ES2878023T3 - Derivados de hemiasterlina para conjugación y terapia - Google Patents

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Abstract

Un compuesto de acuerdo con la fórmula 1000: **(Ver fórmula)** o una sal, solvato, un estereoisómero o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo, en donde: Ar es un arilo monocíclico divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir; un heteroarilo monocíclico de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir; un arilo bicíclico condensado, divalente, de nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir; un heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir; L está ausente o es -CH2-; **(Ver fórmula)** , o **(Ver fórmula)** W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente; EG está ausente o es un grupo eliminador; cada RT es un grupo desencadenante de liberación, en la cadena principal de la fórmula 1000 o unido a EG, en en donde cada RT es opcional; RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible o RT1 está ausente; HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente; HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o **(Ver fórmula)** donde RHP es un grupo hidrófilo monovalente; SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente, y R es **(Ver fórmula)**

Description

DESCRIPCIÓN
Derivados de hemiasterlina para conjugación y terapia
Campo
En el presente documento se proporcionan derivados de hemiasterlina, conjugados de los mismos, composiciones que comprenden los derivados o conjugados de los mismos, métodos para producir los derivados y conjugados de los mismos y métodos para usar los derivados, conjugados y composiciones para el tratamiento de la proliferación celular. Los derivados, conjugados y composiciones son útiles en los métodos de tratamiento y prevención de la proliferación celular y el cáncer, los métodos de detección de la proliferación celular y el cáncer y los métodos de diagnóstico de la proliferación celular y el cáncer.
Antecedentes
Las hemiasterlinas son una clase de tripéptidos modificados del producto natural original hemiasterlina. La hemiasterlina se aísla de las esponjas marinas Cymbastela sp., Hemiasterella minor, Siphonochalina sp., y Auletta sp. (Talpir etal., Tetrahedron Letters, vol. 35, n.°25, págs. 4453-4456, 1994).
Figure imgf000002_0001
Las hemiasterlinas son pseudopéptidos que son inhibidores de la polimerización de tubulina, que comparten un mecanismo de acción antimitótico con las dolastatinas y las criptoficinas. Se ha demostrado la unión no competitiva en el sitio de la vinblastina a la tubulina. Las hemiasterlinas son, en general, sustratos de glucoproteínas de baja permeabilidad (pGP), que los hace eficaces contra tumores que sobreexpresan pGP como mecanismo de resistencia. (Loganzo et al., Cancer Research, vol. 63, págs. 1838-1845, 15 de abril de 2003).
La modificación extensa de la hemiasterlina natural demostró características clave que contribuyen a la actividad nanomolar de esta clase contra una amplia variedad de líneas de células tumorales. Dos derivados, E7974, un derivado de piperidina N-terminal desarrollado en Eisai, y HTI-286, un fenilo N-terminal desarrollado en Wyeth, entraron en ensayos de Fase I. En 2007 se presentaron resultados alentadores para el modelo E7974. (Madajewicz et al., "A phase I trial of E7974 administered on days 1 and 15 of a 28-day cycle in patients with solid malignancies", presentado en la Reunión Anual de la Sociedad Estadounidense de Oncología Clínica; 1-5 de junio de 2007; Chicago, Ill.; y Zojwalla et al., "A phase I trial of E7974 administered on days 1,8, and 15 of a 28-day cycle in patients with solid malignancies", presentado en la Reunión Anual de la Sociedad Estadounidense de Oncología Clínica; 1-5 de junio de 2007; Chicago, Ill; ambos resumidos en Rocha-Lima et al., Cancer, 1 de septiembre de 2012, págs. 4262-4270). Sin embargo, no se han documentado resultados para HTI-286 hasta la fecha.
Figure imgf000002_0002
Además, la conjugación de HTI-286 en el extremo C-terminal con un decapéptido de gastrina VLALAEEEAYGwNleDF-NH2 para el direccionamiento tumoral se describe en Tarsova et al., Publicación de la Solicitud de patente de los Estados Unidos número US 2005/0171014 A1. La actividad documentada, sin embargo, era muy débil.
El documento US 2014/0315954 A1 se refiere a compuestos que se describen por tener actividad citotóxica y/o antimitótica.
Sumario
En el presente documento se proporcionan derivados de hemiasterlina, conjugados de los mismos, composiciones que comprenden los derivados o conjugados de los mismos, métodos para producir los derivados y conjugados de los mismos y métodos para usar los derivados, conjugados y composiciones para el tratamiento de la proliferación celular. Los derivados, conjugados y composiciones son útiles en los métodos de tratamiento y prevención de la proliferación celular y el cáncer, los métodos de detección de la proliferación celular y el cáncer y los métodos de diagnóstico de la proliferación celular y el cáncer.
En un aspecto, en el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula 1000:
Figure imgf000003_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
Ar es un arilo monocíclico divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir; un anillo heteroarilo divalente de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir; un arilo bicíclico condensado, divalente, de nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo heteroarilo condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
Figure imgf000003_0004
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
cada RT es un grupo desencadenante de liberación, en la cadena principal de la fórmula 1000 o unido a EG, en donde cada RT es opcional;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible o RT1 está ausente;
HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Figure imgf000003_0002
en donde RHP es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es
Figure imgf000003_0003
En un aspecto, el presente documento proporciona un conjugado que comprende un compuesto descrito en el presente documento unido a un segundo compuesto a través de un enlazador.
En un aspecto, en el presente documento se proporciona una composición farmacéutica que comprende:
un compuesto o conjugado como se describe en el presente documento y
un excipiente, vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.
En un aspecto, en el presente documento se proporciona una cantidad de un compuesto, conjugado o composición que comprende un compuesto o conjugado, como se describe en el presente documento, para su uso en un método para inhibir la polimerización de la tubulina en un sujeto que lo necesita.
En un aspecto, en el presente documento se proporciona un compuesto, conjugado o composición que comprende un compuesto o conjugado, como se describe en el presente documento, para su uso en un método para tratar la proliferación celular o el cáncer en un sujeto que lo necesita.
En un aspecto, en el presente documento se proporciona un método para producir un conjugado, que comprende poner en contacto un compuesto seleccionado entre el grupo que consiste en:
Figure imgf000005_0001
Figure imgf000006_0001
con un segundo compuesto en condiciones adecuadas para la conjugación del segundo compuesto con el compuesto de una cualquiera de las fórmulas (101)-(111) con el segundo compuesto; en donde el segundo compuesto comprende una azida.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 proporciona los resultados de un ensayo de muerte celular descrito en detalle en el presente documento. El Compuesto 1 racémico [R/S,S,S] se evalúa como un conjugado en la cadena pesada de trastuzumab en F404 y también en la cadena ligera en S7. Todos los demás conjugados de la Figura 1 están en la cadena pesada de trastuzumab en F404. La viabilidad celular relativa de las células SKBR3 se representa gráficamente frente a la concentración de trastuzumab (equis), Compuesto 1 conjugado de trastuzumab F404 [S,S,S] (cuadrados rellenos), Compuesto 1 conjugado de trastuzumab F404 racémico [R/S,S,S] (cuadrados divididos), Compuesto 1 conjugado de trastuzumab S7 racémico [R/S,S,S] (círculos divididos) y un conjugado de trastuzumab auristatina (MMAF) (triángulos abiertos).
La Figura 2a proporciona los resultados de un ensayo de destrucción de células descrito en detalle en el presente documento. En la Figura 2a, la viabilidad celular relativa se representa gráficamente frente a la concentración del Compuesto 1 [S,S,S] (cuadrados rellenos) y Compuesto 1 [R,S,S] (cuadrados blancos) para células SKBR3 en el panel (a), células MdA-MB-453 en el panel (b) y células MDA-MB-468 en el panel (c).
La Figura 2b proporciona los resultados de un ensayo de destrucción celular descrito en detalle en el presente documento. En la Figura 2b, la viabilidad celular relativa se representa gráficamente frente a la concentración del Compuesto 1 [S,S,S] (cuadrados rellenos) y Compuesto 1 [R,S,S] (cuadrados blancos) para células HTC116 en el panel (a), células HT29 en el panel (b) y células SKCO1 en el panel (c).
La Figura 2c proporciona los resultados de un ensayo de destrucción celular descrito en detalle en el presente documento. En la Figura 2c, la viabilidad celular relativa se representa gráficamente frente a la concentración del Compuesto 1 [S,S,S] (cuadrados rellenos) y Compuesto 1 [R,S,S] (cuadrados blancos) para células MDA-MB-435 en el panel (a), células SUDHL6 en el panel (b) y células OMP2 en el panel (c).
Descripción
En el presente documento se proporcionan compuestos (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1-8b), conjugados de los mismos (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b), composiciones que comprenden los compuestos o conjugados de los mismos, métodos para producir los compuestos y conjugados de los mismos y métodos para usar los compuestos, conjugados y composiciones. Los compuestos, conjugados y composiciones son útiles en los métodos de tratamiento y prevención de la proliferación celular y el cáncer, los métodos de detección de la proliferación celular y el cáncer y los métodos de diagnóstico de la proliferación celular y el cáncer.
Definiciones
Cuando se refieren a los compuestos proporcionados en el presente documento, los términos siguientes tienen los significados siguientes a menos que se indique de otro modo. A menos que se defina de otra manera, todos los términos técnicos y científicos usados en el presente documento tienen el mismo significado que entiende habitualmente un experto en la técnica. En el caso en el que exista una pluralidad de definiciones para un término en el presente documento, a menos que se indique lo contrario, prevalecen las indicadas en esta sección. A menos que se especifique de otra manera, en donde un término se define como que está sin sustituir o sustituido, los grupos en la lista de sustituyentes están sin sustituir. Por ejemplo, un grupo alquilo puede estar sustituido con un grupo cicloalquilo y el grupo cicloalquilo no está más sustituido.
El término "alquilo", como se usa en el presente documento, a menos que se especifique otra cosa, se refiere a un hidrocarburo saturado, lineal o ramificado, que puede estar sustituido con grupos halo. En determinados ejemplos, el grupo alquilo es un hidrocarburo primario, secundario o terciario. En determinados ejemplos, el grupo alquilo incluye de uno a diez átomos de carbono, es decir, alquilo C1 a C10. En determinados ejemplos, el grupo alquilo es, por ejemplo, metilo, CF3 , CCh, CFCh, CF2Cl, etilo, CH2CF3, CF2CF3 , propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo, t-butilo, pentilo, isopentilo, neopentilo, hexilo, isohexilo, 3-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo o 2,3-dimetilbutilo. El término incluye grupos alquilo tanto sustituidos como sin sustituir, incluyendo grupos alquilo halogenados. En determinados ejemplos, el grupo alquilo es un grupo alquilo fluorado. En determinados ejemplos, el grupo alquilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1,2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, cicloalquilo, aralquilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario, como saben los expertos en la técnica, por ejemplo, como se muestra en Greene, et al., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley y Sons, segunda edición, 1991.
La expresión "alquilo inferior", como se usa en el presente documento y, a menos que se indique de otra manera, se refiere a un hidrocarburo saturado, lineal o ramificado, que tiene de uno a seis átomos de carbono, es decir, alquilo C1 a C6. En determinados ejemplos, el grupo alquilo inferior es un hidrocarburo primario, secundario o terciario. La expresión incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir.
La expresión "alquilo superior", como se usa en el presente documento y, a menos que se indique de otra manera, se refiere a un hidrocarburo saturado, lineal o ramificado, que tiene de siete a treinta átomos de carbono, es decir, alquilo C7 a C30. En determinados ejemplos, el grupo alquilo superior es un hidrocarburo primario, secundario o terciario. La expresión incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir.
El término "alquilcarbonilo" se refiere al grupo -C(O)(alquilo) en donde el alquilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "alquilsulfanilo" se refiere al grupo -S(alquilo) en donde el alquilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "carboxileno" se refiere a un grupo -C(O)O- o -OC(O)-.
El término "cicloalquilsulfanilo" se refiere al grupo -S(cicloalquilo) en donde el cicloalquilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "arilsulfanilo" se refiere al grupo -S(arilo) en donde arilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "alquilsulfonilo" se refiere al grupo -S(O)2(alquilo) en donde alquilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "cicloalquilsulfonilo" se refiere al grupo -S(O)2(cicloalquilo) en donde cicloalquilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "arilsulfonilo" se refiere al grupo -S(O)2(arilo) en donde arilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "cicloalquilo", como se usa en el presente documento, a menos que se especifique otra cosa, se refiere a un hidrocarburo saturado, monocíclico o policíclico. En determinados ejemplos, cicloalquilo incluye sistemas de anillo condensados, puenteados y espiro. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquilo incluye de tres a diez átomos de carbono, es decir, cicloalquilo C3 a C10. En algunos ejemplos, el cicloalquilo tiene de 3 a 15 (C3-15), de 3 a 10 (C3-10) o de 3 a 7 (C3-7) átomos de carbono. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquilo es, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, ciclohexilmetilo, cicloheptilo, biciclo[2.1.1]hexilo, biciclo[2.2.1]heptilo, decalinilo o adamantilo. El término incluye grupos cicloalquilo tanto sustituidos como sin sustituir, incluyendo grupos cicloalquilo halogenados. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquilo es un grupo cicloalquilo fluorado. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
El término "cicloalquilalquilo" se refiere a un grupo alquilo como se define en el presente documento sustituido con al menos un (en algunos ejemplos, uno o dos) grupo cicloalquilo como se define en el presente documento.
El término "cicloalquilcarbonilo" se refiere al grupo -C(O)(cicloalquilo) en donde cicloalquilo es como se ha definido en el presente documento.
"Alquileno" se refiere a grupos hidrocarburo alifáticos, divalentes, saturados, que incluyen aquellos que tienen de uno a once átomos de carbono que pueden ser de cadena lineal o ramificada. En determinados ejemplos, el grupo alquileno contiene de 1 a 10 átomos de carbono. La expresión incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir. En determinados ejemplos, el alquileno es, por ejemplo, metileno (-CH2-), etileno (-CH2CH2-) o los isómeros de propileno (por ejemplo, -CH2CH2CH2- y -CH(CH3)CH2-). El término incluye grupos alquileno halogenados. En determinados ejemplos, el grupo alquileno es un grupo alquileno fluorado. En determinados ejemplos, el grupo alquileno puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alquilarilo, alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato y fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
"Alquenilo" se refiere a grupos hidrocarburo monovalentes olefínicamente insaturados, en determinados ejemplos, que tienen hasta aproximadamente 11 átomos de carbono, que incluyen de 2 a 8 átomos de carbono o de 2 a 6 átomos de carbono, que puede ser de cadena lineal o ramificada y tiene al menos 1, incluyendo de 1 a 2, sitios de insaturación olefínica. La expresión incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir. En determinados ejemplos, alquenilo es, por ejemplo, etenilo (es decir, vinilo o - CH=CH2), n-propenilo (-CH2CH=CH2) o isopropenilo (-C(CH3)=CH2). El término incluye grupos alquenilo halogenados. En determinados ejemplos, el grupo alquenilo es un grupo alquenilo fluorado. En determinados ejemplos, el grupo alquenilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
El término "cicloalquenilo", como se usa en el presente documento, a menos que se indique otra cosa, se refiere a un hidrocarburo cíclico insaturado (pero no aromático). En determinados ejemplos, cicloalquenilo se refiere a sistemas de anillo mono o multicíclicos que incluyen al menos un doble enlace. En determinados ejemplos, cicloalquilo incluye sistemas de anillo condensados, puenteados y espiro. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquilo incluye al menos tres átomos de carbono, incluyendo de tres a diez átomos de carbono, es decir, cicloalquilo C3 a C10. En algunos ejemplos, el cicloalquenilo tiene de 3 a 10 (C3-10) o de 4 a 7 (C4-7) átomos de carbono. El término incluye grupos cicloalquenilo tanto sustituidos como sin sustituir, incluyendo grupos cicloalquenilo halogenados. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquenilo es un grupo cicloalquenilo fluorado. En determinados ejemplos, el grupo cicloalquenilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
"Alquenileno" se refiere a grupos hidrocarburo divalentes olefínicamente insaturados, en determinados ejemplos, que tienen hasta aproximadamente 11 átomos de carbono o de 2 a 6 átomos de carbono que pueden ser de cadena lineal o ramificada y que tienen al menos 1 o de 1 a 2 sitios de insaturación olefínica. En determinados ejemplos, alquenileno es, por ejemplo, etenileno (-CH=CH-) o los isómeros de propenileno (por ejemplo, -CH=CHCH2- y -C(CH3)=CH- y -CH=C(CH3)-). El término incluye grupos alquenileno tanto sustituidos como sin sustituir, incluyendo grupos alquenileno halogenados. En determinados ejemplos, el grupo alquenileno es un grupo alquenileno fluorado. Los ejemplos no limitantes de restos con los cuales el grupo alquenileno se puede sustituir con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
"Alquinilo" se refiere a grupos hidrocarburos acetilénicamente insaturados, en determinados ejemplos, que tienen hasta aproximadamente 11 átomos de carbono o de 2 a 6 átomos de carbono que pueden ser de cadena lineal o ramificada y que tienen al menos 1 o de 1 a 2 sitios de insaturación de alquinilo. En determinados ejemplos, alquinilo es, por ejemplo, acetilénico, etinilo (-CECH) o propargilo (-CH2CECH). El término incluye grupos alquinilo tanto sustituidos como sin sustituir, incluyendo grupos alquinilo halogenados. En determinados ejemplos, el grupo alquinilo es un grupo alquinilo fluorado. En determinados ejemplos, el grupo alquinilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
El término "arilo", como se usa en el presente documento y, a menos que se indique de otra manera, se refiere a un anillo mono, bi o tricarbocíclico monovalente, de seis a catorce miembros, en donde el anillo monocíclico es aromático y al menos uno de los anillos en el anillo bicíclico y tricíclico es aromático. El grupo arilo puede estar unido al resto de la molécula a través de cualquier carbono en el sistema de anillo. En un ejemplo, un grupo arilo es un grupo arilo C6-C12. En un ejemplo, un grupo arilo es fenilo, indanilo o naftilo. La expresión incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir. En determinados ejemplos, un grupo arilo puede estar sustituido con uno o más (por ejemplo 1, 2, 3, 4 o 5) restos seleccionados independientemente entre el grupo halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), alquilo, haloalquilo, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato y fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario, como saben los expertos en la técnica, por ejemplo, como se muestra en Greene, et al., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley y Sons, segunda edición, 1991.
El término "arilcarbonilo" se refiere al grupo -C(O)(arilo) en donde arilo es como se ha definido en el presente documento.
El término "ariloxi" se refiere al grupo -OR' en donde R' es arilo, como se define en el presente documento.
El término "ariloxialquilo" se refiere a un grupo alquilo como se define en el presente documento sustituido con al menos uno (en algunos ejemplos uno o dos) grupos ariloxi como se define en el presente documento.
"Alcoxi" y "alcoxilo" se refiere al grupo -OR' en donde R' es alquilo o cicloalquilo como se define en el presente documento. En determinados ejemplos, los grupos alcoxi y alcoxilo incluyen, a modo de ejemplo, metoxi, etoxi, npropoxi, isopropoxi, ciclopropoxi, n-butoxi, terc-butoxi, sec-butoxi, n-pentoxi, n-hexoxi o 1,2-dimetilbutoxi.
El término "alcoxialquilo" se refiere a un grupo alquilo sustituido con al menos un (en otro ejemplo, uno o dos) grupos alcoxi como se define en el presente documento.
"Alcoxicarbonilo" se refiere a un radical -C(O)-alcoxi en donde alcoxi es como se ha definido en el presente documento. "Alcoxicarbonilalquilo" se refiere a un grupo alquilo sustituido con al menos un, en otro ejemplo 1 o 2, grupo alcoxicarbonilo, como se define en el presente documento.
"Amino" se refiere al grupo -NR1'R2' o -NR1'-, en donde R1' y R2' son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, heterocíclico, arilo o heteroarilo, cada uno de los cuales es como se ha definido en el presente documento. En un ejemplo, "Amino" es -NH2 o -NH-.
"Carboxilo" o "carboxi" se refiere al radical -C(O)OH.
El término "alquilamino" o "arilamino" se refiere a un grupo amino que tiene un sustituyente alquilo o arilo, respectivamente, por ejemplo -NHCH3 y -NH(fenilo). En determinados ejemplos, el sustituyente alquilo es alquilo inferior. En otro ejemplo, el alquilo o alquilo inferior está sin sustituir.
El término "dialquilamino" se refiere a un grupo amino que tiene dos sustituyentes alquilo, por ejemplo -N(CH3)2. En determinados ejemplos, el sustituyente alquilo es alquilo inferior. En otro ejemplo, el alquilo o alquilo inferior está sin sustituir.
El término "diarilamino" se refiere a un grupo amino que tiene dos sustituyentes arilo.
"Halógeno" o "halo" se refiere a cloro, bromo, flúor o yodo.
"Tioalcoxi" se refiere al grupo -SR' en donde R' es alquilo o cicloalquilo.
El término "heterociclo" o "heterocíclico" se refiere a un sistema de anillo no aromático, monovalente, monocíclico y/o sistema de anillo multicíclico que contiene al menos un anillo no aromático, en donde uno o más de los átomos del anillo no aromático son heteroátomos seleccionados independientemente entre O, S o N y el resto de átomos en el anillo son átomos de carbono y en donde el sistema de anillo multicíclico comprende además un anillo carbocíclico o heterocíclico, aromático o no aromático. En determinados ejemplos, el heterociclo o grupo heterocíclico tiene de 3 a 20, de 3 a 15, de 3 a 10, de 3 a 8, de 4 a 7 o de 5 a 6 átomos en el anillo. Los grupos heterociclo están unidos al resto de la molécula a través de un anillo no aromático. En determinados ejemplos, el heterociclo es un sistema de anillo monocíclico, bicíclico, tricíclico o tetracíclico, que puede incluir un sistema de anillo condensado, espirocíclico o puenteado y en el que los átomos de nitrógeno o azufre pueden estar opcionalmente oxidados, los átomos de nitrógeno pueden estar opcionalmente cuaternizados y algunos anillos pueden estar parcial o completamente saturados o ser aromáticos. El heterociclo puede estar unido a la estructura principal en cualquier heteroátomo o átomo de carbono del anillo no aromático que dé como resultado la creación de un compuesto estable. En determinados ejemplos, heterocíclico es azepinilo, benzodioxanilo, benzodioxolilo, benzofuranonilo, benzopiranonilo, benzopiranilo, benzotetrahidrofuranoílo, benzotetrahidrotienilo, benzotiopiranilo, benzoxazinilo, p-carbolinilo, cromanilo, cromonilo, cinolinilo, cumarinilo, decahidroisoquinolinilo, dihidrobenzoisotiazinilo, dihidrobenzoisoxazinilo, dihidrofurilo, dihidroisoindolilo, dihidropiranilo, dihidropirazolilo, dihidropirazinilo, dihidropiridinilo, dihidropirimidinilo, dihidropirrolilo, dioxolanilo, 1,4-ditianilo, furanonilo, imidazolidinilo, imidazolinilo, indolinilo, isobenzotetrahidrofuranoílo, isobenzotetrahidrotienilo, isocromanilo, isocoumarinilo, isoindolinilo, isotiazolidinilo, isoxazolidinilo, morfolinilo, octahidroindolilo, octahidroisoindolilo, oxazolidinonilo, oxazolidinilo, oxiranilo, piperazinilo, piperidinilo, 4-piperidonilo, pirazolidinilo, pirazolinilo, pirrolidinilo, pirrolinilo, quinuclidinilo, tetrahidrofurilo, tetrahidroisoquinolinilo, tetrahidropiranilo, tetrahidrotienilo, tiamorfolinilo, tiazolidinilo, tetrahidroquinolinilo y 1,3,5-tritianilo. En determinados ejemplos, el heterocíclico también puede estar opcionalmente sustituido como se describe en el presente documento. En determinados ejemplos, el grupo heterocíclico puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), oxo, epoxi, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, alcoxicarbonilo, alcoxicarbonilalquilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo, alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato o fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
El término "heteroarilo" se refiere a un grupo aromático, monocíclico, monovalente y/o grupo multicíclico que contiene al menos un anillo aromático, en donde el anillo monocíclico contiene uno o más heteroátomos seleccionados independientemente entre O, S y N en el anillo y en donde el sistema de anillo multicíclico comprende al menos un anillo aromático y además comprende un anillo carbocíclico o heterocíclico, aromático o no aromático y en donde uno o más de los átomos del anillo en el sistema de anillo multicíclico es un heteroátomo seleccionado independientemente entre O, S y N. Los grupos heteroarilo están unidos al resto de la molécula a través de un anillo aromático. Cada anillo de un grupo heteroarilo puede contener uno o dos átomos O, uno o dos átomos S y/o de uno a cuatro átomos N, con la condición de que el número total de heteroátomos en cada anillo es cuatro o menos y cada anillo contiene al menos un átomo de carbono. En determinados ejemplos, el heteroarilo tiene de 5 a 20, de 5 a 15 o de 5 a 10 átomos en el anillo. En determinados ejemplos, los grupos heteroarilo monocíclicos incluyen, pero no se limitan a, furanilo, imidazolilo, isotiazolilo, isoxazolilo, oxadiazolilo, oxadiazolilo, oxazolilo, pirazinilo, pirazolilo, piridazinilo, piridilo, pirimidinilo, pirrolilo, tiadiazolilo, tiazolilo, tienilo, tetrazolilo, triazinilo y triazolilo. En determinados ejemplos, los grupos heteroarilo bicíclicos incluyen, pero no se limitan a, benzofuranilo, benzoimidazolilo, benzoisoxazolilo, benzopiranilo, benzotiadiazolilo, benzotiazolilo, benzotienilo, benzotriazolilo, benzoxazolilo, furopiridilo, imidazopiridinilo, imidazotiazolilo, indolizinilo, indolilo, indazolilo, isobenzofuranilo, isobenzotienilo, isoindolilo, isoquinolinilo, isotiazolilo, naftiridinilo, oxazolopiridinilo, ftalazinilo, pteridinilo, purinilo, piridopiridilo, pirrolopiridilo, quinolinilo, quinoxalinilo, quinazolinilo, tiadiazolopirimidilo y tienopiridilo. En determinados ejemplos, los grupos heteroarilo tricíclicos incluyen, pero no se limitan a, acridinilo, benzindolilo, carbazolilo, dibenzofuranilo, perimidinilo, fenantrolinilo, fenantridinilo, fenarsazinilo, fenazinilo, fenotiazinilo, fenoxazinilo y xantenilo. En determinados ejemplos, el grupo heteroarilo puede estar sustituido con al menos un (en otro ejemplo con 1, 2, 3, 4 o 5) grupo halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), alquilo, haloalquilo, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato y fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario.
El término "alquilarilo" se refiere a un grupo arilo con un sustituyente alquilo, en donde arilo y alquilo son como se definen en el presente documento. El término "aralquilo" o "arilalquilo" se refiere a un grupo alquilo con un sustituyente arilo, en donde arilo y alquilo son como se definen en el presente documento.
El término "fenileno", como se usa en el presente documento y, a menos que se indique de otra manera, se refiere a un grupo fenilo divalente e incluye restos tanto sustituidos como sin sustituir. En determinados ejemplos, el grupo fenileno puede estar sustituido con uno o más (por ejemplo 1, 2, 3, 4 o 5) restos independientemente seleccionados entre el grupo halógeno (flúor, cloro, bromo o yodo), alquilo, haloalquilo, hidroxilo, alquilcarbonilo, cicloalquilcarbonilo, arilcarbonilo, sulfanilo, alquilsulfanilo, cicloalquilsulfanilo, arilsulfanilo, alquilsulfonilo, cicloalquilsulfonilo, arilsulfonilo, aminocarbonilo, carbamoílo, sulfonamido, amino (como se define en el presente documento, por ejemplo alquilamino, dialquilamino, arilamino, etc.), alcoxi, ariloxi, nitro, ciano, ácido sulfónico, sulfato, sulfonato, ácido fosfónico, fosfato y fosfonato, ya sea sin proteger o protegido, si fuera necesario, como saben los expertos en la técnica, por ejemplo, como se muestra en Greene, et al., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley y Sons, segunda edición, 1991. Cuando se usa fenileno en el contexto de un grupo EG, el fenileno está sustituido con 1,2, 3 o 4 grupos REG, como se definen en el presente documento y/o con 1 o 2 grupos -O-[RT] y/o con 1 o 2 grupos -CH2OC(O)[RT], en donde RT es como se ha definido en el presente documento.
La expresión "grupo protector" como se usa en el presente documento y a menos que se indique otra cosa, se refiere a un grupo que está unido a un átomo de oxígeno, nitrógeno o fósforo para prevenir su posterior reacción o para otros fines. Los expertos en la técnica de la síntesis orgánica conocen una amplia variedad de grupos protectores de oxígeno y nitrógeno.
"Sal farmacéuticamente aceptable" se refiere a cualquier sal de un compuesto que se proporciona en el presente documento que conserve sus propiedades biológicas y que no sea tóxica ni no deseable de otro modo para su uso farmacéutico. Dichas sales pueden derivar de diversos contraiones orgánicos e inorgánicos bien conocidos en la técnica. Dichas sales incluyen, pero no se limitan a: (1) sales de adición de ácido formadas con ácidos orgánicos o inorgánicos tales como: ácido clorhídrico, bromhídrico, sulfúrico, nítrico, fosfórico, sulfámico, acético, trifluoroacético, tricloroacético, propiónico, hexanoico, ciclopentilpropiónico, glicólico, glutárico, pirúvico, láctico, malónico, succínico, sórbico, ascórbico, málico, maleico, fumárico, tartárico, cítrico, benzoico, 3-(4-hidroxibenzoil)benzoico, pícrico, cinámico, mandélico, ftálico, láurico, metanosulfónico, etanosulfónico, 1,2-etano-disulfónico, 2-hidroxietanosulfonico, bencenosulfónico, 4-clorobencenosulfónico, 2-naftalenosulfónico, 4-toluenosulfónico, canfórico, canforsulfónico, 4-metilbiciclo[2.2.2]-oct-2-en-1-carboxílico, glucoheptónico, 3-fenilpropiónico, trimetilacético, ferc-butilacético, laurilsulfúrico, glucónico, benzoico, glutámico, hidroxinaftoico, salicílico, esteárico, ciclohexilsulfámico, quínico y mucónico; o (2) sales de adición de base formadas cuando un protón ácido presente en el compuesto parental o bien (a) se reemplaza con un ion metálico, por ejemplo, un ion de metal alcalino, un ion alcalinotérreo o un ion de aluminio o hidróxidos de metales alcalinos o alcalinotérreos, tales como: hidróxido de sodio, potasio, calcio, magnesio, aluminio, litio, cinc y bario, amoniaco o (b) se coordina con una base orgánica, tal como aminas orgánicas alifáticas, alicíclica o aromáticas, tales como: amoniaco, metilamina, dimetilamina, dietilamina, picolina, etanolamina, dietanolamina, trietanolamina, etilendiamina, lisina, arginina, ornitina, colina, N,N'-dibenciletilen-diamina, cloroprocaína, dietanolamina, procaína, N-bencilfenetilamina, W-metilglucamina piperazina, tris(hidroximetil)-aminometano e hidróxido de tetrametilamonio.
Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen además, a modo de ejemplo solamente y sin limitación, sodio, potasio, calcio, magnesio y amonio, tetraalquilamonio y, cuando el compuesto contiene una funcionalidad básica, sales de ácidos orgánicos o inorgánicos no tóxicos, tales como: hidrohaluros, por ejemplo, clorhidrato y bromhidrato, sulfato, fosfato, sulfamato, nitrato, acetato, trifluoroacetato, tricloroacetato, propionato, hexanoato, ciclopentilopropionato, glicolato, glutarato, piruvato, lactato, malonato, succinato, sorbato, ascorbato, malato, maleato, fumarato, tartarato, citrato, benzoato, 3-(4-hidroxibenzoil)benzoato, picrato, cinamato, mandelato, ftalato, laurato, metanosulfonato (mesilato), etanosulfonato, 1,2-etan-disulfonato, 2-hidroxietanosulfonato, bencenosulfonato (besilato), 4-clorobencenosulfonato, 2-naftalenosulfonato, 4-toluenosulfonato, alcanforato, canforsulfonato, 4-metilbiciclo[2.2.2]-oct-2-en-1-carboxilato, glucoheptonato, 3-fenilpropionato, trimetilacetato, ferc-butilacetato, lauril sulfato, gluconato, benzoato, glutamato, hidroxinaftoato, salicilato, estearato, ciclohexilsulfamato, quinato y muconato.
El término "acilo" se refiere a un grupo de fórmula -C(O)R', en donde R' es alquilo (incluyendo alquilo inferior); cicloalquilo; cicloalquilalquilo; cicloalquenilo; arilo; arilalquilo (incluyendo bencilo); alquilo sustituido (incluyendo alquilo inferior y por ejemplo alcoxialquilo y ariloxialquilo); heterociclo; heterocicloalquilo; heteroarilo y heteroarilalquilo; en donde el cicloalquilo, cicloalquenilo, arilo, heterociclo y heteroarilo puede estar sustituido. En determinados ejemplos, los grupos arilo en el acilo o los ésteres comprenden un grupo fenilo. En determinados ejemplos, los grupos acilo incluyen, por ejemplo, acetilo, trifluoroacetilo, metilacetilo, ciclopropilacetilo, propionilo, butirilo, hexanoílo, heptanoílo, octanoílo, neo-heptanoílo, fenilacetilo, 2-acetoxi-2-fenilacetilo, difenilacetilo, a-metoxi-a-trifluorometil-fenilacetilo, bromoacetilo, 2-nitro-bencenoacetilo, 4-cloro-bencenoacetilo, 2-cloro-2,2-difenilacetilo, 2-cloro-2-fenilacetilo, trimetilacetilo, clorodifluoroacetilo, perfluoroacetilo, fluoroacetilo, bromodifluoroacetilo, metoxiacetilo, 2-tiofenoacetilo, clorosulfonilacetilo, 3-metoxifenilacetilo, fenoxiacetilo, ferc-butilacetilo, tricloroacetilo, monocloro-acetilo, dicloroacetilo, 7H-dodecafluoro-heptanoílo, perfluoro-heptanoílo, 7H-dodeca-fluoroheptanoílo, 7-clorododecafluoro-heptanoílo, 7-cloro-dodecafluoro-heptanoílo, 7H-dodecafluoroheptanoílo, 7H-dodeca-fluoroheptanoílo, nona-fluoro-3,6-dioxaheptanoílo, nonafluoro-3,6-dioxaheptanoílo, perfluoroheptanoílo, metoxibenzoílo, 3-amino-5-feniltiofeno-2-carboxilo de metilo, 3,6-dicloro-2-metoxi-benzoílo, 4-(1,1,2,2-tetrafluoro-etoxi)-benzoílo, 2-bromo-propionilo, omegaaminocaprilo, decanoílo, n-pentadecanoílo, estearilo, 3-ciclopentil-propionilo, 1-benceno-carboxilo, O-acetilmandelilo, pivaloil acetilo, 1-adamantano-carboxilo, ciclohexano-carboxilo, 2,6-piridindicarboxilo, ciclopropano-carboxilo, ciclobutano-carboxilo, perfluorociclohexil carboxilo, 4-metilbenzoílo, clorometil isoxazolil carbonilo, perfluorociclohexil carboxilo, crotonilo, 1-metil-1H-indazol-3-carbonilo, 2-propenilcarbonilo, isovalerilo, 1 -pirrolidinacarbonilo y 4-fenilbenzoílo.
La expresión "aminoácido" se refiere a aminoácidos a, p, y o 8 de origen natural y sintético e incluye, pero no se limita a, aminoácidos que se encuentran en proteínas, es decir, glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, metionina, fenilalanina, triptófano, prolina, serina, treonina, cisteína, tirosina, asparagina, glutamina, aspartato, glutamato, lisina, arginina e histidina. En determinados ejemplos, el aminoácido está en la configuración L. En determinados ejemplos, el aminoácido está en la configuración D. En determinados ejemplos, el aminoácido se proporciona como un sustituyente de un compuesto descrito en el presente documento, en donde el aminoácido es un resto seleccionado entre alanilo, valinilo, leucinilo, isoleucinilo, prolinilo, fenilalaninilo, triptofanilo, metioninilo, glicinilo, serinilo, treoninilo, cisteinilo, tirosinilo, asparaginilo, glutaminilo, aspartoílo, glutaroílo, lisinilo, argininilo, histidinilo, p-alanilo, p-valinilo, pleucinilo, p-isoleucinilo, p-prolinilo, p-fenilalaninilo, p-triptofanilo, p-metioninilo, p-glicinilo, p-serinilo, p-treoninilo, pcisteinilo, p-tirosinilo, p-asparaginilo, p-glutaminilo, p-aspartoílo, p-glutaroílo, p-lisinilo, p-argininilo o p-histidinilo.
La expresión "derivado de aminoácido" se refiere a un grupo derivable de un aminoácido de origen natural o no natural, como se describe y se muestra a modo de ejemplo en el presente documento. Los derivados de aminoácidos son evidentes para los expertos en la técnica e incluyen, pero no se limitan a, éster, amino alcohol, amino aldehído, amino lactona y derivados N-metilo de aminoácidos de origen natural y no natural. En un ejemplo, un compuesto descrito en el presente documento que comprende un derivado de aminoácido, en donde el derivado de aminoácido es -NRX-G(Sc)-C(O)-Q1-, en donde Q1 es -S-, -NRY- u -O-, RY es hidrógeno o alquilo, Se es una cadena lateral de un aminoácido de origen natural o no natural, G es alquileno C1-C2 y RX es hidrógeno o RX y Se, junto con los átomos a los que están unidos, se combina para formar un anillo heterocíclico de cinco miembros. En un ejemplo, se proporciona un derivado de aminoácido como un sustituyente de un compuesto descrito en el presente documento, en donde el sustituyente es -O-C(O)-G(S c)-NH-Q2-, en donde Q2 es un enlace sencillo u -O-, Se es una cadena lateral de un aminoácido de origen natural o no natural y G es alquileno C1-C2. En determinados ejemplos, Q2 y Se, junto con los átomos a los que están unidos, se combina para formar un anillo heterocíclico de cinco miembros. En determinados ejemplos, G es alquileno C1 y Se es hidrógeno, alquilo, arilalquilo, heterocicloalquilo, carboxialquilo, heteroarilalquilo, aminoalquilo, hidroxilalquilo, aminoiminoaminoalquilo, aminocarbonilalquilo, sulfanilalquilo, carbamoilalquilo, alquilsulfanilalquilo o hidroxilarilalquilo. En un ejemplo, se proporciona un derivado de aminoácido como un sustituyente de un compuesto descrito en el presente documento, en donde el derivado de aminoácido está en la configuración D. En un ejemplo, se proporciona un derivado de aminoácido como un sustituyente de un compuesto descrito en el presente documento, en donde el derivado de aminoácido está en la configuración L.
El término "alquilheterociclo" se refiere a un grupo heterociclo con un sustituyente alquilo. El término "heterocicloalquilo" se refiere a un grupo alquilo con un sustituyente heterociclo.
Como se usa en el presente documento, el término "carboxilalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, carboxi, en donde alquilo es como se describe en el presente documento.
El término "alquilheteroarilo" se refiere a un grupo heteroarilo con un sustituyente alquilo. El término "heteroarilalquilo" se refiere a un grupo alquilo con un sustituyente heteroarilo.
Como se usa en el presente documento, el término "aminoalquilo" se refiere a un grupo alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, sustituyente o sustituyentes amino, en donde alquilo y amino son como se describe en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, los términos "hidroxilalquilo" e "hidroxialquilo" se refieren a un grupo alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, hidroxilo, en donde alquilo es como se describe en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "aminoiminoaminoalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, -amino-C(NH)-amino, en donde alquilo y amino son como se describe en el presente documento.
El término aminocarbonilo se refiere al grupo -C(O)(amino) en donde amino es como se ha definido en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "aminocarbonilalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, -C(O)-amino, en donde alquilo y amino son como se describe en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "sulfanilalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, -SH, en donde alquilo es como se describe en el presente documento.
El término "carbamoílo" se refiere a un -NRC(OR', en donde R es hidrógeno o alquilo y R' es alquilo, cicloalquilo, heterociclo, heteroarilo o arilo, como se define en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "carbamoilalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, grupos carbamoílo, como se define en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "alquilsulfanilalquilo" se refiere a un alquilo sustituido con al menos 1, en otro ejemplo 1 o 2, -S-alquilo, en donde alquilo es como se describe en el presente documento.
Como se usa en el presente documento, el término "hidroxilarilalquilo" se refiere al grupo -alquil-aril-OH, en donde alquilo y arilo son como se describe en el presente documento.
La expresión "ácido sulfónico" se refiere al grupo -S(O)2OH.
El término "sulfato" se refiere al grupo -OS(O)2OR en donde R es alquilo o arilalquilo.
El término "sulfonato" se refiere al grupo -S(O)2OR en donde R es alquilo o arilalquilo.
El término "sulfonamido" se refiere al grupo -S(O)2NRR' en donde R es hidrógeno o alquilo y R' es alquilo, cicloalquilo, heterociclo, heteroarilo o arilo, como se define en el presente documento.
El término "fosfato" se refiere al grupo -OP(O)(OR)2 en donde cada R es independientemente alquilo o arilalquilo.
La expresión "ácido fosfónico" se refiere a -P(O)(OH)2.
El término "fosfonato" se refiere al grupo -P(O)(OR)2 en donde cada R es independientemente alquilo o arilalquilo.
Los términos "polipéptido", "péptido" y "proteína" se utilizan indistintamente en el presente documento para referirse a un polímero de restos de aminoácidos. Es decir, una descripción dirigida a polipéptido se aplica igualmente a una descripción de un péptido y una descripción de una proteína y viceversa. Los términos se aplican a polímeros de aminoácidos de origen natural así como a polímeros de aminoácidos en los cuales uno o más restos de aminoácido es un aminoácido modificado. Además, dichos "polipéptidos", "péptidos" y "proteínas" incluyen cadenas de aminoácidos de cualquier longitud, incluyendo proteínas de longitud completa, en donde los restos de aminoácidos se unen mediante enlaces peptídicos covalentes.
Muchos de los compuestos y conjugados descritos en el presente documento tienen centros quirales. La presente divulgación incluye cada estereoisómero de cada compuesto o conjugado con cada estereoquímica posible en cada centro quiral. Ciertos compuestos se identifican por la notación estereoquímica que es conocida por los expertos. En ejemplos concretos, la estereoquímica se identifica con la notación R y S para cada centro quiral, de izquierda a derecha como se representa en las fórmulas 1000, 1001, 1002 y (I), etc. o las fórmulas (C1), F1 y G1, etc. Por ejemplo, la notación [R,S,S] indica la estereoquímica R, S y S en los centros quirales de fórmula (I) de izquierda a derecha, comenzando con la posición del sustituyente metilamino y terminando con la posición del sustituyente isopropilo. De forma similar, la notación [S,S,S] indica estereoquímica S, S y S en los centros quirales de fórmula (I) de izquierda a derecha. Además, la notación racémica [R/S,S,S] indica una mezcla de compuestos [R,S,S] y [S,S,S]. Para otros compuestos y conjugados en el presente documento, la notación se puede aplicar a las estructuras correspondientes.
La expresión "sustancialmente libre de' o "sustancialmente en ausencia de", cuando se usa en relación con un artículo (incluyendo un compuesto, una sal del mismo, un solvato del mismo y una forma sólida del mismo), se refiere al artículo que incluye al menos el 85 % o 90 % en peso, en determinados ejemplos, 95 %, 98 %, 99 % o 100 % en peso, del artículo designado. Por ejemplo, la expresión "sustancialmente libre de" o "sustancialmente en ausencia de" con respecto a la composición, se puede referir a una composición que incluye al menos el 85 % o 90 % en peso, en determinados ejemplos, 95 %, 98 %, 99 % o 100 % en peso, de un estereoisómero designado de un compuesto. En determinados ejemplos, en los métodos y compuestos proporcionados en el presente documento, los compuestos están sustancialmente libres de estereoisómeros sin designar u otros compuestos. Para otro ejemplo, la expresión "sustancialmente libre de" o "sustancialmente en ausencia de" con respecto a una forma sólida se puede referir a una forma sólida que incluye al menos el 85 % o el 90 % en peso, en determinados ejemplos, 95 %, 98 %, 99 % o 100 % en peso, de la forma sólida designada. En determinados ejemplos, en los métodos y compuestos proporcionados en el presente documento, la forma sólida está sustancialmente libre de otras formas sólidas.
De forma similar, el término "aislado" con respecto a una composición se refiere a una composición que incluye al menos el 85 %, 90 %, 95 %, 98 % o 99 % al 100 % en peso, de un compuesto designado, comprendiendo el resto otras especies químicas o estereoisómeros. De forma similar, el término "aislado" con respecto a una forma sólida de un compuesto se refiere a un sólido que incluye al menos el 85 %, 90 %, 95 %, 98 % o 99 % al 100 % en peso, de dicha forma sólida del compuesto, comprendiendo el resto otras formas sólidas del compuesto, otros compuestos, disolvente y/u otras impurezas.
"Solvato" se refiere a un compuesto proporcionado en el presente documento o una sal del mismo, que además incluye una cantidad estequiométrica o no estequiométrica de disolvente unida por fuerzas intermoleculares no covalentes. Cuando el disolvente es agua, el solvato es un hidrato.
"Composición isotópica" se refiere a la cantidad de cada isótopo presente para un átomo determinado y "composición isotópica natural" se refiere a la composición isotópica de origen natural o la abundancia de un átomo dado. Los átomos que contienen su composición isotópica natural también se denominan en el presente documento átomos "no enriquecidos". A menos que se designe de otra manera, los átomos de los compuestos enumerados en el presente documento pretenden representar a cualquier isótopo estable de ese átomo. Por ejemplo, a menos que se indique de otra manera, cuando una posición se designa específicamente "H" o "hidrógeno", se entiende que la posición tiene hidrógeno en su composición isotópica natural.
"Enriquecimiento isotópico" se refiere al porcentaje de incorporación de una cantidad de un isótopo específico en un átomo dado en una molécula en lugar de la abundancia isotópica natural de este átomo. Por ejemplo, un enriquecimiento de deuterio del 1 % en una posición dada significa que el 1 % de las moléculas en una muestra dada contienen deuterio en la posición especificada. Ya que la distribución de origen natural del deuterio es de aproximadamente el 0,0156 %, el enriquecimiento de deuterio en cualquier posición en un compuesto sintetizado que usa materiales de partida no enriquecidos es de aproximadamente el 0,0156 %. El enriquecimiento isotópico de los compuestos que se proporcionan en el presente documento se puede determinar usando métodos analíticos convencionales conocidos por un experto en la técnica, incluyendo espectrometría de masas y espectroscopia de resonancia magnética nuclear.
"Isotópicamente enriquecido" se refiere a un átomo que tiene una composición isotópica distinta de la composición isotópica natural de ese átomo. "Enriquecido isotópicamente" también puede referirse a un compuesto que contiene al menos un átomo que tiene una composición isotópica distinta de la composición isotópica natural de ese átomo.
Como se usa en el presente documento, los grupos "alquilo", "cicloalquilo", "alquenilo", "cicloalquenilo", "alquinilo", "arilo", "alcoxi", "alcoxicarbonilo", "amino", "carboxilo", "alquilamino", "arilamino", "tioalquiloxi", "heterociclilo", "heteroarilo", "alquilheterociclilo", "alquilheteroarilo", "acilo", "aralquilo", "alcarilo", "purina", "pirimidina", "carboxilo" y "aminoácido" opcionalmente comprenden deuterio en una o más posiciones en donde están presentes átomos de hidrógeno y en donde la composición deuterio delo átomo o átomos es distinta de la composición isotópica natural.
También se incluyen en el presente documento, grupos "alquilo", "cicloalquilo", "alquenilo", "cicloalquenilo", "alquinilo", "arilo", "alcoxi", "alcoxicarbonilo", "carboxilo", "alquilamino", "arilamino", "tioalquiloxi", "heterociclilo", "heteroarilo", "alquilheterociclilo", "alquilheteroarilo", "acilo", "aralquilo", "alcarilo", "purina", "pirimidina", "carboxilo" y "aminoácido" que opcionalmente comprenden carbono 13 en una cantidad distinta a la de la composición isotópica natural.
Como se usa en el presente documento, CE50 se refiere a una dosis, concentración o cantidad de un compuesto de ensayo particular que provoca una respuesta dependiente de la dosis al 50 % de expresión máxima de una respuesta particular que se induce, provoca o potencia por el compuesto de ensayo particular.
Como se usa en el presente documento, la CI50 se refiere a una cantidad, concentración o dosis de un compuesto de ensayo particular que consigue una inhibición del 50 % de una respuesta máxima en un ensayo que mide dicha respuesta.
"Cáncer" se refiere a patologías proliferativas celulares, incluyendo: Corazón: sarcoma (angiosarcoma, fibrosarcoma, rabdomiosarcoma, liposarcoma), mixoma, rabdomioma, fibroma, lipoma y teratoma; Pulmón: carcinoma broncogénico (escamocelular, microcítico indiferenciado, macrocítico indiferenciado, adenocarcinoma), carcinoma alveolar (bronquiolar), adenoma bronquial, sarcoma, linfoma, hanlartoma, inesotelioma; Gastrointestinal: colon (carcinoma de colon, adenocarcinoma de colon, adenocarcinoma colorrectal), esófago (carcinoma escamocelular, adenocarcinoma, leiomiosarcoma, linfoma), estómago (carcinoma, linfoma, leiomiosarcoma), páncreas (adenocarcinoma ductal, insulinoma, glucagonoma, gastrinoma, tumores carcinoides, vipoma), intestino delgado (adenocarcinoma, linfoma, tumores carcinoides, sarcoma de Kaposi, leiomioma, hemangioma, lipoma, neurofibroma, fibroma), intestino grueso (adenocarcinoma, adenoma tubular, adenoma velloso, hamartoma, leiomioma); Tracto genitourinario: riñón (adenocarcinoma, tumor de Wilm [nefroblastoma], linfoma, leucemia), vejiga y uretra (carcinoma escamocelular, carcinoma de células transicionales, adenocarcinoma), próstata (adenocarcinoma, sarcoma), testículo (seminoma, teratoma, carcinoma embrionario, teratocarcinoma, coriocarcinoma, sarcoma, carcinoma de células intersticiales, fibroma, fibroadenoma, tumores adenomatoides, lipoma); Hígado: hepatoma (carcinoma hepatocelular), colangiocarcinoma, hepatoblastoma, angiosarcoma, adenoma hepatocelular, hemangioma; Hueso: sarcoma osteogénico (osteosarcoma), fibrosarcoma, histiocitoma fibroso maligno, condrosarcoma, sarcoma de Ewing, linfoma maligno (sarcoma de células del retículo), mieloma múltiple, cordoma maligno de tumor de células gigantes, osteocondroma (exostosis osteocartilaginosa), condroma benigno, condroblastoma, condromixofibroma, osteoma osteoide y tumores de células gigantes; Sistema nervioso: cráneo (osteoma, hemangioma, granuloma, xantoma, osteitis deformante), meninges (meningioma, meningiosarcoma, gliomatosis), cerebro (astrocitoma, meduloblastoma, glioma, ependimoma, germinoma [oma pineal], glioblastoma multiforme, oligodendroglioma, schwannoma, retinoblastoma, tumores congénitos), neurofibroma de médula espinal, meningioma, glioma, sarcoma); Ginecológico: útero (carcinoma endometrial), cérvix (carcinoma cervical, displasia pretumoral de cuello de útero), ovarios (carcinoma de ovario [cistadenocarcinoma seroso, cistadenocarcinoma mucinoso, carcinoma sin clasificar], de ovario resistente a platino, tumores de células granulosas-tecales, tumores de células de Sertoli-Leydig, disgerminoma, teratoma maligno, adenocarcinoma de ovarios), vulva (carcinoma escamocelular, carcinoma intraepitelial, adenocarcinoma, fibrosarcoma, melanoma), vagina (carcinoma de células claras, carcinoma de células escamosas, sarcoma botrioide (rabdomiosarcoma embrionario], trompas de Falopio (carcinoma); Hematológico: sangre (leucemia mieloide [aguda y crónica], leucemia linfoblástica aguda, leucemia linfocítica crónica, enfermedades mieloproliferativas, mieloma múltiple, síndrome mielodisplásico), enfermedad de Hodgkin, linfoma no de Hodgkin [linfoma maligno]; Piel: melanoma, melanoma maligno, carcinoma de células basales, carcinoma de células escamosas, sarcoma de Kaposi, lunares nevo displásicos, lipoma, angioma, dermatofibroma, queloides, psoriasis; Glándulas suprarrenales: neuroblastoma; un linfoma; linfoma de células grandes; linfoma histiocítico y linfocítico mixto difuso; linfoma folicular de linfocitos B; y mama (cáncer de mama que sobreexpresa Her2, cáncer de mama tripe negativo). Por lo tanto, la expresión "célula cancerosa", como se proporciona en el presente documento, incluye una célula afectada por una cualquiera de las afecciones identificadas anteriormente. Como se usa en el presente documento, los términos "sujeto" y "paciente" se usan indistintamente en el presente documento. Los términos "sujeto" y "sujetos" se refieren a un animal, tal como un mamífero, incluyendo un no primate (por ejemplo, una vaca, cerdo, caballo, gato, perro, rata y ratón) y un primate (por ejemplo, un mono, un chimpancé y un ser humano) y, por ejemplo, un ser humano. En determinados ejemplos, el sujeto es refractario o no responde a los tratamientos actuales para la proliferación celular y/o cáncer. En otro ejemplo, el sujeto es un animal de granja (por ejemplo, un caballo, una vaca, un cerdo, etc.) o una mascota (por ejemplo, un perro o un gato). En determinados ejemplos, el sujeto es un ser humano.
Como se usa en el presente documento, las expresiones "agente terapéutico" y "agentes terapéuticos" se refieren a cualquier agente o agentes que se pueden usar en el tratamiento o prevención de una enfermedad o afección o uno o más síntomas de la misma. En determinados ejemplos, la expresión "agente terapéutico" incluye un compuesto proporcionado en el presente documento. En determinados ejemplos, un agente terapéutico es un agente que se sabe que es útil para o se ha usado o se usa actualmente para el tratamiento o prevención de una afección o uno o más de los síntomas de la misma.
"Cantidad terapéuticamente eficaz" se refiere a una cantidad de un compuesto o composición que, cuando se administra a un sujeto para tratar una enfermedad o afección, es suficiente para realizar dicho tratamiento para la enfermedad o afección. Una "cantidad terapéuticamente eficaz" puede variar dependiendo de, entre otros, el compuesto, la enfermedad o afección y su gravedad y la edad, peso, etc., del sujeto que se va a tratar.
"Tratar" o "tratamiento" de cualquier enfermedad o afección se puede referir a mejorar una enfermedad o afección que existe en un sujeto. Como alternativa, "tratar" o "tratamiento" puede incluir mejorar al menos un parámetro físico, que puede ser imperceptible para el sujeto. Además, "tratar" o "tratamiento" puede incluir modular la enfermedad o afección, ya sea físicamente (por ejemplo, estabilización de un síntoma discernible) o fisiológicamente (por ejemplo, estabilización de un parámetro físico) o ambos. Además, "tratar" o "tratamiento" puede incluir retrasar el inicio de la enfermedad o afección.
Como se usa en el presente documento, las expresiones "agente profiláctico" y "agentes profilácticos" se usan en referencia a cualquier agente o agentes que se pueden usar en la prevención de una enfermedad o afección o uno o más de los síntomas de la misma. En determinados ejemplos, la expresión "agente profiláctico" incluye un compuesto proporcionado en el presente documento. En determinados otros ejemplos, la expresión "agente profiláctico" no se refiere a un compuesto proporcionado en el presente documento. Por ejemplo, un agente profiláctico es un agente que se sabe que es útil para o se ha usado o se usa actualmente para prevenir o impedir el inicio, desarrollo, progresión y/o gravedad de una enfermedad o afección.
Como se usa en el presente documento, la oración "cantidad profilácticamente eficaz" se refiere a la cantidad de una terapia (por ejemplo, agente profiláctico) que es suficiente para dar como resultado la prevención o la reducción del desarrollo, recurrencia o inicio de uno o más síntomas asociados a una enfermedad o afección o para aumentar o mejorar el efecto o efectos profilácticos de otra terapia, por ejemplo, otro agente profiláctico).
El término "anticuerpo" se refiere a cualquier macromolécula que sería reconocida como un anticuerpo por los expertos en la técnica. Los anticuerpos comparten propiedades comunes que incluyen la unión y al menos una cadena polipeptídica que es sustancialmente idéntica a una cadena polipeptídica que puede ser codificada por cualquiera de los genes de inmunoglobulina reconocidos por los expertos en la técnica. Los genes de inmunoglobulina incluyen, pero sin limitación, los genes de región constante k, A, a, y (IgG1, IgG2, IgG3 e IgG4), 8, £ y p, así como los genes de la región variable de inmunoglobulinas. El término incluye anticuerpos de longitud completa y fragmentos de anticuerpos reconocidos por los expertos en la técnica, y variantes de los mismos.
La expresión "fragmento de anticuerpo" se refiere a cualquier forma de un anticuerpo que no sea la forma de longitud completa. Los fragmentos de anticuerpos del presente documento incluyen anticuerpos que son componentes más pequeños que existen dentro de los anticuerpos de longitud completa y anticuerpos que han sido diseñados genéticamente. Los fragmentos de anticuerpos incluyen, pero sin limitación, Fv, Fc, Fab y (Fab')2, Fv monocatenario (scFv), diacuerpos, triacuerpos, tetracuerpos, anticuerpos híbridos bifuncionales, CDR1, CDR2, CDR3, combinaciones de CDR, regiones variables, regiones marco y regiones constantes (Maynard y Georgiou, 2000, Annu. Rev. Biomed. Eng. 2:339-76; Hudson, 1998, Curr. Opin. Biotechnol. 9:395-402).
El término "inmunoglobulina (Ig)" se refiere a una proteína que consiste en uno o más polipéptidos sustancialmente codificados por uno de los genes de inmunoglobulina, o una proteína sustancialmente idéntica a la misma en la secuencia de aminoácidos. Las inmunoglobulinas incluyen, pero no se limitan a, anticuerpos. Las inmunoglobulinas pueden tener varias formas estructurales, incluidos los anticuerpos de longitud completa, los fragmentos de anticuerpos y los dominios de inmunoglobulina individuales que incluyen Vh, Cy1, Cy2, Cy3, Vl, y Cl.
La expresión "dominio de inmunoglobulina (Ig)" se refiere a un dominio de proteína que consiste en un polipéptido sustancialmente codificado por un gen de inmunoglobulina. Los dominios de Ig incluyen pero no se limitan a Vh, Cy1, Cy2, Cy3, Vl, y Cl.
La expresión "región variable" de un anticuerpo se refiere a un polipéptido o polipéptidos compuestos por el dominio de inmunoglobulina Vh, los dominios de inmunoglobulina Vl, o los dominios de inmunoglobulina Vh y Vl. La región variable puede referirse a este o estos polipéptidos de forma aislada, como un fragmento de Fv, como un fragmento scFv, como esta región en el contexto de un fragmento de anticuerpo más grande, o como esta región en el contexto de un anticuerpo de longitud completa o una molécula de andamiaje alternativa que no es un anticuerpo.
El término "variable" se refiere al hecho de que ciertas porciones de los dominios variables difieren ampliamente en la secuencia entre los anticuerpos y son responsables de la especificidad de unión de cada anticuerpo particular por su antígeno particular. Sin embargo, la variabilidad no está distribuida uniformemente en todos los dominios variables de anticuerpos. Está concentrada en tres segmentos denominados regiones determinantes de complementariedad (CDR) en los dominios variables tanto de cadena ligera como de cadena pesada. Las porciones más altamente conservadas de los dominios variables se denominan regiones marco conservadas (FR). Los dominios variables de las cadenas pesadas y ligeras naturales comprenden cada uno cuatro regiones FR, que adoptan en gran medida una configuración en lámina p, conectadas por tres o cuatro CDR, que forman bucles que conectan y, en algunos casos, forman parte de, la estructura de lámina p. Las CDR en cada cadena se mantienen juntas muy cerca de las regiones FR y, con las CDR de la otra cadena, contribuyen a la formación del sitio de unión a antígeno de los anticuerpos (véase Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5a Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)).
Los dominios constantes normalmente no están implicados directamente en la unión de un anticuerpo a un antígeno, sino que muestran diversas funciones efectoras. Dependiendo de la secuencia de aminoácidos de la región constante de sus cadenas pesadas, los anticuerpos o inmunoglobulinas se pueden asignar a diferentes clases. Hay cinco clases principales de inmunoglobulinas: IgA, IgD, IgE, IgG e IgM, y varias de estas pueden dividirse además en subclases (isotipos), por ejemplo, IgG1, IgG2, IgG3 y IgG4; IgA1 e IgA2. Las regiones constantes de cadena pesada que corresponden a las diferentes clases de inmunoglobulinas se denominan a, 8, £, y y M, respectivamente. De las diversas clases de inmunoglobulinas humanas, se sabe que solo las IgG1, IgG2, IgG3 e IgM humanas activan el complemento.
El término "conjugado" se refiere a cualquier compuesto que pueda formarse conjugando un compuesto descrito en el presente documento con un segundo compuesto. El segundo compuesto puede ser una molécula pequeña o una macromolécula. En algunos ejemplos, el segundo compuesto es una molécula bioactiva que incluye una proteína, un péptido, un activo nucleico o un híbrido del mismo. En algunos ejemplos, el segundo compuesto es un polímero tal como polietilenglicol. En algunos ejemplos, el segundo compuesto es un agente terapéutico, incluyendo un fármaco disponible comercialmente. En algunos ejemplos, el segundo compuesto es una etiqueta que puede reconocer y unirse a dianas específicas, tal como una carga útil molecular que es dañina para las células diana o una etiqueta útil para la detección o el diagnóstico. En algunos ejemplos, el compuesto descrito en el presente documento está conectado al segundo compuesto mediante un enlazador. En algunos ejemplos, el compuesto descrito en el presente documento está conectado directamente al segundo compuesto sin un enlazador. En otro ejemplo, el segundo compuesto es una molécula pequeña; una macromolécula; molécula bioactiva que incluye una proteína, un péptido, un activo nucleico o un híbrido del mismo; un polímero tal como polietilenglicol; un agente terapéutico, incluyendo un fármaco disponible comercialmente; o una etiqueta que pueda reconocer y unirse a dianas específicas, tal como una carga útil molecular que es dañina para las células diana o una etiqueta útil para la detección o el diagnóstico. En otro ejemplo, el segundo compuesto comprende un aminoácido modificado que comprende un alquino, alqueno colado, tetrazina, tiol, maleimida, carbonilo, oxiamina o azida.
La expresión "variante de secuencia de proteína" se refiere a una secuencia de proteína que tiene uno o más restos que difieren en la identidad de aminoácidos de otra secuencia de proteína similar. Dicha secuencia de proteína similar puede ser la secuencia de proteína natural de tipo silvestre u otra variante de la secuencia de tipo silvestre. Las variantes incluyen proteínas que tienen una o más inserciones, deleciones y sustituciones de aminoácidos. Las variantes también incluyen proteínas que tienen uno o más aminoácidos modificados postraduccionalmente.
La expresión "anticuerpo parental" se refiere a un anticuerpo conocido por los expertos en la técnica que se modifica de acuerdo con la descripción proporcionada en el presente documento. La modificación puede ser física, es decir, reemplazar o modificar química o bioquímicamente uno o más aminoácidos del anticuerpo parental para producir un anticuerpo dentro del alcance de la presente descripción. La modificación también puede ser conceptual, es decir, usando la secuencia de una o más cadenas polipeptídicas del anticuerpo parental para diseñar un anticuerpo que comprende uno o más aminoácidos modificados específicos del sitio de acuerdo con la presente descripción. Los anticuerpos parentales pueden ser anticuerpos de origen natural o anticuerpos diseñados o desarrollados en un laboratorio. Los anticuerpos parentales también pueden ser anticuerpos artificiales o diseñados genéticamente, por ejemplo, anticuerpos quiméricos o humanizados.
La expresión "variante modificada de forma conservativa" se refiere a una proteína que se diferencia de una proteína relacionada por sustituciones conservativas en la secuencia de aminoácidos. Un experto reconocerá que las sustituciones, deleciones o adiciones individuales a un péptido, polipéptido o secuencia de proteínas que altera, añade o elimina un único aminoácido o un pequeño porcentaje de aminoácidos de la secuencia codificada es una "variante modificada conservativamente" en donde la alteración da como resultado la sustitución de un aminoácido por un aminoácido químicamente similar. Las tablas de sustituciones conservativas que proporcionan aminoácidos funcionalmente similares son bien conocidas en la técnica. Dichas variantes modificadas conservativamente son adicionales, y no excluyen, las variantes polimórficas, homólogos interespecies y alelos.
Los ocho grupos siguientes contienen cada uno aminoácidos que son sustituciones conservativas entre sí: 1) Alanina (A), Glicina (G);
2) Ácido aspártico (D), Ácido glutámico (E);
3) Asparagina (N), Glutamina (Q);
4) Arginina (R), Lisina (K);
5) Isoleucina (I), Leucina (L), Metionina (M), Valina (V);
6) Fenilalanina (F), Tirosina (Y), Triptófano (W);
7) Serina (S), Treonina (T); y
8) Cisteína (C), Metionina (M).
Véase, por ejemplo, Creighton, Proteins: Structures and Molecular Properties, W H Freeman y colaboradores; 2a edición (diciembre de 1993).
Los términos "idéntico" o "identidad", en el contexto de dos o más secuencias polipeptídicas, hace referencia a dos o más secuencias o subsecuencias que son iguales. Las secuencias son "sustancialmente idénticas" si tienen un porcentaje de restos de aminoácidos o nucleótidos que son iguales (es decir, aproximadamente el 60 % de identidad, opcionalmente aproximadamente el 65 %, aproximadamente el 70 %, aproximadamente el 75 %, aproximadamente el 80 %, aproximadamente el 85 %, aproximadamente el 90 %, o aproximadamente el 95 % de identidad en una región específica), cuando se compara y alinea para correspondencia máxima en una ventana de comparación, o región designada como medida utilizando uno de los siguientes algoritmos de comparación de secuencias o mediante alineación manual e inspección visual. La identidad puede existir a lo largo de una región que tiene al menos aproximadamente 50 aminoácidos o nucleótidos de longitud en una región que tiene 75-100 aminoácidos o nucleótidos de longitud, o, cuando no se especifica, a lo largo de toda la secuencia o un polipéptido. En el caso de los anticuerpos, la identidad se puede medir fuera de las CDR variables. El alineamiento óptimo de secuencias para la comparación puede realizarse incluso mediante el algoritmo de homología local de Smith y Waterman (1970) Adv. Appl. Math.
2:482c, mediante el algoritmo de alineamiento de homología de Needleman y Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48:443, mediante el método de búsqueda de similitud de Pearson y Lipman (1988) Proc. Nat'l. Acad. Sci. EE.UU. 85:2444, mediante implementaciones informatizadas de estos algoritmos (GAP, BESTFIT, FASTA y TFASTA en el paquete informático de Wisconsin Genetics, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, Wis.); o mediante alineación manual e inspección visual (véase, por ejemplo, Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (suplemento de 1995)).
Los ejemplos de algoritmos que son adecuados para determinar el porcentaje de identidad de secuencia y la similitud de secuencia incluyen los algoritmos BLAST y BLAST 2.0, que se describen en Altschul et al. (1977) Nuc. Acids Res.
25:3389-3402, y Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410, respectivamente. El programa informático para realizar análisis de BLAST está disponible públicamente a través del Centro Nacional para la Información Biotecnológica. Los parámetros del algoritmo BLAST W, T y X determinan la sensibilidad y velocidad del alineamiento. El programa BLASTN (para secuencias de nucleótidos) usa por defecto una longitud de palabra (W) de 11, una expectativa (E) o 10, M=5, N=-4 y una comparación de ambas cadenas. Para las secuencias de aminoácidos, el programa BLASTP usa como valor predeterminado una longitud de palabra de 3, y una expectativa (E) de 10, y las alineaciones de la matriz de puntuación BLOSUM62 (Véase Henikoff y Henikoff (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU. 89:10915) (B) de 50, expectativa (E) de 10, M=5, N =-4 y una comparación de ambas cadenas. El algoritmo BLAST se realiza normalmente con el filtro de "baja complejidad" desactivado. En algunos ejemplos, el algoritmo BLAST se realiza normalmente con el filtro de "baja complejidad" activado.
El algoritmo BLAST también realiza un análisis estadístico de la similitud entre dos secuencias (véase, por ejemplo, Karlin y Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787). Una medida de la similitud proporcionada por el algoritmo BLAST es la probabilidad de suma más pequeña (P(N)), que proporciona una indicación de la probabilidad por la que sucedería una coincidencia entre dos secuencias de nucleótidos o aminoácidos por casualidad. Por ejemplo, un ácido nucleico se considera similar a una secuencia de referencia si la probabilidad de suma más pequeña en una comparación del ácido nucleico de ensayo con el ácido nucleico de referencia es menor de aproximadamente 0,2, en otro ejemplo menos de aproximadamente 0,01 y en otro ejemplo menos de aproximadamente 0,001.
El término "aminoácido" se refiere a aminoácidos naturales y no naturales, así como aminoácidos tales como prolina, análogos de aminoácidos y miméticos de aminoácidos que actúan de manera similar a la de los aminoácidos de origen natural.
Los aminoácidos codificados naturalmente son los aminoácidos proteinogénicos conocidos por los expertos en la técnica. Incluyen los 20 aminoácidos comunes (alanina, arginina, asparagina, ácido aspártico, cisteína, glutamina, ácido glutámico, glicina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, prolina, serina, treonina, triptófano, tirosina y valina) y las menos comunes pirrolisina y selenocisteína. Los aminoácidos codificados naturalmente incluyen variantes postraduccionales de los 22 aminoácidos naturales, como los aminoácidos prenilados, aminoácidos isoprenilados, aminoácidos miristoilados, aminoácidos palmitoilados, aminoácidos glucosilados N-ligados, aminoácidos glucosilados O-ligados, aminoácidos fosforilados y aminoácidos acilados.
La expresión "aminoácido modificado" se refiere a un aminoácido que no es un aminoácido proteinogénico, o una variante del mismo modificada postraduccionalmente. En particular, el término se refiere a un aminoácido que no es uno de los 20 aminoácidos comunes o pirrolisina o selenocisteína, o variantes modificadas postraduccionalmente de los mismos.
La expresión "alqueno sometido a tensión" se refiere a una molécula que comprende un resto alqueno que es capaz de reaccionar con tetrazina en una ligadura de tetrazina. Se describen ligaduras de tetrazina a modo de ejemplo en Blackman etal., 2008, J. Am. Chem. Soc. 130: 13518-13519. Los ejemplos incluyen trans-ciclooctenos y norbornenos. Los compuestos útiles incluyen, pero no se limitan a, trans-cicloocteno, (£)-ciclooct-4-enol, 2,5-dioxo-1-pirrolidinil carbonato de (£)-ciclooct-4-enilo, succinimidil éster del ácido 5-norborneno-2-acético y ácido 5-norborneno-2-endoacético.
El término "tetrazina" se refiere a un compuesto o grupo que comprende la estructura siguiente:
Figure imgf000018_0001
en donde R201 es alquilo inferior. Por ejemplo, R201 puede ser metilo, etilo o propilo. R201 puede ser metilo.
Compuestos
El compuesto puede no ser de fórmula (101), (101a) o (101b) y el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b). El compuesto puede no ser de fórmula (101a) y el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101a). En donde X es
RT
Figure imgf000018_0002
e g -^-
■
el compuesto puede no ser el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b) y el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b). En donde X es
Figure imgf000018_0003
o
RT
^ - r t 1- w 3- h p 1-w 2- e g -^
el compuesto puede no ser el compuesto de fórmula (101a) y el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101a). El compuesto puede no ser de fórmula (101), (101a) o (101b). El compuesto puede no ser de fórmula (101a). En donde X
Figure imgf000018_0004
el compuesto puede no ser el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b). En donde X es
Figure imgf000018_0005
o
RT
^ - r t1- w 3- h p 1-w 2- e g -^-9
el compuesto puede no ser el compuesto de fórmula (101a). El conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b). El conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101a). En donde X es
Figure imgf000019_0001
el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101), (101a) o (101b). En donde X es
o
Figure imgf000019_0002
el conjugado puede no comprender el compuesto de fórmula (101a).
Cuando se usa un intervalo de fórmulas, por ejemplo I-XIXb-2, cada fórmula dentro de ese intervalo está incluida y es como si se enumerara de forma explícita, incluyendo en donde el número romano está seguido por, por ejemplo, "un", "-1", etc. Por ejemplo, I-XIXb-2 incluye Va, XIV y XIXa-1, etc.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula I:
Figure imgf000019_0003
o una
Figure imgf000019_0004
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG es un grupo eliminador;
cada RT es un grupo desencadenante de liberación, en la cadena principal de fórmula (I) o unido a EG, en donde un RT es opcional;
HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es hidrógeno, un grupo de conjugación terminal o un resto divalente de un grupo de conjugación terminal o, como alternativa, W1, W2, W3, W4, W5, EG, RT, HP, SG y R se combinan para formar -H.
En el presente documento se proporciona un compuesto de fórmula 1000 de acuerdo con 1001:
Figure imgf000019_0005
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible;
RT es un grupo desencadenante de liberación unido a EG y en donde RT es opcional;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Figure imgf000020_0001
en donde RSG es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es hidrógeno, un grupo de conjugación terminal o un resto divalente de un grupo de conjugación terminal.
En el presente documento se proporciona un compuesto de fórmula 1000 de acuerdo con 1002:
Figure imgf000020_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible;
RT es un grupo desencadenante de liberación unido a EG y en donde RT es opcional;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Figure imgf000020_0003
en donde RSG es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es hidrógeno, un grupo de conjugación terminal o un resto divalente de un grupo de conjugación terminal.
Un grupo de conjugación se puede usar para conjugar una hemiasterlina modificada como se describe en el presente documento (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1-8b) a cualquier entidad molecular capaz de reaccionar con el grupo de conjugación para formar el conjugado. El grupo de conjugación se puede designar R en el presente documento. El grupo de conjugación puede estar directa o indirectamente unido a la hemiasterlina modificada como se describe en el presente documento (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1-8b) a través de uno o más grupos de unión, grupos eliminadores, grupos desencadenantes de liberación, grupos hidrófobos y/o grupos espaciadores.
Grupos de unión
Los grupos de unión facilitan la incorporación de los grupos eliminadores, grupos desencadenantes de liberación, grupos hidrófobos, grupos espaciadores y/o grupos de conjugación en un compuesto, tales como una hemiasterlina modificada como se describe en el presente documento (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b). Los grupos de unión útiles son conocidos por y son evidentes para los expertos en la técnica. En el presente documento se proporcionan ejemplos de grupos de unión útiles. En determinados ejemplos, los grupos de unión se denominanW1, W2, W3, W4 o W5. En determinados ejemplos, un grupo de unión puede comprender un éster divalente, éter divalente, amida divalente, amina divalente, alquileno, arileno, sulfuro, disulfuro, -C(O)- o una combinación de los mismos. En determinados ejemplos un grupo de unión puede comprender -C(O)-, -O-, -C(O)O-, -OC(O)-, -C(O)NH-, -C(O)NH-alquilo-, -OC(O)NH-, -SC(O)NH-, -NH-, N(alquilo)-, -N(R)-alquilen-N(R)- (en donde cada R es independientemente H o alquilo), -N(CH3)CH2CH2N(CH3)-, -CH2-, -CH2CH2-, -CH(CH3)-, -C(CH3)2-, -CH2CH2CH2-, fenileno, -NHCH2CH2C(O)-, -C(O)CH2CH2NH-, -S-, -S-S-, -OCH2CH2O- o el inverso (por ejemplo, -NHC(O)-) de los mismos o una combinación de los mismos.
Grupos eliminadores
Los grupos eliminadores facilitan la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del resto del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. Los grupos eliminadores también pueden facilitar la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento junto con un grupo desencadenante de liberación. Por ejemplo, el grupo eliminador y el grupo desencadenante de liberación pueden reaccionar en una reacción de liberación para liberar una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. Después del inicio de la reacción de liberación por el desencadenante de liberación, el grupo eliminador escinde el resto biológicamente activo o una forma profármaco del resto biológicamente activo y forma una entidad no tóxica, estable, que no tiene ningún efecto sobre la actividad del resto biológicamente activo.
En determinados ejemplos, el grupo eliminador se denomina EG en el presente documento. Los grupos eliminadores útiles incluyen los descritos en el presente documento. En determinados ejemplos, el grupo eliminador comprende un fenileno, un -C(O)-, un amino o una combinación de los mismos. En determinados ejemplos, el grupo eliminador es:
Figure imgf000021_0001
CF3, -NO2, -CN, flúor, bromo, cloro, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilamino-C(O)-. En la segunda y la tercera estructuras, los expertos reconocerán que EG está unido a un RT que no está dentro de la cadena principal de la fórmula de ejemplo 1000 o (I), como se ha indicado en la descripción anterior de la fórmula 1000 y (I). En algunos ejemplos, cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -CF3, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilamino-C(O)-. En otros ejemplos, cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en hidrógeno, -NO2, -CN, flúor, bromo y cloro.
Grupos desencadenantes de liberación y enlazadores escindibles
En determinados ejemplos, los grupos desencadenantes de liberación facilitan la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del resto del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. En determinados ejemplos, los grupos desencadenantes de liberación también pueden facilitar la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento junto con un grupo eliminador. En algunos ejemplos, el grupo eliminador y el grupo desencadenante de liberación pueden reaccionar en una reacción de liberación para liberar una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. En determinados ejemplos, el desencadenante de liberación puede actuar mediante una reacción conducida biológicamente con alta especificidad tumor: no tumor, tal como la acción proteolítica de una enzima sobreexpresada en un entorno tumoral.
En determinados ejemplos, el grupo desencadenante de liberación se denomina RT en el presente documento. En determinados ejemplos, RT es divalente y está enlazado a la cadena principal de fórmula (I) o 1000. En otros ejemplos, RT es monovalente y está unido a EG como se ha representado anteriormente. Los grupos desencadenantes de liberación útiles incluyen los descritos en el presente documento. En determinados ejemplos, el grupo desencadenante de liberación comprende un resto de un aminoácido o resto natural o no natural de un anillo de azúcar. En determinados ejemplos, el grupo desencadenante de liberación comprende un resto de un aminoácido o resto natural o no natural de un anillo de azúcar.
En algunos ejemplos, el grupo desencadenante de liberación se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre el grupo que consiste en:: dipéptidos, tripéptidos, tetrapéptidos y pentapéptidos, cada uno de los cuales comprende una citrulina. Los dipéptidos a modo de ejemplo incluyen, pero no se limitan a, valina-citrulina (vc o val-cit) y N-metil-valina-citrulina (Me-val-cit). Los tripéptidos a modo de ejemplo incluyen, pero no se limitan a, glicina-valinacitrulina (gly-val-cit). En algunos ejemplos, el grupo desencadenante de liberación se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre el grupo que consiste en: valina-citrulina, N-metil-valina-citrulina y glicina-valina-citrulina, En determinados ejemplos, el grupo desencadenante de liberación es:
Figure imgf000022_0001
Los expertos reconocerán que la primera estructura es divalente y se puede unir con la cadena principal de fórmula (I) o 1000 y que la segunda estructura es monovalente y se puede unir a EG como se representa en las fórmulas (I) y 1000 anteriores.
Los enlazadores escindibles facilitan la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del resto del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. En determinados ejemplos, el desencadenante de liberación puede actuar mediante una reacción conducida biológicamente con alta especificidad tumor:no tumor, tal como la acción proteolítica de una enzima sobreexpresada en un entorno tumoral. En determinados ejemplos, el enlazador escindible se denomina RT1 en el presente documento. Los enlazadores escindibles incluyen los descritos en el presente documento. En algunos ejemplos, el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre el grupo que consiste en dipéptidos, tripéptidos, tetrapéptidos y pentapéptidos. En dichos ejemplos, el enlazador se puede escindir por una proteasa. Los dipéptidos a modo de ejemplo incluyen, pero no se limitan a, valina-alanina (VA o Val-Ala); valina- ácido glutámico (Val-Glu); alanina-fenilalanina (Af o Ala-Phe); fenilalanina-lisina (FK o Phe-Lys) y fenilalanina-homolisina (Phe-homoLys). Los tripéptidos a modo de ejemplo incluyen, pero no se limitan a glicina-glicina-glicina (Gly-Gly-Gly). En determinados ejemplos, el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre el grupo que consiste en dipéptidos y tripéptidos. En determinados ejemplos, el enlazador escindible se deriva de un dipéptido. En determinados ejemplos, el enlazador escindible se deriva de un tripéptido. En determinados ejemplos el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador derivado de valina-alanina, valina-ácido glutámico, fenilalanina-homolisina, fenilalanina-lisina, fenilalaninahomolisina o glicina-glicina-glicina.
En determinados ejemplos el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador seleccionado del grupo que consiste en: dipéptidos, tripéptidos, tetrapéptidos y pentapéptidos; o es
Figure imgf000022_0002
o es
-< í-H N -a lqu ileno
Figure imgf000022_0003
en donde aa es un resto de aminoácido natural o no natural; o es
Figure imgf000022_0004
en donde el
Figure imgf000023_0001
anillo es un anillo heterocíclico de 4-7 miembros que comprende 3-6 átomos de carbono. En determinados ejemplos el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre el grupo que consiste en dipéptidos o tripéptidos; o es
Figure imgf000023_0002
o es
-jj-HN-alquileno
Figure imgf000023_0003
en donde aa es un resto de aminoácido natural o no natural; o es
Figure imgf000023_0004
en donde el
Figure imgf000023_0005
anillo es un anillo heterocíclico de 4-7 miembros que comprende 3-6 átomos de carbono.
En determinados ejemplos el enlazador escindible se deriva de un precursor de enlazador seleccionado entre valinaalanina, valina-ácido glutámico, alanina-fenilalanina; fenilalanina-lisina; fenilalanina-homolisina y glicina-glicina-glicina (Gly-Gly-Gly); o es
Figure imgf000023_0006
o es
-|-HN-alquileno C1.6- c (° )—aa"
en donde aa es un resto de aminoácido natural o no natural; o es
Figure imgf000023_0007
en donde el
Figure imgf000023_0008
anillo es un anillo heterocíclico de 4-7 miembros que comprende 3-6 átomos de carbono.
En determinados ejemplos el enlazador escindible es
Figure imgf000023_0009
Figure imgf000024_0001
Grupos hidrófilos
Los grupos hidrófilos facilitan el aumento de la hidrofilia de los compuestos descritos en el presente documento. Se cree que la hidrofilia aumentada permite mayor solubilidad en soluciones acuosas, tales como las soluciones acuosas encontradas en los sistemas biológicos. Los grupos hidrófilos también pueden funcionar como grupos espaciadores o sustituyentes, que se describen con más detalle en el presente documento.
En determinados ejemplos, el grupo hidrófilo se denomina HP y HP1 en el presente documento. Los grupos hidrófilos útiles incluyen los descritos en el presente documento. En determinados ejemplos, el grupo hidrófilo HP es un poli(etilenglicol) divalente. En determinados ejemplos, el grupo hidrófilo HP es un poli(etilenglicol) divalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000024_0002
en donde m es un número entero de 1 a 12, opcionalmente de 1 a 4, opcionalmente de 2 a 4. En determinados ejemplos, el grupo hidrófilo HP1 es un grupo hidrófilo divalente o un
Figure imgf000024_0003
en donde RSG es un grupo hidrófilo monovalente. En determinados ejemplos, RSG es un poli(etilenglicol) monovalente. En determinados ejemplos, RSG es un poli(etilenglicol) monovalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000024_0004
en donde R es -H o -CH3 y m es un número entero de 1 a 12, opcionalmente de 1 a 4, opcionalmente de 2 a 4. En determinados ejemplos, RSG es un poli(etilenglicol) monovalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000024_0005
en donde R es -H o -CH3 y m es un número entero de 1 a 12, opcionalmente de 1 a 4, opcionalmente de 2 a 4; RSG o es -C1-C6-alquilen-S(O)3-. En determinados ejemplos, RSG es un poli(etilenglicol) monovalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000024_0006
en donde R es -H o -CH3y m es de 2 a 4; o es -CH2CH2-S(O)3-. En determinados ejemplos, RSG es un poli(etilenglicol) monovalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000024_0007
o RSG es -CH2CH2-S(O)3-. En determinados ejemplos, RSG es -Ci-C6-alquilen-S(O)3-. En determinados ejemplos, RSG es -CH2CH2-S(O)s-.
Grupos espaciadores
Los grupos espaciadores facilitan la separación del grupo de conjugación de los otros grupos de los compuestos descritos en el presente documento. Esta separación puede conducir a una conjugación más eficaz de los compuestos descritos en el presente documento a un segundo compuesto. El grupo espaciador también puede estabilizar el grupo de conjugación.
En determinados ejemplos, el grupo espaciado se denomina SG en el presente documento. Los grupos espaciadores útiles incluyen los descritos en el presente documento. En determinados ejemplos, el grupo espaciador es:
Figure imgf000025_0001
En determinados ejemplos, SG, W4 y el grupo HP o HP1 se combinan para formar un poli(etilenglicol) divalente de acuerdo con la fórmula:
Figure imgf000025_0002
en donde m es un número entero de 1 a 12, opcionalmente de 1 a 4, opcionalmente de 2 a 4.
Grupos de conjugación y restos de los mismos
Los grupos de conjugación facilitan la conjugación de los compuestos descritos en el presente documento con un segundo compuesto, tal como un resto de direccionamiento. El grupo de conjugación se denomina R en el presente documento. Los grupos de conjugación pueden reaccionar mediante cualquier mecanismo de reacción adecuado conocido por los expertos en la técnica. Un grupo de conjugación puede reaccionar mediante una reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida. El grupo de conjugación es:
Figure imgf000025_0003
Tras la conjugación, se forma un resto divalente del grupo de conjugación y se une al resto de un segundo compuesto. La estructura del resto divalente se determina por el tipo de reacción de conjugación empleada para formar el conjugado.
Cuando se forma un conjugado mediante una reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida, el resto divalente del grupo de conjugación puede comprender un anillo triazol o un grupo cíclico condensado que comprende un anillo triazol. Cuando se forma un conjugado mediante una reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida, el resto divalente del grupo de conjugación puede ser:
Figure imgf000025_0004
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo condensado bicíclico, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo heteroarilo condensado bicíclico, divalente, de nueve miembros, sustituido o sin sustituir. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es fenileno o indolileno, cada uno de los cuales está sin sustituir o sustituido. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es cualquiera de los siguientes:
Figure imgf000026_0001
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L está ausente. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XVIb1000-1002b, I-Ib o X-XIXb-2 o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L es -CH2-.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "EG" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG comprende fenileno, carboxileno, amino o una combinación de los mismos. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas I 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "EG" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG es:
Figure imgf000026_0002
CF3, -NO2, -CN, flúor, bromo, cloro, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilaminoC(O)-. En la segunda y la tercera estructuras, los expertos en la técnica reconocerán que EG está unido a un RT que no está en la cadena principal de la fórmula 1000 o (I) como se indica en la descripción anterior de la fórmula 1000 y (I). Cada REG se puede seleccionar independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -Cf3, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)-y dialquilaminoC(O)-. Cada REG se puede seleccionar independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, -NO2, -CN, flúor, bromo y cloro.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "RT" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde RT comprende un residuo de un aminoácido natural o no natural o un resto de un azúcar. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 11000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "RT" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde RT es:
Figure imgf000027_0001
Los expertos en la técnica reconocerán que la primera estructura es divalente y se puede unir con la cadena principal de fórmula 1000 o (I) y que la segunda estructura es monovalente y se puede unir a EG como se representa en las fórmulas 1000 y (I) anteriores.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "HP" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde HP comprende poli(etilenglicol). En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "HP" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde HP es:
Figure imgf000027_0002
en donde m es un número entero de 1 a 12.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "SG" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde SG comprende alquileno C1-C10, alquileno C4-C6, -C(O)- o una combinación de los mismos. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "SG" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde SG es:
Figure imgf000027_0003
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "W1", "W2", "W3", "W4", y/o "W5" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o comprenden una cetona divalente, éster divalente, éter divalente, amida divalente, amina divalente, alquileno, arileno, sulfuro, disulfuro, -C(O)- o una combinación de los mismos. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "W1", "W2", "W3", "W4", y/o "W5" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o comprenden -C(O)-, -O-, -C(O)NH-, -C(O)NH-alquilo-, -OC(O)NH-, -SC(O)NH-, -NH-, -NH-alquilo-, -N(CHs)CH2CH2N(CHs)-, -S-, -S-S-, -OCH2CH2O- o una combinación de los mismos.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "R" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R es un grupo de conjugación o un resto de un grupo de conjugación. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "R" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R comprende un alquino. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1002b y I-XIXb-2 en las que el grupo "R" está presente en la fórmula o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R es:
Figure imgf000028_0001
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula 1000a o la fórmula 1000b:
Figure imgf000028_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde X, EG, RT, HP, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1000 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula Ia o la fórmula Ib:
Figure imgf000028_0003
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula I y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula 1001a o la fórmula 1001b:
Figure imgf000029_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula 1002 a o la fórmula 1002b:
Figure imgf000029_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1002 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas II-IX-1:
Figure imgf000030_0001
Figure imgf000031_0001
Figure imgf000032_0001
Figure imgf000033_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5 y R son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas IIa-IXa-1:
Figure imgf000034_0001
Ċ
Figure imgf000036_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5 y R son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas IIb-IXb-1:
Figure imgf000038_0001
Figure imgf000039_0001
Figure imgf000040_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5 y R son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula X:
Figure imgf000040_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula I.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula Xa o Xb:
Figure imgf000040_0003
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula I.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XI-XVI-1:
Figure imgf000041_0001
Figure imgf000042_0001
Figure imgf000043_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XIa-XVIa-1:
Figure imgf000044_0001
Figure imgf000045_0001
Figure imgf000046_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas XIb-XIVb-1:
Figure imgf000047_0001
Figure imgf000048_0001
Figure imgf000049_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG, RT, HP, RT1, HP1, SG, W1, W2, W3, W4, W5, R, L y Ar son como se describe en el contexto de la fórmula 1000, I, 1001 y/o cualquiera de los ejemplos descritos en el presente documento.
El compuesto de Fórmula 1000 o 1001 puede ser donde X es
Figure imgf000049_0002
es
Figure imgf000049_0003
y RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible; o HP1 está ausente y RT1 es un enlazador escindible; y todos los otros grupos son como se definen para la fórmula 1000, 1001 y/o cualquier ejemplo descrito en el presente documento. El compuesto de fórmula 1000 o 1001 puede ser aquel en donde X es
Figure imgf000049_0004
y RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible; o HP1 está ausente y RT1 es un enlazador escindible; EG es
Figure imgf000050_0001
y todos los otros grupos son como se definen para la fórmula 1000, 1001 y/o cualquier ejemplo descrito en el presente documento. El compuesto de fórmula 1000 o 1001 puede ser aquel en donde X es
Figure imgf000050_0002
y RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible; o HP1 está ausente y RT1 es un enlazador escindible; EG es
Figure imgf000050_0003
W1-W5 están ausentes; y todos los otros grupos son como se definen para la fórmula 1000, 1001 y/o cualquier ejemplo descrito en el presente documento. L puede estar ausente.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con la fórmula 1000:
Figure imgf000051_0001
a sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
A r es un indolileno sustituido o sin sustituir o anillo fenileno sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
Figure imgf000051_0003
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, está ausente, -C(O)-, -O-, -C(O)O-, -OC(O)-, -C(O)NH-, -C(O)NH-alquilo-, -OC(O)NH-, -SC(O)NH-, -NH-, -N(alquilo)-, -N(R)-alquilen-N(R)- (en donde cada R es independientemente H o alquilo), -N(CH3)CH2CH2N(CH3)-, -CH2-, -CH2CH2-, -CH(CH3)-, -C(CH3)2-, -CH2CH2CH2-, fenileno, -NHCH2CH2C(O)-, -C(O)CH2CH2NH-, -S-, -S-S-, -OCH2CH2O- o el inverso de los mismos; EG está ausente o EG se selecciona entre
Figure imgf000051_0002
en donde cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -CF3, -NO2, -CN, flúor, bromo, cloro, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilamino-C(O)-;
RT cuando en la cadena principal es
y RT cuando el enlace a un grupo EG es
Figure imgf000052_0001
en donde cada RT es opcional;
RT1 está ausente,
Figure imgf000052_0002
valina-alanina, valina-ácido glutámico, alanina-fenilalanina; fenilalanina-lisina; fenilalanina-homolisina y glicinaglicina-glicina (giy-giy-giy),
Figure imgf000052_0003
en donde aa es un resto de aminoácido natural o no natural o
Figure imgf000052_0004
en donde el
Figure imgf000052_0005
anillo es un anillo heterocíclico de 4-7 miembros que comprende 3-6 átomos de carbono;
HP está ausente o
Figure imgf000052_0006
en donde m es un número entero de 1 a 12;
HP1 está ausente o
Figure imgf000052_0007
en donde RHP es
Figure imgf000052_0008
en donde R es -H o -CH3 y m es un número entero de 1 a 12 o RHP es -alquilen-S(O)3-.
SG está ausente,
Figure imgf000053_0001
y
R es un grupo de conjugación terminal o,
como alternativa, W1, W2, W3, W4, W5, EG, RT, HP, SG y R se combinan para formar -H.
En algunos ejemplos, el compuesto es aquel en donde X es -HP1-RT1-EG-, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -HP1-RT1- en donde RT1 es un enlazador escindible, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -RT1-, -RT-, -RT-EG-, RT1-EG- o -EG(RT)- y todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos descritos en el presente documento. En algunos ejemplos, el compuesto es aquel en donde X es -HP1-RT1-EG-, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -HP1-RT1- en donde RT1 es un enlazador escindible, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -RT1-, -RT-, -RT-EG-, RT1-EG- o -EG(RT)-; el grupo desencadenante de liberación facilita la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado junto con un grupo eliminador; y todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos descritos en el presente documento. En algunos ejemplos, el compuesto es aquel en donde X es -HP1-RT1-EG-, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -HP1-RT1- en donde RT1 es un enlazador escindible, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -RT1-, -RT-, -RT-EG-, RT1-EG- o -EG(RT)-; W1, W4, W5 y L son independientemente un enlace sencillo o están ausentes; el grupo desencadenante de liberación facilita la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado junto con un grupo eliminador; y todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos descritos en el presente documento. En algunos ejemplos, el compuesto es aquel en donde X es -HP1-RT1-EG-, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -HP1-RT1- en donde RT1 es un enlazador escindible, -HP1-RT1- en donde RT1 es un grupo desencadenante de liberación, -RT1-, -RT-, -RT-EG-, RT1-EG- o -EG(RT)-; W1, W4, W5 y L son independientemente un enlace sencillo o están ausentes; SG es
Figure imgf000053_0002
el grupo desencadenante de liberación facilita la separación de una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado junto con un grupo eliminador; y todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 101-108 o 1-8:
Figure imgf000054_0001
Figure imgf000055_0001
Figure imgf000056_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 101a-108a o 1a-8a:
Figure imgf000057_0001
Figure imgf000058_0001
Figure imgf000059_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 101b-108b o 1-8b:
Figure imgf000060_0001
Ċ
Figure imgf000061_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo.
Conjugados
Los compuestos descritos en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo) se puede hacer reaccionar con un segundo compuesto (por ejemplo, un polipéptido o anticuerpo) para formar un conjugado. El segundo compuesto puede ser cualquier compuesto que se sabe que es útil para la conjugación de los compuestos descritos en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001 -1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1-8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo). Los segundos compuestos útiles incluyen polipéptidos y anticuerpos.
En el presente documento se proporciona un conjugado que comprende un compuesto descrito en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo) unido a un segundo compuesto.
En un ejemplo, el conjugado es de acuerdo a la fórmula E1 a continuación:
Figure imgf000062_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir; L está ausente o es -CH2-;
Figure imgf000062_0002
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
cada RT es un grupo desencadenante de liberación, en la cadena principal de la fórmula 1000 o unido a EG, en en donde cada RT es opcional;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible o RT1 está ausente;
HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Figure imgf000062_0003
en donde RHP es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es un resto divalente o un grupo de conjugación terminal o,
como alternativa, W1, W2, W3, W4, W5, EG, RT, HP, SG y R se combinan para formar -H.
En un ejemplo, el conjugado es de acuerdo a la fórmula C1 a continuación:
Figure imgf000063_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
COMP es un resto de un segundo compuesto;
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG es un grupo eliminador;
cada RT es un grupo desencadenante de liberación y un RT es opcional;
HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es un resto divalente de un grupo de conjugación terminal.
En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con la fórmula (F1) o (G1):
Figure imgf000063_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde:
COMP es un resto de un segundo compuesto;
Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir o un anillo arilo o heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible; RT es un grupo desencadenante de liberación unido a EG y en donde RT y RT1 son opcionales;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Rsg
Figure imgf000063_0003
en donde RSG es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente y
R es un resto divalente de un grupo de conjugación terminal.
En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo monocíclico, divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo arilo o heteroarilo condensado bicíclico, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es un anillo heteroarilo condensado bicíclico, divalente, de ocho o nueve miembros, sustituido o sin sustituir. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es fenileno o indolileno, cada uno de los cuales está sin sustituir o sustituido. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Ar es cualquiera de los siguientes:
Figure imgf000064_0001
En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L está ausente. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde L es -CH2-.
En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG comprende fenileno, carboxileno, amina o una combinación de los mismos. En un ejemplo, en el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde EG es:
Figure imgf000064_0002
en donde cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -CF3, -NO2, -CN, flúor, bromo, cloro, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilaminoC(O)-. En la segunda y la tercera estructuras, los expertos en la técnica reconocerán que EG está unido a un RT que no está en la cadena principal de fórmula (I) como se indica en la descripción anterior de la fórmula (I). En algunos ejemplos, cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -CF3 , alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilaminoC(O)-. En otros ejemplos, cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, -NO2 , -CN, flúor, bromo y cloro.
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde RT comprende un residuo de un aminoácido natural o no natural o un resto de un azúcar. En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde RT es:
Figure imgf000065_0001
Los expertos en la técnica reconocerán que la primera estructura es divalente y se puede unir a la cadena principal de la fórmula 1000 o (I) y que la segunda estructura es monovalente y se puede unir a EG como se representa en la fórmula (I) y 1000 anteriores.
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde HP comprende poli(etilenglicol). En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde HP es:
Figure imgf000065_0002
en donde m es un número entero de 1 a 12.
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde SG comprende alquileno C1-C10, alquileno C4-C6, -C(O)- o una combinación de los mismos. En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde SG es:
Figure imgf000065_0003
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o comprenden una cetona divalente, éster divalente, éter divalente, amida divalente, amina divalente, alquileno, arileno, sulfuro, disulfuro, -C(O)-o una combinación de los mismos. En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o comprenden -C(O)-, -O-, -C(O)NH-, -C(O)NH-alquilo-, -OC(O)NH-, -SC(O)NH-, -NH-, -NH-alquilo-,-N(CH3)CH2CH2n (c H3)-, -S-, -S-S-, -OCH2CH2O- o una combinación de los mismos.
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R comprende un anillo de triazol. En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R es un anillo de triazol o un grupo cíclico condensado que comprende un anillo de triazol. En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R es:
Figure imgf000066_0001
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde R es:
Figure imgf000066_0002
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde COMP es un resto de cualquier compuesto que se sabe que es útil para la conjugación de los compuestos de hemiasterlina modificada (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1-8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo). En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde COMP es un residuo de un polipéptido, anticuerpo o cadena de anticuerpo. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde COMP es un resto de un polipéptido. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Co Mp es un resto de un anticuerpo. En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo; en donde Co Mp es un residuo de una cadena de anticuerpo.
En el presente documento se proporciona un conjugado de polipéptido que comprende un compuesto descrito en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo) unido a un polipéptido, en donde el conjugado de polipéptido es de acuerdo a cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP es un resto del polipéptido. En el presente documento se proporciona un conjugado de polipéptido de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde: COMP es un resto de un polipéptido y R es:
Figure imgf000066_0003
En el presente documento se proporciona un conjugado de anticuerpo que comprende un compuesto descrito en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo) enlazado a un anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP es un resto del anticuerpo. En el presente documento se proporciona un conjugado de anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde: COMP es un resto del anticuerpo y R es:
Figure imgf000067_0001
En el presente documento se proporciona un conjugado de cadena de anticuerpo que comprende un compuesto descrito en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo) enlazado a una cadena de anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP es un resto de una cadena de anticuerpo. En el presente documento se proporciona un conjugado de cadena de anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C13b, E1, F1-F13b y G1-G13b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde: COMP es un resto de la cadena de anticuerpo y R es:
Figure imgf000067_0002
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con la fórmula C1a o la fórmula C1b:
Figure imgf000067_0003
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y Ar son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un conjugado de acuerdo con la fórmula siguiente:
Figure imgf000068_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C2-C9:
Figure imgf000069_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000070_0001
Figure imgf000071_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se describe en el contexto de cualquiera de las fórmulas o ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C2a-C9a:
Figure imgf000072_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000073_0001
Figure imgf000074_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se describe en el contexto de cualquiera de las fórmulas o ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C2b-C9b:
Figure imgf000075_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y Ar son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
Ċ
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000076_0001
Figure imgf000077_0001
Figure imgf000078_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se describe en el contexto de cualquiera de las fórmulas o ejemplos descritos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C10-C13:
Figure imgf000078_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000079_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C10a-C13a:
Figure imgf000080_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000080_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el p re sen te d o cu m e n to se p ro po rc ion a un c o m p u e s to de acu e rd o con c u a lq u ie ra de las fó rm u la s C 10b -C 13 b :
Figure imgf000081_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000082_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C14-C17:
Figure imgf000082_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el p re sen te d o cu m e n to se p ro p o rc io n a un co m p u e s to de a cu e rd o con cu a lq u ie ra de las fó rm u la s s ig u ie n tes :
Figure imgf000083_0001
Figure imgf000084_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C14a-C17a:
Figure imgf000084_0002
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000085_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el p re sen te d o cu m e n to se p ro po rc ion a un c o m p u e s to de acu e rd o con cua lq u ie ra de las fó rm u la s C 14b-C 17b:
Figure imgf000086_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde COMP, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y A r son como se describe en el contexto de las fórmulas C1 y I-XVIb.
En el presente documento se proporciona un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000087_0001
o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde todos los otros grupos son como se definen en cualquiera de las fórmulas y/o ejemplos en el presente documento.
En el presente documento se proporciona un método para producir un conjugado (por ejemplo, de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b), que comprende poner en contacto un compuesto descrito en el presente documento (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas I-XVIIIb, 101-111b o 1-8b) con un segundo compuesto en condiciones adecuadas para conjugar el compuesto descrito en el presente documento con el segundo compuesto; en donde el segundo compuesto comprende un aminoácido modificado que comprende un alquino, alqueno sometido a tensión, tetrazina, tiol, maleimida, carbonilo, oxiamina o azida. En un ejemplo, el segundo compuesto es un polipéptido. En un ejemplo, el segundo compuesto es un anticuerpo.
Reacciones de conjugación
Reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida
Ventajosamente, los compuestos descritos en el presente documento que comprenden un grupo alquino terminal de conjugación o un grupo azida (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas I-IXb, XI-XVIIb y 101-111b) facilitan reacciones selectivas y eficaces con un segundo compuesto que comprende un grupo azida complementario o un grupo alquino. Se cree que los grupos azida y alquino reaccionan en una reacción de cicloadición 1,3-dipolar para formar un resto 1,2,3-triazolileno que une el compuesto descrito en el presente documento que comprende un grupo alquino o un grupo azida con el segundo compuesto. Esta reacción entre una azida y un alquino para formar un triazol es en general conocida por los expertos en la técnica como una reacción de cicloadición de Huisgen o una reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida.
La reactividad única de los grupos funcionales azida y alquino los hace útiles para la modificación selectiva de los polipéptidos y otras moléculas biológicas. Las azidas orgánicas, en particular las azidas alifáticas y los alquinos son en general estables frente a condiciones químicas de reacción comunes. En particular, ambos grupos funcionales azida y alquino son inertes frente a las cadenas laterales de los 20 aminoácidos comunes encontrados en los polipéptidos de origen natural. Se cree que, cuando se ponen en estrecha proximidad, la naturaleza "cargada por resorte" de los grupos azida y alquino se revela y estos reaccionan de forma selectiva y eficaz mediante una reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida para generar el triazol correspondiente. Véase, por ejemplo, Chin J., et al., Science 301:964-7 (2003); Wang, Q., et al., J. Am. Chem. Soc. 125, 3192-3193 (2003); Chin, J. W., et al., J. Am. Chem. Soc.
124:9026-9027 (2002).
Debido a que la reacción de cicloadición [3+2] alquino-azida implica una reacción de cicloadición selectiva [véase, por ejemplo, Padwa, A., en COMPREHENSIVE ORGANIC SYNTHESIS, vol. 4, (ed. Trost, B. M., 1991), págs. 1069-1109; Huisgen, R. en 1,3-DIPOLAR CYCLOADDITION CHEMISTRY, (ed. Padwa, A., 1984), págs. 1-176] en vez de una sustitución nucleófila, la incorporación de aminoácidos no codificados de manera natural que portan cadenas laterales que contienen azida y alquino permite modificar de forma selectiva los polipéptidos resultantes en la posición del aminoácido no codificado de manera natural. Las reacciones de cicloadición que implican compuestos que contienen azida o alquino se pueden llevar a cabo a temperatura ambiente en condiciones acuosas mediante la adición de Cu (II) (incluyendo en la forma de una cantidad catalítica de CuSO4) en presencia de un agente reductor para reducir el Cu (II) a Cu (I), in situ, en una cantidad catalítica. Véase, por ejemplo, Wang, Q., et al., J. Am. Chem. Soc. 125, 3192­ 3193 (2003); Tomoe, C. W., et al., J. Org. Chem. 67:3057-3064 (2002); Rostovtsev, et al., Angew. Chem. Int. Ed.
41:2596-2599 (2002). Los agentes reductores a modo de ejemplo incluyen ascorbato, cobre metálico, quinina, hidroquinona, vitamina K, glutatión, cisteína, Fe2+, Co2+ y un potencial eléctrico aplicado.
Reacción inversa de unión con demanda de electrones
Figure imgf000088_0001
Ventajosamente, los compuestos que comprenden una tetrazina terminal o grupo alqueno sometido a tensión proporcionados en el presente documento facilitan de manera selectiva y eficaz las reacciones con un segundo compuesto que comprende un grupo alqueno sometido a tensión o tetrazina. Se cree que la tetracina y el alqueno sometido a presión reaccionan en una reacción inversa de demanda de Diels-Alder seguida de una reacción retro de Diels-Alder que une los compuestos que comprenden una tetrazina terminal o un grupo alqueno sometido a presión proporcionado en el presente documento al segundo compuesto. Se cree que la reacción es específica, con poca o ninguna reactividad cruzada con los grupos funcionales que ocurren en las biomoléculas. La reacción puede realizarse en condiciones suaves, por ejemplo a temperatura ambiente y sin catalizador. Esta reacción entre una tetrazina y un alqueno sometido a tensión normalmente es conocida por los expertos en la técnica como una reacción de ligamiento de tetrazina.
Reacciones de tiol
Figure imgf000089_0001
Ventajosamente, los compuestos que comprenden un grupo tiol terminal o un grupo electrófilo o formador de disulfuro adecuado proporcionados en el presente documento facilitan de manera selectiva y eficaz las reacciones con un segundo compuesto que comprende un grupo electrófilo o formador de disulfuro o un grupo tiol complementario. Se cree que estas reacciones son selectivas con poca o ninguna reactividad cruzada con los grupos funcionales que ocurren en las biomoléculas. En otro ejemplo, la reacción de tiol no incluye la reacción de un grupo maleimida. Reacción carbonilo-oxiamina
Figure imgf000089_0002
Ventajosamente, los compuestos que comprenden un grupo carbonilo u oxamina terminal proporcionados en el presente documento facilitan de forma selectiva y eficaz las reacciones con un segundo compuesto que comprende un grupo oxiamina o carbonilo. Se cree que el carbonilo y la oxiamina reaccionan para formar un enlace oxima. Se cree que la reacción es específica, con poca o ninguna reactividad cruzada con los grupos funcionales que ocurren en las biomoléculas.
Otras reacciones
Otras reacciones de conjugación adecuadas se describen en la bibliografía. Véase, por ejemplo, Lang, K. y Chin, J.
2014, Bioortogonal Reactions for Labeling Proteins, ACS Chem Biol 9, 16-20; Paterson, D. M. et al. 2014, Finding the Right (Bioortogonal) Chemistry, ACS Chem Biol 9, 592-605; King, M. y Wagner, A. 2014, Developments en the Field of Bioortogonal Bond Forming Reactions - Past and Present Trends, Bioconjugate Chem., 2014, 25 (5), págs. 825­ 839; y Ramilo, C.P. y Lin, Q., 2013, Bioortogonal chemistry: strategies and recent developments, Chem Commun 49, 11007-11022.
Reacciones de liberación
Las reacciones de liberación son reacciones que actúan para liberar una porción biológicamente activa de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento del compuesto o conjugado in vivo y/o in vitro. En determinados ejemplos, la porción biológicamente activa liberada es un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1 -8b o una sal, solvato, estereoisómero o tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo. Un ejemplo de una reacción de liberación es una reacción intramolecular entre un grupo eliminador y un grupo desencadenante de liberación de un compuesto o conjugado descrito en el presente documento para liberar una porción biológicamente activa de un compuesto o un conjugado descrito en el presente documento. El propio grupo eliminador se puede descomponer en dos componentes reactivos, como se ejemplifica en estas reacciones donde X es un fármaco que tiene un heteroátomo N u O para enlazar. Las reacciones de liberación a modo de ejemplo se representan en los esquemas siguientes:
Figure imgf000090_0001
Composiciones
Los compuestos y conjugados descritos en el presente documento se pueden formular en composiciones usando los métodos disponibles en la técnica y los divulgados en el presente documento. Cualquiera de los compuestos y conjugados descritos en el presente documento se puede proporcionar en una composición farmacéutica apropiada y administrarse por una vía de administración adecuada.
En el presente documento se proporciona una composición farmacéutica que comprende:
un compuesto (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-l002b y I-XIXb-2, l01-111b o 1 -8b) o conjugado (por ejemplo, un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b) como se ha descrito en el presente documento y
un excipiente, vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.
En determinados ejemplos, las composiciones farmacéuticas proporcionadas en el presente documento comprenden además un vehículo farmacéuticamente aceptable. El vehículo puede ser un diluyente, excipiente o vehículo con el cual se administra la composición farmacéutica. Dichos vehículos farmacéuticos pueden ser líquidos estériles, tales como agua y aceites, incluidos aquellos procedentes del petróleo, de origen animal, vegetal o sintéticos, tales como aceite de cacahuete, aceite de soja, aceite mineral y aceite de sésamo. También se pueden emplear soluciones salinas y soluciones acuosas de dextrona y glicerol como vehículos líquidos, en particular para soluciones inyectables. Los excipientes farmacéuticos adecuados incluyen almidón, glucosa, lactosa, sacarosa, gelatina, malta, arroz, harina, tiza, gel de sílice, estearato sódico, monoestearato de glicerol, talco, cloruro de sodio, leche desnatada en polvo, glicerol, propileno, glicol, agua y etanol. La composición farmacéutica, si se desea, también puede contener cantidades menores de agentes humectantes o emulsionantes o agentes tamponadores del pH. Las composiciones farmacéuticas pueden tener la forma de soluciones, suspensiones, emulsiones, comprimidos, píldoras, cápsulas, polvos y formulaciones de liberación sostenida. Las formulaciones orales pueden incluir vehículos convencionales tales como calidades de manitol, lactosa, almidón, estearato de magnesio, sacarina sódica, celulosa, carbonato de magnesio, etc. Se describen ejemplos de vehículos farmacéuticos adecuados en E.W. Martin, 1990, Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co.
En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se proporciona en una forma adecuada para su administración a un sujeto humano. En algunos ejemplos, la composición farmacéutica contendrá una cantidad profiláctica o terapéuticamente eficaz del polipéptido junto con una cantidad adecuada de vehículo para proporcionar la forma para la administración apropiada al paciente. La formulación debe adecuarse al modo de administración.
En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se proporciona en una forma adecuada para administración intravenosa. Habitualmente, las composiciones adecuadas para administración intravenosa son soluciones en tampón acuoso isotónico estéril. Cuando sea necesario, la composición puede incluir también un agente solubilizante y un anestésico local tal como lignocaína para aliviar el dolor en el lugar de la inyección. Dichas composiciones, sin embargo, se pueden administrar por una vía diferente a la administración intravenosa.
En ejemplos concretos, la composición farmacéutica es adecuada para administración subcutánea. En ejemplos concretos, la composición farmacéutica es adecuada para administración intramuscular.
Los componentes de la composición farmacéutica se pueden suministrar bien por separado o mezclados en una única forma de dosificación, por ejemplo, en forma de un polvo liofilizado o concentrado sin agua. Cuando la composición se va a administrar por infusión, esa se puede dispensar con una botella de infusión que contiene agua o solución salina de calidad farmacéutica estéril. Cuando la composición se administra por inyección, se puede proporcionar una cantidad suficiente de agua estéril para inyección de modo que los ingredientes puedan mezclarse antes de su administración.
En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se suministra en forma de un polvo liofilizado estéril en seco que es capaz de reconstituirse en la concentración apropiada para su administración a un sujeto. En algunos ejemplos, los polipéptidos se suministran en forma de un concentrado sin agua. En algunos ejemplos, el polipéptido se suministra en forma de un polvo liofilizado estéril en seco en una dosis unitaria de al menos 0,5 mg, al menos 1 mg, al menos 2 mg, al menos 3 mg, al menos 5 mg, al menos 10 mg, al menos 15 mg, al menos 25 mg, al menos 30 mg, al menos 35 mg, al menos 45 mg, al menos 50 mg, al menos 60 mg o al menos 75 mg.
En otro ejemplo, la composición farmacéutica se suministra en forma líquida. En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se proporciona en forma líquida y está sustancialmente libre de tensioactivos y/o sales inorgánicas. En algunos ejemplos, el polipéptido se suministra en forma líquida en una dosis unitaria de al menos 0,1 mg/ml, al menos 0,5 mg/ml, al menos 1 mg/ml, al menos 2,5 mg/ml, al menos 3 mg/ml, al menos 5 mg/ml, al menos 8 mg/ml, al menos 10 mg/ml, al menos 15 mg/ml, al menos 25 mg/ml, al menos 30 mg/ml o al menos 60 mg/ml.
En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se formula en forma de sal. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen aquellas formadas con aniones tales como las derivadas de ácido clorhídrico, fosfórico, acético, oxálico, tartárico, etc. y aquellas formadas con cationes tales como las derivadas de sodio, potasio, amonio, calcio, hidróxidos férricos, isopropilamina, trietilamina, 2-etilamino-etanol, histidina, procaína, etc.
Para uso terapéutico, el médico determinará la posología más apropiada de acuerdo con un tratamiento preventivo o curativo y de acuerdo con la edad, peso, estado de la enfermedad y otros factores específicos del sujeto a tratar. En determinados ejemplos, las dosis son de aproximadamente 1 a aproximadamente 1000 mg por día para un adulto o de aproximadamente 5 a aproximadamente 250 mg por día o de aproximadamente 10 a 50 mg por día para un adulto. En determinados ejemplos, las dosis son de aproximadamente 5 a aproximadamente 400 mg por día o de 25 a 200 mg por día para un adulto. En determinados ejemplos, también se contemplan rangos de dosis de aproximadamente 50 a aproximadamente 500 mg.
Métodos de uso para terapia o profilaxis
Determinados compuestos, conjugados, polipéptidos y anticuerpos proporcionados en el presente documento se pueden usar para el tratamiento o prevención de cualquier enfermedad o afección considerada adecuada por el médico experto en la técnica. En general, un método para tratar o prevenir incluye la administración de una cantidad terapéutica o profilácticamente eficaz de un compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende el mismo a un sujeto que lo necesita para tratar o prevenir la enfermedad o afección.
En el presente documento se proporciona un método para inhibir la polimerización de la tubulina en un sujeto que lo necesita que comprende administrar una cantidad eficaz de un compuesto (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b), conjugado (por ejemplo, un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b) o composición que comprende el compuesto o conjugado, como se describe en el presente documento, al sujeto.
En el presente documento se proporciona un método para tratar la proliferación celular o cáncer en un sujeto que lo necesita que comprende administrar una cantidad eficaz de un compuesto (por ejemplo, un compuesto de acuerdo con cualquiera de las fórmulas 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2, 101-111b o 1 -8b), conjugado (por ejemplo, un conjugado de acuerdo con cualquiera de las fórmulas C1-C17b, E1, F1-F17b y G1-G17b) o composición que comprende el compuesto o conjugado, como se describe en el presente documento, al sujeto.
Una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende al mismo es una cantidad que es eficaz para reducir la gravedad, la duración y/o los síntomas de una enfermedad o afección particular. La cantidad del compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que lo comprende, que será terapéuticamente eficaz en la prevención, gestión, tratamiento y/o alivio de una enfermedad particular se puede determinar por técnicas clínicas convencionales. La cantidad precisa del compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende el mismo, a administrar depende, en parte, de la vía de administración, la gravedad de la enfermedad o afección particular y se debe decidir de acuerdo con el criterio del médico y las circunstancias de cada sujeto.
En algunos ejemplos, la cantidad eficaz del compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende el mismo, proporcionada en el presente documento está entre aproximadamente 0,025 mg/kg y aproximadamente 1000 mg/kg de peso corporal de un sujeto humano. En determinados ejemplos, el compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que lo contiene, se administra a un sujeto humano en una cantidad de aproximadamente 1000 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 950 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 900 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 850 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 800 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 750 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 700 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 650 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 600 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 550 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 500 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 450 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 400 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 350 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 300 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 250 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 200 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 150 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 100 mg/kg de peso corporal o menos aproximadamente 95 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 90 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 85 mg/kg de peso corporal menos, aproximadamente 80 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 75 mg/kg de peso corporal o menos, aproximadamente 70 mg/kg de peso corporal o menos o aproximadamente 65 mg/kg de peso corporal o menos.
En algunos ejemplos, la cantidad eficaz del compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende el mismo, proporcionada en el presente documento está entre aproximadamente 0,025 mg/kg y aproximadamente 60 mg/kg de peso corporal de un sujeto humano. En algunos ejemplos, la cantidad eficaz de un compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica que comprende el mismo de la composición farmacéutica proporcionada en el presente documento es de aproximadamente 0,025 mg/kg o menos, aproximadamente 0,05 mg/kg o menos, aproximadamente 0,10 mg/kg o menos, aproximadamente 0,20 mg/kg o menos, aproximadamente 0,40 mg/kg o menos, aproximadamente 0,80 mg/kg o menos, aproximadamente 1,0 mg/kg o menos, aproximadamente 1,5 mg/kg o menos, aproximadamente 3 mg/kg o menos, aproximadamente 5 mg/kg o menos, aproximadamente 10 mg/kg o menos, aproximadamente 15 mg/kg o menos, aproximadamente 20 mg/kg o menos, aproximadamente 25 mg/kg o menos, aproximadamente 30 mg/kg o menos, aproximadamente 35 mg/kg o menos, aproximadamente 40 mg/kg o menos, aproximadamente 45 mg/kg o menos, aproximadamente 50 mg/kg o aproximadamente 60 mg/kg o menos.
La composición farmacéutica del método se puede administrar usando cualquier método conocido por los expertos en la técnica. Por ejemplo, la composición farmacéutica se puede administrar por vía intramuscular, por vía intradérmica, por vía intraperitoneal, por vía intravenosa, por administración subcutánea o cualquier combinación de las mismas. En algunos ejemplos, la composición farmacéutica se administra por vía subcutánea. En algunos ejemplos, la composición se administra por vía intravenosa. En algunos ejemplos, la composición se administra por vía intramuscular.
Los cánceres que se pueden tratar usando un compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo o composición farmacéutica divulgados en el presente documento, incluyen los cánceres en donde Her2 está sobreexpresado, CD7 está sobreexpresado, Her2 no está sobreexpresado y c D7 no está sobreexpresado, En algunos ejemplos, el cáncer es cáncer de pulmón microcítico, cáncer de pulmón no microcítico, cáncer de ovario, cáncer de ovario resistente a platino, adenocarcinoma de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de mama, cáncer de mama que sobreexpresa Her2, cáncer de mama triple negativo, un linfoma, linfoma de células grandes, linfoma histocítico y linfocítico mixto difuso, linfoma folicular de linfocitos B, cáncer de colon, carcinoma de colon, adenocarcinoma de colon, adenocarcinoma colorrectal, melanoma, mieloma de próstata o múltiple. En determinados ejemplos, el cáncer es cáncer de mama, cáncer de pulmón, cáncer de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de próstata, cáncer de colon, cáncer colorrectal, melanoma, cáncer de próstata o mieloma múltiple.
Métodos de ensayo
Los compuestos, conjugados, polipéptidos, los anticuerpos y la composición farmacéutica que comprenden los mismos descritos en el presente documento se pueden analizar para determinar su actividad esperada o una nueva actividad, de acuerdo con cualquier ensayo evidente para los expertos en la técnica. El compuesto, conjugado, polipéptido, anticuerpo, o composición farmacéutica que comprende el mismo puede ensayarse para determinar su actividad en un ensayo funcional o cuantificando la cantidad de proteína presente en un ensayo no funcional, por ejemplo, inmunotinción, ELISA, cuantificación en gel teñido con Coomasie o plata, etc., y determinando la proporción de proteína biológicamente activa con respecto a la proteína total.
La cantidad de proteína producida en una reacción de traducción se puede medir de varias formas. Un método se basa en la disponibilidad de un ensayo que mide la actividad de la proteína particular que se traduce. Un ejemplo de un ensayo para medir la actividad proteica es un sistema de ensayo de luciferasa o un sistema de ensayo de acetiltransferasa cloranfenical. Estos ensayos miden la cantidad de proteína funcionalmente activa producida a partir de la reacción de traducción. Los ensayos de actividad no medirán la proteína de longitud completa que está inactiva debido al plegamiento inadecuado de la proteína o la falta de otras modificaciones postraduccionales necesarias para la actividad de la proteína.
Otro método para medir in vitro la cantidad de proteína producida en reacciones de transcripción y traducción acopladas es realizar las reacciones utilizando una cantidad conocida de aminoácidos radiomarcados, como 35S-metionina, 3H-leucina o 14C-leucina y posteriormente medir la cantidad de aminoácido radiomarcado incorporado en la proteína recién traducida. Los ensayos de incorporación medirán la cantidad de aminoácidos radiomarcados en todas las proteínas producidas en una reacción in vitro de traducción que incluye productos proteicos truncados. La proteína marcada radiactivamente puede separarse adicionalmente en un gel de proteína y, mediante autorradiografía, se confirmó que el producto tiene el tamaño adecuado y que no se han producido productos proteicos secundarios.
Preparación de compuestos de hemiasterlina modificados
Los compuestos proporcionados en el presente documento se pueden preparar, aislar u obtener por cualquier método evidente para los expertos en la técnica. Los compuestos proporcionados en el presente documento se pueden preparar de acuerdo con el esquema general de preparación proporcionado en el presente documento. Las condiciones de reacción, etapas y reactivos no proporcionados en el esquema general de preparación deberían ser evidentes para y conocidos por los expertos en la técnica a la luz de los ejemplos proporcionados en el presente documento.
Esquema general de preparación
Figure imgf000093_0001
En el esquema genera de preparación R, SG, HP, RT, EG, W1, W2, W3, W4, W5, L y Ar son como se describen en el contexto de las fórmulas C1 y 1000-1000b, 1001-1001b, 1002-1002b y I-XIXb-2.
Ejemplos
Como se usa en el presente documento, los símbolos y convenciones usados en estos procesos, esquemas y ejemplos, independientemente de si se define específicamente una abreviatura particular, son consistentes con los usados en la bibliografía científica contemporánea, por ejemplo, el Journal of Biological Chemistry y/o el Journal of the American Chemical Society.
Para todos los ejemplos siguientes, se pueden utilizar procedimientos y métodos de purificación convencionales conocidos por los expertos en la técnica. A menos que se indique otra cosa, todas las temperaturas se expresan en °C (grados Celsius). Todos los métodos se llevan a cabo a temperatura ambiente ("ta" o "t.a."), a menos que se indique lo contrario.
Ejemplo 1a
Síntesis del compuesto 1 (Dos diastereómeros)
Figure imgf000093_0002
Esquema 1
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Preparación del compuesto B2
A un disolvente mixto de diclorometano (100 ml) y HCl 2 N (78 ml, 156 mmol) a -5 °C se le añadió lejía fría (que contenía NaOCl al 6 %, 108 ml, 87 mmol) en porciones. La mezcla se agitó a 0 °C (temperatura interior) durante 5 min. Después se añadió 2-mercaptobezotioazol sódico (B, 5 g, 26 mmol) a la mezcla en múltiples porciones. La mezcla se agitó a de -5 a -10 °C durante 20 min. La capa orgánica (B1, principal es BtsCl) se recogió y se mezcló con L-valinol (3,2 g, 31,2 mmol) y trietil amina (8,7 ml, 121 mmol) en diclorometano a t.a. La mezcla se dejó en agitación a t.a. durante 1 h. El disolvente se eliminó y el producto se purificó por columna de gel de sílice (hexanos:acetato de etilo = 1:1) para dar el producto B2 (3,1 g, 40 %, dos etapas) en forma de un sólido de color blanco.
LC-MS (ESI): 301 (M+1).
RMN 1H (300 MHz, CDCh) 88,08 (dd, J = 2,1 y 7,2 Hz, 1H), 7,96 (dd, J = 1,8 y 6,9 Hz, 1H), 7,58 (m, 2H), 5,46 (s a, 1H), 3,67 (d, J = 4,5 Hz, 2H), 3,54 (s a, 1H), 3,23 (s a, 1H), 1,93 (m, 1H), 0,97 (d, J = 6,9 Hz, 6H).
Preparación del compuesto B3
A una solución de B2 (3 g, 10 mmol, 1,0 equiv.) en dimetilformamida (50 ml) se le añadió carbonato potásico (2,77 g, 20 mmol, 2,0 equiv.) y yodometano (1,25 ml, 20 mmol, 2,0 equiv.) a ta. La mezcla se calentó a 35 °C, 4 h. El disolvente se eliminó y el residuo se trató con acetato de etilo y agua (3x), se secó con Na2SO4 y se concentró para dar el producto B3 (3,14 g, 100 %) en forma de un sólido de color blanco.
LC-MS (ESI): 315 (M+1).
RMN 1H (300 MHz, CDCla) 88,09 (dd, J = 1,6 y 7,5 Hz, 1H), 7,95 (dd, J = 1,8 y 6,9 Hz, 1H), 7,58 (m, 2H), 4,25 (s a, 1H), 2,90 (s, 3H), 1,93 (m, 1H), 1,02 (dd, J = 2,1 y 6,6 Hz, 6H).
Preparación del compuesto B4
A un disolvente mixto de diclorometano (50 ml) y DMSO (1,56 ml, 22 mmol, 2,2 equiv.) a -78 °C se le añadió cloruro de oxalilo (1,05 ml, 12 mmol, 1,2 equiv.) lentamente en atmósfera de nitrógeno y se agitó a esta temperatura durante 30 min. Después se añadió B3 (3,14 g, 10 mmol, 1,0 equiv.) en 20 ml de diclorometano a esta mezcla de reacción a -78 °C en atmósfera de nitrógeno. La mezcla de reacción se dejó en agitación a -78 °C durante 2 h. Después se añadió trietilamina (7 ml, 50 mmol, 5 equiv.) a la reacción y se agitó a -78 °C durante 30 min. y se continuó hasta calentar a 0 °C durante otros 30 min. La mezcla de reacción se vertió en agua enfriada con hielo y se extrajo con DCM (3x). La capa orgánica se lavó con solución semisaturada de cloruro de amonio (2x), salmuera y se secó con sulfato sódico. Se concentró a baja temperatura (por debajo de 30 °C) para dar el producto B4 (3,0 g, 96 %) en forma de un sólido de color blanco.
RMN 1H (300 MHz, CDCh) 89,69 (s, 1H), 8,17 (dd, J = 1,5 y 8,1 Hz, 1H), 7,95 (dd, J = 2,1 y 6,9 Hz, 1H), 7,58 (m, 2H), 4,30 (d, J = 10,2 Hz, 1H), 3,01 (s, 3H), 2,21 (m, 1H), 1,15 (d, J = 6,6 Hz, 3H), 0,98(d, J = 6,6 Hz, 3H).
Preparación del compuesto B5
El producto B4 (3 g, 9,58 mmol, 1,0 equiv.) y [(1-etoxicaarbonil)etiliden]Ph3P (6,95 g, 19,2 mmol, 2 equiv.) se disolvieron en tetrahidrofurano anhidro (60 ml) y se calentó a reflujo, 3 h. La reacción se enfrió a t.a. y se vertió en agua enfriada con hielo. El producto se extrajo con acetato de etilo (3x). La capa orgánica se lavó con salmuera, se secó con sulfato sódico y después se concentró para dar el producto en bruto. Se purificó otra vez con columna de gel de sílice (Hexanos: acetato de etilo = 8:2) para dar el producto B5 (2,9 g, 82 %).
RMN 1H (300 MHz, CDCla) 88,09 (dd, J = 1,2 y 7,2 Hz, 1H), 7,93 (dd, J = 1,8 y 8,1 Hz, 1H), 7,53 (m, 2H), 6,39 (dd, J = 1,6 y 10,5 Hz, 1H), 4,41 (t, J = 10,5 Hz, 1H), 3,87 (c, J = 7,2 Hz, 2H), 3,08 (s, 3H), 1,85 (s, 3H), 1,02-1,08 (m, 6H), 0,83 (d, J = 6,9 Hz, 3H).
Preparación del compuesto B6
A una solución del producto B5 (2,9 g, 7,31 mmol, 1,0 equiv.) en dimetilformamida (30 ml) se le añadió carbonato potásico (4,04 g, 29,2 mmol, 4,0 equiv.) y tiofenol (2,25 ml, 21,9 mmol, 3,0 equiv.). La reacción se agitó a t.a. durante 1 h. Después se procesó con éter dietílico y agua (3x). La capa de éter se extrajo con HCl al 1 %, la acuosa se lavó con éter. La capa acuosa se neutralizó con bicarbonato sódico a pH 8 y se extrajo con diclorometano (3x). La capa orgánica se secó con sulfato sódico y se concentró para dar el producto puro B6 (1,2 g, 84 %) en forma de un aceite de color amarillo.
LC-MS (ESI): 200 (M+1).
RMN 1H (300 MHz, CDCh) 86,48 (dd, J = 1,2 y 10,2 Hz, 1H), 4,18 (c, J = 7,2 Hz, 1H), 3,06 (c, J = 6,3 Hz, 2H), 2,30 (s, 3H), 1,86 (d, J = 1,8 Hz, 2H), 1,72 (m, 1H), 1,28 (t, J = 7,2 Hz, 3H), 0,93 (d, J = 6,9 Hz, 3H), 0,87 (d, J = 6,9 Hz, 3H).
Preparación de los compuestos Bts-Leu-Cl y B7
Esta síntesis se describe en su totalidad en Vedejs and Kongkittingam, "A Total Synthesis of (-)-Hemiasterlin Using N-Bts Methodology," J. Org. Chem. 2001,66(22), 7355-7364. A continuación se proporciona un sumario.
A una solución de Bts-Leu (2,4 g, 7,3 mmol, 1,0 equiv.) en diclorometano anhidro (30 ml) a 0 °C se añadió cloruro de tionilo (1,6 ml, 21,9 mmol, 3,0 equiv.) en atmósfera de nitrógeno. La mezcla de reacción se calentó a reflujo a 42 °C durante 2 h. Se concentró y se co-evaporó con tolueno para dar Bt-Leu-Cl en forma de un sólido en bruto y se usó en la siguiente etapa de reacción sin más purificación.
A una solución del producto B6 (1,2 g, 6,02 mmol) en un disolvente mixto diclorometano y agua (1:1,40 ml) a 0 °C se le añadió una solución de carbonato sódico (1,28 g, 12,04 mmol, 2,0 equiv.) y bicarbonato sódico (1,32 g, 15,7 mmol.
3,2 equiv.) en atmósfera de nitrógeno. El Bts-Leu-Cl recién producido (del anterior) en diclorometano (10 ml) se añadió en esta reacción con jeringa. La mezcla se agitó a 0-5 °C durante 1 h. El producto B7 se extrajo con diclorometano y agua (3x), se secó con sulfato sódico y se concentró para dar el producto en bruto B7, que se purificó por columna de gel de sílice (hexanos:acetato de etilo = 1:1) para dar el producto B7 (1,8 g, 59 %) en forma de un sólido de color blanco. LC-MS (ESI): 510 (M+1).
RMN 1H (300 MHz, CDCls) 88,11 (dd, J = 1,5 Hz, 8,7 Hz, 1H), 7,93 (dd, J = 1,2 Hz, 8,7 Hz, 1H), 7,58 (m, 2H), 6,52 (dd, J = 1,2 Hz, 9,9 Hz, 1H), 6,10 (d, J = 8,7 Hz, 1H), 4,85 (t, J = 10,2 Hz, 1H), 4,47 (d, J = 8,7 Hz, 1H), 4,16 (m, 2H), 2,94 (s, 3H), 1,82 (d, J = 1,2 Hz, 2H), 1,27 (m, 3H), 0,98 (s, 6H), 0,63 (d, J = 6,6 Hz, 3H), -0,12 (d, J = 6,6 Hz, 3H). Preparación del compuesto B8
A una solución de B7 (200 mg, 0,392 mmol, 1,0 equiv.) en DMF (2 ml) se le añadió carbonato potásico (217 mg, 1,57 mmol, 4,0 equiv.) y tiofenol (121 pl, 1,18 mmol, 3,0 equiv.) en nitrógeno a t.a. La mezcla de reacción se agitó a ta. durante 4h y la LC-Ms mostró que la reacción se había completado. La reacción se trató con agua y éter y ácido clorhídrico al 10 % (como se describe en la bibliografía) y se obtuvo B8 puro (100 mg, 82 %). LC-MS (ESI): 313 (M+1). RMN 1H (300 MHz, CDCla) 87,99 (s, 1H), 6,63 (dd, J = 1,2 Hz, 9,9 Hz, 1H), 5,15 (t, J = 9,9 Hz, 1H), 4,19 (m, 2H), 3,45 (s, 1H), 2,86-2,94 (m, 6H), 1,89 (m, 3H), 1,70 (s, o a, 2H), 1,28 (t, J = 5,7 Hz, 3H), -0,86-1,01 (m, 12H).
Esquema 2
Figure imgf000096_0001
Una mezcla de 3-bromobenzaldehído (25,0 g, 135 mmol, 1,0 equiv.), /V-acetil glicina (15,8 g, 135 mmol, 1,0 equiv.) y acetato sódico (10,6 g, 135 mmol, 1,0 equiv.) se suspendió en anhídrido acético (40 ml) y se calentó con agitación a reflujo en atmósfera de N2 durante 5 h. La solución resultante se solidificó al enfriar a temperatura ambiente y se inactivó con agua enfriada con hielo y se filtró. Los sólidos se lavaron dos veces más con agua, se secaron al aire durante 4 h, después se secó otra vez al vacío para dar el compuesto A1 (31 g, 86 %).
Preparación del compuesto A2
Oxazolona A1 (31 g, 117 mmol, 1,0 equiv.) en NaOH 1,0 N (175 ml, 175 mmol, 1,5 equiv.) se agitó a 85 °C hasta que se obtuvo una solución traslúcida de color rojizo. La reacción se enfrió a temperatura ambiente y se acidificó a pH 1,0 con HCl 5 N para precipitar un sólido de color pardo. Se añadió HCl concentrado (30 ml) al matraz y la solución de reacción se diluyó a aproximadamente 500 ml. El reflujo se mantuvo durante otras 5 h. Los sólidos se recogieron por filtración y se lavaron con agua dos veces y se secaron a alto vacío para proporcionar el material en bruto A2 (23 g, 81 %) que se usó sin más purificación.
Preparación del compuesto A3
Se disolvió ácido pirúvico A2 (23 g, 94,7 mmol, 1,0 equiv.) en THF (100 ml) y se enfrió a 0 °C. Se añadió lentamente yoduro de metilo (36 g, 256 mmol, 2,7 equiv.) seguido de NaOH 5 N (80 ml) y la reacción se sometió a reflujo durante una noche. Los volátiles se eliminaron y la solución acuosa residual se extrajo con acetato de etilo y se acidificó con HCl al 10 % a 0 °C a pH 1. La capa acuosa resultante se extrajo con acetato de etilo (2x). Los extractos orgánicos combinados se lavaron con salmuera, se secaron sobre sulfato sódico y se purificaron por cromatografía en columna (EtOAc/hexanos 1:1) para producir el compuesto puro A3 (11 g, 43 %).
Preparación del compuesto A4
Se añadió una solución 2 N de metilamina (14,4 ml, 28,8 mmol, 2,0 equiv.) a una solución del ácido ceto A3 (11 g, 40,6 mmol, 1,0 equiv.) en THF (100 ml) a temperatura ambiente y se agitó durante 4 h. Se añadió una solución 8 N de complejo de piridina-borano (5 ml, 40,6 mmol, 1,0 equiv.) y la mezcla se calentó a 55 °C durante 3 h. La reacción se interrumpió con metanol, se concentró y se diluyó con THF (50 ml) para formar un precipitado de color blanco. El sólido de color blanco precipitado se filtró y se secó al vacío para dar el compuesto A4 (5 g, 61 %).
Preparación del compuesto A5
A una solución del compuesto A4 (1,0 g, 3,5 mmol, 1,0 equiv.) y (Boc)2O (1,15 g, 5,24 mmol, 1,5 equiv.) en THF y agua (1:1,20 ml) se le añadió hidróxido sódico (280 mg, 6,99 mmol, 2,0 equiv.). La mezcla se calentó a 60 °C durante 5 h. La mezcla de reacción se enfrió y se concentró. La solución acuosa residual se acidificó con HCl al 10 % a 0 °C a pH 1 y se extrajo con acetato de etilo (3x). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato sódico y se purificaron con cromatografía en columna ultrarrápida para dar el compuesto A5 (420 mg, 31 %).
Preparación del compuesto A6
Al compuesto A5 (1,58 g, 4,07 mmol, 1 equiv.) en tolueno (15 ml) en un tubo cerrado herméticamente se le añadió hidróxido de amonio (2,7 ml, 40,7 mmol, 10 equiv.) y cobre en polvo (39 mg, 0,61 mmol, 0,15 equiv.). El tubo se calentó a 100 °C durante una noche y se concentró para dar un residuo, que se diluyó con NaHCO3 acuoso y n-butanol. La capa acuosa se extrajo con n-butanol. Las capas orgánicas se concentraron y se purificaron por columna de gel de sílice (DCM:MeOH:Et3N = 9:1:1) para dar el compuesto A6 (680 mg, 52 %).
Preparación del compuesto A7
A una solución del compuesto A6 (1,42 g, 3,36 mmol, 1 equiv.) en THF (10 ml) se le añadió Alloc-OSu (1,34 g, 6,72 mmol, 2 equiv.) y trietilamina (1,4 ml, 10,1 mmol, 3 equiv.). La mezcla se agitó a ta durante toda una noche. El disolvente se eliminó y el residuo se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida (DCM: MeOH = 9:1) para dar el compuesto A7 (1,01 g, 74 %).
Figure imgf000097_0001
Preparación del compuesto A8
A una solución del compuesto A7 (41 mg, 0,1 mmol, 1equiv.) en DCM seco (1,5 ml) se le añadió B8 (31 mg, 0,1 mmol, 1 equiv.) y PyBOP (57,2 mg, 0,11 mmol, 1,1 equiv.). La mezcla se enfrió a 0 °C y se añadió DIEA (49 pl, 0,3 mmol, 3 equiv.). La reacción se agitó a ta durante una noche y se diluyó con DCM y se lavó con agua. La porción acuosa se extrajo otra vez con DCM (2x). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron sobre sulfato sódico, se concentraron a sequedad para dar un producto en bruto. Se purificó por HPLC prep. para dar A8 (10 mg, 14 %) as una mezcla de dos diaestereoisómeros (60:40).
Esquema 4
Figure imgf000098_0001
Preparación del compuesto A9
A una solución del compuesto A8 (150 mg, 0,21 mmol, 1,0 equiv.) y Pd(PPh3)4 (12,4 mg, 0,011 mmol, 0,05 equiv.) en THF (10 ml) se le añadió hidruro de tri-n-butil-estaño (113 pl, 0,43 mmol, 2,0 equiv.). La mezcla se desgasificó y se volvió a llenar con nitrógeno (3x). La reacción se agitó a ta durante 6 h. El disolvente se eliminó y el producto en bruto se purificó por columna de gel de sílice (DCM:MeOH = 9:1) para dar A9 (78 mg, 60 %) en forma de una mezcla de dos isómeros.
Esquema 5
Figure imgf000098_0002
A una solución del compuesto A9 (28 mg, 0,046 mmol, 1 equiv.) en MeOH (1 ml) se le añadió LiOH (10 mg, 0,23 mmol, 5 equiv.) en agua (0,5 ml). La mezcla se agitó a ta durante toda una noche. El producto se purificó por HPLC prep. para dar A12 (23 mg, 85 %).
A una solución de A12 (11 mg, 0,0187 mmol, 1 equiv.) en DCM (1 ml) se le añadió TFA al 10 % en DCM (1 ml). La mezcla se agitó a ta durante 4 h. El disolvente se eliminó y el producto en bruto 1 se purificó por RP-HPLC preparativa dos veces para dar dos isómeros 1a (0,8 mg) y 1b (1 mg).
Ejemplo 1b
Síntesis del compuesto 101 (Dos diastereómeros)
Figure imgf000098_0003
Los enlazadores sintetizados a partir del compuesto de aril amina 1 dan lugar al compuesto escindible 101 que libera los nuevos compuestos parentales de anilina en forma de un par diastereomérico.
Figure imgf000099_0001
A una solución lavada con argón de A9 (27 mg, 0,04 mmol) en 1 ml de CH2CI2 se le añadió fosgeno al 15 % p/v en tolueno (0,6 ml, 0,06 mmol). La mezcla de reacción se calentó a 50 °C en un tubo cerrado herméticamente durante 4 h, se enfrió a temperatura ambiente y los volátiles eliminaron al vacío. Al residuo se le añadió una solución secada al vacío de Fmoc-valina-citrulina-alcoholo p-aminobencílico (26 mg, 0,04 mmol) en 1 ml de DMF. La mezcla de reacción se agitó a 45 °C en atmósfera de argón durante 6 h, después a temperatura ambiente durante 24 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purificó sobre gel de sílice (90:10 CH2Ch:MeOH de eluyente) para dar 10 mg (0,008 mmol) A10 en forma de un sólido de color blanco.
Preparación del compuesto A11
A una solución de A10 en CH2Ch (1 ml) se le añadió piperidina (0,1 ml) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío, al residuo se le añadió N-hidroxisuccinimidil éster de DBCO-succinilo (3,6 mg, 0,009 mmol), DMF (1 ml) y diisopropiletilamina (0,004 ml, 0,02 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 24 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purificó sobre gel de sílice (90:10 CH2Cl2:MeOH de eluyente) para dar 7 mg (0,005 mmol) A11.
Preparación del compuesto 101
El compuesto A11 (7 mg, 0,005 mmol) se disolvió en 3:1:1 de THF:MeOH:H2O (1 ml) y la solución se enfrió a 0 °C. Se añadió UOHH 2O sólido (1,7 mg, 0,4 mmol) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante una noche. Se añadieron algunos microlitros de ácido acético glacial, los volátiles se eliminaron al vacío y el ácido libre 101 se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa (RP-HPLC) usando una columna Ultro 120 (7 ^m), 150x20 mm ID sistema disolvente (agua-acetonitrilo (10 mm NH4OAc), modo de gradiente de ACN al 10 % a ACN al 100% en 50 min, 15 ml/min). LC-MS (ESI): 1282,6 (M+1), 1182,4 (M-Boc+1).
El ácido N-protegido de A11 (5 mg, 0,004) se disolvió en CH2Cl2 (1 ml) y la solución se enfrió a 0 °C. A esto se le añadió a solución 0,2 M de HCO2H en CH2Cl2 (0,039 ml) y la mezcla de reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente durante una noche. Después de que los volátiles se eliminaron al vacío, el aminoácido libre se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa (RP-HPLC) usando una columna Ultro 120 (7 ^m), 150x20 mm ID sistema disolvente (agua-acetonitrilo (10 mm NH4oAc), modo de gradiente de ACN al 10 % a ACN al 100 % en 50 min, 15 ml/min) para dar 3 mg (0,0025 mmol, 65 %) del compuesto 101 en forma de un sólido de color blanco. Ejemplo 1c
Síntesis quiral del compuesto A9a
Figure imgf000100_0001
Los enlazadores sintetizados a partir del compuesto de aril amina 1 dan lugar al compuesto escindible 101 que libera los nuevos compuestos parentales de anilina en forma de un par diastereomérico.
Esquema 7
Figure imgf000101_0001
Preparación del compuesto D12
Ácido 3,3-dimetilacrílico, (97 %, 15,8 g, 157,9 mmol), AICI3 (22 g, 164,9 mmol) y DCM (100 ml) se pusieron en un matraz de fondo redondo de una boca en atmósfera de argón. Se añadió bromobenceno (31 g, 197,4 mmol) produciendo un burbujeo vigoroso. Una vez finalizado el burbujeo, la mezcla de reacción se agitó en un baño de aceite a 65 °C durante 1 h y 30 min y durante una noche a ta en atmósfera de N2. La reacción se vertió en HCl:H2O (1:1) 200 ml lentamente, se añadió EtOAc (300 ml) y la fase orgánica se separó, los productos orgánicos se lavaron con salmuera, se secaron sobre Na2SO4, y se concentraron. Los datos de la RMN 1H de la mezcla en bruto mostraron una mezcla de regioisómeros m,p. El material en bruto se cristalizó en hexano para dar ácido 3-(3-bromofenil)-3-metilbutanoico puro (isómero meta) (14 g, 54,7 mmol, 42 %) en forma de cristales de color pardo.
RMN 1H (400 MHz, CDCh) 8 7,52-7,50 (m, 1H), 7,37-7,35 (m, 1H), 7,35-7,30 (m, 1H), 7,23-7,20 (m, 1H), 2,66 (s, 2H), 1,47 (s, 6 H).
P re p a ra c ió n de l co m p u e s to D13
Se disolvió el ácido 3-(3-bromofenil)-3-metilbutanoico (compuesto D12, 7,7 g, 29,94 mmol) en 170 ml de THF y se enfrió a -20 °C. Se añadieron trietilamina (8,3 ml, 59,89 mmol) y cloruro de trimetilacetilo (3,7 ml, 29,94 mmol) al matraz de reacción produciendo un precipitado de color blanco. La mezcla resultante se agitó a -20 °C durante 1 h en atmósfera de N2 , tras lo cual se añadieron LiCl (1,27 g, 29,94 mmol) y (4S)-(-)-4-isopropil-2oxazolidinona (3,87 g, 29,94 mmol) secuencialmente y la mezcla de reacción resultante se agitó a -20 °C durante 2 h y durante una noche a ta en atmósfera de N2. Se añadió agua y la mezcla de reacción se extrajo con EtOAc (2 x 100 ml). Los extractos orgánicos combinados se secaron sobre sulfato de magnesio y se concentraron al vacío. El producto se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida (gel de sílice, hexano:EtOAc, 4:1) proporcionando el compuesto D13 en forma de un aceite incoloro transparente con un 87 % de rendimiento (9,5 g, 25,79 mmol).
RMN 1H (400 MHz, CDCh) 87,52-7,50 (m, 1H), 7,36-7,31 (m, 2H), 7,21-7,18 (m, 1H), 4,25-4,21 (m, 1H, H-4), 4,17­ 4,09 (m, 2H), 3,42-3,31 (m, 2H, H-10), 2,22-2,10 (m, 1H), 1,50 (s, 3H), 1,49 (s, 3H), 0,86 (d, 3H, J = 6,80 Hz), 0,77 (d, 3H, J=6,80 Hz)
Preparación del compuesto D14
El compuesto de oxazolidinona D13 (8,4 g, 22,8 mmol) se disolvió en THF (100 ml) en atmósfera de argón y se enfrió a -78 °C. Se añadió bis(trimetilsilil)amida potásica (25,1 ml, 1 M en THF, 25,1 mmol) y la solución resultante se agitó a -78 °C durante 1 h y 20 min. Se añadió una solución de 2,4,6-triisopropilbencenosulfonil azida (9,2 g, 29,64 mmol) en THF (40 ml) a -78 °C mediante una cánula y después de 5 min, la mezcla de reacción se trató con ácido acético glacial (6,3 ml, 104,9 mmol), se calentó a 40 °C y se agitó durante otras 10 h a ta. Se añadieron salmuera (270 ml) y agua (35 ml) a la mezcla de color amarillo claro y la fase acuosa se extrajo con (2 x 500 ml) éter dietílico. Los extractos orgánicos combinados se lavaron con una solución saturada de hidrogenocarbonato sódico (2 x 110 ml), se secaron con sulfato de magnesio y se concentraron al vacío. El producto se purificó por cromatografía en columna (3:7 EtOAchexanos), proporcionando el compuesto de azida Dl4 en forma de un aceite incoloro (8,1 g, 19,84 mmol) con un rendimiento del 87 %.
RMN 1H (400 MHz, CDCla) 87,55-7,52 (m, 1H), 7,41-7,39 (m, 1H), 7,23-7,20 (m, 2H), 5,67 (s, 1H), 4,21-4,07 (m, 3H), 3,61 (t, 1H, J = 8,3 Hz), 2,37-2,25 (m, 1H, H-6), 1,56 (s, 3H), 1,54 (s, 3H), 0,89 (d, 3H, J = 6,8 Hz), 0,85 (d, 3H, J = 7,2 Hz).
Preparación del compuesto D15
Se disolvió SnCl2 (5,5 g, 29,32 mmol) en 1,4-dioxano:H2O (2:1) 75 ml y la solución trasparente incolora resultante se enfrió a 0 °C, a la cual se le añadió el compuesto D14 (4 g, 9,77 mmol) disuelto en 20 ml de dioxano y la mezcla de reacción se agitó a ta durante una noche. La reacción se enfrió de nuevo a 0 °C, se añadieron NaHCO3 (4,1 g, 48,86 mmol) y Boc2O (6,4 g, 29,31 mmol) secuencialmente y la reacción se agitó 1 día ay a ta en atmósfera de N2. El disolvente se eliminó a presión reducida, se extrajo con EtOAc (2 x 300 ml) y la capa orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre Na2SO4, se concentró y se purificó por cromatografía en columna (3:7 EtOAc-hexanos), proporcionando el compuesto D15 en forma de un aceite incoloro (4,1 g, 8,48 mmol) en 87,2 % de rendimiento. r MN 1H (400 MHz, CDCh) 87,45 (s a, 1H), 7,35-7,31 (m, 1H), 7,32-729 (m, 1H), 6,17 (d, 1H, J = 9,6 Hz), 5,15 (s a, 1H, NH), 3,89-3,80 (m, 2H), 3,52 (t, 1H, J = 8,3 Hz), 2,33-2,21 (m, 1H), 1,41 (s, 3H), 1,39 (s, 9H), 1,38 (s, 3H), 0,80 (d, 3H, J = 7,2 Hz), 0,78 (d, 3H, J = 6,8 Hz)
Preparación del compuesto D16
El compuesto de oxazolidinona D15 (4,1 g, 8,48 mmol) se disolvió en una mezcla 4:1 de THF:H2O (50 ml). La solución se enfrió a 0 °C. Después se añadieron peróxido de hidrógeno (2,7 ml, 30 % acuoso, 25,44 mmol) e hidróxido de litio (610 mg, 25,44 mmol) a la solución de oxazolidinona y se agitó a temperatura ambiente durante una noche. El exceso de peróxido se inactivó por la adición lenta de hidrógeno sulfito sódico y la agitación continuó durante 1 h. La mezcla se diluyó con EtOAc (50 ml) y H2O (100 ml), la fase acuosa se separó y se acidificó con HCl 1,0 M a 0 °C y se extrajo con acetato de etilo (2 x 200 ml). La capa orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se concentró al vacío para dar un aceite incoloro transparente (2,9 g, 7,83 mmol, 95 %) suficientemente puro para usar en la etapa siguiente sin más purificación. RMN 1H (400 MHz, CDCh) 87,32-7,31 (m, 1H), 7,17-7,10 (m, 2h ), 7,00­ 6,97 (m, 1H), 4,83 (d, 1H, J = 8,8 Hz), 4,41 (d, 1H, J = 8,8 Hz), 1,45 (s, 6H), 1,38 (s, 9H).
Preparación del compuesto A5a
En atmósfera de argón, hidruro sódico (60 %, 830 mg, 22,64 mmol), una cantidad catalítica de yoduro de tetrabutilamonio, seguido de yoduro de metilo (2,0 ml, 32 mmol) se añadieron a una solución con agitación vigorosa del compuesto ácido D16 (1,2 g, 3,23 mmol) en 50 ml de THF seco. La suspensión resultante se agitó 1 día a temperatura ambiente. El exceso de hidruro sódico se inactivó mediante la adición cuidadosa de agua enfriada con hielo y la mezcla se acidificó mediante la adición gota a gota de HCl 1,0 M a pH 3 a 0 °C. La mezcla ácida se extrajo con acetato de etilo (3 x 100 ml), la capa orgánica combinada se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato de magnesio y se concentró al vacío. La purificación del compuesto ácido A5a se realizó por cromatografía en columna sobre gel de sílice (1:2 EtOAc-hexanos con ácido acético al 1 %) dio como resultado un rendimiento del 77 % (0,74 g, 1,93 mmol, 60 %) de un aceite incoloro transparente en forma de una mezcla de rotámeros. RMN 1H (400 MHz, CDCl3) 57,50­ 7,49 (m, 1H), 7,37-7,27 (m, 2H), 7,13-7,07 (m, 1H), 5,15 (s, 0,65H, H-2), 4,95 (s, 0.35H, H-2), 2,51 (s, 1H, H-6), 2,27 (s, 2H, H-6), 1,57 (s, 3H), 1,53-1,38 (m, 12H).
Preparación del compuesto A6a
Al compuesto A5a (600 mg, 1,56 mmol, 1 equiv.) en tolueno (10 ml) en un tubo cerrado herméticamente se le añadió hidróxido de amonio (3 ml, 15,6 mmol, 10 equiv.) y cobre el polvo (20 mg, 0,23 mmol, 0,15 equiv.). El tubo se calentó a 100 °C durante una noche y se enfrió a ta, el tapón del tubo cerrado herméticamente se quitó cuidadosamente, se concentró para dar un residuo, que se diluyó con NaHCO3 acuoso y n-butanol. La capa acuosa se extrajo con nbutanol. Las capas orgánicas se concentraron y se purificaron por columna de gel de sílice (DCM:MeOH:Et3N = 9:1:1) para dar el compuesto A6a (300 mg, 0,930 mmol, 60 %). LC-MS (ESI): 323,4 (M+1), 223,5 (M-Boc+1).
Preparación del compuesto A7A
A una solución del compuesto A6a (300 mg, 0,930 mmol, 1 equiv.) en THF (7 ml) se le añadió Alloc-OSu (199,1 mg, 1,86 mmol, 2 equiv.) y trietilamina (0,51 ml, 3,72 mmol, 4 equiv.). La mezcla se agitó durante una noche a temperatura ambiente en atmósfera de N2. El disolvente se eliminó y el residuo se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida (DCM:MeOH = 9:1) para dar el compuesto A7A (284 mg, 0,70 mmol, 75 %). LC-MS (ESI): 407,4 (M+1), 307,6 (M-Boc+1).
Preparación del compuesto A8A
A una solución del compuesto A7A (220 mg, 0,54 mmol, 1equiv.) en DCM seco (5 ml) se le añadió B8 (202 mg, 0,65 mmol, 1,2 equiv.). La mezcla se enfrió a 0 °C y se añadieron DlEA (49 pl, 0,3 mmol, 3 equiv.) y PyBop (338 mg, 0,65 mmol, 1,2 equiv.) secuencialmente. La reacción se agitó a ta durante una noche en atmósfera de N2 y se diluyó con DCM y se lavó con agua. La capa acuosa se extrajo otra vez con DCM (2 x 50 ml). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron sobre sulfato sódico y se concentraron a sequedad para dar un producto en bruto. Este producto en bruto se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida (EtOAc:hexano = 1:1) para dar el compuesto A8A (200 mg, 0,28 mmol, 53 %). LC-MS (ESI): 701,4 (M+1), 601,6 (M-Boc+1).
Preparación del compuesto A9a
A una solución del compuesto A8A (170 mg, 0,24 mmol, 1,0 equiv.) y Pd(PPh3)4 (28 mg, 0,024 mmol, 0,1 equiv.) en DCM (10 ml) se le añadió hidruro de tri-n-butil-estaño (78 pl, 0,29 mmol, 1,2 equiv.). La mezcla de reacción se desgasificó y se volvió a llenar con nitrógeno. La reacción se agitó durante 3-4 h a ta en atmósfera de N2. El disolvente se eliminó y el producto en bruto se purificó por columna de gel de sílice (EtOAc:hexano = 1:1) para dar A9a (130 mg, 87 %) en forma de un aceite transparente. RMN 1H (400 MHz, CDCl3) 57,11-7,07 (m, 1H), 6,97-6,70 (m, 2H), 6,61­ 6,48 (m, 2H), 6,03-5,97 (m, 1H), 5,12-4,89 (m, 1H), 4,63-4,49 (m, 1H), 4,21-4,01 (m, 2H), 2,93 (s, 3H), 2,83 (m, 3H), 1,83-1,81 (s a, 4H), 1,42 (s, 12H), 1,27-1,17 (m, 6H), 0,87-0,81 (m, 6H), 0,78-0,63 (m, 6H), 0,63 (s, 6H). LC-MS (ESI): 617,6 (M+1).
Ejemplo 1d
Síntesis quiral del compuesto 101a (Diastereómero individual)
Figure imgf000103_0001
El compuesto 101a se produce a partir del compuesto A9a de acuerdo con el esquema 8.
Esquema 8
Figure imgf000104_0001
Preparación del compuesto A10a
A una solución lavada con argón de A9a (27 mg, 0,04 mmol) en 1 ml de CH2Cl2 se le añade 15 % p/v de fosgeno en tolueno (0,6 ml, 0,06 mmol). La mezcla de reacción se calienta a 50 °C en un tubo cerrado herméticamente durante 4 h, se enfría a temperatura ambiente y los volátiles se eliminan al vacío. Al residuo se le añade una solución secada al vacío de Fmoc-valina-citrulina-alcohol p-aminobencílico (26 mg, 0,04 mmol) en 1 ml de DMF. La mezcla de reacción se agita a 45 °C en atmósfera de argón durante 6 h, después a temperatura ambiente durante 24 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purifica sobre gel de sílice (90:10 CH2Cl2:MeOH de eluyente) para dar A10a.
Preparación del compuesto A11a
A una solución de A10a en CH2Cl2 (1 ml) se le añade piperidina (0,1 ml) y la mezcla de reacción se agita a temperatura ambiente durante 1 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío, al residuo se le añade N-hidroxisuccinimidil éster de DBCO-succinilo (3,6 mg, 0,009 mmol), DMF (1 ml) y diisopropiletilamina (0,004 ml, 0,02 mmol). La mezcla de reacción se agita a temperatura ambiente durante 24 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purifica sobre gel de sílice (90:10 CH2Cl2:MeOH de eluyente) para dar A11a.
P rep a ra c ión de l co m p u e s to 101a
El compuesto A11a (7 mg, 0,005 mmol) se disuelve en 3:1:1 de THF:MeOH:H2O (1 ml) y la solución se enfría a 0 °C. Se añade LiOHH2O sólido (1,7 mg, 0,4 mmol) y la mezcla de reacción se agita a temperatura ambiente durante una noche. Se añaden algunos microlitros de ácido acético glacial, los volátiles se eliminan al vacío y el ácido libre 101a se purifica por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa (RP-HPLC) usando una columna Ultro 120 (7 ^m), 150x20 mm ID sistema de disolvente (agua-acetonitrilo (10 mm n H4OAc), modo de gradiente de ACN al 10 % a Ac N al 100 % en 50 min, 15 ml/min).
El ácido N-protegido de A11a (5 mg, 0,004) se disuelve en CH2Cl2 (1 ml) y la solución se enfría a 0 °C. A esto se le añade una solución 0,2 M de HCO2 H en CH2Ch (0,039 ml) y la mezcla de reacción se deja en agitación a temperatura ambiente durante una noche. Después de eliminar los volátiles al vacío, el aminoácido libre se purifica cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa (RP-HPLC) usando una columna Ultro 120 (7 ^m), 150x20 mm ID sistema disolvente (agua-acetonitrilo (10 mm NH4OAc), modo de gradiente de ACN al 10 % a ACN al 100 % en 50 min, 15 ml/min) para dar el compuesto 101a.
Ejemplo 1e
Síntesis del Compuesto (110a)
Figure imgf000105_0001
El compuesto (110a) se prepara de acuerdo con el esquema 9.
Preparación del compuesto A14: El compuesto A14 se preparó a partir del compuesto A13 (usando procedimientos similares a los descritos para el compuesto A8a) mediante el método descrito para el compuesto A9a. Rendimiento: 379 mg (45 %) en forma de una espuma de color blanco. MS (ESI) m/z 603 (M+H)+; RMN 1H (400 MHz, CDCh) 8: 6,96-7,12 (m, 1H), 6,91 (d a, J = 7,5 Hz, 1H), 6,83 (s a, 1H), 6,66-6,80 (m, 1H), 6,51-6,65 (m, 1H), 6,41-6,50 (m, 1H), 5,95 (d a, J = 8,8 Hz, 1H), 5,33 (s, 1H), 4,94-5,11 (m, 1H), 4,92 (s a, 1H), 4,58 (d a, J = 9,5 Hz, 1H), 4,48 (d a, J = 8,5 Hz, 1H), 3,72 (s a, 1H), 3,67 (s a, 3H), 2,73-2,96 (m, 7H), 1,75-1,98 (m, 5H), 1,72 (s a, 1H), 1,49 (s a, 2H), 1,18­ 1,45 (m, 15H), 0,60-0,86 (m, 17H); RMN 13C (400 MHz, CDCh) 8: 171,2, 169,9, 168,2, 168,1, 157,1, 148,8, 146,9, 139.2, 139,0, 132,5, 132,2, 129,7, 116,6, 113,4, 79,8, 65,4, 55,9, 55,2, 52,0, 42,5, 42,5, 34,7, 34,3, 33,9, 31,0, 31,0, 30.2, 30,1, 28,3, 28,3, 26,5, 26,3, 26,2, 19,5, 19,4, 18,8, 18,5, 13,9, 13,8.
Preparación del compuesto A15: A una solución lavada con argón, enfriada con hielo, de A14 (63 mg, 0,1 mmol) en CH2Cl2 (0,8 ml) se le añadió ácido trifluoroacético (0,2 ml, 2,6 mmol). El baño de hielo se retiró y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Los volátiles se eliminaron al vacío para dar A15 en forma de un cristal de color amarillo claro que se usó directamente en la reacción siguiente. MS (ESI) m/z 503 (M+H)+; RMN 1H (400 MHz, CDCla) 8 10,36 (a, 3H), 7,19-8,14 (m, 4H), 6,57 (d a, J = 7,5 Hz, 1H), 5,02-4,45 (m, 3H), 3,68 (s, 3H), 2,97 (s, 3H), 2,38-2,48 (m, 3H), 1,74-1,80 s (m, 3H), 1,18-1,38 (m, 6H), 0,80-0,95 (m, 17H); RMN 13C (400 MHz, CDCh) 8: 170,9, 168,2, 161,5, 145,3, 139,2, 138,0, 131,5, 126,8, 122,3, 117,2, 86,9, 52,1, 40,9, 40,5, 35,3, 34,4, 33,6, 31,4, 29,7, 28,2, 28,3, 27,5, 26,5, 26,4, 26,3, 26,2,19,1, 187, 18,4, 13,8.
Preparación del compuesto A16: El compuesto A16 se preparó a partir del compuesto A15 por el método general descrito para el compuesto A10. Rendimiento: 52 mg (50 %) en forma de una espuma de color blanco. MS (ESI) m/z 1044 (M+H)+; RMN 1H (400 MHz, CDCh) d 9,10 (a, 1H), 7,84 (d a, J = 7,8 Hz, 1H), 7,62 (d, J = 7,6 Hz, 2H), 7,42-7,31 (m, 7H), 7,11-7,23 (m, 7H), 6,94-6,98 (m, 1H), 6,56 (d, J = 8,0 Hz, 1H), 5,94-5,96 (m, 1H), 4,85-5,1 (m, 3H), 4,61-4,80 (m, 2H), 4,15 (t, J = 7,3 Hz, 1H), 4,25 (t, J = 7,0 Hz, 1H), 4,15 (t, J = 7,1 Hz, 1H), 4,05 (t, J = 7,0 Hz, 1H), 3,67 (s, 3H), 3,60 (d J = 3,6 Hz, 1H), 2,89-3,05 (m, 5H),1,80=2,09 (m, 10H), 1,28-1,36 (m, 10H), 0,66-0,99 (m, 17H); RMN 13C (400 MHz, CDCls) 8: 172,4, 172,0, 171,5, 170,9, 168,2, 156,7, 153,9,147,9,143,7, 143,6, 141,3,138,9, 132,3, 129,2, 127,7, 127,0, 125,0, 120,67,1, 66,0, 54,7, 52,0, 49,6, 47,1, 41,2, 35,6, 35,1, 31,1, 31,0, 29,8, 29,2, 26,7, 21,7, 19,5, 19,3, 19,2, 19,0, 18,9, 18,1, 18,0, 13,8.
Preparación del compuesto A17: A una solución lavada con argón de A16 (52 mg, 0,05 mmol) en DMF (0,4 ml) se le añadió N,N-dietilamina (0,2 ml, 5 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente 2 h. Los volátiles se eliminaron al vacío y el residuo se purificó sobre gel de sílice (Biotage Isolera) usando un gradiente de 2-100 % de metanol en cloroformo para producir 23 mg de amina libre en forma de un sólido de color blanco. Esta se purificó otra vez con RP-HPLC (x mm C185 p usando a gradiente lineal del 10 al 90 % de B en A durante 20 minutos (A = NH4OAc 10 mM en agua; B = NH4OAc en 10 mM C ^C N ) y se detectó a 254 y 280 nM para dar A17 Rendimiento 9,5 mg, 24 %). MS (ESI) m/z 822 (M+H)+; RMN 1H (400 MHz, CDCta) 8 9,11 (s, 1H), 7,73 (a, 1H), 7,81 (d, J = 9,5 Hz, 1H), 7,48 (d, J=9,0 Hz, 2H), 7,01-7,3 (m, 4H), 6,57 (dd, J = 1,4, 9,5 Hz, 1H), 5,07 (s, 2H), 5,04 (d, J = 1,1 Hz, 1H), 4,72 (d, J = 9,8 Hz, 1H), 4,6 (t, J = 7,0 Hz, 1H), 3,6 (s, 3H), 3,63 (s, 1H), 3,24 (a, 1H), 3,05 (s, 1H), 3,01, (d J = 6,3 Hz, 1H), 2,95 (s, 3H), 2,08 (a, 2H), 2,01 (s, 3H), 1,98 (s, 3H), 1,80-1,84 (m, 1H), 1,40 (d, J = 6,2 Hz, 4H), 1,31 (s, 6H), 0,92-0,93 (m, 13H), 0,79 (d, J = 6,6 Hz, 8H), 0,71 (d, J = 6,6 Hz, 4H)
Preparación de (110a): En atmósfera de argón, el compuesto A17 (9,8 mg, 0,012 mmol) se agitó con N-hidroxisuccinimidil éster de dibenzociclooctiniladipoílo (Broadpharm 22447, 7,7 mg, 0,018 mmol) en DMF (0,150 ml). A esto se le añadió N,N-diisopropiletilamina (.006 ml, 0,036 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 3 h. Los volátiles se eliminaron al vacío y el residuo se purificó parcialmente sobre gel de sílice usando un gradiente del 2 al 10 % de metanol en cloroformo. Las fracciones que contenían el producto se concentraron al vacío hasta un residuo MS m/z 1137,4. Este residuo (10,6 mg, 0,009 mmol), en atmósfera de argón, se disolvió en 3:1:1 de THF:metanol:agua (0,5 ml), se enfrió en un baño de hielo y se trató con LOH.H2O (2,6 mg, 0,063 mmol). La mezcla de reacción se dejó equilibrar a temperatura ambiente durante una noche. Los volátiles se eliminaron al vacío y el residuo se purificó por RP-HPLC como antes para producir, después de liofilización, (110a), 2,1 mg, 0,002 mmol, en forma de un sólido de color blanco floculante. MS (ESI) m/z 1123 (M+H)+; RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8: 10,02 (d a, J = 3,8 Hz, 1H), 9,67 (s a, 1H), 8,25 (d a, J = 6,8 Hz, 1H), 7,88 (d a, J = 8,8 Hz, 1H), 7,79 (d a, J = 8,3 Hz, 1H), 7,54­ 7,70 (m, 4H), 7,29-7,54 (m, 9H), 7,06-7,27 (m, 3H), 6,40-6,50 (m, 1H), 5,10 (s, 2H), 5,05 (d a, J = 14,1 Hz, 1H), 4,91 (t a, J = 10,2 Hz, 1H), 4,77 (d a, J = 9,5 Hz, 1H), 4,25-4,49 (m, 2H), 4,06-4,24 (m, 2H), 3,60-2,99 (m, amplia envoltura de agua), 2,99 (m, 3H), 2,69-2,82 (m, 3H), 2,56-2,49 (m, envoltura de DMSO), 2,42 (s a, 1H), 2,12-2,29 (m, 3H), 1,90­ 2,11 (m, 6H), 1,73-1,90 (m, 6H), 1,15-0,76 (m, 18H), 0,72 (d a, J = 6,3 Hz, 6H).
S ín tes is de l C o m p u e s to (111a )
Figure imgf000107_0001
El compuesto (111a) se preparó de acuerdo con el esquema 10.
Figure imgf000107_0002
Preparación del compuesto A19: (S,E)-4-((R)-2-((S)-3-(3-aminofenil)-3-metil-2-(metilamino)butanamido)-N,3,3-trimetilbutanamido)-2,5-dimetilhex-2-enoato de etilo
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se cargó con el compuesto A18 (200 mg, 0,32 mmol, 1,0 equiv.) CH2Cl2 seco (3 ml) y la solución transparente se enfrió a 0 °C con un baño de hielo, a esto se le añadió 1 ml de ácido trifluoroacético. La mezcla de reacción se dejó en agitación 4 h a temperatura ambiente. Después de lo cual la LC-MS mostró la finalización de la reacción. El disolvente se eliminó a presión reducida y el material en bruto se liofilizó durante 16 h para dar el compuesto A19 (167 mg, 100 %) en forma de un sólido de color blanquecino.LC-MS (ESI): 517,5 (M+1).
Preparación del compuesto A20: (S,E)-4-((S)-2-((R)-3-(3-((S)-2-((S)-2-((((9H-fluoren-9-il)metoxi)carbonil)amino)-3-metilbutanamido)propanamido)fenil)-3-metil-2-(metilamino)butanamido)-N,3,3-trimetilbutanamido)-2,5-dimetilhex-2-enoato de etilo
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se carga con el compuesto A19 (70 mg, 0,135 mmol, 1 equiv.), Fmoc- valina-alanina-OH (67 mg, 0,162 mmol, 1,2 equiv.) y 1 ml de N,N-dimetilformamida anhidra. La solución transparente resultante se enfrió a 0 °C con un baño de hielo, N,N-diisopropiletilamina (72 pl, 0,405 mmol, 3 equiv.), 3-óxido de hexafluorofosfato de 1-[bis(dimetilamino)metilen]-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]piridinio (HATU) (62 mg, 0,162 mmol, 1,2 equiv.) se añadieron secuencialmente a la reacción. La mezcla de reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente durante una noche en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción. La reacción se interrumpió mediante la adición de NH4Cl saturado (10 ml) y después se extrajo con CH2Cl2 (2 x 100 ml). La capa orgánica se lavó con salmuera saturada (50 ml), se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtró y después se concentró a sequedad a presión reducida. El producto en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID. Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto A20 (86 mg, 0,095 mmol, 70 %) en forma de un sólido de color blanco. LC-Ms (ESI): 909,5 (M+1).
Preparación del compuesto A21:
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se cargó con el compuesto A20 (80 mg, 0,088 mmol), CH2Cl2 seco (2 ml), a esta solución transparente se le añadió piperidina (0,5 ml) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 h en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción, todos los volátiles se eliminaron a presión reducida. La amina libre en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución preparativa de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID. Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contenía NH4OAc 10 mm; Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar la amina libre A20a (51 mg, 0,074 mmol, 85 %) en forma de un sólido de color blanco. LC-MS (ESI): 688 (M+1).
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra magnética de agitación recubierta de teflón se cargó con la amina libre A20a (51 mg, 0,074 mmol). N-hidroxisuccinimidil éster de DBCO adipinilo (41 mg, 0,096 mmol), N,N-dimetilformamida anhidra (0,5 ml) y N,N-diisopropiletilamina (40 pl, 0,22 mmol) se añadieron secuencialmente. La mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y se agitó a temperatura ambiente durante 3 horas en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción. Después de eliminar todos los volátiles al vacío, el residuo se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una coluna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mm ID Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto A21a (52 mg, 0,052 mmol, 70 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 1003,8 (M+1).
Preparación del compuesto (111a):
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta con teflón se carga con el compuesto A21 (50 mg, 0,05 mmoles, 1 equiv.), THF:MeOH:H2O (3:1:1) (1 ml). La solución transparente se enfrió a 0 °C con un baño de hielo. Se añadió LiOHH2O (16 mg, 0,349 mmol, 7 equiv.) y la reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente en atmósfera de N2 durante 7 h, tras lo cual la LC-MS mostró la finalización de la reacción, los volátiles se eliminaron al vacío y el material en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID, Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de elución en gradiente del 10% de disolvente B al 90% de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto (111a) (34 mg, 0,034 mmol, 70 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 974,5 (M+1). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 59,78-9,63 (d a, 1H), 8,34-8,10 (m, 1H), 7,82-7,68 (2H), 7,58-7,35 (m, 8H), 7,34-7,18 (m, 4H), 7,16-7,08 (m, 4H), 6,53-6,52 (m, 1H) 4,98-4,93 (m, 1H), 4,85 (m, 1H), 4,71 (d a, 1H), 4,36-4,26 (m, 1.5H), 4,09-4,04 (m, 1H), 3,67-3,47 (m, 2H), 3,12 (d a, 1H), 2,91-2,87 (m, 3H), 2,13-2,02 (m, 2H), 1,96-1,78 (m, 9H), 1,74-1,61 (m, 5H), 1,31-1,03 (m, 16H), 0,90-0,67 (m, 15H).
Ejemplo 1g
Síntesis del Compuesto (109 a)
Figure imgf000108_0001
El compuesto (109a) se preparó de acuerdo con los esquemas 11a y 11b.
Esquema 11a
Figure imgf000109_0001
Preparación de A22: A22 se preparó por una adaptación directa de los métodos de la bibliografía. (Véase, por ejemplo, Florent et al 1998, J Med Chem 41,3572; y Jeffrey et al 2006, Biocong Chem 17, 831). LC-MS: TR 9,21 min. m/z 763 (M+H)+.
Es uema 11b
Figure imgf000109_0002
Preparación del compuesto A23: Triacetato de (2S,3R,5S,6S)-2-(2-(3-((((9H-fluoren-9-il)metoxi)carbonil)amino)propanamido)-4-((((3-((R)-4-(((S)-1-(((S,E)-6-etoxi-2,5-dimetil-6-oxohex-4-en-3-il)(metil)amino)-3,3-dimetil-1-oxobutan-2-il)amino)-2-metil-3-(metilamino)-4-oxobutan-2-il)fenil)carbamoil)oxi)metil)-6-metilfenoxi)-6-(metoxicarbonil)tetrahidro-2H-piran-3,4,5-triilo
Un recipiente a presión de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se carga con el compuesto A19 (25 mg, 0,048 mmol, 1 equiv.) y 1 ml de CH2Ch anhidro, a esto se le añadió el 15 % p/v de fosgeno en tolueno (0,7 ml) a ta. La mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y esto se agitó en un recipiente cerrado herméticamente durante 17h a ta, después se concentró a presión reducida para eliminar los volátiles y se secó a alto vacío durante al menos 2 horas. A este residuo se le añadió el compuesto A22 (44 mg, 0,058 mmol, 1,2 equiv.,). Esta mezcla se disolvió en 1 ml de N,N-dimetilformamida anhidra. La mezcla de reacción se agitó a 45 °C durante 2 h, después a temperatura ambiente durante 12 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 ^m) C18Q, 150x20 mmlD, Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de elución en gradiente del 10% de disolvente B al 90% de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto A23 (25 mg, 0,019 mmol, 70 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 1305,8 (M+1).
Preparación del compuesto (109a):
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se cargó con el compuesto A23 (23 mg, 0,018 mmol), CH2Cl2 seco (0,5 ml), a esta solución transparente se le añadió piperidina (0,2 ml) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 h en atmósfera de N2 , todos los volátiles se eliminaron a presión reducida. El producto en bruto se disolvió en THF:MeOH:H2O (3:1:1) (1 ml). La solución transparente se enfrió a 0 °C con un baño de hielo. Se añadió U OHH 2O sólido (8 mg, 0,176 mmol, 10 equiv.) y la reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente en atmósfera de N2 durante 7 h, tras lo cual la LC-MS mostró la finalización de la reacción, los volátiles se eliminaron al vacío y el material en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 ^m) C18Q, 150x20 mmID, Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de elución en gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto A23a (8 mg, 0,009 mmol, 50 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 915,7 (M+H), 897,7 (M-H2O+H) Un matraz de fondo redondo de una boca, de 10 ml, secado al horno, equipado con una barra magnética de agitación recubierta de teflón se cargó con la amina libre A23a (8 mg, 0,009 mmol). N-hidroxisuccinimidil éster de DBCO adipinilo (5 mg, 0,011 mmol), N,N-dimetilformamida anhidra (0,3 ml) y W,A/-diisopropiletilamina (10 pl, 0,033 mmol) se añadieron secuencialmente. La mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y se agitó a temperatura ambiente durante 3 horas en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción. Después de eliminar todos los volátiles al vacío, el residuo se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto (109a) (5 mg, 0,004 mmol, 50 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 1230,8 (M+H), 1212,8 (M-H2O+H). RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 89,61-9,55 (m, 2H), 7,85 (s a, 2H), 7,80 (d a, 1H), 7,61-6,97 (m, 15H), 6,64-6,50 (m, 2H), 6,02 (s a, 1H), 5,48 (s a, 1H), 5,17-4,89 (m, 6H), 4,85-4,76 (t a, 1H), 4,71-4,62 (m, 1H), 4,01 (s a, 1H), 3,69-3,66 (m, 3H), 3,10 (s a, 2H), 2,89 (s a, 3H), 2,29-2,26 (m, 19H), 2,13-2,00 (m, H), 1,96-1,56 (m, 18H), 1,80-1,02 (m, 14H), 0,89 (s a, 10H), 0,70 (d, 3H), 0,66 (d, 3H).
Ejemplo 1h
Síntesis del Compuesto (111a)
El compuesto (111a) se preparó de acuerdo con los esquemas 12 y 13.
Esquema 12
Figure imgf000110_0001
Preparación del compuesto A8a: (6S,9S,12S,E)-6-(2-(3-(((aMloxi)carboml)ammo)feml)propan-2-M)-9-(íert-butM)-12-isopropil-2,2,5,11,14-pentametil-4,7,10-trioxo-3-oxa-5,8,11-triazapentadec-13-en-15-oato de etilo
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 100 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se carga con el compuesto A7a (1,1 g, 2,70 mmoles, 1 equiv, preparado internamente), CH2Ch seco (10 ml) y el compuesto B8 (1,00 g, 3,24 mmoles, 1,2 equiv., preparado internamente) en CH2Ch seco (10 ml). La solución transparente resultante se enfrió a 0 °C con un baño de hielo, W,W-diisopropiletilamina (1,5 ml, 8,1 mmoles, 3 equiv.) y hexafluorofosfato de (benzotriazol-1-iloxi)tripirrolidinofosfonio (PyBOp, 1,7 g, 3,24 mmol, 1,2 equiv.,) se añadieron secuencialmente a la solución enfriada. La mezcla de reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente durante una noche en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción. La reacción se interrumpió mediante la adición gota a gota de NH4Cl saturado (10 ml) y después se extrajo con CH2Ch (2 x 200 ml). La capa orgánica se lavó con salmuera saturada (50 ml), se secó sobre Na2SO4 anhidro, se filtró y después se concentró a sequedad a presión reducida. El producto en bruto se purificó por cromatografía ultrarrápida en columna de sílice sobre un sistema Teledyne ISCO (columna ultrarrápida de sílice de 40 g, gradiente: hexano al 30 % de EtOAc/hexano) para dar el compuesto A8a (1,2 g, 1,71 mmol, 63 %) en forma de un aceite viscoso incoloro que lentamente solidifica hasta dar un sólido de color blanquecino después de reposar. LC-MS (ESI): 701,5 (M+1).
Preparación del compuesto A9a: (6R,9S,12S,E)-6-(2-(3-aminofenil)propan-2-il)-9-(terc-butil)-12-isopropil-2,2,5,11,14-pentametil-4,7,10-trioxo-3-oxa-5,8,11-triazapentadec-13-en-15-oato de etilo
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 100 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se carga con el compuesto A8a (1,2 g, 1,71 mmoles, 1,0 equiv, preparado internamente), CH2Ch seco (10 ml). A esta solución transparente, se le añadió secuencialmente tetraquis(trifenilfosfina)paladio (0) (0,98 g, 0,856 mmoles, 0,5 equiv.) e hidruro de tri-n-butil-estaño (0,55 ml, 2,05 mmoles, 1,2 equiv.) a temperatura ambiente en atmósfera de N2. Después de que se completara la adición, la mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y después se agitó a temperatura ambiente en atmósfera de N2. LC-MS y TLC (1:1 de EtOAc/hexano) mostraron que la reacción había finalizado en 4 horas. El disolvente se eliminó a presión reducida y el material en bruto resultante se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida en un sistema Teledyne ISCO (columna ultrarrápida de sílice de 40 g, gradiente: hexano al 50 % de EtOAc/hexano) para dar el compuesto A9a (0,95 g, 1,54 mmoles, rendimiento: 90 %) en forma de una un sólido espumoso de color blanquecino. LC-MS (ESI): 617,3 (M+1).
Figure imgf000111_0001
Preparación del compuesto A19: (S,E)-4-((R)-2-((S)-3-(3-aminofenil)-3-metil-2-(metilamino)butanamido)-N,3,3-trimetilbutanamido)-2,5-dimetilhex-2-enoato de etilo
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se cargó con el compuesto A9a (200 mg, 0,32 mmol, 1,0 equiv.) CH2Ch seco (3 ml) y la solución transparente se enfrió a 0 °C con un baño de hielo, a esto se le añadió 1 ml de ácido trifluoroacético. La mezcla de reacción se dejó en agitación 4 h a temperatura ambiente. Después de lo cual la LC-MS mostró la finalización de la reacción. El disolvente se eliminó a presión reducida y el material en bruto se liofilizó durante 16 h para dar el compuesto A19 (167 mg, 100 %) en forma de un sólido de color blanquecino. LC-MS (ESI): 517,5 (M+1).
Preparación del compuesto A18: (S,E)-4-((S)-2-((R)-3-(3-((((4-((S)-2-((S)-2-((((9H-fluoren-9-il)metoxi)carbonil)amino)-3-metilbutanamido)-5-ureidopentanamido)bencil)oxi)carbonil)amino)fenil)-3-metil-2-(metilamino)butanamido)-N,3,3-trimetilbutanamido)-2,5-dimetilhex-2-enoato de etilo
Un recipiente a presión de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se carga con el compuesto A19 (167 mg, 0,323 mmol, 1 equiv.) (**Nota: el compuesto A19 se secó con una bomba de liofilización durante 15 h antes de usar) y 4 ml de C ^ C h anhidro, a esto se le añadió 15 % p/v de fosgeno en tolueno (5 ml) a ta. La mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y esto se agitó en un recipiente cerrado herméticamente durante 17h a ta, después se concentró a presión reducida para eliminar los volátiles y se secó a alto vacío durante al menos 2 horas. A este residuo se le añadió Fmoc valina-citrulina-alcohol p-aminobencílico (253 mg, 0,42 mmol, 1,3 equiv.). Esta mezcla se disolvió en 3 ml de N,N-dimetilformamida anhidra. La mezcla de reacción se agitó a 45 °C durante 2 h, después a temperatura ambiente durante 12 h. Después de eliminar todos los volátiles al vacío el residuo se purificó por cromatografía en columna ultrarrápida en una columna Teledyne ISCO (columna ultrarrápida de sílice de 24 g, gradiente: CH2Ch al 12 % de MeoH/CH2Ch) para dar el compuesto A18 (247 mg, 0,215 mmol, 67 %) en forma de un sólido de color blanquecino. LC-MS (ESI): 1144,7 (M+1).
Preparación del compuesto A25:
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta de teflón se cargó con el compuesto A18 (240 mg, 0,209 mmol), CH2Ch seco (5 ml), a esta solución transparente se le añadió piperidina (1,5 ml) y la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 h en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción, todos los volátiles se eliminaron a presión reducida. La amina libre en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución preparativa de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID. Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar la amina libre A24 (164 mg, 0,177 mmol, 85 %) en forma de un sólido de color blanco.
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 50 ml, secado al horno, equipado con una barra magnética de agitación recubierta de teflón se cargó con la amina libre A24 (164 mg, 0,177 mmol). Se añadieron secuencialmente N-hidroxisuccinimidil éster de DBCO succinilo (126 mg, 0,313 mmol), N,N-dimetilformamida anhidra (3 ml) y N,N-diisopropiletilamina (110 pl, 0,627 mmol). La mezcla de reacción se lavó abundantemente con argón y se agitó a temperatura ambiente durante 3 horas en atmósfera de N2. La LC-MS mostró la finalización de la reacción. Después de eliminar todos los volátiles al vacío, el residuo se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto A25 (177 mg, 0,146 mmol, 70 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 1209,6 (M+1).
Un matraz de fondo redondo de una boca, de 25 ml, secado al horno, equipado con una barra de agitación magnética recubierta con teflón se carga con el compuesto A25 (177 mg, 0,146 mmoles, 1 equiv.), THF:MeOH:H2O (3:1:1) (5 ml). La solución transparente se enfrió a 0 °C con un baño de hielo. Se añadió L O H H 2O sólido (46 mg, 1,022 mmol, 7 equiv.) y la reacción se dejó en agitación a temperatura ambiente en atmósfera de N2 durante 7 h, tras lo cual la LC-MS mostró la finalización de la reacción, los volátiles se eliminaron al vacío y el material en bruto se purificó por cromatografía líquida de alta resolución de fase inversa usando una columna Ultro 120 (7 pm) C18Q, 150x20 mmID, Sistema disolvente usado Disolvente A: agua que contiene NH4OAc 10 mm; Disolvente B: acetonitrilo que contiene NH4OAc 10 mm, Modo de elución en gradiente del 10 % de disolvente B al 90 % de disolvente B, durante 20 minutos, 10 ml/min), las fracciones puras se recogieron y se liofilizaron para dar el compuesto (101 a) (138 mg, 0,117 mmol, 80 %) en forma de un polvo de color blanco. LC-MS (ESI): 1181,5 (M+1).
Ejemplo 1i
Los anticuerpos se expresaron en una reacción de Xpress CF™ usando procedimientos conocidos por un experto en la técnica. (Véase, por ejemplo, Cai et al. Biotechnol. 2015, 31(3), 823; y Zimmerman et al. Bioconjugate Chem. 2014, 25, 351). El extracto libre de células para este trabajo se creó a partir de una cepa de E. coli RF1 atenuada sensible a OmpT diseñada genéticamente para sobreexpresar DsbC y FkpA de E. coli, así como un ARNt ortogonal que contiene el anti-codón CUA para decodificar el codón de parada ámbar. El extracto se trató con yodoacetamida 75 pM durante 45 min a TA (20 °C) y se añadió a una premezcla que contenía todos los demás componentes, excepto para el ADN de cadena ligera y pesada de IgG. La concentración final en la reacción de síntesis de proteínas fue el 30 % (v/v) de extracto celular, para-azidometilfenilalanina (pAMF) 2 mM (aminoácidos RSP), amino-acil ARNt sintetasa modificada genéticamente 5uM (variante FRS), GSSG 2 mM, glutamato de magnesio 8 mM, glutamato de amonio 10 mM, glutamato de potasio 130 mM, piruvato sódico 35 mM, AMP 1,2 mM, 0,86 mM de cada uno de GMP, UMP y CMP, 2 mM de aminoácidos (excepto 0,5 mM para tirosina y fenilalanina), oxalato de sodio 4 mM, putrescina 1 mM, espermidina 1,5 mM, fosfato de potasio 15 mM, RNAP T7 100 nM, 1 pg/ml de ADN de cadena ligera antiCD74 y 4 pg/ml de ADN de cadena pesada antiCD74. Se usó mutagénesis de sitio dirigido para introducir un codón de parada ámbar (TAG) en la secuencia de nucleótidos para codificar el aminoácido no natural pAMF en las posiciones S7 y F404 (cadenas ligeras y pesadas, respectivamente, numeración kabat). Las reacciones libres de células se iniciaron mediante la adición de ADN plasmídico y se incubaron a 30 °C durante 16 h en placas de Petri de 100 x 10 mm que contenían 10 ml.
Las reacciones libres de células se aclararon mediante centrifugación a 10.000 rpm durante 30 minutos. El sobrenadante clarificado se aplicó a la Proteína A MabSelect SuRe (GE Healthcare) con lavado estándar y elución de pH bajo. Las impurezas tales como los agregados se eliminaron mediante SEC preparativa (Sepax SRT-10C) equilibrada en fosfato de sodio 50 mM, arginina 200 mM, pH 6,5. La formulación final de la muestra se realizó en solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (1x DPBs ).
Las IgG purificadas que contenían pAMF se conjugaron con un compuesto de prueba citotóxico usando química de clic sin cobre con reactivo de ciclooctina tenso (SpAAC, cicloadición de azida de alquino promovida por cepa). En resumen, los compuestos de prueba se disolvieron en DMSO hasta una concentración final de 5 mM. Cada compuesto se añadió a 1 mg/ml de proteína purificada en PBS en una proporción molar de fármaco-enlazador a anticuerpo de 12 a 1. La mezcla de reacción se incubó a TA (20 °C) durante 17 horas. El exceso de fármaco libre se eliminó mediante una placa Zeba (Thermo Scientific) equilibrada en PBS. El análisis DAR se realizó mediante MALDI-TOF (Bruker AutoFlex Speed). La proteína conjugada se redujo durante 10 min a 37 °C con TCEP 10 mM en agua y se diluyó a una concentración final de 50 pg/ml en acetonitrilo al 30 %, ácido trifluoroacético al 0,1 %. Las muestras se combinaron a 1:1 con matriz S-DHB MALDI (50 mg/ml en acetonitrilo al 50 %, se aplicó ácido trifluoroacético al 0,1 %) y 1 pl a la diana MALDI y se secó al vacío. Cada espectro de MALDI se acumuló para 5000 disparos a máxima potencia de láser en modo lineal y el análisis DAR final se calculó comparando la intensidad máxima relativa para especies conjugadas y no conjugadas.
Ejemplo 1j
Se prepararon conjugados del Compuesto 1 con trastuzumab tal como se describe a continuación.
El compuesto 101 o 101a se disolvió en DMSO a una concentración de 5 mM. La solución se añadió al anticuerpo C225 Hc C-term purificado en tampón PBS hasta una concentración final de compuesto de 200 pM y una concentración final de anticuerpo de 3 mg/ml (20 pM) para una proporción molar de 10:1 de compuesto:anticuerpo. La mezcla se incubó a temperatura ambiente (25 °C) durante 16 h. El exceso de compuesto se eliminó usando placas Zeba (Thermo Scientific) equilibradas en PBS a 1X.
Este procedimiento se utilizó para conjugar los compuestos 101 y 101a con trastuzumab HC en F404 y con trastuzumab LC en S7.
Para producir trastuzumab que contiene un grupo azida reactivo para conjugación, ADN que codifica las cadenas pesadas y ligeras de la molécula se clonó en el vector de expresión pUG. Se insertó un codón TAG en las posiciones indicadas mediante PCR superpuesta. Se usó el codón de parada TAA para finalizar la traducción.
Para expresar la proteína, los extractos libres de células se descongelaron a temperatura ambiente y se incubaron con yodoacetamida 50 pM durante 30 min. Las reacciones sin células se llevaron a cabo a 30 °C durante hasta 16 h que contenían extracto tratado con yodoacetamida al 30 % (v/v) con glutamato de magnesio 8 mM, glutamato de amonio 10 mM, glutamato de potasio 130 mM, piruvato sódico 35 mM, AMP 1,2 mM, 0,86 mM de cada uno de GMP, UMP y CMP, 2 mM de aminoácidos para los 18 aminoácidos excepto tirosina y fenilalanina que se agregaron a 0,5 mM, oxalato de sodio 4 mM, putrescina 1 mM, espermidina 1,5 mM, fosfato de potasio 15 mM, T7 RNAP 100 nM, glutatión oxidado 2 mM (GSSG), pAzidometilfenilanina (pAMF) 2 mM, ARNt sintetasa supresora de ámbar 2,5 pM. Las concentraciones de plásmido variante de TAG de cadena pesada y plásmido de cadena ligera de tipo silvestre fueron de 7,5 pg/ml y 2,5 pg/ml, respectivamente.
Los anticuerpos que contenían aminoácidos no naturales fueron purificados por MabSelect y pulidos por Capto adherir y almacenados en tampón PBS antes de su uso.
Las reacciones libres de células anti-CD74 se aclararon mediante centrifugación a 10.000 rpm durante 30 minutos. El sobrenadante clarificado se aplicó a la Proteína A MabSelect SuRe (GE Healthcare) con lavado estándar y elución de pH bajo. Las impurezas tales como los agregados se eliminaron mediante SEC preparativa (Sepax SRT-10C) equilibrada en fosfato de sodio 50 mM, arginina 200 mM, pH 6,5. La formulación final de la muestra se realizó en solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (1x DPBS).
Ejemplo 1k
Producción de anticuerpos anti-CD74 con aminoácidos no naturales
Los anticuerpos se expresaron en una reacción de Xpress CF™ como se describió anteriormente con las siguientes modificaciones. El extracto libre de células para este trabajo se creó a partir de una cepa de E. coli RF1 atenuada sensible a OmpT diseñada genéticamente para sobreexpresar DsbC y FkpA de E. coli, así como un ARNt ortogonal que contiene el anti-codón CUA para decodificar el codón de parada ámbar. El extracto se trató con yodoacetamida 75 pM durante 45 min a TA (20 °C) y se añadió a una premezcla que contenía todos los demás componentes, excepto para el ADN de cadena ligera y pesada de IgG. La concentración final en la reacción de síntesis de proteínas fue el 30 % (v/v) de extracto celular, para-azidometilfenilalanina (pAMF) 2 mM (aminoácidos RSP), amino-acil ARNt sintetasa modificada genéticamente 5uM (variante FRS), GSSG 2 mM, glutamato de magnesio 8 mM, glutamato de amonio 10 mM, glutamato de potasio 130 mM, piruvato sódico 35 mM, AMP 1,2 mM, 0,86 mM de cada uno de GMP, UMP y CMP, 2 mM de aminoácidos (excepto 0,5 mM para tirosina y fenilalanina), oxalato de sodio 4 mM, putrescina 1 mM, espermidina 1,5 mM, fosfato de potasio 15 mM, RNAP T7 100 nM, 1 ^g/ml de ADN de cadena ligera antiCD74 y 4 ^g/ml de ADN de cadena pesada antiCD74. Se usó mutagénesis de sitio dirigido para introducir un codón de parada ámbar (TAG) en la secuencia de nucleótidos para codificar el aminoácido no natural pAMF en las posiciones S7 y F404 (cadenas ligeras y pesadas, respectivamente, numeración kabat). Las reacciones libres de células se iniciaron mediante la adición de ADN plasmídico y se incubaron a 30 °C durante 16 h en placas de Petri de 100 x 10 mm que contenían 10 ml.
Las reacciones libres de células anti-CD74 se aclararon mediante centrifugación a 10.000 rpm durante 30 minutos. El sobrenadante clarificado se aplicó a la Proteína A MabSelect SuRe (GE Healthcare) con lavado estándar y elución de pH bajo. Las impurezas tales como los agregados se eliminaron mediante SEC preparativa (Sepax SRT-10C) equilibrada en fosfato de sodio 50 mM, arginina 200 mM, pH 6,5. La formulación final de la muestra se realizó en solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco (1x Dp Bs ).
Teniendo los anticuerpos preparados aminoácidos no naturales en las posiciones de los restos de cadena pesada 404, 241 y 222, según el esquema de numeración de la UE, y en el resto de cadena ligera 7, según el esquema de numeración de Kabat o Chothia. Un anticuerpo comprendía el resto (56), anterior, en la posición 404, y cuatro anticuerpos comprendían el resto (30), anterior, en cada una de las posiciones 404, 241, 222 (cadena pesada) y 7 (cadena ligera). Cada anticuerpo se expresó con un rendimiento total de al menos 400 mg/l como se muestra en la FlG. 2A, y la IgG intacta se detectaron mediante SDS-PAGE como se muestra en la FIG. 2B.
Producción de conjugado anticuerpo-PEG4 -maytansina
Se obtuvo IgG anti-CD74 purificada que contenía el resto 30 de aminoácido modificado (es decir, para-azido-metil-L-fenilalanina, o pAMF) en la posición UE 404 en sus cadenas pesadas de acuerdo con el Ejemplo 2. La IgG anti-CD74 se conjugó con una hemiasterlina, usando un reactivo de ciclooctina filtrado para producir Conjugado A.
En resumen, DBCO-val-cit-pAB-hemiasterlina de acuerdo con lo siguiente:
Figure imgf000114_0001
se disolvió en DMSO hasta una concentración final de 5 mM. El compuesto se añadió a 1 mg/ml de proteína purificada en PBS en una proporción molar de fármaco a anticuerpo de 12 a 1. La mezcla de reacción se incubó a TA (20 °C) durante 17 horas. El exceso de fármaco libre se eliminó mediante una placa Zeba (Thermo Scientific) equilibrada en PBS.
El análisis DAR se realizó mediante MALDI-TOF (Bruker AutoFlex Speed). La proteína conjugada se redujo durante 10 min a 37 °C con TCEP 10 mM en agua y se diluyó a una concentración final de 50 ^g/ml en acetonitrilo al 30 %, ácido trifluoroacético al 0,1 %. Las muestras se combinaron a 1:1 con matriz S-DHB MALDI (50 mg/ml en acetonitrilo al 50 %, se aplicó ácido trifluoroacético al 0,1 %) y 1 ^l a la diana MALDI y se secó al vacío. Cada espectro de MALDI se acumuló para 5000 disparos a máxima potencia de láser en modo lineal y el análisis DAR final se calculó comparando las alturas de pico relativas para masas conjugadas y no conjugadas para las cadenas pesada y ligera. Por intensidad de pico, MALDI-TOF mostró una proporción de fármaco a anticuerpo (DAR) de 1,88. Conjugado A, como dos regioisómeros:
Ejemplo 2a
Ensayo de línea de células tumorales
Sumario
Los dos diastereómeros del compuesto 1, [S,S,S] y [R,S,S] se analizaron contra líneas celulares de cáncer de mama que expresan Her2, líneas celulares que expresan y no expresan CD74, y líneas celulares que expresan y no expresan Cd 30. Las líneas celulares que expresan Her2 incluyen SKBR3, MDA-MB-453 y MDA-MB-468 que son respectivamente de expresión alta, media y baja de Her2. Las líneas celulares que expresan y no expresan CD74 incluyen SU-DHL6 y OPM2, que expresan y no expresan respectivamente CD74. Las líneas celulares que expresan y no expresan CD30 incluyen células L540 y Raji, que expresan y no expresan respectivamente CD30.
Se descubrió que el Compuesto 1 [S,S,S] que era 20 veces más potente (CI50 promedio de ca 1 nM) contra un panel de estas líneas de células tumorales en comparación con el Compuesto 1 [R,S,S].
Métodos
Los efectos de citotoxicidad de los compuestos de prueba se evaluaron con un ensayo de proliferación celular. Las líneas de células cancerosas adherentes (SKBR3, MDA-MB435, MDA-MB-468, HCT116, HT29, Skco1 y MDA-MB-453) se obtuvieron de ATCC y se mantuvieron en medio DMEM/F12 (50/50) con alto contenido de glucosa (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA) suplementado con suero bovino fetal inactivado por calor al 10% (Hyclone; Thermo Scientific; Waltham, MA), glutamax 2 mM (Invitrogen; Carlsbad, CA) y Penicilina/estreptomicina a 1x (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA). Las líneas celulares en suspensión (SU-DHL-6 y OPM-2) se obtuvieron de ATCC y se mantuvieron en medio RPMI con alto contenido de glucosa (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA) suplementado con suero bovino fetal inactivado por calor al 20 % (Hyclone; Thermo Scientific; Waltham, MA), glutamax 2 mM (Invitrogen; Carlsbad, CA) y Penicilina/estreptomicina a 1x (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA).
Para las células adherentes, se sembraron un total de 1000 células en un volumen de 40 pl en una placa de poliestireno blanco de fondo plano de área media de 96 pocillos el día antes del ensayo. Para células en suspensión, se sembraron un total de 20000 células en un volumen de 40 pl en una placa de poliestireno blanco de fondo plano de área media de 96 pocillos en el día del ensayo.
Los compuestos de prueba se formularon a una concentración 2x en medio de cultivo y se filtraron a través de placas de filtración de 96 pocillos MultiScreen HTS (Millipore; Billerica, MA). Los compuestos esterilizados por filtración se diluyeron en serie en medio de cultivo y se añadieron 40 pl de los compuestos a los pocillos de tratamiento. Para las células adherentes, las placas se cultivaron a 37 °C en una incubadora de CO2 durante 96 horas. Para células en suspensión, el tiempo de incubación fue de 72 horas. Para las mediciones de viabilidad celular, se añadieron 80 pl de reactivo Cell Titer-Glo® (Promega Corp.; Madison, WI) en cada pocillo y las placas se procesaron según las instrucciones del producto.
Se midió la luminiscencia relativa en un lector de placas ENVISION® (Perkin-Elmer; Waltham, MA). Las lecturas de luminiscencia relativa se convirtieron en porcentaje de viabilidad utilizando células no tratadas como controles. Los datos se ajustaron con análisis de regresión no lineal, usando la ecuación de ajuste de 4 parámetros log(inhibidor) frente a la respuesta, de pendiente variable, usando GraphPad Prism (programa informático GraphPad v 5.00; San Diego, CA). Los datos se expresaron como porcentaje de viabilidad celular relativa frente a dosis de compuestos en nM. Se usó la CI50 de destrucción celular calculada por Prism para evaluar la potencia de cada compuesto en cada línea celular.
Resultados
Para todas las líneas de células cancerosas analizadas, el Compuesto 1 [S,S,S] (la CI50 de destrucción celular varió entre 0,74 nM y 9,18 nM) resultó ser de 10 a 20 veces más potente en comparación con el Compuesto 1 [R,S,S] (la CI50 de destrucción de células varió entre 12,21 nM y 91,53 nM).
Los resultados para los conjugados de trastuzumab se proporcionan en la Figura 1 y la Tabla 1. Los resultados para el Compuesto 1 [S,S,S] y [R,S,S] derivado de hemiasterlina, se proporcionan en las Figuras 2a-c y la Tabla 2.
T l 1 - En lín l l m r l n n r z m
Figure imgf000115_0001
continuación
Figure imgf000116_0002
-
Figure imgf000116_0003
Figure imgf000116_0004
Ejemplo 2b
Ensayo de línea de células tumorales
Los efectos de citotoxicidad de los compuestos de prueba en células diana positivas y diana negativas se midieron con un ensayo de proliferación celular. Las líneas de células tumorales se obtuvieron de la American Type Culture Collection (ATCC) y se mantuvieron en medio de Ham F-12: DMEM alto en glucosa (50:50) suplementado con suero bovino fetal inactivado por calor al 10 %, penicilina/estreptomicina al 1 % y L-glutamax 2 mmol/l. Se sembraron células diana positivas y negativas (un total de 625 células por pocillo) en un volumen de 25 pl en una placa de poliestireno blanco de fondo plano de 384 pocillos. Se permitió que las células se adhirieran durante la noche a 37 °C en una incubadora de CO2. Las variantes de ADC se formularon a una concentración de 2x en medio DMEM/F12 y se filtraron a través de placas de filtro de 96 pocillos MultiScreen HTS. Los ADC esterilizados por filtración se diluyeron en serie (1:3) y se añadieron a 25 pl de muestras diluidas en cada pocillo de tratamiento. Luego, las placas se cultivaron a 37 °C en una incubadora de CO2 durante 120 horas. Para la medición de la viabilidad celular, se añadieron 30 pl de reactivo Cell Titer-Glo® (Promega Corp) a cada pocillo y las placas se procesaron según las instrucciones del producto. Se midió la luminiscencia relativa en un lector de placas ENVISION® (Perkin-Elmer; Waltham, MA). Las lecturas de luminiscencia relativa se convirtieron en % de viabilidad utilizando células no tratadas como controles. Los datos se ajustaron con análisis de regresión no lineal, usando la ecuación de ajuste de 4 parámetros log(inhibidor) frente a la respuesta, de pendiente variable, usando GraphPad Prism (programa informático GraphPad v 5.00; San Diego, CA). Los datos se expresaron como % de viabilidad celular relativa frente a dosis de ADC en nM.
Resultados
Tabla 3 - Ensa o de línea celular tumoral con derivados de hemiasterlina
Figure imgf000116_0005
-
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Ejemplo 2c
Unión celular y destrucción celular
El Conjugado A se evaluó para la capacidad de unirse y destruir células que expresan CD74 mediante los métodos siguientes. Las líneas celulares probadas incluyeron células de linterna B, mieloma múltiple y leucemia. Los controles incluyeron anticuerpo anti-CD74 no conjugado.
Ensayo de unión celular
Las líneas celulares se mantuvieron en RPMI, alto en glucosa (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA) suplementado con suero bovino fetal inactivado por calor al 20 % (Hyclone; Thermo Scientific; Waltham, MA), glutamax 2 mM (Invitrogen; Carlsbad, CA) y Penicilina/estreptomicina a 1x (Cellgro-Mediatech; Manassas, VA). Las células se recolectaron y se resuspendieron en tampón FACS (tampón DPBS suplementado con albúmina de suero bovino al 1 %). Se incubó un total de 200.000 células por pocillo en hielo con diluciones en serie de anti-CD74 SP7919 sin conjugación durante 60 minutos. Las células se lavaron dos veces con tampón FACS helado y se incubaron con 5 ug/ml de anticuerpo anti-IgG humana en burro marcado con Alexa 647 (Jackson Immune-Research) en hielo durante otros 60 minutos. Las células no teñidas y las células teñidas con anticuerpo secundario solo se usaron como controles. A continuación, las muestras se lavaron dos veces con tampón FACS y se analizaron con un sistema BD FACS Canto. Las intensidades medias de fluorescencia se ajustaron usando análisis de regresión no lineal con una ecuación de unión específica de sitio en GraphPad Prism. Los datos se expresaron como intensidad fluorescente media geométrica frente a concentración de anticuerpo en nM.
Ensayo de destrucción celular
Los efectos de citotoxicidad de los enlazadores y conjugados libres de fármacos se midieron con un ensayo de proliferación celular. Se sembraron un total de 12500 células en un volumen de 25 pl en una placa de poliestireno blanco de fondo plano de 384 pocillos el día del ensayo. Se formularon conjugados y enlazadores libres de fármaco a una concentración inicial de 2x (1000 nM para enlazadores libres de fármaco y 100 nM para ADC) en medio RPMI y se filtraron a través de placas de filtro MultiScreen HTS de 96 pocillos (Millipore). Los derivados conjugados esterilizados por filtración se diluyeron en serie (1:3) en condiciones estériles y se añadieron a los pocillos de tratamiento. Las placas se cultivaron a 37 °C en una incubadora de CO2 durante 72 horas. Para la medición de la viabilidad celular, se añadieron 30 pl de reactivo Cell Titer-Glo® (Promega Corp.) a cada pocillo y las placas se procesaron según las instrucciones del producto. Se midió la luminiscencia relativa en un lector de placas ENVISION® (Perkin-Elmer; Waltham, MA). Las lecturas de luminiscencia relativa se convirtieron en % de viabilidad utilizando células no tratadas como controles. Los datos se ajustaron con análisis de regresión no lineal, usando la ecuación de ajuste de 4 parámetros log(inhibidor) frente a la respuesta, de pendiente variable, usando GraphPad Prism. Los datos se expresaron como % de viabilidad celular relativa frente a dosis de conjugado o enlazador de fármaco libre en nM.
El Conjugado A se evaluó para la capacidad de unirse y destruir células que expresan CD74. Las líneas celulares probadas incluyeron células de linfoma B, mieloma múltiple y leucemia. Los controles incluyeron anticuerpo anti-CD74 no conjugado. Los resultados se resumen en la siguiente Tabla:
Figure imgf000117_0001

Claims (27)

REIVINDICACIONES
1. Un compuesto de acuerdo con la fórmula 1000:
Figure imgf000118_0001
o una sal, solvato, un estereoisómero o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo, en donde:
Ar es un arilo monocíclico divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir; un heteroarilo monocíclico de cinco o seis miembros, sustituido o sin sustituir; un arilo bicíclico condensado, divalente, de nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir; un heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de ocho, nueve o diez miembros, sustituido o sin sustituir;
L está ausente o es -CH2-;
Figure imgf000118_0002
o
RT
^ -r t1- w 3- h p 1-w 2- e g -^
W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o son un grupo de unión divalente;
EG está ausente o es un grupo eliminador;
cada RT es un grupo desencadenante de liberación, en la cadena principal de la fórmula 1000 o unido a EG, en en donde cada RT es opcional;
RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible o RT1 está ausente;
HP es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo hidrófilo divalente;
HP1 es un enlace sencillo, está ausente, es un grupo hidrófilo divalente o
Figure imgf000118_0003
donde RHP es un grupo hidrófilo monovalente;
SG es un enlace sencillo, está ausente o es un grupo espaciador divalente, y
R es
Figure imgf000118_0004
2. El compuesto de la reivindicación
Figure imgf000118_0005
o una sal, un solvato o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo, en donde EG es un grupo eliminador.
3. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-2, en el que EG es:
Figure imgf000119_0001
en donde cada REG se selecciona independientemente entre el grupo que consiste en: hidrógeno, alquilo, bifenilo, -CF3, -NO2, -CN, flúor, bromo, cloro, alcoxilo, alquilamino, dialquilamino, alquil-C(O)O-, alquilamino-C(O)- y dialquilaminoC(O)-.
4. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que RT comprende un residuo de un aminoácido natural o no natural o un residuo de un azúcar, opcionalmente, en donde RT es:
Figure imgf000119_0002
5. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en el que RT1 es un grupo desencadenante de liberación o un enlazador escindible; opcionalmente, en donde RT1 está ausente;
Figure imgf000119_0003
valina-alanina; valina-ácido glutámico; alanina-fenilalanina; fenilalanina-lisina; fenilalanina-homolisina; glicina-glicinaglicina;
HN-alquileno
Figure imgf000119_0004
-f-HN-alquileno C-i^-C(O)—aa—{
donde aa es un resto de aminoácido natural o no natural; o
Figure imgf000120_0001
donde el anillo
Figure imgf000120_0002
es un anillo heterocíclico de 4-7 miembros que comprende 3-6 átomos de carbono.
6. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que SG comprende alquileno C1-C10, -C(O)- o una combinación de los mismos; opcionalmente, en donde SG es:
Figure imgf000120_0003
7. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que HP comprende poli(etilenglicol); opcionalmente,en donde HP:
Figure imgf000120_0004
siendo m un número entero seleccionado de 1 a 12.
8. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-7, en el que HP1 está ausente o es
Rhp
Figure imgf000120_0005
donde RHP es
Figure imgf000120_0006
y m es un número entero de 1 a 12 o RHP es -Ci-C6-alquilen-SO3-.
9. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que W1, W2, W3, W4 y W5 son cada uno independientemente un enlace sencillo, están ausentes o comprenden -C(O)-, -O-, -C(O)NH-, -C(O)NH-alquilo-, -OC(O)NH-, -SC(O)NH-, -NH-, -NH-alquilo-, -N(CH3)CH2CH2N(CH3)-, -S-, -S-S-, -OCH2CH2O- o una combinación de los mismos.
10. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-9, en el que W1, W2, W3, W4 y W5 independientemente están ausentes o son un enlace o una sal, un solvato o un tautómero farmacéuticamente aceptable del mismo.
11. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que Ar es un arilo monocíclico, divalente, de seis miembros, sustituido o sin sustituir o un heteroarilo monocíclico, divalente de seis miembros, sustituido o sin sustituir.
12. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que Ar es un heteroarilo bicíclico condensado, divalente, de nueve miembros, sustituido o sin sustituir.
13. El compuesto una cualquiera de las reivindicaciones 1-10, en el que Ar es:
Figure imgf000120_0007
14. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-13, en el que L está ausente.
15. El compuesto de la reivindicación 1, de acuerdo con una cualquiera de las fórmulas siguientes:
Figure imgf000121_0001
Figure imgf000122_0001
Figure imgf000123_0001
o una sal, un solvato o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo.
16. El compuesto de la reivindicación 1, que es:
Figure imgf000123_0002
o una sal, un solvato o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo.
17. Un compuesto que es:
Figure imgf000123_0003
o una sal, un solvato o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo.
18. Un conjugado que comprende un compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-17, unido a un segundo compuesto a través de un enlazador.
19. El conjugado de la reivindicación 18, en el que el segundo compuesto es un resto de un polipéptido o de un anticuerpo.
20. Un conjugado seleccionado entre el grupo que consiste en:
Figure imgf000125_0001
Figure imgf000126_0001
Figure imgf000127_0001
o una sal, un solvato, un estereoisómero o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo.
21. El conjugado de la reivindicación 20, que es:
Figure imgf000128_0001
o una sal, un solvato, un estereoisómero o un tautómero farmacéuticamente aceptables del mismo.
22. El conjugado de una cualquiera de las reivindicaciones 18-21, en el que COMP es un resto de un polipéptido; o COMP es un resto de un anticuerpo; o COMP es un resto de una cadena de anticuerpo.
23. Una composición farmacéutica que comprende el compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-17 o un conjugado de una cualquiera de las reivindicaciones 18-22 y un excipiente, un vehículo o un diluyente farmacéuticamente aceptables.
24. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-17, el conjugado de una cualquiera de las reivindicaciones 18-22 o la composición farmacéutica de la reivindicación 23 para su uso en terapia.
25. Una cantidad eficaz del compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-17, el conjugado de una cualquiera de las reivindicaciones 18-22 o la composición farmacéutica de la reivindicación 23 para su uso en un método para inhibir la polimerización de la tubulina en un sujeto que lo necesita; o para su uso en un método para tratar la proliferación celular o el cáncer en un sujeto que lo necesita, opcionalmente, siendo el cáncer: cáncer de pulmón microcítico, cáncer de pulmón no microcítico, cáncer de ovario, cáncer de ovario resistente a platino, adenocarcinoma de ovario, cáncer de endometrio, cáncer de mama, cáncer de mama que sobreexpresa Her2, cáncer de mama triple negativo, un linfoma, linfoma de células grandes; linfoma histiocítico y linfocítico mixto difuso; linfoma folicular de linfocitos B, cáncer de colon, carcinoma de colon, adenocarcinoma de colon, adenocarcinoma colorrectal, melanoma, cáncer de próstata o mieloma múltiple.
26. Un método de producción de un conjugado, que comprende poner en contacto un compuesto seleccionado entre el grupo que consiste en:
Figure imgf000129_0001
Figure imgf000130_0001
con un segundo compuesto en condiciones adecuadas para conjugar el compuesto de una cualquiera de las fórmulas (101)-(111) con el segundo compuesto; en donde el segundo compuesto comprende una azida; opcionalmente, siendo el segundo compuesto un polipéptido, un anticuerpo o una cadena de anticuerpo.
27. El método de la reivindicación 26, en el que el compuesto (101) se pone en contacto con el segundo compuesto que comprende una azida.
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