ES2343201T3 - Vacunas contra el srrp. - Google Patents

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Abstract

Vacuna contra el Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino (SRRP), que comprende el virus de SRRP vivo, caracterizada porque contiene una o varias de las cepas del virus de SRRP que se han depositado el 27 de octubre de 2004 en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC), Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, Gran Bretaña, con los números de entrada ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704, opcionalmente junto con un vehículo farmacéuticamente aceptable, pero no la cepa depositada con el número de entrada ECACC 04102701.

Description

Vacunas contra el SRRP.
Antecedentes de la invención 1. Campo técnico
La presente invención pertenece al campo de las vacunas contra enfermedades infecciosas. Más particularmente, se refiere a vacunas contra el Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino (SRRP), una enfermedad vírica que afecta a los cerdos.
2. Información antecedente
El Virus del Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino (VSRRP) es un virus de ARNss de cadena (+) que pertenece a la familia Arteriviridae. El virus existe en forma de dos genotipos denominados tipo "US" y tipo "EU" que comparten aproximadamente el 50% de homología de secuencia (Dea S y col. (2000). Arch Virol 145:659-88), y que se pueden distinguir por sus propiedades inmunológicas. La mayor parte de la información de la secuenciación de diversos materiales aislados se basa en las proteínas estructurales, es decir, la proteína de la envoltura GP5 que justifica sólo \sim 4% del genoma vírico, mientras que se conoce sólo poco de las proteínas no estructurales (nsp, del inglés "non-structural proteins").
La proteína nsp2 tiene 1078 aminoácidos en el Virus Lelystad (VL), prototipo del tipo EU y sólo comparte 32% de homología con VSRRP-US (Allende R y col. (1999). J Gen Virol 80:307-15). Induce anticuerpos séricos durante la infección natural (Oleksiewicz MB y col. (2001a). J Virol 75:3277-90, Oleksiewicz MB y col. (2001b). Vet Microbiol 81:109-25), parece tener un papel crucial en la replicación vírica (Snijder EJ y col. (2001). J Gen Virol 82:985-94, van der Meer Y y col. (1998). J Virol 72:6689-98) y se cree que tiene funciones específicas de la especie (de Vries AAF y col. (1997). Seminars in Virology 8:33-47). La secuencia de nucleótidos que codifica la secuencia de aminoácidos de nsp2 está representada en SEQ ID NO: 2. Variaciones en la longitud de la región codificadora de nsp2 sólo se han descrito hasta la fecha para un material aislado de tipo US (Shen S y col. (2000). Arch Virol 145:871-83) y para las cepas de tipo EU encontradas en US (Fang Y y col. Virus Res. 2004 Mar 15;100(2):229-35, Ropp SL y col. J Virol. Abril 2004;78(7):3684-703).
El aislamiento de VSRRP y la preparación de vacunas se han descrito en diversas publicaciones (documentos WO 92/21375, WO 93/06211, WO 93/03760, WO 93/07898, WO 96/36356, EP 0 676 467, EP 0 732 340, EP 0 835 930). El documento WO 96/36356 describe una vacuna viva y atenuada contra PRRS. Allende R y col. (2000), Arch Virol 145:1149-1161 compararon la secuencia genómica de una vacuna atenuada contra PRRSV con la de su parental VR-2332 y con la cepa patógena 16244B, e identificaron nueve cambios de aminoácidos. Shen y col. (2000), Arch Virol 145:871-883 determinaron la secuencia de nucleótidos de una cepa de vacuna contra SRRP e identificaron un gen Nsp2 con una única inserción. Fang y col. (2004), Virus Res. 100:229-235 informaron sobre una heterogeneidad de la secuencia en Nsp2 de VSRRP similar al europeo, aislado en los Estados Unidos de América.
Todavía existe la necesidad de proporcionar vacunas con características mejoradas, en particular en relación con la eficacia y la seguridad.
Breve sumario de la invención
La presente invención se refiere a vacunas mejoradas, del tipo vivas modificadas de SRRP, de genotipo Europeo y a nuevas cepas de VSRRP que se pueden utilizar para la preparación de tales vacunas. En particular, la invención proporciona cepas mejoradas del virus de SRRP que se han depositado en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC, del inglés "European Collection of Cell Cultures") con los números de orden ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1: Gel de agarosa (2% de agarosa, teñido con bromuro de etidio) de productos de RT-PCR obtenidos a partir de la región nsp2 (pos. 2068 - 2713) de un material aislado similar a Lelystad (pista 1), Porcilis® PRRS (pista 2) y testigo negativo (pista 3). Pista 4: escalera de 100 pb. Los productos de Porcilis® PRRS (banda doble en 434 y 416 pb y una banda en 347 pb) son menores que el producto similar a LV (569 pb).
Figura 2: Productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de una selección de placas después de un pase sobre el un cultivo de células Ma104.
Figura 3: Secuencia de nucleótidos de una placa representativa de cada variante de longitud, comparada con la secuencia de nucleótidos del Virus Lelystad (LV) prototipo de la cepa.
Figura 4: Productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de diferentes muestras de las dos cerdas que muestran un fracaso reproductor después de la vacunación con Porcilis® PRRS y sus descendientes.
Figura 5: Los productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de muestras clínicas de lechones de 6 semanas de edad, vacunados con Porcilis® PRRS. El círculo muestra las muestras de cerdos con la enfermedad PMWS.
Figura 6A: Secuencia de nucleótidos de los productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de diferentes muestras de campo que muestran la misma deleción de 222 nucleótidos que un grupo de placas obtenidas a partir del frasco de la vacuna Porcilis PRRS (p. ej. la placa P45), comparada con la secuencia de longitud completa (similar a Lelystad) de la placa 36 obtenida a partir de Porcilis.
Figura 6B: Secuencia de nucleótidos de los productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de diferentes muestras de campo que muestran la misma deleción de 135 nucleótidos que un grupo de placas obtenidas a partir del frasco de la vacuna Porcilis PRRS (p. ej. la placa P27), comparada con la secuencia de longitud completa (similar a Lelystad) de la placa 36 obtenida a partir de Porcilis.
Figura 6C: Secuencia de nucleótidos de los productos de la PCR de nsp2 obtenidos a partir de diferentes muestras de campo que muestran la misma deleción de 153 nucleótidos que un grupo de placas obtenidas a partir del frasco de la vacuna Porcilis PRRS (p. ej. la placa 31), comparada con la secuencia de longitud completa (similar a Lelystad) de la placa 36 obtenida a partir de Porcilis.
Descripción detallada de la invención
La presente invención se refiere a vacunas mejoradas contra el SRRP. En particular, la invención se refiere a vacunas vivas modificadas (VVM). Una vacuna viva modificada se caracteriza porque contiene virus vivos que se pueden replicar en cerdos, pero que no ejercen síntomas clínicos de SRRP o sólo pocos síntomas moderados de la enfermedad. Además, después de la administración se induce una respuesta inmune en los cerdos que conduce generalmente a un grado significativo de protección contra una infección posterior con virus patógenos de SRRP. Los virus que muestran tales características se denominan generalmente virus atenuados. En general, el virus atenuado se puede generar a partir de material aislado de virus patógenos, haciendo pases repetidos en células hospedadoras adecuadas, hasta que muestra las propiedades deseadas (documentos WO 92/21375, WO 93/06211, WO 93/03760, WO 93/07898, WO 96/36356, EP 0 676 467, EP 0 732 340, EP 0 835 930). Alternativamente, se puede generar por ingeniería genética, mediante el uso de un clon infeccioso, normalmente un transcrito de ADN complementario de longitud completa del genoma vírico (documentos WO 98/18933, EP 1 018 557, WO 03/062407, Nielsen y col., J Virol 2003, 77:3702-3711). En una realización preferida, la presente invención se refiere a un VVM que contiene virus del SRRP con genotipo Europeo.
La presente invención se basa en el hallazgo inesperado de que la seguridad y la eficacia de un MMV de SRRP se pueden mejorar, si se tiene cuidado de que el virus utilizado para la vacuna no muestre ciertas deleciones en la secuencia de nsp2. Más específicamente, un virus de acuerdo con la invención debe contener una secuencia de nucleótidos de SEQ ID NO: 1 o una secuencia de nucleótidos que difiera de SEQ ID NO: 1 en 1, 2, 3, 4 o 5 nucleótidos (tanto sustituciones y deleciones como inserciones), como parte de una secuencia codificadora de nsp2 parcial o completa. En otras palabras, los nucleótidos que se corresponden con los nucleótidos nºs. 145 a 163 de la SEQ ID NO: 1 no deben estar suprimidos en dicho virus.
Las cepas de virus atenuados que se pueden utilizar para las vacunas de acuerdo con la presente invención, han sido depositadas por Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH, bajo el Tratado de Budapest, el 27 de octubre de 2004, en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC), Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, Gran Bretaña, con los números de entrada 04102703 (VSRRP bs104-P27), 04102702 (VSRRP bs104-P31) y 04102704 (VSRRP bs104-P36). Una vacuna de acuerdo con la presente invención no debe contener, sin embargo, una cepa del virus depositado en la ECACC el mismo día, bajo las mismas condiciones, con el número de entrada 04102701 (VSRRP bs104-P45). Las cepas depositadas se han obtenido por purificación de placas a partir de un producto de vacuna a disposición comercial (Porcilis PRRS, Intervet Deutschland GmbH, Unterschleißheim), tal y como se describe en los ejemplos. Se encontró de forma inesperada que dicho producto comprendía cuatro subclones, teniendo tres de estos clones (ECACC04102703, ECACC04102702 o ECACC 04102704) las características deseadas de acuerdo con la presente invención, volviéndoles adecuados como ingredientes de preparaciones de vacunas mejoradas, mientras que el cuarto clon (ECACC04102701) tiene una deleción no deseada en nsp2.
En un aspecto, la presente invención es una cepa del virus de SRRP que es una cualquiera de las cepas del virus de SRRP que se han depositado el 27 de octubre de 2004, en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC), Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, Gran Bretaña, con los números de entrada ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704. La invención puede tomarse para que se extienda a cepas de virus del SRRP que se han obtenido a partir de las cepas depositadas, mediante propagación o multiplicación en una forma idéntica, en particular los descendientes que poseen las características de las cepas depositadas. Después de una propagación continuada, las cepas pueden adquirir mutaciones, la mayoría de las cuales no alterará significativamente las propiedades de estas cepas.
Para un experto está claro que las cepas de la invención se pueden modificar para impartir otras propiedades deseables a las mismas. Esto se puede conseguir mediante técnicas convencionales de propagación y selección, tales como la propagación continuada en células hospedadoras adecuadas para extender el fenotipo atenuado. Esto se puede conseguir adicionalmente por mutación dirigida a la secuencia de ácido nucleico del genoma de estas cepas mediante técnicas adecuadas de ingeniería genética. Tal y como se ha detallado anteriormente, en tales técnicas se emplea generalmente la construcción de copias de ADN complementario de longitud completa (clones infecciosos) del genoma vírico que se puede modificar entonces mediante métodos de recombinación y de manipulación del ADN (tales como mutagénesis dirigida al sitio, etc.). De este modo, se pueden modificar, por ejemplo, sitios antigénicos o propiedades enzimáticas de las proteínas víricas. Clones infecciosos de las cepas del virus de SRRP de genotipo Europeo y Norteamericano, han sido descritos en la bibliografía, véanse las referencias citadas anteriormente.
Las cepas de virus de SRRP adecuadas para las vacunas de la invención se pueden hacer crecer y recoger por métodos conocidos en la técnica, p. ej., mediante propagación en células hospedadoras adecuadas, tales como la línea de células de simio MA-104, células Vero o macrófagos alveolares porcinos, tal y como se describe en los ejemplos.
Las vacunas que comprenden una cualquiera de las cepas de VSRRP ECACC04102703, ECACC04102702 o ECACC04102704, así como cualquier combinación de estas cepas, pero no la cepa ECACC04102701 de VSRRP, constituyen las realizaciones preferidas de la presente invención. Preferentemente, las vacunas de acuerdo con la presente invención son vacunas vivas modificadas que comprenden una o varias de estas cepas vivas en un vehículo adecuado, pero también se puede utilizar un virus inactivado para preparar vacunas con virus muerto (VM). Las VVM se formulan típicamente para permitir la administración de 10^{1} a 10^{7} partículas víricas por dosis, preferentemente 10^{3} a 10^{5} partículas por dosis, más preferentemente 10^{4} a 10^{5} partículas por dosis (4,0-5,0 log_{10} TCID_{50}). Los VM se pueden formular basándose en un título de preinactivación de 10^{3} a 10^{10} partículas víricas por dosis. La vacuna puede comprender un vehículo farmacéuticamente aceptable, por ejemplo, una solución salina fisiológica. La vacuna puede comprender o no un coadyuvante. Un ejemplo de coadyuvante adecuado es acetato de \alpha-tocoferol que se puede obtener bajo la marca Diluvac Forte®. Alternativa mente, se pueden utilizar, por ejemplo, coadyuvantes a base de alumbre.
Una vacuna de acuerdo con la presente invención se puede presentar en forma de una preparación liofilizada del virus vivo, que se va a reconstituir en un disolvente, para dar como resultado una solución para inyección. El disolvente puede ser, p. ej., agua, solución salina fisiológica o tampón, o un disolvente coadyuvante. El disolvente puede contener coadyuvantes, por ejemplo, acetato de \alpha-tocoferol. La vacuna reconstituida se puede inyectar a continuación en un cerdo, por ejemplo, en forma de inyección intramuscular o intradérmica en el cuello. Para la inyección intramuscular, se puede aplicar un volumen de 2 ml, para una inyección intradérmica es típicamente de 0,2 ml. En un aspecto adicional, la presente invención es, por tanto, un producto de vacuna que comprende en recipientes separados, una composición liofilizada del virus y un disolvente para la reconstitución y, opcionalmente, contiene, además, un folleto o una etiqueta con las instrucciones de uso.
Una vacuna de acuerdo con la presente invención puede no sólo comprender una o varias de las cepas mencionadas anteriormente, sino también puede incluir otros componentes activos contra el SRRP u otras enfermedades porcinas víricas o bacterianas, tales como el circovirus porcino o el virus de la fiebre porcina clásica. Por consiguiente, la invención se refiere adicionalmente a una vacuna tal y como se ha descrito, caracterizada porque contiene al menos un antígeno adicional activo contra una porque contiene al menos un antígeno adicional activo contra una enfermedad porcina que no es el SRRP.
Ejemplos 1. Materiales y Métodos 1.1. Infección experimental de cerdas preñadas con Porcilis® PRRS Diseño del estudio
Catorce cerdas sanas preñadas de una piara que se había confirmado negativa para VSRRP (sometida a ensayo virológico y serológico) se emplearon en este estudio. Las cerdas habían hecho frente a uno o a dos partos y se había confirmado que estaban preñadas en el momento de la vacunación/infección de estimulación el día 94 (+/-3) de la gestación. Se dividieron en tres grupos de tratamiento (tabla 1). El primer grupo se trató con una dosis comercial de Porcilis® PRRS de 2 ml que contenía al menos 10^{4,0} de TCID_{50} i.m., el día 94 (+/- 3) de la gestación. El grupo testigo de la estimulación (grupo 2) recibió una dosis de 10^{4,72} de TCID_{50} en 2 ml de medio de cultivo del material aislado de campo 92045 de la cepa Europea patógena, por vía intranasal. El grupo 3 se vacunó con la dosis comercial de 2 ml que contenía 10^{4,0} de TCID_{50} i.m. de Ingelvac PRRS MLV, siete días antes de la inseminación y se estimuló con el material aislado de campo 92045, de la cepa Europea (10^{4,72} de TCID_{50} en 2 ml de medio de cultivo celular, i.n.) el día 94 (+/- 3) de la gestación.
Los animales del grupo 1 se vigilaron hasta el día 5 posterior al parto. Los animales de los grupos 2 y 3 se vigilaron hasta el día 28 posterior al parto.
Fase animal
Todas las cerdas se acostumbraron a las instalaciones animales, 1 semana antes de la vacunación. En las cerdas y en los lechones, el investigador observó su estado de salud general, una vez al día. Cada animal que moría o que sufría eutanasia, se sometió a un examen post-mortem y a posteriores análisis de laboratorio.
La preñez se confirmó con examen con ultrasonidos. El suero de las cerdas se obtuvo los días de estudio 0, 7, 14 y en el parto, para los análisis con PCR y ELISA. Cualquier material que se asociaba con un aborto, se sometió a pruebas de laboratorio.
En todos los lechones que nacieron muertos se realizó una patología completa de rutina. Se recogieron muestras de tejido pulmonar de todos los lóbulos pulmonares de los lechones que nacieron muertos y de los momificados. Las muestras para el ensayo de la PCR se almacenaron a -70ºC. Se recogieron 2 ml de sangre previa al calostro de cada lechón el día del parto. Se preparó el suero y se almacenaron partes alícuotas a -70ºC. El suero se empleó para someter a ensayo la viremia, para evaluar la infección transplacental. Todos los lechones del grupo 1 que sobrevivieron hasta el día 5, se sometieron a eutanasia con una edad de 5 días.
Parámetros clínicos y de comportamiento reproductor
Se investigaron los siguientes criterios principales (por orden de prioridad): número de lechones nacidos vivos por camada, número de lechones nacidos muertos por camada, número de fetos momificados por camada y número de lechones supervivientes hasta una edad de 5 o 28 días, respectivamente. El número de lechones que nacieron virémicos se determinó empleando un suero previo al calostro. La frecuencia de las muestras de sangre y de tejido que eran positivas para la PCR, procedentes de cerdas y/o lechones, se investigó para evaluar la epidemiología y el curso de la infección.
1.2 Muestras de campo
Las muestras de campo investigadas en este estudio se tomaron a partir de sangre, suero y diversos materiales orgánicos, la mayoría pulmones y nódulos linfáticos, con diagnóstico rutinario de VSRRP, procedentes de diferentes países europeos. Las muestras se almacenaron a -20ºC durante un máximo de 3 días antes de la preparación del ARN y el material residual se transfirió posteriormente a -70ºC para un almacenamiento a largo plazo. El ARN y los productos de la RT-PCR se almacenaron a -20ºC.
1.3. Cultivo celular
Las células Ma104 (clon CL2621) se dejaron crecer en MEM (Dulbecco, Alemania) suplementado con 10% de FCS y antibióticos.
Los macrófagos alveolares porcinos se recogieron empleando un método descrito por Wensvoort y col. (Wensvoort, G. y col. Vet. Quat. 1991, 13:121-130) y modificado del modo siguiente: en cada lóbulo pulmonar se infundieron 50-100 ml de PBS y a continuación se masajearon durante 3 a 5 min. A continuación, se recogió el fluido del lóbulo y se hizo pasar a través de un filtro de gasa. Este procedimiento se repitió hasta que el fluido de lavado era claro. El fluido de lavado reunido se centrifugó a 500 g durante 15 min. a temperatura ambiente. El sedimento se lavó en PBS y se congelaron partes alícuotas de 1 x 10^{7} células en 50% de RPMI 1640 (Biochrom), 40% de FCS y 10% de DMSO, a - 196ºC. Para un uso posterior, las PAMs se cultivaron en medio RPMI 1640 suplementado con 10% de FCS y antibióticos.
1.4. Preparación de material orgánico para aislar virus en cultivo celular
Se transfirieron aproximadamente 0,5 cm^{3} de material de tejido a un tubo que contenía un homogeneizador de acero de tipo Ballet en 1,8 ml de PBS estéril. Los tubos se agitaron durante 10 minutos hasta que se homogeneizó el material orgánico. Los desechos celulares se sedimentaron centrifugando durante 2 min. a 450 g y a temperatura ambiente. El material sobrenadante se hizo pasar a través de un filtro estéril de tamaño de poro 0,45 \mum y se almacenó a -70ºC. Se emplearon partes alícuotas para inocular un cultivo celular en monocapa y semiconfluente, empleando placas de microtitulación de 24 pocillos.
1.5. Aislamiento del ARN
El ARN procedente del material orgánico, se extrajo con el equipo de reactivos RNeasy Mini Kit y el procedente de suero, plasma, material sobrenadante de cultivos celulares y de solución de vacunas con el equipo de reactivos QIAamp Viral RNA Mini Kit (ambos de Qiagen), según las instrucciones del fabricante, empleando aproximadamente 100 mg de material orgánico y 140 \mul de material fluido, respectivamente, para cada preparación. El ARN se eluyó finalmente en 65 \mul de tampón, tal y como recomendaba el fabricante.
1.6. Purificación en placa de los virus
Monocapas confluentes de células Ma104 en placas de cultivo celular de 10 cm de diámetro, se sembraron 48 horas antes de ser infectadas, con el virus respectivo en diluciones décuplas desde 10^{-1} hasta 10^{-4}. Las células se incubaron durante 1 hora con las diluciones de virus que a continuación se retiraron y las células se extendieron con 30 ml de medio de Ma104 que contenía 5% de metilcelulosa (Sigma). Las placas se seleccionaron después de cinco a siete días y se transfirieron a monocapas de Ma104 en placas de 24 pocillos. El virus se recogió de estas placas con aproximadamente 50% de CPE y se sometió a un análisis posterior.
1.7. Ensayo inmunofluorescente
Las células se fijaron a -20ºC durante 15 min. empleando acetona enfriada con hielo: metanol (1:1) y a continuación secado al aire. Después de rehidratar en PBS, las células se incubaron con el anticuerpo monoclonal, específico de VSRRP, SDOW17 (Rural Technologies Inc., EE.UU.) diluido 1:1000 en PBS durante 1 hora. Después de 3 lavados con PBS, las células se incubaron con anticuerpo secundario de cabra anti-ratón, conjugado con FITC (Dianova, Hamburg, Alemania) (1:150 en PBS) durante otra hora. Después de 3 lavados finales con PBS, las células se recubrieron con glicerina: solución de PBS (1:1) y se sometieron a microscopía de inmunofluorescencia.
1.8. nRT-PCR para el diagnóstico y PCR de nsp2
Se realizó una RT-nPCR de diagnóstico para comprobar en las muestras la presencia del virus VSRRP-EU; a continuación, las muestras positivas se sometieron a amplificación del fragmento nsp2. Las secuencias de cebadores se enumeran en la tabla 2.
La RT-nPCR para diagnóstico se realizó con el equipo de reactivos Titan One Tube Kit (Roche Molecular Biochemicals) del modo siguiente: [5 \mul de la preparación de ARN total, tampón de 1*RT-PCR, dNTPs 0,4 mM, 20 pmol de cebadores PLS y PLR, ditiotreitol 5 mM, MgCl_{2} 1 mM, 2,5 - 5 U de RNasin (Promega Ltd), 1 - 2,5 U de mezcla de enzimas, ajustado a un volumen final de 25 \mul con agua destilada tratada con DEPC]. Las condiciones de los ciclos eran las siguientes: 45ºC durante 1 hora, 94ºC durante 2 min. y 30 ciclos a 94ºC durante 30 s, 58ºC durante 45 s y 68ºC durante 45 s, etapa de elongación final a 68ºC durante 5 min. La reacción de la PCR anidada se realizó con Qiagen Taq (Qiagen AG) del modo siguiente: [1 \mul del producto de la RT-PCR, tampón de 1*PCR, 10 \mul de solución Q, MgCl_{2} 3,5 mM, dNTPs 0,3 mM, 20 pmol de cada cebador EU-7-n-s y EU-7-n-as, 2,5 U de polimerasaTaq, ajustado a un volumen final de 50 \mul con agua destilada]. Las condiciones de los ciclos eran las siguientes: 7 ciclos a 94ºC durante 1 min., 58ºC durante 1 min. y 72ºC durante 1 min., seguido de 30 ciclos a 94ºC durante 1 min. y 70ºC durante 1,5 min. (sin etapa de reasociación), etapa de elongación final a 70ºC durante 5 min.
Las muestras positivas se sometieron a continuación a la amplificación del fragmento nsp2, empleando PCR con transcripción inversa en una etapa con los cebadores EU-1a-2058-s y EU-1a-2683-as, con el equipo de reactivos de Qiagen, One Step RT-PCR Kit (Qiagen) del modo siguiente: [2 \mul de la preparación de ARN, 5 \mul de tampón de RT-PCR, 5 \mul de solución Q, dNTPs 0,4 mM, 20 pmol de cada cebador, 2,5 - 5 U de RNasin (Promega), 1 \mul de la mezcla de enzimas One Step, ajustado a un volumen final de 25 \mul con agua destilada tratada con DEPC]. Las condiciones de los ciclos eran las siguientes: 50ºC durante 1 hora, 95ºC durante 15 min. y 40 ciclos a 94ºC durante 60 s, 60ºC durante 5 s, 50ºC durante 5 s y 72ºC durante 2 min., etapa de elongación final a 72ºC durante 10 min.
La reacción de la PCR anidada se realizó con la polimerasa Taq (Qiagen) y la pareja de cebadores EU-1a-2061-s + EU-1a-2574-as, del modo siguiente: [1 \mul del producto de RT-PCR, tampón de 1*PCR buffer, 10 \mul de solución Q, MgCl_{2} 3,5 mM, dNTPs 0,6 mM, 20 pmol de cada cebador, 2,5 U de polimerasa Taq, ajustado a un volumen final de 50 \mul con agua destilada]. Las condiciones de los ciclos eran las siguientes: 8 ciclos a 94ºC durante 1 min., 60ºC durante 5 s, 50ºC durante 5 s y 68ºC durante 45 s, seguido de 50 ciclos a 94ºC durante 1 min. y 70ºC durante 1 min. (sin etapa de reasociación), etapa de elongación final a 70ºC durante 5 min. Los cebadores de la PCR anidada se alargaron con etiquetas M13 para facilitar la secuenciación directa de los nucleótidos de los productos de la PCR.
1.9. Secuenciación de nucleótidos
La secuenciación de nucleótidos se realizó sobre los productos de la PCR anidada que se habían generado con cebadores que contenían una marca M13, directamente desde la reacción de la PCR o a partir de los productos de la PCR que se habían escindido de los geles de agarosa y se habían purificado con el equipo de reactivos de extracción en gel JETsorb kit (Genomed). La secuenciación se realizó empleando el secuenciador automático LI-COR DNA Analyzer GENE READIR 4200® (LI-COR Inc., Lincoln, Nebraska, EE.UU.). Las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos deducidos se analizaron con AlignIR®, vs1.1 (LI-COR Inc., Lincoln, Nebraska, EE.UU.) y el paquete de programas de DNASIS® 2.6 (Hitachi Software Genetic Systems Inc., San Francisco, EE.UU.).
2. Resultados 2.1. Análisis de la PCR de un fragmento nsp2 generado a partir de la vacuna Porcilis® PRRS
Un frasco que contenía 10 dosis de la vacuna viva modificada Porcilis® PRRS liofilizada se reconstituyó con 20 ml de PBS estéril. El ARN se preparó a partir de esta solución y el fragmento nsp2 se sometió a amplificación mediante RT-nPCR, tal y como se ha descrito. El ARN procedente de otra cepa Europea de VSRRP similar a Lelystad con secuencia de nucleótidos conocida, se amplificó como testigo positivo en el mismo experimento. Un producto de la amplificación de 569 pb se esperaba para este fragmento, y se obtuvo para la cepa testigo. Sin embargo, la muestra de Porcilis® PRRS no produjo un producto similar. Por el contrario, mostraba una banda doble en un gel de agarosa regular al 2%, con una banda de aproximadamente 430 pb y la otra de aproximadamente 350 pb (véase, la figura 1).
Ambas bandas se purificaron separadamente a partir del gel y a continuación se sometieron a secuenciación de los nucleótidos. Era obvio que ambos productos de la PCR tenían una deleción, comparados con la secuencia de nucleótidos del virus Lelystad; sin embargo, las secuencias obtenidas eran algo ambiguas y el alcance preciso de la deleción no se pudo determinar. Por ello se decidió purificar en placa la vacuna para excluir que las ambigüedades eran debidas a una cepa de la vacuna no homogénea.
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2.2. Caracterización de las placas obtenidas a partir del virus de la vacuna Porcilis® PRRS
De nuevo se reconstituyó un frasco que contenía 10 dosis de la vacuna Porcilis® PRRS liofilizada, con 20 ml de PBS estéril. La solución de la vacuna reconstituida se incubó con monocapas de Ma104 confluentes, con diferentes diluciones, tal y como se ha descrito en Materiales y Métodos y a continuación se recubrieron con medio que contenía metilcelulosa. Se seleccionaron las placas al cabo de 5 a 7 días de incubación y se dejaron crecer en placas de 24 pocillos sobre Ma104 hasta que mostraron una CPE de aproximadamente 50%. El material sobrenadante de los cultivos celulares se recogió a continuación y se almacenó a -70ºC.
Un total de 47 placas se sometió a una prueba adicional. Para ello, se preparó el ARN a partir del material sobrenadante del primer pase sobre placas de 24 pocillos y se utilizó para la amplificación con RT-nPCR del fragmento nsp2. Los productos resultantes de la PCR se analizaron sobre un gel de agarosa al 2%. El resultado se resume en la tabla 3. Además de las poblaciones mezcladas que se debían probablemente a la superposición de las placas, se encontraron cuatro poblaciones específicas (en el intervalo de tamaño desde aproximadamente 569 pb, 434 pb, 416 pb y 347 pb, respectivamente). Los productos de la PCR de algunas placas representativas se muestran en la figura 2.
La secuencia de nucleótidos de una placa representativa de cada grupo se determinó a continuación mediante secuenciación directa de los productos de la RT-nPCR de nsp2 y se obtuvieron los siguientes resultados: placa nº 36: sin deleción en nsp2; placa nº 27: deleción de 135 nt; placa nº 31: deleción de 153 nt; y placa nº 45: deleción de 222 nt. Las secuencias de nucleótidos de estas placas se muestran en la figura 3.
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2.3. Infección experimental de cerdas preñadas con la vacuna Porcilis® PRRS Parámetros reproductores
Después del parto, las cerdas 7062 y 6677 que se habían vacunado con la vacuna Porcilis® PRRS el día 90 de la gestación, mostraban un fracaso reproductor de moderado a grave (véase la tabla 4). La proporción de animales nacidos muertos y débiles era 62,5% en la camada 7062 y 44,4% en la camada 6677. Además, hasta el día 5 posterior al parto, murieron los cuatro lechones que nacieron vivos de la cerda 7062 y todos los lechones nacidos débiles de la cerda 6677. Las observaciones clínicas se enumeran en la tabla 5. En conclusión, 5 días después del parto sólo sobrevivían 29,4% (5 lechones) de los lechones de ambas camadas.
Seis cerdas del grupo 2 parieron después de la infección con el material aislado 92045 del virus de campo de SRRP. 25,3% y 26,4% de los lechones nacieron muertos o momificados, respectivamente. De los 42 lechones que nacieron vivos, 24 (27,6%) lechones nacieron normales y sólo 18 lechones (20,7%) nacieron normales. De forma similar a las camadas de las cerdas vacunadas con Porcilis® PRRS el día 94 (+/-3) de la gestación, sólo 29,9% de los lechones nacidos sobrevivieron.
Las cerdas vacunadas con VVM de Ingelvac PRRS® e infectadas con la exposición similar al grupo 2, parían 72,9% de lechones sanos normales. 16,7% y 6,2% de los lechones nacieron muertos o momificados, respectivamente. Aunque la cerda 6930 perdió todos los lechones hasta los 28 días de edad, sólo 2 lechones de otras camadas murieron durante este periodo. Por tanto, 60,4% de los cerdos vacunados con Ingelvac PRRS® VVM e infectados por exposición al material aislado 92045 altamente patógeno del virus de campo de SRRP, sobrevivieron hasta una edad de 28 días.
Investigación virológica de las muestras clínicas
Los sueros de las cerdas y de los lechones, así como el tejido pulmonar y el fluido corporal de los lechones del grupo 1, se examinaron para estudiar la presencia de VSRRP. Las muestras positivas para la PCR se sometieron a secuenciación de los nucleótidos de los marcos de lectura abierta 5 y 7 y también del fragmento nsp2. Los resultados obtenidos mediante la PCR y el aislamiento del virus se enumeran en la tabla 6.
En las dos cerdas 6677 y 7062 que padecían fallo reproductor, cada muestra positiva de la PCR mostraba una secuencia del ORF 5 y 7 idéntica a Porcilis® PRRS, indicando que en estos animales no era detectable otra cepa de VSRRP. Aunque se encontró el VSRRP en todos los lechones nacidos muertos de la cerda 7062, sólo un lechón nacido muerto de la cerda 6677 (50%) reaccionaba de forma positiva. Todos los lechones que nacieron débiles de la cerda 7062 y 67% de los lechones nacidos débiles, así como 50% de los lechones nacidos sanos y normales de la cerda 6677 proporcionaban resultados positivos en la PCR, que se verificaron como Porcilis® PRRS por análisis de la secuencia, incluso a partir de muestras tomadas antes de la ingesta del calostro. Por tanto, sólo 4 de los 17 lechones (23,5%) eran negativos para Porcilis® PRRS. Para el fragmento nsp2, todas las muestras mostraban una banda fuerte de aproximadamente 347 pb que se corresponde con la variante más corta de los posibles fragmentos de nsp2 que se pueden amplificar a partir de la vacuna Porcilis® PRRS (figura 4). La mayoría de las muestras tenían una banda muy débil de aproximadamente 434 pb; sólo el lechón 7062/4310 tenía una banda doble fuerte.
Para el diagnóstico diferencial, se investigó material orgánico así como suero para el genotipo US de VSRRP y para PPV, BVD, CSFV, BDV, PrV, PCV2, SIV, PEV/PTV, swParamyxoV, EMCV, swHEV así como para Leptospira spp., Chlamydophila spp. y Chlamydia spp. Todas estas pruebas dieron resultados negativos.
Aislamiento de los virus en Ma104 y en macrófagos alveolares porcinos
El material del pulmón procedente de cinco lechones de cada cerda, se sometió a intentos de aislamiento del virus en células Ma104 y en macrófagos alveolares porcinos, escogiendo dos lechones que habían nacido muertos y tres lechones que habían nacido vivos de cada cerda (véase la tabla 6). Una parte alícuota de 30 \mul de suspensión orgánica homogeneizada y filtrada estérilmente, se empleó para inocular un pocillo de células Ma104 y de células de células PAM, respectivamente. Las células se incubaron a 37ºC y 5% de CO_{2} durante 5 días y a continuación se tiñeron en un ensayo inmunofluorescente con el anticuerpo monoclonal específico de VSRRP, SDOW17. De las diez suspensiones orgánicas, cuatro dieron como resultado un efecto citopático y resultados positivos de la tinción en las células Ma104 y PAM. Las seis muestras restantes dieron resultados negativos en ambos tipos de células.
De cada muestra positiva, se preparó un ARN a partir del material sobrenadante del cultivo celular respectivo, procedente de las células PAM y Ma104. El ARN se sometió a RT-nPCR para el ORF 5 y 7, así como para el fragmento nsp2. La secuenciación de los nucleótidos de los productos de la PCR de los ORF 5 y 7 confirmaba el virus como Porcilis® PRRS. El producto de la PCR de nsp2 daba como resultado sin ambigüedad la secuencia de Porcilis® PRRS con la mayor deleción de 222 nucleótidos.
Tomando el resultado de estos experimentos, se puede concluir que la variante representada por la placa 45 y depositada bajo ECACC04102701, es preferentemente responsable de la infección transplacental y la reducción observada del comportamiento reproductor.
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2.4. Análisis del producto de la amplificación de nsp2, obtenida a partir de muestras de campo de cerdos vacunados previamente con la vacuna Porcilis® PRRS a) Muestras procedentes de una granja vacunada con Porcilis PRRS
Una piara negativa para el virus de campo VSRRP en la que se vacunaba regularmente los lechones con Porcilis® PRRS con 6 semanas de edad, fue investigada en relación con VSRRP-EU. Se tomaron diez muestras de cada lechón con cada edad de 4, 7, 9,5 y 13,5 semanas, respectivamente. En el grupo de 9,5 semanas, tres lechones padecieron el Síndrome de desmedro multisistémico post-destete (PMWS, del inglés "Post-weaning Multisystemic Wasting Síndrome") que se correlaciona frecuentemente con el circovirus 2 porcino y la coinfección con SRRP (Ellis y col., Vet Microbiol 2004, 98:159-163). Un producto específico de la RT-nPCR de VSRRP-EU se obtuvo para 1/10, 7/10, 9/10 y 7/10 animales antes de la vacunación, 1 semana después de la vacunación, 3,5 semanas y 7,5 semanas después de la vacunación. Después de amplificar con RT-PCR la región codificadora de nsp2, procedente de muestras positivas para VSRRP, sólo se obtuvieron productos típicos de la PCR de Porcilis® PRRS: 8 muestras proporcionaban sólo el producto de \sim347 pb, 4 muestras sólo el producto de \sim434 pb y 4 muestras la banda doble de 434 y 347 pb. Ninguna muestra proporcionaba el producto similar a Lelystad (véase la figura 5). La región nsp2 se podía amplificar en tres de los cuatro lechones con la enfermedad PMWS, dos de los cuales mostraban el producto de 434 pb y uno el producto de 347 pb.
b) Variación de la longitud de nsp2 en muestras de campo procedente de diagnósticos de rutina
Se sometieron a amplificación del fragmento nsp2 un total de 514 muestras de sangre y tejido que se habían enviado para diagnosticar piaras sospechosas de padecer SRRP y que habían dado positivo en RT-nPCR de rutina para el VSRRP. Los productos de la amplificación se obtuvieron en 41,4% de las 514 muestras. Se encontraron deleciones de longitudes variadas en 30,7% de las muestras analizadas, lo que indica una frecuencia total de 12,7% de las variantes de la deleción de nsp2 en el campo. En la mayoría de los casos, las bandas encontradas mostraban el mismo patrón que el encontrado en la vacuna Porcilis® PRRS, consistente en una banda (doble) de 434 y 416 pb que no se podía diferenciar fácilmente sobre un gel regular de agarosa al 2% o una banda de 347 pb. Por ello, una selección de las muestras se sometió a secuenciación de nucleótidos para comprobar si estos productos de la PCR se obtenían de hecho a partir del virus de la vacuna Porcilis® PRRS. Los resultados se muestran en la figura 6 A-C.
TABLA 1 Grupos de estudio y tratamiento
1
n - número de cerdas; i.m. por vía intramuscular, i.n. por vía intranasal
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TABLA 2 Secuencias de cebadores para generar productos de nsp2 con RT-PCR
2
Para los cebadores anidados de la PCR, las marcas M13 se marcan con itálica, mientras que la secuencia específica de VSRRP de los cebadores está subrayada.
TABLA 3 Resultados de la PCR de nsp2 procedentes de 47 placas después de 1 pase en cultivo de células Ma104
3
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TABLA 4 Comparación de los parámetros reproductores y de producción de cerdas vacunadas con Porcilis® PRRS el día 94 (+/-) con testigos estimulados y vacunados/estimulados
4
TABLA 5 Determinación clínica de los descendientes de las cerdas vacunadas con Porcilis® PRRS el día 90 de la gestación (grupo 1)
5
D = débil, Dep = deprimido, A = anorexia
^{1}El lechón 4305 muere el día 1 debido a un accidente en la toma de sangre.
^{2}Los lechones 4307 y 4308 mueren debido a agalactia.
^{3}El lechón 4310 mostraba señales graves de neumonía.
TABLA 6 Resultados virológicos procedentes de las cerdas vacunadas con Porcilis® PRRS el día 94 (+/- 3) de la gestación y sus camadas
6
nr: no realizado
*:El fragmento de PCR de la PCR para diagnóstico realizada rutinariamente se secuenció
**Todos los materiales reaislados procedentes de MA 104 y PAMs, se secuenciaron en
ORF 5 y ORF 7 y eran idénticos a Porcilis® PRRS
TABLA 7 Historia de las muestras que tienen un producto de la PCR con deleción en nsp2; compárese con la Figura 6A
7
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TABLA 8 Historia de las muestras que tienen un producto de la PCR con deleción en nsp2; compárese con la Figura 6B
8
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TABLA 9 Historia de las muestras que tienen un producto de la PCR con deleción en nsp2; compárese con la Figura 6C
9
<110> Boehringer Ingelheim Vetmedica GMBH
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<120> Vacuna contra SRRP mejorada
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<130> P01-1833
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<160> 11
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<170> PatentIn versión 3.1
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<210> 1
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<211> 18
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<212> ADN
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<213> Virus del Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino
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<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskip
ccaaagttcc ggcgctgc
\hfill
18
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<210> 2
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<211> 533
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<212> ADN
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<213> Virus del Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino
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<400> 2
10
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<210> 3
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<211> 533
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<212> ADN
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<213> Virus del Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino
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<400> 3
11
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<210> 4
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<211> 18
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 4
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\hskip-.1em\dddseqskip
atggccagcc agtcaatc
\hfill
18
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<210> 5
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 5
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\hskip-.1em\dddseqskip
tcgccctaat tgaataggtg
\hfill
20
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<210> 6
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<211> 39
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 6
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\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaaaacga cggccagtat gataaagtcc cagcgccag
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39
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<210> 7
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<211> 40
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 7
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\hskip-.1em\dddseqskip
caggaaacag ctatgaccct gtatgagcaa ccggcagcat
\hfill
40
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
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<211> 23
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 8
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\hskip-.1em\dddseqskip
tgttgaagga ttgtccgagc tcc
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23
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<210> 9
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<211> 21
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 9
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\hskip-.1em\dddseqskip
agatccaaag gcgaactgct g
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21
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
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<211> 38
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 10
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\hskip-.1em\dddseqskip
tgtaaaacga cggccagttg aaggattgtc cgagctcc
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38
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<210> 11
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<211> 38
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<400> 11
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tgtaaaacga cggccagttg aaggattgtc cgagctcc
\hfill
38

Claims (11)

1. Vacuna contra el Síndrome Reproductor y Respiratorio Porcino (SRRP), que comprende el virus de SRRP vivo, caracterizada porque contiene una o varias de las cepas del virus de SRRP que se han depositado el 27 de octubre de 2004 en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC), Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, Gran Bretaña, con los números de entrada ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704, opcionalmente junto con un vehículo farmacéuticamente aceptable, pero no la cepa depositada con el número de entrada ECACC 04102701.
2. Vacuna de la reivindicación 1, que contiene las cepas del virus de SRRP que se han depositado con los números de entrada ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704.
3. Vacuna de la reivindicación 1 o la reivindicación 2, que contiene adicionalmente un coadyuvante.
4. Vacuna de la reivindicación 3, en la que el coadyuvante es acetato de \alpha-tocoferol.
5. Vacuna de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, que comprende una composición liofilizada del virus.
6. Una cepa del virus de SRRP que es una cualquiera de las cepas del virus de SRRP que se han depositado el 27 de octubre de 2004 en la Colección Europea de Cultivos Celulares (ECACC), Porton Down, Salisbury, Wiltshire, SP4 0JG, Gran Bretaña, con los números de entrada ECACC 04102703, ECACC 04102702 y ECACC 04102704.
7. Método para preparar una vacuna, que comprende incorporar por mezcla una o varias cepas del virus de SRRP según la reivindicación 6, con un vehículo farmacéuticamente aceptable.
8. Uso de un virus de SRRP según la reivindicación 6, para la preparación de una vacuna.
9. Producto de vacuna, que comprende en recipientes separados una composición liofilizada según la reivindicación 5, y un disolvente para la reconstitución y opcionalmente contiene, además, un folleto o una etiqueta que comprende las instrucciones de uso.
10. Producto de vacuna de la reivindicación 9, en donde el disolvente contiene un coadyuvante.
11. Vacuna según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, caracterizada porque contiene al menos un antígeno adicional activo contra una enfermedad porcina que no es el SRRP.
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