HU221124B1 - Production of trehalose in plants - Google Patents
Production of trehalose in plants Download PDFInfo
- Publication number
- HU221124B1 HU221124B1 HU9503723V HUP9503723V HU221124B1 HU 221124 B1 HU221124 B1 HU 221124B1 HU 9503723 V HU9503723 V HU 9503723V HU P9503723 V HUP9503723 V HU P9503723V HU 221124 B1 HU221124 B1 HU 221124B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- plant
- trehalose
- sequence
- gene
- plants
- Prior art date
Links
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 133
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 title claims abstract description 133
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 title claims abstract description 132
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 102
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims abstract description 47
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims abstract description 47
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 35
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims abstract description 29
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims abstract description 29
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims abstract description 6
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 233
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 39
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 34
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 25
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 23
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 21
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 claims description 15
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 14
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 claims description 13
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 claims description 10
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 10
- 101150034999 otsA gene Proteins 0.000 claims description 9
- 108010058731 nopaline synthase Proteins 0.000 claims description 7
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 claims description 5
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 claims description 5
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 5
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 claims description 5
- 108020005120 Plant DNA Proteins 0.000 claims description 4
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 claims description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 3
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 claims description 2
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 54
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 43
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 41
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 41
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 39
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 36
- 108700023224 Glucose-1-phosphate adenylyltransferases Proteins 0.000 description 28
- 108700006291 Sucrose-phosphate synthases Proteins 0.000 description 27
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 27
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 26
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 26
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 19
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 19
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 16
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 14
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 14
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 14
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 12
- SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N indole-3-acetic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC(=O)O)=CNC2=C1 SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 12
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 11
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 11
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 10
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 10
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 10
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 10
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 10
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 10
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 10
- 102100029677 Trehalase Human genes 0.000 description 9
- 108010087472 Trehalase Proteins 0.000 description 9
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 9
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 9
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 9
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 8
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 8
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 8
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 7
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 7
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 7
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 7
- GOSWTRUMMSCNCW-HNNGNKQASA-N 9-ribosyl-trans-zeatin Chemical compound C1=NC=2C(NC\C=C(CO)/C)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O GOSWTRUMMSCNCW-HNNGNKQASA-N 0.000 description 6
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 6
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 6
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 6
- 239000003617 indole-3-acetic acid Substances 0.000 description 6
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 6
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- GOSWTRUMMSCNCW-UHFFFAOYSA-N trans-zeatin riboside Natural products C1=NC=2C(NCC=C(CO)C)=NC=NC=2N1C1OC(CO)C(O)C1O GOSWTRUMMSCNCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 5
- HSCJRCZFDFQWRP-JZMIEXBBSA-N UDP-alpha-D-glucose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-JZMIEXBBSA-N 0.000 description 5
- HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N Uridindiphosphoglukose Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC1C(O)C(O)C(N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 5
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 5
- 239000000463 material Substances 0.000 description 5
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- HNSDLXPSAYFUHK-UHFFFAOYSA-N 1,4-bis(2-ethylhexyl) sulfosuccinate Chemical compound CCCCC(CC)COC(=O)CC(S(O)(=O)=O)C(=O)OCC(CC)CCCC HNSDLXPSAYFUHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NBSCHQHZLSJFNQ-GASJEMHNSA-N D-Glucose 6-phosphate Chemical compound OC1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O NBSCHQHZLSJFNQ-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- VFRROHXSMXFLSN-UHFFFAOYSA-N Glc6P Natural products OP(=O)(O)OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O VFRROHXSMXFLSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101000795074 Homo sapiens Tryptase alpha/beta-1 Proteins 0.000 description 4
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 4
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 4
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 4
- 101150022999 SPS gene Proteins 0.000 description 4
- 101100084449 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) PRP4 gene Proteins 0.000 description 4
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 4
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 4
- 102100029639 Tryptase alpha/beta-1 Human genes 0.000 description 4
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 4
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 4
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 4
- UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N spectinomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](NC)[C@@H](O)[C@H]([C@@H]([C@H]1O1)O)NC)[C@]2(O)[C@H]1O[C@H](C)CC2=O UNFWWIHTNXNPBV-WXKVUWSESA-N 0.000 description 4
- 229960000268 spectinomycin Drugs 0.000 description 4
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 4
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 235000011303 Brassica alboglabra Nutrition 0.000 description 3
- 235000011302 Brassica oleracea Nutrition 0.000 description 3
- 240000008100 Brassica rapa Species 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 3
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 3
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 3
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 description 3
- 240000008415 Lactuca sativa Species 0.000 description 3
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 3
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 3
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 3
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 description 3
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 3
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 3
- 230000000408 embryogenic effect Effects 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 3
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 3
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 3
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 3
- WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N ADP alpha-D-glucoside Chemical compound C([C@H]1O[C@H]([C@@H]([C@@H]1O)O)N1C=2N=CN=C(C=2N=C1)N)OP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N 0.000 description 2
- WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N ADP-mannose Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C(C(C1O)O)OC1COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 240000006108 Allium ampeloprasum Species 0.000 description 2
- 235000005254 Allium ampeloprasum Nutrition 0.000 description 2
- 244000105624 Arachis hypogaea Species 0.000 description 2
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 2
- 235000011293 Brassica napus Nutrition 0.000 description 2
- 235000003899 Brassica oleracea var acephala Nutrition 0.000 description 2
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 2
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 235000000540 Brassica rapa subsp rapa Nutrition 0.000 description 2
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 description 2
- 240000006740 Cichorium endivia Species 0.000 description 2
- 235000005979 Citrus limon Nutrition 0.000 description 2
- 244000131522 Citrus pyriformis Species 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 241000219112 Cucumis Species 0.000 description 2
- 235000009849 Cucumis sativus Nutrition 0.000 description 2
- 240000008067 Cucumis sativus Species 0.000 description 2
- 244000019459 Cynara cardunculus Species 0.000 description 2
- 235000019106 Cynara scolymus Nutrition 0.000 description 2
- GSXOAOHZAIYLCY-UHFFFAOYSA-N D-F6P Natural products OCC(=O)C(O)C(O)C(O)COP(O)(O)=O GSXOAOHZAIYLCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IMXSCCDUAFEIOE-UHFFFAOYSA-N D-Octopin Natural products OC(=O)C(C)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N IMXSCCDUAFEIOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IMXSCCDUAFEIOE-RITPCOANSA-N D-octopine Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H](C)[NH2+][C@H](C([O-])=O)CCCNC(N)=[NH2+] IMXSCCDUAFEIOE-RITPCOANSA-N 0.000 description 2
- 244000000626 Daucus carota Species 0.000 description 2
- 235000002767 Daucus carota Nutrition 0.000 description 2
- 240000000731 Fagus sylvatica Species 0.000 description 2
- 235000010099 Fagus sylvatica Nutrition 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N Glu-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KKCUFHUTMKQQCF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- 101710095003 Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit Proteins 0.000 description 2
- 101710157489 Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic Proteins 0.000 description 2
- 101710161608 Glucose-1-phosphate adenylyltransferase small subunit, chloroplastic/amyloplastic Proteins 0.000 description 2
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N Gly-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 2
- 244000017020 Ipomoea batatas Species 0.000 description 2
- 235000002678 Ipomoea batatas Nutrition 0.000 description 2
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- JRJLGNFWYFSJHB-HOCLYGCPSA-N Leu-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JRJLGNFWYFSJHB-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 2
- PWPBLZXWFXJFHE-RHYQMDGZSA-N Leu-Pro-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PWPBLZXWFXJFHE-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- JIHDFWWRYHSAQB-GUBZILKMSA-N Leu-Ser-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O JIHDFWWRYHSAQB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 2
- ONHCDMBHPQIPAI-YTQUADARSA-N Leu-Trp-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O)N ONHCDMBHPQIPAI-YTQUADARSA-N 0.000 description 2
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 244000070406 Malus silvestris Species 0.000 description 2
- 244000151018 Maranta arundinacea Species 0.000 description 2
- 235000010804 Maranta arundinacea Nutrition 0.000 description 2
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 2
- 244000291473 Musa acuminata Species 0.000 description 2
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 2
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 2
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 2
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 2
- ZWJKVFAYPLPCQB-UNQGMJICSA-N Phe-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(O)=O ZWJKVFAYPLPCQB-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- YMIZSYUAZJSOFL-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YMIZSYUAZJSOFL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N Phosphine Chemical compound P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N Phosphinothricin Natural products CP(O)(=O)CCC(N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 2
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 2
- 101000662819 Physarum polycephalum Terpene synthase 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000830822 Physarum polycephalum Terpene synthase 2 Proteins 0.000 description 2
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 description 2
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 description 2
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N Pro-Thr-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- 240000005809 Prunus persica Species 0.000 description 2
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 240000001987 Pyrus communis Species 0.000 description 2
- 244000088415 Raphanus sativus Species 0.000 description 2
- 244000281247 Ribes rubrum Species 0.000 description 2
- 235000002355 Ribes spicatum Nutrition 0.000 description 2
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 2
- 235000009337 Spinacia oleracea Nutrition 0.000 description 2
- 244000300264 Spinacia oleracea Species 0.000 description 2
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 description 2
- 101150003653 TPS6 gene Proteins 0.000 description 2
- JMBRNXUOLJFURW-BEAPCOKYSA-N Thr-Phe-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N)O JMBRNXUOLJFURW-BEAPCOKYSA-N 0.000 description 2
- DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N Thr-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O DEGCBBCMYWNJNA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 2
- UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N 0.000 description 2
- MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N Tyr-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 2
- PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 2
- DVKFVGVMPLXLKC-PUGXJXRHSA-N [(2s,3r,4s,5s,6r)-2-[(2s,3s,4s,5r)-3,4-dihydroxy-2,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] dihydrogen phosphate Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@]1(CO)[C@@]1(OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 DVKFVGVMPLXLKC-PUGXJXRHSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- HXXFSFRBOHSIMQ-VFUOTHLCSA-N alpha-D-glucose 1-phosphate Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O HXXFSFRBOHSIMQ-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- BGWGXPAPYGQALX-ARQDHWQXSA-N beta-D-fructofuranose 6-phosphate Chemical compound OC[C@@]1(O)O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O BGWGXPAPYGQALX-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 2
- 230000023852 carbohydrate metabolic process Effects 0.000 description 2
- 235000021256 carbohydrate metabolism Nutrition 0.000 description 2
- 229960004261 cefotaxime Drugs 0.000 description 2
- AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M cefotaxime sodium Chemical compound [Na+].N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(C)=O)CS[C@@H]21)C([O-])=O)=O)C(=O)\C(=N/OC)C1=CSC(N)=N1 AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M 0.000 description 2
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N dihydroxy(oxo)silane Chemical compound O[Si](O)=O IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 2
- 235000018927 edible plant Nutrition 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 2
- 241001233957 eudicotyledons Species 0.000 description 2
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 2
- 235000019634 flavors Nutrition 0.000 description 2
- 229950010772 glucose-1-phosphate Drugs 0.000 description 2
- IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N glufosinate-P Chemical compound CP(O)(=O)CC[C@H](N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 102000005396 glutamine synthetase Human genes 0.000 description 2
- 108020002326 glutamine synthetase Proteins 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 2
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 231100001222 nononcogenic Toxicity 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 2
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 2
- 239000012882 rooting medium Substances 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000004114 suspension culture Methods 0.000 description 2
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 2
- 101150065751 tps gene Proteins 0.000 description 2
- -1 trehalose disaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 108020003272 trehalose-phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 150000003625 trehaloses Chemical class 0.000 description 2
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 2
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 2
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 2
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 2
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 2
- XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N (2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DQVAZKGVGKHQDS-UHFFFAOYSA-N 2-[[1-[2-[(2-amino-4-methylpentanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(CC(C)C)C(O)=O DQVAZKGVGKHQDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JUEUYDRZJNQZGR-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-amino-4-methylpentanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]-3-phenylpropanoic acid Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JUEUYDRZJNQZGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AWXGSYPUMWKTBR-UHFFFAOYSA-N 4-carbazol-9-yl-n,n-bis(4-carbazol-9-ylphenyl)aniline Chemical compound C12=CC=CC=C2C2=CC=CC=C2N1C1=CC=C(N(C=2C=CC(=CC=2)N2C3=CC=CC=C3C3=CC=CC=C32)C=2C=CC(=CC=2)N2C3=CC=CC=C3C3=CC=CC=C32)C=C1 AWXGSYPUMWKTBR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 241001677738 Aleuron Species 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- FIHZWZBEAXASKA-UHFFFAOYSA-N Anthron Natural products COc1cc2Cc3cc(C)cc(O)c3C(=O)c2c(O)c1C=CC(C)C FIHZWZBEAXASKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000003911 Arachis Nutrition 0.000 description 1
- OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N Arg-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OZNSCVPYWZRQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KMSHNDWHPWXPEC-BQBZGAKWSA-N Arg-Asp-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KMSHNDWHPWXPEC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- UAOSDDXCTBIPCA-QXEWZRGKSA-N Arg-Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UAOSDDXCTBIPCA-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N Arg-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- IZSMEUDYADKZTJ-KJEVXHAQSA-N Arg-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IZSMEUDYADKZTJ-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- HAJWYALLJIATCX-FXQIFTODSA-N Asn-Asn-Arg Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)CN=C(N)N HAJWYALLJIATCX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZWASIOHRQWRWAS-UGYAYLCHSA-N Asn-Asp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZWASIOHRQWRWAS-UGYAYLCHSA-N 0.000 description 1
- KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- XLZCLJRGGMBKLR-PCBIJLKTSA-N Asn-Ile-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XLZCLJRGGMBKLR-PCBIJLKTSA-N 0.000 description 1
- GKKUBLFXKRDMFC-BQBZGAKWSA-N Asn-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O GKKUBLFXKRDMFC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VPSHHQXIWLGVDD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O VPSHHQXIWLGVDD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- RRKCPMGSRIDLNC-AVGNSLFASA-N Asp-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O RRKCPMGSRIDLNC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 235000021533 Beta vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 241000335053 Beta vulgaris Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 235000014698 Brassica juncea var multisecta Nutrition 0.000 description 1
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 description 1
- 235000011299 Brassica oleracea var botrytis Nutrition 0.000 description 1
- 240000003259 Brassica oleracea var. botrytis Species 0.000 description 1
- 235000011292 Brassica rapa Nutrition 0.000 description 1
- 235000006618 Brassica rapa subsp oleifera Nutrition 0.000 description 1
- 241001301148 Brassica rapa subsp. oleifera Species 0.000 description 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 101100406366 Caenorhabditis elegans pad-2 gene Proteins 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100025570 Cancer/testis antigen 1 Human genes 0.000 description 1
- 240000008574 Capsicum frutescens Species 0.000 description 1
- 241000722731 Carex Species 0.000 description 1
- 235000005747 Carum carvi Nutrition 0.000 description 1
- 240000000467 Carum carvi Species 0.000 description 1
- 235000018536 Cichorium endivia Nutrition 0.000 description 1
- 235000009088 Citrus pyriformis Nutrition 0.000 description 1
- 235000005976 Citrus sinensis Nutrition 0.000 description 1
- 240000002319 Citrus sinensis Species 0.000 description 1
- 241000675108 Citrus tangerina Species 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 235000015510 Cucumis melo subsp melo Nutrition 0.000 description 1
- 235000007129 Cuminum cyminum Nutrition 0.000 description 1
- 244000304337 Cuminum cyminum Species 0.000 description 1
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 1
- 244000052909 Dioscorea esculenta Species 0.000 description 1
- 235000006536 Dioscorea esculenta Nutrition 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000447577 Echinops persicus Species 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 241001070947 Fagus Species 0.000 description 1
- 241000220223 Fragaria Species 0.000 description 1
- 235000016970 Fragaria moschata Nutrition 0.000 description 1
- 240000003362 Fragaria moschata Species 0.000 description 1
- VTTSANCGJWLPNC-ZPFDUUQYSA-N Glu-Arg-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O VTTSANCGJWLPNC-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- LTUVYLVIZHJCOQ-KKUMJFAQSA-N Glu-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LTUVYLVIZHJCOQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PABVKUJVLNMOJP-WHFBIAKZSA-N Glu-Cys Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O PABVKUJVLNMOJP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N Glu-Ile-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N 0.000 description 1
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N Glu-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- QRWPTXLWHHTOCO-DZKIICNBSA-N Glu-Val-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QRWPTXLWHHTOCO-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 1
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- OCQUNKSFDYDXBG-QXEWZRGKSA-N Gly-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OCQUNKSFDYDXBG-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- NZAFOTBEULLEQB-WDSKDSINSA-N Gly-Asn-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)CN NZAFOTBEULLEQB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MBOAPAXLTUSMQI-JHEQGTHGSA-N Gly-Glu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MBOAPAXLTUSMQI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N Gly-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N 0.000 description 1
- JPAACTMBBBGAAR-HOTGVXAUSA-N Gly-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 JPAACTMBBBGAAR-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 1
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 1
- FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N His-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FRDFAWHTPDKRHG-ULQDDVLXSA-N His-Tyr-Arg Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CN=CN1 FRDFAWHTPDKRHG-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 101000856237 Homo sapiens Cancer/testis antigen 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000837344 Homo sapiens T-cell leukemia translocation-altered gene protein Proteins 0.000 description 1
- 101000666730 Homo sapiens T-complex protein 1 subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 206010020649 Hyperkeratosis Diseases 0.000 description 1
- CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N Ile-Arg-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CWJQMCPYXNVMBS-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- ODPKZZLRDNXTJZ-WHOFXGATSA-N Ile-Gly-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N ODPKZZLRDNXTJZ-WHOFXGATSA-N 0.000 description 1
- GLLAUPMJCGKPFY-BLMTYFJBSA-N Ile-Ile-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 GLLAUPMJCGKPFY-BLMTYFJBSA-N 0.000 description 1
- CIJLNXXMDUOFPH-HJWJTTGWSA-N Ile-Pro-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CIJLNXXMDUOFPH-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 1
- XVUAQNRNFMVWBR-BLMTYFJBSA-N Ile-Trp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N XVUAQNRNFMVWBR-BLMTYFJBSA-N 0.000 description 1
- 241001002197 Juglans mollis Species 0.000 description 1
- 235000009496 Juglans regia Nutrition 0.000 description 1
- 240000007049 Juglans regia Species 0.000 description 1
- 108010025815 Kanamycin Kinase Proteins 0.000 description 1
- 241000218652 Larix Species 0.000 description 1
- 235000005590 Larix decidua Nutrition 0.000 description 1
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N Leu-His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- 241000192130 Leuconostoc mesenteroides Species 0.000 description 1
- GAOJCVKPIGHTGO-UWVGGRQHSA-N Lys-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O GAOJCVKPIGHTGO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 241000218922 Magnoliophyta Species 0.000 description 1
- 235000011430 Malus pumila Nutrition 0.000 description 1
- 235000015103 Malus silvestris Nutrition 0.000 description 1
- 235000004456 Manihot esculenta Nutrition 0.000 description 1
- 235000010624 Medicago sativa Nutrition 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 101710188554 NAD-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 241000274772 Otoba Species 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 101710091688 Patatin Proteins 0.000 description 1
- OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N Phe-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N Phe-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CWFGECHCRMGPPT-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- 102000009569 Phosphoglucomutase Human genes 0.000 description 1
- 241000218657 Picea Species 0.000 description 1
- 235000008124 Picea excelsa Nutrition 0.000 description 1
- 240000000020 Picea glauca Species 0.000 description 1
- 235000008127 Picea glauca Nutrition 0.000 description 1
- 235000008331 Pinus X rigitaeda Nutrition 0.000 description 1
- 235000008565 Pinus banksiana Nutrition 0.000 description 1
- 241000218680 Pinus banksiana Species 0.000 description 1
- 235000011613 Pinus brutia Nutrition 0.000 description 1
- 241000018646 Pinus brutia Species 0.000 description 1
- 241000758706 Piperaceae Species 0.000 description 1
- 108700001094 Plant Genes Proteins 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CYQQWUPHIZVCNY-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CYQQWUPHIZVCNY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N Pro-Glu-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XYHMFGGWNOFUOU-QXEWZRGKSA-N Pro-Ile-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 XYHMFGGWNOFUOU-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- XYSXOCIWCPFOCG-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XYSXOCIWCPFOCG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- ZVEQWRWMRFIVSD-HRCADAONSA-N Pro-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O ZVEQWRWMRFIVSD-HRCADAONSA-N 0.000 description 1
- FHZJRBVMLGOHBX-GUBZILKMSA-N Pro-Pro-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O FHZJRBVMLGOHBX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N Pro-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- CWZUFLWPEFHWEI-IHRRRGAJSA-N Pro-Tyr-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CWZUFLWPEFHWEI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 244000007021 Prunus avium Species 0.000 description 1
- 235000010401 Prunus avium Nutrition 0.000 description 1
- 241001290151 Prunus avium subsp. avium Species 0.000 description 1
- 244000141353 Prunus domestica Species 0.000 description 1
- 235000006040 Prunus persica var persica Nutrition 0.000 description 1
- 241000220324 Pyrus Species 0.000 description 1
- 235000014443 Pyrus communis Nutrition 0.000 description 1
- 235000019057 Raphanus caudatus Nutrition 0.000 description 1
- 235000011380 Raphanus sativus Nutrition 0.000 description 1
- 235000006140 Raphanus sativus var sativus Nutrition 0.000 description 1
- 235000001537 Ribes X gardonianum Nutrition 0.000 description 1
- 235000001535 Ribes X utile Nutrition 0.000 description 1
- 235000016919 Ribes petraeum Nutrition 0.000 description 1
- 235000016911 Ribes sativum Nutrition 0.000 description 1
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 1
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 1
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 1
- 241000195974 Selaginella Species 0.000 description 1
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GDUZTEQRAOXYJS-SRVKXCTJSA-N Ser-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N GDUZTEQRAOXYJS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 239000005708 Sodium hypochlorite Substances 0.000 description 1
- 241000208292 Solanaceae Species 0.000 description 1
- 235000002634 Solanum Nutrition 0.000 description 1
- 241000207763 Solanum Species 0.000 description 1
- 101100242848 Streptomyces hygroscopicus bar gene Proteins 0.000 description 1
- 241000187191 Streptomyces viridochromogenes Species 0.000 description 1
- 102100028692 T-cell leukemia translocation-altered gene protein Human genes 0.000 description 1
- 102100038410 T-complex protein 1 subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 235000012419 Thalia geniculata Nutrition 0.000 description 1
- JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N Thr-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)CCCN=C(N)N JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- CQNFRKAKGDSJFR-NUMRIWBASA-N Thr-Glu-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O CQNFRKAKGDSJFR-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N Thr-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- QYDKSNXSBXZPFK-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QYDKSNXSBXZPFK-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- KAFKKRJQHOECGW-JCOFBHIZSA-N Thr-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 KAFKKRJQHOECGW-JCOFBHIZSA-N 0.000 description 1
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- UJGDFQRPYGJBEH-AAEUAGOBSA-N Trp-Ser-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)O)N UJGDFQRPYGJBEH-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- ZZDFLJFVSNQINX-HWHUXHBOSA-N Trp-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)O ZZDFLJFVSNQINX-HWHUXHBOSA-N 0.000 description 1
- ADBDQGBDNUTRDB-ULQDDVLXSA-N Tyr-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ADBDQGBDNUTRDB-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N Tyr-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QSFJHIRIHOJRKS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- SOEGLGLDSUHWTI-STECZYCISA-N Tyr-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 SOEGLGLDSUHWTI-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N Tyr-Tyr-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- QPZMOUMNTGTEFR-ZKWXMUAHSA-N Val-Asn-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](C(C)C)N QPZMOUMNTGTEFR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- PMDOQZFYGWZSTK-LSJOCFKGSA-N Val-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)C(C)C PMDOQZFYGWZSTK-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 241000219094 Vitaceae Species 0.000 description 1
- 235000014787 Vitis vinifera Nutrition 0.000 description 1
- 240000006365 Vitis vinifera Species 0.000 description 1
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 1
- 241000482268 Zea mays subsp. mays Species 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- JUGOREOARAHOCO-UHFFFAOYSA-M acetylcholine chloride Chemical compound [Cl-].CC(=O)OCC[N+](C)(C)C JUGOREOARAHOCO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000007605 air drying Methods 0.000 description 1
- VFRROHXSMXFLSN-KCDKBNATSA-N aldehydo-D-galactose 6-phosphate Chemical compound OP(=O)(O)OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O VFRROHXSMXFLSN-KCDKBNATSA-N 0.000 description 1
- LABSPYBHMPDTEL-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose 6-phosphate Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1 LABSPYBHMPDTEL-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- RWHOZGRAXYWRNX-VFUOTHLCSA-N alpha-D-glucose 1,6-bisphosphate Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H]1O RWHOZGRAXYWRNX-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 235000021016 apples Nutrition 0.000 description 1
- 101150029595 ara gene Proteins 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- 235000016520 artichoke thistle Nutrition 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000003816 axenic effect Effects 0.000 description 1
- 235000021015 bananas Nutrition 0.000 description 1
- 101150103518 bar gene Proteins 0.000 description 1
- 235000021028 berry Nutrition 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 108010051210 beta-Fructofuranosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 235000008429 bread Nutrition 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001390 capsicum minimum Substances 0.000 description 1
- FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N carbenicillin Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)C(C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N 0.000 description 1
- 229960003669 carbenicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-KIIOPKALSA-N chembl3301825 Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)C(O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-KIIOPKALSA-N 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 235000019693 cherries Nutrition 0.000 description 1
- 235000003733 chicria Nutrition 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 235000004879 dioscorea Nutrition 0.000 description 1
- 239000001177 diphosphate Substances 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 230000024346 drought recovery Effects 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 238000010304 firing Methods 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 239000003205 fragrance Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 150000002303 glucose derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N glyphosate Chemical compound OC(=O)CNCP(O)(O)=O XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000002532 grape seed extract Nutrition 0.000 description 1
- 235000021021 grapes Nutrition 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000003898 horticulture Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229910052816 inorganic phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001573 invertase Substances 0.000 description 1
- 235000011073 invertase Nutrition 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 108010026228 mRNA guanylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- 239000006870 ms-medium Substances 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 238000012261 overproduction Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 235000020232 peanut Nutrition 0.000 description 1
- 235000021017 pears Nutrition 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- 108010082527 phosphinothricin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 108091000115 phosphomannomutase Proteins 0.000 description 1
- 229910000073 phosphorus hydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000029553 photosynthesis Effects 0.000 description 1
- 238000010672 photosynthesis Methods 0.000 description 1
- 239000003375 plant hormone Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 235000021018 plums Nutrition 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 230000032361 posttranscriptional gene silencing Effects 0.000 description 1
- 235000013324 preserved food Nutrition 0.000 description 1
- 108010025826 prolyl-leucyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 1
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 description 1
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- FQENQNTWSFEDLI-UHFFFAOYSA-J sodium diphosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O FQENQNTWSFEDLI-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N sodium hypochlorite Chemical compound [Na+].Cl[O-] SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000011877 solvent mixture Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 125000003003 spiro group Chemical group 0.000 description 1
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 235000021012 strawberries Nutrition 0.000 description 1
- 150000003445 sucroses Chemical class 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N sulfuric acid Substances OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019818 tetrasodium diphosphate Nutrition 0.000 description 1
- AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O thiamine pyrophosphate Chemical compound CC1=C(CCOP(O)(=O)OP(O)(O)=O)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- MWOOGOJBHIARFG-UHFFFAOYSA-N vanillin Chemical compound COC1=CC(C=O)=CC=C1O MWOOGOJBHIARFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FGQOOHJZONJGDT-UHFFFAOYSA-N vanillin Natural products COC1=CC(O)=CC(C=O)=C1 FGQOOHJZONJGDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000012141 vanillin Nutrition 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 1
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1048—Glycosyltransferases (2.4)
- C12N9/1051—Hexosyltransferases (2.4.1)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
- A23L3/00—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs
- A23L3/34—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by treatment with chemicals
- A23L3/3454—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by treatment with chemicals in the form of liquids or solids
- A23L3/3463—Organic compounds; Microorganisms; Enzymes
- A23L3/3562—Sugars; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
- A23L3/00—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs
- A23L3/40—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by drying or kilning; Subsequent reconstitution
- A23L3/42—Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by drying or kilning; Subsequent reconstitution with addition of chemicals before or during drying
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1048—Glycosyltransferases (2.4)
- C12N9/1051—Hexosyltransferases (2.4.1)
- C12N9/1066—Sucrose phosphate synthase (2.4.1.14)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Ceramic Products (AREA)
Abstract
A találmány tárgya eljárás trehalóz termelésére egy növényigazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződésre képes E. colitrehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-t tartalmazó nukleinsavathordozó növény termesztése és feldolgozása útján. A találmány tárgya anövényben kifejeződésre képes, a növényi sejt trehalóztermelését és -tartalmát növelő nukleinsavszerkezet, az ezt tartalmazó klónozóvektor,ezt hordozó mikroorganizmus, ezt a nukleinsavszerkezetet tar- talmazórekombináns növényi DNS-genom, növényi sejt, sejttenyészet és növényis, valamint egy eljárás trehalóz termelésére fokozottan képes növénylétrehozására. ŕ
Description
KIVONAT
A találmány tárgya eljárás trehalóz termelésére egy növényi gazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződésre képes E. coli trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-t tartalmazó nukleinsavat hordozó növény termesztése és feldolgozása útján.
A találmány tárgya a növényben kifejeződésre képes, a növényi sejt trehalóztermelését és -tartalmát növelő nukleinsavszerkezet, az ezt tartalmazó klónozóvektor, ezt hordozó mikroorganizmus, ezt a nukleinsavszerkezetet tartalmazó rekombináns növényi DNS-genom, növényi sejt, sejttenyészet és növény is, valamint egy eljárás trehalóz termelésére fokozottan képes növény létrehozására.
A leírás terjedelme 30 oldal (ezen belül 11 lap ábra)
HU 221 124 B1
HU 221 124 Β1
A találmány tárgyát növények szénhidrát-anyagcseréjének módosítása rekombináns DNS-technikák alkalmazásával, az ehhez használható rekombináns DNS, valamint a módosított génállományú növények képezik. Az említett növények különleges szénhidrátok forrásaként használhatók fel, vagy olyan élelmiszerré, takarmánnyá, vagy azok alkotórészeivé dolgozhatók fel, amelyek az említett szénhidrátok jelenlétének következtében javított tulajdonságokkal rendelkeznek például a feldolgozás során.
A trehalózok olyan D-glükozil-D-glükozid típusú diszacharidok, amelyeket két, α,α-, α,β- vagy β,β-kötéssel összekapcsolódó glükózmolekula alkot. A trehalózok, és különösen az α-trehalóz [l-(O-a-D-glükopiranozil)-l’-(O-a-D-glükopiranóz)] a természetben széles körben előforduló diszacharid.
A trehalóz kémiai szintézise bonyolult (védőcsoportot igénylő) és nem hatékony eljárás. A trehalóz jelenleg használt természetes forrásai a kalapos gombák és a Saccharomyces cerevisiae élesztőgomba, amely képes a száraz tömegének 10%-át meghaladó mennyiségű trehalóz felhalmozására. A termelést azonban a magas trehalázaktivitás gátolja, ami a trehalóz gyors lebomlását okozza. Elbein [Adv. Carbohydrate Chem. Biochem. 30, 227-256 (1974)] áttekintést ad a trehalóz diszacharidok, különösen az α,α-trehalóz élő szervezetekben való előfordulásáról és anyagcseréjéről. A növények közül a trehalóz jelenlétét számos alacsonyabb rendű növényfajban, valamint néhány magasabb rendű növényfajban, így például egy szamárkenyérben (Echinops persicus), egy sásban (Carex brunescens) vagy a bükkfában (Fagus silvatica) mutatták ki. Ezeket az eredményeket más szerzők nem erősítették meg [például Kendall és munkatársai, Phytochemistry 29, 2525-2528 (1990)]. így például Kendall - a trehalóznak a magasabb rendű növényekben való előfordulásáról szólva - azt állítja, hogy annak jelenléte csak a kömény (Carum carvi) magvában bizonyított. Egy közleményt a trehalóz napraforgóban való jelenlétéről [Cegla és munkatársai, J. Am. Oil Chem. Soc. 54, 150 (1977)] Kandler és munkatársai [The Biochemistry of Plants, Vol. 3.: Carbohydrates: Structure and Function; ed.: Preiss, J., 228 o., Academic Press] kétségbe vonnak Kendall és munkatársai (idézett mű) alapján. A behálóznák bükkfában és káposztában való előfordulását sem sikerült más szerzőknek megerősíteniük (Kendall és munkatársai, idézett mű és hivatkozásai).
A trehalóznak a magasabb rendű növényekben való látszólagos ritkasága ellenére trehalózlebontó aktivitást mutattak ki a vizsgált növénycsaládok jelentős részéből. Stabil, magas trehalázaktivitást találtak három búzavonalban, egy fenyőfajban (jack pine) és egy csipkeharasztban (Selaginella lepidophyla). Stabil, alacsony trehalázaktivitást találtak a lucernában, a fekete mexikói édeskukoricában és a fehér lucfenyőben. Labilis, közepes aktivitást találtak két különböző canolaszuszpenzióban, de ezeket valószínűleg nem lehetett volna specifikus trehalázaktivitásként leírni. Az árpában, a rozsokban, a szójában és a fekete lucfenyőben egyáltalán nem találtak trehalázaktivitást (Kendall és munkatársai, idézett mű).
Azokban a szervezetekben, amelyek képesek a termelésére, a trehalóz a feltételezések szerint 6-foszfátjaként bioszintetizálódik, de szabad cukor alakjában tárolódik. Ennélfogva feltételezik, hogy azok a szervezetek, amelyek termelik és/vagy tárolják a trehalózt, rendelkeznek egy olyan foszfatázzal, amely képes a trehalóz-6-foszfát elbontására (Elbein, idézett mű). Alig tudunk valamit egy specifikus trehalóz-foszfatáz létezéséről a magasabb rendű növényekben.
A WO93/17093 Al számú nemzetközi szabadalmi bejelentés trehalóz termelését írja le egy transzgén élesztőben, amelyet élesztőből származó, trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló génekkel transzformáltak. A bejelentésben utalnak arra, hogy ezeket az élesztőgéneket alkalmazva magasabb rendű növényekben is lehetne trehalózt termelni, de az igénypontok között nem szerepel a trehalóz termeltetése egy növényben. Megjegyezzük, hogy a WO93/17093 Al számú nemzetközi szabadalmi bejelentés közzététele megelőzte találmányunk benyújtásának időpontját, de később történt találmányunk elsőbbségi időpontjánál.
Találmányunk tárgya eljárás trehalóz termelésére egy növényi gazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződni képes génnek az említett növényi gazdaszervezetben való jelenléte következtében, amely gén szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
b) egy DNS-szekvenciát, amely a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódolja, és adott esetben
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben.
Találmányunk egy másik megvalósítása magában foglalja a trehalóz termelését egy növényi gazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződni képes génnek az említett növényi gazdaszervezetben való jelenléte következtében, amely gén szekvenciája tartalmaz:
d) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
e) egy DNS-szekvenciát, amely a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódolja, és adott esetben
f) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben, és egy növényekben kifejeződni képes gént, amelynek szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
b) egy DNS-szekvenciát, amely egy olyan RNS-szekvenciát kódol, amely legalább részben komplementer egy olyan RNS-szekvenciával, amely egy, az említett növényi gazdaszervezetben természetesen előforduló szacharóz-foszfát-szintetáz-enzimet (SPS-t) kódol, és adott esetben
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben.
Találmányunk egy még további megvalósítása magában foglalja a trehalóz termelését egy növényi gazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződni képes génnek az említett növényi gazdaszervezetben való jelenléte következtében, amely gén szekvenciája tartalmaz:
HU 221 124 Β1
d) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
e) egy DNS-szekvenciát, amely a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódolja, és adott esetben
f) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben, és egy növényekben kifejeződni képes gént, amelynek szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
b) egy DNS-szekvenciát, amely egy olyan RNS-szekvenciát kódol, amely legalább részben komplementer egy olyan RNS-szekvenciával, amely egy, az említett növényi gazdaszervezetben természetesen előforduló ADP-glükóz-pirofoszforiláz-enzimet (AGP-ázt) kódol, és adott esetben
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben.
Találmányunk egy még további megvalósítása magában foglalja a trehalóz termelését egy növényi gazdaszervezetben, egy növényekben kifejeződni képes génnek az említett növényi gazdaszervezetben való jelenléte következtében, amely gén szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
b) egy DNS-szekvenciát, amely a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódolja, és adott esetben
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben, és egy növényekben kifejeződni képes gént, amelynek szekvenciája tartalmaz:
d) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
e) egy DNS-szekvenciát, amely egy olyan RNS-szekvenciát kódol, amely legalább részben komplementer egy olyan RNS-szekvenciával, amely egy, az említett növényi gazdaszervezetben természetesen előforduló szacharóz-foszfát-szintetáz-enzimet (SPS-t) kódol, és adott esetben
f) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben, és egy növényekben kifejeződni képes gént, amelynek szekvenciája tartalmaz:
g) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
h) egy DNS-szekvenciát, amely egy olyan RNS-szekvenciát kódol, amely legalább részben komplementer egy olyan RNS-szekvenciával, amely egy, az említett növényi gazdaszervezetben természetesen előforduló ADP-glükóz-pirofoszforiláz-enzimet (AGP-ázt) kódol, és adott esetben
i) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben.
Találmányunk kiterjed azokra a növényekben kifejeződő génekre is, amelyeket a trehalóz-előállító eljárásban használunk, valamint a növényekben kifejeződő gének kombinációira éppúgy, mint a klónozóplazmidokra, transzformációs vektorokra, mikroorganizmusokra és azon egyedi növényi sejtekre, amelyek a találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes géneket tartalmazzák.
A találmány tárgyához tartozik egy olyan növényi rekombináns DNS-genom is, amely egy olyan, növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfát-szintetázgént tartalmaz, amely természetes módon nincs jelen abban. A találmány tárgyához tartozik továbbá egy olyan növényi rekombináns DNS-genom, amely egy olyan, növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfátszintetáz-gént tartalmaz, amely természetes módon nincs jelen abban, és emellett egy olyan, növényekben kifejeződő gént is, amely gátolni képes egy SPS-aktivitás bioszintézisét és/vagy egy növényekben kifejeződő gént, amely gátolni képes egy AGP-áz-aktivitás bioszintézisét.
A találmány tárgyához tartozik továbbá egy módszer egy trehalóz termelésére képes növény létrehozására, amely módszer az alábbi lépéseket foglalja magában:
1. egy növényekben kifejeződni képes gén bejuttatása egy befogadó növényi sejtbe, amely gén szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
b) egy DNS-szekvenciát, amely a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódolja,
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben, és egy növényekben kifejeződni képes gént, amelynek szekvenciája tartalmaz:
d) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
e) egy DNS-szekvenciát, amely egy szelektíven felismerhető, az említett növényi gazdaszervezetben működőképes markergént kódol, és adott esetben
f) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely működőképes az említett növényi gazdaszervezetben,
2. egy növény kinevelése a transzformált sejtből olyan körülmények között, amelyek lehetővé teszik a szelektíven felismerhető markergén jelenléte alapján történő kiválasztást.
A találmány tárgyához tartoznak továbbá még azok a növények is, amelyek a genetikai módosítás eredményeként (fokozott mértékben) termelnek trehalózt.
A találmány tárgyához tartoznak továbbá az olyan növények, amelyek rekombináns DNS-genomja egy találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes gént tartalmaz.
A találmány tárgyához tartoznak azok a növények is, amelyek rekombináns DNS-genomja egy találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes gént tartalmaz, és trehalózt termelnek.
A találmány tárgyához tartoznak azok a növények is, amelyek a találmány szerinti rekombináns DNS-genommal rendelkeznek és fokozott szárazságtűrést mutatnak.
A találmány magában foglalja a találmány szerinti növények részeit is, mint amilyenek a sejtek vagy protoplasztok, vagy azok tenyészetei, virágok, gyümölcsök, levelek, virágpor, gyökerek (ideértve a hajszálgyökértenyészeteket), magok, hajtások, gumók (ideértve az úgynevezett minigumókat is) és hasonlók.
HU 221 124 Β1
Találmányunk oltalmi körébe tartozik egy eljárás is növények vagy növényi részek tartósítására trehalóz jelenlétében, amely az alábbi lépésekből áll:
1. egy találmány szerinti, trehalózt termelő növény termesztése,
2. a trehalózt tartalmazó növényi részek betakarítása, és
3. a növények vagy növényi részek légszárítása, vagy
4. a növények vagy növényi részek fagyasztva szárítása.
A találmány tárgyához tartoznak azok a növények is, amelyeket a találmány szerinti eljárással tartósítanak.
Találmányunk magában foglal még egy eljárást trehalóz előállítására, amely a következő lépésekből áll:
1. egy olyan növény termesztése, amely egy rekombináns DNS növényi genom jelenléte következtében képes (fokozott mértékben) trehalózt termelni,
2. az említett növény vagy növényi rész betakarítása,
3. a trehalóz kivonása az említett növényből vagy az említett növényi részből.
A találmány tárgyához tartozik egy további eljárás trehalóz előállítására, amely az alábbi lépésekből áll:
1. növényi sejtek tenyésztése, amelyek egy rekombináns DNS növényi genom jelenléte következtében képesek (fokozott mértékben) trehalózt termelni,
2. a trehalóz kivonása az említett növényi sejttenyészetből.
Találmányunk magában foglal még egy izolált nukleinsavszekvenciát, amely egy trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódol. Egy előnyös izolált nukleinsavszekvencia nyerhető E. coliból, még előnyösebb az az izolált nukleinsavszekvencia, amelyet a 2. számú szekvenciavázlat mutat be. Egy másik előnyös megvalósítás az a nukleinsavszekvencia, amely a 3. számú szekvenciavázlatban bemutatott aminosavszekvenciát kódolja.
Az ábrák leírása
1. ábra. A szacharóz és a keményítő vázlatos bioszintézisútjai a növényi tárolószövetben. Az ábrán látható, hogy a levelekben, fotoszintézissel termelt szénhidrátok szacharóz alakjában szállítódnak a háncsszövetben. A tárolószövetbe lépve a szacharózt egy membránhoz kötött invertáz monoszacharidokra, glükózra és ffuktózra bontja. Ezek a monoszacharidok egy sor enzimatikus lépéssel keményítővé és/vagy szacharózzá alakulnak át, mint az elnagyoltan látható az ábrán. Feltehetően a glükóz metabolitjai, a glükóz-6-foszfát (G-6-P) és az uridin-difoszfát-glükóz (UDP-G) szolgálnak annak a TPS-enzimnek szubsztrátjaiként, amelyet a növénybe manipuláltunk a növényekben kifejeződni képes oí.vA gén bejuttatásával. Az ábrán látható, hogy az SPS- és AGP-áz-enzimek szintjének csökkentése fokozza a szubsztrátként rendelkezésre álló UDP-G és G-6-P mennyiségét. Az enzimek gátlását a keresztek jelölik.
2. ábra. Vázlatos térkép a Kohara és munkatársai (1987) által készített, 7F11 számú EMBL4 kiónról, amely az E. coliból származó oZ.sBA operont tartalmazza. A 18,8 kb hosszúságú inszertumot árnyékolással jelöltük. Az otsfs gén klónozásához használt EcoRV és HindlII enzimek restrikciós helyeit feltüntettük éppúgy, mint távolságukat kilobázispárban (kb) az inszertum bal oldali végétől számítva. Az oteA és -B géneket feltüntettük, a nyilak a transzkripció irányát jelzik (a részletes térkép a 8. ábrán látható).
3. ábra. A klónozott burgonya SPS-cDNS-ének szekvenciája. Az aláhúzott szakasz az a kukoricaSPS-cDNS-szekvencia, amit oligonukleotidként használunk a PCR-bővítő reakcióban.
4. ábra. A pMOG664 bináris vektor vázlatos szerkezete.
5. ábra. A pTiBó egy részének restrikciós térképe, amelyen a pMOG579 vektorba klónozott két fragmentum látható.
6. ábra. A pMOG579 vázlatos szerkezete, amelyet a
T-szakasz nélküli helper plazmid megszerkesztéséhez használunk az MOG101 Agrobacterium törzsben.
7. ábra. A pMOG180 expressziós vektor vázlatos szerkezete.
8. ábra. A 7F11 számú EMBL4 klón részletes térképe
Kohara és munkatársai (1987) nyomán, ami az E. coliból származó o/.vBA operont tartalmazza. Az ábrán feltüntettük a TPS nyílt leolvasó keretének (ORF) elhelyezkedését. (*: a HindlII helyek nem szerepelnek Kohara és munkatársai térképén.)
9. ábra. A pMOG799 bináris vektor vázlatos szerkezete.
10. ábra. A pMOG801 bináris vektor vázlatos szerkezete.
11. ábra. A pMOG802 bináris vektor vázlatos szerkezete.
Találmányunk egy előnyös megvalósítása egy burgonyanövény, amely gumóiban trehalóz termelésére képes egy, növényekben kifejeződni képes gén jelenlétének következtében az említett burgonyanövényben, amely gén szekvenciája tartalmaz:
a) egy transzkripciós iniciátorszakaszt, amely a karfíolmozaikvírus (CaMV) 35S RNS-éből származik, és felülről egy kétszeres fokozó szakasz határolja,
b) egy, a trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-szekvenciát, amely az E. coli oteBA operonjában elhelyezkedő otsh. gén kódolószakasza,
c) egy transzkripciós terminátorszekvenciát, amely az Agrobacterium nopalin-szintetáz (nos)-génjéből származik. A transzgén növények gumói, amelyek tartalmazzák a növényekben kifejeződni képes TPS-gént, trehalózt termelnek, míg a kontrollnövények, amelyekből ez a gén hiányzik, nem. Nyilvánvaló, hogy a transzgén gumókban termelődő trehalóz-foszfát trehalózzá alakul át. Nyilvánvaló, hogy nincs szükség egy trehalóz-foszfát-foszfatáz-aktivitás biztosítására, mivel az - úgy látszik - jelen van a burgonyában.
Az 1. ábrán bemutatunk egy módot a TPS jobb szubsztrátellátottságának biztosítására. E célból a glü4
HU 221 124 Bl kóz-6-foszfát és az uridin-difoszfát-glükóz hozzáférhetőségét befolyásoló két gént, egy antiszensz SPS-gént és egy antiszensz AGP-áz-gént klónozunk a CaMV 35S promoter szabályozó hatása alatt a növényi gazdaszervezetben való kifejeződés céljára. Ha ezeket bejuttatjuk egy olyan növényi gazdaszervezetbe, amely a találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes TPSgént tartalmazza, fokozódni fog a TPS szubsztrátellátottsága és ennek megfelelően a trehalózszintézise is. A szakterületen járatosak könnyen rájöhetnek, hogy más antiszensz gének is használhatók a szacharóz vagy keményítő szintézisének gátlására a szubsztrátellátottság javítása céljából.
Noha találmányunkat részletesen burgonyanövényen írjuk le, amiben az E. coliból származó, növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfát-szintetáz-gén kifejeződik a CaMV 35S promoter mint transzkripciós iniciátorszakasz szabályozó hatása alatt, a szakterületen járatosak előtt nyilvánvaló lehet, hogy más magasabb rendű növényi gazdaszervezetek ugyanúgy alkalmasak lehetnek a trehalóz termelésére. Előnyös növényi gazdaszervezetek lehetnek a zárvatermők (Angiospermae), nevezetesen a kétszikűek (Dicotyledoneae), ahová többek között a burgonyafélék (Solanaceae) tartoznak reprezentatív családként, és az egyszikűek (Monocotyledoneae), ahová többek között a pázsitfűfélék (Gramineae) tartoznak reprezentatív családként. A megfelelő növényi gazdaszervezetek közé tartoznak - találmányunk szempontjából meghatározva - azok a növények (valamint az említett növények részei és sejtjei) és utódaik, amelyeket genetikailag módosítottunk rekombináns DNS-technikával a trehalóz termelésének megindítása vagy fokozása érdekében a kívánt növényben vagy növényi szervben; ezek a növények felhasználhatók közvetlenül (például azok a növényfajok, amelyek ehető részeket teremnek), vagy a trehalóz kinyerésére (ami történhet mind ehető, mind ehetetlen növényi gazdaszervezetekből). A találmány szerinti, ehető részeket termő növények közé tartoznak azok, amelyeknek virágzatát fogyasztják, például a karfiol (Brassica oleracea) vagy az articsóka (Cynara scolymus); amelyeknek gyümölcsét fogyasztják, például az alma (Malus pumila), a banán (Musa acuminata), a bogyós gyümölcsök, mint a ribiszke (Ribes rubrum), a szilvák [például a cseresznye (Prunus avium), az őszibarack (P. persica), a nemes szilva (P. domestica)], az uborka (Cucumis sativus), a szőlő (Vitis vinifera), a citrom (Citrus limon), a sárgadinnye (Cucumis meló), az olajos magvúak [például a dió (Juglans regia), a földimogyoró (Arachis hypogeae)], a narancs (Citrus sinensis), a körte (Pyrus communis), a paprika (Solanum capsicum), a szamóca (Fragaria moschata) vagy a paradicsom (Lycopersicon esculentum); amelyeknek leveleit fogyasztják, például a lucerna (Medicago sativa), a káposzták (Brassica oleracea), az endívia (salátakatáng; Cichorium endivia), a póréhagyma (Allium porrum), a saláta (Lactuca sativa), a paraj (spenót; Spinacia oleracea), a dohány (Nicotiana tabacum); amelyeknek a gyökerét fogyasztják, például a nyílgyökér (Maranta arundinacea), a cukorrépa (Béta vulgáris), a sárgarépa (Daucus carota), a kasszava (manióka, Manihot esculenta), a tarlórépa (Brassica rapa), a retek (Raphanus sativus), a jamszgyökér (Dioscorea esculenta) vagy az édesburgonya (Ipomoea batatas); amelyeknek a magvait fogyasztják, például a bab (Phaseolus vulgáris), a borsó (Pisum sativum), a szója (Glycine max), a búza (Triticum aestivum), az árpa (Hordeum vulgare), a kukorica (Zea mays) vagy a rizs (Oryza sativa); és amelyeknek a gumóit fogyasztják, például a karalábé (Brassica oleracea) vagy a burgonya (Solanum tuberosum), vagy hasonlók. Az ehető részek szárítással tartósíthatok a fokozott trehalózszint jelenlétében, amely bennük termelődött a növényekben kifejeződni képes trehalózfoszfát-szintetáz-gén jelenléte következtében. A fokozott szintű trehalóztermelés érdekében előnyös a TPSaktivitást kódoló DNS-t egy növényi szerv- vagy szövetspecifikus promoter szabályozó hatása alá rendelni; annak megválasztása könnyen eldönthető a szakemberek számára.
Bármely trehalóz-foszfát-szintetáz-gént a DNS növényi sejtekben történő kifejeződéséhez szükséges szabályozóelemek hatása alatt - akár specifikus, akár konstitutív - használhatunk, ha az képes egy aktív trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitás termelésére. A 2. számú szekvenciavázlat nukleinsavszekvenciája a valóságban bármely, a találmány szerinti trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódoló nyílt leolvasókeretben megváltoztatható az általa kódolt fehérje aminosavszekvenciájának szükségszerű megváltozása nélkül. Ez a genetikai kód degeneráltságának következménye. így tehát a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódoló nyílt leolvasókeret a kiválasztott növényi gazdaszervezet kódhasználatához adaptálható.
Ugyancsak a 2. számú szekvenciavázlat izolált nukleinsavszekvenciája használható fel a trehalóz-foszfátszintetáz-aktivitás kimutatására más szervezetekben, majd azt követően izolálására úgy, hogy a más forrásokból származó DNS-t az E. coli-génből nyerhető DNS- vagy RNS-fragmentumokkal hibridizáljuk. Az ilyen DNS-szekvenciákat előnyösen szigorú körülmények között (mint például a hőmérséklet, vagy a hibridizációs elegy ionerőssége), hibridizációval vizsgáljuk. A körülmények szigorúsága függ a hibridizáció jellegétől - azaz DNS: DNS, DNS: RNS vagy RNS: RNS hibridizáció -, valamint a legrövidebb hibridizálóffagmentum hosszától. A szakterületen jártasak számára egyszerű egy szigorú hibridizációs rendszer kialakítása.
A trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitás izolálásának forrásai lehetnek mikroorganizmusok (például baktériumok, élesztők, gombák), növények vagy állatok. A más forrásokból származó, trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást kódoló DNS-szekvenciák a találmány szerintihez hasonló eljárással használhatók fel trehalóz termelésére.
A találmány oltalmi körébe tartoznak olyan nukleinsavszekvenciák is, amelyeket a 2. számú szekvenciavázlat nukleinsavszekvenciájának módosítása útján kapunk meg egy vagy több kodon mutációval történő megváltoztatásával úgy, hogy az változást eredményez a fehérje aminosavszekvenciájában is, addig a határig,
HU 221 124 Β1 amíg az aminosavszekvencia mutációja nem szünteti meg teljesen a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitást.
Elvben bármely növényi gazdaszervezet alkalmas bármely, növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfát-szintetáz-génnel való kombinálásra. Amint más forrásokból származó trehalóz-foszfát-szintetáz-gének elérhetővé válnak, úgy azokat hasonló módon lehet majd használni az itt leírt, növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfát-szintetáz-génkombinációk létrehozásához.
Az endogén gének gátlása a trehalóz-foszfát-szintetáz szubsztrátellátottságának fokozása érdekében amire példaként említettük az endogén szacharóz-foszfát-szintetáz- és az ADP-glükóz-pirofoszforiláz-gén gátlását - számos módon valósítható meg, aminek megválasztása találmányunk szempontjából nem kritikus. Előnyös géngátlás érhető el az úgynevezett „antiszensz megközelítés”-sel. Ekkor egy olyan DNS-szekvencia fejeződik ki, amely egy olyan RNS-t termel, amely legalább részben komplementer azzal az RNS-sel, ami azt az enzimatikus aktivitást kódolja, amelyet gátolni kívánunk (példánkban az AGP-ázt vagy az SPS-t). Előnyös a homológ antiszensz (értelmetlen) gének használata, mert hatásosabbak a heterológ géneknél. E stratégia megvalósíthatóságát egy antiszensz SPS-gén burgonyából, egy kukorica-SPS-génszekvenciával mint szondával végzett izolálása bizonyítja. Ezzel nem arra kívánunk utalni, hogy találmányunk megvalósításához szükség van a homológ antiszensz fragmentumok használatára. A nem kívánt enzimatikus aktivitások szintézise egy alternatív módszerrel is blokkolható, amikor a növényi gazdaszervezetben jelen lévő endogén gén egy további másolatát építjük be a növényi gazdaszervezet genomjába. Gyakran megfigyelték, hogy egy gén egy további másolata elnémítja az endogén gént: ezt a hatást a szakirodalomban koszupresszív hatásnak vagy koszupressziónak nevezik.
Elvben azok a kétszikű és egyszikű növények, amelyek könnyebben transzformálhatok, módosíthatók úgy is, hogy egy találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes gént juttatunk egy befogadó sejtbe és felnevelünk egy új növényt, amely tartalmazza és kifejezi a növényekben kifejeződni képes gént. Találmányunk szempontjából azok a növények az előnyösek, amelyek képesek a trehalóz-foszfát trehalózzá konvertálására és nem vagy csak nagyon csekély trehalózlebontó aktivitást tartalmaznak. Belátható azonban, hogy azok a növények, amelyekből hiányzik a trehalóz-foszfát trehalózzá konvertálásának képessége, szintén találmányunk oltalmi körébe tartoznak. Az ilyen növények tovább módosíthatók járulékos gének bejuttatásával, amelyek olyan foszfatázokat kódolnak, amelyek képesek a trehalóz-foszfát trehalózzá konvertálására. Elvben azokkal a növényekkel is számolhatunk, amelyek trehalázokat tartalmaznak, mivel az ilyen növények alkalmassá tehetők a trehalóz termelésére a trehalázok aktivitásának gátlásával, például úgy, hogy az ilyen enzimeket kódoló gének kifejeződését gátolják az antiszensz megközelítés útján.
A növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfátszintetáz-gén bejuttatásának módja egy befogadó növényi sejtbe nem lényeges mindaddig, amíg a gén stabilan beépül az említett növényi sejt genomjába. Az Agrobacterium törzsek használata mellett számos más technika áll rendelkezésre a DNS bejuttatására növényi sejtekbe, mint például protoplasztok transzformálása a kalcium/polietilénglikol módszerrel, elektroporáció és mikroinjektálás, vagy a (bevont) szemcsék belövése [Potrykus, Bio/Technology 8, 535-542 (1992)].
A fenti, úgynevezett közvetlen transzformálómódszerek mellett vektorokat alkalmazó transzformálórendszerek széles köre is rendelkezésre áll, mint amilyenek a virális vektorok (például a karfiol-mozaikvírus, CaMV) és a bakteriális vektorok (például az Agrobacterium nemzetség fajai; Potrykus, idézett mű). Szelekció és/vagy szűrővizsgálat után a transzformálódott protoplasztok, sejtek vagy növényi részek teljes növényekké regenerálhatok a szakterületen ismert módszerekkel [Horsch és munkatársai, Science 225, 1229-1231 (1985)].
Ismert, hogy egyszikű növények alkalmasak a transzformációra, és fertilis transzgén növények regenerálhatok a transzformált növényekből. A reprodukálható szövettenyészet-rendszerek kifejlesztése, valamint a genetikai anyag növényi sejtekbe juttatására szolgáló erőteljes módszerek együtt elősegítik a transzformációt. Jelenleg az egyszikűek transzformálásának előnyös módszerei a mikroszemcsék belövése a növényi szövetdarabokba vagy a szuszpendált sejtekbe, és a DNS közvetlen felvétele vagy elektroporáció [Shimamoto és munkatársai, Natúré 338, 274-276 (1989)]. Transzgén kukoricanövényeket hoztak létre a Streptomyces hygroscopicus bar génjének bejuttatásával - amely a foszfinotricin-acetil-transzferázt kódolja (ez az enzim a foszfinotricin herbicidet inaktiválja) - a kukorica szuszpenziós tenyészetének embriogén sejtjeibe mikroszemcsék belövésével [Gordon-Kamm, Plánt Cell 2, 603-618 (1990)]. Beszámoltak genetikai anyag bejuttatásáról más egyszikűek, például búza és árpa aleuron protoplasztjaiba is [Lee, Plánt Mól. Bioi. 13, 21-30 (1989)]. Búzanövényeket regeneráltak embriogén szuszpenziós tenyészetből úgy, hogy csak az idősebb, kompakt és csomósodott embriogén kalluszszövetet választották ki az embriogén szuszpenziós tenyészet létrehozásához [Vasil, Bio/Technology 8, 429-443 (1990)]. A transzformáló rendszerek kombinálása ezekhez a növényekhez lehetővé teszi találmányunk egyszikűekre való alkalmazását. Ugyanakkor ezek a módszerek kétszikűek transzformálására és regenerálására is alkalmazhatók.
Egyszikű növények, köztük gazdaságilag fontos kultúrák, mint a kukorica, alkalmasak az Agrobacterium törzsekkel végzett DNS-transzferre [159.418 B1 számú európai szabadalmi leírás; Gould és munkatársai, Plánt Physiol. 95, 426-434 (1991)].
Ami a növényi gazdaszervezet megválasztását illeti, előnyös olyan növényfajt választani, amely nem, vagy csak kisfokú trehalózlebontó aktivitással rendelkezik. Nem zárható ki azonban, hogy egy trehalázaktivitással bíró növény megfelelő gazdaszervezet legyen a trehalóz termeléséhez, ámbár szükségessé válhat a trehalázaktivitás gátlásának biztosítása, ha az teljesen
HU 221 124 Β1 megakadályozza a trehalóz felhalmozódását. Az ilyen gátlás megvalósítható a szakterületen jól ismert antiszensz megközelítéssel, és más célra alkalmazva találmányunkban is bemutatjuk.
Belátható az is, hogy találmányunk nem korlátozódik a CaMV 35S promoter mint transzkripciós iniciátorszakasz használatára. A növényekben kifejeződni képes gének kifejeződését szabályozó, alkalmas DNSszekvenciák - köztük markergének, például transzkripciós iniciátorszakaszok, fokozok, nem átíródó vezérszekvenciák és hasonlók - származhatnak bármely olyan génből, amely egy növényi sejtben kifejeződik, például endogén növényi génből, növényi sejtekben természetes körülmények között kifejeződő génekből, például az Agrobacterium vad típusú T-DNS-én találhatókból, növényi vírusok génjeiből, valamint más eukarióta génekből, amelyek tartalmaznak egy transzkripciós iniciátorszakaszt, ami megfelel a transzkripciós iniciátorszakasz konszenzusszekvenciájának. Ugyancsak használhatók a hibrid promoterek, amelyek különböző promoterek funkcionális darabjaiból vagy azok szintetikus megfelelőiből vannak összekombinálva. A konstitutív promotereken kívül használhatók indukálható, vagy kifejeződésük során bármilyen más módon, például fejlődés- vagy sejttípus-specifikus módon szabályozott promoterek is a találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes gének kifejeződésének szabályozására mindaddig, amíg az olyan növényi részekben kifejeződnek, amelyek a TPS szubsztrátját tartalmazzák.
A transzformált sejtek kiválasztása vagy szűrővizsgálata céljából előnyös egy markergént kapcsolni a találmány szerinti, növényekben kifejeződni képes génhez, amit a növényi sejtbe juttatunk. A növény transzformálásához megfelelő markergén megválasztása jóval belül van az átlagosan képzett dolgozó ismeretkörén; a rutinszerűen használt markergénekre néhány példa a neomicin-foszfotranszferáz-gének, amelyek kanamicinrezisztenciát okoznak (EP-B 131.623 számú európai szabadalmi leírás), a patkánymájból izolált glutation-S-transzferáz-gén, ami rezisztenciát biztosít egyes herbicidekkel szemben (EP-A 256.223 számú európai szabadalmi leírás), a glutamin-szintetáz, amely túltermeléses rezisztenciát biztosít a glutamin-szintetáz gátlószereivel, például a foszfínotricinnel szemben (WO87/057327 számú európai szabadalmi leírás), a Streptomyces viridochromogenes acetil-transzferázgénje, amely szintén a foszfínotricinnel szemben nyújt rezisztenciát (EP-A 275.957 számú európai szabadalmi leírás), az 5-enol-sikimát-3-foszfát-szintetáz-génje, amely az N-(foszfono-metil)-glicinnel szemben okoz rezisztenciát, a bar gén, amely rezisztenciát okoz a bialafosz ellen (például a W091/02071 számú nemzetközi szabadalmi leírás), és a hasonlók. A marker megválasztása nem kritikus, amíg az működőképes (azaz szelektív) a választott növényi sejttel kombinálva.
A markergént és a szóban forgó gént nem szükséges összekapcsolni, mert az összekapcsolatlan gének kotranszformálása (4.399.216 számú amerikai egyesült államokbeli szabadalmi leírás) szintén hatásos módszere a növények transzformálásának.
A transzformálás számára előnyös növényi anyag különösen kétszikűek esetében - a levélkorong, ami könnyen transzformálható és jó a regenerációs képessége [Horsch és munkatársai, Science 227, 1229-1231 (1985)].
Bár a trehalóz termelése megvalósítható a növényekben kifejeződni képes trehalóz-foszfát-szintetáz-génnel, mint egyetlen szénhidrát-módosító génnel, találmányunkban példákat mutatunk be olyan járulékos, növényekben kifejeződni képes antiszensz génekre, amelyek képesek fokozni a trehalóz-foszfát-szintetáz szubsztrátellátottságát. Az ilyen génekre speciális példák a kukorica és a burgonya SPS-ának és a burgonya AGPázának növényekben kifejeződni képes antiszensz génjei. A szénhidrát-anyagcsere enzimeinek „leszabályozása” az antiszensz megközelítés alkalmazásával nem korlátozódik a fenti példákra. így például részlegesen komplementer, növényekben kifejeződni képes antiszensz gének használhatók egy célgén kifejeződésének gátlására akkor, ha a növényekben kifejeződni képes antiszensz gén egy olyan transzkriptumot termel, amely megfelelő mértékben komplementer a célgén transzkriptumával és kellő hosszúságú ahhoz, hogy az említett célgén kifejeződését gátolja.
Találmányunk szempontjából közömbös, hogy a két vagy több gén jelenlétét ugyanazon növényben hogyan érjük el. Ez többek között az alábbi módszerek egyikével valósítható meg:
a) a növényvonal transzformálása egy multigénszerkezettel, ami egynél több bejuttatandó gént tartalmaz,
b) ugyanazon növényvonal kotranszformálása különböző szerkezetekkel egy időben,
c) ugyanazon növény többszöri, egymást követő transzformálása a bejuttatandó génekkel,
d) két olyan növény keresztezése, amelyek az ugyanabba a növénybe juttatni kívánt, különböző géneket hordozzák.
Találmányunk alkalmazásának területe a mezőgazdaság és a kertészet, például a módosított növények jobb tulajdonságai miatt, valamint az ipar bármely ága, ahol trehalózt használnak vagy használni fognak. A trehalóz-foszfátot és a trehalózt használhatják mint olyanokat például tisztított formában vagy keverékekben, vagy tárolt tennék formájában a növényi részekben. A (fokozott mennyiségű) trehalóz-foszfátot vagy trehalózt tartalmazó növényi részek használhatók önmagukban, vagy feldolgozhatok anélkül, hogy szükség lenne trehalóz hozzáadására.
A trehalóz ki is vonható a termelő növényekből vagy növényi részekből, és azt követően felhasználható ipari eljárásokban. Az élelmiszeriparban a trehalóz arra használható, hogy élelmiszerekhez adják szárítás előtt. Az élelmiszerek szárítása fontos ipari tartósító módszer. A trehalóz különösen jól használhatónak tűnik az élelmiszer-ipari termékek hagyományos, légszárítással történő tartósításában, és lehetővé teszi a magas minőségű termék gyors visszaalakulását a víz hozzáadása után (Roser és munkatársai, Trends in Food Sci. Technoi. 1991. július, 166-169). Az előnyök közé tartozik a természetes aromák és illatanyagok, a friss termék íze és
HU 221 124 Β1 tápértéke (a fehérjék és vitaminok) megőrzése. Kimutatták, hogy a trehalóz képes a fehérjék és membránok stabilizálására, és egy kémiailag inért, stabil üvegmáz kialakítására. Az ilyen, tökéletesen megszárított élelmiszerek alacsony vízaktivitása megelőzi a kémiai reakciókat, amelyek selejtet okozhatnak.
Ipari növények, mint a kukorica, kasszava, burgonya, cukorrépa és cukornád, régóta használatosak a szénhidráttermékek (keményítők és szacharóz) tömeges előállítására. A trehalóz termelése ezekben a növényekben, elősegítve a trehalóz bioszintézisútjának génmanipulációval végzett beépítése által, lehetővé tenné az ilyen manipulált növények felhasználását a trehalóz termelésére.
Találmányi bejelentésünkben a hivatkozások a szakterület azon szintjét jelentik, amelyen találmányunk alapszik. Az összes közleményt és szabadalmi leírást, amelyre eddig hivatkoztunk vagy amelyekre később hivatkozni fogunk, találmányi bejelentésünkben referenciaként tartjuk számon.
Az alább következő példákat a lehetőségek bemutatására szánjuk és azok semmi módon nem korlátozzák találmányunk oltalmi körét.
Kísérleti módszerek DNS-sel végzett műveletek
Az összes, DNS-sel végzett műveletet (a DNS izolálását E. coliból, hasítását, kapcsolását, transzformálását stb.) a standard receptúrák szerint hajtjuk végre (Sambrook és munkatársai: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. kiadás, Cold Spring Harbor Laboratory Press, CSH, New York, 1989).
Törzsek
Minden példában az E. coli K-12 DH5a törzsét használjuk a klónozáshoz. A növények transzformálásához használt Agrobacterium tumefaciens törzs az MOG101, amely az LÁB 1010 törzsből [Koekman és munkatársai, Plasmid 7, 119 (1982)] a T-DNS-nek egy szpektinomicinrezisztencia-markerrel való helyettesítésével létrehozott, nem onkogén oktopin típusú helpertörzs.
Az MOG101 Agrobacterium törzs létrehozása
Egy bináris vektorrendszert [Hoekema és munkatársai, Natúré, 303, 197 (1983)] használunk a génszerkezetek bejuttatására a burgonya- és dohánynövényekbe. A helperplazmid, amely az Agrobacterium tumefaciens virulenciafunkcióit adja, a pTiBó oktopin Ti-plazmidból származik. Az MOG101 egy olyan Agrobacterium tumefaciens törzs, amely egy nem onkogén Ti-plazmidot hordoz (Koekman és munkatársai, idézett mű), amiből a teljes T-szakasz ki van vágva és egy bakteriális szpektinomicinrezisztencia-markerrel van helyettesítve a Tnl831 transzpozonból [Hooykaas és munkatársai, Plasmid 4, 64-75 (1980)].
A pTiB6 Ti-plazmid két szomszédos T-szakaszt, a TL-t (bal oldali T) és a TR-t (jobb oldali T) tartalmaz. A TL- és TR-hiányos származék létrehozásához megszerkesztjük a pMOG579 átmeneti vektort. A pMOG579 plazmid a pBR322 plazmidnak egy olyan származéka, amely két olyan Ti-plazmid-fragmentumot tartalmaz, amelyek homológok a pTiB6 T-szakaszaitól balra és jobbra kifelé elhelyezkedő fragmentumokkal (az
5. és 6. ábrán árnyékolással jelölve). A két fragmentumot a pMOG579-ben egy 2,5 kb hosszúságú BamHI/HindlII fragmentum választja el, ami Tnl831 transzpozonból származik [Hooykaas és munkatársai, Plasmid 4, 64-75 (1980)], és a szpektinomicinrezisztencia-markert hordozza (6. ábra). A plazmidot bejuttatjuk az LBA1010 jelzésű Agrobacterium tumefaciens törzsbe [C58-C9 (pTiB6) = egy kigyógyított C58 törzs, amelybe a pTiB6 plazmidot triparentális mating útján visszük be E. coliból, a HB101 8pRK2013 helperként való használatával. A transzkonjugánsokat rifampicin- (20 mg/1) és szpektinomicin- (250 mg/1) rezisztenciájuk alapján választjuk ki. Egy kettős rekombináció a pMOG579 és pTiB6 között a karbenicillinrezisztencia (a pBR322 marker) elvesztését és a teljes Tszakasz kiesését okozza, A mintegy 5000 szpektinomicinrezisztens transzkonjugánsból, amit replikamódszerrel vizsgáltunk 100 mg/1 karbenicillinen, mindössze kettőt találtunk érzékenynek. A Southem-analízis azt mutatta, hogy a kettős átkereszteződési esemény kivágta a teljes T-területet. Az így kapott törzs az MOG101. A törzs és megszerkesztése analóg a GV2260 törzsével [Deblaere és munkatársai, Nucl. Acid Rés. 13, 4777-4788 0985)].
Az MOG101 helyett helpertörzsként használhatjuk például az LBA4404-et; ez a törzs ugyancsak megfelelően használható egy bináris plazmid, mint amilyen a pMOG779 bejuttatására és az azt követő növénytranszformálásra. Más megfelelő helpertörzsek is elérhetők.
A pMOG180 expressziós vektor létrehozása
A pMOG180 expressziós vektor a pMOG18 (EP-O 479.359 Al számú európai szabadalmi leírás, 2b. példa) vektor származéka, amiből a GUS-t kódoló gént eltávolítjuk és más géneket inszertálunk az AMV RNS4 vezérszekvencia és a 3’ nos terminátor közé egy BamHI fragmentum alakjában.
Ebből a célból a pMOG18 EcoRI/NcoI fragmentumát, amely a 35S promotert és az AMV RNS4 vezérszekvenciát tartalmazza, PCR-technikát használva szintetikus úton állítjuk elő az alábbi indítószakaszokkal:
5' GTTTCTACAGGACGGAGGATCCT GGAAGTATTTGAAAGA 3 ’ és ’ CAGCTATGACCATGATTACG 3 ’ amivel az Ncol helyet BamHI hasítási hellyé mutáltatjuk. A pMOG18 vektort ezután EcoRI-gyel és BamHI-gyel elvágjuk, ami után az újonnan szintetizált EcoRI/BamHI fragmentumot beragaszthatjuk a restrikciós helyek közé. A PCR-technika okozta véletlen mutációk elkerülésére a promoterszekvenciákban, a szintetikus EcoRI/BamHI fragmentum EcoRI/EcoRV szakaszát kicseréljük egy vad típusú szekvenciára a pMOG18 plazmidból. A rövid EcoRV/BamHI szakaszt szekvenálással ellenőrizzük. Az így kapott plazmidvektor a pMOG180 (7. ábra).
Triparentális mating
A bináris vektorokat a pRK2013 plazmidot [Ditta és munkatársai, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77, 7347 (1980)] tartalmazó HB101 E. coli törzsön keresztül jut8
HU 221 124 Β1 tatjuk az Agrobacterium tumefaciens MOG101 törzsbe és használjuk fel transzformálásra.
A dohány (Nicotiana tabacum SRI) transzformálása
A dohányt a leírt bináris vektort hordozó A. tumefaciens MOG101 törzs [Hoekema és munkatársai, Natúré 303, 179-180 (1983)] és a növényi szövetek együttes tenyésztésével transzformáljuk. Ezt úgy vitelezzük ki, hogy a dohány (Nicotiana tabacum cv. Petit Havana SRI) levélkorongjait használjuk Horsch és munkatársai [Science, 227, 1229-1231 (1985)] leírása szerint. A transzgén növényeket a szelekciós táptalajon amely vagy kanamicint, vagy higromicint tartalmaz a bináris plazmidban jelen levő rezisztenciagénnek megfelelően - kinövő hajtásokból regeneráljuk, gyökereztetjük és ültetjük át talajba.
A burgonya transzformálása
A burgonyát (Solanum tuberosum cv. Désiree) a szóban forgó bináris vektort hordozó A. tumefaciens MOG101 törzzsel transzformáljuk a leírásnak megfelelően [Hoekema és munkatársai, Bio/Technology 7, 273 (1989)]. Az alaptápközeg az MS3OR3, amely MS-tápközegből [Murashige és Skoog, Physiol. Plán. 14, 4Ί3 (1962)] áll, kiegészítve 30 g/1 szacharózzal, R3 vitaminokkal [Ooms és munkatársai, Theor. Appl. Génét. 73, 744 (1987)], 5 pmol zeatin-riboziddal (ZR) és 0,3 pmol indol-ecetsavval (IAA). A tápközeget, ha szükséges, 0,7 g/1 Diachin agarral szilárdítjuk meg.
A Solanum tuberosum cv. Désiree gumóit meghámozzuk és felületüket 0,1% Tween-20-at tartalmazó 0,6%-os nátrium-hipoklorit-oldattal 20 percen át fertőtlenítjük. Ezután a burgonyákat nagy térfogatú steril vízben alaposan mossuk legalább 2 órán át. A gumószövetből dugófúróval készített hengereket körülbelül 2 mm vastagságú korongokra vágjuk. A korongokat 20 percig inkubáljuk egy szuszpenzióban, ami ZR-ot és IAA-at nem tartalmazó MS3OR3 tápközegből és 10ő-107 baktérium/ml mennyiségű, a bináris vektort hordozó Agrobacterium MOGlOl-ből áll. A korongokat ezután szárazra itatjuk steril szűrőpapíron és átrakjuk ZR-ot és IAA-at tartalmazó, szilárd MS3OR3 táptalajra. Két nap múlva a korongokat átrakjuk egy friss táptalajra, amely 100 mg/1 cefotaximot és 50 mg/1 vankomicint tartalmaz. Egy hét után a korongokat újra átrakjuk ugyanarra a táptalajra, ami ekkor 100 mg/1 kanamicint tartalmaz a transzgén hajtások kiválasztásához. A korongokból kiemelkedő hajtásokat 4-8 hét múlva levágjuk és gyökereztető táptalajba tesszük át (MS3OM3 ZR és IAA nélkül, 100 mg/1 cefotaximmal és 100 mg/1 kanamicinnel). A hajtásokat axenikus körülmények között, merisztémaosztással szaporítjuk és a gyökerek megjelenése után talajba ültetjük át. Itt 10 mg/1 higromicint használunk a szelektálásra a 100 mg/1 kanamicin helyett.
A cv. Kardal burgonyát lényegében a cv. Désireevel azonos módon transzformáljuk, kivéve az alábbi módosításokat. A növényi hormonok mennyisége az alaptápközegben: 3,5 mg/1 zeatin-ribozid és 0,03 mg/1 indol-ecetsav. A transzformáláshoz használt Agrobacterium-szuszpenzióban a csíraszám 105—106 baktérium/ml. A kanamicin koncentrációja a gyökereztető táptalajban 50 mg/1.
A trehalóz mérése
A trehalózt lényegében Hottiger és munkatársai [J. Bact. 169, 5518 (1987)] leírása szerint mérjük. A burgonyagumó-szövetet folyékony nitrogénban megfagyasztjuk, mozsárban elporítjuk és ezután 60 percen át extraháljuk szobahőmérsékleten, körülbelül háromszoros térfogatnyi, 500 mmol-os triklór-ecetsav-oldatban. Centrifugálás után az üledéket még egyszer extraháljuk ugyanígy. A két extrakció egyesített felülúszóját antronpozitív anyag jelenlétére vizsgáljuk [Spiro, Meth. Enzymol. 8, 3 (1966)]. A trehalózt vékonyrétegkromatográfiával azonosítjuk. Az extraktumot ionmentesítjük (Merck, Ion exchanger V) és Silica Gél 60 (Merck) lemezekre visszük fel. Miután a lemezeket butanol: piridin: víz = 15:3:2 térfogatarányú oldószerelegyben megfuttattuk, a foltokat tömény kénsavban oldott 5 mg/ml vanillinnal permetezve és 130 °C-ra melegítve tesszük láthatóvá. Standardnak kereskedelmi (Sigma) trehalózt használunk.
A trehalóz kvantitatív mérését ioncserélő kromatográfiával és impulzusüzemű amperometriás detektorai végezzük. Az extraktumot úgy készítjük, hogy 1 ml forró vizet adunk 1 g fagyasztott anyaghoz és 15 percen át forraljuk tovább. A 25 μΐ-es mintákat egy Dionex DX-300 folyadékkromatográfban vizsgáljuk, amely 4x250 mm-es Dionex 35391 Carbopac PA-1 oszloppal és egy 4x50 mm-es Dionex 43096 Carbopac PA-1 előtétoszloppal van felszerelve. Az eluálást 100 mM nátrium-hidroxid-oldattal, 1 ml/perc sebességgel végezzük. A cukrokat egy Dionex PAD-2 impulzusüzemű amperometriás detektor érzékeli. Standardnak kereskedelemben kapható (Sigma) trehalózt használunk.
Az enzimek mérése
Minden méréshez nem transzgén gumóanyagot vagy nem transzgén dohányanyagot használunk kontrollként. A minták fehérjetartalmát Bradford szerint határozzuk meg [Bradford, Anal. Biochem. 72, 248 (1976)]. A gumókivonatokban végzett mérésekhez körülbelül 100 mg-os fagyasztott burgonyagumó-szeleteket homogenizálunk 100 μΐ 20 mmol-os HEPES-pufferben (pH = 7,4), és centrifugáljuk (Eppendorfkészülék, 5 perc maximális sebességen). Az aktivitás méréséhez a felülúszót használjuk.
SPS-aktivitás mérése
Az SPS-aktivitást lényegében Amir és Preiss leírása szerint végezzük [Plánt Physol. 69, 1027-1030 (1982)]. A reakcióelegy összetételének megváltoztatásával az SPS-aktivitás két különböző formája mérhető meg: a Vmax és a Vse,-A Vmax reakcióelegy 3,2 mmol UDP-glükózt, 81 pmol [14C]-UDP-glükózt, 3,2 mmol fruktóz-6-foszfátot, 16 mmol glükóz-6-foszfátot, 100 mmol HEPES-puffert (pH=7,4), 20 mmol magnézium(ll)-kloridot és 5 mmol EDTA-t tartalmaz 50 μΐ végtérfogatban. A Vse| reakcióelegyben a fruktóz-6foszfát és glükóz-6-foszfát koncentrációját megfelezzük és 5 mmol szervetlen foszfátot adunk hozzá. Kontrollként az SPS-aktivitást a VmM reakcióelegyben mérjük ffuktóz-6-foszfát és glükóz-6-foszfát nélkül. A reak9
HU 221 124 Β1 ciót szobahőmérsékleten, 30 percig folytatjuk, és az elegy 5 percen át 95 °C hőmérsékletre melegítésével állítjuk meg. A reakció termékeit alkalikus foszfatázzal kezeljük, a kapott [14C]-szacharózt ioncserélő kromatográfiával választjuk el a szubsztrátoktól. A reakcióban 5 keletkező, radioaktivitással jelölt szacharóz mennyiségét szcintillációs számlálóval mérjük meg.
TPS-aktivitás mérése
A TPS-aktivitást az SPS-aktivitással azonos módon mérjük. Az ioncserélő kromatográfia után a minták 10 defoszforilált szacharózt és trehalózt tartalmaznak. Annak megmérésére, hogy a keletkezett termékeknek mekkora hányada a trehalóz, a mintákat a már leírt módon, vékonyréteg-kromatográfiával elválasztjuk. Az extraktumokat ionmentesítjük (Merck, Ion exchanger V) és Silica Gél 60 (Merck) lemezekre visszük fel. A kromatografálás után a [14C]-szacharózt és a [14C]-trehalózt tartalmazó foltokat lekaparjuk és egy szcintillációs számlálóban mérjük.
AGP-áz-aktivitás mérése
Az AGP-áz-aktivitást Müller-Röber és munkatársai szerint mérjük [EMBO J. 11, 1229 (1992)]. A glükóz-1foszfát keletkezését mérjük ADP-glükózból egy NADfüggő glükóz-6-foszfát-dehidrogenáz-rendszerben.
A reakcióelegy 80 mM HEPES-puffert (pH = 7,4), 25 10 mM magnézium(II)-kloridot, 1 mM ADP-glükózt,
0,6 mM NADot, 10 μΜ glükóz-1,6-difoszfátot, 3 mM ditiotreitolt (DTT), 0,02% marha-szérumalbumint, 1 U nyúlizom-foszfo-glükomutázt (Sigma), 2,5 U NADfüggő Leuconostoc mesenteroides glükóz-6-foszfát-de- 30 hidrogenázt és burgonyagumó-kivonatot tartalmaz.
A reakciót tetranátrium-difoszfát 2 mM végkoncentrációig való hozzáadásával indítjuk meg. A NAD redukcióját spektrofotometriával mérjük 340 nm-nél, 30 °C hőmérsékleten. Az AGP-áz-aktivitás egysége: 1 nmol glükóz-1-foszfát keletkezik 1 perc alatt, 30 °C hőmérsékleten.
1. példa
Teljes hosszúságú E. coli otsA gén klónozása Az E. coliban a trehalóz-foszfát-szintetázt (TPS) az oteA gén kódolja, ami az otoBA-operonban helyezkedik el. Ennek az operonnak a helyét az E. coli kromoszómájában, és transzkripciójának irányát ismerjük [Kaasen és munkatársai, J. Bact. 174, 889 (1992)]. Az oísA gén a 42’-nél helyezkedik el, és Kaasen és munkatársai szerint egy 18,8 kb hosszúságú fragmentumra korlátozódik az EMBL4 genomiális kiónban, Kohara és munkatársai térképén 7F 11-nek jelölve [Cell 50, 495 (1987)]. DNS-t preparálunk a 7F11 lambda-klón lizátumából és HindlII-mal emésztjük. Az izolált, 2,9 kb hosszúságú HindlII fragmentumot (a Jobb oldali” HindlII hely a 15 14,3 kb-nál az inszertumban nincs feltüntetve Kohara és munkatársai térképén, amint azt már Kaasen és munkatársai megjegyezték) a HindlII-mal kiegyenesített pUC18 plazmidba klónozzuk. Az így kapott, pMOG674 jelzésű plazmid 2,9 kb hosszúságú HindlII 20 inszertum szekvenciáját meghatározzuk. A szekvencia tartalmazza az arabinóz-transzportoperon araü génjének egy részét [Scripture és munkatársai, J. Mól. Bioi. 179, 31 (1987)], a TPP-t kódoló oteB gént, amint azt Kaasen és munkatársai lokalizálták, és a TPS-t kódoló otsA gén egy részét. Eszerint az otsA gén nem korlátozódik a 2,9 kb HindlII fragmentumra, mint ahogy azt Kaasen és munkatársai állították. A szekvencia kiegészítése érdekében egy átlapoló BamHI/EcoRI fragmentumot izolálunk és részben szekvenáljuk. Az otsA gén teljes TPS-kódoló szekvenciáját a 2. számú szekvenciavázlatban mutatjuk be. Az otsA gén helyzetét a 7F11 kiónban, és a használt restrikciós helyeket a 8. ábrán mutatjuk be. Egy további HindlII restrikciós hely amely nincs feltüntetve Kohara és munkatársai térké35 pén - található a 2,9 kb fragmentum „bal oldalán”.
A HindlII helyet a pMOG180 plazmidban egy SstI hely váltja fel, ha az alábbi oligonukleotidkettőst:
SstI ’ AGCTCACGAGCTCTCAGG 3 ’ 8. számú szekvenciavázlat 3 ’ GTGCTCGAGAGTCCTCGA 5’ 9. számú szekvenciavázlat klónozzuk a HindlII-mal felvágott pMOG180 plazmidba. Az így kapott vektort pMOG746-nak nevezzük.
A következő oligonukleotidkettőst: 45
BamHI Sphl HindlII
Smal ' GATCCCCCGGGGCATGCAAGCTTG 3 ’ GGGGCCCCGTA CGTTCGAA CCTA G
BamHI ’ 10. számú szekvenciavázlat 5’ 11. számú szekvenciavázlat a BamHI-gyel kiegyenesített pMOG746 vektorba klónozzuk. A vektort a kívánt orientációjú oligonukleotidkettőssel (restrikciós enzimes emésztéssel ellenőrizve) pMOG747-nek nevezzük. A pMOG674 vektor 2,9 kb HindlII fragmentumát a HindlII-mal kiegyenesített pMOG747 plazmidba klónozzuk, és így kapjuk a pMOG748 plazmidot. A körülbelül 2,4 kb hosszúságú
EcoRV/SstI és a körülbelül 3,5 kb hosszúságú SstFSmal fragmentumokat izoláljuk a pMOG748 plazmidból, összekapcsoljuk és E. coliba transzformáljuk, amivel kiejtjük a 2,9 kb-os HindlII fragmentum 3’ végét. A kapott plazmid jele pMOG749. Az otsA gén 5’ végét PCR-eljárással szintetizáljuk, templátként használva a TPS1 és TPS2 szintetikus oligonukleotidokat a pMOG749 plazmiddal.
HU 221 124 Β1
TPS1 5 ’ GAGAAAATACCCGGGGTGATGAC 3 ’ TPS2 5 ’ GATAATCGTGGATCCAGATAATGTC 3 ’
12. számú szekvenciavázlat
13. számú szekvenciavázlat
Szekvenálással sikerült megerősíteni, hogy a 0,4 kb PCR-fragmentum szekvenciája korrekt. A pMOG749 1 kb BamHI/HindlII fragmentumát a 0,4 kb-os Xmal/BamHI PCR-fragmentummal együtt klónozzuk az Xmal-gyel és HindlII-mal kiegyenesített pMOG747 plazmidba. Az így kapott plazmidba - amit HindlII-mal és Sstl-gyel emésztünk - klónozzuk a TPS6/7 szintetikus oligonukleotidkettőst, ami a TPS három C-terminális aminosavát kódolja.
LysLeuAlaStop
TPS6/7 5’ AGCTGGCGTGAGGAGCGGTTAATAAGCTTGAGCT 3’ 3’ CCGCACTCCTCGCCAATTATTCGAAC 5’
A kapott plazmidba, amit HindlII-mal és Sstl-gyel emésztünk, a pMOG749 plazmid 0,25 kb-os 15 HindlII/Sstl fragmentumát klónozzuk, mert ez tartalmazza az Agrobacterium tumefaciens nopalin-szintetáz (NOS)-génjének terminátorát. A kapott plazmid a pMOG798. Ez a plazmid tartalmazza az E. coli otsA génjét a megfelelő orientációban a CaMV kettős fokozó- 20 val rendelkező 35S promoterének szabályozó hatása alatt [Guilley és munkatársai, Cell 30, 763 (1982)], a lucema-mozaikvírus (AMV) RNS4 vezérszekvenciáját [Brederode és munkatársai, Nucl. Acids Rés. 8, 2213 (1980)] és az Agrobacterium tumefaciens nopalin-szinte- 25 tázának transzkripciós terminátorszekvenciáját. A teljes expressziós kazettát egy 2,5 kb hosszúságú EcoRI/SstI fragmentumként klónozzuk az EcoRI-gyel és Sstl-gyel kiegyenesített pMOG23 bináris vektorba. Az így kapott pMOG799 bináris vektort (9. ábra) használjuk burgonya 30 és dohány transzformálására. (A pMOG799 plazmidot hordozó E. coli törzset letétbe helyeztük a Centraal Bureau voor Schimmelcultures (CBS), Phabagen Collections, Padualaan 8, Utrecht, Hollandia gyűjteményében,
CBS 430.93 szám alatt, 1993. augusztus 23-án; a 35 pMOG23 plazmidot CBS 102.90 szám alatt, 1990. június 29-én.)
2. példa
Trehalóztermelés a pMOG799plazmiddal transz- 40 formált dohánynövényben
Dohánylevélkorongokat a pMOG799 bináris vektorral transzformálunk az Agrobacterium tumefaciens segítségével. Húsz, egymástól független transzgén hajtást vizsgáltunk a trehalóz-foszfát-szintetáz-aktivitás jelen- 45 létére. Néhány in vitro nevelt dohánynövény gyökerei rendkívül vastagok voltak a nem transzformált növényekéhez képest. Az ilyen transzgén növények gyökereinek analízise magasabb trehalózszintet mutatott a nem transzgén kontrollnövényekhez képest. 50
Néhány transzformált dohány növény leveleinek analízisénél a következő táblázatban megadott trehalóztartalmakat kaptuk (a frissen begyűjtött levelek tömeg%-ára számítva).
Vonal | Trchalóztartalom |
799 1 | 0,004 |
799-3 | 0,002 |
799-5 | 0,008 |
799-15 | 0,006 |
799-24 | 0,002 |
799-26 | 0,005 |
799-32 | 0,006 |
799-40 | 0,012 |
vad típus | 0,000 |
3. példa
Trehalóztermelés a pMOG799plazmiddal transzformáit burgonyanövényekben
Burgonyagumó-korongokat a pMOG799 bináris vektorral transzformálunk az Agrobacterium tumefaciens segítségével. A transzgén hajtásokat kanamicinnel szelektáljuk. Húsz, egymástól független transzgén hajtást vizsgáltunk a trehalóz-foszfát-szintetázaktivitás jelenlétére. Az enzimet tartalmazó hajtásokból teljes növényeket neveltünk. Az ilyen transzgén növények érett gumóinak analízise emelkedett trehalózszintet mutatott a nem transzgén kontrollnövényekéhez képest. Az MOG799.1 transzgén növényvonalat tovább termesztjük a későbbi vizsgálatok számára.
4. példa
A pMOG664 plazmid megszerkesztése
Két oligonukleotidot szintetizálunk, amelyek megfelelnek a cv. Désiree burgonyagumó ADP-glükóz-pirofoszforiláz (AGP-áz B) kisebb alegysége cDNS-szekvenciájának [Müller-Röber és munkatársai, Mól. Gén. Génét. 224, 136-146(1990)]:
5' rCCCCATGGJJ TCAA A GCA TCC 3 ’ ’ GATTGGATCCAGGGCACGGCTG 3'
4. számú szekvenciavázlat
5. számú szekvenciavázlat
Az oligonukleotidokat úgy terveztük, hogy alkalmas restrikciós helyeket (BamHl és Ncol, aláhúzva) tartalmazzanak a végeiknél, amelyek lehetővé teszik a be60 építésüket egy expressziós kazettába antiszensz orientá11
HU 221 124 Β1 cióban, az ezekkel az enzimekkel végzett emésztés után. Egy, körülbelül 1 kb hosszúságú fragmentumot kibővítünk ezekkel az oligonukleotidokkal PCR-technikát használva; templátként 2 hónapos cv. Désiree burgonyái evél-szövetből készült cDNS-könyvtárból (Clontech) izolálunk DNS-t. Szekvenciaanalízissel kimutatható, hogy a fragmentum azonos a cv. Désiree burgonya AGP-ázának B szekvenciájával (Müller-Röber és munkatársai, idézett mű). BamHI-gyel és Ncol-gyel végzett emésztés után a fragmentumot az ugyanezen enzimekkel felnyitott pM0G18 vektorba klónozzuk. A kapott plazmidból az 1,85 kb hosszúságú EcoRI/BamHI fragmentumot (ami a CaMV 35S promotert, az AMV RNS4 vezérszekvenciát és az antiszensz irányultságú AGP-áz-fragmentumot tartalmazza), valamint a BamHI/HindlII fragmentumot (amely a nopalin-szintetáz (NOS)-gén terminátorszekvenciáját tartalmazza az
Agrobacterium tumefaciensből) háromirányú ligálással a pMOG22 vektorba klónozzuk, amit EcoRI-gyel és HindlII-mal linearizálunk. A pMOG22 bináris vektor tartalmazza a transzgén növények kiválogatásához szükséges, növényekben kifejeződni képes HPTII higromicinrezisztencia-gént. (A pMOG22 plazmidot 1990. január 29-én helyeztük letétbe a Centraal Bureau voor Schimmelcultures-nél 101.90 letéti szám alatt.) Az így kapott pMOG664 bináris vektort (4. ábra) burgo10 nya transzformálására használjuk.
5. példa
A pMOG801 plazmid megszerkesztése
Egy, a kukorica szacharóz-foszfát-szintetáz (SPS) cDNS-szekvenciájával [Worrell és munkatársai, Plánt Cell 3, 1121 (1991)] komplementer oligonukleotidkészletet szintetizálunk, aminek szekvenciája a következő:
5' CT A GGTCGTGA TTCTGA TA CA GGTGGCCA GGTG 3’ 6. szekvenciavázlat 5 ’ CAGCATCGGCATAGTGCCCATGTATCACGTAAGGC 3 ’ 7. szekvenciavázlat
Ezeket az oligonukleotidokat arra használjuk, hogy PCR-technikával kibővítsünk velük egy 370 bázispár hosszúságú DNS-fragmentumot, templátként 2 hónapos cv. Désiree burgonyalevél-szövetből készült 25 cDNS-könyvtárból (Clontech) izolált DNS-t használva. Szekvenciaanalízissel kimutatható, hogy ez a fragmentum homológ a kukorica SPS-szekvenciájával (3. ábra és Worrell és munkatársai id. közleménye).
A PCR-fragmentumot a 2 hónapos Désiree burgonyalevél-szövetből készített cDNS-könyvtár (Clontech) lambda-gtlO könyvtárának szűrésére használjuk. Az egy pozitívan hibridizáló klón inszertumát szekvenciaanalízissel megvizsgálva, a 654 bázispár hosszúságú fragmentum 65%-át azonosnak találtuk a kukoricaSPS-szekvencia megfelelő részével (a 349. nukleotidtól kezdve, Worrell és munkatársai idézett közleményének 11. ábráján). E klón EcoRI inszertumát a BamHI-gyel emésztett pMOG180 plazmidba klónoz30 zuk háromirányú ligálással, az alábbi szintetikus oligonukleotidkettőssel:
’ GA TCGTCA GA TCTA GC 3 ’ 3 ’ CAGTCTAGATCGTTAA 5 ’
14. számú szekvenciavázlat
15. számú szekvenciavázlat
A plazmid, amiben az SPS-fragmentum antiszensz irányultságú a CaMV 35S promoterhez képest, a pMOG787 jelzést kapta. A pMOG787 EcoRI/HindlII fragmentumát háromirányú ligálással, az alábbi szintetikus linkerrel:
5' AGCTTCCCCCCCG 3 ’ 3'AGGGGGGGCTTAA 5'
16. számú szekvenciavázlat
17. számú szekvenciavázlat klónozzuk az EcoRI-gyel kiegyenesített pMOG622 bináris vektorba. A pMOG22 bináris vektor tartalmazza a transzgén növények kiválogatásához szükséges, növényekben kifejeződni képes HPTII higromicinrezisztencia-gént. Az így kapott pMOG801 bináris vektort (10. ábra) használjuk a burgonya transzformálásához.
6. példa
A pMOG802 plazmid megszerkesztése A pMOG801 plazmid EcoRI fragmentumát, ami az antiszensz expressziós kazettát tartalmazza, az EcoRIgyel felnyitott pMOG664 bináris vektorba (ami az antiszensz AGP-áz-kazettát tartalmazza) klónozzuk. Az így kapott bináris vektor a pMOG802 (11. ábra).
7. példa
A pMOG799 éspMOG664plazmidokkal transzformált burgonya trehalóztermelése
A kanamicinrezisztens MOG799.1 növényvonalból - amiben a TPS kifejeződik (9. példa) - nyert burgonyagumó-korongokat a pMOG664 bináris vektorral transzformáljuk, ami az antiszensz AGP-áz expressziós kazettát tartalmazza. A 10 mg/1 higromicinnel kiválogatott transzgén hajtásokat a TPS és az antiszensz AGPáz jelenlétére vizsgáljuk PCR-módszerrel. A mindkét enzimet tartalmazó transzgén növényekben megmérjük a TPS és az AGP-áz aktivitását.
A transzgén gumók vizsgálata azt mutatta, hogy az AGP-áz-aktivitás mértéke az egyedi transzgén vonalban csökkent a nem transzgén kontrolihoz képest. Northern-blot-vizsgálattal kimutattuk, hogy az AGPáz mRNS-ének mennyisége csökkent a transzgén növényekben a nem transzgén kontrollnövényekhez képest. A trehalóz szintje azokban a transzgén növényekben, amelyek TPS-aktivitást mutatnak és alacsonyabb az AGP-áz-szintjük, emelkedett az
HU 221 124 Β1
MOG799.1 transzgén növény vonal gumóiban mérhető szinthez képest.
8. példa
A pMOG799 és pMOGSOl plazmidokkal transzformált burgonya trehalóztermelése
A kanamicinrezisztens MOG799.1 növény vonalból
- amiben a TPS kifejeződik (3. példa) - nyert burgonyagumó-korongokat a pMOG801 bináris vektorral transzformáljuk, ami az antiszensz SPS expressziós kazettát tartalmazza. A 10 mg/1 higromicinnel kiválogatott transzgén hajtásokat a TPS és az antiszensz SPS jelenlétére vizsgáljuk PCR-módszerrel. A mindkét enzimet tartalmazó transzgén növényekben megmérjük a TPS és SPS aktivitását.
A transzgén gumók vizsgálata azt mutatta, hogy az SPS-aktivitás mértéke az egyedi transzgén vonalban csökkent a nem transzgén kontrolihoz képest. Northem-blot-vizsgálattal kimutattuk, hogy az SPS mRNSének mennyisége csökkent a transzgén növényekben a nem transzgén kontrollnövényekhez képest. A trehalóz szintje azokban a transzgén növényekben, amelyek TPS-aktivitást mutatnak és csökkent az SPS-szintjük, emelkedett az MOG799.1 transzgén növény vonal gumóiban talált szinthez képest.
9. példa
A pMOG799 és pMOG802plazmidokkal transzformált burgonya trehalóztermelése
A kanamicinrezisztens MOG799.1 növényvonalból 30
- amiben a TPS kifejeződik (3. példa) - nyert burgonyagumó-korongokat a pMOG802 bináris vektorral transzformáljuk, ami az antiszensz SPS és AGP-áz expressziós kazettákat tartalmazza. A 10 mg/1 higromicinnel kiválogatott transzgén hajtásokat a TPS, az anti- 35 szensz AGP-áz és az antiszensz SPS jelenlétére vizsgáljuk PCR-módszerrel. A mindhárom szerkezetet tartalmazó transzgén növényekben megmérjük a TPS, az AGP-áz és az SPS aktivitását.
A transzgén gumók vizsgálata azt mutatta, hogy az AGP-áz- és az SPS-aktivitás mértéke az egyedi transzgén vonalban csökkent a nem transzgén kontrolihoz képest. Northem-blot-vizsgálattal kimutattuk, hogy az AGP-áz és az SPS mRNS-ének mennyisége csökkent a transzgén növényekben a nem transzgén kontrollnövényekhez képest. A trehalóz szintje azokban a transzgén növényekben, amelyek TPS-aktivitást mutatnak és csökkent az AGP-áz- és az SPS-szintjük, emelkedett az MOG799.1 transzgén növényvonal gumóiban mérhető szinthez képest.
Letétbe helyezett törzsek:
pMOG22: CBS 101.90 letéti szám pMOG23: CBS 102.90 letéti szám pMOG799: CBS 430.93 letéti szám
10. példa
Trehalóztermelés a pMOG845 plazmiddal transzformáit burgonyanövényekben
A 3. példában leírtakhoz hasonlóan burgonyát transzformálunk a pMOG845 vektorral, amely a pMOG799 olyan származéka, amelyben a 35S promoter helyett a gumóspecifikus patatin promoter van. A transzformált növények gumóinak analízisét a következő táblázatban összesítettük (a trehalóztartalom a friss gumók tömeg%ában van megadva).
Vonal | Trehalóztartalom |
845-1-1 | 0,0050 |
845-1-2 | 0,0048 |
845-1-3 | 0,0017 |
845-2-1 | 0,0012 |
845-13-1 | 0,0010 |
1. vad típus | <0,0010 |
2. vad típus | <0,0010 |
3. vad típus | <0,0010 |
SZEKVENCIALISTA
1. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza:
A szekvencia típusa:
A szekvencia száltípusa: A szekvencia topológiája: A molekula típusa: Hipotetikus:
Antiszensz:
Eredete:
Az 1. számú szekvencia leírása: CTAGGTCGTG ATTCTGATAC CTTGCAAACA TGAAAGGAGT GAGGTTGATT CTAGCTATGG GCTGCTGTGG TGCCTACTAT ATTTACATAC CAGAATTTGT ATAGGGGAGC AAGTCAATGC GCCGATGCTG
370 bázispár nukleinsav kettős szálú lineáris cDNS-ből mRNS nem nem burgonya (Solanum tuberosum) cv. Désiree levélszövet
AGGTGGCCAG GTGAAGTATG TCACCGAGTT GATCTCTTGA TGAGCCAATT GAGATGCTCT TCGGATCCCT GCGGACCAGG TGATGGAGCA TTAAGCCACA TGGAAAAGCA GTGTGGCCTT
TAGTAGAGCT TGCTCGAGCA CTCGGCAGAT CACATCCCCA CATGCCCATC TGATGCTTTG TGACAAGATA TTCCAAAAGA TTGTGAATAT GGCAAGGGCT ACGTGATACA TGGGCACTAT
120
180
240
300
360
370
HU 221 124 Β1
2. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza:
A szekvencia típusa:
A szekvencia száltípusa:
A szekvencia topológiája:
A molekula típusa: Hipotetikus:
Antiszensz:
Eredete:
Közvetlen forrása:
Helyzete a genomban: Ismertetőjegyek, kulcs:
gén: termék:
1446 bázispár nukleinsav kettős szálú lineáris genomikus DNS nem nem (Escherichia coli)
7F11 klón
41-42’ térképpozíció CDS (19-1446. helyzet) otsA trehalóz-foszfát-szintetáz
A 2. számú szekvencia leírása:
GAGAAAATAA CAGGAGTG ATG ACT | ATG Me t | AGT Ser | CGT Arg 5 | TTA Le u | GTC GTA GTA TCT AAC | ||||||
Me t 1 | Thr | Va 1 | Va 1 | Va 1 | Ser 10 | Asn | |||||
CGG ATT GCA CCA | CCA GAC | GAG | CAC | GCC | GCC | AGT | GCC | GGT | GGC | CTT | GCC |
Arg Ile Alá Pro | Pro Asp | Glu | Hi s | Al a | Al a | Ser | Al a | Gly | Gly | Leu | Al a |
1 5 | 20 | 25 | |||||||||
GTT GGC ATA CTG | GGG GCA | CTG | AAA | GCC | GCA | GGC | GGA | CTG | TGG | TTT | GGC |
Val Gly Ile Leu | Gly Alá | Leu | Ly s | Al a | Al a | Gly | Gly | Leu | Trp | Phe | Gly |
30 | 35 | 40 | |||||||||
TGG AGT GGT GAA | ACA GGG | AAT | GAG | GAT | CAG | CCG | CTA | AAA | AAG | GTG | AAA |
Trp Ser Gly Glu | Thr Gly | Asn | Glu | As p | Gin | Pro | Leu | Ly s | Ly s | Va 1 | Ly s |
45 | 50 | 55 | |||||||||
AAA GGT AAC ATT | ACG TGG | GCC | TCT | TTT | AAC | CTC | AGC | GAA | CAG | GAC | CTT |
Lys Gly Asn I1e | Thr Trp | Al a | Ser | Phe | Asn | Leu | Ser | Glu | Gin | As p | Leu |
60 | 65 | 70 | 75 | ||||||||
GAC GAA TAC TAC | AAC CAA | TTC | TCC | AAT | GCC | GTT | CTC | TGG | CCC | GCT | TTT |
Asp Glu Tyr Tyr | Asn Gin | Phe | Ser | Asn | Al a | Va 1 | Leu | Trp | Pro | Al a | Phe |
80 | 85 | 90 | |||||||||
CAT TAT CGG CTC | GAT CTG | GTG | CAA | TTT | CAG | CGT | CCT | GCC | TGG | GAC | GGC |
His Tyr Arg Leu | Asp Leu | Va 1 | Gin | Phe | Gin | Arg | Pro | Al a | Trp | As p | Gly |
95 | 100 | 105 | |||||||||
TAT CTA CGC GTA | AAT GCG | TTG | CTG | GCA | GAT | AAA | TTA | CTG | CCG | CTG | TTG |
Tyr Leu Arg Val | Asn Alá | Leu | Leu | Al a | As p | Ly s | Leu | Leu | Pro | Leu | Leu |
110 | 115 | 120 | |||||||||
CAA GAC GAT GAC | ATT ATC | TGG | ATC | CAC | GAT | TAT | CAC | CTG | TTG | CCA | TTT |
Gin Asp Asp Asp | Ile Ile | Trp | I 1 e | Hi s | As p | Tyr | Hi s | Leu | Le u | Pro | Phe |
125 | 130 | 135 | |||||||||
GCG CAT GAA TTA | CGC AAA | CGG | GGA | GTG | AAT | AAT | CGC | ATT | GGT | TTC | TTT |
Alá His Glu Leu | Arg Lys | Arg | Gly | Va 1 | Asn | As n | Arg | Ile | Gly | Phe | Ph e |
140 | 145 | 150 | 155 | ||||||||
CTG CAT ATT CCT | TTC CCG | ACA | CCG | GAA | ATC | TTC | AAC | GCG | CTG | CCG | ACA |
Leu His Ile Pro | Phe Pro | Thr | Pro | Glu | Ile | Ph e | Asn | Al a | Leu | Pro | Thr |
160 | 165 | 170 | |||||||||
TAT GAC ACC TTG | CTT GAA | CAG | CTT | TGT | GAT | TAT | GAT | TTG | CTG | GGT | TTC |
Tyr Asp Thr Leu | Leu Glu | Gin | Leu | Cy s | Asp | Tyr | As p | Leu | Leu | Gly | Ph e |
175 | 180 | 185 | |||||||||
CAG ACA GAA AAC | GAT CGT | CTG | GCG | TTC | CTG | GAT | TGT | CTT | TCT | AAC | CTG |
Gin Thr Glu Asn | Asp Arg | Le u | Al a | Phe | Leu | As p | Cy s | Leu | Ser | As n | Leu |
190 | 195 | 200 | |||||||||
ACC CGC GTC ACG | ACA CGT | AGC | GCA | AAA | AGC | CAT | ACA | GCC | TGG | GGC | AAA |
Thr Arg Val Thr | Thr Arg | Ser | Al a | Ly s | Ser | Hi s | Thr | Al a | Trp | Gly | Ly s |
205 | 210 | 215 | |||||||||
GCA TTT CGA ACA | GAA GTC | TAC | CCG | ATC | GGC | ATT | GAA | CCG | AAA | GAA | ATA |
Alá Phe Arg Thr | Glu Val | Tyr | Pro | Ile | Gly | I le | Glu | Pro | Ly s | Glu | Ile |
220 | 225 | 230 | 235 |
147
195
243
291
339
387
435
483
531
579
627
675
723
HU 221 124 Β1
GCC | AAA | CAG | GCT | GCC | GGG | CCA | CTG | CCG | CCA | AAA | CTG | GCG | CAA | CTT | AAA |
Al a | Ly s | Gin | Al a | Al a | Gly | Pro | Leu | Pro | Pro | Ly s | Leu | Al a | Gin | Leu | Ly s |
240 | 245 | 250 | |||||||||||||
GCG | GAA | CTG | AAA | AAC | GTA | CAA | AAT | ATC | TTT | TCT | GTC | GAA | CGG | CTG | GAT |
Al a | Glu | Leu | Ly s | Asn | Va 1 | Gin | Asn | I le | Phe | Ser | Va 1 | Glu | Arg | Leu | As p |
255 | 260 | 265 | |||||||||||||
TAT | TCC | AAA | GGT | TTG | CCA | GAG | CGT | TTT | CTC | GCC | TAT | GAA | GCG | TTG | CTG |
Tyr | Ser | Ly s | Gly | Leu | Pro | Glu | Arg | Phe | Leu | Al a | Tyr | Glu | Al a | Leu | Leu |
270 | 275 | 280 | |||||||||||||
GAA | AAA | TAT | CCG | CAG | CAT | CAT | GGT | AAA | ATT | CGT | TAT | ACC | CAG | ATT | GCA |
Glu | Ly s | Tyr | Pro | Gin | Hi s | Hi s | Gly | Lys | I le | Arg | Tyr | Thr | Gin | I le | Al a |
285 | 290 | 295 | |||||||||||||
CCA | ACG | TCG | CGT | GGT | GAT | GTG | CAA | GCC | TAT | CAG | GAT | ATT | CGT | CAT | CAG |
Pro | Thr | Ser | Arg | Gly | As p | Va 1 | Gin | Al a | Tyr | Gin | As p | I le | Arg | Hi s | Gin |
300 | 305 | 310 | 315 | ||||||||||||
CTC | GAA | AAT | GAA | GCT | GGA | CGA | ATT | AAT | GGT | AAA | TAC | GGG | CAA | TTA | GGC |
Leu | Glu | Asn | Glu | Al a | Gly | Arg | I le | Asn | Gly | Ly s | Tyr | Gly | Gin | Leu | Gly |
320 | 325 | 330 | |||||||||||||
TGG | ACG | CCG | CTT | TAT | TAT | TTG | AAT | CAG | CAT | TTT | GAC | CGT | AAA | TTA | CTG |
Trp | Thr | Pro | Le u | Tyr | Tyr | Leu | As n | Gin | Hi s | Phe | As p | Arg | Ly s | Leu | Leu |
335 | 340 | 345 | |||||||||||||
ATG | AAA | ATA | TTC | CGC | TAC | TCT | GAC | GTG | GGC | TTA | GTG | ACG | CCA | CTG | CGT |
Me t | Ly s | I le | Ph e | Arg | Tyr | Ser | As p | Val | Gly | Le u | Va 1 | Thr | Pro | Leu | Arg |
350 | 355 | 360 | |||||||||||||
GAC | GGG | ATG | AAC | CTG | GTA | GCA | AAA | GAG | TAT | GTT | GCT | GCT | CAG | GAC | CCA |
As p | Gly | Me t | As n | Leu | Va 1 | Al a | Ly s | Glu | Tyr | Val | Al a | Al a | Gin | As p | Pro |
365 | 370 | 375 | |||||||||||||
GCC | AAT | CCG | GGC | GTT | CTT | GTT | CTT | TCG | CAA | TTT | GCG | GGA | GCG | GCA | AAC |
Al a | As n | Pro | Gly | Va 1 | Leu | Va 1 | Leu | Ser | Gin | Phe | Al a | Gly | Al a | Al a | Asn |
380 | 385 | 390 | 395 | ||||||||||||
GAG | TTA | ACG | TCG | GCG | TTA | ATT | GTT | AAC | CCC | TAC | GAT | CGT | GAC | GAA | GTT |
Glu | Leu | Thr | Ser | Al a | Leu | I le | Va 1 | As n | Pro | Tyr | Asp | Arg | Asp | Glu | Va 1 |
400 | 405 | 410 | |||||||||||||
GCA | GCT | GCG | CTG | GAT | CGT | GCA | TTG | ACT | ATG | TCG | CTG | GCG | GAA | CGT | ATT |
Al a | Al a | Al a | Leu | As p | Arg | Al a | Leu | Thr | Me t | Ser | Leu | Al a | G1 u | Arg | I 1 e |
415 | 420 | 425 | |||||||||||||
TCC | CGT | CAT | GCA | GAA | ATG | CTG | GAC | GTT | ATC | GTG | AAA | AAC | GAT | ATT | AAC |
Ser | Arg | Hi s | Al a | Glu | Me t | Leu | As p | Va 1 | I 1 e | Va 1 | Ly s | Asn | As p | I 1 e | As n |
430 | 435 | 440 | |||||||||||||
CAC | TGG | CAG | GAG | TGC | TTC | ATT | AGC | GAC | CTA | AAG | CAG | ATA | GTT | CCG | CGA |
Hi s | Trp | Gin | Glu | Cy s | Phe | I le | Ser | As p | Leu | Ly s | G1 n | I le | Val | Pro | Arg |
445 | 450 | 455 | |||||||||||||
AGC | GCG | GAA | AGC | CAG | CAG | CGC | GAT | AAA | GTT | GCT | ACC | TTT | CCA | AAG | CTT |
Ser | Al a | Glu | Ser | Gin | Gin | Arg | As p | Ly s | Va 1 | Al a | Thr | Phe | Pro | Ly s | Leu |
460 | 465 | 470 | 475 |
GCG
Al a
3. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza:
A szekvencia típusa:
A szekvencia topológiája:
A molekula típusa:
771
819
867
915
963
1011
1059
1107
1155
1203
1251
1299
347
1395
1443
1446
476 aminosav aminosav lineáris fehérje
A 3. számú szekvencia leírása:
Me | t | Thr | Me t | Ser | Ar | g | Le | u | Va | 1 | Va 1 |
1 | 5 | ||||||||||
As | P | Glu | Hi s | Al a | Al | a | Se | Γ | Al | a | Gly |
20 | |||||||||||
Al | a | Leu | Ly s | Al a | Al | a | G1 | y | G1 | y | Le u |
35 | 40 |
Va 1 | Ser 10 | As n | Arg | I le | Al a | Pro 15 | Pro |
Gly 25 | Le u | Al a | Va 1 | Gly | I 1 e 30 | Leu | Gly |
Trp | Phe | Gly | Trp | Ser 45 | Gly | Glu | Thr |
HU 221 124 Β1
Gly Asn Glu | As p | Gin | Pro | Leu 55 | Ly s | Ly s | Va 1 | Ly s | Ly s 60 | Gly | As n | lle | Thr | ||
50 | |||||||||||||||
Trp | Al a | Ser | Ph e | As n | Leu | Ser | Glu | Gin | As p | Leu | Asp | Glu | Tyr | Tyr | As n |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Gin | Phe | Ser | Asn | Al a | Va 1 | Leu | Trp | Pro | Al a | Phe | Hi s | Tyr | Arg | Leu | As p |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Leu | Va 1 | Gin | Phe | Gin | Arg | Pro | Al a | Trp | As p | Gly | Tyr | Leu | Arg | Val | Asn |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Al a | Leu | Leu | Al a | As p | Ly s | Leu | Le u | Pro | Leu | Leu | Gin | As p | As p | As p | lle |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
lle | Trp | lle | Hi s | As p | Tyr | Hi s | Leu | Leu | Pro | Phe | Al a | Hi s | Glu | Leu | Arg |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Lys | Arg | Gly | Val | Asn | Asn | Arg | lle | Gly | Phe | Phe | Leu | Hi s | lle | Pro | Phe |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Pro | Thr | Pro | Glu | lle | Phe | As n | Alá | Leu | Pro | Thr | Tyr | Asp | Thr | Le u | Leu |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Glu | Gin | Leu | Cy s | As p | Tyr | As p | Leu | Leu | Gly | Phe | Gin | Thr | G1 u | As n | As p |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Arg | Leu | Al a | Phe | Le u | As p | Cy s | Leu | Ser | As n | Leu | Thr | Arg | Va 1 | Thr | Thr |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Arg | Ser | Al a | Ly s | Ser | Hi s | Thr | Al a | Trp | Gly | Ly s | Al a | Phe | Arg | Thr | Glu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Va 1 | Tyr | Pro | lle | Gly | I le | Glu | Pro | Ly s | Glu | I 1 e | Al a | Ly s | Gin | Al a | Al a |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gly | Pro | Leu | Pro | Pro | Ly s | Leu | Al a | Gin | Le u | Ly s | Al a | Glu | Leu | Ly s | Asn |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Va 1 | Gin | Asn | lle | Phe | Ser | Va 1 | Glu | Arg | Leu | As p | Tyr | Ser | Ly s | Gly | Leu |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Pro | Glu | Arg | Phe | Le u | Al a | Tyr | Glu | Al a | Leu | Le u | Glu | Ly s | Tyr | Pro | Gin |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Hi s | Hi s | Gly | Ly s | lle | Arg | Tyr | Thr | Gin | I 1 e | Al a | Pro | Thr | Ser | Arg | Gly |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
As p | Va 1 | Gin | Al a | Tyr | Gin | As p | I 1 e | Arg | Hi s | Gin | Leu | Glu | As n | Glu | Al a |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Gly | Arg | lle | As n | G1 y | Ly s | Tyr | Gly | Gin | Leu | Gly | Trp | Thr | Pro | Leu | Tyr |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Tyr | Le u | Asn | Gin | Hi s | Phe | As p | Arg | Ly s | Le u | Le u | Me t | Ly s | I 1 e | Phe | Arg |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Tyr | Ser | As p | Va 1 | Gly | Leu | Va 1 | Thr | Pro | Le u | Arg | Asp | Gly | Me t | As n | Leu |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Val | Al a | Ly s | Glu | Tyr | Val | Al a | Al a | Gin | As p | Pro | Al a | Asn | Pro | Gly | Val |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Leu | Va 1 | Leu | Ser | Gin | Phe | Al a | Gly | Al a | Al a | As n | Glu | Leu | Thr | Ser | Al a |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Leu | lle | Val | Asn | Pro | Tyr | Asp | Arg | As p | Glu | Va 1 | Al a | Al a | Al a | Leu | As p |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Arg | Al a | Leu | Thr | Me t | Ser | Leu | Al a | Glu | Arg | lle | Ser | Arg | Hi s | Al a | Glu |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Me t | Le u | As p | Val | lle | Val | Ly s | Asn | Asp | lle | Asn | Hi s | Trp | Gin | Glu | Cys |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Phe | lle | Ser | As p | Leu | Ly s | Gin | lle | Va 1 | Pro | Arg | Ser | Alá | G1 u | Ser | Gin |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Gin | Arg | As p | Ly s | Va 1 | Al a | Thr | Phe | Pro | Ly s | Leu | Al a | ||||
465 | 470 | 475 |
4. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza: 22 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
HU 221 124 Β1
Hipotetikus: igen
Az 4. számú szekvencia leírása:
TCCCCATGGA ATCAAAGCAT CC
5. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 22 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
Az 5. számú szekvencia leírása:
GATTGGATCC AGGGCACGGC TG
6. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 33 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 6. számú szekvencia leírása:
CTAGGTCGTG ATTCTGATAC AGGTGGCCAG
7. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 35 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: genomikus DNS
Hipotetikus: igen
A 7. számú szekvencia leírása:
CAGCATCGGC ATAGTGCCCA TGTATCACGT
8. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 18 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 8. számú szekvencia leírása:
AGCTCACGAG CTCTCAGG
9. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 18 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 9. számú szekvencia leírása:
GTGCTCGAGA GTCCTCGA
10. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 24 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 10. számú szekvencia leírása:
GATCCCCCGG GGCATGCAAG CTTG
11. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 24 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
GTG
AAGGC
HU 221 124 Β1
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
All. számú szekvencia leírása: GGGGCCCCGT ACGTTCGAAC CTAG
12. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 23 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 12. számú szekvencia leírása: GAGAAAATAC CCGGGGTGAT GAC
13. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 25 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDN S
Hipotetikus: igen
A 13. számú szekvencia leírása: GATAATCGTG GATCCAGATA ATGTC
14. számú szekvenciavázlat
A szekvencia hossza: 16 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 14. számú szekvencia leírása: GATCGTCAGA TCTAGC
75. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza: 16 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 15. számú szekvencia leírása: CAGTCTAGAT CGTTAA
16. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza: 13 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDN S
Hipotetikus: igen
A 16. számú szekvencia leírása: AGCTTCCCCC CCG
7. számú szekvenciavázlat A szekvencia hossza: 13 bázispár
A szekvencia típusa: nukleinsav
A szekvencia száltípusa: egyszálú
A szekvencia topológiája: lineáris
A molekula típusa: cDNS
Hipotetikus: igen
A 17. számú szekvencia leírása: AGGGGGGGCT TAA
Claims (12)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Nukleinsav, amely egy növényben vagy növényi sejtben kifejeződve növeli az illető növény vagy növényi sejt trehalóztartalmát, azzal jellemezve, hogy a leolvasás irányában haladva tartalmaz:a) az illető növényben vagy növényi sejtben működőképes transzkripciós iniciátorrégiót; ésb) egy E. coli trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-szekvenciát; és adott esetbenc) egy, az illető növényben vagy növényi sejtben működőképes transzkripciós terminációs régiót.
- 2. Az 1. igénypont szerinti nukleinsav, azzal jellemezve, hogy a 3. számú szekvenciavázlatban megadott aminosavszekvenciával jellemzett E. coli trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-szekvenciát tartalmaz.
- 3. Az 1. igénypont szerinti nukleinsav, azzal jellemezve, hogy a Centraal Bureau voor Schimmelculturesnél 430.93 számon letétbe helyezett pMOG799 plazmidban jelen lévő E. coli otsA gén nyílt leolvasási keretét tartalmazó, E. coli trehalóz-foszfát-szintetázt kódoló DNS-szekvenciát tartalmaz.
- 4. Az 1-3. igénypontok bármelyike szerinti nukleinsav, azzal jellemezve, hogy az említett transzkripciós iniciátorrégió-szakasz tartalmazza a karfiol-mozaikvírus 35S RNS-ét kódoló DNS-ének egy promoterrégióját és az Agrobacterium tumefaciens nopalin-szintetázgénjének transzkripciós terminátorrégióját.
- 5. Klónozóvektor, azzal jellemezve, hogy az 1-4. igénypontok bármelyike szerinti nukleinsavat tartalmaz, és a klónozóvektor egy bináris vektor.
- 6. Mikroorganizmus, azzal jellemezve, hogy az 5. igénypont szerinti vektort hordoz, és az Agrobacterium nemzetségbe tartozik.
- 7. Eljárás trehalóz termelésére fokozottan képes növény létrehozására, azzal jellemezve, hogy:i) egy befogadó növényi sejtbe bejuttatunk (a) egy 1-4. igénypontok bármelyike szerinti nukleinsavat vagy egy 5. igénypont szerinti klónozóvektort, vagy egy 6. igénypont szerinti mikroorganizmust; és (b) egy olyan szelektálható markergént kódoló DNS-szekvenciát, amely az illető növényben működőképes; és (c) adott esetben egy, az illető növényi gazdaszervezetben működőképes transzkripciós terminátorszekvenciát; és ii) egy transzformált sejtből a szelektíven felismerhető markergén jelenléte alapján történő kiválasztást lehetővé tevő körülmények között kinevelünk egy növényt.
- 8. Rekombináns növényi DNS-genom, azzal jellemezve, hogy egy 1-4. igénypontok bármelyike szerinti nukleinsavat tartalmaz.
- 9. Növényi sejt, azzal jellemezve, hogy egy 8. igénypont szerinti rekombináns növényi DNS-genomot hordoz.
- 10. Növényi sejttenyészet, azzal jellemezve, hogy a 9. igénypont szerinti növényi sejteket tartalmaz.
- 11. Növény, azzal jellemezve, hogy a 9. vagy 10. igénypont szerinti sejt(ek)et tartalmaz.
- 12. Eljárás trehalóz termelésére, azzal jellemezve, hogyi) egy 11. igénypont szerinti növényt a trehalóztermelést megengedő körülmények között termesztünk;ii) az említett növényt vagy annak részét learatjuk; és iii) kinyerjük a trehalózt az említett növényből vagy az említett növényi részből.HU 221 124 Β1
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP93201904 | 1993-06-30 | ||
PCT/EP1993/002290 WO1995006126A1 (en) | 1993-08-24 | 1993-08-24 | Production of trehalose in plants |
PCT/EP1994/002167 WO1995001446A1 (en) | 1993-06-30 | 1994-06-30 | Production of trehalose in plants |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HUP9503723D0 HUP9503723D0 (en) | 1996-02-28 |
HUT74666A HUT74666A (en) | 1997-01-28 |
HU221124B1 true HU221124B1 (en) | 2002-08-28 |
Family
ID=26070055
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9503723V HU221124B1 (en) | 1993-06-30 | 1994-06-30 | Production of trehalose in plants |
Country Status (19)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0711353B1 (hu) |
JP (1) | JP3645260B2 (hu) |
KR (1) | KR960703436A (hu) |
CN (1) | CN1131315C (hu) |
AT (1) | ATE284446T1 (hu) |
AU (1) | AU697997B2 (hu) |
CA (1) | CA2166063C (hu) |
CZ (1) | CZ290830B6 (hu) |
DE (1) | DE69434173T2 (hu) |
ES (1) | ES2229222T3 (hu) |
FI (1) | FI956317A0 (hu) |
HU (1) | HU221124B1 (hu) |
NO (1) | NO955354L (hu) |
NZ (1) | NZ269548A (hu) |
PL (1) | PL179629B1 (hu) |
RO (1) | RO115650B1 (hu) |
SK (1) | SK166095A3 (hu) |
UA (1) | UA39958C2 (hu) |
WO (1) | WO1995001446A1 (hu) |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FI943133A0 (fi) * | 1994-06-29 | 1994-06-29 | Alko Ab Oy | Transgena vaexter |
JP3563104B2 (ja) * | 1994-03-23 | 2004-09-08 | 呉羽化学工業株式会社 | トレハロースホスホリラーゼおよびその製造法 |
DE4444460A1 (de) * | 1994-11-29 | 1996-05-30 | Inst Genbiologische Forschung | Verfahren zur Steigerung des Ertrags sowie zur Veränderung des Blühverhaltens bei Pflanzen |
IL116564A0 (en) * | 1995-01-04 | 1996-03-31 | Mogen Int | Process for producing trehalose in plants |
EP0784095A3 (en) | 1996-01-12 | 1997-12-29 | Mogen International N.V. | Enhanced accummulation of trehalose in plants |
IN1997CH00924A (en) | 1996-05-03 | 2005-03-04 | Syngenta Mogen Bv | Regulating metabolism by modifying the level of trehalose-6-phosphate |
MX205414B (es) * | 1996-05-08 | 2001-12-07 | Univ Mexico Nacional Autonoma | Metodo para incrementar de trehalosa de los organismos por medio de su transformacion con el adnc de la trehalosa-6-fosfato sintasa/fosfatasa de selaginella lepidophylla. |
TW466116B (en) | 1997-03-04 | 2001-12-01 | Hayashibara Biochem Lab | Reduction inhibitory agent for active-oxygen eliminating activity, method for inhibiting the reduction of said activity, and composition containing said agent |
HUP0102598A3 (en) | 1998-03-11 | 2003-03-28 | Syngenta Participations Ag | Expression of trehalose biosynthetic genes in plants |
EP1002867A1 (en) * | 1998-10-15 | 2000-05-24 | K.U. Leuven Research & Development | Specific genetic modification of the activity of trehalose-6-phosphate synthase and expression in a homologous or heterologous environment |
EP2111456A1 (en) * | 2007-02-08 | 2009-10-28 | BASF Plant Science GmbH | Use of trehalase genes to confer nematode resistance to plants |
EP2238231B1 (en) | 2008-01-03 | 2016-03-23 | Proterro, Inc. | Transgenic photosynthetic microorganisms and photobioreactor |
CN103664333B (zh) * | 2013-11-12 | 2015-03-04 | 宿迁市设施园艺研究院 | 一种含有5-ala和海藻糖的组合物及其制备的叶面肥 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ATE133198T1 (de) * | 1990-03-28 | 1996-02-15 | Gist Brocades Nv | Neue hefestämme mit erhöhtem trehalosegehalt, verfahren zur gewinnung solcher hefen und verwendung dieser hefen |
US5422254A (en) * | 1992-02-14 | 1995-06-06 | Oy Alko Ab | Method to increase the trehalose content of organisms by transforming them with the structural genes for the short and long chains of yeast trehalose synthase |
EP0577915A1 (fr) * | 1992-07-09 | 1994-01-12 | N.V. Algist-Bruggeman | Souches de levures transformées de manière à posséder une résistance au stress et/ou un pouvoir fermentatif amélioré |
-
1994
- 1994-06-30 SK SK1660-95A patent/SK166095A3/sk unknown
- 1994-06-30 ES ES94923710T patent/ES2229222T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-30 DE DE69434173T patent/DE69434173T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-30 AU AU73846/94A patent/AU697997B2/en not_active Ceased
- 1994-06-30 AT AT94923710T patent/ATE284446T1/de not_active IP Right Cessation
- 1994-06-30 RO RO95-02295A patent/RO115650B1/ro unknown
- 1994-06-30 CA CA002166063A patent/CA2166063C/en not_active Expired - Fee Related
- 1994-06-30 CZ CZ19953449A patent/CZ290830B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1994-06-30 EP EP94923710A patent/EP0711353B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-30 HU HU9503723V patent/HU221124B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1994-06-30 CN CN94193026A patent/CN1131315C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1994-06-30 NZ NZ269548A patent/NZ269548A/en unknown
- 1994-06-30 KR KR1019950706055A patent/KR960703436A/ko active IP Right Grant
- 1994-06-30 UA UA95125515A patent/UA39958C2/uk unknown
- 1994-06-30 WO PCT/EP1994/002167 patent/WO1995001446A1/en active IP Right Grant
- 1994-06-30 JP JP50328695A patent/JP3645260B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
1995
- 1995-12-22 PL PL94312303A patent/PL179629B1/pl unknown
- 1995-12-29 FI FI956317A patent/FI956317A0/fi unknown
- 1995-12-29 NO NO955354A patent/NO955354L/no not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
NO955354L (no) | 1996-01-02 |
WO1995001446A1 (en) | 1995-01-12 |
JPH09501313A (ja) | 1997-02-10 |
FI956317A (fi) | 1995-12-29 |
PL179629B1 (pl) | 2000-10-31 |
EP0711353B1 (en) | 2004-12-08 |
NZ269548A (en) | 1997-09-22 |
RO115650B1 (ro) | 2000-04-28 |
CA2166063A1 (en) | 1995-01-12 |
EP0711353A1 (en) | 1996-05-15 |
CZ290830B6 (cs) | 2002-10-16 |
PL312303A1 (en) | 1996-04-15 |
DE69434173T2 (de) | 2005-05-19 |
JP3645260B2 (ja) | 2005-05-11 |
CZ344995A3 (en) | 1997-05-14 |
DE69434173D1 (de) | 2005-01-13 |
CN1129015A (zh) | 1996-08-14 |
SK166095A3 (en) | 1997-01-08 |
CA2166063C (en) | 2008-04-22 |
CN1131315C (zh) | 2003-12-17 |
NO955354D0 (no) | 1995-12-29 |
HUP9503723D0 (en) | 1996-02-28 |
ATE284446T1 (de) | 2004-12-15 |
FI956317A0 (fi) | 1995-12-29 |
ES2229222T3 (es) | 2005-04-16 |
AU697997B2 (en) | 1998-10-22 |
KR960703436A (ko) | 1996-08-17 |
HUT74666A (en) | 1997-01-28 |
AU7384694A (en) | 1995-01-24 |
UA39958C2 (uk) | 2001-07-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6881877B2 (en) | Enhanced accumulation of trehalose in plants | |
WO1995006126A1 (en) | Production of trehalose in plants | |
EP0977870A1 (en) | Regulating metabolism by modifying the level of trehalose-6-phosphate by inhibiting endogenous trehalase levels | |
HU221124B1 (en) | Production of trehalose in plants | |
JPH08510645A (ja) | 貯蔵ジャガイモの品質を改良する方法 | |
US20070169229A1 (en) | Method for increasing an abiotic-resistance in monocot plant | |
WO1996021030A1 (en) | Enhanced accumulation of trehalose in plants | |
HU221515B (en) | Transgenic plants with improved biomass production | |
RU2143496C1 (ru) | Продуцирование трегалозы в растениях | |
CA2235619A1 (en) | Modified plants and plant products | |
AU1487799A (en) | Pre- and postharvest inhibition of remobilisation of storage compounds | |
GB2343183A (en) | Transgenic plants and selection of transformed plant cells | |
AU754482B2 (en) | Enhanced accumulation of trehalose in plants | |
AU2003246315B2 (en) | Transgenic plants presenting a modified inulin producing profile | |
MXPA97000296A (en) | Increased accumulation of trehalosa in plan |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HMM4 | Cancellation of final prot. due to non-payment of fee |