JP2021007403A - 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 - Google Patents
胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2021007403A JP2021007403A JP2020170575A JP2020170575A JP2021007403A JP 2021007403 A JP2021007403 A JP 2021007403A JP 2020170575 A JP2020170575 A JP 2020170575A JP 2020170575 A JP2020170575 A JP 2020170575A JP 2021007403 A JP2021007403 A JP 2021007403A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- react
- seconds
- blastocyst
- temperature
- primer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6809—Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6811—Selection methods for production or design of target specific oligonucleotides or binding molecules
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
- C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/10—Ploidy or copy number detection
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/20—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for computer-aided diagnosis, e.g. based on medical expert systems
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/531—Glycosylase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/537—Protease
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/204—Modifications characterised by specific length of the oligonucleotides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
- C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
- C12Q2531/113—PCR
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
行い、受精卵が体外培養液で5日生長したら、胚は約80〜100個の細胞からなるのう状構造、すなわち胚盤胞で、2〜3個の胚盤胞を母親の子宮に置いた後、理想の場合、子宮に置いた胚盤胞のうち1個〜3個が正常の妊娠期で発育に成功し、出産に至る。しかし、様々な原因で、胚盤胞を子宮に置いてから胎児が生まれるまでの成功率が低く、通常40%程度だけで、母親自身の健康の原因以外、受精卵の品質は胚盤胞発育の失敗の要因の一つである。
染色体(男性はXYで、女性はXXである)。異常の場合、任意の染色体の全部または局部に二倍体よりも多いか少ない状態が現れることがあり、異数体異常と呼び、異数体異常は最も見られる胚発育の失敗につながる染色体異常の形態である。通常の試験管ベビー技術において、顕微鏡による形態観察だけで、複数(通常8〜15個)の胚から2〜3個の比較的に「
正常」のものを選んで母親の子宮に置く。顕微鏡における形態の正常で染色体が正常か反映することができないため、間違えて形態が正常であるが染色体が異常の胚を選んで母親の子宮に置くことで多くの試験管ベビーの受胎の失敗につながる。
よって、染色体正常の胚をスクリーニングして母親の子宮に置くことで、受胎成功率を向上させる。研究では、PGSによって改めて子宮に置く試験管ベビーの操作は成功率を60%
以上に向上させることが示されたが、様々なPGS方法は免疫蛍光検出(FISH)、チップ検出
、第2世代シーケンシング検出などを含む。上記各検出に必要な生物サンプルはいずれも
体外培養胚から採取される1個〜数個の細胞で、このような少量の細胞に対する検出によ
って胚全体の染色体が正常か反映される。
個の栄養膜細胞を吸い取って細胞を分解させ、その中の微量DNAを放出させ、微量DNAに対して全ゲノム増幅を行った後、核酸チップまたは第2世代シーケンシングなどの方法によ
って細胞の染色体の状態を検出する(特許文献1)。理論上、吸い取った数個の細胞における染色体の状態は胚におけるほかの細胞と一致し、この数個の細胞を検出すれば、当該胚の染色体の状態が正常かわかる。一般的に、この時数個の栄養膜細胞を吸い取っても胚の発育に悪影響を与えることがないとされ、生まれた嬰児の健康状況からみても、この操作は確かに健康に影響しない。しかし、当該技術が現れてからまだ日が短く(わずか数年で)、ヒトの終生の健康に長期間の影響があるかまだ観察が必要である。
先で胚盤胞腔液における遊離DNAを吸い取った(特許文献2および非特許文献1)。しかし
ながら、胚盤胞腔液は胚盤胞腔における液体で、胚盤胞腔液を得るには胚盤胞に穴を開けるか穿刺することが必要で、その介入性は依然として胚に不可避な損傷を与える。
損傷につながり、損傷が重すぎると胚の発育が止まる。
る。現在細胞の損失および軽い損傷が胚の発育および生まれた後の健康に悪影響を与える証拠がまだないが、当該技術が現れてからまだ日が短く(わずか数年で)、ヒトの終生の健康に長期間の影響があるかまだ観察が必要である。
体の状態と異なることがあり、検出結果のミスにつながる。
(1)胚盤胞培養液の獲得:単精子注射方法によって受精卵を得、それを3日目の卵割球に培養したら新しく調製された胚盤胞培養小滴に移して胚盤胞の培養を行い、この時3日目
に液置換が必要で、目的は脱落した顆粒球および未受精精子の汚染を除去することで、
胚盤胞になった胚を吸い取り、新しい胚盤胞培養に移すかガラス化冷凍保存プロセスに入り、残った元の胚盤胞培養液は約1μL〜500μL、好ましくは10μL〜200μLで、すなわ
ち、着床前遺伝学的スクリーニング(PGS)のために収集されるサンプルになる工程と、
(2)胚盤胞培養液の採取:工程(1)で得られた元の胚盤胞培養液を溶解液に移し、遠心後、サンプルが次の全ゲノム増幅工程に入る工程と、
(3)胚盤胞培養液における微量DNAの全ゲノム増幅:工程(2)で得られた胚盤胞培養液と
溶解液の混合物に分解酵素を入れ、均一に混合した後インキュベートし、その後分解酵素を不活性化させ、分解物を取ってPCR反応管に入れてPCR反応を行う工程と、
(4)全ゲノム増幅後のDNA産物の分析による胚の染色体の状態の正常かの同定:分析時第2世代シーケンシング、核酸チップまたは免疫蛍光検出を使用する工程と、
を含む方法を提供する。
ー、NTプライマーおよび増幅プライマーを含み、
ここで、前記のNGプライマーおよびNTプライマーは5'末端から3'末端まで共通配列と可変配列を含み、ここで、前記共通配列はG、A、CおよびTの4種類の塩基のうちの3種類または2種類からなり、条件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含むことで、
前記NGプライマーの可変配列は(N)nGGG、(N)xGTGG(N)y、またはその組み合わせからな
る群から選ばれ、前記NTプライマーの可変配列は(N)nTTT、(N)mTNTNG、またはその組み合わせからなる群から選ばれ、ここで、Nは任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチドで
、各nは独立に3〜17の正整数から、各mは独立に3〜15の正整数から、xおよびyはそれぞれ3〜13の正整数から選ばれ、
前記増幅プライマーは前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まない。
、トリプターゼおよびリゾチームのうちの1種類または複数種類から選ばれ、前記分解酵
素の濃度は1-25μg/ml、好ましくは20 μg/mlで、工程(3)では、インキュベート温度は30〜60℃で、インキュベート時間は1min〜12hで、不活性化温度は75〜95℃で、不活性化時
間は1〜15minで、好ましくは、インキュベート温度は40℃で、インキュベート時間は3hで、不活性化温度は90℃で、不活性化時間は5minである。
物質拮抗剤、5〜20mM dNTP、5〜100μM NGおよびNTプライマー、50〜200μM増幅プライマー、0.5〜10単位の核酸ポリメラーゼが含まれ、前記PCR阻害物質拮抗剤はDMSO、ベタイン、ホルムアミド、グリセリンおよびアルブミンのうちの1種類または複数種類から選ばれ
、前記核酸ポリメラーゼはPhi29 DNAポリメラーゼ、Bst DNA ポリメラーゼ、Vent ポリメラーゼ、Deep Vent ポリメラーゼ、Klenow Fragment DNAポリメラーゼI、MMLV逆転写酵素、AMV逆転写酵素、HIV逆転写酵素、Phusion(R)ハイフィデリティーDNAポリメラーゼ、Taqポリメラーゼ、E.coli DNAポリメラーゼ、LongAmp Taq DNAポリメラーゼおよびOneTaq DNAポリメラーゼのうちの1種類または複数種類から選ばれる。
幅混合液の成分は15mM Tris-HCl、15mM (NH4)2SO4、20mM KCl、1mM MgSO4、5% DMSOおよび2%Triton X-100である。
件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含むことで、前記増幅プライマーは前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まない。前記可変配列は(N)nGGG、(N)nTTT、(N)mTNTNG
、(N)xGTGG(N)yからなる群から選ばれ、ここで、Nは任意の天然核酸と塩基対合するヌク
レオチドで、nは3〜17の正整数から、mは3〜15の正整数から、xおよびyはそれぞれ3〜13
の正整数から選ばれる。
配列番号1[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNNNN]、
配列番号2[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNGGG]、
配列番号3[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNTTT]、
配列番号4[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNTNTNG]または
配列番号5[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNGTGGNN]
の配列を含み、ここで、Nは任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチドで、前記増幅プ
ライマーは5'から3'配列番号6[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAG]の配列を有する。
(1)90〜98℃の間に介する第1の変性温度で5〜20s反応させ、
(2)5〜15℃の間に介する第1のアニーリング温度で5〜60s反応させ、15〜25℃の間に介
する第2のアニーリング温度で5〜60s反応させ、25〜35℃の間に介する第3のアニーリング温度で30〜80s反応させ、35〜45℃の間に介する第4のアニーリング温度で5〜60s反応させ、45〜55℃の間に介する第5のアニーリング温度で5〜60s反応させ、
(3)55〜80℃の間に介する第1の伸長温度で10〜150min反応させ、
(4)90〜98℃の間に介する第2の変性温度で5〜30s反応させ、
(5)45〜70℃の間に介する第6のアニーリング温度で10〜30s反応させ、
(6)60〜80℃の間に介する第2の伸長温度で1〜10min反応させ、
(7)工程(4)〜(6)を5〜50サイクル繰り返し、
(8)60〜80℃の間に介する温度で続いて1〜10min伸長反応させ、
(9)増幅された産物を0〜5℃で冷蔵保存するものである。
(1)第1の変性温度95℃で10s反応させ、
(2)第1のアニーリング温度10℃で45s反応させ、第2のアニーリング温度20℃で45s反応
させ、第3のアニーリング温度30℃で60s反応させ、第4のアニーリング温度40℃で45s反応させ、第5のアニーリング温度50℃で45s反応させ、
(3)第1の伸長温度62℃で90min反応させ、
(4)第2の変性温度95℃で20s反応させ、
(5)第6のアニーリング温度59℃で20s反応させ、
(6)第2の伸長温度72℃で3min反応させ、
(7)工程(4)〜(6)を10〜30サイクル繰り返し、
(8)72℃で続いて5min伸長反応させ、
(9)増幅された産物を4℃で冷蔵保存するものである。
ータ分析などを含むが、これらに限定されない工程に従ってサンプルのゲノムにおける各染色体および染色体の局部のコピー数を検出する。正常の染色体および染色体の局部のコピー数は2である。コピーが2よりも大きい(たとえば≧2.5)か2よりも小さい(たとえば≦1.8)場合、いずれもコピー数が異常で、すなわち、染色体に異常が生じたことになる。こ
の正常または異常の検出結果は培養液由来の胚の染色体の正常または異常を表す。染色体が異常の胚を母体に導入すると、胚の着床失敗、流産などの不良な結果につながる。染色
体が正常の胚を母体に導入しないと、受胎が成功する可能性が高くならない。
って、当該胚の染色体の状況(染色体全体または局部の異数体が現れたか)を判断する。胚は早期体外培養の発育過程において胚盤胞培養液に極少量(約数十pg)のDNAを放出するた
め、このように微量のDNAで染色体の異数体の検出を行うには、まずDNAに大幅の均一な増幅を行う必要がある。胚盤胞培養液の体積は約30μLであるため、培養液における胚由来
のDNAは高度に希釈されたもので、同時に胚培養液の成分は複雑で、その中の一部の成分
はDNAの増幅に抑制作用が生じる。本発明における技術方案は上記様々な技術難題を克服
し、胚盤胞培養液から胚の染色体の異数体を検出する技術方法の確立に成功した。
胞の損失と損傷を避け、かつPGSのサンプルを得る時の操作を簡易化する。また、胚盤胞
培養液は試験管ベビーの操作過程における胚体外培養段階の廃棄物で、臨床に余計な面倒を増やさずに相応する胚の染色体の状態に対する評価を実現する。
(i)NGプライマー、NTプライマーおよび増幅プライマーを含む、PCRに使用されるプライマーと、
(ii)任意の胚盤胞培養液とを含み、
ここで、前記のNGプライマーおよびNTプライマーは5'末端から3'末端まで共通配列と可変配列を含み、ここで、前記共通配列はG、A、CおよびTの4種類の塩基のうちの3種類または2種類からなり、条件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含むことで、
前記NGプライマーの可変配列は(N)nGGG、(N)xGTGG(N)y、またはその組み合わせからな
る群から選ばれ、前記NTプライマーの可変配列は(N)nTTT、(N)mTNTNG、またはその組み合わせからなる群から選ばれ、ここで、Nは任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチドで
、各nは独立に3〜17の正整数から、各mは独立に3〜15の正整数から、xおよびyはそれぞれ3〜13の正整数から選ばれ、
前記増幅プライマーは前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まない、
キットも提供する。
μl、好ましくは15〜80μl、より好ましくは20〜60μlである。
本発明の検出技術に使用される胚盤胞培養液は細胞のない胚盤胞培養液である。
本発明は、胚盤胞を培養した後の欠乏培養液(depleted medium)(すなわち前記培養系から分離される培養液)に対して遺伝子検出を行うことによって、胚の染色体が異常か同定
する方法を提供する。
される培養液)に対して遺伝子検出を行う方法は特に制限されないが、通常の方法、たと
えば第2世代シーケンシング、核酸チップ、免疫蛍光検出、蛍光PCR検出、第1世代シーケ
ンシング、第3世代シーケンシング、質量分析、またはこれらの組み合わせによって検出
することができる。
(1)胚盤胞培養液の獲得:単精子注射方法によって受精卵を得、それを3日目の卵割球に培養したら新しく調製された胚盤胞培養小滴に移して胚盤胞の培養を行い、この時3日目
に液置換が必要で、目的は脱落した顆粒球および未受精精子の汚染を除去することで、
胚盤胞になった胚を吸い取り、新しい胚盤胞培養に移すかガラス化冷凍保存プロセスに入り、残った元の胚盤胞培養液は約1μL〜500μL、好ましくは10μL〜200μLで、すなわ
ち、着床前遺伝学的スクリーニング(PGS)のために収集されたサンプルである工程と、
(2)胚盤胞培養液の採取:工程(1)で得られた元の胚盤胞培養液を溶解液に移し、遠心後、サンプルが次の全ゲノム増幅工程に入る工程と、
(3)胚盤胞培養液における微量DNAの全ゲノム増幅:工程(2)で得られた胚盤胞培養液と
溶解液の混合物に分解酵素を入れ、均一に混合した後インキュベートし、その後分解酵素を不活性化させ、分解物を取ってPCR反応管に入れてPCR反応を行う工程と、
(4)全ゲノム増幅後のDNA産物の分析による胚の染色体の状態の正常かの同定:分析時第2世代シーケンシング、核酸チップまたは免疫蛍光検出を使用する工程と、
を含む。
ために収集されたサンプルである。
[発明の効果]
し、得られる染色体異常の検出結果に意外と極めて高い精確性がある。
(2)本発明は単胚培養系を使用し、すなわち、一つの培養小滴において一つだけの胚
を培養し、当該系で得られる染色体異常の検出結果はより精確である。
ド・スプリング・ハーバー研究所出版社、1989) に記載の条件などの通常の条件に、あるいは、メーカーのお薦めの条件に従う。特に説明しない限り、百分率および部は重量百分率および重量部である。
A、Bと2つの体外受精の胚サンプルを選択し、それぞれ胚盤胞細胞を検出する方法およ
び胚盤胞培養液を検出する方法でその染色体の状態を評価したが、具体的な工程は下記の通りである。
1)単精子注射方法によって得られた受精卵を3日目の卵割球に培養したら、新しく調製された胚盤胞培養小滴に移して胚盤胞の培養を行った。
2)胚盤胞になった胚を吸い取り、新しい胚盤胞培養に移すかガラス化冷凍保存プロセ
スに入り、残った元の胚盤胞培養液(約30μL)はPGSのために収集されたサンプルAおよ
びサンプルBで、好ましくは液置換の2〜3日後、胚盤胞になった胚を吸い取った。
1)10μLの溶解液(pHが7.2のTris-HCl 40mM、EDTA 1mM、KCl 15mMおよび3%のTriton X-100)を入れた採取管を室温で2min置き、溶解液が解凍した後、サンプル採取管をミニ遠
心機にセットし、分解液が全部管の底に集まるように30s遠心した。
2)工程1のステップ2)における元の胚盤胞培養液をピペットで全部溶解液に移した。
3)マーカーペンで採取管にサンプルの名称を表記し、ミニ遠心機で30s遠心し、サンプルをすぐ次の全ゲノム増幅工程に供したか、あるいは-20℃または-80℃で冷凍保存した。
1)胚盤胞培養液と溶解液の混合物を室温で溶解させた。
2)管にプロテイナーゼを入れ、上下に吹いて均一に混合した。
3)管を40℃で3hインキュベートした。
4)管を90℃で5min置いて分解酵素を不活性化させた。
5)管から分解産物を取ってPCR反応管に入れた。
6)PCR反応管に増幅混合液(15mM Tris-HCl、15mM (NH4)2SO4、20mM KCl、1mM MgSO4、5% DMSOおよび2% Triton X-100)、5% DMSO、10 mM dNTP、50μM NG (5′-GT GAG TGA TGG TTG AGG TAG TGT GGA GNNNNNGGG-3′)およびNT (5′-GT GAG TGA TGG TTG AGG TAG TGT GGA GNNNNNTTT-3′ )プライマー、100μM増幅プライマー(5′-GT GAG TGA TGG TTGAGG TAG TGT GGA G-3′)、1単位のBstDNAポリメラーゼ、1単位のDeepVentRを入れた。
7)PCR反応管をPCR装置にセットして全ゲノム増幅を行ったが、熱サイクルプログラム
は以下の通りである。
色体の状態の正常か同定した。
いずれも染色体正常と判定されたことが示された。上記結果から、胚盤胞培養液の検出と胚盤胞細胞の検出の2種類の方法によって胚の染色体の状態を同定したところ、同様の結
果が得られたことが示され、さらに、当該非侵入性の検出方法が正確で、信頼できることが実証された。
ランダムに42個の体外培養胚を選択し、それぞれ実施例1における方法に従って胚盤胞
培養液の検出と胚盤胞細胞の検出の2種類の方法の間で比較した。検出結果の相応関係は
、理論上4種類の組み合わせの様態がある。
第2種類.細胞の検出では正常を示し、培養液の検出結果でも正常を示す。
第3種類.細胞の検出では正常を示し、培養液の検出結果では異常を示す。
第4種類.細胞の検出では異常を示し、培養液の検出結果では正常を示す。
に近い検出結果を提供したことは、本発明の有益な価値を証明した。
8例の異なる原因による妊娠困難の患者の胚に対して本発明の実施例1の方法によって胚培養液の検出を実施し、検出結果から染色体正常の胚を選択して母親の子宮に導入した。
者の結果から、本発明の方法で染色体正常の胚を選んで患者の母体に移植して1回で妊娠
に成功し、胚を移植して生存した成功率は5/6(すなわち、83.3%)で、つまり、1例の患者だけ成功しなかったことが示された。
Claims (20)
- 以下の工程(1)-(4)を含む、胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法;
(1)単精子注射方法によって受精卵を取得し、それを3日目の卵割球に培養した後に、新しく調製された胚盤胞培養のための微小滴に移して胚盤胞の培養を行い、その胚盤胞になった胚を吸い取り、新しい胚盤胞培養に移すか又はガラス化冷凍保存プロセスに供し、残った元の胚盤胞培養液を検出用サンプルに供する工程、
(2)工程(1)で得られた胚盤胞培養液を溶解液と混合する工程、
(3)工程(2)で得られた混合物にタンパク質分解酵素を添加した後にインキュベートし、その後、該分解酵素を不活性化させ、その分解物をPCR反応管に入れてPCR反応によ
り全ゲノム増幅反応を行う工程、及び
(4)工程(3)で得られた増幅ゲノムを、第2世代シーケンシング、核酸チップまたは免
疫蛍光検出を使用して、胚の染色体異常を検出する工程。 - 工程(2)における溶解液の成分が、pHが7.0〜8.0のTris-HCl 25〜45 mM、EDTA 0.5
〜3mM、KCl 10〜25mMおよび濃度が0.05%〜5%の界面活性剤で、前記界面活性剤は、Triton X-100、Triton X-114、Tween20、NP40およびSDSから選択される1種類または複数種類
であることを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 溶解液の成分は、好ましくはpHが7.2のTris-HCl 40 mM、EDTA 1mM、KCl 15mMおよ
び3%のTriton X-100であることを特徴とする、請求項2に記載の方法。 - 工程(3)におけるタンパク質分解酵素は、プロテイナーゼK、QIAGEN Protease、ペ
プシン、パパイン、トリプターゼおよびリゾチームから選択される1種類または複数種類
であり、その濃度は1〜25μg/mlであることを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 前記タンパク質分解酵素の濃度は、20μg/mlであることを特徴とする、請求項4に
記載の方法。 - 工程(3)において、インキュベートは温度30〜60℃で、1分〜12時間行い、不活性化
は温度75〜95℃で、1〜15分処理することを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 工程(3)において、インキュベートは温度40℃で、3時間で行い、不活性化は温度90℃で、5分処理することを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 工程(3)において、PCR反応を行う時のPCR反応管に、増幅混合液、0.5%〜20%のPCR阻害物質拮抗剤、5〜20mMのdNTP、5〜100μMのNGおよびNTプライマー、50〜200μMの増
幅プライマー、0.5〜10単位の核酸ポリメラーゼが含まれ、前記PCR阻害物質拮抗剤は、DMSO、ベタイン、ホルムアミド、グリセリンおよびアルブミンからなる群より選択される1
種類または複数種類であり、前記核酸ポリメラーゼは、Phi29 DNAポリメラーゼ、Bst DNA
ポリメラーゼ、Vent ポリメラーゼ、Deep Vent ポリメラーゼ、Klenow Fragment DNAポ
リメラーゼI、MMLV逆転写酵素、AMV逆転写酵素、HIV逆転写酵素、Phusion(商標)ハイフィデリティーDNAポリメラーゼ、Taqポリメラーゼ、E.coli DNAポリメラーゼ、LongAmp Taq DNAポリメラーゼおよびOneTaq DNAポリメラーゼから選択される1種類または複数種類であることを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 前記増幅混合液の成分は、10〜25mMのTris-HCl、5〜25mMの(NH4)2SO4、5〜30mMのKCl、0.5〜5mMのMgSO4、0.1%〜20%のDMSOおよび0.05〜5%のTriton X-100であることを
特徴とする、請求項8に記載の方法。 - 前記増幅混合液の成分は、15mMのTris-HCl、15mMの(NH4)2SO4、20mMのKCl、1mMのMgSO4、5%のDMSOおよび2%のTriton X-100であることを特徴とする、請求項9に記載の方
法。 - 前記NGおよびNTプライマーは、5'末端から3'末端まで共通配列と可変配列を含み、ここで、前記共通配列はG、A、CおよびTの4種類の塩基のうちの3種類または2種類からな
り、条件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含むことで、前記増幅プライマーは前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まないことを特徴とする、請求項8に記載の方法
。 - 前記可変配列は、(N)nGGG、(N)nTTT、(N)mTNTNG、及び(N)xGTGG(N)yからなる群か
ら選ばれ、ここで、Nは、任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチドで、nは、3〜17の
正の整数から、mは、3〜15の正の整数から、xおよびyは、それぞれ3〜13の正の整数から
選ばれることを特徴とする、請求項11に記載の方法。 - 前記NGおよびNTプライマーは、
配列番号1[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNNNN]、
配列番号2[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNGGG]、
配列番号3[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNNNTTT]、
配列番号4[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNTNTNG]、又は
配列番号5[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAGNNNGTGGNN]の配列を含み、ここで、Nは、任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチドで、前記増幅プライマーは、5'から3'配列番号6[GTGAGTGATGGTTGAGGTAGTGTGGAG]の配列を有することを特徴とする、請求項12に記載の方法。 - 工程(3)における全ゲノム増幅の熱サイクルプログラムは、
(1)5〜20秒間、90〜98℃の第1の変性温度で反応させ、
(2)5〜60秒間、5〜15℃の第1のアニーリング温度で反応させ、5〜60 秒間、15〜25℃の第2のアニーリング温度で反応させ、30〜80 秒間、25〜35℃の第3のアニーリング温度
で反応させ、5〜60秒間、35〜45℃の第4のアニーリング温度で反応させ、5〜60秒間、45
〜55℃の第5のアニーリング温度で反応させ、
(3)10〜150分間、55〜80℃の第1の伸長温度で反応させ、
(4)5〜30秒間、90〜98℃の第2の変性温度で反応させ、
(5)10〜30秒間、45〜70℃の第6のアニーリング温度で反応させ、
(6)1〜10分間、60〜80℃の第2の伸長温度で反応させ、
(7)工程(4)〜(6)を5〜50サイクル繰り返し、
(8)1〜10分間、60〜80℃の温度で続いて伸長反応させ、
(9)増幅された産物を0〜5℃で冷蔵保存するものである、
ことを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 工程(3)における全ゲノム増幅の熱サイクルプログラムは、
(1)10秒間、95℃の第1の変性温度で反応させ、
(2)45秒間、第1のアニーリング温度10℃で反応させ、45秒間、第2のアニーリング温
度20℃で反応させ、60秒間、第3のアニーリング温度30℃で反応させ、45秒間、第4のアニーリング温度40℃で反応させ、45秒間、第5のアニーリング温度50℃で反応させ、
(3)90分間、62℃の第1の伸長温度で反応させ、
(4)20秒間、95℃の第2の変性温度で反応させ、
(5)第6のアニーリング温度59℃で20秒間反応させ、
(6)第2の伸長温度72℃で3分間反応させ、
(7)工程(4)〜(6)を10〜30サイクル繰り返し、
(8)続いて、5秒間、72℃で伸長反応させ、
(9)増幅された産物を4℃で冷蔵保存するものである、
ことを特徴とする、請求項14に記載の方法。 - 工程(3)のPCR反応で使用されるプライマーは、NGプライマー、NTプライマー
および増幅プライマーを含み、
ここで、前記のNGプライマーおよびNTプライマーは、5'末端から3'末端まで共通配列と可変配列を含み、ここで、前記共通配列は、G、A、CおよびTの4種類の塩基のうちの3種類または2種類からなり、条件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含むことで、
前記NGプライマーの可変配列は、(N)nGGG、(N)xGTGG(N)y及びその組み合わせからな
る群から選ばれ、前記NTプライマーの可変配列は、(N)nTTT、(N)mTNTNG、及びその組み合わせからなる群から選ばれ、ここで、Nは、任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチド
で、各nは、独立に3〜17の正の整数から、各mは、独立に3〜15の正の整数から、xおよびyは、それぞれ3〜13の正の整数から選ばれ、
前記増幅プライマーは、前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まない、
ことを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する検出キットであって、
(i)NGプライマー、NTプライマーおよび増幅プライマーを含む、PCR増幅に使用されるプライマーと、
(ii)任意の胚盤胞培養液とを含み、
ここで、前記のNGプライマーおよびNTプライマーは、5'末端から3'末端まで共通配列と可変配列とを含み、ここで、前記共通配列はG、A、CおよびTの4種類の塩基のうちの3種類または2種類からなり、条件は前記共通配列が異なる場合GおよびCを含み、
前記NGプライマーの可変配列は、(N)nGGG、(N)xGTGG(N)y、及びその組み合わせから
なる群から選ばれ、前記NTプライマーの可変配列は、(N)nTTT、(N)mTNTNG、及びその組み合わせからなる群から選ばれ、ここで、Nは、任意の天然核酸と塩基対合するヌクレオチ
ドで、各nは、独立に3〜17の正の整数から、各mは、独立に3〜15の正の整数から、xおよ
びyは、それぞれ3〜13の正の整数から選ばれ、
前記増幅プライマーは、前記共通配列を含み、かつ前記可変配列を含まない、
ことを特徴とするキット。 - 前記のNGプライマー、NTプライマーおよび増幅プライマーは、同様の共通配列を有することを特徴とする、請求項17に記載のキット。
- 前記の共通配列の長さは、20〜35nt、好ましくは25〜30ntであることを特徴とする、請求項17に記載のキット。
- 請求項17に記載の検出キットの使用であって、胚盤胞の培養液を用いて胚の染色体異常を検出する製品の製造に使用されることを特徴とする使用。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201510746098.XA CN105368936B (zh) | 2015-11-05 | 2015-11-05 | 一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 |
CN201510746098.X | 2015-11-05 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018543417A Division JP2019506873A (ja) | 2015-11-05 | 2016-11-04 | 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2021007403A true JP2021007403A (ja) | 2021-01-28 |
Family
ID=55371562
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018543417A Pending JP2019506873A (ja) | 2015-11-05 | 2016-11-04 | 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 |
JP2020170575A Pending JP2021007403A (ja) | 2015-11-05 | 2020-10-08 | 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018543417A Pending JP2019506873A (ja) | 2015-11-05 | 2016-11-04 | 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20180327821A1 (ja) |
EP (1) | EP3372690A4 (ja) |
JP (2) | JP2019506873A (ja) |
KR (2) | KR20180088830A (ja) |
CN (2) | CN113684250A (ja) |
AU (2) | AU2016351034B2 (ja) |
BR (1) | BR112018009105A8 (ja) |
TW (1) | TWI622651B (ja) |
WO (1) | WO2017076359A1 (ja) |
Families Citing this family (25)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN113684250A (zh) * | 2015-11-05 | 2021-11-23 | 序康医疗科技(苏州)有限公司 | 一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 |
CN111621548A (zh) * | 2016-04-26 | 2020-09-04 | 序康医疗科技(苏州)有限公司 | 扩增dna的方法 |
CN106086199A (zh) * | 2016-07-05 | 2016-11-09 | 上海序康医疗科技有限公司 | 一种利用不含透明带的囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 |
CN107190101A (zh) * | 2017-08-01 | 2017-09-22 | 安诺优达基因科技(北京)有限公司 | 一种用于胚胎植入前染色体异常检测的方法及试剂盒 |
CN107760773A (zh) * | 2017-10-26 | 2018-03-06 | 北京中仪康卫医疗器械有限公司 | 一种对胚胎培养液进行scRRBS分析的方法 |
CN110317862A (zh) * | 2018-03-28 | 2019-10-11 | 顶探科技(北京)有限公司 | 一种利用哺乳动物胚胎培养液检测小rna的方法 |
WO2020061637A1 (en) * | 2018-09-27 | 2020-04-02 | Monash Ivf Group Limited | Dna from cell-free medium |
CN109402238A (zh) * | 2018-12-19 | 2019-03-01 | 广州海思医疗科技有限公司 | 用于血液、口腔拭子进行pcr的裂解液及试剂盒 |
CN109628566A (zh) * | 2018-12-28 | 2019-04-16 | 北京中仪康卫医疗器械有限公司 | 利用RAD-seq对胚胎进行PGS分析的方法 |
CN109536581B (zh) * | 2018-12-29 | 2022-02-01 | 序康医疗科技(苏州)有限公司 | 一种利用囊胚培养液检测胚胎健康状况的方法和产品 |
CN109609445A (zh) * | 2019-01-07 | 2019-04-12 | 安徽农业大学 | 一种囊胚中单个卵裂球的分离方法 |
CN109629009B (zh) * | 2019-01-10 | 2022-02-22 | 北京中科遗传与生殖医学研究院有限责任公司 | 一种基于RAD-seq对胚胎进行无创PGS的方法 |
CN110964690A (zh) * | 2019-01-16 | 2020-04-07 | 北京大学深圳医院 | 辅助生殖技术实施过程中防止配子错配的方法 |
CN112094840A (zh) * | 2019-06-17 | 2020-12-18 | 南京尧顺禹生物科技有限公司 | 一种用于基因组片段扩增的微量动物样品基因组dna模板的快速制备方法 |
CN110283904A (zh) * | 2019-07-31 | 2019-09-27 | 阿吉安(福州)基因医学检验实验室有限公司 | 同时进行pgt-a和pgt-m的检测方法及其试剂盒 |
CN110423801A (zh) * | 2019-09-06 | 2019-11-08 | 北京协和洛克生物技术有限责任公司 | Mthfr和mtrr基因多态性检测引物、探针、试剂盒及应用 |
CN110669724A (zh) * | 2019-11-08 | 2020-01-10 | 广州达瑞生殖技术有限公司 | 一种囊胚培养液及其制备方法 |
CN111172259A (zh) * | 2020-03-09 | 2020-05-19 | 云南省第一人民医院 | 一种胚胎培养液的卵裂球期的胚胎染色体检测方法 |
CN111440857B (zh) * | 2020-03-11 | 2023-03-21 | 阿吉安(福州)基因医学检验实验室有限公司 | 用于无创胚胎植入前遗传性检测的方法 |
CN112582022B (zh) * | 2020-07-21 | 2021-11-23 | 序康医疗科技(苏州)有限公司 | 用于无创胚胎移植优先级评级的系统和方法 |
CN112592886A (zh) * | 2021-01-04 | 2021-04-02 | 首都医科大学附属北京朝阳医院 | 一种收集ivf-et患者胚胎培养液的方法及其应用 |
KR102310223B1 (ko) * | 2021-07-21 | 2021-10-08 | 주식회사 에이아이더뉴트리진 | 랩온페이퍼칩을 포함하는 구조물에 적용하기 위한 세포용해용 조성물 |
CN113957131B (zh) * | 2021-10-17 | 2024-03-19 | 合肥金域医学检验实验室有限公司 | 一种废旧芯片重新处理再利用的方法 |
CN116103280B (zh) * | 2022-12-28 | 2024-03-15 | 上海亿康医学检验所有限公司 | 样本保存液及其在染色体非整倍体筛查和/或转录组检测中的应用 |
CN117721222B (zh) * | 2024-02-07 | 2024-05-10 | 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) | 一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006087394A (ja) * | 2004-09-27 | 2006-04-06 | Wako Pure Chem Ind Ltd | 核酸抽出方法および核酸抽出キット |
JP2008017851A (ja) * | 2007-09-10 | 2008-01-31 | Toyobo Co Ltd | Dna合成反応を促進する添加剤 |
WO2013116889A1 (de) * | 2012-02-10 | 2013-08-15 | Ivf Zentren Prof. Zech - Bregenz Gmbh | Verfahren zur analyse fetaler nukleinsäuren |
WO2015114574A1 (en) * | 2014-01-30 | 2015-08-06 | Pécsi Tudományegyetem | Preimplantation assessment of embryos through detection of free embryonic dna |
CN105368936A (zh) * | 2015-11-05 | 2016-03-02 | 上海序康医疗科技有限公司 | 一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2394600A1 (en) * | 1999-12-17 | 2001-06-21 | Oregon Health And Science University | Methods for producing transgenic animals |
WO2012166425A2 (en) * | 2011-05-27 | 2012-12-06 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of amplifying whole genome of a single cell |
JP6765960B2 (ja) * | 2013-06-18 | 2020-10-07 | アンスティチュ ナショナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシュ メディカル | 胚の品質を決定するための方法 |
GB201319779D0 (en) * | 2013-11-08 | 2013-12-25 | Cartagenia N V | Genetic analysis method |
-
2015
- 2015-11-05 CN CN202110984786.5A patent/CN113684250A/zh active Pending
- 2015-11-05 CN CN201510746098.XA patent/CN105368936B/zh active Active
-
2016
- 2016-10-28 TW TW105134971A patent/TWI622651B/zh not_active IP Right Cessation
- 2016-11-04 BR BR112018009105A patent/BR112018009105A8/pt not_active IP Right Cessation
- 2016-11-04 AU AU2016351034A patent/AU2016351034B2/en active Active
- 2016-11-04 KR KR1020187016022A patent/KR20180088830A/ko not_active IP Right Cessation
- 2016-11-04 JP JP2018543417A patent/JP2019506873A/ja active Pending
- 2016-11-04 WO PCT/CN2016/104753 patent/WO2017076359A1/zh active Application Filing
- 2016-11-04 US US15/774,186 patent/US20180327821A1/en active Pending
- 2016-11-04 EP EP16861627.4A patent/EP3372690A4/en active Pending
- 2016-11-04 KR KR1020207028157A patent/KR20200118221A/ko not_active Application Discontinuation
-
2020
- 2020-10-08 JP JP2020170575A patent/JP2021007403A/ja active Pending
- 2020-12-10 AU AU2020286291A patent/AU2020286291A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006087394A (ja) * | 2004-09-27 | 2006-04-06 | Wako Pure Chem Ind Ltd | 核酸抽出方法および核酸抽出キット |
JP2008017851A (ja) * | 2007-09-10 | 2008-01-31 | Toyobo Co Ltd | Dna合成反応を促進する添加剤 |
WO2013116889A1 (de) * | 2012-02-10 | 2013-08-15 | Ivf Zentren Prof. Zech - Bregenz Gmbh | Verfahren zur analyse fetaler nukleinsäuren |
US20150031030A1 (en) * | 2012-02-10 | 2015-01-29 | Ivf Zentren Prof. Zech - Bregenz Gmbh | Method for analysing foetal nucleic acids |
WO2015114574A1 (en) * | 2014-01-30 | 2015-08-06 | Pécsi Tudományegyetem | Preimplantation assessment of embryos through detection of free embryonic dna |
CN105368936A (zh) * | 2015-11-05 | 2016-03-02 | 上海序康医疗科技有限公司 | 一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
"THIRD EDITION QIAAMP MINELUTE VIRUS SPIN HANDBOOK",[ONLINE], APR. 2010 UPLOADED, QIAGEN, RETRIVED O, JPN6019020743, ISSN: 0004624738 * |
"製品安全データシートBST DNA POLYMERASE, LARGE FRAGMENT",[ONLINE], 7 MAR 2015 UPLOADED, NEW ENGLAND, JPN6019020744, ISSN: 0004624739 * |
XU J., ET AL., "NONINVASIVE CHROMOSOME SCREENING OF HUMAN EMBRYOS BY GENOME SEQUENCING OF EMBRYO CUL, JPN6019020745, ISSN: 0004624740 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20180327821A1 (en) | 2018-11-15 |
BR112018009105A8 (pt) | 2019-02-26 |
AU2016351034B2 (en) | 2020-12-24 |
KR20180088830A (ko) | 2018-08-07 |
WO2017076359A1 (zh) | 2017-05-11 |
CN113684250A (zh) | 2021-11-23 |
CN105368936A (zh) | 2016-03-02 |
CN105368936B (zh) | 2021-07-30 |
TW201716584A (zh) | 2017-05-16 |
JP2019506873A (ja) | 2019-03-14 |
BR112018009105A2 (pt) | 2018-11-06 |
KR20200118221A (ko) | 2020-10-14 |
AU2016351034A1 (en) | 2018-06-28 |
AU2020286291A1 (en) | 2021-01-21 |
EP3372690A4 (en) | 2019-04-24 |
EP3372690A1 (en) | 2018-09-12 |
TWI622651B (zh) | 2018-05-01 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2021007403A (ja) | 胚盤胞培養液で胚の染色体異常を検出する方法 | |
CN113286892B (zh) | 一种利用囊胚培养液检测胚胎健康状况的方法和产品 | |
Hirayama et al. | Rapid sexing of bovine preimplantation embryos using loop-mediated isothermal amplification | |
Cimadomo et al. | The dawn of the future: 30 years from the first biopsy of a human embryo. The detailed history of an ongoing revolution | |
JP2019506873A5 (ja) | ||
US20080085836A1 (en) | Method for genetic testing of human embryos for chromosome abnormalities, segregating genetic disorders with or without a known mutation and mitochondrial disorders following in vitro fertilization (IVF), embryo culture and embryo biopsy | |
WO2018006706A1 (zh) | 一种利用不含透明带的囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法 | |
de Sousa et al. | Biopsy of bovine embryos produced in vivo and in vitro does not affect pregnancy rates | |
Levinson et al. | Reliable gender screening for human preimplantation embryos, using multiple DNA target-sequences | |
Capalbo et al. | Artificial oocyte activation with calcium ionophore does not cause a widespread increase in chromosome segregation errors in the second meiotic division of the oocyte | |
Mara et al. | Sexing of in vitro produced ovine embryos by duplex PCR | |
CN111440857B (zh) | 用于无创胚胎植入前遗传性检测的方法 | |
US5759772A (en) | Method for determining the sex of an embryo | |
CN111172259A (zh) | 一种胚胎培养液的卵裂球期的胚胎染色体检测方法 | |
De Coster et al. | Parental genomes segregate into distinct blastomeres during multipolar zygotic divisions leading to mixoploid and chimeric blastocysts | |
Peippo et al. | Birth of correctly genotyped calves after multiplex marker detection from bovine embryo microblade biopsies | |
US10947562B2 (en) | Methods for making and using modified oocytes | |
Nix | Exploring methods to understand bovine embryo competency in vitro | |
Finanger | Non-Invasive Methods for Detection of Genetic Abnormalities in Human Embryos Cell-Free DNA Secreted from Human Embryos as an Alternative to DNA from Cell Biopsies for Genetic Analyses | |
Imthurn et al. | Polar body diagnosis (PBD): an alternative and supplement to preimplantation diagnosis for single embryo transfer | |
De Rycke et al. | Preimplantation genetic diagnosis | |
Handyside et al. | Karyomapping for simultaneous genomic evaluation and aneuploidy screening of preimplantation bovine embryos: The first live-born calves | |
Gosden et al. | Micromanipulation in assisted reproductive technology: intracytoplasmic sperm injection, assisted hatching, and preimplantation genetic diagnosis | |
Liebaers et al. | Preimplantation Diagnosis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20201106 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20201106 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20211026 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220126 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20220126 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220531 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20221221 |