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  1. 第1の鎖および第2の鎖を含むRNAiであって、
    a)該第1の鎖および該第2の鎖は、二重鎖を形成し;
    b)該第1の鎖は、ガイド領域を含み、該ガイド領域は、核酸配列5’−UGGCCGUCCAUCUUGGACCCG−3’(配列番号1)、もしくは配列番号1に対して約90%の同一性を有する核酸配列;または核酸配列5’−AGUCGGUGUGGUUGACAAGCA−3’(配列番号7)、もしくは配列番号7に対して約90%の同一性を有する核酸配列を含み;および
    c)該第2の鎖は、非ガイド領域を含む、
    前記RNAi。
  2. (i)ガイド領域の核酸は、核酸配列5’−UGGCCGUCCAUCUUGGACCCG−3’(配列番号1)、もしくは配列番号1に対して約90%の同一性を有する核酸配列を含み;非ガイド領域は、配列5’−CGGGUCCAAGAUGGACGGCCA−3’(配列番号2)、もしくは配列番号2に対して約90%の同一性を有する核酸配列を含む;または
    (ii)ガイド領域の核酸は、核酸配列5’−AGUCGGUGUGGUUGACAAGCA−3’(配列番号7)、もしくは配列番号7に対して約90%の同一性を有する核酸配列を含み;非ガイド領域は、配列5’−UGCUUGUCAACCACACCGACU−3’(配列番号8)、もしくは配列番号8に対して約90%の同一性を有する核酸配列を含む、
    請求項1に記載のRNAi。
  3. 第1の鎖および第2の鎖は、ループ構造を形成することが可能なRNAリンカーによって連結されており、場合により、ここで:
    (i)該RNAリンカーは、4〜50ヌクレオチドを含む;および/または
    (ii)該ループ構造は、4〜20ヌクレオチドを含む;および/または
    (iii)5’から3’へ、該第2の鎖、該RNAリンカー、および該第1の鎖を含む;または
    (iv)5’から3’へ、該第1の鎖、該RNAリンカー、および該第2の鎖を含む、
    請求項1または2に記載のRNAi。
  4. RNAiは、5’から3’へ、第1の鎖、RNAリンカー、および第2の鎖を含み、該RNAiは、配列番号4もしくは配列番号10の核酸配列、または配列番号4もしくは配列番号10のヌクレオチド配列と約90%同一なヌクレオチド配列を含む、請求項3に記載のRNAi。
  5. 低分子阻害性RNA(siRNA)、マイクロRNA(miRNA)、または小ヘアピンRNA(shRNA)である、請求項1〜4のいずれか1項に記載のRNAi。
  6. ハンチントン病に関連するポリペプチドをコードするRNAを標的化し、場合により、該ポリペプチドは、ハンチンチンであり、そして場合により、該ハンチンチンは、ハンチントン病に関連する突然変異を含む、請求項1〜5のいずれか1項に記載のRNAi。
  7. 請求項1〜6のいずれか1項に記載のRNAiをコードする核酸を含む発現コンストラクト。
  8. 請求項7に記載の発現コンストラクトであって、以下の:
    (i)RNAiをコードする核酸は、miRNA足場を含む;および/または
    (ii)RNAiをコードする核酸は、プロモーターに機能するように連結されており、場合により、該プロモーターは、サイトメガロウイルス(CMV)前初期プロモーター、RSV LTR、MoMLV LTR、ホスホグリセリン酸キナーゼ−1(PGK)プロモーター、シミアンウイルス40(SV40)プロモーター、CK6プロモーター、トランスチレチンプロモーター(TTR)、TKプロモーター、テトラサイクリン応答プロモーター(TRE)、HBVプロモーター、hAATプロモーター、LSPプロモーター、キメラ肝臓特異的プロモーター(LSP)、E2Fプロモーター、テロメラーゼ(hTERT)プロモーター;サイトメガロウイルスエンハンサー/ニワトリベータ−アクチン/ウサギβ−グロビンプロモーター(CAG)プロモーター、延長因子1−アルファプロモーター(EF1−アルファ)プロモーター、ヒトβ−グルクロニダーゼプロモーター、ニワトリβ−アクチン(CBA)プロモーター、レトロウイルス性のラウス肉腫ウイルス(RSV)LTRプロモーター、ジヒドロ葉酸レダクターゼプロモーター、および13−アクチンプロモーターから選択される;および/または
    (iii)該発現コンストラクトは、イントロンをさらに含み、場合により、該イントロンは、キメライントロンであり、そして場合により、発現ベクターは、自己相補的なベクターであり、該イントロンは、デルタキメライントロンである;および/または
    (iv)発現コンストラクトは、ポリアデニル化シグナルをさらに含み、場合により、該ポリアデニル化シグナルは、ウシ成長ホルモンのポリアデニル化シグナル、SV40のポリアデニル化シグナル、またはHSV TK pAである、
    上記発現コンストラクト。
  9. 請求項7または8に記載の発現コンストラクトを含むベクター。
  10. 請求項9に記載のベクターであって、以下の:
    (i)該ベクターは、組換えアデノウイルスベクターであり、場合により、該組換えアデノウイルスベクターは、アデノウイルス血清型2、1、5、6、19、3、11、7、14、16、21、12、18、31、8、9、10、13、15、17、19、20、22、23、24〜30、37、40、41、AdHu2、AdHu3、AdHu4、AdHu24、AdHu26、AdHu34、AdHu35、AdHu36、AdHu37、AdHu41、AdHu48、AdHu49、AdHu50、AdC6、AdC7、AdC69、ウシAd3型、イヌAd2型、ヒツジAd、またはブタAd3型から誘導され
    る;または
    (ii)該ベクターは、組換えレンチウイルスベクターであり、場合により、該組換えレンチウイルスベクターは、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、ロスリバーウイルス(RRV)、エボラウイルス、マールブルグウイルス、モコラウイルス、狂犬病ウイルス、RD114またはそれらのバリアントで偽型化したレンチウイルスから誘導される;または
    (iii)該ベクターは、組換え単純疱疹ウイルス(rHSV)ベクターであり、場合により、該rHSVベクターは、rHSV−1またはrHSV−2から誘導される、
    上記ベクター。
  11. rAAVベクターである、請求項9に記載のベクター。
  12. 発現コンストラクトに、1つまたはそれ以上のAAVの逆方向末端反復(ITR)配列が隣接し、場合により、ここで:
    (i)該発現コンストラクトに、2つのAAVのITRが隣接する;および/または
    (ii)該AAVのITRは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAVrh8、AAVrh8R、AAV9、AAV10、AAVrh10、AAV11、AAV12、AAV2R471A、AAV DJ、ヤギAAV、ウシAAV、またはマウスAAV血清型のITRであり、場合により、該AAVのITRは、AAV2のITRである、
    請求項11に記載のrAAVベクター。
  13. スタッファー核酸をさらに含み、場合により、該スタッファー核酸が、RNAiをコードする核酸の上流または下流に配置されている、請求項11または12に記載のrAAVベクター。
  14. ベクターは、自己相補的なrAAVベクターであり、場合により、該ベクターは、RNAiをコードする第1の核酸配列およびRNAiの相補物をコードする第2の核酸配列を含み、該第1の核酸配列は、その長さのほとんどまたは全てにわたり、該第2の核酸配列と鎖内の塩基対を形成することができ、かつ場合により、該第1の核酸配列および該第2の核酸配列は、突然変異したAAVのITRによって連結されており、該突然変異したAAVのITRは、D領域の欠失を含み、そして末端分解配列の突然変異を含む、請求項11〜13のいずれか1項に記載のrAAVベクター。
  15. 請求項9もしくは10に記載のベクター、または請求項11〜14のいずれか1項に記載のrAAVベクター、を含む細胞。
  16. 請求項9に記載のベクターを含むウイルス粒子であって、ここで:
    (i)該ウイルス粒子は、rAAVベクターをキャプシド化するAAV粒子であり、場合により、アデノウイルス粒子は、アデノウイルス血清型2、1、5、6、19、3、11、7、14、16、21、12、18、31、8、9、10、13、15、17、19、20、22、23、24〜30、37、40、41、AdHu2、AdHu3、AdHu4、AdHu24、AdHu26、AdHu34、AdHu35、AdHu36、AdHu37、AdHu41、AdHu48、AdHu49、AdHu50、AdC6、AdC7、AdC69、ウシAd3型、イヌAd2型、ヒツジAd、もしくはブタAd3型由来のキャプシドを含む;または
    (ii)該ウイルス粒子は、組換えアデノウイルスベクターをキャプシド化するアデノウイルス粒子であり、場合により、該アデノウイルス粒子は、アデノウイルス血清型2のキャプシドもしくはアデノウイルス血清型5のキャプシドを含む;または
    (iii)該ウイルス粒子は、組換えレンチウイルスベクターをキャプシド化するレン
    チウイルス粒子であり、場合により、該レンチウイルス粒子は、水疱性口内炎ウイルス(VSV)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、ロスリバーウイルス(RRV)、エボラウイルス、マールブルグウイルス、モコラウイルス、狂犬病ウイルス、RD114もしくはそれらのバリアントで偽型化したキャプシドを含む;または
    (iv)該ウイルス粒子は、組換えHSVベクターをキャプシド化するHSV粒子であり、場合により、該HSV粒子は、rHSV−1粒子またはrHSV−2粒子である、
    上記ウイルス粒子。
  17. 請求項11〜14のいずれか1項に記載のrAAVベクターを含む組換えAAV粒子であって、場合により、ここで:
    (i)AAVウイルス粒子は、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAVrh8、AAVrh8R、AAV9、AAV10、AAVrh10、AAV11、AAV12、AAV2R471A、AAV2/2−7m8、AAV DJ、AAV2 N587A、AAV2 E548A、AAV2 N708A、AAV V708K、AAV2−HBKO、AAVDJ8、AAVPHP.B、AAVPHP.eB、AAVBR1、AAVHSC15、AAVHSC17、ヤギAAV、AAV1/AAV2キメラ、ウシAAV、またはマウスAAVキャプシド rAAV2/HBoV1血清型キャプシドを含む;および/または
    (ii)ITRおよびrAAVウイルス粒子のキャプシドは、同じAAV血清型から誘導される;または
    (iii)ITRおよびrAAVウイルス粒子のキャプシドは、異なるAAV血清型から誘導され、場合により、該ITRは、AAV2から誘導され、該rAAV粒子のキャプシドは、AAV1から誘導される、
    上記組換えAAV粒子。
  18. 請求項16に記載のウイルス粒子または請求項17に記載のrAAV粒子を含む組成物であって、場合により、該組成物は、医薬的に許容される担体をさらに含む、上記組成物。
  19. 請求項1〜6のいずれか1項に記載のRNAi、請求項16に記載のウイルス粒子、請求項17に記載のrAAV粒子、または請求項18に記載の組成物を含むキットであって、場合により、使用説明書をさらに含む、上記キット。
  20. 哺乳動物におけるハンチントン病を処置するための、請求項2〜6のいずれか1項に記載のRNAi、請求項16に記載のウイルス粒子、請求項17に記載のrAAV粒子、または請求項18に記載の組成物。
  21. ハンチントン病を有する哺乳動物における、httの発現を阻害するための、またはhttの細胞における蓄積を阻害するための、請求項2〜6のいずれか1項に記載のRNAi、請求項16に記載のウイルス粒子、請求項17に記載のrAAV粒子、または請求項18に記載の組成物。
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Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MX2017010369A (es) 2015-02-10 2017-12-14 Genzyme Corp Arni variante.
EP3458589A4 (en) 2016-05-18 2020-01-01 Voyager Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING HUNTINGTON'S DISEASE
JP2020518259A (ja) 2017-05-05 2020-06-25 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッドVoyager Therapeutics,Inc. ハンチントン病治療組成物および方法
US11603529B2 (en) 2017-09-22 2023-03-14 Genzyme Corporation Variant RNAi
CN112980837B (zh) * 2019-12-13 2023-07-04 深圳艾码生物科技有限公司 一种抑制HTT基因表达的siRNA及其前体和应用
CN115141848A (zh) * 2021-03-30 2022-10-04 南京大学 一种用于治疗亨廷顿病的rna递送系统

Family Cites Families (36)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU722624B2 (en) 1996-09-06 2000-08-10 Trustees Of The University Of Pennsylvania, The An inducible method for production of recombinant adeno-associated viruses utilizing T7 polymerase
US6995006B2 (en) 1997-09-05 2006-02-07 Targeted Genetics Corporation Methods for generating high titer helper-free preparations of released recombinant AAV vectors
US6566118B1 (en) 1997-09-05 2003-05-20 Targeted Genetics Corporation Methods for generating high titer helper-free preparations of released recombinant AAV vectors
EP2369002A1 (en) 1999-08-09 2011-09-28 Targeted Genetics Corporation Enhancement of expression of a single-stranded, heterologous nucleotide sequence from recombinant viral vectors by designing the sequence such that it forms intrastrand base pairs
AU2001269723B9 (en) 2000-06-01 2006-11-16 University Of North Carolina At Chapel Hill Duplexed parvovirus vectors
US6723551B2 (en) 2001-11-09 2004-04-20 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Production of adeno-associated virus in insect cells
CA2406745C (en) 2001-11-13 2006-01-10 The Trustees Of The University Of Pennsylvania A method of detecting and/or identifying adeno-associated virus (aav) sequences and isolating novel sequences identified thereby
US20050255086A1 (en) * 2002-08-05 2005-11-17 Davidson Beverly L Nucleic acid silencing of Huntington's Disease gene
JP2004101787A (ja) 2002-09-09 2004-04-02 Fuji Xerox Co Ltd 画像形成装置及び現像装置
CA2881743A1 (en) 2002-09-25 2004-04-08 University Of Massachusetts In vivo gene silencing by chemically modified and stable sirna
CA2596588C (en) * 2005-01-31 2017-06-27 University Of Iowa Research Foundation Nucleic acid silencing of huntington's disease gene
WO2006119432A2 (en) 2005-04-29 2006-11-09 The Government Of The U.S.A., As Rep. By The Sec., Dept. Of Health & Human Services Isolation, cloning and characterization of new adeno-associated virus (aav) serotypes
US7902352B2 (en) 2005-05-06 2011-03-08 Medtronic, Inc. Isolated nucleic acid duplex for reducing huntington gene expression
WO2007120542A2 (en) 2006-03-30 2007-10-25 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Aav capsid library and aav capsid proteins
US8173614B2 (en) * 2007-01-03 2012-05-08 Medtronic, Inc. Therapeuting compositions comprising an RNAi agent and a neurotrophic factor and methods of use thereof
US8258286B2 (en) 2007-04-26 2012-09-04 University Of Iowa Research Foundation Reduction of off-target RNA interference toxicity
EP2152874A2 (en) 2007-04-26 2010-02-17 University of Iowa Research Foundation Rna interference suppression of neurodegenerative diseases and methods of use thereof
WO2009098196A2 (en) 2008-02-04 2009-08-13 Biofocus Dpi B.V. Molecular targets and compounds, methods to identify the same, useful in the treatment of neurodegenerative diseases.
EP2250183A4 (en) 2008-02-14 2012-07-25 Michael Paul Marie Gantier SMALL IMMUNOSTIMULATORY RNAI MOLECULES
FR2929292A1 (fr) * 2008-03-28 2009-10-02 Exonhit Therapeutics S A Sa Procede et methodes de diagnostic de la maladie d'alzheimer
WO2011034811A1 (en) 2009-09-17 2011-03-24 Sigma-Aldrich Co. Short rna mimetics
CA3066596A1 (en) 2010-04-23 2011-10-27 University Of Massachusetts Cns targeting aav vectors and methods of use thereof
US8663624B2 (en) 2010-10-06 2014-03-04 The Regents Of The University Of California Adeno-associated virus virions with variant capsid and methods of use thereof
WO2012112832A1 (en) 2011-02-17 2012-08-23 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions and methods for altering tissue specificity and improving aav9-mediated gene transfer
BR112014021104B1 (pt) * 2012-02-29 2023-03-28 Sangamo Biosciences, Inc Proteína de fusão de ocorrência não natural compreendendo um domínio de ligação de dna de dedo de zinco manipulado que se liga a um gene htt, seu uso, método in vitro de modificação da expressão de um gene htt em uma célula, e método de geração de um sistema modelo para o estudo da doença de huntington
CN103224556B (zh) * 2013-01-31 2015-04-15 清华大学 亨廷顿舞蹈症的靶位蛋白质及其编码基因和应用
US9550989B2 (en) 2013-10-03 2017-01-24 Washington University Rational design of microRNA-siRNA chimeras for multi-functional target suppression
NZ719477A (en) * 2013-11-11 2022-05-27 Sangamo Therapeutics Inc Methods and compositions for treating huntington’s disease
FI3628334T3 (fi) * 2014-03-21 2023-09-15 Genzyme Corp Geenihoito verkkokalvon pigmenttirappeuma
CN114231563A (zh) 2014-05-02 2022-03-25 建新公司 用于视网膜及cns基因疗法的aav载体
CN107075514A (zh) * 2014-05-20 2017-08-18 衣阿华大学研究基金会 亨廷顿氏病的治疗化合物
JP6839094B2 (ja) * 2014-12-24 2021-03-03 ユニクア・アイピー・ベーフェー RNAiで誘発されるハンチンチン遺伝子抑制
MX2017010369A (es) 2015-02-10 2017-12-14 Genzyme Corp Arni variante.
EP3458589A4 (en) * 2016-05-18 2020-01-01 Voyager Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING HUNTINGTON'S DISEASE
US11603529B2 (en) 2017-09-22 2023-03-14 Genzyme Corporation Variant RNAi
AR114540A1 (es) * 2018-08-03 2020-09-16 Genzyme Corp VARIANTE DE ARNi CONTRA a-SINUCLEÍNA

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