JP6359372B2 - DARPinを含む二重特異キメラ蛋白質 - Google Patents
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Description
dlgkklleaaragqddevrilmangadvnaddtwgwtplhlaayqghleivevllkngadvnaydyigwtplhlaadghleivevllkngadvnasdyigdtplhlaahnghleivevllkhgadvnaqdkfgktafdisidngnedlaeilq
抗EGFR DARPin−67(配列番号110):
dlgkklleaaragqddevrilmangadvnatdndgntplhlsawighleivevllkhgadvnaddllgmtplhlaadtghleivevllkygadvnardtrgktplhlaardghleivevllkhdadvnaqdkfgktafdisidngnedlaeilq
抗EGFR DARPin−68(配列番号111):
dlgkklleaaragqddevrilmangadvnafdywgmtplhlaadnghleivevllkhgadvnasdnfgftplhlaafyghleivevllkhgadvnafdmwgntplhlaaqnghleivevllkngadvnaqdkfgktafdisidngnedlaeilq
抗EGFR DARPin−69(配列番号112):
dlgkklleaaragqddevrilmangadvnaddnagrtplhlaanfghleivevllkngadvnakghhcntplhlaawaghleivevllkygadvnadddegytplhlaadigdleivevllkygadvnawdmygrtplhlaasaghleivevllkygadvnaqdkfgktafdisidngnedlaeilq
前記二重特異キメラ蛋白質において、前記IgG形態の抗体および/またはscFv−Fc形態の抗体は、抗EGFR DARPinと同一または互いに異なる抗原を標的とするものであってよい。同一の抗原を標的とする場合、前記IgG形態の抗体および/またはscFv−Fc形態の抗体と、抗EGFR DARPinが認識および/または結合する抗原のエピトープが互いに異なっていてよい。
配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR−H1、配列番号5のアミノ酸配列、配列番号2のアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列内の3番目から10番目までのアミノ酸を含む連続した8〜19個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号6のアミノ酸配列、配列番号85のアミノ酸配列、または配列番号85のアミノ酸配列内の1番目から6番目までのアミノ酸を含む連続した6〜13個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H3からなる群より選択された1つ以上の重鎖相補性決定領域(CDR)、または前記1つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変部位;
配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−L1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号9のアミノ酸配列、配列番号86のアミノ酸配列、または配列番号89のアミノ酸配列内の1番目から9番目までのアミノ酸を含む9〜17個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−L3からなる群より選択された1つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記1つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変部位;
前記重鎖相補性決定領域および軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変部位および軽鎖可変部位の組み合わせを含むものであってよい。
Xaa1−Xaa2−Tyr−Tyr−Met−Ser(配列番号4)
一般式II
Arg−Asn−Xaa3−Xaa4−Asn−Gly−Xaa5−Thr(配列番号5)
一般式III
Asp−Asn−Trp−Leu−Xaa6−Tyr(配列番号6)
一般式IV
Lys−Ser−Ser−Xaa7−Ser−Leu−Leu−Ala−Xaa8−Gly−Asn−Xaa9−Xaa10−Asn−Tyr−Leu−Ala(配列番号7)
一般式V
Trp−Xaa11−Ser−Xaa12−Arg−Val−Xaa13(配列番号8)
一般式VI
Xaa14−Gln−Ser−Tyr−Ser−Xaa15−Pro−Xaa16−Thr(配列番号9)
前記一般式Iにおいて、Xaa1は、存在しないかProまたはSerであり、Xaa2は、GluまたはAspであり、
前記一般式IIにおいて、Xaa3は、AsnまたはLysであり、Xaa4は、AlaまたはValであり、Xaa5は、AsnまたはThrであり、
前記一般式IIIにおいて、Xaa6は、SerまたはThrであり、
前記一般式IVにおいて、Xaa7は、His、Arg、GlnまたはLysであり、Xaa8は、SerまたはTrpであり、Xaa9は、HisまたはGlnであり、Xaa10は、LysまたはAsnであり、
前記一般式Vにおいて、Xaa11は、AlaまたはGlyであり、Xaa12は、ThrまたはLysであり、Xaa13は、SerまたはProであり、
前記一般式VIにおいて、Xaa14は、Gly、AlaまたはGlnであり、Xaa15は、Arg、His、Ser、Ala、GlyまたはLysであり、Xaa16は、Leu、Tyr、PheまたはMetである。
配列番号62のアミノ酸配列(このうち、1番目から17番目までのアミノ酸配列はシグナルペプチドである)、配列番号62の18番目から462番目までのアミノ酸配列、配列番号64のアミノ酸配列(このうち、1番目から17番目までのアミノ酸配列はシグナルペプチドである)、配列番号64の18番目から461番目までのアミノ酸配列、配列番号66のアミノ酸配列(このうち、1番目から17番目までのアミノ酸配列はシグナルペプチドである)、および配列番号66の18番目から460番目までのアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を含む重鎖;および
配列番号68のアミノ酸配列(このうち、1番目から20番目までのアミノ酸配列はシグナルペプチドである)、配列番号68の21番目から240番目までのアミノ酸配列、配列番号70のアミノ酸配列(このうち、1番目から20番目までのアミノ酸配列はシグナルペプチドである)、配列番号70の21番目から240番目までのアミノ酸配列、および配列番号108のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を含む軽鎖を含むものであってよい。
配列番号62のアミノ酸配列または配列番号62の18番目から462番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号68のアミノ酸配列または配列番号68の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号64のアミノ酸配列または配列番号64の18番目から461番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号68のアミノ酸配列または配列番号68の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号66のアミノ酸配列または配列番号66の18番目から460番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号68のアミノ酸配列または配列番号68の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号62のアミノ酸配列または配列番号62の18番目から462番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号70のアミノ酸配列または配列番号70の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号64のアミノ酸配列または配列番号64の18番目から461番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号70のアミノ酸配列または配列番号70の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;または
配列番号66のアミノ酸配列または配列番号66の18番目から460番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号70または配列番号70の21番目から240番目までのアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号62のアミノ酸配列または配列番号62の18番目から462番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号108のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;
配列番号64のアミノ酸配列または配列番号64の18番目から461番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号108のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体;および
配列番号66のアミノ酸配列または配列番号66の18番目から460番目までのアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号108のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む抗体からなる群より選択されたものであってよい。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS
<抗HER2抗体の軽鎖可変部位のアミノ酸配列>(配列番号114)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIKR
(2)HER3に対する抗原結合部位:配列番号115のアミノ酸配列を有する重鎖可変部位、配列番号116のアミノ酸配列を有する軽鎖可変部位、またはこれらの組み合わせ(この時、前記重鎖可変部位と軽鎖可変部位は、前記ペプチドリンカーによるかよることなく連結)であってよい。
QVQLQESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANINRDGSASYYVDSVKGRFTISRDDAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGVGYFDLWGRGTLVTVSSAST
<抗HER3抗体の軽鎖可変部位のアミノ酸配列>(配列番号116)
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNFVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSDRPSGVSDRFSGSKSGNTASLIISGLQADDEADYYCSSYGSSSTHVIFGGGTKVTVLG
(3)抗EGGFR/抗HER3二重特異キメラ蛋白質:配列番号117のアミノ酸配列を有する重鎖可変部位、配列番号118のアミノ酸配列を有する軽鎖可変部位、またはこれらの組み合わせ(この時、前記重鎖可変部位と軽鎖可変部位は、前記ペプチドリンカーによるかよることなく連結)であってよい。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLSGDWIHWVRQAPGKGLEWVGEISAAGGYTDYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARESRVSFEAAMDYWGQGTLVTVSS
<抗EGFR/HER3抗体の軽鎖可変部位のアミノ酸配列>(配列番号118)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQNIATDVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSEPEPYTFGQGTKVEIK
前記抗EGFR DARPinと腫瘍関連蛋白質に対する抗体を含む二重特異キメラ蛋白質は、EGFRの活性阻害だけでなく、他の腫瘍関連蛋白質の活性を同時に阻害することによって、より上昇した治療効果を得ることができる。より具体的には、前記抗EGFR DARPinと抗c−Met抗体を含む二重特異キメラ蛋白質は、抗c−Met抗体の細胞内在化(internalization)および分解(degradation)活性によって、c−MetおよびEGFRの活性阻害だけでなく、c−MetおよびEGFRを分解させて総量を減少させることによって、より根本的な遮断を可能にする。したがって、前記抗EGFR DARPinと抗c−Met抗体を含む二重特異キメラ蛋白質は、従来の抗EGFR抗体に耐性が生じた患者へ適用時にも有効な効果を得ることができる。
2.EGFR DARPin配列の汎用化
3.新たなMOA(mechanism of action)によるEGFR活性の阻害
4.従来の抗c−Met抗体、抗HER2抗体、または抗EGFR治療剤より増加した癌細胞抑制効果
5.従来の抗c−Met抗体、抗HER2抗体、または抗EGFR治療剤に対して耐性を有する癌細胞の抑制効果
6.EGFR/METの併用投与またはEGFR/HER2の併用投与と比較して、優れた効能を発揮するIgG−DARPin形態の二重特異キメラ蛋白質の確保
1.1.c−Metに対するマウス抗体‘AbF46’の生産
1.1.1.マウスの免疫化
ハイブリドーマ細胞株の開発に必要な免疫化されたマウスを得るために、5匹のマウスに、1匹あたり100μgのヒトのc−Met/Fc融合蛋白質(R&D Systems)と、同量の完全フロイントアジュバントを混合して、4−6週齢のBALB/cマウス(Japan SLC,Inc.)の腹腔内に注射した。2週後に、前記と同様の方法で、前記抗原として使用されたヒトのc−Met/Fc融合蛋白質を、前記注射した量の半分である50μgを、同量の不完全フロイントアジュバントと混合して、マウスの腹腔内に注射した。1週後、最後のブースティング(boosting)が行われ、3日後に、前記マウスの尾から採血して血清を得た後、1/1000にPBSで希釈して、ELISAでc−Metを認知する抗体の力価が増加することを確認した。前記結果で抗体の量が十分に得られるマウスを選別し、下記の細胞融合過程を行った。
細胞融合実験3日前に、50μgのPBSに、ヒトのc−Met/Fc融合蛋白質の混合物をBALB/cマウス(Japan SLC,Inc.)の腹腔内に注射し、免疫化されたマウスを麻酔した後、体の左側に位置した脾臓を摘出した。摘出した脾臓をメッシュで粉砕して細胞を分離し、培養培地(DMEM、GIBCO、Invitrogen)と混合して、脾臓細胞懸濁液を調製した。前記懸濁液を遠心分離して細胞層を回収した。前記得られた脾臓細胞1x108個と、骨髄腫細胞(Sp2/0)1×108個を混合した後、遠心分離して細胞を沈殿させた。前記遠心分離された沈殿物を徐々に分散させ、培養培地(DMEM)に入っている45%(w/v)ポリエチレングリコール(PEG)(1ml)を処理し、37℃で1分間維持させた後、培養培地(DMEM)1mlを添加した。以降、培養培地(DMEM)10mlを1分間添加し、37℃の水で5分間放置した後、50mlに合わせて再び遠心分離した。細胞沈殿物を分離培地(HAT培地)で1〜2×105/ml程度に再懸濁させ、96ウェル(well)プレートに0.1mlずつ分注した後、37℃の二酸化炭素培養器で培養して、ハイブリドーマ細胞群を作製した。
前記参考例1.1.2で製造されたハイブリドーマ細胞群のうち、c−Met蛋白質にだけ特異的に反応するハイブリドーマ細胞を選別するために、ヒトのc−Met/Fc融合蛋白質とヒトのFc蛋白質を抗原として用いたELISA分析方法によってスクリ−ニングした。
前記参考例1.1.3で得られたハイブリドーマ細胞を無血清培地で培養し、培養液からモノクローナル抗体を生産精製した。
一般に、マウス抗体は、治療目的でヒトに注入された時、免疫拒絶反応(immunogenicity)を示す可能性が高いことから、これを解決するために、前記参考例1.1.で作製されたマウス抗体AbF46から、抗原の結合に関連する可変領域(variable region)を除いた不変領域(constant region)を、ヒトIgG1抗体の配列に置換するキメラ抗体chAbF46を作製した。
1.3.1.重鎖のヒト化(Heavy chain humanization)
H1−heavyおよびH3−heavy2種のデザインのために、まず、Ig Blast(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)を通して、前記参考例1.2で精製されたマウス抗体AbF46のVH遺伝子と最も相同性が高いヒトの生殖腺(germline)遺伝子を分析した。その結果、VH3−71がアミノ酸レベルで83%の相同性を有することを確認し、マウス抗体AbF46のCDR−H1、CDR−H2、CDR−H3をKabat numberingで定義し、マウス抗体AbF46のCDR部分がVH3−71のフレームワークに導入されるようにデザインした。この時、30番(S→T)、48番(V→L)、73番(D→N)、78番(T→L)のアミノ酸は、元々、マウスAbF46抗体のアミノ酸配列にback−mutationした。以降、H1は、追加的に83番(R→K)と84番(A→T)のアミノ酸に突然変異を与え、最終的にH1−heavy(配列番号40)とH3−heavy(配列番号41)を構築した。
H1−light(配列番号43)およびH2−light(配列番号44)の2種のデザインのために、Ig Blast(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)を通して、マウス抗体AbF46のVL遺伝子と最も相同性が高いヒト生殖腺遺伝子を分析した。その結果、VK4−1がアミノ酸レベルで75%の相同性を有することを確認し、マウス抗体AbF46のCDR−L1、CDR−L2、CDR−L3をKabat numberingで定義し、マウス抗体AbF46のCDR部分がVK4−1の骨格に導入されるようにデザインした。この時、H1−lightは、36番(Y→H)、46番(L→M)、49番(Y→I)の3個のアミノ酸を逆変異させ、H2−lightは、49番のアミノ酸(Y→I)1個だけをback−mutationして構築した。
huAbF46抗体の重鎖可変部位および軽鎖可変部位を用いてhuAbF46抗体のscFvを作製するための遺伝子をデザインした。それぞれ重鎖可変部位および軽鎖可変部位を‘VH−リンカー−VL’の形態となるようにし、前記リンカーは‘GLGGLGGGGSGGGGSGGSSGVGS’(配列番号54)のアミノ酸配列を有するようにデザインした。このようにデザインされたhuAbF46抗体のscFvをコーディングするポリヌクレオチド(配列番号55)をバイオニアに依頼して合成し、これを発現させるためのベクターを配列番号56に示した。
1.5.1.標的CDRの選定およびプライマーの作製
huAbF46抗体の親和性成熟(affinity maturation)のために6つの相補性決定部位(CDR)を、前記作製されたマウス抗体AbF46から‘Kabat numbering’によって定義した。それぞれのCDRは下記の表2の通りである。
CDRのランダム配列の導入による抗体ライブラリー遺伝子の構築は、前記参考例1.5.1のような方法で作製されたプライマーを用いて行った。鋳型としてhuAbF46抗体のscFvを含むポリヌクレオチドを用いて、図1に示す方法のように、2個のPCR切片を作製し、これを重複拡張重合酵素連鎖反応(overlap extension PCR)方法により、所望のCDRだけがそれぞれ突然変異したhuAbF46抗体のscFvライブラリー遺伝子を確保して作製された6つのCDRをそれぞれ標的とするライブラリーを構築した。
前記構築されたライブラリーからc−Metに対するライブラリーの結合力を向上させた後、それぞれの個別クローンからscFvの遺伝子配列を分析した。確保された遺伝子配列はそれぞれ下記の表3の通りであり、これをIgG形態に変換した。下記のクローンのうち、L3−1、L3−2、L3−3、L3−5から生産された4種の抗体を選別して後続の実験を行った。
選別された4種の抗体の重鎖をコードするポリヌクレオチドは‘EcoRI−signal sequence−VH−NheI−CH−XhoI’(配列番号38)で構成され、重鎖の場合、親和性の成熟後に、抗体のアミノ酸が変更されなかったので、huAbF46抗体の重鎖をそのまま使用した。ただし、ヒンジ領域は、ヒトIgG1のヒンジでないU6−HC7ヒンジ(配列番号57)に置換した。軽鎖は‘EcoRI−signal sequence−VL−BsiWI−CL−XhoI’で構成されるようにそれぞれデザインして遺伝子を合成し、親和性の成熟後に、選別された前記4種の抗体の軽鎖可変部位を含んでコードするポリヌクレオチド(配列番号58〜配列番号61)をバイオニアに依頼して合成した。以降、Invitrogen社のOptiCHOTM Antibody Express Kit(Cat no.12762−019)に含まれているpOptiVECTM−TOPO TA Cloning Kitに前記重鎖に相当するヌクレオチド配列を有するDNA切片(配列番号38)を、pcDNATM3.3−TOPO TA Cloning Kit(Cat no.8300−01)に前記軽鎖に相当するヌクレオチド配列を有するDNA切片(L3−1由来のCDR−L3を含むDNA切片:配列番号58、L3−2由来のCDR−L3を含むDNA切片:配列番号59、L3−3由来のCDR−L3を含むDNA切片:配列番号60、L3−5由来のCDR−L3を含むDNA切片:配列番号61)を、それぞれEcoRI(NEB、R0101S)とXhoI(NEB、R0146S)制限酵素を用いて、クローニングすることにより、親和性の成熟した抗体の発現のためのベクターを構築した。
前記参考例1.7で選別された4種の抗体のうち、c−Metとの結合親和性が最も高く、Aktのリン酸化およびc−Metの分解の程度が最も低いと測定されたhuAbF46−H4−A1を対象に、ヒンジ領域または不変領域およびヒンジ領域の置換された抗体を作製した。
前記参考例1で作製されたL3−1Y−IgG2のc−末端に4種の抗EGFR DARPin(配列番号109、110、111、および112)をそれぞれ融合させ、4種の抗c−Met抗体/抗EGFR DARPin融合体(抗c−Met/抗EGFR二重特異キメラ蛋白質)を作製した(図3参照)。L3−1Y−IgG2抗体の重鎖と抗EGFR DARPinは、10個のアミノ酸で構成された‘GGGGSGGGGS’(G4S)2リンカーを用いて‘L3−1Y−IgG2重鎖−(G4S)2−抗EGFR DARPin’の形態で作製した。
前記実施例1で製造されたME−19二重抗体の物性を調べるために、前記抗体を精製し、TSKG3000SWXLカラム(Tosho)が装着されたHPLC装備(WATERS2695)に、20ugの抗体を0/5ml/minの速度で注入し、サイズ排除クロマトグラフィーを行った。
前記実施例1で作製された二重特異キメラ蛋白質ME−19のEGFの競合(competition)の可否を確認するために、ELISA法を利用した競合アッセイ(competition assay)を実施した。96−well immunoplate(Nunc)に0.25ug/wellのEGFR(#344−ER、R&D Systems)をコーティングした後、20ng/mlの濃度のbiotinylated EGF(invitrogen)と順次に希釈したME−19を混合して分注し、常温で2時間反応させた。前記反応物を0.05%(w/v)のTween20を含むPBSで5回洗浄した後、これに、HRP(Horse radish peroxidase)が結合されている抗−ストレプトアビジン抗体(#21140、Thermo scientific)を各wellに分注し、常温で1時間反応させた。前記と同様に洗浄した後、発色反応を誘導するために、TMB substrate(eBioscience)を各wellに分注した後、405nmにおける吸光度を測定した。比較のために、二重特異キメラ蛋白質ME−19の代わりに、Erbitux(Merck)を用いて、同様の方法で試験を行った。
前記実施例1で作製された二重特異キメラ蛋白質ME−19のEGFRのリン酸化阻害効果を確認するために、human epidermoid carcinomaであるA431細胞株においてphospho−EGFR測定実験を実施した。96−well cell culture plateに2×104cells/ウェルの量でA431細胞(ATCC)を分注した後、37℃、5%CO2で24時間培養した。前記培養した細胞から培地を除去した後、無血清培地(#30−2002、ATCC)を分注して18時間培養した。前記培養した細胞に二重特異キメラ蛋白質ME−19を5ug/mlの濃度で分注して30分間培養後、200ng/mlの濃度のEGF(R&D systems)を添加して30分間さらに培養した。培養が終わった細胞は溶解した後、phospho−EGFR detection kit(Cell signaling)を用いて405nmにおける吸光度を測定することにより、前記二重特異キメラ蛋白質によるEGFRのリン酸化の程度を測定した。比較のために、二重特異キメラ蛋白質ME−19の代わりに、Erbitux(#ET509081213、Merck)(陽性対照群)を用いて、同様の方法で試験を行った。
前記実施例1で作製された二重特異キメラ蛋白質ME−19の癌細胞増殖阻害効果の試験を行うために、SNU5細胞株(韓国細胞株銀行KCLB No.00005)、MKN45細胞株(韓国細胞株銀行KCLB No.80103)、H1993細胞株(ATCC CRL−5909)、およびA431細胞株(ATCC)に対する細胞増殖阻害効果の試験を行った。
MKN45胃癌細胞株(韓国細胞株銀行KCLB No.80103)を4X104cell/wellの量で用意し、これに、参考例1で用意したL3−1Y−IgG2、cetuximab(#ET509081213、Merck)、および実施例1で作製されたME−19を、それぞれ単独処理または併用処理の方法で、各ウェルあたり1ug/mlの濃度となるように(併用処理の場合、それぞれ1ug/mlとなるように)添加し、2時間、37℃でインキュベーティングした。これに、4%(v/v)ホルムアルデヒドを15分間処理して細胞をプレートに固定させ、PBSで3回洗浄した。その後、ブロッキングバッファー(0.5%(v/v)triton x−100 and 5%(v/v)donkey serum)を常温で1時間処理した後、c−MetおよびEGFRに対する一次抗体(c−Met一次抗体;#FAB3582A、R&D systems、EGFR一次抗体;#5616、Cell signaling)を1:100に希釈し、100μlの量で、15時間、4℃で処理した。PBSで3回洗浄した後、二次抗体(#A21433、Invitrogen)を1:2000に希釈し、100ulの量で、1時間、常温で処理し、再びPBSで3回洗浄して、mounting medium(#H−1200、Vector)としてplateを用意した。前記用意された細胞を、Confocal顕微鏡(Zeiss、LSM710)で細胞を観察した。
抗c−Met/抗EGFR DARPin二重特異キメラ蛋白質による標的受容体であるc−MetとEGFRの発現量の減少を確認するために、ヒトの胃癌細胞株であるMKN45(韓国細胞株銀行KCLB No.80103)とSNU638(ATCC)を、2x103cell/ウェルの量で96ウェルプレートに継代培養しながら、L3−1Y−IgG2、Erbitux、およびME19をそれぞれ5ug/mlの量で処理して24時間培養した。陰性対照群(control)として抗体を添加しない培地を使用した。培養後、細胞をComplete Lysis−M(#04719956001、Roche)で溶解した後、細胞溶解物を収集した。c−Metの発現量測定のために、Total cMet detection ELISA kit(DYC358E、R&D systems)を、EGFRの発現量測定のために、Total EGF Receptor ELISA kit(#7297、Cell Signaling)を製造会社の指示に従って使用した。
Herceptin(Roche)のc−末端に抗EGFR DARPin(配列番号109)を融合させ、抗HER2抗体/抗EGFR DARPin融合体(抗HER2/抗EGFR二重特異キメラ蛋白質)を作製した(図14参照)。Herceptin抗体の重鎖と抗EGFR DARPinを、10個のアミノ酸で構成された‘GGGGSGGGGS’(G4S)2リンカーを用いて連結し、‘Herceptin重鎖−(G4S)2−抗EGFR DARPin’の形態で作製した。
前記実施例8で製造された抗HER2/抗EGFR DARPin二重抗体H2E−01の物性を調べるために、前記抗体を精製し、TSKG3000SWXLカラム(Tosho)が装着されたHPLC装備(WATERS2695)に、20μgの抗体を0/5ml/minの速度で注入し、HPLCを用いてサイズ排除クロマトグラフィーを行った。
前記実施例8で作製された二重特異キメラ蛋白質H2E−01の癌細胞増殖阻害効果の試験を行うために、MKN45細胞株(韓国細胞株銀行KCLB No.80103)に対する細胞増殖阻害効果の試験を行った。
MKN45胃癌細胞株(韓国細胞株銀行KCLB No.80103)を4X104cell/wellの量で用意し、これに、Trastuzumab(Roche)、Cetuximab(#ET509081213、Merck)、および実施例8で作製された抗HER2/抗EGFR DARPin二重抗体H2E−01を、それぞれ単独処理または併用処理の方法で、各ウェルあたり1μg/mlの濃度となるように(併用処理の場合、それぞれ1μg/mlとなるように)添加し、2時間、37℃でインキュベーティングした。これに、4%(v/v)ホルムアルデヒドを15分間処理して細胞をプレートに固定させ、PBSで3回洗浄した。その後、ブロッキングバッファー(0.5%(v/v)triton x−100および5%(v/v)donkey serum)を常温で1時間処理した後、HER2およびEGFRに対する一次抗体(HER2一次抗体:#280003Z、Invitrogen;EGFR一次抗体:#5616、Cell signaling)を1:100に希釈し、100μlの量で、15時間、4℃で処理した。PBSで3回洗浄した後、二次抗体(#A21433、Invitrogen)を1:2000に希釈し、100ulの量で、1時間、常温で処理し、再びPBSで3回洗浄し、mounting medium(#H−1200、Vector)としてplateを用意した。前記用意された細胞を、Confocal顕微鏡(Zeiss、LSM710)で細胞を観察した。
抗EGFR/HER3抗体RG−7597のc−末端に抗EGFR DARPin(配列番号109)を融合させ、抗EGFR/HER3抗体/抗EGFR DARPin融合体(抗HER3/抗EGFR二重特異キメラ蛋白質)を作製した(図17参照)。RG−7597抗体の重鎖とDARpinは、10個のアミノ酸で構成された‘GGGGSGGGGS’(G4S)2リンカーを用いて、‘RG−7597重鎖−(G4S)2−抗EGFR DARPin’の形態で作製した。前記抗EGFR/HER3抗体RG−7597は、次のような重鎖可変部位(配列番号117)および軽鎖可変部位(配列番号118を有するもので、IgG1Fcを用いて作製した。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLSGDWIHWVRQAPGKGLEWVGEISAAGGYTDYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARESRVSFEAAMDYWGQGTLVTVSS
<抗EGFR/HER3抗体の軽鎖可変部位のアミノ酸配列>(配列番号118)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQNIATDVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSEPEPYTFGQGTKVEIK
前記製造された抗EGFR/HER3抗体/抗EGFR DARPin融合体をEH3E−01と名づけた。
前記参考例1で作製された抗c−Met抗体L3−1Y−IgG2のc−末端に2個の抗EGFR DARPin(DARPin−01:配列番号109;DARPin−69:配列番号112)を融合させ、EGFR DARPinがIgGタイプの抗c−Met抗体の各ダイマーのc−末端に2個ずつ結合された抗c−Met抗体/抗EGFR DARPin融合体(抗c−Met/抗EGFR二重特異キメラ蛋白質)を作製した(図19参照)。L3−1Y−IgG2抗体の重鎖とDARpin−01は、10個のアミノ酸で構成された‘GGGGSGGGGS’(G4S)2リンカーを用いて連結し、DARPin−01とDARPin−69も、10個のアミノ酸で構成された‘GGGGSGGGGS’(G4S)2リンカーを用いて連結した。したがって、最終形態は、‘L3−1Y−IgG2重鎖−(G4S)2−抗EGFR DARPin−01−(G4S)2−抗EGFR DARPin−69’の形態である。
Claims (16)
- 抗EGFR DARPin、および
前記抗EGFR DARPinに連結されたIgG形態の抗c−Met抗体、scFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片、またはこれらの組み合わせを含み、
前記抗c−Met抗体または前記抗c−Met抗体断片は配列番号71のアミノ酸配列中の配列番号73(EEPSQ)を含む連続した5〜19個のアミノ酸からなるエピトープに結合する、二重特異キメラ蛋白質。 - 前記抗EGFR DARPinは、配列番号109のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号110のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号111のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、および配列番号112のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPinからなる群より選択された1種以上が1個または2個〜10個繰り返された形態である、請求項1に記載の二重特異キメラ蛋白質。
- 前記IgG形態の抗c−Met抗体またはscFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片は、
配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR−H1、配列番号5のアミノ酸配列、配列番号2のアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列内の3番目から10番目までのアミノ酸を含む連続した8〜19個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号6のアミノ酸配列、配列番号85のアミノ酸配列、または配列番号85のアミノ酸配列内の1番目から6番目までのアミノ酸を含む連続した6〜13個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H3からなる群より選択された1つ以上の重鎖相補性決定領域(CDR)、または前記1つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変部位;
配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−L1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号9のアミノ酸配列、配列番号86のアミノ酸配列、または配列番号89のアミノ酸配列内の1番目から9番目までのアミノ酸を含む9〜17個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−L3からなる群より選択された1つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記1つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変部位;
前記重鎖相補性決定領域および軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変部位および軽鎖可変部位の組み合わせを含むものである、請求項1または2に記載の二重特異キメラ蛋白質。 - 前記CDR−H1は、配列番号1のアミノ酸配列、配列番号22のアミノ酸配列、配列番号23のアミノ酸配列、および配列番号24のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものであり、
前記CDR−H2は、配列番号2のアミノ酸配列、配列番号25のアミノ酸配列、および配列番号26のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものであり、
前記CDR−H3は、配列番号3のアミノ酸配列、配列番号27のアミノ酸配列、配列番号28のアミノ酸配列、および配列番号85のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものであり、
前記CDR−L1は、配列番号10のアミノ酸配列、配列番号29のアミノ酸配列、配列番号30のアミノ酸配列、配列番号31のアミノ酸配列、配列番号32のアミノ酸配列、配列番号33のアミノ酸配列、および配列番号106のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものであり、
前記CDR−L2は、配列番号11のアミノ酸配列、配列番号34のアミノ酸配列、配列番号35のアミノ酸配列、および配列番号36のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものであり、
前記CDR−L3は、配列番号12のアミノ酸配列、配列番号13のアミノ酸配列、配列番号14のアミノ酸配列、配列番号15のアミノ酸配列、配列番号16のアミノ酸配列、配列番号37のアミノ酸配列、配列番号86のアミノ酸配列、および配列番号89のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を有するものである、請求項3に記載の二重特異キメラ蛋白質。 - 前記IgG形態の抗c−Met抗体またはscFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片は、
配列番号17、配列番号74、配列番号87、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、または配列番号94のアミノ酸配列を含む重鎖可変部位、
配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号75、配列番号88、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99、または配列番号107のアミノ酸配列を含む軽鎖可変部位、または
前記重鎖可変部位と軽鎖可変部位の組み合わせを含むものである、請求項3に記載の二重特異キメラ蛋白質。 - 前記IgG形態の抗c−Met抗体は、
配列番号62のアミノ酸配列、配列番号62の18番目から462番目までのアミノ酸配列、配列番号64のアミノ酸配列、配列番号64の18番目から461番目までのアミノ酸配列、配列番号66のアミノ酸配列、および配列番号66の18番目から460番目までのアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を含む重鎖;および
配列番号68のアミノ酸配列、配列番号68の21番目から240番目までのアミノ酸配列、配列番号70のアミノ酸配列、配列番号70の21番目から240番目までのアミノ酸配列、および配列番号108のアミノ酸配列からなる群より選択されたアミノ酸配列を含む軽鎖を含むものである、請求項1または2に記載の二重特異キメラ蛋白質。 - 請求項1〜6のいずれか1項に記載の二重特異キメラ蛋白質を含む、医薬組成物。
- 癌の予防または治療のためのものである、請求項7に記載の医薬組成物。
- 抗EGFR DARPinを、IgG形態の抗c−Met抗体、scFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片、またはこれらの組み合わせに連結させる段階を含み、
前記抗c−Met抗体または前記抗c−Met抗体断片は配列番号71のアミノ酸配列中の配列番号73(EEPSQ)を含む連続した5〜19個のアミノ酸からなるエピトープに結合する、二重特異キメラ蛋白質の製造方法。 - 前記DARPinは、配列番号109のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号110のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号111のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、および配列番号112のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPinからなる群より選択された1種以上が1個または2個〜10個繰り返された形態である、請求項9に記載の二重特異キメラ蛋白質の製造方法。
- 前記IgG形態の抗c−Met抗体またはscFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片は、
配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR−H1、配列番号5のアミノ酸配列、配列番号2のアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列内の3番目から10番目までのアミノ酸を含む連続した8〜19個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号6のアミノ酸配列、配列番号85のアミノ酸配列、または配列番号85のアミノ酸配列内の1番目から6番目までのアミノ酸を含む連続した6〜13個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H3からなる群より選択された1つ以上の重鎖相補性決定領域(CDR)、または前記1つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変部位;
配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−L1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号9のアミノ酸配列、配列番号86のアミノ酸配列、または配列番号89のアミノ酸配列内の1番目から9番目までのアミノ酸を含む9〜17個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−L3からなる群より選択された1つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記1つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変部位;
前記重鎖相補性決定領域および軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変部位および軽鎖可変部位の組み合わせを含むものである、請求項10に記載の二重特異キメラ蛋白質の製造方法。 - 抗EGFR DARPinを、IgG形態の抗c−Met抗体、scFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片、またはこれらの組み合わせに連結させる段階を含み、
前記抗c−Met抗体または前記抗c−Met抗体断片は配列番号71のアミノ酸配列中の配列番号73(EEPSQ)を含む連続した5〜19個のアミノ酸からなるエピトープに結合する、抗c−Met抗体の効能増進方法。 - 前記抗EGFR DARPinは、配列番号109のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号110のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、配列番号111のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPin、および配列番号112のアミノ酸配列を有する抗EGFR DARPinからなる群より選択された1種以上が1個または2個〜10個繰り返された形態である、請求項12に記載の抗c−Met抗体の効能増進方法。
- 前記IgG形態の抗c−Met抗体またはscFv−Fc形態の抗c−Met抗体断片は、
配列番号4のアミノ酸配列を有するCDR−H1、配列番号5のアミノ酸配列、配列番号2のアミノ酸配列、または配列番号2のアミノ酸配列内の3番目から10番目までのアミノ酸を含む連続した8〜19個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号6のアミノ酸配列、配列番号85のアミノ酸配列、または配列番号85のアミノ酸配列内の1番目から6番目までのアミノ酸を含む連続した6〜13個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−H3からなる群より選択された1つ以上の重鎖相補性決定領域(CDR)、または前記1つ以上の重鎖相補性決定領域を含む重鎖可変部位;
配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−L1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号9のアミノ酸配列、配列番号86のアミノ酸配列、または配列番号89のアミノ酸配列内の1番目から9番目までのアミノ酸を含む9〜17個のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有するCDR−L3からなる群より選択された1つ以上の軽鎖相補性決定領域、または前記1つ以上の軽鎖相補性決定領域を含む軽鎖可変部位;
前記重鎖相補性決定領域および軽鎖相補性決定領域の組み合わせ;または
前記重鎖可変部位および軽鎖可変部位の組み合わせを含むものである、請求項12または13に記載の抗c−Met抗体の効能増進方法。 - 請求項1〜6のいずれか1項に記載の二重特異キメラ蛋白質をコードする、核酸分子。
- 請求項15に記載の核酸分子を含む、細胞。
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