JP5950740B2 - 核酸増幅分析装置及び核酸増幅分析方法 - Google Patents
核酸増幅分析装置及び核酸増幅分析方法 Download PDFInfo
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21 ベースライン領域
22 プラトー領域
23 Threshold Line
24 未知試料のNサイクル目の測定値Yを通る基準線
Claims (12)
- 既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した増幅曲線と、標的となるサンプルについて測定した増幅産物に基づく複数の測定値が示し得る曲線とが、その形状において近似しており、
標的となるサンプルについて、核酸増幅反応による増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線が得られるか判断し、当該増幅曲線が得られないと判断した場合に、
既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線を、標的となるサンプルについて測定した増幅産物に基づく複数の測定値のうち所定の測定値と重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、シフトした増幅曲線を標的となるサンプルの増幅曲線とし、当該増幅曲線により核酸増幅反応の立ち上がり値を算出する演算部を有する、核酸増幅分析装置。 - 上記演算部は、不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 上記演算部は、シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 上記演算部は、標的となるサンプルについて測定した測定値から上記他方の軸に平行な直線を引いた直線を基準線とし、基準線と標準液について作製した増幅曲線との交点を求める請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 標的となるサンプルごとに測定の終了を選択できる制御機構を有する請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する機能を備える請求項1記載の核酸増幅分析装置。
- 標的となるサンプルについて、核酸増幅反応による増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線が得られない場合に、
既定濃度の鋳型核酸を含む標準液について作製した、増幅産物に基づく測定値を一方の軸とし、核酸増幅反応の進捗を示す値を他方の軸とした2次元平面上の増幅曲線を、標的となるサンプルについて測定した増幅産物に基づく複数の測定値のうち所定の測定値と重なるように上記他方の軸方向にシフトさせ、シフトした増幅曲線を標的となるサンプルの増幅曲線とし、当該増幅曲線により核酸増幅反応の立ち上がり値を算出する、核酸増幅分析方法。 - 不連続な測定点に対してシグモイド関数を与え、繰り返し施行によるフィッティングによってシグモイド関数のパラメータを確定し、上記増幅曲線として近似式を算出する請求項7記載の核酸増幅分析方法。
- シグモイド曲線の近似式に基づいて、増幅産物に基づく測定値における閾値(Threshold Line)を超える、核酸増幅反応の進捗を示す値を算出する請求項7記載の核酸増幅分析方法。
- 標的となるサンプルについて測定した測定値から上記他方の軸に平行な直線を引いた直線を基準線とし、基準線と標準液について作製した増幅曲線との交点を求める請求項7記載の核酸増幅分析方法。
- 標的となるサンプルごとに測定の終了を選択できる請求項7記載の核酸増幅分析方法。
- 標準液について作製した増幅曲線のデータを記憶する請求項7記載の核酸増幅分析方法。
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