JP2010536340A - Egf受容体を標的とするモノクローナル抗体175ならびにその誘導体および用途 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明の抗体である抗体175およびそのフラグメントまたはそれに由来する単量体、組換え体もしくはハイブリッド抗体は、腫瘍形成性、過剰増殖性または異常細胞において見出され正常または野生型細胞においては検出不可能なEGFRエピトープを認識する。本発明の抗体は、本明細書に記載されている抗体mAb 175により更に例示される。
本発明においては、当技術分野における技量の範囲内の通常の分子生物学、微生物学および組換えDNA技術が用いられうる。そのような技術は文献中に十分に説明されている。例えば、Sambrookら,“Molecular Cloning:A Laboratory Manual”(1989);“Current Protocols in Molecular Biology”Volumes I−III[Ausubel,R.M.編,(1994)];“Cell Biology:A Laboratory Handbook”Volumes I−III[J.E.Celis編(1994))];“Current Protocols in Immunology”Volumes I−III[Coligan,J.E.編,(1994)];“Oligonucleotide Synthesis”(MJ.Gait編 1984);“Nucleic Acid Hybridization”[B.D.Hames & SJ.Higgins編(1985)];“Transcription And Translation”[B.D.Hames & SJ.Higgins編,(1984)];“Animal Cell Culture”[R.I.Freshney編,(1986)];“Immobilized Cells And Enzymes”[IRL Press,(1986)];B.Perbal,“A Practical Guide To Molecular Cloning”(1984)を参照されたい。
「異常発現」なる語は、その種々の文法形態において、増強された発現または翻訳、タンパク質のプロモーターまたは調節体のモジュレーション、タンパク質に関する遺伝子の増幅、あるいは増加した半減期または安定性を含むいずれかの手段により引き起こされる、組織におけるタンパク質の、いずれかの増強もしくは改変された発現または過剰発現(例えば、タンパク質の量における増加)により、非過剰発現状態と比較して大量のタンパク質が存在し又は同時に検出されうることを意味し、それを含みうる。異常発現は、タンパク質の発現の増強またはタンパク質のレベルもしくは量の増加(配列の改変、欠失もしくは挿入またはフォールディングの改変による突然変異タンパク質または変異体と同様に改変タンパク質が発現される場合を含む)により細胞内のタンパク質発現または翻訳後修飾装置に負荷がかかっている又は損なわれている、いずれかの場合または改変を含み、それらを想定している。
フェニルアラニン(Phe又はF) UUU又はUUC
ロイシン(Leu又はL) UUA又はUUG又はCUU又はCUC又はCUA又はCUG
イソロイシン(Ile又はI) AUU又はAUC又はAUA
メチオニン(Met又はM) AUG
バリン(Val又はV) GUU又はGUC又はGUA又はGUG
セリン(Ser又はS) UCU又はUCC又はUCA又はUCG又はAGU又はAGC
プロリン(Pro又はP) CCU又はCCC又はCCA又はCCG
トレオニン(Thr又はT) ACU又はACC又はACA又はACG
アラニン(Ala又はA) GCU又はGCG又はGCA又はGCG
チロシン(Tyr又はY) UAU又はUAC
ヒスチジン(His又はH) CAU又はCAC
グルタミン(Gln又はQ) CAA又はCAG
アスパラギン(Asn又はN) AAU又はAAC
リシン(Lys又はK) AAA又はAAG
アスパラギン酸(Asp又はD) GAU又はGAC
グルタミン酸(Glu又はE) GAA又はGAG
システイン(Cys又はC) UGU又はUGC
アルギニン(Arg又はR) CGU又はCGC又はCGA又はCGG又はAGA又はAGG
グリシン(Gly又はG) GGU又はGGC又はGGA又はGGG
トリプトファン(Trp又はW) UGG
終止コドン UAA(オーカー)又はUAG(アンバー)又はUGA(オパール)。
アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファン、メチオニン。
グリシン、セリン、トレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン。
アスパラギン酸、グルタミン酸。
リシン、アルギニン、ヒスチジン(pH6.0において)。
グリシン 75
アラニン 89
セリン 105
プロリン 115
バリン 117
トレオニン 119
システイン 121
ロイシン 131
イソロイシン 131
アスパラギン 132
アスパラギン酸 133
グルタミン 146
リシン 146
グルタミン酸 147
メチオニン 149
ヒスチジン(pH6.0におけるおの) 155
フェニルアラニン 165
アルギニン 174
チロシン 181
トリプトファン 204。
・正電荷が維持されうるよう、ArgからLysへ、およびその逆。
・負電荷が維持されうるよう、AspからGluへ、およびその逆。
・遊離−OHが維持されうるよう、ThrからSerへ。
・遊離NH2が維持されうるよう、AsnからGlnへ。
本発明は、腫瘍形成性、過剰増殖性または異常細胞において露出されるEGFRエピトープ(ここで、該エピトープは増強され、現され又は明白であり、正常または野生型細胞においては検出可能でない)、特にEGFRペプチド(287CGADSYEMEEDGVRKC302(配列番号14))を認識する新規抗体175またはそのフラグメント(免疫原性フラグメントを含む)を提供する。特定の非限定的な実施形態においては、該抗体は、単純糖質修飾または初期グリコシル化に際して増強される又は明白であり複合糖質またはグリコシル化の存在下では軽減される又は明白ではないEGFRエピトープを認識する。該抗体またはそのフラグメントは、過剰発現、増幅または腫瘍形成事象の非存在下では、正常または野生型EGFRエピトープを含有する正常または野生型細胞に結合せず、また、該細胞を認識しない。
本発明の175抗体またはそのフラグメントの特有の特異性は、従前公知のEGFR抗体で見られうる正常組織の取り込みに関連した問題を伴うことなく、多数の腫瘍形成性細胞型および腫瘍型(例えば、頭部および頸部、乳房、肺、暴行または前立腺腫瘍および神経膠腫)を特定、特徴づけ、標的化および治療、軽減または排除するための診断および治療用途を提供する。したがって、本発明の175抗体またはそのフラグメントを使用して、(例えば、突然変異体または変異体EGFRの増幅または発現により)EGFR、特に、異常な翻訳後修飾を示すものを過剰発現する細胞が認識され、単離され、特徴づけられ、標的化され、治療され、または排除されうる。
ハイブリドーマによりモノクローナル抗体を製造するための一般的方法はよく知られている。不死抗体産生細胞系は、融合以外の技術、例えば、発癌性DNAでのBリンパ球の直接的な形質転換またはエプスタインバーウイルスでのトランスフェクションによっても作製されうる。例えば、M.Schreierら,“Hybridoma Techniques”(1980);Hammerlingら,“Monoclonal Antibodies And T−cell Hybridomas”(1981);Kennettら,“Monoclonal Antibodies”(1980);また、米国特許第4,341,761号、第4,399,121号、第4,427,783号、第4,444,887号、第4,451,570号、第4,466,917号、第4,472,500号、第4,491,632号、第4,493,890号を参照されたい。EFGRに対して産生されたモノクローナル抗体のパネルは、種々の特性、例えばイソタイプ、エピトープ、アフィニティなどに関してスクリーニングされうる。特に興味深いのは、EFGRまたはそのサブユニットの活性を模擬するモノクローナル抗体である。そのようなモノクローナル抗体は特異的結合メンバー活性アッセイにおいて容易に特定されうる。高アフィニティ抗体は、天然または組換え特異的結合メンバーの免疫アフィニティ精製が可能である場合に有用である。本発明の実施において有用なモノクローナル抗体は、適当な抗原特異性の抗体分子を分泌するハイブリドーマを含有する栄養培地を含むモノクローナルハイブリドーマ培養を開始させることにより製造されうる。該培養は、該ハイブリドーマが該抗体分子を培地内に分泌するのに十分な条件下および時間にわたって維持される。ついで該抗体含有培地を集める。ついで、よく知られた技術により、該抗体分子を更に単離することが可能である。
一般に、配列番号1、2、3、4、5および/または6のCDR領域として記載されているのと実質的に同じアミノ酸配列を含むCDR領域は、腫瘍抗原へのCDR領域の結合を可能にする構造体内に含有されるであろう。「記載されているのと実質的に同じ」は、本発明のそのCDR領域が、配列番号1、2、3、4、5および/または6の特定されている領域と同一または高度に相同であることを意味する。「高度に相同」は、少数、好ましくは1〜8、好ましくは1〜5、好ましくは1〜4、または1〜3、または1〜2個のみの置換が該CDR内に施されうることを意味する。
本発明の抗体のインビボ特性、特に、腫瘍:血液比およびクリアランスの速度は、mAb175に少なくとも比肩するものであろう。ヒトまたは動物対象への投与の後、そのような特異的結合メンバーは、>1:1のピーク腫瘍:血液比を示すであろう。好ましくは、そのような比において、該特異的結合メンバーは、1:1より大きな、好ましくは2:1より大きな、より好ましくは5:1より大きな腫瘍:器官比をも有するであろう。好ましくは、そのような比において、該特異的結合メンバーは、腫瘍の部位から離れた器官において<1:1の器官:血液比をも有するであろう。これらの比は、投与された特異的結合メンバーの異化および分泌の器官を除外している。
本発明の抗体は、通常、医薬組成物の形態で投与され、これは、該特異的結合メンバーに加えて、少なくとも1つの成分を含みうる。したがって、本発明の、および本発明に従い使用される医薬組成物は、有効成分に加えて、医薬上許容される賦形剤、担体、バッファー、安定剤または当業者によく知られている他の物質を含みうる。そのような物質は無毒性であるべきであり、有効成分の効力を妨げるべきではない。該担体または他の物質の厳密な性質は、経口経路または注射(例えば、静脈内)によるものでありうる投与経路に左右されるであろう。
また、本発明は、通常の放射線療法と組合された該抗体の使用のための治療用組成物を想定しており、それを含む。EGF受容体を標的化する抗体での治療は通常の放射線療法の効果を増強しうることが示されている(Milasら,Clin Cancer Res.2000 Feb:6(2):701 8,Huangら,Clin Cancer Res.2000 Jun:6(6):2166 74)。
本発明はまた、異常に発現されたEGFRのような刺激の存在を、本発明の175抗体により認識されるその能力を参照することにより検出する方法を含む種々の診断用途に関する。本発明の抗体の診断用途には、当業者によく知られた及び標準的な及び本記載に基づくインビトロおよびインビボ用途が含まれる。EGFR状態(特にEGFRの異常発現に関するもの)のインビトロ査定および評価のための診断アッセイおよびキットは、患者のサンプル、例えば、癌、前癌状態、過剰増殖細胞増殖に関連した状態を有する又は有する疑いのあるもの、または腫瘍サンプルを診断、評価およびモニターするために利用されうる。EGFR状態の査定および評価は、薬物の臨床治験のための患者の適合性、または特定の化学療法剤もしくは本発明の特異的結合メンバー、特に抗体(その組合せを含む)の投与のための、異なる物質または抗体と比較した場合の患者の適合性の判定においても有用である。このタイプの診断モニターおよび評価は、乳癌におけるHER2タンパク質に対する抗体(Hercep Test,Dako Corporation)を利用して既に実施されており、この場合、該アッセイは、ヘルセプチン(Herceptin)を使用する抗体療法に関して患者を評価するためにも用いられる。インビボ用途には、腫瘍のイメージングまたは個体の癌状態の評価(ラジオイメージングを含む)が含まれる。
(a)検出可能な標識への175抗体またはそれに対する特異的結合パートナーの直接的または間接的結合により得られる少なくとも1つの標識された免疫化学的に反応性の成分の予め決められた量、
(b)他の試薬、および
(c)該キットの使用のための説明
を含みうる。
本発明は更に、本発明の抗体175をコードする単離された核酸を提供する。核酸には、DNAおよびRNAが含まれる。好ましい態様においては、本発明は、配列番号1、2、3、4、5および/または6に記載されているポリペプチドを含む前記の本発明のポリペプチドをコードする核酸を提供する。本発明はまた、前記の少なくとも1つのポリヌクレオチドを含むプラスミド、ベクター、転写または発現カセットの形態の構築物を提供する。本発明はまた、前記の1以上の構築物を含む組換え宿主細胞を提供する。提供されるそのもののいずれかの抗体175をコードする核酸は、該抗体のコード化核酸からの発現を含む該抗体の製造方法と同様に、本発明の1つの態様を構成する。発現は、該核酸を含有する組換え宿主細胞を適当な条件下で培養することにより簡便に達成されうる。発現による産生の後、特異的結合メンバーを、任意の適当な技術を用いて単離および/または精製し、ついで適宜、使用することが可能である。
EGFRは、2つの十分に特徴づけられたコンホーマー(係留型(tethered)および非係留型(untethered))として存在する。係留型コンホーマーは、リガンド非含有(そして部分的に連結された)形態の該受容体でのみ観察されており、非係留型の後部−後部二量体を形成するようリガンドにより誘導されうる。mAb806は、細胞表面上の幾つかのトランケート化された、過剰発現された又は活性化された形態のEGFR上のエピトープを認識するが、それは、正常な未刺激細胞上のEGFRを認識しない。もう1つの関連抗体であるmAb175もこの異常エピトープを認識する。本発明者らは、抗体mAb806およびmAb175のFabに結合したEGFR287−302ペプチドエピトープの3D構造を決定した。該抗体の存在下、該ペプチドエピトープは、両方の形態の該受容体において見出されるものに非常に類似したコンホメーションをとる。しかし、wtEGFR構造へのmAb806またはmAb175抗体の結合は、係留型および非係留型コンホメーションの両方において、CR1ドメインとのFabの有意な立体的衝突により抑制されるであろう。CR1ドメインの3Dコンホメーションの精査は、該エピトープの直前のジスルフィド結合の破壊が、いずれかの抗体の結合を可能にするのに十分な程度にCR1ドメインを開くことを可能にすることを示唆した。システイン突然変異体EGFRC271A/C283AはmAb806およびmAb175に結合するだけでなく、その化学量論は1:1である(すなわち、EGFR L2リガンド結合ドメインを認識するmAb528と同等である)。mAb806は、野生型EGFRを発現する細胞のインビトロ増殖を抑制しないが、mAb806は、EGFRC271A/C283Aを発現するBaF/3細胞のリガンド関連刺激を完全に抑制する。本発明者らの結果は、抗体mAb806およびmAb175の結合のメカニズムが、該エピトープが受容体活性化中またはトランケート化もしくは過剰発現により優先的に露出されるEGFRの形態を要することを示している。したがって、他のEGFR抗体とは対照的に、mAb806は、該EGFRを過剰発現する癌患者における腫瘍に優先的に局在する。作用メカニズムは、過剰発現された、トランケート化した又は活性化された形態のEGFRファミリー受容体を有する癌細胞の抗体/インヒビター殺傷を改善するための及び腫瘍を検出するための抗体の作製のための新規アプローチを示唆している。
EGFRは多数のヒト腫瘍の増殖の刺激に関与している。治療用物質としてインヒビターおよびアンタゴニストが使用されているが、1つには、正常組織上のEGFRの阻害のため、そしてもう1つには、それらの物質の幾つかの限定された一時的作用のため(すなわち、Abは、より長い作用を示す)、成功は限定されたものである。抗体Mab806およびMab175は該受容体の異常コンホメーションを認識し、これは、しばしば、腫瘍細胞上では見出されるが、正常細胞上では見出されない。EGFR上のこれらの抗体の三次元結合部位は、それらの腫瘍特異性を説明する異常コンホメーションを識別する。これらの抗体は、他の抗EGFR物質と相乗的に作用して、マウスにおける顕著な腫瘍殺傷を誘発する。該抗体の放射能標識形態を使用した癌患者における初期結果は腫瘍選択性を証明している。
EGFRの、そのリガンドファミリーによる活性化の理解は困難なことであるが、遺伝的(1−3)、生物物理的(4−8)、そしてより最近では、結晶学的(9−17)な素晴らしい研究が、EGFR細胞内チロシンキナーゼドメインを活性化するために必要な複雑な一連のコンホメーション変化および凝集事象の多くを明らかにしている(18)。これらの複雑性のうち、溶液中では、EGFR細胞外ドメインは少なくとも2つの基本的コンホメーション、すなわち、不活性な係留型(tethered)コンホメーションおよび活性な非係留型または伸長型(extedned)リガンド結合「後部−後部」二量体をとることが明らかである。EGFRは、癌に関連した最初の増殖因子受容体であった(19;20)。EGFRは自己分泌リガンドにより活性化され(19;21;22)、高い割合の進行神経膠腫においては、EGFR受容体細胞外ドメインがトランケート化され(23;24)、したがって活性化される。しばしば、EGFRの活性化が悪性状態の維持に要求される。逆に、毛包およびブルンネル腺における少数の細胞を除き、成体生物においては、EGFRは低レベルで発現され、成体期においては不活性である。
mAb175の特異性
予備的結合研究は、mAb175が、mAb806に類似した、EGFRに対する特異性を示すことを示唆した。mAb806(IgG2b)およびmAb175(IgG1)のCDR領域においては、それぞれにおいて僅か1つのアミノ酸相違が存在するだけで、アミノ酸配列はほぼ同一である(図1)。これらの相違の全ては側鎖の電荷およびサイズを維持するものである。明らかに、これらの抗体は、独立して生じている。
mAb175は、アミノ酸6−273が欠失しているΔ2−7EGFRおよびEGFR1−501にも結合するため、mAb175エピトープは残基274−501内に含有されているに違いない。mAb806のエピトープの決定においては、本発明者らは、全てアミノ酸501で終結するヒトGHのカルボキシ末端に融合された一連のc−mycタグ付きEGFRフラグメントを発現させた(45;46)。mAb175はまた、ウエスタンブロットにおいて、274−501および282−501 EGFRフラグメントの両方と反応したが、アミノ酸290または298から始まるフラグメントを検出しなかった(補足的な図9)。全てのGH−EGFR融合タンパク質の存在は、c−myc抗体9E10を使用して確認された(補足的な図9)。したがって、mAb175エピトープの重要な決定基はアミノ酸290の近くに位置する。最後に、mAb806エピトープが欠失した274−501 EGFRフラグメント(Δ287−302)は、mAb175結合に関して陰性であったが(図9)、このことは、この領域がmAb175結合のほとんどを同様に決定したことを示唆している。
本発明者らはU87MG.Δ2−7神経膠腫異種移植片に対するmAb806およびmAb175のインビボ抗腫瘍活性を調べた。異種移植片を、抗体療法(2週間にわたり、示されている日の週3回)を開始する前に6日間樹立させた。この時点で、平均腫瘍体積は100mm3であった(図4A)。mAb175処理は、ビヒクルまたはmAb806での処理と比較して、全体的な腫瘍増殖速度の減少を引き起こし、それは接種後第19日に非常に有意であり(P<0.0001対対照およびP<0.002対ma806)、この時点で、倫理的理由により該対照群を犠死させた。この時点の平均腫瘍体積は、ビヒクル、mAb806およびmAb175に関して、それぞれ1530、300および100mm3であり(図4A)、このことは、mAb175が、Δ2−7EGFRを発現する異種移植片に対する抗腫瘍活性を有することを証明している。
mAb806およびmAb175が、全てではないが幾つかのコンホメーションにおけるEGFRをどのように認識しうるかの分子的詳細を理解するために、酸化型EGFR287−302エピトープと複合体化した(それぞれ、2.0および1.59オングストロームの分解能、図5Aおよび5B)、および単独の(それぞれ、2.3および2.8オングストロームの分解能)、両方の抗体のFabフラグメントの結晶構造を決定した。どちらの場合も、遊離および複合体化Fab構造は実質的に同一であり、該ペプチドおよび該抗体のCDRループのコンホメーションは十分に特徴づけられた(図5)。該エピトープはβ−リボン構造をとり、ここで、該リボンの一方の末端はFabを向き、V299は抗原結合部位の中央部に埋もれている(図5C〜E)。これらの抗体が、遥かに長いポリペプチドに結合することに合致して、該エピトープの両末端は溶媒に露出される。
タンパク質におけるジスルフィド結合は構造的剛性の増強をもたらすが、いくつかの細胞表面受容体、特に、サイトカインおよび増殖因子においては、ジスルフィド結合の一時的破壊およびジスルフィド交換が該受容体の機能を制御しうる(49)。これは、mAb806およびmAb175がそれらの結合部位への接近を達成しうる1つのメカニズムであったため、本発明者らは、271位および283位のシステイン残基の一方または両方をアラニン残基へと突然変異させることにより(C271A/C283A)、該エピトープの接近可能性を増強することを試みた。完全長C271A−、C283A−またはC271A/C283A−EGFRを発現しうるベクターをIL−3依存性Ba/F3細胞系内にトランスフェクトした。C271A−およびC271A/C283A−EGFR突然変異体をwtEGFRと同等のレベルで発現した安定なBa/F3クローンを選択した(図6A)。高レベルの突然変異体C283A−EGFRを発現するBa/F3細胞は観察されなかった。既に記載されているとおり、wtEGFRはmAb806と良くは反応しないが、該突然変異体受容体はmAb528、mAb806および抗FLAG抗体と同じくらい強く反応し、このことは、該受容体が細胞表面で発現され、正しくフォールディングされ、mAb806に対するエピトープがそのような場合に完全に接近可能であることを示唆している。mAb806がC271A/C283A突然変異体を、wtEGFRより効率的に認識することを証明するために、本発明者らはmAb528の結合に対するmAb806の結合の比を決定した。wtおよびC271A/C283A EGFRは共に、N末端においてFLAGタグ化されているため、本発明者らはM2抗体へのmAb806およびmAb528の結合の比をも決定した。既に報告されているとおり、mAb806は、Ba/F3細胞の表面上で発現される全wtEGFRの小さな割合を認識したに過ぎなかった(mAb806/528結合比は0.08である)(表3)。これとは対照的に、mAb806は、細胞表面上で発現されるC271A/C283A突然変異EGFRの実質的に全てを認識した(1.01のmAb806/528結合比)(図6Aおよび表3)。
報告されているとおり(44)、8名の患者[1名の女性および7名の男性;平均年齢61歳(範囲44〜75歳)]がこの第1相治験を完了した。患者8(この患者は原発性脳腫瘍を有していた)を除く全ての患者が参加基準を満たし、研究開始時点で全員が転移性疾患を有していた。腫瘍によるAb取り込みが全患者で見られ、111In−ch806(mAb806のキメラ化形態)は腫瘍における迅速かつ高レベルの取り込みを示した(図7)。正常器官(肝臓、肺、腎臓および脾臓)からの111In−ch806のクリアランスは用量レベル間の相違を示さなかった(44)。特に、肝臓クリアランスは用量レベル間の相違を全く示さず、これは、ch806に関する、肝臓における飽和可能抗原区画を全く示していない。全肝臓取り込みは、最大で、注入直後の14.45±2.43%IDであり、注入後72時間までに8.45±1.63%IDに、そして注入後1週間までに3.18±0.87%IDに減少した。これは、注入後の3日間以上にわたって肝臓において30%ID以上(用量40mgの場合)に達することが示されているwtEGFRに対する抗体(eg225)の取り込み(50)と好対照である。
EGFRまたは関連erbB2のレベルまたは活性が一定しない場合、EGFRファミリーメンバーを標的化するセツキシマブ(cetuximab)およびヘルセプチン(herceptin)のような抗体は癌治療のための重要な選択肢である。これらの抗体の結合部位、標的受容体およびより最近では抗体:受容体複合体の両方の3D構造の決定が、これらの抗体がどのようにして受容体活性化に干渉するのかに関する我々の理解を深めている。これらの研究は、この受容体ファミリー上の他のエピトープの標的化が、癌治療を改善するために抗体の組合せを使用する新たな機会をつくりうることを示唆している。
細胞系
Δ2−7 EGFRでトランスフェクトされたU87MG,Δ2−7(54)およびA431細胞系(2)は既に記載されている。ホルモン非依存性前立腺細胞系DU145(55)はATCC(atcc.org)から入手した。該細胞系の増殖条件に関しては、補足的データを参照されたい。
mAb806およびmAb175はBiological Production Facility(Ludwig Institute for Cancer Research,Melbourne)において製造され精製された。該抗体、抗体フラグメントおよびペプチドエピトープの製造および特徴づけに関しては、補足的データを参照されたい。
補足的データに記載されているとおりにマッピングを行った。
BIAcore 3000を全ての実験に使用した。5μl/分の流速でアミン、チオールまたはPmsカップリングを用いて、推定mAb806エピトープを含有するペプチドをCM5センサーチップ上に固定化した(47)。mAb806およびmAb175を25℃で5μl/分の流速で該センサー表面上を通過させた。各実施の間に、10mM HClを10μl/分の流速で注入することにより、該表面を再生させた。
細胞を細胞溶解バッファー(1% Triton X−100,30mM HEPES,150mM NaCl,500mM 4−(2−アミノエチル)ベンゼンスルホニルフルオリド,150nM アプロチニン,1mM E−64プロテアーゼインヒビター,0.5mM EDTA,および1mM ロイペプチン,pH7.4)で20分間細胞溶解し、14,000×gで30分間の遠心分離により清澄化し、5μg/mlの最終濃度の関連抗体で60分間免疫沈降させ、セファロースAビーズにより一晩捕捉した。ついでサンプルを2×NuPAGE SDSサンプルバッファー(Invitrogen)で溶出し、NuPAGEゲル(3〜8%または4〜12%)上で分離し、Immobilon−Pトランスファーメンブレン(Millipore)上にエレクトロトランスファーし、関連抗体でプローブした後、化学発光ラジオグラフィーにより検出した。
凍結切片を5μg/ml mAb175または無関係なイソタイプ対照で室温で60分間染色した。Dako Envision+HRP検出系を製造業者の説明に従い使用して、結合抗体を検出した。最後に、切片を水で洗浄し、ヘマトキシリンで対比染色し、マウントした。
100μLのPBS中のU87MG.Δ2−7細胞(3×106)を4〜6週齢の雌Balb/cヌードマウス(Animal Research Centre,Perth,Australia)の両脇腹に皮下接種した。全ての研究は、既に報告されている確立された腫瘍モデル(41)を使用して行った。適当な図面説明に示されている平均体積に腫瘍が達したら、治療を開始した。式(長さ×幅2)/2(ここで、長さは最長軸であり、幅は垂直測定値であった)を用いて、mm3単位の腫瘍体積を決定した。データは各治療群ごとに平均腫瘍体積±SEとして表されている。片側スチューデントt検定により有意性に関して全てのデータを分析し、ここで、p<0.05を、統計的に有意であるとみなした。この研究計画はAnimal Ethics Committee of the Austin Hospitalにより承認されたものであった。
(wt)EGFRの突然変異を、部位特異的突然変異誘発キット(Stratagene,La Jolla,CA)を使用して作製した。各突然変異誘発のための鋳型はヒトEGFR cDNA(アクセッション番号x00588)(2)であった。該EGFR突然変異の完全性を確認するために、各構築物の自動ヌクレオチド配列決定を行った。野生型および突然変異(C173A/C281A)EGFRをBaF/3細胞内にエレクトロポレーションによりトランスフェクトした。該細胞系の特徴づけに関する更なる詳細は補足的データに示されている。
Fab806、Fab175および個々のFab−ペプチド複合体を製造および分析するための結晶学的方法ならびに溶液中の15N標識806エピトープペプチドのNMR研究に関する詳細は補足的データに記載されている。分子置換および精密化(以下のとおりに収束するもの)により構造を決定した:Fab806に関してはR=0.225/Rfree=0.289およびFab806:ペプチドに関してはR=0.226/Rfree=0.279;Fab806に関してはR=0.210/Rfree=0.305およびFab806:ペプチドに関してはR=0.203/Rfree=0.257。
インビボでのmAb806の腫瘍特異性を示すために、キメラ形態(ch806)を操作し、cGMP条件下(56)で製造した。806陽性腫瘍を有する患者におけるch806の安全性、体内分布および免疫応答を評価するために、第I相初回人体治験を行った。安全性、体内分布および薬物動態学の結果は既に報告されている(44)。患者における正常組織(すなわち、肝臓)と比較した腫瘍におけるch806の特異性を定めるために、腫瘍および肝臓におけるch806の定量的取り込みを、5〜7mCi(200〜280MBq)の111In−ch806の注射後1週間にわたって得た全身ガンマカメライメージからの111In−ch806の%注射用量(ID)の計算により行った。肝臓および腫瘍線量測定の計算を、累積活性の計算を可能にするバックグラウンドおよび減衰に関して補正された各患者の111In−ch806注入イメージデータセットにおける関心領域に基づいて行った。注射後1週間にわたる腫瘍および肝臓における111In−ch806の濃度を導き出すために、線量測定計算を行った。
実験方法
細胞系
全ての細胞系を、10% FCS(CSL,Melbourne)、2mM グルタミン(Sigma Chemical Co,St.Louis)およびペニシリン/ストレプトマイシン(Life Technologies,Grand Island)を含有するDMEM(Life Technologies,Grand Island,NY)内で維持した。また、400mg/mlのGeneticin(Life Technologies,Inc,Grand Island)内でU87MG.Δ2−7細胞系を維持した。種々のEGF受容体を発現するBaF/3(l)およびBaF/3細胞系(2)を、10% ウシ胎児血清(GIBCO BRL)および10% WEHI−3B馴らし培地(3)(IL−3源としてのもの)で補足されたRPMI 1640(GIBCO BRL)内に常法により維持した。全ての細胞系を、空気/CO2(95%〜5%)雰囲気中、37℃で増殖させた。
抗体の作製。マウス線維芽細胞系NR6ΔEGFRを免疫原として使用した。アジュバント中の5×105〜2×106 細胞でBALB/cマウスの皮下に2〜3週間間隔で5回免疫化することにより、マウスハイブリドーマを作製した。初回注射には、完全フロイントアジュバントを使用した。ついで不完全フロイントアジュバント(Difco)を使用した。免疫化マウスからの脾細胞をマウス骨髄腫細胞系SP2/0と融合させた。新たに作製されたクローンの上清を赤血球吸着アッセイにおいて細胞系NR6、NR6wtEGFRおよびNR6ΔEGFRとの反応性に関してスクリーニングし、ついでヒト神経膠芽細胞腫細胞系U87MG、U87MGwtEGFRおよびU87MGΔEGFRでの赤血球吸着アッセイにより分析した。
これらのフラグメントでのトランスフェクションの前日に、ヒト293T胎児腎線維芽細胞を、2mlの培地を含有する6ウェル組織培養プレート内に、8×105/ウェルで播いた。製造業者の説明に従いLipofectamine 2000(Invitrogen)と複合体化された3〜4μgのプラスミドDNAで細胞をトランスフェクトした。トランスフェクションの24〜48時間後、細胞培養を吸引し、細胞単層を250μlの細胞溶解バッファー(1% Triton X−100,10% グリセロール,150mM NaCl,50mM HEPES(pH7.4),1mM EGTAおよびComplete Protease Inhibitor mix(Roche))中で細胞溶解した。細胞ライセートのアリコート(10〜15μl)を、1.5% β−メルカプトエタノールを含有するSDSサンプルバッファーと混合し、100℃で5分間の加熱により変性させ、10% NuPAGE Bis−Trisポリアクリルアミドゲル(Invitrogen)上で電気泳動させた。ついでサンプルをニトロセルロースメンブレンにエレクトロトランスファーし、それをTBSTバッファー(10mM Tris−HCl,pH8.0,100mM NaClおよび0.1% Tween−20)中で洗浄し、2.5%脱脂乳を含有するTBST中で室温で30分間ブロッキングした。メンブレンを、ブロッキングバッファー中、0.5μg/mlのmAb175と共に4℃で一晩インキュベートした。c−mycエピトープを検出するために、並行メンブレンをmAb9B11(1:5000,Cell Signaling Technology,Danvers,Massachussets)でプローブした。メンブレンをTBST中で洗浄し、ホースラディッシュペルオキシダーゼ結合ウサギ抗マウスIgG(Biorad)を1:5000の希釈度で含有するブロッキングバッファー中で室温で2時間インキュベートした。ついでブロットをTBST中で洗浄し、Western Pico Chemiluminescent Substrate(Pierce,Rockford,Illinois)とのインキュベーションの後、オートラジオグラフィーフィルムを使用して現像した。
増殖ホルモンに融合された、残基274、282、290および298から始まり全てアミノ酸501で終わる一連の重複c−mycタグ化EGFRエクトドメイン断片をは、既に記載されている(6)。
EGFR突然変異体を発現する細胞系の作製
突然変異EGFRを発現する安定細胞系をネオマイシン含有培地内での選択により得た。最終選択後、mRNAを各細胞系から単離し、逆転写し、EGFR配列をPCRにより増幅した。発現されたEGFR内の全ての突然変異を、該PCR産物を配列決定することにより確認した。5% FCS、5mM EDTA、PBS中で10μg/mlの抗EGFR抗体mAb528(9;10)を使用し、ついでAlexa 488標識抗マウスIg(1:4000の最終希釈度)を使用して、FACStar(Becton and Dickinson,Franklin Lakes,NJ)でのFACS分析により、EGFR発現のレベルを決定した。クラスが釣り合った無関係な一次抗体と共に該細胞をインキュベートすることにより、バックグラウンド蛍光を決定した。RPMI,10% FCS、10% WEHI3B馴らし培地および1.5mg/ml G418中、全ての細胞を常法により継代した。
wtEGFRまたはC271A/C283A−EGFRを発現する細胞を洗浄し、血清もIL−3も含有しない培地内で3時間インキュベートした。細胞を遠心分離により集め、EGF(100ng)または同等容量のPBSを含有する培地に再懸濁させた。15分後、細胞を集め、ペレット化し、β−メルカプトエタノールを含有するSDS/PAGEサンプルバッファー中で直接的に細胞溶解した。サンプルをNuPAGE 4〜12% 勾配ゲル上で分離し、Immobilon PVDFメンブレン上にトランスファーし、抗ホスホチロシン(4G10,Upstate Biotechnologies)または抗EGFR抗体(mAb806,LICRにて製造)でプローブした。化学発光を用いて、反応性バンドを検出した。
対数期で増殖している細胞を集め、PBSで2回洗浄して残存IL−3を除去した。細胞をRPMI 1640+10% FCSに再懸濁させ、担体のみ又は漸増濃度のEGFを伴う105 細胞/ウェルで96ウェルプレートに播いた。適当な場合には、一定濃度のmAb528またはmAb806(2μg/ウェル)をも該培地に加えた。MTTアッセイ(11)を用いて、増殖を決定した。
細胞を遠心分離により集め、対照または試験抗体(全て、FACSバッファー中、10μg/ml、氷上で40分間、FACSバッファー中で洗浄)、ついでAlexa488標識抗マウスIgG(1:400の最終希釈度、氷上で20分間)で染色した。該細胞を氷冷FACSバッファーで洗浄し、遠心分離により集め、FACScanで分析し、CellQuest(Becton and Dickinson)における統計ツールを使用してピーク蛍光チャネルおよび蛍光中央値を各サンプルに関して決定した。バックグラウンド(陰性対照)蛍光を全測定値から導き出した。蛍光中央値を、ピーク形状および蛍光強度を最もよく代表するものとして選択し、mAb806対mAb528結合の比を導き出すために用いた。
10mg/ml Fab、ならびに0.1M 酢酸ナトリウムバッファー(pH4.6)、6〜8% PEG6000および15〜20% イソプロパノールを含有するレザバーを使用して、懸滴蒸気拡散(hanging drop vapour diffusion)により、天然806Fabの結晶を成長させた。データ収集のために、0.1M 酢酸ナトリウムバッファー(pH4.6)、10% PEG6000、15〜20% イソプロパノールおよび10% グリセロールを含有する凍結防止剤溶液に結晶を移した。ついで結晶をナイロンループにおいてマウントし、直接的に液体窒素中で瞬間冷凍した。
NMR研究のために、15NH4Clで補足されたNeidhardtの最少培地(19)内で大腸菌(E.coli)を増殖させること以外はFairlieら(18)により既に記載されている方法を用いて、SHP2のSH2ドメインへの融合体として、15N標識ペプチドを組換え製造した。該ペプチドを、CNBrを使用して該融合相手から切断し、逆相HPLCにより精製し、その同一性をMALDI−TOF質量分析およびN末端配列決定により確認した。該ペプチド自体の内部での切断ではなく該融合相手からの切断を可能にするために、806抗体−結合配列内のメチオニン残基をロイシンへと突然変異させた。
Claims (41)
- 腫瘍形成性、過剰増殖性または異常細胞においては見出されるが正常細胞においては検出不可能であるEGFRエピトープを認識する単離された抗体であって、該抗体が連結ペプチドLEEKKGNYVVTDH(配列番号13)を認識せず、該抗体が、配列番号1〜3から選ばれるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDRドメイン配列と、配列番号4〜6から選ばれるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDRドメイン配列とを有する、抗体。
- EGFRアミノ酸ペプチドエピトープ287CGADSYEMEEDGVRKC302(配列番号14)を認識する、請求項1に記載の抗体。
- 配列番号4、5および6を含む重鎖可変領域CDR1、2および3配列を有する単離された抗体。
- 配列番号1、2および3を含む軽鎖可変領域CDR1、2および3配列を有する単離された抗体。
- 完全にヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ化抗体である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の単離された抗体。
- EGFRエピトープペプチド287CGADSYEMEEDGVRKC302(配列番号14)を認識し、de2−7 EGFR連結ペプチドLEEKKGNYVVTDH(配列番号13)を認識しない単離された抗体であって、配列番号1、2、3、4、5および/または6の1以上に記載されているものと実質的に同じポリペプチド配列を含む抗体。
- 該結合ドメインがヒト抗体フレームワークにより含有されている、請求項1〜4または6のいずれか1項に記載の単離された抗体。
- 配列番号4、5および/または6に記載されているCDR配列を有する可変重鎖とヒトIgG1定常領域とを含んでなる抗体。
- 配列番号1、2および/または3に記載されているCDR配列を有する可変軽鎖とヒトカッパ定常領域とを含んでなる抗体。
- 抗体F(ab’) 2 、scFvフラグメント、ジアボディ、トリアボディまたはテトラボディの形態の、請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体。
- 検出可能または機能的な標識を含有する、請求項1〜10のいずれか1項に記載の抗体。
- 該標識が、共有結合している薬物である、請求項11に記載の抗体。
- 該標識が放射能標識である、請求項11に記載の抗体。
- 該抗体がペジル化(pegylated)されている、請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体。
- 請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体をコードする配列を含んでなる単離された核酸。
- 請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体の製造方法であって、該抗体の発現を引き起こす条件下、請求項15記載の核酸を発現させ、該抗体を回収することを含んでなる製造方法。
- ヒトまたは動物の身体の治療または診断の方法において使用するための、請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体。
- EGFR腫瘍抗原に結合しうる抗体の製造方法であって、
a)CDRコード領域を欠くVHドメインをコードする核酸の出発レパートリーを準備し、
b)該レパートリーを、配列番号4、5または6のいずれかに記載されているのと実質的に同じアミノ酸配列をコードするドナー核酸と合体させて、該ドナー核酸を該欠落CDR領域内に挿入して、VHドメインをコードする核酸の産物レパートリーを得、
c)該産物レパートリーの核酸を発現させ、
d)試験動物における>1:1の最大腫瘍:血液局在化比を有し、場合によっては、該比において、<1:1の腫瘍非含有器官:血液比を有する特異的結合メンバーを選択し、
e)該結合メンバーまたはそれをコードする核酸を回収することを含んでなる製造方法。 - ヒト患者における腫瘍の治療方法であって、請求項1〜14および17のいずれか1項に記載の特異的結合メンバーまたは抗体の有効量を該患者に投与することを含んでなる方法。
- 請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体、場合によっては、試薬および/または使用説明を含んでなる、EGFRが異常発現される又はEGFRが増幅される若しくは突然変異体である腫瘍の診断のためのキット。
- 請求項1〜12および15のいずれか1項に記載の抗体、ならびに場合によっては、医薬上許容されるビヒクル、担体または希釈剤を含んでなる医薬組成物。
- 請求項21に記載の医薬組成物の医薬剤形ならびに、化学療法剤、抗EGFR抗体、放射線免疫療法剤およびそれらの組合せよりなる群から選ばれる追加的な抗癌剤を含む別個の医薬剤形とを含んでなる、ヒト患者における腫瘍の治療のためのキット。
- 該化学療法剤が、チロシンキナーゼインヒビター、リン酸化カスケードインヒビター、翻訳後モジュレーター、細胞成長または分裂インヒビター(例えば、抗有糸分裂物質)、シグナル伝達インヒビターおよびそれらの組合せよりなる群から選ばれる、請求項22に記載のキット。
- 該チロシンキナーゼインヒビターが、AG1478、ZD1839、STI571、OSI−774、SU−6668およびそれらの組合せよりなる群から選ばれる、請求項23に記載のキット。
- 該抗EGFR抗体が、抗EGFR抗体528、225、SC−03、DR8.3、L8A4、Y10、ICR62、ABX−EGFおよびそれらの組合せよりなる群から選ばれる、請求項22に記載のキット。
- 請求項1〜9のいずれか1項に記載の抗体またはそのフラグメントをコードするDNA配列またはその縮重変異体を含む組換えDNA分子で形質転換された単細胞宿主。
- 単細胞宿主が、大腸菌(E.coli)、シュードモナス(Pseudomonas)、バシラス(Bacillus)、ストレプトマイセス(Streptomyces)、酵母、CHO、YB/20、NSO、SP2/0、R1.1、B−W、L−M、COS1、COS7、BSC1、BSC40およびBMT10細胞、植物細胞、昆虫細胞ならびにヒト細胞(組織培養内のもの)よりなる群から選ばれる、請求項26に記載の該単細胞宿主。
- 増幅されたEGFRまたはde2−7EGFRの存在を検出するための方法であって、
A.増幅されたEGFRまたはde2−7EGFRの存在が疑われる哺乳動物からの生物学的サンプルを、請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体と、該抗体への該EGFRの結合が生じることを可能にする条件下で接触させ、
B.該サンプルからのEGFRと該抗体との間の結合が生じたかどうかを検出することにより、該EGFRを測定し、
ここで、結合の検出が該サンプル中の該EGFRの存在または活性を示す、方法。 - 請求項28に記載の方法によりEGFRの存在または活性を検出することを含んでなる、哺乳動物における癌を検出するための方法であって、該EGFRの存在の検出が該哺乳動物における腫瘍または癌の存在を示す、方法。
- 請求項21に記載の医薬組成物または請求項22に記載のキットの治療的有効量を哺乳動物に投与することを含んでなる、哺乳動物における癌を予防および/または治療するための方法。
- 請求項21に記載の医薬組成物または請求項22に記載のキットの治療的有効量を哺乳動物に投与することを含んでなる、哺乳動物における異常発現EGFRを産生する脳固有癌の治療方法。
- 該脳固有癌が、膠芽腫、髄芽腫、髄膜腫、腫瘍性星状細胞腫および増殖性動静脈奇形から選ばれる、請求項31に記載の方法。
- 該医薬組成物または該キットを全身投与する、請求項30または31に記載の方法。
- 請求項21に記載の医薬組成物または請求項22に記載のキットの治療的有効量を哺乳動物に投与することを含んでなる、哺乳動物における悪性神経性腫瘍の治療方法。
- 哺乳動物における癌の治療または予防のための、請求項1〜14のいずれか1項に記載の特異的結合メンバーまたは抗体の使用。
- 哺乳動物における癌の治療または予防のための、請求項21に記載の医薬組成物または請求項22に記載のキットの使用。
- 哺乳動物における癌の治療または予防のための医薬の製造のための、請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体の使用。
- 該癌が脳または脳付近に位置する、請求項35〜37のいずれか1項に記載の使用。
- 哺乳動物における神経性腫瘍の治療または予防のための医薬の製造のための、請求項1〜14のいずれか1項に記載の抗体の使用。
- 治療のための方法が放射線免疫療法を含む、請求項35〜39のいずれか1項に記載の使用。
- まず、請求項21に記載の抗体組成物を投与し、ついで、化学療法剤を含む組成物を投与する、請求項35〜39のいずれか1項に記載の使用。
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