KR20150136031A - 인간화 또는 친화도 성숙된 항 앤지오포이에틴-2 항체 및 그의 용도 - Google Patents

인간화 또는 친화도 성숙된 항 앤지오포이에틴-2 항체 및 그의 용도 Download PDF

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Abstract

인간화 및/또는 친화도 개선된 Ang2 특이적 항체, 상기 항체를 유효성분으로 포함하는 혈관신생 저해제 및 Ang2 활성화 및/또는 과생성과 관련된 질병의 예방 및/또는 치료용 조성물, 및 상기 항체를 포함하는 Ang2 활성화 및/또는 과생성과 관련된 질병의 진단용 조성물이 제공된다.

Description

인간화 또는 친화도 성숙된 항 앤지오포이에틴-2 항체 및 그의 용도{Humanized or Affinity-matured Anti ANG-2 antibody and uses thereof}
신생혈관형성 유도인자인 안지오포이에틴-2(Angiopoietin-2; Ang2)에 특이적으로 결합하고, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하며, 인간화 및/또는 친화도 개선된, 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 이의 용도가 제공된다.
혈관 신생(angiogenesis)은 기존 혈관으로부터 새로운 혈관이 생성되는 기작을 의미하며, 기관의 형성, 정상적인 생리학적 성장, 상처 치유 등에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 또한, 비정상적인 혈관 신생은 종양의 성장과 전이, 연령 관련 황반변성, 당뇨병성 망막병증, 건선, 류마티스성 관절염, 만성 염증과 같은 질병에 결정적인 역할을 하는 것으로 알려져 있다.
혈관 신생은 종양의 성장과 전이에 중요한 역할을 한다고 알려져 있으며 새로운 개념의 암 치료제를 개발하기 위해 혈관 신생 기작에 대한 다양한 심도 있는 연구가 진행되고 있다. 상기 연구의 표적이 된 단백질 중 하나가 혈관 발달 및 출생 후 혈관 신생에 관여하는 것으로 알려져 있는 앤지오포이에틴으로서 Ang-1, Ang-2, Ang-3, Ang-4 등이 알려져 있다.
이 중 Ang-2와 관련한 암 조직의 신생 혈관 형성 과정은 다음과 같다. 먼저, 암 조직에서 신생 혈관 형성을 위해 암세포가 기존의 혈관을 선택하는 혈관공용(cooption)이 발생한다. 이후, 안지오포이에틴-2 경로에 의해 기존의 혈관의 기능을 파괴시키는 혈관 퇴화가 일어난다. 기존 혈관의 퇴화로 인해 암 조직 내의 환경은 저산소(hypoxia) 환경이 되어 신생 혈관이 형성될 수 있는 조건을 제공하게 된다. 상기 조건 하에서 혈관 내피 세포 성장 인자(vascular endothelial cell growth factor, VEGF)의 발현이 증가되어 새로운 혈관이 생성된다.
Ang-2의 혈관신생 억제제 개발의 표적으로서의 중요성이 커져가고 있는 상황에서, 보다 효과적이고 강력한 Ang-2 표적 물질의 개발이 요구되고 있다.
일 예는 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다. 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2에 특이적으로 결합하고, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하여 Tie2 수용체의 활성화를 유도하며, 인간화 및/또는 친화도 성숙된 것을 특징으로 한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 Ang2가 결합된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체를 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체를 유효성분으로 포함하는 Tie2 수용체 활성화용 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 신생혈관 형성 저해를 위한 약학 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 혈관 투과성 감소를 위한 약학 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 정상 혈관 생성 유도를 위한 약학 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 신생혈관 형성, 혈관 투과성 증가, 및/또는 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 치료용 약학 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화를 위한 약학 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 Ang2 과발현과 관련된 질병의 진단용 조성물을 제공한다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편, Ang2, 및 Tie2 수용체가 결합된 복합체를 제공한다.
본 발명자들은 Ang2 특이적으로 결합하지만 Ang2와 Tie2 수용체와의 결합을 저해하지 않으며 Ang2와 Tie2 수용체와 함께 복합체(항체/Ang2/Tie2)를 이루는 항체가, 항체의 이합체화(dimerization)를 유도하는 특성을 가지며, 이를 통하여 여기에 복합체화되어 있는 Tie2 수용체를 효과적으로 클러스터링(clustering)시킴으로써, Tie2 수용체 및 이의 하류 신호화 (downstream signaling)의 활성화를 유도할 수 있게 된다는 것을 확인하였다. 이러한 작용 기작을 갖는 항체는 Ang2와 결합하여 세포내 이동(internalization) 및 분해를 유도함으로써 Ang2 기능을 저해하여 circulating Ang2 level을 낮추는 역할을 함과 동시에, Ang2와 함께 Tie2 수용체와 결합하여 Ang1처럼 Tie2 수용체를 활성화시켜 Tie2 downstream signaling을 유도하고 혈관내피세포의 안정화를 유도하는 이중 작용(dual function)을 갖는다.
본 발명은 신생혈관형성 유도인자인 Ang2를 표적으로 하는 치료용 항체에 관한 것으로, Ang2에 특이적으로 결합함으로써 Ang2의 기능을 저해할 뿐 아니라, Ang2와 함께 Tie2에 결합하여 Tie2의 활성화를 유도하는 항 Ang2 항체 및 이의 인간화 및/또는 친화도 성숙된 형태에 관한 것이다. 상기 항 Ang2 항체는 암, 패혈증, 안구질환 등 혈관의 비정상적 활성화 및 기능이상(dysfunction)과 관련된 질병에서 Ang2의 하향조절(downregulation)과 함께, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하여 Tie2 수용체를 활성화 시킴으로써 혈관의 구조적/기능적 정상화(normalization)를 유도함으로써 질병을 치료하는 효과를 갖는다.
구체적으로, 본 발명의 일 예는 신생혈관형성 유도인자인 Ang2(Angiopoietin-2)에 특이적으로 결합(인식)하고, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하는, 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공한다. 즉, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2를 특이적으로 인식하고, Ang2와 Tie2 수용체 모두에 결합하는 것일 수 있다. 또한, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Tie2 수용체의 활성화를 유도하는 것일 수 있다. 이와 같은 Tie2 수용체의 활성화는 Tie2 수용체의 인산화 증가 및/또는 그 하부 신호 경로와 관련된 단백질, 예컨대 Akt(NM_005163), eNOS(NM_000603), 42/44(NM_002745) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 인산화에 의하여 유도될 수 있다. 또한, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Tie2 수용체의 세포 내부로의 이동 (internalization)을 유도하는 것일 수 있다. 즉, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2에 특이적으로 결합하면서도, 기존의 항 Ang2 항체와 달리, Ang2와 Tie2 수용체와의 결합을 저해하지 않음으로써, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하여 복합체를 형성하고, Tie2 수용체의 활성화를 유도하는 것일 수 있다.
상기 항 Ang2 항체는 인간화 및/또는 친화도 성숙 과정을 거침으로써, Ang2에 대한 결합력이 보다 증진되고, 보다 효과적으로 작용할 수 있는 것일 수 있다.
본 발명에서 제공되는 항체의 항원으로 작용하는 Ang2 단백질은 신생혈관 형성과 밀접한 관련이 있으며 혈액 내에 존재하는 가용성 리간드로서, 신생혈관 생성(angiogenesis), 암전이(metastasis), 암세포 침투(invasion) 에 광범위하게 작용한다. 상기 Ang2는 인간, 원숭이 등의 영장류, 마우스, 래트 등의 설치류 등과 같은 포유류로부터 유래하는 것일 수 있으며, 예컨대 인간 Ang2 (예컨대, NCBI Accession No. O15123 등), 원숭이 Ang2 (예컨대, NCBI Accession No. Q8MIK6 등), 마우스 Ang2 (예컨대, NCBI Accession No. O35608 등), 래트 Ang2 (예컨대, NCBI Accession No. O35462 등) 등일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
Tie2 수용체(TEK tyrosine kinase)는 안지오포이에틴-1 수용체로, 마우스(NM_013690; NP_038718), 래트, 인간(NM_000459; NP_000450) 등의 다양한 포유동물의 혈관내피세포(endothelial cell)에서 발현되며, 다양한 downstream signaling에 관여한다.
앞서 설명한 바와 같이, 본 발명에서 제공되는 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2 특이적으로 결합하지만 Ang2와 Tie2 수용체와의 결합을 저해하지 않으며 Ang2와 Tie2 수용체와 함께 복합체(항체/Ang2/Tie2)를 이루는 항체는, 항체의 이합체화(dimerization)를 유도하는 특성을 가지며, 이를 통하여 여기에 복합체화되어 있는 Tie2 수용체를 효과적으로 클러스터링(clustering)시킴으로써, Tie2 수용체 및 이의 하류 신호화 (downstream signaling)의 활성화를 유도할 수 있는 것을 특징으로 한다. 이러한 작용 기작으로 인하여, 본 발명의 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2와 결합하여 세포내 이동(internalization) 및 분해를 유도함으로써 Ang2 기능을 저해하여 circulating Ang2 level을 낮추는 역할을 함과 동시에, Ang2와 함께 Tie2 수용체와 결합하여 Ang1처럼 Tie2 수용체를 활성화시켜 혈관내피세포의 안정화를 유도하는 이중 작용(dual function)을 가짐으로써, Ang2 과발현에 의한 증상(질환)뿐 아니라 혈관내피세포의 안정화 저하, 즉 혈관 침투성 증가로 인한 증상(질환)의 치료에도 유용하게 사용될 수 있다.
상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 인간 Ang2 (hAng2; 서열번호 11; Accession # O15123) 의 루프 1(서열번호 11 중 417번째 아미노산부터 434번째 아미노산까지의 부위)의 전부 또는 일부(예컨대, 루프 중 외부에 노출된 아미노산 잔기 부위로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 아미노산 잔기) 또는 서열번호 11 중에서 루프 1의 외부에 노출된 아미노산 잔기를 하나 이상 포함하는 인접하는 2개 내지 20개, 2개 내지 15개, 2개 내지 10개, 또는 2개 내지 5개의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열 부위를 에피토프로서 인식하거나, 이 부위에 특이적으로 결합하는 것일 수 있다. 상기 '외부에 노출된 아미노산 잔기'는 생물 매질 (biological medium) 등의 용액 환경 (예컨대, 생체내 용액 환경; 예컨대, 생리적 pH, 온도, 등장성 등)에 노출되어 다른 단백질 또는 펩타이드와의 결합에 참여 가능한 잔기를 의미하는 것이다.
Ang2(서열번호 11)
MWQIVFFTLS CDLVLAAAYN NFRKSMDSIG KKQYQVQHGS CSYTFLLPEM
DNCRSSSSPY VSNAVQRDAP LEYDDSVQRL QVLENIMENN TQWLMKLENY
IQDNMKKEMV EIQQNAVQNQ TAVMIEIGTN LLNQTAEQTR KLTDVEAQVL
NQTTRLELQL LEHSLSTNKL EKQILDQTSE INKLQDKNSF LEKKVLAMED
KHIIQLQSIK EEKDQLQVLV SKQNSIIEEL EKKIVTATVN NSVLQKQQHD
LMETVNNLLT MMSTSNSAKD PTVAKEEQIS FRDCAEVFKS GHTTNGIYTL
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IHLKGLTGTA GKISSISQPG NDFSTKDGDN DKCICKCSQM LTGGWWFDAC
GPSNLNGMYY PQRQNTNKFN GIKWYYWKGS GYSLKATTMM IRPADF
예컨대, 상기 항 Ang2 항체는 서열번호 11의 루프 1에 위치하는 Q418, P419, Q418과 P419와의 조합, 또는 서열번호 11 중에서 Q418, P419, Q418과 P419와의 조합의 아미노산 잔기를 포함하는 인접하는 2개 내지 20개, 2개 내지 15개, 2개 내지 10개, 또는 2개 내지 5개의 아미노산을 포함하는 아미노산 서열 부위를 에피토프로 인식하거나 또는 이 부위에 특이적으로 결합하는 것일 수 있다. 일 예에서 상기 항 Ang2 항체는 서열번호 11의 Q418 및 P419의 아미노산 잔기를 에피토프로 인식하거나 또는 이 부분에 특이적으로 결합하는 것일 수 있다.
상기 항 Ang2 항체가 특이적으로 결합하는 부위인 Q418, P419, 또는 이를 포함하는 아미노산 부위(에피토프)는 Ang2의 3차원 구조의 루프 1에 위치하는 노출된 아미노산 잔기로서, Ang2와 Tie2 수용체 간의 결합에 관여하지 않는 부위이다.
상기 항 Ang2 항체가 특이적으로 결합하는 부위인 Q418, P419, 또는 이를 포함하는 아미노산 부위에 있어서, "인접하는 아미노산"은 단백질의 1차 구조뿐 아니라 2차 또는 3차 구조상에서 서로 인접하여 위치하는 아미노산을 의미하는 것일 수 있다. 따라서, 본 명세서에서 "인접하는 아미노산 잔기"는 단백질의 1차, 2차 또는 3차 구조 상에서 연속하는 아미노산 잔기를 의미하는 것일 수 있다.
따라서, 본 발명의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 앞서 설명한 부위를 에피토프로서 인식하거나 여기에 특이적으로 결합하는 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 주형으로 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있다.
구체예에서, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은,
서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상을 포함하는 중쇄(Heavy chain) 상보성 결정 부위(complementarity determining region, CDR), 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위:
서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상을 포함하는 경쇄(Light chain) 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위;
상기 하나 이상의 중쇄 상보성 결정부위 및 하나 이상의 경쇄 상보성 결정부위의 조합; 또는
상기 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위의 조합
을 포함하는 것일 수 있다:
보다 구체적으로, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은
서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)를 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위: 및
서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)를 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위
를 포함하는 것일 수 있다.
일 구체예에서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 중쇄 가변부위는 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 것일 수 있다:
DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSIT SDYAWN WIRQFPGNKLEWMG YINYSGNTDYNPSLKS RSSITRDTSKNQFFLQLNSVTTGDTATYYCAR GNFEGAMDY WGQGTLVTVSS(서열번호 7)
(상기 서열번호 7에서, 밑줄 표시된 굵은 글씨는 순서대로 CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 임)
일 구체예에 따른 항체의 경쇄는 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 것일 수 있다.
SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITC KASQSVSNDVA WYQQKPGQSPKLLIY YASNRYP GVPDRFTGSGYGTDFTFTISTVQAEDLAVYFC QQDYSSPWT FGGGTKLEIK(서열번호 9)
(상기 서열번호 9에서, 밑줄 표시된 굵은 글씨는 순서대로 CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 임)
따라서, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변부위, 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변부위, 또는 상기 중쇄 가변부위와 경쇄 가변부위의 조합을 포함하는 것일 수 있다.
예컨대, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변부위 및 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 것일 수 있다.
상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 하나 이상의 CDR, 예컨대, CDR-H2, CDR-L1 및 CFR-L3로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 CDR의 아미노산 서열에 일부 치환에 의하여, 항체 고유의 활성은 유지하면서, Ang2에 대한 친화도가 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편일 수 있다.
일 예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다음의 치환 중 하나 이상을 포함하는 것일 수 있다:
(1) CDR-H2의 아미노산 서열(YINYSGNTDYNPSLKS; 서열번호 2) 중 1번째 아미노산 잔기 Tyr (Y)가 Lys (K)으로 치환;
(2) CDR-H2의 아미노산 서열 중 3번째 아미노산 잔기 Asn (N)이 Ser (S)으로 치환;
(3) CDR-H2의 아미노산 서열 중 5번째 아미노산 잔기 Ser (S)이 Ala (A)로 치환;
(4) CDR-H2의 아미노산 서열 중 7번째 아미노산 잔기 Asn (N)이 Lys (K)으로 치환;
(5) CDR-L1의 아미노산 서열(KASQSVSNDVA; 서열번호 4) 중 11번째 (마지막) 아미노산 잔기 Ala (A)가 His (H)로 치환;
(6) CDR-L1의 아미노산 서열(KASQSVSNDVA; 서열번호 4) 중 5번째 아미노산 잔기 Ser (S)이 Phe (F)로 치환;
(7) CDR-L1의 아미노산 서열(KASQSVSNDVA; 서열번호 4) 중 8번째 아미노산 잔기 Asn (N)이 Thr (T)로 치환;
(8) CDR-L2의 아미노산 서열(YASNRYP; 서열번호 5) 중 4번째 아미노산 잔기 Asn (N)이 Ile (I)로 치환;
(9) CDR-L2의 아미노산 서열(YASNRYP; 서열번호 5) 중 5번째 아미노산 잔기 Arg (R)이 Pro (P)로 치환;(10) CDR-L3의 아미노산 서열(QQDYSSPWT; 서열번호 6) 중 2번째 서열 Gln (Q)이 His (H)로 치환; 및
(11) CDR-L3의 아미노산 서열 중 8번째 서열 Trp (W)이 Phe (F)로 치환.
일 예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은 다음의 일반식 1(서열번호 20)으로 표현되는 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2를 포함하는 것일 수 있다:
X1-I-X2-Y-X3-G-X4-T-D-Y-N-P-S-L-K-S (일반식 1: 서열번호 20)
상기 일반식 1 중, X1는 Tyr (Y) 또는 Lys (K)이고, X2는 Asn (N) 또는 Ser (S)이며, X3는 Ser (S) 또는 Ala (A)이고, X4는 Asn (N) 또는 Lys (K)이다.
일 구체예에서, 상기 서열번호 20의 아미노산 서열은 서열번호 14 또는 서열번호 15의 아미노산 서열일 수 있다.
다른 예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은 다음의 일반식 2(서열번호 21)로 표현되는 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1을 포함하는 것일 수 있다:
K-A-S-Q-X5-V-S-X6-D-V-X7 (일반식 2: 서열번호 21)
상기 일반식 2 중, X5는 Ser (S) 또는 Phe (F)이고, X6은 Asn (N) 또는 Thr (T)이며, X7은 Ala (A) 또는 His (H)이다.
일 구체예에서, 상기 서열번호 21의 아미노산 서열은 서열번호 16 또는 서열번호 17의 아미노산 서열일 수 있다.
다른 예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은 다음의 일반식 3(서열번호 22)으로 표현되는 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2을 포함하는 것일 수 있다:
Y-A-S-X8-X9-Y-P (일반식 3: 서열번호 22)
상기 일반식 3 중, X8은 Asn (N) 또는 Ile (I)이고, X9는 Arg (R) 또는 Pro (P)이다.
일 구체예에서, 상기 서열번호 22의 아미노산 서열은 서열번호 18의 아미노산 서열일 수 있다.
다른 예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은 다음의 일반식 4(서열번호 23)으로 표현되는 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 것일 수 있다:
Q-X10-D-Y-S-S-P-X11-T (일반식 4: 서열번호 23)
상기 일반식 3 중, X10은 Gln (Q) 또는 His (H)이고, X11은 Trp (W) 또는 Phe (F)이다.
일 구체예에서, 상기 서열번호 20의 아미노산 서열은 서열번호 19의 아미노산 서열일 수 있다.
따라서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은,
서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)를 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위:
서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)를 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위;
상기 중쇄 상보성 결정부위 및 상기 경쇄 상보성 결정부위의 조합; 또는
상기 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위의 조합
을 포함하는 것일 수 있다.
구체적으로, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은,
서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 2, 서열번호 14, 및 서열번호 15로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)를 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위:
서열번호 4, 서열번호 16, 또는 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 5 또는 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 6 또는 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)를 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위;
상기 중쇄 상보성 결정부위 및 상기 경쇄 상보성 결정부위의 조합; 또는
상기 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위의 조합
을 포함하는 것일 수 있다.
상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은,
서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 모두 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위: 및
서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 모두 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위
를 모두 포함하는 것이 아닐 수 있다.
즉, 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 모두 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위: 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 모두 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 모두 포함하는 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편은 본 발명의 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 이의 항원 결합 단편의 범위에서 제외될 수 있다.
구체적으로, 상기 설명한 주형 및 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 중쇄 상보성 결정 부위 및 경쇄 상보성 결정 부위를 아래의 표 1에 정리하였다.
중쇄 CDR 아미노산 서열
CDRH1-KABAT CDRH2-KABAT CDRH3-KABAT
주형 SDYAWN(서열번호1) YINYSGNTDYNPSLKS(서열번호 2) GNFEGAMDY(서열번호3)
친화도 개선 - KISYSGKTDYNPSLKS(서열번호 14) -
- KINYAGNTDYNPSLKS(서열번호 15) -
경쇄 CDR 아미노산 서열
CDRL1-KABAT CDRL2-KABAT CDRL3-KABAT
주형 KASQSVSNDVA
(서열번호4)
YASNRYP
(서열번호 5)
QQDYSSPWT
(서열번호 6)
친화도 개선 KASQSVSNDVH(서열번호 16) YASIPYP(서열번호 18) QHDYSSPFT(서열번호 19)
KASQFVSTDVH(서열번호 17)
일 구체예에서, 상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 다음으로 이루어진 군에서 선택된 것일 수 있다:
(a) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 4의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(b) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 16의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(c) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 15의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 4의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(d) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 15의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 16의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(e) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 2의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 16의 CDRL1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 19의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(f) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 17의 CDRL1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(g) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 4의 CDRL1, 서열번호 18의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편;
(h) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 16의 CDRL1, 서열번호 18의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편; 및
(i) 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 14의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3을 포함하는 중쇄 상보성 결정부위 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 17의 CDRL1, 서열번호 18의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3을 포함하는 경쇄 상보성 결정부위 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
상기 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 10nM 이하, 5 nM 이하, 2 nM 이하, 또는 1 nM 이하, 예컨대, 0.01 내지 10nM, 0.01 내지 5nM, 0.01 내지 2nM, 또는 0.01 내지 1nM의 Ang2에 대한 친화도 (KD)를 갖는 것일 수 있다. 이는 주형 항 Ang2 항체의 Ang2에 대한 친화도 (KD)가 약 8nM인 것과 비교하여 현저하게 증가된 것이라 할 수 있다.
또한, 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편이 제공된다. 상기 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 중쇄 가변부위(서열번호 7) 중 상보성 결정부위 이외의 골격 부위의 일부 아미노산 치환에 의하여 제작될 수 있다. 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 제작에 사용 가능한 중쇄 골격의 아미노산 서열을 아래의 표 2에 나타내었다:
(중쇄 인간화)
FR1 (CDR-H1의 N말단쪽 골격 부위) FR2 (CDR-H1과 CDR-H2 사이의 골격 부위) FR3 (CDR-H2와 CDR-H3 사이의 골격 부위) FR4 (CDR-H3의 C말단쪽 골격 부위)
주형(서열번호 7) DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSIT(서열번호 24) WIRQFPGNKLEWMG(서열번호 29) RSSITRDTSKNQFFLQLNSVTTGDTATYYCAR(서열번호 34) WGQGTLVTVSS(서열번호 39)
인간화 (VH-hu1) QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSIS(서열번호 25) WIRQPPGKGLEWIG(서열번호 30) RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR(서열번호 35) WGQGTLVTVSS(서열번호 40)
인간화 (VH-hu2) QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSIT(서열번호 26) WIRQPPGKGLEWMG(서열번호 31) RSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR(서열번호 36) WGQGTLVTVSS(서열번호 41)
인간화 (VH-hu5) QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSIT(서열번호 27) WIRQPPGKGLEWIG(서열번호 32) RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR(서열번호 37) WGQGTLVTVSS(서열번호 42)
인간화 (VH-hu3) EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSIT(서열번호 28) WVRQAPGKGLEWMG(서열번호 33) RSTISRDTSKNTFYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(서열번호 38) WGQGTLVTVSS(서열번호 43)
또한, 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 경쇄 가변부위(서열번호 9) 중 상보성 결정부위 이외의 골격 부위의 일부 아미노산 치환에 의하여 제작될 수 있다. 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 제작에 사용 가능한 경쇄 골격의 아미노산 서열을 아래의 표 3에 나타내었다:
(경쇄 인간화)
FR1 (CDR-L1의 N말단쪽 골격 부위) FR2 (CDR-L1과 CDR-L2 사이의 골격 부위) FR3 (CDR-L2와 CDR-L3 사이의 골격 부위) FR4 (CDR-L3의 C말단쪽 골격 부위)
주형(서열번호 9) SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITC(서열번호 44) WYQQKPGQSPKLLIY(서열번호 46) GVPDRFTGSGYGTDFTFTISTVQAEDLAVYFC(서열번호 48) FGGGTKLEIK(서열번호 50)
인간화 (VL-hu1) DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(서열번호 45) WYQQKPGKAPKLLIY(서열번호 47) GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(서열번호 49) FGQGTKVEIK(서열번호 51)
따라서, 일 예는 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 제공하며,
상기 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 중쇄 가변 부위는 CDR-H1의 N말단쪽 골격 부위로서 서열번호 24 내지 서열번호 28, 예컨대 서열번호 25 내지 서열번호 28로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, CDR-H1과 CDR-H2 사이의 골격 부위로서 서열번호 29 내지 서열번호 33, 예컨대, 서열번호 30 내지 서열번호 33으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, CDR-H2와 CDR-H3 사이의 골격 부위로서 서열번호 34 내지 서열번호 38, 예컨대, 서열번호 35 내지 서열번호 38로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, 및 CDR-H3의 C말단쪽 골격 부위로서 서열번호 39 내지 서열번호 43, 예컨대, 서열번호 40 내지 서열번호 43으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함할 수 있으며;
경쇄 가변 부위는 CDR-L1의 N말단쪽 골격 부위로서 서열번호 44 또는 서열번호 45, 예컨대, 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, CDR-L1과 CDR-L2 사이의 골격 부위로서 서열번호 46 또는 서열번호 47, 예컨대, 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, CDR-L2와 CDR-L3 사이의 골격 부위로서 서열번호 48 또는 서열번호 49, 예컨대, 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드, 및 CDR-L3의 C말단쪽 골격 부위로서 서열번호 50 또는 서열번호 51, 예컨대, 서열번호 51의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함할 수 있다.
이 때, 상기 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 있어서, 중쇄 가변 부위가 CDR-H1의 N말단쪽 골격 부위로서 서열번호 24의 아미노산 서열을, CDR-H1과 CDR-H2 사이의 골격 부위로서 서열번호 29의 아미노산 서열을, CDR-H2와 CDR-H3 사이의 골격 부위로서 서열번호 34의 아미노산 서열을, 및 CDR-H3의 C말단쪽 골격 부위로서 서열번호 39의 아미노산 서열을 모두 포함하는 경우; 및 경쇄 가변 부위가 CDR-L1의 N말단쪽 골격 부위로서 서열번호 44의 아미노산 서열을, CDR-L1과 CDR-L2 사이의 골격 부위로서 서열번호 46의 아미노산 서열을, CDR-L2와 CDR-L3 사이의 골격 부위로서 서열번호 48의 아미노산 서열을, 및 CDR-L3의 C말단쪽 골격 부위로서 서열번호 50의 아미노산 서열을 모두 포함하는 경우는 제외될 수 있다.
구체예에서, 상기 인간화된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 서열번호 52 내지 서열번호 56으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변부위 및 서열번호 57 내지 서열번호 63으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는 것일 수 있다.
본 발명에서 항체는 동물 유래 항체, 키메릭 항체, 인간화 항체 및 인간 항체를 모두 포함한다. 원하는 항원을 피면역 동물에게 면역시켜 생산하는 동물 유래 항체는 일반적으로 치료 목적으로 인간에 투여 시 면역거부반응이 일어날 수 있으며, 이러한 면역거부반응을 억제하고자 키메릭 항체(chimeric antibody)가 개발되었다. 키메릭 항체는 유전공학적 방법을 이용하여 항-아이소타입(anti-isotype) 반응의 원인이 되는 동물 유래 항체의 불변 영역을 인간 항체의 불변 영역으로 치환한 것이다. 키메릭 항체는 동물 유래 항체에 비하여 항-아이소타입 반응에 있어서 상당 부분 개선되었으나, 여전히 동물 유래 아미노산들이 가변 영역에 존재하고 있어 잠재적인 항-이디오타입(anti-idiotypic) 반응에 대한 부작용을 내포하고 있다. 이러한 부작용을 개선하고자 개발된 것이 인간화 항체(humanized antibody)이다. 이는 키메릭 항체의 가변 영역 중 항원의 결합에 중요한 역할을 하는 CDR(complementaritiy determining regions) 부위를 인간 항체 골격(framework)에 이식하여 제작된다.
인간화 항체를 제작하기 위한 CDR 이식(grafting) 기술에 있어서 가장 중요한 것은 동물 유래 항체의 CDR 부위를 가장 잘 받아들일 수 있는 최적화된 인간 항체를 선정하는 것이며, 이를 위하여 항체 데이터베이스의 활용, 결정구조(crystal structure)의 분석, 분자모델링 기술 등이 활용된다. 그러나, 최적화된 인간 항체 골격에 동물 유래 항체의 CDR 부위를 이식할지라도 동물 유래 항체의 골격에 위치하면서 항원 결합에 영향을 미치는 아미노산이 존재하는 경우가 있기 때문에, 항원 결합력이 보존되지 못하는 경우가 상당수 존재하므로, 항원 결합력을 복원하기 위한 추가적인 항체 공학 기술의 적용은 필수적이라고 할 수 있다.
일 구체예에 따르면, 상기 항체는 마우스 유래 항체, 마우스-인간 키메릭 항체, 인간화 항체, 또는 인간 항체일 수 있다.
본 발명에서 "항체"라 함은, 면역계 내에서 항원의 자극에 의하여 만들어지는 물질을 의미하는 것으로서 그 종류는 특별히 제한되지 않는다. 항체는 최근에 질병 치료제의 용도로 많이 사용되고 있다. 항체는 생체 외뿐 아니라 생체 내에서도 매우 안정하고 반감기가 길기 때문에 대량 발현 및 생산에 유리하다. 또한, 항체는 본질적으로 다이머(dimer) 구조를 가지므로 접착능(avidity)이 매우 높다. 
완전한 항체는 2개의 전장(full length) 경쇄 및 2개의 전장 중쇄를 가지는 구조이며 각각의 경쇄는 중쇄와 이황화 결합으로 연결되어 있다. 항체의 불변 영역은 중쇄 불변 영역과 경쇄 불변 영역으로 나뉘어지며, 중쇄 불변 영역은 감마(γ), 뮤(μ), 알파(α), 델타(δ) 및 엡실론(ε) 타입을 가지고, 서브클래스로 감마1(γ1), 감마2(γ2), 감마3(γ3), 감마4(γ4), 알파1(α1) 및 알파2(α2)를 가진다. 경쇄의 불변 영역은 카파(κ) 및 람다(λ) 타입을 가진다.
용어, "중쇄(heavy chain)"는 항원에 특이성을 부여하기 위해 충분한 가변 영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변 영역 도메인 VH 및 3개의 불변 영역 도메인 CH1, CH2 및 CH3과 힌지(hinge)를 포함하는 전장 중쇄 및 이의 단편을 모두 포함하는 의미로 해석된다. 또한, 용어 "경쇄(light chain)"는 항원에 특이성을 부여하기 위한 충분한 가변영역 서열을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 가변 영역 도메인 VL 및 불변 영역 도메인 CL을 포함하는 전장 경쇄 및 이의 단편을 모두 포함하는 의미로 해석된다.
용어, "CDR(complementarity determining region)"은 면역글로불린의 중쇄 및 경쇄의 고가변 영역(hypervariable region)의 아미노산 서열을 의미한다. 중쇄 및 경쇄는 각각 3개의 CDR을 포함할 수 있다(CDRH1, CDRH2, CDRH3 및 CDRL1, CDRL2, CDRL3). 상기 CDR은 항체가 항원 또는 에피토프에 결합하는 데 있어서 주요한 접촉 잔기를 제공할 수 있다. 한편, 본 명세서에 있어서, 용어, "특이적으로 결합" 또는 "특이적으로 인식"은 당업자에게 통상적으로 공지되어 있는 의미와 동일한 것으로서, 항원 및 항체가 특이적으로 상호작용하여 면역학적 반응을 하는 것을 의미한다.
본 발명에서 제공되는 항체의 항원 결합 단편은 상기 상보성 결정부위를 하나 이상 포함하는 단편일 수 있다.
용어, "항원 결합 단편"은 면역글로불린 전체 구조에 대한 그의 단편으로, 항원이 결합할 수 있는 부분을 포함하는 폴리펩타이드의 일부를 의미한다. 예를 들어, scFv, (scFv)2, scFv-Fc, Fab, Fab' 또는 F(ab')2일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
상기 항원 결합 단편 중 Fab는 경쇄 및 중쇄의 가변영역과 경쇄의 불변 영역 및 중쇄의 첫 번째 불변 영역(CH1)을 가지는 구조로 1개의 항원 결합 부위를 가진다. Fab'는 중쇄 CH1 도메인의 C-말단에 하나 이상의 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역(hinge region)을 가진다는 점에서 Fab와 차이가 있다. F(ab')2 항체는 Fab'의 힌지 영역의 시스테인 잔기가 디설파이드 결합을 이루면서 생성된다. Fv는 중쇄 가변부위및 경쇄 가변부위만을 가지고 있는 최소의 항체조각으로 Fv 단편을 생성하는 재조합 기술은 당업계에 널리 공지되어 있다. 이중쇄 Fv(two-chain Fv)는 비공유 결합으로 중쇄 가변부위와 경쇄 가변부위가 연결되어 있고 단쇄 Fv(single-chain Fv)는 일반적으로 펩타이드 링커를 통하여 중쇄의 가변 영역과 단쇄의 가변 영역이 공유 결합으로 연결되거나 또는 C-말단에서 바로 연결되어 있어서 이중쇄 Fv와 같이 다이머와 같은 구조를 이룰 수 있다. 상기 링커는 1 내지 100개 또는 2 내지 50개의 임의의 아미노산으로 이루어진 펩타이드 링커일 수 있으며, 당업계에 적절한 서열이 알려져 있다. 상기 항원 결합 단편은 단백질 가수분해 효소를 이용해서 얻을 수 있고(예를 들어, 전체 항체를 파파인으로 제한 절단하면 Fab를 얻을 수 있고 펩신으로 절단하면 F(ab')2 단편을 얻을 수 있다), 유전자 재조합 기술을 통하여 제작할 수 있다.
용어 "힌지 영역(hunge region)"은 항체의 중쇄에 포함되어 있는 영역으로서, CH1 및 CH2 영역 사이에 존재하며, 항체 내 항원 결합 부위의 유연성(flexibility)를 제공하는 기능을 하는 영역을 의미한다. 예컨대, 상기 힌지는 인간 항체로부터 유래한 것일 수 있으며, 구체적으로, IgA, IgE, 또는 IgG, 예컨대, IgG1, IgG2, IgG 3, 또는 IgG4로부터 유래한 것일 수 있다.
동물 유래 항체가 키메릭화(chimerization) 과정을 거치게 되면, 동물 유래의 IgG1 힌지는 인간 IgG1 힌지로 치환되지만, 동물 유래 IgG1 힌지는 인간 IgG1 힌지에 비하여 그 길이가 짧고, 두 개의 중쇄 사이의 이황화결합(disulfide bond)이 3개에서 2개로 감소하여 힌지의 경직성(rigidity)이 서로 상이한 효과를 보이게 된다. 따라서, 힌지 영역의 변형(modification)은 인간화 항체의 항원 결합 효율성을 증가시킬 수 있다. 상기 힌지 영역의 아미노산 서열을 변형시키기 위한 아미노산의 결실, 부가 또는 치환 방법은 당업자에게 잘 알려져 있다.
항 Ang2 항체의 가변 부위를 제외한 부분은 인간 항체로부터 유래한 불변부위일 수 있으며, 구체적으로, IgA, IgE, 또는 IgG, 예컨대, IgG1, IgG2, IgG 3, 또는 IgG4로부터 유래한 불변부위일 수 있다.
항 Ang2 항체는 단클론 항체일 수 있다. 단클론 항체는 당 업계에 널리 알려진 방법대로 제조될 수 있다. 예컨대, phage display 기법을 이용해서 제조될 수 있다. 또는, 항 Ang2 항체는 마우스 단클론항체를 이용하여 Schwaber 등의 논문에 기재된 방법에 의하여 마우스 유래의 단클론 항체로 제조될 수 있다(Schwaber, J and Cohen, E. P., "Human x Mouse Somatic Cell Hybrid Clones Secreting Immunoglobulins of Both Parental Types," Nature, 244 (1973), 444-447).
한편, 전형적인 ELISA(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) 포맷을 이용하여 Ang2와의 결합능에 기초하여 개별 단클론항체들을 스크리닝할 수 있다. 결합체들에 대해 분자적 상호작용을 검정하기 위한 경쟁적 ELISA(Competitive ELISA)와 같은 기능성 분석 또는 세포-기반 분석(cell-based assay)과 같은 기능성 분석을 통해 저해 활성에 대해 검정할 수 있다. 그런 다음 강한 저해 활성에 기초하여 선택된 단클론항체 멤버들에 대해 Ang2에 대한 각각의 친화도(Kd values)를 검정한다.
최종 선택된 항체들은 항원결합부를 제외한 나머지 부분이 인간의 면역글로블린 항체화된 항체뿐만 아니라, 인간화 항체로서 제조하여 사용할 수 있다. 인간화 항체의 제조방법은 당 업계에 잘 알려져 있다 (Almagro, J. C. and Fransson, J., "Humanization of antibodies," Frontiers in Bioscience, 13(2008), 1619-1633).
상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체는 수탁번호 (KCLRF-BP-00295)인 하이브리도마 세포주로부터 생산된 항 Ang2 항체를 주형으로 하는 것일 수 있다.
상기 제공되는 서열번호 18, 예컨대, 서열번호 14 또는 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 CDR-H2로서 유용하게 사용될 수 있다. 또한, 서열번호 19, 예컨대, 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 CDR-L1로서 유용하게 사용될 수 있다. 또한, 서열번호 20, 예컨대, 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 CDR-L3로서 유용하게 사용될 수 있다.
따라서, 일 예는, 서열번호 20 (예컨대, 서열번호 14 또는 서열번호 15), 서열번호 21 (예컨대, 서열번호 16 또는 서열번호 17), 서열번호 22 (예컨대, 서열번호 18), 및 서열번호 23 (예컨대, 서열번호 19)으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 제공한다. 앞서 설명한 바와 같이, 상기 폴리펩타이드는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 상보성 결정부위로서 유용하다.
다른 예는 상기 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 서열을 제공한다. 또 다른 예는 상기 폴리뉴클레오타이드 서열을 포함하는 재조합 벡터를 제공한다. 또 다른 예는 상기 재조합 벡터를 포함하는 재조합 세포를 제공한다.
앞서 설명한 바와 같이, 본 발명에서 제안되는 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2와 결합하면서도 Ang2가 Tie2 수용체와 결합하는 것을 저해하지 않고, Ang2와 Tie2 수용체와의 결합을 유도하는 것을 특징으로 한다. 또한, 이와 같이 결합된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 Ang2의 복합체(conjugate)는, Ang1과 같이 작용하여, Tie2 수용체에 결합하고(상기 복합체 중 Ang2 부분이 결합함; 도 7 참조), Tie2 수용체를 활성화시키는 기능을 갖는 것을 특징으로 한다.
따라서, 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 Ang2이 결합된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체를 제공한다. 또 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체를 유효성분으로 포함하는 Tie2 수용체 활성화용 조성물을 제공한다. 또 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체를 Tie2 수용체의 활성화를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, Tie2 수용체 활성화 방법을 제공한다. 상기 Tie2 수용체 활성화 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 Tie2 수용체의 활성화를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 상기 환자는 환자는 인간, 원숭이 등을 포함하는 영장류, 마우스, 래트 등을 포함하는 설치류 등을 포함하는 포유류, 또는 이로부터 분리되거나 인공적으로 배양된 세포, 조직, 체액 등 일 수 있다. 또 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체-Ang2 복합체의 Tie2 수용체 활성화를 위한 용도가 제공된다.
상기한 바와 같이, 본 발명에서 제안되는 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2의 기능을 저해함으로써 비정상적 혈관신생을 저해하는 기능을 가지므로, 비정상적 혈관신생과 관련된 다양한 질병(예컨대, 암)의 예방, 경감, 개선 및/또는 치료에 사용 가능하다 (실시예 13 참조). 또한, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2와 Tie2 간의 결합은 저해하지 않음으로써, Tie2를 활성화시켜, Tie2 신호전달을 활성화시키고, 혈관 내피 또는 림프관 내피의 생성을 촉진하고 이동성을 증가시켜, 혈관 투과성 증가를 억제함으로써, 혈관 투과성과 관련된 다양한 질병(예컨대, 패혈증, 안구질환, 등)의 예방, 경감, 개선 및/또는 치료에 또한 적용 가능하다. 또한, 상기한 바와 같이, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 혈관 내피 또는 림프관 내피의 생성을 촉진하여 건강한 혈관의 형성을 증가 및 혈관을 정상화시키므로, 상처 치유 또는 허혈성 질환 등과 같이 건강한 혈관의 형성을 필요로 하는 다양한 질병 또는 증상의 예방, 경감, 개선 및/또는 치료에도 적용 가능하고, 비정상적으로 형성된 암 혈관을 구조 및 기능적으로 정상적인 상태로 변화시켜 암의 성장 및 전이 가능성을 감소시킨다. 또한, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 염증 반응을 억제하는 효과를 가짐으로써, 다양한 염증 질환의 예방, 경감, 개선 및/또는 치료에도 적용 가능하다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 신생혈관 형성 저해를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 신생혈관 형성 저해를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 신생혈관 형성 저해 방법을 제공한다. 상기 신생혈관 형성 저해 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 신생혈관 형성 저해를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 혈관 투과성 감소를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 혈관 투과성 감소를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 혈관 투과성 감소 방법을 제공한다. 상기 혈관 투과성 감소 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 혈관 투과성 감소를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 Ang2 과발현, 신생혈관 형성, 및/또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 Ang2 과발현, 신생혈관 형성 및/또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 Ang2 과발현, 신생혈관 형성 및/또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료 방법을 제공한다. 상기 예방 및/또는 치료 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 Ang2 과발현, 신생혈관 형성 및/또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 정상 혈관 생성 유도를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 정상 혈관 생성 유도를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 정상 혈관 생성 증가 방법을 제공한다. 상기 혈관 투과성 감소 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 정상 혈관 생성 유도를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료 방법을 제공한다. 상기 예방 및/또는 치료 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 예방 및/또는 치료를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 조직 재생 및/또는 상처 치유(wound healing)용 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 조직 재생 및/또는 상처 치유를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 조직 재생 및/또는 상처 치유 방법을 제공한다. 상기 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 조직 재생 및/또는 상처 치유를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 상기 유효성분의 투여 대상 환자는 예컨대 피부 조직 또는 장기 조직의 손상이 있거나, 피부 이식을 받은 환자일 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화를 위한 약학 조성물을 제공한다. 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화 방법을 제공한다. 상기 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화 방법은 상기 투여하는 단계 이전에 Ang2 저해 및/또는 Tie2 수용체 활성화를 필요로 하는 환자를 확인하는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 항원인 Ang2와 결합된 상태일 수 있다.
상기 약학 조성물의 유효성분인 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2와의 결합에 의하여 기능이 활성화되므로, 상기 항체 또는 항원 결합 단편의 기능을 보다 증진시키기 위하여, 상기 약학 조성물은 Ang2을 추가로 포함하는 것일 수 있다. 또한 상기 방법은 Ang2의 약학적 유효량을 환자에게 투여하는 단계를 추가로 포함할 수 있다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는, 신생혈관 형성 및/또는 혈관 투과성 증가 및/또는 정상 혈관 형성 감소와 관련된 질병의 진단용 조성물을 제공한다.
상기 약학 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함할 수 있으며, 상기 담체는 약물의 제제화에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘, 미네랄 오일 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 약학 조성물은 또한 약학 조성물 제조에 통상적으로 사용되는 희석제, 부형제, 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 추가로 포함할 수 있다.
상기 약학 조성물, 또는 상기 항체 또는 이의 항원결합단편의 약학적 유효량은 경구 또는 비경구로 투여할 수 있다. 비경구 투여인 경우에는 정맥내 주입, 피하 주입, 근육 주입, 복강 주입, 내피 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여 및 직장내 투여 등으로 투여할 수 있다. 경구 투여시, 단백질 또는 펩타이드는 소화가 되기 때문에 경구용 조성물은 활성 약제를 코팅하거나 위에서의 분해로부터 보호되도록 제형화될 수 있다. 또한, 상기 조성물은 활성 물질이 표적 세포로 이동할 수 있는 임의의 장치에 의해 투여될 수 있다.
상기 약학 조성물 내의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 함유량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 간격, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 예컨대, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 1일 투여량은 0.001 내지 1000㎎/kg, 구체적으로 0.01 내지 100㎎/kg, 보다 구체적으로 0.1 내지 50 ㎎/kg범위일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 1일 투여량은 단위 용량 형태로 하나의 제제로 제제화되거나, 적절하게 분량하여 제제화되거나, 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수 있다. 상기 "약학적 유효량"은 소망하는 약리적 효과를 나타낼 수 있는 유효 성분의 함량 또는 투여량을 의미하는 것일 수 있으며, 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 간격, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 정해질 수 있다.
상기 약학적 조성물은 오일 또는 수성 매질중의 용액, 현탁액, 시럽제 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 산제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 등의 형태로 제형화될 수 있으며, 제형화를 위하여 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수 있다.
특히, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 그 항원 결합 단편을 포함하는 약학 조성물은 항체 또는 항원 결합 단편을 포함하므로, 면역 리포좀으로 제형화될 수 있다. 항체를 포함하는 리포좀은 당업계에 널리 알려진 방법에 따라 제조될 수 있다. 상기 면역 리포좀은 포스파티딜콜린, 콜레스테롤 및 폴리에틸렌글리콜-유도체화된 포스파티딜에탄올아민을 포함하는 지질 조성물로서 역상 증발법에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 항체의 Fab' 단편은 디설파이드-교체 반응을 통해 리포좀에 접합될 수 있다.
한편, 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 Ang2에 특이적으로 결합하므로, 이를 이용하여 Ang2를 검출할 수 있으며, 이를 통하여 Ang2의 과발현 여부를 확인할 수 있다. 따라서, 본 발명의 또 다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 Ang2 검출용 조성물 및 Ang2 과발현과 관련된 질병의 진단용 조성물을 제공한다.
또 다른 예에서, 환자로부터 얻어진(또는 분리된) 생물 시료에 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 처리하는 단계; 및 항원-항체 반응 여부를 확인하는 단계를 포함하는 Ang2 검출 방법이 제공된다. 또한, 환자로부터 얻어진 생물 시료에 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 처리하는 단계; 및 항원-항체 반응 여부를 확인하는 단계를 포함하는 Ang2 과발현과 관련된 질병의 진단에 정보를 제공하는 방법이 제공된다. 상기 진단에 정보를 제공하는 방법은 상기 항원-항체 반응 여부를 확인하는 단계에서 항원-항체 반응이 탐지되는 경우 상기 환자를 Ang2 과발현 증상이 존재하거나, Ang2 과발현 관련 질병을 갖는 것으로 판단하는 것일 수 있다. 상기 생물 시료는 환자로부터 얻어진 (또는 분리된) 세포, 조직, 체액 등으로 이루어진 군에서 선택된 것일 수 있다.
상기 항원-항체 반응 여부를 확인하는 단계는 당업계에 공지된 다양한 방법을 통하여 수행할 수 있다. 예컨대, 통상적인 효소 반응, 형광, 발광 및/또는 방사선 검출을 통하여 하여 측정될 수 있으며, 구체적으로, 면역크로마토그래피(Immunochromatography), 면역조직화학염색(Immunohistochemistry), 효소결합 면역흡착 분석(enzyme linked immunosorbent assay: ELISA), 방사선 면역측정법(radioimmunoassay: RIA), 효소 면역분석(enzyme immunoassay: EIA), 형광면역분석(Floresence immunoassay: FIA), 발광면역분석(luminescence immunoassay: LIA), 웨스턴블라팅(Western blotting) 등으로 이루어진 군으로부터 선택된 방법에 의하여 측정될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 약학 조성물 또는 항체 또는 항원결합단편의 투여 또는 진단 대상 환자는 인간, 원숭이 등을 포함하는 영장류, 마우스, 래트 등을 포함하는 설치류 등을 포함하는 포유류, 또는 이로부터 분리되거나 인공적으로 배양된 세포, 조직, 체액 등 일 수 있다.
상기 신생혈관 형성 및/또는 혈관 투과성 증가 및/또는 Ang2 과발현과 관련된 질병은 암; 암전이; 미숙아 망막병증, 황반변성 (예컨대, 연령 관련 황반변성), 당뇨병성 망막병증, 혈관신생성 녹내장 등의 안구혈관질환; 건선, 천식, 류마티스성 관절염, 폐렴, 만성 염증 등의 염증 질환; 감염성질환(감염); 고혈압, 동맥경화 등의 심혈관질환; 신장질환; 패혈증; 천식; 부종; 유전성 출혈성 모세혈관 확장증 (Hereditary hemorrhagic telangiectasia; HHT) 등일 수 있다. 상기 암은 Ang2를 과발현하는 것으로, 고형암 또는 혈액암일 수 있으며, 이에 제한되지 않지만, 편평상피세포암, 소세포폐암, 비소세포폐암, 폐의 선암, 폐의 편평상피암, 복막암, 피부암, 피부 또는 안구내 흑색종, 직장암, 항문부근암, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 만성 또는 급성 백혈병, 림프구 림프종, 간세포암, 위장암, 췌장암, 교아종, 경부암, 난소암, 간암, 방광암, 간종양, 유방암, 결장암, 대장암, 자궁내막 또는 자궁암, 침샘암, 신장암, 전립선암, 음문암, 갑상선암, 두경부암, 뇌암, 골육종 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있다.
상기 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병은 정상 혈관 생성의 유도를 필요로 하는 질병으로서, 심근경색, 협심증, 뇌경색, 뇌졸중(뇌허혈) 등의 허혈성 질환, 버거씨병(폐색성 혈전 혈관염), 무혈관 괴사 (avascular necrosis), 족부궤양 (예컨대, 당뇨병성 족부궤양 등), 발기부전 (erectile dysfunction), 등으로 이루어진 군에서 선택된 것일 수 있다.
또한, 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 혈관을 정상화시킴으로써 치료 약물의 병변 조직(예컨대 Ang2 발현 암조직)으로의 전달을 용이하게 하고 약물에 대한 민감성(sensitiveness)를 증가시켜, 약물의 치료 효능을 증대시키고, 적은 용량의 약물로도 소망하는 효과를 달성할 수 있도록 할 수 있다. 따라서, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 기존의 치료 약물, 예컨대 항암제와 병용투여하여 상기 항암제의 효능을 증대시키기 위한 보조제로 사용될 수 있다.
상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 항암제 효능 증진을 위한 약학 조성물 (항암 보조제)를 제공한다. 다른 예는 항암제 및 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 상기 항암제의 투여를 필요로 하는 환자에게 병용 투여하는 단계를 포함하는, 항암제의 효능 증진 방법을 제공한다. 상기 항암제 효능 증진은 혈관 정상화에 의하여 항암제의 암조직 내부로 전달 효율을 높이고 항암제에 대한 감수성을 높여서, 투여 용량 대비 우수한 항암 효과를 발휘할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 상기 항암 보조제는 항암제의 효능 증진을 위하여 보충적으로 사용되는 약학 조성물을 의미한다.
또 다른 예는 항암제 및 다른 예는 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 암의 예방 및/또는 치료를 위한 병용 투여용 약학 조성물을 제공한다. 일 구체예에서, 상기 병용 투여용 약학 조성물은 항암제의 약학적 유효량 및 상기 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량이 혼합된 혼합제를 포함하는 두 약물의 동시 투여를 위한 형태일 수 있다. 다른 구체예에서, 상기 병용 투여용 약학 조성물은 항암제의 약학적 유효량 및 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량이 각각 제제화되어 동시적 또는 순차적으로 투여되기 위한 형태일 수 있다. 이 경우, 상기 병용 투여용 약학 조성물은 유효 성분으로 항암제의 약학적 유효량을 포함하는 제1 약학 조성물 및 유효성분으로 상기 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 약학적 유효량을 포함하는 제2 약학 조성물을 포함하는 동시적 또는 순차적 투여를 위한 병용 투여용 약학 조성물일 수 있다. 순차적 투여의 경우 그 순서는 서로 바뀌어도 무방하다.
상기 항암제는 암세포 또는 암조직의 성장 저해, 사멸, 전이 억제 등의 효과를 얻기 위하여 사용되는 모든 화학 약물, 항체, 유전자 (예컨대, 안티센스 올리고뉴클레오타이드, siRNA, shRNA, microRNA, 등), 앱타머, 세포치료제, 방사선 치료제 등일 수 있으며, 예컨대, 시스플라틴(Cisplatin), 카보플라틴(Carboplatin), 옥살리플라틴(Oxalliplatin), 파클리탁셀(Paclitaxel), 도세탁셀(Doxetaxel), 빈크리스틴(Vincristine), 독소루비신(Doxorubicin), 다우노루비신(Daunorubicin), 블레오마이신(Bleomycin), 프레드니손(Prednisone), 메토트렉세이트(MTX), 5-플루오로우라실(5-FU), 6-메르캅토퓨린(6-MP), 6-티오구아닌(6-TG) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
다른 예는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편, Ang2, 및 Tie2 수용체가 결합된 복합체를 제공한다. 상기 복합체는 생체 내에 존재하거나, 생체로부터 분리된 세포에 존재하는 것일 수 있다. 또한 상기 복합체 내의 항체는 인접하는 복합체 내의 항체와 이합체를 형성하여, 두 개 또는 그 이상의 복합체를 클러스터링시켜, 두 개 또는 그 이상의 복합체를 포함하는 클러스터를 형성할 수 있다. 이와 같은 작용은 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 Tie2 수용체 활성화 기능과 관련 있다. 상기 복합체는 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 작용, 즉, Ang2의 저해 및/또는 Tie2 수용체의 활성화 여부를 모니터링 하거나, 그 자체로 Ang2의 저해 및/또는 Tie2 수용체의 활성화 용도로 사용될 수 있다.
기존에는 Ang2와 그 수용체인 Tie2와의 결합을 저해함으로써 Ang2에 의한 신생혈관형성을 저해하려는 시도가 있어왔으나, Ang2에 특이적으로 결합하여 Ang2의 세포내 이동 및 분해를 유도하면서 Ang2와 Tie2 수용체와의 결합능은 유지시켜 항체-Ang2-Tie2 수용체 복합체를 형성하면서 Tie2 수용체를 활성화시키는 작용을 하는 항체는 현재까지 알려져 있지 않다. 이러한 상황에서, 본 발명은 Ang2를 저해하면서 동시에 Tie2 수용체를 활성화시켜 하류 신호 전달을 촉진하는 항체의 인간화 및/또는 친화도 개선 기술을 제안함으로써, Ang2에 의한 신생혈관형성을 저해하고 혈관 투과성을 감소시킬 수 있는 보다 효과적인 방법을 제시한다. 본 발명에서 제안되는 인간화 및/또는 친화도 개선된 항체는 암 이외의 비정상적 혈관 형성관련 질환 및/또는 혈관 투과성이 증가되어 유발되는 질환의 진단 및 치료에의 응용 가능성이 기대된다. 상기 인간화 및/또는 친화도 개선된 항체는 화학 의약품 및 기타 다른 항암 치료제와 병용 치료 요법 등에 활용 가능하며, Ang2 특이적인 인지작용을 이용하여 antibody fragment, bi- 또는 multi-specific antibody, protein scaffold 등에 사용 가능할 것으로 기대된다.
도 1은 Ang2-Tie2 competition ELISA에 의하여 측정한 일 실시예에 따른 마우스 항 Ang2 항체 10D6의 처리 농도에 따른 Tie2 수용체와 Ang2간의 결합 정도를 보여주는 그래프로서, 항 Ang2 항체 10D6가 Tie2 수용체와 Ang2간의 결합을 저해하지 않음을 보여준다.
도 2은 일 실시예에 따른 인간화 및 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 처리에 따른 Tie2 수용체의 downstream signaling에 관여하는 Akt의 인산화 정도를 보여주는 그래프이다.
도 3은 일 실시예에서 원하는 CDR만 각각 돌연변이된 10D6 항체의 scFv 라이브러리 유전자 확보를 위한 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 과정을 모식적으로 보여준다.
도 4는 일 실시예에서 원하는 CDR만 각각 돌연변이된 10D6 항체의 scFv 라이브러리 유전자 확보를 위한 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 과정을 모식적으로 보여준다.
도 5는 일 실시예에 따른 인간화 및 친화도 개선된 항 Ang2 항체의 처리에 따른 Tie2 수용체의 downstream signaling에 관여하는 Akt의 인산화 정도를 보여주는 그래프이다.
도 6은 항 Ang2 항체의 Ang2 및 Tie2와의 결합에 의한 복합체 형성을 보여주는 ELISA 그래프이다.
도 7은 Ang2와 Tie2가 결합한 복합체의 3차 구조를 보여주는 것으로, Ang2의 루프 1-4를 보여준다.
이하에서는 실시예를 들어 본 발명을 더욱 구체적으로 설명하고자 하나, 이는 예시적인 것에 불과할 뿐 본 발명의 범위를 제한하고자 함이 아니다. 아래 기재된 실시예들은 발명의 본질적인 요지를 벗어나지 않는 범위에서 변형될 수 있음은 당 업자들에게 있어 자명하다.
실시예 1. Ang2 에 대한 마우스 항체 10 D6 의 제조
1.1. 마우스의 면역화
 항 Ang2 항체는 5주령의 BALB/c 마우스에 인간 Ang2 단백질 (R&D systems; 623-AN-025/CF)를 adjuvant와 함께 투여하여 면역반응을 유도한 후 Schwaber 등의 논문에 기재된 공지된 방법에 의해 개별 항체를 생산하는 하이브리도마들을 제조하였다(Schwaber, J and Cohen, E. P., "Human x Mouse Somatic Cell Hybrid Clones Secreting Immunoglobulins of Both Parental Types," Nature, 244 (1973), 444-447).
보다 구체적으로, 하이브리도마 세포주의 개발에 필요한 면역화 된 마우스를 얻기 위하여, 5마리의 5주령의 BALB/c 마우스(Japan SLC, Inc.)에 한 마리당 100 ug 의 인간의 Ang2 단백질(R&D Systems)과 동량의 완전 프로인드 어주번트(Freund's adjuvant)를 혼합하여 4-6 주된 BALB/c 마우스(Japan SLC, Inc.)의 복강 내에 주사하였다. 2주 후에 상기와 동일한 방법으로 항원(먼저 주사한 양의 절반)을 불완전 프로인드 어주번트(incomplete Freund's adjuvant)와 혼합하여 마우스의 복강 내에 주사하였다. 일주일 후 마지막 부스팅(boosting)이 수행되고 3일 후에 상기 마우스의 꼬리에서 채혈하여 혈청을 얻은 뒤 1/1000로 PBS에 희석하여 ELISA로 Ang2을 인지하는 항체의 역가가 증가됨을 확인하였다. 상기의 결과로 항체의 양이 충분하게 얻어지는 마우스를 선별하여 세포융합과정을 수행하였다.
세포융합 실험 3일 전에 50 ug의 PBS에 인간 Ang2 단백질 (R&D systems) 100ug(microgram)을 혼합한 혼합물을 BALB/c 마우스(Japan SLC, Inc.)의 복강 내에 주사하고, 면역화 된 마우스를 마취한 후 몸통의 좌측에 위치한 비장(spleen)을 적출하였다. 적출한 비장을 메쉬로 갈아서 세포를 분리하고, 배양배지(DMEM, Hyclon)와 혼합하여 비장세포 현탁액을 만들었다. 상기 현탁액을 원심분리하여 세포층을 회수하였다. 상기 얻어진 비장세포 1x108 개와 골수종세포(Sp2/0) 1x107 개를 혼합한 다음 원심분리하여 세포를 침전시켰다. 원심분리된 침전물을 천천히 분산시키고, 배양배지(DMEM)에 들어있는 45% 폴리에틸렌 글리콜(PEG 1500) 1 ㎖을 처리하고, 37 ℃에서 1분 동안 유지시킨 후, 배양배지(DMEM) 1 ㎖을 첨가하였다. 이후 배양배지(DMEM) 10 ㎖을 1분 동안 첨가하고, 37℃의 물에서 5분 동안 방치한 후 50 ㎖로 맞추어 다시 원심분리하였다. 세포 침전물을 분리배지(HAT 배지)에 1~2×105/㎖ 정도로 재현탁시키고, 96-웰(well) 플레이트에 0.1 ㎖씩 분주한 후 37℃ 이산화탄소 배양기에서 배양하여 하이브리도마 세포군을 제작하였다.
1.2. 단클론 항체의 생산 및 정제
상기 얻어진 항체 생산 하이브리도마들로부터 전형적인 ELISA 포맷을 이용하여 Ang2와의 결합능에 기초하여 모 하이브리도마로부터 분화시킨 하이브리도마 중 95개의 항 Ang2 모노클로날 항체를 생산하는 하이브리도마를 선별하였다.
보다 구체적으로, 상기 실시예 1.1에서 제조된 하이브리도마 세포군 중에서 Ang2 단백질에만 특이적으로 반응하는 하이브리도마 세포를 선별하기 위하여 인간의 Ang2 단백질을 항원으로 이용한 ELISA 분석 방법을 통하여 스크리닝하였다.
마이크로타이터 플레이트에 인간의 Ang2 단백질을 한 웰당 각각 100 ng씩 가하여 플레이트 표면에 부착시키고, 반응하지 않은 항원은 세척하여 제거하였다. 상기 실시예 1에서 얻어진 하이브리도마 세포의 배양액을 각각 웰에 50 ㎕씩을 가하여 1 시간 동안 반응시킨 후 인산 완충용액-트윈 20(TBST) 용액으로 충분히 세척하여 반응하지 않은 배양액을 제거하였다. 여기에 염소 항-마우스 IgG-호스래디쉬 퍼옥시다제(goat anti-mouse IgG-HRP)를 가하여 1 시간 동안 실온에서 반응시킨 다음, TBST 용액으로 충분히 세척하였다. 이어서 퍼옥시다제의 기질용액(OPD)을 가하여 반응시키고, 그 반응정도는 엘리자 해독기(ELISA Reader)로 450 nm에서 흡광도를 측정하여 인간의 Ang2 단백질에만 특이적으로 높은 결합력을 갖는 항체를 분비하는 하이브리도마 세포주들을 반복하여 선별하였다. 반복 선별을 통해 얻은 하이브리도마 세포주를 제한 희석(limiting dilution)하여 단일클론 항체를 생성하는 하이브리도마 세포주 58개의 클론을 최종적으로 얻었다.
상기 얻어진 각각의 하이브리도마를 DMEM (Dulbeco's Modified Eagle's Medium)에서 배양한 후 배양액을 모아 프로테인 G-친화성 크로마토그래피법으로 각각의 하이브리도마에서 생산되는 항 Ang2 단클론 항체를 정제하였다.
먼저 10% (v/v) FBS이 포함된 배양배지(DMEM) 배지 50 ㎖에서 배양된 상기 하이브리도마 세포를 원심분리하여 세포 침전물을 20 ㎖ PBS로 2회 이상 세척하여 FBS가 제거된 상태에서 배양배지(DMEM) 배지 50 ㎖을 세포 침전물에 재현탁시킨 후 3일 동안 37℃ 이산화탄소 배양기에서 배양하였다. 이후 원심분리를 통해 항체를 생산하는 세포를 제거하고 항체들이 분비된 배양액을 분리하여 4℃에 보관하거나 바로 모아서 50 ㎖ 내지 300 ㎖의 배양액으로부터 친화성 칼럼(Protein G agarose column; Pharmacia, USA)을 장착한 AKTA 정제 기기(GE Healthcare)를 이용하여 항체를 순수 정제한 후 단백질 응집용 필터(Amicon)를 사용하여 PBS로 상층액을 치환하여 정제된 항체를 보관하고, 이후의 실험에 사용하였다.
1.3. 단클론 항체의 기능 확인 및 마우스 10 D6 항체의 선별
Ang2는 혈관내피세포에 발현된 Tie2 수용체와 결합하여 수용체의 인산화를 유도하여 활성화함으로써 혈관내피세포의 변화를 유도하는 작용을 하므로, 세포기반 분석법을 이용한 항 Ang2 항체의 Tie2 인산화에 미치는 영향을 분석하기 위한 실험을 수행하였다.
이를 위하여, 100mm culture dish에서 HUVEC (ATCC) 세포(1X105개)를 EGM-2 (Lonza) 배지를 이용하여 37℃에서 배양 후, 80~90% confluency를 보이면, 무혈청 배지(Lonza)로 바꾸어 6 내지 16시간동안 37℃에서 배양하였다. PBS로 한 번 세척한 뒤, 1nM의 sodium orthovanadate 가 혼합된 무혈청 배지로 바꾸어 10분간 더 배양하였다. PBS로 한번 세척한 뒤, 상기 실시예 1.2에서 얻어진 Ang2 항체를 다양한 농도 (0.06~600nM)로 Ang2 단백질(R&D systems) 40nM과 혼합하여 20분간 둔 뒤, 상기 배양된 세포에 처리하고 10분간 더 배양하였다.
PBS를 이용하여 상기 세포를 세척한 뒤, lysis buffer (Roche) 400ul를 처리한 후, 세포를 tube에 모으고, 4℃에서 30분간 용해시킨 후, 13,000 rpm 으로 15분간 원심분리하여 상층액을 정량하였다. 25ug의 세포용해물에 1ug의 Tie2 항체 (R&D system)를 넣고 4℃에서 밤새도록(overnight) 반응 시킨 후, protein A bead (GE Healthcare)를 넣어 면역침강(immunoprecipitation)시켰다. 상기 얻어진 반응물을 13,000 rpm 으로 15분간 원심분리하여 펠렛을 얻은 후, lysis buffer (Roche)로 2 내지 3회 세척하고, reducing agent가 혼합된 sample buffer (Invitrogen) 를 넣고 95℃에서 5분간 끓인 뒤, NuPAGE Novex 4-12% Bis-Tris gel running하고(Invitrogen), Nitrocellulose membrane (Invitrogen)에 transfer하였다.
Tie2 수용체의 인산화 여부를 확인하기 위하여, 위의 blot을 3%(v/v) skim milk (Sigma)가 혼합된 PBST로 30분간 blocking 한 뒤, HRP-conjugated anti-phospho tyrosine 항체 (Millipore)를 이용하여 확인하였다. Tie2 확인을 위하여, blot을 stripping buffer (Thermo)에 15분간 반응시킨 뒤, 다시 blocking하여 Tie2 항체 (Santa cruz)를 이용하여 확인하였다. Ang2 단독 처리군 대비 Ang2와 함께 항체를 60nM 넣어 주었을 때 Tie2 인산화를 더 강하게 유도하는 항체를 선별하여 이를 10D6 항체로 명명하였다.
상기 10D6를 생산하는 하이브리도마는 대한민국 서울 종로구 연건동에 소재하는 한국세포주은행에 2013년 5월 13일자로 기탁하여 수탁번호 KCLRF-BP-00295를 부여받았다.
1.4. 마우스 10 D6 항체의 Ang2 에 대한 친화도 시험
상기 항체의 인간 Ang2 단백질에 대한 결합 친화도를BIAcore T100 (GE Healthcare)을 이용한SPR 방식으로 측정하였다. SPR 방식은 센서칩에 코팅된 물질의 상태에 따라 칩을 지나는 빛의 굴절률이 변화하는 원리를 이용한 것으로, 칩에 항원 또는 항체가 코팅된 상태에서 항체 또는 항원을 흘리면 이들간 결합으로 인한 굴절률의 변화가 발생하고, 이를 측정한 수치로부터 Kd 값을 계산한다.
먼저 pH 5.0 아세테이트 용액과 아민 커플링 키트(amine coupling kit; GE Healthcare)를 이용하여 anti-His 항체를 8,000 RU 레벨까지 CM5 센서칩(GE Healthcare)에 고정화시켰다. 여기에 6 ug/ml 농도의 재조합 hAng-2 (C-His, R&D Systems) 단백질을 흘려 보내 100 ~ 200 RU 레벨로 capture시켰다. 여기에 상기 실시예 2에서 얻어진 항체를 100 nM 농도로부터 순차적으로 2배씩 희석시킨 후, 각각 흘려 보내는 방법으로 센서칩에 capture된 항원과 결합 (on), 분리 (off), 해리 (regeneration, 10 mM NaOH 용액 사용)시키며 항원-항체간 친화도를 측정하였다. hAng2에 대하여 위와 같은 방법으로 실험하였으며, 그 결과는 하기 표 4와 같다.   
항체 명칭 hAng2 (Kd)
SAIT-ANG2-AB-m10D6 8.0 nM
1.5. 10 D6 - Ang2 - Tie2 complex 형성 확인을 위한 ELISA assay
10D6 anti-Ang2 항체가 Ang2-Tie2 결합을 저해하지 않고, Tie2 signaling을 활성화 시키는 것을 확인하였기 때문에, 항체와 Ang2 Tie2수용체 간의 complex가 형성되는지 여부를 확인하기 위하여 ELISA 를 수행하였다.
96-well MaxiSorpTM flat-bottom 플레이트 (Nunc)에 4ug/ml의 Tie2-Fc (R&D systems) 또는 BSA (Sigma)로 코팅하였다. 그런 다음, 0.05%(v/v) Tween-20이 포함된 PBS(Phosphate Buffer Saline)로 상기 플레이트를 5회 씻은 후, 1%(v/v) BSA(Bovine serum albumin; Sigma)가 함유된 PBS로 상온에서 2시간 동안 블로킹시켰다. 0.25 ug/ml의 Ang2와 2 ug/ml의 10D6 항체를 각각의 웰에 넣어 준 후, 플레이트를 상온에서 2시간 반응시킨 후, 상기 플레이트를 PBST로 5회 세척하였다. HRP 가 Conjugation 된 항-마우스 IgG 항체 (Sigma)를 1% (v/v)의 BSA가 함유된 PBS로 1:5,000 (v/v) 비율로 희석하여 100 ul 의 양으로 각각의 웰에 넣어주고 상온에서 1시간 반응시킨 후, PBST로 5회 씻어 주었다. 마지막으로 상기 플레이트의 각 웰에 100 ul(microliter)의 TMB 기질 (Cell Signaling)을 첨가하여 3분간 발색반응을 유도시켰으며, 이후, Stop 용액 (Cell Signaling) 100 ul를 첨가하여 반응을 중지시키고, OD450 값을 plate 리더(Molecular Devices) 상에서 측정하였다.
상기 얻어진 결과를 도 6에 나타내었다. 도 6에서 보는 것과 같이 10D6 항체가 Tie2에 결합된 Ang2에 결합하여 complex를 이루는 것을 확인 할 수 있었다.
1.6. Ang2 - Tie2 결합에 대한 마우스 10 D6 항체의 competition ELISA assay
상기 실시예 1.3에서 제작된 Ang-2에 결합하는 항체를 이용하여 Ang2-Tie2 binding competition ELISA를 수행하였다.
보다 구체적으로, 96-웰의 MaxiSorp™ flat-bottom 플레이트 (Nunc)를 4 ug(microgram)/ml의 인간 IgG1의 Fc를 결합시킨 단백질인 hTie2-Fc(R&D Systems)로 코팅하였다. 그런 다음, 0.05%(v/v) Tween-20이 포함된 PBS(Phosphate Buffer Saline)로 상기 플레이트를 5회 씻은 후, 1%(v/v) BSA(Bovine serum albumin; Sigma)가 함유된 PBS로 상온에서 2시간 동안 블로킹시켰다.
Ang2-Tie2 competition ELISA를 위해, 상기 실시예 2에서 제작된 각각의 항 Ang2 항체를 400nM ~ 0.001nM의 다양한 농도로 1% (v/v)의 BSA와 400 ng/ml 의 FLAG-Tagging 된 hAng-2과 함께 상기 hTie-2/Fc 융합 단백질이 코팅된 각각의 웰에 넣어 준 후, 플레이트를 상온에서 2시간 반응시킨 후, 상기 플레이트를 PBST로 5회 세척하였다. HRP 가 Conjugation 된 항-FLAG 항체 (Sigma)를 1% (v/v)의 BSA가 함유된 PBS로 1:5,000 (v/v) 비율로 희석하여 100 ul 의 양으로 각각의 웰에 넣어주고 상온에서 1시간 반응시킨 후, PBST로 5회 씻어 주었다. 마지막으로 상기 플레이트의 각 웰에 100 ul(microliter)의 TMB 기질 (Cell Signaling)을 첨가하여 3분간 발색반응을 유도시켰으며, 이후, Stop 용액 (Cell Signaling) 100 ul를 첨가하여 반응을 중지시키고, OD450 값을 plate 리더(Molecular Devices) 상에서 측정하였다.
비교를 위하여 Ang2-Tie2 결합을 저해하는 anti-Ang2항체인 4H10를 사용하여 상기와 동일한 시험을 수행하였다. 상기 4H10은 다음과 같은 중쇄가변영역과 경쇄가변영역을 갖는 항체이다:
중쇄가변영역(서열번호 12):
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYDMSWVRQAPGKGLEWVSLISPDSSSIYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKDLISFWRGGFDYWGQGTLVTVSS
경쇄가변영역(서열번호 13)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNYVNWYQQLPGTAPKLLIYADSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCGSWDYSLSGYVFGGGTKLTVLG
Ang-Tie2결합을 저해하는 정도(%)를 도1에 나타내었다. 도 1에서 보여지는 바와 같이, Ang2-Tie2 결합을 저해하는 anti-Ang2항체인 4H10과는 달리 10D6항체의 경우에는 Ang2-Tie2 수용체간 결합을 저해하지 않는 것이 확인되었다.
실시예 2: 마우스 10 D6 항체의 유전자 클로닝
상기 실시예 1.3에서 얻어진 항체 생산 하이브리도마(2x106 세포)로부터 RNeasy mini kit (Qiagen)를 이용하여 전체 RNA를 얻었다. 그런 다음, 이를 주형(template)으로 하여, OneStep RT-PCR kit (Qiagen)과 Mouse Ig-Primer Set (Novagen)과 써모사이클러(GeneAmp PCR System 9700, Applied Biosystem)를 사용하여 하기 조건으로 각 하이브리도마에서 생산되는 모노클로날 항체의 중쇄 및 경쇄의 가변영역(variable region) 유전자 서열만 증폭시켰다: 94℃에서 5분간; [50℃에서 30분, 95℃에서 15분], [94℃에서 1분, 50℃에서 1분, 72℃에서 2분]x 35 사이클; 72℃에서 6분간; 4℃로 냉각.
각 반응으로부터 얻어진 PCR 산물을 직접 DNA 염기서열분석(Sequencing)을 수행하여, 각 항체의 CDR, 중쇄 가변부 및 경쇄 가변부 및 이들을 암호화하는 염기서열을 얻었으며, 상기 얻어진 결과를 아래의 표 5 내지 8에 정리하였다:
항체 명칭 중쇄 CDR 서열
CDRH1-KABAT CDRH2-KABAT CDRH3-KABAT
SAIT-ANG2-AB-m10D6 SDYAWN
(서열번호1)
YINYSGNTDYNPSLKS
(서열번호 2)
GNFEGAMDY
(서열번호3)
항체 명칭 경쇄 CDR 아미노산 서열
CDRL1-KABAT CDRL2-KABAT CDRL3-KABAT
SAIT-ANG2-AB-m10D6 KASQSVSNDVA
(서열번호4)
YASNRYP
(서열번호 5)
QQDYSSPWT
(서열번호 6)
항체 명칭 중쇄 가변부 서열
SAIT-ANG2-AB-m10D6 DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSIT SDYAWN WIRQFPGNKLEWMG YINYSGNTDYNPSLKS RSSITRDTSKNQFFLQLNSVTTGDTATYYCAR GNFEGAMDY WGQGTLVTVSS(서열번호 7)
GATGTGCAGCTTCAGGAGTCGGGACCTGACCTGGTGAAACCTTCTCAGTCTCTGTCCCTCACCTGCACTGTCACTGGCTACTCAATCACCAGTGATTATGCCTGGAACTGGATCCGGCAGTTTCCAGGAAACAAACTGGAGTGGATGGGCTACATAAACTACAGTGGTAACACTGACTACAACCCATCTCTCAAAAGTCGAAGCTCTATCACTCGAGACACATCCAAGAACCAGTTCTTCCTGCAGTTGAATTCTGTGACTACTGGGGACACAGCCACATATTACTGTGCAAGAGGTAACTTCGAAGGTGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA(서열번호 8)
항체 명칭 경쇄 가변부 서열
SAIT-ANG2-AB-m10D6 SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITC KASQSVSNDVA WYQQKPGQSPKLLIY YASNRYP GVPDRFTGSGYGTDFTFTISTVQAEDLAVYFC QQDYSSPWT FGGGTKLEIK(서열번호 9)
agtattgtgatgacccagactcccaaattcctgcttgtatcagcaggagacagggttaccataacctgcaaggccagtcagagtgtgagtaatgatgtagcttggtaccaacagaagccagggcagtctcctaaactgctgatatactatgcatccaatcgctaccctggagtccctgatcgcttcactggcagtggatatgggacggatttcactttcaccatcagcactgtgcaggctgaagacctggcagtttatttctgtcagcaggattatagctctccgtggacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaa(서열번호 10)
(상기 표 7 및 8에서, 밑줄 표시된 굵은 글씨는 순서대로 CDR1, CDR2, CDR3 임)
상기의 얻어진 서열 정보를 기반으로 중쇄가변부위와 경쇄가변부위를 코딩하는 단일가닥 DNA를 제작하고, 상기 얻어진 단일가닥 DNA를 인간 kappa 경쇄의 불변부위 및 인간 IgG1의 CH1 부위의 코딩 유전자를 포함하는 벡터에 각각 클로닝하였다. 구체적으로, Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄가변부위에 해당하는 뉴클레오타이드 서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 8)을, pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄가변부위에 해당하는 뉴클레오타이드 서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 10)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여 클로닝함으로써, 키메릭 항체의 발현을 위한 중쇄가변부위를 포함하는 벡터 및 경쇄가변부위를 포함하는 벡터를 각각 구축하였다.
실시예 3: 마우스 10 D6  항체의 scFv 의 제작
마우스 10D6 항체의 중쇄가변영역 및 경쇄가변영역을 이용하여 10D6 항체의 scFv를 제작하기 위한 유전자를 디자인하였다. 중쇄 가변부위(아미노산 서열: 서열번호 7; 코딩 염기서열: 8) 및 경쇄 가변부위(아미노산 서열: 서열번호 9; 코딩 염기서열: 서열번호 10)을 'VH-링커-VL'의 형태가 되도록 하고, 상기 링커는 'GGGGSGGGGSGGGGS(서열번호 76)'의 아미노산 서열을 가지도록 디자인하였다. 이렇게 디자인된 'VH-링커-VL' (10D6 항체의 scFv)의 아미노산 서열과 이를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 서열번호 80 및 서열번호 81에 각각 나타내었다.
실시예 4: 친화도 성숙( affinity maturation )을 위한 라이브러리 유전자의 제작
4.1. 표적 CDR 의 선정 및 프라이머 제작
10D6 항체의 친화도 성숙(affinity maturation)을 위하여 6개의 상보성 결정 부위(complementary determining region, CDR)을 상기 제작된 마우스 항체 10D6으로부터 'Kabat numbering'에 의하여 정의하였으며, 각각의 CDR은 하기 표 9와 같다.
 CDR 아미노산 서열
CDR-H1 SDYAWN(서열번호 1)
CDR-H2 YINYSGNTDYNPSLKS(서열번호 2)
CDR-H3 GNFEGAMDY(서열번호 3)
CDR-L1 KASQSVSNDVA(서열번호 4)
CDR-L2 YASNRYP(서열번호 5)
CDR-L3 QQDYSSPWT(서열번호6)
항체 CDR의 무작위 서열 도입을 위하여 다음과 같이 프라이머를 제작하였다. 기존의 무작위 서열 도입 방식은 돌연변이를 주고자 하는 부위에 동일한 비율의 염기 (25% A, 25% G, 25% C, 25% T)가 도입되도록 N 코돈을 이용하였으나, 본 실시예에서는 10D6 항체의 CDR에 무작위 염기를 도입하기 위하여, 각 CDR의 아미노산을 코딩하는 3개의 야생형(wild-type) 뉴클레오티드 중 첫번째와 두번째 뉴클레오티드의 85%는 그대로 보존하고, 나머지 3개의 염기를 각각 5%씩 도입하는 방식을 취하였다. 또한, 세 번째 뉴클레오티드는 동일하게(33% G, 33% C, 33% T)가 도입되도록 프라이머를 디자인하였다.
4.2. 10 D6  항체의 scFv 의 라이브러리 유전자 제작
CDR의 무작위 서열 도입을 통한 항체 라이브러리 유전자의 구축은 상기 4.1과 같은 방법으로 제작된 프라이머를 이용하여 수행되었다. 주형으로 10D6 scFv(서열번호 81)를 이용하여, 도 3에 나타낸 방법과 같이 2개의 PCR 절편을 제작하고, 이를 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 방법을 통하여, 원하는 CDR만 각각 돌연변이된 10D6 항체의 scFv 라이브러리 유전자를 확보하였다. 이렇게 제작된 6개의 CDR을 각각 표적으로 하는 라이브러리들은 모두 107~108 개 범위 내에서 구축되었다.
각각의 라이브러리는 야생형에 비하여 Ang2에 대한 결합력이 대부분 낮아지는 경향을 보였으나, 일부 Ang2에 대한 결합력이 유지되는 돌연변이들을 확인하였다.
 
실시예 5: 제작된 라이브러리로부터 친화도가 개선된 항체의 선별
상기 실시예 4의 각 라이브러리 중 Ang-2에 강한 결합력을 보이는 상위 1.0%를 각각 분류하였으며, 이 과정은4회 반복하였다. 각각의 개별 scFv의 유전자 서열을 분석하였다. 확보된 유전자 서열은 각각 하기 표 10과 같으며, 이를 IgG 형태로 변환하였다 (중쇄 불변영역: 인간IgG1 불변영역, 경쇄불변영역: 인간 KAPPA CHAIN 의 불변영역). 하기 클론 중에서, VH-6.6, VH-6.7, VL-(6.11), VL-(6.17), 및 VL-HU1(6.22)으로부터 생산된 5종의 항체를 선별하여 후속 실험을 수행하였다. 
클론 이름 도출된 라이브러리 CDR 서열
VH-6.6 CDR-H2 KISYSGKTDYNPSLKS(서열번호14)
VH-6.7 CDR-H2 KINYAGNTDYNPSLKS(서열번호 15)
VL-(6.11) CDR-L1 KASQSVSNDVH(서열번호 16)
VL-(6.17) CDR-L3 QHDYSSPFT(서열번호 19)
VL-(6.22) CDR-L1+ CDR-L3 KASQSVSNDVH(서열번호 16)+ QHDYSSPFT(서열번호 19)
  
실시예 6: 마우스 항체 10 D6 로부터 인간화 항체 10 D6 - HU1 , 10 D6 - HU2 , 10 D6 -HU3, 및 10 D6 - HU5 의 제작
6.1. 중쇄의 인간화( Heavy chain humanization )
10D6-HU1 Heavy, 10D6-HU2-heavy, 및 10D6-HU5-heavy 3종의 디자인을 위하여, 우선 Ig Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여 마우스 항체 10D6의 VH 유전자와 상동성이 높은 인간의 생식선(germline) 유전자를 분석하였다. 그 결과, IGHV4-b*01 (DP-67; accession number: Z12367)이 아미노산 레벨에서 72.2%의 상동성을 가짐을 확인하다. 마우스 항체 10D6의 CDR-H1(서열번호 1), CDR-H2(서열번호 2), 및 CDR-H3(서열번호 3)를 Kabat numbering으로 정의하고, 마우스 항체 10D6의 CDR 부분이 IGHV4-b*01의 골격(framework)에 도입되도록 디자인하였다 (10D6-HU1로 명명; 서열번호 77; QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSISSDYAWNWIRQPPGKGLEWIGYINYSGNTDYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS). 여기서, 30번 아미노산을 원래 마우스 10D6 항체의 아미노산 서열로 back-mutation (S→T)하여, 10D6-HU5(서열번호 56)를 제작하였다. 10D6-HU5에서, 48번(I→M), 67번(V→S), 71번(V→R) 아미노산을 추가로 원래 마우스 10D6 항체의 아미노산 서열로 back-mutation 함으로서 10D6-HU2(서열번호 78; QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGYINYSGNTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS)를 구축하였다.
한편, 10D6-HU3-heavy의 디자인을 위하여, 인간항체의 골격(framework) 서열을 찾아 본 결과, 10D6 항체의 마우스 골격 서열과 서열이 매우 유사하고, 기존의 인간화 항체 중 약 0.1% 수준의 매우 낮은 면역원성 부작용을 보인 허셉틴의 백본(backbone)으로 선정하였다. 마찬가지로 Kabat numbering으로 정의된 마우스 항체 10D6의 CDR-H1, CDR-H2, 및 CDR-H3를 허셉틴 항체의 골격에 도입되도록 디자인하였다. 이때, 27번 (F-Y) 28번(N→S), 30번(K→T), 48번(V→M), 49번(A→G), 67번 (F→S), 71번(A→R), 78번(A→F), 93번(S→A)을 back-mutation 하여 10D6-HU3(서열번호 79; EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSITSDYAWNWVRQAPGKGLEWMGYINYSGNTDYNPSLKSRSTISRDTSKNTFYLQMNSLRAEDTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS)를 구축하였다.
6.2. 경쇄의 인간화( Light chain humanization )
H1-light의 디자인을 위하여, Ig Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)를 통하여, 마우스 항체 10D6의 VL 유전자와 상동성이 높은 인간 생식선 유전자를 분석하였다. 그 결과, IGKV1-39*01(O12; accession number: X59315)이 아미노산 레벨에서 66%의 상동성을 가짐을 확인하였으며, 마우스 항체 10D6의 CDR-L1(서열번호 4), CDR-L2(서열번호 5), 및 CDR-L3(서열번호 6)를 Kabat numbering으로 정의하고, 마우스 항체 10D6의 CDR부분이 IGKV1-39*01의 골격에 도입되도록 디자인하였다.
이후, Invitrogen 사의 OptiCHOTMAntibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(10D6-VHHU1, 10D6-VHHU2, 10D6-VHHU3, 및 10D6-VHHU5)을 EcoRI(NEB, R0101S)과 nheI(NEB, R0131) 제한효소를 사용하여 클로닝하고 pcDNATM3.3-TOPO TA Cloning Kit 에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(10D6-VLHU1(서열번호 57) 코딩: 서열번호 69)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 인간화 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 인간화 항체 10D6-HU1, 10D6-HU2, 10D6-HU3, 및 10D6-HU5를 정제하였다. 
 
실시예 7: 선별된 CDR 의  Humanization 항체로의 이식 및 IgG 로의 변환
상기 선별된 CDR 을 인간화된 항체의 중쇄와 경쇄에 각각 이식하였다. 중쇄는 'EcoRI-signal sequence-VH-NheI-CH-XhoI'로 구성되도록 각각 디자인하여 유전자를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다(서열번호 64-68). 경쇄는 'EcoRI-signal sequence-VL-BsiWI-CL-XhoI'로 구성되도록 각각 디자인하여 유전자를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다(서열번호 69-71). Invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 64-68), pcDNATM3.3-TOPOTA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(서열번호 69-71)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 친화력 성숙된 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 친화력 성숙된 4종의 항체(이하, h10D6-Opti-1,2,3,4로 명명함)를 정제하였다.
클론 이름 항체서열 (VH) 항체서열(VL)
h10D6-OPTI-1 >HU2 -6.6
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 52)
>HU1
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQDYSSPWTFGQGTKLEIK(서열번호 57)
(코딩 염기서열)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGGATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGGGGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(서열번호 64)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 69)
h10D6-OPTI-2 >HU2 -6.7
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKINYAGNTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 53)
>HU1
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQDYSSPWTFGQGTKLEIK(서열번호 57)
(코딩 염기서열)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTAACTATGCCGGTAACACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(서열번호 65)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 69)
h10D6-OPTI-43 >HU2 -6.6
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 52)
>HU1-6.11
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVHWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQDYSSPWTFGQGTKLEIK(서열번호 58)
(코딩 염기서열)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(서열번호 64)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 70)
h10D6-OPTI-55 >HU2 -6.7
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKINYAGNTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 53)
HU1-6.11
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVHWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQDYSSPWTFGQGTKLEIK(서열번호 58)
(코딩 염기서열)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTAACTATGCCGGTAACACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(서열번호 65)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 70)
h10D6-OPTI-3 >HU3-6.6
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSITSDYAWNWVRQAPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNTFYLQMNSLRAEDTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 54) 
>HU1
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(코딩 염기서열)
GAGGTTCAGCTGGTCGAAAGCGGTGGGGGACTCGTGCAGCCAGGCGGTTCTCTTAGATTATCATGTGCCGCATCCGGGTACTCCATCACCTCTGATTATGCATGGAACTGGGTCAGACAAGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAGTGGATGGGGAAGATCTCCTATTCAGGGAAGACAGATTATAATCCTTCGCTGAAAAGCAGATCAACAATTAGTAGAGACACTTCTAAAAATACTTTTTACCTCCAGATGAACAGTCTGCGCGCCGAAGACACCGCCGTGTACTACTGCGCTAGGGGAAATTTCGAGGGAGCTATGGACTATTGGGGCCAGGGCACGTTGGTAACCGTGAGCAGC(서열번호 66)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 69)
h10D6-OPTI-4 >HU3-6.7
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>HU1
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(코딩 염기서열)
GAGGTTCAACTGGTAGAGTCCGGGGGCGGCCTGGTCCAGCCAGGAGGAAGCCTGCGGCTCTCTTGTGCCGCCAGCGGGTATAGTATCACTTCAGATTATGCCTGGAATTGGGTCCGCCAGGCCCCCGGGAAGGGCTTAGAGTGGATGGGTAAAATTAATTACGCAGGCAACACCGACTATAATCCTTCACTGAAATCTAGATCCACCATCTCTAGAGATACAAGTAAGAACACCTTTTACTTGCAGATGAATAGCCTCAGGGCTGAAGACACTGCTGTGTACTACTGCGCAAGAGGAAACTTCGAAGGAGCGATGGATTATTGGGGCCAGGGTACGCTTGTGACAGTGTCCTCT(서열번호 67)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 69)
h10D6-OPTI-16 >HU3-6.6
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSITSDYAWNWVRQAPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNTFYLQMNSLRAEDTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 54)
>HU1-6.11
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(코딩 염기서열)
GAGGTTCAGCTGGTCGAAAGCGGTGGGGGACTCGTGCAGCCAGGCGGTTCTCTTAGATTATCATGTGCCGCATCCGGGTACTCCATCACCTCTGATTATGCATGGAACTGGGTCAGACAAGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAGTGGATGGGGAAGATCTCCTATTCAGGGAAGACAGATTATAATCCTTCGCTGAAAAGCAGATCAACAATTAGTAGAGACACTTCTAAAAATACTTTTTACCTCCAGATGAACAGTCTGCGCGCCGAAGACACCGCCGTGTACTACTGCGCTAGGGGAAATTTCGAGGGAGCTATGGACTATTGGGGCCAGGGCACGTTGGTAACCGTGAGCAGC(서열번호 66)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 70)
h10D6-OPTI-17 >HU3-6.7
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYSITSDYAWNWVRQAPGKGLEWMGKINYAGNTDYNPSLKSRSTISRDTSKNTFYLQMNSLRAEDTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 55)
>HU1-6.11
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(코딩 염기서열)
GAGGTTCAACTGGTAGAGTCCGGGGGCGGCCTGGTCCAGCCAGGAGGAAGCCTGCGGCTCTCTTGTGCCGCCAGCGGGTATAGTATCACTTCAGATTATGCCTGGAATTGGGTCCGCCAGGCCCCCGGGAAGGGCTTAGAGTGGATGGGTAAAATTAATTACGCAGGCAACACCGACTATAATCCTTCACTGAAATCTAGATCCACCATCTCTAGAGATACAAGTAAGAACACCTTTTACTTGCAGATGAATAGCCTCAGGGCTGAAGACACTGCTGTGTACTACTGCGCAAGAGGAAACTTCGAAGGAGCGATGGATTATTGGGGCCAGGGTACGCTTGTGACAGTGTCCTCT(서열번호 67)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 70)
h10D6-OPTI-42 >HU5
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWIGYINYSGNTDYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(서열번호 56)
>HU1-22
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVHWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQHDYSSPFTFGQGTKLEIK(서열번호 59)
(코딩 염기서열)
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCGGGCCCAGGACTGGTGAAGCCTTCGGAGACCCTGTCCCTCACCTGCGCTGTCTCTGGTTACTCCATCACCAGTGATTATGCCTGGAACTGGATCCGGCAGCCCCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATTGGGTACATAAACTACAGTGGTAACACTGACTACAACCCATCTCTCAAAAGTCGAGTCACCATATCAGTAGACACGTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGAGCTCTGTGACCGCCGCAGACACGGCCGTGTATTACTGTGCGAGAGGTAACTTCGAAGGTGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACGCTTGTGACAGTGTCCTCT(서열번호 68)
(코딩 염기서열)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCATGATTATAGCTCTCCGTTCACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(서열번호 71)
(상기 표 11에서, 굵은 글씨는 순서대로 CDR1, CDR2, CDR3 임)
실시예 8: 선별된 항체의 결합 친화도 분석 
표면 플라즈몬 공명(Surface Plasmon Resonance, SPR) 방식을 이용한 항원 친화도 (KD values) 측정 Ang2 항원에 대한 정확한 친화도를 측정하기 위하여 BIAcore T100 (GE Healthcare)을 이용한 SPR 방식으로 항원 친화도를 측정하였다. 25 ug/ml 농도의 anti-His 항체를 pH 5.0 acetate 용액과 amine coupling kit (GE Healthcare)를 이용하여 CM5 센서칩 (GE Healthcare)에 고정화 시켰다. 여기에 재조합 hAng2(R&D Systems) 항원을 6 ug/ml 농도로 capture 시킨 후, 항체를 흘려 항원과 결합 및 해리시키며 항원-항체 친화도를 측정하였다.   상기 얻어진 결과를 아래의 표 12에 나타내었다. 표 12에서 KD 값은 kon값과 koff 값로부터 계산하였다.
항체   kon (1/Ms) koff (1/s) KD (nM)
m10D6  2.410x104  1.932x10-4 8
10D6-HU1 3.082x104  0.002599 84
10D6-HU2 7.298x104 0.003464 47
10D6-HU3 4.503x104 0.001938 43
10D6-HU5  4.856x104  0.003115  64
h10D6-OPTI-1  4.737x105  3.209x10-4 0.68
h10D6-OPTI-2  4.237x105  1.488x10-4 0.34
h10D6-OPTI-43  1.531x106  5.760x10-4 0.38
h10D6-OPTI-55  6.210x105  8.489x10-5 0.14
h10D6-OPTI-3  6.239x105  3.070x10-4 0.49
h10D6-OPTI-4  7.357x105  2.460x10-4 0.33
h10D6-OPTI-16  4.794x105  4.434x10-4 0.92
h10D6-OPTI-17  4.600x105  3.503x10-4 0.76
h10D6-OPTI-42  3.358x105  2.862x10-4 0.85
표 12에서와 같이, 마우스 항체 10D6은 Ang2 항원에 대하여 약 18 nM의 결합력을 보였으며, 친화도가 개선된 5종의 인간화 항체는0.14 nM 내지 0.85 nM범위의 결합력을 보였다. 이는 scFv 형태에서 친화도가 개선된 항체들이 IgG 변환 후에도 최소 5배에서 최대 약 37배까지 친화도가 향상되었음을 보여준다.
실시예 9: 선별된 친화도 개선 항체의 인 비트로( in vitro ) 생물학적 활성 분석
9.1. Akt 인산화 
상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 10D6항체가 Tie2 뿐 만 아니라 downstream signaling의 활성화를 유도하는지 확인하기 위하여, HUVEC (ATCC) 세포에서 Ang2 단독 또는 Ang2와 상기 실시예 7에서 얻어진 10D6 항체(표 11 참조)를 처리하여 Akt 인산화 정도를 비교하였다. 96 well plate에서 HUVEC (ATCC) 세포(2X104개)를 EGM-2 (Lonza) 배지를 이용하여 37℃에서 배양 후, 80~90% confluency를 보이면, 무혈청 배지(Lonza)로 바꾸어 6 시간 동안 37℃에서 배양하였다. 상기 실시예 7에서 얻어진 Ang2 항체를 6nM 또는 1.2nM의 농도로 Ang2 단백질(R&D systems) 4nM과 혼합하여 20분간 둔 뒤, 상기 배양된 세포에 처리하고 30분간 더 배양하였다.
Tie2 수용체의 downstream signaling에 관여하는 Akt의 인산화 여부를 확인하기 위하여, PathScan
Figure pat00001
Phospho-Akt Chemiluminescent Sandwich ELISA Kit (Cell signaling, #7134)을 이용하였다. PBS를 이용하여 상기 세포를 세척한 뒤, lysis buffer (Roche) 30ul 를 처리하고 4℃에서 30분간 세포를 용해시켰다. 각 well에30ul의 diluent buffer(Cell signaling)를 넣어 pipet을 이용해 잘 섞어준 다음, 50ul를 phosphor-Akt Ab coated microwell로 옮겨 2시간 동안 상온에서 반응시켰킨다. 2시간 후, 1X washing buffer(Cell signaling)로 4번 세척 후, 50ul Akt1 detection antibody 용액(Cell signaling)을 넣어 1시간 동안 상온에서 반응시켰다. 동일한 방법으로 well을 세척한 뒤, 50ul HRP-conjugated secondary antibody(Cell signaling)를 넣고 30분간 상온에서 반응시켰다. 위와 동일한 방법으로 well을 세척한 후, luminol/enhancer solution(GE healthcare)과 stable peroxide buffer(GE healthcare)를 1:1(v/v)로 섞어준 용액을 50ul씩 분주하고, plate를 luminometer (Envision 2104 plate reader, Perkin Elmer)에 장착 후 relative lignt unit (RLU)를 측정하였다.
상기 얻어진 결과를 도 2에 나타내었다. 도 2에 나타난 바와 같이, 마우스 10D6 항체와 비교하여, 상기 실시예 7에서 얻어진 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항체가 downstream signaling이 보다 강하게 유도됨을 확인할 수 있다.
실시예 10: 인간화 10 D6  항체 ( Opti -1)의 scFv 의 효모 표면 발현 실험
10.1. 인간화 10 D6  항체 ( Opti -1)의 scFv 를 제작하기 위한 폴리뉴클레오티드의 합성
인간화 10D6 항체(Opti-1)의 중쇄가변영역 및 경쇄가변영역을 이용하여 10D6 항체의 scFv를 제작하기 위한 유전자를 디자인하였다. 중쇄 가변부위(아미노산 서열: Hu2 6.6(서열번호 52); 코딩 염기서열: 서열번호 64) 및 경쇄 가변부위(아미노산 서열: 서열번호 Hu1(서열번호 57); 코딩 염기서열: 서열번호 서열번호 69)을 'VH-링커-VL'의 형태가 되도록 하고, 상기 링커는 'GGGGSGGGGSGGGGS(서열번호 76)'의 아미노산 서열을 가지도록 디자인하였다. 이렇게 디자인된 10D6 opti-1 항체의 scFv('VH-링커-VL'; 서열번호 82)를 코딩하는 폴리뉴클레오티드(서열번호 83)를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다.
 
실시예 11: 2차 친화도 성숙( affinity maturation )을 위한 라이브러리 유전자의 제작
11.1. 표적 CDR 의 선정 및 프라이머 제작
10D6 opti-1 항체의 친화도 성숙(affinity maturation)을 위하여 3개의 상보성 결정 부위(complementary determining region, CDR)을 상기 제작된 10D6-Opti-1 항체로부터 'Kabat numbering'에 의하여 정의하였으며, 각각의 CDR은 하기 표 13과 같다.
 CDR 아미노산 서열
CDR-L1 KASQSVSNDVA(서열번호 4)
CDR-L2 YASNRYP(서열번호 5)
CDR-L3 QQDYSSPWT(서열번호6)
항체 CDR의 무작위 서열 도입을 위하여 다음과 같이 프라이머를 제작하였다. 기존의 무작위 서열 도입 방식은 돌연변이를 주고자 하는 부위에 동일한 비율의 염기 (25% A, 25% G, 25% C, 25% T)가 도입되도록 N 코돈을 이용하였으나, 본 실시예에서는 10D6 opti-1 항체의 CDR에 무작위 염기를 도입하기 위하여, 각 CDR의 아미노산을 코딩하는 3개의 야생형(wild-type) 뉴클레오티드 중 첫번째와 두번째 뉴클레오티드의 85%는 그대로 보존하고, 나머지 3개의 염기를 각각 5%씩 도입하는 방식을 취하였다. 또한, 세 번째 뉴클레오티드는 동일하게(33% G, 33% C, 33% T)가 도입되도록 프라이머를 디자인하였다.
11.2. 10 D6 opti -1 항체의 scFv 의 라이브러리 유전자 제작
CDR의 무작위 서열 도입을 통한 항체 라이브러리 유전자의 구축은 상기 11.1과 같은 방법으로 제작된 프라이머를 이용하여 수행되었다. 주형으로 10D6 opti-1 scFv(서열번호 83)를 이용하여, 도 4에 나타낸 방법과 같이 2개의 PCR 절편을 제작하고, 이를 중복 확장 중합효소연쇄반응(overlap extension PCR) 방법을 통하여, 원하는 CDR만 각각 돌연변이된 10D6 항체의 scFv 라이브러리 유전자를 확보하였다. 이렇게 제작된 6개의 CDR을 각각 표적으로 하는 라이브러리들은 모두 107~108 개 범위 내에서 구축되었다.
각각의 라이브러리는 야생형에 비하여 Ang2에 대한 결합력이 대부분 낮아지는 경향을 보였으나, 일부 Ang2에 대한 결합력이 유지되는 돌연변이들을 확인하였다.
 
실시예 12: 제작된 라이브러리로부터 친화도가 개선된 항체의 선별
상기 실시예 11에서 얻어진 라이브러리 중에서 Ang2에 강한 결합력을 보이는 상위 1.0%를 각각 분류하였고, 이를4회 반복하였다. 각각의 개별 scFv의 유전자 서열을 분석하였다. 확보된 유전자 서열은 각각 하기 표 14와 같으며, 이를 IgG 형태로 변환하였다 (중쇄불변영역: 인간IgG1 불변영역, 경쇄경쇄불변영역: 인간 KAPPA CHAIN 의 불변영역). 하기 클론 중에서, 10D6_VL-Hu1-2.1, 10D6_VL-Hu1-2.4, 10D6_VL-Hu1-2.7, 10D6_VL-Hu1-2.8 으로부터 생산된 4종의 항체를 선별하여 후속 실험을 수행하였다
클론 이름 도출된 라이브러리 CDR 서열
10D6_VL-Hu1-2.1 CDR-L1 KASQFVSTDVH(서열번호 17)
10D6_VL-Hu1-2.4 CDR-L2 YASIPYP(서열번호 18)
10D6_VL-Hu1-2.7 CDR-L1+L2 KASQSVSNDVH(서열번호 16)+YASIPYP(서열번호 18)
10D6_VL-Hu1-2.8 CDR-L1+L2 KASQFVSTDVH(서열번호 XX)+YASIPYP(서열번호 18)
실시예 13: 선별된 CDR 의  Humanization 항체로의 이식 및 IgG 로의 변환
상기 선별된 CDR 을 인간화된 항체의 경쇄에 각각 이식하였다. 중쇄는 Hu2-6.6 이나 Hu3-6.6 서열로 클로닝된 항체를 이용하고. 경쇄는 'EcoRI-signal sequence-VL-BsiWI-CL-XhoI'로 구성되도록 각각 디자인하여 유전자를 바이오니아에 의뢰하여 합성하였다(표 15 참조). invitrogen 사의 OptiCHOTM Antibody Express Kit (Cat no. 12762-019)에 포함되어 있는 pOptiVECTM-TOPO TA Cloning Kit에 상기 중쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(표 15), pcDNATM3.3-TOPOTA Cloning Kit(Cat no. 8300-01)에 상기 경쇄에 해당하는 염기서열을 갖는 DNA 절편(표 15)을 각각 EcoRI(NEB, R0101S)과 XhoI(NEB, R0146S) 제한 효소를 사용하여, 클로닝함으로써, 친화력 성숙된 항체의 발현을 위한 벡터를 구축하였다.
상기 구축된 벡터는 각각 Qiagen Maxiprep kit (Cat no. 12662)을 이용하여 증폭되었으며, 상기 중쇄를 포함하는 벡터 및 경쇄를 포함하는 벡터는 4:1의 비율(80 ug:20 ug)로 293T 세포(2.5 x 107)에 2M CaCl2를 360 ul 첨가하여 트랜스펙션(transfection)하였다. 이후, 10% FBS가 첨가된DMEM 배지에서 37℃, 5% CO2조건 하에서 5시간 동안 배양한 다음, FBS가 첨가되지 않은 DMEM 배지로 48시간 동안 37℃, 5% CO2 조건 하에서 배양하였다.
상기 배양된 세포를 원심분리하여 상등액 각 100 ml을 취하고, AKTA Prime (GE healthcare)를 이용하여 정제하였다. AKTA Prime에 Protein A 컬럼(GE healthcare, 17-0405-03)을 설치하고 배양액을 5 ml/min의 유속으로 흘려준 후, IgG elution buffer(Thermo Scientific, 21004)로 용출하였다. 이를 PBS buffer로 교환하여 최종적으로 친화력 성숙된 10종의 항체(이하, h10D6-Opti-63, 64, 65, 66, 67, 71, 68, 70, 72, 및 73로 명명함)를 정제하였다.
Clone Antibody sequence (VH) Antibody sequence (VL)
h10D6-OPTI-63 >HU2 -6.6
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 52)
>10D6_VL-Hu1-2.1
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQFVSTDVHWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQDYSSPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO: 60)
(coding nucleotide sequence)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGTTCGTGAGTACTGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 72)
h10D6-OPTI-64 >HU2 -6.6
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 52)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGKAPKLLIYYASNRYPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCGQDYASPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO: 87)
(coding nucleotide sequence)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCT
TGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAACCGATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTGGACAGGATTATGCCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 88)
h10D6-OPTI-65 >HU2 -6.6
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSITSDYAWNWIRQPPGKGLEWMGKISYSGKTDYNPSLKSRSTISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGNFEGAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 52)
>10D6_VL-Hu1-2.4
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CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCATCCCATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 73)
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CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACAC
TGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAACCGATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGT
GGACAGGATTATTCTGCCCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 90)
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(coding nucleotide sequence)
CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCATCCCATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 74)
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10D6_VL-Hu1-2.8
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CAGGTGCAACTGCAGGAGTCAGGCCCCGGCCTGGTAAAACCTTCTGAAACGCTCTCACTTACCTGTGCCGTTAGTGGATACTCTATCACTTCCGACTACGCTTGGAATTGGATTCGGCAGCCTCCAGGCAAAGGGCTGGAATGG
ATGGGAAAGATTTCCTATTCCGGTAAGACTGACTACAATCCCAGTCTGAAGAGCAGGTCAACAATCTCCAGAGACACCAGCAAGAATCAGTTTTCCCTGAAATTGTCCTCGGTGACAGCAGCGGATACCGCAGTGTATTATTGCGCCCGCGGTAACTTCGAGGGAGCTATGGATTACTGG
GGGCAGGGTACTCTCGTCACTGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 64)
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GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGTTCGTGAGTACTGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCATCCCATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 75)
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GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGTTCGTGAGTACTGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCAATCGCTACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 72)
h10D6-OPTI-70 >HU3-6.6
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GAGGTTCAGCTGGTCGAAAGCGGTGGGGGACTCGTGCAGCCAGGCGGTTCTCTTAGATTATCATGTGCCGCATCCGGGTACTCCATCACCTCTGATTATGCATGGAACTGGGTCAGACAAGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAGTGGATGGGGAAGATCTCCTATTCAGGGAAGACAGATTATAATCCTTCGCTGAAAAGCAGATCAACAATTAGTAGAGACACTTCTAAAAATACTTTTTACCTCCAGATGAACAGTCTGCGCGCCGAAGACACCGCCGTGTACTACTGCGCTAGGGGAAATTTCGAGGGAGCTATGGACTATTGGGGCCAGGGCACGTTGGTAACCGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 66)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGAGTGTGAGTAATGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCATCCCATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 74)
h10D6-OPTI-73 >HU3-6.6
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10D6_VL-Hu1-2.8
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GAGGTTCAGCTGGTCGAAAGCGGTGGGGGACTCGTGCAGCCAGGCGGTTCTCTTAGATTATCATGTGCCGCATCCGGGTACTCCATCACCTCTGATTATGCATGGAACTGGGTCAGACAAGCCCCCGGAAAGGGCCTGGAGTGGATGGGGAAGATCTCCTATTCAGGGAAGACAGATTATAATCCTTCGCTGAAAAGCAGATCAACAATTAGTAGAGACACTTCTAAAAATACTTTTTACCTCCAGATGAACAGTCTGCGCGCCGAAGACACCGCCGTGTACTACTGCGCTAGGGGAAATTTCGAGGGAGCTATGGACTATTGGGGCCAGGGCACGTTGGTAACCGTGAGCAGC(SEQ ID NO: 66)
(coding nucleotide sequence)
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCCAGTCAGTTCGTGAGTACTGATGTACATTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCATCCATCCCATACCCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGTCTGCAACCTGAAGATTTTGCAACTTACTACTGTCAGCAGGATTATAGCTCTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGGTGGAAATCAAA(SEQ ID NO: 75)
(상기 표 15에서, 굵은 글씨는 순서대로 CDR1, CDR2, CDR3 임)
실시예 14: 선별된 항체의 결합 친화도 분석 
표면 플라즈몬 공명(Surface Plasmon Resonance, SPR) 방식을 이용한 항원 친화도 (KD values) 측정 Ang2 항원에 대한 정확한 친화도를 측정하기 위하여 BIAcore T100 (GE Healthcare)을 이용한 SPR 방식으로 항원 친화도를 측정하였다. 25 ug/ml 농도의 anti-His 항체를 pH 5.0 acetate 용액과 amine coupling kit (GE Healthcare)를 이용하여 CM5 센서칩 (GE Healthcare)에 고정화 시켰다. 여기에 재조합 hAng2(R&D Systems) 항원을 6 ug/ml 농도로 capture 시킨 후, 항체를 흘려 항원과 결합 및 해리시키며 항원-항체 친화도를 측정하였다.   상기 얻어진 결과를 아래의 표 16에 나타내었다. 표 16에서 KD 값은 kon값과 koff 값로부터 계산하였다.
항체   kon (1/Ms) koff (1/s) KD (M)
h10D6-OPTI-63 2.676x106 7.421x10-5 2.773x10-11
h10D6-OPTI-65 4.960x165 2.250x10-5 4.536x10-12
h10D6-OPTI-67 2.080x166 2.684x10-7 1.291x10-13
h10D6-OPTI-68 5.355x105 1.696x10-4 3.168x10-10
h10D6-OPTI-70 2.650x105 1.159x10-4 4.374x10-10
표 16에서와 같이, 친화도가 개선된 8종의 인간화 항체는0.000129 nM 내지 0.43 nM범위의 결합력을 보였다.
실시예 15: 선별된 친화도 개선 항체의 인 비트로( in vitro ) 생물학적 활성 분석
15.1. Akt 인산화 
상기 인간화 및/또는 친화도 성숙된 10D6항체가 Tie2 뿐 만 아니라 downstream signaling의 활성화를 유도하는지 확인하기 위하여, HUVEC (ATCC) 세포에서 Ang2 단독 또는 Ang2와 상기 실시예 13에서 얻어진 10D6 항체(표 15 참조)를 처리하여 Akt 인산화 정도를 비교하였다. 96 well plate에서 HUVEC (ATCC) 세포(2X104개)를 EGM-2 (Lonza) 배지를 이용하여 37℃에서 배양 후, 80~90% confluency를 보이면, 무혈청 배지(Lonza)로 바꾸어 6 시간 동안 37℃에서 배양하였다. 상기 실시예 13에서 얻어진 Ang2 항체를 6nM, 1.2nM, 또는 0.24nM의 농도로 Ang2 단백질(R&D systems) 4nM과 혼합하여 20분간 둔 뒤, 상기 배양된 세포에 처리하고 30분간 더 배양하였다.
Tie2 수용체의 downstream signaling에 관여하는 Akt의 인산화 여부를 확인하기 위하여, PathScan
Figure pat00002
Phospho-Akt Chemiluminescent Sandwich ELISA Kit (Cell signaling, #7134)을 이용하였다. PBS를 이용하여 상기 세포를 세척한 뒤, lysis buffer (Roche) 30ul 를 처리하고 4℃에서 30분간 세포를 용해시켰다. 각 well에30ul의 diluent buffer(Cell signaling)를 넣어 pipet을 이용해 잘 섞어준 다음, 50ul를 phosphor-Akt Ab coated microwell로 옮겨 2시간 동안 상온에서 반응시켰다. 2시간 후, 1X washing buffer(Cell signaling)로 4번 세척 후, 50ul Akt1 detection antibody 용액(Cell signaling)을 넣어 1시간 동안 상온에서 반응시켰다. 동일한 방법으로 well을 세척한 뒤, 50ul HRP-conjugated secondary antibody(Cell signaling)를 넣고 30분간 상온에서 반응시켰다. 위와 동일한 방법으로 well을 세척한 후, luminol/enhancer solution(GE Healthcare)과 stable peroxide buffer(GE Healthcare)를 1:1(v/v)로 섞어준 용액을 50ul씩 분주하고, plate를 luminometer (Envision 2104 plate reader, Perkin Elmer)에 장착 후 relative lignt unit (RLU)를 측정하였다.
상기 얻어진 결과를 도 5에 나타내었다. 도 5에 나타난 바와 같이, 마우스 10D6 항체와 비교하여, 상기 실시예 13에서 얻어진 인간화 및/또는 친화도 성숙된 항체가 downstream signaling이 보다 강하게 유도됨을 확인할 수 있다.
한국세포주연구재단 KCLRF-BP-00295 20130423
<110> SAMSUNG ELECTRONICS CO., LTD. <120> Humanized or Affinity-matured Anti ANG-2 antibody and uses thereof <150> KR10-2014-0063251 <151> 2014-05-26 <160> 90 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-H1 of anti-Ang2 antibody <400> 1 Ser Asp Tyr Ala Trp Asn 1 5 <210> 2 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-H2 of anti-Ang2 antibody <400> 2 Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser 1 5 10 15 <210> 3 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-H3 of anti-Ang2 antibody <400> 3 Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr 1 5 <210> 4 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-L1 of anti-Ang2 antibody <400> 4 Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Val Ala 1 5 10 <210> 5 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-L2 of anti-Ang2 antibody <400> 5 Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> CDR-L3 of anti-Ang2 antibody <400> 6 Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Pro Trp Thr 1 5 <210> 7 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of heavy chain variable region <400> 7 Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Asp Leu Val Lys Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Thr Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Phe Pro Gly Asn Lys Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Ser Ile Thr Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Phe 65 70 75 80 Leu Gln Leu Asn Ser Val Thr Thr Gly Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Ser Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 8 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence encoding heavy chain variable region <400> 8 gatgtgcagc ttcaggagtc gggacctgac ctggtgaaac cttctcagtc tctgtccctc 60 acctgcactg tcactggcta ctcaatcacc agtgattatg cctggaactg gatccggcag 120 tttccaggaa acaaactgga gtggatgggc tacataaact acagtggtaa cactgactac 180 aacccatctc tcaaaagtcg aagctctatc actcgagaca catccaagaa ccagttcttc 240 ctgcagttga attctgtgac tactggggac acagccacat attactgtgc aagaggtaac 300 ttcgaaggtg ctatggacta ctggggtcaa ggaacctcag tcaccgtctc ctca 354 <210> 9 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of light chain variable region <400> 9 Ser Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly 50 55 60 Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala 65 70 75 80 Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 10 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence emcoding light chain 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105 110 Gln Gln Asn Ala Val Gln Asn Gln Thr Ala Val Met Ile Glu Ile Gly 115 120 125 Thr Asn Leu Leu Asn Gln Thr Ala Glu Gln Thr Arg Lys Leu Thr Asp 130 135 140 Val Glu Ala Gln Val Leu Asn Gln Thr Thr Arg Leu Glu Leu Gln Leu 145 150 155 160 Leu Glu His Ser Leu Ser Thr Asn Lys Leu Glu Lys Gln Ile Leu Asp 165 170 175 Gln Thr Ser Glu Ile Asn Lys Leu Gln Asp Lys Asn Ser Phe Leu Glu 180 185 190 Lys Lys Val Leu Ala Met Glu Asp Lys His Ile Ile Gln Leu Gln Ser 195 200 205 Ile Lys Glu Glu Lys Asp Gln Leu Gln Val Leu Val Ser Lys Gln Asn 210 215 220 Ser Ile Ile Glu Glu Leu Glu Lys Lys Ile Val Thr Ala Thr Val Asn 225 230 235 240 Asn Ser Val Leu Gln Lys Gln Gln His Asp Leu Met Glu Thr Val Asn 245 250 255 Asn Leu Leu Thr Met Met Ser Thr Ser Asn Ser Ala Lys Asp Pro Thr 260 265 270 Val Ala Lys Glu Glu Gln Ile Ser Phe Arg Asp Cys Ala Glu Val Phe 275 280 285 Lys Ser Gly His Thr Thr Asn Gly Ile Tyr Thr Leu Thr Phe Pro Asn 290 295 300 Ser Thr Glu Glu Ile Lys Ala Tyr Cys Asp Met Glu Ala Gly Gly Gly 305 310 315 320 Gly Trp Thr Ile Ile Gln Arg Arg Glu Asp Gly Ser Val Asp Phe Gln 325 330 335 Arg Thr Trp Lys Glu Tyr Lys Val Gly Phe Gly Asn Pro Ser Gly Glu 340 345 350 Tyr Trp Leu Gly Asn Glu Phe Val Ser Gln Leu Thr Asn Gln Gln Arg 355 360 365 Tyr Val Leu Lys Ile His Leu Lys Asp Trp Glu Gly Asn Glu Ala Tyr 370 375 380 Ser Leu Tyr Glu His Phe Tyr Leu Ser Ser Glu Glu Leu Asn Tyr Arg 385 390 395 400 Ile His Leu Lys Gly Leu Thr Gly Thr Ala Gly Lys Ile Ser Ser Ile 405 410 415 Ser Gln Pro Gly Asn Asp Phe Ser Thr Lys Asp Gly Asp Asn Asp Lys 420 425 430 Cys Ile Cys Lys Cys Ser Gln Met Leu Thr Gly Gly Trp Trp Phe Asp 435 440 445 Ala Cys Gly Pro Ser Asn Leu Asn Gly Met Tyr Tyr Pro Gln Arg Gln 450 455 460 Asn Thr Asn Lys Phe Asn Gly Ile Lys Trp Tyr Tyr Trp Lys Gly Ser 465 470 475 480 Gly Tyr Ser Leu Lys Ala Thr Thr Met Met Ile Arg Pro Ala Asp Phe 485 490 495 <210> 12 <211> 121 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of heavy chain variable region (4H10) <400> 12 Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30 Asp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ser Leu Ile Ser Pro Asp Ser Ser Ser Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Lys Asp Leu Ile Ser Phe Trp Arg Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly 100 105 110 Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 13 <211> 111 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of light chain variable region (4H10) <400> 13 Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln 1 5 10 15 Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn 20 25 30 Tyr Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Ala Asp Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Lys Ser Gly Thr 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Artificial Sequence <220> <223> Light chain variable region <400> 62 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp 20 25 30 Val His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Ile Pro Tyr Pro Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 63 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Light chain variable region <400> 63 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Phe Val Ser Thr Asp 20 25 30 Val His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Ile Pro Tyr Pro Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 64 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of heavy chain variable region(SEQ ID NO: 52) <400> 64 caggtgcaac tgcaggagtc aggccccggc ctggtaaaac cttctgaaac gctctcactt 60 acctgtgccg ttagtggata ctctatcact tccgactacg cttggaattg gattcggcag 120 cctccaggca aagggctgga atggatggga aagatttcct attccggtaa gactgactac 180 aatcccagtc tgaagagcag gtcaacaatc tccagagaca ccagcaagaa tcagttttcc 240 ctgaaattgt cctcggtgac agcagcggat accgcagtgt attattgcgc ccgcggtaac 300 ttcgagggag ctatggatta ctgggggcag ggtactctcg tcactgtgag cagc 354 <210> 65 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of heavy chain variable region(SEQ ID NO: 53) <400> 65 caggtgcaac tgcaggagtc aggccccggc ctggtaaaac cttctgaaac gctctcactt 60 acctgtgccg ttagtggata ctctatcact tccgactacg cttggaattg gattcggcag 120 cctccaggca aagggctgga atggatggga aagattaact atgccggtaa cactgactac 180 aatcccagtc tgaagagcag gtcaacaatc tccagagaca ccagcaagaa tcagttttcc 240 ctgaaattgt cctcggtgac agcagcggat accgcagtgt attattgcgc ccgcggtaac 300 ttcgagggag ctatggatta ctgggggcag ggtactctcg tcactgtgag cagc 354 <210> 66 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of heavy chain variable region(SEQ ID NO: 54) <400> 66 gaggttcagc tggtcgaaag cggtggggga ctcgtgcagc caggcggttc tcttagatta 60 tcatgtgccg catccgggta ctccatcacc tctgattatg catggaactg ggtcagacaa 120 gcccccggaa agggcctgga gtggatgggg aagatctcct attcagggaa gacagattat 180 aatccttcgc tgaaaagcag atcaacaatt agtagagaca cttctaaaaa tactttttac 240 ctccagatga acagtctgcg cgccgaagac accgccgtgt actactgcgc taggggaaat 300 ttcgagggag ctatggacta ttggggccag ggcacgttgg taaccgtgag cagc 354 <210> 67 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of heavy chain variable region(SEQ ID NO: 55) <400> 67 gaggttcaac tggtagagtc cgggggcggc ctggtccagc caggaggaag cctgcggctc 60 tcttgtgccg ccagcgggta tagtatcact tcagattatg cctggaattg ggtccgccag 120 gcccccggga agggcttaga gtggatgggt aaaattaatt acgcaggcaa caccgactat 180 aatccttcac tgaaatctag atccaccatc tctagagata caagtaagaa caccttttac 240 ttgcagatga atagcctcag ggctgaagac actgctgtgt actactgcgc aagaggaaac 300 ttcgaaggag cgatggatta ttggggccag ggtacgcttg tgacagtgtc ctct 354 <210> 68 <211> 354 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of heavy chain variable region(SEQ ID NO: 56) <400> 68 caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60 acctgcgctg tctctggtta ctccatcacc agtgattatg cctggaactg gatccggcag 120 cccccaggga aggggctgga gtggattggg tacataaact acagtggtaa cactgactac 180 aacccatctc tcaaaagtcg agtcaccata tcagtagaca cgtccaagaa ccagttctcc 240 ctgaagctga gctctgtgac cgccgcagac acggccgtgt attactgtgc gagaggtaac 300 ttcgaaggtg ctatggacta ctggggtcaa ggaacgcttg tgacagtgtc ctct 354 <210> 69 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 57) <400> 69 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtag cttggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaatc gctaccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 70 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 58) <400> 70 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtac attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaatc gctaccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 71 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 59) <400> 71 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtac attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaatc gctaccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcat gattatagct ctccgttcac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 72 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 60) <400> 72 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gttcgtgagt actgatgtac attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaatc gctaccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 73 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 61) <400> 73 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtag cttggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccatcc cataccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 74 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 62) <400> 74 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtac attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccatcc cataccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 75 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of light chain variable region(SEQ ID NO: 63) <400> 75 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gttcgtgagt actgatgtac attggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccatcc cataccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtcagcag gattatagct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 76 <211> 15 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Linker <400> 76 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 10 15 <210> 77 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 10D6-HU1 <400> 77 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Ser Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 35 40 45 Ile Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser 65 70 75 80 Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 78 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 10D6-HU2 <400> 78 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser 65 70 75 80 Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 79 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 10D6-HU3 <400> 79 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Thr Phe Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 80 <211> 240 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VH-linker-VL (scFv) of 10D6 <400> 80 Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Asp Leu Val Lys Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Thr Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Phe Pro Gly Asn Lys Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Ser Ile Thr Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Phe 65 70 75 80 Leu Gln Leu Asn Ser Val Thr Thr Gly Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 115 120 125 Gly Gly Gly Gly Ser Ser Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu 130 135 140 Leu Val Ser Ala Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln 145 150 155 160 Ser Val Ser Asn Asp Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser 165 170 175 Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro Gly Val Pro 180 185 190 Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile 195 200 205 Ser Thr Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp 210 215 220 Tyr Ser Ser Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 225 230 235 240 <210> 81 <211> 720 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of VH-linker-VL (scFv) of 10D6 <400> 81 gatgtgcagc ttcaggagtc gggacctgac ctggtgaaac cttctcagtc tctgtccctc 60 acctgcactg tcactggcta ctcaatcacc agtgattatg cctggaactg gatccggcag 120 tttccaggaa acaaactgga gtggatgggc tacataaact acagtggtaa cactgactac 180 aacccatctc tcaaaagtcg aagctctatc actcgagaca catccaagaa ccagttcttc 240 ctgcagttga attctgtgac tactggggac acagccacat attactgtgc aagaggtaac 300 ttcgaaggtg ctatggacta ctggggtcaa ggaacctcag tcaccgtctc ctcaggcggc 360 ggcggcagcg gcggcggcgg cagcggcggc ggcggcagca gtattgtgat gacccagact 420 cccaaattcc tgcttgtatc agcaggagac agggttacca taacctgcaa ggccagtcag 480 agtgtgagta atgatgtagc ttggtaccaa cagaagccag ggcagtctcc taaactgctg 540 atatactatg catccaatcg ctaccctgga gtccctgatc gcttcactgg cagtggatat 600 gggacggatt tcactttcac catcagcact gtgcaggctg aagacctggc agtttatttc 660 tgtcagcagg attatagctc tccgtggacg ttcggtggag gcaccaagct ggaaatcaaa 720 720 <210> 82 <211> 240 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VH-linker-VL (scFv) of10D6 opti-1 <400> 82 Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu 1 5 10 15 Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Lys Ile Ser Tyr Ser Gly Lys Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser 65 70 75 80 Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 115 120 125 Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu 130 135 140 Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln 145 150 155 160 Ser Val Ser Asn Asp Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala 165 170 175 Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro Gly Val Pro 180 185 190 Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile 195 200 205 Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp 210 215 220 Tyr Ser Ser Pro Trp Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 225 230 235 240 <210> 83 <211> 720 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Coding sequence of VH-linker-VL (scFv) of10D6 opti-1 <400> 83 caggtgcaac tgcaggagtc aggccccggc ctggtaaaac cttctgaaac gctctcactt 60 acctgtgccg ttagtggata ctctatcact tccgactacg cttggaattg gattcggcag 120 cctccaggca aagggctgga atggatggga aagatttcct attccggtaa gactgactac 180 aatcccagtc tgaagagcag gtcaacaatc tccagagaca ccagcaagaa tcagttttcc 240 ctgaaattgt cctcggtgac agcagcggat accgcagtgt attattgcgc ccgcggtaac 300 ttcgagggag ctatggatta ctgggggcag ggtactctcg tcactgtgag cagcggcggc 360 ggcggcagcg gcggcggcgg cagcggcggc ggcggcagcg acatccagat gacccagtct 420 ccatcctccc tgtctgcatc tgtaggagac agagtcacca tcacttgcaa ggccagtcag 480 agtgtgagta atgatgtagc ttggtatcag cagaaaccag ggaaagcccc taagctcctg 540 atctattatg catccaatcg ctaccctggg gtcccatcaa ggttcagtgg cagtggatct 600 gggacagatt tcactctcac catcagcagt ctgcaacctg aagattttgc aacttactac 660 tgtcagcagg attatagctc tccgtggacg ttcggtggag gcaccaaggt ggaaatcaaa 720 720 <210> 84 <211> 118 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Amino acid sequence of heavy chain variable region <400> 84 Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Thr Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Asp 20 25 30 Tyr Ala Trp Asn Trp Ile Arg Gln Phe Pro Gly Asn Lys Leu Glu Trp 35 40 45 Met Gly Tyr Ile Asn Tyr Ser Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Pro Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Arg Ser Ser Ile Thr Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Phe 65 70 75 80 Leu Gln Leu Asn Ser Val Thr Thr Gly Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys 85 90 95 Ala Arg Gly Asn Phe Glu Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105 110 Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 85 <211> 30 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> FR1 (N-terminal frame region of CDR-H1 of 10D6) <400> 85 Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Thr Gly Tyr Ser Ile Thr 20 25 30 <210> 86 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> FR4 (C-terminal frame region of CDR-H3 of 10D6) <400> 86 Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 87 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Light chain variable region <400> 87 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gly Gln Asp Tyr Ala Ser Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 88 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequence coding VL (h10D6-OPTI-64) <400> 88 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtag cttggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaacc gataccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtggacag gattatgcct ctccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321 <210> 89 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Light chain variable region <400> 89 Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp 20 25 30 Val His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Pro Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gly Gln Asp Tyr Ser Ala Pro Trp 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 90 <211> 321 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Nucleotide sequecne coding VL (h10D6-OPTI-66) <400> 90 gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60 atcacttgca aggccagtca gagtgtgagt aatgatgtac actggtatca gcagaaacca 120 gggaaagccc ctaagctcct gatctattat gcatccaacc gataccctgg ggtcccatca 180 aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240 gaagattttg caacttacta ctgtggacag gattattctg ccccgtggac gttcggtgga 300 ggcaccaagg tggaaatcaa a 321

Claims (18)

  1. 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)를 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위:
    서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)를 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위;
    상기 중쇄 상보성 결정부위 및 상기 경쇄 상보성 결정부위의 조합; 또는
    상기 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위의 조합
    을 포함하고,
    단, 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 2의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3를 모두 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 및 서열번호 4의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3를 모두 포함하는 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 제외된,
    앤지오포이에틴-2(Ang2)에 특이적으로 결합하고, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하는, 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  2. 제1항에 있어서,
    서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H1), 서열번호 2, 서열번호 14, 및 서열번호 15로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-H2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 (CDR-H3)를 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 또는 상기 중쇄 상보성 결정부위를 포함하는 중쇄 가변부위:
    서열번호 4, 서열번호 16, 또는 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L1), 서열번호 5 또는 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L2), 및 서열번호 6 또는 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드(CDR-L3)를 포함하는 경쇄 상보성 결정부위, 또는 상기 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 경쇄 가변부위;
    상기 중쇄 상보성 결정부위 및 상기 경쇄 상보성 결정부위의 조합; 또는
    상기 중쇄 가변부위 및 경쇄 가변부위의 조합
    을 포함하고,
    단, 서열번호 1의 CDR-H1, 서열번호 2의 CDR-H2, 및 서열번호 3의 CDR-H3를 모두 포함하는 중쇄 상보성 결정 부위, 및 서열번호 4의 CDR-L1, 서열번호 5의 CDR-L2, 및 서열번호 6의 CDR-L3를 모두 포함하는 경쇄 상보성 결정부위를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 제외된,
    앤지오포이에틴-2(Ang2)에 특이적으로 결합하고, Ang2와 함께 Tie2 수용체에 결합하는, 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  3. 제1항에 있어서,
    서열번호 52 내지 서열번호 56으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변부위, 및 서열번호 57 내지 서열번호 63으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변부위를 포함하는,
    항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항원 결합 단편은 항 Ang2 항체의 scFv, (scFv)2, scFv-Fc, Fab, Fab' 및 F(ab')2로 이루어진 군에서 선택되는 것인, 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는, Ang2 과발현, 신생혈관 형성, 또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병의 예방 또는 치료를 위한 약학 조성물.
  6. 제5항에 있어서, 상기 Ang2 과발현, 신생혈관 형성, 또는 혈관 투과성 증가와 관련된 질병은 암, 암전이, 염증 질환, 감염, 심혈관질환, 신장 질환, 유전성 출혈성 모세혈관 확장증, 천식, 또는 부종인, 약학 조성물.
  7. 제5항에 있어서, Ang2를 추가로 포함하는, 약학 조성물.
  8. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는, 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병의 예방 또는 치료를 위한 약학 조성물.
  9. 제8항에 있어서, 상기 정상 혈관 생성 감소와 관련된 질병은 심근경색, 협심증, 뇌경색, 뇌졸중, 버거씨병, 무혈관 괴사, 족부궤양, 또는 발기부전인, 약학 조성물.
  10. 제8항에 있어서, Ang2를 추가로 포함하는, 약학 조성물.
  11. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는 조직 재생 또는 상처 치유용 약학 조성물.
  12. 제11항에 있어서, Ang2를 추가로 포함하는, 약학 조성물.
  13. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는, Ang2 과발현과 관련된 질병의 진단용 조성물.
  14. 제13항에 있어서, 상기 Ang2 과발현과 관련된 질병은 암, 암전이, 감염, 또는 심혈관질환인, 진단용 조성물.
  15. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 Ang2, 및 Tie2 수용체가 결합된 복합체.
  16. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항의 항 Ang2 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 Ang2와 결합된 복합체.
  17. 서열번호 20, 서열번호 21, 서열번호 22, 및 서열번호 23으로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드.
  18. 제17항에 있어서, 상기 폴리펩타이드는 서열번호 14, 서열번호 15, 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 18, 및 서열번호 19로 이루어진 군에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 것인, 폴리펩타이드.
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