ES2339456T3 - Derivados de pirrol(2,3-b)piridina activos como inhibidores de quinasa, procedimientos para su preparacion y composiciones farmaceuticas que los comprenden. - Google Patents
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Abstract
Un compuesto de fórmula (I) **(Ver fórmula)** en la que R está seleccionado del grupo constituido por -Ra, -CORa, -CONRaRb, -SO2Ra o -COORa. R1 es un grupo -NRcRd o -ORc; en los que Ra, Rb, Rc y Rd, son el mismo o diferentes, y son cada uno independientemente hidrógeno o un grupo opcionalmente sustituido adicionalmente, seleccionado de alquilo C1-C6 lineal o ramificado, alquenilo C2-C6 lineal o ramificado, alquinilo C2-C6 lineal o ramificado, cicloalquilo C3-C6 o cicloalquilalquilo C1-C6, arilo o arilalquilo C1-C6, o heterociclo o heterocicloalquilo C1-C6 o, tomados conjuntamente con el átomo de nitrógeno al que están unidos, tanto Ra como Rb así como Rc y Rd pueden formar un heterociclo de 4 a 7 miembros opcionalmente sustituido, que contiene opcionalmente un heteroátomo o grupo heteroatómico de anillo adicional seleccionado de S, O, N o NH; o isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
Description
Derivados de
pirrol[2,3-b]piridina activos como
inhibidores de quinasa, procedimientos para su preparación y
composiciones farmacéuticas que los comprenden.
La presente solicitud reivindica beneficio de la
Solicitud de Patente Británica N.º 0330043.1 presentada el 24 de
diciembre de 2003.
La presente invención se refiere a derivados de
pirrolo[2,3-b]piridina activos como
inhibidores de quinasa y, más en particular, se refiere a derivados
de pirrolo[2,3-b]piridina sustituidos
adicionalmente en posición 5, a un procedimiento para su
preparación, a bibliotecas combinatorias de los mismos, a
composiciones farmacéuticas que los comprenden y a su uso como
agentes terapéuticos, en particular en el tratamiento de
enfermedades ligadas a proteinaquinasas desreguladas.
El mal funcionamiento de proteinaquinasas (PK)
es el distintivo de numerosas enfermedades. Una gran parte de los
oncogenes y protooncogenes implicados en cánceres humanos codifican
para PK. Las actividades potenciadas de las PK están también
implicadas en muchas enfermedades no malignas tales como hiperplasia
benigna de próstata, adenomatosis familiar, poliposis,
neurofibromatosis, psoriasis, proliferación de células lisas
vasculares asociada con aterosclerosis, fibrosis pulmonar,
glomerulonefritis artrítica y estenosis
post-quirúrgica y reestenosis.
Las PK están también implicadas en afecciones
inflamatorias y en la multiplicación de virus y parásitos. Se cree
que las PK juegan también un papel principal en la patogénesis y el
desarrollo de enfermedades neurodegenerativas.
Para una referencia general al mal
funcionamiento o desregulación de las PK véase, por ejemplo, Current
Opinion in Chemical Biology 1999, 3, 459-465.
Es un objeto de la invención proporcionar
compuestos que sean útiles en terapia como agentes contra una gran
cantidad de enfermedades causadas por, y/o asociadas a, una
actividad proteinaquinasa desrregulada.
Es otro objeto de la invención proporcionar
compuestos que estén dotados con actividad de inhibición de
proteinaquinasas.
Los inventores presentes han descubierto ahora
que algunos derivados de
pirrolo[2,3-b]piridine están dotados
con actividad inhibidora de proteinaquinasas y son así útiles en
terapia en el tratamiento de enfermedades asociadas con
proteinaquinasas desrreguladas.
Más específicamente, los compuestos de la
presente invención son útiles en el tratamiento de una diversidad
de cánceres incluyendo, pero sin limitación: carcinoma tal como
carcinoma de vejiga, de mama, de colon, de riñón, de hígado, de
pulmón, incluyendo cáncer de pulmón de células pequeñas, esófafo,
vesícula biliar, ovario, páncreas, estómago, cuello de útero,
tiroides, próstata, y piel, incluyendo carcinoma de células
escamosas, tumores hematopoyéticos de estirpe linfática, incluyendo
leucemia, leucemia linfocítica aguda, leucemia linfoblástica aguda,
linfoma de células B, linfoma de células T, linfoma de Hodgkin,
linfoma no de Hodgkin, linfoma de células vellosas y linfoma de
Burkett; tumores hematopoyéticos de linaje mieloide, incluyendo
leucemias mielógenas, agudas y crónicas, síndrome mielodisplásico y
leucemina promielocítica; tumores de origen mesenquimal incluyendo
fibrosarcoma y rabdomiosarcoma; tumores del sistema nervioso central
y periférico, incluyendo astrocitoma, neuroblastoma, glioma y
schwannomas; otros tumores, incluyendo melanoma, seminoma,
teratocarcinoma, osteosarcoma, xeroderma pigmentosum,
queratoxantoma, cáncer folicular de tiroides y sarcoma de
Kaposi.
Debido al papel clave de las PK en la regulación
de la proliferación celular, estos compuestos de
pirrolo[2,3-b]piridina son también
útiles en el tratamiento de una diversidad de trastornos
proliferativos celulares tales como, por ejemplo, hiperplasia de
próstata benigna, adenomatosis familiar, poliposis,
neurofibromatosis, psoriasis, proliferación de células lisas
vasculares asociada con aterosclerosis, fibrosis pulmonar,
glomerulonefritis artrítica y estenosis
post-quirúrgica y reestenosis.
Los compuestos de la invención son también
útiles en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, como se
sugiere por el hecho de que la cdk5 está implicada en la
fosforilación de la proteína tau (J. Biochem., 117,
741-749, 1995).
Los compuestos de la presente invención, como
moduladores de apoptosis, son útiles en el tratamiento de cáncer,
infecciones virales, prevención del desarrollo del SIDA en
individuos infectados con el VIH, enfermedades autoimmunes y
trastornos neurodegenerativos.
Los compuestos de la presente invención son
también útiles en inhibir angiogénesis y metástasis tumoral, así
como en el tratamiento de rechazo de trasplante de órganos y en la
enfermedad de huésped contra injerto.
Los compuestos de la invención también actúan
como inhibidores de otras proteinaquinasas, por ejemplo, quinasas
dependientes de ciclinas (cdk) tales como cdk2 y cdk5,
proteinaquinasa C en diferentes isoformas, Met,
PAK-4, PAK-5, ZC-1,
STLK-2, DDR-2, Aurora 1, Aurora 2,
Bub-1, PLK, Chk1, Chk2, HER2, raf 1, MEK1, MAPK,
EGF-R, PDGF-R,
FGF-R, IGF-R, PI3K, quinasa Weel,
Src, Abi, Akt, MAPK, ILK, MK-2,
IKK-2, Cdc7, Nek, y así son efectivas en el
tratamiento de enfermedades asociadas con otras
proteinaquinasas.
Los compuestos de la invención son también
útiles en el tratamiento y prevención de alopecia inducida por
radioterapia o de alopecia inducida por quimioterapia.
Los derivados de
pirrolo-piridinas se conocen ampliamente en la
técnica. Como un ejemplo, el compuesto
3-carboxamido-pirrolo[2,3-b]piridina
se comunica como intermedio sintético en Chemical Abstracts C.A. 93
(1980): 168162.
Se revelan algunos otros derivados de
3-carboxamido de pirrolo-piridinas
adicionalmente N''-sustituidos con grupos indolilo
como agonistas de 5-HT2C/2B (véase documento WO
96/11929); los derivados de 3-carboxamido
anteriores adicionalmente sustituidos con grupos
N-(isoquinolil-etil-ciclohexilo) se
describen como agentes antipsicóticos (véase documentos WO
00/24717; WO 00/21951; WO 00/21950; WO 98/50364); los compuestos de
3-carboxamido-pirrolo-piridinas
N-sustituidos con anillos azabiciclo se describen
también como intermedios sintéticos en la preparación de derivados
de tropilo, que poseen propiedades antitusivas.
Además, los derivados de
3-hidrazido-pirrolo-piridinas
se revelan como intermedios sintéticos para preparar más
inhibidores de proteinaquinasas complejas, como se comunica en el
documento WO 00/71537.
Se revelan también 7-azaindoles
como inhibidores de quinasas N-terminales
C-JUN y de esta manera útiles en el tratamiento de
trastornos neurodegenerativos en el documento WO 03/082868.
Sin embargo, ninguno de los derivados de
pirrolo-piridinas de la técnica anterior dio como
resultado llevar un grupo amino adicional, opcionalmente
funcionalizado de forma adicional, en la posición 5 del esqueleto
de pirrolo-piridinas.
Los compuestos de
pirrolo[2,3-b]piridina de fórmula
general amplia dotados de actividad terapéutica, que incluyen
también actividad inhibidora de proteinaquinasas, se describen
también en los documentos WO 00/71537; WO 01/01986; WO 01/58869; WO
99/32111; WO 99/37637; WO 97/03069; WO 99/58496 y WO 95/28400.
Se describen también derivados de
3-alquenil-pirrolo[2,3-b]piridina
como inhibidores de proteinaquinasas en el documento WO 01/98299 en
el nombre del propio solicitante.
De acuerdo con ello, se describe un
procedimiento para tratar afecciones o enfermedades causadas por,
y/o asociadas con, una actividad proteína quinasa alterada,
administrando a un mamífero en necesidad de la misma una cantidad
efectiva de un compuesto representado por fórmula (I)
en el
que
R está seleccionado del grupo constituido por
-R^{a}, -COR^{a}, -CONR^{a}R^{b}, -SO_{2}R^{a} o
-COOR^{a};
R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d} o
-OR^{c};
en el que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d},
son el mismo o diferentes, y son cada uno independientemente
hidrógeno o un grupo opcionalmente sustituido, seleccionado de
alquilo C_{1}-C_{6} lineal o ramificado,
alquenilo C_{2}-C_{6} lineal o ramificado,
alquinilo C_{2}-C_{6} lineal o ramificado,
cicloalquilo C_{3}-C_{6} o cicloalquilalquilo
C_{1}-C_{6}, arilo o arilalquilo
C_{1}-C_{6}, o heterociclo o heterocicloalquilo
C_{1}-C_{6} o, tomados conjuntamente con el
átomo de nitrógeno al que están unidos, tanto R^{a} como R^{b}
así como R^{c} y R^{d} pueden formar un heterociclo de 4 a 7
miembros opcionalmente sustituido, conteniendo opcionalmente un
heteroátomo de anillo o grupo heteroatómico adicional seleccionado
de S, O N y NH;
o isómeros, tautómeros, vehículos, metabolitos,
profármacos, y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
En el procedimiento descrito anteriormente, la
enfermedad causada por, y/o asociada con, una actividad
proteinaquinasa alterada se selecciona del grupo constituido por
cáncer, trastornos proliferativos celulares, enfermedad de
Alzheimer, infecciones virales, enfermedades autoinmunes y
trastornos neurdegenerativos.
Los tipos específicos de cáncer que los
compuestos de la presente invención son útiles para tratar incluyen,
pero sin limitación, carcinoma, carcinoma de células escamosas,
tumores hematopoyéticos de linaje mieloide o linfoide, tumores de
origen mesenquimal, tumores del sistema nervioso central y
periférico, melanoma, seminoma, teratocarcinoma, osteosarcoma,
xeroderma pigmentosum, queratoxantoma, cáncer folicular de tiroides
y sarcoma de Kaposi.
En el procedimiento descrito anteriormente, el
trastorno proliferativo celular puede estar también seleccionado
del grupo constituido por hiperplasia benigna de próstata,
adenomatosis familiar, poliposis,
neuro-fibromatosis, psoriasis, proliferación de
células vasculares lisas asociadas con aterosclerosis, fibrosis
pulmonar, glomerulonefritis artrítica y estenosis y reestenosis
post-quirúrgicas.
La presente invención proporciona adicionalmente
un compuesto representado por fórmula (I)
en la
que
R está seleccionado del grupo constituido por
-R^{a}, -COR^{a}, -CONR^{a}R^{b}, -SO_{2}R^{a} o
-COOR^{a};
R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d} o
-OR^{c};
en el que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d},
son el mismo o diferentes, y son cada uno independientemente
hidrógeno o un grupo opcionalmente adicionalmente sustituido,
seleccionado de alquilo C_{1}-C_{6} lineal o
ramificado, alquenilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, alquinilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, cicloalquilo C_{3}-C_{6} o
cicloalquilalquilo C_{1}-C_{6}, arilo o
arilalquilo C_{1}-C_{6}, o heterociclo o
heterocicloalquilo C_{1}-C_{6} o, tomados
conjuntamente con el átomo de nitrógeno al que están unidos, tanto
R^{a} como R^{b} así como R^{c} y R^{d} pueden formar un
heterociclo de 4 a 7 miembros opcionalmente sustituido, que
contiene opcionalmente un heteroátomo de anillo o grupo
heteroatómico adicional seleccionado de S, O N y NH;
o isómeros, tautómeros, vehículos, metabolitos,
profármacos, y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
A menos que se especifique en contra, cuando
hacemos referencia a los compuestos de fórmula (I) per se así
como a cualquier composición farmacéutica de los mismos o a
cualquier procedimiento terapéutico de tratamiento que los
comprenda, la presente invención incluye todos los hidratos,
solvatos, complejos. Se describen también metabolitos y profármacos
de los compuestos de la presente invención. Los profármacos son
cualesquiera compuestos unidos covalentemente, que liberan el
fármaco parental activo de acuerdo con la fórmula (I) in
vivo.
Si un centro quiral u otra forma de un centro
isomérico está presente en un compuesto de la presente invención,
todas las formas de tal(es) isómero o isómeros, incluyendo
enantiómeros y diastereómeros, se desean para abarcarse en el
presente documento. Los compuestos que contienen un centro quiral se
pueden usar como una mezcla racémica o como una mezcla racémica
enantioméricamente enriquecida, o la mezcla racémica se puede
separar usando técnicas bien conocidas y se puede usar solo un
enantiómero individual. En casos en los que existe el compuesto en
formas tautómeras, tales como tautómeros cetoenólicos, cada forma
tautómera se contempla como que se incluye en la presente invención
tanto si existe en el equilibrio como si existe predominantemente en
una forma.
En la presente descripción, a menos que se
indique en contra, el término alquilo
C_{1}-C_{6} lineal o ramificado incluye
cualquier grupo alquilo C_{1}-C_{6} tal como,
por ejemplo, metilo, etilo, n-propilo, isopropilo,
n-butilo, isobutilo, sec-butilo,
tert-butilo, n-pentilo,
n-hexilo, y similares.
Ejemplos de alquenilo
C_{2}-C_{6} o alquinilo
C_{2}-C_{6} lineal o ramificado incluye
cualquiera de los grupos insaturados alquenilo o alquinilo con
desde 2 hasta 6 átomos, de carbono, por ejemplo incluyendo pero no
limitados a vinilo, alilo, 1-propenilo,
isopropenilo, 1-, 2- o 3-butenilo, pentenilo,
hexenilo, etinilo, 1- o 2-propinilo, butinilo,
pentinilo, hexinilo, y similares.
El término cicloalquilo
C_{3}-C_{6} se define como como cualquier anillo
carbocíclico de 3 a 6 miembros tal como, por ejemplo, ciclopropilo,
ciclobutilo, ciclopentilo y ciclohexilo, y similares.
A menos que se especifique en contra, por arilo
se quiere decir tanto un carbociclo así como un heterociclo, mono o
bicíclico, con 1 ó 2 restos de anillo bien condensados o bien unidos
el uno al otro por enlaces simples, en los que al menos uno de los
anillos carbocíclico o heterocíclico es aromático pero ello también
incluye 1 ó 2 restos de anillo en los que todos los anillos son
aromáticos. A menos que se especifique en contra, el citado
heterociclo es una anillo de 4 a 7 miembros con desde 1 hasta 3
heteroátomos o grupos heteroatómicos seleccionados entre N, NH, O y
S.
Ejemplos no limitantes de grupos arilo de la
invención son, por ejemplo, fenilo, indanilo, bifenilo, \alpha- o
\beta-naftilo, piridilo, pirazinilo, pirimidinilo,
piridazinilo, indolilo, imidazolilo, imidazopiridilo,
1,2-metilenodioxifenilo, tiazolilo, isotiazolilo,
pirrolilo, pirrolil-fenilo, furilo,
fenil-furilo, benzotetrahidrofuranilo, oxazolilo,
isoxazolilo, pirazolilo, cromenilo, tienilo, benzotienilo,
isoindolinilo, benzoimidazolilo, quinolinilo, isoquinolinilo,
quinoxalinilo, benzofurazanilo, 1,2,3-triazolilo,
1-fenil-1,2,3-triazolilo
y similares.
El término heterociclo (por ejemplo
heterociclilo) o grupo heterocíclico es un heterociclo de 4 a 7
miembros, que abarca grupos heterocíclicos aromáticos también
conocidos como grupos heteroarilo y actualmente comprendidos por el
término arilo, así como grupos heterocíclicos saturados o
parcialmente insaturados, que tienen de 1 a 3 heteroátomos de
anillo o grupos heteroatómicos seleccionados entre N, NH, O y S.
Ejemplos de estos grupos heterocíclicos de 4 ó 7
miembros son, por ejemplo, 1,3-dioxolano, pirano,
pirrolidina, pirrolina, imidazolina, imidazolidina, pirazolidina,
pirazolina, piperidina, piperazina, morfolina, tetrahidrofurano,
hexametilenoimina, 1,4-hexahidrodiazepina,
azetidina, y similares.
Cuando se hace referencia a los compuestos de
fórmula (I) en los que R es un grupo -CONR^{a}R^{b} y/o
R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d} y R^{a} y R^{b} y/o R^{c}
y R^{d} se toman conjuntamente con el nitrógeno al que están
unidos, pueden formar también un heterociclo de 4 a 7 miembros
opcionalmente sustituido que contiene opcionalmente un heteroátomo
de anillo o un grupo heteroatómico de anillo adicional entre S, O N
o NH.
De acuerdo con los significados proporcionados
para R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d}, cualquiera de los grupos
anteriores está insustituido o puede estar adicionalmente
opcionalmente sustituido en cualquiera de sus posiciones libres por
por uno o más grupos, por ejemplo 1 a 6 grupos, seleccionados de:
halógeno, nitro, grupos oxo (=O), carboxi, cIano, alquilo, alquilo
polifluorado, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo;
grupos arilo, heterociclilo, amino y derivados de los mismos tales
como, por ejemplo, grupos formilamino, alquilcarbonilamino,
alquenilcarbonilamino, arilcarbonilamino, alcoxicarbonilamino;
grupos hidroxilo y derivados de los mismos tales como, por ejemplo,
alkoxi, ariloxi, alquilcarboniloxi, arilcarboniloxi,
cicloalqueniloxi o alquilidenoaminoxi; grupos carbonilo y
derivativos de los mismos tales como, por ejemplo, alquilcarbonilo,
arilcarbonilo, alcoxicarbonilo, ariloxicarbonilo,
cicloalquiloxicarbonilo, aminocarbonilo, alquilaminocarbonilo,
dialquilaminocarbonilo; derivados sulfurados tales como, por
ejemplo, alquilltio, ariltio, alquilsulfonilo, arilsulfonilo,
alquilsulfinilo, arilsulfinilo, arilsulfoniloxi, aminosulfonilo,
alquilaminosulfonilo o dialquilaminosulfonilo.
A su vez, cuando sea apropiado, cada uno de los
sustituyentes anteriores puede, además, estar adicionalmente
sustituido con uno o más de los grupos anteriormente
mencionados.
En la presente descripción, a menos que se
especifique en contra, el término halógeno es un átomo de flúor,
cloro, bromo o yodo.
El término alquilo polifluorado se desea para
querer decir un grupo alquilo C_{1}-C_{6} lineal
o ramificado como se define anteriormente, en el que más de un
átomo de hidrógeno está reemplazado por átomos de flúor tales como,
por ejemplo, trifluorometilo, 2,2,2-trifluoroetilo,
1,2-difluoroetilo,
1,1,1,3,3,3-hexafluoropropil-2-ilo,
y similares.
A partir de todo lo anterior, está claro para la
persona experta que cualquier grupo cuyo nombre se ha identificado
como un nombre de compuesto, tal como, por ejemplo,
cicloalquilalquilo, arilalquilo, heterociclilalquilo, alcoxi,
alquiltio, ariloxi, arilalquiloxi, alquilcarboniloxi y similares, se
desea que se interprete convencionalmente a partir de las partes de
las que se deriva. Hasta el momento, como un ejemplo, el término
heterociclil-alquilo representa un grupo alquilo
lineal o ramificado que está adicionalmente sustituido con un grupo
heterocíclico, como se define anteriormente.
La expresión "sales farmacéuticamente
aceptables" abarca sales usadas comúnmente para formar metales
alcalinos y para formar sales de adición de los ácidos libres o de
las bases libres. La naturaleza de la sal no es crítica, dado que
es farmacéuticamente aceptable. Las sales de adición de ácidos
farmacéuticamente aceptables de los compuestos de la presente
invención se preparan preferentemente a partir de un ácido
inorgánico o a partir de un ácido orgánico. Ejemplos de tales
ácidos inorgánicos son ácido clorhídrico, bromhídrico, yodhídrico,
nítrico, carbónico, sulfúrico y fosfórico. Los ácidos orgánicos
apropiados están seleccionados preferentemente de las clases
alifática, cicloalifática, aromática, aralifática, heterocíclica,
carboxílica y sulfónica de ácidos orgánicos, ejemplos de los cuales
son ácido fórmico, acético, trifluoroacético, propiónico, succínico,
glicólico, glucónico, láctico, málico, tartárico, cítrico,
ascórbico, glucurónico, maleico, fumárico, pirúvico, aspártico,
glutámico, benzoico, antranílico, mesílico, salicílico,
p-hidroxibenzoico, fenilacético, mandélico,
embónico (pamoico), metanosulfónico, etanosulfónico,
bencenosulfónico, pantoténico, toluenosulfónico,
2-hidroxietanosulfónico, sulfanílico, esteárico,
ciclohexilaminosulfónico, algénico, hidroxibutírico, galactárico y
galacturónico. Las sales de adición de bases farmacéuticamente
aceptables de los compuestos de la presente invención incluyen
sales metálicas hechas de aluminio, calcio, litio, magnesio,
potasio, sodio y cinc o sales orgánicas hechas de
N,N'-dibencilletilenodiamina, cloroprocaína, colina,
dietanolamina, etilenodiamina, meglumina
(N-metil-glucamina) y procaína.
Todas de estas sales se preparan preferentemente por medios
convencionales a partir de los compuestos correspondientes de la
presente invención, por ejemplo haciéndolos reaccionar con el ácido
o la base apropiados.
Una primera clase de compuestos preferidos de la
invención está representada por los derivados de fórmula (I) en los
que R es un grupo -COR^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d},
en el que R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen
anteriormente.
Otra clase de compuestos preferidos se
representa por los derivados de fórmula (I) en los que R es un grupo
-CONR^{a}R^{b} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los
que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d} son como se definen
anteriormente.
Otra clase de compuestos preferidos se
representa por los derivados de fórmula (I) en los que R es un grupo
-SO_{2}R^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los que
R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen anteriormente.
Otra clase de compuestos preferidos se
representa por los derivados de fórmula (I) en los que R es un grupo
-COOR^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los que
R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen anteriormente.
Otra clase de compuestos preferidos se
representa por los derivados de fórmula (I) en los que R es como se
define en fórmula (I) y R_{1} es un grupo -OR^{c}, en el que
R^{c} es como se define anteriormente.
Otra clase de compuestos preferidos se
representa por los derivados de fórmula (I) en los que R es un grupo
R^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los que R^{a},
R^{c} y R^{d} son como se definen anteriormente.
Preferentemente, dentro de las clases
anteriores, R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d} están seleccionados,
cada uno independientemente, de acuerdo con los significados
comunicados en tablas I y II de la sección experimental.
Para una referencia a ejemplos específicos de
compuestos de fórmula (I) de la invención, opcionalmente en la
forma de sales farmacéuticamente aceptables, véase la sección
experimental.
Como se expone anteriormente, es un objeto
adicional de la presente invención un procedimiento para preparar
los compuestos de fórmula (I).
Por lo tanto, los compuestos de fórmula (I) y
las sales farmacéuticamente aceptables de los mismos se obtienen
usando técnicas estándar conocidas para alguien de habilidad
ordinaria en la técnica. Por ejemplo, se obtienen por un
procedimiento que comprende:
a) hacer reaccionar éster metílico de ácido
1-(fenilsulfonil)-1H-pirrolo[2,3-b]piridina-3-carboxílico
con nitrato de tetrabutilamonio (TBAN) en la presencia de anhídrido
trifluoroacético (TFAA), tal como para obtener un compuesto de
fórmula (II)
\vskip1.000000\baselineskip
b) hacer reaccionar el compuesto de
fórmula (II) en condiciones de hidrólisis básicas o ácidas tal como
para obtener un compuesto de fórmula (III) o una sal del
mismo
c) hacer reaccionar el compuesto de
fórmula (III) con un agente protector carboxi, por ejemplo un agente
esterificante, tal como para obtener un compuesto de
fórmula
en la que Alk representa alquilo,
por ejemplo
metilo;
\vskip1.000000\baselineskip
d) hacer reaccionar el compuesto de fórmula (IV)
con cloruro de estaño(II) y
N-metil-a-pirrolidinona
(NMP), tal como para obtener un compuesto de fórmula (I)
en la que Alk es como se define
anteriormente y, opcionalmente, se hace reaccionar de acuerdo con
una cualquiera de las etapas alternativas (e.1), (e.2), (e.3) o
(e.4)
\vskip1.000000\baselineskip
e.1) con uno cualquiera de los compuestos de
fórmula (V), (VI), (VII) o (VIII)
R^{a}COZ | (V); | R^{a}NCO | (VI); | R^{a}SO_{2}Z | (VII); | R^{a}OCOZ | (VIII) |
en los que R^{a} es como se define
anteriormente y Z es un átomo de halógeno, tal como para obtener un
compuesto de fórmula (I)
en la que Alk es como se define
anteriormente y R es un grupo -COR^{a}, -CONHR^{a},
-SO_{2}R^{a} o -COOR^{a}, respectivamente;
o
\vskip1.000000\baselineskip
e.2) con una amina adecuada de fórmula (IX) en
la presencia de trifosgeno o de un cloroformiato adecuado
(IX)HNR^{a}R^{b}
tal como para obtener el compuesto
anterior de fórmula (I) en la que R es un grupo -CONR^{a}R^{b};
o
\vskip1.000000\baselineskip
(e.3) con un derivado aldehído o cetona adecuado
de fórmula (X) en condiciones operativas reductoras
(X)R^{a}-CO-R^{a}
en la que cada R^{a} is el mismo
o diferente como se define anteriormente, tal como para obtener el
compuesto anterior de fórmula (I) en la que R es un grupo
-CH(R^{a})R^{a};
o
\vskip1.000000\baselineskip
(e.4) con un yoduro o bromuro aromático de
fórmula (XI) o (XII)
R^{a}-I | (XI) | R^{a}-Br | (XII) |
en presencia de un catalizador de
paladio adecuado y de un ligando, tal como para obtener un compuesto
de fórmula (I) en la que R es R^{a} y este último representa un
grupo aromático carbocíclico o heterocíclico; y,
opcionalmente
\vskip1.000000\baselineskip
f) convertir el compuesto de fórmula (I) que se
obtiene de acuerdo con una cualquiera de las etapas (d), (e.1),
(e.2), (e.3) o (e. 4) dentro de otro compuesto de fórmula (I) y/o
dentro de una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
El procedimiento anterior es un procedimiento
análogo que se puede llevar a cabo de acuerdo con procedimientos
bien conocidos.
De acuerdo con la etapa (a) del procedimiento,
la nitración del éster metílico del ácido
1-(fenilsulfonil)-1H-pirrolo[2,3-b]piridina-3-carboxílico
para proporcionar el compuesto de fórmula (II) se lleva a cabo con
nitrato de tetrabutilamonio (TBAN) en la presencia de anhídrido
trifluoroacético (TFAA). La reacción se lleva a cabo en un
disolvente adecuado, por ejemplo un hidrocarburo halogenado tal
como diclorometano, trabajando a una temperatura que varía desde 0ºC
hasta temperatura ambiente y durante un tiempo que varía de
aproximadamente 10 horas a aproximadamente 30 horas.
De acuerdo con la etapa (b) del procedimiento,
el compuesto de fórmula (II) sufre hidrólisis en condiciones
básicas o ácidas. Preferentemente, la reacción se lleva a cabo en la
presencia de hidróxido de sodio acuoso y de
2,2,2-trifluoroetanol (TFE), a una temperatura que
varía de temperatura ambiente a aproximadamente 90ºC y durante un
tiempo desde 4 horas hasta un día. De acuerdo con las condiciones
operativas que se emplean, el compuesto de fórmula (III) podría
obtenerse bien en su forma ácida o, alternativamente, como una
sal.
Preferentemente, la reacción de hidrólisis se
lleva a cabo en condiciones básicas, por ejemplo en la presencia de
hidróxido de sodio, tal como para obtener la sal disódica
correspondiente, como por la sección experimental (véase ejemplo
2).
De acuerdo con la etapa (c) del procedimiento,
el compuesto de fórmula (III) se esterifica de acuerdo con
condiciones operativas bien conocidas en la presencia de alcoholes
adecuados. Como un ejemplo, esta reacción se lleva a cabo en la
presencia de metanol tal como para conseguir el derivado de éster
carboximetílico correspondiente de fórmula (II) en el que Alk
representa metilo.
Alternativamente, el compuesto de fórmula (IV)
de la etapa (c) en la que Alk representa metilo se prepara por la
hidrólisis directa del compuesto de fórmula (II) de acuerdo con
procedimientos conocidos, por ejemplo en la presencia de
trimetilsilanoato de potasio en tetrahidrofurano (THF) o de
trietilamina (TEA) en metanol.
De acuerdo con la etapa (d) del procedimiento,
el grupo nitro del compuesto de fórmula (IV) se reduce al derivado
amino correspondiente. La reducción se lleva a cabo preferentemente
en la presencia de cloruro de estaño(II) y NMP de acuerdo
con procedimientos bien conocidos. Claramente, cualquiera de los
varios procedimientos conocidos en la técnica para reducir grupos
nitro a grupos amino, por ejemplo comprendiendo hidrogenación
catalítica, pueden además implicarse adecuadamente también.
A partir de lo anterior, está claro para el
hombre experto que desde la reacción anterior de la etapa (d) se
obtiene un compuesto de fórmula (I) en la que R es un átomo de
hidrógeno y R_{1} es un grupo -OR^{c} en el que R^{c} es
justo el grupo alquilo que se introduce por la etapa (c) del
procedimiento, por ejemplo metilo.
El compuesto de fórmula (I) así obtenido puede
convertirse opcionalmente en una diversidad de derivados de fórmula
(I) trabajando como se describe en una cualquiera de las etapas
desde (e.1) hasta (e.4) del procedimiento, de acuerdo con
procedimientos bien conocidos.
Típicamente, el compuesto de fórmula (I) de
etapa (d), que lleva un grupo amino en posición 5, se hace
reaccionar: con un compuesto de fórmula (V) tal como para conseguir
el derivado carboxamido correspondiente en el que R es -COR^{a} y
R^{a} es como se define anteriormente; con un compuesto de fórmula
(VI) tal como para conseguir el derivado ureido correspondiente en
el que R es -CONHR^{a} y R^{a} es como se define anteriormente;
con un compuesto de fórmula (VII) tal como para conseguir un
derivado de sulfonamido en el que R es -SO_{2}R^{a} y R^{a}
es como se define anteriormente; con un compuesto de fórmula (VIII)
tal como para conseguir un derivado carbamato en el que R es
-COOR^{a} y R^{a} es como se define anteriormente; con un
compuesto de fórmula (IX) y trifosgeno o un cloroformiato adecuado
tal como para conseguir un derivado de ureido en el que R es
-CONR^{a}R^{b} y R^{a} y R^{b} son como se definen
anteriormente; con un compuesto de fórmula (X) en condiciones
operativas reductoras tales como para conseguir un derivado en el
que R es -CN(R^{a})R^{a} y cada R^{a}, el mismo
o diferentes e independientemente unos de otros, es como se define
anteriormente.
Una cualquiera de las reacciones anteriores se
lleva a cabo de acuerdo con procedimientos convencionales usados
normalmente en la preparación de derivados amino funcionalizados,
empezando a partir de la amina correspondiente.
Dentro de los compuestos de fórmula (V), (VII) o
(VIII) de la etapa (e.1), en particular, Z representa un átomo de
halógeno e, incluso más preferentemente, un átomo de cloro.
A este respecto, el compuesto de fórmula (I) de
la etapa (d) se disuelve en un disolvente adecuado tal como
diclorometano, dimetilformamida, tetrahidrofurano, dioxano o
similares, y se añade en ello una base adecuada tal como
trietilamina, carbonato de sodio o similares.
El compuesto de fórmula general (V), (VII) o
(VIII) se añade después y la mezcla se agita durante un tiempo de
aproximadamente 2 horas a aproximadamente 15 horas, a una
temperatura que varía desde aproximadamente 20ºC hasta
aproximadamente 80ºC. Cuando se usa un isocianato de fórmula general
(VI), las condiciones de reacción son las mismas que anteriormente
salvo porque la base puede no requerirse. En todas estas reacciones,
se puede usar opcionalmente un catalizador adecuado tal como
dimetilaminopiridina.
De acuerdo con la etapa (e.2) del procedimiento,
el compuesto de fórmula (I) obtenido en la etapa (d) se puede hacer
reaccionar con un derivado amina de fórmula (IX) en la presencia de
trifosgeno o de un cloroformiato adecuado tal como, por ejemplo,
4-nitrofenilcloroformiato.
La reacción se lleva a cabo en un disolvente
adecuado tal como un hidrocarburo halogenado, preferentemente
diclorometano, en la presencia de una base tal como, por ejemplo,
diisopropiletilamina o trietilamina y trabajando a temperatura
ambiente.
De acuerdo con la etapa (e.3) del procedimiento,
se hace reaccionar el compuesto de fórmula (I) de etapa (d), en
condiciones reductivas, con un derivado de aldehído o cetona de
fórmula (X) tal como para obtener el compuesto correspondiente de
fórmula (I) en el que R es como se define anteriormente. A partir de
lo anterior, está claro para el hombre experto que empleando un
derivado aldehído de fórmula (X) en el que uno de los dos R^{a}
es un átomo de hidrógeno, el derivado correspondiente en el que R es
-CH_{2}R^{a} se puede obtener. Asimismo, empleando un derivado
de cetona, se pueden obtener los compuestos que tienen R como
-CH(R^{a})R^{a}, en los que cada R^{a} es,
independientemente del otro, como se expone anteriormente pero
diferente de hidrógeno.
De acuerdo con la etapa (e.4) del procedimiento,
el compuesto de fórmula (l) de etapa (d) se convierte en el
derivado arilado correspondiente de fórmula (I) con R como R^{a} y
en el que R^{a} es un grupo arilo, que por lo tanto comprende
grupos aromáticos carbocíclicos o heterocíclicos.
La reacción se lleva a cabo de acuerdo con
procedimientos conocidos, con cualquier yodudo o bromuro de arilo
adecuado de fórmula (XI) o (XII) en la presencia de un catalizador
adecuado, por ejemplo un catalizador de paladio como acetato de
paladio o Pd_{2}(dba)_{3}, y de un ligando
adecuado. Para una referencia general a la reacción de arilación y
a las condiciones operativas de la misma (también inclusivas de
disolventes, catalizadores y ligandos) véase, por ejemplo, J. Am.
Chem. Soc., (2003), 125, 6653-55; JOC (2001), 66,
2560-2565; y JOC (2002), 67,
6479-6486.
Además de lo anterior, está claro para el hombre
experto que, siempre que se desee, cualquiera de los compuestos
anteriores de fórmula (I) así preparado puede convertirse
adicionalmente en otros derivados de fórmula (I), como se expone en
la etapa (f), trabajando de acuerdo con procedimientos
convencionales.
Como un ejemplo, los compuestos de fórmula
(I)
en los que R es uno cualquiera de
los grupos anteriormente mencionados y Alk representa un alquilo
dado, por ejemplo metilo, se pueden convertir en los compuestos de
fórmula
(I):
g) en los que R es como se define
anteriormente y R_{1} es -OR^{c} con R^{c} distinto de metilo,
por reacciones de transesterificación llevadas a cabo de acuerdo
con procedimientos bien conocidos, por ejemplo con un compuesto
adecuado de fórmula
(XIII)
\global\parskip0.950000\baselineskip
(XIII)R^{c}-OH
en condiciones ácidas o básicas,
opcionalmente en la presencia de catalizadores basados en metales,
como óxido de dibutilestaño o alcóxidos de titanio tales como, por
ejemplo, etóxido de titanio (IV), isopropóxido de titanio (IV) y
similares;
h) en los que R es como se define anteriormente
y R_{1} es un grupo -OH, por hidrólisis ácida o básica.
Como un ejemplo adicional, los compuestos de
fórmula (I) en los que R es como se define anteriormente y R_{1}
es un grupo -OR^{c} en el que R^{c} es un grupo alquilo se
pueden convertir también en los derivados amido correspondientes de
fórmula (I)
i) en los que R_{1} es -NR^{c}R^{d}, con
R^{c} y R^{d} como se definen anteriormente, por tratamiento
con amoniaco o con una amina adecuada de fórmula (XIV) o (XV)
(XIV);R^{c}-NH_{2}
(XV)R^{c}R^{d}NH
Opcionalmente en la presencia de catalizador
adecuado tal como, por ejemplo, 2-hidroxipiridina,
yoduro de potasio, cinauro de sodio o
dimetilamino-piridina.
Asimismo, los compuestos de fórmula (I) en los
que R es como se define anteriormente y R_{1} es un grupo
-OR^{c} en el que R^{c} es hidrógeno se convierten opcionalmente
en los derivados amido correspondientes de fórmula (I) trabajando
como se expone en la etapa (i), opcionalmente en la presencia de un
agente condensante adecuado, por ejemplo diciclohexilcarbodiimida
(DCC),
1-etil-3-(3'-dimetilaminopropil)carbodiimida
(EDC), tetrafluoroborato de
O-benzotriazoliltetrametilisouronio (TBTU) o
hexafluorofosfato de
benzotriazol-1-iloxitripirrolidinofosfonio
(PyBOP).
A partir de todo lo anterior, está también claro
para la persona experta en la técnica que si un compuesto de
fórmula (I), preparado de acuerdo con el procedimiento anterior, se
obtiene como una mezcla de isómeros, su separación en los isómeros
individuales de fórmula (I), se llevó a cabo de acuerdo con técnicas
convencionales, está aún dentro del ámbito de la presente
invención.
Asimismo, la conversión en el compuesto libre
(I) de una sal correspondiente del mismo, de acuerdo con
procedimientos bien conocidos en la técnica, está aún dentro del
ámbito de la invención.
Cuando se preparan los compuestos de fórmula (I)
de acuerdo con cualquier variante del procedimiento, que son todos
deseados dentro del ámbito de la invención, grupos funcionales
opcionales dentro de los materiales de partida, los reactivos o los
intermediarios de los mismos, y que podrían dar lugar a reacciones
secundarias no deseadas, son necesarios para protegerse
apropiadamente de acuerdo con técnicas convencionales.
Asimismo, la conversión de estos últimos en los
compuestos desprotegidos libres se puede llevar a cabo de acuerdo
con procedimientos conocidos.
Los materiales de partida del procedimiento
objeto de la presente invención, que comprende cualquier posible
variante, así como cualquier reactante de los mismos, son compuestos
conocidos y si no están comercialmente disponibles per se se
pueden preparar de acuerdo con procedimientos bien conocidos.
Como un ejemplo, el compuesto éster metílico del
ácido
1-(fenilsulfonil)-1H-pirrolo[2,3-b]piridina-3-carboxílico
se puede preparar como se describe en Tetrahedron Letters 40
(1999), 5853-5854.
Asimismo, los compuestos de fórmula (V), (VI),
(VII), (VIII), (IX), (X), (XII), (XIII), (XIV) y (XV) se conocen o
se obtienen fácilmente de acuerdo con procedimientos conocidos.
El compuesto intermedio de fórmula (III) del
procedimiento representa un objeto adicional de la invención.
Además de lo anterior, los compuestos de fórmula
(I) de la invención se preparan ventajosamente de acuerdo con
técnicas de química combinatoria ampliamente conocidas en la
técnica, consiguiendo las reacciones anteriormente mencionadas
entre los intermedios en una forma en serie y trabajando en
condiciones de síntesis en fase sólida (SPS).
Como un ejemplo, los compuestos intermedios de
fórmula (III), que se obtienen de acuerdo con la etapa (b) del
procedimiento, pueden mantenerse fácilmente en una resina
polimérica, por ejemplo por la formación de un grupo carboxamido, y
el intermedio así mantenido puede hacerse reaccionar
subsiguientemente de acuerdo con las etapas que quedan del
procedimiento.
Preferentemente, la resina anterior es una
resina poliestirénica comercialmente disponible que incluye, por
ejemplo, resina Wang, resina de tritilo, resina de
Cl-tritilo, resina de amida de Rink, resina de
Tentagel OH, resina formílica y derivados de las mismas.
De acuerdo con una realización preferida de la
invención, la resina poliestirénica es una resina poliestirénica de
formilo derivatizada que se puede obtener haciendo reaccionar una
resina poliestirénica de formilo comercialmente disponible, por
ejemplo resina AM de
4-(4-formil-3-metoxi-fenoxi)butirilo,
con un derivado amino adecuado en condiciones reductoras, por
ejemplo en la presencia de borohidruro de sodio y derivados del
mismo, sustancialmente como sigue:
La reacción se lleva a cabo preferentemente en
un disolvente adecuado tal como diclorometano y en la presencia de
ácido acético.
Los derivados amino con respaldo polimérico así
obtenidos, en particular aquellos que son referibles como resina
poliestirénica de formilo derivatizada anteriormente, se conocen
ampliamente en la técnica.
En general, las aminas cargadas sobre resinas
formilpoliestirénicas también conocidas como resinas de poliestireno
de metoxibenzaldehído sensibles a ácidos (resinas AMEBA) se
prepararon por aminación reductora estándar en la presencia de un
exceso de amina en TMOF/DCE y NaBH(OAc)_{3} o
AcOH/DMF y NaCNBH_{3}, por ejemplo como se comunica en
Tetrahedron Letters (1997), 38, 7151-7154; J. Am.
Chem. Soc. (1998), 120, 5441; y Chem. Eur. J. (1999), 5, 2787.
Por lo tanto, es un objeto adicional de la
presente invención un procedimiento para preparar los compuestos de
fórmula (I), y las sales farmacéuticamente aceptables de los mismos,
procedimiento que comprende:
j) hacer reaccionar el compuesto de fórmula
(III), que se prepara de acuerdo con la etapa (b), con una resina
poliestirénica de formilo derivatizada de fórmula (XVI)
(XVI)(P)-CH_{2}-NHR^{c}
en la que (P) es la resina y
R^{c} es como se define anteriormente, tal como para obtener un
compuesto de fórmula
(XVII)
k) hacer reaccionar el compuesto de
fórmula (XVII) de acuerdo con la etapa (d) y, opcionalmente, a
cualquiera de las etapas (e.1), (e.2), (e. 3) o (e.4), tal como
para obtener un compuesto de fórmula
(XVIII)
en la que (P), R y R^{c} son como
se definen
anteriormente;
\global\parskip1.000000\baselineskip
l) escindiendo la resina a partir del compuesto
de fórmula (XVIII) en condiciones ácidas tal como para obtener un
compuesto de fórmula (I) en la que R es como se define anteriormente
y R_{1} es un grupo -NHR^{c} en el que R^{c} es como se
define anteriormente; y, opcionalmente,
m) convertir el compuesto de fórmula (I) así
obtenido en otro compuesto de fórmula (I) y/o en sales
farmacéuticamente aceptables del mismo.
De acuerdo con la etapa (j) del procedimiento,
se lleva a cabo la reacción en un disolvente adecuado, por ejemplo
N-metilpirrolidona (NMP), dimetilformamida (DMF) o
diclorometano (DCM), en la presencia de diisopropiletilamina (DIEA)
y de un agente condensante adecuado tal como, por ejemplo,
1-etil-3-(3'-dimetilaminopropil)carbodiimida
(EDC), diciclohexilcarbodiimida (DCC), diisopropilcarbodiimida
(DIC), dimetilaminopiridina (DMAP) y tetrafluoroborato de
O-benzotriazoliltetrametilisouronio (TBTU).
De acuerdo con la etapa (k) del procedimiento,
el compuesto mantenido de fórmula (XVII) se reduce primero como por
la etapa (d) del procedimiento tal como para obtener el derivado
amino, y opcionalmente hacerlo reaccionar adicionalmente como se
indica anteriormente, tal como para dar lugar a una diversidad de
compuestos funcionalizados en posición 5 del anillo de
pirrolo[2,3-b]piridina. Las
condiciones operativas son esencialmente aquellas antes comunicadas
trabajando en condiciones operativas homogéneas.
La escisión de resina de acuerdo con la etapa
(I) puede llevarse a cabo en condiciones ácidas en la presencia de
ácidos adecuados tales como, por ejemplo, ácido clorhídrico o ácido
trifluoroacético.
Claramente, trabajando de acuerdo con técnicas
de química combinatoria como se indicó antes, se puede obtener una
pluralidad de compuestos de fórmula (I).
Por consiguiente, es un objeto adicional de la
presente invención una biblioteca de dos o más compuestos de
fórmula (I)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
en la
que
R está seleccionado del grupo constituido por
-R^{a}, -COR^{a}, -CONR^{a}R^{b}, -SO_{2}R^{a} o
-COOR^{a};
R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d} u
-OR^{c};
en los que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d},
son el mismo o diferentes, y son cada uno independientemente
hidrógeno o un grupo opcionalmente sustituido adicionalmente,
seleccionado de alquilo C_{1}-C_{6} lineal o
ramificado, alquenilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, alquinilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, cicloalquilo C_{3}-C_{6} o
cicloalquilalquilo C_{1}-C_{6}, arilo o
arilalquilo C_{1}-C_{6}, o heterociclo o
heterocicloalquilo C_{1}-C_{6} o, tomados
conjuntamente con el átomo de nitrógeno al que están unidos, tanto
R^{a} y R^{b} así como R^{c} y R^{d} pueden formar un
heterociclo opcionalmente sustituido de 4 a 7 miembros, conteniendo
opcionalmente un heteroátomo de anillo adicional o un grupo
heteroatómico seleccionado de S, O, N o NH;
o isómeros, tautómeros, vehículos, metabolitos,
profármacos, y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
De acuerdo con una realización preferida de la
invención, la biblioteca anteriormente mencionada comprende los
compuestos de fórmula (I) en los que R es un grupo R^{a} y R_{1}
es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los que R^{a}, R^{c} y R^{d}
son como se definen anteriormente.
En otra realización la biblioteca anteriormente
mencionada comprende compuestos de fórmula (I) en los que R es un
grupo -COR^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los que
R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen anteriormente.
En otra realización la biblioteca mencionada
anteriormente comprende compuestos de fórmula (I) en los que R es
un grupo -CONR^{a}R^{b} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d},
en los que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d} son como se definen
anteriormente.
En otra realización la biblioteca mencionada
anteriormente comprende compuestos de fórmula (I) en los que R es
un grupo -SO_{2}R^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en
los que R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen
anteriormente.
En otra realización la biblioteca mencionada
anteriormente comprende compuestos de fórmula (I) en los que R es
un grupo -COOR^{a} y R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d}, en los
que R^{a}, R^{c} y R^{d} son como se definen
anteriormente.
En otra realización la biblioteca mencionada
anteriormente comprende compuestos de fórmula (I) en los que R es
como se define en fórmula (I) y R_{1} es un grupo -OR^{c}, en el
que R^{c} es como se define anteriormente.
Para una referencia general a las bibliotecas
anteriores de compuestos de fórmula (I) véase la sección
experimental.
A partir de todo lo anterior, está claro para el
hombre experto que una vez está preparada así una biblioteca de
derivados de pirrolo[2,3-b]piridina,
por ejemplo constituida por pocos miles de compuestos de fórmula
(I), la citada biblioteca se puede usar muy ventajosamente para
rastreo en busca de las quinasas dadas, como se comunica antes.
Véanse, para una referencia general a
bibliotecas de compuestos y usos de los mismos como herramientas
para rastrear actividades biológicas, J. Med. Chem. 1999, 42,
2373-2382; y Bioorg. Med. Chem. Lett. 10 (2000),
223-226.
Los compuestos de fórmula (I) son activos como
inhibidores de proteínaquinasas y son por lo tanto útiles, por
ejemplo, para restringir la proliferación desrregulada de células
tumorales.
En terapia, son útiles en el tratamiento de
diversos tumores,tales como aquellos antes comunicados, así como en
el tratamiento de otros trastornos proliferativos celulares tales
como soriasis, proliferación de células lisas vasculares asociadas
con aterosclerosis y estenosis y reestenosis quirúrgica y
postquirúrgica y en el tratamiento de la enfermedad de
Alzheimer.
La actividad inhibidora de inhibidores de
cdk/ciclina teóricos y la potencia de compuestos seleccionados se
determina por un procedimiento de ensayo en base al uso de
tecnología SPA (Amersham Pharmacia Biotech).
El ensayo consiste en la transferencia de resto
fosfato marcado con radiactividad por la quinasa a un sustrato
biotinilado. El producto biotinilado marcado con ^{33}P resultante
se deja unir a perlas de SPA recubiertas de estreptavidina
(capacidad de biotina 130 pmol/mg), y la luz emitida se midió en un
contador de centelleo.
Reacción de quinasa: sustrato de histona
H1 biotinilada en el laboratorio de los autores de la presente
invención (Sigma n.º: H-5505) 4 \muM, ATP (0,1
microCi P^{33}\gamma-ATP) 10 \muM, complejo
ciclina A/CDK2 1,1 nM, inhibidor en un volumen final de tampón de
30 \mul (TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM, DTT 7,5 mM +
BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de una placa de 96
pocillos de fondo en forma de U. Después de incubación durante 60
minutos a temperatura ambiente, la reacción se detuvo por adición de
100 \mul de tampón PBS que contenía EDTA 32 mM, 500 \muM de
ATP frío, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA revestidas de
estreptavidina a 10 mg/ml. Después de incubación de 20 minutos, se
retiraron 110 \mul de suspensión y se transfirieron en placas
OPTIPLATE de 96 pocillos que contenían 100 \mul de CsCl 5M.
Después de 4 horas, las placas se leyeron durante 2 minutos en un
lector de radiactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: se probaron
inhibidores a diferentes concentraciones que varían desde 0,0015 a
10 \muM. Se analizaron los datos experimentales por el programa de
ordenador GraphPad Prizm usando la ecuación logística de cuatro
parámetros:
y = nivel
basal+(nivel superior-nivel
basal)/(1+10^{A}((logCI_{50}-x)*pendiente))
donde x es el logaritmo de la
concentración del inhibidor, y es la respuesta; y empieza en el
nivel basal y va al nivel superior con una forma
sigmoidal.
Procedimiento experimental: se llevó a
cabo la reacción en tampón (Tris 10 mM, pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM,
BSA al 0,2 mg/ml, 7,5 mM DTT) conteniendo enzima 3,7 nM, histona y
ATP (proporción constante de ATP 1/3000). La reacción se detuvo con
EDTA y el sustrato se capturó en fosfomembrana (placas de 96
pocillos Multiscreen de Millipore). Después de lavado exhaustivo,
las placas multiscreen se leyeron en un contador top. Se midió el
control (a tiempo cero) para cada concentración de ATP y de
histona.
Diseño experimental: se midieron las
velocidades de reacción a cuatro concentraciones de ATP, sustrato
(histona) e inhibidor. Se diseñó una matriz de concentración de 80
puntos alrededor de los valores de ATP y de Km de sustrato
respectivos, y los valores de CI_{50} del inhibidor (0,3, 1, 3, 9
veces los valores de Km o de CI_{50}). Un experimento durante el
tiempo preliminar en la ausencia de inhibidor y a las diferentes
concentraciones de ATP y de sustrato permite la selección de un
tiempo de punto final individual (10 min) en el intervalo lineal de
la reacción para el experimento de determinación de Ki.
Parámetros cinéticos estimulados: se
estimaron los parámetros cinéticos por regresión de mínimos
cuadrados no lineal simultánea usando [Eq. 1] (inhibidor
competitivo respecto a ATP, mecanismo al azar) usando el grupo de
datos completos (80 puntos):
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
en la que A=[ATP], B=[Sustrato],
l=[inhibidor], Vm= velocidad máxima, Ka, Kb, Ki son las constantes
de disociación de ATP, sustrato e inhibidor respectivamente.
\alpha y \beta son respectivamente el factor de cooperatividad
entre unión a sustrato y unión aATP y el factor de cooperatividad
entre unión a sustrato y unión a
inhibidor.
\vskip1.000000\baselineskip
Además los compuestos seleccionados se
caracterizan en un panel de serina/treonina quinasas estrictamente
relacionado con el ciclo celular (cdk2/ciclina E, cdkl/ciclina B1,
cdk5/p25, cdk4/ciclina D1), y además se caracterizan por
especificidad en MAPK, PKA, EGFR, IGF1-R,
Aurora-2 y Cdc 7.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de histona H1
biotinilada en el laborarorio de los autores de la presente
invención (Sigma n.º: H-5505) 10 \muM, ATP (0,3
microCi P^{33}\gamma-ATP) 30 \muM, 4 ng de
complejo GST-ciclina E/CDK2, inhibidor en un
volumen final de 30 \mul de tampón (TRIS HCl 10 mM pH 7,5,
MgCl_{2} 10 mM, DTT 7,5 mM + BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada
pocillo de una placa de 96 pocillos de fondo en forma de U. Después
de incubación durante 60 min a temperatura ambiente, la reacción se
detuvo por adición de 100 \mul de tampón PBS que contenía EDTA 32
mM, 500 \muM de ATP frío, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA
revestidas de estreptavidina a 10 mg/ml. Después de incubación de
20 minutos, se retiraron 110 \mul de suspensión y se
transfirieron en placas OPTIPLATE de 96 pocillos que contenían 100
\mul de CsCl 5M. Después de 4 horas, las placas se leyeron
durante 2 minutos en un lector de radiactividad
TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de histona
H1 biotinilada en el laborarorio de los autores de la presente
invención (Sigma n.º: H-5505) 4 \muM, ATP (0,2
microCi P^{33}\gamma-ATP) 20 \muM, 3 ng de
complejo ciclina B/CDK1, inhibidor en un volumen final de 30 \mul
de tampón (TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM, DTT 7,5 mM +
BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de una placa de 96
pocillos de fondo en forma de U. Después de incubación durante 20
minutos a temperatura ambiente, la reacción se detuvo por 100 \mul
de PBS + EDTA 32 mM + 0,1% Tritón X-100 + ATP 500
\muM, conteniendo 1 mg de perlas de SPA. Después se transfirió un
volumen de 110 \mul a Optiplate.
Después de 20 minutos de incubación para captura
de sustrato, se añadieron 100 \mul de CsCl 5M para permitir la
estratificación de perlas en la parte superior de la Optiplate y se
dejo permanecer 4 horas antes de la cuenta en el instrumento de
Top-Count.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo de inhibición de actividad cdk5/p25 se
lleva a cabo de acuerdo con el siguiente protocolo.
Reacción de quinasa: sustrato de histona
H1 biotinilada (Sigma n.º: H-5505), 10 \muM ATP
(0,3 microCi P^{33}\gamma-ATP) 30 \muM, 15 ng
de complejo CDK5/p25, inhibidor en un volumen final de 30 \mul de
tampón (TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM, DTT 7,5 mM + BSA a
0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de una placa de 96 pocillos
de fondo en forma de U. Después de incubación durante 35 minutos a
temperatura ambiente, la reacción se detuvo por adición de 100
\mul de tampón PBS conteniendo EDTA 32 mM, 500 \muM de ATP frío,
Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA revestidas de estreptavidina a
10 mg/ml. Después de incubación de 20 minutos, se retiraron 110
\mul de suspensión y se transfirieron en placas OPTIPLATE de 96
pocillos que contenían 100 \mul de CsCl 5M. Después de 4 horas,
las placas se leyeron durante 2 minutos en un lector de
radiactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de
GST-Rb de ratón (769-921) (n.º:
sc-4112 de Santa Cruz) 0,4 \muM, ATP (0,5 \muCi
P^{33}\gamma-ATP) 10 \muM, 100 ng de
GST-cdk4/GST-ciclina D1 expresado en
baculovirus, concentraciones adecuadas de inhibidor en un volumen
final de 50 \mul de tampón (TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCI_{2} 10
mM, DTT 7,5 mM + BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de
una placa de 96 pocillos de fondo en forma de U. Después de
incubación durante 40 minutos a 37ºC, se detuvo la reacción por 20
\mul de EDTA 120 mM.
Captura: se transfirieron 60 \mul de
cada pocillo a placa MultiScreen, para permitir la unión de sustrato
a filtro de fosfocelulosa. Las placas se lavaron después 3 veces
con 150 \mul de PBS libre de Ca^{++}/Mg^{++}/pocillo y se
filtraron por sistema de filtración de MultiScreen.
Detección: se dejaron secar filtros a
37ºC, después se añadió compuesto centelleante a 100 \mul/pocillo
y se detectó fragmento Rb marcado con ^{33}P mediante cuenta de
radiactividad en el instrumento Top-Count.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de MBP
(Sigma n.º: M-1891) biotinilado en el laborarorio de
los autores de la presente invención 10 \muM, ATP (0,15 microCi
P^{33}\gamma-ATP) 15 \muM, 30 ng de
GST-MAPK (Upstate Biothecnology n.º^{s}:
14-173), inhibidor en un volumen final de tampón
(TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM, DTT 7,5 mM + BSA a 0,2
mg/ml) de 30 \mul se añadieron a cada pocillo de una placa de 96
pocillos de fondo en forma de U. Después de incubación durante 35
minutos a temperatura ambiente, la reacción se detuvo por adición
de 100 \mul de tampón de PBS que contenía EDTA a 32 mM, ATP frío a
500 \muM, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA recubiertas de
estreptavidina a 10 mg/ml. Después de 20 minutos de incubación, se
retiraron y transfirieron 110 \mul de suspensión en OPTIPLATE de
96 pocillos conteniendo 100 \mul de CsCl 5M. Después de 4 horas,
se leyeron las placas durante 2 minutos en un lector de
radioactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de histona
H1 biotinilada (Sigma n.º: H-5505) en el laboratorio
de los autores de la presente invención 10 \muM, ATP (0,2 microCi
P^{33}\gamma-ATP) 10 \muM, 0,45 unidades
enzimáticas de PKA (Sigma n.º: 2645), inhibidor en un volumen final
de 30 \mul de tampón (TRIS HCl 10 mM pH 7,5, MgCl_{2} 10 mM,
DTT 7,5 mM + BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de una
placa de 96 pocillos de fondo en forma de U. Después de incubación
durante 90 minutos a temperatura ambiente, la reacción se detuvo por
adición de 100 \mul de tampón PBS conteniendo EDTA 32 mM, 500
\muM de ATP frío, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA revestidas
de estreptavidina a 10 mg/ml. Después de incubación de 20 minutos,
se retiraron 110 \mul de suspensión y se transfirieron en placas
OPTIPLATE de 96 pocillos que contenían 100 \mul de CsCl 5M.
Después de 4 horas, las placas se leyeron durante 2 minutos en un
lector de radiactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: sustrato de MBP
biotinilada (Sigma n.º: M-1891) en el laborarorio de
los autores de la presente invención 10 \muM, ATP (0,04 microCi
P^{33}\gamma-ATP) 2 \muM, 36 ng de
GST-EGFR expresado en células de insecto, inhibidor
en un volumen final de 30 \mul de tampón (Hepes 50 mM pH 7,5,
MgCl_{2} 3 mM, MnCl_{2} 3 mM, DTT 1 mM, NaCO_{3} 3 \muM +
BSA a 0,2 mg/ml) se añadieron a cada pocillo de una placa de 96
pocillos de fondo en forma de U. Después de incubación durante 20
minutos a temperatura ambiente, la reacción se detuvo por adición
de 100 \mul de tampón PBS conteniendo EDTA 32 mM, 500 \muM de
ATP frío, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA revestidas de
estreptavidina a 10 mg/ml. Después de incubación de 20 minutos, se
retiraron 110 \mul de suspensión y se transfirieron en placas
OPTIPLATE de 96 pocillos que contenían 100 \mul de CsCl 5M.
Después de 4 horas, las placas se leyeron durante 2 minutos en un
lector de radiactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo de inhibición de actividad
IGF1-R se lleva a cabo de acuerdo con el siguiente
protocolo.
\newpage
Activación de enzima:
IGF1-R se debe activar por autofosforilación antes
de empezar el experimento. Justo antes del ensayo, se incuba una
solución de enzima concentrada (694 nM) durante media hora a 28ºC en
la presencia de ATP 100 \muM y después se llevó a la dilución de
trabajo en el tampón indicado.
Reacción de quinasa: sustrato de péptido
IRS1 biotinilado (PRIMM) 10 \muM, inhibidor 0-20
\muM, ATP 6 \muM, 1 microCi
P^{33}\gamma-ATP, y
GST-IGF1-R 6 nM (preincubada durante
30 minutos a temperatura ambiente con ATP frío 60 \muM) en un
volumen final de 30 \mul de tampón (Hepes 50 mM pH 7,9, MnCl_{2}
3 mM, DTT 1 mM, NaCO_{3} 3 \muM) se añadieron a cada pocillo de
una placa de 96 pocillos de fondo en forma de U. Después de
incubación durante 35 minutos a temperatura ambiente, la reacción se
detuvo por adición de 100 \mul de tampón de PBS conteniendo EDTA
32 mM, ATP frío 500 \muM, Tritón al 0,1% X100 y perlas de SPA
revestidas de estreptavidina a 10 mg/ml. Después de incubación de
20 minutos, se retiraron 110 \mul de suspensión y se
transfirieron en placas OPTIPLATE de 96 pocillos que contenían 100
\mul de CsCl 5M. Después de 4 horas, las placas se leyeron
durante 2 minutos en un lector de radiactividad
TOP-Count de Packard.
\vskip1.000000\baselineskip
Reacción de quinasa: péptido biotinilado (4
repeticiones de LRRWSLG) 8 \muM, ATP (0,5 \muCi
P^{33}\gamma-ATP) 10 \muM, 7,5 ng de Aurora
2, inhibidor en un volumen final de 30 \mul de tampón (HEPES 50 mM
pH 7,0, MgCl_{2} 10 mM, DTT 1 mM, BSA a 0,2 mg/ml, ortovanadato 3
\muM) se añadieron a cada pocillo de una placa de 96 pocillos de
fondo en forma de U. Después de incubación de 60 minutos a
temperatura ambiente, la reacción se detuvo y el péptido
biotinilado fue capturado añadiendo 100 \mul de suspensión de
perlas.
Estratificación: se añadieron 100 \mul
de CsCl 2,5 M a cada pocillo y se dejaron reposar 4 horas antes de
que se contara la radiactividad en el instrumento
Top-Count.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
\vskip1.000000\baselineskip
El ensayo de inhibición de actividad de
Cdc7/dbf4 se llevó a cabo de acuerdo con el siguiente protocolo.
El sustrato de biotina-MCM2 se
transfosforila por el complejo Cdc7/Dbf4 en la presencia de ATP
localizado con P^{33}\gamma-ATP. El sustrato
biotina-MCM2 fosforilado se captura después por
perlas de SPA revestidas de estreptavidina y la extensión de la
fosforilación se evaluó realizando cuentas de \beta.
El ensayo de inhibición de actividad Cdc7/dbf4
se llevó a cabo en placa de 96 pocillos de acuerdo con el siguiente
protocolo.
Se añadieron a cada pocillo de la placa:
- 10 \mul de sustrato (MCM2 biotinilada,
concentración final 6 \muM)
- 10 \mul enzima (Cdc7/Dbf4, concentración
final de 17,9 nM)
- 10 \mul de compuesto de prueba (12
concentraciones crecientes en el intervalo nM a \muM varían para
generar una curva de respuesta a dosis)
- 10 \mul de una mezcla de ATP frío
(concentración final de 2 \muM) y ATP radioactivo (proporción
molar 1/5000 con ATP frío)
se usó después para comenzar la reacción que se
dejó tener lugar a 37ºC.
Se diluyeron sustrato, enzima y ATP en HEPES 50
mM pH 7,9 conteniendo MgCl_{2} 15 mM, DTT 2 mM, NaCO_{3} 3
\muM, glicerofosfato 2 mM y BSA al 0,2 mg/ml. El disolvente para
los compuestos de prueba contenía también DMSO al 10%.
Después de incubación durante 60 minutos, la
reacción se detuvo añadiendo a cada pocillo 100 \mul de PBS pH
7,4 conteniendo EDTA 50 mM, ATP frío 1 mM, Tritón al 0,1% X100 y
perlas de SPA revestidas de estreptavidina a 10 mg/ml.
Después de incubación de 20 minutos, se
retiraron 110 \mul de suspensión y se transfirieron en OPTIPLACA
de 96 pocillos que contienen 100 \mul de CsCl 5M. Después de 4
horas, las placas se leyeron durante 2 minutos en un lector de
radiactividad TOP-Count de Packard.
Determinación de CI_{50}: véase
anteriormente.
Los compuestos de fórmula (I) de la presente
invención, adecuados para la administración a un mamífero, por
ejemplo a humanos, se pueden administrar por las rutas usuales y el
nivel de dosificación depende de la edad, del peso, de las
afecciones del paciente y de la vía de administración.
Por ejemplo, una dosificación adecuada adoptada
para administración oral de un compuesto de fórmula (I) varía
preferentemente desde aproximadamente 10 hasta aproximadamente 500
mg por dosis, de 1 a 5 veces diarias.
Los compuestos de la invención se pueden
administrar en una diversidad de formas de dosificación, por ejemplo
oralmente, en forma de comprimidos, cápsulas, comprimidos
revestidos de azúcar o de película, soluciones o suspensiones
líquidas; rectalmente en forma de supositorios; parenteralmente, por
ejemplo intramuscularmente, o por inyección o infusión intravenosa
y/o intratecal y/o intraespinal.
Además, los compuestos de la invención se pueden
administrar bien como agentes individuales o bien, alternativamente,
en combinación con tratamientos anticancerígenos conocidos tales
como terapia de radiación o régimen de quimioterapia en combinación
con agentes citostáticos o citotóxicos, agentes del tipo de los
antibióticos, agentes alquilantes, agentes antimetabolitos, agentes
hormonales, agentes inmunológicos, agentes de tipo interferón,
inhibidores de ciclooxigenasa (por ejemplo inhibidores de
COX-2), inhibidores de
metalomatriz-proteasa, inhibidores de telomerasa,
inhibidores de tirosinaquinasa, agentes receptores de factores del
crecimiento, agentes anti-HER, agentes
anti-EGFR, agentes antiangiogénesis, inhibidores de
farnesiltransferasa, inhibidores de ruta de transducción de señales
ras-raf, inhibidores del ciclo celular, inhibidores
de las otras cdk, agentes de unión a tubulina, inhibidores de
topoisomerasa I, inhibidores de topoisomerasa II y similares,
opcionalmente en formulaciones liposomales de los mismos.
Si se formulan como una dosis fija, tales
productos de combinación emplean los compuestos de la presente
invención en el intervalo de dosificación anteriormente descrito y
el otro agente farmacéuticamente activo dentro del intervalo de
dosificación aprobado.
Los compuestos de fórmula (I) se pueden usar
secuencialmente con agentes anticancerígenos conocidos cuando es
inapropiada una formulación de combinación.
La presente invención también incluye
composiciones farmacéuticas que comprenden un compuesto de fórmula
(I) o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo en asociación
con un excipiente farmacéuticamente aceptable (que puede ser un
vehículo o un diluyente).
Las composiciones farmacéuticas que contienen
los compuestos de la invención se preparan usualmente siguiendo
procedimientos convencionales y se administran en una forma
farmacéuticamente adecuada.
Por ejemplo, las formas orales sólidas pueden
contener, conjuntamente con el compuesto activo, diluyentes por
ejemplo lactosa, dextrosa, sacarosa, sucrosa, celulosa, almidón de
patata o almidón de maíz; lubricantes, por ejemplo sílice, talco,
esteárico, estearato de magnesio o estearato de calcio, y/o
polietilenoglicoles; agentes de unión, por ejemplo almidones, goma
arábiga, gelatina, metilcelulosa, carboximetilcelulosa o
polivinilpirrolidona; agentes disgregantes, por ejemplo un almidón,
algínico, alginatos o glicolato de sodio almidón; mezclas
efervescentes; pigmentos; edulcorantes; agentes humectantes tales
como lecitina, polisorbatos, laurilsulfatos; y, en general,
sustancias no tóxicas y farmacológicamente inactivas usadas en
formulaciones farmacéuticas. Las preparaciones farmacéuticas se
elaboraron usando técnicas conocidas, por ejemplo, por medio de
procedimientos de mezcla, granulación, compresión, revestimiento
con azúcar o revestimiento con película.
Las dispersiones líquidas para administración
oral incluyen también por ejemplo jarabes, emulsiones y
suspensiones.
Se prefiere que los jarabes incluyan, por
ejemplo, sacarosa o sacarosa con glicerina y/o manitol y/o sorbitol
como vehículo.
Se prefiere que las suspensiones y las
emulsiones contengan como vehículo, por ejemplo, un caucho natural,
agar, alginato de sodio, pectina, metilcelulosa,
carboximetilcelulosa, o alcohol polivinílico.
La suspensión o las soluciones para inyecciones
intramusculares contiene(n) opcional y preferentemente,
conjuntamente con el compuesto activo, un vehículo
farmacéuticamente aceptable, por ejemplo agua estéril, aceite de
oliva, oleato de etilo, glicoles, por ejemplo propilenoglicol, y,
si se desea, una cantidad adecuada de clorhidrato de lidocaína. Las
soluciones para inyecciones o infusiones intravenosas contienen
opcional y preferentemente como vehículo, por ejemplo, agua estéril
o preferentemente pueden estar en forma de soluciones estériles,
acuosas, salinas isotónicas o pueden contener como un vehículo
propilenoglicol.
Se prefiere que los supositorios contengan
conjuntamente con el compuesto activo un vehículo farmacéuticamente
aceptable, por ejemplo manteca de cacao, polietilenoglicol, un
tensioactivo éster graso de polioxietileno sorbitán o lecitina.
Los siguientes ejemplos se desean por la
presente para ilustrar mejor la presente invención sin plantear
limitación alguna a ella.
La cromatografía ultrarrápida se llevó a cabo en
gel de sílice (calidad Merck 9395, 60A). Los tiempos de retención
de cromatografía líquida a alta presión (HPLC: valores de t.r.) se
determinaron por:
Procedimiento 1
(HPLC_1)
Instrumentación: bomba binaria de Hewlett
Packard 1312A; automuestreador de Gilson 215 ajustado con una
jeringuilla de 1 ml, Detector de Dispersión Lumínica Evaporativa
(ELSD) de Polymer Labs PL1000, y un espectrómetro de masas
Micromass ZMD que opera en modo de ionización positiva de
electropulverización. El eluyente de CL se divide y entra en el
espectrómetro de masas a aproximadamente 200 \mul/minuto, 800
\mul/minuto para el ELS.
Condición cromatográfica: fases móviles de HPLC
constituidas por ácido trifluoroacético al 0,1% en agua de calidad
HPLC (A) y ácido trifluoroacético al 0,1% en acetonitrilo de calidad
HPLC (B). El gradiente de HPLC se muestra en la tabla a
continuación
Los tiempos de retención de ELSD (HPLC a t.r.)
se dan en minutos. La masa se da como proporción m/z.
Procedimiento 2
(HPLC_2)
Instrumentación: sistema de HPLC Waters 2790
equipado con un detector PDA 996 Waters y un espectrómetro de masas
de cuadrupolo individual mod. ZQ de Micromass, equipado con una
fuente iónica de electropulverización (IEP).
Condición cromatográfica: columna RP18 Waters X
Terra (4,6 x 50 mm, 3,5 \mum); la fase móvil A fue tampón de
acetato de amonio 5 mM (pH 5,5 con ácido acético/acetonitrilo 95:5),
y la fase móvil B fue H_{2}O/acetonitrilo (5:95). Gradiente de B
desde el 10 al 90% en 8 minutos, mantener B al 90% 2 minutos.
Detección de UV a 220 nm y a 254 nm. Velocidad de flujo 1 ml/min.
Volumen de inyección 10 \mul. Rastreo completo, intervalo de
masas de 100 a 800 umas. El voltaje capilar fue 2,5 KV; la
temperatura de la fuente fue 120ºC; el cono fue 10 V. Los tiempos
de retención (HPLC a t.r.) se dan en minutos a 220 nm o a 254 nm. La
masa se da como proporción m/z.
Cuando es necesario, los compuestos se han
purificado por HPLC preparativa en una columna Waters Symmetry C18
(19 x 50 mm, 5 \mum) usando una HPLC 600 preparativa de Waters
equipada con detector PDA 996 Waters y un espectrómetro de masas de
cuadrupolo individual mod. ZQ de Micromass, ionización de
pulverización electrónica, modo positivo. La fase móvil A fue ácido
trifluoroacético al 0,01% en agua (TFA), y la fase móvil B fue
acetonitrilo. Gradiente de B del 10 al 90% en 8 minutos, mantenido
B al 90% 2 minutos. Velocidad de flujo 20 ml/minuto.
Se llevó a cabo espectrometría de RMN ^{1}H en
un instrumento de entrante individual Bruker AVANCE a 400 MHz con
gradientes. Se equipó con una sonda QNP (sonda de 4 núcleos
intercambiable - 1H, 13C, 19F y 31 P) (procedimiento de RMN 1) o en
un Mercury VX 400 operando a 400,45 MHz equipado con una sonda de
resonancia doble de 5 mm [1H (15N-31P) ID_PFG
Varian] (procedimiento de RMN 2).
Como se indica antes, varios derivados de
pirrolo-piridinas de fórmula (I) de la invención
(también identificados como azaindoles dentro de poco) se han
sintetizado en paralelo, de acuerdo con técnicas de química
combinatoria.
A este respecto, algunos compuestos así
preparados se han identificado convenientemente y sin ambigüedad,
como por el sistema codificante de tablas III y de V a VIII,
conjuntamente con tiempo de retención de HPLC (procedimientos 1 y
2) y masa. La tabla IV, en cambio, hace referencia a datos de RMN
analítica para algunos compuestos representativos de fórmula (I) de
la biblioteca.
Cada código, que identifica un compuesto de
fórmula (I) específico individual, consta de tres unidades
A-M-B.
A representa cualquier sustituyente R_{1}-
[véase fórmula (I)] y está unido al resto del resto azaindol por el
átomo de carbono tal como para conseguir derivados azaindol que
estén sustituidos en posición 3
(A-M-B); cada radical A
(sustituyente) está representado en la tabla I siguiente.
B representa cualquier sustituyente R- [véase
fórmula (I)] y está unido al resto del resto azaindol por el átomo
de nitrógeno tal como para conseguir derivados azaindol que estén
sustituidos en posición 5 (A-M-B);
cada radical B (sustituyente) está representado en la tabla II
siguiente.
M se refiere al núcleo central del resto
3-carboxi-azaindol divalente que
tiene el grupo -N- en posición 5, sustituido con grupos A y B.
Para facilidad de referencia, cada uno de los
grupos A o B de tablas I y II se ha identificado con la fórmula
química apropiada que indica también el punto de unión con el resto
de la molécula M.
Justo como un ejemplo, el compuesto
A21-M-B10 de tabla V (véase Entrada
3162) representa un azaindol M que está sustituido en posición 5
por el grupo B10 y en posición 3 (a través del grupo -NH-) por el
grupo A21; asimismo, el compuesto
A10-M-B70 de tabla III (véase
Entrada 2083) representa un azaindol M que está sustituido en
posición 5 por el grupo B70 y en posición 3 (a través del grupo
-NH-) por el grupo A10:
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Ejemplo
1
A una solución enfriada en hielo de 187,7 g
(0,616 mol) de nitrato de tetrabutilamonio en 2,07 l de
diclorometano, se añadió gota a gota durante un periodo de 25
minutos anhídrido trifluoroacético (85,7 ml, 0,616 mol), en
nitrógeno. Esta mezcla se transfirió lentamente, por medio de
cánula, a una solución preformada de 150,0 g (0,474 mol) de éster
metílico del ácido
1-(fenilsulfonil)-1H-pirrolo[2,3-b]piridina-3-carboxílico
en 2,7 l de diclorometano a +4ºC. La mezcla de reacción se agitó a
+4ºC durante 4 horas y después se mantuvo a esta temperatura
durante 23 horas adicionales. La masa de reacción fría se vertió en
2,3 l de agua y se agitó durante 1 hora. La fase acuosa se separó y
se extrajo de nuevo con 1 l de diclorometano. Los extractos
orgánicos combinados se concentraron a vacío hasta una suspensión
amarilla espesa, que se trató con 1,05 l de metanol. La suspensión
se enfrió a 0ºC y se agitó durante 1 hora adicional antes de que
ello se filtrara, se lavó con metanol y se secó proporcionando 128
g de compuesto del título puro como un sólido amarillo lanoso
(rendimiento = 74,7%). P.f. = 195-196ºC.
RMN ^{1}H-procedimiento 2
(DMSO): 3,91 (s, 3H), 7,64-7,69 (m, 2H),
7,76-7,81 (m, 1H), 8,25-8,27 (m,
2H), 8,74 (s, 1H), 8,96 (d, 1H, J=2,58 Hz), 9,27 (d, 1H, J=2,58
Hz).
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Ejemplo
2
Se añadieron a una suspensión de 95,7 g (0,265
mol) del compuesto de ejemplo 1 en 1,34 l de
2,2,2-trifluoroetanol, 0,545 l de NaOH al 17%
durante un periodo de 40 minutos en agitación vigorosa. La mezcla
amarillo-naranja se calentó a reflujo durante 16
horas y después se enfrió a 0ºC y se agitó durante 2 horas
adicionales. El precipitado se retiró por filtración, se lavó con
acetona y se secó proporcionando 79,8 g del compuesto del título
como un sólido cristalino naranja (rendimiento = 93,1% como
tetrahidrato). P.f. >230ºC.
RMN ^{1}H-procedimiento 2
(DMSO): 7,83 (sa, 1H), 8,89 (d, 1H, J=2,80 Hz), 9,07 (sa, 1H).
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Ejemplo
3
A una solución transparente del compuesto de
ejemplo 2 (88,10 g, 0,35 mol) en 2,65 l de agua, se añadió gota a
gota HCl concentrado (52,6 ml, 0,526 mol) diluido con 105 ml de agua
durante un periodo de 50 minutos en agitación eficiente a
temperatura ambiente. La suspensión resultante se enfrió a +4ºC y se
agitó durante 1 hora adicional. El precipitado se eliminó por
filtración, se lavó con agua y se secó finalmente dando 55,6 g del
compuesto del título como un polvo amarillo claro (rendimiento =
98,5% (95% del título)). P.f. = 282-285ºC. RMN
^{1}H-procedimiento 2 (DMSO): 8,41 (d, 1H, J=2,83
Hz), 9,00 (d, 1H, J=2,59 Hz), 9,16 (d, 1H, J=2,59 Hz),
12,5-13,0 (sa, 1H), 13,14 (s, 1H).
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Ejemplo
4
Se hinchó en DCM resina AM de
4-(4-formil-3-metoxifenoxi)butirilo
[copoli(estireno-divinilbenceno al 1%) malla
100-200] (1,5 g, 1 equivalente, carga 0,94 mmol/g) y
después se filtró. Se añadió una mezcla de THF/DCM (4:1,15 ml),
isoamilamina (6 eq.) y AcOH (6 eq.). Después de 15 minutos, se
añadió NaBH(OAc)_{3} y la reacción se agitó durante
toda una noche a temperatura ambiente. Después de filtración, la
resina se lavó con metanol (x 3), DMF/DCM (1:1) (x 3) y DCM (x
5).
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Ejemplo
5
Etapa
(a)
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Se añadió a la resina de ejemplo 4 (10 g, 0,77
mmol/g, 7,7 mmol) en DMF anhidro (100 ml)
3-carboxi-5-nitro-7-azaindol
(2,39 g, 11,55 mmol), TBTU (3,71 g, 11,55 mmol) y DIPEA (2,92 g,
23,10 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente
durante 20 horas y después la resina se aisló por filtración. La
resina se lavó secuencialmente con DMF (100 ml), DCM (100 ml), DMF
(100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml),
DCM (100 ml), MeOH (100 ml) y TBME (100 ml x 2) y se secó a vacío
dando la resina unida a 7-azaindol (11,30 g).
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Se llevó a cabo control de carga de resina
mostrando la carga completa del bloque de construcción sobre la
resina y que no ha ocurrido ninguna oligomerización mientras tuvo
lugar el acoplamiento con TBTU. Se usó cloruro de benzoílo con el
fin de terminar amina cargada de resina sin reaccionar (es decir
isoamilamina, por ejemplo 5) y de acilar el
1-NH-azaindol. La ausencia de
benzamida (es decir isoamilbenzamida, por ejemplo 5) en la mezcla
escindida muestra la carga cuantitativa del armazón en la resina. La
presencia de 1-N-benzoilazaindol o
de 1-NH-azaindol, mostró que no ha
ocurrido homoacoplamiento del
3-carboxi-5-nitro-7-azaindol
durante la etapa de carga de resina.
Se añadieron DIPEA (0,035 g, 0,265 mmol) y
cloruro de benzoilo (0,038 g, 0,265 mmol) a la resina obtenida tras
el procedimiento descrito en el ejemplo 5 (etapa a) (0,035 g, 0,027
mmol) en DCM (1 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 4 horas
y la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. El
producto se escindió de la resina (1 ml de TFA al 60%/DCM durante
20 minutos) dando un sólido blanquecino (0,008 g, al 80%). CLEM
(muestra una mezcla del azaindol
1-N-benzoilado y del
1-NH-azaindol): m/z 277 [M+H]+ m/z
318 [M+MeCN+H]^{+} (pureza al 17% a 215 nm) y m/z 381
[M+H]^{+}, m/z 422 [M+MeCN+H]^{+} y m/z 761
[2M+H]^{+} a t.r. 2,04 minutos (pureza del 74% a 215
nm).
\vskip1.000000\baselineskip
Etapa
(b)
A la resina obtenida en la etapa (a) (11 g, 7,5
mmol) en NMP (100 ml), se añadió cloruro dihidrato de
estaño(II) (15,94 g, 77 mmol). La mezcla de reacción se
agitó a temperatura ambiente durante 20 horas y después la resina
se aisló por filtración. La resina se lavó secuencialmente con DMF
(100 ml), DCM (100 ml), DMF (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml),
agua (100 ml), MeOH (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml), DCM (100
ml), MeOH (100 ml), TBME (100 ml x 2) y se secó a vacío dando el
azaindol unido a resina (11,05 g). Se escindieron 0,01 g de resina
con 1 ml de TFA al 60%/DCM durante 20 minutos, dando un sólido
blanquecino (0,0014 g, al 74%).
CLEM: m/z 247 [M+H]+ y m/z 288 [M+MeCN+H]+ a
t.r. 1,35 minutos (pureza al 96% a 215 nm).
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Etapa
c
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Se añadió base de Hunig (0,050 g, 0,385 mmol) a
la resina de la etapa (b) (0,11 g, 0,075 mmol) en DCM (1 ml)
seguida por cloruro de 4-metoxibenzoílo (que
corresponde al fragmento B47 de Tabla II, 0,065 g, 0,385 mmol). La
mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 20 horas
y después la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire.
La resina se agitó en una solución de
acetonitrilo/amoniaco (1 ml, 4:1) durante 4 horas y después se aisló
por filtración. La resina se lavó secuencialmente con DMF (1 ml),
DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH
(1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml
x 2) y después se secó al aire. El producto se escindió de la
resina (TFA al 60%/DCM, 3 x (3 x 0,5 ml)) dando un sólido
blanquecino (0,016 g, al 55%) de fórmula (I) que corresponde a
A32-M-B47 (véase Entrada 964 de
tabla III más adelante).
RMN ^{1}H-procedimiento 1
(MeOH d-4): 8,75 (1H, d, 2,3 Hz), 8,67 (1H, s), 7,97
(1H, s), 7,85 (2H, d, 8,8 Hz), 6,92 (2H, d, 8,9 Hz), 3,75 (3H, s),
3,39 (2H, t, 7,5 Hz), 1,62-1,52 (1H, m),
1,44-1,37 (2H, m), 0,85 (6H, d, 6,6 Hz), no se
observaron indol y NH-amidas;
CLEM (HPLC_1): m/z 381 [M+H]+ a t.r. 1,24
minutos (al 100% por detección de ELS).
Tras el procedimiento descrito anteriormente, es
decir partiendo de cualquier derivado de amino adecuado que se
mantenga sobre la resina de acuerdo con el ejemplo 4, y trabajando
como por las etapas anteriores desde (a) hasta (c) de ejemplo 5 en
la presencia de cualquier derivado de cloruro de acilo, se
prepararon los siguientes compuestos de tabla III (es decir
biblioteca):
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\newpage
Para las entradas desde la 2774 hasta la 2813 de
la Tabla III, también se hace funcionar RMN ^{1}H
(RMN-procedimiento 2) y los datos se comunicaron en
la Tabla IV siguiente
Ejemplo
6
Trabajando como se describe en los ejemplos 4 y
5 y llevando a cabo la reacción de terminación con cloruro de
sulfonilo de
2-trifluorometil-benceno
(correspondiente a fragmento B13 de tabla II) en lugar del derivado
de cloruro de acilo, el compuesto del título se se obtuvo de acuerdo
con las siguientes condiciones operativas.
Se añadieron a la resina que se obtiene en la
etapa (b) de ejemplo 5 (0,11 g, 0,075 mmol) en DCM (1 ml), piridina
(0,030 g, 0,385 mmol), DMAP (0,001 g, 0,0077 mmol) y cloruro de
2-trifluorometilbenceno sulfonilo (0,094 g, 0,385
mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante
20 horas y después la resina se aisló por filtración. La resina se
lavó secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1
ml), MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1
ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secaron
al aire. El producto se escindió de la resina (TFA al 60%/DCM, 3 x
(3 x 0,5 ml)) dando un sólido blanquecino (0,02 g, 55%) que
corresponde al compuesto A32-M-B13
(véase Entrada 3364 de la tabla V más adelante).
CLEM (HPLC_1): m/z 455 [M+H]^{+} y 496
[M+MeCN+H]^{+} a t.r. 1,36 minutos (97,5% por detección
ELS).
Trabajando de acuerdo con cualquier ejemplo
anterior, es decir empezando de acuerdo con cualquier derivado de
amino mantenido en resina adecuado y llevando a cabo la reacción de
terminación con cualquier derivado de cloruro de sulfonilo
adecuado, se obtuvieron así los siguientes compuestos de la Tabla V
(es decir biblioteca).
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Ejemplo
7
La reacción se llevó a cabo trabajando como se
comunica en el ejemplo 4, en la presencia de
4-fluorobencilamina en vez de isoamilamina.
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Ejemplo
8
Etapa
a
A la resina del ejemplo 7 (7,5 g, 0,77 mmol/g,
5,7 mmol) en DMF anhidro (75 ml), se añadieron
3-carboxi-5-nitro-7-azaindol
(1,794 g, 8,67 mmol), TBTU (2,78 g, 8,67 mmol) y DIPEA (2,24 g,
17,34 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente
durante 20 horas y después la resina se aisló mediante filtración.
La resina se lavó secuencialmente con DMF (75 ml), DCM (75 ml), DMF
(75 ml), DCM (75 ml), MeOH (75 ml), DCM (75 ml), MeOH (75 ml), DCM
(75 ml), MeOH (75 ml), TBME (75 ml x 2) y se secó a vacío dando el
7-azaindol unido a resina (8,50 g).
\vskip1.000000\baselineskip
El control de carga de resina se llevó a cabo
mostrando la carga completa del bloque de construcción en la resina
y que no ha ocurrido ninguna oligomerización durante el acoplamiento
con TBTU.
Se añadieron DIPEA (0,035 g, 0,265 mmol) y
cloruro de benzoílo (0,038 g, 0,265 mmol) a la resina (0,035 g,
0,027 mmol) en DCM (1 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 4
horas y la resina se aisló mediante filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y se secó al aire. El producto
se escindió a partir de la resina (1 ml de TFA al 60%/DCM durante 20
minutos) dando un sólido blanquecino (0,007 g, al 64%). CLEM
(HPLC_1) (indol N-benzoilado): m/z 419 [M+H]+ a t.r.
1,56 min (al 97% por detección ELS).
Etapa
b
Se añadieron a la resina de la etapa (a) (8,4 g,
5,7 mmol) en DCM anhidro (75 ml), DMAP (0,07 g, 0,58 mmol) y
di-terc-butilcarbonato (12,60 g,
57,8 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente
durante 20 horas y después se aisló la resina mediante filtración.
La resina se lavó secuencialmente con DMF (75 ml), DCM (75 ml), DMF
(75 ml), DCM (75 ml), MeOH (75 ml), DCM (75 ml), MeOH (75 ml), DCM
(75 ml), MeOH (75 ml), TBME (75 ml x 2) y se secó a vacío dando el
7-azaindol protegido unido a resina (9,0 g).
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Se llevó a cabo control de la protección de
1-N-azaindol mostrando la protección
completa con terc-butoxicarbonilo (boc) en el átomo
de nitrógeno de indazol en la posición 1, y que no estuvieron
presentes grupos NH.
A la resina (0,035 g, 0,027 mmol) en DCM (1 ml),
se añadieron DIPEA (0,035 g, 0,265 mmol) y cloruro de benzoílo
(0,038 g, 0,265 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante 4
horas y la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. El
producto se escindió de la resina (1 ml de TFA al 60%/DCM durante 20
minutos) dando un sólido blanquecino (0,008 g, al 80%). CLEM
(HPLC_1): m/z 315 [M+H]^{+} a t.r. 1,26 min (al 91% por
detección de ELS).
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Etapa
c
Se añadió cloruro dihidrato de estaño (II)
(13,03 g, 57,75 mmol) a la resina de la etapa (b) (9 g, 5,7 mmol)
en NMP (100 ml). La mezcla de reacción se agitó a temperatura
ambiente durante 20 horas y después se aisló la resina mediante
filtración. La resina se lavó secuencialmente con DMF (100 ml), DCM
(100 ml), DMF (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml), agua (100 ml),
MeOH (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100
ml), TBME (100 ml x 2) y se secó a vacío dando el azaindol unido a
resina (8,8 g). Se escindieron 0,01 g de resina (1 ml de TFA al
60%/DCM durante 20 minutos) dando un sólido blanquecino (0,0015 g,
al 69%).
CLEM (HPLC_1): m/z 285 [M+H]+ a t.r. 0,91 min
(al 100% por detección ELS).
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Etapa
d
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A la resina de la etapa (c) (8,8 g, 5,78 mmol)
en DCM (70 ml), se añadieron trietilamina (11,66 g, 115,5 mmol) y
cloroformiato de fenilo (18,01 g, 115,5 mmol). La mezcla de reacción
se agitó a temperatura ambiente durante 20 horas y después la
resina se aisló por filtración. La resina se lavó secuencialmente
con DMF (100 ml), DCM (100 ml), DMF (100 ml), DCM (100 ml), MeOH
(100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml), DCM (100 ml), MeOH (100 ml),
TBME (100 ml x 2) y se secó a vacío dando el azaindol unido a resina
(9,5 g). Se escindieron 0,01 g de resina (1 ml de TFA al 60%/DCM
durante 20 minutos) dando un sólido blanquecino (0,0025 g, 62%).
CLEM (HPLC_1) (sólo
bis-carbamato observado): m/z 525 [M+H]+ a t.r. 1,47
minutos (al 97% por detección de ELS).
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Etapa
e
A la resina de la etapa (d) (0,11 g, 0,077 mmol)
en DCM (1 ml), se añadió 2,6 dimetilpiperazina (correspondiente a
fragmento B139 de Tabla II, 0,176 g, 1,54 mmol). La mezcla de
reacción se agitó a temperatura ambiente durante 72 horas y después
la resina se aisló por filtración. La resina se lavó secuencialmente
con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml),
agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH
(1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. El producto se
escindió a partir de la resina (TFA al 60%/DCM, 3 x (3 x 0,5 ml))
dando un sólido blanquecino (0,031 g, al 95%) que corresponde al
compuesto A12-M-B139 (véase Entrada
3769 de Tabla VI más adelante).
RMN ^{1}H -procedimiento 1 (MeOH
d-4): 8,65 (1H, d, 2,3 Hz), 8,46 (1H, d, 2,3 Hz),
8,13 (1H, s), 7,44-7,37 (2H, m),
7,10-7,03 (2H, m), 4,57 (2H, s), 4,42 (1H, dd, 14,4
Hz, 2,0 Hz), 3,49-3,38 (1H, m),
3,34-3,31 (2H, m), 2,98-2,89 (2H,
m), 1,39 (6H, d, 6,6 Hz), indol y amidas-NH no se
observaron;
CLEM (HPLC_1): m/z 425 [M+H]+ a t.r. 0,95 min
(al 98% por detección ELS).
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(Tabla pasa a página
siguiente)
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Trabajando en analogía a lo que se ha descrito y
usando cualquier material adecuado de partida y reactante del
mismo, se prepararon los siguientes compuestos de Tabla VI (es decir
biblioteca):
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Ejemplo
9
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A una suspensión agitada de resina Wang de PNP
(resina Wang de p-nitrofenilcarbonato, 4,7 g, 0,52
mmol/g, 2,5 mmol) en DMF anhidro (50 ml) a temperatura ambiente se
añadió piperazina (0,637 g, 7,41 mmol) y base de Hunig (0,956 g,
7,41 mmol). La mezcla de reacción se agitó durante 20 horas y se
aisló por filtración. La resina se lavó secuencialmente conh DMF
(50 ml), DCM (50 ml), DMF (50 ml), DCM (50 ml), MeOH (50 ml), DCM
(50 ml), MeOH (50 ml), DCM (50 ml), MeOH (50 ml), TBME (50 ml x 2) y
se secó a vacío dando la diamina unida a resina (4,6 g).
La resina unida a carbamato se tomó en la
siguiente etapa sin análisis adicional.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
10
Etapa
a
A la resina (4,6 g, 0,52 mmol/g, 2,4 mmol) en
DMF anhidro (50 ml), se añadieron
3-carboxi-5-nitro-7-azaindol
(0,743 g, 3,588 mmol), TBTU (1,152 g, 3,588 mmol) y DIPEA (0,927 g,
7,176 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente
durante 20 horas y después la resina se aisló por filtración. La
resina se lavó secuencialmente con DMF (50 ml), DCM (50 ml), DMF
(50 ml), DCM (50 ml), MeOH (50 ml), DCM (50 ml), MeOH (50 ml), DCM
(50 ml), MeOH (50 ml), TBME (50 ml x 2) y se secó a vacío dando el
7-azaindol unido a resina (5,2 g).
Se añadieron DIPEA (0,024 g, 0,182 mmol) y
cloruro de benzoílo (0,025 g, 0,182 mmol) a la resina (0,035 g,
0,0182 mmol) en DCM (1 ml). La mezcla de reacción se agitó durante 4
horas y la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. El
producto se escindió de la resina (1 ml de TFA al 40%/DCM) dando un
sólido blanquecino (0,008 g, al 80%).
CLEM: m/z 380 [M+H]+, m/z 421 [M+MeCN+H]+ a t.r.
1,44 minutos (pureza del 84% a 215 nm).
\vskip1.000000\baselineskip
Etapa
b
A la resina (5 g, 2,3 mmol) en NMP (50 ml) se
añadió cloruro dihidrato de estaño (II) (5,4 g, 23,92 mmol). La
mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 20 horas
y después la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (50 ml), DCM (50 ml), DMF (50 ml), DCM (50
ml), MeOH (50 ml), agua (50 ml), MeOH (50 ml), DCM (50 ml), MeOH
(50 ml), DCM (50 ml), MeOH (50 ml), TBME (50 ml x 2) y se secó a
vacío dando el azaindol unido a resina (5,0 g). Se escindieron 0,01
g de resina (1 ml de TFA al 40%/DCM) dando un sólido blanquecino
(0,0009 g, al 75%).
CLEM: m/z 246 [M+H]+ a t.r. 0,22 min (pureza al
94% a 215 nm).
\vskip1.000000\baselineskip
Etapa
c
A la resina (0,11 g, 0,05 mmol) en DCM (1 ml) se
añadió base de Hunig (0,034 g, 0,26 mmol) y cloruro de benzoílo
(que corresponde a fragmento B25 de tabla II, 0,036 g, 0,26 mmol).
La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 20
horas y después la resina se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. La
resina se agitó en solución de acetonitrilo/amoniaco (1 ml, 4:1)
durante 4 horas y después se aisló por filtración. La resina se lavó
secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), DCM
(1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se secó al aire. El
producto se escindió de la resina (TFA al 40%/DCM, 3 x 0,5 ml)
dando un sólido blanquecino (0,012 g, al 63%) que corresponde al
compuesto A50-M-B25 (véase Entrada
3808 de la tabla VII más adelante).
CLEM (HPLC_1): m/z 350 [M+H]+ a t.r. 0,83
minutos (al 95% por detección de ELS).
\newpage
\global\parskip1.000000\baselineskip
Trabajando como se describe en el ejemplo 10 y
usando cualquier derivado amino mantenido en resina adecuado y
cualquier reactante de cloruro de acilo, se prepararon los
siguientes compuestos (por ejemplo biblioteca):
\newpage
Ejemplo
11
El compuesto del título se preparó trabajando
como se describe en las etapas (a) y (b) del ejemplo 10 y llevando
a cabo la reacción de la etapa (c) con cloruro de sulfonilo, como
sigue:
Etapa
(c)
A la resina (0,11 g, 0,052 mmol) que se obtiene
en la etapa (b) de ejemplo 10, en DCM (1 ml), se añadieron piridina
(0,021 g, 0,26 mmol), DMAP (0,001 g, 0,0052 mmol) y cloruro de
metanosulfonilo (correspondiente al fragmento B1 de tabla II, 0,030
g, 0,26 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente
durante 20 horas y después la resina se aisló por filtración. La
resina se lavó secuencialmente con DMF (1 ml), DCM (1 ml), DMF (1
ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), agua (1 ml), MeOH (1 ml), DCM (1 ml),
MeOH (1 ml), DCM (1 ml), MeOH (1 ml), TBME (1 ml x 2) y después se
secó al aire. El producto se escindió a partir de la resina (TFA al
40%/DCM 3 x 0,5 ml) dando un sólido blanquecino (0,018 g, al 100%)
correspondiente al compuesto del título
A50-M-B1 (véase Entrada 3858 de la
tabla VIII).
CLEM (HPLC_1): m/z 324 [M+H]+ a t.r. 0,22 min
(al 92% por detección con ELS).
Trabajando como se describe en el ejemplo 11 y
usando cualquier derivado amino mantenido adecuadamente en resina y
cualquier reactante de cloruro de sulfonilo, se prepararon los
siguientes compuestos:
Claims (19)
1. Un compuesto de fórmula (I)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
en la
que
R está seleccionado del grupo constituido por
-R^{a}, -COR^{a}, -CONR^{a}R^{b}, -SO_{2}R^{a} o
-COOR^{a}.
R_{1} es un grupo -NR^{c}R^{d} o
-OR^{c};
en los que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d},
son el mismo o diferentes, y son cada uno independientemente
hidrógeno o un grupo opcionalmente sustituido adicionalmente,
seleccionado de alquilo C_{1}-C_{6} lineal o
ramificado, alquenilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, alquinilo C_{2}-C_{6} lineal o
ramificado, cicloalquilo C_{3}-C_{6} o
cicloalquilalquilo C_{1}-C_{6}, arilo o
arilalquilo C_{1}-C_{6}, o heterociclo o
heterocicloalquilo C_{1}-C_{6} o, tomados
conjuntamente con el átomo de nitrógeno al que están unidos, tanto
R^{a} como R^{b} así como R^{c} y R^{d} pueden formar un
heterociclo de 4 a 7 miembros opcionalmente sustituido, que
contiene opcionalmente un heteroátomo o grupo heteroatómico de
anillo adicional seleccionado de S, O, N
o NH;
o NH;
o isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente
aceptables de los mismos.
\vskip1.000000\baselineskip
2. El compuesto de fórmula (I) según la
reivindicación 1, en el que R_{1} es -NR^{c}R^{d}.
3. El compuesto de fórmula (I) según la
reivindicación 1, en el que R^{1} es -OR^{c}.
4. El compuesto de fórmula (l) según la
reivindicación 1, en el que R^{a}, R^{b}, R^{c} y R^{d}
están seleccionados, cada uno independientemente, según se definen
en las tablas I y II.
5. El compuesto de fórmula (I) según la
reivindicación 1, que comprende adicionalmente R^{a}, R^{b},
R^{c} y R^{d} que está sustituido independiente y opcionalmente
por un resto seleccionado del grupo constituido por grupos
halógeno, nitro, oxo (=O), carboxi, ciano, alquilo, alquilo
polifluorado, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo;
arilo, heterociclilo, amino alquillamino, dialquilamino, arilamino,
diarilamino, ureido, alquilureido o arilureido; carbonilamino,
formilamino, alquilcarbonilamino, alquenilcarbonilamino,
arilcarbonilamino, alcoxicarbonilamino; hidroxialcoxi, ariloxi,
alquilcarboniloxi, arilcarboniloxi, cicloalqueniloxi o
alquilidenoaminoxi; alquilcarbonilo, arilcarbonilo, alcoxicarbonilo,
ariloxicarbonilo, cicloalquiloxicarbonilo, aminocarbonilo,
alquilaminocarbonilo, dialquilaminocarbonilo; alquiltio, ariltio,
alquilsulfonilo, arilsulfonilo, alquilsulfinilo, arilsulfinilo,
arilsulfoniloxi, aminosulfonilo, alquilaminosulfonilo y
dialquilaminosulfonilo.
\newpage
6. El compuesto de fórmula (I) según la
reivindicación 1 seleccionado del grupo constituido por:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
en los
que
la estructura de
A-M-B es
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
y M representa el núcleo central
del resto 3-carboxi-azaindol
divalente que tiene el grupo -N- en posición 5 sustituido con
grupos A y
B;
A representa cualquier sustituyente R_{1} y
está unido al resto azaindol por el átomo de carbono tal como para
conseguir derivados de azaindol sustituidos en posición 3, y cada A
es:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
y,
B representa cualquier sustituyente R y está
unido al resto azaindol a través del átomo de nitrógeno tal como
para conseguir derivados de azaindol que estén sustituidos en la
posición 5, y cada B es:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
7. Uso de un compuesto de la reivindicación 1 o
de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo para fabricar un medicamento para tratar enfermedades o
afecciones causadas por y/o asociadas con una actividad
proteinaquinasa alterada mediante la administración a un mamífero en
necesidad del mismo de una cantidad efectiva del compuesto de la
reivindicación 1 o de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente
aceptables del mismo.
8. El uso según la reivindicación 7 en el que la
enfermedad causada por y/o asociada con una actividad
proteinaquinasa alterada es un trastorno de proliferación celular
seleccionado del grupo constituido por cáncer, enfermedad de
Alzheimer, infecciones virales, enfermedades autoinmunes y
trastornos neurodegenerativos.
9. El uso según la reivindicación 8 en el que el
cáncer está seleccionado del grupo constituido por carcinoma,
carcinoma de células escamosas, tumores hematopoyéticos de linaje
linfoide o mieloide, tumores de origen mesenquimal, tumores del
sistema nervioso central y periférico, melanoma, seminoma,
teratocarcinoma, osteosarcoma, xeroderma pigmentosum,
queratoxantoma, cáncer folicular de tiroides y sarcoma de Kaposi y
el trastorno proliferativo celular está seleccionado del grupo
constituido por hiperplasia benigna de próstata, poliposis de
adenomatosis familiar, neuro-fibromatosis,
soriasis, proliferación de células lisas vasculares asociada con
aterosclerosis, fibrosis pulmonar, artritis, glomerulonefritis y
estenosis y reestenosis postquirúrgicas.
10. Uso de un compuesto de la reivindicación 1 o
de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo para fabricar un medicamento para inhibir angiogénesis o
metástasis de tumores en un mamífero mediante la administración a
dicho mamífero en necesidad de tratamiento de una cantidad
terapéuticamente efectiva de un compuesto según la reivindicación 1
o de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo.
11. Uso de un compuesto de la reivindicación 1 o
de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo para fabricar un medicamento para tratar rechace de
transplante de órganos o enfermedad huésped frente a injerto en un
mamífero mediante la administración a dicho mamífero en necesidad de
tratamiento de una cantidad terapéuticamente efectiva de un
compuesto según la reivindicación 1 o de isómeros, tautómeros y
sales farmacéuticamente aceptables del mismo.
12. Uso de un compuesto de la reivindicación 1 o
de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo para fabricar un medicamento para tratar o evitar alopecia
inducida por radioterapia o alopecia inducida por quimioterapia en
un mamífero mediante la administración a dicho mamífero en necesidad
de tratamiento de una cantidad terapéuticamente efectiva de un
compuesto según la reivindicación 1 o de isómeros, tautómeros y
sales farmacéuticamente aceptables del mismo.
13. El uso según la reivindicación 7 en el que
dicho tratamiento comprende adicionalmente someter al mamífero en
necesidad del mismo a un régimen de terapia de radiación o de
quimioterapia en combinación con al menos un agente citostático o
citotóxico.
14. El uso según la reivindicación 7 en el que
el mamífero en necesidad del mismo es un ser humano.
15. Uso de un compuesto de la reivindicación 1 o
de isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente aceptables del
mismo para fabricar un medicamento para inhibir actividad
proteinaquinasa poniendo en contacto la citada quinasa con una
cantidad efectiva de un compuesto de fórmula (I) de acuerdo con la
reivindicación 1 o isómeros, tautómeros y sales farmacéuticamente
aceptables del mismo.
16. Una biblioteca que comprende dos o más
compuestos de acuerdo con la reivindicación 1, preparada dicha
biblioteca de acuerdo con técnicas de química combinatoria en
condiciones de síntesis de fase sólida que comprenden las etapas
de:
a) hacer reaccionar un compuesto de fórmula
(III)
con una resina polimérica, tal como
para obtener un compuesto soportado en
resina;
\vskip1.000000\baselineskip
b) hacer reaccionar el compuesto soportado en
resina con cloruro de estaño (H) y
N-metil-\alpha-pirrolidinona
(NMP), para obtener el derivado 5-amino
correspondiente y, opcionalmente, hacerlo reaccionar según una
cualquiera de las etapas alternativas (c.1), (c.2), (c.3) o
(c.4)
\vskip1.000000\baselineskip
c.1) con uno cualquiera de los compuestos de
fórmula (V), (VI), (VII) o (VIII)
(V);R^{a}COZ
(VI);R^{a}NCO
(VII);R^{a}SO_{2}Z
(VIII),R^{a}OCOZ
en los que Z es un átomo de
halógeno, para obtener un compuesto de fórmula (I) en el que R es un
grupo -COR^{a}, -COHNR^{a}, -SO_{2}R^{a} o -COOR^{a},
respectivamente;
o
\vskip1.000000\baselineskip
c.2) con una amina de fórmula (IX) en presencia
de trifosgeno o de un cloroformiato
(IX)HNR^{a}R^{b}
para obtener un compuesto de
fórmula (I) en la que R es un grupo -CONR^{a}R^{b};
o
\vskip1.000000\baselineskip
c.3) con un derivado aldehído o cetona de
fórmula (X) según las condiciones operativas reductoras
(X)R^{a}-CO-R^{a}
para obtener un compuesto de
fórmula (I) en la que R es un grupo
-CH(R^{a})R^{a};
o
\vskip1.000000\baselineskip
c.4) con un yoduro o bromuro aromático de
fórmula (XI) o (XII)
(XI);R^{a}-I
(XII),R^{a}-Br
en presencia de un catalizador de
paladio y de un ligando, para obtener un compuesto de fórmula (I) en
la que R es R^{a} y R^{a} es un grupo aromático carbocíclico o
heterocíclico;
\vskip1.000000\baselineskip
d) escindir la resina del compuesto soportado en
resina, para obtener un compuesto de fórmula (I); y
opcionalmente
e) convertir el compuesto obtenido de fórmula
(I) en otro compuesto de fórmula (I) y/o en una sal
farmacéuticamente aceptable del mismo.
17. Una composición farmacéutica que comprende
una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto de fórmula (I)
de acuerdo con la reivindicación 1 y, al menos, un excipiente,
vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.
18. La composición farmacéutica según la
reivindicación 17 que comprende adicionalmente uno o más agentes
quimioterapéuticos.
19. Un kit que comprende un compuesto de fórmula
(I) según la reivindicación 1 que está opcionalmente asociado con
un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable y
uno o más agentes quimioterapéuticos.
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