JP2014023435A - 核酸増幅分析装置及び核酸増幅分析方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した増幅曲線と、標的となるサンプルについて作製した増幅曲線とを一点が重なるようにX軸方向にシフトさせ、これら増幅曲線を比較する。
【選択図】図6
Description
21 ベースライン領域
22 プラトー領域
23 Threshold Line
24 未知試料のNサイクル目の測定値Yを通る基準線
Claims (24)
- 既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線と、標的となるサンプルについて作製した増幅曲線とを一点が重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、これら増幅曲線を比較することで上記標的となるサンプルにおける核酸増幅反応の良否を判定する、核酸増幅分析装置。
- 不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する演算機能を有する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する演算機能を有する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 標準液について作製した増幅曲線が標的となるサンプルについて作製した増幅曲線に重なるように上記他方の軸方向に移動させた場合の二曲線の相関を評価する機能を有する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 二曲線の相関を評価した結果、設定範囲外となった場合には測定結果にエラーを付記し、増幅不良を知らせる機能を有する請求項4記載の核酸増幅分析装置。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する機能を備える請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線を、標的となるサンプルについて測定した増幅産物に基づく複数の測定値のうち所定の測定値と重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、シフトした増幅曲線を標的となるサンプルの増幅曲線とする、核酸増幅分析装置。
- 不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する演算機能を有する請求項7記載の核酸増幅分析装置。
- シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する演算機能を有する請求項7記載の核酸増幅分析装置。
- 標的となるサンプルについて測定した測定値から上記他方の軸に平行な直線を引いた直線を基準線とし、基準線と標準液について作製した僧服曲線との交点を求める演算機能を有する請求項7記載の核酸増幅分析装置。
- 標的となるサンプルごとに測定の終了を選択できる制御機構を有する請求項7記載の核酸増幅分析装置。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する機能を備える請求項7記載の核酸増幅分析装置。
- 既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線と、標的となるサンプルについて作製した増幅曲線とを一点が重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、これら増幅曲線を比較することで上記標的となるサンプルにおける核酸増幅反応の良否を判定する、核酸増幅分析方法。
- 不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する演算機能を有する請求項13記載の核酸増幅分析方法。
- シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する演算機能を有する請求項13記載の核酸増幅分析方法。
- 標準液について作製した増幅曲線が標的となるサンプルについて作製した増幅曲線に重なるように上記他方の軸方向に移動させた場合の二曲線の相関を評価する機能を有する請求項13記載の核酸増幅分析方法。
- 二曲線の相関を評価した結果、設定範囲外となった場合には測定結果にエラーを付記し、増幅不良を知らせる機能を有する請求項16記載の核酸増幅分析方法。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する機能を備える請求項13記載の核酸増幅分析方法。
- 既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線を、標的となるサンプルについて測定した増幅産物に基づく複数の測定値のうち所定の測定値と重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、シフトした増幅曲線を標的となるサンプルの増幅曲線とする、核酸増幅分析方法。
- 不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する演算機能を有する請求項19記載の核酸増幅分析方法。
- シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する演算機能を有する請求項19記載の核酸増幅分析方法。
- 標的となるサンプルについて測定した測定値から上記他方の軸に平行な直線を引いた直線を基準線とし、基準線と標準液について作製した僧服曲線との交点を求める演算機能を有する請求項19記載の核酸増幅分析方法。
- 標的となるサンプルごとに測定の終了を選択できる制御機構を有する請求項19記載の核酸増幅分析方法。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する機能を備える請求項19記載の核酸増幅分析方法。
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