ES2316675T3 - Metodos de transferencia genica con retrovirus. - Google Patents

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Mutsumi Sano
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Abstract

Un método para transferir un gen a células diana utilizando un retrovirus que comprende: (i) proporcionar un sustrato sobre el que se han inmovilizado - una sustancia capaz de unirse a un retrovirus y - un anticuerpo que se une específicamente a una célula diana; (ii) poner en contacto dicho sustrato con una suspensión que contiene retrovirus, donde dicha suspensión es un sobrenadante de cultivo no diluido o diluido de células productoras de retrovirus; (iii) lavar el sustrato al cual se une el retrovirus; y (iv) poner en contacto e incubar el sustrato al cual se une el retrovirus con las células diana, caracterizado porque dicho sustrato está en contacto con dicha suspensión que contiene retrovirus durante tres horas o más.

Description

Métodos de transferencia génica con retrovirus.
Campo técnico
La presente invención se refiere a un método que incrementa la eficacia de la transferencia génica a células diana y permite una transducción eficaz de las células diana, así como a una serie de técnicas relacionadas con él, en los campos de la medicina, la tecnología celular, la ingeniería genética, la tecnología evolutiva y similares.
Técnica anterior
Se han elucidado los mecanismos de numerosas enfermedades humanas. Las técnicas de ADN recombinante y las técnicas para transferir un gen a las células han progresado rápidamente. En estas circunstancias, se han desarrollado recientemente protocolos para las terapias génicas somáticas para el tratamiento de enfermedades genéticas graves. Más recientemente, se han hecho intentos de aplicar la terapia génica no solamente al tratamiento de enfermedades genéticas sino también al tratamiento de infecciones virales tales como el SIDA y los cánceres.
En la mayoría de las terapias génicas que se han examinado para la aplicación clínica a seres humanos hasta la fecha, se transfiere un gen a las células utilizando un vector retroviral recombinante. El vector retroviral transfiere eficazmente el gen foráneo de interés a las células e integra establemente el gen en su ADN cromosómico. Por lo tanto, es un medio preferible de transferencia génica concretamente para la terapia génica en la que se desea una expresión génica a largo plazo. Semejante vector se ha sometido a diversas modificaciones con el fin de que no tenga una influencia nociva sobre el organismo con el gen transferido. Por ejemplo, la función de replicación del vector se elimina de manera que el vector utilizado para la transferencia génica mientras se repite una infección ilimitada (transferencia génica).
Puesto que semejante vector (un vector retroviral carente de replicación) no puede replicarse autónomamente, generalmente se prepara un vector retroviral encapsulado en una partícula de virus utilizando células productoras de retrovirus (células de empaquetamiento). El método más simple para transferir eficazmente un gen a células diana comprende cultivar simultáneamente las células diana con las células productoras de retrovirus. No obstante, las células productoras de retrovirus pueden ser contaminadas en las células diana a las cuales se ha transferido un gen que será trasplantado a un organismo vivo en este método.
Recientemente, se informó de que la presencia de fibronectina, un componente de la matriz extracelular, o un fragmento de la misma aumenta la eficacia de la transferencia génica en las células utilizando un retrovirus (J. Clin. Invest., 93:1451-1457 (1994); Blood, 88:855-862 (1996)). Asimismo, se ha demostrado que un fragmento de fibronectina producido por técnicas de ingeniería genética tiene propiedades similares y se puede utilizar para transferir eficazmente un gen foráneo a células troncales hematopoyéticas (documento WO 95/26200). Se ha sugerido que la unión de una región de unión a heparina en la fibronectina a un retrovirus está implicada en el incremento de la eficacia de la transferencia génica debida a la fibronectina.
Además, se describe en el documento WO 97/18318 que las sustancias funcionales distintas de la fibronectina tales como el factor de crecimiento de fibroblastos aumentan la eficacia de la transferencia génica. En la publicación también se describe que se observa asimismo un incremento similar en la eficacia de la transferencia génica cuando se utiliza una mezcla de una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus y otra sustancia funcional que tiene actividad de unión a células.
Los métodos de transferencia génica que utilizan sustancias funcionales permiten una transferencia génica eficaz sin cultivar simultáneamente células productoras de retrovirus y células diana. Se cree que el incremento de eficacia en la transferencia génica por estos métodos se debe al incremento en la oportunidad de interacción entre el retrovirus y las células diana que están localizados entre sí de manera próxima con la ayuda de las sustancias funciona-
les.
En la transferencia génica en la que se utiliza un retrovirus, las células diana se infectan con el retrovirus, dando lugar a la transferencia génica como se ha descrito antes. No obstante, la eficacia de la transferencia génica en la que se utiliza un retrovirus todavía no es satisfactoria para la aplicación clínica práctica. De este modo, se desea incrementar adicionalmente la eficacia de infección.
Se puede obtener una eficacia de infección o una eficacia de la transferencia génica aumentadas incrementando la concentración (título) del retrovirus en la suspensión de virus (sobrenadante) utilizada. No obstante, la construcción y el establecimiento de células productoras de virus que pueden producir virus con un elevado título requieren normalmente mucho trabajo. Se puede concentrar un vector de tipo pseudoviral que utiliza una proteína de la envoltura del virus de la estomatitis vesicular [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:8033-8037 (1993)] mediante centrifugación. No obstante, puesto que semejante concentración se puede utilizar solamente para este vector, ésta no se puede utilizar ampliamente.
\newpage
Adicionalmente, la infección específica de las células diana con un retrovirus en la transferencia génica puede obtener una elevada eficacia de transferencia génica incluso si la pureza de las células diana es baja. Sin embargo, en el estado actual de la técnica no se conoce un método conveniente y eficaz.
Objetos de la invención
A la vista de las circunstancias descritas antes, el principal objeto de la presente invención es proporcionar un método mejorado para transferir un gen a células diana utilizando un retrovirus, en el cual la eficacia de la transferencia génica aumenta y las células diana son eficazmente transducidas.
Más adelante, se explicarán con detalle otros objetos y ventajas de la presente invención con referencia a los dibujos adjuntos.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 ilustra una estructura de una cadena de azúcar del tipo de elevado contenido de manosa que contiene nueve restos manosa en la molécula.
La Figura 2 es un gráfico que muestra la eficacia de la transferencia génica (%) obtenida utilizando CH-296 químicamente modificado en el Ejemplo 3.
La Figura 3 es un gráfico que muestra la relación entre la eficacia de la transferencia génica relativa (%) y el tiempo de contacto/unión en un estudio sobre el efecto de la separación de sustancias inhibidoras de la infección viral en el Ejemplo 13.
La Figura 4 es un gráfico que muestra la relación entre la eficacia de la transferencia génica relativa (%) y los respectivos procedimientos de unión al virus en un estudio sobre el efecto de la unión de retrovirus a sustancias funcionales utilizando el método de centrifugación en el Ejemplo 15.
La Figura 5 es un gráfico que muestra la eficacia de la transferencia génica (%) obtenida utilizando el método de centrifugación o el método de infección por centrifugación en el Ejemplo 15.
Compendio de la invención
Los autores de la presente invención han encontrado que la eficacia de la transferencia génica aumenta poniendo en contacto una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus e inmovilizándola sobre un sustrato con un retrovirus y lavando después el sustrato antes de infectar las células diana.
Los autores de la presente invención también han descubierto que se puede transferir un gen específicamente a las células diana de interés y/o eficazmente infectando las células diana con un retrovirus en presencia de una sustancia funcional tal como un anticuerpo que se une específicamente a las células diana, laminina, un azúcar derivado de laminina o una cadena de azúcar de tipo elevado contenido de manosa.
Los autores de la presente invención han descubierto adicionalmente que se puede aumentar la eficacia de la transferencia génica pre-tratando apropiadamente las células diana antes de someterlas a transferencia génica.
Además, los autores de la presente invención han descubierto que el efecto sobre la transferencia génica de una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un virus puede ser mejorado modificando químicamente la sustancia para incrementar su alcalinidad.
La presente invención se completa basándose en estos nuevos descubrimientos de los autores de la presente invención.
De este modo, el primer aspecto de la presente invención es un método para transferir un gen a una célula diana utilizando un retrovirus de acuerdo con la reivindicación 1 adjunta.
Además, la frecuencia de contacto entre el retrovirus y la sustancia funcional que tiene una actividad de unión al retrovirus se puede incrementar físicamente.
Los ejemplos de las sustancias funcionales que tienen actividad de unión al retrovirus que se pueden utilizar en la presente invención incluyen, pero no están limitadas a, fibronectina, factor de crecimiento de fibroblastos, colágeno de tipo V, polilisina y DEAE-dextrano, así como fragmentos de las mismas y sustancias que tienen una actividad de unión a retrovirus equivalente. La sustancia funcional puede tener actividad de unión a células diana. Alternativamente, se puede utilizar la sustancia funcional combinada con otra sustancia funcional que tiene una actividad de unión a las células diana. Los ejemplos de las sustancias funcionales que tienen una actividad de unión a las células diana que se pueden utilizar incluyen, pero no están limitados a, proteínas de adherencia celular, hormonas, citocinas, anticuerpos, cadenas de azúcar, carbohidratos y metabolitos.
Por ejemplo, se puede utilizar un sobrenadante de cultivo de células productoras de retrovirus como retrovirus para la transferencia génica en la presente invención. El sobrenadante de cultivo puede ser obtenido en presencia de una sustancia que intensifica la producción de retrovirus tal como el butirato de sodio.
Los ejemplos de los anticuerpos que se unen específicamente a las células diana utilizadas en la presente invención incluyen, pero no están limitados a, uno que reconoce una sustancia biológica sobre la superficie de las células diana.
El segundo aspecto de la presente invención es un método para transferir un gen a células diana utilizando un retrovirus de acuerdo con la reivindicación 3 adjunta.
Los ejemplos de las sustancias funcionales que tienen actividad de unión a los retrovirus que se pueden utilizar en el primer y segundo aspectos de la presente invención incluyen, pero no están limitados a, fibronectina, factor de crecimiento de fibroblastos, colágeno de tipo V, polilisina y DEAE-dextrano, así como fragmentos de las mismas y sustancias que tienen una actividad de unión a los retrovirus equivalente. La sustancia funcional puede tener una actividad de unión a las células diana. Además, la sustancia funcional se puede utilizar inmovilizándola sobre un sustrato apropiado.
Descripción detallada de la invención
Normalmente se utiliza un vector retroviral recombinante en el método de transferencia génica de la presente invención. En particular, se utiliza preferiblemente un vector retroviral recombinante carente de replicación. La capacidad de replicación de semejante vector se elimina de manera que no puede replicarse autónomamente en las células infectadas y, por lo tanto, el vector es no patógeno. El vector puede invadir una célula anfitriona tal como una célula de vertebrado (concretamente, una célula de mamífero) e integrarse establemente en un gen foráneo insertado dentro del vector en el ADN cromosómico.
En la presente invención, el gen foráneo que va a ser transferido a las células puede ser utilizado insertándolo en el vector retroviral recombinante bajo el control de un promotor apropiado, por ejemplo, el promotor LTR en el vector retroviral o un promotor foráneo. Además, pueden estar presentes otro elemento regulador (por ejemplo, una secuencia potenciadora o una secuencia terminadora) que coopera con el promotor y un sitio de inicio de la transcripción en el vector con el fin de obtener una transcripción eficaz del gen foráneo. El gen foráneo que se va a transferir puede ser un gen de origen natural o un gen preparado artificialmente. Alternativamente, el gen foráneo puede ser uno en el que las moléculas de ADN de diferentes orígenes se reúnen por medio de ligación u otro medio conocido en la técnica.
Se puede seleccionar cualquier gen del cual se desea la transferencia a las células como gen foráneo a insertar en el vector retroviral. Por ejemplo, se puede utilizar como gen foráneo un gen que codifica una enzima o una proteína asociada con la enfermedad que se va a tratar, un anticuerpo intracelular (véase, por ejemplo, el documento WO 94/02610), un factor de crecimiento, un ácido nucleico antisentido, una ribozima, un falso cebador (véase, por ejemplo, documento WO 90/13641) o similar.
El vector retroviral utilizado en la presente invención puede contener un gen marcador adecuado que permite la selección de las células a las que se ha transferido el gen. Por ejemplo, se puede utilizar como gen marcador un gen de resistencia a fármacos que confiere resistencia a los antibióticos a las células o un gen informador que hace posible distinguir las células a las que se ha transferido el gen detectando la actividad enzimática.
Los vectores que se pueden utilizar en la presente invención incluyen, por ejemplo, vectores retrovirales tales como el vector MFG (ATCC Núm. 68754), el vector \alpha-SGC (ATCC Núm. 68755) y el vector LXSN [BioTechniques, 7:980-990 (1989)]. Los vectores retrovirales utilizados en los Ejemplos de más abajo incluyendo el vector PM5neo [Exp. Hematol., 23:630-638 (1995)] contienen un gen de la neomicina-fosfotransferasa como gen marcador. De este modo, se pueden confirmar las células a las cuales se transfiere el gen utilizando el vector basándose en su resistencia a G418 como índice.
Estos vectores pueden ser preparados en forma de partículas virales en las cuales se empaquetan los vectores utilizando una línea celular de empaquetamiento conocida tal como PG13 (ATCC CRL-10686), PG13/LNc8 (ATCC CRL-10685), PA317 (ATCC CRL-9078), GP+E-86 (ATCC CRL-9642), GP+envAm12 (ATCC CRL-9641) y \varphiCRIP [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85:6460-6464 (1988)].
Se pueden utilizar medios conocidos tales como Medio de Eagle Modificado por Dulbecco y Medio de Dulbecco modificado por Iscoves para cultivar células productoras de virus que se producen transfiriendo un vector retroviral a células de empaquetamiento, o para cultivar células diana. Tales medios son asequibles comercialmente, por ejemplo, de Gibco. Se pueden añadir diversos constituyentes a estos medios dependiendo del tipo de células diana para la transferencia génica u otros objetos. Por ejemplo, se pueden añadir suero o diversas citocinas al medio con el fin de promover o suprimir el crecimiento o la diferenciación de las células diana. Por ejemplo, se puede utilizar suero de ternera (CS) o suero de ternera fetal (FCS) como suero. Los ejemplos de las citocinas incluyen interleucinas (IL-3, IL-6, etc.), factores estimuladores de colonias (G-CSF, GM-CSF etc.), factor de células troncales (SCF), eritropoyetina y diversos factores de crecimiento celulares. Muchas de estas citocinas derivadas de seres humanos son asequibles comercialmente. Entre las citocinas se selecciona una que tiene la actividad adecuada para los objetos. Opcionalmente, las citocinas se pueden utilizar combinadas.
Se utiliza una muestra que contiene un retrovirus tal como un sobrenadante de cultivo de células productoras de virus para el método de transferencia génica de la presente invención. El método para preparar el sobrenadante no está limitado a uno específico. Por ejemplo, se sabe que la adición de butirato de sodio durante el cultivo de células productoras de virus aumenta la cantidad de partículas de virus producidas en el sobrenadante [Human Gene Therapy, 6:1195-1202 (1995)]. El sobrenadante de virus de elevado título preparado de este modo se puede utilizar sin problemas utilizando el método de transferencia génica de la presente invención.
El método de la presente invención se caracteriza porque las células diana se infectan con un retrovirus en presencia de una sustancia funcional que tiene un sitio de unión a retrovirus. Las células a las que se ha transferido el gen se pueden obtener eficazmente infectando las células con un retrovirus en presencia de una cantidad eficaz de semejante sustancia funcional. Además, las sustancias inhibidoras de la infección viral del sobrenadante del virus se pueden separar fácilmente utilizando la sustancia funcional. Adicionalmente, la coexistencia de una sustancia funcional que tiene actividad de unión a células diana permite la transferencia génica con una mayor especificidad y/o eficacia.
Según se utiliza en la presente memoria, una cantidad eficaz es una cantidad eficaz para dar lugar a la transducción de las células diana por medio de la transferencia génica a las células diana utilizando un retrovirus. Una cantidad adecuada se selecciona dependiendo de la sustancia funcional que se va a utilizar y del tipo de células diana. La cantidad se puede determinar, por ejemplo, midiendo la eficacia de la transferencia génica mediante el método descrito en la presente memoria. Según se utiliza en la presente memoria, las actividades de unión a las células diana incluyen no solamente una actividad de unión a las células sino también una actividad de mantenimiento del contacto con las células diana en una solución. Las actividades se pueden medir basándose en la contribución a la eficacia de la transferencia génica como se ha descrito antes. Además, la eficacia de la transferencia génica representa la eficacia de transducción.
Las sustancias funcionales anteriormente mencionadas se pueden utilizar estando disueltas en una solución o siendo inmovilizadas sobre un sustrato apropiado. El sustrato para inmovilizar una sustancia funcional no está limitado a uno específico. Normalmente, se utiliza un recipiente para el cultivo celular o un sustrato con forma de cuentas.
Cuando se utiliza una sustancia funcional que tiene una actividad de unión a un virus y que es inmovilizada sobre un sustrato, la eficacia de la transferencia génica puede incrementarse adicionalmente utilizando las etapas ejemplificadas más abajo.
Primero, se pone en contacto una muestra líquida (p. ej., un sobrenadante de virus) que contiene un retrovirus con un sustrato sobre el que está inmovilizada una sustancia funcional que tiene una actividad de unión a un retrovirus. El sustrato se lava. Después el sustrato se pone en contacto directamente con las células diana. Alternativamente, se añaden a las células diana partículas de virus eluidas del sustrato mediante un método apropiado. De este modo, se puede transferir eficazmente un gen. La sustancia funcional utilizada que tiene una actividad de unión a un retrovirus puede tener actividad de unión a las células diana. Alternativamente, se pueden utilizar combinadas una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus y una sustancia funcional que tiene actividad de unión a células diana.
Una etapa en la que se pone en contacto una muestra líquida que contiene un retrovirus con un sustrato sobre el cual está inmovilizada una sustancia funcional que tiene actividad de unión al retrovirus se lleva a cabo, preferiblemente durante tres horas o más, sin limitación. Asimismo, tampoco están específicamente limitadas otras condiciones incluyendo la temperatura. Por ejemplo, la etapa se puede llevar a cabo, por ejemplo, a la temperatura ambiente o a 37ºC. Se pueden utilizar bajas temperaturas de alrededor de 4ºC dependiendo de la estabilidad de los virus o similares. El sustrato para inmovilizar una sustancia funcional se puede seleccionar apropiadamente dependiendo de los objetos. Si se utiliza un recipiente para el cultivo celular, se pueden iniciar las etapas de transferencia génica añadiendo solamente las células diana. Por ejemplo, se puede utilizar solución salina tamponada con fosfato o solución salina de Hanks, medio líquido utilizado para cultivar células diana o similares para lavar el sustrato.
Un retrovirus se puede unir más eficazmente a una sustancia funcional que tiene actividad de unión al retrovirus incrementando físicamente la frecuencia de contacto entre el retrovirus y la sustancia funcional. Los ejemplos de semejante medio físico incluyen, pero no están limitados a, la utilización del sacudimiento, la filtración y la fuerza centrífuga. La utilización de la fuerza centrífuga se ejemplifica específicamente por un método en el cual se añade una muestra líquida que contiene un retrovirus a un tubo de centrifugación en el cual una sustancia funcional que tiene actividad de unión al retrovirus está inmovilizada al fondo y después el tubo de centrifugación se centrifuga. El retrovirus precipita sobre el fondo del tubo de centrifugación por la fuerza centrífuga durante la centrifugación. Por consiguiente, la frecuencia de contacto entre el retrovirus y la sustancia funcional que tiene actividad de unión al retrovirus aumenta, dando lugar a un incremento en la frecuencia de unión. El método mencionado antes no coloca las células bajo un estrés físico como el método en el cual se hacen precipitar los virus sobre células por medio de la fuerza centrífuga para la infección (documento WO 95/10619). De este modo, el método de la presente invención da lugar a una mayor eficacia de transferencia génica.
La transferencia génica se puede llevar a cabo después de separar una sustancia contenida en una muestra que contiene un retrovirus, cuya existencia no es preferible para la transferencia génica, mediante el procedimiento descrito antes. Por ejemplo, las sustancias separadas mediante el método de la presente invención incluyen sustancias inhibidoras de la infección retroviral derivadas de células de empaquetamiento contenidas en un sobrenadante de virus [Human Gene Therapy, 8:1459-1467 (1997): J. Virol., 70:6468-6473 (1996)], sustancias añadidas durante el cultivo de células productoras de retrovirus con el fin de potenciar la producción de retrovirus tal como forbol 12-miristato 13-acetato (TPA) y dexametasona [Gene Therapy, 2:547-551 (1995)], así como butirato de sodio como se ha descrito antes.
Los ejemplos de las sustancias funcionales que tienen actividad de unión a un retrovirus que puede ser utilizado en la presente invención incluyen, pero no están limitados a, dominio de heparina II de fibronectina, factor de crecimiento de fibroblastos, colágeno de tipo V, polilisina y DEAE-dextrano, así como sustancias funcionalmente equivalentes a estas sustancias funcionales (por ejemplo, una sustancia funcional que tiene un sitio de unión a heparina). Además, se puede utilizar una mezcla de las sustancias funcionales, un polipéptido que contiene la sustancia funcional, un polímero de la sustancia funcional, un derivado de la sustancia funcional y similares.
La actividad de unión a un virus de la sustancia funcional se puede potenciar modificándola químicamente. Los ejemplos de las modificaciones químicas incluyen la activación de un resto aminoácido en la sustancia funcional utilizada y la introducción de un resto alcalino en la sustancia. Por ejemplo, la actividad de unión a un retrovirus se puede incrementar modificando un grupo carboxilo libre en la sustancia funcional que consiste en un péptido o una proteína con una carbodiimida soluble en agua tal como hidrocloruro de 1-etil-3-dimetilaminopropilcarbodiimida para activar el grupo carboxilo. Además, la actividad de unión a un retrovirus se puede incrementar utilizando el grupo carboxilo activado de este modo para introducir un resto alcalino tal como un grupo amino en la sustancia funcional.
Los ejemplos de la sustancia funcional que tiene actividad de unión a las células diana utilizada en la presente invención incluyen, pero no están limitados a, una sustancia que tiene un ligando que se une a las células diana. Los ligandos incluyen proteínas de adherencia celular, hormonas o citocinas, anticuerpos contra los antígenos de la superficie celular, polisacáridos, glicoproteínas, glicolípidos, cadenas de azúcares derivadas de glicoproteínas o glicolípidos, y metabolitos de las células diana. Además, se puede utilizar un polipéptido que contiene la sustancia funcional, un polímero de la sustancia funcional, un derivado de la sustancia funcional, un equivalente funcional de la sustancia funcional o similar.
Un anticuerpo que se une específicamente a las células diana es particularmente útil para transferir específica y eficazmente un gen a células específicas. El anticuerpo que se puede utilizar en la presente invención no está limitado a uno específico. Un anticuerpo contra un antígeno expresado sobre las células diana a las cuales se va a transferir un gen se puede seleccionar apropiadamente para su uso. Semejante anticuerpo se puede producir según los métodos conocidos. Alternativamente, también se pueden utilizar muchos anticuerpos asequibles comercialmente en la actualidad. El anticuerpo puede ser un anticuerpo policlonal o un anticuerpo monoclonal con tal que tenga las propiedades deseadas tales como la especificidad celular. Adicionalmente, también se puede utilizar un anticuerpo o un derivado de un anticuerpo modificado utilizando técnicas conocidas tales como un anticuerpo humanizado, un fragmento Fab o un anticuerpo de cadena sencilla.
Se ha estudiado con detalle la expresión de los respectivos antígenos de leucocitos (también conocidos como antígenos CD) sobre diversas células. De este modo, se puede transferir un gen a las células diana con una elevada especificidad seleccionando un anticuerpo que reconoce un antígeno CD expresado sobre las células diana de interés y utilizándolo en el método de transferencia génica de la presente invención. Por ejemplo, se puede dirigir la transferencia génica a las células T coadyuvantes utilizando un anticuerpo anti-CD4, o a las células troncales hematopoyéticas utilizando un anticuerpo anti-CD34.
Además, se puede utilizar una glicoproteína, laminina, como sustancia funcional que tiene actividad de unión a las células diana para transferir eficazmente un gen a diversas células diana tales como las células hematopoyéticas. La laminina que se puede utilizar en la presente invención puede derivar de ratón o de seres humanos, o puede ser un fragmento de la misma con tal que tenga actividad de unión a las células diana. Como se describe en los ejemplos de más abajo, la cadena de azúcar de la laminina juega un importante papel en la transferencia génica en la que se utiliza la laminina. Por lo tanto, también se puede utilizar una cadena de azúcar liberada de la laminina según un método conocido en el método de la presente invención. Además, también se puede utilizar una glicoproteína que tiene una cadena de azúcar unida a N del tipo de elevado contenido de manosa como la laminina, o una cadena de azúcar liberada de allí o sintetizada químicamente en la presente invención. Adicionalmente, se puede utilizar una sustancia tal como una proteína o similar que tiene la cadena de azúcar mencionada antes anclada a ésta. Por ejemplo, se puede utilizar preferiblemente una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus y que tiene una cadena de azúcar anclada a ésta para la transferencia génica.
La cadena de azúcar de tipo alto contenido de manosa mencionada antes no está limitada a una específica con tal que tenga de 1 a 20 restos manosa en la molécula. Preferiblemente se utiliza una que tiene un resto manosa en su extremo no reductor en el método de la presente invención. La cadena de azúcar se puede utilizar estando anclada a otra molécula apropiada tal como una molécula biológica (por ejemplo, un monosacárido, un oligosacárido, un polisacárido, un aminoácido, un péptido, una proteína o un lípido) o una sustancia artificial tal como una macromolécula sintética.
Las cadenas de azúcar de tipo alto contenido de manosa representativas derivadas de organismos están ejemplificadas por las que tienen una estructura representada por (Manosa)_{n}-(GlucNAc)_{2} [Protein, Nucleic Acid and Enzime, 43:2631-2639 (1998)]. Por ejemplo, se puede utilizar preferiblemente (Manosa)_{9}-(GlucNAc)_{2}, una cadena de azúcar que tiene la estructura descrita antes y contiene nueve restos manosa en la molécula, en el método de transferencia génica de la presente invención, sin limitación (la estructura de esta cadena de azúcar se muestra en la Figura 1).
La sustancia funcional descrita antes se puede obtener a partir de sustancias de origen natural, preparadas artificialmente (por ejemplo, mediante técnicas de ADN recombinante o técnicas de síntesis química), o se puede preparar combinando una sustancia de origen natural y una sustancia preparada artificialmente. Además, se puede utilizar una mezcla de una sustancia funcional que tiene un sitio de unión a retrovirus y otra sustancia funcional que tiene un sitio de unión a una célula diana para la transferencia génica utilizando las sustancias funcionales descritas en el documento WO 97/18318. Alternativamente, se puede utilizar una sustancia funcional que tiene un sitio de unión a retrovirus y un sitio de unión a la célula diana en una única molécula. Se utilizan sustancias funcionales sustancialmente libres de otras proteínas asociadas naturalmente a ellas. Adicionalmente, se puede combinar la sustancia funcional o una combinación de las sustancias funcionales con un medio utilizado para cultivar células diana, factor de crecimiento celular y similares para producir un estuche para la transferencia génica.
La fibronectina o un fragmento de la misma utilizada en el método de la presente invención se puede preparar en una forma sustancialmente pura a partir de materiales de origen natural según los métodos descritos, por ejemplo, en J. Biol. Chem., 256:7277 (1981); J. Cell. Biol., 102:449 (1986); o J. Cell. Biol., 105:489 (1987). La fibronectina o el fragmento de la misma se pueden preparar utilizando técnicas de ADN recombinante como se describe en la Patente de los Estados Unidos Núm. 5.198.423. Específicamente, un fragmento de fibronectina que contiene el dominio de heparina II, que es un sitio de unión a retrovirus, tal como los polipéptidos recombinantes incluyendo CH-296, H-271, H-296 y CH-271 utilizados en los Ejemplos de más abajo, así como el método para obtenerlos se describen con detalle en la publicación de la patente mencionada antes. Estos fragmentos se pueden obtener cultivando cepas de Escherichia coli consignadas con los números de acceso FERM P-10721 (H-296) (fecha de la consigna original: 12 de Mayo de 1989), FERM BP-2799 (CH-271) (fecha de la consigna original: 12 de Mayo de 1989), FERM BP-2800 (CH-296) (fecha de la consigna original: 12 de Mayo de 1989) y FERM BP-2264 (H-271) (fecha de la consigna original: 30 de Enero de 1989) en el National Institute of Bioscience and Human-Technology, Agency of Industrial Science and Technology, Ministry of International Trade and Industry, 1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken como se describe en la publicación. Además, los fragmentos que pueden derivar típicamente de estos fragmentos se pueden preparar modificando los plásmidos albergados en estas cepas de Escherichia coli utilizando técnicas de ADN recombinante conocidas. Entre los fragmentos de fibronectina descritos antes, H-296 tiene un polipéptido de la región de unión a VLA-4, CH-271 tiene un péptido de la región de unión a VLA-5; y CH-296 tiene ambos [Nature Medicine, 2:876-882 (1996)].
Las células a las que se ha transferido el gen se pueden obtener eficazmente infectando las células diana con un retrovirus en presencia de la sustancia funcional. La infección con el retrovirus se puede llevar a cabo según un método convencional, por ejemplo, incubando a 37ºC en CO_{2} al 5%. Estas condiciones y el tiempo de incubación se pueden cambiar adecuadamente dependiendo de las células diana o de los objetos.
Las células diana no son infectadas con un retrovirus cuando están en la fase G_{0}. Por lo tanto, es preferible conducir las células al ciclo celular estimulándolas previamente. Para este propósito, las células diana se cultivan en presencia de un factor de crecimiento adecuado para las células diana antes de la infección de las células con el retrovirus. Por ejemplo, se utilizan diversas citocinas tales como la interleucina-3, la interleucina-6 y el factor de las células troncales para estimular previamente células de médula ósea o células troncales hematopoyéticas para la transferencia
génica.
Se sabe que los receptores de la superficie de las células están implicados en la infección de las células con retrovirus. Se sabe que el transportador de aminoácidos alcalinos y el transportador de fosfato funcionan como receptores para los virus ecotrópicos y los virus anfotrópicos, respectivamente [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93:11407-11413 (1996)]. Es posible producir células diana susceptibles de infección viral tratando previamente las células en un medio en el cual las concentraciones de los aminoácidos alcalinos o los fosfatos, o sus sales o precursores se reducen para activar la expresión o el recambio metabólico de los transportadores.
Sorprendentemente, los autores de la presente invención han descubierto que la activación del receptor de transferrina, del cual no se conocía la implicación en la infección viral, también aumenta la eficacia de la infección retroviral o la eficacia de la transferencia génica. El receptor de transferrina se puede activar, sin limitación, tratando las células diana en un medio que contiene una concentración limitada de Fe. Por ejemplo, se puede utilizar un medio en el cual el Fe es quelado añadiendo desferoxamina.
Preferiblemente, la transferencia génica en la que se utiliza la activación de la transferrina también se lleva a cabo en presencia de la sustancia funcional como se ha descrito antes.
Los ejemplos de las células que se pueden utilizar como diana para la transferencia génica mediante el método de la presente invención incluyen, pero no están limitados a, células troncales, células hematopoyéticas, células mononucleares de baja densidad no adherentes, células adherentes, células de médula ósea, células troncales hematopoyéticas, células troncales de sangre periférica, células de sangre de cordón umbilical, células troncales hematopoyéticas fetales, células troncales embriogénicas, células embrionarias, células germinales primordiales, oocitos, oogonios, óvulos, espermatocitos, espermatozoides, células CD34+, células c-kit+, células progenitoras hematopoyéticas pluripotentes, células progenitoras hematopoyéticas unipotentes, células precursoras eritroides, células madre linfoides, células sanguíneas maduras, linfocitos, células B, células T, fibroblastos, neuroblastos, neurocitos, células endoteliales, células endoteliales vasculares, hepatocitos, mioblastos, células de músculo esquelético, células de músculo liso, células cancerosas, células de mieloma, células de leucemia, etcétera. El método de la presente invención se utiliza preferiblemente para las células hematopoyéticas que son asequibles de la sangre y la médula ósea debido a que estas células son relativamente fáciles de obtener y debido a que las técnicas para cultivarlas y mantenerlas están establecidas. Concretamente, si se pretende una expresión a largo plazo del gen transfectado, las células progenitoras de la sangre tales como las células troncales hematopoyéticas, las células CD34 positivas, las células c-kit positivas y las células progenitoras hematopoyéticas pluripotentes son adecuadas como células diana.
Por ejemplo, se puede llevar a cabo una terapia génica utilizando células troncales hematopoyéticas como células diana mediante el siguiente procedimiento.
Primero, se recoge una sustancia que contiene células troncales hematopoyéticas tales como tejido de médula ósea, sangre periférica y sangre de cordón umbilical. Semejante sustancia puede ser utilizada directamente en el procedimiento de transferencia génica. No obstante, las fracciones de células mononucleares que contienen células troncales hematopoyéticas se preparan normalmente por medio de centrifugación en gradiente de densidad y similares, o las células troncales hematopoyéticas se purifican adicionalmente utilizando moléculas marcadoras de la superficie celular tales como CD34 y/o c-kit. La sustancia que contiene las células troncales hematopoyéticas se infecta con un vector retroviral recombinante, en el cual está insertado un gen de interés según el método de la presente invención, después de haber sido estimulado previamente utilizando un factor de crecimiento celular adecuado, si fuera necesario. Las células con el gen transferido obtenidas de este modo se pueden transplantar a un receptor, por ejemplo, mediante administración intravenosa. Aunque el receptor es preferiblemente el propio donante, se puede llevar a cabo un transplante alogénico, por ejemplo, si se utiliza sangre de cordón umbilical como sustancia, se lleva a cabo el trasplante alogénico.
Algunas terapias génicas que utilizan células troncales hematopoyéticas como células diana son para complementar un gen deficiente o anómalo en un paciente (p. ej., la terapia génica para la deficiencia en ADA o la enfermedad de Gaucher). Además, se puede transferir un gen de resistencia a fármacos a las células troncales hematopoyéticas con el fin de aliviar la lesión de las células hematopoyéticas debida a los agentes quimioterapéuticos utilizados para el tratamiento del cáncer o la leucemia, por ejemplo.
Se investiga una terapia de vacunación contra tumores como terapia génica para el cáncer. En semejante terapia, se transfiere un gen para una citocina a células cancerosas, la capacidad de las células cancerosas para proliferar se impide, y después las células se hacen volver al organismo del paciente para potenciar la inmunidad tumoral [Human Gene Therapy, 5:153-164 (1994)]. Además, se realizan intentos de tratar el SIDA utilizando una terapia génica. En este caso, se considera el siguiente procedimiento. En el procedimiento, un gen que codifica una molécula de ácido nucleico (p. ej., un ácido nucleico antisentido o una ribozima) que interfiere en la replicación o la expresión del gen del VIH (virus de la inmunodeficiencia humana) se transfiere a las células T infectadas con el VIH, el agente causal del SIDA [p. ej., J. Virol., 69:4045-4052 (1995)].
Como se ha descrito antes con detalle, se puede transferir un gen a las células diana con una elevada eficacia y elevada especificidad utilizando la presente invención. Además, el método de la presente invención no requiere un equipo o instrumental especializado y es eficaz para diversos vectores retrovirales y células diana.
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Ejemplos
Los siguientes Ejemplos ilustran la presente invención con más detalle, pero no se debe considerar que limiten el alcance de la misma.
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Ejemplo 1
Preparación de polipéptidos derivados de fibronectina
Se preparó un polipéptido derivado de fibronectina humana, H-271, a partir de Escherichia coli HB101/pHD101 (FERM BP-2264) que contenía un plásmido recombinante pHD101 que contiene un ADN que codifica el polipéptido según el método descrito en la Patente de los Estados Unidos Núm. 5.198.423.
Se preparó un polipéptido derivado de fibronectina humana, H-296, a partir de Escherichia coli HB101/pHD102 (FERM P-10721) que contenía un plásmido recombinante pHD102 que contiene un ADN que codifica el polipéptido según el método descrito en la publicación mencionada antes.
Un polipéptido CH-271 se preparó como sigue.
Brevemente, se cultivó Escherichia coli HB101/pCH101 (FERM BP-2799) según el método descrito en la publicación mencionada antes. CH-271 se obtuvo del cultivo.
Un polipéptido CH-296 se preparó como sigue.
Brevemente, se cultivó Escherichia coli HB101/pCH102 (FERM BP-2800) según el método descrito en la publicación mencionada antes. CH-296 se obtuvo del cultivo.
Un polipéptido CH-274 se preparó como sigue.
Brevemente, se cultivó Escherichia coli JM109/pTF7221 (FERM BP-1915) según el método descrito en la Patente de los Estados Unidos Núm. 5.102.988. C-274 se obtuvo del cultivo.
Se preparó un polipéptido que tenía actividad de unión a un retrovirus derivado de colágeno de tipo V, colV, según el método descrito en el documento WO 97/18318.
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Ejemplo 2
Construcción de un vector retroviral y preparación de sobrenadante de retrovirus
Se introdujo un plásmido de retrovirus, vector PM5neo, que contiene un gen de la neomicina-fosfotransferasa [Exp. Hematol., 23:630-638 (1995)] en células GP+E-86 (ATCC CRL-9642). Las células se cultivaron en Medio de Eagle Modificado de Dulbecco (DMEM; Bio Whittaker) que contenía 10% de suero de ternera fetal (FCS; Gibco), 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina (ambas de Gibco). Todos los DMEM utilizados en el procedimiento de más abajo contenían los antibióticos mencionados antes. Se preparó un sobrenadante que contenía el virus PM5neo añadiendo 4 ml de DMEM conteniendo 10% de FCS a una placa (una placa para cultivo celular de 10 cm recubierta de gelatina, Iwaki Glass) en la cual se habían desarrollado las células productoras mencionadas antes hasta la semi-confluencia, cultivando durante la noche y recogiendo después el sobrenadante. El sobrenadante de cultivo recogido de este modo se filtró a través de un filtro de 0,45 micras (Millipore) para preparar una solución de partida de sobrenadante de virus, que se almacenó a -80ºC hasta su uso.
Los sobrenadantes de virus se prepararon a partir de las siguientes células según el procedimiento descrito antes: células BOSC23 de empaquetamiento ecotrópicas [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:8392-8396 (1993)], en las cuales se había introducido un plásmido de retrovirus pLEIN (Clontech; que contiene un gen de la neomicina fosfotransferasa y un gen de la proteína fluorescente verde potenciado (EGFP)); y células \varphiCRIP de empaquetamiento anfotrópicas [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85:6460-6464 (1988)]. Aquí en lo sucesivo, un virus preparado a partir de células BOSC23 es referido como Eco-EGFP, y un virus preparado a partir de células \varphiCRIP es referido como Anfo-EGFP, respectivamente.
Además, se preparó un sobrenadante de virus a partir de células GP+EnvAm12 (ATCC CRL-9641) que contenía un plásmido de retrovirus, vector TKNeo [J. Exp. Med., 178:529-536 (1993)] (que contiene un gen de la neomicina-fosfotransferasa) según el procedimiento descrito antes. Se utilizó DMEM que contenía 10% de suero de ternera (CS; Gibco) en lugar de FCS.
El título del sobrenadante de virus se midió según un método normalizado [J. Virol., 62:1120-1124 (1988)] en el que se utiliza como índice la eficacia de la transfección de un gen de la neomicina-fosfotranferasa a células NIH/3T3 (ATCC CRL-1658). Se calculó el número de partículas infecciosas contenidas en 1 ml del sobrenadante [cfu/ml]. La cantidad del sobrenadante de virus que se va a añadir en los experimentos de más abajo se determinó basándose en el valor calculado, es decir, el título del sobrenadante.
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Ejemplo 3
Preparación de la sustancia funcional que tiene actividad de unión a retrovirus y medida de su actividad
Se añadieron 50 \mul de una solución de 80 \mug/ml de H-271, H-296, C-274, CH-271, CH-296, ColV, factor de crecimiento de fibroblastos básico humano (bFGF; Progen), tenascina (Gibco) o factor de crecimiento epidérmico (EGF; Takara Shuzo), o 50 \mul de seralbúmina bovina al 2% (BSA, Sigma) a cada pocillo de una microplaca no tratada de 96 pocillos para el cultivo celular (Falcon). La placa se dejó estar a 4ºC durante la noche y después se lavó dos veces con solución salina tamponada con fosfato (PBS; Roman Kogyo). Alternativamente, una vez que la placa se hubo tratado como se ha descrito antes, se dispensaron 0,1 ml de una solución de 4 mg/ml de hidrocloruro de 1-etil-3-dimetilaminopropilcarbodiimida (Sigma) en agua pura estéril en cada pocillo. La reacción se dejó continuar a 37ºC durante 2 horas. La placa se lavó extensamente con agua pura para preparar una placa tratada con carbodiimida. Estas placas se almacenaron a 4ºC hasta que se llevaron a cabo los experimentos de infección viral.
Se añadieron 10^{4} células de leucemia de ratón L1210 (ATCC CCL-219), que se habían hecho crecer en medio RPMI 1640 (Bio Whittaker) suplementado con 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina, y 50 \mul de sobrenadante de virus PM5neo (10^{4} cfu/ml) al pocillo de la microplaca. Una vez que la placa se hubo incubado durante 24 horas, el medio se cambió por el mismo medio que contenía G418 (Gibco) a una concentración final de 0,75 mg/ml, y la placa se incubó después durante 48 horas más. Las células con resistencia a G418 se evaluaron según el método descrito por S. Kim y col., [Gene Therapy, 3:1018-1020 (1996)] con una modificación parcial en la que se medía el color desarrollado utilizando el reactivo Premix WST-1 (Takara Shuzo) como la absorbancia a 450 nm. Después de la incubación, se añadieron 10 \mul/100 \mul de cultivo del reactivo WST-1 al pocillo, la placa se incubó a 37ºC durante 4 horas más. Después se midió la absorbancia a 450 nm y 650 nm utilizando un lector de microplaca, y se calculó la diferencia (450 nm - 650 nm). El valor obtenido utilizando una placa recubierta con 2% de BSA sin tratamien-
to con carbodiimida se definió como el fondo. Los resultados de las tres rondas de estudios se resumen en la Tabla 1.
TABLA 1
1
Como se muestra en la Tabla 1, el incremento de la eficacia de la transferencia génica se observaba para las sustancias funcionales conocidas que tienen actividad de unión a un virus, es decir, H-271, H-296, CH-271, CH-296, ColV y bFGF. Además, aumentaba la aparición de células resistentes a G418 cuando se utilizaban C-274, tenascina, EGF, y BSA, que no tienen actividad de unión a un virus y se llevaba a cabo el tratamiento con carbodiimida.
A continuación, se utilizó CH-296 como sustancia funcional para llevar a cabo los experimentos siguientes.
Se añadieron 0,5 ml de CH-296 de 40 \mug/ml a cada pocillo de una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular (Falcon). La placa se incubó a 4ºC durante la noche y después se lavó con PBS (pH 5,8). Se añadieron a cada pocillo 625 \mul de solución de 10 mg/ml de hidrocloruro de 1-etil-3-dimetilaminopropilcarbodiimida (Sigma) en PBS (pH 5,8) que contenía etilendiamina [NH_{2}(CH_{2})NH_{2}; Nacalai Tesque], trimetilendiamina [NH_{2}(CH_{2})_{3}NH_{2}; Nacalai Tesque] o putrescina [NH_{2}(CH_{2})_{4}NH_{2}; Nacalai Tesque] a diversas concentraciones. La placa se incubó a 37ºC durante 2 horas. Se introdujo un grupo amino en el grupo carboxilo en la molécula de CH-296 por mediación de la carbodiimida en este procedimiento. La placa se lavó tres veces con PBS, y después se bloqueó con glicina/2% de PBS seguido de BSA/2% de PBS.
Las células GP+E86 en las cuales se había introducido un plásmido vector retroviral pLEIN se cultivaron en DMEM que contenía el 10% de CS. Después, se recogió un sobrenadante del cultivo. Se añadieron 0,5 ml de un sobrenadante de virus preparado diluyendo el sobrenadante para llevar la concentración a 1 x 10^{5} cfu/ml a cada pocillo de la placa. La placa se incubó durante 4 horas. Se añadieron adicionalmente 1 x 10^{4} células NIH/3T3 al pocillo. La placa se incubó durante 2 días. Tras la incubación, las células se recogieron utilizando un tampón de separación de células (Bio Whittaker) y se lavaron. Las células que expresaban EGFP se analizaron mediante citometría de flujo utilizando FACSVantage (Becton Dickinson) a una longitud de onda de excitación de 488 nm y una longitud de onda de emisión de 515-545 nm. La capacidad de unión del virus a la placa se expresaba mediante la eficacia de la transferencia del gen a las células. Los resultados se muestran en la Figura 2.
Como se muestra en la Figura 2, la capacidad de unión del virus aumentaba a medida que la concentración del compuesto diamínico utilizado para introducir un grupo amino aumentaba. Se observó un incremento de aproximadamente dos veces en la capacidad de unión del virus cuando se utilizaba putrescina, trimetilendiamina o etilendiamina en la reacción a una concentración de 2 mM en comparación con la capacidad observada utilizando CH-296 no tratado.
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Ejemplo 4
Efecto de la potenciación de la eficacia de la transferencia génica de la laminina
Se utilizó laminina de ratón (Gibco) o laminina humana (Takara Shuzo) combinada con una sustancia funcional con actividad de unión a un virus para llevar a cabo el experimento de transferencia génica. Se recubrió una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular (Falcon) utilizada en el experimento con estas sustancias funcionales según los dos siguientes métodos.
El método del cóctel: Se añade una mezcla de dos sustancias funcionales a la placa. La placa se deja estar a 4ºC durante la noche. La placa se bloquea con el 2% de BSA a 37ºC durante 20 minutos y después se lava con PBS.
El método del recubrimiento previo: Se añade una solución de una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un virus a la placa. La placa se deja estar a 4ºC durante la noche. La solución se separa. Se añade a la placa una solución de laminina. La placa se incuba a 37ºC durante 2 horas, se bloquea con el 2% de BSA, y después se lava con PBS.
Se utilizaron 0,5 ml de la solución de la sustancia funcional para recubrir cada pocillo.
Se añadieron 10^{5} células L1210 y 0,5 ml de sobrenadante de virus Eco-EGFP (10^{5} cfu/ml) al pocillo. La placa se incubó durante 24 horas. Tras la incubación, las células se recogieron utilizando un tampón de separación de células (Bio Whittaker) y se lavaron. Las células que expresaban EGFP se analizaron mediante citometría de flujo utilizando FACSVantage (Becton Dickinson) a una longitud de onda de excitación de 488 nm y una longitud de onda de emisión de 515-545 nm. Se calculó la eficacia de la transferencia génica (la razón de las células que expresaban EFGP con respecto a las células totales). Los resultados experimentales se muestran en las Tablas 2 a 5.
TABLA 2
2
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TABLA 3
3
TABLA 4
4
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TABLA 5
5
Como se muestra en las Tablas 2 y 3, se demostró que un gen es transferido a las células diana muy eficazmente con independencia del método de inmovilización cuando se utilizaba laminina de ratón o humana combinada con una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un virus para la transferencia génica utilizando un retrovirus. Se examinó la eficacia de la transferencia génica utilizando una placa recubierta con CH-296 o CH-271 y laminina según el método del cóctel. Como se muestra en las Tablas 4 y 5, se reveló que las razones óptimas fueron 8:1 (por ejemplo, 80 \mug/ml: 10 \mug/ml) para la combinación de CH-296/laminina de ratón, y 16:1 (por ejemplo, 80 \mug/ml: 5 \mug/ml) para CH-271/laminina de ratón, respectivamente. La eficacia de la transferencia génica aumentaba 2,6 veces y 5,1 veces para CH-296 y CH-271, respectivamente, en comparación con la eficacia de la transferencia génica sin adición de laminina.
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Ejemplo 5
Transferencia génica en células de médula ósea c-kit positivas de ratón utilizando laminina
Se prepararon células de médula ósea c-kit positivas de ratón como sigue. Se sometieron células de médula ósea recogidas de un fémur de un ratón hembra C3H/He de 6-8 semanas de edad (Japan SLC) a centrifugación en gradiente de densidad utilizando Ficoll-Hypaque (1,0875 g/ml, Pharmacia) para preparar una fracción que contenía las células mononucleares de baja densidad. Las células se lavaron con PBS, los eritrocitos se sometieron a lisis utilizando tampón Ery-Lysis (NH_{4}Cl 155 mM, KHCO_{3} 10 mM, EDTA 0,1 mM, pH 7,4), y las células se lavaron de nuevo con PBS. Se añadió 1 \mug/10^{7} células de anticuerpo anti-CD117 de ratón (Pharmingen) a las células de médula ósea resultantes. La mezcla se hizo reaccionar sobre hielo durante 30 minutos. Las células se lavaron con PBS que contenía EDTA 5 mM y 0,5% de BSA, y después se suspendieron en el mismo tampón. Se añadieron a las células 20 \mul/10^{7} células de un anticuerpo secundario conjugado con una microcuenta (Miltenyi Biotec). La mezcla se hizo reaccionar a 4ºC durante 30 minutos. Las células se lavaron con y se resuspendieron en el tampón mencionado antes. Las células unidas a las microcuentas se recogieron utilizando un sistema MACS (Miltenyi Biotec) para obtener células c-kit positivas.
Antes de la infección viral, las células de médula ósea de ratón c-kit positivas se estimularon previamente con el método de Luskey y col. [Blood, 80:396-402 (1992)]. Brevemente, las células se cultivaron en \alpha-MEM (Bio Whittaker) que contenía un 20% de FCS, 20 ng/ml de interleucina-3 de ratón recombinante (Genzyme), 50 ng/ml de interleucina-6 humana recombinante (Genzyme), 100 ng/ml de factor de crecimiento de células troncales de ratón (Genzyme), 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina a 37ºC durante 2 días en presencia de 5% de CO_{2}.
Se recubrió una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular según el método del cóctel utilizando una mezcla que contenía laminina de ratón a una concentración variable y 80 \mug/ml de CH-271. La placa se bloqueó con un 2% de BSA durante 30 minutos, y después se lavó con PBS. Se preparó una placa de control utilizando BSA al 2% en lugar de CH-271. Se añadieron 10^{5} células de médula ósea c-kit positivas y 0,5 ml de sobrenadante de virus Eco-EGFP (10^{5} cfu/ml) a cada pocillo de la microplaca para la infección viral. Tras la incubación durante 48 horas, se añadieron 0,5 ml de medio de nueva aportación al pocillo, y la placa se incubó durante 24 horas más. Tras la incubación, las células se recogieron utilizando un tampón de separación de células y se lavaron. Se calculó la eficacia de la transferencia génica como se describe en el Ejemplo 4. Los resultados de las dos rondas de experimentos se muestran en las Tablas 6 y 7.
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TABLA 6
6
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TABLA 7
7
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Como se muestra en las Tablas 6 y 7, se demostró que también se observaba un efecto muy fuerte de aumento de la eficacia de la transferencia génica cuando se infectaban células de médula ósea c-kit positivas con un retrovirus en una placa recubierta con laminina de ratón y una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un virus, CH-271, según el método del cóctel. La eficacia de la transferencia génica utilizando CH-271 combinado con laminina aumenta 5,7 veces a lo sumo en comparación con aquella en la que se utiliza CH-271 solo.
Además, se llevó a cabo el mismo procedimiento descrito antes utilizando sobrenadante del virus Eco-EGFP a un título de 10^{7} cfu/ml. La eficacia de transferencia génica media de las tres rondas de experimentos se muestra en la Tabla 8. También se demostró en este caso que la eficacia de la transferencia génica utilizando una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus aumentó al utilizar laminina combinada.
TABLA 8
8
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Ejemplo 6
Transferencia génica a células T CD3 positivas derivadas de células de bazo de ratón utilizando laminina
Se prepararon células T CD3 positivas derivadas de bazo de ratón como sigue. Se recogieron células del bazo de un ratón hembra C3H/He de 6-8 semanas de edad. Las células se hicieron pasar a través de un tamiz de 100 \mum (Falcon) para separar los residuos. Las células restantes se lavaron con solución salina equilibrada de Hanks (HBSS, Bio Whittaker) que contenía FCS al 10%, los eritrocitos se lisaron utilizando tampón Ery-Lysis, y las células se lavaron de nuevo con HBSS. Las células resultantes se hicieron pasar a través de un tamiz de 30 \mum (Miltenyi Biotec) para separar los residuos y después se purificaron utilizando una columna para concentrar las células T CD3 positivas (R&D Systems). Las células T CD3 positivas de ratón utilizadas para los experimentos de infección viral se estimularon previamente como sigue. Las células se cultivaron para la estimulación previa en una placa de Petri sobre la cual se habían inmovilizado un anticuerpo anti-CD3 de ratón y un anticuerpo anti-CD28 de ratón (ambos a 1 \mug/ml, Pharmingen). La placa de Petri contenía medio RPMI 1640 (Bio Whittaker) suplementado con 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. Las células se cultivaron a 37ºC durante 2 días en presencia de 5% de CO_{2}.
Se recubrió una microplaca de 24 pocillos utilizando una mezcla que contenía 20 \mug/ml de laminina de ratón y 80 \mug/ml de CH-296 como se describe en el Ejemplo 5. Se añadieron 10^{5} células T CD3-positivas y 0,5 ml de sobrenadante de virus Eco-EGFP (10^{5} cfu/ml) a cada pocillo de la microplaca para la infección viral durante 3 horas. A esto se le añadió el medio RPMI 1640 que contenía 10% de FCS, 500 unidades/ml de interleucina-1\alpha de ratón recombinante (Genzyme), 10 ng/ml de interleucina-2 de ratón recombinante (Genzyme), 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. La incubación continuó durante 48 horas. Tras la incubación, se recogieron las células utilizando un tampón de separación de células y se lavaron. La eficacia de la transferencia génica se calculó como se describe en el Ejemplo 4. Los resultados se muestran en la Tabla 9.
TABLA 9
9
Como se muestra en la Tabla 9, se demostró que la eficacia de la transferencia génica a células T CD3 positivas aumentó por la coexistencia de laminina.
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Ejemplo 7
Implicación de la cadena de azúcar de la molécula de laminina en la transferencia génica
Se recubrió una microplaca de 96 pocillos utilizando 50 \mul/pocillo de una mezcla que contenía 5 \mug/ml de laminina de ratón y 80 \mug/ml de CH-271 como se describe en el Ejemplo 5. Se examinaron los efectos del tratamiento de la placa con diversas enzimas que tenían actividades de escisión de cadenas de azúcar sobre la eficacia de la transferencia génica.
Las placas se trataron con las enzimas como sigue: Se prepararon soluciones de enzima que contenían 500 mU/ml de O-glicanasa (endo-\alpha-N-acetilgalactosaminidasa, Seikagaku Corp.), 500 mU/ml de endoglicosidasa H (endo-\beta-N-acetilglucosaminidasa H, (Seikagaku Corp.), 250 mU/ml de endo-\beta-galactosidasa (Seikagaku Corp.) y 2 mU/ml de \alpha-manosidasa (Seikagaku Corp.) en tampón citrato-fosfato 50 mM (pH 5,0). Se preparó una solución de enzima que contenía 250 mU/ml de glicopeptidasa F (péptido: N-glicosidasa F, Takara Shuzo) en tampón tris-hidrocloruro 100 mM (pH 8,6). Se dispensaron 50 \mul de cada una de las soluciones de enzima en cada pocillo para que reaccionaran a 37ºC durante 20 horas. La placa se lavó luego tres veces con PBS y después se utilizó para los experimentos de infección viral.
A cada pocillo de la microplaca se le añadieron 10^{4} células L1210 de leucemia de ratón en medio RPMI suplementado con un 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mul/ml de estreptomicina, y 50 \mul de sobrenadante de virus PM5neo (10^{4} cfu/ml). La placa se incubó durante 24 horas. El medio se cambió por el mismo medio que contenía G418 (Gibco) a una concentración final de 0,75 mg/ml. La placa se incubó durante 48 horas más. Las células con resistencia a G418 se evaluaron como se describe en el Ejemplo 3. Los resultados se muestran en la Tabla 10. La Tabla 10 resume resultados de tres rondas de experimentos.
TABLA 10
10
Como se muestra en la Tabla 10, cuando se utilizaba CH-271 combinado con laminina, aumentaba la aparición de células resistentes a G418 en comparación con el caso en el que se utilizaba CH-271 solo. El tratamiento de la placa recubierta con laminina con endoglicosidasa H anulaba completamente el efecto promotor de la transferencia génica de la laminina. Además, el tratamiento de la placa con \alpha-manosidasa o glicopeptidasa F disminuyó la eficacia de la transferencia génica en cierta medida. Según un informe relacionado con las cadenas de azúcar de la molécula de laminina [Biochim. Biophys. Acta, 883:112-126 (1986), la mayor parte de las cadenas de azúcar de una molécula de laminina son cadenas de azúcar conectadas a N que están unidas a asparragina. Cuarenta y tres moléculas de cadenas de azúcar conectadas a N están unidas a una molécula de laminina. Entre las cadenas de azúcar, las cadenas de azúcar conectadas a N de la asparragina del tipo de alto contenido de manosa son liberadas mediante el tratamiento con endoglicosidasa H. El hecho de que también se observara descenso en la eficacia de la transferencia génica cuando se trató con \alpha-manosidasa sugiere que las cadenas de azúcar de la molécula de la laminina juegan un importante papel. Tales cadenas de azúcar tienen una estructura que contiene manosa unida \alpha1-2- y/o \alpha1-6-, que es escindida con \alpha-manosidasa, representada por (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn y/o (Manosa)_{6}-(GluNAc)_{2}-Asn. Como se ha descrito antes, se demostró que el efecto promotor de la transferencia génica de la laminina se debe a las cadenas de azúcar de la molécula de laminina, en particular a las cadenas de azúcar del tipo de elevado contenido en manosa.
La implicación de (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn en la transferencia génica se confirmó mediante los siguientes experimentos.
Se desnaturalizó con calor 1 g de aglutinina de soja preparada a partir de harina de soja desgrasada (Sigma) utilizando Sepharose C-2B (Pharmacia) en la cual se había inmovilizado lactosa, y después se digirió con 20 mg de Actinasa E (Kaken Pharmaceutical) en 20 ml de tampón tris-hidrocloruro 50 mM (pH 7,2) que contenía cloruro de calcio 10 mM a 37ºC durante 2 días. Después de inactivar con calor la enzima, la mezcla se sometió a una cromatografía utilizando columnas Sephadex G-15 (50 ml) y Sephadex G-25 (150 ml) para purificar (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn. La Figura 1 ilustra la estructura de (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn de la cual se separa el resto asparragina.
Se preparó una microplaca en la que se habían inmovilizado CH-271 y (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn por medio de enlaces covalentes. Brevemente, se activó una Carboplate de 96 pocillos (placa ELISA Carbo-type) (Sumitomo Bakelite) utilizando 4 mg/ml de solución de carbodiimida soluble en agua a 37ºC durante 2 horas, y después se lavó tres veces con agua estéril. A cada pocillo de la Carboplate de 96 pocillos activada se añadieron 50 \mul de cada una de las soluciones que contenían un 2% de BSA o 80 \mug/ml de CH-271 así como (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn a una concentración variable. La placa se sometió a una reacción de inmovilización a 37ºC durante 2 horas. La placa se bloqueó utilizando solución de glicina al 0,2% a 4ºC durante 15 horas y después se utilizó para los siguientes experimentos de transferencia génica.
Se añadieron 10^{3} células L1210 y 0,1 ml de sobrenadante de virus Eco-EGFP (10^{6} cfu/ml) al pocillo de la microplaca. Después de incubar la placa durante 48 horas, se añadieron al pocillo 0,1 ml de medio RPMI 1640 de nueva aportación que contenía FCS, penicilina y estreptomicina. La placa se incubó durante 24 horas más. Las células se recogieron y se lavaron. La eficacia de la transferencia génica se calculó como se describe en el Ejemplo 4. Los resultados medios de dos experimentos independientes se muestran en la Tabla 11.
TABLA 11
11
Como se muestra en la Tabla 11, la eficacia de la transferencia génica para los pocillos en los cuales se había inmovilizado (Manosa)_{9}-(GluNAc)_{2}-Asn y CH-271 aumentaba dependiendo de la concentración de la cadena de azúcar utilizada. De este modo, se confirmó que la cadena de azúcar que tenía la misma estructura que la de la molécula de laminina contribuía al incremento de la eficacia de la transferencia génica.
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Ejemplo 8
Transferencia génica específica para las células CD4 positivas utilizando el anticuerpo monoclonal anti-CD4
Se recubrió una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular con una combinación de 1 \mug/ml de anticuerpo monoclonal anti-CD4 de ratón o anticuerpo monoclonal anti-CD44 de ratón (ambos de Pharmingen) y 80 \mug/ml de H-271, CH-271 o CH-296 como se describe en el Ejemplo 4. Se aplicó como recubrimiento H-271 según el método de recubrimiento previo mientras CH-271 y CH-296 se aplicaron como recubrimiento según el método del cóctel.
Se añadieron 0,5 ml de sobrenadante de virus Eco-EGFP (10^{7} cfu/ml) a cada pocillo de la microplaca. La placa se incubó a 32ºC durante 3 horas, y después se lavó con medio RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. Se añadieron al pocillo 10^{5} células T CD3 positivas derivadas de células de bazo de ratón preparadas y previamente estimuladas como se describe en el Ejemplo 6 para la infección viral durante 3 horas. Después de eso, se añadió al pocillo medio RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS, 500 unidades de interleucina-1\alpha de ratón recombinante, 10 ng/ml de interleucina-2 de ratón recombinante, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. La placa se incubó durante 48 horas más. Tras la incubación, las células se recogieron utilizando un tampón de separación de células, se lavaron y después se tiñeron con un anticuerpo monoclonal anti-CD4 de ratón (Pharmingen) marcado con ficoeritrina (PE; Pharmingen) y yoduro de propinio (PI, Sigma). Estas células se sometieron a citometría de flujo utilizando FACSVantage a una longitud de onda de excitación de 488 nm y una longitud de onda de emisión de 515-545 nm o 562-588 nm para analizar bidimensionalmente la expresión del antígeno CD4 y la expresión de EGFP en las células viables. Se calcularon las eficacias de la transferencia génica en las células CD4-positivas y las células CD4-negativas. Los resultados se muestran en la Tabla 12. La Tabla 12 resume los resultados de cuatro rondas de experimentos.
TABLA 12
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12
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Como se muestra en la Tabla 12, cuando se llevó a cabo una infección retroviral en una placa recubierta tanto con un anticuerpo monoclonal como con un fragmento de fibronectina, se observó un efecto de aumento de la eficacia de la transferencia génica para las células T CD3 positivas derivadas de células de bazo de ratón.
Entre otros, se debe observar que la eficacia de la transferencia génica a células CD4 positivas era muy superior a la de las células CD4 negativas cuando la infección viral se llevaba a cabo utilizando una combinación de anticuerpo monoclonal anti-CD4 y una sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus. Por ejemplo, la eficacia de la transferencia génica a células CD4 positivas utilizando una combinación de anticuerpo monoclonal anti-CD4 y H-271 era muy elevada (aproximadamente 60%), mientras la eficacia de la transferencia génica a células CD4 negativas era sólo de aproximadamente el 20%. Se observaban resultados similares cuando se utilizaba CH-271 o CH-296 como fragmento de fibronectina.
Por otra parte, el antígeno CD44 se expresa en un 98% de más de las células CD4 positivas y de las células CD4 negativas. Por lo tanto, se esperaba que la eficacia de la transferencia génica se incrementara con independencia de la expresión del antígeno CD4 en las células cuando se utilizaba un anticuerpo monoclonal anti-CD44 para la infección retroviral como se ha descrito antes. Los resultados de la Tabla 12 confirman semejante expectativa.
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Ejemplo 9
Transferencia génica específica para las células CD8-positivas utilizando anticuerpo monoclonal anti-CD8a
Se llevaron a cabo experimentos como se describe en el Ejemplo 8 excepto que se utilizaron H-271 como sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus, y anticuerpo monoclonal anti-CD8a de ratón (Pharmingen) y anticuerpo monoclonal anti-CD44 de ratón como anticuerpos. Se utilizó un anticuerpo monoclonal anti-CD8a de ratón (Pharmingen) marcado con ficoeritrina (PE; Pharmingen) para detectar las células CD8 positivas y CD8 negativas. Los resultados se muestran en la Tabla 13. La Tabla 13 resume los resultados de dos rondas de experimen-
tos.
TABLA 13
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13
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Como se muestra en la Tabla 13, se observó un efecto de aumento de la eficacia de la transferencia génica a las células T CD3 positivas derivadas de células de bazo de ratón cuando se utilizaba una combinación de un anticuerpo monoclonal anti-CD8a y un fragmento de fibronectina.
Cuando se utilizó el anticuerpo monoclonal anti-CD8a, como se observa en el Ejemplo 8, se observó una elevada eficacia de transferencia de genes para las células que expresaban el antígeno CD8 reconocidas por el anticuerpo. Por otra parte, cuando se utilizó un anticuerpo monoclonal contra CD44 que es expresado en un 98% de más de las células CD8 positivas y las células CD8 negativas, no se reconoció una diferencia en la eficacia de la transferencia génica entre las células CD8 positivas y las células CD8 negativas.
Los resultados experimentales de los Ejemplos 8 y 9 son muy significativos. Estos resultados demuestran que un gen de interés se puede transferir específicamente a las células diana si la población celular que contiene las células diana es infectada con un retrovirus que contiene el gen de interés en un recipiente de cultivo que ha sido recubierto utilizando una mezcla (cóctel) de un anticuerpo que se une específicamente a las células diana y una sustancia funcional que tiene actividad de unión al virus.
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Ejemplo 10
Transferencia génica específica de células utilizando un anticuerpo
Se recubrió una microplaca para el cultivo celular de 24 pocillos no tratada como se describe en el Ejemplo 4 según el método del cóctel utilizando 80 \mug/ml de CH-271 y 1 \mug/ml de uno de los anticuerpos monoclonales contra diferentes antígenos de la superficie celular (anticuerpos anti-CD4, anti-CD8, anti-CD44, anti-CD49c, anti-CD49d y anti-CD49e; todos de Pharmingen).
Como células diana se utilizaron K562 (célula de leucemia mielógena crónica humana, ATCC CCL-243), HSB-2 (célula de leucemia linfoblástica aguda humana, CCRF-HSB-2, ATCC CCL-120.1), MOLT-3 (célula de leucemia linfoblástica aguda humana, ATCC CRL-1552) y TF-1 (célula de eritroleucemia humana, ATCC CRL-2003). Se llevó a cabo el análisis FACS en estas células utilizando los respectivos anticuerpos monoclonales marcados para determinar la expresión de los antígenos correspondientes a los anticuerpos.
Se añadieron 0,5 ml de sobrenadante de virus Ampho-EGFP (1 x 10^{6} cfu/ml) a cada pocillo de la microplaca. La placa se incubó a 32ºC durante 3 horas, y después se lavó con medio RPMI 1640 que contenía 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. Se añadieron a cada pocillo 1 x 10^{5} de cada una de las respectivas células suspendidas en 1 ml del medio para la infección viral. Después de incubar durante 3 días más, se recogieron las células utilizando un tampón de separación celular y se lavaron. La eficacia de la transferencia génica con EGFP se calculó según el método de citometría de flujo descrito en el Ejemplo 4.
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Los resultados se muestran en la Tabla 14. Se muestran los resultados medios de tres experimentos independientes.
TABLA 14
14
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La eficacia de la transferencia génica (Efic. transf.) se expresa como un valor relativo (%) suponiendo la eficacia de la transferencia génica sin la adición de un anticuerpo para las respectivas células como el 100%.
Las razones de expresión del antígeno CD (razón exp. ag. CD) representan las proporciones de células positivas (%) en las mediciones FACS como sigue:
-: 10% o menos; +/-: 10-30%; +: 30-60%; ++: 60-90%; +++: 90% o más.
Como se muestra en la Tabla 14, la razón de expresión del antígeno se correspondía con la eficacia de la transferencia génica utilizando el método del cóctel en el cual se utilizaban CH-271 como sustancia de unión al virus y el anticuerpo contra el antígeno de la célula como sustancia de unión a la célula.
Además, se llevaron a cabo experimentos de transferencia génica utilizando 80 \mug/ml de polilisina como sustancia funcional que tiene actividad de unión a un retrovirus en lugar de CH-271. Los anticuerpos monoclonales y las células utilizados así como otras condiciones experimentales fueron los descritos antes. Los resultados se muestran en la Tabla 15. Se muestran los resultados medios de tres experimentos independientes.
TABLA 15
15
La eficacia de la transferencia génica (Efic. transf.) se expresa como un valor relativo (%) suponiendo la eficacia de la transferencia génica sin la adición de un anticuerpo para las respectivas células como el 100%.
Las razones de expresión del antígeno CD (razón exp. ag. CD) representan las proporciones de células positivas (%) en las mediciones FACS como sigue:
-: 10% o menos; +/-: 10-30%; +: 30-60%; ++: 60-90%; +++: 90% o más.
Como se muestra en la Tabla 15, la razón de expresión del antígeno se correspondía con la eficacia de las transferencias génicas utilizando el método del cóctel en el cual se utilizaban polilisina como sustancia de unión al virus y el anticuerpo contra el antígeno de la célula como sustancia de unión a la célula.
Las dos series de resultados experimentales descritas antes demuestran que se puede transferir un gen específicamente a las células diana de interés transfiriendo un gen según el método del cóctel utilizando un anticuerpo que reconoce específicamente un antígeno expresado sobre la célula diana como sustancia de unión a la célula.
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Ejemplo 11
Transferencia génica a células diana cultivadas previamente en medio que contenía desferoxamina
Se transfirieron células de leucemia mielocítica humana HL-60 (ATCC CCL-240) cultivadas en medio RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina al mismo medio que contenía desferoxamina (Sigma) a concentraciones variables el día anterior a los experimentos de infección. Las células se cultivaron a 37ºC durante 20 horas en presencia de 5% de CO_{2}. Las células se lavaron con medio de nueva aportación sin desferoxamina después de su uso, y luego se suspendieron a una concentración de 2 x 10^{5} células/ml para su uso en los siguientes experimentos de infección.
Se añadieron 0,5 ml de CH-271 de 80 \mug/ml a cada pocillo de una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular. La placa se dejó estar a 4ºC durante la noche, se bloqueó utilizando un 2% de BSA durante 30 minutos y se lavó con PBS. Se añadieron 0,5 ml de sobrenadante de virus Ampho-EGFP (10^{6} cfu/ml) al pocillo de la microplaca. La placa se incubó a 32ºC durante 3 horas y se lavó con medio RPMI 1640 que contenía 10% de FCS, 50 unidades de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. Se añadieron 10^{5} células HL-60 precultivadas al pocillo. La placa se incubó durante 48 horas. Al pocillo se le añadieron 0,5 ml de medio RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. La placa se incubó durante 24 horas más. Después de eso, se determinó la eficacia de la transferencia génica como se describe en el Ejemplo 4. Los resultados se muestran en las Tablas
16 y 17.
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TABLA 16
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TABLA 17
17
Como se muestra en las Tablas 16 y 17, se observaba un incremento de la eficacia de la transferencia génica incluso para las células HL-60 mediante el tratamiento previo de las células con desferoxamina durante 20 horas. Se sabía que un gen se transfiere a las células HL-60 con una eficacia muy baja al utilizar CH-271 solo.
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Ejemplo 12
Detección de la presencia de sustancias inhibidoras de la infección viral en el sobrenadante de cultivo
Se diluyó el sobrenadante del virus TKNeo preparado en el Ejemplo 2 con DMEM, un sobrenadante de cultivo de células NIH/3T3 (ATCC CRL-1658) o un sobrenadante de cultivo de células \varphiCRIP a una concentración de 312,5 cfu/ml para su uso en los siguientes procedimientos.
Se añadieron 0,5 ml de CH-296 de 32 \mug/ml a cada pocillo de una microplaca no tratada de 24 pocillos para el cultivo celular. La placa se dejó estar a la temperatura ambiente durante 2 horas, se bloqueó con un 2% de BSA durante 30 minutos y se lavó con PBS. Se añadieron 1 ml del sobrenadante de virus mencionado antes y 2 x 10^{4} células NIH/3T3 al pocillo de la placa. La placa se incubó a 37ºC durante la noche. Las células se cultivaron después en un medio selectivo que contenía 0,75 mg/ml de G418 durante 10 días. Se contó el número de colonias formadas. La razón del número de colonias con respecto al número de colonias formadas en un medio sin G418 se definió como la eficacia de la transferencia génica. Los resultados se muestran en la Tabla 18.
TABLA 18
18
Como se muestra en la Tabla 18, las eficacias de la transferencia génica disminuyeron un quinto o menos cuando se utilizaba la dilución del virus del sobrenadante de cultivo de las células NIH/3T3 o el sobrenadante de cultivo de las células \varphiCRIP en comparación con la eficacia de la transferencia génica en la que se utilizaba la dilución con DMEM. La célula NIH/3T3 es la cepa parental de muchas líneas celulares de empaquetamiento tales como la célula \varphiCRIP y la célula GP+EmvAm12, que se utilizó para generar la célula productora del vector de virus TKNeo utilizado en este experimento. El hecho de que se encuentre actividad inhibidora de la infección retroviral en los sobrenadantes de cultivo de estas células sugiere que los sobrenadantes de virus preparados utilizando células de empaquetamiento similares también contienen sustancias inhibidoras.
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Ejemplo 13
Eliminación de la sustancia inhibidora de la infección viral en sobrenadante de virus
Se utilizaron los siguientes procedimientos para eliminar la sustancia inhibidora de la infección viral encontrada en el Ejemplo 12. El sobrenadante de virus TKNeo preparado en el Ejemplo 2 se diluyó con el sobrenadante de cultivo de las células \varphiCRIP a una concentración de 5000 cfu/ml. El sobrenadante diluido se diluyó además doblemente con DMEM para utilizarlo como muestra que contenía un retrovirus.
Se añadió 1 ml del sobrenadante de virus a cada pocillo de una placa recubierta con CH-296 como se describe en el Ejemplo 11. La placa se incubó durante 1 a 5 horas para poner en contacto y unir las partículas de virus con CH-296. Después la placa se lavó tres veces con PBS. Se añadió al pocillo 1 ml de DMEM que contenía 2 x 10^{4} células NIH/3T3. Como control, se suspendieron 2 x 10^{4} células NIH/3T3 en 1 ml del sobrenadante de virus mencionado antes y después se transfirió inmediatamente a la placa recubierta con CH-296. Estas placas se incubaron a 37ºC durante la noche para permitir que el virus infectara las células. Tras la infección, las células se cultivaron en un medio selectivo que contenía 0,75 mg/ml de G418 durante 10 días, y se contó el número de colonias formadas. Se definió la razón del número de colonias resistentes a G418 con respecto al número de colonias formadas en el medio sin G418 como la eficacia de la transferencia génica. Los resultados se muestran en la Figura 3.
Como se muestra en la Figura 3, se observaba una eficacia de transferencia superior a las 3 horas cuando las partículas de virus se ponían en contacto y se unían con la placa recubierta de CH-296 en comparación con la eficacia del grupo de control. De este modo, se demostró que la actividad de inhibición de la infección viral en un sobrenadante de virus se podía eliminar mediante los procedimientos descritos antes.
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Ejemplo 14
Eliminación de butirato de sodio en sobrenadante de virus
Las células productoras de retrovirus recombinante obtenidas introduciendo un plásmido vector retroviral pLEIN en las células \varphiCRIP se cultivaron en DMEM que contenía un 10% de CS. Cuando las células crecieron hasta la semi-confluencia en una placa de 10 cm, se cambió el medio por 7 ml de RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS o 7 ml de RPMI que contenía butirato de sodio 5 mM (Nacalai Tesque) y 10% de FCS. Después de que las células se cultivaran durante 24 horas, los sobrenadantes se filtraron a través de filtros de 0,45 \mum para obtener sobrenadantes de virus. El título del sobrenadante de virus se determinó como se describe en el Ejemplo 2. El título del sobrenadante de virus sin butirato de sodio era 3,3 x 10^{4} cfu/ml, mientras el título del sobrenadante de virus que contenía butirato de sodio 5 mM era 2 x 10^{6} cfu/ml.
El butirato de sodio tiene actividades de detención del ciclo celular para suprimir el crecimiento celular e inducir la diferenciación. De este modo, puede tener influencia nociva sobre las células infectadas. La eliminación del butirato de sodio contenido en un sobrenadante de virus se evaluó como sigue.
Se utilizaron células HL-60 como células diana. Se añadieron 0,5 ml del sobrenadante de virus antes mencionado a cada pocillo de una placa recubierta con CH-296 como se describe en el Ejemplo 12. La placa se incubó a 37ºC durante 3 horas para poner en contacto y unir las partículas de virus con CH-296. Tras la incubación, la placa se lavó tres veces con PBS. Se añadieron 0,5 ml de medio RPMI 1640 suplementado con 10% de FCS que contenía 5 x 10^{4} células HL-60 al pocillo. Como control, se suspendieron 5 x 10^{4} células HL-60 en 0,5 ml del sobrenadante de virus mencionado antes e inmediatamente después se añadieron a la placa recubierta con CH-296. Estas placas se incubaron a 37ºC durante la noche para permitir que el virus infectara las células. Después de la incubación, se añadió al pocillo 1 ml de medio RPMI 1640 que contenía un 10% de FCS. La placa se incubó durante 48 horas más. Luego se contó el número de células. Además, se detectaron las células que expresaban EGFP según el método de citometría de flujo descrito en el Ejemplo 4 para analizar la eficacia de la transferencia génica. Los resultados se muestran en la Tabla 19.
TABLA 19
19
Como se muestra en la Tabla 19, se observaba una eficacia de la transferencia génica mayor para el grupo de control cuando se utilizaba un sobrenadante de virus preparado añadiendo butirato de sodio, confirmando la eficacia del butirato de sodio en la preparación de virus. No obstante, el número de células viables observado utilizando el sobrenadante que contiene butirato de sodio era un cuarto o menos del observado utilizando el sobrenadante sin butirato de sodio, confirmando que el butirato de sodio suprimía el crecimiento celular. Por otra parte, cuando se puso en contacto y se unían las partículas de virus con la placa recubierta con CH-296 de antemano, la supresión del crecimiento celular, que se observó para un grupo de control utilizando el sobrenadante que contenía butirato de sodio, no se observaba. Se observó incremento en lugar de descenso, de la eficacia de la transferencia génica. De este modo, se demostró que se podía obtener una elevada eficacia de la transferencia génica sin la influencia de butirato de sodio poniendo en contacto el virus con CH-296 seguido de lavado.
A continuación, se utilizó DEAE-dextrano para llevar a cabo experimentos similares.
Se disolvió DEAE-dextrano (Sigma) a una concentración de 10 mg/ml en PBS. La solución se esterilizó filtrando a través de un filtro de 0,22 \mum y se utilizó para recubrir una placa. Se añadieron 1,1 ml de una mezcla obtenida mezclando 10 volúmenes de PBS y 1 volumen de la solución de DEAE-dextrano a cada pocillo de una placa para el cultivo celular no tratada de 6 pocillos (Iwaki Glass). La placa se incubó a 4ºC durante la noche. La solución de DEAE-dextrano se separó de la placa. Se añadieron 2 ml de una solución con el 2% de BSA al pocillo para el tratamiento durante 30 minutos. La placa se lavó tres veces con 2 ml/pocillo de PBS. Como control, se preparó una placa llevando a cabo los mismos procedimientos excepto que se utilizó PBS en lugar de la solución de DEAE-dextrano.
Se preparó un sobrenadante de virus según el método en el cual se añadía butirato de sodio como se ha descrito antes utilizando células productoras de retrovirus recombinante producidas introduciendo un plásmido vector retroviral pLEIN en células GP+E86 [J. Virol., 62:1120-1124 (1988)]. Se añadió a cada pocillo 1 ml de una dilución de virus (1,6 x 10^{6} cfu/ml) obtenido diluyendo 1 volumen del sobrenadante de virus con 20 volúmenes de DMEM que contenía 10% de CS. La placa se incubó a 37ºC durante 2 horas, y después se lavó tres veces con 2 ml/pocillo de PBS. Se añadieron 5 x 10^{4} células NIH/3T3 al pocillo. La placa se incubó a 37ºC durante 3 días en presencia de 5% de CO_{2}. Después de la incubación, las células se trataron con tripsina y se recogieron. Se analizaron las células que expresaban EGFP según el método de citometría de flujo descrito en el Ejemplo 4 para determinar la eficacia de la transferencia génica. Los resultados se muestran en la Tabla 20.
TABLA 20
20
Como se muestra en la Tabla 20, se demostró que el DEAE-dextrano también tiene actividad de unión a un retrovirus, y se puede utilizar para el método de transferencia génica de la presente invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo 15
Unión de la sustancia funcional a retrovirus utilizando el método de centrifugación
Se cultivaron células \varphiCRIP en las cuales se había introducido un plásmido de retrovirus, vector DOL, que contenía un gen de resistencia a la neomicina [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84:2150-2154 (1987)] en DMEM que contenía 10% de CS, 50 unidades/ml de penicilina y 50 \mug/ml de estreptomicina. Se preparó sobrenadante de virus DOL como sigue. Se cambió el medio de una placa de 10 cm en la cual se habían hecho crecer células productoras hasta la semiconfluencia por 5 ml de DMEM que contenía 10% de CS. Al cabo de 24 horas, se recogió el sobrenadante y se filtró a través de un filtro de 0,45 \mum (Millipore). El título del sobrenadante de virus era de 8,7 x 10^{5} cfu/ml.
Se recubrió con CH-296 un tubo de centrifugación (tubo cónico de polipropileno de 50 ml, Falcon) utilizado para infectar células con un retrovirus como sigue. Brevemente, se colocaron lentamente 3 ml de PBS que contenía 40 \mug/ml de CH-296 en la base del tubo de centrifugación. El tubo se dejó estar boca arriba para la incubación a 4ºC durante 16 horas. La solución de CH-296 se cambió por 3,5 ml de PBS que contenía 2% de BSA. El tubo se incubó durante 30 minutos más a la temperatura ambiente, y después se lavó con 5 ml de solución salina equilibrada de Hanks (HBSS, Gibco).
El retrovirus DOL se unió a la base del tubo de centrifugación recubierto con CH-296 como sigue. Brevemente, se colocaron 5 ml de sobrenadante de virus DOL no diluido, o una dilución a la décima o a la centésima del mismo en el tubo de centrifugación. El tubo se centrifugó a 2900 x g a 25ºC durante 3 horas para forzar la unión del retrovirus a CH-296. Como comparación, se añadió a una placa no tratada de 6 pocillos para el cultivo celular (Falcon) recubierta con CH-296 el sobrenadante del virus mencionado antes utilizando PBS que contenía 40 \mug/ml de CH-296 de manera que diera lugar a una densidad de 8 \mug/cm^{2}. Se dejó estar la placa a 37ºC durante 4 horas para la unión y se utilizó en los siguientes procedimientos.
Se llevó a cabo la transferencia génica a células NIH/3T3 utilizando el tubo de centrifugación recubierto con CH-296 al cual se había obligado a unirse el retrovirus mediante centrifugación. Brevemente, se colocaron 1 x 10^{5} células NIH/3T3 en el tubo de centrifugación recubierto con CH-296 en el cual se había centrifugado una de las diluciones seriadas del sobrenadante del virus. El tubo se incubó a 37ºC durante 3 horas (en adelante referido como método de centrifugación). Alternativamente, se incubó la microplaca mencionada antes en las misma condiciones (referidas en adelante como método de unión). Como control, se añadió una mezcla de sobrenadante de virus y NIH/3T3 a la microplaca recubierta con CH-296, y la placa se incubó a 37ºC durante 3 horas. Los resultados obtenidos utilizando el último método se definieron como los del método de infección convencional y se utilizaron para la comparación (referido en adelante como método del sobrenadante). Después de la incubación, se recogieron las células. Se determinó la eficacia de la transferencia génica en las células recogidas como se describe en el Ejemplo 13. Los resultados se muestran en la Figura 4. En la Figura 4, el eje horizontal representa la velocidad de dilución del sobrenadante del virus y el eje vertical representa la eficacia de la transferencia génica. Las barras abiertas, las barras sombreadas y las barras cerradas representan los resultados obtenidos utilizando el método del sobrenadante, el método de unión y el método de centrifugación, respectivamente.
Como se muestra en la Figura 4, la eficacia de la transferencia génica en la que se utiliza el método de centrifugación era mayor que la que utiliza el método del sobrenadante convencional y el método en el cual se ha adsorbido espontáneamente el virus a CH-296 antes de la infección (el método de unión). De este modo, se demostró que se unían más partículas de virus a CH-296 en la base del recipiente obligando al virus a precipitar por la fuerza centrífuga. En particular, el efecto debido a la centrifugación era notable cuando se utilizaba un sobrenadante de virus diluido.
Además, se midieron los títulos de los sobrenadantes del virus recogidos después de la unión del virus utilizando la centrifugación o el reposo (unión). Los resultados se muestran en la Tabla 21.
TABLA 21
21
Como se muestra en le Tabla 21, en caso de reposo, el sobrenadante recogido tenía aproximadamente de un 80 a un 90% del título del sobrenadante antes de la unión. Por otra parte, el título de sobrenadante después de forzar la unión mediante centrifugación era un décimo o menos de la del sobrenadante antes de la unión. Estos resultados demuestran que se unían más partículas de virus a CH-296 por la fuerza centrífuga. El PBS utilizado para lavar el tubo de centrifugación después de la centrifugación contenía aproximadamente un 2% de la cantidad original del virus. Además, se observaba casi la misma eficacia de transferencia génica con independencia de la presencia de la etapa de lavado. Estos resultados sugieren que las partículas de virus eran firmemente mantenidas por CH-296 cuando se utilizaba la centrifugación.
Además, la eficacia de la transferencia génica mediante el método de centrifugación se comparaba con la del método en el cual las células se infectaban con un virus durante la centrifugación.
La eficacia de la transferencia génica a las células NIH/3T3 mediante el método de centrifugación se comparó con la del método de infección por centrifugación, en el cual se hacía precipitar un virus por la fuerza centrífuga sobre las células para su infección (véase el documento WO 95/10619). Para la comparación se utilizaron 5 ml de un sobrenadante de virus diluyendo el sobrenadante de virus preparado utilizando células GP+E86 como se describe en el Ejemplo 14 con un sobrenadante de cultivo de células NIH/3T3 a una concentración de 1 x 10^{5} cfu/ml. Brevemente, la transferencia se llevó a cabo como sigue. Se añadió el sobrenadante de virus mencionado antes a un tubo de centrifugación recubierto con CH-296. El tubo se centrifugó a 30ºC a 2.900 x g durante 4 horas, y después se lavó con PBS. Después las células se añadieron al tubo para la infección a 37ºC durante 4 horas (método de centrifugación). Se añadieron células a un tubo de centrifugación recubierto con CH-296, y se cultivaron durante 2 horas. Se añadió el sobrenadante de virus al tubo. El tubo se centrifugó a 30ºC a 2.900 x g durante 4 horas para la infección (método de infección por centrifugación). En estos métodos, los tubos de centrifugación se recubrían con CH-296 como se ha descrito antes, y se utilizaban 1 x 10^{5} células NIH/3T3 para la transferencia génica. Después de la infección las células se volvieron a cultivar en placa en una placa de 60 mm, y se cultivaron durante 2 días. La eficacia de la transferencia génica con EGFP se determinó después según el método de citometría de flujo descrito en el Ejemplo 4. Los resultados se muestran en la Figura 5.
Como se muestra en la Figura 5, se demostró que la eficacia de la transferencia génica mediante el método de centrifugación era superior que la del método de infección por centrifugación. Se considera que esto es porque la sustancia inhibidoras de la infección del sobrenadante de virus se había eliminado mediante lavado.

Claims (7)

1. Un método para transferir un gen a células diana utilizando un retrovirus que comprende:
(i)
proporcionar un sustrato sobre el que se han inmovilizado
-
\vtcortauna una sustancia capaz de unirse a un retrovirus y
-
\vtcortauna un anticuerpo que se une específicamente a una célula diana;
(ii)
poner en contacto dicho sustrato con una suspensión que contiene retrovirus, donde dicha suspensión es un sobrenadante de cultivo no diluido o diluido de células productoras de retrovirus;
(iii)
lavar el sustrato al cual se une el retrovirus; y
(iv)
poner en contacto e incubar el sustrato al cual se une el retrovirus con las células diana,
caracterizado porque dicho sustrato está en contacto con dicha suspensión que contiene retrovirus durante tres horas o más.
2. El método de acuerdo con la reivindicación 1, donde el anticuerpo reconoce una sustancia biológica sobre la superficie de las células diana.
3. Un método para transferir un gen a células diana utilizando un retrovirus, que comprende:
(i)
proporcionar un sustrato sobre el que se han inmovilizado
-
\vtcortauna una sustancia capaz de unirse a un retrovirus y
-
\vtcortauna laminina, un fragmento de laminina, una cadena de azúcar derivada de laminina o una cadena de azúcar de tipo alto contenido en manosa;
(ii)
poner en contacto dicho sustrato con una suspensión que contiene retrovirus, donde dicha suspensión es un sobrenadante de cultivo no diluido o diluido de células productoras de retrovirus;
(iii)
lavar el sustrato al cual se une el retrovirus; y
(iv)
poner en contacto e incubar el sustrato al cual se une el retrovirus con las células diana,
caracterizado porque dicho sustrato está en contacto con dicha suspensión que contiene retrovirus durante tres horas o más.
4. El método de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde la sustancia capaz de unirse a un retrovirus se selecciona del grupo que consiste en fibronectina, factor de crecimiento de fibroblastos, colágeno de tipo V, polilisina y DEAE-dextrano, así como fragmentos de los mismos.
5. El método de acuerdo con la reivindicación 4, donde la sustancia capaz de unirse a retrovirus tiene una actividad de unión a células diana.
6. El método de acuerdo con las reivindicaciones 1 a 5, donde la frecuencia de contacto entre el retrovirus y la sustancia capaz de unirse a retrovirus aumenta físicamente en la etapa (ii) mediante sacudimiento, filtración o fuerza centrífuga.
7. El método de acuerdo con las reivindicaciones 1 a 6, donde se utiliza un recipiente para cultivo celular o un sustrato particulado como sustrato.
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