JP6976315B2 - 補体因子に基づくアフィニティークロマトグラフィー - Google Patents
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Description
一般に、免疫グロブリンは、いわゆる軽鎖ポリペプチド(軽鎖)2つおよびいわゆる重鎖ポリペプチド(重鎖)2つを含む。重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドはそれぞれ、抗原と相互作用することができる結合領域を含む可変ドメイン(可変領域)(一般に、ポリペプチド鎖のアミノ末端部分)を含む。重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドはそれぞれ、定常領域(一般にカルボキシル末端部分)を含む。重鎖の定常領域は、抗体の(i)Fcγ受容体(FcγR)を有する細胞、例えば食細胞への、または(ii)ブランベル(Brambell)受容体としても公知の新生児型Fc受容体(FcRn)を有する細胞への結合を媒介する。それはまた、成分(C1q)のような古典的補体系の因子を含むいくつかの因子への結合も媒介する。
本明細書において報告される1つの局面は、補体C1q亜成分サブユニットA〜Cの断片を含む融合ポリペプチドの、アフィニティークロマトグラフィーリガンドとしての使用である。
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の融合ポリペプチドであり、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
[本発明1001]
式I:
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の融合ポリペプチド:
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
[本発明1002]
X1、X2、およびX3が存在しかつX4が存在しないか、または、X2、X3、およびX4が存在しかつX1が存在しない、本発明1001の融合ポリペプチド。
[本発明1003]
X1がSEQ ID NO: 10のアミノ酸配列を有し、X2がSEQ ID NO: 11もしくは12のアミノ酸配列を有し、かつX3がSEQ ID NO: 13もしくは14のアミノ酸配列を有するか、または、X2がSEQ ID NO: 13もしくは14のアミノ酸配列を有し、X3がSEQ ID NO: 11もしくは12のアミノ酸配列を有し、かつX4がSEQ ID NO: 10のアミノ酸配列を有する、本発明1001または1002の融合ポリペプチド。
[本発明1004]
C1qAがSEQ ID NO: 07のアミノ酸配列を有し、C1qBがSEQ ID NO: 08のアミノ酸配列を有し、かつC1qCがSEQ ID NO: 09のアミノ酸配列を有する、本発明1001〜1003のいずれかの融合ポリペプチド。
[本発明1005]
TAGが、存在し、かつSEQ ID NO: 15のアミノ酸配列を有する、本発明1001〜1004のいずれかの融合ポリペプチド。
[本発明1006]
式IがN末端からC末端への方向を右から左に表す、本発明1001の融合ポリペプチド。
[本発明1007]
本発明1001〜1006のいずれかの融合ポリペプチドを2〜6つ含む、多量体非共有結合性複合体。
[本発明1008]
前記融合ポリペプチドのうちの少なくとも1つにTAGが存在し、かつ前記融合ポリペプチドのうちの少なくとも1つにTAGが存在しない、本発明1007の多量体非共有結合性複合体。
[本発明1009]
アフィニティークロマトグラフィーにおけるアフィニティークロマトグラフィーリガンドとしての、本発明1001〜1006のいずれかの融合ポリペプチドまたは本発明1007または1008の多量体複合体の使用。
[本発明1010]
前記融合ポリペプチドまたは前記複合体が固相上に固定化されている、本発明1009の使用。
[本発明1011]
前記アフィニティークロマトグラフィーが、少なくとも1つのFc領域を含む抗体または融合ポリペプチドを分離するためのアフィニティークロマトグラフィーである、本発明1009または1010の使用。
[本発明1012]
前記固相がクロマトグラフィー材料である、本発明1010または1011の使用。
[本発明1013]
抗体と参照抗体の保持時間の比を決定することによる該抗体のインビボ半減期の決定のための使用である、本発明1009〜1012のいずれかの使用。
[本発明1014]
1つのFc領域の少なくとも1つのC1q結合部分を含む親抗体または親融合ポリペプチドの修飾抗体または修飾融合ポリペプチドのライブラリーを、該親抗体または親融合ポリペプチドと比べてC1qに対する結合親和性が変化している該修飾抗体または修飾融合ポリペプチドについてスクリーニングするための使用である、本発明1009〜1013のいずれかの使用。
[本発明1015]
1つのFc領域の少なくとも1つのC1q結合部分を含みC1qに対する結合の変化を示す抗体または融合ポリペプチドを同定するための使用である、本発明1009〜1013のいずれかの使用。
[本発明1016]
前記抗体が、融合ポリペプチドの単一特異性抗体もしくは単一特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの二重特異性抗体もしくは二重特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの三重特異性抗体もしくは三重特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの四重特異性抗体もしくは四重特異性抗体断片である、本発明1009〜1015のいずれかの使用。
本発明は、少なくとも一部、補体C1q亜成分サブユニットを配列A-B-Cにおいて含む一本鎖組換えC1qが、改善された特性を有するという知見に基づく。例えば、それは、抗体およびFc領域を含むポリペプチドの解析および分離のために、アフィニティークロマトグラフィーリガンドとして使用することができる。
本発明を実施するために有用な方法および技法は、当業者に公知であり、例えば、Thielens, N.M., et al., J. Immunol. 151 (1993) 6583-6592;Ausubel, F.M., ed., Current Protocols in Molecular Biology, Volumes I〜III (1997)、およびSambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)に記載されている。当業者に公知のように、組換えDNA技術の使用により、核酸および/またはポリペプチドの多数の誘導体の作製が可能である。そのような誘導体は、例えば、置換、改変、交換、欠失、または挿入によって、1つの個々の位置またはいくつかの位置において修飾することができる。修飾または誘導体化は、例えば、部位特異的変異誘発によって実施することができる。そのような修飾は、当業者が容易に実施することができる(例えば、Sambrook, J., et al., Molecular Cloning: A laboratory manual (1999) Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, USAを参照されたい)。組換え技術の使用により、当業者は、様々な宿主細胞を1つまたは複数の異種核酸で形質転換することが可能である。異なる細胞の転写および翻訳、すなわち発現の機構は、同じ要素を使用するが、異なる種に属する細胞は、とりわけ、異なるいわゆるコドン使用頻度を有する場合がある。それによって、(アミノ酸配列に関して)同一のポリペプチドが、異なる核酸によってコードされる場合がある。また、遺伝子コードの縮重のために、異なる核酸が同じポリペプチドをコードする場合がある。
のアミノ酸配列を有する。
‐ FcγRI(CD64)は、単量体IgGに高親和性で結合し、マクロファージ、単球、好中球、および好酸球上に発現している。アミノ酸残基E233〜G236、P238、D265、N297、A327、およびP329(KabatのEU指標による番号付与)のうちの少なくとも1つでのFc領域IgGにおける修飾は、FcγRIに対する結合を減少させる。IgG1中およびIgG4中に置換された、位置233〜236のIgG2残基は、FcγRIに対する結合を103倍減少させ、抗体感作赤血球に対するヒト単球応答を除去した(Armour, K.L., et al., Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624)。
‐ FcγRII(CD32)は、中程度から低い親和性で複合型IgGに結合し、広く発現している。この受容体は、FcγRIIAおよびFcγRIIBの2つのサブタイプに分けることができる。FcγRIIAは、死滅に関与する多くの細胞(例えば、マクロファージ、単球、好中球)上で見出され、死滅プロセスを活性化することができるように見える。FcγRIIBは、阻害性プロセスにおいて役割を果たすように見え、B細胞、マクロファージ上、ならびに肥満細胞および好酸球上で見出される。B細胞上では、さらなる免疫グロブリン産生、および、例えばIgEクラスへのアイソタイプスイッチングを抑制するために機能するように見える。マクロファージ上で、FcγRIIBは、FcγRIIAを通して媒介されるような食作用を阻害するように働く。好酸球および肥満細胞上で、B型は、その別々の受容体へのIgE結合を通したこれらの細胞の活性化を抑制するように手助けする場合がある。FcγRIIAに対する結合の減少が、例えば、アミノ酸残基E233〜G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、R292、およびK414(KabatのEU指標による番号付与)のうちの少なくとも1つに変異を有するIgG Fc領域を含む抗体について見出されている。
‐ FcγRIII(CD16)は、中程度から低い親和性でIgGに結合し、2つのタイプとして存在する。FcγRIIIAは、NK細胞、マクロファージ、好酸球、ならびにいくつかの単球およびT細胞上で見出され、ADCCを媒介する。FcγRIIIBは、好中球上に高発現している。FcγRIIIAに対する結合の減少が、例えば、アミノ酸残基E233〜G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、S239、E269、E293、Y296、V303、A327、K338、およびD376(KabatのEU指標による番号付与)のうちの少なくとも1つに変異を有するIgG Fc領域を含む抗体について見出されている。
(a)アミノ酸残基26〜32(L1)、50〜52(L2)、91〜96(L3)、26〜32(H1)、53〜55(H2)、および96〜101(H3)に存在する超可変ループ(Chothia, C. and Lesk, A.M., J. Mol. Biol. 196 (1987) 901-917);
(b)アミノ酸残基24〜34(L1)、50〜56(L2)、89〜97(L3)、31〜35b(H1)、50〜65(H2)、および95〜102(H3)に存在するCDR(Kabat, E.A. et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991), NIH Publication 91-3242.);
(c)アミノ酸残基27c〜36(L1)、46〜55(L2)、89〜96(L3)、30〜35b(H1)、47〜58(H2)、および93〜101(H3)に存在する抗原接触部(MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996));ならびに
(d)アミノ酸残基46〜56(L2)、47〜56(L2)、48〜56(L2)、49〜56(L2)、26〜35(H1)、26〜35b(H1)、49〜65(H2)、93〜102(H3)、および94〜102(H3)を含む、(a)、(b)、および/または(c)の組合せ
を含む。
100×比X/Y
上式で、Xは、配列アラインメントプログラムALIGN-2によって、そのプログラムによるAおよびBのアラインメントにおいて同一のマッチとして採点されたアミノ酸残基の数であり、Yは、B中のアミノ酸残基の総数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さに等しくない場合、Bに対するAのアミノ酸配列同一性%は、Aに対するBのアミノ酸配列同一性%と等しくならないが認識されると考えられる。別段の記載が特に無い限り、本明細書において使用されるアミノ酸配列同一性%の値はすべて、すぐ前の節で説明したようにして、ALIGN-2コンピュータープログラムを用いて得られる。
典型的には、治療薬として使用されることが意図される非ヒト抗体を、ヒト化して、親の非ヒト抗体の特異性および親和性を保持しつつ、ヒトに対する免疫原性を減少させる。一般に、ヒト化抗体は、HVR、例えば、CDR(またはその一部分)が非ヒト抗体に由来し、かつFR(またはその一部分)がヒト抗体配列に由来する、1つまたは複数の可変ドメインを含む。ヒト化抗体は、任意で、ヒト定常領域の少なくとも一部分または完全長ヒト定常領域も含むことになる。いくつかの態様において、ヒト化抗体中のいくつかのFR残基は、例えば、抗体の特異性または親和性を回復させるためまたは改善するために、非ヒト抗体(例えば、HVR残基が由来する抗体)由来の対応する残基で置換されている。
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の融合ポリペプチドであり、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の固定化された融合ポリペプチドの、アフィニティークロマトグラフィーリガンドとしての使用であり、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の固定化された融合ポリペプチドの、抗体糖型(glycoform)の分離のためのアフィニティークロマトグラフィーリガンドとしての使用であり、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の融合ポリペプチドを含む、アフィニティークロマトグラフィーカラムが報告され、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
X1、X2、X3、X4は互いに独立して、存在するかまたは存在しないかのいずれかであり、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
TAGは、存在してもよいかまたは存在しなくてもよく、
C1qAはSEQ ID NO: 01の断片であり、
C1qBはSEQ ID NO: 03の断片であり、
C1qCはSEQ ID NO: 05の断片であり、かつ
-はペプチド結合を表す。
(a)ライブラリーの個々のメンバーおよび親抗体または親融合ポリペプチドを、本明細書において報告されるC1qアフィニティークロマトグラフィーカラムにアプライする段階;
(b)ライブラリーの個々のメンバーを、イオン強度勾配で回収する段階、および個々の保持時間を測定する段階;ならびに
(c)親抗体または親融合ポリペプチドと比べてC1qに対する結合親和性が変化しているそれらの抗体または融合ポリペプチドを選択する段階
を含む。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は抗体断片である。抗体断片には、Fab断片、Fab'断片、Fab'-SH断片、F(ab')2断片、Fv断片、およびscFv断片、ならびに後述する他の断片が含まれるが、それらに限定されるわけではない特定の抗体断片の概要については、Hudson, P.J. et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134を参照されたい。scFv断片の概要については、例えば、Plueckthun, A., In: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Vol. 113, Rosenburg and Moore (eds.), Springer-Verlag, New York (1994), pp. 269-315を参照されたい。また、WO93/16185ならびにUS5,571,894およびUS5,587,458も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、インビボ半減期が長くなっているFab断片およびF(ab')2断片の考察については、US5,869,046を参照されたい。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は、キメラ抗体である。いくつかのキメラ抗体が、例えば、US4,816,567;およびMorrison, S.L., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81 (1984) 6851-6855において説明されている。1つの例において、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはヒト以外の霊長類、例えばサルに由来する可変領域)およびヒト定常領域を含む。別の例において、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のものから変更された、「クラススイッチされた」抗体である。キメラ抗体には、その抗原結合断片が含まれる。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当技術分野において公知の様々な技術を用いて作製することができる。ヒト抗体は、van Dijk, M.A. and van de Winkel, J.G., Curr. Opin. Pharmacol. 5 (2001) 368-374およびLonberg, N., Curr. Opin. Immunol. 20 (2008) 450-459において一般的に説明されている。
本明細書において報告される方法で使用される抗体は、所望の1種類または複数種類の活性を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって、単離することができる。例えば、ファージディスプレイライブラリーを作製し、所望の結合特徴を有する抗体についてそのようなライブラリーをスクリーニングするための様々な方法が、当技術分野において公知である。このような方法は、例えば、Hoogenboom, H.R., et al., Methods in Molecular Biology 178 (2002) 1-37において概説されており、例えば、McCafferty, J., et al., Nature 348 (1990) 552-554; Clackson, T., et al., Nature 352 (1991) 624-628; Marks, J.D., et al., J. Mol. Biol. 222 (1992) 581-597; Marks, J.D. and Bradbury, A., Methods in Molecular Biology 248 (2003) 161-175; Sidhu, S.S., et al., J. Mol. Biol. 338 (2004) 299-310; Lee, C.V., et al., J. Mol. Biol. 340 (2004) 1073-1093; Fellouse, F.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 (2004) 12467-12472;およびLee, C.V., et al., J. Immunol. Methods 284 (2004) 119-132においてさらに説明されている。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。特定の態様において、二重特異性抗体は、同じ抗原の2つの異なるエピトープに結合し得る。また、二重特異性抗体は、抗原を発現する細胞に細胞障害性物質を局在させるのにも使用され得る。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体断片として調製することができる。
特定の態様において、抗体のアミノ酸配列バリアントが企図されかつ解析される。例えば、抗体の結合親和性および/または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列バリアントは、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な修飾を導入することによって、またはペプチド合成によって、調製することができる。このような修飾には、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失、ならびに/または残基中への挿入、および/もしくは残基の置換が含まれる。最終構築物が所望の特徴、例えば、抗原結合を示すことを条件として、欠失、挿入、および置換の任意の組合せを行って、最終構築物を得てもよい。
特定の態様において、1つまたは複数のアミノ酸置換を有する抗体バリアントが、本明細書において報告される方法で使用される。対象となる置換変異誘発部位には、HVRおよびFRが含まれる。例示的な変更は、表1の「例示的置換」という項目の下に提供し、アミノ酸側鎖のクラスに関してさらに後述する。保存的置換は、表1の「好ましい置換」という項目の下に示す。アミノ酸置換を関心対象の抗体に導入し、その作製物を所望の活性、例えば、保持された/向上した抗原結合、低下した免疫原性、または改善したADCCもしくはCDCについてスクリーニングすることができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性で親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の向きに影響する残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を大きくするか、または小さくするように改変される。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つまたは複数のグリコシル化部位が作製されるかまたは取り除かれるようにアミノ酸配列を改変することによって、簡便に達成することができる。
特定の態様において、1つまたは複数のアミノ酸修飾を、本明細書において報告される方法で使用される抗体のFc領域中に導入し、それによってFc領域バリアントを作製することができる。Fc領域バリアントは、1つまたは複数のアミノ酸位置にアミノ酸修飾(例えば置換)を含むヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のFc領域)を含み得る。
特定の態様において、システインで操作された抗体、例えば、抗体の1つまたは複数の残基がシステイン残基で置換されている「チオMAb」を作製することが望ましい場合がある。特定の態様において、置換される残基は、抗体の接近可能な部位に存在する。それらの残基をシステインで置換することにより、反応性チオール基が、その結果、抗体の接近可能な部位に位置づけられ、本明細書においてさらに説明するように、薬物部分またはリンカー-薬物部分などの他の部分に抗体をコンジュゲートさせて免疫コンジュゲートを作製するために使用され得る。特定の態様において、次の残基の任意の1つまたは複数をシステインで置換してよい:軽鎖のV205(Kabatの番号付与);重鎖のA118(EU番号付与);および重鎖Fc領域のS400(EU番号付与)。システインで操作された抗体は、例えば、US7,521,541において説明されているようにして作製することができる。
特定の態様において、本明細書において報告される方法で使用される抗体は、当技術分野において公知であり、容易に入手可能である付加的な非タンパク性部分を含むようにさらに修飾され得る。抗体の誘導体化に適した部分には、水溶性ポリマーが含まれるがそれに限定されるわけではない。水溶性ポリマーの非限定的な例には、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールの共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸共重合体、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダム共重合体のいずれか)、およびデキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、プロリルプロピレン(prolylpropylene)オキシド/エチレンオキシド共重合体、ポリオキシエチル化ポリオール(例えばグリセロール)、ポリビニルアルコール、ならびにそれらの混合物が含まれるが、それらに限定されるわけではない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中で安定であるため、製造の際に有利であり得る。ポリマーは、任意の分子量のものでよく、分枝状または非分枝状でよい。抗体に結合されるポリマーの数は変動してよく、複数のポリマーが結合される場合、それらは同じ分子または異なる分子でよい。通常、誘導体化のために使用されるポリマーの数および/またはタイプは、限定されるわけではないが、改善しようとする抗体の特定の特性または機能、その抗体誘導体が所定の条件下で治療法において使用されるかどうかなどを含む考慮すべき事柄に基づいて決定することができる。
モノクローナル抗体を作製するための方法は、KohlerおよびMilstein(Nature 256 (1975) 495-497)によって最初に報告されている。その後、抗体をコードする核酸(DNA)を安定に導入することによる、骨髄腫細胞を用いた組換え抗体の作製が報告されている(Oi, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80 (1983) 6351-6355を参照されたい)。
本発明の方法において、1種類または複数種類の細胞障害性物質、例えば、化学療法剤もしくは化学療法薬、増殖抑制剤、毒素(例えば、細菌、真菌、植物、もしくは動物に由来するタンパク毒素、酵素的に活性な毒素、またはそれらの断片)、または放射性同位元素にコンジュゲートされた抗体を含む、免疫コンジュゲートも使用することができる。
エレクトロスプレーイオン化質量分析法(ESI-MS)
N-グリカナーゼplus(Roche)0.5μLおよびリン酸ナトリウム緩衝液(0.1M、pH7.1)を添加することによってタンパク質アリコート(50μg)を脱グリコシル化して、最終試料体積115μLを得た。この混合物を37℃で18時間インキュベートした。その後、還元および変性のために、4M塩酸グアニジン(Pierce)に溶かした0.5M TCEP(Pierce)60μLおよび8M塩酸グアニジン50μLを添加した。この混合物を37℃で30分間インキュベートした。サイズ排除クロマトグラフィー(セファロースG-25、無勾配、2%ギ酸を含む40%アセトニトリル)によって試料を脱塩した。ナノESI供給源(TriVersa NanoMate、Advion)を装備されたQ-TOF機器(maXis、Bruker)を用いて、ESI質量スペクトル(+ve)を記録した。MSパラメーター設定は次のとおりであった:移動:ファンネルRF、400Vpp;ISCIDエネルギー、0eV;多重極RF、400Vpp;四重極:イオンエネルギー、4.0eV;低質量、600m/z;供給源:乾燥ガス、8L/分;乾燥ガスの温度、160℃;コリジョンセル:衝突エネルギー、10eV;衝突RF:2000Vpp;イオンクーラー:イオンクーラーRF、300Vpp;移動時間:120μ秒;プレパルス蓄積、10μ秒;スキャン範囲m/z600〜2000。データを評価するために、施設内で開発したソフトウェア(MassAnalyzer)を使用した。
FcRnに対する野生型抗体および変異体の結合特性を、BIAcore T100機器(BIAcore AB, Uppsala, Sweden)を用いて表面プラズモン共鳴(SPR)技術によって解析した。この方式は、分子相互作用の研究のために十分に確立されている。これにより、リガンド/分析物結合を連続的にリアルタイムでモニタリングし、したがって、様々なアッセイ法設定において動態パラメーターを測定することが可能になる。SPR技術は、金でコーティングされたバイオセンサーチップの表面近くでの屈折率の測定に基づいている。屈折率の変化から、固定化されたリガンドと溶液中に注入された分析物の相互作用によって引き起こされる表面の質量変化が示唆される。分子が、表面の固定化されたリガンドに結合する場合、質量は増加し、解離する場合は質量が減少する。本アッセイ法においては、400応答単位(RU)のレベルまで、アミンカップリングによってFcRn受容体をBIAcore CM5バイオセンサーチップ(GE Healthcare Bioscience, Uppsala, Sweden)上に固定化した。アッセイ法は、PBS、0.05% Tween20 pH6.0(GE Healthcare Bioscience)をランニング緩衝液および希釈用緩衝液として用いて室温で実施した。200nMのネイティブ抗体試料または酸化抗体試料を室温、流速50μL/分で注入した。結合時間は180秒であった。解離相は360秒に及んだ。HBS-P、pH8.0を短時間注入することにより、チップ表面の再生を達成した。注入後180秒および注入後300秒における生物学的応答シグナルの高さを比較することによって、SPRデータの評価を行った。対応するパラメーターは、RU最大レベル(注入後180秒)および後期の安定性(注入終了後300秒)である。
一本鎖C1q融合ポリペプチドの発現
ヘキサヒスチジン(hexahis)タグ付加ポリペプチドを含有する清澄化された上清を、4℃でNi-NTAアフィニティークロマトグラフィー樹脂(Qiagen, Hanbrechtikon, Switzerland)上にロードした。pH 7.4で300 mM NaClを含む、および20 mMイミダゾールを含有する20 mMリン酸ナトリウム緩衝液でのそれぞれの洗浄段階の後、AKTA Explorer 100クロマトグラフィーシステム(GE Healthcare Life Sciences, Uppsala, Sweden)上で、100 mM、それぞれ300 mMイミダゾールを含有する同じ緩衝液でのバッチ溶出を用いて、3 ml/分の流速でポリペプチドを溶出させた。画分を、変性かつ還元条件下でCE-SDS (LabChip GX, Caliper)にしたがってプールし、Amicon Ultra-15(Merck Millipore)を用いて濃縮して、pH 7.4に調整した500 mM NaClを含有する50 mMリン酸ナトリウム緩衝液に対して透析した。精製したポリペプチドを、Nanodrop分光光度計(Nanodrop Technologies, Wilmington, DE)を用いて定量し、CE-SDS(LabChip GX, Caliper)によって解析して、-80℃で保存した。
C1qアフィニティーカラムの調製
pH 7.2に調整し、3 ml PBS中に1錠のCompleteプロテアーゼインヒビター(cOmplete ULTRA Tablets, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Germany)を加えた、125 mM NaClおよび0.02% Tweenを含む2 mM MOPS緩衝液中のAvi Tagを有する一本鎖C1q融合ポリペプチドを、Avidity社のビオチン標識キットを用いて、製造業者の取扱い説明書に従って(Bulk BIRA, Avidity LLC, Denver, CO, USA)ビオチン標識した。ビオチン標識反応は、室温で一晩行った。リガーゼを分離するために、Ni-セファロースクロマトグラフィー(上記を参照されたい)を繰り返した。修飾ポリペプチドを、500 mM NaClを含む50 mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH7.2に対して4℃で一晩透析して、イミダゾールを除去した。
C1qアフィニティーカラムを用いたクロマトグラフィー
受容体誘導体化セファロースを、1 ml Tricorn 5/50カラム(GE Healthcare)に充填し、次いで、C1qカラムを、20 mM HEPES、pH 7.4で平衡化した。
カラム寸法: 50 mm×5 mm
ベッド高: 50 mm
ローディング: 30μgタンパク質/試料
流量: 0.5 ml/分
平衡化緩衝液: 20 mM HEPES、pH 7.4
溶出緩衝液: 20 mM HEPES、500 mM NaCl、pH 7.4
溶出: 10 CVの平衡化緩衝液、30 CVで40%溶出緩衝液まで、5 CVで100%溶出緩衝液まで
C1qを用いたSPRアッセイ法
野生型抗体および変異体のC1qに対する結合特性を、BIAcore T200機器(BIAcore AB, Uppsala, Sweden)を用いて表面プラズモン共鳴(SPR)技術によって解析した。
Claims (11)
- 式I:
TAG-X1-C1qA-X2-C1qB-X3-C1qC-X4 (式I)
の融合ポリペプチドであって、
式中、
X1は、第1のペプチド性リンカーを表し、
X2は、第2のペプチド性リンカーを表し、
X3は、第3のペプチド性リンカーを表し、
X4は、第4のペプチド性リンカーを表し、
TAGはアミノ酸配列タグであり、
C1qAは配列番号07のアミノ酸配列を有し、
C1qBは配列番号08のアミノ酸配列を有し、
C1qCは配列番号09のアミノ酸配列を有し、かつ
-はペプチド結合を表し、
X1、X2、およびX3が存在しかつX4が存在せず、かつX1が配列番号10のアミノ酸配列を有し、X2が配列番号11もしくは12のアミノ酸配列を有し、かつX3が配列番号13もしくは14のアミノ酸配列を有するか、または
X2、X3、およびX4が存在しかつX1が存在せず、かつX2が配列番号13もしくは14のアミノ酸配列を有し、X3が配列番号11もしくは12のアミノ酸配列を有し、かつX4が配列番号10のアミノ酸配列を有し、
TAGが、配列番号15のアミノ酸配列を有する、
前記融合ポリペプチド。 - 式IがN末端からC末端への方向を右から左に表す(N末端-C1qC-C1qB-C1qA-C末端)、請求項1に記載の融合ポリペプチド。
- 請求項1〜2のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを2〜6つ含む、多量体非共有結合性複合体。
- アフィニティークロマトグラフィーにおけるアフィニティークロマトグラフィーリガンドとしての、請求項1〜2のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドまたは請求項3に記載の多量体複合体の使用。
- 前記融合ポリペプチドまたは前記複合体が固相上に固定化されている、請求項4に記載の使用。
- 前記アフィニティークロマトグラフィーが、少なくとも1つのFc領域を含む抗体または融合ポリペプチドを分離するためのアフィニティークロマトグラフィーである、請求項4または5に記載の使用。
- 前記固相がクロマトグラフィー材料である、請求項5または6に記載の使用。
- 抗体と参照抗体の保持時間の比を決定することによる該抗体のインビボ半減期の決定のための使用である、請求項4〜7のいずれか一項に記載の使用。
- 1つのFc領域の少なくとも1つのC1q結合部分を含む親抗体または親融合ポリペプチドの修飾抗体または修飾融合ポリペプチドのライブラリーを、該親抗体または親融合ポリペプチドと比べてC1qに対する結合親和性が変化している該修飾抗体または修飾融合ポリペプチドについてスクリーニングするための使用である、請求項4〜8のいずれか一項に記載の使用。
- 1つのFc領域の少なくとも1つのC1q結合部分を含みC1qに対する結合の変化を示す抗体または融合ポリペプチドを同定するための使用である、請求項4〜8のいずれか一項に記載の使用。
- 前記抗体が、融合ポリペプチドの単一特異性抗体もしくは単一特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの二重特異性抗体もしくは二重特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの三重特異性抗体もしくは三重特異性抗体断片、または融合ポリペプチドの四重特異性抗体もしくは四重特異性抗体断片である、請求項4〜10のいずれか一項に記載の使用。
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