JP2016104028A - バーチャル細胞染色システム - Google Patents

Abstract

【課題】生体細胞の細胞構造をディスプレイするシステム及び方法の提供。【解決手段】生体細胞の複数の細胞構造が記憶され、そしてこの複数の細胞構造の各々の細胞構造に関して、１つ以上の染料色が記憶され、選択された細胞構造が、インプットデバイスから受信され、選択された細胞構造の１つ以上の染料色が読み出され、選択された細胞構造の１つ以上の染料色がディスプレイされ、選択された染料色は、インプットデバイスから受信され、選択された細胞構造が、例示的な細胞画像中で選択された染料色でディスプレイされ、更に生体細胞の三次元画像が記憶され、前記三次元画像は、タッチスクリーンを備えるディスプレイ上にディスプレイされ、ムーブメント選択は、タッチスクリーンから受信され、前記三次元画像は、ムーブメント選択によってディスプレイ上にディスプレイされる様に構成されているプロセッサー。【選択図】なし

Description

関連出願
本出願は、米国特許法第１１９条（ｅ）項のもとで、２０１０年１２月７日出願の米国特許仮出願第６１／４２０，７０８、２０１１年３月８日出願の米国特許仮出願第６１／４５０，５１９号、および２０１１年９月３０日出願の米国特許仮出願第６１／５４１，３７５号の恩典を請求する。上記で特定された出願の開示は、あたかも詳細に示されるかのように、参照によって本明細書に援用される。

分野
本開示は概して、生物学的材料の画像化、ならびに詳細には、細胞および関連の構造のバーチャル染色のためのシステム、方法、ソフトウェアおよびコンピューターで使用可能な媒体に関する。

はじめに
画像化実験では、色素または染料を用いて、生体細胞の種々のオルガネラまたは構造を標識する。細胞のこれらの構造を染色して、例えば、細胞について分析または学習する。細胞の２つ以上の構造が同時に染色される場合が多い。これは、多重染色と呼ばれる。クロストークとは、多重染色から発生する色の重複または混合である。多重染色から発生する色にクロストークが多すぎる場合、個々の構造を識別することが不可能な場合もある。結果として、実験のために細胞の特定の構造を特定または分析することが不可能である場合もある。

伝統的に、多重染色に関与する画像化実験では、クロストークの予防はたいてい、試行錯誤を通じて達成された。典型的には、試薬を購入して、プロトコールを行い、細胞を染色して、互換性の顕微鏡を用いて、クロストークが出現するか否かを決定する。次に、クロストークを生じない染料の組み合わせが見出されるまで、これらの工程を繰り返して行う。このようなアプローチは、必要であるよりも多くの試薬を購入して用いることを必要とする場合が多く、かつまた、画像化実験を行うのに必要な全体的時間を有意に増大し得る。

要旨
バーチャル細胞染色を創出するためのシステムおよび方法が提供される。具体的には、多重染色適用で用いられる試薬の間の色のクロストークを最小限にするための技術が提供される。

一態様では、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステムが提供される。このシステムは、メモリー、インプットデバイス、ディスプレイおよびプロセッサーから構成される。このメモリーは、生体細胞の複数の細胞構造および各々の細胞構造についての１つ以上の染料色を記憶するように構成される。このプロセッサーは、メモリー、インプットデバイスおよびディスプレイと通信状態にある。このプロセッサーはさらに、選択された細胞構造をインプットデバイスから受信するように、選択された細胞構造の１つ以上の染料色を上記メモリーから読み出すように、上記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を上記ディスプレイ上にディスプレイするように、上記インプットデバイスから染料色を受信するように、かつ、上記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である上記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において上記選択された染料色で上記選択された細胞構造をディスプレイするように、構成される。

一態様では、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法が提供される。生体細胞の複数の細胞構造および各々の細胞構造についての１つ以上の染料色が、メモリーを用いて記憶される。選択された細胞構造を、インプットデバイスからプロセッサーを用いて読み出す。選択された細胞構造の１つ以上の染料色は、メモリーからプロセッサーを用いて読み出される。選択された細胞構造の１つ以上の染料色は、ディスプレイ上にプロセッサーを用いてディスプレイされる。選択された染料色を、インプットデバイスから、プロセッサーを用いて受信する。この選択された細胞構造を、プロセッサーを用いて、選択された染料色での選択された細胞構造の染色の見本であるディスプレイ上の例示的な細胞画像において、選択された染料色でディスプレイする。

一態様では、コンピュータープログラム製品であって、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備え、その内容はプロセッサー上で実行される指示を有するプログラムを備え、それによって、生体細胞の細胞構造を提示するための方法を行う、コンピュータープログラム製品が提供される。あるシステムであって、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備え、ここでこの別個のソフトウェアモジュールが、記憶モジュールと染色モジュールとを備えるシステムが提供される。生体細胞の複数の細胞構造および各々の細胞構造についての１つ以上の染料色は、メモリーにおいて、上記記憶モジュールを用いて記憶される。選択された細胞構造は、インプットデバイスから、上記染色モジュールを用いて受信される。上記選択された細胞構造の１つ以上の染料色は、上記メモリーから、上記記憶モジュールを用いて読み出される。上記選択された細胞構造の１つ以上の染料色をディスプレイ上に、上記染色モジュールを用いてディスプレイする。選択された染料色は、上記インプットデバイスから、上記染色モジュールを用いて受信される。上記選択された細胞構造は、上記染色モジュールを用いて、上記選択された染料色での上記選択された細胞構造の染色の見本である上記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、上記選択された染料色でディスプレイされる。

一態様では、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステムが提供される。このシステムは、メモリーとプロセッサーとを備える。このメモリーは、生体細胞の複数の細胞構造および各々の細胞構造についての１つ以上の染料色を記憶するように構成される。このプロセッサーは、上記メモリーおよびクライアントデバイスと通信状態にある。このプロセッサーはさらに、選択された細胞構造を前記クライアントデバイスから受信するように、この選択された細胞構造の１つ以上の染料色を上記メモリーから読み出すように、上記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を上記クライアントデバイス上に通信およびディスプレイするように、選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように、ならびに、上記選択された染料色での上記選択された細胞構造の染色の見本である上記クライアントデバイス上の例示的な細胞画像において、上記選択された細胞構造を上記選択された染料色で通信しかつディスプレイするように、構成される。

一態様では、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法が提供される。カスタマーが、デバイス中で試薬製品に関与するシミュレーションを行うことを可能にするためのプロセッサーを備えるコンピュータープログラム製品が提供される。上記試薬製品に対応する選択可能アイテムは、コンピュータープログラム製品上に、および上記デバイス上にディスプレイされ、ここではカスタマーによって選択された場合、このプロセッサーは、上記試薬製品のオーダーを引き起こすように構成されている。この試薬製品の引き起こされたオーダーは、上記プロセッサーを用いて処理される。

これらおよび他の特徴が本明細書に提供される。
以下に、本発明の基本的な諸特徴および種々の態様を列挙する。
［１］
以下を備える、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステム：
生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを記憶するように構成されたメモリー；
インプットデバイス；
ディスプレイ；ならびに
前記メモリー、前記インプットデバイス、および前記ディスプレイと通信状態にあるプロセッサーであって、
選択された細胞構造をインプットデバイスから受信するように；
前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように；
前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上にディスプレイするように；
選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように；かつ
前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された染料色で前記選択された細胞構造をディスプレイするように、
構成されている、プロセッサー。
［２］
前記メモリーがさらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を記憶するように構成されており、かつ、前記プロセッサーがさらに、選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから読み出し、前記選択された染料色の前記１つ以上の試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイし、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから受信し、かつ前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、［１］記載のシステム。
［３］
前記プロセッサーがさらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから受信するように、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように、第二の選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上にディスプレイするように、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように、かつ、前記選択された染料色と第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された染料色で第二の選択された細胞構造をディスプレイするように構成されている、［１］記載のシステム。
［４］
前記複数の細胞構造が画像として記憶される、［１］記載のシステム。
［５］
前記画像が三次元である、［４］記載のシステム。
［６］
前記例示的な細胞画像が、２つ以上の細胞画像の統合である、［１］記載のシステム。
［７］
前記プロセッサーがさらに、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品をディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、［２］記載のシステム。
［８］
前記プロセッサーがさらに、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムを、ディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、［２］記載のシステム。
［９］
以下の工程を包含する、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法：
生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とをメモリーを用いて記憶する工程；
選択された細胞構造をインプットデバイスからプロセッサーを用いて受信する工程；
前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程；
前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色をディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程；
選択された染料色を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程；および
前記選択された細胞構造の前記選択された染料色での染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された細胞構造を前記選択された染料色で前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程。
［１０］
さらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を記憶する工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程、前記選択された染料色の前記１つ以上の試薬製品を前記プロセッサーを用いて前記ディスプレイ上にディスプレイする工程、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、および前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程を包含する、［９］記載の方法。
［１１］
さらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程、第二の選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、および、前記選択された染料色と第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された染料色で第二の選択された細胞構造を前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程を包含する、［９］記載の方法。
［１２］
前記複数の細胞構造が画像として記憶される、［９］記載の方法。
［１３］
前記画像が三次元である、［１２］記載の方法。
［１４］
例示的な細胞画像中に前記選択された細胞構造を前記選択された染料色でディスプレイする工程がさらに、前記選択された細胞構造を２つ以上の細胞画像の統合としてディスプレイすることを包含する、［８］記載の方法。
［１５］
さらに、前記プロセッサーを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、［１０］記載の方法。
［１６］
さらに、前記プロセッサーを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムを、前記ディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、［１０］記載の方法。
［１７］
以下の工程を含む生体細胞の細胞構造を提示するための方法を行うためにプロセッサー上で実行される指示を有するプログラムをその内容に備える、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備えるコンピュータープログラム製品：
記憶モジュールと染色モジュールとを備える１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムを設ける工程；
生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを前記記憶モジュールを用いてメモリーに記憶する工程；
選択された細胞構造をインプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程；
前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程；
前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色をディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程；
選択された染料色を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程；および
前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された細胞構造を前記選択された染料色で前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程。
［１８］
前記指示によって行われる前記方法がさらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を前記記憶モジュールを用いて記憶する工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記染色モジュールを用いて前記ディスプレイ上にディスプレイする工程、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、および前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程を包含する、［１７］記載のコンピュータープログラム製品。
［１９］
前記指示によって行われる前記方法がさらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、および、前記染色モジュールを用いて、前記選択された染料色と前記第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、前記ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された細胞構造を前記第二の選択された染料色でディスプレイする工程を包含する、［１７］記載のコンピュータープログラム製品。
［２０］
前記複数の細胞構造が画像として記憶される、［１７］記載のコンピュータープログラム製品。
［２１］
前記画像が三次元画像である、［２０］記載のコンピュータープログラム製品。
［２２］
例示的な細胞画像が２つ以上の細胞画像の統合である、［１７］記載のコンピュータープログラム製品。
［２３］
指示によって行われる前記方法がさらに、前記染色モジュールを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品をディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、［１７］記載のコンピュータープログラム製品。
［２４］
指示によって行われる前記方法がさらに、前記染色モジュールを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムをディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、［１８］記載のコンピュータープログラム製品。
［２５］
以下を備える、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステム：
生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを記憶するように構成されたメモリー；ならびに
前記メモリーおよびクライアントデバイスと通信状態にあるプロセッサーであって、
選択された細胞構造を前記クライアントデバイスから受信するように；
前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように；
前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記クライアントデバイス上に通信およびディスプレイするように；
選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように；かつ
前記選択された細胞構造を、前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記クライアントデバイス上の例示的な細胞画像において前記選択された染料色で通信およびディスプレイするように、
さらに構成されている、プロセッサー。
［２６］
前記プロセッサーが、前記クライアントデバイスとネットワーク接続を介して通信する、［２５］記載のシステム。
［２７］
前記選択された細胞構造および選択された染料色が、前記クライアントデバイス上で行われているウェブブラウザー上にディスプレイされる、［２６］記載のシステム。
［２８］
以下の工程を包含する、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法：
デバイス中で試薬製品に関与するシミュレーションをカスタマーが行うことを可能にするためのプロセッサーを備えるコンピュータープログラム製品を提供する工程；
前記コンピュータープログラム製品を用いてかつ前記デバイス上に、前記試薬製品に対応する選択可能アイテムをディスプレイする工程であって、ここで、前記カスタマーによって選択された場合、前記プロセッサーは、前記試薬製品のオーダーを引き起こすように構成されている、工程；ならびに
前記試薬製品の引き起こされたオーダーを前記プロセッサーを用いて処理する工程。

当業者は、下に記載される図面が、例示の目的に過ぎないことを理解する。この図面は、本発明の教示の範囲を決して限定する意図ではない。

図１は、本発明の教示の実施形態が実施され得るシステムを図示するブロック図である。 図２は、種々の実施形態による、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムの例示的な最初のスクリーンである。 図３は、種々の実施形態による、核細胞構造が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図４は、種々の実施形態による、核細胞構造および緑の染料色が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図５は、種々の実施形態による、試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで、核細胞構造および緑の染料色について選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図６は、種々の実施形態による、核および原形質膜細胞構造についての試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図７は、種々の実施形態による、試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで、ミトコンドリア細胞構造および緑の染料色について選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図８は、種々の実施形態による、試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで、リソソーム細胞構造および緑の染料色について選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図９は、種々の実施形態による、ミトコンドリアおよびリソゾームの細胞構造についての試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーンである。 図１０は、種々の実施形態による、生体細胞の三次元（３−Ｄ）細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的な最初のスクリーンである。 図１１は、種々の実施形態による、３−Ｄ細胞画像が傾斜され得ることを示している、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーンである。 図１２は、種々の実施形態による、３−Ｄ細胞画像が傾斜され、パンされ、かつズームされ得ることを示している、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーンである。 図１３は、種々の実施形態による、細胞構造に対する情報を示している生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーンである。 図１４は、種々の実施形態による、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法を示している例示的なフローチャートである。 図１５は、種々の実施形態による、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法を行う、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムの回路図である。 図１６は、種々の実施形態による、生体細胞の三次元細胞構造をディスプレイするための方法を示している、例示的なフローチャートである。 図１７は、種々の実施形態による、生体細胞の三次元細胞構造をディスプレイするための方法を行う、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムの回路図である。 図１８は、シミュレートされた環境で用いられる試薬製品についての情報を得るための方法を示している、例示的なフローチャートである。 図１９は、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法を示している、例示的なフローチャートである。

本発明の教示の１つ以上の実施形態を詳細に記載する前に、当業者は、本発明の教示は、それらの適用が、以下の詳細な説明に示されるか、または図面に例示される構築物の詳細、構成要素の配置、および工程の配置に限定されないことを理解する。また本明細書に用いられる表現および用語は、説明の目的であり、限定と解釈されるべきではないことが理解されるべきである。

詳細な説明
システム
図１は、本発明の教示の実施形態が実行され得る、システム１００を図示するブロック図である。システム１００は、限定するものではないが、コンピューター、携帯電話、タブレットデバイス、ゲーム機、音楽プレイヤー、ビデオプレイヤー、または実験装置であってもよい。コンピューターは、計算可能な任意のデバイスを備えてもよく、これには例えば、ワークステーション、デスクトップコンピューター、ラップトップコンピューターを挙げることができる。種々の実施形態では、システム１００はウェブであってもよいし、またはネットワーク（例えば、ＬＡＮ、ＷＡＮ、インターネットなど）の接続（例えば、有線または無線）を通じて、１つ以上のクライアントデバイスと通信状態にあるように構成され得るアプリケーションサーバーであってもよい。例えば、システム１００は、例えば、Ｃａｔｅｇｏｒｙ６（ＣＡＴ６）、光ファイバー、Ｗｉ−Ｆｉ、ＷＬＡＮなどを介して、インターネットを通じて１つ以上のクライアントデバイス（示さず）に通信的に接続されている、スイッチ、ルーターおよび／またはウェブサーバー（示さず）に通信的に接続されてもよい。

タブレットデバイスとしては、タブレットとして実質的に成形された任意の電気装置を挙げることが可能で、例えば、ｉＰａｄ（登録商標）、Ｗｉｎｄｏｗｓベースのタブレットデバイス、またはＡｎｄｒｏｉｄ（登録商標）ベースのタブレットデバイスを挙げることができる。携帯電話装置としては、ユーザーによって運ばれうる、ユーザーが電話による会話に関わることを可能とする任意のデバイスを挙げることが可能で、これには、例えば、ｉＰｈｏｎｅ（登録商標）、Ｗｉｎｄｏｗｓ Ｐｈｏｎｅ（商標）ベースの携帯電話、ＷｅｂＯＳ（商標）ベースの携帯電話、またはＡｎｄｒｏｉｄベースの携帯電話を挙げることができる。ゲーム機としては、ユーザーが、ビデオゲームを行い、インターネットにアクセスすることを可能にし得る任意のデバイスが挙げられ、これには、例えば、Ｐｌａｙｓｔａｔｉｏｎ（登録商標）の装置またはＷｉｉ（登録商標）の装置を挙げることができる。音楽プレイヤーおよびビデオプレイヤーとしては、それぞれ音楽およびビデオを再生できる任意の装置を挙げることができる。実験装置としては、実験室での使用に適切な任意の装置を挙げることが可能で、これには、例えば、遺伝子分析装置、核酸配列決定機、核酸合成機、核酸精製機、フローサイトメーター、遺伝子発現分析装置、遺伝子マッピング装置、細胞分析装置、細胞カウンター、デジタル顕微鏡などを挙げることができる。

種々の実施形態では、システム１００は、情報を通信するためのバス１０２または他の通信機構、ならびに情報を処理するためにバス１０２と連結されたプロセッサー１０４を備えてもよい。システム１００はまた、ランダムアクセスメモリー（ＲＡＭ）または他の動的記憶デバイス（ベースコールを決定するためにバス１０２と連結されている）であってもよい、メモリー１０６と、プロセッサー１０４によって実行される指示とを備えてもよい。メモリー１０６はまた、プロセッサー１０４によって実行される指示の実行の間に、一時的変数または他の中間情報を記憶するために用いられてもよい。システム１００はさらに、リード・オンリ・メモリ（ＲＯＭ）１０８または他の静的記憶デバイス（プロセッサー１０４の静的な情報および指示を記憶するためにバス１０２に連結された）を備えてもよい。記憶装置１１０、例えば、磁気ディスクまたは他の光ディスクが、情報および指示を記憶するために、設けられて、バス１０２と連結されてもよい。

システム１００は、情報をユーザーにディスプレイするために、バス１０２を介して、ディスプレイ１１２、例えば、陰極線管（ＣＲＴ）または液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）に対して連結されてもよい。英数字および他のキーを含んでもよい、インプットデバイス１１４を、プロセッサー１０４に情報およびコマンド選択を通信するために、バス１０２に連結してもよい。別の種類のユーザーインプットデバイスは、方向の情報およびコマンドの選択をプロセッサー１０４に通信するため、ならびにカーソルの動きをディスプレイ１１２の上で制御するための、カーソルコントロール１１６、例えば、マウス、トラックボールまたはカーソル方向キーまたはタッチパッド（ｔｏｕｃｈ−ｓｅｎｓｉｔｉｖｅ ｐａｄ）またはスクリーンである。このインプットデバイスは典型的には、２つの程度の自由度を２つの軸（第一の軸（すなわち、ｘ）および第二の軸（すなわち、ｙ））に有し、これによって、このデバイスは、平面での位置を特定することが可能になる。

システム１００は、本発明の教示を行うことができる。本発明の教示の特定の実行と一致して、メモリー１０６に含まれる１つ以上の指示の１つ以上の順序を実行するプロセッサー１０４に応答して、システム１００によって、結果が提供される。このような指示は、記憶装置１１０のような別のコンピューター読み取り可能な媒体からメモリー１０６中に読み取られ得る。メモリー１０６に含まれる指示の順序の実行によって、プロセッサー１０４は、本明細書に記載されるプロセスを行うことができるようになる。あるいは、配線で接続された電気回路を、本発明の教示を実行するためのソフトウェア指示の代わりに、またはそれと組み合わせて用いてもよい。従って、本発明の教示の実行は、ハードウェア電気回路およびソフトウェアの任意の特定の組み合わせに限定されない。

「コンピューター読み取り可能な媒体」という用語は、本明細書において用いる場合、実行についてプロセッサー１０４に対して指示を提供することに関与する、任意の有形のかつ一時的でない媒体を指す。このような媒体は、多くの形態をとり、この形態としては、限定するものではないが、不揮発性の媒体、揮発性の媒体および伝送媒体が挙げられる。不揮発性の媒体としては、例えば、光ディスクまたは磁気ディスク、例えば、記憶装置１１０が挙げられる。揮発性媒体としては、動的メモリー、例えば、メモリー１０６が挙げられる。伝送媒体としては、同軸ケーブル、銅線および光ファイバーが挙げられ、これには、バス１０２を含むワイヤが挙げられる。

コンピューター読み取り可能な媒体の共通の形態としては、例えば、フロッピーディスク、フレキシブルディスク、ハードディスク、磁気テープ、または任意の他の磁気媒体、ＣＤ−ＲＯＭ、任意の他の光媒体、パンチカード、紙テープ、穴のパターンを有する任意の他の物理的媒体、ＲＡＭ、ＰＲＯＭ、ＥＰＲＯＭ、ＦＬＡＳＨ−ＥＰＲＯＭ、任意の他のメモリーチップもしくはカートリッジ、またはコンピューターが読むことができる任意の他の有形でかつ一時的でない媒体が挙げられる。

種々の形態のコンピューター読み取り可能な媒体は、実行のためにプロセッサー１０４に１つ以上の指示の１つ以上の順序を伝搬することに関与し得る。例えば、この指示は最初、リモート・コンピューターの磁気ディスクで行われてもよい。このリモート・コンピューターは、指示をその動的メモリーにロードして、モデムを用い電話線を超えてその指示を送ることができる。システム１００に対してローカルなモデムは、電話線上のデータを受信し得、かつ赤外線送信機を用いて、そのデータを赤外線シグナルに変換し得る。バス１０２に連結された赤外線検出器は、赤外線シグナルで運ばれるデータを受信し、かつそのデータをバス１０２上に与え得る。バス１０２は、このデータをメモリー１０６に伝えることが可能で、これからプロセッサー１０４は指示を読み出して実行する。メモリー１０６によって受信される指示は必要に応じて、プロセッサー１０４による実行の前後のいずれかに、記憶装置１１０に記憶され得る。

種々の実施形態によれば、ある方法を行うためにプロセッサーによって実行されるように構成された指示は、有形でかつ一時的でないコンピューター読み取り可能な媒体に記憶される。コンピューター読み取り可能な媒体は、デジタル情報を記憶するデバイスであり得る。例えば、コンピューター−読み取り可能な媒体としては、ソフトウェアを記憶するために当該分野で公知のような、コンパクトディスクリードオンリメモリ（ＣＤ−ＲＯＭ）が挙げられる。コンピューター読み取り可能な媒体は、実行されるように構成された指示を実行するために適切なプロセッサーによってアクセスされる。

システム１００はまた、インプット／アウトプットのポート１１８を備えてもよい。インプット／アウトプットのポート１１８は、通信装置に接続するために用いられ得る。通信装置は、有線または無線のネットワークインターフェース機器を備えてもよい。有線または無線のネットワークインターフェース機器は、私的または公的なネットワークに接続されてもよい。例示的な公的ネットワークとは、例えば、インターネットである。有線または無線のネットワークインターフェース機器は、１つ以上のインターネットサービスのプロバイダー（ＩＳＰ）の１つ以上のコンピューターを通じてインターネットに接続され得る。システム１００は、限定するものではないが、Ｗｅｂベースのシステム、クラウドコンピューティングシステムまたはサービス型ソフトウェアシステム（ｓｏｆｔｗａｒｅ ａｓ ａ ｓｅｒｖｉｃｅ ｓｙｓｔｅｍ）（ＳＡＡＳ）を含み得るシステムの一部であってもよい。

本発明の教示の種々の実行の以下の説明は、例示および説明の目的で提示された。これは、網羅的ではなく、本発明の教示を開示される厳密な形態に限定するものではない。改変および変化型は、上記の教示に照らして可能であるか、または本発明の教示の実施から獲得され得る。さらに、記載された実装としては、ソフトウェアが挙げられるが、本発明の教示は、ハードウェアおよびソフトウェアの組み合わせとして実行されても、またはハードウェア単独で実行されてもよい。本発明の教示は、オブジェクト指向性および非オブジェクト指向性のプログラミングシステムの両方で実行され得る。

データ処理のシステムおよび方法
上記のように、多重染色に関与する画像化実験は伝統的に、発色した色の間のクロストークを防ぐために試行錯誤のアプローチを必要とした。このアプローチでは、試薬の購入、プロトコールの実行、細胞の染色および発色した色の分析という工程を繰り返し実行して、クロストークを最小化または排除する。このアプローチでは、必要であるよりも多くの試薬を購入して用いることが必要となり得、画像化実験を行うために必要な時間全体が延長し得る。

種々の実施形態では、バーチャル細胞染色を創出するためのシステムおよび方法を用いる。このバーチャル細胞染色を用いて、例えば、多重染色に関与する画像化実験で、発色した色の間のクロストークを防ぐかまたは最小限にすることができる。バーチャル細胞染色は、例示的な細胞の１つ以上の構造を電子デバイスのディスプレイ上にディスプレイすること、およびユーザーが細胞の１つ以上の構造の個々の色を変化することを可能にすることを包含する。細胞の１つ以上の構造の色は、１つ以上の構造について公知の試薬から生成される公知の染色によって発色される色に変化され得る。このバーチャル細胞染色によって、ユーザーは、なんら試薬を購入することなく、かつなんら実験プロトコールを行うことなく、複数の多重染色の組み合わせをあてはめることが可能になる。

図２は、種々の実施形態による、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムの例示的な最初のスクリーン２００である。スクリーン２００は、細胞画像エリア２１０、細胞構造メニュー２２０、プロンプト２３０、フルスクリーンボタン２４０、およびフィードバックリンク２５０を備え得る。スクリーン２００では、例示的な細胞画像が、染色に利用可能な細胞構造の全ての画像を含む画像エリア２１０にディスプレイされる。これらの細胞構造はまた、細胞構造メニュー２２０で選択可能なメニューアイテムとして列挙される。細胞画像エリア２１０にディスプレイされ、細胞構造メニュー２２０に列挙される細胞構造としては、限定するものではないが、オートファゴソーム、細胞骨格−アクチン、細胞骨格−チューブリン、小胞体、エンドソーム、ゴルジ、リソソーム、ミトコンドリア、核、ペルオキシソーム、および原形質膜を挙げることができる。

画像エリア２１０でディスプレイされる例示的な細胞画像は、例えば、積層される１つ以上の細胞由来の細胞構造の２つ以上の画像の統合である。細胞構造の２つ以上の画像は、例えば、リアルな細胞の画像または人工的に作製される画像から作成され得る。画像エリア２１０の例示的な細胞画像は、細胞構造をポートレイ／ディスプレイするように設計され、それらがどのように見えるかによって、可視化のために構造を染色するために選択された試薬をアプライしなければならない。画像エリア２１０の例示的な細胞画像の細胞構造は、同じ色で示され得、そして好ましくは色は、染色には用いられない。例示的な細胞画像の細胞構造は、例えば、黒い背景では白い色で示され得る。図１の画像エリア２１０の例示的な細胞画像の細胞構造は、例示の目的のために、白い背景に黒で示される。

細胞構造メニュー２２０に列挙された各々の細胞構造は、選択可能である。プロンプト２３０は、染料を選択して、バーチャル細胞染色を開始するために、細胞構造メニュー２２０に列挙される細胞構造の選択を促す。フルスクリーンボタン２４０およびフィードバックリンク２５０もまた選択可能である。例えば、フルスクリーンボタン２４０によって、スクリーン２００またはスクリーン２００の一部がディスプレイのスクリーン全体を占有するようにさせることができる。フィードバックリンク２５０は、バーチャル細胞染色の開発者に対して通信を提供し得る。この通信には、限定するものではないが、ｅメール、チャット、テキストまたはハイパーリンクを挙げることができる。これにはまた、このシステムの任意の特徴または構成要素に関する情報を含むｅメール、チャット、テキストまたはハイパーリンクを挙げることが可能で、これには、このシステムを用いてオーダーされ得る製品または試薬の１つ以上の特徴に関する情報を含んでいる。

図３は、種々の実施形態による、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステム中で核の細胞構造が選択された後に示される例示的なスクリーン３００である。スクリーン３００では、選択された細胞構造を染色するために利用可能な染料色は、染料色メニュー３１０に示される。染料色は例えば、細胞染色プロトコールが行われた後に細胞構造から発光された光の発光周波数または波長である。

選択された細胞構造を染色するために利用可能な染料色は、例えば、１つ以上の試薬供給業者から入手可能な試薬から決定される。選択された細胞構造を染色するために利用可能な染料色はまた、細胞構造が発することができることが公知である、染料色のスペクトルから決定され得る。例えば、本明細書において示されるとおり、細胞構造「ＮＵＣＬＥＵＳ（核）」は、細胞構造メニュー２２０で強調されており（太字であり）、これによって、細胞構造「ＮＵＣＬＥＵＳ（核）」が選択されたことが示される。核の細胞構造に利用可能な染料色としては、限定するものではないが、青、緑、橙−赤色、または遠赤色を挙げることができる。

染料色メニュー３１０に列挙される染料色の各々は、ユーザーによって選択され得る。染料色メニュー３１０の染料色メニューを選択することによって、バーチャル細胞染色プロセスが続く。細胞構造「ＮＵＣＬＥＵＳ（核）」は、図２に示される最初のスクリーン２００から選択されたので、図３の画像エリア２１０はやはり、例示的な細胞画像を示している。種々の実施形態では、図３の画像エリア２１０は、染料色以外の色で選択された細胞構造の例示的な画像をディスプレイし得る。

図４は、種々の実施形態による、核細胞構造および緑の染料色が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーン４００である。スクリーン４００では、所望の染料色を達成するための、選択された細胞構造を染色するために利用可能な試薬染料製品を、プロダクトメニュー４１０に示す。プロダクトメニュー４１０に示される製品は、選択された細胞構造および選択された染料色の組み合わせから決定される。

プロダクトメニュー４１０では、各々の製品の名称が示される。製品は、１つ以上の種類の画像化実験に用いられ得る。結果として、プロダクトメニュー４１０に示される各々の製品はまた、その製品で行われ得る１つ以上の種類の実験を特定する１つ以上の指標を備え得る。染色試薬製品で行われ得る実験の種類としては、限定するものではないが、生細胞アプリケーション、固定細胞アプリケーションまたは生細胞が固定後に保持されるアプリケーションを挙げることができる。

プロダクトメニュー４１０に列挙される製品名称の各々は、選択可能であり得る。プロダクトメニュー４１０における製品名称の選択によって、バーチャル細胞染色のプロセスが続く。ある製品はまた、染料アプライボタン４２０の隣接する染料アプライボタンを押すことによって選択され得る。本明細書に示されるように、細胞構造「ＮＵＣＬＥＵＳ（核）」が細胞構造メニュー２２０において強調され、染料色「ＧＲＥＥＮ（緑色）」が染料色メニュー３１０で強調され、これによって、プロダクトメニュー４１０中の製品が核細胞構造および緑の染料色の組み合わせに利用可能であることが示される。例示的な細胞画像がやはり画像エリア２１０に示される。種々の実施形態で、および上記のように、画像エリア２１０はまた、選択された細胞構造の例示的な画像を、選択された染料色以外の色でディスプレイし得る。

図５は、種々の実施形態による、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムにおいて核細胞構造を緑の染料色で染色するために試薬製品が選択された後に示される、例示的なスクリーン５００である。スクリーン５００では、選択された試薬製品を、アプライされた染料メニュー５１０に列挙する。選択された試薬製品の染料色で染色された選択された細胞構造の画像を次に、画像エリア２１０にディスプレイする。最終的に、プロダクトメニュー４１０における選択された製品に隣接する染料アプライボタンは外されて、選択された試薬製品がさらに示される。プロダクトメニュー４１０の製品名称はまた、もう選択できないようにされる。

アプライされた染料メニュー５１０では、選択された製品の名称が示され、選択された製品によって行われ得る実験の種類が示される。さらに、選択された試薬製品について、少なくとも１つの供給業者からカタログ番号が入手可能となる。このカタログ番号は、例えば、選択可能である。種々の実施形態では、カタログ番号を選択することによって、選択された製品の供給業者に対する通信が提供され、それによって特定の製品についてより多くの情報を得ることができる。アプライされた染料メニュー５１０で製品名を選択することで、同じ通信を代わりに、または追加して得ることができる。この通信としては、限定するものではないが、ｅメール、テキスト、チャットまたはハイパーリンクを挙げることができる。

アプライされた染料メニュー５１０における選択された製品に隣り合うのは、選択解除ボタン５２０である。選択解除ボタン５２０を用いて、アプライされた染料を外してもよい。選択解除ボタンを選択することによって、アプライされた染料メニュー５１０から選択された製品を外す。次いで、以前の画像を画像エリア２１０に復元してもよく、染料アプライボタンは、選択解除製品の隣に戻されてもよい。言い換えれば、選択解除ボタン５２０を選択すれば、例えば、図４のスクリーン４００に戻される。

図５のスクリーン５００はまた、アプライされた染料メニュー５１０の下に多数のボタンまたは選択可能アイテムを設ける。これらのボタンまたは選択可能アイテムとしては、限定するものではないが、カートへの追加ボタン５３０、ｅメール選択５４０、プリント選択５５０、およびヘルプ選択５６０の追加が挙げられる。カートへの追加ボタン５３０によって、選択された製品を、電子商取引のショッピングカートへ追加することが可能になり、その結果選択された製品が購入され得る。このショッピングカートは、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムのショッピングカートであってもよく、または選択された製品の供給業者のショッピングカートであってもよい。ｅメール選択５４０によって、例えば、スクリーン５００からの選択された製品または任意の他の情報をｅメールすることが可能になる。プリント選択５５０によって、例えば、スクリーン５００からの選択された製品または任意の他の情報をプリントすることが可能になる。ヘルプ選択５６０によって、例えば、選択された製品に対するヘルプ情報、または任意の他の情報がスクリーン５００上に示される。

選択された製品のみが、アプライされた染料メニュー５１０中に挙げられて示される。アプライされた染料メニュー５１０は、２つ以上の選択された製品を含んでもよい。種々の実施形態では、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムは、一回に選択され得る製品数に限界がある場合がある。例えば、このシステムは、選択された製品の数を４までに制限する場合がある。アプライされた染料メニュー５１０における２つ以上の選択された製品は、細胞構造メニュー２２０における細胞構造、および染料色メニュー３１０における色の任意の組み合わせから選択され得る。例えば、アプライされた染料メニュー５１０における、２つ以上の選択された製品は、同じ細胞構造および同じ染料色についてであっても、同じ細胞構造および異なる染料色ついてであっても、異なる細胞構造および同じ染料色ついてであっても、または異なる細胞構造および異なる染料色についてであってもよい。

アプライされた染料メニュー５１０に追加されるか、または外された各々の選択された製品について、画像エリア２１０は、残った細胞構造と染料色との組み合わせを反映する画像でアップデートされ得る。２つ以上の細胞構造の画像は、画像エリア２１０中でお互いの上に積層され得る。種々の実施形態では、アプライされた染料メニュー５１０中に列挙された製品の異なる色は、混合される。なぜなら、光の異なる周波数または波長は、混合されて、画像エリア２１０中に混合された周波数または波長でディスプレイされるからである。結果として、２つの異なる染料色を有する２つの製品の追加によって、例えば、第三の色を有する画像が画像エリア２１０で生じ得る。言い換えれば、画像エリア２１０にディスプレイされる画像は、多重染色およびマルチモーダル染色の両方を示し得る。この画像は、これが異なる組み合わせの細胞構造を示し得るという点で多重性であり、かつ異なる組み合わせの染料色を示し得るという点でマルチモーダルである。

図６は、種々の実施形態による、核および原形質膜細胞構造についての試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーン６００である。スクリーン６００では、核および原形質膜細胞構造が、アプライされた染料メニュー５１０に挙げられて示される。これらの製品の両方とも、染料色が緑についてである。核および原形質膜細胞構造の積層された染色画像は、画像エリア２１０中に提示され得る。画像エリア２１０中の染色された画像は、多重染色の例である。この例では、多重染色から生じる色には明白な「クロストーク」も重複もない。２つの細胞構造は容易に識別可能であり、そのため、細胞構造のこの組み合わせについて異なる製品を試みる必要はない。

原形質膜細胞構造は、例えば、図５の細胞構造メニュー２２０で「ＰＬＡＳＭＡ ＭＥＭＢＲＡＮＥ（原形質膜）」を設定することによって核細胞構造と組み合され得る。緑色の染料色および原形質膜試薬製品を選択した後に、図６のスクリーン６００を作成する。従って、核についての製品を、原形質膜についての製品の前に選択して、図６のスクリーン６００を作成する。しかし、スクリーン６００と同様のスクリーンは、核についての製品を選択する前に、原形質膜についての製品を選択することによって作成してもよい。言い換えれば、画像エリア２１０でディスプレイされる画像は、製品が選択される順序には依存しない。

図７は、種々の実施形態による、試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで、ミトコンドリア細胞構造および緑の染料色について選択された後に示される例示的なスクリーン７００である。スクリーン７００中のアプライされた染料メニュー５１０は、ミトコンドリア細胞構造および緑色の染料色について選択された製品を含み得る。ミトコンドリア細胞構造の画像は、画像エリア２１０において、選択された製品の緑色の染料色で示される。

図８は、種々の実施形態による、試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで、リソソーム細胞構造および緑の染料色について選択された後に示される例示的なスクリーン８００である。スクリーン８００のアプライされた染料メニュー５１０は、リソソーム細胞構造および緑色の染料色について選択された製品を含んでもよい。リソソーム細胞構造の画像は、画像エリア２１０において、選択された製品の緑色の染料色で示される。

図９は、種々の実施形態による、ミトコンドリアおよびリソゾームの細胞構造についての試薬製品が、生体細胞の構造をディスプレイするためのシステムで選択された後に示される例示的なスクリーン９００である。スクリーン９００では、ミトコンドリアおよびリソソーム細胞構造についての製品は、アプライされた染料メニュー５１０に挙げられて示される。これらの試薬製品の両方とも、緑の染料色のためである。ミトコンドリアおよびリソソーム細胞構造の積層された染色された画像はまた、画像エリア２１０中でディスプレイされ得る。画像エリア２１０の染色された画像はまた、多重染色の例である。しかし、この実施例では、多重染色から生じる色の間に有意なクロストークが存在する。従って、ミトコンドリアおよびリソソーム細胞構造は、画像エリア２１０で識別することはできない。

しかし、スクリーン９００は、このクロストークを排除する染料色の組み合わせを見出すために用いられ得る。例えば、アプライされた染料メニュー５１０に列挙されるいずれかの製品は、選択解除されてもよい。細胞構造メニュー２２０、カラー染料メニュー３１０、およびプロダクトメニュー４１０を用いて、染料製品は、別の色で選択されてもよい。このプロセスは、多重染色から生じる色の間のクロストークを減少するかまたは排除する色の組み合わせが見出されるまで繰り返され得る。このプロセスは、試薬をオーダーすることも、実験プロトコールを行うこともなく完了され得る。これもまた、異なる製品の組み合わせが選択できるのと同じ程度に迅速に完了され得る。結果として、バーチャル細胞染色は、画像実験を設定する費用および時間を軽減し得る。

スクリーン９００は、細胞構造の染色された画像を可視化するための画像エリア２１０を備えてもよい。スクリーン９００のような２つ以上のスクリーンは、例えば、異なる染料色で染色された１つ以上の細胞構造を比較するために同時にディスプレイされ得る。種々の実施形態では、スクリーン９００は、異なる染料色で染色される、２つ以上の染色された画像を比較するために、２つ以上の画像エリアを備えてもよい。

図２〜９に概説されるバーチャル細胞染色を用いて、生体細胞について分析および学習してもよい。細胞構造は、他の細胞構造と隔離して可視化されても、または一緒に可視化されてもよい。細胞構造の間の空間的関係が探索され得る。バーチャル細胞染色はまた、細胞構造および生成され得る多くの染料色組み合わせに対して試薬製品をアプライ（適用）することの結果を示す。さらに、これによって、製品の能力および限界が明らかになる。

種々の実施形態では、細胞およびその構造の三次元（３−Ｄ）画像を、バーチャル細胞染色と組み合わせて、さらに、細胞についての分析および学習を補助してもよい。上記のとおり、図２〜９に示される画像は、２−Ｄ画像の２つ以上の層の統合である。これらの２−Ｄ画像でごく接近して示される細胞構造は、三次元で正確に分離され得る。従って、３−Ｄ画像では、これらの層を三次元にすることによって、細胞構造の近接性の洞察を得ることができる。

図１０は、種々の実施形態による、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的な最初のスクリーン１０００である。スクリーン１０００は、３−Ｄ細胞画像１０１０、フィードバック選択１０２０、あなた自身の細胞染色へのバック選択１０３０、および細胞構造メニュー１０４０を含み得る。３−Ｄ細胞画像１０１０は、細胞の３−Ｄ視野およびその内部細胞構造を提供し得る。内部細胞構造をさらに識別するための色を用いる。３−Ｄ細胞画像１０１０は、移動可能であり得る。これは、例えば、パンされても、ズームされても、傾斜されてもまたは回転されてもよい。３−Ｄ細胞画像１０１０は、例えば、画像を１本以上の指で、またはカーソルでタッチすることによって、電子デバイスのディスプレイ上に動かされてもよい。

図１１は、種々の実施形態による、３−Ｄ細胞画像１０１０が傾斜され得ることを示している、生体細胞の３−Ｄ構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーン１１００である。

図１２は、種々の実施形態による、３−Ｄ細胞画像１０１０が傾斜され、パンされ、かつズームされ得ることを示している、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーン１２００である。

図１０に戻ると、フィードバック選択１０２０は、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためにシステムの開発者に通信を提供する。この通信としては、限定するものではないが、ｅメール、チャット、テキストまたはハイパーリンクを挙げることができる。あなた自身の細胞染色へのバック選択１０３０は、バーチャル細胞染色を呼び出す。図２のスクリーン２００は、例えば、あなた自身の細胞染色へのバック選択１０３０を選択した後に示される。図１０の細胞構造メニュー１０４０で選択された同じ細胞構造は、例えば、図２のスクリーン２００で選択され得る。

細胞構造は、図１０の細胞構造メニュー１０４０で選択可能なメニューアイテムとして列挙される。細胞構造メニュー１０４０でディスプレイされる細胞構造としては、限定するものではないが、オートファゴソーム、細胞骨格−アクチン、細胞骨格−チューブリン、小胞体、ゴルジ、リソソーム、ミトコンドリア、核、ペルオキシソームおよび原形質膜を挙げることができる。細胞構造メニュー１０４０において細胞構造を選択することで、その構造が、３−Ｄ細胞画像１０１０中で強調されることが可能になる。例えば、細胞構造「ＮＵＣＬＥＵＳ（核）」は、細胞構造メニュー１０４０で選択されて強調され得る。次に、これによって、核細胞構造１０５０を、３−Ｄ細胞画像１０１０中で強調することが可能になる。

従って、細胞構造は、３−Ｄ細胞画像１０１０中で細胞構造メニュー１０４０を用いて強調されてもよい。上記のとおり、３−Ｄ細胞画像１０１０は、画像を選択することによって動かされ得る。種々の実施形態および代替としては、細胞構造は、画像中の構造を選択することによって３−Ｄ細胞画像１０１０中で強調され得、そして３−Ｄ細胞画像１０１０は、メニューからムーブメント機能を選択することによって動かされ得る。

種々の実施形態および代替としては、細胞構造メニュー１０４０を用いて、選択された細胞構造に対するより多くの情報を得てもよい。この情報としては、細胞構造の例示的な染色された２−Ｄ画像、細胞構造の説明、および細胞を染色して細胞構造を見るために用いられ得る試薬製品の列挙を挙げることができる。同じ細胞構造を３−Ｄで見た直後に、選択された細胞構造の染色された２−Ｄ画像を見ることで、染色された２−Ｄ画像を理解することが補助される。

図１３は、種々の実施形態による、細胞構造に対する情報を示している生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムの例示的なスクリーン１３００である。スクリーン１３００は、２−Ｄ細胞構造画像１３１０と、フィードバック選択１０２０と、あなた自身の細胞染色へのバック選択１０３０と、細胞構造説明１３４０、および試薬製品メニュー１３５０を備え得る。２−Ｄ細胞構造の画像１３１０は、選択された細胞構造の例示的な２−Ｄ染色された画像である。２−Ｄ細胞構造の画像１３１０は、核１３６０の線画として示される。種々の実施形態では、核１３６０の特徴は、例示的な染料色で黒いバックグラウンド上に示される。

上記のとおり、フィードバック選択１０２０は、生体細胞の３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためにシステムの開発者に情報を提供し得る。あなた自身の細胞染色へのバック選択１０３０は、バーチャル細胞染色を呼び出す。細胞構造説明１３４０は、選択された細胞構造の原文どおりの説明であり得る。

試薬製品メニュー１３５０は、選択された細胞構造を染色するための１つ以上の供給業者から利用可能な試薬製品の列挙であり得る。試薬製品メニュー１３５０は、製品名およびカタログ番号を備える。製品名またはカタログ番号のいずれかの選択は、製品についてより多くの情報を提供し得る。この情報は、例えば、生体細胞の３−Ｄ細胞構造または製品の供給業者を提示するためのシステムに由来し得る。

図２〜９に示されるようなバーチャル細胞染色、ならびに３−Ｄ細胞構造をディスプレイするためのシステムおよび方法は、細胞および細胞構造を分析および学習するために有用なツールである。これらのツールは、多数のカスタマーに有用であり、このカスタマーとしては限定するものではないが、研究者、試薬製品供給業者、ヘルスケア供給業者、学生および教育者が挙げられる。さらに、これらのツールを携帯の電子デバイスに配置すれば、その有用性は増す。これらのツールをディスプレイし得る携帯の装置としては、限定するものではないが、タブレット型装置、携帯電話、音楽プレイヤー、ゲーム機またはモバイルコンピューターを挙げることができる。選択を行ってもよく、画像は、例えば、タッチスクリーン、ポインティングデバイスまたはこれらの携帯装置のキーボードを用いて操作されてもよい。

バーチャル細胞染色システム
図１は、システム１００を図示するブロック図であって、ここで本発明の教示の実施形態が実行され得る。生体細胞の細胞構造をディスプレイするためのシステムとしては、メモリー、インプットデバイス、ディスプレイ、およびプロセッサーを挙げることができる。このシステムは、例えば、コンピューター、タブレットデバイス、または携帯電話であってもよい。このシステムは、ネットワークに接続されてもよいし、または接続なしで作動してもよい。このメモリーとしては限定するものではないが、システム１００のＲＡＭ１０６、ＲＯＭ１０８、またはディスク記憶装置１１０を挙げることができる。インプットデバイスとしては、限定するものではないが、インプットデバイス１１４、またはインプット／アウトプットのポート１１８に接続された別のデバイスを挙げることができる。このインプットデバイスは、例えば、ディスプレイのポインティングデバイスまたはタッチスクリーンである。このディスプレイとしては、限定するものではないが、ディスプレイ１１２を挙げることができる。このディスプレイは、例えば、電子ディスプレイである。このプロセッサーとは、限定するものではないが、プロセッサー１０４であってもよい。このプロセッサーは、例えば、マイクロプロセッサー、シグナルプロセッサー、アプリケーション特異的集積回路、またはフィールド・プログラマブル・ゲート・アレイである。

上記のメモリーは、生体細胞の複数の細胞構造を記憶し得る。これはまた、複数の細胞構造の各々の細胞構造についての１つ以上の染料色を記憶し得る。

このプロセッサーは、メモリー、インプットデバイス、およびディスプレイと通信状態にあり得る。このプロセッサーは、選択された細胞構造をインプットデバイスから受信し得る。このインプットデバイスとは、例えば、ディスプレイのタッチスクリーンであってもよい。このプロセッサーは、選択された細胞構造の１つ以上の染料色をメモリーから読み出し得る。このプロセッサーは、選択された細胞構造の１つ以上の染料色をディスプレイ上にディスプレイし得る。このプロセッサーは、選択された染料色をインプットデバイスから受信し得る。最終的に、プロセッサーは、画像実験における選択された染料色での選択された細胞構造の染色の見本であるディスプレイ上の例示的な細胞画像において、選択された細胞構造を選択された染料色でディスプレイし得る。例示的な細胞画像は、例えば、２つ以上の細胞画像の統合である。

種々の実施形態では、このシステムはまた、試薬製品染色についての情報をディスプレイし得る。このメモリーはさらに、１つ以上の染料色の各々の染料色について、その染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を記憶し得る。このプロセッサーはさらに、選択された染料色の１つ以上の試薬製品を、染料色メモリーから読み出し得る。このプロセッサーは、選択された染料色の１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイし得る。このプロセッサーは、選択された試薬製品をインプットデバイスから受信し得る。最終的に、このプロセッサーは、選択された試薬製品をディスプレイ上にディスプレイし得る。種々の実施形態では、このプロセッサーはさらに、選択された試薬製品をディスプレイ上に、選択可能アイテムとしてディスプレイし得、この選択可能アイテムは、選択された場合、選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する。種々の実施形態では、プロセッサーはさらに、選択可能アイテムをディスプレイ上にディスプレイし得、このディスプレイは、選択された場合、選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する。

種々の実施形態では、このシステムは、異なる細胞構造の染料由来の発色の間にクロストークが存在するか否かを示し得る。このプロセッサーはさらに、第二の選択された細胞構造をインプットデバイスから受信し得る。この第二の選択された細胞構造は、早期に選択された選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない。このプロセッサーは、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を、メモリーから読み出し得る。このプロセッサーは、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色をディスプレイ上にディスプレイし得る。このプロセッサーは、第二の選択された染料色をインプットデバイスから受信し得る。このプロセッサーは、第二の選択された細胞構造を、例示的な細胞画像中に、第二の選択された染料色で、ディスプレイ上でディスプレイして、これによって、以前に選択された染料色と第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示し得る。

バーチャル細胞染色方法
図１４は、種々の実施形態による、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法１４００を示している例示的なフローチャートである。

方法１４００の工程１４１０では、生体細胞の複数の細胞構造が記憶されて、この複数の細胞構造の各々の細胞構造について、１つ以上の染料色がメモリーを用いて記憶される。

工程１４２０では、選択された細胞構造が、インプットデバイスからプロセッサーを用いて受信される。

工程１４３０では、選択された細胞構造の１つ以上の染料色は、プロセッサーを用いてメモリーから読み出される。

工程１４４０では、選択された細胞構造の１つ以上の染料色が、ディスプレイ上にプロセッサーを用いてディスプレイされる。

工程１４５０では、選択された染料色は、インプットデバイスからプロセッサーを用いて受信される。

工程１４６０では、選択された細胞構造は、選択された染料色でディスプレイ上の例示的な細胞画像中に、プロセッサーを用いてディスプレイされる。ディスプレイされた画像は、選択された染料色での、選択された細胞構造の染色の見本である。

バーチャル細胞染色コンピュータープログラム製品
種々の実施形態では、コンピュータープログラム製品は、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備え、その内容は、プロセッサー上で実行される指示を有するプログラムを含み、それによって、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法を行う。この方法は、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムによって行われる。

図１５は、種々の実施形態による、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法を行う、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステム１５００の回路図である。種々の実施形態では、システム１５００は、記憶モジュール１５１０と染色モジュール１５２０とを備え得る。

記憶モジュール１５１０は、生体細胞の複数の細胞構造を記憶し、かつ複数の細胞構造の各々の細胞構造について、１つ以上の染料色をメモリーに記憶し得る。染料モジュール１５２０は、選択された細胞構造をインプットデバイスから受信し得る。記憶モジュール１５１０は、選択された細胞構造の１つ以上の染料色をメモリーから読み出し得る。染料モジュール１５２０は、選択された細胞構造の１つ以上の染料色をディスプレイ上にディスプレイし得る。染料モジュール１５２０は、選択された染料色をインプットデバイスから受信し得る。染料モジュール１５２０は、選択された細胞構造を、例示的な細胞画像中で選択された染料色で、ディスプレイ上にディスプレイし得る。このディスプレイされた画像は、画像化実験において、選択された染料色での選択された細胞構造の染色の見本である。

システム１５００の一部として示される種々のモジュール／エンジンは、特定のアプリケーションまたはシステムアーキテクチャの要件次第で、組み合わされてもよいし、または単一のモジュール／エンジン／データの記憶へと分解されてもよいことも理解されるべきである。さらに、種々の実施形態では、システム１５００は、特定のアプリケーションまたはシステムアーキテクチャによって必要とされる、追加のモジュール、エンジン、構成要素またはデータ蓄積を備えてもよい。

３−Ｄ細胞ディスプレイシステム
図１は、システム１００を例示するブロック図であり、ここで本発明の教示の実施形態が実行され得る。生体細胞の三次元の細胞構造をディスプレイするためのシステムは、メモリー、タッチスクリーンを備えるディスプレイ、およびプロセッサーを備えてもよい。このシステムは、例えば、コンピューター、タブレットデバイス、または携帯電話であってもよい。このシステムは、ネットワークに接続されてもよいし、または接続なしで作動することもできる。このメモリーとしては、限定するものではないが、システム１００のＲＡＭ１０６、ＲＯＭ１０８、またはディスク記憶装置１１０を挙げることができる。タッチスクリーンとしては、限定するものではないが、インプットデバイス１１４またはインプット／アウトプットのポート１１８に接続された別のデバイスを挙げることができる。ディスプレイとしては、限定するものではないが、ディスプレイ１１２を挙げることができる。このディスプレイは、例えば、電子ディスプレイであってもよい。このプロセッサーは、限定するものではないが、プロセッサー１０４であってもよい。このプロセッサーは、例えば、マイクロプロセッサー、シグナルプロセッサー、アプリケーション特異的集積回路、またはフィールド・プログラマブル・ゲート・アレイである。

メモリーは、三次元細胞構造を備える生体細胞の三次元画像を記憶し得る。プロセッサーは、ディスプレイ上に三次元画像をディスプレイし得る。プロセッサーは、タッチスクリーンからムーブメント選択を受信し得る。ムーブメント選択としては限定するものではないが、パン、傾斜、回転またはズームのうちの１つを挙げることができる。最終的に、プロセッサーは、ムーブメント選択によって、ディスプレイ上に三次元画像をディスプレイして、異なる視野の三次元細胞構造を示し得る。

種々の実施形態では、細胞構造は、三次元画像で選択され、かつ強調されてもよい。メモリーはさらに、複数の細胞構造を記憶し得る。このプロセッサーはさらに、複数の細胞構造をメモリーから読み出し得る。このプロセッサーは、複数の細胞構造をディスプレイ上にディスプレイし得る。このプロセッサーは、選択された細胞構造を、タッチスクリーンから受信し得る。最終的に、プロセッサーは、選択された細胞構造がディスプレイ上に強調されている三次元画像をディスプレイし得る。

種々の実施形態では、細胞構造が選択されてもよく、より多くの情報が、細胞構造について提供される。メモリーはさらに、複数の細胞構造を記憶し得る。プロセッサーはさらに、複数の細胞構造をメモリーから読み出し得る。プロセッサーは、複数の細胞構造をディスプレイ上にディスプレイし得る。プロセッサーは、選択された細胞構造をタッチスクリーンから受信し得る。最終的に、プロセッサーは、選択された細胞構造についての情報を含むスクリーンをディスプレイ上にディスプレイし得る。この情報としては、例えば、選択された細胞構造の二次元の染色された画像が挙げられ得る。この情報としては、例えば、選択された細胞構造を染色するために用いられ得る１つ以上の試薬製品を挙げることができる。

三次元細胞ディスプレイ方法
図１６は、種々の実施形態による、生体細胞の三次元細胞構造をディスプレイするための方法１６００を示している、例示的なフローチャートである。

方法１６００の工程１６１０では、三次元の細胞構造を含む生体細胞の三次元画像が、メモリーを用いて記憶され得る。

工程１６２０では、三次元画像が、タッチスクリーンを含むディスプレイ上にプロセッサーを用いてディスプレイされ得る。

工程１６３０では、ムーブメント選択は、タッチスクリーンからプロセッサーを用いて受信され得る。

工程１６４０では、三次元画像は、ムーブメント選択に応じてディスプレイ上にディスプレイされて、異なる視野の三次元細胞構造がプロセッサーを用いて示され得る。

３−Ｄ細胞ディスプレイコンピュータープログラム製品
種々の実施形態では、コンピュータープログラム製品は、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備え、その内容は、プロセッサー上で行われている指示を有するプログラムであって、それによって生体細胞の三次元の細胞構造をディスプレイするための方法を行うプログラムを含む。この方法は、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを含み得るシステムによって行われる。

図１７は、種々の実施形態による、生体細胞の三次元細胞構造をディスプレイするための方法を行う、１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備え得るシステム１７００の回路図である。システム１７００は、記憶モジュール１７１０およびディスプレイモジュール１７２０を備え得る。

記憶モジュール１７１０は、三次元細胞構造を備える、生体細胞の三次元画像を記憶し得る。ディスプレイモジュール１７２０は、タッチスクリーンを備えるディスプレイ上に、三次元画像をディスプレイし得る。ディスプレイモジュール１７２０は、ムーブメント選択を、タッチスクリーンから、ディスプレイモジュールを用いて受信し得る。ディスプレイモジュール１７２０は、三次元画像を、ディスプレイ上に、ムーブメント選択に応じてディスプレイし得る。次いで、三次元画像は、異なる視野の三次元細胞構造を示す。

試薬製品の方法
種々の実施形態では、卓上型装置、例えば、デジタル顕微鏡などでは、ユーザーがシミュレーションを行うことが可能で、かつそのシミュレーションに関与する試薬についてのマーケティング情報を得るか、および／またはその試薬をオーダーすることができる、アプリケーションが行われ得る。

図１８は、シミュレートされた環境で用いられる試薬製品についての情報を得るための方法１８００を示している、例示的なフローチャートである。

方法１８００の工程１８１０では、カスタマーがデバイス中で試薬製品に関与するシミュレーションを行うことを可能にするための、プロセッサーを備えるコンピュータープログラム製品が提供され得る。

工程１８２０では、試薬製品に対応する選択可能アイテムは、コンピュータープログラム製品を用いて、デバイス上にディスプレイされ得る。カスタマーによって選択されたとき、プロセッサーは、この試薬製品に関するマーケティング情報をデバイス上にディスプレイするために構成され得る。

コンピュータープログラム製品は、例えば、携帯電話装置または実験装置を備えてもよい。種々の実施形態では、コンピュータープログラム製品は、コンピューター、タブレットデバイス、ゲーム機、ミュージックプレイヤー、およびビデオプレイヤーの１つ以上であってもよい。

図１９は、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法１９００を示している、例示的なフローチャートである。

方法１９００の工程１９１０では、カスタマーがデバイス中で試薬製品に関与するシミュレーションを行うことを可能にするための、プロセッサーを備えるコンピュータープログラム製品が提供され得る。

工程１９２０では、試薬製品に対応する選択可能アイテムは、コンピュータープログラム製品を用いて、デバイス上にディスプレイされ得る。カスタマーによって選択された場合、プロセッサーは、試薬製品のオーダーを引き起こすように構成され得る。

工程１９３０では、試薬製品の引き起こされたオーダーは、プロセッサーを用いて処理され得る。

試薬製品の選択のシステム、方法およびコンピュータープログラム製品
例示的な実施形態によれば、本明細書に提供されるのは、１つ以上の試薬製品を潜在的なカスタマーにディスプレイするためのシステムであり、これは、（１）メモリーであって、試薬製品の複数のカテゴリーの間で分類された複数の試薬製品についての情報（この情報にはその試薬製品の各々についての識別情報と１つ以上の特徴とを含む）を記憶し得るメモリーと；（２）インプットデバイスと；（３）ディスプレイと；（４）このメモリー、インプットデバイス、およびディスプレイと通信状態にあるプロセッサーであって、このプロセッサーは、（ａ）選択された試薬製品カテゴリーを、上記試薬製品カテゴリーから、インプットデバイスを用いて受信するように；（ｂ）この受信された試薬製品カテゴリーに対応する１つ以上の試薬製品をメモリーから読み出すように；（ｃ）この読み出された１つ以上の試薬製品の識別情報および１つ以上の特徴のうちの少なくとも１つをディスプレイすることを含めて、読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイするように；（ｄ）このディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品を、インプットデバイスを用いて受信するように；（ｅ）試薬製品情報アイコンのユーザー選択の際に、受信された試薬製品の１つ以上の特徴を含んでいる情報ビュースクリーンをディスプレイするように；ならびに（ｆ）試薬製品プロトコールアイコンのユーザー選択の際に、受信された試薬製品を用いるために、実験プロトコールの１つ以上の工程を含んでいるプロトコールビュースクリーンをディスプレイするように；構成されている、プロセッサーと、を備える。

このシステムでは、試薬製品のカテゴリーとしては限定するものではないが、以下が挙げられる：ＧＦＰカテゴリー、細胞トラッキングカテゴリー、退色防止カテゴリー、細胞骨格カテゴリー、トラフィッキンングカテゴリー、抗体標識カテゴリー、オルガネラ染料カテゴリー、アポトーシスカテゴリー、細胞周期カテゴリー、細胞生存カテゴリー、酸化的ストレスカテゴリー、細胞増殖カテゴリー、免疫蛍光カテゴリー、自食作用カテゴリー、ＤＮＡ染料カテゴリー、エピトープタグカテゴリー、ＲＮＡ生物学カテゴリー、イオン指示薬カテゴリー、エッセンシャルカテゴリー、およびタンパク質標識カテゴリーのうちの１つ以上。プロセッサーはさらに、（読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイする場合）、この読み出された１つ以上の試薬製品の各々の１つ以上の特徴をディスプレイするように構成されてもよく、この特徴としては、読み出された１つ以上の試薬製品の各々に対応する実験プロトコールを行うのに必要な実践時間または総時間を図示する図式的ダイアルが挙げられる。このプロセッサーはさらに、（読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイする場合）、この読み出された１つ以上の試薬製品の各々の１つ以上の特徴をディスプレイするように構成されてもよく、この特徴としては、読み出された１つ以上の試薬製品の各々が生きた細胞生成物であるか、または化学処理によって固定された生成物であるかについての指標が挙げられる。このインプットデバイスは、ディスプレイのタッチスクリーンを備え得る。このプロセッサーはさらに、読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上に、１つ以上の選択可能アイテムとしてディスプレイするように構成されてもよく（この選択可能アイテムは、選択された場合、この選択されたアイテムに対するより多くの情報を提供する）、さらに、選択可能アイコンをディスプレイ上にディスプレイするように構成されてもよく、このディスプレイは選択された場合、選択されたアイテムをオーダーするというプロセスを開始する。このシステムは、コンピューター、携帯電話、タブレットデバイス、ゲーム機、音楽プレイヤー、ビデオプレイヤー、および実験装置の１つ以上であってもよい。

別の例示的な実施形態によれば、本明細書に提供されるのは、試薬製品についての情報および実験的プロトコールをディスプレイするための方法であって、これには：（１）試薬製品の各々についての識別情報および１つ以上の特徴を含めて、複数の試薬製品カテゴリーのなかで、分類された複数の試薬製品を、メモリーを用いて記憶することと；（２）この試薬製品カテゴリーから選択されたある試薬製品カテゴリーを、プロセッサーを用いて受信することと；（３）受信された試薬製品カテゴリーに対応する１つ以上の試薬製品を、メモリーからプロセッサーを用いて読み出すことと；（４）読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイすることであって、これは読み出された１つ以上の試薬製品の識別情報および１つ以上の特徴のうちの少なくとも１つを、プロセッサーを用いて、ディスプレイ上にディスプレイすることを含んでいることと；（５）このディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品を、プロセッサーを用いて受信することと；（６）試薬製品情報アイコンのユーザー選択の際に、この受信された試薬製品の１つ以上の特徴を含んでいる情報ビュースクリーンをディスプレイすることと；（７）試薬製品プロトコールアイコンのユーザー選択の際に、受信された試薬製品を用いるための実験プロトコールの１つ以上の工程を含んでいるプロトコールビュースクリーンをディスプレイすることと；を包含する。

この方法では、複数の試薬製品カテゴリーのなかで分類された複数の試薬製品を記憶することはさらに、限定するものではないが、ＧＦＰカテゴリー、細胞トラッキングカテゴリー、退色防止カテゴリー、細胞骨格カテゴリー、トラフィッキンングカテゴリー、抗体標識カテゴリー、オルガネラ染料カテゴリー、アポトーシスカテゴリー、細胞周期カテゴリー、細胞生存カテゴリー、酸化的ストレスカテゴリー、細胞増殖カテゴリー、免疫蛍光カテゴリー、自食作用カテゴリー、ＤＮＡ染料カテゴリー、エピトープタグカテゴリー、ＲＮＡ生物学カテゴリー、イオン指示薬カテゴリー、エッセンシャルカテゴリー、およびタンパク質標識カテゴリーのうちの１つ以上のなかから試薬製品を分類することを包含し得る。さらに、試薬製品カテゴリーから選択された試薬製品カテゴリーを受信することはさらに、ディスプレイのタッチスクリーンから試薬製品カテゴリーを受信することを包含し得る。この方法はさらに、ディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品を、選択可能アイテムとしてディスプレイすること（この選択可能アイテムは、選択された場合、選択された試薬製品に対してより多くの情報を提供する）を包含してもよく、これはさらに、選択可能アイコンをディスプレイ上にディスプレイすることを包含し、このディスプレイは、選択された場合、このディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択される試薬製品をオーダーするというプロセスを開始する。

別の例示的な実施形態によれば、本明細書に提供されるのは、コンピュータープログラム製品であって、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備え、その内容は、プロセッサー上で行われている指示を有するプログラムであって、それによって試薬製品についての情報および実験プロトコールをディスプレイするための方法を行うプログラムを含んでもよく、この方法は、（１）記憶モジュールおよびディスプレイモジュールを備える１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムを提供することと；（２）試薬製品の各々について識別情報と１つ以上の特徴とを含む、複数の試薬製品カテゴリーの間で分類された複数の試薬製品を、メモリーを用いて記憶することと；（３）この試薬製品カテゴリーから選択された試薬製品カテゴリーを、プロセッサーを用いて受信することと；（４）この受信された試薬製品カテゴリーに対応する１つ以上の試薬製品を、メモリーからプロセッサーを用いて読み出すことと；（５）この読み出された１つ以上の試薬製品の識別情報と１つ以上の特徴のうちの少なくとも１つを、ディスプレイ上に、プロセッサーを用いてディスプレイすることを含む、読み出された１つ以上の試薬製品をディスプレイ上にディスプレイすることと；（６）ディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品を、プロセッサーを用いて受信することと；（７）試薬製品情報アイコンのユーザー選択の際に、受信された試薬製品の１つ以上の特徴を含んでいる情報ビュースクリーンをディスプレイすることと；（８）試薬製品プロトコールアイコンのユーザー選択の際に、受信された試薬製品を用いるための実験プロトコールの１つ以上の工程を含んでいるプロトコールビュースクリーンをディスプレイすることと、を包含する。

このコンピュータープログラム製品では、複数の試薬製品カテゴリーの間で分類された複数の試薬製品を記憶することはさらに、限定するものではないが、ＧＦＰカテゴリー、細胞トラッキングカテゴリー、退色防止カテゴリー、細胞骨格カテゴリー、トラフィッキンングカテゴリー、抗体標識カテゴリー、オルガネラ染料カテゴリー、アポトーシスカテゴリー、細胞周期カテゴリー、細胞生存カテゴリー、酸化的ストレスカテゴリー、細胞増殖カテゴリー、免疫蛍光カテゴリー、自食作用カテゴリー、ＤＮＡ染料カテゴリー、エピトープタグカテゴリー、ＲＮＡ生物学カテゴリー、イオン指示薬カテゴリー、エッセンシャルカテゴリー、およびタンパク質標識カテゴリーのうちの１つ以上のなかから試薬製品を分類することを包含する。この試薬製品カテゴリーおよび選択された試薬製品は、ディスプレイのタッチスクリーンを用いて受信され得る。指示によって行われる方法はさらに、１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品を、選択可能アイテムとしてディスプレイすることを包含してもよく、この選択可能アイテムは、選択された場合、この選択された試薬製品に対してより多くの情報を提供する。この指示によって行われる方法はさらに、選択可能アイコンをディスプレイ上にディスプレイすることを包含してもよく、このディスプレイは、選択された場合、ディスプレイされた１つ以上の試薬製品から選択された試薬製品をオーダーするというプロセスを開始する。

別の例示的な実施形態によれば、本明細書に提供されるのは、以下を包含する試薬製品を列挙するための方法である：（１）複数の試薬製品についての情報、および対応する組成物情報および実験プロトコール情報を、メモリーを用いてデバイス中に記憶することと；（２）このデバイスのディスプレイ上の第一のビュースクリーン中に、複数の試薬製品の１つ以上のサブセットを、ディスプレイされた試薬製品を記載するサマリー情報およびディスプレイされた試薬製品に対応する実験プロトコールと一緒にディスプレイすることと；（３）ユーザー選択の試薬製品に対応するディスプレイの第二のビュースクリーンにおいて、および情報アイコンのユーザーによるさらなる選択の際、ユーザー選択の試薬製品の各々の構成要素の量、濃度、分子量および保管条件のうちの１つ以上についての詳細な情報をディスプレイすること。

この方法はさらに、ユーザーが選択した試薬製品に対応する第三のビュースクリーンにおいて、およびプロトコールアイコンのユーザーによる選択の際、ユーザーが選択した試薬製品を用いるための実験プロトコールの１つ以上の工程についての詳細な情報をディスプレイすることを包含し、この１つ以上の工程は、除去工程、洗浄工程、作製工程、希釈工程、事前混合工程、遠心分離工程、移動工程、撹拌工程、添加工程、インキュベート工程および画像化工程のうちの１つ以上を含んでいる。この方法では、このデバイスは、携帯電話装置であってもよく、またはこれは、実験装置であってもよく、またはこれは、例えば、コンピューター、タブレットデバイス、ゲーム機、音楽プレイヤー、およびビデオプレイヤーのうちの１つ以上であってもよい。

別の例示的な実施形態によれば、本明細書に提供されるのは、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法であって、この方法は：（１）カスタマーが１つ以上の試薬についての情報を得ることを可能にするためのプロセッサーを備えているコンピュータープログラム製品を、デバイスを用いて提供することと；（２）デバイス上のディスプレイの第一のビュースクリーンに、複数の試薬製品の１つ以上のサブセットを、ディスプレイされた試薬製品を記述する情報、およびディスプレイされた試薬製品に対応する１つ以上の実験プロトコールと一緒にディスプレイすることと；（３）ユーザーが選択した試薬製品に対応するディスプレイの第二のビュースクリーンに、および情報アイコンのユーザーによるさらなる選択の際に、ユーザーが選択した試薬製品の各々の構成要素の量、濃度、分子量および保管条件のうちの１つ以上についての詳細な情報をディスプレイすることと；（４）ユーザーが選択した試薬製品に対応するディスプレイの第三のビュースクリーンに、およびプロトコールアイコンのユーザーによるさらなる選択の際に、ユーザーが選択した試薬製品を用いるための実験プロトコールの１つ以上の工程についての詳細な情報をディスプレイすることとであって、この１つ以上の工程が、除去工程、洗浄工程、作製工程、希釈工程、事前混合工程、遠心分離工程、移動工程、撹拌工程、添加工程、インキュベート工程および画像化工程のうちの１つ以上を含んでいる、ことと；（５）コンピュータープログラム製品を用いてかつディスプレイ上に、ユーザーが選択した試薬製品に対応する選択可能アイテムをディスプレイすることであって、ここでカスタマーによって選択された場合、このプロセッサーが、試薬製品のオーダーを引き起こすように構成されている、ことと；（６）試薬製品の引き起こされたオーダーを、プロセッサーを用いて処理することと、を包含する。

この方法では、デバイスは、例えば、携帯電話装置であっても、または実験装置であっても、またはコンピューター、タブレットデバイス、ゲーム機、音楽プレイヤー、およびビデオプレイヤーのうちの１つ以上であってもよい。

上記のとおり、コンピュータープログラム製品は、例えば、携帯電話装置または実験装置を含んでもよい。種々の実施形態では、このコンピュータープログラム製品は、コンピューター、タブレットデバイス、ゲーム機、音楽プレイヤー、およびビデオプレイヤーのうちの１つ以上であってもよい。

本発明の教示を、種々の実施形態と組み合わせて記載してきたが、本発明の教示は、このような実施形態に限定されないものとする。それどころか、本発明の教示は、種々の代替、改変および等価物を、当業者によって理解されるように包含する。

さらに、記載される種々の実施形態では、本明細書は、ある方法および／またはプロセスを、特定の順序の工程として提示した場合がある。しかし、この方法またはプロセスが、本明細書に示される工程の特定の順序に依拠しないという点で、この方法またはプロセスは、記載される工程の特定の順序に限定されるべきではない。当業者が理解するように、他の順序の工程も可能であり得る。従って、本明細書に示される工程の特定の順序は、特許請求の範囲に対する限定と解釈されるべきではない。さらに、この方法および／またはプロセスに関する特許請求の範囲は、記載の順序でそれらの工程を行うことに限定されるべきではなく、当業者は、その順序が、変化してもよく、それでも種々の実施形態の趣旨および範囲内におさまることを容易に理解し得る。

本明細書に記載される実施形態は、コンピューターシステムに記憶されるデータに関与する種々のコンピューター実施操作を使用し得ることもまた理解されるべきである。これらの操作は、物理的数値の物理的操作を必要とするものである。通常は、必須ではないが、これらの量は、記憶され、移動され、組み合わされ、比較され、そうでなければ、操作され得る電気シグナルまたは磁気シグナルの形態をとる。さらに、行われる操作は、生成、特定、決定または比較のような用語で呼ばれる場合が多い。

本明細書に記載される実施形態の一部を形成する任意の操作は、有用な機械操作である。本明細書に記載される実施形態はまた、これらの操作を行うためのデバイスまたは装置に関する。本明細書に記載されるシステムおよび方法は、必要な目的のための特に構築されてもよいし、またはこれは、コンピューターに記憶されたコンピュータープログラムによって選択的に活性化されるかまたは構成されている一般的な目的のコンピューターであってもよい。具体的には、種々の一般的な目的の機械は、本明細書の教示によって、記載されたコンピュータープログラムで用いられてもよいし、または必要な操作を行うためにより専門的な装置を構築するためにより便利である場合もある。

Claims (28)

1. 以下を備える、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステム：
   生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを記憶するように構成されたメモリー；
   インプットデバイス；
   ディスプレイ；ならびに
   前記メモリー、前記インプットデバイス、および前記ディスプレイと通信状態にあるプロセッサーであって、
   選択された細胞構造をインプットデバイスから受信するように；
   前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように；
   前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上にディスプレイするように；
   選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように；かつ
   前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された染料色で前記選択された細胞構造をディスプレイするように、
   構成されている、プロセッサー。
2. 前記メモリーがさらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を記憶するように構成されており、かつ、前記プロセッサーがさらに、選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから読み出し、前記選択された染料色の前記１つ以上の試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイし、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから受信し、かつ前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、請求項１記載のシステム。
3. 前記プロセッサーがさらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから受信するように、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように、第二の選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上にディスプレイするように、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように、かつ、前記選択された染料色と第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された染料色で第二の選択された細胞構造をディスプレイするように構成されている、請求項１記載のシステム。
4. 前記複数の細胞構造が画像として記憶される、請求項１記載のシステム。
5. 前記画像が三次元である、請求項４記載のシステム。
6. 前記例示的な細胞画像が、２つ以上の細胞画像の統合である、請求項１記載のシステム。
7. 前記プロセッサーがさらに、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品をディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、請求項２記載のシステム。
8. 前記プロセッサーがさらに、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムを、ディスプレイ上にディスプレイするように構成されている、請求項２記載のシステム。
9. 以下の工程を包含する、生体細胞の細胞構造をディスプレイするための方法：
   生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とをメモリーを用いて記憶する工程；
   選択された細胞構造をインプットデバイスからプロセッサーを用いて受信する工程；
   前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程；
   前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色をディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程；
   選択された染料色を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程；および
   前記選択された細胞構造の前記選択された染料色での染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された細胞構造を前記選択された染料色で前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程。
10. さらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を記憶する工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程、前記選択された染料色の前記１つ以上の試薬製品を前記プロセッサーを用いて前記ディスプレイ上にディスプレイする工程、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、および前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程を包含する、請求項９記載の方法。
11. さらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記プロセッサーを用いて読み出す工程、第二の選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上に前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから前記プロセッサーを用いて受信する工程、および、前記選択された染料色と第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された染料色で第二の選択された細胞構造を前記プロセッサーを用いてディスプレイする工程を包含する、請求項９記載の方法。
12. 前記複数の細胞構造が画像として記憶される、請求項９記載の方法。
13. 前記画像が三次元である、請求項１２記載の方法。
14. 例示的な細胞画像中に前記選択された細胞構造を前記選択された染料色でディスプレイする工程がさらに、前記選択された細胞構造を２つ以上の細胞画像の統合としてディスプレイすることを包含する、請求項８記載の方法。
15. さらに、前記プロセッサーを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、請求項１０記載の方法。
16. さらに、前記プロセッサーを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムを、前記ディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、請求項１０記載の方法。
17. 以下の工程を含む生体細胞の細胞構造を提示するための方法を行うためにプロセッサー上で実行される指示を有するプログラムをその内容に備える、一時的でなくかつ有形のコンピューター読み取り可能な記憶媒体を備えるコンピュータープログラム製品：
    記憶モジュールと染色モジュールとを備える１つ以上の別個のソフトウェアモジュールを備えるシステムを設ける工程；
    生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを前記記憶モジュールを用いてメモリーに記憶する工程；
    選択された細胞構造をインプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程；
    前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程；
    前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色をディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程；
    選択された染料色を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程；および
    前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記ディスプレイ上の例示的な細胞画像において、前記選択された細胞構造を前記選択された染料色で前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程。
18. 前記指示によって行われる前記方法がさらに、各々の染料色を生じ得る１つ以上の試薬製品を前記記憶モジュールを用いて記憶する工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程、前記選択された染料色の１つ以上の試薬製品を前記染色モジュールを用いて前記ディスプレイ上にディスプレイする工程、選択された試薬製品を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、および前記選択された試薬製品を前記ディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程を包含する、請求項１７記載のコンピュータープログラム製品。
19. 前記指示によって行われる前記方法がさらに、前記選択された細胞構造と同じ細胞構造ではない第二の選択された細胞構造を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから前記記憶モジュールを用いて読み出す工程、第二の選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記ディスプレイ上に前記染色モジュールを用いてディスプレイする工程、第二の選択された染料色を前記インプットデバイスから前記染色モジュールを用いて受信する工程、および、前記染色モジュールを用いて、前記選択された染料色と前記第二の選択された染料色との間にクロストークが存在するか否かを示すために、前記ディスプレイ上の前記例示的な細胞画像中に第二の選択された細胞構造を前記第二の選択された染料色でディスプレイする工程を包含する、請求項１７記載のコンピュータープログラム製品。
20. 前記複数の細胞構造が画像として記憶される、請求項１７記載のコンピュータープログラム製品。
21. 前記画像が三次元画像である、請求項２０記載のコンピュータープログラム製品。
22. 例示的な細胞画像が２つ以上の細胞画像の統合である、請求項１７記載のコンピュータープログラム製品。
23. 指示によって行われる前記方法がさらに、前記染色モジュールを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品に対するより多くの情報を提供する選択可能アイテムとして、前記選択された試薬製品をディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、請求項１７記載のコンピュータープログラム製品。
24. 指示によって行われる前記方法がさらに、前記染色モジュールを用いて、選択された場合に前記選択された試薬製品をオーダーするプロセスを開始する選択可能アイテムをディスプレイ上にディスプレイする工程を包含する、請求項１８記載のコンピュータープログラム製品。
25. 以下を備える、生体細胞の１つ以上の細胞構造をディスプレイするためのシステム：
    生体細胞の複数の細胞構造と各々の細胞構造についての１つ以上の染料色とを記憶するように構成されたメモリー；ならびに
    前記メモリーおよびクライアントデバイスと通信状態にあるプロセッサーであって、
    選択された細胞構造を前記クライアントデバイスから受信するように；
    前記選択された細胞構造の１つ以上の染料色を前記メモリーから読み出すように；
    前記選択された細胞構造の前記１つ以上の染料色を前記クライアントデバイス上に通信およびディスプレイするように；
    選択された染料色を前記インプットデバイスから受信するように；かつ
    前記選択された細胞構造を、前記選択された染料色での前記選択された細胞構造の染色の見本である前記クライアントデバイス上の例示的な細胞画像において前記選択された染料色で通信およびディスプレイするように、
    さらに構成されている、プロセッサー。
26. 前記プロセッサーが、前記クライアントデバイスとネットワーク接続を介して通信する、請求項２５記載のシステム。
27. 前記選択された細胞構造および選択された染料色が、前記クライアントデバイス上で行われているウェブブラウザー上にディスプレイされる、請求項２６記載のシステム。
28. 以下の工程を包含する、カスタマーが試薬製品をオーダーすることを可能にするための方法：
    デバイス中で試薬製品に関与するシミュレーションをカスタマーが行うことを可能にするためのプロセッサーを備えるコンピュータープログラム製品を提供する工程；
    前記コンピュータープログラム製品を用いてかつ前記デバイス上に、前記試薬製品に対応する選択可能アイテムをディスプレイする工程であって、ここで、前記カスタマーによって選択された場合、前記プロセッサーは、前記試薬製品のオーダーを引き起こすように構成されている、工程；ならびに
    前記試薬製品の引き起こされたオーダーを前記プロセッサーを用いて処理する工程。

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