JP6899779B2 - コムギ雄性不稔遺伝子wmsおよびその葯特異的発現プロモーターならびにそれらの使用 - Google Patents

コムギ雄性不稔遺伝子wmsおよびその葯特異的発現プロモーターならびにそれらの使用 Download PDF

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Description

(関連出願)
本願は、2015年6月4日に出願された中国特許出願第201510303817.0号の優先権を主張するものであり、上記出願の主題はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
(技術分野)
本発明は、1つのコムギ雄性不稔(WMS)遺伝子、その葯特異的遺伝子プロモーターおよびそれらの使用に関する。
植物の雄性不稔性を用いて、選択育種およびハイブリッド種子生産のための交配を容易にすることができる(Raoら,1990;Kempken and Pring,1999;Mackenzie,2012)。多くの作物種では、多数の雄性不稔系統が発見され、貴重な遺伝資源として保存されており、特にトウモロコシおよびコメなどの主要な穀類の雄性不稔系統の作製が多数試みられている。
Pioneer Hi−Bred International社ではSeed Production Technology(SPT)の開発が進められている(Waltz,2012)。トウモロコシでは、SPT技術に雄性稔性の優性Ms45遺伝子、雄性不稔性の劣性ms45遺伝子および可視的選択マーカーのDsRed2遺伝子を使用する。Ms45遺伝子は葯特異的プロモーターによって調節されている。トウモロコシ維持系統DP−32138−1(ms45/ms45、Ms45−DsRed2/_)は花粉供与体としての役割を果たし、これにより生じた非トランスジェニック雄性不稔トウモロコシ系統(ms45/ms45)は雌性近交親としてハイブリッド種子の作製に用いられる。トウモロコシの雄性不稔性に関する研究はほかにもあり、シトクロームP450様遺伝子(Ms26)の変異誘発によってトウモロコシに雄性不稔性が生じる(Djukanovicら,2013)。一方、標的遺伝子の葯特異的発現は、ほかの意図しないペナルティがない雄性不稔性を生じさせるのに極めて重要なものである。Luoら(2006)は、コメcDNAライブラリーの差次スクリーニングによってタペート組織特異的遺伝子RTSを発見した(Luoら,2006)。RTS遺伝子は、減数分裂時にタペート組織に優勢発現を示し、この発現は開花前に消失する。Liuら(2013)は、ハイスループットな発現プロファイリングによってコメの葯特異的脂質輸送タンパク質(OsLTP6)遺伝子を同定した(Liuら,2013)。一般に、雄性稔性/不稔性遺伝子の葯特異的発現は、ハイブリッド種子生産の際に不可欠な系統を導入するのに重要なものである。
哺乳動物をはじめとする真核生物では、ゲノム編集によって標的遺伝子の特異的改変が可能である(ChengおよびAlper,2014)。ごく最近では、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)およびクラスター化され等間隔にスペーサーが入った短い回文型の反復配列(CRISPR)/Cas9がコムギ(Wangら,2014)およびオオムギ(Wendtら,2013;Gurushidzeら,2014)で機能することが明らかにされている。したがって、ゲノム編集を用いて、付加価値生産物の作製に使用し得る標的特異的改変を穀類に導入することが可能である。
Taigu遺伝子雄性不稔コムギ(以降、「Taigu」と称する)は中国で発見された雄性不稔六倍体コムギ変異体である(Yangら,2009)。「Taigu」では、単一の優性遺伝子Ms2が雄性不稔性を決定する。「Taigu」コムギと雄性稔性六倍体コムギを交配すると、そのF植物体は雄性稔性/不稔性に分離し、具体的には、半数が雄性稔性植物体になり、半数が雄性不稔性植物体になる(DengおよびGao,1982)。Ms2遺伝子座については表現型(Rht−Dlcによって生じる矮化)および分子マーカーが開発されている(LiuおよびDeng,1986;Caoら,2009)。1983年以来、中国では「Taigu」コムギが循環選抜のツールとして用いられている。これまでに、Ms2遺伝子または密に連鎖したRht−Dlc/Ms2遺伝子座(以降、RMs2と称する)を保有する中国コムギが数百系統開発されており、「Taiguコムギ」と総称される。2010年までに、RMs2に基づく循環選抜によって耐病性、耐塩性および耐乾性または収量性が向上したコムギが42品種発表されている。生産システムをさらに向上させるべくMs2遺伝子を操作するため、本発明者らは、トランスクリプトーム解析を用いてMs2遺伝子をクローン化することを目的とした。
本発明は、新規なコムギ雄性不稔(WMS)遺伝子、その遺伝子プロモーターおよびそれらの使用を提供する。
本発明では、RNA−seqを用いて減数分裂の初期段階での「Lumai 15」および「Lumai 15+Ms2」(以降、LM15Ms2)の葯トランスクリプトームの特徴を明らかにした。その結果、WMS遺伝子が1つ同定され、その遺伝子は、優性Ms2遺伝子を保有するコムギにのみ減数分裂の初期段階で葯特異的発現を示した。このWMS遺伝子はコムギの雄性不稔性に関与することが示唆され、植物のWMS遺伝子を操作することによってその稔性を変化させ得る。さらに、WMSプロモーターは、葯特異的遺伝子発現を得るのに重要な葯特異的活性を備えるものと考えられた。したがって、本発明は、葯特異的遺伝子発現を得るツール、様々な植物種に雄性不稔性を発現させるツール、様々な植物種の循環選抜を確立するツールおよび種子生産を補助するツールとして用いると極めて有用であると考えられ得る。具体的には、本発明は以下のものに関連する:
[1]以下の(a)〜(e):(a)配列番号1のヌクレオチド配列を含むcDNA;(b)配列番号2のアミノ酸配列をコードするDNA;(c)配列番号6のヌクレオチド配列を含むDNA;(d)(i)配列番号2のアミノ酸配列を含むタンパク質と機能的に等価であり、かつ(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含み、1つまたは複数のアミノ酸が置換、欠失、付加および/または挿入されているタンパク質をコードする、DNA;ならびに(e)(i)配列番号2のアミノ酸配列を含むタンパク質と機能的に等価なタンパク質をコードし、かつ(ii)配列番号1および6のヌクレオチド配列を含むDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAのいずれか1つの単離DNA;
[2]配列番号1および6のDNAの転写産物に相補的なアンチセンスRNAをコードするDNA;
[3]配列番号1および6のDNAの転写産物を特異的に切断するリボザイム活性を備えたRNAをコードするDNA;
[4]植物細胞内で発現すると共抑制作用によって配列番号1および6のDNAの発現をダウンレギュレートするRNAをコードするDNA;
[5][1]のDNAがコードする植物細胞内の内因性転写産物にドミナントネガティブな特徴を備えたRNAをコードするDNA;または[1]のDNAがコードする植物細胞内の内因性タンパク質にドミナントネガティブな特徴を備えたタンパク質をコードするDNA;
[6][1]〜[5]のいずれか1つのDNAを含むベクター;
[7][1]〜[5]のいずれか1つのDNAまたは[6]のベクターが導入されている形質転換植物細胞;
[8][7]の形質転換植物細胞を含む形質転換植物体;
[9][8]の形質転換植物体の形質転換植物体クローンまたは形質転換植物体子孫であって、[7]の形質転換植物細胞を含む形質転換植物体クローンまたは形質転換植物体子孫;
[10][7]の形質転換植物細胞を含む[8]または[9]の形質転換植物体由来の種子、組織および器官;
[11]以下の(a)〜(c):(a)配列番号5のヌクレオチド配列を含むDNA;(b)配列番号5のヌクレオチド配列を含み、1つまたは複数のヌクレオチドが置換、欠失、付加および/または挿入されているDNA;ならびに(c)配列番号5のヌクレオチド配列を含むDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAのいずれか1つのDNAであって、葯特異的プロモーター活性を備えた、DNA;
[12][11]のDNAを含むベクター;
[13][11]または[12]のDNAを含む形質転換植物細胞;
[14][13]の形質転換植物細胞を含む形質転換植物体;
[15][14]の形質転換植物体の形質転換植物体クローンまたは形質転換植物体子孫であって、[13]の形質転換植物細胞を含む形質転換植物体クローンまたは形質転換植物体子孫;
[16][13]の形質転換植物細胞を含む[14]または[15]の形質転換植物体由来の種子、組織および器官;
[17]配列番号1および4のヌクレオチド配列を含むDNAに対するゲノム編集ならびに/あるいは変異誘発誘導によって作製した遺伝子改変植物細胞であって、上記の改変が植物の雄性稔性を調節する遺伝子改変植物細胞;
[18][17]の遺伝子改変植物細胞を含む遺伝子改変植物体;
[19][18]の遺伝子改変植物体の植物体クローンまたは植物体子孫であって、[17]の改変植物細胞を含む植物体クローンまたは植物体子孫;ならびに
[20][17]の改変植物細胞を含む[18]または[19]の遺伝子改変植物体由来の種子、組織および器官。
WMS−EMマーカーおよびWMS−PMマーカーによる遺伝子型同定を示す図である。上側パネルにWMS−EMマーカーによる遺伝子型同定を示し、下側パネルにWMS−PMマーカーによる遺伝子型同定を示した;左側のパネルは普通コムギ(親系統)およびBACクローンの遺伝子型であり、右側のパネルは「LM15Ms2」/「Lumai 15」の組合せによるF個体の遺伝子型であった。F植物体のうち、雄性不稔性植物体3体(S1、S2およびS3)および雄性稔性植物体3体(F1、F2およびF3)を含めた代表的な植物体6体を示した。雄性不稔性形質とともに分離した特異的バンドを矢印で示した。 WMS/wms遺伝子を保有するBACクローンを示す図である。P89およびP1076は劣性wms遺伝子を保有する4D染色体に由来するものであり;P204およびP1593は優性WMS遺伝子を保有する4D染色体に由来するものである。灰色の影を付けた領域は本発明のWMS遺伝子(例えば、配列番号4)の全発現マトリックスを表す。各BACクローンの挿入サイズは一定の尺度に応じたものである。 WMS遺伝子の葯特異的発現を示す図である。A)RT−PCRを実施して葯、苞穎、葉、外穎、内穎、雌ずい、根および茎のWMS cDNAを検出した。B)qRT−PCRを実施して葯、GLP(苞穎、外穎および内穎)、葉、雌ずいおよび茎のWMSのcDNAレベルを測定した。RT−PCR解析およびqRT−PCR解析にはともに、対照としてアクチンを含めた。 WMSプロモーターの葯特異的活性を確認する図である。A)プラスミドを調製してプロモーター活性を試験した;PC613はゲートウェイ適合性GFPカセットを保有するデスティネーションベクターであった;PC966はPWMS::GFP発現カセットを保有し、PWMSはWMSプロモーター(配列番号5)を表した;PC976はWMS遺伝子(配列番号7)のゲノムコピーを保有するものであった;ベクターは3種類とも同じプラスミド骨格pCAMBIA1300を有していた。B)コムギ葯でのGFP蛍光の一過性発現;緑色蛍光シグナルを矢印で示した。C)RT−PCRを実施して、PC976による遺伝子形質転換によって得られたコムギトランスジェニック植物体「JZ7−2」(表3)の葯、苞穎、葉、外穎、内穎、雌ずいおよび茎のWMS cDNAを検出した;「Lumai 15」の葯1および「Lumai 15Ms2」の葯2を含む2つの対照も含めた。バーは100μmである。 優性WMS遺伝子に誘導変異を保有するM植物体のTILLINGスクリーニングおよび稔性葯を示す図である。A)WMS−FP12およびWMS−RP12を用いたPCR解析によって優性WMS遺伝子の存在を確認した(上パネル);選択したM植物体にプライマーWMS−FP8およびWMS−RP8を用いたWMS変異のTILLING検出(S:不稔性分げつ枝;F:稔性分げつ枝;CelI消化バンドを矢印で示した;下パネル)。B)選択したWMS遺伝子のM変異体における稔性葯の発達。対照として「Lumai 15」および「Lumai 15Ms2」を含めた。バーは1.5mmである。 「Bobwhite」における優性WMS遺伝子の遺伝的相補性を示す図である。A)PCR解析によりT世代のゲノム組込み(BARおよびWMS)およびcDNA発現(WMSおよびアクチン)を確認した。B)除草剤耐性に関するBARベースのバイオアッセイ(上パネル;バーは2.5mmである);WMS cDNAの発現によってトランスジェニックT植物体に雄性不稔性の表現型が生じた(下パネル;バーは1.5mmである)。「Bobwhite」は野生型対照としての役割を果たした。 ヤマカモジグサ(Brachypodium)「Bd21−3」における優性WMS遺伝子の遺伝的相補性を示す図である。A)PCR解析によりT世代のゲノム組込み(BARおよびWMS)およびcDNA発現(WMSおよびアクチン)を確認した。B)除草剤耐性に関するBARベースのバイオアッセイ(上パネル;バーは2.5mmである);WMS cDNAの発現によってトランスジェニックT植物体に雄性不稔性の表現型が生じた(下パネル;バーは0.5mmである)。ヤマカモジグサ(Brachypodium)「Bd21−3」を野生型対照として含めた。
(発明の詳細な説明)
本発明は、WMSタンパク質をコードするDNAを提供する。「Taiguコムギ」のWMS cDNAのヌクレオチド配列は配列番号1で表され、WMS cDNAがコードするタンパク質のアミノ酸配列は配列番号2で表され、「Taiguコムギ」のWMS遺伝子のプロモーター、転写可能なフラグメントおよびターミネーターを含む完全長ヌクレオチド配列は配列番号4で表され、「Taiguコムギ」のWMSプロモーターのヌクレオチド配列は配列番号5で表され、「Taiguコムギ」のWMS遺伝子の転写可能なフラグメントのヌクレオチド配列は配列番号6で表される。
本発明は、WMSタンパク質をコードするcDNAおよびゲノムDNAを含む。当業者は、従来の方法を用いてこのcDNAおよびゲノムDNAを調製することができる。例えば、a)「Taiguコムギ」(例えば、「LM15Ms2」)からmRNAを抽出し;b)そのmRNAを鋳型に用いてcDNAを合成し;c)本発明のcDNA(例えば、配列番号1)に特異的なPCRプライマーを用いてWMS cDNAを増幅し;d)そのPCR産物をベクターにクローン化することによってcDNAを調製することができる。同様に、「Taiguコムギ」からゲノムDNAを抽出し、ゲノムライブラリーを構築し(この場合、BAC、コスミド、フォスミドなどをベクターとして使用することができる)、次いで、本発明のDNAフラグメント(例えば、配列番号4)を用いて陽性クローンをスクリーニングすることによってゲノムDNAを調製することができる。このほか、本発明のDNA(例えば、配列番号4)に対するPCRによるクローン化によってゲノムDNAを調製することができる。
本発明は、Taiguコムギ由来のWMSタンパク質(例えば、配列番号2)と機能的に等価なタンパク質をコードするDNAを含む。本明細書では、「Taiguコムギ由来のWMSタンパク質と機能的に等価なタンパク質」は、本発明のWMSタンパク質(例えば、配列番号2)と等価な生物学的機能または生化学的機能を備えた標的タンパク質を意味する。実施例には植物不稔性の誘導が含まれる。被験遺伝子が雄性不稔性を誘導することができるかどうかを評価するには、実施例7に示すように、EMS誘導性変異誘発によって「Taiguコムギ」に変異を誘発することができ、実施例8に示すように、TILLINGによって被験遺伝子のノックアウト変異体およびノックダウン変異体を同定することができる。被験遺伝子によって誘導された雄性不稔性は、雄性稔性コムギ「Bobwhite」の遺伝的相補性を用いて検証することができる。例えば、実施例9に示すように、微粒子銃による撃込みを用いてWMSのゲノム対立遺伝子(配列番号7)を「Bobwhite」に導入することができる。さらに、実施例10に示すように、アグロバクテリウム(Agrobacterium)を介する形質転換を用いて、WMSのゲノム対立遺伝子(配列番号7)をモデル植物のヤマカモジグサ(Brachypodium)に導入することが実行可能である。得られた植物体の表現型を解析することができる。
このような機能の例としてほかにも葯特異的発現があり、これは、葯での発現が実施例5に挙げるほかの組織の少なくとも5倍以上、好ましくは10倍以上、より好ましくは15倍以上という優勢発現を特徴とするものである。被験遺伝子が植物の葯で特異的に転写されるかどうかを評価するために、様々な種類の植物組織からmRNAを抽出することができ、そのmRNAからcDNAを合成する。実施例5に示すように、定量的逆転写PCR(qRT−PCR)を用いて様々な種類の植物組織の被験遺伝子のcDNA量を測定することができる。
WMSタンパク質(配列番号2)と機能的に等価なタンパク質をコードするDNAは、好ましくは単子葉植物、より好ましくはイネ科(Gramineae)、最も好ましくはコムギ連(Triticeae)の種に由来するものである。このようなDNAとしては、例えば、配列番号2のアミノ酸配列を含み1つまたは複数のアミノ酸が置換、欠失、付加または挿入されたタンパク質をコードする本発明(配列番号1または配列番号6)の対立遺伝子、相同体、バリアント、誘導体および変異体が挙げられる。
ゲノム編集を用いて植物および動物の標的遺伝子をノックアウトすることができる(ChengおよびAlper,2014)。ゲノム編集技術は、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFNs)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)およびクラスター化され等間隔にスペーサーが入った短い回文型の反復配列(CRISPR)を含めた多数のものがコムギ(Shanら,2014;Wangら,2014)およびオオムギ(Wendtら,2013;Gurushidzeら,2014)に用いられ成功を収めている。通常、ゲノム編集によって目的とする標的領域に単一または複数の塩基の欠失または挿入が起こり、これがコードエキソンで起こるとアミノ酸の変化またはタンパク質の短縮が引き起こされ得る(Wangら,2014)。導入されたWMSタンパク質が1つまたは複数のアミノ酸の置換、欠失、付加または挿入を含むものであっても、ゲノム編集で得られたDNAが天然のWMSタンパク質(配列番号2)と機能的に等価なタンパク質をコードする限り、そのDNAは本発明のDNAに含まれ得る。本発明のDNAにはほかにも、タンパク質のアミノ酸配列の変異を生じることなくヌクレオチドが変異(保存的変異)した保存的変異体が含まれる。
当業者には、ゲノム編集を用いて本発明のWMS遺伝子およびその相同体(配列番号1および6)を改変することが実行可能である。さらに、変異誘発の誘導または天然の生殖質スクリーニングによって標的変異を導入することが実行可能である。例えば、Sladeら(2005)は、コムギEMS誘導性変異体集団を開発し、次いで、標的化によりゲノム内に局所的損傷を誘導する方法(TILLING)を用いて標的変異を同定することに成功した(Sladeら,2005)。さらに、生殖質プールは大量の自発的変異によって進化し、Ecotillingを用いて生殖質収集物中の標的変異を同定することが実行可能である(Tillら,2006)。当業者には、植物変異体集団を開発し、次いで本発明のDNA(配列番号1および6)内の標的変異を同定することは容易である。同時に、生殖質プールまたは育種系統/品種中の本発明のDNA(配列番号1および6)の自発的変異を同定することは容易である。したがって、本発明はほかにも、(a)ゲノム編集、変異誘発誘導および天然のスクリーニングを用いて、本発明のDNA(配列番号1および6)上に変異(1つまたは複数)を有する植物細胞を作製すること;(b)(a)のタイプの植物細胞を保有する植物体;(c)(a)のタイプの植物細胞を含む(b)のタイプの植物体の植物体クローンまたは植物体子孫;(d)(a)のタイプの細胞を含む(b)および(c)のクローンまたは子孫由来の種子、組織および器官を包含する。
WMSタンパク質(配列番号2)と機能的に等価なタンパク質をコードするDNAを調製する方法としてほかにも、当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)(Saikiら,1985;Hemsleyら,1989;Landtら,1990)、組換えDNA技術および人工遺伝子合成(KosuriおよびChurch,2014)が挙げられる。つまり、WMS遺伝子(配列番号1および6)のヌクレオチド配列に特異的にハイブリダイズするPCRプライマーを使用することによって、またはWMS遺伝子(配列番号1および6)のフラグメントをプローブに用いてDNAおよびcDNAライブラリーをスクリーニングすることによって、コムギをはじめとする植物からWMS遺伝子と相同性の高いDNAを単離することは、当業者には日常的な実験である。ほかにも、PCR技術、組換えDNA技術、人工遺伝子合成などを用いて単離され、WMSタンパク質(配列番号2)と機能的に等価なタンパク質をコードするDNAが本発明のDNAに含まれる。アミノ酸レベルでは、このようにして単離されたDNAはWMSタンパク質(配列番号2)のアミノ酸配列と相同性が高いものと考えられる。相同性が高いとは、アミノ酸配列全体にわたる配列同一性が少なくとも50%以上、好ましくは70%以上、最も好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%および99%またはそれ以上)であることを意味する。
アミノ酸配列およびヌクレオチド配列の同一性はBLASTアルゴリズム(Altschulら,1990;KarlinおよびAltschul,1993)を用いて求めることができる。このアルゴリズムを土台として、BLASTN、BLASTP、BLASTX、TBLASTNおよびTBLASTXと称されるプログラムが発表された(Korfら,2003)。BLASTNはヌクレオチドクエリを用いてヌクレオチドデータベースを検索するものであり;BLASTPはタンパク質クエリを用いてタンパク質データベースを検索するものであり;BLASTXは翻訳ヌクレオチドクエリを用いてタンパク質データベースを検索するものであり;TBLASTNはタンパク質クエリを用いて翻訳ヌクレオチドデータベースを検索するものであり;TBLASTXは翻訳ヌクレオチドクエリを用いて翻訳ヌクレオチドデータベースを検索するものである。上記の解析については基本的な段階が公開されている(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)。
ゲノムDNAまたはcDNAライブラリーのスクリーニングにはサザンブロッティング法(Southern,1975)を用い得る。サザンブロッティングには2つの主要な段階がある。第一段階は、DNAフラグメントをニトロセルロース膜またはナイロン膜に結合させることであり、第二段階は、標識したプローブDNAと膜に結合させたDNAフラグメントとの間でハイブリダイゼーションを実行することである。洗浄時、温度、塩類含有量および時間を制御することによって洗浄ストリンジェンシーを調節する必要がある。SCC緩衝液の塩類含有量の減少(20×、10×、6×、2×、1×、0.5×、0.2×、0.1×)、温度の上昇(42℃、50℃、55℃、60℃、65℃、70℃、75℃)および洗浄時間の増大(1分、2分、5分、10分、15分、20分、30分)に伴ってストリンジェンシーが増大する。本発明では、「高ストリンジェンシー」は、洗浄段階を希薄SCC緩衝液(1×以下)中、高温(55℃以上)下で長時間(10分以上)実施することを表す。
応用には、本発明のWMSタンパク質をコードするDNA(配列番号1および6)は雄性稔性植物体に不稔性を付与するのにも有用であると考えられる。換言すれば、本発明のWMSタンパク質をコードするDNA(配列番号1および6)を適切なベクターに挿入し、雄性稔性植物体を形成することが可能な植物細胞にこのベクターを導入し、得られた組換え植物細胞を再生させ、次いで雄性不稔性の特徴を備えたトランスジェニック植物体を繁殖させることによって、雄性稔性植物体に不稔性を付与することができると考えられる。雄性不稔性植物体は自家受粉できないため、ほかの雄性稔性植物体の花粉を用いてこれを維持する必要がある。一方、本発明のWMSタンパク質をコードするDNA(配列番号1および6)は、WMS遺伝子によって雄性不稔性植物体に稔性を付与するのにも有用であると考えられる。換言すれば、本発明のWMSタンパク質をコードするDNA(配列番号1)のアンチセンスRNA(asRNA)および/またはヘアピンRNA(hpRNA)を適切なベクターに挿入し、雄性不稔性植物体を形成することが可能な植物細胞にこのベクターを導入し、次いで得られた組換え植物細胞を再生させることによって、雄性不稔性植物体に稔性を付与することができると考えられる。雄性不稔性変種は自家受粉できないため、望ましい形質を備えたものであっても、それを維持しようとするのは困難である。しかし、WMSタンパク質をコードするDNA(配列番号1および6)のアンチセンス遺伝子および/またはヘアピンRNAを用いて稔性を取り戻すことができれば、自家受粉が可能となり、望ましい形質の維持も可能となる。
アンチセンス核酸は、転写干渉、RNAマスキング、二本鎖RNA(dsRNA)依存性機序およびクロマチン再構築を介して標的遺伝子の発現を調節する(LapidotおよびPilpel,2006)。本発明に使用するアンチセンス配列は、上記のいずれかの作用によって標的遺伝子の発現を阻害することができる。一実施形態として、ある遺伝子のmRNAの5’末端付近の非翻訳領域に相補的になるよう設計したアンチセンス配列には、その遺伝子の翻訳を阻害する効果がある。ただし、コード領域または3’末端非翻訳領域に相補的な配列を使用することもできる。このように、本発明のDNA(配列番号1)に対して使用することができるアンチセンスDNAには、遺伝子の翻訳領域および非翻訳領域のアンチセンス配列を含むDNAが含まれる。本明細書で使用するアンチセンスDNAをトウモロコシユビキチン(Ubi)プロモーター(Christensenら,1992)またはWMSプロモーター(配列番号5)などのしかるべきプロモーターの下流に連結し、転写終止シグナルを含む配列を好ましくはDNAの3’末端に連結する。このように既知の方法を用いて、調製したDNAを所望の植物体に導入することができる。アンチセンスDNA配列は、形質転換する植物体の内在遺伝子またはその一部分に相補的な配列であるのが好ましいが、遺伝子発現を効果的に阻害することができる限り、完全に相補的なものである必要はない。転写RNAは、標的遺伝子の転写産物に対して好ましくは90%以上、より好ましくは95%以上(例えば、96%、97%、98%、99%またはそれ以上)相補的である。アンチセンス配列を用いて標的遺伝子の発現を効果的に阻害するには、アンチセンスDNAは、少なくとも15ヌクレオチド以上、好ましくは100ヌクレオチド以上、さらにより好ましくは500ヌクレオチド以上含むべきである。使用するアンチセンスDNAは一般に、長さが5kb未満、好ましくは2.5kb未満である。
このほか、標的遺伝子をコードするDNAを用いて内在遺伝子発現の抑制を実施することができる(Hammondら,2001;Paddisonら,2002)。植物細胞にhpRNAを発現させるため、ヘアピンRNAを形成するかRNA干渉(RNAi)を駆動するよう設計したDNAマトリックスをUbiプロモーターなどのプロモーター配列および転写終止配列に連結することができる。hpRNA技術またはRNAi技術を用いることによって、本発明の標的遺伝子の転写産物を特異的にダウンレギュレートすることができ、遺伝子発現を抑制することができる。
このほか、標的遺伝子配列と同一の配列または類似した配列を含むDNAでの形質転換によって生じる共抑制により、内在遺伝子発現の抑制を達成し得る(Smyth,1997;KettingおよびPlasterk,2000)。「共抑制」という用語は、標的内在遺伝子の配列と同一の配列または類似した配列を含む遺伝子を形質転換によって植物体に導入すると、導入外来遺伝子および標的内在遺伝子の両方の発現が抑制される現象を指す。例えば、WMS遺伝子が共抑制された植物体を得るには、WMS遺伝子(配列番号1および6)を発現するよう構築したベクターDNAまたは類似した配列を含むDNAで目的の植物体を形質転換し、このようにして得られた植物体から野生型植物よりも雄性不稔性が抑制された植物体を選択する。共抑制に使用する遺伝子は標的遺伝子と完全に同一なものでなくてもよいが、少なくとも70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%、99%またはそれ以上)の配列同一性を備えたものであるべきである。配列同一性は上記の方法を用いて求めることができる。
さらに、本発明の内在遺伝子発現の抑制は、標的遺伝子にドミナントネガティブな特徴を備えた遺伝子で植物体を形質転換することによっても達成することができる。ドミナントネガティブな特徴を備えた遺伝子とは、発現したときに植物体の本来の内在遺伝子の活性を消失または低下させる機能を備えた遺伝子のことである。ヤマカモジグサ(Brachypodium)ではマイクロRNA(miRNA)miR5200が開花期遺伝子FTのmRNAを切断し、miR5200が過剰発現するとヤマカモジグサ(Brachypodium)の開花期が遅れる(Wuら,2013)。miRNAまたは低分子干渉RNA(siRNA)にはWMSおよびその相同体を標的とし得るものがある。WMSおよびその相同体を標的とする人工マイクロRNA(amiRNA)を設計することも可能である。以上をまとめると、植物体の雄性稔性を制御するため、効果的なamiRNA、miRNAおよびsiRNAの産生を操作してWMSおよびその相同体のmRNA蓄積を調節することが可能である。
植物細胞の形質転換に使用することができるベクターは、植物細胞内で挿入遺伝子を発現することができる限り特に限定されない。例えば、特定の植物組織内で遺伝子を発現させるプロモーター(例えば、本発明の配列番号5のプロモーター)と植物細胞内で構成的に遺伝子を発現させるプロモーター(例えば、Ubiプロモーター)とを含むベクターを使用することができる。さらに、外部刺激によって誘導されたときに活性化されるプロモーターを含むベクターを使用することもできる。本明細書では、「植物細胞」は、様々な植物種の様々な形態の植物細胞、例えば浮遊培養細胞、プロトプラスト、植物切片およびカルスを含む。
ベクターは、ポリエチレングリコール法、エレクトロポレーション法、アグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介法および粒子銃法などの当業者に公知の様々な方法を用いて植物細胞に導入することができる。植物細胞の種類によっては、当業者に公知の方法を用いて形質転換植物細胞から植物体を再生させることも可能である。植物では、例えば、組換え植物を作製する技術が既に多数確立されており、本発明の分野で広く用いられている。このような方法としては、ポリエチレングリコールを用いてプロトプラストに遺伝子を導入し、次いで植物体を再生させる方法、電気パルスを用いてプロトプラストに遺伝子を導入し、次いで植物体を再生させる方法、粒子銃法を用いて細胞内に遺伝子を直接導入し、次いで植物体を再生させる方法のほか、アグロバクテリウム(Agrobacterium)を介して遺伝子を導入し、次いで植物体を再生させる方法が挙げられる。これらの方法を本発明で適宜用いることができる。
本発明のDNAのゲノムが挿入された形質転換植物体が得られれば、その植物体から有性生殖または無性生殖によって子孫を得ることが可能である。上記の植物体、その子孫またはそのクローンから繁殖材料(種子、カルス、プロトプラストなど)を得ることができる。これらの材料を用いて上記の植物体を大量生産することができる。本発明は、本発明に包含されるDNAを導入した植物細胞、その細胞を含む植物体、その植物体の子孫またはクローンのほか、上記の植物体、その子孫およびそのクローンの繁殖材料を含む。したがって、本発明は、(a)本発明のDNAを保有するトランスジェニック植物細胞;(b)(a)のタイプの植物細胞を保有する植物体;(c)(a)のタイプの植物細胞を含む(b)のタイプの植物体の植物体クローンまたは植物体子孫;(d)(a)のタイプの細胞を含む(b)および(c)のクローンまたは子孫由来の種子、組織および器官を包含する。
このようにして作製した植物の稔性/不稔性は、野生型植物のものとは異なるものであることが予想され得る。例えば、コムギ「Bobwhite」は雄性稔性であるが、DNA(例えば、配列番号4)の発現によってトランスジェニックBobwhiteに雄性不稔性が付与される。一方、アンチセンスDNAなどの導入によってTaiguコムギのDNA(例えば、配列番号4)の発現が抑制されていれば、雄性稔性が付与されると考えられる。植物では、本発明の方法を用いて稔性/不稔性を調節し、自家受粉を抑制して他家受粉させることにより、雑種強勢という価値のある特徴を付与することができる。
本発明は、葯特異的プロモーター活性を備えたDNAを提供する。このようなDNAの例には、本発明のWMSタンパク質をコードするDNA(配列番号5)の開始コドン上流のゲノムDNA(配列番号4)がある。本発明のプロモーターDNAには、葯特異的プロモーター活性を備えている限り、配列番号5のヌクレオチド配列と相同性の高いDNAが含まれる。このようなタイプのDNAの例には、1つまたは複数のヌクレオチドが置換、欠失、付加または挿入された配列番号5のヌクレオチド配列を含み、葯特異的プロモーター活性を有するDNAがある。本発明のDNAプロモーターは、好ましくは単子葉植物、より好ましくはイネ科(Gramineae)、最も好ましくはコムギ連(Triticeae)の種に由来するものである。しかし、葯特異的プロモーター機能を備えている限り、その由来は特に限定されない。
葯特異的プロモーター活性を備えたDNAの単離に上記の本発明のWMSタンパク質コードDNAを用いることができる。例えば、本発明のDNA(配列番号6)またはその一部分をプローブに用いてゲノムDNAライブラリーをスクリーニングすることによって、本発明のWMSタンパク質をコードするDNAの上流にあるゲノムDNAを得ることができる。このような上流ゲノムDNAは葯特異的プロモーター活性を備えていると考えられることから、葯内で任意の遺伝子を特異的に発現させるのに使用すれば、その産業上の価値は高くなる。「任意の遺伝子」とは、本発明のDNAプロモーター(配列番号5)によって転写を誘導することができるDNAを意味する。「任意の遺伝子」は任意のコードDNAおよび非コードDNAのフラグメントであってよく、そのうち非コードDNAは、リボザイム活性を備えたものであっても、またはamiRNA、asRNA、hpRNA、miRNA、siRNAなどの作製に使用するものであってもよい。このようなDNAフラグメントは、WMSプロモーター(配列番号5)の下で葯特異的発現パターンを示す。さらに、本発明のWMSタンパク質をコードするDNAはほかにも、植物の葯に特異的に発現することから、花全体を解剖する際に葯組織を特定するマーカーとして有用であると考えられる。
このほか、PCR技術(Saikiら,1985)、組換えDNA技術および人工遺伝子合成(KosuriおよびChurch,2014)を用いて、配列番号5のヌクレオチド配列と相同性の高いDNAを得ることができる。例えば、配列番号5のヌクレオチド配列またはその一部分を含むDNAを鋳型として使用し、DNA分子(配列番号5)と特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドをPCRプライマーとして使用することによって、コムギをはじめとする植物種から配列番号5のヌクレオチド配列と相同性の高いDNAを単離することができる。
このようなDNAの調製には当業者に周知の方法を用いることができる。例えば、配列番号5のヌクレオチド配列を含むDNAに1つまたは複数の塩基の置換、欠失、付加または挿入を含めた変異を導入するには、当該技術分野で周知のゲノム編集技術(ChengおよびAlper,2014)を用いることができる。このほか、部位特異的変異誘発、変異原/放射線誘導性変異誘発およびPCR法(Saikiら,1985;Hemsleyら,1989;Landtら,1990)を用いて変異を導入することができる。
上記のように調製したDNAが葯特異的プロモーター活性を備えているかどうかを検討するには、レポーター遺伝子を用いる既知のレポーターアッセイなどを用いることができる。レポーター遺伝子は、その発現が検出可能なものである限り、特に限定されない。例えば、当業者が一般に使用するレポーター遺伝子としては、ルシフェラーゼ遺伝子(LUC)、β−グルクロニダーゼ遺伝子(GUS)および緑色蛍光遺伝子(GFP)などが挙げられる。レポーター遺伝子の発現レベルは、その種類に応じた当業者に公知の方法を用いて求めることができる。例えば、レポーターであるルシフェラーゼ遺伝子の発現レベルは、ルシフェラーゼ遺伝子発現産物の触媒作用によって引き起こされる蛍光化合物の蛍光を測定することによって求めることができる。GUS遺伝子の発現レベルは、GUS遺伝子発現産物の触媒作用によって引き起こされる5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−グルクロニド(X−Gluc)の発色またはグルクロン(ICN)の発光を分析することによって求めることができる。GFP遺伝子の発現レベルは、GFPタンパク質による蛍光を測定することによって求めることができる。
本発明のプロモーターDNAを用いて、例えば、(a)本発明のプロモーターDNAを含むベクターを構築することによって;(b)任意の遺伝子を(a)のベクター内の本発明のプロモーターDNAの下流に作動可能に連結することによって;(c)WMSプロモーター(配列番号5)または(b)のベクターを保有するトランスジェニック植物細胞を作製することによって;および(d)(c)のトランスジェニック植物細胞を含むトランスジェニック植物体を得ることによって、任意の遺伝子を葯特異的に発現させることができる。「作動可能に連結する」とは、任意の遺伝子が本発明のプロモーターDNAの活性化に応答して発現し得るように、それを本発明のプロモーターDNAと結合させることを意味する。本発明のプロモーターDNAは高い葯特異的活性を備えているため、任意の遺伝子は特に葯に発現し得る遺伝子であるのが好ましい。例えば、コムギの不稔性/稔性に関連する本発明のWMSを用いるのが適切であり得る。本発明のプロモーターDNAを含むベクターの構築には、一般的な遺伝子工学技術を用いることができる。ベクターを導入する植物細胞に関して特に制限はない。上記の当業者に公知の方法は、植物細胞へのベクターの導入、形質転換植物細胞の植物体への再生などに用いることができる。
したがって、本発明は、(a)本発明が包含するプロモーターDNAを有する遺伝子改変植物細胞;(b)(a)のタイプの細胞を含む植物体;(c)(a)のタイプの細胞を含む(b)の植物体の子孫またはクローン;(d)(a)のタイプの細胞を含む(b)および(c)のクローンまたは子孫由来の種子、組織および器官を包含する。
当業者には、ゲノム編集を用いてWMSプロモーター(配列番号5)およびその相同配列を改変したり、変異誘発を用いてWMSプロモーター(配列番号5)およびその相同配列に変異(1つまたは複数)を導入したり、またはWMSプロモーター(配列番号5)およびその相同配列上に天然の自発的変異を同定したりすることが実行可能である。したがって、本発明は、(a)ゲノム編集、変異誘発および天然のスクリーニングによって得られるWMSプロモーター(配列番号5)上の変異を有する遺伝子改変植物細胞;(b)(a)のタイプの細胞を含む植物体;(c)(a)のタイプの細胞を含む(b)の植物体の子孫またはクローン;(d)(a)のタイプの細胞を含む(b)および(c)のクローンまたは子孫由来の種子、組織および器官を包含する。
以上をまとめると、本発明にはWMS遺伝子(配列番号1および6)、WMS相同体およびそのプロモーター(例えば、配列番号5)が含まれる。さらにWMS遺伝子(配列番号1および6)の特異的発現によって、通常の雄性稔性植物に雄性不稔性を付与することが可能である。植物のWMS遺伝子発現を抑制することによって、通常の雄性不稔性植物に雄性稔性の特徴を付与することが可能である。さらに、WMS遺伝子プロモーターは、葯特異的活性を備えていると考えられることから、任意の遺伝子を葯特異的に発現させるのに有用である。予想される通り、WMS(配列番号1および6)、その相同体およびそのプロモーター(例えば、配列番号5)を応用すれば、植物育種および種子産業に大きな進歩がもたらされる。
これより、実施例を用いて本発明を具体的に説明するが、本発明がそれに限定されるものと解釈するべきではない。
実施例
本発明は、山東農業大学(Shandong Agricultural Universtiy)で開発された1対のMs2同質遺伝子コムギ系統「Lumai 15」および「LM15Ms2」に基づくものである。コムギ植物体は、温室内で16時間の光周期下(105μmol・m−2・s−1)、日中温度25〜30℃、夜間温度15〜20℃で維持した。水、通常の化学薬品および植物ホルモンはFisher Scientific社(ピッツバーグ、ペンシルベニア州、米国)およびSigma−Aldrich社(セントルイス、ミズーリ州、米国)から、植物組織培地はPhytoTechnology Laboratories社(オーバーランドパーク、カンザス州、米国)から、微生物増殖培地はBD社(Becton,Dickinson and Company社、フランクリンレイクス、ニュージャージー州、米国)から、抗生物質はGold Biotechnology社(セントルイス、ミズーリ州、米国)から購入したものである。本発明のPCRプライマーを表1に記載する。
Figure 0006899779
実施例1
トランスクリプトーム解析によって葯特異的発現を示す遺伝子を明らかにする
RNAシーケンシング(RNA−seq)では、ハイスループットなDNAシーケンシング技術を用いるcDNAの直接シーケンシングを実施する(Nagalakshmiら,2001)。RNA−seq法を実施して1対のMs2同質遺伝子系統「Lumai 15」と「LM15Ms2」の葯特異的トランスクリプトームを明らかにした。発育段階がほぼ同じ葯を選択する基準として、止め葉と最後から2番目の葉との間の葉耳間長を用いた。葉耳間長が4cmに達した主茎または分げつ枝から葯、雌ずいおよび止め葉を別個に採取した。葯については、「Lumai 15」および「LM15Ms2」の三つ組をそれぞれ準備した。雌ずいについては、「Lumai 15」および「LM15Ms2」由来の組織を等量プールすることによって三つ組を準備し、止め葉についても同様に準備した。Trizol法(Life Technologies社、グランドアイランド、ニューヨーク州、米国)を用いて全RNAを抽出し、Berry Genomics社(北京、中国)が提供するRNA−seqに供した。
平均挿入サイズ500bpのシーケンシングライブラリーを調製した。HiSeq2500(Illumina社、サンディエゴ、米国)を用いて2レーン分の125塩基対のリードについてペアエンド(PE)シーケンシングを実施した。Trimmomatic(Bolgerら,2014)を用いて未処理データを前処理し、アダプター、低品質塩基(品質値Q≦3のリードの半数以上の塩基)および未知の塩基(リードの未知の塩基は3%超)を除外した後、クリーンデータを得た。Trinity(Haasら,2013)を用いてクリーンデータのde novoトランスクリプトームアセンブリを実施した。RSEM(LiおよびDewey,2011)を用いて転写産物の存在量を推定し、edgerプログラム(Robinsonら,2010)を用いて差次的に発現した転写産物/遺伝子を同定した。全般的には、「Lumai 15」の葯よりも「LM15Ms2」の葯の方が発現量の多い遺伝子が多くみられた。特に、未知の遺伝子(配列番号1)は「LM15Ms2」で特異的発現がみられたが、「Lumai 15」では検出されず、「LM15Ms2」にコムギ雄性不稔(WMS)が付与されるものと考えられた。現在WMSという名称のこの未知の遺伝子を機能解析に選択した。
実施例2
WMS遺伝子の完全長cDNAのクローン化
「LM15Ms2」の葯の全RNA(RNAの一部をRNA−seqに供した)を使用して、RevertAid Frist Strand cDNA Synthesis Kit(Thermo Scientific社、ウォルサム、マサチューセッツ州、米国)を用いてcDNAを調製した。SMARTer RACE cDNA Amplification ket(Clontech Laboratories社、マウンテンビュー、カリフォルニア州、米国)を用いたRACE PCRにより「LM15Ms2」からWMS遺伝子(配列番号1)の5’cDNA末端および3’cDNA末端を同定した。5’RACE PCRにはWMS−RP1およびWMS−RP2の2種類のWMSプライマーを使用し、WMS−RP1にWMS−RP2をはめ込んだ。3’RACE PCRには別の2種類のWMSプライマー、WMS−FP1とWMS−FP2を使用し、WMS−FP1にWMS−FP2をはめ込んだ。5’RACE PCR産物および3’RACE PCR産物のシーケンシングにより、RNA−seq解析時に組み立てられたWMS遺伝子の完全長の状態での妥当性が確認された。したがって、WMSプライマーであるWMS−FP3およびWMS−FP3を用いて「LM15Ms2」からWMSの完全長cDNAをクローン化し、これは配列番号1のヌクレオチド配列と一致するものであった。1,485bpのcDNAには882bpのオープンリーディングフレーム(ORF)が含まれていた。cDNAの5’末端にインフレーム停止コドンが2つあることから、予測ORFが信頼できるものであると考えられた。本発明では、予測開始コドンに隣接する上流領域がWMS遺伝子のプロモーターであると考えた。
実施例3
「LM15Ms2」のゲノムBACライブラリーの構築
標準プロトトル(prototol)(LuoおよびWing,2003;Shiら,2011)を用いて「LM15Ms2」の細菌人工染色体(BAC)ライブラリーを構築した。簡潔に述べれば、葉組織から高分子量(HMW)ゲノムDNAを抽出し、制限酵素HindIIIを用いて部分的に消化し、1%アガロース上でパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)により分離し;100〜300kbの範囲のDNAフラグメントをアガロースゲルから回収し、再びPFGEを実施することによって再選択し、HindIIIによって開環し脱リン酸化したBACベクターpIndigoBAC536−S内に連結し;連結産物を大腸菌(E.coli)DH10B T1 Phage−Resistant Cell(Invitrogene社、カールスバッド、カリフォルニア州、米国)に形質転換し;12.5mg/Lのクロラムフェニコール、80mg/LのX−gal、100mg/LのIPTGを含むLB培地で形質転換細胞を選択し;白色コロニーを個々に取り出して384ウェルマイクロタイタープレートに入れた。結果として、BACクローン706,176個を取り出し、384ウェルプレート1,839個に配置した(表2)。無作為に選択した337個のBACクローンに品質検査を実施したころ、平均挿入サイズが124.6kbであり、空き率が0.50%であることがわかった。したがって、「LM15Ms2」BACライブラリーのカバレッジはコムギゲノム(約16Gb)の5.5倍であることがわかった。
Figure 0006899779
実施例4
「LM15Ms2」のBACクローンのスクリーニングおよびシーケンシング
「LM15Ms2」BACライブラリー用にPCRベースのスクリーニング法を開発した。最初に、新たな384ウェルプレートのセットに播種することによってBACライブラリーを複製し、ZR BAC DNA Miniprep Kit(Zymo Research社、アーバイン、カリフォルニア州、米国)を用いて各複製プレートの培養物から一次プラスミドプールを調製し、10個の一次プラドミド(pladmid)プールから等量のプラスミドDNAをプールすることによって超プラスミドプールを作製した。全体で1,839個の一次プラスミドプールを調製し、184個の超プラスミドプールを作製した。
BACライブラリーをスクリーニングするため、WMS遺伝子のcDNA配列(配列番号1)に合わせて複数のPCRプライマーを設計し、次いで、それが「Lumai 15」および「LM15Ms2」由来のゲノムDNAに対して機能するかどうかを試験した。その結果、WMS−FP4およびWMS−RP4によって「Lumai 15」では単一のフラグメントが増幅されたが、「LM15Ms2」では2つのフラグメントが増幅され、「LM15Ms2」の大きい方のフラグメントは、1%アガロースゲルで「Lumai 15」のフラグメントと同じ高さまで泳動した(図1)。小さい方のフラグメントは「LM15Ms2」に特異的であり、「Taiguコムギ」に雄性不稔性をもたらすMs2領域に由来するものである可能性が極めて高いように思われた。実際、小さい方のフラグメントは大きい分離集団(約5000の植物体)の雄性不稔性と共分離し、この集団は、「Lumai 15」の雄性稔性植物体の花粉粒によって受粉した「LM15Ms2」の雄性不稔性植物体から種子を収穫したものであり、雄性稔性と雄性不稔に約半数ずつ分離した。したがって、WMS−FP4プライマーおよびWMS−RP4プライマーを使用することによって、エキソン由来PCRマーカーであるWMS−EMを開発した。
このWMS−EMマーカーを用いて、「LM15Ms2」BACライブラリーの超プラスミドプール、次いで一次プラミド(plamid)プールをスクリーニングした。一次プールが同定されれば、384ウェルPCRを用いてBACクローンが決定されるというものであった。小さいPCR産物を生じたクローン1つおよび大きいPCR産物を生じたクローン2つを併せて計3つのBACクローンが回収された(図2)。大きいPCR産物を生じたBACクローン(P89およびP1076)は、優性Ms2遺伝子を欠く4D染色体から生じたものであり、小さいPCR産物を生じたBACクローン(P1593)は、優性Ms2遺伝子を保有する4D染色体から生じたものである可能性が極めて高い(図1)。P1593のWMS−EMマーカーは雄性不稔性と完全に連鎖しており、P1593上の優性WMS遺伝子であることが示唆され、P89/P1076のWMS−EMマーカーには雄性不稔性との密接な関係はみられず、P89/P1076上の劣性wms遺伝子であることが示唆された。3つのBACクローンはいずれも、Berry Genomics社が提供する次世代シーケンシング用に選択した。アダプター、低品質塩基(品質値Q≦5のリードの半数以上の塩基)および未知の塩基(リードの未知の塩基は10%超)を除外することによって未処理配列データを前処理した。Phrapパッケージのcross matchツール(Ewingら,1998)を用いてBACベクター(pIndigoBAC536−S)および大腸菌(E.coli)ゲノムDNAを除去した。ABySS1.5.2プログラム(Simpsonら,2009)によって、様々なK量体サイズ(21〜91)についてクリーンデータのde novoアセンブリを実施した。配列アセンブリには、最良N50値に相当するK量体値41を選択した。配列解析により、P89とP1076が同じ染色体を表す54,056bpの同一のフラグメントを有することが明らかになったが、この2つはP89/P1076とP1593との間に実在する多型であった。WMS cDNA(配列番号1)によれば、3つのBACにはいずれも、WMS/wms遺伝子の転写可能領域全体が含まれており、P1593の予測WMS cDNAは配列番号1のニュークレトード(neucletode)配列と一致していたが、P89/P1076の予測wms cDNAと配列番号1のニュークレトード(neucletode)配列との間には一ニュークレオチド(neucleotide)多型(SNP)が11個存在していた。比較では、P89とP1076のwms遺伝子はプロモーター(配列番号3)の配列情報が完全なものであったが、P1593のWMS遺伝子は不完全なプロモーターにつながるBACの一端に位置していたため、不完全なものであった(図2)。
したがって、wmsプロモーター(配列番号3)に合わせて複数のPCRプライマーを設計し、次いで、それが「Lumai 15」および「LM15Ms2」由来のゲノムDNAに対して機能するかどうかを試験した。その結果、WMS−FP5およびWMS−RP5によって「Lumai 15」では2本のバンドが増幅されたが、「LM15Ms2」では3本のバンドが増幅され、「LM15Ms2」の小さい方のフラグメントは、1%アガロースゲルで「Lumai 15」のフラグメントと同じ高さまで泳動した(図1)。大きい方のフラグメントは「LM15Ms2」に特異的なものであると思われた。したがって、WMS−FP5プライマーおよびWMS−RP5プライマーを使用することによって、プロモーター由来PCRマーカーであるWMS−PMを開発した。このWMS−PMマーカーを用いて「LM15Ms2」BACライブラリーをスクリーニングした。ほかにもBACクローンP204が同定され(図1および2)、これは優性Ms2遺伝子を有する4D染色体に由来するものであった。BACクローンP204にも同じくシーケンシングおよびアセンブリを実施し、1,212bpがBACクローンP1593と重複していた。比較では、wms遺伝子(配列番号3)は8,657bpであるが、WMS遺伝子の対応する配列は10,592bp(配列番号4)であり、このサイズの差は、主にWMSプロモーターへのトランスポゾン挿入に起因するものである。
実施例5
WMS遺伝子の組織特異的発現の解析
逆転写PCR(RT−PCR)およびqRT−PCRの両方を用いて各コムギ組織のWMS遺伝子のmRNAレベルを測定した。RT−PCRには、WMS−FP6およびWMS−RP6の2種類のWMSプライマーを使用し、アクチン対照としてアクチン−FP1およびアクチン−RP1の2種類のプライマーを使用した。qRT−PCRには、別の2種類のWMSプライマー、WMS−FP7とWMS−RP7を使用し、アクチン対照としてアクチン−FP2およびアクチン−RP2の2種類のプライマーを使用した(Fuら,2007)。WMS遺伝子は、コムギの葯には特異的に発現したが、苞穎、葉、外穎、内穎、雌ずい、根および茎などのほかの組織には発現しなかった(図3A)。葯のWMSのmRNAレベルは、ほかの被験組織よりも100倍顕著であった(図3B)。
実施例6
WMSプロモーターの同定
予測開始コドンの上流にあるDNA領域を優性WMSのものと劣性wmsのものとで比較することによって解析した。機能的プロモーターを回収するため、植物遺伝子、特に未知の植物遺伝子としては比較的長いフラグメント(2〜4kb)を考慮した。本発明では、3502bpのフラグメント(配列番号3)が「Lumai 15」の劣性wms遺伝子のプロモーターであると考えた。「LM15Ms2」の優性WMS遺伝子の対応する領域は5578bp(配列番号4)であった。選択したWMSおよびwmsのプロモーターは、5’末端の2414bpの塩基が一致していたが、wmsプロモーターの残りの1088bpには、WMSプロモーターの残りの3164bpと比較して相当な差がみられた。WMSプロモーターのサイズの増大は、それぞれ275bpおよび1791bpの2つのトランスポゾンの挿入が主な原因であった。WMS遺伝子の5578bpの上流領域が葯特異的活性を備えているのではないかと考えられた。
WMSプロモーター(配列番号5)の葯特異的活性を検証するため、デスティネーションベクターPC613およびGFPレポーター構築物PC966(PWMS::GFP)を含めた2種類の植物発現構築物を調製し(図4A)、ここでは、PWMSはWMSプロモーター(配列番号5)を表す。PC613およびPC966のGFP遺伝子はpGWB4(Nakagawaら,2007)から誘導したものである。PC613およびPC966はともに同じpCAMBIA1300のプラスミド骨格を有していた。PWMSとGFPとの間のDNAリンカーは5’−TAGGGAGAGGCGCGCCGACCCAGCTTTCTTGTACAAAGTGGTGATCATG−3’であり、5’塩基TAGGGAGをWMSプロモーターの末端に由来するものであり、3’末端ATGはGFPの開始コドンを表す。PC613およびPC966を実施例9で説明する通りに様々な花器(外穎、内穎、雌ずいおよび葯)内に撃ち込んだ。撃込みから3日後、実体蛍光顕微鏡下でGFP蛍光を観察した。構築物PC966(PWMS::GFP)を撃ち込んだ組織、特に葯にGFPシグナルが検出されたが、構築物PC613を撃ち込んだ組織には検出されなかった。したがって、本イノベーションのWMSプロモーター(配列番号5)は、プロモーター活性を有し、葯でのGFP発現を促進し得る。
遺伝的相補性試験を実施し(実施例9)、WMSプロモーター(配列番号5)の機能を検証するため、WMSゲノム対立遺伝子(配列番号7)をクローン化し、植物発現構築物PC976の組立てに用いた(図4A)。実施例9で説明する通りにベクター構築および粒子撃込みを実施した。PC966およびPC976にはともに、WMSプロモーター(配列番号5)の同一のフラグメントを用いた。トランスジェニックコムギ系統「JZ7−2」でのWMS遺伝子の組織特異的発現については報告しており(表3)、これにはWMSのWMSプライマーであるWMS−FP6およびWMS−RP6ならびにアクチンプライマーであるアクチン−FP1およびアクチン−RP1を使用した。その結果、本イノベーションのWMSプロモーター(配列番号5)によってWMS遺伝子の葯特異的発現がもたらされたが、葉、茎、苞穎、外穎、内穎および雌ずいを含めたほかの組織には発現がみられなかった(図4C)。結論を述べれば、WMSプロモーター(配列番号5)は葯特異的発現活性を有する。
したがって、WMSプロモーター(配列番号5)と標的遺伝子とを含む発現カセットを組み立てることが実現可能である。この発現カセットを植物(穀類、樹木、野菜および花など)に導入すれば、標的遺伝子の葯特異的発現がもたらされる。このことは、植物に雄性不稔性をはじめとする重要な形質を生じさせるのに重要なものとなる。
実施例7
「LM15RMs2」のEMS集団の開発
メタンスルホン酸エチル(EMS;Sigma−Aldrich社、セントルイス、ミズーリ州)の87.4μM溶液を用いてWMS陽性M植物体1,200体を含む「LM15Ms2」の変異体集団を作出した。簡潔に述べれば、「LM15Ms2」/「Lumai 15」の交配から得られた種子(M)全400個を87.4μMのEMS(0.9%水溶液、v/v)100mlに浸漬した後、150rpmで稼働させた振盪器で25℃にて10時間インキュベートした。EMS処置の後、種子を流水下、室温で4時間洗浄した。変異を誘発したM種子を湿紙上に置き、プラスチックラップで覆ったプラスチック製の箱(長さ×幅×高さ=40cm×30cm×20cm)の中で維持した後、25℃、16時間の光周期下で8日間インキュベートした。根を有する活発な実生を土壌に移植し、4℃の低温室中、12時間の光周期で6週間維持した。次いで、春化処理したM植物体を25℃の温室中、16時間の光周期で維持した。温室では、優性WMS遺伝子を保有する植物体のみを維持したが、優性WMSを欠く植物体を廃棄し、これにより、WMSを有するM植物体1200体を含む変異体集団を得た。
実施例8
「LM15Ms2」のEMS集団のWMS変異のTILLINGスクリーニング
WMSを有するM植物体1200体にはいずれも優性WMS遺伝子が存在することから、これらは雄性不稔性であると考えられる。しかし、WMS遺伝子の変異のなかには、WMS遺伝子の機能を打ち消し雄性稔性の特性を生じさせるものがあると考えられる。したがって、WMSを有するM植物体1200体の穂すべてを対象に雄性稔性/不稔性の特性を検討した。調査した穂3138個のうち20個が、正常な葯、花粉分散および結実を特徴とする雄性稔性の表現型を示した(図5)。
サルコシル法(Yuanら,2012)を用いて、M植物体の主茎に付随する止め葉からゲノムDNAを調製した。Nanodrop分光光度計(Thermo Scientific社、ウィルミントン、デラウェア州、米国)を用いてDNA濃度を測定し、100ng/μlに正規化した。等量のDNAを4倍でプールし、96ウェルフォーマットにまとめた。ほかにも、雄性稔性の穂を生じた主茎または分げつ枝の止め葉からDNA試料を調製した。これらのDNAをそれぞれ等量の野生型「LM15Ms2」由来ゲノムDNAとともに2倍でプールした。
サルコシル法(Yuanら,2012)を用いて全ゲノムDNAを抽出した。植物体のいずれについても、一次分げつ枝の止め葉の一部(長さ3〜5cm)を用いて、独立したDNA試料を調製した。ND2000分光光度計(Thermo Scientific社、ウィルミントン、デラウェア州、米国)によってDNA濃度を測定し、ddHOを用いて100ng/μlに合わせて補正した。DNA試料を4つずつまとめてプールし、96ウェルプレートで保管した。雄性稔性の表現型を示す20個の分げつ枝/穂については、その止め葉を採取して独立したDNA試料を調製した。雄性稔性の分げつ枝が偶然一次分げつ枝であった場合、その一次分げつ枝のDNA試料を代わりに用いた。次いで、雄性稔性分げつ枝のDNAをそれぞれ同じように野生型「LM15Ms2」のDNAとともにプールし、96ウェルプレートで保管した。
改変TILLING法(Uauyら,2009)を用いて、WMS遺伝子に誘導された変異を検出した。ポリアクリルアミド検出法では2段階のスクリーニング法を用いる。1回目のPCRスクリーニングは、以下に示す2つのPCR反応を実施するものである:1)全DNAプールについてKOD FXキット(東洋紡社、大阪、日本)を用いて長距離PCRを実施し、WMS対立遺伝子を増幅した;PCRには、選択的PCRプライマーであるWMS−FP8およびWMS−RP10を使用した;1×PCR緩衝液(KOD−Plus−Neo)、1.5mMのMgSO、0.2mMの各dNTP、0.2μMの各プライマー、200ngのゲノムDNA、1UのTaqポリメラーゼ(KOD−Plus−Neo)およびddHOを含有する混合物50μlを用いてPCRを実施した;PCR反応を以下の条件で実施した:94℃で2分間の初期変性、次いで98℃で10秒間、60℃で30秒間および68℃で6分間を35サイクルならびに68℃で10分間の最終伸長;ddHOを用いてPCR産物を500倍に希釈した後、それを次のPCRの鋳型として使用した;2)1×PCR緩衝液(1.5mMのMgCl、0.2mMの各dNTP;Promega社、マディソン、米国)、0.2μMの各プライマー、希釈したPCR産物のDNA鋳型2μl、1UのTaqポリメラーゼ(Promega社)およびddHOを含有する混合物25μlを用いて2回目のPCRを実施した;増幅には5922bpの鋳型を3つのフラグメントに分割した:第一のフラグメントはWMS−FP8およびWMS−RP8で増幅し、第二のフラグメントはWMS−FP9およびWMS−RP9で増幅し、第三のフラグメントはWMS−FP10およびWMS−RP10で増幅した;PCR反応を以下の条件で実施した:94℃で5分間の初期変性、次いで35サイクル(94℃で30秒間、61℃で30秒間、72℃で90秒間)および72℃で10分間の最終伸長。プール内に変異が存在する場合、PCR反応の最後に変性/再アニーリング段階(99℃で10分間、1サイクル毎に0.3℃低下させながら72℃で20秒間を90サイクル)を組み入れてヘテロ二本鎖を形成させる。
再アニーリング段階の後、Tillらによって記載されているプロトコル(Tillら,2006)を用いて得たセロリジュース抽出物(CJE)でPCR産物を消化した。Uauyらが推奨する通りに(Uauyら,2009)、ヘテロ二本鎖の消化に用いるCJEの量を最適化した。CJE反応には、PCR産物14μl、CJE 1μl、10×消化緩衝液(Tillら,2006)2μlおよびddHO 3μlで最終体積を20μlにしたものを用いた。消化は45℃で30分間実施し、EDTA(75mM)を1試料当たり5μl加えて十分にかき混ぜることによって短時間で停止させた。ブロモフェノールブルー添加染料(6×)を5μl加え、反応混合物を3%ポリアクリルアミドゲル(アクリルアミドとビスの比は19:1)に約24μl負荷した。合計サイズが未変化PCR産物と同等である切断されたPCR産物を検出することによって、陽性プールを特定した。2倍DNAプールについては、切断されたPCRバンドの存在から、選択したDNA試料のPCR鋳型に点変異が存在することがわかった。4倍DNAプールについては、切断されたPCRバンドから、特定したDNAプールのうちの1つのDNA試料が、PCR鋳型内に点変異を保有しているはずであることが明らかになり、この点変異は2回目のスクリーニングで同定することができる。
2回目のスクリーニングを実施して、4倍DNAプールの個々のDNAのうち実際に変異を保有しているものを明らかにした。次いで、個々のDNAをそれぞれ等量の野生型「LM15Ms2」由来ゲノムDNAとともに2倍プールし、次いで、その2倍DNAプールを1回目のスクリーニングで発見した切断産物についてスクリーニングした。
塩基変化を明らかにするため、選択した個々のDNAに通常のPCRを実施し、そのPCR産物にシーケンシングを実施して点変異を明らかにした(図5)。雄性稔性Mの穂で同定された点変異がM植物でも同じく確認された。
TILLINGスクリーニングでは、一次分げつ枝1200個に35例の変異体が明らかになり、雄性稔性分げつ枝20個では変異体が8例みられた(図5)。一次分げつ枝では、WMS遺伝子の変異率は約2.92%である。一方、雄性稔性分げつ枝20個では、検出可能な変異を保有する分げつ枝が実際に8例みられ、12個の分げつ枝はWMS遺伝子に変異がないものと思われた。WMSと雄性稔性とは独立の状態にあること(H仮説)を考慮に入れると、集団の変異率(2.92%)を用いて雄性稔性分げつ枝20個の変異および非変異の予測値が産出され、それぞれ0.58および19.42となる。しかし、カイ二乗適合度検定によって帰無仮説が棄却された(χ=97.13、df=1、P=6.49E−23)。したがって、WMS遺伝子がTaiguコムギの雄性不稔性を決定しているものと思われる。
実施例9
微粒子銃撃込みを用いたトランスジェニックBobwhiteの作製
遺伝的相補性試験を実施するため、KOD FXキットおよび2つの特異的PCRプライマーWMS−FP11およびWMS−RP11を用いて、「LM15Ms2」からWMS遺伝子の10,592bpのゲノムフラグメント(配列番号7)をクローン化した。PCR産物をエントリーベクターおよびデスティネーションベクターにクローン化した後、BAR選択マーカーを保有する植物発現構築物(PC976)を調製した(図4A)。本発明では、WMS遺伝子を保有するBACクローンを得た。本発明のBACクローンからWMS遺伝子(配列番号7)をクローン化すると便利である。Taiguコムギから直接クローン化することに興味がある場合、連続PCR(Vaslら,2004)によって完全長WMS遺伝子(配列番号7)の増幅が容易になる。
コムギの組織培養および微粒子銃撃込みのプロトコルは、これまでの研究(Weeksら,1993;Lvら,2014)によるものを改変したものである。パンコムギ(T.aestivum)の品種「Bobwhite」の未熟穎果を開花から2週間後に採取し、Tween20を0.05%(v/v)含有する70%(v/v)エタノールで5分間、次いで0.05%(v/v)Tween20を添加した20%(v/v)Clorox(登録商標)漂白剤で15分間滅菌し、無菌蒸留水を用いて3〜5回洗浄した。滅菌した穎果から未熟胚(長さ約1mm)を単離し、胚盤を上に向けて解剖用培地(MSベース4.3g/L、マルトース40g/L、チアミン−HCl 0.5mg/L、L−アスパラギン0.15g/L、2,4−D 2mg/L、CuSO 0.78mg/L、Phytagel 2.5g/L、pH5.8)上に置き、22〜23℃の暗所で4〜6日間維持した。次いで、未熟胚を高浸透圧調節物質培地(MSベース4.3g/L、マルトース40g/L、スクロース171.15g/L、チアミン−HCl 0.5mg/L、L−アスパラギン0.15g/L、2,4−D 2mg/L、CuSO 0.78mg/L、Phytagel 2.5g/L、pH5.8)上で4時間処理し、微粒子銃撃込みに供した。撃込みから20時間後、未熟胚を回復培地(解剖培地と同じもの)に移し、22〜23℃の暗所で2週間維持した。胚由来カルスを再生培地(0.1mg/Lの6−BAおよび3mg/Lのビアラホスを添加した解剖培地)に移し、成長チャンバ(22〜23℃、明期16時間/暗期8時間、光強度25μmol・m−2・s−1)内で2週間維持した。再生シュート(2〜3cm)を発根培地(3mg/Lのビアラホスを添加した濃度半分の解剖培地)に移し、再生と同じ環境条件下で維持した。根が十分に発達した活発なシュートを温室内の土壌に根付かせた。
PDS−1000/He Particle Delivery System(Bio−Rad Laboratories社、米国)を用いて微粒子銃撃込みを実施した。3回分の撃込みの準備には、マイクロキャリア(直径0.6μmの金粒子;Bio−Rad社、米国)2mgを1.5mlの微小遠心管に計り取り、純エタノール35μlと混合して滅菌し、遠心分離(12,000rpmで5秒間)によって回収し、上清を除去し、氷冷無菌蒸留水200μlで洗浄し、遠心分離および上清の除去によって収集した。プラスミドDNA20μgを含有する予冷した滅菌水245μlに前処理したマイクロキャリアを再懸濁させ、予冷したCaCl(2.5M)250μlとさらに混合した。必要に応じて、前の諸段階の溶液をピペット操作によって十分にかき混ぜた。次いで、マイクロキャリア懸濁液に予冷したスペルミジン溶液(1.45%、v/v)50μlを添加し、直ちに低温室(4℃)内で15〜20分間ボルテックスすることによってかき混ぜた。プラスミドでコートされたマイクロキャリアを遠心分離(12,000rpmで10秒間)とそれに続く上清の除去によって回収し、最後に純エタノール36μlに再懸濁させた。1回の撃込み毎に、金懸濁液10μlをマクロキャリアディスク(Bio−Rad社)の中心部に装填し、層流フード内で風乾し、1100psi(約7600kPa)の破裂板下でマイクロキャリア発射アセンブリに入れた。直径3.5cmの円形に配置した未熟胚60個をマクロキャリアアセンブリの6cm下方に置いた。PDS−1000/He Systemを製造業者の指示書に従って稼働させた。撃込み条件をヘリウム圧1,300psi(約9000kPa)および真空圧25mmHgとした。
計2742個のコムギ未熟胚に構築物PC976を撃ち込み、個々の胚から植物体がそれぞれ26体再生した(表3)。温室では最初に、0.3%(v/v)Finale(登録商標)除草剤に対する耐性を試験することによって、トランスジェニック植物体と推定される植物体をスクリーニングした。茎伸長期の全分げつ枝(分げつ枝1本当たり葉1枚、葉1枚当たり3cmの部分)を除草剤塗布によって刺激した。塗布から5日後、除草剤感受性を調べた。除草剤耐性分げつ枝の塗布領域は緑色で健常な状態であったが、除草剤感受性分げつ枝のものはしおれていた。除草剤耐性を示した植物体はわずか5体であった(図6および表3)。開花期には、3体の植物体に雄性不稔性がみられ、そのうち2体には除草剤耐性もみられた(図6および表3)。次いで、PCRプライマーBAR−FP1、BAR−RP1、WMS−FP8およびWMS−RP12を用いて推定トランスジェニック植物体のBAR選択マーカーおよびWMS遺伝子の有無を試験した。7体の植物体がBAR遺伝子およびWMS遺伝子ともに陽性であった(表3)。RT−PCRを用いて幼穂でのWMS転写を試験し、この試験では、PCRプライマーとしてWMS遺伝子にはWMS−FP6およびWMS−RP6、内部対照にはアクチン−FP1およびアクチン−RP1を用いた。WMS cDNAは雄性不稔性トランスジェニック植物体3体にのみ検出された(図6)。結論を述べれば、WMSゲノムフラグメント(配列番号7)の導入およびWMS cDNA(配列番号1)の発現によってトランスジェニックコムギに雄性不稔性がもたらされた。したがって、稔性植物(穀類、樹木、花および野菜など)にしかるべきプロモーターの下でWMSゲノムフラグメント(配列番号7)またはWMS cDNA(配列番号1)を導入することによって雄性不稔性トランスジェニック植物が生じ得る。これにより植物の循環選抜およびハイブリッド種子生産が大幅に進歩する。
Figure 0006899779
実施例10
アグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介形質転換を用いたトランスジェニックヤマカモジグサ(Brachypodium)の作製
本発明ではほかにも、モデル植物のヤマカモジグサ(Brachypodium)でWMS遺伝子機能を検証した。エレクトロポレーションによってアグロバクテリウム(Agrobacterium)「AGL1」系統に植物発現構築物PC976(図4A)を送達した。アグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介プロトコル(Braggら,2012)を用いてトランスジェニックヤマカモジグサ(Brachypodium)植物体を得た。
細菌接種材料の調製には、しかるべき抗生物質(カナマイシン50mg/L、カルベニシリン100mg/Lおよびリファンピシン40mg/L)を添加した固体MG/L培地(トリプトン5g/L、Yeat抽出物2.5g/L、NaCl 5g/L、D−マンニトール5g/L、MgSO4 0.1g/L、K2HPO4 0.25g/L、L−グルタミン酸1.2g/L、アガーパワー(Agar power)15g/L、PH7.2)に構築物PC976を保有するアグロバクテリウム(Agrobacterium)AGL1を画線し、28℃の暗所で2日間インキュベートし、アグロバクテリウム(Agrobacterium)コロニーをMG/L培地から掻き取って採取し、OD600が0.6になるよう液体CIMに再懸濁させた。
種子登熟期のミナトカモジグサ(B.distachyon)アクセッション「Bd21−3」から未熟種子を収集し、0.1%(v/v)Triton X−100を添加した10%(v/v)Clorox(登録商標)漂白剤で4分間滅菌し、滅菌水を用いて3回洗浄した。滅菌した種子から未熟胚(長さ0.3〜0.7mm)を単離し、カルス誘導培地(CIM:LSベース4.43g/L、GuSO 0.6mg/L、スクロース30g/L、2,4−D 2.5mg/L、Phytagel 2g/L、PH5.8)上に胚盤を上に向けて置き、暗所にて28℃でインキュベートした。4週間後、胚盤の増殖によってカルスが肉眼で確認できるようになり、黄色を呈した胚由来カルスのみを選択して継代培養およびアグロバクテリウム(Agrobacterium)媒介形質転換に供した。
200μMアセトシリンゴンと0.1%(w/v)synperonic PE/F68とを含有する新鮮なアグロバクテリウム(Agrobacterium)接種材料に胚由来カルスを浸漬することによって5分間感染させ、ろ紙の上で乾燥させて遊離接種材料懸濁液を除去し、22℃の暗所で3日間、3層のろ紙の上でインキュベートした。共培養後、カルスを最初、150mg/Lのtimentinと40mg/Lのヒグロマイシンを添加したCIM培地で1週間、28℃の暗所で維持し、次いで、さらに2週間継代培養した。150mg/Lのtimentinと40mg/Lのヒグロマイシンとを含有する再生培地(Braggら,2012)(LSベース4.43g/L、GuSO 0.6mg/L、マルトース30g/L、カイネチン0.2mg/L、Phytagel 2g/L、PH5.8)に活発なカルスを移し、LD条件(明期16時間/暗期8時間、光強度20μmol・m−2・s−1)下、28℃で維持した。再生シュートが1〜2cmに達したとき、150mg/Lのtimentinを含有する発根培地(Braggら,2012)(ビタミン4.42g/L、スクロース30g/L、Phytagel 2g/Lを含むMSベース、PH5.8)に移し、再生段階と同じ条件下で維持した。再生シュートに健常な根が発達(2〜3cm)してから、温室内の土壌に根付かせた。
計100個のカルスにPC976を有するアグロバクテリウム(Agrobacterium)「AGL1」株を感染させた。独立したカルス8個から植物体11体を回収した(表4)。温室では最初に、0.3%(v/v)Finale(登録商標)除草剤に対する耐性を試験することによって、トランスジェニック植物体と推定される植物体をスクリーニングした。三葉期(高さ約10cm)の全分げつ枝(分げつ枝1本当たり葉1枚、葉1枚当たり1cmの部分)を除草剤塗布によって刺激した。塗布から5日後、除草剤感受性を調べた。除草剤耐性分げつ枝の塗布領域は緑色で健常な状態であったが、除草剤感受性分げつ枝のものはしおれていた。除草剤耐性を示した植物体は10対であった(図7および表4)。開花期には、10体の植物体に雄性不稔性がみられ、除草剤耐性もみられた(図7および表4)。次いで、PCRプライマーBAR−FP1、BAR−RP1、WMS−FP8およびWMS−RP12を用いて推定トランスジェニック植物体のBAR選択マーカーおよびWMS遺伝子の有無を試験した。10体の植物体はいずれもBAR遺伝子およびWMS遺伝子ともに陽性であった(図4)。RT−PCRを用いて幼穂でのWMS転写を試験し、この試験では、PCRプライマーとしてWMS遺伝子にはWMS−FP6およびWMS−RP6、内部対照にはアクチン−FP1およびアクチン−RP1を用いた。雄性不稔性トランスジェニック植物体10体にWMS cDNAが検出された(図7、表4)。以上をまとめると、推定トランスジェニック植物体11体のうち10体が、除草剤耐性を示し、BAR導入遺伝子およびWMS導入遺伝子ともに陽性であり、WMS cDNA陽性であり、かつ雄性不稔性であった。これに対し、除草剤感受性を示し、BAR導入遺伝子およびWMS導入遺伝子の両方を欠き、WMS cDNA陰性であり、かつ雄性稔性である植物体はわずか1体であった。したがって、WMS(配列番号7)のゲノムフラグメントはヤマカモジグサ(Brachypodium)に雄性不稔性を誘導する効力がある。
ここでも同じく、稔性植物(穀類、樹木、花および野菜など)にしかるべきプロモーター下でWMSゲノムフラグメント(配列番号7)またはWMS cDNA(配列番号1)を導入することによって雄性不稔性トランスジェニック植物が生じ得る。これにより植物の循環選抜およびハイブリッド種子生産が大幅に進歩する。
Figure 0006899779
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Claims (8)

  1. 以下の(a)〜():
    (a)配列番号1のヌクレオチド配列を含むcDNA;
    (b)配列番号2のアミノ酸配列をコードするDNA;
    (c)配列番号6のヌクレオチド配列を含むDNA;
    (d)コムギ雄性不稔を引き起こすタンパク質であって、配列番号2のアミノ酸配列と配列同一性が少なくとも90%のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードするDNA;
    (e)コムギ雄性不稔を引き起こすタンパク質をコードするDNAであって、配列番号1または6のヌクレオチド配列を含むDNAと高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAであって、前記高ストリンジェントな条件が、洗浄段階を、0.1×以下の希薄SCC緩衝液中、65℃以上で15分以上実施する条件である、DNA
    (f)コムギ雄性不稔を引き起こすタンパク質をコードするDNAであって、配列番号1または6のヌクレオチド配列と配列同一性が少なくとも90%のヌクレオチド配列を含むDNA;および
    )配列番号1または6のDNAの転写産物に相補的なアンチセンスRNAをコードする、DNA;
    のいずれか1つである単離されたDNA。
  2. ベクター中に提供されている、請求項1に記載の単離されたDNA。
  3. 前記ベクターが、以下の(a)〜(c)のいずれか1つのDNAであって、葯特異的プロモーター活性を備えた、DNA:
    (a)配列番号5のヌクレオチド配列を含むDNA;
    (b)配列番号5のヌクレオチド配列と配列同一性が少なくとも90%のヌクレオチド配列を含むDNA;ならびに
    (c)配列番号5のヌクレオチド配列を含むDNAと高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAであって、前記高ストリンジェントな条件が、0.1×以下の希薄SCC緩衝液中、65℃以上で15分以上実施する条件である、DNA
    をさらに含む、請求項に記載の単離されたDNA。
  4. 請求項1に記載のDNAあるいは請求項またはに記載のベクターで形質転換された形質転換植物細胞。
  5. 請求項に記載の形質転換植物細胞を含む、形質転換植物体。
  6. 請求項に記載の形質転換植物体の種子、組織および器官。
  7. 請求項1〜のいずれか一項に記載のDNAを用いる、植物の雄性稔性を調節する方法。
  8. 請求項1〜のいずれか一項に記載のDNAを用いる、植物に雄性不稔性を付与する方法。
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