JP6595977B2 - 治療剤としてのＧｌａドメイン - Google Patents

Description

本出願は２０１３年３月１５日付け出願の米国仮特許出願第６１／７９１，５３７号および２０１３年３月１５日付け出願の米国仮特許出願第６１／７８７，７５３号（それらの全内容を参照により本明細書に組み入れることとする）に基づく優先権の利益を主張するものである。

１．分野
本開示は、Ｇｌａドメインペプチドおよびポリペプチドを使用する、細胞膜上のホスファチジルセリン（ＰｔｄＳ）の標的化に関する。治療剤としてのこれらのペプチドおよびポリペプチドの使用を開示する。

２．関連技術
ホスファチジルセリン（ＰｔｄＳ）は、通常は細胞膜の内部小葉（ｉｎｎｅｒ−ｌｅａｆｌｅｔ）（細胞膜側）に局在している負荷電リン脂質成分である。しかし、ＰｔｄＳは内部小葉から外部小葉へとスクランブラーゼ（フリッパーゼファミリーのメンバー）により輸送され、細胞表面上に露出されうる。非常に少数の例外を除き、ＰｔｄＳのこの活性外在化は細胞損傷に対する応答である（ｖａｎ ｄｅｎ Ｅｉｊｎｄｅら，２００１；ＥｒｗｉｇおよびＨｅｎｓｏｎ，２００８）。例えば、組織損傷は血小板、白血球および内皮細胞にシグナル伝達して、ＰｔｄＳを迅速かつ可逆的に再分布させ、これは細胞表面上の補体活性化および凝固の促進を招く。同様に、アポトーシスシグナルはＰｔｄＳの外在化を引き起こすが、これはより穏やか且つ持続的な様態で生じる。この外部ＰｔｄＳは、完全かつ有害な免疫応答を抑制しつつ、マクロファージが周辺組織からの瀕死細胞を摂取することを可能にする鍵認識マーカーを与える（ＥｒｗｉｇおよびＨｅｎｓｏｎ，２００８）。この除去プロセスは組織恒常性に必須であり、「健常」環境においてはそれは極めて効率的である。実際、１日当たり＞１０^９個の細胞の喪失にもかかわらず、アポトーシス細胞の組織学的検出は正常組織においては稀な事象である（ＥｌｌｔｉｏｔおよびＲａｖｉｃｈａｎｄｒａｎ，２０１０；Ｅｌｌｔｉｏｔら，２００９）。しかし、多数の病態においては、アポトーシス細胞除去のプロセスが圧倒され、遅延し、または存在しないという証拠が存在する（ＥｌｌｔｉｏｔおよびＲａｖｉｃｈａｎｄｒａｎ，２０１０；Ｌａｈｏｒｔｅら，２００４）。例えば、幾つかの腫瘍学研究は、高いアポトーシス指数がより高い悪性度の腫瘍、転移速度の増加および患者の予後不良に関連づけられることを示唆している（Ｎａｒｅｓｈら，２００１；Ｌｏｏｓｅら，２００７；Ｋｕｒｉｈａｒａら，２００８；Ｋｉｅｔｓｅｌａｅｒら，２００２）。これらの研究およびそれらの類似研究は、アポトーシスおよび外部ＰｔｄＳ発現が疾患の強力なマーカーでありうることを示唆している（ＥｌｌｔｉｏｔおよびＲａｖｉｃｈａｎｄｒａｎ，２０１０）。

アニオン性リン脂質表面に対して高いアフィニティを有する幾つかのタンパク質が存在し、アネキシン（Ａｎｎｅｘｉｎ）−ＶがＰｔｄＳ標的化プローブとして最も広く利用されている（Ｌａｈｏｒｔｅら，２００４）。ＰｔｄＳ含有小胞に対する高いアフィニティ（Ｋ_ｄ＝０．５〜７ｎＭ）および腎臓濾過のための閾値（約６０ｋＤａ）未満である分子量（３７ｋＤａ）を有するアネキシン−Ｖはアポトーシスプローブとして臨床において有望であることが示されている（Ｌｉｎら，２０１０；ＴａｉｔおよびＧｉｂｓｏｎ，１９９２）。更に、それは、腫瘍学、神経学および心臓病学を含む広範な適応症に利用されている（Ｌａｈｏｒｔｅら，２００４；Ｂｏｅｒｓｍａら，２００５；Ｂｌａｎｋｅｎｂｅｒｇ，２００９；Ｒｅｕｔｅｌｉｎｇｓｐｅｒｇｅｒら，２００２）。ＰｔｄＳ細胞表面発現を標的化する生物学的プローブの使用がインビトロおよびインビボの両方で示されている。臨床におけるそれらの有用性は有望ではあるが、それらは大部分が未開発なままである。

概要
したがって、本開示においては、（ａ）ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを準備し、（ｂ）該ペプチドを細胞表面と接触させて、該ポリペプチドを細胞膜上のＰｔｄＳに結合させることを含む、細胞膜ホスファチジルセリン（ＰｔｄＳ）を標的化する方法を提供する。細胞膜は心細胞膜、神経細胞膜、内皮細胞膜、ウイルス感染細胞膜、アポトーシス細胞膜、血小板膜、形質膜由来小胞（ＰＭＶ）または癌細胞膜でありうる。該ポリペプチドは更に、ＥＧＦ結合ドメイン、クリングル（Ｋｒｉｎｇｌｅ）ドメインおよび／または芳香族アミノ酸スタックドメインを含みうる。Ｇｌａドメインは第ＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子、第Ｘ因子、プロテインＳまたはプロテインＣからのものでありうる。該ポリペプチドは更に、検出可能な標識、例えば蛍光標識、化学発光標識、放射能標識、酵素、色素またはリガンドを含みうる。

該ポリペプチドは３００残基以下、２００残基以下または１００残基以下、例えば、１００〜２００および１００〜３００残基でありうる。該ポリペプチドは５〜１５個のＧｌａ残基、９〜１３個のＧｌａ残基、例えば、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４または１５個のＧｌａ残基を含みうる。該ポリペプチドは、１３個を超えるＧｌａ残基を含むが、３０％未満の全Ｇｌａ残基しか含んでいないことが可能である。該ポリペプチドは約４．５〜３０ｋＤａのサイズを有しうる。該ポリペプチドは少なくとも１つのジスルフィド結合または２〜５個のジスルフィド結合を含みうる。該ポリペプチドはプロテインＳ Ｇｌａドメインを含みうる。該ポリペプチドはプロテインＳ Ｇｌａドメイン、プロテインＳ ＥＧＦドメイン、プロトロンビンＧｌａドメイン、プロトロンビンＧｌａ＋プロトロンビンクリングルドメイン、プロテインＺ Ｇｌａドメイン、プロテインＺ Ｇｌａドメイン＋プロトロンビンクリングルドメイン、第ＶＩＩ因子Ｇｌａドメインまたは第ＶＩＩ因子Ｇｌａドメイン＋プロトロンビンクリングルドメインを含みうる。該ポリペプチドは更に、抗体Ｆｃ領域を含みうる。前記のものはいずれも、前記タンパク質の天然配列の保存的置換を含有することが可能であり、および／または記載されている天然ドメインに対する相同性を示しうる。

もう１つの実施形態においては、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象における癌の治療方法を提供する。癌は乳癌、脳癌、胃癌、肺癌、前立腺癌、卵巣癌、精巣癌、結腸癌、皮膚癌、直腸癌、子宮頸癌、子宮癌、肝臓癌、膵臓癌、頭頸部癌または食道癌でありうる。該方法は更に、第２の癌療法、例えば免疫療法、放射線療法、化学療法、毒素療法、サイトカイン療法またはホルモン療法で対象を治療することを含みうる。

更にもう１つの実施形態は、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象における自己免疫疾患の治療方法を含む。該自己免疫疾患は脊椎関節症、強直性脊椎炎、乾癬性関節炎、反応性関節炎、腸炎性関節炎、潰瘍性大腸炎、クローン病、過敏性腸疾患、炎症性腸疾患、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、家族性地中海熱、筋萎縮性側索硬化症、シェーグレン症候群、初期関節炎、ウイルス性関節炎、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、乾癬、血管炎、ウェゲナー肉芽腫症、アジソン病、脱毛症、抗リン脂質症候群、ベーチェット病、セリアック病、慢性疲労症候群、潰瘍性大腸炎、Ｉ型糖尿病、線維筋痛症、自己免疫性胃炎、グッドパスチャー症候群、グレーブス病、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、原発性胆汁性肝硬変、リウマチ熱、サルコイドーシス、強皮症、白斑、血管炎、小血管血管炎、肝炎、原発性胆汁性肝硬変、サルコイドーシス、強皮症、移植片対宿主病（急性および慢性）、再生不良性貧血または周期性好中球減少症でありうる。該方法は更に、第２の自己免疫疾患療法、例えばプレドニゾン（ｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、メチルプレドニゾン（ｍｅｔｈｙｌｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、ベニプレド（Ｖｅｎｉｐｒｅｄ）、セレストン（Ｃｅｌｅｓｔｏｎｅ）、ヒドロコルチゾン（ｈｙｄｒｏｃｏｒｔｉｓｏｎｅ）、トリアムシノクロン（ｔｒｉａｍｃｉｎｏｃｌｏｎｅ）、アリストンパン（Ａｒｉｓｔｏｎｐａｎ）関節内注射、メタプレド（Ｍｅｔｈａｐｒｅｄ）、ラヨス（Ｒａｙｏｓ）経口剤、ベタメタゾン（ｂｅｔａｍｅｔｈａｓｏｎｅ）またはエタネルセプト（ｅｔａｎｅｒｃｅｐｔ）で対象を治療することを含みうる。

更にもう１つの実施形態においては、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象におけるウイルス疾患の治療方法を提供する。該ウイルス疾患はインフルエンザ、ヒト免疫不全ウイルス、デングウイルス、西ナイルウイルス、天然痘ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、朝鮮出血熱ウイルス、水痘、水痘帯状疱疹ウイルス、単純ヘルペスウイルス１または２、エプスタイン−バーウイルス、マールブルグウイルス、ハンタウイルス、黄熱病ウイルス、Ａ、Ｂ、ＣまたはＥ型肝炎、エボラウイルス、ヒトパピローマウイルス、ライノウイルス、コクサッキーウイルス、ポリオウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、狂犬病ウイルス、ニューカッスル病ウイルス、ロタウイルス、ＨＴＬＶ−１および２でありうる。該方法は更に、第２の抗ウイルス療法、例えばアバカビル（Ａｂａｃａｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｙｃｌｏｖｉｒ）、アデフォビル（Ａｄｅｆｏｖｉｒ）、アマンタジン（Ａｍａｎｔａｄｉｎｅ）、アンプレナビル（Ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、アンプリジェン（Ａｍｐｌｉｇｅｎ）、アルビドール（Ａｒｂｉｄｏｌ）、アタザナビル（Ａｔａｚａｎａｖｉｒ）、アトリプラ（Ａｔｒｉｐｌａ）、ボセプレビレルテット（Ｂｏｃｅｐｒｅｖｉｒｅｒｔｅｔ）、シドフォビル（Ｃｉｄｏｆｏｖｉｒ）、コンビビル（Ｃｏｍｂｉｖｉｒ）、ダルナビル（Ｄａｒｕｎａｖｉｒ）、デラビルジン（Ｄｅｌａｖｉｒｄｉｎｅ）、ジダノシン（Ｄｉｄａｎｏｓｉｎｅ）、ドコサノール（Ｄｏｃｏｓａｎｏｌ）、エドクスジン（Ｅｄｏｘｕｄｉｎｅ）、エファビレンツ（Ｅｆａｖｉｒｅｎｚ）、エムトリシタビン（Ｅｍｔｒｉｃｉｔａｂｉｎｅ）、エンフビルチド（Ｅｎｆｕｖｉｒｔｉｄｅ）、エンテカビル（Ｅｎｔｅｃａｖｉｒ）、侵入インヒビター、ファムシクロビル（Ｆａｍｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ホミビルセン（Ｆｏｍｉｖｉｒｓｅｎ）、ホスアンプレナビル（Ｆｏｓａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、ホスカルネット（Ｆｏｓｃａｒｎｅｔ）、ホスホネット（Ｆｏｓｆｏｎｅｔ）、ガンシクロビル（Ｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、イバシタビン（Ｉｂａｃｉｔａｂｉｎｅ）、イムノビル（Ｉｍｕｎｏｖｉｒ）、イドクスウリジン（Ｉｄｏｘｕｒｉｄｉｎｅ）、イミキモド（Ｉｍｉｑｕｉｍｏｄ）、インジナビル（Ｉｎｄｉｎａｖｉｒ）、イノシン（Ｉｎｏｓｉｎｅ）、インテグラーゼインヒビター、インターフェロンＩＩＩ型、インターフェロンＩＩ型、インターフェロンＩ型、インターフェロン、ラミブジン（Ｌａｍｉｖｕｄｉｎｅ）、ロピナビル（Ｌｏｐｉｎａｖｉｒ）、ロビリド（Ｌｏｖｉｒｉｄｅ）、マラビロク（Ｍａｒａｖｉｒｏｃ）、モロキシジン（Ｍｏｒｏｘｙｄｉｎｅ）、メチサゾン（Ｍｅｔｈｉｓａｚｏｎｅ）、ネルフィナビル（Ｎｅｌｆｉｎａｖｉｒ）、ネビラピン（Ｎｅｖｉｒａｐｉｎｅ）、ネキサビル（Ｎｅｘａｖｉｒ）、ヌクレオシド類似体、オセルタミビル（Ｏｓｅｌｔａｍｉｖｉｒ）、ペグインターフェロンアルファ−２ａ、ペンシクロビル（Ｐｅｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ペラミビル（Ｐｅｒａｍｉｖｉｒ）、プレコナリル（Ｐｌｅｃｏｎａｒｉｌ）、ポドフィロトキシン（Ｐｏｄｏｐｈｙｌｌｏｔｏｘｉｎ）、プロテアーゼインヒビター、ラルテグラビル（Ｒａｌｔｅｇｒａｖｉｒ）、逆転写酵素インヒビター、リバビリン（Ｒｉｂａｖｉｒｉｎ）、リマンタジン（Ｒｉｍａｎｔａｄｉｎｅ）、リトナビル（Ｒｉｔｏｎａｖｉｒ）、ピラミジン（Ｐｙｒａｍｉｄｉｎｅ）、サキナビル（Ｓａｑｕｉｎａｖｉｒ）、スタブジン（Ｓｔａｖｕｄｉｎｅ）、相乗的増強剤（抗レトロウイルス）、ティーツリーオイル（Ｔｅａ ｔｒｅｅ ｏｉｌ）、テラプレビル（Ｔｅｌａｐｒｅｖｉｒ）、テノホビル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ）、テノホビルジソプロキシル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ ｄｉｓｏｐｒｏｘｉｌ）、チプラナビル（Ｔｉｐｒａｎａｖｉｒ）、トリフルリジン（Ｔｒｉｆｌｕｒｉｄｉｎｅ）、トリジビル（Ｔｒｉｚｉｖｉｒ）、トロマンタジン（Ｔｒｏｍａｎｔａｄｉｎｅ）、ツルバダ（Ｔｒｕｖａｄａ）、バラシクロビル（Ｖａｌａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、バルガンシクロビル（Ｖａｌｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ビクリビロック（Ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ）、ビダラビン（Ｖｉｄａｒａｂｉｎｅ）、ビラミジン（Ｖｉｒａｍｉｄｉｎｅ）、ザルシタビン（Ｚａｌｃｉｔａｂｉｎｅ）、ザナミビル（Ｚａｎａｍｉｖｉｒ）またはジドブジン（Ｚｉｄｏｖｕｄｉｎｅ）で対象を治療することを含みうる。

更にもう１つの実施形態においては、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象における凝固亢進障害の治療方法を提供する。該方法は更に、１以上の追加的な抗凝固剤で対象を治療することを含みうる。

また、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象における凝固をモジュレーションする方法を提供する。該方法は更に、凝固因子を対象に投与することを含みうる。

更にもう１つの実施形態は、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、対象における敗血症を治療することを含む。更にもう１つの実施形態は、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを鎌状赤血球患者に投与することを含む、鎌状赤血球患者における血管閉塞症急性発症の治療方法を含む。

最後に、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みプロテアーゼまたはホルモン結合ドメインを欠く単離されたポリペプチドを対象に投与することを含む、細胞の表面上のホスファチジルセリンの病的発現により特徴づけられる障害の治療方法を提供する。

本明細書に記載されているいずれかの方法または組成物はいずれかの他の方法または組成物に関して実施されうると想定される。

本発明の他の目的、特徴および利点は以下の詳細な説明から明らかとなろう。しかし、本開示の精神および範囲内の種々の変更および修飾がこの詳細な説明から当業者に明らかとなるため、そのような詳細な説明および特定の実施例は、本開示の特定の実施形態を示しているものの、単なる例示として記載されているに過ぎないと理解されるべきである。

以下の図面は本明細書の一部を構成し、本開示の或る態様を更に実証するものとして含まれる。本開示は、詳細な説明と共にこれらの図面の１以上を参照して更に深く理解されうる。

ＧｌａおよびＧｌａ−ＥＧＦ／クリングルドメインタンパク質のパネルの構築。 発現に関するＧｌａドメインタンパク質構築物の試験。２９３ｃｅｌｌＦｅｃｔｉｎを使用する２９３細胞内への一過性トランスフェクション。１０％ ゲル（還元サンプル含有）、２３．３μｌのローディングされた培地。 発現に関するＧｌａドメインタンパク質構築物の試験。ＢＨＫ２１細胞における一過性トランスフェクション。１０％ ゲル（還元サンプル含有）、２０μｌ（全細胞ペレットの１／１００の）がローディングされた。 シグナル配列の変化は分泌を変化させる。ＢＨＫ２１細胞における一過性トランスフェクション。１０％ ゲル（還元サンプル含有）、１３．３μｌがローディングされた。 プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦ配列。 プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦの精製。Ｆ１〜Ｆ４はカラムクロマトグラフィー画分である。１０％ ゲル、非還元条件。 プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦに関するアポトーシスアッセイ。上および下パネルは同一の重複実験操作を表す。ただし、プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦの量は低減され、抗Ｈｉｓドメイン抗体の量は低減された。 プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦに関するアポトーシスアッセイ。上および下パネルは同一の重複実験操作を表す。ただし、使用されたアネキシンＶの量は下パネルにおいては２倍である。

例示的実施形態の説明
アネキシンと同様に、ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）−ドメインタンパク質、例えば第ＩＩ因子、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子、第Ｘ因子、プロテインＣおよびプロテインＳはアニオン性膜に結合する。実際、アポトーシス特異的プローブとなるように合理的に設計された小分子のモデルとして、Ｇｌａ−ドメインが使用されている（Ｃｏｈｅｎら，２００９）。ここで、本発明者らは、アポトーシスおよび疾患に特異的な生物学的プローブの新規クラスとしてのこれらのＧｌａ−ドメインタンパク質の膜標的化部分の利用を提示する。これらの天然に存在する標的化タンパク質の使用は、より小さいサイズ（＜３０ｋＤａ）という付加的利点と共に、現在のプローブと比較して増強した特異性をもたらしうる。ＥＧＦおよび／またはクリングルドメインを含む、より大きな実施形態においてさえも、これらのタンパク質はアネキシンＶ（３７ｋＤａ）より尚も小さくなることが可能であり、潜在的には僅か＜５ｋＤａとなりうる。これらの生物学的プローブはインビトロおよびインビボの両方においてＰｔｄＳ細胞表面発現を標的化しうる。したがって、アフィニティ、特異性およびサイズにおいてアネキシンＶより優れており、治療剤としての使用の付加的可能性を有するアポトーシス／疾患標的化プローブを開発することが可能である。本開示のこれらの及び他の態様を以下に更に詳細に説明する。

適当な場合には、単数形で用いられる用語は複数形対象物をも含み、その逆も成り立つ。後記のいずれかの定義がいずれかの他の文書（参照により本明細書に組み入れるいずれかの文書を含む）におけるその語の用法に矛盾する場合には、反対の意味が明らかに意図される場合（例えば、その語が元来用いられている文書における場合）を除き、本明細書およびその添付の特許請求の範囲の解釈の目的においては後記の定義が常に優先するものとする。特に示されていない限り、「または」の使用は「および／または」を意味する。本明細書における単数形の使用は、特に示されていない限り、または「１以上」の使用が明らかに不適切である場合を除き、「１以上」を意味する。「含む」、「含み」、「包含する」および「包含し」の使用は互換的であり、限定的ではない。例えば、「含む」なる語は「〜を含むが、〜に限定されない」ことを意味するものとする。「約」なる語は、示されている数のプラスまたはマイナス５％を意味する。

本明細書中で用いる「単離されたペプチドまたはポリペプチド」は、異なる配列を有するペプチドまたはポリペプチドを含む、他の生物学的分子を実質的に含有しないペプチドまたはポリペプチドを意味すると意図される。幾つかの実施形態においては、単離されたペプチドまたはポリペプチドは乾燥重量で少なくとも約７５％、約８０％、約９０％、約９５％、約９７％、約９９％、約９９．９％または約１００％純粋である。幾つかの実施形態においては、純度は例えばカラムクロマトグラフィー、ポリアクリルアミドゲル電気泳動またはＨＰＬＣ分析のような方法により測定されうる。

本明細書中で用いる「保存的置換」は、ポリペプチドの修飾であって、１以上のアミノ酸を、該ポリペプチドの生物学的または生化学的機能の喪失を引き起こさない類似生化学的特性を有するアミノ酸で置換することを含むものを意味する。「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が、類似側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるものである。類似側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが当技術分野において定められている。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、無極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β−分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を含む。本開示の抗体は１以上の保存的アミノ酸置換を有することが可能であり、尚も抗原結合活性を保有しうる。

核酸およびポリペプチドの場合、「実質的な相同性」なる語は、２つの核酸または２つのポリペプチドまたは示されているそれらの配列が、最適にアライメント（整列）され比較された場合に、適当なヌクレオチドまたはアミノ酸の挿入または欠失を伴って、ヌクレオチドまたはアミノ酸の少なくとも約８０％、通常は少なくとも約８５％、幾つかの実施形態においては、約９０％、９１％、９２％、９３％、９４％または９５％、少なくとも１つの実施形態においては、ヌクレオチドまたはアミノ酸の少なくとも約９６％、９７％、９８％、９９％、９９．１％、９９．２％、９９．３％、９９．４％または９９．５％において同一であることを示す。あるいは、核酸に関する実質的な相同性が存在するのは、選択的なハイブリダイゼーション条件下、鎖の相補体に断片がハイブリダイズする場合である。また、本明細書中に挙げられている特定の核酸配列およびアミノ酸配列に対する実質的な相同性を有する核酸配列およびポリペプチド配列も含まれる。

２つの配列の間の同一性（％）は、それらの２つの配列の最適アライメントのために導入される必要があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮した場合の、それらの配列により共有される同一位置の数の関数（すなわち、％相同性＝同一位置の数／位置の総数×１００）である。２つの配列の間の配列の比較および同一性（％）の決定は、限定的なものではないがＶｅｃｔｏｒＮＴＩ^ＴＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐ．，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）のＡｌｉｇｎＸ^ＴＭモジュールのような数学的アルゴリズムを使用して達成されうる。Ａｌｉｇｎ^ＴＭの場合、多重アライメントのデフォルトパラメータはギャップ・オープニング・ペナルティ：１０；ギャップ伸長ペナルティ：０．０５；ギャップ分離ペナルティ範囲：８；アライメント遅延に関する％同一性：４０である（更なる詳細は、ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ．ｃｏｍ／ｓｉｔｅ／ｕｓ／ｅｎ／ｈｏｍｅ／ＬＩＮＮＥＡ−Ｏｎｌｉｎｅ−Ｇｕｉｄｅｓ／ＬＩＮＮＥＡ−Ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ／Ｖｅｃｔｏｒ−ＮＴＩ−Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ／Ｓｅｑｕｅｎｃｅ−ａｎａｌｙｓｉｓ−ａｎｄ−ｄａｔａ−ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ−ｓｏｆｔｗａｒｅ−ｆｏｒ−ＰＣｓ／ＡｌｉｇｎＸ−Ｍｏｄｕｌｅ−ｆｏｒ−Ｖｅｃｔｏｒ−ＮＴＩ−Ａｄｖａｎｃｅ．ｒｅｇ．ｕｓ．ｈｔｍｌにおけるワールド・ワイド・ウェブを参照されたい）。

クエリー（問い合わせ）配列（本開示の配列）と対象配列との間の最良の全体的マッチ（グローバル配列アライメントとも称される）を決定するためのもう１つの方法は、ＣＬＵＳＴＡＬＷコンピュータプログラム（Ｔｈｏｍｐｓｏｎら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９９４，２（２２）：４６７３−４６８０）を使用して決定されることが可能であり、これはＨｉｇｇｉｎｓら，Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ（ＣＡＢＩＯＳ），１９９２，８（２）：１８９−１９１のアルゴリズムに基づく。配列アライメントにおいては、クエリーおよび対象配列は共にＤＮＡ配列である。グローバル配列アライメントの結果は同一性（％）で表される。ペアワイズアライメントにより同一性（％）を計算するためにＤＮＡ配列のＣＬＵＳＴＡＬＷアライメントにおいて使用されうるパラメータはマトリックス＝ＩＵＢ、ｋ−タプル（ｔｕｐｌｅ）＝１、上部対角線（Ｔｏｐ Ｄｉａｇｏｎａｌｓ）の数＝５、ギャップ・ペナルティ＝３、ギャップ・オープン・ペナルティ＝１０、ギャップ伸長ペナルティ＝０．１である。多重アライメントには、以下のＣＬＵＳＴＡＬＷパラメータが使用されうる：ギャップ・オープニング・ペナルティ＝１０、ギャップ伸長ペナルティ＝０．０５；ギャップ分離ペナルティ範囲＝８；アライメント遅延に関する％同一性＝４０。

核酸は全細胞中に、細胞ライセート中に、または部分精製された若しくは実質的に純粋な形態として存在しうる。核酸が「単離されている」または「実質的に純粋にされている」と言えるのは、それが天然環境で通常付随している他の細胞成分から精製されている場合である。核酸を単離するためには、以下のような標準的な技術が用いられうる：アルカリ／ＳＤＳ処理、ＣｓＣｌバンド化、カラムクロマトグラフィー、アガロースゲル電気泳動および当技術分野でよく知られている他の技術。

Ｉ．ホスファチジルセリン（ＰｔｄＳ）
Ａ．構造および合成
ホスファチジルセリン（ＰｔｄＳ、Ｐｔｄ−Ｌ−ＳｅｒまたはＰＳと略される）は、フリッパーゼと称される酵素により細胞膜の内部小葉（サイトゾル側）上で通常は維持されるリン脂質成分である。細胞がアポトーシスを受けると、ホスファチジルセリンはもはや膜のサイトゾル部分に局在せず、細胞の表面上に露出されるようになる。ＰｔｄＳの化学式はＣ_１３Ｈ_２４ＮＯ_１０Ｐであり、３８５．３０４の分子量を有する。その構造は以下のとおりである。

ホスファチジルセリンは、アミノ酸セリンをＣＤＰ（シチジン二リン酸）活性化ホスファチジン酸と縮合させることにより、細菌において生合成される。哺乳類においては、ホスファチジルセリンはホスファチジルコリンおよびホスファチジルエタノールアミンとの塩基交換反応により産生される。逆に、ホスファチジルセリンはまた、ホスファチジルエタノールアミンおよびホスファチジルコリンを与えうる。尤も、動物においては、ホスファチジルセリンからホスファチジルコリンを産生する経路は肝臓内でのみ機能するのであるが。

Ｂ．機能
ホスファチジルセリンの初期研究はウシの脳から化学物質を蒸留した。現在の研究および商業的に入手可能な製品は、狂牛病に関する懸念ゆえに、ダイズから製造される。ダイズ製品におけるセリンに結合している脂肪酸はウシ製品におけるものと同一ではなく、そしてまた、不純物である。ラットにおける予備的研究は、ダイズ製品が少なくともウシ由来製品と同程度に強力であることを示している。

米国ＦＤＡはホスファチジルセリンに「限定的健康強調表示（ｑｕａｌｉｆｉｅｄ ｈｅａｌｔｈ ｃｌａｉｍ）」のステータスを付与しており、「ホスファチジルセリンの摂取は高齢者における痴呆のリスクを低減しうる」および「ホスファチジルセリンの摂取は高齢者における認知機能障害のリスクを低減しうる」と述べている。

ホスファチジルセリンは、サイクリング、ウェイトトレーニングおよび持久走に関わる運動選手における回復を加速し、筋肉痛を予防し、健康状態を改善することが実証されており、そのような運動選手におけるエルゴジェニック特性を有しうるであろう。ダイズ−ＰｔｄＳは用量依存的（４００ｍｇ）に、コルチゾールレベルの運動誘発性上昇を鈍化させることにより運動誘発性ストレスに対処するのに有効なサプリメントであることが報告されている。ＰｔｄＳの補給は運動選手にとっての望ましいホルモンバランスを促し、過剰トレーニングおよび／または過剰ストレッチングに伴う生理的悪化を低減しうるであろう。最近の研究において、ＰｔｄＳは精神的ストレス中の若者のコホートにおける気分を向上させ、ゴルファーのストレス抵抗性を増強することによりティーショット中の精度を改善することが示されている。最初の予備研究は、ＰｔｄＳ補給が、注意欠陥多動性障害を有する子供に有益でありうることを示している。

伝統的に、ＰｔｄＳサプリメント（補給物）はウシ大脳皮質（ＢＣ−ＰＳ）に由来するものであったが、感染性疾患の伝染の可能性ゆえに、ダイズ由来ＰＳ（Ｓ−ＰＳ）が潜在的な安全な代替物として確立されている。ダイズ由来ＰＳは米国食品医薬局により一般に安全だと認定されており（ＧＲＡＳ）、１日３回、２００ｍｇまでの投与量で摂取されれば、高齢者用の安全な栄養サプリメントとなる。ホスファチジルセリンはマウスにおける特異的免疫応答を低減することが示されている。

ＰｔｄＳは肉において見出されうるが、脳内ならびに肝臓および腎臓のような内臓内に最も豊富に存在する。乳製品においては、または白豆を除く植物においては、少量のＰＳが見出されうるに過ぎない。

アネキシン−Ａ５は、ＰｔｄＳに対する強力な結合アフィニティを有する天然に存在するタンパク質である。標識アネキシン−Ａ５はインビトロまたはインビボで細胞の初期ないし中期のアポトーシス状態における細胞の可視化を可能にする。もう１つのＰｔｄＳ結合タンパク質はＭｆｇｅ８である。テクネチウム標識アネキシン−Ａ５は悪性腫瘍と良性腫瘍との識別を可能にし、それらの病理は、良性腫瘍における低率のアポトーシスと比較された場合の、悪性腫瘍における高率の細胞分裂およびアポトーシスを含む。

ＩＩ．Ｇｌａドメインタンパク質
Ａ．Ｇｌａドメイン
Ｇｌａ−ドメインタンパク質の一般構造はＧｌａドメインおよびそれに続くＥＧＦドメインおよびそれに続くＣ末端セリンプロテアーゼドメインの構造である。例外は、ＥＧＦドメインの代わりにクリングルドメインを含有するプロトロンビン、およびセリンプロテアーゼドメインを有さないが、その代わりに性ホルモン結合性グロブリン様（ＳＨＢＧ）ドメインを有するプロテインＳである（ＨａｎｓｓｏｎおよびＳｔｅｎｆｌｏ，２００５）。アニオン性膜に対するＧｌａ−ドメインタンパク質のアフィニティは様々である。大雑把に言うと、それらは以下の３つの範疇に含まれる：１）３０〜５０ｎＭのＫ_ｄを有する高アフィニティ結合体、２）１００〜２００ｎＭのＫ_ｄを有する中アフィニテイ結合体、および３）１０００〜２０００ｎＭのＫ_ｄを有する低アフィニティ結合体。高アフィニティＧｌａドメインタンパク質は、プロテインＳを含有するアニオン性膜に結合することが示されており、このことは特に、アポトーシス細胞への、ＰｔｄＳとのその相互作用を介した結合を示している（Ｗｅｂｂら，２００２）。低アフィニティＧｌａドメインタンパク質は、細胞膜に結合するために二次受容体を用いる。例えば、ＦＶＩＩは組織因子（ＴＦ）を用いる。Ｇｌａドメイン／第１ ＥＧＦドメインはＦＶＩＩの高アフィニティＴＦ結合ドメインを構成すると考えられている。このアプローチに関して重要なことに、結腸直腸癌、ＮＳＣＬ癌および乳癌を含む癌細胞の表面上のＴＦアップレギュレーションを示している多数の研究が存在し、これらの高いＴＦレベルは予後不良に関連づけられている（Ｙｕら，２００４）。アニオン性膜に対するアフィニティはＦＶＩＩに関しては比較的低いが、癌における実証されているＴＦアップレギュレーションと共に高アフィニティＴＦ相互作用の付加はそれを潜在的に興味深い癌特異的プローブにする。

Ｂ．Ｇｌａドメイン含有タンパク質
１．第ＩＩ因子
凝固第ＩＩ因子としても公知であるプロトロンビンはタンパク質分解切断されて凝固カスケードにおいてトロンビンを形成し、これは最終的に出血の抑制をもたらす。トロンビンは今度はセリンプロテアーゼとして作用し、これは可溶性フィブリノーゲンを不溶性フィブリン鎖へと変換し、多数の他の凝固関連反応を触媒する。それは主として肝臓で発現される。

プロトロンビンをコードする遺伝子は第１１染色体上の動原体の領域内に位置する。それは１４個のエキソンから構成され、２４キロベースのＤＮＡを含有する。該遺伝子はシグナル領域、プロペプチド領域、グルタミン酸ドメイン、２個のクリングル領域および触媒ドメインをコードしている。酵素ガンマ−グルタミルカルボキシラーゼは、ビタミンＫの存在下、Ｎ末端グルタミン酸残基をガンマ−カルボキシグルタミン酸残基へと変換する。これらのガンマ−カルボキシグルタミン酸残基は血小板膜上のリン脂質へのプロトロンビンの結合に必要である。

遺伝性第ＩＩ因子欠乏症は、低プロトロンビン血症としてプロトロンビンの全体的合成の低減を、またはプロトロンビン異常症として機能不全プロトロンビンの合成を現しうる常染色体劣性遺伝疾患である。ホモ接合個体は一般に無症候性であり、２〜２５％の機能的プロトロンビンレベルを有する。しかし、症候性個体は、あざができやすくなること、鼻出血、軟部組織出血、過剰術後出血および／または月経過多を示しうる。

プロトロンビンは慢性蕁麻疹、自己免疫疾患および種々の血管障害における役割において或る役割を果たしている。青色皮斑血管障害は免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｍ抗ホスファチジルセリン−プロトロンビン複合体抗体に関連している。上部ないし中央真皮における組織病理学的壊死性血管炎症および抗ホスファチジルセリン−プロトロンビン複合体抗体の存在は皮膚結節性多発動脈炎ではなくアレルギー性皮膚血管炎を示す。

プロトロンビン欠乏症のほかに、プロトロンビンのもう１つの障害としてプロトロンビン２０２１０ａ突然変異が挙げられる。静脈血栓塞栓症の家族性の原因であるプロトロンビン２０２１０ａ突然変異は血漿プロトロンビンのレベルの上昇およびそれに伴う血栓症発生のリスク増大をもたらす。この障害の厳密なメカニズムは解明されていないが、プロトロンビン２０２１０ａ突然変異はプロトロンビン遺伝子の３’非翻訳領域内の２０２１０におけるグアニンからアデニンへの置換を含む。この突然変異は該遺伝子のポリアデニル化部位を変化させ、ｍＲＮＡ合成の上昇およびそれに続くタンパク質発現の上昇をもたらす。

２．第ＶＩＩ因子
第ＶＩＩ因子（かつてはプロコンベルチンとして公知）は、凝固カスケードにおいて血液凝固を引き起こすタンパク質の１つである。第ＶＩＩ因子の遺伝子は第１３染色体（１３ｑ３４）に位置する。それはセリンプロテアーゼクラスの酵素であり、ヒト第ＶＩＩａ因子の組換え形態（ＮｏｖｏＳｅｖｅｎ）は血友病患者における無制御な出血に関して米国食品医薬品局（Ｕ．Ｓ．Ｆｏｏｄ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ）の承認を受けている。それは、安全性の懸念が存在するものの、重篤な制御不能な出血においては無認可で使用されることもある。組換え活性化第ＶＩＩ因子の生物類似（Ｂｉｏｓｉｍｉｌａｒ）形態（ＡｒｙｏＳｅｖｅｎ）はＡｒｙｏＧｅｎ Ｂｉｏｐｈａｒｍａにより製造されている。

第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩ）の主要役割は、組織因子（ＴＦ／第ＩＩＩ因子）と共に凝固の過程を始動させることである。組織因子は血管の外側に見出され、通常は血流にさらされない。血管損傷に際して、組織因子は血液および循環する第ＶＩＩ因子にさらされる。ＦＶＩＩは、ＴＦに結合すると、トロンビン（第ＩＩａ因子）、第Ｘａ因子、第ＩＸａ因子、第ＸＩＩａ因子およびＦＶＩＩａ−ＴＦ複合体自体を含む種々のプロテアーゼによりＦＶＩＩａへと活性化される。ＦＶＩＩａ−ＴＦの最も重要な基質は第Ｘ因子および第ＩＸ因子である。第ＶＩＩ因子は組織因子（ＴＦ）と相互作用することが示されている。

該因子の作用は、凝固の開始のほぼ直後に放出される組織因子経路インヒビター（ＴＦＰＩ）により阻害される。第ＶＩＩ因子はビタミンＫ依存的であり、それは肝臓で産生される。ワルファリンまたは類似抗凝固剤の使用はＦＶＩＩの肝合成を低減する。

欠乏症は稀であり（先天性プロコンベルチン欠乏症）、劣性遺伝する。第ＶＩＩ因子欠乏症は血友病様出血障害として現れる。それは組換え第ＶＩＩａ因子（ＮｏｖｏＳｅｖｅｎまたはＡｒｙｏＳｅｖｅｎ）で治療される。組換え第ＶＩＩａ因子は、置換凝固因子に対するインヒビターを生じるようになった血友病患者（第ＶＩＩＩ因子または第ＩＸ因子欠乏症を伴う）にも使用される。それは制御不能な出血の状況においても使用されているが、この状況におけるその役割は、臨床試験以外でのその使用を支持する証拠が不十分であるため、議論の的となっている。出血におけるその使用の最初の報告は、１９９９年における制御不能な出血を伴うイスラエル兵士におけるものであった。その使用のリスクは動脈血栓症の増加を含む。

３．第ＩＸ因子
第ＩＸ因子（またはクリスマス因子）は凝固系のセリンプロテアーゼの１つである。それはペプチダーゼファミリーＳ１に属する。第ＩＸ因子の遺伝子は第１０染色体（Ｘｑ２７．１−ｑ２７．２）に位置し、したがって、Ｘ染色体連鎖劣性である。この遺伝子における突然変異は女性より男性において遥かに頻繁に影響を及ぼす。このタンパク質の欠乏は血友病Ｂを引き起こす。第ＩＸ因子は、不活性前駆体であるチモーゲンとして産生される。それは、シグナルペプチドを除去するようにプロセシングされ、グリコシル化され、ついで（接触経路の）第ＸＩａ因子または（組織因子経路の）第ＶＩＩａ因子により切断されて、ジスルフィド架橋により鎖が連結された二本鎖形態を生成する。Ｃａ^２＋、膜リン脂質および第ＶＩＩＩ補因子の存在下、第ＩＸａ因子へと活性化されると、それは第Ｘ因子における１つのアルギニン−イソロイシン結合を加水分解して第Ｘａ因子を生成する。第ＩＸ因子はアンチトロンビンにより抑制される。

第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子および第Ｘ因子は全て、血液凝固において中心的役割を果たし、共通のドメイン構造を有する。第ＩＸ因子タンパク質は４つのタンパク質ドメインから構成される。これらはＧｌａドメイン、ＥＧＦドメインの縦列コピーの２つ、および触媒的切断を行うＣ末端トリプシン様ペプチダーゼドメインである。Ｎ末端ＥＧＦドメインは、少なくとも部分的に、組織因子への結合をもたらすことが示されている。Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎらは、第２ＥＧＦドメインの残基８８〜１０９が血小板への結合および第Ｘ因子活性化複合体の構築をもたらすと結論づけている。全４個のドメインの構造は解明されている。２つのＥＧＦドメインおよびトリプシン様ドメインの構造はブタタンパク質に関して決定された。Ｃａ（ＩＩ）依存的リン脂質結合をもたらすＧｌａドメインの構造もＮＭＲにより決定された。「超活性」突然変異体の幾つかの構造が解明されており、これらは凝固カスケードにおける他のタンパク質による第ＩＸ因子活性化の性質を明らかにしている。

第ＩＸ因子の欠乏はクリスマス病（血友病Ｂ）を引き起こす。第ＩＸ因子の１００個を超える突然変異が記載されており、幾つかは症状を引き起こさないが、多くは有意な出血障害を招く。組換え第ＩＸ因子が、クリスマス病を治療するために使用されており、ＢｅｎｅＦＩＸとして商業的に入手可能である。第ＩＸ因子の幾つかの希少突然変異は凝固活性の上昇をもたらし、深部静脈血栓症のような凝固疾患を引き起こしうる。

４．第Ｘ因子
第Ｘ因子（スチュアート−プロワー因子；プロトロンビナーゼ）は凝固カスケードの酵素である。ヒト第Ｘ因子遺伝子は第１３染色体（１３ｑ３４）に位置する。それはセリンエンドペプチダーゼ（プロテアーゼ群Ｓ１）である。第Ｘ因子は肝臓で合成され、その合成にビタミンＫを要する。第Ｘ因子は第ＩＸ因子（内因性Ｘアーゼとして公知の複合体において、その補因子である第ＶＩＩＩ因子を伴う）および第ＶＩＩ因子［その補因子である組織因子（外因性Ｘアーゼとして公知の複合体）を伴う］の両方により第Ｘａ因子へと活性化される。第Ｘ因子の半減期は４０〜４５時間である。したがって、それは最終共通経路またはトロンビン経路の最初のメンバーである。それは、２つの位置（ａｒｇ−ｔｈｒ結合およびついでａｒｇ−ｉｌｅ結合）でプロトロンビンを切断することにより作用し、これは活性トロンビンを生成する。この過程は、第Ｘａ因子がプロトロンビナーゼ複合体において活性化補因子Ｖと複合体形成した場合に最適化される。第Ｘ因子は新鮮凍結血漿およびプロトロンビナーゼ複合体の一部である。唯一の商業的に入手可能な濃縮物は、ＣＳＬ Ｂｅｈｒｉｎｇにより製造された「第Ｘ因子Ｐ Ｂｅｈｒｉｎｇ」である。

第Ｘａ因子は、セリンプロテアーゼインヒビター（セルピン）であるプロテインＺ依存的プロテアーゼインヒビター（ＺＰＩ）により不活性化される。第Ｘａ因子に対するこのタンパク質のアフィニティはプロテインＺの存在により１０００倍増加するが、第ＸＩ因子の不活性化にはそれはプロテインＺを要しない。プロテインＺの欠損は第Ｘａ因子活性の上昇および血栓症の傾向につながる。

第Ｘ因子の先天的欠乏症は非常に稀（１：５００，０００）であり、鼻出血（鼻血）、関節血症（関節内への出血）および胃腸出血を示しうる。先天的欠乏症のほかに、低い第Ｘ因子レベルが幾つかの病態において時々見られうる。例えば、第Ｘ因子欠乏症はアミロイドーシスにおいて見られることがあり、この場合、第Ｘ因子は血管系におけるアミロイド線維に吸着される。また、ビタミンＫの欠乏またはワルファリン（または類似医薬）による拮抗は不活性な第Ｘ因子の産生を招く。ワルファリン療法においては、これは、血栓症を予防するために望ましい。２００７年後半の時点で、新たに出現した５個の抗凝固治療薬のうちの４個がこの酵素を標的化した。直接的なＸａインヒビターは評判のよい抗凝固剤である。

１９６０年代に開発された凝固の伝統的モデルは２つの別々のカスケード、すなわち、外因性（組織因子（ＴＦ））経路および内因性経路を想定していた。これらの経路は共通の一点、すなわち、第Ｘａ因子／第Ｖａ因子複合体の形成に収束し、これは、カルシウムと共に、そしてリン脂質表面上に結合して、プロトロンビン（第ＩＩ因子）からトロンビン（第ＩＩａ因子）を生成する。抗凝固の細胞ベースモデルである新規モデルは凝固における段階を更に詳細に説明するようである。このモデルは以下の３つの段階を有する：１）ＴＦ含有細胞上の凝固の開始、２）該ＴＦ含有細胞上で産生されたトロンビンによるプロコアグラントシグナルの増幅、および３）血小板表面上のトロンビン産生の伝播。

第１段階では、第ＶＩＩ因子は細胞の表面上の膜貫通タンパク質ＴＦに結合し、第ＶＩＩａ因子に変換される。それにより第ＶＩＩａ因子／ＴＦ複合体が生じ、これは第Ｘ因子および第ＩＸ因子の活性化を触媒する。ＴＦ含有細胞の表面上で生じた第Ｘａ因子は第Ｖａ因子と相互作用してプロトロンビナーゼ複合体を形成し、これはＴＦ含有細胞の表面上で少量のトロンビンを生成する。増幅段階である第２段階では、十分なトロンビンが生成していれば、血小板および血小板関連補因子の活性化が生じる。トロンビン生成の第３段階では、第ＸＩａは活性化血小板の表面上の遊離第ＩＸ因子を活性化する。活性化第ＩＸａ因子は第ＶＩＩＩａ因子と共に「テナーゼ」複合体を形成する。この複合体はより多くの第Ｘ因子を活性化し、今度はこれが第Ｖａ因子との新たなプロトロンビナーゼ複合体を形成する。第Ｘａ因子は、大量のプロトロンビンを変換（「トロンビン・バースト（ｔｈｒｏｍｂｉｎ ｂｕｒｓｔ）」）するプロトロンビナーゼ複合体の主要成分である。第Ｘａ因子の各分子は１０００個のトロンビン分子を生成しうる。トロンビンのこの大発生はフィブリン重合を引き起こして血栓を形成する。

第Ｘ因子の合成または活性の抑制は、現在使用されている多数の抗凝固物質の作用メカニズムである。クマリンの合成誘導体であるワルファリンは米国で最も広く使用されている経口抗凝固物質である。幾つかの欧州諸国においては、他のクマリン誘導体（フェノプロクモン（ｐｈｅｎｐｒｏｃｏｕｍｏｎ）およびアセノクマロール（ａｃｅｎｏｃｏｕｍａｒｏｌ））が使用されている。これらの物質はビタミンＫアンタゴニスト（ＶＫＡ）である。ビタミンＫは第ＩＩ因子（プロトロンビン）、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子および第Ｘ因子の肝合成に必須である。ヘパリン（未分画ヘパリン）およびその誘導体である低分子量ヘパリン（ＬＭＷＨ）は、血漿補因子であるアンチトロンビン（ＡＴ）に結合して、幾つかの凝固因子第ＩＩａ、Ｘａ、ＸＩａおよびＸＩＩａ因子を不活性化する。

最近、第Ｘａ因子の新系統の特異的直接作用インヒビターが開発された。これらには、薬物リバロキサバン（ｒｉｖａｒｏｘａｂａｎ）、アピキサバン（ａｐｉｘａｂａｎ）、ベトリキサバン（ｂｅｔｒｉｘａｂａｎ）ＬＹ５１７７１７、ダレキサバン（ｄａｒｅｘａｂａｎ）（ＹＭ１５０）、エドキサバン（ｅｄｏｘａｂａｎ）および８１３８９３が含まれる。これらの物質は現在の療法に対する幾つかの理論的利点を有する。それらは経口投与されうる。それらは迅速な作用発現を示す。そしてそれらは遊離第Ｘａ因子およびプロトロンビナーゼ複合体中の第Ｘａ因子の両方を抑制する点で、第Ｘａ因子に対して、より有効でありうる。

５．プロテインＳ
プロテインＳは、内皮において合成されるビタミンＫ依存性血漿糖タンパク質である。循環中、プロテインＳは、遊離形態と、補体タンパク質Ｃ４ｂ結合タンパク質（Ｃ４ＢＰ）に結合した複合体形態との２つの形態で存在する。ヒトにおいては、プロテインＳはＰＲＯＳ１遺伝子によりコードされる。プロテインＳの最もよく特徴づけられている機能は抗凝固経路におけるその役割であり、これにおいて、それは第Ｖａ因子および第ＶＩＩａ因子の不活性化におけるプロテインＣの補因子として機能する。

プロテインＳはカルボキシル化ＧＬＡドメインを介して負荷電リン脂質に結合しうる。この特性は、アポトーシスを受けている細胞の除去においてプロテインＳが機能することを可能にする。アポトーシスは、望ましくない又は損傷した細胞を組織から除去するために身体により用いられる細胞死の一形態である。アポトーシス性である（すなわち、アポトーシスの過程にある）細胞は、それらの外膜におけるリン脂質の分布をもはや活発には達成できず、したがって、ホスファチジルセリンのような負荷電リン脂質を細胞表面上に提示し始める。健常細胞においては、ＡＴＰ（アデノシン三リン酸）依存的酵素が細胞膜の外側小葉からこれらを除去する。これらの負荷電リン脂質はマクロファージのような食細胞により認識される。プロテインＳは負荷電リン脂質に結合し、アポトーシス細胞と食細胞との間の架橋分子として機能しうる。プロテインＳの架橋特性はアポトーシス細胞の食作用を増強して、それが炎症のような組織損傷のいずれの徴候の発生をも伴うことなく「綺麗に」除去されることを可能にする。

ＰＲＯＳ１遺伝子における突然変異は、血栓症のリスクの増大を招きうる稀な血液障害であるプロテインＳ欠乏症を招きうる。プロテインＳは第Ｖ因子と相互作用することが示されている。

６．プロテインＣ
オートプロトロンビンＩＩＡおよび血液凝固因子ＸＩＶとしても公知であるプロテインＣは酵素原（不活性）タンパク質であり、ヒトおよび他の動物において血液凝固、炎症、細胞死の調節および血管壁の透過性の維持において重要な役割を果たす活性化形態である。活性化プロテインＣ（ＡＰＣ）は、主としてタンパク質第Ｖ_ａ因子および第ＶＩＩＩ_ａ因子をタンパク質分解的に不活性化することにより、これらの作用を達成する。ＡＰＣは、その活性部位にセリンの残基を含有するため、セリンプロテアーゼとして分類される。ヒトにおいては、プロテインＣはＰＲＯＣ遺伝子によりコードされ、これは第２染色体上で見出される。

プロテインＣの酵素原形態は、血漿中を循環するビタミンＫ依存性糖タンパク質である。その構造は、ジスルフィド結合により連結された軽鎖および重鎖からなる二本鎖ポリペプチドの構造である。プロテインＣチモーゲンは、凝固に深く関与しているもう１つのタンパク質であるトロンビンにそれが結合した際に活性化され、プロテインＣの活性化はトロンボモジュリンおよび内皮プロテインＣ受容体（ＥＰＣＲ）の存在により著しく促進される。ＥＰＣＲの役割ゆえに、活性化プロテインＣは主として内皮細胞（すなわち、血管壁を構成する細胞）の近傍で見出され、ＡＰＣが影響を及ぼすのはこれらの細胞および白血球である。抗凝固因子としてプロテインＣが果たす決定的に重要な役割ゆえに、プロテインＣの欠乏またはＡＰＣに対する何らかの種類の抵抗性を示す者は、危険な血液凝固（血栓）を形成する有意に増大したリスクを有する。

活性化ドロトレコギンアルファ（ブランド名Ｘｉｇｒｉｓ）としても公知の活性化プロテインＣの臨床使用への研究は議論の的となっている。製造業者であるＥｌｉ Ｌｉｌｌｙ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙは、重篤な敗血症および敗血性ショックを有する者におけるその使用を促進するために積極的な販売促進キャンペーン（例えば、２００４ Ｓｕｒｖｉｖｉｎｇ Ｓｅｐｓｉｓ Ｃａｍｐａｉｇｎ Ｇｕｉｄｅｌｉｎｅｓのスポンサー）を行った。しかし、それは生存を改善しない（そして出血リスクを上昇させる）ため、その使用は推奨できないことを、２０１１コクラン・レビュー（Ｃｏｃｈｒａｎｅ ｒｅｖｉｅｗ）は見出した。

ヒトプロテインＣは、プロトロンビン、第ＶＩＩ因子、第ＩＸ因子および第Ｘ因子のような血液凝固に影響を及ぼす他のビタミンＫ依存性タンパク質に構造的に類似したビタミンＫ依存性糖タンパク質である。プロテインＣの合成は肝臓内で生じ、一本鎖前駆体分子（３２アミノ酸のＮ末端シグナルペプチドおよびそれに続くプロペプチド）から開始される。プロテインＣは、Ｌｙｓ^１９８およびＡｒｇ^１９９のジペプチドが除去される際に形成される。これは、各鎖上にＮ結合炭水化物を有するヘテロ二量体への変換を引き起こす。該タンパク質は、Ｃｙｓ^１８３とＣｙｓ^３１９との間でジスルフィド結合により連結された１本の軽鎖（２１ｋＤａ）および１本の重鎖（４１ｋＤａ）を有する。

不活性プロテインＣは以下の複数のドメイン内に４１９アミノ酸を含む：１つのＧｌａドメイン（残基４３〜８８）、ヘリックス芳香族セグメント（８９〜９６）、２つの表皮増殖因子（ＥＧＦ）様ドメイン（９７〜１３２および１３６〜１７６）、活性化ペプチド（２００〜２１１）およびトリプシン様セリンプロテアーゼドメイン（２１２〜４５０）。軽鎖は該ＧｌａおよびＥＧＦ様ドメインならびに該芳香族セグメントを含有する。重鎖は該プロテアーゼドメインおよび該活性化ペプチドを含有する。活性化されることになるチモーゲンとしてプロテインＣの８５〜９０％が血漿中を循環するのはこの形態においてである。残存するプロテインＣチモーゲンは該タンパク質の若干修飾された形態を含む。該酵素の活性化は、トロンビン分子が重鎖のＮ末端から該活性化ペプチドを切断除去する際に生じる。活性化部位は、セリンプロテアーゼに典型的な触媒三残基（Ｈｉｓ^２５３、Ａｓｐ^２９９およびＳｅｒ^４０２）を含有する。

プロテインＣの活性化はトロンボモジュリンおよび内皮プロテインＣ受容体（ＥＰＣＲ）により強く促進され、それらのうちの後者は主として内皮細胞（血管の内側の細胞）上で見出される。トロンボモジュリンの存在は活性化を数桁加速し、ＥＰＣＲは活性化を２０倍加速する。これらの２つのタンパク質のいずれかがマウス試料中に存在しない場合、該マウスは、尚も胚状態のままで、過剰な血液凝固により死亡する。内皮上で、ＡＰＣは血液凝固、炎症および細胞死（アポトーシス）の調節において重要な役割を果たす。プロテインＣの活性化に対するトロンボモジュリンの加速効果ゆえに、該タンパク質はトロンビンによってではなくトロンビン−トロンボモジュリン（または更にはトロンビン−トロンボモジュリン−ＥＰＣＲ）複合体によって活性化されると言うこともできる。一旦活性形態になると、ＡＰＣはＥＰＣＲに結合したままであっても結合していなくてもよく、ＥＰＣＲに対して、それはタンパク質チモーゲンとほぼ同じアフィニティを有する。

Ｇｌａドメインは抗凝固のための負荷電リン脂質への、そして細胞保護のためのＥＰＣＲへの結合に特に有用である。１つの特定のエキソサイトが、第Ｖａ因子を効率的に不活性化するプロテインＣの能力を増強する。トロンボモジュリンとの相互作用には、もう１つのことが必要である。

チモーゲン形態のプロテインＣは正常成人血漿中に６５〜１３５ ＩＵ／ｄＬの濃度で存在する。活性化プロテインＣはこれより約２０００倍低いレベルで見出される。軽度のプロテインＣ欠乏症は、２０ ＩＵ／ｄＬを超えるが正常範囲より低い血漿レベルに対応する。中等度に重篤な欠乏症は１〜２０ ＩＵ／ｄＬの血液濃度を示し、重篤な欠乏症は１ ＩＵ／ｄＬ未満の又は検出不能なプロテインＣのレベルを示す。健常正期産児におけるプロテインＣレベルの平均は４０ ＩＵ／ｄＬである。プロテインＣの濃度は６カ月まで増加し、この時点の平均レベルは６０ ＩＵ／ｄＬであり、該レベルは、思春期後に成人レベルに達するまでは、小児の間を通じて低く保たれる。活性化プロテインＣの半減期は約１５分である。

プロテインＣ経路は、ＡＰＣの発現および体内のその活性のレベルを制御する特異的な化学反応である。プロテインＣは多面的であり、２つの主要クラスの機能、すなわち、抗凝固および細胞保護（細胞に対するその直接作用）の機能を有する。プロテインＣがどちらの機能をもたらすかは、それが活性化された後でＡＰＣがＥＰＣＲに結合したままであるか否かに左右され、それが結合していない場合にＡＰＣの抗凝固作用が生じる。この場合、プロテインＣは、第Ｖ_ａ因子および第ＶＩＩＩ_ａ因子を不可逆的にタンパク質分解により不活性化して、それらをそれぞれ第Ｖ_ｉ因子および第ＶＩＩＩ_ｉ因子に変換することにより、抗凝固物質として機能する。活性化プロテインＣは、尚もＥＰＣＲに結合している場合には、その細胞保護作用をもたらして、エフェクター基質ＰＡＲ−１（プロテアーゼ活性化受容体−１）に作用する。ある程度は、ＡＰＣの抗凝固特性はその細胞保護特性から独立している。なぜなら、一方の経路の発現は他方の存在により影響されないからである。

プロテインＣの活性は、利用可能なトロンボモジュリンまたはＥＰＣＲの量を低減することによりダウンレギュレーションされうる。これは、炎症性サイトカイン、例えばインターロイキン−１β（ＩＬ−１β）および腫瘍壊死因子−α（ＴＮＦ−α）により行われうる。活性化白血球は炎症中にこれらの炎症性メディエーターを放出して、トロンボモジュリンおよびＥＰＣＲの両方の生成を抑制し、内皮表面からのそれらの放出を誘導する。これらの作用の両方はプロテインＣ活性化をダウンレギュレーションする。トロンビン自体もＥＰＣＲのレベルに影響を及ぼしうる。また、細胞から放出されるタンパク質はプロテインＣ活性化を妨げ（例えば、好酸球）、これは好酸球増多性心疾患における血栓症を説明しうる。プロテインＣは血小板因子４によりアップレギュレーションされうる。このサイトカインは、プロテインＣのＧｌａドメインからトロンボモジュリンのグリコサミノグリカン（ＧＡＧ）ドメインまでの静電的架橋を形成してそれらの反応に関するミカエリス定数（Ｋ_Ｍ）を減少させることにより、プロテインＣの活性化を改善すると推測される。また、プロテインＣはプロテインＣインヒビターにより抑制される。

遺伝的プロテインＣ欠乏症は、単純なヘテロ接合性に関連したその軽度な形態においては、成人における静脈血栓症の有意に増大したリスクを引き起こす。胎児が該欠乏症に関してホモ接合または複合ヘテロ接合である場合には、電撃性紫斑病、重度の播種性血管内凝固および子宮内の同時静脈血栓塞栓症の症状が認められうる。これは非常に重篤であり、通常は致命的である。マウスにおけるプロテインＣ遺伝子の欠失は誕生時前後に胎児死亡を引き起こす。プロテインＣを有さない胎児マウスは最初は正常に発生するが、重篤な出血、凝固障害、フィブリンの沈着および肝臓の壊死を引き起こす。無症候性個体におけるプロテインＣ欠乏症の頻度は１／２００〜１／５００である。これに対して、該欠乏症の有意な症状は１／２０，０００個体で見出されうる。人種や民族による偏りは見出されていない。

ＡＰＣがその機能を達成できない場合、活性化プロテインＣ抵抗性が生じる。この疾患は、プロテインＣ欠乏症に類似した症状を示す。白人において活性化プロテインＣ抵抗性を招く最も一般的な突然変異はＡＰＣのための第Ｖ因子の切断部位におけるものである。そこでは、Ａｒｇ^５０６はＧｌｎで置換されて、第Ｖ因子ライデン（Ｌｅｉｄｅｎ）を生成する。この突然変異はＲ５０６Ｑとも称される。この切断部位の喪失を招く突然変異は、ＡＰＣが第Ｖ_ａ因子および第ＶＩＩＩ_ａ因子を有効に不活性化するのを実際に阻止する。したがって、そのような者の血液は非常に凝固しやすく、彼は永久に、増大した血栓症リスクを有する。第Ｖ_{ＬＥＩＤＥＮ}因子の突然変異に関してヘテロ接合である個体は、一般集団の場合より５〜７倍高い、静脈血栓症のリスクを有する。ホモ接合被験者は８０倍高いリスクを有する。この突然変異は白人における静脈血栓症の最も一般的な遺伝性リスクでもある。

ＡＰＣ抵抗性の約５％は前記突然変異および第Ｖ_{Ｌｅｉｄｅｎ}因子に関連していない。他の遺伝的突然変異がＡＰＣ抵抗性を引き起こすが、第Ｖ_{Ｌｅｉｄｅｎ}因子が引き起こす程度には程遠い。これらの突然変異は第Ｖ因子の種々の他の形態、第Ｖ因子を標的化する自己抗体の自然生成、およびＡＰＣの補因子のいずれかの機能不全を含む。また、幾つかの後天的条件がＡＰＣの抗凝固機能の達成におけるＡＰＣの効力を低減しうる。血栓形成傾向のある患者の２０％〜６０％はＡＰＣ抵抗性の何らかの形態を有することを、研究は示唆している。

Ｃ．Ｇｌａドメインペプチドおよびポリペプチド
本開示は種々のＧｌａドメイン含有ペプチドおよびポリペプチドの設計、製造および使用を含む。これらの分子の構造的特徴は以下のとおりである。第１に、該ペプチドまたはポリペプチドは、Ｇｌａドメインを構成する約３０〜４５個の連続的残基を含有するＧｌａドメインを有する。したがって、「「Ｘ」以下の連続的残基を有するペプチド」なる語は、「含む」なる語を包含する場合でさえも、より多数の連続的残基を含むとは理解され得ない。第２に、該ペプチドおよびポリペプチドは追加的な非Ｇｌａドメイン残基、例えばＥＧＦドメイン、クリングルドメイン、Ｆｃドメインなどを含有しうる。

一般に、該ペプチドおよびポリペプチドは３００残基以下であり、この場合もまた、３０〜４５個の連続的残基のＧｌａドメインを含む。その全長は３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２２５、２５０、２７５および３００個までの残基でありうる。５０〜３００残基、１００〜３００残基、１５０〜３００残基、２００〜３００残基、５０〜２００残基、１００〜２００残基および１５０〜３００残基および１５０〜２００残基のペプチド長の範囲が想定される。連続的なＧｌａ残基の数は３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４または１５でありうる。

本開示はＬ−配置アミノ酸、Ｄ−配置アミノ酸またはそれらの混合物を使用しうる。Ｌ−アミノ酸は、タンパク質において見出されるアミノ酸の大多数に相当し、一方、Ｄ−アミノ酸は、外来種海棲生物、例えばイモガイにより産生される幾つかのタンパク質において見出される。それらはまた、細菌のペプチドグリカン細胞壁の豊富な成分である。Ｄ−セリンは脳内の神経伝達物質として作用しうる。アミノ酸立体配置のＬおよびＤの規約はアミノ酸自体の光学活性に関するものではなく、そのアミノ酸が理論的に合成されうるグリセルアルデヒドの異性体の光学活性に関するものである（Ｄ−グリセルアルデヒドは右旋光であり、Ｌ−グリセルアルデヒドは左旋光である）。

「全Ｄ」ペプチドの一形態はレトロインベルソペプチドである。天然に存在するポリペプチドのレトロインベルソ修飾は、対応Ｌ−アミノ酸に対応するものとは反対のα−炭素立体化学を有するアミノ酸（すなわち、天然ペプチド配列に対して反対の順序のＤ−アミノ酸）の合成構築を含む。したがって、レトロインベルソ類似体は逆転末端および逆方向のペプチド結合（ＣＯ−ＮＨではなく、ＮＨ−ＣＯ）を有する一方で、天然ペプチド配列の場合と同様の側鎖のトポロジーをほぼ維持している。米国特許第６，２６１，５６９号（これを参照により本明細書に組み入れることとする）を参照されたい。

Ｄ．合成
固相合成技術（Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，１９６３）を用いて、ペプチドおよびポリペプチドを製造することが好都合であろう。他のペプチド合成技術は当業者によく知られている（Ｂｏｄａｎｓｚｋｙら，１９７６；Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，１９８５；Ｓｏｌｉｄ Ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｌｉａ，１９８４）。そのような合成に使用される適当な保護基が前記テキストおよびＰｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ（１９７３）に見出されるであろう。これらの合成方法は、伸長しつつあるペプチド鎖への１以上のアミノ酸残基または適当な保護アミノ酸残基の逐次的付加を含む。通常、第１アミノ酸残基のアミノまたはカルボキシル基を、選択的に除去可能な適当な保護基で保護する。反応性側鎖を含有する含有するアミノ酸、例えばリシンには、選択的に除去可能な異なる保護基を使用する。

一例として固相合成を用いて、保護または誘導体化されたアミノ酸をその非保護カルボキシルまたはアミノ基を介して不活性固体支持体に結合させる。ついでアミノまたはカルボキシル基の保護基を選択的に除去し、適切に保護された相補的（アミノまたはカルボキシル）基を有する、配列内の次のアミノ酸を混合し、固体支持体に既に結合している残基と反応させる。ついでアミノまたはカルボキシル基の保護基をこの新たに付加されたアミノ酸残基から除去し、ついで（適切に保護された）次のアミノ酸を付加し、以下同様である。所望のアミノ酸の全てが適切な順序で連結された後、残存する末端および側鎖基保護基（および固体支持体）を連続的または同時に除去して、最終ペプチドを得る。本開示のペプチドおよびポリペプチドは、好ましくは、ベンジル化またはメチルベンジル化アミノ酸を欠いている。そのような保護基部分は合成の経過中には使用されうるが、それらは、該ペプチドおよびポリペプチドが使用される前に除去される。どこかに記載されているとおり、コンホメーションを制限するために分子内結合を形成させるためには、追加的な反応が必要かもしれない。

２０種の標準的なアミノ酸が使用可能であることに加え、多数の「非標準」アミノ酸が存在する。これらのうちの２つは遺伝暗号により特定されうるが、タンパク質においてはむしろ稀なものである。幾つかのタンパク質内には、通常は終止コドンであるＵＧＡコドンにおいて、セレノシステインが組込まれる。メタンを生成するためにメタン生成アーキアが使用する酵素においては、ピロリシンがメタン生成アーキアにより使用される。それはコドンＵＡＧでコードされる。タンパク質において見出されない非標準的アミノ酸の例には、ランチオニン、２−アミノイソ酪酸、デヒドロアラニンおよび神経伝達物質ガンマ−アミノ酪酸が含まれる。非標準的アミノ酸は、しばしば、標準的アミノ酸の代謝経路における中間体として存在する。例えば、オルニチンおよびシトルリンは、アミノ酸異化作用の一部である尿素回路において存在する。非標準的アミノ酸は、通常、標準的アミノ酸に対する修飾により形成される。例えば、ホモシステインは含硫基移動経路を介して、または中間代謝産物Ｓ−アデノシルメチオニンを経るメチオニンの脱メチル化により形成され、一方、ヒドロキシプロリンはプロリンの翻訳後修飾により形成される。

Ｅ．リンカー
Ｇｌａドメインペプチドまたはポリペプチドを他のタンパク質配列（例えば、抗体Ｆｃドメイン）に融合させるためには、リンカーまたは架橋剤が使用されうる。アフィニティマトリックスの製造、多様な構造体の修飾および安定化、リガンドおよび受容体結合部位の特定ならびに構造研究を含む種々の目的に、二官能性架橋試薬が広範に使用されている。２つの同一官能基を含有するホモ二官能性試薬は、同じ及び異なる巨大分子または巨大分子のサブユニット間の架橋、ならびにポリペプチドリガンドの、それらの特異的結合部位への連結の誘発に非常に効率的であることが判明している。ヘテロ二官能性試薬は２つの異なる官能基を含有する。それらの２つの異なる官能基の反応性の相違を利用することにより、選択的かつ連続的に架橋が制御されうる。該二官能性架橋試薬はそれらの官能基の特異性（例えば、アミノ−、スルフヒドリル−、グアニジノ−、インドール−またはカルボキシル−特異的基）に従い分類されうる。これらのうち、遊離アミノ基に対する試薬は、それらの商業的入手可能性、合成のし易さ、およびそれらが適用されうる穏和な反応条件ゆえに、特に好評となっている。大多数のヘテロ二官能性架橋試薬は第一級アミン反応性基およびチオール反応性基を含有する。

もう１つの例においては、ヘテロ二官能性架橋試薬および該架橋試薬の使用方法は米国特許第５，８８９，１５５号（その全体を参照により具体的に本明細書に組み入れることとする）に記載されている。該架橋試薬は求核性ヒドラジド残基と求電子性マレイミド残基とを併せ持ち、一例においては遊離チオールへのアルデヒドのカップリングを可能にする。該架橋試薬は、種々の官能基を架橋するように修飾可能であり、したがって、ポリペプチドを架橋するのに有用である。特定のポリペプチドが、与えられた架橋試薬に適した残基を天然配列内に含有しない場合には、一次配列における遺伝的または合成的な保存的アミノ酸改変が行われうる。

Ｆ．追加的ペプチド／ポリペプチド配列
薬物開発が達成しようとする１つの要因は適度な循環半減期であり、これは、投薬、薬物投与および有効性に影響を及ぼし、これは生物学的療法には特に重要である。６０ｋＤ未満の小さなタンパク質は腎臓により迅速に除去され、したがって、それらの標的に到達しない。これは、有効性を達成するためには高用量が必要であることを意味する。循環中のタンパク質の半減期を増加させるために現在用いられている修飾には、ペグ化（ＰＥＧｙｌａｔｉｏｎ）；タンパク質、例えばトランスフェリン（ＷＯ０６０９６５１５Ａ２）、アルブミン、成長ホルモン（米国特許公開第２００３１０４５７８ＡＡ号）との結合または遺伝的融合；セルロースとの結合（ＬｅｖｙおよびＳｈｏｓｅｙｏｖ，２００２）；Ｆｃフラグメントとの結合または融合；グリコシル化および突然変異誘発アプローチ（Ｃａｒｔｅｒ，２００６）が含まれる。

ペグ化の場合、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を、例えば血漿タンパク質、抗体または抗体フラグメントでありうるタンパク質に結合させる。抗体のペグ化の効果に関する最初の研究は１９８０年代に行われた。該結合は酵素的または化学的に実施可能であり、当技術分野で十分に確立されている（Ｃｈａｐｍａｎ，２００２；ＶｅｒｏｎｅｓｅおよびＰａｓｕｔ，２００５）。ペグ化により、全サイズが増大することが可能であり、これは腎臓濾過の可能性を低減する。ペグ化は更に、タンパク質分解から保護し、血液からのクリアランスを遅くする。更に、ペグ化は免疫原性を低減し、溶解度を増加させうることが報告されている。ＰＥＧの付加による薬物動態の改善は以下の幾つかの異なるメカニズムによるものである：分子のサイズの増加、タンパク質分解からの保護、抗原性の低減、および細胞受容体からの特定の配列のマスキング。抗体フラグメント（Ｆａｂ）の場合、血漿半減期における２０倍の増加がペグ化により達成されている（Ｃｈａｐｍａｎ，２００２）。

現在のところ、幾つかの承認されたペグ化薬、例えば、２０００年に販売されたＰＥＧ−インターフェロンアルファ２ｂ（ＰＥＧ−ＩＮＴＲＯＮ）および２００２年に販売されたアルファ２ａ（Ｐｅｇａｓｙｓ）が存在する。シムジア（Ｃｉｍｚｉａ）またはセルトリズマブ・ペゴール（Ｃｅｒｔｏｌｉｚｕｍａｂ Ｐｅｇｏｌ）と称される、ＴＮＦアルファに対するペグ化抗体フラグメントが、クローン病の治療に関するＦＤＡ承認のために２００７年に申請され、２００８年４月２２日付けで承認されている。ペグ化の欠点は、１０００ｋＤを超えるＰＥＧ鎖が必要な場合は特に、長い単分散種を合成するのが困難なことである。多数の用途のために、１００００ｋＤを超える鎖長を有する多分散ＰＥＧが使用されていて、種々の長さのＰＥＧ鎖を有するコンジュゲートの集団が生じ、これは、製品間のバッチの等価性を確保するためには詳細な分析を要する。ＰＥＧ鎖の長さが異なれば、それにより生じる生物学的活性も異なることがあり、したがって薬物動態も異なりうる。ペグ化のもう１つの欠点はアフィニティまたは活性の低下であり、それはアルファ−インターフェロンＰｅｇａｓｙｓで観察されているとおりであり、これは天然タンパク質の抗ウイルス活性の僅か７％しか有さないが、血漿半減期の向上により改善された薬物動態を示す。

もう１つのアプローチは、６７ｋＤでありヒトにおいて１９日の血漿半減期を有するアルブミンのような長命タンパク質を薬物に結合（コンジュゲート化）させることである。アルブミンは血漿中の最も豊富なタンパク質であり、血漿ｐＨ調節に関与しているが、血漿中の物質の担体としても働く。ＣＤ４の場合、それをヒト血清アルブミンに融合させた後、血漿半減期の増加が達成されている（Ｙｅｈら，１９９２）。融合タンパク質の他の例としては、インスリン、ヒト成長ホルモン、トランスフェリンおよびサイトカインが挙げられる（Ｄｕｔｔａｒｏｙら，２００５；Ｍｅｌｄｅｒら，２００５；Ｏｓｂｏｒｎら，２００２ａ；Ｏｓｂｏｒｎら，２００２ｂ；Ｓｕｎｇら，２００３、そして、米国特許公開第２００３１０４５７８Ａ１号、ＷＯ０６０９６５１５Ａ２およびＷＯ０７０４７５０４Ａ２（それらの全体を参照により本明細書に組み入れることとする）を参照されたい）。

血漿半減期およびタンパク質の活性に対するグリコシル化の効果は詳細に研究されている。組織プラスミノーゲンアクチベーター（ｔＰＡ）の場合、新たなグリコシル化部位の付加は血漿クリアランスを低減し、効力を改善した（Ｋｅｙｔら，１９９４）。幾つかの組換えタンパク質および免疫グロブリンに糖鎖工学が成功裏に適用されている（Ｅｌｌｉｏｔｔら，２００３；ＲａｊｕおよびＳｃａｌｌｏｎ，２００７；ＳｉｎｃｌａｉｒおよびＥｌｌｉｏｔｔ，２００５；Ｕｍａｎａら，１９９９）。更に、グリコシル化は免疫グロブリンの安定性に影響を及ぼす（Ｍｉｍｕｒａら，２０００；ＲａｊｕおよびＳｃａｌｌｏｎ，２００６）。

融合タンパク質に使用されるもう１つの分子はＩｇＧのＦｃフラグメントである（ＡｓｈｋｅｎａｚｉおよびＣｈａｍｏｗ，１９９７）。Ｆｃ融合アプローチは、例えば、Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎにより開発されたトラップ技術（Ｔｒａｐ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）（例えば、ＩＬ１トラップおよびＶＥＧＦトラップ）において利用されている。ペプチドの半減期を延長させるためのアルブミンの使用は米国特許公開第２００４００１８２７Ａ１号に記載されている。アルブミンの正の効果はＦａｂフラグメントおよびｓｃＦｖ−ＨＳＡ融合タンパク質に関しても報告されている。アルブミンの血清半減期の延長は、ＦｃＲｎによりもたらされるリサイクル・プロセスによるものであることが示されている（Ａｎｄｅｒｓｏｎら，２００６；Ｃｈａｕｄｈｕｒｙら，２００３）。

もう１つの方法は、結合特性を改善するために免疫グロブリンの相互作用をその受容体へ標的化する特異的突然変異誘発技術を用いることである（すなわち、Ｆｃ領域におけるアフィニティ成熟）。ＦｃＲｎに対するアフィニティの増大により、半減期の延長がインビボで達成されうる（Ｇｈｅｔｉｅら，１９９７；Ｈｉｎｔｏｎら，２００６；Ｊａｉｎら，２００７；Ｐｅｔｋｏｖａら，２００６ａ；Ｖａｃｃａｒｏら，２００５）。しかし、アフィニティ成熟法は数ラウンドの突然変異誘発および試験を要する。これは長時間を要し、高いコストがかかり、突然変異した場合に半減期の延長をもたらすアミノ酸の数により制限される。したがって、生物学的療法剤のインビボ半減期を改善するために、簡便な代替アプローチが必要とされている。延長したインビボ半減期を有する治療剤は、治療が長期間を要する場合には特に、慢性疾患、自己免疫障害、炎症性、代謝性、感染性および眼疾患ならびに癌の治療に特に重要である。したがって、種々の治療剤の投与量および／または注射頻度を低減するために、循環中の半減期および持続性が向上した治療剤（例えば、抗体およびＦｃ融合タンパク質）の開発が尚も必要とされている。

Ｇ．標識
本開示のペプチドおよびポリペプチドは診断目的で標識に結合されうる。本開示における標識は、アッセイを用いて検出されうるいずれかの部分と定義される。受容体分子の非限定的な例には、酵素、放射能標識、ハプテン、蛍光標識、リン光分子、化学発光分子、発色団、光親和性分子、着色粒子またはリガンド、例えばビオチンが含まれる。

診断剤としての使用のためには標識コンジュゲート（標識結合体）が一般に好ましい。診断剤は一般に、インビトロ診断に使用されるものと、インビボ診断法に使用されるもの（「定方向イメージング（ｄｉｒｅｃｔｅｄ ｉｍａｇｉｎｇ）」として一般に公知）との２つのクラスに分類される。多数の適当なイメージング剤が、ペプチドおよびポリペプチドへのそれらの結合のための方法と同様、当技術分野で公知である（例えば、米国特許第５，０２１，２３６号、第４，９３８，９４８号および第４，４７２，５０９号を参照されたい）。使用されるイメージング部分は常磁性イオン、放射性同位体、蛍光色素、ＮＭＲ検出可能物質およびＸ線造影剤でありうる。

常磁性イオンの場合、例えば、クロム（ＩＩＩ）、マンガン（ＩＩ）、鉄（ＩＩＩ）、鉄（ＩＩ）、コバルト（ＩＩ）、ニッケル（ＩＩ）、銅（ＩＩ）、ネオジム（ＩＩＩ）、サマリウム（ＩＩＩ）、イッテルビウム（ＩＩＩ）、ガドリニウム（ＩＩＩ）、バナジウム（ＩＩ）、テルビウム（ＩＩＩ）、ジスプロシウム（ＩＩＩ）、ホルミウム（ＩＩＩ）および／またはエルビウム（ＩＩＩ）のようなイオンが挙げられうるが、ガドリニウムが特に好ましい。Ｘ線イメージングのような他の状況で有用なイオンには、ランタン（ＩＩＩ）、金（ＩＩＩ）、鉛（ＩＩ）、および特にビスマス（ＩＩＩ）が含まれるが、これらに限定されるものではない。

治療および／または診断用途のための放射性同位体の場合、アスタチン^２１１、^１４炭素、^５１クロム、^３６塩素、^５７コバルト、^５８コバルト、銅^６７、^１５２ＥＵ、ガリウム^６７、^３水素、ヨウ素^１２３、ヨウ素^１２５、ヨウ素^１３１、インジウム^１１１、^５９鉄、^３２リン、レニウム^１８６、レニウム^１８８、^７５セレン、^３５硫黄、テクネチウム^９９ｍおよび／またはイットリウム^９０が挙げられうるであろう。^１２５Ｉは、しばしば、ある実施形態における使用に好ましく、テクネチウム^９９ｍおよび／またはインジウム^１１１も、しばしば、それらの低いエネルギーおよび長距離検出の適合性ゆえに好ましい。放射性標識ペプチドおよびポリペプチドは、当技術分野でよく知られた方法に従い製造されうる。例えば、ペプチドおよびポリペプチドは、ヨウ化ナトリウムおよび／またはカリウムならびに化学的酸化剤、例えば次亜塩素酸ナトリウム、または酵素酸化剤、例えばラクトペルオキシダーゼとの接触によりヨウ素化されうる。ペプチドは、リガンド交換法により、例えば、ペルテクナートを第一スズ溶液で還元し、該還元テクネチウムをセファデックス（Ｓｅｐｈａｄｅｘ）カラム上にキレート化し、このカラムに該ペプチドを適用することにより、テクネチウム^９９ｍで標識されうる。あるいは、例えば、ペルテクナート、還元剤、例えばＳＮＣｌ_２、バッファー溶液、例えばナトリウム−カリウムフタラート溶液、およびペプチドをインキュベートすることにより、直接標識技術が用いられうる。金属イオンとして存在する放射性同位体をペプチドに結合させるためにしばしば使用される中間官能基として、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）またはエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）が挙げられる。

コンジュゲートとしての使用で想定される蛍光標識には、アレクサ（Ａｌｅｘａ）３５０、アレクサ４３０、ＡＭＣＡ、ＢＯＤＩＰＹ ６３０／６５０、ＢＯＤＩＰＹ ６５０／６６５、ＢＯＤＩＰＹ−ＦＬ、ＢＯＤＩＰＹ−Ｒ６Ｇ、ＢＯＤＩＰＹ−ＴＭＲ、ＢＯＤＩＰＹ−ＴＲＸ、カスケードブルー、Ｃｙ３、Ｃｙ５，６−ＦＡＭ、フルオレセインイソチオシアナート、ＨＥＸ、６−ＪＯＥ、オレゴングリーン４８８、オレゴングリーン５００、オレゴングリーン５１４、パシフィックブルー、ＲＥＧ、ローダミングリーン、ローダミンレッド、レノグラフィン、ＲＯＸ、ＴＡＭＲＡ、ＴＥＴ、テトラメチルローダミンおよび／またはテキサスレッドが含まれる。

想定されるもう１つのタイプのコンジュゲートは、主としてインビトロでの使用に意図されるものであり、この場合、二次結合性リガンドに、および／または発色性基質との接触に際して着色産物を生成する酵素（酵素タグ）に、ペプチドが連結される。適当な酵素の例には、ウレアーゼ、アルカリホスファターゼ、（ホールラディッシュ）水素ペルオキシダーゼまたはグルコースオキシダーゼが含まれる。好ましい二次結合性リガンドとしてはビオチンおよびアビジンおよびストレプトアビジン化合物が挙げられる。そのような標識の使用は当業者によく知られており、例えば米国特許第３，８１７，８３７号、第３，８５０，７５２号、第３，９３９，３５０号、第３，９９６，３４５号、第４，２７７，４３７号、第４，２７５，１４９号および第４，３６６，２４１号に記載されている。

ペプチドのコンジュゲート部分への該ペプチドの結合またはコンジュゲート化のための他の方法は当技術分野で公知である。幾つかの結合方法は、金属キレート錯体、例えば有機キレート剤、例えばジエチレントリアミン五酢酸無水物（ＤＴＰＡ）、エチレントリアミン四酢酸、Ｎ−クロロ−ｐ−トルエンスルホンアミドおよび／またはテトラクロロ−３α−６α−ジフェニルグリコールウリル−３抗体結合体（米国特許第４，４７２，５０９号および第４，９３８，９４８号）の使用を含む。ペプチドまたはポリペプチドを、カップリング剤、例えばグルタルアルデヒドまたはペリオダートの存在下、酵素と反応させることも可能である。フルオレセインマーカーとのコンジュゲートは、これらのカップリング剤の存在下またはイソチオシアナートとの反応により製造される。

ＩＶ．療法
Ａ．医薬製剤および投与経路
臨床適用が想定される場合には、意図される適用に適した形態の医薬組成物を製造することが必要であろう。一般に、これは、発熱物質およびヒトまたは動物に有害でありうる他の不純物を実質的に含有しない組成物を製造することを含む。

運搬ベクター（運搬担体）を安定にし、標的細胞による取り込みを可能にするためには、適当な塩およびバッファーを使用することが一般に望ましいであろう。組換え細胞を患者内に導入する場合には、バッファーも使用されるであろう。本開示の水性組成物は、医薬上許容される担体または水性媒体に溶解または分散された、細胞に対するベクターの有効量を含む。そのような組成物も接種物と称される。「医薬上または薬理学的に許容される」なる語は、動物またはヒトに投与された場合に、有害な、アレルギー性の、または他の望ましくない反応をもたらさない分子および組成物に関するものである。本明細書中で用いる「医薬上許容される担体」は、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌および抗真菌剤、等張剤、吸収遅延剤などを含む。医薬上活性な物質のためのそのような媒体および物質の使用は当技術分野でよく知られている。いずれかの通常の媒体または物質が本開示のベクターまたは細胞に不適合である場合を除き、治療用組成物におけるその使用が想定される。補助的な有効成分も該組成物に配合されうる。

本開示の活性組成物は古典的な医薬製剤を含みうる。本開示によるこれらの組成物の投与は、標的組織に関して有効であるいずれかの一般的な経路によるものとなろう。そのような経路は経口、鼻腔内、頬側、直腸、膣または局所経路を含む。あるいは、投与は同所性、皮内、皮下、筋肉内、腫瘍内、腹腔内または静脈内注射によるものでありうる。そのような組成物は通常、前記の医薬上許容される組成物として投与されるであろう。

活性化合物はまた、非経口的または腹腔内に投与されうる。遊離塩基または薬理学的に許容される塩としての活性化合物の溶液は、ヒドロキシプロピルセルロースのような界面活性剤と適切に混合された水中で調製されうる。分散剤はまた、グリセロール、液体ポリエチレングリコールおよびそれらの混合物中ならびに油中で調製されうる。通常の保存および使用条件下、これらの製剤は、微生物の増殖を防止するための保存剤を含有する。

注射用途に適した医薬形態には、無菌水溶液または分散液、および無菌注射用溶液または分散液の即時調製用の無菌粉末が含まれる。全ての場合において、該形態は無菌でなければならず、容易な注射可能性が存在する程度に流動性でなければならない。それは、製造および貯蔵の条件下で安定でなければならず、細菌および真菌のような微生物の汚染作用に対して防護されなければならない。担体は、例えば水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコールおよび液体ポリエチレングリコールなど）、それらの適当な混合物および植物油を含む、溶媒または分散媒でありうる。適切な流動性は、例えば、レシチンのようなコーティングの使用により、分散液の場合には必要な粒子サイズの維持により、および界面活性剤の使用により維持されうる。微生物の作用の防止は種々の抗細菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどによりもたらされうる。多くの場合、等張剤、例えば、糖または塩化ナトリウムを含有させることが好ましいであろう。注射用組成物の持続的吸収は、吸収を遅らせる物質、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを該組成物において使用することによりもたらされうる。

無菌注射用溶液は、必要に応じて、前記に列挙された種々の他の成分と共に、適当な溶媒中に必要量の活性化合物を配合し、ついで濾過滅菌を行うことにより調製される。一般に、分散液は、基本的な分散媒と前記のものから選ばれる必要な他の成分とを含有する無菌ビヒクル中に種々の無菌有効成分を配合することにより調製される。無菌注射溶液の調製のための無菌粉末の場合、好ましい調製方法は、有効成分およびいずれかの追加的な所望の成分の粉末を、予め滅菌濾過されたその溶液から生成する真空乾燥および凍結乾燥技術である。

本明細書中で用いる「医薬上許容される担体」は、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌および抗真菌剤、等張剤、吸収遅延剤などを含む。医薬上活性な物質のためのそのような媒体および物質の使用は当技術分野でよく知られている。いずれかの通常の媒体または物質が有効成分に不適合である場合を除き、治療用組成物におけるその使用が想定される。補助的な有効成分も該組成物に配合されうる。

経口投与の場合、本開示のペプチドおよびポリペプチドは賦形剤と共に配合されることが可能であり、摂取不能な洗口剤および歯磨剤の形態で使用されうる。洗口剤は、ホウ酸ナトリウム溶液（ドーベル液）のような適当な溶媒中に必要量の有効成分を配合することにより調製されうる。あるいは、有効成分は、ホウ酸ナトリウム、グリセリンおよび炭酸水素カリウムを含有する防腐性洗浄剤に配合されうる。有効成分は、ゲル剤、ペースト剤、散剤（粉末）およびスラリーを含む歯磨剤中に分散されうる。有効成分は、水、結合剤、研磨剤、香味剤、発泡剤、および湿潤剤を含みうるペースト状歯磨剤に治療的有効量で加えられうる。

本開示の組成物は中性または塩の形態で製剤化されうる。医薬上許容される塩には、酸付加塩（タンパク質の遊離アミノ基と共に形成されるもの）、および無機酸、例えば塩酸もしくはリン酸、または有機酸、例えば酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸などと共に形成されるものが含まれる。また、遊離カルボキシル基と共に形成される塩は、無機塩基、例えばナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウムまたは水酸化第二鉄、および有機塩基、例えばイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカインなどから誘導されうる。

製剤化されたら、剤形に適合した様態で、そして治療的に有効な量で、溶液は投与されるであろう。該製剤は注射用溶液、薬物放出カプセルなどのような種々の剤形で容易に投与される。例えば水溶液中の非経口投与の場合、必要に応じて溶液は適切に緩衝化されるべきであり、液体希釈剤は、まず、等張にされるべきである。これらの個々の水溶液は静脈内、筋肉内、皮下および腹腔内投与に特に適している。これに関して、使用されうる無菌水性媒体は、本開示を考慮して、当業者に公知であろう。例えば、１回の投与量を１ｍｌの等張ＮａＣｌ溶液に溶解し、１０００ｍｌの皮下注入液に加えるか又は注入の提示部位に注射することが可能であろう（“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ”，１５ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，ｐｐ．１０３５−１０３８および１５７０−１５８０）。治療される対象の状態に応じて、投与量における幾らかの変動が必然的に生じるであろう。いずれにせよ、投与に関して責任を有する者が個々の対象に対する適当な用量を決定するであろう。更に、ヒトへの投与の場合、製剤は、ＦＤＡオフィス・オブ・バイオロジクス・スタンダード（Ｏｆｆｉｃｅ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ ｓｔａｎｄａｒｄ）により要求される無菌性、発熱性、一般的安全性および純度標準を満たしているべきである。

Ｂ．病態および病状
１．癌
背景
癌は組織からの細胞のクローン集団の増殖により生じる。発癌と称される、癌の発生は、幾つかの方法でモデル化され、特徴づけられうる。癌の発生と炎症との関連性が古くから認識されている。炎症応答は微生物感染に対する宿主防御に関与し、組織修復および再生をも導く。相当な証拠が炎症と癌発生リスクとの関連性を指摘している。すなわち、慢性炎症は異形成を招きうる。数百個の異なるヒト癌形態が存在し、癌の基礎をなす遺伝学および生物学の理解が深まるにつれて、これらの形態は更に細分され、再分類されている。

癌の原因の決定は複雑である。喫煙、ある感染症、放射線、運動不足、肥満および環境汚染を含む多数の事物が癌のリスクを増大させることが知られている。これらは遺伝子を直接的に損傷し、または細胞内の既存の遺伝的欠損と結びついて、該疾患を引き起こしうる。癌の約５〜１０％が完全に遺伝性である。

癌は、ある徴候および症状の存在、スクリーニング試験または医学的イメージングを含む幾つかの方法で検出されうる。可能性のある癌が検出されたら、それは組織サンプルの顕微鏡検査により診断される。癌は通常、化学療法、放射線療法および手術で治療される。癌を生き延びる可能性は癌の型および位置ならびに治療開始時の疾患の度合によって大きく変動する。癌は全年齢の者を冒しうるが、少数の型の癌は小児において、より一般的であり、癌の発生リスクは一般に年齢と共に増加する。２００７年には、癌は世界中の全てのヒトの死亡の約１３％（７９０万人）の原因であった。より多くの者が高齢まで生きるようになり、発展途上世界において大衆の生活様式の変化が生じるにつれて、率は上昇しつつある。

治療は手術、化学療法、放射線、代替医療および緩和ケアの５つの一般的範疇に分類される。手術はほとんどの単離した固形癌の治療の主要方法であり、緩和および生存延長において或る役割を果たしうる。生検が通常要求されるため、それは典型的に、決定的な診断を行い腫瘍を病期分類する上での重要な部分である。限局した癌においては、手術は典型的に、全塊および場合によってはその領域内のリンパ節を除去することを試みる。癌の幾つかの型の場合には、これが、癌を排除するために必要とされる全てである。

手術に加えて、化学療法が、乳癌、結腸直腸癌、膵臓癌、骨肉腫、精巣癌、卵巣癌、および或る肺癌を含む幾つかの異なる癌型において有用であることが判明している。化学療法の有効性は体内の他の組織に対する毒性により限定されることが多い。

放射線療法は、癌を治癒させ又は癌の症状を改善するための電離放射線の使用を含む。それは全症例の約半数で使用され、放射線は近接照射療法の形態での内部線源または外部線源からのものでありうる。放射線は典型的には手術および化学療法に加えて使用されるが、早期頭頸部癌のような或る型の癌では単独で使用されうる。有痛性骨転移では、約７０％の者に有効であることが判明している。

代替治療および補完治療は、伝統医療の一部ではない多様な群のヘルスケアシステム、慣行および製品を含む。「補完医療」は、伝統医療と共に用いられる方法および物質を意味するが、「代替医療」は、伝統医療に代わりに用いられる化合物を意味する。癌に対するほとんどの補完および代替医療は厳密には研究も試験もされていない。幾つかの代替治療が研究され、無効であることが示されているが、尚も販売され宣伝され続けている。

最後に、緩和ケアは、患者の気分を良くするために試みる治療を意味し、癌を攻撃する試みと組合されても組合されなくてもよい。緩和ケアは、癌患者が被る物理的、感情的、精神的および心理社会的苦痛を軽減するための行為を含む。癌細胞を直接的に殺すことを目的とする治療とは異なり、緩和ケアの主な目的は、患者の生活の質を改善することである。

Ｇｌａドメイン活性
本開示の文脈においては、操作されたＧｌａタンパク質が抗癌剤として幾つかの異なる様態で使用されうると想定される。第１に、癌患者は、しばしば、塞栓症および死を招きうる凝固亢進状態を患う。この実施形態においては、（所望によりＦｃ領域に連結されていてもよい）Ｇｌａドメインタンパク質を、塞栓形成および病的凝集を低減するのに十分な量で、患者の血管系内に投与する。本明細書に開示されているそのようなＧｌａドメインタンパク質は、そのような患者における病的凝集を低減、阻止および／または抑制するのに有用である。

また、ＰｔｄＳは、癌に対する免疫応答の抑制において或る役割を果たしていることが公知である。したがって、もう１つ実施形態において、本発明者らは、癌細胞上のＰｔｄＳに結合させ、それを遮断／遮蔽（マスク）するための、Ｇｌａドメインタンパク質の使用を想定している。これは、抗炎症サイトカインを誘導し炎症誘発性サイトカインを抑制することにより癌細胞の免疫逃避を促進させるＰｔｄＳを介する免疫寛容誘発シグナリングを妨げる。これは、後記で詳細に説明されているとおり、他の「標準的」癌治療と組合された場合に特に有用なアプローチとなりうる。

２．自己免疫／炎症疾患
背景
本開示は、種々の自己免疫および／または炎症病態、例えば脊椎関節症、強直性脊椎炎、乾癬性関節炎、反応性関節炎、腸炎性関節炎、潰瘍性大腸炎、クローン病、過敏性腸疾患、炎症性腸疾患、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、家族性地中海熱、筋萎縮性側索硬化症、シェーグレン症候群、初期関節炎、ウイルス性関節炎、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、乾癬、血管炎、ウェゲナー肉芽腫症、アジソン病、脱毛症、抗リン脂質症候群、ベーチェット病、セリアック病、慢性疲労症候群、潰瘍性大腸炎、Ｉ型糖尿病、線維筋痛症、自己免疫性胃炎、グッドパスチャー症候群、グレーブス病、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、原発性胆汁性肝硬変、リウマチ熱、サルコイドーシス、強皮症、白斑、血管炎、小血管血管炎、肝炎、原発性胆汁性肝硬変、サルコイドーシス、強皮症、移植片対宿主病（急性および慢性）、再生不良性貧血または周期性好中球減少症の治療を含む。これらの疾患の診断および治療は文献に十分に記載されている。

Ｇｌａドメイン活性
ある免疫障害は、続発性壊死、炎症誘発性シグナリングおよび自己抗体産生を招く、アポトーシス細胞の食作用欠損により特徴づけられることが公知である。更に、ＰｔｄＳを表面上に含有する形質膜由来小胞（ＰＭＶ）がアポトーシス細胞から放出され、マクロファージのような免疫細胞に結合すると考えられている（ＤｅＲｏｓｅら，２０１１）。Ｇｌａドメインタンパク質は、ＰＭＶの表面上で見出されるＰｔｄＳを遮蔽（マスク）することによりＰＭＶの「おとり（デコイ）」作用を低減しアポトーシス細胞の食作用を可能にするために使用されうる。これは継続的炎症性シグナリングのサイクルを破壊し、免疫過剰活性化を低減するはずである。

３．凝固亢進障害
背景
凝固亢進障害は血液凝固傾向の増大を招いて、患者に静脈および動脈の閉塞のリスクをもたらす。正常な止血または出血の停止においては、血管の損傷部位に血栓が生じる。凝固亢進状態においては、循環血液中で血栓が発生する。これが体内の血管の全体で生じると、血栓症として公知の状態が生じうる。血栓症は梗塞または組織の死を招きうる。凝固亢進障害は高ホモシステイン血症、アンチトロンビンＩＩＩ欠乏症、第Ｖ因子ライデンおよびプロテインＣまたはプロテインＳ欠乏症を含む。

凝固亢進障害の診断は身体検査、病歴および血液検査の組合せで完了する。障害が見つけられたら、凝固作用を低減し血中の流動性を維持するために、クマジンおよびヘパリン抗凝固剤が投与されうる。凝固亢進障害を有する患者の予後は凝固および血栓症の重症度に応じて様々であるが、それが検出されず治療されない場合、血栓症は肺塞栓症および死を招きうるであろう。

鎌状赤血球症（ＳＣＤ）は、凝固障害ではないが、同じ症状の幾つかを有する。興味深いことに、赤血球の亜集団上の表面発現ＰｔｄＳのレベルの増加がこの疾患の普遍的特徴である（Ｗｏｏｄら，Ｂｌｏｏｄ，Ｖｏｌ ８８，Ｎｏ ５（Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ １），１９９６）。ＳＣＤは、異常な硬直した鎌状を呈する赤血球により特徴づけられる、超優性を伴う常染色体劣性遺伝血液障害である。鎌状化は細胞の柔軟性を減少させ、種々の合併症のリスクをもたらす。鎌状化はヘモグロビン遺伝子における突然変異により生じる。平均余命は短くなる。鎌状赤血球症は、マラリアがよく見られる又は見られた熱帯および亜熱帯サハラ以南の一部の地域の出身者（または彼らの子孫）において、より頻繁に生じる。マラリアがよく見られる地域においては、単一の鎌状赤血球遺伝子（鎌状赤血球形質）のみを含有することにおける適応上の利点が存在する。鎌状赤血球症の２つの対立遺伝子の一方のみを有する者は該感染に対して完全に抵抗性ではないが、より耐性であり、したがって、感染した場合に、それほど重篤な症状を示さない。

鎌状赤血球貧血は、ＨｂＳを引き起こす突然変異に関してホモ接合性が存在する特定の形態の鎌状赤血球症の名称である。鎌状赤血球貧血はまた、「ＨｂＳＳ」、「ＳＳ疾患」、「ヘモグロビンＳ」またはそれらの並べ替えで呼ばれる。ただ１つの鎌状赤血球遺伝子および１つの正常成人ヘモグロビン遺伝子を有するヘテロ接合の者においては、それは「ＨｂＡＳ」または「鎌状赤血球形質」と称される。他の、より稀な形態の鎌状赤血球症には、鎌状ヘモグロビンＣ疾患（ＨｂＳＣ）、鎌状ベータ−プラス−サラセミア（ＨｂＳ／β^＋）および鎌状ベータ−ゼロ−サラセミア（ＨｂＳ／β^０）が含まれる。鎌状赤血球症のこれらの他の形態は、ＨｂＳを引き起こす突然変異の唯一のコピーおよびもう１つの異常ヘモグロビン対立遺伝子の１コピーをその患者が有する複合ヘテロ接合状態である。

特定の態様においては、ＳＣＤは血流に関連づけられうる。毛細血管を閉塞し、血流を或る器官へと制限する鎌状赤血球により、血管閉塞危機（血管閉塞症急性発症）が引き起こされ、これは、虚血、疼痛、壊死、そして、しばしば、器官損傷をもたらす、これらの危機の頻度、重症度および持続時間は相当に変動する。疼痛を伴う危機は水分補給、鎮痛薬および輸血で治療され、危機が落ち着くまで、疼痛処置は定期的なオピオイド投与を要する。より軽度な危機の場合には、患者の一部はＮＳＡＩＤ（例えば、ジクロフェナクまたはナプロキセン）で処置される。より重度の危機の場合には、ほとんどの患者は静脈内オピオイド投与のために入院処置を要し、この状況においては患者管理鎮痛（ＰＣＡ）装置が一般に使用される。ペニスまたは肺のような器官が関わる血管閉塞危機は緊急事態とみなされ、赤血球輸血で治療される。ジフェンヒドラミンは、オピオイド使用に伴う痒みに対して、時には有効である。無気肺の発生を最小限に抑えるために深呼吸を促す技術であるインセンティブ・スピロメトリー（ｉｎｃｅｎｔｉｖｅ ｓｐｉｒｏｍｅｔｒｙ）が推奨される。

Ｇｌａドメイン活性
本発明は、凝固亢進状態におけるＰｔｄＳの凝固促進作用を制御または調節するための、Ｇｌａドメインの使用を想定している。ＰｔｄＳ表面発現は凝固カスケードの強力な刺激因子である。Ｇｌａドメインポリペプチドの使用による、露出したＰｔｄＳの遮蔽（マスキング）は、このカスケードを抑制し、または減衰させうるであろう。該疾患に関連した凝固性亢進をＲＢＣの僅かな集団のみが引き起こしうると考えられるＳＣＡ個体に、この治療は特に有益でありうるであろう。

４．ウイルス感染
背景
ウイルスは、生物の生きた細胞内でのみ複製可能な小さな感染因子である。ウイルスは動物および植物から細菌および古細菌にわたる全てのタイプの生物に感染しうる。数百万の異なるタイプが存在するが、約５，０００のウイルスが詳細に記載されている。ウイルスは地球上のほとんど全ての生態系に見られ、生物学的実体の最も豊富なタイプである。

ウイルス粒子（ビリオンとして公知）は以下の２つ又は３つの部分からなる：ｉ）遺伝情報を運ぶ長い分子であるＤＮＡまたはＲＮＡのいずれかから構成される遺伝物質；ｉｉ）これらの遺伝子を保護するタンパク膜；そして幾つかの場合には、ｉｉｉ）細胞の外部に存在する場合にタンパク膜を包囲する脂質のエンベロープ。ウイルスの形状は、単純なラセン形態および正二十面体形態から、より複雑な構造体まで、多岐にわたる。平均的なウイルスは平均的な細菌のサイズの約１００分の１である。ほとんどのウイルスは、光学顕微鏡で直接見ることができないほど小さい。

ウイルスは多数の様態で伝染する。植物におけるウイルスは、しばしば、植物の樹液を吸う昆虫、例えばアブラムシにより、植物から植物へと伝染する。動物におけるウイルスは吸血昆虫により運ばれうる。これらの病原体保有生物はベクターとして公知である。インフルエンザウイルスは咳およびくしゃみによって拡散する。ウイルス性胃腸炎の一般的原因であるノロウイルスおよびロタウイルスは糞口経路で伝染し、接触によって人から人へと移り、食料または水に含まれて体内に侵入する。ＨＩＶは、性的接触および感染血液への曝露により伝染する幾つかのウイルスの１つである。ウイルスが感染しうる宿主細胞の範囲は「宿主域」と称される。これは狭いこともあり、あるいはウイルスが多数の種に感染しうる場合には広くなりうる。

動物におけるウイルス感染は、感染ウイルスを通常は排除する免疫応答を惹起する。免疫応答は、特定のウイルス感染に対する人工獲得免疫を付与するワクチンによっても生成されうる。しかし、エイズおよびウイルス性肝炎を引き起こすウイルスを含む幾つかのウイルスはこれらの免疫応答を回避し、慢性感染を引き起こす。抗生物質はウイルスには無効であるが、幾つかの抗ウイルス薬が開発されている。

種々の疾患は、インフルエンザ、ヒト免疫不全ウイルス、デングウイルス、西ナイルウイルス、天然痘ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、朝鮮出血熱ウイルス、水痘、水痘帯状疱疹ウイルス、単純ヘルペスウイルス１または２、エプスタイン−バーウイルス、マールブルグウイルス、ハンタウイルス、黄熱病ウイルス、Ａ、Ｂ、ＣまたはＥ型肝炎、エボラウイルス、ヒトパピローマウイルス、ライノウイルス、コクサッキーウイルス、ポリオウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、狂犬病ウイルス、ニューカッスル病ウイルス、ロタウイルス、ＨＴＬＶ−１および２を含むウイルス感染により助長される。

Ｇｌａドメイン活性
ＰｔｄＳは静止哺乳類細胞の細胞膜の内部小葉に隔離されている。アポトーシス、細胞損傷および細胞活性化（例えば、ウイルス感染中に観察されるもの）中にホスファチジルセリンの非対称性の喪失が生じる。これは、トランスロカーゼの抑制、またはホスファチジルセリン排出輸送体または脂質−スクランブリング酵素、例えばスクランブラーゼの活性化から生じる（Ｓｏａｒｅｓら，２００８）。ウイルスは、効率的に複製するように宿主細胞を活性化し、ウイルス誘発性細胞活性化は細胞内Ｃａ^２＋の上昇を招き、そしてこれはトランスロカーゼによるホスファチジルセリン輸入の抑制およびホスファチジルセリン排出輸送体の活性化によりホスファチジルセリンの外在化を引き起こしうる。更に、外部宿主細胞表面へのホスファチジルセリンのトランスロケーションは、ウイルス誘発性アポトーシスに関連した初期事象でありうるであろう（Ｓｏａｒｅｓら，２００８）。

感染細胞、出芽ビリオンまたは前アポトーシス細胞由来の微小胞の表面上のＰｔｄＳは免疫回避を招きうる。これらの膜上のＰｔｄＳを遮蔽するために本開示のＧｌａドメインポリペプチドを使用して、正常免疫機能はより効果的にウイルスチャレンジに対処して、ウイルス負荷を低減し、感染を抑制し、ビリオンおよび感染細胞を破壊しうる。

５．敗血症
背景
敗血症においては、炎症および血栓症は循環細胞（例えば、白血球および血小板）、内皮細胞および平滑筋細胞の間の相互作用の原因および結果の両方である。微粒子は、細胞活性化後に生じ体液中に放出される細胞膜由来の炎症誘発性および凝固促進性断片である。血管においては、それらは、多様な細胞源から引き寄せられた生物活性エフェクターのプールを構成し、細胞内メッセンジャーとして作用しうる。微粒子は膜リモデリング後に接近可能にされる凝集促進性リン脂質であるホスファチジルセリン、ならびに内皮および白血球表面における血液凝固の開始因子である組織因子（ＴＦ）を露出させる。それらはＩＬ−１βのための分泌経路を構成し、標的細胞の炎症誘発性応答をアップレギュレーションする。微粒子は健常個体においては低レベルで循環するが、炎症疾患において病態生理学的役割を果たしうる表現型および定量的変化を受ける。微粒子（ＭＰ）は複数の様態により敗血症の発症に関与しうる。それらは血管緊張を調節することが可能であり、強力な血管炎症誘発性および凝固促進性メディエーターである。微粒子の能力は敗血症ショックの多臓器不全の根本的なメカニズムの解明において益々多大な関心が持たれている。

内皮細胞と単球の細胞膜はホスファチジルセリンの外在化およびクリプト化（ｅｎｃｒｙｐｔｅｄ）組織因子ＴＦ発現により再構成されて、細胞表面におけるトロンビン（ＦＩＩａ）産生および第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩａ）活性化を可能にする。ＴＦ含有微粒子の放出と共にブレブ形成が生じて、凝固促進反応のための表面の増大が生じる。ＭＰの放出と共に血小板接着および凝集も生じる。また、血小板およびＭＰは、トロンビンによる第ＸＩ因子活性化のための補因子であるＧＰＩｂαを含有していて、高レベルのトロンビン産生およびフィブリン形成を伴う伝播段階を引き起こす。内皮ＴＦ含有ＭＰはＴＦからＰＭＮへの転移を可能にし、ＴＦ播種および血栓性微小血管症または播種性血管内凝固障害を増進する。血液凝固のＴＦ始動は、ＭＰ上と同様に内皮および単球細胞表面上の組織因子経路インヒビター（ＴＦＰＩ）により迅速にダウンレギュレーションされる。内皮プロテインＣ受容体（ＥＰＣＲ）結合プロテインＣはトロンビン−トロンボモジュリン複合体により活性化され、活性化プロテインＣ（ＡＰＣ）は第Ｖａ因子および第ＶＩＩＩａ因子を抑制して、トロンビン産生の伝播段階を抑制する。また、ＥＰＣＲ結合ＡＰＣは内皮細胞および単球に対する細胞保護作用を有すると共にＮＦ−ＫＢを調節する。ＡＰＣはブレブ形成を誘発し、ＥＰＣＲ含有ＭＰの放出はプロテインＣを活性化して、抗凝固および抗アポトーシス活性の伝播をもたらしうる。

Ｇｌａドメイン活性
本発明は、ＰｔｄＳおよびＴＦを表面上に含有する微粒子の凝固促進作用を制御または調節するための、Ｇｌａドメインの使用を想定している。それらはまた、敗血症において生じる関連炎症誘発性シグナリング（例えば、ＩＬ−１βを介するもの）をダウンレギュレーションし、血管緊張に対するＰｔｄＳ含有微粒子の効果を調節しうる。

Ｃ．治療方法
ペプチドおよびポリペプチドは、単独で又は前記疾患を治療する他の薬物と共に、哺乳動物対象（例えば、ヒト患者）に投与されうる。必要な投与量は投与経路の選択；該ポリペプチドに伴う追加的物質を含む製剤の性質；患者の疾患の性質；対象のサイズ、体重、表面積、年齢および性別；更なる組合せ療法；ならびに担当医師の判断に左右される。適当な投与量は０．０００１〜１０ｍｇ／ｋｇの範囲である。種々の化合物が利用可能であること、および種々の投与経路が様々な効率を示すことを考慮すると、必要な投与量の広範な変動が予想される。例えば、経口投与は静脈注射による投与よりも高い投与量を要すると予想される。これらの投与量レベルの変動は、当技術分野で十分に理解されているとおり、最適化のための標準的な経験的常套手段を用いて調節されうる。投与は１回または複数回（例えば、２回、３回、４回、６回、８回、１０回、２０回、５０回、１００回、１５０回またはそれ以上）でありうる。適当な運搬媒体（例えば、高分子微粒子または移植可能な装置）内へのポリペプチドの封入は、経口運搬の場合には特に、運搬の効率を増加させうる。

Ｄ．併用療法（組合せ療法）
複数の治療様式（しばしば「併用療法（組合せ療法）」と称される）で疾患を治療することは医学の多数の分野において一般的である。本開示の方法および組成物を用いて疾患を治療するためには、一般に、標的細胞または対象をＧｌａドメインポリペプチドおよび少なくとも１つの他の療法と接触させるであろう。これらの療法は、１以上の疾患パラメータの低減を達成するのに有効な併用量で供与されるであろう。この方法は、例えば、両方の物質を含む単一組成物または医薬製剤を使用して、あるいは２つの異なる組成物（ここで、一方の組成物はＧｌａドメインポリペプチドを含み、他方の組成物は他方の物質を含む）または製剤と細胞／対象を同時に接触させることにより、両方の物質／療法と細胞／対象を同時に接触させることを含みうる。

あるいは、Ｇｌａドメインポリペプチドは、数分間〜数週間の間隔で、他方の治療に先行するか、または引き続いて投与されうる。一般に、該療法が有利な併用効果を細胞／対象に尚も及ぼしうるように、各投与の時点の間に有意な期間が経過しないことが保証されるであろう。そのような場合、互いに１２〜２４時間以内、互いに約６〜１２時間以内、または約１２時間のみの遅延時間を伴って、細胞を両方の治療法と接触させることが想定される。しかし、幾つかの状況においては、治療のための期間を有意に延長させることが望ましいことがあり、この場合、各投与の間に数日（２、３、４、５、６または７日）〜数週間（１、２、３、４、５、６、７または８日）が経過する。

また、Ｇｌａドメインタンパク質またはその他の療法／物質の２以上の投与が望ましいことが想定されうる。以下に例示されるとおり（ここで、Ｇｌａドメインタンパク質は「Ａ」であり、その他の療法は「Ｂ」である）、種々の組合せが用いられうる。

Ａ／Ｂ／Ａ Ｂ／Ａ／Ｂ Ｂ／Ｂ／Ａ Ａ／Ａ／Ｂ Ｂ／Ａ／Ａ Ａ／Ｂ／Ｂ Ｂ／Ｂ／Ｂ／Ａ Ｂ／Ｂ／Ａ／Ｂ Ａ／Ａ／Ｂ／Ｂ Ａ／Ｂ／Ａ／Ｂ Ａ／Ｂ／Ｂ／Ａ Ｂ／Ｂ／Ａ／Ａ Ｂ／Ａ／Ｂ／Ａ Ｂ／Ａ／Ａ／Ｂ Ｂ／Ｂ／Ｂ／Ａ Ａ／Ａ／Ａ／Ｂ Ｂ／Ａ／Ａ／Ａ Ａ／Ｂ／Ａ／Ａ Ａ／Ａ／Ｂ／Ａ Ａ／Ｂ／Ｂ／Ｂ Ｂ／Ａ／Ｂ／Ｂ Ｂ／Ｂ／Ａ／Ｂ。他の組合せも想定される。

癌に対する併用療法における使用に適した物質または因子には、放射性核種、化学療法剤または毒素が含まれる。具体的な化学療法剤には以下のものが含まれる：テモゾロミド（ｔｅｍｏｚｏｌｏｍｉｄｅ）、エポチロン（ｅｐｏｔｈｉｌｏｎｅｓ）、メルファラン（ｍｅｌｐｈａｌａｎ）、カルムスチン（ｃａｒｍｕｓｔｉｎｅ）、ブスルファン（ｂｕｓｕｌｆａｎ）、ロムスチン（ｌｏｍｕｓｔｉｎｅ）、シクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、ダカルバジン（ｄａｃａｒｂａｚｉｎｅ）、ポリフェプロザン（ｐｏｌｉｆｅｐｒｏｓａｎ）、イホスファミド（ｉｆｏｓｆａｍｉｄｅ）、クロラムブシル（ｃｈｌｏｒａｍｂｕｃｉｌ）、メクロレタミン（ｍｅｃｈｌｏｒｅｔｈａｍｉｎｅ）、ブスルファン（ｂｕｓｕｌｆａｎ）、シクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、カルボプラチン（ｃａｒｂｏｐｌａｔｉｎ）、シスプラチン（ｃｉｓｐｌａｔｉｎ）、チオテパ（ｔｈｉｏｔｅｐａ）、カペシタビン（ｃａｐｅｃｉｔａｂｉｎｅ）、ストレプトゾシン（ｓｔｒｅｐｔｏｚｏｃｉｎ）、ビカルタミド（ｂｉｃａｌｕｔａｍｉｄｅ）、フルタミド（ｆｌｕｔａｍｉｄｅ）、ニルタミド（ｎｉｌｕｔａｍｉｄｅ）、酢酸ロイプロリド（ｌｅｕｐｒｏｌｉｄｅ）、塩酸ドキソルビシン（ｄｏｘｏｒｕｂｉｃｉｎ）、硫酸ブレオマイシン（ｂｌｅｏｍｙｃｉｎ）、塩酸ダウノルビシン（ｄａｕｎｏｒｕｂｉｃｉｎ）、ダクチノマイシン（ｄａｃｔｉｎｏｍｙｃｉｎ）、リポソームクエン酸ダウノルビシン（ｄａｕｎｏｒｕｂｉｃｉｎ）、リポソーム塩酸ドキソルビシン（ｌｉｐｏｓｏｍａｌ ｄｏｘｏｒｕｂｉｃｉｎ ｈｙｄｒｏｃｈｌｏｒｉｄｅ）、塩酸エピルビシン（ｅｐｉｒｕｂｉｃｉｎ）、塩酸イダルビシン（ｉｄａｒｕｂｉｃｉｎ）、マイトマイシン（ｍｉｔｏｍｙｃｉｎ）、ドキソルビシン（ｄｏｘｏｒｕｂｉｃｉｎ）、バルルビシン（ｖａｌｒｕｂｉｃｉｎ）、アナストロゾール（ａｎａｓｔｒｏｚｏｌｅ）、クエン酸トレミフェン（ｔｏｒｅｍｉｆｅｎｅ）、シタラビン（ｃｙｔａｒａｂｉｎｅ）、フルオロウラシル（ｆｌｕｏｒｏｕｒａｃｉｌ）、フルダラビン（ｆｌｕｄａｒａｂｉｎｅ）、フロクスウリジン（ｆｌｏｘｕｒｉｄｉｎｅ）、インターフェロンα−２ｂ、プリカマイシン（ｐｌｉｃａｍｙｃｉｎ）、メルカプトプリン（ｍｅｒｃａｐｔｏｐｕｒｉｎｅ）、メトトレキサート（ｍｅｔｈｏｔｒｅｘａｔｅ）、インターフェロンα−２ａ、酢酸メドロキシプロゲステロン（ｍｅｄｒｏｘｙｐｒｏｇｅｒｓｔｅｒｏｎｅ）、リン酸エストラムスチン（ｅｓｔｒａｍｕｓｔｉｎｅ）ナトリウム、エストラジオール（ｅｓｔｒａｄｉｏｌ）、酢酸ロイプロリド（ｌｅｕｐｒｏｌｉｄｅ）、酢酸メゲストロール（ｍｅｇｅｓｔｒｏｌ）、酢酸オクトレオチド（ｏｃｔｒｅｏｔｉｄｅ）、ジエチルスチルベステロール（ｄｅｉｔｈｙｌｓｔｉｌｂｅｓｔｒｏｌ）二リン酸、テストラクトン（ｔｅｓｔｏｌａｃｔｏｎｅ）、酢酸ゴセレリン（ｇｏｓｅｒｅｌｉｎ）、リン酸エトポシド（ｅｔｏｐｏｓｉｄｅ）、硫酸ビンクリスチン（ｖｉｎｃｒｉｓｔｉｎｅ）、エトポシド（ｅｔｏｐｏｓｉｄｅ）、ビンブラスチン（ｖｉｎｂｌａｓｔｉｎｅ）、エトポシド（ｅｔｏｐｏｓｉｄｅ）、硫酸ビンクリスチン（ｖｉｎｃｒｉｓｔｉｎｅ）、テニポシド（ｔｅｎｉｐｏｓｉｄｅ）、トラスツズマブ（ｔｒａｓｔｕｚｕｍａｂ）、ゲムツズマブ・オゾガミシン（ｇｅｍｔｕｚｕｍａｂ ｏｚｏｇａｍｉｃｉｎ）、リツキシマブ（ｒｉｔｕｘｉｍａｂ）、エキセメスタン（ｅｘｅｍｅｓｔａｎｅ）、塩酸イリノテカン（ｉｒｉｎｏｔｅｃａｎ）、アスパラギナーゼ（ａｓｐａｒａｇｉｎａｓｅ）、塩酸ゲムシタビン（ｇｅｍｃｉｔａｂｉｎｅ）、アルトレタミン（ａｌｔｒｅｔａｍｉｎｅ）、塩酸トポテカン（ｔｏｐｏｔｅｃａｎ）、ヒドロキシ尿素（ｈｙｄｒｏｘｙｕｒｅａ）、クラドリビン（ｃｌａｄｒｉｂｉｎｅ）、ミトタン（ｍｉｔｏｔａｎｅ）、塩酸プロカルバジン（ｐｒｏｃａｒｂａｚｉｎｅ）、酒石酸ビノレルビン（ｖｉｎｏｒｅｌｂｉｎｅ）、ペントロスタチン（ｐｅｎｔｒｏｓｔａｔｉｎ）ナトリウム、ミトキサントロン（ｍｉｔｏｘａｎｔｒｏｎｅ）、ペガスパルガーゼ（ｐｅｇａｓｐａｒｇａｓｅ）、デニロイキンジフチトクス（ｄｅｎｉｌｅｕｋｉｎ ｄｉｆｔｉｔｉｘ）、アリトレチノイン（ａｌｔｒｅｔｉｎｏｉｎ）、ポルフィマー（ｐｏｒｆｉｍｅｒ）、ベキサロテン（ｂｅｘａｒｏｔｅｎｅ）、パクリタキセル（ｐａｃｌｉｔａｘｅｌ）、ドセタキセル（ｄｏｃｅｔａｘｅｌ）、三酸化ヒ素またはトレチノイン（ｔｒｅｔｉｎｏｉｎ）。毒素には、シュードモナス（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素（ＰＥ３８）、リシンＡ鎖、ジフテリア毒素、ビサイド（Ｂｅｓｉｄｅ）ＰＥおよびＲＴ、ヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質（ＰＡＰ）、サポリンおよびゲロニンが含まれる。癌治療のための放射性核種には、Ｙ−９０、Ｐ−３２、Ｉ−１３１、Ｉｎ−１１１、Ｓｒ−８９、Ｒｅ−１８６、Ｓｍ−１５３およびＳｎ−１１７ｍが含まれる。

自己免疫障害に対する併用療法における使用に適した物質または因子には、抗炎症性および免疫調節組成物が含まれる。これらにはプレドニゾン（ｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、メチルプレドニゾン（ｍｅｔｈｙｌｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、ベニプレド（Ｖｅｎｉｐｒｅｄ）、セレストン（Ｃｅｌｅｓｔｏｎｅ）、ヒドロコルチゾン（ｈｙｄｒｏｃｏｒｔｉｓｏｎｅ）、トリアムシノクロン（ｔｒｉａｍｃｉｎｏｃｌｏｎｅ）、アリストンパン（Ａｒｉｓｔｏｎｐａｎ）関節内注射、メタプレド（Ｍｅｔｈａｐｒｅｄ）、ラヨス（Ｒａｙｏｓ）経口剤、ベタメタゾン（ｂｅｔａｍｅｔｈａｓｏｎｅ）およびエタネルセプト（ｅｔａｎｅｒｃｅｐｔ）が含まれる。

心血管疾患に対する併用療法における使用に適した物質または因子には、ベータブロッカー、抗高血圧薬、強心薬、抗血栓薬、血管拡張薬、ホルモンアンタゴニスト、エンドセリンアンタゴニスト、サイトカインインヒビター／ブロッカー、カルシウムチャネルブロッカー、ホスホジエステラーゼインヒビターおよびアンジオテンシン２型アンタゴニストが含まれる。

凝固亢進障害に対する併用療法における使用に適した物質または因子には、抗凝固剤、例えばヘパリンおよびワルファリンが含まれる。

ウイルス感染に対する併用療法における使用に適した物質または因子には以下のものが含まれる：アバカビル（Ａｂａｃａｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｙｃｌｏｖｉｒ）、アデフォビル（Ａｄｅｆｏｖｉｒ）、アマンタジン（Ａｍａｎｔａｄｉｎｅ）、アンプレナビル（Ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、アンプリジェン（Ａｍｐｌｉｇｅｎ）、アルビドール（Ａｒｂｉｄｏｌ）、アタザナビル（Ａｔａｚａｎａｖｉｒ）、アトリプラ（Ａｔｒｉｐｌａ）、ボセプレビレルテット（Ｂｏｃｅｐｒｅｖｉｒｅｒｔｅｔ）、シドフォビル（Ｃｉｄｏｆｏｖｉｒ）、コンビビル（Ｃｏｍｂｉｖｉｒ）、ダルナビル（Ｄａｒｕｎａｖｉｒ）、デラビルジン（Ｄｅｌａｖｉｒｄｉｎｅ）、ジダノシン（Ｄｉｄａｎｏｓｉｎｅ）、ドコサノール（Ｄｏｃｏｓａｎｏｌ）、エドクスジン（Ｅｄｏｘｕｄｉｎｅ）、エファビレンツ（Ｅｆａｖｉｒｅｎｚ）、エムトリシタビン（Ｅｍｔｒｉｃｉｔａｂｉｎｅ）、エンフビルチド（Ｅｎｆｕｖｉｒｔｉｄｅ）、エンテカビル（Ｅｎｔｅｃａｖｉｒ）、侵入インヒビター、ファムシクロビル（Ｆａｍｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ホミビルセン（Ｆｏｍｉｖｉｒｓｅｎ）、ホスアンプレナビル（Ｆｏｓａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、ホスカルネット（Ｆｏｓｃａｒｎｅｔ）、ホスホネット（Ｆｏｓｆｏｎｅｔ）、ガンシクロビル（Ｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、イバシタビン（Ｉｂａｃｉｔａｂｉｎｅ）、イムノビル（Ｉｍｕｎｏｖｉｒ）、イドクスウリジン（Ｉｄｏｘｕｒｉｄｉｎｅ）、イミキモド（Ｉｍｉｑｕｉｍｏｄ）、インジナビル（Ｉｎｄｉｎａｖｉｒ）、イノシン（Ｉｎｏｓｉｎｅ）、インテグラーゼインヒビター、インターフェロンＩＩＩ型、インターフェロンＩＩ型、インターフェロンＩ型、インターフェロン、ラミブジン（Ｌａｍｉｖｕｄｉｎｅ）、ロピナビル（Ｌｏｐｉｎａｖｉｒ）、ロビリド（Ｌｏｖｉｒｉｄｅ）、マラビロク（Ｍａｒａｖｉｒｏｃ）、モロキシジン（Ｍｏｒｏｘｙｄｉｎｅ）、メチサゾン（Ｍｅｔｈｉｓａｚｏｎｅ）、ネルフィナビル（Ｎｅｌｆｉｎａｖｉｒ）、ネビラピン（Ｎｅｖｉｒａｐｉｎｅ）、ネキサビル（Ｎｅｘａｖｉｒ）、ヌクレオシド類似体、オセルタミビル（Ｏｓｅｌｔａｍｉｖｉｒ）、ペグインターフェロンアルファ−２ａ、ペンシクロビル（Ｐｅｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ペラミビル（Ｐｅｒａｍｉｖｉｒ）、プレコナリル（Ｐｌｅｃｏｎａｒｉｌ）、ポドフィロトキシン（Ｐｏｄｏｐｈｙｌｌｏｔｏｘｉｎ）、プロテアーゼインヒビター、ラルテグラビル（Ｒａｌｔｅｇｒａｖｉｒ）、逆転写酵素インヒビター、リバビリン（Ｒｉｂａｖｉｒｉｎ）、リマンタジン（Ｒｉｍａｎｔａｄｉｎｅ）、リトナビル（Ｒｉｔｏｎａｖｉｒ）、ピラミジン（Ｐｙｒａｍｉｄｉｎｅ）、サキナビル（Ｓａｑｕｉｎａｖｉｒ）、スタブジン（Ｓｔａｖｕｄｉｎｅ）、相乗的増強剤（抗レトロウイルス）、ティーツリーオイル（Ｔｅａ ｔｒｅｅ ｏｉｌ）、テラプレビル（Ｔｅｌａｐｒｅｖｉｒ）、テノホビル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ）、テノホビルジソプロキシル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ ｄｉｓｏｐｒｏｘｉｌ）、チプラナビル（Ｔｉｐｒａｎａｖｉｒ）、トリフルリジン（Ｔｒｉｆｌｕｒｉｄｉｎｅ）、トリジビル（Ｔｒｉｚｉｖｉｒ）、トロマンタジン（Ｔｒｏｍａｎｔａｄｉｎｅ）、ツルバダ（Ｔｒｕｖａｄａ）、バラシクロビル（Ｖａｌａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、バルガンシクロビル（Ｖａｌｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ビクリビロック（Ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ）、ビダラビン（Ｖｉｄａｒａｂｉｎｅ）、ビラミジン（Ｖｉｒａｍｉｄｉｎｅ）、ザルシタビン（Ｚａｌｃｉｔａｂｉｎｅ）、ザナミビル（Ｚａｎａｍｉｖｉｒ）およびジドブジン（Ｚｉｄｏｖｕｄｉｎｅ）。

当業者は“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ”１５ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，ｃｈａｐｔｅｒ ３３、特にｐ．６２４−６５２を参照することが可能である。治療される対象の状態に応じて、投与量における幾らかの変動が必然的に生じるであろう。いずれにせよ、投与に関して責任を有する者が個々の対象に対する適当な用量を決定するであろう。更に、ヒトへの投与の場合、製剤は、ＦＤＡオフィス・オブ・バイオロジクス・スタンダード（Ｏｆｆｉｃｅ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ ｓｔａｎｄａｒｄ）により要求される無菌性、発熱性、一般的安全性および純度標準を満たしているべきである。

また、前記療法のいずれかは治療において単独で有用でありうることが指摘されるべきである。

Ｖ．実施例
以下の実施例は、本開示の好ましい実施形態を実証するために記載されている。以下の実施例に開示されている技術は、本開示の実施において十分に機能することが本発明者により見出された技術の代表例であり、したがって、その実施のための好ましい形態を構成するとみなされうる、と当業者に理解されるべきである。しかし、本開示の精神および範囲から逸脱することなく、開示されている特定の実施形態には多数の変更が施されることが可能であり、同様または類似の結果を尚も与えうる、と当業者は本開示を考慮して理解すべきである。

実施例１
細胞膜に対するＧｌａ−ドメインタンパク質のアフィニティは、調製されたリン脂質小胞を使用することにより、インビトロで決定されている（Ｓｈａｈら，１９９８；Ｎｅｌｓｅｓｔｕｅｎ，１９９９）。しかし、これらのインビトロ値がインビボ状況にどのような置き換わるかについては十分には解明されていない。例えば、ＴＦとのＦＶＩＩの相互作用は、これらのタンパク質のＧｌａドメインは非常に相同であるが、それらの細胞膜結合特異性およびアフィニティにおける追加的相違はそれらのＥＧＦおよび／またはクリングルドメインによってもたらされうることを強調している。残念ながら、これらの相互作用は、リン脂質小胞のみに基づく研究によっては再現され得ず、依然として未特定のままであろう。

したがって、本発明者らは、以下のパネルのタンパク質からＧｌａ＋ＥＧＦ／クリングルドメインおよびＧｌａドメインのみを作製し試験することを提示した：ｈＳ（高アフィニティ結合体）、ｈＺ（中アフィニティ結合体）、ｈＰＴ（中アフィニティ−クリングル含有）、ｈＦＶＩＩ（低アフィニテイ − 癌においてアップレギュレーションもされる二次「受容体」を利用）、およびＢ０１７８（増加したリン脂質アフィニティを有するｈＦＶＩＩ）。これらのタンパク質は、プローブとして（そして、実証され選択的であれば、潜在的に治療剤として）のそれらの使用に有益でありうる、そして現在のところ認識されないままとなっている種々のインビボ結合特性を潜在的に有する。

一般的アプローチは、組換えタンパク質を構築しそれらを発現に関して試験することであった。ついで、結合を評価するためにアッセイが開発されるであろう。ついで、発現および精製方法が最適化され、ついでガンマ−カルボキシル化の品質管理が行われるであろう。

図１は、カルボキシル化部位を含む種々のＧｌａドメインタンパク質からの配列を示す。図２は、操作され２９３細胞内で一過性発現された種々の異なるＧｌａドメインタンパク質の発現を示す。図３はＢＨＫ２１細胞における類似研究を示す。最良発現構築物の１つがプロテインＳ＋ＥＧＦ構築物であると仮定して、プロテインＳからのシグナル配列をプロトロンビンＧｌａ＋クリングルおよびプロテインＺ＋ＥＧＦと共に利用した。しかし、発現は細胞内でのみ観察された（図４）。

プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦを更なる研究に選択した。該配列を図５に示す。ＲＦ２８６培地を使用して、タンパク質をＢＨＫ２１細胞内で産生させた。６００ｍｌを集め、４×濃縮した。精製は以下の３工程を用いた。

１．Ｎｉ−ＮＴＡカラム、１０ｍｌ、新鮮充填。媒体をカラムにローディングし、イミダゾール勾配で溶出する。画分の全てをＧｌａウエスタンブロットに付してＨｉｓタグ付きＧｌａプロテインＳ Ｇ＋Ｅを特定する。

２．ＣａＣｌ_２設定溶出を伴うＨｉｔｒａｐ Ｑ。Ｇｌａ陽性画分をプールし、１０ｍＭ ＣａＣｌ_２溶出を伴う１ｍｌのＨｉｔｒａｐ Ｑに付す。

３．ＣａＣｌ_２勾配（０〜１０ｍＭ シャドウ（ｓｈａｄｏｗ）勾配）を伴うＨｉｔｒａｐ Ｑ。段階精製Ｇｌａタンパク質をＱに付して、勾配ＣａＣｌ_２（１０ｍＭまで）で溶出した。９５％の純度レベルの合計０．９ｍｇのタンパク質が産生された。図６は還元条件および非還元条件の両方における精製画分を示す。図７および８は、ＦＡＣに基づく種々のアポトーシスアッセイを示す。どちらも、プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦ構築物が、アネキシンＶと同様にアポトーシスを受けている細胞に特異的であること（図７）、およびアネキシンＶがプロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦ結合と競合することを示している。

要約すると、プロテインＳ Ｇｌａ＋ＥＧＦを発現させ、精製した。精製された物質に関する分析は、それが高度にガンマ−カルボキシル化されていることを示唆した。ＦＡＣに基づくアポトーシスアッセイは、プロテインＳ Ｇ＋Ｅ（１１ Ｇｌａ）が「アポトーシス」細胞に結合しうること、およびアネキシンＶ競合アッセイにより示されるとおり、細胞へのこの結合がホスファチジルセリンの標的化によるものであることを示した。

本明細書に開示され特許請求されている組成物および／または方法の全ては、本開示を考慮すると、過度な実験を行うことなく製造され実施されうる。本開示の組成物および方法は好ましい実施形態に関して記載されているが、本明細書に記載されている組成物および／または方法に対して、および該方法の工程において、または該工程の順序において、本開示の概念、精神および範囲から逸脱することなく、変更が施されうることが、当業者に明らかであろう。より詳細には、本明細書に記載されている物質の代わりに、化学的かつ生理的に関連している或る物質が使用可能であり、その場合にも同一または類似の結果が達成されるであろうことが明らかであろう。当業者に明らかな全てのそのような類似置換および修飾は、添付の特許請求の範囲により定められる本開示の精神、範囲および概念の範囲内であるとみなされる。

ＶＩ．参考文献
以下の参考文献を、本明細書に記載されているものを補足する典型的な方法または他の詳細をそれらが提供する限りにおいて、参照により本明細書に具体的に組み入れることとする。

Claims (26)

1. （ａ）５〜１５個のガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）残基を有するＧｌａドメイン及びプロテインＳ ＥＧＦドメインを含みホルモン結合ドメインを欠く、４．５〜３０ｋＤのサイズを有する単離されたポリペプチドを準備し、
   （ｂ）該ポリペプチドをインビトロ又はエクスビボで細胞表面と接触させて、該ポリペプチドを細胞膜上のホスファチジルセリンに結合させることを含む、細胞膜ホスファチジルセリンを標的化する方法。
2. 該細胞膜が心細胞膜、神経細胞膜、内皮細胞膜、ウイルス感染細胞膜、アポトーシス細胞膜、血小板膜または癌細胞膜である、請求項１記載の方法。
3. 該ポリペプチドが、蛍光標識、化学発光標識、放射性標識、酵素、色素またはリガンドから成る検出可能な標識を更に含む、請求項１記載の方法。
4. 該ポリペプチドが３００残基以下である、請求項１記載の方法。
5. 該ポリペプチドが１〜５個のジスルフィド結合を含む、請求項１記載の方法。
6. 該ポリペプチドが抗体Ｆｃ領域を更に含む、請求項１記載の方法。
7. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、癌治療用医薬製剤。
8. 該癌が乳癌、脳癌、胃癌、肺癌、前立腺癌、卵巣癌、精巣癌、結腸癌、皮膚癌、直腸癌、子宮頸癌、子宮癌、肝臓癌、膵臓癌、頭頸部癌または食道癌である、請求項７記載の医薬製剤。
9. 治療対象が、免疫療法、放射線療法、化学療法、毒素療法、サイトカイン療法またはホルモン療法から成る第２の癌療法で更に治療される、請求項７記載の医薬製剤。
10. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、自己免疫疾患治療用医薬製剤。
11. 該自己免疫疾患が脊椎関節症、強直性脊椎炎、乾癬性関節炎、反応性関節炎、腸炎性関節炎、潰瘍性大腸炎、クローン病、過敏性腸疾患、炎症性腸疾患、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、家族性地中海熱、筋萎縮性側索硬化症、シェーグレン症候群、初期関節炎、ウイルス性関節炎、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、乾癬、血管炎、ウェゲナー肉芽腫症、アジソン病、脱毛症、抗リン脂質症候群、ベーチェット病、セリアック病、慢性疲労症候群、潰瘍性大腸炎、Ｉ型糖尿病、線維筋痛症、自己免疫性胃炎、グッドパスチャー症候群、グレーブス病、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、原発性胆汁性肝硬変、リウマチ熱、サルコイドーシス、強皮症、白斑、血管炎、小血管血管炎、肝炎、原発性胆汁性肝硬変、サルコイドーシス、強皮症、移植片対宿主病（急性および慢性）、再生不良性貧血または周期性好中球減少症である、請求項１０記載の医薬製剤。
12. 治療対象が、プレドニゾン（ｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、メチルプレドニゾン（ｍｅｔｈｙｌｐｒｅｄｎｉｓｏｎｅ）、ベニプレド（Ｖｅｎｉｐｒｅｄ）、セレストン（Ｃｅｌｅｓｔｏｎｅ）、ヒドロコルチゾン（ｈｙｄｒｏｃｏｒｔｉｓｏｎｅ）、トリアムシノクロン（ｔｒｉａｍｃｉｎｏｃｌｏｎｅ）、アリストンパン（Ａｒｉｓｔｏｎｐａｎ）関節内注射、メタプレド（Ｍｅｔｈａｐｒｅｄ）、ラヨス（Ｒａｙｏｓ）経口剤、ベタメタゾン（ｂｅｔａｍｅｔｈａｓｏｎｅ）またはエタネルセプト（ｅｔａｎｅｒｃｅｐｔ）から成る第２の自己免疫疾患療法で更に治療される、請求項１０記載の医薬製剤。
13. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、ウイルス疾患治療用医薬製剤。
14. 該ウイルス疾患がインフルエンザ、ヒト免疫不全ウイルス、デングウイルス、西ナイルウイルス、天然痘ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、朝鮮出血熱ウイルス、水痘、水痘帯状疱疹ウイルス、単純ヘルペスウイルス１または２、エプスタイン−バーウイルス、マールブルグウイルス、ハンタウイルス、黄熱病ウイルス、Ａ、Ｂ、ＣまたはＥ型肝炎、エボラウイルス、ヒトパピローマウイルス、ライノウイルス、コクサッキーウイルス、ポリオウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、狂犬病ウイルス、ニューカッスル病ウイルス、ロタウイルス、ＨＴＬＶ−１またはＨＴＬＶ−２である、請求項１３記載の医薬製剤。
15. 治療対象が、アバカビル（Ａｂａｃａｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、アシクロビル（Ａｃｙｃｌｏｖｉｒ）、アデフォビル（Ａｄｅｆｏｖｉｒ）、アマンタジン（Ａｍａｎｔａｄｉｎｅ）、アンプレナビル（Ａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、アンプリジェン（Ａｍｐｌｉｇｅｎ）、アルビドール（Ａｒｂｉｄｏｌ）、アタザナビル（Ａｔａｚａｎａｖｉｒ）、アトリプラ（Ａｔｒｉｐｌａ）、ボセプレビレルテット（Ｂｏｃｅｐｒｅｖｉｒｅｒｔｅｔ）、シドフォビル（Ｃｉｄｏｆｏｖｉｒ）、コンビビル（Ｃｏｍｂｉｖｉｒ）、ダルナビル（Ｄａｒｕｎａｖｉｒ）、デラビルジン（Ｄｅｌａｖｉｒｄｉｎｅ）、ジダノシン（Ｄｉｄａｎｏｓｉｎｅ）、ドコサノール（Ｄｏｃｏｓａｎｏｌ）、エドクスジン（Ｅｄｏｘｕｄｉｎｅ）、エファビレンツ（Ｅｆａｖｉｒｅｎｚ）、エムトリシタビン（Ｅｍｔｒｉｃｉｔａｂｉｎｅ）、エンフビルチド（Ｅｎｆｕｖｉｒｔｉｄｅ）、エンテカビル（Ｅｎｔｅｃａｖｉｒ）、侵入インヒビター、ファムシクロビル（Ｆａｍｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ホミビルセン（Ｆｏｍｉｖｉｒｓｅｎ）、ホスアンプレナビル（Ｆｏｓａｍｐｒｅｎａｖｉｒ）、ホスカルネット（Ｆｏｓｃａｒｎｅｔ）、ホスホネット（Ｆｏｓｆｏｎｅｔ）、ガンシクロビル（Ｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、イバシタビン（Ｉｂａｃｉｔａｂｉｎｅ）、イムノビル（Ｉｍｕｎｏｖｉｒ）、イドクスウリジン（Ｉｄｏｘｕｒｉｄｉｎｅ）、イミキモド（Ｉｍｉｑｕｉｍｏｄ）、インジナビル（Ｉｎｄｉｎａｖｉｒ）、イノシン（Ｉｎｏｓｉｎｅ）、インテグラーゼインヒビター、インターフェロンＩＩＩ型、インターフェロンＩＩ型、インターフェロンＩ型、インターフェロン、ラミブジン（Ｌａｍｉｖｕｄｉｎｅ）、ロピナビル（Ｌｏｐｉｎａｖｉｒ）、ロビリド（Ｌｏｖｉｒｉｄｅ）、マラビロク（Ｍａｒａｖｉｒｏｃ）、モロキシジン（Ｍｏｒｏｘｙｄｉｎｅ）、メチサゾン（Ｍｅｔｈｉｓａｚｏｎｅ）、ネルフィナビル（Ｎｅｌｆｉｎａｖｉｒ）、ネビラピン（Ｎｅｖｉｒａｐｉｎｅ）、ネキサビル（Ｎｅｘａｖｉｒ）、ヌクレオシド類似体、オセルタミビル（Ｏｓｅｌｔａｍｉｖｉｒ）、ペグインターフェロンアルファ−２ａ、ペンシクロビル（Ｐｅｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ペラミビル（Ｐｅｒａｍｉｖｉｒ）、プレコナリル（Ｐｌｅｃｏｎａｒｉｌ）、ポドフィロトキシン（Ｐｏｄｏｐｈｙｌｌｏｔｏｘｉｎ）、プロテアーゼインヒビター、ラルテグラビル（Ｒａｌｔｅｇｒａｖｉｒ）、逆転写酵素インヒビター、リバビリン（Ｒｉｂａｖｉｒｉｎ）、リマンタジン（Ｒｉｍａｎｔａｄｉｎｅ）、リトナビル（Ｒｉｔｏｎａｖｉｒ）、ピラミジン（Ｐｙｒａｍｉｄｉｎｅ）、サキナビル（Ｓａｑｕｉｎａｖｉｒ）、スタブジン（Ｓｔａｖｕｄｉｎｅ）、相乗的増強剤（抗レトロウイルス）、ティーツリーオイル（Ｔｅａ ｔｒｅｅ ｏｉｌ）、テラプレビル（Ｔｅｌａｐｒｅｖｉｒ）、テノホビル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ）、テノホビルジソプロキシル（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒ ｄｉｓｏｐｒｏｘｉｌ）、チプラナビル（Ｔｉｐｒａｎａｖｉｒ）、トリフルリジン（Ｔｒｉｆｌｕｒｉｄｉｎｅ）、トリジビル（Ｔｒｉｚｉｖｉｒ）、トロマンタジン（Ｔｒｏｍａｎｔａｄｉｎｅ）、ツルバダ（Ｔｒｕｖａｄａ）、バラシクロビル（Ｖａｌａｃｉｃｌｏｖｉｒ）、バルガンシクロビル（Ｖａｌｇａｎｃｉｃｌｏｖｉｒ）、ビクリビロック（Ｖｉｃｒｉｖｉｒｏｃ）、ビダラビン（Ｖｉｄａｒａｂｉｎｅ）、ビラミジン（Ｖｉｒａｍｉｄｉｎｅ）、ザルシタビン（Ｚａｌｃｉｔａｂｉｎｅ）、ザナミビル（Ｚａｎａｍｉｖｉｒ）またはジドブジン（Ｚｉｄｏｖｕｄｉｎｅ）から成る第２の抗ウイルス療法で更に治療される、請求項１３記載の医薬製剤。
16. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、凝固亢進障害治療用医薬製剤。
17. 治療対象が第２の抗凝固剤で更に治療される、請求項１６記載の医薬製剤。
18. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、治療対象における凝固をモジュレーションするための医薬製剤。
19. 治療対象が、更に凝固因子を投与される、請求項１８記載の医薬製剤。
20. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、敗血症治療用医薬製剤。
21. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチドを含む、鎌状赤血球患者における血管閉塞危機治療用医薬製剤。
22. ガンマ−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）ドメインを含みホルモン結合ドメインを欠き、更にプロテインＳ ＥＧＦドメインを含む単離されたポリペプチド。
23. 該ポリペプチドが、蛍光標識、化学発光標識、放射性標識、酵素、色素またはリガンドから成る検出可能な標識を更に含む、請求項２２記載のポリペプチド。
24. 該ポリペプチドが３００残基以下である、請求項２２記載のポリペプチド。
25. 該ポリペプチドが１〜５個のジスルフィド結合を含む、請求項２２記載のポリペプチド。
26. 該ポリペプチドが抗体Ｆｃ領域を更に含む、請求項２２記載のポリペプチド。

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