JP2009171960A - 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム - Google Patents
4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム Download PDFInfo
- Publication number
- JP2009171960A JP2009171960A JP2008328227A JP2008328227A JP2009171960A JP 2009171960 A JP2009171960 A JP 2009171960A JP 2008328227 A JP2008328227 A JP 2008328227A JP 2008328227 A JP2008328227 A JP 2008328227A JP 2009171960 A JP2009171960 A JP 2009171960A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- coli
- gene
- pha
- coa
- acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title claims description 29
- SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxybutyric acid Chemical compound OCCCC(O)=O SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 title abstract description 55
- 239000005014 poly(hydroxyalkanoate) Substances 0.000 title abstract description 5
- 229920000903 polyhydroxyalkanoate Polymers 0.000 title abstract description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 127
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 52
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 claims abstract description 46
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract description 44
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract description 44
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 claims abstract description 43
- 108010010718 poly(3-hydroxyalkanoic acid) synthase Proteins 0.000 claims abstract description 32
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 30
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 25
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 2-oxoglutaric acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)C(O)=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 17
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 17
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 claims description 16
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 13
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 12
- 101000950981 Bacillus subtilis (strain 168) Catabolic NAD-specific glutamate dehydrogenase RocG Proteins 0.000 claims description 12
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 108010093796 4-hydroxybutyrate dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 9
- 102000016901 Glutamate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 9
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 claims description 9
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 claims description 8
- 108091022930 Glutamate decarboxylase Proteins 0.000 claims description 7
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims description 7
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 7
- 102000008214 Glutamate decarboxylase Human genes 0.000 claims description 6
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims description 4
- 229940006015 4-hydroxybutyric acid Drugs 0.000 abstract description 47
- 239000000178 monomer Substances 0.000 abstract description 22
- 239000002253 acid Substances 0.000 abstract description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 abstract description 4
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 abstract 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 123
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 57
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 39
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 39
- BAMBWCGEVIAQBF-CITAKDKDSA-N 4-hydroxybutyryl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CCCO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 BAMBWCGEVIAQBF-CITAKDKDSA-N 0.000 description 30
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 29
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 29
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 26
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 25
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 24
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 24
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Chemical group N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 229920000071 poly(4-hydroxybutyrate) Polymers 0.000 description 21
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 19
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 19
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 19
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 17
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 17
- 239000000047 product Substances 0.000 description 17
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 13
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 13
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 13
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 13
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 12
- 101150116670 gabT gene Proteins 0.000 description 12
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- 108010078304 poly-beta-hydroxybutyrate polymerase Proteins 0.000 description 12
- 239000001384 succinic acid Substances 0.000 description 12
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 11
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 11
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 10
- KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N putrescine Chemical compound NCCCCN KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- WHBMMWSBFZVSSR-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxybutyric acid Chemical compound CC(O)CC(O)=O WHBMMWSBFZVSSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101100489694 Clostridium kluyveri (strain ATCC 8527 / DSM 555 / NCIMB 10680) 4hbD gene Proteins 0.000 description 9
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 8
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 8
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 8
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 8
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 8
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 8
- 241000252867 Cupriavidus metallidurans Species 0.000 description 7
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 7
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 7
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 description 7
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 7
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 7
- 210000002706 plastid Anatomy 0.000 description 7
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 7
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 7
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 7
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150099894 GDHA gene Proteins 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150118940 gadB gene Proteins 0.000 description 6
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- 101150048611 phaC gene Proteins 0.000 description 6
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 6
- WHBMMWSBFZVSSR-GSVOUGTGSA-N (R)-3-hydroxybutyric acid Chemical group C[C@@H](O)CC(O)=O WHBMMWSBFZVSSR-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 5
- 102100029103 3-ketoacyl-CoA thiolase Human genes 0.000 description 5
- 108010024655 4-hydroxybutyrate CoA-transferase Proteins 0.000 description 5
- 108010003902 Acetyl-CoA C-acyltransferase Proteins 0.000 description 5
- 108700016258 Agmatinases Proteins 0.000 description 5
- 101100494773 Caenorhabditis elegans ctl-2 gene Proteins 0.000 description 5
- 101100112369 Fasciola hepatica Cat-1 gene Proteins 0.000 description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101000746457 Neisseria gonorrhoeae UPF0213 protein in glnA 3'region Proteins 0.000 description 5
- 101100005271 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) cat-1 gene Proteins 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 239000005700 Putrescine Substances 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 5
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 5
- 108091000039 acetoacetyl-CoA reductase Proteins 0.000 description 5
- 102000011229 agmatinase Human genes 0.000 description 5
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 5
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 5
- 230000006870 function Effects 0.000 description 5
- 101150043302 gabD gene Proteins 0.000 description 5
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 5
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 5
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 5
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 5
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 5
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 5
- 229920001013 poly(3-hydroxybutyrate-co-4-hydroxybutyrate) Polymers 0.000 description 5
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 5
- SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-M 4-hydroxybutyrate Chemical compound OCCCC([O-])=O SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 108010065763 Aminobutyraldehyde dehydrogenase Proteins 0.000 description 4
- 102100032252 Antizyme inhibitor 2 Human genes 0.000 description 4
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 4
- 101000798222 Homo sapiens Antizyme inhibitor 2 Proteins 0.000 description 4
- VZUNGTLZRAYYDE-UHFFFAOYSA-N N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine Chemical compound O=NN(C)C(=N)N[N+]([O-])=O VZUNGTLZRAYYDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101710181647 Putrescine aminotransferase Proteins 0.000 description 4
- 108010084086 Succinate-Semialdehyde Dehydrogenase Proteins 0.000 description 4
- 102000005566 Succinate-Semialdehyde Dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 4
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 4
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 4
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 4
- 101150005925 aspC gene Proteins 0.000 description 4
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 4
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 4
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 4
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 150000001261 hydroxy acids Chemical group 0.000 description 4
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 101150031436 sucD gene Proteins 0.000 description 4
- QHHKKMYHDBRONY-WZZMXTMRSA-N (R)-3-hydroxybutanoyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C[C@H](O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 QHHKKMYHDBRONY-WZZMXTMRSA-N 0.000 description 3
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 3
- NDPLAKGOSZHTPH-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxyoctanoic acid Chemical compound CCCCCC(O)CC(O)=O NDPLAKGOSZHTPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101100536799 Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) tgnE gene Proteins 0.000 description 3
- QYPPJABKJHAVHS-UHFFFAOYSA-N Agmatine Natural products NCCCCNC(N)=N QYPPJABKJHAVHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101100224392 Bacillus subtilis (strain 168) dpaA gene Proteins 0.000 description 3
- 101100243766 Dictyostelium discoideum phbA gene Proteins 0.000 description 3
- 108020000311 Glutamate Synthase Proteins 0.000 description 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 3
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 3
- 101100277701 Halobacterium salinarum gdhX gene Proteins 0.000 description 3
- 101100392454 Picrophilus torridus (strain ATCC 700027 / DSM 9790 / JCM 10055 / NBRC 100828) gdh2 gene Proteins 0.000 description 3
- 101100116769 Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) gdhA-2 gene Proteins 0.000 description 3
- 241001415395 Spea Species 0.000 description 3
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 3
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QYPPJABKJHAVHS-UHFFFAOYSA-P agmatinium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCCC[NH3+] QYPPJABKJHAVHS-UHFFFAOYSA-P 0.000 description 3
- HWXBTNAVRSUOJR-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxyglutaric acid Natural products OC(=O)C(O)CCC(O)=O HWXBTNAVRSUOJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940009533 alpha-ketoglutaric acid Drugs 0.000 description 3
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000003578 bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 3
- 230000008238 biochemical pathway Effects 0.000 description 3
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- RGJOEKWQDUBAIZ-UHFFFAOYSA-N coenzime A Natural products OC1C(OP(O)(O)=O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)OC1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 RGJOEKWQDUBAIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005516 coenzyme A Substances 0.000 description 3
- 229940093530 coenzyme a Drugs 0.000 description 3
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 3
- KDTSHFARGAKYJN-UHFFFAOYSA-N dephosphocoenzyme A Natural products OC1C(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)OC1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 KDTSHFARGAKYJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 3
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 3
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 3
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 3
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001301 oxygen Chemical group 0.000 description 3
- 101150046540 phaA gene Proteins 0.000 description 3
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 3
- 229920000520 poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) Polymers 0.000 description 3
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 3
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 3
- 101150010065 sad gene Proteins 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- UIUJIQZEACWQSV-UHFFFAOYSA-N succinic semialdehyde Chemical compound OC(=O)CCC=O UIUJIQZEACWQSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 229920001169 thermoplastic Polymers 0.000 description 3
- 239000004416 thermosoftening plastic Substances 0.000 description 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 3
- YEJRWHAVMIAJKC-UHFFFAOYSA-N 4-Butyrolactone Chemical compound O=C1CCCO1 YEJRWHAVMIAJKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DZQLQEYLEYWJIB-UHFFFAOYSA-N 4-aminobutanal Chemical compound NCCCC=O DZQLQEYLEYWJIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FMHKPLXYWVCLME-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-valeric acid Chemical compound CC(O)CCC(O)=O FMHKPLXYWVCLME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150056162 4hbD gene Proteins 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 2
- 108010003415 Aspartate Aminotransferases Proteins 0.000 description 2
- 102000004625 Aspartate Aminotransferases Human genes 0.000 description 2
- 241000193033 Azohydromonas lata Species 0.000 description 2
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Chemical compound CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000186570 Clostridium kluyveri Species 0.000 description 2
- RGJOEKWQDUBAIZ-IBOSZNHHSA-N CoASH Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 RGJOEKWQDUBAIZ-IBOSZNHHSA-N 0.000 description 2
- 102000005870 Coenzyme A Ligases Human genes 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 101100243777 Dictyostelium discoideum phbB gene Proteins 0.000 description 2
- 101100322242 Drosophila melanogaster nAChRalpha2 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091026898 Leader sequence (mRNA) Proteins 0.000 description 2
- 108010011449 Long-chain-fatty-acid-CoA ligase Proteins 0.000 description 2
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 2
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 2
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 2
- 241000202974 Methanobacterium Species 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 101100463818 Pseudomonas oleovorans phaC1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000205156 Pyrococcus furiosus Species 0.000 description 2
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 2
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 2
- 241000192581 Synechocystis sp. Species 0.000 description 2
- 101100492609 Talaromyces wortmannii astC gene Proteins 0.000 description 2
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 2
- 101150116772 aatA gene Proteins 0.000 description 2
- 101150081706 acsAB gene Proteins 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- WERYXYBDKMZEQL-UHFFFAOYSA-N butane-1,4-diol Chemical compound OCCCCO WERYXYBDKMZEQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000002962 chemical mutagen Substances 0.000 description 2
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 2
- 101150100742 dapL gene Proteins 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- GHLKSLMMWAKNBM-UHFFFAOYSA-N dodecane-1,12-diol Chemical compound OCCCCCCCCCCCCO GHLKSLMMWAKNBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011143 downstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 239000006481 glucose medium Substances 0.000 description 2
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 2
- 238000012269 metabolic engineering Methods 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 239000006151 minimal media Substances 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N nalidixic acid Chemical compound C1=C(C)N=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=C1 MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000210 nalidixic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 101150110984 phaB gene Proteins 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- KCXFHTAICRTXLI-UHFFFAOYSA-N propane-1-sulfonic acid Chemical compound CCCS(O)(=O)=O KCXFHTAICRTXLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150068263 putA gene Proteins 0.000 description 2
- NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N pyridoxal 5'-phosphate Chemical group CC1=NC=C(COP(O)(O)=O)C(C=O)=C1O NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 description 2
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 description 2
- 101150076849 rpoS gene Proteins 0.000 description 2
- 101150101115 speB gene Proteins 0.000 description 2
- VNOYUJKHFWYWIR-ITIYDSSPSA-N succinyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CCC(O)=O)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 VNOYUJKHFWYWIR-ITIYDSSPSA-N 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000009281 ultraviolet germicidal irradiation Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZDSRFXVZVHSYMA-CMOCDZPBSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZDSRFXVZVHSYMA-CMOCDZPBSA-N 0.000 description 1
- WHBMMWSBFZVSSR-GSVOUGTGSA-M (R)-3-hydroxybutyrate Chemical compound C[C@@H](O)CC([O-])=O WHBMMWSBFZVSSR-GSVOUGTGSA-M 0.000 description 1
- NDPLAKGOSZHTPH-SSDOTTSWSA-N (R)-3-hydroxyoctanoic acid Chemical compound CCCCC[C@@H](O)CC(O)=O NDPLAKGOSZHTPH-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- NXOIMAMHRHDCFR-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydro-1h-pyrrole-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1CC=CN1 NXOIMAMHRHDCFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UITHBXHYVUAKKK-UHFFFAOYSA-N 2-(2-hydroxyethyl)hexanoic acid Chemical compound CCCCC(C(O)=O)CCO UITHBXHYVUAKKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HPMGFDVTYHWBAG-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxyhexanoic acid Chemical compound CCCC(O)CC(O)=O HPMGFDVTYHWBAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010060511 4-Aminobutyrate Transaminase Proteins 0.000 description 1
- 102100035923 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 102000008146 Acetate-CoA ligase Human genes 0.000 description 1
- 108010049926 Acetate-CoA ligase Proteins 0.000 description 1
- 241001133760 Acoelorraphe Species 0.000 description 1
- 241001250577 Aethionema grandiflorum Species 0.000 description 1
- 102100028443 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 Human genes 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 241000222518 Agaricus Species 0.000 description 1
- 235000001674 Agaricus brunnescens Nutrition 0.000 description 1
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 241000893512 Aquifex aeolicus Species 0.000 description 1
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 1
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 1
- 241000490494 Arabis Species 0.000 description 1
- 241000205042 Archaeoglobus fulgidus Species 0.000 description 1
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 description 1
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 description 1
- 241000589941 Azospirillum Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- 241000589174 Bradyrhizobium japonicum Species 0.000 description 1
- 241000219198 Brassica Species 0.000 description 1
- 235000011331 Brassica Nutrition 0.000 description 1
- 235000011303 Brassica alboglabra Nutrition 0.000 description 1
- 244000180419 Brassica nigra Species 0.000 description 1
- 235000011291 Brassica nigra Nutrition 0.000 description 1
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 1
- 235000011302 Brassica oleracea Nutrition 0.000 description 1
- 241000219193 Brassicaceae Species 0.000 description 1
- 235000011305 Capsella bursa pastoris Nutrition 0.000 description 1
- 240000008867 Capsella bursa-pastoris Species 0.000 description 1
- 244000020518 Carthamus tinctorius Species 0.000 description 1
- 235000003255 Carthamus tinctorius Nutrition 0.000 description 1
- 241000195654 Chlorella sorokiniana Species 0.000 description 1
- 241000193403 Clostridium Species 0.000 description 1
- 241000193401 Clostridium acetobutylicum Species 0.000 description 1
- 241001468165 Clostridium aminobutyricum Species 0.000 description 1
- 101100473077 Clostridium kluyveri (strain ATCC 8527 / DSM 555 / NCIMB 10680) rpoN gene Proteins 0.000 description 1
- 244000060011 Cocos nucifera Species 0.000 description 1
- 235000013162 Cocos nucifera Nutrition 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 241000589519 Comamonas Species 0.000 description 1
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 description 1
- ABIKNKURIGPIRJ-UHFFFAOYSA-N DL-4-hydroxy caproic acid Chemical compound CCC(O)CCC(O)=O ABIKNKURIGPIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 241001600125 Delftia acidovorans Species 0.000 description 1
- 240000006497 Dianthus caryophyllus Species 0.000 description 1
- 235000009355 Dianthus caryophyllus Nutrition 0.000 description 1
- 240000003421 Dianthus chinensis Species 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 101100121803 Escherichia coli (strain K12) glaR gene Proteins 0.000 description 1
- 101100532764 Escherichia coli (strain K12) scpC gene Proteins 0.000 description 1
- 241000702191 Escherichia virus P1 Species 0.000 description 1
- 108091092566 Extrachromosomal DNA Proteins 0.000 description 1
- 101150071111 FADD gene Proteins 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- 241000224467 Giardia intestinalis Species 0.000 description 1
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 1
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091029795 Intergenic region Proteins 0.000 description 1
- 241000588915 Klebsiella aerogenes Species 0.000 description 1
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 1
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 1
- 241000203353 Methanococcus Species 0.000 description 1
- 241000205284 Methanosarcina acetivorans Species 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 241000186359 Mycobacterium Species 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- XJLXINKUBYWONI-NNYOXOHSSA-O NADP(+) Chemical compound NC(=O)C1=CC=C[N+]([C@H]2[C@@H]([C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](O3)N3C4=NC=NC(N)=C4N=C3)O)O2)O)=C1 XJLXINKUBYWONI-NNYOXOHSSA-O 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 241000221961 Neurospora crassa Species 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 241000607568 Photobacterium Species 0.000 description 1
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 description 1
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 241000589540 Pseudomonas fluorescens Species 0.000 description 1
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 101100000272 Rhizobium meliloti (strain 1021) acsA2 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241001178898 Salsuginea Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 241000490596 Shewanella sp. Species 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000589196 Sinorhizobium meliloti Species 0.000 description 1
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 1
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 241000187432 Streptomyces coelicolor Species 0.000 description 1
- 108090000794 Streptopain Proteins 0.000 description 1
- 102000011929 Succinate-CoA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010075728 Succinate-CoA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 241000205095 Sulfolobus shibatae Species 0.000 description 1
- 241000192584 Synechocystis Species 0.000 description 1
- 244000299461 Theobroma cacao Species 0.000 description 1
- 235000009470 Theobroma cacao Nutrition 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 241000607598 Vibrio Species 0.000 description 1
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 1
- LUTSRLYCMSCGCS-BWOMAWGNSA-N [(3s,8r,9s,10r,13s)-10,13-dimethyl-17-oxo-1,2,3,4,7,8,9,11,12,16-decahydrocyclopenta[a]phenanthren-3-yl] acetate Chemical compound C([C@@H]12)C[C@]3(C)C(=O)CC=C3[C@@H]1CC=C1[C@]2(C)CC[C@H](OC(=O)C)C1 LUTSRLYCMSCGCS-BWOMAWGNSA-N 0.000 description 1
- 241000193450 [Clostridium] symbiosum Species 0.000 description 1
- NSLINMGDAPICAG-XUQBLTEUSA-N [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-4-hydroxy-8H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(3R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxo-4-[[3-oxo-3-(2-sulfanylethylamino)propyl]amino]butyl] hydrogen phosphate Chemical compound OC12N=CN=C(C2=NCN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](OP(=O)(O)O)[C@@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O1)N NSLINMGDAPICAG-XUQBLTEUSA-N 0.000 description 1
- WDJHALXBUFZDSR-UHFFFAOYSA-M acetoacetate Chemical compound CC(=O)CC([O-])=O WDJHALXBUFZDSR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 101150116076 acsA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150083305 acsA2 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 108010069175 acyl-CoA transferase Proteins 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000003277 amino acid sequence analysis Methods 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150072344 argA gene Proteins 0.000 description 1
- 150000001491 aromatic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000010009 beating Methods 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000704 biodegradable plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920000229 biodegradable polyester Polymers 0.000 description 1
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 1
- 238000003965 capillary gas chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 1
- 101150055766 cat gene Proteins 0.000 description 1
- 230000006652 catabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000007334 copolymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- FOTKYAAJKYLFFN-UHFFFAOYSA-N decane-1,10-diol Chemical compound OCCCCCCCCCCO FOTKYAAJKYLFFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 229920001971 elastomer Polymers 0.000 description 1
- 239000000806 elastomer Substances 0.000 description 1
- 230000006862 enzymatic digestion Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006872 enzymatic polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000005350 fused silica glass Substances 0.000 description 1
- 101150056556 gadA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150032444 gadC gene Proteins 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000012246 gene addition Methods 0.000 description 1
- 108091008053 gene clusters Proteins 0.000 description 1
- 238000003208 gene overexpression Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 229940085435 giardia lamblia Drugs 0.000 description 1
- 230000009477 glass transition Effects 0.000 description 1
- 101150041871 gltB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150039906 gltD gene Proteins 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 description 1
- XXMIOPMDWAUFGU-UHFFFAOYSA-N hexane-1,6-diol Chemical compound OCCCCCCO XXMIOPMDWAUFGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 1
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 1
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 1
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 150000002596 lactones Chemical class 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 230000012976 mRNA stabilization Effects 0.000 description 1
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- OEIJHBUUFURJLI-UHFFFAOYSA-N octane-1,8-diol Chemical compound OCCCCCCCCO OEIJHBUUFURJLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 1
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 239000011368 organic material Substances 0.000 description 1
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 238000012261 overproduction Methods 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 101150113864 pat gene Proteins 0.000 description 1
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 1
- 101150032462 phaC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000013492 plasmid preparation Methods 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 238000012643 polycondensation polymerization Methods 0.000 description 1
- -1 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 235000007682 pyridoxal 5'-phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011589 pyridoxal 5'-phosphate Substances 0.000 description 1
- 229960001327 pyridoxal phosphate Drugs 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000007151 ring opening polymerisation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 229930195734 saturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 101150087632 sigL gene Proteins 0.000 description 1
- NBPUSGBJDWCHKC-AENDTGMFSA-M sodium;(3r)-3-hydroxybutanoate Chemical compound [Na+].C[C@@H](O)CC([O-])=O NBPUSGBJDWCHKC-AENDTGMFSA-M 0.000 description 1
- XYGBKMMCQDZQOZ-UHFFFAOYSA-M sodium;4-hydroxybutanoate Chemical compound [Na+].OCCCC([O-])=O XYGBKMMCQDZQOZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 125000002730 succinyl group Chemical group C(CCC(=O)*)(=O)* 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000000153 supplemental effect Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000005891 transamination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000002463 transducing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 230000004102 tricarboxylic acid cycle Effects 0.000 description 1
- 108010068794 tyrosyl-tyrosyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229930195735 unsaturated hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0008—Oxidoreductases (1.) acting on the aldehyde or oxo group of donors (1.2)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08G—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED OTHERWISE THAN BY REACTIONS ONLY INVOLVING UNSATURATED CARBON-TO-CARBON BONDS
- C08G63/00—Macromolecular compounds obtained by reactions forming a carboxylic ester link in the main chain of the macromolecule
- C08G63/02—Polyesters derived from hydroxycarboxylic acids or from polycarboxylic acids and polyhydroxy compounds
- C08G63/06—Polyesters derived from hydroxycarboxylic acids or from polycarboxylic acids and polyhydroxy compounds derived from hydroxycarboxylic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
- C12N9/1029—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1096—Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/62—Carboxylic acid esters
- C12P7/625—Polyesters of hydroxy carboxylic acids
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Polyesters Or Polycarbonates (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Biological Depolymerization Polymers (AREA)
Abstract
【解決手段】PHAシンターゼ、および4HB−CoAトランスフェラーゼからなる群より選択される、異種酵素をコードする遺伝子を、ゲノムに安定に取り込んだ、組換え宿主を用いる上記方法。
【選択図】なし
Description
GerngrossおよびMartinは、PHAシンターゼ基質が、補酵素A(CoA)部分の存在を必要とすることを報告した(Gerngross,T.U.およびMartin,D.P.(1955)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:6279)。従って、4HBの取り込みに必要とされる前駆体は、4HB−CoAである。4−ヒドロキシ酪酸含有PHA合成の最小必要条件を決定するために、4−ヒドロキシ酪酸、3−ヒドロキシ酪酸、Clostridium acetobutylicumから精製された4−ヒドロキシ酪酸CoAトランスフェラーゼ(WilladsenおよびBuckel、FEMS Microbiol.Lett.(1990)70:187−192)、およびPHBシンターゼ(Gerngrossら(1994)Biochemistry 33:9311により精製された)の混合物を、GerngrossおよびMartin(Gerngross,T.U.およびMartin,D.P.(1955)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:6279)により記載されたような条件下でインビトロでインキュベートした。反応産物は単離され、そして4−ヒドロキシ酪酸の取り込みが1H−NMRにより確認された。
α−ケトグルタル酸から4−ヒドロキシブチリルCoAへの変換を可能にする経路は、図2に示される。この経路に関与する酵素は、α−ケトグルタル酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4−ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、および4−ヒドロキシ酪酸CoAトランスフェラーゼである。
グルタミン酸デヒドロゲナーゼをコードするgdhA遺伝子:E.coli(Valleら、Gene(1984)27:193−199およびValleら、Gene(1983)23:199−209)、Klebsiella aerogenes(Mountainら、Mol.Gen.Genet.(1985)199:141−145)、Pyrococcus furiosus(DiRuggieroら、Appl.Environ.Microbiol.(1995)61:159−164;Eggenら、Gene(1993)132:143−148)、Sulfolobus shibatae(Benachenhouら(1994),Gene 140:17−24)、Rumonococcus flavefaciens(Duncanら、Appl,Environ.Microbiol.(1992)58:4032−4037)、Pseudomonas fluorescens(Miyamotoら、J.Biochem.(1992)112:52−56)、Clostridium symbiosum(Tellerら、Eur.J.Biochem.(1992)206:151−159)、Synechocystis(Plant Mol.Biol.(1995)28:173−188)、Corynebacterium glutamicum(Bormannら、Mol.Microbiol.(1992)6:301−308)、Peptostreptococcus asaccharolyticus(Snedecorら(1991)J.Bacteriol.173:6162−6167)、Salmonellatyphimurium(Millerら(1984)J.Bacteriol.157:171−178)、Chlorella sorokiniana(Cockら、Plant Mol.Biol.(1991)17:1023−144)、Saccharomyces cerevisiae(Nagasuら、Gene(1984)37:247−253)、Neurospora crassa(Kinnairdら、Gene(1983)26:253−260)、Giardia lamblia(Yeeら(1992)J.Biol.Chem.267:7539−7544)。
グルタミン酸デヒドロゲナーゼ:(Syntichakiら(1996)Gene 168:87−92)、トウモロコシ(Sakakibaraら(1995),Plant Cell Physiol.36:789−797)、ヒト(Tzimagiogisら(1993),Hum.Genet.91:433−438)、マウス(Tzimagiogisら(1991),Biochem.Biophys.Acta 1089:250−253)、Amuroら(1990),Biochem.Biophys.Acta 1049:216−218)。
Escherichia coliのような細菌は、少なくとも4つの異なるアミノ酸(アルギニン、プロリン、グルタミン、およびグルタミン酸)を異化してGABAを生成し得、GABAは、上記のように4−ヒドロキシ−ブチリルCoAに変換され得る。異化経路は図3に示される。
例えば、アルギニンデカルボキシラーゼをコードするspeA:Escherichia coli(MooreおよびBoyle,J.Bacteriol.172:4631,1990)、Synechocystis sp.(Kanekoら、DNA Res.3:109,1996)、Helicobacter pylori(Tombら、Nature 388:539,1997)、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)(Watsonら、Plant Physiol.114:1569,1997)、ダイズ(Glycine max)(Namら、Plant Cell Physiol.38:1156,1997)、カーネーション(Dianthus caryophyllus)(Changら、Plant Physiol.112:863,1996)、エンドウ(Pisum sativum)(Perez−Amadorら、Plant Mol.Biol.28:997,1995)、トマト(Lycopersicon esculentum)(Rastogiら、Plant Physiol.103:829,1993)、カラスムギ(Avena sativa)(BellおよびMalmberg,Mol.Gen.Genet.224:431,1990)、アブラナ科の植物(Barbarea vulgaris、Nasturtium officinale、Arabis drummondii、Aethionema grandiflora、Capsella bursa−pastoris、Arabidopsis arenosa、Sisymbrium altissimum、Thellungiella salsuginea、Polanisia dodecandra、Stanleya pinnata、Carica papaya、Brassica oleracea、Brassica nigra、Theobroma cacao)(Gallowayら、Mol.Biol.Evol.15,1998)、ラット(Morrisseyら、Kidney Int.47:1458,1995)。
コハク酸から4HB−CoAへの変換についての完全な生化学的経路(図4)は、Clostridium kluyveriにおいて特徴付けられている(SohlingおよびGottschalk,1993,Eur.J.Biochem.212,121−127;Wolffら、1993,Appl.Environ.Microbiol.59,1876−1882;Scherfら、1994,Arch.Microbiol.161.239−245)。最近、C.kluyveriのスクシニルCoA:CoAトランスフェラーゼ(cat1)、コハク酸−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ(sucD)、および4−ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ(4hbD)をコードする遺伝子が同定された(SohlingおよびGottschalk,1996,J.Bacteriol.178,871−880)。これらの遺伝子は、C.kluyveri染色体上の連続したDNA区間に位置し、そして未知機能の3つの遺伝子(orfZ、orfY、およびsigL)により隣接される。この遺伝子は、増殖培地中のコハク酸により誘導されるようである。4−ヒドロキシブチリルCoAトランスフェラーゼをコードする遺伝子は、これらの研究において同定されなかった。
α−ケトグルタル酸またはコハク酸いずれかから4HBへの変換において作用する酵素をコードする代替遺伝子は、相補性研究または発現研究により単離され得る:グルタミン酸−コハク酸セミアルデヒドトランスアミナーゼ遺伝子は、この遺伝子が、窒素源としてのγ−アミノ酪酸利用についてE.coli gabT変異を相補する能力により、遺伝子ライブラリーから単離され得る。同様に、E.coliにおけるグルタミン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子およびグルタミン酸デカルボキシラーゼ遺伝子の変異は相補され得る。代替的4−ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ遺伝子の発現は、E.coliが、炭素源として4−ヒドロキシ酪酸を利用するのを可能にする。BLASTPプログラムおよびGenBankデータベースを用いた酵素相同性検索により、E.coliゲノムにおける4−ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼホモログの存在が示唆される。これらのタンパク質は、遺伝子索引(index)番号:gi|1788795およびgi|1790015と同定された。
株が、接種物計画(inoculum train)および生成操業の期間の間、バイオポリマーを合成する能力を失わないことは、効率的なPHA生成に重要である。任意のphb遺伝子の欠失が産物欠失をもたらすのに対して、新たなモノマーを提供する任意の遺伝子の欠失は、不均一な産物の形成をもたらす。どちらも望ましくなく、従って、株の安定な増殖が必要とされる。不運なことに、トランスフェラーゼまたはシンターゼをコードする遺伝子の単なる組み込みは、有意なポリマー生成をもたらさない。プロモーター領域改変、または変異誘発、または他の既知の技術、それに続くポリマー生成物についてのスクリーニングにより、酵素発現を増強することが必要である。これらの技術を用いて、実施例に記載された株における遺伝子の組み込みは、100,000L容器中での生成に十分な少なくとも50世代の間、安定であることが測定された。
ポリ−(R−3−ヒドロキシ酪酸)(PHB)合成の最小必要条件は、A.eutrophusに由来する精製PHAシンターゼ、および基質(R)−3−ヒドロキシブチリルCoAであることが以前に示された。4−ヒドロキシブチリル−CoAは、Clostridium aminobutyricumから単離された酵素4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼにより触媒されるトランスチオエステル化反応を介して、アセチル−CoAおよび4−ヒドロキシ酪酸からインサイチュで調製され得る。この酵素はまた、遊離酸およびアセチル−CoAからの(R)−3−ヒドロキシブチリル−CoAの形成を触媒する。従って、P(3HB−コ−4HB)を形成するための、4−ヒドロキシブチリル−CoAのインサイチュ合成および(R)−3−ヒドロキシブチリル−CoAとのその共重合の最小必要条件は、緩衝化水溶液中のPHAシンターゼ、(R)−3−ヒドロキシ酪酸、4−ヒドロキシ酪酸、アセチル−CoA、および4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼを含む。これは、以下のように実証された:リン酸カリウム緩衝液(1ml、100mM、pH7.5)に、以下を添加した:アセチル−CoA(0.5mL、30mM)
4−ヒドロキシ酪酸ナトリウム塩(50μl、2M)
(R)−3−ヒドロキシ酪酸ナトリウム塩(100μl、1M)
4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼ(10mg、25単位)PHAシンターゼ(0.05mg)
反応物を室温で一晩放置した。不溶性PHA顆粒の形成に注目した。不溶性物質を遠心分離によりペレット化し、そして凍結乾燥した(0.65mg)。この物質は、粘着性の粘調度を有した。有機物質をCDCl3で抽出し、そして1H−NMRにより分析した。NMR分析により、約20%の4−ヒドロキシ酪酸を含む、ポリ((R)−3−ヒドロキシ酪酸−コ−4−ヒドロキシ酪酸)の形成が確認された。NMRスペクトルは、ポリ((R)−3−ヒドロキシ酪酸−コ−4−ヒドロキシ酪酸)の文献スペクトル(Doi,Y.ら、Macromolecules 1988,21:2722−2727)と一致する。
C.kluyveriに由来するhbcT遺伝子を、標準的な分子生物学的技術を用いてE.coli中で発現した。この遺伝子は、強力なプロモーターの後ろに、そしてこのプロモーターから発現を駆動する条件下で適切なベクターに配置されている。4HBCTを生成する。
E.coli株に、C.kluyveriに由来する4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼをコードする遺伝子を含む、プラスミドpFS16を備え付けた。この遺伝子は、4−ヒドロキシ酪酸を4−ヒドロキシブチリル−CoAに変換し、続いて、4−ヒドロキシブチリル−CoAを、染色体によりコードされるPHBシンターゼによりP4HBに重合すると予想される。株を、炭素源として4−ヒドロキシ酪酸単独またはグルコースと組み合せて有する、10%LBまたは100%LB液体培地50〜100mlを含む、250mlエーレンマイアーフラスコ中で増殖させた。培養物を、0〜250rpmで振盪しながら32〜37℃でインキュベートした。培養物を、インキュベーションの24時間後に採集し、そしてPHAについて分析した。pFS16を有するE.coli MBX769は、その細胞乾燥重量の67%をP4HBホモポリマーとして蓄積する。従って、4HB含有PHAの形成は、プラスミドによりコードされるPHBシンターゼに依存しない。
プラスミドpMUXC5catは、Z.ramigera由来のphbC遺伝子をレシピエント株の染色体に組み込むために、この遺伝子を転位因子上に含む(図5)。強力な翻訳配列を、pTrcベクター(Pharmacia)中で、P.oleovorans由来のphaC1をコードする、PHAシンターゼをコードするpKPS4から得た。この構築物において、phaC1の前には強力なリボソーム結合部位:AGGAGGTTTTT(−ATG)がある。上流の配列を含むphaC1遺伝子を、平滑末端を持つEcoRI−HindIII断片として、pUC18SfiのSmaI部位にクローニングし、pMSXC3を作成した。次に平滑末端のcat遺伝子カセットを、平滑末端のSse8387II部位にクローニングし、pMSXC3catを得た。この時点で、5’末端の27塩基対を除く全てのphaC1をコードする領域を、PstI−BamHI断片として除去し、Z.ramigera由来のphbC遺伝子からの対応する断片と置換した。生じるプラスミドpMSXC5catは、P.oleovoransのPHAシンターゼ由来の9アミノ末端残基、およびZ.ramigera由来の残りの部分を有する、ハイブリッドPHBシンターゼ酵素をコードする。次にC5catカセットをAvrII断片として切除し、pUTHgの対応する部位にクローニングした。これにより、このベクターから水銀抵抗性のマーカーを除去した。生じるプラスミドpMUXC5catは、phbCの前にプロモーター配列の無いC5catミニトランスポゾンを含む。従って、組み込みの際のカセットの発現は、組込み部位に隣接したDNAによって与えられる転写配列に依存する。
(材料および方法)
E.coli株をLuria−Bertani培地(Sambrookら、Molecular Cloning,a laboratory manual、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、NY)中で37℃もしくは30℃で、または最小E2培地(Lageveenら、Appl.Environ.Microbiol.1988、54:2924−2932)中で増殖させた。DNAの操作は、Qiagenプラスミド調製キットまたはQiagen染色体DNA調製キットを用いて製造会社の推奨に従って精製した、プラスミドおよび染色体DNAで行った。DNAは、制限酵素(New England Biolabs、Beverly、MA)を使用して、製造会社の推奨に従って消化した。DNA断片は、Qiagenキットを使用して0.7%アガロース−Tris/酢酸/EDTAゲルから単離した。
NTGまたはEMSを用いた突然変異誘発を、MBX680におけるPHB形成を改善させるために使用した。MBX680をEMSおよびNTGで処理した後、それぞれMBX769およびMBX777株を選択した。これらの細胞株は1%グルコース、0.5%corn steep liquorおよび1mg/mlのクロラムフェニコールを補充したR2培地で培養し得る。MBX769を50mlのR−10培地/0.5%CSL中で2または3%のグルコースと共に、37℃で20から26時間培養した。PHBは細胞乾燥重量の71%蓄積した。同様に、MBX769を50mlのLB中で0.375g/LのKH2PO4、0.875のK2HPO4、および0.25の(NH4)2SO4、および全体で50g/Lのグルコースと共にまたは無しに、培養した(5つのアリコートをインキュベーションの間に加えた)。63時間インキュベートした後、PHBは細胞乾燥重量の96%まで蓄積した。2%グルコースを補充した最少培地中では57%のPBHが蓄積したのに対して、Luria−Bertani/2%グルコース培地で増殖させたMBX777株中のPHB量は67%であった。
E.coliは4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼ活性を有する酵素をコードする内因性の遺伝子を含む。MBX821および1231株を、単独または炭素供給源としてグルコースと組み合わせた4−ヒドロキシ酪酸と共に、50から100mlの10%LB液体培地を含む250mlのエーレンマイヤーフラスコで増殖させた。MBX1231は、1−メチル−3−ニトロ−1−ニトロソグアニジンで処理した後、500μg/mlのクロラムフェニコールを含むプレート上で選択して得られた、MBX821の変異体である。培養物を32℃から33℃で、200rpmで振盪しながらインキュベートした。24時間インキュベートの後培養物を収集し、PHAに関して分析した。表xはこれらの株がP4HBホモポリマーとして細胞乾燥重量の2.5から3.5%を蓄積していることを示している。この株におけるP4HB形成は、PHBシンターゼをコードするプラスミドまたは異種由来の発現した4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼによらない。これらの株を固形培地上で培養すると、P4HB量は11%程度まで向上する。
C.kluyveri由来の4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼは空気、おそらく酸素によって阻害されるようである。高酸素条件下でP4HBを合成するために、4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼをコードするhbcT遺伝子をプラスミド上に有し、そしてPHAシンターゼ遺伝子を染色体上に有するE.coli株の変異体を増殖させ、そして細胞群の大多数が灰色のコロニーを形成する場合に、白色のコロニー(PHAの蓄積を示す)を探索することによって、酸素非感受性変異体をスクリーニングし得る。酸素非感受性細胞株MBX240[pFS16]、MBX379[pFS16]およびMBX830[pFS16]をこの方法を用いて同定した。変異体の集団は、インビボでもとの株をN−メチル−N’−ニトロ−N−ニトロソグアニジンまたはエチルメタンスルホン酸のような化学的突然変異原、または紫外線照射で処理することにより産生し得る。あるいは、hbcTを含むプラスミドに、インビトロでヒドロキシルアミンを用いて突然変異を誘発し得る。次に機能的な4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼを発現している変異体を、固形培地または高度に酸素添加した液体培地中で、4−ヒドロキシ酪酸からのP4HB形成に関してスクリーニングする。
MBX821または1231中で、4HBを4HBCoAに変換する酵素活性の発現を、突然変異誘発によって増大させ得る。固形培地中で増殖させたMBX821および1231中のP4HBの出現には約150時間かかった。改善されたP4HBを蓄積する性質を有する変異体は、これらの細胞株をN−メチル−N’−ニトロ−N−ニトロソグアニジンまたはエチルメタンスルホン酸のような化学的突然変異原、または紫外線照射を用いて、無作為に突然変異誘発した後スクリーニングし得る。望ましい変異体は、4−ヒドロキシ酪酸存在下で、インキュベーションして2から5日以内に白色コロニーを形成する。
植物系が関与する適用には高GC含有量のDNAが必要であるので、代わりの4−ヒドロキシブチリル−CoA生合成遺伝子を同定および単離する必要がある。hbcT遺伝子の低いGC含有量は、他のATリッチなDNAを含む微生物から相同遺伝子を同定および単離するのに有用なプローブとなる。しかし、高GC含有量のhbcT遺伝子は、この方法によっては同定されない。染色体に組み込まれたPHAシンターゼをコードするphbC遺伝子を持つE.coli細胞株を、そのような遺伝子のスクリーニングに使用し得る。遺伝子を植物に導入する適用のためには、高GC含有量のDNAを使用することが望ましい(Perlak F.J.ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1991)88:3324)。例えばhbcT遺伝子がE.coli MBX379で発現された場合、この細胞株は通常の栄養素に加えて4−ヒドロキシ酪酸を含む寒天プレート上でP4HBポリマーを産生し得る。P4HBの形成によってコロニーは簡単に区別できる白色の表現型を持つ。従って、例えば、R.eutropha、A.latus、P.acidovorans、C.testosteroniおよび他のPHB−co−4HB産生生物の遺伝子ライブラリーを、MBX379または同様の細胞株に導入し、4HBを含む増殖培地に直接プレートする。白色コロニーを選択し、蓄積したPHAの組成を決定する。遺伝子ライブラリーは、ゲノムDNAを単離し、DNA断片の代表的な集団をプラスミドベクターにクローニングすることによって、選択した生物から簡単に構築される。代表的なライブラリーは5,000から100,000個のコロニーを持つ。ライブラリーはpLAFR3のようなベクター中の広い宿主域のライブラリーとして、またはpUC19、pBR322のようなベクター中のE.coliライブラリーとしてのいずれかで作製される。ライブラリーのタイプおよびライブラリーを選択した宿主に導入する方法によって、ゲノムDNA断片は大きいか(17−30kb)または比較的小さいか(2−6kb)のいずれかである。ライブラリーを、宿主および使用するベクターに依存して、エレクトロポレーション、形質転換または接合によって、スクリーニング細胞株に導入する。
α−ケトグルタル酸は図7に示したように、4HBに変換し得る細胞代謝物である。その経路は、gabT、gadA/gadBおよびgdhA遺伝子産物によって触媒される回路反応からなる。一旦生成物が4−HBデヒドロゲナーゼおよび4HB−CoAトランスフェラーゼによってさらに4HB−CoAに変換され、PHAシンターゼによってPHAに重合されると、この回路からのコハク酸セミアルデヒドの形成に有利である。
4HBD−C:5’TTTCTCTGAGCTCGGGATATTTAATGATTGTAGG(SacI)。
GH−Dn:5’TTGGGAGCTCTACAGTAAGAAATGCCGTTGG(SacI)。
gadB遺伝子をE.coli染色体からPCRおよび次のプライマーを用いて得た:GB−Up:5’TAAGAGCTCAATTCAGGAGGTTTTTATGGATAAGAAGCAAGTAACGGATTTAAGG(SacI)
GB−Dn:5’TTCCCGGGTTATCAGGTATGCTTGAAGCTGTTCTGTTGGGC(XmaI)。
gabT遺伝子をE.coli染色体からPCRおよび次のプライマーを用いて得た:GT−Up:5’TCCGGATCCAATTCAGGAGGTTTTTATGAACAGCAATAAAGAGTTAATGCAG(BamHI)
GT−Dn:5’GATTCTAGATAGGAGCGGCGCTACTGCTTCGCC(XbaI)。
通常の代謝物GABAはグルタミン酸由来であり、通常主要な代謝ではコハク酸セミアルデヒドを経てコハク酸に代謝される。P4HB形成の、高レベルの中間体を得るために、GABAへの経路を向上させることが望ましくあり得る。グルタミン酸デヒドロゲナーゼによるα−ケトグルタル酸からグルタミン酸への直接の変換の他に、この変換はまた、例えばグルタミン酸および他のアミノ酸、またはプトレッシンのような基質を用いた多くのアミノ基転移反応の一部である。従って、アルギニン(プトレッシンの前駆体)、グルタミン、またはプロリンを過剰に生成する組換えおよび変異生物は、上記で述べられたようにgabT、4hbD、およびhbcTを用いて4HB−CoAの方へ向けられ得るグルタミン酸およびGABAのレベルを増加させた(図10)。
おそらくSucD、4HBDおよびCat1の逆転作用が、4HBをE.coliでの主要な代謝物であるコハク酸に変換するため、cat1、4hbDおよびsucDが導入されている場合、HbcTは4−ヒドロキシ酪酸上でE.coliが成育するのには必要でない(SohlingおよびGottschalk、1996、J.Bacteriol. 178、871−880)。原則として、これらの遺伝子は共にコハク酸から4−HBへの変換を可能にする。そこで、図4に描かれた経路をC.kluyveriのcat1、sucD、4hbD、およびhbcT遺伝子から組み立て得る。あるいは、これらの遺伝子を、C.aminobutyricumのような他のClostridium種から単離し得る。E.coliは自身のスクシニルCoA:CoAトランスフェラーゼを持っているが(sucCD;Mat−Janら、Mol.Gen.Genet.(1989)215:276−280)、E.coliではこの活性は顕著でないので、この遺伝子を他の供給源から導入することが望ましい(AmarasinghamおよびDavis、J.Biol.Chem.(1965)240:3664−3668)。あるいは、E.coli遺伝子の発現をこの適用のために最適化し得る。
中間体がこれらの新しい経路から出て行くのを防ぐために、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(aspC)、およびNADPおよびNAD依存性コハク酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子(sadおよびgabD)を不活性化することが望ましいとされ得る。個々の遺伝子の変異を異なった供給源から得た:aspC13I変異を含む細胞株をE.coli GeneticStock CenterからCGSC5799細胞株として得る。aspC遺伝子は21.1分に位置し、従ってCAG12094(22.25分のzcc−282)またはCAG18478(20.00分のzbj−1230)のTn10(Tc)マーカー、およびCAG12130(21.00分のzcb−3111)のTn10Kmマーカーと連関する。gabD遺伝子の変異は知られておらず、PCRにより遺伝子をクローニングし、抗生物質耐性のような遺伝的マーカーを挿入し、recBC細胞株またはpMAK705のようなこの目的のために構築されたベクターを用いて組み込み、最後に、遺伝子を望ましい宿主に運ぶためにバクテリオファージP1形質導入することによって、この活性を欠失させ得る。
PHAシンターゼ導入遺伝子を含むトランスジェニック植物で発現され得る、4−ヒドロキシ酪酸から4−ヒドロキシブチリルCoAを形成することができる(すなわち、4−ヒドロキシブチリルCoAトランスフェラーゼ活性を持つ)酵素をコードする遺伝子の同定方法を、標準的な手順で開発した。ある場合には、β−ケトチオラーゼおよび/またはアセトアセチルCoA還元酵素のような他のPHA生合成遺伝子を関心のある植物作物で発現させることもまた、有用であり得る。PHAシンターゼ導入遺伝子を脂肪種子作物で発現させる方法は記載されており(米国特許第5,245,023号および米国特許第5,250,430号;米国特許第5,502,273号;米国特許第5,534,432号;米国特許第5,602,321号;米国特許第5,610,041号;米国特許第5,650,555号;米国特許第5,663,063号;国際公開第WO9100917号、国際公開第WO9219747号、国際公開第WO9302187号、国際公開第WO9302194号および国際公開第WO9412014号、Poirierら、1992 Science 256:520−523、WilliamsおよびPeoples、1996 Chemtech 26、38−44)、これらは全て本明細書中に参考として援用される。この目標を達成するために、PHAシンターゼをコードする遺伝子、または1つより多くのサブユニットを持つPHAシンターゼの場合は複数の遺伝子を微生物から植物細胞に運び、PHAシンターゼ酵素の適当な産生レベルを得ることが必要である。それに加えて、さらなるPHA生合成遺伝子、例えばアセトアセチルCoA還元酵素遺伝子、4−ヒドロキシブチリル−CoAトランスフェラーゼ遺伝子または、PHAシンターゼ酵素の基質を合成するのに必要な酵素をコードする他の遺伝子を提供することが必要であり得る。多くの場合、当業者に既知の方法で、異なった植物組織または細胞小器官での発現を調節することが望ましい(GasserおよびFraley、1989、Science 244;1293−1299;Gene Transfer to Plants(1995)、Potrykus,I.およびSpangenberg,G.編、Springer−Verlag Berlin Heidelberg New York.および“Transgenic Plants:A Production Systemfor Industrial and Pharmaceutical Proteins”(1996)、Owen,M.R.L.およびPen,J.編、John Wiley&Sons Ltd. England)。これらは全て本明細書中に参考として援用される。米国特許第5,610,041号は、核の遺伝子からプラスチドへ発現されたタンパク質を導くために、リーダーペプチドを加えることによる、プラスチドへ発現を記載している。より最近の技術は、外来性の遺伝子を組換えにより直接的にプラスチド染色体に入れる直接挿入を可能にする(Svabら、1990、Proc.Natl.Acad.Sci.USA.87:8526−8530;McBrideら、1994、Proc.Natl.Acad.Sci.USA.91:7301−7305)。プラスチドRNAおよびタンパク質合成機構の原核生物的性質はまた、例えばA.eutrophusのphbCABオペロンのような、微生物のオペロンの発現を可能にする。この技術は、複数の酵素が関与する経路をコードする一連の遺伝子を、プラスチドゲノムに直接組み込むことを可能にする。mRNAの安定性および翻訳に関して、プラスチド遺伝子の5’非翻訳領域の重要性を考慮に入れることもまた、重要である(Hauserら、1996、J.Biol.Chem. 271:1486−1497)。ある場合には、オペロンによってコードされる導入遺伝子の発現を最大限にするために、5’非翻訳領域を再遺伝子操作すること、二次構造エレメントを除去すること、または高度に発現しているプラスチド遺伝子由来のエレメントを加えることが有用であり得る。
本発明によって、組換えプロセスが提供され、それにより、代替PHAのモノマー(例えば、4HB)を合成する新たな株を作り出すために、さらなる遺伝子が、トランスジェニックPHBプロデューサーに導入され得る。
Claims (5)
- 宿主において4HBを含むポリマーの生成を増強するための方法であって、該方法は、以下の工程:
ポリヒドロキシアルカノエートシンターゼおよび4HB−CoAトランスフェラーゼからなる群より選択される異種酵素をコードする遺伝子を、該宿主のゲノムに安定に取り込む工程、ならびに
該異種酵素の発現を増強する工程、
を包含する、方法。 - 前記宿主が、ポリヒドロキシアルカノエートシンターゼおよび4HB−CoAトランスフェラーゼの両方をそのゲノムに安定に組み込んだ、請求項1に記載の方法。
- 前記発現が、前記宿主を変異させ、続いて基質として4HBを提供し、そして変異宿主によるポリマー生成についてスクリーニングすることにより増強される、請求項1に記載の方法。
- α−ケトグルタル酸トランスアミナーゼ、グルタミン酸−コハク酸セミアルデヒドトランスアミナーゼ、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、4−ヒドロキシ酪酸デヒドロゲナーゼ、および4−ヒドロキシブチリルCoAトランスフェラーゼからなる群より選択される酵素を発現する宿主を提供する工程をさらに包含する、請求項1に記載の方法。
- アルギニン、グルタミン、またはプロリンを分解して、γアミノ酪酸を生成する酵素を発現する宿主を提供する工程をさらに包含する、請求項1に記載の方法。
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US5937397P | 1997-09-19 | 1997-09-19 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003132325A Division JP2003310262A (ja) | 1997-09-19 | 2003-05-09 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2009171960A true JP2009171960A (ja) | 2009-08-06 |
Family
ID=22022544
Family Applications (4)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2000511853A Withdrawn JP2001516574A (ja) | 1997-09-19 | 1998-09-18 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
JP2003132325A Withdrawn JP2003310262A (ja) | 1997-09-19 | 2003-05-09 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
JP2008328227A Pending JP2009171960A (ja) | 1997-09-19 | 2008-12-24 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
JP2008328226A Pending JP2009082147A (ja) | 1997-09-19 | 2008-12-24 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2000511853A Withdrawn JP2001516574A (ja) | 1997-09-19 | 1998-09-18 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
JP2003132325A Withdrawn JP2003310262A (ja) | 1997-09-19 | 2003-05-09 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008328226A Pending JP2009082147A (ja) | 1997-09-19 | 2008-12-24 | 4−ヒドロキシ酸を含むポリヒドロキシアルカノエートポリマー製造のための生物学的システム |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (6) | US6316262B1 (ja) |
EP (1) | EP1015565B1 (ja) |
JP (4) | JP2001516574A (ja) |
AT (1) | ATE323152T1 (ja) |
AU (1) | AU725516B2 (ja) |
CA (1) | CA2303070C (ja) |
DE (2) | DE69834199T2 (ja) |
WO (1) | WO1999014313A2 (ja) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013018734A1 (ja) | 2011-07-29 | 2013-02-07 | 三井化学株式会社 | 二酸化炭素固定経路を導入した微生物 |
WO2014115815A1 (ja) | 2013-01-24 | 2014-07-31 | 三井化学株式会社 | 二酸化炭素固定回路を導入した微生物 |
Families Citing this family (151)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7455999B2 (en) * | 1998-01-22 | 2008-11-25 | Metabolix, Inc. | Transgenic systems for the manufacture of poly (3-hydroxy-butyrate-co-3-hydroxyhexanoate) |
MXPA00011401A (es) | 1998-05-22 | 2003-04-22 | Metabolix Inc | Composiciones de biopolimero de polimero de polihidroxialcanoato. |
ES2302386T3 (es) | 1998-08-04 | 2008-07-01 | Metabolix, Inc. | Produccion de polihidroxialcanoatos a partir de polioles. |
EP1700908B1 (en) * | 1998-08-18 | 2016-01-06 | Metabolix, Inc. | Transgenic microbial polyhydroxyalkanoate producers |
DE69930276T2 (de) * | 1998-08-18 | 2006-10-05 | Metabolix, Inc., Cambridge | Transgene polyhydroxyalkanoat produzierende mikroben |
ATE292965T1 (de) | 1999-09-14 | 2005-04-15 | Tepha Inc | Therapeutische anwendung von polymere die gamma- hydroxybutyrat enthalten |
DE60140996D1 (de) | 2000-02-11 | 2010-02-25 | Metabolix Inc | Intein enthaltende multigen-expressionskonstrukte |
AU7599601A (en) | 2000-07-21 | 2002-02-05 | Metabolix Inc | Production of polyhydroxyalkanoates from polyols |
US6897338B2 (en) | 2001-12-18 | 2005-05-24 | Metabolix, Inc. | Methods of making intermediates from polyhydroxyalkanoates |
US7318833B2 (en) * | 2001-12-19 | 2008-01-15 | Nmt Medical, Inc. | PFO closure device with flexible thrombogenic joint and improved dislodgement resistance |
US7867250B2 (en) | 2001-12-19 | 2011-01-11 | Nmt Medical, Inc. | Septal occluder and associated methods |
CA2471871A1 (en) * | 2002-01-14 | 2003-07-24 | Nmt Medical, Inc. | Patent foramen ovale (pfo) closure method and device |
US9241695B2 (en) | 2002-03-25 | 2016-01-26 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Patent foramen ovale (PFO) closure clips |
AU2003240549A1 (en) | 2002-06-05 | 2003-12-22 | Nmt Medical, Inc. | Patent foramen ovale (pfo) closure device with radial and circumferential support |
AUPS318202A0 (en) * | 2002-06-26 | 2002-07-18 | Cochlear Limited | Parametric fitting of a cochlear implant |
WO2004024876A2 (en) | 2002-09-12 | 2004-03-25 | Metabolix, Inc. | Polyhydroxyalkanoate production by coenzyme a-dependent aldehyde dehydrogenase pathways |
WO2004037333A1 (en) | 2002-10-25 | 2004-05-06 | Nmt Medical, Inc. | Expandable sheath tubing |
WO2004043508A1 (en) * | 2002-11-06 | 2004-05-27 | Nmt Medical, Inc. | Medical devices utilizing modified shape memory alloy |
AU2003294682A1 (en) | 2002-12-09 | 2004-06-30 | Nmt Medical, Inc. | Septal closure devices |
US7476521B2 (en) | 2003-01-22 | 2009-01-13 | Showa Denko K.K. | Method for acyltransferase reaction using acyl coenzyme A |
DK1638615T3 (en) | 2003-05-08 | 2015-01-12 | Tepha Inc | MEDICAL POLYHYDROXYALKANOATE TEXTILES AND FIBERS |
US8480706B2 (en) | 2003-07-14 | 2013-07-09 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Tubular patent foramen ovale (PFO) closure device with catch system |
US9861346B2 (en) | 2003-07-14 | 2018-01-09 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Patent foramen ovale (PFO) closure device with linearly elongating petals |
ES2436596T3 (es) | 2003-07-14 | 2014-01-03 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Dispositivo tubular de cierre de foramen oval permeable (FOP) con sistema de retención |
DE602004017750D1 (de) | 2003-08-19 | 2008-12-24 | Nmt Medical Inc | Expandierbarer Schleusenschlauch |
US8735113B2 (en) | 2003-10-15 | 2014-05-27 | Newlight Technologies, Llc | Methods and systems for production of polyhydroxyalkanoate |
US7745197B1 (en) | 2003-10-15 | 2010-06-29 | Newlight Technologies, Llc | Process for the utilization of ruminant animal methane emissions |
US7579176B2 (en) | 2003-10-15 | 2009-08-25 | Newlight Technologies, Llc | Method for the production of polyhydroxyalkanoic acid |
US20050273119A1 (en) * | 2003-12-09 | 2005-12-08 | Nmt Medical, Inc. | Double spiral patent foramen ovale closure clamp |
EP1737349A1 (en) | 2004-03-03 | 2007-01-03 | NMT Medical, Inc. | Delivery/recovery system for septal occluder |
US20050267524A1 (en) | 2004-04-09 | 2005-12-01 | Nmt Medical, Inc. | Split ends closure device |
US8361110B2 (en) | 2004-04-26 | 2013-01-29 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Heart-shaped PFO closure device |
US7842053B2 (en) | 2004-05-06 | 2010-11-30 | Nmt Medical, Inc. | Double coil occluder |
US8308760B2 (en) | 2004-05-06 | 2012-11-13 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Delivery systems and methods for PFO closure device with two anchors |
CA2563298A1 (en) | 2004-05-07 | 2005-11-24 | Nmt Medical, Inc. | Catching mechanisms for tubular septal occluder |
JP4720114B2 (ja) * | 2004-05-20 | 2011-07-13 | 三菱化学株式会社 | オキザロ酢酸またはオキザロ酢酸誘導体の製造方法 |
DK1778305T3 (da) | 2004-08-03 | 2010-10-18 | Tepha Inc | Ikke-krøllende polyhydroxyalkanoatsuturer |
EP1827247B8 (en) | 2004-09-24 | 2020-05-06 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Occluder device double securement system for delivery/recovery of such occluder device |
US7732680B2 (en) | 2005-03-16 | 2010-06-08 | Metabolix, Inc. | Chemically inducible expression of biosynthetic pathways |
WO2006102213A1 (en) | 2005-03-18 | 2006-09-28 | Nmt Medical, Inc. | Catch member for pfo occluder |
KR100979694B1 (ko) | 2005-05-24 | 2010-09-02 | 한국과학기술원 | 폴리락테이트 또는 그 공중합체 생성능을 가지는 세포 또는식물 및 이를 이용한 폴리락테이트 또는 그 공중합체의제조방법 |
EP2781593B1 (en) * | 2005-08-22 | 2019-08-07 | Newlight Technologies, Inc. | Process for the treatment of methane emissions |
WO2007120186A2 (en) * | 2005-10-24 | 2007-10-25 | Nmt Medical, Inc. | Radiopaque bioabsorbable occluder |
US20070167981A1 (en) * | 2005-12-22 | 2007-07-19 | Nmt Medical, Inc. | Catch members for occluder devices |
US8979921B2 (en) * | 2006-02-07 | 2015-03-17 | Tepha, Inc. | Polymeric, degradable drug-eluting stents and coatings |
AU2007212501B2 (en) * | 2006-02-07 | 2011-03-31 | Tepha, Inc. | Polymeric, degradable drug-eluting stents and coatings |
US9592325B2 (en) * | 2006-02-07 | 2017-03-14 | Tepha, Inc. | Polymeric, degradable drug-eluting stents and coatings |
US8016883B2 (en) * | 2006-02-07 | 2011-09-13 | Tepha, Inc. | Methods and devices for rotator cuff repair |
US8551135B2 (en) | 2006-03-31 | 2013-10-08 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Screw catch mechanism for PFO occluder and method of use |
US8870913B2 (en) | 2006-03-31 | 2014-10-28 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Catch system with locking cap for patent foramen ovale (PFO) occluder |
WO2007115125A2 (en) | 2006-03-31 | 2007-10-11 | Nmt Medical, Inc. | Deformable flap catch mechanism for occluder device |
US9089627B2 (en) | 2006-07-11 | 2015-07-28 | Abbott Cardiovascular Systems Inc. | Stent fabricated from polymer composite toughened by a dispersed phase |
WO2008010296A1 (fr) * | 2006-07-21 | 2008-01-24 | Kaneka Corporation | Micro-organisme doté d'un gène remplacé et procédé de production de polyester à l'aide dudit micro-organisme |
WO2008042311A1 (en) * | 2006-09-28 | 2008-04-10 | Nmt Medical. Inc. | Perforated expandable implant recovery sheath |
EP2084209B1 (en) * | 2006-11-21 | 2021-06-02 | LG Chem, Ltd. | Copolymer comprising 4-hydroxybutyrate unit and lactate unit and its manufacturing method |
US7943683B2 (en) | 2006-12-01 | 2011-05-17 | Tepha, Inc. | Medical devices containing oriented films of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers |
EP2111186A1 (en) * | 2007-02-02 | 2009-10-28 | Tornier, Inc. | System and method for repairing tendons and ligaments |
TWI568847B (zh) | 2007-03-16 | 2017-02-01 | 奇諾麥提卡公司 | 用於1,4-丁二醇及其前驅物之生物合成的組合物及方法 |
WO2008124603A1 (en) | 2007-04-05 | 2008-10-16 | Nmt Medical, Inc. | Septal closure device with centering mechanism |
WO2008131167A1 (en) | 2007-04-18 | 2008-10-30 | Nmt Medical, Inc. | Flexible catheter system |
US7947483B2 (en) | 2007-08-10 | 2011-05-24 | Genomatica, Inc. | Methods and organisms for the growth-coupled production of 1,4-butanediol |
US8581040B2 (en) | 2007-08-30 | 2013-11-12 | Plant Sensory Systems, Llc | Methods of producing GABA |
US8581041B2 (en) | 2007-08-30 | 2013-11-12 | Plant Sensory Systems, Llc | Methods of producing GABA |
WO2009032755A2 (en) * | 2007-08-30 | 2009-03-12 | Plant Sensory System, Llc. | Alternative methods for the biosynthesis of gaba |
TWI356705B (en) * | 2007-10-25 | 2012-01-21 | Internat Chlorella Co Ltd | Extracts from chlorella sorokiniana |
US20110229942A1 (en) * | 2007-12-13 | 2011-09-22 | Glycos Biotechnologies, Incorporated | Microbial Conversion of Oils and Fatty Acids to High-Value Chemicals |
EP2231913B1 (en) * | 2007-12-19 | 2013-01-23 | Tepha, Inc. | Medical devices containing melt-blown non-wovens of poly-r-hydroxybutyrate and copolymers |
KR20090078925A (ko) * | 2008-01-16 | 2009-07-21 | 주식회사 엘지화학 | 폴리락테이트 또는 그 공중합체 생성능을 가지는 재조합미생물 및 이를 이용한 폴리락테이트 또는 그 공중합체의제조방법 |
US20130165967A1 (en) | 2008-03-07 | 2013-06-27 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Heart occlusion devices |
US20090253154A1 (en) * | 2008-04-02 | 2009-10-08 | Immunosciences Lab., Inc. | Blood and saliva test for detection of delayed food allergy and intolerance against modified foods |
US8487159B2 (en) * | 2008-04-28 | 2013-07-16 | Metabolix, Inc. | Production of polyhydroxybutyrate in switchgrass |
BRPI0915749A2 (pt) * | 2008-07-08 | 2018-07-10 | Opx Biotechnologies Inc | métodos, composições e sistemas para produção biossintética de 1,4-butanodiol |
BRPI0918483A2 (pt) | 2008-09-10 | 2020-07-14 | Genomatica, Inc | organismo microbiano que não ocorre naturalmente, e, método para produzir um composto |
KR20110104492A (ko) | 2008-12-12 | 2011-09-22 | 메타볼릭스 인코포레이티드 | 폴리(5hv)및 5 탄소 화학물질의 생산을 위한 녹색 공정 및 조성물 |
US9023622B2 (en) * | 2009-02-10 | 2015-05-05 | Kyowa Hakko Bio Co., Ltd. | Method for producing L-amino acid using a microorganism with decreased aspartate aminotransferase activity |
US20100229256A1 (en) * | 2009-03-05 | 2010-09-09 | Metabolix, Inc. | Propagation of transgenic plants |
JP5964747B2 (ja) | 2009-06-04 | 2016-08-03 | ゲノマチカ, インク. | 1,4−ブタンジオールの生成のための微生物体及び関連する方法 |
VN29235A1 (ja) | 2009-06-04 | 2012-03-26 | ||
US8956389B2 (en) | 2009-06-22 | 2015-02-17 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
US20120029556A1 (en) | 2009-06-22 | 2012-02-02 | Masters Steven J | Sealing device and delivery system |
BR112012005592A2 (pt) | 2009-09-15 | 2017-05-02 | Donald Danforth Plant Science Center | geração de sementes oleaginosas produzindo alto poliidroxibutirato. |
CA2777459A1 (en) | 2009-10-13 | 2011-04-21 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for the production of 1,4-butanediol, 4-hydroxybutanal, 4-hydroxybutyryl-coa, putrescine and related compounds, and methods related thereto |
US20110125118A1 (en) * | 2009-11-20 | 2011-05-26 | Opx Biotechnologies, Inc. | Production of an Organic Acid and/or Related Chemicals |
US8530210B2 (en) | 2009-11-25 | 2013-09-10 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the coproduction 1,4-butanediol and gamma-butyrolactone |
WO2011068952A1 (en) | 2009-12-02 | 2011-06-09 | Entrigue Surgical, Inc. | Devices for tongue stabilization |
RU2012132908A (ru) | 2010-02-11 | 2014-03-20 | Метаболикс, Инк. | Способ получения производных химических соединений |
US8637286B2 (en) | 2010-02-23 | 2014-01-28 | Genomatica, Inc. | Methods for increasing product yields |
US8048661B2 (en) | 2010-02-23 | 2011-11-01 | Genomatica, Inc. | Microbial organisms comprising exogenous nucleic acids encoding reductive TCA pathway enzymes |
GB2478588A (en) * | 2010-03-12 | 2011-09-14 | G5 Internat Holdings Pte Ltd | Microbial production of polyhydroxyalkanoates (PHAs) using culture medium containing hydrogen |
ES2914695T3 (es) | 2010-03-26 | 2022-06-15 | Tepha Inc | Recubrimientos para la fabricación y la aplicación de dispositivos médicos de polihidroxialcanoato |
US10227718B2 (en) | 2010-06-15 | 2019-03-12 | Tepha, Inc. | Medical devices containing dry spun non-wovens of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers |
US9511169B2 (en) | 2010-06-15 | 2016-12-06 | Tepha, Inc. | Medical devices containing dry spun non-wovens of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers with anisotropic properties |
EP2425865A1 (en) | 2010-08-06 | 2012-03-07 | Aesculap AG | Medicinal thread having a polyhydroxyalkanoate coating |
WO2012037324A2 (en) | 2010-09-15 | 2012-03-22 | Metabolix, Inc. | Increasing carbon flow for polyhydroxybutyrate production in biomass crops |
EP2637734B1 (en) | 2010-11-09 | 2017-09-13 | Tepha, Inc. | Drug eluting cochlear implants |
US8956835B2 (en) | 2010-11-24 | 2015-02-17 | Suny Research Foundation | Methods for producing polyhydroxyalkanoates from biodiesel-glycerol |
US9078634B2 (en) | 2011-01-27 | 2015-07-14 | Cryosa, Llc | Apparatus and methods for treatment of obstructive sleep apnea utilizing cryolysis of adipose tissues |
WO2012122343A2 (en) | 2011-03-08 | 2012-09-13 | Newlight Technologies, Llc | Polyhydroxyalkanoate production method |
EP2702138A2 (en) | 2011-04-29 | 2014-03-05 | Metabolix, Inc. | Green process for producing polyhydroxyalkanoates and chemicals using a renewable feedstock |
ES2722748T3 (es) | 2011-04-29 | 2019-08-16 | Cj Cheiljedang Corp | Procedimiento para la producción de látex por emulsificación mediante fusión |
WO2012170793A1 (en) | 2011-06-08 | 2012-12-13 | Metabolix, Inc. | Biorefinery process for thf production |
US20140170714A1 (en) | 2011-08-10 | 2014-06-19 | Metabolix, Inc. | Post process purification for gamma-butyrolactone production |
US9770232B2 (en) | 2011-08-12 | 2017-09-26 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Heart occlusion devices |
WO2013035372A1 (ja) * | 2011-09-05 | 2013-03-14 | 独立行政法人理化学研究所 | 長主鎖構造を有するポリヒドロキシアルカン酸の製造方法 |
US8680228B2 (en) | 2011-09-27 | 2014-03-25 | Tepha, Inc. | Controlled hydrolysis of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers |
MX363097B (es) | 2011-10-25 | 2019-03-08 | Marrone Bio Innovations Inc | Formulaciones, composiciones, metabolitos de chromobacterium y sus usos. |
BR112014010448A2 (pt) | 2011-11-02 | 2017-04-18 | Genomatica Inc | microorganismos e métodos para a produção de caprolactona |
US20200347417A1 (en) | 2012-03-29 | 2020-11-05 | Newlight Technologies, Inc | Polyhydroxyalkanoate production methods and materials and microorganisms used in same |
US9085784B1 (en) | 2012-03-29 | 2015-07-21 | Newlight Technologies, Llc | Polyhydroxyalkanoate production methods and materials and microorganisms used in same |
SG11201405636QA (en) * | 2012-04-11 | 2014-11-27 | Helmholtz Zentrum für Infektionsforschung GmbH | Pha-producing genetically engineered microorganisms |
WO2013176734A1 (en) | 2012-05-21 | 2013-11-28 | Tepha, Inc. | Resorbable bioceramic compositions of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers |
BR112014030202A2 (pt) | 2012-06-04 | 2017-09-12 | Genomatica Inc | microorganismos e métodos para a produção de 4-hidroxibutirato 1,4-butanodiol e compostos relacionados |
WO2013185009A1 (en) | 2012-06-08 | 2013-12-12 | Metabolix, Inc. | Renewable acrylic acid production and products made therefrom |
WO2014028943A1 (en) | 2012-08-17 | 2014-02-20 | Metabolix, Inc. | Biobased rubber modifiers for polymer blends |
CN104718297B (zh) | 2012-10-10 | 2017-09-29 | Cj第一制糖株式会社 | 聚羟基烷酸酯共聚物组合物及其制备方法 |
ES2774932T3 (es) | 2012-11-14 | 2020-07-23 | Cj Cheiljedang Corp | Producción de sales de 4-hidroxibutirato utilizando materias primas de base biológica |
WO2014113268A1 (en) | 2013-01-15 | 2014-07-24 | Tepha, Inc. | Implants for soft and hard tissue regeneration |
US10828019B2 (en) | 2013-01-18 | 2020-11-10 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
WO2014127053A2 (en) | 2013-02-13 | 2014-08-21 | Metabolix, Inc. | Process for ultra pure chemical production from biobased raw starting materials |
US10201640B2 (en) | 2013-03-13 | 2019-02-12 | Tepha, Inc. | Ultrafine electrospun fibers of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
US10689498B2 (en) | 2013-08-20 | 2020-06-23 | Tepha, Inc. | Closed cell foams including poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
US9687585B2 (en) | 2013-08-20 | 2017-06-27 | Tepha, Inc. | Thermoformed poly-4-hydroxybutyrate medical implants |
US9302029B2 (en) | 2013-10-31 | 2016-04-05 | Tepha, Inc. | Pultrusion of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
US9480780B2 (en) | 2013-11-05 | 2016-11-01 | Tepha, Inc. | Compositions and devices of poly-4-hydroxybutyrate |
WO2015094619A1 (en) | 2013-12-19 | 2015-06-25 | Tornier, Inc. | High-strength bioabsorbable suture |
CA2933746C (en) | 2013-12-26 | 2018-12-04 | Tepha, Inc. | Medical implants including laminates of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
EP3119930B1 (en) | 2014-03-18 | 2018-06-13 | Tepha, Inc. | Micro-fiber webs of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof produced by centrifugal spinning |
ES2911675T3 (es) | 2014-04-30 | 2022-05-20 | Tepha Inc | Implantes tridimensionales reabsorbibles para el refuerzo de tejidos y la reparación de hernias |
ES2674807T3 (es) | 2014-05-16 | 2018-07-04 | Tepha, Inc. | Dispositivos médicos que contienen materiales no tejidos hilados en seco de poli-4-hidroxibutirato y copolímeros con propiedades anisótropas |
US9808230B2 (en) | 2014-06-06 | 2017-11-07 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
WO2016025329A1 (en) | 2014-08-15 | 2016-02-18 | Tepha, Inc. | Self-retaining sutures of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
ES2805803T3 (es) | 2014-08-20 | 2021-02-15 | Tepha Inc | Implantes médicos de poli-4-hidroxibutirato termoformados |
WO2016048950A1 (en) | 2014-09-22 | 2016-03-31 | Tepha, Inc. | Oriented p4hb implants containing antimicrobial agents |
WO2016053741A1 (en) | 2014-10-01 | 2016-04-07 | Cryosa, Llc | Apparatus and methods for treatment of obstructive sleep apnea utilizing cryolysis of adipose tissues |
CA2969429C (en) | 2014-12-11 | 2020-10-27 | Tepha, Inc. | Methods of orienting multifilament yarn and monofilaments of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
US10626521B2 (en) | 2014-12-11 | 2020-04-21 | Tepha, Inc. | Methods of manufacturing mesh sutures from poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
US10801050B2 (en) | 2015-10-23 | 2020-10-13 | Metabolic Explorer | Microorganism modified for the assimilation of levulinic acid |
DK3400100T3 (da) | 2016-01-06 | 2020-10-26 | Archer Daniels Midland Co | Fremgangsmåde til fremstilling af 1,3-butandiol og til eventuelt yderligere fremstilling af (r)-3-hydroxybutyl (r)-3-hydroxybutyrat |
KR101774431B1 (ko) | 2016-01-28 | 2017-09-05 | 한국과학기술원 | 자일로즈로부터 폴리(락테이트-co-글라이콜레이트) 또는 그 공중합체 생산능을 가지는 재조합 미생물 및 이를 이용한 폴리(락테이트-co-글라이콜레이트) 또는 그 공중합체의 제조방법 |
EP3630445B1 (en) | 2017-05-25 | 2022-11-30 | Tepha, Inc. | Continuous formation of tubes of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
CN109112151B (zh) * | 2017-06-23 | 2021-10-29 | 北京蓝晶微生物科技有限公司 | 一种精细调控共聚物中4-羟基丁酸组成比例的基因盒及其应用 |
US10874498B2 (en) | 2017-09-06 | 2020-12-29 | Tepha, Inc. | Calendered surgical meshes comprising polyhydroxyalkanoates |
EP3720514B1 (en) | 2017-12-04 | 2022-04-13 | Tepha, Inc. | Vacuum membrane thermoformed poly-4-hydroxybutyrate medical implants |
EP3802062A2 (en) | 2018-06-11 | 2021-04-14 | Tepha, Inc. | Methods for 3d printing of poly-4-hydroxybutyrate and copolymers |
WO2020092065A1 (en) | 2018-10-29 | 2020-05-07 | Tepha, Inc. | Methods of manufacturing mesh sutures from poly-4-hydroxybutyrate and copolymers thereof |
TWI827804B (zh) | 2019-03-06 | 2024-01-01 | 日商三菱商事生命科學股份有限公司 | 蕈菌絲體之製造方法、含有蕈菌絲體的組成物、以及使用了蕈菌絲體之食品材料 |
FR3109290A1 (fr) | 2020-04-17 | 2021-10-22 | Ph Tech | Dispositif médical comprenant une matrice biologique acellulaire et au moins un polymère |
FR3110077A1 (fr) | 2020-05-12 | 2021-11-19 | Ph Tech | Procédé de fabrication d’un dispositif médical en trois dimensions et dispositif médical obtenu |
FR3113371A1 (fr) | 2020-08-12 | 2022-02-18 | Ph Tech | Dispositif médical comprenant un assemblage d’éléments de matrices biologiques acellulaires et au moins un polymère |
CN113832084B (zh) * | 2021-09-29 | 2024-01-05 | 北京化工大学 | 一种生产聚羟基脂肪酸酯的溶藻弧菌及其应用 |
WO2024072953A1 (en) * | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Kimberly-Clark Worldwide, Inc. | In vitro bioproduction of specific chain length poly(hydroxyalkanoate) monomers |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1996040952A1 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Genemedicine, Inc. | Plasmid for delivery of nucleic acids to cells and methods of use |
WO1997029123A2 (en) * | 1996-02-12 | 1997-08-14 | Plant Bioscience Limited | Nucleic acid encoding gai gene of arabidopsis thaliana |
Family Cites Families (29)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS575693A (en) | 1980-06-13 | 1982-01-12 | Ajinomoto Co Inc | Production of l-arginine through fermentation process |
IE50442B1 (en) * | 1980-11-21 | 1986-04-16 | Loctite Corp | Two part adhesive composition |
US5250430A (en) | 1987-06-29 | 1993-10-05 | Massachusetts Institute Of Technology | Polyhydroxyalkanoate polymerase |
US5245023A (en) * | 1987-06-29 | 1993-09-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Method for producing novel polyester biopolymers |
US4876331A (en) | 1987-08-18 | 1989-10-24 | Mitsubishi Kasei Corporation | Copolyester and process for producing the same |
US4876831A (en) * | 1988-03-14 | 1989-10-31 | Runyon John F | Folding modular building structure |
US5004664A (en) | 1989-02-27 | 1991-04-02 | Xerox Corporation | Toner and developer compositions containing biodegradable semicrystalline polyesters |
US5371002A (en) | 1989-06-07 | 1994-12-06 | James Madison University | Method of production of poly-beta-hydroxyalkanoate copolymers |
EP0482077B1 (en) | 1989-07-10 | 1998-10-21 | Massachusetts Institute Of Technology | Method for producing polyester biopolymers |
IE893328A1 (en) | 1989-10-16 | 1991-04-24 | Mcdaid Denis | Telephone lock |
GB9108756D0 (en) | 1991-04-24 | 1991-06-12 | Ici Plc | Production of polyalkanoate in plants |
US5286842A (en) | 1991-07-01 | 1994-02-15 | Mitsubishi Kasei Corporation | Process for producing a biodegradable polymer |
GB9115245D0 (en) | 1991-07-16 | 1991-08-28 | Ici Plc | Production of polyalkanoate |
US5610041A (en) | 1991-07-19 | 1997-03-11 | Board Of Trustees Operating Michigan State University | Processes for producing polyhydroxybutyrate and related polyhydroxyalkanoates in the plastids of higher plants |
ATE295891T1 (de) | 1991-07-19 | 2005-06-15 | Univ Michigan State | Transgene pflanzen die polyhydroxyalkanoate produzieren |
BR9203053A (pt) | 1991-08-07 | 1993-03-30 | Ajinomoto Kk | Processo para produzir acido l-glutamico pro fermentacao |
JP2777757B2 (ja) | 1991-09-17 | 1998-07-23 | 鐘淵化学工業株式会社 | 共重合体およびその製造方法 |
GB9223332D0 (en) * | 1992-11-06 | 1992-12-23 | Ici Plc | Production of polyhydroxyalkanoate in plants |
CA2127807A1 (en) | 1992-11-20 | 1994-06-09 | John Maliyakal | Transgenic cotton plants producing heterologous bioplastic |
JP3263710B2 (ja) | 1992-12-11 | 2002-03-11 | 高砂香料工業株式会社 | 生分解性光学活性ポリマー及びその製造方法 |
IL108947A0 (en) | 1993-03-12 | 1994-06-24 | Osteopharm Ltd | Bone stimulating factor |
US6849427B1 (en) | 1993-03-12 | 2005-02-01 | Immulogic Pharmaceutical Corp. | Nucleic acids encoding a house dust mite allergen, Der p VII, and uses therefor |
JP3241505B2 (ja) | 1993-08-11 | 2001-12-25 | 高砂香料工業株式会社 | 生分解性光学活性コポリマー及びその製造方法 |
ID23491A (id) | 1994-01-28 | 1995-09-07 | Procter & Gamble | Kopolimer-kopolimer yang dapat dibiodegradasi dan baha-bahan plastik yang terdiri dari kopolimer-kopolimer yang dapat dibiodegradasi |
MX9603065A (es) | 1994-01-28 | 1997-06-28 | Procter & Gamble | Pelicula biodegradable de copolimero 3-polihidroxilobutirato/3-polihidroxilohexanoato. |
CA2125313A1 (en) * | 1994-06-07 | 1995-12-08 | Gerald E. O'grady | Method and apparatus for producing electrical energy within the body of a ruminant |
US5563239A (en) | 1994-11-09 | 1996-10-08 | Eastman Chemical Company | Composition and process for the production of poly(3-hydroxyalkanoates) |
BE1008983A6 (fr) | 1994-12-30 | 1996-10-01 | Faco Sa | Bigoudi. |
WO1998036078A1 (en) * | 1997-02-13 | 1998-08-20 | James Madison University | Methods of making polyhydroxyalkanoates comprising 4-hydroxybutyrate monomer units |
-
1998
- 1998-09-18 EP EP98948384A patent/EP1015565B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-18 JP JP2000511853A patent/JP2001516574A/ja not_active Withdrawn
- 1998-09-18 CA CA2303070A patent/CA2303070C/en not_active Expired - Fee Related
- 1998-09-18 AT AT98948384T patent/ATE323152T1/de not_active IP Right Cessation
- 1998-09-18 AU AU94968/98A patent/AU725516B2/en not_active Ceased
- 1998-09-18 WO PCT/US1998/019659 patent/WO1999014313A2/en active IP Right Grant
- 1998-09-18 US US09/156,809 patent/US6316262B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-18 DE DE69834199T patent/DE69834199T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-18 DE DE69838768T patent/DE69838768T2/de not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-11-09 US US10/006,915 patent/US6689589B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2003
- 2003-05-09 JP JP2003132325A patent/JP2003310262A/ja not_active Withdrawn
-
2004
- 2004-02-06 US US10/773,916 patent/US7081357B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2005
- 2005-10-07 US US11/245,891 patent/US7229804B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-04-16 US US11/735,888 patent/US20100093043A1/en not_active Abandoned
- 2007-10-25 US US11/924,531 patent/US20110008856A1/en not_active Abandoned
-
2008
- 2008-12-24 JP JP2008328227A patent/JP2009171960A/ja active Pending
- 2008-12-24 JP JP2008328226A patent/JP2009082147A/ja active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1996040952A1 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Genemedicine, Inc. | Plasmid for delivery of nucleic acids to cells and methods of use |
WO1997029123A2 (en) * | 1996-02-12 | 1997-08-14 | Plant Bioscience Limited | Nucleic acid encoding gai gene of arabidopsis thaliana |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013018734A1 (ja) | 2011-07-29 | 2013-02-07 | 三井化学株式会社 | 二酸化炭素固定経路を導入した微生物 |
WO2014115815A1 (ja) | 2013-01-24 | 2014-07-31 | 三井化学株式会社 | 二酸化炭素固定回路を導入した微生物 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO1999014313A2 (en) | 1999-03-25 |
JP2009082147A (ja) | 2009-04-23 |
EP1015565A2 (en) | 2000-07-05 |
ATE323152T1 (de) | 2006-04-15 |
AU9496898A (en) | 1999-04-05 |
US20020187530A1 (en) | 2002-12-12 |
AU725516B2 (en) | 2000-10-12 |
DE69838768T2 (de) | 2008-10-30 |
US7229804B2 (en) | 2007-06-12 |
US20100093043A1 (en) | 2010-04-15 |
CA2303070A1 (en) | 1999-03-25 |
CA2303070C (en) | 2011-03-15 |
US20040137586A1 (en) | 2004-07-15 |
US20110008856A1 (en) | 2011-01-13 |
EP1015565B1 (en) | 2006-04-12 |
US6316262B1 (en) | 2001-11-13 |
US7081357B2 (en) | 2006-07-25 |
WO1999014313A3 (en) | 1999-06-03 |
DE69838768D1 (de) | 2008-01-03 |
JP2001516574A (ja) | 2001-10-02 |
JP2003310262A (ja) | 2003-11-05 |
DE69834199T2 (de) | 2006-12-14 |
US6689589B2 (en) | 2004-02-10 |
US20060084155A1 (en) | 2006-04-20 |
DE69834199D1 (de) | 2006-05-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6689589B2 (en) | Biological systems for manufacture of polyhydroxyalkanoate polymers containing 4-hydroxyacids | |
JP4623829B2 (ja) | トランスジェニック微生物のポリヒドロキシアルカノエート産生 | |
JP6223386B2 (ja) | ポリ(5hv)および5炭素化合物を製造するための環境に優しい方法および組成物 | |
EP1208208B1 (en) | Transgenic systems for the manufacture of poly(3-hydroxy -butyrate -co -3- hydroxyhexanoate) | |
EP1710302B1 (en) | Biological systems for manufacture of polyhydroxyalkanoate polymers containing 4-hydroxyacids | |
EP1700909B1 (en) | Transgenic microbial polyhydroxyalkanoate producers | |
BRPI0922410B1 (pt) | Microrganismo recombinante geneticamente modificado para converter 5aminopentanoato em um polímero ou copolímero de polihidroxialcanoato (pha) do mesmo compreendendo 5-hidróxi-valerato, e método para a produção de polímeros ou copolímeros de polihidroxialcanoato (pha) com base em carbonos dos mesmos |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20090804 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20091028 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20091102 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100204 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20100330 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20100623 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20100628 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20110510 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20110909 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20111108 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20111202 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20120809 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20120814 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20130312 |