JP2017501137A5 - - Google Patents
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Description
本発明の局面または態様が、マーカッシュ群または他の選択肢の群の形で記載されている場合、本発明は、列挙された群全体をまとめて包含するだけではなく、その群の各メンバーも個別に包含し、主群の考えうる部分群も全て包含し、群のメンバーの1つまたは複数を欠く主群も包含する。本発明は、請求項に係る発明における群メンバーのいずれかの1つまたは複数の明示的な排除も、想定している。
[本発明1001]
以下の工程を含む、患者における乳がんを処置する方法:
(a)患者がWnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性があるかどうかを同定する工程であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
該同定が、
(i)患者の乳がんの試料を得る工程;
(ii)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(iii)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性がある患者を同定する工程
を含む、工程;ならびに
(b)処置に反応する可能性がある患者に有効量のWnt経路インヒビターを投与する工程。
[本発明1002]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性のあるヒト乳房腫瘍を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1003]
ヒト乳房腫瘍を、Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する工程
を含む、前記方法。
[本発明1004]
Wnt経路インヒビターによる処置に対するヒト乳房腫瘍の反応性を判定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき処置に対する該腫瘍の反応性を判定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1005]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性のある、乳がんを有する患者を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性のある患者を同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1006]
Wnt経路インヒビターによる処置のための乳がんを有する患者を選択する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該バイオマーカーサインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置のための患者を選択する工程
を含む、前記方法。
[本発明1007]
各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1008]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1009]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、本発明1008の方法。
[本発明1010]
Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1011]
Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1012]
抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、本発明1001〜1011のいずれかの方法。
[本発明1013]
Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1014]
乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1016]
Wnt経路インヒビターによる処置が、1つまたは複数の追加の治療剤との併用である、本発明1001〜1015のいずれかの方法。
[本発明1017]
追加の治療剤が化学療法剤である、本発明1016の方法。
[本発明1018]
追加の治療剤がパクリタキセルである、本発明1016の方法。
[本発明1019]
追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、本発明1016の方法。
[本発明1020]
試料が組織試料または腫瘍生検材料である、本発明1001〜1019のいずれかの方法。
[本発明1021]
試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、本発明1001〜1020のいずれかの方法。
[本発明1022]
乳房腫瘍試料または乳がん試料中のFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を検出するためのキットであって、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、前記キット。
[本発明1023]
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を含む、本発明1022のキット。
[本発明1001]
以下の工程を含む、患者における乳がんを処置する方法:
(a)患者がWnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性があるかどうかを同定する工程であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
該同定が、
(i)患者の乳がんの試料を得る工程;
(ii)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(iii)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性がある患者を同定する工程
を含む、工程;ならびに
(b)処置に反応する可能性がある患者に有効量のWnt経路インヒビターを投与する工程。
[本発明1002]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性のあるヒト乳房腫瘍を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1003]
ヒト乳房腫瘍を、Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する工程
を含む、前記方法。
[本発明1004]
Wnt経路インヒビターによる処置に対するヒト乳房腫瘍の反応性を判定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現に基づき処置に対する該腫瘍の反応性を判定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1005]
Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性のある、乳がんを有する患者を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性のある患者を同定する工程
を含む、前記方法。
[本発明1006]
Wnt経路インヒビターによる処置のための乳がんを有する患者を選択する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍の試料を得る工程;
(b)該試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該バイオマーカーサインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(c)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置のための患者を選択する工程
を含む、前記方法。
[本発明1007]
各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1008]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、本発明1001〜1006のいずれかの方法。
[本発明1009]
FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、本発明1008の方法。
[本発明1010]
Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1011]
Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1012]
抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、本発明1001〜1011のいずれかの方法。
[本発明1013]
Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、本発明1001〜1009のいずれかの方法。
[本発明1014]
乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1016]
Wnt経路インヒビターによる処置が、1つまたは複数の追加の治療剤との併用である、本発明1001〜1015のいずれかの方法。
[本発明1017]
追加の治療剤が化学療法剤である、本発明1016の方法。
[本発明1018]
追加の治療剤がパクリタキセルである、本発明1016の方法。
[本発明1019]
追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、本発明1016の方法。
[本発明1020]
試料が組織試料または腫瘍生検材料である、本発明1001〜1019のいずれかの方法。
[本発明1021]
試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、本発明1001〜1020のいずれかの方法。
[本発明1022]
乳房腫瘍試料または乳がん試料中のFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を検出するためのキットであって、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、前記キット。
[本発明1023]
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を含む、本発明1022のキット。
Claims (38)
- Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性のあるヒト乳房腫瘍を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして同定する工程
を含む、前記方法。 - ヒト乳房腫瘍を、Wnt経路インヒビターによる処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(b)該バイオマーカーの発現に基づき、該腫瘍を、処置に反応性または非反応性である可能性があるとして分類する工程
を含む、前記方法。 - Wnt経路インヒビターによる処置に対するヒト乳房腫瘍の反応性を判定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(b)該バイオマーカーの発現に基づき処置に対する該腫瘍の反応性を判定する工程
を含む、前記方法。 - Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性のある、乳がんを有する患者を同定する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性のある患者を同定する工程
を含む、前記方法。 - Wnt経路インヒビターによる処置のための乳がんを有する患者を選択する方法であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
方法が、
(a)患者の乳房腫瘍から採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該バイオマーカーサインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(b)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置のための患者を選択する工程
を含む、前記方法。 - 各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、請求項7に記載の方法。 - Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- 抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
- Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
- 乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
- Wnt経路インヒビターによる処置が、1つまたは複数の追加の治療剤との併用である、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 追加の治療剤が化学療法剤である、請求項15に記載の方法。
- 追加の治療剤がパクリタキセルである、請求項15に記載の方法。
- 追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、請求項15に記載の方法。
- 試料が組織試料または腫瘍生検材料である、請求項1〜18のいずれか一項に記載の方法。
- 試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、請求項1〜19のいずれか一項に記載の方法。
- Wnt経路インヒビターによる処置に反応する可能性があると同定された患者における乳がんを処置するための、有効量のWnt経路インヒビターを含む、薬剤であって、Wnt経路インヒビターが、
を含む重鎖CDR1、
を含む重鎖CDR2、
を含む重鎖CDR3、
を含む軽鎖CDR1、
を含む軽鎖CDR2、および
を含む軽鎖CDR3を含む、ヒトFZD1、FZD2、FZD5、FZD7、およびFZD8に特異的に結合する抗体であり、
該同定が、
(i)患者の乳がんから採取された試料中のバイオマーカーサインの各バイオマーカーの発現レベルを測定する工程であって、該サインがバイオマーカーFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を含む、工程;および
(ii)該バイオマーカーの発現レベルに基づき処置に反応する可能性がある患者を同定する工程
を含む、薬剤。 - 各バイオマーカーの発現が、PCRに基づくアッセイ、qPCRアッセイ、マイクロアレイ、またはRNA配列決定により測定される、請求項21に記載の薬剤。
- FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを用いて測定される、請求項21に記載の薬剤。
- FBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1の発現レベルが、
(a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を用いて測定される、請求項23に記載の薬剤。 - Wnt経路インヒビターが、SEQ ID NO:7を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:8を含む軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
- Wnt経路インヒビターが、PTA-9541としてATCCに寄託したプラスミドによりコードされる重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む抗体である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
- 抗体が、モノクローナル抗体、組換え抗体、キメラ抗体、二重特異性抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、または抗原結合部位を含む抗体フラグメントである、請求項21〜26のいずれか一項に記載の薬剤。
- Wnt経路インヒビターが、抗体OMP-18R5である、請求項21〜24のいずれか一項に記載の薬剤。
- 乳房腫瘍または乳がんがHER2陰性乳房腫瘍である、請求項21〜28のいずれか一項に記載の薬剤。
- 乳房腫瘍または乳がんが、三種陰性乳がん(TNBC)腫瘍である、請求項21〜28のいずれか一項に記載の薬剤。
- 1つまたは複数の追加の治療剤と併用して用いられる、請求項21〜30のいずれか一項に記載の薬剤。
- 追加の治療剤が化学療法剤である、請求項31に記載の薬剤。
- 追加の治療剤がパクリタキセルである、請求項31に記載の薬剤。
- 追加の治療剤がnab結合型パクリタキセル(ABRAXANE)である、請求項31に記載の薬剤。
- 試料が組織試料または腫瘍生検材料である、請求項21〜34のいずれか一項に記載の薬剤。
- 試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)試料である、請求項21〜35のいずれか一項に記載の薬剤。
- 乳房腫瘍試料または乳がん試料中のFBXW2、CCND2、RHOU、CTBP2、WIF1、およびDKK1を検出するためのキットであって、SEQ ID NO:62〜79からなる群より選択されるポリヌクレオチドを含む、前記キット。
- (a) SEQ ID NO:62のフォワードプライマー、SEQ ID NO:63のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:64を含むプローブ;
(b) SEQ ID NO:65のフォワードプライマー、SEQ ID NO:66のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:67を含むプローブ;
(c) SEQ ID NO:68のフォワードプライマー、SEQ ID NO:69のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:70を含むプローブ;
(d) SEQ ID NO:71のフォワードプライマー、SEQ ID NO:72のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:73を含むプローブ;
(e) SEQ ID NO:74のフォワードプライマー、SEQ ID NO:75のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:76を含むプローブ;ならびに
(f) SEQ ID NO:77のフォワードプライマー、SEQ ID NO:78のリバースプライマー、およびSEQ ID NO:79を含むプローブ
を含む、請求項37に記載のキット。
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