ES2652437T3 - Antagonistas de activina-actrii y usos para el tratamiento de trastornos óseos y otros trastornos - Google Patents
Antagonistas de activina-actrii y usos para el tratamiento de trastornos óseos y otros trastornos Download PDFInfo
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Abstract
Un Inhibidor de ActRII para su uso en un método para el tratamiento de la calcificación vascular en un sujeto, donde dicho inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: a) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; b) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; c) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; d) SEQ ID NO: 2; e) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; f) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; g) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; h) SEQ ID NO: 3; i) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; j) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; k) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; 1) SEQ ID NO: 6; m) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; n) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; o) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; p) SEQ ID NO: 7; q) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 12; r) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 12; s) 98% idéntica a la SEQ ID NO: 12; ...
Description
Antagonistas de activina-actrii y usos para el tratamiento de trastornos óseos y otros trastornos
El campo técnico de la presente invención se refiere a la calcificación vascular. La presente invención se refiere a un inhibidor de ActRII para uso en un método de tratamiento de la calcificación vascular en un sujeto tal y como se define en las reivindicaciones.
El crecimiento y la mineralización óseos dependen de las actividades de dos tipos de células, los osteoclastos y los osteoblastos, aunque los condrocitos y las células de la vasculatura también participan en aspectos críticos de estos procesos. A nivel de desarrollo, la formación de hueso se produce mediante dos mecanismos, la osificación endocondral y la osificación intramembranosa, siendo el primero responsable de la formación longitudinal del hueso y el último responsable de la formación de huesos topológicamente planos tales como los huesos del cráneo. La osificación endocondral requiere la formación y degradación secuenciales de estructuras cartilaginosas de las placas de crecimiento que sirven como moldes para la formación de osteoblastos, osteoclastos, la vasculatura y la posterior mineralización. Durante la osificación intramembranosa, se forma hueso directamente en los tejidos conjuntivos. Ambos procesos requieren la infiltración de osteoblastos y posterior deposición en la matriz.
La enfermedad renal crónica está asociada a un deterioro progresivo de la homeostasis mineral, con una alteración de las concentraciones de fósforo y calcio normales en el suero y los tejidos, y a cambios en las hormonas circulantes, tales como la hormona paratiroidea, la 25-hidroxivitamina D, la 1,25-dihidroxivitamina D, otros metabolitos de la vitamina D, el factor de crecimiento fibroblástico 23 y la hormona del crecimiento. Véase, Chronic Kidney Disease-Mineral and Bone Disorder (CKD-MBD), Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) CKD-MBD Work Group, In: Kidney Int Suppl. (2009) 76 (Suppl 113):S1-130, página S3. La homeostasis mineral y hormonal alterada en la enfermedad renal crónica es crítica para la formación inicial de hueso durante el crecimiento (modelado óseo) y para la estructura y función del hueso durante la edad adulta (remodelado óseo). Como resultado, los pacientes con enfermedad renal crónica presentan anomalías óseas. Además, de forma similar, debido a la alteración de las funciones mineral y endocrina, los pacientes con enfermedad renal crónica pueden presentar calcificación extraesquelética. Estos síndromes se denominan trastornos minerales y óseos asociados a la enfermedad renal crónica («CDK-MBD»).
El hueso experimenta un recambio constante. El recambio óseo es el proceso de resorción y posterior sustitución de hueso. Los osteoblastos y osteoclastos son las células necesarias para el recambio óseo. La enfermedad ósea de bajo recambio y la enfermedad ósea adinámica se caracterizan por una resorción y sustitución de hueso reducidas o inexistentes. Los CKD-MBD se pueden caracterizar por un bajo recambio o huesos adinámicos. (Chronic Kidney Disease-Mineral and Bone Disorder (CKD-MBD), Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) CKD-MBD Work Group, In: Kidney Int Suppl. (2009) 76 (Suppl 113):S1-130, página S34).
El aumento de los niveles de calcio en la vasculatura puede derivar en calcificación vascular, una afección caracterizada por un mayor endurecimiento de los vasos. Los pacientes con calcificación vascular tienen mayor riesgo de sufrir infarto de miocardio y la calcificación vascular es especialmente prevalente en pacientes que sufren enfermedades renales, por ejemplo, CKD-MBD. Véase, p. ej., Shanahan y col., 2011, Circ. Res. 109:697-711.
Se han identificado dos receptores tipo II relacionados, ActRIIA y ActRIIB, como receptores tipo II de activinas (Mathews and Vale, 1991, Cell 65:973-982; Attisano y col, 1992, Cell 68: 97-108). Además de con las activinas, ActRIIA y ActRIIB pueden interactuar bioquímicamente con otras proteínas de la familia TGF-beta, incluyendo BMP7, Nodal, GDF8, y GDF11 (Yamashita y col., 1995, J. Cell Biol. 130:217-226; Lee and McPherron, 2001, Proc. Natl. Acad. Sci. 98:9306-9311; Yeo and Whitman, 2001, Mol. Cell 7: 949-957; Oh y col., 2002, Genes Dev. 16:2749-54). ALK4 es el receptor tipo I principal de las activinas, especialmente de la activina A, y ALK-7 puede servir también como receptor de activinas, especialmente de la activina B.
La presente invención se refiere a un inhibidor de ActRII para uso en un método de tratamiento de la calcificación vascular, es decir, la acumulación de sales de calcio en la vasculatura del sujeto, por ejemplo, la calcificación de las arterias del sujeto, donde el inhibidor de ActRIIA es un polipéptido seleccionado de entre el grupo que consiste en: a. un polipéptido al menos un 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 2; b. un polipéptido al menos un 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 2; c. un polipéptido al menos un 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 2; d. la SEQ ID NO: 2; e. un polipéptido al menos un 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 3; f. un polipéptido al menos un 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 3; g. un polipéptido al menos un 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 3; h. la SEQ ID NO: 3; i. un polipéptido al menos un 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 6; j. un polipéptido al menos un 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 6; k. un polipéptido al menos un 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 6; 1. la SEQ ID NO: 6; m. un polipéptido al menos un 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 7; n. un polipéptido al menos un 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 7; o. un polipéptido al menos un 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 7; p. la SEQ ID NO:7; q. un polipéptido al menos un 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 12; r.
un polipéptido al menos un 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 12; s. un polipéptido al menos un 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 12; y t. la SEQ ID NO: 12; u) 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 17; v) 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 17; w) 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 17; x) la SEQ ID NO: 17; y) 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 20; z) 95 % idéntico a la SEQ ID N0: 20; aa) 98 % idéntico a la SEQ ID N0: 20; bb) la SEQ ID N0: 20; cc) 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 21; dd) 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 21; ee) 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 21; ff) la SEQ ID NO: 21; gg) 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 23; hh) 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 23; ii) 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 23; jj) la SEQ ID NO: 23; kk) 90 % idéntico a la SEQ ID NO: 25; 11) 95 % idéntico a la SEQ ID NO: 25; mm) 98 % idéntico a la SEQ ID NO: 25 y nn) la SEQ ID NO: 25; o donde el inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID N0: 7.
En ciertas realizaciones, el sujeto que se va a tratar con los métodos proporcionados en el presente documento tiene menos de 18 años de edad. En ciertas realizaciones, el sujeto que se va a tratar con los métodos proporcionados en el presente documento tiene enfermedad renal crónica en etapa terminal. En ciertas realizaciones, el sujeto que se va a tratar con los métodos proporcionados en el presente documento se somete a diálisis.
Figura 1: Peso corporal de un ratón tras nefrectomía parcial.
Figura 2: Cambios en la BMD mediante DEXA tras nefrectomía parcial en ratones.
Figura 3: Cambios en el hematocrito del equivalente murino de la SEQ ID NO 7 («mActRIIA-Fc») tras nefrectomía parcial en ratones.
Figura 4: Imagen 3D de micro-CT de huesos representativos tras nefrectomía parcial en ratones.
Figura 5: el tratamiento con mActRIIA-Fc aumenta el hematocrito.
Figura 6: mActRIIA-Fc la densidad mineral ósea.
Figura 7: Tomografías micro-CT representativas de fémures.
Figura 8: mActRIIA-Fc aumenta el espesor cortical de la diáfisis media del fémur.
Figura 9: mActRIIA-Fc aumenta el volumen óseo trabecular.
Figura 10: mActRIIA-Fc aumenta el espesor trabecular en el fémur distal.
Figura 11: mActRIIA-Fc provoca una reducción de los niveles de calcio aórtico en un modelo de ratón con CKD.
En el presente documento se desvela un método de tratamiento de trastornos minerales y óseos asociados a la enfermedad renal crónica (CKD-MBD) donde el método comprende la administración de un inhibidor de ActRII a un paciente que necesita tratamiento. El inhibidor de ActRII puede ser un inhibidor de ActRIIA y/o ActRIIB.
Los CKD-MBD se pueden diagnosticar como un trastorno sistémico del metabolismo mineral y óseo debido a la enfermedad renal crónica y se pueden manifestar mediante una o una combinación de (1) anomalías de calcio; fósforo, producto de calcio x fósforo; fosfatasas alcalinas (totales o específicas del hueso); bicarbonato; hormona paratiroidea («PTH»); PTH 1-84, relación PTH 1-84/PTH 7-84; osteocalcina; osteoprotegerina; isoforma 5b de la fosfatasa ácida tartrato-resistente («TRAP-5b»); piridinolina y desoxipiridinolina; péptidos de extensión aminoterminal del procolágeno tipo 1; enlaces cruzados en C-terminal; enlaces cruzados de colágeno en C-terminal; factor de crecimiento fibroblástico 23 («FGF23»); fetulina-A; o metabolismo de la vitamina D; (2) anomalías del recambio, la mineralización, el volumen, el crecimiento lineal o la resistencia óseos y (3) calcificación vascular o de otros tejidos blandos. Véase Nickolas, 2008, Kidney International 74:721-731; and Moe y col., 2006, Kidney International 69:19451953. Se pueden encontrar directrices para el diagnóstico de los CKD-MBD, p. ej., en KDIGO clinical practice guidelines for the prevention, diagnosis, evaluation, and treatment of Chronic Kidney Disease-Mineral and Bone Disorder (CKD-MBD), Kidney Disease: Improving Global Outcomes (KDIGO) CKD-MBD Work Group, In: Kidney Int Suppl. (2009) 76 (Suppl 113):S1-130.
En el presente documento se desvelan métodos de formas de bajo recambio óseo de los CKD-MBD donde el método comprende la administración de un inhibidor de ActRII a un paciente que necesita tratamiento. En el presente documento se desvelan métodos de tratamiento de los CKD-MBD caracterizados por hiperfosfatemia y/o hipercalcemia. En ciertas realizaciones del presente documento, se proporcionan métodos de tratamiento de los CKD-MBD caracterizados por calcificación extraesquelética tales como, pero no limitados a, la calcificación aterosclerótica.
En el presente documento se desvelan métodos de tratamiento de los CKD-MBD, donde la enfermedad renal crónica ha alcanzado una etapa 3, etapa 4, etapa 5, o etapa 5D. En una realización específica, la enfermedad renal es una enfermedad renal en etapa terminal. En ciertas realizaciones del presente documento, se proporcionan métodos de tratamiento de los CKD-MBD caracterizados por una velocidad de filtración glomerular inferior a 60 ml/min/1,73 m2 en adultos o inferior a 89 ml/min/1,73 m2 en pacientes pediátricos. Véase, Moe y col., 2006, Kidney International 69:1945-1953. En ciertas realizaciones del presente documento, se proporcionan métodos de tratamiento en adultos de los CKD-MBD caracterizados por una velocidad de filtración glomerular inferior a 50
2222 2
ml/min/1,73 m , 40 ml/min/1,73 m , 30 ml/min/1,73 m, 20 ml/min/1,73 m o inferior a 10 ml/min/1,73 m . En el
presente documento se desvelan métodos de tratamiento en pacientes pediátricos de los CKD-MBD caracterizados por una velocidad de filtración glomerular inferior a 80 ml/min/1,73 m2, 70 ml/min/1,73 m2, 60 ml/min/1,73 m2, 50
2222 2
ml/min/1,73 m, 40 ml/min/1,73 m, 30 ml/min/1,73 m, 20 ml/min/1,73mo inferior a 10 ml/min/1,73 m.
Sin querer limitarnos a la teoría, una velocidad de filtración glomerular inferior a 60 ml/min/1,73m2 en pacientes adultos e inferior a 89 ml/min/1,73 m2 en pacientes pediátricos deriva en anomalías detectables de los niveles de calcio, los niveles de fósforo, los niveles de PTH y el metabolismo de la vitamina D; y los niveles anómalos de estos marcadores derivan en enfermedad ósea.
En el presente documento se desvelan métodos de tratamiento de una patología ósea asociada a la enfermedad renal crónica, es decir, un CKD-MBD. Véase Moe y col., 2006, Kidney International 69:1945-1953. En ciertas realizaciones, el CKD-MBD es un CKD-MBD de bajo recambio óseo. Los CKD-MBD por recambio bajo se pueden diagnosticar mediante las características histológicas expuestas en la Tabla 1 que se muestra a continuación. Véase National Kidney Foundation, Kidney Disease Outcomes Quality Initiative Guidelines en el sitio web de la National Kidney Foundation.
Tabla 1 Características histológicas de los CKD-MBD de bajo recambio
- Característica
- Adinámico Osteomalacia
- Formación de hueso
- Volumen óseo trabecular
- Normal, bajo Variable
- Bajo, normal o alto
- Volumen de osteoide
- Normal, bajo Alto-muy alto
- Espesor del ribete de osteoide
- Normal, bajo Alto-muy alto
- Número de osteoblastos
- Bajo Bajo
- Velocidad de formación de hueso
- Baja-muy baja Baja-muy baja
- Retraso de la mineralización
- Normal Prolongado
- Resorción ósea
- Perímetro óseo erosionado
- Normal, bajo Variable
- Con frecuencia bajo, puede ser alto
- Número de osteoclastos
- Bajo Bajo, puede ser normal o alto
- Fibrosis medular
- Ausente Ausente
En el presente documento se desvela un método de tratamiento de calcificación extraesquelética en un sujeto, donde dicho método comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII al sujeto. En el presente documento se desvela un método de prevención de calcificación extraesquelética en un sujeto, donde dicho método comprende la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII al sujeto. La calcificación extraesquelética tratada o prevenida en un sujeto mediante los métodos descritos en el presente documento es calcificación vascular, es decir, la acumulación de sales de calcio en la vasculatura del sujeto, por ejemplo, calcificación de las arterias del sujeto.
En ciertas realizaciones, los métodos de tratamiento o prevención de la calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, se llevan a cabo en un sujeto con riego de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular (es decir, se administra al sujeto en riesgo un inhibidor de ActRII de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento). En una realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene hipercolesterolemia. En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene hipertensión. En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene diabetes. En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene una enfermedad renal (por ejemplo, una enfermedad renal en etapa terminal). En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene enfermedad renal crónica. En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene un aumento del estrés oxidativo, por ejemplo, un desequilibrio entre producción de oxidantes y actividad antioxidante en la vasculatura. En otra realización específica, el sujeto con riesgo de sufrir calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene deficiencia de inhibidor de la calcificación (por ejemplo, una deficiencia de una o más de entre fetuina-A, proteína Gla de matriz (MGP) y osteoprotegerina (OPG)).
En ciertas realizaciones, los sujetos que sufren calcificación vascular tratados de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tienen calcificación de la media (también conocida como esclerosis de Mönckeberg o calcinosis de la media). La calcificación de la media se caracteriza por depósitos minerales difusos en la túnica media de las arterias. En una realización específica, los sujetos que sufren calcificación de la media son ancianos. En una realización específica, los sujetos que sufren calcificación de la media tienen un trastorno que provoca la calcificación de la media, por ejemplo, diabetes o una enfermedad renal (por ejemplo, CKD).
En ciertas realizaciones, los sujetos que sufren calcificación vascular tratados de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tienen calcificación de la íntima. La calcificación de la íntima se asocia a la aterosclerosis y progresa a medida que progresan las placas ateroscleróticas.
En ciertas realizaciones, un paciente que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, tiene mayores niveles de FGF23, una hormona producida por los osteocitos en respuesta a la reducción de la carga mecánica, menor formación de hueso y exceso de fósforo en el reservorio intercambiable (véase, p. ej., el documento Hruska and Mathew, 2011, Advances in Chronic Kidney Disease 18(2):98-104), relativo a los niveles de FGF23 en sujetos que no sufren, ni tienen riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular. Se pueden detectar los niveles de FGF23 usando métodos conocidos en la técnica, p. ej., ELISA, usando muestras de los sujetos, p. ej., sangre o suero. En una realización específica, el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre,
o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, es de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 %, 50 % o más del 50 %, superior al nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que no sufre, ni tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular. En otra realización específica, el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, es de aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 %, 30-40 %, 40-50 %, 50-60 %, 50-75 % o 75-100 %, superior al nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que no sufre, ni tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular.
En ciertas realizaciones, los niveles de FGF23 en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, se pueden usar para monitorizar la efectividad de un método descrito en el presente documento, p. ej., un método de tratamiento de una forma de CKD-BMD y/o un método de tratamiento de la calcificación extraesquelética (p. ej., calcificación vascular), donde tales métodos comprenden la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII descrito en el presente documento. En una realización específica, un sujeto tratado de acuerdo con uno o más de los métodos descritos en el presente documento tiene un nivel de FGF23 (p. ej., tal y como se detecta en el suero del sujeto) menor que el nivel de FGF23 detectado en el sujeto antes de ser tratado con un método descrito en el presente documento. En otra realización específica, el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, tratado con un método descrito en el presente documento se ha reducido en aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 %, 50 % o más del 50 % en comparación con el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) detectado en el sujeto antes del tratamiento con un método descrito en el presente documento. En otra realización específica, el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, se ha reducido en aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 %, 3040 %, 40-50 %, 50-60 %, 50-75 % o 75-100 % en comparación con el nivel de FGF23 (p. ej., el nivel detectable en el suero) detectado en el sujeto antes del tratamiento con un método descrito en el presente documento.
En una realización específica del presente documento, se desvela un método de tratamiento de una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular, que comprende: (i) administración de un inhibidor de ActRII a un individuo que padece una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular; (ii) determinación de una cantidad de FGF23 en una muestra de tejido (p. ej., suero) de dicho individuo después de la administración del inhibidor de ActRII y (iii) si la cantidad de FGF23 en dicha muestra de tejido se ha reducido en menos de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 % o 25 %, o en aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 % en comparación con la cantidad de FGF23 determinada en una muestra del mismo tipo de tejido de dicho individuo (p. ej., una muestra diferente de suero del mismo individuo) antes de la administración del inhibidor de ActRII, repetición de la administración del inhibidor de ActRII. En ciertas realizaciones, si la cantidad de FGF23 no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la dosis de inhibidor de ActRII administrada. En ciertas realizaciones, si la cantidad de FGF23 no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la frecuencia de administración del inhibidor de ActRII administrado.
En ciertas realizaciones, un paciente que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, tiene mayores niveles de esclerostina, una proteína que presenta mayores niveles en sujetos que sufren, o tienen riesgo de sufrir, CKD-MBD (véase, p. ej., Graciolli y col., 2010, J Am Soc Nephrol 21:774A), relativo a los niveles de esclerostina en sujetos que no sufren, ni tienen riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular. Se pueden detectar los niveles de esclerostina usando métodos conocidos en la técnica, p. ej., ELISA, usando muestras de los sujetos, p. ej., sangre o suero. En una realización específica, el nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o con riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, es de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 %, 50 % o superior al 50 % superior al nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que no sufre, ni tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular. En otra realización específica, el nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o con riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, es de aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 %, 30-40 %, 40-50 %, 50-60 %, 50-75 % o 75-100 % superior al nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que no sufre, ni tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, por ejemplo, calcificación vascular.
En ciertas realizaciones, los niveles de esclerostina en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, se pueden usar para monitorizar la efectividad de un método descrito en el presente documento, p. ej., un método de tratamiento de una forma de CKD-BMD y/o un método de tratamiento de la calcificación extraesquelética (por ejemplo, calcificación vascular), donde tales métodos comprenden la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII descrito en el presente documento. En una realización específica, un sujeto tratado de acuerdo con uno o más de los métodos descritos en el presente documento tiene un nivel de esclerostina (p. ej., tal y como se detecta en el suero del sujeto) menor que el nivel de esclerostina detectado en el sujeto antes de ser tratado con un método descrito en el presente documento. En otra realización específica, el nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, tratado con un método descrito en el presente documento se ha reducido en aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 %, 50 % o más del 50 % en comparación con el nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) detectado en el sujeto antes del tratamiento con un método descrito en el presente documento. En otra realización específica, el nivel de esclerostina
- (p.
- ej., el nivel detectable en el suero) en un sujeto que sufre, o tiene riesgo de sufrir, una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, se ha reducido en aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 %, 30-40 %, 40-50 %, 50-60 %, 50-75 % o 75-100 % en comparación con el nivel de esclerostina (p. ej., el nivel detectable en el suero) detectado en el sujeto antes del tratamiento con un método descrito en el presente documento.
En el presente documento se desvela un método de tratamiento de una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, que comprende: (i) administración de un inhibidor de ActRII a un individuo que padece una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular; (ii) determinación de una cantidad de esclerostina en una muestra de tejido (p. ej., suero) de dicho individuo después de la administración del inhibidor de ActRII y (iii) si la cantidad de esclerostina en dicha muestra de tejido se ha reducido en menos de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 % o 25 %, o en aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 % en comparación con la cantidad de esclerostina determinada en una muestra del mismo tejido de dicho individuo
- (p.
- ej., una muestra diferente de suero del mismo individuo) antes de la administración del inhibidor de ActRII, repetición de la administración del inhibidor de ActRII. En ciertas realizaciones, si la cantidad de esclerostina no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la dosis del inhibidor de ActRII administrada. En ciertas realizaciones, si la cantidad de esclerostina no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la frecuencia de administración de inhibidor de ActRII administrado.
En ciertas realizaciones, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene menos de 18 años de edad. En una realización específica, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene menos de 13 años de edad. En otra realización específica, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene menos de 12, menos de 11, menos de 10, menos de 9, menos de 8, menos de 7, menos de 6 o menos de 5 años de edad. En otra realización específica, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene de 1-3 años de edad, 3-5 años de edad. 5-7 años de edad, 7-9 años de edad, 9-11 años de edad, 11-13 años de edad, 13-15 años de edad, 15-20 años de edad, 20-25 años de edad, 25-30 años de edad o más de 30 años de edad. En otra realización específica, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene de 30-35 años de edad, 35-40 años de edad, 40-45 años de edad, 45-50 años de edad, 50-55 años de edad, 55-60 años de edad o más de 60 años de edad. En otra realización específica, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene de 60-65 años de edad, 6570 años de edad, 70-75 años de edad, 75-80 años de edad o más de 80 años de edad.
En ciertas realizaciones, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento tiene una enfermedad renal en etapa terminal. En ciertas realizaciones, el sujeto que sufre calcificación vascular tratado de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento se somete a diálisis.
En ciertas realizaciones, la efectividad del tratamiento o la prevención de la calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular, se evalúa usando uno o más ensayos conocidos por los expertos en la materia. Los ensayos ejemplares se describen en la Sección 5.3(a)(iv). De acuerdo con tales realizaciones, un experto en la materia entenderá que al sujeto que está siendo tratado con un inhibidor de ActRII tal y como se describe en el presente documento se le puede ajustar el régimen de tratamiento en función del resultado de los ensayos. Por ejemplo, a un sujeto que está siendo tratado mediante un método descrito en el presente documento y muestra aumento de los niveles de calcio, p. ej., calcio vascular (p. ej., calcio arterial), se le puede administrar una dosis mayor de inhibidor de ActRII o se le puede administrar un inhibidor de ActRII más frecuentemente (es decir, el tiempo entre administraciones de dosis se puede reducir). Por el contrario, a un sujeto que está siendo tratado mediante un método descrito en el presente documento y muestra reducción de los niveles de calcio, p. ej., calcio vascular (p. ej., calcio arterial), se le puede administrar una dosis menor de inhibidor de ActRII o se le puede administrar un inhibidor de ActRII menos frecuentemente (es decir, el tiempo entre administraciones de dosis se puede aumentar).
En ciertas realizaciones, los métodos proporcionados en el presente documento derivan en la mejora de los síntomas de uno o más de los siguientes: hiperfosfatemia, hiperparatiroidismo secundario (debido al aumento de fósforo) y calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular. Cualquier método conocido por el experto en la materia para determinar el grado de estos síntomas se puede usar con los métodos proporcionados en el presente documento. En realizaciones específicas, los métodos descritos en el presente documento derivan en la mejora de uno o más síntomas de la calcificación vascular. Los síntomas ejemplares incluyen, sin limitación, aumentos de los niveles de calcio vascular (p. ej., arterial), aumento de la apoptosis de las células del músculo liso vascular, pérdida de elasticidad arterial, un aumento de la PWV (velocidad de la onda de pulso arterial), desarrollo de hipertrofia ventricular izquierda, reducción de la perfusión de la arteria coronaria e isquemia miocárdica.
En ciertas realizaciones, los métodos descritos en el presente documento derivan en una reducción de los niveles de calcio vascular, p. ej., calcio arterial, en un sujeto de al menos un 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 % o 50 %. En ciertas realizaciones, los métodos descritos en el presente documento derivan en una reducción de los niveles de calcio vascular, p. ej., calcio arterial, en un sujeto del 5-10 %, 10-15 %, 15-20 %, 20-25 %, 25-30 %, 30-35 %, 35-40 %, 40-45 % o 45-50 %.
En el presente documento se desvela un método de reducción de los niveles de calcio vascular en un sujeto, que comprende: (i) administración de un inhibidor de ActRII a un sujeto que necesita una reducción de los niveles de calcio vascular (p. ej., un sujeto que padece una forma de CKD-MBD y/o calcificación extraesquelética, p. ej., calcificación vascular); (ii) determinación de una cantidad de calcio vascular en una muestra de tejido (p. ej., suero) de dicho sujeto después de la administración del inhibidor de ActRII y (iii) si la cantidad de calcio vascular en dicha muestra de tejido se ha reducido menos de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 % o 25 %, o en aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 % en comparación con la cantidad de calcio vascular determinada en una muestra del mismo tejido de dicho sujeto (p. ej., una muestra diferente de suero del mismo individuo) antes de la administración del inhibidor de ActRII, repetición de la administración del inhibidor de ActRII. En ciertas realizaciones, si la cantidad de calcio vascular no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la dosis de inhibidor de ActRII administrada. En ciertas realizaciones, si la cantidad de calcio vascular no se reduce después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la frecuencia de administración del inhibidor de ActRII administrado.
En ciertas realizaciones, los métodos descritos en el presente documento derivan en un descenso de la progresión del puntaje de Agatston de un sujeto que padece o tiene riesgo de desarrollar calcificación vascular. En una realización específica, los métodos descritos en el presente documento permiten un descenso del 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 % o superior al 30 % del puntaje de Agatston de un sujeto que padece o tiene riesgo de desarrollar calcificación vascular en comparación con el puntaje de Agatston del sujeto antes de la administración de un inhibidor de ActRII de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento (véase, p. ej., la Sección 5.3(a)(iv)). En una realización específica, los métodos descritos en el presente documento permiten un descenso del 5-10 %, 10-15 %, 15-20 %, 20-25 %, 25-30 %, 30-35 %, 35-40 %, 40-45 % o 45-50 % del puntaje de Agatston de un sujeto que padece o tiene riesgo de desarrollar calcificación vascular en comparación con el puntaje de Agatston del sujeto antes de la administración de un inhibidor de ActRII de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento (véase, p. ej., la Sección 5.3(a)(iv)).
En otra realización específica, los métodos descritos en el presente documento permiten un descenso de los niveles de calcio en la vasculatura del sujeto, p. ej., un descenso de los niveles de calcio en una o más arterias del sujeto, p.
ej., un sujeto que padece o tiene riesgo de desarrollar calcificación vascular. En otra realización específica, los métodos descritos en el presente documento permiten un descenso de los niveles de fósforo en la vasculatura del sujeto, p. ej., un descenso de los niveles de fósforo en una o más arterias del sujeto, p. ej., un sujeto que padece o tiene riesgo de desarrollar calcificación vascular.
En el presente documento se desvelan métodos de tratamiento de enfermedades óseas de bajo recambio. El recambio óseo bajo se puede diagnosticar usando las pruebas expuestas en la Sección 5.3(a) que se muestra más adelante. Los marcadores bioquímicos del recambio óseo incluyen: enlaces cruzados de colágeno (telopéptido N o telopéptido C) en suero u orina, fosfatasa alcalina específica del hueso, osteocalcina sérica y/o propéptido de colágeno tipo 1, 25-hidroxivitamina D y hormona paratiroidea («PTH»). En una realización específica, la enfermedad ósea de bajo recambio es enfermedad ósea adinámica. En ciertas realizaciones, un paciente que se va a tratar con los métodos proporcionados en el presente documento tiene una reducción del recambio óseo de al menos un 10 %, 20%, 25%, 30%,40 %, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 85 %, 90 %, 95 %, 98 %, 99%odel100%. En ciertas realizaciones, un paciente que se va a tratar con los métodos descritos en el presente documento tiene una reducción del recambio óseo de como mucho un 10 %, 20 %, 25 %, 30 %, 40 %, 50 %, 60 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 98 %, 99 % o del 100 %. En ciertas realizaciones, un paciente que se va a tratar con los métodos descritos en el presente documento tiene una reducción del recambio óseo de entre el 10 % y el 25 %, 20 % y 35 %, 30 % y 45 %, 40 % y 55 %, 50 % y 65 %, 60 % y 75 %, 70 % y 85 %, 80 % y 95 %, 90 % y 100 %. En ciertas realizaciones, la reducción del recambio óseo se compara con los datos históricos del mismo paciente. En otras realizaciones, la reducción del recambio óseo se compara con el recambio óseo promedio de una población sin enfermedades óseas. La población sin enfermedades óseas puede ser de la misma edad y/o el mismo sexo que el paciente.
En el presente documento se describe un método de tratamiento de una enfermedad ósea de bajo recambio, p. ej., enfermedad ósea adinámica, que comprende: (i) administración de un inhibidor de ActRII a un sujeto que tiene una enfermedad ósea de bajo recambio; (ii) determinación del nivel de recambio óseo en dicho sujeto después de la administración del inhibidor de ActRII (p. ej., usando una o más de las pruebas expuestas en la Sección 5.3(a) que se muestra más adelante y/o midiendo uno o más de los marcadores bioquímicos de recambio óseo) y (iii) si el nivel de recambio óseo en el sujeto ha disminuido menos de aproximadamente el 5 %, 10 %, 15 %, 20 % o 25 %, o aproximadamente el 5-10 %, 10-20 %, 20-30 % en comparación con el nivel de recambio óseo del sujeto antes de la administración del inhibidor de ActRII, repetición de la administración del inhibidor de ActRII. En ciertas realizaciones, si el nivel de recambio óseo no ha disminuido después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la dosis del inhibidor de ActRII administrada. En ciertas realizaciones, si el nivel de recambio óseo no ha disminuido después de la administración del inhibidor de ActRII, se puede aumentar la frecuencia de administración del inhibidor de ActRII administrado.
(a) INHIBIDORES DE ACTRIIA
Tal y como se usa en el presente documento, el término «ActRIIA» se refiere a una familia de proteínas que son receptores tipo IIA de activina (ActRIIA) de cualquier especie y variantes procedentes de tales proteínas ActRIIA mediante mutagénesis u otra modificación. Se entiende que la referencia a ActRIIA en el presente documento es una referencia a cualquiera de las formas actualmente identificadas. Los miembros de la familia ActRIIA son generalmente proteínas transmembrana, compuestas por un dominio extracelular de unión a ligando con una región rica en cisteína, un dominio transmembrana y un dominio citoplasmático con prevista actividad serina/treonina quinasa.
Los inhibidores de ActRIIA para uso en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento incluyen, sin limitación, polipéptidos ActRIIA solubles de unión a activina; anticuerpos que se unen a activina (concretamente a las subunidades A o B de activina, también conocidas como ßA o ßB) y alteran la unión a ActRIIA; anticuerpos que se unen a ActRIIA y alteran la unión a activina; proteínas que no son anticuerpos seleccionadas para unión a activina o ActRIIA.(véanse, p.ej., los documentos WO/2002/088171, WO/2006/055689, WO/2002/032925, WO/2005/037989, US 2003/0133939 y US 2005/0238646, para consultar ejemplos de tales proteínas y métodos para el diseño y selección de las mismas) y péptidos aleatorios seleccionados para unión a activina o ActRIIA que se pueden conjugar a un dominio Fc.
En ciertas realizaciones, dos o más proteínas diferentes (u otros restos) con actividad de unión a activina o ActRIIA, especialmente ligantes de activina que bloquean los sitios de unión tipo I (p. ej., un receptor de activina tipo I soluble) y tipo II (p. ej., un receptor de activina tipo II soluble), respectivamente, se pueden enlazar para crear una molécula de unión bifuncional o multifuncional que inhibe al receptor ActRIIA y, por tanto, se pueden usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento. En ciertas realizaciones, los antagonistas del eje de señalización Activina-ActRIIA que inhiben al receptor ActRIIA, entre los que se incluyen aptámeros de ácidos nucleicos, pequeñas moléculas y otros agentes, se usan en las composiciones y los métodos del presente documento.
(i) Inhibidores de ActRIIA que comprenden polipéptidos ActRIIA
El término «polipéptido ActRIIA» incluye polipéptidos que comprenden cualquier polipéptido de un miembro de la familia ActRIIA presente de forma natural, así como cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos, fusiones y formas peptidomiméticas) que retiene una actividad útil. Por ejemplo, los polipéptidos ActRIIA incluyen polipéptidos derivados de la secuencia de cualquier ActRIIA conocido que tenga una secuencia al menos aproximadamente un 80 % idéntica a la secuencia de un polipéptido ActRIIA y, opcionalmente, al menos un 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o más de identidad de secuencia. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIA puede unirse a una proteína ActRIIA y/o activina e inhibir su función. Un polipéptido ActRIIB se puede seleccionar por su capacidad de promover el crecimiento de hueso y la mineralización ósea. Los ejemplos de polipéptidos ActRIIA incluyen el polipéptido precursor del receptor ActRIIA humano (SEQ ID NO: 1) y polipéptidos ActRIIA humanos solubles (p.ej., las SEQ ID NO: 2, 3, 7 y 12). Con respecto al polipéptido precursor del receptor ActRIIA cuya secuencia de aminoácidos está representada en la SEQ ID NO: 1, el péptido señal del polipéptido precursor del ActRIIA humano está localizado en las posiciones de aminoácidos 1 a 20; el dominio extracelular está localizado en las posiciones de aminoácidos 21 a 135 y los sitios de N-glicosilación del polipéptido precursor del ActRIIA humano (SEQ ID NO: 1) están localizados en las posiciones de aminoácidos 43 y 56 de la SEQ ID NO: 1. La secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido precursor del ActRIIB humano de SEQ ID NO: 1 se desvela como SEQ ID NO: 4 (nucleótidos 164-1705 de la entrada NM_001616 del Genbank). La secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido ActRIIA humano soluble de SEQ ID NO: 2 se desvela como SEQ ID NO: 5. Véase la Tabla 6 para ver una descripción de las secuencias.
En realizaciones específicas, los polipéptidos ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento son polipéptidos ActRIIA solubles. Un dominio extracelular de una proteína ActRIIA se puede unir a activina y es generalmente soluble, por lo tanto, se puede denominar un polipéptido ActRIIA de unión a activina soluble. Por tanto, tal y como se usa en el presente documento, el término «polipéptido ActRIIA soluble» generalmente se refiere a polipéptidos que comprenden un dominio extracelular de una proteína ActRIIA, incluyendo cualquier dominio extracelular de una proteína ActRIIA presente de forma natural, así como cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos y formas peptidomiméticas). Los polipéptidos ActRIIA solubles se pueden unir a activina; sin embargo, la proteína ActRIIA de tipo salvaje no exhibe selectividad significativa en la unión a activina frente a GDF8/11. Se puede aportar especificidad añadida a las proteínas ActRIIA nativas o alteradas mediante acoplamiento con un segundo agente de unión a activina selectivo. Ejemplos de polipéptidos ActRIIA de unión a activina solubles se ilustran en las SEQ ID NO: 2, 3, 7, 12 y 13. Otros ejemplos de polipéptidos ActRIIA de unión a activina solubles comprenden una secuencia señal además del dominio extracelular de una proteína ActRIIA, por ejemplo, la secuencia líder de la melitina de abeja melífera (SEQ ID NO: 8), la secuencia líder del activador del plasminógeno tisular (TPA) (SEQ ID NO: 9) o la secuencia líder del ActRIIA nativo (SEQ ID NO: 10). El polipéptido ActRIIA-hFc ilustrado en la SEQ ID NO: 13 usa una secuencia líder de TPA.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una proteína de fusión/conjugada que comprende un dominio de unión a activina de ActRIIA conectado a una porción Fc de un anticuerpo. En ciertas realizaciones, el dominio de unión a activina está conectado a una porción Fc de un anticuerpo a través de un conector, por ejemplo, un conector peptídico. Opcionalmente, el dominio Fc tiene una o más mutaciones en residuos tales como Asp-265, lisina 322 y Asn-434. En ciertos casos, el dominio Fc mutante que tiene una o más de estas mutaciones (p. ej., una mutación Asp-265) tiene menor capacidad de unión al receptor Fcγ que un dominio Fc de tipo salvaje. En otros casos, el dominio Fc mutante que tiene una o más de estas mutaciones (por ejemplo, una mutación Asn-434) tiene mayor capacidad de unión al receptor Fc neonatal (FcRn) de estructura similar a una molécula MHC clase I que un dominio Fc de tipo salvaje. Las proteínas de fusión ejemplares que comprenden un dominio extracelular de ActRIIA soluble fusionado a un dominio Fc se exponen en las SEQ ID NO: 6, 7, 12 y 13.
En una realización específica, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden el dominio extracelular de ActRIIA, o una porción del mismo, conectado a una porción Fc de un anticuerpo, donde dicho inhibidor de ActRIIA comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 75 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 6, 7, 12 y 13. En otra realización específica, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden el dominio extracelular de ActRIIA, o una porción del mismo, conectado a una porción Fc de un anticuerpo, donde dicho inhibidor de ActRIIA comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 6, 7, 12 y 13.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una forma truncada de un dominio extracelular de ActRIIA. El truncamiento puede estar en el extremo C-terminal y/o en el extremo N-terminal del polipéptido ActRIIA. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos de longitud en comparación con el dominio extracelular del polipéptido ActRIIB maduro. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos N-terminales del dominio extracelular del polipéptido ActRIIA maduro. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos C-terminales del dominio extracelular del polipéptido ActRIIA maduro. Por ejemplo, las formas truncadas de ActRIIA incluyen polipéptidos con aminoácidos 20-119; 20-128; 20-129; 20-130; 20-131; 20132; 20-133; 20-134; 20-131; 21-131; 22-131; 23-131; 24-131 y 25-131, donde las posiciones de los aminoácidos se refieren a las posiciones de los aminoácidos en la SEQ ID NO: 1.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden un dominio extracelular de ActRIIA con una o más sustituciones de aminoácidos. En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una forma truncada de un dominio extracelular de ActRIIA que también lleva una sustitución de aminoácido.
En una realización específica, el inhibidor de ActRIIA que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre el dominio extracelular del receptor ActRIIA humano y la porción Fc de IgG1. En otra realización específica, el inhibidor de ActRIIA que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre un dominio extracelular truncado del receptor ActRIIA humano y la porción Fc de IgG1. En otra realización específica, el inhibidor de ActRIIA que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre un dominio extracelular truncado del receptor ActRIIA humano y la porción Fc de IgG1, donde el dominio extracelular truncado del receptor ActRIIA humano posee una o más sustituciones de aminoácidos.
Se pueden obtener fragmentos funcionalmente activos de polipéptidos ActRIIA, por ejemplo, mediante cribado de polipéptidos producidos recombinantemente a partir del correspondiente fragmento del ácido nucleico que codifica un polipéptido ActRIIA. Además, los fragmentos se pueden sintetizar químicamente usando técnicas conocidas en la técnica tales como la síntesis química en fase sólida mediante los métodos Fmoc o t-Boc de Merrifield. Los fragmentos se pueden producir (recombinantemente o mediante síntesis química) y ensayar para identificar los fragmentos peptídicos que pueden funcionar como antagonistas (inhibidores) de la proteína ActRIIA o de la señalización mediada por activina.
Además, se pueden obtener variantes funcionalmente activas de polipéptidos ActRIIA, por ejemplo, mediante cribado de bibliotecas de polipéptidos modificados producidos recombinantemente a partir de los correspondientes ácidos nucleicos mutagenizados que codifican un polipéptido ActRIIA. Las variantes se pueden producir y ensayar para identificar aquellas que pueden funcionar como antagonistas (inhibidores) de la proteína ActRIIA o de la señalización mediada por activina. En ciertas realizaciones, una variante funcional de los polipéptidos ActRIIA comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 75 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 2 o 3. En ciertos casos, la variante funcional tiene una secuencia de aminoácidos al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o 100 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 2 o 3.
Se pueden generar variantes funcionales, por ejemplo, mediante modificación de la estructura de un polipéptido ActRIIA para propósitos tales como la mejora de la eficacia terapéutica o la estabilidad (p. ej., la vida útil de almacenamiento ex vivo y la resistencia a la degradación proteolítica in vivo). Cuando se seleccionan tales polipéptidos ActRIIA modificados para retener la unión a activina, se pueden considerar equivalentes funcionales de los polipéptidos ActRIIA presentes en la naturaleza. También se pueden producir polipéptidos ActRIIA, por ejemplo, mediante sustitución, deleción o adición de aminoácidos. Por ejemplo, cabe esperar que una sustitución aislada de una leucina por una isoleucina o valina, un aspartato por un glutamato, una treonina por una serina o una sustitución similar de un aminoácido por un aminoácido estructuralmente relacionado (p. ej., mutaciones conservadoras) no tendrá un efecto importante sobre la actividad biológica de la molécula resultante. Las sustituciones conservadoras son las que tienen lugar dentro de una familia de aminoácidos que están relacionados en sus cadenas laterales. Se puede determinar fácilmente si un cambio en la secuencia de aminoácidos de un polipéptido ActRIIA deriva en un homólogo funcional mediante evaluación de la capacidad de la variante del polipéptido ActRIIA para producir una respuesta en las células similar a la del polipéptido ActRIIA de tipo salvaje.
En ciertas realizaciones, el inhibidor de ActRIIA que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento puede comprender un polipéptido ActRIIA que tiene una o más mutaciones específicas que pueden alterar la glicosilación del polipéptido. Tales mutaciones pueden introducir o eliminar uno o más sitios de glicosilación, tales como los sitios de O-glicosilación o los sitios de N-glicosilación. Los sitios de reconocimiento de la glicosilación por enlace a asparagina generalmente comprenden una secuencia tripeptídica, asparagina-X-treonina (o asparagina-X-serina) (donde «X» es cualquier aminoácido), que es reconocida específicamente por las enzimas de glicosilación celular apropiadas. La alteración también se puede hacer por adición de, o sustitución de, uno o más residuos de serina o treonina en la secuencia del polipéptido ActRIIA de tipo salvaje (para sitios de O-glicosilación). Una variedad se sustituciones o deleciones en una o ambas de las posiciones de aminoácidos primera y tercera de un sitio de reconocimiento de glicosilación (y/o deleción de aminoácidos en la segunda posición) deriva en la no glicosilación en la secuencia tripeptídica modificada. Otro medio de aumentar el número de restos carbohidrato en un polipéptido ActRIIA es mediante acoplamiento químico o enzimático de glicósidos al polipéptido ActRIIA. Dependiendo del modo de acoplamiento usado, el(los) azúcar(es) se pueden fijar a (a) arginina e histidina; (b) grupos carboxilo libres; (c) grupos sulfhidrilo libres tales como los de la cisteína; (d) grupos hidroxilo libres tales como los de la serina, treonina o hidroxiprolina; (e) residuos aromáticos tales como los de la fenilalanina, tirosina o triptófano o (f) el grupo amida de la glutamina. Estos métodos se describen en el documento WO 87/05330 publicado el 11 de septiembre de 1987, y en Aplin and Wriston (1981) CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306, incorporados por referencia en el presente documento. La eliminación de uno o más restos carbohidrato presentes en un polipéptido ActRIIA se puede conseguir químicamente y/o enzimáticamente. La deglicosilación química puede implicar, por ejemplo, la exposición del polipéptido ActRIIA al compuesto ácido trifluorometanosulfónico o un compuesto equivalente. Este tratamiento deriva en la escisión de la mayoría de los azúcares, o todos ellos, excepto el azúcar de conexión (N-acetilglucosamina o N-acetilgalactosamina), dejando la secuencia de aminoácidos intacta. La deglicosilación química se describe con más detalle en Hakimuddin y col. (1987) Arch. Biochem. Biophys. 259:52 y en Edge y col. (1981) Anal. Biochem. 118:131. La escisión enzimática de restos carbohidrato en polipéptidos ActRIIA se puede conseguir mediante el uso de una variedad de endo-y exoglicosidasas tal y como se describe en Thotakura y col. (1987) Meth. Enzymol. 138:350. La secuencia de un polipéptido ActRIIA se puede ajustar, según convenga, dependiendo del tipo de sistema de expresión usado, ya que todas las células de mamíferos, levaduras, insectos y plantas pueden introducir diferentes patrones de glicosilación que se pueden ver afectados por la secuencia de aminoácidos del péptido. En general, las proteínas ActRIIA para uso en humanos se pueden expresar en una línea celular de mamífero que permita una glicosilación adecuada, tal como las líneas celulares HEK293 o CHO, pero se prevé que otros sistemas de expresión, tales como otras líneas celulares de expresión en mamíferos, líneas celulares de levaduras con enzimas de glicosilación modificadas y células de insectos, también pueden ser útiles.
Además, en el presente documento se desvelan métodos de generación de mutantes, en concreto conjuntos de mutantes combinatoriales de un polipéptido ActRIIA y mutantes de truncamiento; los pools de mutantes combinatoriales son especialmente útiles para la identificación de secuencias de variantes funcionales. El propósito del cribado de tales bibliotecas combinatoriales puede ser el de generar, por ejemplo, variantes del polipéptido ActRIIA que puedan actuar como agonistas o antagonistas o, como alternativa, que posean actividades novedosas en conjunto. A continuación, se describe una variedad de ensayos de cribado, y tales ensayos de pueden usar para evaluar variantes. Por ejemplo, se puede cribar una variante de polipéptido ActRIIA para que tenga capacidad de unión a un ligando de ActRIIA con el fin de evitar la unión de un ligando de ActRIIA a un polipéptido ActRIIA o para que interfiera con la señalización provocada por un ligando de ActRIIA.
Se pueden generar variantes derivadas combinatorialmente que tengan una potencia selectiva, o generalmente mayor, que un polipéptido ActRIIA presente de forma natural. Asimismo, la mutagénesis puede dar lugar a variantes que tengan semividas intracelulares drásticamente diferentes de las del correspondiente polipéptido ActRIIA de tipo salvaje. Por ejemplo, la proteína alterada se puede hacer más estable o menos estable a la degradación proteolítica u otros procesos celulares que derivan en la destrucción o inactivación de un polipéptido ActRIIA nativo. Tales variantes, y los genes que las codifican, se pueden utilizar para alterar los niveles de polipéptidos ActRIIA mediante modulación de la semivida de los polipéptidos ActRIIA. Por ejemplo, una semivida corta puede dar lugar a efectos biológicos más transitorios y puede permitir un control más estrecho de los niveles de polipéptido ActRIIA en el paciente. En una proteína de fusión Fc, se pueden hacer mutaciones en el conector (si lo hay) y/o en la porción Fc para alterar la semivida de la proteína.
Se puede producir una biblioteca combinatorial mediante una biblioteca degenerada de genes que codifican una biblioteca de polipéptidos que incluyen, todos ellos, al menos una porción de secuencias de polipéptidos ActRIIA potenciales. Por ejemplo, se puede ligar enzimáticamente una mezcla de oligonucleótidos sintéticos a secuencias de genes de tal forma que el conjunto degenerado de secuencias de nucleótidos de polipéptido ActRIIA potencial se pueda expresar como polipéptidos individuales o, como alternativa, como un conjunto de proteínas de fusión más grandes (por ejemplo, para expresión en fago).
La biblioteca de homólogos potenciales se puede generar de muchas formas a partir de una secuencia de oligonucleótido degenerada. La síntesis química de una secuencia de gen degenerada se puede llevar a cabo en un sintetizador de ADN automatizado y, a continuación, se pueden ligar los genes sintéticos a un vector de expresión adecuado. La síntesis de oligonucleótidos degenerados se conoce bien en la técnica (véase, por ejemplo, Narang, S A (1983) Tetrahedron 39:3; Itakura y col., (1981) Recombinant DNA, Proc. 3rd Cleveland Sympos. Macromolecules, ed. AG Walton, Amsterdam: Elsevier pp 273-289; Itakura y col., (1984) Annu. Rev. Biochem. 53:323; Itakura y col., (1984) Science 198:1056; Ike y col., (1983) Nucleic Acid Res. 11:477). Tales técnicas se han empleado en la evolución dirigida de otras proteínas (véase, por ejemplo, Scott y col., (1990) Science 249:386-390; Roberts y col., (1992) PNAS USA 89:2429-2433; Devlin y col., (1990) Science 249: 404-406; Cwirla y col., (1990) PNAS USA 87: 6378-6382; así como las patentes US5223409, US5198346 y US5096815).
Como alternativa, se pueden utilizar otras formas de mutagénesis para generar una biblioteca combinatorial. Por ejemplo, se pueden generar y aislar variantes de polipéptido ActRIIA a partir de una biblioteca mediante cribado usando, por ejemplo, mutagénesis dirigida por barrido de alanina y similares (Ruf y col., (1994) Biochemistry 33:1565-1572; Wang y col., (1994) J. Biol. Chem. 269:3095-3099; Balint y col., (1993) Gene 137:109-118; Grodberg y col., (1993) Eur. J. Biochem. 218:597-601; Nagashima y col., (1993) J. Biol. Chem. 268:2888-2892; Lowman y col., (1991) Biochemistry 30:10832-10838 y Cunningham y col., (1989) Science 244:1081-1085); mediante mutagénesis dirigida por barrido de conector (Gustin y col., (1993) Virology 193:653-660; Brown y col., (1992) Mol. Cell Biol. 12:2644-2652; McKnight y col., (1982) Science 232:316); mediante mutagénesis por saturación (Meyers y col., (1986) Science 232:613); mediante mutagénesis dirigida por PCR (Leung y col., (1989) Method Cell Mol Biol 1:1119); o mediante mutagénesis aleatoria, incluyendo mutagénesis química, etc. (Miller y col., (1992) A Short Course in Bacterial Genetics, CSHL Press, Cold Spring Harbor, N.Y.y Greener y col., (1994) Strategies in Mol Biol 7:32-34). La mutagénesis dirigida por barrido de conector, especialmente en un entorno combinatorial, es un método atractivo para la identificación de formas truncadas (bioactivas) de polipéptido ActRIIA.
En la técnica se conoce una amplia gama de técnicas para el cribado de productos génicos de bibliotecas combinatoriales fabricadas mediante mutaciones y truncamientos puntuales y, por ende, para el cribado de genotecas de ADNc para productos génicos que tienen una determinada propiedad. Generalmente, tales técnicas serán adaptables para el cribado rápido de genotecas generadas mediante la mutagénesis combinatorial de polipéptidos ActRIIA. Habitualmente, las bibliotecas generalmente usadas para el cribado de genotecas grandes comprenden la clonación de la genoteca en vectores de expresión replicables, la transformación de las células apropiadas con la biblioteca de vectores resultante y la expresión de los genes combinatoriales en condiciones en las que la detección de una actividad deseada facilita el aislamiento relativamente sencillo del vector que codifica el gen cuyo producto se detectó. Los ensayos preferidos incluyen ensayos de unión a activina y ensayos de señalización celular mediada por activina.
En ciertas realizaciones, los polipéptidos ActRIIA usados en los inhibidores de los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden comprender modificaciones postraduccionales además de las presentes de forma natural en los polipéptidos ActRIIA. Tales modificaciones pueden incluir, pero no se limitan a, acetilación, carboxilación, glicosilación, fosforilación, lipidación y acilación. Como resultado, los polipéptidos ActRIIA modificados pueden contener elementos que no son aminoácidos, tales como polietilenglicoles, lípidos, poli-o monosacáridos y fosfatos. Los efectos de tales elementos que no son aminoácidos sobre la funcionalidad de un polipéptido ActRIIA se pueden ensayar mediante cualquier método conocido por un experto en la materia. Cuando se produce un polipéptido ActRIIA en las células mediante escisión de una forma incipiente del polipéptido ActRIIA, el procesamiento postraduccional también puede ser importante para corregir el plegamiento y/o la función de la proteína. Diferentes células (tales como CHO, HeLa, MDCK, 293, W138, NIH-3T3 o HEK293) tienen maquinaria celular específica y mecanismos característicos para tales actividades postraduccionales y se pueden elegir para garantizar la modificación y el procesamiento correctos de los polipéptidos ActRIIA.
En ciertos aspectos, las variantes funcionales o formas modificadas de los polipéptidos ActRIIA usados en los inhibidores de los métodos y las composiciones descritos en el presente documento incluyen proteínas de fusión que tienen al menos una porción de los polipéptidos ActRIIA y uno o más dominios de fusión. Ejemplos bien conocidos de tales dominios de fusión incluyen, pero no se limitan a, polihistidina, Glu-Glu, glutatión S transferasa (GST), tioredoxina, proteína A, proteína G, una región constante (Fc) de una cadena pesada de inmunoglobulina, proteína de unión a maltosa (MBP) o albúmina sérica humana. Se puede seleccionar un dominio de fusión de tal forma que confiera una propiedad deseada. Por ejemplo, algunos dominios de fusión son especialmente útiles para el aislamiento de las proteínas de fusión mediante cromatografía de afinidad. Para la purificación por afinidad, se usan matrices para cromatografía de afinidad pertinentes, tales como resinas conjugadas con glutatión, amilasa y con níquel o cobalto. Muchas de tales matrices se comercializan en forma de «kit», tal como el sistema de purificación Pharmacia GST y el sistema QIAexpress. TM (Qiagen), útil con parejas de fusión (HIS6). Como otro ejemplo, se puede seleccionar un dominio de fusión de tal modo que facilite la detección de los polipéptidos ActRIIA. Los ejemplos de tales dominios de detección incluyen las diversas proteínas fluorescentes (por ejemplo, GFP), así como «epítopos marcadores», que normalmente son secuencias peptídicas cortas para las que se dispone de un anticuerpo específico. Entre los epítopos marcadores bien conocidos para los que es fácil disponer de anticuerpos monoclonales específicos se incluyen el epítopo FLAG, el virus de la gripe, la hemaglutinina (HA) y los marcadores c-myc. En algunos casos, los dominios de fusión tienen un sitio de escisión para proteasas, tal como para el factor Xa o la trombina, que permite que la proteasa pertinente digiera parcialmente las proteínas de fusión y, por consiguiente, libere de ahí las proteínas recombinantes. A continuación, las proteínas liberadas se pueden aislar del dominio de fusión mediante separación cromatográfica posterior. En ciertas realizaciones preferidas, un polipéptido ActRIIA se fusiona con un dominio que estabiliza el polipéptido ActRIIA in vivo (un «dominio estabilizador»). Por «estabilización» se entiende cualquier cosa que aumenta la semivida en suero, independientemente de si lo hace mediante reducción de la destrucción, reducción de la eliminación por el riñón u otro efecto farmacocinético. Se sabe que las fusiones con la porción Fc de una inmunoglobulina confieren las propiedades farmacocinéticas deseadas a una amplia gama de proteínas. Asimismo, las fusiones a albúmina sérica humana pueden conferir propiedades deseables. Entre otros tipos de dominios de fusión que se pueden seleccionar se incluyen los dominios multimerizantes (p. ej., dimerizantes, tetramerizantes) y los dominios funcionales (que confieren una función biológica adicional, tal como la estimulación adicional del crecimiento óseo o el crecimiento muscular, según convenga).
Se entiende que los diferentes elementos de las proteínas de fusión pueden adoptar cualquier disposición que sea consistente con la funcionalidad deseada. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIA se puede colocar en posición Cterminal respecto a un dominio heterólogo o, como alternativa, un dominio heterólogo se puede colocar en posición C-terminal respecto a un polipéptido ActRIIA. El dominio del polipéptido ActRIIA y el dominio heterólogo no necesitan estar adyacentes en una proteína de fusión, y se pueden incluir dominios o secuencias de aminoácidos adicionales en las posiciones C-o N-terminal de ambos dominios o entre los dominios.
En ciertas realizaciones, los polipéptidos ActRIIA usados en los inhibidores de los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden contener una o más modificaciones que son capaces de estabilizar los polipéptidos ActRIIA. Por ejemplo, tales modificaciones pueden mejorar la semivida in vivo de los polipéptidos ActRIIA, mejorar la semivida circulatoria de los polipéptidos ActRIIA o reducir la degradación proteolítica de los polipéptidos ActRIIA. Tales modificaciones estabilizadoras pueden incluir, pero no se limitan a, proteínas de fusión (incluyendo, por ejemplo, proteínas de fusión que comprenden un polipéptido ActRIIA y un dominio estabilizador), modificaciones de un sitio de glicosilación (incluyendo, por ejemplo, adición de un sitio de glicosilación a un polipéptido ActRIIA) y modificaciones de restos carbohidrato (incluyendo, por ejemplo, la eliminación de restos carbohidrato de un polipéptido ActRIIA). En el caso de las proteínas de fusión, un polipéptido ActRIIA se fusiona con un dominio estabilizador tal como una molécula de IgG (por ejemplo, un dominio Fc). Tal y como se usa en el presente documento, el término «dominio estabilizador» no solo se refiere a un dominio de fusión (por ejemplo, Fc) como ocurre en el caso de las proteínas de fusión, sino que también incluye modificaciones no proteináceas tales como un resto carbohidrato o un polímero no proteináceo tal como polietilenglicol.
En ciertas realizaciones, se pueden usar con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento formas aisladas y/o purificadas de polipéptidos ActRIIA que se aíslan de, o están sustancialmente libres de, otras proteínas. Generalmente, los polipéptidos ActRIIA se pueden producir mediante expresión a partir de ácidos nucleicos recombinantes.
En ciertos aspectos, los polipéptidos ActRIIA usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento se generan usando ácidos nucleicos aislados y/o recombinantes que codifican cualquiera de los polipéptidos ActRIIA (por ejemplo, los polipéptidos ActRIIA solubles), incluyendo fragmentos, variantes funcionales y proteínas de fusión descritos en el presente documento. Por ejemplo, la SEQ ID NO: 4 codifica el polipéptido precursor del ActRIIA humano presente de forma natural, mientras que la SEQ ID NO: 5 codifica el domino extracelular del ActRIIA procesado. Tales ácidos nucleicos pueden ser monocatenarios o bicatenarios. Tales ácidos nucleicos pueden ser moléculas de ADN o ARN. Estos ácidos nucleicos se pueden usar, por ejemplo, en métodos de fabricación de polipéptidos ActRIIA o como agentes terapéuticos directos (p. ej., en una estrategia de terapia génica).
En ciertos aspectos, los ácidos nucleicos que codifican polipéptidos ActRIIA pueden incluir ácidos nucleicos que son variantes de la SEQ ID NO: 4 o 5. Las secuencias de nucleótidos de las variantes incluyen secuencias que difieren en una o más sustituciones, adiciones o deleciones de nucleótidos, tal como las variantes alélicas.
En ciertas realizaciones, las secuencias de ácido nucleico aislado o recombinante que codifican polipéptidos ActRIIA pueden ser al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o 100 % idénticas a la SEQ ID NO: 4 o 5. Un experto en la materia comprenderá que se pueden usar secuencias de ácido nucleico complementarias a la SEQ ID NO: 4 o 5 y variantes de la SEQ ID NO: 4 o 5 en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. En realizaciones adicionales, tales secuencias de ácido nucleico se pueden aislar, recombinar y/o fusionar a una secuencia de nucleótido heterólogo, o pueden proceder de una genoteca de ADN.
En otras realizaciones, los ácidos nucleicos usados en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden incluir secuencias de nucleótidos que se hibridan en condiciones muy rigurosas a la secuencia de nucleótidos determinada por la SEQ ID NO: 4 o 5, la secuencia complementaria de la SEQ ID NO: 4 o 5, o fragmentos de la misma. Un experto en la materia entenderá que se pueden modificar las condiciones de rigurosidad adecuadas que facilitan la hibridación del ADN. Por ejemplo, se puede realizar la hibridación 6,0 veces en cloruro sódico/citrato sódico (SSC) a aproximadamente 45 grados Celsius seguida de un lavado de 2,0 veces con SSC a 50 grados Celsius. Por ejemplo, la concentración de sal en la etapa de lavado se puede seleccionar desde una baja rigurosidad de aproximadamente 2,0 veces con SCC a 50 grados Celsius a una alta rigurosidad de aproximadamente 0,2 veces con SCC a 50 grados Celsius. Además, la temperatura de la etapa de lavado se puede aumentar desde condiciones de baja rigurosidad a temperatura ambiente, aproximadamente 22 grados Celsius, a condiciones de alta rigurosidad a aproximadamente 65 grados Celsius. Se puede variar tanto la temperatura como la sal, o se puede mantener constante la temperatura o la concentración de sal y modificar la otra variable. En una realización, con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento se pueden usar ácidos nucleicos que se hibridan en las condiciones de baja rigurosidad de 6 veces con SCC a temperatura ambiente seguida de un lavado de 2 veces con SCC a temperatura ambiente.
Los ácidos nucleicos aislados que difieren de los ácidos nucleicos expuestos en las SEQ ID NO: 4 o 5 debido a la degeneración del código genético, también se pueden usar en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. Por ejemplo, varios aminoácidos se designan por más de un triplete. Los codones que especifican el mismo aminoácido, o sinónimos (por ejemplo, CAU y CAC son sinónimos para histidina), pueden derivar en mutaciones «silenciosas» que no afectan a la secuencia de aminoácidos de la proteína. Sin embargo, se espera que los polimorfismos de secuencia de ADN que derivan en cambios en las secuencias de aminoácidos de las proteínas objetivo seguirán existiendo entre las células de mamíferos. Un experto en la materia comprenderá que estas variaciones en uno o más nucleótidos (hasta aproximadamente el 3-5 % de nucleótidos) de los ácidos nucleicos que codifican una proteína concreta pueden existir entre individuos de una determinada especie debido a la variación alélica natural.
En ciertas realizaciones, los ácidos nucleicos recombinantes se pueden conectar de forma operativa a una o más secuencias de nucleótidos reguladoras de un constructo de expresión. Generalmente, las secuencias de nucleótidos reguladoras serán adecuadas para la célula huésped usada para la expresión. En la técnica se conocen diversos tipos de vectores de expresión apropiados y secuencias reguladoras adecuadas para una variedad de células huésped. Habitualmente, dichas una o más secuencias de nucleótidos reguladoras pueden incluir, pero no se limitan a, secuencias de promotores, secuencias líder o señal, sitios de unión de ribosomas, secuencias de inicio y terminación de la transcripción, secuencias de inicio y terminación de la traducción y secuencias potenciadoras o secuencias activadoras. Los promotores constitutivos o inducibles tal y como se conocen en la técnica se contemplan en el presente documento. Los promotores pueden ser promotores presentes de forma natural o promotores híbridos que combinan elementos de más de un promotor. Un constructo de expresión puede estar presente en una célula en un episoma, tal como un plásmido, o el constructo de expresión puede estar insertado en un cromosoma. En una realización preferida, el vector de expresión contiene un gen marcador seleccionable para permitir la selección de células huésped transformadas. Los genes marcadores seleccionables son bien conocidos en la técnica y variarán en función de la célula huésped usada.
En ciertos aspectos, el ácido nucleico usado en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritas en el presente documento se puede proporcionar en un vector de expresión que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido ActRIIA y está operativamente conectado a al menos una secuencia reguladora. Las secuencias reguladoras están reconocidas en la técnica y se seleccionan para la expresión directa del polipéptido ActRIIA. Por consiguiente, el término secuencia reguladora incluye promotores, potenciadores y otros elementos de control de la expresión. Secuencias reguladoras ejemplares se describen en Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego, Calif. (1990). Por ejemplo, se puede usar cualquiera de una amplia variedad de secuencias de control de la expresión, que controlan la expresión de una secuencia de ADN cuando están operativamente conectadas a ella, en estos vectores para expresar secuencias de ADN que codifican un polipéptido ActRIIA. Tales secuencias de control de la expresión útiles incluyen, por ejemplo, los promotores tempranos o tardíos del SV40, el promotor tet, el promotor temprano inmediato del adenovirus o citomegalovirus, los promotores RSV, el sistema lac, el sistema trp, el sistema TAC o TRC, el promotor T7 cuya expresión está dirigida por la ARN polimerasa T7, las regiones operadoras y promotoras principales del fago lambda, las regiones de control de la proteína de cubierta fd, el promotor de la 3-fosfoglicerato quinasa u otras enzimas glicolíticas, los promotores de la fosfatasa ácida, por ejemplo, Pho5, los promotores de los factores α de apareamiento de la levadura, el promotor de poliedros del sistema baculovirus y otras secuencias conocidas para el control de la expresión de genes de células procariotas y eucariotas o sus virus y diversas combinaciones de los mismos. Se debe entender que el diseño del vector de expresión puede depender de factores tales como la elección de la célula huésped que se va a transformar y/o el tipo de proteína que se desea expresar. Asimismo, se debe considerar el número de copias del vector, la capacidad para controlar ese número de copias y la expresión de cualquier otra proteína codificada por el vector, tal como los marcadores antibióticos.
Un ácido nucleico recombinante usado en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento se puede producir mediante ligamiento del gen clonado, o una porción del mismo, a un vector adecuado para expresión en células procariotas, células eucariotas (levadura, aviar, insectos o mamíferos) o en ambas. Los vehículos de expresión para la producción de un polipéptido ActRIIA recombinante incluyen plásmidos y otros vectores. Por ejemplo, los vectores adecuados incluyen plásmidos de los tipos: plásmidos derivados de pBR322, plásmidos derivados de pEMBL, plásmidos derivados de pEX, plásmidos derivados de pBTac y plásmidos derivados de pUC para la expresión en células procariotas, tales como
E. coli.
Algunos vectores de expresión en mamíferos contienen tanto secuencias procariotas, para facilitar la propagación del vector en la bacteria, como una o más unidades de transcripción eucariotas, que se expresan en células eucariotas. Los vectores derivados de pcDNAI/amp, pcDNAI/neo, pRc/CMV, pSV2gpt, pSV2neo, pSV2-dhfr, pTk2, pRSVneo, pMSG, pSVT7, pko-neo y pHyg son ejemplos de vectores de expresión en mamíferos adecuados para la transfección de células eucariotas. Algunos de estos vectores están modificados con secuencias procedentes de plásmidos bacterianos, tales como pBR322, para facilitar la replicación y selección de la resistencia a fármacos tanto en células procariotas como en eucariotas. Como alternativa, se pueden usar derivados de virus tales como el virus del papiloma bovino (BPV-1) o el virus Epstein-Barr (pHEBo, derivado de pREP y p205) para la expresión transitoria de proteínas en células eucariotas. Más adelante, en la descripción de los sistemas de administración de terapia génica se pueden encontrar ejemplos de otros sistemas de expresión virales (incluyendo retrovirales). Los diversos métodos empleados en la preparación de los plásmidos y en la transformación de organismos huésped son bien conocidos en la técnica. Para ver otros sistemas de expresión adecuados tanto para células procariotas como para células eucariotas, así como procedimientos recombinantes generales, véase Molecular Cloning A Laboratory Manual, 3rd Ed., ed. by Sambrook, Fritsch and Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001). En algunos casos, puede ser deseable expresar los polipéptidos recombinantes mediante el uso de un sistema de expresión en baculovirus. Los ejemplos de tales sistemas de expresión en baculovirus incluyen vectores derivados de pVL (tales como pVL1392, pVL1393 y pVL941), vectores derivados de pAcUW (tales como pAcUW1) y vectores derivados de pBlueBac (tales como el pBlueBac III que contiene β-gal).
Los vectores se pueden diseñar para la producción de los polipéptidos ActRIIA objetivo en células CHO, tal como un vector Pcmv-Script (Stratagene, La Jolla, Calif.), vectores pcDNA4 (Invitrogen, Carlsbad, Calif.) y vectores pCI-neo (Promega, Madison, Wis.). Como resultará evidente, los constructos génicos objetivo se pueden usar para provocar la expresión de los polipéptidos ActRIIA objetivo en células propagadas en cultivo, p. ej., para producir proteínas, incluyendo proteínas de fusión o variantes proteicas, para su purificación.
Las células huésped transfectadas con un gen recombinante que incluye una secuencia codificante (por ejemplo, SEQ ID NO: 4 o 5) para uno o más de los polipéptidos ActRIIA objetivo se pueden usar en la producción de polipéptidos ActRIIA adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. La célula huésped puede ser cualquier célula procariota o eucariota. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIA proporcionado en el presente documento se puede expresar en células bacterianas tales como las de E. coli, en células de insectos (por ejemplo, usando un sistema de expresión basado en baculovirus), en levaduras o en células de mamíferos. Los expertos en la materia conocen otras células huésped adecuadas.
Por consiguiente, en el presente documento se desvelan métodos de producción de polipéptidos ActRIIA. Por ejemplo, se puede cultivar una célula huésped transfectada con un vector de expresión que codifica un polipéptido ActRIIA en condiciones adecuadas que permitan que se produzca la expresión del polipéptido ActRIIA. El polipéptido ActRIIA se puede secretar y aislar a partir de una mezcla de células y medio que contiene el polipéptido ActRIIA. Como alternativa, el polipéptido ActRIIA se puede retener en el citoplasma o en una fracción de membrana y las células se pueden recolectar y lisar, aislando así la proteína. Un cultivo celular incluye células huésped, medio y otros subproductos. Los medios adecuados para cultivo celular se conocen bien en la técnica. Los polipéptidos ActRIIA objetivo se pueden aislar del medio de cultivo celular, las células huésped o ambos usando técnicas de purificación de proteínas conocidas en la técnica, incluyendo cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de filtración en gel, ultrafiltración, electroforesis, purificación por inmunoafinidad con anticuerpos específicos para epítopos concretos de los polipéptidos ActRIIA y purificación por afinidad con un agente que se une a un dominio fusionado al polipéptido ActRIIA (por ejemplo, se puede usar una columna de proteína A para purificar una fusión ActRIIA-Fc). En una realización preferida, el polipéptido ActRIIA es una proteína de fusión que contiene un dominio que facilita su purificación. En una realización, la purificación se consigue mediante una serie de etapas de cromatografía en columna, incluyendo, por ejemplo, tres o más de la siguientes, en cualquier orden: cromatografía en columna de proteína A, cromatografía en columna de sefarosa Q, cromatografía en columna de fenilsefarosa, cromatografía de exclusión por tamaño y cromatografía de intercambio catiónico. La purificación se podría completar con retención del virus por filtración y sustitución de tampón. Tal y como se ha demostrado en el presente documento, la proteína ActRIIA-Fc se purificó hasta una pureza de > 98 % tal y como se determinó mediante cromatografía de exclusión por tamaño y de > 95 % tal y como se determinó por SDS-PAGE. Este nivel de pureza fue suficiente para conseguir los efectos deseados sobre los huesos de los ratones y un perfil de seguridad aceptable en ratones, ratas y primates no humanos.
En otra realización, un gen de fusión que codifica para una secuencia líder de purificación, tal como la secuencia de un sitio de escisión de la poli-(His)/enteroquinasa del extremo N-terminal de la porción deseada de un polipéptido ActRIIA recombinante, puede permitir la purificación de la proteína de fusión expresada mediante cromatografía de afinidad usando una resina del ion metálico Ni2+. A continuación, la secuencia líder de purificación se puede retirar posteriormente mediante tratamiento con enteroquinasa para proporcionar el polipéptido ActRIIA purificado (p. ej., véase Hochuli y col., (1987) J. Chromatography 411:177; y Janknecht y col., PNAS USA 88:8972).
Las técnicas de fabricación de genes de fusión son bien conocidas. Esencialmente, la unión de diversos fragmentos de ADN que codifican para diferentes secuencias polipeptídicas se puede llevar a cabo de acuerdo con técnicas convencionales, empleando extremos romos o escalonados para ligamiento, digestión con enzima de restricción para proporcionar extremos apropiados, relleno de extremos cohesivos según convenga, tratamiento con fosfatasa alcalina para evitar uniones indeseables y ligamiento enzimático. En otra realización, puede sintetizarse el gen de fusión mediante técnicas convencionales, incluyendo sintetizadores de ADN automatizados. Como alternativa, puede llevarse a cabo la amplificación por PCR de fragmentos génicos usando cebadores de anclaje que dan lugar a protuberancias complementarias entre dos fragmentos génicos consecutivos que pueden alinearse posteriormente para generar una secuencia génica quimérica (véase, por ejemplo, Current Protocols in Molecular Biology, eds. Ausubel y col., John Wiley & Sons: 1992).
La proteína de fusión ActRIIA-Fc se puede expresar en células CHO-DUKX B1 1 transfectadas de forma estable a partir de un vector pAID4 (origen de replicación/potenciador de SV40, promotor de CMV), usando una secuencia líder del plasminógeno tisular de SEQ ID NO: 9. La porción Fc es una secuencia de IgG1 humana, tal y como se muestra en la SEQ ID NO: 7. En ciertas realizaciones, tras la expresión, la proteína contenida tiene, de media, entre aproximadamente 1,5 y 2,5 moles de ácido siálico por molécula de proteína de fusión ActRIIA-Fc.
En ciertas realizaciones la semivida en suero de una fusión ActRIIA-Fc puede ser de 25-32 días en pacientes humanos. Además, el material expresado en la célula CHO puede tener una afinidad por el ligando de activina B más alta que la informada para una proteína de fusión ActRIIA-hFc expresada en células 293 humanas (del Re y col., J Biol Chem. 2004 Dec 17;279(51):53126-35). Además, sin querer limitarnos a la teoría, el uso de la secuencia líder de TPA permitió una producción mayor que otras secuencias líder y, a diferencia de la ActRIIA-Fc expresada con una secuencia líder nativa, puede proporcionar una secuencia N-terminal de alta pureza. El uso de la secuencia líder nativa puede dar dos especies principales de ActRIIA-Fc que tienen una secuencia N-terminal diferente.
(b) INHIBIDORES DE ACTRIIB
Tal y como se usa en el presente documento, el término «ActRIIB» se refiere a una familia de proteínas que son receptores tipo IIB de activina (ActRIIB) de cualquier especie y variantes procedentes de tales proteínas ActRIIB mediante mutagénesis u otra modificación. Se entiende que la referencia a ActRIIB en el presente documento es una referencia a cualquiera de las formas actualmente identificadas del receptor. Los miembros de la familia ActRIIB son generalmente proteínas transmembrana, compuestas por un dominio extracelular de unión a ligando con una región rica en cisteína, un dominio transmembrana y un dominio citoplasmático con prevista actividad serina/treonina quinasa.
Los inhibidores de ActRIIB para uso en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento incluyen, sin limitación, polipéptidos ActRIIB solubles de unión a activina; anticuerpos que se unen a activina (concretamente a las subunidades A o B de activina, también conocidas como ßA o ßB) y alteran la unión a ActRIIB; anticuerpos que se unen a ActRIIB y alteran la unión a activina; proteínas que no son anticuerpos seleccionadas para unión a activina o ActRIIB y péptidos aleatorios seleccionados para unión a activina o ActRIIB que se pueden conjugar a un dominio Fc.
En ciertas realizaciones, dos o más proteínas diferentes (u otros restos) con actividad de unión a activina o ActRIIB, especialmente ligantes de activina que bloquean los sitios de unión tipo I (por ejemplo, un receptor de activina tipo I soluble) y tipo II (por ejemplo, un receptor de activina tipo II soluble), respectivamente, se pueden enlazar para crear una molécula de unión bifuncional o multifuncional que inhibe el ActRIIB y, por tanto, se pueden usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento. En ciertas realizaciones, los antagonistas del eje de señalización Activina-ActRIIB que inhiben el ActRIIB, entre los que se incluyen aptámeros de ácidos nucleicos, pequeñas moléculas y otros agentes, se usan en las composiciones y los métodos del presente documento.
(i) Inhibidores de ActRIIB que comprenden polipéptidos ActRIIB
Tal y como se usa en el presente documento, el término «polipéptido ActRIIB» se refiere a polipéptidos que comprenden cualquier polipéptido de un miembro de la familia ActRIIB presente de forma natural, así como a cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos, fusiones y formas peptidomiméticas) que retiene una actividad útil. Por ejemplo, los polipéptidos ActRIIB incluyen polipéptidos derivados de la secuencia de cualquier receptor ActRIIB conocido que tenga una secuencia al menos aproximadamente un 80 % idéntica a la secuencia de un polipéptido ActRIIB y, opcionalmente, al menos un 85 %, 90 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % o más de identidad de secuencia. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIB puede unirse e inhibir la función de una proteína ActRIIB y/o la activina. Un ejemplo de un polipéptido ActRIIB incluye el polipéptido precursor del ActRIIB humano (SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28). Con respecto al polipéptido precursor del ActRIIB cuya secuencia de aminoácidos está representada por la SEQ ID NO: 16 o la SEQ ID NO: 28 (es decir, el polipéptido precursor del ActRIIB humano), el péptido señal del polipéptido precursor del ActRIIB humano está localizado en los aminoácidos 1 a 18; el dominio extracelular está localizado en los aminoácidos 19 a 134 y los sitios potenciales de N-glicosilación están localizados en las posiciones de aminoácidos 42 y 65. La secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido precursor del ActRIIB humano de SEQ ID NO: 16 se desvela como SEQ ID NO: 19 (la SEQ ID NO: 19 aporta una alanina en el codón correspondiente a la posición de aminoácido 64, pero un experto en la materia la podría modificar fácilmente usando métodos conocidos en la técnica para aportar en su lugar una arginina en el codón correspondiente a la posición de aminoácido 64). Véase la Tabla 6 para ver una descripción de las secuencias.
La numeración de aminoácidos para todos los polipéptidos relacionados con ActRIIB descritos en el presente documento se basa en la numeración de aminoácidos de la SEQ ID NO: 16 y SEQ ID NO: 28 (que solo difieren en el aminoácido expresado en la posición 64), a menos que se indique específicamente lo contrario. Por ejemplo, si un polipéptido ActRIIB se describe como que tiene una sustitución/mutación en la posición de aminoácido 79, entonces se debe entender que esa posición 79 se refiere al aminoácido 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, de las cuales deriva el polipéptido ActRIIB. Asimismo, si un polipéptido ActRIIB se describe como que tiene una alanina o una arginina en la posición de aminoácido 64, entonces se debe entender que esa posición 64 se refiere al aminoácido 64 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, de las cuales deriva el polipéptido ActRIIB.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden polipéptidos que comprenden un dominio de unión a activina de ActRIIB. En algunas realizaciones, los dominios de unión a activina de ActRIIB comprenden el dominio extracelular de ActRIIB o una porción del mismo. En realizaciones específicas, el dominio extracelular de ActRIIB o la porción del mismo son solubles. Formas modificadas de polipéptidos ActRIIB ilustrativas se desvelan en las solicitudes de patente de Estados Unidos con n.º de publicación 20090005308 y 20100068215.
En realizaciones específicas, los polipéptidos ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento son polipéptidos ActRIIB solubles. El término «polipéptido ActRIIB soluble» generalmente se refiere a polipéptidos que comprenden un dominio extracelular de una proteína ActRIIB, incluyendo cualquier dominio extracelular de una proteína ActRIIB presente de forma natural, así como cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos y formas peptidomiméticas). Los polipéptidos ActRIIB solubles se pueden unir a activina; sin embargo, la proteína ActRIIB de tipo salvaje no exhibe selectividad significativa en la unión a activina frente a GDF8/11. En ciertas realizaciones, se pueden usar formas alteradas de ActRIIB con diferentes propiedades de unión en los métodos proporcionados en el presente documento. Tales formas alteradas se desvelan, por ejemplo, en las solicitudes de patente internacional con n.º de publicación. WO 2006/012627 y WO 2010/019261, cuyas descripciones se incorporan por referencia en su totalidad en el presente documento. Se puede aportar especificidad añadida a las proteínas ActRIIB nativas o alteradas mediante acoplamiento con un segundo agente de unión a activina selectivo. Entre los polipéptidos ActRIIB ejemplares se incluye el dominio extracelular de un polipéptido ActRIIB humano (por ejemplo, las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43).
Se ha demostrado que una proteína de fusión Fc que tiene la secuencia extracelular de ActRIIB desvelada por Hilden y col. (Blood, 1994, 83(8):2163-70), que tiene una alanina en la posición correspondiente al aminoácido 64 de la secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB, es decir, la SEQ ID NO: 16 (en el presente documento denominada «A64»), posee una afinidad relativamente baja por la activina y el GDF-11. Por el contrario, una proteína de fusión Fc con una arginina en la posición 64 de la secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB (en el presente documento denominada «R64») tiene una afinidad por la activina y el GDF-11 en el intervalo de nanomolar bajo a picomolar alto (véase, por e. ej., la solicitud de patente de Estados Unidos con n.º de publicación 20100068215). En la SEQ ID NO: 28 se presenta una secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB con una arginina en la posición 64. Por lo tanto, en ciertas realizaciones, los polipéptidos ActRIIB usados de acuerdo con las composiciones y los métodos descritos en el presente documento pueden comprender (i) una alanina en la posición correspondiente al aminoácido 64 de la secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB, es decir, la SEQ ID NO: 16 o (ii) una arginina en la posición 64 de la secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB, es decir, la SEQ ID NO: 28. En otras realizaciones, los polipéptidos ActRIIB usados de acuerdo con las composiciones y los métodos descritos en el presente documento pueden comprender un aminoácido que no sea alanina o arginina en la posición correspondiente al aminoácido 64 de la secuencia de aminoácidos del precursor de ActRIIB, es decir, la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28.
Se ha demostrado que una deleción del nudo de prolina en el C-terminal del dominio extracelular de ActRII reduce la afinidad del receptor por la activina (véase, p. ej., Attisano y col., Cell, 1992, 68(1):97-108). Una proteína de fusión ActRIIB que contiene los aminoácidos 20-119 de la SEQ ID NO: 28 (es decir, SEQ ID NO: 32), «ActRIIB(20-119)-Fc», tiene menor afinidad de unión a GDF-11 y activina que una proteína de fusión ActRIIB-Fc que contiene los aminoácidos 20-134 de la SEQ ID NO: 28 (es decir, SEQ ID NO: 31), «ActRIIB(20-134)-Fc», que incluye la región del nudo de prolina y el dominio yuxtamembrana completo. Sin embargo, una proteína de fusión ActRIIB-Fc que contiene los aminoácidos 20-129 de la SEQ ID NO: 28, «ActRIIB(20-129)-Fc» retiene una actividad similar, pero un tanto menor», que el dominio extracelular no truncado de ActRIIB, incluso aunque la región del nudo de prolina se haya alterado. Por tanto, todos los polipéptidos ActRIIB que comprenden dominios que se detienen en los aminoácidos 134, 133, 132, 131, 130 y 129 de la SEQ ID NO: 28 (o SEQ ID NO: 16) se espera que sean activos, pero los constructos que se detienen en los aminoácidos 133 o 134 pueden ser los más activos. De forma similar, no se espera que las mutaciones en cualquiera de los residuos 129-134 alteren la afinidad de unión al ligando en grandes márgenes, tal y como indica el hecho de que las mutaciones P129 y P130 de la SEQ ID NO: 28 no disminuyen significativamente la unión al ligando. Por lo tanto, los polipéptidos ActRIIB usados de acuerdo con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden terminar tan pronto como en el aminoácido 109 (es decir, la cisteína final) de la SEQ ID NO: 28 (o SEQ ID NO: 16); sin embargo, las formas que terminan en, o entre, las posiciones 109 y 119 de la SEQ ID NO: 28 (o SEQ ID NO: 16) se espera que tengan una capacidad de unión al ligando reducida.
El aminoácido 29 de la SEQ ID NO: 16 y SEQ ID NO: 28 representa la cisteína inicial de la secuencia del precursor de ActRIIB. Se espera que un polipéptido ActRIIB que comience en el aminoácido 29 del N-terminal de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, o antes de esta posición de aminoácido, retendrá la actividad de unión al ligando. Una mutación de alanina a asparagina en la posición 24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 introduce una secuencia de N-glicosilación sin afectar sustancialmente a la unión al ligando. Esto confirma que las mutaciones en la región entre el sitio de escisión del péptido señal y la región entrecruzada de cisteína, correspondiente a los aminoácidos 20-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO. 28, se toleran bien. En concreto, los polipéptidos ActRIIB que comienzan en las posiciones de aminoácidos 20, 21, 22, 23 y 24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 retendrán su actividad y los polipéptidos ActRIIB que comienzan en las posiciones 25, 26, 27, 28 y 29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 también se espera que retengan su actividad. Un polipéptido ActRIIB que comience en la posición de aminoácido 22, 23, 24 o 25 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 tendrá la mayor actividad.
En resumen, las porciones activas (es decir, los polipéptidos ActRIIB) de la proteína precursora de ActRIIB (es decir, SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28) para su uso de acuerdo con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento generalmente comprenderán los aminoácidos 29-109 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, y tales polipéptidos ActRIIB pueden, por ejemplo, comenzar en un residuo correspondiente a cualquiera de los aminoácidos 19-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminar en una posición correspondiente a cualquiera de los aminoácidos 109-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28. Entre los ejemplos concretos de polipéptidos ActRIIB abarcados en el presente documento se incluyen los que empiezan en una posición de aminoácido de 1929, 20-29 o 21-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en una posición de aminoácido de 119-134, 119-133 o 129-134, 129-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28. Otros ejemplos concretos de polipéptidos ActRIIB abarcados en el presente documento incluyen los que empiezan en una posición de aminoácido de 20-24 (o 21-24 o 22-25) de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en una posición de aminoácido de 109-134 (o 109133), 119-134 (o 119-133) o 129-134 (o 129-133) de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28. También se contemplan variantes de polipéptidos ActRIIB que se encuentran dentro de estos intervalos, concretamente las que tienen al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, o 99 % de identidad de secuencia u homología de secuencia con la porción correspondiente de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una forma truncada de un dominio extracelular de ActRIIB. El truncamiento puede estar en el extremo carboxilo terminal y/o en el extremo amino terminal del polipéptido ActRIIB. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos de longitud en comparación con el dominio extracelular del polipéptido ActRIIB maduro. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos N-terminales del dominio extracelular del polipéptido ActRIIB maduro. En ciertas realizaciones, el truncamiento puede ser de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 o 25 aminoácidos C-terminales del dominio extracelular del polipéptido ActRIIB maduro. Por ejemplo, las formas truncadas de ActRIIB incluyen polipéptidos con aminoácidos 20-119; 20-128; 20-129; 20-130; 20-131; 20132; 20-133; 20-134; 20-131; 21-131; 22-131; 23-131; 24-131 y 25-131, donde las posiciones de los aminoácidos se refieren a las posiciones de los aminoácidos en la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28.
Las formas truncadas ejemplares de ActRIIB incluyen (i) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 21-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 (opcionalmente, que empiezan en 22-25 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28) y terminan en cualquiera de los aminoácidos 109-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (ii) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 (opcionalmente, que empiezan en 22-25 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28) y terminan en cualquiera de los aminoácidos 109-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (iii) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 (opcionalmente, que empiezan en 22-25 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO:28) y terminan en cualquiera de los aminoácidos 109-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (iv) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 21-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 109-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (v) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 118-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (vi) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 21-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 118-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (vii) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 128-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (viii) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 128-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (ix) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 21-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 118-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (x) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 118-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28; (xi) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 21-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 128-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y (xii) polipéptidos que empiezan en cualquiera de los aminoácidos 20-29 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y terminan en cualquiera de los aminoácidos 128-133 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28. En una realización específica, un polipéptido ActRIIB comprende, consiste esencialmente en, o consiste en, una secuencia de aminoácidos que empieza en la posición de aminoácido 25 de la SEQ ID NO:16 o SEQ ID NO:28 y termina en la posición de aminoácido 131 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28. En otra realización específica, un polipéptido ActRIIB consiste en, o consiste esencialmente en, la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42, o 43.
Cualquiera de los polipéptidos ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento se puede producir como un homodímero. Cualquiera de los polipéptidos ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento se puede formular como una proteína de fusión que tiene una porción heteróloga que comprende una región constante de una cadena pesada de IgG, tal como un dominio Fc. Cualquiera de los polipéptidos ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento puede comprender un aminoácido ácido en la posición correspondiente a la posición 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, opcionalmente en combinación con una o más sustituciones, deleciones o inserciones de aminoácidos adicionales en comparación con la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28.
En realizaciones específicas, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden un dominio extracelular de ActRIIB con una o más sustituciones/mutaciones de aminoácidos. Tal sustitución/mutación de aminoácidos puede ser, por ejemplo, un intercambio entre la leucina de la posición de aminoácido 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 por un aminoácido ácido, tal como ácido aspártico
o ácido glutámico. Por ejemplo, en los polipéptidos del dominio extracelular de ActRIIB se puede alterar la posición L79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 para conferir propiedades de unión a activina-miostatina (GDF-11) alteradas. Las mutaciones L79A y L79P reducen la unión a GDF-11 en mayor grado que la unión a activina. Las mutaciones L79E y L79D retienen la unión a GDF-11, pero demuestran una gran reducción de la unión a activina.
En ciertas realizaciones, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una forma truncada de un dominio extracelular de ActRIIB que también lleva una sustitución de aminoácido, por ejemplo, un intercambio de la leucina de la posición de aminoácido 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 por un aminoácido ácido, tal como ácido aspártico o ácido glutámico. En una realización específica, la forma truncada de un dominio extracelular de ActRIIB que también lleva una sustitución de aminoácido usada en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es la SEQ ID NO: 23. Las formas de ActRIIB que están truncadas y/o llevan una o más sustituciones de aminoácidos se pueden conectar a un dominio Fc de un anticuerpo tal y como se ha comentado anteriormente.
Se pueden obtener fragmentos funcionalmente activos de polipéptidos ActRIIB, por ejemplo, mediante cribado de polipéptidos producidos recombinantemente a partir del correspondiente fragmento del ácido nucleico que codifica un polipéptido ActRIIB. Además, los fragmentos se pueden sintetizar químicamente usando técnicas conocidas en la técnica tales como la síntesis química en fase sólida mediante los métodos Fmoc o t-Boc de Merrifield. Los fragmentos se pueden producir (recombinantemente o mediante síntesis química) y ensayar para identificar los fragmentos peptídicos que pueden funcionar como antagonistas (inhibidores) de la proteína ActRIIB o de la señalización mediada por activina.
Además, se pueden obtener las variantes funcionalmente activas de polipéptidos ActRIIB, por ejemplo, mediante cribado de bibliotecas de polipéptidos modificados producidos recombinantemente a partir de los correspondientes ácidos nucleicos mutagenizados que codifican un polipéptido ActRIIB. Las variantes se pueden producir y ensayar para identificar aquellas que pueden funcionar como antagonistas (inhibidores) de la proteína ActRIIB o de la señalización mediada por activina. En ciertas realizaciones, una variante funcional de los polipéptidos ActRIIB comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 75 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43. En ciertas realizaciones, la variante funcional tiene una secuencia de aminoácidos al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 96%, 97%, 98% o 99% idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43.
Se pueden generar variantes funcionales, por ejemplo, mediante modificación de la estructura de un polipéptido ActRIIB para propósitos tales como la mejora de la eficacia terapéutica o la estabilidad (por ejemplo, la vida útil de almacenamiento ex vivo y la resistencia a la degradación proteolítica in vivo). Cuando se seleccionan tales polipéptidos ActRIIB modificados para retener la unión a activina, se consideran equivalentes funcionales de los polipéptidos ActRIIB presentes en la naturaleza. También se pueden producir polipéptidos ActRIIB, por ejemplo, mediante sustitución, deleción o adición de aminoácidos. Por ejemplo, cabe esperar que una sustitución aislada de una leucina por una isoleucina o valina, un aspartato por un glutamato, una treonina por una serina o una sustitución similar de un aminoácido por un aminoácido estructuralmente relacionado (p. ej., mutaciones conservadoras) no tendrá un efecto importante sobre la actividad biológica de la molécula resultante. Las sustituciones conservadoras son las que tienen lugar dentro de una familia de aminoácidos que están relacionados en sus cadenas laterales. Se puede determinar fácilmente si un cambio en la secuencia de aminoácidos de un polipéptido ActRIIB deriva en un homólogo funcional mediante evaluación de la capacidad de la variante del polipéptido ActRIIB para producir una respuesta en las células similar a la del polipéptido ActRIIB de tipo salvaje.
En los métodos y composiciones descritos en el presente documento se pueden usar mutantes de un polipéptido ActRIIB, en concreto conjuntos de mutantes combinatoriales de un polipéptido ActRIIB y mutantes de truncamiento; los pools de mutantes combinatoriales son especialmente útiles para la identificación de secuencias de variantes funcionales. El propósito del cribado de tales bibliotecas combinatoriales puede ser el de generar, por ejemplo, variantes del polipéptido ActRIIB que puedan actuar como agonistas o como antagonistas o, como alternativa, que posean actividades novedosas en conjunto.
Se ha demostrado que el bolsillo de unión al ligando de ActRIIB viene definido por los residuos Y31, N33, N35, L38 a T41, E47, E50, Q53 a K55, L57, H58, Y60, S62, K74, W78 a N83, Y85, R87, A92 y E94 a F101 de la SEQ ID NO: 16
o SEQ ID NO: 28. En estas posiciones se espera que se toleren mutaciones conservadoras, aunque una mutación K74A se tolera bien, al igual que las R40A, K55A, F82A y las mutaciones en la posición L79. R40 es una K en Xenopus, lo que indica que se tolerarán bien aminoácidos básicos en esta posición. Q53 es R en ActRIIB bovino y K en ActRIIB de Xenopus y, por lo tanto, los aminoácidos que incluyen R, K, Q, N y H se tolerarán bien en esta posición. Por tanto, una fórmula general para un polipéptido ActRIIB para uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento es una que comprende los aminoácidos 29-109 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, pero que opcionalmente empieza en una posición de aminoácido que varía de 20-24 o 22-25 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 y termina en una posición de aminoácido que varía de 129-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28, y no comprende más de 1, 2, 5 o 15 cambios conservativos de aminoácidos en el bolsillo de unión al ligando y cero, una o más alteraciones no conservativas en las posiciones de aminoácidos 40, 53, 55, 74, 79 y/o 82 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 del bolsillo de unión al ligando. Tal polipéptido ActRIIB puede retener más del 80 %, 90 %, 95 % o 99 % de identidad de secuencia u homología de secuencia con la secuencia de aminoácidos 29-109 de la SEQ ID NO: 16 o r SEQ ID NO: 28. Los sitios fuera del bolsillo de unión, en los cuales se puede tolerar especialmente bien la variabilidad, incluyen los extremos carboxilo y amino terminales del dominio extracelular de ActRIIB y las posiciones 42-46 y 65-73. Una alteración de asparagina a alanina en la posición 65 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 (N65A) mejora realmente la unión al ligando en la A64 original y, por tanto, se espera que no tenga un efecto perjudicial sobre la unión al ligando en la R64 original. Este cambio probablemente elimina la glicosilación en N65 de la A64 original y, por tanto, demuestra es probable que se tolere un cambio significativo en esta región. Mientras que un cambio R64A se tolera mal, R64K se tolera bien y, por tanto, otro residuo básico, tal como H, se puede tolerar bien en la posición 64.
Como ejemplo específico de un polipéptido ActRIIB con una mutación en el dominio de unión al ligando, se puede mutar el residuo de aminoácido positivamente cargado Asp(D80) del dominio de unión al ligando de ActRIIB a un residuo de aminoácido diferente de tal modo que la variante de polipéptido ActRIIB se una preferentemente a GDF8 y no a activina. En una realización específica, el residuo D80 se cambia a un residuo de aminoácido seleccionado de entre el grupo que consiste en: un residuo de aminoácido no cargado, un residuo de aminoácido negativo y un residuo de aminoácido hidrofóbico. Como ejemplo específico adicional, el residuo hidrofóbico L79 se puede alterar a los aminoácidos ácidos ácido aspártico o ácido glutámico para reducir enormemente la unión a activina a la vez que se retiene la unión a GDF11. Como bien sabe un experto en la materia, la mayoría de las mutaciones, variantes o modificaciones descritas se pueden hacer a nivel del ácido nucleico o, en algunos casos, mediante modificación postraduccional o síntesis química. Tales técnicas se conocen bien en la técnica.
En realizaciones específicas, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden una proteína de fusión/conjugada que comprende un dominio extracelular (por ejemplo, un dominio de unión a activina) de un receptor ActRIIB conectado a una porción Fc de un anticuerpo. Tales proteínas de fusión/conjugadas pueden comprender cualquiera de los polipéptidos ActRIIB descritos en el presente documento (por ejemplo, cualquiera de las SEQ ID NO:17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 o 43), cualquiera de los polipéptidos conocidos en la técnica o cualquiera de los polipéptidos ActRIIB generados usando métodos conocidos en la técnica y/o proporcionados en el presente documento.
En ciertas realizaciones, el dominio extracelular está conectado a una porción Fc de un anticuerpo a través de un conector, por ejemplo, un conector peptídico. Los conectores ejemplares incluyen secuencias polipeptídicas cortas tales como de 2-10, 2-5, 2-4, 2-3 residuos de aminoácidos (por ejemplo, residuos de glicina), tal como, por ejemplo, un conector Gly-Gly-Gly. En una realización específica, el conector comprende la secuencia de aminoácidos Gly-Gly-Gly (GGG). En otra realización específica, el conector comprende la secuencia de aminoácidos Thr-Gly-Gly-Gly (TGGG). Opcionalmente, el dominio Fc tiene una o más mutaciones en residuos tales como Asp-265, lisina 322 y Asn-434. En ciertos casos, el dominio Fc mutante que tiene una o más de estas mutaciones (p. ej., una mutación Asp-265) tiene menor capacidad de unión al receptor Fcγ que un dominio Fc de tipo salvaje. En otros casos, el dominio Fc mutante que tiene una o más de estas mutaciones (por ejemplo, una mutación Asn-434) tiene mayor capacidad de unión al receptor Fc neonatal (FcRn) de estructura similar a una molécula MHC clase I que un dominio Fc de tipo salvaje. Las proteínas de fusión ejemplares que comprenden un dominio extracelular de ActRIIB soluble fusionado a un dominio Fc se exponen en las SEQ ID NO: 20, 21, 24, 25, 34, 35, 38, 39, 40, 41, 44, 46 y 47.
En una realización específica, los inhibidores de ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden el dominio extracelular de ActRIIB, o una porción del mismo, conectado a una porción Fc de un anticuerpo, donde dicho inhibidor de ActRIIB comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 75 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 20, 21, 24, 25, 34, 35, 38, 39, 40, 41, 44, 46 y 47. En otra realización específica, los inhibidores del ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento comprenden el dominio extracelular de ActRIIB, o una porción del mismo, conectado a una porción Fc de un anticuerpo, donde dicho inhibidor del ActRIIB comprende una secuencia de aminoácidos que es al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % o 99 % idéntica a una secuencia de aminoácidos seleccionada de entre las SEQ ID NO: 20, 21, 24, 25, 34, 35, 38, 39, 40, 41, 44, 46 y
47.
En una realización específica, el inhibidor de ActRIIB que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre el dominio extracelular del receptor ActRIIB humano y la porción Fc de la IgG1. En otra realización específica, el inhibidor de ActRIIB que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre un dominio extracelular truncado del receptor ActRIIB humano y la porción Fc de la IgG1. En otra realización específica, el inhibidor de ActRIIB que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es una proteína de fusión entre un dominio extracelular truncado del receptor ActRIIB humano y la porción Fc de la IgG1, donde el dominio extracelular truncado del receptor ActRIIB humano posee una sustitución de aminoácido en la posición de aminoácido correspondiente al aminoácido 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28. En una realización, la sustitución de aminoácido en la posición de aminoácido correspondiente al aminoácido 79 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 es una sustitución de leucina por ácido aspártico (es decir, una mutación L79D).
En una realización específica, el inhibidor de ActRIIB que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es las SEQ ID NO: 24 o 25, que representa una proteína de fusión entre el dominio extracelular del receptor ActRIIB humano y la porción Fc de la IgG1, donde dicho dominio extracelular de ActRIIB comprende los aminoácidos 25-131 de la SEQ ID NO: 28 con una mutación L79D. La secuencia de ácido nucleico que codifica la proteína de fusión ActRIIA-Fc de SEQ ID NO: 24 se presenta en la SEQ ID NO: 45.
En otra realización específica, el inhibidor de ActRIIB que se va a usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es la SEQ ID NO: 34 o 35, que representa una proteína de fusión entre el dominio extracelular del receptor ActRIIB humano y la porción Fc de la IgG1, donde dicho dominio extracelular de ActRIIB comprende los aminoácidos 25-131 de la SEQ ID NO: 16 con una mutación L79D.
Los sitios de reconocimiento de la glicosilación por conexión a asparagina generalmente comprenden una secuencia tripeptídica, asparagina-X-treonina (o asparagina-X-serina) (donde «X» es cualquier aminoácido), que es reconocida específicamente por las enzimas de glicosilación celular adecuadas. La alteración también se puede hacer por adición de, o sustitución de, uno o más residuos de serina o treonina en la secuencia del polipéptido ActRIIB de tipo salvaje (para sitios de O-glicosilación). Una variedad se sustituciones o deleciones en una o ambas de las posiciones de aminoácidos primera y tercera de un sitio de reconocimiento de glicosilación (y/o deleción de aminoácidos en la segunda posición) deriva en la no glicosilación en la secuencia tripeptídica modificada. Otro medio de aumentar el número de restos carbohidrato en un polipéptido ActRIIB es mediante acoplamiento químico o enzimático de glicósidos al polipéptido ActRIIB. Dependiendo del modo de acoplamiento usado, el(los) azúcar(es) se pueden fijar a (a) arginina e histidina; (b) grupos carboxilo libres; (c) grupos sulfhidrilo libres tales como los de la cisteína; (d) grupos hidroxilo libres tales como los de la serina, treonina o hidroxiprolina; (e) residuos aromáticos tales como los de la fenilalanina, tirosina o triptófano o (f) el grupo amida de la glutamina. Estos métodos se describen en la solicitud de patente internacional n.º WO 87/05330 publicada el 11 de septiembre de 1987 y en Aplin and Wriston (1981) CRC Crit. Rev. Biochem., pp. 259-306, incorporados por referencia en el presente documento. La eliminación de uno o más restos carbohidrato presentes en un polipéptido ActRIIB se puede conseguir químicamente y/o enzimáticamente. La deglicosilación química puede implicar, por ejemplo, la exposición del polipéptido ActRIIB al compuesto ácido trifluorometanosulfónico o un compuesto equivalente. Este tratamiento deriva en la escisión de la mayoría de los azúcares, o todos ellos, excepto el azúcar de conexión (N-acetilglucosamina o Nacetilgalactosamina), dejando la secuencia de aminoácidos intacta. La deglicosilación química se describe con más detalle en Hakimuddin y col. (1987) Arch. Biochem. Biophys. 259:52 y en Edge y col. (1981) Anal. Biochem. 118:131. La escisión enzimática de restos carbohidrato en polipéptidos ActRIIB se puede conseguir mediante el uso de una variedad de endo-y exoglicosidasas tal y como se describe en Thotakura y col. (1987) Meth. Enzymol. 138:350. La secuencia de un polipéptido ActRIIB se puede ajustar, según convenga, dependiendo del tipo de sistema de expresión usado, ya que todas las células de mamíferos, levadura, insectos y plantas pueden introducir diferentes patrones de glicosilación que se pueden ver afectados por la secuencia de aminoácidos del péptido. En general, las proteínas ActRIIB para uso en humanos se expresarán en una línea celular de mamífero que permita una glicosilación adecuada, tal como las líneas celulares HEK293 o CHO, pero se prevé que otros sistemas de expresión, tales como otras líneas celulares de expresión en mamíferos, líneas celulares de levadura con enzimas de glicosilación modificadas y células de insectos, también pueden ser útiles.
En realizaciones específicas, se pueden usar en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento polipéptidos ActRIIB mutados que comprenden la adición de un sitio de N-glicosilación adicional (N-X-S/T) que aumenta la semivida en suero de una proteína de fusión ActRIIB-Fc en comparación con la forma ActRIIB(R64)-Fc. En una realización específica, la introducción de una asparagina en la posición 24 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28 (A24N) deriva en la creación de una secuencia NXT que confiere una semivida más larga. Se pueden encontrar otras secuencias NX(T/S) en 42-44 (NQS) y 65-67 (NSS), aunque la última puede que no esté eficientemente glicosilada con R en la posición 64 (es decir, en polipéptidos R64). Generalmente, las secuencias N-X-S/T se pueden introducir en posiciones fuera del bolsillo de unión al ligando de ActRIIB, lo cual se ha comentado con detalle anteriormente. Los sitios particularmente adecuados para la introducción de secuencias N-X-S/T no endógenas incluyen los aminoácidos 20-29, 20-24, 22-25, 109-134, 120-134 o 129-134 de la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28. Las secuencias N-X-S/T también se pueden introducir en el conector entre la secuencia ActRIIB y el Fc u otro componente de fusión. Tal sitio se puede introducir con mínimo esfuerzo mediante la introducción de una N en la posición correcta con respecto a una S o T preexistentes o mediante introducción de una S o T en una posición correspondiente a una N preexistente, Por tanto, las alteraciones deseables que crearían un sitio de N-glicosilación son: A24N, R64N, S67N (posiblemente combinada con una alteración N65A), E106N, R112N, G120N, E123N, P129N, A132N, R112S y R112T (con todas las posiciones de aminoácidos correspondientes a las posiciones que se pueden encontrar en la SEQ ID NO: 16 o SEQ ID NO: 28). Cualquier S que se prevea que va a ser glicosilada se puede alterar a una T sin crear un sitio inmunogénico, debido a la protección otorgada por la glicosilación. Asimismo, cualquier T que se prevea que va a ser glicosilada se puede alterar a una S, Por tanto, las alteraciones S67T y S44T están abarcadas en el presente documento. Asimismo, en una variante A24N se puede usar una alteración S26T. Por consiguiente, un polipéptido ActRIIB puede incluir una o más secuencias consenso de N-glicosilación no endógenas adicionales.
Se puede usar una variedad de ensayos de cribado para evaluar variantes del polipéptido ActRIIB. Por ejemplo, se puede cribar una variante de polipéptido ActRIIB para que tenga capacidad de unión a un ligando de ActRIIB, para que evite la unión de un ligando de ActRIIB a un polipéptido ActRIIB o para que interfiera con la señalización provocada por un ligando de ActRIIB. La actividad de un polipéptido ActRIIB o sus variantes también se puede ensayar en un ensayo in vivo o en células.
Se pueden generar variantes derivadas combinatorialmente que tengan una potencia selectiva, o generalmente mayor, que un polipéptido ActRIIB presente de forma natural. Asimismo, la mutagénesis puede dar lugar a variantes que tengan semividas intracelulares drásticamente diferentes de las del correspondiente polipéptido ActRIIB de tipo salvaje. Por ejemplo, la proteína alterada se puede hacer más estable o menos estable a la degradación proteolítica u otros procesos celulares que deriven en la destrucción o inactivación de un polipéptido ActRIIB nativo. Tales variantes, y los genes que las codifican, se pueden utilizar para alterar los niveles de polipéptidos ActRIIB mediante modulación de la semivida de los polipéptidos ActRIIB. Por ejemplo, una semivida corta puede dar lugar a efectos biológicos más transitorios y puede permitir un control más estrecho de los niveles de polipéptido ActRIIB en el paciente. En una proteína de fusión Fc, se pueden hacer mutaciones en el conector (si lo hay) y/o en la porción Fc para alterar la semivida de la proteína.
Se puede producir una biblioteca combinatorial mediante una biblioteca degenerada de genes que codifican una biblioteca de polipéptidos que incluyen, todos ellos, al menos una porción de secuencias de polipéptidos ActRIIB potenciales. Por ejemplo, se puede ligar enzimáticamente una mezcla de oligonucleótidos sintéticos a secuencias de genes de tal forma que el conjunto degenerado de secuencias de nucleótidos de polipéptido ActRIIB potencial se pueda expresar como polipéptidos individuales o, como alternativa, como un conjunto de proteínas de fusión más grandes (por ejemplo, para expresión en fago).
La biblioteca de homólogos potenciales se puede generar de muchas formas a partir de una secuencia de oligonucleótido degenerada. La síntesis química de una secuencia de gen degenerada se puede llevar a cabo en un sintetizador de ADN automatizado y, a continuación, se pueden ligar los genes sintéticos a un vector de expresión adecuado. La síntesis de oligonucleótidos degenerados se conoce bien en la técnica (véase, por ejemplo, Narang, S A (1983) Tetrahedron 39:3; Itakura y col., (1981) Recombinant DNA, Proc. 3rd Cleveland Sympos. Macromolecules, ed. AG Walton, Amsterdam: Elsevier pp 273-289; Itakura y col., (1984) Annu. Rev. Biochem. 53:323; Itakura y col., (1984) Science 198:1056; Ike y col., (1983) Nucleic Acid Res. 11:477). Tales técnicas se han empleado en la evolución dirigida de otras proteínas (véase, por ejemplo, Scott y col., (1990) Science 249:386-390; Roberts y col., (1992) PNAS USA 89:2429-2433; Devlin y col., (1990) Science 249: 404-406; Cwirla y col., (1990) PNAS USA 87: 6378-6382; así como las patentes US5223409, US5198346 y US5096815).
Como alternativa, se pueden utilizar otras formas de mutagénesis para generar una biblioteca combinatorial. Por ejemplo, se pueden generar y aislar variantes de polipéptido ActRIIB a partir de una biblioteca mediante cribado usando, por ejemplo, mutagénesis dirigida por barrido de alanina y similares (Ruf y col., (1994) Biochemistry 33:1565-1572; Wang y col., (1994) J. Biol. Chem. 269:3095-3099; Balint y col., (1993) Gene 137:109-118; Grodberg y col., (1993) Eur. J. Biochem. 218:597-601; Nagashima y col., (1993) J. Biol. Chem. 268:2888-2892; Lowman y col., (1991) Biochemistry 30:10832-10838 y Cunningham y col., (1989) Science 244:1081-1085); mediante mutagénesis dirigida por barrido de conector (Gustin y col., (1993) Virology 193:653-660; Brown y col., (1992) Mol. Cell Biol. 12:2644-2652; McKnight y col., (1982) Science 232:316); mediante mutagénesis por saturación (Meyers y col., (1986) Science 232:613); mediante mutagénesis dirigida por PCR (Leung y col., (1989) Method Cell Mol Biol 1:1119); o mediante mutagénesis aleatoria, incluyendo mutagénesis química, etc. (Miller y col., (1992) A Short Course in Bacterial Genetics, CSHL Press, Cold Spring Harbor, N.Y.y Greener y col., (1994) Strategies in Mol Biol 7:32-34). La mutagénesis dirigida por barrido de conector, especialmente en un entorno combinatorial, es un método atractivo para la identificación de formas truncadas (bioactivas) de polipéptido ActRIIB.
En la técnica se conoce una amplia gama de técnicas para el cribado de productos génicos de bibliotecas combinatoriales fabricadas mediante mutaciones y truncamientos puntuales y, por ende, para el cribado de genotecas de ADNc para productos génicos que tienen una determinada propiedad. Generalmente, tales técnicas serán adaptables para el cribado rápido de genotecas generadas mediante la mutagénesis combinatorial de polipéptidos ActRIIB. Habitualmente, las bibliotecas generalmente usadas para el cribado de genotecas grandes comprenden la clonación de la genoteca en vectores de expresión replicables, la transformación de las células apropiadas con la biblioteca de vectores resultante y la expresión de los genes combinatoriales en condiciones en las que la detección de una actividad deseada facilita el aislamiento relativamente sencillo del vector que codifica el gen cuyo producto se detectó. Los ensayos preferidos incluyen ensayos de unión a activina y ensayos de señalización celular mediada por activina.
En ciertas realizaciones, los polipéptidos ActRIIB usados en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden comprender modificaciones postraduccionales además de las presentes de forma natural en los polipéptidos ActRIIB. Tales modificaciones incluyen, pero no se limitan a, acetilación, carboxilación, glicosilación, fosforilación, lipidación y acilación. Como resultado, los polipéptidos ActRIIB modificados pueden contener elementos que no son aminoácidos, tales como polietilenglicoles, lípidos, poli-o monosacáridos y fosfatos. Los efectos de tales elementos que no son aminoácidos sobre la funcionalidad de un polipéptido ActRIIB se pueden ensayar mediante cualquier método conocido por un experto en la materia. Cuando se produce un polipéptido ActRIIB en las células mediante escisión de una forma incipiente del polipéptido ActRIIB, el procesamiento postraduccional también puede ser importante para corregir el plegamiento y/o la función de la proteína. Diferentes células (tales como CHO, HeLa, MDCK, 293, W138, NIH-3T3 o HEK293) tienen maquinaria celular específica y mecanismos característicos para tales actividades postraduccionales y se pueden elegir para garantizar la modificación y el procesamiento correctos de los polipéptidos ActRIIB.
En ciertos aspectos, las variantes funcionales o formas modificadas de los polipéptidos ActRIIB incluyen proteínas de fusión que tienen al menos una porción de los polipéptidos ActRIIB y uno o más dominios de fusión. Ejemplos bien conocidos de tales dominios de fusión incluyen, pero no se limitan a, polihistidina, Glu-Glu, glutatión S transferasa (GST), tioredoxina, proteína A, proteína G, una región constante (Fc) de una cadena pesada de inmunoglobulina, proteína de unión a maltosa (MBP) o albúmina sérica humana. Se puede seleccionar un dominio de fusión de tal forma que confiera una propiedad deseada. Por ejemplo, algunos dominios de fusión son especialmente útiles para el aislamiento de las proteínas de fusión mediante cromatografía de afinidad. Para la purificación por afinidad, se usan matrices para cromatografía de afinidad pertinentes, tales como resinas conjugadas con glutatión, amilasa y con níquel o cobalto. Muchas de tales matrices se comercializan en forma de «kit», tal como el sistema de purificación Pharmacia GST y el sistema QIAexpressTM (Qiagen), útil con parejas de fusión (HIS6). Como otro ejemplo, se puede seleccionar un dominio de fusión de tal modo que facilite la detección de los polipéptidos ActRIIB. Los ejemplos de tales dominios de detección incluyen las diversas proteínas fluorescentes (por ejemplo, GFP), así como «epítopos marcadores», que normalmente son secuencias peptídicas cortas para las que se dispone de un anticuerpo específico. Entre los epítopos marcadores bien conocidos para los que es fácil disponer de anticuerpos monoclonales específicos se incluyen el epítopo FLAG, el virus de la gripe, la hemaglutinina (HA) y los marcadores c-myc. En algunos casos, los dominios de fusión tienen un sitio de escisión para proteasas, tal como para el factor Xa o la trombina, que permite que la proteasa pertinente digiera parcialmente las proteínas de fusión y, por consiguiente, libere de ahí las proteínas recombinantes. A continuación, las proteínas liberadas se pueden aislar del dominio de fusión mediante separación cromatográfica posterior. En ciertas realizaciones preferidas, un polipéptido ActRIIB se fusiona con un dominio que estabiliza el polipéptido ActRIIB in vivo (un «dominio estabilizador»). Por «estabilización» se entiende cualquier cosa que aumenta la semivida en suero, independientemente de si lo hace mediante reducción de la destrucción, reducción de la eliminación por el riñón u otro efecto farmacocinético. Se sabe que las fusiones con la porción Fc de una inmunoglobulina confieren las propiedades farmacocinéticas deseadas a una amplia gama de proteínas. Asimismo, las fusiones a albúmina sérica humana pueden conferir propiedades deseables. Entre otros tipos de dominios de fusión que se pueden seleccionar se incluyen los dominios multimerizantes (p. ej., dimerizantes, tetramerizantes) y los dominios funcionales (que confieren una función biológica adicional, tal como la estimulación adicional del crecimiento óseo o el crecimiento muscular, según convenga).
Se entiende que los diferentes elementos de las proteínas de fusión pueden adoptar cualquier disposición que sea consistente con la funcionalidad deseada. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIB se puede colocar en posición Cterminal respecto a un dominio heterólogo o, como alternativa, un dominio heterólogo se puede colocar en posición C-terminal respecto a un polipéptido ActRIIB. El dominio del polipéptido ActRIIB y el dominio heterólogo no necesitan estar adyacentes en una proteína de fusión, y se pueden incluir dominios o secuencias de aminoácidos adicionales en las posiciones C-o N-terminal de ambos dominios o entre los dominios.
En ciertas realizaciones, los polipéptidos ActRIIB usados en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento pueden contener una o más modificaciones que sean capaces de estabilizar los polipéptidos ActRIIB. Por ejemplo, tales modificaciones mejoran la semivida in vivo de los polipéptidos ActRIIB, mejorar la semivida circulatoria de los polipéptidos ActRIIB o reducir la degradación proteolítica de los polipéptidos ActRIIB. Tales modificaciones estabilizadoras incluyen, pero no se limitan a, proteínas de fusión (incluyendo, por ejemplo, proteínas de fusión que comprenden un polipéptido ActRIIB y un dominio estabilizador), modificaciones de un sitio de glicosilación (incluyendo, por ejemplo, adición de un sitio de glicosilación a un polipéptido ActRIIB) y modificaciones de restos carbohidrato (incluyendo, por ejemplo, la eliminación de restos carbohidrato de un polipéptido ActRIIB). En el caso de las proteínas de fusión, un polipéptido ActRIIB se fusiona con un dominio estabilizador tal como una molécula de IgG (por ejemplo, un dominio Fc). Tal y como se usa en el presente documento, el término «dominio estabilizador» no solo se refiere a un dominio de fusión (por ejemplo, Fc) como ocurre en el caso de las proteínas de fusión, sino que también incluye modificaciones no proteináceas tales como un resto carbohidrato o un polímero no proteináceo tal como polietilenglicol.
En ciertas realizaciones, los métodos y las composiciones descritos en el presente documento usan formas aisladas
o purificadas de polipéptidos ActRIIB, es decir, polipéptidos que se aíslan de, o están sustancialmente libres de, otras proteínas, se pueden usar en los métodos y composiciones descritos en el presente documento. Generalmente, los polipéptidos ActRIIB se producirán generalmente mediante expresión a partir de ácidos nucleicos recombinantes.
En ciertos aspectos, los polipéptidos ActRIIB usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento están codificados por ácidos nucleicos aislados y/o recombinantes, incluyendo fragmentos, variantes funcionales y proteínas de fusión descritos en el presente documento. Por ejemplo, la SEQ ID NO: 19 codifica el polipéptido precursor del ActRIIB humano presente de forma natural. Los ácidos nucleicos objetivo pueden ser monocatenarios o bicatenarios. Tales ácidos nucleicos pueden ser moléculas de ADN o ARN. Estos ácidos nucleicos se pueden usar, por ejemplo, en métodos de fabricación de polipéptidos ActRIIB o como agentes terapéuticos directos (por ejemplo, en una estrategia de terapia génica).
En ciertos aspectos, los ácidos nucleicos que se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento se entiende que además incluyen ácidos nucleicos que son variantes de la SEQ ID NO: 19, así como variantes de las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43). Las secuencias de nucleótidos de las variantes incluyen secuencias que difieren en una o más sustituciones, adiciones o deleciones de nucleótidos, tal como las variantes alélicas.
En ciertas realizaciones, las secuencias de ácido nucleico aislado o recombinante que se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento son al menos un 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 %, 99 % o 100 % idénticas a la SEQ ID NO: 19 o a las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43). Un experto en la materia comprenderá que las secuencias de ácido nucleico complementarias a la SEQ ID NO: 19 o las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43) y variantes de la SEQ ID NO: 19 o las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43) se pueden usar con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. En realizaciones adicionales, las secuencias de ácido nucleico se pueden aislar, recombinar y/o fusionar con una secuencia de nucleótido heterólogo, o en una genoteca de ADN.
En otras realizaciones, los ácidos nucleicos que se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento incluyen secuencias de nucleótidos que se hibridan en condiciones muy rigurosas a la secuencia de nucleótidos designada en la SEQ ID NO: 19 o a las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43) y secuencias complementarias de la SEQ ID NO: 19 o las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43), o fragmentos de las mismas. Un experto en la materia entenderá que se pueden modificar las condiciones de rigurosidad adecuadas que facilitan la hibridación del ADN. Por ejemplo, se puede realizar la hibridación 6,0 veces en cloruro sódico/citrato sódico (SSC) a aproximadamente 45 grados Celsius seguida de un lavado de 2,0 veces con SSC a 50 grados Celsius. Por ejemplo, la concentración de sal en la etapa de lavado se puede seleccionar desde una baja rigurosidad de aproximadamente 2,0 veces con SCC a 50 grados Celsius a una alta rigurosidad de aproximadamente 0,2 veces con SCC a 50 grados Celsius. Además, la temperatura de la etapa de lavado se puede aumentar desde condiciones de baja rigurosidad a temperatura ambiente, aproximadamente 22 grados Celsius, a condiciones de alta rigurosidad a aproximadamente 65 grados Celsius. Se puede variar tanto la temperatura como la sal, o se puede mantener constante la temperatura o la concentración de sal y modificar la otra variable. En una realización, con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento se pueden usar ácidos nucleicos que se hibridan en las condiciones de baja rigurosidad de 6 veces con SCC a temperatura ambiente seguida de un lavado de 2 veces con SCC a temperatura ambiente.
Los ácidos nucleicos aislados que difieren de los ácidos nucleicos expuestos en la SEQ ID NO: 19 o las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43) debido a la degeneración del código genético, también se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. Por ejemplo, varios aminoácidos se designan por más de un triplete. Los codones que especifican el mismo aminoácido, o sinónimos (por ejemplo, CAU y CAC son sinónimos para histidina), pueden derivar en mutaciones «silenciosas» que no afectan a la secuencia de aminoácidos de la proteína. Sin embargo, se espera que los polimorfismos de secuencia de ADN que derivan en cambios en las secuencias de aminoácidos de las proteínas objetivo seguirán existiendo entre las células de mamíferos. Un experto en la materia comprenderá que estas variaciones en uno o más nucleótidos (hasta aproximadamente el 3-5 % de nucleótidos) de los ácidos nucleicos que codifican una proteína concreta pueden existir entre individuos de una determinada especie debido a la variación alélica natural. Todos, o cualquiera de, tales variaciones de nucleótidos y polimorfismos de aminoácidos resultantes se pueden usar con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento.
En ciertas realizaciones, los ácidos nucleicos recombinantes que se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento se pueden conectar operativamente a una o más secuencias de nucleótido reguladoras en un constructo de expresión. Generalmente, las secuencias de nucleótidos reguladoras serán adecuadas para la célula huésped usada para la expresión. En la técnica se conocen diversos tipos de vectores de expresión apropiados y secuencias reguladoras adecuadas para una variedad de células huésped. Habitualmente, dichas una o más secuencias de nucleótidos reguladoras pueden incluir, pero no se limitan a, secuencias de promotores, secuencias líder o señal, sitios de unión de ribosomas, secuencias de inicio y terminación de la transcripción, secuencias de inicio y terminación de la traducción y secuencias potenciadoras o secuencias activadoras. Los promotores constitutivos o inducibles, tal y como se conocen en la técnica, se pueden usar con los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. Los promotores pueden ser promotores presentes de forma natural o promotores híbridos que combinan elementos de más de un promotor. Un constructo de expresión puede estar presente en una célula en un episoma, tal como un plásmido, o el constructo de expresión puede estar insertado en un cromosoma. En una realización preferida, el vector de expresión contiene un gen marcador seleccionable para permitir la selección de células huésped transformadas. Los genes marcadores seleccionables son bien conocidos en la técnica y variarán en función de la célula huésped usada.
En ciertos aspectos, los ácidos nucleicos que se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritas en el presente documento se proporcionan en un vector de expresión que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido ActRIIB y está operativamente conectada a al menos una secuencia reguladora. Las secuencias reguladoras están reconocidas en la técnica y se seleccionan para la expresión directa del polipéptido ActRIIB. Por consiguiente, el término secuencia reguladora incluye promotores, potenciadores y otros elementos de control de la expresión. Secuencias reguladoras ejemplares se describen en Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology, Academic Press, San Diego, Calif. (1990). Por ejemplo, se puede usar cualquiera de una amplia variedad de secuencias de control de la expresión, que controlan la expresión de una secuencia de ADN cuando están operativamente conectadas a ella, en estos vectores para expresar secuencias de ADN que codifican un polipéptido ActRIIB. Tales secuencias de control de la expresión útiles incluyen, por ejemplo, los promotores tempranos o tardíos del SV40, el promotor tet, el promotor temprano inmediato del adenovirus o citomegalovirus, los promotores RSV, el sistema lac, el sistema trp, el sistema TAC o TRC, el promotor T7 cuya expresión está dirigida por la ARN polimerasa T7, las regiones operadoras y promotoras principales del fago lambda, las regiones de control de la proteína de cubierta fd, el promotor de la 3-fosfoglicerato quinasa u otras enzimas glicolíticas, los promotores de la fosfatasa ácida, por ejemplo, Pho5, los promotores de los
factores α de apareamiento de la levadura, el promotor de poliedros del sistema baculovirus y otras secuencias
conocidas para el control de la expresión de genes de células procariotas y eucariotas o sus virus y diversas combinaciones de los mismos. Se debe entender que el diseño del vector de expresión puede depender de factores tales como la elección de la célula huésped que se va a transformar y/o el tipo de proteína que se desea expresar. Asimismo, se debe considerar el número de copias del vector, la capacidad para controlar ese número de copias y la expresión de cualquier otra proteína codificada por el vector, tal como los marcadores antibióticos.
Un ácido nucleico recombinante se puede producir mediante ligamiento del gen clonado, o una porción del mismo, a un vector adecuado para expresión en células procariotas, células eucariotas (levadura, aviar, insectos o mamíferos)
o en ambas. Los vehículos de expresión para la producción de un polipéptido ActRIIB recombinante incluyen plásmidos y otros vectores. Por ejemplo, los vectores adecuados incluyen plásmidos de los tipos: plásmidos derivados de pBR322, plásmidos derivados de pEMBL, plásmidos derivados de pEX, plásmidos derivados de pBTac y plásmidos derivados de pUC para la expresión en células procariotas, tales como E. coli.
Algunos vectores de expresión en mamíferos contienen tanto secuencias procariotas, para facilitar la propagación del vector en la bacteria, como una o más unidades de transcripción eucariotas, que se expresan en células eucariotas. Los vectores derivados de pcDNAI/amp, pcDNAI/neo, pRc/CMV, pSV2gpt, pSV2neo, pSV2-dhfr, pTk2, pRSVneo, pMSG, pSVT7, pko-neo y pHyg son ejemplos de vectores de expresión en mamíferos adecuados para la transfección de células eucariotas. Algunos de estos vectores están modificados con secuencias procedentes de plásmidos bacterianos, tales como pBR322, para facilitar la replicación y selección de la resistencia a fármacos tanto en células procariotas como en eucariotas. Como alternativa, se pueden usar derivados de virus tales como el virus del papiloma bovino (BPV-1) o el virus Epstein-Barr (pHEBo, derivado de pREP y p205) para la expresión transitoria de proteínas en células eucariotas. Más adelante, en la descripción de los sistemas de administración de terapia génica se pueden encontrar ejemplos de otros sistemas de expresión virales (incluyendo retrovirales). Los diversos métodos empleados en la preparación de los plásmidos y en la transformación de organismos huésped son bien conocidos en la técnica. Para ver otros sistemas de expresión adecuados tanto para células procariotas como para células eucariotas, así como procedimientos recombinantes generales, véase Molecular Cloning A Laboratory Manual, 3rd Ed., ed. by Sambrook, Fritsch and Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001). En algunos casos, puede ser deseable expresar los polipéptidos recombinantes mediante el uso de un sistema de expresión en baculovirus. Los ejemplos de tales sistemas de expresión en baculovirus incluyen vectores derivados de pVL (tales como pVL1392, pVL1393 y pVL941), vectores derivados de pAcUW (tales como pAcUW1) y vectores derivados de pBlueBac (tales como el pBlueBac III que contiene β-gal).
En una realización, se puede diseñar un vector para la producción de los polipéptidos ActRIIB usados en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento en células CHO, tal como un vector Pcmv-Script (Stratagene, La Jolla, Calif.), vectores pcDNA4 (Invitrogen, Carlsbad, Calif.) y vectores pCI-neo (Promega, Madison, Wis.). Como resultará evidente, los constructos génicos objetivo se pueden usar para provocar la expresión de los polipéptidos ActRIIB objetivo en células propagadas en cultivo, por ejemplo, para producir proteínas, incluyendo proteínas de fusión o variantes proteicas, para su purificación.
Las células huésped transfectadas con un gen recombinante que incluye una secuencia codificante (por ejemplo, SEQ ID NO: 19 o las secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos ActRIIB solubles (por ejemplo, ácidos nucleicos que codifican las SEQ ID NO: 17, 18, 23, 26, 27, 29, 30, 31, 32, 33, 36, 37, 42 y 43)) para uno o más de los polipéptidos ActRIIB objetivo se pueden usar para producir polipéptidos ActRIIB adecuados para su uso en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. La célula huésped puede ser cualquier célula procariota o eucariota. Por ejemplo, un polipéptido ActRIIB se puede expresar en células bacterianas tales como las de E. coli, en células de insectos (por ejemplo, usando un sistema de expresión basado en baculovirus), en levaduras o en células de mamíferos. Los expertos en la materia conocen otras células huésped adecuadas.
Por consiguiente, en el presente documento se desvelan métodos de producción de los polipéptidos ActRIIB usados en los métodos y las composiciones descritos en el presente documento. Por ejemplo, se puede cultivar una célula huésped transfectada con un vector de expresión que codifica un polipéptido ActRIIB en condiciones adecuadas que permitan que se produzca la expresión del polipéptido ActRIIB. El polipéptido ActRIIB se puede secretar y aislar a partir de una mezcla de células y medio que contiene el polipéptido ActRIIB. Como alternativa, el polipéptido ActRIIB se puede retener en el citoplasma o en una fracción de membrana y las células se pueden recolectar y lisar, aislando así la proteína. Un cultivo celular incluye células huésped, medio y otros subproductos. Los medios adecuados para cultivo celular se conocen bien en la técnica. Los polipéptidos ActRIIB objetivo se pueden aislar del medio de cultivo celular, las células huésped o ambos usando técnicas de purificación de proteínas conocidas en la técnica, incluyendo cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de filtración en gel, ultrafiltración, electroforesis, purificación por inmunoafinidad con anticuerpos específicos para epítopos concretos de los polipéptidos ActRIIB y purificación por afinidad con un agente que se une a un dominio fusionado al polipéptido ActRIIB (por ejemplo, se puede usar una columna de proteína A para purificar una fusión ActRIIB-Fc). En una realización preferida, el polipéptido ActRIIB es una proteína de fusión que contiene un dominio que facilita su purificación. En una realización preferida, la purificación se consigue mediante una serie de etapas de cromatografía en columna, incluyendo, por ejemplo, tres o más de la siguientes, en cualquier orden: cromatografía en columna de proteína A, cromatografía en columna de sefarosa Q, cromatografía en columna de fenilsefarosa, cromatografía de exclusión por tamaño y cromatografía de intercambio catiónico. La purificación se podría completar con retención del virus por filtración y sustitución de tampón. Tal y como se ha demostrado en el presente documento, la proteína ActRIIB-Fc se purificó hasta una pureza de > 98 %, tal y como se determinó mediante cromatografía de exclusión por tamaño, y de > 95 % tal y como se determinó por SDS-PAGE. Este nivel de pureza fue suficiente para conseguir los efectos deseados sobre los huesos de los ratones y un perfil de seguridad aceptable en ratones, ratas y primates no humanos.
En otra realización, un gen de fusión que codifica para una secuencia líder de purificación, tal como la secuencia de un sitio de escisión de la poli-(His) /enteroquinasa del extremo N-terminal de la porción deseada del polipéptido ActRIIB recombinante, puede permitir la purificación de la proteína de fusión expresada mediante cromatografía de afinidad usando una resina del ión metálico Ni2+. A continuación, la secuencia líder de purificación se puede retirar posteriormente mediante tratamiento con enteroquinasa para proporcionar el polipéptido ActRIIB purificado (por ejemplo, véase Hochuli y col., (1987) J. Chromatography 411:177; y Janknecht y col., PNAS USA 88:8972).
Las técnicas de fabricación de genes de fusión son bien conocidas. Esencialmente, la unión de diversos fragmentos de ADN que codifican para diferentes secuencias polipeptídicas se puede llevar a cabo de acuerdo con técnicas convencionales, empleando extremos romos o escalonados para ligamiento, digestión con enzima de restricción para proporcionar extremos apropiados, relleno de extremos cohesivos según convenga, tratamiento con fosfatasa alcalina para evitar uniones indeseables y ligamiento enzimático. En otra realización, puede sintetizarse el gen de fusión mediante técnicas convencionales, incluyendo sintetizadores de ADN automatizados. Como alternativa, puede llevarse a cabo la amplificación por PCR de fragmentos génicos usando cebadores de anclaje que dan lugar a protuberancias complementarias entre dos fragmentos génicos consecutivos que pueden alinearse posteriormente para generar una secuencia génica quimérica (véase, por ejemplo, Current Protocols in Molecular Biology, eds. Ausubel y col., John Wiley & Sons: 1992).
La proteína de fusión ActRIIB-Fc se puede expresar en células CHO-DUKX B1 transfectadas de forma estable a partir de un vector pAID4 (origen de replicación/potenciador de SV40, promotor de CMV), usando una secuencia líder del plasminógeno tisular de SEQ ID NO: 8. La porción Fc puede comprender una secuencia Fc de IgG1 humana, tal y como se muestra en la SEQ ID NO: 7. En ciertas realizaciones, tras la expresión, la proteína contenida tiene, de media, entre aproximadamente 1,5 y 2,5 moles de ácido siálico por molécula de proteína de fusión ActRIIB-Fc.
En ciertas realizaciones la semivida en suero de una fusión ActRIIB-Fc puede ser de 25-32 días en pacientes humanos. Además, el material expresado en la célula CHO puede tener una afinidad por el ligando de activina B más alta que la informada para una proteína de fusión ActRIIB-hFc expresada en células 293 humanas (del Re y col., J Biol Chem. 2004 Dec 17;279(51):53126-35). Además, sin querer ceñirnos a la teoría, el uso de la secuencia líder de TPA permitió una producción mayor que otras secuencias líder y, a diferencia de la ActRIIB-Fc expresada con una secuencia líder nativa, puede proporcionar una secuencia N-terminal de alta pureza. El uso de la secuencia líder nativa puede dar dos especies principales de ActRIIB-Fc que tienen una secuencia N-terminal diferente.
(ii) Otros inhibidores del receptor ActRII
En ciertas realizaciones, los inhibidores de los receptores ActRII usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento son compuestos de ácido nucleico.
Entre los ejemplos de las categorías de compuestos de ácido nucleico que inhiben los receptores ActRII se incluyen los ácidos nucleicos antisentido, siRNA o constructos de ARNi y constructos de ácidos nucleicos catalíticos. Un compuesto de ácido nucleico puede ser monocatenario o bicatenario. Un compuesto bicatenario también puede incluir regiones protuberantes o de no complementariedad en las que una de las dos cadenas es monocatenaria. Un compuesto monocatenario puede incluir regiones de autocomplementariedad, que significa que el compuesto puede formar una estructura denominada «horquilla» o «tallo-bucle», con una región de estructura de doble hélice.
En ciertas realizaciones, los compuestos de ácido nucleico que inhiben los receptores ActRII pueden comprender una secuencia de nucleótidos que es complementaria a una región que consiste en no más de 1000, no más de 500, no más de 250, no más de 100 o no más de 50, 35, 30, 25, 22, 20 o 18 nucleótidos de la longitud total de la secuencia de ácido nucleico del receptor ActRII o la secuencia de ácido nucleico de la activina (por ejemplo, la secuencia de ácido nucleico de una subunidad de activina A o activina B, también denominadas βA o βB). En realizaciones específicas, la región de complementariedad será de al menos 8 nucleótidos y, opcionalmente, al menos 10 o al menos 15 nucleótidos y, opcionalmente, entre 15 y 25 nucleótidos. Una región de complementariedad puede encontrarse en un intrón, una secuencia codificadora o una secuencia no codificadora del transcripto objetivo, tal como la porción de secuencia codificadora. Generalmente, un compuesto de ácido nucleico que inhibe un receptor ActRII tendrá una longitud de aproximadamente 8 a aproximadamente 500 nucleótidos o pares de bases de longitud y, opcionalmente, la longitud será de aproximadamente 14 a aproximadamente 50 nucleótidos. Un compuesto de ácido nucleico que inhibe un receptor ActRII puede ser un ADN (particularmente para uso como un antisentido), un ARN o un híbrido ARN:ADN. Cualquier cadena puede incluir una mezcla de ADN y ARN, así como formas modificadas que no se pueden clasificar fácilmente ni como ADN ni como ARN. Asimismo, un compuesto de ácido nucleico bicatenario puede ser ADN:ADN, ADN:ARN o ARN:ADN y cualquier cadena también puede incluir una mezcla de ADN y ARN, así como formas modificadas que no se pueden clasificar fácilmente ni como ADN ni como ARN.
Los compuestos de ácido nucleico que inhiben un receptor ActRII pueden incluir cualquier variedad de modificaciones, incluyendo una o modificaciones en el esqueleto (la porción azúcar-fosfato en un ácido nucleico natural, incluyendo enlaces internucleótido) o la porción básica (la porción de purina o pirimidina de un ácido nucleico natural). En ciertas realizaciones, un compuesto de ácido nucleico antisentido tendrá una longitud de aproximadamente 15 a aproximadamente 30 nucleótidos y, con frecuencia, contendrá una o más modificaciones para mejorar ciertas características, tales como la estabilidad en el suero, la estabilidad en una célula o la estabilidad en un lugar en el que es probable que se vaya a administrar el compuesto, tal como, por ejemplo, el estómago en el caso de compuestos de administración por vía oral y el pulmón para compuestos inhalados. En el caso de un constructo de ARNi, la cadena complementaria al transcrito objetivo generalmente será ARN o modificaciones del mismo. La otra cadena puede ser ARN, ADN o cualquier otra variación. La porción dúplex del constructo de ARNi en «horquilla» monocatenario o bicatenario puede, en ciertas realizaciones, tener una longitud de 18 a 40 nucleótidos de longitud y, opcionalmente, de aproximadamente 21 a 23 nucleótidos de longitud siempre que sirva como sustrato para la proteína Dicer. Los ácidos nucleicos catalíticos o enzimáticos pueden ser ribozimas o enzimas de ADN y también pueden contener formas modificadas. En ciertas realizaciones, los compuestos de ácido nucleico que inhiben los receptores ActRII pueden inhibir la expresión de su objetivo en aproximadamente un 50 %, 60 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 99 % o más en condiciones fisiológicas y a una concentración donde un control, con sentido o sin sentido, tiene muy poco o ningún efecto. Las concentraciones para ensayar el efecto de los compuestos de ácido nucleico incluyen 1, 5, 10 micromolar o más.
En otras realizaciones, los inhibidores de los receptores ActRII usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento son anticuerpos. Tales anticuerpos incluyen anticuerpos que se unen a activina
(particularmente a las subunidades A o B de activina, también conocidas como βA o βB) y alteran la unión al
receptor ActRII y anticuerpos que se unen a los polipéptidos del receptor ActRII (por ejemplo, un polipéptido ActRIIA soluble o ActRIIB soluble) y alteran la unión de activina.
Usando inmunógenos derivados de un polipéptido del receptor ActRII o un polipéptido de activina, se pueden fabricar antisueros o anticuerpos monoclonales anti-proteína/anti-péptido mediante protocolos estándar (véase, por ejemplo, Antibodies: A Laboratory Manual ed. by Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press: 1988)). Se puede inmunizar un mamífero, tal como un ratón, un hámster o un conejo con una forma inmunogénica del polipéptido del receptor ActRII, un fragmento antigénico que es capaz de provocar una respuesta de un anticuerpo o una proteína de fusión. Las técnicas que confieren inmunogenicidad a una proteína o un péptido incluyen la conjugación a vehículos u otras técnicas bien conocidas en la técnica. Una porción inmunogénica de un polipéptido del receptor ActRII o de activina se puede administrar en presencia de adyuvante. El progreso de la inmunización se puede monitorizar mediante detección de títulos de anticuerpo en el plasma o el suero. Se puede usar la técnica ELISA estándar u otros inmunoensayos con el inmunógeno como antígeno para evaluar los niveles de anticuerpos.
Tras la inmunización de un animal con una preparación antigénica de un polipéptido del receptor ActRIIA, se puede obtener antisuero y, si se desea, se pueden aislar anticuerpos policlonales del suero. Para producir anticuerpos monoclonales, se pueden recolectar células productoras de anticuerpos (linfocitos) de un animal inmunizado y fusionar mediante procedimientos estándar de fusión de células somáticas con células inmortalizadoras, tales como células de mieloma, para producir células de hibridoma. Tales técnicas son bien conocidas en la técnica e incluyen, por ejemplo, la técnica del hibridoma (originalmente desarrollada por Kohler and Milstein, (1975) Nature, 256: 495497), la técnica del hibridoma de células B humanas (Kozbar y col., (1983) Immunology Today, 4: 72) y la técnica del hibridoma-EBV para producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole y col., (1985) Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc. pp. 77-96). Las células de hibridoma se pueden cribar inmunoquímicamente para la producción de anticuerpos específicamente reactivos con un polipéptido del receptor ActRII y anticuerpos monoclonales aislados de un cultivo que comprende tales células de hibridoma.
El término «anticuerpo», tal y como se usa en el presente documento, incluye fragmentos de los mismos que también son específicamente reactivos con un polipéptido objetivo. Los anticuerpos se pueden fragmentar usando técnicas convencionales y los fragmentos se pueden cribar para que sean útiles de la misma forma que se ha descrito anteriormente para los anticuerpos completos. Por ejemplo, se pueden generar fragmentos F(ab)2 mediante tratamiento del anticuerpo con pepsina. El fragmento F(ab)2 resultante se puede tratar para reducir los puentes disulfuro y producir fragmentos Fab. Un anticuerpo además incluye moléculas biespecíficas, de cadena sencilla, quiméricas, humanizadas y completamente humanas que tienen afinidad por un polipéptido del receptor ActRII o de activina conferida por al menos una región CDR del anticuerpo. Un anticuerpo puede incluir además un marcador fijado a él y capaz de ser detectado (por ejemplo, el marcador puede ser un radioisótopo, un compuesto fluorescente, una enzima o un cofactor de una enzima).
En ciertas realizaciones, el anticuerpo es un anticuerpo recombinante, término que abarca cualquier anticuerpo generado en parte mediante técnicas de biología molecular, incluyendo los anticuerpos injertados con CDR o quiméricos, anticuerpos humanos u otros ensamblados a partir de dominios de anticuerpos seleccionados de bibliotecas, anticuerpos de cadena sencilla y anticuerpos de dominio sencillo (por ejemplo, proteínas VH humanas o proteínas VHH de camélidos). En ciertas realizaciones, un anticuerpo puede ser un anticuerpo monoclonal, y en ciertas realizaciones. Por ejemplo, un método de generación de un anticuerpo monoclonal que se una específicamente a un polipéptido del receptor ActRII o a un polipéptido de activina puede comprender la administración a un ratón de una cantidad de una composición inmunogénica que comprende el polipéptido antigénico efectivo para estimular una respuesta inmune detectable, la obtención de las células productoras de anticuerpos (por ejemplo, células del bazo) del ratón y fusión de las células productoras de anticuerpos con células de mieloma para obtener hibridomas productores de anticuerpos y el ensayo de los hibridomas productores de anticuerpos para identificar un hibridoma que produzca un anticuerpo monoclonal que se una específicamente al antígeno. Una vez obtenido, un hibridoma se puede propagar en un cultivo celular, opcionalmente en condiciones de cultivo en las que las células derivadas del hibridoma produzcan el anticuerpo monoclonal que se une específicamente al antígeno. El anticuerpo monoclonal se puede purificar a partir del cultivo celular.
El adjetivo «específicamente reactivo con», tal y como se usa para hacer referencia a un anticuerpo, significa, como se entiende generalmente en la técnica, que el anticuerpo tiene una selectividad suficiente entre el antígeno de interés (por ejemplo, un polipéptido del receptor ActRII) y otros antígenos que no son de interés y que el anticuerpo se usa para, como mínimo, detectar la presencia del antígeno de interés en un tipo concreto de muestra biológica. En ciertos métodos que emplean el anticuerpo, tales como las aplicaciones terapéuticas, puede ser deseable un mayor grado de especificidad de unión. Los anticuerpos monoclonales generalmente tienen mayor tendencia (en comparación con los anticuerpos monoclonales) a discriminar efectivamente entre los antígenos deseados y los polipéptidos con reactividad cruzada. Una característica que influencia la especificidad de una interacción anticuerpo:antígeno es la afinidad del anticuerpo por el antígeno. Aunque la especificidad deseada se puede alcanzar con un intervalo de afinidades diferentes, generalmente, los anticuerpos preferidos tendrán una afinidad (una constante de disociación) de aproximadamente 10-6, 10-7, 10-8, 10-9 o menos. Dada la extraordinariamente estrecha unión entre la activina y un receptor ActRII, se espera que un anticuerpo neutralizante anti-activina o antireceptor ActRII tenga generalmente una constante de disociación de 10-10 o menos.
Además, las técnicas usadas para cribar anticuerpos con el fin de identificar un anticuerpo deseable pueden influir en las propiedades del anticuerpo obtenido. Por ejemplo, si un anticuerpo se va a usar para unir un antígeno en solución, puede ser deseable ensayar la unión en solución. Se dispone de una variedad de técnicas diferentes para ensayar la interacción entre anticuerpos y antígenos e identificar anticuerpos especialmente convenientes. Tales técnicas incluyen ELISA, ensayos de unión por resonancia de plasmones superficiales (p.ej., el ensayo de unión Biacore.TM., Biacore AB, Uppsala, Suecia), ensayos de captura (p.ej., el sistema de perlas paramagnéticas IGEN International, Inc., Gaithersburg, Md.), Western blot, ensayos de inmunoprecipitación e inmunohistoquímica.
En ciertas realizaciones, los inhibidores del receptor ActRII para uso en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento incluyen formas alternativas de activina, particularmente las que tienen alteraciones en el dominio de unión al receptor tipo I pueden unirse a receptores tipo II y no formar un complejo ternario activo. En ciertas realizaciones, los ácidos nucleicos, tales como las moléculas antisentido, siRNA o ribozimas que inhiben la activina A, B, C o E, o, especialmente, la expresión del receptor ActRII, se pueden usar en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento.
En otras realizaciones, los inhibidores de los receptores ActRII usados en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento son proteínas que no son anticuerpos con actividad antagonista del receptor ActRII, incluyendo inhibina (es decir, la subunidad alfa de la inhibina), follistatina (por ejemplo, follistatina-288 y follistatina315), Cerberus, proteína relacionada con la follistatina ("FSRP"), endoglina, activina C, alfa(2)-macroglobulina, y una activina A mutante M108A (cambio de metionina a alanina en la posición 108).
En una realización específica, el inhibidor del receptor ActRII para uso en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es un polipéptido de follistatina que antagoniza la bioactividad de la activina y/o se une a la activina. El término «polipéptido de follistatina» incluye polipéptidos que comprenden cualquier polipéptido de follistatina presente de forma natural, así como a cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos, fusiones y formas peptidomiméticas) que retiene una actividad útil, y además incluye cualquier monómero o multímero funcional de follistatina. Las variantes de polipéptidos de follistatina que retienen propiedades de unión a activina se pueden identificar en base a estudios previos que implican las interacciones de follistatina y activina. Por ejemplo, el documento, WO2008/030367, desvela dominios de follistatina específicos ("FSDs") que han demostrado ser importantes para la unión a activina. Los polipéptidos de follistatina incluyen polipéptidos derivados de la secuencia de cualquier follistatina conocida que tenga una secuencia al menos aproximadamente un 80 % idéntica a la secuencia de un polipéptido de follistatina y, opcionalmente, al menos un 85 %, 90 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % o más de identidad de secuencia. Entre los ejemplos de polipéptidos de follistatina se incluye el polipéptido de follistatina maduro o isoformas más cortas u otras variantes del polipéptido precursor de la follistatina humana, tal y como se describe en el documento WO2005/025601.
En una realización específica, el inhibidor del receptor ActRII para uso en las composiciones y los métodos descritos en el presente documento es un gen FLRG (follistatin-like related gen) que antagoniza la bioactividad de la activina y/o se une a la activina. El término «polipéptido FLRG» incluye polipéptidos que comprenden cualquier polipéptido FLRG presente de forma natural, así como a cualquier variante de los mismos (incluyendo mutantes, fragmentos, fusiones y formas peptidomiméticas) que retiene una actividad útil. Las variantes de polipéptidos de FLRG que retienen propiedades de unión a activina se pueden identificar usando métodos rutinarios de ensayo de las interacciones de FLRG y activina. Véase, por ejemplo, la patente US6537966, que se incluye en su totalidad por referencia en el presente documento. Los polipéptidos FLRG incluyen polipéptidos derivados de la secuencia de cualquier FLRG conocido que tenga una secuencia al menos aproximadamente un 80 % idéntica a la secuencia de un polipéptido FLRG y, opcionalmente, al menos un 85 %, 90 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % o más de identidad de secuencia.
En ciertas realizaciones, las variantes funcionales o formas modificadas de los polipéptidos de FLRG y los polipéptidos de follistatina incluyen proteínas de fusión que tienen al menos una porción de los polipéptidos de follistatina o polipéptidos de FLRG y uno o más dominios de fusión, tales como, por ejemplo, dominios que facilitan el aislamiento, la detección, la estabilización o la multimerización del polipéptido. Los dominios de fusión adecuados se han comentado con detalle anteriormente en relación con los polipéptidos ActRIIA y ActRIIB. En una realización, un inhibidor del receptor ActRII es una proteína de fusión que comprende una porción de unión a activina de un polipéptido de follistatina fusionado a un dominio Fc. En otra realización, un inhibidor del receptor ActRII es una proteína de fusión que comprende una porción de unión a activina de un polipéptido FLRG fusionado a un dominio Fc.
- (a)
- ENSAYOS DIAGNÓSTICOS
- (i)
- RECAMBIO ÓSEO
Se pueden usar diversos marcadores circulantes del recambio óseo para diagnosticar enfermedades óseas, tales como el recambio óseo bajo. Los marcadores circulantes del recambio óseo son marcadores de la formación de hueso tales como la fosfatasa alcalina específica del hueso (bAP), la osteocalcina, el polipéptido C-terminal del procolágeno tipo I (PICP) y el factor de crecimiento similar a la insulina tipo 1 (IGF-1), siendo algunos de ellos marcadores de resorción ósea tales como piridinolina, desoxipiridinolina, fosfatasa ácida tartrato-resistente (TRAP), TRAP tipo 5b, piridinolina, desoxipiridinolina y telopéptido C-terminal del procolágeno tipo I (ICTP), enlaces cruzados de colágeno en suero u orina (telopéptido N o telopéptido C) y 25-hidroxivitamina D. También se pueden usar ensayos para medir la hormona paratiroidea total (PTH). El experto en la materia conoce métodos de diagnóstico por imagen que permiten la evaluación de la densidad mineral ósea (BMD). Véase, p. ej., Tilman B. Drueke and Sharon
M. Moe, Disturbances of bone and mineral metabolism in chronic kidney disease: an international initiative to improve diagnosis and treatment, Nephrol Dial Transplant (2004) 19: 534-536; Okuno S, Inaba M., Biochemical markers of bone turnover. New aspect. Dialysis and bone metabolic marker, Clin Calcium. 2009 Aug; 19(8): 1084-91; Herberth J, Monier-Faugere MC, Mawad HW, Branscum AJ, Herberth Z, Wang G, Cantor T, Malluche HH, The five most commonly used intact parathyroid hormone assays are useful for screening but not for diagnosing bone turnover abnormalities in CKD-5 patients, Clin Nephrol. 2009 Jul;72(1):5-14; Lehmann G, Ott U, Kaemmerer D, Schuetze J, Wolf G., Bone histomorphometry and biochemical markers of bone turnover in patients with chronic kidney disease Stages 3-5, Clin Nephrol. 2008 Oct;70(4):296-305; Drüeke TB., Is parathyroid hormone measurement useful for the diagnosis of renal bone disease?, Kidney Int. 2008 Mar;73(6):674-6; Yamada S, Inaba M, Kurajoh M, Shidara K, Imanishi Y, Ishimura E, Nishizawa Y., Utility of serum tartrate-resistant acid phosphatase (TRACP5b) as a bone resorption marker in patients with chronic kidney disease: independence from renal dysfunction., Clin Endocrinol (Oxf). 2008 Aug;69(2):189-96. Epub 2008 Jan 23. Véase también, Paul D. Miller, Diagnosis and Treatment of Osteoporosis in Chronic Renal Disease, 2009.
Otro marcador para monitorizar la resorción ósea en pacientes con CKD con disfunción renal leve es la concentración en suero de telopéptido N del colágeno tipo I (S-TNX). Véase, p. ej., Hamano T, Fujii N, Nagasawa Y, Isaka Y, Moriyama T, Okada N, Imai E, Horio M, Ito T., Serum NTX is a practical marker for assessing antiresorptive therapy for glucocorticoid treated patients with chronic kidney disease., Bone. 2006 Nov;39(5):1067-72. Epub 2006 Jun 16.
También se puede usar la tomografía computerizada cuantitativa (QCT) para determinar el recambio óseo.
(ii) MODELO DE ENFERMEDAD ÓSEA ADINÁMICA
Un modelo de ratón de enfermedad ósea adinámica en un entorno renal es el uso de un modelo de nefrectomía en ratón, tal como el modelo de nefrectomía 5/6 usado en las Secciones 6.2 y 6.3, donde los ratones se alimentan con una dieta pobre en fosfato.
En otro modelo de ratón, los ratones se someten a electrocauterización de un riñón y nefrectomía del otro riñón. Los ratones se alimentan con comida pobre en fosfato suplementada con calcitriol. Véase, p. ej., Lund y col., 2004, J Am Soc Nephrol 15:349-369.
(iii) MARCADO ÓSEO CON TETRACICLINA
Una prueba diagnóstica que se puede usar para determinar el tipo de enfermedad ósea asociada a la CKD es la biopsia ósea de cresta ilíaca con doble marcaje con tetraciclina y análisis histomorfométrico del hueso. Véase, p. ej., National Kidney Foundation: NKF KDOQI Guidelines.
(iv) CALCIFICACIÓN VASCULAR
La tomografía computerizada sin contraste (CT) para el diagnóstico del grado de calcificación de la arteria coronaria (CAC) y la CT con contraste para angiografía coronaria no invasiva (CTA) son avances generalmente usados para el diagnóstico de la enfermedad coronaria obstructiva. También se pueden usar para la evaluación del diagnóstico y pronóstico cardíacos la prueba de esfuerzo con radionúclidos, la determinación de calcio en la arteria coronaria por tomografía computerizada y la angiografía coronaria no invasiva. Véase: Berman DS, Shaw LJ, Hachamovitch R, Friedman JD, Polk DM, Hayes SW, Thomson LE, Germano G, Wong ND, Kang X, Rozanski A., Comparative use of radionuclide stress testing, coronary artery calcium scanning, and noninvasive coronary angiography for diagnostic and prognostic cardiac assessment, Semin Nucl Med. 2007 Jan;37(1):2-16.
La determinación de calcio en la arteria coronaria por tomografía computerizada de pacientes asintomáticos se puede usar a modo comparativo. Por ejemplo, los resultados de la determinación de calcio en la arteria coronaria por tomografía computerizada obtenidos antes del brote de la enfermedad renal se pueden usar a modo comparativo cuando la calcificación vascular está relacionada con la enfermedad renal.
Los posibles métodos de detección y cuantificación de la calcificación en la arteria coronaria (CAC) incluyen, pero no se limitan a, tomografía computerizada por rayos X y tomografía computerizada por emisión de fotón único (SPECT) de la perfusión miocárdica. Moser KW, O'Keefe JH Jr, Bateman TM, McGhie IA., Coronary calcium screening in asymptomatic patients as a guide to risk factor modification and stress myocardial perfusion imaging, J Nucl Cardiol. 2003 Nov-Dec;10(6):590-8. También se puede usar la tomografía computerizada multidetector (MDCT) para detectar la calcificación vascular (véase, p. ej., Burrill y col., 2007, Postgrad. Med. J. 83(985):698-704).
Otro método diagnóstico para la calcificación vascular es la absorción de 18F-fluorodesoxiglucosa (FDG) en la pared de la aorta torácica combinada con tomografía de emisión de positrones (PET)/tomografía computerizada (CT). Véase: Tatsumi M, Cohade C, Nakamoto Y, Wahl RL., Fluorodeoxyglucose uptake in the aortic wall at PET/CT: possible finding for active atherosclerosis, Radiology. 2003 Dec;229(3):831-7. Epub 2003 Oct 30.
Incluso, en otra realización, se puede usar CT ultrarrápida para detectar la presencia de enfermedad coronaria aterosclerótica. Véase, p. ej., Breen JF, Sheedy PF 2nd, Schwartz RS, Stanson AW, Kaufmann RB, Moll PP, Rumberger JA, Coronary artery calcification detected with ultrafast CT as an indication of coronary artery disease, Radiology. 1992 Nov;185(2):435-9.
También se puede usar la tomografía computerizada por haz de electrones para diagnosticar la enfermedad arterial coronaria. Véase: Schmermund A, Baumgart D, Sack S, Möhlenkamp S, Grönemeyer D, Seibel R, Erbel R., Assessment of coronary calcification by electron-beam computed tomography in symptomatic patients with normal, abnormal or equivocal exercise stress test, Eur Heart J. 2000 Oct;21(20):1674-82.
Otra prueba para la calcificación vascular considera la composición de las placas en la hipertensión pulmonar plexogénica y tromboembólica. La hipertensión pulmonar tromboembólica crónica está asociada a placas ateroscleróticas con núcleos pultáceos ricos en glicoforina y la hipertensión pulmonar plexogénica a placas fibrosas. El material tromboembólico juega un papel crítico en la formación de núcleos pultáceos cuyo componente principal es la glicoforina procedente de la membrana de los eritrocitos. Por lo tanto, se investigan la hipertensión pulmonar tromboembólica y plexogénica (primaria y secundaria (síndrome de Eisenmenger)). Véase: Arbustini E, Morbini P, D'Armini AM, Repetto A, Minzioni G, Piovella F, Viganó M, Tavazzi L, Plaque composition in plexogenic and thromboembolic pulmonary hypertension: the critical role of thrombotic material in pultaceous core formation, Heart. 2002 Aug;88(2): 177-82.
El puntaje de Agatston, un sistema de puntaje de calcio basado en mediciones de densidad de las placas de calcio depositadas, puede ser útil para cuantificar la calcificación vascular. En este sistema, se pueden medir los niveles de calcificación vascular mediante tomografía computerizada multidetector (MDCT) y se pueden evaluar las atenuaciones de la velocidad de progresión del puntaje de Agatston (véase p. ej., Sharma y col., 2010, Vasc. Health Risk Manag. 6:603-611).
Además, la calcificación vascular se puede evaluar usando los métodos descritos en Adragao y col., 2004, Nephrol. Dial. Transplant 19:1480-1488.
Otro ensayo que se puede usar en la cuantificación de la calcificación vascular en un sujeto es el puntaje de calcio específico de lesión, que comprende un método de medición del calcio resultante de una prueba de CT de calcificación de la arteria coronaria. Este método es descrito por, p. ej., Akram and Voros, 2008, Int. J. cardiovac. Imaging 14:743-749.
- (v)
- ENFERMEDAD RENAL
La velocidad de filtración glomerular se puede determinar mediante cualquier método conocido por el experto en la materia para determinar la enfermedad renal. Véase el sitio web de la National Kidney Foundation.
- (vi)
- PARATIROIDISMO SECUNDARIO
El hiperparatiroidismo secundario se produce cuando la glándula paratiroidea produce demasiada hormona paratiroidea (PTH) debido a la presencia de niveles de calcio demasiado bajos o aumento de los niveles de fósforo. Los niveles de calcio, fósforo y PTH se pueden determinar a partir de muestras de sangre.
(vii) HIPERFOSFATEMIA
Los niveles anómalamente elevados de fosfato en la sangre se pueden determinar mediante cualquier método conocido por el experto en la materia.
(b) Ensayos de cribado
Se pueden ensayar diversas variantes de polipéptidos de ActRII o variantes de polipéptidos de ActRII solubles para determinar su capacidad de inhibición del receptor ActRII. Además, se pueden ensayar compuestos para determinar su capacidad de inhibición del receptor ActRII. Una vez que se ha confirmado la actividad de los inhibidores de ActRII, se pueden usar con los métodos descritos en el presente documento. ActRII puede ser ActRIIA o ActRIIB. Los ensayos que se muestran a continuación se describen para ActRIIA, pero también se pueden realizar para ActRIIB.
Por ejemplo, se puede evaluar el efecto de una variante de polipéptido ActRIIA sobre la expresión de genes implicados en la producción de hueso o la destrucción de hueso. Según sea necesario, esto se puede realizar en presencia de una o más proteínas recombinantes que actúan como ligando de ActRIIA (por ejemplo, activina) y se pueden transfectar las células para producir un polipéptido ActRIIA y/o variantes del mismo y, opcionalmente, un ligando de ActRIIA. Asimismo, se puede administrar un polipéptido ActRIIA a un ratón u otro animal y se pueden evaluar una o más propiedades, tales como la densidad o el volumen. También se puede evaluar la velocidad de curación de fracturas óseas. La absorciometría con rayos X de doble energía (DEXA) es una técnica cuantitativa no invasiva y consolidada para evaluar la densidad ósea en un animal. En humanos, se pueden usar los sistemas DEXA centrales para evaluar la densidad ósea en la columna vertebral y la pelvis. Estos son los mejores indicadores de la densidad ósea global. Los sistemas DEXA periféricos se pueden usar para evaluar la densidad ósea en huesos periféricos, incluyendo, por ejemplo, los huesos de la mano, la muñeca, el tobillo y el pie. Los sistemas de diagnóstico por imagen con rayos X, incluyendo los TAC, se pueden usar para evaluar el crecimiento de hueso y la curación de fracturas. Además, la densidad ósea se puede medir usando tomografía computerizada cuantitativa (qCT). También se puede evaluar la resistencia mecánica del hueso.
En ciertos aspectos del presente documento, se describe el uso de polipéptidos ActRIIA (p. ej., polipéptidos ActRIIA solubles) y polipéptidos de activina para identificar compuestos (agentes) que son agonistas o antagonistas de la vía de señalización activina-ActRIIA. Los compuestos identificados a través de este cribado se pueden ensayar para evaluar su capacidad de modular el crecimiento o la mineralización óseos in vitro. Opcionalmente, estos compuestos se pueden ensayar además en modelos animales para evaluar su capacidad de modular el crecimiento tisular in vivo.
Hay numerosas estrategias para el cribado de agentes terapéuticos para la modulación del crecimiento tisular dirigidos a activina y polipéptidos ActRIIA. En ciertas realizaciones, se puede llevar a cabo un cribado de alto rendimiento de compuestos para identificar agentes que perturban los efectos de la activina o los mediados por ActRIIA sobre el hueso. En ciertas realizaciones, el ensayo se lleva a cabo para cribar e identificar compuestos que inhiben o reducen específicamente la unión de un polipéptido ActRIIA a activina. Como alternativa, el ensayo se puede usar para identificar compuestos que mejoran la unión de un polipéptido ActRIIA a activina. En una realización adicional, los compuestos se pueden identificar por su capacidad de interacción con una activina o un polipéptido ActRIIA.
Una variedad de formatos de ensayo serán suficientes y, en vista de la presente descripción de la invención, los que no están expresamente descritos en el presente documento, aun así, serán comprendidos por un experto en la materia. Tal y como se describe en el presente documento, los compuestos de ensayo (agentes) usados en el presente documento se pueden crear mediante cualquier método de química combinatoria. Como alternativa, los compuestos objetivo pueden ser biomoléculas presentes de forma natural sintetizadas in vivo o in vitro. Los compuestos (agentes) que se van a ensayar para determinar su capacidad para actuar como moduladores del crecimiento tisular se pueden producir, por ejemplo, mediante bacterias, levaduras, plantas u otros organismos (por ejemplo, productos naturales), químicamente (por ejemplo, moléculas pequeñas, peptidomiméticos incluidos) o recombinantemente. Los compuestos de ensayo contemplados en el presente documento incluyen moléculas orgánicas no peptidílicas, péptidos, polipéptidos, peptidomiméticos, azúcares, hormonas y moléculas de ácidos nucleicos. En una realización específica, el agente de ensayo es una molécula orgánica pequeña que tiene un peso molecular inferior a aproximadamente 2000 dalton.
Los compuestos de ensayo se pueden proporcionar como entidades sencillas y discretas o en bibliotecas de mayor complejidad, tales como las hechas mediante química combinatoria. Estas bibliotecas pueden comprender, por ejemplo, alcoholes, haluros alquílicos, aminas, amidas, ésteres, aldehídos, éteres y otras clases de compuestos orgánicos. La presentación de los compuestos de ensayo en los sistemas de ensayo puede ser en forma aislada o como mezclas de compuestos, especialmente en las etapas de cribado iniciales. Opcionalmente, los compuestos se pueden derivatizar de otros compuestos y tener grupos derivatizantes que faciliten el aislamiento de los compuestos. Los ejemplos no limitantes de grupos derivatizantes incluyen biotina, fluoresceína, digoxigenina, proteína verde fluorescente, isótopos, polihistidina, perlas magnéticas, glutatión S transferasa (GST), agentes entrecruzadores fotoactivantes o cualquier combinación de los mismos.
En muchos programas de cribado de fármacos, que ensayan bibliotecas de compuestos y extractos naturales, son deseables ensayos de alto rendimiento con el fin de maximizar el número de compuestos analizados en un periodo de tiempo determinado. Los ensayos que se realizan en sistemas libres de células, tales como los que se pueden obtener con proteínas purificadas o semipurificadas, se prefieren frecuentemente como cribados «primarios» que se pueden generar para permitir un desarrollo rápido y una detección relativamente fácil de una alteración en un objetivo molecular mediada por un compuesto de ensayo. Asimismo, los efectos de la toxicidad o biodisponibilidad celular del compuesto de ensayo, generalmente se pueden ignorar en el sistema in vitro, centrando principalmente el ensayo en cómo el efecto del fármaco sobre el objetivo molecular se puede manifestar en una alteración de la afinidad de unión entre un polipéptido ActRIIA y activina.
A modo meramente ilustrativo, en un ensayo de cribado ejemplar, el compuesto de interés se pone en contacto con un polipéptido ActRIIA aislado y purificado que normalmente es capaz de unirse a activina. A continuación, se añade a la mezcla del compuesto y el polipéptido ActRIIA una composición que contiene un ligando de ActRIIA. La detección y cuantificación de complejos de ActRIIA/activina proporciona un medio de determinación de la eficacia del compuesto en la inhibición (o potenciación) de la formación del complejo entre el polipéptido ActRIIA y activina. La eficacia del compuesto se puede evaluar generando curvas dosis-respuesta a partir de los datos obtenidos usando diversas concentraciones del compuesto de ensayo. Asimismo, se puede realizar también un ensayo de control para proporcionar una referencia comparativa. Por ejemplo, en un ensayo de control se añade activina aislada y purificada a una composición que contiene el polipéptido ActRIIA y se cuantifica la formación de complejo ActRIIA/activina en ausencia del compuesto de ensayo. Se entenderá que, en general, se puede modificar el orden en que se pueden mezclar los reactivos y que estos se pueden mezclar simultáneamente. Asimismo, en lugar de proteínas purificadas, se pueden usar extractos y lisados celulares para conseguir un sistema de ensayo libre de células.
La formación del complejo entre el polipéptido ActRIIA y activina se puede detectar mediante una variedad de técnicas. Por ejemplo, la modulación de la formación de complejos se puede cuantificar usando, por ejemplo, proteínas marcadas de forma detectable, tales como polipéptido ActRIIA o activina marcados con radioisótopos (p.
ej., P, S, C o H), marcados fluorescentemente (p. ej., FITC) o marcados enzimáticamente, mediante inmunoensayo o mediante detección cromatográfica.
En ciertas realizaciones del presente documento, se contempla el uso de ensayos de polarización de fluorescencia y transferencia de energía por resonancia de fluorescencia (FRET) en la medición, tanto directa como indirecta, del grado de interacción entre un polipéptido ActRIIA y su proteína de unión. Además, otros modos de detección, tales como los basados en guías de onda ópticas (publicación PCT WO 96/26432 y patente US5677196), resonancia por plasmones superficiales (SPR), sensores de carga superficial y sensores de fuerza superficial, son compatibles con muchas realizaciones descritas en el presente documento.
Asimismo, se puede usar un ensayo de trampa de interacción, también conocido como el «ensayo doble híbrido», para identificar agentes que alteran o potencian la interacción entre un polipéptido ActRIIA y su proteína de unión. Véase, por ejemplo, la patente US5283317; Zervos y col. (1993) Cell 72:223-232; Madura y col. (1993) J Biol Chem 268:12046-12054; Bartel y col. (1993) Immunotechnology 14:920-924 y Hoogenboom y col. (1993) Oncogene 8:1693-1696). En una realización específica del presente documento, se contempla el uso de sistemas doble híbrido inversos para identificar compuestos (p. ej., moléculas pequeñas o péptidos) que disocian las interacciones entre un polipéptido ActRIIA y su proteína de unión. Véanse, por ejemplo, Vidal and Legrain, (1999) Nucleic Acids Res 27:919-29; Vidal and Legrain, (1999) Trends Biotechnol 17:374-81 y las patentes US5525490; US5955280 y US5965368.
En ciertas realizaciones, los compuestos objetivo se pueden identificar por su capacidad de interacción con un polipéptido ActRIIA o de activina. La interacción entre el compuesto y el polipéptido ActRIIA o de activina puede ser covalente o no covalente. Por ejemplo, tal interacción se puede identificar al nivel de proteína usando métodos bioquímicos in vitro, incluyendo fotoentrecruzamiento, unión a ligando marcado radioactivamente y cromatografía de afinidad (Jakoby W B y col., 1974, Methods in Enzymology 46: 1). En ciertos casos, los compuestos se pueden cribar en un ensayo basado en mecanismos de acción, tal como un ensayo para detectar compuestos que se unen a un polipéptido de activina o ActRIIA. Este puede incluir un evento de unión en fase sólida o en fase fluida. Como alternativa, el gen que codifica un polipéptido de activina o ActRIIA se puede transfectar con un sistema reportero (p. ej., β-galactosidasa, luciferasa o proteína verde fluorescente) en una célula y cribar frente a la biblioteca, preferentemente un mediante cribado de alto rendimiento o con miembros individuales de la biblioteca. Se pueden usar otros ensayos de unión basados en mecanismos de acción, por ejemplo, ensayos de unión que detectan cambios en la energía libre. Los ensayos de unión se pueden realizar con el objetivo fijado a un pocillo, perla o chip, capturado mediante un anticuerpo inmovilizado o se pueden resolver mediante electroforesis capilar. Normalmente, los compuestos unidos se pueden detectar usando resonancia colorimétrica, de fluorescencia o por plasmones superficiales.
En ciertos aspectos del presente documento, se desvelan métodos y agentes para la modulación (estimulación o inhibición) de la formación de hueso y el aumento de la masa ósea. Por lo tanto, cualquier compuesto identificado se puede ensayar en células o tejidos completos, in vitro o in vivo, para confirmar su capacidad para modular el crecimiento o la mineralización óseos. Para este propósito, se pueden utilizar diversos métodos conocidos en la técnica. En particular, se pueden ensayar los compuestos para determinar su capacidad de aumentar el recambio óseo.
Por ejemplo, se puede determinar el efecto de los polipéptidos ActRIIA o de activina, o de los compuestos de ensayo, sobre el crecimiento de hueso o de cartílago mediante medición de la inducción de Msx2 o diferenciación de células osteoprogenitoras a osteoblastos en ensayos basados en células (véase, p. ej., Daluiski y col., Nat Genet. 2001, 27(1):84-8; Hino y col., Front Biosci. 2004, 9:1520-9). Otro ejemplo de ensayo basado en células incluye el análisis de la actividad osteogénica de los polipéptidos ActRII o de activina y los compuestos de ensayo en células progenitoras mesenquimales y células osteoblásticas. A modo ilustrativo, se pueden generar constructos de adenovirus recombinantes que expresan un polipéptido ActRIIA o de activina para infectar células progenitoras mesenquimales pluripotentes C3H10T1/2, células preosteoblásticas C2C12 y células osteoblásticas TE-85. A continuación, se determina la actividad osteogénica mediante medición de la inducción de la fosfatasa alcalina, la osteocalcina y la mineralización de la matriz (véase, p. ej., Cheng y col., J bone Joint Surg Am. 2003, 85-A(8): 154452).
También se desvelan en el presente documento ensayos in vivo para medir el crecimiento de hueso y de cartílago. Por ejemplo, Namkung-Matthai y col., Bone, 28:80-86 (2001) desvelan un modelo osteoporótico de rata en el que se estudia la reparación ósea en el periodo temprano tras la fractura. Kubo y col., Steroid Biochemistry & Molecular Biology, 68:197-202 (1999) también desvelan un modelo osteoporótico de rata en el que se estudia la reparación ósea en el periodo temprano tras la fractura. Andersson y col., J. Endocrinol. 170:529-537 describen un modelo de ratón de osteoporosis en el que los ratones se someten a ovariectomía, que provoca que los ratones pierdan un contenido mineral óseo y una densidad mineral ósea sustanciales, perdiendo el hueso trabecular aproximadamente el 50 % de densidad mineral ósea. La densidad ósea se podría aumentar en los ratones sometidos a ovariectomía mediante administración de factores tales como la hormona paratiroidea. En ciertos aspectos, se pueden usar los ensayos de curación de fracturas conocidos en la técnica. Estos ensayos incluyen la técnica de fractura, el análisis histológico y el análisis biomecánico, que se describen en, por ejemplo, la patente US6521750, que desvela protocolos experimentales para provocar fracturas, así como para medir el grado de fractura y el proceso de reparación.
En el presente documento se desvelan métodos de tratamiento de los CKD-MBD y/o la enfermedad ósea de bajo recambio, donde los métodos comprenden la administración a un paciente que necesita tratamiento de una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII (véase la Sección 5.2). En ciertas realizaciones, un inhibidor de ActRII es un inhibidor de ActRIIA tal y como se expone en la Sección 5.2(a). En otras realizaciones, un inhibidor de ActRII es un inhibidor de ActRIIB tal y como se expone en la Sección 5.2(a). En ciertas realizaciones, un inhibidor de ActRII es una combinación de un inhibidor de ActRIIA y un inhibidor de ActRIIB.
En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es suficiente para mejorar un síntoma de los CKD-MBD. En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es suficiente para evitar que empeore al menos un síntoma de los CKD-MBD.
En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII mejora o estabiliza la función renal. La función renal se puede medir mediante la velocidad de filtración glomerular. Véase, p. ej., la Sección 5.4(a)(iv). En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es una dosis diaria que es suficiente para estabilizar la velocidad de filtración glomerular de un paciente con CKD-MBD durante la duración del tratamiento con inhibidor de ActRII y durante al menos 3 meses, 6 meses, 9 meses o 12 meses. En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es una dosis diaria que es suficiente para aumentar la velocidad de filtración glomerular en al menos un 5 %, 10 %, 15 %, 20 %, 25 %, 30 %, 35 %, 40%, 45 %o almenos un 50 %.
En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII aumenta el nivel de glóbulos rojos y/o los niveles de hemoglobina en el paciente.
En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es efectiva para (a) aumentar los niveles de glóbulos rojos y/o hemoglobina del paciente; (b) mejorar la calidad ósea y/o la densidad mineral ósea del paciente y (c) mejorar la función renal del paciente.
En ciertas realizaciones, una cantidad terapéuticamente efectiva de un inhibidor de ActRII es efectiva para (a) aumentar los niveles de glóbulos rojos y/o hemoglobina del paciente; (b) mejorar el recambio óseo del paciente y (c) mejorar la función renal del paciente.
En ciertas realizaciones, el inhibidor de ActRII se dosifica en intervalos y cantidades suficientes para alcanzar concentraciones en suero de 0,2 microgramos/kg o más, y niveles en suero de 1 microgramo/kg, son deseables concentraciones de 2 microgramos/kg o más para conseguir efectos significativos sobre la densidad y resistencia óseas. Los regímenes de dosificación se pueden diseñar para alcanzar concentraciones en suero de entre 0,2 y 15 microgramos/kg y, opcionalmente, de entre 1 y 5 microgramos/kg. En humanos, los niveles en suero de 0,2 microgramos/kg se pueden alcanzar con una sola dosis de 0,1 mg/kg o más y los niveles en suero de 1 microgramo/kg se pueden alcanzar con una sola dosis de 0,3 mg/kg o más. La semivida en suero observada de la molécula es de entre aproximadamente 20 y 30 días, sustancialmente más largas que la de la mayoría de proteínas de fusión Fc y, por tanto, se puede alcanzar un nivel en suero efectivo sostenido, por ejemplo, mediante dosificación con 0,2-0,4 mg/kg semanalmente o bisemanalmente, o se pueden usar dosis más altas con intervalos más largos entre dosificaciones. Por ejemplo, se podrían usar dosis de 1-3 mg/kg mensualmente o bimensualmente, y el efecto sobre el hueso puede ser lo suficientemente duradero como para que esa dosificación sea necesaria solo una vez cada 3, 4, 5, 6, 9, 12 o más meses.
En ciertas realizaciones, los antagonistas de activina-ActRII (p. ej., los polipéptidos ActRII) se formulan con un vehículo farmacéuticamente aceptable para uso con los métodos descritos en el presente documento. Por ejemplo, un polipéptido ActRII se puede administrar por sí solo o como un componente de una formulación farmacéutica (composición terapéutica). Los compuestos objetivo se pueden formular para administración por cualquier vía conveniente para uso en medicina humana o veterinaria. ActRII puede ser ActRIIA o ActRIIB.
En ciertas realizaciones, los métodos terapéuticos descritos en el presente documento incluyen la administración de la composición sistémicamente o localmente en forma de un implante o dispositivo. Cuando se administran, las composiciones terapéuticas usadas en el presente documento pueden estar en una forma fisiológicamente aceptable libre de pirógenos. Se pueden administrar simultáneamente o secuencialmente a los compuestos objetivo agentes terapéuticamente útiles distintos de los antagonistas de ActRIIA que, opcionalmente, también pueden ir incluidos en la composición tal y como se ha descrito anteriormente (p. ej., polipéptidos ActRII, tales como polipéptidos ActRIIA y/o ActRIIB (véase la Sección 5.2)).
Habitualmente, los antagonistas de ActRIIA se administrarán parenteralmente. Las composiciones farmacéuticas adecuadas para administración parenteral pueden comprender uno o más polipéptidos ActRII en combinación con una o más soluciones acuosas o no acuosas isotónicas, dispersiones, suspensiones, emulsiones o polvos estériles que se pueden reconstituir en soluciones o dispersiones inyectables estériles justo antes de su uso, farmacéuticamente estables que pueden contener antioxidantes, tampones, bacteriostáticos, solutos que hacen la formulación isotónica con la sangre del receptor previsto, agentes de suspensión o agentes espesantes. Los ejemplos de vehículos acuosos y no acuosos adecuados que pueden emplearse en las composiciones farmacéuticas usadas en los métodos descritos en el presente documento incluyen agua, etanol, polioles (tales como glicerol, propilenglicol, polietilenglicol y similares), y mezclas adecuadas de los mismos, aceites vegetales, tal como aceite de oliva, y ésteres orgánicos inyectables, tales como oleato de etilo. La fluidez adecuada se puede mantener, por ejemplo, mediante el uso de materiales de revestimiento, tales como lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersiones y mediante el uso de tensioactivos.
Además, la composición se puede encapsular o inyectar en una forma apta para su administración en un sitio de un tejido objetivo (p. ej., hueso). En ciertas realizaciones, las composiciones usadas en los métodos descritos en el presente documento pueden incluir una matriz capaz de liberar uno o más compuestos terapéuticos (p. ej., polipéptidos ActRIIA) en un sitio de un tejido objetivo (p. ej., hueso) que proporciona una estructura para el tejido en desarrollo y es capaz de ser reabsorbida óptimamente en el cuerpo. Por ejemplo, la matriz puede proporcionar la liberación lenta de los polipéptidos ActRIIA. Tales matrices se pueden formar con materiales que actualmente se usan para otras aplicaciones médicas implantadas.
La elección del material de la matriz se basa en la biocompatibilidad, la biodegradabilidad, las propiedades mecánicas, el aspecto cosmético y las propiedades de la interfaz. La aplicación concreta de las composiciones objetivo definirá la formulación apropiada. Las matrices potenciales para las composiciones pueden ser sulfato cálcico, fosfato tricálcico, hidroxiapatita, ácido poliláctico y polianhídridos biodegradables y químicamente definidos. Otros materiales potenciales son biodegradables y biológicamente bien definidos, tales como el colágeno óseo o dérmico. Otras matrices adicionales comprenden proteínas puras o componentes de la matriz extracelular. Otras matrices potenciales son no biodegradables y químicamente definidas, tales como hidroxiapatita, biovidrio, aluminatos u otros materiales cerámicos sinterizados. Las matrices pueden comprender combinaciones de cualquiera de los tipos de material anteriormente mencionados, tales como ácido poliláctico e hidroxiapatita o colágeno y fosfato tricálcico. Los materiales biocerámicos pueden tener alterada su composición, tal como en el fosfato-aluminato cálcico, y se pueden procesar para alterar su tamaño de poro, tamaño de partícula, forma de partícula y biodegradabilidad.
En ciertas realizaciones, las composiciones usadas en los métodos descritos en el presente documento se pueden administrar oralmente, p. ej., en forma de cápsulas, sellos, píldoras, comprimidos, pastillas para chupar (usando una base saborizada, normalmente sucrosa y acacia o tragacanto), polvos, gránulos o como una solución o una suspensión en un líquido acuoso o no acuoso, o como una emulsión de aceite en agua o agua en aceite, o como un elixir o jarabe, o como pastillas (usando una base inerte, tal como gelatina y glicerina o sucrosa y acacia) y/o como enjuagues bucales y similares, conteniendo todas ellas una cantidad predeterminada de un agente como ingrediente activo. Un agente también se puede administrar como un bolo, un electuario o una pasta.
En las formas de dosificación sólidas para administración oral (cápsulas, comprimidos, pastillas, grageas, polvos, gránulos y similares) se pueden mezclar uno o más compuestos terapéuticos usados en los métodos descritos en el presente documento con uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables, tales como citrato sódico o fosfato dicálcico y/o uno de los siguientes: (1) cargas o diluyentes, tales como féculas, lactosa, sucrosa, glucosa, manitol y/o ácido salicílico; (2) ligantes, tales como, por ejemplo, carboximetilcelulosa, alginatos, gelatina, polivinilpirrolidona, sucrosa y/o acacia; (3) humectantes, tales como glicerol; (4) agentes desintegrantes, tales como agar-agar, carbonato cálcico, fécula de patata o tapioca, ácido algínico, ciertos silicatos y carbonato sódico; (5) agentes retardantes de la disolución, tales como parafina; (6) acelerantes de la absorción, tales como compuestos de amonio cuaternario; (7) agentes humectantes, tales como, por ejemplo, alcohol cetílico y monoestearato de glicerol; (8) absorbentes, tales como caolín y arcilla de bentonita; (9) lubricantes, tales como talco, estearato de calcio, estearato de magnesio, polietilenglicoles sólidos, laurilsulfato de sodio y mezclas de los mismos y (10) agentes colorantes. En el caso de las cápsulas, comprimidos y pastillas, las composiciones farmacéuticas también pueden comprender agentes tamponadores. Las composiciones sólidas de un tipo similar se pueden empelar como cargas en cápsulas de gelatina rellenas duras y blandas usando excipientes tales como lactosa o azúcares de la leche, así como polietilenglicoles de alto peso molecular y similares.
Las formas de dosificación líquidas para administración oral incluyen emulsiones, microemulsiones, soluciones, suspensiones, jarabes y elixires farmacéuticamente aceptables. Además del ingrediente activo, las formas de dosificación líquidas pueden contener diluyentes inertes habitualmente usados en la técnica, tales como agua u otros solventes, agentes solubilizantes y emulsionantes, tales como alcohol etílico, alcohol isopropílico, carbonato de etilo, acetato de etilo, alcohol bencílico, benzoato de bencilo, propilenglicol, 1,3-butilenglicol, aceites (en concreto aceites de semilla de algodón, cacahuete, maíz, germen, oliva, ricino y sésamo), glicerol, alcohol tetrahidrofurílico, polietilenglicoles y ésteres de ácidos grasos de sorbitano y mezclas de los mismos. Además de diluyentes inertes, las composiciones orales también pueden incluir adyuvantes tales como agentes humectantes, agentes de suspensión y emulsionantes, agentes edulcorantes, saborizantes, colorantes, perfumantes y conservantes.
Las suspensiones, además de los compuestos activos, pueden contener agentes de suspensión tales como alcoholes isoestearílicos etoxilados, polietilensorbitol, ésteres de sorbitano, celulosa microcristalina, metahidróxido de aluminio, bentonita, agar-agar, tragacanto y mezclas de los mismos.
Las composiciones usadas en los métodos descritos en el presente documento también pueden contener adyuvantes tales como conservantes, agentes humectantes, agentes emulsionantes y agentes dispersantes. La prevención de la acción de los microorganismos se puede asegurar mediante la inclusión de diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabeno, clorobutanol, ácido fenol sórbico y similares. También puede ser deseable incluir agentes isotónicos, tales como azúcares, cloruro sódico y similares en las composiciones. Además, la absorción prolongada de la forma farmacéutica inyectable puede ser provocada por la inclusión de agentes que retardan la absorción tales como monoestearato de aluminio y gelatina.
Se entiende que el régimen de dosificación lo determinará el médico responsable del tratamiento considerando diversos factores que modifican la acción de los compuestos objetivo usados en los métodos descritos en el presente documento (p. ej., polipéptidos ActRII, tales como polipéptidos ActRIIA y/o ActRIIB (véase la Sección 5.2)). Los diversos factores incluyen, pero no se limitan a, la cantidad de peso óseo que se desea que se forme, el grado de pérdida de densidad ósea, el sitio del daño óseo, el estado del hueso dañado, la edad, el sexo y la dieta del paciente, la gravedad de cualquier enfermedad que pueda estar contribuyendo a la pérdida ósea, el tiempo de administración y otros factores clínicos. Opcionalmente, la dosificación puede variar con el tipo de matriz usada en la reconstitución y los tipos de compuestos de la composición. La adición de otros factores de crecimiento conocidos a la composición final también puede afectar a la dosificación. El progreso se puede monitorizar mediante evaluación periódica del crecimiento y/o la reparación óseos, por ejemplo, mediante rayos X (incluyendo DEXA), determinaciones histomorfométricas y marcado con tetraciclina.
En ciertas realizaciones, los métodos descritos en el presente documento comprenden terapia génica para la producción in vivo de polipéptidos ActRII. Tal terapia consigue su efecto terapéutico mediante introducción de las secuencias de polinucleótidos de ActRII en células o tejidos que tienen los trastornos enumerados anteriormente. La administración de secuencias de polinucleótidos de ActRII se puede conseguir usando un vector de expresión recombinante tal como un virus quimérico o un sistema de dispersión coloidal. Para la administración terapéutica de secuencias de polinucleótidos de ActRII es preferible el uso de liposomas dirigidos. Los polipéptidos ActRII pueden ser polipéptidos ActRIIA y/o polipéptidos de ActRIIB (véase la Sección 5.2)).
Los diversos vectores virales que se pueden usar para terapia génica tal y como se ha enseñado en el presente documento incluyen adenovirus, virus del herpes, vaccinia virus o, preferentemente, virus ARN tales como retrovirus. Preferentemente, el vector retroviral es un derivado de un retrovirus murino o aviar. Los ejemplos de vectores retrovirales en los que se puede insertar un único gen extraño incluyen, pero no se limitan a: virus de la leucemia murina de Moloney (MoMuLV), virus del sarcoma murino de Harvey (HaMuSV), virus del tumor mamario murino (MuMTV) y virus del sarcoma de Rous (RSV). Varios vectores retrovirales pueden incorporar múltiples genes. Todos estos vectores pueden transferir o incorporar un gen para un marcador seleccionable de forma que las células transducidas se puedan identificar y generar. Los vectores retrovirales se pueden hacer específicos de un objetivo mediante fijación de, por ejemplo, un azúcar, un glicolípido o una proteína. El direccionamiento preferido se puede conseguir usando un anticuerpo. Los expertos en la materia reconocerán que se pueden insertar en el genoma retroviral o fijar en una envoltura viral secuencias de polinucleótidos específicas para permitir la administración específica al objetivo del vector retroviral que contiene el polinucleótido ActRIIA. En una realización preferida, el vector se dirige al hueso o al cartílago.
Como alternativa, se pueden transfectar directamente células de cultivo tisular con plásmidos que codifican los genes estructurales retrovirales gag, pol y env, mediante transfección por el método del fosfato cálcico. A continuación, estas células son transfectadas con el plásmido vector que contiene los genes de interés. Las células resultantes liberan el vector retroviral en el medio de cultivo.
Otro sistema de liberación dirigido para polinucleótidos de ActRIIA es un sistema de dispersión coloidal. Los sistemas de dispersión coloidal incluyen complejos macromoleculares, nanocápsulas, microesferas, perlas y sistemas basados en lípidos que incluyen emulsiones de aceite en agua, micelas, micelas mixtas y liposomas. Un sistema coloidal que se puede usar es un liposoma. Los liposomas son vesículas artificiales con membrana que son útiles como vehículos de entrega in vitro e in vivo. El ARN, ADN y los viriones intactos se pueden encapsular en el interior acuoso y entregar a las células en una forma biológicamente activa (véase, p. ej., Fraley y col., Trends Biochem. Sci., 6:77, 1981). Los métodos efectivos de transferencia génica que usan como vehículo un liposoma se conocen en la técnica, véase, p. ej., Mannino, y col., Biotechniques, 6:682, 1988. La composición del liposoma es normalmente una combinación de fosfolípidos, normalmente en combinación con esteroides, especialmente colesterol. También se pueden usar otros lípidos u otros fosfolípidos. Las características físicas de los liposomas dependen del pH, la fuerza iónica y la presencia de cationes divalentes.
Los ejemplos de lípidos útiles en la producción de liposomas incluyen compuestos de fosfatidilo, tales como fosfatidilglicerol, fosfatidilcolina, fosfatidilserina, fosfatidiletanolamina, esfingolípidos, cerebrósidos y gangliósidos. Los fosfolípidos ilustrativos incluyen fosfatidilcolina, dipalmitoilfosfatidilcolina y diestearoilfosfatidilcolina del huevo. El direccionamiento de liposomas se conoce en la técnica y también es posible en función de, por ejemplo, la especificidad para órganos, la especificidad para células y la especificidad para orgánulos.
En ciertas realizaciones, el inhibidor de ActRIIA es sustancialmente puro en una composición farmacéutica. Específicamente, como máximo un 20 %, 10 %, 5 %, 2,5 %, 1 %, 0,1 % o como máximo un 0,05 % de los compuestos presentes en la composición farmacéutica son compuestos distintos del inhibidor de ActRII y el vehículo farmacéuticamente aceptable.
(a) Proteínas de fusión ActRIIA-Fc
Se describe una proteína de fusión ActRIIA que tiene el dominio extracelular del ActRIIA humano fusionado a un dominio Fc humano o de ratón con un conector mínimo. Los constructos se denominan ActRIIA-hFc y mActRIIA-Fc, respectivamente. ActRIIA-hFc se proporciona como SEQ ID NO: 7. mActRIIA-Fc es el equivalente murino a la SEQ ID NO: 7.
Se expresaron las proteínas ActRIIA-hFc y mActRIIA-Fc en líneas celulares CHO. Se consideraron tres secuencias líder diferentes:
- (i)
- Melitina de abeja melífera (HBML): SEQ ID NO: 8
- (ii)
- Activador del plasminógeno tisular (TPA) SEQ ID NO: 9
(iii) ActRIIA nativo: SEQ ID NO: 10
La forma seleccionada emplea la líder del TPA y tiene la siguiente secuencia de aminoácidos sin procesar expuesta en la SEQ ID NO: 13. Este polipéptido es codificado por la SEQ ID NO: 14.
(b) Proteínas de fusión ActRIIB-Fc
La estructura cocristalina de un dominio extracelular de ActRIIB humano fusionado a un dominio Fc y activina humanos no mostró ningún papel en la unión al ligando para los 15 aminoácidos finales (C-terminal) (denominados la «cola» en el presente documento) del dominio extracelular. Esta secuencia no se resolvió en la estructura cristalina, lo que sugiere que estos residuos están presentes en un bucle flexible que no se empaqueta uniformemente en el cristal. Thompson y col. EMBO J. 2003 Apr 1; 22(7):1555-66. Esta secuencia también se conserva mal entre ActRIIB y ActRIIA. Por consiguiente, estos residuos se omitieron del constructo de fusión ActRIIB-Fc básico u original. Además, la posición 64 de la forma original está ocupada por una alanina, lo cual generalmente se considera la forma de «tipo salvaje», aunque hay un alelo A64R presente de forma natural. Por tanto, la fusión ActRIIB-Fc original tiene la secuencia desvelada como SEQ ID NO: 21.
Sorprendentemente, se encontró que la cola C-terminal mejora la unión a activina y GDF-11, por tanto, una versión preferida de ActRIIB-Fc tiene una secuencia de SEQ ID NO: 20.
Una variedad de variantes de ActRIIB que se pueden usar de acuerdo con los métodos descritos en el presente documento se describen en la solicitud de patente internacional publicada como WO2006/012627 (véanse, p. ej., las págs. 59-60), incorporada por referencia en su totalidad en el presente documento.
6.2 EFECTOS DE LA INHIBICIÓN DE mACTRIIA EN UN MODELO DE RATÓN DE ENFERMEDAD RENAL CRÓNICA
Este estudio se diseñó para estudiar los efectos de ActRIIA de ratón fusionado con Fc de ratón a través de un conector mínimo (SEQ ID NO: 15) sobre el tratamiento de parámetros sanguíneos y óseos en un modelo de ratón de enfermedad renal crónica y CKD-MBD.
Los pacientes con enfermedad renal crónica (CKD) pueden llegar a estar anémicos y también osteopénicos. En este modelo, se usaron ratones con ablación renal parcial (nefrectomía 5/6) como modelo de CKD para ensayar los efectos del polipéptido con la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 15. Se sometieron los ratones a dos cirugías para 1) extirpar un riñón por completo y 2) ligar 2 de las 3 arterias renales al riñón restante. También se incluyeron ratones operados de forma simulada como controles. La cirugía simulada y la nefrectomía 5/6 se realizaron en Jackson Laboratories.
Tras la recepción de los ratones, se sometieron a dieta rica en grasas durante toda la duración del estudio. Dos semanas después de la cirugía final, se dividieron los ratones en grupos (tanto SIMULADO como CKD) y se comenzó a dosificar el vehículo (PBS) o mActRIIA-Fc a 10 mg/kg dos veces a la semana durante 8 semanas. Se tomaron recuentos sanguíneos completos (CBC) periódicamente durante el estudio para evaluar la presencia de anemia.
Se determinó la densidad mineral ósea usando absorciometría con rayos X de doble energía (DEXA, PIXIMus). A la conclusión del estudio, se llevaron a cabo necropsias para recoger los huesos largos de las extremidades posteriores y los órganos principales. El riñón sobrante se envió para su procesamiento histológico y tinción con hematoxilina-eosina o tinción tricrómica. Se sometieron los fémures a uCT (Scanco) para determinar la microarquitectura ósea.
Los ratones parecían normales y saludables durante todo el periodo de estudio y ganaron peso a medida que el estudio progresaba (Figura 1). La densidad mineral ósea aumentó en los cuatro grupos de ratones, pero los ratones tratados con mActRIIA-Fc (SIMULADOS y CKD) tenían aumentos mayores que cualquiera de los grupos tratados con vehículo (Figura 2). El tratamiento con mActRIIA-Fc en ratones CKD obtuvo densidades minerales que igualaban o superaban a las de los rayones tratados con VEH SIMULADOS al final del estudio. Los ratones CKD se volvieron anémicos al final del estudio (HCT < 40 %), pero el tratamiento con mActRIIA-Fc evitó la anemia en el grupo CKD (HCT > 40 %; Figura 3). Los ratones tratados con mActRIIA-Fc del grupo SIMULADO también mostraron aumentos de HCT en comparación con los controles VEH. El análisis micro-CT de los fémures tras la disección mostró aumentos de hueso trabecular en los ratones tratados con mActRIIA-Fc, pero no hubo diferencias importantes entre los grupos SIMULADO y CKD tratados con vehículo en este momento de la progresión de la enfermedad. En la necropsia, no se observaron diferencias importantes en el peso de los órganos, aunque los ratones tratados con mActRIIA-Fc tenían un ligero aumento del peso de las bolsas de grasa. Las secciones histológicas con tinción tricrómica del riñón sobrante no indicaron fibrosis generalizada en los ratones CKD en este punto del estudio.
La nefrectomía 5/6 en roedores es un protocolo experimental habitualmente realizado y usado para modelos de enfermedad renal crónica. En esta cirugía bifásica, se extirpan 2/3 de un riñón y el riñón completo del lado contralateral usando procedimientos quirúrgicos asépticos. Como resultado de la cirugía, el animal experimenta una
5 función renal deficiente y exhibe un comportamiento patológico análogo a los humanos con enfermedad renal crónica.
La cirugía simulada y la nefrectomía 5/6 se realizaron en Jackson Laboratories de acuerdo con procedimientos operativos estándar. Se permitió que los animales se recuperaran de la cirugía y, a continuación, se enviaron. Los animales se aclimataron a las condiciones de laboratorio durante un mínimo de 48 horas antes de realizar las
10 primeras mediciones. Durante este periodo, se observaron todos los animales en busca de cualquier signo de anomalía clínica que los pudiera excluir del estudio. Se asignó a los animales un número de estudio en las tarjetas identificativas de sus jaulas y se identificaron de forma única mediante marcado en las orejas.
Se diluyó la proteína ActRIIA-mIgG2aFc usando PBS estéril hasta una concentración de 2,0 mg/ml. La concentración de dosificación fue: 2,0 mg/ml. Se almacenó la proteína ActRIIA-mIgG2aFc a -65 °C ± 15 °C, el
15 material se puede descongelar a temperatura ambiente o durante la noche a 4 °C. La proteína congelada se mantuvo en hielo húmedo hasta su uso.
Se sometieron treinta ratones hembra C57BL/6 (10 semanas de edad) a nefrectomía 5/6 en la que un riñón se extirpa completamente y, a continuación, se ligan 2 de las 3 venas renales al riñón restante dos semanas después. También se realizaron en treinta hembras C57BL/6 cirugías simuladas en las que los animales se sometieron al 20 mismo procedimiento quirúrgico abdominal, pero sin extirpación de los riñones. Después de que se recuperaran de la segunda cirugía se enviaron los animales y se permitió que se aclimataran a las condiciones de laboratorio durante un mínimo de 48 horas. Dos meses después de la segunda cirugía, se asignaron aleatoriamente los ratones a uno de los cuatro grupos de tratamiento, con 15 ratones por grupo (Tabla 2). Se pesaron los ratones y se les aplicó una dosis de mActRIIA-Fc o PBS dos veces a la semana durante un total de 8 semanas. Se hicieron mediciones
25 longitudinales de la densidad mineral ósea (BMD) y los parámetros hematológicos en el punto de partida, en un punto intermedio y a la conclusión del estudio. En la necropsia, se recogieron los huesos y se almacenaron para su examen histológico o análisis por micro-CT.
Tabla 2:
- Grupo
- N Ratones Dieta Tratamiento Cirugía Concentración Ruta
- 1
- 15 C57BL/6 Comida PBS Simulada volumen S.C.
- 2
- 15 C57BL/6 Comida mActRIIA-Fc Simulada 10 mg/kg S.C.
- 3
- 15 C57BL/6 Comida PBS Nefr. 5/6 volumen S.C.
- 4
- 15 C57BL/6 Comida mActRIIA-Fc Nefr. 5/6 10 mg/kg S.C.
30 (a) PROCEDIMIENTOS EXPERIMENTALES
- (i)
- Modificación quirúrgica
Se sometieron ratones hembra C57BL/6 de 10 semanas de edad a una cirugía en dos etapas para lograr una nefrectomía 5/6 o la cirugía simulada equivalente.
- (ii)
- Dosificación a los animales
35 La administración de dosis en el presente estudio comenzó un mes después de la finalización de la nefrectomía 5/6. Se pesaron los ratones y se les administraron 10 mg/kg de PBS o mActRIIA-Fc dos veces a la semana mediante inyección subcutánea.
(iii) Densitometría ósea DXA
Se realizaron mediciones longitudinales de BMD mensualmente mediante densitometría ósea DXA (Lunar PIXIMus, 40 GE Medical Systems) a ratones anestesiados. Durante los análisis de BMD por DXA se eliminó la cabeza del ratón de la región de interés evitar los aparatos de cuantificación asociados al cráneo.
(iv) Toma de muestras de sangre
Se realizaron mediciones longitudinales de recuentos sanguíneos completos (HM2, VetScan) en sangre recogida mensualmente mediante extracción submandibular. Al final del estudio se realizó una extracción terminal, se recogió la sangre y se dividió en un tubo que contenía EDTA para su análisis CBC o en un tubo de separación de suero para la toma de muestras de suero. El suero se congeló a -80 ºC para su análisis futuro.
- (v)
- Análisis del suero
El suero congelado se descongeló y se analizaron 100 microlitros usando un analizador Vetscan VS2 (Abaxis, Inc.). Se uso un rotor diagnóstico integral para analizar las muestras y determinar la albúmina sérica (ALB), la fosfatasa alcalina (ALP), la alanina aminotransferasa (ALT), la amilasa (AMY), bilirrubina total (TBIL), el nitrógeno ureico en sangre (BUN), el calcio total (Ca++), el fósforo (PHOS), la creatinina (CRE), la glucosa (GLU), el sodio (NA+), el potasio (K+), la proteína total (TP) y la globulina (GLOB).
- (vi)
- Necropsia
A la finalización de estudio, se sacrificaron los ratones mediante inhalación de CO2. Se extirparon los riñones y bazos, se pesaron y se almacenaron en formalina al 10 %. Se recogieron las tibias y fémures y se almacenaron en etanol al 70 %.
(vii) Análisis por micro-CT
Al final del experimento, se diseccionaron el fémur y tibia izquierdos de cada ratón y se fijaron en etanol al 70 %. Se sometieron los huesos a micro-CT usando un dispositivo Scanco (VivaCT75, Scanco) a 55 kV, 145 microA y un tamaño de vóxel de 20 micrómetros. Las imágenes obtenidas se reconstruyeron usando el software de Scanco incorporado. Se evaluó el volumen de hueso trabecular (BV/TV) y el espesor trabecular (TbTh) en una sección de 400 micrómetros de hueso que estaba ubicada a 200 micrómetros del extremo distal del fémur. Se midió el espesor cortical en una sección de 200 micrómetros de hueso centrada en la línea media del fémur.
(viii) ANÁLISIS DE DATOS
Se realizaron comparaciones entre los ratones y tejidos tratados con mActRIIA-Fc y con vehículo mediante la prueba t de Student usando Microsoft Excel. Los datos se expresaron como media ± SEM.
(b) Resultados
Investigamos la capacidad de mActRIIA-Fc para evitar la anemia y la pérdida ósea en un modelo de ratón de enfermedad renal crónica. Después de 2 meses de progresión de la enfermedad siguientes a la nefrectomía 5/6 (Día 0), los ratones sometidos a nefrectomía 5/6 (CKD) exhibieron una reducción significativa del hematocrito en comparación con las cohortes simuladas (-5,4 %, P<0,01). La toma de muestras de sangre longitudinal y su posterior análisis CBC mostraron que los ratones tratados con mActRIIA-Fc, tanto en la cohorte simulada como en la CKD, mostraban aumentos significativos del hematocrito en comparación con sus equivalentes tratados con VEH después de 4 y 8 semanas de tratamiento (Figura 5).
Después de 2 meses de progresión de la enfermedad siguientes a la nefrectomía 5/6 (Día 0), los ratones sometidos a nefrectomía 5/6 (CKD) exhibieron una reducción significativa de la BMD en comparación con las cohortes simuladas (-5,4 %, P<0,01). A lo largo de 6 semanas de tratamiento, las cohortes simulada y CKD tratadas con mActRIIA-Fc tenían una BMD significativamente mayor que la de sus equivalentes tratados con VEH (Figura 6).
A la finalización del estudio, se recogieron las extremidades posteriores y se fijaron en etanol al 70 %. El fémur derecho se sometió a micro-CT (VivaCT 75, Scanco) para cuantificar la estructura ósea cortical y trabecular. La Figura 7 muestra imágenes de secciones transversales de fémures de cada grupo de tratamiento. Los ratones nefrectomizados exhibían menor espesor cortical y no presentaban cambios obvios en la estructura del hueso trabecular.
Los ratones tratados con mActRIIA-Fc exhibían aumento tanto del espesor cortical como del volumen de hueso trabecular. Se usaron análisis de la diáfisis media del fémur para cuantificar el espesor cortical medio en cada cohorte (Figura 8). Los ratones CKD presentaban huesos corticales más finos que sus equivalentes simulados en ambas cohortes, VEH (P<0,01) y mActRIIA-Fc (P<0,01). Los ratones tratados con mActRIIA-Fc presentaban un aumento significativo de hueso cortical en ambas cohortes, simulada (+17 %, P<0,01) y CKD (+19,2 %, P<0.01), en comparación con los respectivos ratones tratados con VEH. Tal como evidencian las imágenes de las muestras de la Figura 7, los análisis del fémur distal revelaron aumentos drásticos del volumen y espesor de hueso trabecular en los ratones tratados con mActRIIA-Fc. mActRIIA-Fc fue capaz de aumentar significativamente el volumen de hueso trabecular (Figura 9) y el espesor trabecular (Figura 10) con respecto a los ratones tratados con VEH en ambas cohortes, simulada y CKD. En la semana 8, las mediciones del volumen de hueso trabecular demostraron que los ratones tratados con mActRIIA-Fc presentaban un aumento significativo del volumen de hueso trabecular en ambas cohortes, simulada (+549 %, P<0,001) y CKD (+827 %, P<0,001), en comparación con los respectivos ratones tratados con VEH. En la semana 8, las mediciones del espesor trabecular demostraron que los ratones tratados con mActRIIA-Fc presentaban un aumento significativo del espesor trabecular en las cohortes CKD (+62 %, P<0,001) en comparación con los respectivos ratones tratados con VEH.
En el momento del sacrificio final, se tomó sangre entera de todos los animales y se procesó para obtener suero. Las muestras de suero se analizaron usando un analizador Vetscan VS2 (Abaxis, Inc) usando un rotor de perfil integral. Los valores medios de los analitos de cada grupo se muestran en la Tabla 3. La comparación de los grupos de control SIMULADO y CKD, mostró los aumentos de nitrógeno ureico en sangre (BUN) y creatinina (CRE) esperados a causa de la función renal deficiente. Además, la ALT y la amilasa (AMY) aumentaron en los ratones CKD debido a la alteración de la función renal o como indicativo de que la nefrectomía también altera la función del hígado. Los niveles de calcio (CA++) y fosfatasas alcalinas totales (ALP) también aumentaron según lo esperado debido al aumento de recambio óseo. El tratamiento con mActRIIA-Fc aumentó los niveles de ALP tanto en los ratones SIMULADOS como en los CKD debido a las propiedades anabólicas óseas del fármaco. En los ratones CKD, el tratamiento con mActRIIA-Fc redujo los niveles de albúmina (ALB), proteína total (TP) y CRE en comparación con los controles CKD-VEH, pero no fueron diferentes de los de los ratones SIMULADOS. No se cree que estos cambios sean relevantes para el modelo o tratamiento en este puto.
Tabla 3
- VEH SIMULADO
- mActRIIA-Fc SIMULADO CKD VEH CKD mActRIIA-Fc
- AMY
- U/L 865,45 ± 39,41 803,38 ± 66,06 1486,18 ± 53,82 1418,42 ± 36,68
- TBIL
- mg/dL 0,25 ± 0,02 0,23 ± 0,02 0,23 ± 0,01 0,27 ± 0,01ū
- BUN
- mg/dL 27,92 ± 1,39 29,20 ± 1,26 52,75 ± 2,66 51,50 ± 2,10
- CA++
- mg/dL 10,18 ± 0,16 10,38 ± 0,12 11,00 ± 13 11,33 ± 0,13
- PHOS
- mg/dL 8,58 ± 0,17 8,96 ± 0,28 8,28 ± 0,36 7,96 ± 0,26
- CRE
- mg/dL 0,33 ± 0,05 0,40 ± 0,05 0,44 ± 0,05 0,31 ± 0,02ū
- GLU
- mg/dL 198,50 ± 6,52 260,90 ± 28,79* 223,67 ± 13,53 260,86 ± 14,98
- NA+
- mmol/L 156,50 ± 0,77 157,60 ± 0,73 158,58 ± 2,37 155,64 ± 0,34
- K+
- mmol/L 7,65 ± 0,14 7,85 ± 0,15 7,98 ± 0,14 7,77 ± 0,13
- TP
- g/dL 5,66 ± 0,05 5,42 ± 0,057* 5,73 ± 0,08 5,47 ± 0,07ū
- GLOB
- g/dL 1,79 ± 0,08 1,67 ± 0,06 1,73 ± 0,07 1,97 ± 0,06ū
- *= p<0,05 frente a SIMULADO VEH; ++ = p<0,05 frente a CKD VEH
(c) CONCLUSIONES
El tratamiento con mActRIIA-Fc fue capaz de evitar la anemia y la pérdida ósea en un modelo de nefrectomía 5/6 de enfermedad renal crónica. Los ratones CKD estaban anémicos, presentaban menor BMD y una estructura ósea cortical más fina en el fémur que sus equivalentes SIMULADOS. El tratamiento con mActRIIA-Fc de ratones CKD aumentó el hematocrito, la BMD y la estructura ósea cortical significativamente con respecto a los ratones tratados con VEH. Asimismo, mActRIIA-Fc fue capaz de aumentar el volumen de hueso trabecular y el espesor trabecular en los ratones CKD a valores superiores a los de los ratones tratados con VEH en ambas cohortes, simulada y CKD. Estos datos demuestran que el bloqueo de la señalización del receptor IIA de activina mediante administración de mActRIIA-FC puede evitar la anemia y la pérdida ósea en un modelo de nefrectomía 5/6 de enfermedad renal crónica.
6.4 EJEMPLO PROFÉTICO DE INHIBICIÓN DE mACTRIIA PARA TRATAR LA ENFERMEDAD ÓSEA ADINÁMICA EN EL CONTEXTO DE LA CKD
Los ratones se sometieron a electrocauterización de un riñón y nefrectomía del otro riñón. Los ratones se alimentan con comida pobre en fosfato suplementada con calcitriol. Véase, p. ej., Lund y col., 2004, J Am Soc Nephrol 15:349
369.
Este estudio está diseñado para estudiar los efectos de ActRIIA soluble de ratón fusionado con Fc de ratón a través de un conector mínimo (SEQ ID NO: 15) sobre el tratamiento de parámetros sanguíneos y óseos en un modelo de ratón de enfermedad ósea adinámica.
Se usan ratones con electrocauterización de un riñón y nefrectomía del otro riñón como modelo de hueso adinámico en el contexto de la CKD («ADB») para ensayar los efectos del polipéptido con la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 15 en este modelo. Se someten los ratones a dos cirugías para 1) extirpar un riñón por completo y 2) electrocauterizar el otro riñón. También se incluyen ratones operados de forma simulada como controles. Las cirugías se pueden llevar a cabo tal y como se describe en Lund y col., 2004, J Am Soc Nephrol 15:349-369.
Un grupo de ratones se somete a dieta alimenticia baja en fosfato suplementada con calcitriol. Otro grupo de ratones se somete a dieta alimenticia normal. Dos semanas después de la cirugía final, se dividen los ratones en grupos (tanto SIMULADO como ADB) y se comienza a administrar vehículo (PBS) o mActRIIA-Fc a 10 mg/kg dos veces a la semana durante 8 semanas. Se toman recuentos sanguíneos completos (CBC) periódicamente durante el estudio para evaluar la presencia de anemia.
Se determina la densidad mineral ósea usando absorciometría con rayos X de doble energía (DEXA, PIXIMus). A la conclusión del estudio, se llevan a cabo necropsias para recoger los huesos largos de las extremidades posteriores y los órganos principales. El riñón sobrante se envía para su procesamiento histológico y tinción con hematoxilinaeosina o tinción tricrómica. Se someten los fémures a uCT (Scanco) para determinar la microarquitectura ósea. También se puede usar la tomografía computerizada cuantitativa (QCT) para determinar el recambio óseo.
Este ejemplo demuestra que la inhibición de ActRIIA es efectiva en la reducción de los niveles de calcio en la vasculatura de los sujetos y, por tanto, representa un medio de tratamiento de la calcificación vascular.
Se indujo enfermedad renal crónica (CKD) en etapa 3 a ratones ldlr -/-de 14 semanas de edad (C57B1/6J original; Jackson Laboratory) alimentados con dietas ricas en grasa («ratones CKD»). Se sabe que el receptor de lipoproteínas de baja densidad (Idlr) está implicado en la eliminación de lípidos y los ratones transgénicos Idlr representan un modelo de aterosclerosis. Los ratones deficientes en Idlr alimentados con dietas ricas en grasa/colesterol desarrollan aterosclerosis y placas aórticas asociadas a la calcificación estimulada por la CKD inducida mediante ablación renal. Se indujo CKD en los ratones tdtr -/-mediante nefrectomía 5/6 (véase arriba). Tal y como se ha descrito anteriormente, la nefrectomía 5/6 comprende la extirpación completa de un riñón seguida de ligación de 2 de las 3 venas renales en el riñón restante.
En la semana 22, se consolidó la calcificación vascular en los ratones CKD, tal y como se confirmó mediante cuantificación química de la calcificación. En resumen, se diseccionaron los corazones y aortas de los ratones en el momento del sacrificio y se eliminó todo el tejido extraño mediante disección roma bajo un microscopio de disección. Se desecaron los tejidos durante 20-24 horas a 55 ºC, se pesaron y se pulverizaron con un mortero. Se eluyó calcio en ácido fórmico al 10 % (10:1 v/p) durante 24 horas a 4 ºC. Se ensayó el contenido de calcio del eluido usando un método cresolftaleína complexona (Sigma, St Louis), de acuerdo con las instrucciones del fabricante, y se corrigieron los resultados para el peso de tejido seco.
Se dividieron los ratones CKD en dos grupos experimentales (i) ratones tratados con mActRIIA-Fc y (ii) ratones CKD-3-Vehículo, a los que se administró solo la porción de vehículo de la composición mActRIIA-Fc (es decir, se administró a los ratones una composición salina sin mActRIIA-Fc). A los ratones tratados con mActRIIA-Fc (n = 5) se les administraron 10 mg/kg de mActRIIA-Fc dos veces a la semana durante 6 semanas. A los ratones CKD-3-Vehículo (n = 6; vehículo = solución salina) se les administró solo vehículo en los mismos días que se administraba mActRIIA-Fc a los ratones tratados con mActRIIA-Fc. Los ratones de tipo salvaje (n = 6; C57B1/6J original) y los ratones SIMULADOS (n = 8; C57B1/6J original) se usaron como controles negativos. Los ratones SIMULADOS consistían en ratones ldlr-l-que fueron operados pero no se les indujo CKD (p. ej., no se llevó a cabo la nefrectomía). Todos los ratones fueron sacrificados en la semana 28 para evaluación de los niveles de calcio aórtico en cada uno de los cuatro grupos de tratamiento (CKD-3-Vehículo; tratados con mActRIIA-Fc; SIMULADOS y tipo salvaje).
La Tabla 4, que se muestra a continuación, presenta los niveles de calcio aórtico observados en cada ratón usado en el estudio (columna 2), así como los niveles de calcio promedio de cada uno de los grupos de estudio SIMULADO, CDK-3-Vehículo, mActRIIA-Fc y tipo salvaje (columna 3). Los resultados se presentan de forma gráfica en la Figura 11. Tal y como demuestran los datos, se observó una clara reducción del calcio aórtico en los ratones pertenecientes al grupo tratado con mActRIIA-Fc en comparación con el grupo tratado con vehículo. En 4 de los 5 ratones CKD que fueron tratados con mActRIIA-Fc, los niveles de calcio aórtico eran comparables a los niveles observados en los dos grupos de control negativo (ratones tipo salvaje y SIMULADOS).
Se sabe que los niveles de calcio vascular (p. ej., arterial) elevados están asociados a la calcificación vascular (véase, p. ej., Raggi P y col., Clin J Am Soc Nephrol 2008; 3: 836-843). Por tanto, los resultados anteriores indican que la inhibición de ActRIIA representa una estrategia adecuada para el tratamiento y la prevención de la calcificación vascular.
Tabla 4: Niveles de calcio aórtico
- Grupo experimental
- Niveles de Ca2+ específicos del sujeto (mg/g) Ca2+ promedio en mg/g
- Tipo salvaje (n = 6)
- 0,25; 0,11; 0,26; 0,36; 0,31; 0,35 0,27 ± 0,09
- Simulado (n = 8)
- 0,28; 0,18; 0,24; 0,16; 0,13; 0,25; 0,26; 0,27 0,22 ± 0,06
- CKD-3-Vehículo (n = 6)
- 0,58; 0,17; 0,51; 0,56; 0,31; 0,99 0,52 ± 0,28
- mActRIIA-Fc (n = 5)
- 0,83; 0,28; 0,19; 0,13; 0,04 0,29 ± 0,31
Este ejemplo describe un estudio del efecto de la inhibición de ActRII sobre la calcificación vascular en sujetos con enfermedad renal crónica.
Se puede usar el modelo de CKD-MBD precoz descrito en los ejemplos anteriores. En este modelo, se añade la ablación renal a la deficiencia genética del receptor de LDL, ldlr, y se alimentan los ratones con una dieta rica en grasa y colesterol. En la CKD en etapa 3, los animales presentan estimulación de la calcificación vascular inducida por la CKD, disminución de la formación ósea, niveles de FGF23 elevados, hiperfosfatemia y niveles de PTH elevados.
(a) Materiales y métodos
Animales y dietas: Se pueden adquirir ratones con deficiencia del receptor de LDL (LDLR -/-) a partir de ratones C57B1/6J originales o C57B1/6J tipo salvaje en Jackson Laboratory (Bar Harbor, Maine) y alimentar en un ambiente libre de patógenos. Los animales se pueden destetar a las tres semanas y pasar a una dieta alimenticia con 6,75 % de calorías en forma de grasa. A las 10 semanas se puede iniciar una dieta rica en colesterol (0,15 %) que contiene un 42 % de calorías en forma de grasa (Harlan Teklad, Madison WI, n.º de producto TD88137), una dieta que ha mostrado generar aterosclerosis con calcificación vascular en este contexto genético (véase, p. ej., Towler y col., 1998, J Biol Chem 273:30427-30434). El contenido de calcio en todas las dietas puede ser del 0,6 %. Se puede permitir que los animales consuman agua a voluntad y se mantienen de acuerdo con las directrices de cuidado animal nacionales y locales. Se les puede administrar mActRIIA-Fc por vía IP (10 mg/kg) dos veces a la semana.
Procedimientos quirúrgicos: Se puede utilizar un procedimiento en dos etapas para provocar CKD tal y como se ha descrito anteriormente (véase, p. ej., Davies y col., 2003, J Am Soc Nephrol 14:1559-1567 y Davies y col., 2005, J Am Soc Nephrol 16:917-928). En resumen, se puede aplicar electrocauterización al riñón derecho a través de una incisión de 2 cm en el costado a las 10 semanas de su nacimiento seguida de nefrectomía total izquierda a través de una incisión similar 2 semanas después. Los animales control pueden someterse a operaciones simuladas en las que se expone y moviliza el riñón apropiado, pero no se trata de ninguna otra forma. Se puede usar anestesia intraperitoneal (13 mg/kg de xilazina y 87 mg/kg de ketamina) para todos los procedimientos. Se pueden tomar muestras de sangre de la vena safena en la semana 1 posterior a la segunda cirugía para evaluar el punto de referencia para la función renal posquirúrgica. Se pueden sacrificar los animales bajo anestesia a las 20 semanas o 26 semanas, dependiendo del grupo, después de que se haya extraído la sangre mediante punción intracardiaca. El corazón y la aorta se pueden diseccionar en bloque.
Reparación tisular: Los animales reseccionados de pueden fijar en formalina y, a continuación, dividir como se indica a continuación: el corazón, la aorta ascendente y el arco aórtico se pueden separar de la aorta descendente y biseccionar sagitalmente a través del tracto de salida de la aorta. La aorta descendente se puede biseccionar coronalmente, aproximadamente a la mitad de su longitud. Los cuatro trozos se pueden integrar en el mismo bloque de cera. Se pueden realizar cortes (de 5 µm de espesor) y someter a tinción con hematoxilina-eosina, tricrómica, con rojo de alizarina y de von Kossa.
Inmunohistoquímica: Las secciones de tejido se pueden preparar como se ha indicado anteriormente, desparafinizar en xileno y rehidratar en etanoles graduados. Se puede bloquear la actividad peroxidasa endógena mediante incubación en peróxido de hidrógeno al 3 % (Sigma, St Louis MO) y se puede bloquear la unión inespecífica mediante incubación durante 10 minutos con una solución de caseína en PBS ('Background SNIPER', propiedad de BioCare Medical, Walnut Creek CA). La recuperación del antígeno se puede realizar mediante incubación durante 5 minutos en tampón citrato ('Decloaker' BioCare Medical, Walnut Creek CA) a 100 °C. Las secciones se pueden incubar con anticuerpo policlonal de cabra purificado por afinidad contra osteocalcina de ratón (OC) (Biogenesis Inc, Brentwood NH) durante la noche y, a continuación, incubar con anticuerpo secundario de ratón anti-cabra biotinilado durante 10 minutos antes de la tinción con peroxidasa conjugada con estreptavidina (todos los reactivos, BioCare Medical, Walnut Creek CA) y contrateñir con hematoxilina al 0,1 % (Sigma).
RT-PCR: Se puede extraer ARN de las muestras de tejido usando el kit RNAqueous-4PCR (Ambion), de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Se puede realizar la RT-PCR usando el kit One-step RT-PCR (Qiagen, Valencia CA) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Las condiciones pueden ser: 50 °C durante 30 min, 95 °C durante 15 min, a continuación, 35-40 ciclos de 94 °C durante 1 min, 60 °C durante 1 min y 72 °C durante 1 min y, a continuación, 72 °C durante 10 min. Se puede seleccionar un cebador específico de la osteocalcina murina y la GAPDH murina.
Cuantificación química de la calcificación: Los corazones y aortas se pueden diseccionar en el momento del sacrificio y eliminar todo el tejido extraño mediante disección roma bajo un microscopio de disección. Los tejidos se pueden desecar durante 20-24 horas a 55 ºC, pesar y pulverizar con un mortero. Se puede eluir calcio en ácido fórmico al 10 % (10:1 v/p) durante 24 horas a 4 ºC. El contenido de calcio del eluido se puede ensayar usando un método cresolftaleína complexona (Sigma, St Louis), de acuerdo con las instrucciones del fabricante, y los resultados se pueden corregir para el peso de tejido seco.
Histomorfometría ósea: Se puede determinar la velocidad de formación de hueso mediante doble marcado fluorescente. Todos los ratones pueden recibir calceína por vía intraperitoneal (20 mg/kg) durante 7 d y sacrificarse 2 d después. En el momento en que se sacrifican los animales, se pueden diseccionar todos los fémures y colocarse en etanol al 70 %. Los especímenes se pueden implantar sin descalcificar en un kit de integración plástico H7000 (Energy Beam Sciences). Se pueden seccionar los huesos longitudinalmente a través del plano frontal en secciones de 10 µm con un micrótomo JB-4 (Energy Beam Sciences). Las secciones sin teñir se pueden usar para análisis mediante fluorescencia con marcado por calceína. Los portaobjetos se pueden examinar con una magnificación de 400X con un microscopio Leitz unido a un analizador de imágenes Osteomeasure (Osteometrics, Atlanta GA). Se pueden examinar diez campos contiguos de 0,0225 mm2 del fémur distal, 150 µm proximales la placa de crecimiento, por animal.
Mediciones de hormona paratiroidea y química sérica: Se pueden obtener muestras de sangre a las 2 y 8 semanas de CKD mediante aspiración con tubo capilar de la vena safena y con un procedimiento diferente (punción intracardiaca) en el momento del sacrificio (12 semanas de CKD) y transferir a tubos heparinizados. Tras la centrifugación (a 400X g durante 5 minutos), se puede retirar el plasma, dividir en alícuotas y congelar a -80 ºC. Los niveles de PTH intacta se pueden medir (mediciones solo en el momento del sacrificio debido al volumen de sangre requerido) mediante ensayo inmunoradiométrico de doble sitio (IRMA) usando un kit disponible en el mercado (Immutopics, San Clemente, CA). El nitrógeno ureico en sangre (BUN) y el calcio y fósforo en suero se pueden medir usando técnicas de análisis multicanal estándar.
Mediciones de FGF23: Se puede adquirir un ensayo ELISA para FGF23 murina de la empresa Kainos.
Mediciones de DKK1 y osteocalcina: Se pueden usar ensayos ELISA comerciales para DKK1 y osteocalcina infracarboxilada.
Mediciones de OPG y sRANKL: La proporción de OPG a RANKL se puede determinar en ensayos séricos. Estos ensayos han mostrado una buena correlación con el recambio óseo y la resorción ósea excesiva (véase, p. ej., Geusens y col., 2006, Arthritis & Rheumatism 54:1772-17775). Los niveles de sRANKL en el suero se pueden determinar mediante un radioinmunoensayo (Linco Research, St. Louis MO). Los niveles de OPG en el suero se pueden medir mediante un método ELISA (OSTEOmedical NL, Marishof, NL). Los coeficientes de variación (CV) intra-e interensayo son inferiores al 10 % para ambos ensayos según los fabricantes. El límite de detección para sRANKL es de 0,08 pmol/1 y para OPG es de 0,14 pmol/l.
Mediciones de marcadores de recambio óseo: El P1Np y la osteocalcina séricos se pueden usar como marcadores de actividad osteoblástica y la forma de fosfatasa ácida tartrato-resistente 5b (TRACP 5b) (mouseTRAP, IDS Ltd, Bolden, UK) se puede usar como marcador de los niveles osteoclásticos.
Mediciones de marcadores de inflamación: Los ensayos séricos de TNF alfa y proteína C reactiva se pueden usar para realizar un seguimiento de los niveles de inflamación y de la respuesta a mActRIIA-Fc.
Análisis estadístico: Los datos se pueden analizar para determinar su importancia estadística (P<.05) usando ANOVA. La comparación se puede hacer entre animales tratados con vehículo (grupo de control) y los tratados con mActRIIA-Fc. La comparación también se puede hacer entre ratones operados de forma simulada y ratones CKD tratados con vehículo y mActRIIA-Fc. Estos análisis se pueden realizar con el paquete estadístico SPSS 11.0 (Needham Heights, MA).
Los ratones usados en el estudio se pueden colocar en uno de los ocho grupos, tal y como se muestra a continuación en la Tabla 5.
Tabla 5
- Grupo
- Descripción del grupo N.º de animales
- A
- Tipo salvaje 10
- B
- LDLR Rica en grasa/CKD tratados con vehículo, eut. 22 sem. 10
- C
- LDLR Rica en grasa/CKD tratados con RAP-011, eut. 22 sem. 10
- D
- LDLR Rica en grasa/CKD tratados con vehículo, eut. 28 sem. 10
- E
- LDLR Rica en grasa/CKD tratados con RAP-011, eut. 28 sem. 10
- F
- LDLR Rica en grasa/operación simulada, eut. 28 sem. 10
- G
- LDLR Rica en grasa/operación simulada, eut. 20 sem. 10
- H
- LDLR Rica en grasa/CKD, eut. a las 14 semanas 10
Un grupo de animales (Grupo H de la Tabla 5) se puede sacrificar a las 14 semanas para medir la calcificación vascular y la histomorfometría de referencia en el momento de establecer la terapia. Los grupos C y E se pueden
5 usar para evaluar la eficacia del tratamiento con mActRIIA-Fc en comparación con los grupos tratados con vehículo (grupos B y D) a lo largo de periodos variables de CKD. Los grupos F y G son animales de la misma edad alimentados con dieta rica en grasa y operados de forma simulada que se pueden usar como control para los efectos de la CKD. Los tamaños de grupo de 10 animales por grupo tras su aleatorización en los grupos de tratamiento pueden ser suficiente para obtener importancia estadística.
10 A las 16-18 semanas, se puede medir la velocidad de filtración glomerular (GFR) mediante inyección de inulina al ratón y medición de su desaparición. En la eutanasia, se puede extraer sangre mediante punción intracardiaca y se pueden determinar los niveles de DKK1, FGF23, osteocalcina, PTH y calcitriol, junto con los niveles de calcio sérico, Pi, nitrógeno ureico en sangre (BUN), galactosa y colesterol.
Se pueden analizar las aortas de los animales ldlr-/-CKD alimentados con dieta rica en grasa. Se pueden obtener
15 los niveles de calcio aórtico total y las secciones microscópicas con tinción de von Kossa. Las aortas se pueden procesar para obtener ARN para análisis de la expresión génica aórtica. Las aortas se pueden procesar para inmunohistoquímica. A las 22 semanas, en el modelo de CKD descrito anteriormente, la edad de eutanasia para los grupos B y C, la calcificación vascular se consolida y la enfermedad ósea adinámica está presente a pesar del hiperparatiroidismo secundario. Entre las 22 y 28 semanas, la calcificación vascular es progresiva y los efectos de la
20 presencia de hormona paratiroidea comienzan a aumentar las superficies osteoblásticas.
El estudio descrito en este ejemplo se puede usar para determinar los efectos de la inhibición de ActRIIA sobre la calcificación vascular, las velocidades de remodelación ósea y el hiperparatiroidismo observados en sujetos con CKD.
Tabla 6: Información de las secuencias
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 1
- Polipéptido precursor de ActRIIA humano
- 2
- Secuencia de polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular) procesado
- 3
- Secuencia de polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos C-terminales
- 4
- Secuencia de ácido nucleico que codifica la proteína precursora de ActRIIA humano
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 5
- Secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular)
- 6
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIA fusionado a un dominio Fc
- 7
- Dominio extracelular de
- ActRIIA humano fusionado a un dominio Fc humano
- 8
- Secuencia líder de melitina de abeja melífera (HBML) MKFLVNVALVFMVVYISYIYA
- 9
- Secuencia líder de activador del plasminógeno tisular (TPA) MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSP
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 10
- Líder de ActRIIA nativo MGAAAKLAFAVFLISCSSGA
- 11
- Secuencia Nterminal de ActRIIA-hFc y ActRIIA-mFc ILGRSETQE
- 12
- Proteína ActRIIA con deleción de los 15 aminoácidos Cterminales del dominio extracelular de ActRIIA
- 13
- ActRIIA-hFc sin procesar con secuencia líder de TPA
- 14
- Secuencia de ácido nucleico que codifica ActRIIA-hFc sin procesar con secuencia líder de TPA
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 15
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 4 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25130 de la SEQ ID NO: 28) y con una mutación
- L79D
- 16
- Secuencia de proteína precursora de ActRIIB humano (A64)
- 17
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 19134 de la SEQ ID NO: 16)
- 18
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos C-terminales (aminoácidos 19119 de la SEQ ID NO: 16)
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 19
- Secuencia de ácido nucleico que codifica una proteína precursora de ActRIIB (A64) humano
- 20
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB (A64; SEQ ID NO: 17) fusionado a un dominio Fc
- 21
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- ActRIIB (A64) con deleción de los 15 aminoácidos Cterminales (SEQ ID NO: 18) fusionado a un dominio Fc
- 22
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 5 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25129 de la SEQ ID NO: 28) y con una mutación L79D
- 23
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 28) y con una mutación L79D
- 24
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc sin procesar con deleción de los
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 28), con una mutación L79D y con secuencia líder de TPA
- 25
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc procesada con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 28) y con una mutación L79D
- 26
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 16)
- 27
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos C-terminales (aminoácidos 20119 de la SEQ ID NO: 16)
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 28
- Secuencia de proteína precursora de ActRIIB humano (R64)
- 29
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 19134 de la SEQ ID NO: 28)
- 30
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos C-terminales (aminoácidos 19119 de la SEQ ID NO: 28)
- 31
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 28)
- 32
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado
- con deleción de los 15 aminoácidos Cterminales (aminoácidos 20119 de la SEQ ID NO: 28)
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 33
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 16) y con una mutación L79D
- 34
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc sin procesar con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 16), con una mutación L79D y con secuencia líder de TPA
- 35
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc procesada con deleción de los 6 aminoácidos Nterminales del dominio EC
- y deleción de los 3 aminoácidos Cterminales del dominio EC (aminoácidos 25131 de la SEQ ID NO: 16) y con una mutación L79D
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 36
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 28) con mutación L79D
- 37
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 16) con mutación L79D
- 38
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 28) con mutación L79D fusionado a un dominio Fc con un conector GGG
- 39
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 16) con mutación L79D
- fusionado a un dominio Fc
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 40
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 28) con mutación L79D fusionado a un dominio Fc y con secuencia líder de TPA
- 41
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado (aminoácidos 20134 de la SEQ ID NO: 16) con mutación L79D fusionado a un dominio Fc y con secuencia líder de TPA
- 42
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la secuencia Cterminal (desvelado en el documento WO2007/053775)
- 43
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la secuencia Cterminal (desvelado en el documento
- WO2007/053775) que tiene una mutación L79D
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 44
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la secuencia Cterminal (desvelado en el documento WO2007/053775) que tiene una mutación L79D fusionado a un dominio Fc con un conector TGGG
- 45
- Secuencia de ácido nucleico que codifica la SEQ ID NO: 24
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 46
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB (R64; SEQ ID NO: 29) fusionado a un dominio Fc
- 47
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB (R64) con deleción de los 15 aminoácidos Cterminales (SEQ ID NO: 30) fusionado a un dominio Fc
- 48
- Proteína precursora GDF11 sin procesar en su longitud total, es decir, preproteína GDF11
- 49
- Secuencia de ácido nucleico que codifica la SEQ ID NO: 48
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 50
- Propéptido GDF11 de proteína GDF11 humana
- 51
- Secuencia de ácido nucleico que codifica la SEQ ID NO: 50
- 52
- Proteína GDF11 humana madura
- SEQ ID NO:
- Descripción Secuencia
- 53
- Secuencia de ácido nucleico que codifica la SEQ ID NO: 52
- 54
- Dominio extracelular de ActRIIA murino fusionado a un dominio Fc murino («mActRIIA-Fc») Equivalente murino de la SEQ ID NO: 7. Comprende IgG2a murina fusionada al dominio extracelular de ActRIIA.
LISTADO DE SECUENCIAS
<110> Celgene Corporation, Washington University, Victor Schorr Sloan, Keith Hruska, Yifu Fang
<120> ANTAGONISTAS DE ACTIVINA-ACTRII Y USOS PARA EL TRATAMIENTO DE TRASTORNOS ÓSEOS Y OTROS TRASTORNOS
<130> 12827-375-228
<140> 10 <141>
<150> 61/721,898
<151>
<150> 61/740,665 15
<151>
<160> 53
20 <170> FastSEQ para Windows versión 4.0
<210> 1
<211> 513 25 <212> PRT
<213> Homo sapiens
<220> 30 <223> Polipéptido precursor de ActRIIA humano
<400> 1 <210> 2
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular) procesado 10
<400> 2
- 15
- <210> 3 <211> 100 <212> PRT <213> Secuencia artificial
- 20
- <220> <223> Secuencia de polipéptido aminoácidos C-terminales ActRIIA humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15
<400> 3
<211> 1542
<212> ADN
<213> Homo sapiens
10 <220>
<223> Precursor de ActRIIA humano
<400> 4
<210> 5
<211> 345
<212> ADN
- <213>
- Homo sapiens 20
<220>
<223> Polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular)
<210> 6
<211> 225
<212> PRT
- <213>
- Secuencia artificial 5
<220>
<223> Constructo sintético: proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIA fusionado a un dominio Fc
10 <220>
<221> MOD_RES
<222> (43)..(43)
<223> Asp o Ala
15 <220>
<221> MOD_RES
<222> (100)..(100)
<223> Lys o Ala
20 <220>
<221> MOD_RES
<222> (212)..(212)
<223> Asn o Ala
25 <400> 6
30 <210> 7
<211> 344
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
35 <220>
<223> Constructo sintético: domino extracelular de ActRIIA humano fusionado a un dominio Fc humano
<400> 7 5 <210> 8
<211> 21
<212> PRT
<213> Apis mellifera
10 <220>
<223> Secuencia líder de melitina de abeja melífera
<400> 8
<210> 9
<211> 22
<212> PRT
<213> Desconocida 20
<220>
<223> Secuencia líder de activador del plasminógeno tisular (TPA)
<400> 9 <210> 10
<211> 20
5 <212> PRT
<213> Desconocida
<220>
<223> Líder de ActRIIA nativo 10
<400> 10
<210> 11 15 <211> 9
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220> 20 <223> Constructo sintético: secuencia N-terminal de ActRIIA-hFc y ActRIIA-mFc
<400> 11
25 <210> 12
<211> 329
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
30 <220>
<223> Constructo sintético: proteína ActRIIA-Fc con deleción de los 15 aminoácidos C-terminales del dominio extracelular de ActRIIA
<400> 12 <210> 13
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Constructo sintético: ActRIIA-hFc sin procesar con secuencia líder de TPA 10
<400> 13 <210> 14
<211> 1114
5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Constructo sintético: ActRIIA-hFc sin procesar con secuencia líder de TPA 10
<400> 14
<210> 15
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Constructo sintético: secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción 10 de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y deleción de los 4 aminoácidos C-terminales del dominio EC
<400> 15
15 <210> 16
<211> 512
<212> PRT
<213> Homo sapiens
20 <220>
<223> Polipéptido precursor de ActRIIB humano
<400> 16
<210> 17
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado 10
<400> 17 15 <210> 19
- 5
- <210> 18 <211> 101 <212> PRT <213> Secuencia artificial
- 10
- <220> <223> Secuencia de polipéptido aminoácidos C-terminales ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15
- <400> 18
<211> 1539
<212> ADN
<213> Homo sapiens
20 <220>
<223> Precursor de ActRIIB (A64) humano
<400> 19
<210> 20
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Constructo sintético: proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB fusionado 10 a un dominio Fc
<400> 20
<210> 21
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Constructo sintético: proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB (A64) con 10 deleción de los 15 aminoácidos C-terminales fusionado a un dominio Fc
<210> 22
<211> 105
<212> PRT 20 <213> Secuencia artificial <220>
<223> secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y deleción de los 5 aminoácidos C-terminales del dominio EC y con una mutación L79D
<400> 22
<210> 23
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos 15 N-terminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC y con una mutación L79D
<400> 23
20 <210> 24
<211> 360
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
25 <220>
<223> Proteína de fusión ActRIIB-Fc sin procesar con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC, con una mutación L79D y con secuencia líder de TPA
<400> 24 <210> 25
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc procesada con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y 10 deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC y con una mutación L79D
<400> 25
<210> 26
<213> Homo sapiens
<220>
- <223>
- Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado 10
<400> 26
<210> 28
<213> Homo sapiens
<220>
- <223>
- Polipéptido precursor de ActRIIB humano 20
<400> 28
<210> 29
<213> Homo sapiens
<220>
- <223>
- Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado 10
- <210> 27
- <211> 100
- <212> PRT
- <213> Secuencia artificial
- 5
- <220>
- <223>
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15
- aminoácidos C-terminales
- 10
- <400> 27
<400> 29 15 <210> 31
- 5
- <210> 30 <211> 101 <212> PRT <213> Secuencia artificial
- 10
- <220> <223> Polipéptido terminales ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos C
- <400> 30
<211> 115
<212> PRT
<213> Homo sapiens
20 <220>
<223> Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado
<210> 32
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 15 aminoácidos Cterminales
<400> 32
10 <210> 33
<211> 107
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
15 <220>
<223> Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC y con una mutación L79D
<210> 34
<211> 360
<212> PRT 25 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Proteína de fusión ActRIIB-Fc sin procesar con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y
deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC, con una mutación L79D y con secuencia líder de TPA 30
<400> 34 <210> 35
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Proteína de fusión ActRIIB-Fc procesada con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y 10 deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC y con una mutación L79D
<400> 35
<210> 36
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) con mutación L79D 10
<400> 36
<210> 37
<211> 115
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) con mutación L79D
<210> 38
<211> 343
<212> PRT 15 <213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con mutación L79D fusionado a
un dominio Fc con un conector GGG 20
<400> 38 <210> 39
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con mutación L79D fusionado a 10 un dominio Fc
<400> 39
<210> 40
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con mutación L79D fusionado a 10 un dominio Fc y con secuencia líder de TPA
<400> 40
<210> 41
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado con mutación L79D fusionado a 10 un dominio Fc y con secuencia líder de TPA
<400> 41
<210> 42
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Polipéptido ActRIIA humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la secuencia C10 terminal
<400> 42
15 <210> 43
<211> 141
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la secuencia Cterminal que tiene una mutación L79D
<210> 44
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Secuencia de polipéptido ActRIIB humano soluble (extracelular) procesado que tiene una variante de la 10 secuencia C-terminal que tiene una mutación L79D fusionado a un dominio Fc con un conector TGGG
<400> 44 <210> 45
<211> 1083
5 <212> ADN
<213> Secuencia artificial
<220>
<223> Proteína de fusión ActRIIB-Fc sin procesar con deleción de los 6 aminoácidos N-terminales del dominio EC y 10 deleción de los 3 aminoácidos C-terminales del dominio EC, con una mutación L79D y con secuencia líder de TPA
<400> 45
15 <210> 46
<211> 344
<212> PRT
<213> Secuencia artificial
20 <220>
<223> Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB fusionado a un dominio Fc
<400> 46
<210> 47
<213> Secuencia artificial
<220>
- <223>
- Proteína de fusión que comprende un dominio extracelular soluble de ActRIIB (R64) con deleción de los 15 10 aminoácidos C-terminales fusionado a un dominio Fc
<400> 47
<210> 48
<213> Desconocida
<220>
- <223>
- Proteína precursora GDF11 sin procesar en su longitud total (preproteína GDF11) 10
<400> 48 <210> 49
<211> 1221
5 <212> ADN
<213> Desconocida
<220>
<223> Proteína precursora GDF11 sin procesar en su longitud total (preproteína GDF11) 10
<400> 49
15 <210> 50
<211> 274
<212> PRT
<213> Homo sapiens
20 <220>
<223> Propéptido GDF11 de proteína humana GDF11
<400> 50
5 <210> 51
<211> 822
<212> ADN
<213> Homo sapiens
10 <220>
<223> Propéptido GDF11 de proteína humana GDF11
<400> 51
<210> 52
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Proteína GDF11 humana madura
<400> 52
5 <210> 53
<211> 327
<212> ADN
<213> Homo sapiens
<223> Propéptido GDF11 de proteína humana GDF11
<400> 53
Claims (10)
- REIVINDICACIONES1. Un Inhibidor de ActRII para su uso en un método para el tratamiento de la calcificación vascular en un sujeto, donde dicho inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada delgrupo que consiste en: a) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; b) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; c) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 2; d) SEQ ID NO: 2; e) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; f) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; g) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 3; h) SEQ ID NO: 3; i) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; j) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; k) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 6; 1) SEQ ID NO: 6; m) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; n) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; o) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 7; p) SEQ ID NO: 7; q) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 12; r) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 12; s) 98% idéntica a la SEQ ID NO: 12; t) SEQ ID NO: 12; u) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 17; v) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 17; w) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 17; x) SEQ ID NO: 17; y) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 20; z) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 20; aa) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 20; bb) SEQ ID NO: 20; cc) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 21; dd) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 21; ee) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 21; ff) SEQ ID NO: 21; gg) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 23;hh) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 23;ii) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 23;jj) SEQ ID NO: 23;kk) 90 % idéntica a la SEQ ID NO: 25;5 ll) 95 % idéntica a la SEQ ID NO: 25;mm) 98 % idéntica a la SEQ ID NO: 25;nn) SEQ ID NO: 25;odonde el inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:7.10 2. El inhibidor de ActRII para su uso en la reivindicación 1, donde dicho inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
- 3. El inhibidor de ActRII para su uso en la reivindicación 1, donde dicho inhibidor de ActRII es un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25.
- 4. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde el método es para 15 reducir los niveles de calcio vascular en el sujeto.
- 5. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde dicho inhibidor de ActRII reduce o mejora uno o más síntomas de calcificación vascular, donde dichos uno o más síntomas son un aumento de los niveles de calcio vascular, aumento de la apoptosis de las células del músculo liso vascular, pérdida de elasticidad arterial, un aumento de la velocidad de onda de pulso arterial, desarrollo de hipertrofia ventricular20 izquierda, reducción de la perfusión de la arteria coronaria e isquemia miocárdica.
-
- 6.
- El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, donde el inhibidor de ActRII se administra por vía parenteral.
-
- 7.
- El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene menos de 18 años.
25 8. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene nefropatía terminal. - 9. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto se está sometiendo a diálisis.
- 10. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene 30 nefropatía crónica.
-
- 11.
- El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene hipertensión.
-
- 12.
- El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene hipercolesterolemia.
35 13. El inhibidor de ActRII para su uso en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, donde el sujeto tiene diabetes.96 97 98100 101
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