JP2019531724A - イヌアデノウイルスベクター - Google Patents

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Abstract

本発明は、CAdVベクターワクチンの分野、特にそのようなベクターワクチン由来の標的抗原の発現に好適なプロモーターに関する。開示および特許請求されるのは、組換えイヌアデノウイルス、それらを作製する方法、それらの使用(免疫学的、免疫原性ワクチンもしくは治療用組成物における、または、DNAのクローニング、複製もしくは発現のためのベクターとして、ならびに該組成物およびベクターを使用する方法としての使用を含む)、それら由来の発現産物、および該発現産物の使用である。さらに、開示および特許請求されるのは、トランケートEHV4プロモーター、該プロモーターを含有する発現カセット、ならびに該プロモーターまたは発現カセットを含有する組換えウイルスおよびプラスミドである。

Description

配列表
本出願は、37 C.F.R. 1.821〜1.825に従って配列表を含有する。本出願に付随する配列表は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
A.技術分野
本発明は、(ベクター)ワクチンの分野に関し、特にそのようなベクターワクチン由来の標的抗原の発現に好適な改良された発現カセットを有する組換えイヌアデノウイルス2型に特に関する。
B.関連技術の背景および説明
アデノウイルスは、組換えワクチン用のベクターとして広く調査されている(総説Bru, T., S. Salinas, and E.J. Kremer, An update on canine adenovirus type 2 and its vectors. viruses, 2010. 2 (9): p. 2134-53参照)。詳細には遺伝子療法およびワクチン開発の分野で、ここ20〜30年間にわたって蓄積されたアデノウイルスに関する豊富な情報がある。アデノウイルスの、以下のいくつかの特徴から、遺伝子導入ツールとしてアデノウイルスは魅力的である:(1)アデノウイルスゲノムの構造は十分に特徴づけられている、(2)ウイルスDNAの大部分は外来配列により置換することができる、(3)組換えバリアントが比較的安定している、(4)組換えウイルスが高力価で増殖することができる、(5)ヒト悪性腫瘍はアデノウイルスとは無関係である、および(6)ワクチンとしての弱毒野生型アデノウイルスの使用は安全である。
有効なベクターCAV−2ワクチンの公表された標的としては、ネコ(Hu, R.L., et al., Experimental immunization of cats with a recombinant rabies-canine adenovirus vaccine elicits a long-lasting neutralizing antibody response against rabies. Vaccine, 2007. 25 (29): p. 5301-7)、イヌ(Hu, R., et al., Prevention of rabies virus infection in dogs by a recombinant canine adenovirus type-2 encoding the rabies virus glycoprotein. Microbes Infect, 2006. 8 (4): p. 1090-7)、マウス(Li, J., et al., A single immunization with a recombinant canine adenovirus expressing the rabies virus G protein confers protective immunity against rabies in mice. Virology, 2006. 356 (1-2): p. 147-54)、アライグマ(Henderson, H., et al., Oral immunization of raccoons and skunks with a canine adenovirus recombinant rabies vaccine. Vaccine, 2009. 27 (51): p. 7194-7)、ヒツジ(Bouet-Cararo, C., et al., Canine adenoviruses elicit both humoral and cell-mediated immune responses against rabies following immunization of sheep. Vaccine, 2011. 29 (6): p. 1304-10)、スカンク(Henderson, H., et al., Oral immunization of raccoons and skunks with a canine adenovirus recombinant rabies vaccine. Vaccine, 2009. 27 (51): p. 7194-7)、およびブタ(Liu, Y., et al., Efficacy and safety of a live canine adenovirus-vectored rabies virus vaccine in swine. Vaccine, 2008. 26 (42): p. 5368-72)の狂犬病、イヌジステンパー(Fischer, L., et al., Vaccination of puppies born to immune dams with a canine adenovirus-based vaccine protects against a canine distemper virus challenge. Vaccine, 2002. 20 (29-30): p. 3485-97)、およびネコ汎白血球減少症(Yang, S., et al., Complete protection of cats against feline panleukopenia virus challenge by a recombinant canine adenovirus type 2 expressing VP2 from FPV. Vaccine, 2008. 26 (11): p. 1482-7)が挙げられる。CAV−2は、イヌ(Zhang, S., et al., Oral vaccination of dogs (Canis familiaris) with baits containing the recombinant rabies-canine adenovirus type-2 vaccine confers long-lasting immunity against rabies. Vaccine, 2008. 26 (3): p. 345-50)、狂犬病に対するアライグマおよびスカンク(Henderson, H., et al., 2009, Zhao et al. 2014. Experimental Oral Immunization of Ferret Badgers (Melogale moschata) with a Recombinant Canine Adenovirus Vaccine CAV-2-E3Δ-RGP and an Attenuated Rabies Virus SRV9. J. Wildlife Diseases 50 (2):374-377.)の経口ワクチン接種による有効性によって示されるように、経口ワクチンとして使用される可能性も示している。興味深いことに、複製可能なアデノウイルスベースのベクターは、ベクターに対する受動免疫にもかかわらず有効性を示しており(Gallichan, W.S., et al., Mucosal immunization with a recombinant adenovirus vector induces local and systemic immunity and protection from herpes simplex virus. Adv Exp Med Biol, 1995. 371B: p. 1581-5;Lubeck, M.D., et al., Immunogenicity of recombinant adenovirus-human immunodeficiency virus vaccines in chimpanzees following 鼻腔内投与. AIDS Res Hum Retroviruses, 1994. 10 (11): p. 1443-9;Wang, Y., et al., The use of an E1-deleted, 複製-defective adenovirus recombinant expressing the rabies virus glycoprotein for early vaccination of mice against rabies virus. J Virol, 1997. 71 (5): p. 3677-8)、これらが母体由来免疫を克服し得ることを示唆している(Papp, Z., L.A. Babiuk, and M.E. Baca-Estrada, The effect of pre-existing adenovirus-specific immunity on immune responses induced by recombinant adenovirus expressing glycoprotein D of bovine herpesvirus type 1. Vaccine, 1999. 17 (7-8): p. 933-43;Babiuk, L.A. and S.K. Tikoo, Adenoviruses as vectors for delivering vaccines to mucosal surfaces. J Biotechnol, 2000. 83 (1-2): p. 105-13)。このことは、Fischerら(2002)によってイヌジステンパーに関して確認された。しかし、既存の抗体は、免疫化の経口経路の使用を妨げる可能性がある(Wright, N., et al., High prevalence of antibodies against canine adenovirus (CAV) type 2 in domestic dog populations in South Africa precludes the use of CAV-based recombinant rabies vaccines. Vaccine, 2013. 31 (38): p. 4177-82)。
イヌアデノウイルス2型(CAV−2)は、通常、気道の不顕性から軽度の感染を引き起こし、一般的な蔓延している感染性気管気管支炎の原因の1つとみなされている(Buonavoglia, C. and V. Martella, Canine respiratory viruses. Vet Res, 2007. 38 (2): p. 355-73;Tham, K.M., G.W. Horner, and R. Hunter, Isolation and identification of canine adenovirus type-2 from the upper respiratory tract of a dog. N Z Vet J, 1998. 46 (3): p. 102-5)。CAV−2はまた、腸炎のエピソードにも関与しており(Hamelin, C., P. Jouvenne, and R. Assaf, Association of a type-2 canine adenovirus with an outbreak of diarrheal disease among a large dog congregation. J Diarrhoeal Dis Res, 1985. 3 (2): p. 84-7;Macartney, L., H.M. Cavanagh, and N. Spibey, Isolation of canine adenovirus-2 from the feces of dogs with enteric disease and its unambiguous typing by restriction endonuclease mapping. Res Vet Sci, 1988. 44 (1): p. 9-14)、神経学的徴候を有するイヌの脳で検出されている(Benetka, V., et al., Canine adenovirus type 2 infection in four puppies with neurological signs. Vet Rec, 2006. 158 (3): p. 91-4.)。いくつかのCAV2ベースのワクチンが開発され、子犬および成犬のワクチン接種に世界中で広く使用されている。改変生CAV−2ワクチンは、イヌ集団におけるCAV−2の循環低下に極めて有効であることが証明された(Buonavoglia et al., 2007)。CAV−2をワクチン接種されたイヌは、CAV−1およびCAV−2の両方に対する免疫ができる(Appel, M., et al., Pathogenicity of low-virulence strains of two canine adenovirus types. Am J Vet Res, 1973. 34(4): p. 543-50;Appel, M., L.E. Carmichael, and D.S. Robson, Canine adenovirus type 2-induced immunity to two canine adenoviruses in pups with maternal antibody. Am J Vet Res, 1975. 36(08): p. 1199-202)。両方のイヌアデノウイルス型に対する子犬の免疫化にCAV−2を使用することによって、CAV−1ワクチンで遭遇する安全性関連の副作用が消失した(Bittle, J.L., W.A. Grant, and F.W. Scott, Canine and feline immunization guidelines--1982. J Am Vet Med Assoc, 1982. 181(4): p. 332-5;Curtis, R. and K.C. Barnett, The 'blue eye' phenomenon. Vet Rec, 1983. 112(15): p. 347-53)。ワクチンとしてのCAV2の明白な安全性は、30年間利用されてきた間に、イヌおよび人間を含む他の動物種でワクチン誘発およびワクチン関連合併症がないことによって十分に証明されている。さらに、野外血清学的調査からの結果は、多くの野生動物(キツネ、アライグマ、スカンクおよびマングース)が、CAV2または抗原的に関連するウイルス感染に無症候性に曝露されていることを示している(Summer et al., 1988)。イヌアデノウイルス血清型2(CAV2)のワクチン株は、それ故に、特にイヌのワクチン接種のための有効なベクターベースのワクチン候補を引き出すのに検討することができる安全な複製可能な宿主限定ウイルスの珍しい例を提供する。
イヌアデノウイルスはそれ故に、ベクターウイルスワクチンを開発するための多くの理想的な特徴を有する。上記に詳述したような安全および有効な使用に加えて、イヌアデノウイルスは:ウイルス病原体標的が防御を必要とし得る、ワクチンに対する体液性および細胞性免疫応答;幅広い潜在的な宿主域および組織向性を有する;非エンベロープウイルスであり、そのためエンベロープウイルスより安定である可能性が高い;高力価まで増殖することができ、十分に確立された作製プロトコルおよびアッセイが実施されている:複製可能なウイルスおよび複製欠損ウイルスの両方として使用することができる;ならびに比較的大量の異種DNAを有することができ、特にCAdVが「gutless」である場合、約30kbの外来性DNAが挿入され得るが、該ウイルスは、次いでヘルパーウイルスの存在下でレスキューされなければならないことを含む、重要な特徴を提供する。
米国特許第6,090,393号(参照により本明細書に組み込まれている)においてFisherらは、E1、E3内の非必須領域もしくは部分、および/または右ITRとE4 転写単位の間のゲノムの右端に挿入された外来性DNAを有する組換えCAdV2の使用を記載した。E3領域は、この領域の一部が、in vitroおよびin vivoいずれでも感染性ウイルス形成に必須ではないとして同定され(例えば、HAVおよびウシAd3から得られたデータに基づき)、それ故に挿入領域として標的とされたため、組換え体の生成に使用された。E1領域が欠失されているアデノウイルスベクターは複製能力がなく、他の課題を抱えており、故に使用には好ましくなかった。
Fisherらは、マウスサイトメガロウイルスまたはヒトサイトメガロウイルスMCMVまたはHCMVに由来するトランケートプロモーター、例えば、HCMV−IEまたはMCMV−IEの使用をさらに開示した。hCMV−IEプロモーターは、最先端の技術としておよび有望な上流の制御領域としてFisherらによって選択され、組織培養における組換えタンパク質発現の最高レベルおよび最長持続と関連があると結論づけられた。hCMV−IEプロモーターはまた、試験されたほとんど全ての細胞株で作動することが見出されたため、明らかな利点であるとみなされた。HCMV−IEなどのプロモーターの一部の標的欠失を推進する背景は、プロモーターのサイズを縮小し、故にアデノウイルスのパッキング制限に対処することであった。Fisherらは、91bpのサイズを有するHCMV−IEの活性断片、または466bpのサイズを有するMCMV−IEの活性断片、すなわち、約91bpのトランケートされた転写的に活性なHCMV−IE、または約466bpのトランケートされた転写的に活性なMCMV−IEを特に開示した。
Fisherらは、様々な組換えCAdV2ベクター、例えば、ワクシニアウイルスH6(vH6)プロモーターと作動可能に連結されたCDVヘマグルチニン(haemagluttanin)(HA)または融合(F)タンパク質のポリヌクレオチドをコードする発現カセットの構築を記載しているが、Fisherらは、構築したCAdV2ベクターのいずれからも強いCDV抗原発現を実証しなかった。代わりに、Fisherの‘393号特許は、E3挿入部位の一般的なヌクレオチドサイズの制限を、安定な発現に関する変数として開示したが、感染細胞におけるウイルスレスキューまたは異種タンパク質の発現に寄与するようなプロモーターの選択のいかなる可能性可変性についての観察および/または検討も一切なかった。Fisherら、2002年の後続試験において("Vaccination of puppies born to immune dams with a canine adenovirus-based vaccine protects against a canine distemper virus challenge" Vaccine 20 (2002) 3485-3497)、Fisherらは、CDV HAおよびF発現カセットが、hCMV IEプロモーターの91bp断片によって駆動されるベクターのE3領域に挿入されている、2つの組換えCAdV2ウイルスの初めての構築および特性決定を報告した。Fisherらは、CAV2複製の開始後のトランスジーン遺伝子の発現を促進するために、hCMVIE 5’UTRをhAd2 TPLでさらに置き換えた。まとめると、クローニング戦略の重点は、CDV HAおよびF cDNA両方の発現カセットのサイズを最小化することであった。さらに、該試験は、特定の挿入部位、欠失サイズ、挿入サイズ、および挿入方向による潜在的なウイルス回収問題を詳らかにした。その試験においてFisherらは、正しい挿入を示す安定なクローンを回収することができ、免疫化後の免疫の誘導についてアッセイすることができた。CDV HA全体をコードするrCAdV2およびvCA17の混合物の血清陰性子犬への単回鼻腔内投与後、極めて高い全身のCDV SN力価(>2.0log10)およびチャレンジ後のほぼ完全な防御が観察された。しかし、子犬はHAおよびF抗原を含有する2つのベクターの混合物で免疫されたため、著者らは、一方または両方のベクターが、免疫されたイヌにおいてCDV導入遺伝子を発現したかどうかについて結論づけることはできず、また個々の細胞集団において導入遺伝子の強い発現を決定的に実証することもなかった。
本明細書に記載された実験は、タンパク質の検出(IFA、フローサイトメトリー、ドットブロット)により測定する場合、E3ゲノム遺伝子座で挿入されたカセットからの強い導入遺伝子発現は、複製可能なrCAdV−2 CMV5駆動導入遺伝子発現カセットに感染した細胞では観察されなかったことを実証する。実際に、本明細書の実験は、CMV5プロモーターを含む発現カセットを有するrCAdV−2ベクターがレスキューされ得ず、そのためタンパク質発現は感染細胞では測定され得なかったことを示している。これは、それらの発現カセットを含有する同じトランスファープラスミドによるin vitroでの一過的なトランスフェクションが、タンパク質発現レベルに関してCMV5プロモーター活性はCMVieプロモーター活性より大きかったことを実証するという事実にもかかわらず、示されたのであった。故に、強い再現可能な導入遺伝子発現、および/またはウイルスレスキューの欠如から、CAdV2ベクター、特に複製が起きない宿主におけるCMV駆動発現カセットの有用性は極めて疑わしくなった。
したがって、非常に強力で組織特異的でないHCMVおよびMCMV(マウスサイトメガロウイルス)IEプロモーター−エンハンサーは、CAdV2が複製する標的種における様々な研究活動および限られた有用性に十分に適合され得るが、これらは、他の種において使用するCAdV2ベクターワクチンの構築のための有効なおよびまたは信頼性が高いプロモーターとはみなされなかった。必要なことは、様々な種において使用するワクチンの作製のための組換えCAdV2ウイルスに関して、CMVプロモーターを、目的の抗原エピトープの安定した強い再現可能な発現を駆動することができる有効なプロモーターと置き換えることであった。
任意のそのような障害を避けるために、本発明は、特にベクターワクチンの文脈の中で、ならびに特にCAdV−2ベクターの文脈の中での導入遺伝子発現のための新しい制御核酸配列/プロモーター配列を提供する。
したがって、上記の技術的問題の解決策は請求項に特徴づけられる記載および実施形態によって達成され、その異なる態様内の本発明は請求項に従って実施される。
本発明は、導入遺伝子発現のための新しい制御核酸配列/プロモーター配列、免疫原性組成物、ワクチン、および当技術分野の欠点を克服する関連方法を提供する。
ヘルペスウイルスを含む様々なベクター系での高レベルの導入遺伝子発現を駆動するために広く使用される確立されたプロモーター配列は、HCMV(Boshart et al., 1985; Foecking and Hofstetter 1986)またはマウスサイトメガロウイルス(MCMV;Dorsch-Hasler et al., 1985)の最初期遺伝子のプロモーター配列、または例えばSV40ラージT抗原プロモーターなど、サルウイルス40(SV40)のような腫瘍ウイルスの強力なプロモーター、ならびに他多数(例えば、Kim et al., 1990)である。そのような強力なプロモーターは、様々な細胞培養系で自律的に機能するため、細胞生物学者に好まれた。ウイルス複製に関して、感染細胞は、ウイルス機能によってウイルス複製機構へと形質転換される。
しかし、改良されたベクターワクチンに関して、上記の自律的な強力なプロモーターはいずれも選択肢として見られていない。特にCMV由来プロモーターは、組換えCAdV2ベクターワクチンにおける導入遺伝子発現の有効な再現可能な駆動因子ではなかった。
したがって、EHV−1 β−およびγ−遺伝子のもののような、ウイルス複製に関して高い活性を有するプロモーターを提供する必要がある。内部相同組換えのリスクが起こることなく、したがって遺伝的不安定性なく、1つのベクター分子に2回同一のDNA配列を使用することはできないため、本発明は、EHV−4の公表されたゲノム配列由来の新しい代替えのプロモーター配列を提供する(ウマヘルペスウイルス4株 NS80567、完全ゲノム、Accession AF030027、Version AF030027.1 GI:2605950、1998年5月21日)。EHV−1遺伝子との遺伝子の配列同一性は55〜84%の範囲内である。
本発明は2つの新しいプロモーター:4pgG600および4pMCP600、ならびにより短い長さのそれらの誘導体を提供し、それらは細胞培養において、または細胞培養のrCAdV−BAC複製の背景において、一過的なトランスフェクション後に機能的であることが示される。
本発明は2つの新しいプロモーター:p430およびp455を提供し、それらは細胞培養において、およびp455は、動物(ブタ)においてもrCAdV2複製の背景で機能的であることが示されている。ウイルス複製サイクル中の2つの新しいプロモーターの活性レベルは、in vitroでのプロモーター動態実験から推測されるように、非常に類似しているようである。
本発明によって提供された新しいプロモーター配列は、イヌアデノウイルス(CAdV)ベクター背景において効率的であることが示されている。
上記のように、CMV5プロモーター配列が、E3領域に位置する発現カセットに存在した場合、組換えCAdVのレスキューは達成されなかった。これは、発現カセットのサイズが観察された実験的なゲノムサイズ制限を超えなかったため、配列特異的であるようである。対照的に、p430およびp455などの本発明の新しいEHV−4由来プロモーター配列は、導入遺伝子発現を促進するだけでなく、ウイルスレスキューの重要なステップを妨げず、それ故に、先行技術のプロモーター配列を考えると有利である。
本発明は、先行技術につきものの問題を解決し、当技術の状態の明らかな進歩を提供する。
一般に、本発明は、ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターと作動可能に連結された少なくとも1つの異種DNAをコードする発現カセットを含む組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを提供する。
本発明は、ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターが、4pgG600(配列番号29)もしくは4pMCP600(配列番号30)またはその相補的なヌクレオチド配列またはその機能的断片もしくは機能的誘導体またはその相補的なヌクレオチド配列を含み、前記プロモーター配列が異種抗原の発現をもたらす、rCAdVベクターにさらに関する。
特定の態様では、該プロモーター配列の機能的断片または誘導体は、少なくとも80%、85%の配列同一性、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%の配列同一性、より好ましくは95%、96%、97%、98%、99%、99.9%の配列同一性を有する。
特定の態様では、機能的断片は、4pgG600(配列番号29)のトランケーション(truncation)またはその相補的なヌクレオチド配列であり、好ましくは配列同一性は、全長にわたって少なくとも72%である。
特定の態様では、機能的断片は、4pMCP600(配列番号30)のトランケーションまたはその相補的なヌクレオチド配列であり、好ましくは配列同一性は、全長にわたって少なくとも78%である(またはより高い)。
さらなる特定の態様では、プロモーター4pgG600(配列番号29)または4pMCP600(配列番号30)配列の機能的断片または誘導体は、550ヌクレオチド、好ましくは500、490、480、470、460、455、450、445、440、435、434、433、432、431、430ヌクレオチド、最も好ましくは455または430ヌクレオチドの長さを有する。
さらなる特定の態様では、rCAdVベクターは、4pgG600(配列番号29)を含むウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターを含む。
さらなる特定の態様では、rCAdVベクターは、4pMCP600(配列番号30)を含むウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターを含む。
さらなる特定の態様では、rCAdVベクターは、4pG430(配列番号31)を含むウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターを含む。
さらなる特定の態様では、rCAdVベクターは、gMCP455(配列番号32)を含むウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターを含む。
本発明の特定の態様では、rCAdVベクターは、感染性CAdVとしてパッケージされる。
本発明のさらに別の実施形態では、rCAdVベクターは、目的のエピトープ、生物学的応答調節因子、増殖因子、認識配列、治療用遺伝子、および融合タンパク質からなる群から選択されるポリペプチドをコードする異種DNAを含む。
本発明の特定の態様では、異種DNAは、目的の抗原エピトープをコードする。
本発明のさらに別の実施形態では、目的の抗原エピトープは、イヌもしくはネコ病原体の抗原である。
本発明の特定の態様では、目的の抗原エピトープは、食品生産動物病原体に由来する抗原であり、より詳細には食品生産動物病原体は、ブタ、ウシ、ウマ、家禽、および/またはヒツジ動物に由来し、ならびにより詳細には食品生産動物病原体は、ウシウイルス性下痢症ウイルス(BVDV)、パラインフルエンザ3ウイルス(PI−3)、感染性ウシ鼻気管炎ウイルス(IBR)、ウシRSウイルス(BRSV)、ウシヘルペスウイルス(BHV)、ウシロタウイルス(BRV)、ウシエンテロウイルス(BEV)、ウシコロナウイルス(Coronovirus)(BCV)、ウシ狂犬病(BR)、ウシパルボウイルス(BPV)、アデノウイルス、アストロウイルス、マンヘミア・ヘモリチカ(以前はパスツレラ・ヘモリチカ)、パスツレラ・マルトシダ、ヘモフィルス・ソムナス(ヒストフィルス・オビスおよびヘモフィルス・アグニ)、アクチノマイセス(コリネバクテリウム)、アクチノマイセス・ピオゲネス、クラミジア・シッタシ、カンピロバクター・フィタス・ベネレアリスおよびカンピロバクター・フィタス・フィタス(以前はC・フィタス・インテスチナリス)、レプトスピラ・インテロガンス、レプトスピラ・ハージョ、レプトスピラ・ポモナ、およびレプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・カニコーラ、レプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・ハージョ(レプトスピラ・ハージョプラジトノ(Leptospira hardjoprajitno)およびレプトスピラ・ハージョボビス(Leptospira hardjo−bovis))、ブルセラ・アボルタス、ブルセラ・スイスおよびブルセラ・メリテンシス、リステリア・モノサイトゲネス、クラミジア・シッタシ、クロストリジウム・ショウベイ、クロストリジウム・セプチカム、クロストリジウム・ヘモリチクム、クロストリジウム・ノビイ、クロストリジウム・ソルデリ、クロストリジウム・パーフリンゲンス、クロストリジウム・テタニ、モラキセラ・ボビス、クレブシエラ属種、クレブシエラ・ニューモニエ、サルモネラ・ティフィムリウム;サルモネラ・ニューポート、ヨーネ菌(Mycobacterium avium paratuberculosis、マイコバクテリウム・アビウム・パラツベルクローシス)、クリプトスポリジウム・パルバム(Cryptsporidium parvum)、クリプトスポリジウム・ホミニス(Cryptsporidium hominis)、黄色ブドウ球菌(スタフィロコッカス・アウレウス)、ストレプトコッカス・ディスガラクティエ、ストレプトコッカス・ウベリス、ストレプトコッカス・アガラクチア、大腸菌(エスケリキア・コリ)、マイコプラズマ属種、マイコプラズマ・ディスパー、およびウレアプラズマ属種、トリトリコモナス・フィータス、トリコフィトン・ベルコーズム、トリコフィトン・メンタグロフィテス、トリコフィトン・サルキソヴィー(Trichophyton sarkisovii)、ネオスポラ・カニナム(以前はトキソプラズマ・ゴンディ)、バベシア・ビゲミナおよびバベシア・ボビス、ディクチオカウルス・ヴィヴィパロウス(Dictyocaulus viviparous)(肺虫症)、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明の特定の態様では、目的の抗原エピトープは、食品生産動物病原体に由来する抗原であり、より詳細には食品生産動物病原体は、ブタ、ウシ、ウマ、家禽、および/またはヒツジ動物に由来し、ならびにより詳細には食品生産動物病原体は、サルモネラ属種、特にサルモネラ・ティフィムリウム、S.コレラスイス;アストロウイルス;ロタウイルス;伝染性胃腸炎ウイルス;ブラキスピラ属種、特にB.ヒオディセンテリア、B.ピロシコリ;クロストリジウム属種、特にC.ディフィシル、ウェルシュ菌(C.パーフリンゲンス)A、BおよびC型、C.ノビイ、C.セプチカム、C.テタニ;ブタ腸管ピコルナウイルス;ブタ腸管カリシウイルス;アクチノバシラス・プルロニューモニエなどの呼吸器病原体;ボルデテラ・ブロンキセプティカ;エリシペロスリクス・ルシオパシエ(Erysipelothrix rhsiopathiae);ヘモフィルス・パラスイス、特に亜型1、7および14;パスツレラ属種、特にP.マルトシダ;マイコプラズマ属種.、特にM.ハイオニューモニエ、M.ヒオリニス;ブタインフルエンザウイルスA型 ;PRRSウイルス;ブタサーコウイルス;ブタパルボウイルス;仮性狂犬病ウイルス;エペリスロゾーノシス・スイス(Eperythrozoonosis suis)、マイコバクテリウム属種、特にM.アビウム、M.イントラセルラーレ、M.ボビス;ブタ呼吸器コロナウイルス;ブタコロナウイルス、特にTGEV、PEDV、およびデルタコロナウイルス;アルカノバクテリウム・ピオゲネス;ブタアデノウイルス;豚コレラ;ブタサイトメガロウイルス;アフリカ豚コレラ;または大腸菌(エスケリキア・コリ)、ストレプトコッカス属種、特にS.スイス、S.ポルシナス(S.porcinus)、S.ディスガラクティエ、好ましくは亜種エクイシミリス;ブルセラ・スイス、特に次亜種1、2および3型を含む他の病原体;レプトスピラ属種、特にL.オーストラリス、L.カニコーラ、L.グリッポチフォーサ、L.ポモナ、L.レプトスピラ・イクテロヘモラジア(L.icterohaemorrhagicae)、L.インターロガンス、L.タラソビ(L.tarassovi)、L.ハージョ、L.セジュロ(L.sejroe);脳心筋炎ウイルス;赤血球凝集脳脊髄炎ウイルス;日本脳炎ウイルス;西ナイルウイルス;レオウイルス;ルブラウイルス;メナングルウイルス;ニパウイルス;水疱性口内炎ウイルス;ブタの水疱性発疹のウイルス:ブタポックスウイルス;ブタヘルペスウイルス;およびスタフィロコッカス・ヒカス、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明のさらなる実施形態では、目的の抗原エピトープは、モルビリウイルス抗原、狂犬病糖タンパク質、ネコ白血病ウイルス(FeLV)エンベロープタンパク質、免疫不全ウイルス抗原、パルボウイルス抗原、ポックスウイルス抗原からなる群から選択される。
本発明は、上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクター、および薬学的にまたは獣医学的に許容される、許容される担体または希釈剤を含む免疫原性またはワクチン組成物にさらに関する。
別の態様では、上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含む免疫原性またはワクチン組成物は、経口、皮内、筋肉内または鼻腔内適用に好適である。
本発明は、(a)上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含む組換えrCAdVベクターを宿主細胞に導入するステップ、(b)好適な条件下で感染細胞を培養するステップ、(c)感染細胞および/またはベクターおよび/またはウイルス成分を回収するステップを含み、(d)ステップ(c)の回収物を精製するステップを含んでもよく、(e)前記回収物を薬学的に許容される担体と混合するステップを含む、感染と関連するまたは感染によって引き起こされる1つまたは複数の臨床徴候の発生率または重症度を低減するための、上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含む免疫原性組成物またはワクチンを作製する方法にさらに関する。
本発明は、上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含むワクチンの免疫原性組成物の治療有効量を動物に投与するステップを含む、動物において病原体の感染によって引き起こされる臨床徴候もしくは疾患を低減もしくは予防する方法、または動物において病原体の感染を処置もしくは予防する方法で使用するための方法にさらに関する。
上記の実施形態の方法のいずれかによる特定の態様では、免疫原性組成物は1回投与される。
上記の実施形態の方法のいずれかによる特定の態様では、免疫原性組成物は2回用量として投与される。
上記の実施形態の方法のいずれかによる特定の態様では、免疫原性組成物は、経口、皮内、筋肉内または鼻腔内投与される。
上記の実施形態の方法のいずれかによる特定の態様では、免疫原性組成物は、同種および/または異種ウイルスチャレンジに対する防御をもたらす。
本発明は、上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含む免疫原性組成物を動物に投与するステップを含む、動物において病原体によって引き起こされる臨床疾患に対する免疫性を前記動物に与える方法にさらに関し、これにより免疫原性組成物またはワクチンは、感染の臨床徴候を引き起こさないが、前記病原体の病原体型に対する免疫性を動物に与える免疫応答を誘導することができる。
上記の方法による本発明の特定の態様では、免疫原性組成物が1回投与され、または代わりに2回用量として投与される。
上記の方法による本発明の特定の態様では、免疫原性組成物は、経口、皮内、筋肉内または鼻腔内投与される。
上記の方法による本発明の特定の態様では、免疫原性組成物は、同種および/または異種ウイルスチャレンジに対する防御をもたらす。
本発明は、(a)上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含むワクチンを動物に投与することができるディスペンサー、および(b)上記の実施形態のいずれかによる組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクターを含む免疫原性組成物またはワクチンを含み、(c)指示リーフレットを含んでもよい、動物において病原体と関連する疾患に対して、動物にワクチン接種するための、および/または動物において病原体と関連するもしくは病原体によって引き起こされる1つもしくは複数の臨床徴候の発生率もしくは重症度を低減するためのキットにさらに関する。
本発明は、上記の実施形態の組換えイヌアデノウイルス2型(rCAdV2)を発現する真核生物の宿主細胞株にさらに関する。
別の特定の態様では、宿主細胞株は、PK/WRL細胞株、RK13細胞株、MDBK細胞株、ST細胞株、AI−ST細胞株、VERO細胞株、Sf9細胞株、Sf21、Sfプラス細胞株、MDCK細胞株、および/またはそれらの派生物からなる群から選択される哺乳動物細胞株または昆虫細胞株である。
さらに別の特定の態様では、宿主細胞株は、上記の実施形態の組換えイヌアデノウイルス2型(rCAdV2)を発現する原核生物の宿主細胞株である。
定義
特に定義しない限り、本明細書で使用される全ての技術および科学用語は、出願時に本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。用語の意味および範囲は、明らかであるはずであるが、あらゆる潜在的な多義性がある場合には、本明細書で提供した定義は、任意の辞書の定義または外部の定義よりも優先される。さらに、文脈によって特に必要とされない限り、単数形の用語は複数を含み、複数形の用語は単数を含む。本明細書では、特に言及しない限り、「または(or)」の使用は「および/または(and/or)」を意味する。さらに、用語「含む(including)」ならびに「含む(includes)」および「含まれる(included)」など他の形態の使用は限定されない。本明細書で参照した全ての特許および刊行物は、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明の実施は、他に示さない限り、当技術分野の範囲内である、ウイルス学、分子生物学、微生物学、組換えDNA技術、タンパク質化学、および免疫学の従来の技術を用いる。そのような技術は文献で完全に説明されている。例えば、Sambrook, Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Vols. I, II and III, Second Edition (1989);DNA Cloning, Vols. I and II (D. N. Glover ed. 1985);Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait ed. 1984);Nucleic Acid Hybridization (B. D. Hames & S. J. Higgins eds. 1984);Animal Cell Culture (R. K. Freshney ed. 1986);Immobilized Cells and Enzymes (IRL press, 1986);Perbal, B., A Practical Guide to Molecular Cloning (1984);the series, Methods In Enzymology (S. Colowick and N. Kaplan eds., Academic Press, Inc.);Protein purification methods - a practical approach (E.L.V. Harris and S. Angal, eds., IRL Press at Oxford University Press);およびHandbook of Experimental Immunology, Vols. I-IV (D. M. Weir and C. C. Blackwell eds., 1986, Blackwell Scientific Publications)を参照。
本発明を詳細に記載する前に、本発明は特定のDNA、ポリペプチド配列またはプロセスのパラメーターに限定されず、当然変化し得るものと理解される。本明細書で使用する用語は、単に本発明の特定の実施形態を記載する目的のためであり、限定することを意図しないことも理解される。本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「1つの(a)」「1つの(an)」および「その(the)」は、文脈が特に明確に規定しない限り、複数の参照を含むことに注意しなければならない。したがって、例えば、「抗原(an antigen)」という言及は2つまたはそれ以上の抗原の混合物を含み、「賦形剤(an excipient)」という言及は2つまたはそれ以上の賦形剤の混合物を含むなどである。
分子生物学定義
用語「ベクター」は、当技術分野で公知のように、遺伝材料を宿主細胞に伝達するために使用されるポリヌクレオチド構築物、典型的にはプラスミドまたは細菌人工染色体、または弱毒生ウイルスベクターを指す。ベクターは、例えば、細菌、ウイルス、ファージ、細菌人工染色体、コスミド、またはプラスミドであってよい。本明細書で使用する場合、ベクターは、DNAまたはRNAのいずれかから構成されるまたはDNAまたはRNAのいずれかを含有することができる。いくつかの実施形態では、ベクターはDNAから構成される。いくつかの実施形態では、ベクターは感染性ウイルスである。そのようなウイルスベクターは、細胞培養でも宿主動物でもウイルスベクターの複製に機能を持たない外来遺伝子を有するように操作されたウイルスゲノムを含有する。本開示の特定の態様に従って、ベクターは、遺伝材料の単なる伝達、宿主細胞または生物のトランスフェクションのため、ワクチン、例えばDNAワクチンとしての使用のため、または遺伝子発現目的のためなど、様々な態様のために使用され得る。遺伝子発現は、遺伝子と呼ばれる特定のポリヌクレオチド配列によって導かれるように細胞におけるタンパク質の生合成を記載する用語である。特定の態様では、ベクターは、適切な環境に存在する場合に、ベクターが有する1つまたは複数の遺伝子によってコードされるタンパク質の発現を導くことができるベクターである「発現ベクター」であってよい。
ベクターおよび発現のためにベクター(または組換え体)を作製および/または使用する方法は、特に、米国特許第4,603,112号、第4,769,330号、第5,174,993号、第5,505,941号、第5,338,683号、第5,494,807号、第4,722,848号、第5,942,235号、第5,364,773号、第5,762,938号、第5,770,212号、第5,942,235号、第382,425号、PCT国際公開第94/16716号、国際公開第96/39491号、国際公開第95/30018号、Paoletti, "Applications of pox virus vectors to vaccination: An update, "PNAS USA 93: 11349-11353, October 1996;Moss, "Genetically engineered poxviruses for recombinant gene expression, vaccination, and safety," PNAS USA 93: 11341-11348, October 1996;Smith et al., U.S. Pat. No. 4,745,051(recombinant baculovirus);Richardson, C. D. (Editor), Methods in Molecular Biology 39, "Baculovirus Expression Protocols" (1995 Humana Press Inc.);Smith et al., "Production of Human Beta Interferon in Insect Cells Infected with a Baculovirus Expression Vector", Molecular and Cellular Biology, December, 1983, Vol. 3, No. 12, p. 2156-2165;Pennock et al., "Strong and Regulated Expression of Escherichia coli B-Galactosidase in Infect Cells with a Baculovirus vector, "Molecular and Cellular Biology March 1984, Vol. 4, No. 3, p. 406;EPA0370573;米国特許出願第920,197号、1986年10月16日出願;欧州特許出願公開第265785号;米国特許第4,769,331号(組換えヘルペスウイルス);Roizman, "The function of herpes simplex virus genes: A primer for genetic engineering of novel vectors," PNAS USA 93:11307-11312, October 1996;Andreansky et al., "The application of genetically engineered herpes simplex viruses to the treatment of experimental brain tumors," PNAS USA 93: 11313-11318, October 1996;Robertson et al., "Epstein-Barr virus vectors for gene delivery to B lymphocytes", PNAS USA 93: 11334-11340, October 1996;Frolov et al., "Alphavirus-based expression vectors: Strategies and applications," PNAS USA 93: 11371-11377, October 1996;Kitson et al., J. Virol. 65, 3068-3075, 1991;米国特許第5,591,439号、第5,552,143号;国際公開第98/00166号;両方とも1996年7月3日に出願された、許可された米国特許出願第08/675,556号、および第08/675,566号(組換えアデノウイルス);Grunhaus et al., 1992, "Adenovirus as cloning vectors," Seminars in Virology (Vol. 3) p. 237-52, 1993;Ballay et al. EMBO Journal, vol. 4, p. 3861-65, Graham, Tibtech 8, 85-87, April, 1990;Prevec et al., J. Gen Virol. 70, 42434;PCT WO91/11525;Felgner et al. (1994), J. Biol. Chem. 269, 2550-2561, Science, 259: 1745-49, 1993;およびMcClements et al., "Immunization with DNA vaccines encoding glycoprotein D or glycoprotein B, alone or in combination, induces protective immunity in animal models of herpes simplex virus-2 disease", PNAS USA 93: 11414-11420, October 1996;および米国特許第5,591,639号、第5,589,466号、および第5,580,859号、ならびに国際公開第90/11092号、国際公開第93/19183号、国際公開第94/21797号、国際公開第95/11307号、国際公開第95/20660号;Tang et al., Nature, and Furth et al., Analytical Biochemistry, relating to DNA expression vectorsに開示の方法によるまたは類似してよい。また、国際公開第98/33510号;Ju et al., Diabetologia, 41: 736-739, 1998 (lentiviral expression system);Sanford et al.,米国特許第4,945,050号;Fischbach et al. (Intracel);国際公開第90/01543号;Robinson et al., Seminars in Immunology vol. 9, pp. 271-283 (1997), (DNA vector systems);Szoka et al.,米国特許第4,394,448号(生細胞にDNAを挿入する方法);McCormick et al.,米国特許第5,677,178号 (細胞変性ウイルスの使用);および米国特許第5,928,913号(遺伝子送達のためのベクター);ならびに本明細書で引用した他の文献も参照。
用語「ウイルスベクター」は宿主細胞にそれが入り込むと特定の生物活性、例えばベクターによって運ばれた導入遺伝子の発現をもたらすように、組換えDNA技術によって操作された遺伝子改変ウイルスを記載する。特定の態様では、導入遺伝子は抗原である。ウイルスベクターは標的細胞、組織、または生物において複製可能であってもなくてもよい。
ウイルスベクターの生成は、例えば、Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, N.Y. (1989)) or K. Maramorosch and H. Koprowski (Methods in Virology Volume VIII, Academic Press Inc. London, UK (2014))に記載されるように、限定はされないが、制限エンドヌクレアーゼによる消化、ライゲーション、形質転換、プラスミド精製、DNAシーケンシング、細胞培養へのトランスフェクションの標準的な技術を含む、当技術分野で周知の好適な遺伝子工学技術を使用して達成され得る。
ウイルスベクターは、任意の公知の生物のゲノムからの配列を組み込むことができる。配列は、それらの自然な形態に組み込まれることができ、または任意の方法で改変され、所望の活性を得ることができる。例えば、配列は、挿入、欠損または置換を含むことができる。さらに、配列は、目的の遺伝子の翻訳効率を高めて生きた生物におけるタンパク質発現を改善するように「コドン最適化」されてもよい。例えば、目的の遺伝子は、タンパク質のアミノ酸配列自体を変更することなく、特定のアミノ酸をコードするのに使用されるコドンを変更するために変異(またはde novo合成)されてもよい。稀なコドンが、宿主生物の遺伝子中のより豊富なコドンによって置き換えられてもよい。目的の遺伝子におけるコドンの最適化は、宿主細胞背景での遺伝子の機能性および/または発現を増加させる最良の方法となり得る。
ウイルスベクターは2つまたはそれ以上の目的のタンパク質のコード領域を含むことができる。例えば、ウイルスベクターは、目的の第1のタンパク質のコード領域および目的の第2のタンパク質のコード領域を含むことができる。目的の第1のタンパク質および目的の第2のタンパク質は同じまたは異なっていてもよい。いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、目的の第3または第4のタンパク質のコード領域を含むことができる。目的の第3および第4のタンパク質は同じまたは異なっていてもよい。1つのウイルスベクターによってコードされる目的の2つまたはそれ以上のタンパク質の全長は異なり得る。例えば、2つまたはそれ以上のタンパク質の全長は、少なくとも約200アミノ酸であってよい。少なくとも約250アミノ酸、少なくとも約300アミノ酸、少なくとも約350アミノ酸、少なくとも約400アミノ酸、少なくとも約450アミノ酸、少なくとも約500アミノ酸、少なくとも約550アミノ酸、少なくとも約600アミノ酸、少なくとも約650アミノ酸、少なくとも約700アミノ酸、少なくとも約750アミノ酸、少なくとも約800アミノ酸、またはそれ以上。
好ましいウイルスベクターは、イヌアデノウイルスのCAdV2ベクターを含む。
本開示の特定の態様により、用語「ウイルスベクター」または代わりに「ウイルス構築物」は、CAdV−1およびCAdV−2(イヌアデノウイルス)などのアデノウイルス科(AdV)から選択されるウイルスに由来する組換えウイルス構築物を指す(van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R. and Wickner, R.B. (2000). Virus taxonomy. Seventh report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Academic Press, San Diego. 1162 pp参照)。
用語「ウイルスベクター」および「ウイルス構築物」は交換可能に使用することができる。
用語「構築物」は、本明細書で使用する場合、人工的に生成されたプラスミド、BAC、または組換えウイルスなどの組換え核酸を指す。
用語「プラスミド」は、細菌宿主細胞内の細菌染色体とは独立して複製される細胞質DNAを指す。本発明の特定の態様では、用語「プラスミド」および/または「トランスファープラスミド」および/または「導入断片」は、例えばウイルスベクターへの挿入のための発現カセットの構築に有用な組換えDNA技術のエレメントを指す。別の特定の態様では、用語「プラスミド」は、DNAワクチン接種目的のために有用なプラスミドを特定するために使用され得る。
本明細書で使用される場合、用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」は、交換可能であり任意の核酸を指す。
用語「核酸」、「核酸配列」、「ヌクレオチド配列」、「ポリヌクレオチド」、「ポリヌクレオチド配列」、「RNA配列」または「DNA配列」は、本明細書で使用される場合、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチドまたはポリヌクレオチドおよびその断片および部分、ならびにゲノムまたは合成起源のDNAまたはRNAを指し、それらは一本鎖または二本鎖であってよく、センスまたはアンチセンス鎖を表してよい。配列は、非コード配列、コード配列、または両方の混合であってよい。本発明の核酸配列は、当業者に周知の標準的な技術を使用して調製され得る。
用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」は、5つの生物学的に生じる塩基(アデニン、グアニン、チミン、シトシンおよびウラシル)以外の塩基から構成される核酸も特別に含む。
用語「制御核酸」、「制御エレメント」および「発現調節エレメント」は交換可能に使用され、特定の宿主生物において作動可能に連結されたコード配列の発現に影響し得る核酸分子を指す。これらの用語は、プロモーター、プロモーター配列、RNAポリメラーゼと転写因子の基本的な相互作用に必要なコアエレメント、上流エレメント、エンハンサーおよび応答エレメントを含む、転写を促進または制御する全てのエレメントに広く使用され、全てのエレメントをカバーする。原核生物における例示的な制御エレメントは、プロモーター、オペレーター配列およびリボソーム結合部位を含む。真核細胞において使用される制御エレメントは、限定はされないが、転写および翻訳調節配列、例えばプロモーター、エンハンサー、スプライシングシグナル、ポリアデニル化シグナル、ターミネーター、タンパク質分解シグナル、配列内リボソーム進入部位(IRES)、ピコルナウイルス2A配列等を含むことができ、コード配列の発現および/または宿主細胞におけるコードポリペプチドの産生を提供および/または制御する。
「配列内リボソーム進入部位」または「IRES」は、IRESの5’の遺伝子に非依存的に翻訳開始を機能的に促進し、動物細胞において2つのシストロン(オープンリーディングフレーム)が単一の転写物から翻訳されるようにする配列を記載する。IRESは、そのすぐ下流のオープンリーディングフレームの翻訳のための非依存的なリボソーム進入部位を提供する。ポリシストロニックであり得る、すなわちmRNAから順に翻訳されるいくつかの異なるポリペプチドをコードする細菌mRNAとは異なり、動物細胞のほとんどのmRNAは、モノシストロニックであり1つのポリペプチドのみの合成のためにコードする。真核細胞におけるポリシストロニック転写により、翻訳は翻訳開始部位の最も5’側から開始され、最初の終止コドンで終結され、転写物はリボソームから放出され、mRNAにおいて最初にコードされたポリペプチドのみの翻訳をもたらす。真核細胞では、転写物の第2のまたは続くオープンリーディングフレームに作動可能に連結されたIRESを有するポリシストロニック転写は、その下流のオープンリーディングフレームの連続的な翻訳を可能にし、同じ転写物によってコードされた2つまたはそれ以上のポリペプチドを産生する。IRESは様々な長さであってよく、例えば、脳心筋炎ウイルス(EMCV)、ピコルナウイルス(例えば、口蹄疫ウイルス、FMDVまたはポリオウイルス(PV)、またはC型肝炎ウイルス(HCV)など、さまざまな起源由来であってよい。ベクター構築物における様々なIRES配列およびそれらの使用が記載され、当技術分野で周知されている。下流のコード配列は、下流の遺伝子の発現にネガティブに影響しないであろう任意の距離でIRESの3’端に作動可能に連結されている。IRESと下流の遺伝子の始まりの間の最適なまたは許容的な距離は、距離を変化させ、距離の関数として発現を測定することによって容易に決定することができる。
用語「2a」または「2aペプチド」は、短いオリゴペプチド配列を意味し、2aおよび「2a様」と記載され、リボソームスキッピングとして定義されたプロセスによって、翻訳の際にタンパク質間の切断を媒介することができるリンカーとして機能する。そのような2aおよび「2a様」配列(ピコナウイルス科および他のウイルスまたは細胞配列に由来する)は、複数の遺伝子配列を単一の遺伝子に鎖状につなぐために使用され、同じ細胞内でのそれらの共発現を確実にすることができる(Luke and Ryan, 2013参照)。
本明細書で使用する場合、用語「プロモーター」または「プロモーター配列」は、RNAポリメラーゼの結合を許容し、遺伝子の転写を導くヌクレオチド配列を意味する。典型的には、プロモーターは、遺伝子の5’非コード領域、遺伝子の転写開始部位の近位に位置する。転写の開始に機能するプロモーター内の配列エレメントは、コンセンサスヌクレオチド配列によって特徴づけられることが多い。プロモーターの例としては、限定はされないが、細菌、酵母、植物、ウイルス、および哺乳動物(ウマ、ブタ、ウシおよびヒトを含む)などの動物、トリまたは昆虫由来のプロモーターが挙げられる。プロモーターは、誘導性、抑圧可能、および/または構成的であり得る。誘導性プロモーターは、温度の変化など、培養条件のいくつかの変化に応じてそれらの調節下でDNAからの転写のレベルの増加を開始する(Ptashne, 2014)。当業者に周知のプロモーターの例としては、例えば、SV40ラージT、HCMVおよびMCMV最初期遺伝子1、ヒト伸長因子アルファプロモーター、バキュロウイルスポリへドリンプロモーターが挙げられる。
本発明の文脈で、本明細書で使用する場合、用語プロモーターは、特に機能的断片、例えば、4pgG600(配列番号29)のトランケーションまたはその相補的なヌクレオチド配列を指し、好ましくは配列同一性が全長にわたって(少なくとも)72%(またはより高い)である。さらに、本発明の文脈で、本明細書で使用する場合、用語プロモーターは、特に機能的断片、例えば、4pMCP600(配列番号30)のトランケーションまたはその相補的なヌクレオチド配列を指し、好ましくは配列同一性が全長にわたって(少なくとも)78%である(またはより高い)。最も好ましくは、「プロモーター」は、p430(配列番号31)またはp455(配列番号32)を指す。用語「p430」、「gG430」、および「430」は、明細書、図面、配列表等を通して同義的および交換可能に使用される。用語「p455」、「MCP455」および「455」は、明細書、図面、配列表等を通して同義的および交換可能に使用される。
EHV−4プロモーターは、ウイルスによって提供されるトランス活性化タンパク質でトランス活性化された領域、およびトランケートされた転写的に活性なプロモーターが由来する完全長プロモーターの最小プロモーター領域を含む、好ましくはトランケートされた転写的に活性なプロモーターである。本明細書の目的のために、「プロモーター」は、最小プロモーターおよび上流の制御配列に対応するDNA配列の結合からなる。「最小プロモーター」は、CAP部位プラスTATAボックス(基本レベルの転写のための最小配列;未制御レベルの転写)からなり、「上流の制御配列」は、上流のエレメントおよび/またはエンハンサー配列からなる。さらに、用語「トランケートされた(truncated)」は、完全長プロモーターが完全には存在しないこと、すなわち、完全長プロモーターのある程度の部分が除去されていることを示す。好ましい実施形態でのトランケートプロモーターは、ウマヘルペスウイルス4(本明細書では4pgG600(配列番号29)、4pMCP600(配列番号30)と呼ばれるEHV−4ゲノム)に由来し、トランケートプロモーターは、それぞれ完全長配列に由来するpgG430(配列番号31)またはgMCP455(配列番号32)である。
プロモーターは、例えば、それぞれウマ4pgG600(配列番号29)、4pMCP600(配列番号30)による塩基対に基づく完全長プロモーターから、5%、10%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、40%、45%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、およびさらには90%までのサイズの低減があるようにトランケートすることができる。実際に、本発明のトランケートプロモーターは、トランケートプロモーターが挿入されるウイルスまたは系によって提供されるトランス活性化タンパク質によりトランス活性化されるトランケーション内の任意の領域から基本的になってもよく、故に最小プロモーターである。
本発明のトランケートされた「転写的に活性な」または「コンピテントな」プロモーターは、ウマヘルペスウイルス4ゲノムに由来するトランケートされた転写的に活性な真核生物ヘルペスウイルスプロモーター、EHV−4 gG430(配列番号31)およびgMCP455(配列番号32)プロモーターを指す。「活性な」(または「コンピテントな」)により、トランケートされた転写的に活性なプロモーターは、完全長プロモーターの転写活性の少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%、および最も好ましくは少なくとも95%を示すべきである。完全長プロモーターのヌクレオチドまたは部分もしくは領域の欠失は、図示されたものに加えて活性断片の生成に関する本明細書の教示から、過度な実験をすることなく行うことができる。
本発明の実施において有用なプロモーターは、したがって、十分なプロモーター活性およびそれ故にプロモーターとしての機能を維持し、誘導体またはサブ断片が由来する実際のまたは完全長のプロモーターのものと実質的に類似したプロモーター活性を有利には有する、完全長プロモーターの誘導体および/またはサブ断片を含み得る。本明細書で使用される場合、用語「誘導体」または「サブ断片」は、野生型プロモーターと比較した場合、プロモーター配列が実質的に同等の機能を有するようにトランケーションおよび/または置換/欠失などの改変を有する核酸配列を指す。これらの誘導体またはサブ断片は、部位特異的変異誘発によるように故意であり得、または自然発生的であり得るわずかな改変を有する核酸配列を含む。プロモーターが、例えば、目的の抗原をコードする作動可能に連結されたポリペプチドの発現を駆動するのに「転写的に活性な」または「コンピテントな」ままである限り、用語「誘導体」は、配列に対する欠失、付加および置換をさらに企図する。
用語「エンハンサー」は、cis位置にあるポリヌクレオチド配列を意味し、プロモーターの活性に作用し、したがって、このプロモーターに機能的に結合した遺伝子またはコード配列の転写を刺激する。プロモーターとは異なり、エンハンサーの効果は位置および方向に非依存的であり、したがってそれらは、イントロン内またはコード領域内でさえも転写ユニットの前または後に位置することができる。エンハンサーは、転写ユニットのすぐ近くとプロモーターからかなり距離のある位置の両方に位置し得る。プロモーターと物理的および機能的なオーバーラップを有することもできる。当業者は、様々な起源由来の(およびGenBankなどのデータバンクに寄託された、例えばSV40エンハンサー、CMVエンハンサー、ポリオーマエンハンサー、アデノウイルスエンハンサー)多くのエンハンサーを把握しており、それらは非依存的なエレメントまたはポリヌクレオチド配列内にクローニングされたエレメントとして利用可能である(例えば、ATCCに寄託され、または市販され、および個々の起源)。多くのプロモーター配列はまた、頻繁に使用されるCMVプロモーターなどのエンハンサー配列も含有する。ヒトCMVエンハンサーは、これまでに同定された最も強いエンハンサーの1つである。誘導性エンハンサーの1つの例は、メタロチオネインエンハンサーであり、グルココルチコイドまたは重金属によって刺激され得る。
用語「相補的ヌクレオチド配列」は、DNAまたはRNAなどのポリヌクレオチドの2対の鎖の1つの鎖を記載する。相補的な鎖のヌクレオチド配列は、各アデノシンはチミン(またはRNAの場合はウラシル)、各グアニンはシトシン、逆もまた同様になるように、その対の鎖のヌクレオチド配列を写す。例えば、5’−GCATAC−3’の相補的ヌクレオチド配列は3’−CGTATG−5’、またはRNAの場合は3’−CGUAUG−5’である。
用語「遺伝子」、「目的の遺伝子」は、本明細書で使用する場合、同じ意味を有し、目的の産物をコードする任意の長さのポリヌクレオチド配列を指す。遺伝子は、コード配列の前(5’非コードまたは非翻訳配列)および後(3’非コードまたは非翻訳配列)に制御配列をさらに含んでよい。選択された配列は全長またはトランケート、融合、またはタグ化遺伝子であってよく、cDNA、ゲノムDNA、またはDNA断片であってよい。ポリペプチドまたはRNAをコードするゲノムDNAは、成熟メッセンジャーRNA(mRNA)からスプライシングされ、したがって、同じポリペプチドまたはRNAをコードするcDNAには存在しない、非コード領域(すなわち、イントロン)を含み得ることが通常理解される。それは、天然配列、すなわち自然発生的な形態であってよく、または変異され、または異なる起源由来の配列を含んでもよく、そうでなければ所望のように改変されてもよい。これらの改変は、選択された宿主細胞またはタグ付けにおけるコドン利用を最適化するコドン最適化を含む。さらに、それらは、例えば(潜在性の)スプライスドナー、アクセプター部位および枝分かれ点、ポリアデニル化シグナル、TATAボックス、chi部位、リボソーム進入部位、繰り返し配列、二次構造(例えば、ステムループ)、転写因子または他の制御因子の結合部位、制限酵素部位等のcis作用性部位の除去または付加を含み、限定はされないが、わずかな例を挙げることができる。選択された配列は、分泌、細胞質、核、膜結合または細胞表面ポリペプチドをコードすることができる。
定義により、「エピトープ」は、宿主に投与されると、体液性型(B細胞)および/または細胞性型(T細胞)の免疫応答を惹起することができるという意味で免疫学的に活性な抗原決定基である。これらは、分子上の抗原性の特定の化学基またはペプチド配列である。抗体は、ポリペプチド上の特定の抗原エピトープを特異的に結合する。エピトープの特定の非限定的な例としては、ポリペプチド中のテトラペプチドからペンタペプチド配列、多糖類中のトリグリコシドからペンタグリコシド配列が挙げられる。動物では、ほとんどの抗原が、いくつかのまたはさらに多くの抗原決定基を同時に提示するであろう。そのようなポリペプチドは、免疫原性ポリペプチドとして認めることもでき、エピトープはさらに記載されるように同定され得る。
「目的のエピトープ」は、例えば、非限定的な例:パラミクソウイルス抗原、例えば、HAまたはFのようなイヌジステンパーウイルス(CDV)抗原、ウシRSウイルス(BRSV)抗原、ウシパラインフルエンザウイルス3型(bPIV3);狂犬病糖タンパク質、例えば、狂犬病糖タンパク質G;鳥インフルエンザ抗原、例えば、七面鳥インフルエンザHA、核タンパク質(NP)のようなニワトリ/ペンシルバニア/1/83インフルエンザ抗原;ウシ白血病ウイルス抗原、例えば、gp51、30エンベロープ;ニューカッスル病ウイルス(NDV)抗原、例えば、HNまたはF;ネコ白血病ウイルス抗原(FeLV)、例えば、FeLVエンベロープタンパク質;ヘルペスウイルス糖タンパク質、例えば、ネコヘルペスウイルス、ウマヘルペスウイルス、ウシヘルペスウイルス、仮性狂犬病ウイルス、またはイヌヘルペスウイルス(イヌヘルペスウイルス糖タンパク質gB、gCまたはgD)由来の糖タンパク質;フラビウイルス抗原、例えば、西ナイルウイルスまたはダニ媒介脳炎ウイルス抗原;免疫不全ウイルス抗原、例えば、ネコ免疫不全ウイルス(FIV)抗原;パルボウイルス抗原、例えば、イヌパルボウイルスVP2抗原;ウマインフルエンザ抗原;マレック病ウイルス抗原;ポックスウイルス抗原、例えば、鶏痘ウイルス抗原;伝染性ファブリキウス嚢病ウイルス抗原、例えば、VP2、VP3、VP4;コロナウイルス抗原、例えばブタコロナウイルス(TGEV、PEDVおよびデルタコロナSPIKE抗原)、イヌ、および/またはネコ、家禽(例えば伝染性気管支炎ウイルス(IBV))由来のもの;またはペスチウイルス抗原、例えば、ウシウイルス性下痢症ウイルス抗原などの、獣医学的病原体または毒素の抗原、または獣医学的病原体もしくは毒素の抗原由来、または病原体に関して応答を誘発する別の抗原もしくは毒素、または病原体に関して応答を誘発する別の抗原または毒素由来であってもよい。
本明細書で使用される場合、用語「目的のヌクレオチド配列」または「目的の配列」は、必ずしも遺伝子を含まないが、遺伝子または他の遺伝情報のエレメントまたは部分、例えばori(複製オリジン)を含み得るため、目的の遺伝子より一般的な用語である。目的のヌクレオチド配列は、それがコード配列を含むかどうかに非依存的な任意のDNAまたはRNA配列であり得る。
「オープンリーディングフレーム」または「ORF」は、翻訳開始シグナルまたはATGもしくはAUGなどの開始コドン、および終止コドンを含み、ポリペプチド配列に潜在的に翻訳され得る、DNAまたはRNAのいずれかの核酸配列の長さを指す。
用語「転写」は、細胞でのmRNAの生合成を記載する。
用語「発現」は、本明細書で使用する場合、宿主細胞内での核酸配列の転写および/または翻訳を指す。本発明の特定の態様に従って、用語「発現」は、宿主細胞内での異種および/または外来性核酸配列の転写および/または翻訳を指す。宿主細胞における所望の産物の発現レベルは、細胞に存在する相当するRNAまたはmRNAの量、または選択された配列によってコードされる所望のポリペプチドの量のいずれかに基づいて決定され得る。例えば、選択された配列から転写されたmRNAは、ノーザンブロットハイブリダイゼーション、リボヌクレアーゼRNAプロテクション、細胞内RNAのin situハイブリダイゼーションによって、またはRTqPCR(逆転写後の定量的PCR)によって定量され得る。選択された配列から発現されたタンパク質は、様々な方法、例えばELISAによって、ウェスタンブロットによって、ラジオイムノアッセイによって、免疫沈降によって、タンパク質の生物活性のアッセイによって、またはタンパク質の免疫染色後のFACS解析によって定量され得る。
用語「発現カセット」または「転写ユニット」または「発現ユニット」は、転写される1つまたは複数の遺伝子を含有するベクター、構築物またはポリヌクレオチド配列内の領域を定義し、転写される遺伝子をコードするヌクレオチド配列ならびに発現カセット内に含有される制御エレメントを含有するポリヌクレオチド配列が、互いに作動可能に連結されている。それらは、プロモーターから転写され、転写は、少なくとも1つのポリアデニル化シグナルによって終結される。1つの特定の態様では、それらは1つの単一のプロモーターから転写される。結果として、異なる遺伝子は少なくとも転写的に連結されている。1つより多くのタンパク質または産物は転写され、各転写ユニット(マルチシストロン転写ユニット)から発現される。各転写ユニットは、ユニット内に含有される任意の選択された配列の転写および翻訳に必要な制御エレメントを含むであろう。各転写ユニットは、同じまたは異なる制御エレメントを含有し得る。例えば、各転写ユニットは、同じターミネーターを含有してもよく、IRESエレメントまたはイントロンは、転写ユニット内での遺伝子の機能的な連結に使用され得る。ベクターまたはポリヌクレオチド配列は1つより多くの転写ユニットを含有し得る。
用語「発現増加」、「力価または生産性増加」または「発現または生産性改善」により、好適な対照との比較、例えば、cDNAによってコードされるタンパク質対イントロン含有遺伝子によってコードされるタンパク質による、宿主細胞に導入された異種および/または外来性配列、例えば治療タンパク質をコードする遺伝子の発現、合成または分泌の増加を意味する。本発明に記載の細胞が、本明細書に記載の本発明による方法に従って培養される場合、およびこの細胞が、特定の生産性または力価において少なくとも1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍または5倍増加した場合、力価または生産性増加がある。本発明に記載の細胞が、本明細書に記載の本発明による方法に従って培養される場合、およびこの細胞が、特定の生産性または力価において少なくとも1.2倍または少なくとも1.5倍または少なくとも2倍または少なくとも3倍増加した場合も、力価または生産性増加がある。本発明に記載の細胞が、本明細書に記載の本発明による方法に従って培養される場合、およびこの細胞が、特定の生産性または力価において少なくとも1.2倍〜5倍、好ましくは1.5倍〜5倍、より好ましくは2倍〜5倍、特に好ましくは3倍〜5倍増加した場合も、特別な力価または生産性増加がある。「発現増加」は、そのうえ、より多くの細胞が目的の遺伝子/配列を実際に発現することを意味し得る。例えば発現は、本発明の新しいプロモーターが、別のプロモーターによってもたらされた発現と比較して、検出可能な導入遺伝子発現を発現または有する回収細胞数の点で増加していることを意味し得る。発現増加は、細胞ごとに検出可能なmRNAおよび/またはタンパク質のレベルの増加も意味し得る。
発現、力価または生産性増加は、本発明に記載の異種ベクターを使用することによって得ることができる。これは、追加の選択可能マーカーとして、1つまたは複数の蛍光タンパク質(例えばGFP)または細胞表面マーカーを含有する組換え宿主細胞のFACSアシスト選択などの他の手法と組合せることができる。発現増加を得る他の方法、および使用することができる異なる方法の組合せも、例えばクロマチン構造(例えば、LCR、UCOE、EASE、アイソレーター、S/MARs、STARエレメント)の操作のためのcis活性エレメントの使用、(人工)転写因子の使用、内在性または異種および/または外来性遺伝子発現を上方制御するための天然または合成剤による細胞の処置、mRNAまたはタンパク質の安定性(半減期)の改善、mRNA翻訳の開始の改善、エピソーム性プラスミドの使用による遺伝子用量の増加(複製オリジンとしてウイルス配列の使用に基づく、例えばSV40、ポリオーマ、アデノウイルス、EBV、またはBPV)、DNAコンカテマーに基づく増幅促進配列またはin vitro増幅システムの使用に基づく。
「発現増加」を測定するためのアッセイは、多重反応モニタリング(MRM)などのLC−MS/MSベースのタンパク質測定;ウェスタンブロット、ドットブロット、または免疫拡散法、フローサイトメトリーなどの抗体ベースの検出方法;ならびに間接免疫蛍光(IFA)、および赤血球凝集アッセイによる生物活性の測定である。
「プロモーター活性」は、それぞれのプロモーターの調節下で転写されるmRNAの定量によって間接的に測定される。mRNAは、内因性の標準と比較して、RTqPCRによって定量される。
用語「ウイルス力価」は、ウイルス調製物の容積当たりの感染ユニットの測定である。ウイルス力価は、生物学的手順のエンドポイントであり、並行して行った試験の特定の割合で効果を示す希釈率として定義される(Reed and Muench, 1938)。特に、1ミリリットル当たりの組織培養感染量50(TCID50/ml)は、その希釈率で並行して接種された細胞培養の数の50%が感染する、ウイルス調製物の希釈率を与える。
「転写制御エレメント」は、通常、発現される遺伝子配列の上流のプロモーター、転写開始および終結部位、およびポリアデニル化シグナルを含む。
用語「転写開始部位」は、転写一次産物、すなわちmRNA前駆体に組み込まれる最初の核酸に相当する構築物の核酸を指す。転写開始部位は、プロモーター配列とオーバーラップしてよい。
「終結シグナル」または「ターミネーター」または「ポリアデニル化シグナル」または「ポリA」または転写終結部位」または「転写終結エレメント」は、真核生物のmRNAの3’端の特異的部位での切断、および切断された3’端での約100〜200アデニンヌクレオチド(ポリAテイル)の配列の転写後組込みを引き起こし、したがって、RNAポリメラーゼに転写を終結させるシグナル配列である。ポリアデニル化シグナルは切断部位および下流に位置する配列の約10〜30ヌクレオチド上流に配列AATAAAを含む。tk ポリA、SV40後期および初期ポリA、BGH ポリA(例えば、米国特許第5,122,458号に記載)またはハムスター増殖ホルモンポリA(国際公開第2010010107号)など、様々なポリアデニル化エレメントが公知である。
「翻訳制御エレメント」は、発現される各個々のポリペプチドに翻訳開始部位(AUG)、終止コドンおよびポリAシグナルを含む。配列内リボソーム進入部位(IRES)は、いくつかの構築物に含まれてよい。発現を最適化するため、発現される核酸配列の5’−および/または3’−非翻訳領域を除去、付加、または変更し、転写または翻訳のいずれかのレベルで、発現を干渉または減少させ得る、任意の潜在的に余分で不適切な代わりの翻訳開始コドンまたは他の配列を除外することが得策であり得る。コンセンサスリボソーム結合部位(Kozak配列)は開始コドンのすぐ上流に挿入され、翻訳、したがって発現を増強することができる。このリボソーム結合部位周辺の増加A/U含量は、さらにリボソーム結合により効果的である。
定義により、宿主細胞に挿入された全てのポリヌクレオチド配列または全ての遺伝子およびそれによりコードされるそれぞれのタンパク質またはRNAは、異なる(ウイルス)種に由来する場合、宿主細胞に対して、「外来性」、「外来性配列」、「外来性遺伝子」、「外来性コード配列」と呼ばれる。したがって、本発明のEHV−4ベースのプロモーターは、CAdVベクターを考慮して外来性である。イヌではない抗原など、目的の任意のイヌではない配列または遺伝子は、したがって、目的の外来性配列もしくは遺伝子または本発明の特定の態様に記載の抗原である。
定義により、宿主細胞に挿入された全てのポリヌクレオチド配列または全ての遺伝子およびそれによりコードされるそれぞれのタンパク質またはRNAは、宿主細胞に対して、「異種、「異種配列」、「異種遺伝子」、「異種コード配列」、「導入遺伝子」または「異種タンパク質」と呼ばれる。これは、導入される配列または導入される遺伝子が、宿主細胞の内在性配列または内在性遺伝子と同一である場合でさえも適用する。抗原など目的の配列または遺伝子に関して本明細書で使用する場合、用語「異種」は、目的の前記配列または遺伝子、特に前記抗原は、その天然種の背景の外で発現されることを意味する。
用語「非天然型」は、この文脈において天然には生じない抗原などの目的の任意の配列または遺伝子、例えば異なる種由来の抗原などの目的のハイブリッド配列もしくは配列もしくは遺伝子、または人工的な変異、挿入、欠損等により天然の産物ではない、抗原などの目的の配列もしくは遺伝子を意味する。
用語「組換え」は、本発明の明細書を通して、用語「非天然型」、「異種」および「外来性」と交換可能に使用される。したがって、「組換え」タンパク質は、異種または外来性ポリヌクレオチド配列のいずれかから発現されるタンパク質である。ウイルスに関して使用される場合、用語組換えは、ウイルスゲノムの人工的な操作によって産生されるウイルスを意味する。外来性抗原コード配列など、異種または外来性配列を含むウイルスは、組換えウイルスである。用語組換えウイルスおよび用語非天然型ウイルスは、交換可能に使用される。
したがって、用語「異種ベクター」は、異種または外来性ポリヌクレオチド配列を含むベクターを意味する。用語「組換えベクター」は、異種または組換えポリヌクレオチド配列を含むベクターを意味する。
本明細書で使用する場合、用語「作動可能に連結される」は、制御エレメントと遺伝子またはそのコード領域の間の接続を記載するために使用される。典型的には、遺伝子発現は、1つまたは複数の制御エレメント、例えば、限定はされないが、構成的または誘導性プロモーター、組織特異的制御エレメント、およびエンハンサーの調節下に置かれる。遺伝子またはコード領域は、制御エレメントと「作動可能に連結される(operably linked to)」または「作動可能に連結される(operatively linked to)」または「作動可能に関連する(operably associated with)」と言われ、遺伝子またはコード領域が制御エレメントによって調節または影響されることを意味する。例えば、プロモーターがコード配列の転写または発現に影響する場合、プロモーターはコード配列に作動可能に連結される。
さらに、本明細書の範囲内で、用語「機能的連結」、「機能的に連結された」または「作動可能に連結された」は、2つまたはそれ以上の核酸配列または配列エレメントが、それらが意図した方法で機能するように配置されることを意味する。例えば、cis位置で連結された遺伝子配列の転写を調節または調整することができる場合、ポロモーター/エンハンサーまたはターミネーターは、コード遺伝子配列に機能的に連結される。通常、必ずしもそうではないが、機能的に連結されたDNA配列は隣接し、2つのポリペプチドコード領域を合わせる必要がある場合または分泌シグナルペプチドの場合、隣接し、リーディングフレームである。しかしながら、作動可能に連結されたプロモーターは、通常、上流に位置し、作動可能に連結されたターミネーターは、通常、コード配列の下流に位置するが、必ずしもそれと隣接していない。エンハンサーは、それらがコード配列の転写を増加する限り、必ずしも隣接していない。このため、それらはコード配列の上流に位置することも、下流に位置することもあり、幾らか距離を隔てていることもある。ポリアデニル化部位は、コード配列を通ってポリアデニル化シグナルまで転写が進行するようにコード配列の3’端に位置する場合、コード配列に作動可能に連結される。連結は、例えば、好適な制限部位もしくは平滑末端でのライゲーションにより、または融合PCR法を使用することにより、当技術分野で公知の組換え方法によって達成される。合成オリゴヌクレオチドリンカーまたはアダプターは、好適な制限部位が存在しない場合、従来の実行と一致して使用され得る。
したがって、プロモーター配列の、用語「機能的断片または誘導体」は、断片または誘導体が依然としてプロモーター活性が有効であることを意味する。プロモーター活性の評価方法の機能的アッセイは、当業者に周知である(Bustin, S. 2000. Absolute quantification of mRNA using real-time reverse transcription polymerase chain reaction assays. Journal of Molecular Endocrinology 25(2): 169-193; Nolan, T. Rebecca E Hands, R.E., and Bustin S.A. 2006. Quantification of mRNA using real-time RT-PCR Nature Protocols 1: 1559-1582)。そのような機能アッセイの例示的な実施形態としては、例えば、プロモーター動態実験が挙げられる。プロモーターまたはその断片がレポーター導入遺伝子の転写を導く発現カセットを有するベクターウイルスを感染させた細胞は、異なる時間インキュベートされる。全RNAは、感染後の異なる時間で回収された試料から調製される。DNaseI消化によるコンタミネートしたDNAの破壊後、RNAは逆転写される。RNA調製物からのコンタミネートしたDNAの除去の成功を実証するため、1つの複製試料が逆転写酵素(RT)の添加によって処理され、2つ目の複製はRTの添加無しで処理される。生じるcDNAは精製され、従来のPCRの鋳型として使用される。RTの添加によって処理された試料のみがPCR産物を産生するはずである。これらのcDNAは、次いで、レポーター導入遺伝子のプライマーによるqPCRに、ウイルスベクターの必須遺伝子(内部標準遺伝子)のプライマーによるものと並行して使用することができ、その転写は、感染および複製の効率のための内部標準を提供する。レポーターのqPCR値は、内部標準遺伝子のqPCR値を使用して、異なる構築物および感染後の時間の間でノーマライズされる。これは、異なるプロモーターおよびその断片のプロモーター活性の解釈を可能にする。
「配列相同性」は、本明細書で使用する場合、2つの配列の関連性を決定する方法を指す。配列相同性を決定するため、2つまたはそれ以上の配列が最適にアラインされ、必要であればギャップが導入される。しかしながら、「配列同一性」とは対照的に、配列相同性を決定する場合には、保存的なアミノ酸置換は一致としてカウントされる。言い換えると、参照配列と95%の配列相同性を有するポリペプチドまたはポリヌクレオチドを得るため、85%、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%、さらにより好ましくは95%、96%、97%、98%、99%、99.9%の参照配列のアミノ酸残基またはヌクレオチドが一致しなければならず、別のアミノ酸またはヌクレオチドとの保存的な置換を含まなければならない、または、参照配列における、保存的な置換を含まない、全アミノ酸残基またはヌクレオチドの15%まで、好ましくは10%、9%、8%、7%、6%まで、さらにより好ましくは5%、4%、3%、2%、1%、0.1%までのアミノ酸またはヌクレオチドの数が、参照配列に挿入され得る。好ましくは、相同配列は、少なくとも50、さらにより好ましくは100、さらにより好ましくは250、さらにより好ましくは500ヌクレオチドのストレッチを含む。
当技術分野で公知のように、「配列同一性」は、2つまたはそれ以上のポリペプチド配列または2つまたはそれ以上のポリヌクレオチド配列、すなわち、参照配列と、参照配列と比較される所与の配列の間の関係を指す。配列同一性は、配列が最適にアラインされた後に所与の配列を参照配列と比較することによって決定され、そのような配列のストリング間の一致により決定されるように、最も高い程度の配列類似性を産生する。そのようなアライメントにより、配列同一性は、位置ごとに確認され、例えば配列は、その位置で、ヌクレオチドまたはアミノ酸残基が同一である場合、特定の位置で「同一」である。そのような位置同一性の総数は、次いで参照配列のヌクレオチドまたは残基の総数によって割られ、%配列同一性を与える。配列同一性は、限定はされないが、Computational Molecular Biology, Lesk, A. N., ed., Oxford University Press, New York (1988), Biocomputing:Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York (1993);Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M., and Griffin, H. G., eds., Humana Press, New Jersey (1994);Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinge, G., Academic Press (1987);Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M. Stockton Press, New York (1991);およびCarillo, H., and Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988)に記載のものを含む公知の方法によって容易に算出することができ、その教示は参照により本明細書に組み込まれる。配列同一性を決定する好ましい方法は、試験した配列間で最大の一致を与えるように設計される。配列同一性を決定する方法は、所与の配列間の配列同一性を決定する一般的に利用可能なコンピュータープログラムでコード化される。そのようなプログラムの例としては、限定はされないが、GCGプログラムパッケージ(Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research, 12(1):387 (1984))、BLASTP、BLASTNおよびFASTA(Altschul, S. F. et al., J. Molec. Biol., 215:403-410 (1990)が挙げられる。BLASTXプログラムはNCBIおよび他の供給元から公的に利用可能である(BLAST Manual, Altschul, S. et al., NCVI NLM NIH Bethesda, MD 20894, Altschul, S. F. et al., J. Molec. Biol., 215:403-410 (1990)、その教示は参照により本明細書に組み込まれる)。これらのプログラムは、所与の配列と参照配列の間に最高レベルの配列同一性を産生するため、デフォルトのギャップ重み付けを使用して配列を最適にアラインする。例として、参照ヌクレオチド配列に対して、例えば、少なくとも85%、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%、さらにより好ましくは95%、96%、97%、98%、99%、99.9%「配列同一性」を有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドによって、所与のポリヌクレオチド配列が、参照ヌクレオチド配列のそれぞれ100ヌクレオチド当たり15まで、好ましくは10まで、さらにより好ましくは5までの点変異を含み得ることを除いて、所与のポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が参照配列と同一であることが意図される。言い換えると、参照ヌクレオチド配列に対して、少なくとも85%、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%、さらにより好ましくは95%、96%、97%、98%、99%、99.9%同一性を有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドにおいて、参照配列のヌクレオチドの15%まで、好ましくは10%、9%、8%、7%、6%、さらにより好ましくは5%、4%、3%、2%、1%、0.1%までが欠損または別のヌクレオチドによって置換され、参照配列の総ヌクレオチドの15%まで、好ましくは10%、9%、8%、7%、6%、さらにより好ましくは5%、4%、3%、2%、1%、0.1%までのヌクレオチドの数が参照配列に挿入され得る。参照配列のこれらの変異は、参照ヌクレオチド配列の5’または3’末端位置またはそれらの末端位置間のどこでも起こることがあり、参照配列、または参照配列内の1つまたは複数の隣接基のいずれかのヌクレオチド中で個々に分散される。同様に、参照アミノ酸配列に対して、例えば、少なくとも85%、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%、さらにより好ましくは95%、96%、97%、98%、99%配列同一性を有する所与のアミノ酸配列を有するポリペプチドによって、所与のポリペプチド配列が、参照アミノ酸配列のそれぞれ100アミノ酸当たり15まで、好ましくは10、9、8、7、6まで、さらにより好ましくは5、4、3、2、1までのアミノ酸変化を含み得ることを除いて、ポリペプチドの所与のアミノ酸配列が参照配列と同一であることが意図される。言い換えると、参照アミノ酸配列と、少なくとも85%、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%、さらにより好ましくは95%、96%、97%、98%、99%配列同一性を有する所与のポリペプチド配列を得るため、参照配列のアミノ酸残基の15%まで、好ましくは10%、9%、8%、7%まで、さらにより好ましくは5%、4%、3%、2%、1%までが欠損または別のアミノ酸と置換され、参照配列のアミノ酸残基の総数の15%まで、好ましくは10%、9%、8%、7%まで、さらにより好ましくは5%、4%、3%、2%、1%までのアミノ酸の数が参照配列に挿入され得る。参照配列のこれらの変更は、参照アミノ酸配列のアミノもしくはカルボキシ末端位置、またはそれらの末端位置間のどこでも起こることがあり、参照配列または参照配列内の1つまたは複数の隣接基のいずれかの残基中で個々に分散される。好ましくは、同一ではない残基位置は、保存的アミノ酸置換によって異なる。しかしながら、配列同一性を決定する場合、保存的置換は一致として含まれない。
用語「配列同一性」または「パーセント同一性」は、本明細書において交換可能に使用される。本発明の目的のため、2つのアミノ酸配列または2つの核酸配列のパーセント同一性を決定するため、配列は最適な比較目的のためにアラインされることが本明細書において規定される(例えば、ギャップが、第2のアミノ酸または核酸配列との最適なアライメントのために第1のアミノ酸または核酸の配列に導入され得る)。相当するアミノ酸またはヌクレオチド位置におけるアミノ酸またはヌクレオチド残基が、次いで比較される。第1の配列の位置が、第2の配列の相当する位置と同じアミノ酸またはヌクレオチド残基によって占められる場合、分子はその位置で同一である。2つの配列間のパーセント同一性は、配列によって共有される同一の位置の数の関数である(すなわち、%同一性=同一な位置の数/位置の総数(すなわちオーバーラップする位置)×100)。好ましくは、2つの配列は同じ長さである。
配列比較は、比較される2つの配列の全長にわたって、または2つの配列の断片にわたって行われ得る。典型的には、比較は、比較される2つの配列の全長にわたって行われる。しかしながら、配列同一性は、例えば、20、50、100またはそれ以上の隣接するアミノ酸残基の領域にわたって行われ得る。
当業者は、2つの配列間の相同性を決定するために、いくつかの異なるコンピュータープログラムが利用可能であることを知っている。例えば、配列の比較および2つの配列間のパーセント同一性の決定は、数値計算用アルゴリズムを使用して達成され得る。好ましい実施形態では、2つのアミノ酸または核酸配列間のパーセント同一性は、Blosum 62マトリックスまたはPAM250マトリックス、および16、14、12、10、8、6、または4のギャップ重み付けならびに1、2、3、4、5、または6の長さ重み付けのいずれかを使用して、Accelrys GCGソフトウェアパッケージ(http://www.accelrys.com/products/gcg/で入手可能)のGAPプログラムに組み込まれるNeedlemanおよびWunsch(J. Mol. Biol. (48): 444-453 (1970))アルゴリズムを使用して決定される。当業者は、これら全ての異なるパラメーターがわずかに異なる結果をもたらすが、2つの配列の全体的なパーセンテージ同一性は、異なるアルゴリズムを使用する場合著しくは変更されないことを認識する。
本発明のタンパク質配列または核酸配列は、「問い合わせ配列」としてさらに使用され、公共のデータベースに対して検索を実施し、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定する。そのような検索は、Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10のBLASTNおよびBLASTPプログラム(バージョン2.0)を使用して実施することができる。BLASTタンパク質検索はBLASTPプログラム、スコア=50、ワード長=3で実施され、本発明のタンパク質分子に相同のアミノ酸配列を得ることができる。比較目的のためのギャップ付きアライメントを得るため、Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25(17): 3389-3402に記載されるように、Gapped BLASTが利用され得る。BLASTおよびGapped BLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム(例えばBLASTPおよびBLASTN)のデフォルトのパラメーターが使用され得る。国立バイオテクノロジー情報センターのホームページhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/を参照。
EHV−1、EHV−4、及びCAdV/組換えベクター技術の定義
用語「ウマ(equid)」または「ウマ(equine)」または「ウマ(equin)」は、ウマ、ロバ、およびシマウマを含み、好ましくはウマである、ウマ科を意味するまたはウマ科に属する。さらに、用語「ウマ(equid)」または「ウマ(equine)」または「ウマ(equin)」は、ウマ科のメンバーのハイブリッドも包含する(例えば、ラバ、ケツテイ等)。
「ヘルペスウイルス」または「ヘルペスウイルスベクター」は、ヘルペスウイルス目のヘルペスウイルス科の種を指す。
用語「ウマヘルペスウイルスベクター」または「ウマヘルペスウイルス」は、ウマに感染するヘルペスウイルス科のメンバーを意味する。これまでのところ、8つの異なる種のウマヘルペスウイルスが同定され、5つはアルファヘルペスウイルス亜科に属し、3つはガンマヘルペスウイルス科に属する。(http://www.ictvonline.org/virustaxonomy.asp Virus Taxonomy: 2015 Release EC 47, London, UK, July 2015; Email ratification 2016 (MSL #30)
用語「EHV−1」は、ヘルペスウイルス科のアルファヘルペスウイルス属のバリセロウイルス亜属のメンバー、ウマヘルペスウイルス1型を意味する。EHV−1の非限定的な参照配列は、例えば野生型EHV−1株ab4(Genbank受入番号AY665713.1)またはRacH(Hubert, P. H., Birkenmaier, S., Rziha, H.-J. and Osterrieder, N. (1996), Alterations in the Equine Herpesvirus Type-1 (EHV-1) Strain RacH During Attenuation. Journal of Veterinary Medicine, Series B, 43: 1-14.)であろう。
用語EHV−4は、ヘルペスウイルス科のアルファヘルペスウイルス属のバリセロウイルス亜属のメンバー、ウマヘルペスウイルス4型を意味する。
用語「CAdV」、「CAV」、「CAV−1」または「CAV−2」は、それぞれ、アデノウイルス科のマストアデノウイルス属のメンバー、イヌアデノウイルス1型または2型を意味する。しかしながら、より新しい分類学(http://www.ictvonline.org/virustaxonomy.asp Virus Taxonomy: 2015 Release EC 47, London, UK, July 2015; Email ratification 2016 (MSL #30)によると、用語イヌアデノウイルス(CAdV)は現在、CAV−2およびCAV−1の両方の種を包含する。
「組換えCAdVベクター」または「rCAdV」および/または「rCAdVベクター」または「rCAdV」または「rCAdV2」は、例えば導入遺伝子発現マーカー(緑色蛍光タンパク質など)、ならびに好ましい実施形態では少なくとも1つの「目的の遺伝子」および/または「目的のエピトープ」をコードする、少なくとも1つの外来性発現カセット(すなわち、プロモーター、エンハンサー、および他の好適な制御エレメントと作動可能に連結したコード配列を含有する)を含むイヌアデノウイルスを指す。
rCAdVベクターは、ウイルス学および分子生物学の分野の当業者に公知の標準的な方法によって作製することができる。しかし、CAdVゲノムの操作およびベクターの作製を促進するために、本発明は、CAdVゲノムをコードする核酸を含有する細菌シャトルベクター、1つの非限定的な例ではpBR322プラスミドも提供する。さらに、細菌人工染色体(「BAC」)も、細菌系でのCAdVの操作を促進することができる。
ワクチンの定義
「免疫原性または免疫学的組成物」は、組成物に対する細胞または抗体媒介性免疫応答の宿主での免疫学的応答を引き出す少なくとも1つの抗原、またはその免疫原性部分を含む物質の組成物を指す。
本明細書で使用する用語「抗原」は、当技術分野で周知であり、免疫原性、すなわち免疫原である物質、ならびに免疫学的不応性、または免疫不応答、すなわち外来物質に対する体の防御機構による反応の欠如を誘導する物質を含む。本明細書で使用する場合、用語「抗原」は、エピトープを含有するまたは含む、全長タンパク質ならびにそのペプチド断片を意味することが意図される。
本明細書で使用する場合、「免疫原性組成物」は、例えば、本明細書に記載のように免疫学的応答を引き出すウイルス表面タンパク質など、ポリペプチドまたはタンパク質を指し得る。用語「免疫原性断片」または「免疫原性部分」は、1つまたは複数のエピトープを含み、したがって、本明細書に記載の免疫学的応答を引き出すタンパク質またはポリペプチドの断片またはトランケートおよび/または置換形態を指す。一般に、そのようなトランケートおよび/または置換形態、または断片は、全長タンパク質からの少なくとも6個の隣接するアミノ酸を含む。そのような断片は、当技術分野で周知のいくつかのエピトープマッピング技術を使用して同定され得る。例えば、Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66 (Glenn E. Morris, Ed., 1996) Humana Press, Totowa, New Jersey参照。例えば、線状エピトープは、タンパク質分子の部分に相当する多数のペプチドを固体支持体上で同時合成し、ペプチドが依然として支持体に結合しているうちに、ペプチドを抗体と反応させることによって決定され得る。そのような技術は公知であり、当技術分野で記載されている。例えば、米国特許第4,708,871号;Geysen et al. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3998-4002;およびGeysen et al. (1986) Molec. Immunol. 23:709-715参照。同様に、構造エピトープは、例えば、X線結晶解析および二次元核磁気共鳴によるなどアミノ酸の空間的な構造を決定することにより容易に同定される。上記のEpitope Mapping Protocolsを参照。合成抗原も、例えばポリエピトープ、隣接エピトープ、および他の組換えまたは合成由来の抗原の定義内に含まれる。例えば、Bergmann et al. (1993) Eur. J. Immunol. 23:2777-2781;Bergmann et al. (1996), J. Immunol. 157:3242-3249;Suhrbier, A. (1997), Immunol. and Cell Biol. 75:402-408;およびGardner et al., (1998) 12th World AIDS Conference, Geneva, Switzerland, June 28-July 3, 1998参照。(その教示および内容は全て本明細書に参照により組み込まれる。)
本発明は、組換えCAdVウイルスまたはベクター、および薬学的に許容される担体または希釈剤を含有する「免疫原性組成物」、または「ワクチン組成物」をさらに提供する。組換えCAdVウイルスまたはベクター(またはその発現産物)を含有する免疫原性組成物は、免疫学的応答--局所または全身を誘発する。応答は防御的であり得るが、防御的である必要はない。ワクチン組成物は、局所または全身の防御的応答を誘発する。したがって、用語「免疫原性組成物」は、「ワクチン組成物」を含む(2つの前の用語は防御的組成物であり得るため)。
本明細書で使用する場合、用語「ワクチン」は、動物の免疫学的応答を誘導する少なくとも1つの免疫学的活性成分、および可能だが必ずではない活性成分の免疫学的活性を増強する1つまたは複数のさらなる成分を含む医薬組成物を指す。ワクチンは、医薬組成物に典型的なさらなる成分をさらに含み得る。区別すると、ワクチンの免疫学的活性成分は、いわゆる改変生ワクチン(MLV)でのその元々の形態または弱毒化粒子のいずれかの完全なウイルス粒子、またはいわゆる死菌ワクチン(KV)での適切な方法によって不活性化された粒子を含み得る。別の形態では、ワクチンの免疫学的活性成分は、生物の適切なエレメント(サブユニットワクチン)を含んでよく、これらのエレメントは、粒子全体を破壊すること、またはそのような粒子を含有する増殖培地のいずれか、および任意選択により所望の構造を産生する続く精製ステップによって、または例えば細菌、昆虫、哺乳動物、もしくは他の種に基づく好適なシステムの使用による適切な操作を含む合成プロセスによって、さらに任意選択により続く単離および精製手順、または好適な医薬組成物(ポリヌクレオチドワクチン接種)を使用する遺伝材料の直接組込みによるワクチンを必要とする動物における合成プロセスの誘導によって生成される。ワクチンは、1つのまたは同時に1つより多くの上記のエレメントを含み得る。本発明の特定の態様内で使用される場合、「ワクチン」は生ワクチンまたは生ウイルスを指し、組換えワクチンとも呼ばれる。本発明の別の特定の態様では、「ワクチン」は、ウイルス様粒子(VLP)を含む不活性化または死菌ウイルスを指す。したがって、ワクチンは、サブユニットワクチンまたは死菌(KV)または不活性化ワクチンであってよい。
「動物」により、哺乳動物、ヒト、トリ等がが意図される。動物は、ウマ(equine)(例えば、ウマ(horse)、シマウマ、ロバ)、イヌ(canine)(例えば、イヌ(dog)、オオカミ、キツネ、コヨーテ、ジャッカル)、ネコ(feline)(例えば、ライオン、トラ、イエネコ、野生のネコ、他の大型ネコ、ならびにチーターおよびオオヤマネコを含む他のネコ)、ヒツジ(ovine)(例えば、ヒツジ(sheep))、ウシ(bovine)(例えば、ウシ(cattle)、ウシ(cow)、バッファロー)、ブタ(swaine)(ブタ(pig))、トリ(avian)(例えば、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、七面鳥、ウズラ、キジ、オウム、フィンチ、タカ、カラス、ダチョウ、エミューおよびヒクイドリ)、霊長類(例えば、原猿類、メガネザル、サル、テナガザル、類人猿)、および魚からなる群から選択され得る。用語「動物」は、胚形成期および胎児期を含む全ての発生段階における個々の動物も含む。用語「食品生産動物」は、ウシ、ブタ、ウマ、家禽、ヒツジ、魚等などの、ヒトによる消費のために使用されるイヌ以外の動物を意味し、好ましくは食品生産動物は、ブタおよびウシ、最も好ましくはブタを意味する。
イヌ以外の伴侶動物の例はネコ種を含む。
イヌ以外の動物への投与のために、組換えCAdVは、増殖性複製を伴わない発現という利点を提供する。イヌアデノウイルスの複製はイヌ種に限られ、ヒトを含むイヌ以外のいずれの種においても増殖性感染を引き起こすCAdV2の文献での報告はない。この宿主制限は、他の種へのウイルスの伝播に対する固有の安全バリアを提供し、いくつもの種において獣医学的用途でのCAdV2ベースのワクチンベクターの使用を魅力的な提案にしている。したがって、本発明は、宿主に組換えCAdV2ウイルスまたはベクターを投与または接種してタンパク質を増幅または発現させるための方法を包含する。これにより宿主はイヌではなく、または組換えウイルスもしくはベクターの天然の宿主ではなく、ならびに/または増殖性複製を伴わないおよび/もしくは複製サイクルが限られた形で発現が生じる。
CAdV、および特にCAdV2は、イヌにおいてワクシニア株として使用されるため、イヌ動物への投与のために、本発明は、目的の追加のエピトープ、例えば、イヌ病原体または毒素の抗原を導入するための手段を提供する。それによりrCAdV2ベクターにコードされる目的の追加のエピトープの発現は、イヌまたは子イヌにワクシニア組換えCAdV2を接種してそれらの目的のエピトープおよびイヌアデノウイルスに対する応答をin vivoで誘発する手段を提供する。追加の目的のエピトープは、イヌ病原体(アデノウイルス以外の)の抗原、イヌ病原体(アデノウイルス以外の)の抗原由来、イヌまたは子イヌにおいてイヌ病原体(アデノウイルス以外の)に対する応答を誘発する別の抗原、またはイヌまたは子イヌにおいてイヌ病原体(アデノウイルス以外の)に対する応答を誘発する別の抗原由来であってもよい。
したがって、本発明は、組換えCAdV2が、イヌ病原体例:狂犬病、イヌヘルペスウイルス、イヌジステンパーウイルス、イヌパルボウイルス等の任意の抗原由来の目的のエピトープをコードする異種DNAを含有できることを提供する。本発明の実施形態は、1つを超えるタンパク質をコードする、例えば、イヌ病原体の抗原などの2つ以上のエピトープをコードする外来性DNAを含有するCAdV組換え体を含む。本発明は、他の抗原と組み合わせてCAdV組換え体を含有する組成物も想定する。
イヌ以外の動物への投与のために、本発明は、目的のエピトープを導入するための手段を提供し、目的の抗原エピトープは、ウシ病原体:ウシウイルス性下痢症ウイルス(BVDV)、パラインフルエンザ3ウイルス(PI−3)、感染性ウシ鼻気管炎ウイルス(IBR)、ウシRSウイルス(BRSV)、ウシヘルペスウイルス(BHV)、ウシロタウイルス(BRV)、ウシエンテロウイルス(BEV)、ウシコロナウイルス(BCV)、ウシ狂犬病(BR)、ウシパルボウイルス(BPV)、アデノウイルス、アストロウイルス、マンヘミア・ヘモリチカ(以前はパスツレラ・ヘモリチカ)、パスツレラ・マルトシダ、ヘモフィルス・ソムナス(ヒストフィルス・オビスおよびヘモフィルス・アグニ)、アクチノマイセス(コリネバクテリウム)、アクチノマイセス・ピオゲネス、クラミジア・シッタシ、カンピロバクター・フィタス・ベネレアリスおよびカンピロバクター・フィタス・フィタス(以前はC・フィタス・インテスチナリス)、レプトスピラ・インテロガンス、レプトスピラ・ハージョ、レプトスピラ・ポモナ、およびレプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・カニコーラ、レプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・ハージョ(レプトスピラ・ハージョプラジトノおよびレプトスピラ・ハージョボビス)、ブルセラ・アボルタス、ブルセラ・スイスおよびブルセラ・メリテンシス、リステリア・モノサイトゲネス、クラミジア・シッタシ、クロストリジウム ショウベイ、クロストリジウム・セプチカム、クロストリジウム・ヘモリチクム、クロストリジウム・ノビイ、クロストリジウム・ソルデリ、クロストリジウム・パーフリンゲンス、クロストリジウム・テタニ、モラキセラ・ボビス、クレブシエラ属種、クレブシエラ・ニューモニエ、サルモネラ・ティフィムリウム;サルモネラ・ニューポート、ヨーネ菌(マイコバクテリウム・アビウム・パラツベルクローシス)、トリ結核菌属種、クリプトスポリジウム・パルバム、クリプトスポリジウム・ホミニス、黄色ブドウ球菌(スタフィロコッカス・アウレウス)、ストレプトコッカス・ディスガラクティエ、ストレプトコッカス・ウベリス、ストレプトコッカス・アガラクチア、大腸菌(エスケリキア・コリ)、マイコプラズマ属種、マイコプラズマ・ディスパー、およびウレアプラズマ属種、トリトリコモナス・フィータス、トリコフィトン・ベルコーズム、トリコフィトン・メンタグロフィテス、トリコフィトン・サルキソヴィー、ネオスポラ・カニナム(以前はトキソプラズマ・ゴンディ)、バベシア・ビゲミナおよびバベシア・ボビス、ディクチオカウルス・ヴィヴィパロウス(肺虫症)、ならびにそれらの組み合わせの群から選択されるもののような食品生産動物病原体に由来する抗原である。イヌ以外の動物への投与のために、本発明は、目的のエピトープを導入するための手段を提供し、目的の抗原エピトープは、ブタ病原体:サルモネラ属種、特にS.ティフィムリウム、S.コレラスイス;アストロウイルス;ロタウイルス;伝染性胃腸炎ウイルス;ブラキスピラ属種、特にB.ヒオディセンテリア、B.ピロシコリ;クロストリジウム属種、特にC.ディフィシル、ウェルシュ菌(C.パーフリンゲンス)A、BおよびC型、C.ノビイ、C.セプチカム、C.テタニ;ブタ腸管ピコルナウイルス;ブタ腸管カリシウイルス;アクチノバシラス・プルロニューモニエを含む呼吸器病原体;ボルデテラ・ブロンキセプティカ;エリシペロスリクス・ルシオパシエ;ヘモフィルス・パラスイス、特に亜型1、7および14;パスツレラ属種、特にP.マルトシダ;マイコプラズマ属種、特にM.ハイオニューモニエ、M.ヒオリニス;ブタインフルエンザウイルスA型;PRRSウイルス;ブタサーコウイルス;ブタパルボウイルス;仮性狂犬病ウイルス;エペリスロゾーノシス・スイス、マイコバクテリウム属種、特にM.アビウム、M.イントラセルラーレ、M.ボビス;ブタ呼吸器コロナウイルス;ブタコロナウイルス、特にTGEV、PEDV、およびデルタコロナウイルス;アルカノバクテリウム・ピオゲネス;ブタアデノウイルス;豚コレラ;ブタサイトメガロウイルス;アフリカ豚コレラ;または、大腸菌(エスケリキア・コリ)、ストレプトコッカス属種、特にS.スイス、S.ポルシナス、S.ディスガラクティエ、好ましくは亜種エクイシミリス;ブルセラ・スイス、特に次亜種1、2および3型;レプトスピラ属種、特にL.オーストラリス、L.カニコーラ、L.グリッポチフォーサ、L.ポモナ、L.イクテロヘモラジア、L.インターロガンス、L.タラソビ、L.ハージョ、L.セジュロ;脳心筋炎ウイルス;赤血球凝集脳脊髄炎ウイルス;日本脳炎ウイルス;西ナイルウイルス;レオウイルス;ルブラウイルス;メナングルウイルス;ニパウイルス;水疱性口内炎ウイルス;ブタの水疱性発疹のウイルス:ブタポックスウイルス;ブタヘルペスウイルス;およびスタフィロコッカス・ヒカスを含む他の病原体、ならびにそれらの組み合わせの群から選択されるもののような食品生産動物病原体に由来する抗原である。
用語「DNAワクチン接種」または「ポリヌクレオチドワクチン接種」は、好適な医薬組成物を使用する遺伝材料の直接接種を意味する。
不活性化の様々な物理的および化学的方法が当技術分野で公知である。用語「不活性化」は、照射(紫外線(UV)、X線、電子ビームまたはガンマ照射)、加熱、または化学的に処置され、その免疫原性を保持しながらそのようなウイルスまたは細菌を不活性化または死滅させた、以前は毒性だったまたは非毒性ウイルスまたは細菌を指す。好適な不活性化剤としては、ベータ−プロピオラクトン、バイナリーまたはベータまたはアセチルエチレンイミン、グルテルアルデヒド(gluteraldehyde)、オゾン、およびホルマリン(ホルムアルデヒド)が挙げられる。
ホルマリンまたはホルムアルデヒドによる不活性化のため、ホルムアルデヒドを、典型的には水およびメチルアルコールと混合して、ホルマリンを作製する。メチルアルコールの添加により、活性化プロセス中の分解または交差反応を防ぐ。一実施形態では、37%ホルムアルデヒド溶液の約0.1〜1%を使用して、ウイルスまたは細菌を不活性化する。材料は不活性化されるが、高用量による副作用が起こるほど多くないことを確実にするように、ホルマリンの量を調節することが重要である。
より詳細には、ウイルスの文脈における用語「不活性化」は、ウイルスがin vivoまたはin vitroでそれぞれ複製することができないことを意味し、細菌の文脈における用語「不活性化」は、細菌がin vivoまたはin vitroで増殖できないことを意味する。例えば、用語「不活性化」は、in vitroで繁殖し、次いでもはや複製できないように化学的または物理的な手段を使用して不活性化されたウイルスを指し得る。別の例では、用語「不活性化」は、繁殖し、次いでワクチンの成分として使用され得るバクテリンを生じるなど、細菌、細菌の断片または成分の懸濁液を生じる、化学的または物理的な手段を使用して不活性化された細菌を指し得る。
本明細書で使用される場合、用語「不活性化」、「死菌」または「KV」は交換可能に使用される。
用語「生ワクチン」は、生きた生物または複製可能なウイルスもしくはウイルスベクターのいずれかを含むワクチンを指す。
「医薬組成物」は、それが投与される生物の、または住み着いている生物の、または生物上の生理学、例えば免疫学的機能を改変することができる1つまたは複数の成分から基本的になる。用語は、限定はされないが、抗生物質または駆虫薬、ならびに、例えば、限定はされないが、プロセシング特性、無菌性、安定性、経腸または非経口経路、例えば、経口、鼻腔内、静脈内、筋肉内、皮下、皮内、または他の好適な経路を介して組成物を投与する可能性、投与後の耐性、または調節性放出特性などの特定の他の目的を達成するために一般に使用される他の構成成分を含む。そのような医薬組成物の1つの非限定的な例は、単に、実証目的のために挙げられ、以下のように調製され得る:感染細胞培養の細胞培養上澄み液は安定剤(例えば、スペルミジンおよび/またはウシ血清アルブミン(BSA)と混合され、混合物は続いて他の方法により凍結乾燥または脱水される。ワクチン接種の前に、混合物は次いで、水溶液(例えば、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)または非水性溶液(例えば、油エマルジョン、アルミニウムベースのアジュバント)中で再水和される。
組換えウイルスベクターベースのワクチンに関して、投与経路は、有利にはSC、IM、TD、またはIDであり得る。この投与は、針を備えたまたは針なしシリンジ装置によってなされてもよい。本発明の実施形態は、経口(orally)、鼻腔内、肛門、膣、経口(peroral)、胃内、非経口、皮下、皮内、筋肉内、または静脈内投与することができる。本発明の組成物の例としては、懸濁液、シロップまたはエリキシル剤などの、開口部(例えば、経口(orally)、鼻腔、肛門、膣、経口(perorally)、胃内等)投与用の液体調製物;および、滅菌懸濁液またはエマルジョンなどの、非経口、皮下、皮内、筋肉内または静脈内投与(例えば、注射可能な投与)用の調製物が挙げられる。そのような組成物では、組換えCAdV2および/または抗原は、滅菌水、生理食塩水、グルコース等などの好適な担体、希釈剤、または賦形剤と混合されていてもよい。組成物は凍結乾燥することもできる。組成物は、所望の投与経路および調製物に応じて、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝剤、アジュバント、ゲル化添加剤または増粘添加剤、保存剤、香味剤、着色料等などの補助物質を含有することができる。
1つの態様では本発明は、プライム投与およびブースト投与が、薬学的または獣医学的に許容される賦形剤、希釈剤、アジュバント、またはビヒクル、および本発明の組換えCAdVを含む組成物を利用する、「プライムブースト」投与レジメンに基づくワクチン戦略に関する。
プライムブーストは、少なくとも1つの共通の抗原および/またはそのバリアントもしくは断片を用いる少なくとも1回のプライム投与および少なくとも1回のブースト投与を含む。プライム投与に使用されるワクチンは、後のブースターワクチンとして使用されるものと実際は異なっていてもよい。プライム投与およびブースト投与は両方とも、本発明の組換えCAdVを含んでもよいことがさらに留意される。プライム投与は、1回または複数回の投与を含んでもよい。同様に、ブースト投与は、1回または複数回の投与を含んでもよい。
本発明の別の態様は、本発明によるプライムブーストワクチン接種のためのキットに関する。キットは、少なくとも2つのバイアル、すなわち、本発明によるプライムワクチン接種のためのワクチンを含有する第1のバイアル、および本発明によるブーストワクチン接種のためのワクチンを含有する第2のバイアルを含んでもよい。キットは、追加のプライムワクチン接種または追加のブーストワクチン接種のための追加の第1のまたは第2のバイアルを有利には含有してもよい。
1つの実施形態では、キットは、一方が本発明によるプライムワクチン接種のためのプラスミドベースのワクチンを含有し、他方のバイアルが本発明によるブーストワクチン接種のための組換えウイルスベクターベースのワクチンを含有する、2つのバイアルを含んでもよい。
本明細書で使用される場合、「薬学的にまたは獣医学的に許容される担体」は、ありとあらゆる溶媒、分散培地、コーティング、アジュバント、安定化剤、希釈剤、保存剤、抗菌および抗真菌剤、等張剤、吸着遅延剤などを含む。いくつかの好ましい実施形態、特に本発明での使用のための凍結乾燥免疫原性組成物、安定化剤を含むものは、凍結乾燥またはフリーズドライのための安定剤を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫原性組成物はアジュバントを含有する。本明細書で使用する場合、「アジュバント」は、水酸化アルミニウムおよびリン酸アルミニウム、サポニン、例えばQuil A、QS−21(Cambridge Biotech Inc.、Cambridge MA)、GPI−0100(Galenica Pharmaceuticals,Inc.、Birmingham、AL)、油中水型エマルジョン、水中油型エマルジョン、水中油中水型エマルジョンを含み得る。エマルジョンは、特に、軽質流動パラフィンオイル(ヨーロッパ薬局方型);スクアランまたはスクアレンなどのイソプレノイドオイル;アルケンのオリゴマー化から生じるオイル、特にイソブテンまたはデセン;線状アルキル基を含有する酸のまたはアルコールのエステル、より具体的には、植物油、オレイン酸エチル、プロピレングリコールジ−(カプリル酸/カプリン酸)、グリセリルトリ−(カプリル酸/カプリン酸)またはプロピレングリコールジオレエート;分枝脂肪酸またはアルコールのエステル、特にイソステアリン酸のエステルに基づき得る。オイルは乳化剤と組合せて使用され、エマルジョンを形成する。乳化剤は、好ましくは非イオン性界面活性剤、特にソルビタンのエステル、マンニド(例えば、無水マンニトールオレエート)のエステル、グリコールのエステル、ポリグリセリンのエステル、プロピレングリコールのエステル、およびオレイン酸、イソステアリン酸、リシノール酸またはヒドロキシステアリン酸の、エトキシル化されていてもよいエステル、ポリオキシプロピレン−ポリオキシエチレンコポリマーブロック、特にプルロニック製品、特にL121である。Hunter et al., The Theory and Practical Application of Adjuvants (Ed.Stewart-Tull, D. E. S.), JohnWiley and Sons, NY, pp51-94 (1995) and Todd et al., Vaccine 15:564-570 (1997)参照。例示的なアジュバントは、"Vaccine Design, The Subunit and Adjuvant Approach" edited by M. Powell and M. Newman, Plenum Press, 1995の147頁に記載されているSPTエマルジョン、およびこの同じ書籍の183頁に記載されているエマルジョンMF59である。
アジュバントのさらなる例は、アクリル酸またはメタクリル酸のポリマーおよび無水マレイン酸とアルケニル誘導体のコポリマーから選択される化合物である。有利なアジュバント化合物は、特に糖または多価アルコールのポリアルケニルエーテルと架橋されたアクリル酸またはメタクリル酸のポリマーである。これらの化合物は用語カルボマーで公知である(Phameuropa Vol. 8, No. 2, June 1996)。当業者は、少なくとも3個、好ましくは8個以下のヒドロキシル基を有し、少なくとも3個のヒドロキシルの水素原子が少なくとも2個の炭素原子を有する不飽和脂肪族ラジカルで置き換えられているポリヒドロキシル化化合物と架橋したそのようなアクリルポリマーについて記載している米国特許第2,909,462号を参照することもできる。好ましいラジカルは、2〜4個の炭素原子を含有するもの、例えば、ビニル、アリルおよび他のエチレン性不飽和基である。不飽和ラジカルは、それ自体がメチルなどの他の置換基を含有し得る。CARBOPOL(登録商標)の名称で販売されている製品(BF Goodrich、Ohio、USA)が特に適している。これらは、アリルスクロースまたはアリルペンタエリスリトールと架橋されている。それらとしては、Carbopol 974P、934Pおよび971Pを挙げることができる。CARBOPOL(登録商標)971Pの使用が最も好ましい。無水マレイン酸とアルケニル誘導体のコポリマーは、コポリマーEMA(Monsanto)であり、これらは無水マレイン酸とエチレンのコポリマーである。これらのポリマーを水に溶解させることにより酸性溶液が生じ、これを、免疫原性組成物、免疫学的組成物またはワクチン組成物自体が組み込まれるアジュバント溶液をもたらすために、好ましくは生理的なpHまで中和する。
さらに好適なアジュバントとしては、多くの他のものもあり、限定はされないが、RIBIアジュバント系(Ribi Inc.)、ブロックコポリマー(CytRx、Atlanta GA)、SAF−M(Chiron、Emeryville CA)、モノホスホリルリピドA、アブリジン脂質−アミンアジュバント、大腸菌(エスケリキア・コリ)由来の熱不安定性エンテロトキシン(組換えまたは他の方法)、コレラ毒素、IMS1314またはムラミルジペプチド、または天然に存在するもしくは組換えサイトカインもしくはその類似体または内在性サイトカイン放出の刺激薬が挙げられる。
アジュバントは、用量当たり約100μg〜約10mgの量で、好ましくは用量当たり約100μg〜約10mgの量で、より好ましくは用量当たり約500μg〜約5mgの量で、さらにより好ましくは用量当たり約750μg〜約2.5mgの量で、最も好ましくは用量当たり約1mgの量で添加することができると予測される。あるいは、アジュバントは、最終製品の容積で約0.01〜50%の濃度、好ましくは約2%〜30%の濃度、より好ましくは約5%〜25%の濃度、なおさらに好ましくは約7%〜22%の濃度、および最も好ましくは10%〜20%の濃度であってよい。
「希釈剤」としては、水、生理食塩水、デキストロース、エタノール、グリセロール等を挙げることができる。等張剤としては、とりわけ、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースを挙げることができる。安定剤としては、とりわけ、アルブミンおよびエチレンジアミン四酢酸のアルカリ塩が挙げられる。
「単離された」は、その天然の状態から「人間の手によって」変更されたこと、すなわち、それが天然に存在する場合、その元々の環境から変更または取り出された、またはその両方であることを意味する。例えば、本明細書でその用語が用いられる場合、生きている生物内に天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは「単離され」ていないが、その天然の状態で共存する材料から分離された同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、「単離され」ている。
「弱毒化」は、病原体の毒性を低下させることを意味する。本発明では、「弱毒化」は「非病原性」と同義である。本発明では、弱毒化ウイルスは、感染の臨床徴候を引き起こさないが標的動物における免疫応答を誘導することはできるように毒性を低下させたものであるが、弱毒化ウイルス、特に請求項のようにCAdVウイルスベクターを感染させた動物における臨床徴候の発生率または重症度が、弱毒化していないウイルスまたは病原体を感染させ、弱毒化ウイルスを受けていない「対照群」の動物と比較して低下することも意味し得る。この場合、用語「低下する/低下した」は、上記で定義された対照群と比較して少なくとも10%、好ましくは25%、さらにより好ましくは50%、なおより好ましくは60%、さらにより好ましくは70%、なおより好ましくは80%、さらにより好ましくは90%、および最も好ましくは100%の低下を意味する。したがって、例えば請求項のように弱毒化ウイルスベクターなどの、弱毒化した非病原性病原体、特に請求項のようにCAdVウイルスベクターが、改変生ワクチン(MLV)または改変生免疫原性組成物の生成に好適である。
本明細書では、「有効用量」は、限定はされないが、抗原が投与される動物における臨床症状の減少をもたらす免疫応答を引き出す、または引き出すことができる抗原の量を意味する。
本明細書で使用する場合、用語「有効量」は、組成物の文脈では、動物において感染または付随する疾患の発生率を低下させるまたはその重症度を軽減する免疫応答を誘導することができる免疫原性組成物の量を意味する。特に、有効量は、用量当たりのコロニー形成単位(CFU)を指す。あるいは、療法の文脈では、用語「有効量」は、疾患もしくは障害、または1つもしくは複数のその症状の重症度または持続時間を低下または好転させるため、疾患または障害の前進を予防するため、疾患または障害の後退を引き起こすため、疾患または障害に付随する1つまたは複数の症状の再発、発生、発症、または進行を予防するため、または、別の療法または治療剤による予防もしくは処置を増強もしくは改善するために十分である療法の量を指す。
「免疫応答」または「免疫学的応答」は、限定はされないが、目的の(免疫原性)組成物またはワクチンに対する細胞および/または抗体により媒介される免疫応答の発生を意味する。通常、免疫応答または免疫学的応答は、限定はされないが、以下の作用の1つまたは複数を含む:目的の組成物またはワクチンに含まれる1つまたは複数の抗原を特異的に対象とする抗体、B細胞、ヘルパーT細胞、サプレッサーT細胞、および/または細胞傷害性T細胞の産生または活性化。好ましくは、宿主は治療的または防御的な免疫学的(記憶)応答のいずれかを示し、したがって、新しい感染に対する抵抗性が増強され、および/または疾患の臨床的な重症度が低下する。そのような防御は、症状の数、症状の重症度の低下、もしくは病原体の感染に伴う症状の1つまたは複数の欠如、ウイルス血症の発症の遅延、ウイルスの持続性の低下、全ウイルス負荷量の減少および/またはウイルス排泄の減少のいずれかによって実証される。したがって、本発明は、組換えCAdVウイルスまたはベクターおよび薬学的に許容される担体または希釈剤を含む免疫原性またはワクチン組成物を宿主に投与するステップを含む、宿主脊椎動物において「免疫学的応答を誘導する」方法も提供する。
「疾患に対する防御」、「防御免疫」、「機能免疫」、「臨床症状の低減」、「免疫学的応答の誘導」、「中和抗体および/または血清変換の誘導/産生」、および同様の語句は、疾患または感染に曝露された免疫されていない対象において予測されるものよりも少ない有害作用をもたらす、抗原に対する抗体産生、および/または本発明の1つもしくは複数の治療用組成物もしくはそれらの組み合わせの投与によって生じる、疾患もしくは状態に対する部分的もしくは完全な応答をもたらすことを意味する。すなわち、ワクチン接種された対象では感染の有害作用の重症度が低下する。ワクチン接種された対象では、感染が減少し得る、遅くなり得る、または場合により完全に予防され得る。本明細書では、感染の完全な予防を意味する場合には、明確に記載される。完全な予防と記載されていない場合、この用語は、部分的な予防を含む。
本明細書では、「臨床徴候の発生率および/または重症度の低下」または「臨床症状の減少」は、限定はされないが、野生型感染と比較した、群内の感染した対象の数の減少、感染の臨床徴候を示す対象の数の減少もしくは排除、または1または複数の対象に存在する任意の臨床徴候の重症度の低下を意味する。例えば、病原体負荷量の減少、病原体の排出、病原体の伝染の減少、またはマラリアの任意の症候性の臨床徴候の減少のいずれかを指すべきである。好ましくは、本発明の治療用組成物を受けた1またはそれ以上の対象において、組成物を受けておらず感染する対象と比較して、これらの臨床徴候が少なくとも10%減少する。より好ましくは、本発明の組成物を受けた対象において臨床徴候が少なくとも20%、好ましくは少なくとも30%、より好ましくは少なくとも40%、さらにより好ましくは少なくとも50%減少する。
本明細書では、用語「防御の増大」は、限定はされないが、ワクチン接種された対象の群における感染因子による感染に付随する1つまたは複数の臨床症状が、ワクチン接種されていない対象の対照群に対して統計的に優位に減少することを意味する。用語「統計的に有意な臨床症状の減少」は、限定はされないが、感染因子によるチャレンジ後に、ワクチン接種された対象の群における少なくとも1つの臨床症状の発生頻度が、ワクチン接種されていない対照群よりも少なくとも10%、好ましくは20%、より好ましくは30%、さらにより好ましくは50%、およびさらにより好ましくは70%低いことを意味する。
「長期にわたる防御」は、少なくとも3週間、より好ましくは少なくとも3ヵ月、なおより好ましくは少なくとも6ヵ月にわたって持続する「改善された有効性」を指す。家畜の場合、長期にわたる防御は、動物が食肉用に販売される平均年齢まで持続するものとされることが最も好ましい。
ウイルスによって誘導される、用語「ウイルス血症の減少」は、限定はされないが、動物の血流に入るウイルスの減少を意味し、ウイルス血症のレベル、すなわち血清mL当たりのウイルスDNAまたはRNAのコピー数または血清デシリットル当たりのプラーク形成コロニーの数が、組成物を受けておらず、感染し得る動物と比較して少なくとも50%、本発明の組成物を受けた動物の血清中で減少する。より好ましくは、ウイルス血症レベルは、本発明の組成物を受けた動物で、少なくとも90%、好ましくは少なくとも99.9%、より好ましくは少なくとも99.99%、およびさらにより好ましくは少なくとも99.999%減少する。
本明細書で使用する場合、用語「ウイルス血症」は、動物、特に哺乳動物、トリ、または昆虫の血流中でウイルス粒子が複製および/または循環する状態として特に理解される。
「安全性」は、ワクチン接種後にワクチン接種された動物において、限定はされないが、細菌ベースのワクチンの毒性への潜在的復帰、持続性の全身性疾病またはワクチン投与の部位における許容できない炎症などの臨床的に重大な副作用を含む有害な結果が存在しないことを指す。
用語「ワクチン接種(vaccination)」または「ワクチン接種すること(vaccinating)」またはその変形は、本明細書で使用する場合、限定はされないが、動物に投与されると、動物における免疫応答を直接または間接的に引き出すまたは引き出すことができる本発明の免疫原性組成物の投与を含むプロセスを意味する。
「死亡率」とは、本発明の文脈では、感染によって引き起こされる死亡を指し、感染が、苦痛を予防し、その生涯に人道的な終わりをもたらすために動物を安楽死させるほど重症である状況を含む。
製剤
組成物を投与する対象は、限定はされないが、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、家禽(例えば、ニワトリ)、ヤギ、ネコ、イヌ、ハムスター、マウスおよびラット、を含む動物であることが好ましく、最も好ましくは、哺乳動物はブタである。
本発明の製剤は、有効な免疫量の1つまたは複数の免疫原性組成物および生理学的に許容されるビヒクルを含む。ワクチンは、有効な免疫量の1つまたは複数の免疫原性組成物および生理学的に許容されるビヒクルを含む。製剤は投与の形式に適したものであるべきである。
免疫原性組成物は、所望であれば、微量の湿潤剤または乳化剤、またはpH緩衝剤も含有してよい。免疫原性組成物は、液剤、懸濁剤、エマルジョン、錠剤、ピル、カプセル剤、持続放出製剤、または散剤であってよい。経口製剤としては、例えば、医薬品グレードのマンニトール、ラクトース、でんぷん、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなどの標準の担体を挙げることができる。
投与の好ましい経路としては、限定はされないが、鼻腔内、経口、皮内、および筋肉内が挙げられる。飲料水での投与、最も好ましくは単回用量が望ましい。当業者は、本発明の組成物が、1用量、2用量、またはそれ以上の用量で、ならびに他の投与経路によって投与することもできることを理解するであろう。例えば、そのような他の経路としては、皮下、皮内、腹腔内、皮内が挙げられ、所望の処置の持続時間および効果に応じて、本発明による組成物は、1回または数回、また断続的に、例えば、数日、数週間または数ヵ月にわたって毎日、異なる投与量、例えば、約103〜108TCID50(上記のウイルス力価を参照)で投与することができる。本発明の特定の態様では、特に生ウイルス/生ワクチンに関して、投与量は約103〜108TCID50である。
組成物は、所望であれば、活性成分を含有する1つまたは複数の単位剤形を含有し得るパックまたはディスペンサーデバイス中に存在してよい。このパックは、例えば、ブリスターパックなどの金属またはプラスチックホイルを含んでよい。このパックまたはディスペンサーデバイスには、投与、好ましくは哺乳動物、特にブタに投与するための指示書が添付されていてよい。そのような容器に関しては、医薬品または生物学的製品の製造、使用または販売を規制する政府機関によって規定された形態で通知され、その通知は、ヒトへの投与のための製造、使用または販売機関による認可を反映している。
以下の図は本明細書の一部を形成し、本発明の特定の態様をさらに実証するために含まれる。本発明は、これらの図の1つまたは複数を本明細書で提示されている特定の実施形態の詳細な説明と組合せて参照することによってよりよく理解することができる。
CAdV2感染性クローンの生成の概略図である。(A)介在ユニーク制限部位を含むウイルスゲノムの5’および3’末端をコードし、pBR322大腸菌(E.coli)シャトルベクターにクローニングされた合成DNA断片。PmeI制限エンドヌクレアーゼ部位(矢印)が、pBR322ベクター骨格からのCAdV−2ゲノムの切り出しを促進するためにITRの5’および3’末端で該構築物に操作された。(B)BJ5183 REC+大腸菌における相同組換えによりベクターにクローニングされたdsDNA CAdV−2ゲノム。(C)成功したHR組換えrCAdV−2感染性クローン。ITR=逆方向末端反復。 CAdV−2のE3領域の構成の概略図である。 線状化感染性クローンDNAとE3標的化CAdV−2導入断片の間の相同組換えの概略図である。 CAdV−2骨格中のBIVI生成E3欠失(ΔE3AおよびΔE3B)導入断片の概略図である。 BIVI生成E3欠失の概略図である。A)E3 ORFの概略図と残りのORF1および2 DNAの合計サイズならびに各々の量。B)ΔE3AおよびΔE3Bコンフィギュレーションに残っているE3 ORF1およびORF2 DNAの合計量を示すCAdV−2ゲノムの概略図。「A」欠失(ΔE3A)では、E3 ORF1の最初の186ヌクレオチドおよびORF2の最後の301ヌクレオチドを除く全てが欠失されたが、E3「B」欠失(ΔE3B)については、E3 ORF1の186ヌクレオチドおよびORF2の83ヌクレオチドが残っている。 発現カセットのE3欠失および挿入を示す図である。 トランスフェクトMDCK細胞においてIFAにより検出される、発現構築物からの一過的な発現によるCPV VP2発現の定量によるプロモーター強度の分析を示す図である。パネルA:CMVieまたはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトされたMDCK細胞のCPV IFAが示される。パネルB:示されているCMVie、CAG、またはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトされたMDCK細胞のCPV VP2 ELISAのヒストグラム。パネルC:示されているCMVieまたはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトされたCPV VP2陽性MDCK細胞のMolecular Devices ImageXpress MicroXL定量のヒストグラム。 CAV−2 MCS−1−5骨格中のCMVie EGFP SV40ポリA発現カセットの概略図。挿入は、E3 ORF1の最初の186ヌクレオチドおよび最後の82ヌクレオチドを除く全てが欠失されているΔE3B ORF2の中である。EGFP遺伝子の後にSV40ポリAシグナルが続く。ITR=逆方向末端反復。 CAV−2骨格中のCMVie CPV VP2(n)SV40ポリA発現カセットの概略図である。挿入は、E3 ORF1の最初の186ヌクレオチドおよび最後の82ヌクレオチドを除く全てが欠失されているΔE3B ORF2の中である。VP2(n)遺伝子の後にSV40ポリAシグナルが続く。 感染細胞および上清からから精製されたrCAV−2 DNAのPCR分析を示す図である。PCRは、単離されたウイルスDNA由来のrCAV2ΔE3B/CMVie CPV VP2におけるCMVie CPV VP2(n)導入遺伝子発現カセットの存在を検証するのに使用された。パネルA、pCAV−2対照ウイルス;パネルB、クローン#1;パネルC、クローン#2。パネルD、CMVie CPV VP2(n)トランスファープラスミドによる対照反応。Mは1Kb+ DNAラダーである。パネルE.導入遺伝子発現カセット特異的PCR反応の予測結果。反応1および2は、CAV−2 H−A P VIII、U−exonおよびCVP VP2に特異的なプライマーを利用する;反応3、4および5は、CPV VP2に特異的なプライマーを利用する(パネルEを参照)。反応7(CAdV−2の陽性反応)は、CAV−2特異的H−A P VIIIおよびU−exonプライマーを使用する。 rCAV−2感染MDCK細胞のフローサイトメトリー分析を示す図である。パネルA〜Fは、シグナル細胞に存在するシグナルのヒストグラムである。懸濁MDCK細胞は、BRSV F(co)(パネルBおよびE)発現カセットを有するrCAV−2対照ウイルスに感染させ、またはCPV VP2(co)(パネルCおよびF)発現カセットを有するrCAV−2に感染させ、FITCコンジュゲート抗CPV VP2(パネルA、BおよびC)抗体またはFITCコンジュゲート抗CAV2(パネルD、EおよびF)抗体のいずれかで感染後72時間染色された。パネルGは、パネルA〜Fに示した結果のまとめおよび定量である。 CAdV−2骨格中のCMVie BRSV F(co)BGHポリA発現カセットの概略図である。BRSV F(co)遺伝子の後にBGHポリAシグナルが続く。 CAdV−2骨格中のCMVie RabGP BGHポリA発現カセットの概略図である。RabGP遺伝子の後にBGHポリAシグナルが続く。 rCAV−2 RabGP P2ウイルス感染E1B−MDCK細胞のCAdV−2特異的IFAを示す図である。感染E1B−MDCK細胞のCAdV−2 IFAが、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)に直接コンジュゲートされた抗CAdV−2抗体、ならびにマウス抗RabGモノクローナル抗体およびFITCコンジュゲートヤギ抗マウス抗体を用いて感染細胞後60時間行われた。 rCAV−2 RabGP P2ウイルス感染E1B−MDCK細胞のCAdV−2特異的IFAを示す図である。感染E1B−MDCK細胞のCAdV−2 IFAが、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)に直接コンジュゲートされた抗CAdV−2抗体、ならびにマウス抗RabGモノクローナル抗体およびFITCコンジュゲートヤギ抗マウス抗体を用いて感染細胞後60時間行われた。 CAdV2 CMVie CPV VP2感染AI−ST 2015細胞のフローサイトメトリー分析:感染後72時間を示す図である。 新しいEHV−4プロモーターを有するrCAdV−2:感染AI−ST 2015細胞のフローサイトメトリー分析:感染後48時間を示す図である。 新しいEHV−4プロモーターを有するrCAdV−2:感染MDCK細胞におけるCPV VP2タンパク質発現のドットブロット分析を示す図である。一次抗体=1/50 抗CPV−FITC mAb(VMRD);二次抗体=1/1.000 ヤギ−抗マウスIgG−ペルオキシダーゼ(JIR)。(A)元々のドットブロットデータ。(B)ドットブロットから作成された半定量的データ:定量のため、ドットブロットはImageJソフトウェアを使用して分析される(Burger, W., Burge, M.J. (Eds.), 2008. Digital Image Processing: An algorithmic introduction using Java. Springer-Verlag, New York)。画像カラーは、反転されバックグラウンドが引かれ、記録した各ドットの密度を統合する。値は、以下のように+および−指定に割り当てられる。“++++”=>800000、“+++”=500000〜800000、“++”=300000〜499999、“+”=120000〜299999、“+/−“=80000〜119999および“−“=<80000。 rCAdV−2感染性クローンによって感染されたAI−ST 2015細胞によるRabGタンパク質発現のフローサイトメトリー分析のまとめを示す図である。 rCAdV−2 p430およびp455(それぞれgG430およびMCP455として示される)RabGに感染させた細胞におけるCPV VP2の検出を示す図である。 rCAdV−2 p455(MCP455として示される)RabGに感染させた細胞におけるRabGの検出を示す図である。 rCAdV−2 p455(MCP455と示される)RabGに感染させた細胞におけるCAdV−2およびRabG両方の検出を示す図である。
配列概要:
以下の配列は、本発明において本明細書に詳細に記載され、開示される。
Figure 2019531724

Figure 2019531724
以下の例は、本発明の好ましい実施形態を実証するために含まれる。以下の例に開示されている技法は本発明の実施において十分に機能することを本発明者らが発見した代表的な技法であり、したがって、それを実施するための好ましい方式を構成するとみなすことができることが当業者には理解されるべきである。しかしながら、当業者は、本開示に照らして、開示されている特定の実施形態に多くの変更を行うことができ、それでもなお本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく同様または類似の結果が得られることを理解するべきである。
(例1)
CAdVウイルス単離
CAdV2ウイルスは、喉頭気管炎を有するイヌ由来の咽頭スワブから最初に単離し、American Type Culture Collection(ATCC)MDCK細胞株CCL−34の第1継代として得た。ウイルスを取得後8回継代し、第8継代をアリコートし、マスターシードウイルスとして指定した。ストックCAdV−2マスターシードウイルスは、Boehringer Ingelheim Vetmedica, Inc.において参照CAdV−2、MSV Lot #001−dil、F:11−24−98下で作製した。ストックCAdV−2マスターシードは、Toronto株(Genbank受入番号U77082.1)と密接に関連している。CAdV−2は、イヌワクチンとしてBoehringer Ingelheim Vetmedica, Inc.から市販されている。
感染性クローンDNAは、pBR322低コピー大腸菌シャトルベクターにクローニングされた全CAdV−2ゲノムである。相同組換えアライグマ(Kremer, E.J., et al., Canine adenovirus vectors: an alternative for adenovirus-mediated gene transfer. J Virol, 2000. 74(1): p. 505-12.)を使用して、感染性クローンDNAを構築した。CAdV−2 DNAをストックCAdV−2MLV)から精製し、CAdV−2逆方向末端反復に相同なDNAを含有するpBR322ベースのベクターとの組換えをBJ5183大腸菌中において生じさせた。
完全な感染性クローンDNAの提示のために、線状化感染性クローンDNA、図1をトランスフェクトしたMadine Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞からCAdV−2をレスキューした。
(例2)
e3欠失挿入CAdVクローンの生成
CAdV−2は、動物用のベクターウイルスワクチンとして成功裡に利用されている。CAdV−2のE3ドメインは必須ではないことが公知であり(E3オープンリーディングフレーム(ORF)はいずれも、組織培養でのウイルス複製に必要とされない(Fisher et al. 2002))、異種DNAの挿入のための論理的標的となる。
導入遺伝子がE3ドメインに局在化される有効なCAdV−2ベースのワクチンの例としては、イヌジステンパーウイルス(Fisher et al. 2002)、ネコ汎白血球減少症ウイルス(Yang et al. 2008)、およびネコの狂犬病(Hu et al., 2007)、イヌ(Hu et al., 2006)、マウス(Li et al., 2006)、アライグマ、ブタ(Lui et al., 2008)、スカンク(Henderson et al., 2009)およびヒツジ(Bouet-Cararo et al., 2011)が挙げられる。
図2は、CAdV−2のE3領域の構成の概略図である。4146bp NruI(bp 23932)/SalI(bp 28078)制限エンドヌクレアーゼ断片が、H−Aタンパク質VIII、ORF1、ORF2、およびU Exonとして示されたオープンリーディングフレーム(ORF)とともに図示される。選択制限エンドヌクレアーゼ部位(NruI、DraIII、SspIおよびSalI)の位置がこのDNA断片について示され、ナンバリングは、密接に関連するCAdV−2のToronto株(Genbank受入番号 U77082.1)と比較している。
Fischerら(2002)によって述べられているように、E3領域のゲノム構成は、異なるアデノウイルス間で緩く保存されているに過ぎず(Linne, T., Differences in the E3 regions of the canine adenovirus type 1 and type 2. Virus Res, 1992. 23(1-2): p. 119-33)、したがって、CAdV2 E3領域非必須遺伝子座の正確な境界は、他のウイルスのE3挿入部位から置き換えることができない。第1の構築物では、E3由来の全ORF1およびORF2 DNAセグメントを欠失させて、導入遺伝子挿入サイズを最大化したが、感染性クローンDNAはrCAdV−2のレスキューを促進しなかった。この戦略は、5’E3隣接DNAのE3 ORF1(異なるリーディングフレーム)へと伸びるヘキソン関連タンパク質VIII遺伝子(H−A− PVIII)の最後の5個のコドン(終止コドンを含む)を不注意に欠失させ、実質的な3’伸長を有するH−A PVIII遺伝子をもたらす(5個のアミノ酸欠失と、それに続く実質的なc末端付加を有するH−A PVIIIをもたらし得る)ことが見出された。
故に、5’および3’E3隣接DNAがE3 ORF1の最初の183bpおよびORF2の最後の47bpを含有するように、トランスファープラスミドをデザインし直した。これは、rCAdV−2レスキューに十分であることが見出された。
(例3)
rCAdV−2感染性クローンDNAの生成のための相同組換え
Chartierら(1996)およびKremerら(2000)による論文に記載された方法に基づく、線状化CAdV−2感染性クローンDNAとE3標的化CAdV−2トランスファープラスミド/断片の間の、Rec+ BJ5183大腸菌における相同組換えを、導入遺伝子発現カセットがE3ドメインに局在化されたrCAdV−2の生成に使用した。図3に図示されるように、E3ドメインにユニーク制限部位を含有する感染性クローンは、a)E3領域に対する導入遺伝子発現カセットを標的とする、およびb)E3の選んだ部分を効果的に欠失させるように、導入遺伝子発現カセットの5’および3’両方に約500bpのCAdV−2隣接DNAを含有する導入断片と再結合する。
導入遺伝子特異的PCRスクリーニングを用いて同定された拡大BJ5183クローンからDNAを単離し、これらのDNAをアガロースゲル電気泳動によって分離して、23.1Kbまたは>23.1Kbでの移動を検証した(成功したHRは、スーパーコイルDNAとして、0.7%アガロースゲルで23.1kbマーカーに同様に移動する約35kbのDNA種をもたらす)。これらのDNAを次いで形質転換し、哺乳動物細胞におけるrCAdV−2の生成のための大規模精製および使用のために、Stbl2またはXL−10 Gold大腸菌のどちらかで拡大させた。
図3は、E3残りの部分の間に位置する上述のE3欠失およびユニーク制限部位(多重クローニング部位のMCSと命名される)を包含する、NruI/SalI線状化感染性クローンDNA(天然のCAdV−2配列)とE3標的化CAdV−2導入断片の間の相同組換えの概略図である。感染性クローンDNAは、左右逆方向末端反復、それぞれLITRおよびRITRに隣接されている。
(例4)
ΔE3 rCAdV−2感染性クローンDNAの生成
E3欠失rCAdV−2:ΔE3AおよびΔE3B
オーバーラップ伸長PCRを使用して、選んだE3欠失ならびにBJ5183大腸菌における標的化相同組換え(HR)を促進するための約500塩基の5’および3’隣接配列をコードする、CAdV−2E3標的化導入断片を生成した(概略図、図4および図5参照)。図5AおよびBに見られるように、「A」欠失(ΔE3A)では、E3 ORF1の最初の186ヌクレオチドおよびORF2の最後の301ヌクレオチドを除く全てが欠失されたが、E3「B」欠失(ΔE3B)については、E3 ORF1の186ヌクレオチドおよびORF2の83ヌクレオチドが残っている(5’および3’隣接については、配列番号1および配列番号2参照)。
ΔE3AおよびΔE3B欠失を有する両方の感染性クローンは、トランスフェクトMDCKおよびE1B−MDCK細胞から成功裡にレスキューされた。これは、特定のE3欠失が、ウイルスレスキューを支持することを示している。ΔE3Bコンフィギュレーションはより大きなE3欠失を包含するため、フォワードに進むrCAdV−2を有する導入遺伝子発現カセットの生成に最適なデザインになった。このより大きな欠失は、E3領域の実質的に全て、例えば、E3領域の約82%が、ウイルスレスキューに悪影響を与えることなく欠失され得ることを示す。
(例5)
CMVプロモーターを含むE3欠失/挿入発現カセットの構築
HCMV−IEおよびCMV5プロモーターの生成:
ヒトサイトメガロウイルス前初期プロモーター(hCMV−IE)(配列番号3)の3’末端の増幅を、プライマー対hCMV−IE 5’F(配列番号5)(5’−TTATTAATAGTAATCAATTACGGGG−3’)/hCMV−IE 3’R(配列番号6)(5’−GCCACCGTACACGCCTACCGCCC−3’)およびテンプレートとしてのBAC DNA EHV−gG(10ng)を用いて、以前に記載したようにPCRによって実施した。得られたDNA断片を、その後、pCR(商標)BluntII TOPO(登録商標)ベクター(ThermoFisher Scientific)にクローニングし、制限酵素Kpn−1およびBamH−1による消化によって切り出し、CAdVトランスファープラスミドのさらなる操作および構築のために、pUC18ベースのプラスミドシャトルベクターにさらにクローニングした。ヒトCMV5プロモーター(配列番号4)を、それぞれ5’−3’Spe−1およびBamH−1制限部位を有するGenScript(登録商標)遺伝子合成産物を用いて合成し、CAdVトランスファープラスミドのさらなる操作および構築のために、pUC57大腸菌シャトルベクターにクローニングした。
CMVIEおよびCMV5プロモーター活性の比較:
文献での報告は、CMVieプロモーターと対比してCMV5プロモーターによって駆動される哺乳動物導入遺伝子発現カセットからのより強いタンパク質発現を示している。CMV5プロモーターは、CMVie転写開始部位の下流に、スプライスドナー部位およびアクセプター部位に挟まれたアデノウイルス主要後期エンハンサーとともにヒトアデノウイルス5型(HuAd5)アデノウイルストリパータイトリーダーをコードする約560bpのDNAを含有する点で、CMVieプロモーターとは異なる(Massie et al., 1995, Improved adenovirus vector provides herpes simplex virus ribonucleotide reductase R1 and R2 subunits very efficiently. Nature Biotechnology 13:602-608)。CMV5プロモーターの使用は、293個の細胞でタンパク質発現を実質的に増加させることが示された(Massie et al., 1998, Inducible overexpression of a toxic protein by an adenovirus vector with a tetracycline-regulatable expression cassette. Journal of Virology 72 (3):2289-2296)。
これらの報告と一致して、CPV VP2を含有する発現プラスミドの一過的なトランスフェクションによる、CMVieまたはCMV5のどちらかによって駆動されるカセットからのタンパク質発現の直接比較は、CMVieプロモーターと対比してCMV5プロモーターによって駆動される哺乳動物導入遺伝子発現カセットからのより強いタンパク質発現を実証する。図7に示すように、トランスフェクトMDCK細胞においてIFAによって検出される、発現構築物からの一過的な発現によるCPV VP2発現の定量によるプロモーター強度の分析を実施した。パネルAでは、CMVieまたはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトしたMDCK細胞のCPV IFAが示される。パネルBは、CMVie、またはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトしたMDCK細胞のCPV VP2 ELISAのヒストグラムである。パネルCは、示されているCMVieまたはCMV5プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現プラスミドをトランスフェクトしたCPV VP2陽性MDCK細胞のMolecular Devices ImageXpress MicroXL定量のヒストグラムである。結果は、CMV5プロモーターが導入遺伝子の強い発現を指示できること、ならびに光学密度IFAおよびFITC陽性MDCK細胞の相対数のいずれに関しても、CMV5からの発現はCMVieプロモーターより大きいことを示している。故にCMV5プロモーターが、CAdV−2発現カセットの転写を駆動するために選ばれた。しかし、CMV5プロモーターを含有するrCAdV−2感染性クローンはいずれも、rCAdV−2のレスキューをもたらさなかった。
表2に示すように、CMV5は、VP2導入遺伝子の強い一過的な発現を駆動したが、CMV5プロモーターを含有するrCAdV−2感染性クローンはいずれも、rCAdV−2のレスキューをもたらさなかった。
CMV5プロモーター配列がrCAdV−2レスキューを妨げている可能性があるかどうかを直接検討するために、CMV5プロモーター、多重クローニング部位(MCS)およびサルウイルス40(SV40)ポリアデニル化(ポリA)配列を含有するDNA断片を、CAdV−2ゲノムのE3領域に組み込んだ。CMV5をCMVie(およびMCS)から区別するDNAの約560bpを除く、ΔE3BにクローニングしたDNAの成分の全てが、以前にレスキューされたrCAdV−2ウイルスの一部である。レスキューの試みは成功せず、CMV5プロモーターがrCAdV−2のレスキューを妨げることを強く示唆した。この結論を支持するために、相同組換えを使用して、この感染性クローン中のCMV5 MCS SV40ポリA領域を「レスキュー可能な」CMVieベースの発現カセットと置き換える、対となる実験をデザインした。
CAdV2ゲノムのΔE3B領域に挿入されたCMV−IE−EGF発現カセット発現カセットを含有するrCAdV−2ΔE3B/CMVie EGFPの生成:
増強緑色蛍光タンパク質(EGFP、Clontech)発現カセット(2.6kb(配列番号7、CMVie EGFP)を有するrCAdV−2を、ウイルスレスキューの評価を促進し、選んだ細胞株および種における向性をin vivoで評価するために生成した。簡単には、CAdV−2ΔE3B標的化CMVie EGFP導入断片(ORF1(5’)の183位で終わりCAdV−2E3 ORF2(3’)の82位で始まる約500bp CAdV−2DNAに隣接された、CMVie駆動EGFP ORFとこれに続くSV40ポリアデニル化配列)を相同組換えに使用して、rCAdV−2ΔE3B/CMVie EGFPを生成した。成功したHRイベントを、約35kbのDNA種の検出によって評価した。PCRコロニースクリーニングを実施して、導入遺伝子発現カセットを含有するクローンを同定した(フォワードP 配列番号8、リバースP 配列番号9)。陽性クローンをアガロースゲル電気泳動によって可視化し、陽性クローンはEFG導入遺伝子カセットに対応する約0.7kb PCR産物を有した。さらに、適切な導入遺伝子挿入および配列を、ILLUMINA(登録商標)MiSeq Sequencer、NextEr_XTライブラリー調製方法、ならびにNexGeneソフトウェア(Softgenetic、バージョン2.3)およびSEQUENCER(登録商標)ソフトウェア(Genecodes、バージョン5.1)を用いた配列分析によって確認した。
rCAdV−2GFPの成功したPme−1消化は、2つの種、すなわち、約32.7kb(rCAdV−2ゲノム)および約2.7kb(PBR322断片)をもたらした。MDCKおよびE1B−MDCK細胞のトランスフェクションは、LIPOFECTAMINE(登録商標)2000トランスフェクション試薬(ThermoFisher Scientific)を用いて達成した。rCAdV−2ΔE3B/CMVie EGFP感染性クローンを、トランスフェクト細胞で蛍光によるGFPシグナルによって示されるように、トランスフェクトMDCKおよびE1B−MDCK細胞から成功裡にレスキューした。ウイルスをトランスフェクト細胞上清/ライセートから回収し、3回連続凍結解凍サイクル(−70℃/37℃)にかけ、フィルター滅菌し、それらをMDCKおよびE1B−MDCKの両方に伝播した。感染細胞を、次いで感染依存的EGFFシグナルについて蛍光顕微鏡法により観察した(データ不図示)。
CMVIE EGFP SV40ポリA導入遺伝子発現カセットは、CAdV2のΔE3Bドメインに成功裡にクローニングされた。組換えウイルスは成功裡にレスキューされ、EGFPは感染後の蛍光顕微鏡分析によって検出することができた。
CMV5プロモーターを有するrCAdV−2 ΔE3Bレスキュー不可能感染性クローンからの増強緑色蛍光タンパク質(EGFP)発現カセットを有するrCAdV−2 ΔE3Bの生成およびレスキュー:
CMV5プロモーターはrCAdV−2レスキューを阻害するという結論を支持するために(上記の「導入遺伝子発現のためのCMV5プロモーターの使用」セクション参照)、相同組換えを使用して、MCS−1感染性クローン中のCMV5 MCS SV40ポリA領域を「レスキュー可能な」CMVieベースの発現カセットと置き換える、対となる実験を行った。簡単には、上記のCAdV−2E3標的化CMVie EGFP導入遺伝子導入断片を相同組換えに使用して、感染性クローンMCS−1−5(MCS−1−5はCMV5プロモーター、小さな多重クローニング部位(MCS)およびSV40ポリアデニル化配列を含有する)からΔE3B rCAdV−2を生成した。MCS−1−5に由来する精製した約2.6Kb EGFP導入断片および線状化rCAV−2感染性クローンDNAを、電気穿孔によりBJ5183大腸菌細胞に同時形質転換し、次いで50mg/mLカルベニシリンを含むLB寒天プレートで選択した。PCRコロニースクリーニングを実施して、導入遺伝子発現カセットを含有するクローンを同定した。成功した相同組換えは、スーパーコイルDNAとして、0.7%アガロースゲルで23.1KbマーカーDNA種とともに流れる、または23.1KbマーカーDNA種より幾分速く流れる約35KbのDNA種をもたらす。陽性クローンをアガロースゲル電気泳動によって可視化した(図4)。感染性クローンDNAのCAV−2 MCS−1−5骨格中のCMVie EGFP SV40ポリA発現カセットの概略図を、図8に図示する。
PmeI消化rCAV−2 MCS−1−5 EGFPウイルスを、LIPOFECTAMINE(登録商標)2000 CDおよび3000を用いてMDCK細胞およびE1B−MDCK細胞にトランスフェクトした。rCAdV−2 MCS−1−5感染性クローンDNAに由来するrCAdV−2ΔE3B/CMVie EGFP感染性クローンは、トランスフェクト細胞で蛍光によるGFPシグナルによって示されるように、トランスフェクトE1B−MDCK細胞からのrCAdV−2のレスキューを成功裡に促進した(データ不図示)。補遺VI(バックグラウンド)において明らかなように、CAdV−2MCS−1骨格に由来するEGFP発現カセットを有するrCAdV−2のレスキューは、rCAdV−2レスキューの阻害がCMV5依存性であり、CMV5中の560bp huAd5 DNA配列に、さらに局在化される(more so is localized)という結論をさらに支持する。
CAdV2ゲノムのΔE3B領域に挿入されたCMV−IE−VP2発現カセット発現カセットを含有するrCAdV−2ΔE3B/CMVie CPV VP2(天然)の生成:
イヌパルボウイルス(CPV)VP2遺伝子を有するrCAdV−2を生成した。簡単には、上記と同様に、CMVie駆動CPV VP2 ORF(配列番号10)を含有するCAdV−2ΔE3標的化導入断片を相同組換えに使用して、VP2発現カセットを含有するΔE3B rCAdV−2を生成した(図9参照)。成功した導入遺伝子組み込みを含有するクローンをPCRスクリーニングによって検出し、1.7kb PCR 産物をアガロースゲル電気泳動によって可視化した。適切な導入遺伝子挿入および配列を、ILLUMINA(登録商標)MiSeq Sequencer、NextEr_XTライブラリー調製方法、ならびにNexGeneソフトウェア(Softgenetic、バージョン2.3)およびSEQUENCER(登録商標)ソフトウェア(Genecodes、バージョン5.1)を用いた配列分析によって確認した。
rCAdV−2GFPの成功したPme−1消化は、2つの種、すなわち、約32.7kb(rCAdV−2ゲノム)および約2.7kb(PBR322断片)をもたらした。rCAdV−2ΔE3B/CMVie CPV VP2感染性クローンを、CAdV−2IFAによって検出されるように、トランスフェクトMDCKおよびE1B−MDCK細胞から成功裡にレスキューした(データ不図示)。VP2タンパク質に対する免疫蛍光抗体染色の欠如によって検出されるように、感染細胞中のCPV VP2タンパク質発現は成功しなかったが、導入遺伝子発現カセットの存在は、PCRによる精製ウイルスゲノムで検出された。
感染細胞および上清から精製したrCAV−2 DNAのPCR分析を使用して、rCAV2ΔE3B/CMVie CPV VP2クローンにおけるCMVie CPV VP2(n)導入遺伝子発現カセットの存在を検証した(図10)。パネルA、pCAV−2対照ウイルス;パネルB、クローン#1;パネルC、クローン#2。パネルD、CMVie CPV VP2(n)トランスファープラスミドによる対照反応。Mは1Kb+ DNAラダーである。パネルE.導入遺伝子発現カセット特異的PCR反応の予測結果。反応1および2は、CAV−2 H−A P VIII、U−exon(配列番号11、配列番号12)およびCVP VP2(配列番号13、配列番号14) に特異的なプライマーを利用する;反応3、4および5は、CPV VP2に特異的なプライマーを利用する(参照パネルE)(配列番号15〜20)。反応7(CAdV−2の陽性反応)は、CAV−2特異的H−A P VIIIおよびU−exonプライマーを使用する(配列番号21、配列番号22)。
したがって、CMVIE CPV VP2(n)SV40ポリA導入遺伝子発現カセットは、CAdV2のΔE3Bドメインに成功裡にクローニングされ、組換えウイルスは成功裡にレスキューされ、VP2配列の存在は確認されたが、VP2タンパク質発現は検出できなかった。
CAdV2ゲノムのΔE3B領域に挿入されたCMV−IE−VP2発現カセットを含有する、rCAdV−2ΔE3B/CMVie CPV VP2(コドン最適化された)の生成:
CAdV−2E3標的化CMVie CPV VP2コドン最適化(co)導入遺伝子導入断片(ORF1(5’)の183位で終わり、CAdV−2E3 ORF2(3’)の82位で始まる約500bp CAdV−2DNAに隣接された、CMVie駆動CPV VP2 ORF(co)とこれに続くウシ成長ホルモン(BGH)ポリアデニル化配列))(配列番号23)をオーバーラップ伸長PCRによって生成し、アーカイブおよび増幅のためにTOPOベクターにクローニングした。構築物を相同組換えに使用してΔE3B rCAdV−2を生成した。
成功した導入遺伝子組み込みを含有するクローンをPCRスクリーニングによって検出し、2.3kb PCR産物をアガロースゲル電気泳動によって可視化した。適切な導入遺伝子挿入および配列を、Sequencer、NextEr_XTライブラリー調製方法、ならびにNexGeneソフトウェア(Softgenetic、バージョン2.3)およびSEQUENCER(登録商標)ソフトウェア(Genecodes、バージョン5.1)を用いた配列分析によって確認した。
rCAdV−2ΔE3B/CMVie CPV VP2(co)感染性クローンを、トランスフェクトMDCKおよびE1B−MDCK細胞から成功裡にレスキューし、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)に直接コンジュゲートされた抗CAdV−2抗体を用いてP1感染細胞で実施したCAdV−2IFAによって実証した(データ不図示)。レスキューウイルスが、CMVie CPV VP2(co)導入遺伝子発現カセットをコードすることを検証するために、P2ウイルスrCAdV−2ゲノムおよびP5 CAdV−2ゲノムを精製した。CAdV−2ゲノムの領域(ヘキソン関連タンパク質VIII(H−A P VIII)およびU−exon)に特異的なプライマーを用いた抽出DNAのPCR分析は、CMVieプロモーターおよびCPV VP2を使用した(データ不図示)。PCR分析は正しいサイズのPCR産物をもたらし、精製P2ウイルスゲノムがCMVie CPV VP2(co)導入遺伝子発現カセットをコードすることを示した。
CAdV2およびCPV VP2に対する抗体を用いたCMVie CPV VP2(co)rCAdV感染細胞のフローサイトメトリー分析を使用して、感染MDCK細胞の発現を検証した。簡単には、懸濁MDCK細胞を12ウェルフォーマットでrCAdV−2および対照rCAdV−2に感染させ、72時間培養した(加湿インキュベーター中、125rpmで37℃、5.0%CO2)。細胞を次いで採取し、PBS、次いでCYTOFIX/CYTOPERM(商標)Fixation/Permeabiliation Kit(BD Biosciences、Cat.#554714)を用いて洗浄し、CYTOFIX(商標)固定液と、これに続く2つのCYTOPERM(商標)透過処理溶液洗浄で処置した。細胞を次いで、FITCコンジュゲート抗CAdV−2または抗CPV VP2抗体(それぞれ、抗CAV2抗体:VMRD、カタログ#CJ−F−CAV−50Xおよび抗CPV VP2抗体:VMRD、カタログ#CJ−F−CPV 50X)とインキュベートし、CYTOPERM(商標)で2×洗浄し、BD Biosciences FACSCANTO(商標)フローサイトメトリーシステムを用いるフローサイトメトリーによって分析した。
図11は、CMVie CPV VP2(co)rCAdV感染MDCK細胞のフローサイトメトリー分析からの結果を示す。パネルA〜Fは、シグナル細胞に存在するシグナルのヒストグラムである。懸濁MDCK細胞を、BRSV F(co)(パネルBおよびE)発現カセットを有するrCAdV−2対照ウイルスに感染させ、またはCPV VP2(co)(パネルCおよびF)発現カセットを有するrCAV−2に感染させ、FITCコンジュゲート抗CPV VP2(パネルA、BおよびC)抗体またはFITCコンジュゲート抗CAV2(パネルD、EおよびF)抗体のいずれかで感染後72時間に染色した。パネルGは、図11にみられる結果のまとめおよび定量である。抗CAV−2による染色の結果は、rCAV2−BRSV F(co)またはrCAV2−CPV VP2(co)感染(図1、それぞれパネルEおよびF)MDCK細胞のほとんどがCAdV2タンパク質を発現するが、非感染細胞(図1、パネルD)は実質的にCAdV−2陰性であることを示している。抗CPV VP2抗体による染色(図1、パネルA、BおよびC)は、いくらかのバックグラウンドシグナルが、抗CPV VP2抗体による非感染およびrCAV2−BRSV F感染細胞(それぞれ、パネルAおよびB)で観察されるものの、rCAV2−CPV VP2感染MDCK細胞(パネルC)のみがCPV VP2タンパク質を発現することを示している。
故に、CMVie CPV VP2コドン最適化(co)導入遺伝子発現カセットは、CAdV2のΔE3Bドメインに成功裡にクローニングされた。組換えウイルスは、トランスフェクトMDCK細胞からレスキューされ、導入遺伝子発現カセットは、精製ウイルスゲノムで検出された。CPV VP2 mRNAが感染細胞で検出され(データ不図示)、感染細胞でのCPV VP2のタンパク質発現が、天然のVP2発現カセットとは対照的にフローサイトメトリー分析によって確認された。
CAdV2ゲノムのΔE3B領域に挿入されたコドン最適化ウシ呼吸器合胞体ウイルス融合タンパク質発現カセットを有するrCAdV−2 ΔE3Bの生成:
簡単には、ORF1(5’)の183位で終わり、CAdV−2E3 ORF2(3’)の82位で始まる約500bp CAdV−2DNAに隣接された、CMVie駆動CPVウシ呼吸器合胞体ウイルス(BRSV)融合(F)タンパクORFとこれに続くBGHポリアデニル化配列を含有するCAdV−2E3標的化導入断片を相同組換えに使用して、ΔE3B rCAdV−2を生成した(配列番号27)。BRSV F遺伝子の天然(n)およびコドン最適化(co)バージョンの両方を、CAdV−2ベクターバックグラウンドにクローニングし、導入遺伝子の両方のバージョンを有するウイルスを成功裡にレスキューした。しかし、BRSV F(co)遺伝子のみを下流の適用に使用した。
rCAdV−2ΔE3B/CMVie BRSV F(CO)感染性クローンは、ウイルス上清/細胞ライセートに感染した細胞のCPEによって示されるように、MDCK細胞から成功裡にレスキューされた。導入遺伝子発現カセットの存在は、精製ウイルスゲノムで検出された。DNAをP3 rCAV2−BRSV F(co)ウイルスから抽出し、PCR分析のテンプレートとして使用して、ウイルスゲノム中のBRSV F(co)遺伝子の存在を検出した。導入遺伝子を配列決定して遺伝子配列を確認した。
感染細胞によるBRSV Fの発現を、フローサイトメトリー分析によって確認した(図11参照)。
CAdV2ゲノムのΔE3B領域に挿入された狂犬病糖タンパク質(n)発現カセットを有するrCAdV−2 ΔE3Bの生成:
簡単には、ORF1(5’)の183位で終わり、CAdV−2E3 ORF2(3’)の82位で始まる約500bp CAdV−2DNAに隣接された、CMVie駆動パスツール株狂犬病糖タンパク質(RabGP)ORFとこれに続くBGHポリアデニル化配列を含有するCAdV−2E3標的化導入断片を相同組換えに使用して、ΔE3B rCAdV−2を生成した(配列番号25)(参照図13)。天然のパスツール狂犬病G遺伝子を、アライグマポックスベースの狂犬病ワクチン(rRCNV狂犬病G2ワクチン)、Lot #D015−054−)からPCR増幅した。増幅RabGP DNAの予測サイズは約1.6Kbである。
RabGP 断片を、次いでpUC18−B−Bf1b−CO断片にライゲートし、TOP10大腸菌に形質転換した。RabGP DNAのPCRコロニースクリーニングを、RabGP特異的プライマーを用いて実施した(データ不図示)。
DNAを、導入断片(約3.45Kb)を遊離させるPmeI、およびベクター骨格を切断するScaIで消化して、導入断片の同定を促進した。精製した約3.45Kb PmeI CMVie RabGP(n)導入遺伝子(発現カセット)導入断片、および線状化rCAV−2感染性クローンDNAを、電気穿孔によりBJ5183大腸菌細胞に同時形質転換し、次いで50μg/mLアンピシリンを含むLB寒天プレートで選択した。PCRコロニースクリーニングを実施して、導入遺伝子発現カセットを含有するクローンを同定し、アガロースゲル電気泳動によって可視化した(データ不図示)。
PmeI消化HRクローンDNAを、LIPOFECTAMINE(登録商標)2000 CDを用いてE1B−MDCK細胞にトランスフェクトした。rCAdV−2ΔE3B/CMVie RabGP感染性クローンを、図14に示されたCAdV−2IFAによって示されるように、トランスフェクトE1B−MDCK細胞から成功裡にレスキューし、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)に直接コンジュゲートされた抗CAdV−2抗体を用いたrCAV−2 RabGP P2ウイルス感染EIB-MDCK細胞のCAdV−2IFAは、抗RabGおよびCAdV−2免疫蛍光(パネルBおよびC、感染後48および72時間)の両方によるrCAdV−2レスキューを確認する。
図14、パネルBおよびCの蛍光(CAV−2+およびRabG+)細胞によって示されるように、rCAV−2 RabGP E2およびE3ウイルスに感染したE1B−MDCK細胞は狂犬病Gを発現した。しかし、RabG+細胞数は、CAdV−2+細胞よりかなり少ないようである。
Figure 2019531724

表2にまとめられているように、トランスフェクトMDCKまたはE1B−MDCK細胞からのrCAdV−2のレスキューを促進しなかった多くのΔE3Bベースの感染性クローンが生成された。これらには、CPV VP2、およびCMV5プロモーターによって駆動される導入遺伝子発現カセットを含有する狂犬病G、ヌクレオチド配列がコドン最適化された狂犬病糖タンパク質Gを含有するクローン(SAD P5/88株との76%同一性、およびクローンs containing the hMGFP(緑色)(Promega)およびMCherry(赤色)(Clontech)蛍光タンパク質レポーター構築物(データ不図示)が含まれる。
天然および最適化されたコドン配列の両方が、BRSV FおよびCPV VP2を有するrCAdV−2のレスキューを促進したことから(上記表2参照)、同程度のサイズのインサート間で比較した場合、この変動性は単にコドン最適化の現れということではない。実際に、天然のhMGFPおよびMCherry ORFを有するrCAdV−2感染性クローンも、rCAdV−2レスキューを促進しなかった(データ不図示)。まとめると、データは、CAdV−2ベクタープラットフォームの文脈でのCMVプロモーターの使用は予測不可能であること、およびプロモーターの選択は、rCAdV−2クローンのレスキューに大きな影響を与える可能性があるため、発現カセットの構築において重要な検討事項であることを示唆した。
(例6)
EHV4プロモーターを有する発現カセット
新しいウマ由来プロモーターの同定および構築:
ウマヘルペスウイルス4型(EHV4)由来の新規の異種のウマプロモーターを同定および単離した。2つのプロモーター:(1)糖タンパク質G(gG)をコードするORF70の600bp EHV−4 gGプロモーター(4pgG600)(配列番号29)、および(2)主キャプシドタンパク質(MCP)をコードするORF42の600塩基対EHV−4 MCPプロモーター(4pMCP600)(配列番号30)が対象となった。糖タンパク質G遺伝子(orf70)は、複製サイクルの初期および後期に活性である(Colle et al. 1995、Drummer et al. 1998)。主キャプシドタンパク質は、ビリオンの最も豊富な構成成分の1つであり、新しく合成されたウイルスDNAのパッケージングの準備ができるとすぐに細胞核でのキャプシドのアセンブリーに必要とされる。したがって、そのプロモーターは、ウイルス複製サイクルの初期および後期に活性であると予測される。CAdV骨格のサイズ制限を気にして、両方のEHV−4プロモーター配列をそれらの元々の長さのおよそ75%にトランケートした。特に、600bp 4pgG600プロモーターは、430bpにトランケートしてプロモーター断片p430(配列番号31)を、600bp 4pMCP600プロモーターは、455bpにトランケートしてプロモーター断片p455(配列番号32)を生成した。
rCAdV−2ワクチンウイルス感染細胞によるウイルス様粒子(VLP)の生成は、イヌアデノウイルス(CAdV−2)ワクチン有効性に重要な因子あり得る。上記に詳述したように、CMVie駆動CPV VP2発現カセットを含有するrCAdV−2はレスキューすることができたが、rCAdV−2 CMVie CPV VP2感染細胞での実質的なVP2発現(VLP生成のための)は、従来のCMVieプロモーターを用いて達成することはできなかった。さらに、CMV5プロモーターを含有するrCAdV−2 VP2ウイルスはレスキューすることができなかった。したがって、目的の抗原の強い安定な再現可能な発現を駆動できる上記の同定された特徴を有する新しいプロモーターを使用することが対象となった。
EHV−4 P CPV VP2(co)を含有するCAdV−2トランスファープラスミドの生成BamHI:KpnI/EHV−4 P DNAの生成:
EHV−4プロモーター断片gG430およびMCP455を、以下のオリゴヌクレオチド対、すなわち、それぞれ
gG430 F:TTTAAAGGTACCTCTATTTGAGGACCCGCCGAGTACC(配列番号33);
gG430 R:AAATTTGGATCCAACTGCAGCTTATCACAGCTTTACAGGTGG(配列番号34)
MCP455 F:TTTAAAGGTACCACTGGTGGTAGCATATACTACCTTTATTTATACGC(配列番号35);
MCP455 R:AAATTTGGATCCGATCCTATGGTAGCGGTAAAACACCG(配列番号36)を用いて勾配PCR増幅した。
増幅されたgG430およびMCP455 DNAの予測サイズは、それぞれ454および479bpである。
ΔE3Bにおける成功した組み込みおよびrCAV−2のレスキューに使用した、以前に調製したCAdV−2トランスファープラスミド(上記に詳述した)を、CMVieプロモーターとEHV−4プロモーターとのBamHI/KpnIベースの交換によってCPV VP2トランスファープラスミドを含有するEHV−4プロモーターのベースとして使用した。
「非スプライシング」(配列番号37)および「Gen0.95」(配列番号38)と命名された2つの異なるコドン最適化CPV VP2配列を使用して、CMVieによって駆動される発現カセットを含有するCAdV−2トランスファープラスミドを調製した。Gen0.95は、コドン適合指数(CAI)0.95を有するGenscriptから入手したコドン最適化CPV VP2配列である。スプライス部位ファインダーアルゴリズム(2013/2014(著作権)Human Splicing Finder−Ghadi Rai;Inserm UMR_S910−Aix Marseille Universite、27 Boulevard Jean Moulin、13385 Marseille Cedex 05によってデザインされた)によるGen0.95の分析は、43個の潜在的なスプライスドナー部位の存在を示唆した。89ヌクレオチド変化(Gen0.95に対して5.07%配列変化)を作成して、アミノ酸配列を変えない、またはイヌ種に基づく最も好ましくはコドンを生成する40個のスプライスドナー部位を排除した。
上記の2つのVP2配列を含有する精製した約3.5Kb PmeI EHV−4 P CPV VP2(co)導入断片、および線状化rCAV−2感染性クローンDNAを、相同組換えのために電気穿孔によりBJ5183 大腸菌細胞に同時形質転換した。インタクトなクローンを50μg/mLアンピシリンを含むLB寒天プレートで選択した。適切な組み込みサイズおよび配向を有するクローンをPCRスクリーニングによって同定し、選択し、拡大させた。
pCAV−2感染性クローンの成功したPmeI消化は、約33.5(pCAV−2ゲノム)および約2.7(pBR322断片)KbのDNA種をもたらす。PmeI消化感染性クローンを、LIPOFECTAMINE(登録商標)3000を用いてE1B−MDCKおよびMDCK細胞にトランスフェクトした。pCAV2ΔE3B/pgG430−VP2(非スプライシング)(配列番号39)、pCAV2ΔE3B/gG430−VP2(Gen0.95)(配列番号40)またはpCAV2ΔE3B/p455−VP2(Gen0.95)(配列番号41)と命名された継代1(P1)から継代7(P7)ウイルスを、3回連続凍結解凍サイクル(−70℃/37℃)にかけたトランスフェクト細胞上清/ライセートから回収し、フィルター滅菌し、次いでE1B−MDCK細胞に伝播した。
CAdV−2およびCPV VP2タンパク質発現に関する免疫蛍光アッセイ(IFA)のために、AI−ST細胞を選んだrCAdV−2に感染させた。感染72時間後、細胞をCYTOFIX/CYTOPERM(商標)Fixation/Permeabilization Kit(BD Biosciences、Cat. #554714)で固定し、Cytofix(商標)固定液とそれに続く2つのCYTOPERM(商標)透過処理溶液洗浄で処置した。細胞を次いでFITCコンジュゲート抗CAdV−2または抗CPV VP2抗体(それぞれ、抗CAdV2抗体(mAb):VMRD、カタログ#CJ−F−CAV−50Xおよび抗CPV VP2抗体:VMRD、カタログ#CJ−F−CPV 50X)とインキュベートし、CYTOPERM(商標)で2×洗浄し、BD Biosciences FACSCANTO(商標)Flow Cytometry系を用いてフローサイトメトリーによって分析した。
CAdV−2およびCPV VP2タンパク質は、CPV VP2の2つの異なるヌクレオチドバリアントを有するrCAdV−2を感染させたAI−ST 2015細胞のかなりの割合において、IFAによって容易に可視化され、FCによって検出される(DesplおよびGen0.95、感染後48時間および72時間)。かなりのCPV VP2タンパク質が、ドットブロットによって組織培養上澄み液/ライセート(凍結/解凍後)で同定された(アセンブルしたVLPの存在を非常に反映しているようである)。
図19の結果は、CAV−2およびCPV VP2タンパク質が、感染AI−ST細胞のIFAによって容易に可視化される(ただし、無関係のBRSV導入遺伝子をコードするrCAdV−2に感染した細胞では可視化されない)ことを示す。これは、gG430およびMCP455 EHV−4プロモーターの両方によって駆動された非スプライシングおよびGen0.95 CPV VP2(co)配列バリアントの両方からの強いCPV VP2発現を示している(図19A参照)。CPV VP2発現は、元々のrCAdV−2 CMVie CPV VP2に感染した細胞の3%未満で検出され(図15参照)、新しいEHV4由来プロモーターp430およびp455によって駆動されるCPV VP2発現カセットを有するrCAdV−2を成功裡にレスキューすることができたことを示した。驚くべきことに、gG430およびMCP455 EHV−4プロモーターによって駆動されるCPV VP2発現は、CMV5プロモーター配列がΔE3B位置で利用されたCAdVベクター(この場合、ウイルスレスキューは成功しなかった)と比較して、感染細胞の14%〜36%で検出された(図16参照)。
感染細胞における導入遺伝子発現を分析するためにドットブロット分析を行なった。簡単には、感染AI ST(rEHV−1の)およびE1B MDCK(rCAdV−2の)細胞由来の清澄化した(6000×g、5分)組織培養上清/ライセート(凍結/解凍)を装置への添加前にPBSで段階希釈し、吸引によってPVDFに吸着させた。次のステップは、TBST中の5.0% BioRad Blotting Grade Blockerに30分暴露され、一次抗体に1.0時間暴露され、TBSTで3回洗浄され、ペルオキシダーゼ−コンジュゲート二次抗体(抗マウスおよび抗ブタ、Jackson ImmunoResearch)に1.0時間暴露され、TMBによって可視化される。定量のため、ドットブロットは、ImageJソフトウェアを使用して分析された(Burger, W., Burge, M.J. (Eds.), 2008. Digital Image Processing: An algorithmic introduction using Java. Springer-Verlag, New York)。画像カラーは、反転されてバックグラウンドを引き、記録された各ドットの密度を統合される。値は、以下のように+および−表記で割り当てられる:「++++」=>800000、「+++」=500000〜800000、「++」=300000〜499999、「+」=120000〜299999、「+/−」=80000〜119999、および「−」=<80000。
図17に見られるように、強力なCPV VP2タンパク質シグナルが、CPV VP2に対するEHV−4プロモーター駆動発現カセットをコードするrCAdV−2によって感染した細胞由来の組織培養上清/ライセートで観察されたが、無関係の発現カセットをコードするrCAdV−2に感染した細胞由来の試料ではシグナルは検出されなかった。これらの結果は、かなりのCPV VP2タンパク質が組織培養上清において同定されたことを示している。これらの結果は、アセンブルされたCPV VP2 VLPの存在を反映している可能性が極めて高い。これは、CMVie駆動CPV VP2シグナルが、バックグラウンドレベル以下であり、陰性対照(CAdV−2、rCAdV−2 CMVie BRSV F感染細胞および非感染細胞由来の細胞培養上清/ライセート)由来の上清/ライセートに匹敵することをドットブロット分析が示した、元々のrCAdV−2 CMVie CPV VP2とは対照的であった。
図17に見られるように、VP2タンパク質は上清で認識することができ、それ故に、免疫原性に必要なコンフォメーションにあると予測される。重要なことに、上記のように組換えCAdV−2のレスキューは、導入遺伝子がCMV5プロモーター配列によって駆動されるクローンでは達成されなかった。したがって、本発明の新しいEHV−4由来プロモーター配列、例えばp430およびp455は、導入遺伝子の発現を促進するだけでなく、ウイルスレスキューの重要なステップも支持する。
EHV−4プロモーターCPV RabG(n)を含有するCAdV−2トランスファープラスミドの生成:
第2のCAdV−2構築物は、本発明の新しいEHV−4由来p455プロモーターを使用して生成された。感染細胞による発現が従来のCMVieプロモーターを使用して観察されなかったため、rCAdV−2 RabG(n)が選択された。
この実験の目的は、rCAdV−2 p455 RabG(n)−感染AI−ST 2015細胞によるEHV−4プロモーター駆動RabGタンパク質発現の測定によって、第2の導入遺伝子、RabG(膜タンパク質)を有するrCAdV−2に関して新しいEHV−4プロモーターの活性を確認することであった。
RabG(n)配列を、上記に論じたようにレスキューされたrCAV−2 CMVie RabG(n)(配列番号25)から単離した。ATG開始コドンのすぐ5’側のKozak配列を含む1596bp RabG(n)配列を、BamHIおよびSalI(それぞれ5’および3’)制限エンドヌクレアーゼで切り出し、gG430プロモーターおよびMCP455プロモーターを含むBamHI/SalI切断rCAdV導入断片にライゲートし、次いでTOP10大腸菌に形質転換した。
精製した約3.3Kb PmeI EHV−4 P RabG(n)導入断片および線状化rCAV−2感染性クローンDNAを、相同組換えのために電気穿孔によりBJ5183大腸菌細胞に同時形質転換した。インタクトなクローンを50μg/mLカルベニシリンを含むLB寒天プレートで選択した。PCRコロニースクリーニングを実施して、EHV−4 pG430/RabG(n)(配列番号42)およびEHV−4 p455/RabG(n)(配列番号43)クローンを同定した。クローンをRabG DNAに特異的なプライマーでスクリーニングし、アガロースゲル電気泳動によって可視化した。予測されたDNAは1501bpである。
PmeI消化感染性クローンを、LIPOFECTAMINE(登録商標)3000を用いてE1B−MDCKおよびMDCK細胞にトランスフェクトした。pCAV2ΔEB3/gG430またはMCP455 RabG(n)と命名された継代1〜7(P1〜P7)ウイルスを、3回連続凍結解凍サイクル(−70℃/37℃)にかけたトランスフェクト細胞上清/ライセートから回収し、フィルター滅菌し、次いでE1B−MDCK細胞に伝播した。
IFAおよびフローサイトメトリーは、rCAdV−2感染AI−ST 2015細胞におけるRabGのEHV−4プロモーター駆動発現を評価するために用いられた。CAdV−2タンパク質発現は、抗CAdV−2 FITCコンジュゲートブタポリクローナル抗体(VMRD)によってプローブされた。RabGタンパク質発現は、マウスモノクローナル抗体(Novus)によってプローブされた。CAdV−2およびRabGタンパク質は、RabG(n)を有するrCAdV−2を感染させたAI−ST 2015細胞において、IFAによって容易に可視化され、FCによって検出される(感染後72時間で)。
図18の結果は、CAV−2およびRabGタンパク質が、選んだrCAdV−2およびrEHV−1によって感染したAI−ST 2015細胞においてフローサイトメトリー分析により容易に検出されることを示している。これらの結果は、MCP455 EHV−4プロモーターによって駆動されるRabGのかなりの発現を実証するものである。対照的に、RabGは、rCAdV−2 p455 RabGに感染した細胞で容易に検出されるが(図19BおよびC参照)、発現は、元々のrCAdV−2 CMVie RabGに感染した細胞の<2.0%で検出される(図18参照)。
結論として、gG430およびMCP455 RabG(n)SV40ポリA導入遺伝子発現カセットは、CAdV−2のΔE3Bドメインに成功裡にクローニングされた。組換えウイルスは、ウイルス感染細胞におけるCPEによって示されるようにトランスフェクトE1B−MDCK細胞からレスキューされた。感染AI−ST 2015およびBIVI 2011 MDCK細胞におけるrCAdV−2によるRabG導入遺伝子のMCP455プロモーター駆動発現が、IFAおよびフローサイトメトリーによって確認された。
(例7)
rCAdV−CMV/CPV VP2を含む医薬組成物(ワクチン)の調製:
イヌパルボウイルス(CPV)は、毒性、宿主、および環境因子によって高い罹患率および死亡率の原因となり得る高度に伝染性のウイルスである。過去30年にわたって、MLVおよび死滅ウイルスワクチンを利用する、イヌのための有効なワクチンプログラムの使用は、死亡率を大幅に低下させた。CPVは、キャプシドを形成する2つの構造タンパク質(VP1およびVP2)を有する非エンベロープ一本鎖DNAウイルスである。VP2は、ウイルス病原性および宿主免疫応答と関係していることが公知であり、したがって、組換えCAdV2系における組み込みおよび発現のための本発明者らの最適な標的である。
この試験の目的は、MLV混合ワクチンと比較した実験的rCAV2−CPV VP2ワクチンの有効性の予備的評価を実施することであった。MLV混合は、確立された最小免疫量と、特定の抗原ごとに現在の製品で確立されているような各分画の放出用量の間のレベルでブレンドされたヌアデノウイルス2型(CAV2)、イヌジステンパーウイルス(CDV)、およびイヌパルボウイルス(CPV)を含有した。
この試験では、CAdV−CPV VP2ベクターワクチンがCPVチャレンジに対して防御を提供するかを決定するために、rCAV2−CPV VP2を3週間空けた2回投与レジメンで6〜7週齢の子犬に投与した。現在、MLVワクチンがCPVおよびICHに対する防御のゴールドスタンダードであるため、試験群を、CPV、CDV、およびCAdV2を含有するMLVワクチンコンボの、3週間空けた2回投与レジメンを投与した6〜7週齢の子犬と比較した。この群を陽性対照群とみなした。第3の群は、チャレンジ対照としてPBSの3週間空けた2回投与レジメンを投与した。有効性を評価するために、イヌを2回目のワクチン接種のおよそ3週間後にCPV−2bでチャレンジした。
試験ワクチンを、3週間空けた2回投与レジメンで与えられる1ml皮下用量として、6週2日齢〜7週2日齢の12匹の健康なCAV2およびCPV血清陰性イヌに投与した。12匹を以下の通り2つの試験群に分けた:群1 − rCAV2−CPV VP2@8.0log/ml;群2 − MLV混合(CAV2、CDV、CPV)。
リン酸緩衝食塩水(PBS)を、3週間空けた2回投与レジメンで与えられる1ml皮下用量として、6週2日齢〜7週2日齢の6匹の健康なCAV2およびCPV血清陰性イヌの群に投与した。この群は群3とみなされ、試験のチャレンジ対照としての役割を果たした。群1〜3の全ての動物を、22DPV2に毒性CPV−2bで口と鼻にチャレンジした。チャレンジ後の臨床症例データ(臨床徴候、発熱、リンパ球減少症、白血球減少症および糞便中のCPVの検出)を分析した。
ワクチン製剤:
rCAV2−CPV VP2組織培養ストックを、以下に述べる目標用量まで0.01M PBSで希釈した。アジュバントは使用しなかった。MLV陽性対照を製剤化し、SGGK安定剤とともに凍結乾燥した。コンボ中の各抗原は、SOLOJEC(登録商標)製品ラインの最小免疫量より高かった。ワクチンの目標投与量は、以下の通りであった:
Figure 2019531724
チャレンジ材料:
チャレンジ当日、凍結CPV−2bチャレンジ材料の3つのバイアルを、36±2℃の水槽で手でバイアルを撹拌して急速解凍した。材料を次いで、細胞培養培地に所望の濃度まで1:10希釈した。チャレンジ接種材料は、調製およびチャレンジ手順の間中常に氷上に残っていた。
ワクチン抗原滴定:CAV2−CPV VP2
簡単には、ワクチンの10倍段階希釈物を作成した。各希釈物を、Madin−Darbyイヌ腎臓(MDCK)細胞を2.0×105細胞/mlで播種した96ウェルプレート中5ウェルの各々に、1ウェル当たり100マイクロリットルで添加した。5回の再現をワクチンごとに実施した。プレートを36±1°Cおよび5±0.5% CO2、4±1日間インキュベートした。インキュベーション期間後、プレートを固定し、ベクターのみを染色し、読み取った。力価を、Reed and Muench方法を用いて50%エンドポイントについて計算した。
陽性対照(CPV−CDV−CAdV2)
簡単には、ワクチン10倍段階希釈物を作成した。各希釈物を、適切な濃度の細胞(CPV − 2×105細胞/mlのMDCK、CDV − 2×105細胞/mlのVERO、CAV2 − 2×105細胞/mlのMDCK)を播種した96ウェルプレート中5ウェルの各々に、1ウェル当たり100マイクロリットルで添加した。5回の再現を抗原分画ごとに実施した。プレートを36±1°Cおよび5±0.5%CO2、3〜6日間インキュベートした。インキュベーション期間後、プレートを固定し、直接FAコンジュゲートで染色し、読み取った。力価を、Reed and Muench方法を用いて50%エンドポイントについて計算した。
血清
各イヌからの最大10mLの全血を、血清について0 DPV1に開始して毎週採取した。特定の時点には、以下が含まれた:0DPV1、7DPV1、14DPV1、21DPV1/0DPV2、7DPV2、および14DPV2。血液を凝固させ、1,000〜1,300×gで遠心分離して血清を分離し、少なくとも2アリコートに分注した。血清は、抗体力価の評価まで−20℃以下で保管した。
血清学的分析は、血清中和(SN)アッセイを用いて実施した。SNアッセイを使用してCAV2、CPV−2b、およびCPV−2cに対する血清抗体力価を測定した。
CAdV2血清学的検査のために、簡単には、加熱不活性化血清の段階希釈物を等容量のウイルス懸濁液(50〜300 FAID50)と混合した。血清−ウイルス混合物を36±1℃で1時間インキュベートした。96ウェルマイクロタイタープレートに、次いでMDCK細胞(0.1ml/ウェルで2×105細胞)を播種した。プレートを加湿5+0.5%CO2インキュベーターで5±1日間、36±1℃でインキュベートした。プレートを氷冷アセトンで15±5分間固定し、ウイルスを特異的免疫蛍光によって検出した。免疫蛍光によるウイルスの検出がないことは、SN抗体の存在を示した。SN抗体力価の決定のために、50%中和エンドポイントをReed and Muench方法を用いて計算した。
Figure 2019531724

CPV−2b血清学的検査のために、簡単には、加熱不活性化血清の段階希釈物を等容量のウイルス懸濁液(50〜300 FAID50)と混合した。血清−ウイルス混合物を36±1℃で1時間インキュベートした。イヌ腎臓(DKFD−00)細胞(0.1ml/ウェルで2×105細胞)を、次いで96ウェルマイクロタイタープレートの全てのウェルに添加した。プレートを加湿5+0.5%CO2インキュベーターで6±1日間、36±1℃でインキュベートした。プレートを氷冷アセトンで15±5分間固定し、ウイルスを特異的免疫蛍光によって検出した。免疫蛍光によるウイルスの検出がないことは、SN抗体の存在を示した。SN抗体力価の決定のために、50%中和エンドポイントをReed and Muench方法を用いて計算した。
Figure 2019531724
CPV−2c血清学的検査のために、簡単には、加熱不活性化血清の段階希釈物を等容量のウイルス懸濁液(50〜300 FAID50)と混合した。血清−ウイルス混合物を36±1℃で1時間インキュベートした。96ウェルマイクロタイタープレートに、次いでMDCK細胞(0.1ml/ウェルで7×104細胞/ml)を播種した。プレートを加湿5+0.5%CO2インキュベーターで5±1日間、36±1℃でインキュベートした。プレートを氷冷アセトンで15±5分間固定し、ウイルスを特異的免疫蛍光によって検出した。免疫蛍光によるウイルスの検出がないことは、SN抗体の存在を示した。SN抗体力価の決定のために、50%中和エンドポイントをReed and Muench方法を用いて計算した。
Figure 2019531724
CAdV2、CPV−2bおよびCPV−2c抗体について互いに比較した場合、明確な抗体応答が3群との関連で認められた。
CAdV2−CPV VP2群は、MLV群と比較して7DPV1にはるかに強力なCAdV2抗体応答を示したが、14DPV1までにはこれらの群のGMT値は類似していた。両群の抗体力価は21DPV1までに漸減し、この時点で動物を追加免疫した。追加免疫後、両群の抗体レベルは急上昇し、次いで徐々に安定した。CAdV2−CPV VP2群はMLV群より高い力価で安定した。陰性対照群は、試験の過程を通じてCAdV2抗体陰性のままであった。
2つのワクチン接種群のCAdV2抗体応答とは対照的に、CAdV2−CPV VP2群のCPV抗体応答は2回目のワクチン接種まで最小であり、この時点でCPV抗体力価は7DPV2に急上昇し、次いでCPVによるチャレンジまで安定した。チャレンジ後CAdV2−CPV VP2群の抗体応答は再び急上昇した。MLVワクチンは1回目のワクチン接種に対して十分に応答し、2回目のワクチン接種に対してさらに応答した。MLV群のCPV抗体レベルは2回目のワクチン接種後に安定し、試験のチャレンジ期中、有意な増加を示さなかった。陰性対照動物は、有意なCPV抗体力価を示したチャレンジ期後1回目の採決まで、ワクチン接種期を通じてCPV抗体陰性のままであった。
臨床的観察:
全ての動物を観察し、直腸温を−2、−1および0DPCにベースラインを小数第2位で四捨五入した度数(華氏)について毎日測定した。チャレンジ後、動物を最大14日間、毎日モニタリングし、直腸温および臨床徴候の観察値を測定した。動物ケージは、その日の観察が終了するまで掃除しなかった。
CPVの臨床徴候には、限定はされないが、以下が含まれた:(1)血便−通常、下痢と関連する少なくとも10%の血液を含有する特異的糞便および/または粘液;糞便は典型的には暗赤色色であり、独特の強力な鉄臭を有する、(2)粘液便−少なくとも10%の粘液を含有する特異的糞便は下痢と関連する可能性があり、血液を含有する場合または含有しない場合がある。粘液便は、質感および/または形を有する場合または有さない場合がある、(3)下痢−水っぽい質感のない平たい水たまり、(4)直腸温が、>103.4°Fおよびベースラインの体温より少なくとも華氏1度高ければ、発熱を示した。体温が、99.5°F以下およびベースラインの体温より少なくとも華氏1度低ければ、低体温を示した。
全てのイヌを、チャレンジ後の体重減少/増加の決定のために、0、7および14DPCに小数第2位で四捨五入したキログラム(kg)で体重測定した。全ての体重は体重記録に収集した。
臨床徴候に関して、チャレンジ後の下痢、粘液便、または血便を含むCPV感染に特有のいずれかの臨床徴候のシグナル発生は、動物を臨床徴候陽性として定義した。食欲不振、抑うつ/嗜眠、および嘔吐の存在も、動物をパルボウイルス感染陽性として評価するための補助的基準としての使用で知られている。
この試験では18匹中4匹が、2DPCに下痢または嘔吐を示した。これらの臨床徴候は、3〜4DPCの典型的なCPV発症範囲外であり、チャレンジ中に使用された空腹および/または麻酔法による可能性がある。それらはCPV感染の徴候とはみなされない。
rCAdV2−CPV VP2群(群1)は、6匹中1匹が血性粘液便を1日間示した10DPCまで、感染の徴候を示さなかった。この群の1匹が、以前に述べたようにCPV発症の範囲外である嘔吐の徴候を2DPCに示し、それ故に感染の徴候とはみなされないことが留意されるべきである。
MLV群(群2)では6匹中2匹が、5および7DPCに臨床徴候を示し、イヌ#12は7DPCに粘液便が認められ、イヌ#13は5および7DPCに下痢があった。この群の3匹が、以前に述べたようにCPV発症の範囲外である嘔吐または下痢の徴候を2DPCに示し、それ故に感染の徴候とはみなされないことが留意されるべきである。
陰性対照群(群3)の全てのイヌが、4DPCに始まり11DPCに終わる一連の中程度から重度の臨床徴候(下痢、粘液便、脱水、嘔吐、食欲不振、血便)を示し、4匹はCPVで死亡した(7DPCに3匹、8DPCに1匹)。
発熱:発熱に関して、チャレンジ後の発熱のシグナル発生(≧103.4°Fおよびチャレンジ前のベースラインより少なくとも1度高い直腸温)により、動物を陽性として分類した。
rCAdV2−CPV VP2試験群(群1)は、6匹中3匹で1回の発熱;9DPCに1匹、12DPCに2匹を示した。MLV群(群2)の6匹は発熱を示さなかった。陰性対照群(群3)では、6匹中3匹が4〜5DPCにわたって少なくとも1回の発熱を示した(1匹は2回示した)。6匹中2匹は、7DPCに低体温を示した。
体重:体重減少/増加を週ベースで決定するために、個々の動物ごとの体重を、前の週からの体重を引いて評価した。
rCAdV2−CPV VP2試験群(群1)もMLV試験群(群2)も、7または14DPCに体重減少を示した動物はいなかった。陰性対照群(群3)の全ての動物は、7DPCに0.1〜0.8キログラムにわたる体重減少を示した。14DPCに群3で試験に残っている動物は、7DPCから体重増加を経験した。
リンパ球減少症:リンパ球減少症に関して、チャレンジ後のリンパ球減少症のシグナル発生(チャレンジ前のベースラインの≧50%減少)により、イヌを陽性として分類した。この試験では、rCAdV2−CPV VP2試験群(群1)には、発症が9〜12DPCにわたる少なくとも1回のリンパ球減少症にかかった6匹中3匹が含まれた。MLV群(群2)はリンパ球減少症の徴候を示さなかった。陰性対照群(群3)の全ての動物は、少なくとも1回のリンパ球減少症にかかり、発症は4DPCであった。
白血球減少症:白血球減少症に関して、チャレンジ後の白血球減少症のシグナル発生(チャレンジ前のベースラインの≧50%減少)により、イヌを陽性として分類した。この試験では、rCAdV2−CPV VP2試験群(群1)およびMLV群(群2)は、白血球減少症の徴候を示さなかった。陰性対照群(群3)には、少なくとも1回の白血球減少症にかかり、6DPCに発症した6匹中5匹が含まれた。
糞便試料からのウイルス単離:CPV糞便中ウイルス単離に関して、チャレンジ後の糞便中のCPVウイルスの検出のシグナル発生により、イヌを陽性として分類した。≦1.5Log10FAID50/mlのCPV糞便中ウイルス力価を、CPV糞便中ウイルス単離陰性として記録した。全ての他の記録された力価>1.5Log10FAID50/mlを、CPV糞便中ウイルス検出陽性として分類した。
この試験では、rCAdV2−CPV VP2(群1)群には、8〜14DPCに始まる少なくとも1日のウイルス排出を示した6匹中4匹が含まれた。MLV群(群2)は、検出可能な量の生きたウイルスを排出しなかった。陰性対照群の全ての動物は、3または4DPCに始まり9DPCまで持続する検出可能な量のウイルスを糞便中に排出した。
結果のまとめ:
まとめると、イヌ、6週2日齢〜7週2日齢に、1.0mlの以下のワクチンを0DPV1および21DPV1にワクチン接種した:(群1)rCAdV2−CPV VP2=8.0log/ml、(群2)MLVコンボ− CAdV2/CDV/CPV=4.7/2.6/3.9log/ml、(群3)PBS対照。全てのワクチン接種イヌを、22DPV2に毒性CPV−2bで口と鼻にチャレンジした。
rCAdV2−CPV VP2試験ワクチンは、2回投与レジメンで1回投与当たり8.0logで与えた場合、有効性基準を満たさなかった。イヌ3匹は発熱、糞便へのCPV排出およびリンパ球減少症を示し、イヌ1匹はイヌパルボウイルス確定的な臨床徴候を示した。イヌ4匹はCPVの排出のみを示した。ワクチンは、およそ10DPCまで初期の防御を提供するようであった。これは、陰性対照と比較して感染の臨床徴候の発症遅延である。1つワクチン接種には、原因不明の完全な角膜混濁が報告された。
(例8)
rCAdV−EHV−4 p430/RabG(n)を含む医薬組成物(ワクチン)の調製:
rCAdV−EHV−4 p430/RabG(n)ワクチンを含む医薬組成物(ワクチン)の調製:
ワクチン製剤:
rCAdV−EHV−4 pp430/RabG(N)組織培養ストックを、目標用量まで0.01M PBSで希釈した。アジュバントは使用しなかった。
rCAdV−EHV−4 P430/RabG(n)を用いたブタの接種および血清学的応答の評価:
試験デザイン:4〜8週齢のワクチン接種子ブタ群および対照群、投与(単回/2回)は筋肉内に2ml/回であった。
ベクターワクチンとしての特性を若齢子ブタで調査するために、rCAdV−EHV−4 P(GG430)RABG(N)C1をワクチン接種−血清学的検査試験で試験した。
詳細には、子ブタにrCAdV−EHV−4 p430/RabG(N)C1を試験0および21日目に6.7logの用量で2回ワクチン接種した(2ショットワクチン接種、2×rCAdV)。非ワクチン接種群は陰性対照としての役目を果たした。
血清学的検査:ワクチン接種後の血清転換を測定するためのアッセイ
ワクチン接種後のCAdV−2中和抗体の導入を、rCAdV−2 p430 RabGワクチンを1回または2回ワクチン接種された動物由来の血清で試験した。ワクチン接種動物は、CAdV2に対して検出可能なウイルス中和(VN)力価を示したが、非ワクチン接種群由来の血清は、検出可能なCAdV−2中和抗体レベルがなかった(表2)。カンザス州立大学狂犬病研究所による血清で実施した迅速蛍光焦点抑制試験(RFFIT)は、ワクチン接種動物12匹中3匹で検出可能なRFFIT力価を示し、狂犬病中和抗体を測定する対照群では検出可能なRFFIT力価はなかった。ELISAによる全狂犬病抗体試験およびCAdVウイルス排出も試験した。
Figure 2019531724
これらの結果は、目的の導入遺伝子の有効な発現を実証することによる(ワクチンウイルスの何割が感染細胞での目的の導入遺伝子の発現をもたらすかの発現評価による)CAdVベクターにおける本発明のEHV−4プロモーターの有用性、ならびにウイルスレスキュー、およびワクチン接種動物における導入遺伝子の免疫原性を確認するものである。発現評価は、CMVプロモーターによって駆動される発現カセットを有するCAdVベクターでは可能でさえなかった。本明細書において開示され、特許請求されている組成物および方法は全て、本開示に照らして、過度な実験を伴わずに作製および実行することができる。本発明の組成物および方法は好ましい実施形態に関して記載されているが、本明細書に記載の組成物および方法ならびに方法のステップまたは一連のステップに、本発明の概念、趣旨および範囲から逸脱することなく変形を適用することができることが当業者には明らかになろう。より詳細には、化学的にかつ生理的に関連する特定の薬剤で本明細書に記載の薬剤を置換することができるが、同じまたは同様の結果が実現されることが明らかになろう。当業者に明らかであるそのような同様の置換および修飾は全て、以下の特許請求の範囲によって定義される本発明の趣旨、範囲および概念の中にあるとみなされる。
(参考文献)
以下の参考文献は、それにより本明細書に記載のものを補足する例示的な処置上のまたは他の詳細が提供される限りでは、明確に参照により本明細書に組み込まれる。

Figure 2019531724

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Claims (36)

  1. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターと作動可能に連結された少なくとも1つの異種DNAをコードする発現カセットを含む組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクター。
  2. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターが、4pgG600(配列番号29)もしくは4pMCP600(配列番号30)またはその相補的なヌクレオチド配列またはその機能的断片もしくは機能的誘導体またはその相補的なヌクレオチド配列を含み、前記プロモーター配列が異種抗原の発現をもたらす、請求項1のrCAdVベクター。
  3. プロモーター配列の機能的断片または誘導体が、少なくとも80%、85%の配列同一性、好ましくは90%、91%、92%、93%、94%の配列同一性、より好ましくは95%、96%、97%、98%、99%、99.9%の配列同一性を有する、請求項2のrCAdVベクター。
  4. 機能的断片が、4pgG600(配列番号29)のトランケーションまたはその相補的なヌクレオチド配列であり、好ましくは配列同一性が全長にわたって少なくとも72%である、請求項2のrCAdVベクター。
  5. 機能的断片が、4pMCP600(配列番号30)のトランケーションまたその相補的なヌクレオチド配列であり、好ましくは配列同一性が全長にわたって少なくとも78%である(またはより高い)、請求項2のrCAdVベクター。
  6. プロモーター配列の機能的断片または誘導体が、550ヌクレオチド、好ましくは500、490、480、470、460、455、450、445、440、435、434、433、432、431、430ヌクレオチド、最も好ましくは455または430ヌクレオチドの長さを有する、請求項2のrCAdVベクター。
  7. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターが4pgG600(配列番号29)を含む、請求項1のrCAdVベクター。
  8. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターが4pMCP600(配列番号30)を含む、請求項1のrCAdVベクター。
  9. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターがG430(配列番号31)を含む、請求項1のrCAdVベクター。
  10. ウマヘルペスウイルス4(EHV4)プロモーターがgMCP455(配列番号32)を含む、請求項1のrCAdVベクター。
  11. 感染性CAdVとしてパッケージされる、請求項1のrCAdVベクター。
  12. 異種DNAが、目的のエピトープ、生物学的応答調節因子、増殖因子、認識配列、治療用遺伝子、および融合タンパク質からなる群から選択されるポリペプチドをコードする、請求項1のrCAdVベクター。
  13. 異種DNAが目的の抗原エピトープをコードする、請求項12のrCAdVベクター。
  14. 目的の抗原エピトープが、イヌまたはネコ病原体の抗原である、請求項13のrCAdVベクター。
  15. 目的の抗原エピトープが、食品生産動物病原体に由来する抗原である、請求項13のrCAdVベクター。
  16. 目的の抗原エピトープが、モルビリウイルス抗原、狂犬病糖タンパク質、ネコ白血病ウイルス(FeLV)エンベロープタンパク質、免疫不全ウイルス抗原、パルボウイルス抗原、ポックスウイルス抗原からなる群から選択される、請求項14のrCAdVベクター。
  17. 食品生産動物病原体が、ブタ、ウシ、ウマ、家禽、および/またはヒツジ動物に由来する、請求項15のrCAdVベクター。
  18. 食品生産動物病原体が、ウシウイルス性下痢症ウイルス(BVDV)、パラインフルエンザ3ウイルス(PI−3)、感染性ウシ鼻気管炎ウイルス(IBR)、ウシRSウイルス(BRSV)、ウシヘルペスウイルス(BHV)、ウシロタウイルス(BRV)、ウシエンテロウイルス(BEV)、ウシコロナウイルス(BCV)、ウシ狂犬病(BR)、ウシパルボウイルス(BPV)、アデノウイルス、アストロウイルス、マンヘミア・ヘモリチカ(以前はパスツレラ・ヘモリチカ)、パスツレラ・マルトシダ、ヘモフィルス・ソムナス(ヒストフィルス・オビスおよびヘモフィルス・アグニ)、アクチノマイセス(コリネバクテリウム)、アクチノマイセス・ピオゲネス、クラミジア・シッタシ、カンピロバクター・フィタス・ベネレアリスおよびカンピロバクター・フィタス・フィタス(以前はC・フィタス・インテスチナリス)、レプトスピラ・インテロガンス、レプトスピラ・ハージョ、レプトスピラ・ポモナ、およびレプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・カニコーラ、レプトスピラ・グリッポチフォーサ、レプトスピラ・ハージョ(レプトスピラ・ハージョプラジトノおよびレプトスピラ・ハージョボビス)、ブルセラ・アボルタス、ブルセラ・スイスおよびブルセラ・メリテンシス、リステリア・モノサイトゲネス、クラミジア・シッタシ、クロストリジウム・ショウベイ、クロストリジウム・セプチカム、クロストリジウム・ヘモリチクム、クロストリジウム・ノビイ、クロストリジウム・ソルデリ、クロストリジウム・パーフリンゲンス、クロストリジウム・テタニ、モラキセラ・ボビス、クレブシエラ属種、クレブシエラ・ニューモニエ、サルモネラ・ティフィムリウム;サルモネラ・ニューポート、マイコバクテリウム・アビウム・パラツベルクローシス、クリプトスポリジウム・パルバム、クリプトスポリジウム・ホミニス、スタフィロコッカス・アウレウス、ストレプトコッカス・ディスガラクティエ、ストレプトコッカス・ウベリス、ストレプトコッカス・アガラクチア、大腸菌(エスケリキア・コリ)、マイコプラズマ属種、マイコプラズマ・ディスパー、およびウレアプラズマ属種、トリトリコモナス・フィータス、トリコフィトン・ベルコーズム、トリコフィトン・メンタグロフィテス、トリコフィトン・サルキソヴィー、ネオスポラ・カニナム(以前はトキソプラズマ・ゴンディ)、バベシア・ビゲミナおよびバベシア・ボビス、ディクチオカウルス・ヴィヴィパロウス(肺虫症)、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項17のrCAdVベクター。
  19. 食品生産動物病原体が、サルモネラ属種、特にS.ティフィムリウム、S.コレラスイス;アストロウイルス;ロタウイルス;伝染性胃腸炎ウイルス;ブラキスピラ属種、特にB.ヒオディセンテリア、B.ピロシコリ;クロストリジウム属種、特にC.ディフィシル、C.パーフリンゲンスA、BおよびC型、C.ノビイ、C.セプチカム、C.テタニ;ブタ腸管ピコルナウイルス;ブタ腸管カリシウイルス;アクチノバシラス・プルロニューモニエなどの呼吸器病原体;ボルデテラ・ブロンキセプティカ;エリシペロスリクス・ルシオパシエ;ヘモフィルス・パラスイス、特に亜型1、7および14;パスツレラ属種、特にP.マルトシダ;マイコプラズマ属種、特にM.ハイオニューモニエ、M.ヒオリニス;ブタインフルエンザウイルスA型;PRRSウイルス;ブタサーコウイルス;ブタパルボウイルス;仮性狂犬病ウイルス;エペリスロゾーノシス・スイス、マイコバクテリウム属種、特にM.アビウム、M.イントラセルラーレ、M.ボビス;ブタ呼吸器コロナウイルス;ブタコロナウイルス、特にTGEV、PEDV、およびデルタコロナウイルス;アルカノバクテリウム・ピオゲネス;ブタアデノウイルス;豚コレラ;ブタサイトメガロウイルス;アフリカ豚コレラ;または、他の病原体、例えば、大腸菌(エスケリキア・コリ)、ストレプトコッカス属種、特にS.スイス、S.ポルシナス、S.ディスガラクティエ、好ましくは亜種エクイシミリス;ブルセラ・スイス、特に次亜種1、2および3型;レプトスピラ属種、特にL.オーストラリス、L.カニコーラ、L.グリッポチフォーサ、L.ポモナ、L.イクテロヘモラジア、L.インターロガンス、L.タラソビ、L.ハージョ、L.セジュロ;脳心筋炎ウイルス;赤血球凝集脳脊髄炎ウイルス;日本脳炎ウイルス;西ナイルウイルス;レオウイルス;ルブラウイルス;メナングルウイルス;ニパウイルス;水疱性口内炎ウイルス;ブタの水疱性発疹のウイルス:ブタポックスウイルス;ブタヘルペスウイルス;およびスタフィロコッカス・ヒカスを含む他の病原体、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項17のrCAdVベクター。
  20. 請求項1から19に記載の組換えイヌアデノウイルス(rCAdV)ベクター、および薬学的または獣医学的に許容される、許容される担体または希釈剤を含む免疫原性またはワクチン組成物。
  21. 前記担体が経口、皮内、筋肉内、または鼻腔内適用に好適である、請求項20の免疫原性またはワクチン組成物。
  22. a.請求項1から19に記載の組換えrCAdVベクターを宿主細胞に導入するステップ、
    b.好適な条件下で感染細胞を培養するステップ、
    c.感染細胞および/またはベクターおよび/またはウイルス成分を回収するステップ
    を含み、
    d.ステップ(c)の回収物を精製するステップ
    を含んでもよく、
    e.前記回収物を薬学的に許容される担体と混合するステップ
    を含む、感染と関連するまたは感染によって引き起こされる1つまたは複数の臨床徴候の発生率または重症度を低減するための免疫原性組成物またはワクチンを作製する方法。
  23. 好ましくは使用するための、請求項20に記載のワクチンの免疫原性組成物の治療有効量を動物に投与するステップを含む、動物において病原体の感染によって引き起こされる臨床徴候もしくは疾患を低減もしくは予防する方法、または動物において病原体の感染を処置もしくは予防する方法で使用するための方法。
  24. 免疫原性組成物が1回投与される、請求項23の方法。
  25. 免疫原性組成物が2回用量として投与される、請求項23の方法。
  26. 免疫原性組成物が、経口、皮内、筋肉内または鼻腔内投与される、請求項23の方法。
  27. 免疫原性組成物が、同種および/または異種ウイルスチャレンジに対する防御をもたらす、請求項23の方法。
  28. 動物における病原体によって引き起こされる臨床疾患に対する免疫性を前記動物に与える方法であって、請求項20に記載の免疫原性組成物を動物に投与するステップを含み、これにより、前記免疫原性組成物またはワクチンが感染の臨床徴候を引き起こさないが前記病原体の病原体型に対する免疫性を動物に与える免疫応答を誘導することができる、方法。
  29. 免疫原性組成物が1回投与される、請求項28の方法。
  30. 免疫原性組成物が2回用量として投与される、請求項29の方法。
  31. 免疫原性組成物が、経口、皮内、筋肉内または鼻腔内投与される、請求項28の方法。
  32. 免疫原性組成物が、同種および/または異種ウイルスチャレンジに対する防御をもたらす、請求項28の方法。
  33. a.動物にワクチンを投与することができるディスペンサー、および
    b.請求項20に記載の免疫原性組成物またはワクチン
    を含み、
    c.指示リーフレット
    を含んでもよい、動物における病原体に関連する疾患に対して前記動物をワクチン接種するための、および/または、動物における病原体に関連するまたは病原体によって引き起こされる1つまたは複数の臨床徴候の発生率または重症度を低減するための、キット。
  34. 請求項1から19の組換えイヌアデノウイルス2型(rCAdV2)を発現する真核生物の宿主細胞株。
  35. 前記宿主細胞株が、PK/WRL細胞株、RK13細胞株、MDBK細胞株、ST細胞株、AI−ST細胞株、VERO細胞株、Sf9細胞株、Sf21、Sfプラス細胞株、MDCK細胞株、および/またはそれらの派生物からなる群から選択される哺乳動物細胞株または昆虫細胞株である、請求項34の真核生物の宿主細胞株。
  36. 請求項1から19の組換えイヌアデノウイルス2型(rCAdV2)を発現する原核生物の宿主細胞株。
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