JP2018503668A - 膵臓癌を処置するためのペプチドをベースとする方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本明細書で用いるとき、単数形「a」、「and」、及び「the」は、文脈が明白にそうでないと示さない限り、複数への言及を含む。ゆえに、例えば、「細胞」への言及は、複数のかかる細胞を含み、「タンパク質」への言及は、1つまたは複数のタンパク質及び当業者に公知のその等価物への言及を含む、等である。本明細書で使用される全ての技術用語及び科学用語は、そうでないと明白に示されない限り、本発明が属する技術分野の当業者に一般的に理解されるものと同じ意味を有する。
ペプチドAは、配列Lys−Phe−Arg−Lys−Ala−Phe−Lys−Arg−Phe−Phe(配列番号1)を有するペプチドを含むか、このペプチドから実質的に構成されるか、またはこのペプチドから構成される。
本明細書に記載のペプチドの「変異体」は、本明細書に開示のポリペプチドと実質的に類似し、主題のポリペプチドの少なくとも1つの抗炎症特性または抗癌性を保持する、ポリペプチドである。変異体は、本明細書に開示の主題のポリペプチドのN末端もしくはC末端で1つもしくは複数のアミノ酸残基の欠失(すなわち、トランケーション)を、本明細書に開示の主題のポリペプチドの1つもしくは複数の内部部位で1つもしくは複数のアミノ酸残基の欠失及び/もしくは付加を、ならびに/または、本明細書に開示の主題のポリペプチドの1つもしくは複数の位置で1つもしくは複数のアミノ酸残基の置換を含むことができる。12アミノ酸残基以下の長さである主題のポリペプチドについては、変異体ポリペプチドは、好ましくは3つ以下(例えば、2、1、または無し)の欠失したアミノ酸残基を、内部で、N末端で、及び/またはC末端でのいずれかの位置で含む。
化学的または遺伝的手段による、本明細書に記載の任意の抗炎症性ポリペプチドの改変も本発明の方法及び組成物の文脈において企図される。そのような改変の例には、LまたはD型の非天然アミノ酸及び/または天然アミノ酸を伴う部分または完全配列のペプチドの構築を含む。例えば、本明細書に開示のペプチドのいずれか及びそれらの任意の変異体は、全てD型に産生されることができる。さらには、ポリペプチドを改変して、アミノ酸の側鎖またはN末端もしくはC末端に共有結合した炭水化物または脂質部分、例えば、糖または脂肪酸を含有することができる。加えて、ポリペプチドを改変して、投与に際して溶解度及び/または半減期を向上させることができる。例えば、ポリエチレングリコール(PEG)及び関連するポリマーは、血中でのタンパク質治療剤の溶解度及び半減期を向上させるために使用されている。従って、ポリペプチドは、PEGポリマー等により改変することができる。ポリペプチドは、硫黄、亜リン酸、ハロゲン、金属等を含有するように改変されることもでき、アミノ酸模倣物を使用してポリペプチドを産生することができる。一実施形態では、ポリペプチドは、アミノ酸模倣物を含み、分解に対する耐性などの特性を向上させる。例えば、ポリペプチドは、1つまたは複数の(例えば、全ての)ペプチドモノマーを含むことができる。
ある特定の実施形態では、本発明は、対象において膵臓癌または膵臓癌に関連する1つもしくは複数の症状を処置する(例えば、軽減、寛解、緩和、安定させる、発症を遅延させる、進行を阻害する、重症度を低下させる、及び/または発生率を低下させる)及び/または防止するための方法及び組成物を提供する。対象はヒトであり得る。
加えて、抗炎症性ポリペプチド(またはかかるポリペプチドを含む医薬組成物)が膵臓癌の処置において有効であると現在公知であるかまたは今後発見される少なくとも1つの他の薬物または治療と併用して投与されることができる、処置の方法(及び組成物)を本明細書に開示する。一実施形態では、薬物は、化学療法剤である。別の実施形態では、化学療法薬は、アルキル化剤、代謝拮抗薬/ヌクレオシド類似体(例えば、5−フルオロウラシル、6−メルカプトプリン、カペシタビン、シタラビン、フロクスウリジン、フルダラビン、ゲムシタビン、ヒドロキシウレア(hydroxurea)、メトトレキサート、ペメトレキセド等)、抗腫瘍抗生物質及びペプチド抗生物質、例えば、アントラサイクリン(例えば、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルシシン(idarucicin)等)、アクチニマイシン−D(actinimycin−D)、ブレオマイシン、マイトマイシンC、ミトキサントロン等、トポイソメラーゼ阻害薬(例えば、エトポシド、テニポシド、ミトキサントロン等)、細胞分裂阻害薬(例えば、タキサン、エポチロン、ビンカアルキロイド(vinca alkyloids)、エストラムスチン等)、コルチコステロイド(例えば、プレドニゾン、メチルプレドニゾン、デキサメタゾン等)、細胞骨格破壊剤/タキサン、エポチロン、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤、キナーゼ阻害剤、白金系薬剤、レチノイド、ビンカアルカロイド(及び誘導体)、ならびに他の薬剤、例えば、酵素(例えば、L−アスパラギナーゼ)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、治療用癌ワクチン、モノクローナル抗体(腫瘍特異的モノクローナル抗体を含む)、サイトカイン(例えば、IL−2及びIFN−α)、及び免疫チェックポイント阻害剤様抗CTLA4または抗PD−1及び抗PD−1L薬剤からなる群より選択される。
一実施形態では、本発明の処置方法は、対象を膵臓癌と診断すること、または、処置中に、処置方法の有効性を診断することを追加で含む。膵臓癌は、i)画像検査(膵臓を含む内臓を視覚化するために例えば、超音波、コンピュータ断層撮影(CT)スキャン、及び磁気共鳴画像法(MRI))、ii)腹部内部からの超音波内視鏡検査法(EUS)を使用する膵臓の超音波画像、iii)血液検査(膵臓癌細胞により放出される(腫瘍マーカーを含む)特定のタンパク質について検査するため)、iv)腹腔鏡検査(膵臓の外科的視覚化)、iv)内視鏡的逆行性胆道膵管撮影(ERCP)、v)顕微鏡下で調べるために少量の組織試料を膵臓から除去する生検(例えば、細針吸引を介してまたはERCP中)、ならびに/または、vi)経皮経肝胆管造影(PTC)により診断され得る。
本開示の膵臓癌を処置するための組成物は、当該分野で公知であり文献において広く記載されている従来法のいずれかに従って製剤化されてよい。ゆえに、活性成分(例えば、ペプチドAもしくはペプチドB、またはそれらの変異体)は、任意で他の活性物質と一緒に、組成物の特定の使用に適切な1つまたは複数の従来の薬学的に許容され得るキャリア、希釈剤及び/または賦形剤等と組み込まれて、投与に好適であるかまたは好適にすることができる従来の調製物を産生してよい。それらは、意図する投与様式及び治療用途に応じて、液体、半固体または固体、液体溶液、分散液、懸濁液等として製剤化され得る。いくつかの実施形態では、本発明の組成物は、注射可能または注入可能な溶液の形態で調製される。
一態様では、本発明は、膵臓癌を処置するためのキットであって、ペプチドA及び/またはペプチドB、もしくはそれらの変異体、またはこれを含む組成物を含む、前記キットをさらに提供する。キットは、使用説明書、他の治療剤(すなわち、膵臓癌の併用療法用)、投与用の組成物を調製するための他の試薬、例えば、希釈剤、またはデバイスまたは他の材料、薬学的に許容され得るキャリア、及び対象に投与するためのデバイスまたは他の材料を含むが、これらに限定されない、1つまたは複数の他の要素を含むことができる。使用説明書は、本明細書に記載するように、例えば、ヒト対象における、推奨投与量及び/または投与様式を含む、治療適用のための説明書を含むことができる。いくつかの実施形態では、前記キットは、本明細書に記載のような方法及び用途、例えば、治療的、診断的、またはイメージング方法にて使用するためのものであるか、またはin vitroアッセイまたは方法において使用するためのものである。
上記のように、膵臓癌を有する対象の予後改善における1つの主要な障害は、治療可能時間域の欠如である。初期の癌性病変は、検出閾値を遥かに下回る。診断時までに、初期(T1)腫瘍でさえも転移性であることがあり、従来の処置に耐性であり得る。in vitro及びin vivoにおける実験的成功と臨床治験における失望の間の相違は、腫瘍微小環境の再現における現在の実験設定の非効性からの生じる可能性が高い。腫瘍塊の80%以上を形成し得る膵管腺癌の線維性間質は、悪性細胞の受動的足場ではなく、むしろ、それらは、発癌において積極的な役割を果たす。これが、異種/同種移植マウスモデルにおいてしばしば欠けている要素である(Erkan,et al.2012 Curr Mol Med 12(3):288−303;Olive,et al.2009 Science 324(5933):1457−61)。
ペプチドAは、炎症を制御する様々なシグナル伝達経路の特定の成分を標的とするペプチド結合試験を介して抗炎症活性を有すると同定された。ペプチド結合は、ボストン大学にて開発されたウェブベースのClusPro(登録商標)アルゴリズムを使用して以前に評価された。ペプチドAは、RelB、TGFβ、Notch1、Wnt8R、TRAIL、IL−6R、IL−10R、EGFR、及びCDK6に対して、高い結合親和性を実証した。ペプチドAは、ヒストン修飾酵素HMT、ならびに(両方とも炎症ならびに腫瘍発生及び転移に関連する)マクロファージ活性及びアポトーシスに関連するタンパク質、例えば、CD47、SIRP−α、CD206、及びTGM2に対しても、高い結合親和性を実証した。最終的に、ペプチドAは、ヒト血清アルブミン(HSA)に対して高い結合親和性を有すると見いだされた。血清アルブミンは、循環中の最も豊富なタンパク質であり、固形腫瘍、特に膵臓腫瘍は、血清アルブミンをそれらの細胞中に(飲作用のプロセスを通して)取込み、エネルギー源としてそれを使用するだろう。
ペプチドAは、ゲムシタビンと併用されて、生存を、膵臓癌のKP16トランスジェニックマウスモデルにおいて改善した(図1B)。所望の遺伝子型(Pdx−1−Cre;LSL−KrasG12D/+;Ink4a(p16)/Arf(p19)flox/flox)を有するマウスを選択し、経腹壁的超音波を6週目に開始して、スクリーニングした。2〜4mm2 の間の腫瘍を処置のために選択した。腫瘍を有するマウスを、以下の処置に無作為に割り当てた。ビヒクル(100μl H2 OまたはPBSの腹腔内注射)、100μlのPBSの容量中の腹腔内注射による50mg/kgの週2回のゲムシタビン、100μlのH2 O中の腹腔内注射により週2回与えられる20mg/kgのペプチドA、及びそれぞれの溶媒中の20mg/kgの用量で週2回与えられるペプチドAと50mg/kgゲムシタビン週2回の併用とした。ペプチドAは、膵臓癌の増殖をトランスジェニック動物において停止させた(図1A及び1B、ペプチドAは「RP−182」として示す)。
ペプチドA及びゲムシタビンの組み合わせ(ペプチドA+ゲムシタビン)を臨床治験中の他の治験薬(さらに1つは規制当局の認可を得ている)と比較したとき、それぞれ膵臓癌の比較可能な動物モデルにおいて、ペプチドAは、平均生存において対照を超えるより大きな増加率(%)を示した。比較目的のために使用された治験薬には、SB225002/TgfbrKO/Kras、これは、膵管腺癌のマウスモデルにおいて、CXCR2を阻害し、腫瘍−間質相互作用を妨害し、生存を改善する(Hideaki Ijichi,et al.2011;The Journal of Clinical Investigationを参照されたい。本紙では、薬物及びビヒクル対照に関するデータのみを提供する)、IPI−926/Trp53R172H/Kras、これは膵臓癌のマウスモデルにおいて、ヘッジホッグシグナル伝達を阻害し、化学療法の送達を向上させる(Kenneth P.Olive et al.2009;Scienceを参照されたい)、PEGH20/Trp53R172H/Kras、これは間質の酵素的標的化を伴い、膵管腺癌の処置に対する物理的な障壁を切断する(Paolo Provenzano et al.2012;Cancer Cellを参照されたい)を含む。引用する研究のそれぞれについて、全体生存転帰を見直し、ビヒクルで処置したコホートの転帰を対照と設定した。生存における変化または腫瘍増殖における変化(元の刊行物において記録された中央値として)を、コホートあたりの変化率(%)としてグラフ化した(図2、ペプチドAは「RP−182」として示す)。
ペプチドAの細胞標的及び/または分子標的を明瞭にするために、p16膵臓癌細胞に対する分子標的をランダム10merペプチドの結合と比較した。(8(gly)リンカー+cysを介した)C末端ビオチン標識物を、漸増濃度で10分間、p16膵臓癌細胞とインキュベートし、過剰なペプチドを洗い落とし、細胞をフルオロ標識したストレプトアビジンと再インキュベートし、フローサイトメトリーにより分析した。総細胞に対するストレプトアビジン標識細胞の割合を、各濃度に関してグラフ化し、完全EC50薬物結合曲線を構築した(Inglese,et al.2006 PNAS USA 103(31):11473−8)。図5に示すように、C末端−ビオチン化ペプチドA(「RP−182」)と、ランダム10merビオチン化ペプチド(「Elimペプチド」)の結合の比較は、ペプチドA結合がp16膵臓癌細胞に特異的であることを示した。対照10−merペプチドの無(または非特異的)結合と比較した結合曲線の形状及び立体配置(フルクラスla曲線、シグモイド形)は、「促進された結合」、すなわち特定の細胞表面機構を通した結合を示し、これは、in silicoでのコンピュータモデリングデータと一致する。加えて、ペプチドAは、対照10merペプチドよりも癌細胞に対して5倍超強い結合を呈した(図5)。
ペプチドAが、癌細胞にそのN末端またはC末端を介して結合するかどうかを決定するために、N末端及びC末端で標識されたペプチドA(「RP−182」)の細胞結合、続いてフローサイトメトリーを介した結合、非結合細胞画分の決定を、先行実施例のように実行した。図6のEC50曲線は、N末端を介した癌細胞の優先結合を示す。ペプチドAのN末端のビオチン化を通した立体障害は、log倍率で低減した細胞結合をもたらす。
ペプチドAを、膵臓癌の別のマウスモデル、異所性HPAC異種移植片モデル(ヒトHPAC癌細胞を移植された免疫低下状態のマウス)において試験した。1×106 ヒト膵臓細胞、ルシフェラーゼタグ付きを32匹のヌード無胸腺マウスに注射した。次いで、マウスにビヒクル、ペプチドA、ゲムシタビン、またはペプチドA+ゲムシタビンを、ペプチドAについては20mg/kgの濃度で腹腔内に週2回、及び120mg/kgのゲムシタビン週1回を与えた(注射した)。4週間の処置の後、腫瘍及び脾臓を回収し、CD11b+磁気細胞分離を行った。単離したCD11b+細胞をin vitroでHPACと共培養した。癌細胞の生存能を、ルシフェラーゼタグ付き癌細胞のルシフェラーゼ活性を介して定量化した。ペプチドA処置動物から得たCD11b陽性細胞は、ビヒクル処置動物から得たCD11b共培養細胞と比較して、癌細胞の増殖を阻害した。
ペプチドBが、膵臓癌の免疫系に影響を与えるかどうかを調査するために、ビヒクル対2mg/kgのペプチドBを用いて1日1回腹腔内処置されたP16腫瘍を、摘出し、消化し、以前に滴定して最適化した免疫細胞マーカーとインキュベートし、多色フローサイトメトリーにより分析した。様々な細胞分集団の細胞画分を図8に示す。ペプチドB(「RP−398」として示す)は、これらの腫瘍においてB細胞を増加させ、これらの腫瘍においてマクロファージを低下させることにより膵臓癌における免疫系に影響を与えることが見いだされた。
ペプチドA処置対未処置腫瘍から単離されたマクロファージは挙動が異なることが見いだされた。腹腔内注射により週2回ビヒクルまたは20mg/kgペプチドAのいずれかを用いて処置されたHPAC異種移植片を、1.5cmを超えたときに回収し、消化し、CD11b細胞を磁気ビーズプルダウンにより単離した。80%を超えるプルダウン後のCD11b陽性細胞の濃縮を、フローサイトメトリーにより確認した。単離したCD11b陽性細胞を、5,000個のルシフェラーゼタグ付きHPAC細胞と、3:1及び10:1の比率で共培養し、癌細胞の増殖を、ルシフェラーゼタグ活性を使用して測定した。ペプチドA処置腫瘍由来のマクロファージは、それらと共培養されたとき、抗腫瘍活性を増加させ、癌細胞の増殖を停止させた(データは示さず)。
質量分析を使用して、マウスの血清中のペプチドAを定量化した(データは示さず)。本明細書に記載のマウス研究において使用された用量での腹腔内注射は、生物学的効果を発揮できる測定可能な血清濃度をもたらした。ペプチドAは、イオン質量分析計で検出可能であり、5分後の質量は688.08であり、長時間の勾配を伴った。マウス血清中へのペプチドAのスパイクイン実験により、同一の質量及び時間変動が確認された。算出した血清濃度(ng/ml)は、生物学的機能を発揮可能であるようにペプチドAについて一致した(データは示さず)。マウス血清中のペプチドを測定するこの能力は、薬物動態及び毒性試験の基礎である。
本明細書中に引用される出願及び特許のそれぞれ、ならびに該出願及び特許のそれぞれに引用される各文献または参考文献(各発行特許の出願手続き中、「出願引用文献」を含む)、ならびにこれらの出願及び特許のいずれかに対応する及び/またはそれからの優先権を主張するPCT及び外国出願または特許、ならびに出願引用文献のそれぞれに引用されるまたは言及される文献のそれぞれは、参照により本明細書に明示的に組み込まれ、本発明の実践において採用され得る。より一般的には、文献または参考文献は、特許請求の範囲の前の参考文献一覧または明細書自体においてのいずれかで本明細書に引用され、これらの文献または参考文献のそれぞれ(「本明細書引用参考文献」)、ならびに本明細書引用参考文献のそれぞれに引用される各文献または参考文献(任意の製造業者の仕様書、説明書等を含む)は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる。
配列表テキストファイルを本明細書に添付し、これは、2015年10月13日に作製され、サイズは2キロバイトであり、ファイル名は「6137NCI−38−PCT_Sequence listing_ST25」であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (10)
- 対象において膵臓癌を処置するための方法であって、前記対象に、アミノ酸配列Lys−Phe−Arg−Lys−Ala−Phe−Lys−Arg−Phe−Phe(配列番号1)もしくはPhe−Ala−Lys−Lys−Phe−Ala−Lys−Lys−Phe−Lys(配列番号2)を含むペプチドまたはその多量体、誘導体、もしくは変異体を投与することを含むことを特徴とする方法。
- 前記ペプチドが、ポリエチレングリコールリンカーにコンジュゲートすることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記ペプチドが、配列番号1の二量体もしくは四量体のうちの少なくとも1つ、またはそれらの組み合わせとして投与されることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記投与が、追加の治療剤の投与をさらに含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記治療剤が、化学療法剤であることを特徴とする請求項4に記載の方法。
- 前記化学療法剤が、ゲムシタビンまたは免疫チェックポイント阻害剤からなる群より選択されることを特徴とする請求項5に記載の方法。
- 前記化学療法剤が、ゲムシタビンアブラキサン、またはフォルフィリノックス(フルオロウラシル、ロイコボリン、イリノテカン、オキサリプラチンレジメン)であることを特徴とする請求項5に記載の方法。
- 前記投与が、非経口であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ペプチドが、約0.05〜約25mg/kgの投与量で投与されることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記対象がヒトであることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
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