ES2762618T3 - Microorganismos que producen ácido docosahexaenoico y utilización de los mismos - Google Patents

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Abstract

Microorganismo que pertenece al género Aurantiochytrium que presenta un gen de ARNr 18S que consiste en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID nº 1 a 5.

Description

DESCRIPCIÓN
Microorganismos que producen ácido docosahexaenoico y utilización de los mismos.
Campo técnico
La presente invención se refiere a un nuevo microorganismo que produce ácido docosahexaenoico (en adelante en la presente memoria denominado “DHA”) y a métodos para producir una composición que contiene DHA, DHA y alquil-éster de DHA utilizando el microorganismo.
Antecedentes de la técnica
El DHA es un ácido graso poliinsaturado contenido abundantemente en los fosfolípidos cerebrales y similares de los mamíferos, incluyendo el ser humano, y es conocido que desempeña un papel importante en el mantenimiento o desarrollo de las funciones cerebrales. El ser humano posee la capacidad de sintetizar DHA a partir de ácido linolénico; sin embargo, la cantidad del mismo es mucho menor de la necesaria y es conocido que el DHA debe obtenerse del exterior. Por este motivo, se comercializan muchos alimentos, complementos y leche para bebés que contienen DHA.
Entre los ejemplos de DHA contenido en dichos productos se incluye el DHA obtenido mediante extracción a partir de aceites de pescado. Los aceites de pescado son económicos y ricos en DHA y, por lo tanto, son buenas fuentes de DHA. Sin embargo, considerando el reciente incremento de la demanda de DHA, la acumulación de PCB o metales pesados en peces que acompaña a la contaminación marina, etc., se demanda un suministro más seguro y estable de DHA.
Además del DHA obtenido mediante extracción a partir de aceites de pescado, entre los ejemplos se incluye DHA producido mediante un método de fermentación utilizando un microorganismo. Se ha conocido desde hace mucho tiempo que las microalgas marinas producen un lípido que contiene DHA (documento no de patente n° 1). Sin embargo, existen problemas en que la cantidad de DHA contenida en las microalgas es reducida, el cultivo a alta densidad resulta difícil, etc. y, por lo tanto, no se ha llevado a cabo la producción a un nivel comercial.
Como método para producir DHA mediante fermentación a un nivel comercial, la utilización del dinoflagelado Crypthecodinium cohnii es el primer estudio (documento de patente n° 1 y documentos no de patente n° 2 y n° 3). Posteriormente se han encontrado múltiples microorganismos que poseen la capacidad de producir DHA, y son microorganismos que muestran la máxima capacidad de producir d Ha , microorganismos Labyrinthulea y entre los ejemplos de dichos microorganismos se incluyen Schizochytrium sp. cepa ATCC 20888 y cepas derivadas de la misma (documentos de patente n° 2 y n° 3), Aurantiochytrium limacinum (anteriormente clasificado como Schizochytrium limacinum) cepa SR21 (documentos de patente n° 4 a n° 6 y el documento no de patente n° 4), el microorganismo Labyrinthulea cepa 12B (documento de patente n° 7), Thraustochytrium sp. cepa LEF (documento de patente n° 8) y similares. El documento WO 2007/068997 A2, Yang H.L. et al. ("Isolation and Characterization of Taiwanese Heterotrophic Microalgae: Screening of Strains for Docosahexaenoic Acid (DHA)", Marine Biotechnology, vol. 12, páginas 173-185); documento WO 2011/139040 A2; Won-Kyung Hong et al ("Production of Lipids Containing High Levels of Docosahexaenoic Acid by a Newly Isolated Microalga, sp. KRS101" Applied Biochemistry and Biotechnology; parte A; Enzyme Engineering and Biotechnology, Humana Press Inc, vol. 164, n° 8, páginas 1468-1480) dan a conocer cepas de traustoquítridos que presentan secuencias de ARNr 18S diferentes de SEC ID n° 1 a n° 5.
El documento JP 2004 501603 A da a conocer cepas de Thraustochytrium y Schizochytrium que son capaces de producir DHA.
El documento WO 2012/175027 A1 se refiere a métodos de mutagénesis de Schizochytrium sp y cepas variantes producidas a partir del mismo.
El documento JP H10 72590 A da a conocer Aurantiochytrium limacinum cepa SR21, que produce ácido docosahexaenoico (DHA).
Entre estos microorganismos Labyrinthulea, un microorganismo que muestra la máxima capacidad de producción de DHA es Schizochytrium cepa S31 (cepa ATCC n° 20888) (documento de patente n° 9). La capacidad de producir DHA del microorganismo es mucho más elevada que en otros informes, y el método de fermentación para DHA que utiliza el microorganismo puede afirmarse que es el procedimiento de producción mediante fermentación de menor coste.
Sin embargo, ni siquiera con el procedimiento de producción mediante fermentación, el coste es superior al del método de extracción a partir de aceites de pescado y, por lo tanto, se han requerido mejoras adicionales de la productividad.
Documentos de la técnica relacionada
Documentos de patente
Documento de patente n° 1 JP-T-5-503425
Documento de patente n° 2 JP-T-8-502405
Documento de patente n° 3 JP-T-8-509355
Documento de patente n° 4 JP-A-9-000284
Documento de patente n° 5 JP-A-10-072590
Documento de patente n° 6 JP-A-10-310556
Documento de patente n° 7 JP-A-2006-230403
Documento de patente n° 8 JP-A-2005-102680
Documento de patente n° 9 JP-T-2004-501603
Documentos no de patente
Documento no de patente n° 1: J. Protozoal (1970), Vol. 17, pp. 213-219
Documento no de patente n° 2: Single Cell Oils a Oc S Press (2005), vol.6, páginas 86-98
Documento no de patente n° 3: Single Cell Oils AOCS Press (2005), vol. 8, páginas 107-123 Documento no de patente n° 4: APL. Microbiol. Biotechnol. (1998), vol. 49, páginas 72-76
Sumario de la invención
Problemas que debe resolver la invención
Un objetivo de la presente invención es proporcionar un microorganismo que presente una capacidad más elevada de producir DHA que anteriormente y asimismo proporcionar métodos eficientes para producir una composición que contiene DHA, y alquil-éster de DHA utilizando el microorganismo.
Medios para resolver los problemas
La presente invención se refiere a formas de realización según definen en las reivindicaciones y en [1] a [5], a continuación.
[1] Un microorganismo perteneciente al género Aurantiochytrium que presenta un gen de ARNr 18S consistente en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID n° 1 a n° 5.
[2] Aurantiochytrium sp. cepa OH4 (número de acceso: FERM BP-11524).
[3] Un método para producir una composición que contiene DHA, que comprende cultivar el microorganismo indicado en cualquiera de [1] a [2], anteriormente, en un medio que permite producir la composición que contiene DHA y acumularla en un cultivo, y recolectar la composición que contiene DHA a partir del cultivo.
[4] Un método para producir DHA, que comprende separar y recolectar DHA a partir de la composición que contiene DHA recolectada en [3], anteriormente.
[5] Un método para producir alquil-éster de DHA, que comprende separar y recolectar alquil-éster de DHA a partir de la composición que contiene DHA recolectada en [3], anteriormente.
La exposición se refiere a:
[3] Un microorganismo que es un mutante obtenido a partir del microorganismo indicado en [1] o [2], anteriormente, como cepa parental y que presenta una capacidad más elevada de producir DHA que la cepa parental.
[4] Aurantiochytrium sp. cepa LTR23.
Efectos de la invención
Según la presente invención, se proporciona un microorganismo perteneciente al género Aurantiochytrium que presenta un gen de ARNr 18S consistente en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID n° 1 a n° 5, y un método para producir la composición que contiene DHA, DHA y alquil-éster de DHA, mediante un procedimiento de fermentación utilizando el microorganismo.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1 es una vista que representa las cantidades producidas de DHA y las proporciones de DHA a ácidos grasos totales en microorganismos productores de DHA recogidos de una zona costera de Okinawa.
La figura 2 es una fotomicrografía de Aurantiochytrium sp. cepa OH4.
La figura 3 es una vista en que se añade a la figura 1 la cantidad producida de DHA y las proporciones de DHA a ácidos grasos totales en Aurantiochytrium sp. cepa LTR23.
Formas de realización para poner en práctica la invención
1. Microorganismo de la invención
El microorganismo de la presente invención es un microorganismo perteneciente al género Aurantiochytrium que presenta uno o más, preferentemente dos o más, más preferentemente tres o más, todavía más preferentemente cuatro o más genes de ARNr 18S, consistiendo cada uno en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID n° 1 a n° 5, y es más preferentemente un microorganismo perteneciente al género Aurantiochytrium que presenta la totalidad de los genes de ARNr 18S consistente en la secuencia de bases representada mediante las SEC ID n° 1 a n° 5, respectivamente. Basándose en las características morfológicas y las características biológicas moleculares, tal como se mencionan posteriormente, el microorganismo de la presente invención se considera que pertenece al filo Heterokonta del reino Chromista y pertenece además al orden Labyrinthulida de la clase Labyrinthulea. Con respecto a los rangos taxonómicos de familia y posteriormente, considerando las características fisiomorfológicas y las secuencias de bases de los genes de ARNr 18S, se considera que pertenece al género Aurantiochytrium de la familia Thraustochytriaceae.
Entre los ejemplos del microorganismo de la presente invención se incluyen Aurantiochytrium sp. cepa OH4 (número de acceso: FERM BP-11524) y similares. Además, los microorganismos que son mutantes obtenidos mediante la utilización del microorganismo de la presente invención como cepa parental y que presentan una capacidad más elevada de producir DHA que la cepa parental asimismo pueden producirse de acuerdo con la presente exposición. Entre los ejemplos de dicho microorganismo se incluyen Aurantiochytrium sp. cepa LTR23, y similares.
El anteriormente mencionado Aurantiochytrium sp. cepa OH4 se ha depositado en el depósito de microorganismos de patente del National Institute of Technology and Evaluation (NITE), situado en Central 6, 1-1, Higashi, Tsukubashi, Ibaraki-ken, Japón (código postal 305-8566). La fecha de recepción (fecha de depósito) es 11 de enero de 2013, y el número de acceso es FERM BP-11524.
La cepa parental tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a una cepa original que debe someterse a la introducción de una mutación, sustitución génica mediante una técnica de recombinación de ADN o similar. La cepa original que debe someterse a sustitución génica mediante una técnica de recombinación de ADN o similar asimismo se denomina cepa huésped.
El mutante tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a un microorganismo que puede obtenerse mediante la utilización de un método convencional de introducción de mutaciones, un método de sustitución génica mediante una técnica de recombinación de ADN, o similar, a partir del microorganismo de la presente invención como cepa parental.
El microorganismo que presente una capacidad más elevada de producir DHA que la cepa parental tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a un microorganismo en el que la cantidad de composición que contiene DHA o DHA que puede obtenerse a partir del cultivo completo es elevada al cultivar la cepa parental y el mutante bajo las mismas condiciones de cultivo.
Entre los ejemplos de la composición que contiene DHA pueden incluirse aceites y grasas que contienen DHA o fosfolípidos que contienen DHA, preferentemente aceites y grasas que contienen DHA.
Hasta ahora se han encontrado muchos tipos de microorganismos pertenecientes al género Aurantiochytrium; sin embargo, el microorganismo de la presente invención presenta una secuencia de bases diferente del gen de ARNr 18S que dichos microorganismos y, además, tal como se muestra en los ejemplos indicados posteriormente, el peso celular seco y el contenido de DHA al cultivar el microorganismo son significativamente más elevados que en los microorganismos convencionalmente conocidos de los que se informa como microorganismos de elevada producción de DHA y, por lo tanto, el microorganismo de la presente invención puede distinguirse claramente de los microorganismos convencionalmente conocidos pertenecientes al género Aurantiochytrium.
2. Método para la obtención del microorganismo de la invención
El microorganismo de la presente invención puede obtenerse mediante el método siguiente.
Se recoge una muestra del océano, preferentemente de agua salobre, más preferentemente de hojas caídas recogidas del suelo de un manglar.
La muestra se sumerge en agua marina artificial que contiene un antibiótico, preferentemente penicilina G y estreptomicina, y después, el sobrenadante del agua marina artificial se aplica sobre un medio de agar que contiene el antibiótico y se incuba durante varios días a una temperatura de 20°C a 40°C, preferentemente a 25°C. De esta manera, muchos procariotas presentes en el medio ambiente no pueden crecer y, por lo tanto, el microorganismo de la presente invención, que es un eucariota, puede concentrarse.
Se aísla una colonia y a partir del cultivo obtenido mediante cultivo utilizando un medio líquido, se extrae el ADN genómico siguiendo un procedimiento común. Mediante la utilización del ADN genómico como molde, se lleva a cabo una reacción de p Cr utilizando oligo-ADN con las secuencias de bases representadas mediante SEC ID n° 6 y n° 7, respectivamente, que pueden amplificar un gen de ARNr 18S, como conjunto de cebadores.
A uno de los cebadores del conjunto se le añade una etiqueta compuesta de 3 a 6 bases, preferentemente 4 a 5 bases, más preferentemente 4 bases para el análisis simultáneo de múltiples muestras de acuerdo con "Highspeed sequence analysis outsourcing service, Application No. 01, Analysis of 16S rRNA PCR sample" (tríptico de Takara Bio, Inc.). Además, a ambos cebadores se añade un oligonucleótido necesario para el análisis con un secueciador GS FLX (Roche Diagnostics K.K.).
Mediante la determinación de la secuencia con el secuenciador GS FLX utilizando el producto de reacción de PCR anteriormente mencionado, por ejemplo, en el caso de que se fije el tamaño de la etiqueta anteriormente mencionada en 4 bases, y hasta 256 tipos de secuencias de etiqueta, pueden secuenciarse 256 tipos de genes de ARNr 18S mediante una operación de secuenciación sin requerir una operación de clonación. Específicamente, mediante la mezcla de 256 tipos de productos de PCR, se determinan las secuencias de bases con el secuenciador GS FLX y las secuencias de bases tras la determinación se clasifican en 256 tipos mediante la utilización de las secuencias de la etiqueta como índice.
El ADN genómico que debe utilizarse como el molde para la reacción de PCR puede ser un ADN genómico extraído de una sola cepa o puede ser una mezcla de ADN genómicos extraídos de múltiples cepas. Sin embargo, en el caso de que se utilice una mezcla de ADN genómicos extraídos de múltiples cepas, el cribado de muchas cepas puede llevarse a cabo más convenientemente mediante la combinación del método indicado posteriormente.
Por ejemplo, se amplifica una región génica de ARNr 18S mediante la mezcla de los ADN genómicos extraídos de 100 tipos de cepas y se utiliza la mezcla resultante como un molde para una reacción de PCR y asimismo utilizando el conjunto de cebadores anteriormente indicado.
Los productos de PCR se secuencian con el secuenciador GS FLX y, en el caso de que se encuentre presente el gen de ARNr 18S que consiste en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID n° 1 a n° 5, se observa que se encuentra presente por lo menos una cepa del microorganismo de la presente invención entre los 100 tipos de cepas. Por otra parte, en el caso de que no se encuentre presente el gen de ARNr 18S, se observa que el microorganismo de la presente invención no se encuentra presente entre los 100 tipos de cepas.
En el caso de que se encuentre presente el microorganismo de la presente invención entre los 100 tipos de cepas, puede especificarse el microorganismo utilizando un método con el secuenciador GS FLX anteriormente indicado mediante una operación de secuenciación.
Es decir, mediante la utilización del método anteriormente indicado, en el caso en que se fije el tamaño de la secuencia de etiqueta en 4 bases, pueden analizarse hasta 256 tipos de ADN genómicos mixtos mediante la primera operación de secuenciación, y el microorganismo de la presente invención puede determinarse de entre un máximo de 256 tipos de microorganismos mediante la segunda operación de secuenciación y, por lo tanto, con respecto a un máximo de 65,536 tipos de microorganismo, puede determinarse si un microorganismo es o no el microrganismo de la presente invención mediante únicamente dos operaciones de secuenciación sin requerir una operación de clonación.
Por otra parte, en el caso de que se fije el tamaño de la secuencia de etiqueta en 5 bases, pueden analizarse hasta 1.024 tipos de ADN genómicos mixtos mediante la primera operación de secuenciación, y el microorganismo de la presente invención puede determinarse de entre un máximo de 1.024 tipos de microorganismos mediante la segunda operación de secuenciación y, por lo tanto, con respecto a un máximo de 1,048,576 tipos de microorganismo, puede determinarse si un microorganismo es o no el microorganismo de la presente invención mediante únicamente dos operaciones de secuenciación sin requerir una operación de clonación.
El microorganismo que debe someterse al análisis de secuenciación anteriormente indicado puede confirmarse que produce DHA previamente. De esta manera, en el caso de que el número de cepas que debe analizarse sea pequeño, asimismo puede determinarse si el microorganismo es o no el microorganismo de la presente invención mediante determinación de la secuencia utilizando el método de Sanger convencional.
El mutante de la presente exposición con una mayor capacidad de producir DHA que la cepa parental puede obtenerse mediante la utilización del microorganismo de la presente invención como cepa parental y utilizando un método convencional de tratamiento de mutación, por ejemplo se lleva a cabo un tratamiento de mutación de manera que la tasa de mortalidad del microorganismo sea de 98%, preferentemente de 99%, lo más preferentemente de 99.9%, con un tratamiento con N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG) o un tratamiento de radiación UV y se aísla una colonia superviviente y se examina la productividad de DHA.
La productividad de DHA puede examinarse mediante un método en el que se extrae un lípido a partir de una solución de cultivo utilizando el método de Bligh y Dyer (Bligh E.G. Y Dyer W.J., Can. J. Biochem. Physiol. 37911 (1959)) y se seca bajo presión reducida y después el lípido seco se somete a metilación de los ácidos grasos utilizando el kit de metilación de ácidos grasos (Nacalai Tesque, Inc.) y el metil-éster de ácido graso obtenido se extrae con n-hexano y se analiza mediante cromatografía de gases.
3. Método para producir la composición que contiene DHA de la invención
Puede producirse una composición que contiene DHA mediante el cultivo del microorganismo de la presente invención en un medio que permite producir y acumular en el cultivo la composición que contiene DHA y recolectar la composición que contiene DHA a partir del cultivo.
El cultivo del microorganismo de la presente invención puede obtenerse mediante inoculación del microorganismo en un medio apropiado y cultivo del microorganismo según un procedimiento común.
Respecto al medio, puede utilizarse cualquier medio conocido que contenga una fuente de carbono, una fuente de nitrógeno, una sal inorgánica y similares. Entre los ejemplos de la fuente de carbono se incluyen un carbohidrato, tal como glucosa, fructosa o galactosa, y aparte de ellos, un aceite o un lípido, tal como ácido oleico o aceite de soja, glicerol, acetato sódico o similares. Dichas fuentes de carbono pueden utilizarse, por ejemplo, a una concentración de 20 a 300 g por litro de medio. Según una forma de realización particularmente preferida, mediante la alimentación de una fuente de carbono después de consumir la fuente inicial de carbono, puede llevarse a cabo en continuo el cultivo. Mediante la realización del cultivo bajo dichas condiciones, puede incrementarse la cantidad de la fuente de carbono y, de esta manera, puede incrementarse la cantidad producida de la composición que contiene DHA.
Además, como fuente de nitrógeno, puede utilizarse nitrógeno orgánico, tal como extracto de levadura, licor de maceración del maíz, polipeptona, glutamato sódico o urea, o nitrógeno inorgánico, tal como acetato amónico, sulfato amónico, cloruro amónico, nitrato sódico, nitrato amónico o amonio.
Como la sal inorgánica, puede combinarse convenientemente y utilizarse fosfato potásico o similar.
Resulta preferido que el medio que contiene los componentes respectivos anteriormente indicados se utilice mediante esterilización en una autoclave tras ajustar el pH a un intervalo de 4,0 a 9,5 mediante la adición de un ácido o base apropiado.
La temperatura de cultivo es generalmente de 10°C a 45°C, preferentemente de 20°C a 37°C. La temperatura de cultivo preferentemente se controla para que sea una temperatura de cultivo a la que pueda producirse una composición que contiene DHA. El pH durante el cultivo es generalmente de 3,5 a 9,5, preferentemente de 4,5 a 9,5. Un pH particularmente preferido varía dependiendo del propósito deseado y para producir una gran cantidad de un aceite o grasa, el pH es de 5,0 a 8,0.
El periodo de cultivo puede fijarse en, por ejemplo, 2 a 7 días, y el cultivo puede llevarse a cabo mediante cultivo bajo agitación por aireación o similar.
Mediante el cultivo del microorganismo de la presente invención tal como como se ha indicado anteriormente, puede obtenerse un cultivo que contiene el microorganismo en una cantidad de generalmente 50 a 200 g, preferentemente de 100 a 200 g en términos de peso celular seco por litro de medio.
Como método para separar la solución de cultivo y los microorganismos del cultivo, puede llevarse a cabo un método convencional conocido por el experto en la materia y, por ejemplo, la separación puede llevarse a cabo mediante un método de centrifugación, filtración o similar.
Los microorganismos separados del cultivo se homogeneizan mediante, por ejemplo, ultrasonidos, un molino DYNO-MILL o similar, y después, por ejemplo, se lleva a cabo una extracción con solvente, con cloroformo, hexano, hexano, butanol o similar, de manera que puede obtenerse una composición que contiene DHA.
Mediante el método para producir una composición que contiene DHA de la presente invención, puede obtenerse la composición que contiene DHA en una cantidad de 5 a 100 g, preferentemente de 10 a 80 g por cada 100 g de peso celular seco.
La composición que contiene DHA que debe producirse mediante el método de producción anteriormente indicado se somete a, por ejemplo, un método tal como un método de fraccionamiento con solvente a baja temperatura [Koretaro Takahashi, Journal of Japan Oil Chemist's Society, 40: 931-941 (1991)] o mediante un método de liberación y eliminación de ácidos grasos de cadena corta con una hidrolasa, tal como una lipasa [Koretaro Takahashi, Journal of Japan Oil Chemist's Society, 40: 931-941 (1991)], para concentrar la composición que contiene DHA, de manera que puede obtenerse una composición que contiene DHA que presenta un elevado contenido de DHA.
4. Método para producir DHA de la invención
El método para producir DHA de la presente invención se caracteriza por la separación y recolección de DHA a partir de la composición que contiene DHA obtenida mediante el método de producción indicado en 3, anteriormente.
La separación y recolección de DHA a partir de la composición que contiene DHA puede llevarse a cabo mediante la preparación de ácidos grasos mixtos que contienen DHA a partir de la composición que contiene DHA mediante, por ejemplo, un método de hidrólisis, seguido de la separación y recolección de DHA mediante, por ejemplo, un método de adición de urea, un método de separación mediante enfriamiento, cromatografía líquida de alto rendimiento, cromatografía de fluidos supercríticos o similares.
5. Método para producir alquil-éster de DHA de la invención
El método para producir alquil-éster de DHA de la presente invención se caracteriza por la separación y recolección de DHA a partir de la composición que contiene DHA obtenida mediante el método de producción indicado en 3, anteriormente.
El alquil-éster de DHA no se encuentra particularmente limitado con la condición de que sea alquil-éster de DHA; sin embargo, entre los ejemplos del mismo se incluyen preferentemente metil-éster de DHA o etil-éster de DHA, más preferentemente etil-éster de DHA.
La separación y recolección del alquil-éster de DHA a partir de la composición que contiene DHA puede llevarse a cabo mediante la preparación de alquil-ésteres de ácidos grasos mixtos que contienen DHA a partir de la composición que contiene DHA mediante, por ejemplo, un método de alcoholisis, seguido de la separación y recolección de alquil-éster de DHA mediante, por ejemplo, un método de adición de urea, un método de separación mediante enfriamiento, cromatografía líquida de alto rendimiento, cromatografía de fluidos supercríticos o similares. A continuación en la presente memoria, se muestran ejemplos de la invención de la presente solicitud; sin embargo, la presente invención no se encuentra limitada a estos ejemplos.
Ejemplo 1
Obtención del microorganismo de la invención (1)
1. Aislamiento del microorganismo de la invención
Como muestra, a partir de la que se aísla el microorganismo de la presente invención, se utilizaron hojas caídas recogidas del suelo de un manglar (una zona de aguas salobres) próxima a una zona costera en Okinawa. Las hojas caídas se sumergieron en agua marina artificial que contenía penicilina G y estreptomicina a una concentración de 300 mg/l y después, el sobrenadante del agua marina artificial se aplicó sobre un medio agar para el aislamiento que contenía penicilina G y estreptomicina (cada uno a una concentración de 300 mg/l) y se incubó a 25°C durante varios días.
Como medio agar para el aislamiento, se utilizó un medio agar que presentaba la composición siguiente: 0.2% de glucosa, 0.02% de extracto de levadura, 50% de agua marina artificial, 0.05% de glutamato sódico y 1.5% de agarosa.
Tras confirmar la aparición de muchas colonias sobre la placa de agar, se separaron las colonias y se cultivaron en un medio líquido para la evaluación a 30°C durante 48 horas.
Como medio líquido para la evaluación, se utilizó un medio líquido que presentaba la composición siguiente: 9% de glucosa, 1% de extracto de levadura, 1% de peptona y 50% de agua marina artificial.
A partir de la solución de cultivo, se extrajo un líquido utilizando el método de Bligh y Dyer (Bligh E.G. y Dyer W.J., Can. J. Biochem. Physiol. 37911 (1959)) y se secó bajo presión reducida. A continuación, el lípido seco se sometió a metilación de los ácidos grasos utilizando un kit de metilación de ácidos grasos (Nacalai Tesque, Inc.) y el metiléster de ácido graso obtenido mediante dicho tratamiento se extrajo con n-hexano. Dicho metil-éster de ácido graso se analizó mediante cromatografía de gases y se examinó la cantidad y composición de los ácidos grasos en la solución de cultivo.
Las condiciones para la cromatografía de gases se fijaron de la manera siguiente.
- Columna: HR-SS-10 (Shinwa Chemical Industries Ltd.), 0.25 mm x 25 m
- Gas portador: He, 30 ml/min
- Temperatura de la columna: 190°C
- Detección: FID
Según el procedimiento anterior, pudieron obtenerse 1239 cepas de microorganismos productores de DHA a partir de 5000 o más cepas de organismos derivados de manglar.
El contenido de DHA y la proporción de DHA a ácidos grasos totales en el cultivo de cada uno de los microorganismos productores de DHA obtenidos en este momento se muestran en la figura 1. A partir de la figura 1 se confirmó que existe una tendencia a que generalmente se incremente la proporción de DHA, se deteriore el crecimiento, de manera que se reduce la cantidad de ácidos grasos totales y se reduce el contenido de DHA, y se confirmó que la proporción de DHA en las cepas que producen una gran cantidad de ácidos grasos se concentraba a aproximadamente 30% a 40%, tal como es conocido. De entre ellas, se seleccionó una cepa que crecía bien y que mostraba una productividad de DHA elevada, y se denominó “cepa OH4”.
2. Características morfológicas de la cepa OH4
La cepa OH4 es unicelular y puede crecer en presencia de penicilina G y estreptomicina y, por lo tanto, se concluye que la cepa OH4 es un eucariota unicelular. Además, basándose en el hecho de que se aisló la cepa OH4 a partir de una muestra derivada del suelo del manglar y de que el contenido de DHA era muy elevado, se presumió que la cepa OH4 era un traustoquítrido perteneciente a los Heterokonta.
En la cepa OH4, pudo observarse una red ectoplásmica que se extendía desde una célula esférica con un diámetro de 10 a 20 pm en el medio agar anteriormente indicado para el aislamiento y, por lo tanto, se confirmó que la cepa OH4 pertenece a la familia Thraustochytriaceae de la clase Labyrinthulea del reino Chromista. Además, se confirmó que las células vegetativas presentan una forma esférica y proliferan mediante fisión binaria de los microorganismos. Dicha historia vital es característica del género Aurantiochytrium (Yokoyama R. et. al., Mycoscience 48: 329-341; Daisuke Honda, Phylogeny and Taxonomy of the Labyrinthula, Kaiyo to Seibutsu (Aquabiology), 23: 7-18, 2001). En la figura 2 se muestra una fotomicrografía de la cepa OH4.
3. Características biológicas moleculares de la cepa OH4
Se recuperó la cepa OH4 cultivada mediante la utilización del medio líquido anteriormente indicado para la evaluación en la etapa de crecimiento logarítmica y se extrajo el ADN genómico total mediante un procedimiento común utilizando perlas de vidrio y fenol-cloroformo. Se llevó a cabo una reacción de PCR utilizando el ADN genómico obtenido como molde y oligonucleótidos que consistían en las secuencias de bases representadas mediante las SEC ID n° 6 y n° 7, respectivamente, como un conjunto de cebadores, y se amplificó un gen de ARNr 18S. La secuencia de bases del producto de PCR obtenido se determinó mediante el método de Sanger.
En este método, en el procedimiento de determinación de la secuencia de bases del gen de ARNr 18S de la cepa OH4, se encontró que la molécula era polimórfica. Es un fenómeno convencionalmente conocido que la secuencia del gen de ARNr 18S de un microorganismo Labyrinthulea es polimórfica (documento de patente n° 7). Las secuencias de bases de los genes de ARNr 18S de la cepa OH4 se representan mediante las SEC ID n° 1 a n° 5, respectivamente.
Además, las diferencias en las secuencias polimórficas respectivas se muestran en la tabla 1. Se muestran los números de bases basados en la SEC ID n° 4, que es la secuencia más larga.
Tabla 1 Comparación de las secuencias génicas de ARNr 18S de la cepa OH4
Figure imgf000008_0001
Figure imgf000009_0001
Las secuencias de bases representadas mediante las SEC ID n° 1 a n° 5 se buscaron utilizando el algoritmo BLAST de Karlin y Altschul [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873 (1993) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)]. Como resultado, dichas secuencias de bases mostraron una identidad de 99% respecto a las secuencias de bases de los genes de ARNr 18S de Aurantiochytrium sp. cepa KRS101 y de Aurantiochytrium sp. cepa BL11.
Por otra parte, no se encontraron secuencias que se correspondiesen por completo con ninguna de las secuencias de bases representadas mediante las SEC ID n° 1 a n° 5 en la base de datos NCBI.
Basándose en las características morfológicas y características biológicas moleculares anteriormente indicadas, se concluyó que la cepa OH4 es un microorganismo nuevo perteneciente al género Aurantiochytrium y denominado "Aurantiochytrium sp. cepa OH4", y depositado en el depósito de microorganismos de patentes del National Institute of Technology and Evaluation (NlTE) (Central 6, 1-1, Higashi, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, Japón) el 11 de enero de 2013 bajo el número de acceso Fe RM BP-11524.
Por otra parte, la clasificación podría cambiar por el avance de la investigación en el futuro; sin embargo, el microorganismo de la presente invención todavía es un nuevo microorganismo.
Ejemplo 2
Obtención de microorganismos mutantes utilizando el microorganismo de la invención (2)
1. Adquisición de mutante obtenido mediante la utilización de Aurantiochytrium sp. cepa OH4 como cepa parental Se sometió la cepa OH4 de Aurantiochytrium sp. A un tratamiento de mutación con N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG) de manera que la tasa de mortalidad fuese de 99.9%. A continuación, se aisló una colonia superviviente y se cultivó en un medio líquido para la evaluación a 30°C durante 48 horas. Como resultado, pudo obtenerse una cepa en la que la proporción de DHA se había incrementado en aproximadamente 1,6 veces, y junto a ello, se había incrementado el contenido de DHA en aproximadamente 3 veces. Esta cepa se denominó "Aurantiochytrium sp. cepa LTR23”.
La figura 3 es una vista en la que el contenido de DHA y la proporción de DHA a ácidos grasos totales en el cultivo de Aurantiochytrium sp. cepa LTR23 se ha añadido a la figura 1. A partir de la figura 3 pudo confirmarse que Aurantiochytrium sp. cepa LTR23 presenta una proporción de DHA más elevada y asimismo un contenido de DHA más elevado que un aislado espontáneo.
Ejemplo 3
Producción industrial de composición que contiene DHA de la invención
1. Cultivo de Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y cepa LTR23
Se cultivó cada una de Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y cepa LTR23 en un fermentador de tanque. Además, para la comparación, se cultivaron bajo las mismas condiciones Aurantiochytrium limacinum cepa SR21 (documentos de patente n° 4 a n° 6 y documento no de patente n° 4) y Schizochytrium sp. cepa S31 (documento de patente n° 9), los cuales se ha informado que son microorganismos de producción elevada de DHA.
Aurantiochytrium limacinum cepa SR21 (ATCC n° MYA-1381) y Schizochytrium sp. cepa S31 (ATCC n° 20888) se obtuvieron de la American Type Culture Collection (ATCC).
Cada una de las cepas microbianas criopreservadas anteriormente indicadas se inoculó en el medio agar para el aislamiento utilizado en el ejemplo 1. Tras confirmar que los microorganismos crecían suficientemente, se desprendieron del medio mediante raspado y se inocularon en el medio líquido para la evaluación utilizado en el ejemplo 1 para llevar a cabo el cultivo de siembra. Tras confirmar que los microorganismos crecían suficientemente mediante el cultivo de siembra, se inocularon los microorganismos en un fermentador de tanque de 3 l. La composición del medio en el fermentador de tanque de 3 l estaba de acuerdo con la del documento de patente n° 9.
Es decir, se preparó un medio compuesto de sulfato sódico (12 g/L), KCl (0.5 g/l), MgSO4-7H2O (2 g/l), antiespumante Hodag K-60 (0.35 g/l), K2SO4 (0.65 g/l), KH2PO4 (1 g/l), (NH4)2SO4 (1 g/l), C a C h ^^ O (0.17 g/l), MnCl2-4H2O (3 mg/l), ZnSO4-7H2O (3 mg/l), C o C h ^ ^ O (0.04 mg/l), Na2MoO4'2H2O (0.04 mg/l), CuSO4'5H2O (2 mg/l), MSO46H2O (2 mg/l), FeSO4-7H2O (10 mg/l), tiamina (9.5 mg/l), vitamina B12 (0.15 mg/l) y pantotenato cálcico (3.2 mg/l).
Los cambios fueron los siguientes: debido a que el consumo de azúcar de Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y cepa LTR23 es elevado, se fijó la concentración de glucosa en 120 g/l y, además, como fuente de nitrógeno, se utilizó una solución de NH4OH al 28%. En el estadio en que los 120 g/l de glucosa en el medio se habían consumido por completo, se alimentó adicionalmente al medio una solución de glucosa a una concentración de 65% y se llevó a cabo el cultivo en continuo durante un máximo de 85 horas.
A partir del cultivo obtenido, de la misma manera que en el ejemplo 1, se extrajo un lípido mediante el método de Bligh y Dyer, seguido de metilación, y el lípido se analizó mediante cromatografía de gases.
Los microorganismos obtenidos se congelaron a -80°C, seguido de liofilización, obteniendo de esta manera microorganismos secos. El peso de los microorganismos secos obtenidos de esta manera se midió y se convirtió en la cantidad original de la solución de cultivo, calculando de esta manera el peso celular seco (PCS) en el cultivo.
Se resumen los resultados del cultivo en la tabla 2 a continuación.
Tabla 2 Resultados del cultivo en fermentador de tanque
Figure imgf000010_0001
Como resultado del cultivo, en el caso de Aurantiochytrium sp. cepa OH4, el peso celular seco era de 145.3 g/l de cultivo, y el contenido de DHA era de 26 g/l de cultivo, que resultó ser significativamente más elevado que en los microorganismos de los que se ha informado como microorganismos de elevada producción de DHA. Debido a que el DHA se acumula en los microorganismos, un peso celular seco elevado presenta la ventaja de que la cantidad de DHA que puede recolectarse finalmente es elevada.
Además, en el caso de Aurantiochytrium sp. cepa lTR23, el contenido de DHA era de 44 g/l de cultivo, la composición de DHA en los ácidos grasos totales era de 52% y la productividad de DHA era de 0.505 g/l/h y, de esta manera, se demostró que Aurantiochytrium sp. cepa LTR23 sobrepasa a Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y los microorganismos de los que se ha informado como microorganismos de producción elevada de DHA.
2. Composición de ácidos grasos en Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y cepa LTR23
La composición de ácidos grasos en Aurantiochytrium sp. cepa OH4 y cepa LTR23 cultivadas en el fermentador de tanque se muestran en la tabla 3, a continuación. Los valores para Schizochytrium sp. cepa S31 se han reimpreso del documento no de patente n° 2.
Tabla 3 Composición de ácidos grasos
Figure imgf000010_0002
A partir de los resultados anteriores, se demostró que, en la composición de ácidos grasos de Aurantiochytrium sp. cepa LTR23, se reduce el nivel de ácido palmítico y de los ácidos grasos saturados de cadena corta, y se incrementa el nivel de ácidos grasos poliinsaturados tales como DHA y 22:5 (n-6). Es conocido que los ácidos grasos saturados incrementan el colesterol-LDL y la proporción de colesterol total a colesterol-HDL, y se señala que existe una posibilidad de que se incremente el riesgo de diabetes. Por lo tanto, asimismo desde el punto de vista nutricional, se demuestra la significación de Aurantiochytrium sp. cepa LTR23.

Claims (5)

REIVINDICACIONES
1. Microorganismo que pertenece al género Aurantiochytrium que presenta un gen de ARNr 18S que consiste en la secuencia de bases representada mediante cualquiera de las SEC ID n° 1 a 5.
2. Aurantiochytrium sp. cepa OH4 (número de acceso: FERM BP-11524).
3. Método para producir una composición que contiene DHA, que comprende cultivar el microorganismo según la reivindicación 1 o 2 en un medio, permitir que la composición que contiene DHA sea producida y acumulada en un cultivo y recoger la composición que contiene DHA a partir del cultivo.
4. Método para producir DHA que comprende separar y recoger DHA a partir de la composición que contiene DHA recogida según la reivindicación 3.
5. Método para producir alquil éster de DHA que comprende separar y recoger alquil éster de DHA a partir de la composición que contiene DHA recogida según la reivindicación 4.
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