FI120100B - Yhdistelmä-mersasidiini ja sen valmistusmenetelmä - Google Patents
Yhdistelmä-mersasidiini ja sen valmistusmenetelmä Download PDFInfo
- Publication number
- FI120100B FI120100B FI954220A FI954220A FI120100B FI 120100 B FI120100 B FI 120100B FI 954220 A FI954220 A FI 954220A FI 954220 A FI954220 A FI 954220A FI 120100 B FI120100 B FI 120100B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- sequence
- dna
- amino acid
- lantibiotics
- mersacidin
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/50—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link
- C07K7/54—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring
- C07K7/56—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring the cyclisation not occurring through 2,4-diamino-butanoic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/32—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Bacillus (G)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oncology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
Description
Yhdistelraä-mersasidiini ja sen valmistusmenetelmä Tämä keksintö liittyy erityisesti mersasidiini-peptidiantibiootin rakennegeenin sekvenssiin. Sekvensoin-5 nilla on saatu selville, että premersasidiini koostuu epätavallisen pitkästä 48 aminohapon johtosekvenssistä ja 20 aminohapon propeptidiosasta, joka biosynteesin aikana muokkautuu kypsäksi lantibiootiksi.
Mersasidiini kuuluu bakterisidisten peptidien ryh-10 mään, jolle on annettu nimitys lantibiootit, millä halutaan painottaa sitä, että nämä peptidit sisältävät harvinaisia aminohappoja lantioniinia ja/tai 3-metyylilantio-niinia. Näissä peptideissä esiintyy säännönmukaisesti myös muita muunnettuja aminohappoja, kuten dehydroalaniinia ja 15 dehydrobutyriinia, kun taas S-aminovinyylikysteiiniä ja lysinoalaniinia esiintyy vain muutamissa lantibiooteissa [Jung, G., Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 30 (1991) 1051 -1068]. Lantibiootit ovat grampositiivisten bakteerien tuottamia ja ne ovat muodostuneet ribosomeissa syntetoitu-20 neista prepeptideistä. Lantibioottien rakennegeenejä on löydetty joko bakteerien kromosomista (esimerkiksi subtiilini ja kinnamysiini) tai liittyneenä siirtymiskykyisiin elementteihin, kuten transposoneihin (esimerkiksi nisiini) tai suuriin plasmideihin (esimerkiksi epidermiini ja 25 Pep5). Prepeptidit koostuvat N-terminaalisesta johtosekvenssistä, joka pilkkoutuu pois, kun prepeptidiä tuottava solu on kuljettanut prepeptidin ulos solusta, sekä C-ter-minaalisesta propeptidistä, joka muokkautuu translaation jälkeen kypsäksi lantibiootiksi [Jung, G., (1991), edel- 30 lä]. Muokkautumisen ensimmäisessä vaiheessa seriiniryhmä dehydroituu dehydroalaniiniksi (Dha) ja treoniiniryhmä dehydrobutyriiniksi (Dhb) [Weil, H.-P., et ai., Eur. J. Biochem. 194 (1990) 217 - 223]. Kysteiiniryhmien SH-ryhmät reagoivat sitten Dha:n tai Dhb:n kaksoissidosten kanssa, 2 mistä muodostuu Dha:n yhteydessä lantioniineja tai Dhb:n yhteydessä metyylilantioniineja.
Mersasidiini eristettiin Bacillus-lajin HIL Y-85,54728:n viljelmän supernatantista ja se herätti huo-5 miota, koska se on erittäin tehokas metisilliiniresistent-tiä Staphylococcus aureusta (MRSA) vastaan in vivo -olosuhteissa [Chatterjee, S., et ai., J. Antibiotics 45 (1992) 839 - 845]. Mersasidiini on pienikokoisin (1 825 Da) tähän mennessä eristetty lantibiootti, joka syntetoituu 20 amino-10 hapon propeptidistä ja sisältää 3 metyylilantioniiniryhmää, yhden dehydroalaniiniryhmän ja yhden S-aminovinyyli-2-metyylikysteiiniryhmän (kuvio IA) [Chatterjee, S., et ai., J. Antibiotics 45 (1992) 832 - 838]. Mersasidiinissa ei ole lainkaan nettovarausta ja se on ominaisuuksiltaan kokonaan 15 hydrofobinen. Viimeaikaiset koetulokset ovat osoittaneet, että mersasidiini estää peptidoglykaanien biosynteesiä. Tämä tapahtuu todennäköisimmin transglykosylaatiotasolla mekanismilla, joka poikkeaa nykyisin käytössä olevien MRSA:ta vastaan suunnattujen antibioottien mekanismeista.
20 Näistä syistä tämä keksintö liittyy premersasidii- niin, jonka aminohapposekvenssi on kuviossa 2 esitetyn sekvenssin mukainen ja joka sisältää aminohapot nro 1-68.
Tämän keksinnön toisena sovellutusmuotona ovat pre-mersasidiinia tai promersasidiinia koodaavat DNA-mole-25 kyylit, erityisesti DNA-molekyylit, joiden nukleotidise-kvenssi on kuviossa 2 esitetyn sekvenssin mukainen ja jotka sisältävät premersasidiinia koodaavat nukleotidit nro 22 - 225 tai promersasidiinia koodaavat nukleotidit nro 166 - 225; mainittua DNA:ta sisältävä vektori ja mainittua 30 vektoria sisältävä isäntäsolu.
3
Toisena sovellutusmuotona on premersasidiinin, pro-mersasidiini tai kypsän mersasidiinin valmistusmenetelmä, jossa käytetään tämän alan ammattikokemuksen perusteella tunnettuja geeniteknisiä menetelmiä, toisin sanottuna pre-5 mersasidiinia tai promersasidiinia koodaavia mainittuja DNA-molekyylejä sisältävää sopivaa isäntäsolua viljellään sopivissa olosuhteissa, minkä jälkeen eristetään mainitun isäntäsolun, edullisesti grampositiivisen bakteerin, kuten Bacillus-, Streptomyces- tai Streptococcus-bakteerin, il-10 mentämä premersasidiini, promersasidiini tai kypsä mersa-sidiini.
Lopuksi on mainittava, että tämän keksinnön mukaista premersasidiini- tai promersasidiinipeptidiä tai niiden geenejä voidaan käyttää kypsän mersasidiinin valmistukses-15 sa esimerkiksi julkaisussa WO-90/00 558 kuvatulla tavalla.
Kypsä mersasidiini on käyttökelpoista esimerkiksi peptidiantibioottina elintarvikkeiden säilönnässä erityisesti metisilliiniresistenttiä Staphylococcus aureusta vastaan tai antibioottina ihmisten tai eläinten Staphylo-20 coccus aureus -infektioiden hoitoon. Keksintöä voidaan lisäksi käyttää sellaisten entistä laajakirjoisempien tai tehokkuudeltaan poikkeavien mersasidiinijohdannaisten aikaansaamiseksi, joiden aminohapposekvenssiä on muokattu. Lisäksi tämä keksintö avaa uusia tapoja mersasidiinin tai 25 sen johdannaisten ilmentämiseksi geenitekniikalla normaalitasoa voimakkaammin.
Piirrosten kuvaus
Kuvio 1: A) Mersasidiini-lantibiootin rakenne. B) Oletettu prepeptidisekvenssi ja parhaan arvauksen mu-30 kainen 51 emäksen pituinen sekvenssi (guessmer), jota käytettiin rakennegeenin tunnistukseen.
Kuvio 2: Mersasidiini-lantibiootinmrsA-rakennegee-nin nukleotidisekvenssi ja prepeptidin päätelty aminohapposekvenssi. ATG-aloituskodonin edellä oleva ribosomia 35 sitova kohta on ympäröity suorakaiteella ja muokkautumis- 4 kohta on merkitty nuolella. Oletettu rho:sta riippumaton terminaattorisekvenssi on alleviivattu.
Kuvio 3: Useiden lantibioottien johtosekvenssien vertailu. Säilyneet sekvenssit on merkitty lihavoinnilla.
5 Esimerkki 1. Mersasidiinin rakennegeenin kloonaus Mersasidiinin oletettu propeptidisekvenssi (kuvio IB) pääteltiin mersasidiinin rakenteen perusteella ja se perustuu yleisiin tietoihin lantibioottien biosynteesistä. 10 Kuvattu koetin syntetoitiin PCR-MateR-laitteella (Applied Biosystems, Weiterstadt, Saksa) parhaan arvauksen mukaisena 51 emäksen sekvenssinä, joka perustuu Bacilluksen kodo-nipreferenssiin, ja se varustettiin digoksigeniinileimalla (Boehringer-Mannheim, Mannheim, Saksa) (kuvio IB). Amino-15 butyryyliryhmät (metyylilantioniinin Abus-puoli) ovat peräisin treoniiniryhmistä kun taas alaniiniryhmät (metyylilantioniinin Alas-puoli) on propeptidissä koodattu kysteii-niryhminä. Terminaalisen rengasrakenteen muodostava S-ami-novinyyli-2-metyylikysteiini muodostuu luultavasti oksida-20 tiivisesti dekarboksyloituneesta metyylilantioniinista, kuten C-terminaalisen S-aminovinyylikysteiinin sisältävän epidermiinin osalta on osoitettu [Kupke, T., et ai., J. Bacteriol. 174 (1992) 5354 - 5361].
Koska tuottajakannasta ei pystytty havaitsemaan 25 plasmideja, niin kromosomaalinen DNA valmistettiin Marmu-rin [Marmur, J., J. Mol. Biol. 3 (1961) 208 - 218] kuvaamalla menetelmällä sillä poikkeuksella, että tehtiin vain yksi uuttaminen ja saostus kloroformilla ja että sen jälkeen DNA liuotettiin tasapainotuspuskuriliuokseen ja puh-30 distettiin QiagentipR 100 -kolonnissa (Diagen, Hilden,
Saksa). Seoksesta, joka oli saatu kromosomin pilkkomisesta Hind III -restriktioentsyymillä, hybridisoitui Southern-blottauksessa [Southern, E.M., J. Mol. Biol. 98 (1975) 503 - 517] 51 °C:ssa koettimeen vain yksi 2 ke:n suurui-35 nen vyöhyke. 1,9 - 2,3 ke:n suuruiset fragmentit leikat- 5
tiin irti geelistä, eluoitiin BiotrapR-eluointiaineella (Schleicher ja Schull, Dassel, Saksa) ja jatkokloonattiin vektoriin pUC18 [Yanish-Perron, C. , et ai., Gene 33 (1985) 103 - 109] E. colissa. Useista yhdistelmä-pesäkkeistä pe-5 räisin olevat plasmidit valmistettiin Birnboimin ja Dolyn menetelmällä [Birnboim, H.C. ja Doly, J., Nucl. Acids Res. 7 (1979) 1513 - 1523], pilkottiin Hind III :11a ja käsiteltiin koettimella, jonka sekvenssi oli parhaan arvauksen mukainen. Yhtä positiivisen signaalin antanutta kloo-10 nia tutkittiin tarkemmin pilkkomalla sitä ensin monilla erilaisilla restriktioentsyymeillä ja tekemällä sitten Southern-blottaukset. Lopuksi 1,3 ke:n suuruinen EcoR I -Hind III -fragmentti jatkokloonattiin vektoreihin pEMBL 18 ja pEMBL 19 [Dente, L., et ai., Nucleic Acids Res. 11 15 (1983) 1645 - 1655] E. colissa. Lisäksi 0,6 ke:n EcoR V
-fragmentti kloonattiin pCUl-vektoriin [Augustin, J. , et ai., Eur. J. Biochem. 204 (1992) 1149 - 1154] sen jälkeen, kun EcoR I -kohta oli muokattu kohdemutageneesillä EcoR V -kohdaksi käyttäen transformaatiokohdemutageneesipakkausta 20 (Clontech, Palo Aito, USA).
2. Mersasidiinin mrsA-rakennegeenin nukleotidisek- venssi Tämä 0,6 ke:n fragmentti sekvensoitiin kaksinauhai-sesta DNA:sta automaattisella A.L.F.-DNA-sekvensointilait-25 teella (Pharmacia, Bryssel, Belgia) käyttäen ketjun di-deoksiterminaatiomenetelmää [Sanger, F., et ai., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 74 (1977) 5463 - 5467]; alukkeina käytettiin AutoreadR-sekvensointipakkauksen (Pharmacia, Bryssel, Belgia) yleisaluketta ja käänteisaluketta (rever-30 sal primer) sekä kahta synteettistä oligonuklotidia 5'-(TCTCTTCCATTTTTTTG)3' ja 5'-(AAATCAAATTAACAAATAC)3'. Mersasidiinin mrsA-rakennegeenin nukleotidisekvenssi on esitetty kuviossa 2. Mahdollinen ribosomia sitova kohta (AGG GGG) löydettiin kahdeksan emäsparin päästä avoimen 35 lukukehyksen ATG-aloituskodonista vastasuuntaan. Sekvens- 6 sin C-terminaalinen osa sopii yhteen mersasidiinin julkaistun primaarirakenteen kanssa [Chatterjee, S., et ai., J. Antibiotics 45 (1992) 832 - 838] sekä sen ehdotetun propeptidisekvenssin kanssa. N-terminaalinen osa koostuu 5 48 aminohapon johtosekvenssistä (nuoli kuviossa 2). Pro- mersasidiini koostuu 20 aminohaposta. Prepetidin kokonaispituus on siis 68 aminohappoa ja sen laskennallinen suhteellinen moolimassa on 7 228 Da. Kahdeksan emäksen päästä TAA (okra)-lopetuskodonista myötäsuuntaan löydettiin sil-10 mukkarakenne, jonka vapaan energian arvoksi saatiin -86,7 kJ mol"1 ja kannan kooksi saatiin 14 emäsparia ja joka voisi toimia rho:sta riippumattomana terminaatiosekvenssinä transkription aikana sitä seuraavan TTTATT-sekvenssin johdosta (kuvio 2).
15 3. Mersasidiinipeptidin karakterisointi
Lantibiootit on jaettu kahteen alaryhmään [Jung, G., (1991), edellä)]. A-tyypin lantibiootit ovat pitkän omaisia amfifiilisiä peptideitä, jotka muodostavat väliaikaisia reikiä niille herkkien bakteerien membraaneihin 20 [Sahl, H.-G., Pore formation in bacterial membranes by cationic lantibiotics, teoksessa Jung, G. ja Sahl, H.-G. (toim.), Nisin and novel lantibiotics (1991) 347 - 358, Escom, Leiden). B-tyypin lantibiootit ovat Streptomyces-bakteerin tuottamia globulaarisia peptidejä, joiden suh-25 teellinen moolimassa on alle 2 100 Da ja jotka ovat erittäin homologisia aminohapposekvenssin ja sellaisen rengas-rakenteen suhteen, joka sisältää alkupään kondensoitumisen loppupäähän [Jung, G., (1991), edellä]. Tähän mennessä mersasidiinia ei pystytty luokittelemaan kumpaankaan ryh-30 mään kuuluvaksi [Bierbaum, G. ja Sahl, H.G., Zbl. Bakt.
278 (1993) 1 - 22]. Tässä mielessä on erityisen mielenkiintoista verrata mersasidiinin prepeptidisekvenssiä A-ja B-tyypin lantibioottien prepeptidisekvensseihin.
Mersasidiinissa on säilynyt kaksi lantibioottien 35 johtosekvensseille yhteistä ominaispiirrettä: i) johtosek- 7 venssissä ei ole kysteiiniä [Jung, G., (1991), edellä], ii) johtosekvenssin C-terminaalisessa osassa otaksutaan olevan taipumusta a--kierteen muodostumiseen. A-tyypin lan-tibioottien johtopeptidien kyseessä ollessa on tällaisten 5 rakenne-elementtien olemassaolo ennustettu ja osoitettu määrittämällä Sirkulaarinen dikroismi trifluorietanolin ja veden seoksissa (Beck-Sickinger, A.G. ja Jung, G., Synthesis and conformational analysis of lantibiotic leader-, pro- and prepeptides, teoksessa Jung, G. ja Sahl, H.-G. 10 (toim.), Nisin and novel lantibiotics (1991) 218 - 230,
Escom, Leiden). Mersasidiinin johtosekvenssi on kaikissa muissa suhteissa tähän mennessä kuvatuista A-tyypin lanti-bioottien johtosekvensseistä poikkeva: kuvion 3 mukaisesti se muistuttaa pituudeltaan ja varausjakaumaltaan (48 ami-15 nohappoa ja 12 varausta) pikemminkin B-tyypin lantibioo-tin, kinnamysiinin, epätavallisen pitkää 59 aminohapon johtosekvenssiä (11 varausta) [Kaletta, C. et ai., Pep5, a new lantibiotic: structural gene isolation and prepetide sequence, Arch. Microbiol. 152 (1989) 16 - 19]. Sitä vas-20 toin tyypillisessä voimakkaasti varautuneessa A-tyypin lantibiootin johtosekvenssissä, esimerkiksi Pep5-johtosek-venssissä, on yhteensä vain 26 aminohappoa 10 varauksellista ryhmää kohti [Kaletta, C. (1989), edellä). A-tyypin lantibioottien säilyneitä sekvenssejä (esimerkiksi F D/N 25 L D/E -sekvenssimotiivi) ei esiinny mersasidiinin johto-peptidissä. Mersasidiinin johtosekvenssin proteaasilla pilkkoutuva kohta ("4M - "3E - '2A - _1A - +1C) poikkeaa A-tyypin lantibioottien säilyneestä kohdasta (kuvio 3). Tässä on havaittu joko nisiinityyppinen pilkkoutumiskohta 30 (-1, positiivisesti varautunut aminohappo; -2, proliini; -3, negatiivisesti varautunut tai polaarinen ja -4, hydrofobinen) tai hydrofobinen glysiini, joka sisältää lakti-siini 481 :n, Piard, J.-C., et ai., J. Biol. Chem 268 (1993) 16361 - 16368, tai streptokokkiini A-FF22:n [Hynes, 35 W.L., et ai., Appi. Env. Microbiol. 59 (1993) 1969 - 1971] 8 pilkkoutumiskohtia. Kinnamysiinin (_3A - ”2F - _1A) -pilkkou-tumiskohta [Kaletta, C., et al., (1989), edellä] on yhdenmukainen Sec-reaktiotien kautta erittyvien proteiinien ("3A - ~2X - _1Α) -säännön suhteen. Johtopäätöksenä voidaan 5 sanoa, että mersasidiinin prepeptidissä ei esiinny A-tyy-pin lantibioottien johtosekvenssien säilyneiden sekvenssien suhteen homologisia kohtia. Mersasidiinin prepeptidin pituus ja varausjakauma muistuttavat kinnamysiinin prepeptidin vastaavia ominaisuuksia, mutta aminohappotasolla ei 10 ole havaittavissa ilmiselvää sekvenssihomologiaa. Mersasi-diini on A-tyypin lantibiootteja pienempi, sillä ei ole positiivista varausta eikä se depolarisoi membraaneja vaan ennemminkin inhiboi peptidoglykaanien biosynteesiä. Tämä sekä johtopeptidin ominaisuudet osoittavat, että mersasi-15 diini muistuttaa enemmän B-tyypin lantibiootteja kuin A-tyypin lantibiootteja. Viime aikoina on saatu selville toisen, niin ikään soluseinän biosynteesiä inhiboivan lan-tibiootin, aktagardiinin, sekvenssi ja yhdyssiltojen muodostuminen [Somma, S., et ai., Antimicrob. Agents Che-20 mother. 11 (1977) 396 - 401]. Vertailu mersasidiiniin osoittaa, että yksi rengas on lähes täysin säilynyt kummassakin lantibiootissa. Tähän mennessä karakterisoitujen B-tyypin lantibioottien, duramysiini-A:n, -B:n, -C:n, an-koveniinin ja kinnamysiinin välisen suuren homologian huo-25 mioon ottaen myös näitä peptidejä voidaan pitää rakenteellisina variantteina, kuten on havaittu epidermiinin ja gallidermiinin tai nisiini A:n ja nisiini Z:n yhteydessä. Edellä mainituista syistä tässä keksinnössä tehdään ehdotus, jonka mukaan mersasidiini ja aktagardiini olisi luo-30 kiteltava B-tyypin lantibiooteiksi ja ettei B-tyypin lan-tibiooteilla tarkoitettaisi ainoastaan duramysiinin rakenteellisia variantteja vaan että niihin kuuluisivat myös pienet globulaariset pienivarauksiset lantibiootit, jotka inhiboivat entsyymiaktiivisuutta.
9
SEQUENCE LISTING
(1) GENERAL INFORMATION:
(i) APPLICANTS
(A) NAMES Hoechst Aktiengesellschaft (B) STREETS - (C) CITY: Frankfurt am Main (D) STATE: - (E) COUNTRY: Germany (F) POSTAL CODE (ZIP): 65926 (G) TELEPHONE: 069-305-6031 (H) TELEFAX: 069-35 7175 (I) TELEX: 41234700 hod (ii) TITLE OF INVENTION: Recombinant Mersacidin and a method for production (iii) NUMBER OF SEQUENCES: 4 (iv) COMPUTER READABLE FORM: (A) MEDIUM TYPE: Floppy disk (B) COMPUTER: IBM PC compatible
(C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS/MS-DOS
(D) SOFTWARE: Patentin Release #1.0, Version #1.25 (EPO) (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 17 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: DNA (genomic)
(iii) HYPOTHETICAL: YES
(iii) ANTI-SENSE: YES
(vi) FEATURE: (A) NAME/KEY: exon (B) LOCATION: 1..17 (ix) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 1: TCTCTTCCAT TTTTTTG 17 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 19 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: DNA (genomic)
(iii) HYPOTHETICAL: YES
(iii) ANTI-SENSE: YES
(vi) FEATURE: (A) NAME/KEY: exon (B) LOCATION: 1..19 10 (ix) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 2: ÄAATCAAATT AACAAATAC 19 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 288 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: DNA (genomic)
(iii) HYPOTHETICAL: NO
(iii) ANTI-SENSE: YES
(vi) ORIGINAL SOURCE: (A) SCIENTIFIC NAME: Mersacidin (B) STRAIN: Bacillus (C) INDIVIDUAL ISOLATE: HIL Y-85,54728 (ix) FEATURE:
(A) NAME/KEY: RBS
(B) LOCATION: 1..21 (ix) FEATURE:
(A) NAME/KEY: CDS
(B) LOCATION: 22..225 (ix) FEATURE: (A) NAME/KEY: Terminator (B) LOCATION: 208..288 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3: CTTAATAAGG GGGTGAATAC A ATG AGT CAA GAA GCT ATC ATT CGT TCA TGG 51
Met Ser Gin Glu Ala lie lie Arg Ser Trp 15 10 AAA GAT CCT TTT TCC CGT GAA AAT TCT ACA CAA AAT CCA GCT GGT AAC 99
Lys Asp Pro Phe Ser Arg Glu Asn Ser Thr Gin Asn Pro Ala Gly Asn 15 20 25 CCA TTC AGT GAG CTG AAA GAA GCA CAA ATG GAT AAG TTA GTA GGT GCG 147
Pro Phe Ser Glu Leu Lys Glu Ala Gin Met Asp Lys Leu Val Gly Ala 30 35 40 GGA GAC ATG GAA GCA GCA TGT ACT TTT ACA TTG CCT GGT GGC GGC GGT 195
Gly Asp Met Glu Ala Ala Cys Thr Phe Thr Leu Pro Gly Gly Gly Gly 45 50 55 GTT TGT ACT CTA ACT TCT GAA TGT ATT TGT TAATTTGATT TATATAGGCT 245
Val Cys Thr Leu Thr Ser Glu Cys lie Cys 60 65 GTTTCCCTTC AGAAGGAACA GCCTATATTT TATTATATAA ACT 288 1 INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4: (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: (A) LENGTH: 68 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: linear 11 (ii) MOLECULE TYPE: protein (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 4:
Met Ser Gin Glu Ala lie lie Arg Ser Trp Lys Asp Pro Phe Ser Arg 15 10 15
Glu Asn Ser Thr Gin Asn Pro Ala Gly Asn Pro Phe Ser Glu Leu Lys 20 25 30
Glu Ala Gin Met Asp Lys Leu Val Gly Ala Gly Asp Met Glu Ala Ala 35 40 45
Cys Thr Phe Thr Leu Pro Gly Gly Gly Gly Val Cys Thr Leu Thr Ser 50 55 60
Glu Cys lie Cys 65
Claims (8)
1. Premersasidiini, tunnettu siitä, että sen aminohapposekvenssi on aminohaposta nro 1 aminohappoon nro 5 68 kuviossa 2 esitetyn sekvenssin mukainen.
2. DNA, tunnettu siitä, että se koodaa patenttivaatimuksen 1 mukaista premersasidiinia.
3. DNA, tunnettu siitä, että se koodaa premersasidiinia, jonka nukleiinihapposekvenssi on nukleiinihap- 10 ponumerosta 22 nukleiinihapponumeroon 225 kuviossa 2 esitetyn sekvenssin mukainen.
4. DNA, tunnettu siitä, että se koodaa pro-mersasidiinia, jonka nukleiinihapposekvenssi on nukleiini-happonumerosta 166 nukleiinihapponumeroon 225 kuviossa 2 esi- 15 tetyn sekvenssin mukainen.
5. Vektori, tunnettu siitä, että se sisältää DNArta, joka on jonkin patenttivaatimuksista 2, 3 tai 4 mukainen DNA.
6. Isäntäsolu, tunnettu siitä, että se si- 20 sältää patenttivaatimuksen 5 mukaisen vektorin.
7. Premersasidiinin, promersasidiinin tai kypsän mer- sasidiinin valmistusmenetelmä, tunnettu siitä, että se käsittää vaiheet, jotka ovat: (a) viljellään patenttivaatimusten 2-4 mukaisen
25 DNA-sekvenssin sisältävää sopivaa isäntäsolua sopivissa olo suhteissa; ja (b) eristetään premersasidiini, promersasidiini tai kypsä mersasidiini.
8. Patenttivaatimuksen 1 premersasidiinin käyttö 30 kypsän mersasidiinin valmistamiseen.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP94114298 | 1994-09-12 | ||
EP94114298A EP0700998B1 (en) | 1994-09-12 | 1994-09-12 | Recombinant mersacidin and a method for production |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
FI954220A0 FI954220A0 (fi) | 1995-09-08 |
FI954220A FI954220A (fi) | 1996-03-13 |
FI120100B true FI120100B (fi) | 2009-06-30 |
Family
ID=8216276
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
FI954220A FI120100B (fi) | 1994-09-12 | 1995-09-08 | Yhdistelmä-mersasidiini ja sen valmistusmenetelmä |
Country Status (19)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5667991A (fi) |
EP (1) | EP0700998B1 (fi) |
JP (1) | JPH0898695A (fi) |
KR (1) | KR100394289B1 (fi) |
CN (1) | CN1149287C (fi) |
AT (1) | ATE255165T1 (fi) |
AU (1) | AU696450B2 (fi) |
CA (1) | CA2157975C (fi) |
CZ (1) | CZ285741B6 (fi) |
DE (1) | DE69433357T2 (fi) |
DK (1) | DK0700998T3 (fi) |
ES (1) | ES2207636T3 (fi) |
FI (1) | FI120100B (fi) |
HU (1) | HU216619B (fi) |
IL (1) | IL115242A0 (fi) |
NZ (1) | NZ272960A (fi) |
PT (1) | PT700998E (fi) |
RU (1) | RU2198924C2 (fi) |
SI (1) | SI9500270B (fi) |
Families Citing this family (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6778596B1 (en) * | 1999-03-12 | 2004-08-17 | Aware, Inc. | Method and multi-carrier transceiver with stored application profiles for supporting multiple applications |
US6667991B1 (en) * | 1999-03-12 | 2003-12-23 | Aware, Inc. | Method for synchronizing seamless rate adaptation |
US6861236B2 (en) | 2002-05-24 | 2005-03-01 | Applied Nanosystems B.V. | Export and modification of (poly)peptides in the lantibiotic way |
GB0406870D0 (en) * | 2004-03-26 | 2004-04-28 | Novacta Biosystems Ltd | Improvements relating to the production of lantibiotics |
US7592308B2 (en) | 2004-03-26 | 2009-09-22 | Novacta Biosystems Limited | F3W variants of the lantibiotic mersacidin and its use |
CA2623624A1 (en) * | 2005-09-27 | 2007-04-05 | Novacta Biosystems Limited | Variants of the lantibiotic mersacidin and their use |
GB0600928D0 (en) | 2006-01-17 | 2006-02-22 | Novacta Biosystems Ltd | Improvements relating to lantibiotics |
GB0714029D0 (en) | 2007-07-18 | 2007-08-29 | Novacta Biosystems Ltd | Lantibiotic-based compounds having antimicrobial activity |
GB0714030D0 (en) | 2007-07-18 | 2007-08-29 | Novacta Biosystems Ltd | The use of type-B lantibiotic-based compounds having antimicrobial activity |
WO2009121483A1 (en) * | 2008-04-02 | 2009-10-08 | Sanofi-Aventis | Highly bridged peptides from actinomadura namibiensis |
WO2010058238A1 (en) * | 2008-11-24 | 2010-05-27 | Sentinella Pharmaceuticals, Inc. ("Sentinella") | Lantibiotic carboxyamide derivatives with enhanced antibacterial activity |
JP5719312B2 (ja) | 2009-01-14 | 2015-05-13 | ノヴァクタ バイオシステムズ リミティッド | デオキシアクタガルジン誘導体 |
CA2750883A1 (en) | 2009-02-04 | 2010-08-12 | Novacta Biosystems Limited | Actagardine derivatives |
GB201001688D0 (en) | 2010-02-02 | 2010-03-17 | Novacta Biosystems Ltd | Compounds |
GB201013513D0 (en) | 2010-08-11 | 2010-09-22 | Novacta Biosystems Ltd | Formulations |
CN106188253B (zh) * | 2016-08-26 | 2020-08-18 | 上海交通大学 | 抗菌肽Lexapeptide及其制备方法和用途 |
MX2021009398A (es) | 2019-02-05 | 2021-11-17 | Elanco Us Inc | Composiciones probioticas que comprenden cepas de lactobacillus reuteri y metodos de uso. |
CN111235119B (zh) * | 2020-03-05 | 2021-11-23 | 苏州十一方生物科技有限公司 | 一种融合抗菌蛋白的制备及应用 |
CN114457102B (zh) * | 2022-02-24 | 2023-12-26 | 重庆市畜牧科学院 | 用于编码分泌型Mersacidin的基因表达盒及其制备方法 |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5218101A (en) * | 1988-07-05 | 1993-06-08 | The University Of Maryland | Leader sequence inducing a post-translational modification of polypeptides in bacteria, and gene therefor |
IN167138B (fi) * | 1988-08-17 | 1990-09-01 | Hoechst India |
-
1994
- 1994-09-12 PT PT94114298T patent/PT700998E/pt unknown
- 1994-09-12 DK DK94114298T patent/DK0700998T3/da active
- 1994-09-12 ES ES94114298T patent/ES2207636T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-12 DE DE69433357T patent/DE69433357T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-12 EP EP94114298A patent/EP0700998B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-12 AT AT94114298T patent/ATE255165T1/de active
-
1995
- 1995-09-01 SI SI9500270A patent/SI9500270B/sl not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 FI FI954220A patent/FI120100B/fi not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 US US08/524,677 patent/US5667991A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-09-08 AU AU30554/95A patent/AU696450B2/en not_active Ceased
- 1995-09-08 CN CNB951162330A patent/CN1149287C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1995-09-08 CZ CZ952318A patent/CZ285741B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-09-08 NZ NZ272960A patent/NZ272960A/en not_active IP Right Cessation
- 1995-09-11 CA CA002157975A patent/CA2157975C/en not_active Expired - Fee Related
- 1995-09-11 IL IL11524295A patent/IL115242A0/xx not_active IP Right Cessation
- 1995-09-11 JP JP7232356A patent/JPH0898695A/ja active Pending
- 1995-09-11 RU RU95115686/13A patent/RU2198924C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1995-09-11 HU HU9502643A patent/HU216619B/hu not_active IP Right Cessation
- 1995-09-12 KR KR1019950029599A patent/KR100394289B1/ko not_active IP Right Cessation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA2157975C (en) | 2008-11-18 |
IL115242A0 (en) | 1995-12-31 |
CN1131192A (zh) | 1996-09-18 |
CN1149287C (zh) | 2004-05-12 |
AU696450B2 (en) | 1998-09-10 |
FI954220A0 (fi) | 1995-09-08 |
EP0700998A1 (en) | 1996-03-13 |
AU3055495A (en) | 1996-03-28 |
HU9502643D0 (en) | 1995-11-28 |
JPH0898695A (ja) | 1996-04-16 |
NZ272960A (en) | 1996-05-28 |
CZ231895A3 (en) | 1996-03-13 |
SI9500270B (sl) | 2002-02-28 |
HUT73800A (en) | 1996-09-30 |
SI9500270A (en) | 1996-04-30 |
US5667991A (en) | 1997-09-16 |
DE69433357D1 (de) | 2004-01-08 |
RU2198924C2 (ru) | 2003-02-20 |
EP0700998B1 (en) | 2003-11-26 |
KR100394289B1 (ko) | 2003-10-22 |
FI954220A (fi) | 1996-03-13 |
ES2207636T3 (es) | 2004-06-01 |
HU216619B (hu) | 1999-07-28 |
PT700998E (pt) | 2004-03-31 |
CA2157975A1 (en) | 1996-03-13 |
DE69433357T2 (de) | 2004-09-09 |
ATE255165T1 (de) | 2003-12-15 |
KR960010863A (ko) | 1996-04-20 |
CZ285741B6 (cs) | 1999-10-13 |
DK0700998T3 (da) | 2004-03-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
FI120100B (fi) | Yhdistelmä-mersasidiini ja sen valmistusmenetelmä | |
Bierbaum et al. | Cloning, sequencing and production of the lantibiotic mersacidin | |
Stein et al. | Two different lantibiotic-like peptides originate from the ericin gene cluster of Bacillus subtilis A1/3 | |
Bierbaum et al. | Engineering of a novel thioether bridge and role of modified residues in the lantibiotic Pep5 | |
Martínez-Bueno et al. | Determination of the gene sequence and the molecular structure of the enterococcal peptide antibiotic AS-48 | |
Engelke et al. | Identification and sequence analysis of the Rhizobium meliloti dctA gene encoding the C4-dicarboxylate carrier | |
Schnell et al. | Analysis of genes involved in the biosynthesis of lantibiotic epidermin | |
Klein et al. | Genes involved in self-protection against the lantibiotic subtilin produced by Bacillus subtilis ATCC 6633 | |
Hynes et al. | Cloning of the gene encoding streptococcin A-FF22, a novel lantibiotic produced by Streptococcus pyogenes, and determination of its nucleotide sequence | |
Hanson et al. | The hbpA gene of Haemophilus influenzae type b encodes a heme-binding lipoprotein conserved among heme-dependent Haemophilus species | |
Bierbaum et al. | Construction of an expression system for engineering of the lantibiotic Pep5 | |
Ebisu et al. | Conserved structures of cell wall protein genes among protein-producing Bacillus brevis strains | |
EP1169340B1 (en) | Lantibiotic | |
US6855518B2 (en) | Anti-listeria bacteriocin | |
US6699839B1 (en) | Lantibiotic from Streptococcus mutans, method of production and use thereof | |
FI104498B (fi) | Biosynteettinen menetelmä kemiallisten yhdisteiden valmistamiseksi | |
Kanatani et al. | Cloning and nucleotide sequence of the gene for acidocin 8912, a bacteriocin from Lactobacillus acidophilus TK8912 | |
Stein et al. | Two Different Lantibiotic-Like Peptides | |
Götz et al. | Structure and DNA-Sequence Analysis of the Staphylococcal Lantibiotics Epidermin and Gallidermin | |
Quadri | Biochemical and genetic characterization of antimicrobial peptides produced by carnobacterium piscicola LV17B | |
ZA200209666B (en) | Anti-listeria bacteriocin. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FG | Patent granted |
Ref document number: 120100 Country of ref document: FI |
|
MM | Patent lapsed |