JP2018524978A5 - - Google Patents
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Claims (22)
- 第1のマトリックス材料を含むカラム、試料受けチャンバー、温度制御チャネル又はチャンバー、試薬及び/又は緩衝液を含有する複数のチャンバーを含み、使用中は前記チャンバーのうちの少なくとも1つが亜硫酸水素塩試薬を含有しており、前記チャンバーのうちの少なくとも1つが脱スルホン化/溶出緩衝液を含有しており、第2のマトリックス材料を含む第2のカラムを任意選択で含む、核酸のメチル化状態を決定するためのカートリッジ。
- 使用中は、グアニジニウムチオシアネートエタノール(GTC-EtOH)を含む試薬を含有するチャンバーを含む、請求項1に記載のカートリッジ。
- 前記第2のカラムが存在しない、請求項1又は2に記載のカートリッジ。
- 前記温度制御チャネル又はチャンバーが熱サイクルチャネル又はチャンバーである、請求項1から3のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- 前記亜硫酸水素塩試薬が、亜硫酸水素アンモニウム、メタ亜硫酸水素ナトリウム、亜硫酸水素カリウム、亜硫酸水素セシウム、及びDABSOからなる群から選択される化合物を含む、請求項1から4のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- 前記カートリッジが、メチル化特異的PCRプライマー、メチル化特異的PCRプローブ、PCR酵素、及びPCR反応緩衝液からなる群から選択される1つ又は複数の試薬を含有する1つ又は複数のチャンバーを含む、請求項1から5のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- メチル化特異的PCRプライマー、メチル化特異的PCRプローブ、PCR酵素、及びPCR反応緩衝液からなる群から選択される1つ又は複数の試薬を含有する少なくとも2つのチャンバーを含有する、請求項6に記載のカートリッジ。
- 変換されたDNAのフォワード鎖のメチル化を検出するためのプライマー及びプローブを含有する少なくとも1つのチャンバーを含有する、並びに/又は
変換されたDNAのリバース鎖のメチル化を検出するためのプライマー及びプローブを含有する少なくとも1つのチャンバーを含有する、
請求項1から7のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - 前記PCRプライマー、及び/又はプローブ、及び/又は酵素をビーズとして提供する、請求項6から8のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- 前記試料受けチャンバー、前記カラム、前記複数のチャンバー、及び前記温度制御加熱チャネル又はチャンバーが、選択的に流体連結している、請求項1から9のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- 前記試料受けチャンバー、前記カラム、前記複数のチャンバー、及び前記温度制御チャネル又はチャンバーが、マイクロ流体チャネル及び弁によって選択的に流体連結している、請求項10に記載のカートリッジ。
- 前記試料受けチャンバー、前記カラム、前記複数のチャンバー、及び前記温度制御チャネル若しくはチャンバー又は前記温度制御チャネル若しくはチャンバー内へのポートが、中央弁の周りに配置されており、前記中央弁内のチャネルと選択的に流体連結しており、前記中央弁が、前記中央弁と流体連結しているチャンバーから流体を出し入れすることができるプランジャーを収容するように構成されている、請求項10に記載のカートリッジ。
- 使用中は、前記カートリッジが、
試料を含有する第1のチャンバーと、
グアニジニウムチオスルフェート-エタノール(GTC-EtOH)溶液を含有する第2のチャンバーと、
亜硫酸水素塩試薬を含有する第3のチャンバーと、
緩衝液を含有する第4のチャンバーと、
すすぎ溶液を含有する第5のチャンバーと、
溶出/脱スルホン化試薬を含有する第6のチャンバーと
を含むように構成されている、請求項1から12のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - 前記第1のチャンバーがGTC-EtOH-Tween抽出/沈殿試薬中の前記試料を含有する、請求項13に記載のカートリッジ。
- 試料をカートリッジ内に入れる時点若しくはその間近に亜硫酸水素塩試薬をカートリッジに加えるように構成されている、及び/又は
試料をカートリッジ内に入れる時点若しくはその間近にGTC-ETOH-Tween緩衝液を加えるように構成されている、
請求項1から14のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - 亜硫酸水素塩試薬をカートリッジの成分として提供する、及び/又は
GTC-ETOH-Tween緩衝液をカートリッジの成分として提供する、
請求項1から14のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - 前記カートリッジが、PCRプライマー及び/又はプローブ及び/又はPCR酵素を含有する第7のチャンバーを含む、請求項1から16のいずれか一項に記載のカートリッジ。
- 亜硫酸水素塩変換された、メチル化された、及び/又はメチル化されていない配列に特異的なプライマーを含有する1つ又は複数のチャンバーを含む、並びに/或いは
TaqMan PCR反応の試薬を含有する1つ又は複数のチャンバーを含む、並びに/或いは
増幅されたメチル化された配列のマーカーである1つ若しくは複数の蛍光プローブ及び/又は増幅されたメチル化されていない配列のマーカーである1つ若しくは複数の蛍光プローブを含有する、1つ又は複数のチャンバーを含む、
請求項1から17のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - 前記プローブが蛍光レポーター色素及び消光色素を含み、プローブが、Taq DNAポリメラーゼの5'から3'のヌクレアーゼ活性による切断の際にシグナルをもたらす、請求項18に記載のカートリッジ。
- 増幅された目的領域中の異なるメチル化された領域にそれぞれ特異的な複数のプローブを含む、又は
増幅された目的領域中の同じメチル化された領域にそれぞれ特異的な複数のプローブを含む、又は
増幅された目的領域中のメチル化された領域に特異的な単一のプローブを含む、
請求項18又は19に記載のカートリッジ。 - MGMT、RASSF1A、ADAMTS1、BNC1、HIST1H3C、HOXB4、RASGRF2、TM6SF1、及びAKR1B1からなる群から選択される遺伝子のプロモーター領域のメチル化を決定するためのプライマー及び/又はプローブを含有する、並びに/或いは
表5(Table 5)、9(Table 9)、若しくは10(Table 10)に示す1つ若しくは複数のプライマー、及び/又は表5(Table 5)、9(Table 9)、若しくは10(Table 10)に示す1つ若しくは複数のプローブを含有する、
請求項1から20のいずれか一項に記載のカートリッジ。 - メチルトランスフェラーゼについてのRNAの発現レベルを決定するために構成されている、請求項1から21のいずれか一項に記載のカートリッジ。
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| EP3652343A1 (en) * | 2017-07-13 | 2020-05-20 | Yissum Research Development Company of the Hebrew University of Jerusalem Ltd. | Dual-probe digital droplet pcr strategy for specific detection of tissue-specific circulating dna molecules |
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| WO2020252721A1 (en) * | 2019-06-20 | 2020-12-24 | The Johns Hopkins University | Dna methylation markers and their use in differentiation of suspected cancerous lymph node biopsy samples |
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| MX2024008473A (es) * | 2022-01-06 | 2024-07-12 | The Univ Of Chicago | Metodos y composiciones para deteccion y analisis rapidos de metilacion de citosina de arn y adn. |
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Family Cites Families (60)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA1190838A (en) | 1981-07-17 | 1985-07-23 | Cavit Akin | Homogeneous nucleic acid hybridization diagnostics by non-radiative energy transfer |
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| US5494810A (en) | 1990-05-03 | 1996-02-27 | Cornell Research Foundation, Inc. | Thermostable ligase-mediated DNA amplifications system for the detection of genetic disease |
| US5210015A (en) | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
| US5538848A (en) | 1994-11-16 | 1996-07-23 | Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. | Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe |
| EP1958955B1 (en) | 1996-02-09 | 2013-09-04 | Cornell Research Foundation, Inc. | Spatially addressable oligonucleotide arrays and method of making the same |
| AU713667B2 (en) | 1996-04-12 | 1999-12-09 | Phri Properties, Inc. | Detection probes, kits and assays |
| CA2255774C (en) | 1996-05-29 | 2008-03-18 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection of nucleic acid sequence differences using coupled ligase detection and polymerase chain reactions |
| US6312892B1 (en) | 1996-07-19 | 2001-11-06 | Cornell Research Foundation, Inc. | High fidelity detection of nucleic acid differences by ligase detection reaction |
| US5958349A (en) | 1997-02-28 | 1999-09-28 | Cepheid | Reaction vessel for heat-exchanging chemical processes |
| US6251594B1 (en) * | 1997-06-09 | 2001-06-26 | Usc/Norris Comprehensive Cancer Ctr. | Cancer diagnostic method based upon DNA methylation differences |
| WO1999033559A1 (en) | 1997-12-24 | 1999-07-08 | Cepheid | Integrated fluid manipulation cartridge |
| US6027998A (en) | 1997-12-17 | 2000-02-22 | Advanced Micro Devices, Inc. | Method for fully planarized conductive line for a stack gate |
| US6506594B1 (en) | 1999-03-19 | 2003-01-14 | Cornell Res Foundation Inc | Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays |
| US6942771B1 (en) * | 1999-04-21 | 2005-09-13 | Clinical Micro Sensors, Inc. | Microfluidic systems in the electrochemical detection of target analytes |
| CA2373249C (en) * | 1999-05-28 | 2011-08-02 | Cepheid | Apparatus and method for cell disruption |
| US6818185B1 (en) | 1999-05-28 | 2004-11-16 | Cepheid | Cartridge for conducting a chemical reaction |
| US6403037B1 (en) | 2000-02-04 | 2002-06-11 | Cepheid | Reaction vessel and temperature control system |
| CA2410950A1 (en) | 2000-05-30 | 2001-12-06 | Hans-Michael Wenz | Methods for detecting target nucleic acids using coupled ligation and amplification |
| US6605451B1 (en) | 2000-06-06 | 2003-08-12 | Xtrana, Inc. | Methods and devices for multiplexing amplification reactions |
| US20060134643A1 (en) * | 2000-06-19 | 2006-06-22 | Kurt Berlin | Bisulfite conversion of DNA |
| DE10112515B4 (de) | 2001-03-09 | 2004-02-12 | Epigenomics Ag | Verfahren zum Nachweis von Cytosin-Methylierungsmustern mit hoher Sensitivität |
| JP2003144172A (ja) * | 2001-11-16 | 2003-05-20 | Nisshinbo Ind Inc | メチル化検出用オリゴヌクレオチド固定化基板 |
| AU2003236461B2 (en) * | 2002-08-29 | 2009-05-28 | Epigenomics Ag | Improved method for bisulfite treatment |
| US7288373B2 (en) * | 2003-05-02 | 2007-10-30 | Human Genetic Signatures Pty Ltd. | Treatment of methylated nucleic acid |
| EP1692264A2 (en) | 2003-10-28 | 2006-08-23 | The Johns Hopkins University | Quantitative multiplex methylation-specific pcr |
| JP2008513022A (ja) | 2004-09-15 | 2008-05-01 | マイクロチップ バイオテクノロジーズ， インコーポレイテッド | マイクロ流体デバイス |
| US20060068399A1 (en) | 2004-09-24 | 2006-03-30 | Cepheid | Multiple bead reagent system for protein based assays with optimized matrices |
| EP2803734B1 (en) * | 2005-04-01 | 2017-09-20 | Epigenomics AG | Improved bisulfite conversion of DNA |
| US20060286577A1 (en) * | 2005-06-17 | 2006-12-21 | Xiyu Jia | Methods for detection of methylated DNA |
| US9568424B2 (en) * | 2005-06-23 | 2017-02-14 | Biocartis Nv | Cartridge, system and method for automated medical diagnostics |
| JP5049274B2 (ja) | 2005-06-30 | 2012-10-17 | ビオカルティ ソシエテ アノニム | 自動化医療診断のためのカートリッジ |
| WO2007068437A1 (en) * | 2005-12-14 | 2007-06-21 | Roche Diagnostics Gmbh | New method for bisulfite treatment |
| JP5063616B2 (ja) * | 2006-02-03 | 2012-10-31 | インテジェニックス インコーポレイテッド | マイクロ流体デバイス |
| US20090036665A1 (en) * | 2007-07-11 | 2009-02-05 | Gonzalo Domingo | Disposable Sample Processing Unit |
| CN101802223A (zh) * | 2007-08-15 | 2010-08-11 | 香港大学 | 用于高通量亚硫酸氢盐dna-测序的方法和组合物及其用途 |
| WO2009108260A2 (en) | 2008-01-22 | 2009-09-03 | Microchip Biotechnologies, Inc. | Universal sample preparation system and use in an integrated analysis system |
| FR2928659B1 (fr) * | 2008-03-12 | 2012-01-13 | Biomerieux Sa | Procede pour le diagnostic ou pronostic in vitro du cancer du testicule |
| CN101285096A (zh) | 2008-06-03 | 2008-10-15 | 中国人民解放军第二军医大学 | 一种快速检测dna甲基化的方法 |
| US20120252015A1 (en) * | 2011-02-18 | 2012-10-04 | Bio-Rad Laboratories | Methods and compositions for detecting genetic material |
| EP2218793A1 (en) * | 2009-02-13 | 2010-08-18 | Alphagenics International SA | Detection of MGMT methylation in tumors |
| EP2462245B1 (en) * | 2009-08-06 | 2016-10-05 | Cornell University | Device and methods for epigenetic analysis |
| WO2011106314A2 (en) * | 2010-02-25 | 2011-09-01 | Advanced Liquid Logic, Inc. | Method of making nucleic acid libraries |
| GB201004147D0 (en) | 2010-03-12 | 2010-04-28 | Dna Electronics Ltd | Method and apparatus for sensing methylation |
| CN101984069B (zh) | 2010-09-19 | 2012-07-25 | 生工生物工程(上海)有限公司 | 一种快速检测dna甲基化的试剂盒及方法 |
| US20150136604A1 (en) * | 2011-10-21 | 2015-05-21 | Integenx Inc. | Sample preparation, processing and analysis systems |
| EP2841600B1 (en) | 2012-04-27 | 2024-04-24 | Cepheid | Apparatus with heterogeneous processing modules |
| JP6543569B2 (ja) | 2012-05-22 | 2019-07-10 | ザ・ジョンズ・ホプキンス・ユニバーシティ | 定量的多重メチル化特異的ＰＣＲ法−ｃＭｅｔｈＤＮＡ、試薬、及びその使用 |
| WO2013192570A1 (en) * | 2012-06-21 | 2013-12-27 | Gigagen, Inc. | System and methods for genetic analysis of mixed cell populations |
| JP6289473B2 (ja) * | 2012-09-05 | 2018-03-07 | セファイド | 流体解析システムにおけるユニバーサルドッキングベイおよびデータドア |
| CA2886389A1 (en) | 2012-09-28 | 2014-04-03 | Cepheid | Methods for dna and rna extraction from fixed paraffin-embedded tissue samples |
| US20140272967A1 (en) | 2013-03-13 | 2014-09-18 | Abbott Molecular Inc. | Systems and methods for isolating nucleic acids |
| WO2014160117A1 (en) * | 2013-03-14 | 2014-10-02 | Abbott Molecular Inc. | Multiplex methylation-specific amplification systems and methods |
| US9670479B2 (en) * | 2013-03-15 | 2017-06-06 | F Cubed, LLC | Sample preparation device and methods of use |
| GB201316347D0 (en) | 2013-09-13 | 2013-10-30 | Cancer Rec Tech Ltd | Biological fluid filtration assembly |
| KR20150038944A (ko) | 2013-10-01 | 2015-04-09 | 주식회사 바이오이즈 | 유전자의 메틸화 여부 및 비율의 분석방법 |
| US20150099670A1 (en) * | 2013-10-07 | 2015-04-09 | Weiwei Li | Method of preparing post-bisulfite conversion DNA library |
| ES2815684T3 (es) | 2015-06-10 | 2021-03-30 | Biocartis N V | Detección mejorada de ADN metilado |
| EP3839047A1 (en) | 2015-06-15 | 2021-06-23 | Cepheid | Integrated purification and measurement of dna methylation and co-measurement of mutations and/or mrna expression levels in an automated reaction cartridge |
| CN110267744A (zh) | 2016-12-12 | 2019-09-20 | 塞弗德公司 | 在自动化反应盒中DNA甲基化的整合的纯化和测量以及突变和/或mRNA表达水平的共同测量 |
-
2016
- 2016-06-14 EP EP20202659.7A patent/EP3839047A1/en active Pending
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