JP6410810B2 - 脳内のアミロイドβペプチド蓄積状態を評価するサロゲート・バイオマーカー及びその分析方法 - Google Patents
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Description
(1) 被験対象に由来する生体由来試料を、
APP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)と、
APP669−711(配列番号7)、APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)、APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)、APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)、APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)からなる群から選ばれる少なくとも1つと
を含むマーカーの検出に供して、前記生体由来試料中の
APP672−713(Aβ1−42)と、
APP669−711、APP672−709(Aβ1−38)、APP674−711(Aβ3−40)、APP672−710(Aβ1−39)、APP672−711(Aβ1−40)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)からなる群から選ばれる前記少なくとも1つと
の各測定レベルを得る測定工程と、
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP669−711レベルの比:
APP669−711/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−709(Aβ1−38)レベルの比:
APP672−709(Aβ1−38)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP674−711(Aβ3−40)レベルの比:
APP674−711(Aβ3−40)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−710(Aβ1−39)レベルの比:
APP672−710(Aβ1−39)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−711(Aβ1−40)レベルの比:
APP672−711(Aβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42); 及び
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するOxAPP672−711(OxAβ1−40)レベルの比:
OxAPP672−711(OxAβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42)
からなる群から選ばれる少なくとも1つの比を求める算出工程と、
被験対象の前記各比が、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−の前記各比を基準レベルとして、前記各比の基準レベルよりも高い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量よりも多いと判断する評価工程と、
を含む脳内のAβ蓄積状態を判断する分析方法。
APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ: 及び
OxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ
からなる群から選ばれる脳内のAβ蓄積状態を判断するマーカー。
被験対象の前記APP672−713(Aβ1−42)の測定レベルが、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−のAPP672−713(Aβ1−42)のレベルを基準レベルとして、前記基準レベルよりも低い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量より多いと判断する評価工程と、
を含む脳内のAβ蓄積状態を判断する分析方法。
被験対象に由来する生体由来試料を、
APP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)と、
APP669−711(配列番号7)、APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)、APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)、APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)、APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)からなる群から選ばれる少なくとも1つと
を含むマーカーの検出に供して、前記生体由来試料中の
APP672−713(Aβ1−42)と、
APP669−711、APP672−709(Aβ1−38)、APP674−711(Aβ3−40)、APP672−710(Aβ1−39)、APP672−711(Aβ1−40)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)からなる群から選ばれる前記少なくとも1つと
の各測定レベルを得る測定工程と、
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP669−711レベルの比:
APP669−711/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−709(Aβ1−38)レベルの比:
APP672−709(Aβ1−38)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP674−711(Aβ3−40)レベルの比:
APP674−711(Aβ3−40)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−710(Aβ1−39)レベルの比:
APP672−710(Aβ1−39)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−711(Aβ1−40)レベルの比:
APP672−711(Aβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42); 及び
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するOxAPP672−711(OxAβ1−40)レベルの比:
OxAPP672−711(OxAβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42)
からなる群から選ばれる少なくとも1つの比を求める算出工程と
を行い、
医学的介入の前における被験対象の前記各比と、医学的介入の後における被験対象の前記各比との比較を行い、脳内のAβ蓄積状態に関して前記医学的介入の有効性を判断する方法。
本発明において、被験対象には、ヒト、及びヒト以外の哺乳動物(ラット、イヌ、ネコなど)が含まれる。以下、ヒトの場合について主として説明するが、ヒト以外の哺乳動物の場合にも、同様である。
本発明のマーカーは、被験者の生体由来試料において検出及び分析可能である。従って、本発明の方法においては、被験者の生体由来試料中のマーカーのレベルが分析される。
本発明のマーカーは、生体由来試料中のAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)と、APP669−711(配列番号7)、APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)、APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)、APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)、APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)からなる群から選ばれる少なくとも1つとの組み合わせからなる。これらマーカーは、脳内のAβ蓄積が陰性である認知機能正常者からの血漿試料中のレベルと、脳内のAβが過剰に蓄積されている被験者からの血漿試料中のレベルとの間に有意な差が認められたものである。
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIA
APP669−711(配列番号7):
VKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2):
EFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGV
APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
OxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5):
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV (Met 706が酸化されている)
APP-derived peptides: APP派生型ペプチド
Theoretical average mass: 理論平均質量
Swedish変異:APP670〜671 のアミノ酸 KM が NL に変異している
Italian変異:APP673 のアミノ酸 A が V に変異している
Leuven変異:APP682 のアミノ酸 E が K に変異している
Icelandic変異:APP673 のアミノ酸 A が T に変異している
British変異:APP677 のアミノ酸 H が R に変異している
Tottori変異:APP678 のアミノ酸 D が N に変異している
Arctic変異:APP693 のアミノ酸 E が G に変異している
Iowa変異:APP694 のアミノ酸 D が N に変異している
Dutch変異:APP693 のアミノ酸 E が Q に変異している
本明細書において、アルツハイマー病の進行度合いの観点から、次のように分類する。
NC+:脳内のAβの蓄積が陽性で、認知機能障害は現れていない者
MCI:脳内のAβの蓄積が陽性で、軽度認知機能障害が現れている者
AD: 脳内のAβの蓄積が陽性で、認知機能障害が現れている者
PiB+:NC+とMCIとADのグループを合わせたグループ
認知機能障害の有無に関わらず、脳内のAβの蓄積が陽性と判定された者
通常、脳内のAβの蓄積状態の判断については、PiB-PET画像を元に大脳皮質と白質のPiB集積量の比較により判定する。
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP669−711レベルの比:
APP669−711/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−709(Aβ1−38)レベルの比:
APP672−709(Aβ1−38)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP674−711(Aβ3−40)レベルの比:
APP674−711(Aβ3−40)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−710(Aβ1−39)レベルの比:
APP672−710(Aβ1−39)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−711(Aβ1−40)レベルの比:
APP672−711(Aβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42); 及び
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するOxAPP672−711(OxAβ1−40)レベルの比:
OxAPP672−711(OxAβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42)
からなる群から選ばれる少なくとも1つの比を求める算出工程と、
被験対象の前記各比が、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−の前記各比を基準レベルとして、前記各比の基準レベルよりも高い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量よりも多いと判断する評価工程と、
を含む。これにより、脳内のAβ蓄積状態を判断する、あるいは判断の補助とすることができる。
被験対象の前記APP672−713(Aβ1−42)の測定レベルが、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−のAPP672−713(Aβ1−42)のレベルを基準レベルとして、前記基準レベルよりも低い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量より多いと判断する評価工程と、
を含む。これにより、脳内のAβ蓄積状態を判断する、あるいは判断の補助とすることができる。
(1)臨床サンプルを用いた、本発明マーカーによるアルツハイマー病診断の性能評価
国立長寿医療研究センターにて、NC−、NC+、MCI、ADのグループに分類された症例の血漿サンプルを用意した。
NC+:脳内のAβの蓄積が陽性で、認知機能障害は現れていない者
MCI:脳内のAβの蓄積が陽性で、軽度認知機能障害が現れている者
AD: 脳内のAβの蓄積が陽性で、認知機能障害が現れている者
PiB+:NC+とMCIとADのグループを合わせたグループ
認知機能障害の有無に関わらず、脳内のAβが陽性と判定された者
Aβの第3−8残基をエピトープとする抗Aβ抗体(6E10: Covance)250μgを Ficin アガロースビーズ (Thermo) 1250 μL(33%スラリー)により消化、Aβの第18−22残基をエピトープとする抗Aβ抗体 (4G8: Covance)100 μgをリシルエンドペプチダーゼ (LysC) 500 ngにより消化し、それぞれの消化物をサイズ排除クロマトグラフィーで分離・分取した。分画したサンプルを還元および非還元 SDS-PAGE で確認し、F(ab')2 に相当するフラクションをプールした。この 6E10 と 4G8 の F(ab')2 画分をそれぞれ30mMの濃度の cysteamine で還元することにより F(ab') が得られた。次に、アミノ磁気ビーズ (Dynabeads M-270 Amine: Invitrogen) 5 μL(ビーズ量150 μg)を用意し、その表面に結合しているアミノ基に SM(PEG)24 の NHS基を室温で30分間反応させることで、PEGとビーズを共有結合させた。磁気ビーズに結合された SM(PEG) 24 に、6E10 F(ab')と 4G8 F(ab')を 0.25 μgずつ同時に加えたものを室温で2時間反応させてマレイミド基とチオール基を共有結合させた。最後に、0.4 mM L-システインを室温で30分間反応させることで、マレイミド基のブロッキングを行った。作製された抗体固定化ビーズは使用するまで4℃で保存した。
内部標準ペプチドとして AnaSpec (San Jose, CA, USA)の安定同位体標識されたAβ1-38(SIL-Aβ1-38と呼ぶ)を使用した。SIL-Aβ1-38 は Pheと Ileの炭素原子が13Cで置換されている。SIL-Aβ1-38の乾燥品を50 mM NaOHで溶解した後に、COSMOSIL(R) 5Diol-120-II [7.5 mm I.D. x 600mm] column (Nacalai Tesque, Kyoto) を設置した Prominence HPLC System (Shimadzu Corp, Kyoto, Japan)でサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を行った。移動相:40 mM Tris-HCl, pH8.0、流速:1 mL/min、カラム温度:25 ℃、検出波長:214/280 nmの設定で行った。分取したフラクションの一部は非還元状態で15-20% Tricine-SDS-PAGEへ供し、Silver Staining kit (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA)でバンドを染色した。単量体と確認されたフラクションを 1 mg/mL bovine serum albuminを含む40 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH8.0 で希釈した後、分注して -80 ℃で保存した。一部を取り出し、Human Amyloid β (1-38) (FL) Assay Kit (Immuno-Biological Laboratories; Gunma, Japan)を用いてSIL-Aβ1-38の濃度を測定した。
全62症例に対して、抗体固定化ビーズを用いて内部標準ペプチドとしてSIL-Aβ1-38を用いて、IP-MSを行った。
ヒト血漿 250 μLに、10 pM SIL-Aβ1-38を含む結合バッファー (0.2%(w/v) n-Dodecyl-β-D-maltoside (DDM), 0.2%(w/v) n-Nonyl-β-D-thiomaltoside (NTM), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4) 250 μLを混合させた。この血漿サンプルに含まれる沈殿物は Ultrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いて遠心除去した。Protein G Plus Agarose (50% slurry; Pierce, Rockford, IL) 500 μLをH2O 400 μLで1回洗浄後、洗浄バッファー(0.1%(w/v) DDM, 0.1%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4) 400 μLで3回洗浄した。そのProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間インキュベーションさせた。血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた後、OTG-glycineバッファー(1% n-Octyl-β-D-thioglucoside (OTG), 50mM glycine , pH2.8)で2回洗浄、洗浄バッファー100 μLで3回洗浄された抗体固定化ビーズ 150 μgに血漿サンプルを混合させて4℃で1時間インキュベーションすることによりAβ及びAβ様ペプチドを捕捉した。その後、洗浄バッファー500 μLで1回洗浄、100 μLで4回洗浄後、50 mM 酢酸アンモニウム20 μLで2回洗浄した。さらにH2O 20 μLで1回洗浄した後、5 mM 塩酸を含む70% アセトニトリル 2.5 μLで抗体固定化ビーズに捕捉されたAβ及びAβ様ペプチドを溶出させた。溶出液を0.5 μLずつμFocus MALDI plateTM 900 μm上の4 wellへ滴下した。0.5 μLのマトリックス溶液(0.5 mg/mL CHCA, 0.2%(w/v) MDPNA)を混合した後、Linear TOF MSで測定した。
NC−と比較して各グループ(NC+、MCI、AD)との間のより明確な差を見るために、さらに以下の検討を行った。
Cut-off point: カットオフ値
Positive Predictive Value(PPV)=(真陽性の数)/(真陽性の数+偽陽性の数)
Negative Predictive Value(NPV)=(真陰性の数)/(真陰性の数+偽陰性の数)
Accuracy=(真陽性の数+真陰性の数)/全症例数
脳内のAβ蓄積はアルツハイマー病の重要な病理学的指標であり、認知症が顕在化するかなり前からAβの過剰蓄積は開始していることが知られている。PiBはAβ凝集体に特異的に結合する放射性薬剤であり、その集積をPETで測定することにより脳内のAβの蓄積を画像化することができる。高い精度で脳内のAβ蓄積が陽性である被験者を判断できる能力を示した血漿中APP669-711/APP672-713 (Aβ1-42)が脳内Aβ蓄積状態を反映しているかどうかを調べるために、APP669-711/APP672-713 (Aβ1-42)と脳皮質領域のPiB集積平均値(mcSUVR:mean cortical Standard Uptake Value Ratio)との相関を解析した。
Claims (4)
- 被験対象に由来する血液試料を、
APP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)と、
APP669−711(配列番号7)、APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)、APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)、APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)、APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)からなる群から選ばれる少なくとも1つと
を含むマーカーの検出に供して、前記血液試料中の
APP672−713(Aβ1−42)と、
APP669−711、APP672−709(Aβ1−38)、APP674−711(Aβ3−40)、APP672−710(Aβ1−39)、APP672−711(Aβ1−40)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)からなる群から選ばれる前記少なくとも1つと
の各測定レベルを得る測定工程と、
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP669−711レベルの比:
APP669−711/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−709(Aβ1−38)レベルの比:
APP672−709(Aβ1−38)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP674−711(Aβ3−40)レベルの比:
APP674−711(Aβ3−40)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−710(Aβ1−39)レベルの比:
APP672−710(Aβ1−39)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−711(Aβ1−40)レベルの比:
APP672−711(Aβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42); 及び
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するOxAPP672−711(OxAβ1−40)レベルの比:
OxAPP672−711(OxAβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42)
からなる群から選ばれる少なくとも1つの比を求める算出工程と
を行い、
被験対象の前記各比が、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−の前記各比を基準レベルとして、前記各比の基準レベルよりも高い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量よりも多いことを示す、脳内のAβ蓄積状態を判断するための分析方法。 - 血液試料中のAPP669−711(配列番号7)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ:
APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ: 及び
OxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)とAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)との組み合わせ
からなる群から選ばれる脳内のAβ蓄積状態を判断するマーカー。 - 被験対象に由来する血液試料をAPP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)を含むマーカーの検出に供して、前記血液試料中のAPP672−713(Aβ1−42)の測定レベルを得る測定工程を行い、
被験対象の前記APP672−713(Aβ1−42)の測定レベルが、脳内のAβの蓄積が陰性である認知機能正常者NC−のAPP672−713(Aβ1−42)のレベルを基準レベルとして、前記基準レベルよりも低い場合に、被験対象の脳内Aβの蓄積量は、前記認知機能正常者NC−の脳内Aβの蓄積量より多いことを示す、脳内のAβ蓄積状態を判断するための分析方法。 - 被験対象に対して行われた医学的介入の前後において、
被験対象に由来する血液試料を、
APP672−713(Aβ1−42)(配列番号6)と、
APP669−711(配列番号7)、APP672−709(Aβ1−38)(配列番号1)、APP674−711(Aβ3−40)(配列番号2)、APP672−710(Aβ1−39)(配列番号3)、APP672−711(Aβ1−40)(配列番号4)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)(配列番号5)からなる群から選ばれる少なくとも1つと
を含むマーカーの検出に供して、前記血液試料中の
APP672−713(Aβ1−42)と、
APP669−711、APP672−709(Aβ1−38)、APP674−711(Aβ3−40)、APP672−710(Aβ1−39)、APP672−711(Aβ1−40)、及びOxAPP672−711(OxAβ1−40)からなる群から選ばれる前記少なくとも1つと
の各測定レベルを得る測定工程と、
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP669−711レベルの比:
APP669−711/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−709(Aβ1−38)レベルの比:
APP672−709(Aβ1−38)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP674−711(Aβ3−40)レベルの比:
APP674−711(Aβ3−40)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−710(Aβ1−39)レベルの比:
APP672−710(Aβ1−39)/APP672−713(Aβ1−42);
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するAPP672−711(Aβ1−40)レベルの比:
APP672−711(Aβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42); 及び
APP672−713(Aβ1−42)レベルに対するOxAPP672−711(OxAβ1−40)レベルの比:
OxAPP672−711(OxAβ1−40)/APP672−713(Aβ1−42)
からなる群から選ばれる少なくとも1つの比を求める算出工程と
を行い、
医学的介入の前における被験対象の前記各比と、医学的介入の後における被験対象の前記各比との比較を行う、脳内のAβ蓄積状態に関して前記医学的介入の有効性を判断するための方法。
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