JP5886302B2 - 多様な生体試料分析のための自動リアルタイムpcrシステム - Google Patents
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- G01N35/028—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor using a plurality of sample containers moved by a conveyor system past one or more treatment or analysis stations having reaction cells in the form of microtitration plates
-
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-
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-
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-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
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- B03C—MAGNETIC OR ELECTROSTATIC SEPARATION OF SOLID MATERIALS FROM SOLID MATERIALS OR FLUIDS; SEPARATION BY HIGH-VOLTAGE ELECTRIC FIELDS
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-
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-
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- G01N2035/046—General conveyor features
- G01N2035/0465—Loading or unloading the conveyor
-
- G—PHYSICS
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- G01N35/0098—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor involving analyte bound to insoluble magnetic carrier, e.g. using magnetic separation
Description
acid testing)の一番広く使われる検査方法であり、遺伝子を定性だけではなく定量的に短時間に分析することができるので、体外診断の市場の中で一番速い速度で成長しており、世界市場が年平均約20%に成長している。
load test)、診断検査の結果を独立的に確認するための確診検査(confirmatory test)、治療法の決定と薬物選択及び薬効評価のための薬物遺伝体検査(pharmacogenomic
test)、疾患予防を目的で遺伝的素因(genetic predisposition)を確認するとか、腫瘍に係わる異常遺伝子を検出するかまたはモニタリング(monitoring)する分野などに多様に応用されている。
9970434、US Pat. 11977697)、リアルタイム定量PCRを遂行することができるカートリッジ(US Pat. 6660228、US Pat. 7101509)、個別的に核酸抽出とリアルタイム定量PCRを遂行することができるカートリッジ形態の自動化装備(US
Pat. 6660228、US Pat. 710150、US Pat. 11742028)を開発した。ここで、GeneXpertはInfinityシステムとして(カートリッジ単位で)1個、4個、または16個のカートリッジを使い、カートリッジの装着及び検査を自動で遂行する。
Pat. 7718421、US Pat. 7785535、US Pat. 12782354)。
Pat. 12515003、200090719、20090130745、20080714)。
bank screening)のような数百余個の試料を処理するのには時間があまり長くかかり、検査者が随時管理しなければならない限界がある。
generations)以下の短時間だけ培養した後、培養前後の試料をリアルタイム定量PCRでDNA量を相対定量法で比較すれば、短時間内に生きている生菌数を正確に分析ができる。本発明の装備を使って同様な原理で自動で抗生剤感受性検査を遂行することができる。抗生剤が含まれた培地と抗生剤が含まれない培地で2〜4時間培養した後、各微生物の遺伝子である16S
rRNA配列やrpoB遺伝子をリアルタイム定量PCRで分析して抗生剤感受性を速かに検査する方法が報告されている(Journal of Antimicrobial
Chemotherapy(2004) 53、 538−541)。グラム陽性菌類は4時間、グラム陰性菌は2時間のうちに、35度でそれぞれ異なる抗生剤を添加して培養した後、リアルタイム定量PCRで分析すると、4時間ないし6時間内に抗生剤感受性を迅速に分かることができる方法として提案された。しかし、このような機能をする自動化装備はまだ開発されていない。本発明は、それぞれ異なる抗生剤を含んでいるマルチウェルに微生物を含んでいる生体試料を同量で加えて一定時間培養した後、リアルタイム定量分析を行ってターゲット微生物の核酸の数を相対定量法で比較することで微生物の抗生剤の感受性を迅速に分析して短時間内に効果的な抗生剤を選択する手段を提供することである。
antibody)に抗原を固定化させた後、これにターゲット核酸でラベリングされた第2抗体を固定した後、これをリアルタイム定量PCRで分析する方法である。第2抗体はターゲット核酸が共有結合で付いている抗体と第2抗体にストレプトアビジン(streptavidin)が結合されたものにさらにビオチン(biotin)でラベリングされたターゲット核酸を付けた抗体を含む(Nature
Protocols 1918−19308、(2007))。この方法は、ターゲット核酸を第2抗体に付ける方法によって多くの段階の付着反応と洗浄段階を経て、最終的に抗原に付いているターゲット核酸をリアルタイム定量PCRで定量分析する。したがって、定量免疫PCRはそれぞれのステップがいずれも敏感度、特異性、再現性に決定的な役目をする。それにもかかわらず、まだ自動で多数の試料を処理する装備が開発されていない。
200:精製用マルチウェルプレート
210:細胞溶解溶液用マルチウェルプレート
220:磁性粒子分散溶液用マルチウェルプレート
230:核酸結合用マルチウェルプレート
241、242、243:洗浄溶液用マルチウェルプレート
250:核酸溶出溶液用マルチウェルプレート
310:精製用ピペット
320:分注用ピペット
400:PCR用マルチウェルプレート
410:第1PCR用マルチウェルプレート
420:第2PCR用マルチウェルプレート
1000:デッキ
1110H:把持ホール
2000:自動デッキ保管及びデッキ移動装置
2000C:保管ケース
2000C−1:ドア
2100:積層ラック
2110:ラック
2112:パレットガイド
2130:パレット
2130H:引出用パレット溝
2131:パレット移送用ドッグ
2210M:積層ラック昇降モーター
2240S:積層ラック昇降用ボールスクリュー軸
2240N:積層ラック昇降用ボールナット
2250:積層ラック上下移動連結部材
2300:パレット移動装置
2310:パレット移動モーター
2320:パレット前後移動ベルト
2330:パレット前後移動ブロック
2400:デッキ移送機
2410:デッキ移送モーター
2430:デッキ左右移動ベルト
2440:デッキ引出スライダー連結部材
2450:デッキ引出スライダー
2451:デッキ引出突起
2451−1:挿着ピン
3000:シリンジブロック
3100:シリンジピン
Claims (29)
- 生体試料に含有されたターゲット物質内のターゲット核酸、前記生体試料に含有されたターゲット物質を培養した後、前記生体試料に含有されたターゲット物質内のターゲット核酸、及び、前記生体試料に含有されたターゲット抗原と抗原抗体反応によって結合された付着用ターゲット核酸のいずれかを精製するための生体試料処理用マルチウェルプレート及びリアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入されたPCR用マルチウェルプレート400を搭載するためのデッキ1000、
前記生体試料から前記ターゲット核酸または培養された前記ターゲット核酸を自動で精製し、精製された前記ターゲット核酸または培養後に精製された前記ターゲット核酸を前記PCR用マルチウェルプレート400に分注して前記リアルタイム定量PCRのための試薬と混合するか、あるいは前記生体試料に含有された前記ターゲット抗原と抗原抗体反応によって結合された前記付着用ターゲット核酸を自動で精製し、精製された前記付着用ターゲット核酸を前記PCR用マルチウェルプレート400に分注して前記リアルタイム定量PCRのための試薬と混合するための自動精製及び反応準備装置、
前記デッキ1000を入出庫するためのドア2000C−1が形成され、内部を特定の温度に維持することができる保管ケース2000C及び前記保管ケース2000Cから前記デッキ1000を前記自動精製及び反応準備装置に移動させるためのデッキ移送機2400を備える自動デッキ保管及びデッキ移動装置2000、
精製された前記ターゲット核酸、培養後に精製された前記ターゲット核酸または精製された前記付着用ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400の上面を密封するための密封装置6000、
前記PCR用マルチウェルプレート400に遠心力を加え、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの側壁に残留する物質を離脱させて、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの底方向に移動させるための遠心分離機7200、
前記PCR用マルチウェルプレート400内の前記ターゲット物質を増幅するためのリアルタイム定量遺伝子増幅装置8000、及び
精製された前記ターゲット核酸、培養後に精製された前記ターゲット核酸または精製された前記付着用ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記密封装置6000に移動させ、前記密封装置6000によって密封された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記遠心分離機7200に移動させ、前記遠心分離機7200によって遠心力が加わった前記PCR用マルチウェルプレート400を前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000に移動させるためのPCR用マルチウェルプレート移動装置9000、
を含むことを特徴とする、多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記自動精製及び反応準備装置は、
流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000、
前記多数の第1装着部3330に装着された前記多数のピペットPが前記生体試料処理用マルチウェルプレート及び前記PCR用マルチウェルプレート400のそれぞれの直上方に位置するように、前記シリンジブロック3000を移動させるシリンジブロック移動装置4000、
前記シリンジブロック移動装置4000に連結設置される溶液受皿移動装置によって前記多数の第1装着部3330に装着された前記多数のピペットPの下部に移動可能に設置される溶液受皿4375、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で第1特定マルチウェルプレートに磁場を印加するために、磁石5110を前記第1特定マルチウェルプレートの下部に移動させる磁場印加装置5100、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で第2特定マルチウェルプレートを加熱するために、ヒーティングブロック5220を前記第2特定マルチウェルプレートの下部に移動させるヒーティング装置5200、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの上面を密封している密封フィルムに孔を形成するための千枚通し状の多数のパンチャーピン12110が突設され、前記シリンジブロック3000の下部に設置され、前記多数のピペットPとは異なる時点で前記多数の第1装着部3330に分離可能に装着されるパンチャー12100、及び
前記シリンジブロック3000の下部に設置され、前記多数の第1装着部3330に装着された前記多数のピペットPから捨てられる廃液を排出するための廃液排出部12300、
を含むことを特徴とする、請求項1に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記溶液受皿移動装置は、
前記シリンジブロック移動装置4000に連結される溶液受皿用支持板4371、及び
前記溶液受皿用支持板4371に設置され、前記溶液受皿4375を水平方向に回転させるために前記溶液受皿4375に連結される溶液受皿移動モーター4373、
を含むことを特徴とする、請求項2に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記自動精製及び反応準備装置は、
流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000、
前記多数の第1装着部3330に装着された前記多数のピペットPが前記生体試料処理用マルチウェルプレート及び前記PCR用マルチウェルプレート400のそれぞれの直上方に位置するように、前記シリンジブロック3000を移動させるシリンジブロック移動装置4000、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で第1特定マルチウェルプレートに磁場を印加するために、磁石5110を前記第1特定マルチウェルプレートの下部に移動させる磁場印加装置5100、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で第2特定マルチウェルプレートを加熱するために、ヒーティングブロック5220を前記第2特定マルチウェルプレートの下部に移動させるヒーティング装置5200、
前記生体試料処理用マルチウェルプレートの上面を密封している密封フィルムに孔を形成するための千枚通し状の多数のパンチャーピン12110が突設され、前記シリンジブロック3000の下部に設置され、前記多数のピペットPとは異なる時点で前記多数の第1装着部3330に分離可能に装着されるパンチャー12100、
圧縮空気供給管が連結され、前記圧縮空気供給管を通じて流入した圧縮空気が流出され、前記多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第2装着部12210が形成され、前記シリンジブロック3000の下部に設置され、前記多数のピペットP及び前記パンチャー12100とは異なる時点で前記多数の第1装着部3330に分離可能に装着されるマルチウェルプレート用蒸発ブロック12200、及び
前記シリンジブロック3000の下部に設置され、前記多数の第1装着部3330に装着された前記多数のピペットPから捨てられる廃液を排出するための廃液排出部12300、
を含むことを特徴とする、請求項1に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記リアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入されたPCR用マルチウェルプレート400はリアルタイム定量PCRのための試薬が注入された多数のチューブが備えられた増幅キットプレートであり、
前記第1特定マルチウェルプレートは、前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で、前記デッキ1000への装着の際に磁性粒子の懸濁された磁性粒子懸濁液が注入されている磁性粒子分散溶液用マルチウェルプレート220であり、
前記第2特定マルチウェルプレートは、前記生体試料処理用マルチウェルプレートの中で、前記デッキ1000への装着の際に前記生体試料が注入されている前記生体試料用マルチウェルプレート100であることを特徴とする、請求項4に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記生体試料処理用マルチウェルプレートは、
前記生体試料用マルチウェルプレート100、
前記デッキ1000への装着の際に細胞溶解溶液が注入されている細胞溶解溶液用マルチウェルプレート210、
前記磁性粒子分散溶液用マルチウェルプレート220、
前記デッキ1000への装着の際に核酸結合溶液が注入されている核酸結合溶液用マルチウェルプレート230、
前記デッキ1000への装着の際に洗浄溶液が注入されている洗浄溶液用マルチウェルプレート241、242、243、及び
前記デッキ1000への装着の際に核酸溶出溶液が注入されている核酸溶出溶液用マルチウェルプレート250、
を含むことを特徴とする、請求項5に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記多数のピペットPは多数の精製用ピペットP1または前記多数の精製用ピペットP1より容量の少ない多数の分注用ピペットP2であり、
前記デッキ1000には、前記多数の精製用ピペットP1が挿着収容される精製用ピペット310、及び前記多数の分注用ピペットP2が挿着収容される分注用ピペット320が搭載され、
前記PCR用マルチウェルプレート400は、第1PCR用マルチウェルプレート410及び第2PCR用マルチウェルプレート420を含むことを特徴とする、請求項2〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記磁場印加装置5100は、
前記磁石5110が設置される磁石装着ブロック5120、及び
前記磁石装着ブロック5120を昇降させる磁石装着ブロック昇降部、
を含むことを特徴とする、請求項2〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記磁石装着ブロック5120の上昇の際、前記磁石5110の上端部が前記磁性粒子分散溶液用マルチウェルプレート220に形成されたそれぞれのウェルを取り囲むために、前記磁石5110は多数が相互に離隔して設置される棒状の棒磁石であることを特徴とする、請求項8に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。
- 前記磁石装着ブロック昇降部は、
前記磁石装着ブロック5120の下部に位置する磁場印加装置用支持板5130、及び
前記磁場印加装置用支持板5130に連結設置され、前記磁石装着ブロック5120を昇降させるために前記磁石装着ブロック5120に連結される磁石装着ブロック昇降モーター5120M、
を含むことを特徴とする、請求項8に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記ヒーティング装置5200は、前記ヒーティングブロック5220を昇降させるためのヒーティングブロック昇降部を含むことを特徴とする、請求項2〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。
- 前記磁場印加装置5100は、
前記磁石装着ブロック5120の下部に位置する磁場印加装置用支持板5130、及び
前記磁場印加装置用支持板5130に連結設置され、前記磁石装着ブロック5120を昇降させるために前記磁石装着ブロック5120に連結される磁石装着ブロック昇降モーター5120M、
を含み、
前記ヒーティング装置5200は、
前記ヒーティングブロック5220を前記デッキ1000の前後方向に移動させるためのヒーティングブロック前後移動装置を含み、
前記磁場印加装置用支持板5130とヒーティング装置用支持板5230は前記デッキ1000の前後方向に隣合って相互に連結されることを特徴とする、請求項11に記載の自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記シリンジブロック3000は、
多数の棒状のシリンジピン3100が付着され、上下に移動可能なシリンジピンホルダー3200、
前記多数のシリンジピン3100の上下移動を案内するシリンジピン案内孔3310Hが形成されるシリンジピン案内ブロック3300、
前記シリンジピンホルダー3200に接触して下方に移動することで、前記多数の第1装着部3330にそれぞれ相異なる時点で装着された前記多数のピペットP、前記パンチャー12100、及び前記マルチウェルプレート用蒸発ブロック12200の中で少なくとも前記多数のピペットP及び前記マルチウェルプレート用蒸発ブロック12200を分離させるための第1分離部、及び
前記シリンジピンホルダー3200に接触して下方に移動することで、前記マルチウェルプレート用蒸発ブロック12200に備えられる第2−2分離部と連動して前記多数の第2装着部12210に装着された前記多数のピペットPを分離させるための第2−1分離部、
を含むことを特徴とする、請求項4〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記シリンジブロック移動装置4000は、前記シリンジブロック3000を前記デッキ1000の前後方向に移動させるシリンジブロック前後移動装置4100、前記デッキ1000の左右方向に移動させるシリンジブロック左右移動装置4200、及び上下方向に移動させるシリンジブロック上下移動装置4300を含み、
前記シリンジブロック前後移動装置4100は、シリンジブロック前後移動体4110、及び前記シリンジブロック前後移動体4110から離隔して設置され、前記シリンジブロック前後移動体4110を前記デッキ1000の前後方向に移動させるために前記シリンジブロック前後移動体4110に連結されるシリンジブロック前後移動モーター4110M、を含み、
前記シリンジブロック左右移動装置4200は、前記シリンジブロック前後移動体4110に固定設置されるシリンジブロック左右移動モーター4210M、及び前記デッキ1000の左右方向に移動できるように前記シリンジブロック前後移動体4110に設置され、前記シリンジブロック左右移動モーター4210Mに連結されるシリンジブロック左右移動体4210、を含み、
前記シリンジブロック上下移動装置4300は、前記シリンジブロック左右移動体4210に固定設置されるシリンジブロック上下移動装置用支持板4360、及び前記シリンジブロック上下移動装置用支持板4360に装着されて、前記シリンジブロック3000を上下方向に移動させるために前記シリンジブロック3000に連結されるシリンジブロック前後移動モーター4110M、を含むことを特徴とする、請求項2〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記自動デッキ保管及びデッキ移動装置2000は、
多数のラック2110が上下に積層されてなる積層ラック2100、及び
前記ドア2000C−1を通じて多数の前記デッキ1000がそれぞれ多数の前記ラック2110に入出庫可能となるように前記積層ラック2100を上下に移動させる積層ラック昇降装置、
を含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記自動デッキ保管及びデッキ移動装置2000は、
前記ラック2110に備えられるパレットガイド2112にスライド可能に装着され、一側面にパレット移送用ドッグ2131及び引出用パレット溝2130Hが形成されるパレット2130、及び
前記デッキ1000が前記パレット2130の上面に装着可能となるように、前記パレット移送用ドッグ2131と接触して前記パレット2130をスライドさせて前記保管ケース2000Cの外部に引き出すパレット移動装置2300、
を含むことを特徴とする、請求項15に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記密封装置6000は、
前記PCR用マルチウェルプレート400が装着され、前記デッキ1000の前後方向に移動できるように設置される密封ローディングプレート6294、
密封フィルムを支持する下部圧迫部6230、
下方に移動して前記下部圧迫部6230の上面に位置する前記密封フィルムを圧迫するように前記下部圧迫部6230の上部に設置される上側圧迫部6243、
下方に移動して前記下部圧迫部6230と前記上側圧迫部6243の間に圧迫された前記密封フィルムを切断するように前記上側圧迫部6243の前方または後方に設置されるフィルムカッター6250、及び
前記PCR用マルチウェルプレート400の上面に装着される前記密封フィルムを前記PCR用マルチウェルプレート400に熱圧着するために、前記密封装置用中間板6260の上部に下方に移動可能に設置されるフィルムヒーティングブロック6310、
を含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための電子同室時間定量増幅システム。 - 前記下部圧迫部6230に弾性接触する第1支持スプリング6241、
前記第1支持スプリング6241に弾支されて前記上側圧迫部6243上部に設置され、前記フィルムカッター6250が設置される上側圧迫部支持ブロック6240、
前記上側圧迫部6243と前記上側圧迫部支持ブロック6240の間に弾性接触するように設置される第2支持スプリング6242、及び
前記上側圧迫部6243に連結されて前記上側圧迫部6243の上側に延設され、上下方向にスライド可能に前記上側圧迫部支持ブロック6240に結合され、前記上側圧迫部支持ブロック6240からの離脱を防止するためのストッパー6244−1が形成される上側圧迫部支持棒6244、
をさらに含むことを特徴とする、請求項17に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記遠心分離機7200に移送されるに先立ち、前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記密封装置6000から移動した前記PCR用マルチウェルプレート400に振動を加えることで前記PCR用マルチウェルプレート400に注入された物質を混合するためのボーデッキスミキサー7100をさらに含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。
- 前記遠心分離機7200は、
上下方向に設置され、遠心分離機用モーター7200Mによって回転する遠心分離機用従動軸7230、
両側端に開放部が形成されるように"I"字形に形成され、前記遠心分離機用従動軸7230に一体的に締結される遠心分離機用回転板7240、及び
前記PCR用マルチウェルプレート400が装着され、前記遠心分離機用回転板7240の回転の際、前記PCR用マルチウェルプレート400の上面が内側に向かい、下面が外側に向かって傾くように、前記遠心分離機用回転板7240の両側端開放部に回動可能に装着される遠心分離機用装着ブロック7250、
を含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000は、
前記デッキ移送機2400によって移動した前記デッキ1000の前方上側に左右方向に設置されるPCR用マルチウェルプレート移動案内ブロック9100、
PCR用マルチウェルプレート左右移動モーター9210Mに連結され、前記デッキ1000の左右方向に移動できるように前記PCR用マルチウェルプレート移動案内ブロック9100に設置されるPCR用マルチウェルプレート左右移動ブロック9210、
前記PCR用マルチウェルプレート左右移動ブロック9210に前後方向に突出して装着されるPCR用マルチウェルプレート前後移動案内ブロック9320、
前記PCR用マルチウェルプレート前後移動案内ブロック9320に設置されたPCR用マルチウェルプレート前後移動モーター9310Mに連結され、前記デッキ1000の前後方向に移動できるように前記PCR用マルチウェルプレート前後移動案内ブロック9320に設置されるPCR用マルチウェルプレート前後移動ブロック9314、
前記PCR用マルチウェルプレート前後移動ブロック9314に固定設置されるPCR用マルチウェルプレート上下移動案内ブロック9410、及び
前記PCR用マルチウェルプレート上下移動案内ブロック9410に設置されたPCR用マルチウェルプレート上下移動モーター9510Mに連結され、上下方向に移動できるように設置されるPCR用マルチウェルプレート把持手段9600、
を含むことを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の多様な生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システム。 - 請求項1の生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システムを用いた自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法において、
ターゲット物質を含む生体試料が注入された生体試料用マルチウェルプレート100、前記ターゲット物質内のターゲット核酸を精製するための多数の精製用マルチウェルプレート200、及び前記リアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入されたPCR用前記マルチウェルプレート400が搭載された前記デッキ1000を前記保管ケース2000Cに入庫させるデッキ入庫段階、
前記デッキ1000を、前記デッキ移送機2400によって、流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000の下部に移動させるデッキ移動段階、
前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000、前記生体試料用マルチウェルプレート100、及び前記多数の精製用マルチウェルプレート200によって前記ターゲット核酸を精製するターゲット核酸精製段階、
前記精製されたターゲット核酸を前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000によって前記PCR用マルチウェルプレート400に分注するターゲット核酸分注段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記密封装置6000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第1移動段階、
前記密封装置6000によって前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400の上面を密封するPCR用マルチウェルプレート密封段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記遠心分離機7200に移動させるPCR用マルチウェルプレート第3移動段階、
前記遠心分離機7200によって前記PCR用マルチウェルプレート400に遠心力を加え、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの側壁に残留する物質を離脱させて、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの底方向に移動させるPCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階、
前記PCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート400を前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第4移動段階、及び
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって前記PCR用マルチウェルプレート400内の前記ターゲット核酸をリアルタイムで増幅するターゲット核酸リアルタイム定量増幅段階、
を含むことを特徴とする、自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法。 - 前記ターゲット核酸リアルタイム定量増幅段階は、前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって、時間の経過による前記ターゲット核酸の定量増幅量を示すリアルタイム核酸定量増幅データを獲得し、獲得された前記リアルタイム核酸定量増幅データを表示するか、あるいは獲得された前記リアルタイム核酸定量増幅データを外部に送出することを特徴とする、請求項22に記載の自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法。
- 前記デッキ入庫段階では、前記デッキ1000が前記保管ケース2000Cに多数入庫され、
前記PCR用マルチウェルプレート第1移動段階の遂行後、前記デッキ1000を前記デッキ移送機2400によって前記保管ケース2000Cに移動させるデッキ原位置移動段階、及び
リアルタイム増幅が遂行された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によってマルチウェルプレート収集容器に投入するPCR用マルチウェルプレート第5移動段階(S10000)、
を含み、
前記多数のデッキ1000に搭載されたそれぞれの前記生体試料に対するターゲット核酸の精製過程及び精製されたターゲット核酸の増幅過程が遂行されるように、前記デッキ移動段階から前記PCR用マルチウェルプレート第5移動段階までの段階は前記保管ケース2000Cに入庫された前記デッキ1000の個数に対応して繰り返し行われることを特徴とする、請求項22に記載の自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法。 - 前記多数のデッキ1000のいずれか一つのデッキ1000が前記デッキ原位置移動段階によって前記保管ケース2000Cに移動すれば、前記多数のデッキ1000の他の一つのデッキ1000が前記デッキ移動段階によって前記シリンジブロック3000の下部に移動し、
前記いずれか一つのデッキ1000に搭載された前記生体試料に対するターゲット核酸精製及び精製されたターゲット核酸の増幅のために行われる段階の中で前記PCR用マルチウェルプレート密封段階から前記PCR用マルチウェルプレート第5移動段階までの段階は、前記他の一つのデッキ1000に搭載された前記生体試料に対するターゲット核酸精製及び精製されたターゲット核酸の増幅のために行われる段階の中で前記デッキ移動段階から前記デッキ原位置移動段階までの段階と同時に行われることを特徴とする、請求項24に記載の自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法。 - 前記PCR用マルチウェルプレート密封段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400をボーデッキスミキサー7100に移動させるPCR用マルチウェルプレート第2移動段階、及び
前記PCR用マルチウェルプレート第2移動段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート第3移動段階の遂行に先立ち、上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400に前記ボーデッキスミキサー7100によって振動を加えることで、上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400内の注入液を振盪して混合するPCR用マルチウェルプレート注入液混合段階、
をさらに含むことを特徴とする、請求項22〜25のいずれか一項に記載の自動核酸精製及びリアルタイム定量遺伝子増幅方法。 - 請求項1の生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システムによって生体試料に含有された病源菌を培養した後、リアルタイム定量PCRを行って前記病源菌の生菌数を検査するリアルタイム定量PCRを用いた病源菌の生菌数検査方法において、
一つの単位ウェルを構成する二つのウェルには培養液と混合された同一生体試料が注入され、他の単位ウェルには培養液と混合された他の生体試料が注入され、それぞれの前記単位ウェルのいずれか一つのウェルには殺菌物質が注入された生体試料用マルチウェルプレート100、前記病源菌に含有されたターゲット核酸を精製するための多数の精製用マルチウェルプレート200、及び前記リアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入された前記PCR用マルチウェルプレート400が搭載された前記デッキ1000を前記保管ケース2000Cに入庫させるデッキ入庫段階、
前記保管ケース2000Cで、前記生体試料用マルチウェルプレート100に含まれている前記病源菌を所定の条件で培養する生体試料病源菌培養段階、
前記デッキ1000を、流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000の下部に移動させるデッキ移動段階、
前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000、前記生体試料用マルチウェルプレート100、及び前記多数の精製用マルチウェルプレート200によって前記ターゲット核酸を精製するターゲット核酸精製段階、
前記精製されたターゲット核酸を前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000によって前記PCR用マルチウェルプレート400に分注するターゲット核酸分注段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400を密封装置6000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第1移動段階、
前記密封装置6000によって、前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400の上面を密封するPCR用マルチウェルプレート密封段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記遠心分離機7200に移動させるPCR用マルチウェルプレート第3移動段階、
前記遠心分離機7200によって前記PCR用マルチウェルプレート400に遠心力を加え、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの側壁に残留する物質を離脱させて、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの底方向に移動させるPCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階、
前記PCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート400を前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によってリアルタイム定量遺伝子増幅装置8000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第4移動段階、
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって前記PCR用マルチウェルプレート400内の前記ターゲット核酸をリアルタイムで増幅するターゲット核酸リアルタイム定量増幅段階、及び
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって、時間の経過による前記ターゲット核酸の定量増幅量を示すリアルタイム核酸定量増幅データを獲得し、前記それぞれの単位ウェルの中で殺菌物質が注入されたウェルと殺菌物質が注入されていないウェル内の精製された前記ターゲット核酸のリアルタイム核酸定量増幅データを用いた相手定量分析によって前記それぞれの単位ウェルの中で殺菌物質が注入されたウェルの生菌数を獲得する生菌数獲得段階、
を含むことを特徴とする、リアルタイム定量PCRを用いた病源菌の自動生菌数検査方法。 - 請求項1の生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システムによって生体試料に含有された病源菌を抗生剤を含む培養液で培養した後、リアルタイム定量PCRを行って前記病源菌の抗生剤感受性を分析するリアルタイム定量PCRを用いた病源菌の抗生剤感受性分析方法において、
一つの単位ウェルを構成するM個のウェルには培養液と混合された同一生体試料が注入され、他の単位ウェルには培養液と混合された他の生体試料が注入され、それぞれの前記単位ウェルの中でM−1個のウェルにはそれぞれ互いに異なる抗生剤が注入された生体試料用マルチウェルプレート100、前記病源菌に含有されたターゲット核酸を精製するための多数の精製用マルチウェルプレート200、及び前記リアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入された前記PCR用マルチウェルプレート400が搭載された前記デッキ1000を前記保管ケース2000Cに入庫させるデッキ入庫段階、
前記保管ケース2000Cで、前記生体試料用マルチウェルプレート100に含まれている前記病源菌を所定の条件で培養する生体試料病源菌培養段階、
前記デッキ1000を、流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000の下部に移動させるデッキ移動段階、
前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000、前記生体試料用マルチウェルプレート100、及び前記多数の精製用マルチウェルプレート200によって前記ターゲット核酸を精製するターゲット核酸精製段階、
前記精製されたターゲット核酸を前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000によって前記PCR用マルチウェルプレート400に分注するターゲット核酸分注段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記密封装置6000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第1移動段階、
前記密封装置6000によって前記ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400の上面を密封するPCR用マルチウェルプレート密封段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記遠心分離機7200に移動させるPCR用マルチウェルプレート第3移動段階、
前記遠心分離機7200によって前記PCR用マルチウェルプレート400に遠心力を加え、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの側壁に残留する物質を離脱させて前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの底方向に移動させるPCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階、
前記PCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート400を前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第4移動段階、
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって前記PCR用マルチウェルプレート400内の前記ターゲット核酸をリアルタイムで増幅するターゲット核酸リアルタイム定量増幅段階、及び
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって、時間の経過による前記ターゲット核酸の定量増幅量を示すリアルタイム核酸定量増幅データを獲得し、前記それぞれの単位ウェルの中で抗生剤が注入されたウェルと抗生剤が注入されていないウェル内の精製された前記ターゲット核酸のリアルタイム核酸定量増幅データを用いた相手定量分析によって前記それぞれの単位ウェルに注入された互いに異なる抗生剤の感受性を獲得する抗生剤感受性獲得段階、
を含むことを特徴とする、リアルタイム定量PCRを用いた病源菌の自動抗生剤感受性分析方法。 - 請求項1の生体試料分析のための自動リアルタイム定量増幅システムによって定量免疫PCRを遂行することで、生体試料に含有された抗原の濃度を定量検査する定量免疫PCRを用いた抗原濃度獲得方法において、
ターゲット抗原が含有された生体試料が注入された生体試料用マルチウェルプレート100、前記ターゲット抗原と結合する抗原結合用第1抗体がコートされている磁性粒子の懸濁された磁性粒子懸濁液が注入されている捕捉抗体磁性粒子懸濁液用マルチウェルプレート、付着用ターゲット核酸がラベリングされ、前記抗原結合用第1抗体に捕捉された前記ターゲット抗原と結合するための第2抗体が含有された第2抗体含有溶液が注入されているターゲット核酸ラベル用マルチウェルプレート、洗浄溶液が注入されている洗浄溶液用マルチウェルプレート241、242、243、核酸溶出溶液が注入されている核酸溶出溶液用マルチウェルプレート250、及び前記リアルタイム定量PCRのための反応混合物が注入された前記PCR用マルチウェルプレート400が搭載された前記デッキ1000を前記保管ケース2000Cに入庫させるデッキ入庫段階、
前記デッキ1000を、流動性物質の吸入及び吐出のための多数のピペットPを分離可能に装着するための多数の第1装着部3330が形成されたシリンジブロック3000の下部に移動させるデッキ移動段階、
前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000、前記生体試料用マルチウェルプレート100、前記捕捉抗体磁性粒子懸濁液用マルチウェルプレート、前記ターゲット核酸ラベル用マルチウェルプレート、前記洗浄溶液用マルチウェルプレート241、242、243、及び前記核酸溶出溶液用マルチウェルプレート250によって抗原抗体反応を遂行し、前記第2抗体にラベリングされた前記付着用ターゲット核酸を精製するターゲット核酸精製段階、
前記精製された付着用ターゲット核酸を前記多数のピペットPが分離可能に装着された前記シリンジブロック3000によって前記PCR用マルチウェルプレート400に分注するターゲット核酸分注段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記付着用ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記密封装置6000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第1移動段階、
前記密封装置6000によって前記付着用ターゲット核酸の分注された前記PCR用マルチウェルプレート400の上面を密封するPCR用マルチウェルプレート密封段階、
前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって上面の密封された前記PCR用マルチウェルプレート400を前記遠心分離機7200に移動させるPCR用マルチウェルプレート第3移動段階、
前記遠心分離機7200によって前記PCR用マルチウェルプレート400に遠心力を加えて、前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの側壁に残留する物質を離脱させて前記PCR用マルチウェルプレート400に備えられたそれぞれのウェルの底方向に移動させるPCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階、
前記PCR用マルチウェルプレート注入液沈降段階の遂行後、前記PCR用マルチウェルプレート400を前記PCR用マルチウェルプレート移動装置9000によって前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000に移動させるPCR用マルチウェルプレート第4移動段階、
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって前記PCR用マルチウェルプレート400内の前記付着用ターゲット核酸をリアルタイムで増幅するターゲット核酸リアルタイム定量増幅段階、及び
前記リアルタイム定量遺伝子増幅装置8000によって、時間の経過による前記付着用ターゲット核酸の定量増幅量を示すリアルタイム核酸定量増幅データを獲得し、獲得された前記リアルタイム核酸定量増幅データによって前記生体試料に含有された前記抗原の濃度を獲得する抗原濃度獲得段階、
を含むことを特徴とする、定量免疫PCRを用いた自動抗原濃度獲得方法。
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