得る。
リンカーは、合成ＩＣＲリプレッサーの主要な活性（例えば、活性化ＩＣＲを抑制する合成ＩＣＲリプレッサーの能力、抑制可能ＩＣＲの二量体化ドメインに結合する合成ＩＣＲリプレッサーの二量体化ドメインの能力を含む）を無効にしない限り、合成ＩＣＲリプレッサー中、好適な構成で利用することができる。
２つ以上のリンカーを含む好適なリンカー（例えば、２つ以上のリンカーは同じでも異なってもよく、複数のリンカーが３つ以上、４つ以上、５つ以上、６つ以上である場合などを含み、全てのリンカーが異なり、複数のリンカーが、１つを超える位置で利用されるいくつかのリンカーと１つの位置のみで特異的に利用されるいくつかのリンカーの混合を含む場合などを含む）を当該合成ＩＣＲリプレッサーに利用することができ、例えば、ＣＡＲでの使用が許容される本明細書に記載されるリンカーを含む。
追加配列
本開示のヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲは、１つ以上の追加のポリペプチドドメインを更に含み得、そのようなドメインには、シグナル配列、エピトープタグ、親和性ドメイン及び検出可能なシグナルを生成するポリペプチドが含まれるが、これらに限定されない。
シグナル配列
当該抑制可能合成ＩＣＲ、例えば、刺激性ＩＣＲまたはＩＣＲリプレッサーでの使用に好適なシグナル配列には、天然シグナル配列、合成（例えば、人工）シグナル配列などを含む、任意の真核生物シグナル配列が含まれる。
エピトープタグ
好適なエピトープタグには、ヘマグルチニン（ＨＡ；例えば、ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９４）、ＦＬＡＧ（例えば、ＤＹＫＤＤＤＤＫ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９５）、ｃ－ｍｙｃ（例えば、ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９６）などが含まれるが、これらに限定されない。
親和性ドメイン
親和性ドメインは、結合パートナー（例えば、同定または精製に有用な固体支持体上に固定されたものなど）と相互作用することができるペプチド配列を含む。発現タンパク質に融合されたヒスチジンなどの複数の連続する単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列を、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムへの高親和性結合による組み換えタンパク質のワンステップ精製に使用することができる。例示的な親和性ドメインには、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９７）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９８）、Ｃ－ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５９９）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６００）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０１）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０２）、ＧＳＴ、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０３）、Ｐｈｅ－Ｈｉｓ－Ｈｉｓ－Ｔｈｒ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：６０４）、キチン結合ドメイン、Ｓペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、
Figure 0007068169000219
、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、レコベリン、Ｓ－モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋ及びカルレチニンに由来するものなどのカルシウム結合ドメイン、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列ならびにマルトース結合タンパク質が含まれる。
検出可能なシグナル生成ポリペプチド
好適な検出可能なシグナル生成タンパク質には、例えば、蛍光タンパク質、検出可能なシグナルを生成物として生成する反応を触媒する酵素などが含まれる。
好適な蛍光タンパク質には、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）またはそのバリアント、ＧＦＰの青色蛍光変異体（ＢＦＰ）、ＧＦＰのシアン蛍光変異体（ＣＦＰ）、ＧＦＰの黄色蛍光変異体（ＹＦＰ）、改良型ＧＦＰ（ＥＧＦＰ）、改良型ＣＦＰ（ＥＣＦＰ）、改良型ＹＦＰ（ＥＹＦＰ）、ＧＦＰＳ６５Ｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、Ｔｏｐａｚ（ＴＹＦＰ）、Ｖｅｎｕｓ、Ｃｉｔｒｉｎｅ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、ＧＦＰｕｖ、不安定化ＥＧＦＰ（ｄＥＧＦＰ）、不安定化ＥＣＦＰ（ｄＥＣＦＰ）、不安定化ＥＹＦＰ（ｄＥＹＦＰ）、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、Ｔ－Ｓａｐｐｈｉｒｅ、ＣｙＰｅｔ、ＹＰｅｔ、ｍＫＯ、ＨｃＲｅｄ、ｔ－ＨｃＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ２、ＤｓＲｅｄモノマー、Ｊ－Ｒｅｄ、ダイマー２、ｔ－ダイマー２（１２）、ｍＲＦＰ１、ポシロポリン、Ｒｅｎｉｌｌａ ＧＦＰ、Ｍｏｎｓｔｅｒ ＧＦＰ、ｐａＧＦＰ、Ｋａｅｄｅタンパク質及びＫｉｎｄｌｉｎｇタンパク質、フィコビリタンパク質及びフィコビリタンパク質結合体（Ｂ－フィコエリトリン、Ｒ－フィコエリトリン及びアロフィコシアニンを含む）が含まれるが、これらに限定されない。蛍光タンパク質の他の例には、ｍＨｏｎｅｙｄｅｗ、ｍＢａｎａｎａ、ｍＯｒａｎｇｅ、ｄＴｏｍａｔｏ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＴａｎｇｅｒｉｎｅ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ１、ｍＲａｓｐｂｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ２、ｍＰｌｕｍ（Ｓｈａｎｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２：９０５－９０９）などが含まれる。花虫類種に由来する種々の蛍光及び有色タンパク質のいずれか、例えば、Ｍａｔｚ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：９６９－９７３に記載されているものなども使用に適している。
好適な酵素には、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β－ガラクトシダーゼ（ＧＡＬ）、グルコース－６－リン酸デヒドロゲナーゼ、β－Ｎ－アセチルグルコサミニダーゼ、β－グルクロニダーゼ、インベルターゼ、キサンチンオキシダーゼ、ホタルルシフェラーゼ、グルコースオキシダーゼ（ＧＯ）などが含まれるが、これらに限定されない。
条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体
いくつかの場合において、本開示の条件付活性ヘテロ二量体ポリペプチドは、条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体である。「条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体」とは、シグナル伝播が、例えば、リガンド結合誘導二量体化による二量体化に天然に依存する細胞表面受容体のバリアントを意味し、バリアントは、二量体化対の１つのメンバーを含み、二量体化物質の存在によって誘導される二量体化対の二量体化に条件的に依存するような改変（例えば、天然細胞表面受容体または他の親細胞表面受容体の改変）を含む。したがって、本開示の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、概して、二量体化対の第２のメンバーを含む細胞表面受容体ポリペプチドと対を形成する二量体化対の第１のメンバーを含む細胞表面受容体ポリペプチドを含み得る。例えば、いくつかの実施形態において、リガンドの存在下で二量体を天然に形成する第１の二量体化依存性細胞表面受容体は、核内ホルモン受容体のＬＢＤを含むように改変され、第２の二量体化依存性細胞表面受容体は、核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むように改変され、これにより、第１の二量体化依存性細胞表面受容体と第２の二量体化依存性細胞表面受容体が、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化するようにする。
いくつかの場合において、第１及び第２の二量体化依存性細胞表面受容体は、同じ二量体化依存性細胞表面受容体であってよく、すなわち、第１及び第２の二量体化依存性細胞表面受容体は、二量体化リガンドの存在下で天然にホモ二量体を形成する。したがって、いくつかの場合において、第１及び第２の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、一方が核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、他方が核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むという点でのみ異なり得る。
いくつかの場合において、第１及び第２の二量体化依存性細胞表面受容体は、異なる二量体化依存性細胞表面受容体であってよく、すなわち、第１及び第２の二量体化依存性細胞表面受容体は、二量体化リガンドの存在下で天然にヘテロ二量体を形成する。したがって、いくつかの場合において、第１及び第２の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、一方のメンバーに存在する核内ホルモン受容体のＬＢＤ及び他方のメンバーに存在する核内ホルモン受容体のコレギュレーター以外の１つ以上のドメインが異なり得る。
「二量体化依存性細胞表面受容体」とは、第２のポリペプチドとの二量体化に依存して細胞内シグナルを伝播する任意の細胞表面受容体ポリペプチドを意味する。二量体化依存性細胞表面受容体は、その天然の状況において、一般に、受容体のリガンド結合に応答して二量体化し得る。有用な二量体化依存性細胞表面受容体には、二量体化してホモ二量体を形成するもの、二量体化してヘテロ二量体を形成するもの、及び二量体化して状況に応じてホモ二量体またはヘテロ二量体を形成するものが含まれる。
本開示の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、様々な方法で構築することができる。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、他の点では未改変の二量体化依存性細胞表面受容体に付加または組み換え的に挿入される。いくつかの場合において、二量体化依存性細胞表面受容体の１つ以上のドメインが、核内ホルモン受容体または核内ホルモン受容体のコレギュレーターで置き換えられる。いくつかの場合において、核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターは、改変された二量体化依存性細胞表面受容体、例えば、その天然リガンド結合活性を除去するか、その天然受容体リガンドに結合できないように（例えば、内因性リガンド結合ドメインの全てまたは一部の欠失、リガンド結合ドメインの変異などにより）改変されている二量体化依存性細胞表面受容体に付加または組み換え的に挿入され得る。いくつかの場合において、二量体化依存性細胞表面受容体の内因性リガンド結合ドメインが、核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターで置き換えられ得る。
例えば、いくつかの実施形態において、サイトカイン受容体の内因性リガンド結合ドメインを当該開示の核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターで置き換えて、条件付活性二量体化依存性サイトカイン受容体を作製することができる。いくつかの実施形態において、サイトカイン受容体の内因性リガンド結合ドメインを完全または部分的に除去することができ、当該開示の核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを、改変されたサイトカイン受容体に付加または挿入して、条件付活性二量体化依存性サイトカイン受容体を作製することができる。
いくつかの実施形態において、ＲＴＫの内因性リガンド結合ドメインを当該開示の核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターで置き換えて、条件付活性二量体化依存性ＲＴＫを作製することができる。いくつかの実施形態において、ＲＴＫの内因性リガンド結合ドメインを完全または部分的に除去することができ、当該開示の核内ホルモン受容体のＬＢＤまたは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを、改変されたＲＴＫに付加または挿入して、条件付活性二量体化依存性ＲＴＫを作製することができる。
サイトカイン受容体
上述のように、二量体化依存性細胞表面受容体の有用な非限定的な例には、例えば、ホモ二量体を形成するサイトカイン受容体及びヘテロ二量体を形成するサイトカイン受容体を含む、サイトカイン受容体が挙げられる。有用なサイトカイン受容体には、例えば、ＩＬ－２ファミリー受容体、ＩＬ－３ファミリー受容体、ＩＬ－６ファミリー受容体、ＩＬ－１２ファミリー受容体、プロラクチンファミリー受容体、インターフェロンファミリー受容体、ＩＬ－１０ファミリー受容体、ＩＬ－１７ファミリー受容体、免疫グロブリン様スーパーファミリー受容体、腫瘍壊死因子ファミリー受容体、ケモカイン受容体、ＴＧＦ－βファミリー受容体などが含まれるが、これらに限定されない。
ＩＬ－２ファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン１３受容体α２、インターロイキン－２受容体サブユニットα、インターロイキン－２受容体サブユニットβ、インターロイキン－２受容体サブユニットγ、インターロイキン－４受容体サブユニットα、インターロイキン－７受容体サブユニットα、インターロイキン９受容体、インターロイキン－１３受容体サブユニットα１、インターロイキン－１５受容体サブユニットα、インターロイキン２１受容体、サイトカイン受容体様因子２などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５３に記載される。
ＩＬ－３ファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン３受容体αサブユニット、インターロイキン５受容体αサブユニット、ＧＭ－ＣＳＦ受容体αサブユニット、サイトカイン受容体共通βサブユニットなどが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５４に記載される。
ＩＬ－６ファミリー受容体の非限定的な例には、レプチン受容体、ＩＬ６Ｒ（インターロイキン－６受容体αサブユニット／インターロイキン６受容体）、ＩＬ６ＳＴ（インターロイキン－６受容体βサブユニット／インターロイキン６シグナル伝達因子）、インターロイキン－１１受容体αサブユニット、インターロイキン２７受容体α、インターロイキン－３１受容体αサブユニット、毛様体神経栄養因子受容体αサブユニット、白血病抑制因子受容体、オンコスタチンＭ特異的受容体βサブユニットなどが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５５に記載される。
ＩＬ－１２ファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン－１２受容体β１サブユニット、インターロイキン－１２受容体β２サブユニット、インターロイキン２３受容体などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５６に記載される。
プロラクチンファミリー受容体の非限定的な例には、エイスロポエチン受容体、顆粒球コロニー刺激因子受容体、成長ホルモン受容体、プロラクチン受容体、トロンボポエチン受容体などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５７に記載される。
インターフェロンファミリー受容体の非限定的な例には、インターフェロンα／β受容体１、インターフェロンα／β受容体２、インターフェロンγ受容体１、インターフェロンγ受容体２などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５８に記載される。
ＩＬ－１０ファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン－２２受容体α２、インターロイキン１０受容体αサブユニット、インターロイキン１０受容体βサブユニット、インターロイキン２０受容体αサブユニット、インターロイキン２０受容体βサブユニット、インターロイキン２２受容体α１サブユニット、インターフェロン－λ受容体サブユニット１などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図５９に記載される。
ＩＬ－１７ファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン１７受容体Ａ、インターロイキン１７受容体Ｂ、インターロイキン１７受容体Ｃ、インターロイキン－１７受容体Ｄ、インターロイキン１７受容体Ｅなどが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図６０に記載される。
免疫グロブリン様スーパーファミリー受容体の非限定的な例には、インターロイキン１受容体Ｉ型、インターロイキン１受容体ＩＩ型、インターロイキン－１受容体様１、インターロイキン－１受容体様２、インターロイキン－１８ １、ＩＬ－１受容体アクセサリータンパク質、ＩＬ－１８受容体アクセサリータンパク質、ＰＤＧＦＲα（血小板由来成長因子受容体α）、ＰＤＧＦＲβ（血小板由来成長因子受容体β）、ＫＩＴがん原遺伝子受容体チロシンキナーゼ、ＣＳＦＲ（コロニー刺激因子１受容体）などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図６１に記載される。
腫瘍壊死因子ファミリー受容体の非限定的な例には、ＴＮＦＲ１（腫瘍壊死因子受容体１／ＴＮＦＲＳＦ１Ａ）、ＴＮＦＲ２（腫瘍壊死因子受容体２／ＴＮＦＲＳＦ１Ｂ）、リンホトキシンβ受容体／ＴＮＦＲＳＦ３、ＯＸ４０／ＴＮＦＲＳＦ４、ＣＤ４０／ＴＮＦＲＳＦ５、Ｆａｓ／ＴＮＦＲＳＦ６、デコイ受容体３／ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＤ２７／ＴＮＦＲＳＦ７、ＣＤ３０／ＴＮＦＲＳＦ８、４－１ＢＢ／ＴＮＦＲＳＦ９、ＤＲ４（細胞死受容体４／ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ）、ＤＲ５（細胞死受容体５／ＴＮＦＲＳＦ１０Ｂ）、デコイ受容体１／ＴＮＦＲＳＦ１０Ｃ、デコイ受容体２／ＴＮＦＲＳＦ１０Ｄ、ＲＡＮＫ（ＮＦ－κＢ活性化受容体／ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ）、ＯＰＧ（オステオプロテゲリン／ＴＮＦＲＳＦ１１Ｂ）、ＤＲ３（細胞死受容体３／ＴＮＦＲＳＦ２５）、ＴＷＥＡＫ受容体／ＴＮＦＲＳＦ１２Ａ、ＴＡＣＩ／ＴＮＦＲＳＦ１３Ｂ、ＢＡＦＦ－Ｒ（ＢＡＦＦ受容体／ＴＮＦＲＳＦ１３Ｃ）、ＨＶＥＭ（ヘルペスウイルス侵入メディエーター／ＴＮＦＲＳＦ１４）、神経成長因子受容体／ＴＮＦＲＳＦ１６、ＢＣＭＡ（Ｂ細胞成熟抗原／ＴＮＦＲＳＦ１７）、ＧＩＴＲ（グルココルチコイド誘導ＴＮＦ受容体／ＴＮＦＲＳＦ１８）、ＴＡＪ（細胞傷害及びＪＮＫインデューサー／ＴＮＦＲＳＦ１９）、ＲＥＬＴ／ＴＮＦＲＳＦ１９Ｌ、ＤＲ６（細胞死受容体６／ＴＮＦＲＳＦ２１）、ＴＮＦＲＳＦ２２、ＴＮＦＲＳＦ２３、エクトジスプラシンＡ２アイソフォーム受容体／ＴＮＦＲＳ２７、エクトジスプラシン１無汗症受容体などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図６２に記載される。
ケモカイン受容体の非限定的な例には、ＣＣＲ１、ＣＣＲ２、ＣＣＲ３、ＣＣＲ４、ＣＣＲ５、ＣＣＲ６、ＣＣＲ７、ＣＣＲ８、ＣＣＲ９、ＣＣＲ１０、ＣＸＣＲ１（ＩＬ８Ｒａ）、ＣＸＣＲ２（ＩＬ８Ｒｂ）、ＣＸＣＲ３、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ５、ＣＸＣＲ６、ＣＸ３ＣＲ１などが挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図６３に記載される。
ＴＧＦ－βファミリー受容体の非限定的な例には、トランスフォーミング増殖因子β受容体Ｉ型（ＴＧＦＢＲ１（ＡＬＫ５））、トランスフォーミング増殖因子β受容体ＩＩ型（ＴＧＦＢＲ２（ＭＦＳ２））及びトランスフォーミング増殖因子β受容体ＩＩＩ型（ＴＧＦＢＲ３（β－グリカン））が挙げられる。当該例のアミノ酸配列は、図６４に記載される。
受容体チロシンキナーゼ
上述のように、二量体化依存性細胞表面受容体の有用な非限定的な例には、例えば、ホモ二量体を形成するＲＴＫ及びヘテロ二量体を形成するＲＴＫを含む、受容体チロシンキナーゼ（ＲＴＫ）が挙げられる。有用なＲＴＫには、例えば、ＭＥＲＴＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００６３３４）、ＬＭＴＫ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０７３９０３）、ＣＳＦ１Ｒ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１２７５６３４）、ＥＧＦＲ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５２１９）、ＥＰＨＡ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４２２）、ＥＰＨＡ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５２２３）、ＥＰＨＡ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５２２４）、ＥＰＨＡ４（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１２９１４６５）、ＥＰＨＡ５（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３０）、ＥＰＨＡ７（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３１）、ＥＰＨＡ８（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０６５３８７）、ＥＰＨＢ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３２）、ＥＰＨＢ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１２９６１２２）、ＥＰＨＢ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３４）、ＥＰＨＢ４（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３５）、ＥＰＨＢ６（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３６）、ＥＲＢＢ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４４３９）、ＥＲＢＢ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１９７３）、ＥＲＢＢ４（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５２２６）、ＦＧＦＲ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０７５５９８）、ＦＧＦＲ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００１３３）、ＦＧＦＲ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００１３２）、ＦＧＦＲ４（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２００２）、ＬＭＴＫ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０５５７３１）、ＦＬＴ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２０１０）、ＦＬＴ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４１１０）、ＦＬＴ４（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿８９１５５５）、ＡＬＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４２９５）、ＥＰＨＡ１０（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０９２９０９）、ＥＰＨＡ６（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１２６５２２９）、ＩＧＦ１Ｒ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００８６６）、ＩＮＳＲ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００１９９）、ＩＮＳＲＲ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０５５０３０）、ＫＤＲ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２２４４）、ＫＩＴ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００２１３）、ＬＴＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２３３５）、ＭＥＴ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００２３６）、ＭＳＴ１Ｒ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２４３８）、ＭＵＳＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５５８３）、ＮＴＲＫ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２５２０）、ＮＴＲＫ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０１８０７４）、ＮＴＲＫ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０１２３３８）、ＲＯＲ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５００３）、ＲＯＲ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００４５５１）、ＤＤＲ２（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０１４７９６）、ＰＤＧＦＲＡ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００６１９７）、ＰＤＧＦＲＢ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２６００）、ＡＸＬ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０６８７１３）、ＰＴＫ７（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２８１２）、ＲＥＴ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０６６１２４）、ＲＯＳ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２９３５）、ＲＹＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００２９４９）、ＴＥＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿０００４５０）、ＴＩＥ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００５４１５）、ＴＹＲＯ３（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００６２８４）、ＤＤＲ１（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１２８４５８３）、ＡＡＴＫ（ＲｅｆＳｅｑアクセッション番号ＮＰ＿００１０７３８６４）などが含まれるが、これらに限定されない。当該例のアミノ酸配列は、図６５に記載される。
二量体化対
上述のように、本開示の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、概して、二量体化対の第２のメンバーを含む第２の細胞表面受容体ポリペプチドと条件付きで二量体化可能な二量体化対の第１のメンバーを含む細胞表面受容体ポリペプチドを含み得る。したがって、本開示の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、核内ホルモン受容体のＬＢＤまたはコレギュレーターペプチドを含む二量体化対のメンバーを含み得る。２つの条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、一方の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体が、核内ホルモン受容体のＬＢＤを含む二量体化対の第１のメンバーを含み、他方の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体が、同じ核内ホルモン受容体のコレギュレーターペプチドを含む二量体化対の第２のメンバーを含むシステムとして利用することができる。二量体化対の第１及び第２のメンバーは、二量体化物質（例えば、核内ホルモンまたは核内ホルモンの機能的誘導体もしくはアナログ；本明細書中、「二量体化因子」とも称される）の存在下で、互いに結合し得、２つの条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体ポリペプチドの二量体化をもたらし得る。二量体化対の第１のメンバーまたは二量体化対の第２のメンバーは、「二量体化ドメイン」と称されることもある。
核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメインは、上に述べたものを含むがこれらに限定されない、種々の核内ホルモン受容体のいずれかであり得る。好適なコレギュレーターポリペプチドは、完全長の天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、天然核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドの断片を含む。好適なコレギュレーターポリペプチドは、合成または組み換え核内ホルモンコレギュレーターポリペプチドを含む。好適なコレギュレーターポリペプチドの非限定的な例には、上に述べたものが挙げられる。
核酸
本開示は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。単一の核酸分子は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの２つ以上の部分をコードする複数の配列を含み得る。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの２つ以上の部分は、複数の個々の核酸分子（例えば、複数の核酸ベクター）にわたって分離され得る。本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸は、いくつかの実施形態において、例えば、組み換え発現ベクターを含む、ＤＮＡであり得る。本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸は、いくつかの実施形態において、ＲＮＡ、例えば、ｉｎ ｖｉｔｒｏ合成ＲＮＡであり得る。
いくつかの場合において、本開示の核酸は、第１の部分のみ、例えば、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの第１のポリペプチド鎖のみをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、本開示の核酸は、第２の部分のみ、例えば、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの第２のポリペプチド鎖のみをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、本開示の核酸は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの両方のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む。
いくつかの場合において、本開示の単一の核酸は、本開示の２つ以上の条件付活性ポリペプチドをコードする１つ以上のヌクレオチド配列を含み得る。例えば、いくつかの場合において、本開示の核酸は、二量体化対の第１のメンバーを含む第１の条件付活性ポリペプチドと、二量体化対の第２のメンバーを含む第２の条件付活性ポリペプチドとをコードし得る。いくつかの実施形態において、本開示の核酸は、二量体化対の第１のメンバーを含む第１の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体と、二量体化対の第２のメンバーを含む第２の条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体とをコードする１つまたは複数の配列を含み得る。いくつかの実施形態において、２つの条件付活性二量体化依存性細胞表面受容体は、それぞれ二量体化対の半分を含有するが、別々の核酸上に存在する配列によってコードされてもよい。
いくつかの場合において、当該核酸は、例えば、哺乳動物細胞における、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの産生を提供する。他の場合において、当該核酸は、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードする核酸の増幅を提供する。
本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えば、プロモーター及びエンハンサーなどに機能的に連結され得る。いくつかの場合において、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードする核酸は、目的とする特定の細胞種での発現のために、組織特異的プロモーターに機能的に連結される。例えば、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは、１つ以上の免疫細胞種における特異的発現のために、免疫細胞特異的プロモーターに機能的に連結され得る。他の場合において、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは、例えば、ユビキタスプロモーター、構成的プロモーター、異種プロモーター、制御性プロモーター（例えば、誘導性プロモーター、可逆的プロモーターなど）などを含む、一般的な（すなわち、非免疫細胞特異的）プロモーターに機能的に連結され得る。
一般的なプロモーター
好適なプロモーター及びエンハンサーの要素は、当該技術分野において知られている。細菌細胞における発現の場合、好適なプロモーターには、ｌａｃＩ、ｌａｃＺ、Ｔ３、Ｔ７、ｇｐｔ、λＰ及びｔｒｃが含まれるが、これらに限定されない。真核細胞における発現の場合、好適なプロモーターには、サイトメガロウイルス前初期プロモーター、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼプロモーター、初期及び後期ＳＶ４０プロモーター、レトロウイルス由来の長い末端リピート中に存在するプロモーター、マウスメタロチオネインＩプロモーター、ならびに当該技術分野において既知の様々なプロモーターが含まれるが、これらに限定されない。
原核生物宿主細胞での使用に好適なプロモーターには、バクテリオファージＴ７ ＲＮＡポリメラーゼプロモーター；ｔｒｐプロモーター；ｌａｃオペロンプロモーター；ハイブリッドプロモーター、例えば、ｌａｃ／ｔａｃハイブリッドプロモーター、ｔａｃ／ｔｒｃハイブリッドプロモーター、ｔｒｐ／ｌａｃプロモーター、Ｔ７／ｌａｃプロモーター；ｔｒｃプロモーター；ｔａｃプロモーターなど；ａｒａＢＡＤプロモーター；ｉｎ ｖｉｖｏ調節プロモーター、例えば、ｓｓａＧプロモーターまたは関連するプロモーター（例えば、米国特許出願公開第２００４０１３１６３７号参照）、ｐａｇＣプロモーター（Ｐｕｌｋｋｉｎｅｎ ａｎｄ Ｍｉｌｌｅｒ，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．，１９９１：１７３（１）：８６－９３；Ａｌｐｕｃｈｅ－Ａｒａｎｄａ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，１９９２；８９（２１）：１００７９－８３）、ｎｉｒＢプロモーター（Ｈａｒｂｏｒｎｅ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏ．６：２８０５－２８１３）及び同等物（例えば、Ｄｕｎｓｔａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．６７：５１３３－５１４１；ＭｃＫｅｌｖｉｅ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｖａｃｃｉｎｅ ２２：３２４３－３２５５、及びＣｈａｔｆｉｅｌｄ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１０：８８８－８９２参照）；シグマ７０プロモーター、例えば、コンセンサスシグマ７０プロモーター（例えば、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＸ７９８９８０、ＡＸ７９８９６１及びＡＸ７９８１８３参照）；静止期プロモーター、例えば、ｄｐｓプロモーター、ｓｐｖプロモーターなど；病原性アイランドＳＰＩ－２に由来するプロモーター（例えば、ＷＯ９６／１７９５１参照）；ａｃｔＡプロモーター（例えば、Ｓｈｅｔｒｏｎ－Ｒａｍａ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．７０：１０８７－１０９６参照；ｒｐｓＭプロモーター（例えば、Ｖａｌｄｉｖｉａ ａｎｄ Ｆａｌｋｏｗ（１９９６）．Ｍｏｌ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２２：３６７参照）；ｔｅｔプロモーター（例えば、Ｈｉｌｌｅｎ，Ｗ．ａｎｄ Ｗｉｓｓｍａｎｎ，Ａ．（１９８９）Ｉｎ Ｓａｅｎｇｅｒ，Ｗ．ａｎｄ Ｈｅｉｎｅｍａｎｎ，Ｕ．（ｅｄｓ），Ｔｏｐｉｃｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｐｒｏｔｅｉｎ－Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ．Ｍａｃｍｉｌｌａｎ，Ｌｏｎｄｏｎ，ＵＫ，Ｖｏｌ．１０，ｐｐ．１４３－１６２参照）；ＳＰ６プロモーター（例えば、Ｍｅｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９８４）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１２：７０３５）などが含まれるが、これらに限定されない。大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）などの原核生物での使用に好適な強いプロモーターには、Ｔｒｃ、Ｔａｃ、Ｔ５、Ｔ７及びＰλが含まれるが、これらに限定されない。細菌宿主細胞での使用のためのオペレーターの非限定的な例には、ラクトースプロモーターオペレーター（ＬａｃＩリプレッサータンパク質は、ラクトースと接触すると立体構造を変え、これにより、ＬａｃＩリプレッサータンパク質がオペレーターに結合することを妨げる）、トリプトファンプロモーターオペレーター（ＴｒｐＲリプレッサータンパク質は、トリプトファンと接触すると、オペレーターに結合する立体構造を取り、トリプトファンの非存在下では、ＴｒｐＲリプレッサータンパク質は、オペレーターに結合しない立体構造を有する）及びｔａｃプロモーターオペレーター（例えば、ｄｅＢｏｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９８３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８０：２１－２５参照）が挙げられる。
好適な可逆的プロモーターは、可逆的誘導性プロモーターを含め、当該技術分野において知られている。そのような可逆的プロモーターは、多くの生物、例えば、真核生物及び原核生物から単離され得、これらに由来し得る。第１の生物に由来する可逆的プロモーターを第２の生物で使用するために改変すること（例えば、第１の原核生物及び第２の真核生物、第１の真核生物及び第２の原核生物など）は、当該技術分野においてよく知られている。そのような可逆的プロモーター、及びそのような可逆的プロモーターをベースにするが、追加の制御タンパク質も含むシステムには、アルコール調節プロモーター（例えば、アルコールデヒドロゲナーゼＩ（ａｌｃＡ）遺伝子プロモーター、アルコールトランス活性化因子タンパク質（ＡｌｃＲ）に応答するプロモーターなど）、テトラサイクリン調節プロモーター（例えば、Ｔｅｔ活性化因子、ＴｅｔＯＮ、ＴｅｔＯＦＦなどを含むプロモーターシステム）、ステロイド調節プロモーター（例えば、ラットグルココルチコイド受容体プロモーターシステム、ヒトエストロゲン受容体プロモーターシステム、レチノイドプロモーターシステム、甲状腺プロモーターシステム、エクジソンプロモーターシステム、ミフェプリストンプロモーターシステムなど）、金属調節プロモーター（例えば、メタロチオネインプロモーターシステムなど）、病因関連調節プロモーター（例えば、サリチル酸調節プロモーター、エチレン調節プロモーター、ベンゾチアジアゾール調節プロモーターなど）、温度調節プロモーター（例えば、ヒートショック誘導性プロモーター（例えば、ＨＳＰ－７０、ＨＳＰ－９０、ダイズヒートショックプロモーターなど）、光調節プロモーター、合成誘導性プロモーターなどが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、例えば、酵母細胞における発現のための好適なプロモーターは、ＡＤＨ１プロモーター、ＰＧＫ１プロモーター、ＥＮＯプロモーター、ＰＹＫ１プロモーターなどの構成的プロモーター、またはＧＡＬ１プロモーター、ＧＡＬ１０プロモーター、ＡＤＨ２プロモーター、ＰＨＯ５プロモーター、ＣＵＰ１プロモーター、ＧＡＬ７プロモーター、ＭＥＴ２５プロモーター、ＭＥＴ３プロモーター、ＣＹＣ１プロモーター、ＨＩＳ３プロモーター、ＡＤＨ１プロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＧＡＰＤＨプロモーター、ＡＤＣ１プロモーター、ＴＲＰ１プロモーター、ＵＲＡ３プロモーター、ＬＥＵ２プロモーター、ＥＮＯプロモーター、ＴＰ１プロモーター及びＡＯＸ１（例えば、ピキア属における使用）などの制御性プロモーターである。適切なベクター及びプロモーターの選択は、十分に当業者の技術レベルの範囲内である。
免疫細胞プロモーター
いくつかの場合において、本開示の核酸は、限定するものではないが、リンパ球、造血幹細胞及び／またはその子孫（すなわち、免疫細胞子孫）などを含む、１つ以上の免疫細胞種で発現される免疫細胞特異的プロモーターを含む。任意の簡便かつ適切な免疫細胞特異的遺伝子プロモーターが本開示の核酸において有用であり得る。いくつかの場合において、本開示の核酸の免疫細胞特異的プロモーターは、Ｔ細胞特異的プロモーターであり得る。いくつかの場合において、本開示の核酸の免疫細胞特異的プロモーターは、軽鎖及び／または重鎖免疫グロブリン遺伝子プロモーターであり得、１つ以上の関連するエンハンサー要素を含んでもよいし、含まなくてもよい。
いくつかの場合において、本開示の核酸の免疫細胞特異的プロモーターは、Ｂ２９遺伝子プロモーター、ＣＤ１４遺伝子プロモーター、ＣＤ４３遺伝子プロモーター、ＣＤ４５遺伝子プロモーター、ＣＤ６８遺伝子プロモーター、ＩＦＮ－β遺伝子プロモーター、ＷＡＳＰ遺伝子プロモーター、Ｔ細胞受容体β鎖遺伝子プロモーター、Ｖ９γ（ＴＲＧＶ９）遺伝子プロモーター、Ｖ２δ（ＴＲＤＶ２）遺伝子プロモーターなどのプロモーターであり得る。
いくつかの場合において、本開示の核酸の免疫細胞特異的プロモーターは、免疫細胞で発現されるウイルスプロモーターであり得る。したがって、いくつかの場合において、本開示の核酸において有用なウイルスプロモーターには、免疫細胞ウイルスに由来するウイルスプロモーターが含まれ、例えば、レンチウイルスプロモーター（例えば、ＨＩＶ、ＳＩＶ、ＦＩＶ、ＥＩＡＶまたはビスナプロモーター）（例えば、ＬＴＲプロモーターなどを含む）、レトロウイルス科プロモーター（例えば、ＨＴＬＶ－Ｉプロモーター、ＨＴＬＶ－ＩＩプロモーターなどを含む）などが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、プロモーターは、ＣＤ８細胞特異的プロモーター、ＣＤ４細胞特異的プロモーター、好中球特異的プロモーターまたはＮＫ特異的プロモーターである。例えば、ＣＤ４遺伝子プロモーターを使用することができ、例えば、Ｓａｌｍｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：７７３９、及びＭａｒｏｄｏｎ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｂｌｏｏｄ １０１：３４１６を参照されたい。別の例として、ＣＤ８遺伝子プロモーターを使用することができる。ＮＫ細胞特異的発現は、Ｎｃｒ１（ｐ４６）プロモーターの使用によって達成することができ、例えば、Ｅｃｋｅｌｈａｒｔ ｅｔ ａｌ．（２０１１）Ｂｌｏｏｄ １１７：１５６５を参照されたい。
更なる核酸要素、構築物及びその使用
いくつかの場合において、好適なプロモーターを含有する遺伝子座または構築物または導入遺伝子は、誘導性システムの誘導によって不可逆的に切り替えられる。不可逆的切り替えの誘導に好適なシステムは、当該技術分野においてよく知られている。例えば、不可逆的切り替えの誘導は、Ｃｒｅ－ｌｏｘ媒介組み換えを利用することができる（例えば、Ｆｕｈｒｍａｎｎ－Ｂｅｎｚａｋｅｉｎ，ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ（２０００）２８：ｅ９９参照；当該開示を参照により本明細書に援用する）。当業者に知られているリコンビナーゼ、エンドヌクレアーゼ、リガーゼ、組み換え部位などの任意の好適な組み合わせを、不可逆に的切り替え可能なプロモーターの作製に使用することができる。本明細書に別途記載される、部位特異的組み換えを実施するための方法、機序及び要件は不可逆的切り替えプロモーターの作製に有用であり、また当該技術分野においてよく知られている。例えば、Ｇｒｉｎｄｌｅｙ ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｎｎｕａｌ Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，５６７－６０５及びＴｒｏｐｐ（２０１２）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｊｏｎｅｓ＆Ｂａｒｔｌｅｔｔ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｓｕｄｂｕｒｙ，ＭＡ）（これらの開示を参照により本明細書に援用する）を参照されたい。
当該ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、発現ベクター及び／またはクローニングベクター中に存在し得る。当該ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドが２つ以上の別個のポリペプチドの間で分割される場合、２つ以上のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、同じまたは別個のベクター中にクローニングされ得る。発現ベクターは、選択マーカー、複製起点、ならびに複製及び／またはベクターの維持を提供する他の特徴を含み得る。好適な発現ベクターには、例えば、プラスミド、ウイルスベクターなどが含まれる。
多数の好適なベクター及びプロモーターが当業者に知られており、多くは、当該組み換え構築物を作製するのに、商業的に入手可能である。次のベクターを例として記載する。細菌：ｐＢｓ、ファージスクリプト、ＰｓｉＸ１７４、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ、ｐＢｓＫＳ、ｐＮＨ８ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８ａ、ｐＮＨ４６ａ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ（Ｌａ Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．，ＵＳＡ））；ｐＴｒｃ９９Ａ、ｐＫＫ２２３－３、ｐＫＫ２３３－３、ｐＤＲ５４０及びｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ（Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ））。真核生物：ｐＷＬｎｅｏ、ｐＳＶ２ｃａｔ、ｐＯＧ４４、ＰＸＲ１、ｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）ｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ及びｐＳＶＬ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）。
発現ベクターは、一般に、プロモーター配列の近くに位置する簡便な制限部位を有し、異種タンパク質をコードする核酸配列の挿入をもたらす。発現宿主において機能する選択マーカーが存在してもよい。好適な発現ベクターには、ウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス、ポリオウイルス、アデノウイルスをベースにするウイルスベクター（例えば、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３５：２５４３ ２５４９，１９９４；Ｂｏｒｒａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ６：５１５ ５２４，１９９９；Ｌｉ ａｎｄ Ｄａｖｉｄｓｏｎ，ＰＮＡＳ ９２：７７００ ７７０４，１９９５；Ｓａｋａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｈ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ５：１０８８ １０９７，１９９９；ＷＯ９４／１２６４９、ＷＯ９３／０３７６９、ＷＯ９３／１９１９１、ＷＯ９４／２８９３８、ＷＯ９５／１１９８４及びＷＯ９５／００６５５参照）、アデノ随伴ウイルス（例えば、Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ９：８１ ８６，１９９８、Ｆｌａｎｎｅｒｙ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：６９１６ ６９２１，１９９７；Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３８：２８５７ ２８６３，１９９７；Ｊｏｍａｒｙ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ４：６８３ ６９０，１９９７、Ｒｏｌｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ １０：６４１ ６４８，１９９９；Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ ５：５９１ ５９４，１９９６；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ＷＯ９３／０９２３９、Ｓａｍｕｌｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．（１９８９）６３：３８２２－３８２８；Ｍｅｎｄｅｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｖｉｒｏｌ．（１９８８）１６６：１５４－１６５、及びＦｌｏｔｔｅ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ（１９９３）９０：１０６１３－１０６１７参照）、ＳＶ４０、単純ヘルペスウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（例えば、Ｍｉｙｏｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ９４：１０３１９ ２３，１９９７；Ｔａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ ７３：７８１２ ７８１６，１９９９参照）；レトロウイルスベクター（例えば、マウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ならびにラウス肉腫ウイルス、Ｈａｒｖｅｙ肉腫ウイルス、トリ白血病ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルス及び乳腺腫瘍ウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクター）などが含まれるが、これらに限定されない。
上述のように、いくつかの実施形態において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸は、いくつかの実施形態において、ＲＮＡ、例えば、ｉｎ ｖｉｔｒｏ合成ＲＮＡであり得る。ＲＮＡのｉｎ ｖｉｔｒｏ合成の方法は、当該技術分野において知られており任意の既知の方法を使用して、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを合成することができる。ＲＮＡを宿主細胞に導入するための方法は、当該技術分野において知られている。例えば、Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ．（２０１０）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１５：９０５３を参照されたい。本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを宿主細胞に導入することは、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｖｏで実施することができる。例えば、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの第１及び／または第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを用いて、宿主細胞（例えば、ＮＫ細胞、細胞傷害性Ｔリンパ球など）のエレクトロポレーションをｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで行うことができる。
細胞
本開示は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを生成するように遺伝子改変された哺乳動物細胞を提供する。
好適な哺乳動物細胞には、初代細胞及び不死化細胞株が含まれる。好適な哺乳動物細胞株には、ヒト細胞株、非ヒト霊長類細胞株、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）細胞株などが含まれる。好適な哺乳動物細胞株には、ＨｅＬａ細胞（例えば、米国培養細胞系統保存機関（ＡＴＣＣ）番号ＣＣＬ－２）、ＣＨＯ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ９６１８、ＣＣＬ６１、ＣＲＬ９０９６）、２９３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１５７３）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ－１６５８）、Ｈｕｈ－７細胞、ＢＨＫ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＣＬ１０）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１７２１）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ－７細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１６５１）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＣＬＩ．３）、ヒト胎児腎細胞（ＨＥＫ）（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１５７３）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞、Ｈｕｔ－７８、Ｊｕｒｋａｔ、ＨＬ－６０、ＮＫ細胞株（例えば、ＮＫＬ、ＮＫ９２及びＹＴＳ）などが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの場合において、好適な細胞には、Ｔｈｅｍｅｌｉ ｅｔ ａｌ．Ｃｅｌｌ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌ．２０１５ Ａｐｒ ２；１６（４）：３５７－６６（当該開示の全体を参照により本明細書に援用する）に記載されているものが含まれる。
いくつかの場合において、細胞は、不死化細胞株ではなく、個体から得られた細胞（例えば、初代細胞）である。例えば、いくつかの場合において、細胞は、個体から得られた免疫細胞、免疫細胞の前駆細胞または免疫幹細胞である。一例として、細胞は、個体から得られたＴリンパ球またはその前駆細胞である。別の例として、細胞は、個体から得られた細胞傷害性細胞またはその前駆細胞である。別の例として、細胞は、個体から得られた幹細胞または前駆細胞である。
有用性
本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは、様々な研究及び治療法に有用であり、これらについて本明細書で提供される。
いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドが、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド中に存在するときには個別には活性を示さないが、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドのＬＢＤのコレギュレーターペプチドへの結合を誘導する二量体化物質の存在下では活性を示す、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドを含む場合、本開示は、活性を活性化させる方法を提供する。したがって、例えば、本開示は、ポリペプチドを活性化させる（ポリペプチドの活性を誘導する）方法であって、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを二量体化物質と接触させることを含み、ポリペプチドは、ヘテロ二量体ポリペプチド中に、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドとして存在し、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドは、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド中に存在しているときに個別には活性を示さないが、二量体化物質の存在下では活性を示す、方法を提供する。誘導される活性は、第１の異種ポリペプチド及び第２の異種ポリペプチドの性質に依存する。例えば、第１の異種ポリペプチドと第２の異種ポリペプチドがそれぞれ受容体と共受容体である場合、活性は、受容体の共受容体への結合、または受容体の共受容体への結合から生じる下流の活性であり得る。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを接触させることは、ｉｎ ｖｉｔｒｏで生じ、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは細胞中に存在しない。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを接触させることは、ｉｎ ｖｉｔｒｏの細胞で生じ、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは細胞中に存在する。いくつかの場合において、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを接触させることは、ｉｎ ｖｉｖｏの細胞で生じ、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは細胞中に存在する。
細胞の活性を調節するための方法
本開示は、細胞の活性を調節（活性化、抑制化）するための方法を提供する。方法は、概して、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを発現する細胞を二量体化物質と接触させることを伴う。いくつかの場合において、方法は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを発現する細胞を二量体化物質及び第２の物質（例えば、抗原）と接触させることを伴う。
免疫細胞を活性化する方法
本開示は、免疫細胞を活性化する方法を提供し、免疫細胞は、本開示のオンスイッチＣＡＲを発現する。本開示は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｉｎ ｖｉｖｏ、またはｅｘ ｖｉｖｏで免疫細胞を活性化する方法を提供する。方法は、概して、免疫細胞を（ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｉｎ ｖｉｖｏ、またはｅｘ ｖｉｖｏで）二量体化物質及び抗原と接触させることを伴い、免疫細胞は、本開示のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲを生成するように遺伝子改変されている。ヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲは、二量体化物質及び抗原の存在下で二量体化し、免疫細胞を活性化し、これにより、活性化された免疫細胞をもたらす。免疫細胞には、例えば、細胞障害性Ｔリンパ球、ＮＫ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）などが含まれる。
遺伝子改変された免疫細胞（例えば、Ｔリンパ球、ＮＫ細胞）を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバー（例えば、抗原、リガンド、受容体）と接触させることは、免疫細胞によるサイトカイン産生を、特異的結合対の第２のメンバー及び／または二量体化物質の非存在下で免疫細胞によって産生されるサイトカインの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させ得る。産生が増加し得るサイトカインには、ＩＬ－２及びＩＦＮ－γが含まれるが、これらに限定されない。
遺伝子改変された免疫細胞（例えば、Ｔリンパ球、ＮＫ細胞）を二量体化物質及び抗原と接触させることは、免疫細胞によるサイトカインの産生を、抗原及び／または二量体化物質の非存在下で免疫細胞によって産生されるサイトカインの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させ得る。産生が増加し得るサイトカインには、ＩＬ－２及びＩＦＮ－γが含まれるが、これらに限定されない。
遺伝子改変された細胞傷害性細胞（例えば、細胞傷害性Ｔリンパ球）を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバー（例えば、抗原、リガンド、受容体）と接触させることは、細胞傷害性細胞の細胞傷害活性を、二量体化物質の非存在下における細胞傷害性細胞の細胞傷害活性と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させ得る。
遺伝子改変された細胞傷害性細胞（例えば、細胞傷害性Ｔリンパ球）を二量体化物質及び抗原と接触させることは、細胞傷害性細胞の細胞傷害活性を、二量体化物質の非存在下における細胞傷害性細胞の細胞傷害活性と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させ得る。
他の実施形態において、遺伝子改変された宿主細胞を二量体化物質及び抗原と接触させることにより、例えば、宿主免疫細胞に応じて、細胞増殖、細胞生存、細胞死などが増加または減少し得る。
本開示は、条件付きで活性化可能な細胞をもたらす方法を提供する。方法は、概して、本開示のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターまたはＲＮＡ（例えば、ｉｎ ｖｉｔｒｏ転写ＲＮＡ）を用いて哺乳動物細胞を遺伝子改変することを伴う。遺伝子改変された細胞は、ａ）ＣＡＲの第１のポリペプチドが結合する抗原、及びｂ）二量体化因子（二量体化物質）の存在下で、条件付きで活性化可能である。遺伝子改変は、ｉｎ ｖｉｖｏ、ｉｎ ｖｉｔｒｏ、またはｅｘ ｖｉｖｏで実施することができる。細胞は、免疫細胞（例えば、Ｔリンパ球またはＮＫ細胞）、幹細胞、前駆細胞などであり得る。
いくつかの場合において、遺伝子改変は、ｅｘ ｖｉｖｏで実施される。例えば、個体からＴリンパ球、幹細胞またはＮＫ細胞が得られ、個体から得られた細胞は、本開示のＣＡＲを発現するように遺伝子改変される。遺伝子改変された細胞は、ａ）ＣＡＲの第１のポリペプチドが結合する抗原、及びｂ）二量体化因子の存在下で、条件付きで活性化可能である。いくつかの場合において、遺伝子改変された細胞は、ｅｘ ｖｉｖｏで活性化される。他の場合において、遺伝子改変された細胞は、個体（例えば、当該細胞を得た個体）に導入され、遺伝子改変された細胞は、例えば、個体に二量体化因子を投与することによって、ｉｎ ｖｉｖｏで活性化される。例えば、抗原が個体の細胞の表面上に存在する場合、抗原を投与する必要はない。遺伝子改変された細胞は、個体の細胞の表面上に存在する抗原と接触し、二量体化因子を個体に投与すると、遺伝子改変された細胞が活性化される。例えば、遺伝子改変された細胞がＴリンパ球である場合、遺伝子改変された細胞は、細胞表面上にＣＡＲが結合する抗原を提示する細胞に対して、細胞傷害性を示し得る。
免疫細胞の活性化を抑制する方法
本開示は、免疫細胞活性化を抑制する方法を提供し、かかる方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｉｎ ｖｉｖｏ、またはｅｘ ｖｉｖｏで適用可能である。方法は、概して、免疫細胞（ｉｎ ｖｉｔｒｏ、ｉｎ ｖｉｖｏ、またはｅｘ ｖｉｖｏで）を二量体化因子と接触させることを伴い、免疫細胞は、本開示のヘテロマー条件付抑制可能合成ＩＣＲを生成するように遺伝子改変される。ヘテロマー条件付抑制可能ＩＣＲは、二量体化因子の存在下で二量体化し、免疫細胞の活性化を抑制し、これにより、抑制された免疫細胞をもたらす。免疫細胞には、例えば、細胞障害性Ｔリンパ球、ＮＫ細胞、ＣＤ４＋Ｔ細胞、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）などが含まれる。
遺伝子改変された免疫細胞（例えば、Ｔリンパ球、ＮＫ細胞）を二量体化物質と接触させることは、免疫細胞によるリンパ球細胞表面抗原の発現、例えば、免疫細胞活性化、Ｔ細胞活性化を示す細胞表面抗原などの発現を、二量体化物質の非存在下で活性化免疫細胞によって発現される細胞表面抗原の量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて抑制し得る。産生が抑制され得るリンパ球細胞表面抗原には、例えば、ＣＤ６９が含まれるが、これらに限定されない。
遺伝子改変された免疫細胞（例えば、Ｔリンパ球、ＮＫ細胞）を二量体化物質と接触させることは、免疫細胞によるサイトカインの産生を、二量体化物質の非存在下で活性化免疫細胞によって産生されるサイトカインの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて抑制し得る。産生が抑制され得るサイトカインには、ＩＬ－２及びＩＦＮ－γが含まれるが、これらに限定されない。
製剤、用量及び投与経路
上に論じたように、本開示の治療法は、有効量の二量体化因子物質を、それを必要とする個体に投与することを伴い、また抗原の投与も伴い得る。
二量体化因子物質の「有効量」は、いくつかの場合において、１以上の用量がそれを必要とする個体に投与されたとき、当該ＣＡＲを発現するＴリンパ球の細胞傷害活性のレベルを、二量体化因子物質の非存在下におけるＴリンパ球の細胞傷害活性と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させる量である。
二量体化因子物質の「有効量」は、いくつかの場合において、１以上の用量がそれを必要とする個体に投与されたとき、当該ＣＡＲを発現するＮＫ細胞の細胞傷害活性のレベルを、二量体化物質の非存在下におけるＮＫ細胞の細胞傷害活性と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、または１０倍を超えて増加させる量である。
二量体化因子物質の「有効量」は、いくつかの場合において、１以上の用量がそれを必要とする個体に投与されたとき、二量体化物質の非存在下におけるがん細胞の数及び／または腫瘍量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、または７５％を超えて、個体におけるがん細胞の数を減少させ、かつ／または個体における腫瘍量を減少させる量である。
いくつかの実施形態において、二量体化因子の有効量は、１以上の用量が単独（例えば、単剤療法）、または１つ以上の追加の治療薬との組み合わせ（例えば、併用療法）で投与されたとき、腫瘍成長速度、がん細胞数及び腫瘍量のうちの１つ以上を、二量体化因子での治療が行われない状態での腫瘍成長速度、がん細胞数または腫瘍量と比較して、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％またはそれを超えて減少させるのに有効な量である。
製剤
当該方法において、二量体化因子は、所望の治療効果または診断効果をもたらすことのできる任意の簡便な手段を使用して、宿主に投与することができる。したがって、二量体化因子は、治療的投与のための様々な製剤に組み込むことができる。より具体的には、二量体化因子は、適切な薬学的に許容される担体または希釈剤との組み合わせにより医薬組成物に製剤化することができ、錠剤、カプセル剤、散剤、顆粒剤、軟膏剤、液剤、坐剤、注射剤、吸入剤及びエアゾール剤などの固体、半固体、液体または気体形態の調製物に製剤化され得る。
医薬品の剤形において、二量体化因子は、その薬学的に許容される塩の形態で投与されてもよいし、単独または適切な会合形態で、及び他の薬学的に活性な化合物との組み合わせで使用することもできる。以下の方法及び賦形剤は、単なる例示であり、決して限定的なものではない。
好適な賦形剤ビヒクルは、例えば、水、生理食塩水、ブドウ糖、グリセロール、エタノールなど及びこれらの組み合わせである。加えて、所望により、ビヒクルは、湿潤剤もしくは乳化剤またはｐＨ緩衝剤などの少量の補助物質を含有してもよい。そのような剤形を調製する実際の方法は、当業者にはよく知られており、または明白であろう。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ'ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ，１７ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，１９８５を参照されたい。投与される組成物または製剤は、任意の事象において、治療がなされる対象において所望の状態を達成するのに十分な量の二量体化因子を含有し得る。
ビヒクル、補助剤、担体または希釈剤などの薬学的に許容される賦形剤は、一般に容易に入手可能である。更に、ｐＨ調整剤及び緩衝剤、等張化剤、安定剤、湿潤剤などの薬学的に許容される補助物質も一般に容易に入手可能である。
経口用調製物の場合、二量体化因子は、単独で、または適切な添加剤、例えば、ラクトース、マンニトール、トウモロコシデンプンまたはジャガイモデンプンなどの従来の添加剤；結晶性セルロース、セルロース誘導体、アラビアゴム、トウモロコシデンプンまたはゼラチンなどの結合剤；トウモロコシデンプン、ジャガイモデンプンまたはカルボキシメチルセルロースナトリウムなどの崩壊剤；タルクまたはステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤；ならびに、所望により、希釈剤、緩衝剤、湿潤剤、保存剤及び矯味剤と組み合わせて使用して、錠剤、散剤、顆粒剤またはカプセル剤を作製することができる。
二量体化因子は、水性溶媒、または植物油もしくは他の類似の油、合成脂肪酸グリセリド、高級脂肪酸のエステルもしくはプロピレングリコールなどの非水性溶媒中で、所望により、可溶化剤、等張化剤、懸濁化剤、乳化剤、安定剤及び保存剤などの従来の添加剤とともに、二量体化物質を溶解、懸濁または乳化することによって、注射用調製物に製剤化することができる。
二量体化因子を含む医薬組成物は、所望の純度を有する二量体化因子を、任意選択の生理学的に許容される担体、賦形剤、安定剤、界面活性剤、緩衝剤及び／または等張化剤と混合することによって調製される。許容可能な担体、賦形剤及び／または安定剤は、使用される用量及び濃度で、レシピエントに対して無毒であり、リン酸、クエン酸及び他の有機酸などの緩衝剤；アスコルビン酸、グルタチオン、システイン、メチオニン及びクエン酸を含む抗酸化剤；保存剤（エタノール、ベンジルアルコール、フェノール、ｍ－クレゾール、ｐ－クロロ－ｍ－クレゾール、メチルパラベンもしくはプロピルパラベン、塩化ベンザルコニウムまたはこれらの組み合わせなど）；アルギニン、グリシン、オルニチン、リシン、ヒスチジン、グルタミン酸、アスパラギン酸、イソロイシン、ロイシン、アラニン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、メチオニン、セリン、プロリン及びこれらの組み合わせなどのアミノ酸；単糖、二糖及び他の炭水化物；低分子量（約１０残基未満）のポリペプチド；ゼラチンもしくは血清アルブミンなどのタンパク質；ＥＤＴＡなどのキレート剤；トレハロース、スクロース、ラクトース、グルコース、マンノース、マルトース、ガラクトース、フルクトース、ソルボース、ラフィノース、グルコサミン、Ｎ－メチルグルコサミン、ガラクトサミン及びノイラミン酸などの糖；ならびに／またはＴｗｅｅｎ、Ｂｒｉｊ Ｐｌｕｒｏｎｉｃ、Ｔｒｉｔｏｎ－Ｘもしくはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの非イオン性界面活性剤を含む。
医薬組成物は、液状形態、凍結乾燥形態、または凍結乾燥形態から再構成された液状形態（投与前に凍結乾燥調製物が無菌溶液で再構成される）であってよい。凍結乾燥組成物を再構成するための標準的手順は、（典型的に、凍結乾燥中に除去された量と同等の量）の純水を加えることであるが、非経口投与用医薬組成物を作製する場合は、抗菌剤を含む溶液を使用してもよい。Ｃｈｅｎ（１９９２）Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ Ｉｎｄ Ｐｈａｒｍ １８，１３１１－５４も参照されたい。
「単位剤形」という用語は、本明細書で使用されるとき、ヒト及び動物対象にとって１回用量として適切な物理的に別個の単位を指し、各単位は、薬学的に許容される希釈剤、担体またはビヒクルとともに所望の効果をもたらすのに十分な量になるように計算された所定の量の二量体化因子を含有する。所与の二量体化因子の詳細は、使用される具体的な二量体化因子及び達成されるべき効果、ならびに宿主における各二量体化因子に関連する薬力学に依存し得る。
いくつかの実施形態において、二量体化因子は、制御放出製剤に製剤化される。徐放性調製物は、当該技術分野においてよく知られている方法を使用して調製することができる。徐放性調製物の好適な例には、二量体化因子を含有する固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、マトリックスは、成形物品、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリックスの例には、ポリエステル、Ｌ－グルタミン酸とエチル－Ｌ－グルタミン酸のコポリマー、非分解性エチレンビニルアセテート、ヒドロゲル、ポリラクチド、分解性乳酸－グリコール酸コポリマー及びポリ－Ｄ－（－）－３－ヒドロキシ酪酸が挙げられる。生物活性の起こり得る損失は、適切な添加剤の使用、含水量の制御、及び特定のポリマーマトリックス組成物の開発によって防ぐことができる。
用量
好適な用量は、様々な臨床学的因子に基づき、主治医または他の有資格医療関係者によって決定され得る。医療分野においてよく知られているように、任意の１人の患者に対する用量は、患者の体格、体の表面積、年齢、投与される具体的な二量体化因子、患者の性別、投与の時間及び経路、全般的な健康状態、ならびに同時に投与される他の薬物を含む、多くの要因に依存する。二量体化因子は、１用量当たり１ｎｇ／ｋｇ体重～２０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ体重～１０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ体重～５ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得るが、前述の要因を特に考慮した上で、この例示的な範囲を下回る用量または上回る用量が想定される。レジメンが連続注入である場合、１μｇ～１０ｍｇ／ｋｇ体重／分の範囲内であってもよい。
当業者であれば、用量レベルが、具体的な二量体化因子、症状の重症度、及び副作用に対する対象の感受性に応じて変わり得ることは容易に理解するであろう。所与の化合物に好ましい用量は、様々な手段により、当業者によって容易に決定される。
投与経路
二量体化因子は、ｉｎ ｖｉｖｏ法及びｅｘ ｖｉｖｏ法、ならびに全身及び局所投与経路を含む、任意の利用可能な方法及び好適な薬物送達経路を使用して個体に投与される。
従来の薬学的に許容される投与経路には、腫瘍内、腫瘍周辺、筋肉内、気管内、頭蓋内、皮下、皮内、局所適用、静脈内、動脈内、経直腸、経鼻、経口、ならびに他の経腸及び非経口の投与経路が含まれる。投与経路は、二量体化因子及び／または所望の効果に応じて、組み合わされてもよいし、所望により調節されてもよい。二量体化因子は、単回投与または複数回投与で投与され得る。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、経口投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、吸入経路により投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、経鼻投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、局所投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、腫瘍内に投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、腫瘍周辺に投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、頭蓋内投与される。いくつかの実施形態において、二量体化因子は、静脈内投与される。
当該物質は、全身または局所経路を含む、従来の薬物の送達に好適な任意の利用可能な従来の方法及び経路を使用して宿主に投与することができる。概して、本発明によって企図される投与経路には、経腸、非経口または吸入経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。
吸入投与以外の非経口投与経路には、局所、経皮的、皮下、筋肉内、眼窩内、嚢内、脊髄内、胸骨内、腫瘍内、腫瘍周辺及び静脈内経路、すなわち、消化管以外を通る任意の投与経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。非経口投与は、二量体化因子の全身送達または局所送達をもたらすように実施され得る。全身送達が所望される場合、投与は、典型的に、医薬品の浸潤性または全身吸収による局所投与または粘膜投与を伴う。
二量体化因子はまた、経腸投与によって対象に送達することができる。経腸投与経路には、経口及び経直腸（例えば、坐剤の使用）による送達が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。
治療とは、宿主を冒す病的状態に関連する症状を少なくとも改善することを意味し、ここで、改善は、広い意味で使用され、治療がなされるがんなどの病的状態に関連する指標（例えば、症状）の程度を少なくとも低減させることを指す。したがって、治療はまた、病的状態または少なくともそれに伴う症状が完全に抑制されるか（例えば、発症の阻止）、停止し（例えば、終了）、これにより、宿主が当該病的状態または少なくとも当該病的状態を特徴付ける症状を患っていない状況を含む。
いくつかの実施形態において、二量体化因子は、注射及び／または送達により、例えば、脳動脈内の部位または直接的に脳組織に投与される。二量体化因子は、例えば、直接注射、浸透圧ポンプまたは徐放性粒子などの薬物送達デバイスの埋め込み、標的部位へのパーティクルガン送達などによって、標的部位に直接投与することができる。
本開示の非限定的な態様の例
上に記載される本主題の実施形態を含む態様は、単独でも、または１つ以上の他の態様もしくは実施形態との組み合わせでも有益であり得る。前述の説明を限定することなく、１～４５の番号を付した本開示のある特定の非限定的な態様を以下に記載する。本開示を読めば当業者には明らかであるように、個々に番号が付された態様のそれぞれは、個々に番号が付された先行の態様または後述の態様のいずれかとともに使用または組み合わせてもよい。これは、全てのそのような態様の組み合わせに対する支持を提供することを意図しており、以下に明示的に記載される態様の組み合わせに限定されるものではない。
１．
ａ）二量体化対の第１のメンバー及び第１の異種ポリペプチドを含む第１のキメラポリペプチドと、
ｂ）二量体化対の第２のメンバー及び第２の異種ポリペプチドを含む第２のキメラポリペプチドと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
２．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）α鎖であり、
ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＴＣＲβ鎖である、
態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
３．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ヘテロ二量体の第１のポリペプチドであり、
ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドである、
態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
４．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＮ末端部分であり、
ｂ）第２の異種ポリペプチドは、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＣ末端部分であり、
ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼの酵素機能を回復させる、
態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
５．
ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼがクラス２のＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓエンドヌクレアーゼである、態様４に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
６．
クラス２のＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓエンドヌクレアーゼが、ＩＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質、Ｖ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質またはＶＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質である、態様５に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
７．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、酵素のＮ末端部分であり、
ｂ）第２の異種ポリペプチドは、酵素のＣ末端部分であり、
第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、酵素の酵素活性を回復させる、
態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
８．
酵素が、キナーゼ、プロテアーゼ、ホスファターゼまたはカスパーゼである、態様７に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
９．
第１のポリペプチド及び第２のポリペプチドは、二量体化物質によって媒介される二量体化の際に近接すると活性を示すが、個別には活性を示さない、態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
１０．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＮ末端部分であり、
ｂ）第２の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＣ末端部分であり、
第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、抗原受容体のシグナル伝達活性を回復させる、
態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
１１．
ａ）第１の異種ポリペプチドは、受容体のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドは、抗原受容体のＣ末端部分であり、二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化は、受容体のシグナル伝達活性を回復させる、態様１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
１２．
二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤが、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである、態様１～１１のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
１３．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される、態様１～１２のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
１４．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、以下から選択される、態様１～１２のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド：
Figure 0007068169000220
Figure 0007068169000221
Figure 0007068169000222
。
１５．
ａ）第１のキメラポリペプチドであって、
ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
ｉｉ）第１の調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及び
ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
を含む、第１のキメラポリペプチドと、
ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、
ｉ）膜貫通ドメイン、
ｉｉ）第２の調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、第２のキメラポリペプチドと
を含むか、
ａ）第１のキメラポリペプチドであって、
ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
ｉｉ）調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、
ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
を含む、第１のキメラポリペプチドと、
ｂ）第２のキメラポリペプチドであって、
ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、第２のキメラポリペプチドと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
ヘテロ二量体条件付活性受容体。
１６．
第１のポリペプチドが、特異的結合対の第１のメンバーと膜貫通ドメインとの間に介在するヒンジ領域を含む、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
１７．
特異的結合対の第１のメンバーが、抗体もしくは抗体断片、リガンド、受容体、または非抗体ベースの認識足場である、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
１８．
ヒンジ領域が、免疫グロブリンＩｇＧヒンジ領域またはＣＤ８由来のヒンジである、態様１７に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
１９．
第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ、ＯＸ－４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２及びＣＤ２８から選択される、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２０．
細胞内シグナル伝達ドメインが、ＺＡＰ７０及びＣＤ３－ζから選択される、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２１．
細胞内シグナル伝達ドメインが、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２２．
二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤが、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである、態様１５～２１のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２３．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される、態様１５～２２のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２４．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、以下から選択される、態様１５～２２のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体：
Figure 0007068169000223
Figure 0007068169000224
Figure 0007068169000225
。
２５．
ｉ）第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢに由来し、
ｉｉ）二量体化対の第１及び第２のメンバーは、ＰＰＡＲγ及びＳＲＣ３であり、
ｉｉ）シグナル伝達ドメインは、ＩＴＡＭを含む、
態様１８に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２６．
特異的結合対の第１のメンバーが一本鎖Ｆｖである、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２７．
特異的結合対の第１のメンバーが、細胞上、固体表面上、または脂質二重層に存在するエピトープと結合する、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２８．
細胞ががん細胞である、態様２７に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
２９．
細胞内シグナル伝達ドメインが、細胞内抑制ドメインである、態様１５に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
３０．
細胞内抑制ドメインが、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ４、ＨＰＫ１、ＳＨＰ１、ＳＨＰ２、Ｓｔｓ１及びＣｓｋからなる群から選択されるタンパク質に由来する、態様２９に記載のヘテロ二量体条件付活性受容体。
３１．
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）であって、以下：
二量体化対の第１のメンバーを含む合成刺激性ＩＣＲであって、二量体化対の第１のメンバーは合成刺激性ＩＣＲに連結されている、合成刺激性ＩＣＲと、
細胞内抑制ドメインに連結された二量体化対の第２のメンバーを含む合成ＩＣＲリプレッサーと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
合成刺激性ＩＣＲと合成ＩＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）。
３２．
合成刺激性ＩＣＲが、細胞内共刺激ドメインを含む、態様３１に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３３．
細胞内共刺激ドメインが、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＯＸ－４０、ＢＴＬＡ、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ及びＨＶＥＭからなる群から選択される、態様３２に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３４．
二量体化対の第１のメンバーが、合成刺激性ＩＣＲに細胞内で連結され、二量体化対の第２のメンバーが、細胞内抑制ドメインに細胞内で連結されている、態様３１～３３のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３５．
合成ＩＣＲリプレッサーが、膜貫通ドメインを更に含む、態様３１～３４のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３６．
二量体化対の第２のメンバーが、膜貫通ドメインに細胞内で連結されている、態様３５に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３７．
二量体化対の第２のメンバーは、細胞外であり、膜貫通ドメインを介して細胞内抑制ドメインに連結されている、態様３５に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３８．
刺激性ＩＣＲが、可溶性抗原と結合する、態様３１～３７のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
３９．
刺激性ＩＣＲが、細胞表面抗原と結合する、態様３１～３８のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４０．
細胞内抑制ドメインが、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ４、ＨＰＫ１、ＳＨＰ１、ＳＨＰ２、Ｓｔｓ１及びＣｓｋからなる群から選択されるタンパク質に由来する抑制ドメインである、態様３１～３９のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４１．
合成刺激性ＩＣＲが、ＣＤ３－ζシグナル伝達ドメイン、ＺＡＰ７０シグナル伝達ドメイン及び免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）からなる群から選択される細胞内シグナル伝達ドメインを含む、態様３１～４０のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４２．
二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤが、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである、態様３１～４１のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４３．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される、態様４１または４２に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４４．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、以下から選択される、態様４１または４２に記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ：
Figure 0007068169000226
Figure 0007068169000227
。
４５．
合成刺激性ＩＣＲが、合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）またはその一部である、態様３１～４４のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４６．
合成刺激性ＩＣＲが、合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）またはその一部である、態様３１～４５のいずれか１つに記載の条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
４７．
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって、以下：
ａ）合成刺激性ＣＡＲであって、
ｉ）細胞外認識ドメイン、
ｉｉ）細胞外認識ドメインに連結された膜貫通ドメイン、
ｉｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、及び
ｉｖ）細胞内刺激ドメイン
を含む、合成刺激性ＣＡＲと、
ｂ）合成ＣＡＲリプレッサーであって、
ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメイン
を含む、合成ＣＡＲリプレッサーと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
合成刺激性ＣＡＲと合成ＣＡＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
４８．
合成ＣＡＲリプレッサーが、二量体化対の第２のメンバーに連結された膜貫通ドメイン、細胞内抑制ドメイン、またはその両方を更に含む、態様４７に記載のヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＣＡＲ。
４９．
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）であって、以下：
ａ）合成刺激性ＴＣＲであって、
ｉ）膜貫通ドメイン、
ｉｉ）膜貫通ドメインに連結された二量体化対の第１のメンバー、
ｉｉｉ）少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖を含む操作されたＴＣＲポリペプチドであって、少なくとも１つのＴＣＲα鎖またはβ鎖は、膜貫通ドメインまたは二量体化対の第１のメンバーに連結されている、操作されたＴＣＲポリペプチド
を含む、合成刺激性ＴＣＲと、
ｂ）合成ＴＣＲリプレッサーであって、
ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｉ）二量体化対の第２のメンバーに連結された細胞内抑制ドメイン
を含む、合成ＴＣＲリプレッサーと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
合成刺激性ＴＣＲと合成ＴＣＲリプレッサーは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
ヘテロ二量体条件付抑制可能合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）。
５０．
合成ＴＣＲリプレッサーが、二量体化対の第２のメンバーに連結された膜貫通ドメイン、細胞内抑制ドメイン、またはその両方を更に含む、態様４９に記載のヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＴＣＲ。
５１．
操作されたＴＣＲポリペプチドが、ＴＣＲγ鎖を更に含む、態様４９または５０に記載のヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＴＣＲ。
５２．
ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であって、以下：
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
ｉｉ）第１の調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、及び
ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
を含む、第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）膜貫通ドメイン、
ｉｉ）第２の調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、第２のポリペプチドと
を含むか、
ａ）第１のポリペプチドであって、
ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
ｉｉ）調節ドメイン、
ｉｉｉ）二量体化対の第１のメンバー、
ｉｖ）特異的結合対の第１のメンバーと調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
を含む、第１のポリペプチドと、
ｂ）第２のポリペプチドであって、
ｉ）二量体化対の第２のメンバー、及び
ｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、第２のポリペプチドと
を含み、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
二量体化対の第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ二量体化対の第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
第１のポリペプチドと第２のポリペプチドは、ＬＢＤのコレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、ヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）。
５３．
第１のポリペプチドが、特異的結合対の第１のメンバーと膜貫通ドメインとの間に介在するヒンジ領域を含む、態様５２に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５４．
特異的結合対の第１のメンバーが、抗体もしくは抗体断片、リガンド、または受容体である、態様５２に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５５．
ヒンジ領域が、免疫グロブリンＩｇＧヒンジ領域またはＣＤ８由来のヒンジである、態様５３に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５６．
第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ、ＯＸ－４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２及びＣＤ２８から選択される、態様５２に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５７．
細胞内シグナル伝達ドメインが、ＺＡＰ７０及びＣＤ３－ζから選択される、態様５２に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５８．
細胞内シグナル伝達ドメインが、免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む、態様５２に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
５９．
二量体化対の核内ホルモン結合メンバーのＬＢＤが、エストロゲン受容体、エクジソン受容体、ＰＰＡＲγ受容体、グルココルチコイド受容体、アンドロゲン受容体、甲状腺ホルモン受容体、ミネラルコルチコイド受容体、プロゲステロン受容体、ビタミンＤ受容体、ＰＰＡＲβ受容体、ＰＰＡＲα受容体、プレグナンＸ受容体、肝臓Ｘ受容体、ファルネソイドＸ受容体、レチノイドＸ受容体、ＲＡＲ関連オーファン受容体及びレチノイン酸受容体から選択される核内ホルモン受容体のＬＢＤである、態様５２～５８のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
６０．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、ＳＲＣ１、ＧＲＩＰ１、ＡＩＢ１、ＰＧＣ１ａ、ＰＧＣ１ｂ、ＰＲＣ、ＴＲＡＰ２２０、ＡＳＣ２、ＣＢＰ、Ｐ３００、ＣＩＡ、ＡＲＡ７０、ＴＩＦ１、ＮＳＤ１、ＳＭＡＰ、Ｔｉｐ６０、ＥＲＡＰ１４０、Ｎｉｘ１、ＬＣｏＲ、Ｎ－ＣｏＲ、ＳＭＲＴ、ＲＩＰ１４０及びＰＲＩＣ２８５から選択される、態様５２～５９のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
６１．
核内ホルモン受容体のコレギュレーターが、以下から選択される、態様５２～５９のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ：
Figure 0007068169000228
Figure 0007068169000229
Figure 0007068169000230
。
６３．
特異的結合対の第１のメンバーが一本鎖Ｆｖである、態様５２～６２のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
６４．
特異的結合対の第１のメンバーが、細胞上、固体表面上、または脂質二重層に存在するエピトープと結合する、態様５２～６３のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
６５．
細胞ががん細胞である、態様６４に記載のヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲ。
６６．
態様１～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたは受容体を産生するように遺伝子改変された、哺乳動物細胞。
６７．
幹細胞、前駆細胞、または幹細胞もしくは前駆細胞に由来する細胞である、態様６６に記載の細胞。
６８．
Ｔリンパ球またはＮＫ細胞である、態様６６に記載の細胞。
６９．
態様１～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体またはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸。
７０．
ヌクレオチド配列が、プロモーターに機能的に連結されている、態様６９に記載の核酸。
７１．
プロモーターが、誘導性プロモーターである、態様６９に記載の核酸。
７２．
プロモーターが、細胞型特異的または組織特異的プロモーターである、態様６９に記載の核酸。
７３．
プロモーターが、Ｔリンパ球特異的プロモーターまたはＮＫ細胞特異的プロモーターである、態様７２に記載の核酸。
７４．
核酸が、ｉｎ ｖｉｔｒｏで転写されたＲＮＡである、態様６９～７３のいずれか１つに記載の核酸。
７５．
態様６９～７４のいずれか１つに記載の核酸を含む、組み換え発現ベクター。
７６．
真核細胞の活性を調節する方法であって、
ａ）態様１～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたは受容体を真核細胞において発現させる工程と、
ｂ）細胞をリガンドと接触させる工程とを含む、方法。
７７．
Ｔリンパ球の活性を調節する方法であって、Ｔリンパ球を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーと接触させる工程を含み、Ｔリンパ球は、態様１５～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体を産生するように遺伝子改変され、ヘテロ二量体条件付活性受容体は、二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーの存在下で二量体化して、Ｔリンパ球の活性を調節し、これにより、調節されたＴリンパ球が生じる、方法。
７８．
特異的結合対の第２のメンバーが抗原である、態様７７に記載の方法。
７９．
当該接触させる工程が、ｉｎ ｖｉｖｏで生じる、態様７７に記載の方法。
８０．
Ｔリンパ球が活性化され、これにより、活性化されたＴリンパ球が生じる、態様７７に記載の方法。
８１．
活性化されたＴリンパ球が、標的細胞の殺傷を媒介する、態様８０に記載の方法。
８２．
活性化されたＴリンパ球が、ＩＬ－２及び／またはＩＦＮ－γを産生する、態様８０に記載の方法。
８３．
標的細胞ががん細胞である、態様８１に記載の方法。
８４．
態様６６～６８のいずれか１つに記載の細胞を作製する方法であって、態様１～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体もしくはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを用いて哺乳動物細胞を遺伝子改変する工程、または態様１～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体もしくはポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを用いて哺乳動物細胞を遺伝子改変する工程を含む、方法。
８５．
当該遺伝子改変が、ｅｘ ｖｉｖｏで実施される、態様８４に記載の方法。
８６．
細胞が、Ｔリンパ球、幹細胞、ＮＫ細胞、前駆細胞、幹細胞に由来する細胞、または前駆細胞に由来する細胞である、態様８４に記載の方法。
８７．
個体のがんを治療する方法であって、
ｉ）態様４９～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを用いて、個体から得たＴリンパ球を遺伝子改変する工程であって、ヘテロ二量体条件付活性ＣＡＲの抗原結合ドメインは、個体のがん細胞上のエピトープに対して特異的であり、当該遺伝子改変は、ｅｘ ｖｉｖｏで実施される、遺伝子改変する工程と、
ｉｉ）遺伝子改変されたＴリンパ球を個体に導入する工程と、ｉｉｉ）有効量の二量体化物質を個体に投与する工程と
を含み、
二量体化物質は、ヘテロ二量体条件付活性受容体の二量体化を誘導し、当該二量体化は、遺伝子改変されたＴリンパ球の活性化及びがん細胞の殺傷をもたらし、これにより、がんを治療する、方法。
８８．
二量体化物質が、核内ホルモン受容体のＬＢＤとコレギュレーターを結合させる核内ホルモンである、態様８７に記載の方法。
８９．
宿主細胞の活性を調節する方法であって、宿主細胞を二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーと接触させる工程を含み、Ｔリンパ球は、態様４９～６５のいずれか１つに記載のヘテロ二量体条件付活性受容体を産生するように遺伝子改変され、ヘテロ二量体条件付活性受容体は、二量体化物質及び特異的結合対の第２のメンバーの存在下で二量体化して、宿主細胞の少なくとも１つの活性を調節する、方法。
９０．
活性が、増殖、細胞生存、アポトーシス、遺伝子発現または免疫活性化である、態様８９に記載の方法。
９１．
特異的結合対の第２のメンバーが抗原である、態様８９に記載の方法。
以下の実施例は、本発明の実施法及び使用法に関する完全な開示と説明を当業者に提供するために記載されるものであり、発明者らが発明とみなすものの範囲を限定するものでも、以下の実験が行われた実験の全てであることまたは以下の実験のみが行われたことを示すものではない。使用される数（例えば量、温度など）に関しては、正確さを確保するように努めたが、多少の実験誤差及び偏差を考慮されたい。別途指定のない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度は摂氏度であり、圧力は大気圧または略大気圧である。標準的な略語、例えば、ｂｐ：塩基対、ｋｂ：キロベース、ｐｌ：ピコリットル、ｓまたはｓｅｃ：秒、ｍｉｎ：分、ｈまたはｈｒ：時間、ａａ：アミノ酸、ｋｂ：キロベース、ｂｐ：塩基対、ｎｔ：ヌクレオチド、ｉ．ｍ．：筋肉内、ｉ．ｐ．：腹腔内、ｓ．ｃ．：皮下などが使用され得る。
材料及び方法
次の材料及び方法を実施例１及び２に記載される実験において使用した。
ＰＰＡＲγをベースにしたオンスイッチＣＡＲの構築
抗ヒトＣＤ１９ ｓｃＦｖをコードする配列を発現ベクターにクローニングした。ヒト４－１ＢＢ共刺激及びＣＤ３ζ ＩＴＡＭシグナル伝達鎖を、Ｏｐｅｎ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓから供給されたｃＤＮＡからクローニングした。ＰＰＡＲγ ＬＢＤ及びＳＲＣ３コアクチベーターペプチドをコードする配列は、ＩＤＴ ＤＮＡでカスタム合成した。標準的な分子クローニング技術（ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、制限消化、ライゲーション、相同ＤＮＡ組み換えなど）を適用して、各オンスイッチＣＡＲ分子のレンチウイルス発現プラスミドを作製した。
エフェクター細胞及び標的細胞の培養条件
ＮＦＡＴ活性化により緑色蛍光タンパク質を発現するＪｕｒｋａｔ細胞株を使用した。１０％ＦＢＳ、ペニシリン及びストレプトマイシンを添加したＲＰＭＩ－１６４０培地中に細胞株を維持した。１０％ＦＢＳを添加したＩＭＤＭ中で、Ｕ．Ｐｅｎｎから得たＫ５６２標的細胞（ＣＤ１９＋／－）を培養した。
レンチウイルスを用いたエフェクター細胞の操作
リポフェクタミンＬＴＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ＃１５３３８）を使用して、ｐＨＲ’ＳＩＮ：ＣＳＷ遺伝子導入発現ベクター、ウイルスパッケージングプラスミドｐＣＭＶｄＲ８．９１及びｐＭＤ２．ＧをコトランスフェクトしたＬｅｎｔｉ－Ｘ２９３Ｔ細胞（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ ＃６３２１８０）から汎親和性ＶＳＶ－Ｇ偽型レンチウイルスを作製した。感染培地の上清をトランスフェクションから４８時間後に回収し、これを直接形質導入に使用した。
Ｊｕｒｋａｔ細胞は、形質導入の１～２日前に分け、細胞培養物が形質導入時に確実に対数期になるようにした。形質導入細胞を少なくとも７日間培養し、実験が実施される前に必要に応じて豊富なＣＡＲ発現について選別した。オンスイッチＣＡＲ分子の発現レベルは、フローサイトメトリーによって定量した。オンスイッチＣＡＲ（ｓｃＦｖを特徴とする）の部分１は、抗ＣＤ１９ ｓｃＦｖの上流にあるｍｙｃエピトープを認識するフルオロフォア結合抗ｍｙｃ抗体で染色した。オンスイッチＣＡＲ（ＣＤ３ζ ＩＴＡＭを特徴とする）の部分２は、ＩＴＡＭの下流にあるｍＣｈｅｒｒｙの蛍光を使用して定量した。
オンスイッチＪｕｒｋａｔ細胞によるＩＬ－２産生の定量
オンスイッチＣＡＲを発現するＪｕｒｋａｔ Ｔ細胞を、ＣＤ１９＋／－Ｋ５６２標的細胞と、１：２のエフェクター：標的比で共培養した。ロシグリタゾン（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ ＃Ｒ２４０８）をＤＭＳＯ中に溶解し、最終濃度が１０μＭになるように試料に加えた。二量体因子を含まない試料は、それぞれのビヒクル対照（１：３０００の希釈のジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）または１：１０００の希釈のエタノール）を含有した。インキュベーションから１８時間後に培地の上清を回収し、ＢＤ ＯｐｔＥＩＡ Ｈｕｍａｎ ＩＬ－２ ＥＬＩＳＡ Ｓｅｔ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ ＃５５５１９０）で分析した。
ホルモン受容体をベースにしたオンスイッチＣＡＲの構築
抗ヒトＣＤ１９ ｓｃＦｖをコードする配列をクローニングした。ヒト４－１ＢＢ共刺激及びＣＤ３ζ ＩＴＡＭシグナル伝達鎖を、Ｏｐｅｎ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓから供給されたｃＤＮＡからクローニングした。エストロゲン受容体ＬＢＤ及びコアクチベーターペプチドをコードする配列は、ＩＤＴ ＤＮＡでカスタム合成した。コアクチベーターペプチドの配列は、Ｈｅｌｄｒｉｎｇ ｅｔ ａｌ Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ．２００７ Ａｐｒ ６；２８２（１４）：１０４４９－５５，ＰＭＩＤ １７２８３０７２から得た。標準的な分子クローニング技術（ＰＣＲ、制限消化、ライゲーション、相同ＤＮＡ組み換えなど）を適用して、各オンスイッチＣＡＲ分子のレンチウイルス発現プラスミドを作製した。
オンスイッチＪｕｒｋａｔ細胞によるＣＤ－６９発現の定量
ＮＦＡＴ活性化により緑色蛍光タンパク質を発現するＪｕｒｋａｔ細胞株を使用した。１０％ＦＢＳ及びグルタミンを添加したＲＰＭＩ－１６４０培地中に細胞株を維持した。１０％ＦＢＳを添加したＤＭＥＭ中で、Ｋ５６２標的細胞（ＣＤ１９＋／－）を培養した。ＣＡＲ構築物を含むレンチウイルスを感染させたＪｕｒｋａｔ細胞を、標的抗原（ＣＤ１９）または無関係の抗原（メソテリン）を発現するＫ５６２標的細胞と共培養した。４－ヒドロキシタモキシフェン（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ ＃Ｈ７９０４）をＤＭＳＯ中に溶解し、最終濃度が０～１０μＭになるように試料に加えた。ラパログＡ／Ｃヘテロ二量体化物質（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ ＃６３５０５５）をエタノール中に溶解し、最終濃度が５００ｎＭになるように試料に加えた。細胞を２４時間培養し、ＣＤ６９発現について染色し、フローサイトメーターで解析した。
レンチウイルスを用いたエフェクター細胞の操作
リポフェクタミンＬＴＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ＃１５３３８）を使用して、ｐＨＲ’ＳＩＮ：ＣＳＷ遺伝子導入発現ベクター、ウイルスパッケージングプラスミドｐＣＭＶｄＲ８．９１及びｐＭＤ２．ＧをコトランスフェクトしたＬｅｎｔｉ－Ｘ２９３Ｔ細胞（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ ＃６３２１８０）から汎親和性ＶＳＶ－Ｇ偽型レンチウイルスを作製した。感染培地の上清をトランスフェクションから４８時間後に回収し、これを直接形質導入に使用した。
Ｊｕｒｋａｔ細胞は、形質導入の１～２日前に分け、細胞培養物が形質導入時に確実に対数期になるようにした。形質導入細胞を少なくとも７日間培養し、実験が実施される前に必要に応じて豊富なＣＡＲ発現について選別した。オンスイッチＣＡＲ分子の発現レベルは、フローサイトメトリーによって定量した。オンスイッチＣＡＲ（ｓｃＦｖを特徴とする）の部分１は、抗ＣＤ１９ ｓｃＦｖの上流にあるｍｙｃエピトープを認識するフルオロフォア結合抗ｍｙｃ抗体で染色した。オンスイッチＣＡＲ（ＣＤ３ζ ＩＴＡＭを特徴とする）の部分２は、ＩＴＡＭの下流にあるｍＣｈｅｒｒｙの蛍光を使用して定量した。
実施例１：ＰＰＡＲγをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物
ＰＰＡＲγをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物を作製した。図１２は、一般化した核内ホルモンリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）／コアクチベーターペプチドオンスイッチＣＡＲの全体構造の模式図を表す。図１３は、構築物の全体構造の模式図を表す。構築物を表３に列挙する。ＦＫＢＰ及びＦＲＢ＊ドメインを含むオンスイッチ構築物（ｂＣＷ１９７、ｂＣＷ２０６、ｂＣＷ２０７）を陽性対照及び陰性対照のＣＡＲとして使用した。
（表３）
Figure 0007068169000231
ＣＡＲ構築物に含まれるＰＰＡＲγのリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）のアミノ酸配列及び使用したコレギュレーターペプチドのアミノ酸配列を以下に示す。
ＣＡＲ構築物ｂＣＷ４９５に含まれるＰＰＡＲγのＬＢＤのアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000232
構築物ｂＣＷ４９２の短いタイプ（Ｐ７２９～Ａ７５０）のヒトＳＲＣ３コレギュレーターペプチドのアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000233
短いタイプ（Ｐ７２９～Ａ７５０）のヒトＳＲＣ３コレギュレーターペプチドの構築物ｂＣＷ４９３は、３つのタンデムコピーを含有し、そのコピー間にリンカー／スペーサーを含むことから、ｂＣＷ４９３のリンカー／スペーサーを含むコレギュレーターペプチドのアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000234
配列中、リンカー／スペーサーのアミノ酸を下線で示す。
構築物ｂＣＷ４９４は、長いタイプ（Ｍ６７３～Ａ７５０）のヒトＳＲＣ３コレギュレーターペプチドを含有し、ｂＣＷ４９４のヒトＳＲＣ３のアミノ酸配列は、
Figure 0007068169000235
である。
ＰＰＡＲγ ＣＡＲ構築物ｐ５１のコレギュレーターペプチド含有ポリペプチド鎖（ｐ５１ ｂＣＷ ４９２ １×ＳＲＣ３の短いコレギュレーターペプチド及び４－１ＢＢを含むｍｙｃ抗ＣＤ１９オンスイッチ部分１）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000236
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。
ＰＰＡＲγ ＣＡＲ構築物ｐ５２（ｐ５２ ｂＣＷ ４９４ １×ＳＲＣ３の長いコレギュレーターペプチド及び４－１ＢＢを含むｍｙｃ ａＣＤ１９オンスイッチ部分１）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000237
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。
ＰＰＡＲγ ＣＡＲ構築物ｐ５５（ｐ５５ ｂＣＷ４９３二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×短いＳＲＣ３ペプチド（ｐＨＲ中））のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000238
配列中、抗ＣＤ１９配列を太字で示し、ＣＤ８α膜貫通（ＴＭ）ドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢ配列を斜字体太字で示し、コレギュレーターペプチドを下線（一重下線）で示す。
ＰＰＡＲγ ＣＡＲ構築物Ｐ５６（ｐ５６ ｂＣＷ４９５ Ｋｏｚａｋ ｄＤＡＰ１０ ＣＤ８ａ ＴＭ－４１ＢＢ－ＧＳ×８－ＰＰＡＲｇ ＬＢＤ－ＧＳ×４－ζ－ＧＳ×４－ｍＣｈｅｒｒｙ（ｐＨＲ中））のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000239
Figure 0007068169000240
ＬＢＤを下線（一重下線）で示し、ＣＤ８α ＴＭドメインを二重下線で示し、４－１ＢＢを太字で示し、ζを斜字体太字で示す。
結果
図１４は、ロシグリタゾン二量体化因子（１０マイクロモル）の存在下または非存在下で、Ｋ５６２標的細胞（指定の＋／－ ＣＤ１９ Ａｇ）と１８時間共培養した後のオンスイッチＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞（指定のレンチウイルス構築物で形質導入した細胞）によるＩＬ－２サイトカイン産生を示す。
実施例２：ＥＲ－αをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物
ＥＲαをベースにしたオンスイッチＣＡＲ構築物を作製した。図１５は、構築物の全体構造の模式図を表す。構築物を表４に列挙する。ＦＫＢＰ及びＦＲＢ＊ドメインを含むオンスイッチ構築物（ｂＣＷ１９７、ｂＣＷ２０６、ｂＣＷ２０７）を陽性対照及び陰性対照のＣＡＲとして使用した。
（表４）
Figure 0007068169000241
ＥＲαをベースにしたオンスイッチＣＡＲの様々な構成成分のアミノ酸配列は、次のとおりである。
ａ．構築物ｂＣＷ５０３のヒトエストロゲン受容体αのＬＢＤ：
Figure 0007068169000242
ｂ．構築物ｂＣＷ５０４の変異型ヒトエストロゲン受容体αのＬＢＤ：
Figure 0007068169000243
ｃ．構築物ｂＣＷ５０５の変異型ヒトエストロゲン受容体αのＬＢＤ：
Figure 0007068169000244
Figure 0007068169000245
ｄ．ｂＣＷ５０１の３×αβＶコアクチベーターペプチド：
Figure 0007068169000246
ｅ．ｂＣＷ５０２の３×ＣｏＲＮＲコアクチベーターペプチド：
Figure 0007068169000247
ｂＣＷ５０１構築物（ｐ２５ ｂＣＷ５０１ ３×αβＶペプチド及び４－１ＢＢを含むｍｙｃ ａＣＤ１９オンスイッチ部分１）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000248
配列中、コレギュレーターペプチドαβＶを下線で示す。
ｂＣＷ５０２構築物（ｐ２６ ｂＣＷ５０２ ３×ＣｏＲＮＲペプチド及び４－１ＢＢを含むｍｙｃ ａＣＤ１９オンスイッチ部分１）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000249
配列中、３×ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドを下線で示す。
ｂＣＷ５０３構築物（ｐ２７ ｂＣＷ５０３ ヒトＥＲα ＬＢＤを含むオンスイッチＣＡＲ部分２）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000250
Figure 0007068169000251
配列中、ＥＲ ＬＢＤを下線で示す。
ｂＣＷ５０４構築物（ｐ２８ ｂＣＷ５０４ ヒトＥＲα ＬＢＤ及びＹ５３７Ｆを含むオンスイッチＣＡＲ部分２）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000252
配列中、ＥＲα ＬＢＤを下線で示し、Ｙ５３７Ｆ置換を太字で示す。
ｂＣＷ５０５構築物（ｐ２９ ｂＣＷ５０５ ヒトＥＲα ＬＢＤ及びＹ５３７Ｆ・Ｇ５２１Ｒを含むオンスイッチＣＡＲ部分２）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000253
Figure 0007068169000254
配列中、ＥＲα ＬＢＤを下線で示し、Ｙ５３６Ｆ及びＧ５２１Ｒの各置換を太字で示す。
ｂＣＷ５０６構築物（ｐ３０ ｂＣＷ５０６ ヘリックス１２なしのヒトＥＲα ＬＢＤを含むオンスイッチＣＡＲ部分２）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000255
配列中、ＥＲα ＬＢＤ（ヘリックス１２を含まない）を下線で示す。
ｂＣＷ５０７構築物（ｐ３１ ｂＣＷ５０７ ヘリックス１２なしのヒトＥＲα ＬＢＤ及びＧ５２１Ｒを含むオンスイッチＣＡＲ部分２）のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000256
Figure 0007068169000257
配列中、ＥＲα ＬＢＤ（ヘリックス１２を含まない）を下線で示し、Ｇ５２１Ｒ置換を太字で示す。
「ｐ４０二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＮＲ０Ｂ１ペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000258
配列中、３×ＮＲ０Ｂ１コレギュレーターペプチドを下線で示す。
「ｐ４１二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＮＣＯＡ１ペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000259
配列中、３×ＮＣＯＡ１ペプチドを下線で示す。
「ｐ４２二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＮＣＯＡ２ペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000260
配列中、３×ＮＣＯＡ２ペプチドを下線で示す。
「ｐ４３二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＰＧＣ－１ペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000261
配列中、３×ＰＧＣ－１ペプチドを下線で示す。
「ｐ４４二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＮＲＩＰ１ペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000262
配列中、３×ＮＲＩＰ１ペプチドを下線で示す。
「ｐ４５ Ｋｏｚａｋ ｄＤＡＰ１０ ＣＤ８ａ ＴＭ－４１ＢＢ－ＧＳ×８－ＥＲｂＬＢＤ－ＧＳ×４－ζ－ＧＳ×４－ｍＣｈｅｒｒｙ（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000263
Figure 0007068169000264
配列中、ＥＲβ ＬＢＤを下線で示す。
「ｐ１７９二量体型 ｍｙｃ ａＣＤ１９ ＣＤ８ａ ヒンジ ＴＭ ４１ＢＢ リンカー ３×ＳＲＣ－１ ＮＲＩＶペプチド（ｐＨＲ中）」と称される構築物のアミノ酸配列は、次のとおりである。
Figure 0007068169000265
配列中、３×ＮＲＩＶ１ペプチドを下線で示す。
結果
データを図１６Ａ及び図１６Ｂに示す。図１６Ａ：小分子二量体化因子（４－ヒドロキシタモキシフェンまたはラパログＡＰ２１９６７）の存在下または非存在下で、ＣＤ１９または無関係の抗原メソテリン（「メソ」）を発現するＫ５６２標的細胞と２４時間共培養した後のＥＲ ＣＡＲ＋（ｂＣＷ５０２及びｂＣＷ５０５）を発現するＪｕｒｋａｔ細胞によるＣＤ６９のアップレギュレーション。ＣＤ１９を発現するＫ５６２細胞の存在下でのみ、ＥＲ ＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞のＣＤ６９発現が４－ヒドロキシタモキシフェンにより強く誘導される（ＥＣ５０ 約１００ｎＭ）。ラパマイシンＣＡＲ及び不活化ラパマイシンＣＡＲ（ＩＴＡＭ中にシグナル伝達を無効にする変異を含む）をそれぞれ陽性対照及び陰性対照として試験した。図１６Ｂ：図１６Ａに記載の実験からのＦＡＣＳデータ。ＣＤ１９抗原及び４－ヒドロキシタモキシフェン処理に応じたＥＲ ＣＡＲ＋Ｊｕｒｋａｔ細胞におけるＣＤ６９のアップレギュレーションを示している。
実施例３：二量体化因子による初代ヒトＴ細胞の制御活性化
４－ヒドロキシタモキシフェン薬物の存在下で誘導されたヒトエストロゲン受容体βのリガンド結合ドメインと転写コリプレッサー由来の小ペプチドとのヘテロ二量体化による細胞機能の制御を評価した。本方法は、ＤＮＡ結合及び／もしくは転写活性、またはポリペプチド構成成分の由来であるヒトエストロゲン受容体βの任意のＤＮＡ結合機能もしくは転写活性化機能を伴わない。
ヒトエストロゲン受容体β核内受容体ペプチド系が初代ヒトＴ細胞で発現され、オンスイッチＣＡＲ活性を調節することができることを確認した。ヒトエストロゲン受容体βリガンド結合ドメイン及びコリプレッサーペプチド（ＣｏＲＮＲ）を含むように、ＣＤ１９特異的オンスイッチＣＡＲを構築した。Ｔ細胞膜内の一般的な構築物及び標的細胞の表面上に発現した関連ＣＤ１９抗原の模式図を図１７に示す。初代ＣＤ８＋Ｔ細胞に導入すると、安定した発現が観察され、形質導入した細胞は、４－ヒロキシタモキシフェン薬物を添加すると、Ｔ細胞活性化の増大を示した。
次の構築物をコードする核酸配列を使用した。次の配列を有する「ｐ２６ ｂＣＷ ５０２ ３×ＣｏＲＮＲペプチド及び４－１ＢＢを含むｍｙｃ ａＣＤ１９オンスイッチ部分１」：
Figure 0007068169000266
配列中、３×ＣｏＲＮＲコレギュレーターペプチドを下線で示す。次の配列を有する「ｐ４５ Ｋｏｚａｋ ｄＤＡＰ１０ ＣＤ８ａ ＴＭ－４１ＢＢ－ＧＳ×８－ＥＲｂＬＢＤ－ＧＳ×４－ζ－ＧＳ×４－ｍＣｈｅｒｒｙ（ｐＨＲ中）」：
Figure 0007068169000267
配列中、ＥＲβ ＬＢＤを下線で示す。
具体的には、ヒトエストロゲン受容体βリガンド結合ドメイン（ＥＲ－β）及びコリプレッサーペプチド（ＣｏＲＮＲ）を含むように構築したＣＤ１９特異的オンスイッチＣＡＲを発現する初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞によるＣＤ６９のアップレギュレーションについて、小分子二量体化因子（４－ヒドロキシタモキシフェンまたはラパログ「ラパ」）の存在下または非存在下で、ＣＤ１９または無関係の抗原メソテリン（「メソ」）を発現するＫ５６２標的細胞と２４時間共培養した後に測定した。図１８Ａに示されるように、ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲオンスイッチＣＡＲ構築物を発現する初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞のＣＤ１９抗原誘導活性化は、培養物に供給された小分子二量体化因子の用量に依存した。４－ヒドロキシタモキシフェンの用量の増加と、ＣＤ６９陽性初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞の数の増加との間の相関を示す、フローサイトメトリーデータから得たヒストグラムを図１８Ｂに示す。
ＣＤ１９特異的ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲオンスイッチＣＡＲを発現する初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞による細胞殺傷についても評価した。具体的には、様々な濃度の薬物（４－ヒドロキシタモキシフェン（４ＨＴ）またはラパログ）の存在下で、ＣＤ１９特異的ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲオンスイッチＣＡＲ（ＥＲ－ＣＡＲ）を発現する初代ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞と２２時間共培養した後に残っているＣＤ１９発現Ｋ５６２標的細胞のパーセントを測定した（図５２）。ＣＤ１９特異的一本鎖第２世代ＣＡＲ（「第２世代ＣＡＲ」）を発現する細胞及びＣＤ１９特異的ラパログオンスイッチＣＡＲを発現する細胞（ラパログ二量体化物質の投与を伴う）を陽性対照として使用した。陰性対照には、ＥＲ－ＣＡＲ Ｔ細胞を発現する細胞の４ＨＴの非存在下（エタノールビヒクルのみ、「ＥＲ－ＣＡＲ＋ＥｔＯＨ」）及びＥＲ－ＣＡＲオンスイッチ構築物の部分２のみを発現する（すなわち、部分１を含まない）細胞の４ＨＴの存在下を含めた。これらの結果は、ＥＲ－β／ＣｏＲＮＲ二量体化可能オンスイッチＣＡＲを発現する初代Ｔ細胞による薬物（４ＨＴ）誘導性標的細胞殺傷（すなわち、誘導性細胞傷害活性）を示している。
Ｔ細胞活性化の増大はまた、ヘテロ二量体化分子がヒトビタミンＤ受容体リガンド結合ドメインの一部及びＳＲＣ２－３コアクチベーターペプチドから構成される分割オンスイッチＣＡＲ構築物を発現する初代ＣＤ８＋Ｔ細胞でも観察された。この系において、Ｔ細胞は、ビタミンＤアナログのカルシポトリオールの存在下において、活性化の増大を示した。
本発明について、その特定の実地形態を参照しながら説明したが、当業者であれば、本発明の本来の趣旨及び範囲から逸脱することなく、種々の変更を行うことができ、同等物を代わりに使用できることを理解されよう。更に、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、１つまたは複数のプロセスステップを本発明の目的、趣旨及び範囲に適合させるように、多くの改変を行ってもよい。こうした改変は全て、本明細書に添付される特許請求の範囲に含まれることが意図される。

Claims (15)

  1. ａ）二量体化対の第１のメンバー及び第１の異種ポリペプチドを含む第１のキメラポリペプチドと、
    ｂ）二量体化対の第２のメンバー及び第２の異種ポリペプチドを含む第２のキメラポリペプチドと
    を含み、かつ核内ホルモン受容体のＤＮＡ結合ドメインを含まない、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドであって、
    前記二量体化対の前記第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ前記二量体化対の前記第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
    前記二量体化対の前記第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ前記二量体化対の前記第２のメンバーは核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
    前記核内ホルモン受容体はエストロゲン受容体であり、かつ前記コレギュレーターの配列はSEQ ID NO: 12を含むか、
    前記核内ホルモン受容体はＰＰＡＲγ受容体であり、かつ前記コレギュレーターの配列はSEQ ID NO: 696を含み、
    前記第１のキメラポリペプチドと前記第２のキメラポリペプチドは、前記ＬＢＤの前記コレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
    前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  2. ａ）前記第１の異種ポリペプチドが受容体のＮ末端部分であり、
    ｂ）前記第２の異種ポリペプチドが前記受容体のＣ末端部分であり、
    前記二量体化物質によって媒介される前記第１のキメラポリペプチドと前記第２のキメラポリペプチドの二量体化が、前記受容体のシグナル伝達活性を回復させるか；または
    ａ）前記第１の異種ポリペプチドが酵素のＮ末端部分であり、
    ｂ）前記第２の異種ポリペプチドが前記酵素のＣ末端部分であり、
    前記第１のキメラポリペプチドと前記第２のキメラポリペプチドの二量体化が、前記酵素の酵素活性を回復させる、
    請求項１に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  3. 前記受容体がキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ヘテロ二量体であり、かつ
    ａ）前記第１の異種ポリペプチドがＣＡＲヘテロ二量体の第１のポリペプチドであり、
    ｂ）前記第２の異種ポリペプチドがＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドであるか；または
    前記受容体がＴ細胞受容体（ＴＣＲ）であり、かつ
    ａ）前記第１の異種ポリペプチドがＴＣＲα鎖であり、
    ｂ）前記第２の異種ポリペプチドがＴＣＲβ鎖である、
    請求項２に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  4. 前記酵素がＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼであり、任意でクラス２のＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓエンドヌクレアーゼであり、任意でＩＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質、Ｖ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質またはＶＩ型ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓタンパク質であり、かつ
    ａ）前記第１の異種ポリペプチドが前記ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＮ末端部分であり、
    ｂ）前記第２の異種ポリペプチドが前記ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼのＣ末端部分であり、
    前記ＬＢＤの前記コレギュレーターへの結合を誘導する前記二量体化物質によって媒介される前記第１のキメラポリペプチドと前記第２のキメラポリペプチドの二量体化が、前記ＲＮＡ誘導型エンドヌクレアーゼの酵素機能を回復させる、
    請求項２に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  5. 前記受容体がＣＡＲヘテロ二量体であり、
    ａ）前記ＣＡＲヘテロ二量体の第１のポリペプチドが、
    ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
    ｉｉ）第１の調節ドメイン、
    ｉｉｉ）前記二量体化対の前記第１のメンバー、及び
    ｉｖ）前記特異的結合対の第１のメンバーと前記第１の調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
    を含み、
    ｂ）前記ＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドが、
    ｉ）膜貫通ドメイン、
    ｉｉ）第２の調節ドメイン、
    ｉｉｉ）前記二量体化対の前記第２のメンバー、及び
    ｉｖ）細胞内シグナル伝達ドメイン
    を含むか、または
    ａ）前記ＣＡＲヘテロ二量体の第１のポリペプチドが、
    ｉ）特異的結合対の第１のメンバー、
    ｉｉ）調節ドメイン、
    ｉｉｉ）前記二量体化対の前記第１のメンバー、
    ｉｖ）前記特異的結合対の第１のメンバーと前記調節ドメインとの間に介在する膜貫通ドメイン
    を含み、
    ｂ）前記ＣＡＲヘテロ二量体の第２のポリペプチドが、
    ｉ）前記二量体化対の第２のメンバー、及び
    ｉｉ）細胞内シグナル伝達ドメイン
    を含む、
    請求項３に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  6. 前記特異的結合対の前記第１のメンバーが、抗体もしくは抗体断片、リガンド、受容体、または非抗体ベースの認識足場であり、任意で、前記抗体もしくは抗体断片、リガンド、受容体、または非抗体ベースの認識足場が、細胞上の、固体表面上の、もしくは脂質二重層上に存在するエピトープと結合し；
    前記第１及び第２の調節ドメインは、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＢＴＬＡ、ＯＸ－４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ、ＨＶＥＭ、ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２及びＣＤ２８から選択され；かつ／または
    前記細胞内シグナル伝達ドメインが、ＺＡＰ７０及びＣＤ３－ζから選択される、
    請求項５に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチド。
  7. 合成刺激性ＩＣＲと合成ＩＣＲリプレッサーとを含み、かつ核内ホルモン受容体のＤＮＡ結合ドメインを含まない、ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）であって、
    前記合成刺激性ＩＣＲは二量体化対の第１のメンバーを含み、かつ前記合成ＩＣＲリプレッサーは細胞内抑制ドメインに連結された前記二量体化対の第２のメンバーを含み、
    前記二量体化対の前記第１のメンバーは核内ホルモン受容体のリガンド結合ドメイン（ＬＢＤ）を含み、かつ前記二量体化対の前記第２のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターを含むか、
    前記二量体化対の前記第１のメンバーは核内ホルモン受容体のコレギュレーターであり、かつ前記二量体化対の前記第２のメンバーは前記核内ホルモン受容体のＬＢＤを含み、
    前記核内ホルモン受容体はエストロゲン受容体であり、かつ前記コレギュレーターの配列はSEQ ID NO: 12を含むか、
    前記核内ホルモン受容体はＰＰＡＲγ受容体であり、かつ前記コレギュレーターの配列はSEQ ID NO: 696を含み、
    前記合成刺激性ＩＣＲと前記合成ＩＣＲリプレッサーは、前記ＬＢＤの前記コレギュレーターへの結合を誘導する二量体化物質の存在下で二量体化する、
    前記ヘテロ二量体条件付抑制可能合成免疫細胞受容体（ＩＣＲ）。
  8. 前記合成刺激性ＩＣＲが、細胞内共刺激ドメインを含み、任意で、前記細胞内共刺激ドメインが、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＯＸ－４０、ＢＴＬＡ、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＧＩＴＲ及びＨＶＥＭからなる群から選択され；
    前記細胞内抑制ドメインが、ＰＤ－１、ＣＴＬＡ４、ＨＰＫ１、ＳＨＰ１、ＳＨＰ２、Ｓｔｓ１及びＣｓｋからなる群から選択されるタンパク質に由来する抑制ドメインであり；かつ／または
    前記合成刺激性ＩＣＲが、ＣＤ３－ζシグナル伝達ドメイン、ＺＡＰ７０シグナル伝達ドメイン及び免疫受容体チロシン活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）からなる群から選択される細胞内シグナル伝達ドメインを含む、
    請求項７に記載のヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
  9. 前記合成刺激性ＩＣＲが、合成キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）もしくはその一部であるか、または
    前記合成刺激性ＩＣＲが、合成Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）もしくはその一部である、
    請求項７または８に記載のヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲ。
  10. 請求項１～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲを産生するように遺伝子改変され、任意で、幹細胞、前駆細胞、幹細胞もしくは前駆細胞に由来する細胞、Ｔリンパ球、またはＮＫ細胞である、哺乳動物細胞。
  11. 請求項１～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸または前記核酸を含む組み換え発現ベクター。
  12. 真核細胞の活性を調節するｅｘ ｖｉｖｏ方法であって、
    ａ）請求項１～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲを前記真核細胞において発現させる工程と、
    ｂ）前記細胞を前記リガンドと接触させる工程とを含む、前記方法。
  13. Ｔリンパ球の活性をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで調節する方法であって、前記Ｔリンパ球を二量体化物質及び抗原とｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで接触させる工程を含み、前記Ｔリンパ球は、請求項２および５～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲを産生するように遺伝子改変され、前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは、ａ）第１の異種ポリペプチドが受容体のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドが前記受容体のＣ末端部分であり、前記二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化が受容体のシグナル伝達活性を回復させる、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドであり、前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドまたはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲは、前記二量体化物質及び前記抗原の存在下で二量体化して、前記Ｔリンパ球の活性を調節し、これにより、調節されたＴリンパ球が生じ、かつ／または前記Ｔリンパ球が活性化され、これにより、活性化されたＴリンパ球が生じる、前記方法。
  14. 請求項１０に記載の細胞をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで作製する方法であって、請求項１～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドもしくはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターを用いて哺乳動物細胞をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで遺伝子改変する工程、または請求項１～９のいずれか一項に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドもしくはヘテロ二量体条件付抑制可能合成ＩＣＲをコードするヌクレオチド配列を含むＲＮＡを用いて哺乳動物細胞をｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで遺伝子改変する工程を含み；任意で、前記細胞が、Ｔリンパ球、幹細胞、ＮＫ細胞、前駆細胞、幹細胞に由来する細胞、もしくは前駆細胞に由来する細胞である、前記方法。
  15. 遺伝子改変されたＴリンパ球と二量体化物質との組み合わせを含む、個体のがんを治療するための医薬であって、
    前記Ｔリンパ球が、請求項５または６に記載のヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドを産生するように遺伝子改変されており、前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドは、ａ）第１の異種ポリペプチドが受容体のＮ末端部分であり、ｂ）第２の異種ポリペプチドが前記受容体のＣ末端部分であり、前記二量体化物質によって媒介される第１のキメラポリペプチドと第２のキメラポリペプチドの二量体化が受容体のシグナル伝達活性を回復させる、ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドであり、前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの特異的結合対の第１のメンバーは、前記個体のがん細胞上のエピトープに対して特異的であり、かつ前記二量体化物質は、前記ヘテロ二量体条件付活性ポリペプチドの二量体化を誘導し、前記二量体化は、前記遺伝子改変されたＴリンパ球の活性化及び前記がん細胞の殺傷をもたらし、これにより、前記がんを治療する、前記医薬。
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