JP2002520062A - 真核細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法及び手段 - Google Patents

真核細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法及び手段

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Abstract

(57)【要約】 内因性ポリ−ADP−リボースポリメラーゼ(PARP)の発現及び/又は見かけの活性に影響する“PCD調節性キメラ遺伝子”を導入することによって、真核細胞及び生物体、特に植物細胞及び植物体におけるプログラムされた細胞死(PCD)手段及び方法を提供する。プログラムされた細胞死を阻害又は誘発することができる。本発明は、特にPCD調節のためのPARP活性を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列の、ストレス耐性細胞及び生物体を産生するための成長速度を高めるための使用に関する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ(PARP)タンパク質、
特にPARPタンパク質突然変異体、又はその部分、及びそれをコードする遺伝
子の、プログラムされた細胞死が改変された真核細胞及び生物、特に植物細胞及
び植物を生成するための使用に関する。これらの細胞におけるPARPタンパク
質のレベル若しくは活性の調節によって、細胞、好ましくは選ばれた細胞の少な
くとも一部で、プログラムされた細胞死(PCD)が誘発されるか、又はその逆
に、ある生物の細胞、若しくは細胞の少なくとも一部のPCDが阻害されるかの
いずれかである、真核細胞及び生物、特に植物細胞及び植物が与えられる。本発
明は、そのような遺伝子を発現する、真核細胞及び生物、特に植物細胞及び植物
にも関する。
【0002】 (関連する技術の記載) プログラムされた細胞死(PCD)は、動物・植物双方の選ばれた細胞の、発
生過程の際の、又は環境的な合図に応答しての、排除に関連する生理学的な細胞
死の過程である〔総説については、Ellis et al., 1991;Pennell & Lamb, 1997
を参照されたい〕。PCDを生じている細胞の崩壊は、形態学的には、細胞質及
び核の、しばしば小さく密閉されたパケットに至る、凝縮、収縮及び分断を伴う
〔Cohen, 1993;Wang et al., 1996〕。生化学的には、PCDは、核DNAの、
オリゴヌクレオソームを表す、一般的には約50kbのフラグメントへの分断とと
もに、システインプロテイナーゼ及びエンドヌクレアーゼの誘導を特徴とする。
DNAの分断は、細胞の切片におけるDNA3′−OH基の、末端デオキシヌク
レオチジルトランスフェラーゼ仲介dUTPニック末端標識化(TUNEL)に
よって検出することができる〔Gavrieli et al., 1992〕。PCDによる細胞死
は、壊死とは明確に異なり、後者は、細胞の膨潤、溶解、及び細胞内容の漏出を
伴う。
【0003】 動物では、PCDは、変態におけるオタマジャクシの尾の細胞、脊椎動物の発
生中の指の間の細胞、過剰生産された脊椎動物のニューロン、細胞特化の際の細
胞、例えば角質細胞等々のような、望ましくない細胞の排除又は死に関連する。
それ以後は適性に機能することができない損傷した細胞も、PCDによって排除
され、それらが増殖及び/又は拡散するのが防止される。PCD又はその欠如は
、ヒトにおける数多くの病理学的状態(エイズ、アルツハイマー病、ハンチント
ン病、ルーゲーリッグ病、癌)にも関与している。
【0004】 植物では、PCDは、例えば、胚の発生の際の胚柄細胞の除去、単子葉類の種
子の発芽後の胚柄細胞の排除;種子発芽及び実生成長後の根冠細胞の排除;木部
管状要素若しくは毛状突起、又は単性花で発育不全となる花器官の発生に見られ
るような細胞特化の際の細胞死のような、数多くの発生過程に関与することが立
証され、又は考えられている。また、低酸素条件下の根における通気組織の形成
、及びある種の植物における葉裂若しくは貫入の形成も、PCDを伴うと思われ
る。植物における大規模な細胞死は、葉その他の器官の老化の際に発生する。植
物における過敏性応答、換言すれば悪性ではない病原体の進入部位に発生して、
限定された病変へと導く急速な細胞死は、環境的な合図に応答してのPCDのも
う一つの例である。
【0005】 懸濁培養、特に低密度細胞懸濁培養中に死ぬ、動物又は植物細胞も、PCDの
特徴性を明らかに示す。
【0006】 PCD又はアポトーシスに関与することが示唆されている酵素は、ポリ(AD
P−リボース)ポリメラーゼである。ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ(
PARP)は、ポリ(ADP−リボース)トランスフェラーゼ(ADPRT)(
EC2.4.2.30)としても知られていて、脊椎動物、節足動物、軟体動物、粘菌類、
双鞭毛藻類、真菌類その他の、酵母を除く下等真核生物を包含する、ほとんどの
真核生物に見出される核酵素である。酵素活性は、多数の植物でも立証されてい
る〔Payne et al., 1976; Willmitzer & Wagner, 1982; Chen et al., 1994;
O'Farrell, 1995〕。
【0007】 PARPは、NAD+に由来するADP−リボース部分の、主として、標的タ
ンパク質中のグルタミン酸残基のカルボキシル基への転移、及びその後のADP
−リボース重合を触媒する。主要標的タンパク質は、PARP自身であるが、ヒ
ストン、高移動度群染色体タンパク質、トポイソメラーゼ、エンドヌクレアーゼ
及びDNAポリメラーゼも、この修飾を受けることが示されている。
【0008】 動物のPARPタンパク質は、ほとんどの細胞種に多量に存在する113〜1
20kDaの核タンパク質であって、3個所の主要な機能的ドメイン:すなわち、
2個所のジンクフィンガードメインを含む、アミノ末端DNA結合ドメイン、カ
ルボキシル末端の触媒性ドメイン、及び自己修飾される内部ドメインからなる〔
de Murcia & Menissier de Murcia, 1994; Kameshita et al., 1984;Lindahl
et al., 1995〕。in vitroでの酵素活性は、DNAの一本鎖切断に結合する際に
非常に上昇する。in vivo活性は、結果的にDNA切断を生じる条件によって誘
導される〔Alvarez-Gonzalez & Althaus, 1989; Ikejima et al., 1990〕。中
央ドメインの自己修飾は、明らかに、PARPの負のフィードバック調節として
役立つ。
【0009】 植物細胞におけるPARP活性は、標識されたNAD+から根冠細胞の核への3 Hの取込みを調べることによって、最初に立証された〔Payne et al., 1976;Wi
llmitzer & Wagner, 1982〕。酵素活性は、トウモロコシの若芽からも部分的に
精製され、113kDaという見かけ分子量のタンパク質に関連することが見出さ
れて、植物PARPは、動物からの酵素に類似する可能性があることが示唆され
た〔Chen et al., 1994;O'Farrell, 1995〕。
【0010】 PARPに対応するcDNAは、哺乳動物、ニワトリ、ツメガエル属、昆虫及
びカエノラーブディチス・エレガンスCaenorhabditis elegansを包含する、いく
つかの種から単離されている。Chenら(1994)は、トウモロコシの核におけるP
ARP活性を報告し、この酵素活性を、トウモロコシの核の抽出物中に存在する
約114kDaのタンパク質の存在と結び付けた。O'Farrell(1995)は、トウモロ
コシから単離されたRNAに対する、(最高度に保存された配列に基づく縮重プ
ライマーを用いた)RT−PCR増幅が、300bpのフラグメントを生じること
を報告し、ヒトPARPタンパク質とのアミノ酸レベルでの60%の同一性を示
した。Lepiniecら(1995)は、シロイヌナズナArabidopsis thalianaから、脊椎
動物PARPの触媒ドメインに酷似する、72kDaのタンパク質をコードする完
全長cDNAを単離し、クローニングしている。このタンパク質のN末端ドメイ
ンは、脊椎動物からの対応するPARPとのいかなる配列類似性も示さないが、
数多くの核タンパク質及びDNA結合タンパク質のN末端との類似性を示す、ア
ミノ酸の4本の範囲(A1、A2、B及びCと命名)で構築される。A1及びA
2の予測された二次構造は、らせん−ループ−らせん構造であった。
【0011】 Genbankのデータベースは、トウモロコシZea maysからの2種類の配列を有す
るが、それに対する翻訳産物のアミノ酸配列は、従来のPARPタンパク質(A
J222589)、又はアラビドプシス属で同定されたような、非慣用的PAR
P(AJ222588)のいずれかとの相同性を有する。
【0012】 真核細胞におけるPARP及びポリADPリボシル化の機能は、完全に明らか
ではない。PARPは、細胞分裂及び細胞分化でのDNAの修復、複製及び組換
えのような、多数の細胞性過程、又はゲノムの完全性の変化を感知する、シグナ
リング経路で直接にか、若しくは間接的にかのいずれかで関与しているか、或い
は関与すると考えられている。PARP活性は、細胞のNAD+プールを有意に
減少させ得ることから、この酵素は、プログラムされた細胞死に決定的な役割を
果たす可能性がある〔Heller et al., 1995;Zhang et al., 1994〕。更に、N
AD+加水分解から得られたニコチンアミド、又はポリADP−リボースグリコ
ヒドロラーゼによるポリADP−リボースの代謝回転産物は、真核細胞における
ストレス応答シグナルであり得ることが示唆されている。
【0013】 植物PARPの生物学的機能に関して現在入手できる情報は、PARP阻害剤
を関与させる実験から得られていて、タバコにおける相同染色体内組換え率が、
3−アミノベンズアミド(3−ABA)の適用後に上昇することから、DNA損
傷の部位での相同組換えの妨害におけるin vivoでの役割が示唆される〔Puchta
et al., 1995〕。更に、ヒャクニチソウ属又はキクイモHelianthus tuberosumへ
のPARP阻害剤、例えば3−ABA、ニコチンアミド及び6(5H)−フェナ
ストリジノンの適用は、管状要素の発生を妨害することが示され〔Hawkins & Ph
illips, 1983;Phillips & Hawkins, 1985;Shoji et al., 1997;Sugiyama et
al., 1995〕、植物におけるプログラムされた細胞死の例であると見られている
【0014】 PCT出願の国際公開特許第97/06267号公報は、真核細胞、特に植物
細胞の形質転換を(質的にか、又は量的に)改良するための、PARP阻害剤の
使用を記載している。
【0015】 Lazebnikら(1994)は、動物細胞のアポトーシスでの初期の事象である、PA
RPを切断できる、インターロイキン1−β転換酵素に類似する特性を有するプ
ロテアーゼ同定した。
【0016】 Kuepperら(1990)、及びMolinetteら(1993)は、トランスフェクションした
CV−1サル細胞又はヒト繊維芽細胞における、46kDaのヒトPARPDNA
結合ドメイン、及びその様々な突然変異体形態の過剰産生を記載し、これらの細
胞における、常在PARP活性のトランス優性阻害、及びその結果としての塩基
除去DNA修復の遮断を立証している。
【0017】 Dingら(1992)、及びSmulsonら(1995)は、哺乳動物細胞におけるアンチセ
ンスRNA発現によるPARPの欠乏を記載し、DNA鎖切断の結合の遅延、及
び3T3−L1前脂肪細胞の分化の阻害を観察している。
【0018】 Menissier de Murciaら(1997)、及びWangら(1995、1997)は、PARP遺
伝子が突然変異したトランスジェニック「ノックアウト」マウスを作り出して、
PARPが必須タンパク質ではないことを示している。しかし、PARP欠乏マ
ウスの細胞は、よりDNA損傷に感受性であり、誘導された細胞死のいくつかの
面で動物の正常細胞と異なる〔Heller et al., 1995〕。
【0019】 (発明の要約及び目的) 本発明は、真核細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法であって
、ZAPクラスのPARP遺伝子のヌクレオチド配列、及びNAPクラスのPA
RP遺伝子のヌクレオチド配列を用いて、好ましくは、内因性PARP遺伝子の
発現を低下させるか、内因性PARP遺伝子がコードするタンパク質の見かけの
活性を低下させるか、又は内因性PARP遺伝子のヌクレオチド配列を変更して
、真核細胞のPARP活性全体の機能レベルを低下させることを含む方法を提供
する。
【0020】 本発明は、第一及び第二のPCD調節キメラ遺伝子を真核細胞、好ましくは植
物細胞に導入することを含む、真核細胞におけるプログラムされた細胞死を調節
する方法であって、該第一PCD調節キメラ遺伝子が、動作可能に結合されたD
NA領域である:真核細胞内で機能的であるプロモーター;転写されたときに、
ZAPクラスのPARPタンパク質を含むジンクフィンガーの機能レベルを低下
させることができるか、又は発現されたときに、ZAPクラスのPARPタンパ
ク質の機能レベルを低下させる、ペプチド若しくはタンパク質に翻訳されること
ができるかのいずれかのRNA分子を生じるDNA領域;並びに転写終結及びア
デニル化に関与するDNA領域を含み、
【0021】 該第二PCD調節キメラ遺伝子が、動作可能に結合されたDNA領域である:
該真核細胞内で機能的であるプロモーター;転写されたときに、NAPクラスの
PARPタンパク質の機能レベルを低下させることができるか、又は発現された
ときに、NAPクラスのPARPタンパク質の機能レベルを低下させる、ペプチ
ド若しくはタンパク質に翻訳されることができるかのいずれかのRNA分子を生
じるDNA領域;並びに転写終結及びアデニル化に関与するDNA領域を含み、
そして該真核細胞における見かけのPARP活性全体を有意に(好ましくは、見
かけのPARP活性全体を、真核細胞における正常な見かけのPARP活性から
約75〜約90%低下させ、該真核細胞を、プログラムされた細胞死から防護す
る)か、又はほとんど完全に(好ましくは、見かけのPARP活性全体を、該真
核細胞における正常な見かけのPARP活性から約90〜約100%低下させ、
該真核細胞を、プログラムされた細胞死によって死滅させる)低下させる方法も
提供する。
【0022】 好ましくは、該第一の転写されるDNA領域、若しくは該第二の転写されるD
NA領域、又はその双方は、ZAP若しくはNAPクラスの内因性PARP遺伝
子のセンスDNA鎖と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌ
クレオチド配列を含み、ZAP若しくはNAPクラスの内因性PARP遺伝子の
発現を低下させることができるセンスRNA分子をコードする。
【0023】 本発明が提供する、プログラムされた細胞死を調節する代替的な一方法では、
該第一の転写されるDNA領域、若しくは該第二の転写されるDNA領域、又は
その双方は、ZAP若しくはNAPクラスの内因性PARP遺伝子のセンスDN
A鎖の相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌクレオ
チド配列を含み、ZAP若しくはNAPクラスの該内因性PARP遺伝子の発現
を低下させることができるRNA分子をコードする。
【0024】 本発明が提供する、プログラムされた細胞死を調節する代替的なもう一つの方
法では、該第一及び/又は第二の転写されるDNA領域は、ZAP若しくはNA
Pクラスの内因性PARP遺伝子の転写の結果得られるmRNAと75%同一で
ある、少なくとも約100ヌクレオチドのセンスヌクレオチド配列を含むRNA
分子をコードし、該RNA分子は、ZAP若しくはNAPクラスの該内因性PA
RP遺伝子の転写の結果得られる該mRNAの相補体と75%同一である、少な
くとも約100ヌクレオチドのアンチセンスヌクレオチド配列を更に含み、該セ
ンス及びアンチセンスヌクレオチド配列は、二本鎖RNA領域を形成することが
でき、かつ該RNA分子は、ZAP若しくはNAPクラスの該内因性PARP遺
伝子の発現を低下させることができる。
【0025】 本発明が提供する、プログラムされた細胞死を調節する代替的な更に一つの方
法では、該第一及び/又は第二の転写されるDNA領域は、ZAP若しくはNA
Pクラスの内因性PARP遺伝子がコードするPARPタンパク質の見かけの活
性を低下させ得る、好ましくは、SEQ ID NO:4第1〜159番アミノ酸のアミノ
酸配列、若しくはSEQ ID NO:6第1〜138番アミノ酸のアミノ酸配列から選ば
れるアミノ酸配列を含むか、又はSEQ ID NO:2第1〜370番アミノ酸のアミノ
酸配列、SEQ ID NO:11第1〜98番アミノ酸のアミノ酸配列、又は第1〜88
番アミノ酸のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:11のアミノ酸配列で置きかえられた
、SEQ ID NO:2第1〜370番アミノ酸のアミノ酸配列から選ばれるアミノ酸配
列を含む、優性ネガティブPARP突然変異体をコードする。
【0026】 該第一及び第二PCD調節キメラ遺伝子、又はその双方のプロモーターは、組
織特異的性若しくは誘導可能プロモーター、例えば、真菌応答性プロモーター、
線虫応答性プロモーター、葯選択的プロモーター、柱頭選択的プロモーター、裂
開帯選択的プロモーターから選ばれるプロモーターであってよい。
【0027】 本発明は、PCD調節キメラ遺伝子を植物細胞に導入することを含む、植物細
胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法であって、該PCD調節キメ
ラ遺伝子が、動作可能に結合されたDNA領域である:植物発現性プロモーター
;転写されたときに、内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができるか
、又は発現されたときに、該植物細胞における見かけのPARP活性を低下させ
るペプチド若しくはタンパク質に翻訳されることができるかのいずれかである、
RNA分子を生じるDNA領域;並びに転写終結及びアデニル化に関与するDN
A領域を含み、該植物細胞における見かけのPARP活性全体を、該植物細胞に
おける正常な見かけのPARP活性から約75〜約100%低下させる方法も提
供する。
【0028】 該第一及び第二PCD調節キメラ遺伝子はもとより、該第一及び第二PCD調
節キメラ遺伝子を含む真核細胞、特に植物細胞、並びにそのような細胞を含む非
ヒト真核生物、とくに植物を提供することは、本発明のもう一つの目的である。
【0029】 PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含む、植物の細胞にお
けるプログラムされた細胞死を調節する方法であって、該PCD調節キメラ遺伝
子が、動作可能に結合されたDNA領域である:植物発現性プロモーター;転写
されたときに、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下させることが
できる、RNA分子を生じるDNA領域;並びに転写終結及びアデニル化に関与
するDNA領域を含む方法提供することは、本発明のもう一つの目的である。
【0030】 本発明は、PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含む、植物
の成長速度を上昇させる方法であって、該PCD調節キメラ遺伝子が、動作可能
に結合されたDNA領域である:植物発現性プロモーター;転写されたときに、
ZAPクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる、RNA
分子を生じるDNA領域;並びに転写終結及びアデニル化に関与するDNA領域
を含む方法にも関する。
【0031】 PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含む、植物のストレス
耐性細胞を生成する方法であって、該PCD調節キメラ遺伝子が、動作可能に結
合されたDNA領域である:植物発現性プロモーター;転写されたときに、ZA
Pクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる、RNA分子
を生じるDNA領域;並びに転写終結及びアデニル化に関与するDNA領域を含
む方法を提供することは、本発明のもう一つの目的である。
【0032】 本発明は、PARP活性を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列の
、植物細胞若しくは植物におけるプログラムされた細胞死を調節するためか、ス
トレス耐性である植物細胞又は植物を生成するためか、又は植物細胞又は植物の
成長速度を上昇させるための用途にも関する。
【0033】 (好適実施態様の詳細な説明) 本発明を目的として、用語「植物発現性プロモーター」とは、植物細胞での転
写を駆動し得るプロモーターを意味する。これは、植物起源のいかなるプロモー
ターも包含するが、植物細胞での転写を指令できる非植物起源のいかなるプロモ
ーター、例えば、CaMV35S又はT−DNA遺伝子プロモーターのような、
ウイルス若しくは細菌起源の一定のプロモーターも包含する。
【0034】 用語「遺伝子の発現」とは、調節性領域、特にプロモーターの制御下にあるD
NA領域が、生物学的に活性である、すなわち別の核酸若しくはタンパク質との
相互作用が可能であるか、又は生物学的に活性であるポリペプチド若しくはタン
パク質へと翻訳され得るかのいずれかである、RNAへと転写される過程を意味
する。遺伝子は、該遺伝子の発現の最終産物が、生物学的活性RNA、例えばア
ンチセンスRNA又はリボザイムであるとき、RNAをコードすると言われる。
遺伝子は、該遺伝子の発現の最終産物が、生物学的活性タンパク質又はポリペプ
チドであるとき、タンパク質をコードすると言われる。
【0035】 用語「遺伝子」とは、適切な調節性領域、例えば植物発現性プロモーターの制
御下にある細胞内で、RNA分子(例えばmRNA)へと転写されるDNA(「
転写されるDNA領域」)を含む、いかなるDNAフラグメントも意味する。し
たがって、遺伝子は、プロモーター、5′リーダー配列、コーディング領域、及
びポリアデニル化部位を含む3′領域のような、動作可能に結合されたいくつか
のDNAフラグメントを含んでよい。内因性植物遺伝子は、植物種に天然に見出
される遺伝子である。キメラ遺伝子は、植物種に通常は見出されないいかなる遺
伝子、或いはこれに代えて、プロモーターが、自然界では、転写されるDNA領
域の一部若しくは全部にか、又は該遺伝子の少なくとも一つの別の調節性領域に
付随しない、いかなる遺伝子でもある。
【0036】 本明細書に用いられる限りで、「含む」は、言及された限りでの、記載された
特徴、完全なもの、工程又は構築要素の存在を特定するとして解されるものとす
るが、一つ又はそれ以上の特徴、完全なもの、段階若しくは構築要素、又はそれ
らの集まりの存在を排除しない。したがって、例えば、ヌクレオチド又はアミノ
酸の配列を含む、核酸又はタンパク質は、実際に引用されたものより多くのヌク
レオチド又はアミノ酸を含む、すなわち、より大きい核酸又はタンパク質に包埋
されていてよい。機能的又は構造的に定義されたDNA領域を含むキメラ遺伝子
は、追加のDNA領域等々を含んでよい。
【0037】 本発明は、一方では、真核細胞、特に植物細胞、格別にトウモロコシZea mays
の細胞が、大きさ及びアミノ酸配列は異なるが、ともにDNA、特に一本鎖切断
を有するDNAと結合でき、ともにポリADPリボシル化活性を有する、機能的
に重要な少なくとも二つのPARPタンパク質イソ型(クラス)を同時に含むと
いう発見に基づく。他方では、本発明者らは、真核生物、特に植物におけるプロ
グラムされた細胞死は、PARP遺伝子の発現レベルを変更するか、又はコード
されるタンパク質の活性を遺伝的に変更することによって調節できること、及び
この目標を達成するには、両遺伝子の発現を変更する必要があるか、又はこれに
代えて、両クラスのタンパク質の活性を変更する必要があることを理解している
【0038】 真核細胞、特に植物細胞が、異なるクラスの遺伝子によってコードされるPA
RPタンパク質の二つの機能的イソ型を含むことを示す技術の不足が、組換えD
NA法による、これらの細胞におけるPARP活性の効率的な調節を妨げてきた
ことは明らかである。この方法及び手段の様々な実施態様は、説明、実施例及び
請求項によって示す。
【0039】 したがって、本発明は、真核細胞、好ましくは植物細胞におけるプログラムさ
れた細胞死若しくはアポトーシスの、PARP遺伝子の発現レベルの変更による
か、又は該真核細胞内のPARPタンパク質の活性、若しくは見かけの活性の変
更による調節、すなわち増強又は阻害に関する。好都合にも、PARP遺伝子の
発現レベル、又はPARPタンパク質の活性は、PARP遺伝子の発現を変更す
るPCD調節キメラ遺伝子の導入、及び/又はPARPタンパク質の見かけの活
性を変更するPCD調節キメラ遺伝子の導入、及び/又は内因性のPARPコー
ディング遺伝子の変更によって、遺伝的に制御される。
【0040】 本明細書に用いられる限りで、指定された細胞に関する「増強されたPCD」
とは、本発明の方法によって誘発され、そのため、本発明の方法によって調節さ
れない正常植物の類似の細胞と比較して、類似の条件下でPCDを蒙る運命には
なかったような細胞の死を意味する。
【0041】 指定された細胞に関する「阻害されたPCD」とは、通常は(本発明の方法に
よる干渉なしには)、特定の条件下で、プログラムされた細胞死を蒙るはずであ
ったような細胞又は細胞群の、より大きい画分が、これらの条件下で生存する過
程として解されるものとする。
【0042】 したがって、導入されたPCD調節キメラ遺伝子、又は調節された内因性遺伝
子の発現は、PARPタンパク質の機能レベルに影響を及ぼし、プログラムされ
た細胞死に間接的に干渉することになる。PARPタンパク質の機能レベルの程
々の低下は、プログラムされた細胞死の阻害、特にプログラムされた細胞死の防
止へと導くのに対し、PARPタンパク質の機能レベルの重大な低下は、プログ
ラムされた細胞死の導入へと導く。
【0043】 本発明によれば、真核細胞、特に植物細胞におけるプログラムされた細胞死を
阻害又は防止するには、PARPタンパク質、及び/又はその活性若しくは見か
けの活性の組み合せたレベルの両方を有意に低下させるが、(PARPに直接又
は間接的に支配される)DNA修復が、PARPタンパク質の機能が阻害された
細胞が、DNA損傷から回復できないようにしてか、又はそのゲノムの完全性を
維持できないようにして阻害されることは回避するのが好ましい。好ましくは、
標的細胞内のPARPタンパク質のレベル及び/又は活性を、標的細胞における
正常なレベル及び/又は活性から約75%、好ましくは約80%、特に約90%
低下させる結果、PARPの正常なレベル及び/又は活性の約25%、好ましく
は約20%、特に約10%が標的細胞内に保持されなければならない。更に、P
ARPタンパク質のレベル及び/又は活性の低下は、標的細胞における正常な活
性及び/又はレベルの95%を越えてはならず、好ましくは90%を越えてはな
らないと考えられる。PARPタンパク質のような特異的タンパク質の含有量を
決定する方法は、当業者には周知であり、特異的抗体を用いたそのようなタンパ
ク質の(組織化学的)定量を包含するが、これらに限定されない。PARP活性
を定量する方法も、当技術に利用可能であり、上記のTUNELアッセイ(in v
ivoで)、又はポリ(ADP−リボース)の合成のためのCollinge & Althaus(1
994)が記載したin vitroアッセイを包含する(実施例を参照されたい)。
【0044】 本発明によれば、また、真核細胞、特に植物細胞にプログラムされた細胞死を
誘発するには、DNA修復、及びゲノムの完全性の維持がそれ以後は可能でなく
なるように、PARPタンパク質、及び/又はその活性若しくは見かけの活性の
組み合せたレベルの両方を、実質的に低下させ、好ましくはほとんど完全に低下
させるのが好ましい。好ましくは、標的細胞内のPARPタンパク質の組み合せ
たレベル及び/又は活性を、標的細胞内の正常なレベル及び/又は活性から少な
くとも約90%、好ましくは約95%、より好ましくは約99%低下させなけれ
ばならず、特にPARP活性は、完全に阻害しなければならない。両クラスのP
ARPタンパク質の機能レベルは、別個に、上記のレベルまで低下させるのが特
に好ましい。
【0045】 本発明を目的として、PARPタンパク質は、ポリ(ADP−リボース)ポリ
メラーゼ活性を有し、好ましくはいわゆる「PARPシグニチャー」を含むタン
パク質として定義される。PARPシグニチャーは、PARPタンパク質間で高
度に保存されたアミノ酸配列であって、Murcia及びMenussier de Murcia(1994
)によって、マウスMus musculusのPARPタンパク質からの、第858番アミ
ノ酸から第906番アミノ酸に達するとして定義された。このドメインは、トウ
モロコシの慣用的なPARPタンパク質の第817〜865番のアミノ酸配列(
ZAP1;SEQ ID NO:2)、トウモロコシの慣用的PARPタンパク質の第82
7〜875番のアミノ酸配列(ZAP2;SEQ ID NO:11)、トウモロコシの非
慣用的PARPタンパク質の第500〜547番のアミノ酸配列(SEQ ID NO:4
)、シロイヌナズナの非慣用的PARPの第485〜532番のアミノ酸配列(
SEQ ID NO:6)に相当する。このアミノ酸配列は、異なる(約90〜100%の
配列同一性を有する)PARPタンパク質間で高度に保存されている。特に保存
されているのは、マウスのPARPタンパク質の第891番のリシンであって(
SEQ ID NO:2の第850番、SEQ ID NO:11の第861番、SEQ ID NO:4の第5
32番、SEQ ID NO:6の第517番に相当)、PARPタンパク質の触媒活性に
関与すると考えられる。特に、マウスのPARPタンパク質の第865、866
、893、898及び899番、又は他の配列について相当する位置のアミノ酸
が通用する。PARPタンパク質は、N末端のDNA結合ドメイン、及び/又は
核局在化シグナル(NLS)を更に含んでもよい。
【0046】 現在、2クラスのPARPタンパク質が記載されている。本明細書で定義され
る限りでの第一のクラスは、いわゆる古典的な含ジンクフィンガーPARPタン
パク質(ZAP)を含む。これらのタンパク質は、大きさが113〜120kDa
にわたり、該タンパク質のN末端ドメインに位置する、特に該タンパク質の初め
の約355〜約375アミノ酸内に位置する、少なくとも一つ、好ましくは二つ
のジンクフィンガーの存在を更に特徴とする。ジンクフィンガーは、Zn原子を
錯化できる配列CxxCxnHxxC(nは、26〜30に変動し得る)を有するペプチド
配列として定義される。ZAPクラスのPARPタンパク質についてのアミノ酸
配列の例は、PIRタンパク質データベース中に、登録番号P18493(ウシ
Bos taurus)、P26466(ヤケイGallus gallus)、P35875(キイロ
ショウジョウバエDrosophila melanogaster)、P09874(ヒトHomo sapien
s)、P11103(ハツカネズミMus musculus)、Q08824(マスOncoryn
chus masou)、P27008(ドブネズミRattus norvegicus)、Q11208
(サルコファーガ・ペレグリナSarcophaga peregrina)及びP31669(アフ
リカツメガエルXenopus laevis)で見出すことができる配列、並びにトウモロコ
シのZAP1及びZAP2タンパク質の現在同定されている配列(SEQ ID NO:2
/SEQ ID NO:11)を包含する。
【0047】 対応するcDNAのヌクレオチド配列は、EMBLデータベース中に、登録番
号D90073(ウシ)、X52690(ニワトリ)、D13806(キイロシ
ョウジョウバエ)、M32721(ヒト)、X14206(ハツカネズミ)、D
13809(マス)、X65496(ドブネズミ)、D16482(サルコファ
ーガ・ペレグリナ)及びD14667(アフリカツメガエル)の下に、並びにSE
Q ID NO:1及び10(トウモロコシ)に見出すことができる。
【0048】 本明細書で定義される限りでの第二のクラスは、いわゆる非古典的PARPタ
ンパク質(NAP)を含む。これらのタンパク質は、類似しており(72〜73
kDa)、該タンパク質のN末端でのジンクフィンガーの不在、及びDNA結合タ
ンパク質との類似性を有するアミノ酸の範囲を含むN末端ドメインの存在を更に
特徴とする。好ましくは、これらのクラスのPARPタンパク質は、配列RGxxxx
GxKxxxxxRL(アミノ酸は、標準的な一字コードで表され、xは、いかなるアミノ
酸も意味する;SEQ ID NO:7)を含む約30〜32アミノ酸の少なくとも一つの
アミノ酸配列を含む。はるかに好ましくは、これらのPARPタンパク質は、配
列xLxVxxxRxxLxxRGLxxxGVKxxLVxRLxxAI(SEQ ID NO:8)(いわゆるA1ドメイ
ン)を有する約32アミノ酸の少なくとも一つのアミノ酸配列、若しくは配列GM
xxxELxxxAxxRGxxxxGxKKDxxRLxx(SEQ ID NO:9)(いわゆるA2ドメイン)を有
する約32アミノ酸の少なくとも一つのアミノ酸配列、又はその双方を含む。特
に、A1及びA2ドメインは、らせん−ループ−らせん構造を形成することがで
きる。これらのPARPタンパク質は、塩基性の「B」ドメイン(約35〜約5
6アミノ酸のK/Rに富むアミノ酸配列、核に向けてのタンパク質の照準に関与
)、及び/又は酸性の「C」ドメイン(約36アミノ酸のD/Eに富むアミノ酸
配列)を更に含んでもよい。NAPクラスのタンパク質配列の例は、シロイヌナ
ズナのAPPタンパク質(PIRタンパク質データベースから登録番号Q112
07の下に情報が得られる;SEQ ID NO:6)、及びトウモロコシのNAPタンパ
ク質(SEQ ID NO:4)を包含する。対応するcDNAの配列は、EMBLデータ
ベース中に、登録番号Z48243の下に、及びSEQ ID NO:3に見出すことができる。
第二のクラスのPARPタンパク質が、実際にPARPタンパク質であること、
すなわちDNA依存ポリ(ADP−リボース)重合を触媒できることは、本発明
者らによって立証された(実施例2を参照されたい)。
【0049】 本発明者らは、真核細胞、特に植物細胞が、両クラスのPARPタンパク質を
コードする遺伝子を同時に発現することを、更に立証した。
【0050】 本発明を目的として、定義された限りでの両クラスのPARPタンパク質をコ
ードするその他の遺伝子若しくはcDNA、又はその一部を、他の真核生物の種
若しくは変種から、特に他の植物種若しくは変種から単離できることは明らかで
ある。これらのPARP遺伝子又はcDNAは、例えば、上記のPARP遺伝子
若しくはcDNA、又はその一部(好ましくは、上記のPARPシグニチャーを
コードするヌクレオチド配列を含む、遺伝子フラグメントのような保存された部
分)のヌクレオチド配列を有するDNAフラグメントをプローブとして用いる、
サザンハイブリダイゼーション(PARP遺伝子を単離しようとする種と、プロ
ーブを最終的に派生させる種との間の関係に応じての、低厳密度又は高厳密度ハ
イブリダイゼーションのいずれか)によって、単離することができる。植物遺伝
子がコードするPARPタンパク質のPARPシグニチャーに相当するヌクレオ
チド配列は、SEQ ID NO:1ヌクレオチド第2558〜2704番のヌクレオチド
配列、SEQ ID NO:3ヌクレオチド第1595〜1747番のヌクレオチド配列、
又はSEQ ID NO:5ヌクレオチド第1575〜1724番のヌクレオチド配列であ
る。PARP遺伝子のクラス間で区別しなければならないならば、好ましくは、
PARP遺伝子の、そのクラスに特異的である部分、例えば、触媒ドメインに先
行するN末端ドメイン、又はその一部を用いなければならない。
【0051】 これに代えて、PARPタンパク質又はその一部をコードする遺伝子若しくは
cDNAは、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14に示される配列に対応するヌクレ
オチド配列を有する縮重プライマー、又はSEQ ID NO:15〜20に示される配列
に対応するヌクレオチド配列を有するプライマーのような、適切なプライマーを
用いたPCR増幅によって単離することができる。しかし、当業者が、PCRに
用いるための代替的オリゴヌクレオチドを設計するか、又はPARP遺伝子のい
ずれかの、少なくとも20、好ましくは少なくとも約30、特に少なくとも約5
0の連続するヌクレオチドからなるヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチド
を用いて、遺伝子又はその一部をPCR増幅によって単離することができること
は、明らかである。
【0052】 これらの手法の組合わせ、又は部分的フラグメント、及び例えばPCR増幅を
用いて得られるそのヌクレオチド配列に基づいて、遺伝子若しくはcDNAを単
離するために当業者が利用できる、その他の手法(例えばRACE−PCR)を
用いて、本発明の方法に用いるのに適するPARP遺伝子又はその一部を単離で
きることは、明らかである。
【0053】 その上、アミノ酸のいくつかが、その他の化学的に類似するアミノ酸と交換さ
れた(いわゆる保存的置換)、PARPタンパク質をコードするPARP遺伝子
、又は合成PARP遺伝子(天然PARP遺伝子と類似のタンパク質をコードす
るが、遺伝暗号の縮重に基づいて、異なるヌクレオチド配列を有する)、及びそ
れらの一部も、本発明の方法に適する。
【0054】 本発明の一面では、真核細胞、特に植物細胞におけるPCDを、これらの真核
細胞内のPARPの機能レベルの程々の低下によって阻害する。
【0055】 本発明の第一の面の一実施態様では、真核細胞、特に植物細胞内のPARPの
機能レベルを、これらの細胞での転写を指令できるプロモーター、好ましくは植
物発現性プロモーターと、転写されたときに、両クラスのPARP遺伝子がコー
ドする内因性PARP活性の機能レベルを低下させ得る、生物学的に活性である
RNA分子を生じるDNA領域に動作可能に結合された、機能的3′転写終結及
びポリアデニル化領域とを含む、少なくとも一つのPCD調節キメラ遺伝子のこ
れらの細胞への導入によって低下させる。
【0056】 好適実施態様では、少なくとも二つのそのようなPCD調節キメラ遺伝子を細
胞に導入し、それによって、第一のPCD調節キメラ遺伝子がコードする生物学
的活性RNAは、NAPクラスの遺伝子がコードする内因性PARP活性の機能
レベルを低下させ、かつそれによって、第二のPCD調節キメラ遺伝子がコード
する生物学的活性RNAは、ZAPクラスクラスの遺伝子がコードする内因性P
ARP活性の機能レベルを低下させるため、組み合せたPARP活性が、適度に
低下する。
【0057】 特に好適な実施態様では、PCD調節キメラ遺伝子は、内因性PARP遺伝子
の発現レベルを低下させることによって、内因性PARP活性の機能レベルを低
下させる。このためには、転写されたDNA領域は、翻訳に利用できるNAP及
びZAPクラスのPARPタンパク質をコードするmRNAを減少させる生物学
的活性RNAをコードする。これは、アンチセンスRNA、共抑制又はリボザイ
ム作用のような手法を通じて達成することができる。
【0058】 本明細書に用いられる限りで、「共抑制」とは、RNA蓄積を、配列特異的な
方式で、転写及び/又は転写後抑制に付して、内因性相同遺伝子又はトランス遺
伝子の発現の抑制を招く過程を意味する。
【0059】 したがって、内因性PARP遺伝子の発現の抑制は、DNA領域に動作可能に
結合された強力なプロモーターを含む、トランス遺伝子を導入し、そのために、
得られる転写されたRNAが、その発現を抑制しようとするPARP遺伝子の部
分の、コードする及び/若しくは転写されるDNA配列(センス)、又は相補体
(アンチセンス)と、少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%、特に8
5%、より特に少なくとも90%、特別には少なくとも95%の同一性を有する
か、或いは同一である、ヌクレオチド配列を含むセンスRNA若しくはアンチセ
ンスRNAであることによって達成することができる。好ましくは、転写される
DNA領域は、機能的タンパク質をコードしない。特に、転写領域は、タンパク
質をコードしない。更に、センス又はアンチセンス領域のヌクレオチド配列は、
好ましくは、長さが少なくとも約100ヌクレオチド、より好ましくは少なくと
も約250ヌクレオチド、特に少なくとも約500ヌクレオチドでなければなら
ないが、その発現を低下させようとする遺伝子のコーディング領域の全長にわた
ってもよい。
【0060】 本発明を目的として、関連する二つのヌクレオチド又はアミノ酸配列の、百分
率として表される「配列同一性」とは、最適に整列させた二つの配列中の、比較
した位置の数で除した、同一残基を有する位置の数(x100)を意味する。間
隙、すなわち整列させて、一方の配列には存在するが、他方には存在しない位置
は、残基が同一でない位置と見なされる。二つの配列の整列は、ウィルバー−リ
ップマンアルゴリズム〔Wilbur & Lipmann, 1983〕によって、20ヌクレオチド
又はアミノ酸というウィンドウサイズ、2アミノ酸という語長、及び4という間
隙ペナルティーを用いて実施する。上記の配列の整列を包含する配列データのコ
ンピュータ支援解析及び解釈は、好都合にも、Intelligenetics(登録商標)のS
uite(Intelligenetics Inc., CA)というプログラムのような、商業的に入手で
きるソフトウェアパッケージを用いて実施することができる。
【0061】 当業者には、一つ又はそれ以上のセンス若しくはアンチセンスPCD調節キメ
ラ遺伝子を用いて、本発明の第一の面の目標を達成できることは明らかであると
思われる。一つのセンス又はアンチセンスPCD調節キメラ遺伝子を用いたとき
は、この遺伝子は、両クラスのPARP遺伝子の発現を同時に低下させることが
可能でなければならない。これは、例えば、キメラ遺伝子の転写領域を、両クラ
スの遺伝子の発現が、一つのセンス又はアンチセンスRNAによって調節される
ように選ぶ、すなわち両クラスのPARP遺伝子の最高の相同性を有するDNA
領域に対応する標的領域を選び、センス及びアンチセンスRNAについて上に記
載した条件に合う、両標的領域に対応する転写センス又はアンチセンスDNA領
域を組み込むことによって、達成することができる。これに代えて、それぞれ、
PARP遺伝子の一方のクラスの発現を調節するのに特異的である種々のセンス
又はアンチセンスRNA領域を、一つのPCD調節キメラ遺伝子の一つの転写領
域がコードする一つのRNA分子に組み合せることができる。明らかに、一方の
クラスのPARP遺伝子の発現を調節するのに特異的である種々のセンス又はア
ンチセンスRNA領域は、別個のPCD調節キメラ遺伝子として導入することが
できる。
【0062】 好適なセンス及びアンチセンスコーディング転写領域は、PARP遺伝子のN
末端ドメインから選ばれる少なくとも約100の連続ヌクレオチドの配列に(上
記の配列同一性の制約を有して)相当する、好ましくは、SEQ ID NO:1第113
〜1189番ヌクレオチドの配列、SEQ ID NO:3第107〜583番ヌクレオチ
ドの配列、SEQ ID NO:5第131〜542番ヌクレオチドの配列、又はSEQ ID N
O:10第81〜1180番ヌクレオチドの配列から選ばれる、少なくとも約10
0の連続ヌクレオチドの配列に相当するヌクレオチド配列に相当する。しかし、
PARP遺伝子のN末端ドメインの完全な配列に、又はPARP遺伝子の完全な
配列、特にそのタンパク質コーディング領域にさえ相当する配列を含む、センス
又はアンチセンスコーディング転写領域を用い得ることは、明らかである。更に
好ましいのは、PARP遺伝子のC末端触媒性ドメインから選ばれる、少なくと
も約100の連続ヌクレオチドの配列、好ましくは、PARPシグニチャーコー
ディングヌクレオチド配列、特に上記のPARPシグニチャーコーディングヌク
レオチド配列を含む、少なくとも100ヌクレオチドの配列に(上記の配列同一
性の制約を有して)相当する、転写センス及びアンチセンスコーディング領域で
ある。やはり、PARP遺伝子のC末端ドメインの完全配列に相当する配列を含
む、転写センス又はアンチセンスコーディング領域を用い得ることは、明らかで
ある。
【0063】 もう一つの特に好適な実施態様では、PCD調節キメラ遺伝子は、両クラスの
内因性PARPの見かけの活性レベルを低下させることによって、内因性PAR
P活性の機能レベルを低下させる。このためには、転写されるDNA領域は、生
物学的活性RNAをコードし、それが、NAP若しくはZAPクラスのPARP
タンパク質、又は両者を阻害するタンパク質若しくはペプチド、例えば不活性化
抗体又は優性ネガティブPARP突然変異体へと翻訳される。
【0064】 「PARPタンパク質の不活性化抗体」は、PARPタンパク質のいくつかの
エピトープ、例えば、ZAP1の第111〜118位からのジンクフィンガーII
の部分、又はZAP2の対応するペプチドを対象とするエピトープに少なくとも
特異的に結合し、標的タンパク質の活性を阻害する、抗体又はその部分である。
【0065】 本明細書に用いられる限りで、「優性ネガティブPARP突然変異体」は、P
ARPタンパク質(又はその変化形)、好ましくは、真核標的宿主細胞に内因性
であるPARPタンパク質の少なくとも一部を含む、PARP活性を保有せず、
該宿主細胞内で発現されたとき、該内因性PARPタンパク質の活性に対して阻
害効果を有するタンパク質又はペプチドである。好適な優性ネガティブPARP
突然変異体は、機能性DNA結合ドメイン(又はその変化形)を、触媒ドメイン
なしに含む(例えば、ZAPクラスのPARPの約355〜約375アミノ酸の
ドメインを含むN末端ジンクフィンガー、特に、SEQ ID NO:2第1〜370番ア
ミノ酸のアミノ酸配列を含むDNA結合タンパク質ドメイン、SEQ ID NO:11第
1〜98番アミノ酸のアミノ酸配列を含むDNA結合タンパク質ドメイン、若し
くは第1〜88番アミノ酸のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:11の第1位のアミノ
酸から第98位のアミノ酸までのアミノ酸配列で置きかえられた、SEQ ID NO:2
第1〜370番アミノ酸のアミノ酸配列を含むDNA結合タンパク質ドメイン、
又は例えば、NAPクラスのPARPの約135〜約160アミノ酸のN末端D
NA結合タンパク質ドメイン、特に、SEQ ID NO:4第1〜159番アミノ酸のア
ミノ酸配列を含むDNA結合タンパク質ドメイン、若しくはSEQ ID NO:6第1〜
138番アミノ酸のアミノ酸配列を含むDNA結合タンパク質ドメイン)か、若
しくは機能性触媒ドメインなしに含む(例えば、いわゆるPARPシグニチャー
が突然変異した、特にSEQ ID NO:2の第850位、SEQ ID NO:4の第532位、
SEQ ID NO:6の第517位の保存されたリシンが突然変異した不活性PARP突
然変異体)か、又はそれからなるタンパク質である。好ましくは、優性ネガティ
ブPARP突然変異体は、それらのDNA結合活性を保持しなければならない。
優性ネガティブPARP突然変異体は、担体タンパク質、例えばβ−グルクロニ
ダーゼと融合させることができる(SEQ ID NO:12)。
【0066】 また、1種類又はそれ以上の優性ネガティブPARP突然変異体をコードする
一つ若しくはそれ以上のPCD調節遺伝子を用いて、本発明の第一の面の目標を
達成することができる。一つのPCD調節キメラ遺伝子を用いたときは、この遺
伝子は両クラスのPARP遺伝子の発現を同時に低下させることができなければ
ならない。
【0067】 本発明の第一の面のもう一つの実施態様では、これらの細胞内の内因性PAR
P遺伝子のヌクレオチド配列を、コードされる突然変異PARPタンパク質が、
その活性の約10%を保持するように調節することによって、真核細胞、特に植
物細胞におけるPARPの機能レベルを低下させる。内因性PARP遺伝子のそ
のような調節を達成する方法は、例えば米国特許第5,527,695号明細書
に記載された方法によって、内因性PARP遺伝子を突然変異PARP遺伝子と
交換するための相同組換えを包含する。好適実施態様では、内因性PARP遺伝
子のヌクレオチド配列の、そのような部位指向性調節は、国際公開特許第96/
22364号公報又は米国特許第5,565,350号明細書に記載のとおり、
キメラDNA/RNAオリゴヌクレオチドの導入によって達成される。
【0068】 しかし、植物細胞に関しては、好ましくは、一方のクラスのPARP遺伝子、
特にZAPクラスのPARP遺伝子の発現を低下させる活性を有する生物学的活
性RNAをコードする、一つのPCD調節キメラ遺伝子の導入は、本発明の第一
の面によるこれらの植物細胞内のPARP活性全体の低下、すなわちこれらの植
物細胞におけるプログラムされた細胞死を阻害又は予防するのに充分であり得る
【0069】 本発明のこの実施態様では、PCD調節キメラ遺伝子は、好ましくは、本明細
書に述べた基準によれば、内因性PARP遺伝子の一方に対するセンスRNAと
して分類する、好ましくは少なくとも100ヌクレオチドの長さの、少なくとも
一つのRNA領域を含み、かつ本明細書に述べた基準によれば、内因性PARP
遺伝子の一方に対するアンチセンスRNAとして分類する、好ましくは少なくと
も100ヌクレオチドの長さの、少なくとも一つの別のRNA領域を含み、その
ために、該アンチセンス及びセンスRNA領域が、好ましくは少なくとも約10
0ヌクレオチドの距離にわたって、二本鎖領域へと組み合わせることが可能な、
生物学的活性RNAのコードを有する転写領域を含む。
【0070】 一方のクラスのPARPタンパク質、特に、本明細書に記載されたようなZA
PクラスのPARPタンパク質の機能又は見かけのレベルを低下させることがで
きる、一つのPCD調節キメラ遺伝子の導入も、本発明の第一の面による、植物
細胞におけるPARP活性全体の低下に同様に充分であり得ると予測される。
【0071】 本発明の第一の面による、少なくとも一つのPCD調節キメラ遺伝子を含む、
植物細胞におけるプログラムされた細胞死の低下又は阻害は、不都合な状態に対
する増強された耐性、例えば、化学物質の投与が与えるストレスに対する耐性、
寒冷ストレス耐性、病原体及び疫病が与えるストレスに対する耐性、乾燥耐性、
熱ストレス耐性等々を生じることができる。
【0072】 本発明のもう一つの面では、真核細胞、好ましくは選ばれた細胞、特に選ばれ
た植物細胞のプログラムされた死を、PARPの機能レベルの重大な低下、好ま
しくはDNA修復、又はゲノム完全性の維持がそれ以後不可能となるような、ほ
とんど完全な低下によって増強する。
【0073】 本発明のこの面の一実施態様では、真核細胞、好ましくは植物細胞内のPAR
Pの機能レベルを、これらの細胞での転写を指令できるプロモーター、好ましく
は植物発現性プロモーターと、転写されたとき、両クラスのPARP遺伝子がコ
ードする内因性PARP活性の機能レベルを低下させ得る生物学的活性RNA分
子を生じる、DNA領域に動作可能に結合された、機能性3′転写終結及びポリ
アデニル化領域とを含む、少なくとも一つのPCD調節キメラ遺伝子をこれらの
細胞に導入することによって、大幅に低下させ、特にほぼ完全に抑止する。
【0074】 本発明の第二の面の好適実施態様では、少なくとも二つのそのようなPCD調
節キメラ遺伝子を細胞に導入し、それによって、第一のPCD調節キメラ遺伝子
がコードする生物学的活性RNAが、NAPクラスの遺伝子がコードする内因性
PARP活性の機能レベルを低下させ、かつそれによって、第二のPCD調節キ
メラ遺伝子がコードする生物学的活性RNAが、ZAPクラスの遺伝子がコード
する内因性PARP活性の機能レベルを低下させる結果、組み合されたPARP
活性を大幅に低下させ、特にほぼ完全に除去する。
【0075】 本発明の第一の面について述べたとおり、PCD調節キメラ遺伝子の転写領域
は、生物学的活性RNAをコードし、それが、(例えばアンチセンス作用、共抑
制、又はリボザイム作用を通じて)内因性PARP遺伝子の発現に干渉すること
ができるか、又は該生物学的活性RNAが、NAP若しくはZAPクラスのPA
RPタンパク質を阻害できるペプチド若しくはタンパク質、例えば不活性化する
抗体、又は優性ネガティブPARP突然変異体に更に翻訳されることができる。
【0076】 本発明の第二の面の特に好適な実施態様では、PCD調節キメラ遺伝子(PC
D増強キメラ遺伝子)の転写領域は、本明細書に述べた基準によれば、内因性P
ARP遺伝子の少なくとも一方に対するセンスRNAとして分類する、(好まし
くは少なくとも約100ヌクレオチドの長さの)少なくとも一つのRNA領域と
、本明細書に述べた基準によれば、内因性PARP遺伝子の少なくとも一方に対
するアンチセンスRNAとして分類する、(好ましくは少なくとも約100ヌク
レオチドの長さの)少なくとも一つのRNA領域とを含み、そのために、該アン
チセンス及びセンスRNA領域が(好ましくは少なくとも約100ヌクレオチド
の距離にわたる)二本鎖領域へと組み合わせることができる、生物学的活性RN
Aのコードを有する。特に好適な実施態様では、一方は、NAPクラスのPAR
Pタンパク質の機能レベルを低下させるよう照準され、他方は、ZAPクラスの
PARPタンパク質の機能レベルを低下させるよう照準された、少なくとも二つ
のそのようなPCD調節遺伝子を、真核細胞又は生物、好ましくは植物細胞又は
植物に導入する。
【0077】 本発明のキメラ性PCD調節遺伝子の転写されるDNA領域に関する、異なる
実施態様を様々な組合せで用いて、本発明の目標に到達できることは明らかであ
る。例えば、第一のキメラ性PCD調節遺伝子は、ZAPクラスの内因性PAR
P遺伝子の発現を低下させるよう設計されたセンスRNAをコードしてよく、一
方、第二のキメラ性PCD調節遺伝子は、NAPクラスの内因性PARP遺伝子
の発現を低下させるよう設計された優性ネガティブPARP突然変異体をコード
してよい。
【0078】 真核細胞へのPCD調節キメラ遺伝子の導入が、最終的に、これらの細胞での
組み合せたPARPの程々に低下したか、又は大幅に低下した機能レベル(すな
わち阻害されたPCDのか、又は増強されたPCDの)のいずれを招くことにな
るかは、これらのPCD調節遺伝子の(転写レベル又は組み合された転写/翻訳
レベルのいずれかでの)発現レベルによって決定されることになる。PCD調節
遺伝子の発現レベルへの主な寄与因子は、プロモーター領域の選択であるが、他
の因子(例えば、これらに限られないが、3′末端の選択、イントロンの存在、
転写領域のコドン使用法、mRNAの安定度、翻訳開始部位周辺の共通配列の存
在、5′及び3′非翻訳RNA領域の選択、PEST配列の存在、安定に組み込
まれたPCD調節遺伝子の挿入部位を囲む染色質構造の影響、導入されたPCD
調節遺伝子のコピー数等々)、又はそれらの組合せも、PCD調節遺伝子の最終
的な発現レベルに寄与することになる。一般に、組み合されたPARPの機能レ
ベルの程々の低下は、比較的弱いプロモーターを含むPCD調節遺伝子によって
達成できるが、組み合されたPARPの機能レベルの大幅な低下は、比較的強い
プロモーターを含むPCD調節遺伝子によって達成できると想定することができ
る。しかし、特定のプロモーターを含むPCD調節遺伝子の発現レベル、及び結
果的にはPCDに対するその効果は、既述のとおり、その他の寄与因子との相関
として変動することができる。
【0079】 本発明の特定の実施態様を目的として、PCD調節キメラ遺伝子は、構築性プ
ロモーター、又は生物体内、特に植物体内の至るところの細胞型のすべて若しく
は大部分で発現されるプロモーター、例えば、T−DNA遺伝子に由来するプロ
モーター領域、特にアグロバクテリウム属のTi若しくはRiプラスミドのオパ
イン合成酵素遺伝子(例えばnos、ocsプロモーター)、又はウイルス遺伝
子のプロモーター領域(例えばCaMV35Sプロモーター、又はその変種)を
含んでよい。
【0080】 随意にか、又は環境的なきっかけに応じて、例えば、外部の刺激、例えば、こ
れらに限られないが、化学的化合物(例えば毒性緩和剤、除草剤、グルココルチ
コイド)の適用、明条件、非生物的ストレス(例えば、傷害、重金属、極端な温
度、塩分又は乾燥)若しくは生物的ストレス(例えば、真菌、ウイルス、細菌、
昆虫、線虫、マイコプラズマ、及びマイコプラズマ様生物等々を包含する、病原
体又は疫病の感染)によって活性化できる、誘導性プロモーターを含ませること
によって、PCD調節遺伝子の発現を制御するのが更に好都合であり得る。本発
明に適する植物発現性の誘導性プロモーターの例は、線虫誘導性プロモーター(
例えば国際公開特許第92/21757号公報に開示されたもの)、真菌誘導性
プロモーター(国際公開特許第93/19188号、第96/28561号公報
)、デキサメタゾンのようなグルココルチコイドの適用後に誘導できるプロモー
ター、又はテトラサイクリンの適用後に抑制若しくは活性化されるプロモーター
〔Gatz et al., 1988;Weinmann et al., 1994〕である。
【0081】 特に本発明の第二の面(すなわち増強されたPCD)に関する、本発明のいく
つかの実施態様では、プログラムされた細胞死に対する効果を生物、特に植物の
細胞の特定のサブセットに限定するのが好都合又は必要であり、そのため、PC
D調節遺伝子は、組織特異的又は細胞型特異的プロモーターを包含し得る。特定
の組織又は細胞型で選択的に発現される、適切な植物発現性プロモーターの例は
、当業者には公知であり、種子特異的プロモーター(例えば国際公開特許第89
/03887号公報)、器官原基特異的プロモーター〔An et al., 1996〕、茎
特異的プロモーター〔Keller et al., 1988〕、葉特異的プロモーター〔Hudspet
h et al., 1989〕、葉肉特異的プロモーター(例えば、光誘導性のリブロース−
1,5−ビスリン酸カルボキシラーゼプロモーター)、根特異的プロモーター〔
Keller et al., 1989〕、塊茎特異的プロモーター〔Keil et al., 1989〕、維管
束組織特異的プロモーター〔Peleman et al., 1989〕、分裂組織特異的プロモー
ター〔例えば無苗条分裂組織(STM)遺伝子のプロモーター、Long et al., 1
996〕、原基特異的プロモーター〔例えばキンギョソウ属CycD3a遺伝子、D
oonan et al., 1998〕、葯特異的プロモーター(国際公開特許第89/1039
6号、第92/13956号、第92/13957号公報)、柱頭特異的プロモ
ーター(国際公開特許第91/02068号公報)、裂開帯特異的プロモーター
(国際公開特許第97/13865号公報)、種子特異的プロモーター(国際公
開特許第89/03887号公報)等々を包含するが、これらに限定されない。
【0082】 好ましくは、本発明のキメラ性PCD調節遺伝子は、植物発現性プロモーター
、好ましくは構築性プロモーター、例えばCaMV35Sプロモーター、又はリ
ブロース−1,5−ビスリン酸カルボキシラーゼの小さい副単位をコードする遺
伝子のプロモーターのような光誘導性プロモーターにその5′末端で動作可能に
結合され、かつ適切な植物転写3′末端形成及びポリアデニル化シグナルにその
3′末端で動作可能に結合された、マーカーDNAを含む、マーカー遺伝子、好
ましくはキメラマーマー遺伝子を伴う。マーカーDNAの選択は、決定的に重要
ではなく、適切ないかなるマーカーDNAを用いることもできることが予測され
る。例えば、マーカーDNAは、区別できる「色」を形質転換された植物細胞に
与えるタンパク質をコードすることができるか(例えばA1遺伝子〔Meyer et a
l., 1987〕又は緑色蛍光タンパク質〔Sheen et al., 1995〕)、除草剤耐性を形
質転換された植物細胞に与えることができるか(例えば、ホスフィノトリシンに
対する耐性をコードするbar遺伝子:ヨーロッパ特許第0,242,246号
公報)、又は抗生物質耐性を形質転換された細胞に与えることができる(例えば
ゲンタマイシンに対する耐性をコードするaac(6′)遺伝子:国際公開特許
第94/01560号公報)。
【0083】 PCD調節キメラ遺伝子を真核細胞に導入する方法、とくに植物細胞を形質転
換する方法は、当技術に周知であり、本発明の方法に決定的に重要ではないと考
えられる。形質転換は、一時的にか、又は安定的にかのいずれかに形質転換され
た(そのために、PCD調節キメラ遺伝子が、細胞のゲノム、特に細胞の核ゲノ
ムに安定的に挿入された)細胞を生じる。
【0084】 真核細胞及び生物、特に植物細胞及び植物におけるプログラムされた細胞死を
変更するための、本発明に記載された方法及び手段が、いくつかの重要な用途の
可能性を有することは明らかである。本発明の方法及び手段によるPCDの阻害
は、国際公開特許第97/06267号公報に記載されたとおり、形質転換の際
に細胞、特に植物細胞に賦課されるストレスを救済し、そのため、形質転換効率
を高めるのに用いることができる。PCDの阻害も、真核細胞、特に植物細胞の
細胞培養を改良するのに用いることができる。本発明の手段及び方法を用いて、
特定の細胞型にPCDを誘発することは、細胞毒素の利用を要する方法に用いる
ことができる。PCDは、細胞を死なせる「自然な」方法であることから、本発
明のPCD増強性キメラ遺伝子の利用は、細胞溶解へと導くRNアーゼ又はジフ
テリア毒素のような、その他の細胞毒性遺伝子の利用に優る改良を構築する。そ
の上、標的細胞とは異なる細胞における、PCD増強性遺伝子の低レベルの発現
は、これらの細胞におけるPARP活性の大幅な低下に代えて、適度な低下へと
導き、こうして、非標的細胞におけるPCDを実際に阻害することになる。
【0085】 植物に関しては、PCD増強性キメラ遺伝子の好ましい適用は、
【0086】 1.単数又は複数のPCD増強性キメラ遺伝子が、国際公開特許第93/191
88号又は第96/28561号公報に記載されたような、真菌応答プロモータ
ーを含むことによって、真菌の感染に対して防護された植物の生成;
【0087】 2.単数又は複数のPCD増強性キメラ遺伝子が、国際公開特許第92/217
57号公報に開示されたような、線虫誘導性プロモーターを含むことによる、線
虫耐性植物の生成;
【0088】 3.単数又は複数のPCD増強性キメラ遺伝子が、(国際公開特許第89/10
396号、第92/13956号及び第92/13957号公報に開示されたよ
うな)葯特異的プロモーター、又は(国際公開特許第91/02068号公報に
開示されたような)柱頭特異的プロモーターを含むことによる、雄又は雌の不稔
植物の生成;
【0089】 4.単数又は複数のPCD増強性キメラ遺伝子が、(国際公開特許第97/13
865号公報に開示されたような)裂開帯特異的プロモーターを含むことによる
、改良された種子破片の特徴性を有する植物の生成; を包含するが、これらに限定されない。
【0090】 意外にも、本発明の第一の面によるPCD調節キメラ遺伝子、好ましくは、Z
APクラスのPARP遺伝子の発現を調節するキメラ遺伝子、特に、転写領域が
、本明細書に記載されたような、センス及びアンチセンスRNAを同時に含む、
生物学的活性RNAをコードする、ZAPクラスのPARP遺伝子の発現を調節
するキメラ遺伝子の導入の際に、植物のカルス及び植物が、強化された成長を示
すことが見出された。
【0091】 本発明を特定の作用様式に限定するものではないが、増大した成長は、おそら
く、細胞分裂を阻害しているシグナルに対する閾値を上昇させ、こうして、より
活発に成長する植物へと導くことによる、プログラムされた細胞死を生じる細胞
の数の減少の結果であると考えられる。これらの植物は、本願の別の個所で説明
したとおり、よりストレス耐性でもある。
【0092】 したがって、第三の面では、本発明は、本発明の第一の面による少なくとも一
つのPCD調節キメラ遺伝子、好ましくは、ZAPクラスのPARP遺伝子の発
現を調節するキメラ遺伝子、特に、転写領域が、センス及びアンチセンスRNA
を同時に含む生物学的活性RNAのコードを有する、ZAPクラスのPARP遺
伝子の発現を調節するキメラ遺伝子を含む、植物細胞、植物組織及び植物の成長
、好ましくは栄養成長を増大させる方法にも関する。
【0093】 本発明は、本質的にはすべての植物種及び変種に適用できることは明らかであ
るが、本発明は、商業的価値を有する植物におけるプログラムされた細胞死を変
更するのに特に適すると思われる。本発明を適用できる、特に好ましい植物は、
トウモロコシ、採油用セイヨウアブラナ、アマニ、コムギ、イネ科植物、ムラサ
キウマゴヤシ、マメ科植物、アブラナ科植物、トマト、レタス、ワタ、コメ、オ
オムギ、バレイショ、タバコ、テンサイ、ヒマワリ、及びカーネーション、キク
、バラ、チューリップなどの鑑賞植物である。
【0094】 得られる形質転換された植物は、同じ特徴を有する、より形質転換された植物
を生産するか、又は本発明の細胞分裂制御キメラ遺伝子を、同じであるか若しく
は関連する植物種のその他の変種に導入するための、慣用の育種計画に用いるこ
とができる。形質転換された植物から得られた種子は、本発明のPCD調節遺伝
子を、安定的なゲノム挿入断片として含有する。
【0095】 下記の非限定的実施例は、アポトーシス制御キメラ遺伝子の構築、及びそのよ
うな遺伝子の、真核細胞及び生物におけるプログラムされた細胞死の調節のため
の用途を説明する。実施例中に別途記載されない限り、すべての組換えDNAの
手法は、Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, S
econd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY、並びにAusubel et
al. (1994) Current Protocols in Molecular Biology, Current Protocols, U
SAの第1及び2巻に記載されたとおりの標準的プロトコルに従って実施した。植
物の分子的作業の標準的材料及び方法は、BIOS Scientific Publications Ltd.
(UK)及びBlackwell Scientific Publications, UKが共同で出版した、R.D.D. Cr
oyによるPlant Molecular Biology Labfax (1993)に記載されている。
【0096】 説明及び実施例の全体を通して、下記の配列が参照される: SEQ ID NO:1:トウモロコシのZAP遺伝子のDNA配列(zap1) SEQ ID NO:2:トウモロコシのZAPタンパク質のタンパク質配列(ZAP1) SEQ ID NO:3:トウモロコシのNAP遺伝子のDNA配列(nap) SEQ ID NO:4:トウモロコシのNAPタンパク質のタンパク質配列(NAP) SEQ ID NO:5:シロイヌナズナのNAP遺伝子のDNA配列(app) SEQ ID NO:6:シロイヌナズナのNAPタンパク質のタンパク質配列(APP) SEQ ID NO:7:非慣用的PARPタンパク質のAドメインに対する共通配列 SEQ ID NO:8:非慣用的PARPタンパク質のA1ドメインに対する共通配列 SEQ ID NO:9:非慣用的PARPタンパク質のA2ドメインに対する共通配列 SEQ ID NO:10:トウモロコシの第二のZAP遺伝子のDNA配列(Zap2) SEQ ID NO:11:トウモロコシの第二のZAPタンパク質のタンパク質配列(ZA
P2) SEQ ID NO:12:APPのDNA結合ドメインとGUSタンパク質との間の融合
タンパク質のアミノ酸配列 SEQ ID NO:13:縮重PCRプライマー SEQ ID NO:14:縮重PCRプライマー SEQ ID NO:15:PCRプライマー SEQ ID NO:16:PCRプライマー SEQ ID NO:17:PCRプライマー SEQ ID NO:18:PCRプライマー SEQ ID NO:19:PCRプライマー SEQ ID NO:20:PCRプライマー SEQ ID NO:21:appプロモーター−gus翻訳融合
【0097】 配列リストのフリーテキスト 下記のフリーテキストを、本願の配列リストの部に用いた: <223>人工配列の記載:非慣用的PARPタンパク質のAドメイン <223>人工配列の記載:非慣用的PARPタンパク質のA1ドメイン <223>人工配列の記載:非慣用的PARPタンパク質のA2ドメイン <223>人工配列の記載:APPのN末端ドメインとGUSタンパク質との間
の融合タンパク質 <223>人工配列の記載:縮重PCRプライマー <223>人工配列の記載:PCRプライマーとして用いるためのオリゴヌクレ
オチド <223>人工配列の記載:β−グルクロニダーゼ遺伝子とのAPPプロモータ
ーの融合 <223>翻訳開始コドン
【0098】
【実施例】
実験の手順 酵母及び細菌の菌株 APPタンパク質の発現には、サッカロミセス・セレビシエSaccharomyces ce
revisiaeの菌株DY(MATa his3 can1-10 ade2 leu2 trp1 ura3::(3xSV40 AP1-l
acZ)〔Kuge & Jones, 1994〕を用いた。酵母の形質転換は、Dohmenら(1991)に
従って実施した。菌株は、最小SDC培地(0.67%酵母窒素ベース、0.3
7%カザアミノ酸、2%グルコース、50mg/lのアデニン、及び40mg/lのトリ
プトファン)で増殖させた。APP発現の誘導には、SDC中のグルコースを2
%ガラクトースに置き換えた。
【0099】 プラスミド操作及びライブラリースクリーニングには、大腸菌Escherichia co
liの菌株XL−1(Stratagene, La Jolla, CA)を用い、標準的手順〔Ausubel
et al., 1987;Sambrook et al., 1989〕に従って実施した。APPタンパク質
の発現には、大腸菌BL21〔Studier & Moffat, 1986〕を、植物の安定形質転
換には、アグロバクターAgrobacterium tumefaciensC58C1RifR株(pGV2
260)〔Dablaere et al., 1985〕を、それぞれ用いた。
【0100】 ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ活性のアッセイ APPの酵素活性は、下記のとおり調製した酵母菌株の全タンパク質抽出物中
で検定した。DY(pV8SPA)又はDY(pYeDP1/8−2)を、旋回
振盪機上のSDC培地50ml中で、150rpm、30℃で終夜増殖させた。1,000
xgでの遠心分離によって、酵母細胞を採集し、0.1Mリン酸カリウム緩衝液
(pH6.5)150mlで3回洗浄し、ソルビトール緩衝液(1.2Mソルビトー
ル、0.12MK2HPO4、0.033Mクエン酸、pH5.9)5ml中に再懸濁さ
せた。リティカーゼ(Boehringer, Mannheim、ドイツ国)を細胞懸濁液に加えて
、30U/mlの最終濃度とし、30℃で1時間、細胞を温置した。次いで、酵母の
スフェロプラストを、ソルビトール緩衝液で3回洗浄し、氷冷溶菌緩衝液(10
0mMトリスHCl、pH7.5、400mMNaCl、1mMEDTA、10%グリセ
リン、1mMDTT)2ml中に再懸濁させた。音波処理の後、溶菌液を、20,000x
g、4℃で20分間遠心分離し、上清を、反応緩衝液(100mMトリスHCl、
pH8.0、10mMMgCl2、1mMDTT)で平衡させたEcono-Pack(登録商標
)10DGカラム(Bio-Rad, Richmond, CA)上で脱塩した。タンパク質のタン
パク質分解による分解を抑えるため、溶菌及び反応緩衝液は、50mlあたり1錠
のプロテアーゼ阻害剤反応混液(Boehringer)で強化した。核酸を、NaCl及
び硫酸プロタミンを、それぞれ、600mM及び10mg/mlの最終濃度まで加える
ことによって、全抽出物から取り出した。室温で10分間の温置の後、20,000x
g、4℃で15分間の遠心分離によって、沈澱を除去した。上清の緩衝液を、Ec
ono-Pack10DGカラム上でのゲル濾過によって、反応緩衝液と交換した。
【0101】 ポリ(ADP−リボース)の合成のアッセイは、Collinge及びAlthaus(1994
)を適応させた。約500μgの全酵母タンパク質を、32P−NAD+30μCi(
500Ci/mmol)、60μMの最終濃度までの未標識NAD+、及び10μg/mlの
音波処理したサケ精子DNAで補強した反応緩衝液中で温置した。室温で40分
間温置した後、停止緩衝液(200mMトリスHCl、pH7.6、0.1MNaC
l、5mMEDTA、1%Na+−N−ラウロイル−サルコシン、及び20μg/ml
プロテイナーゼK)500μlを加え、反応物を、37℃で終夜温置した。フェ
ノール及びフェノール/クロロホルム抽出の後、0.1MNaAc(pH5.2)
とともに2.5容のエタノールを用いて、重合体を沈澱させた。ペレットを、7
0%エタノールで洗浄し、乾燥し、70%ホルムアミド、10mMEDTA、0.
01%ブロモフェノールブルー、及び0.01%キシレンシアノールに溶解した
。サンプルを、80℃で10分間加熱し、次いで、12%ポリアクリルアミド/
6M尿素の配列決定用ゲルに装荷した。ゲルを、3MM紙(Whatman Internation
al, Maidstone、英国)上で乾燥し、Kodak X-OmatX線フィルム(Eastman Kodak
, Richmond, NY)に曝露させるか、又はPhosphorImager(登録商標)445SI
(Molecular Dynamics, Sunnyvale, CA)を用いて走査するかのいずれかに付し
た。
【0102】 免疫学的手法 アミノ酸Met310〜His637のAPPポリペプチドをコードする断端appのcD
NAを、大腸菌BL21(pETΔNdeSPA)の500ml培養体を1mMイソプロピル
−β−D−チオガラクトピラノシドで誘導した後、N末端の6個のヒスチジン残
基との翻訳融合として発現させた。APPポリペプチドは、製造者(Qiagen, Ch
atsworth, CA)のプロトコルに従って、Ni2+−NTA−アガロースカラムによ
る(6M塩酸グアニジウムの存在下での)変性条件下のアフィニティークロマト
グラフィーによって、ほぼ均質となるまで精製した。PBSに対して透析した後
、可溶性及び不溶性APPポリペプチドの混合物を用いて、2羽のNew Zealand
White系ウサギを、標準的免疫感作プロトコル〔Harlow & Lane, 1988〕に従って
感作した。ウエスタンブロット分析のため、タンパク質を、変性用SDS−PA
GEによって変化させ〔Sambrook et al., 1989;Harlow & Lane, 1988〕、Semi
-Dry Blotter II(Kem-Em-Tec, Copenhagen, Denmark)を用いて、ニトロセルロ
ース膜(Hybond-C, Amersham)に移した。
【0103】 酵母細胞におけるin situ抗原定位を、記載されたとおり〔Harlow & Lane, 19
88〕実施した。酵母スフェロプラスト内のAPPタンパク質を定位するため、抗
APP血清を、トリス緩衝生理食塩水−BSA緩衝液中で1:3,000〜1:
5,000に希釈した。ポリ(ADP−リボース)重合体を特異的に認識する1
0Hモノクローナル抗体〔Ikajima et al., 1990〕を、PBS緩衝液中で1:1
00に希釈して用いた。マウス抗体を、フルオレセイン=イソチオシアナート(
FITC)(Sigma)と結合したヒツジ抗マウスIgGのF(ab′)2フラグメ
ントを1:200の希釈で用いて検出した。ウサギIgGを、CY−3と結合し
たヒツジ抗ウサギIgGヒツジF(ab′)2フラグメント(Sigma)を1:20
0の希釈で用いて検出した。DNAの視覚化には、スライドを、10μg/mlの4
′,6′−ジアミジノ−2−フェニルインドール(DAPI;Sigma)とともに
PBS中で1分間温置した。蛍光造影は、Axiskopという表面蛍光顕微鏡(Zeiss
, Jena、ドイツ国)で実施した。FITC及びCY−3の観察には、それぞれ、
23及び15のフィルターキューブを用いた。細胞は、フジカラー100スーパ
ープラスフィルムで撮影した。
【0104】 植物材料及び組織化学的分析 タバコNicotiana tabacumのSR1系〔Maliga et al., 1975〕を用い、アグロ
バクターC58C1RifR株(pGV2260;pGCNSPAGUS)との葉盤共培養の手順〔
De Block et al., 1987〕に従って、安定的な形質転換体を生成した。対照とし
ては、35SCaMVの制御下での真正GUSタバコSR1系を用いた。app
プロモーター−GUS融合の形質転換には、シロイヌナズナの生態型Columbiaを
in situ浸透の手順に従って用いた。
【0105】 GUS活性のin situ組織化学的染色のため、植物サンプルを、氷冷90%ア
セトン中で30分間固定し、0.1MK2HPO4(pH7.8)で洗浄し、次いで
、染色緩衝液(0.1MK2HPO4、pH7.8、2mMX−Gluc、20mMFe3 + −EDTA)中で37℃で温置した。染色された植物組織は、70%エタノー
ル中で4℃で貯蔵した。必要なときは、フェノール性酸化による組織の褐変を、
ラクトフェノールとの温置によって緩和した〔Beeckman & Engler, 1994〕。G
US染色は、Jenalumar光学顕微鏡(Zeiss)下で検査した。植物組織を、フジカ
ラー100スーパープラスフィルムで撮影した。
【0106】 その他の方法 プラスミド構築工程は、UBS Biochemicals(Cleveland, OH)が提供するプロ
トコルに従って実施した、DNA配列決定によって定型的に確認した。核酸ハイ
ブリダイゼーションのための32P標識化DNAのプローブは、Ready-PrimeDN
A標識化キット(Amersham)によって合成した。DNA及びRNAハイブリダイ
ゼーション実験のために、Church及びGilbert(1984)の緩衝系(0.25Mリン
酸ナトリウム、pH7.2、7%SDS、1%BSA、1mMEDTA)を用いた。
ウエスタンブロット分析のために、酵母全タンパク質を、植物組織について記載
されたとおりに〔Hurkman & Tanaka, 1986〕、基本的にはフェノールで抽出した
。ノーザンブロット分析のためには、全酵母RNAを、記載されたとおりに〔Au
subel et al., 1987〕、熱フェノールで抽出した。RNAは、グリオキサールで
変性させた後に、1.5%アガロースゲル上で分離した〔Sambrook et al., 198
9〕。Hybond-Nナイロンフィルター(Amersham)を、核酸ブロット分析に用いた
【0107】 実施例1:トウモロコシのPARP相同体をコードする遺伝子の単離 単数又は複数のPARP相同体をコードするトウモロコシcDNAを単離する
目的で、二つの取組み方に従った。第一に、トウモロコシcDNAライブラリー
を、アラビドプシス属appcDNAから調製したDNAプローブを用いて、低
厳密度DNA−DNAハイブリダイゼーション条件下でスクリーニングした。第
二に、トウモロコシPARPの部分のPCR増幅を、テンプレートとしての第一
鎖cDNA、及び「PARPシグニチャー」の配列に基づいて設計した、すべて
の公知PARPタンパク質のうちで最も保存されたアミノ酸配列である、二つの
縮重プライマーを用いて実施した。
【0108】 トウモロコシ(Zea mays L.)、同系繁殖系B734の葉からのλZAP(Strat
agene)cDNA。標準的手順〔Sambrook et al., 1989〕に従って、プラーク(
500,000)をスクリーニングした。アラビドプシス属のappプローブによるス
クリーニングの後、1.4kbpの不完全長cDNAを精製した。appプローブ
による最初のcDNAライブラリースクリーニング、及びその後のcDNA末端
の5′急速増幅(RACE)PCR分析の後、nap遺伝子、すなわちアラビド
プシス属appのトウモロコシの相同体を同定した。5′RACEPCRのため
に、Marathonキット(Clontech, Palo Alto, CA)、及び1週齢のトウモロコシ
の若芽の内鞘、外鞘および葉から単離したトウモロコシポリ(A)+RNA0.
5μgを用いてテンプレートを調製した。PCR増幅のための遺伝子特異的な、
入れ子型nestedプライマーは、napプライマーについては 5′-GGGACCATGTAGTTTATCTTGACCT-3′(SEQ ID NO:15)及び 5′-GACCTCGTACCCCAACTCTTCCCCAT-3′(SEQ ID NO:16)であった。増幅された
PCR産物を、サブクローニングし、配列決定した。800bpのフラグメントを
、nap特異的プライマーで増幅したところ、nap cDNAの2,295bp
長の配列を再構築するのを可能にした(SEQ ID NO:3)。
【0109】 NAPタンパク質は、653アミノ酸長であり(分子質量:〜73kDa;SEQ I
D NO:4)、APPに極めて似ていた(61%の配列同一性、及び69%の類似
性)。最も重要なことに、NAPは、APPに一致するN末端の構築を有し(図
1A)、植物におけるAPP様タンパク質の構造への非常に厳格な選別圧力を示
唆する。nap遺伝子は、トウモロコシゲノム内で独特であり(図2A)、2.
4kbの転写体をコードしていた(図2C)。
【0110】 「PARPシグニチャー」内の非常に高度に保存された領域に基づく縮重プラ
イマーと、テンプレートとしてのトウモロコシからの第一鎖cDNAとを用いて
、310bpのフラグメントを増幅した。Y=C/T;R=A/G;N=A/G/
C/Tでの縮重プライマー 5′-CCGAATTCGGNTAYATGTTYGGNAA-3′(SEQ ID NO:13)、及び 5′-CCGAATTCACNATRTAYTCRTTRTA-3′(SEQ ID NO:14) でのPCRのために、第一鎖のcDNAを、テンプレートとして用い、トウモロ
コシの若葉からのポリ(A)+RNA5μg、及びMuMLV逆転写酵素を用いて
合成した。PCR増幅を、100μlの体積としたTaqDNAポリメラーゼで、下
記の条件を用いて実施した:95℃で1分、45℃で2分、72℃で3分、次い
で、95℃で1分、45℃で2分、72℃で3分の38周期、72℃で10分の
最終温置。
【0111】 310bpフラグメントの配列は、同じ領域にわたるヒトPARPとの55%の
配列同一性、及び64%の配列類似性を示したが、しかし、napcDNAの配
列とは異なっていた。3個のzapcDNAを、縮重プライマーとのPCRによ
って得られた、310bpフラグメントによるスクリーニング後に同定した。これ
ら3個の精製されたcDNAは、すべて、同じ3′非コーディング領域を有する
ため、同じ転写体に由来し;最長クローン(#9)を両鎖につして配列決定した
(SEQ ID NO:1)。このcDNAは、689アミノ酸のPARP相同ポリペプチ
ドをコードし(SEQ ID NO:2、分子質量:〜109kDa)、ZAP1と名付けた
(図1B)。ZAP1の第一のジンクフィンガーは、第三のシステイン残基を含
まないCKSCxxxHASVという配列を有するため、おそらく、非機能性であった。
【0112】 トウモロコシのLG2080系からのzap転写体の5′RACEPCR分析
(スクリーニングしたcDNAライブラリーは、同系繁殖系B734から作成し
た)を、下記のzap特異的プライマー: 5′-AAGTCGACGCGGCCGCCACACCTAGTGCCAGGTCAG-3′(SEQ ID NO:17)、及び 5′-ATCTCAATTGTACATTTCTCAGGA-3′(SEQ ID NO:18) を用いて、上記のとおり実施した。450bpのPCR産物が、zap特異的プラ
イマーによるPCR後に得られた。5′末端での長さの僅かな違いのため独立で
ある、zap特異的プライマーで生成した8個の5′RACEPCRフラグメン
トを配列決定した。LG2080のトウモロコシ植物体からのすべての転写体に
、コーディング領域に追加の配列の挿入が存在し、それがZAPタンパク質を1
1アミノ酸だけ長くしていた(980アミノ酸、分子質量:〜110.4kDa)
。ZAP2のジンクフィンガーIは、標準的であり、CKSCxxxHARCと解読した(
図1B;SEQ ID NO:11)。配列の差は、トウモロコシの変種間の差、二つの相
同遺伝子の発現、又は交番的スプライシングによると思われる。事実、トウモロ
コシは、少なくとも二つのzap遺伝子を有する可能性があり(図2B)、それ
らは、3.4〜3.5kbの転写体をコードしている(図2D)。zapcDNA
から調製したプローブによるDNAゲルブロットの実験は、アラビドプシス属に
相同遺伝子が存在することを示した。
【0113】 構造上は、ZAPは、動物からのPARPに非常に類似した。二つのジンクフ
ィンガーで構築される、充分に保存されたDNA結合ドメインを保有した(マウ
スPARPのDNA結合ドメインとの36%の同一性及び45%の類似性)。下
記のジンクフィンガーの配列のみを比較することによって、はるかに高い相同性
が示された:マウスの酵素中のAla1−Phe162(44%の同一性、及び54%の類
似性)、並びにマウスPARP中の核局在化シグナル(NLS)から下流のドメ
インのLeu237〜Ser360(40%の同一性、及び50%の類似性)。哺乳動物PA
RPに特徴的な二極性核局在化シグナルが、ZAP中に同定できなかったのに対
し、配列KRKKは、一極性NLSに適合した(図1B)。推定される自己修飾
ドメインは、ZAPには僅かにのみ保存され、マウスPARPにおけるより短か
った。ZAP、NAP、APP及びマウスPARP間の触媒ドメインの相同性の
編成を、図2に示す。注目すべきことに、ZAPのNAD+結合ドメインは、A
PP及びNAPのそれ(それぞれ、40%及び42%の配列同一性)より、哺乳
動物の酵素(48%の同一性)に類似したのに対し、APP及びNAPは、それ
らの触媒ドメインで68%及び76%類似した。
【0114】 実施例2.非慣用的PARPタンパク質は、DNA依存性ポリ(ADP−リボー
ス)ポリメラーゼ活性を有する APPは、DNA依存性ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼである。 NAPクラスのPARP様タンパク質の活性を理解するために、(酵母で発現
された)APPタンパク質の、より詳細な研究を実施した。アラビドプシス属A
PPタンパク質の発現及び酵素分析のための生物としての、酵母の選択は、数多
くの理由からなされた。真核生物として、サッカロミセス・セレビシエは、他の
真核生物の未変性タンパク質の発現に、より充分に適し、他のほとんどの真核細
胞とは異なって、内因性PARP活性を保有しない〔Lindahl et al., 1995〕。
【0115】 完全長appcDNAを、下記のようにして、ガラクトース誘導性酵母プロモ
ーターの制御下で、pYeDP1/8−2に入れた。完全長appcDNAは、
XhoI−EcoRIフラグメントとして、pC3〔Lepiniec et al., 1995〕
から切り出した。末端を、DNAポリメラーゼIのクレノウフラグメントで充填
し、このフラグメントを、酵母発現ベクターpYeDP1/8−2〔Cullin & P
ompon, 1988〕のSmaI部位にサブクローニングした。得られた発現ベクターpV
8SPA(図4)を、サッカロミセス・セレビシエDY株中に形質転換した。
【0116】 大腸菌でのAPP発現のために、appcDNAの完全なコーディング領域を
、プライマーの 5′-AGGATCCCATGGCGAACAAGCTCAAAGTGAC-3′(SEQ ID NO:19)、及び 5′-AGGATCCTTAGTGCTTGTAGTTGAAT-3′(SEQ ID NO:20) を用いて、PfuDNAポリメラーゼ(Stratagene)でPCR増幅し、BamHIフ
ラグメントとしてpET19b(Novagene, Madison, WI)にサブクローニング
して、pETSPAを得た。pETSPAからの大腸菌BL21での完全長AP
Pの発現は、非常に僅かであった。より充分な発現を得るために、pETSPA
をNcoI及びNdeI、又はSmaIで消化し、末端を、DNAポリメラーゼ
Iのクレノウフラグメントで充填し、次いで、プラスミドを自己結合させた。得
られたプラスミドのpETΔNdeSPA及びpETΔSmaSPAのうち、p
ETΔNdeSPAのみが、大腸菌BL21における断端APPポリペプチド(
Met310〜His637)の充分な発現を与えたにすぎなかった。
【0117】 酵母におけるAPPの発現を、ノーザン及びウエスタンブロット分析によって
確認した(図4)。pV8SPA中のプロモーターは、細胞をグルコース上で増
殖させ、ガラクトース含有培地で抑制したときに、不活性であるため、その発現
は、炭素源によって厳しく調節されると予測された。しかし、空ベクターを含有
する対照DY株と比較しての、RNAのノーザンブロット分析、及びDY(pV
8SPA)中のタンパク質の免疫ブロット分析は、appのmRNA及びAPP
のタンパク質は、グルコース含有培地で増殖させたときでさえ、酵母中に発現さ
れることを示した(図4B、列2)。グルコース含有培地で観察された発現の特
色は、appmRNA及びAPPタンパク質は、双方とも、ガラクトースによる
誘導後に検出されたそれより短かいことであった(図4Bの列2及び4を比較さ
れたい)。より高分子量のAPPポリペプチド(見かけ上は完全長タンパク質)
は、ガラクトース含有培地でのみ検出されたにすぎないが、そのような細胞は、
断端mRNA及びタンパク質も発現した。この所見についての最もあり得る説明
は、DY(pV8SPA)株をグルコースで増殖させたとき、発現カセットから
の漏出的発現が存在して、転写開始点から200〜300bp下流で始まる転写が
、ガラクトース誘導後に観察されたということである。この比較的短いmRNA
は、おそらく、APPの第1メチオニン(Met1)に対するコードを保有せず、そ
のため、翻訳は、Met72で開始される。これは、グルコース又はガラクトースで
増殖させた株からの、APPポリペプチドの分子質量の−5kDaという、観察さ
れた差(算出された差は、7.5kDaである)を説明すると思われる。分子質量
の差が、ポリ(ADP−リボシル)化による自己修飾に帰され得るという可能性
は、PARP阻害剤、例えば3ABA及びニコチンアミドの存在下での株の増殖
によって、排除される(図4B;列6及び8を列4と比較されたい)。
【0118】 ポリ(ADP−リボース)の合成を検出するために、全タンパク質を、異なる
条件下で増殖させた酵母菌株から抽出し、放射性標識化NAD+の存在下で温置
した。in vivoでのポリ(ADP−リボース)の合成、及びAPPのあり得る自
己修飾を防ぐため、3ABA、すなわちPARPの可逆的阻害剤の存在下でも菌
株を増殖させ、その後、阻害剤は、脱塩の際にタンパク質抽出物から除去した。
図5は、ポリ(ADP−リボース)が、ガラクトースで増殖させたDY(pV8
SPA)のタンパク質抽出物によって合成されるが(図5A、列1及び2)、空
ベクターを有する株によっては合成されないことを示す(図5A、列4)。アラ
ビドプシス属のAPPは、長さが40残基までの重合体を合成することができて
(図5A、列1)、放射能の大部分は、10〜15量体に取り込まれたことも認
めることができる。この所見は、他の著者が検出した重合体の大きさに一致する
〔Chen et al., 1994〕。酵母菌株を3ABAとともに増殖させたときの方が、
それなしのときより多くの放射能が重合体に取り込まれたが(図5A、列2と比
較した列1);その理由は、阻害された培養体から抽出されたAPPが、より少
なく自己修飾されたか(自己修飾は、PARPの活性を阻害すると考えられる)
、又は標識されたNAD+が、阻害されない培養体からの酵素によって、既存重
合体の延長に用いられた結果、全体として、より低い比活性を生じたかのいずれ
かである可能性がある。同じ反応条件下で、ヒトPARPによって、反応緩衝液
のみでか、又はDY(pYeDP1/8−2)からの酵母の全タンパク質抽出物
の存在下で合成されたポリ(ADP−リボース)は(図5A、それぞれ列5及び
6)、おそらくは400量体までの、はるかに長い鎖を示した〔de Murcia & Me
nissier de Murcia, 1994〕。
【0119】 ニックDNAによる酵素活性の刺激は、動物からのPARPの周知の特性であ
る〔Alvarez-Gonzalez & Althaus, 1989〕。そのため、本発明者らは、APPタ
ンパク質の活性が、DNA依存性であるか否かを試験した。ガラクトース増殖D
Y(pV8SPA)のタンパク質抽出物から、酵母核酸(DNA、RNA)及び
多少の塩基性タンパク質を除去した後、ポリ(ADP−リボース)の合成を、上
昇する濃度の音波処理したサケ精子DNAの存在下で分析した。図5Bに認め得
るとおり、反応物中に存在するDNAの量と、32P−NAD+の取込みとの間に
は、直接的相関が存在した。リン光画像の走査は、40μg/mlのDNAを含有す
る反応混合物中の方が、2μg/mlのDNAのそれより〜6倍もの多くの放射能が
、ポリ(ADP−リボース)に取り込まれることを示した(図5B、それぞれ列
4および2)。重合体の合成は、反応混合物中の3ABAに感受性であった(図
5B、列5)。
【0120】 APPは核タンパク質である 動物細胞では、PARP活性は、核内に局在する〔Schreiber et al., 1992〕
。APPの細胞内局在は、それが核であるならば、APPが真正の植物PARP
であることの、重要な追加的指標を与えることができると思われる。このため、
酵母細胞内のAPPポリペプチドの局在を、抗APP抗血清を用いて分析した。
ガラクトースで増殖させた酵母細胞内のAPPポリペプチドは、主として、核内
に見出された。この局在は、PARP阻害剤の培地中の存在に影響されなかった
【0121】 加えて、本発明者らは、APPが、ヒトPARPについて報告されたように〔
Collinge & Althaus, 1994〕、酵母細胞内で構築的に活性であるか否かを試験し
た。ここでは、固定した酵母スフェロプラストを、ポリ(ADP−リボース)重
合体を特異的に認識する、モノクローナル抗体10H抗体〔Kawamitsu et al.,
1984〕とともに温置した。10H抗体による、陽性の黄色がかった緑色の蛍光シ
グナルは、核内に局在し、ガラクトースで増殖させたDY(pV8SPA)細胞
でのみ観察された。陽性染色は、PARP阻害剤の3ABA及びニコチンアミド
の存在下で増殖させた細胞では、大幅に減少した。
【0122】 植物細胞におけるAPPの細胞内局在を同定するため、植物の研究で広汎に採
用される取組み方、すなわち、タンパク質融合が、トランスジェニック植物又は
トランスフェクション細胞内で生じたの値の、問題のタンパク質とレポーター遺
伝子との間に形成される融合タンパク質の細胞下位置の検証〔Citovsky et al.,
1994;Sakamoto & Nagatani, 1996;Terzaghi et al., 1997;von Arnim & Den
g, 1994〕を用いた。GUSと、APPポリペプチドのMet1〜Pro407に広がる部
分との、N末端翻訳性融合を実施した。APPと、細菌GUSとの翻訳性融合は
、下記のとおり構築した。プラスミドpETSPAをSmaIで切断し、アルカ
リ性ホスファターゼで処理し、pGUS1からの平滑末端NcoI−XbaIフ
ラグメントに結合した(Plant Genetic Systems N.V., Gent、ベルギー国)。結
合ミックスを、EcoRIXL−1中に形質転換し、細胞を、0.1mMイソプロ
ピル−β−D−チオガラクトピラノシド、40μg/ml5−ブロモ−4−クロロ−
3−インドール−β−D−グルクロニド、及び100μg/mlアンピシリンで強化
した、LB培地上に平板播種した。このようにして、pETSPAGUSを、青
色のコロニーとして選別した。大腸菌における〜110kDa融合タンパク質の発
現は、in situGUS活性ゲル〔Lee et al., 1995〕によって確認した。APP
−GUS融合体を、CaMVの35Sプロモーターの制御下に置き(pETSP
AGUSからのクレノウ平滑末端化BamHIフラグメントを、SmaI消化し
たpJD330にサブクローニングした)〔Gallie & Walbot, 1992〕、得られ
た発現カセットを、XbaIフラグメントとして、pCGN1547というバイナリ
ーベクター〔McBride & Summerfelt, 1990〕のXbaI部位にサブクローニングして
、pGCNSPAGUSを得た。最後に、pGCNSPAGUSを、凍結解凍形
質転換の手順によって、アグロバクターC58C1RifR(pGV2260)に導入し
た。
【0123】 融合タンパク質の発現は、大腸菌で確認した。35SCaMVプロモーターの
制御下のキメラcDNAを、タバコゲノムに安定的に組み込んだ。独立した4種
類のトランスジェニックタバコの植物体からの子孫を、in situでの組織化学的
染色後に、GUS活性の細胞下分布について解析した〔Jefferson et al., 1987
〕。2日齢の若芽では、GUS活性は、子葉及び根で検出できたが、胚軸及び根
端では検出できなかった。根組織が透明なため、GUS染色は、根毛及び表皮細
胞の核内に明瞭に局限された。加えて、多少の拡散、すなわち他の根細胞の非局
在性染色が、特に維管束環沿いに見られた。この非核内GUS染色は、葉の組織
では、更に傑出していた。若い真の葉又は子葉は、核の強い青色の染色を示すの
に対し、細胞質の多少の拡散染色も存在した。しかし、充分に展開した葉では、
GUS染色は、均質になり、CaMV35Sプロモーターの制御下でGUSで形
質転換した対照植物に類似したが、後者では、GUSは、細胞質で発現された。
結果的に、より高齢の葉又は子葉は、GUS染色が特定のいかなる細胞区画にも
局限されない維管束を除いて、組織化学的に検出できるGUS活性を、実際上全
く示さなかった。
【0124】 DNAリガーゼIの欠乏は、app遺伝子の発現を誘導する 動物細胞内のPARPは、最も豊富な核タンパク質の一つであり、その活性は
、損傷したDNAに結合した際のタンパク質でのアロステリックな変化によって
調節される。本発明者らは、アラビドプシス属におけるapp遺伝子が、非常に
低レベルの発現を有していて、この遺伝子の転写活性は、in vivoでのAPP機
能に不可欠であり得るのを示唆することを見出した。この仮説を検定するため、
DNAリガーゼIの欠乏によって生じるin vivoゲノム不安定化の際に、app
遺伝子の発現を調べた。アラビドプシス属DNAリガーゼI遺伝子における、T
−DNA挿入突然変異、すなわちSK1B2系を、あらかじめ単離した〔Babiyc
huk et al., 1997〕。この突然変異は、同型接合状態では致死的であるが、突然
変異した対立遺伝子は、配偶子からの正常な伝達を示す。そのため、本発明者ら
は、突然変異に関して同型接合である細胞は、突然変異した花粉による突然変異
胚嚢の受精直後に、細胞周期のS期の間の不完全なDNA合成のために死ぬもの
と予測した。
【0125】 GUSのコーディング領域を、APPの初めの5アミノ酸、及びapp5′フ
ランキング配列の2kbと枠内融合させた、appプロモーター−GUS翻訳融合
を構築した(SEQ ID NO:21)。この融合タンパク質をコードする遺伝子を、ア
ラビドプシス属へと形質転換した。野生型との2回の戻し交雑の後、appプロ
モーター−GUSで形質転換した異型接合植物を、アラビドプシス属のSK1B
2系と交雑した。対照植物、及びリガーゼ突然変異について異型接合である植物
の花序を、GUSの活性について染色した。加齢の組織でほとんどは検出される
、GUS染色のパターンは、おそらくapp遺伝子の発現を反映するが、本発明
者らは、調節配列のすべてが、用いた構築体に存在することの確かな証拠は得て
いない。このパターンは、突然変異リガーゼ遺伝子を保有しない対照植物と、突
然変異について異型接合である植物との花序でも、ともに同じであった。融合タ
ンパク質を有する突然変異植物の胚珠の約4分の1は、GUS陽性であった。よ
り精密な顕微鏡検査は、GUS陽性の胚珠では、配偶体のみが染色されたにすぎ
ない。対照植物と、突然変異植物との間の唯一の差は、DNAリガーゼ遺伝子に
おける突然変異であった。そのため、本発明者らは、app遺伝子は、DNA切
断の蓄積か、又は突然変異した花粉で受精した突然変異胚嚢の死のいずれかのた
めに、誘導されると結論した。胚嚢のGUS染色は、受粉後24時間以内にか、
又はそのため受精後の非常に早期に出現することが見出された。
【0126】 実施例3.PCD調節キメラ遺伝子の構築、及びアグロバクター菌株へのそのよ
うなPCD調節遺伝子を含むT−DNAベクターの導入 3.1.p35S:(dsRNA-APP)及びp35S:(dsRNA-ZAP)遺伝子の構築 標準的組換えDNAの手順を用いて、図6(構築体1及び5)に模式的に描い
たとおり、下記のDNA領域を動作可能に結合した:
【0127】 p35S:(dsRNA-ZAP)キメラ遺伝子に対して ・CaMV35Sプロモーター領域〔Odell et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・ZAPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(ハイブリダイゼーションによっ
て単離された、SEQ ID NO:10に対するシロイヌナズナ相同体) ・逆配向のZAP2コーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0128】 p35S:(dsRNA-APP)キメラ遺伝子に対して ・CaMV35Sプロモーター領域〔Odell et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・APPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(SEQ ID NO:5) ・逆配向のAPPコーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0129】 3.2.pNOS:(dsRNA-APP)及びpNOS:(dsRNA-ZAP)遺伝子の構築 標準的組換えDNAの手順を用いて、図6(構築体2及び6)に模式的に描い
たとおり、下記のDNA領域を動作可能に結合した:
【0130】 pNOS:(dsRNA-ZAP)キメラ遺伝子に対して ・NOSプロモーター領域〔Herrera-Estrella et al., 1983〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・ZAPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(ハイブリダイゼーションによっ
て単離された、SEQ ID NO:10に対するシロイヌナズナ相同体) ・逆配向のZAP2コーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0131】 pNOS:(dsRNA-APP)キメラ遺伝子に対して ・NOSプロモーター領域〔Herrera-Estrella et al., 1983〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・APPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(SEQ ID NO:5) ・逆配向のAPPコーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0132】 3.3.pTA29:(dsRNA-APP)及びpTA29:(dsRNA-ZAP)遺伝子の構築 標準的組換えDNAの手順を用いて、図6(構築体3及び7)に模式的に描い
たとおり、下記のDNA領域を動作可能に結合した:
【0133】 pTA29:(dsRNA-ZAP)キメラ遺伝子に対して ・TA29プロモーター領域(国際公開特許第89/10396号公報) ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・ZAPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(ハイブリダイゼーションによっ
て単離された、SEQ ID NO:10に対するシロイヌナズナ相同体) ・逆配向のZAP2コーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0134】 pTA29:(dsRNA-APP)キメラ遺伝子に対して ・TA29プロモーター領域(国際公開特許第89/10396号公報) ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・APPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(SEQ ID NO:5) ・逆配向のAPPコーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0135】 3.4.pNTP303:(dsRNA-APP)及びpNTP303:(dsRNA-ZAP)遺伝子の
構築 標準的組換えDNAの手順を用いて、図6(構築体4及び8)に模式的に描い
たとおり、下記のDNA領域を動作可能に結合した:
【0136】 pNTP303:(dsRNA-ZAP)キメラ遺伝子に対して ・NPT303プロモーター領域〔Wetering, 1994〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・ZAPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(ハイブリダイゼーションによっ
て単離された、SEQ ID NO:10に対するシロイヌナズナ相同体) ・逆配向のZAP2コーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0137】 pNTP303:(dsRNA-APP)キメラ遺伝子に対して ・NPT303プロモーター領域〔Wetering, 1994〕 ・Cab22リーダー領域〔Harpster et al., 1988〕 ・APPコーディングDNA領域(ほぼ完全)(SEQ ID NO:5) ・逆配向のAPPコーディングDNA領域の5′末端の約500bp ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0138】 3.5.キメラ性マーカー遺伝子の構築 標準的組換えDNAの手順を用いて、図6に模式的に描いたとおり、下記のD
NA領域を動作可能に結合した:
【0139】 gatマーカー遺伝子に対して ・Act2プロモーター領域〔An et al., 1996〕 ・アミノグリコシド6′−アセチルトランスフェラーゼコーディングDNA(国
際公開特許第94/26913号公報) ・ノパリンシンターゼ遺伝子の3′末端〔Depicker et al., 1982〕
【0140】 barマーカー遺伝子に対して ・Act2プロモーター領域〔An et al., 1996〕 ・ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼコーディングDNA(米国特
許第5,646,024号明細書) ・ノパリンシンターゼ遺伝子の3′末端〔Depicker et al., 1982〕
【0141】 3.6.PCD調節キメラ遺伝子を含むT−DNAベクターの構築 適切な制限酵素を用いて、3.1〜3.5の下に記載したキメラ性PCD調節
遺伝子を切り出し、gatマーカー遺伝子又はbarマーカー遺伝子のいずれか
とともに、pGSV5に由来するT−DNAベクター(国際公開特許第97/1
3865号公報)のT−DNA境界間のポリリンカーに導入した。得られたT−
DNAベクターを、図6に模式的に示す。
【0142】 3.7.アグロバクテリウム属へのT−DNAの導入 Walkerpeach及びVelten(1995)が記載したとおりの電気穿孔法によって、T
−DNAベクターをアグロバクターC58C1Rif株(pGV4000)に導入し、
スペクチノマイシン及びストレプトマイシンを用いて、形質転換体を選別した。
【0143】 実施例4.実施例3のT−DNAベクターによるシロイヌナズナのアグロバクタ
ー介在形質転換 アグロバクター菌株を用いて、シロイヌナズナ変種C24を、Valvekensら(1
992)が記載したとおりの根の形質転換法を適用して形質転換した。外植片を、
それぞれ、dsRNA−APP及びdsRNA−ZAP構築体を含むアグロバク
ター菌株に同時感染させた。dsRNA−APP構築体は、pact:bar遺
伝子と併用した。dsRNA−ZAP構築体は、pact:gat遺伝子と併用
した。形質転換体を、ホスフィノトリシン耐性について選別した。再生した根付
いたトランスジェニック系統を、カナマイシン耐性についてのスクリーニングに
よって、他のT−DNAの存在について試験した。両T−DNAを含むトランス
ジェニック系統を、温室に移した。T0トランスジェニック系統の表現型を記録
し、T1世代は、更に、より詳しく調べた。
【0144】 実施例5.実施例3のT−DNAベクターによるセイヨウアブラナBrassica nap
usのアグロバクター介在形質転換 アグロバクター菌株を用いて、セイヨウアブラナ変種N90−740を、下記
の変更を除いて基本的にはDe Blockら(1989)が記載したとおりの、胚軸形質転
換法を適用して形質転換した。
【0145】 −胚軸外植片を、A2培地〔MS、0.5g/lのMes(pH5.7)、1.2
%グルコース、0.5%アガロース、1mg/lの2,4−D、0.25mg/lのナフ
タレン酢酸(NAA)、及び1mg/lの6−ベンジルアミノプリン(BAP)〕で
1日間前培養した。
【0146】 −感染培地A3は、MS、0.5g/lのMes(pH5.7)、1.2%グルコ
ース、0.1mg/lのNAA、0.75mg/lのBAP、及び0.01mg/lのジベレ
リン酸(GA3)であった。
【0147】 −選別培地A5Gは、MS、0.5g/lのMes(pH5.7)、1.2%グル
コース、40mg/lのアデニン−SO4、0.5g/lのポリビニルピロリドン(P
VP)、0.5%アガロース、0.1mg/lのNAA、0.75mg/lのBAP、0
.01mg/lのGA3、250mg/lのカルベニシリン、250mg/lのトリアシリン
、5mg/lのAgNO3に3週間であった。この期間後、選別をA5J培地で継続
した(3%ショ糖以外はA5Gと同様)。
【0148】 −再生培地A6は、MS、0.5g/lのMes(pH5.7)、2%ショ糖、4
0mg/lのアデニン.SO4、0.5g/lのPVP、0.5%アガロース、0.0
025mg/lのBAP、及び250mg/lのトリアシリンであった。
【0149】 −健康な苗条を、根付け培地に移したが、これは、1リットル入り容器中のA
9:半濃度のMS、1.5%ショ糖(pH5.8)、100mg/lのトリアシリン、
0.6%寒天であった。MSは、ムラシゲ−スコーグ培地〔Murashige & Skoog,
1962〕を意味する。
【0150】 dsRNA−APP及びdsRNA−ZAPの両T−DNA構築体を同じ植物
細胞に導入するには、基本的にはDe Block及びDebrouwer(1991)が記載したと
おりの、共形質転換法を適用した。形質転換した植物系統を、ホスフィノトリシ
ン含有培地で選別し、その後、再生した根付いた苗条を、カナマイシン耐性につ
いて試験することによって、第二のT−DNAの存在をスクリーニングした。共
形質転換の実験では、dsRNA−APP構築体は、pact:bar遺伝子と
併用した。dsRNA−ZAP構築体は、pact:gat遺伝子と併用した。
両T−DNAを含むトランスジェニック系統を、温室に移した。T0トランスジ
ェニック系統の表現型を記録し、T1世代は、更に、より詳しく調べた。
【0151】 実施例6.植物系統の活力を試験するためのin vitroアッセイ 6.1.セイヨウアブラナについての適応度アッセイ 培地及び反応緩衝液 播種培地: 半濃度のムラシゲ−スコーグ塩類 2%ショ糖 pH5.8 0.6%寒天 カルス誘導培地:A2S MS培地、0.5g/lのMes(pH5.8)、3%ショ糖、40mg/lのアデニ
ン−SO4、1mg/lの2,4−D、0.25mg/lのNAA、1mg/lのBAP 温置培地: 25mMリン酸カリウム緩衝液、pH5.8 2%ショ糖 培地25mlに対して1滴のトゥイーン20 反応緩衝液: 50mMリン酸カリウム緩衝液、pH7.4 10mM2,3,5−トリフェニルテトラゾリウムクロリド(TTC)(=3.
35mg/ml) 緩衝液25mlに対して1滴のトゥイーン20
【0152】 種子の滅菌、及び苗条の栽培 種子を、70%エタノールに2分間浸漬し、次いで、0.1%のトゥイーン2
0を含有する次亜塩素酸ナトリウム溶液(約6%の活性塩素を有する)中で15
分間表面滅菌した。最後に、種子を、滅菌蒸留水1lで洗浄した。播種培地約7
5mlを内容する1リットル入り容器(Weck)あたり7個の種子を入れた。種子を
、23℃、及び16時間の光周期での30μEinstein/秒・m2で発芽させた。 実験間の標準化のために、N90−740系統を常に含めた。
【0153】 胚軸外植片の前培養 −播種の12〜14日後に、胚軸を約7mmの分節に切断した。Optiluxペトリ
皿(FalconS1005)1枚あたり胚軸25個。 −胚軸外植片を、A2S培地にて、23〜25℃で4日間培養した(30μEi
nstein/秒・m2)。なお、アッセイを実施するには、1系統あたり約150〜3
00個の胚軸外植片が必要であった。 −胚軸外植片を、温置培地30mlを内容するOptiluxペトリ皿(FalconS10
05)に移した。 −暗所にて24℃で約20時間温置した。
【0154】 TTC−アッセイ −150個の胚軸外植片を、50ml入りFalcon管に移した。 −反応緩衝液(TTCなし)で洗浄。 −管1本あたり25〜30mlの反応緩衝液を加えた。 管1:TTC加えず。 *バックグラウンド吸収測定のため。 *1実験あたり1系統で充分。 管2:10mMTTCを添加(外植片を水没させなければならないが、減圧浸
透はさせない)。 −管を上下反転させる。 −暗所にて、26℃で約1時間温置(終結反応なし)。 −胚軸を脱イオン水で洗浄。 −水を除去。 −−70℃で30分間凍結。 −室温で解凍(暗所にて)。 −エタノール(技術用)50mlを添加。 −還元したTTC−Hを1時間の振盪によって抽出。 −抽出物の吸光を485nmで測定。なお、還元TTC−Hは、安定的でないた
め、暗中に保ち、できるだけ速やかにO.D.485を測定する。 O.D.485(TTC-H)=(O.D.485+TTC)−(O.D.485−TTC) −異なる無関係の実験のサンプル間のTTC還元容量の比較は、異なる実験で
のN90−740のTTC還元能力を100%に設定することによって、実施す
ることができる。 −高いTTC還元能力の系統は、活力に富むが、低いTTC還元能力の系統は
、弱かった。
【0155】 6.2.アラビドプシス属についての適応度アッセイ 培地及び反応緩衝液 植物培地: 半濃度のムラシゲ−スコーグ塩類 1.5%ショ糖 pH5.8 0.6%寒天 オートクレーブで15分 フィルター滅菌した100mg/lのmyo−イノシトールを添加 −0.5mg/lのピリドキシン −0.5mg/lのニコチン酸 −1mg/lのチアミン 温置培地: 10mMリン酸カリウム緩衝液、pH5.8 2%ショ糖 培地25mlに対して1滴のトゥイーン20 反応緩衝液: 50mMリン酸カリウム緩衝液、pH7.4 10mM2,3,5−トリフェニルテトラゾリウムクロリド(TTC)(=3.
35mg/ml) 緩衝液25mlに対して1滴のトゥイーン20
【0156】 アラビドプシス属の植物体 −アラビドプシス属の種子の滅菌 70%エタノールに2分間。 漂白剤(6%活性塩素)+溶液20mlに対して1滴のトゥイーン20に10分
間。 滅菌水で5回洗浄。なお、滅菌は、2ml入りエッペンドルフ管中で実施。アラ
ビドプシス属種子は、管底に沈んで、1ml入りピペットによる液体の除去を可能
にする。 −アラビドプシス属の植物体の栽培 種子を、±100mlの植物培地を内容する「Falcon格子間組織培養盤」(第3
025番)に播種:1種子/格子。 植物体を23℃で栽培、40μEinstein/秒・m2、明16時間−暗8時間で約
3週間(植物体は、花芽の形成を開始)。 追記: *アッセイを実施するには、1系統あたり約90〜110の植物体が必要。 *較正のための対照系統(C24;Columbia等々)を含む。
【0157】 前温置 −(鋏を用いて)根を切断することによって、アラビドプシス属の若芽を採集。 各若芽を、直ちに、温置培地に入れた(若芽は、水没させなければならないが
、減圧浸透はさせない)。 温置培地:「Falcon格子間組織培養盤」(第3025番)中に±150ml。 (a)温置培地:バックグラウンド吸収の定量のため(TTCアッセイを参照
されたい)。 (b)温置培地 (c)温置培地+2mMナイアシンアミド 1ペトリ皿あたり30〜35の若芽(しかし、すべての系統及び各条件につい
て同量の若芽)。 −暗中24℃で±20時間温置した。
【0158】 TTCアッセイ −若芽を50ml入りFalcon管に移した。 −反応緩衝液(TTCなし)で洗浄。 −管1本あたり30〜35mlの反応緩衝液を加えた。 (a)TTC加えず(バックグラウンド吸収測定のため)。 (b)及び(c)+10mMTTC。 (若芽を水没させなければならないが、減圧浸透はさせない)。 −暗所にて、26℃で約1時間温置(終結反応なし)。 −胚軸を脱イオン水で洗浄。 −水を除去。 −−70℃で30分間凍結。 −室温で解凍(暗所にて)。 −エタノール(技術用)50mlを添加。 −還元したTTC−Hを1時間の振盪によって抽出。 −抽出物の吸光を485nmで測定。なお、還元TTC−Hは、安定的でないた
め、暗中に保ち、できるだけ速やかにO.D.485を測定する。 −試験系統対対象系統の還元性質の比較(30〜35植物体の集団について) O.D.485(TTC-H)=(O.D.485+TTC)−(O.D.485−TTC) −異なる無関係の実験のサンプル間のTTC還元容量の比較は、異なる実験で
の対照系統(C24;Columbia等々)のTTC還元容量を100%に設定するこ
とによって、実施することができる。 −高いTTC還元能力の系統は、活力に富むが、低いTTC還元容量の系統は
、弱かった。 −温置培地へのナイアシンアミドの添加が、より高いTTC還元容量を招くな
らば、それは、(C24及びColumbiaについて示されたとおり)より低い適応度
の指標となる。
【0159】 実施例7.dsRNA−APP及びdsRNA−ZAP構築体をともに含むトラ
ンスジェニック系統の表現型解析 タペータム組織又は花粉特異的プロモーターの制御下でdsRNA−APP及
びdsRNA−ZAPを含む、T0系統の花の表現型、及び花粉の生存度(Alex
ander染色〔Alexander, 1969〕及び発芽アッセイ)を記録した。アラビドプシス
属については、T1世代は、自家受粉によるか、又は植物が雄性不稔ならば、非
形質転換野生型植物の花粉を用いた戻し交雑によって得た。セイヨウアブラナに
ついては、T1世代は、常に、非形質転換植物の花粉を用いた戻し交雑によって
得た。
【0160】 T1種子を、カナマイシン含有培地で発芽させ、その後、耐性植物を、ホスフ
ィノトリシン耐性についてのアンモニウムマルチウェルアッセイ〔De Block et
al., 1995〕によって記録した。両T−DNAを有する植物の半分を、温室に移
して、植物の雄性不稔を記録したが、他の半分は、適応度アッセイによって、植
物の活力を定量するのに用いた。
【0161】 35S又はNOSプロモーターの制御下で、PCD調節遺伝子の組合せ(AP
P/ZAP)を含む植物については、多数のトランスジェニック系統で、高い活
力が観察された。
【0162】 TA29の制御下で、PCD調節遺伝子の組合せ(APP/ZAP)を含む植
物については、多数のトランスジェニック系統で、雄性不稔が観察された。NT
P303の制御下で、PCD調節遺伝子の組合せ(APP/ZAP)を含む植物
については、多数のトランスジェニック系統で、花粉不稔が観察された。
【0163】 実施例8.PCD調節キメラ遺伝子を含む植物の表現型解析 p35S:(dsRNA−ZAP)キメラ遺伝子のもう一つの例を、標準的組
換えDNAの手順を用いて、下記のDNA領域を動作可能に結合することによっ
て構築した: ・CaMV35S2プロモーター領域〔Odell et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域コーディングDNA〔Harpster et al., 1988〕 ・SEQ ID NO:10の第279位〜第1,728位ヌクレオチドのヌクレオチド配
列を有する、HincII部位からSnaBI部位までの、トウモロコシのZAP2コーデ
ィングDNA領域 ・逆配向のHincII部位からEcoRV部位までのZAP2コーディング領域の5′末
端(SEQ ID NO:10の第279位〜第792位のヌクレオチドのヌクレオチド配
列の相補体を有する) ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0164】 このキメラ遺伝子を、barマーカー遺伝子とともに、pGSV5(国際公開
特許第97/13865号公報に記載された)に由来するT−DNAベクターの
T−DNA境界間のポリリンカーに導入し、T−DNAベクターpTYG33を
得て、これを、記載のとおりの電気穿孔によって、アグロバクテリウム属のC5
8C1Rif(pGV4000)に導入した。
【0165】 pNOS::(dsRNA-ZAP)キメラ遺伝子のもう一つの例を、標準的組換えDN
Aの手順を用いて、下記のDNA領域を動作可能に結合することによって構築し
た: ・ノパリンシンターゼプロモーター領域〔Herrera-Estrella et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域コーディングDNA〔Harpster et al., 1988〕 ・SEQ ID NO:10の第279位〜第1,728位ヌクレオチドのヌクレオチド配
列を有する、HincII部位からSnaBI部位までの、トウモロコシのZAP2コーデ
ィングDNA領域 ・逆配向のHincII部位からEcoRV部位までのZAP2コーディング領域の5′末
端(SEQ ID NO:10の第279位〜第792位のヌクレオチドのヌクレオチド配
列の相補体を有する) ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0166】 このキメラ遺伝子を、barマーカー遺伝子とともに、pGSV5(国際公開特
許第97/18365号公報に記載された)に由来するT−DNAベクターのT
−DNA境界間のポリリンカーに導入し、T−DNAベクターpTYG34を得
て、これを、記載のとおりの電気穿孔によって、アグロバクテリウム属のC58
C1Rif(pGV4000)に導入した。
【0167】 p35S::(dsRNA-APP)キメラ遺伝子のもう一つの例を、標準的組換えDN
Aの手順を用いて、下記のDNA領域を動作可能に結合することによって構築し
た: ・CaMV35S2プロモーター領域〔Odell et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域コーディングDNA〔Harpster et al., 1988〕 ・SEQ ID NO:5の第189位〜第1,349位ヌクレオチドのヌクレオチド配列
を有する、ScaI部位からSmaI部位までの、シロイヌナズナのAPPコーディング
DNA領域 ・逆配向のScaI部位からHaeIII部位までのZAP2コーディング領域の5′末端
(SEQ ID NO:5の第189位〜第784位のヌクレオチドのヌクレオチド配列の
相補体を有する) ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0168】 このキメラ遺伝子を、barマーカー遺伝子とともに、pGSV5(国際公開
特許第97/13865号公報に記載された)に由来するT−DNAベクターの
T−DNA境界間のポリリンカーに導入し、T−DNAベクターpTYG29を
得て、これを、記載のとおりの電気穿孔によって、アグロバクテリウム属のC5
8C1Rif(pGV4000)に導入した。
【0169】 pNOS::(dsRNA-APP)キメラ遺伝子のもう一つの例を、標準的組換えDN
Aの手順を用いて、下記のDNA領域を動作可能に結合することによって構築し
た: ・ノパリンシンターゼプロモーター領域〔Herrera-Estrella et al., 1985〕 ・Cab22リーダー領域コーディングDNA〔Harpster et al., 1988〕 ・SEQ ID NO:5の第189位〜第1,349位ヌクレオチドのヌクレオチド配列
を有する、ScaI部位からSmaI部位までの、シロイヌナズナのAPPコーディング
DNA領域 ・逆配向のScaI部位からHaeIII部位までのZAP2コーディング領域の5′末端
(SEQ ID NO:5の第189位〜第784位のヌクレオチドのヌクレオチド配列の
相補体を有する) ・CaMV35S3′末端領域〔Mogen et al., 1990〕
【0170】 このキメラ遺伝子を、barマーカー遺伝子とともに、pGSV5(国際公開
特許第97/13865号公報に記載された)に由来するT−DNAベクターの
T−DNA境界間のポリリンカーに導入し、T−DNAベクターpTYG30を
得て、これを、記載のとおりの電気穿孔によって、アグロバクテリウム属のC5
8C1Rif(pGV4000)に導入した。
【0171】 得られたアグロバクテリウム属の菌株を用いて、異なるPCD調節遺伝子を、
セイヨウアブラナ及びシロイヌナズナ(Columbia及びC24)の植物に、実施例
4及び5に記載されたとおりに導入した。
【0172】 T0世代の自家受粉によって得られたトランスジェニックシロイヌナズナの植
物(T1世代)を、ホスフィノトリシンを含有する培地で発芽させた。耐性トラ
ンスジェニック植物を、更に栽培した。
【0173】 pTYG33におけるようにpNOS::(dsRNA-ZAP)構築体を、又はpTY
G34におけるようにp35S:(dsRNA-ZAP)構築体を含む、トランスジェニック
T1植物(ともにColumbia又はC24に由来)の成長は、PCD調節キメラ遺伝
子なしのT−DNAベクターのT−DNAによって形質転換された、対照のトラ
ンスジェニック植物より有意に速かった(表1を参照されたい)。
【0174】 アラビドプシス属のT1トランスジェニック植物(Columbiaから派生)のスト
レス耐性を、10若しくは50mg/lのいずれかのサリチル酸溶液上の、又は対照
用に単にH2O上の小型の浮水植物によって評価した。ストレス感受性植物は、
温置1〜2日後に、漂白されたか、又は巻きあがった葉を発生したが、ストレス
耐性植物は、少なくとも5日間健全なままであった。やはり、pTYG33にお
けるようにpNOS::(dsRNA-ZAP)構築体を、又はpTYG34におけるよう
にp35S:(dsRNA-ZAP)構築体を含むトランスジェニック植物は、対照トランス
ジェニック植物より有意にストレス耐性であった(表1を参照されたい)。
【0175】 pTYG29、pTYG30、pTYG33又はpTYG34のdsRNA−
ZAP若しくはdsRNA−APP構築体によって形質転換した、セイヨウアブ
ラナから得られたPPT耐性トランスジェニックカルスを、50mg/lのアスピリ
ンを含有する培地で2日間温置した。2日後、カルスの重量を決定し、カルスを
、アスピリンなしの培地に移し、更に5日間温置した。5日の期間の終点で、カ
ルスの重量を決定し、重量の造花を、2日の期間の温置後の重量に対する百分率
として表した。対照として、PCD調節キメラ遺伝子なしのT−DNAによって形
質転換されたトランスジェニックカルスを、2日間の温置の際に全くアスピリン
を加えなかった以外は、同じ手順に処した。結果を表2に要約し、PCD調節キ
メラ遺伝子を含むセイヨウアブラナ細胞が、対照細胞よりストレス耐性であるこ
とを示す。
【0176】
【表1】
【0177】
【表2】
【0178】
【表3】
【0179】
【表4】
【0180】
【表5】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 植物ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼの推定されるN末端アミノ酸配列
を示す図である。 (A)シロイヌナズナAPP(A.th.APP;EMBL登録番号Z48243;SEQ ID NO:
6)及びトウモロコシ相同NAP(Z.m.NAP;EMBL登録番号AJ222588;SEQ I
D NO:4)に見出されるNAD+結合ドメインの上流の配列の整合を示す。示した
ドメイン区分は、以前に報告されたとおりである〔Lepiniec et al., 1995〕。
Bドメインに位置する核局在化シグナル(NLS)を、カッコによって示す。B
ドメインの配列は、双子葉植物と単子葉植物との間で非常に良く保存されてはい
ない。Cドメインは、おそらく、動物のPARPの自己修飾ドメインに、機能上
匹敵する。トウモロコシNAPには、不完全反復であるA1及びA2も存在する
。反復配列内の内部的に不完全な二重対称性を示すため、アミノ酸残基の特性を
、下記のとおり、配列の下に強調した:黒丸、疎水性残基;白丸、グリシン;(
+)、正に帯電した残基;(−)、負に帯電した残基;波線、何らかの残基。対
称軸は、垂直な矢じりによって示し、矢じりの線は、アミノ酸側鎖の特性の逆向
きの反復を有する領域を明示する。 (B)マウスPARPとトウモロコシZAPとのDNA結合ドメインと自動触媒
ドメインとの整合を示す。トウモロコシZAP1及びZAP2(5′RACEP
CRによって発見された部分cDNA)を含むジンクフィンガーを、それぞれ、
Z.m.ZAP(EMBL登録番号AJ222589;SEQ ID NO:2)及びZ.
m.ZAP(race)(第1位〜第98位アミノ酸のSEQ ID NO:11)として、また
マウスPARPをM.m.ADPRT(Swissprot登録番号P11103)として示す。マ
ウス酵素のジンクフィンガー及び二極性NLSをカッコによって、Caspase3切断
部位を星印によって、ZAPタンパク質中の推定されるNLSを、トウモロコシ
配列の下の太字のカッコによって示す。すべての配列で保存されているアミノ酸
残基を、四角で囲み;類似の物理化学的特性を有するアミノ酸残基を、基準とし
ての最上部の配列とともに影を付けた。
【図2】 マウスPARP及び植物PARPタンパク質のNAD+結合ドメインの比較を
示す図である。「PARPシグネチャー」の範囲を、配列の上に示す。名称、及
び配列の整合は、図1のとおりである。
【図3】 nap及びzap遺伝子についての遺伝子コピー数、及び転写体の大きさの見
積もりを示す図である。 (A)及び(B) 示された制限エンドヌクレアーゼで消化し、アガロースゲル
電気泳動によって分離し、ブロットし、NAD+結合ドメインをコードしない、
nap及びzapcDNAの5′ドメインから調製した、放射性標識化DNAプ
ローブとハイブリダイズさせた、変種LG2080のトウモロコシゲノムDNA
である。napプローブ(A)で得られたハイブリダイゼーションパターンは、
単純であり、トウモロコシゲノム中の単一のnap遺伝子を示す。ハイブリダイ
ゼーションパターン(B)から認識できるとおり、少なくとも二つのzap遺伝
子が存在する可能性がある。zap及びnap遺伝子がコードする転写体の大き
さを決定するため、6日齢の若芽の根(列1)及び苗条(列2)から抽出したポ
リ(A)+RNA約1μgを、グリオキサールによる変性後にアガロースゲル上で
分離し、ブロットし、nap(C)及びzap(D)の32P標識化cDNAとハ
イブリダイズさせた。λDNAの33P5′末端標識化BstEIIフラグメント
を、分子量マーカーとして、DNA及びRNA双方のゲルブロット実験で用い;
それらの位置を、各パネルの左にkbで示した。
【図4】 酵母におけるAPP発現の解析を示す図である。 (A)pV8SPA内の発現カセットの模式図である。app cDNAの発現
は、cycl遺伝子(CYC1)の最小TATAボックス含有プロモーター領域
と、ガラクトースによるプロモーター活性化を与えるgal10遺伝子(GAL
10)の上流活性化プロモーター領域とからなる、キメラ酵母プロモーターによ
って駆動される。下流の調節配列は、ホスホグリセロールキナーゼをコードする
遺伝子(3PGK)に由来する〔Kuge & Jones, 1994〕。appコーディング領
域は、早くから提唱されたとおり〔Lepiniec et al., 1995〕、推定ドメインに
おける区分を有して描かれ;A1及びA2は、不完全な27アミノ酸反復に相当
し、その間に、正に荷電したアミノ酸に富み、数多くのDNA結合タンパク質の
DNA結合ドメインに似た配列(Bドメイン)がある。Bドメインのアミノ酸配
列は、地図の下に示され、NLSとして機能し得る、アルギニン及びリシン残基
の範囲は、太字で描かれている。メチオニン残基(M1、M72)は、翻訳開始コ
ドンとして機能し得るが、地図の上に示される。Cドメインは、グルタミン酸残
基に富み、その配列ではなく組成が、動物のPARPの自己修飾ドメインに似て
いる。 (B)それぞれ「vector」及び「app」として示した、DY(pYeD
P1/8−2)及びDY(pV8SPA)株の免疫ブロット(ウエスタンブロッ
ト)及びノーザンブロット分析である。菌株を、グルコース(GUL)、ガラク
トース(GAL)、ガラクトース及び3mM3ABA(GAL+3ABA)を追加
したSDC培地で増殖させた。全RNA又は全タンパク質は、同じ培養体から抽
出した。全タンパク質10μgを、10%SDS−PAGE上での電気泳動によ
って分画し、電気泳動ブロットに付し、抗APP抗血清でプローブした。全RN
A5μgを、1.5%アガロースゲル上での電気泳動によって分画し、ナイロン
膜に転写し、appcDNAに由来する32P標識化DNAフラグメントとハイブ
リダイズさせた。分子量マーカー帯の位置を、キロベース(kb)及びキロダルト
ン(kDa)で左に示す。
【図5】 APPタンパク質のポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ活性を示す図であ
る。 (A)全タンパク質抽出物を、2%ガラクトース(vector GAL)のS
DCで増殖させたDY(pYeDP1/8−2)、並びに2%グルコース(ap
p GLU)、2%ガラクトース(app GAL)、又は2%ガラクトース及
び3mM3ABA(app GAL+3ABA)のいずれかのSDCで増殖させた
DY(pV8SPA)から調製した。これらの抽出物におけるポリ(ADP−リ
ボース)の合成を検出するために、サンプルを、32P−NAD+とともに室温で
40分間温置した。2例の対照反応を実施した:精製したヒトPARP100ng
を、反応緩衝液内でのみか(PARP)(列5)、又はグルコース上で増殖させ
たDY(pYeDP1/8−2)の培養体から作成したタンパク質抽出物ととも
にか(vector GLU+PARP)(列6)のいずれかで温置した。X-Om
atというコダックフィルムへの乾燥ゲルの曝露後に得られた、オートラジオグラ
フを示す。ORiは、配列決定用ゲルの始点に相当する。 (B)DY(pV8SPA)からのタンパク質抽出物中のDNAによるポリ(A
DP−リボース)合成の刺激を示す。核酸枯渇酵母抽出物に加えた、音波処理し
たサケ精子DNAの量を、μg/mlで示す。ポリ(ADP−リボース)の合成は、
反応の一つに3mMの濃度で加えた3ABAによって遮断された(列5)。ポリ(
ADP−リボース)の最大の回収を確保するするために、グリコーゲン20μg
を、沈澱段階の際の担体として含めたが;これは、認識できるとおり、取り込ま
れなかった標識の多量の持越を招いた。
【図6】 本発明のPCD調節キメラ遺伝子を含むT−DNAベクターの模式的表現を示
す図である。P35S:CaMV35Sプロモーター;L:cab22リーダー
;ZAP:ZAPクラスのPARP遺伝子のコーディング領域;5′ZAP:逆
配向でのZAPクラスのPARP遺伝子のコーディング領域のN末端部分;3′
35S:CaMV35Sの3′末端転写終結シグナル、及びポリアデニル化シグ
ナル;pACT2:アクチン遺伝子のプロモーター領域;pNOS:ノパリンシ
ンターゼ遺伝子プロモーター;gat:ゲンタマイシンアセチルトランスフェラ
ーゼ;bar:ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ;3′NOS:
ノパリンシンターゼ遺伝子の3′末端転写終結シグナル及びポリアデニル化シグ
ナル;APP:NAPクラスのPARP遺伝子のコーディング領域;5′APP
:逆配向でのNAPクラスのPARP遺伝子のコーディング領域のN末端部分;
LB;左T−DNA境界;RB:右T−DNA境界;pTA29:タペータム組
織特異的プロモーター;pNTP303:花粉特異的プロモーター。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,UG,ZW),E A(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ,BA ,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,CU, CZ,DE,DK,EE,ES,FI,GB,GD,G E,GH,GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS ,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LC,LK, LR,LS,LT,LU,LV,MD,MG,MK,M N,MW,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,RU ,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM, TR,TT,UA,UG,UZ,VN,YU,ZA,Z W (72)発明者 デ・ブロック,マルク ベルギー国、ベー−9820 メレルベーケ、 アブリコゼンストラート 26 Fターム(参考) 2B030 AA02 AB03 AD20 CA06 CA17 CA19 CB02 CD03 CD07 CD09 4B024 AA08 BA10 CA04 CA07 DA01 DA05 EA01 EA04 FA02 GA11 HA01 4B050 CC03 CC04 CC05 DD07 DD13 LL10 4B065 AA11X AA88X AA88Y AB01 BA02 CA29 CA53

Claims (41)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 真核細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法で
    あって、(I)ZAPクラスのポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ(PAR
    P)遺伝子のヌクレオチド配列と、(II)NAPクラスのPARP遺伝子のヌク
    レオチド配列とを用いて、該真核細胞におけるPARP活性全体の機能レベルを
    低下させることを含む方法。
  2. 【請求項2】 該真核細胞に対して内因性であるPARP遺伝子の発現を、
    ZAPクラスの該PARP遺伝子の該ヌクレオチド配列と、NAPクラスの該P
    ARP遺伝子のヌクレオチド配列とを用いることによって低下させることを更に
    含む請求項1記載の方法。
  3. 【請求項3】 内因性PARP遺伝子がコードするタンパク質の見かけの活
    性を、ZAPクラスの該PARP遺伝子の該ヌクレオチド配列と、NAPクラス
    の該PARP遺伝子のヌクレオチド配列とを用いることによって低下させること
    を更に含む請求項1記載の方法。
  4. 【請求項4】 内因性PARP遺伝子のヌクレオチド配列を、ZAPクラス
    の該PARP遺伝子の該ヌクレオチド配列と、NAPクラスの該PARP遺伝子
    のヌクレオチド配列とによって変更することを更に含む請求項1記載の方法。
  5. 【請求項5】 第一及び第二のPCD調節キメラ遺伝子を真核細胞に導入す
    ることを含む、真核細胞におけるプログラムされた細胞死(PCD)を調節する
    方法であって、該第一PCD調節キメラ遺伝子が、下記の動作可能に結合された
    DNA領域: (a)該真核細胞内で機能的である第一プロモーター; (b)転写されたときに、 (i)ZAPクラスのPARPタンパク質を含むジンクフィンガーの機能レベ
    ルを低下させることができるか、又は (ii)発現されたときに、ZAPクラスのPARPタンパク質の機能レベルを
    低下させる、ペプチド若しくはタンパク質に翻訳されることができるかのいずれ
    かの RNA分子を生じる、第一DNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含み、かつ 該第二PCD調節キメラ遺伝子が、下記の動作可能に結合されたDNA領域:
    (a)該真核細胞内で動作可能である第二プロモーター; (b)転写されたときに、 (i)NAPクラスのPARPタンパク質の機能レベルを低下させることがで
    きるか、又は (ii)発現されたときに、NAPクラスのPARPタンパク質の機能レベルを
    低下させる、ペプチド若しくはタンパク質に翻訳されることができるかのいずれ
    かの RNA分子を生じる、第二DNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含み、 該真核細胞における見かけのPARP活性全体を有意にか、又はほとんど完全
    に低下させる方法。
  6. 【請求項6】 該第一の転写されるDNA領域が、センスRNA分子をコー
    ドする(ここで、該DNA領域は、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子のセン
    スDNA鎖と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌクレオチ
    ド配列を含み、そして該センスRNA分子は、ZAPクラスの該内因性PARP
    遺伝子の発現を低下させることができる)請求項5記載の方法。
  7. 【請求項7】 該第二の転写されるDNA領域が、センスRNA分子をコー
    ドする(ここで、該DNA領域は、NAPクラスの内因性PARP遺伝子のセン
    スDNA鎖と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌクレオチ
    ド配列を含み、そして該センスRNA分子は、NAPクラスの該内因性PARP
    遺伝子の発現を低下させることができる)請求項5記載の方法。
  8. 【請求項8】 該第一の転写されるDNA領域が、センスRNA分子をコー
    ドする(ここで、該DNA領域は、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子のセン
    スDNA鎖と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌクレオチ
    ド配列を含み、そして該センスRNA分子は、ZAPクラスの該内因性PARP
    遺伝子の発現を低下させることができる)請求項7記載の方法。
  9. 【請求項9】 該第一の転写されるDNA領域が、アンチセンスRNA分子
    をコードする(ここで、該DNA領域は、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子
    のDNA鎖の相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオチドのヌ
    クレオチド配列を含み、そして該アンチセンスRNA分子は、ZAPクラスの該
    内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる)請求項5記載の方法。
  10. 【請求項10】 該第二の転写されるDNA領域が、アンチセンスRNA分
    子をコードする(ここで、該DNA領域は、NAPクラスの内因性PARP遺伝
    子のセンスDNA鎖の相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオ
    チドのヌクレオチド配列を含み、そして該アンチセンスRNA分子は、NAPク
    ラスの該内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる)請求項5記載
    の方法。
  11. 【請求項11】 該第一の転写されるDNA領域が、アンチセンスRNA分
    子をコードする(ここで、該DNA領域は、ZAPクラスの内因性PARP遺伝
    子のセンスDNA鎖の相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌクレオ
    チドのヌクレオチド配列を含み、そして該アンチセンスRNA分子は、ZAPク
    ラスの該内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる)請求項10記
    載の方法。
  12. 【請求項12】 該第一の転写されるDNA領域が、ZAPクラスの内因性
    PARP遺伝子の転写の結果得られるmRNAと75%同一である、少なくとも
    約100ヌクレオチドのセンスヌクレオチド配列を含むRNA分子をコードする
    (ここで、該RNA分子は、ZAPクラスの該内因性PARP遺伝子の転写の結
    果得られる該mRNAの相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌクレ
    オチドのアンチセンスヌクレオチド配列を更に含み、該センス及びアンチセンス
    ヌクレオチド配列は、二本鎖RNA領域を形成することができ、かつ該RNA分
    子は、ZAPクラスの該内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができる
    )請求項5記載の方法。
  13. 【請求項13】 該第二の転写されるDNA領域が、NAPクラスの内因性
    PARP遺伝子の転写の結果得られるmRNAと75%同一である、少なくとも
    約100ヌクレオチドのセンスヌクレオチド配列を含むRNA分子をコードする
    、(ここで、該RNA分子は、NAPクラスの該内因性PARP遺伝子の転写の
    結果得られる該mRNAの相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌク
    レオチドのアンチセンスヌクレオチド配列を更に含み、該センス及びアンチセン
    スヌクレオチド配列は、二本鎖RNA領域を形成することができ、かつ該RNA
    分子は、NAPクラスの該内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができ
    る)請求項5記載の方法。
  14. 【請求項14】 該第一の転写されるDNA領域が、ZAPクラスの内因性
    PARP遺伝子の転写の結果得られるmRNAと75%同一である、少なくとも
    約100ヌクレオチドのセンスヌクレオチド配列を含むRNA分子をコードする
    、(ここで、該RNA分子は、ZAPクラスの該内因性PARP遺伝子の転写の
    結果得られる該mRNAの相補体と75%同一である、少なくとも約100ヌク
    レオチドのアンチセンスヌクレオチド配列を更に含み、該センス及びアンチセン
    スヌクレオチド配列は、二本鎖RNA領域を形成することができ、かつ該RNA
    分子は、ZAPクラスの該内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができ
    る)請求項10記載の方法。
  15. 【請求項15】 該第一の転写されるDNA領域が、ZAPクラスの内因性
    PARP遺伝子がコードするPARPタンパク質の見かけの活性を低下させ得る
    、優性ネガティブPARP突然変異体をコードする請求項5記載の方法。
  16. 【請求項16】 該第二の転写されるDNA領域が、NAPクラスの内因性
    PARP遺伝子がコードするPARPタンパク質の見かけの活性を低下させ得る
    、優性ネガティブPARP突然変異体をコードする請求項5記載の方法。
  17. 【請求項17】 該第一の転写されるDNA領域が、ZAPクラスの内因性
    PARP遺伝子がコードするPARPタンパク質の見かけの活性を低下させ得る
    、優性ネガティブPARP突然変異体をコードする請求項16記載の方法。
  18. 【請求項18】 該優性ネガティブPARP突然変異体が、SEQ ID NO:4第
    1〜159番アミノ酸のアミノ酸配列、又はSEQ ID NO:6第1〜138番アミノ
    酸のアミノ酸配列から選ばれるアミノ酸配列を含む請求項16記載の方法。
  19. 【請求項19】 該優性ネガティブPARP突然変異体が、SEQ ID NO:2第
    1〜370番アミノ酸のアミノ酸配列、SEQ ID NO:11第1〜98番アミノ酸の
    アミノ酸配列、又は第1〜88番アミノ酸のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:11の
    アミノ酸配列で置きかえられた、SEQ ID NO:2第1〜370番アミノ酸のアミノ
    酸配列から選ばれるアミノ酸配列を含む請求項17記載の方法。
  20. 【請求項20】 該第一又は該第二のプロモーターが、組織特異性又は誘導
    可能プロモーターである請求項5記載の方法。
  21. 【請求項21】 該第一又は該第二のプロモーターが、真菌応答性プロモー
    ター、線虫応答性プロモーター、葯選択的プロモーター、柱頭選択的プロモータ
    ー、裂開帯選択的プロモーターから選ばれる請求項20記載の方法。
  22. 【請求項22】 該見かけのPARP活性全体を、該真核細胞における正常
    な見かけのPARP活性の約75〜約90%に低下させ、該真核細胞を、プログ
    ラムされた細胞死から防護する請求項5〜21のいずれか一項に記載の方法。
  23. 【請求項23】 該見かけのPARP活性全体を、該真核細胞における正常
    な見かけのPARP活性の約90〜約100%に低下させ、該真核細胞を、プロ
    グラムされた細胞死によって殺す請求項5〜21のいずれか一項に記載の方法。
  24. 【請求項24】 該真核細胞が、植物細胞である請求項22記載の方法。
  25. 【請求項25】 該真核細胞が、植物細胞である請求項23記載の方法。
  26. 【請求項26】 PCD調節キメラ遺伝子を植物細胞に導入することを含む
    、植物細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法であって、該PCD
    調節キメラ遺伝子が、下記の動作可能に結合されたDNA領域: (a)植物発現性プロモーター; (b)転写されたときに、 (i)内因性PARP遺伝子の発現を低下させることができるか、又は (ii)発現されたときに、該植物細胞における見かけのPARP活性を低下さ
    せるペプチド若しくはタンパク質に翻訳されることができるかのいずれかの RNA分子を生じるDNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含み、 該植物細胞における見かけのPARP活性全体を、該植物細胞における正常な
    見かけのPARP活性から約75〜約100%低下させる方法。
  27. 【請求項27】 請求項5〜21のいずれか一項に記載の第一及び第二PC
    D調節キメラ遺伝子。
  28. 【請求項28】 請求項27記載の第一及び第二PCD調節キメラ遺伝子を
    含む真核細胞。
  29. 【請求項29】 植物細胞である、請求項28記載の真核細胞。
  30. 【請求項30】 請求項28記載の真核細胞を含む、非ヒト真核生物。
  31. 【請求項31】 請求項29記載の植物細胞を含む植物。
  32. 【請求項32】 請求項27記載の第一及び第二PCD調節キメラ遺伝子を
    含む、請求項31記載の植物の種子。
  33. 【請求項33】 PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含
    む、植物の該細胞におけるプログラムされた細胞死を調節する方法であって、該
    PCD調節キメラ遺伝子が、下記の動作可能に結合されたDNA領域: (a)植物発現性プロモーター; (b)転写されたときに、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下さ
    せることができるRNA分子を生じる、DNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含む方法。
  34. 【請求項34】 PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含
    む、植物の成長速度を上昇させる方法であって、該PCD調節キメラ遺伝子が、
    下記の動作可能に結合されたDNA領域: (a)植物発現性プロモーター; (b)転写されたときに、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下さ
    せることができるRNA分子を生じる、DNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含む方法。
  35. 【請求項35】 PCD調節キメラ遺伝子を植物の細胞に導入することを含
    む、植物のストレス耐性細胞を産生する方法であって、該PCD調節キメラ遺伝
    子が、下記の動作可能に結合されたDNA領域: (a)植物発現性プロモーター; (b)転写されたときに、ZAPクラスの内因性PARP遺伝子の発現を低下さ
    せることができるRNA分子を生じる、DNA領域;並びに (c)転写終結及びポリアデニル化に関与するDNA領域 を含む方法。
  36. 【請求項36】 PARP活性を有するタンパク質をコードするヌクレオチ
    ド配列の、植物細胞又は植物におけるプログラムされた細胞死を調節するための
    使用。
  37. 【請求項37】 PARP活性を有する該タンパク質が、ZAPクラスのP
    ARPタンパク質である請求項36記載の使用。
  38. 【請求項38】 PARP活性を有するタンパク質をコードするヌクレオチ
    ド配列の、ストレス耐性である植物細胞又は植物を産生するための使用。
  39. 【請求項39】 PARP活性を有する該タンパク質が、ZAPクラスのP
    ARPタンパク質である請求項38記載の使用。
  40. 【請求項40】 PARP活性を有するタンパク質をコードするヌクレオチ
    ド配列の、植物細胞又は植物の成長速度を上昇させるための使用。
  41. 【請求項41】 PARP活性を有する該タンパク質が、ZAPクラスのP
    ARPタンパク質である請求項40記載の使用。
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