JP2010134195A - 顕微鏡システム、標本観察方法およびプログラム - Google Patents
顕微鏡システム、標本観察方法およびプログラム Download PDFInfo
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Abstract
【解決手段】本発明のある実施の形態において、高解像画像取得処理部453は、顕微鏡装置2に対する動作指示を行い、標本領域を部分毎に撮像した複数の標本領域区画画像を取得する。そして、高解像画像取得処理部453は、各標本領域区画画像を繋ぎ合せてVS画像を生成する。色素量算出部455は、VS画像の画素毎に、対応する標本位置における染色色素毎の色素量を算出する。色素選択処理部456は、染色色素の中から表示対象色素を選択する。表示画像生成部457は、VS画像の各画素における表示対象色素の色素量をもとに、表示対象色素による標本Sの染色状態を表した表示画像を生成する。そして、VS画像表示処理部454は、生成した表示画像を表示部43に表示する処理を行う。
【選択図】図1
Description
図1は、実施の形態1の顕微鏡システム1の全体構成例を説明する模式図である。図1に示すように、顕微鏡システム1は、顕微鏡装置2とホストシステム4とがデータの送受可能に接続されて構成されている。なお、図1では、顕微鏡装置2の構成を模式的に示すとともに、ホストシステム4の主要な機能ブロックを示している。以下、図1に示す対物レンズ27の光軸方向をZ方向とし、Z方向と垂直な平面をXY平面として定義する。
実施の形態1では、VS画像の各画素の画素値をもとに、対応する標本S上の各標本位置における色素量を算出することとした。これに対し、算出した色素量を補正可能に構成してもよい。図18は、実施の形態2におけるホストシステム4aの主要な機能ブロックを示す図である。なお、実施の形態1で説明した構成と同一の構成については、同一の符号を付する。図18に示すように、実施の形態2の顕微鏡システムを構成するホストシステム4aは、入力部41、表示部43、処理部45a、記録部47a等を備える。
図23は、実施の形態3におけるホストシステム4bの主要な機能ブロックを示す図である。なお、実施の形態1で説明した構成と同一の構成については、同一の符号を付する。図23に示すように、実施の形態3の顕微鏡システムを構成するホストシステム4bは、入力部41、表示部43、処理部45b、記録部47b等を備える。
図26は、実施の形態4におけるホストシステム4cの主要な機能ブロックを示す図である。なお、実施の形態1と同様の構成には同一の符号を付する。図26に示すように、ホストシステム4cは、入力部41、表示部43、処理部45c、記録部47c等を備える。
図29は、実施の形態5におけるホストシステム4dの主要な機能ブロックを示す図である。なお、実施の形態1で説明した構成と同一の構成については、同一の符号を付する。図29に示すように、実施の形態5の顕微鏡システムを構成するホストシステム4dは、入力部41、表示部43、処理部45d、記録部47d等を備える。
2 顕微鏡装置
21 電動ステージ
221,231 モータ
223 XY駆動制御部
233 Z駆動制御部
24 顕微鏡本体
251 コレクタレンズ
252 照明系フィルタユニット
253 視野絞り
254 開口絞り
255 折曲げミラー
256 コンデンサ光学素子ユニット
257 トップレンズユニット
26 レボルバ
27 対物レンズ
28 光源
29 鏡筒
291 ビームスプリッタ
30 フィルタユニット
303 光学フィルタ
31 双眼部
311 接眼レンズ
32 TVカメラ
33 顕微鏡コントローラ
34 TVカメラコントローラ
4,4a,4b,4c,4d ホストシステム
41 入力部
43 表示部
45,45a,45b,45c,45d 処理部
451,451c,451d VS画像生成部
452 低解像画像取得処理部
453,453d 高解像画像取得処理部
454,454a,454b,454c,454d VS画像表示処理部
455,455b,460c,460d 色素量算出部
456 色素選択処理部
457,457a,457b 表示画像生成部
458a 色素量補正部
459b 擬似表示色割当部
461c 注目領域設定部
462c 注目領域画像取得処理部
463d 露光条件設定部
47,47a,47b,47c,47d 記録部
471,471c,471d VS画像生成プログラム
473,473a,473b,473c,473d VS画像表示処理プログラム
475b 擬似表示色データ
5,5c VS画像ファイル
S 標本
Claims (17)
- 顕微鏡を用い、複数の色素によって多重染色された標本を撮像した標本画像を取得する画像取得手段と、
前記標本画像の画素毎に、対応する標本上の位置を染色している色素毎の色素量を取得する色素量取得手段と、
前記複数の色素の中から表示対象色素を選択する色素選択手段と、
前記標本画像の各画素における前記表示対象色素の色素量をもとに、前記表示対象色素による前記標本の染色状態を表した表示画像を生成する表示画像生成手段と、
前記表示画像を表示部に表示する処理を行う表示処理手段と、
を備えることを特徴とする顕微鏡システム。 - 前記複数の色素のうちの少なくとも1つの色素の選択を依頼する色素選択依頼手段を備え、
前記色素選択手段は、前記色素選択依頼手段による依頼に応答して選択された色素を前記表示対象色素として選択することを特徴とする請求項1に記載の顕微鏡システム。 - 前記色素量取得手段によって前記表示対象色素について取得された色素量を所定の補正係数を用いて補正する色素量補正手段を備え、
前記表示画像生成手段は、前記色素量補正手段による補正後の前記表示対象色素の色素量をもとに、前記表示画像を生成することを特徴とする請求項1または2に記載の顕微鏡システム。 - 前記複数の色素のうちの所定の色素に対して、該色素による染色状態を表すための表示色を割り当てる表示色割当手段を備え、
前記表示画像生成手段は、前記表示色割当手段によって前記表示対象色素に前記表示色が割り当てられている場合に、該表示対象色素の色素量をもとに、前記表示対象色素による前記標本の染色状態を前記割り当てられている表示色で表した表示画像を生成することを特徴とする請求項1〜3のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。 - 前記表示画像生成手段は、前記表示対象色素の色素量をもとに、前記割り当てられている表示色の分光特性を用いて前記表示画像の画素値を算出し、前記表示画像を生成することを特徴とする請求項4に記載の顕微鏡システム。
- 前記複数の色素は、所定の標的分子の発現を標識することによって前記標本を染色する分子標的用色素を含み、
前記表示色割当手段は、前記分子標的用色素に対して前記表示色を割り当てることを特徴とする請求項5に記載の顕微鏡システム。 - 前記画像取得手段は、前記標本と対物レンズとを前記対物レンズの光軸と直交する面内で相対的に移動させながら、前記標本を部分毎に撮像して複数の標本画像を取得し、
前記複数の標本画像を繋ぎ合せて1枚の標本画像を生成する標本画像生成手段を備えることを特徴とする請求項1〜6のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。 - 前記標本画像中に注目領域を設定する注目領域設定手段と、
前記顕微鏡による前記標本の観察倍率を、前記標本画像を取得したときの前記標本の観察倍率よりも高い観察倍率に変更する倍率変更手段と、
前記倍率変更手段によって変更された観察倍率で、前記注目領域を撮像した注目領域画像を取得する注目領域画像取得手段と、
を備えることを特徴とする請求項1〜7のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。 - 前記複数の色素は、所定の標的分子の発現を標識することによって前記標本を染色する分子標的用色素を含み、
前記注目領域設定手段は、前記分子標的用色素によって標識されている前記標的分子の高発現部位を抽出し、前記注目領域として設定することを特徴とする請求項8に記載の顕微鏡システム。 - 前記注目領域設定手段は、前記標本画像中から低輝度部位を抽出し、前記注目領域として設定することを特徴とする請求項8に記載の顕微鏡システム。
- 前記注目領域画像取得手段は、前記対物レンズの光軸方向に沿って前記標本と前記対物レンズとの相対距離を変化させながら、前記注目領域を撮像した複数の注目領域画像を取得することを特徴とする請求項8〜10のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。
- 前記画像取得手段は、前記標本を撮像する際の露光条件を段階的に設定する露光条件設定手段を有し、前記露光条件設定手段によって設定された露光条件に従って前記標本画像を取得することを特徴とする請求項1〜11のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。
- 前記画像取得手段によって取得された前記標本画像の明るさを判定する明るさ判定手段を備え、
前記露光条件設定手段は、前記明るさ判定手段によって判定された明るさに応じて前記露光条件の段階的な設定を行うことを特徴とする請求項12に記載の顕微鏡システム。 - 前記露光条件設定手段は、前記画像取得手段によって取得された前記標本画像を構成する画素に対応する標本上の位置が所定の色素によって染色されている場合に、前記露光条件の段階的な設定を行うことを特徴とする請求項12または13に記載の顕微鏡システム。
- 前記露光条件設定手段は、前記画像取得手段によって取得された前記標本画像を構成する画素に対応する標本上の位置が所定の色素によって染色されている場合であって、前記標本画像において前記染色されている位置が占める面積が所定の面積以上である場合に、前記露光条件の段階的な設定を行うことを特徴とする請求項12〜14のいずれか1つに記載の顕微鏡システム。
- 顕微鏡を用い、複数の色素によって多重染色された標本を撮像した標本画像を取得する画像取得工程と、
前記標本画像の画素毎に、対応する標本上の位置を染色している色素毎の色素量を取得する色素量取得工程と、
前記複数の色素の中から表示対象色素を選択する色素選択工程と、
前記標本画像の各画素における前記表示対象色素の色素量をもとに、前記表示対象色素による前記標本の染色状態を表した表示画像を生成する表示画像生成工程と、
前記表示画像を表示部に表示する処理を行う表示処理工程と、
を含むことを特徴とする標本観察方法。 - コンピュータに、
顕微鏡に対する動作指示を用い、複数の色素によって多重染色された標本を撮像した標本画像を取得する画像取得ステップと、
前記標本画像の画素毎に、対応する標本上の位置を染色している色素毎の色素量を取得する色素量取得ステップと、
前記複数の色素の中から表示対象色素を選択する色素選択ステップと、
前記標本画像の各画素における前記表示対象色素の色素量をもとに、前記表示対象色素による前記標本の染色状態を表した表示画像を生成する表示画像生成ステップと、
前記表示画像を表示部に表示する処理を行う表示処理ステップと、
を実行させることを特徴とするプログラム。
Priority Applications (3)
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